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Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000157391	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528	ENSGT01030000234620.a.b.b.b	ENSGT00530000064210	ENSGT00390000011724	ENSGT00950000182836.b.a.b	ENSGT00940000156989 #22	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b	ENSGT00390000002089.a.b	ENSGT00940000160954	ENSGT00940000154196.b	ENSGT00940000155793	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294
Steppe mouse	MODERN SPECIES	2667															ENSMSIG00000026735	Nek2 (ENSMSIG00000026753) #22	ENSMSIG00000026779	Slc30a1 (ENSMSIG00000026786)	ENSMSIG00000026792	Rd3 (ENSMSIG00000026807)	ENSMSIG00000026824	Traf5 (ENSMSIG00000026837)	Rcor3 (ENSMSIG00000026869)	Kcnh1 (ENSMSIG00000027136)	ENSMSIG00000027154
spretus	MODERN SPECIES		Angel2 (MGP_SPRETEiJ_G0015840)	Vash2 (MGP_SPRETEiJ_G0015841)	Flvcr1 (MGP_SPRETEiJ_G0015842)	Spata45 (MGP_SPRETEiJ_G0015843)	Tatdn3 (MGP_SPRETEiJ_G0015844)	Nsl1 (MGP_SPRETEiJ_G0015845)	Batf3 (MGP_SPRETEiJ_G0015846)	Garin4 (MGP_SPRETEiJ_G0015847)	Atf3 (MGP_SPRETEiJ_G0015848)	Nenf (MGP_SPRETEiJ_G0015849)	Pacc1 (MGP_SPRETEiJ_G0015850)	Ppp2r5a (MGP_SPRETEiJ_G0015851)	Dtl (MGP_SPRETEiJ_G0015852)	Ints7 (MGP_SPRETEiJ_G0015853)	Lpgat1 (MGP_SPRETEiJ_G0015854)	Nek2 (MGP_SPRETEiJ_G0015855) #22	Slc30a1 (MGP_SPRETEiJ_G0015856)	Rd3 (MGP_SPRETEiJ_G0015857)	MGP_SPRETEiJ_G0015858	Rcor3 (MGP_SPRETEiJ_G0015859)	Kcnh1 (MGP_SPRETEiJ_G0015860)	Hhat (MGP_SPRETEiJ_G0015861)	Sertad4 (MGP_SPRETEiJ_G0015862)	MGP_SPRETEiJ_G0015863	Utp25 (MGP_SPRETEiJ_G0015864)	Irf6 (MGP_SPRETEiJ_G0015865)	A130010J15Rik (MGP_SPRETEiJ_G0015866)	Traf3ip3 (MGP_SPRETEiJ_G0015867)	Lamb3 (MGP_SPRETEiJ_G0015868)	Hsd11b1 (MGP_SPRETEiJ_G0015869)	G0s2 (MGP_SPRETEiJ_G0015870)
Mouse	MODERN SPECIES		Angel2 (ENSMUSG00000026634)	Vash2 (ENSMUSG00000037568)	Flvcr1 (ENSMUSG00000066595)	Spata45 (ENSMUSG00000057072)	Tatdn3 (ENSMUSG00000026632)	Nsl1 (ENSMUSG00000062510)	Batf3 (ENSMUSG00000026630)	Garin4 (ENSMUSG00000091017)	Atf3 (ENSMUSG00000026628)	Nenf (ENSMUSG00000037499)	Pacc1 (ENSMUSG00000026627)	Ppp2r5a (ENSMUSG00000026626)	Dtl (ENSMUSG00000037474)	Ints7 (ENSMUSG00000037461)	Lpgat1 (ENSMUSG00000026623)	Nek2 (ENSMUSG00000026622) #22	Slc30a1 (ENSMUSG00000037434)	Rd3 (ENSMUSG00000049353)	Traf5 (ENSMUSG00000026637)	Rcor3 (ENSMUSG00000037395)	Kcnh1 (ENSMUSG00000058248)	Hhat (ENSMUSG00000037375)	Sertad4 (ENSMUSG00000016262)	Syt14 (ENSMUSG00000016200)	Utp25 (ENSMUSG00000016181)	Irf6 (ENSMUSG00000026638)	A130010J15Rik (ENSMUSG00000079144)	Traf3ip3 (ENSMUSG00000037318)	Lamb3 (ENSMUSG00000026639)	Hsd11b1 (ENSMUSG00000016194)	G0s2 (ENSMUSG00000009633)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES		Angel2 (MGP_CAROLIEiJ_G0015040)	Vash2 (MGP_CAROLIEiJ_G0015041)	Flvcr1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015042)	Spata45 (MGP_CAROLIEiJ_G0015043)	Tatdn3 (MGP_CAROLIEiJ_G0015044)	Nsl1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015045)	Batf3 (MGP_CAROLIEiJ_G0015046)	Garin4 (MGP_CAROLIEiJ_G0015047)	Atf3 (MGP_CAROLIEiJ_G0015048)	Nenf (MGP_CAROLIEiJ_G0015049)	Pacc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015050)	Ppp2r5a (MGP_CAROLIEiJ_G0015051)	Dtl (MGP_CAROLIEiJ_G0015052)	Ints7 (MGP_CAROLIEiJ_G0015053)	Lpgat1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015054)	Nek2 (MGP_CAROLIEiJ_G0015055) #22	Slc30a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015056)	Rd3 (MGP_CAROLIEiJ_G0015057)	MGP_CAROLIEiJ_G0015058	Rcor3 (MGP_CAROLIEiJ_G0015059)	Kcnh1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015060)	Hhat (MGP_CAROLIEiJ_G0015061)	Sertad4 (MGP_CAROLIEiJ_G0015062)	MGP_CAROLIEiJ_G0015063	Utp25 (MGP_CAROLIEiJ_G0015064)	Irf6 (MGP_CAROLIEiJ_G0015065)	A130010J15Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0015066)	Traf3ip3 (MGP_CAROLIEiJ_G0015067)	Lamb3 (MGP_CAROLIEiJ_G0015068)	Hsd11b1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015069)	G0s2 (MGP_CAROLIEiJ_G0015070)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	18	Angel2 (MGP_PahariEiJ_G0028272)	Vash2 (MGP_PahariEiJ_G0028273)	Flvcr1 (MGP_PahariEiJ_G0028274)	Spata45 (MGP_PahariEiJ_G0028275)	MGP_PahariEiJ_G0028276	Nsl1 (MGP_PahariEiJ_G0028277)	Batf3 (MGP_PahariEiJ_G0028278)	Garin4 (MGP_PahariEiJ_G0028279)	Atf3 (MGP_PahariEiJ_G0028280)	Nenf (MGP_PahariEiJ_G0028281)	Pacc1 (MGP_PahariEiJ_G0028282)	Ppp2r5a (MGP_PahariEiJ_G0028283)	Dtl (MGP_PahariEiJ_G0028284)	Ints7 (MGP_PahariEiJ_G0028285)	Lpgat1 (MGP_PahariEiJ_G0028286)	Nek2 (MGP_PahariEiJ_G0028287) #22	Slc30a1 (MGP_PahariEiJ_G0028288)	Rd3 (MGP_PahariEiJ_G0028289)	MGP_PahariEiJ_G0028290	Rcor3 (MGP_PahariEiJ_G0028291)	Kcnh1 (MGP_PahariEiJ_G0028292)	Hhat (MGP_PahariEiJ_G0028293)	Sertad4 (MGP_PahariEiJ_G0028294)	MGP_PahariEiJ_G0028295	Utp25 (MGP_PahariEiJ_G0028296)	Irf6 (MGP_PahariEiJ_G0028297)	A130010J15Rik (MGP_PahariEiJ_G0028298)	Traf3ip3 (MGP_PahariEiJ_G0028299)	MGP_PahariEiJ_G0028300	Hsd11b1 (MGP_PahariEiJ_G0028301)	G0s2 (MGP_PahariEiJ_G0028302)
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000157391	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528	ENSGT01030000234620.a.b.b.b	ENSGT00530000064210	ENSGT00390000011724	ENSGT00950000182836.b.a.b	ENSGT00940000156989 #22	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b	ENSGT00390000002089.a.b	ENSGT00940000160954	ENSGT00940000154196.b	ENSGT00940000155793	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157391	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528	ENSGT01030000234620.a.b.b.b	ENSGT00530000064210	ENSGT00390000011724	ENSGT00950000182836.b.a.b	ENSGT00940000156989 #22	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b	ENSGT00390000002089.a.b	ENSGT00940000160954	ENSGT00940000154196.b	ENSGT00940000155793	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294
Golden Hamster	MODERN SPECIES	755	Vash2 (ENSMAUG00000009215)	Flvcr1 (ENSMAUG00000016771)	Spata45 (ENSMAUG00000016023)	Tatdn3 (ENSMAUG00000018308)	Nsl1 (ENSMAUG00000016792)	Batf3 (ENSMAUG00000014205)	Garin4 (ENSMAUG00000013757)	Atf3 (ENSMAUG00000011123)	Nenf (ENSMAUG00000010743)	Pacc1 (ENSMAUG00000009322)	Ppp2r5a (ENSMAUG00000000319)	ENSMAUG00000021059	Ints7 (ENSMAUG00000002724)	ENSMAUG00000000601	Lpgat1 (ENSMAUG00000000283)	Nek2 (ENSMAUG00000007374) #22	ENSMAUG00000001247	Slc30a1 (ENSMAUG00000021127)	Rd3 (ENSMAUG00000019032)	Traf5 (ENSMAUG00000001323)	Rcor3 (ENSMAUG00000000503)	Kcnh1 (ENSMAUG00000019709)	Hhat (ENSMAUG00000008212)	Sertad4 (ENSMAUG00000000932)	ENSMAUG00000000396	Syt14 (ENSMAUG00000001868)	Utp25 (ENSMAUG00000017463)	Irf6 (ENSMAUG00000019003)	Traf3ip3 (ENSMAUG00000000850)	Hsd11b1 (ENSMAUG00000012170)	G0s2 (ENSMAUG00000010676)
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	2	Angel2 (ENSCGRG00001024663)	Vash2 (ENSCGRG00001022829)	Flvcr1 (ENSCGRG00001021256)	Spata45 (ENSCGRG00001020534)	Tatdn3 (ENSCGRG00001019330)	Nsl1 (ENSCGRG00001017667)	Batf3 (ENSCGRG00001017448)	Garin4 (ENSCGRG00001010554)	Atf3 (ENSCGRG00001013063)	Nenf (ENSCGRG00001012055)	Pacc1 (ENSCGRG00001006900)	Ppp2r5a (ENSCGRG00001002484)	Dtl (ENSCGRG00001023163)	ENSCGRG00001020112	Lpgat1 (ENSCGRG00001001129)	Nek2 (ENSCGRG00001023977) #22	ENSCGRG00001017398	Slc30a1 (ENSCGRG00001025069)	Rd3 (ENSCGRG00001024990)	Traf5 (ENSCGRG00001022795)	Rcor3 (ENSCGRG00001020719)	Kcnh1 (ENSCGRG00001014833)	Hhat (ENSCGRG00001018458)	Sertad4 (ENSCGRG00001015220)	Syt14 (ENSCGRG00001011845)	Utp25 (ENSCGRG00001019879)	Irf6 (ENSCGRG00001005349)	A130010J15Rik (ENSCGRG00001002638)	ENSCGRG00001004266	Hsd11b1 (ENSCGRG00001024469)	G0s2 (ENSCGRG00001010736)
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000157391	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528	ENSGT01030000234620.a.b.b.b	ENSGT00530000064210	ENSGT00390000011724	ENSGT00950000182836.b.a.b	ENSGT00940000156989 #22	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b	ENSGT00390000002089.a.b	ENSGT00940000160954	ENSGT00940000154196.b	ENSGT00940000155793	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	2	Angel2 (ENSPEMG00000009630)	Vash2 (ENSPEMG00000009643)	Flvcr1 (ENSPEMG00000014742)	Spata45 (ENSPEMG00000015887)	Tatdn3 (ENSPEMG00000016778)	Nsl1 (ENSPEMG00000001946)	Batf3 (ENSPEMG00000007835)	ENSPEMG00000029759	Garin4 (ENSPEMG00000027162)	ENSPEMG00000024914	Nenf (ENSPEMG00000004190)	Ppp2r5a (ENSPEMG00000007353)	Dtl (ENSPEMG00000009566)	Ints7 (ENSPEMG00000014500)	Lpgat1 (ENSPEMG00000016230)	Nek2 (ENSPEMG00000011480) #22	ENSPEMG00000031137	Slc30a1 (ENSPEMG00000002874)	Rd3 (ENSPEMG00000020626)	Traf5 (ENSPEMG00000022373)	Rcor3 (ENSPEMG00000007457)	Kcnh1 (ENSPEMG00000010427)	Hhat (ENSPEMG00000001916)	Sertad4 (ENSPEMG00000010470)	Syt14 (ENSPEMG00000000255)	ENSPEMG00000029864	Utp25 (ENSPEMG00000000712)	Irf6 (ENSPEMG00000020332)	A130010J15Rik (ENSPEMG00000022277)	Traf3ip3 (ENSPEMG00000021211)	Hsd11b1 (ENSPEMG00000009872)
Prairie vole	MODERN SPECIES	14	Angel2 (ENSMOCG00000022027)	Vash2 (ENSMOCG00000002399)	Flvcr1 (ENSMOCG00000013229)	Spata45 (ENSMOCG00000017094)	Tatdn3 (ENSMOCG00000019831)	Nsl1 (ENSMOCG00000020317)	Batf3 (ENSMOCG00000020540)	Garin4 (ENSMOCG00000017084)	Atf3 (ENSMOCG00000019538)	Nenf (ENSMOCG00000010741)	Pacc1 (ENSMOCG00000015297)	Ppp2r5a (ENSMOCG00000018187)	ENSMOCG00000021658	Ints7 (ENSMOCG00000015050)	Lpgat1 (ENSMOCG00000016824)	Nek2 (ENSMOCG00000012191) #22	ENSMOCG00000015595	ENSMOCG00000007231	Rd3 (ENSMOCG00000015661)	Traf5 (ENSMOCG00000017302)	Rcor3 (ENSMOCG00000009813)	Kcnh1 (ENSMOCG00000001718)	Hhat (ENSMOCG00000017999)	Sertad4 (ENSMOCG00000021162)	Syt14 (ENSMOCG00000000936)	Utp25 (ENSMOCG00000018890)	Irf6 (ENSMOCG00000016987)	A130010J15Rik (ENSMOCG00000003288)	Traf3ip3 (ENSMOCG00000010371)	Hsd11b1 (ENSMOCG00000002294)	G0s2 (ENSMOCG00000002733)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1872	Rps6kc1 (ENSNGAG00000007216)	Angel2 (ENSNGAG00000009708)	Vash2 (ENSNGAG00000000617)	Flvcr1 (ENSNGAG00000009986)	Spata45 (ENSNGAG00000001409)	Tatdn3 (ENSNGAG00000015819)	Nsl1 (ENSNGAG00000021030)	Batf3 (ENSNGAG00000012341)	Atf3 (ENSNGAG00000017384)	Nenf (ENSNGAG00000015999)	Pacc1 (ENSNGAG00000001036)	Ppp2r5a (ENSNGAG00000011634)	Dtl (ENSNGAG00000015330)	Ints7 (ENSNGAG00000011793)	Lpgat1 (ENSNGAG00000020207)	Nek2 (ENSNGAG00000016403) #22	Slc30a1 (ENSNGAG00000018380)	Rd3 (ENSNGAG00000016374)	Traf5 (ENSNGAG00000014232)	Rcor3 (ENSNGAG00000010546)	Kcnh1 (ENSNGAG00000007409)	Hhat (ENSNGAG00000000647)	ENSNGAG00000014711	Syt14 (ENSNGAG00000008408)	Utp25 (ENSNGAG00000014664)	Irf6 (ENSNGAG00000006422)	A130010J15Rik (ENSNGAG00000010551)	ENSNGAG00000000822	ENSNGAG00000000847	Hsd11b1 (ENSNGAG00000011047)	G0s2 (ENSNGAG00000006335)
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	202	Angel2 (ENSJJAG00000011228)	Vash2 (ENSJJAG00000010725)	Flvcr1 (ENSJJAG00000008943)	Tatdn3 (ENSJJAG00000019566)	Nsl1 (ENSJJAG00000018765)	Batf3 (ENSJJAG00000018647)	Garin4 (ENSJJAG00000018541)	Atf3 (ENSJJAG00000017443)	Nenf (ENSJJAG00000017183)	Pacc1 (ENSJJAG00000016674)	Ppp2r5a (ENSJJAG00000000086)	ENSJJAG00000011922	Dtl (ENSJJAG00000018467)	Ints7 (ENSJJAG00000016411)	Lpgat1 (ENSJJAG00000015813)	Nek2 (ENSJJAG00000013121) #22
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	345	Angel2 (ENSDORG00000000752)	Vash2 (ENSDORG00000000751)	Flvcr1 (ENSDORG00000002942)	Spata45 (ENSDORG00000014481)	Tatdn3 (ENSDORG00000014148)	Nsl1 (ENSDORG00000028451)	Batf3 (ENSDORG00000025907)	Garin4 (ENSDORG00000006027)	Atf3 (ENSDORG00000025141)	Nenf (ENSDORG00000027260)	Pacc1 (ENSDORG00000007633)	Ppp2r5a (ENSDORG00000007631)	Dtl (ENSDORG00000004346)	Ints7 (ENSDORG00000004343)	Lpgat1 (ENSDORG00000025440)	Nek2 (ENSDORG00000030036) #22	Slc30a1 (ENSDORG00000028201)	Rd3 (ENSDORG00000006538)	Traf5 (ENSDORG00000006546)	Rcor3 (ENSDORG00000012726)	ENSDORG00000030102	Kcnh1 (ENSDORG00000005642)	Hhat (ENSDORG00000016124)	Sertad4 (ENSDORG00000026519)	Syt14 (ENSDORG00000010099)	Utp25 (ENSDORG00000008892)	Irf6 (ENSDORG00000008891)	A130010J15Rik (ENSDORG00000008890)	ENSDORG00000028685	ENSDORG00000008886	Hsd11b1 (ENSDORG00000028793)
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000157391	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528	ENSGT01030000234620.a.b.b.b	ENSGT00530000064210	ENSGT00390000011724	ENSGT00950000182836.b.a.b	ENSGT00940000156989 #22	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b	ENSGT00390000002089.a.b	ENSGT00940000160954	ENSGT00940000154196.b	ENSGT00940000155793	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420.b	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000157391	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528	ENSGT01030000234620.a.b.b.b	ENSGT00530000064210	ENSGT00390000011724	ENSGT00950000182836.b.a.b	ENSGT00940000156989 #22	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b	ENSGT00390000002089.a.b	ENSGT00940000160954	ENSGT00940000154196.b	ENSGT00940000155793	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420.a.b	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000157391	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528	ENSGT01030000234620.a.b.b.b	ENSGT00530000064210	ENSGT00390000011724	ENSGT00950000182836.b.a.b	ENSGT00940000156989 #22	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b	ENSGT00390000002089.a.b	ENSGT00940000160954	ENSGT00940000154196.b	ENSGT00940000155793	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420.a.b	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	63	ENSGT00940000157391	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528	ENSGT01030000234620.a.b.b.b	ENSGT00530000064210	ENSGT00390000011724	ENSGT00950000182836.b.a.b	ENSGT00940000156989 #22	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b	ENSGT00390000002089.a.b	ENSGT00940000160954	ENSGT00940000154196.b	ENSGT00940000155793	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420.b	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	49	ANGEL2 (ENSUPAG00010017360)	VASH2 (ENSUPAG00010017339)	FLVCR1 (ENSUPAG00010017304)	SPATA45 (ENSUPAG00010017301)	TATDN3 (ENSUPAG00010017273)	NSL1 (ENSUPAG00010017261)	BATF3 (ENSUPAG00010017257)	ENSUPAG00010017246	ATF3 (ENSUPAG00010017228)	NENF (ENSUPAG00010017224)	PACC1 (ENSUPAG00010017213)	PPP2R5A (ENSUPAG00010017203)	DTL (ENSUPAG00010017177)	INTS7 (ENSUPAG00010017150)	LPGAT1 (ENSUPAG00010017120)	NEK2 (ENSUPAG00010017077) #22	ENSUPAG00010017072	SLC30A1 (ENSUPAG00010017069)	RD3 (ENSUPAG00010017064)	TRAF5 (ENSUPAG00010017058)	RCOR3 (ENSUPAG00010016853)	KCNH1 (ENSUPAG00010016824)	HHAT (ENSUPAG00010016783)	SERTAD4 (ENSUPAG00010016763)	SYT14 (ENSUPAG00010016724)	UTP25 (ENSUPAG00010016705)	IRF6 (ENSUPAG00010016697)	C1orf74 (ENSUPAG00010016689)	TRAF3IP3 (ENSUPAG00010016581)	HSD11B1 (ENSUPAG00010016557)	G0S2 (ENSUPAG00010016551)
Squirrel	MODERN SPECIES	157	ANGEL2 (ENSSTOG00000028746)	VASH2 (ENSSTOG00000001090)	FLVCR1 (ENSSTOG00000021795)	SPATA45 (ENSSTOG00000034873)	TATDN3 (ENSSTOG00000007141)	NSL1 (ENSSTOG00000023856)	BATF3 (ENSSTOG00000007136)	GARIN4 (ENSSTOG00000007130)	ATF3 (ENSSTOG00000007121)	ENSSTOG00000022293	PACC1 (ENSSTOG00000023262)	PPP2R5A (ENSSTOG00000013569)	DTL (ENSSTOG00000013557)	INTS7 (ENSSTOG00000013543)	LPGAT1 (ENSSTOG00000019588)	NEK2 (ENSSTOG00000014117) #22	SLC30A1 (ENSSTOG00000019654)	RD3 (ENSSTOG00000024456)	TRAF5 (ENSSTOG00000011997)	RCOR3 (ENSSTOG00000011987)	KCNH1 (ENSSTOG00000011975)	HHAT (ENSSTOG00000011967)	SERTAD4 (ENSSTOG00000012625)	SYT14 (ENSSTOG00000022494)	UTP25 (ENSSTOG00000016545)	IRF6 (ENSSTOG00000028204)	C1orf74 (ENSSTOG00000016543)	TRAF3IP3 (ENSSTOG00000016542)	HSD11B1 (ENSSTOG00000016541)	G0S2 (ENSSTOG00000020915)	LAMB3 (ENSSTOG00000023256)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	12	ANGEL2 (ENSMMMG00000000181)	VASH2 (ENSMMMG00000000245)	FLVCR1 (ENSMMMG00000000275)	ENSMMMG00000000314	TATDN3 (ENSMMMG00000000340)	NSL1 (ENSMMMG00000000394)	BATF3 (ENSMMMG00000000419)	ENSMMMG00000000435	ATF3 (ENSMMMG00000000462)	ENSMMMG00000000478	PACC1 (ENSMMMG00000000497)	PPP2R5A (ENSMMMG00000000523)	DTL (ENSMMMG00000000544)	INTS7 (ENSMMMG00000000585)	LPGAT1 (ENSMMMG00000000636)	NEK2 (ENSMMMG00000000670) #22	RD3 (ENSMMMG00000000691)	TRAF5 (ENSMMMG00000000707)	RCOR3 (ENSMMMG00000000787)	KCNH1 (ENSMMMG00000000821)	HHAT (ENSMMMG00000000889)	SERTAD4 (ENSMMMG00000000936)	SYT14 (ENSMMMG00000000958)	UTP25 (ENSMMMG00000000999)	IRF6 (ENSMMMG00000001014)	C1orf74 (ENSMMMG00000001035)	TRAF3IP3 (ENSMMMG00000001053)	HSD11B1 (ENSMMMG00000001148)	G0S2 (ENSMMMG00000001164)	LAMB3 (ENSMMMG00000001176)	CAMK1G (ENSMMMG00000001301)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	3	ENSSVLG00005016057	SPATA45 (ENSSVLG00005016084)	TATDN3 (ENSSVLG00005016168)	ENSSVLG00005016573	NSL1 (ENSSVLG00005016609)	BATF3 (ENSSVLG00005016663)	GARIN4 (ENSSVLG00005016703)	ENSSVLG00005016732	NENF (ENSSVLG00005016898)	PACC1 (ENSSVLG00005016932)	PPP2R5A (ENSSVLG00005017066)	ENSSVLG00005017261	DTL (ENSSVLG00005017356)	INTS7 (ENSSVLG00005017717)	LPGAT1 (ENSSVLG00005017852)	NEK2 (ENSSVLG00005017885) #22	SLC30A1 (ENSSVLG00005018112)	ENSSVLG00005018155	RD3 (ENSSVLG00005018174)	TRAF5 (ENSSVLG00005018217)	RCOR3 (ENSSVLG00005018255)	ENSSVLG00005018344	KCNH1 (ENSSVLG00005018426)	HHAT (ENSSVLG00005018844)	SERTAD4 (ENSSVLG00005019187)	ENSSVLG00005019238	ENSSVLG00005019515	UTP25 (ENSSVLG00005019768)	IRF6 (ENSSVLG00005019827)	C1orf74 (ENSSVLG00005019960)	TRAF3IP3 (ENSSVLG00005020051)
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	49	ENSGT00940000157391	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374.d	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528	ENSGT01030000234620.a.b.b.b	ENSGT00530000064210	ENSGT00390000011724	ENSGT00950000182836.b.a.b	ENSGT00940000156989 #22	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b	ENSGT00940000157923	ENSGT00950000183059.b.a.b	ENSGT00940000155103.a.b	ENSGT00730000111198	ENSGT00940000157060.t	ENSGT00940000155092.b	ENSGT00390000017364	ENSGT00390000015553.a.a.b	ENSGT00940000162691	ENSGT00730000111005	ENSGT00390000016158	ENSGT00940000156546	ENSGT00940000160590
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000157391	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374.d	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528	ENSGT01030000234620.a.b.b.b	ENSGT00530000064210	ENSGT00390000011724	ENSGT00950000182836.b.a.b	ENSGT00940000156989 #22	ENSGT00940000156484.b	ENSGT00940000157923	ENSGT00950000183059.b.a.b	ENSGT00940000155103.a.b	ENSGT00730000111198	ENSGT00940000157060.t	ENSGT00940000155092.b	ENSGT00390000017364	ENSGT00390000015553.a.a.b	ENSGT00940000162691	ENSGT00730000111005	ENSGT00390000016158	ENSGT00940000156546	ENSGT00940000160590	ENSGT00940000156992
Guinea pig	MODERN SPECIES	13	ANGEL2 (ENSCPOG00000003875)	VASH2 (ENSCPOG00000003871)	ENSCPOG00000023888	FLVCR1 (ENSCPOG00000011300)	SPATA45 (ENSCPOG00000002457)	TATDN3 (ENSCPOG00000002454)	NSL1 (ENSCPOG00000002451)	BATF3 (ENSCPOG00000032323)	ATF3 (ENSCPOG00000034947)	ENSCPOG00000033847	PACC1 (ENSCPOG00000009329)	PPP2R5A (ENSCPOG00000040049)	DTL (ENSCPOG00000014965)	INTS7 (ENSCPOG00000014960)	LPGAT1 (ENSCPOG00000011269)	NEK2 (ENSCPOG00000011264) #22	SLC30A1 (ENSCPOG00000013692)	PSEN2 (ENSCPOG00000001827)	PLD5 (ENSCPOG00000033411)	ENSCPOG00000002221	ENSCPOG00000002683	ENSCPOG00000034860	SDCCAG8 (ENSCPOG00000015503)	AKT3 (ENSCPOG00000015504)	ZBTB18 (ENSCPOG00000035384)	C1orf100 (ENSCPOG00000002339)	ADSS2 (ENSCPOG00000002342)	DESI2 (ENSCPOG00000002091)	COX20 (ENSCPOG00000032295)	HNRNPU (ENSCPOG00000011887)	EFCAB2 (ENSCPOG00000024335)
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157391	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374.d	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528	ENSGT01030000234620.a.b.b.b	ENSGT00530000064210	ENSGT00390000011724	ENSGT00950000182836.b.a.b	ENSGT00940000156989 #22	ENSGT00940000156484.b	ENSGT00940000157923	ENSGT00950000183059.b.a.b	ENSGT00660000097201	ENSGT00940000155103.a.b	ENSGT00730000111198	ENSGT00940000157060.t	ENSGT00940000155092.b	ENSGT00390000017364	ENSGT00390000015553.a.a.b	ENSGT00940000162691	ENSGT00730000111005	ENSGT00390000016158	ENSGT00940000156546	ENSGT00940000160590
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	113	PROX1 (ENSCLAG00000009881)	RPS6KC1 (ENSCLAG00000008718)	ANGEL2 (ENSCLAG00000007133)	VASH2 (ENSCLAG00000008864)	FLVCR1 (ENSCLAG00000012241)	SPATA45 (ENSCLAG00000008856)	TATDN3 (ENSCLAG00000008909)	NSL1 (ENSCLAG00000015217)	ATF3 (ENSCLAG00000013767)	ENSCLAG00000007912	PACC1 (ENSCLAG00000009570)	PPP2R5A (ENSCLAG00000012816)	DTL (ENSCLAG00000014236)	INTS7 (ENSCLAG00000011748)	LPGAT1 (ENSCLAG00000011509)	NEK2 (ENSCLAG00000010880) #22	SLC30A1 (ENSCLAG00000009695)	PSEN2 (ENSCLAG00000013788)	PLD5 (ENSCLAG00000014400)	ENSCLAG00000010377	CEP170 (ENSCLAG00000015564)	SDCCAG8 (ENSCLAG00000011676)	ENSCLAG00000009649	ZBTB18 (ENSCLAG00000015788)	C1orf100 (ENSCLAG00000007599)	ADSS2 (ENSCLAG00000008748)	CATSPERE (ENSCLAG00000009169)	DESI2 (ENSCLAG00000011829)	HNRNPU (ENSCLAG00000007100)	ENSCLAG00000007770	EFCAB2 (ENSCLAG00000008343)
Degu	DUPLICATION
Degu	MODERN SPECIES	58	ANGEL2 (ENSODEG00000014913)	VASH2 (ENSODEG00000014165)	FLVCR1 (ENSODEG00000013456)	SPATA45 (ENSODEG00000014271)	TATDN3 (ENSODEG00000013799)	NSL1 (ENSODEG00000014696)	ENSODEG00000013720	GARIN4 (ENSODEG00000013574)	ATF3 (ENSODEG00000013598)	NENF (ENSODEG00000016432)	PACC1 (ENSODEG00000013328)	PPP2R5A (ENSODEG00000014272)	DTL (ENSODEG00000016385)	INTS7 (ENSODEG00000013809)	LPGAT1 (ENSODEG00000013429)	ENSODEG00000014021 #22	ENSODEG00000013939	SLC30A1 (ENSODEG00000014581)	PSEN2 (ENSODEG00000013898)	PLD5 (ENSODEG00000013817)	ENSODEG00000014152	ENSODEG00000014979	ENSODEG00000013620	ENSODEG00000016144	ENSODEG00000014847	SDCCAG8 (ENSODEG00000013437)	ENSODEG00000013767	AKT3 (ENSODEG00000013255)	ZBTB18 (ENSODEG00000014080)	C1orf100 (ENSODEG00000012902)	ADSS2 (ENSODEG00000015411)
Degu	MODERN SPECIES	42	ENSODEG00000017174	ENSODEG00000016422	SREK1IP1 (ENSODEG00000016833)	SHISAL2B (ENSODEG00000016823)	RGS7BP (ENSODEG00000016411)	ENSODEG00000016704	HTR1A (ENSODEG00000020427)	ENSODEG00000016461	ENSODEG00000020425	ENSODEG00000017157	ENSODEG00000020362	IPO11 (ENSODEG00000017269)	ENSODEG00000016524	DIMT1 (ENSODEG00000016626)	KIF2A (ENSODEG00000016553)	ENSODEG00000020469 #22	ENSODEG00000020416	ENSODEG00000016595	ZSWIM6 (ENSODEG00000016625)	ENSODEG00000020436	NDUFAF2 (ENSODEG00000016635)	ERCC8 (ENSODEG00000016868)	ENSODEG00000017264	ELOVL7 (ENSODEG00000016616)	DEPDC1B (ENSODEG00000016998)	PDE4D (ENSODEG00000017385)	ENSODEG00000017206	ENSODEG00000020417	RAB3C (ENSODEG00000016836)	ENSODEG00000016930	PLK2 (ENSODEG00000016972)
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	16	ENSHGLG00000043491	CENPF (ENSHGLG00000012286)	PTPN14 (ENSHGLG00000006819)	SMYD2 (ENSHGLG00000005014)	PROX1 (ENSHGLG00000004005)	ENSHGLG00000011298	ANGEL2 (ENSHGLG00000009577)	ENSHGLG00000007863	ENSHGLG00000006406	NENF (ENSHGLG00000005390)	PACC1 (ENSHGLG00000004632)	ENSHGLG00000003379	DTL (ENSHGLG00000006063)	INTS7 (ENSHGLG00000005372)	LPGAT1 (ENSHGLG00000008115)	NEK2 (ENSHGLG00000004280) #22	ENSHGLG00000028910	ENSHGLG00000037874	ENSHGLG00000005464	ENSHGLG00000032112	MAP1LC3C (ENSHGLG00000037027)	ENSHGLG00000004656	ENSHGLG00000040176	ENSHGLG00000006833	ENSHGLG00000043505	ENSHGLG00000011191	ENSHGLG00000006465	ENSHGLG00000038674	ENSHGLG00000004271	AKT3 (ENSHGLG00000006424)	ENSHGLG00000043051