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Degu	DUPLICATION
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Marmotini_b	DUPLICATION
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	166						ENSGT00940000154682.C #11	ENSGT00940000161548 #12	ENSGT00530000063497.b #13	ENSGT00940000162448 #15	ENSGT00390000017201 #17	ENSGT00940000155151.b #18	ENSGT00960000186747	ENSGT00940000157892 #20	ENSGT00490000043442 #21	ENSGT00390000003718.d.kd.b	ENSGT00390000017398.i #22	ENSGT01030000234635.a.a.a.a #23	ENSGT00940000156924 #24	ENSGT00950000183036.a.a #25	ENSGT00950000183036.a.b #26	ENSGT01050000244941.B.d #27	ENSGT00390000007688 #28	ENSGT00390000012891 #29	ENSGT00390000003298 #31	ENSGT01100000263525.a.b.b.c.b	ENSGT00940000153231.B.w #32	ENSGT00390000002634.b #34	ENSGT00940000153229.B #33	ENSGT00940000163788 #36	ENSGT00530000063936.b #35	ENSGT00940000161169 #37
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	330						CLCA1 (ENSUPAG00010012033) #11	CLCA2 (ENSUPAG00010011985) #12	ODF2L (ENSUPAG00010011819) #13	ENSUPAG00010011804 #15	ZNHIT6 (ENSUPAG00010011778) #17	CCN1 (ENSUPAG00010011774) #18	ENSUPAG00010011773	DDAH1 (ENSUPAG00010011761) #20	BCL10 (ENSUPAG00010011755) #21	ENSUPAG00010011746	ENSUPAG00010011740 #22	SYDE2 (ENSUPAG00010011732) #23	DNAI3 (ENSUPAG00010011711) #24	MCOLN3 (ENSUPAG00010011700) #25	MCOLN2 (ENSUPAG00010011678) #26	LPAR3 (ENSUPAG00010011664) #27	SSX2IP (ENSUPAG00010011627) #28	CTBS (ENSUPAG00010011611) #29	ENSUPAG00010011599 #31	ENSUPAG00010011592	RPF1 (ENSUPAG00010011580) #32	DNASE2B (ENSUPAG00010011561) #34	ENSUPAG00010011547 #33	ENSUPAG00010011541 #36	SAMD13 (ENSUPAG00010011529) #35	PRKACB (ENSUPAG00010011454) #37
Squirrel	MODERN SPECIES	208										ENSSTOG00000031983 #15	ZNHIT6 (ENSSTOG00000024455) #17	CCN1 (ENSSTOG00000019882) #18	ENSSTOG00000031250	DDAH1 (ENSSTOG00000012594) #20	BCL10 (ENSSTOG00000027214) #21	C1orf52 (ENSSTOG00000010698) #22	SYDE2 (ENSSTOG00000012586) #23	DNAI3 (ENSSTOG00000012564) #24	MCOLN3 (ENSSTOG00000011310) #25	MCOLN2 (ENSSTOG00000011302) #26	LPAR3 (ENSSTOG00000005282) #27	SSX2IP (ENSSTOG00000008644) #28	CTBS (ENSSTOG00000015319) #29	ENSSTOG00000021329 #31	ENSSTOG00000033029 #31	GNG5 (ENSSTOG00000008641)	RPF1 (ENSSTOG00000008635) #32	DNASE2B (ENSSTOG00000023007) #34	ENSSTOG00000022835 #33	SAMD13 (ENSSTOG00000003083) #35	PRKACB (ENSSTOG00000003074) #37
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000017398.j #22
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	173												PPEF1 (ENSUPAG00010013699)	RS1 (ENSUPAG00010013669)	CDKL5 (ENSUPAG00010013645)	SCML2 (ENSUPAG00010013630)	ENSUPAG00010013622 #22	RAI2 (ENSUPAG00010013618)	ENSUPAG00010013597	NHS (ENSUPAG00010013557)	REPS2 (ENSUPAG00010013493)	RBBP7 (ENSUPAG00010013404)	TXLNG (ENSUPAG00010013379)	SYAP1 (ENSUPAG00010013371)	ENSUPAG00010013364	S100G (ENSUPAG00010013357)	CTPS2 (ENSUPAG00010013304)	GRPR (ENSUPAG00010013272)	AP1S2 (ENSUPAG00010013242)	ZRSR2 (ENSUPAG00010013230)	ENSUPAG00010013220	CA5B (ENSUPAG00010013214)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	96	ENSMMMG00000006883 #10	ENSMMMG00000007100 #10	ENSMMMG00000008525 #10	CLCA1 (ENSMMMG00000008544) #11	CLCA2 (ENSMMMG00000008561) #12	ODF2L (ENSMMMG00000008590) #13	ENSMMMG00000008742	ENSMMMG00000008750 #15	ENSMMMG00000008758	ZNHIT6 (ENSMMMG00000008767) #17	CCN1 (ENSMMMG00000008796) #18	ENSMMMG00000008810	DDAH1 (ENSMMMG00000008813) #20	ENSMMMG00000008820 #21	ENSMMMG00000008825	C1orf52 (ENSMMMG00000008832) #22	SYDE2 (ENSMMMG00000008839) #23	DNAI3 (ENSMMMG00000008854) #24	MCOLN3 (ENSMMMG00000008888) #25	MCOLN2 (ENSMMMG00000008910) #26	LPAR3 (ENSMMMG00000008955) #27	SSX2IP (ENSMMMG00000008964) #28	CTBS (ENSMMMG00000009025) #29	ENSMMMG00000009057 #31	GNG5 (ENSMMMG00000009067)	RPF1 (ENSMMMG00000009079) #32	DNASE2B (ENSMMMG00000009098) #34	ENSMMMG00000009120 #33	SAMD13 (ENSMMMG00000009129) #35	ENSMMMG00000009152	ENSMMMG00000009169 #37
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES		CLCA2 (ENSSVLG00005001063) #12	ODF2L (ENSSVLG00005001026) #13	ENSSVLG00005000969	ENSSVLG00005000957	COL24A1 (ENSSVLG00005000916) #15	ENSSVLG00005000886	ZNHIT6 (ENSSVLG00005000846) #17	ENSSVLG00005000810	CCN1 (ENSSVLG00005000795) #18	ENSSVLG00005000783	ENSSVLG00005000769	DDAH1 (ENSSVLG00005000747) #20	ENSSVLG00005000713	ENSSVLG00005000702	BCL10 (ENSSVLG00005000684) #21	C1orf52 (ENSSVLG00005000674) #22	GABARAP (ENSSVLG00005000657)	SYDE2 (ENSSVLG00005000635) #23	DNAI3 (ENSSVLG00005000535) #24	MCOLN3 (ENSSVLG00005000388) #25	MCOLN2 (ENSSVLG00005000331) #26	LPAR3 (ENSSVLG00005000296) #27	SSX2IP (ENSSVLG00005000274) #28	CTBS (ENSSVLG00005000249) #29	SPATA1 (ENSSVLG00005000234) #31	ENSSVLG00005000219	RPF1 (ENSSVLG00005000206) #32	DNASE2B (ENSSVLG00005000189) #34	ENSSVLG00005000176 #33	SAMD13 (ENSSVLG00005000161) #35	PRKACB (ENSSVLG00005023190) #37