Bilateria DUPLICATION Bilateria DUPLICATION Bilateria DUPLICATION Bilateria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 Chordata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 911 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 104 ENSGT00940000161136 ENSGT00940000159348 ENSGT00950000183094.a ENSGT00390000011497 ENSGT00390000018360 ENSGT00940000156893 ENSGT00390000002049.d ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b ENSGT00940000157006 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00990000205656 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 104 ENSGT00390000005318.a ENSGT00390000003420.b ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.B ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00390000018044.b.b ENSGT00940000163917.b ENSGT00950000182938.b.b.b.b.b.a ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000166634 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00990000205656 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 80 ENSGT00390000005318.a ENSGT00940000161213 ENSGT00390000003420.b ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.B ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00390000018044.b.b ENSGT00940000163917.b ENSGT00950000182938.b.b.b.b.b.a ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00990000205656 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 Amniota ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000178986 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000164047.c.b ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E ENSGT00390000018729.a #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 ENSGT00940000156943 #37 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000164634 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000164047.c.b ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 Theria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01070000254624 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000164047.c.b ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT01100000263809 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000164047.c.b ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT00390000002428.a.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 ENSGT00940000156943 #37 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT00390000002428.a.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 ENSGT00940000156943 #37 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT00390000002428.a.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 ENSGT00940000156943 #37 Glires ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 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ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 ENSGT00940000156943 #37 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 ENSGT00940000156943 #37 Kangaroo rat MODERN SPECIES 344 Pias2 (ENSDORG00000013246) #22 St8sia5 (ENSDORG00000014254) #23 ENSDORG00000014253 #24 Rnf165 (ENSDORG00000008058) #25 8030462N17Rik (ENSDORG00000004172) #26 Haus1 (ENSDORG00000023830) #27 Atp5a1 (ENSDORG00000009630) #28 Pstpip2 (ENSDORG00000003911) #29 Epg5 (ENSDORG00000013620) #30 ENSDORG00000013618 #31 Slc14a1 (ENSDORG00000014939) #32 ENSDORG00000014932 #33 Setbp1 (ENSDORG00000006424) #34 Syt4 (ENSDORG00000012271) #35 Rit2 (ENSDORG00000009400) #36 Pik3c3 (ENSDORG00000014804) #37 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT01100000263809 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT01030000234510.a.a.b ENSGT01030000234510.a.a.a.a.a.a ENSGT00390000002368 Lesser Egyptian jerboa DUPLICATION Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 60 BC031181 (ENSJJAG00000013965) Dym (ENSJJAG00000000543) ENSJJAG00000011899 ENSJJAG00000014372 ENSJJAG00000011224 Smad7 (ENSJJAG00000017342) Ctif (ENSJJAG00000013706) ENSJJAG00000000639 Zbtb7c (ENSJJAG00000005484) ENSJJAG00000000783 Smad2 (ENSJJAG00000021902) Skor2 (ENSJJAG00000013235) ENSJJAG00000009768 Hdhd2 (ENSJJAG00000020515) Katnal2 (ENSJJAG00000013360) ENSJJAG00000021561 #22 St8sia5 (ENSJJAG00000023613) #23 Loxhd1 (ENSJJAG00000012049) #24 Rnf165 (ENSJJAG00000014596) #25 8030462N17Rik (ENSJJAG00000015948) #26 ENSJJAG00000014908 #27 ENSJJAG00000022136 #28 Pstpip2 (ENSJJAG00000011600) #29 Epg5 (ENSJJAG00000008036) #30 Siglec15 (ENSJJAG00000011775) Slc14a1 (ENSJJAG00000009670) #32 ENSJJAG00000021572 #33 Setbp1 (ENSJJAG00000004320) #34 ENSJJAG00000000736 Mc2r (ENSJJAG00000000906) Mc5r (ENSJJAG00000012730) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 66 ENSJJAG00000019056 Ccdc171 (ENSJJAG00000020916) ENSJJAG00000015360 Snapc3 (ENSJJAG00000018408) Ttc39b (ENSJJAG00000004238) ENSJJAG00000010564 ENSJJAG00000015519 Cer1 (ENSJJAG00000023511) Zdhhc21 (ENSJJAG00000002851) Nfib (ENSJJAG00000013052) ENSJJAG00000010432 Mpdz (ENSJJAG00000012097) Lurap1l (ENSJJAG00000014520) Tyrp1 (ENSJJAG00000015009) ENSJJAG00000010326 ENSJJAG00000023453 #22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT01100000263809 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT01030000234510.a.a.b ENSGT01030000234510.a.a.a.a.a.a ENSGT00390000002368 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1888 Dym (ENSNGAG00000020852) ENSNGAG00000001549 Smad7 (ENSNGAG00000004962) Ctif (ENSNGAG00000011452) Zbtb7c (ENSNGAG00000012022) Smad2 (ENSNGAG00000013343) Skor2 (ENSNGAG00000018430) ENSNGAG00000020722 Hdhd2 (ENSNGAG00000000250) Katnal2 (ENSNGAG00000010954) Pias2 (ENSNGAG00000010511) #22 St8sia5 (ENSNGAG00000017269) #23 Loxhd1 (ENSNGAG00000020158) #24 Rnf165 (ENSNGAG00000012965) #25 8030462N17Rik (ENSNGAG00000014428) #26 Haus1 (ENSNGAG00000001553) #27 Atp5a1 (ENSNGAG00000009807) #28 Pstpip2 (ENSNGAG00000018122) #29 Epg5 (ENSNGAG00000005612) #30 Siglec15 (ENSNGAG00000013867) Slc14a1 (ENSNGAG00000014056) #32 ENSNGAG00000015050 #33 Setbp1 (ENSNGAG00000016368) #34 Mc2r (ENSNGAG00000014364) Mc5r (ENSNGAG00000008073) Rnmt (ENSNGAG00000014958) Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT01100000263809 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00950000183211.a.b ENSGT00530000063631.a ENSGT00390000011362 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT01100000263809 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846.u #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a.e #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00950000183211.a.b ENSGT00530000063631.a ENSGT00390000011362 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT01100000263809 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 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Or13c3 (ENSMAUG00000004828) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01100000263809 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846.u #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a.e #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00950000183211.a.b ENSGT00530000063631.a ENSGT00390000011362 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 10 Myo5b (ENSPEMG00000020539) Acaa2 (ENSPEMG00000022034) ENSPEMG00000025726 ENSPEMG00000028900 Lipg (ENSPEMG00000021868) Rpl17 (ENSPEMG00000001520) Dym (ENSPEMG00000020826) Smad7 (ENSPEMG00000021331) Ctif (ENSPEMG00000022746) Zbtb7c (ENSPEMG00000020629) Smad2 (ENSPEMG00000020383) Skor2 (ENSPEMG00000022190) ENSPEMG00000026193 Hdhd2 (ENSPEMG00000020912) Katnal2 (ENSPEMG00000021096) Pias2 (ENSPEMG00000022220) #22 St8sia5 (ENSPEMG00000022119) #23 Loxhd1 (ENSPEMG00000022919) #24 ENSPEMG00000029031 #25 8030462N17Rik (ENSPEMG00000010341) #26 Haus1 (ENSPEMG00000021388) #27 Atp5a1 (ENSPEMG00000022004) #28 Pstpip2 (ENSPEMG00000022379) #29 Epg5 (ENSPEMG00000022153) #30 Siglec15 (ENSPEMG00000024146) ENSPEMG00000028869 Slc14a1 (ENSPEMG00000008835) #32 ENSPEMG00000022112 #33 Setbp1 (ENSPEMG00000021869) #34 ENSPEMG00000006471 Pard6g (ENSPEMG00000025457) Prairie vole MODERN SPECIES 5 ENSMOCG00000008152 Myo5b (ENSMOCG00000022368) Acaa2 (ENSMOCG00000004236) Lipg (ENSMOCG00000020738) Rpl17 (ENSMOCG00000012741) BC031181 (ENSMOCG00000012446) Dym (ENSMOCG00000022593) Smad7 (ENSMOCG00000001269) Ctif (ENSMOCG00000020507) Zbtb7c (ENSMOCG00000017640) Smad2 (ENSMOCG00000017648) Skor2 (ENSMOCG00000018264) ENSMOCG00000009073 Hdhd2 (ENSMOCG00000008063) Katnal2 (ENSMOCG00000011716) Pias2 (ENSMOCG00000015605) #22 St8sia5 (ENSMOCG00000011361) #23 Loxhd1 (ENSMOCG00000016732) #24 ENSMOCG00000019837 #25 8030462N17Rik (ENSMOCG00000000844) #26 Haus1 (ENSMOCG00000011366) #27 Atp5a1 (ENSMOCG00000009175) #28 Pstpip2 (ENSMOCG00000006361) #29 Epg5 (ENSMOCG00000015567) #30 Siglec15 (ENSMOCG00000007709) ENSMOCG00000002421 #32 Slc14a2 (ENSMOCG00000013965) #33 Setbp1 (ENSMOCG00000021557) #34 Pard6g (ENSMOCG00000019881) ENSMOCG00000019582 Rbfa (ENSMOCG00000018963) Murinae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01100000263809 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00950000183211.a.b ENSGT00530000063631.a ENSGT00390000011362 Rat MODERN SPECIES 9 Mbd1 (ENSRNOG00000024104) Myo5b (ENSRNOG00000014104) Acaa2 (ENSRNOG00000013766) Lipg (ENSRNOG00000018694) Slc25a6 (ENSRNOG00000042387) Rpl17 (ENSRNOG00000018680) Dym (ENSRNOG00000018425) Smad7 (ENSRNOG00000018359) Ctif (ENSRNOG00000018342) ENSRNOG00000067472 Zbtb7c (ENSRNOG00000047924) Smad2 (ENSRNOG00000018140) Skor2 (ENSRNOG00000018006) Ier3ip1 (ENSRNOG00000043171) Katnal2 (ENSRNOG00000017788) Pias2 (ENSRNOG00000017493) #22 St8sia5 (ENSRNOG00000022691) #23 Loxhd1 (ENSRNOG00000017410) #24 Rnf165 (ENSRNOG00000048824) #25 RGD1308601 (ENSRNOG00000017215) #26 ENSRNOG00000063575 Haus1 (ENSRNOG00000017067) #27 Atp5f1a (ENSRNOG00000017032) #28 Pstpip2 (ENSRNOG00000016987) #29 Epg5 (ENSRNOG00000052894) #30 Siglec15 (ENSRNOG00000033588) Slc14a1 (ENSRNOG00000016753) #32 Slc14a2 (ENSRNOG00000061714) #33 Setbp1 (ENSRNOG00000016208) #34 ENSRNOG00000065450 Pard6g (ENSRNOG00000055157) Mus ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT01100000263809 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648.c ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00950000183211.a.b ENSGT00530000063631.a ENSGT00390000011362 Shrew mouse MODERN SPECIES 6 Cfap53 (MGP_PahariEiJ_G0019129) Myo5b (MGP_PahariEiJ_G0019130) Acaa2 (MGP_PahariEiJ_G0019131) Lipg (MGP_PahariEiJ_G0019132) Rpl17 (MGP_PahariEiJ_G0019133) BC031181 (MGP_PahariEiJ_G0019134) Dym (MGP_PahariEiJ_G0019135) Smad7 (MGP_PahariEiJ_G0019136) Ctif (MGP_PahariEiJ_G0019137) Zbtb7c (MGP_PahariEiJ_G0019138) Smad2 (MGP_PahariEiJ_G0019139) Skor2 (MGP_PahariEiJ_G0019140) MGP_PahariEiJ_G0019141 Hdhd2 (MGP_PahariEiJ_G0019142) Katnal2 (MGP_PahariEiJ_G0019143) Pias2 (MGP_PahariEiJ_G0019144) #22 MGP_PahariEiJ_G0019145 St8sia5 (MGP_PahariEiJ_G0019146) #23 MGP_PahariEiJ_G0019147 #24 Rnf165 (MGP_PahariEiJ_G0019148) #25 8030462N17Rik (MGP_PahariEiJ_G0019149) #26 Haus1 (MGP_PahariEiJ_G0019150) #27 Atp5a1 (MGP_PahariEiJ_G0019151) #28 Pstpip2 (MGP_PahariEiJ_G0019152) #29 Epg5 (MGP_PahariEiJ_G0019153) #30 Siglec15 (MGP_PahariEiJ_G0019154) Slc14a1 (MGP_PahariEiJ_G0019155) #32 Slc14a2 (MGP_PahariEiJ_G0019156) #33 MGP_PahariEiJ_G0019157 Setbp1 (MGP_PahariEiJ_G0019158) #34 Pard6g (MGP_PahariEiJ_G0019159) Mus_A ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT01100000263809 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648.c ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00950000183211.a.b ENSGT01100000265037 ENSGT00530000063631.a Ryukyu mouse MODERN SPECIES 9 Cfap53 (MGP_CAROLIEiJ_G0022400) Myo5b (MGP_CAROLIEiJ_G0022401) Acaa2 (MGP_CAROLIEiJ_G0022402) Lipg (MGP_CAROLIEiJ_G0022403) Rpl17 (MGP_CAROLIEiJ_G0022404) 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ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648.c ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00950000183010.a.b.a.a.a.a.a.b.l.d ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00950000183211.a.b ENSGT01100000265037 Mouse MODERN SPECIES 9 Cfap53 (ENSMUSG00000035394) Myo5b (ENSMUSG00000025885) Acaa2 (ENSMUSG00000036880) Lipg (ENSMUSG00000053846) Rpl17 (ENSMUSG00000062328) BC031181 (ENSMUSG00000036299) Dym (ENSMUSG00000035765) Smad7 (ENSMUSG00000025880) Ctif (ENSMUSG00000052928) Zbtb7c (ENSMUSG00000044646) Smad2 (ENSMUSG00000024563) Skor2 (ENSMUSG00000091519) Ier3ip1 (ENSMUSG00000090000) 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ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00950000183010.a.b.a.a.a.a.a.b.l.d ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00950000183211.a.b ENSGT01100000265037 spretus MODERN SPECIES 9 Cfap53 (MGP_SPRETEiJ_G0023313) Myo5b (MGP_SPRETEiJ_G0023314) Acaa2 (MGP_SPRETEiJ_G0023315) Lipg (MGP_SPRETEiJ_G0023316) MGP_SPRETEiJ_G0023317 BC031181 (MGP_SPRETEiJ_G0023318) Dym (MGP_SPRETEiJ_G0023319) Smad7 (MGP_SPRETEiJ_G0023320) Ctif (MGP_SPRETEiJ_G0023321) Zbtb7c (MGP_SPRETEiJ_G0023322) Smad2 (MGP_SPRETEiJ_G0023323) Skor2 (MGP_SPRETEiJ_G0023324) MGP_SPRETEiJ_G0023325 Hdhd2 (MGP_SPRETEiJ_G0023326) Katnal2 (MGP_SPRETEiJ_G0023327) Pias2 (MGP_SPRETEiJ_G0023328) #22 MGP_SPRETEiJ_G0023329 St8sia5 (MGP_SPRETEiJ_G0023330) #23 Loxhd1 (MGP_SPRETEiJ_G0023331) #24 8030462N17Rik (MGP_SPRETEiJ_G0023333) #26 Haus1 (MGP_SPRETEiJ_G0023334) #27 Atp5a1 (MGP_SPRETEiJ_G0023335) #28 Pstpip2 (MGP_SPRETEiJ_G0023336) #29 Epg5 (MGP_SPRETEiJ_G0023337) #30 Siglec15 (MGP_SPRETEiJ_G0023338) Slc14a1 (MGP_SPRETEiJ_G0023339) #32 Slc14a2 (MGP_SPRETEiJ_G0023340) #33 MGP_SPRETEiJ_G0023341 Setbp1 (MGP_SPRETEiJ_G0023342) #34 Eola1 (MGP_SPRETEiJ_G0023343) MGP_SPRETEiJ_G0023344 Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse MODERN SPECIES 2730 ENSMSIG00000031992 #22 St8sia5 (ENSMSIG00000031990) #23 Loxhd1 (ENSMSIG00000031989) #24 Rnf165 (ENSMSIG00000031988) #25 8030462N17Rik (ENSMSIG00000031987) #26 Haus1 (ENSMSIG00000031985) #27 Atp5a1 (ENSMSIG00000031984) #28 Pstpip2 (ENSMSIG00000031982) #29 Steppe mouse MODERN SPECIES 3130 Lipg (ENSMSIG00000019321) Rpl17 (ENSMSIG00000019275) BC031181 (ENSMSIG00000019259) ENSMSIG00000019247 Dym (ENSMSIG00000019180) Smad7 (ENSMSIG00000019123) ENSMSIG00000019110 Ctif (ENSMSIG00000019005) Zbtb7c (ENSMSIG00000018967) ENSMSIG00000018946 Smad2 (ENSMSIG00000018887) Skor2 (ENSMSIG00000018834) ENSMSIG00000018819 Hdhd2 (ENSMSIG00000018790) Katnal2 (ENSMSIG00000018633) ENSMSIG00000018626 #22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00390000002428.a.g.b ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 ENSGT00940000156943 #37 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b 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ENSSVLG00005021930 ENSSVLG00005021944 ENSSVLG00005021980 ENSSVLG00005022012 ENSSVLG00005022087 ENSSVLG00005022131 ENSSVLG00005022162 ENSSVLG00005022225 ENSSVLG00005022258 ENSSVLG00005022282 ENSSVLG00005022318 ENSSVLG00005022349 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.a.a.a.b.k ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT00390000002428.a.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 ENSGT00940000156943 #37 Rabbit MODERN SPECIES 20 ENSOCUG00000012485 ENSOCUG00000027094 ENSOCUG00000038051 DYM (ENSOCUG00000015851) SMAD7 (ENSOCUG00000024309) CTIF (ENSOCUG00000024842) ENSOCUG00000026631 ZBTB7C (ENSOCUG00000022348) SMAD2 (ENSOCUG00000011290) ENSOCUG00000027573 IER3IP1 (ENSOCUG00000012555) HDHD2 (ENSOCUG00000006979) ENSOCUG00000035984 ENSOCUG00000006940 KATNAL2 (ENSOCUG00000006971) PIAS2 (ENSOCUG00000006900) #22 ENSOCUG00000033989 #24 RNF165 (ENSOCUG00000011801) #25 C18orf25 (ENSOCUG00000009573) #26 HAUS1 (ENSOCUG00000017483) #27 ENSOCUG00000003967 #28 PSTPIP2 (ENSOCUG00000000324) #29 EPG5 (ENSOCUG00000003950) #30 SIGLEC15 (ENSOCUG00000023340) SLC14A1 (ENSOCUG00000006758) #32 ENSOCUG00000006749 #33 SETBP1 (ENSOCUG00000009706) #34 SYT4 (ENSOCUG00000009669) #35 RIT2 (ENSOCUG00000003652) #36 PIK3C3 (ENSOCUG00000009451) #37 ENSOCUG00000039403 Pika MODERN SPECIES 4011 ENSOPRG00000006243 #22 Tree shrew MODERN SPECIES 1407 ENSTBEG00000014666 #22 ST8SIA5 (ENSTBEG00000014559) #23 Primates ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT00390000002428.a.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 ENSGT00940000156943 #37 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741.s ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 ENSGT00940000156943 #37 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741.s ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 ENSGT00940000156943 #37 Mouse lemur MODERN SPECIES 10 CFAP53 (ENSMICG00000006410) MYO5B (ENSMICG00000005287) ACAA2 (ENSMICG00000005278) LIPG (ENSMICG00000017104) ENSMICG00000017102 C18orf32 (ENSMICG00000042525) DYM (ENSMICG00000017535) SMAD7 (ENSMICG00000034183) CTIF (ENSMICG00000010167) ZBTB7C (ENSMICG00000038331) SMAD2 (ENSMICG00000007882) SKOR2 (ENSMICG00000031129) IER3IP1 (ENSMICG00000043887) HDHD2 (ENSMICG00000042121) KATNAL2 (ENSMICG00000007857) PIAS2 (ENSMICG00000013229) #22 ST8SIA5 (ENSMICG00000013224) #23 ENSMICG00000017500 #28 LOXHD1 (ENSMICG00000001316) #24 RNF165 (ENSMICG00000011741) #25 C18orf25 (ENSMICG00000004834) #26 HAUS1 (ENSMICG00000017501) #27 ENSMICG00000028901 #28 PSTPIP2 (ENSMICG00000017499) #29 EPG5 (ENSMICG00000017498) #30 SIGLEC15 (ENSMICG00000017497) SLC14A1 (ENSMICG00000017496) #32 SLC14A2 (ENSMICG00000017495) #33 SETBP1 (ENSMICG00000017494) #34 SYT4 (ENSMICG00000027289) #35 RIT2 (ENSMICG00000006203) #36 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 62 ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741.s ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 ENSGT00940000156943 #37 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 262 ACAA2 (ENSPCOG00000021233) LIPG (ENSPCOG00000017489) ENSPCOG00000024759 C18orf32 (ENSPCOG00000028796) DYM (ENSPCOG00000010198) SMAD7 (ENSPCOG00000003237) CTIF (ENSPCOG00000013391) ZBTB7C (ENSPCOG00000019918) SMAD2 (ENSPCOG00000000934) SKOR2 (ENSPCOG00000016973) IER3IP1 (ENSPCOG00000000443) HDHD2 (ENSPCOG00000024401) KATNAL2 (ENSPCOG00000013440) PIAS2 (ENSPCOG00000028397) #22 ST8SIA5 (ENSPCOG00000021186) #23 LOXHD1 (ENSPCOG00000027350) #24 RNF165 (ENSPCOG00000017842) #25 C18orf25 (ENSPCOG00000026561) #26 HAUS1 (ENSPCOG00000024124) #27 ATP5F1A (ENSPCOG00000017027) #28 PSTPIP2 (ENSPCOG00000021273) #29 EPG5 (ENSPCOG00000026516) #30 SIGLEC15 (ENSPCOG00000026160) SLC14A1 (ENSPCOG00000027560) #32 SLC14A2 (ENSPCOG00000003875) #33 SETBP1 (ENSPCOG00000022384) #34 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 606 MYO5B (ENSPSMG00000019098) ACAA2 (ENSPSMG00000018945) LIPG (ENSPSMG00000018901) ENSPSMG00000018857 ENSPSMG00000018846 DYM (ENSPSMG00000018799) SMAD7 (ENSPSMG00000018729) 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#30 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1904 SKOR2 (ENSRBIG00000043935) IER3IP1 (ENSRBIG00000028883) ENSRBIG00000034951 ENSRBIG00000006980 ELOA2 (ENSRBIG00000033712) KATNAL2 (ENSRBIG00000040316) PIAS2 (ENSRBIG00000038220) #22 ST8SIA5 (ENSRBIG00000030321) #23 LOXHD1 (ENSRBIG00000042735) #24 RNF165 (ENSRBIG00000023642) #25 C18orf25 (ENSRBIG00000030339) #26 HAUS1 (ENSRBIG00000035142) #27 ATP5F1A (ENSRBIG00000039573) #28 PSTPIP2 (ENSRBIG00000030324) #29 EPG5 (ENSRBIG00000034374) #30 SIGLEC15 (ENSRBIG00000032827) SLC14A1 (ENSRBIG00000006426) #32 SLC14A2 (ENSRBIG00000044802) #33 SETBP1 (ENSRBIG00000031542) #34 ENSRBIG00000042956 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.e.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 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ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000156943 #37 ENSGT00940000158673 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00390000002428.a.g.b ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000156943 #37 ENSGT00940000154201.a.a.a.b Pecora ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00390000002428.a.g.b ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT01030000234510.a.a.b ENSGT01030000234510.a.a.a.a.a.a ENSGT00390000002368 Yarkand deer MODERN SPECIES 19 ACAA2 (ENSCHYG00000026661) LIPG (ENSCHYG00000026718) ENSCHYG00000026734 C18orf32 (ENSCHYG00000026758) DYM (ENSCHYG00000026793) SMAD7 (ENSCHYG00000026860) CTIF (ENSCHYG00000026870) ENSCHYG00000026884 ZBTB7C (ENSCHYG00000009960) ENSCHYG00000010021 SMAD2 (ENSCHYG00000010054) ENSCHYG00000010193 ENSCHYG00000010350 HDHD2 (ENSCHYG00000010250) KATNAL2 (ENSCHYG00000010401) PIAS2 (ENSCHYG00000010761) #22 ENSCHYG00000010966 ST8SIA5 (ENSCHYG00000011028) #23 LOXHD1 (ENSCHYG00000011324) #24 ENSCHYG00000013406 #26 ENSCHYG00000013803 HAUS1 (ENSCHYG00000013860) #27 ATP5F1A (ENSCHYG00000014052) #28 PSTPIP2 (ENSCHYG00000014255) #29 ENSCHYG00000014621 EPG5 (ENSCHYG00000014653) #30 SIGLEC15 (ENSCHYG00000014853) SLC14A1 (ENSCHYG00000014960) #32 SLC14A2 (ENSCHYG00000015148) #33 SETBP1 (ENSCHYG00000015524) #34 ENSCHYG00000015620 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00390000002428.a.g.b ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846.ab #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT01030000234510.a.a.b ENSGT01030000234510.a.a.a.a.a.a ENSGT00390000002368 Siberian musk deer MODERN SPECIES 132 ENSMMSG00000006303 ACAA2 (ENSMMSG00000006348) LIPG (ENSMMSG00000006397) ENSMMSG00000006453 C18orf32 (ENSMMSG00000006526) DYM (ENSMMSG00000006548) SMAD7 (ENSMMSG00000006627) CTIF (ENSMMSG00000006694) ZBTB7C (ENSMMSG00000006737) ENSMMSG00000006765 SKOR2 (ENSMMSG00000006829) IER3IP1 (ENSMMSG00000006915) HDHD2 (ENSMMSG00000006946) KATNAL2 (ENSMMSG00000006988) ENSMMSG00000007106 PIAS2 (ENSMMSG00000007137) #22 ST8SIA5 (ENSMMSG00000007341) #23 LOXHD1 (ENSMMSG00000007604) #24 RNF165 (ENSMMSG00000011227) #25 C18orf25 (ENSMMSG00000011290) #26 HAUS1 (ENSMMSG00000011347) #27 ATP5F1A (ENSMMSG00000011430) #28 ENSMMSG00000011466 PSTPIP2 (ENSMMSG00000011495) #29 EPG5 (ENSMMSG00000011583) #30 SIGLEC15 (ENSMMSG00000011634) SLC14A1 (ENSMMSG00000011666) #32 SLC14A2 (ENSMMSG00000011706) #33 SETBP1 (ENSMMSG00000011794) #34 MC2R (ENSMMSG00000011827) MC5R (ENSMMSG00000011839) Bovidae ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00390000002428.a.g.b ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846.ab #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00950000183198.c.b.a.u ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT01030000234510.a.a.b ENSGT01030000234510.a.a.a.a.a.a Bovinae ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741.i.b ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846.ab #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00950000183198.c.b.a.u ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT01030000235502 ENSGT01030000234510.a.a.b Bos ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741.j ENSGT00950000183010.a.b.a.b.a ENSGT00390000018741.i.b ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846.ab #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00950000183198.c.b.a.u ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00390000010047.b.kb ENSGT01030000235502 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741.j ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846.ab #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00950000183198.c.b.a.u ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00390000010047.b.kb ENSGT01030000235502 Domestic yak MODERN SPECIES 13 ACAA2 (ENSBGRG00000023212) LIPG (ENSBGRG00000023098) ENSBGRG00000022965 ENSBGRG00000022927 DYM (ENSBGRG00000022704) SMAD7 (ENSBGRG00000022643) ENSBGRG00000022591 CTIF (ENSBGRG00000022473) ZBTB7C (ENSBGRG00000022372) SMAD2 (ENSBGRG00000022238) ENSBGRG00000022203 IER3IP1 (ENSBGRG00000022154) HDHD2 (ENSBGRG00000022037) KATNAL2 (ENSBGRG00000021942) ENSBGRG00000021911 PIAS2 (ENSBGRG00000021507) #22 ST8SIA5 (ENSBGRG00000021274) #23 LOXHD1 (ENSBGRG00000019547) #24 RNF165 (ENSBGRG00000019400) #25 C18orf25 (ENSBGRG00000019304) #26 HAUS1 (ENSBGRG00000019042) #27 ATP5F1A (ENSBGRG00000018791) #28 PSTPIP2 (ENSBGRG00000018564) #29 EPG5 (ENSBGRG00000018124) #30 SIGLEC15 (ENSBGRG00000018017) SLC14A1 (ENSBGRG00000017647) #32 SLC14A2 (ENSBGRG00000017535) #33 SETBP1 (ENSBGRG00000017294) #34 ENSBGRG00000017233 #34 ENSBGRG00000017170 MC2R (ENSBGRG00000017129) Wild yak MODERN SPECIES 2191 ENSBMUG00000012703 IER3IP1 (ENSBMUG00000012714) HDHD2 (ENSBMUG00000012729) KATNAL2 (ENSBMUG00000012760) PIAS2 (ENSBMUG00000012834) #22 ST8SIA5 (ENSBMUG00000012907) #23 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.a ENSGT00390000018741.i.b ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846.ab #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00390000010047.b.kb ENSGT01030000235502 ENSGT01030000234510.a.a.b Cow MODERN SPECIES 16 MYO5B (ENSBTAG00000019455) ACAA2 (ENSBTAG00000002863) LIPG (ENSBTAG00000048916) RPL17 (ENSBTAG00000022902) C24H18orf32 (ENSBTAG00000021334) DYM (ENSBTAG00000000024) SMAD7 (ENSBTAG00000012441) CTIF (ENSBTAG00000018901) ZBTB7C (ENSBTAG00000013306) SMAD2 (ENSBTAG00000039916) SKOR2 (ENSBTAG00000032962) IER3IP1 (ENSBTAG00000032961) HDHD2 (ENSBTAG00000011893) KATNAL2 (ENSBTAG00000019331) ENSBTAG00000047547 PIAS2 (ENSBTAG00000007833) #22 ST8SIA5 (ENSBTAG00000001770) #23 LOXHD1 (ENSBTAG00000015210) #24 ENSBTAG00000048422 RNF165 (ENSBTAG00000001128) #25 C24H18orf25 (ENSBTAG00000032964) #26 HAUS1 (ENSBTAG00000002512) #27 ATP5F1A (ENSBTAG00000002507) #28 PSTPIP2 (ENSBTAG00000002624) #29 EPG5 (ENSBTAG00000012067) #30 SIGLEC15 (ENSBTAG00000016620) SLC14A1 (ENSBTAG00000019870) #32 SLC14A2 (ENSBTAG00000002099) #33 SETBP1 (ENSBTAG00000018088) #34 ENSBTAG00000046153 ENSBTAG00000048673 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 16 ACAA2 (ENSBIXG00005026872) LIPG (ENSBIXG00005004622) ENSBIXG00005007771 ENSBIXG00005027155 DYM (ENSBIXG00005027220) SMAD7 (ENSBIXG00005004711) CTIF (ENSBIXG00005007777) ZBTB7C (ENSBIXG00005027504) SMAD2 (ENSBIXG00005027591) SKOR2 (ENSBIXG00005004756) IER3IP1 (ENSBIXG00005027693) ENSBIXG00005027700 HDHD2 (ENSBIXG00005027742) KATNAL2 (ENSBIXG00005004778) ENSBIXG00005006537 PIAS2 (ENSBIXG00005027955) #22 ST8SIA5 (ENSBIXG00005028065) #23 LOXHD1 (ENSBIXG00005028849) #24 ENSBIXG00005005062 RNF165 (ENSBIXG00005002180) #25 C18orf25 (ENSBIXG00005002109) #26 ENSBIXG00005005126 #27 ATP5F1A (ENSBIXG00005002010) #28 PSTPIP2 (ENSBIXG00005029098) #29 EPG5 (ENSBIXG00005005178) #30 SIGLEC15 (ENSBIXG00005029135) SLC14A1 (ENSBIXG00005001781) #32 SLC14A2 (ENSBIXG00005029181) #33 SETBP1 (ENSBIXG00005029205) #34 ENSBIXG00005029232 MC2R (ENSBIXG00005006098) American bison MODERN SPECIES 3076 DYM (ENSBBBG00000010404) SMAD7 (ENSBBBG00000010410) CTIF (ENSBBBG00000010421) ENSBBBG00000010424 ZBTB7C (ENSBBBG00000010443) SMAD2 (ENSBBBG00000010465) SKOR2 (ENSBBBG00000010476) IER3IP1 (ENSBBBG00000010485) HDHD2 (ENSBBBG00000010488) KATNAL2 (ENSBBBG00000010508) PIAS2 (ENSBBBG00000010545) #22 Caprinae DUPLICATION Caprinae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00390000002428.a.g.b ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b.m #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846.ab.a #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00950000183198.c.b.a.u ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT01030000234510.a.a.b ENSGT01030000234510.a.a.a.a.a.a Goat MODERN SPECIES 16 ACAA2 (ENSCHIG00000024466) ENSCHIG00000003894 LIPG (ENSCHIG00000015994) ENSCHIG00000011677 C18orf32 (ENSCHIG00000021354) ENSCHIG00000004940 DYM (ENSCHIG00000001838) SMAD7 (ENSCHIG00000019461) CTIF (ENSCHIG00000014455) ZBTB7C (ENSCHIG00000001635) SMAD2 (ENSCHIG00000020206) SKOR2 (ENSCHIG00000011642) IER3IP1 (ENSCHIG00000020552) HDHD2 (ENSCHIG00000015973) KATNAL2 (ENSCHIG00000021217) ENSCHIG00000014561 #22 ST8SIA5 (ENSCHIG00000021775) #23 LOXHD1 (ENSCHIG00000019780) #24 RNF165 (ENSCHIG00000009622) #25 C18orf25 (ENSCHIG00000014294) #26 HAUS1 (ENSCHIG00000027208) #27 ENSCHIG00000014708 #28 PSTPIP2 (ENSCHIG00000019291) #29 EPG5 (ENSCHIG00000003358) #30 SIGLEC15 (ENSCHIG00000008764) SLC14A1 (ENSCHIG00000006085) #32 SLC14A2 (ENSCHIG00000023270) #33 SETBP1 (ENSCHIG00000014366) #34 MC2R (ENSCHIG00000006175) MC5R (ENSCHIG00000019609) RNMT (ENSCHIG00000000428) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 15 ACAA2 (ENSOARG00020011796) LIPG (ENSOARG00020011622) RPL17 (ENSOARG00020011339) C18orf32 (ENSOARG00020011289) ENSOARG00020011257 DYM (ENSOARG00020011069) SMAD7 (ENSOARG00020010974) CTIF (ENSOARG00020010822) ZBTB7C (ENSOARG00020010706) SMAD2 (ENSOARG00020010458) SKOR2 (ENSOARG00020010308) IER3IP1 (ENSOARG00020010237) HDHD2 (ENSOARG00020010165) ENSOARG00020010055 KATNAL2 (ENSOARG00020009912) PIAS2 (ENSOARG00020009642) #22 ST8SIA5 (ENSOARG00020009312) #23 LOXHD1 (ENSOARG00020006581) #24 RNF165 (ENSOARG00020006346) #25 C18orf25 (ENSOARG00020025062) #26 HAUS1 (ENSOARG00020025030) #27 ATP5F1A (ENSOARG00020025008) #28 PSTPIP2 (ENSOARG00020024936) #29 ENSOARG00020024920 EPG5 (ENSOARG00020024844) #30 SIGLEC15 (ENSOARG00020024818) SLC14A1 (ENSOARG00020024788) #32 SLC14A2 (ENSOARG00020024734) #33 SETBP1 (ENSOARG00020024713) #34 ENSOARG00020024696 MC2R (ENSOARG00020024677) Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.b.n #22 Goat MODERN SPECIES 13 LCMT2 (ENSCHIG00000004003) TGM7 (ENSCHIG00000018370) TGM5 (ENSCHIG00000015160) MIS18BP1 (ENSCHIG00000023697) FANCM (ENSCHIG00000015176) FKBP3 (ENSCHIG00000018893) PRPF39 (ENSCHIG00000010118) TOGARAM1 (ENSCHIG00000015767) KLHL28 (ENSCHIG00000023507) C14orf28 (ENSCHIG00000008954) ENSCHIG00000012257 ENSCHIG00000017232 ENSCHIG00000016320 ENSCHIG00000014697 ENSCHIG00000007447 ENSCHIG00000025383 #22 LRFN5 (ENSCHIG00000008107) ENSCHIG00000016309 ENSCHIG00000018649 FBXO33 (ENSCHIG00000018083) ENSCHIG00000010530 PNN (ENSCHIG00000016458) TRAPPC6B (ENSCHIG00000009203) GEMIN2 (ENSCHIG00000009881) SEC23A (ENSCHIG00000026578) CLEC14A (ENSCHIG00000008637) SSTR1 (ENSCHIG00000006157) ENSCHIG00000013240 FOXA1 (ENSCHIG00000023519) MIPOL1 (ENSCHIG00000011846) SLC25A21 (ENSCHIG00000017403) Cetacea ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01030000234626.D 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ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.a.a.a.b ENSGT00390000018741.k ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00390000008808.k.a.a ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01000000220806 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00950000183064.b.d ENSGT00940000153244.B.y.b ENSGT00940000159026 #35 Beluga whale MODERN SPECIES 85 SKOR2 (ENSDLEG00000017834) ENSDLEG00000017903 HDHD2 (ENSDLEG00000017914) KATNAL2 (ENSDLEG00000017942) ENSDLEG00000018112 PIAS2 (ENSDLEG00000018124) #22 ST8SIA5 (ENSDLEG00000018143) #23 LOXHD1 (ENSDLEG00000018163) #24 RNF165 (ENSDLEG00000018238) #25 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(ENSMMNG00015002843) #30 SIGLEC15 (ENSMMNG00015002905) SLC14A1 (ENSMMNG00015002937) #32 SLC14A2 (ENSMMNG00015002988) #33 SETBP1 (ENSMMNG00015003067) #34 ENSMMNG00015003095 ENSMMNG00015003111 SYT4 (ENSMMNG00015003150) #35 Vaquita MODERN SPECIES 5 ACAA2 (ENSPSNG00000009112) LIPG (ENSPSNG00000009216) ENSPSNG00000009327 ENSPSNG00000009445 DYM (ENSPSNG00000009515) ENSPSNG00000009632 ENSPSNG00000009707 CTIF (ENSPSNG00000009732) ZBTB7C (ENSPSNG00000009825) SMAD2 (ENSPSNG00000009901) SKOR2 (ENSPSNG00000010229) IER3IP1 (ENSPSNG00000010315) HDHD2 (ENSPSNG00000010382) KATNAL2 (ENSPSNG00000010440) ENSPSNG00000010683 PIAS2 (ENSPSNG00000010743) #22 ST8SIA5 (ENSPSNG00000010902) #23 LOXHD1 (ENSPSNG00000011419) #24 RNF165 (ENSPSNG00000013772) #25 C18orf25 (ENSPSNG00000013977) #26 HAUS1 (ENSPSNG00000014089) #27 ATP5F1A (ENSPSNG00000014199) #28 PSTPIP2 (ENSPSNG00000014312) #29 EPG5 (ENSPSNG00000014417) #30 SIGLEC15 (ENSPSNG00000014516) SLC14A1 (ENSPSNG00000014661) #32 SLC14A2 (ENSPSNG00000015077) #33 SETBP1 (ENSPSNG00000015348) #34 ENSPSNG00000015482 ENSPSNG00000015523 ENSPSNG00000015545 Blue whale MODERN SPECIES 5 LIPG (ENSBMSG00010021562) ENSBMSG00010021535 C18orf32 (ENSBMSG00010021530) DYM (ENSBMSG00010021517) SMAD7 (ENSBMSG00010021494) CTIF (ENSBMSG00010021461) ZBTB7C (ENSBMSG00010021442) SMAD2 (ENSBMSG00010021413) SKOR2 (ENSBMSG00010021387) ENSBMSG00010021377 IER3IP1 (ENSBMSG00010021374) HDHD2 (ENSBMSG00010021363) ENSBMSG00010021354 KATNAL2 (ENSBMSG00010021337) ENSBMSG00010021325 PIAS2 (ENSBMSG00010021288) #22 ST8SIA5 (ENSBMSG00010021215) #23 LOXHD1 (ENSBMSG00010020792) #24 RNF165 (ENSBMSG00010020628) #25 C18orf25 (ENSBMSG00010020596) #26 HAUS1 (ENSBMSG00010020557) #27 ATP5F1A (ENSBMSG00010020528) #28 ENSBMSG00010020513 PSTPIP2 (ENSBMSG00010020499) #29 EPG5 (ENSBMSG00010020473) #30 SIGLEC15 (ENSBMSG00010020448) SLC14A1 (ENSBMSG00010020365) #32 SLC14A2 (ENSBMSG00010020311) #33 SETBP1 (ENSBMSG00010020281) #34 SYT4 (ENSBMSG00010020248) #35 ENSBMSG00010020228 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT00390000002428.a.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 Arabian camel MODERN SPECIES 23 ACAA2 (ENSCDRG00005010799) ENSCDRG00005010930 LIPG (ENSCDRG00005010970) RPL17 (ENSCDRG00005011453) C18orf32 (ENSCDRG00005011639) DYM (ENSCDRG00005011719) ENSCDRG00005012031 ENSCDRG00005012050 CTIF (ENSCDRG00005012119) ZBTB7C (ENSCDRG00005012395) SMAD2 (ENSCDRG00005012465) IER3IP1 (ENSCDRG00005012846) HDHD2 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ENSGT01080000257333.E.o.a.b ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT01030000240358 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a.b ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 Caniformia ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.a.a.a.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT01030000240358 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846.bb.b #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a.b ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.c.a ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 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#27 ENSGT00550000074846.bb.b #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT00940000167582 #31 ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 Ursus ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00950000183005.a.a ENSGT01050000244995 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a.d ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846.bb.b #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 ENSGT00940000156943 #37 ENSGT00940000154201.a.a.a.b American black bear MODERN SPECIES 2360 PIAS2 (ENSUAMG00000008036) #22 ST8SIA5 (ENSUAMG00000008510) #23 Polar bear MODERN SPECIES 96 CXXC1 (ENSUMAG00000003014) MBD1 (ENSUMAG00000002947) MYO5B (ENSUMAG00000002812) ACAA2 (ENSUMAG00000002792) LIPG (ENSUMAG00000002779) ENSUMAG00000002766 C18orf32 (ENSUMAG00000002755) DYM (ENSUMAG00000002750) ENSUMAG00000002746 CTIF (ENSUMAG00000002735) ZBTB7C (ENSUMAG00000002721) SMAD2 (ENSUMAG00000002720) IER3IP1 (ENSUMAG00000002717) HDHD2 (ENSUMAG00000002716) KATNAL2 (ENSUMAG00000002674) PIAS2 (ENSUMAG00000002661) #22 ST8SIA5 (ENSUMAG00000002618) #23 LOXHD1 (ENSUMAG00000002413) #24 RNF165 (ENSUMAG00000002386) #25 C18orf25 (ENSUMAG00000002382) #26 HAUS1 (ENSUMAG00000002378) #27 ATP5F1A (ENSUMAG00000002375) #28 PSTPIP2 (ENSUMAG00000002367) #29 EPG5 (ENSUMAG00000002362) #30 SLC14A1 (ENSUMAG00000002359) #32 ENSUMAG00000002312 #33 SETBP1 (ENSUMAG00000002294) #34 SYT4 (ENSUMAG00000002280) #35 RIT2 (ENSUMAG00000002274) #36 PIK3C3 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ENSGT00550000074846.bb.b.a #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a.b ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00390000016908.b ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161706 ENSGT00390000000920 ENSGT00940000163114 ENSGT00940000161959 ENSGT00940000161276.C ENSGT00940000161986 ENSGT00940000161896.a.a ENSGT00910000144329 ENSGT00940000162189 ENSGT00940000161606 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846.bb.b.a #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a.b ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00950000182901.b ENSGT00390000016908.b 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ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 ENSGT00940000156943 #37 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00390000002428.a.g.b ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a.b ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 ENSGT00940000156943 #37 Microbat DUPLICATION Microbat MODERN SPECIES 953 MBD1 (ENSMLUG00000008286) ENSMLUG00000016723 MYO5B (ENSMLUG00000016701) ACAA2 (ENSMLUG00000022960) LIPG 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(ENSECAG00000001651) SMAD7 (ENSECAG00000020583) CTIF (ENSECAG00000020473) ZBTB7C (ENSECAG00000020456) SMAD2 (ENSECAG00000015132) SKOR2 (ENSECAG00000040113) IER3IP1 (ENSECAG00000026829) HDHD2 (ENSECAG00000012664) ENSECAG00000010000 KATNAL2 (ENSECAG00000010207) PIAS2 (ENSECAG00000002816) #22 ST8SIA5 (ENSECAG00000023864) #23 LOXHD1 (ENSECAG00000022216) #24 RNF165 (ENSECAG00000021547) #25 ENSECAG00000031869 C18orf25 (ENSECAG00000020333) #26 HAUS1 (ENSECAG00000016553) #27 ATP5F1A (ENSECAG00000021561) #28 PSTPIP2 (ENSECAG00000019025) #29 EPG5 (ENSECAG00000002267) #30 SIGLEC15 (ENSECAG00000018025) SLC14A1 (ENSECAG00000014487) #32 SLC14A2 (ENSECAG00000034918) #33 SETBP1 (ENSECAG00000019793) #34 SYT4 (ENSECAG00000017570) #35 RIT2 (ENSECAG00000016682) #36 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 Hedgehog MODERN SPECIES 8411 PIAS2 (ENSEEUG00000005935) #22 Common shrew MODERN SPECIES 6365 PIAS2 (ENSSARG00000008586) #22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT01100000263809 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000164047.c.b ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 Xenarthra DUPLICATION Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.b.fb #22 Sloth MODERN SPECIES 7789 PIAS2 (ENSCHOG00000005911) #22 Armadillo MODERN SPECIES 3631 TMEM229B (ENSDNOG00000032813) ENSDNOG00000004245 PLEKHH1 (ENSDNOG00000004784) PIGH (ENSDNOG00000004804) ENSDNOG00000043235 ARG2 (ENSDNOG00000004808) VTI1B (ENSDNOG00000003643) RDH11 (ENSDNOG00000042867) RDH12 (ENSDNOG00000003650) ENSDNOG00000034723 ENSDNOG00000044979 RAD51B (ENSDNOG00000049492) ZFP36L1 (ENSDNOG00000005159) ENSDNOG00000048622 ACTN1 (ENSDNOG00000045722) ENSDNOG00000042062 #22 DCAF5 (ENSDNOG00000018872) EXD2 (ENSDNOG00000046970) GALNT16 (ENSDNOG00000042275) ERH (ENSDNOG00000034098) SLC39A9 (ENSDNOG00000034206) PLEKHD1 (ENSDNOG00000036900) ENSDNOG00000012317 ENSDNOG00000039786 SUSD6 (ENSDNOG00000025953) SRSF5 (ENSDNOG00000006160) SLC10A1 (ENSDNOG00000006170) ENSDNOG00000030920 SMOC1 (ENSDNOG00000007841) SLC8A3 (ENSDNOG00000049755) Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 212 ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b.gb #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 Armadillo MODERN SPECIES 4785 ENSDNOG00000025727 IER3IP1 (ENSDNOG00000032201) HDHD2 (ENSDNOG00000001000) KATNAL2 (ENSDNOG00000001108) ENSDNOG00000011855 #22 ST8SIA5 (ENSDNOG00000032248) #23 LOXHD1 (ENSDNOG00000005137) #24 RNF165 (ENSDNOG00000023586) #25 C18orf25 (ENSDNOG00000048603) #26 HAUS1 (ENSDNOG00000033685) #27 ENSDNOG00000006331 #28 PSTPIP2 (ENSDNOG00000037520) #29 ENSDNOG00000014995 #30 ENSDNOG00000035305 #30 SIGLEC15 (ENSDNOG00000014982) SLC14A1 (ENSDNOG00000032760) #32 SLC14A2 (ENSDNOG00000017162) #33 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT01100000263809 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000164047.c.b ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT01100000263809 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000164047.c.b ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.o.a ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 Hyrax MODERN SPECIES 7241 PIAS2 (ENSPCAG00000012046) #22 Elephant MODERN SPECIES 375 MBD1 (ENSLAFG00000031328) ENSLAFG00000015611 MYO5B (ENSLAFG00000015591) ACAA2 (ENSLAFG00000022796) LIPG (ENSLAFG00000003595) RPL17 (ENSLAFG00000005569) C18orf32 (ENSLAFG00000021351) DYM (ENSLAFG00000017747) SMAD7 (ENSLAFG00000008013) CTIF (ENSLAFG00000016335) ZBTB7C (ENSLAFG00000003436) SMAD2 (ENSLAFG00000000143) SKOR2 (ENSLAFG00000020778) HDHD2 (ENSLAFG00000004419) KATNAL2 (ENSLAFG00000004417) PIAS2 (ENSLAFG00000018135) #22 ST8SIA5 (ENSLAFG00000010716) #23 LOXHD1 (ENSLAFG00000008500) #24 ENSLAFG00000030824 ENSLAFG00000008497 #25 C18orf25 (ENSLAFG00000013703) #26 ENSLAFG00000010897 #27 ENSLAFG00000031983 #27 ATP5F1A (ENSLAFG00000014779) #28 ENSLAFG00000002465 #29 EPG5 (ENSLAFG00000002464) #30 SLC14A1 (ENSLAFG00000009224) #32 SLC14A2 (ENSLAFG00000026942) #33 SETBP1 (ENSLAFG00000003458) #34 ENSLAFG00000012899 SYT4 (ENSLAFG00000010312) #35 Tenrec MODERN SPECIES 7755 PIAS2 (ENSETEG00000019191) #22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01070000254624 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846.e #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 ENSGT00940000156943 #37 Opossum DUPLICATION Opossum DUPLICATION Opossum MODERN SPECIES 2 LIPG 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ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 ENSGT00940000156943 #37 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.a.a.b ENSGT00950000183010.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846.e #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 ENSGT00940000156943 #37 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01070000254624 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.a.a.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846.e #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E ENSGT00390000018729.a.a #32 ENSGT00390000018729.a.b #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 ENSGT00940000156943 #37 koala MODERN SPECIES 22 LIPG (ENSPCIG00000028229) ENSPCIG00000028230 C18orf32 (ENSPCIG00000032291) DYM (ENSPCIG00000031532) SMAD7 (ENSPCIG00000019168) CTIF (ENSPCIG00000026247) ZBTB7C (ENSPCIG00000015685) SMAD2 (ENSPCIG00000015690) SKOR2 (ENSPCIG00000006700) IER3IP1 (ENSPCIG00000033187) HDHD2 (ENSPCIG00000006706) 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RNF165 (ENSVURG00010022261) #25 C18orf25 (ENSVURG00010022255) #26 HAUS1 (ENSVURG00010022251) #27 ENSVURG00010022245 #28 PSTPIP2 (ENSVURG00010022237) #29 EPG5 (ENSVURG00010022212) #30 ENSVURG00010022201 SLC14A1 (ENSVURG00010022183) #32 SLC14A2 (ENSVURG00010022169) #33 ENSVURG00010022157 SETBP1 (ENSVURG00010022154) #34 ENSVURG00010022140 Wallaby MODERN SPECIES 180 ENSMEUG00000013788 #22 Tasmanian devil MODERN SPECIES ENSSHAG00000010062 ENSSHAG00000003364 ACAA2 (ENSSHAG00000001241) LIPG (ENSSHAG00000004911) ENSSHAG00000003060 ENSSHAG00000030929 DYM (ENSSHAG00000001181) SMAD7 (ENSSHAG00000017444) CTIF (ENSSHAG00000027815) ZBTB7C (ENSSHAG00000024277) SMAD2 (ENSSHAG00000012837) ENSSHAG00000012107 SKOR2 (ENSSHAG00000025447) HDHD2 (ENSSHAG00000024217) KATNAL2 (ENSSHAG00000003042) PIAS2 (ENSSHAG00000005954) #22 ST8SIA5 (ENSSHAG00000021657) #23 ENSSHAG00000017868 #24 RNF165 (ENSSHAG00000017805) #25 C18orf25 (ENSSHAG00000017414) #26 HAUS1 (ENSSHAG00000030289) #27 ENSSHAG00000017177 #28 PSTPIP2 (ENSSHAG00000017036) #29 EPG5 (ENSSHAG00000016721) #30 ENSSHAG00000016659 SLC14A1 (ENSSHAG00000032087) #32 SLC14A2 (ENSSHAG00000016114) #33 SETBP1 (ENSSHAG00000011290) #34 SYT4 (ENSSHAG00000030482) #35 RIT2 (ENSSHAG00000027427) #36 ENSSHAG00000030977 Platypus MODERN SPECIES 14 ENSOANG00000008126 MYO5B (ENSOANG00000008127) ACAA2 (ENSOANG00000002559) LIPG (ENSOANG00000001131) ENSOANG00000002910 DYM (ENSOANG00000007612) ENSOANG00000007611 CTIF (ENSOANG00000001337) ZBTB7C (ENSOANG00000005929) SMAD2 (ENSOANG00000001971) SKOR2 (ENSOANG00000038832) IER3IP1 (ENSOANG00000045983) ENSOANG00000042577 HDHD2 (ENSOANG00000012019) KATNAL2 (ENSOANG00000012018) PIAS2 (ENSOANG00000012017) #22 ST8SIA5 (ENSOANG00000014835) #23 LOXHD1 (ENSOANG00000014833) #24 RNF165 (ENSOANG00000014831) #25 C18orf25 (ENSOANG00000004994) #26 ENSOANG00000048405 UBAP2 (ENSOANG00000010219) UBE2R2 (ENSOANG00000036151) NOL6 (ENSOANG00000010217) AQP3 (ENSOANG00000014661) ENSOANG00000045749 TPGS2 (ENSOANG00000004563) ENSOANG00000021740 ENSOANG00000045275 ENSOANG00000045452 ENSOANG00000038440 Sauria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000178986 ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E ENSGT00390000018729.a.d #33 ENSGT00390000018729.a.c #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 ENSGT00940000156943 #37 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01030000235140 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 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ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.n ENSGT00390000018729.a.d #33 ENSGT00390000018729.a.c #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 ENSGT00940000156943 #37 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01030000235140 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.n ENSGT00390000018729.a.d #33 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ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E.n ENSGT00390000018729.a.d #33 ENSGT00390000018729.a.c.b #33 ENSGT00390000018729.a.c.a #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 2042 ZBTB7C (ENSCABG00000020683) SMAD2 (ENSCABG00000020680) IER3IP1 (ENSCABG00000020676) HDHD2 (ENSCABG00000020673) KATNAL2 (ENSCABG00000020670) PIAS2 (ENSCABG00000020669) #22 ENSCABG00000020668 ST8SIA5 (ENSCABG00000020667) #23 Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 20 ACAA2 (ENSGEVG00005019715) LIPG (ENSGEVG00005019740) ENSGEVG00005019793 C18orf32 (ENSGEVG00005019829) DYM (ENSGEVG00005019836) SMAD7 (ENSGEVG00005019841) CTIF (ENSGEVG00005019849) ENSGEVG00005019871 ZBTB7C (ENSGEVG00005019877) ENSGEVG00005019880 SMAD2 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12 ENSGT01030000235140 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a.d ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846.eb.b #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E ENSGT00390000018729.a.d #33 ENSGT00390000018729.a.c #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 ENSGT00940000156943 #37 Neognathae_b DUPLICATION Neognathae_b DUPLICATION Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01030000235140 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 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ENSGT00940000156943 #37 Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01030000235140 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872.j ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a.d ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b.hb.a #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167.c.a #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846.eb.b #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E ENSGT00390000018729.a.d #33 ENSGT00390000018729.a.c #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 ENSGT00940000156943 #37 Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT01030000235140 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 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ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167.d #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846.db #28 ENSGT00390000016167.c.b #26 ENSGT00940000167769 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E ENSGT00390000018729.a.d #33 ENSGT00390000018729.a.c #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026.d #35 Kakapo MODERN SPECIES 19 ENSSHBG00005011586 MYO5B (ENSSHBG00005011309) ACAA2 (ENSSHBG00005011224) LIPG (ENSSHBG00005011192) ENSSHBG00005011099 C18orf32 (ENSSHBG00005011080) DYM (ENSSHBG00005011046) SMAD7 (ENSSHBG00005011025) ENSSHBG00005011002 ZBTB7C (ENSSHBG00005010973) ENSSHBG00005010919 ENSSHBG00005010880 IER3IP1 (ENSSHBG00005010867) HDHD2 (ENSSHBG00005010840) KATNAL2 (ENSSHBG00005010077) ENSSHBG00005009962 #22 ENSSHBG00005009938 ST8SIA5 (ENSSHBG00005009922) #23 LOXHD1 (ENSSHBG00005008933) #24 RNF165 (ENSSHBG00005008844) #25 ENSSHBG00005008835 ENSSHBG00005008832 #26 ENSSHBG00005008822 PSTPIP2 (ENSSHBG00005008805) #29 ENSSHBG00005008791 #28 EPG5 (ENSSHBG00005008678) #30 ENSSHBG00005008642 ENSSHBG00005008633 #33 ENSSHBG00005008572 #33 ENSSHBG00005008557 #34 ENSSHBG00005008553 #35 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.b.hb.b #22 Passeriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.b.hb.b #22 Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.b.hb.b #22 Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.b.hb.b #22 Medium ground finch MODERN SPECIES 466 ENSGFOG00000002714 #22 Passeroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.b.hb.b #22 Common canary MODERN SPECIES 350 ENSSCAG00000008159 #22 Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.b.hb.b #22 Kakapo DUPLICATION Kakapo MODERN SPECIES 4 ENSSHBG00005001019 ENSSHBG00005001021 ENSSHBG00005001022 ENSSHBG00005001024 ENSSHBG00005001027 ENSSHBG00005001030 ENSSHBG00005001032 ENSSHBG00005001033 ENSSHBG00005001035 ENSSHBG00005001037 ENSSHBG00005001040 ENSSHBG00005001041 ENSSHBG00005001042 ENSSHBG00005001044 ENSSHBG00005001048 ENSSHBG00005001049 #22 ENSSHBG00005001050 #22 ENSSHBG00005001051 ENSSHBG00005001056 ENSSHBG00005001057 ENSSHBG00005001058 ENSSHBG00005001059 ENSSHBG00005001060 ENSSHBG00005001061 ENSSHBG00005001062 ENSSHBG00005001063 ENSSHBG00005001064 ENSSHBG00005001065 ENSSHBG00005001066 ENSSHBG00005001067 ENSSHBG00005001070 Kakapo MODERN SPECIES 4 ENSSHBG00005001021 ENSSHBG00005001022 ENSSHBG00005001024 ENSSHBG00005001027 ENSSHBG00005001030 ENSSHBG00005001032 ENSSHBG00005001033 ENSSHBG00005001035 ENSSHBG00005001037 ENSSHBG00005001040 ENSSHBG00005001041 ENSSHBG00005001042 ENSSHBG00005001044 ENSSHBG00005001048 ENSSHBG00005001049 #22 ENSSHBG00005001050 #22 ENSSHBG00005001051 ENSSHBG00005001056 ENSSHBG00005001057 ENSSHBG00005001058 ENSSHBG00005001059 ENSSHBG00005001060 ENSSHBG00005001061 ENSSHBG00005001062 ENSSHBG00005001063 ENSSHBG00005001064 ENSSHBG00005001065 ENSSHBG00005001066 ENSSHBG00005001067 ENSSHBG00005001070 ENSSHBG00005001075 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.b.ib #22 Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.b.ib #22 Golden eagle MODERN SPECIES 91 ENSACCG00020009495 MYO5B (ENSACCG00020016656) ACAA2 (ENSACCG00020016573) LIPG (ENSACCG00020016557) RPL17 (ENSACCG00020016537) C18orf32 (ENSACCG00020016535) DYM (ENSACCG00020016531) SMAD7 (ENSACCG00020016530) CTIF (ENSACCG00020016528) ZBTB7C (ENSACCG00020016526) SMAD2 (ENSACCG00020016518) SKOR2 (ENSACCG00020016513) IER3IP1 (ENSACCG00020016510) HDHD2 (ENSACCG00020016506) KATNAL2 (ENSACCG00020016503) PIAS2 (ENSACCG00020016500) #22 ENSACCG00020016495 ST8SIA5 (ENSACCG00020016492) #23 LOXHD1 (ENSACCG00020016482) #24 RNF165 (ENSACCG00020016454) #25 ENSACCG00020016448 C18orf25 (ENSACCG00020016442) #26 HAUS1 (ENSACCG00020016407) #27 ATP5F1A (ENSACCG00020016399) #28 PSTPIP2 (ENSACCG00020016388) #29 EPG5 (ENSACCG00020016353) #30 ENSACCG00020016332 ENSACCG00020016311 #33 ENSACCG00020016281 #33 SETBP1 (ENSACCG00020016273) #34 SYT4 (ENSACCG00020016267) #35 Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01030000235140 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a.d ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846.eb.b #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E ENSGT00390000018729.a.d #33 ENSGT00390000018729.a.c #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 ENSGT00940000156943 #37 Anatidae ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT01030000235140 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a.c ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846.eb.b #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E ENSGT00390000018729.a.d #33 ENSGT00390000018729.a.c #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 ENSGT00940000156943 #37 Duck MODERN SPECIES 4281 MYO5B (ENSAPLG00000005427) ACAA2 (ENSAPLG00000006058) LIPG (ENSAPLG00000008809) ENSAPLG00000008451 C18orf32 (ENSAPLG00000017090) DYM (ENSAPLG00000007759) ENSAPLG00000022343 SMAD7 (ENSAPLG00000001268) CTIF (ENSAPLG00000014486) ZBTB7C (ENSAPLG00000016660) SMAD2 (ENSAPLG00000004964) SKOR2 (ENSAPLG00000022487) IER3IP1 (ENSAPLG00000018295) HDHD2 (ENSAPLG00000004974) KATNAL2 (ENSAPLG00000005005) PIAS2 (ENSAPLG00000005190) #22 ENSAPLG00000022068 ST8SIA5 (ENSAPLG00000011069) #23 LOXHD1 (ENSAPLG00000010718) #24 ENSAPLG00000018736 RNF165 (ENSAPLG00000006619) #25 C18orf25 (ENSAPLG00000017723) #26 HAUS1 (ENSAPLG00000011232) #27 ATP5F1A (ENSAPLG00000011512) #28 PSTPIP2 (ENSAPLG00000011930) #29 EPG5 (ENSAPLG00000011964) #30 ENSAPLG00000024300 ENSAPLG00000024359 #33 ENSAPLG00000012208 #33 SETBP1 (ENSAPLG00000017129) #34 SYT4 (ENSAPLG00000011860) #35 Pink-footed goose MODERN SPECIES 346 ENSABRG00000019488 KATNAL2 (ENSABRG00000019473) PIAS2 (ENSABRG00000019457) #22 ST8SIA5 (ENSABRG00000019447) #23 ENSABRG00000019443 #24 RNF165 (ENSABRG00000019433) #25 C18orf25 (ENSABRG00000019430) #26 Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000182938.b.b.b.b.b.b ENSGT00940000159146 ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.a.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872.k ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a.d.a.b ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 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(ENSCJPG00005005205) #26 HAUS1 (ENSCJPG00005005206) #27 ATP5F1A (ENSCJPG00005005208) #28 PSTPIP2 (ENSCJPG00005005209) #29 EPG5 (ENSCJPG00005005256) #30 ENSCJPG00005005293 ENSCJPG00005005294 #33 SETBP1 (ENSCJPG00005005325) #34 SYT4 (ENSCJPG00005005351) #35 RIT2 (ENSCJPG00005005369) #36 PIK3C3 (ENSCJPG00005005375) #37 ENSCJPG00005005432 Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000182938.b.b.b.b.b.b ENSGT00940000159146 ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.a.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872.k ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a.d.a.b ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167.a #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846.eb.b #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E ENSGT00390000018729.a.d #33 ENSGT00390000018729.a.c #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 ENSGT00940000156943 #37 Turkey DUPLICATION Turkey MODERN SPECIES 1299 ENSMGAG00000001140 NEDD4L (ENSMGAG00000000935) ENSMGAG00000021263 ALPK2 (ENSMGAG00000018725) ENSMGAG00000001342 MALT1 (ENSMGAG00000001082) ENSMGAG00000001162 SEC11C (ENSMGAG00000001165) ENSMGAG00000022342 CTIF (ENSMGAG00000021290) ZBTB7C (ENSMGAG00000001366) SMAD2 (ENSMGAG00000001351) IER3IP1 (ENSMGAG00000020998) HDHD2 (ENSMGAG00000004803) KATNAL2 (ENSMGAG00000004476) ENSMGAG00000001384 #22 ST8SIA5 (ENSMGAG00000016483) #23 LOXHD1 (ENSMGAG00000016776) #24 RNF165 (ENSMGAG00000001405) #25 C18orf25 (ENSMGAG00000021854) #26 HAUS1 (ENSMGAG00000001559) #27 ENSMGAG00000009963 #28 PSTPIP2 (ENSMGAG00000001515) #29 EPG5 (ENSMGAG00000001532) #30 ENSMGAG00000001401 ENSMGAG00000009233 #33 ENSMGAG00000009227 #33 SETBP1 (ENSMGAG00000009445) #34 SYT4 (ENSMGAG00000001587) #35 PIK3C3 (ENSMGAG00000009060) #37 ENSMGAG00000022981 Turkey 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ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E ENSGT00390000018729.a.d #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 Laterata ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01030000235140 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E ENSGT00390000018729.a.d #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 ENSGT00940000161402 #36 ENSGT00940000156943 #37 ENSGT00940000154201.a.a.a.b Common wall lizard MODERN SPECIES 2 ENSPMRG00000010121 MYO5B (ENSPMRG00000009756) ACAA2 (ENSPMRG00000009605) LIPG (ENSPMRG00000009592) ENSPMRG00000009575 C18orf32 (ENSPMRG00000009571) DYM (ENSPMRG00000009531) SMAD7 (ENSPMRG00000009512) CTIF (ENSPMRG00000009496) ZBTB7C (ENSPMRG00000009478) ENSPMRG00000009469 SMAD2 (ENSPMRG00000009455) SKOR2 (ENSPMRG00000009448) HDHD2 (ENSPMRG00000009442) KATNAL2 (ENSPMRG00000015210) PIAS2 (ENSPMRG00000015190) #22 ENSPMRG00000015174 ST8SIA5 (ENSPMRG00000015167) #23 LOXHD1 (ENSPMRG00000015049) #24 RNF165 (ENSPMRG00000015013) #25 ENSPMRG00000015011 C18orf25 (ENSPMRG00000015004) #26 ENSPMRG00000015002 ATP5F1A (ENSPMRG00000014993) #28 PSTPIP2 (ENSPMRG00000014981) #29 EPG5 (ENSPMRG00000014633) #30 ENSPMRG00000014575 ENSPMRG00000014565 #33 SETBP1 (ENSPMRG00000014561) #34 ENSPMRG00000014558 ENSPMRG00000014556 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 34 MYO5B (ENSSMRG00000016569) ACAA2 (ENSSMRG00000016578) LIPG (ENSSMRG00000016580) RPL17 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ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 ENSGT01080000257333.E ENSGT00390000018729.a.d #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000159026 #35 Indian cobra MODERN SPECIES 1 ENSNNAG00000013638 MYO5B (ENSNNAG00000013682) ACAA2 (ENSNNAG00000013909) LIPG (ENSNNAG00000013974) ENSNNAG00000014239 C18orf32 (ENSNNAG00000014266) DYM (ENSNNAG00000014278) SMAD7 (ENSNNAG00000014299) CTIF (ENSNNAG00000014324) ZBTB7C (ENSNNAG00000014457) SMAD2 (ENSNNAG00000014472) ENSNNAG00000014533 IER3IP1 (ENSNNAG00000014563) ENSNNAG00000014575 KATNAL2 (ENSNNAG00000014598) PIAS2 (ENSNNAG00000014631) #22 ENSNNAG00000014747 ST8SIA5 (ENSNNAG00000014880) #23 LOXHD1 (ENSNNAG00000014987) #24 RNF165 (ENSNNAG00000015582) #25 ENSNNAG00000015609 C18orf25 (ENSNNAG00000015617) #26 ENSNNAG00000015653 ATP5F1A (ENSNNAG00000015663) #28 PSTPIP2 (ENSNNAG00000015692) #29 ENSNNAG00000015772 #33 SYT4 (ENSNNAG00000015811) #35 ENSNNAG00000015828 PIK3C3 (ENSNNAG00000015843) #37 ENSNNAG00000015877 ENSNNAG00000015888 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT01030000235140 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 2997 PIAS2 (ENSLLTG00000008779) #22 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT01030000235140 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b.a.b.b.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 366 SKOR2 (ENSNSUG00000010155) IER3IP1 (ENSNSUG00000010156) ENSNSUG00000010157 KATNAL2 (ENSNSUG00000010158) PIAS2 (ENSNSUG00000010159) #22 ENSNSUG00000010162 Eastern brown snake MODERN SPECIES 2 ENSPTXG00000017817 MYO5B (ENSPTXG00000006873) ACAA2 (ENSPTXG00000006871) LIPG (ENSPTXG00000006699) ENSPTXG00000006694 C18orf32 (ENSPTXG00000006692) DYM (ENSPTXG00000006583) SMAD7 (ENSPTXG00000006582) CTIF (ENSPTXG00000006581) ZBTB7C (ENSPTXG00000006580) SMAD2 (ENSPTXG00000006579) SKOR2 (ENSPTXG00000006578) IER3IP1 (ENSPTXG00000006577) HDHD2 (ENSPTXG00000006576) KATNAL2 (ENSPTXG00000006575) PIAS2 (ENSPTXG00000006574) #22 ENSPTXG00000006543 Lizard MODERN SPECIES ENSACAG00000038205 ENSACAG00000035791 ENSACAG00000036056 RYR3 (ENSACAG00000015401) ENSACAG00000034962 AVEN (ENSACAG00000015390) CHRM5 (ENSACAG00000015381) ENSACAG00000015369 EMC7 (ENSACAG00000015350) KATNBL1 (ENSACAG00000015339) ENSACAG00000028574 SKOR2 (ENSACAG00000006146) ENSACAG00000036900 HDHD2 (ENSACAG00000044652) KATNAL2 (ENSACAG00000012057) PIAS2 (ENSACAG00000012084) #22 ENSACAG00000012275 ST8SIA5 (ENSACAG00000012397) #23 ENSACAG00000038362 LOXHD1 (ENSACAG00000012527) #24 RNF165 (ENSACAG00000012611) #25 ENSACAG00000040406 C18orf25 (ENSACAG00000012627) #26 HAUS1 (ENSACAG00000012652) #27 ATP5F1A (ENSACAG00000012698) #28 PSTPIP2 (ENSACAG00000012789) #29 ENSACAG00000044541 EPG5 (ENSACAG00000012846) #30 ENSACAG00000040459 ENSACAG00000012950 ENSACAG00000012956 #33 tuatara MODERN SPECIES 631 SMAD7 (ENSSPUG00000015295) CTIF (ENSSPUG00000014734) ENSSPUG00000014650 ZBTB7C (ENSSPUG00000014644) ENSSPUG00000014624 HDHD2 (ENSSPUG00000014604) KATNAL2 (ENSSPUG00000014578) PIAS2 (ENSSPUG00000014552) #22 ENSSPUG00000014537 Anura ANCESTRAL SPECIES 158 ENSGT00940000155402.a.b ENSGT01030000234626.D ENSGT00940000159394 ENSGT00950000183010.a.b ENSGT00390000018741 ENSGT00390000008772 ENSGT00940000159872 ENSGT00940000153432.A.b ENSGT00940000159814 ENSGT00940000153499.a ENSGT00940000160474 ENSGT00510000047648 ENSGT00940000155805 ENSGT00940000157302 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT01030000234535.C #23 ENSGT00390000018830 #24 ENSGT00940000156997 #25 ENSGT00390000016167 #26 ENSGT00940000161143 ENSGT00390000006029 #27 ENSGT00550000074846 #28 ENSGT00940000158788 #29 ENSGT00390000007354 #30 Frog MODERN SPECIES ENSXETG00000047825 ENSXETG00000047713 tor4a (ENSXETG00000020322) ctif (ENSXETG00000026836) smad7 (ENSXETG00000020317) dym (ENSXETG00000020310) c18orf32 (ENSXETG00000026840) rpl17 (ENSXETG00000020308) zbtb7c (ENSXETG00000035017) smad2 (ENSXETG00000020292) ENSXETG00000045677 ENSXETG00000038874 ier3ip1 (ENSXETG00000046485) hdhd2 (ENSXETG00000020183) katnal2 (ENSXETG00000033325) pias2 (ENSXETG00000021519) #22 eef2.2 (ENSXETG00000021508) epg5 (ENSXETG00000032699) #30 ENSXETG00000049379 PSTPIP2 (ENSXETG00000033294) #29 atp5f1a (ENSXETG00000002315) #28 haus1 (ENSXETG00000021500) #27 fdx2 (ENSXETG00000021499) c18orf25 (ENSXETG00000021498) #26 rnf165 (ENSXETG00000036743) #25 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(ENSLACG00000009849) ENSLACG00000009668 ENSLACG00000009071 PIAS2 (ENSLACG00000006457) #22 ENSLACG00000004710 ENSLACG00000003830 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 139 ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b ENSGT00940000157036 ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.a ENSGT00940000162613 ENSGT00940000161905 ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000161213 ENSGT00940000159179 ENSGT00940000160028 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000154662.d ENSGT00940000159261 ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00990000205656 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 ENSGT00940000157273 Reedfish MODERN SPECIES 15 ENSECRG00000007356 pax5 (ENSECRG00000007323) zcchc7 (ENSECRG00000007299) grhprb (ENSECRG00000007286) grhpra (ENSECRG00000007277) ZBTB5 (ENSECRG00000007270) slc25a51a (ENSECRG00000007262) 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ENSGT00900000141071.b ENSGT00940000166020 ENSGT00940000156090.a ENSGT00390000007354 #30 ENSGT00390000005869.b ENSGT00940000175463 ENSGT00390000003255 ENSGT00950000183112.b.a.b ENSGT00940000162653 ENSGT00940000157902 ENSGT00390000018729.a.e #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000155179 Spotted gar MODERN SPECIES 658 fsta (ENSLOCG00000006942) ENSLOCG00000006931 MOCS2 (ENSLOCG00000006920) ITGA2 (ENSLOCG00000006872) ITGA1 (ENSLOCG00000006845) isl1a (ENSLOCG00000006816) si:dkey-3h3.3 (ENSLOCG00000006799) parp8 (ENSLOCG00000006783) ENSLOCG00000006774 golph3a (ENSLOCG00000006756) mtmr12 (ENSLOCG00000006743) zfr (ENSLOCG00000006727) sub1b (ENSLOCG00000006692) npr3 (ENSLOCG00000006676) arid3c (ENSLOCG00000006663) pias2 (ENSLOCG00000006647) #22 ENSLOCG00000006634 fancg (ENSLOCG00000006614) vcp (ENSLOCG00000006589) hwa (ENSLOCG00000006577) akr1a1a (ENSLOCG00000006557) dnajb5 (ENSLOCG00000006541) ENSLOCG00000006504 epg5 (ENSLOCG00000006481) #30 lix1 (ENSLOCG00000006461) riok2 (ENSLOCG00000006432) ENSLOCG00000006413 rgmb (ENSLOCG00000006395) erap2 (ENSLOCG00000006368) ERAP2 (ENSLOCG00000006336) lnpep (ENSLOCG00000006318) Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000161247 ENSGT00940000156244 ENSGT00390000013835 ENSGT00940000157072.b ENSGT00940000153731.a.a ENSGT00940000154578.B ENSGT00950000183129.b.a ENSGT00940000157749 ENSGT00910000144505 ENSGT00390000007153.a.a.a ENSGT00940000160263 ENSGT00940000155290.C ENSGT00390000008802.a.a ENSGT00440000033872 ENSGT00940000160028 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000154662.d ENSGT00940000159261.d.b ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.b ENSGT00390000007195 ENSGT00900000141071.b ENSGT00940000166020 ENSGT00940000156090.a ENSGT00390000007354 #30 ENSGT00390000005869.b ENSGT00940000175463 ENSGT00390000003255 ENSGT00950000183112.b.a.b ENSGT01090000260661 ENSGT00940000162653 ENSGT00940000157902 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 83 ENSGT00940000157072.a ENSGT00530000066485 ENSGT00510000047669 ENSGT00940000156303 ENSGT00940000157646 ENSGT00940000153731.a.a.h ENSGT00950000183129.b.a ENSGT00940000157749.a ENSGT00390000007153.a.a.a.c.b ENSGT00390000007153.a.a.a.d ENSGT00940000160263.h ENSGT00940000155290.C.x ENSGT00390000008802.a.a ENSGT00440000033872.d ENSGT00940000160028 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00900000141071.a.a ENSGT01000000214630 ENSGT00940000156090.a ENSGT00390000018729.a.e.h #33 ENSGT00940000158784.v #34 ENSGT01030000234623.a.b.a.f ENSGT00940000155227.a ENSGT00940000156640 ENSGT00940000156354.m ENSGT00510000046704.b.a.e ENSGT00390000003122.a ENSGT00940000158176 ENSGT00940000158270 ENSGT00990000203589.b.b.d ENSGT00940000157310.j P. kingsleyae MODERN SPECIES 2 ENSPKIG00000016000 MOCS2 (ENSPKIG00000016063) ITGA2 (ENSPKIG00000016088) ITGA1 (ENSPKIG00000016168) ENSPKIG00000016360 ENSPKIG00000016369 isl1a (ENSPKIG00000016392) parp8 (ENSPKIG00000016486) ENSPKIG00000016635 ENSPKIG00000016705 mtmr12 (ENSPKIG00000016715) ZFR (ENSPKIG00000016781) sub1b (ENSPKIG00000016923) npr3 (ENSPKIG00000016941) ENSPKIG00000016979 pias2 (ENSPKIG00000017057) #22 vcp (ENSPKIG00000017173) hwa (ENSPKIG00000017253) ENSPKIG00000017266 dnajb5 (ENSPKIG00000017272) ENSPKIG00000017306 #33 SETBP1 (ENSPKIG00000017335) #34 serinc5 (ENSPKIG00000017366) thbs4b (ENSPKIG00000017424) tent2 (ENSPKIG00000017504) homer1b (ENSPKIG00000017568) JMY (ENSPKIG00000017638) bhmt (ENSPKIG00000017692) DMGDH (ENSPKIG00000017764) ARSB (ENSPKIG00000017800) lhfpl2a (ENSPKIG00000017855) Asian bonytongue MODERN SPECIES 21 fstb (ENSSFOG00015017792) ENSSFOG00015017776 MOCS2 (ENSSFOG00015030071) ITGA2 (ENSSFOG00015017736) ENSSFOG00015028008 ITGA1 (ENSSFOG00015017615) isl1a (ENSSFOG00015017541) parp8 (ENSSFOG00015017441) ENSSFOG00015017401 golph3a (ENSSFOG00015024847) mtmr12 (ENSSFOG00015017341) ZFR (ENSSFOG00015017300) sub1b (ENSSFOG00015031985) npr3 (ENSSFOG00015017270) ENSSFOG00015026815 pias2 (ENSSFOG00015017181) #22 vcp (ENSSFOG00015017111) hwa (ENSSFOG00015025358) dnajb5 (ENSSFOG00015017075) SETBP1 (ENSSFOG00015017063) #34 serinc5 (ENSSFOG00015017025) thbs4b (ENSSFOG00015016974) tent2 (ENSSFOG00015016954) homer1b (ENSSFOG00015016907) JMY (ENSSFOG00015016891) bhmt (ENSSFOG00015016840) DMGDH (ENSSFOG00015016787) ARSB (ENSSFOG00015016765) lhfpl2a (ENSSFOG00015031014) SCAMP1 (ENSSFOG00015016716) AP3B1 (ENSSFOG00015016624) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 169 ENSGT00940000153731.a.a ENSGT00940000154578.B ENSGT00950000183129.b.a ENSGT00940000157749 ENSGT00910000144505 ENSGT00390000007153.a.a.a ENSGT00940000160263 ENSGT00940000155290.C ENSGT00390000008802.a.a ENSGT00440000033872 ENSGT00940000160028 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00390000007195 ENSGT00900000141071.b ENSGT00940000166020 ENSGT00940000156090.a ENSGT00390000007354 #30 ENSGT00390000005869.b ENSGT00940000175463 ENSGT00390000003255 ENSGT00950000183112.b.a.b ENSGT01090000260661 ENSGT00940000162653 ENSGT00940000157902 ENSGT00390000018729.a.e #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000155179 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000157724.b ENSGT00940000161247 ENSGT00940000156244.a.a ENSGT00390000013835 ENSGT00940000157072.b ENSGT00940000153731.a.a ENSGT00940000154578.B ENSGT00950000183129.b.a ENSGT00940000157749 ENSGT00390000007153.a.a.a ENSGT00940000160263 ENSGT00940000155290.C ENSGT00390000008802.a.a ENSGT00440000033872 ENSGT00940000160028 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00390000007195 ENSGT00900000141071.b ENSGT00940000166020 ENSGT00940000156090.a ENSGT00390000007354 #30 ENSGT00390000005869.b ENSGT00390000003255 ENSGT00950000183112.b.a.b ENSGT01090000260661 ENSGT00940000162653 ENSGT00940000157902 ENSGT00390000018729.a.e #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000155179 ENSGT01030000234623.a.b.a Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 269 ENSGT00940000155776.b ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000154662.d ENSGT00390000007195 ENSGT00900000141071.b ENSGT00940000166020 ENSGT00940000156090.a ENSGT00390000007354 #30 ENSGT00390000005869.b ENSGT00390000003255 ENSGT00950000183112.b.a.b ENSGT00940000162653 ENSGT00940000157902 ENSGT00390000018729.a.e #33 ENSGT00940000158784 #34 ENSGT00940000155179 ENSGT01030000234623.a.b.a Denticle herring MODERN SPECIES 2 COX5B (ENSDCDG00000004410) EP400 (ENSDCDG00000004432) ELMOD3 (ENSDCDG00000004775) AEBP1 (ENSDCDG00000004803) POLR3D (ENSDCDG00000004822) mak16 (ENSDCDG00000004830) ENSDCDG00000004833 ENSDCDG00000004842 ENSDCDG00000004853 hsd17b1 (ENSDCDG00000004867) SLC18A1 (ENSDCDG00000004897) RIMBP2 (ENSDCDG00000004936) ADGRD1 (ENSDCDG00000004978) ENSDCDG00000005244 RICTOR (ENSDCDG00000005281) pias2 (ENSDCDG00000005411) #22 EEF2 (ENSDCDG00000007631) fancg (ENSDCDG00000010927) vcp (ENSDCDG00000011128) dnajb5 (ENSDCDG00000013801) epg5 (ENSDCDG00000014020) #30 lix1 (ENSDCDG00000016542) riok2 (ENSDCDG00000016556) rgmb (ENSDCDG00000016577) erap2 (ENSDCDG00000016630) lnpep (ENSDCDG00000016984) slc14a2 (ENSDCDG00000017377) #33 SETBP1 (ENSDCDG00000017976) #34 cdk7 (ENSDCDG00000018040) serinc5 (ENSDCDG00000018088) thbs4a (ENSDCDG00000018205) Atlantic herring MODERN SPECIES 23 UNC5C (ENSCHAG00000008751) bmpr1ba (ENSCHAG00000012209) pdlim5a (ENSCHAG00000012627) opn4xb (ENSCHAG00000012656) EGFLAM (ENSCHAG00000012688) GDNF (ENSCHAG00000013121) nipbla (ENSCHAG00000013147) slc1a3a (ENSCHAG00000013333) lmbrd2a (ENSCHAG00000013430) UGT3A2 (ENSCHAG00000014471) spef2 (ENSCHAG00000014510) lifra (ENSCHAG00000014794) ENSCHAG00000015001 RICTOR (ENSCHAG00000015143) ENSCHAG00000017160 pias2 (ENSCHAG00000017215) #22 EEF2 (ENSCHAG00000018904) fancg (ENSCHAG00000019588) vcp (ENSCHAG00000019611) akr1a1a (ENSCHAG00000020098) dnajb5 (ENSCHAG00000020223) epg5 (ENSCHAG00000020254) #30 lix1 (ENSCHAG00000021068) riok2 (ENSCHAG00000021077) ENSCHAG00000021186 ENSCHAG00000021202 slc14a2 (ENSCHAG00000021211) #33 SETBP1 (ENSCHAG00000021253) #34 mtx3 (ENSCHAG00000021271) thbs4a (ENSCHAG00000021328) serinc5 (ENSCHAG00000023325) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 78 ENSGT00940000157724.b ENSGT00940000161247 ENSGT00940000156244.a.a 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ENSGT00900000141071.b ENSGT00940000166020 ENSGT00940000156090.a ENSGT00390000007354 #30 ENSGT00390000003255 Channel catfish MODERN SPECIES 14 Snx18 (ENSIPUG00000008781) hspb3 (ENSIPUG00000008774) arl15 (ENSIPUG00000008726) ndufs4 (ENSIPUG00000008708) fsta (ENSIPUG00000008682) isl1 (ENSIPUG00000008663) si:dkey-3h3.3 (ENSIPUG00000008643) parp8 (ENSIPUG00000008453) pdzd2 (ENSIPUG00000008305) golph3 (ENSIPUG00000008286) mtmr12 (ENSIPUG00000008256) zfr (ENSIPUG00000008192) sub1 (ENSIPUG00000008166) npr3 (ENSIPUG00000008136) arid3a (ENSIPUG00000008074) PIAS2 (ENSIPUG00000007997) #22 EEF2 (ENSIPUG00000007921) fancg (ENSIPUG00000007884) vcp (ENSIPUG00000007814) DNAJB5 (ENSIPUG00000007791) epg5 (ENSIPUG00000007541) #30 riok2 (ENSIPUG00000007450) rab14 (ENSIPUG00000007415) gsnb (ENSIPUG00000007354) ttf1 (ENSIPUG00000007333) ENSIPUG00000007318 camk2b1 (ENSIPUG00000007027) si:dkey-174n20.1 (ENSIPUG00000006997) ENSIPUG00000006932 pik3ip1 (ENSIPUG00000006910) Limk2 (ENSIPUG00000006810) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000157724.b ENSGT00940000161247 ENSGT00940000156244.a.a ENSGT00390000013835 ENSGT00940000157072.b ENSGT00940000153731.a.a ENSGT00940000154578.B ENSGT00950000183129.b.a ENSGT00940000157749 ENSGT00390000007153.a.a.a ENSGT00940000160263 ENSGT00940000155290.C ENSGT00390000008802.a.a ENSGT00440000033872 ENSGT00940000160028 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00390000007195 ENSGT00900000141071.b ENSGT00940000166020 ENSGT00940000156090.a ENSGT00390000007354 #30 ENSGT00390000003255 ENSGT00940000156812 ENSGT00940000154089.b ENSGT00940000156240 ENSGT00940000164635 ENSGT00390000003209 ENSGT00940000164527.a ENSGT00390000001777 ENSGT00940000155101.d ENSGT00940000156428 Electric eel MODERN SPECIES 20 snx18a (ENSEEEG00000000186) hspb3 (ENSEEEG00000000180) arl15a (ENSEEEG00000000173) ndufs4 (ENSEEEG00000000166) fsta (ENSEEEG00000000138) isl1a (ENSEEEG00000000110) si:dkey-3h3.3 (ENSEEEG00000000067) parp8 (ENSEEEG00000022873) ENSEEEG00000022867 golph3a (ENSEEEG00000022866) mtmr12 (ENSEEEG00000022864) zfr (ENSEEEG00000022852) sub1b (ENSEEEG00000022843) npr3 (ENSEEEG00000022824) arid3c (ENSEEEG00000022821) pias2 (ENSEEEG00000022819) #22 EEF2 (ENSEEEG00000022407) fancg (ENSEEEG00000022348) vcp (ENSEEEG00000022178) ENSEEEG00000022158 dnajb5 (ENSEEEG00000022155) epg5 (ENSEEEG00000022104) #30 riok2 (ENSEEEG00000022089) atxn2 (ENSEEEG00000022082) mapkapk5 (ENSEEEG00000022058) aldh2.2 (ENSEEEG00000021913) ENSEEEG00000021902 tmem116 (ENSEEEG00000021901) zgc:153044 (ENSEEEG00000021900) MN1 (ENSEEEG00000021899) PITPNB (ENSEEEG00000021896) Characoidei ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000157724.b ENSGT00940000161247 ENSGT00940000156244.a.a ENSGT00390000013835 ENSGT00940000157072.b ENSGT00940000153731.a.a ENSGT00940000154578.B ENSGT00950000183129.b.a ENSGT00940000157749 ENSGT00390000007153.a.a.a ENSGT00940000160263 ENSGT00940000155290.C ENSGT00390000008802.a.a ENSGT00440000033872 ENSGT00940000160028 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 266 arl15a (ENSPNAG00000025599) ndufs4 (ENSPNAG00000025577) fsta (ENSPNAG00000025539) isl1a (ENSPNAG00000025512) si:dkey-3h3.3 (ENSPNAG00000005470) parp8 (ENSPNAG00000025464) ENSPNAG00000005150 golph3a (ENSPNAG00000003890) mtmr12 (ENSPNAG00000004826) zfr (ENSPNAG00000025151) sub1b (ENSPNAG00000005998) npr3 (ENSPNAG00000003857) arid3c (ENSPNAG00000024948) pias2 (ENSPNAG00000024833) #22 Mexicana tetra MODERN SPECIES 28 snx18a (ENSAMXG00000019680) hspb3 (ENSAMXG00000024932) arl15a (ENSAMXG00000019670) ndufs4 (ENSAMXG00000019660) fsta (ENSAMXG00000031165) isl1a (ENSAMXG00000032758) si:dkey-3h3.3 (ENSAMXG00000036640) parp8 (ENSAMXG00000019624) ENSAMXG00000019594 golph3a (ENSAMXG00000018844) mtmr12 (ENSAMXG00000034750) zfr (ENSAMXG00000019511) sub1b (ENSAMXG00000037104) npr3 (ENSAMXG00000019445) arid3c (ENSAMXG00000019435) pias2 (ENSAMXG00000002435) #22 MN1 (ENSAMXG00000013235) PITPNB (ENSAMXG00000030401) ENSAMXG00000034576 TTC28 (ENSAMXG00000013238) ENSAMXG00000040861 ENSAMXG00000041958 ENSAMXG00000039595 ENSAMXG00000035142 ENSAMXG00000037751 ostf1 (ENSAMXG00000035744) ENSAMXG00000029122 me2 (ENSAMXG00000041378) elac1 (ENSAMXG00000043092) ENSAMXG00000042514 SMAD4 (ENSAMXG00000003756) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 115 ENSGT00940000157724.b ENSGT00940000161247 ENSGT00940000156244.a.a ENSGT00390000013835 ENSGT00940000157072.b ENSGT00940000153731.a.a ENSGT00940000154578.B ENSGT00950000183129.b.a ENSGT00940000157749 ENSGT00390000007153.a.a.a ENSGT00940000160263 ENSGT00940000155290.C ENSGT00390000008802.a.a ENSGT00440000033872 ENSGT00940000160028 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00390000007195 ENSGT00900000141071.b ENSGT00940000166020 ENSGT00940000156090.a ENSGT00390000007354 #30 ENSGT00390000003255.l ENSGT00940000156812 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157724.b.c ENSGT00940000161247.b ENSGT00940000156244.a.a.b ENSGT00390000013835.r ENSGT00940000157072.b.c ENSGT00940000153731.a.a.j ENSGT00940000154578.B.b ENSGT00950000183129.b.a.b ENSGT00940000157749.c ENSGT00390000007153.a.a.a.x ENSGT00940000160263.i ENSGT00940000155290.C.z ENSGT00390000008802.a.a.a ENSGT00440000033872.e ENSGT00940000160028.b ENSGT01030000234539.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000154662.d.t.a ENSGT00390000007195.e ENSGT00900000141071.b.e ENSGT00940000166020.a ENSGT00940000156090.a.a.a ENSGT00390000007354.c #30 ENSGT00390000003255.l.b ENSGT00940000175463 ENSGT00390000003255.k ENSGT00940000156812.c ENSGT00390000013370.e ENSGT00390000002172.B.j ENSGT00940000159009.h ENSGT00940000155093.b.jb ENSGT00390000018434.b.b Goldfish MODERN SPECIES 44 snx18a (ENSCARG00000042176) hspb3 (ENSCARG00000042227) arl15a (ENSCARG00000042233) ndufs4 (ENSCARG00000042254) fsta (ENSCARG00000042302) isl1a (ENSCARG00000042344) si:dkey-3h3.3 (ENSCARG00000042364) parp8 (ENSCARG00000042429) ENSCARG00000042813 golph3a (ENSCARG00000042854) mtmr12 (ENSCARG00000042913) zfr (ENSCARG00000043125) sub1b (ENSCARG00000044211) npr3 (ENSCARG00000044225) arid3c (ENSCARG00000044397) pias2 (ENSCARG00000044481) #22 EEF2 (ENSCARG00000044543) fancg (ENSCARG00000044567) vcp (ENSCARG00000044756) akr1a1a (ENSCARG00000044833) dnajb5 (ENSCARG00000045049) epg5 (ENSCARG00000045133) #30 ENSCARG00000045916 ENSCARG00000045943 atxn2 (ENSCARG00000046031) ENSCARG00000046299 bcl7a (ENSCARG00000046345) alkbh2 (ENSCARG00000046391) ncor1 (ENSCARG00000046748) pigl (ENSCARG00000055483) ubb (ENSCARG00000055534) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157724.b.c ENSGT00940000161247.b ENSGT00940000156244.a.a.b ENSGT00390000013835.r ENSGT00940000157072.b.c ENSGT00940000153731.a.a.j ENSGT00940000154578.B.b ENSGT00950000183129.b.a.b ENSGT00940000157749.c ENSGT00390000007153.a.a.a.x ENSGT00940000160263.i ENSGT00940000155290.C.z ENSGT00390000008802.a.a.a ENSGT00440000033872.e ENSGT00940000160028.b ENSGT01030000234539.a.a.b.b.a #22 ENSGT00940000154662.d.t.a ENSGT00390000007195.e ENSGT00900000141071.b.e ENSGT00940000166020.a ENSGT00940000156090.a.a.a ENSGT00390000007354.c #30 ENSGT00390000003255.l.b ENSGT00940000156812.c ENSGT00390000013370.e ENSGT00390000002172.B.j ENSGT00940000159009.h ENSGT00940000155093.b.jb ENSGT00390000018434.a ENSGT00390000003183.z ENSGT00940000162439 Golden-line barbel MODERN SPECIES 316 hspb3 (ENSSGRG00000028511) arl15a (ENSSGRG00000028510) ndufs4 (ENSSGRG00000028509) fsta (ENSSGRG00000028482) isl1a (ENSSGRG00000028480) si:dkey-3h3.3 (ENSSGRG00000028479) ENSSGRG00000028478 parp8 (ENSSGRG00000027482) ENSSGRG00000027452 golph3a (ENSSGRG00000027451) mtmr12 (ENSSGRG00000027450) zfr (ENSSGRG00000026818) sub1b (ENSSGRG00000026788) npr3 (ENSSGRG00000026766) arid3c (ENSSGRG00000026762) pias2 (ENSSGRG00000026690) #22 EEF2 (ENSSGRG00000024971) fancg (ENSSGRG00000024929) vcp (ENSSGRG00000024843) akr1a1a (ENSSGRG00000024839) akr1a1a (ENSSGRG00000024825) dnajb5 (ENSSGRG00000024822) ENSSGRG00000024821 epg5 (ENSSGRG00000024727) #30 Common carp reference MODERN SPECIES 7 arl15a (ENSCCRG00000064325) ndufs4 (ENSCCRG00000039827) fsta 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ENSGT00390000007153.a.a.a.w ENSGT00940000160263.j ENSGT00940000155290.C.y ENSGT00390000008802.a.a.b ENSGT00440000033872.f ENSGT00940000160028.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b.b #22 ENSGT00940000154662.d.t.b ENSGT00390000007195.f ENSGT00900000141071.b.f ENSGT00940000156090.a.a.b ENSGT00390000007354.d #30 ENSGT00390000003255.l.a ENSGT00940000156812.d ENSGT00390000013370.f ENSGT00940000159009.g ENSGT00950000183155.a.b.a.b ENSGT00940000155093.b.kb ENSGT00390000018434.b.a ENSGT00390000003183 ENSGT00940000157820.a.b ENSGT01020000230351.E.d.b Goldfish MODERN SPECIES 23 snx18a (ENSCARG00000069246) hspb3 (ENSCARG00000069252) arl15a (ENSCARG00000069255) ndufs4 (ENSCARG00000069257) fsta (ENSCARG00000069267) isl1a (ENSCARG00000069278) si:dkey-3h3.3 (ENSCARG00000069281) parp8 (ENSCARG00000069319) ENSCARG00000069469 golph3a (ENSCARG00000069483) mtmr12 (ENSCARG00000069490) zfr (ENSCARG00000069515) sub1b (ENSCARG00000069564) npr3 (ENSCARG00000069567) arid3c (ENSCARG00000069580) pias2 (ENSCARG00000069598) 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ENSGT00390000003917.j Golden-line barbel MODERN SPECIES 452 si:dkey-3h3.3 (ENSSGRG00000053695) si:dkey-3h3.3 (ENSSGRG00000053693) parp8 (ENSSGRG00000053578) ENSSGRG00000053559 ENSSGRG00000053557 golph3a (ENSSGRG00000053555) mtmr12 (ENSSGRG00000053554) zfr (ENSSGRG00000053399) sub1b (ENSSGRG00000053396) npr3 (ENSSGRG00000053395) arid3c (ENSSGRG00000053391) pias2 (ENSSGRG00000053356) #22 EEF2 (ENSSGRG00000053283) fancg (ENSSGRG00000053263) fancg (ENSSGRG00000053262) vcp (ENSSGRG00000053148) ENSSGRG00000053140 akr1a1a (ENSSGRG00000053137) ENSSGRG00000053136 epg5 (ENSSGRG00000053064) #30 atxn2 (ENSSGRG00000052985) ENSSGRG00000052984 bcl7a (ENSSGRG00000052982) alkbh2 (ENSSGRG00000052981) ENSSGRG00000052980 ncor1 (ENSSGRG00000052709) pigl (ENSSGRG00000052685) Common carp reference MODERN SPECIES 15 snx18a (ENSCCRG00000060082) hspb3 (ENSCCRG00000036152) arl15a (ENSCCRG00000055046) ndufs4 (ENSCCRG00000065799) fsta (ENSCCRG00000036960) isl1a (ENSCCRG00000025874) si:dkey-3h3.3 (ENSCCRG00000010773) parp8 (ENSCCRG00000079113) ENSCCRG00000017026 golph3a (ENSCCRG00000072296) mtmr12 (ENSCCRG00000023838) zfr (ENSCCRG00000015687) sub1b (ENSCCRG00000015592) npr3 (ENSCCRG00000018998) arid3c (ENSCCRG00000072347) pias2 (ENSCCRG00000066280) #22 ENSCCRG00000055671 fancg (ENSCCRG00000005759) vcp (ENSCCRG00000066539) ENSCCRG00000077162 dnajb5 (ENSCCRG00000048206) epg5 (ENSCCRG00000046846) #30 riok2 (ENSCCRG00000038700) atxn2 (ENSCCRG00000038646) ENSCCRG00000038602 alkbh2 (ENSCCRG00000064649) ENSCCRG00000038589 ncor1 (ENSCCRG00000030840) pigl (ENSCCRG00000007765) ENSCCRG00000061316 p2rx5 (ENSCCRG00000007738) Zebrafish MODERN SPECIES 20 arl15a (ENSDARG00000076040) hspb3 (ENSDARG00000067714) ENSDARG00000113635 ndufs4 (ENSDARG00000052840) fsta (ENSDARG00000052846) isl1a (ENSDARG00000004023) si:dkey-3h3.3 (ENSDARG00000067718) parp8 (ENSDARG00000059789) ENSDARG00000059801 golph3a (ENSDARG00000052851) mtmr12 (ENSDARG00000059817) zfr (ENSDARG00000027109) sub1b (ENSDARG00000007720) npr3 (ENSDARG00000035253) arid3c (ENSDARG00000067729) pias2 (ENSDARG00000092979) #22 EEF2 (ENSDARG00000035256) fancg (ENSDARG00000024967) vcp (ENSDARG00000020008) akr1a1a (ENSDARG00000035257) dnajb5 (ENSDARG00000052881) epg5 (ENSDARG00000059846) #30 riok2 (ENSDARG00000035264) atxn2 (ENSDARG00000052897) ENSDARG00000059855 bcl7a (ENSDARG00000052907) alkbh2 (ENSDARG00000059856) ENSDARG00000076830 ENSDARG00000094458 ENSDARG00000092311 ncor1 (ENSDARG00000035285) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 243 ENSGT00940000157072.b.a.b ENSGT00940000153731.a.a ENSGT00940000154578.B ENSGT00950000183129.b.a ENSGT00940000157749 ENSGT00910000144505 ENSGT00390000007153.a.a.a ENSGT00940000160263 ENSGT00940000155290.C ENSGT00390000008802.a.a ENSGT00440000033872 ENSGT00940000160028 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000158884 ENSGT00740000116886 ENSGT00940000156516 ENSGT00990000204357 ENSGT00940000160018 ENSGT00390000002575 ENSGT00940000153654 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 97 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ENSSSAG00000108845 pias2 (ENSSSAG00000045074) #22 ENSSSAG00000045387 ENSSSAG00000045063 ENSSSAG00000109028 ENSSSAG00000044999 ENSSSAG00000044988 ENSSSAG00000103704 psat1 (ENSSSAG00000044965) ppil2 (ENSSSAG00000044893) ENSSSAG00000111503 ENSSSAG00000094263 ENSSSAG00000088976 ENSSSAG00000084314 mapk1 (ENSSSAG00000043206) ENSSSAG00000043329 ENSSSAG00000043598 River trout MODERN SPECIES 39 snx18a (ENSSTUG00000010463) arl15a (ENSSTUG00000001092) ENSSTUG00000001096 ndufs4 (ENSSTUG00000001097) fsta (ENSSTUG00000001106) isl1a (ENSSTUG00000001151) si:dkey-3h3.3 (ENSSTUG00000001158) parp8 (ENSSTUG00000001272) ENSSTUG00000002497 golph3a (ENSSTUG00000002511) zfr (ENSSTUG00000002552) ENSSTUG00000003092 ENSSTUG00000003102 npr3 (ENSSTUG00000003112) arid3c (ENSSTUG00000003139) pias2 (ENSSTUG00000003169) #22 ENSSTUG00000003203 EEF2 (ENSSTUG00000003231) bmp3 (ENSSTUG00000004276) ENSSTUG00000004344 isca1 (ENSSTUG00000006103) ENSSTUG00000006111 psat1 (ENSSTUG00000006121) ppil2 (ENSSTUG00000006198) ENSSTUG00000007808 ENSSTUG00000007817 ENSSTUG00000007822 ENSSTUG00000007864 ENSSTUG00000007880 rufy3 (ENSSTUG00000007899) ENSSTUG00000008502 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000157724.b.b.a ENSGT00940000156244.a.a ENSGT00390000013835 ENSGT00940000157072.b.a.a.a.b ENSGT01070000254526.a ENSGT00940000153731.a.a.k.a ENSGT00940000154578.B ENSGT00950000183129.b.a.d ENSGT00940000157749.w.b ENSGT00910000144505.a ENSGT00390000007153.a.a.a.o.b ENSGT00940000155290.C.fb.b.b ENSGT00390000008802.a.b ENSGT00440000033872.t.a ENSGT00940000160028.c ENSGT01030000234539.a.a.b.b.c #22 ENSGT00940000154662.d.m ENSGT00940000159775.j ENSGT00940000156859.dc.b ENSGT00490000043385.qc ENSGT00940000153241.A ENSGT00940000153189.A ENSGT00940000156035.z ENSGT00940000165677 ENSGT00940000155949.k ENSGT00420000029943 ENSGT00940000157861 ENSGT00390000001195.a.a ENSGT00940000153424.a.b ENSGT00390000015513.a.b.a ENSGT00940000154886.b.a.a Rainbow trout MODERN SPECIES 2 parp8 (ENSOMYG00000033894) ENSOMYG00000059275 ENSOMYG00000033870 ENSOMYG00000054927 ENSOMYG00000059176 golph3a (ENSOMYG00000027717) ENSOMYG00000061373 ENSOMYG00000057733 zfr (ENSOMYG00000034081) ENSOMYG00000055951 ENSOMYG00000033918 npr3 (ENSOMYG00000035643) ENSOMYG00000075869 ENSOMYG00000075728 ENSOMYG00000074534 pias2 (ENSOMYG00000003682) #22 ENSOMYG00000003725 ENSOMYG00000003560 ENSOMYG00000003514 ENSOMYG00000057736 ENSOMYG00000003457 psat1 (ENSOMYG00000003398) ENSOMYG00000065873 ENSOMYG00000062187 ENSOMYG00000074484 ENSOMYG00000061699 ENSOMYG00000039494 ENSOMYG00000003286 ENSOMYG00000003261 ENSOMYG00000003238 ENSOMYG00000003186 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 72 ENSGT00940000154091.a.a.s.a.d ENSGT00940000157724.b.b.a ENSGT00940000156244.a.a ENSGT00390000013835 ENSGT00940000157072.b.a.a.a.b ENSGT00940000153731.a.a.k.a ENSGT00940000154578.B ENSGT00950000183129.b.a.d ENSGT00940000157749.w.b ENSGT00910000144505.a ENSGT00390000007153.a.a.a.o.b ENSGT00940000155290.C.fb.b.b ENSGT00390000008802.a.b ENSGT00440000033872.t.a ENSGT00940000160028.c ENSGT01030000234539.a.a.b.b.c #22 ENSGT00940000154662.d.m ENSGT00940000159775.j ENSGT00940000156859.dc.b ENSGT00490000043385.qc ENSGT00940000153241.A ENSGT00940000153189.A ENSGT00940000156035.z ENSGT00940000165677 ENSGT00940000155949.k ENSGT00420000029943 ENSGT00940000157861 ENSGT00390000001195.a.a ENSGT00940000153424.a.b ENSGT00390000015513.a.b.a ENSGT00940000154886.b.a.a Coho salmon MODERN SPECIES 28 ENSOKIG00005031235 si:dkey-3h3.3 (ENSOKIG00005031222) ENSOKIG00005031216 parp8 (ENSOKIG00005030593) ENSOKIG00005030459 ENSOKIG00005030440 ENSOKIG00005014698 ENSOKIG00005014687 golph3a (ENSOKIG00005014672) zfr (ENSOKIG00005014315) SUB1 (ENSOKIG00005014285) ENSOKIG00005014265 npr3 (ENSOKIG00005014251) ENSOKIG00005014242 arid3c (ENSOKIG00005014231) pias2 (ENSOKIG00005014159) #22 EEF2 (ENSOKIG00005013988) ENSOKIG00005013956 ENSOKIG00005013954 BMP3 (ENSOKIG00005013950) TUT7 (ENSOKIG00005012525) ISCA1 (ENSOKIG00005012439) psat1 (ENSOKIG00005012421) ppil2 (ENSOKIG00005012413) ENSOKIG00005012408 ENSOKIG00005012402 ENSOKIG00005012354 ENSOKIG00005012338 rufy3 (ENSOKIG00005011897) ENSOKIG00005011830 ENSOKIG00005011814 Chinook salmon MODERN SPECIES 776 SLC6A19 (ENSOTSG00005017499) ENSOTSG00005017484 ENSOTSG00005017477 pias2 (ENSOTSG00005017454) #22 EEF2 (ENSOTSG00005017450) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 2218 ENSGT00940000160028.d ENSGT01030000234539.a.a.b.b.d #22 Huchen MODERN SPECIES 6213 ENSHHUG00000019130 #22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 476 ENSGT00440000033872.s ENSGT00940000160028.d ENSGT01030000234539.a.a.b.b.d #22 Salmo ANCESTRAL SPECIES 229 ENSGT00940000156290.a ENSGT00940000156282.a.a.f ENSGT00940000160420.g ENSGT00940000156489 ENSGT00390000015513.a.a.b ENSGT00940000154969.b.b ENSGT00940000156035.y.b.a ENSGT00940000156771.i ENSGT00940000159010.e.b ENSGT00940000153710.a ENSGT01030000234519.e.a.a.a.b.f.e ENSGT01030000234539.a.a.b.b.d #22 River trout MODERN SPECIES 19 dmrt1 (ENSSTUG00000014046) FBP2 (ENSSTUG00000014023) tars1 (ENSSTUG00000013369) ENSSTUG00000013265 ENSSTUG00000013259 rufy3 (ENSSTUG00000013218) mapk1 (ENSSTUG00000013149) ENSSTUG00000013132 stambpb (ENSSTUG00000013100) ENSSTUG00000013095 ENSSTUG00000013082 ENSSTUG00000011956 ENSSTUG00000011853 ENSSTUG00000011850 pias2 (ENSSTUG00000011825) #22 mtmr12 (ENSSTUG00000011781) ENSSTUG00000011761 ENSSTUG00000011707 mtmr12 (ENSSTUG00000011694) zfr (ENSSTUG00000010030) ENSSTUG00000009940 npr3 (ENSSTUG00000009840) arid3c (ENSSTUG00000009790) isca1 (ENSSTUG00000009778) ENSSTUG00000009746 bmp3 (ENSSTUG00000009732) cfap299 (ENSSTUG00000009726) golph3a (ENSSTUG00000009711) ENSSTUG00000009708 ENSSTUG00000009698 Atlantic salmon MODERN SPECIES 16 dmrt3a (ENSSSAG00000111724) dmrt1 (ENSSSAG00000087484) ENSSSAG00000087799 fbp2 (ENSSSAG00000063352) ENSSSAG00000063393 ENSSSAG00000115084 ENSSSAG00000104793 ENSSSAG00000110445 ENSSSAG00000063288 ENSSSAG00000099967 ENSSSAG00000083315 ENSSSAG00000121874 ENSSSAG00000064811 ENSSSAG00000063273 ENSSSAG00000107782 ENSSSAG00000063251 #22 ENSSSAG00000063261 ENSSSAG00000094406 ENSSSAG00000063191 ENSSSAG00000119443 npr3 (ENSSSAG00000083188) ENSSSAG00000054500 ENSSSAG00000101075 zfr (ENSSSAG00000057996) mtmr12 (ENSSSAG00000063174) golph3a (ENSSSAG00000088620) ENSSSAG00000103447 ENSSSAG00000102097 ENSSSAG00000087576 ENSSSAG00000111260 parp8 (ENSSSAG00000054252) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 77 ENSGT00940000155816.b.g.a ENSGT00940000158223.i ENSGT00940000154091.a.a.s.a.c ENSGT00940000157724.b.b.b ENSGT00940000161247 ENSGT00940000157072.b.a.b ENSGT00940000153731.a.a.k.b ENSGT00950000183129.b.a.c ENSGT00940000157749.w.a ENSGT00390000007153.a.a.a.o.a ENSGT00940000160263 ENSGT00940000155290.C.fb.a ENSGT00440000033872.t.b ENSGT00440000033872.s ENSGT00940000160028.d ENSGT01030000234539.a.a.b.b.d #22 ENSGT00940000166264 ENSGT00390000016547 ENSGT00940000159775.i Rainbow trout MODERN SPECIES 27 ENSOMYG00000072286 isl1a (ENSOMYG00000031729) parp8 (ENSOMYG00000031804) ENSOMYG00000065284 ENSOMYG00000069321 ENSOMYG00000062061 golph3a (ENSOMYG00000064681) ENSOMYG00000062956 mtmr12 (ENSOMYG00000031873) zfr (ENSOMYG00000031900) ENSOMYG00000056123 npr3 (ENSOMYG00000031590) ENSOMYG00000068176 ENSOMYG00000072757 ENSOMYG00000031544 ENSOMYG00000031492 #22 ENSOMYG00000003743 ENSOMYG00000075752 ENSOMYG00000032688 dmrt1 (ENSOMYG00000030875) dmrt3a (ENSOMYG00000054257) dmrt2a (ENSOMYG00000030848) ENSOMYG00000077300 slc4a4a (ENSOMYG00000029314) ENSOMYG00000074912 ENSOMYG00000031416 ENSOMYG00000030988 ENSOMYG00000031461 ENSOMYG00000066635 ENSOMYG00000050942 ENSOMYG00000057560 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 983 ENSGT01030000234539.a.a.b.b.d #22 ENSGT00940000166264 Chinook salmon MODERN SPECIES 28 KCMF1 (ENSOTSG00005008002) ENSOTSG00005008000 ENSOTSG00005007999 rasgef1ba (ENSOTSG00005007998) ENSOTSG00005007997 ENSOTSG00005007995 ENSOTSG00005007993 mrpl1 (ENSOTSG00005007992) golph3a (ENSOTSG00005007989) ENSOTSG00005007988 mtmr12 (ENSOTSG00005007987) zfr (ENSOTSG00005007986) ENSOTSG00005007985 arid3c (ENSOTSG00005007974) ENSOTSG00005007973 pias2 (ENSOTSG00005007972) #22 ENSOTSG00005007971 fbp2 (ENSOTSG00005007970) dmrt1 (ENSOTSG00005007969) dmrt3a (ENSOTSG00005007968) dmrt2a (ENSOTSG00005007967) slc4a4a (ENSOTSG00005004430) Northern pike MODERN SPECIES 12 ENSELUG00000032932 gpx8 (ENSELUG00000013928) CDC20B (ENSELUG00000025013) MCIDAS (ENSELUG00000013917) CCNO (ENSELUG00000013902) bmp2k (ENSELUG00000013888) paqr3a (ENSELUG00000013818) antxr2a (ENSELUG00000013774) prdm8b (ENSELUG00000013680) fgf5 (ENSELUG00000013670) anxa3 (ENSELUG00000013648) ENSELUG00000025556 mrpl1 (ENSELUG00000013391) cnot6l (ENSELUG00000013353) ENSELUG00000001269 pias2 (ENSELUG00000013232) #22 EEF2 (ENSELUG00000013203) ENSELUG00000013150 cfap299 (ENSELUG00000013164) bmp3 (ENSELUG00000013133) prkg2 (ENSELUG00000013125) ENSELUG00000013049 isca1 (ENSELUG00000012889) ENSELUG00000012840 psat1 (ENSELUG00000012823) ENSELUG00000012798 stambpb (ENSELUG00000012739) ppil2 (ENSELUG00000012512) ENSELUG00000011879 ENSELUG00000031321 mapk1 (ENSELUG00000011849) Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 276 ENSGT00940000155290.C ENSGT00390000008802.a.a ENSGT00440000033872 ENSGT00940000158884 ENSGT00740000116886 ENSGT00940000156516 ENSGT00990000204357 ENSGT00940000160018 ENSGT00390000002575 ENSGT00940000153654 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 Cod MODERN SPECIES 2 ENSGMOG00000012960 ENSGMOG00000030226 ENSGMOG00000000942 ENSGMOG00000009638 ENSGMOG00000015201 ENSGMOG00000001832 ENSGMOG00000002015 ENSGMOG00000019480 ppm1f (ENSGMOG00000023154) ENSGMOG00000016220 ENSGMOG00000035980 sdf2l1 (ENSGMOG00000001950) ydjc (ENSGMOG00000016209) ENSGMOG00000016194 ENSGMOG00000031696 ENSGMOG00000030007 #22 ENSGMOG00000023470 ENSGMOG00000011659 ENSGMOG00000013285 ENSGMOG00000003967 ENSGMOG00000020038 ENSGMOG00000025179 ENSGMOG00000017460 ENSGMOG00000030514 ENSGMOG00000036642 ENSGMOG00000027961 ENSGMOG00000023947 ENSGMOG00000017565 ENSGMOG00000017850 ENSGMOG00000035445 ENSGMOG00000029335 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 133 ENSGT00940000155290.C ENSGT00390000008802.a.a ENSGT00440000033872 ENSGT00950000183129.b.a ENSGT00940000154578.B ENSGT00940000153731.a.a ENSGT00940000166823 ENSGT00440000039046 ENSGT00390000015930 ENSGT00390000002575 ENSGT00940000153654 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 23 golph3a (ENSMMDG00005010152) sub1b (ENSMMDG00005010153) npr3 (ENSMMDG00005010154) ENSMMDG00005010159 ENSMMDG00005010162 zfr (ENSMMDG00005010185) ENSMMDG00005010406 parp8 (ENSMMDG00005010420) si:dkey-3h3.3 (ENSMMDG00005010551) isl1a (ENSMMDG00005010552) ENSMMDG00005010554 rad17 (ENSMMDG00005010556) zgc:86811 (ENSMMDG00005010564) ydjc (ENSMMDG00005010572) ube2l3b (ENSMMDG00005010575) pias2 (ENSMMDG00005010598) #22 EEF2 (ENSMMDG00005010610) arid3c (ENSMMDG00005010770) ENSMMDG00005010774 dctd (ENSMMDG00005010781) dctd (ENSMMDG00005010849) dctd (ENSMMDG00005010850) dctd (ENSMMDG00005010853) dctd (ENSMMDG00005010857) entpd2a.1 (ENSMMDG00005010860) nelfb (ENSMMDG00005010864) ENSMMDG00005010871 arrdc1a (ENSMMDG00005004160) ehmt1a (ENSMMDG00005004202) cacna1ba (ENSMMDG00005004588) man1b1b (ENSMMDG00005004610) Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 73 ENSGT00940000155290.C ENSGT00390000008802.a.a ENSGT00440000033872 ENSGT00940000154578.B ENSGT00940000153731.a.a ENSGT00940000166823 ENSGT00440000039046 ENSGT00390000015930 ENSGT00390000002575 ENSGT00940000153654.ve.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160028 ENSGT00940000156117.e.a ENSGT00390000017892 ENSGT00940000156820.a.a.f ENSGT00530000063335.B.a.b ENSGT00940000158634.a.d ENSGT00390000005811 ENSGT00940000155305.b.a ENSGT00940000154742.b ENSGT00940000159721.g ENSGT00510000048902.a.e ENSGT00390000012710.a.b ENSGT00530000063681.b.a ENSGT00390000012355.A.a.a.a ENSGT00940000165661 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 515 nr6a1a (ENSHCOG00000001676) olfml2a (ENSHCOG00000001668) ENSHCOG00000001661 rpl35 (ENSHCOG00000001654) golga1 (ENSHCOG00000001647) PPP6C (ENSHCOG00000001623) ENSHCOG00000001613 ENSHCOG00000001606 ENSHCOG00000001601 sh3glb2a (ENSHCOG00000001595) dph7 (ENSHCOG00000001585) mrpl41 (ENSHCOG00000001577) PNPLA7 (ENSHCOG00000001566) zfr (ENSHCOG00000001548) ankrd34bb (ENSHCOG00000001528) pias2 (ENSHCOG00000001514) #22 arid3c (ENSHCOG00000001493) ptar1 (ENSHCOG00000001485) ENSHCOG00000001480 ENSHCOG00000001473 ENSHCOG00000001466 fxn (ENSHCOG00000001463) ube2l3b (ENSHCOG00000000054) ydjc (ENSHCOG00000001453) zgc:86811 (ENSHCOG00000001449) rad17 (ENSHCOG00000001433) ENSHCOG00000001408 isl1a (ENSHCOG00000001403) ENSHCOG00000001396 ENSHCOG00000001376 ENSHCOG00000001349 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000012710.a.b.g.b ENSGT00940000155290.C ENSGT01030000234773 ENSGT00390000008802.a.a ENSGT00440000033872 ENSGT00940000157749 ENSGT00910000144505 ENSGT00390000007153.a.a.a ENSGT00940000154578.B ENSGT00940000153731.a.a ENSGT00940000166823 ENSGT00440000039046 ENSGT00390000015930 ENSGT00390000002575 ENSGT00940000153654.ve.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160028 ENSGT00940000156117.e.a ENSGT00390000017892 ENSGT00940000156820.a.a.f ENSGT00530000063335.B.a.b ENSGT00940000158634.a.d ENSGT00390000005811 ENSGT00940000155305.b.a ENSGT00940000154742.b ENSGT00940000159721.g ENSGT00510000048902.a.e ENSGT00390000012710.a.b.h ENSGT00390000000543 ENSGT00940000158560 ENSGT00940000161618 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000155290.C ENSGT01030000234773 ENSGT00390000008802.a.a ENSGT00440000033872 ENSGT00940000157749 ENSGT00390000007153.a.a.a ENSGT00940000154578.B ENSGT00940000153731.a.a ENSGT00940000166823 ENSGT00440000039046 ENSGT00390000015930 ENSGT00390000002575 ENSGT00940000153654.ve.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160028 ENSGT00940000156117.e.a ENSGT00390000017892 ENSGT00940000156820.a.a.f ENSGT00530000063335.B.a.b ENSGT00940000158634.a.d ENSGT00390000005811 ENSGT00940000155305.b.a ENSGT00940000154742.b ENSGT00940000159721.g ENSGT00510000048902.a.e ENSGT00390000012710.a.b.h Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000155290.C ENSGT01030000234773 ENSGT00390000008802.a.a ENSGT00440000033872 ENSGT00940000157749 ENSGT00390000007153.a.a.a ENSGT00940000154578.B ENSGT00940000153731.a.a ENSGT00940000166823 ENSGT00440000039046 ENSGT00390000015930 ENSGT00390000002575 ENSGT00940000153654.ve.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160028 ENSGT00940000156117.e.a ENSGT00390000017892 ENSGT00940000156820.a.a.f ENSGT00530000063335.B.a.b ENSGT00940000158634.a.d ENSGT00390000005811 ENSGT00940000155305.b.a ENSGT00940000154742.b ENSGT00940000159721.g ENSGT00510000048902.a.e Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00390000008802.a.a ENSGT00440000033872 ENSGT00940000157749 ENSGT00390000007153.a.a.a ENSGT00940000154578.B ENSGT00940000153731.a.a ENSGT00940000166823 ENSGT00440000039046 ENSGT00390000015930 ENSGT00390000002575 ENSGT00940000153654.ve.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160028 ENSGT00940000156117.e.a ENSGT00390000017892 ENSGT00940000156820.a.a.f ENSGT00530000063335.B.a.b ENSGT00940000158634.a.d ENSGT00390000005811 ENSGT00940000155305.b.a Zig-zag eel MODERN SPECIES 87 dhfr (ENSMAMG00000017483) ENSMAMG00000027737 fam151b (ENSMAMG00000017597) ENSMAMG00000017607 ENSMAMG00000017639 ENSMAMG00000017650 ENSMAMG00000017698 golph3a (ENSMAMG00000017735) ENSMAMG00000017756 isl1a (ENSMAMG00000017775) ccdc125 (ENSMAMG00000017808) ENSMAMG00000017821 AK6 (ENSMAMG00000025322) ENSMAMG00000017865 ENSMAMG00000017870 ENSMAMG00000024421 #22 ENSMAMG00000017909 ENSMAMG00000017927 ENSMAMG00000017941 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01060000248544.b ENSGT00940000155841.c.a ENSGT00940000155290.C ENSGT01050000246882 ENSGT00390000008802.a.a ENSGT00440000033872 ENSGT00940000157749 ENSGT00390000007153.a.a.a ENSGT00940000154578.B ENSGT00940000153731.a.a ENSGT00940000166823 ENSGT00440000039046 ENSGT00390000015930 ENSGT00390000002575 ENSGT00940000153654.ve.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160028 ENSGT00940000156117.e.a ENSGT00390000017892 ENSGT00940000156820.a.a.f ENSGT00530000063335.B.a.b ENSGT00940000158634.a.d ENSGT00390000005811 ENSGT00940000158560 ENSGT00940000161618 ENSGT00440000038604.j ENSGT00530000063681.b.a ENSGT00390000012355.A.a.a.a ENSGT00940000165661 ENSGT00490000043395 ENSGT00730000110989.c.b Climbing perch MODERN SPECIES 22 ENSATEG00000010251 ENSATEG00000010271 ENSATEG00000028598 ENSATEG00000025825 ENSATEG00000029605 NPR3 (ENSATEG00000010351) ENSATEG00000010387 GOLPH3 (ENSATEG00000010417) ENSATEG00000028382 ENSATEG00000010443 ccdc125 (ENSATEG00000010465) ENSATEG00000010493 zgc:86811 (ENSATEG00000010509) ENSATEG00000010526 ENSATEG00000027233 ENSATEG00000010570 #22 ENSATEG00000010618 mamdc2a (ENSATEG00000010656) ptar1 (ENSATEG00000027595) APBA1 (ENSATEG00000010723) ENTREP1 (ENSATEG00000010776) TJP2 (ENSATEG00000010798) FXN (ENSATEG00000027030) ENSATEG00000010912 ENSATEG00000011192 ENSATEG00000026853 ENSATEG00000011214 ENSATEG00000029581 gtf2h2 (ENSATEG00000011243) ENSATEG00000011304 marveld2b (ENSATEG00000011334) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 9 ENSBSLG00000024337 SH3GLB2 (ENSBSLG00000024138) zfr (ENSBSLG00000023503) ENSBSLG00000023431 sub1b (ENSBSLG00000023428) npr3 (ENSBSLG00000023421) ENSBSLG00000023418 golph3a (ENSBSLG00000023413) ENSBSLG00000023408 isl1a (ENSBSLG00000023404) ccdc125 (ENSBSLG00000023396) rad17 (ENSBSLG00000023383) zgc:86811 (ENSBSLG00000023380) ydjc (ENSBSLG00000023378) ube2l3b (ENSBSLG00000023373) pias2 (ENSBSLG00000023215) #22 ENSBSLG00000023187 arid3c (ENSBSLG00000023124) mamdc2a (ENSBSLG00000023096) ptar1 (ENSBSLG00000023079) APBA1 (ENSBSLG00000022972) ENSBSLG00000022952 ENSBSLG00000022945 tjp2b (ENSBSLG00000022502) ABCA2 (ENSBSLG00000022371) fxn (ENSBSLG00000022338) FUT7 (ENSBSLG00000021837) ENSBSLG00000021825 fam151b (ENSBSLG00000021752) ankrd34bb (ENSBSLG00000021729) dhfr (ENSBSLG00000021701) Carangaria ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000171469 ENSGT00940000155841.c.a ENSGT00940000155290.C ENSGT01030000234773 ENSGT00390000008802.a.a ENSGT00440000033872 ENSGT00940000157749 ENSGT00390000007153.a.a.a ENSGT00940000154578.B ENSGT00940000153731.a.a ENSGT00940000166823 ENSGT00440000039046 ENSGT00390000015930 ENSGT00390000002575 ENSGT00940000153654.ve.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160028 ENSGT00940000156117.e.a ENSGT00390000017892 ENSGT00940000156820.a.a.f ENSGT00530000063335.B.a.b ENSGT00940000158634.a.d ENSGT00390000005811 ENSGT00940000155305.b.a ENSGT00940000154742.b ENSGT00940000159721.g ENSGT00510000048902.a.e Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 69 ENSGT00940000155290.C ENSGT01030000234773 ENSGT00390000008802.a.a ENSGT00440000033872 ENSGT00940000157749 ENSGT00390000007153.a.a.a ENSGT00940000154578.B ENSGT00510000047669 ENSGT00530000066485 ENSGT00940000153731.a.a ENSGT00940000166823 ENSGT00440000039046 ENSGT00390000015930 ENSGT00390000002575 ENSGT00940000153654.ve.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160028 ENSGT00940000156117.e.a ENSGT00390000017892 ENSGT00940000156820.a.a.f ENSGT00530000063335.B.a.b ENSGT00390000005811 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(ENSLBEG00000009282) LRRTM4 (ENSLBEG00000009268) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000164721.a ENSGT00390000000459.c ENSGT01010000224027 ENSGT00940000159669.b ENSGT00390000008802.a.a ENSGT00440000033872 ENSGT00940000157749 ENSGT00390000007153.a.a.a ENSGT00940000154578.B ENSGT00940000153731.a.a ENSGT00940000166823 ENSGT00440000039046 ENSGT00390000015930 ENSGT00390000002575 ENSGT00940000153654.ve.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160028 ENSGT00940000156117.e.a ENSGT00390000017892 ENSGT00940000156820.a.a.f ENSGT00530000063335.B.a.b ENSGT00940000158634.a.d ENSGT00390000005811 ENSGT00940000155305.b.a ENSGT00940000154742.b ENSGT00940000159721.g ENSGT00510000048902.a.e ENSGT00390000012710.a.b.g.b ENSGT00390000012710.a.b.g.a Perciformes ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT01030000234773 ENSGT00940000166509 ENSGT00390000008802.a.a ENSGT00440000033872 ENSGT00940000157749 ENSGT00390000007153.a.a.a ENSGT00940000154578.B ENSGT00940000153731.a.a ENSGT00940000166823 ENSGT00440000039046 ENSGT00390000015930 ENSGT00390000002575 ENSGT00940000153654.ve.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160028 ENSGT00940000156117.e.a ENSGT00390000017892 ENSGT00940000156820.a.a.f ENSGT00530000063335.B.a.b ENSGT00940000158634.a.d ENSGT00390000005811 ENSGT00940000155305.b.a ENSGT00940000159721.g ENSGT00510000048902.a.e Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000156763.b.b ENSGT00940000159669.a ENSGT00940000159633 ENSGT01030000234773 ENSGT00940000166509 ENSGT00440000033872 ENSGT00940000157749 ENSGT00390000007153.a.a.a ENSGT00940000154578.B ENSGT00940000153731.a.a ENSGT00940000166823 ENSGT00440000039046 ENSGT00390000015930 ENSGT00390000002575 ENSGT00940000153654.ve.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160028 ENSGT00940000156117.e.a ENSGT00390000017892 ENSGT00940000156820.a.a.f ENSGT00530000063335.B.a.b ENSGT00940000158634.a.d ENSGT00390000005811 ENSGT00940000155305.b.a ENSGT00940000159721.g ENSGT00510000048902.a.e ENSGT00940000155290.C ENSGT00940000153231.A ENSGT00390000016002.o.a ENSGT00940000156621.e.a ENSGT00940000155188.B.b.d Pike perch MODERN SPECIES 16 araf (ENSSLUG00000005839) ENSSLUG00000005816 ENSSLUG00000005811 npr3 (ENSSLUG00000005754) ENSSLUG00000005744 PDZD2 (ENSSLUG00000005714) golph3a (ENSSLUG00000005705) ENSSLUG00000005689 isl1a (ENSSLUG00000005671) ENSSLUG00000005659 ccdc125 (ENSSLUG00000005626) rad17 (ENSSLUG00000005519) zgc:86811 (ENSSLUG00000005487) ydjc (ENSSLUG00000005480) ube2l3b (ENSSLUG00000005450) pias2 (ENSSLUG00000005430) #22 arid3c (ENSSLUG00000005404) ENSSLUG00000005391 mamdc2a (ENSSLUG00000005339) ptar1 (ENSSLUG00000005312) APBA1 (ENSSLUG00000005183) ENTREP1 (ENSSLUG00000005165) tjp2b (ENSSLUG00000025742) fxn (ENSSLUG00000025711) HMGCR (ENSSLUG00000025708) gcnt4a (ENSSLUG00000025702) fam169aa (ENSSLUG00000025701) zfr (ENSSLUG00000025645) imp4 (ENSSLUG00000025616) RABL6 (ENSSLUG00000025610) TRAF2 (ENSSLUG00000025591) Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 58 ENSGT00390000008802.a.a ENSGT00440000033872 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ENSGT00390000002575 ENSGT00940000153654.ve.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160028 ENSGT00940000156117.e.a ENSGT00390000017892 ENSGT00940000156820.a.a.f ENSGT00510000048902.a.e ENSGT00940000159721.g ENSGT00940000154742.b ENSGT00940000155305.b.a ENSGT00390000005811 ENSGT00940000158634.a.d.a ENSGT00940000158634.a.d.b ENSGT00530000063335.B.a.b ENSGT00950000183002.B.a.a ENSGT00530000063843.a ENSGT00940000159838 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 149 ENSGT00940000153731.a.a ENSGT00940000166823 ENSGT00940000179758 ENSGT00440000039046 ENSGT00390000015930 ENSGT00390000002575 ENSGT00940000153654.ve.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160028 ENSGT00940000156117.e.a ENSGT00390000017892 ENSGT00940000156820.a.a.f ENSGT00510000048902.a.e ENSGT00940000159721.g ENSGT00940000154742.b ENSGT00940000155305.b.a ENSGT00390000005811 ENSGT00940000158634.a.d.a ENSGT00530000063335.B.a.b ENSGT00950000183002.B.a.a ENSGT00530000063843.a ENSGT00940000159838 ENSGT00940000155422.bb Clown anemonefish MODERN SPECIES 1819 ube2l3b (ENSAOCG00000016507) pias2 (ENSAOCG00000016487) #22 ENSAOCG00000016339 arid3c (ENSAOCG00000016324) mamdc2a (ENSAOCG00000016286) ptar1 (ENSAOCG00000001116) APBA1 (ENSAOCG00000016219) fam169aa (ENSAOCG00000016138) gcnt4a (ENSAOCG00000016111) HMGCR (ENSAOCG00000016096) fxn (ENSAOCG00000016015) ENSAOCG00000001100 Orange clownfish MODERN SPECIES 19 isl1a (ENSAPEG00000012376) ccdc125 (ENSAPEG00000012439) ENSAPEG00000012447 rad17 (ENSAPEG00000012452) zgc:86811 (ENSAPEG00000012479) ydjc (ENSAPEG00000012513) ube2l3b (ENSAPEG00000012533) pias2 (ENSAPEG00000012550) #22 arid3c (ENSAPEG00000012743) mamdc2a (ENSAPEG00000012829) ptar1 (ENSAPEG00000012867) APBA1 (ENSAPEG00000012903) ENSAPEG00000012941 ENSAPEG00000013011 HMGCR (ENSAPEG00000013032) fxn (ENSAPEG00000013094) ENSAPEG00000013114 tjp2b (ENSAPEG00000013132) ENTREP1 (ENSAPEG00000013159) ENSAPEG00000013277 ENSAPEG00000013288 noxa1 (ENSAPEG00000013318) dpp7 (ENSAPEG00000013335) Spiny chromis MODERN SPECIES 873 gps1 (ENSAPOG00000002418) slc25a23b (ENSAPOG00000000917) pdxdc1 (ENSAPOG00000002479) gspt1l (ENSAPOG00000002524) ENSAPOG00000002535 RRN3 (ENSAPOG00000002550) ENSAPOG00000002612 pias2 (ENSAPOG00000002631) #22 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 591 ccdc125 (ENSSPAG00000011864) rad17 (ENSSPAG00000011897) zgc:86811 (ENSSPAG00000011919) ydjc (ENSSPAG00000011940) ube2l3b (ENSSPAG00000011950) pias2 (ENSSPAG00000011965) #22 arid3c (ENSSPAG00000011996) mamdc2a (ENSSPAG00000012012) ptar1 (ENSSPAG00000012054) APBA1 (ENSSPAG00000012091) fam169aa (ENSSPAG00000012121) ENSSPAG00000012141 gcnt4a (ENSSPAG00000012157) Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00390000012710.a.b.g.a ENSGT00940000155290.C ENSGT01030000234773 ENSGT00390000008802.a.a ENSGT00440000033872 ENSGT00940000157749 ENSGT00910000144505 ENSGT00390000007153.a.a.a ENSGT00940000154578.B ENSGT00940000153731.a.a ENSGT00940000166823 ENSGT00440000039046 ENSGT00390000015930 ENSGT00390000002575 ENSGT00940000153654.ve.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160028 ENSGT00940000156117.e.a ENSGT00390000017892 ENSGT00940000156820.a.a.f ENSGT00390000005811 ENSGT00940000155305.b.a ENSGT00940000158560 ENSGT00940000161618 ENSGT00440000038604.j ENSGT00940000154149.a.b ENSGT00940000155127.a.b ENSGT00950000183002.B.a.a ENSGT00530000063843.a ENSGT00940000159838 ENSGT00940000155422.bb Midas cichlid MODERN SPECIES 1278 ube2l3b (ENSACIG00000001265) pias2 (ENSACIG00000001110) #22 arid3c (ENSACIG00000001080) mamdc2a (ENSACIG00000001039) ptar1 (ENSACIG00000001010) man1b1b (ENSACIG00000000934) dpp7 (ENSACIG00000000824) noxa1 (ENSACIG00000000773) ENSACIG00000000755 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00530000063681.b.a ENSGT00940000155290.C ENSGT01030000234773 ENSGT00390000008802.a.a ENSGT00440000033872 ENSGT00940000157749 ENSGT00910000144505 ENSGT00390000007153.a.a.a ENSGT00940000154578.B ENSGT00940000153731.a.a ENSGT00940000166823 ENSGT00440000039046 ENSGT00390000015930 ENSGT00390000002575 ENSGT00940000153654.ve.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160028 ENSGT00390000017892 ENSGT00940000156820.a.a.f ENSGT00390000005811 ENSGT00940000155305.b.a ENSGT00940000158560 ENSGT00940000161618 ENSGT00440000038604.j ENSGT00940000154149.a.b ENSGT00940000155127.a.b ENSGT00950000183002.B.a.a ENSGT00530000063843.a ENSGT00940000159838 ENSGT00550000074961.a ENSGT00940000153772.B Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00530000063681.b.a ENSGT00940000155290.C ENSGT01030000234773 ENSGT00390000008802.a.a ENSGT00440000033872 ENSGT00940000157749 ENSGT00910000144505 ENSGT00390000007153.a.a.a ENSGT00940000154578.B ENSGT00940000153731.a.a ENSGT00940000166823 ENSGT00440000039046 ENSGT00390000015930 ENSGT00390000002575 ENSGT00940000153654.ve.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160028 ENSGT00390000017892 ENSGT00940000156820.a.a.f ENSGT00390000005811 ENSGT00940000155305.b.a ENSGT00940000158560 ENSGT00940000161618 ENSGT00440000038604.j ENSGT00940000154149.a.b ENSGT00940000155127.a.b ENSGT00950000183002.B.a.a ENSGT00530000063843.a ENSGT00940000159838 ENSGT00550000074961.a ENSGT00940000153772.B Haplochromini DUPLICATION Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00530000063681.b.a ENSGT00940000155290.C ENSGT01030000234773 ENSGT00390000008802.a.a ENSGT00440000033872 ENSGT00940000157749 ENSGT00910000144505 ENSGT00390000007153.a.a.a ENSGT00940000154578.B ENSGT00940000153731.a.a ENSGT00940000166823 ENSGT00440000039046 ENSGT00390000015930 ENSGT00390000002575 ENSGT00940000153654.ve.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b.g #22 ENSGT00940000160028 ENSGT00390000017892 ENSGT00940000156820.a.a.f ENSGT00390000005811 ENSGT00940000155305.b.a ENSGT00940000158560 ENSGT00940000161618 ENSGT00440000038604.j ENSGT00940000154149.a.b ENSGT00940000155127.a.b ENSGT00950000183002.B.a.a ENSGT00530000063843.a ENSGT00940000159838 ENSGT00550000074961.a ENSGT00940000153772.B Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00530000063681.b.a ENSGT00940000155290.C ENSGT01030000234773 ENSGT00390000008802.a.a ENSGT00440000033872 ENSGT00940000157749 ENSGT00910000144505 ENSGT00390000007153.a.a.a ENSGT00940000154578.B ENSGT00940000153731.a.a ENSGT00940000166823 ENSGT00440000039046 ENSGT00390000015930 ENSGT00390000002575 ENSGT00940000153654.ve.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b.g #22 ENSGT00940000160028 ENSGT00390000017892 ENSGT00940000156820.a.a.f ENSGT00390000005811 ENSGT00940000155305.b.a ENSGT00940000158560 ENSGT00940000161618 ENSGT00440000038604.j ENSGT00940000154149.a.b ENSGT00940000155127.a.b ENSGT00950000183002.B.a.a ENSGT00530000063843.a ENSGT00940000159838 ENSGT00550000074961.a ENSGT00940000153772.B Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00530000063681.b.a ENSGT00940000155290.C ENSGT01030000234773 ENSGT00390000008802.a.a ENSGT00440000033872 ENSGT00940000157749 ENSGT00910000144505 ENSGT00390000007153.a.a.a ENSGT00940000154578.B ENSGT00940000153731.a.a ENSGT00940000181527 ENSGT00440000039046 ENSGT00390000015930 ENSGT00390000002575 ENSGT00940000153654.ve.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b.g #22 ENSGT00940000160028 ENSGT00390000017892 ENSGT00940000156820.a.a.f ENSGT00390000005811 ENSGT00940000155305.b.a ENSGT00940000158560 ENSGT00940000161618 ENSGT00440000038604.j ENSGT00940000154149.a.b ENSGT00940000155127.a.b ENSGT00940000180886 ENSGT00950000183002.B.a.a ENSGT00530000063843.a ENSGT00940000159838 ENSGT00550000074961.a Eastern happy MODERN SPECIES 3 sub1b (ENSACLG00000016875) npr3 (ENSACLG00000016943) ENSACLG00000017002 ENSACLG00000017014 ENSACLG00000017207 golph3a (ENSACLG00000017212) ENSACLG00000017230 isl1a (ENSACLG00000017272) ENSACLG00000017295 ccdc125 (ENSACLG00000017333) rad17 (ENSACLG00000017343) zgc:86811 (ENSACLG00000017375) ydjc (ENSACLG00000017403) ENSACLG00000017448 ube2l3b (ENSACLG00000017455) pias2 (ENSACLG00000017476) #22 arid3c (ENSACLG00000017567) ptar1 (ENSACLG00000017605) APBA1 (ENSACLG00000017620) fxn (ENSACLG00000017696) HMGCR (ENSACLG00000017730) ABCA2 (ENSACLG00000017831) FUT7 (ENSACLG00000018010) ENSACLG00000018056 niban2b (ENSACLG00000018067) stxbp1b (ENSACLG00000018134) ENSACLG00000018224 ENSACLG00000018240 ENSACLG00000018251 noxa1 (ENSACLG00000018256) dpp7 (ENSACLG00000018297) Zebra mbuna MODERN SPECIES 1094 ggt5a (ENSMZEG00005018640) arrdc1a (ENSMZEG00005018638) ENSMZEG00005018633 nelfb (ENSMZEG00005018628) entpd2a.1 (ENSMZEG00005018626) fgf17 (ENSMZEG00005018507) FKBP15 (ENSMZEG00005018492) ccn1l2 (ENSMZEG00005018490) ENSMZEG00005018483 ENSMZEG00005018473 tubb2b (ENSMZEG00005018470) ENSMZEG00005018466 ENSMZEG00005018462 ENSMZEG00005018459 ENSMZEG00005018456 pias2 (ENSMZEG00005018453) #22 arid3c (ENSMZEG00005018451) ptar1 (ENSMZEG00005018445) APBA1 (ENSMZEG00005018435) FXN (ENSMZEG00005018430) HMGCR (ENSMZEG00005018425) ABCA2 (ENSMZEG00005018396) ENSMZEG00005017846 ENSMZEG00005017826 FUT7 (ENSMZEG00005017821) ENSMZEG00005017819 niban2b (ENSMZEG00005017814) stxbp1b (ENSMZEG00005017808) ENSMZEG00005017806 WHRN (ENSMZEG00005017800) noxa1 (ENSMZEG00005017794) P. nyererei MODERN SPECIES 348 golph3a (ENSPNYG00000006691) ENSPNYG00000006674 isl1a (ENSPNYG00000006651) ccdc125 (ENSPNYG00000006639) rad17 (ENSPNYG00000006615) ENSPNYG00000006604 zgc:86811 (ENSPNYG00000006583) ydjc (ENSPNYG00000006570) ube2l3b (ENSPNYG00000006556) pias2 (ENSPNYG00000006405) #22 arid3c (ENSPNYG00000006357) ptar1 (ENSPNYG00000006345) APBA1 (ENSPNYG00000006301) fxn (ENSPNYG00000006288) HMGCR (ENSPNYG00000006232) ABCA2 (ENSPNYG00000006126) FUT7 (ENSPNYG00000006099) ENSPNYG00000006077 ENSPNYG00000005970 niban2b (ENSPNYG00000005900) stxbp1b (ENSPNYG00000005853) noxa1 (ENSPNYG00000005827) dpp7 (ENSPNYG00000005776) ENSPNYG00000005751 golga1 (ENSPNYG00000005715) Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 611 ENSHBUG00000022316 ENSHBUG00000022291 ENSHBUG00000022272 ENSHBUG00000022193 isl1a (ENSHBUG00000021312) ccdc125 (ENSHBUG00000021285) rad17 (ENSHBUG00000021268) zgc:86811 (ENSHBUG00000021248) ydjc (ENSHBUG00000021209) ube2l3b (ENSHBUG00000021175) pias2 (ENSHBUG00000021152) #22 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.b.h #22 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.b.h #22 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.b.h #22 Zebra mbuna MODERN SPECIES 14 fam151b (ENSMZEG00005021240) zfr (ENSMZEG00005021243) ENSMZEG00005021248 sub1b (ENSMZEG00005021252) npr3 (ENSMZEG00005021256) ENSMZEG00005021262 golph3a (ENSMZEG00005021273) ENSMZEG00005021277 isl1a (ENSMZEG00005021281) ENSMZEG00005021283 ENSMZEG00005021287 rad17 (ENSMZEG00005021292) zgc:86811 (ENSMZEG00005021300) ydjc (ENSMZEG00005021304) ube2l3b (ENSMZEG00005021306) pias2 (ENSMZEG00005021311) #22 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 382 ENSNBRG00000008434 sub1b (ENSNBRG00000008451) npr3 (ENSNBRG00000008484) ENSNBRG00000008493 ENSNBRG00000008516 ENSNBRG00000008560 golph3a (ENSNBRG00000008567) si:dkey-3h3.3 (ENSNBRG00000008573) isl1a (ENSNBRG00000008593) ENSNBRG00000008638 ENSNBRG00000008649 rad17 (ENSNBRG00000008670) zgc:86811 (ENSNBRG00000008702) ydjc (ENSNBRG00000008734) ube2l3b (ENSNBRG00000008744) pias2 (ENSNBRG00000008761) #22 arid3c (ENSNBRG00000008813) ptar1 (ENSNBRG00000008889) APBA1 (ENSNBRG00000008905) fxn (ENSNBRG00000008946) HMGCR (ENSNBRG00000008965) ENSNBRG00000009010 ENSNBRG00000009060 ENSNBRG00000009274 FUT7 (ENSNBRG00000010028) ENSNBRG00000010085 niban2b (ENSNBRG00000010154) stxbp1b (ENSNBRG00000010196) ENSNBRG00000010303 ENSNBRG00000010330 noxa1 (ENSNBRG00000010365) Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia MODERN SPECIES 3 npr3 (ENSONIG00000013952) ENSONIG00000030448 ENSONIG00000035127 ENSONIG00000037357 golph3a (ENSONIG00000013949) ENSONIG00000013948 ENSONIG00000028197 isl1a (ENSONIG00000013945) ccdc125 (ENSONIG00000013944) rad17 (ENSONIG00000013936) zgc:86811 (ENSONIG00000013935) ydjc (ENSONIG00000013933) ENSONIG00000033311 ENSONIG00000038225 ube2l3b (ENSONIG00000013931) pias2 (ENSONIG00000013927) #22 arid3c (ENSONIG00000013925) ptar1 (ENSONIG00000013924) APBA1 (ENSONIG00000013918) ENSONIG00000032671 ENSONIG00000034062 arrdc1a (ENSONIG00000020231) ENSONIG00000020230 nelfb (ENSONIG00000020229) fgf17 (ENSONIG00000020227) FKBP15 (ENSONIG00000020226) ccn1l2 (ENSONIG00000038451) ENSONIG00000020224 ENSONIG00000037430 ENSONIG00000032695 ENSONIG00000029706 Nile tilapia MODERN SPECIES 396 ENSONIG00000028588 ENSONIG00000035067 pias2 (ENSONIG00000027593) #22 ENSONIG00000028517 ENSONIG00000034946 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00440000039046 ENSGT00390000015930 ENSGT00390000002575 ENSGT00940000153654.ve.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160028 ENSGT00390000017892 ENSGT00940000156820.a.a.f ENSGT00390000005811 ENSGT00940000155305.b.a ENSGT01090000260180 ENSGT00940000158884 ENSGT00940000156516 ENSGT00740000116886 ENSGT00940000160018 ENSGT00940000155771.d ENSGT00730000110989.c.b ENSGT00490000043395 ENSGT00940000165661 ENSGT00390000012355.A.a.a.a Oryzias ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT00940000165661 ENSGT00490000043395 ENSGT00730000110989.c.b ENSGT00940000155771.d ENSGT00940000160018 ENSGT00740000116886 ENSGT00940000156516 ENSGT00940000158884 ENSGT01090000260180 ENSGT00940000155305.b.a ENSGT00940000156820.a.a.f ENSGT00440000039046 ENSGT00390000015930 ENSGT00390000002575 ENSGT00940000153654.ve.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160028 ENSGT00390000017892 ENSGT00940000164100.A.c.b.b.e.b ENSGT00950000182960.a.b Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 69 ENSGT00390000012355.A.a.a.a ENSGT00940000165661 ENSGT00490000043395 ENSGT00730000110989.c.b ENSGT00940000155771.d ENSGT00940000160018 ENSGT00940000156516 ENSGT00940000158884 ENSGT01090000260180 ENSGT00940000155305.b.a ENSGT00940000156820.a.a.f ENSGT00440000039046 ENSGT00390000015930 ENSGT00390000002575 ENSGT00940000153654.ve.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160028 ENSGT00390000017892 ENSGT00940000164100.A.c.b.b.e.b ENSGT00950000182960.a.b.r Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 23 gtf2h2 (ENSORLG00000028550) oclnb (ENSORLG00000017272) marveld2b (ENSORLG00000017278) il-17n (ENSORLG00000029840) sdf2l1 (ENSORLG00000024163) TOP3B (ENSORLG00000017296) ppm1f (ENSORLG00000017302) ENSORLG00000026679 ENSORLG00000023660 HMGCR (ENSORLG00000017313) ENSORLG00000017317 rad17 (ENSORLG00000017335) AK6 (ENSORLG00000017342) ydjc (ENSORLG00000017345) ube2l3b (ENSORLG00000017349) pias2 (ENSORLG00000017353) #22 ENSORLG00000023271 arid3c (ENSORLG00000017354) ptar1 (ENSORLG00000020189) ENSORLG00000024751 ENSORLG00000024673 ENSORLG00000024117 ENSORLG00000024578 ENSORLG00000022599 ENSORLG00000017168 ENSORLG00000022360 ENSORLG00000017381 ENSORLG00000024176 ENSORLG00000030268 ENSORLG00000022843 ENSORLG00000027319 Chinese medaka MODERN SPECIES 730 zfr (ENSOSIG00000018290) ENSOSIG00000018276 ENSOSIG00000018273 ENSOSIG00000018269 oclnb (ENSOSIG00000018268) marveld2b (ENSOSIG00000018243) TOP3B (ENSOSIG00000018211) HMGCR (ENSOSIG00000018056) ENSOSIG00000018008 rad17 (ENSOSIG00000017998) ydjc (ENSOSIG00000017994) ube2l3b (ENSOSIG00000017952) pias2 (ENSOSIG00000017841) #22 arid3c (ENSOSIG00000017800) Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00940000165661 ENSGT00490000043395 ENSGT00730000110989.c.b ENSGT00940000155771.d ENSGT00940000160018 ENSGT00740000116886 ENSGT00940000156516 ENSGT00940000158884 ENSGT01090000260180 ENSGT00940000155305.b.a ENSGT00940000156820.a.a.f ENSGT00440000039046 ENSGT00390000015930 ENSGT00390000002575 ENSGT00940000153654.ve.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160028 ENSGT00390000017892 ENSGT00530000063843.a ENSGT00940000159838 ENSGT00940000155422.bb ENSGT00940000155275.c.b.b ENSGT00940000156811.a ENSGT00940000159428.f ENSGT00940000156902.a ENSGT00940000177919 ENSGT00940000153877.a.b ENSGT00530000065225 ENSGT00980000198897 ENSGT00940000155816.b ENSGT00940000159393 Indian medaka MODERN SPECIES 36 gtf2h2 (ENSOMEG00000003197) oclnb (ENSOMEG00000003171) marveld2b (ENSOMEG00000003160) sdf2l1 (ENSOMEG00000003143) ENSOMEG00000003138 TOP3B (ENSOMEG00000003122) ppm1f (ENSOMEG00000003068) ENSOMEG00000003038 ENSOMEG00000003022 HMGCR (ENSOMEG00000003003) ENSOMEG00000023621 rad17 (ENSOMEG00000023608) zgc:86811 (ENSOMEG00000023591) ydjc (ENSOMEG00000023580) ube2l3b (ENSOMEG00000023571) pias2 (ENSOMEG00000023562) #22 arid3c (ENSOMEG00000023548) ptar1 (ENSOMEG00000023532) ENSOMEG00000023509 dpp7 (ENSOMEG00000023444) man1b1b (ENSOMEG00000023320) cacna1ba (ENSOMEG00000023284) EEIG1 (ENSOMEG00000023233) ENSOMEG00000023218 zdhhc12a (ENSOMEG00000023195) ENSOMEG00000023185 SET (ENSOMEG00000023178) si:ch211-51h9.7 (ENSOMEG00000023155) rasgef1ba (ENSOMEG00000023143) prkg2 (ENSOMEG00000023095) bmp3 (ENSOMEG00000023080) Javanese ricefish MODERN SPECIES 23 SNX2 (ENSOJAG00000006276) ENSOJAG00000006137 ENSOJAG00000006129 ENSOJAG00000005948 ENSOJAG00000005926 ENSOJAG00000005915 ENSOJAG00000005906 ENSOJAG00000005863 ppm1f (ENSOJAG00000005844) ENSOJAG00000005817 HMGCR (ENSOJAG00000010070) ENSOJAG00000009817 rad17 (ENSOJAG00000009794) AK6 (ENSOJAG00000009779) ydjc (ENSOJAG00000009772) pias2 (ENSOJAG00000009574) #22 arid3c (ENSOJAG00000009467) ptar1 (ENSOJAG00000009452) ENSOJAG00000009443 ENSOJAG00000009426 ENSOJAG00000009351 ENSOJAG00000008957 ENSOJAG00000008866 ENSOJAG00000008843 ENSOJAG00000008731 ENSOJAG00000008683 ENSOJAG00000008671 TOP3B (ENSOJAG00000008174) ENSOJAG00000008154 sdf2l1 (ENSOJAG00000008147) marveld2b (ENSOJAG00000008136) Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 59 ENSGT00440000039046 ENSGT00390000015930 ENSGT00390000002575 ENSGT00940000153654.ve.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000160028 ENSGT00390000017892 ENSGT00940000156820.a.a.f ENSGT00390000005811 ENSGT00940000155305.b.a ENSGT00940000160018 ENSGT00940000155771.d ENSGT00730000110989.c.b ENSGT00490000043395.m ENSGT00940000165661 ENSGT00390000012355.A.a.a.a ENSGT00530000063681.b.a ENSGT00390000012710.a.b.h ENSGT00940000155290.C.db ENSGT01030000234773 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00940000165661 ENSGT00490000043395.m ENSGT00730000110989.c.b ENSGT00940000155771.d ENSGT00940000160018 ENSGT00940000155305.b.a ENSGT00390000005811 ENSGT00940000156820.a.a.f ENSGT00390000017892 ENSGT00940000160028 ENSGT00390000002575 ENSGT00440000038604.j ENSGT00940000161618 ENSGT00940000158560 ENSGT00390000000543 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000153654.ve.a ENSGT00440000039046 ENSGT00390000015930 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 117 ENSGT00940000160028 ENSGT00390000002575 ENSGT00440000038604.j ENSGT00940000161618 ENSGT00940000158560 ENSGT00940000174976 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000153654.ve.a ENSGT00440000039046 ENSGT00390000015930 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 541 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000153654.ve.a ENSGT00440000039046 ENSGT00390000015930 Amazon molly MODERN SPECIES 784 ABCA2 (ENSPFOG00000000292) ENSPFOG00000000282 pias2 (ENSPFOG00000000261) #22 ube2l3b (ENSPFOG00000000239) rad17 (ENSPFOG00000000209) zgc:86811 (ENSPFOG00000000193) Sailfin molly MODERN SPECIES 3301 ENSPLAG00000002235 #22 Guppy MODERN SPECIES 7 ENSPREG00000011153 ydjc (ENSPREG00000011121) ENSPREG00000011096 FUT7 (ENSPREG00000011085) ABCA2 (ENSPREG00000010988) ENSPREG00000010952 pias2 (ENSPREG00000010891) #22 rad17 (ENSPREG00000010825) ube2l3b (ENSPREG00000010788) zgc:86811 (ENSPREG00000010775) Platyfish MODERN SPECIES 3 sdf2l1 (ENSXMAG00000004473) ENSXMAG00000029422 HMGCR (ENSXMAG00000006482) fxn (ENSXMAG00000026768) ENSXMAG00000009438 ptar1 (ENSXMAG00000018186) arid3c (ENSXMAG00000023890) ENSXMAG00000024971 ydjc (ENSXMAG00000012792) ENSXMAG00000023132 NPDC1 (ENSXMAG00000018967) ENSXMAG00000000674 ENSXMAG00000014014 ENSXMAG00000013651 paxx (ENSXMAG00000003796) pias2 (ENSXMAG00000026350) #22 ENSXMAG00000029927 ube2l3b (ENSXMAG00000029408) rad17 (ENSXMAG00000030085) zgc:86811 (ENSXMAG00000025350) NAME_4 ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 Mummichog MODERN SPECIES 1279 ENSFHEG00000011671 #22 ENSFHEG00000011679 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 315 dpp7 (ENSCVAG00000017384) man1b1b (ENSCVAG00000017341) pias2 (ENSCVAG00000017308) #22 ube2l3b (ENSCVAG00000017252) rad17 (ENSCVAG00000017237) PNPLA7 (ENSCVAG00000017226) mrpl41 (ENSCVAG00000017212) dph7 (ENSCVAG00000017203) sh3glb2a (ENSCVAG00000017184) ENSCVAG00000017035 ENSCVAG00000017025 PPP6C (ENSCVAG00000017013) golga1 (ENSCVAG00000016953) rpl35 (ENSCVAG00000000427) ENSCVAG00000016745 olfml2a (ENSCVAG00000016741) nr6a1a (ENSCVAG00000016696) nr5a1a (ENSCVAG00000016667) Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 309 ENSGT00440000039046 ENSGT00390000015930 ENSGT00390000002575 ENSGT00940000153654.ve.a ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 Turquoise killifish MODERN SPECIES 1011 ENSNFUG00015011959 #22 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 337 rad17 (ENSKMAG00000017010) zgc:86811 (ENSKMAG00000016969) ENSKMAG00000016948 ydjc (ENSKMAG00000016941) ube2l3b (ENSKMAG00000016934) pias2 (ENSKMAG00000016893) #22 ENSKMAG00000016878 arid3c (ENSKMAG00000016848) Elephant shark MODERN SPECIES 2053 hdhd2 (ENSCMIG00000008431) katnal2 (ENSCMIG00000008427) pias2 (ENSCMIG00000008419) #22 Ecdysozoa ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 Caenorhabditis elegans MODERN SPECIES 3 T25B9.1 (WBGene00012007) T25B9.2 (WBGene00012008) T25B9.5 (WBGene00012011) T25B9.4 (WBGene00012010) T25B9.6 (WBGene00012012) ugt-54 (WBGene00012013) T25B9.11 (WBGene00044990) T25B9.12 (WBGene00044991) T25B9.8 (WBGene00012014) T25B9.9 (WBGene00012015) inpp-1 (WBGene00012016) swt-3 (WBGene00007384) srd-7 (WBGene00005085) pept-2 (WBGene00003876) zipt-2.1 (WBGene00014669) miz-1 (WBGene00011259) #22 npax-3 (WBGene00011257) best-15 (WBGene00011258) T11G6.5 (WBGene00011720) T11G6.4 (WBGene00011719) T11G6.3 (WBGene00011718) T11G6.2 (WBGene00011717) hars-1 (WBGene00002001) rbm-22 (WBGene00011722) nish-1 (WBGene00008750) F13E9.11 (WBGene00008760) F13E9.12 (WBGene00008761) fipr-14 (WBGene00008751) sdz-13 (WBGene00008755) fipr-15 (WBGene00008752) F13E9.13 (WBGene00044797) Bilateria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.a ##22 Chordata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.a ##22 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES 351 ENSGT01030000234539.a.a.b.a ##22 ENSGT00940000157859 Gnathostomata DUPLICATION Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 970 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000161732 ENSGT00940000157244 ENSGT00940000161509 ENSGT00940000155399 ENSGT00940000162656 ENSGT00410000026290 ENSGT00940000160567 ENSGT00940000154566 ENSGT00390000002390.b ENSGT00390000005131 ENSGT00570000079224 ENSGT00390000005125 ENSGT00940000158341 ENSGT01030000234534.B.a.a.b ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00940000158423 ENSGT00940000164422 ENSGT00940000164158.A ENSGT00950000185785 ENSGT00390000014273.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00940000160132 ENSGT00940000159088 ENSGT00390000016256 ENSGT00940000164105 Anura ANCESTRAL SPECIES 109 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(ENSECAG00000015900) HJV (ENSECAG00000028996) TXNIP (ENSECAG00000028144) ANKRD34A (ENSECAG00000002458) LIX1L (ENSECAG00000020654) ENSECAG00000046198 RBM8A (ENSECAG00000022024) GNRHR2 (ENSECAG00000023497) PEX11B (ENSECAG00000002265) ITGA10 (ENSECAG00000008533) ANKRD35 (ENSECAG00000016226) PIAS3 (ENSECAG00000017540) ##22 NUDT17 (ENSECAG00000023259) POLR3C (ENSECAG00000023713) RNF115 (ENSECAG00000009030) CD160 (ENSECAG00000010888) PDZK1 (ENSECAG00000011351) ENSECAG00000013689 GJA8 (ENSECAG00000002537) GJA5 (ENSECAG00000022462) ENSECAG00000006074 ACP6 (ENSECAG00000022581) BCL9 (ENSECAG00000004159) ENSECAG00000038633 CHD1L (ENSECAG00000008915) FMO5 (ENSECAG00000019741) PRKAB2 (ENSECAG00000020796) Donkey MODERN SPECIES 17 ENSEASG00005036493 ENSEASG00005037866 ENSEASG00005002125 ENSEASG00005002130 ENSEASG00005037767 ENSEASG00005025106 TXNIP (ENSEASG00005007477) POLR3GL (ENSEASG00005007466) ANKRD34A (ENSEASG00005007463) LIX1L (ENSEASG00005007459) RBM8A (ENSEASG00005007455) ENSEASG00005007451 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ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT01100000263570.B.t.b ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 ENSGT00950000183190.a.a.b ENSGT00940000156349 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000153125.D.a.a ENSGT01100000263575.B.u ENSGT00940000156302 ENSGT01100000263559.A.f ENSGT01100000263506.a.e.b ENSGT01050000244808.A.b.b.a ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01060000248645 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00390000007258 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT01100000263570.B.t.b ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 ENSGT00950000183190.a.a.b ENSGT00940000156349 Microbat DUPLICATION Microbat MODERN SPECIES 1011 ENSMLUG00000029864 TDRD3 (ENSMLUG00000000235) ENSMLUG00000025272 DIAPH3 (ENSMLUG00000010018) ENSMLUG00000023454 ##22 PCDH17 (ENSMLUG00000005588) ENSMLUG00000004822 ENSMLUG00000029892 ENSMLUG00000022766 Microbat MODERN SPECIES 863 ENSMLUG00000016326 ##22 ENSMLUG00000024319 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 14 ENSRFEG00010019380 ENSRFEG00010019363 ENSRFEG00010019351 ENSRFEG00010019339 H2BC18 (ENSRFEG00010019313) FCGR1A (ENSRFEG00010019271) HJV (ENSRFEG00010019205) TXNIP (ENSRFEG00010019128) POLR3GL (ENSRFEG00010019091) ANKRD34A (ENSRFEG00010019075) LIX1L (ENSRFEG00010019031) RBM8A (ENSRFEG00010018987) PEX11B (ENSRFEG00010018908) ITGA10 (ENSRFEG00010018433) ANKRD35 (ENSRFEG00010018199) PIAS3 (ENSRFEG00010018138) ##22 NUDT17 (ENSRFEG00010018121) POLR3C (ENSRFEG00010018066) RNF115 (ENSRFEG00010018030) CD160 (ENSRFEG00010017930) PDZK1 (ENSRFEG00010017870) ENSRFEG00010017789 GJA8 (ENSRFEG00010017764) ACP6 (ENSRFEG00010017620) BCL9 (ENSRFEG00010017559) ENSRFEG00010017488 CHD1L (ENSRFEG00010015905) ENSRFEG00010015720 ENSRFEG00010015393 ENSRFEG00010015308 PRKAB2 (ENSRFEG00010015269) Megabat MODERN SPECIES 2106 ENSPVAG00000014460 TXNIP (ENSPVAG00000014463) POLR3GL (ENSPVAG00000014464) ANKRD34A (ENSPVAG00000014466) ENSPVAG00000014467 RBM8A (ENSPVAG00000014471) ENSPVAG00000014473 PEX11B (ENSPVAG00000014475) ITGA10 (ENSPVAG00000014476) ANKRD35 (ENSPVAG00000014477) PIAS3 (ENSPVAG00000014478) ##22 NUDT17 (ENSPVAG00000014481) POLR3C (ENSPVAG00000014483) RNF115 (ENSPVAG00000014487) CD160 (ENSPVAG00000014488) PDZK1 (ENSPVAG00000014490) ENSPVAG00000014491 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263559.B ENSGT01100000263506.a.e.b ENSGT01050000244808.A.b.b.a ENSGT00950000183190.a.b.a.b ENSGT00420000029746.f ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01060000248645 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00390000007258 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT01100000263570.B.t.a ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 ENSGT00420000029746.e.b Suina ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT01100000263506.a.e.b ENSGT01050000244808.A.b.b.a ENSGT00950000183190.a.b.a.b ENSGT00420000029746.f ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01100000264175 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT01100000263570.B.t.a ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 ENSGT00420000029746.e.b ENSGT00950000183190.a.a.b Chacoan peccary MODERN SPECIES 29 ENSCWAG00000010582 H2BC18 (ENSCWAG00000010598) ENSCWAG00000010635 ENSCWAG00000010702 ENSCWAG00000010758 HJV (ENSCWAG00000010824) TXNIP (ENSCWAG00000010902) ENSCWAG00000010984 ANKRD34A (ENSCWAG00000011022) LIX1L (ENSCWAG00000011045) RBM8A (ENSCWAG00000011078) ENSCWAG00000011122 PEX11B (ENSCWAG00000011193) ITGA10 (ENSCWAG00000011314) ANKRD35 (ENSCWAG00000011823) PIAS3 (ENSCWAG00000012113) ##22 NUDT17 (ENSCWAG00000012279) POLR3C (ENSCWAG00000012364) RNF115 (ENSCWAG00000012426) PDZK1 (ENSCWAG00000012473) ENSCWAG00000012533 GJA8 (ENSCWAG00000012679) GJA5 (ENSCWAG00000012696) ACP6 (ENSCWAG00000012718) BCL9 (ENSCWAG00000012850) ENSCWAG00000012894 CHD1L (ENSCWAG00000012998) FMO5 (ENSCWAG00000014798) PRKAB2 (ENSCWAG00000014832) ENSCWAG00000000055 PDE4DIP (ENSCWAG00000000459) Pig MODERN SPECIES 12 H3C14 (ENSSSCG00000063270) ENSSSCG00000059426 H2BC18 (ENSSSCG00000062160) FCGR1A 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H2BC18 (ENSPSNG00000001038) ENSPSNG00000001015 ENSPSNG00000000971 HJV (ENSPSNG00000000911) TXNIP (ENSPSNG00000000878) POLR3GL (ENSPSNG00000000850) ANKRD34A (ENSPSNG00000000834) LIX1L (ENSPSNG00000000812) ENSPSNG00000000786 PEX11B (ENSPSNG00000000744) ITGA10 (ENSPSNG00000000636) ANKRD35 (ENSPSNG00000000537) PIAS3 (ENSPSNG00000000478) ##22 NUDT17 (ENSPSNG00000000422) POLR3C (ENSPSNG00000000389) RNF115 (ENSPSNG00000000340) ENSPSNG00000000296 PDZK1 (ENSPSNG00000000251) ENSPSNG00000000162 GJA8 (ENSPSNG00000000089) GJA5 (ENSPSNG00000000070) ENSPSNG00000000045 ACP6 (ENSPSNG00000005293) BCL9 (ENSPSNG00000005241) ENSPSNG00000005153 CHD1L (ENSPSNG00000004698) PRKAB2 (ENSPSNG00000004433) ENSPSNG00000004389 Blue whale MODERN SPECIES ENSBMSG00010003874 ENSBMSG00010003866 ENSBMSG00010003857 ENSBMSG00010003847 H2BC18 (ENSBMSG00010003841) ENSBMSG00010003827 HJV (ENSBMSG00010003805) TXNIP (ENSBMSG00010003790) POLR3GL (ENSBMSG00010003781) ANKRD34A (ENSBMSG00010003767) LIX1L (ENSBMSG00010003757) RBM8A (ENSBMSG00010003752) PEX11B (ENSBMSG00010003741) ITGA10 (ENSBMSG00010003688) NUDT17 (ENSBMSG00010003650) ENSBMSG00010003614 ##22 POLR3C (ENSBMSG00010003595) ENSBMSG00010003585 ENSBMSG00010003575 PDZK1 (ENSBMSG00010003562) ENSBMSG00010003553 GJA8 (ENSBMSG00010003547) GJA5 (ENSBMSG00010003545) ACP6 (ENSBMSG00010003521) BCL9 (ENSBMSG00010003513) CHD1L (ENSBMSG00010003302) ENSBMSG00010003208 PRKAB2 (ENSBMSG00010003183) ENSBMSG00010003163 PDE4DIP (ENSBMSG00010001649) SEC22B (ENSBMSG00010001456) Pecora ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01100000263474.a.b.a.d ENSGT01100000263506.a.e.b ENSGT01050000244808.A.b.b.a ENSGT00950000183190.a.b.a.b ENSGT00420000029746.f ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01060000248645 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT01100000263570.B.t.a ENSGT01100000263570.B.t.b ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 ENSGT00420000029746.e.b Percora_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01100000263474.a.b.a.d ENSGT01100000263506.a.e.b ENSGT01050000244808.A.b.b.a ENSGT00950000183190.a.b.a.b ENSGT00420000029746.f ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01060000248645 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT01100000263570.B.t.a ENSGT01100000263570.B.t.b ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 ENSGT00420000029746.e.b Bovidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01100000263514.A.e.a.a ENSGT01100000263506.a.e.b ENSGT01050000244808.A.b.b.a ENSGT00950000183190.a.b.a.b ENSGT00420000029746.f ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01060000248645 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT01100000263570.B.t.a ENSGT01100000263570.B.t.b ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 ENSGT00420000029746.e.b Caprinae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01100000263575.B.u ENSGT01100000263559.B ENSGT01100000263506.a.e.b ENSGT01050000244808.A.b.b.a ENSGT00950000183190.a.b.a.b ENSGT00420000029746.f ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01060000248645 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT01100000263570.B.t.a ENSGT01100000263570.B.t.b ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 ENSGT00950000183190.a.a.b Rambouillet Sheep MODERN SPECIES ENSOARG00020006725 H3-7 (ENSOARG00020006703) H2BC18 (ENSOARG00020006656) FCGR1A (ENSOARG00020006588) ENSOARG00020006514 ENSOARG00020006487 ENSOARG00020006466 HJV (ENSOARG00020004031) TXNIP (ENSOARG00020003962) POLR3GL (ENSOARG00020003936) ANKRD34A (ENSOARG00020003925) LIX1L (ENSOARG00020003889) RBM8A (ENSOARG00020003860) PEX11B (ENSOARG00020003815) ITGA10 (ENSOARG00020003429) PIAS3 (ENSOARG00020003167) ##22 NUDT17 (ENSOARG00020003144) POLR3C (ENSOARG00020003118) RNF115 (ENSOARG00020003086) PDZK1 (ENSOARG00020003047) ENSOARG00020003006 GJA8 (ENSOARG00020002990) GJA5 (ENSOARG00020002982) ACP6 (ENSOARG00020002966) BCL9 (ENSOARG00020002952) ENSOARG00020002939 CHD1L (ENSOARG00020002654) FMO5 (ENSOARG00020002609) PRKAB2 (ENSOARG00020002599) ENSOARG00020002576 ENSOARG00020002566 Goat MODERN SPECIES 22 ENSCHIG00000013241 ENSCHIG00000009699 ENSCHIG00000010234 H2BC18 (ENSCHIG00000007673) FCGR1A (ENSCHIG00000027141) ENSCHIG00000017683 ENSCHIG00000023415 HJV (ENSCHIG00000010408) TXNIP (ENSCHIG00000017689) POLR3GL (ENSCHIG00000008824) ANKRD34A (ENSCHIG00000007942) LIX1L (ENSCHIG00000012584) RBM8A (ENSCHIG00000012114) ITGA10 (ENSCHIG00000027027) ANKRD35 (ENSCHIG00000018547) PIAS3 (ENSCHIG00000010071) ##22 NUDT17 (ENSCHIG00000014413) POLR3C (ENSCHIG00000022431) RNF115 (ENSCHIG00000025502) PDZK1 (ENSCHIG00000011722) ENSCHIG00000017806 GJA5 (ENSCHIG00000010714) ENSCHIG00000018629 ACP6 (ENSCHIG00000024823) BCL9 (ENSCHIG00000009988) ENSCHIG00000009796 ENSCHIG00000022455 ENSCHIG00000026995 CHD1L (ENSCHIG00000013871) FMO5 (ENSCHIG00000014242) PRKAB2 (ENSCHIG00000015966) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01100000263506.a.e.a.a.a.a.b.a ENSGT01100000263506.a.e.b ENSGT01050000244808.A.b.b.a ENSGT00950000183190.a.b.a.b ENSGT00420000029746.f ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01060000248645 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT01100000263570.B.t.a ENSGT01100000263570.B.t.b ENSGT01100000263514.B.m.a.b ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153118.db.a.a.b.a.a ENSGT01100000263506.a.e.b ENSGT01050000244808.A.b.b.a 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ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT01100000263570.B.t.a ENSGT01100000263570.B.t.b ENSGT01100000263514.B.m.a.b ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 Wild yak MODERN SPECIES 1010 HJV (ENSBMUG00000007305) TXNIP (ENSBMUG00000007292) POLR3GL (ENSBMUG00000007276) ANKRD34A (ENSBMUG00000007260) LIX1L (ENSBMUG00000007068) RBM8A (ENSBMUG00000006964) ENSBMUG00000006914 PEX11B (ENSBMUG00000006890) ITGA10 (ENSBMUG00000006839) ANKRD35 (ENSBMUG00000006800) PIAS3 (ENSBMUG00000006760) ##22 NUDT17 (ENSBMUG00000006726) POLR3C (ENSBMUG00000006719) RNF115 (ENSBMUG00000006704) PDZK1 (ENSBMUG00000006691) ENSBMUG00000006661 GJA8 (ENSBMUG00000006652) GJA5 (ENSBMUG00000006639) ACP6 (ENSBMUG00000006624) BCL9 (ENSBMUG00000006604) Domestic yak MODERN SPECIES 22 ENSBGRG00000016114 H2BC18 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ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01100000263480.a.a.a.b.a.b.b.a.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT01100000263570.B.t.a ENSGT01100000263570.B.t.b ENSGT01100000263514.B.m.a.b ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 Cow MODERN SPECIES 22 H3C13 (ENSBTAG00000050881) H2BC18 (ENSBTAG00000032455) FCGR1A (ENSBTAG00000008592) ENSBTAG00000037565 MGC134040 (ENSBTAG00000022741) HJV (ENSBTAG00000021823) TXNIP (ENSBTAG00000020060) POLR3GL (ENSBTAG00000013910) ANKRD34A (ENSBTAG00000008365) RBM8A (ENSBTAG00000008369) GNRHR2 (ENSBTAG00000008370) PEX11B (ENSBTAG00000008372) ITGA10 (ENSBTAG00000008373) ANKRD35 (ENSBTAG00000038844) ENSBTAG00000052421 PIAS3 (ENSBTAG00000021634) ##22 NUDT17 (ENSBTAG00000021635) POLR3C (ENSBTAG00000021637) RNF115 (ENSBTAG00000008131) ENSBTAG00000053114 PDZK1 (ENSBTAG00000005810) GPR89A (ENSBTAG00000005809) GJA8 (ENSBTAG00000021833) GJA5 (ENSBTAG00000006720) ACP6 (ENSBTAG00000017051) BCL9 (ENSBTAG00000002422) OR13L2 (ENSBTAG00000046242) OR13L12 (ENSBTAG00000046872) ENSBTAG00000035013 ENSBTAG00000054541 CHD1L (ENSBTAG00000020831) Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 22 ENSBIXG00005004313 H2BC18 (ENSBIXG00005025377) FCGR1A (ENSBIXG00005025364) ENSBIXG00005025348 ENSBIXG00005025317 ENSBIXG00005025301 HJV (ENSBIXG00005006687) TXNIP (ENSBIXG00005025179) POLR3GL (ENSBIXG00005025127) ANKRD34A (ENSBIXG00005025105) ENSBIXG00005025081 ENSBIXG00005025011 ITGA10 (ENSBIXG00005004255) ANKRD35 (ENSBIXG00005024727) ENSBIXG00005004206 PIAS3 (ENSBIXG00005024590) ##22 NUDT17 (ENSBIXG00005024499) POLR3C (ENSBIXG00005024477) PDZK1 (ENSBIXG00005024420) ENSBIXG00005024308 ENSBIXG00005024260 GJA8 (ENSBIXG00005004114) GJA5 (ENSBIXG00005024004) ACP6 (ENSBIXG00005023973) BCL9 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(ENSCHYG00000005455) GJA5 (ENSCHYG00000005464) ACP6 (ENSCHYG00000005483) BCL9 (ENSCHYG00000005533) ENSCHYG00000005572 CHD1L (ENSCHYG00000005754) ENSCHYG00000006443 PDE4DIP (ENSCHYG00000006902) SEC22B (ENSCHYG00000010779) NOTCH2 (ENSCHYG00000010973) Camelidae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01100000263559.B ENSGT01100000263559.A.f ENSGT01100000263506.a.e.b ENSGT01050000244808.A.b.b.a ENSGT00950000183190.a.b.a.b ENSGT00420000029746.f ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01060000248645 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT00910000145379 ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 Arabian camel MODERN SPECIES 13 ENSCDRG00005015303 ENSCDRG00005015297 H2BC18 (ENSCDRG00005015267) FCGR1A 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ENSGT00420000029746.f ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01060000248645 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00390000007258 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01090000260658 ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT01100000263570.B ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 Primates ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01100000263559.A.f.e ENSGT01100000263506.a.e.b ENSGT01050000244808.A.b.b.a ENSGT00950000183190.a.b.a.b ENSGT00420000029746.f ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01060000248645 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00390000007258 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153118.db.a.a.b.a.a ENSGT00940000153125.B ENSGT01100000263506.a.e.b ENSGT01050000244808.A.b.b.a ENSGT00950000183190.a.b.a.b ENSGT00420000029746.f ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01060000248645 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00390000007258 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 ENSGT00940000162954 ENSGT00940000155030 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01060000248645 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00390000007258 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 ENSGT00940000162954 ENSGT00940000155030 Mouse lemur MODERN SPECIES 11 ENSMICG00000043363 H2AC18 (ENSMICG00000043969) ENSMICG00000046339 ENSMICG00000045632 FCGR1A (ENSMICG00000033541) ENSMICG00000029326 HJV (ENSMICG00000037948) TXNIP (ENSMICG00000038247) POLR3GL (ENSMICG00000034663) ANKRD34A (ENSMICG00000044107) LIX1L (ENSMICG00000043095) RBM8A (ENSMICG00000031698) PEX11B (ENSMICG00000028232) ITGA10 (ENSMICG00000036050) ANKRD35 (ENSMICG00000028514) PIAS3 (ENSMICG00000033732) ##22 NUDT17 (ENSMICG00000031177) POLR3C (ENSMICG00000034253) RNF115 (ENSMICG00000044821) CD160 (ENSMICG00000038733) ENSMICG00000028695 PDZK1 (ENSMICG00000038001) ENSMICG00000005562 ACP6 (ENSMICG00000005556) BCL9 (ENSMICG00000038350) CHD1L (ENSMICG00000002497) FMO5 (ENSMICG00000002485) PRKAB2 (ENSMICG00000002483) NOTCH2 (ENSMICG00000016769) SEC22B (ENSMICG00000027609) ENSMICG00000041490 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01060000248645 ENSGT00940000165934 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00390000007258 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 ENSGT00940000162954 ENSGT00940000155030 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 285 HJV (ENSPCOG00000021570) ENSPCOG00000021634 TXNIP (ENSPCOG00000026484) POLR3GL (ENSPCOG00000015376) LIX1L (ENSPCOG00000019652) RBM8A (ENSPCOG00000022886) ENSPCOG00000018753 ITGA10 (ENSPCOG00000022970) ANKRD35 (ENSPCOG00000024317) PIAS3 (ENSPCOG00000015621) ##22 NUDT17 (ENSPCOG00000027998) POLR3C (ENSPCOG00000024937) RNF115 (ENSPCOG00000025202) CD160 (ENSPCOG00000021195) PDZK1 (ENSPCOG00000017661) ENSPCOG00000026855 GJA8 (ENSPCOG00000017237) ENSPCOG00000018085 ACP6 (ENSPCOG00000000088) BCL9 (ENSPCOG00000016470) ENSPCOG00000027985 ENSPCOG00000018579 CHD1L (ENSPCOG00000023924) FMO5 (ENSPCOG00000021948) PRKAB2 (ENSPCOG00000014742) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 195 HJV (ENSPSMG00000013090) TXNIP (ENSPSMG00000013120) ENSPSMG00000013158 ANKRD34A (ENSPSMG00000013169) LIX1L (ENSPSMG00000013178) RBM8A (ENSPSMG00000013193) PEX11B (ENSPSMG00000013208) ITGA10 (ENSPSMG00000013227) ANKRD35 (ENSPSMG00000013257) PIAS3 (ENSPSMG00000013317) ##22 NUDT17 (ENSPSMG00000013359) POLR3C (ENSPSMG00000013402) RNF115 (ENSPSMG00000013416) CD160 (ENSPSMG00000013433) PDZK1 (ENSPSMG00000013455) ENSPSMG00000013481 GJA8 (ENSPSMG00000013496) GJA5 (ENSPSMG00000013497) ACP6 (ENSPSMG00000013564) BCL9 (ENSPSMG00000013606) ENSPSMG00000013618 CHD1L (ENSPSMG00000013817) FMO5 (ENSPSMG00000013977) PRKAB2 (ENSPSMG00000014030) ADAM30 (ENSPSMG00000014073) Bushbaby MODERN SPECIES 188 HJV (ENSOGAG00000026238) TXNIP (ENSOGAG00000000199) POLR3GL (ENSOGAG00000000200) ANKRD34A (ENSOGAG00000028203) LIX1L (ENSOGAG00000031746) RBM8A (ENSOGAG00000000202) PEX11B (ENSOGAG00000000204) ITGA10 (ENSOGAG00000000205) ANKRD35 (ENSOGAG00000025100) PIAS3 (ENSOGAG00000000207) ##22 NUDT17 (ENSOGAG00000000208) POLR3C (ENSOGAG00000000209) RNF115 (ENSOGAG00000000210) CD160 (ENSOGAG00000027280) PDZK1 (ENSOGAG00000028874) ENSOGAG00000003605 GJA8 (ENSOGAG00000024601) GJA5 (ENSOGAG00000024557) ACP6 (ENSOGAG00000003598) BCL9 (ENSOGAG00000003597) CHD1L (ENSOGAG00000008775) FMO5 (ENSOGAG00000012809) PRKAB2 (ENSOGAG00000012807) ADAM30 (ENSOGAG00000029766) NOTCH2 (ENSOGAG00000015075) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01100000263575.B.t.a.b ENSGT01100000263506.a.e.b ENSGT01050000244808.A.b.b.a ENSGT00950000183190.a.b.a.b ENSGT00420000029746.f ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01060000248645 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00390000007258 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 Tarsier MODERN SPECIES 5845 HFE2 (ENSTSYG00000013724) TXNIP (ENSTSYG00000013551) POLR3GL (ENSTSYG00000000052) LIX1L (ENSTSYG00000007282) RBM8A (ENSTSYG00000028809) 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(ENSCSAG00000001746) ENSCSAG00000000175 SEC22B (ENSCSAG00000001743) NOTCH2 (ENSCSAG00000001741) ADAM30 (ENSCSAG00000001737) ENSCSAG00000001734 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00730000110915.b ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 ENSGT00420000029746.e.a.b.b.b.a ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01060000248645 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00390000007258 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT00860000136151.f ENSGT00420000029746.e.a.b.a.a.a.b ENSGT00950000183190.a.a.b ENSGT00940000156349 ENSGT00940000155030 ENSGT00940000162954 ENSGT00420000029746.e.a.b.a.a.a.a.b.a ENSGT00420000029746.e.a.b.a.a.a.a.b.b.b.b ENSGT00940000161011 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00730000110915.b ENSGT00940000159402 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(ENSMNEG00000037230) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00730000110915.b ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 ENSGT00420000029746.e.a.b.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01060000248645 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00390000007258 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT00860000136151.f Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 131 ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 ENSGT00830000128380.q.a.b ENSGT00420000029746.e.a.b.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01060000248645 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00390000007258 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT00860000136151.f Sooty mangabey MODERN SPECIES 194 CHD1L (ENSCATG00000031044) FMO5 (ENSCATG00000040938) PRKAB2 (ENSCATG00000000041) ENSCATG00000017276 ENSCATG00000042290 HJV (ENSCATG00000038953) TXNIP (ENSCATG00000036044) POLR3GL (ENSCATG00000029165) ANKRD34A (ENSCATG00000022266) LIX1L (ENSCATG00000043797) RBM8A (ENSCATG00000021691) ENSCATG00000040744 PEX11B (ENSCATG00000043142) ITGA10 (ENSCATG00000036989) ANKRD35 (ENSCATG00000033067) PIAS3 (ENSCATG00000033935) ##22 NUDT17 (ENSCATG00000044860) POLR3C (ENSCATG00000040166) RNF115 (ENSCATG00000013570) CD160 (ENSCATG00000044591) PDZK1 (ENSCATG00000029964) ENSCATG00000036016 ENSCATG00000034054 Drill MODERN SPECIES 1162 FMO5 (ENSMLEG00000026338) PRKAB2 (ENSMLEG00000041069) ENSMLEG00000042644 ENSMLEG00000028976 ENSMLEG00000001564 HJV (ENSMLEG00000036644) TXNIP (ENSMLEG00000024506) POLR3GL (ENSMLEG00000025659) ANKRD34A (ENSMLEG00000027890) LIX1L (ENSMLEG00000029509) RBM8A (ENSMLEG00000039155) ENSMLEG00000033510 PEX11B (ENSMLEG00000035501) ITGA10 (ENSMLEG00000005613) ANKRD35 (ENSMLEG00000037307) PIAS3 (ENSMLEG00000042795) ##22 NUDT17 (ENSMLEG00000036200) POLR3C (ENSMLEG00000031091) ENSMLEG00000000453 RNF115 (ENSMLEG00000031561) CD160 (ENSMLEG00000033371) PDZK1 (ENSMLEG00000043823) ENSMLEG00000029169 ENSMLEG00000044374 ENSMLEG00000023206 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 203 ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01060000248645 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00390000007258 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT00940000154810.c ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 ENSGT00830000128380.q.a.b Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 68 HJV (ENSRBIG00000031275) TXNIP (ENSRBIG00000039040) POLR3GL (ENSRBIG00000042869) ANKRD34A (ENSRBIG00000001302) LIX1L (ENSRBIG00000027718) RBM8A (ENSRBIG00000039233) ENSRBIG00000036990 PEX11B (ENSRBIG00000031295) ITGA10 (ENSRBIG00000035019) ANKRD35 (ENSRBIG00000033813) PIAS3 (ENSRBIG00000031384) ##22 NUDT17 (ENSRBIG00000036472) POLR3C (ENSRBIG00000035432) RNF115 (ENSRBIG00000038852) CD160 (ENSRBIG00000029966) PDZK1 (ENSRBIG00000038400) ENSRBIG00000033905 GJA8 (ENSRBIG00000028150) GJA5 (ENSRBIG00000020890) ACP6 (ENSRBIG00000039939) BCL9 (ENSRBIG00000018886) ENSRBIG00000036800 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1787 ENSRROG00000037765 HJV (ENSRROG00000039652) TXNIP (ENSRROG00000038277) POLR3GL (ENSRROG00000042893) ANKRD34A (ENSRROG00000024046) LIX1L (ENSRROG00000043656) ENSRROG00000040324 ENSRROG00000033269 PEX11B (ENSRROG00000035432) ITGA10 (ENSRROG00000038520) ANKRD35 (ENSRROG00000032024) PIAS3 (ENSRROG00000036054) ##22 NUDT17 (ENSRROG00000041547) POLR3C (ENSRROG00000039959) RNF115 (ENSRROG00000039547) CD160 (ENSRROG00000033492) PDZK1 (ENSRROG00000043643) ENSRROG00000031200 ENSRROG00000043079 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000156302 ENSGT01100000263559.A.f.e ENSGT01060000248528.b.kh.yb.b.b.a.a ENSGT01100000263506.a.e.b ENSGT01050000244808.A.b.b.a ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01060000248645 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00390000007258 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000156302 ENSGT01100000263559.A.f.e ENSGT01060000248528.b.kh.yb.b.b.a.a ENSGT01100000263506.a.e.b ENSGT01050000244808.A.b.b.a ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01060000248645 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00390000007258 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 Marmoset MODERN SPECIES 9 ENSCJAG00000084541 ENSCJAG00000081006 ENSCJAG00000083457 ENSCJAG00000086209 HJV (ENSCJAG00000041142) TXNIP (ENSCJAG00000002161) POLR3GL (ENSCJAG00000002179) ANKRD34A (ENSCJAG00000002193) LIX1L (ENSCJAG00000002198) RBM8A (ENSCJAG00000046869) ENSCJAG00000002216 PEX11B (ENSCJAG00000002223) ITGA10 (ENSCJAG00000002231) ENSCJAG00000073435 ANKRD35 (ENSCJAG00000002247) PIAS3 (ENSCJAG00000002257) ##22 NUDT17 (ENSCJAG00000074938) POLR3C (ENSCJAG00000002314) RNF115 (ENSCJAG00000002332) CD160 (ENSCJAG00000002349) PDZK1 (ENSCJAG00000002353) ENSCJAG00000002362 GJA8 (ENSCJAG00000002367) GJA5 (ENSCJAG00000084416) ACP6 (ENSCJAG00000002370) BCL9 (ENSCJAG00000002384) CHD1L (ENSCJAG00000002406) ENSCJAG00000039766 FMO5 (ENSCJAG00000056470) PRKAB2 (ENSCJAG00000076520) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 115 ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01060000248645 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00940000167151 ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00390000007258 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 Capuchin MODERN SPECIES 541 HJV (ENSCCAG00000028604) TXNIP (ENSCCAG00000028414) POLR3GL (ENSCCAG00000025552) ANKRD34A (ENSCCAG00000019915) ENSCCAG00000034407 ENSCCAG00000028589 ENSCCAG00000020366 PEX11B (ENSCCAG00000029335) ITGA10 (ENSCCAG00000027810) ANKRD35 (ENSCCAG00000020263) PIAS3 (ENSCCAG00000020706) ##22 NUDT17 (ENSCCAG00000036240) POLR3C (ENSCCAG00000027077) RNF115 (ENSCCAG00000025268) CD160 (ENSCCAG00000034950) PDZK1 (ENSCCAG00000027287) ENSCCAG00000028988 ENSCCAG00000031658 ENSCCAG00000018187 ACP6 (ENSCCAG00000021812) BCL9 (ENSCCAG00000024432) CHD1L (ENSCCAG00000036079) FMO5 (ENSCCAG00000027415) PRKAB2 (ENSCCAG00000035402) ENSCCAG00000018893 ENSCCAG00000020684 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 253 HJV (ENSSBOG00000018828) TXNIP (ENSSBOG00000025441) LIX1L (ENSSBOG00000031027) RBM8A (ENSSBOG00000031316) ENSSBOG00000034418 PEX11B (ENSSBOG00000028402) ITGA10 (ENSSBOG00000027492) ANKRD35 (ENSSBOG00000030477) PIAS3 (ENSSBOG00000024628) ##22 NUDT17 (ENSSBOG00000018888) POLR3C (ENSSBOG00000028429) RNF115 (ENSSBOG00000028123) CD160 (ENSSBOG00000017632) PDZK1 (ENSSBOG00000024467) ENSSBOG00000029296 GJA8 (ENSSBOG00000016505) ACP6 (ENSSBOG00000020765) BCL9 (ENSSBOG00000031636) ENSSBOG00000027332 Mas night monkey DUPLICATION Mas night monkey MODERN SPECIES 643 ENSANAG00000021930 ENSANAG00000033730 ENSANAG00000021979 ENSANAG00000026292 TXNIP (ENSANAG00000029418) POLR3GL (ENSANAG00000034566) ANKRD34A (ENSANAG00000011901) LIX1L (ENSANAG00000027833) ENSANAG00000025460 RBM8A (ENSANAG00000004525) ENSANAG00000025306 PEX11B (ENSANAG00000034355) ITGA10 (ENSANAG00000028564) ANKRD35 (ENSANAG00000025664) ENSANAG00000019413 ##22 NUDT17 (ENSANAG00000029932) POLR3C (ENSANAG00000036434) RNF115 (ENSANAG00000031327) CD160 (ENSANAG00000037284) PDZK1 (ENSANAG00000030760) ENSANAG00000028144 ENSANAG00000025157 GJA8 (ENSANAG00000024079) ACP6 (ENSANAG00000036043) ENSANAG00000027807 CHD1L (ENSANAG00000024347) ENSANAG00000021255 FMO5 (ENSANAG00000020271) PRKAB2 (ENSANAG00000032448) Mas night monkey MODERN SPECIES 966 SRFBP1 (ENSANAG00000022485) PRR16 (ENSANAG00000022482) ENSANAG00000022201 FAM170A (ENSANAG00000022413) HSD17B4 (ENSANAG00000026074) TNFAIP8 (ENSANAG00000023898) DMXL1 (ENSANAG00000028002) ENSANAG00000022169 ENSANAG00000026934 ENSANAG00000024770 ENSANAG00000024194 SEMA6A (ENSANAG00000025286) ENSANAG00000026968 ENSANAG00000025676 COMMD10 (ENSANAG00000022465) ENSANAG00000024151 ##22 ENSANAG00000023278 ARL14EPL (ENSANAG00000023687) LVRN (ENSANAG00000027157) ENSANAG00000023676 ATG12 (ENSANAG00000023055) CDO1 (ENSANAG00000025385) KLHL25 (ENSANAG00000018034) AKAP13 (ENSANAG00000027868) PDE8A (ENSANAG00000024243) SLC28A1 (ENSANAG00000026896) ALPK3 (ENSANAG00000023039) ZNF592 (ENSANAG00000023866) ENSANAG00000023536 SEC11A (ENSANAG00000026730) NMB (ENSANAG00000025389) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263559.A.f.e ENSGT01100000263506.a.e.b ENSGT01050000244808.A.b.b.a ENSGT00950000183190.a.b.a.b ENSGT00420000029746.f ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01060000248645 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00390000007258 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01090000260658 ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT01100000263570.B ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 Tree shrew MODERN SPECIES 719 TXNIP (ENSTBEG00000014689) ENSTBEG00000014721 ANKRD34A (ENSTBEG00000014832) LIX1L (ENSTBEG00000014860) RBM8A (ENSTBEG00000014947) ENSTBEG00000014981 PEX11B (ENSTBEG00000015030) ENSTBEG00000015039 ITGA10 (ENSTBEG00000015073) PIAS3 (ENSTBEG00000015429) ##22 NUDT17 (ENSTBEG00000015448) POLR3C (ENSTBEG00000015610) Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT01100000263559.A.f.e ENSGT01100000263506.a.e.b ENSGT01050000244808.A.b.b.a ENSGT00950000183190.a.b.a.b ENSGT00420000029746.f ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01060000248645 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00390000007258 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01090000260658 ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT01100000263570.B ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156302 ENSGT01100000263559.A.f.e ENSGT01100000263506.a.e.b ENSGT01050000244808.A.b.b.a ENSGT00950000183190.a.b.a.b ENSGT00420000029746.f ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01060000248645 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00390000007258 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT01100000263570.B ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 ENSGT00940000155030 Rabbit MODERN SPECIES 4 ENSOCUG00000038567 ENSOCUG00000022427 ENSOCUG00000021718 ENSOCUG00000023196 HJV (ENSOCUG00000006209) ENSOCUG00000007257 TXNIP (ENSOCUG00000003010) POLR3GL (ENSOCUG00000006212) ANKRD34A (ENSOCUG00000029638) LIX1L (ENSOCUG00000003018) RBM8A (ENSOCUG00000025693) PEX11B (ENSOCUG00000003029) ITGA10 (ENSOCUG00000003032) ENSOCUG00000028209 ANKRD35 (ENSOCUG00000002128) PIAS3 (ENSOCUG00000026198) ##22 POLR3C (ENSOCUG00000003050) ENSOCUG00000003055 ENSOCUG00000030350 ENSOCUG00000024935 ENSOCUG00000002960 ENSOCUG00000030987 GJA8 (ENSOCUG00000002957) GJA5 (ENSOCUG00000016576) ACP6 (ENSOCUG00000000444) BCL9 (ENSOCUG00000012143) ENSOCUG00000027286 CHD1L (ENSOCUG00000009336) FMO5 (ENSOCUG00000009330) PRKAB2 (ENSOCUG00000009325) NOTCH2 (ENSOCUG00000016565) Pika MODERN SPECIES 4788 ENSOPRG00000009271 ##22 ENSOPRG00000009291 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163525 ENSGT01060000248528.b.jh.a.b ENSGT01100000263559.A.f.d.a.b ENSGT01100000263506.a.e.b ENSGT01050000244808.A.b.b.a ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01060000248645 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00390000007258 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01090000260658 ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT01100000263570.B ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156302 ENSGT01060000248528.b.kh.yb.a.b ENSGT01100000263559.A.f.e ENSGT01100000263506.a.e.b ENSGT01050000244808.A.b.b.a ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01060000248645 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT00910000145379.c ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00390000007258 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT01100000263570.B ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 ENSGT00950000183190.a.a.b Kangaroo rat MODERN SPECIES 358 Zfp326 (ENSDORG00000014049) ENSDORG00000000376 Lrrc8c (ENSDORG00000026385) Lrrc8b (ENSDORG00000010331) ENSDORG00000023821 Hjv (ENSDORG00000004311) Txnip (ENSDORG00000014260) ENSDORG00000014259 Ankrd34a (ENSDORG00000027982) Lix1l (ENSDORG00000004221) ENSDORG00000027340 ENSDORG00000004224 Pex11b (ENSDORG00000023422) Itga10 (ENSDORG00000008520) Ankrd35 (ENSDORG00000001803) Pias3 (ENSDORG00000013427) ##22 Polr3c (ENSDORG00000013430) Rnf115 (ENSDORG00000007839) ENSDORG00000008399 Gpr89 (ENSDORG00000023702) Gja8 (ENSDORG00000000930) ENSDORG00000016000 Bcl9 (ENSDORG00000003296) Chd1l (ENSDORG00000013555) ENSDORG00000001332 ENSDORG00000000256 Prkab2 (ENSDORG00000027473) ENSDORG00000024515 Sec22b (ENSDORG00000023311) Notch2 (ENSDORG00000001171) Reg4 (ENSDORG00000009271) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT01100000263559.A.f.d.a.a ENSGT00940000156302 ENSGT01060000248528.b.kh.yb.a.b ENSGT01100000263559.A.f.e ENSGT01100000263506.a.e.b ENSGT01050000244808.A.b.b.a ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01060000248645 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00390000007258 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT01100000263570.B ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 ENSGT00950000183190.a.a.b Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 69 Mtmr11 (ENSJJAG00000013193) Sf3b4 (ENSJJAG00000022500) Sv2a (ENSJJAG00000019928) Bola1 (ENSJJAG00000018323) ENSJJAG00000014139 ENSJJAG00000020529 Hjv (ENSJJAG00000012429) Txnip (ENSJJAG00000013701) ENSJJAG00000019638 Ankrd34a (ENSJJAG00000011251) Lix1l (ENSJJAG00000017071) ENSJJAG00000009488 Pex11b (ENSJJAG00000003343) Itga10 (ENSJJAG00000023352) Ankrd35 (ENSJJAG00000001517) Pias3 (ENSJJAG00000020778) ##22 Nudt17 (ENSJJAG00000018335) Polr3c (ENSJJAG00000011447) Rnf115 (ENSJJAG00000007841) ENSJJAG00000000868 Gpr89 (ENSJJAG00000020361) Gja8 (ENSJJAG00000013389) Gja5 (ENSJJAG00000009810) ENSJJAG00000021945 Bcl9 (ENSJJAG00000020720) ENSJJAG00000023016 Fmo5 (ENSJJAG00000018621) Prkab2 (ENSJJAG00000023668) ENSJJAG00000019713 ENSJJAG00000010827 Notch2 (ENSJJAG00000013302) Muroidea ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000163525 ENSGT01060000248528.b.kh.xb.b.b ENSGT01060000248528.b.jh.a.b ENSGT01100000263559.A.f.d.a.b ENSGT01100000263506.a.e.b ENSGT01050000244808.A.b.b.a ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01060000248645 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00390000007258 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT01100000263570.B ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 ENSGT00950000183190.a.a.b Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 566 Hjv (ENSNGAG00000022980) Txnip (ENSNGAG00000005485) ENSNGAG00000021570 Ankrd34a (ENSNGAG00000023908) Lix1l (ENSNGAG00000022975) ENSNGAG00000016038 Pex11b (ENSNGAG00000018663) Itga10 (ENSNGAG00000012531) Ankrd35 (ENSNGAG00000017275) Pias3 (ENSNGAG00000003830) ##22 Nudt17 (ENSNGAG00000014352) Polr3c (ENSNGAG00000013090) Rnf115 (ENSNGAG00000009988) ENSNGAG00000022883 Gpr89 (ENSNGAG00000020501) Gja8 (ENSNGAG00000016598) Gja5 (ENSNGAG00000014986) Acp6 (ENSNGAG00000018284) Bcl9 (ENSNGAG00000016930) ENSNGAG00000016310 ENSNGAG00000015883 Chd1l (ENSNGAG00000000908) Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01100000263506.a.e.a.a.a.b.b.b ENSGT01060000248528.b.kh.xb.a.b ENSGT00940000153092.a.a.c.a.a.f.b ENSGT01100000263559.A.f.e ENSGT01100000263506.a.e.b ENSGT01050000244808.A.b.b.a ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT00940000165934 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00390000007258 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 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ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT01100000263570.B ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 ENSGT00950000183190.a.a.b Prairie vole MODERN SPECIES 8 Mrpl9 (ENSMOCG00000002992) Oaz3 (ENSMOCG00000002831) ENSMOCG00000002113 Lingo4 (ENSMOCG00000002527) Rorc (ENSMOCG00000004458) Them5 (ENSMOCG00000002275) Hjv (ENSMOCG00000013781) Txnip (ENSMOCG00000015375) Polr3gl (ENSMOCG00000001317) Ankrd34a (ENSMOCG00000003145) Lix1l (ENSMOCG00000015984) ENSMOCG00000017782 Pex11b (ENSMOCG00000018183) Itga10 (ENSMOCG00000022662) Ankrd35 (ENSMOCG00000012567) Pias3 (ENSMOCG00000019927) ##22 Nudt17 (ENSMOCG00000001212) Polr3c (ENSMOCG00000000997) Rnf115 (ENSMOCG00000019619) Cd160 (ENSMOCG00000021710) Pdzk1 (ENSMOCG00000004696) Gpr89 (ENSMOCG00000005315) Gja8 (ENSMOCG00000009290) Gja5 (ENSMOCG00000019445) Acp6 (ENSMOCG00000021116) Bcl9 (ENSMOCG00000002460) Chd1l (ENSMOCG00000006305) Fmo5 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ENSGT00940000160426 ENSGT01100000263559.A.f.e ENSGT01100000263506.a.e.b ENSGT01050000244808.A.b.b.a ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01060000248645 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00390000007258 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01090000260658 ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT01100000263570.B ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT01100000263575.B.u ENSGT00940000156302 ENSGT01100000263559.A.f.e ENSGT01100000263506.a.e.b ENSGT01050000244808.A.b.b.a ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01100000264175 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT01100000263570.B ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 ENSGT00950000183190.a.a.b ENSGT00940000156349 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01100000264175 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT01100000263570.B ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 ENSGT00950000183190.a.a.b ENSGT00940000156349 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01100000264175 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT01100000263570.B ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 ENSGT00950000183190.a.a.b ENSGT00940000156349 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 275 HJV (ENSCLAG00000001025) TXNIP (ENSCLAG00000000404) ENSCLAG00000000412 ANKRD34A (ENSCLAG00000000448) LIX1L (ENSCLAG00000000519) RBM8A (ENSCLAG00000000547) PEX11B (ENSCLAG00000000635) ITGA10 (ENSCLAG00000000814) ANKRD35 (ENSCLAG00000000443) PIAS3 (ENSCLAG00000000625) ##22 NUDT17 (ENSCLAG00000001048) POLR3C (ENSCLAG00000001652) RNF115 (ENSCLAG00000000561) PDZK1 (ENSCLAG00000000212) ENSCLAG00000000463 GJA8 (ENSCLAG00000017420) GJA5 (ENSCLAG00000000616) ENSCLAG00000000638 ACP6 (ENSCLAG00000000662) BCL9 (ENSCLAG00000000718) ENSCLAG00000000734 ENSCLAG00000000754 CHD1L (ENSCLAG00000000880) FMO5 (ENSCLAG00000000948) PRKAB2 (ENSCLAG00000000963) Degu MODERN SPECIES 371 HJV (ENSODEG00000000544) TXNIP (ENSODEG00000000474) ENSODEG00000000270 ANKRD34A (ENSODEG00000018558) LIX1L (ENSODEG00000000194) ENSODEG00000000114 ENSODEG00000000986 PEX11B (ENSODEG00000000939) ITGA10 (ENSODEG00000000677) ANKRD35 (ENSODEG00000000594) PIAS3 (ENSODEG00000000344) ##22 NUDT17 (ENSODEG00000000612) POLR3C (ENSODEG00000000304) ENSODEG00000000255 RNF115 (ENSODEG00000000231) ENSODEG00000000182 ENSODEG00000000161 GJA5 (ENSODEG00000018514) ENSODEG00000000102 ENSODEG00000001175 BCL9 (ENSODEG00000001161) ENSODEG00000001153 Guinea pig MODERN SPECIES 2 SELENOF (ENSCPOG00000037223) HS2ST1 (ENSCPOG00000005010) LMO4 (ENSCPOG00000012113) PKN2 (ENSCPOG00000000537) GTF2B (ENSCPOG00000014028) KYAT3 (ENSCPOG00000009695) HJV (ENSCPOG00000010745) TXNIP (ENSCPOG00000027326) ENSCPOG00000030717 ANKRD34A (ENSCPOG00000013792) LIX1L (ENSCPOG00000013799) RBM8A (ENSCPOG00000022453) PEX11B (ENSCPOG00000002755) ITGA10 (ENSCPOG00000002756) ANKRD35 (ENSCPOG00000002766) PIAS3 (ENSCPOG00000002771) ##22 POLR3C (ENSCPOG00000004654) RNF115 (ENSCPOG00000024517) PDZK1 (ENSCPOG00000005364) ENSCPOG00000008390 GJA8 (ENSCPOG00000019781) GJA5 (ENSCPOG00000008219) ACP6 (ENSCPOG00000012209) BCL9 (ENSCPOG00000012202) ENSCPOG00000022795 CHD1L (ENSCPOG00000009000) Fmo5 (ENSCPOG00000013868) PRKAB2 (ENSCPOG00000033400) ENSCPOG00000007934 SEC22B (ENSCPOG00000031768) NOTCH2 (ENSCPOG00000015738) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 10 ENSHGLG00000036146 HIST1H4I (ENSHGLG00000040309) ENSHGLG00000040039 ENSHGLG00000038422 ENSHGLG00000009060 ENSHGLG00000035132 ENSHGLG00000005199 ANKRD34A (ENSHGLG00000009270) ENSHGLG00000005879 LIX1L (ENSHGLG00000008928) RBM8A (ENSHGLG00000033593) ENSHGLG00000006230 PEX11B (ENSHGLG00000005185) ITGA10 (ENSHGLG00000010384) ANKRD35 (ENSHGLG00000008812) PIAS3 (ENSHGLG00000005009) ##22 NUDT17 (ENSHGLG00000034982) POLR3C (ENSHGLG00000014978) ENSHGLG00000014613 ENSHGLG00000041766 ENSHGLG00000049549 ENSHGLG00000009553 ENSHGLG00000008167 GJA8 (ENSHGLG00000020482) ENSHGLG00000006450 GJA5 (ENSHGLG00000037183) ENSHGLG00000043134 ENSHGLG00000004803 BCL9 (ENSHGLG00000013904) ENSHGLG00000034080 ENSHGLG00000048596 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153118.db.a.a.b.a.b ENSGT00940000153118.db.a.a.b.a.a ENSGT01100000263575.B.u ENSGT01100000263506.a.e.b ENSGT01050000244808.A.b.b.a ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01060000248645 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00390000007258 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01090000260658 ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493.m ENSGT00940000159284 ENSGT00940000162954 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 99 ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01060000248645 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000002799 ENSGT01090000260200.e ENSGT00940000157203 ENSGT00390000007258 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01090000260658 ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493.n Alpin marmot MODERN SPECIES 138 HJV (ENSMMMG00000015524) TXNIP (ENSMMMG00000015514) ENSMMMG00000015500 ANKRD34A (ENSMMMG00000015494) LIX1L (ENSMMMG00000015481) RBM8A (ENSMMMG00000015472) ENSMMMG00000015463 PEX11B (ENSMMMG00000015439) ITGA10 (ENSMMMG00000015372) ANKRD35 (ENSMMMG00000015361) PIAS3 (ENSMMMG00000015314) ##22 POLR3C (ENSMMMG00000015297) ENSMMMG00000015296 RNF115 (ENSMMMG00000015274) CD160 (ENSMMMG00000015256) PDZK1 (ENSMMMG00000015180) ENSMMMG00000015172 GJA8 (ENSMMMG00000015166) ENSMMMG00000015162 GJA5 (ENSMMMG00000015156) ACP6 (ENSMMMG00000015008) BCL9 (ENSMMMG00000014990) CHD1L (ENSMMMG00000014961) ENSMMMG00000014946 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 186 ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01060000248645 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000002799 ENSGT01090000260200.e ENSGT00940000157203 ENSGT00390000007258 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 810 HJV (ENSUPAG00010010065) TXNIP (ENSUPAG00010010057) ENSUPAG00010010032 ANKRD34A (ENSUPAG00010010029) LIX1L (ENSUPAG00010010014) RBM8A (ENSUPAG00010009994) ENSUPAG00010009988 PEX11B (ENSUPAG00010009966) ITGA10 (ENSUPAG00010009892) ANKRD35 (ENSUPAG00010009874) PIAS3 (ENSUPAG00010009842) ##22 POLR3C (ENSUPAG00010009818) ENSUPAG00010009816 ENSUPAG00010009804 CD160 (ENSUPAG00010009794) Squirrel MODERN SPECIES 466 HJV (ENSSTOG00000013901) TXNIP (ENSSTOG00000013904) POLR3GL (ENSSTOG00000013914) ANKRD34A (ENSSTOG00000022513) LIX1L (ENSSTOG00000020689) RBM8A (ENSSTOG00000013917) ENSSTOG00000013923 PEX11B (ENSSTOG00000030389) ITGA10 (ENSSTOG00000013934) ANKRD35 (ENSSTOG00000023029) PIAS3 (ENSSTOG00000006105) ##22 POLR3C (ENSSTOG00000014601) RNF115 (ENSSTOG00000013568) ENSSTOG00000010189 GJA8 (ENSSTOG00000022242) ACP6 (ENSSTOG00000000856) BCL9 (ENSSTOG00000000850) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES ENSSVLG00005000095 ENSSVLG00005000088 ENSSVLG00005004594 H2BC18 (ENSSVLG00005004581) FCGR1A (ENSSVLG00005004523) HJV (ENSSVLG00005004426) TXNIP (ENSSVLG00005004403) POLR3GL (ENSSVLG00005004386) ANKRD34A (ENSSVLG00005004364) LIX1L (ENSSVLG00005004342) RBM8A (ENSSVLG00005004314) ENSSVLG00005004296 PEX11B (ENSSVLG00005004265) ITGA10 (ENSSVLG00005004180) ANKRD35 (ENSSVLG00005004120) PIAS3 (ENSSVLG00005004062) ##22 NUDT17 (ENSSVLG00005004030) POLR3C (ENSSVLG00005004005) RNF115 (ENSSVLG00005003979) CD160 (ENSSVLG00005003958) ENSSVLG00005003919 ENSSVLG00005003882 GJA8 (ENSSVLG00005003866) GJA5 (ENSSVLG00005003855) ACP6 (ENSSVLG00005003822) BCL9 (ENSSVLG00005003796) ENSSVLG00005003777 ENSSVLG00005003766 ENSSVLG00005003761 ENSSVLG00005003748 CHD1L (ENSSVLG00005003586) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 117 ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01100000263883 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00940000174226 ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00390000007258 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684 ENSGT01050000244864.D ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT01100000263570.B ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 146 ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT00940000165856 ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT00940000174226 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00390000007258 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684.d ENSGT01050000244864.D ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT01100000263570.B ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 ENSGT00940000162954.j Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 148 ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT00940000165856 ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT00940000174226 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00390000007258 ENSGT00950000182849.A.f.b ENSGT00390000000684.d ENSGT01050000244864.D ENSGT01050000244864.C ENSGT00940000158408 ENSGT00730000110915.b ENSGT01100000263570.B ENSGT00940000159402 ENSGT00940000160493 ENSGT00940000159284 ENSGT00940000162954.j Elephant MODERN SPECIES 67 HJV (ENSLAFG00000023384) TXNIP (ENSLAFG00000011010) ENSLAFG00000011013 LIX1L (ENSLAFG00000011028) ENSLAFG00000011031 ENSLAFG00000021886 ENSLAFG00000016093 PEX11B (ENSLAFG00000030003) ITGA10 (ENSLAFG00000029411) ANKRD35 (ENSLAFG00000032168) PIAS3 (ENSLAFG00000008326) ##22 NUDT17 (ENSLAFG00000008330) POLR3C (ENSLAFG00000029485) RNF115 (ENSLAFG00000008332) CD160 (ENSLAFG00000008333) PDZK1 (ENSLAFG00000028525) ENSLAFG00000012258 GJA8 (ENSLAFG00000004247) GJA5 (ENSLAFG00000030397) ACP6 (ENSLAFG00000014859) BCL9 (ENSLAFG00000014851) ENSLAFG00000026876 ENSLAFG00000027490 ENSLAFG00000029760 ENSLAFG00000031352 CHD1L (ENSLAFG00000018136) Hyrax MODERN SPECIES 6966 ANKRD35 (ENSPCAG00000010198) PIAS3 (ENSPCAG00000010300) ##22 NUDT17 (ENSPCAG00000010453) POLR3C (ENSPCAG00000010501) RNF115 (ENSPCAG00000010610) CD160 (ENSPCAG00000010675) Tenrec MODERN SPECIES 10395 ENSETEG00000010010 ##22 NUDT17 (ENSETEG00000010012) Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 261 ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000158522 ENSGT01100000263883 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00390000005869.a ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000014273.b ENSGT00940000158423 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00390000007258 ENSGT00950000182849.A.f.b Armadillo MODERN SPECIES 4158 ENSDNOG00000034450 HJV (ENSDNOG00000039654) TXNIP (ENSDNOG00000038212) ENSDNOG00000016011 ANKRD34A (ENSDNOG00000048350) LIX1L (ENSDNOG00000034222) PEX11B (ENSDNOG00000025467) ITGA10 (ENSDNOG00000016024) ANKRD35 (ENSDNOG00000040291) PIAS3 (ENSDNOG00000010958) ##22 NUDT17 (ENSDNOG00000016299) POLR3C (ENSDNOG00000012149) ENSDNOG00000044139 RNF115 (ENSDNOG00000035217) CD160 (ENSDNOG00000036112) ENSDNOG00000000375 Platypus MODERN SPECIES 88 APH1A (ENSOANG00000043325) ENSOANG00000039352 ENSOANG00000045338 PLEKHO1 (ENSOANG00000041629) ENSOANG00000003375 MTMR11 (ENSOANG00000040114) ENSOANG00000037391 HJV (ENSOANG00000040602) TXNIP (ENSOANG00000041306) ENSOANG00000040128 ENSOANG00000043050 ENSOANG00000043928 PEX11B (ENSOANG00000040317) ITGA10 (ENSOANG00000046912) ANKRD35 (ENSOANG00000021904) PIAS3 (ENSOANG00000040422) ##22 ENSOANG00000038849 RNF115 (ENSOANG00000036987) ENSOANG00000047977 ENSOANG00000034161 ENSOANG00000049515 ENSOANG00000039089 ENSOANG00000050560 ARHGEF11 (ENSOANG00000038766) ENSOANG00000049547 ENSOANG00000041104 ENSOANG00000043311 KIRREL1 (ENSOANG00000031542) ENSOANG00000050273 ENSOANG00000009678 MBLAC1 (ENSOANG00000048702) Sauria ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000161732 ENSGT00940000157244 ENSGT00940000161509 ENSGT00940000155399 ENSGT00940000162656 ENSGT00410000026290.i ENSGT00940000160567 ENSGT00940000154566 ENSGT00390000002390.b ENSGT00390000005131 ENSGT00570000079224 ENSGT00390000005125 ENSGT00940000158341 ENSGT01030000234534.B.a.a.b ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00940000158423 ENSGT00940000164422 ENSGT00940000164158.A ENSGT00950000185785 ENSGT00390000014273.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000012355.B.b ENSGT01060000248645 ENSGT00940000158522 ENSGT00950000183112.b.b Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000165149 ENSGT00940000161732 ENSGT00940000157244 ENSGT00940000161509 ENSGT00940000155399 ENSGT00940000162656 ENSGT00940000160567 ENSGT00940000154566 ENSGT00390000002390.b ENSGT00390000005131 ENSGT00570000079224 ENSGT00390000005125 ENSGT00940000158341 ENSGT01030000234534.B.a.a.b ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00940000158423 ENSGT00940000164422 ENSGT00940000164158.A ENSGT00390000014273.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000012355.B.b ENSGT01060000248645 ENSGT00940000158522 ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00950000186203 tuatara MODERN SPECIES 1930 RAB25 (ENSSPUG00000002555) ENSSPUG00000002526 MEX3A (ENSSPUG00000002522) LMNA (ENSSPUG00000002510) SEMA4A (ENSSPUG00000002416) SLC25A44 (ENSSPUG00000002391) PMF1 (ENSSPUG00000002356) PAQR6 (ENSSPUG00000002286) SMG5 (ENSSPUG00000002260) TMEM79 (ENSSPUG00000002207) GLMP (ENSSPUG00000002191) CCT3 (ENSSPUG00000002180) SSR2 (ENSSPUG00000002144) ARHGEF2 (ENSSPUG00000002103) ENSSPUG00000002083 PIAS3 (ENSSPUG00000001929) ##22 NUDT17 (ENSSPUG00000001888) POLR3C (ENSSPUG00000001834) RNF115 (ENSSPUG00000001822) ITGA10 (ENSSPUG00000001665) ENSSPUG00000001627 PEX11B (ENSSPUG00000001598) LIX1L (ENSSPUG00000001586) RBM8A (ENSSPUG00000001576) ENSSPUG00000001354 ANKRD34A (ENSSPUG00000001325) POLR3GL (ENSSPUG00000001305) TXNIP (ENSSPUG00000001302) ENSSPUG00000001224 ENSSPUG00000001218 ENSSPUG00000001204 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT00940000158341 ENSGT01030000234534.B.a.a.b ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 Elapidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 Indian cobra MODERN SPECIES 17 ENSNNAG00000018650 ITGA10 (ENSNNAG00000018665) RNF115 (ENSNNAG00000018688) POLR3C (ENSNNAG00000018690) NUDT17 (ENSNNAG00000018695) PEX11B (ENSNNAG00000018700) ENSNNAG00000018701 RBM8A (ENSNNAG00000018706) PRRC1 (ENSNNAG00000018711) ENSNNAG00000018715 FRMD8 (ENSNNAG00000018718) ENSNNAG00000018725 ENSNNAG00000018727 ENSNNAG00000018730 RXFP4 (ENSNNAG00000018732) PIAS3 (ENSNNAG00000018737) ##22 SMG5 (ENSNNAG00000018751) ATG2A (ENSNNAG00000018767) SCYL1 (ENSNNAG00000018772) ENSNNAG00000018776 PC (ENSNNAG00000018779) ENSNNAG00000018800 ENSNNAG00000018802 ENSNNAG00000018804 RHBG (ENSNNAG00000018811) ENSNNAG00000018829 ENSNNAG00000018839 HAPLN2 (ENSNNAG00000018844) MEF2D (ENSNNAG00000018857) IQGAP3 (ENSNNAG00000018874) NAXE (ENSNNAG00000018884) Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 121 ENSGT00570000079224 ENSGT00390000005131 ENSGT00940000164158.A ENSGT00940000164422 ENSGT00940000158423 ENSGT00940000157203 ENSGT00390000002799 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000014273.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT00390000003837 ENSGT00530000063721.B ENSGT01030000234534.B.a.a.b ENSGT00940000158341 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 295 CCT3 (ENSNSUG00000010560) ENSNSUG00000010564 ENSNSUG00000010566 ITGA10 (ENSNSUG00000010572) RNF115 (ENSNSUG00000010578) ENSNSUG00000010586 POLR3C (ENSNSUG00000010588) PEX11B (ENSNSUG00000010665) LIX1L (ENSNSUG00000010666) RBM8A (ENSNSUG00000010667) PRRC1 (ENSNSUG00000010671) ENSNSUG00000010673 FRMD8 (ENSNSUG00000010674) RXFP4 (ENSNSUG00000010679) ARHGEF2 (ENSNSUG00000010682) PIAS3 (ENSNSUG00000010694) ##22 Eastern brown snake MODERN SPECIES 183 CCT3 (ENSPTXG00000013701) ENSPTXG00000013699 ENSPTXG00000013698 ENSPTXG00000013697 ITGA10 (ENSPTXG00000013696) RNF115 (ENSPTXG00000013694) POLR3C (ENSPTXG00000013693) NUDT17 (ENSPTXG00000013689) PEX11B (ENSPTXG00000013687) LIX1L (ENSPTXG00000013684) RBM8A (ENSPTXG00000013683) PRRC1 (ENSPTXG00000017964) FRMD8 (ENSPTXG00000017963) RXFP4 (ENSPTXG00000017962) ARHGEF2 (ENSPTXG00000017960) PIAS3 (ENSPTXG00000017959) ##22 ANKRD35 (ENSPTXG00000017958) Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 6014 PIAS3 (ENSLLTG00000009822) ##22 Lizard MODERN SPECIES 162 ENSACAG00000013782 ##22 Laterata ANCESTRAL SPECIES 89 ENSGT00940000158341 ENSGT01030000234534.B.a.a.b ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 Common wall lizard MODERN SPECIES 7 TXNIP (ENSPMRG00000017147) ENSPMRG00000017140 ENSPMRG00000017137 ENSPMRG00000017132 ANKRD34A (ENSPMRG00000017128) ENSPMRG00000017125 RBM8A (ENSPMRG00000017123) ENSPMRG00000017120 LIX1L (ENSPMRG00000017117) PEX11B (ENSPMRG00000017106) ENSPMRG00000017101 ENSPMRG00000017097 ARHGEF2 (ENSPMRG00000017077) ENSPMRG00000017067 ANKRD35 (ENSPMRG00000017060) PIAS3 (ENSPMRG00000017047) ##22 NUDT17 (ENSPMRG00000017035) ENSPMRG00000017028 PAQR6 (ENSPMRG00000017021) SMG5 (ENSPMRG00000017013) TMEM79 (ENSPMRG00000017009) GLMP (ENSPMRG00000018637) CCT3 (ENSPMRG00000018628) ENSPMRG00000018624 SSR2 (ENSPMRG00000018621) CST6 (ENSPMRG00000018614) NAALADL1 (ENSPMRG00000018264) EEF1G (ENSPMRG00000018217) ENSPMRG00000018212 AHNAK (ENSPMRG00000018207) SAC3D1 (ENSPMRG00000018206) Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 186 F11R (ENSSMRG00000013772) ENSSMRG00000013771 USF1 (ENSSMRG00000013767) ARHGAP30 (ENSSMRG00000013762) NECTIN4 (ENSSMRG00000013760) ENSSMRG00000013758 TMEM79 (ENSSMRG00000013742) SMG5 (ENSSMRG00000013737) ENSSMRG00000013734 ENSSMRG00000013731 ITLN1 (ENSSMRG00000013729) ARHGEF2 (ENSSMRG00000013715) RXFP4 (ENSSMRG00000013714) ENSSMRG00000013713 ANKRD35 (ENSSMRG00000013712) PIAS3 (ENSSMRG00000013711) ##22 NUDT17 (ENSSMRG00000013710) SSR2 (ENSSMRG00000013706) ENSSMRG00000013705 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000161732 ENSGT00940000157244 ENSGT00940000161509 ENSGT00940000155399 ENSGT00940000162656 ENSGT00410000026290.i ENSGT00940000160567 ENSGT00940000154566 ENSGT00390000002390.b ENSGT00390000005131 ENSGT00570000079224 ENSGT00390000005125 ENSGT00940000158341 ENSGT01030000234534.B.a.a.b ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00940000158423 ENSGT00940000164422 ENSGT00940000164158.A ENSGT00950000185785 ENSGT00390000014273.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000012355.B.b ENSGT01100000263845 ENSGT00940000158522 ENSGT00950000183112.b.b Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000161732 ENSGT00940000157244 ENSGT00940000161509 ENSGT00940000155399 ENSGT00940000162656 ENSGT00410000026290.i ENSGT00940000160567 ENSGT00940000154566 ENSGT00390000002390.b ENSGT00390000005131 ENSGT00570000079224 ENSGT00390000005125 ENSGT00940000158341 ENSGT01030000234534.B.a.a.b ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00940000158423 ENSGT00940000164422 ENSGT00940000164158.A ENSGT00950000185785 ENSGT00390000014273.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00530000063712.a.a ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00940000165934 ENSGT00940000158522 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000161732 ENSGT00940000157244 ENSGT00940000161509 ENSGT00940000155399 ENSGT00940000162656 ENSGT00410000026290.i ENSGT00940000160567 ENSGT00940000154566 ENSGT00390000002390.b ENSGT00390000005131.a ENSGT00570000079224 ENSGT00390000005125 ENSGT00940000158341 ENSGT01030000234534.B.a.a.b ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00940000158423 ENSGT00940000164422 ENSGT00940000164158.A ENSGT00950000185785 ENSGT00390000014273.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00940000165934 ENSGT00940000158522 ENSGT00950000183112.b.b Emydidae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000161732 ENSGT00940000157244.h.b ENSGT00940000161509 ENSGT00940000155399 ENSGT00940000162656 ENSGT00410000026290.i ENSGT00940000160567 ENSGT00940000154566 ENSGT00390000002390.b ENSGT00390000005131.a ENSGT00570000079224 ENSGT00390000005125 ENSGT00940000158341 ENSGT01030000234534.B.a.a.b ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00940000158423 ENSGT00940000164422 ENSGT00940000164158.A ENSGT00950000185785 ENSGT00390000014273.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00940000165934 ENSGT00940000158522 ENSGT00950000183112.b.b painted turtle MODERN SPECIES 738 RXFP4 (ENSCPBG00000007801) ANKRD35 (ENSCPBG00000007806) PIAS3 (ENSCPBG00000007837) ##22 NUDT17 (ENSCPBG00000007873) POLR3C (ENSCPBG00000007883) RNF115 (ENSCPBG00000007896) ITGA10 (ENSCPBG00000007907) ENSCPBG00000007912 ENSCPBG00000007920 ENSCPBG00000007924 PEX11B (ENSCPBG00000007934) LIX1L (ENSCPBG00000007937) RBM8A (ENSCPBG00000007941) ENSCPBG00000007948 ANKRD34A (ENSCPBG00000007952) ENSCPBG00000007959 TXNIP (ENSCPBG00000007972) ENSCPBG00000007978 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 102 ENSTMTG00000021000 ENSTMTG00000021004 ENSTMTG00000021008 SLC25A44 (ENSTMTG00000021015) PMF1 (ENSTMTG00000021018) ENSTMTG00000021022 PAQR6 (ENSTMTG00000021023) SMG5 (ENSTMTG00000021032) TMEM79 (ENSTMTG00000021042) GLMP (ENSTMTG00000021048) CCT3 (ENSTMTG00000021053) ARHGEF2 (ENSTMTG00000021070) ENSTMTG00000021094 RXFP4 (ENSTMTG00000021106) ANKRD35 (ENSTMTG00000021116) PIAS3 (ENSTMTG00000021168) ##22 NUDT17 (ENSTMTG00000021186) POLR3C (ENSTMTG00000021195) RNF115 (ENSTMTG00000021211) ITGA10 (ENSTMTG00000021222) ENSTMTG00000021255 ENSTMTG00000021259 PEX11B (ENSTMTG00000021263) LIX1L (ENSTMTG00000021264) RBM8A (ENSTMTG00000003055) ENSTMTG00000003085 ANKRD34A (ENSTMTG00000003181) ENSTMTG00000003193 TXNIP (ENSTMTG00000003202) HJV (ENSTMTG00000003210) ENSTMTG00000003216 Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000161732 ENSGT00940000157244 ENSGT00940000161509 ENSGT00940000155399 ENSGT00940000162656 ENSGT00960000189418 ENSGT00940000160567 ENSGT00940000154566 ENSGT00390000002390.b ENSGT00390000005131.a ENSGT00570000079224 ENSGT00390000005125 ENSGT00940000158341 ENSGT01030000234534.B.a.a.b ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00940000158423 ENSGT00940000164422 ENSGT00940000164158.A ENSGT00390000014273.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000012355.B.b ENSGT00940000165934 ENSGT00940000158522 ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000165753 Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 1671 SLC25A44 (ENSCABG00000018148) PMF1 (ENSCABG00000018150) ENSCABG00000018151 ENSCABG00000018152 SMG5 (ENSCABG00000018154) TMEM79 (ENSCABG00000018156) ENSCABG00000018157 ENSCABG00000018158 CCT3 (ENSCABG00000018159) SSR2 (ENSCABG00000018160) ARHGEF2 (ENSCABG00000018164) ENSCABG00000018294 RXFP4 (ENSCABG00000018295) ENSCABG00000018296 ANKRD35 (ENSCABG00000018298) PIAS3 (ENSCABG00000018299) ##22 NUDT17 (ENSCABG00000018301) POLR3C (ENSCABG00000018302) RNF115 (ENSCABG00000018303) ITGA10 (ENSCABG00000018305) ENSCABG00000018306 PEX11B (ENSCABG00000018308) LIX1L (ENSCABG00000018310) RBM8A (ENSCABG00000018312) ENSCABG00000018313 ANKRD34A (ENSCABG00000018322) ENSCABG00000018323 TXNIP (ENSCABG00000018325) HJV (ENSCABG00000018327) ENSCABG00000018329 ENSCABG00000018333 Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 16 LMNA (ENSGEVG00005016668) SEMA4A (ENSGEVG00005016697) SLC25A44 (ENSGEVG00005016726) PMF1 (ENSGEVG00005016760) ENSGEVG00005016778 PAQR6 (ENSGEVG00005016803) SMG5 (ENSGEVG00005016873) TMEM79 (ENSGEVG00005016914) GLMP (ENSGEVG00005017028) CCT3 (ENSGEVG00005017052) SSR2 (ENSGEVG00005017086) ARHGEF2 (ENSGEVG00005017131) ENSGEVG00005017171 RXFP4 (ENSGEVG00005017219) ANKRD35 (ENSGEVG00005017285) PIAS3 (ENSGEVG00005017589) ##22 NUDT17 (ENSGEVG00005017632) POLR3C (ENSGEVG00005017684) RNF115 (ENSGEVG00005011822) ITGA10 (ENSGEVG00005011912) ENSGEVG00005012138 ENSGEVG00005012211 PEX11B (ENSGEVG00005012234) LIX1L (ENSGEVG00005012253) RBM8A (ENSGEVG00005012278) ENSGEVG00005012351 ANKRD34A (ENSGEVG00005012643) ENSGEVG00005012685 TXNIP (ENSGEVG00005012717) HJV (ENSGEVG00005012744) ENSGEVG00005012816 Chinese turtle MODERN SPECIES 779 ENSPSIG00000009833 S100A10 (ENSPSIG00000009746) ENSPSIG00000009724 THEM4 (ENSPSIG00000009620) C2CD4D (ENSPSIG00000000600) RORC (ENSPSIG00000008995) ENSPSIG00000008807 ENSPSIG00000008797 TDRKH (ENSPSIG00000008541) OAZ3 (ENSPSIG00000007970) MRPL9 (ENSPSIG00000007207) RIIAD1 (ENSPSIG00000007178) ENSPSIG00000007119 ENSPSIG00000007110 SNX27 (ENSPSIG00000006075) PIAS3 (ENSPSIG00000005069) ##22 POLR3C (ENSPSIG00000004694) RNF115 (ENSPSIG00000004247) ITGA10 (ENSPSIG00000003717) ENSPSIG00000003692 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000158341 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00940000158423 ENSGT00940000164422 ENSGT00390000014273.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000012355.B.b ENSGT01100000263845 ENSGT00940000158522 ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000165753 ENSGT00510000048165 Aves ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000158341 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00940000158423 ENSGT00940000164422 ENSGT00390000014273.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000012355.B.b ENSGT01100000263845 ENSGT00940000158522 ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000165753 ENSGT00510000048165 African ostrich MODERN SPECIES 728 PIAS3 (ENSSCUG00000010897) ##22 POLR3C (ENSSCUG00000010901) RNF115 (ENSSCUG00000010908) Neognathae ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000158341 ENSGT00530000063074.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.a ##22 ENSGT00390000013847 ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00940000158423 ENSGT00940000164422 ENSGT00390000014273.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00390000012355.B.b ENSGT01100000263845 ENSGT00940000158522 ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000165753 ENSGT00510000048165 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000158641 ENSGT00940000156794 ENSGT00390000009895 ENSGT00940000160112 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ENSGT00390000002799 ENSGT00940000157203 ENSGT00940000158423 ENSGT00940000164422 ENSGT00390000014273.b ENSGT00390000005869.a ENSGT00730000111185 ENSGT01050000244841.A.a.b ENSGT00530000063712.a.a.h ENSGT00390000012355.B.b ENSGT01100000263845 ENSGT00940000158522 ENSGT00950000186203 ENSGT00950000183112.b.b Golden eagle MODERN SPECIES 25 GABPB2 (ENSACCG00020001233) MLLT11 (ENSACCG00020001253) CDC42SE1 (ENSACCG00020001273) BNIPL (ENSACCG00020001318) PRUNE1 (ENSACCG00020001410) MINDY1 (ENSACCG00020001441) CERS2 (ENSACCG00020001469) SETDB1 (ENSACCG00020001501) ENSACCG00020001538 ARNT (ENSACCG00020001572) CTSK (ENSACCG00020001655) CTSS (ENSACCG00020001709) ENSACCG00020001764 ARHGEF2 (ENSACCG00020001874) ANKRD35 (ENSACCG00020001982) PIAS3 (ENSACCG00020002050) ##22 NUDT17 (ENSACCG00020002095) POLR3C (ENSACCG00020002120) RNF115 (ENSACCG00020002154) ITGA10 (ENSACCG00020002214) ENSACCG00020002265 PEX11B (ENSACCG00020002287) LIX1L (ENSACCG00020002309) RBM8A (ENSACCG00020002326) ENSACCG00020002351 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ENSGT00730000111185 ENSGT00390000012355.B.b ENSGT01100000264033 ENSGT00950000183112.b.b ENSGT00940000165753 ENSGT00510000048165 ENSGT00950000182940.b.a.b ENSGT00870000136537 ENSGT00940000160276 ENSGT00940000159172 ENSGT00950000183076.a.b.b.a.b ENSGT00730000111346 Chicken MODERN SPECIES 17 INSRR (ENSGALG00010027350) ENSGALG00010027348 ENSGALG00010027341 PRCC (ENSGALG00010027334) HDGF (ENSGALG00010027332) MRPL24 (ENSGALG00010027326) RRNAD1 (ENSGALG00010027325) ISG20L2 (ENSGALG00010027323) CRABP2 (ENSGALG00010027322) ENSGALG00010028745 NES (ENSGALG00010028348) BCAN (ENSGALG00010028339) HAPLN2 (ENSGALG00010028329) RHBG (ENSGALG00010028321) MEF2D (ENSGALG00010028314) PIAS3 (ENSGALG00010028748) ##22 ENSGALG00010028742 PEX11B (ENSGALG00010027423) LIX1L (ENSGALG00010027895) RBM8A (ENSGALG00010027889) ENSGALG00010028732 ENSGALG00010028727 ENSGALG00010027593 HJV (ENSGALG00010027586) ENSGALG00010028698 BOLA1 (ENSGALG00010027977) SV2A (ENSGALG00010028753) SF3B4 (ENSGALG00010028887) MTMR11 (ENSGALG00010028752) OTUD7B (ENSGALG00010028750) ENSGALG00010027297 Coelacanth MODERN SPECIES 325 PEX11B (ENSLACG00000017914) zgc:64022 (ENSLACG00000017780) tlr18 (ENSLACG00000017699) ITGA10 (ENSLACG00000017533) PIAS3 (ENSLACG00000017337) ##22 NUDT17 (ENSLACG00000017283) POLR3C (ENSLACG00000017216) RNF115 (ENSLACG00000017108) ENSLACG00000017028 CRABP2 (ENSLACG00000016804) ISG20L2 (ENSLACG00000016732) METTL25B (ENSLACG00000016641) MRPL24 (ENSLACG00000016614) HDGF (ENSLACG00000016471) ENSLACG00000016286 NTRK1 (ENSLACG00000015751) ENSLACG00000015473 ENSLACG00000015295 ENSLACG00000015056 RBM8A (ENSLACG00000014365) Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 223 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000164138 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b Elephant shark MODERN SPECIES 1767 smad3b 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ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00950000182965.a.a ENSGT01030000234518.B.a.b ENSGT00940000159819 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 92 ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000153499.b.b.d ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000164138 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00950000182965.a.a ENSGT01030000234518.B.a.b ENSGT00940000159819 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00940000166523 ENSGT00940000157244 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000153499.b.b.d ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000164138 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00950000182965.a.a ENSGT01030000234518.B.a.b ENSGT00940000159819 Spotted gar MODERN SPECIES 669 dis3l (ENSLOCG00000013846) tipin (ENSLOCG00000013854) map2k1 (ENSLOCG00000013858) rpl4 (ENSLOCG00000013867) zwilch (ENSLOCG00000013873) lctla (ENSLOCG00000013878) crybgx (ENSLOCG00000013888) snapc5 (ENSLOCG00000013891) smad6a (ENSLOCG00000013892) smad3b (ENSLOCG00000013897) aagab (ENSLOCG00000013907) iqch (ENSLOCG00000013914) zgc:162898 (ENSLOCG00000013920) map2k5 (ENSLOCG00000013923) skor1a (ENSLOCG00000013929) PIAS1 (ENSLOCG00000013933) ##22 calml4a (ENSLOCG00000013940) CLN6 (ENSLOCG00000013946) ENSLOCG00000013948 itga11a (ENSLOCG00000013952) CORO2B (ENSLOCG00000013967) anp32a (ENSLOCG00000013972) NOX5 (ENSLOCG00000013975) glcea (ENSLOCG00000013983) paqr5a (ENSLOCG00000013987) kif23 (ENSLOCG00000013995) tle3a (ENSLOCG00000014008) UACA (ENSLOCG00000014022) morf4l1 (ENSLOCG00000014029) ENSLOCG00000017946 ADAMTS7 (ENSLOCG00000014032) Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 148 ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000153499.b.b.d ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT01030000234534.B.a.b ENSGT00950000182965.a.a ENSGT00940000157475 ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000155837 ENSGT00940000158844 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000162591 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00940000158689 ENSGT00940000155465.i ENSGT00940000155465.j ENSGT00940000164138 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000157859 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00390000018400.a ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000018145 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000165890 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b.d ENSGT00390000007218 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00950000182965.a.a ENSGT00940000157475 ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000155837 ENSGT00940000158844 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000162591 ENSGT00950000182907.a.b.b.b.a ENSGT00940000158689 ENSGT00940000155465.i ENSGT00940000164138 ENSGT00940000159819 ENSGT00940000154617.B.e ENSGT00390000008748.b.f ENSGT00940000159572.a.a P. kingsleyae MODERN SPECIES 146 ENSPKIG00000015215 ENSPKIG00000015455 dis3l (ENSPKIG00000015490) ENSPKIG00000015547 tipin (ENSPKIG00000015565) map2k1 (ENSPKIG00000015608) rpl4 (ENSPKIG00000015644) lctla (ENSPKIG00000015716) smad6a (ENSPKIG00000015767) smad3b (ENSPKIG00000015799) aagab (ENSPKIG00000015838) zgc:162898 (ENSPKIG00000015892) map2k5 (ENSPKIG00000015970) ENSPKIG00000016124 skor1a (ENSPKIG00000016152) PIAS1 (ENSPKIG00000016189) ##22 morf4l1 (ENSPKIG00000016253) UACA (ENSPKIG00000016315) tle3a (ENSPKIG00000016380) ENSPKIG00000016421 kif23 (ENSPKIG00000016508) paqr5a (ENSPKIG00000016740) glceb (ENSPKIG00000016806) NOX5 (ENSPKIG00000016853) anp32a (ENSPKIG00000016897) CORO2B (ENSPKIG00000016948) itga11a (ENSPKIG00000017016) ENSPKIG00000017070 ENSPKIG00000017089 ADAMTS7 (ENSPKIG00000017111) chrna7a (ENSPKIG00000017165) Asian bonytongue MODERN SPECIES 2 lctla (ENSSFOG00015008481) crybgx (ENSSFOG00015008536) smad6a (ENSSFOG00015029740) smad3b (ENSSFOG00015008603) aagab (ENSSFOG00015008638) zgc:162898 (ENSSFOG00015008646) map2k5 (ENSSFOG00015008680) ENSSFOG00015028767 skor1a (ENSSFOG00015008718) PIAS1 (ENSSFOG00015008750) ##22 ENSSFOG00015027278 morf4l1 (ENSSFOG00015008833) UACA (ENSSFOG00015008887) tle3a (ENSSFOG00015008917) kif23 (ENSSFOG00015009021) paqr5a (ENSSFOG00015009123) glceb (ENSSFOG00015009150) NOX5 (ENSSFOG00015009192) anp32a (ENSSFOG00015032753) CORO2B (ENSSFOG00015009298) itga11a (ENSSFOG00015009348) ENSSFOG00015009558 ENSSFOG00015027576 ADAMTS7 (ENSSFOG00015009600) ENSSFOG00015026980 Clupeocephala DUPLICATION Clupeocephala DUPLICATION Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000161659 ENSGT00940000158995.a ENSGT00940000163126.a.b ENSGT00940000159258.d ENSGT00980000198641 ENSGT00940000155333.A.a ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000157369.b ENSGT00940000165890 ENSGT00940000158146.a ENSGT00940000153499.b.b.d.b ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440.g.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.a ##22 ENSGT01030000234518.B.a.b.a.b ENSGT00940000158440.h ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b ##22 ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT00940000157475 ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000155837 ENSGT00940000158844 ENSGT00390000006043 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 327 ENSGT00940000159068 ENSGT00940000156718 ENSGT00530000063582.b ENSGT00390000007623.c ENSGT01030000235035 ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000157369.b ENSGT00940000165890 ENSGT00940000158146.a ENSGT00940000153499.b.b.d.b ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440.g.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.a ##22 ENSGT01030000234534.B.a.b.a.b ENSGT01030000234518.B.a.b.a.b.i ENSGT00940000157475.s.a ENSGT01030000234519.e.b.j ENSGT00940000155837 ENSGT00940000158844 ENSGT00390000006043.o Otophysi ANCESTRAL SPECIES 150 ENSGT00940000159068 ENSGT00940000156718 ENSGT00530000063582.b ENSGT00390000007623.c ENSGT01030000235035 ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000157369.b ENSGT00940000165890 ENSGT00940000158146.a ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b.j ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440.g.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.a ##22 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ENSCARG00000030747 ##22 Goldfish MODERN SPECIES 25 crybgx (ENSCARG00000035878) smad6a (ENSCARG00000035887) smad3a (ENSCARG00000035926) ENSCARG00000036461 mns1 (ENSCARG00000036477) ENSCARG00000036525 itga11a (ENSCARG00000036622) CORO2B (ENSCARG00000036888) anp32a (ENSCARG00000038207) glceb (ENSCARG00000038379) paqr5b (ENSCARG00000038406) CORO2B (ENSCARG00000038715) anp32a (ENSCARG00000040449) UACA (ENSCARG00000040575) PIAS1 (ENSCARG00000040731) ##22 ENSCARG00000040854 ##22 cldn15a (ENSCARG00000040864) fis1 (ENSCARG00000040876) GIGYF1 (ENSCARG00000052910) Zebrafish MODERN SPECIES 22 ENSDARG00000105574 nr1h3 (ENSDARG00000098439) MADD (ENSDARG00000003495) bbox1 (ENSDARG00000036135) ENSDARG00000111781 fibinb (ENSDARG00000087196) ENSDARG00000105641 dis3l (ENSDARG00000053200) tipin (ENSDARG00000036136) lctla (ENSDARG00000036139) crybgx (ENSDARG00000036140) smad6a (ENSDARG00000053209) smad3a (ENSDARG00000036096) map2k5 (ENSDARG00000011851) skor1a (ENSDARG00000069030) PIAS1 (ENSDARG00000036094) ##22 ENSDARG00000069028 UACA (ENSDARG00000060238) tle3b (ENSDARG00000069006) paqr5b (ENSDARG00000052688) glceb (ENSDARG00000068981) anp32a (ENSDARG00000006487) CORO2B (ENSDARG00000079440) itga11a (ENSDARG00000036086) ITLN1 (ENSDARG00000095082) ENSDARG00000105568 itln2 (ENSDARG00000036084) ENSDARG00000093796 ENSDARG00000105598 zgc:153219 (ENSDARG00000054054) mns1 (ENSDARG00000060169) Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00950000183051.b.a ENSGT00940000156397.a.a ENSGT00940000159068 ENSGT00940000156718 ENSGT00530000063582.b ENSGT00390000007623.c ENSGT01030000235035 ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764.`b ENSGT00940000157369.b ENSGT00940000165890 ENSGT00940000158146.a ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b.j ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440.g.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.a ##22 ENSGT01030000234534.B.a.b.a.b ENSGT00940000157475.s.a ENSGT01030000234519.e.b.j.b.b ENSGT00940000158844.k ENSGT00390000006043.o ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00940000158689 ENSGT00940000155465.i ENSGT00730000111210 ENSGT00950000182885.A.a.e ENSGT00940000156912.c.a ENSGT00940000158805.a ENSGT00940000159515.c.b ENSGT00940000158300.f ENSGT00390000011846 Channel catfish MODERN SPECIES 19 znf536 (ENSIPUG00000020834) nr1h3 (ENSIPUG00000019883) ENSIPUG00000019875 madd (ENSIPUG00000019744) Bbox1 (ENSIPUG00000019724) fibin (ENSIPUG00000019720) muc15 (ENSIPUG00000019713) dis3l (ENSIPUG00000019669) tipin (ENSIPUG00000019666) crybgx (ENSIPUG00000019649) LCTL (ENSIPUG00000019586) smad6a (ENSIPUG00000019564) SMAD3 (ENSIPUG00000019525) map2k5 (ENSIPUG00000019485) skor1a (ENSIPUG00000019469) PIAS1 (ENSIPUG00000019429) ##22 ENSIPUG00000019422 uaca (ENSIPUG00000019360) tle3b (ENSIPUG00000019127) paqr5b (ENSIPUG00000019056) Glce (ENSIPUG00000019029) anp32a (ENSIPUG00000019014) coro2b (ENSIPUG00000018930) itga11 (ENSIPUG00000018854) mns1 (ENSIPUG00000018825) tph1b (ENSIPUG00000018783) Kcnc1 (ENSIPUG00000018769) cd81a (ENSIPUG00000018729) PKP3 (ENSIPUG00000018677) ENSIPUG00000018598 tssc4 (ENSIPUG00000018585) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00950000183051.b.a ENSGT00940000156397.a.a ENSGT00940000159068 ENSGT00940000156718 ENSGT00530000063582.b ENSGT00390000007623.c ENSGT01030000235035 ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764.`b ENSGT00940000157369.b ENSGT00940000165890 ENSGT00940000158146.a ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b.j ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440.h ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.a ##22 ENSGT01030000234534.B.a.b.a.b ENSGT00940000157475.s.a ENSGT01030000234519.e.b.j.b.b ENSGT00940000158844.k ENSGT00390000006043.o ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00940000158689 ENSGT00940000155465.i ENSGT00730000111210 ENSGT00950000182885.A.a.e ENSGT00940000156912.c.a ENSGT00940000158805.a ENSGT00940000159515.c.b ENSGT00940000158300.f ENSGT00390000011846 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00950000183051.b.a ENSGT00940000156397.a.a ENSGT00940000159068 ENSGT00940000156718 ENSGT00530000063582.b ENSGT00390000007623.c ENSGT01030000235035 ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764.`b ENSGT00940000157369.b ENSGT00940000165890 ENSGT00940000158146.a ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b.j ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440.h ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.a ##22 ENSGT01030000234534.B.a.b.a.b ENSGT00940000157475.s.a ENSGT01030000234519.e.b.j.b.b ENSGT00940000158844.k ENSGT00390000006043.o ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00940000158689 ENSGT00940000155465.i ENSGT00730000111210 ENSGT00950000182885.A.a.e ENSGT00940000156912.c.a ENSGT00940000158805.a ENSGT00940000159515.c.b ENSGT00940000158300.f ENSGT00390000011846 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 92 ZNF536 (ENSPNAG00000014223) nr1h3 (ENSPNAG00000014241) MADD (ENSPNAG00000014316) bbox1 (ENSPNAG00000014337) fibinb (ENSPNAG00000014347) ENSPNAG00000014354 dis3l (ENSPNAG00000014400) tipin (ENSPNAG00000014414) lctla (ENSPNAG00000003140) crybgx (ENSPNAG00000014505) smad6a (ENSPNAG00000014514) smad3a (ENSPNAG00000014544) map2k5 (ENSPNAG00000014566) ENSPNAG00000014587 PIAS1 (ENSPNAG00000003192) ##22 ENSPNAG00000014629 UACA (ENSPNAG00000003210) tle3b (ENSPNAG00000014802) paqr5b (ENSPNAG00000003288) glceb (ENSPNAG00000003298) anp32a (ENSPNAG00000014867) CORO2B (ENSPNAG00000014897) itga11a (ENSPNAG00000003319) mns1 (ENSPNAG00000003324) tph1b (ENSPNAG00000014954) kcnc1a (ENSPNAG00000014969) cd81a (ENSPNAG00000015010) PKP3 (ENSPNAG00000015030) ANO9 (ENSPNAG00000015146) tssc4 (ENSPNAG00000015157) Mexicana tetra MODERN SPECIES 47 ENSAMXG00000033278 nr1h3 (ENSAMXG00000006277) MADD (ENSAMXG00000006269) bbox1 (ENSAMXG00000006257) fibinb (ENSAMXG00000025955) ENSAMXG00000006252 dis3l (ENSAMXG00000006220) tipin (ENSAMXG00000035999) lctla (ENSAMXG00000006194) crybgx (ENSAMXG00000006190) ENSAMXG00000029211 smad6a (ENSAMXG00000006188) smad3a (ENSAMXG00000006181) map2k5 (ENSAMXG00000006170) ENSAMXG00000006162 PIAS1 (ENSAMXG00000006151) ##22 ENSAMXG00000025954 UACA (ENSAMXG00000006145) Electric eel MODERN SPECIES 82 ZNF536 (ENSEEEG00000020210) tshz3b (ENSEEEG00000020209) ZNF507 (ENSEEEG00000020208) 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SPECIES 17 orc6 (ENSMMDG00005012351) mylk3 (ENSMMDG00005012352) zgc:92818 (ENSMMDG00005012354) lrp3 (ENSMMDG00005012355) slc7a10a (ENSMMDG00005012358) rhpn2 (ENSMMDG00005012374) cep89 (ENSMMDG00005013375) zgc:165481 (ENSMMDG00005013378) ABCC12 (ENSMMDG00005013387) tmem208 (ENSMMDG00005013549) smad6a (ENSMMDG00005013552) ENSMMDG00005013629 SMAD3 (ENSMMDG00005013632) map2k5 (ENSMMDG00005013634) skor1a (ENSMMDG00005013640) PIAS1 (ENSMMDG00005013642) ##22 ENSMMDG00005013674 ENSMMDG00005013682 UACA (ENSMMDG00005014056) TLE3 (ENSMMDG00005014073) kif23 (ENSMMDG00005017427) paqr5a (ENSMMDG00005017824) glceb (ENSMMDG00005018113) anp32a (ENSMMDG00005018115) CORO2B (ENSMMDG00005018117) itga11a (ENSMMDG00005018120) ENSMMDG00005018123 ADAMTS7 (ENSMMDG00005018126) calml4a (ENSMMDG00005018129) ENSMMDG00005018130 chrna7a (ENSMMDG00005018132) Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000160700 ENSGT00390000009277 ENSGT00940000157545 ENSGT00510000047812 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000159628.c 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ENSTNIG00000003884 Fugu MODERN SPECIES 4 bloc1s6 (ENSTRUG00000021749) mibp2 (ENSTRUG00000016897) HAPLN3 (ENSTRUG00000016895) mfge8a (ENSTRUG00000016888) smad6a (ENSTRUG00000032173) abhd2a (ENSTRUG00000016883) rlbp1a (ENSTRUG00000016880) slc39a1 (ENSTRUG00000016874) tmem208 (ENSTRUG00000026186) tmem208 (ENSTRUG00000016873) ENSTRUG00000029807 smad6a (ENSTRUG00000022333) SMAD3 (ENSTRUG00000002512) map2k5 (ENSTRUG00000016851) skor1a (ENSTRUG00000016849) PIAS1 (ENSTRUG00000016843) ##22 ENSTRUG00000016840 ENSTRUG00000016836 UACA (ENSTRUG00000016819) TLE3 (ENSTRUG00000016796) kif23 (ENSTRUG00000016789) paqr5a (ENSTRUG00000016784) glceb (ENSTRUG00000024535) anp32a (ENSTRUG00000028503) CORO2B (ENSTRUG00000016762) itga11a (ENSTRUG00000016742) ENSTRUG00000016739 ADAMTS7 (ENSTRUG00000016709) calml4a (ENSTRUG00000016707) cln6a (ENSTRUG00000016705) ddb1 (ENSTRUG00000016682) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000160700 ENSGT00390000009277 ENSGT00940000157545 ENSGT00510000047812 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Ballan wrasse MODERN SPECIES 104 chrna7a (ENSLBEG00000018486) ENSLBEG00000018521 calml4a (ENSLBEG00000018565) ADAMTS7 (ENSLBEG00000018586) ENSLBEG00000018644 itga11a (ENSLBEG00000018674) CORO2B (ENSLBEG00000018741) anp32a (ENSLBEG00000018773) rlbp1a (ENSLBEG00000018790) slc39a1 (ENSLBEG00000018824) tmem208 (ENSLBEG00000018834) smad6a (ENSLBEG00000018875) SMAD3 (ENSLBEG00000018909) map2k5 (ENSLBEG00000018972) skor1a (ENSLBEG00000019091) PIAS1 (ENSLBEG00000019115) ##22 ENSLBEG00000019169 ENSLBEG00000019201 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000160700 ENSGT00390000009277 ENSGT00940000157545 ENSGT00510000047812 ENSGT00940000159842.qc ENSGT00940000159628.c ENSGT00940000156049.b ENSGT00950000182902.b.a.d.a ENSGT00940000164526.a ENSGT00940000164669 ENSGT00390000008139 ENSGT00940000158146.a ENSGT00940000153499.b.b.d.a.a ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440.g.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.a ##22 ENSGT01030000234518.B.a.b.a.b ENSGT00950000182965.a.b.a.b ENSGT00940000157475 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ENSGT00400000022240 ENSGT00940000154617.B.c Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000160700 ENSGT00390000009277 ENSGT00940000157545 ENSGT00510000047812 ENSGT00940000159842.qc ENSGT00940000159628.c ENSGT00940000156049.b ENSGT00950000182902.b.a.d.a ENSGT00940000164526.a ENSGT00940000164669 ENSGT00390000008139 ENSGT00940000158146.a ENSGT00940000153499.b.b.d.a.a ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440.g.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.a ##22 ENSGT01030000234518.B.a.b.a.b ENSGT00950000182965.a.b.a.b ENSGT00940000157475 ENSGT01030000234519.e.b.k.a ENSGT00940000155837.p ENSGT00940000158844 ENSGT00390000006043 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00940000158689 ENSGT00940000155465.i ENSGT01030000234518.B.a.b.a.a ENSGT00940000159819 ENSGT00940000157859.a.a ENSGT00400000022240 ENSGT00940000154617.B.c Seriola ANCESTRAL SPECIES 73 ENSGT00940000160700 ENSGT00390000009277 ENSGT00940000157545 ENSGT00510000047812 ENSGT00940000159842.qc ENSGT00940000159628.c ENSGT00940000156049.b ENSGT00950000182902.b.a.d.a ENSGT00940000164526.a ENSGT00940000164669 ENSGT00390000008139 ENSGT00940000158146.a ENSGT00940000153499.b.b.d.a.a ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440.g.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.a ##22 ENSGT01030000234518.B.a.b.a.b ENSGT00950000182965.a.b.a.b ENSGT00940000157475 ENSGT01030000234519.e.b.k.a ENSGT00940000155837.p ENSGT00940000158844 ENSGT00940000157231.b ENSGT00950000183058.A.a.d ENSGT00950000183058.A.b.b ENSGT00390000018895.a ENSGT00390000000155.a.a ENSGT00390000011985 ENSGT01090000259985.b.b.a.a.k.b.d ENSGT01090000259985.b.b.a.a.k.b.c ENSGT01090000259985.b.b.a.b Greater amberjack MODERN SPECIES 242 spata5l1 (ENSSDUG00000016519) zgc:153317 (ENSSDUG00000016526) slc30a4 (ENSSDUG00000016531) bloc1s6 (ENSSDUG00000016550) mibp2 (ENSSDUG00000016586) HAPLN3 (ENSSDUG00000016925) mfge8a (ENSSDUG00000016943) abhd2a (ENSSDUG00000016969) ENSSDUG00000017002 slc39a1 (ENSSDUG00000017030) tmem208 (ENSSDUG00000017044) smad6a (ENSSDUG00000017082) SMAD3 (ENSSDUG00000017091) map2k5 (ENSSDUG00000017109) skor1a (ENSSDUG00000017148) PIAS1 (ENSSDUG00000017186) ##22 ENSSDUG00000017219 ENSSDUG00000017240 UACA (ENSSDUG00000017296) TLE3 (ENSSDUG00000017338) kif23 (ENSSDUG00000017423) paqr5a (ENSSDUG00000017537) gpa33a (ENSSDUG00000017645) ENSSDUG00000017688 ildr1a (ENSSDUG00000017720) tmem39a (ENSSDUG00000017772) PRSS23 (ENSSDUG00000017799) ENSSDUG00000017815 ENSSDUG00000017839 ENSSDUG00000017856 ENSSDUG00000017877 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2930 spata5l1 (ENSSLDG00000009352) zgc:153317 (ENSSLDG00000009371) slc30a4 (ENSSLDG00000009443) bloc1s6 (ENSSLDG00000009498) mibp2 (ENSSLDG00000009812) HAPLN3 (ENSSLDG00000010248) mfge8a (ENSSLDG00000010267) abhd2a (ENSSLDG00000010303) rlbp1a (ENSSLDG00000010365) slc39a1 (ENSSLDG00000010382) tmem208 (ENSSLDG00000010399) smad6a (ENSSLDG00000010424) SMAD3 (ENSSLDG00000010443) map2k5 (ENSSLDG00000010494) skor1a (ENSSLDG00000010569) PIAS1 (ENSSLDG00000010594) ##22 ENSSLDG00000010659 ENSSLDG00000010683 UACA (ENSSLDG00000010731) TLE3 (ENSSLDG00000010840) kif23 (ENSSLDG00000010981) paqr5a (ENSSLDG00000011203) ENSSLDG00000011227 ENSSLDG00000011255 ildr1a (ENSSLDG00000011305) tmem39a (ENSSLDG00000011350) PRSS23 (ENSSLDG00000011393) ENSSLDG00000011408 ENSSLDG00000011434 ENSSLDG00000011466 ENSSLDG00000011495 Barramundi perch MODERN SPECIES 96 spata5l1 (ENSLCAG00010001260) zgc:153317 (ENSLCAG00010001243) slc30a4 (ENSLCAG00010001238) bloc1s6 (ENSLCAG00010001233) mibp2 (ENSLCAG00010001214) HAPLN3 (ENSLCAG00010001202) mfge8a (ENSLCAG00010001190) abhd2a (ENSLCAG00010001176) ENSLCAG00010001169 slc39a1 (ENSLCAG00010001163) tmem208 (ENSLCAG00010001154) smad6a (ENSLCAG00010001144) SMAD3 (ENSLCAG00010001077) map2k5 (ENSLCAG00010001045) skor1a (ENSLCAG00010001038) PIAS1 (ENSLCAG00010001027) ##22 ENSLCAG00010001024 ENSLCAG00010001017 UACA (ENSLCAG00010001004) TLE3 (ENSLCAG00010000716) kif23 (ENSLCAG00010000311) paqr5a (ENSLCAG00010000180) glceb (ENSLCAG00010021542) anp32a (ENSLCAG00010021535) CORO2B (ENSLCAG00010021461) itga11a (ENSLCAG00010021386) ENSLCAG00010021364 ADAMTS7 (ENSLCAG00010021162) calml4a (ENSLCAG00010021069) ENSLCAG00010021064 chrna7a (ENSLCAG00010021054) Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000160700 ENSGT00390000009277 ENSGT00940000157545 ENSGT00510000047812 ENSGT00940000159842.qc ENSGT00940000159628.c ENSGT00940000156049.b ENSGT00950000182902.b.a.d.a ENSGT00940000164526.a ENSGT00940000164669 ENSGT00390000008139 ENSGT00940000158146.a ENSGT00940000153499.b.b.d.a.a ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440.g.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.a ##22 ENSGT01030000234518.B.a.b.a.b ENSGT00950000182965.a.b.a.b ENSGT00940000157475 ENSGT01030000234519.e.b.k.a ENSGT00940000155837.p Turbot MODERN SPECIES 17 spata5l1 (ENSSMAG00000021290) zgc:153317 (ENSSMAG00000029975) slc30a4 (ENSSMAG00000021292) bloc1s6 (ENSSMAG00000021293) mibp2 (ENSSMAG00000021294) HAPLN3 (ENSSMAG00000030247) MFGE8 (ENSSMAG00000021296) abhd2a (ENSSMAG00000021297) ENSSMAG00000021298 slc39a1 (ENSSMAG00000034740) ENSSMAG00000021300 smad6a (ENSSMAG00000021301) ENSSMAG00000021302 map2k5 (ENSSMAG00000021303) skor1a (ENSSMAG00000017446) PIAS1 (ENSSMAG00000021305) ##22 ENSSMAG00000021306 ENSSMAG00000021307 UACA (ENSSMAG00000021308) ENSSMAG00000021309 KIF23 (ENSSMAG00000021310) ENSSMAG00000021311 grk1a (ENSSMAG00000021312) ENSSMAG00000021313 pros1 (ENSSMAG00000021314) ENSSMAG00000021316 ENSSMAG00000021317 ENSSMAG00000021318 mettl21e (ENSSMAG00000036671) ENSSMAG00000021320 blzf1 (ENSSMAG00000021321) Tongue sole MODERN SPECIES 15 spata5l1 (ENSCSEG00000012712) ENSCSEG00000012721 dtwd1 (ENSCSEG00000012745) fgf7 (ENSCSEG00000012750) cops2 (ENSCSEG00000012761) SECISBP2L (ENSCSEG00000012789) ENSCSEG00000012802 ppm1g (ENSCSEG00000012809) mis12 (ENSCSEG00000012823) dld (ENSCSEG00000012831) fam120b (ENSCSEG00000012863) ENSCSEG00000012883 rufy2 (ENSCSEG00000012890) ENSCSEG00000012937 skor1a (ENSCSEG00000012944) PIAS1 (ENSCSEG00000012959) ##22 ENSCSEG00000012976 ENSCSEG00000012979 UACA (ENSCSEG00000012989) TLE3 (ENSCSEG00000013018) CSMD1 (ENSCSEG00000013080) ENSCSEG00000013156 rnaset2 (ENSCSEG00000013249) ENSCSEG00000013268 ENSCSEG00000013929 ENSCSEG00000013937 ddx21 (ENSCSEG00000013939) mpc1 (ENSCSEG00000013953) kifbp (ENSCSEG00000014017) ENSCSEG00000014023 vps26a (ENSCSEG00000014043) Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000004624.a.b ENSGT00940000160700 ENSGT00390000009277 ENSGT00940000157545 ENSGT00510000047812 ENSGT00940000159842.qc ENSGT00940000156049.b ENSGT00950000182902.b.a.d.a ENSGT00940000164526.a ENSGT00940000164669 ENSGT00390000008139 ENSGT00940000158146.a ENSGT00940000153499.b.b.d.a.a ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440.g.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.a ##22 ENSGT01030000234518.B.a.b.a.b ENSGT00950000182965.a.b.a.b ENSGT00940000157475 ENSGT01030000234519.e.b.k.a ENSGT00940000155837.p ENSGT00940000158844 ENSGT00390000006043 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00940000158689 ENSGT00940000155465.i ENSGT01030000234518.B.a.b.a.a ENSGT00940000159819 ENSGT00940000157859.a.a ENSGT00400000022240 ENSGT00940000154617.B.c Zig-zag eel MODERN SPECIES 17 ENSMAMG00000011790 spata5l1 (ENSMAMG00000011820) zgc:153317 (ENSMAMG00000011844) slc30a4 (ENSMAMG00000011974) bloc1s6 (ENSMAMG00000012006) mibp2 (ENSMAMG00000012031) MFGE8 (ENSMAMG00000012053) abhd2a (ENSMAMG00000012096) ENSMAMG00000028309 slc39a1 (ENSMAMG00000012122) ENSMAMG00000012132 smad6a (ENSMAMG00000012145) ENSMAMG00000012151 map2k5 (ENSMAMG00000012181) skor1a (ENSMAMG00000012260) PIAS1 (ENSMAMG00000012267) ##22 ENSMAMG00000012294 ENSMAMG00000012298 UACA (ENSMAMG00000012323) TLE3 (ENSMAMG00000012393) KIF23 (ENSMAMG00000012444) paqr5a (ENSMAMG00000012518) glceb (ENSMAMG00000012531) anp32a (ENSMAMG00000012549) CORO2B (ENSMAMG00000012992) itga11a (ENSMAMG00000013043) ENSMAMG00000013288 ENSMAMG00000013295 ENSMAMG00000024970 ENSMAMG00000013333 ENSMAMG00000013354 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000004624.a.b ENSGT00940000160700 ENSGT00390000009277 ENSGT00940000157545 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SPECIES 1133 ENSCVAG00000004637 ##22 ENSCVAG00000004659 ##22 ENSCVAG00000004664 ENSCVAG00000004715 UACA (ENSCVAG00000004755) Mummichog MODERN SPECIES 2381 ENSFHEG00000002718 spata5l1 (ENSFHEG00000002745) zgc:153317 (ENSFHEG00000002784) slc30a4 (ENSFHEG00000002802) bloc1s6 (ENSFHEG00000002826) mibp2 (ENSFHEG00000002843) mfge8a (ENSFHEG00000000710) abhd2a (ENSFHEG00000002888) ENSFHEG00000002949 slc39a1 (ENSFHEG00000002989) tmem208 (ENSFHEG00000003000) smad6a (ENSFHEG00000003014) SMAD3 (ENSFHEG00000003038) map2k5 (ENSFHEG00000003062) skor1a (ENSFHEG00000003074) PIAS1 (ENSFHEG00000003099) ##22 ENSFHEG00000003106 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00950000182902.b.a.d.a ENSGT00940000164526.a ENSGT00940000164669 ENSGT00390000008139 ENSGT00940000158146.a ENSGT00940000153499.b.b.d.a.a ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440.g.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.a ##22 ENSGT01030000234518.B.a.b.a.b ENSGT00950000182965.a.b.a.b ENSGT00940000157475 ENSGT01030000234519.e.b.k.a ENSGT00940000155837.p ENSGT00940000158844 ENSGT00390000006043 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00940000158689 ENSGT00940000155465.i ENSGT01030000234518.B.a.b.a.a ENSGT00940000159819 ENSGT00940000157859.a.a ENSGT00400000022240 ENSGT00940000154617.B.c Mangrove rivulus MODERN SPECIES 48 DOK4 (ENSKMAG00000012096) ccdc102a (ENSKMAG00000012052) txlng (ENSKMAG00000012016) rbb4l (ENSKMAG00000011977) HDGFL3 (ENSKMAG00000011937) TSSK2 (ENSKMAG00000011920) BNC1 (ENSKMAG00000011907) gjd6 (ENSKMAG00000011890) ENSKMAG00000011864 slc39a1 (ENSKMAG00000011846) tmem208 (ENSKMAG00000011828) smad6a (ENSKMAG00000011817) SMAD3 (ENSKMAG00000011796) map2k5 (ENSKMAG00000011774) skor1a (ENSKMAG00000011761) PIAS1 (ENSKMAG00000011737) ##22 ENSKMAG00000011711 ENSKMAG00000011691 UACA (ENSKMAG00000011640) TLE3 (ENSKMAG00000011582) Turquoise killifish MODERN SPECIES 1616 DTWD1 (ENSNFUG00015011814) ENSNFUG00015011688 SPATA5L1 (ENSNFUG00015011676) zgc:153317 (ENSNFUG00015011668) SLC30A4 (ENSNFUG00015011646) bloc1s6 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ENSGT00940000157859.a.a ENSGT00400000022240 ENSGT00940000154617.B.c Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000157545 ENSGT00510000047812 ENSGT00940000159842.qc ENSGT00940000159628.c ENSGT00940000156049.b ENSGT00950000182902.b.a.d.a ENSGT00940000164526.a ENSGT00940000164669 ENSGT01030000234614.B.a.a.a.s.b ENSGT00390000000223 ENSGT00390000008139 ENSGT00940000158146.a ENSGT00940000153499.b.b.d.a.a ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440.g.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.a ##22 ENSGT01030000234534.B.a.b.a.b ENSGT00950000182965.a.b.a.b ENSGT00940000157475 ENSGT01030000234519.e.b.k.a ENSGT00940000155837.p ENSGT00940000158844 ENSGT00390000006043 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00940000158689 ENSGT00940000155465.i ENSGT01030000234518.B.a.b.a.a ENSGT00940000159819 ENSGT00940000157859.a.a ENSGT00400000022240 ENSGT00940000154617.B.c Eastern happy MODERN SPECIES slc30a4 (ENSACLG00000016688) bloc1s6 (ENSACLG00000016660) mibp2 (ENSACLG00000016621) HAPLN3 (ENSACLG00000016603) mfge8a 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MODERN SPECIES 320 bloc1s6 (ENSNBRG00000022319) mibp2 (ENSNBRG00000022296) HAPLN3 (ENSNBRG00000022217) mfge8a (ENSNBRG00000022184) abhd2a (ENSNBRG00000022158) ENSNBRG00000022124 ENSNBRG00000022117 slc39a1 (ENSNBRG00000022103) ENSNBRG00000022097 STOM (ENSNBRG00000022084) tmem208 (ENSNBRG00000022070) smad6a (ENSNBRG00000022000) SMAD3 (ENSNBRG00000021957) map2k5 (ENSNBRG00000021875) skor1a (ENSNBRG00000021849) PIAS1 (ENSNBRG00000021813) ##22 ENSNBRG00000021798 ENSNBRG00000021781 UACA (ENSNBRG00000021740) TLE3 (ENSNBRG00000021683) kif23 (ENSNBRG00000021562) paqr5a (ENSNBRG00000021452) glceb (ENSNBRG00000021430) anp32a (ENSNBRG00000021326) CORO2B (ENSNBRG00000021273) itga11a (ENSNBRG00000021060) ENSNBRG00000021011 ENSNBRG00000020929 calml4a (ENSNBRG00000020905) ENSNBRG00000020818 chrna7a (ENSNBRG00000020709) Nile tilapia MODERN SPECIES slc30a4 (ENSONIG00000013317) mibp2 (ENSONIG00000013305) HAPLN3 (ENSONIG00000013302) mfge8a (ENSONIG00000013296) abhd2a (ENSONIG00000013290) 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(ENSACIG00000017282) CORO2B (ENSACIG00000017345) itga11a (ENSACIG00000017368) ENSACIG00000017458 ADAMTS7 (ENSACIG00000017468) calml4a (ENSACIG00000017515) cln6a (ENSACIG00000017522) chrna7a (ENSACIG00000017537) Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 152 ENSGT00940000158146.a ENSGT00940000153499.b.b.d.a.a ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440.g.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.a ##22 ENSGT01030000234518.B.a.b.a.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b ##22 ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT00940000157475 ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000165054.A.c ENSGT00940000155837.p ENSGT00940000158844 ENSGT00390000006043 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00940000158689 ENSGT00940000155465.i ENSGT00400000022240 ENSGT00940000157859.a.a ENSGT01030000234518.B.a.b.a.a Northern pike MODERN SPECIES 1 ENSELUG00000030198 ttc17 (ENSELUG00000020818) ENSELUG00000020845 ENSELUG00000020858 LRRC4C (ENSELUG00000031309) apip (ENSELUG00000020924) slc1a2a (ENSELUG00000000921) PAMR1 (ENSELUG00000020976) CRY2 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ENSGT00940000153499.b.b.d.a.a ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440.g.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.a.k.a.a ##22 ENSGT01030000234518.B.a.b.a.b ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT00950000182965.a.b.b.b ENSGT00940000157475 ENSGT01030000234519.e.b.m.a ENSGT00940000165054.A.c ENSGT00940000155837.p.d ENSGT00940000155837.p.c.a ENSGT00940000158844 ENSGT00390000006043 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00940000158689 ENSGT00940000155465.i ENSGT00940000154725.j.e.a ENSGT00400000022240 Huchen MODERN SPECIES 3556 ENSHHUG00000037918 skor1a (ENSHHUG00000037935) ENSHHUG00000037972 ##22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000153272.a.b.c.j ENSGT00390000015016.c ENSGT00940000155352.eb.a.b ENSGT00940000158980.tb ENSGT00940000154963.h ENSGT00390000014757.w.a ENSGT00940000161814.g.b.g.d.b.a ENSGT00940000157089.A.a ENSGT00940000159073 ENSGT00390000013315 ENSGT00940000161262.a.n ENSGT00940000158146.a.c.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.a ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440.g.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.a.k.a.a ##22 ENSGT01030000234518.B.a.b.a.b ENSGT00950000182965.a.b.a.a.h ENSGT00950000182965.a.b.a.a.g ENSGT00940000157475 ENSGT01030000234519.e.b.m.a ENSGT00940000165054.A.c ENSGT00940000155837.p.d ENSGT00940000155837.p.c.a ENSGT00940000158844 ENSGT00390000006043 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00940000158689 ENSGT00940000155465.i ENSGT00940000154725.j.e.a ENSGT00400000022240 Salmo ANCESTRAL SPECIES 396 ENSGT00940000158440.g.a.f ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.a.k.a.a ##22 ENSGT01030000234518.B.a.b.a.b.c Atlantic salmon MODERN SPECIES 2 ENSSSAG00000004788 ENSSSAG00000109804 ENSSSAG00000020893 ENSSSAG00000019260 ENSSSAG00000113219 ENSSSAG00000086111 ENSSSAG00000106407 ENSSSAG00000116546 ENSSSAG00000097937 ENSSSAG00000024743 smad6a (ENSSSAG00000103532) ENSSSAG00000005798 map2k5 (ENSSSAG00000088189) ENSSSAG00000118360 skor1a (ENSSSAG00000010641) PIAS1 (ENSSSAG00000101551) ##22 ENSSSAG00000091284 morf4l1 (ENSSSAG00000005810) ENSSSAG00000040259 ENSSSAG00000097865 TLE3 (ENSSSAG00000074519) ENSSSAG00000113764 KIF23 (ENSSSAG00000120697) PAQR5 (ENSSSAG00000113393) glceb (ENSSSAG00000111912) anp32a (ENSSSAG00000043489) CORO2B (ENSSSAG00000065753) itga11a (ENSSSAG00000102694) ENSSSAG00000084875 ENSSSAG00000063200 ENSSSAG00000082053 River trout MODERN SPECIES 209 MAP2K5 (ENSSTUG00000029973) ENSSTUG00000030019 skor1a (ENSSTUG00000030043) ENSSTUG00000030087 ENSSTUG00000030100 ##22 ENSSTUG00000030116 smad6a (ENSSTUG00000030138) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 341 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.a.k.a.a ##22 ENSGT01030000234518.B.a.b.a.b ENSGT00950000182965.a.b.a.a.h Rainbow trout DUPLICATION Rainbow trout MODERN SPECIES 27 ttc17 (ENSOMYG00000066781) hsd17b12b (ENSOMYG00000054352) ENSOMYG00000002918 ENSOMYG00000030570 ENSOMYG00000061757 apip (ENSOMYG00000071183) slc1a2a (ENSOMYG00000002858) ENSOMYG00000069110 ENSOMYG00000002832 ENSOMYG00000068058 smad6a (ENSOMYG00000074703) ENSOMYG00000002807 map2k5 (ENSOMYG00000064462) skor1a (ENSOMYG00000057349) ENSOMYG00000077338 PIAS1 (ENSOMYG00000070434) ##22 ENSOMYG00000002685 morf4l1 (ENSOMYG00000002673) ENSOMYG00000070845 ENSOMYG00000002551 TLE3 (ENSOMYG00000051984) ENSOMYG00000054756 KIF23 (ENSOMYG00000002448) PAQR5 (ENSOMYG00000002128) glceb (ENSOMYG00000021963) ENSOMYG00000073466 anp32a (ENSOMYG00000039157) CORO2B (ENSOMYG00000021985) itga11a (ENSOMYG00000001389) st3gal-i (ENSOMYG00000075936) ENSOMYG00000001458 Rainbow trout MODERN SPECIES 18 ttc17 (ENSOMYG00000040239) hsd17b12b (ENSOMYG00000065304) ENSOMYG00000040103 ENSOMYG00000055763 apip (ENSOMYG00000072316) slc1a2a (ENSOMYG00000051777) ENSOMYG00000024704 ENSOMYG00000057959 ENSOMYG00000056192 ENSOMYG00000064779 smad6a (ENSOMYG00000050910) smad3 (ENSOMYG00000064926) map2k5 (ENSOMYG00000065445) skor1a (ENSOMYG00000040079) ENSOMYG00000076342 PIAS1 (ENSOMYG00000049756) ##22 ENSOMYG00000064318 mo4l1 (ENSOMYG00000049978) UACA (ENSOMYG00000057286) TLE3 (ENSOMYG00000048144) ENSOMYG00000069520 kif23 (ENSOMYG00000039505) PAQR5 (ENSOMYG00000034607) glceb (ENSOMYG00000034637) anp32a (ENSOMYG00000037247) CORO2B (ENSOMYG00000075332) ENSOMYG00000058683 itga11a (ENSOMYG00000068392) ENSOMYG00000068823 ENSOMYG00000060771 ENSOMYG00000068105 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.a.k.a.b ##22 Huchen MODERN SPECIES 2939 ENSHHUG00000044061 ##22 ENSHHUG00000044065 morf4l1 (ENSHHUG00000044066) UACA (ENSHHUG00000044113) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.a.k.a.b ##22 Salmo ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000155352.eb.a.b ENSGT00940000158980.tb ENSGT00940000154963.h ENSGT00390000014757.w.a ENSGT00940000161814.g.b.g.d.b.a ENSGT00940000157089.A.a ENSGT00940000159073 ENSGT00390000013315 ENSGT00940000161262.a.n.e ENSGT00940000158146.a.c.a.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.a.d ENSGT00940000158146.a.c.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.a.c ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440.g.a.e.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.a.k.a.b ##22 ENSGT01030000234518.B.a.b.a.b.d ENSGT00950000182965.a.b.a.a.h Atlantic salmon MODERN SPECIES 18 ENSSSAG00000040431 ENSSSAG00000091855 apip (ENSSSAG00000042232) slc1a2a (ENSSSAG00000009050) ENSSSAG00000062807 CRY2 (ENSSSAG00000069768) ENSSSAG00000112050 ENSSSAG00000114794 ENSSSAG00000120164 ENSSSAG00000085173 chst1 (ENSSSAG00000004800) smad6a (ENSSSAG00000088892) ENSSSAG00000121852 map2k5 (ENSSSAG00000089565) skor1a (ENSSSAG00000065500) PIAS1 (ENSSSAG00000085914) ##22 ENSSSAG00000040397 mo4l1 (ENSSSAG00000081184) ENSSSAG00000096373 ENSSSAG00000113826 TLE3 (ENSSSAG00000084287) ENSSSAG00000076630 KIF23 (ENSSSAG00000095510) PAQR5 (ENSSSAG00000055316) glceb (ENSSSAG00000111347) anp32a (ENSSSAG00000113550) CORO2B (ENSSSAG00000120941) itga11a (ENSSSAG00000082935) ENSSSAG00000085685 ENSSSAG00000067960 ENSSSAG00000063212 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.a.k.a.b ##22 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.a.k.a.b ##22 Coho salmon MODERN SPECIES 358 ENSOKIG00005039398 PIAS1 (ENSOKIG00005038768) ##22 ENSOKIG00005038723 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.a.k.b ##22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.a.k.b ##22 Salmo ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.a.k.b ##22 River trout DUPLICATION River trout MODERN SPECIES 268 ENSSTUG00000024071 ##22 ENSSTUG00000024065 morf4l1 (ENSSTUG00000023850) morf4l1 (ENSSTUG00000023309) ENSSTUG00000023276 ENSSTUG00000023236 ##22 River trout MODERN SPECIES 268 ENSSTUG00000023236 ##22 ENSSTUG00000023276 morf4l1 (ENSSTUG00000023309) morf4l1 (ENSSTUG00000023850) ENSSTUG00000024065 ENSSTUG00000024071 ##22 Huchen MODERN SPECIES 7884 ENSHHUG00000021009 ##22 ENSHHUG00000021011 ENSHHUG00000021015 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.a.l ##22 Huchen MODERN SPECIES 10687 ENSHHUG00000016050 ##22 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000163126.a.b ENSGT00940000159258.d ENSGT00980000198641 ENSGT00940000155333.A.a ENSGT00530000063106.B 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ENSGT00390000008748.b.g.b Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b.f ENSGT00940000155836.A ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369.a ENSGT00390000010331 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b ##22 ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT01030000234519.e.b.l ENSGT01030000234519.e.b.k.b ENSGT00940000155837.o ENSGT00510000047881 ENSGT00990000203778 ENSGT00940000158775 ENSGT00390000016785 ENSGT00510000048454 ENSGT00930000151035.a ENSGT00390000012069 ENSGT00940000165047 ENSGT00940000157760.g.b ENSGT00940000165330 ENSGT00440000033504.A Cod MODERN SPECIES 22 SLC24A1 (ENSGMOG00000024598) ENSGMOG00000008354 ENSGMOG00000036396 ENSGMOG00000008355 ENSGMOG00000008356 map2k1 (ENSGMOG00000008358) rpl4 (ENSGMOG00000008359) zwilch (ENSGMOG00000008360) LCTL (ENSGMOG00000008361) snapc5 (ENSGMOG00000036981) smad6b (ENSGMOG00000008363) smad3b (ENSGMOG00000029371) aagab (ENSGMOG00000008365) zgc:162898 (ENSGMOG00000008367) skor1b (ENSGMOG00000033826) PIAS1 (ENSGMOG00000008372) ##22 morf4l1 (ENSGMOG00000008374) kif23 (ENSGMOG00000017492) ddb2 (ENSGMOG00000017517) kbtbd4 (ENSGMOG00000017530) rapsn (ENSGMOG00000017544) ighmbp2 (ENSGMOG00000017553) chid1 (ENSGMOG00000017597) gatd1 (ENSGMOG00000017617) cd151 (ENSGMOG00000017632) cracr2b (ENSGMOG00000017652) tmem138 (ENSGMOG00000032822) tmem258 (ENSGMOG00000017689) ENSGMOG00000032469 ENSGMOG00000017728 Fadsd6 (ENSGMOG00000017746) Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b.f ENSGT00940000155836.A ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369.a ENSGT00390000010331 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b ##22 ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT01030000234519.e.b.k.b ENSGT00940000155837.o ENSGT00510000047881 ENSGT00990000203778 ENSGT00940000158775 ENSGT00390000016785 ENSGT00510000048454 ENSGT00930000151035.a ENSGT00390000012069 ENSGT00940000165047 ENSGT00940000157760.g.b ENSGT00940000165330 ENSGT00440000033504.A ENSGT00390000018587.f Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 20 ints14 (ENSMMDG00005010242) SLC24A1 (ENSMMDG00005010216) ENSMMDG00005010200 ENSMMDG00005010191 map2k1 (ENSMMDG00005010104) rpl4 (ENSMMDG00005009927) zwilch (ENSMMDG00005009915) LCTL (ENSMMDG00005009714) snapc5 (ENSMMDG00005009708) smad6b (ENSMMDG00005009705) smad3b (ENSMMDG00005009590) aagab (ENSMMDG00005009566) iqch (ENSMMDG00005009565) zgc:162898 (ENSMMDG00005009564) skor1b (ENSMMDG00005009562) PIAS1 (ENSMMDG00005009535) ##22 morf4l1 (ENSMMDG00005009517) TLE3 (ENSMMDG00005007447) kif23 (ENSMMDG00005004943) ddb2 (ENSMMDG00005004863) ENSMMDG00005004856 kbtbd4 (ENSMMDG00005004850) rapsn (ENSMMDG00005004846) ighmbp2 (ENSMMDG00005004807) chid1 (ENSMMDG00005004213) gatd1 (ENSMMDG00005004177) cd151 (ENSMMDG00005004047) cracr2b (ENSMMDG00005021345) tmem138 (ENSMMDG00005021341) ENSMMDG00005021340 MYRF (ENSMMDG00005021336) Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b.f.c ENSGT00940000155836.A ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369.a ENSGT00390000010331 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b ##22 ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT01030000234519.e.b.k.b ENSGT00940000155837.o ENSGT00510000047881 ENSGT00990000203778 ENSGT00940000158775 ENSGT00390000016785 ENSGT00510000048454 ENSGT00930000151035.a ENSGT00390000012069 ENSGT00940000165047 ENSGT00940000157760.g.b ENSGT00940000165330 ENSGT00440000033504.A ENSGT00390000018587.f Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 249 hacd3 (ENSHCOG00000014277) ints14 (ENSHCOG00000014315) SLC24A1 (ENSHCOG00000014347) ENSHCOG00000014412 ENSHCOG00000014452 map2k1 (ENSHCOG00000014666) rpl4 (ENSHCOG00000014929) zwilch (ENSHCOG00000014943) LCTL (ENSHCOG00000014977) snapc5 (ENSHCOG00000014982) smad6b (ENSHCOG00000015011) smad3b (ENSHCOG00000015055) aagab (ENSHCOG00000015070) zgc:162898 (ENSHCOG00000015085) skor1b (ENSHCOG00000015092) PIAS1 (ENSHCOG00000015129) ##22 morf4l1 (ENSHCOG00000000418) TLE3 (ENSHCOG00000015185) kif23 (ENSHCOG00000015297) ddb2 (ENSHCOG00000015319) ENSHCOG00000015337 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b.f.c ENSGT00940000155836.A ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369.a ENSGT00390000010331 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b ##22 ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT01030000234519.e.b.k.b ENSGT00940000155837.o ENSGT00510000047881 ENSGT00990000203778 ENSGT00940000158775 ENSGT00390000016785 ENSGT00510000048454 ENSGT00930000151035.a ENSGT00390000012069 ENSGT00940000165047 ENSGT00940000157760.g.b ENSGT00940000165330 ENSGT00440000033504.A ENSGT00390000018587.f Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b.f.c ENSGT00940000155836.A ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369.a ENSGT00390000010331 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b ##22 ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT01030000234519.e.b.k.b ENSGT00940000155837.o ENSGT00510000047881 ENSGT00990000203778 ENSGT00940000158775 ENSGT00390000016785 ENSGT00510000048454 ENSGT00930000151035.a ENSGT00390000012069 ENSGT00940000165047 ENSGT00940000157760.g.b ENSGT00940000165330 ENSGT00440000033504.A ENSGT00390000018587.f Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b.f.c ENSGT00940000155836.A ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369.a ENSGT00390000010331 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b ##22 ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT01030000234519.e.b.k.b ENSGT00940000155837.o.f ENSGT00510000047881 ENSGT00990000203778 ENSGT00940000158775 ENSGT00390000016785 ENSGT00510000048454 ENSGT00930000151035.a ENSGT00390000012069 ENSGT00940000165047 ENSGT00940000157760.g.b ENSGT00940000165330 ENSGT00440000033504.A ENSGT00390000018587.f Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00530000062962.b.a.f ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b.f.c ENSGT00940000155836.A ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b.p ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369.a ENSGT00390000010331 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b ##22 ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT01030000234519.e.b.k.b ENSGT00940000155837.o.e.a ENSGT00510000047881 ENSGT00990000203778 ENSGT00940000158775 ENSGT00390000016785.c ENSGT00510000048454 ENSGT00940000160974.b.c ENSGT00390000017767.a.b ENSGT00390000010968.a ENSGT00940000164955.b ENSGT00940000156976.gb ENSGT00940000154905.i.b ENSGT00940000160836.d.b.a.a Tetraodon MODERN SPECIES 4 arih1 (ENSTNIG00000008420) ppcdc (ENSTNIG00000008421) hacd3 (ENSTNIG00000008422) ints14 (ENSTNIG00000008423) SLC24A1 (ENSTNIG00000008424) ENSTNIG00000008425 ENSTNIG00000008426 map2k1 (ENSTNIG00000008427) rpl4 (ENSTNIG00000008428) zwilch (ENSTNIG00000008429) LCTL (ENSTNIG00000008430) smad6b (ENSTNIG00000008431) smad3b (ENSTNIG00000008432) aagab (ENSTNIG00000008433) skor1b (ENSTNIG00000001504) PIAS1 (ENSTNIG00000008434) ##22 morf4l1 (ENSTNIG00000008435) TLE3 (ENSTNIG00000008436) kif23 (ENSTNIG00000008437) ENSTNIG00000008438 drd4a (ENSTNIG00000008439) GRAMD4 (ENSTNIG00000008440) ENSTNIG00000000775 CERK (ENSTNIG00000008441) ENSTNIG00000002358 MYO9A (ENSTNIG00000008442) ENSTNIG00000001255 ENSTNIG00000000287 OAZ2 (ENSTNIG00000008443) ppib (ENSTNIG00000008444) adpgk (ENSTNIG00000008445) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b.f.c ENSGT00940000155836.A ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369.a ENSGT00390000010331 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b ##22 ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT01030000234519.e.b.k.b ENSGT00940000155837.o.f ENSGT00510000047881 ENSGT00990000203778 ENSGT00940000158775 ENSGT00390000016785 ENSGT00510000048454 ENSGT00930000151035.a ENSGT00390000012069 ENSGT00940000165047 ENSGT00940000157760.g.b ENSGT00940000165330 ENSGT00440000033504.A ENSGT00390000018587.f Ballan wrasse MODERN SPECIES 40 SLC24A1 (ENSLBEG00000016038) SLC24A1 (ENSLBEG00000016014) ENSLBEG00000015940 ENSLBEG00000015733 map2k1 (ENSLBEG00000015601) rpl4 (ENSLBEG00000015490) zwilch (ENSLBEG00000015453) LCTL (ENSLBEG00000015396) snapc5 (ENSLBEG00000015381) smad6b (ENSLBEG00000015360) smad3b (ENSLBEG00000015322) aagab (ENSLBEG00000015299) iqch (ENSLBEG00000015224) zgc:162898 (ENSLBEG00000015192) skor1b (ENSLBEG00000015181) PIAS1 (ENSLBEG00000015142) ##22 morf4l1 (ENSLBEG00000015124) TLE3 (ENSLBEG00000015053) kif23 (ENSLBEG00000014888) ddb2 (ENSLBEG00000014759) ENSLBEG00000014710 kbtbd4 (ENSLBEG00000014698) rapsn (ENSLBEG00000014666) ENSLBEG00000014647 ighmbp2 (ENSLBEG00000014501) chid1 (ENSLBEG00000014374) gatd1 (ENSLBEG00000014333) cd151 (ENSLBEG00000014313) cracr2b (ENSLBEG00000014261) tmem258 (ENSLBEG00000014160) tmem138 (ENSLBEG00000014175) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b.f.c ENSGT00940000155836.A ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369.a ENSGT00390000010331 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b ##22 ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT01030000234519.e.b.k.b ENSGT00940000155837.o.f ENSGT00510000047881 ENSGT00990000203778 ENSGT00940000158775 ENSGT00390000016785 ENSGT00510000048454 ENSGT00930000151035.a ENSGT00390000012069 ENSGT00940000165047 ENSGT00940000157760.g.b ENSGT00940000165330 ENSGT00440000033504.A ENSGT00390000018587.f Perciformes ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b.f.c ENSGT00940000155836.A ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369.a ENSGT00390000010331 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b ##22 ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT01030000234519.e.b.k.b ENSGT00940000155837.o.f ENSGT00510000047881 ENSGT00990000203778 ENSGT00940000158775 ENSGT00390000016785 ENSGT00510000048454 ENSGT00930000151035.a ENSGT00390000012069 ENSGT00940000165047 ENSGT00940000157760.g.b ENSGT00940000165330 ENSGT00440000033504.A ENSGT00390000018587.f Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b.f.c ENSGT00940000155836.A ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369.a ENSGT00390000010331 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b ##22 ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT01030000234519.e.b.k.b ENSGT00940000155837.o.f ENSGT00510000047881 ENSGT00940000158775 ENSGT00390000016785 ENSGT00510000048454 ENSGT00930000151035.a ENSGT00390000012069 ENSGT00940000165047 ENSGT00940000157760.g.b ENSGT00940000165330 ENSGT00440000033504.A ENSGT00390000018587.f ENSGT00390000010089 Lumpfish MODERN SPECIES 21 SLC24A1 (ENSCLMG00005000323) ENSCLMG00005000266 ENSCLMG00005000242 map2k1 (ENSCLMG00005000174) RPL4 (ENSCLMG00005019911) rpl4 (ENSCLMG00005019898) zwilch (ENSCLMG00005019897) LCTL (ENSCLMG00005019896) snapc5 (ENSCLMG00005019894) smad6b (ENSCLMG00005019893) smad3b (ENSCLMG00005019769) aagab (ENSCLMG00005019765) iqch (ENSCLMG00005019726) zgc:162898 (ENSCLMG00005019722) skor1b (ENSCLMG00005019721) PIAS1 (ENSCLMG00005019623) ##22 morf4l1 (ENSCLMG00005019604) TLE3 (ENSCLMG00005019055) kif23 (ENSCLMG00005018591) ddb2 (ENSCLMG00005018579) kbtbd4 (ENSCLMG00005018576) rapsn (ENSCLMG00005018574) ENSCLMG00005018573 ighmbp2 (ENSCLMG00005018566) chid1 (ENSCLMG00005018557) gatd1 (ENSCLMG00005018556) cd151 (ENSCLMG00005018550) cracr2b (ENSCLMG00005018549) tmem138 (ENSCLMG00005018547) tmem258 (ENSCLMG00005018546) MYRF (ENSCLMG00005018545) Stickleback MODERN SPECIES 14 ints14 (ENSGACG00000004827) SLC24A1 (ENSGACG00000004859) ENSGACG00000004867 ENSGACG00000004885 map2k1 (ENSGACG00000004903) rpl4 (ENSGACG00000004968) zwilch (ENSGACG00000005043) LCTL (ENSGACG00000005057) snapc5 (ENSGACG00000005078) smad6b (ENSGACG00000005085) smad3b (ENSGACG00000005092) aagab (ENSGACG00000005119) iqch (ENSGACG00000005158) zgc:162898 (ENSGACG00000005167) skor1b (ENSGACG00000005171) PIAS1 (ENSGACG00000005176) ##22 morf4l1 (ENSGACG00000005181) TLE3 (ENSGACG00000005213) kif23 (ENSGACG00000005226) ddb2 (ENSGACG00000005252) kbtbd4 (ENSGACG00000005255) rapsn (ENSGACG00000005265) ighmbp2 (ENSGACG00000005293) chid1 (ENSGACG00000005331) gatd1 (ENSGACG00000005355) cd151 (ENSGACG00000005365) ENSGACG00000005397 cracr2b (ENSGACG00000005399) tmem138 (ENSGACG00000005406) tmem258 (ENSGACG00000005414) MYRF (ENSGACG00000005416) Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b.f.c ENSGT00940000155836.A ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369.a ENSGT00390000010331 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b ##22 ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT01030000234519.e.b.k.b ENSGT00940000155837.o.f ENSGT00510000047881 ENSGT00990000203778 ENSGT00940000158775 ENSGT00390000016785 ENSGT00510000048454 ENSGT00930000151035.a ENSGT00390000012069 ENSGT00940000165047 ENSGT00940000157760.g.b ENSGT00440000033504.A ENSGT00390000018587.f ENSGT00390000010089 Channel bull blenny MODERN SPECIES 20 ints14 (ENSCGOG00000010944) SLC24A1 (ENSCGOG00000010978) ENSCGOG00000011005 ENSCGOG00000012718 map2k1 (ENSCGOG00000012783) rpl4 (ENSCGOG00000014628) zwilch (ENSCGOG00000014660) LCTL (ENSCGOG00000014696) snapc5 (ENSCGOG00000014701) smad6b (ENSCGOG00000014702) smad3b (ENSCGOG00000014715) aagab (ENSCGOG00000015616) iqch (ENSCGOG00000015654) zgc:162898 (ENSCGOG00000015744) skor1b (ENSCGOG00000015746) PIAS1 (ENSCGOG00000015764) ##22 morf4l1 (ENSCGOG00000016522) TLE3 (ENSCGOG00000017111) kif23 (ENSCGOG00000017942) ddb2 (ENSCGOG00000018311) ENSCGOG00000018313 kbtbd4 (ENSCGOG00000018314) rapsn (ENSCGOG00000018322) ighmbp2 (ENSCGOG00000018334) chid1 (ENSCGOG00000018514) gatd1 (ENSCGOG00000018608) cd151 (ENSCGOG00000018619) cracr2b (ENSCGOG00000018659) tmem138 (ENSCGOG00000018664) tmem258 (ENSCGOG00000018662) EPS8L2 (ENSCGOG00000018669) Pike perch MODERN SPECIES 6 ints14 (ENSSLUG00000018842) SLC24A1 (ENSSLUG00000018879) ENSSLUG00000018947 ENSSLUG00000019161 map2k1 (ENSSLUG00000000165) rpl4 (ENSSLUG00000000272) zwilch (ENSSLUG00000000305) LCTL (ENSSLUG00000000329) snapc5 (ENSSLUG00000000334) smad6b (ENSSLUG00000000337) smad3b (ENSSLUG00000000353) aagab (ENSSLUG00000000395) iqch (ENSSLUG00000000409) zgc:162898 (ENSSLUG00000000425) skor1b (ENSSLUG00000000431) PIAS1 (ENSSLUG00000000454) ##22 morf4l1 (ENSSLUG00000000519) TLE3 (ENSSLUG00000000698) kif23 (ENSSLUG00000000973) ddb2 (ENSSLUG00000001144) ENSSLUG00000001150 kbtbd4 (ENSSLUG00000001154) rapsn (ENSSLUG00000001159) ENSSLUG00000001166 ighmbp2 (ENSSLUG00000001171) chid1 (ENSSLUG00000001180) gatd1 (ENSSLUG00000001189) cd151 (ENSSLUG00000001196) cracr2b (ENSSLUG00000001204) tmem138 (ENSSLUG00000001207) tmem258 (ENSSLUG00000001211) Eupecaria_C DUPLICATION Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b.a ##22 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b.a ##22 Large yellow croaker MODERN SPECIES 492 tmem138 (ENSLCRG00005007292) cracr2b (ENSLCRG00005007296) cd151 (ENSLCRG00005007302) gatd1 (ENSLCRG00005007306) chid1 (ENSLCRG00005007309) ighmbp2 (ENSLCRG00005007561) ENSLCRG00005007582 rapsn (ENSLCRG00005007583) kbtbd4 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ENSGT00990000203778 ENSGT00940000158775 ENSGT00390000016785 ENSGT00510000048454 ENSGT00930000151035.a ENSGT00390000012069 ENSGT00940000165047 ENSGT00940000157760.g.b ENSGT00440000033504.A ENSGT00390000018587.f ENSGT00390000010089 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b.f.c ENSGT00940000155836.A ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369.a ENSGT00390000010331 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b ##22 ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT01030000234519.e.b.k.b ENSGT00940000155837.o ENSGT00510000047881 ENSGT00990000203778 ENSGT00940000158775 ENSGT00390000016785 ENSGT00510000048454 ENSGT00930000151035.a ENSGT00390000012069 ENSGT00940000165047 ENSGT00940000157760.g.b ENSGT00440000033504.A ENSGT00390000018587.f ENSGT00390000010089 Climbing perch MODERN SPECIES 19 ints14 (ENSATEG00000009319) SLC24A1 (ENSATEG00000009377) ENSATEG00000009439 ENSATEG00000009531 map2k1 (ENSATEG00000009613) rpl4 (ENSATEG00000009670) zwilch (ENSATEG00000009702) LCTL (ENSATEG00000009711) snapc5 (ENSATEG00000009776) smad6b (ENSATEG00000009784) smad3b (ENSATEG00000009812) aagab (ENSATEG00000009864) iqch (ENSATEG00000009880) C15orf61 (ENSATEG00000028998) skor1b (ENSATEG00000009950) PIAS1 (ENSATEG00000009975) ##22 morf4l1 (ENSATEG00000009987) ENSATEG00000010004 kif23 (ENSATEG00000010066) ddb2 (ENSATEG00000010174) ENSATEG00000010195 kbtbd4 (ENSATEG00000010209) rapsn (ENSATEG00000010221) ENSATEG00000026938 ighmbp2 (ENSATEG00000010246) ENSATEG00000010296 chid1 (ENSATEG00000010306) cd151 (ENSATEG00000010314) cracr2b (ENSATEG00000010344) tmem138 (ENSATEG00000010383) tmem258 (ENSATEG00000029336) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 17 ints14 (ENSBSLG00000014980) SLC24A1 (ENSBSLG00000015079) ENSBSLG00000015093 ENSBSLG00000015132 map2k1 (ENSBSLG00000015609) rpl4 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ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369.a ENSGT00390000010331 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b.a ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b ##22 ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT01030000234519.e.b.k.b ENSGT00940000155837.o.d ENSGT00940000155837.o.c ENSGT00510000047881 ENSGT00990000203778 ENSGT00940000158775 ENSGT00390000016785 ENSGT00510000048454.l ENSGT00930000151035.a ENSGT00390000012069 ENSGT00940000165047 ENSGT00940000157760.g.b ENSGT00940000165330 ENSGT00440000033504.A Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b.f.c ENSGT00940000155836.A ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369.a ENSGT00390000010331 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b.a ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b 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ENSACIG00000004872 cracr2b (ENSACIG00000004899) tmem138 (ENSACIG00000004920) Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01030000234532.B.e.b.f.c ENSGT01030000234532.B.e.b.f.d ENSGT00940000155836.A ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369.a ENSGT00390000010331 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b ##22 ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT01030000234519.e.b.k.b ENSGT00940000155837.o ENSGT00510000047881 ENSGT01060000249026 ENSGT00940000158775 ENSGT00390000016785 ENSGT00510000048454 ENSGT00930000151035.a ENSGT00390000012069 ENSGT00940000165047 ENSGT00940000157760.g.b ENSGT00940000165330 ENSGT00440000033504.A ENSGT00390000018587.f Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01030000234532.B.e.b.f.c ENSGT01030000234532.B.e.b.f.d ENSGT00940000155836.A ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b 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ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b ##22 ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT01030000234519.e.b.k.b ENSGT00940000155837.o ENSGT00510000047881 ENSGT01060000249026 ENSGT00940000158775 ENSGT00390000016785 ENSGT00510000048454 ENSGT00930000151035.a ENSGT00390000012069 ENSGT00940000165047 ENSGT00940000157760.g.b ENSGT00940000165330 ENSGT00440000033504.A ENSGT00390000018587.f Mangrove rivulus MODERN SPECIES 6 ENSKMAG00000019281 SLC24A1 (ENSKMAG00000019301) ENSKMAG00000019332 ENSKMAG00000019409 map2k1 (ENSKMAG00000019462) rpl4 (ENSKMAG00000019520) zwilch (ENSKMAG00000019558) LCTL (ENSKMAG00000019610) snapc5 (ENSKMAG00000019691) smad6b (ENSKMAG00000019704) smad3b (ENSKMAG00000019721) aagab (ENSKMAG00000019751) iqch (ENSKMAG00000019782) zgc:162898 (ENSKMAG00000019840) skor1b (ENSKMAG00000019852) PIAS1 (ENSKMAG00000019888) ##22 morf4l1 (ENSKMAG00000019932) TLE3 (ENSKMAG00000019987) kif23 (ENSKMAG00000020065) ddb2 (ENSKMAG00000020178) ENSKMAG00000020196 kbtbd4 (ENSKMAG00000020215) rapsn 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ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369.a ENSGT00390000010331 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b ##22 ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT01030000234519.e.b.k.b ENSGT00940000155837.o ENSGT00510000047881 ENSGT01060000249026 ENSGT00940000158775 ENSGT00390000016785 ENSGT00510000048454 ENSGT00930000151035.a ENSGT00390000012069 ENSGT00940000165047 ENSGT00940000157760.g.b ENSGT00940000165330 ENSGT00440000033504.A ENSGT00390000018587.f Poecilia ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01030000234532.B.e.b.f.c ENSGT01030000234532.B.e.b.f.d ENSGT00940000155836.A ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369.a ENSGT00390000010331 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b 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ENSGT00390000012069 ENSGT00940000165047 ENSGT00940000157760.g.b ENSGT00440000033504.A ENSGT00390000018587.f ENSGT00390000010089 Sailfin molly MODERN SPECIES 1411 smad3b (ENSPLAG00000007952) aagab (ENSPLAG00000007922) iqch (ENSPLAG00000007903) zgc:162898 (ENSPLAG00000007775) skor1b (ENSPLAG00000007766) PIAS1 (ENSPLAG00000007727) ##22 morf4l1 (ENSPLAG00000007668) Amazon molly MODERN SPECIES 332 ENSPFOG00000023612 SLC24A1 (ENSPFOG00000007134) ENSPFOG00000007336 ENSPFOG00000007620 map2k1 (ENSPFOG00000008205) rpl4 (ENSPFOG00000008365) zwilch (ENSPFOG00000008447) LCTL (ENSPFOG00000008595) snapc5 (ENSPFOG00000021667) smad6b (ENSPFOG00000008775) smad3b (ENSPFOG00000008802) aagab (ENSPFOG00000008893) iqch (ENSPFOG00000008947) zgc:162898 (ENSPFOG00000009031) skor1b (ENSPFOG00000009041) PIAS1 (ENSPFOG00000009110) ##22 morf4l1 (ENSPFOG00000009311) TLE3 (ENSPFOG00000009535) kif23 (ENSPFOG00000009992) ddb2 (ENSPFOG00000010390) kbtbd4 (ENSPFOG00000010466) rapsn (ENSPFOG00000010493) ENSPFOG00000010570 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cracr2b (ENSPREG00000011392) tmem138 (ENSPREG00000011458) Platyfish MODERN SPECIES 11 ENSXMAG00000015778 SLC24A1 (ENSXMAG00000015769) ENSXMAG00000003464 ENSXMAG00000003498 map2k1 (ENSXMAG00000003499) rpl4 (ENSXMAG00000029529) zwilch (ENSXMAG00000003532) LCTL (ENSXMAG00000003540) snapc5 (ENSXMAG00000003549) smad6b (ENSXMAG00000003550) smad3b (ENSXMAG00000003553) aagab (ENSXMAG00000003564) iqch (ENSXMAG00000003568) zgc:162898 (ENSXMAG00000022123) skor1b (ENSXMAG00000003579) PIAS1 (ENSXMAG00000003583) ##22 morf4l1 (ENSXMAG00000003604) TLE3 (ENSXMAG00000003621) kif23 (ENSXMAG00000003667) ddb2 (ENSXMAG00000003694) ENSXMAG00000023989 kbtbd4 (ENSXMAG00000003696) ENSXMAG00000000599 ENSXMAG00000026603 ighmbp2 (ENSXMAG00000003705) chid1 (ENSXMAG00000003714) gatd1 (ENSXMAG00000028803) cd151 (ENSXMAG00000003730) ENSXMAG00000003735 cracr2b (ENSXMAG00000003737) tmem138 (ENSXMAG00000024333) NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 114 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b ENSGT00390000007218 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ENSFHEG00000021119 cracr2b (ENSFHEG00000021107) Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1118 smad6b (ENSCVAG00000007818) smad3b (ENSCVAG00000007804) aagab (ENSCVAG00000007763) ENSCVAG00000007712 zgc:162898 (ENSCVAG00000007700) skor1b (ENSCVAG00000007694) PIAS1 (ENSCVAG00000007674) ##22 morf4l1 (ENSCVAG00000007618) Oryzias ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT01030000234532.B.e.b.f.c ENSGT01030000234532.B.e.b.f.d ENSGT00940000155836.A ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369.a ENSGT00390000010331 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b ##22 ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT01030000234519.e.b.k.b ENSGT00940000155837.o ENSGT00510000047881 ENSGT01060000249026 ENSGT00940000158775 ENSGT00390000016785 ENSGT00510000048454 ENSGT00930000151035.a ENSGT00390000012069 ENSGT00940000165047 ENSGT00940000157760.g.b ENSGT00940000165330 ENSGT00440000033504.A ENSGT00390000018587.f Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000009486 ENSGT01030000234532.B.e.b.f.c ENSGT01030000234532.B.e.b.f.d ENSGT00940000155836.A ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369.a ENSGT00390000010331 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b ##22 ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT01030000234519.e.b.k.b ENSGT00940000155837.o ENSGT00510000047881 ENSGT01060000249026 ENSGT00940000158775 ENSGT00390000016785 ENSGT00510000048454 ENSGT00930000151035.a ENSGT00390000012069 ENSGT00940000165047 ENSGT00940000157760.g.b ENSGT00440000033504.A ENSGT00390000018587.f ENSGT00390000010089 Chinese medaka MODERN SPECIES 766 hacd3 (ENSOSIG00000021945) ints14 (ENSOSIG00000022003) ENSOSIG00000022075 SLC24A1 (ENSOSIG00000022079) ENSOSIG00000022109 ENSOSIG00000022181 map2k1 (ENSOSIG00000022353) rpl4 (ENSOSIG00000022390) zwilch (ENSOSIG00000022469) LCTL (ENSOSIG00000022490) snapc5 (ENSOSIG00000022501) smad6b (ENSOSIG00000022504) smad6b (ENSOSIG00000022510) zgc:162898 (ENSOSIG00000000720) skor1b (ENSOSIG00000000726) PIAS1 (ENSOSIG00000000776) ##22 morf4l1 (ENSOSIG00000001015) TLE3 (ENSOSIG00000001248) kif23 (ENSOSIG00000006428) ddb2 (ENSOSIG00000010596) ENSOSIG00000010597 kbtbd4 (ENSOSIG00000010600) rapsn (ENSOSIG00000010602) ENSOSIG00000010607 chid1 (ENSOSIG00000010614) gatd1 (ENSOSIG00000010617) cd151 (ENSOSIG00000010618) cracr2b (ENSOSIG00000010620) tmem138 (ENSOSIG00000010623) tmem258 (ENSOSIG00000010624) MYRF (ENSOSIG00000010627) Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 20 ENSORLG00000028299 ENSORLG00000026631 SLC24A1 (ENSORLG00000007029) ENSORLG00000007022 ENSORLG00000006997 map2k1 (ENSORLG00000006926) rpl4 (ENSORLG00000006882) zwilch (ENSORLG00000006863) LCTL (ENSORLG00000006840) ENSORLG00000025403 smad6b (ENSORLG00000006825) smad3b (ENSORLG00000006803) aagab (ENSORLG00000006754) zgc:162898 (ENSORLG00000006741) skor1b (ENSORLG00000006736) PIAS1 (ENSORLG00000006728) ##22 morf4l1 (ENSORLG00000025632) TLE3 (ENSORLG00000006700) kif23 (ENSORLG00000006689) ddb2 (ENSORLG00000006657) ENSORLG00000029307 kbtbd4 (ENSORLG00000006648) rapsn (ENSORLG00000006635) ENSORLG00000006610 ighmbp2 (ENSORLG00000006561) chid1 (ENSORLG00000006537) gatd1 (ENSORLG00000006504) cd151 (ENSORLG00000006486) cracr2b (ENSORLG00000006469) tmem258 (ENSORLG00000026488) tmem138 (ENSORLG00000024177) Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234532.B.e.b.f.c ENSGT01030000234532.B.e.b.f.d ENSGT00940000155836.A ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369.a ENSGT00390000010331 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b ##22 ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT01030000234519.e.b.k.b ENSGT00940000155837.o ENSGT00510000047881 ENSGT01060000249026 ENSGT00940000158775 ENSGT00390000016785 ENSGT00510000048454 ENSGT00930000151035.a ENSGT00390000012069 ENSGT00940000165047 ENSGT00940000157760.g.b ENSGT00940000165330 ENSGT00440000033504.A ENSGT00390000018587.f Javanese ricefish MODERN SPECIES 20 hacd3 (ENSOJAG00000015219) ints14 (ENSOJAG00000014921) ENSOJAG00000014816 SLC24A1 (ENSOJAG00000014806) ENSOJAG00000014599 ENSOJAG00000013786 map2k1 (ENSOJAG00000013527) rpl4 (ENSOJAG00000013399) zwilch (ENSOJAG00000013246) smad6b (ENSOJAG00000013057) smad3b (ENSOJAG00000012829) aagab (ENSOJAG00000012590) iqch (ENSOJAG00000012524) zgc:162898 (ENSOJAG00000012513) skor1b (ENSOJAG00000012503) PIAS1 (ENSOJAG00000012338) ##22 morf4l1 (ENSOJAG00000012268) TLE3 (ENSOJAG00000011183) kif23 (ENSOJAG00000008816) ddb2 (ENSOJAG00000008503) ENSOJAG00000008474 kbtbd4 (ENSOJAG00000008453) rapsn (ENSOJAG00000008442) ENSOJAG00000008433 ighmbp2 (ENSOJAG00000008377) chid1 (ENSOJAG00000007755) cd151 (ENSOJAG00000007680) tmem138 (ENSOJAG00000007666) cracr2b (ENSOJAG00000007642) tmem258 (ENSOJAG00000007628) MYRF (ENSOJAG00000007560) Indian medaka MODERN SPECIES 15 ENSOMEG00000020379 ENSOMEG00000020330 ENSOMEG00000020303 rnf19a (ENSOMEG00000020280) pabpc1a (ENSOMEG00000020219) ENSOMEG00000020153 ZNF706 (ENSOMEG00000020130) ENSOMEG00000000761 ncalda (ENSOMEG00000020074) smad6b (ENSOMEG00000020048) smad3b (ENSOMEG00000020016) aagab (ENSOMEG00000019971) iqch (ENSOMEG00000019948) zgc:162898 (ENSOMEG00000019899) skor1b (ENSOMEG00000019886) PIAS1 (ENSOMEG00000019860) ##22 morf4l1 (ENSOMEG00000019799) TLE3 (ENSOMEG00000019731) kif23 (ENSOMEG00000019673) ddb2 (ENSOMEG00000019402) ENSOMEG00000019359 kbtbd4 (ENSOMEG00000019350) rapsn (ENSOMEG00000019340) ENSOMEG00000019319 ighmbp2 (ENSOMEG00000019296) chid1 (ENSOMEG00000019221) gatd1 (ENSOMEG00000000503) cd151 (ENSOMEG00000019118) ENSOMEG00000019083 cracr2b (ENSOMEG00000019073) tmem138 (ENSOMEG00000019039) Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 152 ENSGT00940000158146.a ENSGT00940000153499.b.b.d.a.a ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440.g.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.a ##22 ENSGT01030000234518.B.a.b.a.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b ##22 ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT00940000157475 ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000165054.A.c ENSGT00940000155837.p ENSGT00940000158844 ENSGT00390000006043 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00940000158689 ENSGT00940000155465.i ENSGT00400000022240 ENSGT00940000157859.a.a ENSGT01030000234518.B.a.b.a.a ENSGT00940000159819 ENSGT00940000154617.B.c Northern pike MODERN SPECIES 18 MYRF (ENSELUG00000023732) TMEM80 (ENSELUG00000023746) EPS8L2 (ENSELUG00000023804) fads2 (ENSELUG00000023847) LRRC10B (ENSELUG00000023860) SYT7 (ENSELUG00000023938) ENSELUG00000023968 ENSELUG00000024009 PNPLA2 (ENSELUG00000024038) ENSELUG00000034022 smad3b (ENSELUG00000024171) aagab (ENSELUG00000024235) iqch (ENSELUG00000024287) zgc:162898 (ENSELUG00000025422) skor1b (ENSELUG00000024340) PIAS1 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ENSGT00930000151035.a ENSGT00390000012069 ENSGT00940000165047 Salmo ANCESTRAL SPECIES 199 ENSGT00940000154914.wb.a ENSGT00390000018145.r ENSGT00390000010331.k.b ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b.g.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b.c.a ##22 ENSGT00940000154257.a ENSGT00940000155837.o ENSGT00990000203778 ENSGT00940000158775 ENSGT00390000016785 ENSGT00930000151035.a ENSGT00390000012069 ENSGT00940000165047 ENSGT00390000018587.f.d River trout MODERN SPECIES 37 SLC24A1 (ENSSTUG00000002759) ENSSTUG00000002749 ENSSTUG00000002742 cyp11a1.1 (ENSSTUG00000002155) ENSSTUG00000002125 cib2 (ENSSTUG00000002119) ENSSTUG00000002102 ENSSTUG00000002089 GCNT3 (ENSSTUG00000001883) foxb1a (ENSSTUG00000001625) rab11a (ENSSTUG00000001124) rpl4 (ENSSTUG00000010410) snapc5 (ENSSTUG00000010396) zgc:162898 (ENSSTUG00000010384) skor1b (ENSSTUG00000010371) PIAS1 (ENSSTUG00000010120) ##22 anxa2a (ENSSTUG00000009997) kif23 (ENSSTUG00000009676) ENSSTUG00000009648 kbtbd4 (ENSSTUG00000009644) rapsn 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(ENSOTSG00005047013) ACVR1B (ENSOTSG00005047016) Chinook salmon MODERN SPECIES 14 idh3g (ENSOTSG00005045780) fam3a (ENSOTSG00005045828) ENSOTSG00005045829 phf8 (ENSOTSG00005045830) l1cama (ENSOTSG00005045875) ribc1 (ENSOTSG00005045876) smc1al (ENSOTSG00005045879) cacna1sb (ENSOTSG00005045984) tmem9 (ENSOTSG00005046144) ENSOTSG00005046146 C1QL4 (ENSOTSG00005046147) zgc:153867 (ENSOTSG00005046151) neurod4 (ENSOTSG00005046159) ENSOTSG00005046165 skor1b (ENSOTSG00005046171) ENSOTSG00005046172 ##22 ENSOTSG00005046174 ##22 anxa2a (ENSOTSG00005046178) ENSOTSG00005046182 kif23 (ENSOTSG00005046189) ENSOTSG00005046221 kbtbd4 (ENSOTSG00005046222) rapsn (ENSOTSG00005046223) ighmbp2 (ENSOTSG00005046236) chid1 (ENSOTSG00005046473) gatd1 (ENSOTSG00005046474) tmem258 (ENSOTSG00005046476) ENSOTSG00005046477 USP11 (ENSOTSG00005046478) ANKRD33 (ENSOTSG00005047012) acvrl1 (ENSOTSG00005047013) Chinook salmon MODERN SPECIES 687 ENSOTSG00005039964 coro7 (ENSOTSG00005039968) ENSOTSG00005039969 ##22 Coho salmon MODERN SPECIES 1 fads2 (ENSOKIG00005011983) EPS8L2 (ENSOKIG00005011829) TMEM80 (ENSOKIG00005011808) ENSOKIG00005011798 tmem258 (ENSOKIG00005011783) tmem138 (ENSOKIG00005024640) ENSOKIG00005024630 ENSOKIG00005024624 ENSOKIG00005024593 SMAD3 (ENSOKIG00005024533) aagab (ENSOKIG00005024492) ENSOKIG00005024473 ENSOKIG00005024463 ENSOKIG00005024451 ENSOKIG00005024437 ENSOKIG00005024128 ##22 ENSOKIG00005020649 ENSOKIG00005020544 ddb2 (ENSOKIG00005020530) ENSOKIG00005020382 CD151 (ENSOKIG00005020322) ENSOKIG00005020309 ENSOKIG00005020296 smad6b (ENSOKIG00005020286) snapc5 (ENSOKIG00005020275) LCTL (ENSOKIG00005020135) zwilch (ENSOKIG00005020066) rpl4 (ENSOKIG00005019951) map2k1 (ENSOKIG00005019896) ENSOKIG00005019888 ENSOKIG00005019877 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b.d ##22 Huchen MODERN SPECIES 9989 ENSHHUG00000010207 ##22 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 607 ENSGT00940000158440.h ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b ##22 ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT00940000157475.s.b ENSGT01030000234519.e.b.i.a Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 358 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.a ##22 ENSGT01030000234518.B.a.b.a.b.j ENSGT00940000158440.h ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.a.b ##22 ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT01030000235447 ENSGT00940000157475.s.b ENSGT01030000234519.e.b.i.a Denticle herring MODERN SPECIES 205 ENSDCDG00000008613 ENSDCDG00000008466 ##22 morf4l1 (ENSDCDG00000008284) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 192 ENSGT00390000017953.A ENSGT00940000156684 ENSGT00940000156476.h ENSGT00390000016075 ENSGT00390000012715.f ENSGT00390000012715.e ENSGT00940000154905.i.b ENSGT00940000159572.a.b ENSGT00390000008748.b.g.a ENSGT00940000164099.a.b ENSGT00940000154617.B.d ENSGT00390000016791 ENSGT00390000017697.a ENSGT01030000234534.B.a.b.a.a ENSGT00940000157859.a.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.b ##22 ENSGT01030000234534.B.a.b.a.b ENSGT00940000157859.a.a ENSGT00400000022240 ENSGT00940000164138 ENSGT00940000155465.j ENSGT00940000155465.i ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00940000162591 ENSGT00390000016223 ENSGT00940000160394.b ENSGT00390000007640.b.b ENSGT00940000156152.e.a.b ENSGT00940000156124.c.b ENSGT00940000159837 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234532.B.e.b.f ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369.a ENSGT00390000010331 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.b ##22 ENSGT00510000047881 ENSGT00990000203778 ENSGT00940000158775 ENSGT00390000016785 ENSGT00510000048454 ENSGT00930000151035.a Otophysi ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01030000234532.B.e.b.f ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369.a ENSGT00390000010331 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b.i ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.b ##22 ENSGT01030000234518.B.a.b.a.b.j ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT01030000235447 ENSGT00940000157475.s.b ENSGT01030000234519.e.b.j.b.a ENSGT00940000155837 ENSGT00940000158844.l ENSGT00510000047881 ENSGT00990000203778 ENSGT00940000158775 ENSGT00390000016785 ENSGT00510000048454 ENSGT00930000151035.a ENSGT00940000154961 ENSGT00590000083189.c Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01030000234532.B.e.b.f ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369.a ENSGT00390000010331 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b.i ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b 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ENSGT00990000203778 ENSGT00940000158775 ENSGT00390000016785 ENSGT00510000048454 ENSGT00930000151035.a ENSGT00940000154961 ENSGT00590000083189.c Characoidei ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT01030000234532.B.e.b.f ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369.a ENSGT00390000010331 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b.i ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.b ##22 ENSGT01030000234518.B.a.b.a.b.j ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT00940000157475.t ENSGT01030000235447 ENSGT00940000157475.s.b ENSGT01030000234519.e.b.j.b.a ENSGT00940000155837 ENSGT00940000158844.l ENSGT00510000047881 ENSGT00990000203778 ENSGT00940000158775 ENSGT00390000016785 ENSGT00510000048454 ENSGT00930000151035.a ENSGT00940000154961 Red-bellied piranha MODERN SPECIES SLC24A1 (ENSPNAG00000003338) dennd4a (ENSPNAG00000014917) rab11a 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kbtbd4 (ENSEEEG00000011030) rapsn (ENSEEEG00000011031) Channel catfish MODERN SPECIES 23 slc24a1 (ENSIPUG00000021316) dennd4a (ENSIPUG00000021338) Rab11a (ENSIPUG00000021401) megf11 (ENSIPUG00000021414) map2k1 (ENSIPUG00000021471) rpl4-b (ENSIPUG00000021502) zwilch (ENSIPUG00000021572) LCTL (ENSIPUG00000021616) snapc5 (ENSIPUG00000021633) SMAD6 (ENSIPUG00000021637) smad3b (ENSIPUG00000021649) AAGAB (ENSIPUG00000021694) iqch (ENSIPUG00000021716) c4h15orf61 (ENSIPUG00000021762) skor1b (ENSIPUG00000022829) PIAS1 (ENSIPUG00000022852) ##22 morf4l1 (ENSIPUG00000022885) ENSIPUG00000022933 gro2 (ENSIPUG00000022942) kif23 (ENSIPUG00000022986) paqr5a (ENSIPUG00000023028) KBTBD4 (ENSIPUG00000023030) rapsn (ENSIPUG00000023032) ighmbp2 (ENSIPUG00000023036) agk (ENSIPUG00000023045) kiaa1147 (ENSIPUG00000023061) wee2 (ENSIPUG00000023076) bida (ENSIPUG00000023114) bcl2l13 (ENSIPUG00000023119) wnt2 (ENSIPUG00000023126) asz1 (ENSIPUG00000023130) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT01030000234532.B.e.b.f ENSGT00940000155836.B ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.A.b ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369.a ENSGT00390000010331 ENSGT00940000158146.b ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b.i ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.b ##22 ENSGT01030000234518.B.a.b.a.b.j ENSGT00950000182965.a.b.a.a ENSGT01030000235447 ENSGT00940000157475.s.b ENSGT01030000234519.e.b.j.b.a ENSGT00940000155837 ENSGT00940000158844.l ENSGT00510000047881 ENSGT00940000158775 ENSGT00390000016785 ENSGT01030000234583.a.a.d ENSGT00930000151035.a ENSGT00940000154961 ENSGT00590000083189.c ENSGT00940000158803 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 74 ENSGT01030000234532.B.e.b.f.a ENSGT00940000155836.B.d ENSGT00940000154914.ub ENSGT00940000155333.A.b.a ENSGT00940000153487.b.b.t ENSGT00390000018145.e ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369.a.d ENSGT00390000010331.m ENSGT00940000158146.b.e ENSGT00940000153499.b.b.d.a.b.i.a ENSGT00390000007218.r ENSGT00390000008908.b ENSGT00390000015942 ENSGT00940000158440.g.b.b ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.b.a ##22 ENSGT00950000182965.a.b.a.a.c ENSGT01030000235447 ENSGT00940000157475.s.b.b ENSGT01030000234519.e.b.j.b.a.b Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 37 hacd3 (ENSCARG00000063827) ints14 (ENSCARG00000063746) SLC24A1 (ENSCARG00000063727) dennd4a (ENSCARG00000062471) rab11a (ENSCARG00000062368) ENSCARG00000058612 map2k1 (ENSCARG00000057706) rpl4 (ENSCARG00000057625) LCTL (ENSCARG00000057492) snapc5 (ENSCARG00000057463) smad6b (ENSCARG00000057432) smad3b (ENSCARG00000057166) aagab (ENSCARG00000057137) ENSCARG00000057132 skor1b (ENSCARG00000057106) ENSCARG00000057077 ##22 ENSCARG00000057062 ric8b (ENSCARG00000057023) rfx4 (ENSCARG00000056887) mlycd (ENSCARG00000056868) clns1a (ENSCARG00000056853) aqp11 (ENSCARG00000056843) pak1 (ENSCARG00000056359) GDPD4 (ENSCARG00000056300) ENSCARG00000056175 ompa 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ENSGT00940000158803.m ENSGT00990000204811.b ENSGT00390000015552.k.a ENSGT00940000159231.a Common carp reference MODERN SPECIES 9 ints14 (ENSCCRG00000047151) SLC24A1 (ENSCCRG00000066083) dennd4a (ENSCCRG00000020231) rab11a (ENSCCRG00000059058) ENSCCRG00000009371 map2k1 (ENSCCRG00000035016) rpl4 (ENSCCRG00000034465) LCTL (ENSCCRG00000034940) snapc5 (ENSCCRG00000076911) smad6b (ENSCCRG00000028531) smad3b (ENSCCRG00000014185) aagab (ENSCCRG00000014234) iqch (ENSCCRG00000014287) ENSCCRG00000064665 skor1b (ENSCCRG00000043233) PIAS1 (ENSCCRG00000043261) ##22 ENSCCRG00000031056 morf4l1 (ENSCCRG00000031057) ENSCCRG00000064433 ENSCCRG00000043403 tle3a (ENSCCRG00000029847) kif23 (ENSCCRG00000004087) ddb2 (ENSCCRG00000018879) kbtbd4 (ENSCCRG00000019417) rapsn (ENSCCRG00000019414) ighmbp2 (ENSCCRG00000018868) agk (ENSCCRG00000005190) dennd11 (ENSCCRG00000018614) wee2 (ENSCCRG00000018593) bcl2l13 (ENSCCRG00000057754) bida (ENSCCRG00000061096) Golden-line barbel DUPLICATION Golden-line barbel MODERN SPECIES 54 SLC24A1 (ENSSGRG00000029751) dennd4a (ENSSGRG00000028490) rab11a (ENSSGRG00000028469) ENSSGRG00000028343 map2k1 (ENSSGRG00000026412) rpl4 (ENSSGRG00000026237) zwilch (ENSSGRG00000026228) LCTL (ENSSGRG00000026226) snapc5 (ENSSGRG00000026223) smad6b (ENSSGRG00000026221) smad3b (ENSSGRG00000025385) aagab (ENSSGRG00000025352) iqch (ENSSGRG00000025341) zgc:162898 (ENSSGRG00000025335) skor1b (ENSSGRG00000025333) ENSSGRG00000025332 ##22 PIAS1 (ENSSGRG00000025330) ##22 morf4l1 (ENSSGRG00000025132) ENSSGRG00000025130 tle3a (ENSSGRG00000022755) kif23 (ENSSGRG00000021128) ddb2 (ENSSGRG00000021066) kbtbd4 (ENSSGRG00000021064) rapsn (ENSSGRG00000021063) agk (ENSSGRG00000021061) ighmbp2 (ENSSGRG00000021054) dennd11 (ENSSGRG00000021018) wee2 (ENSSGRG00000020988) bida (ENSSGRG00000020987) bcl2l13 (ENSSGRG00000020986) wnt2 (ENSSGRG00000020985) Golden-line barbel MODERN SPECIES 54 dennd4a (ENSSGRG00000028490) rab11a (ENSSGRG00000028469) ENSSGRG00000028343 map2k1 (ENSSGRG00000026412) rpl4 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ENSGT00940000155837.q ENSGT00510000047881 ENSGT00940000158775.j ENSGT00390000016785.e ENSGT01030000234583.a.a.d ENSGT00930000151035.a.b ENSGT00940000154961.o ENSGT00590000083189.c.b ENSGT00940000158803.n Goldfish MODERN SPECIES 9 SLC24A1 (ENSCARG00000012194) dennd4a (ENSCARG00000012263) rab11a (ENSCARG00000013410) ENSCARG00000013448 map2k1 (ENSCARG00000013618) rpl4 (ENSCARG00000013743) zwilch (ENSCARG00000013771) LCTL (ENSCARG00000013798) snapc5 (ENSCARG00000013818) smad6b (ENSCARG00000013826) smad3b (ENSCARG00000013852) aagab (ENSCARG00000013875) iqch (ENSCARG00000013907) zgc:162898 (ENSCARG00000013951) skor1b (ENSCARG00000013956) PIAS1 (ENSCARG00000013991) ##22 ENSCARG00000014119 morf4l1 (ENSCARG00000014135) ENSCARG00000014215 tle3a (ENSCARG00000014265) ENSCARG00000015092 kif23 (ENSCARG00000015149) paqr5a (ENSCARG00000016813) ddb2 (ENSCARG00000016846) kbtbd4 (ENSCARG00000016868) rapsn (ENSCARG00000016874) ENSCARG00000016880 ENSCARG00000016889 agk (ENSCARG00000016912) synm (ENSCARG00000017710) wee1 (ENSCARG00000017772) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 209 ENSGT00940000158440.g.b.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.b.b ##22 ENSGT00950000182965.a.b.a.a.d ENSGT00940000157475.s.b.a ENSGT01030000234519.e.b.j.b.a.a ENSGT00940000155837.r ENSGT00510000047881.f ENSGT00940000158775.j ENSGT00390000016785.e ENSGT01030000234583.a.a.d ENSGT00930000151035.a.b ENSGT00940000154961.o ENSGT00590000083189.c.b ENSGT00940000158803.n ENSGT00990000204811.a ENSGT00390000015552.k.b ENSGT00940000159231.b Common carp reference MODERN SPECIES 19 ints14 (ENSCCRG00000017792) SLC24A1 (ENSCCRG00000009282) ENSCCRG00000072431 dennd4a (ENSCCRG00000009528) rab11a (ENSCCRG00000009402) ENSCCRG00000073950 map2k1 (ENSCCRG00000077344) zwilch (ENSCCRG00000034439) LCTL (ENSCCRG00000017070) snapc5 (ENSCCRG00000078719) smad6b (ENSCCRG00000017061) smad3b (ENSCCRG00000067387) aagab (ENSCCRG00000016912) iqch (ENSCCRG00000077345) skor1b (ENSCCRG00000014176) PIAS1 (ENSCCRG00000030976) ##22 morf4l1 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(ENSDARG00000012718) bida (ENSDARG00000069290) bcl2l13 (ENSDARG00000062370) Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000159421 ENSGT00390000005939.b ENSGT00940000159068 ENSGT00940000156718 ENSGT00530000063582.b ENSGT00390000007623.c ENSGT01030000235035 ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000157369.b ENSGT00940000165890 ENSGT00940000158146.a ENSGT00940000153499.b.b.d.a.a ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440.g.a ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.b ##22 ENSGT01030000234534.B.a.b.a.b ENSGT01030000234518.B.a.b.a.b.i ENSGT00940000157475.s.a ENSGT01030000234519.e.b.i.b ENSGT00940000158844 ENSGT00390000006043.o ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00940000158689 ENSGT00940000155465.i ENSGT00530000063760.a ENSGT00940000159506 ENSGT00940000153289.b ENSGT00940000166109 ENSGT01050000244857.C.a.a ENSGT00940000165193 Denticle herring DUPLICATION Denticle herring MODERN SPECIES 7 ZNF821 (ENSDCDG00000035051) ATXN1L (ENSDCDG00000035052) nr1h3 (ENSDCDG00000035058) MADD (ENSDCDG00000035262) bbox1 (ENSDCDG00000035684) fibinb (ENSDCDG00000035687) ENSDCDG00000035691 dis3l (ENSDCDG00000035696) tipin (ENSDCDG00000022673) lctla (ENSDCDG00000022677) crybgx (ENSDCDG00000022683) smad6a (ENSDCDG00000022684) SMAD3 (ENSDCDG00000022693) map2k5 (ENSDCDG00000022906) skor1a (ENSDCDG00000023245) PIAS1 (ENSDCDG00000023259) ##22 ENSDCDG00000023290 UACA (ENSDCDG00000023294) tle3a (ENSDCDG00000023378) paqr5b (ENSDCDG00000025967) glceb (ENSDCDG00000025970) CORO2B (ENSDCDG00000026021) itga11a (ENSDCDG00000027395) ENSDCDG00000027515 PCSK6 (ENSDCDG00000027564) snrpa1 (ENSDCDG00000029782) selenos (ENSDCDG00000029783) chsy1 (ENSDCDG00000029786) ENSDCDG00000029805 aldh1a3 (ENSDCDG00000030365) asb7 (ENSDCDG00000030473) Denticle herring MODERN SPECIES 102 skor1a (ENSDCDG00000010370) ENSDCDG00000010363 ##22 ENSDCDG00000010356 UACA (ENSDCDG00000010321) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.b ##22 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.b ##22 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b.b ##22 Huchen MODERN SPECIES 6662 arid3c (ENSHHUG00000008341) ENSHHUG00000008342 ##22 ENSHHUG00000008350 Reedfish DUPLICATION Reedfish DUPLICATION Reedfish MODERN SPECIES 344 map2k5 (ENSECRG00000014745) ENSECRG00000014816 ENSECRG00000014827 ENSECRG00000014865 ENSECRG00000014883 ENSECRG00000014900 ##22 ENSECRG00000014924 Reedfish MODERN SPECIES 8 dis3l (ENSECRG00000017497) tipin (ENSECRG00000017552) map2k1 (ENSECRG00000017617) rpl4 (ENSECRG00000017761) zwilch (ENSECRG00000017849) lctla (ENSECRG00000017984) crybgx (ENSECRG00000018775) snapc5 (ENSECRG00000018817) smad6a (ENSECRG00000018835) smad3b (ENSECRG00000018886) aagab (ENSECRG00000019047) iqch (ENSECRG00000019116) zgc:162898 (ENSECRG00000019374) map2k5 (ENSECRG00000019409) ENSECRG00000019494 ENSECRG00000019525 ##22 PIAS1 (ENSECRG00000019551) ##22 calml4a (ENSECRG00000019589) hmg20a (ENSECRG00000019610) PEAK1 (ENSECRG00000019637) ENSECRG00000019664 ppib (ENSECRG00000019696) PCLAF (ENSECRG00000019739) csnk1g1 (ENSECRG00000019804) ENSECRG00000020166 ENSECRG00000020214 trip4 (ENSECRG00000020251) znf609a (ENSECRG00000020289) senp8 (ENSECRG00000020323) myo9aa (ENSECRG00000020382) ENSECRG00000020599 Reedfish MODERN SPECIES 8 tipin (ENSECRG00000017552) map2k1 (ENSECRG00000017617) rpl4 (ENSECRG00000017761) zwilch (ENSECRG00000017849) lctla (ENSECRG00000017984) crybgx (ENSECRG00000018775) snapc5 (ENSECRG00000018817) smad6a (ENSECRG00000018835) smad3b (ENSECRG00000018886) aagab (ENSECRG00000019047) iqch (ENSECRG00000019116) zgc:162898 (ENSECRG00000019374) map2k5 (ENSECRG00000019409) ENSECRG00000019494 ENSECRG00000019525 ##22 PIAS1 (ENSECRG00000019551) ##22 calml4a (ENSECRG00000019589) hmg20a (ENSECRG00000019610) PEAK1 (ENSECRG00000019637) ENSECRG00000019664 ppib (ENSECRG00000019696) PCLAF (ENSECRG00000019739) csnk1g1 (ENSECRG00000019804) ENSECRG00000020166 ENSECRG00000020214 trip4 (ENSECRG00000020251) znf609a (ENSECRG00000020289) senp8 (ENSECRG00000020323) myo9aa (ENSECRG00000020382) ENSECRG00000020599 nr2e3 (ENSECRG00000020622) Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000164138 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT01030000235447 ENSGT00950000182965.a.a ENSGT01030000234518.B.a.b Coelacanth MODERN SPECIES 578 PIAS1 (ENSLACG00000016111) ##22 CALML4 (ENSLACG00000016042) CLN6 (ENSLACG00000015987) ITGA11 (ENSLACG00000015593) CORO2B (ENSLACG00000014505) anp32a (ENSLACG00000014232) NOX5 (ENSLACG00000013864) GLCE (ENSLACG00000013181) PAQR5 (ENSLACG00000012656) KIF23 (ENSLACG00000012307) TLE3 (ENSLACG00000007395) UACA (ENSLACG00000000975) Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000164138 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00950000182965.a.b.b.b ENSGT01030000234518.B.b ENSGT00940000159819 Anura ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00940000157475 ENSGT00950000182965.a.a ENSGT00940000159819 ENSGT00390000017697.a ENSGT00390000016791 Frog MODERN SPECIES 3 dis3l (ENSXETG00000015865) tipin (ENSXETG00000024752) map2k1 (ENSXETG00000015887) snapc5 (ENSXETG00000015893) rpl4 (ENSXETG00000015898) zwilch (ENSXETG00000015894) lctl (ENSXETG00000015904) smad6 (ENSXETG00000015939) smad3 (ENSXETG00000007804) aagab (ENSXETG00000007805) pnlip (ENSXETG00000007807) c15orf61 (ENSXETG00000030493) map2k5 (ENSXETG00000007809) ENSXETG00000044421 skor1 (ENSXETG00000007811) pias1 (ENSXETG00000007813) ##22 calml4 (ENSXETG00000007814) 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(ENSSPUG00000012998) Episquamata ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00950000186456 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000164138 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00950000182965.a.b.b.a ENSGT00940000159819 ENSGT00390000017697.a Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00950000186456 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ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000155836.B.m ENSGT00940000155836.B.n ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b.d ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000164138 ENSGT00940000155465.c ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000159819 ENSGT00390000017697.a ENSGT00390000016791 ENSGT00390000018400 ENSGT01040000240503.A.a.a ENSGT00530000063675.a ENSGT00940000156346.g Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00390000009486 ENSGT00940000155836.B.m ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b.d ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 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ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000164138 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00950000182965.a.b.b.a ENSGT00940000159819 ENSGT00390000017697.a Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 46 RAB11A (ENSSMRG00000021588) MEGF11 (ENSSMRG00000021585) DIS3L (ENSSMRG00000021584) TIPIN (ENSSMRG00000021582) MAP2K1 (ENSSMRG00000021581) SNAPC5 (ENSSMRG00000021580) RPL4 (ENSSMRG00000021574) ZWILCH (ENSSMRG00000021573) SMAD6 (ENSSMRG00000021572) SMAD3 (ENSSMRG00000021571) AAGAB (ENSSMRG00000021570) IQCH (ENSSMRG00000021569) C15orf61 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ENSGT01030000234534.B.a.b ENSGT00950000182965.a.b.b.b Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00950000186456 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00950000182965.a.b.b.a ENSGT01030000234534.B.a.b ENSGT00940000159819 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 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MORF4L2 (ENSCABG00000007226) Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 1 DIS3L (ENSGEVG00005005574) TIPIN (ENSGEVG00005005547) MAP2K1 (ENSGEVG00005005509) SNAPC5 (ENSGEVG00005005478) RPL4 (ENSGEVG00005005421) ZWILCH (ENSGEVG00005005317) LCTL (ENSGEVG00005005207) SMAD6 (ENSGEVG00005005184) SMAD3 (ENSGEVG00005005160) AAGAB (ENSGEVG00005005135) ENSGEVG00005005107 IQCH (ENSGEVG00005005068) C15orf61 (ENSGEVG00005005051) MAP2K5 (ENSGEVG00005004903) SKOR1 (ENSGEVG00005004798) PIAS1 (ENSGEVG00005004663) ##22 CALML4 (ENSGEVG00005004576) CLN6 (ENSGEVG00005004545) FEM1B (ENSGEVG00005004527) ITGA11 (ENSGEVG00005004365) CORO2B (ENSGEVG00005004248) ENSGEVG00005004193 NOX5 (ENSGEVG00005004166) GLCE (ENSGEVG00005004077) ENSGEVG00005012114 PAQR5 (ENSGEVG00005012089) KIF23 (ENSGEVG00005011913) TLE3 (ENSGEVG00005011815) UACA (ENSGEVG00005011665) MORF4L2 (ENSGEVG00005011639) ENSGEVG00005011604 Emydidae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764.b 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(ENSABRG00000007970) CORO2B (ENSABRG00000007931) ENSABRG00000007925 ENSABRG00000007920 NOX5 (ENSABRG00000007909) GLCE (ENSABRG00000007906) PAQR5 (ENSABRG00000007901) KIF23 (ENSABRG00000007848) ENSABRG00000007124 UACA (ENSABRG00000007097) MORF4L1 (ENSABRG00000007094) ADAMTS7 (ENSABRG00000007081) Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00950000182965.a.b.b.a ENSGT00940000159819 ENSGT00390000017697.a Japanese quail MODERN SPECIES 1 RAB11A (ENSCJPG00005020908) MEGF11 (ENSCJPG00005020910) DIS3L (ENSCJPG00005020941) TIPIN (ENSCJPG00005020942) MAP2K1 (ENSCJPG00005020944) SNAPC5 (ENSCJPG00005020958) RPL4 (ENSCJPG00005020961) ZWILCH (ENSCJPG00005020968) SMAD6 (ENSCJPG00005020969) SMAD3 (ENSCJPG00005020970) AAGAB (ENSCJPG00005020971) IQCH (ENSCJPG00005020972) C15orf61 (ENSCJPG00005020973) MAP2K5 (ENSCJPG00005020975) SKOR1 (ENSCJPG00005020991) PIAS1 (ENSCJPG00005020993) ##22 CALML4 (ENSCJPG00005020995) CLN6 (ENSCJPG00005020996) FEM1B (ENSCJPG00005020997) ITGA11 (ENSCJPG00005020998) CORO2B (ENSCJPG00005020999) ENSCJPG00005021000 GLCE (ENSCJPG00005021002) PAQR5 (ENSCJPG00005021003) KIF23 (ENSCJPG00005021004) ENSCJPG00005021053 ENSCJPG00005021054 UACA (ENSCJPG00005021056) MORF4L2 (ENSCJPG00005021057) ADAMTS7 (ENSCJPG00005021058) CIAO2A (ENSCJPG00005021059) Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00950000182965.a.b.b.a ENSGT00940000159819 ENSGT00390000017697.a Chicken MODERN SPECIES 1 RAB11A (ENSGALG00010017870) MEGF11 (ENSGALG00010017904) DIS3L (ENSGALG00010017941) TIPIN (ENSGALG00010017956) MAP2K1 (ENSGALG00010018000) SNAPC5 (ENSGALG00010018020) RPL4 (ENSGALG00010018036) ZWILCH (ENSGALG00010018042) SMAD6 (ENSGALG00010018054) SMAD3 (ENSGALG00010018099) AAGAB (ENSGALG00010018150) IQCH (ENSGALG00010018192) C15orf61 (ENSGALG00010016968) MAP2K5 (ENSGALG00010017039) SKOR1 (ENSGALG00010017146) PIAS1 (ENSGALG00010017264) ##22 CALML4 (ENSGALG00010017314) CLN6 (ENSGALG00010017327) FEM1B (ENSGALG00010017354) ENSGALG00010017382 ITGA11 (ENSGALG00010017403) CORO2B (ENSGALG00010017482) ANP32A (ENSGALG00010017558) NOX5 (ENSGALG00010017588) GLCE (ENSGALG00010016452) PAQR5 (ENSGALG00010016459) KIF23 (ENSGALG00010016498) TLE3 (ENSGALG00010020011) UACA (ENSGALG00010020056) MORF4L2 (ENSGALG00010020090) ADAMTS7 (ENSGALG00010016209) Turkey MODERN SPECIES 3 DENND4A (ENSMGAG00000009728) RAB11A (ENSMGAG00000009797) MEGF11 (ENSMGAG00000009776) DIS3L (ENSMGAG00000009805) TIPIN (ENSMGAG00000009857) MAP2K1 (ENSMGAG00000009864) ENSMGAG00000019153 RPL4 (ENSMGAG00000009822) ZWILCH (ENSMGAG00000009851) SMAD6 (ENSMGAG00000009875) SMAD3 (ENSMGAG00000009879) AAGAB (ENSMGAG00000009906) IQCH (ENSMGAG00000009928) C15orf61 (ENSMGAG00000022676) MAP2K5 (ENSMGAG00000009937) PIAS1 (ENSMGAG00000009994) ##22 CALML4 (ENSMGAG00000010048) CLN6 (ENSMGAG00000010054) ENSMGAG00000010069 ITGA11 (ENSMGAG00000010073) CORO2B (ENSMGAG00000010149) ENSMGAG00000010171 NOX5 (ENSMGAG00000010183) GLCE (ENSMGAG00000010210) PAQR5 (ENSMGAG00000010133) KIF23 (ENSMGAG00000010217) TLE3 (ENSMGAG00000010249) UACA (ENSMGAG00000010428) ENSMGAG00000010385 ENSMGAG00000010348 ENSMGAG00000018525 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00950000182965.a.b.b.a ENSGT00940000159819 ENSGT00390000017697.a Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00950000182965.a.b.b.a ENSGT00940000159819 ENSGT00390000017697.a Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000154914 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 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ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT01060000252718 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00960000188521 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240.nc ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043.e ENSGT00990000212087 ENSGT00390000006043.f ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00950000182965.a.b.b.a Zebra finch DUPLICATION Zebra finch MODERN SPECIES 1 ENSTGUG00000021449 ENSTGUG00000024498 ENSTGUG00000009614 ENSTGUG00000020847 ANP32A (ENSTGUG00000009670) ENSTGUG00000026437 ENSTGUG00000019518 ENSTGUG00000024602 ENSTGUG00000024307 ENSTGUG00000009704 ENSTGUG00000009715 ENSTGUG00000009720 ENSTGUG00000009742 ENSTGUG00000022232 ENSTGUG00000024398 ENSTGUG00000018967 ##22 ENSTGUG00000009596 ENSTGUG00000009599 ENSTGUG00000009612 ENSTGUG00000009638 ENSTGUG00000022622 ENSTGUG00000022919 ENSTGUG00000028493 ENSTGUG00000020592 ENSTGUG00000022584 ENSTGUG00000023502 ENSTGUG00000026895 ENSTGUG00000024617 ENSTGUG00000020557 ENSTGUG00000021838 ENSTGUG00000009778 Zebra finch MODERN SPECIES 1 MEGF11 (ENSTGUG00000009293) DIS3L (ENSTGUG00000009315) TIPIN (ENSTGUG00000009358) ENSTGUG00000019914 MAP2K1 (ENSTGUG00000009363) RPL4 (ENSTGUG00000009403) ZWILCH (ENSTGUG00000009439) LCTL (ENSTGUG00000009457) SMAD6 (ENSTGUG00000009467) SMAD3 (ENSTGUG00000009470) AAGAB (ENSTGUG00000009497) IQCH (ENSTGUG00000009504) ENSTGUG00000009527 MAP2K5 (ENSTGUG00000009531) ENSTGUG00000025021 ENSTGUG00000009553 ##22 ENSTGUG00000029271 ENSTGUG00000021449 ENSTGUG00000024498 ENSTGUG00000009614 ENSTGUG00000020847 ANP32A (ENSTGUG00000009670) ENSTGUG00000026437 ENSTGUG00000019518 ENSTGUG00000024602 ENSTGUG00000024307 ENSTGUG00000009704 ENSTGUG00000009715 ENSTGUG00000009720 ENSTGUG00000009742 ENSTGUG00000022232 Common canary MODERN SPECIES 12 DIS3L (ENSSCAG00000010324) TIPIN (ENSSCAG00000010328) MAP2K1 (ENSSCAG00000010333) ENSSCAG00000010341 RPL4 (ENSSCAG00000010344) ZWILCH (ENSSCAG00000010364) LCTL (ENSSCAG00000010374) ENSSCAG00000010394 ENSSCAG00000010404 SMAD6 (ENSSCAG00000010407) SMAD3 (ENSSCAG00000010414) AAGAB (ENSSCAG00000010418) IQCH (ENSSCAG00000010432) ENSSCAG00000010438 MAP2K5 (ENSSCAG00000010448) PIAS1 (ENSSCAG00000010481) ##22 CALML4 (ENSSCAG00000010490) ENSSCAG00000010493 ENSSCAG00000010498 ENSSCAG00000010505 ITGA11 (ENSSCAG00000010528) CORO2B (ENSSCAG00000010620) ENSSCAG00000010637 NOX5 (ENSSCAG00000010650) GLCE (ENSSCAG00000010658) ENSSCAG00000010664 PAQR5 (ENSSCAG00000010668) KIF23 (ENSSCAG00000010811) TLE3 (ENSSCAG00000011497) ENSSCAG00000012151 UACA (ENSSCAG00000012188) Flycatcher MODERN SPECIES 1 VPS13C (ENSFALG00000012641) ENSFALG00000012743 TLN2 (ENSFALG00000012750) TPM1 (ENSFALG00000026833) LACTB (ENSFALG00000012785) RPL4 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IQCH (ENSPMJG00000009995) C15orf61 (ENSPMJG00000009998) MAP2K5 (ENSPMJG00000010012) PIAS1 (ENSPMJG00000010016) ##22 ENSPMJG00000010020 FEM1B (ENSPMJG00000010022) ITGA11 (ENSPMJG00000010024) ENSPMJG00000010045 ENSPMJG00000010057 ENSPMJG00000010061 NOX5 (ENSPMJG00000010066) GLCE (ENSPMJG00000010071) KIF23 (ENSPMJG00000010072) TLE3 (ENSPMJG00000010074) ENSPMJG00000010244 ENSPMJG00000010262 UACA (ENSPMJG00000010263) MORF4L2 (ENSPMJG00000010268) ADAMTS7 (ENSPMJG00000010272) Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00950000182965.a.b.b.a ENSGT00940000159819 ENSGT00390000017697.a Golden eagle MODERN SPECIES 21 RAB11A (ENSACCG00020009992) MEGF11 (ENSACCG00020010081) DIS3L (ENSACCG00020010156) TIPIN (ENSACCG00020010172) MAP2K1 (ENSACCG00020010187) SNAPC5 (ENSACCG00020010201) RPL4 (ENSACCG00020000310) ZWILCH (ENSACCG00020000434) LCTL (ENSACCG00020000480) SMAD6 (ENSACCG00020000507) SMAD3 (ENSACCG00020000522) AAGAB (ENSACCG00020000560) C15orf61 (ENSACCG00020000661) MAP2K5 (ENSACCG00020000704) SKOR1 (ENSACCG00020000753) PIAS1 (ENSACCG00020000781) ##22 CALML4 (ENSACCG00020000839) CLN6 (ENSACCG00020000865) FEM1B (ENSACCG00020000880) ITGA11 (ENSACCG00020001060) CORO2B (ENSACCG00020001194) ENSACCG00020001229 NOX5 (ENSACCG00020001264) GLCE (ENSACCG00020001293) PAQR5 (ENSACCG00020001307) KIF23 (ENSACCG00020001359) TLE3 (ENSACCG00020001470) UACA (ENSACCG00020001551) MORF4L2 (ENSACCG00020001635) ADAMTS7 (ENSACCG00020001776) CIAO2A (ENSACCG00020001958) Kakapo MODERN SPECIES 1 ENSSHBG00005009158 DIS3L (ENSSHBG00005009084) TIPIN (ENSSHBG00005009068) MAP2K1 (ENSSHBG00005009053) SNAPC5 (ENSSHBG00005009047) RPL4 (ENSSHBG00005009017) ZWILCH (ENSSHBG00005008951) LCTL (ENSSHBG00005008922) SMAD6 (ENSSHBG00005000779) SMAD3 (ENSSHBG00005000770) AAGAB (ENSSHBG00005000737) IQCH (ENSSHBG00005000728) C15orf61 (ENSSHBG00005000716) MAP2K5 (ENSSHBG00005000699) SKOR1 (ENSSHBG00005011833) PIAS1 (ENSSHBG00005011813) ##22 CALML4 (ENSSHBG00005011797) CLN6 (ENSSHBG00005011786) FEM1B (ENSSHBG00005011772) ITGA11 (ENSSHBG00005011743) CORO2B (ENSSHBG00005011717) ENSSHBG00005011703 NOX5 (ENSSHBG00005011668) GLCE (ENSSHBG00005011650) PAQR5 (ENSSHBG00005011637) KIF23 (ENSSHBG00005011580) TLE3 (ENSSHBG00005011543) UACA (ENSSHBG00005011394) MORF4L2 (ENSSHBG00005011335) ADAMTS7 (ENSSHBG00005008371) CIAO2A (ENSSHBG00005008250) Mammalia ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000155333.B 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811 SKOR1 (ENSDNOG00000044658) ENSDNOG00000012802 PIAS1 (ENSDNOG00000013630) ##22 CALML4 (ENSDNOG00000043091) CLN6 (ENSDNOG00000039415) FEM1B (ENSDNOG00000012810) ITGA11 (ENSDNOG00000012822) ENSDNOG00000045706 CORO2B (ENSDNOG00000035953) ENSDNOG00000037960 ENSDNOG00000045325 NOX5 (ENSDNOG00000005365) GLCE (ENSDNOG00000042897) PAQR5 (ENSDNOG00000044935) KIF23 (ENSDNOG00000014185) ENSDNOG00000030825 TLE3 (ENSDNOG00000019320) UACA (ENSDNOG00000017227) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00910000147890 ENSGT00910000147041 ENSGT00940000158146 ENSGT00860000136046 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00910000146962 ENSGT00960000188521 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00910000147890 ENSGT00910000147041 ENSGT00940000158146 ENSGT00860000136046 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00910000146962 ENSGT00960000188521 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00910000147890 ENSGT00910000147041 ENSGT00940000158146 ENSGT00860000136046 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00910000146962 ENSGT00960000188521 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00910000147041 ENSGT00940000158146 ENSGT00860000136046 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00910000146962 ENSGT00960000188521 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00860000136046 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00910000146962 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 Felidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b 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ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 Tiger MODERN SPECIES 204 RAB11A (ENSPTIG00000021637) MEGF11 (ENSPTIG00000001273) DIS3L (ENSPTIG00000009042) ENSPTIG00000009826 MAP2K1 (ENSPTIG00000010070) SNAPC5 (ENSPTIG00000010493) ENSPTIG00000010784 ZWILCH (ENSPTIG00000011456) LCTL (ENSPTIG00000012036) SMAD3 (ENSPTIG00000012606) AAGAB (ENSPTIG00000013747) IQCH (ENSPTIG00000014096) ENSPTIG00000015816 MAP2K5 (ENSPTIG00000016073) ENSPTIG00000017654 PIAS1 (ENSPTIG00000017759) ##22 CALML4 (ENSPTIG00000018784) CLN6 (ENSPTIG00000019082) FEM1B (ENSPTIG00000019928) ITGA11 (ENSPTIG00000020061) CORO2B (ENSPTIG00000001549) ENSPTIG00000006135 NOX5 (ENSPTIG00000006417) GLCE (ENSPTIG00000008506) PAQR5 (ENSPTIG00000008616) KIF23 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Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 66 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 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ENSNVIG00000015659 CORO2B (ENSNVIG00000015623) ENSNVIG00000015596 ENSNVIG00000015562 SPESP1 (ENSNVIG00000015552) NOX5 (ENSNVIG00000015522) GLCE (ENSNVIG00000015508) PAQR5 (ENSNVIG00000015474) ENSNVIG00000015440 OR4E1 (ENSNVIG00000015435) OR4E2 (ENSNVIG00000015433) Ferret MODERN SPECIES 228 DIS3L (ENSMPUG00000000378) TIPIN (ENSMPUG00000000365) MAP2K1 (ENSMPUG00000000363) SNAPC5 (ENSMPUG00000000356) ENSMPUG00000000337 ZWILCH (ENSMPUG00000000333) LCTL (ENSMPUG00000000312) ENSMPUG00000000309 SMAD6 (ENSMPUG00000000307) SMAD3 (ENSMPUG00000000304) AAGAB (ENSMPUG00000000292) IQCH (ENSMPUG00000000289) C15orf61 (ENSMPUG00000000287) MAP2K5 (ENSMPUG00000000285) SKOR1 (ENSMPUG00000000283) PIAS1 (ENSMPUG00000000281) ##22 CALML4 (ENSMPUG00000000270) CLN6 (ENSMPUG00000000267) FEM1B (ENSMPUG00000000266) ITGA11 (ENSMPUG00000000221) CORO2B (ENSMPUG00000000220) ENSMPUG00000000218 ENSMPUG00000000216 SPESP1 (ENSMPUG00000000214) NOX5 (ENSMPUG00000000210) GLCE (ENSMPUG00000000209) PAQR5 (ENSMPUG00000000205) RPLP1 (ENSMPUG00000000204) OR4E1 (ENSMPUG00000019444) OR4E2 (ENSMPUG00000019443) SALL2 (ENSMPUG00000000199) Ursidae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 Giant Panda MODERN SPECIES 15 MEGF11 (ENSAMEG00000003131) DIS3L (ENSAMEG00000003166) TIPIN (ENSAMEG00000027725) MAP2K1 (ENSAMEG00000003218) SNAPC5 (ENSAMEG00000003249) ENSAMEG00000029170 ZWILCH (ENSAMEG00000003251) LCTL (ENSAMEG00000003300) SMAD6 (ENSAMEG00000029979) SMAD3 (ENSAMEG00000003318) AAGAB (ENSAMEG00000028433) IQCH (ENSAMEG00000005044) C15orf61 (ENSAMEG00000029099) MAP2K5 (ENSAMEG00000005013) SKOR1 (ENSAMEG00000004996) PIAS1 (ENSAMEG00000014025) ##22 CALML4 (ENSAMEG00000014054) CLN6 (ENSAMEG00000014058) FEM1B (ENSAMEG00000014073) ITGA11 (ENSAMEG00000014076) CORO2B (ENSAMEG00000014093) ENSAMEG00000014117 SPESP1 (ENSAMEG00000014134) NOX5 (ENSAMEG00000014136) ENSAMEG00000020008 GLCE (ENSAMEG00000030318) PAQR5 (ENSAMEG00000024842) KIF23 (ENSAMEG00000014201) RPLP1 (ENSAMEG00000014251) TLE3 (ENSAMEG00000015806) UACA (ENSAMEG00000008900) Ursus ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.a.b.a.b ENSGT00550000074698.k.a.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 Polar bear MODERN SPECIES 320 DENND4A (ENSUMAG00000012290) RAB11A (ENSUMAG00000012273) MEGF11 (ENSUMAG00000012242) DIS3L (ENSUMAG00000012227) TIPIN (ENSUMAG00000012215) MAP2K1 (ENSUMAG00000012208) RPL4 (ENSUMAG00000012178) ZWILCH (ENSUMAG00000012145) LCTL (ENSUMAG00000012072) ENSUMAG00000012057 AAGAB (ENSUMAG00000012048) IQCH (ENSUMAG00000012020) C15orf61 (ENSUMAG00000012016) MAP2K5 (ENSUMAG00000011992) ENSUMAG00000011983 PIAS1 (ENSUMAG00000011980) ##22 CALML4 (ENSUMAG00000011979) ENSUMAG00000011962 FEM1B (ENSUMAG00000011958) ITGA11 (ENSUMAG00000011792) CORO2B (ENSUMAG00000011755) ENSUMAG00000011740 ENSUMAG00000011724 SPESP1 (ENSUMAG00000011718) NOX5 (ENSUMAG00000011648) GLCE (ENSUMAG00000011629) PAQR5 (ENSUMAG00000011621) KIF23 (ENSUMAG00000010352) ENSUMAG00000010153 TLE3 (ENSUMAG00000009457) UACA (ENSUMAG00000009412) American black bear DUPLICATION American black bear MODERN SPECIES 1989 ENSUAMG00000015301 ##22 CALML4 (ENSUAMG00000015403) CLN6 (ENSUAMG00000015413) FEM1B (ENSUAMG00000015428) ITGA11 (ENSUAMG00000015440) American black bear MODERN SPECIES 1990 ENSUAMG00000015454 ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00910000147041 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 Equus ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b.ic ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 Donkey MODERN SPECIES 11 DIS3L (ENSEASG00005006407) TIPIN (ENSEASG00005006396) MAP2K1 (ENSEASG00005006387) SNAPC5 (ENSEASG00005006384) RPL4 (ENSEASG00005006373) ZWILCH (ENSEASG00005006339) LCTL (ENSEASG00005006319) ENSEASG00005025450 SMAD3 (ENSEASG00005006315) AAGAB (ENSEASG00005006311) IQCH (ENSEASG00005006301) ENSEASG00005006297 MAP2K5 (ENSEASG00005006290) SKOR1 (ENSEASG00005006277) ENSEASG00005006267 PIAS1 (ENSEASG00005006262) ##22 CALML4 (ENSEASG00005033729) CLN6 (ENSEASG00005034200) FEM1B (ENSEASG00005006255) ITGA11 (ENSEASG00005006251) CORO2B (ENSEASG00005006245) ENSEASG00005006243 SPESP1 (ENSEASG00005028304) NOX5 (ENSEASG00005006228) ENSEASG00005025046 GLCE (ENSEASG00005006223) PAQR5 (ENSEASG00005006222) KIF23 (ENSEASG00005005598) ENSEASG00005030200 TLE3 (ENSEASG00005005509) UACA (ENSEASG00005005496) Horse MODERN SPECIES DIS3L (ENSECAG00000007302) TIPIN (ENSECAG00000004590) MAP2K1 (ENSECAG00000010640) RPL4 (ENSECAG00000023179) ZWILCH (ENSECAG00000018367) LCTL (ENSECAG00000014254) SMAD6 (ENSECAG00000013706) SMAD3 (ENSECAG00000020259) ENSECAG00000047849 AAGAB (ENSECAG00000013142) IQCH (ENSECAG00000007674) ENSECAG00000029823 MAP2K5 (ENSECAG00000022411) SKOR1 (ENSECAG00000036584) ENSECAG00000005747 PIAS1 (ENSECAG00000007993) ##22 CALML4 (ENSECAG00000021844) CLN6 (ENSECAG00000016991) FEM1B (ENSECAG00000015587) ITGA11 (ENSECAG00000023104) CORO2B (ENSECAG00000014020) ENSECAG00000002541 SPESP1 (ENSECAG00000002377) NOX5 (ENSECAG00000018409) GLCE (ENSECAG00000014998) ENSECAG00000059303 PAQR5 (ENSECAG00000008154) KIF23 (ENSECAG00000014536) ENSECAG00000008542 TLE3 (ENSECAG00000004807) UACA (ENSECAG00000016261) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00910000147041 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465.h ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.a.b.a.b ENSGT00940000156593 Megabat MODERN SPECIES 368 PIAS1 (ENSPVAG00000004511) ##22 CALML4 (ENSPVAG00000004512) CLN6 (ENSPVAG00000004514) Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00910000147041 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465.h ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.a.b.a.b ENSGT00940000156593 Microbat MODERN SPECIES 1275 SMAD3 (ENSMLUG00000002185) AAGAB (ENSMLUG00000002191) IQCH (ENSMLUG00000002192) C15orf61 (ENSMLUG00000029534) MAP2K5 (ENSMLUG00000002205) PIAS1 (ENSMLUG00000010321) ##22 CALML4 (ENSMLUG00000010350) CLN6 (ENSMLUG00000008964) FEM1B (ENSMLUG00000008987) ITGA11 (ENSMLUG00000008993) Greater horseshoe bat DUPLICATION Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 24 DIS3L (ENSRFEG00010004058) TIPIN (ENSRFEG00010004026) MAP2K1 (ENSRFEG00010004010) SNAPC5 (ENSRFEG00010003999) ENSRFEG00010003980 ZWILCH (ENSRFEG00010003952) LCTL (ENSRFEG00010003917) ENSRFEG00010003900 SMAD6 (ENSRFEG00010003887) SMAD3 (ENSRFEG00010003872) AAGAB (ENSRFEG00010003850) IQCH (ENSRFEG00010003782) MAP2K5 (ENSRFEG00010003624) SKOR1 (ENSRFEG00010003500) ENSRFEG00010003474 ENSRFEG00010003431 ##22 ENSRFEG00010003398 CLN6 (ENSRFEG00010003356) FEM1B (ENSRFEG00010003282) ITGA11 (ENSRFEG00010003262) CORO2B (ENSRFEG00010003225) ENSRFEG00010003201 SPESP1 (ENSRFEG00010003175) ENSRFEG00010003165 GLCE (ENSRFEG00010003151) PAQR5 (ENSRFEG00010003129) KIF23 (ENSRFEG00010003091) ENSRFEG00010003032 ARF6 (ENSRFEG00010003001) ENSRFEG00010002991 SOS2 (ENSRFEG00010002884) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES SH2D1A (ENSRFEG00010001590) ENSRFEG00010001623 ENSRFEG00010001654 ENSRFEG00010001663 ENSRFEG00010001678 ENSRFEG00010001706 ENSRFEG00010001715 STAG2 (ENSRFEG00010001764) XIAP (ENSRFEG00010001930) ENSRFEG00010001946 ENSRFEG00010001965 ENSRFEG00010001976 ENSRFEG00010001983 THOC2 (ENSRFEG00010002030) ENSRFEG00010002182 ENSRFEG00010002197 ##22 GRIA3 (ENSRFEG00010002235) ENSRFEG00010002304 ENSRFEG00010002315 ENSRFEG00010002340 C1GALT1C1 (ENSRFEG00010002347) MCTS1 (ENSRFEG00010002366) CUL4B (ENSRFEG00010002422) LAMP2 (ENSRFEG00010002495) ENSRFEG00010002563 ATP1B4 (ENSRFEG00010002584) TMEM255A (ENSRFEG00010002695) ENSRFEG00010002755 ZBTB33 (ENSRFEG00010008643) NKAP (ENSRFEG00010008685) ENSRFEG00010008720 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 Suina ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.l.g.a.a ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 Pig MODERN SPECIES TIPIN (ENSSSCG00000004942) MAP2K1 (ENSSSCG00000004943) SNAPC5 (ENSSSCG00000038941) RPL4 (ENSSSCG00000004945) ZWILCH (ENSSSCG00000004946) ENSSSCG00000051767 LCTL (ENSSSCG00000004947) SMAD6 (ENSSSCG00000004948) SMAD3 (ENSSSCG00000004952) AAGAB (ENSSSCG00000004951) ENSSSCG00000057448 ENSSSCG00000034963 C15orf61 (ENSSSCG00000004954) MAP2K5 (ENSSSCG00000004955) SKOR1 (ENSSSCG00000004956) PIAS1 (ENSSSCG00000004958) ##22 CALML4 (ENSSSCG00000026517) CLN6 (ENSSSCG00000004957) FEM1B (ENSSSCG00000022419) ITGA11 (ENSSSCG00000004961) CORO2B (ENSSSCG00000004962) ENSSSCG00000004963 SPESP1 (ENSSSCG00000032244) NOX5 (ENSSSCG00000004966) GLCE (ENSSSCG00000026078) PAQR5 (ENSSSCG00000004968) KIF23 (ENSSSCG00000004969) RPLP1 (ENSSSCG00000004970) TLE3 (ENSSSCG00000004971) UACA (ENSSSCG00000004973) LARP6 (ENSSSCG00000004974) Chacoan peccary MODERN SPECIES 786 MEGF11 (ENSCWAG00000015726) DIS3L (ENSCWAG00000015597) TIPIN (ENSCWAG00000015560) MAP2K1 (ENSCWAG00000015519) SNAPC5 (ENSCWAG00000015485) RPL4 (ENSCWAG00000015376) ZWILCH (ENSCWAG00000015266) LCTL (ENSCWAG00000015109) SMAD6 (ENSCWAG00000015079) SMAD3 (ENSCWAG00000015026) AAGAB (ENSCWAG00000014993) IQCH (ENSCWAG00000014432) C15orf61 (ENSCWAG00000014382) MAP2K5 (ENSCWAG00000013886) SKOR1 (ENSCWAG00000013676) PIAS1 (ENSCWAG00000013465) ##22 CALML4 (ENSCWAG00000013422) CLN6 (ENSCWAG00000013181) FEM1B (ENSCWAG00000013140) ITGA11 (ENSCWAG00000013057) CORO2B (ENSCWAG00000012937) ENSCWAG00000012876 SPESP1 (ENSCWAG00000012853) GLCE (ENSCWAG00000012796) PAQR5 (ENSCWAG00000012711) KIF23 (ENSCWAG00000012586) ENSCWAG00000012519 TLE3 (ENSCWAG00000009720) UACA (ENSCWAG00000009354) LARP6 (ENSCWAG00000009304) LRRC49 (ENSCWAG00000008776) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00910000147890 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 83 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00910000147890 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 Arabian camel MODERN SPECIES 32 MEGF11 (ENSCDRG00005002479) DIS3L (ENSCDRG00005002526) TIPIN (ENSCDRG00005002562) MAP2K1 (ENSCDRG00005002580) SNAPC5 (ENSCDRG00005002604) ENSCDRG00005002627 ZWILCH (ENSCDRG00005002673) LCTL (ENSCDRG00005002712) ENSCDRG00005002745 ENSCDRG00005002755 SMAD3 (ENSCDRG00005002780) AAGAB (ENSCDRG00005002843) IQCH (ENSCDRG00005002929) C15orf61 (ENSCDRG00005003109) MAP2K5 (ENSCDRG00005003152) PIAS1 (ENSCDRG00005003494) ##22 ENSCDRG00005003580 CALML4 (ENSCDRG00005003629) CLN6 (ENSCDRG00005003662) ENSCDRG00005003720 ENSCDRG00005003749 RAB8B (ENSCDRG00005003808) APH1B (ENSCDRG00005003835) CA12 (ENSCDRG00005003913) ENSCDRG00005004006 ENSCDRG00005006370 TPM1 (ENSCDRG00005006508) TLN2 (ENSCDRG00005008648) ENSCDRG00005009161 VPS13C (ENSCDRG00005009482) RORA (ENSCDRG00005010112) Alpaca MODERN SPECIES 57 PIAS1 (ENSVPAG00000007408) ##22 CALML4 (ENSVPAG00000007410) ENSVPAG00000007411 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145.xc ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00910000147890 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000005764 ENSGT00390000012563.i.a ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145.xc.b ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00910000147890 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 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CLN6 (ENSTTRG00000016026) FEM1B (ENSTTRG00000016027) ITGA11 (ENSTTRG00000016031) CORO2B (ENSTTRG00000016032) Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000012563.i.a ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145.xc.b ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00910000147890 ENSGT00940000158146 ENSGT00390000000134.b.p.b ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT01010000222830.d.a ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.a.b.a.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00540000070023.c.b.a.a.a.a Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00860000136093.d ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 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ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 Yarkand deer MODERN SPECIES 3 TIPIN (ENSCHYG00000010297) MAP2K1 (ENSCHYG00000010364) ENSCHYG00000010432 SNAPC5 (ENSCHYG00000010450) ENSCHYG00000010506 ZWILCH (ENSCHYG00000010774) LCTL (ENSCHYG00000011283) ENSCHYG00000011323 SMAD6 (ENSCHYG00000011380) SMAD3 (ENSCHYG00000011473) AAGAB (ENSCHYG00000011610) IQCH (ENSCHYG00000011825) C15orf61 (ENSCHYG00000012160) MAP2K5 (ENSCHYG00000012261) SKOR1 (ENSCHYG00000013681) PIAS1 (ENSCHYG00000013992) ##22 CALML4 (ENSCHYG00000014198) CLN6 (ENSCHYG00000014290) FEM1B (ENSCHYG00000014524) ITGA11 (ENSCHYG00000014651) CORO2B (ENSCHYG00000016934) ENSCHYG00000017234 SPESP1 (ENSCHYG00000017531) NOX5 (ENSCHYG00000017570) ENSCHYG00000017784 ENSCHYG00000018101 ENSCHYG00000018227 ENSCHYG00000018296 ENSCHYG00000018365 ENSCHYG00000018954 ENSCHYG00000019075 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145.xc ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00910000147890 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145.xc ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00910000147890 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145.xc ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00910000147890 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 Bos ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145.xc.e.a ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00910000147890 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145.xc.e.a ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00910000147890 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 Cow MODERN SPECIES 1 MEGF11 (ENSBTAG00000034140) DIS3L (ENSBTAG00000000371) TIPIN (ENSBTAG00000000372) MAP2K1 (ENSBTAG00000033983) SNAPC5 (ENSBTAG00000005210) RPL4 (ENSBTAG00000005211) ZWILCH (ENSBTAG00000005213) LCTL (ENSBTAG00000005214) ENSBTAG00000050356 SMAD6 (ENSBTAG00000000625) SMAD3 (ENSBTAG00000012599) AAGAB (ENSBTAG00000040368) IQCH (ENSBTAG00000013638) C10H15orf61 (ENSBTAG00000045628) MAP2K5 (ENSBTAG00000000218) PIAS1 (ENSBTAG00000005564) ##22 CALML4 (ENSBTAG00000025822) CLN6 (ENSBTAG00000005565) FEM1B (ENSBTAG00000008378) ITGA11 (ENSBTAG00000008380) CORO2B (ENSBTAG00000012681) ANP32A (ENSBTAG00000012365) SPESP1 (ENSBTAG00000005994) NOX5 (ENSBTAG00000009030) GLCE (ENSBTAG00000001405) PAQR5 (ENSBTAG00000020352) KIF23 (ENSBTAG00000009983) RPLP1 (ENSBTAG00000018320) TLE3 (ENSBTAG00000015580) UACA (ENSBTAG00000013982) LARP6 (ENSBTAG00000003915) Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 1 MEGF11 (ENSBIXG00005029582) DIS3L (ENSBIXG00005029839) TIPIN (ENSBIXG00005029852) ENSBIXG00005029869 SNAPC5 (ENSBIXG00005029881) ENSBIXG00005029889 ZWILCH (ENSBIXG00005029921) LCTL (ENSBIXG00005029961) SMAD6 (ENSBIXG00005030012) SMAD3 (ENSBIXG00005030065) AAGAB (ENSBIXG00005030085) IQCH (ENSBIXG00005030120) C15orf61 (ENSBIXG00005030179) MAP2K5 (ENSBIXG00005030309) SKOR1 (ENSBIXG00005030471) PIAS1 (ENSBIXG00005030503) ##22 CALML4 (ENSBIXG00005030510) ENSBIXG00005030548 FEM1B (ENSBIXG00005030567) ITGA11 (ENSBIXG00005030585) CORO2B (ENSBIXG00005030625) ENSBIXG00005030667 SPESP1 (ENSBIXG00005030688) NOX5 (ENSBIXG00005030704) GLCE (ENSBIXG00005030727) PAQR5 (ENSBIXG00005030752) KIF23 (ENSBIXG00005030772) ENSBIXG00005030831 TLE3 (ENSBIXG00005030890) UACA (ENSBIXG00005030994) LARP6 (ENSBIXG00005031031) Bos_a ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145.xc.e.a ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00960000188521 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 Wild yak MODERN SPECIES 552 DIS3L (ENSBMUG00000005883) TIPIN (ENSBMUG00000005904) MAP2K1 (ENSBMUG00000005924) SNAPC5 (ENSBMUG00000005936) ENSBMUG00000005950 ZWILCH (ENSBMUG00000006013) LCTL (ENSBMUG00000006040) ENSBMUG00000006090 SMAD3 (ENSBMUG00000006115) AAGAB (ENSBMUG00000006202) IQCH (ENSBMUG00000006265) ENSBMUG00000006346 MAP2K5 (ENSBMUG00000006406) SKOR1 (ENSBMUG00000006456) PIAS1 (ENSBMUG00000006486) ##22 CALML4 (ENSBMUG00000006499) CLN6 (ENSBMUG00000006571) FEM1B (ENSBMUG00000006589) ITGA11 (ENSBMUG00000006621) CORO2B (ENSBMUG00000006646) ENSBMUG00000006692 Domestic yak MODERN SPECIES 2 DIS3L (ENSBGRG00000024760) TIPIN (ENSBGRG00000024730) MAP2K1 (ENSBGRG00000024678) SNAPC5 (ENSBGRG00000024649) ENSBGRG00000024489 ZWILCH (ENSBGRG00000024356) LCTL (ENSBGRG00000024229) SMAD6 (ENSBGRG00000024050) SMAD3 (ENSBGRG00000023965) AAGAB (ENSBGRG00000023783) IQCH (ENSBGRG00000023490) ENSBGRG00000023451 ENSBGRG00000023428 MAP2K5 (ENSBGRG00000023013) SKOR1 (ENSBGRG00000022855) PIAS1 (ENSBGRG00000022493) ##22 CALML4 (ENSBGRG00000022400) CLN6 (ENSBGRG00000022143) FEM1B (ENSBGRG00000022079) ITGA11 (ENSBGRG00000021881) CORO2B (ENSBGRG00000021747) ENSBGRG00000021463 ENSBGRG00000021382 NOX5 (ENSBGRG00000021070) GLCE (ENSBGRG00000020997) PAQR5 (ENSBGRG00000020916) ENSBGRG00000020887 KIF23 (ENSBGRG00000020219) ENSBGRG00000020068 TLE3 (ENSBGRG00000018260) ENSBGRG00000018101 American bison MODERN SPECIES 2972 ENSBBBG00000001484 MEGF11 (ENSBBBG00000009393) DIS3L (ENSBBBG00000001485) ENSBBBG00000009401 MAP2K1 (ENSBBBG00000009402) SNAPC5 (ENSBBBG00000009405) RPL4 (ENSBBBG00000009410) ZWILCH (ENSBBBG00000007486) LCTL (ENSBBBG00000009415) SMAD6 (ENSBBBG00000001493) SMAD3 (ENSBBBG00000009419) AAGAB (ENSBBBG00000009422) IQCH (ENSBBBG00000009426) C15orf61 (ENSBBBG00000009428) MAP2K5 (ENSBBBG00000009430) PIAS1 (ENSBBBG00000009435) ##22 CALML4 (ENSBBBG00000009437) CLN6 (ENSBBBG00000001505) FEM1B (ENSBBBG00000009440) ITGA11 (ENSBBBG00000009443) CORO2B (ENSBBBG00000009445) ENSBBBG00000009447 SPESP1 (ENSBBBG00000001512) NOX5 (ENSBBBG00000009452) GLCE (ENSBBBG00000009453) PAQR5 (ENSBBBG00000009457) KIF23 (ENSBBBG00000001518) ENSBBBG00000009487 TLE3 (ENSBBBG00000009541) UACA (ENSBBBG00000009586) LARP6 (ENSBBBG00000009602) Caprinae ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764.o ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145.xc ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 Goat MODERN SPECIES 1 ENSCHIG00000000481 MAP2K1 (ENSCHIG00000021340) SNAPC5 (ENSCHIG00000011315) RPL4 (ENSCHIG00000012421) ZWILCH (ENSCHIG00000015830) LCTL (ENSCHIG00000017181) SMAD6 (ENSCHIG00000012651) SMAD3 (ENSCHIG00000013774) ENSCHIG00000015028 IQCH (ENSCHIG00000009034) C15orf61 (ENSCHIG00000026630) MAP2K5 (ENSCHIG00000022039) SKOR1 (ENSCHIG00000017580) ENSCHIG00000010951 ENSCHIG00000003884 PIAS1 (ENSCHIG00000014001) ##22 CALML4 (ENSCHIG00000005207) CLN6 (ENSCHIG00000024128) FEM1B (ENSCHIG00000023393) ITGA11 (ENSCHIG00000025296) CORO2B (ENSCHIG00000023253) ENSCHIG00000011806 SPESP1 (ENSCHIG00000013213) NOX5 (ENSCHIG00000023480) GLCE (ENSCHIG00000014850) PAQR5 (ENSCHIG00000016710) KIF23 (ENSCHIG00000001851) ENSCHIG00000010546 ENSCHIG00000019921 TLE3 (ENSCHIG00000018271) ENSCHIG00000023174 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 23 MEGF11 (ENSOARG00020006928) DIS3L (ENSOARG00020007756) TIPIN (ENSOARG00020007825) MAP2K1 (ENSOARG00020007890) SNAPC5 (ENSOARG00020007973) RPL4 (ENSOARG00020008040) ZWILCH (ENSOARG00020008203) LCTL (ENSOARG00020008384) SMAD6 (ENSOARG00020008552) SMAD3 (ENSOARG00020008589) ENSOARG00020008703 IQCH (ENSOARG00020008820) C15orf61 (ENSOARG00020009584) MAP2K5 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ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 Primates ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145.cb.a ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00910000147890 ENSGT00910000147041 ENSGT00940000158146 ENSGT00860000136046 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00910000146962 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145.cb.a ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00910000147890 ENSGT00910000147041 ENSGT00940000158146 ENSGT00860000136046 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00910000146962 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145.cb.a.a.a ENSGT00390000013696 ENSGT00910000147890 ENSGT00940000157369 ENSGT00910000147041 ENSGT00940000158146 ENSGT00860000136046 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00910000146962 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b.ub ENSGT00390000011417.l ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145.cb.a.a.a ENSGT00390000013696 ENSGT00910000147890 ENSGT00940000157369 ENSGT00910000147041 ENSGT00940000158146 ENSGT00860000136046 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00910000146962 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b.ub ENSGT00390000011417.l ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b 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ENSGT00950000182907.a.b.b.b.ub ENSGT00390000011417.l ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00940000160452.n ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000153487.b.b.i.a ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145.cb.a.b.a.a ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00910000147041 ENSGT00860000136046 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00910000146962 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b.ub ENSGT00390000011417.l ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00940000160452.n ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b Pan ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000153487.b.b.i.a ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145.cb.a.b.a.a ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00910000147041 ENSGT00860000136046 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00910000146962 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b.ub ENSGT00390000011417.l ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00940000160452.n ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b Bonobo MODERN SPECIES 6 ENSPPAG00000033063 SNAPC5 (ENSPPAG00000041196) ENSPPAG00000035309 ZWILCH (ENSPPAG00000033861) LCTL (ENSPPAG00000040836) SMAD6 (ENSPPAG00000027722) ENSPPAG00000036915 ENSPPAG00000020485 SMAD3 (ENSPPAG00000033769) AAGAB (ENSPPAG00000041055) IQCH (ENSPPAG00000042974) C15orf61 (ENSPPAG00000026999) MAP2K5 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KIF23 (ENSG00000137807) RPLP1 (ENSG00000137818) TLE3 (ENSG00000140332) Gorilla MODERN SPECIES 6 ENSGGOG00000042752 SNAPC5 (ENSGGOG00000003693) ENSGGOG00000003695 ZWILCH (ENSGGOG00000003703) LCTL (ENSGGOG00000006350) SMAD6 (ENSGGOG00000013002) ENSGGOG00000038329 ENSGGOG00000012045 ENSGGOG00000004714 IQCH (ENSGGOG00000004722) C15orf61 (ENSGGOG00000004732) MAP2K5 (ENSGGOG00000004734) ENSGGOG00000042211 ENSGGOG00000027762 ENSGGOG00000004743 PIAS1 (ENSGGOG00000016852) ##22 ENSGGOG00000040187 ENSGGOG00000007834 CLN6 (ENSGGOG00000007840) FEM1B (ENSGGOG00000028408) ITGA11 (ENSGGOG00000013093) CORO2B (ENSGGOG00000013046) ANP32A (ENSGGOG00000015417) CIAPIN1 (ENSGGOG00000039236) SPESP1 (ENSGGOG00000013653) NOX5 (ENSGGOG00000010059) GLCE (ENSGGOG00000016777) PAQR5 (ENSGGOG00000003967) KIF23 (ENSGGOG00000003971) ENSGGOG00000023164 RPLP1 (ENSGGOG00000003980) Orangutan MODERN SPECIES 6 TIPIN (ENSPPYG00000031745) MAP2K1 (ENSPPYG00000006576) ENSPPYG00000032290 SNAPC5 (ENSPPYG00000040277) RPL4 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MAP2K5 (ENSNLEG00000013066) ENSNLEG00000032785 SKOR1 (ENSNLEG00000013091) ENSNLEG00000031759 PIAS1 (ENSNLEG00000013103) ##22 ENSNLEG00000013164 CLN6 (ENSNLEG00000013178) FEM1B (ENSNLEG00000013213) ITGA11 (ENSNLEG00000013220) CORO2B (ENSNLEG00000013333) ANP32A (ENSNLEG00000013347) SPESP1 (ENSNLEG00000013404) NOX5 (ENSNLEG00000013408) GLCE (ENSNLEG00000013449) PAQR5 (ENSNLEG00000032338) KIF23 (ENSNLEG00000013478) ENSNLEG00000013547 TLE3 (ENSNLEG00000013552) UACA (ENSNLEG00000013640) LARP6 (ENSNLEG00000013691) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000153487.b.b.i.a ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145.cb.a.a.a ENSGT00390000013696 ENSGT00910000147890 ENSGT00940000157369 ENSGT00910000147041 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00910000146962 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b.ub ENSGT00390000011417.l ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00910000147053 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000005764.g.a ENSGT00940000153487.b.b.i.a ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145.cb.a.a.a ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00910000147041 ENSGT00940000158146 ENSGT01030000234570.d.b.a.a.a.b.a.b.a.c.b ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b.ub ENSGT00390000011417.l ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00910000147053 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 Vervet Monkey MODERN SPECIES 18 TIPIN (ENSCSAG00000013176) MAP2K1 (ENSCSAG00000013191) SNAPC5 (ENSCSAG00000013199) ENSCSAG00000013205 ZWILCH (ENSCSAG00000013218) LCTL (ENSCSAG00000013237) SMAD6 (ENSCSAG00000013248) ENSCSAG00000013271 ENSCSAG00000019736 SMAD3 (ENSCSAG00000013275) AAGAB (ENSCSAG00000013281) IQCH (ENSCSAG00000013352) C15orf61 (ENSCSAG00000013380) MAP2K5 (ENSCSAG00000013397) SKOR1 (ENSCSAG00000013424) PIAS1 (ENSCSAG00000013455) ##22 CALML4 (ENSCSAG00000013468) CLN6 (ENSCSAG00000013477) ENSCSAG00000013485 ITGA11 (ENSCSAG00000013505) CORO2B (ENSCSAG00000013518) ANP32A (ENSCSAG00000013528) SPESP1 (ENSCSAG00000013535) NOX5 (ENSCSAG00000013567) GLCE (ENSCSAG00000013585) PAQR5 (ENSCSAG00000013592) KIF23 (ENSCSAG00000013602) ENSCSAG00000013638 TLE3 (ENSCSAG00000013657) UACA (ENSCSAG00000013665) LARP6 (ENSCSAG00000013672) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000005764.g.a ENSGT00940000153487.b.b.i.a ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145.cb.a.a.a ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00910000147041 ENSGT00940000158146 ENSGT01030000234570.d.b.a.a.a.b.a.b.a.c.b ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b.ub ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00910000147053 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b.nb ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 Macaca ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000005764.g.a ENSGT00940000153487.b.b.i.a ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145.cb.a.a.a ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00910000147041 ENSGT00940000158146 ENSGT01030000234570.d.b.a.a.a.b.a.b.a.c.b ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b.ub ENSGT00390000011417.l ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00910000147053 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b.nb ENSGT01030000234519.e.b Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 77 MAP2K1 (ENSMNEG00000027299) SNAPC5 (ENSMNEG00000032504) ENSMNEG00000027886 ZWILCH (ENSMNEG00000034955) LCTL (ENSMNEG00000002923) ENSMNEG00000031888 SMAD6 (ENSMNEG00000034598) ENSMNEG00000032567 ENSMNEG00000030486 SMAD3 (ENSMNEG00000033094) AAGAB (ENSMNEG00000040056) IQCH (ENSMNEG00000034386) C15orf61 (ENSMNEG00000034192) MAP2K5 (ENSMNEG00000043681) SKOR1 (ENSMNEG00000032875) PIAS1 (ENSMNEG00000030278) ##22 CALML4 (ENSMNEG00000033193) CLN6 (ENSMNEG00000034743) FEM1B (ENSMNEG00000033491) ITGA11 (ENSMNEG00000031314) CORO2B (ENSMNEG00000028626) ANP32A (ENSMNEG00000043179) ENSMNEG00000038547 SPESP1 (ENSMNEG00000024286) NOX5 (ENSMNEG00000032218) ENSMNEG00000024626 GLCE (ENSMNEG00000039663) PAQR5 (ENSMNEG00000008177) KIF23 (ENSMNEG00000028825) ENSMNEG00000003053 TLE3 (ENSMNEG00000036112) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000005764.g.a ENSGT00940000153487.b.b.i.a ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145.cb.a.a.a ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00910000147041 ENSGT00940000158146 ENSGT01030000234570.d.b.a.a.a.b.a.b.a.c.b ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b.ub ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00940000164709.a.b.b.a.a.b.b.b.b.a.a.a.a ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b.nb ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 17 TIPIN (ENSMFAG00000031924) MAP2K1 (ENSMFAG00000036522) ENSMFAG00000063036 SNAPC5 (ENSMFAG00000046383) RPL4 (ENSMFAG00000036412) ZWILCH (ENSMFAG00000036529) LCTL (ENSMFAG00000000458) ENSMFAG00000037066 ENSMFAG00000062655 SMAD3 (ENSMFAG00000001781) AAGAB (ENSMFAG00000040550) IQCH (ENSMFAG00000001124) C15orf61 (ENSMFAG00000053739) MAP2K5 (ENSMFAG00000030100) SKOR1 (ENSMFAG00000001347) PIAS1 (ENSMFAG00000038832) ##22 CLN6 (ENSMFAG00000042975) CALML4 (ENSMFAG00000036145) FEM1B (ENSMFAG00000064469) ITGA11 (ENSMFAG00000001090) CORO2B (ENSMFAG00000030894) ANP32A (ENSMFAG00000043083) ENSMFAG00000050608 SPESP1 (ENSMFAG00000043000) NOX5 (ENSMFAG00000000728) ENSMFAG00000063916 GLCE (ENSMFAG00000045812) ENSMFAG00000059741 PAQR5 (ENSMFAG00000040350) KIF23 (ENSMFAG00000041684) RPLP1 (ENSMFAG00000000366) Rhesus MODERN SPECIES 17 MAP2K1 (ENSMMUG00000016840) SNAPC5 (ENSMMUG00000060148) RPL4 (ENSMMUG00000016844) ZWILCH (ENSMMUG00000029588) LCTL (ENSMMUG00000017447) ENSMMUG00000063378 SMAD6 (ENSMMUG00000019018) ENSMMUG00000057696 SMAD3 (ENSMMUG00000015455) ENSMMUG00000051534 AAGAB (ENSMMUG00000041415) IQCH (ENSMMUG00000015458) C7H15orf61 (ENSMMUG00000060549) MAP2K5 (ENSMMUG00000014482) SKOR1 (ENSMMUG00000014485) PIAS1 (ENSMMUG00000011699) ##22 CLN6 (ENSMMUG00000011703) FEM1B (ENSMMUG00000008311) ITGA11 (ENSMMUG00000004026) CORO2B (ENSMMUG00000006356) ANP32A (ENSMMUG00000022717) ENSMMUG00000064021 SPESP1 (ENSMMUG00000063939) NOX5 (ENSMMUG00000006230) ENSMMUG00000063948 ENSMMUG00000063000 GLCE (ENSMMUG00000021364) PAQR5 (ENSMMUG00000014886) KIF23 (ENSMMUG00000014887) RPLP1 (ENSMMUG00000014888) TLE3 (ENSMMUG00000014023) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00390000005764.g.a ENSGT00940000153487.b.b.i.a ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145.cb.a.a.a ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00910000147041 ENSGT00940000158146 ENSGT01030000234570.d.b.a.a.a.b.a.b.a.c.b ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b.ub ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00910000147053 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b.mb.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 Olive baboon MODERN SPECIES 17 TIPIN (ENSPANG00000016672) MAP2K1 (ENSPANG00000016664) SNAPC5 (ENSPANG00000016665) ENSPANG00000016666 ZWILCH (ENSPANG00000016646) LCTL (ENSPANG00000016647) SMAD6 (ENSPANG00000016648) ENSPANG00000016626 SMAD3 (ENSPANG00000016627) AAGAB (ENSPANG00000016628) IQCH (ENSPANG00000016625) C15orf61 (ENSPANG00000016591) MAP2K5 (ENSPANG00000016592) SKOR1 (ENSPANG00000016593) ENSPANG00000043681 PIAS1 (ENSPANG00000016583) ##22 CALML4 (ENSPANG00000016584) CLN6 (ENSPANG00000016585) ENSPANG00000037059 FEM1B (ENSPANG00000016581) ITGA11 (ENSPANG00000016582) CORO2B (ENSPANG00000016540) ENSPANG00000048171 ANP32A (ENSPANG00000016536) SPESP1 (ENSPANG00000016524) NOX5 (ENSPANG00000016528) ENSPANG00000043271 ENSPANG00000050078 GLCE (ENSPANG00000016492) PAQR5 (ENSPANG00000016380) KIF23 (ENSPANG00000016368) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00390000005764.g.a ENSGT00940000153487.b.b.i.a ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145.cb.a.a.a ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00910000147041 ENSGT00940000158146 ENSGT01030000234570.d.b.a.a.a.b.a.b.a.c.b ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b.ub ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00910000147053 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b.mb.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 Sooty mangabey MODERN SPECIES 336 MAP2K1 (ENSCATG00000038127) SNAPC5 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(ENSMLEG00000032633) AAGAB (ENSMLEG00000042581) IQCH (ENSMLEG00000008461) C15orf61 (ENSMLEG00000044432) MAP2K5 (ENSMLEG00000032952) SKOR1 (ENSMLEG00000033424) PIAS1 (ENSMLEG00000042488) ##22 CALML4 (ENSMLEG00000034518) CLN6 (ENSMLEG00000031755) FEM1B (ENSMLEG00000031589) ITGA11 (ENSMLEG00000034075) CORO2B (ENSMLEG00000034024) ANP32A (ENSMLEG00000028255) SPESP1 (ENSMLEG00000035603) NOX5 (ENSMLEG00000025119) ENSMLEG00000026060 GLCE (ENSMLEG00000000746) PAQR5 (ENSMLEG00000039613) KIF23 (ENSMLEG00000005210) ENSMLEG00000024166 ENSMLEG00000036890 TLE3 (ENSMLEG00000033578) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00940000153487.b.b.i.a ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145.cb.a.a.a ENSGT00390000013696 ENSGT00910000147890 ENSGT00940000157369 ENSGT00910000147041 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00910000146962 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 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SPECIES 27 ENSGT00390000005764.g.a.a ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145.cb.a.a.a ENSGT00390000013696 ENSGT00910000147890 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00910000146962 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b.ub ENSGT00390000011417.l.b ENSGT00390000005362 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00910000147263 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000170330 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145.cb.a.a.a ENSGT00390000013696 ENSGT00910000147890 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00910000146962 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PIAS1 (ENSTSYG00000010953) ##22 CALML4 (ENSTSYG00000033850) CLN6 (ENSTSYG00000025814) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145.cb.a ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 ENSGT00510000050001 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145.cb.a ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 ENSGT00510000050001 Mouse lemur MODERN SPECIES 22 AQP9 (ENSMICG00000038252) POLR2M (ENSMICG00000047017) MYZAP (ENSMICG00000012910) CGNL1 (ENSMICG00000002354) TCF12 (ENSMICG00000009110) ZNF280D (ENSMICG00000013140) MNS1 (ENSMICG00000002649) TEX9 (ENSMICG00000028185) RFX7 (ENSMICG00000000614) NEDD4 (ENSMICG00000037350) ENSMICG00000010451 ENSMICG00000045671 C15orf61 (ENSMICG00000046601) MAP2K5 (ENSMICG00000006137) SKOR1 (ENSMICG00000006148) PIAS1 (ENSMICG00000016982) ##22 CALML4 (ENSMICG00000042372) CLN6 (ENSMICG00000016990) FEM1B (ENSMICG00000028605) ITGA11 (ENSMICG00000001504) CORO2B (ENSMICG00000001523) ENSMICG00000038351 ENSMICG00000043092 SPESP1 (ENSMICG00000045479) GLCE (ENSMICG00000044587) PAQR5 (ENSMICG00000012222) KIF23 (ENSMICG00000012227) RPLP1 (ENSMICG00000036579) TLE3 (ENSMICG00000002321) UACA (ENSMICG00000034701) LARP6 (ENSMICG00000011234) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 197 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 1013 GRIA3 (ENSPCOG00000016277) THOC2 (ENSPCOG00000001806) ENSPCOG00000022393 ENSPCOG00000023829 ENSPCOG00000018424 XIAP (ENSPCOG00000016280) STAG2 (ENSPCOG00000021674) ENSPCOG00000021441 SH2D1A (ENSPCOG00000017696) TENM1 (ENSPCOG00000017310) ENSPCOG00000020709 ENSPCOG00000008025 DCAF12L2 (ENSPCOG00000005793) PRR32 (ENSPCOG00000024831) PIAS1 (ENSPCOG00000011730) ##22 CALML4 (ENSPCOG00000020593) CLN6 (ENSPCOG00000026911) ENSPCOG00000016679 FEM1B (ENSPCOG00000028566) ITGA11 (ENSPCOG00000017850) CORO2B (ENSPCOG00000018103) ENSPCOG00000016650 ENSPCOG00000016339 SPESP1 (ENSPCOG00000018248) GLCE (ENSPCOG00000021724) PAQR5 (ENSPCOG00000022087) KIF23 (ENSPCOG00000023767) ENSPCOG00000018774 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 313 SMAD6 (ENSPSMG00000000845) ENSPSMG00000000854 SMAD3 (ENSPSMG00000001058) AAGAB (ENSPSMG00000001327) IQCH (ENSPSMG00000001397) C15orf61 (ENSPSMG00000001411) MAP2K5 (ENSPSMG00000001626) SKOR1 (ENSPSMG00000001884) ENSPSMG00000001902 PIAS1 (ENSPSMG00000001932) ##22 CALML4 (ENSPSMG00000001943) CLN6 (ENSPSMG00000002045) FEM1B (ENSPSMG00000002150) ITGA11 (ENSPSMG00000002246) CORO2B (ENSPSMG00000002320) ENSPSMG00000002406 SPESP1 (ENSPSMG00000002424) GLCE (ENSPSMG00000002447) PAQR5 (ENSPSMG00000002489) KIF23 (ENSPSMG00000002749) RPLP1 (ENSPSMG00000003344) ENSPSMG00000003349 Bushbaby MODERN SPECIES 126 MAP2K1 (ENSOGAG00000015876) SNAPC5 (ENSOGAG00000015881) ENSOGAG00000015884 ZWILCH (ENSOGAG00000015886) LCTL (ENSOGAG00000015893) SMAD6 (ENSOGAG00000015387) ENSOGAG00000034467 ENSOGAG00000029245 SMAD3 (ENSOGAG00000014217) AAGAB (ENSOGAG00000014219) IQCH (ENSOGAG00000014224) ENSOGAG00000028206 C15orf61 (ENSOGAG00000027440) MAP2K5 (ENSOGAG00000002480) SKOR1 (ENSOGAG00000025983) PIAS1 (ENSOGAG00000014134) ##22 CALML4 (ENSOGAG00000014140) CLN6 (ENSOGAG00000014142) FEM1B (ENSOGAG00000014143) ITGA11 (ENSOGAG00000014144) CORO2B (ENSOGAG00000026008) ENSOGAG00000003058 GLCE (ENSOGAG00000029673) PAQR5 (ENSOGAG00000012036) KIF23 (ENSOGAG00000034448) RPLP1 (ENSOGAG00000029641) TLE3 (ENSOGAG00000004789) UACA (ENSOGAG00000006940) LARP6 (ENSOGAG00000000522) LRRC49 (ENSOGAG00000000523) ENSOGAG00000031017 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 Tree shrew MODERN SPECIES 801 PIAS1 (ENSTBEG00000015408) ##22 ENSTBEG00000015859 FEM1B (ENSTBEG00000016028) ITGA11 (ENSTBEG00000016039) Glires ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00950000183167.a.b.a ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000154905 ENSGT00390000014038 ENSGT00940000159572 ENSGT00390000008859.b.d.j ENSGT00950000183129.b.b ENSGT00940000154201.a.b ENSGT00390000008107.c.b ENSGT00980000199570 ENSGT00940000155744 Rabbit MODERN SPECIES 8 DIS3L (ENSOCUG00000002206) TIPIN (ENSOCUG00000002212) ENSOCUG00000023060 MAP2K1 (ENSOCUG00000008782) SNAPC5 (ENSOCUG00000039231) ENSOCUG00000008794 ZWILCH (ENSOCUG00000008800) LCTL (ENSOCUG00000021771) ENSOCUG00000006134 ENSOCUG00000014186 SMAD3 (ENSOCUG00000029601) ENSOCUG00000039204 AAGAB (ENSOCUG00000006644) IQCH (ENSOCUG00000006647) MAP2K5 (ENSOCUG00000009024) PIAS1 (ENSOCUG00000000618) ##22 CLN6 (ENSOCUG00000017533) FEM1B (ENSOCUG00000026586) ITGA11 (ENSOCUG00000017726) ENSOCUG00000036279 MYO9A (ENSOCUG00000017425) SENP8 (ENSOCUG00000026054) GRAMD2A (ENSOCUG00000006107) ENSOCUG00000006119 PARP6 (ENSOCUG00000004374) CELF6 (ENSOCUG00000021663) HEXA (ENSOCUG00000009190) ENSOCUG00000009207 ARIH1 (ENSOCUG00000011272) Pika MODERN SPECIES 335 PIAS1 (ENSOPRG00000014396) ##22 CALML4 (ENSOPRG00000014428) CLN6 (ENSOPRG00000002040) FEM1B (ENSOPRG00000014433) ITGA11 (ENSOPRG00000014438) Rodentia ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00940000162591 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 ENSGT00940000157011 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 ENSGT00940000157011 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 ENSGT00940000157011 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 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Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 284 Rab11a (ENSCGRG00001023313) Megf11 (ENSCGRG00001019210) Dis3l (ENSCGRG00001017825) Tipin (ENSCGRG00001018146) Snapc5 (ENSCGRG00001013968) Zwilch (ENSCGRG00001018206) Lctl (ENSCGRG00001017716) Smad6 (ENSCGRG00001002733) Smad3 (ENSCGRG00001013999) Aagab (ENSCGRG00001020082) Iqch (ENSCGRG00001006084) ENSCGRG00001000811 2300009A05Rik (ENSCGRG00001009275) Map2k5 (ENSCGRG00001024707) Skor1 (ENSCGRG00001000300) Pias1 (ENSCGRG00001018818) ##22 Calml4 (ENSCGRG00001023410) Cln6 (ENSCGRG00001016348) Fem1b (ENSCGRG00001018487) Itga11 (ENSCGRG00001016586) Coro2b (ENSCGRG00001025051) ENSCGRG00001022637 Spesp1 (ENSCGRG00001015906) Glce (ENSCGRG00001019156) Paqr5 (ENSCGRG00001021586) Kif23 (ENSCGRG00001024682) ENSCGRG00001022135 Tle3 (ENSCGRG00001024081) Uaca (ENSCGRG00001000355) Larp6 (ENSCGRG00001024472) Lrrc49 (ENSCGRG00001011265) Golden Hamster MODERN SPECIES 672 Rab11a (ENSMAUG00000018551) Megf11 (ENSMAUG00000003129) Dis3l (ENSMAUG00000008265) Tipin 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ENSPEMG00000000682 Fem1b (ENSPEMG00000028410) Itga11 (ENSPEMG00000014149) Coro2b (ENSPEMG00000016326) Anp32a (ENSPEMG00000017392) ENSPEMG00000017757 Glce (ENSPEMG00000030703) Paqr5 (ENSPEMG00000016716) Kif23 (ENSPEMG00000018508) ENSPEMG00000000345 ENSPEMG00000026526 Tle3 (ENSPEMG00000008382) Uaca (ENSPEMG00000012249) Prairie vole MODERN SPECIES 13 Dis3l (ENSMOCG00000005278) Tipin (ENSMOCG00000010343) Map2k1 (ENSMOCG00000013072) Snapc5 (ENSMOCG00000015348) ENSMOCG00000021901 Zwilch (ENSMOCG00000017159) Lctl (ENSMOCG00000004744) Smad6 (ENSMOCG00000014458) Smad3 (ENSMOCG00000018490) Aagab (ENSMOCG00000021340) Iqch (ENSMOCG00000016873) 2300009A05Rik (ENSMOCG00000013991) Map2k5 (ENSMOCG00000022058) Skor1 (ENSMOCG00000018261) ENSMOCG00000019235 Pias1 (ENSMOCG00000022074) ##22 Calml4 (ENSMOCG00000018493) Cln6 (ENSMOCG00000021992) Fem1b (ENSMOCG00000005442) Itga11 (ENSMOCG00000003119) Coro2b (ENSMOCG00000011097) ENSMOCG00000004428 ENSMOCG00000014776 Spesp1 (ENSMOCG00000016907) Glce (ENSMOCG00000019169) Paqr5 (ENSMOCG00000009266) Kif23 (ENSMOCG00000008773) ENSMOCG00000008158 Tle3 (ENSMOCG00000007663) ENSMOCG00000009835 Uaca (ENSMOCG00000012899) Murinae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01050000248351 ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 Mus ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01050000248351 ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b.t.b ENSGT01050000248351 ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 Ryukyu mouse MODERN SPECIES 18 Dis3l (MGP_CAROLIEiJ_G0032344) Tipin (MGP_CAROLIEiJ_G0032343) MGP_CAROLIEiJ_G0032342 Map2k1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032341) Snapc5 (MGP_CAROLIEiJ_G0032340) Rpl4 (MGP_CAROLIEiJ_G0032339) Zwilch (MGP_CAROLIEiJ_G0032338) Lctl (MGP_CAROLIEiJ_G0032337) Smad6 (MGP_CAROLIEiJ_G0032336) Smad3 (MGP_CAROLIEiJ_G0032335) Aagab (MGP_CAROLIEiJ_G0032334) Iqch (MGP_CAROLIEiJ_G0032333) 2300009A05Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0032332) Map2k5 (MGP_CAROLIEiJ_G0032331) Skor1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032330) Pias1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032329) ##22 Calml4 (MGP_CAROLIEiJ_G0032328) Cln6 (MGP_CAROLIEiJ_G0032327) Fem1b (MGP_CAROLIEiJ_G0032326) Itga11 (MGP_CAROLIEiJ_G0032325) Coro2b (MGP_CAROLIEiJ_G0032324) Anp32a (MGP_CAROLIEiJ_G0032323) Spesp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032322) Glce (MGP_CAROLIEiJ_G0032321) Paqr5 (MGP_CAROLIEiJ_G0032320) Kif23 (MGP_CAROLIEiJ_G0032319) Rplp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0032318) Tle3 (MGP_CAROLIEiJ_G0032317) MGP_CAROLIEiJ_G0032316 Uaca (MGP_CAROLIEiJ_G0032315) Larp6 (MGP_CAROLIEiJ_G0032314) Mus_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000154925.c.a ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145 ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859.e.b ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b.t.b ENSGT01050000248351 ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 Mouse MODERN SPECIES 18 Dis3l (ENSMUSG00000032396) Tipin (ENSMUSG00000032397) Uchl4 (ENSMUSG00000035337) Map2k1 (ENSMUSG00000004936) Snapc5 (ENSMUSG00000032398) Rpl4 (ENSMUSG00000032399) Zwilch (ENSMUSG00000032400) Lctl (ENSMUSG00000032401) Smad6 (ENSMUSG00000036867) Smad3 (ENSMUSG00000032402) Aagab (ENSMUSG00000037257) Iqch (ENSMUSG00000037801) 2300009A05Rik (ENSMUSG00000032403) Map2k5 (ENSMUSG00000058444) Skor1 (ENSMUSG00000022245) Pias1 (ENSMUSG00000032405) ##22 Calml4 (ENSMUSG00000032246) Cln6 (ENSMUSG00000032245) Fem1b (ENSMUSG00000032244) Itga11 (ENSMUSG00000032243) Coro2b (ENSMUSG00000041729) Anp32a (ENSMUSG00000032249) Spesp1 (ENSMUSG00000046846) Glce (ENSMUSG00000032252) Paqr5 (ENSMUSG00000032278) Kif23 (ENSMUSG00000032254) Rplp1 (ENSMUSG00000007892) Tle3 (ENSMUSG00000032280) Uaca (ENSMUSG00000034485) Larp6 (ENSMUSG00000034839) Lrrc49 (ENSMUSG00000047766) Mus_C ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000154925.c.a ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 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Tle3 (ENSNGAG00000018146) Uaca (ENSNGAG00000015211) Larp6 (ENSNGAG00000014238) Lesser Egyptian jerboa DUPLICATION Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 92 ENSJJAG00000019234 Dis3l (ENSJJAG00000016147) Tipin (ENSJJAG00000017947) Map2k1 (ENSJJAG00000021452) Snapc5 (ENSJJAG00000022013) ENSJJAG00000013677 Zwilch (ENSJJAG00000010189) Lctl (ENSJJAG00000013579) Smad6 (ENSJJAG00000019623) Smad3 (ENSJJAG00000021414) ENSJJAG00000018312 Iqch (ENSJJAG00000024416) 2300009A05Rik (ENSJJAG00000019436) Map2k5 (ENSJJAG00000024208) Skor1 (ENSJJAG00000003624) ENSJJAG00000019728 ##22 Calml4 (ENSJJAG00000014113) Cln6 (ENSJJAG00000024405) Fem1b (ENSJJAG00000018686) Itga11 (ENSJJAG00000007244) Coro2b (ENSJJAG00000003058) Anp32a (ENSJJAG00000019278) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 41 ENSJJAG00000014954 Mis18bp1 (ENSJJAG00000022998) Fkbp3 (ENSJJAG00000019949) Prpf39 (ENSJJAG00000022757) Togaram1 (ENSJJAG00000013948) Klhl28 (ENSJJAG00000016796) Gm527 (ENSJJAG00000014810) ENSJJAG00000003126 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ENSGT00940000159103 ENSGT00940000157011 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 19 ENSHGLG00000007770 ENSHGLG00000005971 ENSHGLG00000048822 ENSHGLG00000010036 ENSHGLG00000040904 ENSHGLG00000008054 ZWILCH (ENSHGLG00000016059) LCTL (ENSHGLG00000015669) SMAD6 (ENSHGLG00000008453) SMAD3 (ENSHGLG00000048787) AAGAB (ENSHGLG00000038898) ENSHGLG00000026352 C15orf61 (ENSHGLG00000038870) MAP2K5 (ENSHGLG00000006627) SKOR1 (ENSHGLG00000017297) Pias1 (ENSHGLG00000019002) ##22 Calml4 (ENSHGLG00000018794) CLN6 (ENSHGLG00000017958) FEM1B (ENSHGLG00000017948) ITGA11 (ENSHGLG00000007233) CORO2B (ENSHGLG00000015273) ENSHGLG00000013229 SPESP1 (ENSHGLG00000046924) GLCE (ENSHGLG00000033764) PAQR5 (ENSHGLG00000009727) KIF23 (ENSHGLG00000009784) RPLP1 (ENSHGLG00000039543) TLE3 (ENSHGLG00000008782) ENSHGLG00000042030 ENSHGLG00000005840 UACA (ENSHGLG00000006182) Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145.vb ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 ENSGT00940000157011 Guinea pig MODERN SPECIES LGSN (ENSCPOG00000008736) KHDRBS2 (ENSCPOG00000025621) PRIM2 (ENSCPOG00000003912) ENSCPOG00000035048 RAB23 (ENSCPOG00000030218) BAG2 (ENSCPOG00000040302) ZNF451 (ENSCPOG00000002491) BEND6 (ENSCPOG00000015453) DST (ENSCPOG00000005092) SMAD6 (ENSCPOG00000001535) SMAD3 (ENSCPOG00000021314) AAGAB (ENSCPOG00000000965) C15orf61 (ENSCPOG00000022542) MAP2K5 (ENSCPOG00000000970) SKOR1 (ENSCPOG00000012665) PIAS1 (ENSCPOG00000007278) ##22 CALML4 (ENSCPOG00000033517) CLN6 (ENSCPOG00000007282) FEM1B (ENSCPOG00000031057) ITGA11 (ENSCPOG00000012877) CORO2B (ENSCPOG00000023117) ENSCPOG00000008829 GLCE (ENSCPOG00000020608) Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000155333.B ENSGT00530000063106.B ENSGT00390000005764 ENSGT00940000153487.b.b ENSGT00390000010331 ENSGT00390000018145.vb ENSGT00390000013696 ENSGT00940000157369 ENSGT00940000158146 ENSGT00940000153499.b.b ENSGT00390000007218 ENSGT00390000008908 ENSGT00390000015942 ENSGT00940000157505 ENSGT00940000158440 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000157859 ENSGT00400000022240 ENSGT00940000161115 ENSGT00940000155465 ENSGT00940000158689 ENSGT00950000182907.a.b.b.b ENSGT00390000005362 ENSGT00390000006043 ENSGT00940000158844 ENSGT00940000155837 ENSGT00550000074698.k.b.b ENSGT01030000234519.e.b ENSGT00940000157475 ENSGT00940000159103 ENSGT00940000157011 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 157 MEGF11 (ENSCLAG00000013146) DIS3L (ENSCLAG00000005741) TIPIN (ENSCLAG00000004924) MAP2K1 (ENSCLAG00000013042) SNAPC5 (ENSCLAG00000011660) RPL4 (ENSCLAG00000010827) ZWILCH (ENSCLAG00000010124) LCTL (ENSCLAG00000004564) ENSCLAG00000005550 SMAD3 (ENSCLAG00000005027) AAGAB (ENSCLAG00000008364) IQCH (ENSCLAG00000011031) C15orf61 (ENSCLAG00000008894) MAP2K5 (ENSCLAG00000005277) SKOR1 (ENSCLAG00000007488) PIAS1 (ENSCLAG00000008129) ##22 CALML4 (ENSCLAG00000008707) CLN6 (ENSCLAG00000007035) FEM1B (ENSCLAG00000004834) ITGA11 (ENSCLAG00000006568) CORO2B (ENSCLAG00000006658) ENSCLAG00000010256 SPESP1 (ENSCLAG00000009992) GLCE (ENSCLAG00000009057) PAQR5 (ENSCLAG00000008730) KIF23 (ENSCLAG00000009415) ENSCLAG00000008677 TLE3 (ENSCLAG00000006154) UACA (ENSCLAG00000016558) LARP6 (ENSCLAG00000007893) LRRC49 (ENSCLAG00000007536) Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 67 DIS3L (ENSODEG00000015811) MAP2K1 (ENSODEG00000016739) ENSODEG00000016495 ZWILCH (ENSODEG00000016374) LCTL (ENSODEG00000016271) ENSODEG00000020317 SMAD6 (ENSODEG00000016272) SMAD3 (ENSODEG00000015739) ENSODEG00000015886 ENSODEG00000020336 IQCH (ENSODEG00000016134) C15orf61 (ENSODEG00000016721) ENSODEG00000016511 MAP2K5 (ENSODEG00000015607) SKOR1 (ENSODEG00000015903) PIAS1 (ENSODEG00000016418) ##22 CALML4 (ENSODEG00000015441) CLN6 (ENSODEG00000015888) ENSODEG00000016475 ENSODEG00000020366 ITGA11 (ENSODEG00000015700) CORO2B (ENSODEG00000016099) ENSODEG00000016071 GLCE (ENSODEG00000015883) PAQR5 (ENSODEG00000015793) KIF23 (ENSODEG00000015341) ENSODEG00000015331 TLE3 (ENSODEG00000015524) UACA (ENSODEG00000015800) LARP6 (ENSODEG00000015958) LRRC49 (ENSODEG00000015345) Degu MODERN SPECIES 165 LVRN (ENSODEG00000002192) ARL14EPL (ENSODEG00000002532) ENSODEG00000002563 ENSODEG00000002580 ENSODEG00000002602 SEMA6A (ENSODEG00000002653) ENSODEG00000002744 ENSODEG00000018768 ENSODEG00000018846 DTWD2 (ENSODEG00000001974) ENSODEG00000018764 DMXL1 (ENSODEG00000002200) ENSODEG00000002485 ENSODEG00000018825 HSD17B4 (ENSODEG00000002614) ENSODEG00000003016 ##22 FAM170A (ENSODEG00000003032) ENSODEG00000003051 ENSODEG00000003064 PRR16 (ENSODEG00000003401) ENSODEG00000003412 Cyclostomata DUPLICATION Cyclostomata DUPLICATION Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES 667 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.c.a ##22 ENSGT00940000154662 Lamprey MODERN SPECIES 24 ENSPMAG00000001204 ##22 EEF2 (ENSPMAG00000001142) ENSPMAG00000001141 Hagfish MODERN SPECIES 957 ENSEBUG00000015842 ENSEBUG00000006863 ENSEBUG00000003250 ENSEBUG00000000626 SLC39A1 (ENSEBUG00000014789) ENSEBUG00000013084 ENSEBUG00000013727 ##22 EEF2 (ENSEBUG00000009369) ENSEBUG00000007772 ENSEBUG00000015927 ENSEBUG00000015278 Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES 369 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.c.b ##22 ENSGT00940000157859 Hagfish MODERN SPECIES 1380 nsa2 (ENSEBUG00000009588) ENSEBUG00000001033 ENSEBUG00000004460 ENSEBUG00000003041 ENSEBUG00000010628 ENSEBUG00000005800 ENSEBUG00000003949 psma4 (ENSEBUG00000009681) slc25a44a (ENSEBUG00000006984) crabp2b (ENSEBUG00000015443) dapk2a (ENSEBUG00000011743) ENSEBUG00000012768 ENSEBUG00000009184 rps2 (ENSEBUG00000015127) ENSEBUG00000010517 ##22 ENSEBUG00000014076 Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES 417 ENSGT01030000234539.a.a.b.a.d ##22 ENSGT00940000155465.k Lamprey MODERN SPECIES 1054 ENSPMAG00000005551 katnal2 (ENSPMAG00000005512) ENSPMAG00000005462 ##22 mcm7 (ENSPMAG00000005356) Hagfish MODERN SPECIES 988 ENSEBUG00000016787 ENSEBUG00000010829 ENSEBUG00000001716 ENSEBUG00000011590 ENSEBUG00000014055 ENSEBUG00000009485 ENSEBUG00000014135 LDHC (ENSEBUG00000016283) erlin1 (ENSEBUG00000016105) ENSEBUG00000002723 ENSEBUG00000014536 ENSEBUG00000015287 ENSEBUG00000014508 ENSEBUG00000003867 ENSEBUG00000008793 ENSEBUG00000012381 ##22 ENSEBUG00000006290 ENSEBUG00000016929 ENSEBUG00000013747 ENSEBUG00000016769 ENSEBUG00000007635 ENSEBUG00000007251 ENSEBUG00000015135 NOX5 (ENSEBUG00000015760) anp32e (ENSEBUG00000006914) coro2aa (ENSEBUG00000013149) ENSEBUG00000002778 ENSEBUG00000001508 ENSEBUG00000004225 ndufa2 (ENSEBUG00000012351) Bilateria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 Chordata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 301 ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000154662 ENSGT00940000157006 ENSGT01030000234542.b.b.a.b Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 104 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000154737.c ENSGT00940000160191 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000159440 ENSGT00940000159004 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000160050 ENSGT00990000205656 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000157006 ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b ENSGT00390000002049.d ENSGT00940000156893 ENSGT00390000018360 ENSGT00390000011497 ENSGT00950000183094.a ENSGT00940000159348 ENSGT00940000161136 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 104 ENSGT00390000003420.b ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.B ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00390000018044.b.b ENSGT00940000163917.b ENSGT00950000182938.b.b.b.b.b.a ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000166634 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00990000205656 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c Coelacanth MODERN SPECIES 723 MFSD12 (ENSLACG00000015304) GIPC3 (ENSLACG00000015126) TBXA2R (ENSLACG00000015049) cactin (ENSLACG00000014782) PIP5K1C (ENSLACG00000014534) TJP3 (ENSLACG00000014070) APBA3 (ENSLACG00000013941) MRPL54 (ENSLACG00000013912) malt2 (ENSLACG00000013659) rx1 (ENSLACG00000013485) MATK (ENSLACG00000013081) ZFR2 (ENSLACG00000012528) ATCAY (ENSLACG00000011669) ENSLACG00000011124 PIAS4 (ENSLACG00000010963) ##22 ENSLACG00000010819 ZBTB7A (ENSLACG00000010404) MAP2K2 (ENSLACG00000009760) CREB3L3 (ENSLACG00000009185) rxfp3.2b (ENSLACG00000008427) SIRT6 (ENSLACG00000007794) ANKRD24 (ENSLACG00000007315) EBI3 (ENSLACG00000007004) YJU2 (ENSLACG00000006741) SHD (ENSLACG00000005422) FSD1 (ENSLACG00000003071) STAP2 (ENSLACG00000002248) Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 80 ENSGT00390000003420.b ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.B ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00390000018044.b.b ENSGT00940000163917.b ENSGT00950000182938.b.b.b.b.b.a ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT01030000234539.a.a.b.b #22 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00990000205656 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 Anura ANCESTRAL SPECIES 197 ENSGT00940000161213 ENSGT00390000003420.b ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.B ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163917.b ENSGT00950000182938.b.b.b.b.b.a ENSGT00940000160775 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a Leishan spiny toad DUPLICATION Leishan spiny toad MODERN SPECIES ENSLLEG00000003351 ENSLLEG00000003404 ENSLLEG00000003410 UHRF1 (ENSLLEG00000003444) ENSLLEG00000003578 ENSLLEG00000003586 ENSLLEG00000003594 ENSLLEG00000003667 NOA1 (ENSLLEG00000003839) ENSLLEG00000003862 ENSLLEG00000003871 ENSLLEG00000003879 ENSLLEG00000003910 ENSLLEG00000003974 ENSLLEG00000003980 ENSLLEG00000003988 ##22 ZBTB7A (ENSLLEG00000003998) ENSLLEG00000004002 ENSLLEG00000004022 ENSLLEG00000004042 LSM4 (ENSLLEG00000004045) ENSLLEG00000004051 ENSLLEG00000004060 ENSLLEG00000004068 ENSLLEG00000004075 ENSLLEG00000004080 ENSLLEG00000004084 ENSLLEG00000004087 ATCAY (ENSLLEG00000004102) ENSLLEG00000004129 ENSLLEG00000004130 Leishan spiny toad MODERN SPECIES ENSLLEG00000002697 ENSLLEG00000002675 ENSLLEG00000002660 SH2D4A (ENSLLEG00000002624) CSGALNACT1 (ENSLLEG00000002574) INTS10 (ENSLLEG00000002389) HGSNAT (ENSLLEG00000002203) POMK (ENSLLEG00000002153) FNTA (ENSLLEG00000002129) ENSLLEG00000002109 KCMF1 (ENSLLEG00000002059) ENSLLEG00000002032 SLC20A2 (ENSLLEG00000001933) ENSLLEG00000001893 ENSLLEG00000001878 ENSLLEG00000001715 ##22 ENSLLEG00000001652 ENSLLEG00000001635 LSM7 (ENSLLEG00000001566) SPPL2B (ENSLLEG00000001488) ENSLLEG00000001463 TMPRSS9 (ENSLLEG00000001418) TIMM13 (ENSLLEG00000001377) LMNB2 (ENSLLEG00000001327) ENSLLEG00000001294 PPP1R3B (ENSLLEG00000001279) ENSLLEG00000001256 ENSLLEG00000001244 SAFB (ENSLLEG00000001137) ENSLLEG00000001115 ENSLLEG00000000630 Frog MODERN SPECIES hmg20b (ENSXETG00000022092) gipc3 (ENSXETG00000022097) tbxa2r (ENSXETG00000022101) cactin (ENSXETG00000022106) pip5k1c (ENSXETG00000006418) tjp3 (ENSXETG00000006407) apba3 (ENSXETG00000030272) mrpl54 (ENSXETG00000033250) rax2 (ENSXETG00000031298) XB5845204 [provisional:cplx4] (ENSXETG00000039840) matk (ENSXETG00000032315) atcay (ENSXETG00000006394) dapk3 (ENSXETG00000006396) ENSXETG00000047159 fbxl16 (ENSXETG00000006391) pias4 (ENSXETG00000006386) ##22 gramd2a (ENSXETG00000030132) XB5954422 [provisional] (ENSXETG00000006382) lrrc14b (ENSXETG00000001796) lmnb2 (ENSXETG00000001795) timm13 (ENSXETG00000046447) tmprss9 (ENSXETG00000001793) rpl36 (ENSXETG00000039651) ENSXETG00000047842 sppl2b (ENSXETG00000001791) lsm7 (ENSXETG00000022166) cers4 (ENSXETG00000036458) fbn3 (ENSXETG00000001781) ctxn1 (ENSXETG00000046070) timm44 (ENSXETG00000001779) hnrnpm (ENSXETG00000001777) Amniota ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00950000183102.B ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00390000018044.b.b ENSGT00940000163917.b ENSGT00950000182938.b.b.b.b.b.a ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000154779.a.a ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a ENSGT00940000160088 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000159237 ENSGT00990000205656 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c Mammalia ANCESTRAL SPECIES 61 ENSGT00940000161213 ENSGT00390000003420.b ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.B ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163917.b ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 ENSGT00940000157273 Platypus DUPLICATION Platypus MODERN SPECIES 35 ENSOANG00000043592 RYBP (ENSOANG00000050562) ENSOANG00000038226 ENSOANG00000043879 ENSOANG00000038599 ENSOANG00000045913 FEM1C (ENSOANG00000037326) ENSOANG00000045434 CNBP (ENSOANG00000040160) AKAP8LY (ENSOANG00000047029) ENSOANG00000044776 ENSOANG00000037290 ENSOANG00000037198 ENSOANG00000038603 ENSOANG00000048071 ENSOANG00000046095 ##22 AMHY (ENSOANG00000049951) STK11Y (ENSOANG00000050581) PPP4R2Y (ENSOANG00000038432) ENSOANG00000047700 ENSOANG00000045767 ENSOANG00000047215 ENSOANG00000042739 Platypus MODERN SPECIES 85 FZR1 (ENSOANG00000007656) ENSOANG00000015682 ENSOANG00000014325 HMG20B (ENSOANG00000013515) TBXA2R (ENSOANG00000037569) PIP5K1C (ENSOANG00000006295) TJP3 (ENSOANG00000006294) APBA3 (ENSOANG00000006293) ENSOANG00000037708 MATK (ENSOANG00000010674) ENSOANG00000011220 ATCAY (ENSOANG00000006292) NMRK2 (ENSOANG00000035130) DAPK3 (ENSOANG00000003319) ENSOANG00000014032 PIAS4 (ENSOANG00000031620) ##22 ZBTB7A (ENSOANG00000045647) MAP2K2 (ENSOANG00000045918) CREB3L3 (ENSOANG00000013246) SIRT6 (ENSOANG00000008787) ANKRD24 (ENSOANG00000048879) EBI3 (ENSOANG00000028577) YJU2 (ENSOANG00000008914) SHD (ENSOANG00000014374) FSD1 (ENSOANG00000006431) ENSOANG00000006439 DNM2 (ENSOANG00000013365) TMED1 (ENSOANG00000037520) ENSOANG00000009834 CARM1 (ENSOANG00000045313) YIPF2 (ENSOANG00000050867) Theria ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000161213 ENSGT00390000003420.b ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.B ENSGT00940000159258 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ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 ENSGT00940000157273 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183102.B ENSGT00940000159258 ENSGT00390000001450.h.a.b.b ENSGT00940000154650.d.f.d.a.a ENSGT00950000182890.D.c.b.a.a.b.a.a.a ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163917.b ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 ENSGT00940000157273 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 20 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ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 ENSGT00940000157273 Common wonbat MODERN SPECIES 580 ENSVURG00010024755 PIP5K1C (ENSVURG00010024749) ENSVURG00010024743 ENSVURG00010024741 ENSVURG00010024739 ENSVURG00010024737 TJP3 (ENSVURG00010024727) APBA3 (ENSVURG00010024720) MRPL54 (ENSVURG00010024716) ENSVURG00010024713 MATK (ENSVURG00010024711) ZFR2 (ENSVURG00010024701) ATCAY (ENSVURG00010024696) DAPK3 (ENSVURG00010024691) EEF2 (ENSVURG00010024687) PIAS4 (ENSVURG00010024683) ##22 ZBTB7A (ENSVURG00010024681) MAP2K2 (ENSVURG00010024677) CREB3L3 (ENSVURG00010024676) SIRT6 (ENSVURG00010024673) ANKRD24 (ENSVURG00010024667) EBI3 (ENSVURG00010024663) YJU2 (ENSVURG00010024661) ENSVURG00010024660 SHD (ENSVURG00010024657) ENSVURG00010024655 FSD1 (ENSVURG00010024652) STAP2 (ENSVURG00010024642) MPND (ENSVURG00010024637) SH3GL1 (ENSVURG00010024635) ENSVURG00010024633 koala MODERN SPECIES 214 TJP3 (ENSPCIG00000025374) APBA3 (ENSPCIG00000025381) MRPL54 (ENSPCIG00000025383) ENSPCIG00000025384 MATK (ENSPCIG00000025386) ZFR2 (ENSPCIG00000025388) ATCAY (ENSPCIG00000025395) NMRK2 (ENSPCIG00000025398) DAPK3 (ENSPCIG00000025399) EEF2 (ENSPCIG00000025403) PIAS4 (ENSPCIG00000025412) ##22 ZBTB7A (ENSPCIG00000025417) MAP2K2 (ENSPCIG00000006438) CREB3L3 (ENSPCIG00000006434) SIRT6 (ENSPCIG00000006432) ENSPCIG00000035510 EBI3 (ENSPCIG00000036381) YJU2 (ENSPCIG00000006341) SHD (ENSPCIG00000006337) FSD1 (ENSPCIG00000006329) STAP2 (ENSPCIG00000006321) MPND (ENSPCIG00000006318) SH3GL1 (ENSPCIG00000006316) CHAF1A (ENSPCIG00000006291) UBXN6 (ENSPCIG00000006287) HDGFL2 (ENSPCIG00000003977) Wallaby MODERN SPECIES 1445 PIAS4 (ENSMEUG00000016301) ##22 Tasmanian devil MODERN SPECIES PIP5K1C (ENSSHAG00000004499) ENSSHAG00000027582 ENSSHAG00000030933 ENSSHAG00000030563 ENSSHAG00000024272 TJP3 (ENSSHAG00000001439) APBA3 (ENSSHAG00000002223) MRPL54 (ENSSHAG00000002557) ENSSHAG00000003118 MATK (ENSSHAG00000003362) ENSSHAG00000004724 ATCAY (ENSSHAG00000006184) ENSSHAG00000030604 DAPK3 (ENSSHAG00000030421) EEF2 (ENSSHAG00000007539) PIAS4 (ENSSHAG00000024821) ##22 ZBTB7A (ENSSHAG00000027505) MAP2K2 (ENSSHAG00000009251) CREB3L3 (ENSSHAG00000009874) SIRT6 (ENSSHAG00000009965) ANKRD24 (ENSSHAG00000010216) EBI3 (ENSSHAG00000027537) YJU2 (ENSSHAG00000010428) SHD (ENSSHAG00000010563) FSD1 (ENSSHAG00000030022) STAP2 (ENSSHAG00000023692) MPND (ENSSHAG00000000206) ENSSHAG00000000851 CHAF1A (ENSSHAG00000000307) UBXN6 (ENSSHAG00000029235) ENSSHAG00000027707 Opossum MODERN SPECIES 2 ENSMODG00000029488 ENSMODG00000043432 ENSMODG00000012204 monDomV1R1215 (ENSMODG00000039829) VN2R501 (ENSMODG00000037853) TJP3 (ENSMODG00000000580) APBA3 (ENSMODG00000000598) ENSMODG00000000602 ENSMODG00000000607 MATK (ENSMODG00000000637) ZFR2 (ENSMODG00000000675) ATCAY (ENSMODG00000000696) NMRK2 (ENSMODG00000000709) DAPK3 (ENSMODG00000043143) EEF2 (ENSMODG00000000750) PIAS4 (ENSMODG00000000765) ##22 ENSMODG00000045895 ZBTB7A (ENSMODG00000000778) MAP2K2 (ENSMODG00000000809) CREB3L3 (ENSMODG00000000817) ENSMODG00000024036 YJU2 (ENSMODG00000000841) SHD (ENSMODG00000000858) ENSMODG00000027838 FSD1 (ENSMODG00000000881) STAP2 (ENSMODG00000000895) MPND (ENSMODG00000000907) SH3GL1 (ENSMODG00000000931) CHAF1A (ENSMODG00000000950) ENSMODG00000000967 HDGFL2 (ENSMODG00000000988) Eutheria ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00730000111899 ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00520000060565 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 79 ENSGT00390000003420.b ENSGT00730000111899 ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 ENSGT00940000157273 ENSGT00940000153942.a.f Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 1541 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 Armadillo MODERN SPECIES 1151 EEF2 (ENSDNOG00000001613) PIAS4 (ENSDNOG00000045174) ##22 ZBTB7A (ENSDNOG00000036619) Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 97 ENSGT00390000003420.b ENSGT00730000111899 ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 ENSGT00940000157273 ENSGT00940000153942.a.f Tenrec MODERN SPECIES 6068 PIAS4 (ENSETEG00000019562) ##22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 101 ENSGT00390000003420.b ENSGT00730000111899 ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 ENSGT00940000157273 ENSGT00940000153942.a.f Elephant MODERN SPECIES 60 HMG20B (ENSLAFG00000007845) GIPC3 (ENSLAFG00000007849) ENSLAFG00000030325 TBXA2R (ENSLAFG00000027874) ENSLAFG00000031774 PIP5K1C (ENSLAFG00000022484) TJP3 (ENSLAFG00000027222) APBA3 (ENSLAFG00000015080) MRPL54 (ENSLAFG00000029657) MATK (ENSLAFG00000022360) ZFR2 (ENSLAFG00000020813) ATCAY (ENSLAFG00000012399) NMRK2 (ENSLAFG00000031525) DAPK3 (ENSLAFG00000029621) EEF2 (ENSLAFG00000009159) PIAS4 (ENSLAFG00000009166) ##22 MAP2K2 (ENSLAFG00000015636) ENSLAFG00000010510 SIRT6 (ENSLAFG00000026522) ANKRD24 (ENSLAFG00000009676) EBI3 (ENSLAFG00000022621) YJU2 (ENSLAFG00000007891) SHD (ENSLAFG00000009357) FSD1 (ENSLAFG00000030096) STAP2 (ENSLAFG00000026115) MPND (ENSLAFG00000029255) SH3GL1 (ENSLAFG00000023065) CHAF1A (ENSLAFG00000000293) UBXN6 (ENSLAFG00000028613) HDGFL2 (ENSLAFG00000029578) PLIN4 (ENSLAFG00000000789) Hyrax MODERN SPECIES 595 PIAS4 (ENSPCAG00000003586) ##22 ZBTB7A (ENSPCAG00000003642) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00730000111899 ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00520000060565 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00730000111899 ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00520000060565 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00730000111899 ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00520000060565 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00730000111899 ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00520000060565 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 Suina ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000003420.b ENSGT00730000111899 ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 ENSGT00940000157273 Pig MODERN SPECIES 10 TBXA2R (ENSSSCG00000033759) CACTIN (ENSSSCG00000032085) ENSSSCG00000050486 PIP5K1C (ENSSSCG00000013490) TJP3 (ENSSSCG00000013491) APBA3 (ENSSSCG00000013492) MRPL54 (ENSSSCG00000024242) RAX2 (ENSSSCG00000032429) MATK (ENSSSCG00000013494) ZFR2 (ENSSSCG00000013495) ATCAY (ENSSSCG00000026754) NMRK2 (ENSSSCG00000040860) DAPK3 (ENSSSCG00000032170) EEF2 (ENSSSCG00000025675) ENSSSCG00000050591 PIAS4 (ENSSSCG00000022066) ##22 ZBTB7A (ENSSSCG00000029236) MAP2K2 (ENSSSCG00000027127) CREB3L3 (ENSSSCG00000013501) SIRT6 (ENSSSCG00000013496) ANKRD24 (ENSSSCG00000013497) EBI3 (ENSSSCG00000013498) YJU2 (ENSSSCG00000013499) SHD (ENSSSCG00000013503) TMIGD2 (ENSSSCG00000052810) FSD1 (ENSSSCG00000013505) STAP2 (ENSSSCG00000013506) MPND (ENSSSCG00000013507) SH3GL1 (ENSSSCG00000013508) CHAF1A (ENSSSCG00000013509) UBXN6 (ENSSSCG00000013510) Chacoan peccary MODERN SPECIES 770 HMG20B (ENSCWAG00000010811) GIPC3 (ENSCWAG00000010858) TBXA2R 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ENSGT00390000007100 ENSGT00960000192381 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 Arabian camel MODERN SPECIES 14 HMG20B (ENSCDRG00005005967) GIPC3 (ENSCDRG00005005946) TBXA2R (ENSCDRG00005005933) CACTIN (ENSCDRG00005005904) PIP5K1C (ENSCDRG00005005583) TJP3 (ENSCDRG00005005310) APBA3 (ENSCDRG00005005256) MRPL54 (ENSCDRG00005005240) RAX2 (ENSCDRG00005005226) MATK (ENSCDRG00005005153) ZFR2 (ENSCDRG00005005063) ATCAY (ENSCDRG00005005006) NMRK2 (ENSCDRG00005004939) DAPK3 (ENSCDRG00005004913) EEF2 (ENSCDRG00005004859) PIAS4 (ENSCDRG00005004818) ##22 ZBTB7A (ENSCDRG00005004798) MAP2K2 (ENSCDRG00005004746) CREB3L3 (ENSCDRG00005004679) ENSCDRG00005004643 ANKRD24 (ENSCDRG00005004507) EBI3 (ENSCDRG00005004472) YJU2 (ENSCDRG00005004442) SHD (ENSCDRG00005004404) ENSCDRG00005004340 FSD1 (ENSCDRG00005004266) STAP2 (ENSCDRG00005004207) MPND (ENSCDRG00005004145) SH3GL1 (ENSCDRG00005004008) CHAF1A (ENSCDRG00005003943) UBXN6 (ENSCDRG00005003901) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00730000111899 ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00520000060565 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00730000111899 ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00520000060565 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 Yarkand deer MODERN SPECIES 32 HMG20B (ENSCHYG00000003538) GIPC3 (ENSCHYG00000003521) TBXA2R (ENSCHYG00000003508) CACTIN (ENSCHYG00000003483) PIP5K1C (ENSCHYG00000003264) TJP3 (ENSCHYG00000003169) APBA3 (ENSCHYG00000003126) RAX2 (ENSCHYG00000003107) MATK (ENSCHYG00000003016) MRPL54 (ENSCHYG00000002977) ZFR2 (ENSCHYG00000002949) ATCAY (ENSCHYG00000002905) NMRK2 (ENSCHYG00000002878) DAPK3 (ENSCHYG00000002848) ENSCHYG00000002813 PIAS4 (ENSCHYG00000002769) ##22 ZBTB7A (ENSCHYG00000002749) ENSCHYG00000002715 CREB3L3 (ENSCHYG00000002681) SIRT6 (ENSCHYG00000002658) ANKRD24 (ENSCHYG00000002425) EBI3 (ENSCHYG00000002313) YJU2 (ENSCHYG00000002292) SHD (ENSCHYG00000002265) ENSCHYG00000002245 FSD1 (ENSCHYG00000002221) STAP2 (ENSCHYG00000002168) MPND (ENSCHYG00000002106) SH3GL1 (ENSCHYG00000002051) CHAF1A (ENSCHYG00000001952) UBXN6 (ENSCHYG00000001896) Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00730000111899 ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00520000060565 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 Siberian musk deer MODERN SPECIES 99 GIPC3 (ENSMMSG00000023147) TBXA2R (ENSMMSG00000023142) ENSMMSG00000023139 CACTIN (ENSMMSG00000023129) PIP5K1C (ENSMMSG00000023101) TJP3 (ENSMMSG00000023025) APBA3 (ENSMMSG00000023004) MRPL54 (ENSMMSG00000022990) RAX2 (ENSMMSG00000022983) MATK (ENSMMSG00000022958) ZFR2 (ENSMMSG00000022940) ATCAY (ENSMMSG00000022923) NMRK2 (ENSMMSG00000022912) DAPK3 (ENSMMSG00000022904) EEF2 (ENSMMSG00000022885) PIAS4 (ENSMMSG00000022871) ##22 ZBTB7A (ENSMMSG00000022860) MAP2K2 (ENSMMSG00000022835) CREB3L3 (ENSMMSG00000022814) SIRT6 (ENSMMSG00000022789) ANKRD24 (ENSMMSG00000022747) EBI3 (ENSMMSG00000022725) YJU2 (ENSMMSG00000022712) SHD (ENSMMSG00000022694) ENSMMSG00000022677 FSD1 (ENSMMSG00000022670) STAP2 (ENSMMSG00000022651) MPND (ENSMMSG00000022624) SH3GL1 (ENSMMSG00000022602) CHAF1A (ENSMMSG00000022582) ENSMMSG00000022557 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003420.b ENSGT00730000111899 ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000161213 ENSGT00390000003420.b ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00960000192381 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 ENSGT00940000157273 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 21 HMG20B (ENSOARG00020018879) GIPC3 (ENSOARG00020018810) TBXA2R (ENSOARG00020018783) CACTIN (ENSOARG00020018654) PIP5K1C (ENSOARG00020017829) TJP3 (ENSOARG00020017288) APBA3 (ENSOARG00020017206) MRPL54 (ENSOARG00020017174) RAX2 (ENSOARG00020017140) MATK (ENSOARG00020017085) ZFR2 (ENSOARG00020016870) ATCAY (ENSOARG00020016696) ENSOARG00020016636 DAPK3 (ENSOARG00020016591) EEF2 (ENSOARG00020016508) PIAS4 (ENSOARG00020016478) ##22 ZBTB7A (ENSOARG00020016414) MAP2K2 (ENSOARG00020016331) CREB3L3 (ENSOARG00020016282) SIRT6 (ENSOARG00020016205) ANKRD24 (ENSOARG00020016056) EBI3 (ENSOARG00020016010) YJU2 (ENSOARG00020015953) SHD (ENSOARG00020015785) ENSOARG00020015717 FSD1 (ENSOARG00020015484) STAP2 (ENSOARG00020015409) MPND (ENSOARG00020014684) SH3GL1 (ENSOARG00020014536) CHAF1A (ENSOARG00020014361) UBXN6 (ENSOARG00020014307) Goat MODERN SPECIES 26 HMG20B (ENSCHIG00000023604) GIPC3 (ENSCHIG00000018804) TBXA2R (ENSCHIG00000012747) CACTIN (ENSCHIG00000026750) PIP5K1C (ENSCHIG00000022491) TJP3 (ENSCHIG00000017841) APBA3 (ENSCHIG00000014574) MRPL54 (ENSCHIG00000026538) RAX2 (ENSCHIG00000020868) MATK (ENSCHIG00000014576) ZFR2 (ENSCHIG00000024368) ATCAY (ENSCHIG00000026683) NMRK2 (ENSCHIG00000008917) DAPK3 (ENSCHIG00000018026) ENSCHIG00000013910 PIAS4 (ENSCHIG00000015352) ##22 ZBTB7A (ENSCHIG00000022661) MAP2K2 (ENSCHIG00000014919) CREB3L3 (ENSCHIG00000026228) SIRT6 (ENSCHIG00000025871) ANKRD24 (ENSCHIG00000022948) EBI3 (ENSCHIG00000026597) ENSCHIG00000016966 SHD (ENSCHIG00000016892) FSD1 (ENSCHIG00000020728) STAP2 (ENSCHIG00000010686) MPND (ENSCHIG00000015132) SH3GL1 (ENSCHIG00000027242) CHAF1A (ENSCHIG00000013105) UBXN6 (ENSCHIG00000004865) HDGFL2 (ENSCHIG00000019288) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00730000111899 ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 Bos ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00730000111899 ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000003420.b ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 ENSGT00940000157273 Wild yak MODERN SPECIES 763 GIPC3 (ENSBMUG00000018028) TBXA2R (ENSBMUG00000018072) CACTIN (ENSBMUG00000018104) PIP5K1C (ENSBMUG00000018181) TJP3 (ENSBMUG00000018288) APBA3 (ENSBMUG00000018325) MRPL54 (ENSBMUG00000018345) RAX2 (ENSBMUG00000018362) MATK (ENSBMUG00000018375) ZFR2 (ENSBMUG00000018402) ATCAY (ENSBMUG00000018411) NMRK2 (ENSBMUG00000018462) DAPK3 (ENSBMUG00000018482) ENSBMUG00000018505 PIAS4 (ENSBMUG00000018518) ##22 ZBTB7A (ENSBMUG00000018531) MAP2K2 (ENSBMUG00000018543) CREB3L3 (ENSBMUG00000018566) SIRT6 (ENSBMUG00000018589) ANKRD24 (ENSBMUG00000018653) EBI3 (ENSBMUG00000018691) YJU2 (ENSBMUG00000018705) SHD (ENSBMUG00000018741) TMIGD2 (ENSBMUG00000018751) FSD1 (ENSBMUG00000018781) STAP2 (ENSBMUG00000018840) MPND (ENSBMUG00000018908) SH3GL1 (ENSBMUG00000018967) CHAF1A (ENSBMUG00000018995) UBXN6 (ENSBMUG00000019018) Domestic yak MODERN SPECIES 27 GIPC3 (ENSBGRG00000021004) TBXA2R (ENSBGRG00000020972) CACTIN (ENSBGRG00000020942) PIP5K1C (ENSBGRG00000020521) TJP3 (ENSBGRG00000019950) APBA3 (ENSBGRG00000019857) MRPL54 (ENSBGRG00000019811) RAX2 (ENSBGRG00000019785) MATK (ENSBGRG00000019523) ZFR2 (ENSBGRG00000019327) ATCAY (ENSBGRG00000019249) NMRK2 (ENSBGRG00000019172) DAPK3 (ENSBGRG00000019101) EEF2 (ENSBGRG00000018816) ENSBGRG00000018795 PIAS4 (ENSBGRG00000018519) ##22 ZBTB7A (ENSBGRG00000018478) MAP2K2 (ENSBGRG00000018429) CREB3L3 (ENSBGRG00000017902) SIRT6 (ENSBGRG00000017784) ANKRD24 (ENSBGRG00000017470) EBI3 (ENSBGRG00000017377) ENSBGRG00000017328 SHD (ENSBGRG00000017098) ENSBGRG00000017038 FSD1 (ENSBGRG00000016795) STAP2 (ENSBGRG00000016477) MPND (ENSBGRG00000015810) SH3GL1 (ENSBGRG00000015300) CHAF1A (ENSBGRG00000015141) UBXN6 (ENSBGRG00000014883) Bos_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00730000111899 ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01100000263504.a.b.a.b.a.b.ib ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 Cow MODERN SPECIES 26 ENSBTAG00000053812 TBXA2R (ENSBTAG00000014944) CACTIN (ENSBTAG00000010373) PIP5K1C (ENSBTAG00000000710) TJP3 (ENSBTAG00000018342) APBA3 (ENSBTAG00000008395) MRPL54 (ENSBTAG00000008396) RAX2 (ENSBTAG00000009750) MATK (ENSBTAG00000006619) ZFR2 (ENSBTAG00000000755) ATCAY (ENSBTAG00000018375) NMRK2 (ENSBTAG00000031573) DAPK3 (ENSBTAG00000020417) EEF2 (ENSBTAG00000004258) ENSBTAG00000045914 PIAS4 (ENSBTAG00000000753) ##22 ZBTB7A (ENSBTAG00000020117) MAP2K2 (ENSBTAG00000024450) CREB3L3 (ENSBTAG00000010215) SIRT6 (ENSBTAG00000019909) ENSBTAG00000052694 ENSBTAG00000054046 EBI3 (ENSBTAG00000012829) YJU2 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MPND (ENSBIXG00005013751) SH3GL1 (ENSBIXG00005013675) American bison MODERN SPECIES 3349 GIPC3 (ENSBBBG00000000334) TBXA2R (ENSBBBG00000000372) CACTIN (ENSBBBG00000000388) PIP5K1C (ENSBBBG00000000451) TJP3 (ENSBBBG00000023169) APBA3 (ENSBBBG00000006868) MRPL54 (ENSBBBG00000023057) RAX2 (ENSBBBG00000008182) MATK (ENSBBBG00000023026) ENSBBBG00000023003 ATCAY (ENSBBBG00000022991) ENSBBBG00000006028 DAPK3 (ENSBBBG00000022951) EEF2 (ENSBBBG00000022915) ENSBBBG00000022877 PIAS4 (ENSBBBG00000022869) ##22 ZBTB7A (ENSBBBG00000022852) MAP2K2 (ENSBBBG00000022851) CREB3L3 (ENSBBBG00000022831) SIRT6 (ENSBBBG00000022808) ENSBBBG00000008311 EBI3 (ENSBBBG00000022773) YJU2 (ENSBBBG00000022764) SHD (ENSBBBG00000022746) TMIGD2 (ENSBBBG00000022717) FSD1 (ENSBBBG00000022701) STAP2 (ENSBBBG00000008960) MPND (ENSBBBG00000022616) SH3GL1 (ENSBBBG00000022500) CHAF1A (ENSBBBG00000022444) UBXN6 (ENSBBBG00000022409) Cetacea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000161033 ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.b.a.a 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ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 ENSGT00940000157273 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000161033 ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.b.a.a ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.a.m ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.a ENSGT00940000162830.a.b.b ENSGT00940000162830.a.b.a ENSGT00940000162830.a.a.a ENSGT00940000163425 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a 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ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 ENSGT00940000157273 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000161033 ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.b.a.a ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.a.m ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.a ENSGT00940000162830.a.b.b ENSGT00940000162830.a.b.a ENSGT00940000162830.a.a.a ENSGT00940000163425 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 ENSGT00940000157273 ENSGT00940000153942.a.f Beluga whale MODERN SPECIES 62 AES (ENSDLEG00000020354) ENSDLEG00000020351 ENSDLEG00000020344 ENSDLEG00000020339 ENSDLEG00000020335 ENSDLEG00000020333 ENSDLEG00000020329 ZNF555 (ENSDLEG00000020325) RAX2 (ENSDLEG00000020322) MATK (ENSDLEG00000020319) ZFR2 (ENSDLEG00000020297) ATCAY (ENSDLEG00000020274) NMRK2 (ENSDLEG00000020268) DAPK3 (ENSDLEG00000020266) EEF2 (ENSDLEG00000020260) PIAS4 (ENSDLEG00000020241) ##22 ZBTB7A (ENSDLEG00000020233) MAP2K2 (ENSDLEG00000020230) CREB3L3 (ENSDLEG00000020225) SIRT6 (ENSDLEG00000020222) ANKRD24 (ENSDLEG00000020203) EBI3 (ENSDLEG00000020198) YJU2 (ENSDLEG00000020194) SHD (ENSDLEG00000020188) FSD1 (ENSDLEG00000020184) STAP2 (ENSDLEG00000020176) MPND (ENSDLEG00000020118) SH3GL1 (ENSDLEG00000020106) CHAF1A (ENSDLEG00000020099) UBXN6 (ENSDLEG00000020093) HDGFL2 (ENSDLEG00000020084) Narwhal MODERN SPECIES 298 GNA11 (ENSMMNG00015001728) TLE5 (ENSMMNG00015001757) TLE2 (ENSMMNG00015001829) ENSMMNG00015001925 ENSMMNG00015001966 ENSMMNG00015001988 ENSMMNG00015002004 ZNF555 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(ENSFCAG00000007145) ATCAY (ENSFCAG00000013498) DAPK3 (ENSFCAG00000013501) EEF2 (ENSFCAG00000000909) PIAS4 (ENSFCAG00000018666) ##22 ZBTB7A (ENSFCAG00000045801) MAP2K2 (ENSFCAG00000014137) CREB3L3 (ENSFCAG00000014139) SIRT6 (ENSFCAG00000014140) ANKRD24 (ENSFCAG00000029510) EBI3 (ENSFCAG00000014148) YJU2 (ENSFCAG00000014150) SHD (ENSFCAG00000014152) FSD1 (ENSFCAG00000014156) STAP2 (ENSFCAG00000021949) MPND (ENSFCAG00000019038) SH3GL1 (ENSFCAG00000025662) CHAF1A (ENSFCAG00000014158) UBXN6 (ENSFCAG00000027049) HDGFL2 (ENSFCAG00000006283) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00730000111899 ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00520000060565 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 ENSGT00940000157273 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00390000003420.b ENSGT00730000111899 ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 ENSGT00940000157273 ENSGT00940000153942.a.f Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00390000003420.b ENSGT00730000111899 ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00940000159004 ENSGT00960000192381 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 ENSGT00940000157273 ENSGT00940000153942.a.f Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 9 HMG20B (ENSRFEG00010020638) GIPC3 (ENSRFEG00010020593) TBXA2R (ENSRFEG00010020570) CACTIN (ENSRFEG00010020557) PIP5K1C (ENSRFEG00010020492) TJP3 (ENSRFEG00010020437) APBA3 (ENSRFEG00010020395) MRPL54 (ENSRFEG00010020373) RAX2 (ENSRFEG00010020350) MATK (ENSRFEG00010020199) ZFR2 (ENSRFEG00010020171) ATCAY (ENSRFEG00010020101) NMRK2 (ENSRFEG00010020068) DAPK3 (ENSRFEG00010020027) EEF2 (ENSRFEG00010019895) PIAS4 (ENSRFEG00010019828) ##22 ZBTB7A (ENSRFEG00010019791) ENSRFEG00010019770 MAP2K2 (ENSRFEG00010019724) CREB3L3 (ENSRFEG00010019660) SIRT6 (ENSRFEG00010019622) ANKRD24 (ENSRFEG00010019433) EBI3 (ENSRFEG00010019381) SHD (ENSRFEG00010019283) ENSRFEG00010019258 FSD1 (ENSRFEG00010019207) STAP2 (ENSRFEG00010019155) MPND (ENSRFEG00010018966) SH3GL1 (ENSRFEG00010018888) CHAF1A (ENSRFEG00010018850) UBXN6 (ENSRFEG00010018790) Microbat MODERN SPECIES 1657 ATCAY (ENSMLUG00000003760) NMRK2 (ENSMLUG00000016715) DAPK3 (ENSMLUG00000006239) ENSMLUG00000014241 PIAS4 (ENSMLUG00000008650) ##22 ZBTB7A (ENSMLUG00000008667) MAP2K2 (ENSMLUG00000008679) CREB3L3 (ENSMLUG00000008703) SIRT6 (ENSMLUG00000008726) ANKRD24 (ENSMLUG00000008742) EBI3 (ENSMLUG00000008782) Megabat MODERN SPECIES 2070 ATCAY (ENSPVAG00000017488) NMRK2 (ENSPVAG00000017492) DAPK3 (ENSPVAG00000017494) EEF2 (ENSPVAG00000017495) PIAS4 (ENSPVAG00000017496) ##22 ZBTB7A (ENSPVAG00000017500) Equus ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00390000003420.b ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00520000060565 ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 ENSGT00940000157273 Donkey MODERN SPECIES 12 HMG20B (ENSEASG00005022241) GIPC3 (ENSEASG00005022246) TBXA2R (ENSEASG00005022250) CACTIN (ENSEASG00005030573) PIP5K1C (ENSEASG00005022261) TJP3 (ENSEASG00005022268) APBA3 (ENSEASG00005022276) MRPL54 (ENSEASG00005022283) RAX2 (ENSEASG00005026320) MATK (ENSEASG00005022288) ZFR2 (ENSEASG00005022296) ATCAY (ENSEASG00005028112) NMRK2 (ENSEASG00005031157) DAPK3 (ENSEASG00005022305) EEF2 (ENSEASG00005022311) PIAS4 (ENSEASG00005022327) ##22 ZBTB7A (ENSEASG00005032317) ENSEASG00005025779 CREB3L3 (ENSEASG00005022352) SIRT6 (ENSEASG00005022360) ANKRD24 (ENSEASG00005038678) EBI3 (ENSEASG00005022379) YJU2 (ENSEASG00005022383) SHD (ENSEASG00005022388) ENSEASG00005025910 FSD1 (ENSEASG00005022397) STAP2 (ENSEASG00005024518) MPND (ENSEASG00005022406) SH3GL1 (ENSEASG00005022411) CHAF1A (ENSEASG00005022431) UBXN6 (ENSEASG00005022450) Horse MODERN SPECIES 28 MFSD12 (ENSECAG00000050601) ENSECAG00000033958 TBXA2R (ENSECAG00000038039) ENSECAG00000051988 CACTIN (ENSECAG00000039454) PIP5K1C (ENSECAG00000033728) APBA3 (ENSECAG00000021308) TJP3 (ENSECAG00000011885) RAX2 (ENSECAG00000027953) MATK (ENSECAG00000057591) ZFR2 (ENSECAG00000007090) ATCAY (ENSECAG00000015094) NMRK2 (ENSECAG00000022841) DAPK3 (ENSECAG00000012570) EEF2 (ENSECAG00000020547) PIAS4 (ENSECAG00000018697) ##22 ZBTB7A (ENSECAG00000040226) MAP2K2 (ENSECAG00000009157) CREB3L3 (ENSECAG00000015101) SIRT6 (ENSECAG00000015304) ANKRD24 (ENSECAG00000016048) EBI3 (ENSECAG00000018667) YJU2 (ENSECAG00000022785) SHD (ENSECAG00000005602) TMIGD2 (ENSECAG00000011606) FSD1 (ENSECAG00000046915) STAP2 (ENSECAG00000030351) MPND (ENSECAG00000029898) SH3GL1 (ENSECAG00000024773) CHAF1A (ENSECAG00000014377) UBXN6 (ENSECAG00000021994) Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 Common shrew MODERN SPECIES 475 PIAS4 (ENSSARG00000008386) ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000161213 ENSGT00390000003420.b ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000161213 ENSGT00390000003420.b ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 Glires ANCESTRAL SPECIES 25 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ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00390000005318.a ENSGT00940000161213 ENSGT00390000003420.b ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00390000005318.a ENSGT00940000161213 ENSGT00390000003420.b ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00950000183171.A.b.a.b ENSGT00940000159037 ENSGT00940000160231 ENSGT00940000159915 ENSGT01100000263497.E.a.b ENSGT00950000182964.a.b.b ENSGT00940000160274 ENSGT00390000014000 ENSGT00940000159993 ENSGT00940000158753 ENSGT00510000047872 ENSGT00940000162661 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00390000005318.a ENSGT00940000161213 ENSGT00390000003420.b ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00950000183171.A.b.a.b ENSGT00940000159037 ENSGT00940000160231 ENSGT00940000159915 ENSGT01100000263497.E.a.b ENSGT00950000182964.a.b.b ENSGT00940000160274 ENSGT00390000014000 ENSGT00940000159993 ENSGT00940000158753 ENSGT00510000047872 ENSGT00940000162661 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000005318.a ENSGT00940000161213 ENSGT00390000003420.b ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00950000183171.A.b.a.b ENSGT00940000159037 ENSGT00940000160231 ENSGT00940000159915 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ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00950000183171.A.b.a.b ENSGT00940000159037 ENSGT00940000160231 ENSGT00940000159915 ENSGT01100000263497.E.a.b ENSGT00950000182964.a.b.b ENSGT00940000160274 ENSGT00390000014000.l ENSGT00940000159993 ENSGT00940000158753.j ENSGT00510000047872 ENSGT00940000162661 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 2 Mfsd12 (ENSCGRG00001018366) Hmg20b (ENSCGRG00001016795) Gipc3 (ENSCGRG00001016082) Tbxa2r (ENSCGRG00001014446) Cactin (ENSCGRG00001021287) Pip5k1c (ENSCGRG00001017002) Tjp3 (ENSCGRG00001001459) Apba3 (ENSCGRG00001019836) Mrpl54 (ENSCGRG00001019482) Matk (ENSCGRG00001015278) Zfr2 (ENSCGRG00001019870) Atcay (ENSCGRG00001017209) Nmrk2 (ENSCGRG00001016553) Dapk3 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American deer mouse MODERN SPECIES 14 Mfsd12 (ENSPEMG00000020766) Hmg20b (ENSPEMG00000014935) Gipc3 (ENSPEMG00000014161) Tbxa2r (ENSPEMG00000015376) Cactin (ENSPEMG00000021732) Pip5k1c (ENSPEMG00000020543) Tjp3 (ENSPEMG00000021396) Apba3 (ENSPEMG00000021227) Mrpl54 (ENSPEMG00000022929) Matk (ENSPEMG00000020804) Zfr2 (ENSPEMG00000020763) Atcay (ENSPEMG00000021027) Nmrk2 (ENSPEMG00000021630) ENSPEMG00000020977 Eef2 (ENSPEMG00000021167) Pias4 (ENSPEMG00000021214) ##22 Zbtb7a (ENSPEMG00000025614) Map2k2 (ENSPEMG00000021952) Creb3l3 (ENSPEMG00000008823) Thop1 (ENSPEMG00000023842) Sgta (ENSPEMG00000020795) Slc39a3 (ENSPEMG00000020829) Diras1 (ENSPEMG00000015735) Gadd45b (ENSPEMG00000021504) Lmnb2 (ENSPEMG00000021474) Timm13 (ENSPEMG00000011224) Tmprss9 (ENSPEMG00000017231) ENSPEMG00000022141 ENSPEMG00000031069 Lsm7 (ENSPEMG00000027858) Lingo3 (ENSPEMG00000013558) Murinae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000005318.a ENSGT00940000161213 ENSGT00390000003420.b ENSGT01030000234559.a.a.a 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ENSGT00940000159261 ENSGT00950000183171.A.b.a.b ENSGT00940000159037 ENSGT00940000160231 ENSGT00940000159915 ENSGT01100000263497.E.a.b ENSGT00950000182964.a.b.b ENSGT00940000160274 ENSGT00390000014000 ENSGT00940000159993 ENSGT00940000158753 ENSGT00510000047872 ENSGT00940000162661 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000005318.a ENSGT00940000161213 ENSGT00390000003420.b ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a.c.b ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00950000183171.A.b.a.b ENSGT00940000159037 ENSGT00940000160231 ENSGT00940000159915 ENSGT01100000263497.E.a.b ENSGT00950000182964.a.b.b ENSGT00940000160274 ENSGT00390000014000 ENSGT00940000159993 ENSGT00940000158753 ENSGT00510000047872 ENSGT00940000162661 Mus_B ANCESTRAL 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(ENSHGLG00000040448) DOHH (ENSHGLG00000039512) ENSHGLG00000019144 ENSHGLG00000040783 SGTA (ENSHGLG00000018547) SLC39A3 (ENSHGLG00000033652) DIRAS1 (ENSHGLG00000013381) GNG7 (ENSHGLG00000017287) GADD45B (ENSHGLG00000044805) ENSHGLG00000015025 DAPK3 (ENSHGLG00000009769) ENSHGLG00000007881 PIAS4 (ENSHGLG00000006172) ##22 ZBTB7A (ENSHGLG00000011811) MAP2K2 (ENSHGLG00000009089) CREB3L3 (ENSHGLG00000050546) SIRT6 (ENSHGLG00000006696) ANKRD24 (ENSHGLG00000010865) ENSHGLG00000005526 YJU2 (ENSHGLG00000008096) SHD (ENSHGLG00000007108) TMIGD2 (ENSHGLG00000036449) FSD1 (ENSHGLG00000006238) STAP2 (ENSHGLG00000008727) MPND (ENSHGLG00000006669) SH3GL1 (ENSHGLG00000005623) CHAF1A (ENSHGLG00000005439) ENSHGLG00000035324 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01050000244887.B ENSGT00500000044945.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00950000182916.a.a ENSGT00940000154660.a ENSGT00500000044957 ENSGT00950000183171.A.b.a.b ENSGT00940000159037 ENSGT00940000160231 ENSGT00940000159915 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(ENSCLAG00000006871) CHAF1A (ENSCLAG00000008702) UBXN6 (ENSCLAG00000010885) Degu MODERN SPECIES 91 NCLN (ENSODEG00000013853) CELF5 (ENSODEG00000014460) NFIC (ENSODEG00000015267) ENSODEG00000015846 DOHH (ENSODEG00000014181) ENSODEG00000013996 THOP1 (ENSODEG00000013736) SGTA (ENSODEG00000014332) SLC39A3 (ENSODEG00000014274) DIRAS1 (ENSODEG00000020412) GNG7 (ENSODEG00000014141) GADD45B (ENSODEG00000014386) ENSODEG00000014763 DAPK3 (ENSODEG00000014160) ENSODEG00000014175 PIAS4 (ENSODEG00000015061) ##22 ZBTB7A (ENSODEG00000014027) MAP2K2 (ENSODEG00000014670) SIRT6 (ENSODEG00000015363) ENSODEG00000014163 EBI3 (ENSODEG00000014290) ENSODEG00000020237 YJU2 (ENSODEG00000014993) SHD (ENSODEG00000014897) FSD1 (ENSODEG00000014478) STAP2 (ENSODEG00000015068) MPND (ENSODEG00000014317) SH3GL1 (ENSODEG00000015344) CHAF1A (ENSODEG00000015861) UBXN6 (ENSODEG00000015912) ENSODEG00000015495 Guinea pig MODERN SPECIES 253 DOHH (ENSCPOG00000035221) THOP1 (ENSCPOG00000021762) SGTA (ENSCPOG00000030366) SLC39A3 (ENSCPOG00000034643) GNG7 (ENSCPOG00000033946) GADD45B (ENSCPOG00000034176) ENSCPOG00000037980 DAPK3 (ENSCPOG00000031679) EEF2 (ENSCPOG00000015697) PIAS4 (ENSCPOG00000002364) ##22 ZBTB7A (ENSCPOG00000035268) MAP2K2 (ENSCPOG00000025428) CREB3L3 (ENSCPOG00000010134) ENSCPOG00000006206 EBI3 (ENSCPOG00000000706) YJU2 (ENSCPOG00000000707) SHD (ENSCPOG00000008098) FSD1 (ENSCPOG00000019419) STAP2 (ENSCPOG00000025858) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000161213 ENSGT00390000003420.b ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a.l ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 ENSGT00940000157273 ENSGT00940000153942.a.f Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 7 MFSD12 (ENSSVLG00005023702) HMG20B (ENSSVLG00005023762) GIPC3 (ENSSVLG00005023804) TBXA2R (ENSSVLG00005023817) CACTIN (ENSSVLG00005023836) PIP5K1C (ENSSVLG00005023887) TJP3 (ENSSVLG00005023962) MRPL54 (ENSSVLG00005024184) RAX2 (ENSSVLG00005024207) MATK (ENSSVLG00005024229) ZFR2 (ENSSVLG00005024341) ATCAY (ENSSVLG00005024510) ENSSVLG00005024541 DAPK3 (ENSSVLG00005024571) ENSSVLG00005024605 PIAS4 (ENSSVLG00005024634) ##22 ZBTB7A (ENSSVLG00005024657) ENSSVLG00005024698 CREB3L3 (ENSSVLG00005024770) SIRT6 (ENSSVLG00005024827) ANKRD24 (ENSSVLG00005024883) EBI3 (ENSSVLG00005024929) YJU2 (ENSSVLG00005016793) SHD (ENSSVLG00005016880) ENSSVLG00005017014 FSD1 (ENSSVLG00005017052) STAP2 (ENSSVLG00005017361) ENSSVLG00005017600 MPND (ENSSVLG00005017709) SH3GL1 (ENSSVLG00005018172) CHAF1A (ENSSVLG00005018270) Marmotini ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000161213 ENSGT00390000003420.b ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a.l ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 ENSGT00940000157273 ENSGT00940000153942.a.f Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000161213 ENSGT00390000003420.b ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a.l ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 ENSGT00940000157273 ENSGT00940000153942.a.f Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 301 HMG20B (ENSUPAG00010008513) GIPC3 (ENSUPAG00010008525) TBXA2R (ENSUPAG00010008535) CACTIN (ENSUPAG00010008542) PIP5K1C (ENSUPAG00010008552) TJP3 (ENSUPAG00010008756) APBA3 (ENSUPAG00010008831) MRPL54 (ENSUPAG00010008838) RAX2 (ENSUPAG00010008848) MATK (ENSUPAG00010008858) ZFR2 (ENSUPAG00010009277) ATCAY (ENSUPAG00010009286) NMRK2 (ENSUPAG00010009304) DAPK3 (ENSUPAG00010009346) EEF2 (ENSUPAG00010009366) PIAS4 (ENSUPAG00010009393) ##22 ZBTB7A (ENSUPAG00010009414) MAP2K2 (ENSUPAG00010009423) CREB3L3 (ENSUPAG00010009456) SIRT6 (ENSUPAG00010009478) ANKRD24 (ENSUPAG00010009488) EBI3 (ENSUPAG00010009541) YJU2 (ENSUPAG00010009548) SHD (ENSUPAG00010009570) FSD1 (ENSUPAG00010009576) STAP2 (ENSUPAG00010009594) MPND (ENSUPAG00010009625) SH3GL1 (ENSUPAG00010009851) CHAF1A (ENSUPAG00010009868) UBXN6 (ENSUPAG00010009881) HDGFL2 (ENSUPAG00010009901) Squirrel MODERN SPECIES 188 HMG20B (ENSSTOG00000022314) GIPC3 (ENSSTOG00000007215) TBXA2R (ENSSTOG00000028290) CACTIN (ENSSTOG00000001235) PIP5K1C (ENSSTOG00000023021) TJP3 (ENSSTOG00000024962) APBA3 (ENSSTOG00000000352) MRPL54 (ENSSTOG00000022378) RAX2 (ENSSTOG00000024315) MATK (ENSSTOG00000011892) ZFR2 (ENSSTOG00000025821) ATCAY (ENSSTOG00000026376) NMRK2 (ENSSTOG00000021661) DAPK3 (ENSSTOG00000005038) EEF2 (ENSSTOG00000005050) PIAS4 (ENSSTOG00000012472) ##22 ZBTB7A (ENSSTOG00000026956) MAP2K2 (ENSSTOG00000002366) CREB3L3 (ENSSTOG00000028871) SIRT6 (ENSSTOG00000022298) ENSSTOG00000032271 ENSSTOG00000024418 EBI3 (ENSSTOG00000024345) YJU2 (ENSSTOG00000014684) SHD (ENSSTOG00000024753) FSD1 (ENSSTOG00000008010) STAP2 (ENSSTOG00000022594) MPND (ENSSTOG00000008666) SH3GL1 (ENSSTOG00000008579) CHAF1A (ENSSTOG00000014889) UBXN6 (ENSSTOG00000014906) Alpin marmot MODERN SPECIES 88 ENSMMMG00000016765 ENSMMMG00000016774 DOHH (ENSMMMG00000016778) ENSMMMG00000016780 ENSMMMG00000016792 HMG20B (ENSMMMG00000016794) GIPC3 (ENSMMMG00000016813) ENSMMMG00000016827 CACTIN (ENSMMMG00000016832) TJP3 (ENSMMMG00000016855) APBA3 (ENSMMMG00000016885) ZFR2 (ENSMMMG00000016959) NMRK2 (ENSMMMG00000017009) DAPK3 (ENSMMMG00000017015) EEF2 (ENSMMMG00000017019) PIAS4 (ENSMMMG00000017032) ##22 MAP2K2 (ENSMMMG00000017211) ANKRD24 (ENSMMMG00000018078) ENSMMMG00000018130 YJU2 (ENSMMMG00000018139) SHD (ENSMMMG00000018157) FSD1 (ENSMMMG00000018181) STAP2 (ENSMMMG00000018200) MPND (ENSMMMG00000018208) SH3GL1 (ENSMMMG00000018246) CHAF1A (ENSMMMG00000018263) UBXN6 (ENSMMMG00000018303) HDGFL2 (ENSMMMG00000018325) ENSMMMG00000018410 LRG1 (ENSMMMG00000018424) ENSMMMG00000018426 Primates ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000161213 ENSGT00390000003420.b ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 ENSGT00940000157273 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000161213 ENSGT00390000003420.b ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 ENSGT00940000157273 Tarsier MODERN SPECIES 1912 DAPK3 (ENSTSYG00000035745) EEF2 (ENSTSYG00000028021) PIAS4 (ENSTSYG00000026272) ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000161213 ENSGT00390000003420.b ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 ENSGT00940000157273 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003420.b ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00910000147218 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00390000017269 ENSGT00910000147341 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c.a Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00910000147666 ENSGT00940000158364 ENSGT00910000147218 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00390000017269 ENSGT00910000147341 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c.a Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00910000147666 ENSGT00940000158364 ENSGT00910000147218 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662.gb.a ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00390000017269 ENSGT00910000147341 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c.a Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00910000147666 ENSGT00940000158364 ENSGT00910000147218 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662.gb.a ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00390000017269 ENSGT00910000147341 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c.a Macaca ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000003420.b.a.b ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00910000147218 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662.gb.a ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c.a ENSGT00440000034888 ENSGT00940000157273 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000161213 ENSGT00390000003420.b.b ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00910000147218 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000154662.gb.a ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000164709.a.b.b.a.a.b.b.b.b.a.b.a.d.a.a.a.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c.a ENSGT00440000034888 Rhesus MODERN SPECIES 10 CACTIN (ENSMMUG00000028931) PIP5K1C (ENSMMUG00000008137) TJP3 (ENSMMUG00000028930) APBA3 (ENSMMUG00000009672) MRPL54 (ENSMMUG00000044080) RAX2 (ENSMMUG00000056802) MATK (ENSMMUG00000001917) ZFR2 (ENSMMUG00000054579) ATCAY (ENSMMUG00000039195) ENSMMUG00000064233 ENSMMUG00000056147 NMRK2 (ENSMMUG00000015273) DAPK3 (ENSMMUG00000022765) ENSMMUG00000065079 EEF2 (ENSMMUG00000022767) PIAS4 (ENSMMUG00000011018) ##22 ZBTB7A (ENSMMUG00000063320) MAP2K2 (ENSMMUG00000019564) ENSMMUG00000063002 CREB3L3 (ENSMMUG00000019954) SIRT6 (ENSMMUG00000019955) ANKRD24 (ENSMMUG00000028928) YJU2 (ENSMMUG00000010100) SHD (ENSMMUG00000028927) TMIGD2 (ENSMMUG00000045860) FSD1 (ENSMMUG00000000268) STAP2 (ENSMMUG00000000271) ENSMMUG00000059812 MPND (ENSMMUG00000028926) SH3GL1 (ENSMMUG00000000273) CHAF1A (ENSMMUG00000016706) Crab-eating macaque MODERN SPECIES 10 NFIC (ENSMFAG00000000744) SMIM24 (ENSMFAG00000037612) FZR1 (ENSMFAG00000003458) TEKTIP1 (ENSMFAG00000036699) MFSD12 (ENSMFAG00000039649) APBA3 (ENSMFAG00000044015) MRPL54 (ENSMFAG00000003311) MATK (ENSMFAG00000030470) RAX2 (ENSMFAG00000065615) ZFR2 (ENSMFAG00000031215) ATCAY (ENSMFAG00000002982) ENSMFAG00000040276 ENSMFAG00000052942 ENSMFAG00000028991 NMRK2 (ENSMFAG00000033332) PIAS4 (ENSMFAG00000046119) ##22 MAP2K2 (ENSMFAG00000039192) ENSMFAG00000053986 CREB3L3 (ENSMFAG00000040065) SIRT6 (ENSMFAG00000001546) ANKRD24 (ENSMFAG00000038641) EBI3 (ENSMFAG00000038770) TMIGD2 (ENSMFAG00000031969) YJU2 (ENSMFAG00000059349) SHD (ENSMFAG00000033388) FSD1 (ENSMFAG00000041951) STAP2 (ENSMFAG00000030521) MPND (ENSMFAG00000033303) SH3GL1 (ENSMFAG00000044037) HDGFL2 (ENSMFAG00000000309) PLIN4 (ENSMFAG00000000239) Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 76 TBXA2R (ENSMNEG00000029210) CACTIN (ENSMNEG00000038257) PIP5K1C (ENSMNEG00000023721) TJP3 (ENSMNEG00000029063) APBA3 (ENSMNEG00000028714) MRPL54 (ENSMNEG00000039499) RAX2 (ENSMNEG00000034075) MATK (ENSMNEG00000042873) ZFR2 (ENSMNEG00000043770) ATCAY (ENSMNEG00000027990) ENSMNEG00000016763 ENSMNEG00000018044 NMRK2 (ENSMNEG00000033367) DAPK3 (ENSMNEG00000034480) EEF2 (ENSMNEG00000021403) PIAS4 (ENSMNEG00000030027) ##22 ZBTB7A (ENSMNEG00000033804) MAP2K2 (ENSMNEG00000044105) CREB3L3 (ENSMNEG00000039631) SIRT6 (ENSMNEG00000029466) ANKRD24 (ENSMNEG00000044905) EBI3 (ENSMNEG00000044798) YJU2 (ENSMNEG00000036028) SHD (ENSMNEG00000032816) TMIGD2 (ENSMNEG00000041785) FSD1 (ENSMNEG00000026815) STAP2 (ENSMNEG00000033310) MPND (ENSMNEG00000014406) SH3GL1 (ENSMNEG00000003775) CHAF1A (ENSMNEG00000039177) UBXN6 (ENSMNEG00000030532) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 13 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ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c.a Drill MODERN SPECIES 1534 TBXA2R (ENSMLEG00000040764) CACTIN (ENSMLEG00000017451) PIP5K1C (ENSMLEG00000031430) TJP3 (ENSMLEG00000019934) APBA3 (ENSMLEG00000038059) ENSMLEG00000039241 RAX2 (ENSMLEG00000032619) MATK (ENSMLEG00000030543) ZFR2 (ENSMLEG00000004713) ENSMLEG00000044258 ATCAY (ENSMLEG00000036887) ENSMLEG00000015044 NMRK2 (ENSMLEG00000040462) DAPK3 (ENSMLEG00000028735) EEF2 (ENSMLEG00000031184) PIAS4 (ENSMLEG00000036604) ##22 ENSMLEG00000035883 ENSMLEG00000027287 ZBTB7A (ENSMLEG00000044096) MAP2K2 (ENSMLEG00000031781) CREB3L3 (ENSMLEG00000026233) SIRT6 (ENSMLEG00000031246) ANKRD24 (ENSMLEG00000022250) EBI3 (ENSMLEG00000032602) YJU2 (ENSMLEG00000017413) ENSMLEG00000013785 FSD1 (ENSMLEG00000039314) STAP2 (ENSMLEG00000028740) MPND 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ENSGT01030000234559.a.a.a ENSGT00950000183102.A.a ENSGT00940000159258 ENSGT00940000160036 ENSGT00940000160384 ENSGT00390000001201 ENSGT00940000163572 ENSGT00940000160775 ENSGT00940000162148 ENSGT00940000158364 ENSGT00910000147218 ENSGT00940000159842 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154662 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00390000017269 ENSGT00940000162053 ENSGT00940000153487.b.a.e ENSGT00940000159261 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160050 ENSGT00530000063615.a ENSGT00940000159004 ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c.a ENSGT00440000034888 Chimpanzee MODERN SPECIES 10 HMG20B (ENSPTRG00000010268) GIPC3 (ENSPTRG00000010269) TBXA2R (ENSPTRG00000050832) CACTIN (ENSPTRG00000010272) PIP5K1C (ENSPTRG00000010273) TJP3 (ENSPTRG00000010274) APBA3 (ENSPTRG00000010275) MRPL54 (ENSPTRG00000010276) RAX2 (ENSPTRG00000010277) MATK (ENSPTRG00000010278) ZFR2 (ENSPTRG00000010279) ATCAY (ENSPTRG00000023462) 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STAP2 (ENSG00000178078) MPND (ENSG00000008382) SH3GL1 (ENSG00000141985) CHAF1A (ENSG00000167670) UBXN6 (ENSG00000167671) Gorilla MODERN SPECIES 10 GIPC3 (ENSGGOG00000027202) TBXA2R (ENSGGOG00000013761) CACTIN (ENSGGOG00000012532) PIP5K1C (ENSGGOG00000012543) TJP3 (ENSGGOG00000004626) APBA3 (ENSGGOG00000004637) MRPL54 (ENSGGOG00000014722) RAX2 (ENSGGOG00000014727) MATK (ENSGGOG00000014700) ZFR2 (ENSGGOG00000002866) ATCAY (ENSGGOG00000006826) ENSGGOG00000038336 NMRK2 (ENSGGOG00000004857) DAPK3 (ENSGGOG00000002018) EEF2 (ENSGGOG00000012869) PIAS4 (ENSGGOG00000007895) ##22 ENSGGOG00000005124 ENSGGOG00000043433 ENSGGOG00000009097 MAP2K2 (ENSGGOG00000008832) CREB3L3 (ENSGGOG00000008831) SIRT6 (ENSGGOG00000008838) ANKRD24 (ENSGGOG00000013418) EBI3 (ENSGGOG00000011932) YJU2 (ENSGGOG00000000335) SHD (ENSGGOG00000010231) TMIGD2 (ENSGGOG00000040045) FSD1 (ENSGGOG00000012955) STAP2 (ENSGGOG00000012964) MPND (ENSGGOG00000008189) SH3GL1 (ENSGGOG00000008198) Orangutan MODERN SPECIES 10 HMG20B 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ENSGT00390000007100 ENSGT00940000159440 ENSGT00530000063841.b.d ENSGT00940000160191 ENSGT00940000154737.c ENSGT00440000034888 ENSGT00940000157273 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 348 HMG20B (ENSPCOG00000013810) GIPC3 (ENSPCOG00000000061) TBXA2R (ENSPCOG00000015698) CACTIN (ENSPCOG00000015989) PIP5K1C (ENSPCOG00000021588) TJP3 (ENSPCOG00000020238) APBA3 (ENSPCOG00000026721) MRPL54 (ENSPCOG00000027550) RAX2 (ENSPCOG00000022891) MATK (ENSPCOG00000018010) ZFR2 (ENSPCOG00000016923) ATCAY (ENSPCOG00000027482) NMRK2 (ENSPCOG00000022831) DAPK3 (ENSPCOG00000023275) EEF2 (ENSPCOG00000023522) PIAS4 (ENSPCOG00000004662) ##22 ZBTB7A (ENSPCOG00000027776) MAP2K2 (ENSPCOG00000004497) CREB3L3 (ENSPCOG00000017862) SIRT6 (ENSPCOG00000028709) ANKRD24 (ENSPCOG00000012089) EBI3 (ENSPCOG00000022898) YJU2 (ENSPCOG00000017988) SHD (ENSPCOG00000023655) TMIGD2 (ENSPCOG00000022704) FSD1 (ENSPCOG00000023842) STAP2 (ENSPCOG00000021854) MPND (ENSPCOG00000014436) SH3GL1 (ENSPCOG00000025140) CHAF1A (ENSPCOG00000024961) 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eagle MODERN SPECIES 3 MYO1F (ENSACCG00020016023) ZNF414 (ENSACCG00020016006) ENSACCG00020015996 ACER1 (ENSACCG00020015987) MLLT1 (ENSACCG00020015972) ACSBG2 (ENSACCG00020015951) RFX2 (ENSACCG00020015906) ENSACCG00020015877 DUS3L (ENSACCG00020015859) NRTN (ENSACCG00020015844) ENSACCG00020015834 ATCAY (ENSACCG00020015815) NMRK2 (ENSACCG00020015806) DAPK3 (ENSACCG00020015793) EEF2 (ENSACCG00020015772) PIAS4 (ENSACCG00020015756) ##22 ZBTB7A (ENSACCG00020015748) MAP2K2 (ENSACCG00020015740) CREB3L3 (ENSACCG00020015724) SIRT6 (ENSACCG00020015712) ANKRD24 (ENSACCG00020015679) EBI3 (ENSACCG00020015642) FBN3 (ENSACCG00020015604) CTXN1 (ENSACCG00020015575) TIMM44 (ENSACCG00020015520) YJU2 (ENSACCG00020015454) SHD (ENSACCG00020015436) ENSACCG00020015425 FSD1 (ENSACCG00020015405) STAP2 (ENSACCG00020015392) MPND (ENSACCG00020015358) Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000006876 ENSGT00950000182907.b ENSGT00730000110920.b.a.a ENSGT00940000158800 ENSGT00940000155332.A 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##22 ZBTB7A (ENSSPUG00000010974) MAP2K2 (ENSSPUG00000010956) CREB3L3 (ENSSPUG00000010942) ENSSPUG00000010936 SIRT6 (ENSSPUG00000010923) ENSSPUG00000010907 EBI3 (ENSSPUG00000010892) YJU2 (ENSSPUG00000010883) SHD (ENSSPUG00000010859) FSD1 (ENSSPUG00000010821) STAP2 (ENSSPUG00000010751) ENSSPUG00000010644 SH3GL1 (ENSSPUG00000010563) CHAF1A (ENSSPUG00000010528) UBXN6 (ENSSPUG00000010482) Episquamata ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00940000159237 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000162053 ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 Laterata ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000162053 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000154779.a.a ENSGT00940000164644 ENSGT00940000160888 ENSGT00390000005847 ENSGT00940000165063 ENSGT00940000164521 ENSGT00390000006553 ENSGT00910000144227.s.a ENSGT00940000161178 ENSGT00940000158364 ENSGT00390000004172.s ENSGT00940000163125 ENSGT00950000182993.A.a Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 94 HCN2 (ENSSMRG00000016345) POLRMT (ENSSMRG00000016346) ENSSMRG00000016347 SBNO2 (ENSSMRG00000016348) STK11 (ENSSMRG00000016349) CBARP (ENSSMRG00000016350) CIRBP (ENSSMRG00000016351) MIDN (ENSSMRG00000016352) ATP5F1D (ENSSMRG00000016353) ENSSMRG00000016354 EFNA2 (ENSSMRG00000016355) ENSSMRG00000016357 ENSSMRG00000016358 MAP2K2 (ENSSMRG00000016359) ZBTB7A (ENSSMRG00000016360) PIAS4 (ENSSMRG00000016361) ##22 EEF2 (ENSSMRG00000016362) ENSSMRG00000016364 ENSSMRG00000016365 Common wall lizard MODERN SPECIES 9 PPP1R18 (ENSPMRG00000021692) DHX16 (ENSPMRG00000021700) C6orf136 (ENSPMRG00000021718) ATAT1 (ENSPMRG00000021725) MRPS18B (ENSPMRG00000021734) ENSPMRG00000021739 PPP1R10 (ENSPMRG00000021748) ABCF1 (ENSPMRG00000021774) POLE4 (ENSPMRG00000021791) ENSPMRG00000021796 GNL1 (ENSPMRG00000021811) ENSPMRG00000021828 CREB3L3 (ENSPMRG00000021853) MAP2K2 (ENSPMRG00000021863) ZBTB7A (ENSPMRG00000021873) PIAS4 (ENSPMRG00000021877) ##22 EEF2 (ENSPMRG00000021887) DAPK3 (ENSPMRG00000021899) ENSPMRG00000021924 ENSPMRG00000021941 ENSPMRG00000021954 ENSPMRG00000021964 ENSPMRG00000022044 ENSPMRG00000022243 FEM1A (ENSPMRG00000022251) TICAM1 (ENSPMRG00000022253) ENSPMRG00000022261 ARRDC5 (ENSPMRG00000022267) UHRF1 (ENSPMRG00000022277) KDM4B (ENSPMRG00000022291) PTPRS (ENSPMRG00000022813) Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 99 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT00940000162053 ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 Lizard MODERN SPECIES 2186 ENSACAG00000025865 ##22 Elapidae ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00390000003488.a.b.a ENSGT00390000000777 ENSGT00940000153321.b.a.t ENSGT00940000153321.b.a.u ENSGT01000000215054 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a.q.a ENSGT00940000162053 ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 Indian cobra MODERN SPECIES MPND (ENSNNAG00000002302) SH3GL1 (ENSNNAG00000002334) CHAF1A (ENSNNAG00000002363) UBXN6 (ENSNNAG00000002377) ENSNNAG00000002386 ENSNNAG00000002391 ENSNNAG00000002397 ENSNNAG00000002405 ENSNNAG00000002413 ENSNNAG00000002417 ANKRD24 (ENSNNAG00000002428) SIRT6 (ENSNNAG00000002440) CREB3L3 (ENSNNAG00000002452) ENSNNAG00000002482 ZBTB7A (ENSNNAG00000002492) PIAS4 (ENSNNAG00000002501) ##22 EEF2 (ENSNNAG00000002519) DAPK3 (ENSNNAG00000002558) ENSNNAG00000002566 ENSNNAG00000002577 ENSNNAG00000002600 ENSNNAG00000002674 ENSNNAG00000002684 ENSNNAG00000002692 ENSNNAG00000002708 ENSNNAG00000002720 ENSNNAG00000002731 ENSNNAG00000002741 ENSNNAG00000002753 ENSNNAG00000002772 ENSNNAG00000002783 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 135 ENSGT00390000003488.a.b.a ENSGT00390000000777 ENSGT00940000153321.b.a.t ENSGT00940000153321.b.a.u ENSGT01000000215054 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a.q.a ENSGT00940000162053 ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000153424.a.a.d ENSGT00940000154779.a.a Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 142 ENSGT01000000215054 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159237 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000153487.b.a.q.a ENSGT00940000162053 ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000154662 ENSGT00940000161753 ENSGT00940000153424.a.a.d ENSGT00940000154779.a.a Eastern brown snake MODERN SPECIES 171 TNFAIP8L1 (ENSPTXG00000017715) MYDGF (ENSPTXG00000017716) ENSPTXG00000017717 ENSPTXG00000017718 ENSPTXG00000017719 ANKRD24 (ENSPTXG00000017721) CREB3L3 (ENSPTXG00000017722) MAP2K2 (ENSPTXG00000017723) ENSPTXG00000017724 ENSPTXG00000011168 PIAS4 (ENSPTXG00000011170) ##22 ENSPTXG00000011171 ENSPTXG00000011174 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 364 ENSNSUG00000010144 SIRT6 (ENSNSUG00000010142) ENSNSUG00000010141 ZBTB7A (ENSNSUG00000010140) PIAS4 (ENSNSUG00000010139) ##22 EEF2 (ENSNSUG00000010137) DAPK3 (ENSNSUG00000010086) Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 9609 ENSLLTG00000009351 ##22 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 939 ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 172 ENSGT00940000160088 ENSGT00940000159261 ENSGT00940000159179 ENSGT00940000161213 ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00950000183005.b.b ENSGT01100000264330 ENSGT00940000161905 ENSGT00940000162613 ENSGT00950000183005.b.a ENSGT00390000018299 ENSGT00940000157036 ENSGT00940000166752 ENSGT00940000153487.b.a ENSGT01030000234539.a.a.a ##22 ENSGT00940000166634 ENSGT00950000183103.d.b ENSGT00940000160463 ENSGT00940000164500 ENSGT00390000006809 ENSGT00940000159808 ENSGT00390000006337 ENSGT00720000108823 ENSGT00390000005235 Osteoglossocephalai DUPLICATION Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234539.a.a.a.e ##22 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 72 ENSGT00940000160050 ENSGT00950000182971.B.a.a ENSGT00940000160480.c.b ENSGT00940000156569.a.b.a.b ENSGT00390000008279.b.l ENSGT00940000165458 ENSGT00390000012355.A.b ENSGT00940000155914.c.b ENSGT00390000018395 ENSGT00500000045074 ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823 ENSGT00940000159808.j ENSGT00940000164500.a ENSGT00950000183103.d.b.a.a ENSGT01030000234539.a.a.a.e ##22 ENSGT00940000153487.b.a.t ENSGT00940000166752.b ENSGT00940000157036.e.b ENSGT00940000162613.d ENSGT00940000154662.d.d.b.a ENSGT00940000159261.d.b ENSGT00940000160088 ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00940000177291 ENSGT00950000183112.b.a.a.b.a ENSGT00950000183112.b.a.a.b.b ENSGT00940000162487 ENSGT00950000182925.C.a.a ENSGT00940000161721.h ENSGT00940000156523.b.f Asian bonytongue MODERN SPECIES 17 cks2 (ENSSFOG00015011286) odf3l2a (ENSSFOG00015011278) crlf1a (ENSSFOG00015011257) ENSSFOG00015011186 keap1a (ENSSFOG00015025073) zgc:110158 (ENSSFOG00015011080) ENSSFOG00015031291 ELL (ENSSFOG00015026649) ISYNA1 (ENSSFOG00015010978) plekhj1 (ENSSFOG00015025381) sf3a2 (ENSSFOG00015033304) oaz1a (ENSSFOG00015010906) ENSSFOG00015025090 ENSSFOG00015030242 ONECUT3 (ENSSFOG00015024703) pias4b (ENSSFOG00015010810) ##22 MAP2K2 (ENSSFOG00015028124) ENSSFOG00015029384 tcf3a (ENSSFOG00015010645) ENSSFOG00015010547 eef2b (ENSSFOG00015010432) CREB3L3 (ENSSFOG00015010395) sirt6 (ENSSFOG00015028025) CELF5 (ENSSFOG00015010315) HSD11B1L (ENSSFOG00015010301) ENSSFOG00015010276 FGF22 (ENSSFOG00015010264) HCN2 (ENSSFOG00015010200) ENSSFOG00015010250 bsg (ENSSFOG00015028160) rnf126 (ENSSFOG00015010159) P. kingsleyae MODERN SPECIES 57 grk7a (ENSPKIG00000012017) ENSPKIG00000011995 gk5 (ENSPKIG00000011960) ENSPKIG00000011925 ENSPKIG00000011903 ppp1r7 (ENSPKIG00000011862) ubxn7 (ENSPKIG00000011801) ENSPKIG00000011763 ENSPKIG00000011737 PSMD2 (ENSPKIG00000011651) ENSPKIG00000011576 AP2M1 (ENSPKIG00000011484) pcyt1ab (ENSPKIG00000011434) zgc:92744 (ENSPKIG00000011400) SUCNR1 (ENSPKIG00000011391) PIAS4 (ENSPKIG00000011366) ##22 MAP2K2 (ENSPKIG00000011327) ENSPKIG00000011310 tcf3a (ENSPKIG00000011233) MEX3D (ENSPKIG00000011176) eef2b (ENSPKIG00000011101) ENSPKIG00000011068 sirt6 (ENSPKIG00000011041) ENSPKIG00000010998 rgmd (ENSPKIG00000010968) HSD11B1L (ENSPKIG00000010947) ENSPKIG00000010931 FGF22 (ENSPKIG00000010914) HCN2 (ENSPKIG00000010869) bsg (ENSPKIG00000010826) ENSPKIG00000010809 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 577 ENSGT01030000234539.a.a.a.e ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.b ENSGT00940000157036.e.b ENSGT01000000214836 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 201 ENSGT00390000012355.A.b ENSGT00940000155914.c.b ENSGT00390000018395 ENSGT00500000045074 ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823 ENSGT00410000028808 ENSGT00940000164500.a ENSGT00950000183103.d.b.a.a ENSGT01030000234539.a.a.a.e ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.b ENSGT00940000157036.e.b ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.a ENSGT00940000162613 ENSGT00940000161905.b ENSGT00940000159179.g ENSGT00940000154662.d ENSGT00940000159261.d.b ENSGT01030000234518.B.a.a ENSGT00940000160088 ENSGT00940000154716.hc.a.a ENSGT00950000182925.C.a.a ENSGT00940000156523.b.d ENSGT00940000157113.d Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 65 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##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.b ENSGT00940000157036.e.b ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.a.a ENSGT00940000162613 ENSGT00940000161905.b ENSGT00940000159179.g ENSGT00940000154662.d ENSGT00390000002913 ENSGT00940000158163.a ENSGT00940000158649.a.b.a ENSGT00390000012913.a.a ENSGT00940000159946.h ENSGT00950000183110.b.a.d Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 366 ENSGT00980000199858.a ENSGT00940000157535.m.b.c ENSGT01100000263491.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000165396.B.s ENSGT01100000263491.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000165396.B.t.a ENSGT01100000263495.A.a.b.b.a.a.a.b.a.a ENSGT00390000018395.a ENSGT00500000045074 ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823.k.a ENSGT00940000164500.a.a.a ENSGT00720000108823.k.b ENSGT00940000164500.a.a.b ENSGT00950000183103.d.b.a.a ENSGT01030000234539.a.a.a.e ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.b.b ENSGT00940000157036.e.b.g ENSGT00950000183005.b.a.a ENSGT00940000162613.e ENSGT00940000161905.b.a ENSGT00940000159179.g.a Goldfish MODERN SPECIES 11 sbno2a (ENSCARG00000003640) 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ENSGT00940000165396.B.t.a ENSGT01100000263495.A.a.b.b.a.a.a.b.a.a ENSGT00390000018395.a ENSGT00500000045074 ENSGT00390000005235.h ENSGT00720000108823.k.a ENSGT00940000164500.a.a.a ENSGT00950000183103.d.b.a.a.i ENSGT01030000234539.a.a.a.e ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.b.b ENSGT00940000157036.e.b.g ENSGT00950000183005.b.a.a ENSGT00940000162613.e ENSGT00940000161905.b.a ENSGT00940000159179.g.a Common carp reference MODERN SPECIES 21 ENSCCRG00000062639 pnp5b (ENSCCRG00000065090) ENSCCRG00000058515 ENSCCRG00000054097 ENSCCRG00000042353 si:ch211-155e24.3 (ENSCCRG00000066415) ENSCCRG00000040566 ENSCCRG00000069822 ENSCCRG00000040609 tpgs1 (ENSCCRG00000062131) plekhj1 (ENSCCRG00000040625) sf3a2 (ENSCCRG00000070094) ENSCCRG00000064800 ENSCCRG00000063966 ENSCCRG00000029100 pias4b (ENSCCRG00000020596) ##22 map2k2b (ENSCCRG00000020612) tcf3a (ENSCCRG00000035505) ENSCCRG00000079293 MEX3D (ENSCCRG00000058664) ENSCCRG00000039392 ENSCCRG00000035403 eef2b (ENSCCRG00000035228) ENSCCRG00000011585 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##22 map2k2b (ENSDARG00000068918) tcf3a (ENSDARG00000005915) mbd3a (ENSDARG00000061774) BTBD2 (ENSDARG00000104653) eef2b (ENSDARG00000100371) ARMC6 (ENSDARG00000103770) slc25a42 (ENSDARG00000099368) ENSDARG00000115552 tm6sf2a (ENSDARG00000105208) sbno2a (ENSDARG00000098801) ARHGAP45 (ENSDARG00000052496) POLR2E (ENSDARG00000074274) gpx4b (ENSDARG00000076836) PIP5K1C (ENSDARG00000100313) rab11bb (ENSDARG00000090086) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 427 ENSGT01030000234539.a.a.a.e ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.b ENSGT00940000157036.e.b ENSGT01000000214836 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000165622.i.a ENSGT01030000234567.B.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000163253.b.c.a.b ENSGT00510000049027.d ENSGT00390000009230.b ENSGT00940000158050 ENSGT00410000025695.a ENSGT00940000157113.d ENSGT00940000156523.b.d ENSGT00950000182925.C.a.a ENSGT00950000183104.B.a.b.a.a ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823 ENSGT00940000164500.a ENSGT00950000183103.d.b.a.a ENSGT01030000234539.a.a.a.e ##22 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ENSGT01030000234539.a.a.a.e ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.b.d ENSGT00940000157036.e.b.b ENSGT01000000214836 ENSGT00950000183005.b.a.f ENSGT00940000162613.h ENSGT00940000154929.B.h ENSGT00940000159179.g.d ENSGT00940000154662.d.l.b.b ENSGT01030000234518.B.a.a.d ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000160088.d ENSGT00940000164811.a.b.b.c ENSGT00950000183102.B.f ENSGT00940000165656 ENSGT00940000154737.c.g.d Atlantic salmon MODERN SPECIES 5 ENSSSAG00000080695 ENSSSAG00000119558 ENSSSAG00000080551 ENSSSAG00000085793 stk11 (ENSSSAG00000094770) ENSSSAG00000080535 ENSSSAG00000080530 ENSSSAG00000080520 ENSSSAG00000080517 ENSSSAG00000081269 plekhj1 (ENSSSAG00000087805) sf3a2 (ENSSSAG00000080497) ENSSSAG00000080494 ENSSSAG00000098495 onecut3 (ENSSSAG00000080491) pias4b (ENSSSAG00000080484) ##22 map2k2b (ENSSSAG00000110636) tcf3 (ENSSSAG00000080422) ENSSSAG00000114488 QCR10 (ENSSSAG00000080419) ENSSSAG00000080413 mbd3a (ENSSSAG00000080410) MEX3D (ENSSSAG00000080408) ENSSSAG00000085886 ENSSSAG00000113276 ENSSSAG00000102159 EF2 (ENSSSAG00000079662) ENSSSAG00000079652 ENSSSAG00000079649 ENSSSAG00000063987 cactin (ENSSSAG00000079631) River trout MODERN SPECIES 13 ENSSTUG00000042759 ENSSTUG00000042522 ENSSTUG00000042472 ENSSTUG00000042453 stk11 (ENSSTUG00000042429) ENSSTUG00000042288 rnf126 (ENSSTUG00000042229) ENSSTUG00000042201 ENSSTUG00000042172 ENSSTUG00000042146 fzr1a (ENSSTUG00000041577) plekhj1 (ENSSTUG00000041529) sf3a2 (ENSSTUG00000041509) ENSSTUG00000041459 ENSSTUG00000041450 pias4b (ENSSTUG00000041412) ##22 map2k2b (ENSSTUG00000040895) tcf3a (ENSSTUG00000040504) ENSSTUG00000040487 mbd3a (ENSSTUG00000040441) MEX3D (ENSSTUG00000040434) BTBD2 (ENSSTUG00000040152) eef2b (ENSSTUG00000040026) ENSSTUG00000040011 sirt6 (ENSSTUG00000039934) ENSSTUG00000039921 cactin (ENSSTUG00000039909) ENSSTUG00000039902 sema4e (ENSSTUG00000039817) sh3gl1a (ENSSTUG00000039762) rorcb (ENSSTUG00000039738) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00940000163253.b.c.a.b.b 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ENSGT01030000234539.a.a.a.e ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.b.d ENSGT00940000157036.e.b.b ENSGT01000000214836 ENSGT00950000183005.b.a.f ENSGT00940000162613.h Chinook salmon MODERN SPECIES 285 ENSOTSG00005023022 ENSOTSG00005023024 pias4b (ENSOTSG00005023026) ##22 Coho salmon MODERN SPECIES 23 ENSOKIG00005024320 ENSOKIG00005024217 ENSOKIG00005024199 ENSOKIG00005024194 stk11 (ENSOKIG00005050234) SUGP1 (ENSOKIG00005050228) RNF126 (ENSOKIG00005050226) ENSOKIG00005050223 ENSOKIG00005050221 ENSOKIG00005050216 ENSOKIG00005050205 plekhj1 (ENSOKIG00005050200) sf3a2 (ENSOKIG00005050196) ENSOKIG00005050194 ENSOKIG00005050191 pias4b (ENSOKIG00005050185) ##22 map2k2b (ENSOKIG00005050173) tcf3a (ENSOKIG00005050153) ENSOKIG00005050138 mbd3a (ENSOKIG00005050135) MEX3D (ENSOKIG00005050133) UNC13A (ENSOKIG00005050044) BTBD2 (ENSOKIG00005050006) eef2b (ENSOKIG00005049981) RXFP3 (ENSOKIG00005049961) ENSOKIG00005049958 cactin (ENSOKIG00005049952) sema4e (ENSOKIG00005049934) sh3gl1a (ENSOKIG00005049928) ENSOKIG00005049922 ENSOKIG00005049920 Rainbow trout MODERN SPECIES 29 ENSOMYG00000065367 ENSOMYG00000025552 ENSOMYG00000025525 stk11 (ENSOMYG00000025490) ENSOMYG00000025369 ENSOMYG00000025305 ENSOMYG00000054246 ENSOMYG00000019717 ENSOMYG00000075756 ENSOMYG00000019145 plekhj1 (ENSOMYG00000019086) sf3a2 (ENSOMYG00000019075) ENSOMYG00000056264 ENSOMYG00000019056 ENSOMYG00000019049 pias4b (ENSOMYG00000019044) ##22 map2k2b (ENSOMYG00000019038) tcf3a (ENSOMYG00000019014) UQCR11 (ENSOMYG00000019001) ENSOMYG00000052459 mbd3a (ENSOMYG00000018993) MEX3D (ENSOMYG00000018976) ENSOMYG00000075676 ENSOMYG00000018794 eef2b (ENSOMYG00000018631) ENSOMYG00000072890 ENSOMYG00000018556 cactin (ENSOMYG00000018504) sema4e (ENSOMYG00000018449) sh3gl1a (ENSOMYG00000027559) ENSOMYG00000077132 Huchen MODERN SPECIES 1889 ENSHHUG00000022988 ENSHHUG00000022992 pias4b (ENSHHUG00000023007) ##22 map2k2b (ENSHHUG00000023032) tcf3a (ENSHHUG00000023302) ENSHHUG00000023451 mbd3a (ENSHHUG00000023467) MEX3D (ENSHHUG00000023474) ENSHHUG00000023491 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 199 ENSGT00500000045074 ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823 ENSGT00940000159808 ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b ENSGT00940000164108.b.a ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.a ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.a ENSGT00940000162613 ENSGT00940000161905.b ENSGT01100000264330 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000161213 ENSGT00940000159179.h ENSGT00940000159179.g ENSGT00940000159261.d.a Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 125 ENSGT00940000156569.a.b.a ENSGT00940000165458 ENSGT00950000183049.C.a.b ENSGT00390000012355.A.b ENSGT00940000155914.c.b ENSGT00390000018395 ENSGT00500000045074 ENSGT00390000005235 ENSGT00720000108823 ENSGT00410000028808 ENSGT00940000164500.a ENSGT00950000183103.d.b.a.a 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ENSGT00940000161905.b ENSGT00940000159179.g ENSGT00940000154662.d ENSGT00940000159261.d.b ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000160088 ENSGT00940000164811.a.b.b ENSGT00950000183102.B ENSGT00940000165656 ENSGT00530000063841.b.b Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000008279.b ENSGT00950000183049.C.a.a ENSGT00940000156705 ENSGT00940000155914.c.a ENSGT00390000013515 ENSGT00390000006337 ENSGT00940000159808 ENSGT00610000087460 ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b ENSGT00940000164108.b.a ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.a ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000161213 ENSGT00940000159179.h ENSGT00940000154662.d.l.a ENSGT00940000159261.d.a ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000154716.hc ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00940000177291 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01000000219677 ENSGT00940000156569.a.b.b.f ENSGT00390000008279.b.c ENSGT00950000183049.C.a.a.a ENSGT00940000156705.f ENSGT00940000155914.c.a.b ENSGT00390000013515.g ENSGT00390000006337 ENSGT00940000159808.e ENSGT00940000159808.f.a ENSGT00610000087460 ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b.c ENSGT00950000183103.d.b.a.b.a ENSGT00940000166634.e ENSGT01030000234539.a.a.a.f.a ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.a.c ENSGT00940000166752.e ENSGT00940000157036.e.a.d ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.b.c ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B.g.a ENSGT00940000161213.c ENSGT00940000159179.h ENSGT00940000154662.d.l.a.a ENSGT00940000159261.d.a.d ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000154201.a.a.b.d.cb.b.a ENSGT00950000183112.b.a.a.a.d ENSGT00940000162487.t.a Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000156569.a.b.b.f ENSGT00390000008279.b.c ENSGT00950000183049.C.a.a.a ENSGT00940000156705.f ENSGT00940000155914.c.a.b ENSGT00390000013515.g ENSGT00390000006337 ENSGT00940000159808.f.a ENSGT00610000087460 ENSGT00940000159808.e ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b.c ENSGT00940000164108.b.a.c ENSGT00950000183103.d.b.a.b.a ENSGT00940000166634.e ENSGT01030000234539.a.a.a.f.a ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.a.c ENSGT00940000166752.e ENSGT00940000157036.e.a.d ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.b.c ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B.g.a ENSGT00940000161213.c ENSGT00940000159179.h ENSGT00940000154662.d.l.a.a ENSGT00940000159261.d.a.d ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000154201.a.a.b.d.cb.b.a ENSGT00950000183112.b.a.a.a.d ENSGT00940000162487.t.a Salmo ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000162399.p.b ENSGT00940000160988 ENSGT00940000156569.a.b.b.f ENSGT00390000008279.b.c ENSGT00950000183049.C.a.a.a ENSGT00940000156705.f ENSGT00940000155914.c.a.b ENSGT00390000013515.g ENSGT00390000006337 ENSGT00940000159808.e ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b.c ENSGT00940000164108.b.a.c ENSGT00950000183103.d.b.a.b.a ENSGT00940000166634.e ENSGT01030000234539.a.a.a.f.a ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.a.c ENSGT00940000166752.e ENSGT00940000157036.e.a.d ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.b.c ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B.g.a ENSGT00940000161213.c ENSGT00940000159179.h ENSGT00940000154662.d.l.a.a ENSGT00940000159261.d.a.d ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00990000213636 ENSGT00940000154201.a.a.b.d.cb.b.a ENSGT00950000183112.b.a.a.a.d Atlantic salmon MODERN SPECIES 1 ENSSSAG00000089847 sac3d1 (ENSSSAG00000063395) crlf1b (ENSSSAG00000085552) tmem59l (ENSSSAG00000094749) ssbp4 (ENSSSAG00000115956) fkbp8 (ENSSSAG00000062933) ell (ENSSSAG00000062878) dot1l (ENSSSAG00000061712) amh (ENSSSAG00000061537) oaz1 (ENSSSAG00000061483) org (ENSSSAG00000061454) lingo3a (ENSSSAG00000120773) nfil3-4 (ENSSSAG00000061418) ENSSSAG00000061384 foxq2 (ENSSSAG00000061378) pias4a (ENSSSAG00000060551) ##22 map2k2a (ENSSSAG00000102037) ENSSSAG00000105293 tcf3b 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SPECIES 26 ENSOMYG00000028843 crlf1b (ENSOMYG00000025390) tmem59l (ENSOMYG00000025330) ssbp4 (ENSOMYG00000028010) fkbp8 (ENSOMYG00000027698) ell (ENSOMYG00000027667) ENSOMYG00000027287 amh (ENSOMYG00000027120) oaz1a (ENSOMYG00000027112) org (ENSOMYG00000027097) lingo3a (ENSOMYG00000027063) nfil3-4 (ENSOMYG00000027055) ENSOMYG00000027045 foxq2 (ENSOMYG00000027035) ENSOMYG00000069495 pias4a (ENSOMYG00000026996) ##22 map2k2a (ENSOMYG00000026830) ENSOMYG00000026747 tcf3b (ENSOMYG00000026566) ENSOMYG00000026379 ENSOMYG00000026298 mbd3b (ENSOMYG00000025002) ENSOMYG00000067858 ENSOMYG00000018017 hmg20b (ENSOMYG00000017483) btbd2a (ENSOMYG00000017261) ENSOMYG00000016947 ENSOMYG00000067523 creb3l3a (ENSOMYG00000016901) rxfp3.2b (ENSOMYG00000016896) celf5a (ENSOMYG00000016886) Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000160988 ENSGT00940000156569.a.b.b.f ENSGT00390000008279.b.c ENSGT00950000183049.C.a.a.a ENSGT00940000156705.f ENSGT00940000155914.c.a.b ENSGT00390000013515.g ENSGT00390000006337 ENSGT00940000159808.f.a ENSGT00940000159808.e ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b.c ENSGT00940000164108.b.a.c ENSGT00950000183103.d.b.a.a.b ENSGT00940000166634.e ENSGT01030000234539.a.a.a.f.a ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.a.c ENSGT00940000166752.e ENSGT00940000157036.e.a.d ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.b.c ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B.g.a ENSGT00940000161213.c ENSGT00940000159179.h ENSGT00940000154662.d.l.a.a ENSGT00940000159261.d.a.d ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000154201.a.a.b.d.cb.b.a ENSGT00950000183112.b.a.a.a.d ENSGT00940000162487.t.a Coho salmon MODERN SPECIES 4 crlf1b (ENSOKIG00005039856) tmem59l (ENSOKIG00005039865) ENSOKIG00005039907 ssbp4 (ENSOKIG00005039948) fkbp8 (ENSOKIG00005040657) ell (ENSOKIG00005040869) DOT1L (ENSOKIG00005041013) amh (ENSOKIG00005041367) ENSOKIG00005041381 oaz1a (ENSOKIG00005041388) org (ENSOKIG00005041463) lingo3a (ENSOKIG00005041488) nfil3-4 (ENSOKIG00005041496) ONECUT3 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ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156569.a.b.b.e ENSGT00390000008279.b.d ENSGT00950000183049.C.a.a.b ENSGT00940000156705.e ENSGT00940000155914.c.a.a ENSGT00390000013515.h ENSGT00940000179866.a ENSGT00940000159808.f.b ENSGT01010000226535 ENSGT00940000164500.b.d ENSGT00940000164108.b.a.d ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b.b ENSGT00940000166634.f ENSGT01030000234539.a.a.a.f.b ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.a.d ENSGT00940000166752.f ENSGT00940000157036.e.a.c ENSGT00970000193487 ENSGT00950000183005.b.b.d ENSGT00940000154929.B.g.b ENSGT00940000161213.d ENSGT00940000154662.d.l.a.b ENSGT00940000159261.d.a.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000154716.hc ENSGT00940000154201.a.a.b.d.cb.b.b ENSGT00940000177291 ENSGT00950000183112.b.a.a.a.c ENSGT00940000162487.t.b Salmo ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000156569.a.b.b.e ENSGT00390000008279.b.d ENSGT00950000183049.C.a.a.b ENSGT00940000156705.e ENSGT00940000155914.c.a.a ENSGT00390000013515.h ENSGT00940000179866.a ENSGT00940000159808.f.b ENSGT01010000226535 ENSGT00940000164500.b.d ENSGT00940000164108.b.a.d ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b.b ENSGT00940000166634.f ENSGT01030000234539.a.a.a.f.b ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.a.d ENSGT00940000166752.f ENSGT00940000157036.e.a.c ENSGT01100000264042 ENSGT00950000183005.b.b.d ENSGT00940000154929.B.g.b ENSGT00940000161213.d ENSGT00940000154662.d.l.a.b ENSGT00940000159261.d.a.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000154716.hc ENSGT00940000154201.a.a.b.d.cb.b.b ENSGT00950000183112.b.a.a.a.c ENSGT00940000177291 ENSGT00940000162487.t.b Atlantic salmon MODERN SPECIES 15 crlf1b (ENSSSAG00000008860) tmem59l (ENSSSAG00000008926) ENSSSAG00000118135 ssbp4 (ENSSSAG00000009016) ENSSSAG00000108322 ell (ENSSSAG00000009143) ENSSSAG00000009382 oaz1s (ENSSSAG00000009700) ENSSSAG00000009718 ENSSSAG00000009764 lingo3a (ENSSSAG00000110799) ENSSSAG00000082536 ENSSSAG00000112330 ENSSSAG00000101819 ENSSSAG00000009895 ENSSSAG00000009906 ##22 foxq2 (ENSSSAG00000009926) mp2k2 (ENSSSAG00000009933) tcf3b (ENSSSAG00000010042) ENSSSAG00000094304 ENSSSAG00000105808 ENSSSAG00000010477 hmg20b (ENSSSAG00000017779) ef2 (ENSSSAG00000017975) creb3l3a (ENSSSAG00000018991) celf5a (ENSSSAG00000019628) rgmd (ENSSSAG00000020190) ENSSSAG00000020311 hsd11b1la (ENSSSAG00000020651) micos13 (ENSSSAG00000105399) ENSSSAG00000025124 River trout MODERN SPECIES 33 rex1bd (ENSSTUG00000005100) crlf1b (ENSSTUG00000005109) tmem59l (ENSSTUG00000005117) ssbp4 (ENSSTUG00000005138) fkbp8 (ENSSTUG00000005192) ell (ENSSTUG00000005235) ENSSTUG00000005243 DOT1L (ENSSTUG00000005256) ENSSTUG00000005384 oaz1a (ENSSTUG00000005404) lingo3a (ENSSTUG00000005411) nfil3-4 (ENSSTUG00000005418) ENSSTUG00000005431 ENSSTUG00000005496 foxq2 (ENSSTUG00000005501) pias4a (ENSSTUG00000005509) ##22 map2k2a (ENSSTUG00000005571) ENSSTUG00000005792 tcf3b (ENSSTUG00000005813) ENSSTUG00000005992 ENSSTUG00000006003 ENSSTUG00000006148 hmg20b 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ENSGT00950000183112.b.a.a.a.c ENSGT00940000162487.t.b Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00390000010974 ENSGT00940000166035 ENSGT00940000156569.a.b.b.e ENSGT00390000008279.b.d ENSGT00950000183049.C.a.a.b ENSGT00940000156705.e ENSGT00940000155914.c.a.a ENSGT00390000013515.h ENSGT00940000159808.f.b ENSGT01010000226535 ENSGT00940000164500.b.d ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b.b ENSGT00940000166634.f ENSGT01030000234539.a.a.a.f.b ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.a.d ENSGT00940000166752.f ENSGT00940000157036.e.a.c ENSGT00950000183005.b.b.d ENSGT00940000154929.B.g.b ENSGT00940000161213.d ENSGT00940000154662.d.l.a.b ENSGT00940000159261.d.a.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000154716.hc.f ENSGT00940000154201.a.a.b.d.cb.b.b ENSGT00940000177291 ENSGT00950000183112.b.a.a.a.c ENSGT00940000162487.t.b ENSGT00390000002629.v.a Coho salmon MODERN SPECIES 1 rex1bd (ENSOKIG00005022126) crlf1b (ENSOKIG00005022067) tmem59l (ENSOKIG00005022039) ssbp4 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ENSGT00940000159808 ENSGT00610000087460 ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b ENSGT00940000164108.b.a ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.a ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT00970000193487 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000161905.a ENSGT00940000166909 ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000161213 ENSGT00940000154662.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000159261.d.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00940000177291 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000156705 ENSGT00940000155914.c.a ENSGT00390000013515 ENSGT00390000006337 ENSGT00990000206265 ENSGT00940000179866 ENSGT00940000159808 ENSGT00610000087460 ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b ENSGT00940000164108.b.a ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.a ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT00970000193487 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000161905.a ENSGT00940000166909 ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000161213 ENSGT00940000154662.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000159261.d.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00940000177291 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 469 serbp1a (ENSHCOG00000001044) tmem59l (ENSHCOG00000001047) ENSHCOG00000001053 ssbp4 (ENSHCOG00000001058) fkbp8 (ENSHCOG00000001065) ell (ENSHCOG00000001070) DOT1L (ENSHCOG00000001086) amh (ENSHCOG00000001199) oaz1a (ENSHCOG00000001278) org (ENSHCOG00000001285) lingo3a (ENSHCOG00000001286) ENSHCOG00000000737 ENSHCOG00000001314 ONECUT3 (ENSHCOG00000001323) foxq2 (ENSHCOG00000001331) pias4a (ENSHCOG00000001356) ##22 map2k2a (ENSHCOG00000001372) ENSHCOG00000001375 tcf3b (ENSHCOG00000001392) ENSHCOG00000001404 ENSHCOG00000001410 mbd3b (ENSHCOG00000001424) ENSHCOG00000001450 hmg20b (ENSHCOG00000001458) 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97 ENSGT00940000157484 ENSGT00940000160540 ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.a ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT00970000193487 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000161213 ENSGT00940000154662.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000159261.d.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00950000183112.b.a.a.a ENSGT00940000162487.h ENSGT00940000162487.g Sailfin molly MODERN SPECIES 52 ENSPLAG00000010209 ENSPLAG00000010180 ENSPLAG00000010172 ONECUT3 (ENSPLAG00000010117) foxq2 (ENSPLAG00000010072) pias4a (ENSPLAG00000010061) ##22 map2k2a (ENSPLAG00000010038) ENSPLAG00000010005 tcf3b (ENSPLAG00000009999) ENSPLAG00000009907 ENSPLAG00000009897 ENSPLAG00000009874 ENSPLAG00000009845 hmg20b (ENSPLAG00000000702) ENSPLAG00000009753 rxfp3.2b (ENSPLAG00000009691) creb3l3a (ENSPLAG00000009679) ENSPLAG00000009650 Amazon molly MODERN SPECIES 487 lingo3a 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373 crlf1b (ENSCVAG00000016874) tmem59l (ENSCVAG00000016909) ssbp4 (ENSCVAG00000016987) fkbp8 (ENSCVAG00000017001) ell (ENSCVAG00000017084) DOT1L (ENSCVAG00000017122) amh (ENSCVAG00000017392) oaz1a (ENSCVAG00000017453) ENSCVAG00000017460 org (ENSCVAG00000017464) lingo3a (ENSCVAG00000017476) nfil3-4 (ENSCVAG00000017490) ENSCVAG00000017513 ONECUT3 (ENSCVAG00000017518) foxq2 (ENSCVAG00000017544) pias4a (ENSCVAG00000017561) ##22 map2k2a (ENSCVAG00000017585) ENSCVAG00000017592 Mummichog MODERN SPECIES 2455 ONECUT3 (ENSFHEG00000012254) foxq2 (ENSFHEG00000012274) pias4a (ENSFHEG00000012325) ##22 map2k2a (ENSFHEG00000000276) ENSFHEG00000012353 tcf3b (ENSFHEG00000012518) ENSFHEG00000012553 mbd3b (ENSFHEG00000012565) unc13a (ENSFHEG00000012669) hmg20b (ENSFHEG00000012684) ENSFHEG00000012721 rxfp3.2b (ENSFHEG00000012734) creb3l3a (ENSFHEG00000012771) celf5a (ENSFHEG00000012816) rgmd (ENSFHEG00000012836) hsd11b1la (ENSFHEG00000012843) hsd11b1la (ENSFHEG00000012868) micos13 (ENSFHEG00000012877) Oryzias ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000008279.b ENSGT00950000183049.C.a.a ENSGT00940000156705 ENSGT00940000155914.c.a ENSGT00390000013515 ENSGT00390000006337 ENSGT00940000159808 ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.a ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000161213 ENSGT00940000154662.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000159261.d.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00940000177291 ENSGT00950000183112.b.a.a.a ENSGT00940000162487 ENSGT00390000002629 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000182983.B.a.a ENSGT00940000157375.c ENSGT00390000008279.b ENSGT00950000183049.C.a.a ENSGT00940000156705 ENSGT00940000155914.c.a ENSGT00390000013515 ENSGT00390000006337 ENSGT00940000159808 ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.a ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000161213 ENSGT00940000154662.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000159261.d.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00940000177291 ENSGT00950000183112.b.a.a.a ENSGT00940000162487.j ENSGT00390000002629 Chinese medaka MODERN SPECIES 704 ENSOSIG00000007367 DOT1L (ENSOSIG00000007376) amh (ENSOSIG00000008970) lingo3a (ENSOSIG00000009340) ENSOSIG00000009341 ENSOSIG00000009342 ONECUT3 (ENSOSIG00000009343) pias4a (ENSOSIG00000009344) ##22 map2k2a (ENSOSIG00000009348) ENSOSIG00000009601 ENSOSIG00000009602 tcf3b (ENSOSIG00000009603) UQCR11 (ENSOSIG00000009604) ENSOSIG00000009605 mbd3b (ENSOSIG00000009626) hmg20b (ENSOSIG00000009948) ENSOSIG00000009949 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 18 enc3 (ENSORLG00000005152) 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SPECIES 6 ENSGT00950000183049.C.a.a ENSGT00940000156705 ENSGT00940000155914.c.a ENSGT00390000013515 ENSGT00390000006337 ENSGT00940000159808.g ENSGT00990000206265 ENSGT00940000159808.h ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b ENSGT00940000164108.b.a ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.a ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT00970000193487 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000161213 ENSGT00940000154662.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000159261.d.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00940000177291 ENSGT00950000183112.b.a.a.a ENSGT00940000162487 Climbing perch MODERN SPECIES 17 ssbp4 (ENSATEG00000001551) fkbp8 (ENSATEG00000001536) ell (ENSATEG00000001436) amh (ENSATEG00000025688) ENSATEG00000000020 ENSATEG00000000602 amh (ENSATEG00000027298) ENSATEG00000025489 oaz1a (ENSATEG00000029408) org (ENSATEG00000024225) lingo3a (ENSATEG00000024223) ENSATEG00000024219 ENSATEG00000024214 ENSATEG00000024210 foxq2 (ENSATEG00000024209) pias4a (ENSATEG00000024205) ##22 map2k2a (ENSATEG00000024201) ENSATEG00000024198 tcf3b (ENSATEG00000024190) ENSATEG00000015593 ENSATEG00000024182 mbd3b (ENSATEG00000024170) unc13a (ENSATEG00000024156) hmg20b (ENSATEG00000024149) ENSATEG00000024140 ENSATEG00000024139 ENSATEG00000024136 celf5a (ENSATEG00000024133) ENSATEG00000024132 rgmd (ENSATEG00000025956) hsd11b1la (ENSATEG00000024125) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 15 rex1bd (ENSBSLG00000020103) tmem59l (ENSBSLG00000020107) ssbp4 (ENSBSLG00000020131) fkbp8 (ENSBSLG00000020358) ell (ENSBSLG00000020371) DOT1L (ENSBSLG00000020487) amh (ENSBSLG00000020545) oaz1a (ENSBSLG00000000482) org (ENSBSLG00000000508) lingo3a (ENSBSLG00000000528) nfil3-4 (ENSBSLG00000000543) ENSBSLG00000000554 ENSBSLG00000000564 ONECUT3 (ENSBSLG00000000585) foxq2 (ENSBSLG00000000594) pias4a (ENSBSLG00000000614) ##22 map2k2a (ENSBSLG00000000681) ENSBSLG00000000752 tcf3b (ENSBSLG00000000772) ENSBSLG00000000795 mbd3b (ENSBSLG00000000820) ENSBSLG00000000972 hmg20b (ENSBSLG00000001058) ENSBSLG00000001069 rxfp3.2b (ENSBSLG00000001074) creb3l3a (ENSBSLG00000001077) celf5a (ENSBSLG00000001385) rgmd (ENSBSLG00000001602) ENSBSLG00000001604 hsd11b1la (ENSBSLG00000001619) hsd11b1la (ENSBSLG00000001666) Carangaria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000008279.b ENSGT00950000183049.C.a.a ENSGT00940000156705 ENSGT00940000155914.c.a ENSGT00390000013515 ENSGT00390000006337 ENSGT00940000159808 ENSGT00610000087460 ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b ENSGT00940000164108.b.a ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.a ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT00970000193487 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000161905.a ENSGT00940000161213 ENSGT00940000154662.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000159261.d.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00940000177291 ENSGT00950000183112.b.a.a.a ENSGT00940000162487 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000008279.b ENSGT00950000183049.C.a.a ENSGT00940000156705 ENSGT00940000155914.c.a ENSGT00390000013515 ENSGT00390000006337 ENSGT00940000159808 ENSGT00610000087460 ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b ENSGT00940000164108.b.a ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.a ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT00970000193487 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000161905.a ENSGT00940000161213 ENSGT00940000154662.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000159261.d.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00940000177291 ENSGT00950000183112.b.a.a.a ENSGT00940000162487 Seriola ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000008279.b ENSGT00950000183049.C.a.a ENSGT00940000156705 ENSGT00940000155914.c.a ENSGT00390000013515 ENSGT00390000006337 ENSGT00940000159808 ENSGT00610000087460 ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b ENSGT00940000164108.b.a ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.a ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT00970000193487 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000161905.a ENSGT00940000161213 ENSGT00940000154662.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000159261.d.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00940000177291 ENSGT00950000183112.b.a.a.a ENSGT00940000162487 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2779 crlf1b (ENSSLDG00000018252) tmem59l (ENSSLDG00000018268) ssbp4 (ENSSLDG00000018284) fkbp8 (ENSSLDG00000018302) ell (ENSSLDG00000018316) DOT1L (ENSSLDG00000018347) amh (ENSSLDG00000018418) oaz1a (ENSSLDG00000018586) org (ENSSLDG00000018605) lingo3a (ENSSLDG00000018623) nfil3-4 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ENSGT00940000155914.c.a ENSGT00390000013515 ENSGT00390000006337 ENSGT00940000159808 ENSGT00610000087460 ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b ENSGT00940000164108.b.a ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.a ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT00970000193487 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000161213 ENSGT00940000154662.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000159261.d.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00940000177291 ENSGT00950000183112.b.a.a.a ENSGT00940000162487 Turbot MODERN SPECIES 3 rex1bd (ENSSMAG00000029680) crlf1b (ENSSMAG00000010468) tmem59l (ENSSMAG00000026832) ssbp4 (ENSSMAG00000010536) fkbp8 (ENSSMAG00000010583) ENSSMAG00000010716 ENSSMAG00000010865 oaz1a (ENSSMAG00000036339) ENSSMAG00000010955 org (ENSSMAG00000010979) lingo3a (ENSSMAG00000010996) nfil3-4 (ENSSMAG00000023493) ENSSMAG00000011008 ENSSMAG00000011032 foxq2 (ENSSMAG00000027229) pias4a (ENSSMAG00000011051) ##22 map2k2a (ENSSMAG00000011095) ENSSMAG00000011133 tcf3b (ENSSMAG00000011141) ENSSMAG00000011289 ENSSMAG00000011344 mbd3b (ENSSMAG00000011414) ENSSMAG00000011477 ENSSMAG00000011593 hmg20b (ENSSMAG00000011561) ENSSMAG00000011623 ENSSMAG00000011634 celf5a (ENSSMAG00000011707) rgmd (ENSSMAG00000011765) hsd11b1la (ENSSMAG00000011781) micos13 (ENSSMAG00000035702) Tongue sole MODERN SPECIES 11 FAM78B (ENSCSEG00000005582) rex1bd (ENSCSEG00000005583) crlf1b (ENSCSEG00000005591) tmem59l (ENSCSEG00000005608) ssbp4 (ENSCSEG00000005625) fkbp8 (ENSCSEG00000005642) ell (ENSCSEG00000005649) DOT1L (ENSCSEG00000005666) amh (ENSCSEG00000005692) oaz1a (ENSCSEG00000005700) org (ENSCSEG00000005703) lingo3a (ENSCSEG00000005708) ENSCSEG00000005713 nfil3-4 (ENSCSEG00000005727) ENSCSEG00000005733 pias4a (ENSCSEG00000005736) ##22 map2k2a (ENSCSEG00000005743) ENSCSEG00000005752 tcf3b (ENSCSEG00000005762) ENSCSEG00000005775 ENSCSEG00000005781 yjefn3 (ENSCSEG00000005787) gatad2ab (ENSCSEG00000005801) MAU2 (ENSCSEG00000005813) slc25a42 (ENSCSEG00000005845) tmem161a (ENSCSEG00000005851) ENSCSEG00000005870 borcs8 (ENSCSEG00000006744) ENSCSEG00000006752 rfxank (ENSCSEG00000006758) nr2c2ap (ENSCSEG00000006765) Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000156705 ENSGT00940000155914.c.a ENSGT00390000013515 ENSGT00390000006337 ENSGT01030000236343 ENSGT00940000179866 ENSGT00940000159808 ENSGT00610000087460 ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b ENSGT00940000164108.b.a ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.a ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT00970000193487 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000161213 ENSGT00940000154662.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000159261.d.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00940000177291 ENSGT00950000183112.b.a.a.a ENSGT00940000162487 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156569.a.b.b ENSGT00390000008279.b ENSGT00950000183049.C.a.a ENSGT00940000156705 ENSGT00940000155914.c.a ENSGT00390000013515 ENSGT00390000006337 ENSGT00940000159808 ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b ENSGT00940000164108.b.a ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.a ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT00970000193487 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000161213 ENSGT00940000154662.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000159261.d.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00940000177291 ENSGT00950000183112.b.a.a.a ENSGT00940000162487 Fugu MODERN SPECIES 12 rex1bd (ENSTRUG00000024133) crlf1b (ENSTRUG00000017809) tmem59l (ENSTRUG00000017813) ssbp4 (ENSTRUG00000017822) fkbp8 (ENSTRUG00000017825) ell (ENSTRUG00000017827) DOT1L (ENSTRUG00000017836) amh (ENSTRUG00000017845) oaz1 (ENSTRUG00000017848) org (ENSTRUG00000021694) lingo3a (ENSTRUG00000029689) nfil3-4 (ENSTRUG00000024024) ENSTRUG00000017852 ONECUT3 (ENSTRUG00000017862) foxq2 (ENSTRUG00000019696) pias4 (ENSTRUG00000017867) ##22 map2k2a (ENSTRUG00000017876) ENSTRUG00000017896 tcf3b (ENSTRUG00000017901) ENSTRUG00000024626 ENSTRUG00000019805 hmg20b (ENSTRUG00000023188) eef2b (ENSTRUG00000017921) rxfp3.2b (ENSTRUG00000017932) creb3l3a (ENSTRUG00000017933) ENSTRUG00000024401 celf5a (ENSTRUG00000017937) ENSTRUG00000028383 rgmd (ENSTRUG00000017971) hsd11b1la (ENSTRUG00000017980) micos13 (ENSTRUG00000024935) Tetraodon MODERN SPECIES slc35a3a (ENSTNIG00000006641) FAM78B (ENSTNIG00000006642) crlf1b (ENSTNIG00000019587) tmem59l (ENSTNIG00000019440) ssbp4 (ENSTNIG00000004007) fkbp8 (ENSTNIG00000005610) ell (ENSTNIG00000004352) DOT1L (ENSTNIG00000004351) ENSTNIG00000000746 oaz1a (ENSTNIG00000005649) org (ENSTNIG00000005650) lingo3a (ENSTNIG00000004974) ENSTNIG00000004975 ENSTNIG00000004976 ENSTNIG00000004331 pias4a (ENSTNIG00000003243) ##22 map2k2a (ENSTNIG00000003242) ENSTNIG00000004415 tcf3b (ENSTNIG00000004414) ENSTNIG00000010626 ENSTNIG00000010627 mbd3b (ENSTNIG00000010628) ENSTNIG00000010629 hmg20b (ENSTNIG00000010630) eef2b (ENSTNIG00000010631) RXFP3 (ENSTNIG00000010632) creb3l3a (ENSTNIG00000010633) celf5a (ENSTNIG00000010634) rgmd (ENSTNIG00000010635) hsd11b1la (ENSTNIG00000010636) micos13 (ENSTNIG00000010637) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156705 ENSGT00940000155914.c.a ENSGT00390000013515 ENSGT00390000006337 ENSGT01030000236343 ENSGT00940000179866 ENSGT00940000159808 ENSGT00610000087460 ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b ENSGT00940000164108.b.a ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.a ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT00970000193487 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000161213 ENSGT00940000154662.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000159261.d.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00940000177291 ENSGT00950000183112.b.a.a.a ENSGT00940000162487 Ballan wrasse MODERN SPECIES 45 ssbp4 (ENSLBEG00000018672) fkbp8 (ENSLBEG00000018640) ell (ENSLBEG00000018604) ENSLBEG00000018587 DOT1L (ENSLBEG00000018459) amh (ENSLBEG00000018391) oaz1a (ENSLBEG00000018367) ENSLBEG00000018346 org (ENSLBEG00000018328) lingo3a (ENSLBEG00000018319) nfil3-4 (ENSLBEG00000018305) ENSLBEG00000018297 ENSLBEG00000018270 ONECUT3 (ENSLBEG00000018257) foxq2 (ENSLBEG00000018243) pias4a (ENSLBEG00000018229) ##22 map2k2a (ENSLBEG00000018179) ENSLBEG00000018148 tcf3b (ENSLBEG00000018121) ENSLBEG00000018105 ENSLBEG00000018071 ENSLBEG00000018021 ENSLBEG00000017985 unc13a (ENSLBEG00000017253) hmg20b (ENSLBEG00000016997) ENSLBEG00000016853 rxfp3.2b (ENSLBEG00000016833) creb3l3a (ENSLBEG00000016806) celf5a (ENSLBEG00000016733) ENSLBEG00000016696 rgmd (ENSLBEG00000016677) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000156705 ENSGT00940000155914.c.a ENSGT00390000013515 ENSGT00390000006337 ENSGT01030000236343 ENSGT00940000179866 ENSGT00940000159808 ENSGT00610000087460 ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b ENSGT00940000164108.b.a ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.a ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT00970000193487 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000161213 ENSGT00940000154662.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000159261.d.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00940000177291 ENSGT00950000183112.b.a.a.a ENSGT00940000162487 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000183049.C.a.a ENSGT00940000156705 ENSGT00940000155914.c.a ENSGT00390000013515 ENSGT00390000006337 ENSGT01030000236343 ENSGT00940000159808 ENSGT00610000087460 ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b ENSGT00940000164108.b.a ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.a ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT00970000193487 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000161213 ENSGT00940000154662.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000159261.d.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00940000177291 ENSGT00950000183112.b.a.a.a ENSGT00940000162487 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000008279.b ENSGT00950000183049.C.a.a ENSGT00940000156705 ENSGT00940000155914.c.a ENSGT00390000013515 ENSGT00390000006337 ENSGT01030000236343 ENSGT00940000159808 ENSGT00610000087460 ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b ENSGT00940000164108.b.a ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.a ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT00970000193487 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000161213 ENSGT00940000154662.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000159261.d.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00950000183112.b.a.a.a ENSGT00940000177291 ENSGT00940000162487 Lumpfish MODERN SPECIES 19 rex1bd (ENSCLMG00005016724) crlf1b (ENSCLMG00005016733) tmem59l (ENSCLMG00005016760) ssbp4 (ENSCLMG00005016764) fkbp8 (ENSCLMG00005016767) ell (ENSCLMG00005016774) DOT1L (ENSCLMG00005016800) amh (ENSCLMG00005016820) oaz1a (ENSCLMG00005016821) org (ENSCLMG00005016822) lingo3a (ENSCLMG00005016825) ENSCLMG00005016826 ENSCLMG00005016827 ONECUT3 (ENSCLMG00005016830) foxq2 (ENSCLMG00005016831) pias4a (ENSCLMG00005016833) ##22 map2k2a (ENSCLMG00005016837) ENSCLMG00005016924 tcf3b (ENSCLMG00005016927) ENSCLMG00005016989 ENSCLMG00005016993 ENSCLMG00005017013 ENSCLMG00005017014 ENSCLMG00005017025 hmg20b (ENSCLMG00005000069) ENSCLMG00005000167 rxfp3.2b (ENSCLMG00005000364) creb3l3a (ENSCLMG00005000369) ENSCLMG00005000371 rgmd (ENSCLMG00005000373) ENSCLMG00005000374 Stickleback MODERN SPECIES 8 tmem59l (ENSGACG00000012501) ENSGACG00000012506 ssbp4 (ENSGACG00000012509) fkbp8 (ENSGACG00000012561) ell (ENSGACG00000012588) DOT1L (ENSGACG00000012616) amh (ENSGACG00000012629) ENSGACG00000012639 oaz1a (ENSGACG00000012643) ENSGACG00000012649 org (ENSGACG00000012651) lingo3a (ENSGACG00000012652) ENSGACG00000012656 ENSGACG00000012658 ONECUT3 (ENSGACG00000012671) pias4a (ENSGACG00000012681) ##22 map2k2a (ENSGACG00000012686) ENSGACG00000012730 tcf3b (ENSGACG00000012737) ENSGACG00000012755 mbd3b (ENSGACG00000012760) hmg20b (ENSGACG00000012785) ENSGACG00000012793 rxfp3.2b (ENSGACG00000012856) creb3l3a (ENSGACG00000012860) celf5a (ENSGACG00000012870) rgmd (ENSGACG00000012876) hsd11b1la (ENSGACG00000012884) ENSGACG00000012902 ENSGACG00000012927 ENSGACG00000012935 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000008279.b ENSGT00950000183049.C.a.a ENSGT00940000156705 ENSGT00940000155914.c.a ENSGT00390000013515 ENSGT00390000006337 ENSGT00940000159808 ENSGT00610000087460 ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b ENSGT00940000164108.b.a ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.a ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT00970000193487 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000161213 ENSGT00940000154662.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000159261.d.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00940000177291 ENSGT00950000183112.b.a.a.a ENSGT00940000162487 Channel bull blenny MODERN SPECIES 18 ENSCGOG00000009542 ssbp4 (ENSCGOG00000009536) fkbp8 (ENSCGOG00000009474) ell (ENSCGOG00000009470) DOT1L (ENSCGOG00000008368) amh (ENSCGOG00000008344) oaz1a (ENSCGOG00000008337) ENSCGOG00000008332 org (ENSCGOG00000008327) lingo3a (ENSCGOG00000008324) nfil3-4 (ENSCGOG00000008321) ENSCGOG00000008319 ENSCGOG00000008285 ONECUT3 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ENSGT00950000183112.b.a.a.a ENSGT00940000162487 Gilthead seabream MODERN SPECIES 2 crlf1b (ENSSAUG00010017185) tmem59l (ENSSAUG00010017182) ssbp4 (ENSSAUG00010017171) fkbp8 (ENSSAUG00010017158) ell (ENSSAUG00010016910) DOT1L (ENSSAUG00010016896) amh (ENSSAUG00010016872) oaz1a (ENSSAUG00010016869) org (ENSSAUG00010016866) lingo3a (ENSSAUG00010016865) ENSSAUG00010016864 ENSSAUG00010016863 ENSSAUG00010016859 ONECUT3 (ENSSAUG00010016857) foxq2 (ENSSAUG00010016856) pias4a (ENSSAUG00010016853) ##22 map2k2a (ENSSAUG00010016794) ENSSAUG00010016791 tcf3b (ENSSAUG00010016777) UQCR11-A (ENSSAUG00010016776) ENSSAUG00010016761 mbd3b (ENSSAUG00010014453) ENSSAUG00010006800 hmg20b (ENSSAUG00010006681) ENSSAUG00010006609 rxfp3.2b (ENSSAUG00010006596) creb3l3a (ENSSAUG00010006590) celf5a (ENSSAUG00010006236) ENSSAUG00010006223 rgmd (ENSSAUG00010006219) hsd11b1la (ENSSAUG00010006216) Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000156569.a.b.b ENSGT00390000008279.b ENSGT00950000183049.C.a.a ENSGT00940000156705 ENSGT00940000155914.c.a ENSGT00390000013515 ENSGT00390000006337 ENSGT00940000159808 ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b ENSGT00940000164108.b.a ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.a ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT00970000193487 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000161213 ENSGT00940000154662.c ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000159261.d.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00950000183112.b.a.a.a ENSGT00940000177291 ENSGT00940000162487 European seabass MODERN SPECIES 17 crlf1b (ENSDLAG00005018938) tmem59l (ENSDLAG00005018947) ssbp4 (ENSDLAG00005028129) fkbp8 (ENSDLAG00005006935) ell (ENSDLAG00005006945) ENSDLAG00005007009 ENSDLAG00005007127 oaz1a (ENSDLAG00005007152) org (ENSDLAG00005032582) lingo3a (ENSDLAG00005029798) nfil3-4 (ENSDLAG00005034126) ENSDLAG00005032586 ENSDLAG00005007203 ENSDLAG00005007246 foxq2 (ENSDLAG00005007454) pias4a (ENSDLAG00005007467) ##22 map2k2a (ENSDLAG00005007532) ENSDLAG00005027950 tcf3b (ENSDLAG00005007641) ENSDLAG00005007902 mbd3b (ENSDLAG00005008038) ENSDLAG00005010545 hmg20b (ENSDLAG00005012176) ENSDLAG00005007255 ENSDLAG00005012187 ENSDLAG00005012189 celf5a (ENSDLAG00005012223) rgmd (ENSDLAG00005034969) ENSDLAG00005013250 hsd11b1la (ENSDLAG00005033494) micos13 (ENSDLAG00005030603) Large yellow croaker MODERN SPECIES 489 crlf1b (ENSLCRG00005003674) tmem59l (ENSLCRG00005003673) ssbp4 (ENSLCRG00005000927) fkbp8 (ENSLCRG00005000803) ell (ENSLCRG00005020613) DOT1L (ENSLCRG00005020600) amh (ENSLCRG00005020594) oaz1a (ENSLCRG00005020593) org (ENSLCRG00005020591) lingo3a (ENSLCRG00005020590) nfil3-4 (ENSLCRG00005020589) ENSLCRG00005020588 ENSLCRG00005020585 ONECUT3 (ENSLCRG00005020583) foxq2 (ENSLCRG00005020582) pias4a (ENSLCRG00005020574) ##22 map2k2a (ENSLCRG00005020546) ENSLCRG00005020543 tcf3b (ENSLCRG00005020537) ENSLCRG00005020535 ENSLCRG00005020531 mbd3b (ENSLCRG00005019959) unc13a (ENSLCRG00005014451) hmg20b (ENSLCRG00005014394) hmg20b (ENSLCRG00005014392) ENSLCRG00005014391 ENSLCRG00005014318 rxfp3.2b (ENSLCRG00005014316) creb3l3a (ENSLCRG00005014315) celf5a (ENSLCRG00005013906) rgmd (ENSLCRG00005013898) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 18 rex1bd (ENSMMDG00005006791) crlf1b (ENSMMDG00005006789) tmem59l (ENSMMDG00005006788) ssbp4 (ENSMMDG00005006752) fkbp8 (ENSMMDG00005006732) ell (ENSMMDG00005006702) DOT1L (ENSMMDG00005005213) amh (ENSMMDG00005005169) oaz1a (ENSMMDG00005005165) org (ENSMMDG00005005160) lingo3a (ENSMMDG00005005157) nfil3-4 (ENSMMDG00005005154) ENSMMDG00005005147 ONECUT3 (ENSMMDG00005005143) foxq2 (ENSMMDG00005005140) pias4a (ENSMMDG00005005133) ##22 map2k2a (ENSMMDG00005004987) ENSMMDG00005004983 tcf3b (ENSMMDG00005004729) ENSMMDG00005004684 ENSMMDG00005004563 mbd3b (ENSMMDG00005004502) ENSMMDG00005004469 ENSMMDG00005004444 hmg20b (ENSMMDG00005004430) btbd2a 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ENSGT00390000006337 ENSGT00990000206265 ENSGT01030000236343 ENSGT00940000159808 ENSGT00610000087460 ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b ENSGT00940000164108.b.a ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.a ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT01100000264042 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000161905.a ENSGT00940000166909 ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000161213 ENSGT00940000159179.h ENSGT00940000159261.d.a ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000154716.hc.b ENSGT00940000154201.a.a.b.d Otophysi ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00940000156705 ENSGT00940000155914.c.a ENSGT00390000013515 ENSGT00390000006337 ENSGT00990000206265 ENSGT01030000236343 ENSGT00940000159808 ENSGT00610000087460 ENSGT00390000006809 ENSGT00940000164500.b ENSGT00940000164108.b.a ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b ENSGT00940000166634 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.a ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT01100000264042 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000161905.a ENSGT00940000166909 ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000161213 ENSGT00940000159179.h ENSGT00940000159261.d.a ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000154716.hc.b ENSGT00940000154201.a.a.b.d Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.b.a ENSGT01030000234519.e.a.a.b.b.a.b.g ENSGT01030000234519.e.a.a.b.b.a.b.h ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.b.b.a ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.b.a.b.f ENSGT00940000162569.b.k.a ENSGT00940000165296 ENSGT00940000161259.B.a ENSGT00940000164811.a.a ENSGT00550000075067 ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000166572 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.a ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT01100000264042 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000161905.a ENSGT00940000166909 ENSGT00940000161213 ENSGT00940000159179.h ENSGT00940000159261.d.a ENSGT01030000234534.B.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00950000183112.b.a.a.a Channel catfish MODERN SPECIES 1 soul4 (ENSIPUG00000001884) klc4 (ENSIPUG00000001836) ENSIPUG00000001808 tle2a (ENSIPUG00000001748) ENSIPUG00000001716 ENSIPUG00000001703 tle5 (ENSIPUG00000001688) gna11a (ENSIPUG00000001673) gna15.4 (ENSIPUG00000001668) C2CD4C (ENSIPUG00000001665) ap3d1 (ENSIPUG00000001409) hdgfl2 (ENSIPUG00000001382) UBXN6 (ENSIPUG00000001356) chaf1a (ENSIPUG00000001333) scamp4 (ENSIPUG00000001316) pias4 (ENSIPUG00000001271) ##22 map2k2a (ENSIPUG00000001241) ENSIPUG00000001238 tcf3b (ENSIPUG00000001114) MBD3 (ENSIPUG00000001096) mbd3b (ENSIPUG00000001063) unc13a (ENSIPUG00000001021) hmg20b (ENSIPUG00000000999) btbd2a (ENSIPUG00000000969) ENSIPUG00000000950 creb3l3a (ENSIPUG00000000934) rxfp3.2b (ENSIPUG00000000930) celf5 (ENSIPUG00000000913) rgmd 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ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.b.a.b.f ENSGT00940000162569.b.k.a ENSGT00940000165296 ENSGT00940000161259.B.a ENSGT00940000164811.a.a ENSGT00550000075067 ENSGT00940000153942.a.f ENSGT00940000157273 ENSGT00440000034888 ENSGT00940000166572 ENSGT01030000234539.a.a.a.f ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.a ENSGT00940000166752 ENSGT00940000157036.e.a ENSGT01100000264042 ENSGT00950000183005.b.b ENSGT00940000155402.a.a ENSGT00940000154929.B Red-bellied piranha MODERN SPECIES 82 plpp2b (ENSPNAG00000018445) tle2a (ENSPNAG00000018400) ENSPNAG00000018379 tle5 (ENSPNAG00000018350) gna11a (ENSPNAG00000018340) gna15.4 (ENSPNAG00000018305) ENSPNAG00000018296 C2CD4C (ENSPNAG00000018287) cdc34a (ENSPNAG00000018281) ap3d1 (ENSPNAG00000003512) hdgfl2 (ENSPNAG00000017800) ubxn6 (ENSPNAG00000017694) chaf1a (ENSPNAG00000017687) scamp4 (ENSPNAG00000017680) pias4a (ENSPNAG00000017645) ##22 map2k2a (ENSPNAG00000017601) ENSPNAG00000017546 tcf3b (ENSPNAG00000017522) ENSPNAG00000017417 ENSPNAG00000017398 mbd3b 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midn (ENSCARG00000033931) cirbpb (ENSCARG00000033908) ENSCARG00000044991 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 321 ENSGT00390000008279.b.i ENSGT00950000183049.C.a.a.g.b ENSGT00940000156705.c ENSGT00940000155914.c.a.c.b ENSGT00390000013515.f ENSGT00390000006337.a ENSGT00990000206265 ENSGT00940000159808.c ENSGT00390000006809.b ENSGT00940000164500.b.b ENSGT00940000164108.b.a.b ENSGT00940000164108.b.b ENSGT00940000160463 ENSGT00950000183103.d.b.a.b.c ENSGT00940000166634.b ENSGT01030000234539.a.a.a.f.f ##22 ENSGT00940000153487.b.a.s.a.b ENSGT00940000166752.c ENSGT00940000157036.e.a.a.a ENSGT00390000018299 ENSGT00950000183005.b.b.b ENSGT00940000155402.a.a.c ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000161213.b ENSGT00940000161905.a.b ENSGT00940000166909 ENSGT00940000161213.a ENSGT00940000159179.h.b Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00390000008279.b.j ENSGT00950000183049.C.a.a.g.a ENSGT00940000156705.d ENSGT00940000155914.c.a.c.a ENSGT00390000013515.e ENSGT00390000006337.b ENSGT00990000206265 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DUPLICATION Platypus DUPLICATION Platypus DUPLICATION Platypus MODERN SPECIES 84 NDUFA7 (ENSOANG00000041371) ENSOANG00000044705 ENSOANG00000002981 ENSOANG00000002980 ENSOANG00000048974 ENSOANG00000014639 ELAVL1 (ENSOANG00000014244) FBN3 (ENSOANG00000006384) ENSOANG00000012135 ENSOANG00000050796 ADAMTS18 (ENSOANG00000000765) ENSOANG00000044665 ##22 ENSOANG00000029789 ##22 ENSOANG00000036397 ##22 ENSOANG00000034044 ##22 ENSOANG00000049686 ##22 ENSOANG00000021183 ##22 ENSOANG00000031495 ##22 CDH8 (ENSOANG00000004496) ENSOANG00000031988 ##22 ENSOANG00000030315 ##22 CDH11 (ENSOANG00000045203) CDH5 (ENSOANG00000021655) ENSOANG00000047853 ENSOANG00000038283 ENSOANG00000020353 ENSOANG00000035981 CMTM3 (ENSOANG00000036392) CMTM4 (ENSOANG00000036276) DYNC1LI2 (ENSOANG00000036166) ENSOANG00000030082 Platypus MODERN SPECIES 84 ENSOANG00000030082 DYNC1LI2 (ENSOANG00000036166) CMTM4 (ENSOANG00000036276) CMTM3 (ENSOANG00000036392) ENSOANG00000035981 ENSOANG00000020353 ENSOANG00000038283 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