Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000155337 ENSGT00950000183050.b.b.a ENSGT00390000000583 #19 ENSGT00940000153464.B #20 ENSGT00530000063410.a #21 ENSGT00390000016551 #22 ENSGT00940000157597 ENSGT00940000155345 ENSGT00390000012029 ENSGT00550000074956 ENSGT00940000157824 ENSGT00940000158659 ENSGT00390000008178 ENSGT00390000007529 ENSGT00940000158732 ENSGT00940000156467 ENSGT00940000156983.a.a ENSGT00390000005537 ENSGT00940000158042 ENSGT00940000157361 ENSGT00940000157837 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000009597 ENSGT00940000156327 ENSGT00940000156841 ENSGT00940000154556 ENSGT00940000154958 ENSGT00940000155078.a.b.a.b ENSGT00810000125473.A ENSGT00940000157081 ENSGT00530000063867.b ENSGT00940000154186.a ENSGT00940000155337 ENSGT00950000183050.b.b.a ENSGT00390000000583 #19 ENSGT00940000153464.B #20 ENSGT00530000063410.a #21 ENSGT00390000016551 #22 ENSGT00940000161234 ENSGT00940000157597 ENSGT00940000155345 ENSGT00390000012029 ENSGT00550000074956 ENSGT00940000157824 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ENSGT00390000008178 ENSGT00390000016883 ENSGT00390000007529 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 47 ENSUPAG00010010722 SPRED2 (ENSUPAG00010010724) ENSUPAG00010010742 ACTR2 (ENSUPAG00010010750) RAB1A (ENSUPAG00010010773) CEP68 (ENSUPAG00010010822) SLC1A4 (ENSUPAG00010010829) ENSUPAG00010010837 SERTAD2 (ENSUPAG00010010839) AFTPH (ENSUPAG00010010843) LGALSL (ENSUPAG00010010929) PELI1 (ENSUPAG00010010945) VPS54 (ENSUPAG00010010962) #19 UGP2 (ENSUPAG00010011000) #20 MDH1 (ENSUPAG00010011052) #21 WDPCP (ENSUPAG00010011061) #22 OTX1 (ENSUPAG00010011094) EHBP1 (ENSUPAG00010011097) TMEM17 (ENSUPAG00010011243) B3GNT2 (ENSUPAG00010011255) ENSUPAG00010011263 CCT4 (ENSUPAG00010011275) FAM161A (ENSUPAG00010011296) ENSUPAG00010011301 XPO1 (ENSUPAG00010011307) USP34 (ENSUPAG00010011360) ENSUPAG00010011445 C2orf74 (ENSUPAG00010011464) SANBR (ENSUPAG00010011475) PEX13 (ENSUPAG00010011557) PUS10 (ENSUPAG00010011569) Squirrel MODERN SPECIES 91 ENSSTOG00000024155 SPRED2 (ENSSTOG00000022318) ACTR2 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WDPCP (ENSPVAG00000005192) #22 OTX1 (ENSPVAG00000005191) EHBP1 (ENSPVAG00000005184) Equus ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597 ENSGT00940000156327 ENSGT00940000156841 ENSGT00940000154556 ENSGT00940000154958 ENSGT00810000125473.A ENSGT00940000157081 ENSGT00530000063867.b ENSGT00940000154186.a ENSGT00940000155337 ENSGT00950000183050.b.b.a ENSGT00390000000583 #19 ENSGT00940000153464.B #20 ENSGT00530000063410.a #21 ENSGT00390000016551 #22 ENSGT00940000161234 ENSGT00940000157597 ENSGT00940000153899.b.b ENSGT00940000155345 ENSGT00390000012029 ENSGT00550000074956 ENSGT00940000157824 ENSGT00940000153408.B ENSGT00940000158659 ENSGT00940000157344 ENSGT00390000004911 ENSGT00390000008178 ENSGT01090000263393 ENSGT01030000236025 ENSGT00390000007529 Donkey MODERN SPECIES 26 ETAA1 (ENSEASG00005007305) MEIS1 (ENSEASG00005007304) SPRED2 (ENSEASG00005027956) ACTR2 (ENSEASG00005007299) RAB1A (ENSEASG00005034669) CEP68 (ENSEASG00005007297) SLC1A4 (ENSEASG00005007296) 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OTOR (ENSECRG00000018250) SNRPB2 (ENSECRG00000018213) KIF16B (ENSECRG00000018085) flrt3 (ENSECRG00000018051) ndufaf5 (ENSECRG00000018020) esf1 (ENSECRG00000017987) Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000156841 ENSGT00940000154556 ENSGT00940000154958 ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000155078.a.b.a.b ENSGT00810000125473.A ENSGT00940000157081 ENSGT00530000063867.b ENSGT00940000154186.a ENSGT00940000155337 ENSGT00940000166587 ENSGT00950000183050.b.b.b.b ENSGT00390000000583 #19 ENSGT00940000153464.B #20 ENSGT00530000063410.a #21 ENSGT00390000016551 #22 ENSGT00940000161234 ENSGT00940000157597 ENSGT00940000155345 ENSGT00390000012029 ENSGT00550000074956 ENSGT00940000157824 ENSGT00940000153408.B ENSGT00940000158659 ENSGT00940000163878 ENSGT00390000008178 ENSGT00390000016883 ENSGT00390000007529 ENSGT00940000158732 ENSGT00940000156467 ENSGT00940000156983.a.a Spotted gar MODERN SPECIES 654 meis1b (ENSLOCG00000016026) spred2b (ENSLOCG00000016028) actr2a (ENSLOCG00000016032) zgc:153169 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#21 ENSGT00390000016551 #22 ENSGT00940000161234 ENSGT00940000157597 ENSGT00940000155345.q ENSGT00940000157824.i.b Turbot MODERN SPECIES 6 ENSSMAG00000005156 ENSSMAG00000005228 ENSSMAG00000006032 ENSSMAG00000006082 ENSSMAG00000006131 ENSSMAG00000006166 si:ch1073-126c3.2 (ENSSMAG00000006174) ENSSMAG00000006181 ENSSMAG00000026344 ENSSMAG00000006235 MDH1 (ENSSMAG00000006275) #21 ENSSMAG00000006305 #20 ENSSMAG00000006334 ENSSMAG00000006366 LGALSL (ENSSMAG00000026617) WDPCP (ENSSMAG00000006459) #22 otx1 (ENSSMAG00000034338) EHBP1 (ENSSMAG00000006498) b3gnt2b (ENSSMAG00000006538) ENSSMAG00000032801 ENSSMAG00000008173 ENSSMAG00000008104 ENSSMAG00000033224 ENSSMAG00000022976 ENSSMAG00000007832 ENSSMAG00000007765 ENSSMAG00000028253 ENSSMAG00000023273 ENSSMAG00000007740 ENSSMAG00000007690 gins1 (ENSSMAG00000007654) Tongue sole MODERN SPECIES 3 ldb3a (ENSCSEG00000001614) bmpr1aa (ENSCSEG00000001608) rps27a (ENSCSEG00000001603) ENSCSEG00000001598 rtn4a (ENSCSEG00000001594) lhb (ENSCSEG00000001582) 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ENSGT00390000017697.b ENSGT00940000167313 ENSGT00390000004153.d ENSGT00940000162528 ENSGT00940000165226 ENSGT00940000165928 ENSGT00950000182919.C ENSGT00940000158988.a.b ENSGT00940000161503.b ENSGT00390000001859.f Tetraodon MODERN SPECIES 9 ppp3r1a (ENSTNIG00000009824) pno1 (ENSTNIG00000009825) dnaaf10 (ENSTNIG00000009826) c1d (ENSTNIG00000009827) meis1b (ENSTNIG00000009828) SPRED2 (ENSTNIG00000009829) actr2a (ENSTNIG00000009830) ENSTNIG00000009831 lgalslb (ENSTNIG00000009832) ENSTNIG00000009833 peli1b (ENSTNIG00000009834) ugp2b (ENSTNIG00000009837) #20 peli1b (ENSTNIG00000009836) ugp2b (ENSTNIG00000009835) #20 MDH1 (ENSTNIG00000009838) #21 WDPCP (ENSTNIG00000009839) #22 otx1 (ENSTNIG00000009840) EHBP1 (ENSTNIG00000009841) ENSTNIG00000009842 b3gnt2b (ENSTNIG00000009843) ciao2b (ENSTNIG00000009844) ENSTNIG00000009845 ENSTNIG00000009846 mtx2 (ENSTNIG00000009847) ENSTNIG00000001778 ENSTNIG00000001779 ENSTNIG00000001782 chrna1 (ENSTNIG00000009848) cdh11 (ENSTNIG00000009849) MCM8 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ENSSAUG00010004671 ENSSAUG00010004672 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a.h ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000177700 ENSGT01100000263533.b.a.a.a ENSGT01030000235205 ENSGT00940000155337.ab ENSGT00940000166587 ENSGT00950000183050.b.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000153464.B.z.b #20 ENSGT00530000063410.a.q.a #21 ENSGT00390000016551 #22 ENSGT00940000161234 ENSGT00940000157597 ENSGT00940000155345.q ENSGT00940000157824.i.b ENSGT00940000160228.i.a.a ENSGT00390000017697.b ENSGT00910000144296 ENSGT00390000004153.d ENSGT00940000162528 ENSGT00940000165226 ENSGT00940000165928 ENSGT00950000182919.C ENSGT00940000158988.a.b ENSGT00940000161503.b ENSGT00390000001859.f Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.ab ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a.h ENSGT00940000154556.a.b ENSGT01030000234576.D.a.a.b.a.a.a.a.b ENSGT00940000155337.ab ENSGT00940000166587 ENSGT00950000183050.b.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000153464.B.z.b #20 ENSGT00530000063410.a.q.a #21 ENSGT00390000016551 #22 ENSGT00940000161234 ENSGT00940000157597 ENSGT00940000155345.q ENSGT00940000177342.a ENSGT00940000160228.i.a.a ENSGT00390000017697.b ENSGT00910000144296 ENSGT00390000004153.d ENSGT00940000162528 ENSGT00940000165226 ENSGT00940000165928 ENSGT00950000182919.C ENSGT00940000158988.a.b ENSGT00390000001859.f ENSGT00940000156851.d Lumpfish MODERN SPECIES 6 pno1 (ENSCLMG00005009452) dnaaf10 (ENSCLMG00005009463) c1d (ENSCLMG00005009465) ENSCLMG00005009466 ENSCLMG00005009467 SPRED2 (ENSCLMG00005009468) ACTR2 (ENSCLMG00005009470) ENSCLMG00005009540 ENSCLMG00005009542 lgalslb (ENSCLMG00005009545) ENSCLMG00005009551 peli1b (ENSCLMG00005009602) ENSCLMG00005009603 ugp2b (ENSCLMG00005009607) #20 MDH1 (ENSCLMG00005009623) #21 ENSCLMG00005009634 #22 otx1 (ENSCLMG00005009635) EHBP1 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ENSGT00940000158988.a.b ENSGT00940000161503.b ENSGT00390000001859.f Channel bull blenny MODERN SPECIES 6 pno1 (ENSCGOG00000014929) dnaaf10 (ENSCGOG00000014955) c1d (ENSCGOG00000014962) meis1b (ENSCGOG00000014989) SPRED2 (ENSCGOG00000017236) ACTR2 (ENSCGOG00000017247) ENSCGOG00000017511 ENSCGOG00000017515 ENSCGOG00000017517 ENSCGOG00000017519 lgalslb (ENSCGOG00000017523) ENSCGOG00000017525 peli1b (ENSCGOG00000017558) ENSCGOG00000017565 MDH1 (ENSCGOG00000017586) #21 WDPCP (ENSCGOG00000018045) #22 otx1 (ENSCGOG00000018063) EHBP1 (ENSCGOG00000018066) b3gnt2b (ENSCGOG00000018067) ENSCGOG00000018070 ENSCGOG00000018075 ENSCGOG00000018126 ciao2b (ENSCGOG00000018127) ENSCGOG00000018133 GPR155 (ENSCGOG00000018145) tmem41ab (ENSCGOG00000018577) ENSCGOG00000018578 cdh5 (ENSCGOG00000018579) mtx2 (ENSCGOG00000018582) ENSCGOG00000018583 ENSCGOG00000018584 Pike perch MODERN SPECIES 30 c1d (ENSSLUG00000008045) ENSSLUG00000008032 meis1b (ENSSLUG00000007585) SPRED2 (ENSSLUG00000007558) ACTR2 (ENSSLUG00000007306) ENSSLUG00000007287 ENSSLUG00000007277 ENSSLUG00000007269 ENSSLUG00000007265 ENSSLUG00000007259 lgalslb (ENSSLUG00000007241) ENSSLUG00000007184 peli1b (ENSSLUG00000007153) ugp2b (ENSSLUG00000005472) #20 mdh1aa (ENSSLUG00000018360) #21 WDPCP (ENSSLUG00000018353) #22 otx1 (ENSSLUG00000018349) EHBP1 (ENSSLUG00000018256) b3gnt2b (ENSSLUG00000018228) ENSSLUG00000016721 ciao2b (ENSSLUG00000016626) ENSSLUG00000016623 ENSSLUG00000016618 ENSSLUG00000016614 GPR155 (ENSSLUG00000016573) tmem41ab (ENSSLUG00000016558) ENSSLUG00000016553 cdh5 (ENSSLUG00000016548) mtx2 (ENSSLUG00000016529) ENSSLUG00000016498 ENSSLUG00000016476 Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 341 ENSLBEG00000005960 #22 otx1 (ENSLBEG00000005993) EHBP1 (ENSLBEG00000006024) b3gnt2b (ENSLBEG00000006120) ENSLBEG00000006139 ENSLBEG00000006157 ciao2b (ENSLBEG00000006191) ENSLBEG00000006224 ENSLBEG00000006252 GPR155 (ENSLBEG00000006296) tmem41ab (ENSLBEG00000006364) ENSLBEG00000006385 cdh5 (ENSLBEG00000006406) Ballan wrasse MODERN SPECIES 1662 ENSLBEG00000012214 #22 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000177700 ENSGT01100000263533.b.a.a.a ENSGT00940000155337.ab ENSGT00940000166587 ENSGT00950000183050.b.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000153464.B.z.b #20 ENSGT00530000063410.a.q.a #21 ENSGT00390000016551 #22 ENSGT00940000161234 ENSGT00940000157597 ENSGT00940000155345.q ENSGT00940000157824.i.b ENSGT00940000160228.i.a.a ENSGT00390000017697.b ENSGT00910000144296 ENSGT00940000167313 ENSGT00390000004153.d ENSGT00940000162528 ENSGT00940000165226 ENSGT00940000165928 ENSGT00950000182919.C ENSGT00940000158988.a.b ENSGT00940000161503.b Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000177700 ENSGT00940000155337.ab ENSGT00940000166587 ENSGT00950000183050.b.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000153464.B.z.b #20 ENSGT00530000063410.a.q.a #21 ENSGT00390000016551 #22 ENSGT00940000161234 ENSGT00940000157597 ENSGT00940000155345.q ENSGT00940000157824.i.b ENSGT00940000160228.i.a.a ENSGT00390000017697.b ENSGT00910000144296 ENSGT00940000167313 ENSGT00390000004153.d ENSGT00940000162528 ENSGT00940000165226 ENSGT00940000165928 ENSGT00950000182919.C ENSGT00940000158988.a.b ENSGT00940000161503.b Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000177700 ENSGT00940000155337.ab ENSGT00940000166587 ENSGT00950000183050.b.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000153464.B.z.b #20 ENSGT00530000063410.a.q.a #21 ENSGT00390000016551 #22 ENSGT00940000161234 ENSGT00940000157597 ENSGT00940000155345.q ENSGT00940000157824.i.b ENSGT00940000160228.i.a.a ENSGT00390000017697.b ENSGT00910000144296 ENSGT00940000167313 ENSGT00390000004153.d ENSGT00940000162528 ENSGT00940000165226 ENSGT00940000165928 ENSGT00950000182919.C ENSGT00940000158988.a.b ENSGT00940000161503.b Midas cichlid MODERN SPECIES 230 cnrip1b (ENSACIG00000012353) ppp3r1a (ENSACIG00000012385) pno1 (ENSACIG00000012543) dnaaf10 (ENSACIG00000012570) c1d (ENSACIG00000012684) ENSACIG00000012728 meis1b (ENSACIG00000012745) SPRED2 (ENSACIG00000012773) actr2a (ENSACIG00000012799) ENSACIG00000012820 lgalslb (ENSACIG00000012830) ENSACIG00000012854 peli1b (ENSACIG00000012890) ugp2b (ENSACIG00000012903) #20 MDH1 (ENSACIG00000012929) #21 WDPCP (ENSACIG00000012952) #22 otx1 (ENSACIG00000012995) EHBP1 (ENSACIG00000013008) b3gnt2b (ENSACIG00000013061) ENSACIG00000013066 ENSACIG00000013085 ENSACIG00000013207 ciao2b (ENSACIG00000013440) ENSACIG00000013460 GPR155 (ENSACIG00000013555) tmem41ab (ENSACIG00000013588) ENSACIG00000013609 ENSACIG00000013670 ENSACIG00000013685 mtx2 (ENSACIG00000013757) ENSACIG00000013877 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000177700 ENSGT00940000155337.ab ENSGT00940000166587 ENSGT00950000183050.b.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000153464.B.z.b #20 ENSGT00530000063410.a.q.a #21 ENSGT00390000016551 #22 ENSGT00940000161234 ENSGT00940000157597 ENSGT00940000155345.q ENSGT00940000157824.i.b ENSGT00940000160228.i.a.a ENSGT00390000017697.b ENSGT00910000144296 ENSGT00940000167313 ENSGT00390000004153.d ENSGT00940000162528 ENSGT00940000165226 ENSGT00940000165928 ENSGT00950000182919.C ENSGT00940000158988.a.b ENSGT00940000161503.b Nile tilapia MODERN SPECIES 4 actr2a (ENSONIG00000001245) ENSONIG00000039063 ENSONIG00000030341 lgalslb (ENSONIG00000001248) ENSONIG00000008025 ENSONIG00000032553 ENSONIG00000039754 ENSONIG00000004918 ENSONIG00000040742 ENSONIG00000039915 ENSONIG00000028845 ENSONIG00000041039 peli1b (ENSONIG00000027571) ugp2b (ENSONIG00000001254) #20 mdh1aa (ENSONIG00000001264) #21 WDPCP (ENSONIG00000001271) #22 otx1 (ENSONIG00000035027) EHBP1 (ENSONIG00000001281) b3gnt2b (ENSONIG00000020730) ENSONIG00000034429 ENSONIG00000035344 ENSONIG00000001289 ciao2b (ENSONIG00000001310) wipf1 (ENSONIG00000001313) GPR155 (ENSONIG00000001317) tmem41ab (ENSONIG00000001320) ENSONIG00000026582 cdh5 (ENSONIG00000001324) mtx2 (ENSONIG00000001332) ENSONIG00000039782 ENSONIG00000036413 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000177700 ENSGT00940000155337.ab ENSGT00940000166587 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ENSGT00940000158988.a.b ENSGT00940000161503.b Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 318 ppp3r1a (ENSHBUG00000000555) pno1 (ENSHBUG00000018572) dnaaf10 (ENSHBUG00000018541) c1d (ENSHBUG00000018531) ENSHBUG00000018526 meis1b (ENSHBUG00000018510) SPRED2 (ENSHBUG00000018425) actr2a (ENSHBUG00000018399) ENSHBUG00000018375 ENSHBUG00000018356 lgalslb (ENSHBUG00000018349) ENSHBUG00000018319 peli1b (ENSHBUG00000018272) ugp2b (ENSHBUG00000018209) #20 MDH1 (ENSHBUG00000001045) #21 WDPCP (ENSHBUG00000018121) #22 otx1 (ENSHBUG00000018104) EHBP1 (ENSHBUG00000018080) b3gnt2b (ENSHBUG00000018017) ENSHBUG00000018008 ENSHBUG00000017992 ciao2b (ENSHBUG00000017958) ENSHBUG00000017937 ENSHBUG00000017927 GPR155 (ENSHBUG00000017909) tmem41ab (ENSHBUG00000017882) ENSHBUG00000017845 cdh5 (ENSHBUG00000017838) mtx2 (ENSHBUG00000017811) ENSHBUG00000017792 ENSHBUG00000017648 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000155337.ab ENSGT00940000166587 ENSGT00950000183050.b.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000153464.B.z.b #20 ENSGT00530000063410.a.q.a #21 ENSGT00390000016551 #22 ENSGT00940000161234 ENSGT00940000157597 ENSGT00940000155345.q ENSGT00940000157824.i.b ENSGT00940000160228.i.a.a ENSGT00390000017697.b ENSGT00910000144296 ENSGT00390000004153.d ENSGT00940000162528 ENSGT00940000165226 ENSGT00940000165928 ENSGT00950000182919.C ENSGT00940000158988.a.b ENSGT00940000161503.b ENSGT00390000001859.f P. nyererei MODERN SPECIES 349 ppp3r1a (ENSPNYG00000008986) pno1 (ENSPNYG00000008942) dnaaf10 (ENSPNYG00000008828) c1d (ENSPNYG00000008789) ENSPNYG00000008771 ENSPNYG00000008745 meis1b (ENSPNYG00000008708) SPRED2 (ENSPNYG00000008682) actr2a (ENSPNYG00000008624) ENSPNYG00000008600 lgalslb (ENSPNYG00000008578) ENSPNYG00000008530 peli1b (ENSPNYG00000008495) ugp2b (ENSPNYG00000008441) #20 MDH1 (ENSPNYG00000008390) #21 ENSPNYG00000008363 #22 otx1 (ENSPNYG00000008345) EHBP1 (ENSPNYG00000008205) b3gnt2b (ENSPNYG00000008156) ENSPNYG00000007421 ciao2b (ENSPNYG00000007207) wipf1a (ENSPNYG00000007173) GPR155 (ENSPNYG00000007158) tmem41ab (ENSPNYG00000007133) ENSPNYG00000007119 cdh5 (ENSPNYG00000007107) mtx2 (ENSPNYG00000007071) ENSPNYG00000007006 ENSPNYG00000006956 ENSPNYG00000006941 chrna1 (ENSPNYG00000006909) Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000155337.ab ENSGT00940000166587 ENSGT00950000183050.b.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000153464.B.z.b #20 ENSGT00530000063410.a.q.a #21 ENSGT00390000016551 #22 ENSGT00940000161234 ENSGT00940000157597 ENSGT00940000155345.q ENSGT00940000157824.i.b ENSGT00940000160228.i.a.a ENSGT00390000017697.b ENSGT00910000144296 ENSGT00390000004153.d ENSGT00940000162528 ENSGT00940000165226 ENSGT00940000165928 ENSGT00950000182919.C ENSGT00940000158988.a.b ENSGT00940000161503.b ENSGT00390000001859.f Zebra mbuna MODERN SPECIES 1095 cnrip1b (ENSMZEG00005027347) ppp3r1a (ENSMZEG00005027346) pno1 (ENSMZEG00005027345) dnaaf10 (ENSMZEG00005027344) c1d (ENSMZEG00005027343) ENSMZEG00005027342 meis1b (ENSMZEG00005027341) SPRED2 (ENSMZEG00005027339) actr2a (ENSMZEG00005027338) ENSMZEG00005027337 lgalslb (ENSMZEG00005027336) ENSMZEG00005027335 peli1b (ENSMZEG00005027334) ugp2b (ENSMZEG00005027333) #20 MDH1 (ENSMZEG00005027332) #21 WDPCP (ENSMZEG00005027331) #22 otx1 (ENSMZEG00005027330) ENSMZEG00005027329 EHBP1 (ENSMZEG00005027328) b3gnt2b (ENSMZEG00005027327) ENSMZEG00005027326 ENSMZEG00005027325 ciao2b (ENSMZEG00005027324) wipf1a (ENSMZEG00005027323) GPR155 (ENSMZEG00005027322) tmem41ab (ENSMZEG00005027321) ENSMZEG00005027320 ENSMZEG00005027319 cdh5 (ENSMZEG00005027318) mtx2 (ENSMZEG00005027317) ENSMZEG00005027316 Eastern happy MODERN SPECIES 4 cnrip1b (ENSACLG00000026147) ppp3r1a (ENSACLG00000026154) pno1 (ENSACLG00000026167) dnaaf10 (ENSACLG00000026190) c1d (ENSACLG00000026206) ENSACLG00000026219 meis1b (ENSACLG00000026249) SPRED2 (ENSACLG00000026311) actr2a (ENSACLG00000026334) ENSACLG00000026357 lgalslb (ENSACLG00000026386) ENSACLG00000026411 peli1b (ENSACLG00000026494) ugp2b (ENSACLG00000026535) #20 MDH1 (ENSACLG00000026557) #21 WDPCP (ENSACLG00000026647) #22 otx1 (ENSACLG00000026686) EHBP1 (ENSACLG00000026697) b3gnt2b (ENSACLG00000026781) ENSACLG00000026787 ENSACLG00000026798 ciao2b (ENSACLG00000026816) wipf1a (ENSACLG00000026823) GPR155 (ENSACLG00000026841) tmem41ab (ENSACLG00000026863) ENSACLG00000026881 ENSACLG00000026887 cdh5 (ENSACLG00000026891) mtx2 (ENSACLG00000026900) ENSACLG00000026918 ENSACLG00000026925 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 224 ENSGT00940000153464.B.z.b #20 ENSGT00530000063410.a.q.a #21 ENSGT00390000016551 #22 ENSGT00940000161234 ENSGT00940000157597 ENSGT00940000155345.q ENSGT00940000177342.a ENSGT00940000160228.i.a.a.c Bicolor damselfish DUPLICATION Bicolor damselfish MODERN SPECIES 2597 ENSSPAG00000008335 #22 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 2038 UGP2 (ENSSPAG00000005159) #20 mdh1aa (ENSSPAG00000005125) #21 WDPCP (ENSSPAG00000005091) #22 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 104 ENSGT00390000001878 ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00390000007701 ENSGT00940000165449 ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000177019 ENSGT00390000016757 ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00730000111005 ENSGT00950000182958.b.a.b.m.a.a.a ENSGT00940000153464.B.z.b #20 ENSGT00530000063410.a.q.a #21 ENSGT00390000016551 #22 ENSGT00940000161234 ENSGT00940000157597 ENSGT00940000155345.q Spiny chromis MODERN SPECIES 66 mrps5 (ENSAPOG00000006057) malb (ENSAPOG00000006001) ENSAPOG00000005898 ENSAPOG00000005883 zgc:65997 (ENSAPOG00000005863) ENSAPOG00000005837 ENSAPOG00000005801 ANAPC1 (ENSAPOG00000005760) vip (ENSAPOG00000005552) fbxo5 (ENSAPOG00000005525) MTRF1L (ENSAPOG00000005515) desi2 (ENSAPOG00000005457) ugp2b (ENSAPOG00000005410) #20 MDH1 (ENSAPOG00000005335) #21 WDPCP (ENSAPOG00000005298) #22 otx1 (ENSAPOG00000005278) EHBP1 (ENSAPOG00000005245) b3gnt2b (ENSAPOG00000005146) Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 128 ENSGT00390000001878 ENSGT00940000154987.i.b.a.a ENSGT00940000154987.i.a ENSGT00390000007701 ENSGT00940000165449 ENSGT00940000157373.l ENSGT00940000177019 ENSGT00390000016757 ENSGT00950000183154.a.b ENSGT00530000063692.b ENSGT00940000155683 ENSGT00730000111005 ENSGT00950000182958.b.a.b.m.a.a.a ENSGT00940000153464.B.z.b #20 ENSGT00530000063410.a.q.a #21 ENSGT00390000016551 #22 ENSGT00940000161234 ENSGT00940000157597 Orange clownfish MODERN SPECIES 12 ENSAPEG00000000837 nphp1 (ENSAPEG00000000781) zgc:65997 (ENSAPEG00000000758) pank1a (ENSAPEG00000000663) ENSAPEG00000000621 ENSAPEG00000000568 ENSAPEG00000000536 ANAPC1 (ENSAPEG00000000359) ENSAPEG00000000317 vip (ENSAPEG00000023817) fbxo5 (ENSAPEG00000023803) MTRF1L (ENSAPEG00000023778) desi2 (ENSAPEG00000023757) ugp2b (ENSAPEG00000023717) #20 MDH1 (ENSAPEG00000023690) #21 ENSAPEG00000023677 #22 otx1 (ENSAPEG00000023664) EHBP1 (ENSAPEG00000023607) ENSAPEG00000023573 Clown anemonefish MODERN SPECIES 758 ENSAOCG00000014815 ENSAOCG00000000997 #22 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000177700 ENSGT00940000164807.G.a.a.b ENSGT01100000263533.b.a.a.a ENSGT00940000155337.ab ENSGT00940000166587 ENSGT00950000183050.b.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000153464.B.z.b #20 ENSGT00530000063410.a.q.a #21 ENSGT00390000016551 #22 ENSGT00940000161234 ENSGT00940000157597 ENSGT00940000155345.q ENSGT00940000157824.i.b ENSGT00940000160228.i.a.a ENSGT00390000017697.b ENSGT00910000144296 ENSGT00940000167313 ENSGT00390000004153.d ENSGT00940000162528 ENSGT00940000165226 ENSGT00940000165928 ENSGT00950000182919.C ENSGT00940000158988.a.b ENSGT00940000161503.b Oryzias ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT01030000235154 ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000155337.ab ENSGT01100000263533.b.a.a.a ENSGT00940000166587 ENSGT00950000183050.b.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000153464.B.z.b #20 ENSGT00530000063410.a.q.a #21 ENSGT00390000016551 #22 ENSGT00940000161234 ENSGT00940000157597 ENSGT00940000155345.q ENSGT00940000157824.i.b ENSGT00950000183166.a.a.a.b.f ENSGT00940000157820.a.b.cb ENSGT00950000182812.C ENSGT00940000156225 ENSGT00940000154877.B ENSGT01100000263502.B.a.a.d.b.c.a ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155571.A ENSGT00940000170913 ENSGT00950000183175.A.c ENSGT00660000095541.a.a Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT01030000235154 ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000155337.ab ENSGT01100000263533.b.a.a.a ENSGT00940000166587 ENSGT00950000183050.b.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000153464.B.z.b #20 ENSGT00530000063410.a.q.a #21 ENSGT00390000016551 #22 ENSGT00940000161234 ENSGT00940000157597 ENSGT00940000155345.q ENSGT00940000157824.i.b ENSGT00950000183166.a.a.a.b.f ENSGT00940000157820.a.b.cb ENSGT00950000182812.C ENSGT00940000156225 ENSGT00940000154877.B ENSGT01100000263502.B.a.a.d.b.c.a ENSGT00440000033965 ENSGT00940000155571.A ENSGT00940000170913 ENSGT00950000183175.A.c ENSGT00660000095541.a.a Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 6 pno1 (ENSORLG00000002371) dnaaf10 (ENSORLG00000030098) c1d (ENSORLG00000021968) ENSORLG00000030003 ENSORLG00000026767 ENSORLG00000023223 meis1b (ENSORLG00000002411) SPRED2 (ENSORLG00000002435) actr2a (ENSORLG00000002451) lgalslb (ENSORLG00000028938) ENSORLG00000022965 ENSORLG00000027511 peli1b (ENSORLG00000002477) ugp2b (ENSORLG00000002512) #20 mdh1ab (ENSORLG00000002524) #21 WDPCP (ENSORLG00000029431) #22 otx1 (ENSORLG00000028142) EHBP1 (ENSORLG00000002562) b3gnt2b (ENSORLG00000002565) ENSORLG00000002570 ENSORLG00000024628 ENSORLG00000030264 rps27a (ENSORLG00000029546) ENSORLG00000028617 bmpr1aa (ENSORLG00000002596) ldb3a (ENSORLG00000002622) OPN4 (ENSORLG00000002633) prorsd1 (ENSORLG00000025145) ENSORLG00000002678 ENSORLG00000028949 sncga (ENSORLG00000002687) Chinese medaka MODERN SPECIES 794 ENSOSIG00000009435 cnrip1b (ENSOSIG00000009432) ppp3r1a (ENSOSIG00000009392) pno1 (ENSOSIG00000009390) dnaaf10 (ENSOSIG00000009388) c1d (ENSOSIG00000009385) ENSOSIG00000009381 ENSOSIG00000009379 SPRED2 (ENSOSIG00000009377) actr2a (ENSOSIG00000009372) LGALSL (ENSOSIG00000009371) ENSOSIG00000009349 peli1b (ENSOSIG00000009346) ENSOSIG00000009345 MDH1 (ENSOSIG00000009213) #21 WDPCP (ENSOSIG00000009212) #22 otx1 (ENSOSIG00000009211) EHBP1 (ENSOSIG00000009187) b3gnt2b (ENSOSIG00000009174) Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000015405 ENSGT01030000235154 ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000155337.ab ENSGT00940000166587 ENSGT00950000183050.b.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000153464.B.z.b #20 ENSGT00530000063410.a.q.a #21 ENSGT00390000016551 #22 ENSGT00940000161234 ENSGT00940000157597 ENSGT00940000155345.q ENSGT00940000157824.i.b ENSGT00940000157820.a.b.cb ENSGT00950000182812.C ENSGT00940000156225 ENSGT00940000154877.B ENSGT01100000263502.B.a.a.d.b.c.a ENSGT00440000033965 ENSGT00940000170913 ENSGT00950000183175.A.c ENSGT00660000095541.a.a ENSGT00390000013968 ENSGT00940000166409 Indian medaka MODERN SPECIES 27 ppp3r1a (ENSOMEG00000023323) pno1 (ENSOMEG00000023300) dnaaf10 (ENSOMEG00000023287) ttl (ENSOMEG00000023276) fignl1 (ENSOMEG00000023258) ikzf1 (ENSOMEG00000023255) ENSOMEG00000023245 SPRED2 (ENSOMEG00000023237) actr2a (ENSOMEG00000023221) lgalslb (ENSOMEG00000023198) ENSOMEG00000023188 ENSOMEG00000023167 peli1b (ENSOMEG00000023127) ugp2b (ENSOMEG00000023112) #20 MDH1 (ENSOMEG00000023091) #21 WDPCP (ENSOMEG00000023058) #22 otx1 (ENSOMEG00000023010) EHBP1 (ENSOMEG00000022982) b3gnt2b (ENSOMEG00000022896) ENSOMEG00000022888 ENSOMEG00000000614 rps27a (ENSOMEG00000022866) ENSOMEG00000022851 bmpr1aa (ENSOMEG00000022835) ldb3a (ENSOMEG00000022787) OPN4 (ENSOMEG00000022728) prorsd1 (ENSOMEG00000022715) ENSOMEG00000022707 ENSOMEG00000022699 SNCG (ENSOMEG00000022691) ninl (ENSOMEG00000022666) Javanese ricefish MODERN SPECIES 6 ENSOJAG00000020324 ENSOJAG00000020334 c1d (ENSOJAG00000020345) ENSOJAG00000020351 ENSOJAG00000020360 ENSOJAG00000020372 ENSOJAG00000020381 meis1b (ENSOJAG00000020400) SPRED2 (ENSOJAG00000020417) actr2a (ENSOJAG00000020442) lgalslb (ENSOJAG00000020506) ENSOJAG00000020511 peli1b (ENSOJAG00000001747) ugp2b (ENSOJAG00000001808) #20 MDH1 (ENSOJAG00000001886) #21 WDPCP (ENSOJAG00000002012) #22 ENSOJAG00000002113 ENSOJAG00000002126 otx1 (ENSOJAG00000002138) EHBP1 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ENSGT00940000158988.a.b ENSGT00940000161503.b Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000156530.c.`b.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000177700 ENSGT01100000263533.b.a.a.a.d.b ENSGT00940000155337.ab ENSGT00940000166587 ENSGT00950000183050.b.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000153464.B.z.b #20 ENSGT00530000063410.a.q.a #21 ENSGT00390000016551 #22 ENSGT00940000161234 ENSGT00940000157597 ENSGT00940000155345.q ENSGT00940000157824.i.b ENSGT00940000177342.a ENSGT00940000160228.i.a.a ENSGT00390000017697.b ENSGT00910000144296 ENSGT00390000004153.d ENSGT00940000162528 ENSGT00940000165226 ENSGT00940000165928 ENSGT00950000182919.C ENSGT00940000158988.a.b ENSGT00940000161503.b Mangrove rivulus MODERN SPECIES 3 ENSKMAG00000015037 ENSKMAG00000015052 c1d (ENSKMAG00000015077) ENSKMAG00000015108 meis1b (ENSKMAG00000015139) SPRED2 (ENSKMAG00000015205) actr2a 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ENSGT00390000004153.d ENSGT00940000162528 ENSGT00940000165226 ENSGT00940000165928 ENSGT00950000182919.C ENSGT00940000158988.a.b ENSGT00940000161503.b Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l.q ENSGT00940000156841.a.a ENSGT00940000154556.a.b ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000164807.G.a.a.b ENSGT01100000263533.b.a.a.a ENSGT00940000155337.ab ENSGT00940000166587 ENSGT00950000183050.b.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000153464.B.z.b #20 ENSGT00530000063410.a.q.a #21 ENSGT00390000016551 #22 ENSGT00940000161234 ENSGT00940000157597 ENSGT00940000155345.q ENSGT00940000160228.i.a.a ENSGT00390000017697.b ENSGT00940000157361.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.a ENSGT00940000154866.B.a ENSGT00530000068411 ENSGT00940000153566.b ENSGT01030000234610.b.a.b.b ENSGT00740000115593 ENSGT00940000155078.a.b.a.b ENSGT00810000125473.A ENSGT00390000009155 Platyfish MODERN SPECIES 14 dnaaf10 (ENSXMAG00000029168) c1d 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ENSGT00940000155080 ENSGT00940000157081 ENSGT01050000244843.d.f.b.b.b ENSGT01010000225286 ENSGT00940000155337.ab ENSGT00940000166587.b.a ENSGT00940000166587.a ENSGT00950000183050.b.b.b.a.a.a.a.e ENSGT01100000263516.a.b.b.b.b.a.a.b.b.a.a.b.b.a.b ENSGT00940000153464.B.z.b.e #20 ENSGT00530000063410.a.q.a #21 ENSGT00390000016551.g #22 ENSGT00940000161234.c ENSGT00940000157597.i Salmo DUPLICATION Salmo ANCESTRAL SPECIES 630 ENSGT00390000016551.g.a #22 ENSGT00940000157597.j Atlantic salmon MODERN SPECIES ENSSSAG00000047198 ENSSSAG00000090377 ENSSSAG00000096529 ENSSSAG00000001213 ENSSSAG00000087311 ENSSSAG00000119645 ENSSSAG00000061071 ENSSSAG00000098259 LGALSL (ENSSSAG00000083428) ENSSSAG00000103788 ENSSSAG00000001253 peli1b (ENSSSAG00000118555) ENSSSAG00000088036 ugp2b (ENSSSAG00000082064) #20 MDH1 (ENSSSAG00000052128) #21 WDPCP (ENSSSAG00000120781) #22 EHBP1 (ENSSSAG00000084388) ENSSSAG00000115891 ENSSSAG00000098224 ENSSSAG00000098410 ENSSSAG00000088767 ENSSSAG00000021967 ENSSSAG00000057531 ENSSSAG00000062472 ENSSSAG00000000159 ENSSSAG00000110873 ENSSSAG00000060340 ENSSSAG00000000164 UB2D4 (ENSSSAG00000000166) tfam (ENSSSAG00000082652) phyhiplb (ENSSSAG00000086921) River trout MODERN SPECIES 59 ENSSTUG00000020907 #22 Salmo ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D.u.a ENSGT00950000183136.b.a.a ENSGT00940000165329 ENSGT00940000155080.m ENSGT00940000157081 ENSGT01050000244843.d.f.b.b.a.a.a ENSGT00940000154186.a.q.c ENSGT00940000155337.ab.d ENSGT00940000166587.b.a ENSGT00940000166587.a ENSGT00950000183050.b.b.b.a.a.a.a.f ENSGT01100000263516.a.b.b.b.b.a.a.b.b.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000153464.B.z.b.e #20 ENSGT00530000063410.a.q.a #21 ENSGT00390000016551.g.b #22 ENSGT00940000161234.c ENSGT00940000157597.i River trout DUPLICATION River trout MODERN SPECIES 35 lmbrd1 (ENSSTUG00000020610) ADGRB3 (ENSSTUG00000020495) zgc:171579 (ENSSTUG00000020488) ENSSTUG00000020427 ENSSTUG00000020382 slc1a4 (ENSSTUG00000020308) ENSSTUG00000020208 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ENSGT00940000157597.i Rainbow trout DUPLICATION Rainbow trout MODERN SPECIES 320 ENSOMYG00000066029 #22 ENSOMYG00000070366 Rainbow trout MODERN SPECIES 15 ENSOMYG00000063026 ENSOMYG00000062764 ENSOMYG00000069645 ENSOMYG00000076738 ENSOMYG00000060292 LGALSL (ENSOMYG00000048473) ENSOMYG00000047940 ENSOMYG00000054025 ENSOMYG00000058969 ENSOMYG00000050522 ENSOMYG00000052586 ENSOMYG00000073561 ENSOMYG00000064319 ugp2b (ENSOMYG00000062041) #20 MDH1 (ENSOMYG00000068231) #21 WDPCP (ENSOMYG00000051782) #22 ENSOMYG00000066146 ENSOMYG00000067498 otx1 (ENSOMYG00000044589) Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016551.h.a.a #22 Coho salmon MODERN SPECIES 680 ENSOKIG00005040612 #22 Huchen MODERN SPECIES 7525 ENSHHUG00000004011 #22 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016551.h.a.b #22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016551.h.a.b #22 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016551.h.a.b #22 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016551.h.a.b #22 Chinook salmon MODERN SPECIES 1515 ENSOTSG00005024341 #22 Coho salmon MODERN SPECIES 33 ENSOKIG00005043468 ENSOKIG00005043503 fam135a (ENSOKIG00005043539) ENSOKIG00005043868 col9a1b (ENSOKIG00005043881) ENSOKIG00005043905 ENSOKIG00005043937 lmbrd1 (ENSOKIG00005044062) ENSOKIG00005045213 ENSOKIG00005045219 ADGRB3 (ENSOKIG00005045271) ENSOKIG00005045378 ENSOKIG00005045414 zgc:171579 (ENSOKIG00005045417) ENSOKIG00005045420 ENSOKIG00005045428 #22 ENSOKIG00005045435 ENSOKIG00005045441 SLC1A4 (ENSOKIG00005045486) ENSOKIG00005045511 ENSOKIG00005045522 ENSOKIG00005045528 LGALSL (ENSOKIG00005045534) ENSOKIG00005045554 ENSOKIG00005045645 ENSOKIG00005045719 ENSOKIG00005045728 ENSOKIG00005045806 UGP2 (ENSOKIG00005045840) #20 MDH1 (ENSOKIG00005045989) #21 ENSOKIG00005046266 Huchen MODERN SPECIES 9066 ENSHHUG00000003825 #22 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016551.h.b #22 Huchen MODERN SPECIES 8279 ENSHHUG00000005474 #22 Northern pike MODERN SPECIES 4 ENSELUG00000013239 ENSELUG00000029673 ENSELUG00000034060 ENSELUG00000033665 ENSELUG00000034614 lgalslb (ENSELUG00000013610) ENSELUG00000013717 peli1b (ENSELUG00000013744) ENSELUG00000013758 ENSELUG00000029570 ugp2b (ENSELUG00000013792) #20 ENSELUG00000032007 MDH1 (ENSELUG00000013840) #21 ENSELUG00000030195 otx1 (ENSELUG00000013906) WDPCP (ENSELUG00000013884) #22 EHBP1 (ENSELUG00000014117) b3gnt2b (ENSELUG00000014198) XPO1 (ENSELUG00000014306) SANBR (ENSELUG00000014318) pex13 (ENSELUG00000014334) rel (ENSELUG00000014377) ENSELUG00000001419 ENSELUG00000014470 papolg (ENSELUG00000014497) ACTR2 (ENSELUG00000014576) SPRED2 (ENSELUG00000014634) ENSELUG00000031773 ENSELUG00000014739 ENSELUG00000014766 ENSELUG00000014800 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.b ENSGT00940000154556.c.b ENSGT00810000125473.A ENSGT00940000157081 ENSGT00530000063867.b.b ENSGT00940000155337.ab ENSGT00940000177700 ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000166587 ENSGT00950000183050.b.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000153464.B.z.b #20 ENSGT00530000063410.a.r #21 ENSGT00390000016551 #22 ENSGT00940000161234 ENSGT00940000157597 ENSGT00940000155345.q ENSGT00940000157824.i.b ENSGT00940000153408.B.t ENSGT00390000008178 ENSGT00390000016883 ENSGT00940000158732 ENSGT00940000156467 ENSGT00940000156983.a.a.r ENSGT00390000005537 ENSGT00940000158042 ENSGT00940000157361.a ENSGT00940000160412.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.a Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000183091.A.b.n ENSGT00390000015405 ENSGT00390000009597.c ENSGT00940000156327.l ENSGT00940000156841.b ENSGT00940000154556.c.b ENSGT00810000125473.A ENSGT00940000157081 ENSGT00530000063867.b.b ENSGT00940000155337.ab ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000166587 ENSGT00950000183050.b.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000153464.B.z.b #20 ENSGT00530000063410.a.r #21 ENSGT00390000016551 #22 ENSGT00940000161234 ENSGT00940000157597 ENSGT00940000155345.q ENSGT00940000157824.i.b ENSGT00940000153408.B.t ENSGT00390000008178 ENSGT00390000016883 ENSGT00940000158732 ENSGT00940000156467 ENSGT00940000156983.a.a.r ENSGT00390000005537 ENSGT00940000158042 ENSGT00940000160412.b ENSGT01030000234532.A.a.a.b.j.a ENSGT00940000166683.a.a Atlantic herring MODERN SPECIES 4 spred2b (ENSCHAG00000018338) pno1 (ENSCHAG00000018350) dnaaf10 (ENSCHAG00000018360) c1d (ENSCHAG00000018513) slc1a4 (ENSCHAG00000018548) sertad2b (ENSCHAG00000018647) lgalslb (ENSCHAG00000018658) ENSCHAG00000018678 ENSCHAG00000018667 ENSCHAG00000018691 peli1b (ENSCHAG00000018837) ugp2b (ENSCHAG00000018928) #20 ENSCHAG00000019202 ENSCHAG00000000462 mdh1ab (ENSCHAG00000000940) #21 WDPCP (ENSCHAG00000001434) #22 otx1 (ENSCHAG00000001784) EHBP1 (ENSCHAG00000001812) b3gnt2b (ENSCHAG00000002172) b3gnt2b (ENSCHAG00000002175) ENSCHAG00000002206 XPO1 (ENSCHAG00000002294) SANBR (ENSCHAG00000003275) pex13 (ENSCHAG00000003593) rel (ENSCHAG00000003607) papolg (ENSCHAG00000003904) bcl11aa (ENSCHAG00000009178) fancl (ENSCHAG00000009225) vrk2 (ENSCHAG00000009283) ccdc85a (ENSCHAG00000009349) soul2 (ENSCHAG00000009362) Denticle herring MODERN SPECIES 18 spred2b (ENSDCDG00000032821) actr2b (ENSDCDG00000032825) zgc:153169 (ENSDCDG00000032906) rab1ab (ENSDCDG00000032925) cep68 (ENSDCDG00000032975) slc1a4 (ENSDCDG00000013999) sertad2b (ENSDCDG00000014115) lgalslb (ENSDCDG00000014126) ENSDCDG00000014146 ENSDCDG00000014166 ENSDCDG00000014232 peli1b (ENSDCDG00000014302) ugp2b (ENSDCDG00000014366) #20 ENSDCDG00000015051 mdh1ab (ENSDCDG00000015055) #21 WDPCP (ENSDCDG00000015075) #22 otx1 (ENSDCDG00000015687) EHBP1 (ENSDCDG00000015700) b3gnt2b (ENSDCDG00000015811) ENSDCDG00000015816 XPO1 (ENSDCDG00000015851) SANBR (ENSDCDG00000015943) pex13 (ENSDCDG00000016023) rel (ENSDCDG00000016031) papolg (ENSDCDG00000016269) bcl11aa (ENSDCDG00000022234) ENSDCDG00000022240 ENSDCDG00000022243 fancl (ENSDCDG00000022247) vrk2 (ENSDCDG00000022282) ccdc85a (ENSDCDG00000022284) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 229 ENSGT00940000166587 ENSGT00950000183050.b.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000153464.B.z.b #20 ENSGT00530000063410.a.q.a #21 ENSGT00390000016551 #22 ENSGT00940000161234 ENSGT00940000157597 ENSGT00940000155345.q ENSGT00940000157824.i.b ENSGT00940000153408.B.t.d.a ENSGT00390000008178 ENSGT00390000016883 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000157593 ENSGT00700000104522 ENSGT01030000234606.a.a.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00950000182805.a.b Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00940000156416.d ENSGT00390000014563.a.a.b ENSGT00940000156276 ENSGT00940000155109.a.a ENSGT00940000160793 ENSGT01100000263540.A.a ENSGT00390000018613.a ENSGT00950000183148.b.b ENSGT00940000177700 ENSGT00940000154186.a.q.g ENSGT00940000174754 ENSGT00940000166587 ENSGT00950000183050.b.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000153464.B.z.b #20 ENSGT00530000063410.a.q.a #21 ENSGT00390000016551 #22 ENSGT00940000161234 ENSGT00940000157597 ENSGT00940000155345.q ENSGT00940000157824.i.b ENSGT00940000153408.B.t.d.a ENSGT00390000008178 ENSGT00390000016883 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000157593 ENSGT00700000104522 ENSGT01030000234606.a.a.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00950000182805.a.b Channel catfish MODERN SPECIES 28 phyhipla (ENSIPUG00000013956) ENSIPUG00000013947 ENSIPUG00000013942 ube2d1a (ENSIPUG00000013898) ENSIPUG00000013889 vsx1 (ENSIPUG00000013858) ENTPD6 (ENSIPUG00000013815) ENSIPUG00000013756 pygb (ENSIPUG00000013662) ENSIPUG00000013655 ENSIPUG00000013628 abcG20 (ENSIPUG00000013458) peli1b (ENSIPUG00000013383) UGP2 (ENSIPUG00000013211) #20 MDH1 (ENSIPUG00000013164) #21 WDPCP (ENSIPUG00000013126) #22 otx1 (ENSIPUG00000013113) EHBP1 (ENSIPUG00000013044) b3gnt2b (ENSIPUG00000013024) Xpo1 (ENSIPUG00000012891) kiaa1841 (ENSIPUG00000012801) pex13 (ENSIPUG00000012783) pdzd8 (ENSIPUG00000012766) slc18a2 (ENSIPUG00000012691) kcnk18 (ENSIPUG00000012673) ENSIPUG00000012647 ENSIPUG00000012617 ENSIPUG00000012593 vax1 (ENSIPUG00000012584) ATP6V1B2 (ENSIPUG00000012539) shtn1 (ENSIPUG00000012494) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000156416.d ENSGT00390000014563.a.a.b ENSGT00940000156276 ENSGT00940000155109.a.a ENSGT00940000160793 ENSGT01100000263540.A.a ENSGT00390000018613.a ENSGT00950000183148.b.b ENSGT00940000177700 ENSGT00940000154186.a.q.g.a ENSGT00940000166587 ENSGT00950000183050.b.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000153464.B.z.b #20 ENSGT00530000063410.a.q.a #21 ENSGT00390000016551 #22 ENSGT00940000161234 ENSGT00940000157597 ENSGT00940000155345.q ENSGT00940000157824.i.b ENSGT00940000153408.B.t.d.a ENSGT00390000008178 ENSGT00390000016883 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000157593 ENSGT00700000104522 ENSGT00940000165789 ENSGT01030000234606.a.a.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00510000048167.a Characoidei ANCESTRAL SPECIES 149 ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00940000156416.d ENSGT00390000014563.a.a.b ENSGT00940000156276 ENSGT00940000155109.a.a ENSGT00940000160793 ENSGT00940000157776.d ENSGT01100000263540.A.a 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eel MODERN SPECIES 291 ube2d1a (ENSEEEG00000005771) ENSEEEG00000005754 vsx1 (ENSEEEG00000005752) entpd6 (ENSEEEG00000005751) ENSEEEG00000005749 pygb (ENSEEEG00000005688) ENSEEEG00000005676 ENSEEEG00000005675 ENSEEEG00000005673 peli1b (ENSEEEG00000005670) ugp2b (ENSEEEG00000005505) #20 MDH1 (ENSEEEG00000005124) #21 ENSEEEG00000005103 #22 otx1 (ENSEEEG00000005101) ENSEEEG00000005100 EHBP1 (ENSEEEG00000005099) b3gnt2b (ENSEEEG00000005098) XPO1 (ENSEEEG00000005037) SANBR (ENSEEEG00000005004) pex13 (ENSEEEG00000004983) PDZD8 (ENSEEEG00000004979) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT00390000006218 ENSGT00390000010799 ENSGT00940000165091.d.c ENSGT00390000002053 ENSGT00940000154531 ENSGT00950000183034.B ENSGT00940000154186.a.q ENSGT00940000174754 ENSGT00940000166587 ENSGT00950000183050.b.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000153464.B.z.b #20 ENSGT00530000063410.a.r #21 ENSGT00390000016551 #22 ENSGT00940000161234 ENSGT00940000157597 ENSGT00940000155345.q ENSGT00940000157824.i.b ENSGT00940000153408.B.t.d.a 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