Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000154130.a.a.a	ENSGT00950000183047.c.a	ENSGT00940000160446 #7	ENSGT00940000154063.C.a.b #8	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a.d #9	ENSGT01060000248544.a.a.b.a.a.c #12	ENSGT00390000006744 #13	ENSGT00390000006244 #14	ENSGT00940000164486 #15	ENSGT00940000161972 #16	ENSGT00940000161573 #17	ENSGT00950000183101.a.b.a #18	ENSGT00940000159428 #19	ENSGT00940000162419 #20	ENSGT00940000156051 #21	ENSGT00440000038032 #22	ENSGT00950000182993.B.b #23	ENSGT00390000014585 #24	ENSGT00390000005830 #25	ENSGT00730000110920.b.a.a #26	ENSGT00940000158800 #27	ENSGT00940000155332.A #29	ENSGT01050000244879.a.a.a #30	ENSGT00940000158588 #31	ENSGT00940000162442 #32	ENSGT00390000007212 #33	ENSGT00390000012434 #34	ENSGT00550000075134 #37	ENSGT00390000016128	ENSGT00940000162714	ENSGT00530000063553.b.a
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	21	GPR108 (ENSOARG00020016672) #7	C3 (ENSOARG00020016763) #8	ENSOARG00020016803 #9	ENSOARG00020016859 #10	ENSOARG00020017608 #11	ENSOARG00020018946 #12	CD70 (ENSOARG00020019022) #13	ENSOARG00020019063 #14	ENSOARG00020019106 #15	TUBB4A (ENSOARG00020019161) #16	DENND1C (ENSOARG00020019197) #17	CRB3 (ENSOARG00020019269) #18	SLC25A23 (ENSOARG00020019333) #19	SLC25A41 (ENSOARG00020019425) #20	KHSRP (ENSOARG00020019494) #21	GTF2F1 (ENSOARG00020019647) #22	PSPN (ENSOARG00020019711) #23	ALKBH7 (ENSOARG00020019744) #24	CLPP (ENSOARG00020019811) #25	ACER1 (ENSOARG00020019869) #26	MLLT1 (ENSOARG00020019921) #27	ENSOARG00020020028 #28	ACSBG2 (ENSOARG00020020054) #29	RFX2 (ENSOARG00020020257) #30	RANBP3 (ENSOARG00020020564) #31	CAPS (ENSOARG00020020769) #32	VMAC (ENSOARG00020020817) #33	NDUFA11 (ENSOARG00020020850) #34	ENSOARG00020020891 #35	NRTN (ENSOARG00020020907) #36	DUS3L (ENSOARG00020020943) #37
Goat	DUPLICATION
Goat	MODERN SPECIES	26	ADGRE1 (ENSCHIG00000021647) #11	VAV1 (ENSCHIG00000011155)	SH2D3A (ENSCHIG00000025393)	TRIP10 (ENSCHIG00000022584)	GPR108 (ENSCHIG00000009700) #7	C3 (ENSCHIG00000008320) #8	TNFSF14 (ENSCHIG00000020880) #12	ENSCHIG00000026611 #13	ENSCHIG00000004302 #14	TUBB4A (ENSCHIG00000020195) #16	DENND1C (ENSCHIG00000017569) #17	CRB3 (ENSCHIG00000023021) #18	SLC25A23 (ENSCHIG00000008013) #19	SLC25A41 (ENSCHIG00000017363) #20	KHSRP (ENSCHIG00000027053) #21	ENSCHIG00000011986 #22	PSPN (ENSCHIG00000018638) #23	ALKBH7 (ENSCHIG00000024761) #24	CLPP (ENSCHIG00000023189) #25	ACER1 (ENSCHIG00000008361) #26	ENSCHIG00000016868 #28	MLLT1 (ENSCHIG00000022842) #27	ACSBG2 (ENSCHIG00000016276) #29	RFX2 (ENSCHIG00000023052) #30	RANBP3 (ENSCHIG00000021064) #31	CAPS (ENSCHIG00000022459) #32	VMAC (ENSCHIG00000004574) #33	NDUFA11 (ENSCHIG00000021213) #34	PRR22 (ENSCHIG00000022206)	DUS3L (ENSCHIG00000021327) #37	LONP1 (ENSCHIG00000003365)
Goat	MODERN SPECIES		EIF2B5 (ENSCHIG00000026144)	DVL3 (ENSCHIG00000013014)	AP2M1 (ENSCHIG00000018814)	ABCF3 (ENSCHIG00000018349)	VWA5B2 (ENSCHIG00000007439)	ALG3 (ENSCHIG00000015770)	CAMK2N2 (ENSCHIG00000018201)	ECE2 (ENSCHIG00000012826)	PSMD2 (ENSCHIG00000016997)	EIF4G1 (ENSCHIG00000009775)	FAM131A (ENSCHIG00000015881)	CLCN2 (ENSCHIG00000012282)	POLR2H (ENSCHIG00000006695)	THPO (ENSCHIG00000017758)	CHRD (ENSCHIG00000011375)	ENSCHIG00000020124 #22	ENSCHIG00000009628	EPHB3 (ENSCHIG00000005276)	MAGEF1 (ENSCHIG00000018285)	ENSCHIG00000010591	VPS8 (ENSCHIG00000011920)	C3orf70 (ENSCHIG00000017215)	ENSCHIG00000006056	EHHADH (ENSCHIG00000010352)	MAP3K13 (ENSCHIG00000015662)	ENSCHIG00000003347	LIPH (ENSCHIG00000014282)	ENSCHIG00000018521	IGF2BP2 (ENSCHIG00000015258)	ENSCHIG00000018541	ENSCHIG00000014097