Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT01020000230346.A	ENSGT00390000007753.b	ENSGT00940000153986.a	ENSGT00390000006080	ENSGT01050000244902.b.c.a	ENSGT01050000244902.b.c.b	ENSGT00940000157901 #14	ENSGT00390000005163 #15	ENSGT01100000263497.C	ENSGT00940000155517 #16	ENSGT00940000155959 #17	ENSGT00940000154071.A	ENSGT00950000183148.a #19	ENSGT00940000161597 #20	ENSGT00660000095541.a.b #21	ENSGT00940000156106 #22	ENSGT00940000158704 #23	ENSGT00940000158072 #24	ENSGT00940000159132.a #25	ENSGT00940000156502 #26	ENSGT00490000043421 #27	ENSGT00940000158324 #28	ENSGT00940000157135 #29	ENSGT00940000156593 #30	ENSGT00390000018516 #31	ENSGT00940000157150 #32	ENSGT00940000157509 #33	ENSGT00390000012435 #34	ENSGT00510000048466 #35	ENSGT00390000007341.a #36	ENSGT00940000161656
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000158275 #8	ENSGT00950000182808.a.a.b.a #9	ENSGT00390000018436.a.a #10	ENSGT00940000157547 #11	ENSGT00520000055955 #12	ENSGT00830000128402	ENSGT00940000157901 #14	ENSGT00390000005163 #15	ENSGT01100000263497.C	ENSGT00940000155517 #16	ENSGT00940000155959 #17	ENSGT00940000154071.A	ENSGT00950000183148.a #19	ENSGT00940000161597 #20	ENSGT00660000095541.a.b #21	ENSGT00940000156106 #22	ENSGT00940000158704 #23	ENSGT00940000158072 #24	ENSGT00940000159132.a #25	ENSGT00940000156502 #26	ENSGT00490000043421 #27	ENSGT00940000158324 #28	ENSGT00940000157135 #29	ENSGT00940000156593 #30	ENSGT00390000018516 #31	ENSGT00940000157150 #32	ENSGT00940000157509 #33	ENSGT00390000012435 #34	ENSGT00510000048466 #35	ENSGT00390000007341.a #36	ENSGT00390000018085.a.a.a.a #37
Alpin marmot	MODERN SPECIES	1	SUSD6 (ENSMMMG00000000906) #7	SRSF5 (ENSMMMG00000000934) #8	SLC10A1 (ENSMMMG00000000980) #9	SMOC1 (ENSMMMG00000001018) #10	SLC8A3 (ENSMMMG00000001131) #11	COX16 (ENSMMMG00000001177) #12	ENSMMMG00000001187 #13	NID2 (ENSMMMG00000001212) #14	RTRAF (ENSMMMG00000001263) #15	FRMD6 (ENSMMMG00000001292) #16	ENSMMMG00000001345 #17	ENSMMMG00000001375 #18	PYGL (ENSMMMG00000001386) #19	ABHD12B (ENSMMMG00000001413) #20	NIN (ENSMMMG00000001504) #21	SAV1 (ENSMMMG00000001694) #22	ENSMMMG00000001706 #23	MAP4K5 (ENSMMMG00000001735) #24	CDKL1 (ENSMMMG00000001936) #25	DMAC2L (ENSMMMG00000001954) #26	L2HGDH (ENSMMMG00000001966) #27	SOS2 (ENSMMMG00000002005) #28	VCPKMT (ENSMMMG00000002166) #29	ARF6 (ENSMMMG00000002177) #30	NEMF (ENSMMMG00000002268) #31	KLHDC2 (ENSMMMG00000002856) #32	KLHDC1 (ENSMMMG00000002951) #33	POLE2 (ENSMMMG00000002980) #34	DNAAF2 (ENSMMMG00000003007) #35	MGAT2 (ENSMMMG00000003019) #36	ENSMMMG00000003026 #37
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000158275 #8	ENSGT00950000182808.a.a.b.a #9	ENSGT00390000018436.a.a #10	ENSGT00940000157547 #11	ENSGT00520000055955 #12	ENSGT00830000128402.q	ENSGT00940000157901 #14	ENSGT00390000005163 #15	ENSGT01100000263497.C	ENSGT00940000155517 #16	ENSGT00940000155959 #17	ENSGT00940000154071.A	ENSGT00950000183148.a #19	ENSGT00940000161597 #20	ENSGT00660000095541.a.b #21	ENSGT00940000156106 #22	ENSGT00940000158704 #23	ENSGT00940000158072 #24	ENSGT00940000159132.a #25	ENSGT00940000156502 #26	ENSGT00490000043421 #27	ENSGT00940000158324 #28	ENSGT00940000157135 #29	ENSGT00940000156593 #30	ENSGT00390000018516 #31	ENSGT00940000157150 #32	ENSGT00940000157509 #33	ENSGT00390000012435 #34	ENSGT00510000048466 #35	ENSGT00390000007341.a #36	ENSGT00940000161656
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	84			SMOC1 (ENSUPAG00010001178) #10	SLC8A3 (ENSUPAG00010001266) #11	ENSUPAG00010001319 #12	ENSUPAG00010001337	NID2 (ENSUPAG00010001363) #14	RTRAF (ENSUPAG00010001411) #15	GNG2 (ENSUPAG00010001421)	FRMD6 (ENSUPAG00010001440) #16	TMX1 (ENSUPAG00010001455) #17	TRIM9 (ENSUPAG00010001494)	PYGL (ENSUPAG00010001687) #19	ABHD12B (ENSUPAG00010001707) #20	NIN (ENSUPAG00010001816) #21	SAV1 (ENSUPAG00010007736) #22	ATL1 (ENSUPAG00010007750) #23	MAP4K5 (ENSUPAG00010007764) #24	CDKL1 (ENSUPAG00010007853) #25	DMAC2L (ENSUPAG00010007867) #26	L2HGDH (ENSUPAG00010007904) #27	SOS2 (ENSUPAG00010007931) #28	VCPKMT (ENSUPAG00010008108) #29	ARF6 (ENSUPAG00010008117) #30	NEMF (ENSUPAG00010008130) #31	KLHDC2 (ENSUPAG00010008179) #32	KLHDC1 (ENSUPAG00010008181) #33	POLE2 (ENSUPAG00010008225) #34	DNAAF2 (ENSUPAG00010008249) #35	ENSUPAG00010008252	ENSUPAG00010008255 ##37
Squirrel	MODERN SPECIES	95	ENSSTOG00000023687	SMOC1 (ENSSTOG00000003894) #10	SLC8A3 (ENSSTOG00000003907) #11	COX16 (ENSSTOG00000031505) #12	SYNJ2BP (ENSSTOG00000014437)	NID2 (ENSSTOG00000001067) #14	ENSSTOG00000029910 ##37	ENSSTOG00000034522 #15	GNG2 (ENSSTOG00000027320)	FRMD6 (ENSSTOG00000003275) #16	TMX1 (ENSSTOG00000016236) #17	TRIM9 (ENSSTOG00000011982)	PYGL (ENSSTOG00000011960) #19	ABHD12B (ENSSTOG00000011954) #20	NIN (ENSSTOG00000021244) #21	SAV1 (ENSSTOG00000026356) #22	ATL1 (ENSSTOG00000011921) #23	MAP4K5 (ENSSTOG00000021920) #24	CDKL1 (ENSSTOG00000028678) #25	DMAC2L (ENSSTOG00000034611) #26	L2HGDH (ENSSTOG00000011889) #27
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	11	GPR137C (ENSSVLG00005006997)	TXNDC16 (ENSSVLG00005007046)	PTGER2 (ENSSVLG00005007122)	ENSSVLG00005007151	PTGDR (ENSSVLG00005007172)	NID2 (ENSSVLG00005007195) #14	RTRAF (ENSSVLG00005007221) #15	ENSSVLG00005007247	FRMD6 (ENSSVLG00005007280) #16	ENSSVLG00005007323	ENSSVLG00005007350 #17	TRIM9 (ENSSVLG00005007402)	PYGL (ENSSVLG00005007538) #19	ABHD12B (ENSSVLG00005007765) #20	NIN (ENSSVLG00005007948) #21	SAV1 (ENSSVLG00005008036) #22	ATL1 (ENSSVLG00005008081) #23	MAP4K5 (ENSSVLG00005008150) #24	CDKL1 (ENSSVLG00005008203) #25	DMAC2L (ENSSVLG00005008238) #26	L2HGDH (ENSSVLG00005008301) #27	SOS2 (ENSSVLG00005008363) #28	VCPKMT (ENSSVLG00005008401) #29	ARF6 (ENSSVLG00005008433) #30	NEMF (ENSSVLG00005008455) #31	KLHDC2 (ENSSVLG00005008503) #32	KLHDC1 (ENSSVLG00005008548) #33	ENSSVLG00005008574	POLE2 (ENSSVLG00005008639) #34	DNAAF2 (ENSSVLG00005008952) #35	MGAT2 (ENSSVLG00005008964) #36