Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156739.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000164132	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000163340
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000164132	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000163340
Glires	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000164132	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000163340
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000164132	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000163340
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000164132	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000160680	ENSGT00940000156768
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000164132	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000163412	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951.u	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000160680
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000164132	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000163412	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951.u	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000160680
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000164132	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000163412	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951.u	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009.s.a	ENSGT00940000160680	ENSGT00940000156768
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000164132	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000163412	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951.u	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009.s.a	ENSGT00940000160680	ENSGT00940000156768
Mus	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000164132	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000163412	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951.u	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009.s.a	ENSGT00940000160680	ENSGT00940000156768
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000164132	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000163412	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951.u	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009.s.a	ENSGT00940000160680	ENSGT00940000156768
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B.c	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000164132	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000163412	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951.u	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009.s.a	ENSGT00940000160680	ENSGT00940000156768
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B.c	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000163412	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951.u	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009.s.a	ENSGT00940000160680	ENSGT00940000156768	ENSGT00940000160342
Steppe mouse	DUPLICATION
Steppe mouse	MODERN SPECIES	2014														Fam131a (ENSMSIG00000007799) #20	Clcn2 (ENSMSIG00000007825) #21	Polr2h (ENSMSIG00000008034) #22	Thpo (ENSMSIG00000008081) #23	Chrd (ENSMSIG00000008143) #24
Steppe mouse	MODERN SPECIES	2413																ENSMSIG00000030774 ##22	2700097O09Rik (ENSMSIG00000030775)	ENSMSIG00000030776	ENSMSIG00000030778	Baz1a (ENSMSIG00000030780)	Cfl2 (ENSMSIG00000030790)	Snx6 (ENSMSIG00000030794)
spretus	MODERN SPECIES	7	Cyp2ab1 (MGP_SPRETEiJ_G0021471)	Abcc5 (MGP_SPRETEiJ_G0021472)	Eif2b5 (MGP_SPRETEiJ_G0021473)	Dvl3 (MGP_SPRETEiJ_G0021474)	Ap2m1 (MGP_SPRETEiJ_G0021475)	Abcf3 (MGP_SPRETEiJ_G0021476)	Vwa5b2 (MGP_SPRETEiJ_G0021477)	Alg3 (MGP_SPRETEiJ_G0021478)	Ece2 (MGP_SPRETEiJ_G0021479)	Camk2n2 (MGP_SPRETEiJ_G0021480)	MGP_SPRETEiJ_G0021481	MGP_SPRETEiJ_G0021482	Eif4g1 (MGP_SPRETEiJ_G0021483)	Fam131a (MGP_SPRETEiJ_G0021484) #20	Clcn2 (MGP_SPRETEiJ_G0021485) #21	Polr2h (MGP_SPRETEiJ_G0021486) #22	Thpo (MGP_SPRETEiJ_G0021487) #23	Chrd (MGP_SPRETEiJ_G0021488) #24	Ephb3 (MGP_SPRETEiJ_G0021489)	Vps8 (MGP_SPRETEiJ_G0021490)	2510009E07Rik (MGP_SPRETEiJ_G0021491)	Ehhadh (MGP_SPRETEiJ_G0021492)	Map3k13 (MGP_SPRETEiJ_G0021493)	Tmem41a (MGP_SPRETEiJ_G0021494)	Liph (MGP_SPRETEiJ_G0021495)	Senp2 (MGP_SPRETEiJ_G0021496)	Igf2bp2 (MGP_SPRETEiJ_G0021497)	Etv5 (MGP_SPRETEiJ_G0021499)	Dgkg (MGP_SPRETEiJ_G0021500)	Crygs (MGP_SPRETEiJ_G0021501)	Tbccd1 (MGP_SPRETEiJ_G0021502)
Mouse	MODERN SPECIES	7	Abcc5 (ENSMUSG00000022822)	Eif2b5 (ENSMUSG00000003235)	Dvl3 (ENSMUSG00000003233)	Ap2m1 (ENSMUSG00000022841)	Abcf3 (ENSMUSG00000003234)	Vwa5b2 (ENSMUSG00000046613)	Alg3 (ENSMUSG00000033809)	Eef1akmt4 (ENSMUSG00000115219)	Eef1ece2 (ENSMUSG00000115293)	Camk2n2 (ENSMUSG00000051146)	Ece2 (ENSMUSG00000022842)	Psmd2 (ENSMUSG00000006998)	Eif4g1 (ENSMUSG00000045983)	Fam131a (ENSMUSG00000050821) #20	Clcn2 (ENSMUSG00000022843) #21	Polr2h (ENSMUSG00000021018) #22	Thpo (ENSMUSG00000022847) #23	Chrd (ENSMUSG00000006958) #24	Teddm3 (ENSMUSG00000090356)	Ephb3 (ENSMUSG00000005958)	Vps8 (ENSMUSG00000033653)	2510009E07Rik (ENSMUSG00000043391)	Ehhadh (ENSMUSG00000022853)	Map3k13 (ENSMUSG00000033618)	Tmem41a (ENSMUSG00000022856)	Liph (ENSMUSG00000044626)	Senp2 (ENSMUSG00000022855)	Igf2bp2 (ENSMUSG00000033581)	Tra2b (ENSMUSG00000022858)	Etv5 (ENSMUSG00000013089)	Dgkg (ENSMUSG00000022861)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	7	Cyp2ab1 (MGP_CAROLIEiJ_G0020574)	Abcc5 (MGP_CAROLIEiJ_G0020575)	Eif2b5 (MGP_CAROLIEiJ_G0020576)	Dvl3 (MGP_CAROLIEiJ_G0020577)	Ap2m1 (MGP_CAROLIEiJ_G0020578)	Abcf3 (MGP_CAROLIEiJ_G0020579)	Vwa5b2 (MGP_CAROLIEiJ_G0020580)	Alg3 (MGP_CAROLIEiJ_G0020581)	Ece2 (MGP_CAROLIEiJ_G0020582)	Camk2n2 (MGP_CAROLIEiJ_G0020583)	MGP_CAROLIEiJ_G0020584	MGP_CAROLIEiJ_G0020585	Eif4g1 (MGP_CAROLIEiJ_G0020586)	Fam131a (MGP_CAROLIEiJ_G0020587) #20	Clcn2 (MGP_CAROLIEiJ_G0020588) #21	Polr2h (MGP_CAROLIEiJ_G0020589) #22	Thpo (MGP_CAROLIEiJ_G0020590) #23	Chrd (MGP_CAROLIEiJ_G0020591) #24	Teddm3 (MGP_CAROLIEiJ_G0020592)	Ephb3 (MGP_CAROLIEiJ_G0020593)	Vps8 (MGP_CAROLIEiJ_G0020594)	2510009E07Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0020595)	Ehhadh (MGP_CAROLIEiJ_G0020596)	Map3k13 (MGP_CAROLIEiJ_G0020597)	Tmem41a (MGP_CAROLIEiJ_G0020598)	Liph (MGP_CAROLIEiJ_G0020599)	Senp2 (MGP_CAROLIEiJ_G0020600)	Igf2bp2 (MGP_CAROLIEiJ_G0020601)	Tra2b (MGP_CAROLIEiJ_G0020602)	Etv5 (MGP_CAROLIEiJ_G0020603)	Dgkg (MGP_CAROLIEiJ_G0020604)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	3	Cyp2ab1 (MGP_PahariEiJ_G0016278)	Abcc5 (MGP_PahariEiJ_G0016279)	Eif2b5 (MGP_PahariEiJ_G0016280)	Dvl3 (MGP_PahariEiJ_G0016281)	Ap2m1 (MGP_PahariEiJ_G0016282)	Abcf3 (MGP_PahariEiJ_G0016283)	Vwa5b2 (MGP_PahariEiJ_G0016284)	Alg3 (MGP_PahariEiJ_G0016285)	Ece2 (MGP_PahariEiJ_G0016286)	Camk2n2 (MGP_PahariEiJ_G0016287)	MGP_PahariEiJ_G0016288	MGP_PahariEiJ_G0016289	MGP_PahariEiJ_G0016290	Fam131a (MGP_PahariEiJ_G0016291) #20	Clcn2 (MGP_PahariEiJ_G0016292) #21	Polr2h (MGP_PahariEiJ_G0016293) #22	Thpo (MGP_PahariEiJ_G0016294) #23	Chrd (MGP_PahariEiJ_G0016295) #24	MGP_PahariEiJ_G0016296	Ephb3 (MGP_PahariEiJ_G0016297)	Vps8 (MGP_PahariEiJ_G0016298)	2510009E07Rik (MGP_PahariEiJ_G0016299)	Ehhadh (MGP_PahariEiJ_G0016300)	Map3k13 (MGP_PahariEiJ_G0016301)	Tmem41a (MGP_PahariEiJ_G0016302)	Liph (MGP_PahariEiJ_G0016303)	Senp2 (MGP_PahariEiJ_G0016304)	Igf2bp2 (MGP_PahariEiJ_G0016305)	Tra2b (MGP_PahariEiJ_G0016306)	Etv5 (MGP_PahariEiJ_G0016307)	Dgkg (MGP_PahariEiJ_G0016308)
Rat	DUPLICATION
Rat	MODERN SPECIES	2	Cyp2ab1 (ENSRNOG00000042367)	Abcc5 (ENSRNOG00000029178)	Rps15al2 (ENSRNOG00000032877)	Eif2b5 (ENSRNOG00000038160)	Dvl3 (ENSRNOG00000001708)	Abcf3 (ENSRNOG00000001710)	Ap2m1 (ENSRNOG00000001709)	Vwa5b2 (ENSRNOG00000001707)	Alg3 (ENSRNOG00000001712)	Eef1akmt4 (ENSRNOG00000029529)	Ece2 (ENSRNOG00000001715)	Psmd2 (ENSRNOG00000001719)	Eif4g1 (ENSRNOG00000001738)	Fam131a (ENSRNOG00000063031) #20	Clcn2 (ENSRNOG00000001742) #21	Polr2h (ENSRNOG00000001748) #22	Thpol1 (ENSRNOG00000046850) #23	Chrd (ENSRNOG00000001750) #24	RGD1563956 (ENSRNOG00000025014)	RGD1560559 (ENSRNOG00000025031)	Ephb3 (ENSRNOG00000031801)	Vps8 (ENSRNOG00000001764)	C11h3orf70 (ENSRNOG00000063811)	Ehhadh (ENSRNOG00000001770)	LOC120095693 (ENSRNOG00000039674)	Map3k13 (ENSRNOG00000025423)	Tmem41a (ENSRNOG00000046283)	Liph (ENSRNOG00000047894)	Senp2 (ENSRNOG00000001773)	Igf2bp2 (ENSRNOG00000025946)	AABR07034641.1 (ENSRNOG00000033115)
Rat	DUPLICATION
Rat	MODERN SPECIES	1	Pde6g (ENSRNOG00000069361)	Tspan10 (ENSRNOG00000046076)	Nploc4 (ENSRNOG00000036698)	Faap100 (ENSRNOG00000036699)	Fscn2 (ENSRNOG00000036700)	Actg1 (ENSRNOG00000036701)	Bahcc1 (ENSRNOG00000043102)	ENSRNOG00000065844	Slc38a10 (ENSRNOG00000004604)	Tepsin (ENSRNOG00000028161)	Cep131 (ENSRNOG00000004430)	Aatk (ENSRNOG00000004392)	Baiap2 (ENSRNOG00000004049)	Chmp6 (ENSRNOG00000004014)	Rptor (ENSRNOG00000003821)	AABR07030911.1 (ENSRNOG00000032442) #22	Nptx1 (ENSRNOG00000003741)	Endov (ENSRNOG00000003699)	Rnf213 (ENSRNOG00000029658)	Slc26a11 (ENSRNOG00000030537)	Sgsh (ENSRNOG00000064880)	Card14 (ENSRNOG00000047367)	Eif4a3 (ENSRNOG00000045791)	Gaa (ENSRNOG00000047656)	Ccdc40 (ENSRNOG00000059401)	Tbc1d16 (ENSRNOG00000049758)	Cbx4 (ENSRNOG00000063043)	Cbx8 (ENSRNOG00000048113)	Cbx2 (ENSRNOG00000049215)	Rbfox3 (ENSRNOG00000003386)	Engase (ENSRNOG00000027498)
Rat	MODERN SPECIES	9	Npc1 (ENSRNOG00000012016)	Rmc1 (ENSRNOG00000012597)	Riok3 (ENSRNOG00000023376)	Tmem241 (ENSRNOG00000023412)	Cables1 (ENSRNOG00000012795)	Rbbp8 (ENSRNOG00000012899)	Gata6 (ENSRNOG00000023433)	ENSRNOG00000071008	Mib1 (ENSRNOG00000013281)	Abhd3 (ENSRNOG00000029370)	Snrpd1 (ENSRNOG00000013714)	ENSRNOG00000065471	Esco1 (ENSRNOG00000014031)	LOC103694176 (ENSRNOG00000065120)	Greb1l (ENSRNOG00000023492)	LOC120098305 (ENSRNOG00000030649) #22	Rock1 (ENSRNOG00000031092)	Usp14 (ENSRNOG00000014981)	Thoc1 (ENSRNOG00000015332)	Sec13-ps2 (ENSRNOG00000068190)	ENSRNOG00000066369	Colec12 (ENSRNOG00000016366)	Cetn1 (ENSRNOG00000016409)	Zfp136 (ENSRNOG00000016417)	ENSRNOG00000069557	ENSRNOG00000069512	Mtmr1 (ENSRNOG00000002697)	F8 (ENSRNOG00000031197)	Fundc2 (ENSRNOG00000024066)	Cmc4 (ENSRNOG00000056435)	Vom2r75 (ENSRNOG00000022955)
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000164132	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951.u	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009.t	ENSGT00940000160680	ENSGT00940000156768
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000164132	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951.u	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009.t	ENSGT00940000160680	ENSGT00940000156768
Golden Hamster	MODERN SPECIES	645	Parl (ENSMAUG00000004411)	Abcc5 (ENSMAUG00000016654)	Eif2b5 (ENSMAUG00000018803)	Dvl3 (ENSMAUG00000018768)	Ap2m1 (ENSMAUG00000021138)	Abcf3 (ENSMAUG00000017666)	Vwa5b2 (ENSMAUG00000008822)	Alg3 (ENSMAUG00000019456)	Camk2n2 (ENSMAUG00000009092)	Ece2 (ENSMAUG00000011426)	Psmd2 (ENSMAUG00000014316)	ENSMAUG00000008684	Eif4g1 (ENSMAUG00000021452)	Fam131a (ENSMAUG00000015455) #20	Clcn2 (ENSMAUG00000020728) #21	Polr2h (ENSMAUG00000016338) #22	Thpo (ENSMAUG00000018682) #23	Chrd (ENSMAUG00000019283) #24	Ephb3 (ENSMAUG00000012646)	Vps8 (ENSMAUG00000001955)	2510009E07Rik (ENSMAUG00000010164)	Ehhadh (ENSMAUG00000004866)	Map3k13 (ENSMAUG00000012001)	ENSMAUG00000017908	Liph (ENSMAUG00000020980)	Senp2 (ENSMAUG00000016075)	Igf2bp2 (ENSMAUG00000008302)	ENSMAUG00000002746	Etv5 (ENSMAUG00000016484)	Dgkg (ENSMAUG00000006899)	Crygs (ENSMAUG00000006202)
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	382	Cyp2ab1 (ENSCGRG00001000606)	Abcc5 (ENSCGRG00001020997)	ENSCGRG00001023699	Eif2b5 (ENSCGRG00001008638)	Dvl3 (ENSCGRG00001018864)	Ap2m1 (ENSCGRG00001011476)	Abcf3 (ENSCGRG00001000537)	Vwa5b2 (ENSCGRG00001020976)	Alg3 (ENSCGRG00001010029)	Ece2 (ENSCGRG00001019837)	Camk2n2 (ENSCGRG00001011488)	Psmd2 (ENSCGRG00001017872)	Eif4g1 (ENSCGRG00001024063)	Fam131a (ENSCGRG00001014728) #20	Clcn2 (ENSCGRG00001008852) #21	Polr2h (ENSCGRG00001004900) #22	Thpo (ENSCGRG00001010258) #23	Chrd (ENSCGRG00001016660) #24	Teddm3 (ENSCGRG00001008819)	Ephb3 (ENSCGRG00001013531)	Vps8 (ENSCGRG00001018671)	2510009E07Rik (ENSCGRG00001016389)	Ehhadh (ENSCGRG00001017424)	Map3k13 (ENSCGRG00001019360)	ENSCGRG00001024021	Liph (ENSCGRG00001010260)	Senp2 (ENSCGRG00001023472)	Igf2bp2 (ENSCGRG00001019401)	ENSCGRG00001010314	Tra2b (ENSCGRG00001012362)	Etv5 (ENSCGRG00001021130)
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000164132	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951.u	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009.t	ENSGT00940000163340	ENSGT00940000160680
Prairie vole	MODERN SPECIES	126	Parl (ENSMOCG00000015256)	Cyp2ab1 (ENSMOCG00000006421)	Abcc5 (ENSMOCG00000004720)	Eif2b5 (ENSMOCG00000016708)	Dvl3 (ENSMOCG00000012179)	Ap2m1 (ENSMOCG00000014484)	Abcf3 (ENSMOCG00000006812)	Vwa5b2 (ENSMOCG00000003248)	Alg3 (ENSMOCG00000017690)	Ece2 (ENSMOCG00000001939)	Camk2n2 (ENSMOCG00000012422)	Psmd2 (ENSMOCG00000016565)	Eif4g1 (ENSMOCG00000016131)	Fam131a (ENSMOCG00000009027) #20	Clcn2 (ENSMOCG00000001859) #21	Polr2h (ENSMOCG00000004886) #22	Thpo (ENSMOCG00000014210) #23	Chrd (ENSMOCG00000016712) #24	Ephb3 (ENSMOCG00000015859)	Vps8 (ENSMOCG00000017404)	2510009E07Rik (ENSMOCG00000021384)	Ehhadh (ENSMOCG00000016389)	Map3k13 (ENSMOCG00000009150)	ENSMOCG00000000347	Liph (ENSMOCG00000017252)	Senp2 (ENSMOCG00000001811)	Igf2bp2 (ENSMOCG00000019099)	Tra2b (ENSMOCG00000021560)
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	3	Cyp2ab1 (ENSPEMG00000010910)	Abcc5 (ENSPEMG00000009351)	Eif2b5 (ENSPEMG00000009037)	Dvl3 (ENSPEMG00000017805)	Ap2m1 (ENSPEMG00000006895)	Abcf3 (ENSPEMG00000013382)	Vwa5b2 (ENSPEMG00000014803)	Alg3 (ENSPEMG00000011841)	Eef1akmt4 (ENSPEMG00000031228)	Camk2n2 (ENSPEMG00000010089)	Ece2 (ENSPEMG00000000352)	Psmd2 (ENSPEMG00000011042)	Eif4g1 (ENSPEMG00000017256)	Fam131a (ENSPEMG00000028135) #20	Clcn2 (ENSPEMG00000008108) #21	Polr2h (ENSPEMG00000029633) #22	Thpo (ENSPEMG00000009973) #23	Chrd (ENSPEMG00000009578) #24	Teddm3 (ENSPEMG00000025801)	Ephb3 (ENSPEMG00000024277)	Vps8 (ENSPEMG00000003807)	ENSPEMG00000029353	Ehhadh (ENSPEMG00000010711)	Map3k13 (ENSPEMG00000014973)	Tmem41a (ENSPEMG00000000662)	Liph (ENSPEMG00000010159)	Senp2 (ENSPEMG00000023466)	ENSPEMG00000028030	B3gnt5 (ENSPEMG00000011328)	Lamp3 (ENSPEMG00000023896)	ENSPEMG00000030166
Upper Galilee mountains blind mole rat	DUPLICATION
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	757	ENSNGAG00000020075	Parl (ENSNGAG00000015430)	Eif2b5 (ENSNGAG00000023841)	Dvl3 (ENSNGAG00000010230)	Ap2m1 (ENSNGAG00000022188)	Abcf3 (ENSNGAG00000023909)	Vwa5b2 (ENSNGAG00000021963)	Alg3 (ENSNGAG00000008806)	Ece2 (ENSNGAG00000024299)	Camk2n2 (ENSNGAG00000024362)	Psmd2 (ENSNGAG00000010621)	ENSNGAG00000020539	ENSNGAG00000022175	Fam131a (ENSNGAG00000019596) #20	Clcn2 (ENSNGAG00000021473) #21	ENSNGAG00000023997 #22	Thpo (ENSNGAG00000024253) #23	Chrd (ENSNGAG00000002968) #24	Ephb3 (ENSNGAG00000023003)	Vps8 (ENSNGAG00000010229)	2510009E07Rik (ENSNGAG00000003496)	Ehhadh (ENSNGAG00000022028)	Map3k13 (ENSNGAG00000017162)	ENSNGAG00000016716	Liph (ENSNGAG00000001457)	ENSNGAG00000022944	Senp2 (ENSNGAG00000019966)	ENSNGAG00000022590	Igf2bp2 (ENSNGAG00000012680)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1835						ENSNGAG00000018769	Pfkfb2 (ENSNGAG00000000896)	Yod1 (ENSNGAG00000011252)	AA986860 (ENSNGAG00000000410)	Fcamr (ENSNGAG00000018120)	Pigr (ENSNGAG00000019403)	Fcmr (ENSNGAG00000020854)	Il24 (ENSNGAG00000017137)	Il20 (ENSNGAG00000017734)	Il19 (ENSNGAG00000016846)	ENSNGAG00000015806 #22	Il10 (ENSNGAG00000016509)	Mapkapk2 (ENSNGAG00000005753)	Dyrk3 (ENSNGAG00000015789)	Eif2d (ENSNGAG00000017892)	Rassf5 (ENSNGAG00000013948)	Ikbke (ENSNGAG00000018023)	Srgap2 (ENSNGAG00000017369)	Fam72a (ENSNGAG00000000297)	Avpr1b (ENSNGAG00000005328)	Ctse (ENSNGAG00000017938)	ENSNGAG00000019005	Slc26a9 (ENSNGAG00000012565)	Pm20d1 (ENSNGAG00000000944)	Slc41a1 (ENSNGAG00000011919)	Rab29 (ENSNGAG00000015383)
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	54	ENSJJAG00000020951	Abcc5 (ENSJJAG00000018438)	Eif2b5 (ENSJJAG00000004949)	Dvl3 (ENSJJAG00000011264)	Ap2m1 (ENSJJAG00000024086)	Abcf3 (ENSJJAG00000014872)	Vwa5b2 (ENSJJAG00000011906)	Alg3 (ENSJJAG00000000348)	Camk2n2 (ENSJJAG00000023253)	Ece2 (ENSJJAG00000014145)	Psmd2 (ENSJJAG00000024332)	ENSJJAG00000020262	ENSJJAG00000012185	Fam131a (ENSJJAG00000019311) #20	Clcn2 (ENSJJAG00000015086) #21	Polr2h (ENSJJAG00000015574) #22	ENSJJAG00000018272 #23	Chrd (ENSJJAG00000020171) #24	ENSJJAG00000021068	Ephb3 (ENSJJAG00000002329)	Vps8 (ENSJJAG00000024356)	2510009E07Rik (ENSJJAG00000018683)	Ehhadh (ENSJJAG00000012085)	Map3k13 (ENSJJAG00000021115)	ENSJJAG00000015465	Liph (ENSJJAG00000019318)	Senp2 (ENSJJAG00000023556)	Igf2bp2 (ENSJJAG00000015876)	Tra2b (ENSJJAG00000011893)	Etv5 (ENSJJAG00000008806)	Dgkg (ENSJJAG00000001970)
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	481	Parl (ENSDORG00000014935)	Cyp2ab1 (ENSDORG00000026348)	Abcc5 (ENSDORG00000014941)	Eif2b5 (ENSDORG00000005107)	Dvl3 (ENSDORG00000004638)	Ap2m1 (ENSDORG00000004640)	Abcf3 (ENSDORG00000024153)	Vwa5b2 (ENSDORG00000007935)	Alg3 (ENSDORG00000007936)	Ece2 (ENSDORG00000007937)	Psmd2 (ENSDORG00000007939)	ENSDORG00000029000	ENSDORG00000010226	Fam131a (ENSDORG00000023946) #20	Clcn2 (ENSDORG00000010613) #21	Polr2h (ENSDORG00000027475) #22	ENSDORG00000010616 #23	Chrd (ENSDORG00000010617) #24	Ephb3 (ENSDORG00000003084)	ENSDORG00000025676	ENSDORG00000008079
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000164132	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000163340
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000163412	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000160680	ENSGT00940000156768	ENSGT00940000160342
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000156921	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000163412	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000160680	ENSGT00940000156768	ENSGT00940000160342
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000156921	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000163412	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000160680	ENSGT00940000156768	ENSGT00940000160342
Degu	DUPLICATION
Degu	MODERN SPECIES	167	ENSODEG00000012268	ENSODEG00000012404	EIF2B5 (ENSODEG00000012756)	DVL3 (ENSODEG00000012849)	AP2M1 (ENSODEG00000012988)	ABCF3 (ENSODEG00000013982)	VWA5B2 (ENSODEG00000013878)	ALG3 (ENSODEG00000013548)	ECE2 (ENSODEG00000015263)	CAMK2N2 (ENSODEG00000012896)	PSMD2 (ENSODEG00000013158)	ENSODEG00000013872	ENSODEG00000012718	FAM131A (ENSODEG00000013175) #20	CLCN2 (ENSODEG00000014349) #21	ENSODEG00000013008 #22	ENSODEG00000014007 #23	CHRD (ENSODEG00000013793) #24	ENSODEG00000013444	ENSODEG00000013783	EPHB3 (ENSODEG00000013528)	VPS8 (ENSODEG00000013592)	C3orf70 (ENSODEG00000013857)
Degu	MODERN SPECIES	361															ENSODEG00000012519	ENSODEG00000020005 #22	RDH13 (ENSODEG00000011963)	EPS8L1 (ENSODEG00000011275)	PPP1R12C (ENSODEG00000010142)	TNNT1 (ENSODEG00000010639)	TNNI3 (ENSODEG00000011412)	DNAAF3 (ENSODEG00000010996)	SYT5 (ENSODEG00000011988)	ENSODEG00000012643	TMEM86B (ENSODEG00000011909)	ENSODEG00000011540	HSPBP1 (ENSODEG00000010633)	BRSK1 (ENSODEG00000014498)	TMEM150B (ENSODEG00000010863)	KMT5C (ENSODEG00000010521)	COX6B2 (ENSODEG00000010701)
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	127	PARL (ENSCLAG00000014470)	ENSCLAG00000016420	ABCC5 (ENSCLAG00000014609)	EIF2B5 (ENSCLAG00000012914)	DVL3 (ENSCLAG00000014292)	AP2M1 (ENSCLAG00000014315)	ABCF3 (ENSCLAG00000016152)	VWA5B2 (ENSCLAG00000012845)	ALG3 (ENSCLAG00000015577)	CAMK2N2 (ENSCLAG00000014688)	ECE2 (ENSCLAG00000012028)	PSMD2 (ENSCLAG00000015382)	EIF4G1 (ENSCLAG00000012942)	FAM131A (ENSCLAG00000013327) #20	CLCN2 (ENSCLAG00000015337) #21	POLR2H (ENSCLAG00000013016) #22	THPO (ENSCLAG00000013534) #23	CHRD (ENSCLAG00000017299) #24	EPHB3 (ENSCLAG00000012937)	VPS8 (ENSCLAG00000013054)	C3orf70 (ENSCLAG00000014228)	ENSCLAG00000011937	ENSCLAG00000014449	MAP3K13 (ENSCLAG00000014253)	ENSCLAG00000013974	LIPH (ENSCLAG00000014995)	SENP2 (ENSCLAG00000012512)	IGF2BP2 (ENSCLAG00000014808)	TRA2B (ENSCLAG00000015607)	ETV5 (ENSCLAG00000014773)	DGKG (ENSCLAG00000014904)
Guinea pig	MODERN SPECIES	7	MAP6D1 (ENSCPOG00000013222)	PARL (ENSCPOG00000013997)	ENSCPOG00000025499	ABCC5 (ENSCPOG00000011252)	EIF2B5 (ENSCPOG00000012458)	DVL3 (ENSCPOG00000026862)	AP2M1 (ENSCPOG00000012463)	ABCF3 (ENSCPOG00000012469)	VWA5B2 (ENSCPOG00000027260)	ALG3 (ENSCPOG00000019613)	ECE2 (ENSCPOG00000013082)	PSMD2 (ENSCPOG00000009183)	EIF4G1 (ENSCPOG00000007336)	FAM131A (ENSCPOG00000031188) #20	CLCN2 (ENSCPOG00000009200) #21	POLR2H (ENSCPOG00000040303) #22	ENSCPOG00000030572 #23	CHRD (ENSCPOG00000007354) #24	EPHB3 (ENSCPOG00000000977)	VPS8 (ENSCPOG00000010486)	C3orf70 (ENSCPOG00000001519)	ENSCPOG00000040809	ENSCPOG00000007398	MAP3K13 (ENSCPOG00000014720)	TMEM41A (ENSCPOG00000036340)	LIPH (ENSCPOG00000013818)	SENP2 (ENSCPOG00000025946)	IGF2BP2 (ENSCPOG00000005471)	TRA2B (ENSCPOG00000006313)	ETV5 (ENSCPOG00000010094)	DGKG (ENSCPOG00000010104)
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	27	HTR3E (ENSHGLG00000040578)	EIF2B5 (ENSHGLG00000017325)	ENSHGLG00000041686	DVL3 (ENSHGLG00000017314)	AP2M1 (ENSHGLG00000016752)	ABCF3 (ENSHGLG00000016746)	VWA5B2 (ENSHGLG00000016728)	ALG3 (ENSHGLG00000016704)	EEF1AKMT4 (ENSHGLG00000045913)	CAMK2N2 (ENSHGLG00000044517)	ECE2 (ENSHGLG00000014845)	PSMD2 (ENSHGLG00000014466)	ENSHGLG00000013899	FAM131A (ENSHGLG00000013050) #20	CLCN2 (ENSHGLG00000012758) #21	POLR2H (ENSHGLG00000048890) #22	THPO (ENSHGLG00000043140) #23	ENSHGLG00000012005 #24	ENSHGLG00000032546 #24	ENSHGLG00000041027 #24	ENSHGLG00000048985	ENSHGLG00000043750	ENSHGLG00000050729	ENSHGLG00000020960	ENSHGLG00000011167	VPS8 (ENSHGLG00000016688)	C3orf70 (ENSHGLG00000048928)	ENSHGLG00000016485	EHHADH (ENSHGLG00000038703)	MAP3K13 (ENSHGLG00000017309)	ENSHGLG00000019199
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000164132	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000163340
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	1	ABCC5 (ENSSVLG00005004668)	ENSSVLG00005004623	EIF2B5 (ENSSVLG00005004601)	DVL3 (ENSSVLG00005004544)	AP2M1 (ENSSVLG00005015912)	ABCF3 (ENSSVLG00005015804)	VWA5B2 (ENSSVLG00005015467)	ALG3 (ENSSVLG00005015409)	EEF1AKMT4 (ENSSVLG00005015366)	CAMK2N2 (ENSSVLG00005015328)	ECE2 (ENSSVLG00005014218)	PSMD2 (ENSSVLG00005013466)	EIF4G1 (ENSSVLG00005012942)	FAM131A (ENSSVLG00005012712) #20	CLCN2 (ENSSVLG00005012577) #21	POLR2H (ENSSVLG00005012448) #22	THPO (ENSSVLG00005012371) #23	CHRD (ENSSVLG00005012258) #24	ENSSVLG00005012180	ENSSVLG00005012152	ENSSVLG00005012108	ENSSVLG00005012020	VPS8 (ENSSVLG00005011854)	C3orf70 (ENSSVLG00005011786)	EHHADH (ENSSVLG00005011738)	ENSSVLG00005011717	MAP3K13 (ENSSVLG00005011382)	ENSSVLG00005011241	LIPH (ENSSVLG00005011034)	SENP2 (ENSSVLG00005010952)	ENSSVLG00005010910
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	57	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000164132	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516.q.b	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00940000153710.a.l	ENSGT00950000183009
Alpin marmot	DUPLICATION
Alpin marmot	MODERN SPECIES	24	TSSK6 (ENSMMMG00000003603)	NDUFA13 (ENSMMMG00000003609)	YJEFN3 (ENSMMMG00000003614)	CILP2 (ENSMMMG00000003635)	PBX4 (ENSMMMG00000003652)	ENSMMMG00000003669	LPAR2 (ENSMMMG00000003676)	GMIP (ENSMMMG00000003685)	ATP13A1 (ENSMMMG00000003751)	ENSMMMG00000003843	ENSMMMG00000003852	ENSMMMG00000003860	ENSMMMG00000003867	ENSMMMG00000003887	CAMP (ENSMMMG00000003889)	ENSMMMG00000003899 #22	ENSMMMG00000003905	CDC25A (ENSMMMG00000003916)	ENSMMMG00000004321	ENSMMMG00000004336	ENSMMMG00000004343	ENSMMMG00000004367	DHX30 (ENSMMMG00000004544)	SMARCC1 (ENSMMMG00000005131)	CSPG5 (ENSMMMG00000005719)	ELP6 (ENSMMMG00000005727)	SCAP (ENSMMMG00000005743)	ENSMMMG00000005771	ENSMMMG00000006140	KLHL18 (ENSMMMG00000006141)	KIF9 (ENSMMMG00000006191)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	65	ENSMMMG00000006241	ENSMMMG00000006246	ABCC5 (ENSMMMG00000006275)	EIF2B5 (ENSMMMG00000006358)	DVL3 (ENSMMMG00000006390)	AP2M1 (ENSMMMG00000006465)	ABCF3 (ENSMMMG00000006539)	VWA5B2 (ENSMMMG00000006578)	ALG3 (ENSMMMG00000006608)	EEF1AKMT4 (ENSMMMG00000006671)	ECE2 (ENSMMMG00000006677)	PSMD2 (ENSMMMG00000006803)	EIF4G1 (ENSMMMG00000006821)	FAM131A (ENSMMMG00000007631) #20	CLCN2 (ENSMMMG00000007660) #21	POLR2H (ENSMMMG00000007825) #22	THPO (ENSMMMG00000007840) #23	CHRD (ENSMMMG00000007845) #24	ENSMMMG00000007976	ENSMMMG00000007979	EPHB3 (ENSMMMG00000007987)	MAGEF1 (ENSMMMG00000008030)	VPS8 (ENSMMMG00000008041)	ENSMMMG00000008532	ENSMMMG00000008550	MAP3K13 (ENSMMMG00000008557)	TMEM41A (ENSMMMG00000008592)	LIPH (ENSMMMG00000008606)	SENP2 (ENSMMMG00000008647)	IGF2BP2 (ENSMMMG00000008674)	ENSMMMG00000008702
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	79	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000155470.b	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000164132	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00910000148595	ENSGT00940000157516.q.a	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00940000153710.a.l
Squirrel	MODERN SPECIES	178	PARL (ENSSTOG00000023222)	ENSSTOG00000019669	ABCC5 (ENSSTOG00000003886)	EIF2B5 (ENSSTOG00000021575)	DVL3 (ENSSTOG00000008239)	AP2M1 (ENSSTOG00000008273)	ABCF3 (ENSSTOG00000008295)	VWA5B2 (ENSSTOG00000008179)	ALG3 (ENSSTOG00000028571)	CAMK2N2 (ENSSTOG00000023761)	ECE2 (ENSSTOG00000008215)	PSMD2 (ENSSTOG00000008234)	EIF4G1 (ENSSTOG00000021912)	FAM131A (ENSSTOG00000021429) #20	CLCN2 (ENSSTOG00000008267) #21	POLR2H (ENSSTOG00000008300) #22	THPO (ENSSTOG00000008312) #23	CHRD (ENSSTOG00000008321) #24	EPHB3 (ENSSTOG00000009427)	MAGEF1 (ENSSTOG00000014789)	VPS8 (ENSSTOG00000022395)	C3orf70 (ENSSTOG00000006003)	ENSSTOG00000032120	EHHADH (ENSSTOG00000027701)	MAP3K13 (ENSSTOG00000001986)	TMEM41A (ENSSTOG00000001995)	LIPH (ENSSTOG00000011247)	SENP2 (ENSSTOG00000011258)	ENSSTOG00000033088	IGF2BP2 (ENSSTOG00000022077)	ENSSTOG00000033354
Arctic ground squirrel	DUPLICATION
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	73	TM6SF2 (ENSUPAG00010018116)	SUGP1 (ENSUPAG00010018104)	MAU2 (ENSUPAG00010018075)	GATAD2A (ENSUPAG00010018036)	TSSK6 (ENSUPAG00010018027)	YJEFN3 (ENSUPAG00010018017)	CILP2 (ENSUPAG00010018008)	PBX4 (ENSUPAG00010017995)	LPAR2 (ENSUPAG00010017989)	GMIP (ENSUPAG00010017934)	ATP13A1 (ENSUPAG00010017873)	ENSUPAG00010017861	ENSUPAG00010017854	ENSUPAG00010017852	CAMP (ENSUPAG00010017843)	ENSUPAG00010017839 #22	CDC25A (ENSUPAG00010017812)	ENSUPAG00010017794	ENSUPAG00010017787	ENSUPAG00010017306	DHX30 (ENSUPAG00010017216)	ENSUPAG00010017204	SMARCC1 (ENSUPAG00010017138)	CSPG5 (ENSUPAG00010017126)	ELP6 (ENSUPAG00010017114)	SCAP (ENSUPAG00010017105)	PTPN23 (ENSUPAG00010017097)	ENSUPAG00010017093	KLHL18 (ENSUPAG00010017081)	KIF9 (ENSUPAG00010017029)	ENSUPAG00010017013
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	67	ENSUPAG00010003684	ABCC5 (ENSUPAG00010003605)	EIF2B5 (ENSUPAG00010003579)	DVL3 (ENSUPAG00010003477)	ENSUPAG00010003469	ABCF3 (ENSUPAG00010003427)	VWA5B2 (ENSUPAG00010003400)	ALG3 (ENSUPAG00010003339)	EEF1AKMT4 (ENSUPAG00010003328)	CAMK2N2 (ENSUPAG00010003323)	ECE2 (ENSUPAG00010003253)	PSMD2 (ENSUPAG00010003228)	EIF4G1 (ENSUPAG00010002903)	FAM131A (ENSUPAG00010002887) #20	CLCN2 (ENSUPAG00010002755) #21	POLR2H (ENSUPAG00010002737) #22	THPO (ENSUPAG00010002733) #23	CHRD (ENSUPAG00010002655) #24	ENSUPAG00010002644	EPHB3 (ENSUPAG00010002608)	MAGEF1 (ENSUPAG00010002606)	VPS8 (ENSUPAG00010002273)	C3orf70 (ENSUPAG00010002260)	ENSUPAG00010002254	ENSUPAG00010002246	ENSUPAG00010002245	MAP3K13 (ENSUPAG00010002192)	TMEM41A (ENSUPAG00010002185)	LIPH (ENSUPAG00010002143)	SENP2 (ENSUPAG00010002084)	ENSUPAG00010002075
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000164132	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000163340	ENSGT00940000160680
Pika	MODERN SPECIES	381													EIF4G1 (ENSOPRG00000014891)	FAM131A (ENSOPRG00000014953) #20	CLCN2 (ENSOPRG00000014972) #21	POLR2H (ENSOPRG00000015024) #22	THPO (ENSOPRG00000015031) #23	CHRD (ENSOPRG00000015046) #24
Rabbit	MODERN SPECIES	5	ENSOCUG00000010112	ENSOCUG00000023795	EIF2B5 (ENSOCUG00000004536)	DVL3 (ENSOCUG00000036386)	AP2M1 (ENSOCUG00000004556)	ABCF3 (ENSOCUG00000004565)	VWA5B2 (ENSOCUG00000014683)	ALG3 (ENSOCUG00000026514)	EEF1AKMT4 (ENSOCUG00000037277)	CAMK2N2 (ENSOCUG00000025446)	ECE2 (ENSOCUG00000014702)	PSMD2 (ENSOCUG00000007058)	EIF4G1 (ENSOCUG00000006110)	FAM131A (ENSOCUG00000023671) #20	CLCN2 (ENSOCUG00000007065) #21	POLR2H (ENSOCUG00000007078) #22	THPO (ENSOCUG00000007080) #23	CHRD (ENSOCUG00000007084) #24	ENSOCUG00000023062	ENSOCUG00000025191	EPHB3 (ENSOCUG00000012637)	VPS8 (ENSOCUG00000002059)	ENSOCUG00000014627	EHHADH (ENSOCUG00000012197)	ENSOCUG00000023997	MAP3K13 (ENSOCUG00000005035)	TMEM41A (ENSOCUG00000026127)	LIPH (ENSOCUG00000005043)	SENP2 (ENSOCUG00000005048)	IGF2BP2 (ENSOCUG00000005057)	ENSOCUG00000026350
Tree shrew	MODERN SPECIES	4016												PSMD2 (ENSTBEG00000000644)	EIF4G1 (ENSTBEG00000001955)	ENSTBEG00000003447 #20	CLCN2 (ENSTBEG00000003946) #21	POLR2H (ENSTBEG00000005571) #22	ENSTBEG00000005809 #24
Primates	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000164132	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000163340
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000164132	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000163340
Lemuriformes	DUPLICATION
Lemuriformes	DUPLICATION
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000018195.a.a #22
Mouse lemur	DUPLICATION
Mouse lemur	MODERN SPECIES	27	TMEM135 (ENSMICG00000013387)	FZD4 (ENSMICG00000012533)	PRSS23 (ENSMICG00000026361)	ME3 (ENSMICG00000000951)	ENSMICG00000037743	CCDC81 (ENSMICG00000000948)	HIKESHI (ENSMICG00000000946)	ENSMICG00000010728	PICALM (ENSMICG00000017261)	CCDC83 (ENSMICG00000017254)	SYTL2 (ENSMICG00000005519)	CREBZF (ENSMICG00000033683)	TMEM126A (ENSMICG00000005510)	TMEM126B (ENSMICG00000029604)	ENSMICG00000009022	ENSMICG00000027485 #22	ENSMICG00000043874	KCTD14 (ENSMICG00000044183)	NDUFC2 (ENSMICG00000041506)	ALG8 (ENSMICG00000015000)	KCTD21 (ENSMICG00000046215)	USP35 (ENSMICG00000038576)	GAB2 (ENSMICG00000015054)	NARS2 (ENSMICG00000015093)	TENM4 (ENSMICG00000015118)	PRCP (ENSMICG00000011983)	DDIAS (ENSMICG00000033865)	RAB30 (ENSMICG00000012002)	PCF11 (ENSMICG00000008986)	ANKRD42 (ENSMICG00000009004)	CCDC90B (ENSMICG00000038111)
Mouse lemur	MODERN SPECIES	9	SLC26A1 (ENSMICG00000033003)	IDUA (ENSMICG00000012938)	FGFRL1 (ENSMICG00000030053)	RNF212 (ENSMICG00000047687)	ENSMICG00000033680	ENSMICG00000036701	SPON2 (ENSMICG00000002454)	CTBP1 (ENSMICG00000012941)	MAEA (ENSMICG00000012953)	UVSSA (ENSMICG00000012963)	ENSMICG00000044932	NKX1-1 (ENSMICG00000042887)	FAM53A (ENSMICG00000044027)	SLBP (ENSMICG00000014244)	TMEM129 (ENSMICG00000014263)	ENSMICG00000033578 #22	FGFR3 (ENSMICG00000008153)	LETM1 (ENSMICG00000008169)	NSD2 (ENSMICG00000011335)	NELFA (ENSMICG00000011366)	C4orf48 (ENSMICG00000046656)	NAT8L (ENSMICG00000045400)	POLN (ENSMICG00000047538)	HAUS3 (ENSMICG00000028831)	MXD4 (ENSMICG00000047939)	ZFYVE28 (ENSMICG00000031619)	CFAP99 (ENSMICG00000036187)	RNF4 (ENSMICG00000041515)	FAM193A (ENSMICG00000008863)	TNIP2 (ENSMICG00000008835)	SH3BP2 (ENSMICG00000002298)
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000156739.b.a.b	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195.a.b #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000164132	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000163340
Mouse lemur	MODERN SPECIES		ENSMICG00000049301	ENSMICG00000049183	HTR3E (ENSMICG00000049068)	EIF2B5 (ENSMICG00000049428)	DVL3 (ENSMICG00000049000)	AP2M1 (ENSMICG00000048935)	ABCF3 (ENSMICG00000049418)	VWA5B2 (ENSMICG00000049272)	ALG3 (ENSMICG00000048992)	EEF1AKMT4 (ENSMICG00000049030)	CAMK2N2 (ENSMICG00000049125)	PSMD2 (ENSMICG00000049512)	EIF4G1 (ENSMICG00000049010)	FAM131A (ENSMICG00000049438) #20	CLCN2 (ENSMICG00000049507) #21	ENSMICG00000048991 #22	THPO (ENSMICG00000049369) #23	CHRD (ENSMICG00000049478) #24	ENSMICG00000049109	EPHB3 (ENSMICG00000049312)	ENSMICG00000049325	VPS8 (ENSMICG00000048987)	ENSMICG00000049412	C3orf70 (ENSMICG00000049150)	EHHADH (ENSMICG00000049546)	MAP3K13 (ENSMICG00000049178)	ENSMICG00000049489	TMEM41A (ENSMICG00000049227)	LIPH (ENSMICG00000049296)	SENP2 (ENSMICG00000049584)	ENSMICG00000049453
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000156739.b.a.a	ENSGT00940000156739.b.a.b	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000156921	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195.a.b #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000164132	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000163340
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	28	ABCC5 (ENSPSMG00000021810)	ENSPSMG00000021631	HTR3E (ENSPSMG00000021608)	EIF2B5 (ENSPSMG00000021580)	DVL3 (ENSPSMG00000021524)	AP2M1 (ENSPSMG00000021479)	ABCF3 (ENSPSMG00000021387)	VWA5B2 (ENSPSMG00000021312)	ALG3 (ENSPSMG00000021275)	CAMK2N2 (ENSPSMG00000021256)	ECE2 (ENSPSMG00000021210)	PSMD2 (ENSPSMG00000021009)	EIF4G1 (ENSPSMG00000020536)	FAM131A (ENSPSMG00000020112) #20	CLCN2 (ENSPSMG00000020050) #21	POLR2H (ENSPSMG00000019838) #22	THPO (ENSPSMG00000019800) #23	CHRD (ENSPSMG00000019718) #24	ENSPSMG00000019612	EPHB3 (ENSPSMG00000019601)	MAGEF1 (ENSPSMG00000019564)	VPS8 (ENSPSMG00000019512)	C3orf70 (ENSPSMG00000019396)	EHHADH (ENSPSMG00000019386)	MAP3K13 (ENSPSMG00000019366)	TMEM41A (ENSPSMG00000019334)	LIPH (ENSPSMG00000019291)	SENP2 (ENSPSMG00000019181)	IGF2BP2 (ENSPSMG00000019124)
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000018195.b #22
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000018195.b #22
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	51	ENSPCOG00000015936	ENSPCOG00000027112	HTR3E (ENSPCOG00000024574)	EIF2B5 (ENSPCOG00000010623)	DVL3 (ENSPCOG00000020025)	AP2M1 (ENSPCOG00000027377)	ABCF3 (ENSPCOG00000005372)	VWA5B2 (ENSPCOG00000024622)	ALG3 (ENSPCOG00000017288)	CAMK2N2 (ENSPCOG00000026701)	ECE2 (ENSPCOG00000027101)	PSMD2 (ENSPCOG00000002411)	EIF4G1 (ENSPCOG00000026717)	FAM131A (ENSPCOG00000026923) #20	CLCN2 (ENSPCOG00000021839) #21	POLR2H (ENSPCOG00000021194) #22	ENSPCOG00000025834 #23	CHRD (ENSPCOG00000013990) #24	EPHB3 (ENSPCOG00000021424)	MAGEF1 (ENSPCOG00000023097)	VPS8 (ENSPCOG00000018114)	C3orf70 (ENSPCOG00000005512)	ENSPCOG00000015872	EHHADH (ENSPCOG00000017468)	MAP3K13 (ENSPCOG00000027126)	ENSPCOG00000022730	LIPH (ENSPCOG00000028723)	ENSPCOG00000026834	IGF2BP2 (ENSPCOG00000027031)	TRA2B (ENSPCOG00000019183)	ETV5 (ENSPCOG00000027859)
Bushbaby	MODERN SPECIES	378	ENSOGAG00000016123	ENSOGAG00000007890	EIF2B5 (ENSOGAG00000016131)	DVL3 (ENSOGAG00000016139)	AP2M1 (ENSOGAG00000012286)	ABCF3 (ENSOGAG00000033289)	VWA5B2 (ENSOGAG00000010433)	ALG3 (ENSOGAG00000032319)	EEF1AKMT4 (ENSOGAG00000026060)	CAMK2N2 (ENSOGAG00000025540)	ECE2 (ENSOGAG00000015273)	PSMD2 (ENSOGAG00000015282)	EIF4G1 (ENSOGAG00000015291)	CLCN2 (ENSOGAG00000034793) #21	FAM131A (ENSOGAG00000015302) #20	POLR2H (ENSOGAG00000001599) #22	THPO (ENSOGAG00000026490) #23	CHRD (ENSOGAG00000001601) #24	EPHB3 (ENSOGAG00000032936)	VPS8 (ENSOGAG00000000569)
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000163340	ENSGT00940000160680
Tarsier	DUPLICATION
Tarsier	DUPLICATION
Tarsier	MODERN SPECIES	5226								VWA5B2 (ENSTSYG00000027027)	ALG3 (ENSTSYG00000029996)	ECE2 (ENSTSYG00000000069)	CAMK2N2 (ENSTSYG00000000071)	PSMD2 (ENSTSYG00000003883)	EIF4G1 (ENSTSYG00000004963)	FAM131A (ENSTSYG00000010041) #20	CLCN2 (ENSTSYG00000010046) #21	POLR2H (ENSTSYG00000007705) #22	THPO (ENSTSYG00000007715) #23	CHRD (ENSTSYG00000012392) #24	EPHB3 (ENSTSYG00000033553)	ENSTSYG00000032712
Tarsier	MODERN SPECIES	4041															SREK1 (ENSTSYG00000036957)	ENSTSYG00000031691 #22	ERBIN (ENSTSYG00000010928)	ENSTSYG00000028634
Tarsier	MODERN SPECIES	3412																ENSTSYG00000031988 #22
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000163412	ENSGT01100000266984	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	43	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT01100000266984	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000163340	ENSGT00940000160680
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT01100000266984	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000163340	ENSGT00940000160680
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000156921	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT01100000266984	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000163340	ENSGT00940000160680
Capuchin	MODERN SPECIES	111	ENSCCAG00000031577	HTR3C (ENSCCAG00000031177)	HTR3E (ENSCCAG00000037415)	EIF2B5 (ENSCCAG00000028693)	DVL3 (ENSCCAG00000035355)	AP2M1 (ENSCCAG00000025069)	ABCF3 (ENSCCAG00000027906)	VWA5B2 (ENSCCAG00000032876)	ALG3 (ENSCCAG00000025533)	ECE2 (ENSCCAG00000023381)	CAMK2N2 (ENSCCAG00000035659)	PSMD2 (ENSCCAG00000033966)	EIF4G1 (ENSCCAG00000037187)	FAM131A (ENSCCAG00000015189) #20	CLCN2 (ENSCCAG00000024395) #21	POLR2H (ENSCCAG00000035087) #22	THPO (ENSCCAG00000030833) #23	CHRD (ENSCCAG00000030574) #24	ENSCCAG00000031842	EPHB3 (ENSCCAG00000021502)	VPS8 (ENSCCAG00000000885)	C3orf70 (ENSCCAG00000024959)	EHHADH (ENSCCAG00000032559)	MAP3K13 (ENSCCAG00000034196)	ENSCCAG00000019766	TMEM41A (ENSCCAG00000037561)	LIPH (ENSCCAG00000032080)	SENP2 (ENSCCAG00000026576)	IGF2BP2 (ENSCCAG00000034879)	ENSCCAG00000034367	TRA2B (ENSCCAG00000021227)
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	62	HTR3C (ENSSBOG00000029560)	ENSSBOG00000012724	HTR3E (ENSSBOG00000021223)	EIF2B5 (ENSSBOG00000028500)	DVL3 (ENSSBOG00000035979)	ENSSBOG00000033126	ABCF3 (ENSSBOG00000029094)	VWA5B2 (ENSSBOG00000026464)	ALG3 (ENSSBOG00000029414)	ECE2 (ENSSBOG00000032623)	CAMK2N2 (ENSSBOG00000025366)	PSMD2 (ENSSBOG00000023851)	EIF4G1 (ENSSBOG00000026347)	FAM131A (ENSSBOG00000023167) #20	CLCN2 (ENSSBOG00000027612) #21	POLR2H (ENSSBOG00000033101) #22	THPO (ENSSBOG00000003075) #23	CHRD (ENSSBOG00000017364) #24	EPHB3 (ENSSBOG00000033735)	VPS8 (ENSSBOG00000035918)	C3orf70 (ENSSBOG00000010200)	EHHADH (ENSSBOG00000027792)	MAP3K13 (ENSSBOG00000036137)	TMEM41A (ENSSBOG00000025942)	LIPH (ENSSBOG00000024446)	SENP2 (ENSSBOG00000028956)	IGF2BP2 (ENSSBOG00000021548)	ENSSBOG00000025205	ENSSBOG00000033780	TRA2B (ENSSBOG00000034804)	ENSSBOG00000020514
Marmoset	MODERN SPECIES	6	HTR3C (ENSCJAG00000013149)	HTR3E (ENSCJAG00000013139)	EIF2B5 (ENSCJAG00000013108)	DVL3 (ENSCJAG00000013060)	AP2M1 (ENSCJAG00000012998)	ABCF3 (ENSCJAG00000012959)	VWA5B2 (ENSCJAG00000015206)	ALG3 (ENSCJAG00000015172)	EEF1AKMT4 (ENSCJAG00000065303)	CAMK2N2 (ENSCJAG00000022233)	ECE2 (ENSCJAG00000015132)	PSMD2 (ENSCJAG00000034394)	EIF4G1 (ENSCJAG00000014999)	FAM131A (ENSCJAG00000046825) #20	CLCN2 (ENSCJAG00000014964) #21	POLR2H (ENSCJAG00000014959) #22	ENSCJAG00000048180 #23	CHRD (ENSCJAG00000014925) #24	ENSCJAG00000077185	EPHB3 (ENSCJAG00000014911)	ENSCJAG00000078189	MAGEF1 (ENSCJAG00000022232)	VPS8 (ENSCJAG00000014866)	C3orf70 (ENSCJAG00000022231)	EHHADH (ENSCJAG00000057316)	MAP3K13 (ENSCJAG00000014818)	TMEM41A (ENSCJAG00000046285)	LIPH (ENSCJAG00000014798)	SENP2 (ENSCJAG00000014775)	IGF2BP2 (ENSCJAG00000014731)	TRA2B (ENSCJAG00000014710)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	793	ABCC5 (ENSANAG00000022138)	HTR3C (ENSANAG00000038263)	HTR3E (ENSANAG00000037618)	EIF2B5 (ENSANAG00000030694)	DVL3 (ENSANAG00000020734)	AP2M1 (ENSANAG00000035232)	ABCF3 (ENSANAG00000032695)	VWA5B2 (ENSANAG00000023436)	ALG3 (ENSANAG00000036858)	CAMK2N2 (ENSANAG00000026673)	ECE2 (ENSANAG00000036188)	PSMD2 (ENSANAG00000014874)	EIF4G1 (ENSANAG00000029514)	FAM131A (ENSANAG00000025503) #20	CLCN2 (ENSANAG00000029687) #21	POLR2H (ENSANAG00000020244) #22	THPO (ENSANAG00000018591) #23	CHRD (ENSANAG00000023833) #24	EPHB3 (ENSANAG00000002566)	VPS8 (ENSANAG00000004123)	C3orf70 (ENSANAG00000031232)	EHHADH (ENSANAG00000029291)	MAP3K13 (ENSANAG00000020466)	ENSANAG00000023228	LIPH (ENSANAG00000032573)	ENSANAG00000033678	ENSANAG00000025957	IGF2BP2 (ENSANAG00000031810)
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B.a	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000163412	ENSGT01100000266984	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913.g.a	ENSGT00950000183009
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000163899	ENSGT01020000230401.a.a.b.b.t.eb	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B.a	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000163412	ENSGT01100000266984	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913.g.a	ENSGT00950000183009
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	67	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT01020000230401.a.a.b.b.t.eb	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000156921	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000153386.B.a	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951.m	ENSGT00940000154913.g.a	ENSGT00910000144347.w.b.a.b	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000160680
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	193	HTR3D (ENSRBIG00000032796)	HTR3C (ENSRBIG00000036099)	HTR3E (ENSRBIG00000033134)	ENSRBIG00000035285	EIF2B5 (ENSRBIG00000043590)	DVL3 (ENSRBIG00000028805)	AP2M1 (ENSRBIG00000009213)	ABCF3 (ENSRBIG00000019800)	VWA5B2 (ENSRBIG00000032106)	ALG3 (ENSRBIG00000040140)	ECE2 (ENSRBIG00000036172)	PSMD2 (ENSRBIG00000006300)	EIF4G1 (ENSRBIG00000037279)	FAM131A (ENSRBIG00000041210) #20	CLCN2 (ENSRBIG00000005264) #21	POLR2H (ENSRBIG00000032148) #22	THPO (ENSRBIG00000042346) #23	CHRD (ENSRBIG00000026452) #24	EPHB3 (ENSRBIG00000029113)	MAGEF1 (ENSRBIG00000024480)	VPS8 (ENSRBIG00000037729)	EHHADH (ENSRBIG00000039839)	MAP3K13 (ENSRBIG00000031196)	TMEM41A (ENSRBIG00000039643)	LIPH (ENSRBIG00000024834)	ENSRBIG00000039436	IGF2BP2 (ENSRBIG00000044700)	ENSRBIG00000034338	TRA2B (ENSRBIG00000042036)	ETV5 (ENSRBIG00000030144)	DGKG (ENSRBIG00000033670)
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1274	HTR3C (ENSRROG00000040115)	HTR3E (ENSRROG00000008280)	ENSRROG00000032052	EIF2B5 (ENSRROG00000037560)	DVL3 (ENSRROG00000034279)	AP2M1 (ENSRROG00000036642)	ABCF3 (ENSRROG00000043684)	VWA5B2 (ENSRROG00000035763)	ALG3 (ENSRROG00000045654)	CAMK2N2 (ENSRROG00000041861)	ECE2 (ENSRROG00000002110)	PSMD2 (ENSRROG00000044729)	EIF4G1 (ENSRROG00000004376)	FAM131A (ENSRROG00000029240) #20	CLCN2 (ENSRROG00000034513) #21	POLR2H (ENSRROG00000040465) #22	THPO (ENSRROG00000044393) #23	CHRD (ENSRROG00000045705) #24	EPHB3 (ENSRROG00000018942)	MAGEF1 (ENSRROG00000006271)	ENSRROG00000021069	ENSRROG00000038770
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B.a	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000163412	ENSGT01100000266984	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913.g.a	ENSGT00950000183009
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	6	HTR3E (ENSCSAG00000013540)	EIF2B5 (ENSCSAG00000013546)	DVL3 (ENSCSAG00000013555)	AP2M1 (ENSCSAG00000013562)	ABCF3 (ENSCSAG00000013570)	ENSCSAG00000018881	VWA5B2 (ENSCSAG00000013625)	ALG3 (ENSCSAG00000013667)	CAMK2N2 (ENSCSAG00000013676)	EEF1AKMT4 (ENSCSAG00000013680)	ECE2 (ENSCSAG00000013685)	PSMD2 (ENSCSAG00000013695)	EIF4G1 (ENSCSAG00000013704)	FAM131A (ENSCSAG00000013711) #20	CLCN2 (ENSCSAG00000013719) #21	POLR2H (ENSCSAG00000013724) #22	THPO (ENSCSAG00000013734) #23	CHRD (ENSCSAG00000013808) #24	ENSCSAG00000013845	EPHB3 (ENSCSAG00000013918)	MAGEF1 (ENSCSAG00000018880)	VPS8 (ENSCSAG00000013962)	C3orf70 (ENSCSAG00000013974)	EHHADH (ENSCSAG00000013978)	MAP3K13 (ENSCSAG00000013988)	TMEM41A (ENSCSAG00000013993)	LIPH (ENSCSAG00000014004)	ENSCSAG00000018879	IGF2BP2 (ENSCSAG00000014019)	TRA2B (ENSCSAG00000014034)	ETV5 (ENSCSAG00000014046)
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B.a	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000163412	ENSGT01100000266984	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913.g.a	ENSGT00940000165389
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B.a	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT01100000266984	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913.g.a	ENSGT00940000165389	ENSGT00950000183009
Olive baboon	MODERN SPECIES	11	HTR3D (ENSPANG00000015215)	HTR3E (ENSPANG00000030960)	EIF2B5 (ENSPANG00000017089)	DVL3 (ENSPANG00000001019)	AP2M1 (ENSPANG00000012299)	ABCF3 (ENSPANG00000005352)	VWA5B2 (ENSPANG00000020342)	ALG3 (ENSPANG00000019141)	EEF1AKMT4 (ENSPANG00000038392)	CAMK2N2 (ENSPANG00000035922)	ECE2 (ENSPANG00000004695)	PSMD2 (ENSPANG00000009701)	EIF4G1 (ENSPANG00000009907)	FAM131A (ENSPANG00000009226) #20	CLCN2 (ENSPANG00000006013) #21	POLR2H (ENSPANG00000020585) #22	THPO (ENSPANG00000021682) #23	CHRD (ENSPANG00000004697) #24	ENSPANG00000043611	EPHB3 (ENSPANG00000020586)	MAGEF1 (ENSPANG00000025490)	ENSPANG00000042922	ENSPANG00000043884	VPS8 (ENSPANG00000020170)	C3orf70 (ENSPANG00000010170)	EHHADH (ENSPANG00000004698)	MAP3K13 (ENSPANG00000019213)	TMEM41A (ENSPANG00000018544)	LIPH (ENSPANG00000017806)	SENP2 (ENSPANG00000008047)	IGF2BP2 (ENSPANG00000007053)
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	52	ENSGT00940000156739.b.b.a	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B.a	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT01100000266984	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913.g.a	ENSGT00940000165389	ENSGT00950000183009
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	424	HTR3D (ENSCATG00000039231)	HTR3C (ENSCATG00000043397)	HTR3E (ENSCATG00000044422)	EIF2B5 (ENSCATG00000043245)	DVL3 (ENSCATG00000039827)	AP2M1 (ENSCATG00000042400)	ABCF3 (ENSCATG00000042195)	VWA5B2 (ENSCATG00000041491)	ALG3 (ENSCATG00000002971)	CAMK2N2 (ENSCATG00000044862)	ECE2 (ENSCATG00000037480)	PSMD2 (ENSCATG00000037182)	EIF4G1 (ENSCATG00000009656)	FAM131A (ENSCATG00000040934) #20	CLCN2 (ENSCATG00000039019) #21	POLR2H (ENSCATG00000045313) #22	THPO (ENSCATG00000029879) #23	CHRD (ENSCATG00000033542) #24	EPHB3 (ENSCATG00000039267)	MAGEF1 (ENSCATG00000007663)	VPS8 (ENSCATG00000043704)	C3orf70 (ENSCATG00000044227)	EHHADH (ENSCATG00000026843)	ENSCATG00000033245	MAP3K13 (ENSCATG00000037932)	TMEM41A (ENSCATG00000032720)	LIPH (ENSCATG00000040040)	SENP2 (ENSCATG00000043579)	IGF2BP2 (ENSCATG00000036407)	ENSCATG00000029225	TRA2B (ENSCATG00000040153)
Drill	MODERN SPECIES	835					EIF2B5 (ENSMLEG00000028338)	DVL3 (ENSMLEG00000033587)	AP2M1 (ENSMLEG00000037216)	ABCF3 (ENSMLEG00000042008)	VWA5B2 (ENSMLEG00000027486)	ALG3 (ENSMLEG00000035248)	ECE2 (ENSMLEG00000036718)	PSMD2 (ENSMLEG00000035735)	EIF4G1 (ENSMLEG00000035567)	FAM131A (ENSMLEG00000037842) #20	CLCN2 (ENSMLEG00000027990) #21	POLR2H (ENSMLEG00000039827) #22	THPO (ENSMLEG00000034666) #23	CHRD (ENSMLEG00000031355) #24	EPHB3 (ENSMLEG00000044283)	MAGEF1 (ENSMLEG00000027002)	VPS8 (ENSMLEG00000042688)	EHHADH (ENSMLEG00000041567)	MAP3K13 (ENSMLEG00000029983)	TMEM41A (ENSMLEG00000042391)	LIPH (ENSMLEG00000021383)	SENP2 (ENSMLEG00000029477)	IGF2BP2 (ENSMLEG00000039422)	ENSMLEG00000036287	TRA2B (ENSMLEG00000005550)	ETV5 (ENSMLEG00000039363)	DGKG (ENSMLEG00000031083)
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B.a	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000163412	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913.g.a	ENSGT00940000165389	ENSGT00950000183009
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B.a	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913.g.a	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000163340	ENSGT00940000160680
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	11	HTR3C (ENSMFAG00000042002)	HTR3E (ENSMFAG00000001496)	EIF2B5 (ENSMFAG00000045589)	DVL3 (ENSMFAG00000035356)	AP2M1 (ENSMFAG00000024802)	ABCF3 (ENSMFAG00000000479)	VWA5B2 (ENSMFAG00000033707)	ALG3 (ENSMFAG00000001621)	EEF1AKMT4 (ENSMFAG00000061218)	CAMK2N2 (ENSMFAG00000062559)	ECE2 (ENSMFAG00000045351)	PSMD2 (ENSMFAG00000037802)	EIF4G1 (ENSMFAG00000034331)	FAM131A (ENSMFAG00000028860) #20	CLCN2 (ENSMFAG00000041358) #21	POLR2H (ENSMFAG00000038115) #22	THPO (ENSMFAG00000044370) #23	CHRD (ENSMFAG00000001808) #24	EPHB3 (ENSMFAG00000037014)	ENSMFAG00000054411	VPS8 (ENSMFAG00000044357)	C3orf70 (ENSMFAG00000063392)	EHHADH (ENSMFAG00000064074)	MAP3K13 (ENSMFAG00000043040)	TMEM41A (ENSMFAG00000037943)	ENSMFAG00000062847	LIPH (ENSMFAG00000002524)	SENP2 (ENSMFAG00000002841)	IGF2BP2 (ENSMFAG00000039540)	TRA2B (ENSMFAG00000042624)	ENSMFAG00000002453
Rhesus	MODERN SPECIES	11	HTR3D (ENSMMUG00000040299)	HTR3C (ENSMMUG00000013846)	HTR3E (ENSMMUG00000047491)	EIF2B5 (ENSMMUG00000006562)	DVL3 (ENSMMUG00000006553)	AP2M1 (ENSMMUG00000006557)	ABCF3 (ENSMMUG00000006558)	VWA5B2 (ENSMMUG00000018949)	ALG3 (ENSMMUG00000018951)	ECE2 (ENSMMUG00000018955)	CAMK2N2 (ENSMMUG00000018956)	PSMD2 (ENSMMUG00000000800)	EIF4G1 (ENSMMUG00000010934)	FAM131A (ENSMMUG00000007503) #20	CLCN2 (ENSMMUG00000007507) #21	POLR2H (ENSMMUG00000007524) #22	THPO (ENSMMUG00000007525) #23	CHRD (ENSMMUG00000007528) #24	EPHB3 (ENSMMUG00000003304)	MAGEF1 (ENSMMUG00000002953)	VPS8 (ENSMMUG00000000425)	C2H3orf70 (ENSMMUG00000059767)	EHHADH (ENSMMUG00000053997)	MAP3K13 (ENSMMUG00000023814)	TMEM41A (ENSMMUG00000046626)	SENP2 (ENSMMUG00000013018)	IGF2BP2 (ENSMMUG00000023416)	ENSMMUG00000059287	TRA2B (ENSMMUG00000001185)	ENSMMUG00000041182	ETV5 (ENSMMUG00000013610)
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	563	ABCC5 (ENSMNEG00000030465)	HTR3D (ENSMNEG00000036660)	HTR3C (ENSMNEG00000036620)	EIF2B5 (ENSMNEG00000035864)	DVL3 (ENSMNEG00000030669)	AP2M1 (ENSMNEG00000037624)	ABCF3 (ENSMNEG00000025213)	VWA5B2 (ENSMNEG00000034270)	ALG3 (ENSMNEG00000023448)	ECE2 (ENSMNEG00000041186)	CAMK2N2 (ENSMNEG00000037400)	PSMD2 (ENSMNEG00000036128)	EIF4G1 (ENSMNEG00000037668)	FAM131A (ENSMNEG00000042277) #20	CLCN2 (ENSMNEG00000031059) #21	POLR2H (ENSMNEG00000037272) #22	THPO (ENSMNEG00000032607) #23	CHRD (ENSMNEG00000043026) #24	EPHB3 (ENSMNEG00000041937)	MAGEF1 (ENSMNEG00000001725)	VPS8 (ENSMNEG00000033716)	C3orf70 (ENSMNEG00000039646)	EHHADH (ENSMNEG00000035474)	MAP3K13 (ENSMNEG00000041428)	ENSMNEG00000033877	LIPH (ENSMNEG00000030357)	SENP2 (ENSMNEG00000043899)	IGF2BP2 (ENSMNEG00000042466)	ENSMNEG00000042433	TRA2B (ENSMNEG00000034273)	ENSMNEG00000041807
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B.a	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913.g.a	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000163340	ENSGT00940000160680
Gibbon	MODERN SPECIES	1	ENSNLEG00000034463	HTR3C (ENSNLEG00000026619)	HTR3E (ENSNLEG00000026869)	EIF2B5 (ENSNLEG00000006103)	ENSNLEG00000029322	DVL3 (ENSNLEG00000006124)	AP2M1 (ENSNLEG00000006139)	ABCF3 (ENSNLEG00000006173)	VWA5B2 (ENSNLEG00000006214)	ALG3 (ENSNLEG00000006230)	ECE2 (ENSNLEG00000006276)	PSMD2 (ENSNLEG00000006305)	EIF4G1 (ENSNLEG00000006350)	FAM131A (ENSNLEG00000027935) #20	CLCN2 (ENSNLEG00000006373) #21	ENSNLEG00000029447 #22	THPO (ENSNLEG00000006409) #23	CHRD (ENSNLEG00000006417) #24	ENSNLEG00000018953	EPHB3 (ENSNLEG00000006254)	MAGEF1 (ENSNLEG00000018943)	VPS8 (ENSNLEG00000006431)	C3orf70 (ENSNLEG00000006443)	EHHADH (ENSNLEG00000006445)	ENSNLEG00000036008	ENSNLEG00000030523	MAP3K13 (ENSNLEG00000006452)	ENSNLEG00000006465	LIPH (ENSNLEG00000006469)	SENP2 (ENSNLEG00000006484)	IGF2BP2 (ENSNLEG00000006508)
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899	ENSGT00510000047568	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B.a	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913.g.a	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000163340	ENSGT00940000160680
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000163899.c	ENSGT00510000047568	ENSGT00390000008610.a.b.a.a.a.s.b	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B.a	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00390000018145.cb.a.b.a.b	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951.o	ENSGT00940000154913.g.a	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000163340
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000163899.c	ENSGT00510000047568	ENSGT00390000008610.a.b.a.a.a.s.b	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000164140	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000156921	ENSGT00940000153386.B.a	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00390000018145.cb.a.b.a.b	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951.o	ENSGT00940000154913.g.a	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000163340
Pan	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156739.b.a	ENSGT00940000163899.d	ENSGT00510000047568	ENSGT00390000008610.a.b.a.a.a.s.b	ENSGT00950000182903.a.a	ENSGT00940000159223	ENSGT00940000155604	ENSGT00940000157096	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000156921	ENSGT00390000004940.a.a	ENSGT00940000153386.B.a	ENSGT00940000154648.a.a	ENSGT00950000183106.a.a.b #20	ENSGT00940000155439 #21	ENSGT00390000018195 #22	ENSGT00390000006294 #23	ENSGT00940000161767 #24	ENSGT00940000158024.C	ENSGT00940000163736	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00390000018145.cb.a.b.a.b	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951.o	ENSGT00940000154913.g.a	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000163340
Chimpanzee	MODERN SPECIES	16	HTR3E (ENSPTRG00000015678)	ENSPTRG00000050156	EIF2B5 (ENSPTRG00000015679)	ENSPTRG00000015680	DVL3 (ENSPTRG00000015681)	AP2M1 (ENSPTRG00000015682)	ABCF3 (ENSPTRG00000015683)	VWA5B2 (ENSPTRG00000015685)	ALG3 (ENSPTRG00000047056)	ECE2 (ENSPTRG00000015687)	CAMK2N2 (ENSPTRG00000015688)	PSMD2 (ENSPTRG00000015689)	EIF4G1 (ENSPTRG00000015690)	FAM131A (ENSPTRG00000015691) #20	CLCN2 (ENSPTRG00000015692) #21	POLR2H (ENSPTRG00000047600) #22	THPO (ENSPTRG00000015694) #23	CHRD (ENSPTRG00000015695) #24	EPHB3 (ENSPTRG00000015696)	MAGEF1 (ENSPTRG00000015697)	VPS8 (ENSPTRG00000015698)	C3H3orf70 (ENSPTRG00000052586)	EHHADH (ENSPTRG00000015699)	MAP3K13 (ENSPTRG00000015700)	ENSPTRG00000039091	TMEM41A (ENSPTRG00000015701)	LIPH (ENSPTRG00000015702)	SENP2 (ENSPTRG00000015703)	IGF2BP2 (ENSPTRG00000015705)	TRA2B (ENSPTRG00000015707)	ENSPTRG00000049385
Bonobo	MODERN SPECIES	16	HTR3C (ENSPPAG00000039021)	HTR3E (ENSPPAG00000028726)	ENSPPAG00000026468	EIF2B5 (ENSPPAG00000030604)	ENSPPAG00000033710	DVL3 (ENSPPAG00000041835)	AP2M1 (ENSPPAG00000035664)	ABCF3 (ENSPPAG00000041562)	VWA5B2 (ENSPPAG00000027581)	ALG3 (ENSPPAG00000027959)	ECE2 (ENSPPAG00000027988)	PSMD2 (ENSPPAG00000035691)	EIF4G1 (ENSPPAG00000042782)	FAM131A (ENSPPAG00000036558) #20	CLCN2 (ENSPPAG00000032193) #21	POLR2H (ENSPPAG00000035658) #22	THPO (ENSPPAG00000031907) #23	CHRD (ENSPPAG00000034959) #24	EPHB3 (ENSPPAG00000034296)	MAGEF1 (ENSPPAG00000023136)	VPS8 (ENSPPAG00000038646)	ENSPPAG00000027965	EHHADH (ENSPPAG00000041357)	MAP3K13 (ENSPPAG00000033601)	ENSPPAG00000031324	TMEM41A (ENSPPAG00000028753)	LIPH (ENSPPAG00000038711)	SENP2 (ENSPPAG00000040440)	IGF2BP2 (ENSPPAG00000034539)	TRA2B (ENSPPAG00000034619)	ENSPPAG00000038181
Human	MODERN SPECIES	15	HTR3E (ENSG00000186038)	EIF2B5 (ENSG00000145191)	DVL3 (ENSG00000161202)	AP2M1 (ENSG00000161203)	ABCF3 (ENSG00000161204)	VWA5B2 (ENSG00000145198)	ALG3 (ENSG00000214160)	EEF1AKMT4 (ENSG00000284753)	EEF1AKMT4-ECE2 (ENSG00000284917)	CAMK2N2 (ENSG00000163888)	ECE2 (ENSG00000145194)	PSMD2 (ENSG00000175166)	EIF4G1 (ENSG00000114867)	FAM131A (ENSG00000175182) #20	CLCN2 (ENSG00000114859) #21	POLR2H (ENSG00000163882) #22	THPO (ENSG00000090534) #23	CHRD (ENSG00000090539) #24	EPHB3 (ENSG00000182580)	MAGEF1 (ENSG00000177383)	VPS8 (ENSG00000156931)	C3orf70 (ENSG00000187068)	EHHADH (ENSG00000113790)	MAP3K13 (ENSG00000073803)	TMEM41A (ENSG00000163900)	LIPH (ENSG00000163898)	SENP2 (ENSG00000163904)	IGF2BP2 (ENSG00000073792)	TRA2B (ENSG00000136527)	ETV5 (ENSG00000244405)	DGKG (ENSG00000058866)
Gorilla	MODERN SPECIES	16	ENSGGOG00000036841	ENSGGOG00000007484	HTR3C (ENSGGOG00000039758)	HTR3E (ENSGGOG00000041086)	EIF2B5 (ENSGGOG00000007425)	ENSGGOG00000026674	DVL3 (ENSGGOG00000007433)	AP2M1 (ENSGGOG00000007445)	ABCF3 (ENSGGOG00000007448)	VWA5B2 (ENSGGOG00000007552)	ALG3 (ENSGGOG00000007563)	EEF1AKMT4-ECE2 (ENSGGOG00000007568)	CAMK2N2 (ENSGGOG00000001936)	PSMD2 (ENSGGOG00000027136)	EIF4G1 (ENSGGOG00000013919)	POLR2H (ENSGGOG00000002912) #22	ENSGGOG00000038977 #21	THPO (ENSGGOG00000000109) #23	CHRD (ENSGGOG00000000110) #24	EPHB3 (ENSGGOG00000016281)	MAGEF1 (ENSGGOG00000009456)	VPS8 (ENSGGOG00000013880)	C3orf70 (ENSGGOG00000038959)	EHHADH (ENSGGOG00000007702)	ENSGGOG00000040789	MAP3K13 (ENSGGOG00000012960)	ENSGGOG00000037271	TMEM41A (ENSGGOG00000037311)	LIPH (ENSGGOG00000013546)	SENP2 (ENSGGOG00000015642)	IGF2BP2 (ENSGGOG00000015035)
Orangutan	MODERN SPECIES	16	ENSPPYG00000014343	EIF2B5 (ENSPPYG00000014344)	ENSPPYG00000037065	DVL3 (ENSPPYG00000014345)	AP2M1 (ENSPPYG00000014346)	ABCF3 (ENSPPYG00000014347)	VWA5B2 (ENSPPYG00000014349)	ALG3 (ENSPPYG00000014350)	EEF1AKMT4 (ENSPPYG00000014351)	CAMK2N2 (ENSPPYG00000014352)	ECE2 (ENSPPYG00000014353)	PSMD2 (ENSPPYG00000014354)	EIF4G1 (ENSPPYG00000025902)	ENSPPYG00000014355 #20	CLCN2 (ENSPPYG00000014356) #21	POLR2H (ENSPPYG00000014357) #22	ENSPPYG00000014358 #23	CHRD (ENSPPYG00000014359) #24	EPHB3 (ENSPPYG00000032019)	MAGEF1 (ENSPPYG00000014361)	VPS8 (ENSPPYG00000014362)	C3orf70 (ENSPPYG00000014363)	EHHADH (ENSPPYG00000014364)	MAP3K13 (ENSPPYG00000014365)	TMEM41A (ENSPPYG00000014366)	LIPH (ENSPPYG00000014367)	SENP2 (ENSPPYG00000014368)	IGF2BP2 (ENSPPYG00000014373)	TRA2B (ENSPPYG00000014374)	ENSPPYG00000014375	ETV5 (ENSPPYG00000014376)