Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES	1165																ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	641													ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	55	ENSGT00940000167209	ENSGT00940000160504	ENSGT00940000160992	ENSGT00940000165326	ENSGT00940000157034	ENSGT00940000155393.d	ENSGT00940000157669	ENSGT00940000155543	ENSGT00940000157582	ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163923	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000154868.a.b	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B	ENSGT00940000156585	ENSGT00390000013174	ENSGT00940000155194	ENSGT00940000161879
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT00940000167209	ENSGT00940000160504	ENSGT00940000160992	ENSGT00940000165326	ENSGT00940000157034	ENSGT00940000155393.d	ENSGT00940000157669	ENSGT00940000155543	ENSGT00940000157582	ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163923	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000157531	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000154868.a.b	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00960000189819	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	35												ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163923	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000154868.a.b	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163923	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B	ENSGT01090000260040.b.b.b.a
Theria	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Primates	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a.`b	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a.`b	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	691						RPA2 (ENSPSMG00000022009) #12	THEMIS2 (ENSPSMG00000021997) #13	PPP1R8 (ENSPSMG00000021970) #14	ENSPSMG00000021962 #15	STX12 (ENSPSMG00000021953) #16	ENSPSMG00000021867 #17	ENSPSMG00000021791 #18	IFI6 (ENSPSMG00000021789) #19	FGR (ENSPSMG00000021779) #20	AHDC1 (ENSPSMG00000021757) #21	WASF2 (ENSPSMG00000021751) #22
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	344	PHACTR4 (ENSPCOG00000015433)	MED18 (ENSPCOG00000022541)	SESN2 (ENSPCOG00000023322)	ATP5IF1 (ENSPCOG00000028473)	EYA3 (ENSPCOG00000009524)	XKR8 (ENSPCOG00000009916)	SMPDL3B (ENSPCOG00000026165)	RPA2 (ENSPCOG00000023673) #12	THEMIS2 (ENSPCOG00000002667) #13	PPP1R8 (ENSPCOG00000013455) #14	STX12 (ENSPCOG00000014712) #16	FAM76A (ENSPCOG00000017956) #17	IFI6 (ENSPCOG00000019541) #19	FGR (ENSPCOG00000021101) #20	AHDC1 (ENSPCOG00000012355) #21	WASF2 (ENSPCOG00000018308) #22	GPR3 (ENSPCOG00000007979)	CD164L2 (ENSPCOG00000008888)	FCN3 (ENSPCOG00000024318)	MAP3K6 (ENSPCOG00000027489)	SYTL1 (ENSPCOG00000017349)	TMEM222 (ENSPCOG00000015289)	WDTC1 (ENSPCOG00000019286)	SLC9A1 (ENSPCOG00000028671)	TENT5B (ENSPCOG00000011763)	ENSPCOG00000023329	KDF1 (ENSPCOG00000017396)	NUDC (ENSPCOG00000026222)	NR0B2 (ENSPCOG00000024094)	GPATCH3 (ENSPCOG00000020145)	GPN2 (ENSPCOG00000016261)
Mouse lemur	MODERN SPECIES	11	ATP5IF1 (ENSMICG00000001227)	ENSMICG00000001222	PTAFR (ENSMICG00000047486)	EYA3 (ENSMICG00000011109)	XKR8 (ENSMICG00000047287)	SMPDL3B (ENSMICG00000011091)	RPA2 (ENSMICG00000042716) #12	THEMIS2 (ENSMICG00000011084) #13	ENSMICG00000036349	PPP1R8 (ENSMICG00000043807) #14	ENSMICG00000011066 #16	FAM76A (ENSMICG00000038656) #17	IFI6 (ENSMICG00000008189) #19	FGR (ENSMICG00000006166) #20	AHDC1 (ENSMICG00000029375) #21	WASF2 (ENSMICG00000015799) #22	GPR3 (ENSMICG00000044683)	CD164L2 (ENSMICG00000015791)	FCN3 (ENSMICG00000015785)	MAP3K6 (ENSMICG00000015758)	SYTL1 (ENSMICG00000015733)	TMEM222 (ENSMICG00000015726)	WDTC1 (ENSMICG00000015711)	SLC9A1 (ENSMICG00000015698)	TENT5B (ENSMICG00000033781)	KDF1 (ENSMICG00000043402)	NUDC (ENSMICG00000027846)	NR0B2 (ENSMICG00000032290)	GPATCH3 (ENSMICG00000015656)	GPN2 (ENSMICG00000029529)	SFN (ENSMICG00000015648)
Bushbaby	MODERN SPECIES	271	SESN2 (ENSOGAG00000010330)	ENSOGAG00000010337	ENSOGAG00000015597	PTAFR (ENSOGAG00000029942)	XKR8 (ENSOGAG00000015591)	SMPDL3B (ENSOGAG00000015590)	RPA2 (ENSOGAG00000015583) #12	THEMIS2 (ENSOGAG00000015580) #13	EYA3 (ENSOGAG00000015592)	ENSOGAG00000015577 #14	STX12 (ENSOGAG00000015570) #16	FAM76A (ENSOGAG00000015566) #17	IFI6 (ENSOGAG00000027393) #19	FGR (ENSOGAG00000015559) #20	AHDC1 (ENSOGAG00000034492) #21	WASF2 (ENSOGAG00000033524) #22	GPR3 (ENSOGAG00000029314)	CD164L2 (ENSOGAG00000015109)	FCN3 (ENSOGAG00000015106)	MAP3K6 (ENSOGAG00000015094)	SYTL1 (ENSOGAG00000015086)	TMEM222 (ENSOGAG00000015081)	WDTC1 (ENSOGAG00000015076)	SLC9A1 (ENSOGAG00000002087)	TENT5B (ENSOGAG00000002086)	TRNP1 (ENSOGAG00000029493)	KDF1 (ENSOGAG00000002084)	NUDC (ENSOGAG00000002080)	NR0B2 (ENSOGAG00000002078)	GPATCH3 (ENSOGAG00000011647)	GPN2 (ENSOGAG00000033911)
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Tarsier	MODERN SPECIES	4840						SLC4A4 (ENSTSYG00000001802)	ENSTSYG00000026757	RPA2 (ENSTSYG00000010706) #12	THEMIS2 (ENSTSYG00000031992) #13	PPP1R8 (ENSTSYG00000010379) #14	STX12 (ENSTSYG00000035844) #16	FAM76A (ENSTSYG00000004933) #17	IFI6 (ENSTSYG00000001596) #19	FGR (ENSTSYG00000030870) #20	AHDC1 (ENSTSYG00000010630) #21	WASF2 (ENSTSYG00000014297) #22	GPR3 (ENSTSYG00000034225)	CD164L2 (ENSTSYG00000033975)	FCN3 (ENSTSYG00000012269)	MAP3K6 (ENSTSYG00000012237)	SYTL1 (ENSTSYG00000029347)	TMEM222 (ENSTSYG00000033362)	WDTC1 (ENSTSYG00000028104)	SLC9A1 (ENSTSYG00000035533)	FAM46B (ENSTSYG00000035698)	KDF1 (ENSTSYG00000027104)	NUDC (ENSTSYG00000003312)	NR0B2 (ENSTSYG00000033702)	GPATCH3 (ENSTSYG00000011753)	GPN2 (ENSTSYG00000011752)	SFN (ENSTSYG00000013087)
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a.fb.b.b.a	ENSGT00390000012569.a.fb.b.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045.g.b #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a.fb.a.b.a	ENSGT00390000015229.p	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045.g.b.a #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a.fb.a.b.a	ENSGT00390000015229.p	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045.g.b.a #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a.fb.a.b.a	ENSGT00390000015229.p	ENSGT00390000012569.a.fb.a.b.b	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045.g.b.a #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B	ENSGT01090000260040.b.b.b.a
Capuchin	MODERN SPECIES	87	DNAJC8 (ENSCCAG00000026898)	ENSCCAG00000027313	EYA3 (ENSCCAG00000024843)	XKR8 (ENSCCAG00000033700)	SMPDL3B (ENSCCAG00000023858)	RPA2 (ENSCCAG00000025366) #12	THEMIS2 (ENSCCAG00000035270) #13	PPP1R8 (ENSCCAG00000025347) #14	STX12 (ENSCCAG00000023253) #16	ENSCCAG00000031655	FAM76A (ENSCCAG00000032340) #17	IFI6 (ENSCCAG00000033587) #19	FGR (ENSCCAG00000026723) #20	AHDC1 (ENSCCAG00000019652) #21	ENSCCAG00000019701	WASF2 (ENSCCAG00000033324) #22	GPR3 (ENSCCAG00000000295)	CD164L2 (ENSCCAG00000023007)	FCN3 (ENSCCAG00000022265)	MAP3K6 (ENSCCAG00000019188)	SYTL1 (ENSCCAG00000024708)	WDTC1 (ENSCCAG00000026157)	SLC9A1 (ENSCCAG00000026782)	TENT5B (ENSCCAG00000036493)	ENSCCAG00000028136	ENSCCAG00000020074	KDF1 (ENSCCAG00000015434)	NUDC (ENSCCAG00000033425)	NR0B2 (ENSCCAG00000030627)	GPATCH3 (ENSCCAG00000030482)	GPN2 (ENSCCAG00000027501)
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	44									PPP1R8 (ENSSBOG00000032910) #14	STX12 (ENSSBOG00000014436) #16	FAM76A (ENSSBOG00000026158) #17	IFI6 (ENSSBOG00000034960) #19	FGR (ENSSBOG00000033596) #20	AHDC1 (ENSSBOG00000026685) #21	ENSSBOG00000002550	WASF2 (ENSSBOG00000022556) #22	GPR3 (ENSSBOG00000015463)	CD164L2 (ENSSBOG00000016074)	FCN3 (ENSSBOG00000035705)	MAP3K6 (ENSSBOG00000022232)	SYTL1 (ENSSBOG00000022361)	TMEM222 (ENSSBOG00000031879)	WDTC1 (ENSSBOG00000024363)	ENSSBOG00000026222	SLC9A1 (ENSSBOG00000034296)	TENT5B (ENSSBOG00000023376)	KDF1 (ENSSBOG00000022048)	NUDC (ENSSBOG00000035376)	NR0B2 (ENSSBOG00000026068)	GPATCH3 (ENSSBOG00000019680)	GPN2 (ENSSBOG00000031587)
Marmoset	MODERN SPECIES	19	ATP5IF1 (ENSCJAG00000048007)	ENSCJAG00000009556	PTAFR (ENSCJAG00000022642)	EYA3 (ENSCJAG00000009498)	XKR8 (ENSCJAG00000009496)	SMPDL3B (ENSCJAG00000009490)	RPA2 (ENSCJAG00000009473) #12	ENSCJAG00000009445 #13	PPP1R8 (ENSCJAG00000009406) #14	STX12 (ENSCJAG00000009378) #16	ENSCJAG00000077742	FAM76A (ENSCJAG00000009327) #17	IFI6 (ENSCJAG00000009319) #19	FGR (ENSCJAG00000009293) #20	AHDC1 (ENSCJAG00000009280) #21	WASF2 (ENSCJAG00000009264) #22	GPR3 (ENSCJAG00000009260)	CD164L2 (ENSCJAG00000009245)	FCN3 (ENSCJAG00000009233)	MAP3K6 (ENSCJAG00000009171)	SYTL1 (ENSCJAG00000009140)	TMEM222 (ENSCJAG00000009112)	WDTC1 (ENSCJAG00000009088)	SLC9A1 (ENSCJAG00000009011)	ENSCJAG00000072688	ENSCJAG00000083746	TENT5B (ENSCJAG00000060780)	TRNP1 (ENSCJAG00000046636)	KDF1 (ENSCJAG00000010076)	NUDC (ENSCJAG00000010033)	NR0B2 (ENSCJAG00000010029)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	1281	SESN2 (ENSANAG00000029947)	ATP5IF1 (ENSANAG00000029390)	ENSANAG00000033952	ENSANAG00000032813	EYA3 (ENSANAG00000024390)	XKR8 (ENSANAG00000020923)	SMPDL3B (ENSANAG00000029765)	ENSANAG00000033411	THEMIS2 (ENSANAG00000032929) #13	PPP1R8 (ENSANAG00000011047) #14	STX12 (ENSANAG00000034764) #16	FAM76A (ENSANAG00000034741) #17	IFI6 (ENSANAG00000034223) #19	FGR (ENSANAG00000033090) #20	AHDC1 (ENSANAG00000026196) #21	WASF2 (ENSANAG00000029609) #22	GPR3 (ENSANAG00000016515)	CD164L2 (ENSANAG00000024020)	FCN3 (ENSANAG00000030001)	MAP3K6 (ENSANAG00000027054)	SYTL1 (ENSANAG00000028160)	TMEM222 (ENSANAG00000029313)	ENSANAG00000023312	WDTC1 (ENSANAG00000025177)	SLC9A1 (ENSANAG00000028650)	ENSANAG00000016046	TENT5B (ENSANAG00000028081)	TRNP1 (ENSANAG00000032266)	ENSANAG00000021922	KDF1 (ENSANAG00000027498)	NUDC (ENSANAG00000028557)
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000012569.a.fb.b.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00940000154861.d	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045.g.b #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00390000001447.q	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000001376.bb.a.a	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Hominoidea	DUPLICATION
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Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	72															ENSGT00870000136506.ob.a.a	ENSGT00950000182962.b.a.g #22	ENSGT00910000147902
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Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000001278.b.a.b	ENSGT00940000160369	ENSGT00940000158975	ENSGT00940000156963.a.b	ENSGT00940000160485	ENSGT00390000001505.a.a	ENSGT00940000162890	ENSGT00940000163107	ENSGT00940000159633	ENSGT00940000161978	ENSGT00940000161081	ENSGT00940000161209	ENSGT00940000157571	ENSGT00390000018078	ENSGT00870000136506.ob.a.a	ENSGT00950000182962.b.a.g #22	ENSGT00910000147902	ENSGT00940000162553	ENSGT00940000162614	ENSGT00940000162205	ENSGT00940000163698	ENSGT00390000012484.e.a.b	ENSGT00390000012484.f.a.b.b.a.b.a	ENSGT00390000012484.f.a.b.b.a.a.a.b.a	ENSGT00390000012484.f.a.b.b.a.b.b.a	ENSGT00630000089895.x	ENSGT00940000161233	ENSGT00730000111146	ENSGT01030000234564.a.a.b.a	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00940000159173
Pan	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000001278.b.a.b	ENSGT00940000160369	ENSGT00940000158975	ENSGT00940000156963.a.b	ENSGT00940000160485	ENSGT00390000001505.a.a	ENSGT00940000162890	ENSGT00940000163107	ENSGT00940000159633	ENSGT00940000161978	ENSGT00940000161081	ENSGT00940000161209	ENSGT00940000157571	ENSGT00390000018078	ENSGT00870000136506.ob.a.a	ENSGT00950000182962.b.a.g #22	ENSGT00910000147902	ENSGT00940000162553	ENSGT00940000162614	ENSGT00940000162205	ENSGT00940000163698	ENSGT00390000012484.e.a.b	ENSGT00390000012484.f.a.b.b.a.b.a	ENSGT00390000012484.f.a.b.b.a.a.a.b.a	ENSGT00390000012484.f.a.b.b.a.b.b.a	ENSGT00630000089895.x	ENSGT00940000161233	ENSGT00730000111146	ENSGT01030000234564.a.a.b.a	ENSGT00530000063715.a	ENSGT00940000159173
Bonobo	MODERN SPECIES	369	RBM10 (ENSPPAG00000040583)	ENSPPAG00000034605	UBA1 (ENSPPAG00000039495)	CDK16 (ENSPPAG00000031958)	USP11 (ENSPPAG00000033692)	ENSPPAG00000036049	ZNF157 (ENSPPAG00000042083)	ZNF41 (ENSPPAG00000035075)	ARAF (ENSPPAG00000015632)	ENSPPAG00000028720	TIMP1 (ENSPPAG00000029120)	CFP (ENSPPAG00000039755)	ELK1 (ENSPPAG00000043075)	UXT (ENSPPAG00000029051)	ENSPPAG00000033508	ENSPPAG00000035272 #22	ENSPPAG00000025952	ZNF81 (ENSPPAG00000027628)	ZNF630 (ENSPPAG00000036338)	ENSPPAG00000037481	ENSPPAG00000029279	ENSPPAG00000034188	ENSPPAG00000035462	SSX3 (ENSPPAG00000043286)	ENSPPAG00000030049	SLC38A5 (ENSPPAG00000037376)	FTSJ1 (ENSPPAG00000028540)	PORCN (ENSPPAG00000032866)	ENSPPAG00000041670	TBC1D25 (ENSPPAG00000038374)	RBM3 (ENSPPAG00000034179)
Chimpanzee	MODERN SPECIES	972	RBM10 (ENSPTRG00000021837)	ENSPTRG00000047195	UBA1 (ENSPTRG00000051849)	CDK16 (ENSPTRG00000021840)	USP11 (ENSPTRG00000047301)	ENSPTRG00000042709	ZNF157 (ENSPTRG00000021842)	ZNF41 (ENSPTRG00000021843)	ARAF (ENSPTRG00000021846)	SYN1 (ENSPTRG00000043680)	ENSPTRG00000044804	CFP (ENSPTRG00000021849)	ELK1 (ENSPTRG00000021850)	UXT (ENSPTRG00000021851)	ENSPTRG00000047992	ENSPTRG00000000408 #22	ENSPTRG00000051718	ZNF81 (ENSPTRG00000023331)	ZNF182 (ENSPTRG00000028288)	ENSPTRG00000021853	ENSPTRG00000041924	ENSPTRG00000021919	ENSPTRG00000021921	ENSPTRG00000042703	ENSPTRG00000051358	ENSPTRG00000023969	ENSPTRG00000049383	SLC38A5 (ENSPTRG00000021860)	FTSJ1 (ENSPTRG00000049433)	PORCN (ENSPTRG00000047836)	EBP (ENSPTRG00000044865)
Gibbon	MODERN SPECIES	449	NDUFB11 (ENSNLEG00000003004)	RBM10 (ENSNLEG00000003018)	UBA1 (ENSNLEG00000003096)	CDK16 (ENSNLEG00000003184)	USP11 (ENSNLEG00000003207)	ENSNLEG00000031525	ZNF157 (ENSNLEG00000003324)	ZNF41 (ENSNLEG00000003328)	ENSNLEG00000036307	ENSNLEG00000003363	SYN1 (ENSNLEG00000026808)	CFP (ENSNLEG00000003373)	ELK1 (ENSNLEG00000003420)	UXT (ENSNLEG00000028907)	ENSNLEG00000030427	ENSNLEG00000003477 #22	ENSNLEG00000035243	ENSNLEG00000028377	ZNF81 (ENSNLEG00000003479)	ZNF182 (ENSNLEG00000003482)	ENSNLEG00000003487	ZNF630 (ENSNLEG00000003503)	ENSNLEG00000032650	ENSNLEG00000003612	ENSNLEG00000003614	ENSNLEG00000028121	ENSNLEG00000036118	ENSNLEG00000032683	FTSJ1 (ENSNLEG00000007816)	PORCN (ENSNLEG00000007822)	EBP (ENSNLEG00000007836)
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Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000012569.a.fb.b.a.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00940000154861.d	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045.g.b #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00550000076274	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a.h #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000001376.bb.a.a	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000012569.a.fb.b.a.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00940000154861.d	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045.g.b #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00550000076274	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a.h #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000001376.bb.a.a	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000012569.a.fb.b.a.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00940000154861.d	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045.g.b #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00550000076274	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a.h #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000001376.bb.a.a	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Pan	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01060000248589.D	ENSGT00940000154861.d	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045.g.b #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00550000076274	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00390000003710.d.c.a #18	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a.h #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00390000012818.o.a.b	ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.c	ENSGT00390000000903.a.f.a	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000001376.bb.a.a	ENSGT00390000016565
Chimpanzee	MODERN SPECIES		PTAFR (ENSPTRG00000000424)	ENSPTRG00000044631	EYA3 (ENSPTRG00000000423)	XKR8 (ENSPTRG00000000422)	SMPDL3B (ENSPTRG00000000421)	RPA2 (ENSPTRG00000000420) #12	THEMIS2 (ENSPTRG00000000419) #13	ENSPTRG00000052043	PPP1R8 (ENSPTRG00000000417) #14	STX12 (ENSPTRG00000000416) #16	FAM76A (ENSPTRG00000000414) #17	IFI6 (ENSPTRG00000000413) #19	ENSPTRG00000040060 #18	FGR (ENSPTRG00000000411) #20	AHDC1 (ENSPTRG00000000410) #21	WASF2 (ENSPTRG00000000409) #22	GPR3 (ENSPTRG00000044871)	CD164L2 (ENSPTRG00000000406)	FCN3 (ENSPTRG00000000405)	MAP3K6 (ENSPTRG00000000404)	SYTL1 (ENSPTRG00000000403)	TMEM222 (ENSPTRG00000000402)	WDTC1 (ENSPTRG00000000401)	ENSPTRG00000044112	ENSPTRG00000052422	ENSPTRG00000042092	SLC9A1 (ENSPTRG00000051037)	TENT5B (ENSPTRG00000000397)	TRNP1 (ENSPTRG00000046384)	ENSPTRG00000044717	KDF1 (ENSPTRG00000000396)
Bonobo	MODERN SPECIES		DNAJC8 (ENSPPAG00000032103)	PTAFR (ENSPPAG00000024566)	ENSPPAG00000041305	EYA3 (ENSPPAG00000038235)	XKR8 (ENSPPAG00000032312)	SMPDL3B (ENSPPAG00000033356)	RPA2 (ENSPPAG00000021088) #12	THEMIS2 (ENSPPAG00000031100) #13	ENSPPAG00000004249	PPP1R8 (ENSPPAG00000036845) #14	STX12 (ENSPPAG00000041257) #16	FAM76A (ENSPPAG00000033431) #17	IFI6 (ENSPPAG00000031946) #19	ENSPPAG00000005765 #18	FGR (ENSPPAG00000029323) #20	WASF2 (ENSPPAG00000041993) #22	GPR3 (ENSPPAG00000016740)	CD164L2 (ENSPPAG00000031928)	FCN3 (ENSPPAG00000038009)	MAP3K6 (ENSPPAG00000040813)	SYTL1 (ENSPPAG00000011464)	TMEM222 (ENSPPAG00000027696)	WDTC1 (ENSPPAG00000030849)	ENSPPAG00000040781	ENSPPAG00000027951	ENSPPAG00000031182	SLC9A1 (ENSPPAG00000043811)	TENT5B (ENSPPAG00000035934)	ENSPPAG00000041792	KDF1 (ENSPPAG00000030084)	NUDC (ENSPPAG00000000217)
Human	MODERN SPECIES		SESN2 (ENSG00000130766)	ATP5IF1 (ENSG00000130770)	DNAJC8 (ENSG00000126698)	PTAFR (ENSG00000169403)	EYA3 (ENSG00000158161)	XKR8 (ENSG00000158156)	SMPDL3B (ENSG00000130768)	RPA2 (ENSG00000117748) #12	THEMIS2 (ENSG00000130775) #13	PPP1R8 (ENSG00000117751) #14	STX12 (ENSG00000117758) #16	FAM76A (ENSG00000009780) #17	IFI6 (ENSG00000126709) #19	FGR (ENSG00000000938) #20	AHDC1 (ENSG00000126705) #21	WASF2 (ENSG00000158195) #22	GPR3 (ENSG00000181773)	CD164L2 (ENSG00000174950)	FCN3 (ENSG00000142748)	MAP3K6 (ENSG00000142733)	SYTL1 (ENSG00000142765)	TMEM222 (ENSG00000186501)	WDTC1 (ENSG00000142784)	SLC9A1 (ENSG00000090020)	TENT5B (ENSG00000158246)	TRNP1 (ENSG00000253368)	KDF1 (ENSG00000175707)	NR0B2 (ENSG00000131910)	NUDC (ENSG00000090273)	GPATCH3 (ENSG00000198746)	GPN2 (ENSG00000142751)
Gorilla	MODERN SPECIES		ENSGGOG00000043416	ENSGGOG00000023525	EYA3 (ENSGGOG00000008544)	XKR8 (ENSGGOG00000014917)	SMPDL3B (ENSGGOG00000014912)	RPA2 (ENSGGOG00000015287) #12	THEMIS2 (ENSGGOG00000009217) #13	ENSGGOG00000040440	ENSGGOG00000043200	PPP1R8 (ENSGGOG00000012062) #14	STX12 (ENSGGOG00000001668) #16	FAM76A (ENSGGOG00000006690) #17	IFI6 (ENSGGOG00000000776) #19	FGR (ENSGGOG00000000775) #20	AHDC1 (ENSGGOG00000014466) #21	WASF2 (ENSGGOG00000004436) #22	GPR3 (ENSGGOG00000041212)	CD164L2 (ENSGGOG00000025436)	FCN3 (ENSGGOG00000000047)	MAP3K6 (ENSGGOG00000000045)	SYTL1 (ENSGGOG00000000043)	TMEM222 (ENSGGOG00000000040)	WDTC1 (ENSGGOG00000012009)	ENSGGOG00000000755	ENSGGOG00000022556	ENSGGOG00000040604	ENSGGOG00000043274	SLC9A1 (ENSGGOG00000001596)	TENT5B (ENSGGOG00000008075)	ENSGGOG00000042470	KDF1 (ENSGGOG00000023640)
Orangutan	MODERN SPECIES		SESN2 (ENSPPYG00000001643)	ATP5IF1 (ENSPPYG00000001644)	ENSPPYG00000025833	PTAFR (ENSPPYG00000001647)	EYA3 (ENSPPYG00000001648)	XKR8 (ENSPPYG00000039433)	SMPDL3B (ENSPPYG00000001650)	RPA2 (ENSPPYG00000001651) #12	THEMIS2 (ENSPPYG00000001652) #13	PPP1R8 (ENSPPYG00000001654) #14	ENSPPYG00000001653	STX12 (ENSPPYG00000001655) #16	FAM76A (ENSPPYG00000001656) #17	IFI6 (ENSPPYG00000001658) #19	FGR (ENSPPYG00000001659) #20	WASF2 (ENSPPYG00000001661) #22	GPR3 (ENSPPYG00000001662)	CD164L2 (ENSPPYG00000001663)	FCN3 (ENSPPYG00000001664)	MAP3K6 (ENSPPYG00000001665)	SYTL1 (ENSPPYG00000001666)	TMEM222 (ENSPPYG00000001667)	WDTC1 (ENSPPYG00000001668)	ENSPPYG00000017919	SLC9A1 (ENSPPYG00000001669)	ENSPPYG00000033121	TENT5B (ENSPPYG00000038825)	TRNP1 (ENSPPYG00000036663)	KDF1 (ENSPPYG00000001672)	NUDC (ENSPPYG00000001673)	NR0B2 (ENSPPYG00000001674)
Gibbon	MODERN SPECIES	16	DNAJC8 (ENSNLEG00000009762)	PTAFR (ENSNLEG00000009760)	EYA3 (ENSNLEG00000009724)	XKR8 (ENSNLEG00000009722)	SMPDL3B (ENSNLEG00000009709)	RPA2 (ENSNLEG00000009702) #12	ENSNLEG00000009697 #13	ENSNLEG00000009695	PPP1R8 (ENSNLEG00000009676) #14	STX12 (ENSNLEG00000030651) #16	ENSNLEG00000029142	FAM76A (ENSNLEG00000027579) #17	IFI6 (ENSNLEG00000009659) #19	ENSNLEG00000009650 #20	AHDC1 (ENSNLEG00000034636) #21	ENSNLEG00000009635 #22	GPR3 (ENSNLEG00000028413)	CD164L2 (ENSNLEG00000009625)	FCN3 (ENSNLEG00000009613)	MAP3K6 (ENSNLEG00000009550)	SYTL1 (ENSNLEG00000009521)	TMEM222 (ENSNLEG00000009516)	WDTC1 (ENSNLEG00000009495)	ENSNLEG00000035618	SLC9A1 (ENSNLEG00000009434)	TENT5B (ENSNLEG00000009432)	NUDC (ENSNLEG00000009404)	NR0B2 (ENSNLEG00000009403)	GPATCH3 (ENSNLEG00000009387)	GPN2 (ENSNLEG00000009383)	SFN (ENSNLEG00000018582)
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000012569.a.fb.b.b.a.a	ENSGT00390000012569.a.fb.b.b.a.b	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00940000154861.d	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045.g.b #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000001376.bb.a.a	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	82	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a.fb.b.b.a.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00940000154861.d	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045.g.b #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000155479	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000001376.bb.a.a	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361.d	ENSGT00390000015719.c
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1846	ATP5IF1 (ENSRBIG00000044587)	ENSRBIG00000035627	ENSRBIG00000003411	ENSRBIG00000036065	EYA3 (ENSRBIG00000038991)	XKR8 (ENSRBIG00000041388)	SMPDL3B (ENSRBIG00000039924)	RPA2 (ENSRBIG00000036230) #12	THEMIS2 (ENSRBIG00000012387) #13	PPP1R8 (ENSRBIG00000012191) #14	STX12 (ENSRBIG00000036484) #16	FAM76A (ENSRBIG00000031849) #17	IFI6 (ENSRBIG00000020079) #19	FGR (ENSRBIG00000039817) #20	AHDC1 (ENSRBIG00000014826) #21	WASF2 (ENSRBIG00000042169) #22	GPR3 (ENSRBIG00000014455)	CD164L2 (ENSRBIG00000034769)	FCN3 (ENSRBIG00000042599)	ENSRBIG00000037465	SYTL1 (ENSRBIG00000029326)	TMEM222 (ENSRBIG00000043541)	WDTC1 (ENSRBIG00000040615)	SLC9A1 (ENSRBIG00000022222)	ENSRBIG00000014897	TENT5B (ENSRBIG00000033865)	TRNP1 (ENSRBIG00000032398)	ENSRBIG00000014734	KDF1 (ENSRBIG00000027752)	NUDC (ENSRBIG00000018562)	NR0B2 (ENSRBIG00000037548)
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	2213	ATP5IF1 (ENSRROG00000036303)	ENSRROG00000045532	ENSRROG00000013306	PTAFR (ENSRROG00000003323)	ENSRROG00000030937	EYA3 (ENSRROG00000036974)	XKR8 (ENSRROG00000034100)	SMPDL3B (ENSRROG00000035411)	RPA2 (ENSRROG00000040865) #12	THEMIS2 (ENSRROG00000024691) #13	PPP1R8 (ENSRROG00000041525) #14	STX12 (ENSRROG00000031145) #16	FAM76A (ENSRROG00000033795) #17	IFI6 (ENSRROG00000027931) #19	FGR (ENSRROG00000040142) #20	WASF2 (ENSRROG00000012791) #22	GPR3 (ENSRROG00000016304)	CD164L2 (ENSRROG00000033312)	FCN3 (ENSRROG00000033384)	MAP3K6 (ENSRROG00000031761)	SYTL1 (ENSRROG00000037744)	TMEM222 (ENSRROG00000032428)	WDTC1 (ENSRROG00000039571)	SLC9A1 (ENSRROG00000035382)	ENSRROG00000030078	TENT5B (ENSRROG00000045423)	ENSRROG00000045205	KDF1 (ENSRROG00000042590)	NUDC (ENSRROG00000037321)	NR0B2 (ENSRROG00000042749)	GPATCH3 (ENSRROG00000038382)
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000006264.j	ENSGT00390000012569.a.fb.b.b.a.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00940000154861.d	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045.g.b #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000001376.bb.a.a	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	12	SESN2 (ENSCSAG00000001009)	ENSCSAG00000001008	ENSCSAG00000001007	ENSCSAG00000000654	PTAFR (ENSCSAG00000000653)	EYA3 (ENSCSAG00000001006)	XKR8 (ENSCSAG00000001005)	RPA2 (ENSCSAG00000001004) #12	THEMIS2 (ENSCSAG00000001003) #13	PPP1R8 (ENSCSAG00000001002) #14	STX12 (ENSCSAG00000001000) #16	FAM76A (ENSCSAG00000000999) #17	IFI6 (ENSCSAG00000000997) #19	FGR (ENSCSAG00000000996) #20	AHDC1 (ENSCSAG00000000652) #21	WASF2 (ENSCSAG00000000995) #22	GPR3 (ENSCSAG00000000651)	CD164L2 (ENSCSAG00000000994)	FCN3 (ENSCSAG00000000993)	MAP3K6 (ENSCSAG00000000992)	SYTL1 (ENSCSAG00000000991)	TMEM222 (ENSCSAG00000000990)	WDTC1 (ENSCSAG00000000989)	SLC9A1 (ENSCSAG00000000988)	TENT5B (ENSCSAG00000000987)	TRNP1 (ENSCSAG00000000650)	KDF1 (ENSCSAG00000000986)	NUDC (ENSCSAG00000000985)	NR0B2 (ENSCSAG00000000984)	GPATCH3 (ENSCSAG00000000983)	GPN2 (ENSCSAG00000000982)
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000006264.j	ENSGT00390000012569.a.fb.b.b.a.b	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00940000154861.d	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045.g.b #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000001376.bb.a.a	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Macaca	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000006264.i.a	ENSGT00390000012569.a.fb.b.b.a.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00940000154861.d	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045.g.b #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	217	ATP5IF1 (ENSMNEG00000020230)	ENSMNEG00000011552	PTAFR (ENSMNEG00000023879)	ENSMNEG00000043243	EYA3 (ENSMNEG00000030436)	XKR8 (ENSMNEG00000037672)	SMPDL3B (ENSMNEG00000040406)	RPA2 (ENSMNEG00000032153) #12	THEMIS2 (ENSMNEG00000036095) #13	PPP1R8 (ENSMNEG00000030784) #14	STX12 (ENSMNEG00000005186) #16	ENSMNEG00000041438	FAM76A (ENSMNEG00000027606) #17	IFI6 (ENSMNEG00000029593) #19	FGR (ENSMNEG00000043664) #20	WASF2 (ENSMNEG00000033479) #22	GPR3 (ENSMNEG00000019217)	CD164L2 (ENSMNEG00000040766)	FCN3 (ENSMNEG00000038862)	MAP3K6 (ENSMNEG00000028644)	SYTL1 (ENSMNEG00000038366)	TMEM222 (ENSMNEG00000038995)	WDTC1 (ENSMNEG00000041566)	SLC9A1 (ENSMNEG00000010902)	TENT5B (ENSMNEG00000042604)	TRNP1 (ENSMNEG00000003839)	KDF1 (ENSMNEG00000042498)	NUDC (ENSMNEG00000030640)	NR0B2 (ENSMNEG00000040399)	GPATCH3 (ENSMNEG00000033889)	GPN2 (ENSMNEG00000041201)
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264.i.a	ENSGT00390000012569.a.fb.b.b.a.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045.g.b #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES		ATP5IF1 (ENSMFAG00000037657)	ENSMFAG00000040941	PTAFR (ENSMFAG00000063827)	EYA3 (ENSMFAG00000045224)	STX12 (ENSMFAG00000003645) #16	XKR8 (ENSMFAG00000037317)	SMPDL3B (ENSMFAG00000044059)	RPA2 (ENSMFAG00000022522) #12	THEMIS2 (ENSMFAG00000030730) #13	PPP1R8 (ENSMFAG00000001557) #14	FAM76A (ENSMFAG00000051312) #17	IFI6 (ENSMFAG00000034666) #19	ENSMFAG00000049622	FGR (ENSMFAG00000037860) #20	AHDC1 (ENSMFAG00000004617) #21	WASF2 (ENSMFAG00000001141) #22	GPR3 (ENSMFAG00000026566)	CD164L2 (ENSMFAG00000032742)	FCN3 (ENSMFAG00000000683)	MAP3K6 (ENSMFAG00000039505)	SYTL1 (ENSMFAG00000002518)	TMEM222 (ENSMFAG00000003393)	WDTC1 (ENSMFAG00000040733)	ENSMFAG00000047298	ENSMFAG00000037876	TENT5B (ENSMFAG00000003756)	KDF1 (ENSMFAG00000042338)	NUDC (ENSMFAG00000035581)	NR0B2 (ENSMFAG00000042880)	GPATCH3 (ENSMFAG00000030918)	GPN2 (ENSMFAG00000036999)
Rhesus	MODERN SPECIES		DNAJC8 (ENSMMUG00000017080)	PTAFR (ENSMMUG00000063261)	ENSMMUG00000060250	EYA3 (ENSMMUG00000012965)	XKR8 (ENSMMUG00000054886)	ENSMMUG00000018175	RPA2 (ENSMMUG00000018172) #12	THEMIS2 (ENSMMUG00000018170) #13	ENSMMUG00000056206	STX12 (ENSMMUG00000012252) #14	ENSMMUG00000057915	FAM76A (ENSMMUG00000012243) #17	IFI6 (ENSMMUG00000011454) #19	FGR (ENSMMUG00000014434) #20	AHDC1 (ENSMMUG00000009868) #21	WASF2 (ENSMMUG00000018221) #22	GPR3 (ENSMMUG00000018325)	FCN3 (ENSMMUG00000018322)	MAP3K6 (ENSMMUG00000018318)	SYTL1 (ENSMMUG00000004768)	TMEM222 (ENSMMUG00000004767)	WDTC1 (ENSMMUG00000004762)	ENSMMUG00000049904	SLC9A1 (ENSMMUG00000016893)	TENT5B (ENSMMUG00000015115)	TRNP1 (ENSMMUG00000021031)	NUDC (ENSMMUG00000010290)	KDF1 (ENSMMUG00000002555)	NR0B2 (ENSMMUG00000010291)	GPATCH3 (ENSMMUG00000018723)	GPN2 (ENSMMUG00000018721)
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000012569.a.fb.b.b.a.a	ENSGT00390000012569.a.fb.b.b.a.b	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00940000154861.d	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045.g.b #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000001376.bb.a.a	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Olive baboon	MODERN SPECIES		ATP5IF1 (ENSPANG00000018327)	ENSPANG00000012833	PTAFR (ENSPANG00000006117)	ENSPANG00000042576	EYA3 (ENSPANG00000016511)	XKR8 (ENSPANG00000007916)	SMPDL3B (ENSPANG00000007129)	RPA2 (ENSPANG00000017991) #12	THEMIS2 (ENSPANG00000005205) #13	PPP1R8 (ENSPANG00000043070) #14	STX12 (ENSPANG00000007130) #16	FAM76A (ENSPANG00000000247) #17	IFI6 (ENSPANG00000000246) #19	FGR (ENSPANG00000016682) #20	AHDC1 (ENSPANG00000006132) #21	WASF2 (ENSPANG00000013871) #22	GPR3 (ENSPANG00000001840)	CD164L2 (ENSPANG00000017456)	FCN3 (ENSPANG00000012868)	MAP3K6 (ENSPANG00000006133)	SYTL1 (ENSPANG00000005720)	TMEM222 (ENSPANG00000018881)	WDTC1 (ENSPANG00000008666)	ENSPANG00000034989	ENSPANG00000042373	TENT5B (ENSPANG00000007821)	TRNP1 (ENSPANG00000018909)	ENSPANG00000005605	KDF1 (ENSPANG00000023562)	NUDC (ENSPANG00000019007)	NR0B2 (ENSPANG00000002391)
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000006264.j	ENSGT00390000012569.a.fb.b.b.a.b	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00940000154861.d	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045.g.b #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	227	ENSCATG00000033266	PTAFR (ENSCATG00000005828)	ENSCATG00000017621	EYA3 (ENSCATG00000027843)	XKR8 (ENSCATG00000015702)	SMPDL3B (ENSCATG00000017005)	RPA2 (ENSCATG00000044566) #12	THEMIS2 (ENSCATG00000031969) #13	PPP1R8 (ENSCATG00000032635) #14	STX12 (ENSCATG00000032583) #16	FAM76A (ENSCATG00000033886) #17	ENSCATG00000033546	IFI6 (ENSCATG00000016831) #19	FGR (ENSCATG00000044439) #20	AHDC1 (ENSCATG00000004004) #21	WASF2 (ENSCATG00000027046) #22	GPR3 (ENSCATG00000006977)	CD164L2 (ENSCATG00000044159)	FCN3 (ENSCATG00000020495)	MAP3K6 (ENSCATG00000025890)	SYTL1 (ENSCATG00000044339)	TMEM222 (ENSCATG00000044475)	WDTC1 (ENSCATG00000044454)	ENSCATG00000033551	SLC9A1 (ENSCATG00000033651)	TENT5B (ENSCATG00000017109)	TRNP1 (ENSCATG00000004345)	KDF1 (ENSCATG00000015571)	NR0B2 (ENSCATG00000044469)	GPATCH3 (ENSCATG00000033598)	GPN2 (ENSCATG00000033688)
Drill	MODERN SPECIES	832	ENSMLEG00000027639	ENSMLEG00000003164	PTAFR (ENSMLEG00000000550)	ENSMLEG00000033540	EYA3 (ENSMLEG00000042664)	XKR8 (ENSMLEG00000043403)	SMPDL3B (ENSMLEG00000039800)	RPA2 (ENSMLEG00000031567) #12	THEMIS2 (ENSMLEG00000040682) #13	PPP1R8 (ENSMLEG00000041495) #14	STX12 (ENSMLEG00000038548) #16	FAM76A (ENSMLEG00000033923) #17	IFI6 (ENSMLEG00000037855) #19	FGR (ENSMLEG00000032617) #20	AHDC1 (ENSMLEG00000027938) #21	WASF2 (ENSMLEG00000041634) #22	GPR3 (ENSMLEG00000027688)	CD164L2 (ENSMLEG00000038397)	FCN3 (ENSMLEG00000017979)	MAP3K6 (ENSMLEG00000041031)	SYTL1 (ENSMLEG00000044240)	TMEM222 (ENSMLEG00000031793)	WDTC1 (ENSMLEG00000028076)	SLC9A1 (ENSMLEG00000014293)	TENT5B (ENSMLEG00000042465)	ENSMLEG00000026434	KDF1 (ENSMLEG00000041584)	NUDC (ENSMLEG00000036923)	NR0B2 (ENSMLEG00000030851)	GPATCH3 (ENSMLEG00000033364)	GPN2 (ENSMLEG00000025975)
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Glires	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000155543	ENSGT00940000157582	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00940000164617	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B	ENSGT00940000156585	ENSGT00390000013174
Rabbit	MODERN SPECIES	4	GMEB1 (ENSOCUG00000010893)	TAF12 (ENSOCUG00000003935)	RAB42 (ENSOCUG00000003933)	ENSOCUG00000002353	ENSOCUG00000002346	PHACTR4 (ENSOCUG00000027528)	SESN2 (ENSOCUG00000014896)	ENSOCUG00000017932	PTAFR (ENSOCUG00000017831)	EYA3 (ENSOCUG00000008020)	SMPDL3B (ENSOCUG00000012589)	PPP1R8 (ENSOCUG00000013594) #14	FAM76A (ENSOCUG00000014830) #17	FGR (ENSOCUG00000008922) #20	AHDC1 (ENSOCUG00000008914) #21	WASF2 (ENSOCUG00000002394) #22	GPR3 (ENSOCUG00000027272)	ENSOCUG00000007587	MAP3K6 (ENSOCUG00000002379)	SYTL1 (ENSOCUG00000002371)	TMEM222 (ENSOCUG00000007371)	WDTC1 (ENSOCUG00000016358)	SLC9A1 (ENSOCUG00000023061)	ENSOCUG00000006426	KDF1 (ENSOCUG00000006421)	NUDC (ENSOCUG00000006418)	NR0B2 (ENSOCUG00000006416)	GPATCH3 (ENSOCUG00000006411)	ENSOCUG00000006407	ZDHHC18 (ENSOCUG00000006400)	PIGV (ENSOCUG00000017959)
Pika	MODERN SPECIES	3553																WASF2 (ENSOPRG00000002324) #22	GPR3 (ENSOPRG00000002319)	CD164L2 (ENSOPRG00000002306)	ENSOPRG00000002269	MAP3K6 (ENSOPRG00000002203)	ENSOPRG00000002184	TMEM222 (ENSOPRG00000002159)	WDTC1 (ENSOPRG00000002127)
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT00960000190607	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT00960000190607	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B	ENSGT01090000260040.b.b.b.a
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	92	ENSUPAG00010020838	SESN2 (ENSUPAG00010020839)	ATP5IF1 (ENSUPAG00010020850)	ENSUPAG00010020856	PTAFR (ENSUPAG00010020865)	EYA3 (ENSUPAG00010020872)	XKR8 (ENSUPAG00010020998)	SMPDL3B (ENSUPAG00010021005)	THEMIS2 (ENSUPAG00010021016) #13	PPP1R8 (ENSUPAG00010021025) #14	ENSUPAG00010021039	STX12 (ENSUPAG00010021044) #16	FAM76A (ENSUPAG00010021053) #17	FGR (ENSUPAG00010021065) #20	AHDC1 (ENSUPAG00010021095) #21	WASF2 (ENSUPAG00010021099) #22	GPR3 (ENSUPAG00010021112)	CD164L2 (ENSUPAG00010021117)	MAP3K6 (ENSUPAG00010021121)	SYTL1 (ENSUPAG00010021146)	TMEM222 (ENSUPAG00010021173)	WDTC1 (ENSUPAG00010021189)	SLC9A1 (ENSUPAG00010021229)	ENSUPAG00010021249	TENT5B (ENSUPAG00010021251)	TRNP1 (ENSUPAG00010021254)	ENSUPAG00010021256	KDF1 (ENSUPAG00010021258)	NUDC (ENSUPAG00010021264)	NR0B2 (ENSUPAG00010021267)	GPATCH3 (ENSUPAG00010021268)
Squirrel	MODERN SPECIES	74	MED18 (ENSSTOG00000020723)	SESN2 (ENSSTOG00000009293)	ATP5IF1 (ENSSTOG00000020766)	DNAJC8 (ENSSTOG00000012834)	PTAFR (ENSSTOG00000015934)	EYA3 (ENSSTOG00000004478)	XKR8 (ENSSTOG00000023254)	SMPDL3B (ENSSTOG00000004468)	RPA2 (ENSSTOG00000004433) #12	THEMIS2 (ENSSTOG00000034218) #13	PPP1R8 (ENSSTOG00000004381) #14	STX12 (ENSSTOG00000019943) #16	FAM76A (ENSSTOG00000004331) #17	FGR (ENSSTOG00000026717) #20	AHDC1 (ENSSTOG00000025025) #21	WASF2 (ENSSTOG00000003138) #22	GPR3 (ENSSTOG00000024790)	CD164L2 (ENSSTOG00000024078)	MAP3K6 (ENSSTOG00000014251)	SYTL1 (ENSSTOG00000014242)	TMEM222 (ENSSTOG00000014234)	WDTC1 (ENSSTOG00000014225)	SLC9A1 (ENSSTOG00000009815)	ENSSTOG00000025429	ENSSTOG00000021677	TENT5B (ENSSTOG00000022787)	KDF1 (ENSSTOG00000015233)	NUDC (ENSSTOG00000021201)	NR0B2 (ENSSTOG00000024249)	GPATCH3 (ENSSTOG00000015220)	GPN2 (ENSSTOG00000015216)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	15	MED18 (ENSMMMG00000013084)	SESN2 (ENSMMMG00000013099)	ATP5IF1 (ENSMMMG00000013117)	DNAJC8 (ENSMMMG00000013133)	PTAFR (ENSMMMG00000013184)	EYA3 (ENSMMMG00000013195)	XKR8 (ENSMMMG00000013348)	SMPDL3B (ENSMMMG00000013366)	RPA2 (ENSMMMG00000013382) #12	THEMIS2 (ENSMMMG00000013395) #13	PPP1R8 (ENSMMMG00000013396) #14	ENSMMMG00000013416	STX12 (ENSMMMG00000013420) #16	FAM76A (ENSMMMG00000013430) #17	FGR (ENSMMMG00000013453) #20	WASF2 (ENSMMMG00000013504) #22	GPR3 (ENSMMMG00000013517)	CD164L2 (ENSMMMG00000013519)	MAP3K6 (ENSMMMG00000013538)	SYTL1 (ENSMMMG00000013574)	TMEM222 (ENSMMMG00000013607)	WDTC1 (ENSMMMG00000013616)	SLC9A1 (ENSMMMG00000013639)	TENT5B (ENSMMMG00000013661)	TRNP1 (ENSMMMG00000013667)	ENSMMMG00000013673	KDF1 (ENSMMMG00000013677)	NUDC (ENSMMMG00000013689)	NR0B2 (ENSMMMG00000013702)	GPATCH3 (ENSMMMG00000013707)	ENSMMMG00000013717
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES		SESN2 (ENSSVLG00005011840)	ATP5IF1 (ENSSVLG00005011758)	DNAJC8 (ENSSVLG00005011722)	PTAFR (ENSSVLG00005011699)	EYA3 (ENSSVLG00005011513)	ENSSVLG00005011412	XKR8 (ENSSVLG00005011375)	SMPDL3B (ENSSVLG00005011082)	RPA2 (ENSSVLG00005010920) #12	THEMIS2 (ENSSVLG00005010773) #13	PPP1R8 (ENSSVLG00005010667) #14	STX12 (ENSSVLG00005010643) #16	ENSSVLG00005010611	FAM76A (ENSSVLG00005010519) #17	FGR (ENSSVLG00005003584) #20	WASF2 (ENSSVLG00005003551) #22	GPR3 (ENSSVLG00005003531)	CD164L2 (ENSSVLG00005003518)	MAP3K6 (ENSSVLG00005003393)	SYTL1 (ENSSVLG00005003264)	TMEM222 (ENSSVLG00005003203)	WDTC1 (ENSSVLG00005003051)	SLC9A1 (ENSSVLG00005002990)	ENSSVLG00005002968	TENT5B (ENSSVLG00005002952)	TRNP1 (ENSSVLG00005002944)	ENSSVLG00005002925	KDF1 (ENSSVLG00005002908)	NUDC (ENSSVLG00005002888)	NR0B2 (ENSSVLG00005002872)	ENSSVLG00005002863
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	26	SESN2 (ENSHGLG00000011617)	ENSHGLG00000050011	DNAJC8 (ENSHGLG00000011449)	PTAFR (ENSHGLG00000048424)	ENSHGLG00000032519	EYA3 (ENSHGLG00000018515)	ENSHGLG00000046470	XKR8 (ENSHGLG00000012712)	SMPDL3B (ENSHGLG00000012112)	RPA2 (ENSHGLG00000018528) #12	THEMIS2 (ENSHGLG00000019146) #13	ENSHGLG00000014326 #14	FAM76A (ENSHGLG00000009747) #17	FGR (ENSHGLG00000018738) #20	AHDC1 (ENSHGLG00000014470) #21	WASF2 (ENSHGLG00000048286) #22	GPR3 (ENSHGLG00000046961)	ENSHGLG00000013863	FCN3 (ENSHGLG00000012337)	MAP3K6 (ENSHGLG00000012888)	SYTL1 (ENSHGLG00000011880)	TMEM222 (ENSHGLG00000011121)	ENSHGLG00000007610	WDTC1 (ENSHGLG00000013846)	ENSHGLG00000044722	SLC9A1 (ENSHGLG00000036829)	ENSHGLG00000047714	TENT5B (ENSHGLG00000034048)	TRNP1 (ENSHGLG00000041801)	KDF1 (ENSHGLG00000012217)	NUDC (ENSHGLG00000011404)
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B	ENSGT01090000260040.b.b.b.a
Guinea pig	MODERN SPECIES	25	SESN2 (ENSCPOG00000000236)	ATP5IF1 (ENSCPOG00000030836)	DNAJC8 (ENSCPOG00000014652)	PTAFR (ENSCPOG00000031748)	EYA3 (ENSCPOG00000012512)	ENSCPOG00000033302	SMPDL3B (ENSCPOG00000008773)	RPA2 (ENSCPOG00000008766) #12	THEMIS2 (ENSCPOG00000033796) #13	PPP1R8 (ENSCPOG00000036078) #14	STX12 (ENSCPOG00000013160) #16	FAM76A (ENSCPOG00000006186) #17	ENSCPOG00000031828	FGR (ENSCPOG00000015092) #20	AHDC1 (ENSCPOG00000022607) #21	WASF2 (ENSCPOG00000012376) #22	GPR3 (ENSCPOG00000027123)	CD164L2 (ENSCPOG00000022092)	MAP3K6 (ENSCPOG00000012359)	SYTL1 (ENSCPOG00000012354)	TMEM222 (ENSCPOG00000020198)	WDTC1 (ENSCPOG00000012347)	SLC9A1 (ENSCPOG00000035897)	TENT5B (ENSCPOG00000032542)	KDF1 (ENSCPOG00000022999)	NUDC (ENSCPOG00000010413)	NR0B2 (ENSCPOG00000010409)	GPATCH3 (ENSCPOG00000010404)	GPN2 (ENSCPOG00000002848)	SFN (ENSCPOG00000035257)	ZDHHC18 (ENSCPOG00000010395)
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	159	MED18 (ENSCLAG00000015343)	SESN2 (ENSCLAG00000011979)	ATP5IF1 (ENSCLAG00000014624)	DNAJC8 (ENSCLAG00000007390)	PTAFR (ENSCLAG00000017842)	EYA3 (ENSCLAG00000008901)	XKR8 (ENSCLAG00000011287)	SMPDL3B (ENSCLAG00000011768)	RPA2 (ENSCLAG00000010772) #12	THEMIS2 (ENSCLAG00000012140) #13	PPP1R8 (ENSCLAG00000011211) #14	STX12 (ENSCLAG00000013795) #16	FAM76A (ENSCLAG00000008844) #17	FGR (ENSCLAG00000014147) #20	AHDC1 (ENSCLAG00000013754) #21	WASF2 (ENSCLAG00000013958) #22	GPR3 (ENSCLAG00000012893)	FCN3 (ENSCLAG00000010084)	MAP3K6 (ENSCLAG00000015178)	SYTL1 (ENSCLAG00000011750)	TMEM222 (ENSCLAG00000014379)	WDTC1 (ENSCLAG00000012710)	SLC9A1 (ENSCLAG00000011250)	TENT5B (ENSCLAG00000010180)	KDF1 (ENSCLAG00000009636)	NUDC (ENSCLAG00000008191)	NR0B2 (ENSCLAG00000012438)	GPATCH3 (ENSCLAG00000012064)	GPN2 (ENSCLAG00000015368)	SFN (ENSCLAG00000018088)	ZDHHC18 (ENSCLAG00000015099)
Degu	MODERN SPECIES	204	ENSODEG00000003721	PTAFR (ENSODEG00000018990)	EYA3 (ENSODEG00000003507)	XKR8 (ENSODEG00000003481)	ENSODEG00000003467	ENSODEG00000004443 #12	THEMIS2 (ENSODEG00000004403) #13	ENSODEG00000004373	PPP1R8 (ENSODEG00000004352) #14	STX12 (ENSODEG00000004182) #16	ENSODEG00000019037	FAM76A (ENSODEG00000004142) #17	ENSODEG00000019010	FGR (ENSODEG00000004016) #20	AHDC1 (ENSODEG00000019150) #21	WASF2 (ENSODEG00000003793) #22	GPR3 (ENSODEG00000004543)	CD164L2 (ENSODEG00000004416)	MAP3K6 (ENSODEG00000004172)	SYTL1 (ENSODEG00000003707)	TMEM222 (ENSODEG00000003675)	WDTC1 (ENSODEG00000003804)	ENSODEG00000003743	SLC9A1 (ENSODEG00000003659)	TENT5B (ENSODEG00000003616)	TRNP1 (ENSODEG00000003604)	ENSODEG00000003581	ENSODEG00000003339	NR0B2 (ENSODEG00000003311)	GPATCH3 (ENSODEG00000003292)	GPN2 (ENSODEG00000003267)
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	325	Med18 (ENSDORG00000003626)	Sesn2 (ENSDORG00000004491)	Atpif1 (ENSDORG00000004489)	Dnajc8 (ENSDORG00000004488)	Ptafr (ENSDORG00000027100)	Eya3 (ENSDORG00000015614)	Xkr8 (ENSDORG00000023428)	Smpdl3b (ENSDORG00000015612)	Rpa2 (ENSDORG00000003741) #12	Themis2 (ENSDORG00000003740) #13	ENSDORG00000025172 #14	Stx12 (ENSDORG00000001059) #16	Fam76a (ENSDORG00000000575) #17	Fgr (ENSDORG00000015238) #20	Ahdc1 (ENSDORG00000010729) #21	Wasf2 (ENSDORG00000007346) #22	Gpr3 (ENSDORG00000007347)	Cd164l2 (ENSDORG00000009477)	ENSDORG00000009474	Map3k6 (ENSDORG00000009469)	Sytl1 (ENSDORG00000009466)	Tmem222 (ENSDORG00000009464)	Wdtc1 (ENSDORG00000012982)	Slc9a1 (ENSDORG00000012211)	Tent5b (ENSDORG00000015648)	ENSDORG00000030030	Kdf1 (ENSDORG00000023459)	Nudc (ENSDORG00000026035)	Nr0b2 (ENSDORG00000023804)	ENSDORG00000005205	Gpn2 (ENSDORG00000005203)
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	201	Phactr4 (ENSJJAG00000015640)	Sesn2 (ENSJJAG00000011184)	Atpif1 (ENSJJAG00000010517)	ENSJJAG00000009301	Ptafr (ENSJJAG00000012719)	Eya3 (ENSJJAG00000017580)	Xkr8 (ENSJJAG00000015552)	Smpdl3b (ENSJJAG00000015036)	ENSJJAG00000014579 #12	Themis2 (ENSJJAG00000012926) #13	ENSJJAG00000010784 #14	Stx12 (ENSJJAG00000004079) #16	ENSJJAG00000002452 #17	Fgr (ENSJJAG00000019812) #20	Ahdc1 (ENSJJAG00000019425) #21	Wasf2 (ENSJJAG00000019149) #22	Gpr3 (ENSJJAG00000018961)	Cd164l2 (ENSJJAG00000014470)	ENSJJAG00000014104	Map3k6 (ENSJJAG00000020163)	Sytl1 (ENSJJAG00000011352)	Tmem222 (ENSJJAG00000002275)	Wdtc1 (ENSJJAG00000021957)	Slc9a1 (ENSJJAG00000019281)	ENSJJAG00000017789	Kdf1 (ENSJJAG00000017615)	Nudc (ENSJJAG00000017209)	Nr0b2 (ENSJJAG00000012389)	Gpatch3 (ENSJJAG00000003292)	Gpn2 (ENSJJAG00000022134)	Sfn (ENSJJAG00000012903)
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	967										Ppp1r8 (ENSNGAG00000001089) #14	Stx12 (ENSNGAG00000022319) #16	Fam76a (ENSNGAG00000021702) #17	ENSNGAG00000012320	Fgr (ENSNGAG00000014779) #20	Ahdc1 (ENSNGAG00000013639) #21	Wasf2 (ENSNGAG00000017438) #22	Gpr3 (ENSNGAG00000017974)	Cd164l2 (ENSNGAG00000019740)	Map3k6 (ENSNGAG00000017010)	Sytl1 (ENSNGAG00000014815)	Tmem222 (ENSNGAG00000011488)	Wdtc1 (ENSNGAG00000013121)	Slc9a1 (ENSNGAG00000016127)	ENSNGAG00000020552	Tent5b (ENSNGAG00000010187)	ENSNGAG00000016538
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00900000143263	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Mus	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00900000143263	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00900000143263	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00900000143263	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Mouse	MODERN SPECIES	13	Med18 (ENSMUSG00000066042)	Sesn2 (ENSMUSG00000028893)	Atpif1 (ENSMUSG00000054428)	Dnajc8 (ENSMUSG00000054405)	Ptafr (ENSMUSG00000056529)	Eya3 (ENSMUSG00000028886)	Xkr8 (ENSMUSG00000037752)	Smpdl3b (ENSMUSG00000028885)	Rpa2 (ENSMUSG00000028884) #12	Themis2 (ENSMUSG00000037731) #13	Ppp1r8 (ENSMUSG00000028882) #14	Stx12 (ENSMUSG00000028879) #16	Fam76a (ENSMUSG00000028878) #17	Fgr (ENSMUSG00000028874) #20	Ahdc1 (ENSMUSG00000037692) #21	Wasf2 (ENSMUSG00000028868) #22	Gpr3 (ENSMUSG00000049649)	Cd164l2 (ENSMUSG00000028865)	Map3k6 (ENSMUSG00000028862)	Sytl1 (ENSMUSG00000028860)	Tmem222 (ENSMUSG00000028857)	Wdtc1 (ENSMUSG00000037622)	Slc9a1 (ENSMUSG00000028854)	Tent5b (ENSMUSG00000046694)	Trnp1 (ENSMUSG00000056596)	Kdf1 (ENSMUSG00000037600)	Nudc (ENSMUSG00000028851)	Nr0b2 (ENSMUSG00000037583)	Gpatch3 (ENSMUSG00000028850)	Gpn2 (ENSMUSG00000028848)	Sfn (ENSMUSG00000047281)
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073.g #17	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00900000143263	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Steppe mouse	MODERN SPECIES	3343															Ahdc1 (ENSMSIG00000026167) #21	Wasf2 (ENSMSIG00000026175) #22	Gpr3 (ENSMSIG00000026220)	Cd164l2 (ENSMSIG00000026225)	Map3k6 (ENSMSIG00000026242)	ENSMSIG00000026328	Tmem222 (ENSMSIG00000026400)	Wdtc1 (ENSMSIG00000026410)	Slc9a1 (ENSMSIG00000026439)	Tent5b (ENSMSIG00000026455)	ENSMSIG00000026463	Trnp1 (ENSMSIG00000026468)	Kdf1 (ENSMSIG00000026473)	ENSMSIG00000026482	Nudc (ENSMSIG00000026485)	Nr0b2 (ENSMSIG00000026492)	Gpatch3 (ENSMSIG00000026503)
spretus	MODERN SPECIES	13	Med18 (MGP_SPRETEiJ_G0027547)	Sesn2 (MGP_SPRETEiJ_G0027548)	Atpif1 (MGP_SPRETEiJ_G0027549)	Dnajc8 (MGP_SPRETEiJ_G0027550)	Ptafr (MGP_SPRETEiJ_G0027551)	Eya3 (MGP_SPRETEiJ_G0027552)	Xkr8 (MGP_SPRETEiJ_G0027553)	Smpdl3b (MGP_SPRETEiJ_G0027554)	Rpa2 (MGP_SPRETEiJ_G0027555) #12	Themis2 (MGP_SPRETEiJ_G0027556) #13	Ppp1r8 (MGP_SPRETEiJ_G0027557) #14	Stx12 (MGP_SPRETEiJ_G0027558) #16	Fam76a (MGP_SPRETEiJ_G0027559) #17	Fgr (MGP_SPRETEiJ_G0027560) #20	Ahdc1 (MGP_SPRETEiJ_G0027561) #21	Wasf2 (MGP_SPRETEiJ_G0027562) #22	Gpr3 (MGP_SPRETEiJ_G0027563)	Cd164l2 (MGP_SPRETEiJ_G0027564)	Map3k6 (MGP_SPRETEiJ_G0027565)	Sytl1 (MGP_SPRETEiJ_G0027566)	Tmem222 (MGP_SPRETEiJ_G0027567)	Wdtc1 (MGP_SPRETEiJ_G0027568)	Slc9a1 (MGP_SPRETEiJ_G0027569)	Tent5b (MGP_SPRETEiJ_G0027570)	Trnp1 (MGP_SPRETEiJ_G0027571)	Kdf1 (MGP_SPRETEiJ_G0027572)	Nudc (MGP_SPRETEiJ_G0027573)	Nr0b2 (MGP_SPRETEiJ_G0027574)	Gpatch3 (MGP_SPRETEiJ_G0027575)	Gpn2 (MGP_SPRETEiJ_G0027576)	Zdhhc18 (MGP_SPRETEiJ_G0027577)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	13	Med18 (MGP_CAROLIEiJ_G0026566)	Sesn2 (MGP_CAROLIEiJ_G0026567)	Atpif1 (MGP_CAROLIEiJ_G0026568)	MGP_CAROLIEiJ_G0026569	Ptafr (MGP_CAROLIEiJ_G0026570)	Eya3 (MGP_CAROLIEiJ_G0026571)	Xkr8 (MGP_CAROLIEiJ_G0026572)	Smpdl3b (MGP_CAROLIEiJ_G0026573)	Rpa2 (MGP_CAROLIEiJ_G0026574) #12	Themis2 (MGP_CAROLIEiJ_G0026575) #13	Ppp1r8 (MGP_CAROLIEiJ_G0026576) #14	Stx12 (MGP_CAROLIEiJ_G0026577) #16	Fam76a (MGP_CAROLIEiJ_G0026578) #17	Fgr (MGP_CAROLIEiJ_G0026579) #20	Ahdc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0026580) #21	Wasf2 (MGP_CAROLIEiJ_G0026581) #22	Gpr3 (MGP_CAROLIEiJ_G0026582)	Cd164l2 (MGP_CAROLIEiJ_G0026583)	Map3k6 (MGP_CAROLIEiJ_G0026584)	Sytl1 (MGP_CAROLIEiJ_G0026585)	Tmem222 (MGP_CAROLIEiJ_G0026586)	Wdtc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0026587)	Slc9a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0026588)	Tent5b (MGP_CAROLIEiJ_G0026589)	Trnp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0026590)	Kdf1 (MGP_CAROLIEiJ_G0026591)	Nudc (MGP_CAROLIEiJ_G0026592)	Nr0b2 (MGP_CAROLIEiJ_G0026593)	Gpatch3 (MGP_CAROLIEiJ_G0026594)	Gpn2 (MGP_CAROLIEiJ_G0026595)	Sfn (MGP_CAROLIEiJ_G0026596)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	19	Med18 (MGP_PahariEiJ_G0028899)	Sesn2 (MGP_PahariEiJ_G0028900)	Atpif1 (MGP_PahariEiJ_G0028901)	MGP_PahariEiJ_G0028902	Ptafr (MGP_PahariEiJ_G0028903)	Eya3 (MGP_PahariEiJ_G0028904)	Xkr8 (MGP_PahariEiJ_G0028905)	Smpdl3b (MGP_PahariEiJ_G0028906)	Rpa2 (MGP_PahariEiJ_G0028907) #12	Themis2 (MGP_PahariEiJ_G0028908) #13	Ppp1r8 (MGP_PahariEiJ_G0028909) #14	MGP_PahariEiJ_G0028910 #16	Fam76a (MGP_PahariEiJ_G0028911) #17	Fgr (MGP_PahariEiJ_G0028912) #20	Ahdc1 (MGP_PahariEiJ_G0028913) #21	Wasf2 (MGP_PahariEiJ_G0028914) #22	Gpr3 (MGP_PahariEiJ_G0028915)	Cd164l2 (MGP_PahariEiJ_G0028916)	Map3k6 (MGP_PahariEiJ_G0028917)	Sytl1 (MGP_PahariEiJ_G0028918)	Tmem222 (MGP_PahariEiJ_G0028919)	Wdtc1 (MGP_PahariEiJ_G0028920)	Slc9a1 (MGP_PahariEiJ_G0028921)	Tent5b (MGP_PahariEiJ_G0028922)	Trnp1 (MGP_PahariEiJ_G0028923)	Kdf1 (MGP_PahariEiJ_G0028924)	Nudc (MGP_PahariEiJ_G0028925)	Nr0b2 (MGP_PahariEiJ_G0028926)	Gpatch3 (MGP_PahariEiJ_G0028927)	Gpn2 (MGP_PahariEiJ_G0028928)	Sfn (MGP_PahariEiJ_G0028929)
Rat	MODERN SPECIES	15	Med18 (ENSRNOG00000067073)	Sesn2 (ENSRNOG00000042785)	Atp5if1 (ENSRNOG00000013300)	Dnajc8 (ENSRNOG00000013255)	Ptafr (ENSRNOG00000013231)	Eya3 (ENSRNOG00000010396)	Xkr8 (ENSRNOG00000024312)	Smpdl3b (ENSRNOG00000042326)	Rpa2 (ENSRNOG00000013005) #12	Themis2 (ENSRNOG00000012965) #13	Ppp1r8 (ENSRNOG00000059550) #14	Stx12 (ENSRNOG00000011804) #16	Fam76a (ENSRNOG00000011254) #17	Fgr (ENSRNOG00000009912) #20	Ahdc1 (ENSRNOG00000042855) #21	Wasf2 (ENSRNOG00000009805) #22	Gpr3 (ENSRNOG00000009540)	Sytl1 (ENSRNOG00000008600)	Cd164l2 (ENSRNOG00000009505)	Map3k6 (ENSRNOG00000008936)	Tmem222 (ENSRNOG00000008564)	Wdtc1 (ENSRNOG00000008377)	Slc9a1 (ENSRNOG00000007982)	Tent5b (ENSRNOG00000056153)	Trnp1 (ENSRNOG00000055936)	ENSRNOG00000068236	Kdf1 (ENSRNOG00000055933)	AC118963.1 (ENSRNOG00000049922)	Nudc (ENSRNOG00000051720)	Nr0b2 (ENSRNOG00000007229)	ENSRNOG00000066253
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000157582	ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000164617	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	111	MED18 (ENSCGRG00001022480)	Sesn2 (ENSCGRG00001020650)	Atpif1 (ENSCGRG00001023397)	ENSCGRG00001000534	Ptafr (ENSCGRG00001012404)	Eya3 (ENSCGRG00001018576)	Xkr8 (ENSCGRG00001017118)	Smpdl3b (ENSCGRG00001016883)	Rpa2 (ENSCGRG00001007332) #12	Themis2 (ENSCGRG00001024729) #13	Ppp1r8 (ENSCGRG00001019839) #14	Stx12 (ENSCGRG00001016934) #16	ENSCGRG00001007863 #17	Fgr (ENSCGRG00001024485) #20	Ahdc1 (ENSCGRG00001012820) #21	Wasf2 (ENSCGRG00001020852) #22	Gpr3 (ENSCGRG00001001244)	Cd164l2 (ENSCGRG00001024895)	Map3k6 (ENSCGRG00001019547)	Sytl1 (ENSCGRG00001013995)	Tmem222 (ENSCGRG00001020116)	Wdtc1 (ENSCGRG00001015126)	Slc9a1 (ENSCGRG00001002747)	Tent5b (ENSCGRG00001024770)	Trnp1 (ENSCGRG00001024587)	ENSCGRG00001022474	Kdf1 (ENSCGRG00001003180)	ENSCGRG00001022208	Nr0b2 (ENSCGRG00001020066)	Gpatch3 (ENSCGRG00001002930)	Gpn2 (ENSCGRG00001023875)
Golden Hamster	MODERN SPECIES	709	Phactr4 (ENSMAUG00000018484)	Med18 (ENSMAUG00000019176)	Sesn2 (ENSMAUG00000000726)	ENSMAUG00000018320	Ptafr (ENSMAUG00000008850)	Eya3 (ENSMAUG00000015674)	Xkr8 (ENSMAUG00000009395)	Smpdl3b (ENSMAUG00000014184)	Rpa2 (ENSMAUG00000002825) #12	Themis2 (ENSMAUG00000000821) #13	Ppp1r8 (ENSMAUG00000009797) #14	Stx12 (ENSMAUG00000016314) #16	Fam76a (ENSMAUG00000016561) #17	Fgr (ENSMAUG00000006765) #20	Ahdc1 (ENSMAUG00000013108) #21	Wasf2 (ENSMAUG00000012124) #22	Gpr3 (ENSMAUG00000014246)	ENSMAUG00000011191	Map3k6 (ENSMAUG00000017302)	Sytl1 (ENSMAUG00000018014)	Tmem222 (ENSMAUG00000007829)	Wdtc1 (ENSMAUG00000004693)	ENSMAUG00000001078	Tent5b (ENSMAUG00000014675)	Trnp1 (ENSMAUG00000019939)	Kdf1 (ENSMAUG00000021929)	Nudc (ENSMAUG00000008166)	Nr0b2 (ENSMAUG00000020860)	Gpatch3 (ENSMAUG00000002005)	Gpn2 (ENSMAUG00000013057)	Sfn (ENSMAUG00000008489)
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B	ENSGT01090000260040.b.b.b.a
Prairie vole	MODERN SPECIES	1	Med18 (ENSMOCG00000022182)	Sesn2 (ENSMOCG00000012718)	Atpif1 (ENSMOCG00000002419)	Dnajc8 (ENSMOCG00000017213)	Ptafr (ENSMOCG00000013409)	Eya3 (ENSMOCG00000004582)	Xkr8 (ENSMOCG00000002218)	Smpdl3b (ENSMOCG00000016324)	Rpa2 (ENSMOCG00000007092) #12	Themis2 (ENSMOCG00000003168) #13	ENSMOCG00000022691 #14	Stx12 (ENSMOCG00000014196) #16	Fam76a (ENSMOCG00000021395) #17	Fgr (ENSMOCG00000019562) #20	Ahdc1 (ENSMOCG00000016500) #21	Wasf2 (ENSMOCG00000015492) #22	Gpr3 (ENSMOCG00000014276)	Cd164l2 (ENSMOCG00000012161)	Map3k6 (ENSMOCG00000022830)	Sytl1 (ENSMOCG00000006535)	Tmem222 (ENSMOCG00000001826)	Wdtc1 (ENSMOCG00000021708)	Slc9a1 (ENSMOCG00000001951)	Tent5b (ENSMOCG00000006029)	Trnp1 (ENSMOCG00000004450)	Kdf1 (ENSMOCG00000008803)	ENSMOCG00000009769	Nr0b2 (ENSMOCG00000022706)	Gpatch3 (ENSMOCG00000022375)	Gpn2 (ENSMOCG00000016502)	Sfn (ENSMOCG00000007160)
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	11	Sesn2 (ENSPEMG00000001779)	Atpif1 (ENSPEMG00000025196)	Dnajc8 (ENSPEMG00000013544)	Ptafr (ENSPEMG00000025544)	Eya3 (ENSPEMG00000000391)	Xkr8 (ENSPEMG00000025921)	Smpdl3b (ENSPEMG00000003316)	Rpa2 (ENSPEMG00000006270) #12	Themis2 (ENSPEMG00000008336) #13	Ppp1r8 (ENSPEMG00000003512) #14	Stx12 (ENSPEMG00000025346) #16	ENSPEMG00000014678 #17	Fgr (ENSPEMG00000000914) #20	Ahdc1 (ENSPEMG00000014274) #21	ENSPEMG00000013859	Wasf2 (ENSPEMG00000011815) #22	Gpr3 (ENSPEMG00000005212)	Cd164l2 (ENSPEMG00000013041)	Map3k6 (ENSPEMG00000015180)	Sytl1 (ENSPEMG00000011614)	Tmem222 (ENSPEMG00000017489)	Wdtc1 (ENSPEMG00000011264)	Slc9a1 (ENSPEMG00000008998)	Tent5b (ENSPEMG00000026289)	ENSPEMG00000024927	ENSPEMG00000020456	Kdf1 (ENSPEMG00000010418)	Nudc (ENSPEMG00000020579)	Nr0b2 (ENSPEMG00000020621)	Gpatch3 (ENSPEMG00000020632)	Gpn2 (ENSPEMG00000020796)
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182962.b.a #22
Hedgehog	MODERN SPECIES	5175																ENSEEUG00000012916 #22
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
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Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
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Cetacea	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045.i #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
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Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045.i #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045.i #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00390000006051.a.a.b	ENSGT00910000147719.b	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045.i #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00900000143263	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Narwhal	MODERN SPECIES	304	ATP5IF1 (ENSMMNG00015012814)	DNAJC8 (ENSMMNG00015012830)	ENSMMNG00015012849	ENSMMNG00015012858	EYA3 (ENSMMNG00015012893)	XKR8 (ENSMMNG00015012929)	SMPDL3B (ENSMMNG00015012953)	ENSMMNG00015012999 #12	THEMIS2 (ENSMMNG00015013027) #13	PPP1R8 (ENSMMNG00015005107) #14	ENSMMNG00015005158 #16	FAM76A (ENSMMNG00015005176) #17	IFI6 (ENSMMNG00015005200) #19	FGR (ENSMMNG00015005239) #20	AHDC1 (ENSMMNG00015005285) #21	WASF2 (ENSMMNG00015005306) #22	GPR3 (ENSMMNG00015005327)	CD164L2 (ENSMMNG00015005349)	FCN3 (ENSMMNG00015005371)	MAP3K6 (ENSMMNG00015005411)	SYTL1 (ENSMMNG00015005447)	TMEM222 (ENSMMNG00015005469)	WDTC1 (ENSMMNG00015005489)	SLC9A1 (ENSMMNG00015005523)	TENT5B (ENSMMNG00015005548)	TRNP1 (ENSMMNG00015005564)	KDF1 (ENSMMNG00015005581)	ENSMMNG00015005598	NUDC (ENSMMNG00015005615)	NR0B2 (ENSMMNG00015005644)	GPATCH3 (ENSMMNG00015005660)
Beluga whale	MODERN SPECIES	51	DNAJC8 (ENSDLEG00000013340)	PTAFR (ENSDLEG00000013349)	ENSDLEG00000013354	ENSDLEG00000013366	EYA3 (ENSDLEG00000013376)	XKR8 (ENSDLEG00000013433)	SMPDL3B (ENSDLEG00000013442)	ENSDLEG00000013454 #12	THEMIS2 (ENSDLEG00000013466) #13	PPP1R8 (ENSDLEG00000013472) #14	ENSDLEG00000013481 #16	FAM76A (ENSDLEG00000013491) #17	IFI6 (ENSDLEG00000013516) #19	FGR (ENSDLEG00000013542) #20	AHDC1 (ENSDLEG00000013602) #21	WASF2 (ENSDLEG00000013613) #22	GPR3 (ENSDLEG00000013622)	CD164L2 (ENSDLEG00000013628)	FCN3 (ENSDLEG00000013645)	MAP3K6 (ENSDLEG00000013702)	SYTL1 (ENSDLEG00000013757)	TMEM222 (ENSDLEG00000013791)	WDTC1 (ENSDLEG00000013819)	SLC9A1 (ENSDLEG00000013897)	FAM46B (ENSDLEG00000013920)	TRNP1 (ENSDLEG00000013926)	KDF1 (ENSDLEG00000013935)	ENSDLEG00000013942	NUDC (ENSDLEG00000013949)	NR0B2 (ENSDLEG00000013970)	GPATCH3 (ENSDLEG00000013973)
Vaquita	MODERN SPECIES		ATP5IF1 (ENSPSNG00000006090)	DNAJC8 (ENSPSNG00000006061)	PTAFR (ENSPSNG00000006046)	EYA3 (ENSPSNG00000005970)	XKR8 (ENSPSNG00000005907)	SMPDL3B (ENSPSNG00000005806)	RPA2 (ENSPSNG00000005730) #12	PDCD2 (ENSPSNG00000005696)	THEMIS2 (ENSPSNG00000005589) #13	PPP1R8 (ENSPSNG00000005558) #14	ENSPSNG00000005541 #16	FAM76A (ENSPSNG00000005498) #17	IFI6 (ENSPSNG00000005464) #19	FGR (ENSPSNG00000005414) #20	AHDC1 (ENSPSNG00000005397) #21	WASF2 (ENSPSNG00000005360) #22	GPR3 (ENSPSNG00000005331)	CD164L2 (ENSPSNG00000005310)	FCN3 (ENSPSNG00000005274)	MAP3K6 (ENSPSNG00000005216)	SYTL1 (ENSPSNG00000005181)	TMEM222 (ENSPSNG00000003266)	WDTC1 (ENSPSNG00000003225)	SLC9A1 (ENSPSNG00000003197)	ENSPSNG00000003188	TENT5B (ENSPSNG00000003178)	TRNP1 (ENSPSNG00000003165)	ENSPSNG00000003155	KDF1 (ENSPSNG00000003088)	NUDC (ENSPSNG00000003066)	NR0B2 (ENSPSNG00000003055)
Dolphin	MODERN SPECIES	5406															AHDC1 (ENSTTRG00000013821) #21	WASF2 (ENSTTRG00000013825) #22
Sperm whale	MODERN SPECIES	205																WASF2 (ENSPCTG00005009257) #22	GPR3 (ENSPCTG00005009417)	CD164L2 (ENSPCTG00005009440)	MAP3K6 (ENSPCTG00005009804)	SYTL1 (ENSPCTG00005010445)
Blue whale	MODERN SPECIES		SESN2 (ENSBMSG00010000531)	ENSBMSG00010000494	ENSBMSG00010000451	PTAFR (ENSBMSG00010000435)	EYA3 (ENSBMSG00010000306)	XKR8 (ENSBMSG00010000229)	SMPDL3B (ENSBMSG00010000155)	ENSBMSG00010000072 #12	THEMIS2 (ENSBMSG00010000049) #13	PPP1R8 (ENSBMSG00010000031) #14	STX12 (ENSBMSG00010000024) #16	ENSBMSG00010000015	ENSBMSG00010000011 #17	IFI6 (ENSBMSG00010000005) #19	FGR (ENSBMSG00010007414) #20	WASF2 (ENSBMSG00010007386) #22	GPR3 (ENSBMSG00010007372)	CD164L2 (ENSBMSG00010007357)	MAP3K6 (ENSBMSG00010007232)	SYTL1 (ENSBMSG00010007172)	TMEM222 (ENSBMSG00010007152)	WDTC1 (ENSBMSG00010007126)	SLC9A1 (ENSBMSG00010007105)	TENT5B (ENSBMSG00010007093)	TRNP1 (ENSBMSG00010007081)	ENSBMSG00010007072	KDF1 (ENSBMSG00010007059)	NUDC (ENSBMSG00010007048)	NR0B2 (ENSBMSG00010007031)	GPATCH3 (ENSBMSG00010007019)	GPN2 (ENSBMSG00010006997)
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264.c	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Yarkand deer	MODERN SPECIES	31	ENSCHYG00000003358	DNAJC8 (ENSCHYG00000003338)	EYA3 (ENSCHYG00000003037)	XKR8 (ENSCHYG00000002982)	SMPDL3B (ENSCHYG00000002959)	RPA2 (ENSCHYG00000002933) #12	THEMIS2 (ENSCHYG00000002918) #13	ENSCHYG00000002910	PPP1R8 (ENSCHYG00000002883) #14	STX12 (ENSCHYG00000002839) #16	FAM76A (ENSCHYG00000002798) #17	IFI6 (ENSCHYG00000002768) #19	ENSCHYG00000002750 #20	AHDC1 (ENSCHYG00000002738) #21	ENSCHYG00000002732	WASF2 (ENSCHYG00000002699) #22	GPR3 (ENSCHYG00000002685)	CD164L2 (ENSCHYG00000002659)	MAP3K6 (ENSCHYG00000002378)	SYTL1 (ENSCHYG00000002263)	TMEM222 (ENSCHYG00000002225)	WDTC1 (ENSCHYG00000002182)	SLC9A1 (ENSCHYG00000002158)	TENT5B (ENSCHYG00000002147)	KDF1 (ENSCHYG00000002127)	NUDC (ENSCHYG00000002088)	NR0B2 (ENSCHYG00000002069)	GPATCH3 (ENSCHYG00000002063)	GPN2 (ENSCHYG00000002038)	SFN (ENSCHYG00000002025)	ZDHHC18 (ENSCHYG00000002005)
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264.c	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	354	PTAFR (ENSMMSG00000018035)	EYA3 (ENSMMSG00000018084)	ENSMMSG00000018375	XKR8 (ENSMMSG00000018399)	SMPDL3B (ENSMMSG00000018430)	RPA2 (ENSMMSG00000018523) #12	ENSMMSG00000018576 #13	ENSMMSG00000018593 #13	PPP1R8 (ENSMMSG00000018605) #14	STX12 (ENSMMSG00000018678) #16	FAM76A (ENSMMSG00000018778) #17	ENSMMSG00000018954	IFI6 (ENSMMSG00000018977) #19	FGR (ENSMMSG00000019004) #20	AHDC1 (ENSMMSG00000019054) #21	WASF2 (ENSMMSG00000019069) #22	GPR3 (ENSMMSG00000019127)	CD164L2 (ENSMMSG00000019144)	MAP3K6 (ENSMMSG00000019207)	SYTL1 (ENSMMSG00000019547)	TMEM222 (ENSMMSG00000019584)	WDTC1 (ENSMMSG00000019642)	SLC9A1 (ENSMMSG00000019705)	TENT5B (ENSMMSG00000019758)	TRNP1 (ENSMMSG00000019769)	KDF1 (ENSMMSG00000019780)	NUDC (ENSMMSG00000019794)	NR0B2 (ENSMMSG00000019826)	GPATCH3 (ENSMMSG00000019842)	GPN2 (ENSMMSG00000019861)	SFN (ENSMMSG00000019892)
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264.c	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045.k #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264.c	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045.k.b #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B	ENSGT01090000260040.b.b.b.a
Bos	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264.c	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045.k.b #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B	ENSGT01090000260040.b.b.b.a
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000006264.c	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00910000147719.b	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045.k.b #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B	ENSGT01090000260040.b.b.b.a	ENSGT00940000156585
Domestic yak	MODERN SPECIES	11	ENSBGRG00000013691	EYA3 (ENSBGRG00000013293)	XKR8 (ENSBGRG00000013224)	SMPDL3B (ENSBGRG00000012884)	ENSBGRG00000012726 #12	ENSBGRG00000012694 #13	THEMIS2 (ENSBGRG00000012596) #13	ENSBGRG00000012570	PPP1R8 (ENSBGRG00000012519) #14	STX12 (ENSBGRG00000012395) #16	ENSBGRG00000012364	FAM76A (ENSBGRG00000012076) #17	IFI6 (ENSBGRG00000011996) #19	FGR (ENSBGRG00000011695) #20	AHDC1 (ENSBGRG00000011636) #21	WASF2 (ENSBGRG00000011448) #22	GPR3 (ENSBGRG00000011392)	CD164L2 (ENSBGRG00000011089)	MAP3K6 (ENSBGRG00000009866)	SYTL1 (ENSBGRG00000009724)	ENSBGRG00000009602	WDTC1 (ENSBGRG00000009375)	SLC9A1 (ENSBGRG00000009191)	TENT5B (ENSBGRG00000009168)	KDF1 (ENSBGRG00000009082)	NUDC (ENSBGRG00000008992)	ENSBGRG00000008953	GPATCH3 (ENSBGRG00000008880)	SFN (ENSBGRG00000008845)	GPN2 (ENSBGRG00000008777)	ZDHHC18 (ENSBGRG00000008689)
Wild yak	MODERN SPECIES	762	ATP5IF1 (ENSBMUG00000017659)	DNAJC8 (ENSBMUG00000017600)	PTAFR (ENSBMUG00000017560)	ENSBMUG00000017537	EYA3 (ENSBMUG00000017528)	XKR8 (ENSBMUG00000017423)	SMPDL3B (ENSBMUG00000017413)	ENSBMUG00000017390 #12	THEMIS2 (ENSBMUG00000017367) #13	PPP1R8 (ENSBMUG00000017340) #14	STX12 (ENSBMUG00000017327) #16	FAM76A (ENSBMUG00000017312) #17	IFI6 (ENSBMUG00000017279) #19	FGR (ENSBMUG00000017246) #20	AHDC1 (ENSBMUG00000017189) #21	WASF2 (ENSBMUG00000017163) #22	GPR3 (ENSBMUG00000017133)	CD164L2 (ENSBMUG00000017125)	MAP3K6 (ENSBMUG00000017097)	SYTL1 (ENSBMUG00000017014)	TMEM222 (ENSBMUG00000016948)	WDTC1 (ENSBMUG00000016909)	SLC9A1 (ENSBMUG00000016893)	TENT5B (ENSBMUG00000016880)	KDF1 (ENSBMUG00000016871)	NUDC (ENSBMUG00000016856)	NR0B2 (ENSBMUG00000016841)	GPATCH3 (ENSBMUG00000016826)	GPN2 (ENSBMUG00000016798)	SFN (ENSBMUG00000016763)	ZDHHC18 (ENSBMUG00000016747)
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264.c	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045.k.b #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B	ENSGT01090000260040.b.b.b.a
Cow	MODERN SPECIES	11	SESN2 (ENSBTAG00000002363)	ATP5IF1 (ENSBTAG00000006342)	DNAJC8 (ENSBTAG00000018385)	PTAFR (ENSBTAG00000027051)	EYA3 (ENSBTAG00000043989)	XKR8 (ENSBTAG00000008800)	SMPDL3B (ENSBTAG00000012997)	RPA2 (ENSBTAG00000006225) #12	THEMIS2 (ENSBTAG00000006223) #13	PPP1R8 (ENSBTAG00000003866) #14	STX12 (ENSBTAG00000001192) #16	FAM76A (ENSBTAG00000019614) #17	IFI6 (ENSBTAG00000007554) #19	FGR (ENSBTAG00000011784) #20	AHDC1 (ENSBTAG00000037456) #21	WASF2 (ENSBTAG00000018374) #22	GPR3 (ENSBTAG00000002505)	CD164L2 (ENSBTAG00000019728)	MAP3K6 (ENSBTAG00000010254)	SYTL1 (ENSBTAG00000010253)	TMEM222 (ENSBTAG00000010249)	ENSBTAG00000050795	WDTC1 (ENSBTAG00000053588)	SLC9A1 (ENSBTAG00000008766)	TENT5B (ENSBTAG00000018413)	TRNP1 (ENSBTAG00000054719)	KDF1 (ENSBTAG00000019252)	NUDC (ENSBTAG00000004416)	NR0B2 (ENSBTAG00000014848)	GPATCH3 (ENSBTAG00000014849)	GPN2 (ENSBTAG00000014850)
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	11	DNAJC8 (ENSBIXG00005010254)	ENSBIXG00005010236	PTAFR (ENSBIXG00005000806)	EYA3 (ENSBIXG00005000796)	XKR8 (ENSBIXG00005005690)	SMPDL3B (ENSBIXG00005009947)	ENSBIXG00005009925 #12	THEMIS2 (ENSBIXG00005009901) #13	PPP1R8 (ENSBIXG00005000665) #14	STX12 (ENSBIXG00005009866) #16	FAM76A (ENSBIXG00005009850) #17	ENSBIXG00005000618	IFI6 (ENSBIXG00005009818) #19	FGR (ENSBIXG00005009794) #20	AHDC1 (ENSBIXG00005009747) #21	WASF2 (ENSBIXG00005009713) #22	GPR3 (ENSBIXG00005009673)	CD164L2 (ENSBIXG00005009652)	MAP3K6 (ENSBIXG00005006314)	SYTL1 (ENSBIXG00005009106)	WDTC1 (ENSBIXG00005000370)	ENSBIXG00005008936	SLC9A1 (ENSBIXG00005008927)	TENT5B (ENSBIXG00005008901)	TRNP1 (ENSBIXG00005008892)	NUDC (ENSBIXG00005008880)	KDF1 (ENSBIXG00005000292)	NR0B2 (ENSBIXG00005005573)	GPATCH3 (ENSBIXG00005008799)	GPN2 (ENSBIXG00005008762)	SFN (ENSBIXG00005008749)
American bison	MODERN SPECIES	3363	SESN2 (ENSBBBG00000013292)	ATP5IF1 (ENSBBBG00000013307)	DNAJC8 (ENSBBBG00000001607)	ENSBBBG00000013333	PTAFR (ENSBBBG00000002716)	EYA3 (ENSBBBG00000013430)	XKR8 (ENSBBBG00000013441)	SMPDL3B (ENSBBBG00000013467)	ENSBBBG00000013481 #12	THEMIS2 (ENSBBBG00000013489) #13	PPP1R8 (ENSBBBG00000013499) #14	STX12 (ENSBBBG00000013509) #16	FAM76A (ENSBBBG00000013527) #17	IFI6 (ENSBBBG00000002792) #19	FGR (ENSBBBG00000013566) #20	WASF2 (ENSBBBG00000013586) #22	GPR3 (ENSBBBG00000013590)	CD164L2 (ENSBBBG00000013599)	MAP3K6 (ENSBBBG00000013689)	SYTL1 (ENSBBBG00000013744)	ENSBBBG00000013753	WDTC1 (ENSBBBG00000013773)	SLC9A1 (ENSBBBG00000013790)	TENT5B (ENSBBBG00000002954)	KDF1 (ENSBBBG00000013807)	NUDC (ENSBBBG00000013813)	NR0B2 (ENSBBBG00000013818)	GPATCH3 (ENSBBBG00000013829)	GPN2 (ENSBBBG00000002968)	SFN (ENSBBBG00000002970)	ZDHHC18 (ENSBBBG00000002907)
Caprinae	DUPLICATION
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182962.b.a.e #22
Goat	MODERN SPECIES	9	FAM187B (ENSCHIG00000021244)	FXYD5 (ENSCHIG00000026985)	ENSCHIG00000014550	ENSCHIG00000027209	LGI4 (ENSCHIG00000005629)	ENSCHIG00000012557	HPN (ENSCHIG00000023913)	SCN1B (ENSCHIG00000026195)	GRAMD1A (ENSCHIG00000019950)	ZNF792 (ENSCHIG00000025015)	ENSCHIG00000013449	ZNF599 (ENSCHIG00000025528)	ENSCHIG00000014055	ENSCHIG00000021338	ENSCHIG00000009298	ENSCHIG00000024732 #22	ENSCHIG00000013055	ENSCHIG00000022635	ENSCHIG00000011644	WTIP (ENSCHIG00000025695)	UBA2 (ENSCHIG00000014051)	PDCD2L (ENSCHIG00000024774)	GPI (ENSCHIG00000016122)	GARRE1 (ENSCHIG00000007746)	ENSCHIG00000008709	LSM14A (ENSCHIG00000009458)	KCTD15 (ENSCHIG00000023579)	CHST8 (ENSCHIG00000019583)	PEPD (ENSCHIG00000015514)	CEBPG (ENSCHIG00000008784)	CEBPA (ENSCHIG00000011587)
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264.c	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045.l #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a.f #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00730000110997.k.a	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	11	SESN2 (ENSOARG00020018898)	ATP5IF1 (ENSOARG00020019017)	DNAJC8 (ENSOARG00020019115)	ENSOARG00020019236	EYA3 (ENSOARG00020019284)	XKR8 (ENSOARG00020020079)	SMPDL3B (ENSOARG00020020126)	RPA2 (ENSOARG00020020276) #12	THEMIS2 (ENSOARG00020020351) #13	PPP1R8 (ENSOARG00020020388) #14	STX12 (ENSOARG00020020460) #16	FAM76A (ENSOARG00020020517) #17	IFI6 (ENSOARG00020021024) #19	FGR (ENSOARG00020021091) #20	AHDC1 (ENSOARG00020021138) #21	WASF2 (ENSOARG00020021160) #22	GPR3 (ENSOARG00020021228)	CD164L2 (ENSOARG00020021247)	MAP3K6 (ENSOARG00020021395)	SYTL1 (ENSOARG00020021924)	TMEM222 (ENSOARG00020021961)	ENSOARG00020022006	WDTC1 (ENSOARG00020022036)	SLC9A1 (ENSOARG00020022275)	TENT5B (ENSOARG00020022308)	TRNP1 (ENSOARG00020022331)	KDF1 (ENSOARG00020022342)	NUDC (ENSOARG00020022358)	NR0B2 (ENSOARG00020022389)	GPATCH3 (ENSOARG00020022411)	GPN2 (ENSOARG00020022460)
Goat	MODERN SPECIES	11	SESN2 (ENSCHIG00000023698)	ATP5IF1 (ENSCHIG00000007574)	ENSCHIG00000026518	PTAFR (ENSCHIG00000012038)	EYA3 (ENSCHIG00000026543)	XKR8 (ENSCHIG00000026584)	SMPDL3B (ENSCHIG00000014109)	RPA2 (ENSCHIG00000018966) #12	THEMIS2 (ENSCHIG00000012658) #13	PPP1R8 (ENSCHIG00000024272) #14	STX12 (ENSCHIG00000024442) #16	FAM76A (ENSCHIG00000010125) #17	IFI6 (ENSCHIG00000017858) #19	FGR (ENSCHIG00000015392) #20	AHDC1 (ENSCHIG00000015263) #21	WASF2 (ENSCHIG00000023712) #22	GPR3 (ENSCHIG00000011308)	CD164L2 (ENSCHIG00000024012)	FCN3 (ENSCHIG00000023030)	MAP3K6 (ENSCHIG00000004209)	SYTL1 (ENSCHIG00000022293)	TMEM222 (ENSCHIG00000018082)	ENSCHIG00000005039	WDTC1 (ENSCHIG00000011601)	SLC9A1 (ENSCHIG00000023737)	TENT5B (ENSCHIG00000019519)	TRNP1 (ENSCHIG00000010909)	ENSCHIG00000019557	KDF1 (ENSCHIG00000024708)	NUDC (ENSCHIG00000009787)	NR0B2 (ENSCHIG00000026969)
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B	ENSGT00940000156585	ENSGT00390000013174
Alpaca	MODERN SPECIES	5487																ENSVPAG00000000554 #22
Arabian camel	MODERN SPECIES	4	SESN2 (ENSCDRG00005009534)	ATP5IF1 (ENSCDRG00005009468)	DNAJC8 (ENSCDRG00005009348)	PTAFR (ENSCDRG00005009309)	EYA3 (ENSCDRG00005008747)	XKR8 (ENSCDRG00005008698)	SMPDL3B (ENSCDRG00005008566)	RPA2 (ENSCDRG00005008368) #12	THEMIS2 (ENSCDRG00005008258) #13	PPP1R8 (ENSCDRG00005008155) #14	STX12 (ENSCDRG00005008126) #16	FAM76A (ENSCDRG00005007930) #17	IFI6 (ENSCDRG00005007894) #19	FGR (ENSCDRG00005007737) #20	AHDC1 (ENSCDRG00005007718) #21	WASF2 (ENSCDRG00005007664) #22	GPR3 (ENSCDRG00005007635)	CD164L2 (ENSCDRG00005007565)	MAP3K6 (ENSCDRG00005007422)	SYTL1 (ENSCDRG00005007351)	ENSCDRG00005007278	WDTC1 (ENSCDRG00005007230)	SLC9A1 (ENSCDRG00005007172)	TENT5B (ENSCDRG00005007132)	KDF1 (ENSCDRG00005007013)	NUDC (ENSCDRG00005006914)	NR0B2 (ENSCDRG00005006876)	GPATCH3 (ENSCDRG00005006833)	GPN2 (ENSCDRG00005006791)	ZDHHC18 (ENSCDRG00005006661)	PIGV (ENSCDRG00005006607)
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00390000005534.b.b.c.a	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00390000003248.a.b.a.a	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Panthera	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00390000005534.b.b.c.a	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000161804.f	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00390000003248.a.b.a.a	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Tiger	MODERN SPECIES	111															AHDC1 (ENSPTIG00000014345) #21	WASF2 (ENSPTIG00000014362) #22	GPR3 (ENSPTIG00000009268)	CD164L2 (ENSPTIG00000014373)	FCN3 (ENSPTIG00000014389)	MAP3K6 (ENSPTIG00000014433)	SYTL1 (ENSPTIG00000014534)	TMEM222 (ENSPTIG00000014570)	WDTC1 (ENSPTIG00000014587)	SLC9A1 (ENSPTIG00000014613)	TENT5B (ENSPTIG00000014641)	ENSPTIG00000014652	KDF1 (ENSPTIG00000014656)	NUDC (ENSPTIG00000014669)	NR0B2 (ENSPTIG00000014689)	GPATCH3 (ENSPTIG00000014693)	ENSPTIG00000014705
Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00390000005534.b.b.c.a	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000161804.f	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00390000003248.a.b.a.a	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
lion	MODERN SPECIES	8	DNAJC8 (ENSPLOG00000007924)	PTAFR (ENSPLOG00000007953)	EYA3 (ENSPLOG00000008003)	XKR8 (ENSPLOG00000008129)	SMPDL3B (ENSPLOG00000008186)	RPA2 (ENSPLOG00000008334) #12	THEMIS2 (ENSPLOG00000008402) #13	PPP1R8 (ENSPLOG00000008473) #14	STX12 (ENSPLOG00000008547) #16	FAM76A (ENSPLOG00000008609) #17	ENSPLOG00000008704	IFI6 (ENSPLOG00000008736) #19	FGR (ENSPLOG00000008770) #20	AHDC1 (ENSPLOG00000008801) #21	ENSPLOG00000008820	WASF2 (ENSPLOG00000008859) #22	GPR3 (ENSPLOG00000008898)	CD164L2 (ENSPLOG00000008921)	FCN3 (ENSPLOG00000008994)	MAP3K6 (ENSPLOG00000009129)	SYTL1 (ENSPLOG00000009458)	TMEM222 (ENSPLOG00000009496)	WDTC1 (ENSPLOG00000009580)	SLC9A1 (ENSPLOG00000009616)	TENT5B (ENSPLOG00000009648)	TRNP1 (ENSPLOG00000009668)	KDF1 (ENSPLOG00000009687)	NUDC (ENSPLOG00000009710)	NR0B2 (ENSPLOG00000009763)	GPATCH3 (ENSPLOG00000009784)	GPN2 (ENSPLOG00000009798)
leopard	MODERN SPECIES	145	DNAJC8 (ENSPPRG00000023348)	PTAFR (ENSPPRG00000022317)	EYA3 (ENSPPRG00000023907)	XKR8 (ENSPPRG00000012969)	SMPDL3B (ENSPPRG00000012800)	RPA2 (ENSPPRG00000011127) #12	THEMIS2 (ENSPPRG00000010577) #13	PPP1R8 (ENSPPRG00000010064) #14	STX12 (ENSPPRG00000009522) #16	FAM76A (ENSPPRG00000008178) #17	IFI6 (ENSPPRG00000007307) #19	ENSPPRG00000007183	FGR (ENSPPRG00000006632) #20	AHDC1 (ENSPPRG00000021945) #21	ENSPPRG00000005758	WASF2 (ENSPPRG00000005663) #22	GPR3 (ENSPPRG00000021926)	CD164L2 (ENSPPRG00000005218)	FCN3 (ENSPPRG00000005121)	MAP3K6 (ENSPPRG00000004619)	SYTL1 (ENSPPRG00000001681)	TMEM222 (ENSPPRG00000000473)	WDTC1 (ENSPPRG00000022741)	ENSPPRG00000023306	SLC9A1 (ENSPPRG00000023440)	TENT5B (ENSPPRG00000023756)	TRNP1 (ENSPPRG00000021647)	ENSPPRG00000023811	KDF1 (ENSPPRG00000023953)	NUDC (ENSPPRG00000024046)	NR0B2 (ENSPPRG00000024101)
Cat	MODERN SPECIES	239	ATP5IF1 (ENSFCAG00000013395)	DNAJC8 (ENSFCAG00000013393)	PTAFR (ENSFCAG00000012031)	EYA3 (ENSFCAG00000003408)	XKR8 (ENSFCAG00000034139)	RPA2 (ENSFCAG00000039600) #12	THEMIS2 (ENSFCAG00000003404) #13	PPP1R8 (ENSFCAG00000027954) #14	FAM76A (ENSFCAG00000035488) #17	ENSFCAG00000021929	IFI6 (ENSFCAG00000033862) #19	FGR (ENSFCAG00000007868) #20	STX12 (ENSFCAG00000029657) #16	AHDC1 (ENSFCAG00000007867) #21	ENSFCAG00000033739	WASF2 (ENSFCAG00000007866) #22	GPR3 (ENSFCAG00000010306)	CD164L2 (ENSFCAG00000010305)	MAP3K6 (ENSFCAG00000007864)	SYTL1 (ENSFCAG00000030775)	TMEM222 (ENSFCAG00000027299)	WDTC1 (ENSFCAG00000010303)	SLC9A1 (ENSFCAG00000010301)	TENT5B (ENSFCAG00000010300)	TRNP1 (ENSFCAG00000045565)	KDF1 (ENSFCAG00000023735)	NUDC (ENSFCAG00000012822)	NR0B2 (ENSFCAG00000012821)	GPATCH3 (ENSFCAG00000012819)	GPN2 (ENSFCAG00000012818)	SFN (ENSFCAG00000052603)
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000012569.a.a	ENSGT00390000006264.f	ENSGT00390000012569.a.b	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000012569.a.a	ENSGT00390000006264.f	ENSGT00390000012569.a.b	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Dog	MODERN SPECIES	11	MED18 (ENSCAFG00845010525)	SESN2 (ENSCAFG00845010570)	ATP5IF1 (ENSCAFG00845010681)	DNAJC8 (ENSCAFG00845010729)	PTAFR (ENSCAFG00845010815)	EYA3 (ENSCAFG00845010903)	XKR8 (ENSCAFG00845011047)	SMPDL3B (ENSCAFG00845011070)	THEMIS2 (ENSCAFG00845011158) #13	RPA2 (ENSCAFG00845011391) #12	PPP1R8 (ENSCAFG00845011474) #14	STX12 (ENSCAFG00845011509) #16	FAM76A (ENSCAFG00845011543) #17	ENSCAFG00845010242 #19	FGR (ENSCAFG00845010301) #20	WASF2 (ENSCAFG00845010413) #22	GPR3 (ENSCAFG00845010599)	CD164L2 (ENSCAFG00845010625)	MAP3K6 (ENSCAFG00845010722)	SYTL1 (ENSCAFG00845010866)	TMEM222 (ENSCAFG00845010930)	WDTC1 (ENSCAFG00845010979)	SLC9A1 (ENSCAFG00845011051)	TENT5B (ENSCAFG00845011088)	TRNP1 (ENSCAFG00845011105)	ENSCAFG00845011115	KDF1 (ENSCAFG00845011124)	NUDC (ENSCAFG00845011150)	NR0B2 (ENSCAFG00845011182)	GPATCH3 (ENSCAFG00845011199)	GPN2 (ENSCAFG00845011238)
Dingo	MODERN SPECIES	41	SESN2 (ENSCAFG00020023502)	ENSCAFG00020023497	DNAJC8 (ENSCAFG00020023488)	PTAFR (ENSCAFG00020023486)	EYA3 (ENSCAFG00020023433)	XKR8 (ENSCAFG00020023415)	ENSCAFG00020023408	RPA2 (ENSCAFG00020023397) #12	THEMIS2 (ENSCAFG00020023394) #13	PPP1R8 (ENSCAFG00020023390) #14	STX12 (ENSCAFG00020023387) #16	FAM76A (ENSCAFG00020023311) #17	IFI6 (ENSCAFG00020023299) #19	FGR (ENSCAFG00020022400) #20	AHDC1 (ENSCAFG00020022386) #21	WASF2 (ENSCAFG00020022369) #22	GPR3 (ENSCAFG00020022364)	CD164L2 (ENSCAFG00020022358)	MAP3K6 (ENSCAFG00020022327)	TMEM222 (ENSCAFG00020022297)	WDTC1 (ENSCAFG00020022295)	SLC9A1 (ENSCAFG00020021719)	TENT5B (ENSCAFG00020021681)	TRNP1 (ENSCAFG00020021680)	ENSCAFG00020021677	KDF1 (ENSCAFG00020021675)	NUDC (ENSCAFG00020021647)	NR0B2 (ENSCAFG00020021643)	GPATCH3 (ENSCAFG00020021640)	ENSCAFG00020021638	ENSCAFG00020021637
Red fox	MODERN SPECIES	103	SESN2 (ENSVVUG00000012387)	ATP5IF1 (ENSVVUG00000012384)	ENSVVUG00000012347	PTAFR (ENSVVUG00000012345)	EYA3 (ENSVVUG00000012251)	XKR8 (ENSVVUG00000012245)	SMPDL3B (ENSVVUG00000012240)	RPA2 (ENSVVUG00000012237) #12	THEMIS2 (ENSVVUG00000012229) #13	PPP1R8 (ENSVVUG00000012220) #14	STX12 (ENSVVUG00000012213) #16	FAM76A (ENSVVUG00000012204) #17	IFI6 (ENSVVUG00000012198) #19	FGR (ENSVVUG00000012177) #20	AHDC1 (ENSVVUG00000012164) #21	WASF2 (ENSVVUG00000012157) #22	GPR3 (ENSVVUG00000012155)	CD164L2 (ENSVVUG00000012153)	SYTL1 (ENSVVUG00000012094)	TMEM222 (ENSVVUG00000012088)	WDTC1 (ENSVVUG00000012082)	SLC9A1 (ENSVVUG00000012068)	TENT5B (ENSVVUG00000012066)	ENSVVUG00000012063	KDF1 (ENSVVUG00000012057)	NUDC (ENSVVUG00000012049)	NR0B2 (ENSVVUG00000012044)	GPATCH3 (ENSVVUG00000012041)	GPN2 (ENSVVUG00000012034)	SFN (ENSVVUG00000012027)	ZDHHC18 (ENSVVUG00000012001)
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
American mink	MODERN SPECIES	9	SESN2 (ENSNVIG00000023817)	ATP5IF1 (ENSNVIG00000023815)	DNAJC8 (ENSNVIG00000023813)	PTAFR (ENSNVIG00000023812)	EYA3 (ENSNVIG00000023808)	XKR8 (ENSNVIG00000023806)	SMPDL3B (ENSNVIG00000023805)	RPA2 (ENSNVIG00000023804) #12	THEMIS2 (ENSNVIG00000023803) #13	PP1R8 (ENSNVIG00000023801) #14	STX12 (ENSNVIG00000023800) #16	FAM76A (ENSNVIG00000023798) #17	IFI6 (ENSNVIG00000023797) #19	FGR (ENSNVIG00000023796) #20	AHDC1 (ENSNVIG00000023795) #21	WASF2 (ENSNVIG00000023794) #22	GPR3 (ENSNVIG00000023793)	CD164L2 (ENSNVIG00000023792)	MAP3K6 (ENSNVIG00000023767)	SYTL1 (ENSNVIG00000023745)	TMEM222 (ENSNVIG00000023737)	WDTC1 (ENSNVIG00000023727)	SLC9A1 (ENSNVIG00000023725)	TENT5B (ENSNVIG00000023724)	TRNP1 (ENSNVIG00000023723)	ENSNVIG00000023721	CA172 (ENSNVIG00000023720)	NUDC (ENSNVIG00000023719)	NR0B2 (ENSNVIG00000023716)	GPATCH3 (ENSNVIG00000023714)	GPN2 (ENSNVIG00000023711)
Ferret	MODERN SPECIES	167	SESN2 (ENSMPUG00000015535)	ATP5IF1 (ENSMPUG00000015536)	DNAJC8 (ENSMPUG00000015540)	PTAFR (ENSMPUG00000018809)	EYA3 (ENSMPUG00000015548)	XKR8 (ENSMPUG00000015551)	SMPDL3B (ENSMPUG00000015553)	RPA2 (ENSMPUG00000015563) #12	THEMIS2 (ENSMPUG00000015575) #13	PPP1R8 (ENSMPUG00000015577) #14	STX12 (ENSMPUG00000015578) #16	FAM76A (ENSMPUG00000015579) #17	ENSMPUG00000015599 #19	FGR (ENSMPUG00000015600) #20	AHDC1 (ENSMPUG00000018811) #21	WASF2 (ENSMPUG00000015601) #22	GPR3 (ENSMPUG00000018813)	CD164L2 (ENSMPUG00000015613)	MAP3K6 (ENSMPUG00000015615)	SYTL1 (ENSMPUG00000015617)	TMEM222 (ENSMPUG00000015642)	WDTC1 (ENSMPUG00000015651)	SLC9A1 (ENSMPUG00000015654)	TENT5B (ENSMPUG00000015656)	TRNP1 (ENSMPUG00000015658)	KDF1 (ENSMPUG00000015660)	NUDC (ENSMPUG00000015663)	NR0B2 (ENSMPUG00000015664)	GPATCH3 (ENSMPUG00000015665)	GPN2 (ENSMPUG00000015666)	ENSMPUG00000018816
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B	ENSGT01090000260040.b.b.b.a.b
Giant Panda	MODERN SPECIES	11	MED18 (ENSAMEG00000011315)	SESN2 (ENSAMEG00000011266)	ATP5IF1 (ENSAMEG00000025701)	DNAJC8 (ENSAMEG00000011231)	ENSAMEG00000020209	EYA3 (ENSAMEG00000011164)	SMPDL3B (ENSAMEG00000011140)	RPA2 (ENSAMEG00000011132) #12	THEMIS2 (ENSAMEG00000011126) #13	PPP1R8 (ENSAMEG00000029383) #14	STX12 (ENSAMEG00000011073) #16	FAM76A (ENSAMEG00000011050) #17	ENSAMEG00000011039 #19	FGR (ENSAMEG00000010994) #20	AHDC1 (ENSAMEG00000020208) #21	WASF2 (ENSAMEG00000010979) #22	GPR3 (ENSAMEG00000020207)	CD164L2 (ENSAMEG00000028803)	MAP3K6 (ENSAMEG00000010924)	SYTL1 (ENSAMEG00000010899)	TMEM222 (ENSAMEG00000010882)	WDTC1 (ENSAMEG00000010864)	SLC9A1 (ENSAMEG00000010839)	TENT5B (ENSAMEG00000010835)	ENSAMEG00000026569	KDF1 (ENSAMEG00000010831)	NUDC (ENSAMEG00000010820)	NR0B2 (ENSAMEG00000010817)	GPATCH3 (ENSAMEG00000010801)	GPN2 (ENSAMEG00000030549)	PIGV (ENSAMEG00000010771)
Ursus	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B	ENSGT01090000260040.b.b.b.a.b
American black bear	MODERN SPECIES	6141																WASF2 (ENSUAMG00000000571) #22
Polar bear	MODERN SPECIES	189	SESN2 (ENSUMAG00000011123)	ATP5IF1 (ENSUMAG00000011151)	DNAJC8 (ENSUMAG00000011154)	PTAFR (ENSUMAG00000011170)	EYA3 (ENSUMAG00000011197)	ENSUMAG00000011201	SMPDL3B (ENSUMAG00000011203)	RPA2 (ENSUMAG00000011210) #12	THEMIS2 (ENSUMAG00000011236) #13	ENSUMAG00000011237 #13	PPP1R8 (ENSUMAG00000011243) #14	STX12 (ENSUMAG00000011252) #16	FAM76A (ENSUMAG00000011259) #17	ENSUMAG00000011264 #19	FGR (ENSUMAG00000011271) #20	WASF2 (ENSUMAG00000011424) #22	GPR3 (ENSUMAG00000011428)	CD164L2 (ENSUMAG00000011432)	TMEM222 (ENSUMAG00000011485)	WDTC1 (ENSUMAG00000011493)	SLC9A1 (ENSUMAG00000011532)	TENT5B (ENSUMAG00000011875)	ENSUMAG00000011881	KDF1 (ENSUMAG00000011883)	NUDC (ENSUMAG00000011889)	NR0B2 (ENSUMAG00000011892)	GPATCH3 (ENSUMAG00000011894)	GPN2 (ENSUMAG00000011897)	SFN (ENSUMAG00000011901)	ZDHHC18 (ENSUMAG00000011906)	PIGV (ENSUMAG00000011910)
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Equus	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Donkey	MODERN SPECIES	25	SESN2 (ENSEASG00005010029)	ATP5IF1 (ENSEASG00005034782)	DNAJC8 (ENSEASG00005010027)	PTAFR (ENSEASG00005036385)	EYA3 (ENSEASG00005009517)	ENSEASG00005023883	SMPDL3B (ENSEASG00005009506)	ENSEASG00005009504 #12	THEMIS2 (ENSEASG00005009503) #13	PPP1R8 (ENSEASG00005009499) #14	STX12 (ENSEASG00005009498) #16	IFI6 (ENSEASG00005025976) #19	FAM76A (ENSEASG00005009497) #17	FGR (ENSEASG00005009494) #20	AHDC1 (ENSEASG00005009489) #21	WASF2 (ENSEASG00005009488) #22	GPR3 (ENSEASG00005031706)	CD164L2 (ENSEASG00005009485)	FCN3 (ENSEASG00005032502)	MAP3K6 (ENSEASG00005008765)	SYTL1 (ENSEASG00005008710)	TMEM222 (ENSEASG00005027327)	WDTC1 (ENSEASG00005008688)	SLC9A1 (ENSEASG00005008683)	TENT5B (ENSEASG00005030650)	TRNP1 (ENSEASG00005008681)	KDF1 (ENSEASG00005008678)	NUDC (ENSEASG00005008644)	NR0B2 (ENSEASG00005008640)	GPATCH3 (ENSEASG00005008636)	GPN2 (ENSEASG00005033906)
Horse	MODERN SPECIES	11	MED18 (ENSECAG00000057255)	SESN2 (ENSECAG00000001989)	DNAJC8 (ENSECAG00000012708)	ATP5IF1 (ENSECAG00000011826)	PTAFR (ENSECAG00000049724)	EYA3 (ENSECAG00000017176)	XKR8 (ENSECAG00000043252)	SMPDL3B (ENSECAG00000000634)	THEMIS2 (ENSECAG00000008596) #13	FAM76A (ENSECAG00000019350) #17	RPA2 (ENSECAG00000005616) #12	PPP1R8 (ENSECAG00000009693) #14	STX12 (ENSECAG00000012718) #16	FGR (ENSECAG00000007837) #20	AHDC1 (ENSECAG00000010246) #21	WASF2 (ENSECAG00000010268) #22	GPR3 (ENSECAG00000005510)	CD164L2 (ENSECAG00000014444)	FCN3 (ENSECAG00000014857)	MAP3K6 (ENSECAG00000015410)	SYTL1 (ENSECAG00000020672)	WDTC1 (ENSECAG00000024411)	SLC9A1 (ENSECAG00000011296)	TENT5B (ENSECAG00000018835)	TRNP1 (ENSECAG00000049020)	KDF1 (ENSECAG00000020561)	NUDC (ENSECAG00000021311)	NR0B2 (ENSECAG00000050372)	GPATCH3 (ENSECAG00000007653)	GPN2 (ENSECAG00000041580)	ENSECAG00000045174
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00900000143263	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	27	DNAJC8 (ENSRFEG00010007033)	PTAFR (ENSRFEG00010007010)	ENSRFEG00010006978	ENSRFEG00010006954	EYA3 (ENSRFEG00010006785)	XKR8 (ENSRFEG00010006721)	SMPDL3B (ENSRFEG00010006653)	RPA2 (ENSRFEG00010006599) #12	THEMIS2 (ENSRFEG00010006552) #13	PPP1R8 (ENSRFEG00010006439) #14	STX12 (ENSRFEG00010006392) #16	FAM76A (ENSRFEG00010006284) #17	IFI6 (ENSRFEG00010006222) #19	FGR (ENSRFEG00010006173) #20	AHDC1 (ENSRFEG00010006151) #21	WASF2 (ENSRFEG00010006106) #22	GPR3 (ENSRFEG00010006070)	CD164L2 (ENSRFEG00010006017)	FCN3 (ENSRFEG00010005924)	MAP3K6 (ENSRFEG00010005701)	SYTL1 (ENSRFEG00010004356)	TMEM222 (ENSRFEG00010004325)	WDTC1 (ENSRFEG00010004284)	SLC9A1 (ENSRFEG00010004258)	TENT5B (ENSRFEG00010004245)	TRNP1 (ENSRFEG00010004240)	ENSRFEG00010004229	KDF1 (ENSRFEG00010004215)	NUDC (ENSRFEG00010004201)	NR0B2 (ENSRFEG00010004192)	GPATCH3 (ENSRFEG00010004179)
Microbat	MODERN SPECIES	1134	SESN2 (ENSMLUG00000000171)	ENSMLUG00000000170	DNAJC8 (ENSMLUG00000000165)	PTAFR (ENSMLUG00000000164)	EYA3 (ENSMLUG00000000155)	AHDC1 (ENSMLUG00000014574) #21	XKR8 (ENSMLUG00000000154)	SMPDL3B (ENSMLUG00000026678)	RPA2 (ENSMLUG00000000151) #12	THEMIS2 (ENSMLUG00000000147) #13	PPP1R8 (ENSMLUG00000000144) #14	STX12 (ENSMLUG00000000141) #16	FAM76A (ENSMLUG00000000136) #17	IFI6 (ENSMLUG00000014587) #19	FGR (ENSMLUG00000014580) #20	WASF2 (ENSMLUG00000001835) #22	CD164L2 (ENSMLUG00000024507)	FCN3 (ENSMLUG00000001825)	MAP3K6 (ENSMLUG00000001811)	SYTL1 (ENSMLUG00000001802)	TMEM222 (ENSMLUG00000004145)	WDTC1 (ENSMLUG00000004136)	SLC9A1 (ENSMLUG00000004681)	TENT5B (ENSMLUG00000004676)	TRNP1 (ENSMLUG00000004673)	KDF1 (ENSMLUG00000004669)	NUDC (ENSMLUG00000004662)	NR0B2 (ENSMLUG00000004658)	GPATCH3 (ENSMLUG00000023528)	GPN2 (ENSMLUG00000004651)	ENSMLUG00000010207
Megabat	MODERN SPECIES	2869																WASF2 (ENSPVAG00000008485) #22	GPR3 (ENSPVAG00000008483)	CD164L2 (ENSPVAG00000008482)	FCN3 (ENSPVAG00000008479)	MAP3K6 (ENSPVAG00000008476)	SYTL1 (ENSPVAG00000008473)	TMEM222 (ENSPVAG00000008472)
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B
Armadillo	MODERN SPECIES	1291	ENSDNOG00000038753	ENSDNOG00000045464	ENSDNOG00000042785	PTAFR (ENSDNOG00000044017)	EYA3 (ENSDNOG00000044648)	XKR8 (ENSDNOG00000032960)	SMPDL3B (ENSDNOG00000032579)	RPA2 (ENSDNOG00000023660) #12	THEMIS2 (ENSDNOG00000013968) #13	PPP1R8 (ENSDNOG00000033057) #14	STX12 (ENSDNOG00000049359) #16	FAM76A (ENSDNOG00000049213) #17	ENSDNOG00000034433	FGR (ENSDNOG00000014797) #20	AHDC1 (ENSDNOG00000038844) #21	WASF2 (ENSDNOG00000034536) #22	GPR3 (ENSDNOG00000024172)	CD164L2 (ENSDNOG00000039635)	FCN3 (ENSDNOG00000031654)	MAP3K6 (ENSDNOG00000009722)	SYTL1 (ENSDNOG00000009697)	TMEM222 (ENSDNOG00000043003)	WDTC1 (ENSDNOG00000001232)
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Tenrec	MODERN SPECIES	3841																ENSETEG00000016430 #22	GPR3 (ENSETEG00000016428)	MAP3K6 (ENSETEG00000016421)	SYTL1 (ENSETEG00000016418)	ENSETEG00000016414
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Hyrax	MODERN SPECIES	6098																ENSPCAG00000009891 #22	GPR3 (ENSPCAG00000009870)
Elephant	MODERN SPECIES	332	ATP5IF1 (ENSLAFG00000005700)	DNAJC8 (ENSLAFG00000005695)	PTAFR (ENSLAFG00000007791)	EYA3 (ENSLAFG00000008613)	XKR8 (ENSLAFG00000008610)	SMPDL3B (ENSLAFG00000008605)	RPA2 (ENSLAFG00000014387) #12	THEMIS2 (ENSLAFG00000009492) #13	PPP1R8 (ENSLAFG00000017834) #14	STX12 (ENSLAFG00000017828) #16	FAM76A (ENSLAFG00000017824) #17	ENSLAFG00000023210 #19	ENSLAFG00000022930 #19	FGR (ENSLAFG00000011018) #20	AHDC1 (ENSLAFG00000030861) #21	WASF2 (ENSLAFG00000006048) #22	GPR3 (ENSLAFG00000010606)	CD164L2 (ENSLAFG00000026681)	MAP3K6 (ENSLAFG00000006042)	SYTL1 (ENSLAFG00000006041)	TMEM222 (ENSLAFG00000006037)	WDTC1 (ENSLAFG00000006032)	SLC9A1 (ENSLAFG00000011339)	TENT5B (ENSLAFG00000023075)	KDF1 (ENSLAFG00000016045)	NUDC (ENSLAFG00000027857)	NR0B2 (ENSLAFG00000016698)	GPATCH3 (ENSLAFG00000016691)	GPN2 (ENSLAFG00000021641)	SFN (ENSLAFG00000007721)	ZDHHC18 (ENSLAFG00000016682)
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Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00390000006264	ENSGT00390000012569.a	ENSGT01060000248589.D	ENSGT00950000182978.B	ENSGT01090000260093.b	ENSGT00950000183182.a.a	ENSGT00390000010045 #12	ENSGT00530000063770.c.a #13	ENSGT00940000156115 #14	ENSGT01000000214440.A.a.b.a #16	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000163188	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Common wonbat	MODERN SPECIES	1016							ENSVURG00010007451	ENSVURG00010007425	ENSVURG00010007415	ENSVURG00010007408 #12	ENSVURG00010007404 #13	ENSVURG00010007390 #14	ENSVURG00010007383 #16	ENSVURG00010007340 #17	ENSVURG00010007319 #20	WASF2 (ENSVURG00010007302) #22	CD164L2 (ENSVURG00010007273)	FCN3 (ENSVURG00010007261)	MAP3K6 (ENSVURG00010007128)	SYTL1 (ENSVURG00010007100)	TMEM222 (ENSVURG00010007064)	WDTC1 (ENSVURG00010007025)	SLC9A1 (ENSVURG00010007010)	TENT5B (ENSVURG00010007003)	ENSVURG00010007001	ENSVURG00010006997	NR0B2 (ENSVURG00010006991)	GPATCH3 (ENSVURG00010006982)	GPN2 (ENSVURG00010006977)	SFN (ENSVURG00010006971)	ZDHHC18 (ENSVURG00010006957)
koala	MODERN SPECIES	14	MED18 (ENSPCIG00000022383)	SESN2 (ENSPCIG00000022378)	ATP5IF1 (ENSPCIG00000022375)	DNAJC8 (ENSPCIG00000022366)	PTAFR (ENSPCIG00000022363)	EYA3 (ENSPCIG00000022339)	XKR8 (ENSPCIG00000022335)	SMPDL3B (ENSPCIG00000022329)	RPA2 (ENSPCIG00000022320) #12	THEMIS2 (ENSPCIG00000022310) #13	PPP1R8 (ENSPCIG00000036471) #14	STX12 (ENSPCIG00000022297) #16	FAM76A (ENSPCIG00000022294) #17	FGR (ENSPCIG00000000551) #20	AHDC1 (ENSPCIG00000009216) #21	WASF2 (ENSPCIG00000034938) #22	GPR3 (ENSPCIG00000024859)	CD164L2 (ENSPCIG00000024856)	ENSPCIG00000034177	MAP3K6 (ENSPCIG00000024851)	SYTL1 (ENSPCIG00000024846)	TMEM222 (ENSPCIG00000024842)	WDTC1 (ENSPCIG00000024839)	SLC9A1 (ENSPCIG00000012661)	TENT5B (ENSPCIG00000031333)	TRNP1 (ENSPCIG00000012669)	KDF1 (ENSPCIG00000012674)	NUDC (ENSPCIG00000012676)	NR0B2 (ENSPCIG00000012680)	ENSPCIG00000033728	GPATCH3 (ENSPCIG00000012681)
Wallaby	MODERN SPECIES	11038																WASF2 (ENSMEUG00000007015) #22
Tasmanian devil	MODERN SPECIES	2	PHACTR4 (ENSSHAG00000006497)	MED18 (ENSSHAG00000031976)	SESN2 (ENSSHAG00000004785)	ENSSHAG00000022171	DNAJC8 (ENSSHAG00000003717)	PTAFR (ENSSHAG00000026787)	ENSSHAG00000029212	EYA3 (ENSSHAG00000027000)	XKR8 (ENSSHAG00000026927)	SMPDL3B (ENSSHAG00000015331)	RPA2 (ENSSHAG00000015255) #12	THEMIS2 (ENSSHAG00000015133) #13	PPP1R8 (ENSSHAG00000024313) #14	FAM76A (ENSSHAG00000022341) #17	FGR (ENSSHAG00000001546) #20	WASF2 (ENSSHAG00000004886) #22	GPR3 (ENSSHAG00000032210)	CD164L2 (ENSSHAG00000003127)	SYTL1 (ENSSHAG00000021748)	TMEM222 (ENSSHAG00000025224)	WDTC1 (ENSSHAG00000001544)	SLC9A1 (ENSSHAG00000021244)	TENT5B (ENSSHAG00000026408)	TRNP1 (ENSSHAG00000029647)	KDF1 (ENSSHAG00000032177)	ENSSHAG00000029984	NUDC (ENSSHAG00000003633)	NR0B2 (ENSSHAG00000014359)	GPATCH3 (ENSSHAG00000026633)	GPN2 (ENSSHAG00000027495)	SFN (ENSSHAG00000024644)
Opossum	MODERN SPECIES	3	DISP3 (ENSMODG00000011068)	FBXO2 (ENSMODG00000011053)	FBXO44 (ENSMODG00000011049)	MAD2L2 (ENSMODG00000011006)	DRAXIN (ENSMODG00000010996)	ENSMODG00000010990	ENSMODG00000044923	MTHFR (ENSMODG00000010976)	CLCN6 (ENSMODG00000010962)	NPPA (ENSMODG00000010914)	ENSMODG00000010906	KIAA2013 (ENSMODG00000010897)	PLOD1 (ENSMODG00000010880)	MFN2 (ENSMODG00000010801)	ENSMODG00000010745	WASF2 (ENSMODG00000014503) #22	GPR3 (ENSMODG00000014490)	ENSMODG00000014488	ENSMODG00000043200	MAP3K6 (ENSMODG00000014479)	ENSMODG00000014461	TMEM222 (ENSMODG00000044127)	WDTC1 (ENSMODG00000014445)	ENSMODG00000014436	TENT5B (ENSMODG00000014427)	KDF1 (ENSMODG00000014422)	ENSMODG00000014391	NR0B2 (ENSMODG00000014420)	GPATCH3 (ENSMODG00000014417)	GPN2 (ENSMODG00000042945)	SFN (ENSMODG00000023920)
Platypus	MODERN SPECIES	7	MED18 (ENSOANG00000036333)	SESN2 (ENSOANG00000000634)	ENSOANG00000049622	DNAJC8 (ENSOANG00000048514)	ENSOANG00000000475	ENSOANG00000038747	ENSOANG00000000149	ENSOANG00000037115	PPP1R8 (ENSOANG00000008315) #14	STX12 (ENSOANG00000008316) #16	FAM76A (ENSOANG00000039444) #17	ENSOANG00000045139	ENSOANG00000040112	FGR (ENSOANG00000010074) #20	AHDC1 (ENSOANG00000048348) #21	WASF2 (ENSOANG00000042525) #22	GPR3 (ENSOANG00000002859)	ENSOANG00000035989	MAP3K6 (ENSOANG00000040771)	SYTL1 (ENSOANG00000046382)	ENSOANG00000048882	WDTC1 (ENSOANG00000046790)	TENT5B (ENSOANG00000036422)	SLC9A1 (ENSOANG00000002338)	KDF1 (ENSOANG00000043515)	NUDC (ENSOANG00000037443)	NR0B2 (ENSOANG00000006533)	GPATCH3 (ENSOANG00000039186)	GPN2 (ENSOANG00000048781)	SFN (ENSOANG00000006084)	ZDHHC18 (ENSOANG00000050720)
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000160504	ENSGT00940000161879	ENSGT00940000160992	ENSGT00940000161085	ENSGT00940000157034	ENSGT00940000157669	ENSGT00940000155543	ENSGT00940000157582	ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163923.e	ENSGT00940000163923.f	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000157531	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000154868.a.b	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000161879	ENSGT00940000160992	ENSGT00940000161085	ENSGT00940000157034	ENSGT00940000157669	ENSGT00940000155543	ENSGT00940000157582	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000161215.hc.b	ENSGT00940000163282.j	ENSGT00940000163923.e	ENSGT00940000163923.f	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000157531	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000154868.a.b	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	31														ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000157531.k	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000154868.a.b	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	27														ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000157531.k	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000154868.a.b	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	39																ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000157531.k	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000154868.a.b	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	111	OPRD1 (ENSTMTG00000012388)	RCC1 (ENSTMTG00000012408)	PHACTR4 (ENSTMTG00000012459)	SESN2 (ENSTMTG00000012540)	FAM76A (ENSTMTG00000012563) #17	ENSTMTG00000012595	IFI6 (ENSTMTG00000012623) #19	ENSTMTG00000012637	ENSTMTG00000012680	ENSTMTG00000012689	ENSTMTG00000012703	ENSTMTG00000012717	ENSTMTG00000012746	AHDC1 (ENSTMTG00000012770) #21	ENSTMTG00000012779	WASF2 (ENSTMTG00000012789) #22	GPR3 (ENSTMTG00000012809)	CD164L2 (ENSTMTG00000012818)	ENSTMTG00000012835	MAP3K6 (ENSTMTG00000012859)	SYTL1 (ENSTMTG00000012905)	ENSTMTG00000012936	TMEM222 (ENSTMTG00000012958)	WDTC1 (ENSTMTG00000010408)	SLC9A1 (ENSTMTG00000010422)	TENT5B (ENSTMTG00000010434)	TRNP1 (ENSTMTG00000010438)	KDF1 (ENSTMTG00000010454)	NUDC (ENSTMTG00000010465)	NR0B2 (ENSTMTG00000010483)	GPATCH3 (ENSTMTG00000010492)
painted turtle	MODERN SPECIES	757									ENSCPBG00000024865	ENSCPBG00000024868	ENSCPBG00000024872	ENSCPBG00000024874	ENSCPBG00000024875	AHDC1 (ENSCPBG00000024880) #21	ENSCPBG00000024883	WASF2 (ENSCPBG00000024887) #22	GPR3 (ENSCPBG00000024890)	CD164L2 (ENSCPBG00000024894)	ENSCPBG00000024896	MAP3K6 (ENSCPBG00000024904)	SYTL1 (ENSCPBG00000024928)	ENSCPBG00000024939	TMEM222 (ENSCPBG00000024943)	WDTC1 (ENSCPBG00000024946)	SLC9A1 (ENSCPBG00000024951)	TENT5B (ENSCPBG00000024956)	TRNP1 (ENSCPBG00000024958)	KDF1 (ENSCPBG00000024960)	NUDC (ENSCPBG00000024964)	NR0B2 (ENSCPBG00000024966)	GPATCH3 (ENSCPBG00000024968)
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	53	ENSGT00940000161085	ENSGT00940000157034	ENSGT00940000157669	ENSGT00940000155543	ENSGT00940000157582	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000161215.hc.b	ENSGT00940000163178 #19	ENSGT00940000163282.j	ENSGT00940000163923.e.c	ENSGT00940000163923.e.d	ENSGT00940000163923.f	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000157531.k	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000154868.a.b	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	12	ENSGEVG00005005358	ENSGEVG00005005311	ENSGEVG00005005264	ENSGEVG00005005245	OPRD1 (ENSGEVG00005005214)	RCC1 (ENSGEVG00005005188)	PHACTR4 (ENSGEVG00005005142)	SESN2 (ENSGEVG00005005043)	ENSGEVG00005004945	ENSGEVG00005004911	ENSGEVG00005004831	ENSGEVG00005004770	ENSGEVG00005004746	FGR (ENSGEVG00005004709) #20	AHDC1 (ENSGEVG00005004682) #21	WASF2 (ENSGEVG00005004635) #22	GPR3 (ENSGEVG00005004575)	CD164L2 (ENSGEVG00005004553)	ENSGEVG00005004509	MAP3K6 (ENSGEVG00005004395)	SYTL1 (ENSGEVG00005004336)	ENSGEVG00005004298	TMEM222 (ENSGEVG00005021265)	WDTC1 (ENSGEVG00005021264)	SLC9A1 (ENSGEVG00005021263)	TENT5B (ENSGEVG00005021262)	TRNP1 (ENSGEVG00005021261)	KDF1 (ENSGEVG00005021260)	NUDC (ENSGEVG00005021259)	NR0B2 (ENSGEVG00005021258)	GPATCH3 (ENSGEVG00005021257)
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	2225	OPRD1 (ENSCABG00000009799)	RCC1 (ENSCABG00000009802)	PHACTR4 (ENSCABG00000009807)	ENSCABG00000009809	ENSCABG00000009810	SESN2 (ENSCABG00000009813)	FAM76A (ENSCABG00000009817) #17	ENSCABG00000009820	IFI6 (ENSCABG00000009824) #19	ENSCABG00000009827	ENSCABG00000009828	ENSCABG00000009830	ENSCABG00000009835	FGR (ENSCABG00000009837) #20	AHDC1 (ENSCABG00000009842) #21	WASF2 (ENSCABG00000009843) #22	GPR3 (ENSCABG00000009844)	ENSCABG00000009846	ENSCABG00000009847	MAP3K6 (ENSCABG00000009850)	SYTL1 (ENSCABG00000009852)	ENSCABG00000009853	TMEM222 (ENSCABG00000009856)	WDTC1 (ENSCABG00000009862)	SLC9A1 (ENSCABG00000009864)	TENT5B (ENSCABG00000009867)	KDF1 (ENSCABG00000009869)	NUDC (ENSCABG00000009873)	NR0B2 (ENSCABG00000009874)	GPATCH3 (ENSCABG00000009876)	GPN2 (ENSCABG00000009877)
Chinese turtle	MODERN SPECIES	488									ENSPSIG00000002545	ENSPSIG00000002601	ENSPSIG00000002608	ENSPSIG00000002618	ENSPSIG00000002619	AHDC1 (ENSPSIG00000002681) #21	ENSPSIG00000002689	WASF2 (ENSPSIG00000002694) #22	GPR3 (ENSPSIG00000002780)	ENSPSIG00000002802
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000160504	ENSGT00940000160992	ENSGT00940000161085	ENSGT00940000157034	ENSGT00940000157669	ENSGT00940000155543	ENSGT00940000157582	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000161215.hc.b	ENSGT00940000163282.j	ENSGT00940000163923.e	ENSGT00940000163923.f	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000154868.a.b	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	58	CATSPER4 (ENSCPRG00005003024)	E2F2 (ENSCPRG00005003031)	ASAP3 (ENSCPRG00005003050)	TCEA3 (ENSCPRG00005003102)	OPRD1 (ENSCPRG00005003124)	RCC1 (ENSCPRG00005003145)	PHACTR4 (ENSCPRG00005003163)	SESN2 (ENSCPRG00005003191)	FAM76A (ENSCPRG00005003198) #17	ENSCPRG00005003204	ENSCPRG00005003220	ENSCPRG00005003223	ENSCPRG00005003225	ENSCPRG00005003238	AHDC1 (ENSCPRG00005003254) #21	WASF2 (ENSCPRG00005003258) #22	GPR3 (ENSCPRG00005003261)	CD164L2 (ENSCPRG00005003266)	MAP3K6 (ENSCPRG00005003286)	SYTL1 (ENSCPRG00005003362)	ENSCPRG00005003408	TMEM222 (ENSCPRG00005003410)	WDTC1 (ENSCPRG00005003421)	SLC9A1 (ENSCPRG00005003430)	TENT5B (ENSCPRG00005003432)	KDF1 (ENSCPRG00005003440)	NUDC (ENSCPRG00005003451)	NR0B2 (ENSCPRG00005003471)	GPATCH3 (ENSCPRG00005003479)	GPN2 (ENSCPRG00005003511)	ENSCPRG00005003521
Aves	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000156761	ENSGT00940000167209	ENSGT00940000160504	ENSGT00940000160992	ENSGT00940000161085	ENSGT00940000157034	ENSGT00940000157669	ENSGT00940000155543	ENSGT00940000157582	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163923.e	ENSGT00940000163923.f	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B	ENSGT01090000260040.b.b.b.a
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000156761	ENSGT00940000167209	ENSGT00940000160504	ENSGT00940000160992	ENSGT00940000161085	ENSGT00940000157034	ENSGT00940000157669	ENSGT00940000155543	ENSGT00940000157582	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163923.e	ENSGT00940000163923.f	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B	ENSGT01090000260040.b.b.b.a
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000156761	ENSGT00940000167209	ENSGT00940000160504	ENSGT00940000160992	ENSGT00940000161085	ENSGT00940000157034	ENSGT00940000157669	ENSGT00940000155543	ENSGT00940000157582	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163923.e	ENSGT00940000163923.f	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00960000191085	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000164873	ENSGT00390000002144	ENSGT00410000025596.a.b	ENSGT01100000263839	ENSGT00940000156761	ENSGT00940000160992	ENSGT00940000161085	ENSGT00940000157034	ENSGT00940000157669	ENSGT00940000155543	ENSGT00940000157582	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163923.f.b	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00960000189819	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B	ENSGT01090000260040.b.b.b.a	ENSGT00940000156585
Duck	MODERN SPECIES	15	TAF12 (ENSAPLG00000002881)	ENSAPLG00000016740	GMEB1 (ENSAPLG00000002955)	YTHDF2 (ENSAPLG00000020468)	E2F2 (ENSAPLG00000021411)	ENSAPLG00000031239	ENSAPLG00000018663	TCEA3 (ENSAPLG00000025037)	OPRD1 (ENSAPLG00000002972)	RCC1 (ENSAPLG00000026840)	PHACTR4 (ENSAPLG00000019553)	ENSAPLG00000022334	SESN2 (ENSAPLG00000010959)	FAM76A (ENSAPLG00000004037) #17	ENSAPLG00000022698	WASF2 (ENSAPLG00000010236) #22	ENSAPLG00000015805	ENSAPLG00000016993	TMEM222 (ENSAPLG00000021290)	WDTC1 (ENSAPLG00000015930)	SLC9A1 (ENSAPLG00000016147)	TENT5B (ENSAPLG00000001361)	ENSAPLG00000025590	ENSAPLG00000019975	KDF1 (ENSAPLG00000010691)	NUDC (ENSAPLG00000010698)	NR0B2 (ENSAPLG00000010744)	GPATCH3 (ENSAPLG00000010745)	GPN2 (ENSAPLG00000010758)	ZDHHC18 (ENSAPLG00000010792)	SFN (ENSAPLG00000010782)
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	73			E2F2 (ENSABRG00000005175)	ASAP3 (ENSABRG00000003095)	TCEA3 (ENSABRG00000002935)	OPRD1 (ENSABRG00000002932)	RCC1 (ENSABRG00000002909)	PHACTR4 (ENSABRG00000002835)	SESN2 (ENSABRG00000002796)	FAM76A (ENSABRG00000002772) #17	ENSABRG00000002732	ENSABRG00000002709	ENSABRG00000002676	AHDC1 (ENSABRG00000002665) #21	ENSABRG00000002652	WASF2 (ENSABRG00000002634) #22	GPR3 (ENSABRG00000002622)	CD164L2 (ENSABRG00000002608)	MAP3K6 (ENSABRG00000002099)	TMEM222 (ENSABRG00000002037)	WDTC1 (ENSABRG00000002008)	SLC9A1 (ENSABRG00000001962)	TENT5B (ENSABRG00000001947)	KDF1 (ENSABRG00000001922)	NUDC (ENSABRG00000001885)	NR0B2 (ENSABRG00000001870)	GPATCH3 (ENSABRG00000001851)	GPN2 (ENSABRG00000001830)	SFN (ENSABRG00000001785)	ZDHHC18 (ENSABRG00000001770)	PIGV (ENSABRG00000001605)
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000156761	ENSGT00940000167209	ENSGT00940000160504	ENSGT00940000160992	ENSGT00940000161085	ENSGT00940000157034	ENSGT00940000157669	ENSGT00940000155543	ENSGT00940000157582	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163923.e	ENSGT00940000163923.f	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT00960000189365	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B	ENSGT01090000260040.b.b.b.a	ENSGT00940000156585
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00410000025596.a.b	ENSGT00940000156761	ENSGT00940000160504	ENSGT00940000160992	ENSGT00940000161085	ENSGT00940000157034	ENSGT00940000157669	ENSGT00940000155543	ENSGT00940000157582	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163923.e	ENSGT00940000163923.f	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT00960000189365	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B	ENSGT01090000260040.b.b.b.a	ENSGT00940000156585
Turkey	MODERN SPECIES	17	ENSMGAG00000015701	ENSMGAG00000001228	ENSMGAG00000001236	ENSMGAG00000001272	GPN2 (ENSMGAG00000000868)	ENSMGAG00000015704	ZDHHC18 (ENSMGAG00000020751)	GPATCH3 (ENSMGAG00000000813)	NR0B2 (ENSMGAG00000000867)	KDF1 (ENSMGAG00000000825)	ENSMGAG00000000836	ENSMGAG00000001425	ENSMGAG00000001406	ENSMGAG00000018576	ENSMGAG00000022066	ENSMGAG00000001349 #22	ENSMGAG00000021765	ENSMGAG00000000710	ENSMGAG00000000702	ZNF593 (ENSMGAG00000016623)	CNKSR1 (ENSMGAG00000000695)	CEP85 (ENSMGAG00000000692)	SH3BGRL3 (ENSMGAG00000021285)	UBXN11 (ENSMGAG00000000686)	CRYBG2 (ENSMGAG00000000679)	LIN28A (ENSMGAG00000009456)	DHDDS (ENSMGAG00000009462)	ENSMGAG00000009472	RPS6KA1 (ENSMGAG00000009480)	ENSMGAG00000009537	PIGV (ENSMGAG00000009569)
Chicken	MODERN SPECIES	15	YTHDF2 (ENSGALG00010015166)	ENSGALG00010015185	ID3 (ENSGALG00010016447)	E2F2 (ENSGALG00010016567)	ASAP3 (ENSGALG00010016556)	TCEA3 (ENSGALG00010016543)	OPRD1 (ENSGALG00010016944)	RCC1 (ENSGALG00010016936)	PHACTR4 (ENSGALG00010016925)	SESN2 (ENSGALG00010016875)	FAM76A (ENSGALG00010018339) #17	ENSGALG00010016870	ENSGALG00010018329	FGR (ENSGALG00010016861) #20	AHDC1 (ENSGALG00010016852) #21	WASF2 (ENSGALG00010016849) #22	ENSGALG00010016825	MAP3K6 (ENSGALG00010016816)	SYTL1 (ENSGALG00010016809)	TMEM222 (ENSGALG00010016802)	WDTC1 (ENSGALG00010016799)	SLC9A1 (ENSGALG00010016793)	TENT5B (ENSGALG00010012654)	TRNP1 (ENSGALG00010017829)	KDF1 (ENSGALG00010013187)	NR0B2 (ENSGALG00010013182)	NUDC (ENSGALG00010013165)	GPATCH3 (ENSGALG00010013093)	GPN2 (ENSGALG00010013087)	SFN (ENSGALG00010014011)	ZDHHC18 (ENSGALG00010014002)
Japanese quail	MODERN SPECIES	15	YTHDF2 (ENSCJPG00005016262)	ENSCJPG00005016261	ID3 (ENSCJPG00005016260)	E2F2 (ENSCJPG00005016258)	ASAP3 (ENSCJPG00005016116)	TCEA3 (ENSCJPG00005016106)	OPRD1 (ENSCJPG00005016105)	RCC1 (ENSCJPG00005016103)	PHACTR4 (ENSCJPG00005016101)	SESN2 (ENSCJPG00005016100)	FAM76A (ENSCJPG00005016099) #17	ENSCJPG00005016045	ENSCJPG00005016044	FGR (ENSCJPG00005016042) #20	AHDC1 (ENSCJPG00005016038) #21	WASF2 (ENSCJPG00005016036) #22	ENSCJPG00005016033	ENSCJPG00005016032	TMEM222 (ENSCJPG00005016031)	WDTC1 (ENSCJPG00005016030)	SLC9A1 (ENSCJPG00005016029)	TENT5B (ENSCJPG00005016028)	ENSCJPG00005016026	KDF1 (ENSCJPG00005016025)	NUDC (ENSCJPG00005016024)	NR0B2 (ENSCJPG00005016022)	GPATCH3 (ENSCJPG00005016021)	GPN2 (ENSCJPG00005016020)	SFN (ENSCJPG00005016019)	ZDHHC18 (ENSCJPG00005016018)	ENSCJPG00005016016
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000156761	ENSGT00940000167209	ENSGT00940000160504	ENSGT00940000160992	ENSGT00940000161085	ENSGT00940000157034	ENSGT00940000157669	ENSGT00940000155543	ENSGT00940000157582	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163923.e	ENSGT00940000163923.f	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B	ENSGT01090000260040.b.b.b.a
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES	23				ENSGT00940000160504	ENSGT00940000160992	ENSGT00940000161085	ENSGT00940000157034	ENSGT00940000157669	ENSGT00940000155543	ENSGT00940000157582	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163923.f	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B	ENSGT01090000260040.b.b.b.a	ENSGT00940000156585
Great tit	MODERN SPECIES	15	MACO1 (ENSPMJG00000000097)	ENSPMJG00000000086	LDLRAP1 (ENSPMJG00000000050)	ID3 (ENSPMJG00000018446)	E2F2 (ENSPMJG00000018445)	ENSPMJG00000018444	TCEA3 (ENSPMJG00000018443)	OPRD1 (ENSPMJG00000018442)	RCC1 (ENSPMJG00000018440)	PHACTR4 (ENSPMJG00000018439)	SESN2 (ENSPMJG00000018438)	FAM76A (ENSPMJG00000018437) #17	ENSPMJG00000018436	FGR (ENSPMJG00000018435) #20	AHDC1 (ENSPMJG00000018432) #21	WASF2 (ENSPMJG00000018431) #22	ENSPMJG00000018428	SYTL1 (ENSPMJG00000018427)	TMEM222 (ENSPMJG00000018426)	WDTC1 (ENSPMJG00000018425)	SLC9A1 (ENSPMJG00000018424)	TENT5B (ENSPMJG00000018423)	KDF1 (ENSPMJG00000018421)	NUDC (ENSPMJG00000018420)	NR0B2 (ENSPMJG00000018419)	GPATCH3 (ENSPMJG00000018418)	ENSPMJG00000018417	GPN2 (ENSPMJG00000018416)	SFN (ENSPMJG00000018415)	ENSPMJG00000018413	PIGV (ENSPMJG00000018412)
Passeriformes_d	ANCESTRAL SPECIES	23				ENSGT00940000160504	ENSGT00940000160992	ENSGT00940000161085	ENSGT00940000157034	ENSGT00940000157669	ENSGT00940000155543	ENSGT00940000157582	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163923.f	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B	ENSGT01090000260040.b.b.b.a	ENSGT00940000156585
Flycatcher	MODERN SPECIES	15							ID3 (ENSFALG00000010806)	E2F2 (ENSFALG00000010803)	ASAP3 (ENSFALG00000010769)	TCEA3 (ENSFALG00000010750)	RCC1 (ENSFALG00000010730)	PHACTR4 (ENSFALG00000010715)	SESN2 (ENSFALG00000010708)	ENSFALG00000002817	FGR (ENSFALG00000002793) #20	WASF2 (ENSFALG00000000708) #22	GPR3 (ENSFALG00000000702)	CD164L2 (ENSFALG00000023339)	SYTL1 (ENSFALG00000000694)	WDTC1 (ENSFALG00000000691)	ENSFALG00000023022	SLC9A1 (ENSFALG00000000683)	TENT5B (ENSFALG00000014519)	KDF1 (ENSFALG00000006529)	NUDC (ENSFALG00000006516)	NR0B2 (ENSFALG00000006497)	GPATCH3 (ENSFALG00000024384)	GPN2 (ENSFALG00000000321)	SFN (ENSFALG00000014247)	ENSFALG00000027881	ENSFALG00000027764
Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES	22				ENSGT00940000160504	ENSGT00940000160992	ENSGT00940000165326	ENSGT00940000157034	ENSGT00940000157669	ENSGT00940000155543	ENSGT00940000157582	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163923.f	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747.b.a	ENSGT00940000160747.a	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B	ENSGT01090000260040.b.b.b.a
Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	22				ENSGT00940000160504	ENSGT00940000160992	ENSGT00940000165326	ENSGT00940000157034	ENSGT00940000157669	ENSGT00940000155543	ENSGT00940000157582	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163923.f	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747.b.a	ENSGT00940000160747.a	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B	ENSGT01090000260040.b.b.b.a
Common canary	MODERN SPECIES	65				ID3 (ENSSCAG00000008336)	E2F2 (ENSSCAG00000008329)	ENSSCAG00000008039	TCEA3 (ENSSCAG00000008008)	OPRD1 (ENSSCAG00000008006)	RCC1 (ENSSCAG00000007998)	PHACTR4 (ENSSCAG00000007987)	SESN2 (ENSSCAG00000007973)	FAM76A (ENSSCAG00000007969) #17	ENSSCAG00000007964	FGR (ENSSCAG00000007933) #20	AHDC1 (ENSSCAG00000007925) #21	WASF2 (ENSSCAG00000007921) #22	GPR3 (ENSSCAG00000007910)	ENSSCAG00000007899	SYTL1 (ENSSCAG00000007895)	TMEM222 (ENSSCAG00000007892)	WDTC1 (ENSSCAG00000007881)	SLC9A1 (ENSSCAG00000007437)	ENSSCAG00000007342	KDF1 (ENSSCAG00000007336)	NUDC (ENSSCAG00000007332)	NR0B2 (ENSSCAG00000007325)	GPATCH3 (ENSSCAG00000007317)	GPN2 (ENSSCAG00000007312)	ZDHHC18 (ENSSCAG00000007309)	PIGV (ENSSCAG00000007303)	ARID1A (ENSSCAG00000007186)
Zebra finch	MODERN SPECIES	16	DNAJC8 (ENSTGUG00000000890)	ENSTGUG00000000899	HNRNPR (ENSTGUG00000000880)	ID3 (ENSTGUG00000000904)	E2F2 (ENSTGUG00000000907)	ENSTGUG00000000911	TCEA3 (ENSTGUG00000000930)	OPRD1 (ENSTGUG00000000934)	RCC1 (ENSTGUG00000000940)	PHACTR4 (ENSTGUG00000000943)	SESN2 (ENSTGUG00000000945)	FAM76A (ENSTGUG00000000951) #17	ENSTGUG00000000955	ENSTGUG00000000957	AHDC1 (ENSTGUG00000022877) #21	WASF2 (ENSTGUG00000000966) #22	GPR3 (ENSTGUG00000000969)	ENSTGUG00000023189	SYTL1 (ENSTGUG00000025002)	WDTC1 (ENSTGUG00000000973)	SLC9A1 (ENSTGUG00000000976)	TENT5B (ENSTGUG00000000977)	TRNP1 (ENSTGUG00000027930)	KDF1 (ENSTGUG00000000978)	NUDC (ENSTGUG00000000980)	NR0B2 (ENSTGUG00000000984)	GPATCH3 (ENSTGUG00000000986)	GPN2 (ENSTGUG00000000990)	SFN (ENSTGUG00000018532)	ZDHHC18 (ENSTGUG00000000992)	PIGV (ENSTGUG00000000996)
Medium ground finch	MODERN SPECIES	139					OPRD1 (ENSGFOG00000006052)	TCEA3 (ENSGFOG00000006059)	ENSGFOG00000006066	E2F2 (ENSGFOG00000006080)	ID3 (ENSGFOG00000006093)	RCC1 (ENSGFOG00000006100)	PHACTR4 (ENSGFOG00000006113)	SESN2 (ENSGFOG00000006120)	FAM76A (ENSGFOG00000006127) #17	ENSGFOG00000006139	FGR (ENSGFOG00000006174) #20	WASF2 (ENSGFOG00000006201) #22	CD164L2 (ENSGFOG00000006209)	TMEM222 (ENSGFOG00000006214)	WDTC1 (ENSGFOG00000006223)	SLC9A1 (ENSGFOG00000006232)	TENT5B (ENSGFOG00000006235)	KDF1 (ENSGFOG00000006243)	NUDC (ENSGFOG00000006257)	GPATCH3 (ENSGFOG00000006273)	GPN2 (ENSGFOG00000006290)	SFN (ENSGFOG00000006297)	ZDHHC18 (ENSGFOG00000006307)	PIGV (ENSGFOG00000006314)	ARID1A (ENSGFOG00000006335)	RPS6KA1 (ENSGFOG00000006433)	ENSGFOG00000007336
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	31															ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B	ENSGT01090000260040.b.b.b.a
Kakapo	MODERN SPECIES	6	YTHDF2 (ENSSHBG00005017454)	ID3 (ENSSHBG00005017453)	ENSSHBG00005017452	E2F2 (ENSSHBG00005017450)	ASAP3 (ENSSHBG00005008310)	ENSSHBG00005007799	TCEA3 (ENSSHBG00005007790)	OPRD1 (ENSSHBG00005007780)	RCC1 (ENSSHBG00005007765)	PHACTR4 (ENSSHBG00005007730)	SESN2 (ENSSHBG00005007712)	FAM76A (ENSSHBG00005007686) #17	ENSSHBG00005007623	ENSSHBG00005007587	ENSSHBG00005007489	WASF2 (ENSSHBG00005007459) #22	GPR3 (ENSSHBG00005007451)	CD164L2 (ENSSHBG00005007438)	TMEM222 (ENSSHBG00005007411)	WDTC1 (ENSSHBG00005007394)	SLC9A1 (ENSSHBG00005007382)	TENT5B (ENSSHBG00005007375)
Golden eagle	MODERN SPECIES	7	ENSACCG00020010823	ID3 (ENSACCG00020010811)	E2F2 (ENSACCG00020010796)	ASAP3 (ENSACCG00020010776)	ENSACCG00020010764	ENSACCG00020010744	OPRD1 (ENSACCG00020010727)	RCC1 (ENSACCG00020010714)	PHACTR4 (ENSACCG00020010676)	SESN2 (ENSACCG00020010646)	FAM76A (ENSACCG00020010617) #17	ENSACCG00020010590	ENSACCG00020010553	ENSACCG00020010496	AHDC1 (ENSACCG00020010469) #21	WASF2 (ENSACCG00020010443) #22	GPR3 (ENSACCG00020010424)	ENSACCG00020010410	MAP3K6 (ENSACCG00020010161)	SYTL1 (ENSACCG00020009888)	TMEM222 (ENSACCG00020009875)	WDTC1 (ENSACCG00020009856)	SLC9A1 (ENSACCG00020009844)	TENT5B (ENSACCG00020009834)	TRNP1 (ENSACCG00020009812)	KDF1 (ENSACCG00020009796)	NUDC (ENSACCG00020009786)	NR0B2 (ENSACCG00020009770)	GPATCH3 (ENSACCG00020009759)	GPN2 (ENSACCG00020009746)	SFN (ENSACCG00020009727)
African ostrich	MODERN SPECIES	868																WASF2 (ENSSCUG00000014790) #22	GPR3 (ENSSCUG00000014783)	ENSSCUG00000014781	ENSSCUG00000014777	ENSSCUG00000014775	WDTC1 (ENSSCUG00000014773)	SLC9A1 (ENSSCUG00000014762)	TENT5B (ENSSCUG00000014755)	KDF1 (ENSSCUG00000014753)	NUDC (ENSSCUG00000014750)	NR0B2 (ENSSCUG00000014749)	GPATCH3 (ENSSCUG00000014745)	GPN2 (ENSSCUG00000014741)	SFN (ENSSCUG00000014738)	PIGV (ENSSCUG00000014731)	ARID1A (ENSSCUG00000014721)
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000161879	ENSGT00940000160992.b	ENSGT00940000161085	ENSGT00940000157034	ENSGT00940000157669	ENSGT00940000155543	ENSGT00940000157582	ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163282.k.a	ENSGT00940000163923.e	ENSGT00940000163923.f	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000157531	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000154868.a.b	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
tuatara	MODERN SPECIES	531							ENSSPUG00000017740	SESN2 (ENSSPUG00000017749)	FAM76A (ENSSPUG00000017760) #17	ENSSPUG00000017771	ENSSPUG00000017780	ENSSPUG00000017797	ENSSPUG00000017804	FGR (ENSSPUG00000017811) #20	AHDC1 (ENSSPUG00000017825) #21	WASF2 (ENSSPUG00000017858) #22	GPR3 (ENSSPUG00000017868)	ENSSPUG00000017873	MAP3K6 (ENSSPUG00000017886)	SYTL1 (ENSSPUG00000017914)	TMEM222 (ENSSPUG00000017932)	WDTC1 (ENSSPUG00000017937)	SLC9A1 (ENSSPUG00000017949)
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000161879	ENSGT00940000160992.b	ENSGT00940000161085	ENSGT00940000157034	ENSGT00940000157669	ENSGT00940000155543	ENSGT00940000157582	ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163282.k.a	ENSGT00940000163923.e	ENSGT00940000163923.f	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000157531	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000154868.a.b	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00940000156317.l	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000160504	ENSGT00940000161879	ENSGT00940000160992.b	ENSGT00940000161085	ENSGT00940000157034	ENSGT00940000157669	ENSGT00940000155543	ENSGT00940000157582	ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163282.k.a	ENSGT00940000163923.e	ENSGT00940000163923.f	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000157531	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000154868.a.b	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00940000156317.l	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c
Common wall lizard	MODERN SPECIES	16	WDTC1 (ENSPMRG00000009261)	ENSPMRG00000009256	ENSPMRG00000009250	ENSPMRG00000009244	TMEM222 (ENSPMRG00000009236)	PHACTR4 (ENSPMRG00000009195)	MED18 (ENSPMRG00000009177)	SESN2 (ENSPMRG00000009161)	FAM76A (ENSPMRG00000009135) #17	ENSPMRG00000009120	ENSPMRG00000009115	ENSPMRG00000009104	ENSPMRG00000009089	ENSPMRG00000009078	AHDC1 (ENSPMRG00000009067) #21	WASF2 (ENSPMRG00000009056) #22	GPR3 (ENSPMRG00000009045)	CD164L2 (ENSPMRG00000009039)	ENSPMRG00000009031	MAP3K6 (ENSPMRG00000008995)	SYTL1 (ENSPMRG00000008979)	ENSPMRG00000008962	RCC1 (ENSPMRG00000008955)	OPRD1 (ENSPMRG00000008949)	ENSPMRG00000008946	TCEA3 (ENSPMRG00000008935)	ASAP3 (ENSPMRG00000008909)	E2F2 (ENSPMRG00000008903)	ENSPMRG00000008896	ENSPMRG00000008893	ENSPMRG00000008891
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	53	E2F2 (ENSSMRG00000002739)	ASAP3 (ENSSMRG00000002736)	ENSSMRG00000002735	ENSSMRG00000002734	OPRD1 (ENSSMRG00000002731)	RCC1 (ENSSMRG00000002729)	PHACTR4 (ENSSMRG00000002722)	MED18 (ENSSMRG00000002592)	SESN2 (ENSSMRG00000002553)	FAM76A (ENSSMRG00000002548) #17	ENSSMRG00000002539	ENSSMRG00000002537	ENSSMRG00000002524	ENSSMRG00000002513	AHDC1 (ENSSMRG00000002496) #21	WASF2 (ENSSMRG00000002478) #22	GPR3 (ENSSMRG00000002473)	CD164L2 (ENSSMRG00000002466)	ENSSMRG00000002456	MAP3K6 (ENSSMRG00000002451)	SYTL1 (ENSSMRG00000002437)	ENSSMRG00000002449	TMEM222 (ENSSMRG00000002433)	WDTC1 (ENSSMRG00000002425)	SLC9A1 (ENSSMRG00000002417)	TENT5B (ENSSMRG00000002406)	ENSSMRG00000002398	TRNP1 (ENSSMRG00000002385)	KDF1 (ENSSMRG00000002384)	NUDC (ENSSMRG00000002382)	NR0B2 (ENSSMRG00000002381)
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000161879	ENSGT00940000160992.a	ENSGT00940000160992.b	ENSGT00940000161085	ENSGT00940000157034	ENSGT00940000157669	ENSGT00940000155543	ENSGT00940000157582	ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163923.e	ENSGT00940000163923.f	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000154868.a.b	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00940000156317.l	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Lizard	MODERN SPECIES	1076													ENSACAG00000001138	FGR (ENSACAG00000000905) #20	AHDC1 (ENSACAG00000017829) #21	WASF2 (ENSACAG00000017831) #22	MAP3K6 (ENSACAG00000017835)	SYTL1 (ENSACAG00000017840)	ENSACAG00000017843	ENSACAG00000017844	RCAN3 (ENSACAG00000017846)	SRRM1 (ENSACAG00000017848)	CLIC4 (ENSACAG00000017852)	RUNX3 (ENSACAG00000017855)
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000160504	ENSGT00940000161879	ENSGT00940000160992.b	ENSGT00940000161085	ENSGT00940000157034	ENSGT00940000157669	ENSGT00940000155543	ENSGT00940000157582.a	ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163923.e	ENSGT00940000163923.f	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b	ENSGT00940000159398.g	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000154868.a.b	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00940000156317.l	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000161879	ENSGT00940000160992.a	ENSGT00940000160992.b	ENSGT00940000161085	ENSGT00940000157034	ENSGT00940000157669	ENSGT00940000155543	ENSGT00940000157582.a	ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163923.e	ENSGT00940000163923.f	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00960000189365	ENSGT00940000159398.g	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000154868.a.b	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00940000156317.l	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000161879	ENSGT00940000160992.a	ENSGT00940000160992.b	ENSGT00940000161085	ENSGT00940000157034	ENSGT00940000157669	ENSGT00940000155543	ENSGT00940000157582.a	ENSGT00390000003312	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000163923.e	ENSGT00940000163923.f	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00960000189365	ENSGT00940000159398.g	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000154868.a.b	ENSGT00390000007371	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00940000156317.l	ENSGT00390000017418	ENSGT00390000016565	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000015719.c	ENSGT00390000004191
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	80	ID3 (ENSNSUG00000014010)	E2F2 (ENSNSUG00000014009)	ASAP3 (ENSNSUG00000013924)	ENSNSUG00000013923	ENSNSUG00000013922	OPRD1 (ENSNSUG00000013918)	RCC1 (ENSNSUG00000013917)	ENSNSUG00000013912	ENSNSUG00000013911	MED18 (ENSNSUG00000013910)	FAM76A (ENSNSUG00000013908) #17	ENSNSUG00000013907	ENSNSUG00000013906	ENSNSUG00000013905	AHDC1 (ENSNSUG00000013903) #21	WASF2 (ENSNSUG00000013901) #22	GPR3 (ENSNSUG00000013900)	ENSNSUG00000013899	SYTL1 (ENSNSUG00000013898)	ENSNSUG00000013897	TMEM222 (ENSNSUG00000013896)	WDTC1 (ENSNSUG00000013895)	SLC9A1 (ENSNSUG00000013894)	TENT5B (ENSNSUG00000013892)	ENSNSUG00000013891	TRNP1 (ENSNSUG00000013889)	KDF1 (ENSNSUG00000013887)	NUDC (ENSNSUG00000013862)	NR0B2 (ENSNSUG00000013861)	GPATCH3 (ENSNSUG00000013860)	GPN2 (ENSNSUG00000013859)
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	19	ENSPTXG00000005389	ENSPTXG00000005393	ASAP3 (ENSPTXG00000005395)	ENSPTXG00000005396	ENSPTXG00000005398	OPRD1 (ENSPTXG00000005399)	RCC1 (ENSPTXG00000005400)	PHACTR4 (ENSPTXG00000005405)	MED18 (ENSPTXG00000005408)	SESN2 (ENSPTXG00000005410)	FAM76A (ENSPTXG00000005413) #17	ENSPTXG00000005416	ENSPTXG00000005419	FGR (ENSPTXG00000005421) #20	AHDC1 (ENSPTXG00000005424) #21	WASF2 (ENSPTXG00000005425) #22	GPR3 (ENSPTXG00000005428)	ENSPTXG00000005429	MAP3K6 (ENSPTXG00000005442)	SYTL1 (ENSPTXG00000005487)	ENSPTXG00000005488	TMEM222 (ENSPTXG00000005490)	WDTC1 (ENSPTXG00000005491)	SLC9A1 (ENSPTXG00000005493)	TENT5B (ENSPTXG00000005495)	ENSPTXG00000005496	KDF1 (ENSPTXG00000005497)	NUDC (ENSPTXG00000005499)	NR0B2 (ENSPTXG00000005500)	GPATCH3 (ENSPTXG00000005501)	GPN2 (ENSPTXG00000005502)
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	1405																WASF2 (ENSLLTG00000002057) #22	GPR3 (ENSLLTG00000002052)
Indian cobra	MODERN SPECIES	11	ENSNNAG00000004723	ENSNNAG00000004700	ENSNNAG00000004689	ASAP3 (ENSNNAG00000004607)	TCEA3 (ENSNNAG00000004558)	OPRD1 (ENSNNAG00000004544)	RCC1 (ENSNNAG00000004513)	MED18 (ENSNNAG00000004457)	PHACTR4 (ENSNNAG00000004401)	SESN2 (ENSNNAG00000004318)	FAM76A (ENSNNAG00000004205) #17	ENSNNAG00000004121	ENSNNAG00000004086	FGR (ENSNNAG00000004005) #20	AHDC1 (ENSNNAG00000003964) #21	WASF2 (ENSNNAG00000003926) #22	GPR3 (ENSNNAG00000003904)	CD164L2 (ENSNNAG00000003877)	MAP3K6 (ENSNNAG00000003752)	SYTL1 (ENSNNAG00000003725)	ENSNNAG00000003700	TMEM222 (ENSNNAG00000003679)	WDTC1 (ENSNNAG00000003635)	SLC9A1 (ENSNNAG00000003600)	TENT5B (ENSNNAG00000003536)	ENSNNAG00000009226	TRNP1 (ENSNNAG00000009209)	KDF1 (ENSNNAG00000009182)	NUDC (ENSNNAG00000009135)	NR0B2 (ENSNNAG00000009091)	GPATCH3 (ENSNNAG00000009029)
Anura	ANCESTRAL SPECIES	34														ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT00950000182900.B	ENSGT00390000007371	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000156338	ENSGT00940000160747	ENSGT00960000189819	ENSGT00390000016565.f	ENSGT00390000016565.e	ENSGT00940000155361	ENSGT00390000004191	ENSGT00950000183172.B	ENSGT00390000013174	ENSGT00940000155194	ENSGT00940000159314	ENSGT00950000182802.B
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	5	XKR8 (ENSLLEG00000001783)	ENSLLEG00000001771	SMPDL3B (ENSLLEG00000001757)	ENSLLEG00000001736 #12	ENSLLEG00000001723	ENSLLEG00000001713	THEMIS2 (ENSLLEG00000001699) #13	UBE2T (ENSLLEG00000001681)	STX12 (ENSLLEG00000001602) #16	PPP1R8 (ENSLLEG00000001541) #14	ENSLLEG00000001520	ENSLLEG00000001504	ENSLLEG00000001475	FGR (ENSLLEG00000001445) #20	AHDC1 (ENSLLEG00000001420) #21	WASF2 (ENSLLEG00000001386) #22	ENSLLEG00000001381	ENSLLEG00000001370	WDTC1 (ENSLLEG00000001340)	TMEM222 (ENSLLEG00000001310)	SYTL1 (ENSLLEG00000001241)	ENSLLEG00000001141	SLC9A1 (ENSLLEG00000000871)	TENT5B (ENSLLEG00000000845)	ENSLLEG00000000840	ENSLLEG00000000823	NUDC (ENSLLEG00000000702)	GPATCH3 (ENSLLEG00000000641)	ENSLLEG00000000635	GPN2 (ENSLLEG00000000578)	PIGV (ENSLLEG00000000554)
Frog	MODERN SPECIES	2	ctps1 (ENSXETG00000012949)	rcc1 (ENSXETG00000012969)	oprd1 (ENSXETG00000033842)	tcea3 (ENSXETG00000012975)	ENSXETG00000020617	taf12 (ENSXETG00000020616)	rab39a (ENSXETG00000020622)	gmeb1 (ENSXETG00000020625)	ythdf2 (ENSXETG00000020636)	gngt2.1 (ENSXETG00000030624)	msra.2 (ENSXETG00000020629)	id3 (ENSXETG00000020653)	sesn2 (ENSXETG00000020644)	fgr (ENSXETG00000020659) #20	ahdc1 (ENSXETG00000018716) #21	wasf2 (ENSXETG00000003647) #22	wdtc1 (ENSXETG00000020662)	tmem222 (ENSXETG00000020673)	sytl1 (ENSXETG00000020676)	slc9a1 (ENSXETG00000020678)	tent5b (ENSXETG00000020683)	ENSXETG00000036010	kdf1 (ENSXETG00000020684)	nudc (ENSXETG00000020686)	gpatch3 (ENSXETG00000020692)	pigv (ENSXETG00000020693)	ENSXETG00000044298	arid1a (ENSXETG00000020695)	rps6ka1 (ENSXETG00000012289)	ENSXETG00000043352	hmgn2 (ENSXETG00000012323)
Coelacanth	MODERN SPECIES	306	CENPO (ENSLACG00000022674)	PTRHD1 (ENSLACG00000018052)	NCOA1 (ENSLACG00000017956)	EFHC1 (ENSLACG00000017717)	TRAM2 (ENSLACG00000017648)	RCC1 (ENSLACG00000017540)	PHACTR4 (ENSLACG00000017437)	MED18 (ENSLACG00000017315)	SESN2 (ENSLACG00000017259)	zgc:110239 (ENSLACG00000017200)	FAM76A (ENSLACG00000017154) #17	FGR (ENSLACG00000016907) #20	ENSLACG00000016880	AHDC1 (ENSLACG00000016403) #21	ENSLACG00000016242	WASF2 (ENSLACG00000016132) #22	GPR3 (ENSLACG00000022227)	ENSLACG00000015719	ENSLACG00000015622	ENSLACG00000015555	MAP3K6 (ENSLACG00000015267)	SYTL1 (ENSLACG00000015092)	tpbga (ENSLACG00000014617)	TMEM222 (ENSLACG00000014459)	WDTC1 (ENSLACG00000014179)	ENSLACG00000013069	KDF1 (ENSLACG00000012128)	NUDC (ENSLACG00000011655)	NR0B2 (ENSLACG00000011527)	GPATCH3 (ENSLACG00000011400)	GPN2 (ENSLACG00000011279)
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	72	ENSGT00940000157669	ENSGT00940000155543	ENSGT00940000157582	ENSGT00950000183053.A	ENSGT00940000157218.C	ENSGT01030000234623.a.a.b	ENSGT01030000235111	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	274																ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000177340	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000156529	ENSGT00940000156072.b	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000163923	ENSGT00940000163960.a	ENSGT00390000010887.b	ENSGT00530000063426.b.a	ENSGT00940000154798.b	ENSGT00940000157740
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000160796	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000175786	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000177340	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000156529	ENSGT00940000156072.b	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000163923	ENSGT00940000163960.a	ENSGT00390000010887.b	ENSGT00940000157740	ENSGT00940000154798.b	ENSGT00530000063426.b.a	ENSGT00940000164552	ENSGT00390000011115	ENSGT00390000008551
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	219	ENSGT00940000156095.n	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000175786	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000155462.ab	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000177340	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000163923
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	241	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000175786	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00390000002881	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000177340	ENSGT00390000017352	ENSGT00940000159342.a	ENSGT00940000164175.b
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	281	ENSGT00940000157125	ENSGT00940000153814.a	ENSGT00390000009163	ENSGT00940000155574.C	ENSGT00940000163083	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00940000159638	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000177340	ENSGT00390000017352
Atlantic herring	MODERN SPECIES	10	matn1 (ENSCHAG00000005773)	hibadha (ENSCHAG00000005661)	ENSCHAG00000005648	ENSCHAG00000005623	ENSCHAG00000005577	ENSCHAG00000005567	ASTE1 (ENSCHAG00000005541)	ENSCHAG00000005525	ENSCHAG00000005439	rpl14 (ENSCHAG00000005404)	ENSCHAG00000005388	ENSCHAG00000005377	matn1 (ENSCHAG00000005329)	yrk (ENSCHAG00000002597) #20	AHDC1 (ENSCHAG00000002423) #21	wasf2 (ENSCHAG00000026894) #22	gpr3 (ENSCHAG00000026892)	ENSCHAG00000026889	si:ch211-199g17.9 (ENSCHAG00000026888)	fam83hb (ENSCHAG00000026884)	ENSCHAG00000026881	pum1 (ENSCHAG00000026815)	fkbp9 (ENSCHAG00000026745)	crtap (ENSCHAG00000026725)	SUSD5 (ENSCHAG00000026721)	clasp2 (ENSCHAG00000023833)	pdcd6ip (ENSCHAG00000023606)	cyhr1 (ENSCHAG00000023599)	ENSCHAG00000023589	DCLK3 (ENSCHAG00000023539)	ENSCHAG00000023530
Denticle herring	MODERN SPECIES	19	ENSDCDG00000031995	clasp2 (ENSDCDG00000027979)	pdcd6ip (ENSDCDG00000027567)	cyhr1 (ENSDCDG00000027565)	ENSDCDG00000027563	fabp3 (ENSDCDG00000027562)	zcchc17 (ENSDCDG00000027561)	snrnp40 (ENSDCDG00000027533)	nkain1 (ENSDCDG00000027531)	pum1 (ENSDCDG00000026845)	SDC3 (ENSDCDG00000026799)	matn1 (ENSDCDG00000026793)	yrk (ENSDCDG00000022794) #20	ENSDCDG00000022721	AHDC1 (ENSDCDG00000022720) #21	wasf2 (ENSDCDG00000022715) #22	gpr3 (ENSDCDG00000022706)	ENSDCDG00000022700	ENSDCDG00000022696	kat2b (ENSDCDG00000022584)	ENSDCDG00000022563	tbc1d5 (ENSDCDG00000020593)	ENSDCDG00000020516	dazl (ENSDCDG00000020453)	oxnad1 (ENSDCDG00000020449)	ENSDCDG00000020447	igf2bp3 (ENSDCDG00000020441)	ENSDCDG00000020438	ENSDCDG00000020437	cbx3a (ENSDCDG00000020424)	ENSDCDG00000020341
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00940000159476.j	ENSGT00940000159476.i	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000175786	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00390000002881	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000177340	ENSGT00390000017352	ENSGT00940000159342.a	ENSGT00940000157613	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00940000156790	ENSGT00940000166232	ENSGT00950000183029.B.j.g.a	ENSGT00950000183029.B.j.g.b	ENSGT01050000244827.E	ENSGT00910000144211	ENSGT00940000166197	ENSGT00390000002428.a	ENSGT00490000043398
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000159476.j	ENSGT00940000159476.i	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000175786	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00390000002881	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000177340	ENSGT00390000017352	ENSGT00940000159342.a	ENSGT00940000157613	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00940000156790	ENSGT00940000166232	ENSGT00950000183029.B.j.g.a	ENSGT00950000183029.B.j.g.b	ENSGT01050000244827.E	ENSGT00910000144211	ENSGT00940000166197	ENSGT00390000002428.a	ENSGT00490000043398
Channel catfish	MODERN SPECIES	16	ENSIPUG00000020535	ENSIPUG00000020530	fabp3 (ENSIPUG00000020525)	zcchc17 (ENSIPUG00000020511)	snrnp40 (ENSIPUG00000020472)	nkain1 (ENSIPUG00000020456)	pum1 (ENSIPUG00000020421)	sdc3 (ENSIPUG00000020392)	nobox (ENSIPUG00000020371)	LAPTM4A (ENSIPUG00000020348)	matn1 (ENSIPUG00000020337)	sesn2 (ENSIPUG00000020323)	fgr (ENSIPUG00000020219) #20	ahdc1 (ENSIPUG00000020214) #21	ENSIPUG00000020205	wasf2 (ENSIPUG00000020198) #22	gpr3 (ENSIPUG00000020193)	cd164l2 (ENSIPUG00000020166)	ENSIPUG00000020141	fam83h (ENSIPUG00000020131)	KIAA0319L (ENSIPUG00000020105)	CAP1 (ENSIPUG00000020066)	ppt1 (ENSIPUG00000020038)	ENSIPUG00000019972	ENSIPUG00000019957	ENSIPUG00000019880	ENSIPUG00000019867	rpl11 (ENSIPUG00000019795)	ENSIPUG00000019774	tceb3 (ENSIPUG00000019763)	pithd1 (ENSIPUG00000019752)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000156148	ENSGT00940000163083	ENSGT00940000156095.n	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476.j	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000175786	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000177340	ENSGT00390000017352	ENSGT00940000159342.a	ENSGT00940000157613	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00940000156790	ENSGT00940000166232	ENSGT00950000183029.B.j.g.a	ENSGT00950000183029.B.j.g.b	ENSGT01050000244827.E	ENSGT00910000144211	ENSGT00940000166197	ENSGT00390000002428.a	ENSGT00490000043398
Electric eel	MODERN SPECIES	637							zcchc17 (ENSEEEG00000018644)	snrnp40 (ENSEEEG00000018626)	nkain1 (ENSEEEG00000018617)	pum1 (ENSEEEG00000018183)	SDC3 (ENSEEEG00000018180)	ENSEEEG00000018179	matn1 (ENSEEEG00000018178)	sesn2 (ENSEEEG00000018177)	yrk (ENSEEEG00000015172) #20	wasf2 (ENSEEEG00000015122) #22	gpr3 (ENSEEEG00000015120)	ENSEEEG00000015119
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000156148	ENSGT00940000163083	ENSGT00940000156095.n	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476.j	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000175786	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000177340	ENSGT00390000017352	ENSGT00940000159342.a	ENSGT00940000157613	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00940000156790	ENSGT00940000166232	ENSGT00950000183029.B.j.g.a	ENSGT00950000183029.B.j.g.b	ENSGT01050000244827.E	ENSGT00910000144211	ENSGT00940000166197	ENSGT00390000002428.a	ENSGT00490000043398
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	1	cyhr1 (ENSPNAG00000005034)	DCLK3 (ENSPNAG00000026847)	fabp3 (ENSPNAG00000004117)	zcchc17 (ENSPNAG00000026780)	snrnp40 (ENSPNAG00000026769)	nkain1 (ENSPNAG00000026733)	pum1 (ENSPNAG00000026728)	SDC3 (ENSPNAG00000007081)	ENSPNAG00000026558	ENSPNAG00000026544	matn1 (ENSPNAG00000007138)	sesn2 (ENSPNAG00000006738)	yrk (ENSPNAG00000004051) #20	AHDC1 (ENSPNAG00000004726) #21	ENSPNAG00000026358	wasf2 (ENSPNAG00000026345) #22	gpr3 (ENSPNAG00000026328)	ENSPNAG00000026316	si:ch211-199g17.9 (ENSPNAG00000026286)	fam83hb (ENSPNAG00000026242)	KIAA0319L (ENSPNAG00000026231)	cap1 (ENSPNAG00000006261)	ppt1 (ENSPNAG00000026191)	ENSPNAG00000004013	ENSPNAG00000026137	ENSPNAG00000026105	ENSPNAG00000026075	rpl11 (ENSPNAG00000026061)	ENSPNAG00000026024	eloa (ENSPNAG00000025986)	pithd1 (ENSPNAG00000025972)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	15	cyhr1 (ENSAMXG00000020589)	ENSAMXG00000032506	ENSAMXG00000036806	fabp3 (ENSAMXG00000042510)	zcchc17 (ENSAMXG00000020595)	snrnp40 (ENSAMXG00000020599)	nkain1 (ENSAMXG00000042549)	pum1 (ENSAMXG00000020607)	SDC3 (ENSAMXG00000020610)	ENSAMXG00000037645	ENSAMXG00000037364	matn1 (ENSAMXG00000020612)	sesn2 (ENSAMXG00000020616)	yrk (ENSAMXG00000020619) #20	AHDC1 (ENSAMXG00000025287) #21	wasf2 (ENSAMXG00000020622) #22	gpr3 (ENSAMXG00000036140)	ENSAMXG00000020624	si:ch211-199g17.9 (ENSAMXG00000041603)	fam83hb (ENSAMXG00000020626)	KIAA0319L (ENSAMXG00000020627)	cap1 (ENSAMXG00000020631)	ppt1 (ENSAMXG00000036664)	ENSAMXG00000020643	ENSAMXG00000029743	ENSAMXG00000020663	rpl11 (ENSAMXG00000034710)	ENSAMXG00000030505	eloa (ENSAMXG00000029662)	pithd1 (ENSAMXG00000038633)	lypla2 (ENSAMXG00000038933)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000159476.j.b	ENSGT00940000159476.i	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000175786	ENSGT00940000159638.g	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00390000002881	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000177340	ENSGT00390000017352	ENSGT00940000159342.a	ENSGT00940000157613	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00940000156790	ENSGT00940000166232	ENSGT00950000183029.B.j.g.a	ENSGT00950000183029.B.j.g.b	ENSGT01050000244827.E	ENSGT00910000144211	ENSGT00940000166197	ENSGT00390000002428.a	ENSGT00490000043398
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	97	ENSGT00390000018258.n	ENSGT00940000159476.j.b	ENSGT00940000159476.i	ENSGT00940000155104.i	ENSGT00510000047363.ec	ENSGT00940000155058.r	ENSGT00940000159949.d	ENSGT00940000158079.a	ENSGT00940000160209.a	ENSGT00650000093445.d	ENSGT00940000175786.a	ENSGT00940000159638.g.a	ENSGT00950000183168.B.a.a	ENSGT00940000157554.s.a #20	ENSGT00390000018883.c #21	ENSGT00950000182962.b.a.a #22	ENSGT00530000063929.a.b.h.a
Goldfish	MODERN SPECIES	38	pdcd6ip (ENSCARG00000064352)	ENSCARG00000065429	cyhr1 (ENSCARG00000065469)	FABP-3 (ENSCARG00000065484)	zcchc17 (ENSCARG00000065499)	snrnp40 (ENSCARG00000065518)	nkain1 (ENSCARG00000065536)	pum1 (ENSCARG00000065574)	SDC3 (ENSCARG00000065809)	ENSCARG00000065818	ENSCARG00000065824	matn1 (ENSCARG00000065836)	sesn2 (ENSCARG00000018320)	yrk (ENSCARG00000018346) #20	AHDC1 (ENSCARG00000018410) #21	wasf2 (ENSCARG00000018420) #22	CD164L2 (ENSCARG00000018441)	si:ch211-199g17.9 (ENSCARG00000018451)	fam83hb (ENSCARG00000018473)	KIAA0319L (ENSCARG00000018518)	cap1 (ENSCARG00000019433)	ppt1 (ENSCARG00000019499)	ENSCARG00000019568	ENSCARG00000019582	ENSCARG00000019630	rpl11 (ENSCARG00000019634)	ENSCARG00000019656	eloa (ENSCARG00000019670)	pithd1 (ENSCARG00000019687)	lypla2 (ENSCARG00000019704)	ankib1a (ENSCARG00000019717)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	124	ENSGT00390000018258.n	ENSGT00940000159476.j.b	ENSGT00940000159476.i	ENSGT00940000155104.i	ENSGT00510000047363.ec	ENSGT00940000155058.r	ENSGT00940000159949.d	ENSGT00940000158079.a	ENSGT00940000160209.a	ENSGT00650000093445.d	ENSGT00940000175786.a	ENSGT00940000159638.g.a	ENSGT00950000183168.B.a.a	ENSGT00940000157554.s.a #20	ENSGT00390000018883.c #21	ENSGT00950000182962.b.a.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a.b	ENSGT00530000063929.a.b.h.a	ENSGT00940000177340	ENSGT00390000017352.e	ENSGT00940000159342.a.c	ENSGT00940000157613.g	ENSGT00390000017955.c.sb	ENSGT00940000156790.fb	ENSGT00940000166232.d	ENSGT00950000183029.B.j.g.a	ENSGT00950000183029.B.j.g.b	ENSGT01050000244827.E.h.b	ENSGT00910000144211.k	ENSGT00940000166197.d	ENSGT00390000002428.a.a
Common carp reference	MODERN SPECIES	31	ENSCCRG00000050861	cyhr1 (ENSCCRG00000072599)	ENSCCRG00000079492	ENSCCRG00000050856	fabp3 (ENSCCRG00000050853)	zcchc17 (ENSCCRG00000050846)	snrnp40 (ENSCCRG00000079296)	pum1 (ENSCCRG00000050733)	SDC3 (ENSCCRG00000042010)	ENSCCRG00000050201	ENSCCRG00000081784	matn1 (ENSCCRG00000079213)	sesn2 (ENSCCRG00000031091)	yrk (ENSCCRG00000061987) #20	AHDC1 (ENSCCRG00000062000) #21	wasf2 (ENSCCRG00000071212) #22	gpr3 (ENSCCRG00000077745)	CD164L2 (ENSCCRG00000042396)	si:ch211-199g17.9 (ENSCCRG00000050871)	fam83hb (ENSCCRG00000050874)	ENSCCRG00000024103	cap1 (ENSCCRG00000024091)	ppt1 (ENSCCRG00000024020)	ENSCCRG00000024006	ENSCCRG00000041266	ENSCCRG00000041301	ENSCCRG00000082450	rpl11 (ENSCCRG00000041254)	ENSCCRG00000041241	eloa (ENSCCRG00000068552)	lypla2 (ENSCCRG00000058275)
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	143	pdcd6ip (ENSSGRG00000014905)	ENSSGRG00000014977	cyhr1 (ENSSGRG00000014978)	DCLK3 (ENSSGRG00000014979)	fabp3 (ENSSGRG00000014983)	zcchc17 (ENSSGRG00000014987)	snrnp40 (ENSSGRG00000014990)	nkain1 (ENSSGRG00000015064)	pum1 (ENSSGRG00000015138)	SDC3 (ENSSGRG00000018132)	ENSSGRG00000018133	ENSSGRG00000018134	matn1 (ENSSGRG00000018135)	yrk (ENSSGRG00000018208) #20	AHDC1 (ENSSGRG00000023178) #21	wasf2 (ENSSGRG00000023179) #22	gpr3 (ENSSGRG00000023180)	ENSSGRG00000023181	si:ch211-199g17.9 (ENSSGRG00000023183)	fam83hb (ENSSGRG00000023184)	si:ch211-199g17.9 (ENSSGRG00000023185)	fam83hb (ENSSGRG00000023186)	KIAA0319L (ENSSGRG00000023196)	ppt1 (ENSSGRG00000023705)	ENSSGRG00000023764	ENSSGRG00000023785	ENSSGRG00000024658	rpl11 (ENSSGRG00000024659)	ENSSGRG00000024790	ENSSGRG00000024791	eloa (ENSSGRG00000024793)
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Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000156095.n.b	ENSGT00390000018258.m	ENSGT00940000159476.j.a	ENSGT00940000155104.j	ENSGT00510000047363.fc	ENSGT00940000155058.q	ENSGT00940000159949.c	ENSGT00940000158079.b	ENSGT00940000160209.b	ENSGT00650000093445.c	ENSGT00940000175786.b	ENSGT00940000159638.g.b	ENSGT00950000183168.B.a.b	ENSGT00940000157554.s.b #20	ENSGT00390000018883.d #21	ENSGT00950000182962.b.a.b #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a.a	ENSGT00530000063929.a.b.h.b	ENSGT00940000159342.a.d	ENSGT00940000157613.h	ENSGT00390000017955.c.rb	ENSGT00940000156790.gb	ENSGT00940000166232.c	ENSGT00940000162741	ENSGT01050000244827.E.h.a	ENSGT00910000144211.j	ENSGT00940000166197.c	ENSGT00390000002428.a.b	ENSGT00490000043398	ENSGT00940000156197.fb	ENSGT00940000165758.b
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Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000156148	ENSGT00940000163083	ENSGT00940000155609.l	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079	ENSGT01000000220517	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000177340	ENSGT00940000160932	ENSGT01100000263491.a.a.c.b	ENSGT00940000159968	ENSGT00390000004541	ENSGT00550000075032	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000162490	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000163607	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000155783	ENSGT00390000000916	ENSGT01030000234543.F
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Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000155609.l	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000175655	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000177340	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000159968	ENSGT00390000004541	ENSGT00940000165470	ENSGT00550000075032	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000162490	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000163607	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000155783	ENSGT00390000000916	ENSGT01030000234543.F
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000155609.l	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000175655	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000177340	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000159968	ENSGT00390000004541	ENSGT00940000165470	ENSGT00550000075032	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000162490	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000163607	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000155783	ENSGT00390000000916	ENSGT01030000234543.F
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000155609.l	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000175655	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000177340	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000159968	ENSGT00390000004541	ENSGT00940000165470	ENSGT00550000075032	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000162490	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000163607	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000155783	ENSGT00390000000916	ENSGT01030000234543.F
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000155609.l	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000175655	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445.e	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000177340	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000159968.k	ENSGT00390000004541	ENSGT00940000165470	ENSGT00550000075032	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000162490	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000163607	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000155783	ENSGT00390000000916	ENSGT01030000234543.F
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000155609.l	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000175655	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445.e	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000177340	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000165470	ENSGT00940000159968.k	ENSGT00390000004541	ENSGT00550000075032	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000162490	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000163607	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000155783	ENSGT00390000000916	ENSGT01030000234543.F
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000155609.l	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000175655	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445.e	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000177340	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000165470.c	ENSGT00390000004541.i	ENSGT00550000075032	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000162490	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000163607	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000155783	ENSGT00390000000916	ENSGT01030000234543.F	ENSGT00450000040303
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	420	ENSHBUG00000018525	cyhr1 (ENSHBUG00000018564)	ENSHBUG00000018600	fabp3 (ENSHBUG00000018630)	zcchc17 (ENSHBUG00000018638)	snrnp40 (ENSHBUG00000018648)	nkain1 (ENSHBUG00000018655)	pum1 (ENSHBUG00000018718)	SDC3 (ENSHBUG00000018726)	ENSHBUG00000018741	matn1 (ENSHBUG00000018779)	sesn2 (ENSHBUG00000018793)	yrk (ENSHBUG00000018891) #20	AHDC1 (ENSHBUG00000018918) #21	ENSHBUG00000018932	wasf2 (ENSHBUG00000018965) #22	gpr3 (ENSHBUG00000018989)	ENSHBUG00000018995	ENSHBUG00000019006	ENSHBUG00000019017	rbm48 (ENSHBUG00000019023)	pex1 (ENSHBUG00000019037)	elmo1 (ENSHBUG00000000569)	rp9 (ENSHBUG00000019272)	si:dkey-184p18.2 (ENSHBUG00000019280)	poc1bl (ENSHBUG00000019319)	GALNT12 (ENSHBUG00000019369)	gabbr2 (ENSHBUG00000019409)	elp2 (ENSHBUG00000019419)	ctnnal1 (ENSHBUG00000019506)	abitram (ENSHBUG00000019570)
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000163083	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000175655	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445.e	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000177340	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000165470.c	ENSGT00390000004541.i	ENSGT00550000075032	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000162490	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000163607	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000155783	ENSGT00390000000916	ENSGT01030000234543.F	ENSGT00450000040303
P. nyererei	MODERN SPECIES	323	clasp2 (ENSPNYG00000009999)	ubp1 (ENSPNYG00000009934)	pdcd6ip (ENSPNYG00000009865)	cyhr1 (ENSPNYG00000009822)	ENSPNYG00000009796	fabp3 (ENSPNYG00000009774)	zcchc17 (ENSPNYG00000009648)	snrnp40 (ENSPNYG00000009590)	nkain1 (ENSPNYG00000009573)	pum1 (ENSPNYG00000009518)	SDC3 (ENSPNYG00000009499)	matn1 (ENSPNYG00000009467)	sesn2 (ENSPNYG00000009443)	yrk (ENSPNYG00000009397) #20	AHDC1 (ENSPNYG00000009375) #21	wasf2 (ENSPNYG00000009358) #22	gpr3 (ENSPNYG00000009348)	ENSPNYG00000009332	sytl1 (ENSPNYG00000009297)	ENSPNYG00000009244	rbm48 (ENSPNYG00000009226)	pex1 (ENSPNYG00000009123)	elmo1 (ENSPNYG00000009038)	rp9 (ENSPNYG00000009006)	ENSPNYG00000008984	poc1bl (ENSPNYG00000008921)	GALNT12 (ENSPNYG00000008883)	gabbr2 (ENSPNYG00000008853)	elp2 (ENSPNYG00000008757)	ctnnal1 (ENSPNYG00000008694)	abitram (ENSPNYG00000008660)
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000163083	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000175655	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445.e	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000177340	ENSGT00940000155843	ENSGT01030000234954	ENSGT00960000186804	ENSGT00940000165470.c	ENSGT00390000004541.i	ENSGT00550000075032	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000162490	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000163607	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000155783	ENSGT00390000000916
Eastern happy	MODERN SPECIES	13	cyhr1 (ENSACLG00000019052)	ENSACLG00000019088	fabp3 (ENSACLG00000019164)	zcchc17 (ENSACLG00000019174)	snrnp40 (ENSACLG00000019198)	nkain1 (ENSACLG00000019271)	ENSACLG00000019342	pum1 (ENSACLG00000019354)	SDC3 (ENSACLG00000019403)	ENSACLG00000019430	matn1 (ENSACLG00000019461)	sesn2 (ENSACLG00000019538)	yrk (ENSACLG00000019592) #20	AHDC1 (ENSACLG00000019654) #21	ENSACLG00000019695	wasf2 (ENSACLG00000019704) #22	gpr3 (ENSACLG00000019717)	ENSACLG00000019748	ENSACLG00000019764	rbm48 (ENSACLG00000019775)	ENSACLG00000019790	pex1 (ENSACLG00000019864)	elmo1 (ENSACLG00000019940)	rp9 (ENSACLG00000020012)	si:dkey-184p18.2 (ENSACLG00000020040)	poc1bl (ENSACLG00000020070)	GALNT12 (ENSACLG00000020111)	gabbr2 (ENSACLG00000020171)	elp2 (ENSACLG00000020239)	ctnnal1 (ENSACLG00000020419)	abitram (ENSACLG00000020504)
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1104	pdcd6ip (ENSMZEG00005005702)	cyhr1 (ENSMZEG00005005727)	ENSMZEG00005005750	fabp3 (ENSMZEG00005005765)	zcchc17 (ENSMZEG00005005784)	snrnp40 (ENSMZEG00005005797)	nkain1 (ENSMZEG00005005810)	pum1 (ENSMZEG00005005834)	ENSMZEG00005005900	ENSMZEG00005005916	matn1 (ENSMZEG00005005935)	sesn2 (ENSMZEG00005005978)	yrk (ENSMZEG00005006002) #20	AHDC1 (ENSMZEG00005006063) #21	ENSMZEG00005006079	wasf2 (ENSMZEG00005006089) #22	gpr3 (ENSMZEG00005006118)	ENSMZEG00005006129	ENSMZEG00005006139	ENSMZEG00005006162	rbm48 (ENSMZEG00005006153)	pex1 (ENSMZEG00005006172)	elmo1 (ENSMZEG00005006212)	rp9 (ENSMZEG00005006301)	si:dkey-184p18.2 (ENSMZEG00005006323)	poc1bl (ENSMZEG00005006343)	GALNT12 (ENSMZEG00005006369)	gabbr2 (ENSMZEG00005006407)	elp2 (ENSMZEG00005006437)	ctnnal1 (ENSMZEG00005006483)	abitram (ENSMZEG00005006527)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	302	clasp2 (ENSNBRG00000011064)	ubp1 (ENSNBRG00000010962)	pdcd6ip (ENSNBRG00000010918)	cyhr1 (ENSNBRG00000010900)	ENSNBRG00000010843	fabp3 (ENSNBRG00000010816)	zcchc17 (ENSNBRG00000010797)	snrnp40 (ENSNBRG00000010763)	nkain1 (ENSNBRG00000010742)	pum1 (ENSNBRG00000010689)	SDC3 (ENSNBRG00000010675)	matn1 (ENSNBRG00000010639)	sesn2 (ENSNBRG00000010615)	yrk (ENSNBRG00000010599) #20	AHDC1 (ENSNBRG00000010575) #21	wasf2 (ENSNBRG00000010545) #22	gpr3 (ENSNBRG00000010526)	ENSNBRG00000010509	ENSNBRG00000010494	rbm48 (ENSNBRG00000010483)	efcab1 (ENSNBRG00000010436)	pex1 (ENSNBRG00000010320)	elmo1 (ENSNBRG00000010259)	rp9 (ENSNBRG00000010234)	si:dkey-184p18.2 (ENSNBRG00000010220)	poc1bl (ENSNBRG00000010176)	GALNT12 (ENSNBRG00000010145)	gabbr2 (ENSNBRG00000010104)	elp2 (ENSNBRG00000009896)	ctnnal1 (ENSNBRG00000009824)	abitram (ENSNBRG00000009799)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	13	ENSONIG00000002315	cyhr1 (ENSONIG00000002313)	ENSONIG00000029139	fabp3 (ENSONIG00000040251)	zcchc17 (ENSONIG00000031036)	snrnp40 (ENSONIG00000002305)	nkain1 (ENSONIG00000002303)	pum1 (ENSONIG00000002290)	SDC3 (ENSONIG00000041022)	ENSONIG00000036823	matn1 (ENSONIG00000002278)	sesn2 (ENSONIG00000002274)	yrk (ENSONIG00000002248) #20	AHDC1 (ENSONIG00000022711) #21	ENSONIG00000038803	wasf2 (ENSONIG00000002236) #22	gpr3 (ENSONIG00000020846)	ENSONIG00000038865	sytl1 (ENSONIG00000002228)	efcab1 (ENSONIG00000002223)	rbm48 (ENSONIG00000002218)	pex1 (ENSONIG00000002198)	elmo1 (ENSONIG00000002179)	rp9 (ENSONIG00000002174)	si:dkey-184p18.2 (ENSONIG00000032391)	poc1bl (ENSONIG00000002161)	GALNT12 (ENSONIG00000002153)	gabbr2 (ENSONIG00000002134)	elp2 (ENSONIG00000002123)	ctnnal1 (ENSONIG00000002117)	abitram (ENSONIG00000002111)
Midas cichlid	MODERN SPECIES	1257	clasp2 (ENSACIG00000020207)	ubp1 (ENSACIG00000020276)	pdcd6ip (ENSACIG00000020302)	cyhr1 (ENSACIG00000020337)	ENSACIG00000020355	fabp3 (ENSACIG00000020437)	zcchc17 (ENSACIG00000020915)	snrnp40 (ENSACIG00000020980)	nkain1 (ENSACIG00000020994)	pum1 (ENSACIG00000021013)	SDC3 (ENSACIG00000021045)	matn1 (ENSACIG00000021057)	sesn2 (ENSACIG00000021080)	yrk (ENSACIG00000021107) #20	AHDC1 (ENSACIG00000021132) #21	wasf2 (ENSACIG00000021139) #22	gpr3 (ENSACIG00000021155)	ENSACIG00000021166	sytl1 (ENSACIG00000021196)	rbm48 (ENSACIG00000021495)	efcab1 (ENSACIG00000021546)	pex1 (ENSACIG00000021560)	elmo1 (ENSACIG00000021643)	rp9 (ENSACIG00000021679)	poc1bl (ENSACIG00000021700)	GALNT12 (ENSACIG00000021730)	GABBR1 (ENSACIG00000021766)	sh3bp5la (ENSACIG00000021795)	mgat1a (ENSACIG00000021809)	rnf183 (ENSACIG00000021816)	dhx16 (ENSACIG00000021825)
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000156148	ENSGT00940000163083	ENSGT00940000155609.l	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000159968	ENSGT00390000004541	ENSGT00550000075032	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000162490	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000163607	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000155783	ENSGT00390000000916	ENSGT01030000234543.F	ENSGT00450000040303	ENSGT00940000159104.c
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	910	pdcd6ip (ENSSPAG00000016883)	ENSSPAG00000016856	cyhr1 (ENSSPAG00000016837)	ENSSPAG00000016817	fabp3 (ENSSPAG00000016809)	zcchc17 (ENSSPAG00000016785)	snrnp40 (ENSSPAG00000016742)	nkain1 (ENSSPAG00000016711)	pum1 (ENSSPAG00000016636)	SDC3 (ENSSPAG00000016621)	matn1 (ENSSPAG00000016599)	sesn2 (ENSSPAG00000016579)	yrk (ENSSPAG00000016541) #20	AHDC1 (ENSSPAG00000016527) #21	ENSSPAG00000016515	wasf2 (ENSSPAG00000016506) #22	gpr3 (ENSSPAG00000016491)	sytl1 (ENSSPAG00000016473)	efcab1 (ENSSPAG00000016417)	rbm48 (ENSSPAG00000016398)	pex1 (ENSSPAG00000016289)
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000156148	ENSGT00940000163083	ENSGT00940000155609.l	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000159968	ENSGT00390000004541	ENSGT00550000075032	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000162490	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000163607	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000155783	ENSGT00390000000916	ENSGT01030000234543.F	ENSGT00450000040303	ENSGT00940000159104.c
Spiny chromis	MODERN SPECIES	336	pdcd6ip (ENSAPOG00000021926)	ENSAPOG00000021873	cyhr1 (ENSAPOG00000021811)	ENSAPOG00000021766	fabp3 (ENSAPOG00000021755)	zcchc17 (ENSAPOG00000021724)	snrnp40 (ENSAPOG00000021710)	nkain1 (ENSAPOG00000000615)	pum1 (ENSAPOG00000021632)	SDC3 (ENSAPOG00000021526)	matn1 (ENSAPOG00000021505)	sesn2 (ENSAPOG00000021467)	yrk (ENSAPOG00000021415) #20	AHDC1 (ENSAPOG00000021368) #21	ENSAPOG00000021354	wasf2 (ENSAPOG00000021335) #22	gpr3 (ENSAPOG00000021322)	sytl1 (ENSAPOG00000021310)	efcab1 (ENSAPOG00000021278)	rbm48 (ENSAPOG00000021259)	pex1 (ENSAPOG00000021243)	elmo1 (ENSAPOG00000001090)
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000156148	ENSGT00940000163083	ENSGT00940000155609.l	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000159968	ENSGT00390000004541	ENSGT00550000075032	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000162490	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000163607	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000155783	ENSGT00390000000916	ENSGT01030000234543.F	ENSGT00450000040303	ENSGT00940000159104.c
Orange clownfish	MODERN SPECIES	8	pdcd6ip (ENSAPEG00000014219)	ENSAPEG00000014325	cyhr1 (ENSAPEG00000014374)	ENSAPEG00000014406	fabp3 (ENSAPEG00000014441)	zcchc17 (ENSAPEG00000014460)	snrnp40 (ENSAPEG00000014482)	nkain1 (ENSAPEG00000014505)	pum1 (ENSAPEG00000014550)	SDC3 (ENSAPEG00000014671)	matn1 (ENSAPEG00000014686)	sesn2 (ENSAPEG00000014729)	yrk (ENSAPEG00000014809) #20	ENSAPEG00000014881 #21	ENSAPEG00000014957	wasf2 (ENSAPEG00000014969) #22	gpr3 (ENSAPEG00000014986)	ENSAPEG00000015000	efcab1 (ENSAPEG00000015021)	rbm48 (ENSAPEG00000015063)	pex1 (ENSAPEG00000015081)	elmo1 (ENSAPEG00000015109)	ENSAPEG00000015134	rp9 (ENSAPEG00000015143)	si:dkey-184p18.2 (ENSAPEG00000015169)	poc1bl (ENSAPEG00000015193)	GALNT12 (ENSAPEG00000015222)	gabbr2 (ENSAPEG00000015305)	elp2 (ENSAPEG00000015373)	ctnnal1 (ENSAPEG00000015409)	abitram (ENSAPEG00000015483)
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	770										ENSAOCG00000008712	matn1 (ENSAOCG00000008700)	sesn2 (ENSAOCG00000008672)	yrk (ENSAOCG00000008657) #20	AHDC1 (ENSAOCG00000000502) #21	ENSAOCG00000008595	wasf2 (ENSAOCG00000008587) #22	gpr3 (ENSAOCG00000008572)	sytl1 (ENSAOCG00000008564)	efcab1 (ENSAOCG00000008536)	rbm48 (ENSAOCG00000008510)	pex1 (ENSAOCG00000008501)
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000155609.l	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000175655	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000177340	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000159968	ENSGT00390000004541	ENSGT00940000165470	ENSGT00550000075032	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000162490	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000163607	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000155783	ENSGT00390000000916	ENSGT01030000234543.F
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000155609.l	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000175655	ENSGT00940000158079.h	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000159968	ENSGT00390000004541	ENSGT00550000075032	ENSGT01030000234542.b.a.a.a.a	ENSGT00940000154870.A.b	ENSGT00940000175914	ENSGT00940000154879	ENSGT00390000014273.b	ENSGT00390000008274	ENSGT00390000002869	ENSGT00940000158522.m	ENSGT00390000004097.b	ENSGT00940000157833.h.a
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000163083	ENSGT00940000155609.l	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079.h	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000159968	ENSGT00390000004541	ENSGT00550000075032	ENSGT01030000234542.b.a.a.a.a	ENSGT00940000154870.A.b	ENSGT00940000175914	ENSGT00940000154879	ENSGT00390000014273.b	ENSGT00390000008274	ENSGT00390000002869	ENSGT00940000158522.m	ENSGT00390000004097.b	ENSGT00940000157833.h.a
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	2	ENSORLG00000011606	cyhr1 (ENSORLG00000011594)	ENSORLG00000011581	fabp3 (ENSORLG00000011573)	zcchc17 (ENSORLG00000011563)	snrnp40 (ENSORLG00000011539)	nkain1 (ENSORLG00000022267)	pum1 (ENSORLG00000011482)	SDC3 (ENSORLG00000026192)	ENSORLG00000028896	matn1 (ENSORLG00000011158)	sesn2 (ENSORLG00000011116)	yrk (ENSORLG00000011084) #20	AHDC1 (ENSORLG00000026505) #21	ENSORLG00000029572	wasf2 (ENSORLG00000011056) #22	gpr3 (ENSORLG00000011034)	sytl1 (ENSORLG00000011030)	efcab1 (ENSORLG00000011017)	rbm48 (ENSORLG00000011006)	pex1 (ENSORLG00000010989)	ENSORLG00000010968	ENSORLG00000026637	ilf2 (ENSORLG00000010955)	pex11b (ENSORLG00000010937)	snapin (ENSORLG00000028872)	chtopa (ENSORLG00000010919)	txnipa (ENSORLG00000010885)	gatad2b (ENSORLG00000010868)	ENSORLG00000010840	ENSORLG00000030489
Chinese medaka	MODERN SPECIES	13	pdcd6ip (ENSOSIG00000011247)	ENSOSIG00000011259	cyhr1 (ENSOSIG00000011264)	ENSOSIG00000011279	fabp3 (ENSOSIG00000012052)	snrnp40 (ENSOSIG00000012057)	nkain1 (ENSOSIG00000012738)	pum1 (ENSOSIG00000012797)	SDC3 (ENSOSIG00000015985)	ENSOSIG00000015986	matn1 (ENSOSIG00000015987)	sesn2 (ENSOSIG00000015988)	yrk (ENSOSIG00000016005) #20	AHDC1 (ENSOSIG00000017214) #21	ENSOSIG00000017215	wasf2 (ENSOSIG00000017216) #22	gpr3 (ENSOSIG00000017218)	sytl1 (ENSOSIG00000017220)	efcab1 (ENSOSIG00000017221)	rbm48 (ENSOSIG00000017223)	pex1 (ENSOSIG00000017225)	ENSOSIG00000017252	ENSOSIG00000000018	si:dkey-81h8.1 (ENSOSIG00000000026)	ilf2 (ENSOSIG00000000030)	pex11b (ENSOSIG00000000037)	snapin (ENSOSIG00000000041)	chtopa (ENSOSIG00000000043)	txnipa (ENSOSIG00000000059)	gatad2b (ENSOSIG00000000064)	ENSOSIG00000000070
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000156148	ENSGT00940000163083	ENSGT00940000155609.l	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000175655	ENSGT00940000158079.h	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000159968	ENSGT00390000004541	ENSGT00550000075032	ENSGT01030000234542.b.a.a.a.a	ENSGT00940000154870.A.b	ENSGT00940000175914	ENSGT00940000154879	ENSGT00390000014273.b	ENSGT00390000008274	ENSGT00390000002869	ENSGT00940000158522.m	ENSGT00390000004097.b	ENSGT00940000157833.h.a
Indian medaka	MODERN SPECIES	3	cyhr1 (ENSOMEG00000009594)	ENSOMEG00000009551	fabp3 (ENSOMEG00000009508)	zcchc17 (ENSOMEG00000009464)	snrnp40 (ENSOMEG00000009419)	nkain1 (ENSOMEG00000009358)	ENSOMEG00000009335	pum1 (ENSOMEG00000009312)	SDC3 (ENSOMEG00000009263)	ENSOMEG00000009228	matn1 (ENSOMEG00000009191)	sesn2 (ENSOMEG00000009161)	yrk (ENSOMEG00000009132) #20	AHDC1 (ENSOMEG00000009078) #21	ENSOMEG00000009051	wasf2 (ENSOMEG00000009029) #22	gpr3 (ENSOMEG00000009008)	ENSOMEG00000008987	ENSOMEG00000008958	efcab1 (ENSOMEG00000008894)	rbm48 (ENSOMEG00000008875)	pex1 (ENSOMEG00000008843)	ENSOMEG00000008775	ENSOMEG00000008743	si:dkey-81h8.1 (ENSOMEG00000008718)	ilf2 (ENSOMEG00000008691)	pex11b (ENSOMEG00000008633)	snapin (ENSOMEG00000008619)	chtopa (ENSOMEG00000008602)	txnipa (ENSOMEG00000008557)	gatad2b (ENSOMEG00000008522)
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	2	ubp1 (ENSOJAG00000016569)	pdcd6ip (ENSOJAG00000016848)	ENSOJAG00000016911	cyhr1 (ENSOJAG00000016981)	ENSOJAG00000017012	fabp3 (ENSOJAG00000017031)	zcchc17 (ENSOJAG00000001627)	snrnp40 (ENSOJAG00000001749)	nkain1 (ENSOJAG00000001884)	pum1 (ENSOJAG00000002521)	ENSOJAG00000005385	matn1 (ENSOJAG00000005406)	sesn2 (ENSOJAG00000005447)	yrk (ENSOJAG00000005571) #20	ENSOJAG00000005716	wasf2 (ENSOJAG00000005733) #22	gpr3 (ENSOJAG00000005759)	sytl1 (ENSOJAG00000005794)	efcab1 (ENSOJAG00000005836)	rbm48 (ENSOJAG00000005852)	ENSOJAG00000006233	ENSOJAG00000006389	ENSOJAG00000006408	ilf2 (ENSOJAG00000006438)	pex11b (ENSOJAG00000006478)	snapin (ENSOJAG00000006488)	chtopa (ENSOJAG00000006506)	txnipa (ENSOJAG00000006544)	gatad2b (ENSOJAG00000006560)	ENSOJAG00000006887	ENSOJAG00000009818
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000163083	ENSGT00940000155609.l	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000177340	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000159968	ENSGT00390000004541	ENSGT00940000165470	ENSGT00550000075032	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000162490	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000163607	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000155783	ENSGT00390000000916	ENSGT01030000234543.F
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000163083	ENSGT00940000155609.l	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000177340	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000159968	ENSGT00390000004541	ENSGT00940000165470	ENSGT00550000075032	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000162490	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000163607	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000155783	ENSGT00390000000916	ENSGT01030000234543.F
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000163083	ENSGT00940000155609.l	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000177340	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000165470	ENSGT00390000004541	ENSGT00550000075032	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000162490	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000163607	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000155783	ENSGT00390000000916	ENSGT01030000234543.F	ENSGT00450000040303
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000163083	ENSGT00940000155609.l	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000177340	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000165470	ENSGT00390000004541	ENSGT00550000075032	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000162490	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000163607	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000155783	ENSGT00390000000916	ENSGT01030000234543.F	ENSGT00450000040303
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000163083	ENSGT00940000155609.l	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000165470	ENSGT00390000004541	ENSGT00550000075032	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000162490	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000163607	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000155783	ENSGT00390000000916	ENSGT01030000234543.F	ENSGT00450000040303	ENSGT00940000159104.c
Amazon molly	MODERN SPECIES	273	cyhr1 (ENSPFOG00000008037)	ENSPFOG00000008018	fabp3 (ENSPFOG00000007975)	zcchc17 (ENSPFOG00000007896)	snrnp40 (ENSPFOG00000007663)	nkain1 (ENSPFOG00000024013)	pum1 (ENSPFOG00000007289)	SDC3 (ENSPFOG00000007251)	ENSPFOG00000022548	ENSPFOG00000021771	matn1 (ENSPFOG00000007107)	sesn2 (ENSPFOG00000007014)	yrk (ENSPFOG00000006894) #20	ENSPFOG00000022762 #21	ENSPFOG00000006884	wasf2 (ENSPFOG00000006805) #22	gpr3 (ENSPFOG00000020064)	sytl1 (ENSPFOG00000006726)	ENSPFOG00000006660	rbm48 (ENSPFOG00000006610)	pex1 (ENSPFOG00000006185)	elmo1 (ENSPFOG00000005937)	rp9 (ENSPFOG00000005886)	si:dkey-184p18.2 (ENSPFOG00000005865)	poc1bl (ENSPFOG00000005740)	GALNT12 (ENSPFOG00000005544)	gabbr2 (ENSPFOG00000005184)	elp2 (ENSPFOG00000004952)	ctnnal1 (ENSPFOG00000004435)	abitram (ENSPFOG00000004337)	sla1a (ENSPFOG00000004247)
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Guppy	MODERN SPECIES	441	ubp1 (ENSPREG00000005474)	pdcd6ip (ENSPREG00000005420)	cyhr1 (ENSPREG00000005377)	ENSPREG00000005350	fabp3 (ENSPREG00000005333)	zcchc17 (ENSPREG00000005325)	snrnp40 (ENSPREG00000005289)	nkain1 (ENSPREG00000005269)	pum1 (ENSPREG00000005195)	SDC3 (ENSPREG00000005172)	ENSPREG00000005136	matn1 (ENSPREG00000005069)	sesn2 (ENSPREG00000005042)	yrk (ENSPREG00000005009) #20	AHDC1 (ENSPREG00000004999) #21	wasf2 (ENSPREG00000004977) #22	gpr3 (ENSPREG00000004960)	ENSPREG00000004949	sytl1 (ENSPREG00000004917)	ENSPREG00000004820	rbm48 (ENSPREG00000004778)	pex1 (ENSPREG00000004750)	elmo1 (ENSPREG00000004642)	rp9 (ENSPREG00000004608)	si:dkey-184p18.2 (ENSPREG00000004553)	poc1bl (ENSPREG00000004517)	GALNT12 (ENSPREG00000004498)	gabbr2 (ENSPREG00000004442)	elp2 (ENSPREG00000004409)	ctnnal1 (ENSPREG00000004309)	abitram (ENSPREG00000004268)
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Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000163083	ENSGT00940000155609.l	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000177340	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000159968	ENSGT00390000004541	ENSGT00550000075032	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000162490	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000163607	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000155783	ENSGT00390000000916	ENSGT01030000234543.F	ENSGT00450000040303
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Zig-zag eel	MODERN SPECIES	2	pdcd6ip (ENSMAMG00000011771)	ENSMAMG00000011755	cyhr1 (ENSMAMG00000011735)	ENSMAMG00000011727	fabp3 (ENSMAMG00000026283)	zcchc17 (ENSMAMG00000011701)	snrnp40 (ENSMAMG00000011680)	nkain1 (ENSMAMG00000011666)	pum1 (ENSMAMG00000011606)	ENSMAMG00000011597	SDC3 (ENSMAMG00000011593)	matn1 (ENSMAMG00000011559)	sesn2 (ENSMAMG00000011556)	yrk (ENSMAMG00000011539) #20	ENSMAMG00000011526	wasf2 (ENSMAMG00000011496) #22	gpr3 (ENSMAMG00000011470)	ENSMAMG00000011450	ENSMAMG00000011436	ENSMAMG00000026305	pex1 (ENSMAMG00000011417)	elmo1 (ENSMAMG00000011399)	rp9 (ENSMAMG00000011389)	si:dkey-184p18.2 (ENSMAMG00000027397)	poc1bl (ENSMAMG00000011344)	ENSMAMG00000011339	gabbr2 (ENSMAMG00000011310)	elp2 (ENSMAMG00000011006)	ENSMAMG00000010897	ENSMAMG00000010977	ENSMAMG00000010864
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000156148	ENSGT00940000163083	ENSGT00940000155609.l	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000168856	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000175655	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000177340	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000159968	ENSGT00390000004541	ENSGT00550000075032	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000162490	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000163607	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000155783	ENSGT00390000000916	ENSGT01030000234543.F	ENSGT00450000040303
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Seriola	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT01100000263710	ENSGT00940000155609.l	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000168856	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000159968	ENSGT00390000004541	ENSGT00550000075032	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000162490	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000163607	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000155783	ENSGT00390000000916	ENSGT01030000234543.F	ENSGT00450000040303	ENSGT00940000159104.c
Greater amberjack	MODERN SPECIES	48	ENSSDUG00000009214	ENSSDUG00000009188	cyhr1 (ENSSDUG00000009157)	ENSSDUG00000009135	fabp3 (ENSSDUG00000009119)	zcchc17 (ENSSDUG00000009095)	snrnp40 (ENSSDUG00000009073)	nkain1 (ENSSDUG00000009061)	pum1 (ENSSDUG00000009021)	SDC3 (ENSSDUG00000009005)	matn1 (ENSSDUG00000008977)	sesn2 (ENSSDUG00000008919)	yrk (ENSSDUG00000008865) #20	AHDC1 (ENSSDUG00000008843) #21	ENSSDUG00000008827	wasf2 (ENSSDUG00000008811) #22	gpr3 (ENSSDUG00000008797)	sytl1 (ENSSDUG00000008733)	efcab1 (ENSSDUG00000008664)	rbm48 (ENSSDUG00000008641)	pex1 (ENSSDUG00000008582)	elmo1 (ENSSDUG00000008440)	rp9 (ENSSDUG00000008393)	si:dkey-184p18.2 (ENSSDUG00000008371)	poc1bl (ENSSDUG00000008312)	GALNT12 (ENSSDUG00000008275)	gabbr2 (ENSSDUG00000008215)	elp2 (ENSSDUG00000008064)	ctnnal1 (ENSSDUG00000008004)	abitram (ENSSDUG00000007970)	sla1a (ENSSDUG00000007948)
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2890	ENSSLDG00000010078	ENSSLDG00000010034	cyhr1 (ENSSLDG00000009992)	ENSSLDG00000009980	ENSSLDG00000009966	fabp3 (ENSSLDG00000009949)	zcchc17 (ENSSLDG00000009837)	snrnp40 (ENSSLDG00000009778)	nkain1 (ENSSLDG00000009742)	pum1 (ENSSLDG00000009667)	SDC3 (ENSSLDG00000009649)	matn1 (ENSSLDG00000009602)	sesn2 (ENSSLDG00000009540)	yrk (ENSSLDG00000009505) #20	AHDC1 (ENSSLDG00000009452) #21	wasf2 (ENSSLDG00000009424) #22	gpr3 (ENSSLDG00000009406)	sytl1 (ENSSLDG00000009367)	efcab1 (ENSSLDG00000009280)	rbm48 (ENSSLDG00000009209)	pex1 (ENSSLDG00000009178)	elmo1 (ENSSLDG00000009100)	rp9 (ENSSLDG00000009087)	si:dkey-184p18.2 (ENSSLDG00000009072)	poc1bl (ENSSLDG00000009037)	GALNT12 (ENSSLDG00000008995)	gabbr2 (ENSSLDG00000008904)	elp2 (ENSSLDG00000008775)	ctnnal1 (ENSSLDG00000008673)	abitram (ENSSLDG00000008634)	sla1a (ENSSLDG00000008598)
Barramundi perch	MODERN SPECIES	163	pdcd6ip (ENSLCAG00010008358)	ENSLCAG00010008314	cyhr1 (ENSLCAG00010008295)	ENSLCAG00010008219	fabp3 (ENSLCAG00010008193)	zcchc17 (ENSLCAG00010008172)	snrnp40 (ENSLCAG00010008123)	nkain1 (ENSLCAG00010008114)	pum1 (ENSLCAG00010008106)	ENSLCAG00010008092	ENSLCAG00010008089	matn1 (ENSLCAG00010008083)	sesn2 (ENSLCAG00010008057)	yrk (ENSLCAG00010008022) #20	AHDC1 (ENSLCAG00010007997) #21	wasf2 (ENSLCAG00010007987) #22	gpr3 (ENSLCAG00010007985)	ENSLCAG00010007981	sytl1 (ENSLCAG00010007948)	efcab1 (ENSLCAG00010007937)	rbm48 (ENSLCAG00010007933)	pex1 (ENSLCAG00010007927)	elmo1 (ENSLCAG00010007762)	rp9 (ENSLCAG00010007717)	si:dkey-184p18.2 (ENSLCAG00010007709)	poc1bl (ENSLCAG00010007691)	GALNT12 (ENSLCAG00010007667)	gabbr2 (ENSLCAG00010007616)	ENSLCAG00010007594	ctnnal1 (ENSLCAG00010007489)	abitram (ENSLCAG00010007378)
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000163083	ENSGT00940000155609.l	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000175655	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000159968	ENSGT00390000004541	ENSGT00550000075032	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000162490	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000163607	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000155783	ENSGT00390000000916	ENSGT01030000234543.F	ENSGT00450000040303	ENSGT00940000159104.c
Tongue sole	MODERN SPECIES	9	ubp1 (ENSCSEG00000016364)	pdcd6ip (ENSCSEG00000016266)	cyhr1 (ENSCSEG00000016245)	ENSCSEG00000016146	fabp3 (ENSCSEG00000016106)	zcchc17 (ENSCSEG00000016039)	snrnp40 (ENSCSEG00000016015)	nkain1 (ENSCSEG00000016008)	ENSCSEG00000016001	pum1 (ENSCSEG00000015981)	SDC3 (ENSCSEG00000015975)	matn1 (ENSCSEG00000015965)	sesn2 (ENSCSEG00000015952)	yrk (ENSCSEG00000015945) #20	AHDC1 (ENSCSEG00000015938) #21	wasf2 (ENSCSEG00000015926) #22	gpr3 (ENSCSEG00000015920)	sytl1 (ENSCSEG00000015907)	efcab1 (ENSCSEG00000015901)	rbm48 (ENSCSEG00000015892)	pex1 (ENSCSEG00000015819)	lrrc3b (ENSCSEG00000015803)	arih1 (ENSCSEG00000015797)	OXSM (ENSCSEG00000015793)	ngly1 (ENSCSEG00000015674)	top2b (ENSCSEG00000015595)	SACM1L (ENSCSEG00000015556)	ENSCSEG00000015541	ppp1r11 (ENSCSEG00000015537)	vars2 (ENSCSEG00000015432)	mgat1b (ENSCSEG00000015414)
Turbot	MODERN SPECIES	14	fkbp9 (ENSSMAG00000010666)	pdcd6ip (ENSSMAG00000010694)	ENSSMAG00000010735	cyhr1 (ENSSMAG00000010771)	ENSSMAG00000010800	fabp3 (ENSSMAG00000026107)	zcchc17 (ENSSMAG00000023280)	snrnp40 (ENSSMAG00000010857)	nkain1 (ENSSMAG00000010877)	pum1 (ENSSMAG00000010918)	SDC3 (ENSSMAG00000011055)	matn1 (ENSSMAG00000011096)	sesn2 (ENSSMAG00000011123)	yrk (ENSSMAG00000011159) #20	ENSSMAG00000011214	wasf2 (ENSSMAG00000011240) #22	gpr3 (ENSSMAG00000011252)	ENSSMAG00000011273	ENSSMAG00000011308	ENSSMAG00000011292	pex1 (ENSSMAG00000011321)	ENSSMAG00000027956	elmo1 (ENSSMAG00000012599)	rp9 (ENSSMAG00000012574)	si:dkey-184p18.2 (ENSSMAG00000012564)	poc1bl (ENSSMAG00000012533)	ENSSMAG00000012511	gabbr2 (ENSSMAG00000012423)	elp2 (ENSSMAG00000012337)	ENSSMAG00000012223	ENSSMAG00000012305
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000156148	ENSGT00940000163083	ENSGT00940000155609.l	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079	ENSGT01000000220517	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000177340	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000165470	ENSGT00940000154446.b.b.a	ENSGT01100000263491.a.a.c.b	ENSGT00940000159968	ENSGT00390000004541	ENSGT00550000075032	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000162490	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000163607	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000155783
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000163083	ENSGT00940000155609.l	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000165470	ENSGT00940000159968	ENSGT00390000004541	ENSGT00550000075032	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000162490	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000163607	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000155783	ENSGT00390000000916	ENSGT01030000234543.F	ENSGT00450000040303
Fugu	MODERN SPECIES	3	pdcd6ip (ENSTRUG00000013431)	ENSTRUG00000013414	cyhr1 (ENSTRUG00000013359)	ENSTRUG00000025961	fabp3 (ENSTRUG00000022364)	zcchc17 (ENSTRUG00000013252)	snrnp40 (ENSTRUG00000013161)	nkain1 (ENSTRUG00000013140)	pum1 (ENSTRUG00000013121)	SDC3 (ENSTRUG00000024296)	ENSTRUG00000032188	sesn2 (ENSTRUG00000012703)	yrk (ENSTRUG00000012570) #20	AHDC1 (ENSTRUG00000021782) #21	ENSTRUG00000021499	wasf2 (ENSTRUG00000012486) #22	gpr3 (ENSTRUG00000030758)	sytl1 (ENSTRUG00000012408)	ENSTRUG00000012350	rbm48 (ENSTRUG00000012275)	pex1 (ENSTRUG00000012156)	elmo1 (ENSTRUG00000011805)	rp9 (ENSTRUG00000011735)	si:dkey-184p18.2 (ENSTRUG00000022571)	poc1bl (ENSTRUG00000011585)	GALNT12 (ENSTRUG00000011499)	gabbr2 (ENSTRUG00000011256)	elp2 (ENSTRUG00000011088)	ctnnal1 (ENSTRUG00000010980)	abitram (ENSTRUG00000024581)	sla1a (ENSTRUG00000024852)
Tetraodon	MODERN SPECIES	15	clasp2 (ENSTNIG00000016973)	ubp1 (ENSTNIG00000016974)	pdcd6ip (ENSTNIG00000016975)	ENSTNIG00000016976	cyhr1 (ENSTNIG00000016977)	ENSTNIG00000016978	fabp3 (ENSTNIG00000016979)	zcchc17 (ENSTNIG00000016980)	snrnp40 (ENSTNIG00000016981)	nkain1 (ENSTNIG00000016982)	pum1 (ENSTNIG00000016983)	SDC3 (ENSTNIG00000016984)	matn1 (ENSTNIG00000016985)	yrk (ENSTNIG00000016986) #20	ENSTNIG00000016987 #21	wasf2 (ENSTNIG00000016988) #22	sytl1 (ENSTNIG00000016989)	efcab1 (ENSTNIG00000016990)	rbm48 (ENSTNIG00000016991)	pex1 (ENSTNIG00000016992)	elmo1 (ENSTNIG00000016993)	rp9 (ENSTNIG00000016994)	poc1bl (ENSTNIG00000016995)	ENSTNIG00000016996	poc1bl (ENSTNIG00000016997)	gabbr2 (ENSTNIG00000016998)	ENSTNIG00000000328	elp2 (ENSTNIG00000003144)	ctnnal1 (ENSTNIG00000003145)	abitram (ENSTNIG00000019799)	sla1a (ENSTNIG00000000633)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000156148	ENSGT00940000163083	ENSGT00940000155609.l	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079	ENSGT01000000220517	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000177340	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000165470	ENSGT00940000154446.b.b.a	ENSGT01100000263491.a.a.c.b	ENSGT00940000159968	ENSGT00390000004541	ENSGT00550000075032	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000162490	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000163607	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000155783
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	42	pdcd6ip (ENSLBEG00000002824)	ENSLBEG00000002779	cyhr1 (ENSLBEG00000002750)	ENSLBEG00000002697	fabp3 (ENSLBEG00000002665)	zcchc17 (ENSLBEG00000002644)	snrnp40 (ENSLBEG00000002611)	nkain1 (ENSLBEG00000002584)	pum1 (ENSLBEG00000002527)	SDC3 (ENSLBEG00000002508)	ENSLBEG00000002497	matn1 (ENSLBEG00000002480)	sesn2 (ENSLBEG00000002464)	yrk (ENSLBEG00000002440) #20	AHDC1 (ENSLBEG00000002387) #21	wasf2 (ENSLBEG00000002344) #22	gpr3 (ENSLBEG00000002311)	ENSLBEG00000002304	sytl1 (ENSLBEG00000001503)	efcab1 (ENSLBEG00000001376)	rbm48 (ENSLBEG00000001370)	pex1 (ENSLBEG00000001358)	elmo1 (ENSLBEG00000001249)	rp9 (ENSLBEG00000001181)	poc1bl (ENSLBEG00000001092)	GALNT12 (ENSLBEG00000001029)	gabbr2 (ENSLBEG00000000938)	elp2 (ENSLBEG00000000916)	ctnnal1 (ENSLBEG00000000862)	abitram (ENSLBEG00000000835)	sla1a (ENSLBEG00000000824)
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000156148	ENSGT00940000163083	ENSGT00940000155609.l	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079	ENSGT01000000220517	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000160932	ENSGT01100000263491.a.a.c.b	ENSGT00940000159968	ENSGT00390000004541	ENSGT00550000075032	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000162490	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000163607	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000155783	ENSGT00390000000916	ENSGT01030000234543.F	ENSGT00450000040303
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000155574.C	ENSGT00940000156148	ENSGT00940000163083	ENSGT00940000155609.l	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000160932	ENSGT01100000263491.a.a.c.b	ENSGT00940000159968	ENSGT00390000004541	ENSGT00550000075032	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000162490	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000163607	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000155783	ENSGT00390000000916	ENSGT01030000234543.F	ENSGT00450000040303
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000155574.C	ENSGT00940000156148	ENSGT00940000163083	ENSGT00940000155609.l	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000160932	ENSGT01100000263491.a.a.c.b	ENSGT00940000159968	ENSGT00390000004541	ENSGT00550000075032	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000162490	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000163607	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000155783	ENSGT00390000000916	ENSGT01030000234543.F	ENSGT00450000040303
European seabass	MODERN SPECIES	22	pdcd6ip (ENSDLAG00005008436)	ENSDLAG00005008391	cyhr1 (ENSDLAG00005034723)	ENSDLAG00005008192	fabp3 (ENSDLAG00005008171)	zcchc17 (ENSDLAG00005030970)	snrnp40 (ENSDLAG00005007940)	nkain1 (ENSDLAG00005007922)	pum1 (ENSDLAG00005023846)	SDC3 (ENSDLAG00005023804)	ENSDLAG00005028332	matn1 (ENSDLAG00005023798)	yrk (ENSDLAG00005023223) #20	AHDC1 (ENSDLAG00005029529) #21	gpr3 (ENSDLAG00005027580)	wasf2 (ENSDLAG00005029787) #22	ENSDLAG00005023161	ENSDLAG00005033799	ENSDLAG00005023130	ENSDLAG00005023123	pex1 (ENSDLAG00005022992)	elmo1 (ENSDLAG00005022494)	si:dkey-184p18.2 (ENSDLAG00005022461)	poc1bl (ENSDLAG00005022406)	ENSDLAG00005022361	gabbr2 (ENSDLAG00005022337)	elp2 (ENSDLAG00005022305)	ENSDLAG00005026480	ENSDLAG00005022098	sla1a (ENSDLAG00005022077)	ENSDLAG00005022071
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	484	ENSLCRG00005010047	cyhr1 (ENSLCRG00005010045)	ENSLCRG00005009725	fabp3 (ENSLCRG00005009677)	zcchc17 (ENSLCRG00005009638)	snrnp40 (ENSLCRG00005009485)	nkain1 (ENSLCRG00005009472)	pum1 (ENSLCRG00005008849)	SDC3 (ENSLCRG00005008773)	ENSLCRG00005008754	matn1 (ENSLCRG00005008752)	sesn2 (ENSLCRG00005008731)	yrk (ENSLCRG00005007845) #20	ENSLCRG00005007783	ENSLCRG00005007780	wasf2 (ENSLCRG00005007773) #22	gpr3 (ENSLCRG00005007770)	sytl1 (ENSLCRG00005007769)	efcab1 (ENSLCRG00005007765)	rbm48 (ENSLCRG00005007757)	pex1 (ENSLCRG00005006972)	elmo1 (ENSLCRG00005005097)	rp9 (ENSLCRG00005004959)	si:dkey-184p18.2 (ENSLCRG00005004946)	poc1bl (ENSLCRG00005004871)	ENSLCRG00005004712	gabbr2 (ENSLCRG00005004514)	elp2 (ENSLCRG00005004051)	ctnnal1 (ENSLCRG00005003761)	abitram (ENSLCRG00005003736)	sla1a (ENSLCRG00005003734)
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Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079	ENSGT01000000220517	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00390000002881	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000154446.b.b.a	ENSGT01100000263491.a.a.c.b	ENSGT00940000159968	ENSGT00390000004541	ENSGT00550000075032	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000162490	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000163607	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000155783	ENSGT00390000000916	ENSGT01030000234543.F
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000155609.l	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00390000002881	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000159968	ENSGT00390000004541	ENSGT00550000075032	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000162490	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000163607	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000155783	ENSGT00390000000916	ENSGT01030000234543.F	ENSGT00450000040303	ENSGT00940000159104.c
Pike perch	MODERN SPECIES	41	ENSSLUG00000024666	cyhr1 (ENSSLUG00000024661)	ENSSLUG00000024658	fabp3 (ENSSLUG00000024657)	zcchc17 (ENSSLUG00000024651)	snrnp40 (ENSSLUG00000024638)	nkain1 (ENSSLUG00000024629)	pum1 (ENSSLUG00000023878)	SDC3 (ENSSLUG00000023728)	ENSSLUG00000023723	matn1 (ENSSLUG00000023718)	sesn2 (ENSSLUG00000023699)	yrk (ENSSLUG00000023653) #20	AHDC1 (ENSSLUG00000023634) #21	ENSSLUG00000023625	wasf2 (ENSSLUG00000023621) #22	gpr3 (ENSSLUG00000023613)	sytl1 (ENSSLUG00000023604)	efcab1 (ENSSLUG00000023599)	rbm48 (ENSSLUG00000023594)	pex1 (ENSSLUG00000023579)	elmo1 (ENSSLUG00000022222)	rp9 (ENSSLUG00000022125)	si:dkey-184p18.2 (ENSSLUG00000022121)	poc1bl (ENSSLUG00000022093)	GALNT12 (ENSSLUG00000022070)	gabbr2 (ENSSLUG00000022014)	elp2 (ENSSLUG00000021982)	ctnnal1 (ENSSLUG00000021939)	abitram (ENSSLUG00000021932)	sla1a (ENSSLUG00000021928)
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Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000163083	ENSGT00940000155609.l	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079	ENSGT01000000220517	ENSGT00940000160209	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000160932	ENSGT01100000263491.a.a.c.b	ENSGT00940000159968	ENSGT00390000004541	ENSGT00550000075032	ENSGT00940000155994	ENSGT00940000162490	ENSGT00390000013383	ENSGT00940000163607	ENSGT00940000157173	ENSGT00940000155783	ENSGT00390000000916	ENSGT01030000234543.F	ENSGT00450000040303
Stickleback	MODERN SPECIES	9	ENSGACG00000005581	ENSGACG00000005588	cyhr1 (ENSGACG00000005591)	ENSGACG00000005594	fabp3 (ENSGACG00000005599)	zcchc17 (ENSGACG00000005616)	snrnp40 (ENSGACG00000005655)	nkain1 (ENSGACG00000005700)	pum1 (ENSGACG00000005717)	ENSGACG00000005736	ENSGACG00000005739	matn1 (ENSGACG00000005741)	sesn2 (ENSGACG00000005748)	yrk (ENSGACG00000005767) #20	ENSGACG00000005776	wasf2 (ENSGACG00000005777) #22	gpr3 (ENSGACG00000005789)	sytl1 (ENSGACG00000005790)	efcab1 (ENSGACG00000005798)	rbm48 (ENSGACG00000005801)	pex1 (ENSGACG00000005816)	elmo1 (ENSGACG00000005835)	rp9 (ENSGACG00000005861)	si:dkey-184p18.2 (ENSGACG00000005866)	ENSGACG00000005872	poc1bl (ENSGACG00000005874)	GALNT12 (ENSGACG00000005879)	ENSGACG00000005894	gabbr2 (ENSGACG00000005895)	elp2 (ENSGACG00000005913)	ctnnal1 (ENSGACG00000005928)
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Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	86									elmo1 (ENSHCOG00000018083)	ENSHCOG00000018112	efcab1 (ENSHCOG00000018127)	sesn2 (ENSHCOG00000018142)	ENSHCOG00000018162 #20	yrk (ENSHCOG00000018194) #20	AHDC1 (ENSHCOG00000018204) #21	wasf2 (ENSHCOG00000018215) #22	gpr3 (ENSHCOG00000018219)	sytl1 (ENSHCOG00000018229)	nasp (ENSHCOG00000018251)	ENSHCOG00000018278
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	2	pdcd6ip (ENSMMDG00005023041)	ENSMMDG00005023046	cyhr1 (ENSMMDG00005023048)	ENSMMDG00005023051	fabp3 (ENSMMDG00005023052)	zcchc17 (ENSMMDG00005023054)	snrnp40 (ENSMMDG00005023056)	nkain1 (ENSMMDG00005023060)	pum1 (ENSMMDG00005023136)	SDC3 (ENSMMDG00005024225)	ENSMMDG00005024227	matn1 (ENSMMDG00005024230)	sesn2 (ENSMMDG00005024231)	yrk (ENSMMDG00005024234) #20	AHDC1 (ENSMMDG00005024241) #21	wasf2 (ENSMMDG00005024242) #22	gpr3 (ENSMMDG00005024243)	sytl1 (ENSMMDG00005024244)	ENSMMDG00005024247	efcab1 (ENSMMDG00005024248)	rbm48 (ENSMMDG00005024251)	pex1 (ENSMMDG00005024261)	elmo1 (ENSMMDG00005024321)	rp9 (ENSMMDG00005024394)	si:dkey-184p18.2 (ENSMMDG00005024396)	ENSMMDG00005024398	poc1bl (ENSMMDG00005024402)	GALNT12 (ENSMMDG00005024406)	gabbr2 (ENSMMDG00005024407)	elp2 (ENSMMDG00005024409)	ctnnal1 (ENSMMDG00005024410)
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000018258	ENSGT00950000182824.a.b.b.d	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079	ENSGT01000000220517	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000177340	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000163923	ENSGT00940000164843.b	ENSGT00940000155697.B	ENSGT00390000003571.g	ENSGT00940000159099	ENSGT00390000012495	ENSGT00390000016277.a.l	ENSGT00940000155365.a.b	ENSGT00390000007888	ENSGT00390000001663	ENSGT00940000155909.o.b	ENSGT00940000154766.a.a
Salmoninae	DUPLICATION
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Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00390000018258.o.a	ENSGT00950000182824.a.b.b.d.f	ENSGT00940000159476.l	ENSGT00940000155104.h	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058.s	ENSGT00940000159949.b	ENSGT00940000158079.c	ENSGT00940000160209.d.b	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000159638.c.a	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554.cb.b #20	ENSGT00390000018883.f #21	ENSGT00390000002881.gc	ENSGT00950000182962.b.a.c #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a.d	ENSGT00940000160932.c.a	ENSGT00940000163923	ENSGT00940000164843.b.f	ENSGT00940000155697.B.h	ENSGT00390000003571.g.e	ENSGT00940000159099.l.a	ENSGT00390000012495	ENSGT00390000016277.a.l.a.b	ENSGT00940000155365.a.b	ENSGT00390000007888.g	ENSGT00940000155909.o.b.c	ENSGT00940000154766.a.a.lb	ENSGT00940000156424.b.c.b	ENSGT00940000157811.b.b.g
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Chinook salmon	MODERN SPECIES	4	cyhr1 (ENSOTSG00005009166)	ENSOTSG00005009167	ENSOTSG00005009168	ENSOTSG00005009169	zcchc17 (ENSOTSG00005009170)	snrnp40 (ENSOTSG00005019033)	nkain1 (ENSOTSG00005019048)	pum1 (ENSOTSG00005019083)	ENSOTSG00005027004	ENSOTSG00005027008	matn1 (ENSOTSG00005027010)	sesn2 (ENSOTSG00005027011)	ENSOTSG00005027013	AHDC1 (ENSOTSG00005027015) #21	ENSOTSG00005027016	wasf2 (ENSOTSG00005027018) #22	gpr3 (ENSOTSG00005027019)	sytl1 (ENSOTSG00005027029)	zgc:103438 (ENSOTSG00005027032)	ENSOTSG00005027036	ENSOTSG00005027042	ENSOTSG00005027043	TRIM71 (ENSOTSG00005027051)	ENSOTSG00005027070	ENSOTSG00005027071	ENSOTSG00005027073	ENSOTSG00005027074	ENSOTSG00005027075	rpl14 (ENSOTSG00005027076)	grb10a (ENSOTSG00005027080)	trioa (ENSOTSG00005027085)
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Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000153814.a.e	ENSGT00390000009163.i.b	ENSGT00940000153845.a.b.b	ENSGT00940000155574.C.m.b	ENSGT00940000156148.c.b	ENSGT00940000163083.k.a.a	ENSGT00940000163083.k.b	ENSGT00390000018258.o.b	ENSGT00940000155104.g	ENSGT00940000155058.t	ENSGT00940000159949.a	ENSGT00940000158079.d	ENSGT00940000160209.d.a	ENSGT00940000157554.cb.a #20	ENSGT00390000018883.e #21	ENSGT00950000182962.b.a.d #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a.c	ENSGT00940000160932.c.b	ENSGT00390000003571.g.f	ENSGT00940000159099.l.b	ENSGT00390000016277.a.l.b	ENSGT00390000007888.h	ENSGT00940000156213.q.b.a	ENSGT00530000063698.b.k.b	ENSGT00940000157833.h.a.c.a	ENSGT00940000155019.a.a.c.b	ENSGT01000000214440.A.a.b.a.g.b.a.c #16	ENSGT00940000156139.c.b	ENSGT00940000155579.b.b	ENSGT00390000001153.lb	ENSGT00530000063632.B.a.f
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000159342.a.e	ENSGT00940000157125.e	ENSGT00940000153814.a.e	ENSGT00940000153845.a.b.b	ENSGT00940000155574.C.m.b	ENSGT00940000156148.c.b	ENSGT00940000163083.k.b	ENSGT00390000018258.o.b	ENSGT00950000182824.a.b.b.d.e	ENSGT00940000155104.g	ENSGT00940000155058.t	ENSGT00940000159949.a	ENSGT00940000158079.d	ENSGT00940000160209.d.a	ENSGT00940000157554.cb.a #20	ENSGT00950000182962.b.a.d #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a.c	ENSGT00940000160932.c.b	ENSGT00390000003571.g.f	ENSGT00940000159099.l.b	ENSGT00390000016277.a.l.b	ENSGT00390000007888.h	ENSGT00940000156213.q.a.a.a.a	ENSGT00530000063698.b.k.b	ENSGT00940000157833.h.a.c.a	ENSGT00940000155019.a.a.c.a.a	ENSGT01000000214440.A.a.b.a.g.b.a.c #16	ENSGT00940000156139.c.b	ENSGT00940000155579.b.b	ENSGT00390000001153.lb	ENSGT00530000063632.B.a.f
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	5	fbxl2 (ENSSSAG00000081026)	ENSSSAG00000094283	clasp2 (ENSSSAG00000080762)	ENSSSAG00000086880	ubp1 (ENSSSAG00000080525)	pdcd6ip (ENSSSAG00000054882)	cyhr1 (ENSSSAG00000054923)	ENSSSAG00000053914	FABPH (ENSSSAG00000054088)	snrnp40 (ENSSSAG00000080354)	nkain1 (ENSSSAG00000054108)	pum1 (ENSSSAG00000082549)	SDC3 (ENSSSAG00000107734)	ENSSSAG00000091499	FGR (ENSSSAG00000118016) #20	ENSSSAG00000054933 #22	GPR3 (ENSSSAG00000078324)	ENSSSAG00000102061	ENSSSAG00000042781	ENSSSAG00000042788	ENSSSAG00000085335	ENSSSAG00000113631	ENSSSAG00000042831	ENSSSAG00000109031	srsf4 (ENSSSAG00000109482)	ENSSSAG00000108316	EPB41 (ENSSSAG00000039495)	ccn2b (ENSSSAG00000110341)	TSAP1 (ENSSSAG00000044363)	ENSSSAG00000071496	ppp1r11 (ENSSSAG00000107802)
River trout	MODERN SPECIES	345																ENSSTUG00000042237 #22	sytl1 (ENSSTUG00000042203)	ENSSTUG00000042158
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000153814.a.e	ENSGT00390000009163.i.b	ENSGT00940000153845.a.b.b	ENSGT00940000155574.C.m.b	ENSGT00940000156148.c.b	ENSGT00940000163083.k.a.a	ENSGT00390000018258.o.b	ENSGT00940000159476.k	ENSGT00940000155104.g	ENSGT00940000155058.t	ENSGT00940000159949.a	ENSGT00940000158079.d	ENSGT00940000160209.d.a	ENSGT00940000157554.cb.a #20	ENSGT00390000018883.e #21	ENSGT00950000182962.b.a.d #22	ENSGT00940000160932.c.b	ENSGT00390000003571.g.f	ENSGT00940000159099.l.b	ENSGT00390000016277.a.l.b	ENSGT00390000007888.h	ENSGT00940000156213.q.b.a	ENSGT00530000063698.b.k.b	ENSGT00940000157833.h.a.c.a	ENSGT00940000155019.a.a.c.b	ENSGT01000000214440.A.a.b.a.g.b.a.c #16	ENSGT00940000156139.c.b	ENSGT00940000155579.b.b	ENSGT00970000193610.e	ENSGT00390000001153.lb	ENSGT00530000063632.B.a.f
Rainbow trout	MODERN SPECIES	24	ENSOMYG00000048555	clasp2 (ENSOMYG00000074294)	ubp1 (ENSOMYG00000077660)	pdcd6ip (ENSOMYG00000006025)	cyhr1 (ENSOMYG00000005872)	fabp3 (ENSOMYG00000005893)	snrnp40 (ENSOMYG00000005806)	nkain1 (ENSOMYG00000005739)	ENSOMYG00000074165	ENSOMYG00000069130	pum1 (ENSOMYG00000074731)	SDC3 (ENSOMYG00000061113)	ENSOMYG00000064715	yrk (ENSOMYG00000064825) #20	ENSOMYG00000005608 #21	wasf2 (ENSOMYG00000074056) #22	ENSOMYG00000072438	ENSOMYG00000059604	cck-t (ENSOMYG00000005443)	ENSOMYG00000056050	ENSOMYG00000050303	ENSOMYG00000068205	ENSOMYG00000064238	ENSOMYG00000005110	srsf4 (ENSOMYG00000051923)	ENSOMYG00000004983	ENSOMYG00000004914	ccn2b (ENSOMYG00000071790)	stx12 (ENSOMYG00000004887) #16	trnau1apa (ENSOMYG00000004869)	ENSOMYG00000004711
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000153814.a.e	ENSGT00390000009163.i.b	ENSGT00940000153845.a.b.b	ENSGT00940000155574.C.m.b	ENSGT00940000156148.c.b	ENSGT00940000163083.k.a.a	ENSGT00390000018258.o.b	ENSGT00940000159476.k	ENSGT00940000155104.g	ENSGT00940000155058.t	ENSGT00940000159949.a	ENSGT00940000158079.d	ENSGT00940000160209.d.a	ENSGT00940000157554.cb.a #20	ENSGT00390000018883.e #21	ENSGT00950000182962.b.a.d #22	ENSGT00940000160932.c.b	ENSGT00940000159099.l.b	ENSGT00390000016277.a.l.b	ENSGT00390000007888.h	ENSGT00940000156213.q.a.b	ENSGT00940000158275.cb	ENSGT00530000063698.b.k.b	ENSGT00940000157833.h.a.c.a	ENSGT00940000155019.a.a.c.b	ENSGT01000000214440.A.a.b.a.g.b.a.c #16	ENSGT00940000156139.c.b	ENSGT00940000155579.b.b	ENSGT00970000193610.e	ENSGT00390000001153.lb	ENSGT00530000063632.B.a.f
Chinook salmon	MODERN SPECIES	293																ENSOTSG00005028869 #22	ENSOTSG00005028867	TRIM71 (ENSOTSG00005028864)	ABHD5 (ENSOTSG00005028861)	ENSOTSG00005028833
Coho salmon	MODERN SPECIES	5	ENSOKIG00005024079	fbxl2 (ENSOKIG00005024103)	clasp2 (ENSOKIG00005024353)	ubp1 (ENSOKIG00005027216)	pdcd6ip (ENSOKIG00005027371)	cyhr1 (ENSOKIG00005027586)	ENSOKIG00005027609	ENSOKIG00005027634	fabp3 (ENSOKIG00005027664)	snrnp40 (ENSOKIG00005027686)	nkain1 (ENSOKIG00005027849)	pum1 (ENSOKIG00005027892)	SDC3 (ENSOKIG00005028114)	yrk (ENSOKIG00005028174) #20	ENSOKIG00005029681 #21	wasf2 (ENSOKIG00005029684) #22	ENSOKIG00005029691	ENSOKIG00005029733	ENSOKIG00005029738	TRIM71 (ENSOKIG00005029766)	ABHD5 (ENSOKIG00005029874)	rpl14 (ENSOKIG00005029882)	ENSOKIG00005029901	ENSOKIG00005029886	ENSOKIG00005029911	ENSOKIG00005029952	ccn2b (ENSOKIG00005030032)	stx12 (ENSOKIG00005030057) #16	trnau1apa (ENSOKIG00005030103)	sacm1la (ENSOKIG00005030305)	ppp1r11 (ENSOKIG00005031308)
Huchen	MODERN SPECIES	8837																wasf2 (ENSHHUG00000000287) #22	gpr3 (ENSHHUG00000000300)
Northern pike	MODERN SPECIES	9	ENSELUG00000002532	cyhr1 (ENSELUG00000002515)	ARHGAP4 (ENSELUG00000002498)	ENSELUG00000002476	fabp3 (ENSELUG00000030686)	zcchc17 (ENSELUG00000002450)	snrnp40 (ENSELUG00000002438)	nkain1 (ENSELUG00000002423)	pum1 (ENSELUG00000002409)	SDC3 (ENSELUG00000002387)	ENSELUG00000002382	matn1 (ENSELUG00000002380)	sesn2 (ENSELUG00000002374)	yrk (ENSELUG00000002361) #20	ENSELUG00000002344	wasf2 (ENSELUG00000002334) #22	gpr3 (ENSELUG00000002328)	ENSELUG00000002319	zgc:103438 (ENSELUG00000002304)	ENSELUG00000002298	ENSELUG00000002286	ENSELUG00000032915	trim71 (ENSELUG00000024622)	ENSELUG00000024619	ENSELUG00000034568	ENSELUG00000024544	rpl14 (ENSELUG00000024535)	ENSELUG00000024476	grb10a (ENSELUG00000024451)	trioa (ENSELUG00000024397)	CFAP90 (ENSELUG00000031507)
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160796	ENSGT00390000018258	ENSGT00940000159476	ENSGT00940000155104	ENSGT00510000047363	ENSGT00940000155058	ENSGT00940000159949	ENSGT00940000158079	ENSGT00940000160209	ENSGT00650000093445	ENSGT00940000175786	ENSGT00940000159638	ENSGT00950000183168.B.a	ENSGT00940000157554 #20	ENSGT00390000018883 #21	ENSGT00950000182962.b.a #22	ENSGT01060000248564.b.a.a.a	ENSGT00940000177340	ENSGT00940000160073 #17	ENSGT00940000156529	ENSGT00940000156072.b	ENSGT00940000160932	ENSGT00940000163923	ENSGT00940000164843.b	ENSGT00940000162649	ENSGT00940000163960.a	ENSGT00390000010887.b	ENSGT00940000157740	ENSGT00940000154798.b	ENSGT00530000063426.b.a	ENSGT00940000164552
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	15	cyhr1 (ENSSFOG00015031227)	DCLK3 (ENSSFOG00015024444)	fabp3 (ENSSFOG00015021320)	zcchc17 (ENSSFOG00015021334)	snrnp40 (ENSSFOG00015021344)	nkain1 (ENSSFOG00015021363)	pum1 (ENSSFOG00015021412)	SDC3 (ENSSFOG00015026152)	ENSSFOG00015026177	ENSSFOG00015021457	matn1 (ENSSFOG00015021478)	sesn2 (ENSSFOG00015021495)	yrk (ENSSFOG00015021516) #20	AHDC1 (ENSSFOG00015021553) #21	ENSSFOG00015021560	wasf2 (ENSSFOG00015021571) #22	gpr3 (ENSSFOG00015029053)	ENSSFOG00015021585	FAM76A (ENSSFOG00015021597) #17	ENSSFOG00015021606	sytl1 (ENSSFOG00015021628)	zgc:103438 (ENSSFOG00015021650)	ENSSFOG00015021660	ENSSFOG00015021674	ENSSFOG00015021693	ENSSFOG00015021711	ENSSFOG00015021769	zgc:114119 (ENSSFOG00015021849)	ENSSFOG00015021854	ENSSFOG00015021896	ENSSFOG00015021910
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Spotted gar	MODERN SPECIES	672	zmpste24 (ENSLOCG00000004363)	ENSLOCG00000004377	rpl13a (ENSLOCG00000004388)	hnrnpr (ENSLOCG00000004400)	ENSLOCG00000018281	LUZP1 (ENSLOCG00000004433)	kdm1a (ENSLOCG00000004475)	tmem30b (ENSLOCG00000004514)	dnajc8 (ENSLOCG00000004544)	PTAFR (ENSLOCG00000018282)	ENSLOCG00000004573	pacrg (ENSLOCG00000004588)	qkia (ENSLOCG00000004615)	AHDC1 (ENSLOCG00000004640) #21	ENSLOCG00000004653	wasf2 (ENSLOCG00000004668) #22	gpr3 (ENSLOCG00000018283)	CD164L2 (ENSLOCG00000004699)	FAM76A (ENSLOCG00000004719) #17	ENSLOCG00000004733	SLC30A2 (ENSLOCG00000004764)	sytl1 (ENSLOCG00000004774)	zgc:110239 (ENSLOCG00000004812)	ENSLOCG00000004843	ENSLOCG00000004864	ENSLOCG00000004880	ENSLOCG00000004899	ENSLOCG00000004913	zgc:114119 (ENSLOCG00000004930)	ENSLOCG00000004946	ENSLOCG00000004978
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