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Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000159397	ENSGT00390000013264.d #7	ENSGT00390000010172 #8	ENSGT00390000003428 #9	ENSGT00440000033811 #11	ENSGT00940000165267 #12	ENSGT01030000238073 #10	ENSGT00940000159453 #14	ENSGT00940000158640 #15	ENSGT00940000162193 #16	ENSGT00510000048726 #17	ENSGT00940000160654 #18	ENSGT00940000157580 #19	ENSGT00390000005261 #20	ENSGT00500000044920 #21	ENSGT00940000156710 #22	ENSGT00940000155626 #23	ENSGT00940000156021 #24	ENSGT00940000156043	ENSGT00390000003601.b #25	ENSGT00940000158757 #26	ENSGT00940000162578	ENSGT00390000011192 #28	ENSGT00940000158643 #29	ENSGT00940000153284.b #30	ENSGT00390000013532.j #31	ENSGT00390000013532.i ##31	ENSGT00390000008110 #32	ENSGT00940000156935 #33	ENSGT00510000048509 #34	ENSGT00530000063690.a.b.a.b #35
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Guinea pig	MODERN SPECIES	24	ENSCPOG00000000220	SRP72 (ENSCPOG00000000218) #7	ENSCPOG00000010749 #8	PPAT (ENSCPOG00000000216) #9	AASDH (ENSCPOG00000000215) #11	ENSCPOG00000040605 #12	ENSCPOG00000000214 #10	CEP135 (ENSCPOG00000003212) #14	EXOC1 (ENSCPOG00000003208) #15	EXOC1L (ENSCPOG00000040720) #16	NMU (ENSCPOG00000009016) #17	PDCL2 (ENSCPOG00000036525) #18	CLOCK (ENSCPOG00000011807) #19	TMEM165 (ENSCPOG00000011803) #20	SRD5A3 (ENSCPOG00000011801) #21	KDR (ENSCPOG00000010001) #22	KIT (ENSCPOG00000011411) #23	PDGFRA (ENSCPOG00000011782) #24	GSX2 (ENSCPOG00000005837)	CHIC2 (ENSCPOG00000040036) #25	LNX1 (ENSCPOG00000010775) #26	ENSCPOG00000010770	SCFD2 (ENSCPOG00000039431) #28	RASL11B (ENSCPOG00000010760) #29	USP46 (ENSCPOG00000007660) #30	ENSCPOG00000011469 #31	SGCB (ENSCPOG00000030752) #32	DCUN1D4 (ENSCPOG00000008945) #33	CWH43 (ENSCPOG00000014177) #34	ENSCPOG00000019887 #35	OCIAD1 (ENSCPOG00000011863) #36
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Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	2	ENSUPAG00010021417	ENSUPAG00010021399 #8	ENSUPAG00010021395	ENSUPAG00010021392	PPAT (ENSUPAG00010021383) #9	AASDH (ENSUPAG00010021378) #11	CRACD (ENSUPAG00010021307)	ENSUPAG00010021057 #14	EXOC1 (ENSUPAG00010020914) #15	EXOC1L (ENSUPAG00010020900) #16	NMU (ENSUPAG00010020889) #17	PDCL2 (ENSUPAG00010020882) #18	CLOCK (ENSUPAG00010020844) #19	TMEM165 (ENSUPAG00010020837) #20	SRD5A3 (ENSUPAG00010020831) #21	KDR (ENSUPAG00010020785) #22	KIT (ENSUPAG00010020754) #23	PDGFRA (ENSUPAG00010020707) #24	GSX2 (ENSUPAG00010020700)	CHIC2 (ENSUPAG00010020698) #25	LNX1 (ENSUPAG00010020578) #26	ENSUPAG00010020429 #27	SCFD2 (ENSUPAG00010020412) #28	RASL11B (ENSUPAG00010020408) #29	USP46 (ENSUPAG00010020388) #30	ENSUPAG00010020376 #31	ENSUPAG00010020374 ##31	SGCB (ENSUPAG00010020369) #32	LRRC66 (ENSUPAG00010020366)	DCUN1D4 (ENSUPAG00010020336) #33	CWH43 (ENSUPAG00010020291) #34
Squirrel	MODERN SPECIES	82	SRP72 (ENSSTOG00000007305) #7	PAICS (ENSSTOG00000007284) #8	PPAT (ENSSTOG00000007261) #9	AASDH (ENSSTOG00000007226) #11	ENSSTOG00000028370 #12	ENSSTOG00000032240 #10	CEP135 (ENSSTOG00000000223) #14	EXOC1 (ENSSTOG00000023883) #15	EXOC1L (ENSSTOG00000010455) #16	ENSSTOG00000033766	NMU (ENSSTOG00000006143) #17	PDCL2 (ENSSTOG00000006124) #18	CLOCK (ENSSTOG00000016179) #19	TMEM165 (ENSSTOG00000025897) #20	SRD5A3 (ENSSTOG00000016177) #21	KDR (ENSSTOG00000016171) #22	KIT (ENSSTOG00000000752) #23	PDGFRA (ENSSTOG00000011314) #24	GSX2 (ENSSTOG00000023286)	CHIC2 (ENSSTOG00000023668) #25	LNX1 (ENSSTOG00000012178) #26	ENSSTOG00000012166 #27	SCFD2 (ENSSTOG00000012162) #28	RASL11B (ENSSTOG00000027610) #29	ENSSTOG00000033365	USP46 (ENSSTOG00000012149) #30	ENSSTOG00000004581 #31	ENSSTOG00000032283 ##31	SGCB (ENSSTOG00000004569) #32	LRRC66 (ENSSTOG00000022844)	DCUN1D4 (ENSSTOG00000013799) #33
Alpin marmot	MODERN SPECIES	9	ARL9 (ENSMMMG00000021256)	SRP72 (ENSMMMG00000021224) #7	PAICS (ENSMMMG00000021214) #8	ENSMMMG00000021211	ENSMMMG00000021205 #9	AASDH (ENSMMMG00000021120) #11	CRACD (ENSMMMG00000020998)	ENSMMMG00000020762 #14	EXOC1 (ENSMMMG00000020709) #15	EXOC1L (ENSMMMG00000020698) #16	NMU (ENSMMMG00000020691) #17	PDCL2 (ENSMMMG00000020666) #18	CLOCK (ENSMMMG00000020601) #19	TMEM165 (ENSMMMG00000020591) #20	SRD5A3 (ENSMMMG00000020584) #21	KDR (ENSMMMG00000020555) #22	KIT (ENSMMMG00000020518) #23	PDGFRA (ENSMMMG00000020466) #24	GSX2 (ENSMMMG00000020460)	CHIC2 (ENSMMMG00000020457) #25	LNX1 (ENSMMMG00000020305) #26	ENSMMMG00000020140	SCFD2 (ENSMMMG00000020102) #28	RASL11B (ENSMMMG00000020096) #29	ENSMMMG00000020094	ENSMMMG00000020086	USP46 (ENSMMMG00000020069) #30	ENSMMMG00000020060 #31	ENSMMMG00000020059 ##31	SGCB (ENSMMMG00000020055) #32	LRRC66 (ENSMMMG00000020043)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	18	ARL9 (ENSSVLG00005019282)	SRP72 (ENSSVLG00005019460) #7	ENSSVLG00005019565 #8	PPAT (ENSSVLG00005019646) #9	ENSSVLG00005019738	AASDH (ENSSVLG00005019805) #11	CRACD (ENSSVLG00005020021)	ENSSVLG00005020514 #14	ENSSVLG00005020590 #15	EXOC1L (ENSSVLG00005020891) #16	NMU (ENSSVLG00005020969) #17	PDCL2 (ENSSVLG00005021329) #18	CLOCK (ENSSVLG00005021388) #19	TMEM165 (ENSSVLG00005021425) #20	SRD5A3 (ENSSVLG00005021472) #21	KDR (ENSSVLG00005021516) #22	KIT (ENSSVLG00005021747) #23	PDGFRA (ENSSVLG00005022004) #24	GSX2 (ENSSVLG00005022055)	CHIC2 (ENSSVLG00005022117) #25	ENSSVLG00005022179	LNX1 (ENSSVLG00005022254) #26	FIP1L1 (ENSSVLG00005022448)	SCFD2 (ENSSVLG00005022776) #28	RASL11B (ENSSVLG00005022855) #29	ENSSVLG00005022878	USP46 (ENSSVLG00005022950) #30	SPATA18 (ENSSVLG00005023119) #31	SGCB (ENSSVLG00005023300) #32	LRRC66 (ENSSVLG00005023343)	ENSSVLG00005023431 #33