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lemur MODERN SPECIES 24 SAMSN1 (ENSMICG00000016350) HSPA13 (ENSMICG00000027708) ENSMICG00000032352 RBM11 (ENSMICG00000037489) LIPI (ENSMICG00000004142) ROBO2 (ENSMICG00000010408) ROBO1 (ENSMICG00000005222) GBE1 (ENSMICG00000006182) CADM2 (ENSMICG00000014503) VGLL3 (ENSMICG00000043885) #16 ENSMICG00000037728 ##17 POU1F1 (ENSMICG00000009690) #18 HTR1F (ENSMICG00000043065) #19 CGGBP1 (ENSMICG00000047167) #20 ZNF654 (ENSMICG00000031713) #21 C3orf38 (ENSMICG00000017722) #22 ENSMICG00000029440 EPHA3 (ENSMICG00000005266) #24 PROS1 (ENSMICG00000011858) STX19 (ENSMICG00000030627) ARL13B (ENSMICG00000011874) NSUN3 (ENSMICG00000011886) ENSMICG00000008770 ENSMICG00000027233 ENSMICG00000047247 Bushbaby MODERN SPECIES 124 LIPI (ENSOGAG00000005758) ENSOGAG00000027120 ENSOGAG00000032694 ROBO2 (ENSOGAG00000011404) ENSOGAG00000009747 ENSOGAG00000029904 GBE1 (ENSOGAG00000000770) CADM2 (ENSOGAG00000010480) VGLL3 (ENSOGAG00000010364) #16 POU1F1 (ENSOGAG00000004578) #18 CHMP2B (ENSOGAG00000004577) ##17 HTR1F (ENSOGAG00000027352) #19 CGGBP1 (ENSOGAG00000034139) #20 ENSOGAG00000034600 #21 ENSOGAG00000029395 #21 C3orf38 (ENSOGAG00000028975) #22 ENSOGAG00000029652 ENSOGAG00000028160 #23 EPHA3 (ENSOGAG00000013293) #24 ENSOGAG00000010941 ENSOGAG00000033367 ENSOGAG00000030999 PROS1 (ENSOGAG00000001770) ARL13B (ENSOGAG00000001771) STX19 (ENSOGAG00000001774) NSUN3 (ENSOGAG00000001776) ENSOGAG00000030126 ENSOGAG00000033348 ENSOGAG00000029221 ENSOGAG00000033469 ENSOGAG00000000535 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000157806 ENSGT00890000139503 ENSGT00940000162802 ENSGT00870000136493.c ENSGT00940000161940 ENSGT00940000156324 ENSGT00940000154477.i ENSGT00390000017040 ENSGT00940000155947 ENSGT00530000063353.a.b.b #16 ENSGT00950000182832.B #17 ENSGT00940000158913 #18 ENSGT01010000222287.B.b.a.a.a #19 ENSGT00390000017898 #20 ENSGT00950000183034.A #21 ENSGT00390000000367 #22 ENSGT00390000012239 #23 ENSGT00940000157088.r #24 ENSGT00940000154035.b ENSGT01050000244948.c.a ENSGT00940000156365 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(ENSCCAG00000029126) #16 CHMP2B (ENSCCAG00000019581) #17 POU1F1 (ENSCCAG00000027193) #18 ENSCCAG00000008935 ENSCCAG00000001323 HTR1F (ENSCCAG00000003234) #19 CGGBP1 (ENSCCAG00000032149) #20 ZNF654 (ENSCCAG00000012733) #21 C3orf38 (ENSCCAG00000027482) #22 ENSCCAG00000031735 ENSCCAG00000026260 ENSCCAG00000022181 ENSCCAG00000023786 #24 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 71 ROBO1 (ENSSBOG00000028513) GBE1 (ENSSBOG00000021136) CADM2 (ENSSBOG00000020426) ENSSBOG00000002165 ENSSBOG00000034560 VGLL3 (ENSSBOG00000033718) #16 CHMP2B (ENSSBOG00000027652) #17 POU1F1 (ENSSBOG00000028765) #18 HTR1F (ENSSBOG00000011789) #19 CGGBP1 (ENSSBOG00000016247) #20 ZNF654 (ENSSBOG00000018458) #21 C3orf38 (ENSSBOG00000031553) #22 EPHA3 (ENSSBOG00000035210) #24 PROS1 (ENSSBOG00000034702) ARL13B (ENSSBOG00000028083) NSUN3 (ENSSBOG00000029999) ENSSBOG00000031875 ENSSBOG00000017639 ENSSBOG00000019683 EPHA6 (ENSSBOG00000028512) ARL6 (ENSSBOG00000031045) CRYBG3 (ENSSBOG00000023182) RIOX2 (ENSSBOG00000035025) 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Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000017955.c.s.b ENSGT00940000156324 ENSGT00940000154477.i ENSGT00390000017040 ENSGT00940000155947 ENSGT00530000063353.a.b.b #16 ENSGT00950000182832.B #17 ENSGT00940000158913 #18 ENSGT01010000222287.B.b.a.a.a #19 ENSGT00390000017898 #20 ENSGT00950000183034.A #21 ENSGT00390000000367 #22 ENSGT00390000012239 #23 ENSGT00940000157088.r #24 ENSGT00940000156365 ENSGT00910000148001 ENSGT00940000154035.b ENSGT01050000244948.c.a ENSGT00390000010283.`b.b ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000154490.b ENSGT00940000156459 ENSGT00940000160816 ENSGT00390000000083.b ENSGT00940000159906 ENSGT01090000260017.c.b.a.b.a.a ENSGT01090000260017.c.b.a.a.e.d.a Hominidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000017955.c.s.b ENSGT00940000156324 ENSGT00940000154477.i ENSGT00390000017040 ENSGT00940000155947 ENSGT00530000063353.a.b.b #16 ENSGT00950000182832.B #17 ENSGT00940000158913 #18 ENSGT01010000222287.B.b.a.a.a #19 ENSGT00390000017898 #20 ENSGT00950000183034.A #21 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ENSGT00390000017898 #20 ENSGT00950000183034.A #21 ENSGT00390000000367 #22 ENSGT00940000157088.r #24 ENSGT00730000111097.f.a.b.a.a.a ENSGT00940000154035.b ENSGT01050000244948.c.a ENSGT00940000156365 ENSGT00910000148001 ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000154490.b ENSGT00940000156459 ENSGT00940000160816 ENSGT00390000000083.b ENSGT00940000159906 ENSGT01090000260017.c.b.a.a.e.d.a ENSGT01090000260017.c.b.a.a.e.d.b.a ENSGT01090000260017.c.b.a.a.e.d.b.b Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 545 HTR1F (ENSMNEG00000001964) #19 ZNF654 (ENSMNEG00000030504) #21 C3orf38 (ENSMNEG00000043791) #22 EPHA3 (ENSMNEG00000036058) #24 ENSMNEG00000044283 PROS1 (ENSMNEG00000039512) ARL13B (ENSMNEG00000033653) ENSMNEG00000035986 STX19 (ENSMNEG00000042939) ENSMNEG00000002221 NSUN3 (ENSMNEG00000028804) ENSMNEG00000008849 ENSMNEG00000037242 EPHA6 (ENSMNEG00000032163) ARL6 (ENSMNEG00000032712) CRYBG3 (ENSMNEG00000043832) RIOX2 (ENSMNEG00000044647) GABRR3 (ENSMNEG00000031878) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155366.a.w.b ENSGT00940000156324 ENSGT00940000154477.i ENSGT00400000022973.a.b.a ENSGT00950000183087.A.a.b.b.g.f.d ENSGT00390000017040 ENSGT00980000202068.a.a.b.b ENSGT00940000155947 ENSGT00530000063353.a.b.b #16 ENSGT00950000182832.B #17 ENSGT00940000158913 #18 ENSGT00390000017898 #20 ENSGT00950000183034.A #21 ENSGT00390000000367 #22 ENSGT01100000263577.a.a.b.a.b.a.a.a.b.a ENSGT00390000012239 #23 ENSGT00940000157088.r #24 ENSGT00940000154035.b ENSGT01050000244948.c.a ENSGT00940000156365 ENSGT00390000010283.`b.b ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000154490.b ENSGT00940000156459 ENSGT00940000160816 ENSGT00390000000083.b ENSGT00940000159906 ENSGT01090000260017.c.b.a.a.e.d.a ENSGT01090000260017.c.b.a.a.e.d.b.a Crab-eating macaque MODERN SPECIES 11 ROBO2 (ENSMFAG00000000082) ROBO1 (ENSMFAG00000037016) ENSMFAG00000045324 GBE1 (ENSMFAG00000042659) ENSMFAG00000052399 ENSMFAG00000050404 CADM2 (ENSMFAG00000002627) VGLL3 (ENSMFAG00000003253) #16 CHMP2B (ENSMFAG00000033665) #17 POU1F1 (ENSMFAG00000031190) #18 ENSMFAG00000055407 ENSMFAG00000033818 ENSMFAG00000065497 ZNF654 (ENSMFAG00000041264) #21 CGGBP1 (ENSMFAG00000052960) #20 C3orf38 (ENSMFAG00000045545) #22 ENSMFAG00000050699 CSNKA2IP (ENSMFAG00000053253) #23 ENSMFAG00000046323 EPHA3 (ENSMFAG00000031166) #24 PROS1 (ENSMFAG00000043290) STX19 (ENSMFAG00000007249) ARL13B (ENSMFAG00000044585) DHFR2 (ENSMFAG00000054542) ENSMFAG00000040015 NSUN3 (ENSMFAG00000037638) EPHA6 (ENSMFAG00000000192) ARL6 (ENSMFAG00000035901) CRYBG3 (ENSMFAG00000046104) RIOX2 (ENSMFAG00000041662) ENSMFAG00000053932 Rhesus MODERN SPECIES 11 ENSMMUG00000064687 ENSMMUG00000056687 ROBO1 (ENSMMUG00000002327) ENSMMUG00000064882 ENSMMUG00000049913 GBE1 (ENSMMUG00000015877) ENSMMUG00000057275 ENSMMUG00000049535 CADM2 (ENSMMUG00000000583) VGLL3 (ENSMMUG00000000519) #16 CHMP2B (ENSMMUG00000016246) #17 POU1F1 (ENSMMUG00000016244) #18 HTR1F (ENSMMUG00000054402) CGGBP1 (ENSMMUG00000047994) #20 ZNF654 (ENSMMUG00000043727) #21 C2H3orf38 (ENSMMUG00000021507) #22 ENSMMUG00000049786 CSNKA2IP (ENSMMUG00000045282) #23 EPHA3 (ENSMMUG00000008242) #24 ENSMMUG00000058321 PROS1 (ENSMMUG00000020334) STX19 (ENSMMUG00000045475) ARL13B (ENSMMUG00000020335) ENSMMUG00000055230 DHFR2 (ENSMMUG00000057255) ENSMMUG00000050792 NSUN3 (ENSMMUG00000020337) ENSMMUG00000012920 EPHA6 (ENSMMUG00000023330) ARL6 (ENSMMUG00000038349) RIOX2 (ENSMMUG00000017872) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156324 ENSGT00940000154477.i ENSGT00390000017040 ENSGT00940000155947 ENSGT00530000063353.a.b.b #16 ENSGT00950000182832.B #17 ENSGT00940000158913 #18 ENSGT01010000222287.B.b.a.a.a #19 ENSGT00390000017898 #20 ENSGT00950000183034.A #21 ENSGT00390000000367 #22 ENSGT00940000157088.r #24 ENSGT00730000111097.f.a.b.a.a.a ENSGT00940000154035.b ENSGT00940000156365 ENSGT01050000244948.c.a ENSGT00390000010283.`b.b ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000154490.b ENSGT00940000156459 ENSGT00940000160816 ENSGT00390000000083.b ENSGT00940000159906 ENSGT01090000260017.c.b.a.a.e.d.a ENSGT01090000260017.c.b.a.a.e.d.b.a ENSGT01090000260017.c.b.a.a.e.d.b.b Olive baboon MODERN SPECIES 11 ROBO2 (ENSPANG00000016829) ROBO1 (ENSPANG00000013370) GBE1 (ENSPANG00000012561) CADM2 (ENSPANG00000006775) VGLL3 (ENSPANG00000014750) #16 CHMP2B (ENSPANG00000001270) #17 POU1F1 (ENSPANG00000001271) #18 ENSPANG00000049203 ENSPANG00000019784 ENSPANG00000012560 #20 ZNF654 (ENSPANG00000017486) #21 C3orf38 (ENSPANG00000024996) #22 EPHA3 (ENSPANG00000025220) #24 ENSPANG00000049414 PROS1 (ENSPANG00000008519) ARL13B (ENSPANG00000018309) STX19 (ENSPANG00000007239) DHFR2 (ENSPANG00000023705) NSUN3 (ENSPANG00000014749) ENSPANG00000039441 ENSPANG00000046660 EPHA6 (ENSPANG00000010320) ENSPANG00000007310 ARL6 (ENSPANG00000007238) CRYBG3 (ENSPANG00000019144) RIOX2 (ENSPANG00000009187) GABRR3 (ENSPANG00000018919) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 140 ENSGT00940000156324 ENSGT00940000154477.i ENSGT00390000017040 ENSGT00940000155947 ENSGT00530000063353.a.b.b #16 ENSGT00950000182832.B #17 ENSGT00940000158913 #18 ENSGT01010000222287.B.b.a.a.a #19 ENSGT00950000183034.A #21 ENSGT00390000000367 #22 ENSGT00910000148050 ENSGT00940000157088.r #24 ENSGT00730000111097.f.a.b.a.a.a ENSGT00940000154035.b ENSGT00940000156365 ENSGT01050000244948.c.a ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000154490.b ENSGT00940000156459 ENSGT00940000160816 ENSGT00390000000083.b ENSGT00940000159906 ENSGT01090000260017.c.b.a.a.e.d.a ENSGT01090000260017.c.b.a.a.e.d.b.b ENSGT01090000260017.c.b.a.a.f Drill MODERN SPECIES 643 HTR1F (ENSMLEG00000028052) #19 ZNF654 (ENSMLEG00000034170) #21 C3orf38 (ENSMLEG00000027488) #22 ENSMLEG00000030205 EPHA3 (ENSMLEG00000040711) #24 ENSMLEG00000027777 PROS1 (ENSMLEG00000032716) ARL13B (ENSMLEG00000038191) STX19 (ENSMLEG00000020260) NSUN3 (ENSMLEG00000039542) ENSMLEG00000029421 ENSMLEG00000014203 Sooty mangabey MODERN SPECIES 620 CADM2 (ENSCATG00000036410) VGLL3 (ENSCATG00000029921) #16 CHMP2B (ENSCATG00000043825) #17 POU1F1 (ENSCATG00000033860) #18 HTR1F (ENSCATG00000018755) #19 ENSCATG00000032374 ZNF654 (ENSCATG00000037345) #21 C3orf38 (ENSCATG00000041683) #22 ENSCATG00000029354 ENSCATG00000031209 ENSCATG00000041362 EPHA3 (ENSCATG00000036316) #24 PROS1 (ENSCATG00000035148) STX19 (ENSCATG00000028840) ARL13B (ENSCATG00000009050) ENSCATG00000037229 NSUN3 (ENSCATG00000032928) EPHA6 (ENSCATG00000015323) ARL6 (ENSCATG00000031356) CRYBG3 (ENSCATG00000032391) RIOX2 (ENSCATG00000036355) GABRR3 (ENSCATG00000041792) ENSCATG00000031527 Vervet Monkey MODERN SPECIES 14 ENSCSAG00000005858 ROBO2 (ENSCSAG00000005865) ENSCSAG00000005886 ENSCSAG00000005899 GBE1 (ENSCSAG00000005907) ENSCSAG00000018731 CADM2 (ENSCSAG00000005916) VGLL3 (ENSCSAG00000005920) #16 CHMP2B (ENSCSAG00000005923) #17 POU1F1 (ENSCSAG00000005925) #18 ENSCSAG00000018730 CGGBP1 (ENSCSAG00000018729) #20 ZNF654 (ENSCSAG00000005929) #21 C3orf38 (ENSCSAG00000005931) #22 EPHA3 (ENSCSAG00000005935) #24 PROS1 (ENSCSAG00000005942) STX19 (ENSCSAG00000005944) ARL13B (ENSCSAG00000005948) 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(ENSRBIG00000028353) NUP58 (ENSRBIG00000037830) ENSRBIG00000039093 ENSRBIG00000039368 Tarsier MODERN SPECIES 5013 ENSTSYG00000027178 HTR1F (ENSTSYG00000002005) #19 CGGBP1 (ENSTSYG00000007202) #20 ZNF654 (ENSTSYG00000037228) #21 C3orf38 (ENSTSYG00000014103) #22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157806 ENSGT00890000139503 ENSGT00940000162802 ENSGT00870000136493.c ENSGT00940000161940 ENSGT00940000156324 ENSGT00940000154477.i ENSGT00390000017040 ENSGT00940000155947 ENSGT00530000063353.a.b.b #16 ENSGT00950000182832.B #17 ENSGT00940000158913 #18 ENSGT01010000222287.B.b.a.a.a #19 ENSGT00390000017898 #20 ENSGT00950000183034.A #21 ENSGT00390000000367 #22 ENSGT00390000012239 #23 ENSGT00940000157088 #24 ENSGT00940000154035.b ENSGT01050000244948.c.a ENSGT00940000156365 ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000154490.b ENSGT00940000156459 ENSGT00940000160816 ENSGT00390000000083.b ENSGT00940000159906 ENSGT01090000260017.c.b.a.b.b.r ENSGT01090000260017.c.b.a.b.a.b 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chinchilla MODERN SPECIES 114 SAMSN1 (ENSCLAG00000005821) HSPA13 (ENSCLAG00000005707) RBM11 (ENSCLAG00000005374) LIPI (ENSCLAG00000005197) ROBO2 (ENSCLAG00000004623) ENSCLAG00000009848 ROBO1 (ENSCLAG00000015477) GBE1 (ENSCLAG00000005860) CADM2 (ENSCLAG00000004950) VGLL3 (ENSCLAG00000004309) #16 CHMP2B (ENSCLAG00000004251) #17 POU1F1 (ENSCLAG00000008895) #18 HTR1F (ENSCLAG00000008847) #19 ENSCLAG00000010225 #20 ZNF654 (ENSCLAG00000009137) #21 C3orf38 (ENSCLAG00000008911) #22 EPHA3 (ENSCLAG00000008216) #24 ENSCLAG00000007467 PROS1 (ENSCLAG00000006656) ARL13B (ENSCLAG00000006379) STX19 (ENSCLAG00000005443) NSUN3 (ENSCLAG00000004168) ENSCLAG00000007975 EPHA6 (ENSCLAG00000012297) ARL6 (ENSCLAG00000011788) CRYBG3 (ENSCLAG00000007113) RIOX2 (ENSCLAG00000006223) GABRR3 (ENSCLAG00000006076) Degu MODERN SPECIES 107 ENSODEG00000010452 METTL18 (ENSODEG00000011388) ENSODEG00000011249 SCYL3 (ENSODEG00000011505) ENSODEG00000013130 ENSODEG00000011891 CADM2 (ENSODEG00000011473) VGLL3 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C3orf38 (ENSOCUG00000014034) #22 ENSOCUG00000031707 ENSOCUG00000026380 #23 ENSOCUG00000024255 EPHA3 (ENSOCUG00000010465) #24 PROS1 (ENSOCUG00000025358) STX19 (ENSOCUG00000001785) ARL13B (ENSOCUG00000025555) NSUN3 (ENSOCUG00000011677) ENSOCUG00000013576 ENSOCUG00000037233 ENSOCUG00000036085 ENSOCUG00000035896 ENSOCUG00000037792 EPHA6 (ENSOCUG00000029519) ARL6 (ENSOCUG00000029293) Pika MODERN SPECIES 9138 C3orf38 (ENSOPRG00000016024) #22 Tree shrew MODERN SPECIES 6413 ENSTBEG00000000976 #21 C3orf38 (ENSTBEG00000000879) #22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157806 ENSGT00890000139503 ENSGT00940000162802 ENSGT00870000136493.c ENSGT00940000161940 ENSGT00940000156324 ENSGT00940000154477 ENSGT00390000017040 ENSGT00940000155947 ENSGT00530000063353.a.b.b #16 ENSGT00950000182832.B #17 ENSGT00940000158913 #18 ENSGT01010000222287.B.b.a.a.a #19 ENSGT00390000017898 #20 ENSGT00950000183034.A #21 ENSGT00390000000367 #22 ENSGT00390000012239 #23 ENSGT00940000157088 #24 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leopard MODERN SPECIES 128 ENSPPRG00000024357 VGLL3 (ENSPPRG00000024362) #16 CHMP2B (ENSPPRG00000022602) #17 POU1F1 (ENSPPRG00000022584) #18 HTR1F (ENSPPRG00000011399) #19 ENSPPRG00000011392 #20 ZNF654 (ENSPPRG00000022565) #21 C3orf38 (ENSPPRG00000022552) #22 EPHA3 (ENSPPRG00000022528) #24 PROS1 (ENSPPRG00000022467) ARL13B (ENSPPRG00000022426) STX19 (ENSPPRG00000011375) NSUN3 (ENSPPRG00000022388) lion MODERN SPECIES 9 ROBO2 (ENSPLOG00000015871) ENSPLOG00000015735 ROBO1 (ENSPLOG00000014250) ENSPLOG00000014139 ENSPLOG00000014098 GBE1 (ENSPLOG00000013937) ENSPLOG00000013875 CADM2 (ENSPLOG00000013632) ENSPLOG00000013561 VGLL3 (ENSPLOG00000013497) #16 CHMP2B (ENSPLOG00000013401) #17 POU1F1 (ENSPLOG00000013268) #18 HTR1F (ENSPLOG00000013246) #19 CGGBP1 (ENSPLOG00000013226) #20 ZNF654 (ENSPLOG00000013196) #21 C3orf38 (ENSPLOG00000013154) #22 ENSPLOG00000013137 #23 ENSPLOG00000013102 EPHA3 (ENSPLOG00000012751) #24 PROS1 (ENSPLOG00000012461) STX19 (ENSPLOG00000012404) ARL13B 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ENSGT01090000260017.c.b.a.b.b ENSGT01090000260017.c.b.a.b.a.b ENSGT01090000260017.c.b.a.b.a.a Dog MODERN SPECIES 26 C33H3orf38 (ENSCAFG00845030412) #22 ENSCAFG00845030425 ENSCAFG00845030437 ENSCAFG00845030457 #23 EPHA3 (ENSCAFG00845030500) #24 PROS1 (ENSCAFG00845030582) ARL13B (ENSCAFG00845030616) STX19 (ENSCAFG00845030641) NSUN3 (ENSCAFG00845030646) ENSCAFG00845014808 ENSCAFG00845014851 ENSCAFG00845014877 ENSCAFG00845015035 ENSCAFG00845015075 ARL6 (ENSCAFG00845015298) CRYBG3 (ENSCAFG00845015402) Dingo MODERN SPECIES 65 C3orf38 (ENSCAFG00020010046) #22 ENSCAFG00020010037 #23 EPHA3 (ENSCAFG00020009975) #24 PROS1 (ENSCAFG00020009928) STX19 (ENSCAFG00020009915) ARL13B (ENSCAFG00020009901) NSUN3 (ENSCAFG00020009899) ENSCAFG00020009881 ENSCAFG00020009869 ENSCAFG00020009849 ENSCAFG00020009845 ARL6 (ENSCAFG00020009819) CRYBG3 (ENSCAFG00020009652) RIOX2 (ENSCAFG00020009638) ENSCAFG00020009634 ENSCAFG00020009623 Red fox MODERN SPECIES 6 CUNH3orf38 (ENSVVUG00000021477) #22 CSNKA2IP (ENSVVUG00000021486) #23 EPHA3 (ENSVVUG00000021494) #24 PROS1 (ENSVVUG00000021507) ARL13B (ENSVVUG00000021511) STX19 (ENSVVUG00000021519) NSUN3 (ENSVVUG00000021521) ENSVVUG00000021523 ENSVVUG00000021543 EPHA6 (ENSVVUG00000021548) ARL6 (ENSVVUG00000021551) CRYBG3 (ENSVVUG00000021552) RIOX2 (ENSVVUG00000021556) ENSVVUG00000021560 ENSVVUG00000021561 ENSVVUG00000021562 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00890000139503 ENSGT00940000162802 ENSGT00870000136493.c ENSGT00940000161940 ENSGT00940000154477 ENSGT00940000156324 ENSGT00940000153284.b.p ENSGT00390000017040 ENSGT00940000155947 ENSGT00530000063353.a.b.b #16 ENSGT00950000182832.B #17 ENSGT00940000158913 #18 ENSGT01010000222287.B.b.a.a.a #19 ENSGT00390000017898 #20 ENSGT00950000183034.A #21 ENSGT00390000000367 #22 ENSGT00390000012239 #23 ENSGT00940000157088 #24 ENSGT00940000154035.b ENSGT01050000244948.c.a ENSGT00940000156365 ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000154490.b ENSGT00940000156459 ENSGT00940000160816 ENSGT00390000000083.b 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ENSUAMG00000013555 #22 ENSUAMG00000013557 #23 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157806 ENSGT00890000139503 ENSGT00940000162802 ENSGT00870000136493.c ENSGT00940000161940 ENSGT00940000156324 ENSGT00940000154477 ENSGT00390000017040 ENSGT00940000155947 ENSGT00530000063353.a.b.b #16 ENSGT00950000182832.B #17 ENSGT00940000158913 #18 ENSGT01010000222287.B.b.a.a.a #19 ENSGT00390000017898 #20 ENSGT00950000183034.A #21 ENSGT00390000000367 #22 ENSGT00390000012239 #23 ENSGT00940000157088 #24 ENSGT00940000154035.b ENSGT01050000244948.c.a ENSGT00940000156365 ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000154490.b ENSGT00940000156459 ENSGT00910000144911 ENSGT00940000160816 ENSGT00390000000083.b ENSGT00940000159906 ENSGT01090000260017.c.b.a.b.b ENSGT01090000260017.c.b.a.b.a.b ENSGT01090000260017.c.b.a.b.a.a Equus ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000157806 ENSGT00890000139503 ENSGT00940000162802 ENSGT00870000136493.c ENSGT00940000161940 ENSGT00940000156324 ENSGT00940000154477 ENSGT00390000017040 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HTR1F (ENSOARG00020002525) #19 CGGBP1 (ENSOARG00020002537) #20 ZNF654 (ENSOARG00020002568) #21 C3orf38 (ENSOARG00020002608) #22 ENSOARG00020002616 #23 EPHA3 (ENSOARG00020002625) #24 PROS1 (ENSOARG00020002698) ARL13B (ENSOARG00020002758) STX19 (ENSOARG00020002829) NSUN3 (ENSOARG00020002833) ENSOARG00020002843 ENSOARG00020002852 ENSOARG00020002856 ENSOARG00020002865 ENSOARG00020002873 CYP4F21 (ENSOARG00020002888) ENSOARG00020002924 ENSOARG00020002976 ENSOARG00020003031 Goat MODERN SPECIES ROBO2 (ENSCHIG00000012230) ENSCHIG00000020246 ENSCHIG00000024065 ENSCHIG00000017301 ENSCHIG00000001025 ENSCHIG00000005825 GBE1 (ENSCHIG00000025102) CADM2 (ENSCHIG00000024207) ENSCHIG00000003941 VGLL3 (ENSCHIG00000021391) #16 CHMP2B (ENSCHIG00000014003) #17 POU1F1 (ENSCHIG00000026743) #18 ENSCHIG00000003029 CGGBP1 (ENSCHIG00000013576) #20 ZNF654 (ENSCHIG00000014626) #21 C3orf38 (ENSCHIG00000011989) #22 ENSCHIG00000025993 EPHA3 (ENSCHIG00000015544) #24 PROS1 (ENSCHIG00000010494) ARL13B (ENSCHIG00000015560) STX19 (ENSCHIG00000002872) NSUN3 (ENSCHIG00000012629) ENSCHIG00000007885 ENSCHIG00000007969 EPHA6 (ENSCHIG00000022528) ENSCHIG00000017327 ARL6 (ENSCHIG00000017792) ENSCHIG00000004089 ENSCHIG00000016450 RCAN1 (ENSCHIG00000021307) ENSCHIG00000023335 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000162802 ENSGT00870000136493.c ENSGT00940000161940 ENSGT00940000154477 ENSGT00940000156324 ENSGT00940000157074.ib.b ENSGT00390000017040 ENSGT00940000161003.b ENSGT00940000155947 ENSGT00530000063353.a.b.b #16 ENSGT00950000182832.B #17 ENSGT00940000158913 #18 ENSGT01010000222287.B.b.a.a.a #19 ENSGT00390000017898 #20 ENSGT00950000183034.A #21 ENSGT00390000000367 #22 ENSGT00390000012239 #23 ENSGT00940000157088 #24 ENSGT00940000154035.b ENSGT00940000156365 ENSGT01050000244948.c.a ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000154490.b ENSGT00940000156459 ENSGT00940000160816 ENSGT00390000000083.b ENSGT00940000159906 ENSGT01090000260017.c.b.a.b.b.f ENSGT01090000260017.c.b.a.b.a.a.y.b ENSGT01090000260017.c.b.a.b.b.e Bos ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00890000139503 ENSGT00940000162802 ENSGT00870000136493.c ENSGT00940000161940.f ENSGT00940000154477 ENSGT00940000156324 ENSGT00940000157074.ib.b ENSGT00390000017040 ENSGT00940000155947 ENSGT00530000063353.a.b.b #16 ENSGT00950000182832.B #17 ENSGT00940000158913 #18 ENSGT01010000222287.B.b.a.a.a #19 ENSGT00390000017898 #20 ENSGT00950000183034.A #21 ENSGT00390000000367 #22 ENSGT00390000012239 #23 ENSGT00940000157088 #24 ENSGT00940000154035.b ENSGT00940000156365 ENSGT01050000244948.c.a ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000154490.b ENSGT00940000156459 ENSGT00940000160816 ENSGT00390000000083.b ENSGT00940000159906 ENSGT01090000260017.c.b.a.b.b.f ENSGT01090000260017.c.b.a.b.a.a.y.a.b ENSGT01090000260017.c.b.a.b.b.e Bos_b ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000162802 ENSGT00870000136493.c ENSGT00940000161940.f ENSGT00940000154477 ENSGT00940000156324 ENSGT00940000157074.ib.b ENSGT00390000017040 ENSGT00940000161003.b ENSGT00940000155947 ENSGT00530000063353.a.b.b #16 ENSGT00950000182832.B #17 ENSGT00940000158913 #18 ENSGT01010000222287.B.b.a.a.a #19 ENSGT00390000017898 #20 ENSGT00950000183034.A #21 ENSGT00390000000367 #22 ENSGT00390000012239 #23 ENSGT00940000157088 #24 ENSGT00940000154035.b ENSGT00940000156365 ENSGT01050000244948.c.a ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000154490.b ENSGT00940000156459 ENSGT00940000160816 ENSGT00390000000083.b ENSGT00940000159906 ENSGT01090000260017.c.b.a.b.b.f ENSGT01090000260017.c.b.a.b.a.a.y.a.b ENSGT01090000260017.c.b.a.b.b.e Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES ENSBIXG00005021777 ENSBIXG00005021769 ENSBIXG00005021750 ENSBIXG00005021731 GBE1 (ENSBIXG00005021600) ENSBIXG00005021569 ENSBIXG00005021559 CADM2 (ENSBIXG00005007370) ENSBIXG00005021271 VGLL3 (ENSBIXG00005021216) #16 CHMP2B (ENSBIXG00005003570) #17 POU1F1 (ENSBIXG00005021068) #18 HTR1F 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(ENSBTAG00000023652) ARL13B (ENSBTAG00000005155) STX19 (ENSBTAG00000005162) NSUN3 (ENSBTAG00000015728) ENSBTAG00000034182 ENSBTAG00000050258 EPHA6 (ENSBTAG00000044111) ARL6 (ENSBTAG00000010091) CRYBG3 (ENSBTAG00000047147) RIOX2 (ENSBTAG00000015546) GABRR3 (ENSBTAG00000001416) OR5AC31 (ENSBTAG00000048630) ENSBTAG00000054232 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01010000222287.B.b.a.a.a #19 ENSGT00390000017898 #20 ENSGT00950000183034.A #21 ENSGT00390000000367 #22 ENSGT00390000012239 #23 ENSGT00940000157088 #24 ENSGT00940000154035.b ENSGT00940000156365 ENSGT01050000244948.c.a ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00950000182825.A.a.b.a.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000154490.b ENSGT00940000156459 ENSGT00940000160816 ENSGT00390000000083.b ENSGT00940000159906 ENSGT01090000260017.c.b.a.b.b.f ENSGT01090000260017.c.b.a.b.b.e ENSGT01090000260017.c.b.a.b.a.b Domestic yak MODERN SPECIES ATP5PO (ENSBGRG00000000144) MRPS6 (ENSBGRG00000000146) ENSBGRG00000000147 ENSBGRG00000000148 SMIM11 (ENSBGRG00000000149) C21orf140 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DUPLICATION Sperm whale MODERN SPECIES RBM11 (ENSPCTG00005020241) LIPI (ENSPCTG00005020089) ENSPCTG00005019983 ROBO2 (ENSPCTG00005019510) ROBO1 (ENSPCTG00005018380) GBE1 (ENSPCTG00005018274) ENSPCTG00005018235 CADM2 (ENSPCTG00005017923) VGLL3 (ENSPCTG00005017816) #16 ENSPCTG00005017777 CHMP2B (ENSPCTG00005017666) #17 POU1F1 (ENSPCTG00005017504) #18 HTR1F (ENSPCTG00005017483) #19 CGGBP1 (ENSPCTG00005017471) #20 ZNF654 (ENSPCTG00005017396) #21 C1H3orf38 (ENSPCTG00005017377) #22 EPHA3 (ENSPCTG00005017153) #24 PROS1 (ENSPCTG00005016923) STX19 (ENSPCTG00005016902) ARL13B (ENSPCTG00005016685) NSUN3 (ENSPCTG00005016640) EPHA6 (ENSPCTG00005016174) ARL6 (ENSPCTG00005016118) CRYBG3 (ENSPCTG00005015975) RIOX2 (ENSPCTG00005015885) GABRR3 (ENSPCTG00005015754) ENSPCTG00005015729 ENSPCTG00005015303 ENSPCTG00005015120 GPR15 (ENSPCTG00005015092) CPOX (ENSPCTG00005015043) Sperm whale MODERN SPECIES 5 SCO1 (ENSPCTG00005013222) ADPRM (ENSPCTG00005013144) TMEM220 (ENSPCTG00005012983) TMEM238L 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POU1F1 (ENSDNOG00000005896) #18 HTR1F (ENSDNOG00000048869) #19 ENSDNOG00000031923 #20 ENSDNOG00000032322 #21 ENSDNOG00000041508 #21 C3orf38 (ENSDNOG00000046425) #22 CSNKA2IP (ENSDNOG00000038347) #23 MSTO1 (ENSDNOG00000040970) ENSDNOG00000023921 SYT11 (ENSDNOG00000000368) RIT1 (ENSDNOG00000000369) KHDC4 (ENSDNOG00000000370) RXFP4 (ENSDNOG00000017055) ARHGEF2 (ENSDNOG00000017057) Sloth MODERN SPECIES 6208 ENSCHOG00000006889 #21 ENSCHOG00000006894 #22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00390000007999 ENSGT00940000157806 ENSGT00890000139503 ENSGT00870000136493.c ENSGT00940000161940 ENSGT00940000156324 ENSGT00940000154477 ENSGT00390000017040 ENSGT00940000155947 ENSGT00530000063353.a.b.b #16 ENSGT00950000182832.B #17 ENSGT00940000158913 #18 ENSGT00940000163614 ENSGT00390000017898 #20 ENSGT00950000183034.A #21 ENSGT00390000000367 #22 ENSGT00390000012239 #23 ENSGT00940000157088 #24 ENSGT00940000154035.b ENSGT00940000156365 ENSGT01050000244948.c.a ENSGT00940000153665.b.a.a 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