Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	60								ENSGT00940000156821.p.b	ENSGT00940000153143.a.b.b.a.b.d.b.a.b.b #7	ENSGT00940000153143.a.a.f.e.a.b #8	ENSGT00940000153143.a.a.f.e.a.a.a #9	ENSGT00940000153143.a.b.b.a.b.d.b.b.f.b.b ##7	ENSGT00940000153143.a.a.f.e.b.b #14	ENSGT00950000185265 #13	ENSGT00940000153143.a.b.b.a.b.d.a ##7	ENSGT00730000111212.i.a #22	ENSGT00940000161777.b
Bos	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000156175	ENSGT00390000000481	ENSGT00950000182882.A.b.a	ENSGT00940000153143.a.b.b.a.b.d.b.a.b.a.a ##7	ENSGT00940000156821.p.b	ENSGT00940000153143.a.b.b.a.b.d.b.a.b.b #7	ENSGT00940000153143.a.a.f.e.a.b #8	ENSGT00940000153143.a.a.f.e.a.a.a #9	ENSGT00940000153143.a.a.f.e.a.a.b.b #10	ENSGT00940000153143.a.a.f.e.a.a.b.a #11	ENSGT00940000153143.a.b.b.a.b.d.b.b.f.b.b ##7	ENSGT00940000153143.a.a.f.e.b.b #14	ENSGT00950000185265.d #13	ENSGT00950000185265.c #20	ENSGT00940000153143.a.b.b.a.b.d.a ##7	ENSGT00730000111212.i.a #22	ENSGT00940000161777.b	ENSGT01100000263480.a.a.a.a.b.a.a.a.b.a.a.b.b.a.a.b #25	ENSGT00940000155472.a.a #26	ENSGT00510000047764 #27	ENSGT00940000156619 #29	ENSGT00390000015216 #30	ENSGT00940000157480 #31	ENSGT00950000183004.a.b.a.a #32	ENSGT00940000155529.C #33	ENSGT00390000013249 #34	ENSGT00940000153305.d.`b.b #35	ENSGT00940000159477 #36	ENSGT00590000083094.a.b #37	ENSGT01100000263477.B.d.b	ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000157866	ENSGT00390000002582	ENSGT00940000157852	ENSGT00940000159695.h	ENSGT00940000155142	ENSGT00390000011176	ENSGT00940000156175	ENSGT00390000000481	ENSGT00950000182882.A.b.a	ENSGT00940000153143.a.b.b.a.b.d.b.a.b.b #7	ENSGT00940000153143.a.a.f.e.a.b #8	ENSGT00940000153143.a.a.f.e.a.a.a #9	ENSGT00940000153143.a.a.f.e.a.a.b.b #10	ENSGT00940000153143.a.a.f.e.a.a.b.a #11	ENSGT00940000153143.a.b.b.a.b.d.a ##7	ENSGT00730000111212.i.a #22	ENSGT00550000074794.k.b.a #24	ENSGT01100000263480.a.a.a.a.b.a.a.a.b.a.a.b.b.a.a.b #25	ENSGT00940000155472.a.a #26	ENSGT00510000047764 #27	ENSGT00940000156619 #29	ENSGT00390000015216 #30	ENSGT00940000157480 #31	ENSGT00950000183004.a.b.a.a #32	ENSGT00940000155529.C #33	ENSGT00390000013249 #34	ENSGT00940000153305.d.`b.b #35	ENSGT00940000159477 #36	ENSGT00590000083094.a.b #37	ENSGT01100000263477.B.d.b	ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	23	ENSBIXG00005020596 #7	ENSBIXG00005020605 #8	ENSBIXG00005020637 #9	ENSBIXG00005003487 #10	ENSBIXG00005020654 #11	ENSBIXG00005020661 #12	ENSBIXG00005020677 #13	ENSBIXG00005020685 #14	ENSBIXG00005020688 #15	ENSBIXG00005020710 #16	ENSBIXG00005020722 #17	ENSBIXG00005020732 #18	ENSBIXG00005020739 #19	ENSBIXG00005003508 #20	ENSBIXG00005020753 #21	LSM8 (ENSBIXG00005007213) #22	ENSBIXG00005020819 #23	ENSBIXG00005020842 #24	ENSBIXG00005020857 #25	KCND2 (ENSBIXG00005020893) #26	TSPAN12 (ENSBIXG00005020981) #27	ENSBIXG00005021009 #28	ING3 (ENSBIXG00005021098) #29	CPED1 (ENSBIXG00005021186) #30	WNT16 (ENSBIXG00005021232) #31	FAM3C (ENSBIXG00005021252) #32	PTPRZ1 (ENSBIXG00005021416) #33	AASS (ENSBIXG00005021503) #34	ENSBIXG00005003630 #35	FEZF1 (ENSBIXG00005000004) #36	CADPS2 (ENSBIXG00005007840) #37
Cow	MODERN SPECIES	23	ENSBTAG00000053253	SUGCT (ENSBTAG00000032121)	MPLKIP (ENSBTAG00000018715)	CDK13 (ENSBTAG00000001528)	ENSBTAG00000054825	RALA (ENSBTAG00000006661)	YAE1 (ENSBTAG00000001892)	POU6F2 (ENSBTAG00000013648)	VPS41 (ENSBTAG00000007305)	AMPH (ENSBTAG00000031967)	ENSBTAG00000000144 #7	ENSBTAG00000053474 #9	ENSBTAG00000055254 ##7	ENSBTAG00000002859 #14	ENSBTAG00000049399 ##7	LSM8 (ENSBTAG00000012649) #22	ENSBTAG00000006152 #23	ENSBTAG00000031464 #24	KCND2 (ENSBTAG00000032077) #26	TSPAN12 (ENSBTAG00000015337) #27	ING3 (ENSBTAG00000016332) #29	CPED1 (ENSBTAG00000002938) #30	WNT16 (ENSBTAG00000002940) #31	FAM3C (ENSBTAG00000007976) #32	PTPRZ1 (ENSBTAG00000012119) #33	AASS (ENSBTAG00000012128) #34	FEZF1 (ENSBTAG00000005103) #36	CADPS2 (ENSBTAG00000005110) #37	TAS2R16 (ENSBTAG00000032049)	SLC13A1 (ENSBTAG00000006674)	IQUB (ENSBTAG00000004405)
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000155142	ENSGT00390000011176	ENSGT00940000156175	ENSGT00390000000481	ENSGT00950000182882.A.b.a	ENSGT00940000153143.a.b.b.a.b.d.b.a.b.a.a ##7	ENSGT00940000156821.p.b	ENSGT00940000153143.a.b.b.a.b.d.b.a.b.b #7	ENSGT00940000153143.a.a.f.e.a.b #8	ENSGT00940000153143.a.a.f.e.a.a.a #9	ENSGT00940000153143.a.a.f.e.a.a.b.b #10	ENSGT00940000153143.a.a.f.e.a.a.b.a #11	ENSGT00940000153143.a.b.b.a.b.d.b.b.f.b.b ##7	ENSGT00950000185265.c #20	ENSGT00940000153143.a.b.b.a.b.d.a ##7	ENSGT00730000111212.i.a #22	ENSGT00940000161777.b	ENSGT01100000263480.a.a.a.a.b.a.a.a.b.a.a.b.b.a.a.b #25	ENSGT00940000155472.a.a #26	ENSGT00510000047764 #27	ENSGT00940000156619 #29	ENSGT00390000015216 #30	ENSGT00940000157480 #31	ENSGT00950000183004.a.b.a.a #32	ENSGT00940000155529.C #33	ENSGT00390000013249 #34	ENSGT00940000159477 #36	ENSGT00590000083094.a.b #37	ENSGT01100000263477.B.d.b	ENSGT01030000234550.a.a.d.a.a	ENSGT00990000210481
Wild yak	MODERN SPECIES	362														ENSBMUG00000011929 #20	ENSBMUG00000011918 ##7	LSM8 (ENSBMUG00000011907) #22	ENSBMUG00000011893
American bison	MODERN SPECIES	3079														ENSBBBG00000022660 #13	ENSBBBG00000022653 ##7	LSM8 (ENSBBBG00000022649) #22	ENSBBBG00000022640	ENSBBBG00000022631 ##23	ENSBBBG00000022622 ##24