Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	254		ENSGT00940000159184.d #9	ENSGT00390000013048.u.a #10	ENSGT00950000182913.A.b.b.a #11	ENSGT00950000182913.A.b.a.f #12	ENSGT00940000164905.e.a #13	ENSGT00940000154666.u #14	ENSGT00940000156956.l ##15	ENSGT00940000153678.a.b.d #16	ENSGT00390000006485.d.i #17	ENSGT00940000166567.l #18	ENSGT00940000154285.b.a.b.c #19	ENSGT00940000166567.k.b ##18	ENSGT00940000156939.e.b #20	ENSGT00390000000417.a.b.i #21	ENSGT00390000010152.g.b #22	ENSGT00940000159763.c #23	ENSGT00940000157816.a.b.j #24	ENSGT00940000160601.m #26	ENSGT00940000158825.c.g #27	ENSGT00940000161128.j #28	ENSGT01090000260003.a.a.e #29	ENSGT00940000157182.g.b.s #30	ENSGT00390000002105.a #31	ENSGT00950000182973.b.a.e #32	ENSGT00940000155628.q #33	ENSGT00390000006548.a.a #34	ENSGT00940000156684.t.b #35	ENSGT00940000154617.B.c.a #36	ENSGT00940000159572.a.a.b #37	ENSGT00390000008748.b.g.b.a
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	110	ENSGT00390000000221.A.c.b #7	ENSGT00940000157223.a #8	ENSGT00940000159184.d #9	ENSGT00390000013048.u.a #10	ENSGT00950000182913.A.b.b.a #11	ENSGT00950000182913.A.b.a.f #12	ENSGT00940000164905.e.a #13	ENSGT00940000154666.u #14	ENSGT00940000156956.k.b #15	ENSGT00940000153678.a.b.d #16	ENSGT00390000006485.d.i #17	ENSGT00940000166567.l #18	ENSGT00940000154285.b.a.b.c.a #19	ENSGT00940000156939.e.b #20	ENSGT00390000000417.a.b.i #21	ENSGT00390000010152.g.b #22	ENSGT00940000159763.c #23	ENSGT00940000157816.a.b.j #24	ENSGT00940000166897.b #25	ENSGT00940000160601.m #26	ENSGT00940000158825.c.g #27	ENSGT00940000161128.j #28	ENSGT01090000260003.a.a.e #29	ENSGT00940000157182.g.b.s #30	ENSGT00390000002105.a #31	ENSGT00950000182973.b.a.e #32	ENSGT00940000155628.q #33	ENSGT00390000006548.a.a #34	ENSGT00940000156684.t.b #35	ENSGT00940000154617.B.c.a #36	ENSGT00940000159572.a.a.b #37
Common carp reference	MODERN SPECIES	6	MICAL2 (ENSCCRG00000064288)	dkk3a (ENSCCRG00000014225) #7	usp47 (ENSCCRG00000014365) ##8	vat1l (ENSCCRG00000027568) #9	bola3 (ENSCCRG00000002888) #10	bco1 (ENSCCRG00000027496) #11	bco1l (ENSCCRG00000013748) #12	ENSCCRG00000013741 #13	ipo7 (ENSCCRG00000013081) #14	tmem41b (ENSCCRG00000071144) #15	DENND5A (ENSCCRG00000043145) #16	sinhcafl (ENSCCRG00000062499) #17	ENSCCRG00000057903 #19	ENSCCRG00000043061 #20	dhcr7 (ENSCCRG00000057526) #21	nadsyn1 (ENSCCRG00000002307) #22	tpcn2 (ENSCCRG00000045490) #23	ccnd1 (ENSCCRG00000007012) #24	lto1 (ENSCCRG00000065219) #25	fgf19 (ENSCCRG00000004531) #26	fgf4 (ENSCCRG00000067051) #27	fgf3 (ENSCCRG00000004557) #28	zgc:153993 (ENSCCRG00000046765) #29	ano1a (ENSCCRG00000020360) #30	FADD (ENSCCRG00000072094) #31	pacsin3 (ENSCCRG00000021727) #32	csnk1g1 (ENSCCRG00000033888) #33	ENSCCRG00000012636	rps17 (ENSCCRG00000074570) #34	neo1a (ENSCCRG00000028503) #35	chrna7a (ENSCCRG00000016316) #36
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000010152.g.a.a ##22
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000010152.g.a.a ##22
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	61	TEAD1 (ENSSGRG00000015278)	parvab (ENSSGRG00000015281)	MICAL2 (ENSSGRG00000015385)	dkk3a (ENSSGRG00000015386) #7	usp47 (ENSSGRG00000015388) #8	CLEC3A (ENSSGRG00000015512)	vat1l (ENSSGRG00000015514) ##9	bco1 (ENSSGRG00000015516) ##12	bco1l (ENSSGRG00000015524) ##12	ipo7 (ENSSGRG00000015566) ##14	tmem41b (ENSSGRG00000015657) ##15	DENND5A (ENSSGRG00000015660) ##16	sinhcafl (ENSSGRG00000015782) #17	MMP15 (ENSSGRG00000015795) ##20	dhcr7 (ENSSGRG00000016611) ##21	nadsyn1 (ENSSGRG00000016645) ##22	tpcn2 (ENSSGRG00000016652) ##23	ccnd1 (ENSSGRG00000016653) ##24	ENSSGRG00000016672	fgf19 (ENSSGRG00000016673) ##26	fgf4 (ENSSGRG00000016674) ##27	fgf3 (ENSSGRG00000016675) ##28	ENSSGRG00000016676	SLC2A13 (ENSSGRG00000016677)	ENSSGRG00000016678	ENSSGRG00000016679	slco1d1 (ENSSGRG00000016692)	ENSSGRG00000017122	ENSSGRG00000017127	IAPP (ENSSGRG00000017128)	pyroxd1 (ENSSGRG00000017130)
Goldfish	MODERN SPECIES	25	TEAD1 (ENSCARG00000007719)	MICAL2 (ENSCARG00000008255)	ENSCARG00000008294	usp47 (ENSCARG00000008428) #8	vat1l (ENSCARG00000010717) #9	bola3 (ENSCARG00000010740) #10	ipo7 (ENSCARG00000010932) #14	bco1 (ENSCARG00000014207) #11	ENSCARG00000014263 #13	tmem41b (ENSCARG00000014300) #15	DENND5A (ENSCARG00000014366) #16	sinhcafl (ENSCARG00000015973) #17	ENSCARG00000015984 ##18	MMP15 (ENSCARG00000016014) #20	dhcr7 (ENSCARG00000016168) #21	nadsyn1 (ENSCARG00000016229) ##22	tpcn2 (ENSCARG00000016284) #23	ccnd1 (ENSCARG00000016361) #24	ENSCARG00000016373	fgf3 (ENSCARG00000016384) #28	fgf4 (ENSCARG00000016389) #27	zgc:153993 (ENSCARG00000016399) #29	ano1a (ENSCARG00000016419) #30	ENSCARG00000016562 #31	pacsin3 (ENSCARG00000016585) #32	csnk1g1 (ENSCARG00000016635) #33	rps17 (ENSCARG00000016679) #34	neo1a (ENSCARG00000017084) #35	chrna7a (ENSCARG00000029091) #36	ENSCARG00000029212 #37	znf609b (ENSCARG00000029233)
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000010152.g.a.b ##22
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000010152.g.a.b ##22
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	183															dhcr7 (ENSSGRG00000008624) #21	nadsyn1 (ENSSGRG00000008625) ##22	tpcn2 (ENSSGRG00000008655) #23	ccnd1 (ENSSGRG00000008656) #24	lto1 (ENSSGRG00000008670) #25	fgf19 (ENSSGRG00000008671) #26	fgf4 (ENSSGRG00000008673) #27	fgf4 (ENSSGRG00000008674) #27	fgf3 (ENSSGRG00000008676) #28	zgc:153993 (ENSSGRG00000008677) #29	ano1a (ENSSGRG00000008684) #30	pacsin3 (ENSSGRG00000009241) #32	csnk1g1 (ENSSGRG00000009631) #33	rps17 (ENSSGRG00000010006) #34	neo1a (ENSSGRG00000010040) #35	chrna7a (ENSSGRG00000012746) #36	ENSSGRG00000012747 #37