Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000163107	ENSGT00940000162553	ENSGT00940000162614 #10	ENSGT00940000162205 #11	ENSGT00940000162921 #12	ENSGT00940000163698	ENSGT00390000012484 #13	ENSGT00940000161233 #14	ENSGT00730000111146 #15	ENSGT01030000234564.a.a.b.a #16	ENSGT00530000063715.a #17	ENSGT00940000159173 #18	ENSGT00940000153524.b.a.a #19	ENSGT00940000153634.a #20	ENSGT00730000110895.b.b #21	ENSGT00940000160063 #22	ENSGT00940000153941.a.b #23	ENSGT00940000161156 #24	ENSGT00940000159563 #25	ENSGT00940000162901 #27	ENSGT00390000013488 #26	ENSGT00390000017780.e #28	ENSGT00950000183102.C #29	ENSGT00950000182827.B #30	ENSGT00940000161689 #31	ENSGT00940000158963 #32	ENSGT00940000162057 #33	ENSGT00720000108868 #34	ENSGT00940000157503 #35	ENSGT00940000154102.b #36	ENSGT00390000008631.b #37
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	81				ENSGT00940000162614 #10	ENSGT00940000162205 #11	ENSGT00940000162921 #12	ENSGT00390000012484 #13	ENSGT00940000161233 #14	ENSGT00730000111146 #15	ENSGT01030000234564.a.a.b.a #16	ENSGT00530000063715.a #17	ENSGT00940000159173 #18	ENSGT00940000153524.b.a.a #19	ENSGT00940000153634.a #20	ENSGT00730000110895.b.b #21	ENSGT00940000160063 #22	ENSGT00940000153941.a.b #23	ENSGT00940000161156 #24	ENSGT00940000159563 #25	ENSGT00940000162901.c #27	ENSGT00390000013488 #26	ENSGT00390000017780.e #28	ENSGT00950000183102.C #29	ENSGT00950000182827.B #30	ENSGT00940000161689 #31	ENSGT00940000158963 #32	ENSGT00940000162057 #33	ENSGT00720000108868 #34	ENSGT00940000157503 #35	ENSGT00940000154102.b #36	ENSGT00390000008631.b #37
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	120				ENSGT00940000162614 #10	ENSGT00940000162205 #11	ENSGT00940000162921 #12	ENSGT00390000012484 #13	ENSGT00940000161233 #14	ENSGT00730000111146 #15	ENSGT01030000234564.a.a.b.a #16	ENSGT00530000063715.a #17	ENSGT00940000159173 #18	ENSGT00940000153524.b.a.a #19	ENSGT00940000153634.a #20	ENSGT00730000110895.b.b #21	ENSGT00940000160063 #22	ENSGT00940000153941.a.b #23	ENSGT00940000161156 #24	ENSGT00940000159563 #25	ENSGT00940000162901.c #27	ENSGT00390000013488 #26	ENSGT00390000017780.e #28	ENSGT00950000183102.C #29	ENSGT00950000182827.B #30	ENSGT00940000161689 #31	ENSGT00940000158963 #32	ENSGT00940000162057 #33	ENSGT00720000108868 #34	ENSGT00940000157503 #35	ENSGT00940000154102.b #36	ENSGT00390000008631.b #37
Squirrel	MODERN SPECIES	321			ENSSTOG00000028170 #9	ZNF182 (ENSSTOG00000020030) #10	ENSSTOG00000006249 #11	ENSSTOG00000034288 #12	ENSSTOG00000015375 #13	SLC38A5 (ENSSTOG00000001034) #14	FTSJ1 (ENSSTOG00000027717) #15	PORCN (ENSSTOG00000001047) #16	EBP (ENSSTOG00000001055) #17	TBC1D25 (ENSSTOG00000026006) #18	ENSSTOG00000027493 #19	WDR13 (ENSSTOG00000014866) #20	WAS (ENSSTOG00000028043) #21	SUV39H1 (ENSSTOG00000015328) #22	GLOD5 (ENSSTOG00000014150) #23	GATA1 (ENSSTOG00000026993) #24	HDAC6 (ENSSTOG00000014156) #25	PCSK1N (ENSSTOG00000025546) #26	ERAS (ENSSTOG00000028430) #27	TIMM17B (ENSSTOG00000014173) #28	PQBP1 (ENSSTOG00000034920) #29	SLC35A2 (ENSSTOG00000014179) #30	PIM2 (ENSSTOG00000014191) #31	OTUD5 (ENSSTOG00000014202) #32	KCND1 (ENSSTOG00000019883) #33	GRIPAP1 (ENSSTOG00000014221) #34	TFE3 (ENSSTOG00000014237) #35	CCDC120 (ENSSTOG00000020841) #36	PRAF2 (ENSSTOG00000009679) #37
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	341						ZNF182 (ENSUPAG00010002470) #10	ENSUPAG00010002478 #11	ENSUPAG00010002488 #12	SLC38A5 (ENSUPAG00010002495) #14	FTSJ1 (ENSUPAG00010002545) #15	PORCN (ENSUPAG00010002577) #16	EBP (ENSUPAG00010002710) #17	TBC1D25 (ENSUPAG00010002723) #18	WDR13 (ENSUPAG00010002757) #20	WAS (ENSUPAG00010002779) #21	SUV39H1 (ENSUPAG00010002798) #22	ENSUPAG00010002821	GLOD5 (ENSUPAG00010002824) #23	GATA1 (ENSUPAG00010002837) #24	HDAC6 (ENSUPAG00010002848) #25	ERAS (ENSUPAG00010002926) #27	PCSK1N (ENSUPAG00010002932) #26	TIMM17B (ENSUPAG00010002940) #28	PQBP1 (ENSUPAG00010002947) #29	SLC35A2 (ENSUPAG00010002977) #30	PIM2 (ENSUPAG00010002998) #31	OTUD5 (ENSUPAG00010003005) #32	KCND1 (ENSUPAG00010003047) #33	GRIPAP1 (ENSUPAG00010003056) #34	ENSUPAG00010003193 #35	CCDC120 (ENSUPAG00010003364) #36
Alpin marmot	MODERN SPECIES	120				ZNF182 (ENSMMMG00000012687) #10	ENSMMMG00000012682 #11	ENSMMMG00000012670 #12	ENSMMMG00000012648 #13	SLC38A5 (ENSMMMG00000012638) #14	FTSJ1 (ENSMMMG00000012579) #15	PORCN (ENSMMMG00000012383) #16	EBP (ENSMMMG00000012370) #17	TBC1D25 (ENSMMMG00000012349) #18	RBM3 (ENSMMMG00000012319) #19	WDR13 (ENSMMMG00000012299) #20	WAS (ENSMMMG00000012285) #21	SUV39H1 (ENSMMMG00000012267) #22	ENSMMMG00000012261	ENSMMMG00000012256	GLOD5 (ENSMMMG00000012244) #23	GATA1 (ENSMMMG00000012237) #24	HDAC6 (ENSMMMG00000012161) #25	ENSMMMG00000012156 #27	PCSK1N (ENSMMMG00000012151) #26	TIMM17B (ENSMMMG00000012146) #28	PQBP1 (ENSMMMG00000012121) #29	OTUD5 (ENSMMMG00000012061) #32	KCND1 (ENSMMMG00000012055) #33	GRIPAP1 (ENSMMMG00000011943) #34	TFE3 (ENSMMMG00000011726) #35	ENSMMMG00000011713 #37	WDR45 (ENSMMMG00000011555)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	156	ELK1 (ENSSVLG00005010829)	ENSSVLG00005010750	ZNF81 (ENSSVLG00005010677)	ZNF182 (ENSSVLG00005010624) #10	ENSSVLG00005010573 #11	ENSSVLG00005010552 #12	ENSSVLG00005010511	ENSSVLG00005010403 #13	FTSJ1 (ENSSVLG00005010314) #15	PORCN (ENSSVLG00005021517) #16	EBP (ENSSVLG00005021464) #17	TBC1D25 (ENSSVLG00005021446) #18	RBM3 (ENSSVLG00005021391) #19	WDR13 (ENSSVLG00005021358) #20	WAS (ENSSVLG00005021256) #21	SUV39H1 (ENSSVLG00005021209) #22	GLOD5 (ENSSVLG00005021145) #23	GATA1 (ENSSVLG00005021013) #24	HDAC6 (ENSSVLG00005020953) #25	ERAS (ENSSVLG00005020927) #27	PCSK1N (ENSSVLG00005020895) #26	TIMM17B (ENSSVLG00005020828) #28	PQBP1 (ENSSVLG00005020775) #29	SLC35A2 (ENSSVLG00005020649) #30	PIM2 (ENSSVLG00005020572) #31	OTUD5 (ENSSVLG00005020359) #32	KCND1 (ENSSVLG00005020301) #33	GRIPAP1 (ENSSVLG00005020144) #34	TFE3 (ENSSVLG00005020065) #35	CCDC120 (ENSSVLG00005019933) #36	PRAF2 (ENSSVLG00005019896) #37