Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000161456 #8 ENSGT00730000111340 #9 ENSGT00940000157224 #10 ENSGT01010000222666 ENSGT00940000158652 #12 ENSGT00530000064222.b #13 ENSGT00390000011854 #14 ENSGT00940000159561 ENSGT00940000158237 #15 ENSGT00950000183050.b.a #16 ENSGT00390000013544 #17 ENSGT00940000155014 #18 ENSGT01010000230324 #19 ENSGT00390000012837 #20 ENSGT00390000006191 #21 ENSGT00390000005665 #22 ENSGT00390000001071 #23 ENSGT00390000008727.a.b #25 ENSGT00390000012816 #26 ENSGT00910000144250 #27 ENSGT00550000074912 #28 ENSGT00940000156159 #29 ENSGT00390000011698.c.b #30 ENSGT00940000160102 #31 ENSGT00390000012397 #32 ENSGT00950000183181.B.a #33 ENSGT00940000156452 #37 ENSGT00950000182998.A ENSGT00390000002032 ENSGT00390000018097 ENSGT00390000001277 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 11 WDHD1 (ENSSVLG00005004416) #7 SOCS4 (ENSSVLG00005004401) #8 ENSSVLG00005004383 #9 LGALS3 (ENSSVLG00005004351) #10 ENSSVLG00005004332 #11 DLGAP5 (ENSSVLG00005004281) #12 FBXO34 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