Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00390000001301	ENSGT00940000155719.b	ENSGT00940000155116.b	ENSGT00950000183055.b.a #10	ENSGT00940000157323 #11	ENSGT00390000008458 #12	ENSGT00940000161583 #13	ENSGT00390000008984 #14	ENSGT00940000162309 #15	ENSGT00390000010494 #16	ENSGT00390000003555 #17	ENSGT00940000156842 #18	ENSGT00640000091487 #19	ENSGT01060000248588.a.c.b #20	ENSGT00390000012346 #21	ENSGT00940000155372 #22	ENSGT00950000183130.A #23	ENSGT00940000155988 #24	ENSGT01070000253744.a.b	ENSGT00510000046908.a.a.b	ENSGT00390000007586.a.b	ENSGT00940000158340	ENSGT00940000153395.a	ENSGT00940000155475	ENSGT00800000124172	ENSGT00530000064570	ENSGT00940000156337	ENSGT00950000183027.b	ENSGT00950000183054.a.a.a	ENSGT00950000182924.A.b.a.b	ENSGT00550000075003
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	75	ENSGT00390000001301	ENSGT00940000155719.b	ENSGT00940000155116.b	ENSGT00950000183055.b.a #10	ENSGT00940000157323 #11	ENSGT00390000008458 #12	ENSGT00940000161583 #13	ENSGT00390000008984 #14	ENSGT00940000162309 #15	ENSGT00390000010494 #16	ENSGT00390000003555 #17	ENSGT00940000156842 #18	ENSGT00640000091487 #19	ENSGT01060000248588.a.c.b #20	ENSGT00390000012346 #21	ENSGT00940000155372 #22	ENSGT00950000183130.A #23	ENSGT00940000155988 #24	ENSGT01070000253744.a.b	ENSGT00510000046908.a.a.b	ENSGT00390000007586.a.b	ENSGT00940000158340	ENSGT00940000153395.a	ENSGT00940000155475	ENSGT00800000124172	ENSGT00530000064570	ENSGT00940000156337	ENSGT00950000183027.b	ENSGT00950000183054.a.a.a	ENSGT00950000182924.A.b.a.b	ENSGT00550000075003
Degu	MODERN SPECIES	297				SPRY1 (ENSODEG00000000325) #10	SPATA5 (ENSODEG00000000401) #11	NUDT6 (ENSODEG00000000982) #12	FGF2 (ENSODEG00000001008) #13	BBS12 (ENSODEG00000001051) #14	ENSODEG00000001131 #15	IL21 (ENSODEG00000001146) #16	IL2 (ENSODEG00000001158) #17	ADAD1 (ENSODEG00000001197) #18	BLTP1 (ENSODEG00000001505) #19	TRPC3 (ENSODEG00000001237) #20	BBS7 (ENSODEG00000001786) #21	CCNA2 (ENSODEG00000002082) #22	EXOSC9 (ENSODEG00000000589) #23	ANXA5 (ENSODEG00000000798) #24
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	135	INTU (ENSCLAG00000004954)	FAT4 (ENSCLAG00000006183)	ANKRD50 (ENSCLAG00000003314)	SPRY1 (ENSCLAG00000003787) #10	SPATA5 (ENSCLAG00000005265) #11	NUDT6 (ENSCLAG00000006306) #12	FGF2 (ENSCLAG00000003340) #13	ENSCLAG00000008111 #15	BBS12 (ENSCLAG00000017705) #14	IL21 (ENSCLAG00000009098) #16	IL2 (ENSCLAG00000009317) #17	ADAD1 (ENSCLAG00000004688) #18	BLTP1 (ENSCLAG00000007818) #19	TRPC3 (ENSCLAG00000003574) #20	BBS7 (ENSCLAG00000004340) #21	CCNA2 (ENSCLAG00000003880) #22	EXOSC9 (ENSCLAG00000004644) #23	ANXA5 (ENSCLAG00000004278) #24	ENSCLAG00000005382	QRFPR (ENSCLAG00000006789)	TNIP3 (ENSCLAG00000004304)	NDNF (ENSCLAG00000004819)	PRDM5 (ENSCLAG00000005392)	ENSCLAG00000003295	MAD2L1 (ENSCLAG00000003756)	PDE5A (ENSCLAG00000004806)	FABP2 (ENSCLAG00000004293)	C4orf3 (ENSCLAG00000005064)	USP53 (ENSCLAG00000005403)	MYOZ2 (ENSCLAG00000003567)	SYNPO2 (ENSCLAG00000004412)
Guinea pig	MODERN SPECIES	7	INTU (ENSCPOG00000001974)	FAT4 (ENSCPOG00000003631)	ANKRD50 (ENSCPOG00000012841)	SPRY1 (ENSCPOG00000035769) #10	SPATA5 (ENSCPOG00000005397) #11	ENSCPOG00000030140 #12	FGF2 (ENSCPOG00000005386) #13	BBS12 (ENSCPOG00000005539) #14	ENSCPOG00000021793 #15	IL21 (ENSCPOG00000012431) #16	IL2 (ENSCPOG00000008265) #17	ADAD1 (ENSCPOG00000014455) #18	BLTP1 (ENSCPOG00000010581) #19	TRPC3 (ENSCPOG00000001231) #20	BBS7 (ENSCPOG00000001229) #21	CCNA2 (ENSCPOG00000010373) #22	EXOSC9 (ENSCPOG00000034344) #23	ANXA5 (ENSCPOG00000038586) #24	QRFPR (ENSCPOG00000001530)	TNIP3 (ENSCPOG00000003813)	NDNF (ENSCPOG00000009703)	PRDM5 (ENSCPOG00000012883)	MAD2L1 (ENSCPOG00000030145)	PDE5A (ENSCPOG00000008756)	FABP2 (ENSCPOG00000008750)	C4orf3 (ENSCPOG00000021561)	ENSCPOG00000001323	MYOZ2 (ENSCPOG00000007291)	SYNPO2 (ENSCPOG00000020548)	SEC24D (ENSCPOG00000004621)	METTL14 (ENSCPOG00000037880)