Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT00390000001301	ENSGT00940000155719.b #8	ENSGT00940000155116.b #9	ENSGT00950000183055.b.a #10	ENSGT00940000157323 #11	ENSGT00390000008458 #12	ENSGT00940000161583 #13	ENSGT00390000008984 #14	ENSGT00940000162309 #15	ENSGT00390000010494 #16	ENSGT00390000003555 #17	ENSGT00940000156842 #18	ENSGT00640000091487 #19	ENSGT01060000248588.a.c.b #20	ENSGT00390000012346 #21	ENSGT00940000155372 #22	ENSGT00950000183130.A #23	ENSGT01010000222815	ENSGT00940000155988 #24	ENSGT01070000253744.a.b #25	ENSGT00510000046908.a.a.b #26	ENSGT00390000007586.a.b #27	ENSGT00940000158340 #28	ENSGT00940000153395.a #29	ENSGT00940000155475	ENSGT00800000124172	ENSGT00940000156337	ENSGT00950000183027.b	ENSGT00950000183054.a.a.a	ENSGT01060000248649.a	ENSGT00950000182924.A.b.a.b
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	45	ENSGT00390000001301	ENSGT00940000155719.b #8	ENSGT00940000155116.b #9	ENSGT00950000183055.b.a #10	ENSGT00940000157323 #11	ENSGT00390000008458 #12	ENSGT00940000161583 #13	ENSGT00390000008984 #14	ENSGT00940000162309 #15	ENSGT00390000010494 #16	ENSGT00390000003555 #17	ENSGT00940000156842 #18	ENSGT00640000091487 #19	ENSGT01060000248588.a.c.b #20	ENSGT00390000012346 #21	ENSGT00940000155372 #22	ENSGT00950000183130.A #23	ENSGT01010000222815	ENSGT00940000155988 #24	ENSGT01070000253744.a.b #25	ENSGT00510000046908.a.a.b #26	ENSGT00390000007586.a.b #27	ENSGT00940000158340 #28	ENSGT00940000153395.a #29
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	148	ENSGT00390000001301	ENSGT00940000155719.b #8	ENSGT00940000155116.b #9	ENSGT00950000183055.b.a #10	ENSGT00940000157323 #11	ENSGT00390000008458 #12	ENSGT00940000161583 #13	ENSGT00390000008984 #14	ENSGT00940000162309 #15	ENSGT00390000010494 #16	ENSGT00390000003555 #17	ENSGT00940000156842 #18	ENSGT00640000091487 #19	ENSGT01060000248588.a.c.b #20	ENSGT00390000012346 #21	ENSGT00940000155372 #22	ENSGT00950000183130.A #23	ENSGT01010000222815	ENSGT00940000155988 #24	ENSGT01070000253744.a.b #25	ENSGT00510000046908.a.a.b #26	ENSGT00390000007586.a.b #27	ENSGT00940000158340 #28	ENSGT00940000153395.a #29
Squirrel	MODERN SPECIES	262		FAT4 (ENSSTOG00000010020) #8	ANKRD50 (ENSSTOG00000020609) #9	SPRY1 (ENSSTOG00000019856) #10	SPATA5 (ENSSTOG00000016252) #11	NUDT6 (ENSSTOG00000020437) #12	FGF2 (ENSSTOG00000028359) #13	BBS12 (ENSSTOG00000010337) #14	ENSSTOG00000024309 #15	IL21 (ENSSTOG00000012108) #16	IL2 (ENSSTOG00000016100) #17	ADAD1 (ENSSTOG00000027523) #18	BLTP1 (ENSSTOG00000016095) #19	TRPC3 (ENSSTOG00000014731) #20	BBS7 (ENSSTOG00000026947) #21	CCNA2 (ENSSTOG00000008011) #22	EXOSC9 (ENSSTOG00000007984) #23	ANXA5 (ENSSTOG00000015236) #24	QRFPR (ENSSTOG00000011128) #25	ENSSTOG00000002218 #26	NDNF (ENSSTOG00000026308) #27	PRDM5 (ENSSTOG00000004741) #28	MAD2L1 (ENSSTOG00000025410) #29
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	504														TRPC3 (ENSUPAG00010003020) #20	BBS7 (ENSUPAG00010003036) #21	CCNA2 (ENSUPAG00010003078) #22	EXOSC9 (ENSUPAG00010003098) #23	SMIM43 (ENSUPAG00010003133)	ANXA5 (ENSUPAG00010003144) #24	QRFPR (ENSUPAG00010003178) #25	ENSUPAG00010003212 #26	NDNF (ENSUPAG00010003281) #27	PRDM5 (ENSUPAG00010003287) #28	MAD2L1 (ENSUPAG00010003371) #29
Alpin marmot	MODERN SPECIES	5	FAT4 (ENSMMMG00000014294) #8	ANKRD50 (ENSMMMG00000014280) #9	SPRY1 (ENSMMMG00000014257) #10	SPATA5 (ENSMMMG00000014189) #11	ENSMMMG00000014177 #12	FGF2 (ENSMMMG00000014167) #13	BBS12 (ENSMMMG00000014165) #14	ENSMMMG00000014128 #15	ENSMMMG00000014115	IL21 (ENSMMMG00000014088) #16	IL2 (ENSMMMG00000014074) #17	ADAD1 (ENSMMMG00000014047) #18	BLTP1 (ENSMMMG00000013870) #19	TRPC3 (ENSMMMG00000013843) #20	BBS7 (ENSMMMG00000013792) #21	CCNA2 (ENSMMMG00000013774) #22	EXOSC9 (ENSMMMG00000013752) #23	ANXA5 (ENSMMMG00000013732) #24	QRFPR (ENSMMMG00000013643) #25	ENSMMMG00000013612 #26	NDNF (ENSMMMG00000013604) #27	PRDM5 (ENSMMMG00000013584) #28	MAD2L1 (ENSMMMG00000013561) #29
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	18	FAT4 (ENSSVLG00005016900) #8	ANKRD50 (ENSSVLG00005016833) #9	SPRY1 (ENSSVLG00005016820) #10	SPATA5 (ENSSVLG00005016625) #11	NUDT6 (ENSSVLG00005016540) #12	FGF2 (ENSSVLG00005016503) #13	BBS12 (ENSSVLG00005016487) #14	ENSSVLG00005016460 #15	ENSSVLG00005016447	IL21 (ENSSVLG00005016343) #16	IL2 (ENSSVLG00005016296) #17	ENSSVLG00005016021 #18	BLTP1 (ENSSVLG00005015963) #19	TRPC3 (ENSSVLG00005015770) #20	BBS7 (ENSSVLG00005015419) #21	CCNA2 (ENSSVLG00005015372) #22	ENSSVLG00005015214 #23	SMIM43 (ENSSVLG00005015189)	ANXA5 (ENSSVLG00005014980) #24	ENSSVLG00005014925	QRFPR (ENSSVLG00005014858) #25	NDNF (ENSSVLG00005014362) #27	PRDM5 (ENSSVLG00005014293) #28	MAD2L1 (ENSSVLG00005014204) #29	ENSSVLG00005014083	PDE5A (ENSSVLG00005013841)	FABP2 (ENSSVLG00005013640)	USP53 (ENSSVLG00005013592)	MYOZ2 (ENSSVLG00005013483)	ENSSVLG00005013417	SEC24D (ENSSVLG00005013288)