Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000009310 #8 ENSGT00940000163241 #9 ENSGT00940000160784 #10 ENSGT00940000154563.r #11 ENSGT00940000155199 #12 ENSGT00390000016889 #13 ENSGT00950000182825.A.a.a #14 ENSGT00940000163751 #15 ENSGT00940000157076 #16 ENSGT00940000157586 #17 ENSGT00940000157067 #18 ENSGT00940000157365 #19 ENSGT00940000159939 #20 ENSGT00940000164079 ENSGT00940000160979 #21 ENSGT00940000159657.d #22 ENSGT01100000263518.B.b.a #23 ENSGT00940000158955 #24 ENSGT00940000160431 #25 ENSGT00390000017780.f #26 ENSGT00940000159825 #27 ENSGT00730000111186 #28 ENSGT00390000008224 #29 ENSGT00940000156637 #30 ENSGT00900000143186 ENSGT00940000156777 #31 ENSGT00440000039564.a.a #32 ENSGT01030000234588.b.a #33 ENSGT00390000005256 #34 ENSGT00940000154709.a.a #35 ENSGT00940000156735 #36 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00390000009310 #8 ENSGT00940000163241 #9 ENSGT00940000160784 #10 ENSGT00940000154563.r #11 ENSGT00940000155199 #12 ENSGT00390000016889 #13 ENSGT00950000182825.A.a.a #14 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