Vertebrata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000157548 #22
Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES	57										ENSGT00990000205360	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680	ENSGT00950000183015.D	ENSGT00940000153692.A	ENSGT00940000155133.b	ENSGT00390000012574	ENSGT00950000182808.a.a.a.a.b	ENSGT00950000182974.a.b	ENSGT00940000157583
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	57											ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00950000183015.D	ENSGT00940000153692.A	ENSGT00940000155133.b	ENSGT00950000182808.a.a.a.a.b
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	271											ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000165114	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000160325.a	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT00940000162090	ENSGT00390000003175.a.b
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000165114	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000166264	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000160325.a	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT00940000162090
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000165114	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000166264	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT00940000162090	ENSGT00390000003175.a.b
Theria	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000166264	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT00940000162090	ENSGT00390000003175.a.b
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000164242	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT00940000162090
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00950000185288	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00900000143161	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00950000185288	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00900000143161	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00900000143161	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914
Glires	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00900000143161	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	42	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT00940000162090
Pika	MODERN SPECIES	1600															ANXA3 (ENSOPRG00000008243) #21	BMP2K (ENSOPRG00000008256) #22	PAQR3 (ENSOPRG00000008282) #23
Rabbit	MODERN SPECIES	6	ENSOCUG00000011382	STBD1 (ENSOCUG00000025567)	CCDC158 (ENSOCUG00000013553)	ENSOCUG00000033565	ENSOCUG00000012454	SEPTIN11 (ENSOCUG00000001289)	ENSOCUG00000012682	ENSOCUG00000037165	CCNG2 (ENSOCUG00000008388)	CXCL13 (ENSOCUG00000024738)	ENSOCUG00000001139	CNOT6L (ENSOCUG00000002497)	MRPL1 (ENSOCUG00000003852)	FRAS1 (ENSOCUG00000017867)	ANXA3 (ENSOCUG00000017878) #21	BMP2K (ENSOCUG00000011578) #22	PAQR3 (ENSOCUG00000011585) #23	ENSOCUG00000033437	NAA11 (ENSOCUG00000010102)	GK2 (ENSOCUG00000025309)	ENSOCUG00000036221	ANTXR2 (ENSOCUG00000004747)	ENSOCUG00000026562	FGF5 (ENSOCUG00000012418)	ENSOCUG00000034305	CFAP299 (ENSOCUG00000003708)	BMP3 (ENSOCUG00000000658)	PRKG2 (ENSOCUG00000008464)	RASGEF1B (ENSOCUG00000010456)	HNRNPD (ENSOCUG00000001357)	HNRNPDL (ENSOCUG00000013805)
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00900000143161	ENSGT00940000167166	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00900000143161	ENSGT00940000167166	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827.t	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00900000143161	ENSGT00940000167166	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT01030000234601.c.b.a	ENSGT00390000013620.g.a	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827.t	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00900000143161	ENSGT00940000167166	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914
Guinea pig	MODERN SPECIES	5	NUP54 (ENSCPOG00000000161)	SCARB2 (ENSCPOG00000012985)	STBD1 (ENSCPOG00000030175)	CCDC158 (ENSCPOG00000011711)	ENSCPOG00000030634	SHROOM3 (ENSCPOG00000013833)	SOWAHB (ENSCPOG00000022364)	SEPTIN11 (ENSCPOG00000009037)	CCNI (ENSCPOG00000009041)	CCNG2 (ENSCPOG00000013523)	ENSCPOG00000001379	CNOT6L (ENSCPOG00000010337)	MRPL1 (ENSCPOG00000031686)	FRAS1 (ENSCPOG00000012831)	ANXA3 (ENSCPOG00000012850) #21	BMP2K (ENSCPOG00000011715) #22	PAQR3 (ENSCPOG00000011724) #23	ENSCPOG00000031824	NAA11 (ENSCPOG00000019924)	ANTXR2 (ENSCPOG00000001271)	PRDM8 (ENSCPOG00000019738)	FGF5 (ENSCPOG00000001393)	CFAP299 (ENSCPOG00000004055)	BMP3 (ENSCPOG00000033994)	PRKG2 (ENSCPOG00000014935)	ENSCPOG00000003412	ENSCPOG00000036603	ENSCPOG00000032197	HNRNPD (ENSCPOG00000040484)	HNRNPDL (ENSCPOG00000015619)	ENOPH1 (ENSCPOG00000015620)
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT01030000234601.c.b.a	ENSGT00390000013620.g.a	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827.t	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT00940000162090
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	140	ENSCLAG00000006752	SCARB2 (ENSCLAG00000006924)	CCDC158 (ENSCLAG00000007109)	SHROOM3 (ENSCLAG00000004897)	SOWAHB (ENSCLAG00000005693)	SEPTIN11 (ENSCLAG00000006114)	CCNI (ENSCLAG00000006499)	CCNG2 (ENSCLAG00000006623)	ENSCLAG00000006918	ENSCLAG00000003952	CNOT6L (ENSCLAG00000004598)	MRPL1 (ENSCLAG00000005041)	ENSCLAG00000005247	FRAS1 (ENSCLAG00000005115)	ANXA3 (ENSCLAG00000004295) #21	BMP2K (ENSCLAG00000004531) #22	PAQR3 (ENSCLAG00000004835) #23	NAA11 (ENSCLAG00000004971)	ANTXR2 (ENSCLAG00000005549)	PRDM8 (ENSCLAG00000009045)	FGF5 (ENSCLAG00000009223)	CFAP299 (ENSCLAG00000009393)	BMP3 (ENSCLAG00000009762)	PRKG2 (ENSCLAG00000007228)	RASGEF1B (ENSCLAG00000004224)	ENSCLAG00000006377	HNRNPD (ENSCLAG00000006540)	ENSCLAG00000008428	ENOPH1 (ENSCLAG00000008708)	TMEM150C (ENSCLAG00000008893)	SCD5 (ENSCLAG00000009253)
Degu	MODERN SPECIES	209								ENSODEG00000002115	ENSODEG00000002141	CNOT6L (ENSODEG00000004161)	ENSODEG00000004187	MRPL1 (ENSODEG00000004206)	ENSODEG00000004236	FRAS1 (ENSODEG00000004296)	ENSODEG00000004480 #21	BMP2K (ENSODEG00000004544) #22	PAQR3 (ENSODEG00000004606) #23	ENSODEG00000019058	ENSODEG00000004629	ANTXR2 (ENSODEG00000004699)	PRDM8 (ENSODEG00000004830)	FGF5 (ENSODEG00000004879)	CFAP299 (ENSODEG00000004917)	BMP3 (ENSODEG00000002639)	PRKG2 (ENSODEG00000002666)	ENSODEG00000018836	RASGEF1B (ENSODEG00000002708)	ENSODEG00000002822	ENSODEG00000018914	ENSODEG00000002855
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	26	HPGDS (ENSHGLG00000039097)	ENSHGLG00000048563	ENSHGLG00000032448	ENSHGLG00000006128	ENSHGLG00000033607	ENSHGLG00000035615	BMPR1B (ENSHGLG00000008496)	ENSHGLG00000015705	ENSHGLG00000013357	ENSHGLG00000008980	ENSHGLG00000045804	ENSHGLG00000013760	ENSHGLG00000049854	ENSHGLG00000005415	ANXA3 (ENSHGLG00000005040) #21	ENSHGLG00000004648 #22	ENSHGLG00000004308 #23	NAA11 (ENSHGLG00000004240)	ENSHGLG00000040025	GK2 (ENSHGLG00000004055)	ENSHGLG00000040695	ENSHGLG00000005029	ENSHGLG00000037275	ANTXR2 (ENSHGLG00000003724)	PRDM8 (ENSHGLG00000047978)	ENSHGLG00000039017	FGF5 (ENSHGLG00000008222)	ENSHGLG00000032267	CFAP299 (ENSHGLG00000007902)	BMP3 (ENSHGLG00000007595)	PRKG2 (ENSHGLG00000007272)
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	47	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000175746.a.a.b	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914.q	ENSGT01030000234578.A.a
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	73	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834
Squirrel	MODERN SPECIES	276	NUP54 (ENSSTOG00000009529)	SCARB2 (ENSSTOG00000009541)	FAM47E (ENSSTOG00000009561)	STBD1 (ENSSTOG00000012600)	CCDC158 (ENSSTOG00000012606)	SHROOM3 (ENSSTOG00000020677)	SOWAHB (ENSSTOG00000027913)	SEPTIN11 (ENSSTOG00000008117)	ENSSTOG00000008131	CCNG2 (ENSSTOG00000027922)	CXCL13 (ENSSTOG00000015287)	CNOT6L (ENSSTOG00000015293)	MRPL1 (ENSSTOG00000001415)	FRAS1 (ENSSTOG00000011319)	ANXA3 (ENSSTOG00000020088) #21	BMP2K (ENSSTOG00000005803) #22	PAQR3 (ENSSTOG00000005831) #23	NAA11 (ENSSTOG00000025010)
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	285							SOWAHB (ENSUPAG00010008589)	ENSUPAG00010008576	SEPTIN11 (ENSUPAG00010008308)	CCNI (ENSUPAG00010008294)	CCNG2 (ENSUPAG00010008267)	CNOT6L (ENSUPAG00010008241)	MRPL1 (ENSUPAG00010008162)	FRAS1 (ENSUPAG00010008059)	ANXA3 (ENSUPAG00010008034) #21	BMP2K (ENSUPAG00010007968) #22	PAQR3 (ENSUPAG00010007927) #23	ENSUPAG00010007920	ENSUPAG00010007898	GK2 (ENSUPAG00010007894)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	59	SCARB2 (ENSMMMG00000006532)	ENSMMMG00000006501	STBD1 (ENSMMMG00000006497)	CCDC158 (ENSMMMG00000006444)	SHROOM3 (ENSMMMG00000006413)	ENSMMMG00000006397	SEPTIN11 (ENSMMMG00000006323)	CCNI (ENSMMMG00000006313)	CCNG2 (ENSMMMG00000006291)	ENSMMMG00000006280	ENSMMMG00000006269	CNOT6L (ENSMMMG00000006238)	MRPL1 (ENSMMMG00000006161)	FRAS1 (ENSMMMG00000006039)	ANXA3 (ENSMMMG00000006017) #21	BMP2K (ENSMMMG00000005982) #22	PAQR3 (ENSMMMG00000005949) #23	ENSMMMG00000005934	ENSMMMG00000005922	ANTXR2 (ENSMMMG00000005901)	PRDM8 (ENSMMMG00000005885)	FGF5 (ENSMMMG00000005878)	CFAP299 (ENSMMMG00000005872)	BMP3 (ENSMMMG00000005861)	PRKG2 (ENSMMMG00000005810)	RASGEF1B (ENSMMMG00000005646)	ENSMMMG00000005621	HNRNPD (ENSMMMG00000005546)	HNRNPDL (ENSMMMG00000005515)	ENSMMMG00000005483	TMEM150C (ENSMMMG00000005472)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	18	CCDC158 (ENSSVLG00005024597)	SHROOM3 (ENSSVLG00005024547)	SOWAHB (ENSSVLG00005024521)	SEPTIN11 (ENSSVLG00005024472)	CCNI (ENSSVLG00005024437)	CCNG2 (ENSSVLG00005024382)	CXCL13 (ENSSVLG00005024355)	ENSSVLG00005024335	ENSSVLG00005024208	ENSSVLG00005024181	ENSSVLG00005024131	ENSSVLG00005024108	FRAS1 (ENSSVLG00005023684)	ENSSVLG00005023616	ANXA3 (ENSSVLG00005023519) #21	BMP2K (ENSSVLG00005023420) #22	PAQR3 (ENSSVLG00005023375) #23	ENSSVLG00005023346	NAA11 (ENSSVLG00005023333)	ENSSVLG00005023309	ANTXR2 (ENSSVLG00005023242)	ENSSVLG00005023206	FGF5 (ENSSVLG00005023174)	CFAP299 (ENSSVLG00005023128)	BMP3 (ENSSVLG00005023094)	PRKG2 (ENSSVLG00005022851)	RASGEF1B (ENSSVLG00005022447)	HNRNPD (ENSSVLG00005022330)	HNRNPDL (ENSSVLG00005022171)	ENOPH1 (ENSSVLG00005022006)	TMEM150C (ENSSVLG00005021907)
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000164242	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00900000143161	ENSGT00940000167166	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	368	Scarb2 (ENSDORG00000005294)	ENSDORG00000007800	Stbd1 (ENSDORG00000009454)	Ccdc158 (ENSDORG00000009456)	Shroom3 (ENSDORG00000012959)	ENSDORG00000025484	Sowahb (ENSDORG00000015525)	Septin11 (ENSDORG00000015527)	ENSDORG00000029625	Ccng2 (ENSDORG00000007156)	Cxcl13 (ENSDORG00000029327)	Cnot6l (ENSDORG00000011458)	Mrpl1 (ENSDORG00000015752)	Fras1 (ENSDORG00000008295)	Anxa3 (ENSDORG00000008315) #21	Bmp2k (ENSDORG00000013890) #22	Paqr3 (ENSDORG00000013893) #23	ENSDORG00000024213	Antxr2 (ENSDORG00000008986)	Prdm8 (ENSDORG00000015398)	Fgf5 (ENSDORG00000013481)	Cfap299 (ENSDORG00000000888)	Bmp3 (ENSDORG00000008380)	Prkg2 (ENSDORG00000008384)	Rasgef1b (ENSDORG00000008210)	ENSDORG00000028788	Hnrnpd (ENSDORG00000012507)	ENSDORG00000000968	Enoph1 (ENSDORG00000000973)	Tmem150c (ENSDORG00000028142)	ENSDORG00000015366
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000164242	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00900000143161	ENSGT00940000167166	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000164242.a	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00900000143161	ENSGT00940000167166	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000164242.a	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00900000143161	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00860000136197	ENSGT00940000154426.b.b
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT01030000234531.A.b.b.b.e.a.a.a.b.a.b	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000164242.a	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00900000143161	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00860000136197	ENSGT00940000154426.b.b
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00940000165223	ENSGT01030000234531.A.b.b.b.e.a.a.a.b.a.b	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000164242.a	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00900000143161	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00860000136197	ENSGT00940000154426.b.b
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	76	Ccdc158 (ENSCGRG00001020351)	Shroom3 (ENSCGRG00001013324)	Septin11 (ENSCGRG00001000184)	Ccni (ENSCGRG00001019404)	Ccng2 (ENSCGRG00001000047)	ENSCGRG00001021211	ENSCGRG00001000219	ENSCGRG00001018445	Cxcl13 (ENSCGRG00001021479)	Cnot6l (ENSCGRG00001022099)	ENSCGRG00001021246	ENSCGRG00001002514	ENSCGRG00001005376	Fras1 (ENSCGRG00001010821)	Anxa3 (ENSCGRG00001015457) #21	Bmp2k (ENSCGRG00001009725) #22	Paqr3 (ENSCGRG00001013078) #23	Naa11 (ENSCGRG00001001343)	Gk2 (ENSCGRG00001001900)	Antxr2 (ENSCGRG00001004640)	Prdm8 (ENSCGRG00001011271)	Fgf5 (ENSCGRG00001014809)	Cfap299 (ENSCGRG00001005694)	ENSCGRG00001002838	Bmp3 (ENSCGRG00001013590)	Prkg2 (ENSCGRG00001021769)	Rasgef1b (ENSCGRG00001019748)	ENSCGRG00001021743	Vamp9 (ENSCGRG00001023846)	Hnrnpd (ENSCGRG00001014634)	Hnrnpdl (ENSCGRG00001010960)
Golden Hamster	MODERN SPECIES	629	ENSMAUG00000007451	Ccdc158 (ENSMAUG00000017239)	Shroom3 (ENSMAUG00000014696)	Sowahb (ENSMAUG00000000109)	Septin11 (ENSMAUG00000008193)	ENSMAUG00000000254	ENSMAUG00000017282	Ccng2 (ENSMAUG00000008907)	ENSMAUG00000007718	ENSMAUG00000001477	Cxcl13 (ENSMAUG00000017977)	ENSMAUG00000008880	Mrpl1 (ENSMAUG00000019228)	Fras1 (ENSMAUG00000000182)	Anxa3 (ENSMAUG00000014728) #21	Bmp2k (ENSMAUG00000017881) #22	Antxr2 (ENSMAUG00000010350)	Prdm8 (ENSMAUG00000018541)	ENSMAUG00000016825	Cfap299 (ENSMAUG00000016118)	Prkg2 (ENSMAUG00000018572)	Rasgef1b (ENSMAUG00000012337)	ENSMAUG00000016729	Vamp9 (ENSMAUG00000004512)	Hnrnpd (ENSMAUG00000008830)	ENSMAUG00000003347	Hnrnpdl (ENSMAUG00000011132)	ENSMAUG00000008281	Tmem150c (ENSMAUG00000016382)
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT01030000234531.A.b.b.b.e.a.a.a.b.a.b	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000164242.a	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a
Prairie vole	MODERN SPECIES	349	Scarb2 (ENSMOCG00000015507)	Fam47e (ENSMOCG00000011533)	Stbd1 (ENSMOCG00000022025)	Ccdc158 (ENSMOCG00000017131)	Shroom3 (ENSMOCG00000007993)	Sowahb (ENSMOCG00000006041)	Septin11 (ENSMOCG00000014932)	Ccni (ENSMOCG00000008434)	Ccng2 (ENSMOCG00000001565)	ENSMOCG00000013280	Cxcl13 (ENSMOCG00000021469)	Cnot6l (ENSMOCG00000009451)	Mrpl1 (ENSMOCG00000017395)	Fras1 (ENSMOCG00000001319)	Anxa3 (ENSMOCG00000017318) #21	Bmp2k (ENSMOCG00000021912) #22	Paqr3 (ENSMOCG00000010365) #23	Naa11 (ENSMOCG00000003829)	Gk2 (ENSMOCG00000004127)	Antxr2 (ENSMOCG00000022157)	Prdm8 (ENSMOCG00000020529)	Fgf5 (ENSMOCG00000014384)	Cfap299 (ENSMOCG00000020365)	ENSMOCG00000007117	Bmp3 (ENSMOCG00000000488)	Prkg2 (ENSMOCG00000018972)	Rasgef1b (ENSMOCG00000021595)	ENSMOCG00000010622	Hnrnpd (ENSMOCG00000021398)	Hnrnpdl (ENSMOCG00000015928)	Enoph1 (ENSMOCG00000008624)
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	1	Ccng2 (ENSPEMG00000015827)	ENSPEMG00000031191	ENSPEMG00000010896	ENSPEMG00000024546	ENSPEMG00000017363	ENSPEMG00000030477	ENSPEMG00000011518	ENSPEMG00000008737	Cxcl13 (ENSPEMG00000010815)	Cnot6l (ENSPEMG00000011554)	Mrpl1 (ENSPEMG00000018072)	ENSPEMG00000024801	ENSPEMG00000026583	Fras1 (ENSPEMG00000017422)	Anxa3 (ENSPEMG00000000393) #21	Bmp2k (ENSPEMG00000018145) #22	Paqr3 (ENSPEMG00000002261) #23	Naa11 (ENSPEMG00000003745)	Gk2 (ENSPEMG00000004823)	Antxr2 (ENSPEMG00000013646)	Prdm8 (ENSPEMG00000014817)	Fgf5 (ENSPEMG00000024375)	Cfap299 (ENSPEMG00000018712)	ENSPEMG00000024918	Bmp3 (ENSPEMG00000018921)	Prkg2 (ENSPEMG00000019159)	Rasgef1b (ENSPEMG00000000367)	Vamp9 (ENSPEMG00000014065)	Hnrnpd (ENSPEMG00000014804)	Hnrnpdl (ENSPEMG00000016545)	Enoph1 (ENSPEMG00000006785)
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000164242.a	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00860000136197	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914
Mus	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00900000143778	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000164242.a	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00900000143161	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00860000136197	ENSGT00940000154426.b.b
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00900000143778	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000164242.a	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00860000135924	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00900000143161	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00860000136197
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00900000143778	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000164242.a	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00860000135924	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00860000136197	ENSGT00940000154426.b.b
Mouse	MODERN SPECIES	14	Pramel45 (ENSMUSG00000092166)	Gm16513 (ENSMUSG00000095996)	Pramel46 (ENSMUSG00000096066)	Pramel47 (ENSMUSG00000079424)	Pramel48 (ENSMUSG00000070677)	Gm3286 (ENSMUSG00000079423)	Pramel49 (ENSMUSG00000094043)	Pramel50 (ENSMUSG00000096139)	Gm7982 (ENSMUSG00000072814)	E330014E10Rik (ENSMUSG00000072813)	Cxcl13 (ENSMUSG00000023078)	Cnot6l (ENSMUSG00000034724)	Mrpl1 (ENSMUSG00000029486)	Fras1 (ENSMUSG00000034687)	Anxa3 (ENSMUSG00000029484) #21	Bmp2k (ENSMUSG00000034663) #22	Paqr3 (ENSMUSG00000055725) #23	Naa11 (ENSMUSG00000046000)	Gk2 (ENSMUSG00000050553)	Antxr2 (ENSMUSG00000029338)	Prdm8 (ENSMUSG00000035456)	Fgf5 (ENSMUSG00000029337)	Cfap299 (ENSMUSG00000057816)	Bmp3 (ENSMUSG00000029335)	Prkg2 (ENSMUSG00000029334)	Rasgef1b (ENSMUSG00000089809)	Vamp9 (ENSMUSG00000105078)	Hnrnpd (ENSMUSG00000000568)	Hnrnpdl (ENSMUSG00000029328)	Enoph1 (ENSMUSG00000029326)	Tmem150c (ENSMUSG00000050640)
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000164242.a	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00860000135924	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00900000143161	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00860000136197
spretus	MODERN SPECIES	14	Nup54 (MGP_SPRETEiJ_G0028414)	Scarb2 (MGP_SPRETEiJ_G0028415)	Fam47e (MGP_SPRETEiJ_G0028416)	Stbd1 (MGP_SPRETEiJ_G0028417)	Ccdc158 (MGP_SPRETEiJ_G0028418)	Shroom3 (MGP_SPRETEiJ_G0028419)	Sowahb (MGP_SPRETEiJ_G0028420)	Septin11 (MGP_SPRETEiJ_G0028421)	Ccni (MGP_SPRETEiJ_G0028422)	Ccng2 (MGP_SPRETEiJ_G0028424)	Cxcl13 (MGP_SPRETEiJ_G0028425)	Cnot6l (MGP_SPRETEiJ_G0028426)	Mrpl1 (MGP_SPRETEiJ_G0028427)	Fras1 (MGP_SPRETEiJ_G0028428)	Anxa3 (MGP_SPRETEiJ_G0028429) #21	Bmp2k (MGP_SPRETEiJ_G0028430) #22	Paqr3 (MGP_SPRETEiJ_G0028431) #23	Naa11 (MGP_SPRETEiJ_G0028432)	Gk2 (MGP_SPRETEiJ_G0028433)	Antxr2 (MGP_SPRETEiJ_G0028434)	Prdm8 (MGP_SPRETEiJ_G0028435)	Fgf5 (MGP_SPRETEiJ_G0028436)	Cfap299 (MGP_SPRETEiJ_G0028437)	MGP_SPRETEiJ_G0028438	Bmp3 (MGP_SPRETEiJ_G0028439)	Prkg2 (MGP_SPRETEiJ_G0028440)	Rasgef1b (MGP_SPRETEiJ_G0028441)	MGP_SPRETEiJ_G0028442	Hnrnpd (MGP_SPRETEiJ_G0028443)	MGP_SPRETEiJ_G0028444	Hnrnpdl (MGP_SPRETEiJ_G0028445)
Steppe mouse	MODERN SPECIES	2585														Fras1 (ENSMSIG00000021152)	Anxa3 (ENSMSIG00000021090) #21	Bmp2k (ENSMSIG00000020881) #22	Paqr3 (ENSMSIG00000020866) #23	ENSMSIG00000020855
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	14	Nup54 (MGP_CAROLIEiJ_G0027417)	Scarb2 (MGP_CAROLIEiJ_G0027418)	Fam47e (MGP_CAROLIEiJ_G0027419)	Stbd1 (MGP_CAROLIEiJ_G0027420)	MGP_CAROLIEiJ_G0027421	Shroom3 (MGP_CAROLIEiJ_G0027422)	Sowahb (MGP_CAROLIEiJ_G0027423)	Septin11 (MGP_CAROLIEiJ_G0027424)	Ccni (MGP_CAROLIEiJ_G0027425)	Ccng2 (MGP_CAROLIEiJ_G0027427)	Cxcl13 (MGP_CAROLIEiJ_G0027428)	Cnot6l (MGP_CAROLIEiJ_G0027429)	MGP_CAROLIEiJ_G0027430	Fras1 (MGP_CAROLIEiJ_G0027431)	Anxa3 (MGP_CAROLIEiJ_G0027432) #21	Bmp2k (MGP_CAROLIEiJ_G0027433) #22	Paqr3 (MGP_CAROLIEiJ_G0027434) #23	Naa11 (MGP_CAROLIEiJ_G0027435)	Gk2 (MGP_CAROLIEiJ_G0027436)	Antxr2 (MGP_CAROLIEiJ_G0027437)	Prdm8 (MGP_CAROLIEiJ_G0027438)	Fgf5 (MGP_CAROLIEiJ_G0027439)	Cfap299 (MGP_CAROLIEiJ_G0027440)	MGP_CAROLIEiJ_G0027441	Bmp3 (MGP_CAROLIEiJ_G0027442)	Prkg2 (MGP_CAROLIEiJ_G0027443)	Rasgef1b (MGP_CAROLIEiJ_G0027444)	MGP_CAROLIEiJ_G0027445	Hnrnpd (MGP_CAROLIEiJ_G0027446)	MGP_CAROLIEiJ_G0027447	MGP_CAROLIEiJ_G0027448
Shrew mouse	MODERN SPECIES	4	Scarb2 (MGP_PahariEiJ_G0017196)	Fam47e (MGP_PahariEiJ_G0017197)	Stbd1 (MGP_PahariEiJ_G0017198)	Ccdc158 (MGP_PahariEiJ_G0017199)	Shroom3 (MGP_PahariEiJ_G0017200)	Sowahb (MGP_PahariEiJ_G0017201)	Septin11 (MGP_PahariEiJ_G0017202)	Ccni (MGP_PahariEiJ_G0017203)	MGP_PahariEiJ_G0017204	Ccng2 (MGP_PahariEiJ_G0017205)	Cxcl13 (MGP_PahariEiJ_G0017206)	Cnot6l (MGP_PahariEiJ_G0017207)	Mrpl1 (MGP_PahariEiJ_G0017208)	Fras1 (MGP_PahariEiJ_G0017209)	Anxa3 (MGP_PahariEiJ_G0017210) #21	Bmp2k (MGP_PahariEiJ_G0017211) #22	Paqr3 (MGP_PahariEiJ_G0017212) #23	Naa11 (MGP_PahariEiJ_G0017213)	Gk2 (MGP_PahariEiJ_G0017214)	Antxr2 (MGP_PahariEiJ_G0017215)	Prdm8 (MGP_PahariEiJ_G0017216)	Fgf5 (MGP_PahariEiJ_G0017217)	Cfap299 (MGP_PahariEiJ_G0017218)	MGP_PahariEiJ_G0017219	Bmp3 (MGP_PahariEiJ_G0017220)	Prkg2 (MGP_PahariEiJ_G0017221)	Rasgef1b (MGP_PahariEiJ_G0017222)	MGP_PahariEiJ_G0017223	Hnrnpd (MGP_PahariEiJ_G0017224)	MGP_PahariEiJ_G0017225	Hnrnpdl (MGP_PahariEiJ_G0017226)
Rat	MODERN SPECIES	5	RGD1561226 (ENSRNOG00000067406)	ENSRNOG00000069393	RGD1559654 (ENSRNOG00000067042)	LOC685782 (ENSRNOG00000067111)	LOC120096510 (ENSRNOG00000063375)	RGD1565660 (ENSRNOG00000043130)	ENSRNOG00000065688	LOC100909497 (ENSRNOG00000064574)	Pramef20-ps1 (ENSRNOG00000067899)	Cxcl13 (ENSRNOG00000024899)	Cnot6l (ENSRNOG00000002075)	ENSRNOG00000070590	Mrpl1 (ENSRNOG00000002070)	Fras1 (ENSRNOG00000002053)	Anxa3 (ENSRNOG00000002045) #21	Bmp2k (ENSRNOG00000002040) #22	Paqr3 (ENSRNOG00000002035) #23	Naa11 (ENSRNOG00000002031)	Gk2 (ENSRNOG00000029397)	Antxr2 (ENSRNOG00000000081)	Prdm8 (ENSRNOG00000002004)	Fgf5 (ENSRNOG00000022631)	Cfap299 (ENSRNOG00000067409)	Bmp3 (ENSRNOG00000002381)	Prkg2 (ENSRNOG00000002361)	Rasgef1b (ENSRNOG00000002345)	LOC102557303 (ENSRNOG00000053017)	Hnrnpd (ENSRNOG00000002292)	Hnrnpdl (ENSRNOG00000002270)	Enoph1 (ENSRNOG00000002262)	Tmem150c (ENSRNOG00000002258)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1240										ENSNGAG00000010612	Cxcl13 (ENSNGAG00000015990)	Cnot6l (ENSNGAG00000019803)	Mrpl1 (ENSNGAG00000015669)	Fras1 (ENSNGAG00000015647)	Anxa3 (ENSNGAG00000006592) #21	Bmp2k (ENSNGAG00000009494) #22	Paqr3 (ENSNGAG00000001386) #23	Naa11 (ENSNGAG00000012153)	Gk2 (ENSNGAG00000012407)	Antxr2 (ENSNGAG00000016913)	Prdm8 (ENSNGAG00000011065)	Fgf5 (ENSNGAG00000023189)
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	51	Oprk1 (ENSJJAG00000019887)	ENSJJAG00000011904	Npbwr1 (ENSJJAG00000012018)	ENSJJAG00000019800	Alkal1 (ENSJJAG00000000797)	St18 (ENSJJAG00000020074)	ENSJJAG00000008876	ENSJJAG00000011205	Cxcl13 (ENSJJAG00000015547)	Cnot6l (ENSJJAG00000020583)	ENSJJAG00000012403	Mrpl1 (ENSJJAG00000012571)	ENSJJAG00000017212	Fras1 (ENSJJAG00000013532)	Anxa3 (ENSJJAG00000013184) #21	ENSJJAG00000010058 #22	ENSJJAG00000019336 #23	Gk2 (ENSJJAG00000022767)	Antxr2 (ENSJJAG00000017756)	Prdm8 (ENSJJAG00000014847)	Fgf5 (ENSJJAG00000014176)	Cfap299 (ENSJJAG00000020179)	Bmp3 (ENSJJAG00000007207)	Prkg2 (ENSJJAG00000017807)	Rasgef1b (ENSJJAG00000023286)	ENSJJAG00000023150	Hnrnpd (ENSJJAG00000023387)	ENSJJAG00000021673	ENSJJAG00000001501	Tmem150c (ENSJJAG00000014488)	ENSJJAG00000023656
Tree shrew	MODERN SPECIES	1872																BMP2K (ENSTBEG00000008031) #22	PAQR3 (ENSTBEG00000008898) #23
Primates	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00950000185288	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT01030000234601.c.b.a	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT00940000162090
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	52																ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT00940000162090	ENSGT00390000003175.a.b	ENSGT00940000161474.b
Mouse lemur	MODERN SPECIES	21						UNC5C (ENSMICG00000009052)	BMPR1B (ENSMICG00000009046)	PDLIM5 (ENSMICG00000012960)	HPGDS (ENSMICG00000047172)	ENSMICG00000045422	FGF5 (ENSMICG00000047847)	ENSMICG00000047874 #23	ENSMICG00000009863	ANTXR2 (ENSMICG00000028154)	PRDM8 (ENSMICG00000032467)	ENSMICG00000033669 #22	FRAS1 (ENSMICG00000043414)	BMP3 (ENSMICG00000045548)	PRKG2 (ENSMICG00000034314)	ENSMICG00000030486	STPG2 (ENSMICG00000011562)	RAP1GDS1 (ENSMICG00000011571)	TSPAN5 (ENSMICG00000005809)	EIF4E (ENSMICG00000001482)	METAP1 (ENSMICG00000006107)	ADH5 (ENSMICG00000006116)	ADH4 (ENSMICG00000006121)	ENSMICG00000006437	ENSMICG00000043541	ADH7 (ENSMICG00000003495)	C4orf17 (ENSMICG00000003501)
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	64																ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT00940000162090	ENSGT00390000003175.a.b	ENSGT00940000161474.b
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	64																ENSPSMG00000019953 #22	PAQR3 (ENSPSMG00000019940) #23	ENSPSMG00000019922	ENSPSMG00000019921	ANTXR2 (ENSPSMG00000019909)	PRDM8 (ENSPSMG00000019777)	FGF5 (ENSPSMG00000019764)	CFAP299 (ENSPSMG00000019753)	BMP3 (ENSPSMG00000019744)	PRKG2 (ENSPSMG00000019732)	RASGEF1B (ENSPSMG00000019686)	HNRNPDL (ENSPSMG00000019624)	ENOPH1 (ENSPSMG00000019574)	TMEM150C (ENSPSMG00000019533)	SCD5 (ENSPSMG00000019517)	SEC31A (ENSPSMG00000019006)
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	583															FRAS1 (ENSPCOG00000021589)	ENSPCOG00000017050 #22	PAQR3 (ENSPCOG00000004948) #23
Bushbaby	MODERN SPECIES	154	FAM47E (ENSOGAG00000016355)	STBD1 (ENSOGAG00000016357)	CCDC158 (ENSOGAG00000016358)	SHROOM3 (ENSOGAG00000004154)	ENSOGAG00000030730	SOWAHB (ENSOGAG00000004162)	ENSOGAG00000031799	SEPTIN11 (ENSOGAG00000005210)	CCNI (ENSOGAG00000005215)	CCNG2 (ENSOGAG00000005218)	ENSOGAG00000028294	ENSOGAG00000034053	CNOT6L (ENSOGAG00000012122)	MRPL1 (ENSOGAG00000012126)	ANXA3 (ENSOGAG00000013988) #21	BMP2K (ENSOGAG00000014701) #22	PAQR3 (ENSOGAG00000014710) #23	ENSOGAG00000034058	NAA11 (ENSOGAG00000016917)	GK2 (ENSOGAG00000031593)	ANTXR2 (ENSOGAG00000010124)	PRDM8 (ENSOGAG00000026262)	FGF5 (ENSOGAG00000011243)	BMP3 (ENSOGAG00000011248)	PRKG2 (ENSOGAG00000011251)	RASGEF1B (ENSOGAG00000000086)	HNRNPD (ENSOGAG00000004075)	HNRNPDL (ENSOGAG00000002501)	ENOPH1 (ENSOGAG00000002502)	TMEM150C (ENSOGAG00000032649)	SCD5 (ENSOGAG00000002504)
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00950000185288	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT01050000244891.A.j.b	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00950000185288	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914.u.a
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000007731	ENSGT00940000154632.q.b.b	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000182895.a.a.a.a.a.a.b.a.a	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154259.l.c.b	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT01050000244891.A.j.b	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00950000185288	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00390000002414.`b.a.b	ENSGT00940000154426.b.b
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000154632.q.b.b	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000182895.a.a.a.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000164037	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154259.l.c.b	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT01050000244891.A.j.b	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00390000002414.`b.a.b	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914.u.a
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00940000154632.q.b.b	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154259.l.c.b	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT01050000244891.A.j.b	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914.u.a	ENSGT01030000234578.A.a
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00940000154632.q.b.b	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154259.l.c.b	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT01050000244891.A.j.b	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a	ENSGT00950000182882.A.a.e.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b
Gorilla	MODERN SPECIES	17	CCDC158 (ENSGGOG00000007500)	SHROOM3 (ENSGGOG00000004907)	ENSGGOG00000041687	ENSGGOG00000001400	SOWAHB (ENSGGOG00000007620)	SEPTIN11 (ENSGGOG00000015115)	ENSGGOG00000028429	CCNI (ENSGGOG00000003624)	CCNG2 (ENSGGOG00000000063)	CXCL13 (ENSGGOG00000014120)	CNOT6L (ENSGGOG00000023412)	MRPL1 (ENSGGOG00000001304)	FRAS1 (ENSGGOG00000003170)	ENSGGOG00000038764	ANXA3 (ENSGGOG00000010223) #21	BMP2K (ENSGGOG00000023805) #22	PAQR3 (ENSGGOG00000007996) #23	NAA11 (ENSGGOG00000012948)	ANTXR2 (ENSGGOG00000023286)	ENSGGOG00000042585	PRDM8 (ENSGGOG00000007501)	FGF5 (ENSGGOG00000002941)	CFAP299 (ENSGGOG00000036236)	ENSGGOG00000023342	BMP3 (ENSGGOG00000005183)	PRKG2 (ENSGGOG00000006600)	RASGEF1B (ENSGGOG00000001423)	ENSGGOG00000040696	ENSGGOG00000039142	ENSGGOG00000026120	HNRNPD (ENSGGOG00000026760)
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00940000154632.q.b.b	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154259.l.c.b	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT01050000244891.A.j.b	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a	ENSGT00950000182882.A.a.e.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b
Human	MODERN SPECIES	16	SCARB2 (ENSG00000138760)	FAM47E (ENSG00000189157)	FAM47E-STBD1 (ENSG00000272414)	STBD1 (ENSG00000118804)	CCDC158 (ENSG00000163749)	SHROOM3 (ENSG00000138771)	SOWAHB (ENSG00000186212)	SEPTIN11 (ENSG00000138758)	CCNI (ENSG00000118816)	CCNG2 (ENSG00000138764)	CXCL13 (ENSG00000156234)	CNOT6L (ENSG00000138767)	MRPL1 (ENSG00000169288)	FRAS1 (ENSG00000138759)	ANXA3 (ENSG00000138772) #21	BMP2K (ENSG00000138756) #22	PAQR3 (ENSG00000163291) #23	NAA11 (ENSG00000156269)	GK2 (ENSG00000196475)	ANTXR2 (ENSG00000163297)	PRDM8 (ENSG00000152784)	FGF5 (ENSG00000138675)	CFAP299 (ENSG00000197826)	BMP3 (ENSG00000152785)	PRKG2 (ENSG00000138669)	RASGEF1B (ENSG00000138670)	HNRNPD (ENSG00000138668)	HNRNPDL (ENSG00000152795)	ENOPH1 (ENSG00000145293)	TMEM150C (ENSG00000249242)	SCD5 (ENSG00000145284)
Pan	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00940000154632.q.b.b	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154259.l.c.b	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298.a	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT01050000244891.A.j.b	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a	ENSGT00950000182882.A.a.e.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b
Chimpanzee	MODERN SPECIES	17	STBD1 (ENSPTRG00000016188)	CCDC158 (ENSPTRG00000016189)	SHROOM3 (ENSPTRG00000016190)	SOWAHB (ENSPTRG00000016191)	ENSPTRG00000039424	SEPTIN11 (ENSPTRG00000016192)	CCNI (ENSPTRG00000016194)	ENSPTRG00000045676	CCNG2 (ENSPTRG00000016196)	CXCL13 (ENSPTRG00000016197)	CNOT6L (ENSPTRG00000016198)	MRPL1 (ENSPTRG00000016199)	ENSPTRG00000050542	FRAS1 (ENSPTRG00000016200)	ANXA3 (ENSPTRG00000016202) #21	BMP2K (ENSPTRG00000016203) #22	PAQR3 (ENSPTRG00000016204) #23	NAA11 (ENSPTRG00000016205)	GK2 (ENSPTRG00000039094)	ANTXR2 (ENSPTRG00000016207)	ENSPTRG00000009570	PRDM8 (ENSPTRG00000016208)	FGF5 (ENSPTRG00000016209)	ENSPTRG00000050139	CFAP299 (ENSPTRG00000023807)	BMP3 (ENSPTRG00000016210)	PRKG2 (ENSPTRG00000016212)	RASGEF1B (ENSPTRG00000016213)	ENSPTRG00000048463	ENSPTRG00000048058	HNRNPD (ENSPTRG00000016215)
Bonobo	MODERN SPECIES	17	FAM47E (ENSPPAG00000040715)	STBD1 (ENSPPAG00000033341)	ENSPPAG00000038404	CCDC158 (ENSPPAG00000043751)	SHROOM3 (ENSPPAG00000044071)	SOWAHB (ENSPPAG00000031327)	ENSPPAG00000042568	SEPTIN11 (ENSPPAG00000041700)	CCNI (ENSPPAG00000040247)	CCNG2 (ENSPPAG00000040593)	CXCL13 (ENSPPAG00000038035)	ENSPPAG00000030178	MRPL1 (ENSPPAG00000041378)	FRAS1 (ENSPPAG00000042050)	ANXA3 (ENSPPAG00000033529) #21	BMP2K (ENSPPAG00000024069) #22	PAQR3 (ENSPPAG00000041185) #23	ENSPPAG00000039906	GK2 (ENSPPAG00000024051)	ANTXR2 (ENSPPAG00000040045)	ENSPPAG00000031889	ENSPPAG00000035358	FGF5 (ENSPPAG00000031449)	ENSPPAG00000030825	CFAP299 (ENSPPAG00000043350)	BMP3 (ENSPPAG00000039992)	PRKG2 (ENSPPAG00000040807)	RASGEF1B (ENSPPAG00000032967)	ENSPPAG00000037195	ENSPPAG00000002564	HNRNPD (ENSPPAG00000035750)
Orangutan	MODERN SPECIES	17	FAM47E (ENSPPYG00000014860)	STBD1 (ENSPPYG00000029580)	CCDC158 (ENSPPYG00000014861)	SHROOM3 (ENSPPYG00000014862)	SOWAHB (ENSPPYG00000014863)	SEPTIN11 (ENSPPYG00000014864)	ENSPPYG00000014865	CCNI (ENSPPYG00000014866)	ENSPPYG00000033367	CCNG2 (ENSPPYG00000014867)	CXCL13 (ENSPPYG00000014868)	CNOT6L (ENSPPYG00000014869)	MRPL1 (ENSPPYG00000014870)	FRAS1 (ENSPPYG00000014871)	ANXA3 (ENSPPYG00000014872) #21	BMP2K (ENSPPYG00000014873) #22	PAQR3 (ENSPPYG00000014874) #23	NAA11 (ENSPPYG00000014875)	GK2 (ENSPPYG00000030605)	ANTXR2 (ENSPPYG00000014877)	PRDM8 (ENSPPYG00000037483)	FGF5 (ENSPPYG00000036534)	CFAP299 (ENSPPYG00000014881)	BMP3 (ENSPPYG00000014882)	PRKG2 (ENSPPYG00000014883)	RASGEF1B (ENSPPYG00000014884)	HNRNPD (ENSPPYG00000014885)	HNRNPDL (ENSPPYG00000014886)	ENOPH1 (ENSPPYG00000014887)	TMEM150C (ENSPPYG00000041101)	SCD5 (ENSPPYG00000014889)
Gibbon	MODERN SPECIES	24	CCDC158 (ENSNLEG00000008104)	ENSNLEG00000031212	SHROOM3 (ENSNLEG00000008134)	ENSNLEG00000028042	SOWAHB (ENSNLEG00000008144)	SEPTIN11 (ENSNLEG00000032040)	ENSNLEG00000035237	CCNI (ENSNLEG00000027989)	ENSNLEG00000008165	CCNG2 (ENSNLEG00000008169)	CXCL13 (ENSNLEG00000008184)	CNOT6L (ENSNLEG00000028820)	ENSNLEG00000008205	FRAS1 (ENSNLEG00000008239)	ANXA3 (ENSNLEG00000008349) #21	BMP2K (ENSNLEG00000008399) #22	PAQR3 (ENSNLEG00000008420) #23	ENSNLEG00000008443	ANTXR2 (ENSNLEG00000008447)	ENSNLEG00000008504	FGF5 (ENSNLEG00000008509)	CFAP299 (ENSNLEG00000035919)	ENSNLEG00000029351	BMP3 (ENSNLEG00000008513)	PRKG2 (ENSNLEG00000008516)	RASGEF1B (ENSNLEG00000027448)	ENSNLEG00000032894	ENSNLEG00000035815	HNRNPD (ENSNLEG00000008600)	ENSNLEG00000027418	HNRNPDL (ENSNLEG00000008636)
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000007731	ENSGT00940000154632.q.b.b	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000182895.a.a.a.a.a.a.b.a.a	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154259.l.c.b	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT01050000244891.A.j.b	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00950000185288	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00390000002414.`b.a.b	ENSGT00940000154426.b.b
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000007731	ENSGT00940000154632.q.b.b	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000182895.a.a.a.a.a.a.b.a.a	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154259.l.c.b	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT01050000244891.A.j.b	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00950000185288	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00390000002414.`b.a.b	ENSGT00940000154426.b.b
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000007731	ENSGT00940000154632.q.b.b	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000182895.a.a.a.a.a.a.b.a.a	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154259.l.c.b	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT01050000244891.A.j.b	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00950000185288	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00390000002414.`b.a.b	ENSGT00940000154426.b.b
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00940000154632.q.b.b	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154259.l.c.b	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000163699	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00950000185288	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00390000002414.`b.a.b	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914.u.a.a
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154259.l.c.b	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000163699	ENSGT01040000240559.b.a.b.a.a.a.a	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00950000185288	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914.u.a.a	ENSGT01030000234578.A.a
Rhesus	MODERN SPECIES	15	NUP54 (ENSMMUG00000020910)	SCARB2 (ENSMMUG00000020913)	FAM47E (ENSMMUG00000020914)	CCDC158 (ENSMMUG00000020916)	SHROOM3 (ENSMMUG00000020919)	SOWAHB (ENSMMUG00000018186)	CCNI (ENSMMUG00000019904)	SEPTIN11 (ENSMMUG00000019901)	CCNG2 (ENSMMUG00000000914)	CXCL13 (ENSMMUG00000023186)	CNOT6L (ENSMMUG00000045609)	ENSMMUG00000030317	ENSMMUG00000062865	FRAS1 (ENSMMUG00000002564)	ANXA3 (ENSMMUG00000022218) #21	BMP2K (ENSMMUG00000011639) #22	PAQR3 (ENSMMUG00000014501) #23	ENSMMUG00000007366	ENSMMUG00000062999	NAA11 (ENSMMUG00000021988)	GK2 (ENSMMUG00000062120)	ENSMMUG00000054193	ANTXR2 (ENSMMUG00000003333)	PRDM8 (ENSMMUG00000051357)	FGF5 (ENSMMUG00000009067)	CFAP299 (ENSMMUG00000042925)	BMP3 (ENSMMUG00000010347)	PRKG2 (ENSMMUG00000019859)	RASGEF1B (ENSMMUG00000021074)	ENSMMUG00000065133	HNRNPD (ENSMMUG00000060484)
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	15	SOWAHB (ENSMFAG00000053078)	ENSMFAG00000033306	SEPTIN11 (ENSMFAG00000042066)	CCNI (ENSMFAG00000036157)	ENSMFAG00000051687	CCNG2 (ENSMFAG00000003008)	ENSMFAG00000064005	CXCL13 (ENSMFAG00000032774)	ENSMFAG00000056801	CNOT6L (ENSMFAG00000044296)	ENSMFAG00000030593	ENSMFAG00000048610	ENSMFAG00000063246	ANXA3 (ENSMFAG00000003067) #21	ENSMFAG00000056033	BMP2K (ENSMFAG00000044445) #22	PAQR3 (ENSMFAG00000000708) #23	ENSMFAG00000049217	NAA11 (ENSMFAG00000000164)	GK2 (ENSMFAG00000013321)	ANTXR2 (ENSMFAG00000045998)	PRDM8 (ENSMFAG00000062412)	FGF5 (ENSMFAG00000034249)	ENSMFAG00000049106	CFAP299 (ENSMFAG00000036519)	BMP3 (ENSMFAG00000062109)	PRKG2 (ENSMFAG00000037961)	ENSMFAG00000058029	RASGEF1B (ENSMFAG00000045661)	HNRNPD (ENSMFAG00000031674)	HNRNPDL (ENSMFAG00000052836)
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	544	FAM47E (ENSMNEG00000030910)	STBD1 (ENSMNEG00000043007)	ENSMNEG00000041762	CCDC158 (ENSMNEG00000034010)	SHROOM3 (ENSMNEG00000041162)	SOWAHB (ENSMNEG00000000899)	SEPTIN11 (ENSMNEG00000044831)	CCNI (ENSMNEG00000028966)	ENSMNEG00000042595	CCNG2 (ENSMNEG00000039529)	CXCL13 (ENSMNEG00000035580)	CNOT6L (ENSMNEG00000041259)	ENSMNEG00000007399	FRAS1 (ENSMNEG00000042250)	ANXA3 (ENSMNEG00000029892) #21	BMP2K (ENSMNEG00000038848) #22	PAQR3 (ENSMNEG00000028234) #23	ENSMNEG00000044172	SEC61B (ENSMNEG00000043625)	ALG2 (ENSMNEG00000017386)	TGFBR1 (ENSMNEG00000031623)	ENSMNEG00000032468	GALNT12 (ENSMNEG00000036584)	ANKS6 (ENSMNEG00000040621)	ENSMNEG00000033637	GABBR2 (ENSMNEG00000030933)	TBC1D2 (ENSMNEG00000031380)	CORO2A (ENSMNEG00000039937)	TRIM14 (ENSMNEG00000028196)	NANS (ENSMNEG00000038699)	ANP32B (ENSMNEG00000005268)
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000007731	ENSGT00940000154632.q.b.b	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000182895.a.a.a.a.a.a.b.a.a	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154259.l.c.b	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT01050000244891.A.j.b	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00390000002414.`b.a.b	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914.u.a
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT00390000007731	ENSGT00940000154632.q.b.b	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000182895.a.a.a.a.a.a.b.a.a	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154259.l.c.b	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT01050000244891.A.j.b	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00390000002414.`b.a.b	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914.u.a	ENSGT01030000234578.A.a
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	507	FAM47E (ENSCATG00000042206)	STBD1 (ENSCATG00000042702)	CCDC158 (ENSCATG00000044186)	ENSCATG00000029651	SHROOM3 (ENSCATG00000036610)	SOWAHB (ENSCATG00000013510)	ENSCATG00000011822	SEPTIN11 (ENSCATG00000027299)	CCNI (ENSCATG00000039303)	CCNG2 (ENSCATG00000031723)	CXCL13 (ENSCATG00000041898)	CNOT6L (ENSCATG00000029623)	ENSCATG00000023355	FRAS1 (ENSCATG00000040368)	ANXA3 (ENSCATG00000043647) #21	BMP2K (ENSCATG00000034365) #22	PAQR3 (ENSCATG00000041783) #23	ENSCATG00000034500	GK2 (ENSCATG00000018607)	ANTXR2 (ENSCATG00000034895)	ENSCATG00000039592	PRDM8 (ENSCATG00000039393)	FGF5 (ENSCATG00000045326)	CFAP299 (ENSCATG00000041881)	BMP3 (ENSCATG00000014546)	PRKG2 (ENSCATG00000036587)	RASGEF1B (ENSCATG00000031794)	HNRNPD (ENSCATG00000039829)	HNRNPDL (ENSCATG00000038573)	ENOPH1 (ENSCATG00000041399)	TMEM150C (ENSCATG00000043198)
Drill	MODERN SPECIES	1484	CCDC158 (ENSMLEG00000029903)	ENSMLEG00000031918	SHROOM3 (ENSMLEG00000043380)	ENSMLEG00000003215	SOWAHB (ENSMLEG00000027713)	SEPTIN11 (ENSMLEG00000041438)	ENSMLEG00000040458	CCNI (ENSMLEG00000035678)	ENSMLEG00000013658	CCNG2 (ENSMLEG00000034874)	CXCL13 (ENSMLEG00000042962)	CNOT6L (ENSMLEG00000029198)	MRPL1 (ENSMLEG00000030203)	FRAS1 (ENSMLEG00000043062)	ANXA3 (ENSMLEG00000042748) #21	BMP2K (ENSMLEG00000034112) #22	PAQR3 (ENSMLEG00000029581) #23	ENSMLEG00000036976	GK2 (ENSMLEG00000019097)	ANTXR2 (ENSMLEG00000028687)	ENSMLEG00000031504	ENSMLEG00000044340	FGF5 (ENSMLEG00000033354)	CFAP299 (ENSMLEG00000039070)	BMP3 (ENSMLEG00000042217)
Olive baboon	MODERN SPECIES	13	STBD1 (ENSPANG00000040607)	CCDC158 (ENSPANG00000018334)	SHROOM3 (ENSPANG00000023419)	SOWAHB (ENSPANG00000006580)	SEPTIN11 (ENSPANG00000021634)	ENSPANG00000045426	CCNI (ENSPANG00000026447)	CCNG2 (ENSPANG00000019978)	CXCL13 (ENSPANG00000046468)	ENSPANG00000038020	CNOT6L (ENSPANG00000007831)	MRPL1 (ENSPANG00000007832)	FRAS1 (ENSPANG00000021635)	ANXA3 (ENSPANG00000015227) #21	ENSPANG00000039501	BMP2K (ENSPANG00000022484) #22	PAQR3 (ENSPANG00000018977) #23	NAA11 (ENSPANG00000003252)	GK2 (ENSPANG00000034595)	ANTXR2 (ENSPANG00000005128)	ENSPANG00000041255	PRDM8 (ENSPANG00000048356)	FGF5 (ENSPANG00000012555)	CFAP299 (ENSPANG00000030944)	BMP3 (ENSPANG00000006053)	PRKG2 (ENSPANG00000022485)	RASGEF1B (ENSPANG00000018336)	HNRNPD (ENSPANG00000011785)	HNRNPDL (ENSPANG00000004761)	ENOPH1 (ENSPANG00000024164)	ENSPANG00000012556
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	26	NUP54 (ENSCSAG00000004641)	SCARB2 (ENSCSAG00000004640)	FAM47E (ENSCSAG00000004635)	STBD1 (ENSCSAG00000004633)	CCDC158 (ENSCSAG00000004624)	ENSCSAG00000004602	SHROOM3 (ENSCSAG00000004597)	SOWAHB (ENSCSAG00000000418)	SEPTIN11 (ENSCSAG00000004591)	CCNG2 (ENSCSAG00000004588)	CXCL13 (ENSCSAG00000004584)	CNOT6L (ENSCSAG00000004580)	ENSCSAG00000004577	FRAS1 (ENSCSAG00000004546)	ANXA3 (ENSCSAG00000004501) #21	BMP2K (ENSCSAG00000004496) #22	PAQR3 (ENSCSAG00000004487) #23	NAA11 (ENSCSAG00000000417)	GK2 (ENSCSAG00000000416)	ANTXR2 (ENSCSAG00000004485)	PRDM8 (ENSCSAG00000004478)	ENSCSAG00000000415	FGF5 (ENSCSAG00000004474)	BMP3 (ENSCSAG00000004472)	PRKG2 (ENSCSAG00000004470)	RASGEF1B (ENSCSAG00000004467)	ENSCSAG00000000414	HNRNPD (ENSCSAG00000004463)	HNRNPDL (ENSCSAG00000004461)	ENOPH1 (ENSCSAG00000004460)	TMEM150C (ENSCSAG00000004455)
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00940000154632.q.b.b	ENSGT00390000013339	ENSGT00950000182895.a.a.a.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000157778	ENSGT00940000154259.l.c.b	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	547	STBD1 (ENSRBIG00000041441)	ENSRBIG00000040524	CCDC158 (ENSRBIG00000044923)	ENSRBIG00000032978	SHROOM3 (ENSRBIG00000030001)	ENSRBIG00000040031	SEPTIN11 (ENSRBIG00000024343)	CCNI (ENSRBIG00000043408)	ENSRBIG00000040037	CCNG2 (ENSRBIG00000030318)	CXCL13 (ENSRBIG00000034644)	CNOT6L (ENSRBIG00000027644)	MRPL1 (ENSRBIG00000040801)	FRAS1 (ENSRBIG00000027344)	ANXA3 (ENSRBIG00000012224) #21	BMP2K (ENSRBIG00000043864) #22	PAQR3 (ENSRBIG00000044432) #23	ENSRBIG00000002758	NAA11 (ENSRBIG00000026628)	ENSRBIG00000044982	GK2 (ENSRBIG00000024897)	ANTXR2 (ENSRBIG00000043594)	ENSRBIG00000036670	PRDM8 (ENSRBIG00000018524)	FGF5 (ENSRBIG00000041306)
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	825																BMP2K (ENSRROG00000023003) #22	PAQR3 (ENSRROG00000006656) #23
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00910000147465	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000163699	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00950000183120.e.b.a.b	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT01050000244891.A.j.b	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000158010.c	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914.u.a
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00910000147465	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000163699	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00950000183120.e.b.a.b	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000158010.c	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914.u.a	ENSGT01030000234578.A.a
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00950000182895.a.a.a.a.b.k.w.b.a	ENSGT00940000157778	ENSGT00910000147465	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p	ENSGT00530000064194	ENSGT00940000153294.m.a.c.a.e.b	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000163699	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00950000183120.e.b.a.b	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a.j.a	ENSGT00940000158010.c	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914.u.a	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT01100000267065	ENSGT00940000162090
Capuchin	MODERN SPECIES	123										CXCL13 (ENSCCAG00000037128)	CNOT6L (ENSCCAG00000025000)	ENSCCAG00000033201	FRAS1 (ENSCCAG00000034015)	ANXA3 (ENSCCAG00000031047) #21	ENSCCAG00000033111	BMP2K (ENSCCAG00000035233) #22	PAQR3 (ENSCCAG00000030402) #23	TTLL6 (ENSCCAG00000031760)	ENSCCAG00000031353	ENSCCAG00000033997	ENSCCAG00000035420	UBE2Z (ENSCCAG00000034036)	SNF8 (ENSCCAG00000025774)	GIP (ENSCCAG00000032674)	IGF2BP1 (ENSCCAG00000031817)	B4GALNT2 (ENSCCAG00000029481)	GNGT2 (ENSCCAG00000021230)	ABI3 (ENSCCAG00000034155)	PHOSPHO1 (ENSCCAG00000031753)	ZNF652 (ENSCCAG00000034341)	ENSCCAG00000031356
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	51	ENSSBOG00000025539	CCNI (ENSSBOG00000035507)	ENSSBOG00000035303	ENSSBOG00000017033	CCNG2 (ENSSBOG00000020531)	ENSSBOG00000020872	ENSSBOG00000020463	ENSSBOG00000034318	CXCL13 (ENSSBOG00000027580)	CNOT6L (ENSSBOG00000028521)	ENSSBOG00000005784	ENSSBOG00000020474	FRAS1 (ENSSBOG00000034612)	ENSSBOG00000033139	ANXA3 (ENSSBOG00000035199) #21	BMP2K (ENSSBOG00000026807) #22	PAQR3 (ENSSBOG00000018736) #23	ENSSBOG00000026056	ANTXR2 (ENSSBOG00000028910)	ENSSBOG00000027768	FGF5 (ENSSBOG00000020601)	CFAP299 (ENSSBOG00000020874)	BMP3 (ENSSBOG00000034127)	PRKG2 (ENSSBOG00000032891)	RASGEF1B (ENSSBOG00000024557)	ENSSBOG00000029602	ENSSBOG00000028838	HNRNPD (ENSSBOG00000032881)	ENOPH1 (ENSSBOG00000030492)	ENSSBOG00000019290	TMEM150C (ENSSBOG00000027224)
Marmoset	MODERN SPECIES	15	SHROOM3 (ENSCJAG00000014716)	ENSCJAG00000063754	ENSCJAG00000084057	SOWAHB (ENSCJAG00000040356)	SEPTIN11 (ENSCJAG00000014744)	CCNI (ENSCJAG00000014768)	ENSCJAG00000072539	CCNG2 (ENSCJAG00000014789)	ENSCJAG00000061022	ENSCJAG00000043973	CXCL13 (ENSCJAG00000056177)	CNOT6L (ENSCJAG00000014846)	ENSCJAG00000047043	FRAS1 (ENSCJAG00000014882)	ANXA3 (ENSCJAG00000014968) #21	BMP2K (ENSCJAG00000014993) #22	PAQR3 (ENSCJAG00000046327) #23	NAA11 (ENSCJAG00000023110)	GK2 (ENSCJAG00000023111)	ANTXR2 (ENSCJAG00000015024)	ENSCJAG00000022250	PRDM8 (ENSCJAG00000015064)	FGF5 (ENSCJAG00000076442)	CFAP299 (ENSCJAG00000015075)	BMP3 (ENSCJAG00000062893)	PRKG2 (ENSCJAG00000015083)	ENSCJAG00000073198	RASGEF1B (ENSCJAG00000015113)	ENSCJAG00000023152	ENSCJAG00000048181	ENSCJAG00000071896
Mas night monkey	MODERN SPECIES	406	ENSANAG00000027451	CCNG2 (ENSANAG00000028262)	SURF1 (ENSANAG00000036054)	ENSANAG00000030565	MED22 (ENSANAG00000022695)	ENSANAG00000032954	ENSANAG00000037450	CXCL13 (ENSANAG00000037253)	CNOT6L (ENSANAG00000023917)	ENSANAG00000026675	ENSANAG00000035463	ENSANAG00000028297	FRAS1 (ENSANAG00000026061)	ANXA3 (ENSANAG00000025473) #21	ENSANAG00000011900	BMP2K (ENSANAG00000032256) #22	PAQR3 (ENSANAG00000032440) #23	ANTXR2 (ENSANAG00000020620)	ENSANAG00000038151	PRDM8 (ENSANAG00000027638)	ENSANAG00000018328	FGF5 (ENSANAG00000029794)	CFAP299 (ENSANAG00000029362)	BMP3 (ENSANAG00000038265)	PRKG2 (ENSANAG00000033813)	ENSANAG00000019728	ENSANAG00000035812	ENSANAG00000032331	RASGEF1B (ENSANAG00000021844)	ENSANAG00000034721	HNRNPD (ENSANAG00000035221)
Tarsier	MODERN SPECIES	1014																ENSTSYG00000030452 #22	PAQR3 (ENSTSYG00000004438) #23
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00950000185288	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00900000143161	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00950000185288	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00900000143161	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00950000183087.B	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000163699	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00950000185288	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00900000143161	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b
Suina	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00950000183087.B	ENSGT00940000156423	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000163699	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00900000143161	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	142	ENSCWAG00000017680	STBD1 (ENSCWAG00000017600)	CCDC158 (ENSCWAG00000017403)	SHROOM3 (ENSCWAG00000016829)	SOWAHB (ENSCWAG00000016762)	SEPTIN11 (ENSCWAG00000016500)	CCNI (ENSCWAG00000016427)	ENSCWAG00000016396	CCNG2 (ENSCWAG00000016282)	ENSCWAG00000016228	ENSCWAG00000016202	CNOT6L (ENSCWAG00000015985)	ENSCWAG00000015958	FRAS1 (ENSCWAG00000015162)	ENSCWAG00000015061 #21	BMP2K (ENSCWAG00000014996) #22	PAQR3 (ENSCWAG00000014942) #23	NAA11 (ENSCWAG00000014920)	GK2 (ENSCWAG00000014899)	ANTXR2 (ENSCWAG00000014795)	PRDM8 (ENSCWAG00000014759)	FGF5 (ENSCWAG00000014726)	CFAP299 (ENSCWAG00000014668)	BMP3 (ENSCWAG00000014630)	PRKG2 (ENSCWAG00000014533)	RASGEF1B (ENSCWAG00000013985)	HNRNPD (ENSCWAG00000013762)	HNRNPDL (ENSCWAG00000013621)	ENOPH1 (ENSCWAG00000013561)	TMEM150C (ENSCWAG00000013440)	SCD5 (ENSCWAG00000013393)
Pig	MODERN SPECIES	16																BMP2K (ENSSSCG00000027722) #22	PAQR3 (ENSSSCG00000009259) #23	NAA11 (ENSSSCG00000009258)	GK2 (ENSSSCG00000009257)	ANTXR2 (ENSSSCG00000009256)	PRDM8 (ENSSSCG00000036555)	ENSSSCG00000033490	FGF5 (ENSSSCG00000058425)	CFAP299 (ENSSSCG00000037723)	BMP3 (ENSSSCG00000029061)	PRKG2 (ENSSSCG00000009250)	RASGEF1B (ENSSSCG00000029507)	ENSSSCG00000053473	ENSSSCG00000055411	HNRNPD (ENSSSCG00000009249)	ENSSSCG00000040448
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00950000183087.B	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000163699	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00950000185288	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000163699	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT00940000162090
Arabian camel	MODERN SPECIES	11	SCARB2 (ENSCDRG00005001322)	FAM47E (ENSCDRG00005001906)	STBD1 (ENSCDRG00005001922)	CCDC158 (ENSCDRG00005001945)	SHROOM3 (ENSCDRG00005001979)	ENSCDRG00005002004	SOWAHB (ENSCDRG00005002018)	SEPTIN11 (ENSCDRG00005002036)	CCNI (ENSCDRG00005002079)	CCNG2 (ENSCDRG00005002086)	CXCL13 (ENSCDRG00005002099)	CNOT6L (ENSCDRG00005002116)	ENSCDRG00005002153	FRAS1 (ENSCDRG00005002175)	ANXA3 (ENSCDRG00005002209) #21	BMP2K (ENSCDRG00005002238) #22	PAQR3 (ENSCDRG00005002297) #23	NAA11 (ENSCDRG00005002308)	GK2 (ENSCDRG00005002316)	ANTXR2 (ENSCDRG00005002333)	PRDM8 (ENSCDRG00005002363)	FGF5 (ENSCDRG00005002376)	CFAP299 (ENSCDRG00005002389)	BMP3 (ENSCDRG00005002412)	PRKG2 (ENSCDRG00005002430)	RASGEF1B (ENSCDRG00005002503)	HNRNPD (ENSCDRG00005002738)	HNRNPDL (ENSCDRG00005002963)	ENOPH1 (ENSCDRG00005003055)	TMEM150C (ENSCDRG00005003088)	SCD5 (ENSCDRG00005003107)
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00950000183087.B	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000163699	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00950000185288	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914.l	ENSGT01030000234578.A.a
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00910000148412	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163699	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00950000185288	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914.l	ENSGT01030000234578.A.a
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00910000148412	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163699	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00950000185288	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914.l	ENSGT01030000234578.A.a
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00910000148412	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00950000185288	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914.l	ENSGT01030000234578.A.a
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00940000162252	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000163699	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000166264	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914.l	ENSGT01030000234578.A.a
Goat	MODERN SPECIES	25	STBD1 (ENSCHIG00000012021)	CCDC158 (ENSCHIG00000025634)	SHROOM3 (ENSCHIG00000021130)	ENSCHIG00000014894	SOWAHB (ENSCHIG00000010690)	SEPTIN11 (ENSCHIG00000021075)	CCNI (ENSCHIG00000015282)	CCNG2 (ENSCHIG00000002533)	ENSCHIG00000021974	ENSCHIG00000016915	CNOT6L (ENSCHIG00000006297)	ENSCHIG00000011183	FRAS1 (ENSCHIG00000024787)	ENSCHIG00000022327	ANXA3 (ENSCHIG00000011590) #21	BMP2K (ENSCHIG00000017622) #22	PAQR3 (ENSCHIG00000013139) #23	NAA11 (ENSCHIG00000009560)	GK2 (ENSCHIG00000010705)	ANTXR2 (ENSCHIG00000012966)	PRDM8 (ENSCHIG00000019206)	FGF5 (ENSCHIG00000024886)	ENSCHIG00000013260	ENSCHIG00000018831	ENSCHIG00000008411	ENSCHIG00000016918	BMP3 (ENSCHIG00000024999)	PRKG2 (ENSCHIG00000014973)	RASGEF1B (ENSCHIG00000022490)	HNRNPD (ENSCHIG00000022317)	ENSCHIG00000010260
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	22	CXCL11 (ENSOARG00020004611)	NUP54 (ENSOARG00020004646)	SCARB2 (ENSOARG00020004707)	ENSOARG00020004803	STBD1 (ENSOARG00020004904)	CCDC158 (ENSOARG00020004930)	ENSOARG00020006114	SEPTIN11 (ENSOARG00020006144)	CCNI (ENSOARG00020006256)	CCNG2 (ENSOARG00020006282)	ENSOARG00020006387	CNOT6L (ENSOARG00020006410)	ENSOARG00020006669	FRAS1 (ENSOARG00020006780)	ANXA3 (ENSOARG00020007381) #21	BMP2K (ENSOARG00020007544) #22	PAQR3 (ENSOARG00020008001) #23	NAA11 (ENSOARG00020008072)	GK2 (ENSOARG00020008089)	BMP3 (ENSOARG00020008128)	ENSOARG00020008183	ANTXR2 (ENSOARG00020008268)	PRDM8 (ENSOARG00020008584)	FGF5 (ENSOARG00020008615)	ENSOARG00020008692	PRKG2 (ENSOARG00020008731)	RASGEF1B (ENSOARG00020009096)	HNRNPD (ENSOARG00020009917)	ENSOARG00020010101	HNRNPDL (ENSOARG00020010186)	ENOPH1 (ENSOARG00020010424)
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00910000148412	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547.d	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00950000185288	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914.l	ENSGT01030000234578.A.a
American bison	MODERN SPECIES	3145										ENSBBBG00000006132	CXCL13 (ENSBBBG00000023445)	CNOT6L (ENSBBBG00000023434)	MRPL1 (ENSBBBG00000023376)	FRAS1 (ENSBBBG00000023365)	ANXA3 (ENSBBBG00000023185) #21	BMP2K (ENSBBBG00000000370) #22	PAQR3 (ENSBBBG00000000416) #23	NAA11 (ENSBBBG00000000439)	GK2 (ENSBBBG00000000452)	ANTXR2 (ENSBBBG00000000462)	PRDM8 (ENSBBBG00000023142)	FGF5 (ENSBBBG00000023125)	CFAP299 (ENSBBBG00000023119)	BMP3 (ENSBBBG00000023104)	PRKG2 (ENSBBBG00000023088)	RASGEF1B (ENSBBBG00000023005)	ENSBBBG00000022894	HNRNPD (ENSBBBG00000022878)	HNRNPDL (ENSBBBG00000005995)	ENSBBBG00000022729	TMEM150C (ENSBBBG00000022705)
Bos	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00910000148412	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547.d	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00950000185288	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b.g.a	ENSGT00440000039914.l	ENSGT01030000234578.A.a
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00910000148412	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000163699	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547.d	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00950000185288	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b.g.a	ENSGT00440000039914.l	ENSGT01030000234578.A.a
Cow	MODERN SPECIES	25	ENSBTAG00000004921	STBD1 (ENSBTAG00000010389)	CCDC158 (ENSBTAG00000012157)	ENSBTAG00000050665	SHROOM3 (ENSBTAG00000019633)	SOWAHB (ENSBTAG00000038148)	SEPTIN11 (ENSBTAG00000021372)	CCNI (ENSBTAG00000000599)	CCNG2 (ENSBTAG00000021768)	ENSBTAG00000048934	CXCL13 (ENSBTAG00000008479)	CNOT6L (ENSBTAG00000049571)	MRPL1 (ENSBTAG00000018360)	FRAS1 (ENSBTAG00000010716)	ANXA3 (ENSBTAG00000010153) #21	BMP2K (ENSBTAG00000001126) #22	PAQR3 (ENSBTAG00000008887) #23	NAA11 (ENSBTAG00000013149)	GK2 (ENSBTAG00000039245)	ENSBTAG00000032979	ENSBTAG00000032034	ANTXR2 (ENSBTAG00000014324)	PRDM8 (ENSBTAG00000020570)	FGF5 (ENSBTAG00000017348)	CFAP299 (ENSBTAG00000035776)	ENSBTAG00000054713	BMP3 (ENSBTAG00000017642)	PRKG2 (ENSBTAG00000002978)	RASGEF1B (ENSBTAG00000006561)	ENSBTAG00000052070	HNRNPD (ENSBTAG00000013952)
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	25	CCDC158 (ENSBIXG00005023597)	ENSBIXG00005004011	SHROOM3 (ENSBIXG00005023403)	SOWAHB (ENSBIXG00005023342)	SEPTIN11 (ENSBIXG00005003988)	CCNI (ENSBIXG00005023180)	CCNG2 (ENSBIXG00005007172)	ENSBIXG00005023046	ENSBIXG00005023018	ENSBIXG00005003924	CNOT6L (ENSBIXG00005022921)	ENSBIXG00005005754	ENSBIXG00005022747	FRAS1 (ENSBIXG00005022695)	ANXA3 (ENSBIXG00005022397) #21	BMP2K (ENSBIXG00005022256) #22	ENSBIXG00005022181	PAQR3 (ENSBIXG00005022171) #23	NAA11 (ENSBIXG00005022145)	GK2 (ENSBIXG00005022137)	ENSBIXG00005003758	ANTXR2 (ENSBIXG00005002605)	PRDM8 (ENSBIXG00005022026)	FGF5 (ENSBIXG00005003711)	CFAP299 (ENSBIXG00005021935)	BMP3 (ENSBIXG00005021925)	PRKG2 (ENSBIXG00005021890)	RASGEF1B (ENSBIXG00005021796)	ENSBIXG00005003631	HNRNPDL (ENSBIXG00005021441)	ENOPH1 (ENSBIXG00005021273)
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00910000148412	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547.d	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393.e	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00950000185288	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b.g.a	ENSGT00440000039914.l	ENSGT01030000234578.A.a
Domestic yak	MODERN SPECIES	25	FAM47E (ENSBGRG00000014524)	STBD1 (ENSBGRG00000014491)	CCDC158 (ENSBGRG00000014187)	SHROOM3 (ENSBGRG00000014140)	ENSBGRG00000014119	SOWAHB (ENSBGRG00000014093)	SEPTIN11 (ENSBGRG00000013500)	CCNI (ENSBGRG00000013344)	CCNG2 (ENSBGRG00000013081)	ENSBGRG00000012992	CNOT6L (ENSBGRG00000012752)	ENSBGRG00000012614	ENSBGRG00000012600	FRAS1 (ENSBGRG00000011868)	ANXA3 (ENSBGRG00000011623) #21	BMP2K (ENSBGRG00000011372) #22	PAQR3 (ENSBGRG00000011120) #23	ENSBGRG00000011067	NAA11 (ENSBGRG00000011033)	GK2 (ENSBGRG00000011003)	ANTXR2 (ENSBGRG00000010544)	PRDM8 (ENSBGRG00000010467)	FGF5 (ENSBGRG00000010381)	CFAP299 (ENSBGRG00000024488)	BMP3 (ENSBGRG00000024470)	PRKG2 (ENSBGRG00000024304)	RASGEF1B (ENSBGRG00000023927)	ENSBGRG00000023638	ENOPH1 (ENSBGRG00000023470)	TMEM150C (ENSBGRG00000023370)	SCD5 (ENSBGRG00000023293)
Wild yak	MODERN SPECIES	310												CNOT6L (ENSBMUG00000016369)	MRPL1 (ENSBMUG00000016395)	FRAS1 (ENSBMUG00000016462)	ANXA3 (ENSBMUG00000016494) #21	BMP2K (ENSBMUG00000016531) #22	PAQR3 (ENSBMUG00000016548) #23
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	1274	FAM47E (ENSMMSG00000022132)	STBD1 (ENSMMSG00000022116)	CCDC158 (ENSMMSG00000021996)	SHROOM3 (ENSMMSG00000021964)	SOWAHB (ENSMMSG00000021956)	ENSMMSG00000021943	SEPTIN11 (ENSMMSG00000021892)	CCNI (ENSMMSG00000021856)	ENSMMSG00000021819	ENSMMSG00000021808	CXCL13 (ENSMMSG00000021798)	CNOT6L (ENSMMSG00000021746)	ENSMMSG00000021719	FRAS1 (ENSMMSG00000021491)	ANXA3 (ENSMMSG00000021446) #21	BMP2K (ENSMMSG00000021282) #22	PAQR3 (ENSMMSG00000021240) #23	NAA11 (ENSMMSG00000021219)	GK2 (ENSMMSG00000021207)	ENSMMSG00000021199	ENSMMSG00000021187	ANTXR2 (ENSMMSG00000021106)	PRDM8 (ENSMMSG00000021087)	FGF5 (ENSMMSG00000021067)	CFAP299 (ENSMMSG00000021036)	BMP3 (ENSMMSG00000021012)	PRKG2 (ENSMMSG00000020832)	RASGEF1B (ENSMMSG00000020501)	ENSMMSG00000020463	HNRNPD (ENSMMSG00000020376)	HNRNPDL (ENSMMSG00000020337)
Yarkand deer	MODERN SPECIES	29	FAM47E (ENSCHYG00000003357)	STBD1 (ENSCHYG00000003378)	ENSCHYG00000003398	ENSCHYG00000003504	SOWAHB (ENSCHYG00000003621)	SEPTIN11 (ENSCHYG00000003647)	CCNI (ENSCHYG00000003757)	ENSCHYG00000003768	ENSCHYG00000003784	CXCL13 (ENSCHYG00000003791)	CNOT6L (ENSCHYG00000003801)	ENSCHYG00000003818	FRAS1 (ENSCHYG00000003866)	ENSCHYG00000004027	ANXA3 (ENSCHYG00000004042) #21	BMP2K (ENSCHYG00000004068) #22	PAQR3 (ENSCHYG00000004092) #23	NAA11 (ENSCHYG00000004102)	GK2 (ENSCHYG00000004107)	ANTXR2 (ENSCHYG00000004118)	ENSCHYG00000005672	FGF5 (ENSCHYG00000005708)	CFAP299 (ENSCHYG00000005738)	BMP3 (ENSCHYG00000005757)	PRKG2 (ENSCHYG00000005786)	RASGEF1B (ENSCHYG00000005923)	ENSCHYG00000006116	ENSCHYG00000006163	HNRNPD (ENSCHYG00000006262)	HNRNPDL (ENSCHYG00000006411)	ENSCHYG00000006449
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00390000007818.e.b.b	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00950000183087.B	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292.e.a	ENSGT00530000064292.f	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000163699	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00950000185288	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914.k.a	ENSGT01030000234578.A.a
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00390000007818.e.b.b	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00950000183087.B	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292.f	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000163699	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547.e	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00950000185288	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914.k.a	ENSGT00440000039914.l
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00390000007818.e.b.b	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00950000183087.B	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292.f	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000163699	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547.e	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00950000185288	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914.k.a	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT00940000162090	ENSGT00390000003175.a.b
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00390000007818.e.b.b	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00950000183087.B	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292.f	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000163699	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00390000004965.v.a.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547.e	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00950000185288	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914.k.a	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT00940000162090
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00390000007818.e.b.b	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00950000183087.B	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292.f	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000163699	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00390000012840.t	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00390000004965.v.a.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547.e	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00950000185288	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914.l
Narwhal	MODERN SPECIES	307	SHROOM3 (ENSMMNG00015017330)	ENSMMNG00015017308	SOWAHB (ENSMMNG00015017298)	SEPTIN11 (ENSMMNG00015017204)	CCNI (ENSMMNG00015017152)	ENSMMNG00015017139	CCNG2 (ENSMMNG00015017074)	ENSMMNG00015017048	CXCL13 (ENSMMNG00015017029)	CNOT6L (ENSMMNG00015017008)	ENSMMNG00015016978	ENSMMNG00015016965	FRAS1 (ENSMMNG00015016709)	ANXA3 (ENSMMNG00015016624) #21	ENSMMNG00015016596	BMP2K (ENSMMNG00015016553) #22	PAQR3 (ENSMMNG00015016509) #23	ANTXR2 (ENSMMNG00015016408)	PRDM8 (ENSMMNG00015016357)	ENSMMNG00015016337	FGF5 (ENSMMNG00015016317)	CFAP299 (ENSMMNG00015016262)	BMP3 (ENSMMNG00015016234)	PRKG2 (ENSMMNG00015016089)	ENSMMNG00015016036	RASGEF1B (ENSMMNG00015015856)	HNRNPD (ENSMMNG00015015699)	HNRNPDL (ENSMMNG00015015647)	ENSMMNG00015015615	TMEM150C (ENSMMNG00015015593)	SCD5 (ENSMMNG00015015566)
Beluga whale	MODERN SPECIES	53	ENSDLEG00000015824	STBD1 (ENSDLEG00000015838)	CCDC158 (ENSDLEG00000015849)	SHROOM3 (ENSDLEG00000015932)	ENSDLEG00000015970	SOWAHB (ENSDLEG00000015980)	ENSDLEG00000015993	CCNI (ENSDLEG00000016013)	CCNG2 (ENSDLEG00000016020)	ENSDLEG00000016035	CNOT6L (ENSDLEG00000016050)	ENSDLEG00000016069	FRAS1 (ENSDLEG00000016106)	ENSDLEG00000016269	ANXA3 (ENSDLEG00000016290) #21	BMP2K (ENSDLEG00000016387) #22	PAQR3 (ENSDLEG00000016440) #23	ENSDLEG00000016454	ENSDLEG00000013142	ANTXR2 (ENSDLEG00000013156)	PRDM8 (ENSDLEG00000013179)	FGF5 (ENSDLEG00000013201)	ENSDLEG00000013213	BMP3 (ENSDLEG00000013222)	PRKG2 (ENSDLEG00000013241)	RASGEF1B (ENSDLEG00000013280)	ENSDLEG00000013303	ENSDLEG00000013314	HNRNPD (ENSDLEG00000013324)	HNRNPDL (ENSDLEG00000013418)	ENOPH1 (ENSDLEG00000013449)
Vaquita	MODERN SPECIES	16	ENSPSNG00000000899	STBD1 (ENSPSNG00000000938)	CCDC158 (ENSPSNG00000000994)	SHROOM3 (ENSPSNG00000001091)	SOWAHB (ENSPSNG00000001128)	SEPTIN11 (ENSPSNG00000001151)	CCNI (ENSPSNG00000001186)	CCNG2 (ENSPSNG00000001207)	CXCL13 (ENSPSNG00000001231)	CNOT6L (ENSPSNG00000001257)	ENSPSNG00000001294	FRAS1 (ENSPSNG00000001387)	ENSPSNG00000001499	ENSPSNG00000001511	ANXA3 (ENSPSNG00000001556) #21	BMP2K (ENSPSNG00000001611) #22	PAQR3 (ENSPSNG00000001664) #23	ANTXR2 (ENSPSNG00000001741)	PRDM8 (ENSPSNG00000001797)	ENSPSNG00000001811	FGF5 (ENSPSNG00000001825)	CFAP299 (ENSPSNG00000001847)	BMP3 (ENSPSNG00000001867)	PRKG2 (ENSPSNG00000001904)	RASGEF1B (ENSPSNG00000002075)	ENSPSNG00000002219	HNRNPD (ENSPSNG00000002253)	HNRNPDL (ENSPSNG00000002324)	ENSPSNG00000002379	TMEM150C (ENSPSNG00000002402)	SCD5 (ENSPSNG00000002435)
Dolphin	MODERN SPECIES	605																BMP2K (ENSTTRG00000002159) #22	PAQR3 (ENSTTRG00000002164) #23
Sperm whale	MODERN SPECIES	18	ENSPCTG00005005327	STBD1 (ENSPCTG00005005376)	CCDC158 (ENSPCTG00005005424)	ENSPCTG00005005556	SHROOM3 (ENSPCTG00005005583)	SOWAHB (ENSPCTG00005005618)	SEPT11 (ENSPCTG00005005661)	CCNI (ENSPCTG00005005776)	CCNG2 (ENSPCTG00005005808)	ENSPCTG00005005333	CNOT6L (ENSPCTG00005005384)	MRPL1 (ENSPCTG00005005524)	FRAS1 (ENSPCTG00005005595)	ANXA3 (ENSPCTG00005005879) #21	ENSPCTG00005005952	BMP2K (ENSPCTG00005006011) #22	ENSPCTG00005006124	PAQR3 (ENSPCTG00005006146) #23	NAA11 (ENSPCTG00005006161)	GK2 (ENSPCTG00005006175)	ANTXR2 (ENSPCTG00005006215)	PRDM8 (ENSPCTG00005006296)	FGF5 (ENSPCTG00005006319)	CFAP299 (ENSPCTG00005006341)	BMP3 (ENSPCTG00005006372)	PRKG2 (ENSPCTG00005006399)	RASGEF1B (ENSPCTG00005006551)	ENSPCTG00005006934	HNRNPD (ENSPCTG00005006976)	HNRNPDL (ENSPCTG00005007083)	ENOPH1 (ENSPCTG00005007192)
Blue whale	MODERN SPECIES	16	STBD1 (ENSBMSG00010005782)	CCDC158 (ENSBMSG00010005725)	SHROOM3 (ENSBMSG00010005606)	ENSBMSG00010005554	SOWAHB (ENSBMSG00010005544)	SEPTIN11 (ENSBMSG00010005525)	CCNI (ENSBMSG00010005496)	ENSBMSG00010005485	CCNG2 (ENSBMSG00010005470)	ENSBMSG00010003506	CNOT6L (ENSBMSG00010003490)	ENSBMSG00010003462	ENSBMSG00010003445	FRAS1 (ENSBMSG00010003407)	ANXA3 (ENSBMSG00010003373) #21	BMP2K (ENSBMSG00010003358) #22	PAQR3 (ENSBMSG00010003341) #23	ENSBMSG00010003336	GK2 (ENSBMSG00010003328)	ENSBMSG00010003321	ANTXR2 (ENSBMSG00010003304)	PRDM8 (ENSBMSG00010003278)	FGF5 (ENSBMSG00010003271)	CFAP299 (ENSBMSG00010003256)	BMP3 (ENSBMSG00010003245)	PRKG2 (ENSBMSG00010003209)	ENSBMSG00010003184	RASGEF1B (ENSBMSG00010003013)	HNRNPD (ENSBMSG00010002956)	ENSBMSG00010002940	ENSBMSG00010002914
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00950000185288	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00500000044831.a.a.b.l	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00950000185288	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914
Equus	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00500000044831.a.a.b.l	ENSGT00940000156320	ENSGT00950000182922.a.a.a.b.b.a.a.b	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00950000185288	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914
Donkey	MODERN SPECIES	22	SCARB2 (ENSEASG00005016464)	FAM47E (ENSEASG00005016462)	STBD1 (ENSEASG00005031934)	CCDC158 (ENSEASG00005016456)	ENSEASG00005016318	SHROOM3 (ENSEASG00005016451)	SOWAHB (ENSEASG00005016448)	SEPTIN11 (ENSEASG00005016442)	CCNI (ENSEASG00005016435)	CCNG2 (ENSEASG00005016433)	CXCL13 (ENSEASG00005016431)	CNOT6L (ENSEASG00005016429)	MRPL1 (ENSEASG00005016425)	FRAS1 (ENSEASG00005016375)	ANXA3 (ENSEASG00005016357) #21	BMP2K (ENSEASG00005016349) #22	PAQR3 (ENSEASG00005016343) #23	ENSEASG00005016339	NAA11 (ENSEASG00005025370)	ENSEASG00005025644	ANTXR2 (ENSEASG00005016321)	ENSEASG00005015304	PRDM8 (ENSEASG00005036983)	FGF5 (ENSEASG00005016309)	CFAP299 (ENSEASG00005016307)	BMP3 (ENSEASG00005016301)	PRKG2 (ENSEASG00005016287)	RASGEF1B (ENSEASG00005016283)	HNRNPD (ENSEASG00005016278)	HNRNPDL (ENSEASG00005016276)	ENOPH1 (ENSEASG00005016274)
Horse	MODERN SPECIES	22	SCARB2 (ENSECAG00000024722)	FAM47E (ENSECAG00000024233)	STBD1 (ENSECAG00000029043)	CCDC158 (ENSECAG00000019478)	SHROOM3 (ENSECAG00000019008)	SEPTIN11 (ENSECAG00000005768)	CCNI (ENSECAG00000020161)	ENSECAG00000049588	CCNG2 (ENSECAG00000014113)	CXCL13 (ENSECAG00000011845)	CNOT6L (ENSECAG00000001582)	ENSECAG00000037682	ENSECAG00000029472	FRAS1 (ENSECAG00000007044)	ANXA3 (ENSECAG00000018419) #21	BMP2K (ENSECAG00000016099) #22	PAQR3 (ENSECAG00000015867) #23	ENSECAG00000035157	ENSECAG00000039776	GK2 (ENSECAG00000002394)	ENSECAG00000057492	ENSECAG00000002184	ANTXR2 (ENSECAG00000017827)	PRDM8 (ENSECAG00000017778)	FGF5 (ENSECAG00000015710)	CFAP299 (ENSECAG00000030795)	BMP3 (ENSECAG00000014379)	PRKG2 (ENSECAG00000024387)	ENSECAG00000045826	RASGEF1B (ENSECAG00000020438)	HNRNPD (ENSECAG00000055320)
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000163699	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT00940000162090
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000163699	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT00940000162090
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	23	CXCL11 (ENSRFEG00010020953)	NUP54 (ENSRFEG00010020975)	SCARB2 (ENSRFEG00010021015)	FAM47E (ENSRFEG00010021095)	STBD1 (ENSRFEG00010021110)	CCDC158 (ENSRFEG00010021128)	SHROOM3 (ENSRFEG00010000274)	SOWAHB (ENSRFEG00010000397)	SEPTIN11 (ENSRFEG00010000486)	CCNI (ENSRFEG00010000568)	CCNG2 (ENSRFEG00010000593)	CNOT6L (ENSRFEG00010000632)	ENSRFEG00010000688	FRAS1 (ENSRFEG00010000743)	ANXA3 (ENSRFEG00010000942) #21	BMP2K (ENSRFEG00010000981) #22	PAQR3 (ENSRFEG00010001055) #23	NAA11 (ENSRFEG00010001082)	GK2 (ENSRFEG00010001093)	ANTXR2 (ENSRFEG00010001113)	PRDM8 (ENSRFEG00010001150)	FGF5 (ENSRFEG00010001172)	CFAP299 (ENSRFEG00010001198)	BMP3 (ENSRFEG00010001224)	PRKG2 (ENSRFEG00010001249)	RASGEF1B (ENSRFEG00010001308)	ENSRFEG00010001394	HNRNPD (ENSRFEG00010001426)	HNRNPDL (ENSRFEG00010001497)	ENOPH1 (ENSRFEG00010001560)	TMEM150C (ENSRFEG00010001626)
Microbat	MODERN SPECIES	949						ENSMLUG00000014877	CCNI (ENSMLUG00000001380)	CCNG2 (ENSMLUG00000027700)	ENSMLUG00000022353	ENSMLUG00000003461	ENSMLUG00000008088	CNOT6L (ENSMLUG00000000936)	ENSMLUG00000011011	ENSMLUG00000012678	ANXA3 (ENSMLUG00000012732) #21	BMP2K (ENSMLUG00000008985) #22	PAQR3 (ENSMLUG00000029116) #23	ENSMLUG00000004070	GK2 (ENSMLUG00000013156)	ANTXR2 (ENSMLUG00000015495)	PRDM8 (ENSMLUG00000030190)	FGF5 (ENSMLUG00000000156)	ENSMLUG00000015854	ENSMLUG00000000161	BMP3 (ENSMLUG00000000163)	PRKG2 (ENSMLUG00000017311)	RASGEF1B (ENSMLUG00000017316)	ENSMLUG00000025219	ENSMLUG00000026634	HNRNPD (ENSMLUG00000010628)	HNRNPDL (ENSMLUG00000014452)
Megabat	MODERN SPECIES	870														FRAS1 (ENSPVAG00000016521)	ANXA3 (ENSPVAG00000016524) #21	BMP2K (ENSPVAG00000016526) #22	PAQR3 (ENSPVAG00000016528) #23
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000153096.b.c.b.b.e.b	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a
Panthera	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000153096.b.c.b.b.e.b	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a	ENSGT00440000039914
Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000153096.b.c.b.b.e.b	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a	ENSGT00440000039914
lion	MODERN SPECIES	4	SCARB2 (ENSPLOG00000001393)	ENSPLOG00000001345	STBD1 (ENSPLOG00000001247)	CCDC158 (ENSPLOG00000001049)	SHROOM3 (ENSPLOG00000000970)	SOWAHB (ENSPLOG00000000958)	SEPTIN11 (ENSPLOG00000000909)	CCNI (ENSPLOG00000000860)	CCNG2 (ENSPLOG00000000783)	CXCL13 (ENSPLOG00000000738)	CNOT6L (ENSPLOG00000000709)	MRPL1 (ENSPLOG00000000542)	ENSPLOG00000000377	FRAS1 (ENSPLOG00000014170)	ANXA3 (ENSPLOG00000014093) #21	BMP2K (ENSPLOG00000013976) #22	PAQR3 (ENSPLOG00000013923) #23	NAA11 (ENSPLOG00000013903)	GK2 (ENSPLOG00000013882)	ENSPLOG00000013825	ANTXR2 (ENSPLOG00000013567)	ENSPLOG00000013529	PRDM8 (ENSPLOG00000013495)	FGF5 (ENSPLOG00000013453)	CFAP299 (ENSPLOG00000013407)	BMP3 (ENSPLOG00000013370)	PRKG2 (ENSPLOG00000013034)	ENSPLOG00000012985	RASGEF1B (ENSPLOG00000012759)	HNRNPD (ENSPLOG00000012405)	ENSPLOG00000012354
leopard	MODERN SPECIES	2	SCARB2 (ENSPPRG00000000276)	FAM47E (ENSPPRG00000001347)	STBD1 (ENSPPRG00000001497)	CCDC158 (ENSPPRG00000003721)	SOWAHB (ENSPPRG00000017174)	SEPTIN11 (ENSPPRG00000007487)	CCNI (ENSPPRG00000007759)	CCNG2 (ENSPPRG00000008201)	ENSPPRG00000008329	CXCL13 (ENSPPRG00000008576)	CNOT6L (ENSPPRG00000008857)	MRPL1 (ENSPPRG00000009221)	FRAS1 (ENSPPRG00000024528)	ANXA3 (ENSPPRG00000023422) #21	ENSPPRG00000023188	BMP2K (ENSPPRG00000000756) #22	PAQR3 (ENSPPRG00000000942) #23	NAA11 (ENSPPRG00000017693)	GK2 (ENSPPRG00000017703)	ANTXR2 (ENSPPRG00000003020)	PRDM8 (ENSPPRG00000004618)	FGF5 (ENSPPRG00000005086)	CFAP299 (ENSPPRG00000005846)	BMP3 (ENSPPRG00000006241)	PRKG2 (ENSPPRG00000007997)	RASGEF1B (ENSPPRG00000011648)	HNRNPD (ENSPPRG00000012258)	HNRNPDL (ENSPPRG00000013787)	ENSPPRG00000015090	ENOPH1 (ENSPPRG00000016757)	TMEM150C (ENSPPRG00000020494)
Tiger	MODERN SPECIES	44	ART3 (ENSPTIG00000009266)	NUP54 (ENSPTIG00000008475)	SCARB2 (ENSPTIG00000003626)	FAM47E (ENSPTIG00000021069)	STBD1 (ENSPTIG00000020749)	CCDC158 (ENSPTIG00000020021)	SOWAHB (ENSPTIG00000005705)	SEPTIN11 (ENSPTIG00000017796)	CCNI (ENSPTIG00000017639)	CCNG2 (ENSPTIG00000016584)	CXCL13 (ENSPTIG00000016243)	CNOT6L (ENSPTIG00000015698)	MRPL1 (ENSPTIG00000015465)	FRAS1 (ENSPTIG00000011186)	ANXA3 (ENSPTIG00000010481) #21	BMP2K (ENSPTIG00000009591) #22	PAQR3 (ENSPTIG00000009175) #23	NAA11 (ENSPTIG00000005597)	GK2 (ENSPTIG00000005588)	ANTXR2 (ENSPTIG00000007236)	ENSPTIG00000006254	FGF5 (ENSPTIG00000005402)	CFAP299 (ENSPTIG00000002765)	BMP3 (ENSPTIG00000001121)	PRKG2 (ENSPTIG00000021439)	RASGEF1B (ENSPTIG00000020355)	ENSPTIG00000020124	HNRNPD (ENSPTIG00000019434)	HNRNPDL (ENSPTIG00000018505)	ENOPH1 (ENSPTIG00000017297)	TMEM150C (ENSPTIG00000016662)
Cat	MODERN SPECIES	235	ART3 (ENSFCAG00000027376)	NUP54 (ENSFCAG00000001118)	SCARB2 (ENSFCAG00000001121)	FAM47E (ENSFCAG00000041994)	STBD1 (ENSFCAG00000028423)	SHROOM3 (ENSFCAG00000012875)	SOWAHB (ENSFCAG00000023286)	SEPTIN11 (ENSFCAG00000027412)	CCNI (ENSFCAG00000003637)	CCNG2 (ENSFCAG00000026008)	CXCL13 (ENSFCAG00000033954)	CNOT6L (ENSFCAG00000008322)	MRPL1 (ENSFCAG00000013776)	FRAS1 (ENSFCAG00000011279)	ANXA3 (ENSFCAG00000011280) #21	BMP2K (ENSFCAG00000002953) #22	PAQR3 (ENSFCAG00000043055) #23	ENSFCAG00000006803	GK2 (ENSFCAG00000041141)	ENSFCAG00000052546	ANTXR2 (ENSFCAG00000018869)	PRDM8 (ENSFCAG00000042322)	FGF5 (ENSFCAG00000029635)	CFAP299 (ENSFCAG00000027644)	BMP3 (ENSFCAG00000007811)	PRKG2 (ENSFCAG00000007814)	RASGEF1B (ENSFCAG00000028077)	VAMP9 (ENSFCAG00000053179)	HNRNPD (ENSFCAG00000027404)	ENSFCAG00000028355	HNRNPDL (ENSFCAG00000000455)
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b.x.a	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00390000003552.o.b	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000163699	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00950000186138	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00500000044831.a.a.b.l	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b.x.a	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00390000003552.o.b	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000163699	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00950000186138	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00500000044831.a.a.b.l	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00390000016988.a.a.a.a.a.a.b.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b.x.a	ENSGT00440000039914
Dingo	MODERN SPECIES	342	ENSCAFG00020011546	SHROOM3 (ENSCAFG00020011481)	SOWAHB (ENSCAFG00020011471)	SEPTIN11 (ENSCAFG00020011148)	CCNI (ENSCAFG00020011143)	AHCY (ENSCAFG00020011137)	CCNG2 (ENSCAFG00020011134)	ENSCAFG00020011129	ENSCAFG00020011123	CNOT6L (ENSCAFG00020011108)	ENSCAFG00020011079	ENSCAFG00020011074	FRAS1 (ENSCAFG00020011017)	ANXA3 (ENSCAFG00020010989) #21	ENSCAFG00020010985	BMP2K (ENSCAFG00020010964) #22	PAQR3 (ENSCAFG00020010935) #23	ENSCAFG00020010916	GK2 (ENSCAFG00020010894)	ENSCAFG00020010886	ENSCAFG00020010865	ANTXR2 (ENSCAFG00020010842)	ENSCAFG00020010823	PRDM8 (ENSCAFG00020010813)	FGF5 (ENSCAFG00020010809)	ENSCAFG00020010807	BMP3 (ENSCAFG00020010793)	PRKG2 (ENSCAFG00020010735)	RASGEF1B (ENSCAFG00020010726)	ENSCAFG00020010724	ENSCAFG00020010723
Dog	MODERN SPECIES	25	SHROOM3 (ENSCAFG00845014821)	SOWAHB (ENSCAFG00845014859)	ENSCAFG00845014878	SEPTIN11 (ENSCAFG00845015064)	CCNI (ENSCAFG00845015315)	ENSCAFG00845015412	CCNG2 (ENSCAFG00845015436)	CXCL13 (ENSCAFG00845015471)	CNOT6L (ENSCAFG00845015630)	ENSCAFG00845015835	MRPL1 (ENSCAFG00845015904)	FRAS1 (ENSCAFG00845016022)	ENSCAFG00845016133	ENSCAFG00845016158	ANXA3 (ENSCAFG00845016191) #21	BMP2K (ENSCAFG00845016378) #22	PAQR3 (ENSCAFG00845016686) #23	NAA11 (ENSCAFG00845016750)	GK2 (ENSCAFG00845016772)	ENSCAFG00845016799	ANTXR2 (ENSCAFG00845017156)	ENSCAFG00845017632	PRDM8 (ENSCAFG00845017674)	FGF5 (ENSCAFG00845017837)	CFAP299 (ENSCAFG00845017920)	BMP3 (ENSCAFG00845017996)	PRKG2 (ENSCAFG00845018088)	RASGEF1B (ENSCAFG00845018382)	ENSCAFG00845018639	HNRNPD (ENSCAFG00845018743)	HNRNPDL (ENSCAFG00845018924)
Red fox	MODERN SPECIES	27	ANKRD34B (ENSVVUG00000024950)	ENSVVUG00000024949	DHFR (ENSVVUG00000024946)	MSH3 (ENSVVUG00000024903)	RASGRF2 (ENSVVUG00000024881)	CKMT2 (ENSVVUG00000024873)	CCNI (ENSVVUG00000024871)	CCNG2 (ENSVVUG00000024867)	CXCL13 (ENSVVUG00000024863)	CNOT6L (ENSVVUG00000024858)	MRPL1 (ENSVVUG00000024857)	ENSVVUG00000024856	FRAS1 (ENSVVUG00000024813)	ANXA3 (ENSVVUG00000024795) #21	ENSVVUG00000024794	BMP2K (ENSVVUG00000024784) #22	PAQR3 (ENSVVUG00000024780) #23	ENSVVUG00000024772	ENSVVUG00000024769	GK2 (ENSVVUG00000024765)	ANTXR2 (ENSVVUG00000024752)	ENSVVUG00000024749	FGF5 (ENSVVUG00000024746)	ENSVVUG00000024743	BMP3 (ENSVVUG00000024734)	PRKG2 (ENSVVUG00000024673)	RASGEF1B (ENSVVUG00000024668)	ENSVVUG00000024667	HNRNPD (ENSVVUG00000024658)	ENSVVUG00000024657	HNRNPDL (ENSVVUG00000024653)
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b.x.a	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	133														ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000166264	ENSGT00940000168595	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b.y.b	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a
American mink	MODERN SPECIES	133														FRAS1 (ENSNVIG00000005158)	ANXA3 (ENSNVIG00000005122) #21	ENSNVIG00000005108 #22	PAQR3 (ENSNVIG00000005092) #23	GK2 (ENSNVIG00000005087)	ANTXR2 (ENSNVIG00000005045)	ENSNVIG00000005029	FGF5 (ENSNVIG00000005009)	ENSNVIG00000005003	BMP3 (ENSNVIG00000004988)	PRKG2 (ENSNVIG00000004908)	RASGEF1B (ENSNVIG00000004857)	ENSNVIG00000004837	HNRNPD (ENSNVIG00000004778)	ENSNVIG00000004759	ENOPH1 (ENSNVIG00000004745)	T150C (ENSNVIG00000004713)	SCD5 (ENSNVIG00000004692)
Ferret	MODERN SPECIES	391										ENSMPUG00000006802	MRPL1 (ENSMPUG00000006794)	FRAS1 (ENSMPUG00000006768)	ANXA3 (ENSMPUG00000006760) #21	ENSMPUG00000006755	ENSMPUG00000006751	ENSMPUG00000006695 #22	PAQR3 (ENSMPUG00000006650) #23	ENSMPUG00000006642	GK2 (ENSMPUG00000019962)	ANTXR2 (ENSMPUG00000006627)	ENSMPUG00000006581	ENSMPUG00000006574	PRDM8 (ENSMPUG00000006558)	ENSMPUG00000006550	FGF5 (ENSMPUG00000006523)	ENSMPUG00000006519	ENSMPUG00000006514
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778.eb	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00390000003552.r.b	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000166264	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b.x.a	ENSGT00440000039914
Giant Panda	MODERN SPECIES	2	FAM47E (ENSAMEG00000011810)	STBD1 (ENSAMEG00000011812)	CCDC158 (ENSAMEG00000011815)	SHROOM3 (ENSAMEG00000011822)	SOWAHB (ENSAMEG00000003246)	SEPTIN11 (ENSAMEG00000013821)	CCNI (ENSAMEG00000013810)	CCNG2 (ENSAMEG00000013793)	ENSAMEG00000030583	CXCL13 (ENSAMEG00000002513)	CNOT6L (ENSAMEG00000005570)	MRPL1 (ENSAMEG00000005556)	FRAS1 (ENSAMEG00000005463)	ENSAMEG00000019487	ANXA3 (ENSAMEG00000005375) #21	BMP2K (ENSAMEG00000005341) #22	PAQR3 (ENSAMEG00000005319) #23	ENSAMEG00000024337	GK2 (ENSAMEG00000019462)	ENSAMEG00000027026	ANTXR2 (ENSAMEG00000005247)	ENSAMEG00000019664	PRDM8 (ENSAMEG00000024487)	FGF5 (ENSAMEG00000005239)	CFAP299 (ENSAMEG00000005237)	ENSAMEG00000026264	BMP3 (ENSAMEG00000005230)	PRKG2 (ENSAMEG00000005199)	RASGEF1B (ENSAMEG00000005176)	ENSAMEG00000031158	HNRNPD (ENSAMEG00000005158)
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	83	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778.eb	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00550000074803	ENSGT00390000013740	ENSGT00940000163834	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00390000011272	ENSGT00530000063687.b.b.b	ENSGT01030000234549.a.a.a.b.b	ENSGT00940000162843	ENSGT00940000162426
Polar bear	MODERN SPECIES	183	ENSUMAG00000007659	NUP54 (ENSUMAG00000007669)	SCARB2 (ENSUMAG00000007709)	FAM47E (ENSUMAG00000007843)	STBD1 (ENSUMAG00000007849)	CCDC158 (ENSUMAG00000007861)	SHROOM3 (ENSUMAG00000007894)	SEPTIN11 (ENSUMAG00000007904)	CCNI (ENSUMAG00000007929)	CCNG2 (ENSUMAG00000007945)	CXCL13 (ENSUMAG00000007951)	CNOT6L (ENSUMAG00000007955)	MRPL1 (ENSUMAG00000007973)	FRAS1 (ENSUMAG00000008017)	ANXA3 (ENSUMAG00000008071) #21	BMP2K (ENSUMAG00000008088) #22	PAQR3 (ENSUMAG00000008113) #23	ENSUMAG00000008159	GK2 (ENSUMAG00000008167)	ENSUMAG00000008169	ANTXR2 (ENSUMAG00000008239)	FGF5 (ENSUMAG00000008558)	ENSUMAG00000008564	BMP3 (ENSUMAG00000008570)	PRKG2 (ENSUMAG00000008585)	RASGEF1B (ENSUMAG00000008667)	ENSUMAG00000008674	ENSUMAG00000008681	HNRNPD (ENSUMAG00000008685)	ENOPH1 (ENSUMAG00000008688)	TMEM150C (ENSUMAG00000008691)
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES	935																ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23
Common shrew	MODERN SPECIES	2759																ENSSARG00000011122 #22	PAQR3 (ENSSARG00000011145) #23
Hedgehog	MODERN SPECIES	3658																BMP2K (ENSEEUG00000012116) #22	PAQR3 (ENSEEUG00000012162) #23
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000164242	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT00940000162090
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES	511																ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b
Sloth	MODERN SPECIES	3212																BMP2K (ENSCHOG00000002787) #22
Armadillo	MODERN SPECIES	2783														ENSDNOG00000032942	ENSDNOG00000036394	BMP2K (ENSDNOG00000031685) #22	PAQR3 (ENSDNOG00000018292) #23	GK2 (ENSDNOG00000035210)	ANTXR2 (ENSDNOG00000018261)	PRDM8 (ENSDNOG00000011667)	FGF5 (ENSDNOG00000042844)	BMP3 (ENSDNOG00000045849)	ENSDNOG00000037558	RASGEF1B (ENSDNOG00000005271)	ENSDNOG00000035927
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000164242	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT00940000162090
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000162425	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000164242	ENSGT01000000214434.B.b.e.b	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426.b.b	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT00940000162090
Elephant	MODERN SPECIES	302	SCARB2 (ENSLAFG00000008871)	FAM47E (ENSLAFG00000008798)	STBD1 (ENSLAFG00000006680)	CCDC158 (ENSLAFG00000006683)	SHROOM3 (ENSLAFG00000022184)	ENSLAFG00000003940	SEPTIN11 (ENSLAFG00000016488)	CCNI (ENSLAFG00000029218)	CCNG2 (ENSLAFG00000006212)	CXCL13 (ENSLAFG00000010039)	CNOT6L (ENSLAFG00000011449)	MRPL1 (ENSLAFG00000011456)	ENSLAFG00000007543	ENSLAFG00000028453	ANXA3 (ENSLAFG00000011787) #21	BMP2K (ENSLAFG00000011439) #22	PAQR3 (ENSLAFG00000011445) #23	ENSLAFG00000001999	GK2 (ENSLAFG00000030288)	ANTXR2 (ENSLAFG00000003706)	PRDM8 (ENSLAFG00000016169)	FGF5 (ENSLAFG00000016173)	ENSLAFG00000004273	BMP3 (ENSLAFG00000016636)	PRKG2 (ENSLAFG00000007763)	RASGEF1B (ENSLAFG00000005606)	ENSLAFG00000030625	ENSLAFG00000000887	HNRNPD (ENSLAFG00000016483)	HNRNPDL (ENSLAFG00000008612)	ENOPH1 (ENSLAFG00000008619)
Tenrec	MODERN SPECIES	3511																ENSETEG00000004513 #22	ENSETEG00000004519 #23
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000154426.b.a.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000166264	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000160897	ENSGT01030000234574.B.c.a	ENSGT00530000063424.b	ENSGT00390000003791	ENSGT00940000157350
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000154426.b.a.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000160897	ENSGT01030000234574.B.c.a	ENSGT00530000063424.b.a	ENSGT00390000003791	ENSGT00940000157350	ENSGT00950000183015.D
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00440000039914	ENSGT00940000154426.b.a.b.a	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000160897	ENSGT01030000234574.B.c.a	ENSGT00530000063424.b.a	ENSGT00390000003791	ENSGT00940000157350	ENSGT00950000183015.D
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00440000039914	ENSGT00940000154426.b.a.b.a	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000165128	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000160897	ENSGT01030000234574.B.c.a	ENSGT00530000063424.b.a	ENSGT00390000003791.u.a	ENSGT00940000157350	ENSGT00950000183015.D
Common wonbat	MODERN SPECIES	666	ENOPH1 (ENSVURG00010010464)	ENSVURG00010010478	HNRNPD (ENSVURG00010010545)	ENSVURG00010010572	RASGEF1B (ENSVURG00010010605)	ENSVURG00010010660	ENSVURG00010010672	SEPTIN11 (ENSVURG00010010674)	CCNI (ENSVURG00010010687)	CCNG2 (ENSVURG00010010701)	CNOT6L (ENSVURG00010010740)	ENSVURG00010010751	FRAS1 (ENSVURG00010010815)	ENSVURG00010010983	ANXA3 (ENSVURG00010010998) #21	BMP2K (ENSVURG00010011015) #22	PAQR3 (ENSVURG00010011029) #23	ANTXR2 (ENSVURG00010011045)	PRDM8 (ENSVURG00010011069)	FGF5 (ENSVURG00010011079)	ENSVURG00010011087
koala	MODERN SPECIES	31	TMEM150C (ENSPCIG00000003045)	ENOPH1 (ENSPCIG00000003064)	ENSPCIG00000003089	HNRNPD (ENSPCIG00000003112)	ENSPCIG00000010777	RASGEF1B (ENSPCIG00000016369)	ENSPCIG00000028011	SOWAHB (ENSPCIG00000004099)	SEPTIN11 (ENSPCIG00000028014)	CCNI (ENSPCIG00000028015)	CCNG2 (ENSPCIG00000028018)	CNOT6L (ENSPCIG00000027504)	ENSPCIG00000028020	ENSPCIG00000012720	ANXA3 (ENSPCIG00000012713) #21	BMP2K (ENSPCIG00000025824) #22	PAQR3 (ENSPCIG00000025826) #23	ANTXR2 (ENSPCIG00000007919)	PRDM8 (ENSPCIG00000037036)	ENSPCIG00000007911	CFAP299 (ENSPCIG00000007903)	BMP3 (ENSPCIG00000007894)	PRKG2 (ENSPCIG00000020110)	WDFY3 (ENSPCIG00000024383)	CDS1 (ENSPCIG00000024379)	NKX6-1 (ENSPCIG00000019277)	ENSPCIG00000037118	GPAT3 (ENSPCIG00000031909)	ENSPCIG00000019736	ENSPCIG00000019737	HELQ (ENSPCIG00000019746)
Wallaby	MODERN SPECIES	4619																ENSMEUG00000014532 #22	PAQR3 (ENSMEUG00000014552) #23
Tasmanian devil	MODERN SPECIES	5	ENSSHAG00000013658	ENSSHAG00000013616	ENSSHAG00000013312	ENSSHAG00000012974	ENSSHAG00000012394	ENSSHAG00000008657	ENSSHAG00000032288	SEPTIN11 (ENSSHAG00000024880)	CCNI (ENSSHAG00000005656)	CCNG2 (ENSSHAG00000003541)	ENSSHAG00000023685	CNOT6L (ENSSHAG00000006072)	MRPL1 (ENSSHAG00000001696)	ENSSHAG00000004305	ENSSHAG00000002514 #21	BMP2K (ENSSHAG00000007049) #22	PAQR3 (ENSSHAG00000006742) #23	ANTXR2 (ENSSHAG00000018339)	PRDM8 (ENSSHAG00000028441)	FGF5 (ENSSHAG00000023688)	ENSSHAG00000017421	CFAP299 (ENSSHAG00000025271)	BMP3 (ENSSHAG00000017046)	ENSSHAG00000016791	ENSSHAG00000015550	CDS1 (ENSSHAG00000015378)	ENSSHAG00000027228	NKX6-1 (ENSSHAG00000024406)	GPAT3 (ENSSHAG00000007521)	ENSSHAG00000007154	ENSSHAG00000007084
Opossum	MODERN SPECIES	4	ENSMODG00000036668	ENPEP (ENSMODG00000005847)	ENSMODG00000025546	EGF (ENSMODG00000005870)	LRIT3 (ENSMODG00000005879)	ENSMODG00000005889	ENSMODG00000042020	GAR1 (ENSMODG00000005897)	CFI (ENSMODG00000005914)	PLA2G12A (ENSMODG00000005928)	ENSMODG00000005948	MCUB (ENSMODG00000005959)	ENSMODG00000020811	ANXA3 (ENSMODG00000020809) #21	ENSMODG00000023534	BMP2K (ENSMODG00000020807) #22	PAQR3 (ENSMODG00000020805) #23	ENSMODG00000046007	ENSMODG00000020795	ANTXR2 (ENSMODG00000020794)	PRDM8 (ENSMODG00000048981)	ENSMODG00000020788	ENSMODG00000020786	ENSMODG00000044211	BMP3 (ENSMODG00000020784)	PRKG2 (ENSMODG00000020783)	WDFY3 (ENSMODG00000020782)	CDS1 (ENSMODG00000020781)	NKX6-1 (ENSMODG00000020778)	ENSMODG00000039714	GPAT3 (ENSMODG00000020776)
Platypus	MODERN SPECIES	1	ENSOANG00000005448	IL6ST (ENSOANG00000005447)	ANKRD55 (ENSOANG00000010876)	MAP3K1 (ENSOANG00000013632)	SETD9 (ENSOANG00000045833)	MIER3 (ENSOANG00000048775)	GPBP1 (ENSOANG00000013639)	PLK2 (ENSOANG00000013641)	ENSOANG00000007024	SEPTIN11 (ENSOANG00000013643)	CCNI (ENSOANG00000013645)	CCNG2 (ENSOANG00000009391)	CNOT6L (ENSOANG00000003561)	MRPL1 (ENSOANG00000003564)	ENSOANG00000003565	BMP2K (ENSOANG00000003566) #22	ENSOANG00000003567 #23	ANTXR2 (ENSOANG00000044651)	ENSOANG00000049135	ENSOANG00000050861	ENSOANG00000043047	ENSOANG00000042950	PRKG2 (ENSOANG00000013019)	HNRNPD (ENSOANG00000001932)	HNRNPDL (ENSOANG00000004651)	ENOPH1 (ENSOANG00000049418)	ENSOANG00000040678	CCDC158 (ENSOANG00000003480)	ENSOANG00000049586	ENSOANG00000011811	SCARB2 (ENSOANG00000008995)
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00940000155534.u.a	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292.b	ENSGT00990000205360	ENSGT00530000064292.a	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000166264	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000160325.a	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT00940000162090
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000165114	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00940000155534.u.a	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00990000205360	ENSGT00530000064292.a	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000160325.a	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT00940000162090	ENSGT00390000003175.a.b
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000165114.b	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00940000155534.u.a	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00990000205360	ENSGT00530000064292.a	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000160325.a	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT00940000162090	ENSGT00390000003175.a.b
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00940000165114.b	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778.x	ENSGT00940000155534.u.a	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00960000190413	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000160325.a	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT00940000162090	ENSGT00390000003175.a.b
Common wall lizard	MODERN SPECIES	17	ENSPMRG00000008943	ENSPMRG00000008936	ENSPMRG00000008929	ENSPMRG00000023296	SOWAHB (ENSPMRG00000023293)	SEPTIN11 (ENSPMRG00000023282)	CCNI (ENSPMRG00000023276)	CCNG2 (ENSPMRG00000023272)	ENSPMRG00000023269	ENSPMRG00000023267	CNOT6L (ENSPMRG00000023261)	MRPL1 (ENSPMRG00000023254)	ENSPMRG00000023206	ANXA3 (ENSPMRG00000023195) #21	ENSPMRG00000023172	BMP2K (ENSPMRG00000023158) #22	PAQR3 (ENSPMRG00000023152) #23	ANTXR2 (ENSPMRG00000023140)	PRDM8 (ENSPMRG00000023132)	FGF5 (ENSPMRG00000023129)	CFAP299 (ENSPMRG00000023125)	BMP3 (ENSPMRG00000023119)	PRKG2 (ENSPMRG00000023109)	RASGEF1B (ENSPMRG00000023097)	ENSPMRG00000023088	ATP5F1D (ENSPMRG00000023087)	ENSPMRG00000023083	HNRNPD (ENSPMRG00000023075)	HNRNPDL (ENSPMRG00000023070)	ENOPH1 (ENSPMRG00000023067)	TMEM150C (ENSPMRG00000023061)
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	11		ENSSMRG00000012827	CCDC158 (ENSSMRG00000012828)	SHROOM3 (ENSSMRG00000012836)	ENSSMRG00000012840	ENSSMRG00000012843	SEPTIN11 (ENSSMRG00000012846)	CCNI (ENSSMRG00000012847)	CCNG2 (ENSSMRG00000012848)	ENSSMRG00000012850	ENSSMRG00000012851	CNOT6L (ENSSMRG00000012881)	MRPL1 (ENSSMRG00000012882)	ENSSMRG00000012884	ANXA3 (ENSSMRG00000012886) #21	BMP2K (ENSSMRG00000012887) #22	PAQR3 (ENSSMRG00000012888) #23	ENSSMRG00000012889	ANTXR2 (ENSSMRG00000012892)	PRDM8 (ENSSMRG00000012893)	FGF5 (ENSSMRG00000012894)	CFAP299 (ENSSMRG00000012895)	BMP3 (ENSSMRG00000012897)	PRKG2 (ENSSMRG00000012898)	RASGEF1B (ENSSMRG00000012899)	ENSSMRG00000012901	HNRNPD (ENSSMRG00000012902)	HNRNPDL (ENSSMRG00000012903)	ENOPH1 (ENSSMRG00000012904)	TMEM150C (ENSSMRG00000012905)	SCD5 (ENSSMRG00000012906)
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000165114.b	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00940000155534.u.a	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00990000205360	ENSGT00530000064292.a	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000160325.a	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT00940000162090	ENSGT00390000003175.a.b
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00940000155534.u.a	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00990000205360	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000166264	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT00940000162090	ENSGT00390000003175.a.b	ENSGT00940000155881
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	55	ENSGT00940000157870	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00990000205360	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320.a	ENSGT00940000156320.b	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000166264	ENSGT00940000168595	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT00940000162090
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	56	ENSGT00940000157870	ENSGT00390000013620	ENSGT00940000153372.A.e.a.a	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00990000205360	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320.b	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000166264	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT00940000162090	ENSGT00390000003175.a.b	ENSGT00940000155881
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	117														ENSPTXG00000018066	ANXA3 (ENSPTXG00000018013) #21	BMP2K (ENSPTXG00000018002) #22	PAQR3 (ENSPTXG00000018000) #23	ANTXR2 (ENSPTXG00000017996)	PRDM8 (ENSPTXG00000017992)	ENSPTXG00000017991	ENSPTXG00000017990	BMP3 (ENSPTXG00000017988)	PRKG2 (ENSPTXG00000017985)	RASGEF1B (ENSPTXG00000017983)	HNRNPD (ENSPTXG00000017981)	HNRNPDL (ENSPTXG00000017980)	ENOPH1 (ENSPTXG00000017979)	TMEM150C (ENSPTXG00000017978)	SCD5 (ENSPTXG00000017977)	SEC31A (ENSPTXG00000017976)	LIN54 (ENSPTXG00000017975)
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	82	ENSNSUG00000001929	NUP54 (ENSNSUG00000001927)	SCARB2 (ENSNSUG00000001921)	STBD1 (ENSNSUG00000001919)	CCDC158 (ENSNSUG00000001903)	SHROOM3 (ENSNSUG00000001895)	SOWAHB (ENSNSUG00000001894)	SEPTIN11 (ENSNSUG00000001861)	CCNI (ENSNSUG00000001854)	CCNG2 (ENSNSUG00000001853)	ENSNSUG00000001852	CNOT6L (ENSNSUG00000001851)	MRPL1 (ENSNSUG00000001780)	ENSNSUG00000001776	ANXA3 (ENSNSUG00000001770) #21	ENSNSUG00000001768 #22	PAQR3 (ENSNSUG00000001766) #23	ANTXR2 (ENSNSUG00000001436)	PRDM8 (ENSNSUG00000001435)	ENSNSUG00000001433	ENSNSUG00000001432	BMP3 (ENSNSUG00000001410)	ENSNSUG00000001405	RASGEF1B (ENSNSUG00000001378)	ENSNSUG00000001375	HNRNPD (ENSNSUG00000001373)	HNRNPDL (ENSNSUG00000001371)	ENOPH1 (ENSNSUG00000001370)	TMEM150C (ENSNSUG00000001347)	SCD5 (ENSNSUG00000001343)	ENSNSUG00000001341
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	1060																BMP2K (ENSLLTG00000006690) #22	PAQR3 (ENSLLTG00000006825) #23
Indian cobra	MODERN SPECIES	3	ENSNNAG00000016360	ENSNNAG00000016368	ENSNNAG00000016380	STBD1 (ENSNNAG00000016388)	CCDC158 (ENSNNAG00000016397)	ENSNNAG00000016423	ENSNNAG00000016437	SEPTIN11 (ENSNNAG00000016449)	CCNI (ENSNNAG00000016489)	CCNG2 (ENSNNAG00000016507)	ENSNNAG00000016513	CNOT6L (ENSNNAG00000016525)	MRPL1 (ENSNNAG00000016557)	ENSNNAG00000016584	ANXA3 (ENSNNAG00000016686) #21	BMP2K (ENSNNAG00000016701) #22	PAQR3 (ENSNNAG00000016718) #23	ANTXR2 (ENSNNAG00000016725)	PRDM8 (ENSNNAG00000016753)	ENSNNAG00000016762	ENSNNAG00000016767	ENSNNAG00000016774	BMP3 (ENSNNAG00000016784)	ENSNNAG00000016786	RASGEF1B (ENSNNAG00000016793)	HNRNPD (ENSNNAG00000016809)	HNRNPDL (ENSNNAG00000016831)	ENOPH1 (ENSNNAG00000016845)	TMEM150C (ENSNNAG00000016854)	SCD5 (ENSNNAG00000004001)	SEC31A (ENSNNAG00000004060)
Lizard	MODERN SPECIES	4	CCDC158 (ENSACAG00000012498)	SHROOM3 (ENSACAG00000012483)	ENSACAG00000041656	SOWAHB (ENSACAG00000012473)	SEPTIN11 (ENSACAG00000012255)	CCNI (ENSACAG00000012214)	CCNG2 (ENSACAG00000012149)	ENSACAG00000042223	CXCL13 (ENSACAG00000037544)	CNOT6L (ENSACAG00000012099)	MRPL1 (ENSACAG00000012069)	ENSACAG00000037179	ENSACAG00000035324	ENSACAG00000011941	ANXA3 (ENSACAG00000006203) #21	BMP2K (ENSACAG00000006356) #22	PAQR3 (ENSACAG00000006437) #23	ENSACAG00000035242	OSTC (ENSACAG00000012543)	ENSACAG00000045518	ETNPPL (ENSACAG00000012569)	SEC24B (ENSACAG00000012684)	MCUB (ENSACAG00000012831)	CASP6 (ENSACAG00000012875)	PLA2G12A (ENSACAG00000043243)	ENSACAG00000029395	ENSACAG00000010059	GAR1 (ENSACAG00000010031)	ENSACAG00000010114	LRIT3 (ENSACAG00000010138)	EGF (ENSACAG00000010153)
tuatara	MODERN SPECIES	1423												CNOT6L (ENSSPUG00000002016)	MRPL1 (ENSSPUG00000002005)	ENSSPUG00000001557	ANXA3 (ENSSPUG00000001502) #21	BMP2K (ENSSPUG00000001495) #22	PAQR3 (ENSSPUG00000001473) #23
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00940000155534.u.a	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292.b	ENSGT00990000205360	ENSGT00530000064292.a	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000166264	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000160325.a	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT00940000162090
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00940000155534.u.a	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292.b	ENSGT00990000205360	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000162130	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000166264	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000160325.a	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT00940000162090	ENSGT00390000003175.a.b
Chinese turtle	MODERN SPECIES	1923	ENSPSIG00000009184	STBD1 (ENSPSIG00000001756)	CCDC158 (ENSPSIG00000008743)	SHROOM3 (ENSPSIG00000007784)	ENSPSIG00000007376	ENSPSIG00000007128	SEPTIN11 (ENSPSIG00000017552)	ENSPSIG00000017542	CCNI (ENSPSIG00000017268)	CCNG2 (ENSPSIG00000016955)	ENSPSIG00000016914	CNOT6L (ENSPSIG00000016241)	MRPL1 (ENSPSIG00000015906)	FRAS1 (ENSPSIG00000014377)	ANXA3 (ENSPSIG00000010853) #21	BMP2K (ENSPSIG00000009847) #22	PAQR3 (ENSPSIG00000009437) #23
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00960000189639	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00940000155534.u.a	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292.b	ENSGT00990000205360	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000166264	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000160325.a	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT00940000162090	ENSGT00390000003175.a.b
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00960000189639	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00940000155534.u.a	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00530000064292.b	ENSGT00990000205360	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000166264	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000160325.a	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT00940000162090	ENSGT00390000003175.a.b
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	593														ENSCABG00000002309	ANXA3 (ENSCABG00000002334) #21	BMP2K (ENSCABG00000002338) #22	PAQR3 (ENSCABG00000002343) #23
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	19	ENSGEVG00005004146	STBD1 (ENSGEVG00005004132)	CCDC158 (ENSGEVG00005004098)	SHROOM3 (ENSGEVG00005004005)	ENSGEVG00005003954	SOWAHB (ENSGEVG00005003932)	SEPTIN11 (ENSGEVG00005003921)	CCNI (ENSGEVG00005003909)	CCNG2 (ENSGEVG00005003894)	ENSGEVG00005003887	ENSGEVG00005003874	CNOT6L (ENSGEVG00005003849)	MRPL1 (ENSGEVG00005003827)	ENSGEVG00005003756	ANXA3 (ENSGEVG00005003703) #21	BMP2K (ENSGEVG00005003689) #22	PAQR3 (ENSGEVG00005003666) #23	ANTXR2 (ENSGEVG00005003624)	PRDM8 (ENSGEVG00005003605)	FGF5 (ENSGEVG00005003593)	ENSGEVG00005003584	CFAP299 (ENSGEVG00005003578)	BMP3 (ENSGEVG00005003568)	RASGEF1B (ENSGEVG00005003532)	ENSGEVG00005003502	HNRNPD (ENSGEVG00005003478)	HNRNPDL (ENSGEVG00005003463)	ENOPH1 (ENSGEVG00005003454)	TMEM150C (ENSGEVG00005003441)	SCD5 (ENSGEVG00005003418)	SEC31A (ENSGEVG00005003370)
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00960000189639	ENSGT00390000007731	ENSGT00390000013339	ENSGT00940000157778	ENSGT00940000155534.u.a	ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a	ENSGT00940000160196	ENSGT00940000154827	ENSGT00940000156423	ENSGT00990000205360	ENSGT00990000213510	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000166264	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000160325.a	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT00940000162090	ENSGT00390000003175.a.b
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	63	SCARB2 (ENSTMTG00000004308)	ENSTMTG00000004302	STBD1 (ENSTMTG00000004298)	SHROOM3 (ENSTMTG00000004101)	ENSTMTG00000004072	SOWAHB (ENSTMTG00000004065)	SEPTIN11 (ENSTMTG00000004048)	CCNI (ENSTMTG00000004039)	CCNG2 (ENSTMTG00000004031)	ENSTMTG00000003988	ENSTMTG00000003975	CNOT6L (ENSTMTG00000003952)	MRPL1 (ENSTMTG00000003928)	ENSTMTG00000003655	ANXA3 (ENSTMTG00000003594) #21	BMP2K (ENSTMTG00000003553) #22	PAQR3 (ENSTMTG00000003519) #23	ANTXR2 (ENSTMTG00000003403)	PRDM8 (ENSTMTG00000003381)	FGF5 (ENSTMTG00000003353)	ENSTMTG00000003336	BMP3 (ENSTMTG00000003319)	RASGEF1B (ENSTMTG00000003306)	ENSTMTG00000003295	HNRNPD (ENSTMTG00000003266)	HNRNPDL (ENSTMTG00000003251)	ENOPH1 (ENSTMTG00000003239)	TMEM150C (ENSTMTG00000003220)	SCD5 (ENSTMTG00000003174)	SEC31A (ENSTMTG00000003133)	THAP9 (ENSTMTG00000003117)
painted turtle	DUPLICATION
painted turtle	MODERN SPECIES	1004													ENSCPBG00000014793	ANXA3 (ENSCPBG00000014784) #21	ENSCPBG00000014783	BMP2K (ENSCPBG00000014779) #22	PAQR3 (ENSCPBG00000014774) #23
painted turtle	MODERN SPECIES	709	FIGLA (ENSCPBG00000003776)	ADD2 (ENSCPBG00000003740)	SNRNP27 (ENSCPBG00000003716)	MXD1 (ENSCPBG00000003695)	ENSCPBG00000003673	FAM136A (ENSCPBG00000003652)	SNRPG (ENSCPBG00000003642)	PCYOX1 (ENSCPBG00000003626)	TIA1 (ENSCPBG00000003611)	C2orf42 (ENSCPBG00000003591)	ENSCPBG00000003535	TGFA (ENSCPBG00000003503)	ENSCPBG00000003493	ENSCPBG00000003481	ANXA4 (ENSCPBG00000003449)	ENSCPBG00000003424 #22	ENSCPBG00000003404	NFU1 (ENSCPBG00000003389)	GFPT1 (ENSCPBG00000003360)	ANTXR1 (ENSCPBG00000003314)	ENSCPBG00000003285	ENSCPBG00000003225	GKN2 (ENSCPBG00000003194)	ENSCPBG00000003176	BMP10 (ENSCPBG00000003155)	ARHGAP25 (ENSCPBG00000003140)	CDS2 (ENSCPBG00000003128)	PCNA (ENSCPBG00000003114)	TMEM230 (ENSCPBG00000003096)	SLC23A2 (ENSCPBG00000003065)	RASSF2 (ENSCPBG00000003027)
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	80															ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000166264	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	32	ENSCPRG00005007143	ENSCPRG00005007171	RASSF6 (ENSCPRG00005007267)	ENSCPRG00005007275	ENSCPRG00005007280	ENSCPRG00005007284	MTHFD2L (ENSCPRG00005007287)	EREG (ENSCPRG00005007293)	AREG (ENSCPRG00005007297)	USO1 (ENSCPRG00005007325)	G3BP2 (ENSCPRG00005007491)	CDKL2 (ENSCPRG00005007511)	THAP6 (ENSCPRG00005007520)	RCHY1 (ENSCPRG00005007527)	ANXA3 (ENSCPRG00005007548) #21	BMP2K (ENSCPRG00005007561) #22	PAQR3 (ENSCPRG00005007579) #23	ANTXR2 (ENSCPRG00005007592)	PRDM8 (ENSCPRG00005007601)	FGF5 (ENSCPRG00005007605)	ENSCPRG00005007606	CFAP299 (ENSCPRG00005007610)	BMP3 (ENSCPRG00005007618)	PRKG2 (ENSCPRG00005007623)	RASGEF1B (ENSCPRG00005007628)
Aves	ANCESTRAL SPECIES	93																ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775
African ostrich	MODERN SPECIES	78																BMP2K (ENSSCUG00000000132) #22	ENSSCUG00000000131
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00940000153768.a	ENSGT00390000000113.A.c	ENSGT00390000000113.A.d	ENSGT00940000159886	ENSGT00940000160757.vb.b	ENSGT00940000160757.vb.a	ENSGT00940000162559.c	ENSGT00940000160757.wb	ENSGT00940000160901	ENSGT00510000048556	ENSGT00510000048748	ENSGT00940000160696	ENSGT00390000017018.b	ENSGT00940000174851	ENSGT00390000011365.b	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00940000153768.a.b	ENSGT00390000000113.A.c	ENSGT00390000000113.A.d	ENSGT00940000159886	ENSGT00940000160757.vb.b	ENSGT00940000160757.vb.a	ENSGT00940000162559.c	ENSGT00940000160757.wb	ENSGT00940000160901	ENSGT00510000048556	ENSGT00510000048748	ENSGT00940000160696	ENSGT00390000017018.b	ENSGT00940000174851	ENSGT00390000011365.b	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000162658.a.b.a	ENSGT00940000159025	ENSGT00390000002509	ENSGT00390000010702	ENSGT00390000002485	ENSGT00730000111375	ENSGT00510000046787.e.a
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000153768.a.b	ENSGT00390000000113.A.c	ENSGT00390000000113.A.d	ENSGT00940000159886	ENSGT00940000160757.vb.b	ENSGT00940000160757.vb.a	ENSGT00940000162559.c	ENSGT00940000160757.wb	ENSGT00940000160901	ENSGT00510000048556	ENSGT00510000048748	ENSGT00940000160696	ENSGT00390000017018.b	ENSGT00940000174851	ENSGT00390000011365.b	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000162658.a.b.a	ENSGT00940000159025	ENSGT00390000002509	ENSGT00940000173410	ENSGT00390000002485	ENSGT00730000111375	ENSGT00510000046787.e.a
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	133	ADAMTS3 (ENSABRG00000007319)	COX18 (ENSABRG00000007291)	ANKRD17 (ENSABRG00000007272)	ALB (ENSABRG00000007261)	ENSABRG00000007247	RASSF6 (ENSABRG00000007244)	ENSABRG00000007242	ENSABRG00000007219	ENSABRG00000007177	ENSABRG00000007168	MTHFD2L (ENSABRG00000007154)	EREG (ENSABRG00000007138)	AREG (ENSABRG00000007134)	USO1 (ENSABRG00000007110)	G3BP2 (ENSABRG00000007098)	BMP2K (ENSABRG00000007090) #22	PAQR3 (ENSABRG00000007085) #23	ANTXR2 (ENSABRG00000007073)	PRDM8 (ENSABRG00000007068)	FGF5 (ENSABRG00000007009)	CFAP299 (ENSABRG00000006980)	BMP3 (ENSABRG00000006973)	RASGEF1B (ENSABRG00000006928)	PRKG2 (ENSABRG00000006902)	ABCG2 (ENSABRG00000006889)	PKD2 (ENSABRG00000006874)	SPP1 (ENSABRG00000006867)	ENSABRG00000006864	IBSP (ENSABRG00000006858)	ENSABRG00000006846	SPARCL1 (ENSABRG00000006836)
Duck	MODERN SPECIES	22	ENSAPLG00000028470	ALB (ENSAPLG00000010999)	ENSAPLG00000011956	RASSF6 (ENSAPLG00000012335)	ENSAPLG00000023047	ENSAPLG00000012692	ENSAPLG00000018570	ENSAPLG00000021960	MTHFD2L (ENSAPLG00000012869)	EPGN (ENSAPLG00000012940)	EREG (ENSAPLG00000012982)	AREG (ENSAPLG00000017459)	USO1 (ENSAPLG00000013128)	ENSAPLG00000023742	G3BP2 (ENSAPLG00000013777)	BMP2K (ENSAPLG00000014134) #22	PAQR3 (ENSAPLG00000018923) #23	ANTXR2 (ENSAPLG00000014640)	CFAP299 (ENSAPLG00000015021)	BMP3 (ENSAPLG00000015075)	RASGEF1B (ENSAPLG00000015111)	PRKG2 (ENSAPLG00000015473)	PKD2 (ENSAPLG00000002737)	ENSAPLG00000003038	ENSAPLG00000028651	SPARCL1 (ENSAPLG00000003209)	ENSAPLG00000021509	ENSAPLG00000029063	ENSAPLG00000029297	KLHL8 (ENSAPLG00000003622)	AFF1 (ENSAPLG00000004059)
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000154593.a.b	ENSGT00940000158368	ENSGT00390000006915.d	ENSGT00940000158602	ENSGT00910000144159.B	ENSGT00940000159851	ENSGT00390000009223	ENSGT00940000156167.b	ENSGT00940000160901	ENSGT00510000048556	ENSGT00510000048748	ENSGT00940000160696	ENSGT00390000017018.b	ENSGT00940000174851	ENSGT00390000011365.b	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000159025	ENSGT00390000002509	ENSGT00390000010702	ENSGT00390000002485	ENSGT00940000173785	ENSGT00730000111375	ENSGT00510000046787.e.a	ENSGT00390000017405
Japanese quail	MODERN SPECIES	22	GLRA3 (ENSCJPG00005009946)	GPM6A (ENSCJPG00005009954)	WDR17 (ENSCJPG00005009956)	SPATA4 (ENSCJPG00005009959)	ASB5 (ENSCJPG00005009960)	ENSCJPG00005009961	SPCS3 (ENSCJPG00005009962)	VEGFC (ENSCJPG00005009963)	MTHFD2L (ENSCJPG00005009966)	EPGN (ENSCJPG00005009967)	EREG (ENSCJPG00005009968)	AREG (ENSCJPG00005009972)	USO1 (ENSCJPG00005009974)	ENSCJPG00005009976	G3BP2 (ENSCJPG00005009977)	BMP2K (ENSCJPG00005009978) #22	PAQR3 (ENSCJPG00005009979) #23	ANTXR2 (ENSCJPG00005009983)	PRDM8 (ENSCJPG00005009988)	FGF5 (ENSCJPG00005009989)	BMP3 (ENSCJPG00005009992)	RASGEF1B (ENSCJPG00005009993)	PRKG2 (ENSCJPG00005009999)	PKD2 (ENSCJPG00005010000)	SPP1 (ENSCJPG00005010001)	ENSCJPG00005010004	IBSP (ENSCJPG00005010005)	ENSCJPG00005010006	SPARCL1 (ENSCJPG00005010007)	NUDT9 (ENSCJPG00005010008)	ENSCJPG00005010009
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000009873	ENSGT00940000154593.a.b	ENSGT00940000158368	ENSGT00390000006915.d	ENSGT00940000158602	ENSGT00910000144159.B	ENSGT00940000159851	ENSGT00390000009223	ENSGT00940000156167.b	ENSGT00940000160901	ENSGT00510000048556	ENSGT00510000048748	ENSGT00940000160696	ENSGT00390000017018.b	ENSGT00390000011365.b	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000159025	ENSGT00390000002509	ENSGT00390000010702	ENSGT00940000173410	ENSGT00390000002485	ENSGT00730000111375	ENSGT00510000046787.e.a	ENSGT00390000017405
Chicken	MODERN SPECIES	33	HPGD (ENSGALG00010002632)	GLRA3 (ENSGALG00010002656)	GPM6A (ENSGALG00010003347)	WDR17 (ENSGALG00010003384)	SPATA4 (ENSGALG00010003397)	ASB5 (ENSGALG00010003412)	SPCS3 (ENSGALG00010003442)	VEGFC (ENSGALG00010003259)	ENSGALG00010003278	MTHFD2L (ENSGALG00010003303)	EPGN (ENSGALG00010003315)	EREG (ENSGALG00010003322)	AREG (ENSGALG00010003223)	USO1 (ENSGALG00010002441)	G3BP2 (ENSGALG00010002459)	BMP2K (ENSGALG00010003165) #22	PAQR3 (ENSGALG00010003171) #23	ANTXR2 (ENSGALG00010003189)	PRDM8 (ENSGALG00010002796)	FGF5 (ENSGALG00010002801)	BMP3 (ENSGALG00010002819)	RASGEF1B (ENSGALG00010002880)	PRKG2 (ENSGALG00010003198)	PKD2 (ENSGALG00010003204)	SPP1 (ENSGALG00010003220)	MEPE (ENSGALG00010002469)	IBSP (ENSGALG00010002428)	SPARCL1 (ENSGALG00010003771)	NUDT9 (ENSGALG00010003788)	ENSGALG00010004976	ENSGALG00010003797
Turkey	MODERN SPECIES	24	ENSMGAG00000022067	ENSMGAG00000007541	ENSMGAG00000007547	ENSMGAG00000022528	ENSMGAG00000019649	ENSMGAG00000007496	ENSMGAG00000007518	ENSMGAG00000007522	PKD2 (ENSMGAG00000007470)	ENSMGAG00000007424	ENSMGAG00000007408	ENSMGAG00000007405	ENSMGAG00000007399	ENSMGAG00000018376	ENSMGAG00000007307	ENSMGAG00000007258 #22	ENSMGAG00000007285 #23	ENSMGAG00000007221	AREG (ENSMGAG00000007140)	ENSMGAG00000007149	ENSMGAG00000007121	ENSMGAG00000007127	MTHFD2L (ENSMGAG00000007102)	ENSMGAG00000007088	ENSMGAG00000007085	ASB5 (ENSMGAG00000007064)	ENSMGAG00000007014	ENSMGAG00000019055	ENSMGAG00000020257	ENSMGAG00000006945	ENSMGAG00000006917
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000000113.A.c	ENSGT00390000000113.A.d	ENSGT00940000159886	ENSGT00940000160757.vb.b	ENSGT00940000160757.vb.a.b	ENSGT00940000160757.vb.a.a	ENSGT00940000162559.c	ENSGT00940000160757.wb	ENSGT00940000162559.d	ENSGT00940000160901	ENSGT00510000048556	ENSGT00510000048748	ENSGT00940000160696	ENSGT00390000017018.b	ENSGT00390000011365.b	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00530000063506.A	ENSGT00940000153768.a	ENSGT00390000000113.A.c	ENSGT00900000143472	ENSGT00390000011365.b	ENSGT00390000017018.b	ENSGT00940000160696	ENSGT00510000048748	ENSGT00510000048556	ENSGT00940000160901	ENSGT00940000162559.c	ENSGT00940000160757.vb.a.a	ENSGT00940000160757.vb.a.b	ENSGT00940000160757.vb.b	ENSGT00940000159886	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000159775
Great tit	MODERN SPECIES	23	SLC4A4 (ENSPMJG00000000919)	ADAMTS3 (ENSPMJG00000000895)	COX18 (ENSPMJG00000000872)	ANKRD17 (ENSPMJG00000000728)	G3BP2 (ENSPMJG00000000714)	USO1 (ENSPMJG00000000620)	AREG (ENSPMJG00000000608)	EREG (ENSPMJG00000000604)	EPGN (ENSPMJG00000000597)	ALB (ENSPMJG00000000532)	MTHFD2L (ENSPMJG00000000523)	ENSPMJG00000000501	ENSPMJG00000000494	ENSPMJG00000000482	RASSF6 (ENSPMJG00000000450)	BMP2K (ENSPMJG00000000407) #22	PAQR3 (ENSPMJG00000000394) #23	ANTXR2 (ENSPMJG00000000314)	PRDM8 (ENSPMJG00000000300)	FGF5 (ENSPMJG00000000296)	BMP3 (ENSPMJG00000000215)	SLC7A11 (ENSPMJG00000000204)	ENSPMJG00000000194	PCDH18 (ENSPMJG00000000161)	ENSPMJG00000000111
Passeriformes_d	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00530000063506.A	ENSGT00940000153768.a	ENSGT00390000000113.A.c	ENSGT00900000143472	ENSGT00390000011365.b	ENSGT00390000017018.b	ENSGT00940000160696	ENSGT00510000048748	ENSGT00510000048556	ENSGT00940000160901	ENSGT00940000162559.c	ENSGT00940000160757.vb.a.a	ENSGT00940000160757.vb.a.b	ENSGT00940000160757.vb.b	ENSGT00940000159886	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000159775
Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00530000063506.A	ENSGT00940000153768.a	ENSGT00390000000113.A.c	ENSGT00900000143472	ENSGT00390000011365.b	ENSGT00390000017018.b	ENSGT00940000160696	ENSGT00510000048748	ENSGT00510000048556	ENSGT00940000160901	ENSGT00940000162559.c	ENSGT00940000160757.vb.a.a	ENSGT00940000160757.vb.a.b	ENSGT00940000160757.vb.b	ENSGT00940000159886	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000159775
Medium ground finch	MODERN SPECIES	7																BMP2K (ENSGFOG00000005407) #22	PAQR3 (ENSGFOG00000005443) #23	ENSGFOG00000005463	ANTXR2 (ENSGFOG00000005469)	FGF5 (ENSGFOG00000005491)	BMP3 (ENSGFOG00000005554)	KLHL8 (ENSGFOG00000005557)	HSD17B11 (ENSGFOG00000005567)	ENSGFOG00000005576	NUDT9 (ENSGFOG00000005581)	SPARCL1 (ENSGFOG00000005588)	ENSGFOG00000005607	IBSP (ENSGFOG00000005618)	SPP1 (ENSGFOG00000005629)	PKD2 (ENSGFOG00000005660)	ABCG2 (ENSGFOG00000006578)
Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000156085	ENSGT00530000063506.A	ENSGT00940000153768.a	ENSGT00390000000113.A.c	ENSGT00390000011365.b	ENSGT00390000017018.b	ENSGT00940000160696	ENSGT00510000048748	ENSGT00510000048556	ENSGT00940000160901	ENSGT00940000162559.c	ENSGT00940000160757.vb.a.a	ENSGT00940000160757.vb.a.b	ENSGT00940000160757.vb.b	ENSGT00940000159886	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000159775
Zebra finch	MODERN SPECIES	25											ENSTGUG00000015202	ENSTGUG00000023971	PCDH10 (ENSTGUG00000025978)	PCDH18 (ENSTGUG00000001502)	SLC7A11 (ENSTGUG00000001504)	BMP2K (ENSTGUG00000001513) #22	PAQR3 (ENSTGUG00000001520) #23	ANTXR2 (ENSTGUG00000001523)	PRDM8 (ENSTGUG00000021340)	FGF5 (ENSTGUG00000026235)	BMP3 (ENSTGUG00000001533)	RASSF6 (ENSTGUG00000011147)	ENSTGUG00000001542	ENSTGUG00000020501	ENSTGUG00000001543	ENSTGUG00000022241	MTHFD2L (ENSTGUG00000029267)	EREG (ENSTGUG00000028843)	AREG (ENSTGUG00000001551)	USO1 (ENSTGUG00000001555)	G3BP2 (ENSTGUG00000001561)
Common canary	DUPLICATION
Common canary	MODERN SPECIES	64	ADAMTS3 (ENSSCAG00000004685)	COX18 (ENSSCAG00000004720)	ANKRD17 (ENSSCAG00000004730)	ALB (ENSSCAG00000004747)	G3BP2 (ENSSCAG00000004754)	USO1 (ENSSCAG00000004770)	AREG (ENSSCAG00000004794)	EREG (ENSSCAG00000004797)	EPGN (ENSSCAG00000004802)	MTHFD2L (ENSSCAG00000004808)	ENSSCAG00000004812	ENSSCAG00000004816	ENSSCAG00000004820	ENSSCAG00000004833	RASSF6 (ENSSCAG00000004840)	BMP2K (ENSSCAG00000004852) #22	PAQR3 (ENSSCAG00000004862) #23	ANTXR2 (ENSSCAG00000004867)	ENSSCAG00000004878	FGF5 (ENSSCAG00000004888)	BMP3 (ENSSCAG00000004895)
Common canary	MODERN SPECIES	50	ENSSCAG00000015788	RETSAT (ENSSCAG00000015795)	ENSSCAG00000015801	ENSSCAG00000015806	H2AZ2 (ENSSCAG00000015814)	MAT2A (ENSSCAG00000015818)	ENSSCAG00000015821	USP39 (ENSSCAG00000015826)	MXD1 (ENSSCAG00000015832)	SNRNP27 (ENSSCAG00000015840)	ADD2 (ENSSCAG00000015842)	HK2 (ENSSCAG00000015956)	ENSSCAG00000016101	ENSSCAG00000016110	ANXA4 (ENSSCAG00000016127)	ENSSCAG00000016134 #22	ENSSCAG00000016138	NFU1 (ENSSCAG00000016140)	GFPT1 (ENSSCAG00000016186)	ANTXR1 (ENSSCAG00000016295)	GKN2 (ENSSCAG00000016309)	BMP10 (ENSSCAG00000016311)	ARHGAP25 (ENSSCAG00000016314)	CDS2 (ENSSCAG00000016342)	PCNA (ENSSCAG00000016398)	TMEM230 (ENSSCAG00000016407)	SLC23A2 (ENSSCAG00000016411)	PRNP (ENSSCAG00000016418)	LRRTM4 (ENSSCAG00000016419)	POLB (ENSSCAG00000016422)	VDAC3 (ENSSCAG00000016426)
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00940000153768.a	ENSGT00390000000113.A.c	ENSGT00390000000113.A.d	ENSGT00940000159886	ENSGT00940000160757.vb.b	ENSGT00940000160757.vb.a.b	ENSGT00940000160757.vb.a.a	ENSGT00940000162559.c	ENSGT00940000160757.wb	ENSGT00940000162559.d	ENSGT00940000160901	ENSGT00510000048748	ENSGT00940000160696	ENSGT00390000017018.b	ENSGT00390000011365.b	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775
Kakapo	MODERN SPECIES	20	ENSSHBG00005017417	ENSSHBG00005017416	ENSSHBG00005017415	ENSSHBG00005017414	RASSF6 (ENSSHBG00005017413)	ENSSHBG00005017412	ALB (ENSSHBG00005017404)	ANKRD17 (ENSSHBG00005014959)	COX18 (ENSSHBG00005014646)	ADAMTS3 (ENSSHBG00005014619)	MTHFD2L (ENSSHBG00005014593)	EREG (ENSSHBG00005014574)	AREG (ENSSHBG00005014567)	USO1 (ENSSHBG00005014449)	G3BP2 (ENSSHBG00005014416)	BMP2K (ENSSHBG00005014386) #22	PAQR3 (ENSSHBG00005014356) #23	ANTXR2 (ENSSHBG00005014336)	PRDM8 (ENSSHBG00005014285)	FGF5 (ENSSHBG00005014259)	BMP3 (ENSSHBG00005014244)	SEC24D (ENSSHBG00005014200)	ENSSHBG00005014183	SYNPO2 (ENSSHBG00005014167)	MYOZ2 (ENSSHBG00005014150)	USP53 (ENSSHBG00005014131)	ENSSHBG00005014105	FABP2 (ENSSHBG00005014095)	PDE5A (ENSSHBG00005012439)	RPL7L1 (ENSSHBG00005012330)	MAD2L1 (ENSSHBG00005012317)
Golden eagle	MODERN SPECIES		ANKRD17 (ENSACCG00020000292)	ALB (ENSACCG00020000329)	ENSACCG00020000379	RASSF6 (ENSACCG00020000399)	ENSACCG00020000419	ENSACCG00020000435	ENSACCG00020000450	ENSACCG00020000497	ENSACCG00020000529	ENSACCG00020000562	MTHFD2L (ENSACCG00020000633)	EREG (ENSACCG00020000683)	AREG (ENSACCG00020000702)	USO1 (ENSACCG00020000825)	G3BP2 (ENSACCG00020000954)	BMP2K (ENSACCG00020000979) #22	PAQR3 (ENSACCG00020001011) #23	ANTXR2 (ENSACCG00020001032)	ENSACCG00020001048	FGF5 (ENSACCG00020001086)	CFAP299 (ENSACCG00020001111)	BMP3 (ENSACCG00020001122)
Anura	ANCESTRAL SPECIES	195														ENSGT00510000047171	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158010	ENSGT00940000154426	ENSGT00440000039914	ENSGT01030000234578.A.a	ENSGT00390000003175.a.b	ENSGT00940000155881
Frog	MODERN SPECIES		ankrd24 (ENSXETG00000034477)	ENSXETG00000047898	ENSXETG00000044750	ebi3 (ENSXETG00000024149)	ENSXETG00000041245	b4galt1.1 (ENSXETG00000024147)	b4galt1.2 (ENSXETG00000024146)	ENSXETG00000048464	dnaja1 (ENSXETG00000024144)	smu1 (ENSXETG00000024145)	aptx (ENSXETG00000024143)	elp1 (ENSXETG00000009534)	kcmf1 (ENSXETG00000009533)	slc20a2 (ENSXETG00000009532)	ENSXETG00000047341	bmp2k (ENSXETG00000036643) #22	paqr3 (ENSXETG00000009529) #23	antxr2 (ENSXETG00000021531)	prdm8 (ENSXETG00000021533)	fgf5 (ENSXETG00000047496)	cfap299 (ENSXETG00000041273)	ENSXETG00000045898	bmp3 (ENSXETG00000021538)	prkg2 (ENSXETG00000021539)	ENSXETG00000037333	fnta (ENSXETG00000004459)	kpna1 (ENSXETG00000004460)	hgsnat (ENSXETG00000036665)	ints10 (ENSXETG00000004462)	csgalnact1 (ENSXETG00000004463)	sh2d4a (ENSXETG00000004464)
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES		MLLT1 (ENSLLEG00000011840)	ENSLLEG00000011821	ENSLLEG00000011811	ENSLLEG00000011735	ENSLLEG00000011701	ENSLLEG00000011646	ENSLLEG00000011581	ENSLLEG00000011442	ENSLLEG00000011422	WRN (ENSLLEG00000010747)	PURG (ENSLLEG00000010681)	ENSLLEG00000010618	ENSLLEG00000010589	ENSLLEG00000010513	ENSLLEG00000010486	BMP2K (ENSLLEG00000010261) #22	PAQR3 (ENSLLEG00000010190) #23	ENSLLEG00000010175	ANTXR2 (ENSLLEG00000010046)	PRDM8 (ENSLLEG00000009999)	ENSLLEG00000009958	ENSLLEG00000009917	ENSLLEG00000009904	ENSLLEG00000009888	ENSLLEG00000009868	ENSLLEG00000009833	ENSLLEG00000009823	CFAP299 (ENSLLEG00000009747)	ENSLLEG00000009722	BMP3 (ENSLLEG00000009687)	PRKG2 (ENSLLEG00000009361)
Coelacanth	MODERN SPECIES	1608															ENSLACG00000011222	BMP2K (ENSLACG00000002799) #22	PAQR3 (ENSLACG00000000866) #23
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	65	ENSGT00940000156282.a.a	ENSGT00940000154821.b	ENSGT00940000156085	ENSGT01070000253744.b.b	ENSGT00390000000113.B	ENSGT00940000156290	ENSGT00940000157321	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000158529	ENSGT00940000156035	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00940000154091.a.a	ENSGT00940000157724	ENSGT00940000161247	ENSGT00940000156244
Reedfish	MODERN SPECIES	15	slc4a4a (ENSECRG00000012016)	dck (ENSECRG00000012135)	mob1bb (ENSECRG00000012154)	GRSF1 (ENSECRG00000012177)	rufy3 (ENSECRG00000012250)	ENSECRG00000012363	cxcl11.1 (ENSECRG00000012371)	cxcl11.1 (ENSECRG00000012379)	ENSECRG00000012390	ENSECRG00000012405	cnot6l (ENSECRG00000012417)	mrpl1 (ENSECRG00000012444)	fras1 (ENSECRG00000012495)	ENSECRG00000012672	anxa3b (ENSECRG00000012690) #21	bmp2k (ENSECRG00000012715) #22	paqr3b (ENSECRG00000012735) #23	ENSECRG00000012753	ENSECRG00000012772	antxr2a (ENSECRG00000012790)	ENSECRG00000012830	prdm8b (ENSECRG00000012835)	fgf5 (ENSECRG00000012850)	cfap299 (ENSECRG00000012869)	bmp3 (ENSECRG00000012877)	prkg2 (ENSECRG00000012892)	rasgef1ba (ENSECRG00000012934)	ENSECRG00000012994	tmem175 (ENSECRG00000012999)	CDS1 (ENSECRG00000013020)	WDFY3 (ENSECRG00000013052)
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000156282.a.a	ENSGT00940000154821.b	ENSGT00940000156085	ENSGT01070000253744.b.b	ENSGT00390000000113.B	ENSGT00940000156290	ENSGT00940000157321	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000158529	ENSGT00940000156035	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174 #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291 #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00980000198897	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00500000045469	ENSGT00940000154091.a.a	ENSGT00940000157724
Spotted gar	MODERN SPECIES	658	plk2b (ENSLOCG00000007594)	GPBP1 (ENSLOCG00000007574)	mier3b (ENSLOCG00000007562)	SETD9 (ENSLOCG00000007551)	pdxp (ENSLOCG00000007538)	mrps36 (ENSLOCG00000007526)	ENSLOCG00000007511	ENSLOCG00000007496	ENSLOCG00000007481	ENSLOCG00000007469	ENSLOCG00000007450	zgc:114200 (ENSLOCG00000007436)	cnot6l (ENSLOCG00000007420)	mrpl1 (ENSLOCG00000007408)	fras1 (ENSLOCG00000007363)	bmp2k (ENSLOCG00000007340) #22	paqr3b (ENSLOCG00000007313) #23	ENSLOCG00000007301	ENSLOCG00000007287	antxr2a (ENSLOCG00000007243)	prdm8b (ENSLOCG00000007226)	fgf5 (ENSLOCG00000007208)	ENSLOCG00000007197	ENSLOCG00000007184	bmp3 (ENSLOCG00000007173)	prkg2 (ENSLOCG00000007145)	rasgef1ba (ENSLOCG00000007128)	ENSLOCG00000007114	tmem175 (ENSLOCG00000007095)	CDS1 (ENSLOCG00000007080)	WDFY3 (ENSLOCG00000007056)
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000154821.b	ENSGT00940000156085	ENSGT01070000253744.b.b.e	ENSGT00390000000113.B	ENSGT00940000156290.a	ENSGT00940000157321	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000158529	ENSGT00940000156035	ENSGT01080000257489	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00980000198897	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00500000045469	ENSGT00940000154091.a.a.s.a	ENSGT00940000157724.b
Osteoglossiformes	DUPLICATION
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	460											ENSGT00940000165677	ENSGT00940000156035.u	ENSGT01080000257489	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761.k	ENSGT00940000157548.c #22	ENSGT00940000155291.a #23
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	8	dmrt2a (ENSSFOG00015014922)	SMARCA2 (ENSSFOG00015014870)	adamts3 (ENSSFOG00015014846)	NPFFR2 (ENSSFOG00015029921)	gc (ENSSFOG00015014799)	slc4a4a (ENSSFOG00015032673)	dck (ENSSFOG00015014636)	ENSSFOG00015030617	rufy3 (ENSSFOG00015014519)	NPFFR2 (ENSSFOG00015014828)	slc4a4a (ENSSFOG00015014669)	ENSSFOG00015030739	ENSSFOG00015014499	mrpl1 (ENSSFOG00015014444)	fras1 (ENSSFOG00015014319)	bmp2k (ENSSFOG00015014230) #22	paqr3a (ENSSFOG00015014198) #23	prdm8b (ENSSFOG00015014182)	fgf5 (ENSSFOG00015014172)	cfap299 (ENSSFOG00015024666)	bmp3 (ENSSFOG00015014060)	prkg2 (ENSSFOG00015014011)	ENSSFOG00015013997	rasgef1ba (ENSSFOG00015013898)	CDS1 (ENSSFOG00015013857)	WDFY3 (ENSSFOG00015025167)	snx18b (ENSSFOG00015013812)	ARL15 (ENSSFOG00015013759)	ndufs4 (ENSSFOG00015013736)	fsta (ENSSFOG00015013720)	WHRN (ENSSFOG00015013707)
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	180	ENSPKIG00000019732	coq4 (ENSPKIG00000019707)	hdhd3 (ENSPKIG00000019695)	slc31a1 (ENSPKIG00000019675)	tgfa (ENSPKIG00000019657)	SLC2A11 (ENSPKIG00000019631)	PATZ1 (ENSPKIG00000019584)	EIF4ENIF1 (ENSPKIG00000019521)	CARD9 (ENSPKIG00000019487)	ENSPKIG00000019469	grsf1 (ENSPKIG00000019432)	rufy3 (ENSPKIG00000019344)	mrpl1 (ENSPKIG00000019299)	ENSPKIG00000019282	fras1 (ENSPKIG00000019151)	bmp2k (ENSPKIG00000019084) #22	prdm8b (ENSPKIG00000019066)	fgf5 (ENSPKIG00000019047)	PPIL3 (ENSPKIG00000019031)	pomt1 (ENSPKIG00000018915)	ENSPKIG00000018856	med27 (ENSPKIG00000018804)	slc4a4a (ENSPKIG00000018691)	adamts3 (ENSPKIG00000018591)	ENSPKIG00000018469	dmrt2a (ENSPKIG00000018410)	fbp2 (ENSPKIG00000018383)	dapk1 (ENSPKIG00000018149)	gas1a (ENSPKIG00000018079)
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	83						ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000156290.b	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000156035.v	ENSGT01060000248978.a	ENSGT00940000161751	ENSGT01060000248978.b	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000163761.l	ENSGT00940000159174.e #21	ENSGT00940000157548.d #22	ENSGT00940000155291.b #23	ENSGT00940000156320	ENSGT00890000139463.b.b.b.b	ENSGT00940000159775.c	ENSGT00940000155816.b.i	ENSGT00390000015667.c	ENSGT00940000158223.b	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00940000154091.a.a.s.a	ENSGT00940000157724.b	ENSGT00940000157072.a	ENSGT00530000066485	ENSGT00510000047669	ENSGT00940000156303	ENSGT00940000157646
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	2															anxa3b (ENSPKIG00000015225) #21	ENSPKIG00000015295 #22	paqr3b (ENSPKIG00000015318) #23	antxr2a (ENSPKIG00000015356)	PRDM8 (ENSPKIG00000015409)	bmp3 (ENSPKIG00000015421)	rasgef1ba (ENSPKIG00000015496)	tmem175 (ENSPKIG00000015649)	ENSPKIG00000015724	WDFY3 (ENSPKIG00000015795)	ENSPKIG00000015905	snx18a (ENSPKIG00000015935)	ARL15 (ENSPKIG00000015963)	fstb (ENSPKIG00000015978)	ENSPKIG00000016000	MOCS2 (ENSPKIG00000016063)	ITGA2 (ENSPKIG00000016088)
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	121				ENSGT00940000154886.a.b	ENSGT00940000154821.a.a	ENSGT01070000253744.b.b.f	ENSGT00940000156290.b	ENSGT00940000157321	ENSGT01050000244898.b.b	ENSGT00940000158529	ENSGT01000000214878	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00980000198897	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00500000045469	ENSGT00940000154091.a.a.s.a	ENSGT00940000157724.a.a
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	253											ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00980000198897	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	137	ENSGT00940000153181	ENSGT00940000177481	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00940000159428.f	ENSGT00940000156811.a	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000166264	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00980000198897	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00990000203821
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	42	ENSGT00940000177481	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00940000159428.f	ENSGT00940000156811.a	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00980000198897	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00990000203821	ENSGT00990000207738	ENSGT00730000112019
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	23	ptgesl (ENSMMDG00005013751)	gle1 (ENSMMDG00005013734)	odf2b (ENSMMDG00005013732)	SET (ENSMMDG00005013727)	ENSMMDG00005013725	zdhhc12a (ENSMMDG00005013721)	slc25a25a (ENSMMDG00005013380)	ENSMMDG00005013373	EEIG1 (ENSMMDG00005013369)	ENSMMDG00005013363	ENSMMDG00005013360	ENSMMDG00005013357	cnot6l (ENSMMDG00005013356)	mrpl1 (ENSMMDG00005013349)	anxa3a (ENSMMDG00005013089) #21	bmp2k (ENSMMDG00005013085) #22	fbl (ENSMMDG00005013082)	paqr3a (ENSMMDG00005013079) #23	antxr2a (ENSMMDG00005013078)	prdm8b (ENSMMDG00005013074)	fgf5 (ENSMMDG00005013073)	cfap299 (ENSMMDG00005013071)	bmp3 (ENSMMDG00005013069)	prkg2 (ENSMMDG00005013067)	ENSMMDG00005013064	rasgef1ba (ENSMMDG00005013047)	ENSMMDG00005013031	tmem175 (ENSMMDG00005013023)	ENSMMDG00005012251	WDFY3 (ENSMMDG00005011129)	ENSMMDG00005011103
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000177481	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00940000159428.f	ENSGT00940000156811.a	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00980000198897	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00990000203821	ENSGT00730000112019	ENSGT00900000141033.a
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000177481	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01000000214675	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00980000198897	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00990000203821	ENSGT00730000112019	ENSGT00900000141033.a
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000153181	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01000000214675	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00980000198897	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00990000203821	ENSGT00730000112019	ENSGT00900000141033.a
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00440000038585.d	ENSGT00940000153181	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01000000214675	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00980000198897	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00990000203821	ENSGT00730000112019	ENSGT00900000141033.a
Tetraodontidae	DUPLICATION
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	75	ENSGT00440000038585.d	ENSGT00940000153181	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01000000214675	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548.e #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00980000198897
Tetraodon	DUPLICATION
Tetraodon	MODERN SPECIES	26	ENSTNIG00000001392	slc43a2b (ENSTNIG00000006856)	ENSTNIG00000006855	ENSTNIG00000000985	ENSTNIG00000006850	serpinf1 (ENSTNIG00000006849)	slco2b1 (ENSTNIG00000006848)	ENSTNIG00000000144	FHL3 (ENSTNIG00000006814)	utp11 (ENSTNIG00000006813)	ENSTNIG00000006812	ENSTNIG00000006811	ENSTNIG00000006810	ENSTNIG00000001652	ENSTNIG00000007014	bmp2k (ENSTNIG00000006809) #22	tbpl1 (ENSTNIG00000006808)	ENSTNIG00000006807	bnc2 (ENSTNIG00000006806)	ENSTNIG00000006805	chodl (ENSTNIG00000006804)	bmp2k (ENSTNIG00000006803) #22	angel2 (ENSTNIG00000009275)	FERMT1 (ENSTNIG00000006792)	ENSTNIG00000006791	BARX2 (ENSTNIG00000006763)	ENSTNIG00000006762	ACLY (ENSTNIG00000006758)	ENSTNIG00000006757	PPP6R2 (ENSTNIG00000006753)	ENSTNIG00000006752
Tetraodon	MODERN SPECIES	26	chodl (ENSTNIG00000006804)	bmp2k (ENSTNIG00000006803) #22	angel2 (ENSTNIG00000009275)	FERMT1 (ENSTNIG00000006792)	ENSTNIG00000006791	BARX2 (ENSTNIG00000006763)	ENSTNIG00000006762	ACLY (ENSTNIG00000006758)	ENSTNIG00000006757	PPP6R2 (ENSTNIG00000006753)	ENSTNIG00000006752	KLHL11 (ENSTNIG00000006751)	ACLY (ENSTNIG00000006750)	RECK (ENSTNIG00000006746)	galnt14 (ENSTNIG00000006654)	ENSTNIG00000006738 #22	paqr3a (ENSTNIG00000006737) #23	mrps16 (ENSTNIG00000006736)	errfi1a (ENSTNIG00000006735)	ENSTNIG00000006734	exoc4 (ENSTNIG00000006701)	ENSTNIG00000006683	ENSTNIG00000006678	dcaf5 (ENSTNIG00000006677)	actn1 (ENSTNIG00000006676)	naga (ENSTNIG00000006675)	RECK (ENSTNIG00000006674)	ENSTNIG00000006673	ENSTNIG00000006651	ENSTNIG00000001344	zfp36l1a (ENSTNIG00000002277)
Fugu	MODERN SPECIES	13	ENSTRUG00000008343	ENSTRUG00000007730	SMARCB1 (ENSTRUG00000007532)	ralgds (ENSTRUG00000007032)	ptgesl (ENSTRUG00000006963)	gle1 (ENSTRUG00000006713)	odf2b (ENSTRUG00000006261)	SET (ENSTRUG00000006019)	ENSTRUG00000028789	zdhhc12a (ENSTRUG00000023407)	ENSTRUG00000005098	EEIG1 (ENSTRUG00000004766)	cxcl13 (ENSTRUG00000025714)	cnot6l (ENSTRUG00000004332)	mrpl1 (ENSTRUG00000004229)	bmp2k (ENSTRUG00000001574) #22	paqr3a (ENSTRUG00000001442) #23	antxr2a (ENSTRUG00000001021)	prdm8b (ENSTRUG00000001003)	fgf5 (ENSTRUG00000000972)	cfap299 (ENSTRUG00000024534)	bmp3 (ENSTRUG00000022136)	prkg2 (ENSTRUG00000030228)	ENSTRUG00000027081	ENSTRUG00000031589	rasgef1ba (ENSTRUG00000002006)	UNC5D (ENSTRUG00000003106)	hdr (ENSTRUG00000004271)	cyb561a3a (ENSTRUG00000004442)	loxl2b (ENSTRUG00000004680)	sfrp1 (ENSTRUG00000005052)
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000157548.f #22
Tetraodon	MODERN SPECIES	26	slco2b1 (ENSTNIG00000006848)	ENSTNIG00000000144	FHL3 (ENSTNIG00000006814)	utp11 (ENSTNIG00000006813)	ENSTNIG00000006812	ENSTNIG00000006811	ENSTNIG00000006810	ENSTNIG00000001652	ENSTNIG00000007014	bmp2k (ENSTNIG00000006809) #22	tbpl1 (ENSTNIG00000006808)	ENSTNIG00000006807	bnc2 (ENSTNIG00000006806)	ENSTNIG00000006805	chodl (ENSTNIG00000006804)	bmp2k (ENSTNIG00000006803) #22	angel2 (ENSTNIG00000009275)	FERMT1 (ENSTNIG00000006792)	ENSTNIG00000006791	BARX2 (ENSTNIG00000006763)	ENSTNIG00000006762	ACLY (ENSTNIG00000006758)	ENSTNIG00000006757	PPP6R2 (ENSTNIG00000006753)	ENSTNIG00000006752	KLHL11 (ENSTNIG00000006751)	ACLY (ENSTNIG00000006750)	RECK (ENSTNIG00000006746)	galnt14 (ENSTNIG00000006654)	ENSTNIG00000006738 #22	paqr3a (ENSTNIG00000006737) #23
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00440000038585.d	ENSGT00940000153181	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01000000214675	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00980000198897	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00990000203821	ENSGT00730000112019	ENSGT00900000141033.a
Ballan wrasse	DUPLICATION
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	1262															anxa3a (ENSLBEG00000020013) #21	bmp2k (ENSLBEG00000019963) #22
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	1910																bmp2k (ENSLBEG00000005145) #22
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00440000038585.d	ENSGT00940000153181	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01000000214675	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00980000198897	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00990000203821	ENSGT00730000112019	ENSGT00900000141033.a
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00440000038585.d	ENSGT00940000153181	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01000000214675	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00980000198897	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00990000203821	ENSGT00730000112019	ENSGT00900000141033.a
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000153181	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00940000159428.f	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01000000214675	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000179147	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00980000198897	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00990000203821	ENSGT00730000112019	ENSGT00900000141033.a
Lumpfish	MODERN SPECIES	24	ptgesl (ENSCLMG00005008414)	gle1 (ENSCLMG00005008417)	ENSCLMG00005008426	SET (ENSCLMG00005008432)	ENSCLMG00005008436	zdhhc12a (ENSCLMG00005008437)	slc25a25a (ENSCLMG00005008439)	EEIG1 (ENSCLMG00005008446)	ENSCLMG00005008448	cnot6l (ENSCLMG00005008450)	mrpl1 (ENSCLMG00005008451)	fras1 (ENSCLMG00005008462)	ENSCLMG00005009780	ENSCLMG00005009781	anxa3a (ENSCLMG00005009784) #21	bmp2k (ENSCLMG00005010426) #22	ENSCLMG00005010427	antxr2a (ENSCLMG00005010428)	prdm8b (ENSCLMG00005010430)	fgf5 (ENSCLMG00005010446)	cfap299 (ENSCLMG00005010458)	bmp3 (ENSCLMG00005010460)	prkg2 (ENSCLMG00005010462)	rasgef1ba (ENSCLMG00005010468)	ENSCLMG00005010498	tmem175 (ENSCLMG00005010499)	ENSCLMG00005010501	WDFY3 (ENSCLMG00005010632)	ENSCLMG00005011059	ENSCLMG00005011061	ENSCLMG00005011062
Stickleback	MODERN SPECIES	345															ENSGACG00000001187 #21	bmp2k (ENSGACG00000001223) #22	ENSGACG00000001230
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00440000038585.d	ENSGT00940000153181	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01000000214675	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00980000198897	ENSGT00940000181199	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00990000203821	ENSGT00730000112019
Pike perch	MODERN SPECIES	2	SMARCB1 (ENSSLUG00000016035)	ralgds (ENSSLUG00000016245)	ptgesl (ENSSLUG00000016262)	gle1 (ENSSLUG00000016320)	odf2b (ENSSLUG00000003180)	SET (ENSSLUG00000003221)	ENSSLUG00000003284	ZDHHC12 (ENSSLUG00000003314)	ENSSLUG00000003337	EEIG1 (ENSSLUG00000003485)	ENSSLUG00000003509	cnot6l (ENSSLUG00000003517)	mrpl1 (ENSSLUG00000003550)	fras1 (ENSSLUG00000003738)	anxa3a (ENSSLUG00000004661) #21	bmp2k (ENSSLUG00000004724) #22	paqr3a (ENSSLUG00000004747) #23	antxr2a (ENSSLUG00000004794)	prdm8b (ENSSLUG00000005126)	fgf5 (ENSSLUG00000005136)	cfap299 (ENSSLUG00000005159)	bmp3 (ENSSLUG00000005194)	prkg2 (ENSSLUG00000005203)	rasgef1ba (ENSSLUG00000005403)	ENSSLUG00000006490	tmem175 (ENSSLUG00000006498)	CDS1 (ENSSLUG00000006549)	WDFY3 (ENSSLUG00000007745)	ENSSLUG00000007815	ENSSLUG00000007822	ENSSLUG00000007826
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	23	p2rx7 (ENSCGOG00000008280)	GPR21 (ENSCGOG00000008275)	ENSCGOG00000008236	ENSCGOG00000008202	ENSCGOG00000008194	sh2d3cb (ENSCGOG00000008188)	tor2a (ENSCGOG00000008183)	ptrh1 (ENSCGOG00000008177)	ENSCGOG00000008175	ENSCGOG00000008168	ENSCGOG00000008166	cnot6l (ENSCGOG00000007865)	mrpl1 (ENSCGOG00000007855)	fras1 (ENSCGOG00000007055)	anxa3a (ENSCGOG00000006885) #21	bmp2k (ENSCGOG00000006773) #22	paqr3a (ENSCGOG00000006766) #23	antxr2a (ENSCGOG00000006760)	prdm8b (ENSCGOG00000006758)	fgf5 (ENSCGOG00000006755)	cfap299 (ENSCGOG00000006750)	bmp3 (ENSCGOG00000006746)	prkg2 (ENSCGOG00000006343)	ENSCGOG00000006335	rasgef1ba (ENSCGOG00000006252)	ENSCGOG00000006227	ENSCGOG00000006216	ENSCGOG00000006213	ENSCGOG00000006211	tmem175 (ENSCGOG00000006209)	ENSCGOG00000005044
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00440000038585.d	ENSGT00940000153181	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01000000214675	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00980000198897	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00990000203821	ENSGT00730000112019	ENSGT00900000141033.a
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00440000038585.d	ENSGT00940000153181	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01000000214675	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00980000198897	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00990000203821	ENSGT00730000112019	ENSGT00900000141033.a
European seabass	MODERN SPECIES	13	ENSDLAG00005011669	ralgds (ENSDLAG00005011426)	ptgesl (ENSDLAG00005029853)	ENSDLAG00005011064	ENSDLAG00005032978	ENSDLAG00005030645	zdhhc12a (ENSDLAG00005010586)	ENSDLAG00005033111	ENSDLAG00005010492	ENSDLAG00005010455	ENSDLAG00005010439	cnot6l (ENSDLAG00005010354)	mrpl1 (ENSDLAG00005010312)	fras1 (ENSDLAG00005009656)	anxa3a (ENSDLAG00005009598) #21	bmp2k (ENSDLAG00005009534) #22	paqr3a (ENSDLAG00005009524) #23	antxr2a (ENSDLAG00005009431)	prdm8b (ENSDLAG00005009423)	fgf5 (ENSDLAG00005027058)	cfap299 (ENSDLAG00005031738)	bmp3 (ENSDLAG00005030723)	prkg2 (ENSDLAG00005009149)	ENSDLAG00005009137	rasgef1ba (ENSDLAG00005008289)	tmem175 (ENSDLAG00005026463)	ENSDLAG00005008114	ENSDLAG00005008024	ENSDLAG00005007992	ENSDLAG00005033541	ENSDLAG00005022643
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	2	SMARCB1 (ENSLCRG00005019630)	ralgds (ENSLCRG00005019654)	ptgesl (ENSLCRG00005019686)	gle1 (ENSLCRG00005019695)	odf2b (ENSLCRG00005019897)	SET (ENSLCRG00005019898)	ENSLCRG00005019905	zdhhc12a (ENSLCRG00005019907)	slc25a25a (ENSLCRG00005019910)	EEIG1 (ENSLCRG00005019969)	cxcl13 (ENSLCRG00005019970)	cnot6l (ENSLCRG00005019972)	mrpl1 (ENSLCRG00005019980)	fras1 (ENSLCRG00005019992)	anxa3a (ENSLCRG00005020507) #21	bmp2k (ENSLCRG00005020510) #22	paqr3a (ENSLCRG00005020512) #23	antxr2a (ENSLCRG00005020514)	prdm8b (ENSLCRG00005020519)	fgf5 (ENSLCRG00005020520)	cfap299 (ENSLCRG00005020522)	bmp3 (ENSLCRG00005020524)	prkg2 (ENSLCRG00005020530)	rasgef1ba (ENSLCRG00005020540)	ENSLCRG00005020548	tmem175 (ENSLCRG00005020549)	ENSLCRG00005020553	WDFY3 (ENSLCRG00005020725)	ENSLCRG00005000079	ENSLCRG00005000086	RUSC2 (ENSLCRG00005000094)
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	19	ralgds (ENSSAUG00010019526)	ptgesl (ENSSAUG00010019561)	gle1 (ENSSAUG00010019564)	odf2b (ENSSAUG00010019584)	SET (ENSSAUG00010019589)	ENSSAUG00010019594	ENSSAUG00010019598	zdhhc12a (ENSSAUG00010019602)	slc25a25a (ENSSAUG00010019609)	EEIG1 (ENSSAUG00010020236)	ENSSAUG00010020238	cnot6l (ENSSAUG00010020241)	mrpl1 (ENSSAUG00010020244)	fras1 (ENSSAUG00010020316)	anxa3a (ENSSAUG00010021091) #21	bmp2k (ENSSAUG00010021094) #22	paqr3a (ENSSAUG00010021097) #23	antxr2a (ENSSAUG00010021102)	prdm8b (ENSSAUG00010021106)	fgf5 (ENSSAUG00010021107)	cfap299 (ENSSAUG00010021109)	bmp3 (ENSSAUG00010021110)	prkg2 (ENSSAUG00010021114)	rasgef1ba (ENSSAUG00010021123)	ENSSAUG00010021287	tmem175 (ENSSAUG00010021290)	CDS1 (ENSSAUG00010021299)	ENSSAUG00010021756	ENSSAUG00010021759	WDFY3 (ENSSAUG00010021766)	ENSSAUG00010021804
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000153181	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01000000214675	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00980000198897	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00990000203821	ENSGT00730000112019	ENSGT00900000141033.a
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00440000038585.d	ENSGT00940000153181	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01000000214675	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00980000198897	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00990000203821	ENSGT00730000112019	ENSGT00900000141033.a
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	23	SMARCB1 (ENSMAMG00000024616)	ralgds (ENSMAMG00000017154)	ptgesl (ENSMAMG00000017132)	ENSMAMG00000017122	ENSMAMG00000017108	ENSMAMG00000017088	ENSMAMG00000026069	zdhhc12a (ENSMAMG00000026638)	ENSMAMG00000017059	ENSMAMG00000017016	ENSMAMG00000016994	cnot6l (ENSMAMG00000016954)	mrpl1 (ENSMAMG00000016943)	ENSMAMG00000016921	fras1 (ENSMAMG00000016723)	bmp2k (ENSMAMG00000016670) #22	paqr3a (ENSMAMG00000016652) #23	antxr2a (ENSMAMG00000016575)	prdm8b (ENSMAMG00000016558)	fgf5 (ENSMAMG00000016546)	cfap299 (ENSMAMG00000016537)	bmp3 (ENSMAMG00000016532)	ENSMAMG00000016521	prkg2 (ENSMAMG00000016490)	ENSMAMG00000027390	rasgef1ba (ENSMAMG00000016463)	tmem175 (ENSMAMG00000026590)	ENSMAMG00000016411	ENSMAMG00000016258	ENSMAMG00000016239	ENSMAMG00000016209
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000153181	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00940000159428.f	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01000000214675	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00980000198897	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00990000203821	ENSGT00730000112019	ENSGT00900000141033.a
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	20	ralgds (ENSBSLG00000010815)	ptgesl (ENSBSLG00000010597)	gle1 (ENSBSLG00000010071)	odf2b (ENSBSLG00000009914)	ENSBSLG00000009904	SET (ENSBSLG00000009862)	ENSBSLG00000009827	zdhhc12a (ENSBSLG00000009719)	ENSBSLG00000009141	EEIG1 (ENSBSLG00000009044)	ENSBSLG00000009012	cnot6l (ENSBSLG00000008890)	mrpl1 (ENSBSLG00000008886)	paqr3a (ENSBSLG00000008209) #23	anxa3a (ENSBSLG00000008004) #21	bmp2k (ENSBSLG00000007854) #22	paqr3a (ENSBSLG00000007818) #23	antxr2a (ENSBSLG00000020768)	prdm8b (ENSBSLG00000020765)	fgf5 (ENSBSLG00000020763)	cfap299 (ENSBSLG00000020762)	bmp3 (ENSBSLG00000020760)	prkg2 (ENSBSLG00000020748)	rasgef1ba (ENSBSLG00000020734)	tmem175 (ENSBSLG00000020727)	CDS1 (ENSBSLG00000020483)	WDFY3 (ENSBSLG00000020390)	ENSBSLG00000020384	ENSBSLG00000020383	ENSBSLG00000020381	RUSC2 (ENSBSLG00000020375)
Climbing perch	DUPLICATION
Climbing perch	MODERN SPECIES	22	ralgds (ENSATEG00000009124)	ptgesl (ENSATEG00000009084)	ENSATEG00000009075	ENSATEG00000009062	ENSATEG00000026057	ENSATEG00000009001	zdhhc12a (ENSATEG00000027259)	ENSATEG00000008907	ENSATEG00000008850	ENSATEG00000008820	cnot6l (ENSATEG00000008774)	mrpl1 (ENSATEG00000008760)	ENSATEG00000028884	fras1 (ENSATEG00000008714)	anxa3a (ENSATEG00000008692) #21	bmp2k (ENSATEG00000008678) #22	paqr3a (ENSATEG00000008640) #23	antxr2a (ENSATEG00000008630)	prdm8b (ENSATEG00000008618)	fgf5 (ENSATEG00000008566)	cfap299 (ENSATEG00000025717)	bmp3 (ENSATEG00000008513)	prkg2 (ENSATEG00000008455)	ENSATEG00000025728	rasgef1ba (ENSATEG00000008387)	tmem175 (ENSATEG00000008316)	ENSATEG00000008269	ENSATEG00000008017	ENSATEG00000008002	ENSATEG00000007991	ENSATEG00000007907
Climbing perch	MODERN SPECIES	22	gins4 (ENSATEG00000023090)	ppp1r3c2b (ENSATEG00000027914)	ENSATEG00000023111	ENSATEG00000023119	ENSATEG00000023136	inpp5l (ENSATEG00000023149)	nkx6.3 (ENSATEG00000023173)	ENSATEG00000023181	sorbs3 (ENSATEG00000029115)	pdlim2 (ENSATEG00000023207)	adgra2 (ENSATEG00000023233)	ENSATEG00000023246	prlhr2a (ENSATEG00000023254)	got1l1 (ENSATEG00000023267)	adrb3a (ENSATEG00000023273)	ENSATEG00000023282 #22	ENSATEG00000028141	ENSATEG00000023312	ENSATEG00000023325	ENSATEG00000000048	ENSATEG00000000174	ENSATEG00000000258	kansl3 (ENSATEG00000000386)	bmp1a (ENSATEG00000000432)	ENSATEG00000000522	ENSATEG00000000721	zgc:56596 (ENSATEG00000026546)	ENSATEG00000026852	ENSATEG00000000819	ENSATEG00000001058	BIN3 (ENSATEG00000001065)
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000153181	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01000000214675	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00980000198897	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00990000203821	ENSGT00730000112019	ENSGT00900000141033.a
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00440000038585.d	ENSGT00940000153181	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00980000198897	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00990000203821	ENSGT00730000112019	ENSGT00900000141033.a
Tongue sole	MODERN SPECIES	398	rorb (ENSCSEG00000013781)	MFSD3 (ENSCSEG00000013796)	anxa1a (ENSCSEG00000013804)	trpm6 (ENSCSEG00000013825)	gstt1a (ENSCSEG00000013896)	MMP11 (ENSCSEG00000013903)	SMARCB1 (ENSCSEG00000013915)	ralgds (ENSCSEG00000013932)	ptgesl (ENSCSEG00000013962)	gle1 (ENSCSEG00000013971)	tmem127 (ENSCSEG00000013978)	EEIG1 (ENSCSEG00000013982)	cnot6l (ENSCSEG00000014001)	mrpl1 (ENSCSEG00000014014)	fras1 (ENSCSEG00000014030)	bmp2k (ENSCSEG00000014120) #22	tmem161b (ENSCSEG00000014135)	mef2cb (ENSCSEG00000014176)	ENSCSEG00000014198	ENSCSEG00000014245	mtrfr (ENSCSEG00000014536)	ENSCSEG00000014546	rilpl2 (ENSCSEG00000014557)	hip1rb (ENSCSEG00000014573)	HCAR1 (ENSCSEG00000014656)	KNTC1 (ENSCSEG00000014672)	rsrc2 (ENSCSEG00000014723)	zcchc8 (ENSCSEG00000014732)	ENSCSEG00000014748	ENSCSEG00000014754	mlxip (ENSCSEG00000014767)
Turbot	MODERN SPECIES	21	ralgds (ENSSMAG00000015906)	ptgesl (ENSSMAG00000015877)	ENSSMAG00000015860	ENSSMAG00000015844	ENSSMAG00000015773	ENSSMAG00000015733	zdhhc12a (ENSSMAG00000028113)	ENSSMAG00000015655	ENSSMAG00000015602	cnot6l (ENSSMAG00000015568)	mrpl1 (ENSSMAG00000015530)	ENSSMAG00000022919	ENSSMAG00000027126	fras1 (ENSSMAG00000015329)	anxa3a (ENSSMAG00000015210) #21	bmp2k (ENSSMAG00000015159) #22	paqr3a (ENSSMAG00000015141) #23	antxr2a (ENSSMAG00000015047)	prdm8b (ENSSMAG00000032252)	fgf5 (ENSSMAG00000014917)	cfap299 (ENSSMAG00000023130)	bmp3 (ENSSMAG00000014899)	prkg2 (ENSSMAG00000014846)	ENSSMAG00000014834	rasgef1ba (ENSSMAG00000014793)	tmem175 (ENSSMAG00000014746)	ENSSMAG00000014739	ENSSMAG00000014606	ENSSMAG00000034610	ENSSMAG00000014558	ENSSMAG00000014583
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	64	ENSGT00940000153181	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01000000214675	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00980000198897	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00990000203821	ENSGT00730000112019	ENSGT00900000141033.a
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	145											ENSGT01000000214675	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00990000203821	ENSGT00730000112019
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2921	mapk1 (ENSSLDG00000025502)	ypel1 (ENSSLDG00000025506)	ppil2 (ENSSLDG00000025508)	stambpb (ENSSLDG00000025521)	slc39a14 (ENSSLDG00000025523)	ascc2 (ENSSLDG00000025524)	ENSSLDG00000025526	sec14l8 (ENSSLDG00000000095)	cfap157 (ENSSLDG00000000200)	ENSSLDG00000000253	ENSSLDG00000000327	cnot6l (ENSSLDG00000000335)	mrpl1 (ENSSLDG00000000399)	fras1 (ENSSLDG00000000454)	anxa3a (ENSSLDG00000000748) #21	bmp2k (ENSSLDG00000000797) #22	paqr3a (ENSSLDG00000000972) #23	antxr2a (ENSSLDG00000001027)	prdm8b (ENSSLDG00000001184)	fgf5 (ENSSLDG00000001193)	cfap299 (ENSSLDG00000001204)	bmp3 (ENSSLDG00000001230)	prkg2 (ENSSLDG00000001240)	rasgef1ba (ENSSLDG00000001319)	tmem175 (ENSSLDG00000001389)	CDS1 (ENSSLDG00000001395)	WDFY3 (ENSSLDG00000001468)	ENSSLDG00000001768	ENSSLDG00000001777	RASEF (ENSSLDG00000001784)	FRMD3 (ENSSLDG00000001803)
Greater amberjack	MODERN SPECIES	77										ENSSDUG00000018398	ENSSDUG00000018414	cnot6l (ENSSDUG00000018426)	mrpl1 (ENSSDUG00000018458)	fras1 (ENSSDUG00000018493)	anxa3a (ENSSDUG00000018612) #21	bmp2k (ENSSDUG00000018658) #22	paqr3a (ENSSDUG00000018749) #23	antxr2a (ENSSDUG00000018781)	prdm8b (ENSSDUG00000018817)	fgf5 (ENSSDUG00000018843)	cfap299 (ENSSDUG00000018856)	bmp3 (ENSSDUG00000018877)	prkg2 (ENSSDUG00000018893)	rasgef1ba (ENSSDUG00000018940)	tmem175 (ENSSDUG00000018976)	CDS1 (ENSSDUG00000019029)	WDFY3 (ENSSDUG00000019106)	ENSSDUG00000019242	ENSSDUG00000019252	ENSSDUG00000019288	ENSSDUG00000019304
Barramundi perch	DUPLICATION
Barramundi perch	MODERN SPECIES	47	SMARCB1 (ENSLCAG00010007012)	ralgds (ENSLCAG00010006941)	ptgesl (ENSLCAG00010006928)	gle1 (ENSLCAG00010006924)	odf2b (ENSLCAG00010006921)	SET (ENSLCAG00010006918)	ENSLCAG00010006912	zdhhc12a (ENSLCAG00010006906)	slc25a25a (ENSLCAG00010006899)	EEIG1 (ENSLCAG00010006892)	ENSLCAG00010006886	cnot6l (ENSLCAG00010006876)	mrpl1 (ENSLCAG00010006871)	fras1 (ENSLCAG00010006776)	anxa3a (ENSLCAG00010006716) #21	bmp2k (ENSLCAG00010006686) #22	paqr3a (ENSLCAG00010006668) #23
Barramundi perch	MODERN SPECIES	95	gins4 (ENSLCAG00010027523)	ppp1r3c2b (ENSLCAG00010027528)	PHYHIP (ENSLCAG00010027530)	POLR3D (ENSLCAG00010027531)	GPAT4 (ENSLCAG00010027538)	inpp5l (ENSLCAG00010027544)	nkx6.3 (ENSLCAG00010027549)	ENSLCAG00010027551	sorbs3 (ENSLCAG00010027555)	pdlim2 (ENSLCAG00010027561)	adgra2 (ENSLCAG00010027592)	ENSLCAG00010027631	prlhr2a (ENSLCAG00010027632)	got1l1 (ENSLCAG00010027633)	adrb3a (ENSLCAG00010027634)	ENSLCAG00010027635 #22	med22 (ENSLCAG00010027637)	zgc:103692 (ENSLCAG00010027639)	nfu1 (ENSLCAG00010027643)	gfpt1 (ENSLCAG00010027672)	ANTXR1 (ENSLCAG00010027684)	ENSLCAG00010027687	ENSLCAG00010027689	ENSLCAG00010027691	kansl3 (ENSLCAG00010027694)	bmp1a (ENSLCAG00010027713)	DISP3 (ENSLCAG00010027756)	ENSLCAG00010027759	zgc:56596 (ENSLCAG00010027760)	ENSLCAG00010027761	ENSLCAG00010027767
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00940000159428.f	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01000000214675	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000166264	ENSGT00940000178095	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00980000198897	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00990000203821
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000153181	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000159428.f	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01000000214675	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000178095	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00940000175973	ENSGT00990000203821	ENSGT00730000112019
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	57	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00440000038585.d	ENSGT00940000156340.a.c	ENSGT00940000163205.c	ENSGT00950000182888.a.b	ENSGT00940000154130.a.b.f	ENSGT00940000165787.a.b	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT01000000214675	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000154742.b	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00980000198897	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000177919	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000159428.f	ENSGT00940000156811.a
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	56			ENSGT00940000153181	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00440000038585.d	ENSGT00940000156340.a.c	ENSGT00940000163205.c	ENSGT00950000182888.a.b	ENSGT00940000154130.a.b.f	ENSGT00940000165787.a.b	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT01000000214675	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00980000198897	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000177919	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000159428.f	ENSGT00940000156811.a	ENSGT00940000155275.c.b.b
Indian medaka	MODERN SPECIES	36	sh3glb2a (ENSOMEG00000022698)	mrpl41 (ENSOMEG00000022717)	dph7 (ENSOMEG00000022726)	ENSOMEG00000022741	zgc:64051 (ENSOMEG00000022754)	araf (ENSOMEG00000022770)	imp4 (ENSOMEG00000022789)	RABL6 (ENSOMEG00000022840)	TRAF2 (ENSOMEG00000000918)	ENSOMEG00000022890	fras1 (ENSOMEG00000022923)	ANXA3 (ENSOMEG00000022937) #21	ENSOMEG00000022947	ENSOMEG00000022978	ENSOMEG00000022989	bmp2k (ENSOMEG00000023004) #22	paqr3a (ENSOMEG00000023014) #23	ENSOMEG00000023024	ENSOMEG00000023030	ENSOMEG00000023047	antxr2a (ENSOMEG00000023062)	prdm8b (ENSOMEG00000023069)	fgf5 (ENSOMEG00000023074)	bmp3 (ENSOMEG00000023080)	prkg2 (ENSOMEG00000023095)	rasgef1ba (ENSOMEG00000023143)	si:ch211-51h9.7 (ENSOMEG00000023155)	SET (ENSOMEG00000023178)	ENSOMEG00000023185	zdhhc12a (ENSOMEG00000023195)	ENSOMEG00000023218
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	23	ralgds (ENSOJAG00000017274)	ptgesl (ENSOJAG00000017416)	gle1 (ENSOJAG00000017430)	SMARCB1 (ENSOJAG00000017471)	ENSOJAG00000017564	gstt1a (ENSOJAG00000017574)	tor2a (ENSOJAG00000017582)	SH2D3C (ENSOJAG00000017583)	ENSOJAG00000017589	ENSOJAG00000017601	ENSOJAG00000017622	cnot6l (ENSOJAG00000017630)	mrpl1 (ENSOJAG00000017674)	anxa3a (ENSOJAG00000019068) #21	ENSOJAG00000019112	bmp2k (ENSOJAG00000019124) #22	paqr3a (ENSOJAG00000019225) #23	ENSOJAG00000019252	ENSOJAG00000019269	ENSOJAG00000019288	WHRN (ENSOJAG00000019289)	stxbp1b (ENSOJAG00000019404)	ENSOJAG00000020671	FUT7 (ENSOJAG00000020696)	niban2b (ENSOJAG00000020765)	FHIP2B (ENSOJAG00000021006)	DNM1 (ENSOJAG00000021036)	med27 (ENSOJAG00000021253)	ENSOJAG00000021272	ENSOJAG00000021312	OLFM1 (ENSOJAG00000000220)
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	75	ENSGT00940000153181	ENSGT00390000000224	ENSGT00940000176203	ENSGT00440000038585.d	ENSGT00940000156340.a.c	ENSGT00940000163205.c	ENSGT00950000182888.a.b	ENSGT00940000154130.a.b.f	ENSGT00940000165787.a.b	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT01000000214675	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000154742.b	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT01050000245948	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00980000198897	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000177919	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000159428.f
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	23	gstt1a (ENSORLG00000018586)	tor2a (ENSORLG00000020659)	ENSORLG00000023470	ENSORLG00000020660	ENSORLG00000026024	ENSORLG00000024363	ENSORLG00000029185	cnot6l (ENSORLG00000018874)	ENSORLG00000024950	mrpl1 (ENSORLG00000018859)	ENSORLG00000030227	ENSORLG00000026119	ENSORLG00000028901	anxa3a (ENSORLG00000025572) #21	ENSORLG00000030530	bmp2k (ENSORLG00000017807) #22	paqr3a (ENSORLG00000017797) #23	ENSORLG00000029742	ENSORLG00000025154	antxr2a (ENSORLG00000017791)	prdm8b (ENSORLG00000017786)	fgf5 (ENSORLG00000025472)	ENSORLG00000029424	ENSORLG00000024952	bmp3 (ENSORLG00000017782)	prkg2 (ENSORLG00000017779)	rasgef1ba (ENSORLG00000017776)	ENSORLG00000029039	ENSORLG00000017771	ENSORLG00000017769	si:ch211-51h9.7 (ENSORLG00000030167)
Chinese medaka	MODERN SPECIES	914															ENSOSIG00000010014	bmp2k (ENSOSIG00000010011) #22	paqr3a (ENSOSIG00000010008) #23
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000159428.f	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01100000264138	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000178095	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00940000175973	ENSGT00730000112019	ENSGT00900000141033.a
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000159428.f	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01100000264138	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000154742.b	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000178095	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00940000175973.b	ENSGT00940000175973.a	ENSGT00730000112019
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000159428.f	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01100000264138	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT01030000234583.a.a.c.b.a.a.b.a.b.b	ENSGT00940000162660.b.a.h.a	ENSGT00940000154742.b	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000178095	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00940000175973.b	ENSGT00940000175973.a	ENSGT00730000112019
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000159428.f	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01100000264138	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT01030000234583.a.a.c.b.a.a.b.a.b.b	ENSGT00940000162660.b.a.h.a	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00940000175973.b	ENSGT00940000175973.a	ENSGT00730000112019	ENSGT00900000141033.a
Guppy	MODERN SPECIES	461	ralgds (ENSPREG00000003910)	ptgesl (ENSPREG00000003883)	gle1 (ENSPREG00000003860)	odf2b (ENSPREG00000003839)	SET (ENSPREG00000003819)	ENSPREG00000003772	ZDHHC12 (ENSPREG00000003761)	ENSPREG00000003726	EEIG1 (ENSPREG00000003697)	ENSPREG00000003597	cnot6l (ENSPREG00000003561)	mrpl1 (ENSPREG00000003524)	ENSPREG00000003502	anxa3a (ENSPREG00000003441) #21	ENSPREG00000003268	bmp2k (ENSPREG00000003209) #22	paqr3a (ENSPREG00000003191) #23	antxr2a (ENSPREG00000003163)	prdm8b (ENSPREG00000003150)	fgf5 (ENSPREG00000003136)	ENSPREG00000003129	ENSPREG00000003114	bmp3 (ENSPREG00000003106)	prkg2 (ENSPREG00000003068)	rasgef1ba (ENSPREG00000003026)	tmem175 (ENSPREG00000003017)	ENSPREG00000002989	WDFY3 (ENSPREG00000002701)	ENSPREG00000002619	ENSPREG00000002612	ENSPREG00000002606
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	95	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000159428.f	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01100000264138	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT01030000234583.a.a.c.b.a.a.b.a.b.b	ENSGT00940000162660.b.a.h.a	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223.g	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00940000175973.b	ENSGT00730000112019	ENSGT00900000141033.a	ENSGT00940000154929.C
Sailfin molly	MODERN SPECIES	204								EEIG1 (ENSPLAG00000019812)	ENSPLAG00000019831	cnot6l (ENSPLAG00000019862)	mrpl1 (ENSPLAG00000019871)	fras1 (ENSPLAG00000020041)	anxa3a (ENSPLAG00000020202) #21	ENSPLAG00000020215	ENSPLAG00000020611	bmp2k (ENSPLAG00000020669) #22
Amazon molly	MODERN SPECIES	272	ptgesl (ENSPFOG00000013850)	gle1 (ENSPFOG00000013740)	odf2b (ENSPFOG00000013650)	si:ch211-51h9.7 (ENSPFOG00000013648)	SET (ENSPFOG00000013616)	ENSPFOG00000013424	zdhhc12a (ENSPFOG00000013419)	ENSPFOG00000013351	EEIG1 (ENSPFOG00000013232)	cnot6l (ENSPFOG00000013163)	mrpl1 (ENSPFOG00000013095)	fras1 (ENSPFOG00000012315)	anxa3a (ENSPFOG00000012259) #21	ENSPFOG00000020659	ENSPFOG00000012248	bmp2k (ENSPFOG00000012197) #22	paqr3a (ENSPFOG00000012169) #23	antxr2a (ENSPFOG00000011750)	prdm8b (ENSPFOG00000011716)	fgf5 (ENSPFOG00000011697)	cfap299 (ENSPFOG00000024060)	bmp3 (ENSPFOG00000011654)	prkg2 (ENSPFOG00000011281)	rasgef1ba (ENSPFOG00000011020)	tmem175 (ENSPFOG00000011009)	ENSPFOG00000010795	WDFY3 (ENSPFOG00000009798)	ENSPFOG00000022967	ENSPFOG00000009752	RUSC2 (ENSPFOG00000009557)	ENSPFOG00000022862
Platyfish	MODERN SPECIES	3	odf2b (ENSXMAG00000002830)	si:ch211-51h9.7 (ENSXMAG00000021072)	SET (ENSXMAG00000002845)	ENSXMAG00000002866	zdhhc12a (ENSXMAG00000002879)	ENSXMAG00000002883	EEIG1 (ENSXMAG00000002891)	ENSXMAG00000024753	cnot6l (ENSXMAG00000002900)	mrpl1 (ENSXMAG00000002920)	fras1 (ENSXMAG00000002929)	anxa3a (ENSXMAG00000002973) #21	ENSXMAG00000020871	ENSXMAG00000009911	ENSXMAG00000022853	bmp2k (ENSXMAG00000009913) #22	paqr3a (ENSXMAG00000009926) #23	antxr2a (ENSXMAG00000009937)	prdm8b (ENSXMAG00000021552)	ENSXMAG00000026319	fgf5 (ENSXMAG00000022690)	ENSXMAG00000022946	cfap299 (ENSXMAG00000021717)	bmp3 (ENSXMAG00000009998)	prkg2 (ENSXMAG00000010000)	rasgef1ba (ENSXMAG00000010014)	tmem175 (ENSXMAG00000010037)	ENSXMAG00000010049	WDFY3 (ENSXMAG00000010057)	ENSXMAG00000027878	ENSXMAG00000027693
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	128	ENSGT00940000177481	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01100000264138	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00940000175973.b	ENSGT00940000175973.a	ENSGT00730000112019	ENSGT00900000141033.a
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	201	ptgesl (ENSCVAG00000021891)	gle1 (ENSCVAG00000021883)	odf2b (ENSCVAG00000021855)	SET (ENSCVAG00000021845)	si:ch211-51h9.7 (ENSCVAG00000000776)	ENSCVAG00000021813	zdhhc12a (ENSCVAG00000021800)	ENSCVAG00000021796	ENSCVAG00000021767	EEIG1 (ENSCVAG00000021746)	ENSCVAG00000021689	cnot6l (ENSCVAG00000021683)	mrpl1 (ENSCVAG00000021636)	fras1 (ENSCVAG00000021626)	anxa3a (ENSCVAG00000021463) #21	bmp2k (ENSCVAG00000021452) #22	paqr3a (ENSCVAG00000021390) #23	antxr2a (ENSCVAG00000021330)	ENSCVAG00000021224	prdm8b (ENSCVAG00000021206)	fgf5 (ENSCVAG00000021198)	bmp3 (ENSCVAG00000021175)	prkg2 (ENSCVAG00000021153)	rasgef1ba (ENSCVAG00000021087)	tmem175 (ENSCVAG00000021016)	ENSCVAG00000021008	WDFY3 (ENSCVAG00000020959)	ENSCVAG00000020743	ENSCVAG00000020737
Mummichog	MODERN SPECIES	2221	ENSFHEG00000011983	ptgesl (ENSFHEG00000012004)	ENSFHEG00000012011	odf2b (ENSFHEG00000012030)	SET (ENSFHEG00000012102)	ENSFHEG00000012136	zdhhc12a (ENSFHEG00000012156)	slc25a25a (ENSFHEG00000012188)	EEIG1 (ENSFHEG00000012288)	ENSFHEG00000000776	ENSFHEG00000012333	cnot6l (ENSFHEG00000012364)	mrpl1 (ENSFHEG00000012375)	fras1 (ENSFHEG00000012531)	anxa3a (ENSFHEG00000012543) #21	bmp2k (ENSFHEG00000012592) #22	paqr3a (ENSFHEG00000012622) #23	antxr2a (ENSFHEG00000012645)	prdm8b (ENSFHEG00000012656)	fgf5 (ENSFHEG00000012680)	cfap299 (ENSFHEG00000012685)	bmp3 (ENSFHEG00000012705)	prkg2 (ENSFHEG00000012735)	rasgef1ba (ENSFHEG00000012834)	ENSFHEG00000012855	tmem175 (ENSFHEG00000012931)	ENSFHEG00000012953	ENSFHEG00000012980	ENSFHEG00000012989	ENSFHEG00000013013	ENSFHEG00000013018
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	66	ENSGT00940000153181	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01100000264138	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00940000175973	ENSGT00730000112019	ENSGT00900000141033.a	ENSGT00740000117099	ENSGT00940000165775.a
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1620	ENSNFUG00015005938	ENSNFUG00015005933	MAPK1 (ENSNFUG00015005761)	GRSF1 (ENSNFUG00015005747)	rufy3 (ENSNFUG00015005729)	SET (ENSNFUG00015005715)	ENSNFUG00015005568	ZDHHC12A (ENSNFUG00015005541)	slc25a25a (ENSNFUG00015005276)	EEIG1 (ENSNFUG00015005206)	ENSNFUG00015005181	cnot6l (ENSNFUG00015005095)	MRPL1 (ENSNFUG00015005061)	ENSNFUG00015005050	ENSNFUG00015004945	bmp2k (ENSNFUG00015004873) #22	PAQR3A (ENSNFUG00015004840) #23	antxr2a (ENSNFUG00015004779)	PRDM8B (ENSNFUG00015004758)	fgf5 (ENSNFUG00015017967)	ENSNFUG00015017964	cfap299 (ENSNFUG00015017962)	bmp3 (ENSNFUG00015017961)	PRKG2 (ENSNFUG00015017919)	rasgef1ba (ENSNFUG00015017781)	ENSNFUG00015017276	ENSNFUG00015017204	CCL-C5A (ENSNFUG00015017198)	RUSC2 (ENSNFUG00015017183)	ENSNFUG00015017172	ENSNFUG00015014321
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	143														fras1 (ENSKMAG00000003187)	anxa3a (ENSKMAG00000003310) #21	bmp2k (ENSKMAG00000003344) #22	paqr3a (ENSKMAG00000003360) #23	antxr2a (ENSKMAG00000003428)	prdm8b (ENSKMAG00000003454)	fgf5 (ENSKMAG00000003484)	cfap299 (ENSKMAG00000003501)	bmp3 (ENSKMAG00000003514)	prkg2 (ENSKMAG00000003533)	rasgef1ba (ENSKMAG00000003601)	ENSKMAG00000003638	WDFY3 (ENSKMAG00000003701)	ENSKMAG00000003897	ENSKMAG00000003905	RUSC2 (ENSKMAG00000003920)	ENSKMAG00000003973	ENSKMAG00000003982
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000177481	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01000000214675	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000166264	ENSGT00940000178095	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00980000198897	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00990000203821
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00440000038585.d	ENSGT00940000153181	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000159428.f	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01000000214675	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000166264	ENSGT00940000178095	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393.d	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00980000198897	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00990000203821
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00440000038585.d	ENSGT00940000153181	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000159428.f	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01000000214675	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000166264	ENSGT00940000178095	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393.c	ENSGT00940000159393.d	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00990000203821
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000159428.f	ENSGT00940000168284.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01000000214675.f	ENSGT01000000214675.e	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000166264	ENSGT00940000178095	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393.c	ENSGT00940000159393.d	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00990000203821
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	513															fras1 (ENSAOCG00000002677)	bmp2k (ENSAOCG00000013066) #22
Orange clownfish	MODERN SPECIES	19	ptgesl (ENSAPEG00000020358)	gle1 (ENSAPEG00000020337)	ENSAPEG00000020315	si:ch211-51h9.7 (ENSAPEG00000020302)	SET (ENSAPEG00000020267)	ENSAPEG00000020213	zdhhc12a (ENSAPEG00000020199)	ENSAPEG00000020157	ENSAPEG00000020147	EEIG1 (ENSAPEG00000020095)	ENSAPEG00000020079	ENSAPEG00000020064	cnot6l (ENSAPEG00000020035)	mrpl1 (ENSAPEG00000020020)	fras1 (ENSAPEG00000019848)	bmp2k (ENSAPEG00000019803) #22	paqr3a (ENSAPEG00000019761) #23	antxr2a (ENSAPEG00000019728)	prdm8b (ENSAPEG00000019708)	fgf5 (ENSAPEG00000019694)	ENSAPEG00000019686	cfap299 (ENSAPEG00000019661)	ENSAPEG00000019628	bmp3 (ENSAPEG00000019607)	prkg2 (ENSAPEG00000019541)	rasgef1ba (ENSAPEG00000019492)	tmem175 (ENSAPEG00000019435)	ENSAPEG00000019417	WDFY3 (ENSAPEG00000019217)	ENSAPEG00000019201	ENSAPEG00000019194
Bicolor damselfish	DUPLICATION
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	67																bmp2k (ENSSPAG00000015555) #22
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	502	ppp1r3c2b (ENSSPAG00000023321)	PHYHIP (ENSSPAG00000023325)	POLR3D (ENSSPAG00000023326)	GPAT4 (ENSSPAG00000023329)	inpp5l (ENSSPAG00000023333)	nkx6.3 (ENSSPAG00000023335)	ENSSPAG00000023339	sorbs3 (ENSSPAG00000023342)	ENSSPAG00000023343	pdlim2 (ENSSPAG00000023344)	adgra2 (ENSSPAG00000023348)	ENSSPAG00000000036	prlhr2a (ENSSPAG00000000038)	got1l1 (ENSSPAG00000000062)	adrb3a (ENSSPAG00000000131)	ENSSPAG00000000180 #22
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000000224	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01000000214675	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000162168	ENSGT00980000203258	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000178095	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00980000198897	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00990000203821	ENSGT00730000112019
Midas cichlid	MODERN SPECIES	430										cnot6l (ENSACIG00000002515)	ENSACIG00000002503	fras1 (ENSACIG00000002338)	ENSACIG00000002322	mrpl1 (ENSACIG00000002298)	ENSACIG00000002289	bmp2k (ENSACIG00000002264) #22	paqr3a (ENSACIG00000002247) #23	antxr2a (ENSACIG00000002193)	prdm8b (ENSACIG00000002182)	fgf5 (ENSACIG00000002164)	cfap299 (ENSACIG00000002150)	bmp3 (ENSACIG00000002127)	prkg2 (ENSACIG00000002085)	rasgef1ba (ENSACIG00000002051)
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01000000214675.a	ENSGT01000000214675.b	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000154742.b	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000178095	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00980000198897	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00990000203821	ENSGT00730000112019
Nile tilapia	MODERN SPECIES	3	odf2b (ENSONIG00000013972)	SET (ENSONIG00000013978)	ENSONIG00000013980	zdhhc12a (ENSONIG00000013983)	slc25a25a (ENSONIG00000013984)	EEIG1 (ENSONIG00000013986)	ENSONIG00000036109	ENSONIG00000013990	ENSONIG00000029845	ENSONIG00000040434	cnot6l (ENSONIG00000013992)	anxa3a (ENSONIG00000014003) #21	ENSONIG00000041641	mrpl1 (ENSONIG00000014024)	ENSONIG00000036787	bmp2k (ENSONIG00000014028) #22	paqr3a (ENSONIG00000014029) #23	antxr2a (ENSONIG00000014031)	prdm8b (ENSONIG00000014038)	fgf5 (ENSONIG00000033859)	cfap299 (ENSONIG00000040094)	bmp3 (ENSONIG00000014041)	prkg2 (ENSONIG00000014042)	rasgef1ba (ENSONIG00000014048)	ENSONIG00000030843	tmem175 (ENSONIG00000014051)	ENSONIG00000014052	WDFY3 (ENSONIG00000014054)	ENSONIG00000027724	ENSONIG00000014063	ENSONIG00000014064
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01000000214675.a	ENSGT01000000214675.b	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000154742.b	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000178095	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00990000203821	ENSGT00730000112019	ENSGT00900000141033.a
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	342	ralgds (ENSNBRG00000015947)	ENSNBRG00000016013	ptgesl (ENSNBRG00000016023)	gle1 (ENSNBRG00000016042)	si:ch211-51h9.7 (ENSNBRG00000016071)	SET (ENSNBRG00000016087)	ENSNBRG00000016206	zdhhc12a (ENSNBRG00000016210)	ENSNBRG00000016231	EEIG1 (ENSNBRG00000016255)	ENSNBRG00000016296	cnot6l (ENSNBRG00000016345)	anxa3a (ENSNBRG00000016379) #21	fras1 (ENSNBRG00000016480)	mrpl1 (ENSNBRG00000016660)	bmp2k (ENSNBRG00000016695) #22	paqr3a (ENSNBRG00000016767) #23	ENSNBRG00000016796	ENSNBRG00000016817	prdm8b (ENSNBRG00000016843)	fgf5 (ENSNBRG00000016873)	cfap299 (ENSNBRG00000016894)	bmp3 (ENSNBRG00000016914)	prkg2 (ENSNBRG00000016941)	rasgef1ba (ENSNBRG00000016984)	ENSNBRG00000017018	tmem175 (ENSNBRG00000017127)	ENSNBRG00000017149	ENSNBRG00000017169	ENSNBRG00000017194	ENSNBRG00000017219
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01000000214675.a	ENSGT01000000214675.b	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000154742.b	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000178095	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00990000203821	ENSGT00730000112019	ENSGT00900000141033.a
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01000000214675.a	ENSGT01000000214675.b	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000154742.b	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00990000203821	ENSGT00730000112019	ENSGT00900000141033.a	ENSGT00940000154929.C
P. nyererei	MODERN SPECIES	333	ENSPNYG00000007183	ralgds (ENSPNYG00000007083)	ptgesl (ENSPNYG00000007045)	gle1 (ENSPNYG00000007027)	si:ch211-51h9.7 (ENSPNYG00000007013)	SET (ENSPNYG00000006988)	ENSPNYG00000006951	zdhhc12a (ENSPNYG00000006930)	slc25a25a (ENSPNYG00000006896)	EEIG1 (ENSPNYG00000006862)	ENSPNYG00000006814	cnot6l (ENSPNYG00000006717)	anxa3a (ENSPNYG00000006673) #21	fras1 (ENSPNYG00000006517)	mrpl1 (ENSPNYG00000006464)	bmp2k (ENSPNYG00000006420) #22	paqr3a (ENSPNYG00000006408) #23	antxr2a (ENSPNYG00000006393)	prdm8b (ENSPNYG00000006374)	fgf5 (ENSPNYG00000006352)	ENSPNYG00000006340	bmp3 (ENSPNYG00000006285)	prkg2 (ENSPNYG00000006244)	rasgef1ba (ENSPNYG00000006195)	tmem175 (ENSPNYG00000006139)	ENSPNYG00000006078	WDFY3 (ENSPNYG00000005870)	ENSPNYG00000005826	ENSPNYG00000005811	ENSPNYG00000005791	ENSPNYG00000005781
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000012903	ENSGT00530000063497.a.b	ENSGT00530000065225	ENSGT00940000153877.a.b	ENSGT00940000164790.b	ENSGT00940000156902.a	ENSGT00940000157207.a.b	ENSGT00940000156811.a	ENSGT01000000214675.a	ENSGT01000000214675.b.c	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000154742.b	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00990000203821	ENSGT00730000112019	ENSGT00900000141033.a	ENSGT00940000165775.a
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1094	SET (ENSMZEG00005020199)	si:ch211-51h9.7 (ENSMZEG00005020203)	ENSMZEG00005020205	zdhhc12a (ENSMZEG00005020210)	slc25a25a (ENSMZEG00005020213)	ENSMZEG00005020216	ENSMZEG00005020218	EEIG1 (ENSMZEG00005020220)	ENSMZEG00005020224	ENSMZEG00005020226	ENSMZEG00005020229	cnot6l (ENSMZEG00005020235)	anxa3a (ENSMZEG00005020243) #21	fras1 (ENSMZEG00005020260)	mrpl1 (ENSMZEG00005020288)	bmp2k (ENSMZEG00005020293) #22	paqr3a (ENSMZEG00005020302) #23	antxr2a (ENSMZEG00005020312)	prdm8b (ENSMZEG00005020318)	fgf5 (ENSMZEG00005020322)	cfap299 (ENSMZEG00005020333)	bmp3 (ENSMZEG00005020338)	prkg2 (ENSMZEG00005020341)	rasgef1ba (ENSMZEG00005020351)	tmem175 (ENSMZEG00005020375)	ENSMZEG00005020387	WDFY3 (ENSMZEG00005020414)	ENSMZEG00005020473	ENSMZEG00005020477	RUSC2 (ENSMZEG00005020480)	ENSMZEG00005020504
Eastern happy	MODERN SPECIES	3	odf2b (ENSACLG00000000651)	si:ch211-51h9.7 (ENSACLG00000000679)	SET (ENSACLG00000000683)	ENSACLG00000000701	zdhhc12a (ENSACLG00000000722)	slc25a25a (ENSACLG00000000744)	EEIG1 (ENSACLG00000000773)	ENSACLG00000000842	ENSACLG00000000848	ENSACLG00000000864	cnot6l (ENSACLG00000000879)	anxa3a (ENSACLG00000000913) #21	fras1 (ENSACLG00000000997)	mrpl1 (ENSACLG00000001464)	ENSACLG00000001486	bmp2k (ENSACLG00000001497) #22	paqr3a (ENSACLG00000001605) #23	ENSACLG00000001651	antxr2a (ENSACLG00000001655)	prdm8b (ENSACLG00000001706)	fgf5 (ENSACLG00000002101)	cfap299 (ENSACLG00000002106)	bmp3 (ENSACLG00000002116)	prkg2 (ENSACLG00000002125)	rasgef1ba (ENSACLG00000002361)	tmem175 (ENSACLG00000002448)	CDS1 (ENSACLG00000002480)	WDFY3 (ENSACLG00000002519)	ENSACLG00000002783	ENSACLG00000002800	RUSC2 (ENSACLG00000002879)
Burton s mouthbrooder	DUPLICATION
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	315									ENSHBUG00000001107	ENSHBUG00000004697	cnot6l (ENSHBUG00000004755)	anxa3a (ENSHBUG00000004806) #21	fras1 (ENSHBUG00000004962)	mrpl1 (ENSHBUG00000004985)	ENSHBUG00000004996	bmp2k (ENSHBUG00000005128) #22	paqr3a (ENSHBUG00000005153) #23	antxr2a (ENSHBUG00000005164)	prdm8b (ENSHBUG00000005172)	fgf5 (ENSHBUG00000005177)	ENSHBUG00000005185	cfap299 (ENSHBUG00000005207)	bmp3 (ENSHBUG00000005251)	prkg2 (ENSHBUG00000005289)	rasgef1ba (ENSHBUG00000005319)	tmem175 (ENSHBUG00000005356)	ENSHBUG00000005384	WDFY3 (ENSHBUG00000005505)	ENSHBUG00000005522	ENSHBUG00000005528	RUSC2 (ENSHBUG00000005535)
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	320	POLR3D (ENSHBUG00000012288)	GPAT4 (ENSHBUG00000012317)	nkx6.3 (ENSHBUG00000012336)	ENSHBUG00000012348	ENSHBUG00000012366	ENSHBUG00000012377	inpp5l (ENSHBUG00000012395)	ENSHBUG00000012413	sorbs3 (ENSHBUG00000012434)	pdlim2 (ENSHBUG00000012452)	adgra2 (ENSHBUG00000012464)	ENSHBUG00000012497	ENSHBUG00000000354	prlhr2a (ENSHBUG00000012521)	adrb3a (ENSHBUG00000012536)	ENSHBUG00000012544 #22	med22 (ENSHBUG00000012558)	zgc:103692 (ENSHBUG00000012573)	nfu1 (ENSHBUG00000012612)	gfpt1 (ENSHBUG00000012707)	ANTXR1 (ENSHBUG00000012787)	ENSHBUG00000012818	kansl3 (ENSHBUG00000012854)	bmp1a (ENSHBUG00000012971)	DISP3 (ENSHBUG00000012982)	ENSHBUG00000013068	zgc:56596 (ENSHBUG00000013073)	ENSHBUG00000013087	ENSHBUG00000013103	BIN3 (ENSHBUG00000013120)	egr3 (ENSHBUG00000000382)
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	97	ENSGT00500000045469	ENSGT00940000159394	ENSGT00510000047171.z	ENSGT00390000014879.c.b	ENSGT00390000000113.A.a.a	ENSGT00940000166353	ENSGT00730000113053	ENSGT00940000169510	ENSGT00940000156901.B	ENSGT00940000159928	ENSGT00940000177226	ENSGT00940000159371	ENSGT00950000183104.A.a.b	ENSGT00940000153270.b.a	ENSGT00940000155998	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000157298	ENSGT01000000214878
Northern pike	MODERN SPECIES	12	zgc:158260 (ENSELUG00000014435)	ENSELUG00000014400	ST8SIA3 (ENSELUG00000014364)	RAB27B (ENSELUG00000031156)	zgc:152968 (ENSELUG00000014272)	tal2 (ENSELUG00000001638)	ENSELUG00000014178	ENSELUG00000014082	ENSELUG00000013977	ENSELUG00000013958	ENSELUG00000032932	gpx8 (ENSELUG00000013928)	CDC20B (ENSELUG00000025013)	MCIDAS (ENSELUG00000013917)	CCNO (ENSELUG00000013902)	bmp2k (ENSELUG00000013888) #22	paqr3a (ENSELUG00000013818) #23	antxr2a (ENSELUG00000013774)	prdm8b (ENSELUG00000013680)	fgf5 (ENSELUG00000013670)	anxa3 (ENSELUG00000013648) #21	ENSELUG00000025556	mrpl1 (ENSELUG00000013391)	cnot6l (ENSELUG00000013353)	ENSELUG00000001269	pias2 (ENSELUG00000013232)	EEF2 (ENSELUG00000013203)	ENSELUG00000013150	cfap299 (ENSELUG00000013164)	bmp3 (ENSELUG00000013133)	prkg2 (ENSELUG00000013125)
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	965												ENSGT00950000183104.A.a.b	ENSGT00940000159371.m	ENSGT00940000153270.b.a	ENSGT00940000155998	ENSGT00940000157548.q.a #22	ENSGT00940000156320.c.c.a
Huchen	DUPLICATION
Huchen	MODERN SPECIES	5132															bmp2k (ENSHHUG00000051917) #22	ENSHHUG00000051916 #22
Huchen	MODERN SPECIES	5132																bmp2k (ENSHHUG00000051917) #22	ENSHHUG00000051916 #22
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	113	ENSGT00940000153731.a.a.k.b	ENSGT00940000157072.b.a.b	ENSGT00940000161247	ENSGT00940000157724.b.b.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.a.c	ENSGT00940000155680.d.`b.b	ENSGT00940000158223.i	ENSGT00940000155816.b.g.a	ENSGT00390000014879.c.b.d.a.b.a	ENSGT00510000047171.z.d	ENSGT00940000159394.h	ENSGT00950000183104.A.a.b	ENSGT00940000159371.m	ENSGT00940000153270.b.a	ENSGT00940000155998	ENSGT00940000157548.q.a #22	ENSGT00940000156320.c.d	ENSGT00890000139463.b.b.b.f.b	ENSGT00940000158449.e.b	ENSGT00940000163761.i	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000157298.n	ENSGT01000000214878.e.b	ENSGT01060000253410	ENSGT00940000158884	ENSGT00940000156516	ENSGT00990000204357	ENSGT00940000160018.n	ENSGT00390000002575	ENSGT00940000153654.`f.a.b.a	ENSGT00990000207738.b
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	85	ENSGT00940000155680.d.`b.b	ENSGT00940000158223.i	ENSGT00940000155816.b.g.a	ENSGT01090000260468.a	ENSGT00940000157845.f	ENSGT00940000156901.B.a	ENSGT00940000169510	ENSGT00730000113053.a	ENSGT00390000014879.c.b.c	ENSGT00510000047171.z.d	ENSGT00940000159394.h	ENSGT00950000183104.A.a.b	ENSGT00940000159371.m	ENSGT00940000153270.b.a	ENSGT00940000155998	ENSGT00940000157548.q.a #22	ENSGT00940000156320.c.d	ENSGT00890000139463.b.b.b.f.b	ENSGT00940000158449.e.b	ENSGT00940000163761.i	ENSGT00940000162168.q	ENSGT00940000157298.n	ENSGT01000000214878.e.b.b	ENSGT01060000253410	ENSGT00940000158884	ENSGT00990000204357	ENSGT00940000156516	ENSGT00940000160018.n	ENSGT00390000002575	ENSGT00940000153654.`f.a.b.a	ENSGT00940000153654.`f.a.b.b
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	16	ENSSSAG00000053614	ENSSSAG00000118933	ENSSSAG00000053392	ENSSSAG00000099408	ENSSSAG00000053429	ENSSSAG00000053589	ENSSSAG00000104894	ENSSSAG00000117621	ENSSSAG00000086471	ENSSSAG00000116569	ENSSSAG00000053486	GPX8 (ENSSSAG00000090378)	CDC20B (ENSSSAG00000053336)	MCIDAS (ENSSSAG00000098117)	ENSSSAG00000103697	bmp2k (ENSSSAG00000053206) #22	ENSSSAG00000120097	antxr2a (ENSSSAG00000116038)	prdm8b (ENSSSAG00000053004)	fgf5 (ENSSSAG00000096652)	ENSSSAG00000105033	ENSSSAG00000088603	fras1 (ENSSSAG00000053053)	ENSSSAG00000071567	cnot6l (ENSSSAG00000092108)	ENSSSAG00000103305	ENSSSAG00000071584	ENSSSAG00000087881	ENSSSAG00000115022	ENSSSAG00000102448	ENSSSAG00000110758
River trout	MODERN SPECIES	19	ENSSTUG00000007233	NOD1 (ENSSTUG00000007192)	ENSSTUG00000007184	ENSSTUG00000007175	ENSSTUG00000007157	ENSSTUG00000007147	ENSSTUG00000007142	slc20a2 (ENSSTUG00000007136)	KCMF1 (ENSSTUG00000007115)	ENSSTUG00000007107	lipg (ENSSTUG00000006832)	CDC20B (ENSSTUG00000006767)	gpx8 (ENSSTUG00000006748)	ENSSTUG00000006736	CCNO (ENSSTUG00000006653)	bmp2k (ENSSTUG00000006623) #22	antxr2a (ENSSTUG00000006579)	prdm8b (ENSSTUG00000006568)	fgf5 (ENSSTUG00000006553)	fras1 (ENSSTUG00000004652)	mrpl1 (ENSSTUG00000004402)	ENSSTUG00000004395	cnot6l (ENSSTUG00000004336)	ENSSTUG00000004311	ENSSTUG00000004302	ENSSTUG00000004297	ENSSTUG00000004265	ENSSTUG00000004243	ENSSTUG00000004235	ENSSTUG00000004207	ENSSTUG00000004192
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	77	ENSGT00940000153731.a.a.k.b	ENSGT00940000157072.b.a.b	ENSGT00940000161247	ENSGT00940000157724.b.b.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.a.c	ENSGT00940000158223.i	ENSGT00940000155816.b.g.a	ENSGT00940000156901.B.a	ENSGT00390000014879.c.b.d.a.b.a	ENSGT00510000047171.z.d	ENSGT00940000159394.h	ENSGT00950000183104.A.a.b	ENSGT00940000159371.m	ENSGT00940000153270.b.a	ENSGT00940000155998	ENSGT00940000157548.q.a #22	ENSGT00940000156320.c.c.a	ENSGT00940000156320.c.d	ENSGT00890000139463.b.b.b.f.b	ENSGT00940000158449.e.b	ENSGT00940000163761.i	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000157298.n	ENSGT01000000214878.e.b	ENSGT01060000253410	ENSGT00940000158884	ENSGT00940000156516	ENSGT00990000204357	ENSGT00940000160018.n	ENSGT00390000002575	ENSGT00940000153654.`f.a.b.a
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	87	ENSGT00950000183129.b.a.c	ENSGT00940000161247	ENSGT00940000157724.b.b.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.a.c	ENSGT00940000158223.i	ENSGT00940000155816.b.g.a	ENSGT00940000156901.B.a	ENSGT00510000048748	ENSGT00730000113053.a	ENSGT00390000014879.c.b.d.a.b.a	ENSGT00510000047171.z.d	ENSGT00940000159394.h	ENSGT00940000159371.m	ENSGT00940000153270.b.a	ENSGT00940000155998	ENSGT00940000157548.q.a #22	ENSGT00940000156320.c.c.a	ENSGT00890000139463.b.b.b.f.b	ENSGT00940000158449.e.b	ENSGT00940000163761.i	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000157298.n	ENSGT01000000214878.e.b	ENSGT00940000158884	ENSGT00940000156516	ENSGT00990000204357	ENSGT00940000160018.n	ENSGT00390000002575	ENSGT00940000153654.`f.a.b.a	ENSGT00990000207738.b	ENSGT00730000112019.a
Coho salmon	MODERN SPECIES	22	RASGEF1B (ENSOKIG00005001074)	ENSOKIG00005001120	ENSOKIG00005001129	ENSOKIG00005001142	ENSOKIG00005001147	ENSOKIG00005001153	ENSOKIG00005001171	KCMF1 (ENSOKIG00005001209)	lipg (ENSOKIG00005001220)	ENSOKIG00005001241	ENSOKIG00005001250	ENSOKIG00005001286	gpx8 (ENSOKIG00005001327)	ENSOKIG00005001334	CCNO (ENSOKIG00005001336)	bmp2k (ENSOKIG00005001340) #22	antxr2a (ENSOKIG00005001351)	ENSOKIG00005001360	prdm8b (ENSOKIG00005001364)	fgf5 (ENSOKIG00005001366)	fras1 (ENSOKIG00005001406)	mrpl1 (ENSOKIG00005001570)	ENSOKIG00005001575	cnot6l (ENSOKIG00005001580)	ENSOKIG00005001593	ENSOKIG00005001600	ENSOKIG00005001605	ENSOKIG00005001611	ENSOKIG00005001613	ENSOKIG00005001617	ENSOKIG00005001621
Rainbow trout	MODERN SPECIES	27	ENSOMYG00000032059	ENSOMYG00000032068	ENSOMYG00000057194	ENSOMYG00000032574	ENSOMYG00000057745	ENSOMYG00000032562	ENSOMYG00000074126	ENSOMYG00000048447	ENSOMYG00000063869	ENSOMYG00000032145	ENSOMYG00000055213	CDC20B (ENSOMYG00000055342)	GPX8 (ENSOMYG00000032660)	ENSOMYG00000032652	CCNO (ENSOMYG00000032626)	bmp2k (ENSOMYG00000032591) #22	ENSOMYG00000028091	ENSOMYG00000050219	ENSOMYG00000073003	antxr2a (ENSOMYG00000061375)	prdm8b (ENSOMYG00000001176)	fgf5 (ENSOMYG00000053332)	ENSOMYG00000069185	ENSOMYG00000072498	ENSOMYG00000074516	ENSOMYG00000050245	ENSOMYG00000072096	ENSOMYG00000001262	ENSOMYG00000039860	ENSOMYG00000023130	ENSOMYG00000066326
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	414	ENSGT00940000157072.b.a.a.a.b	ENSGT00390000013835	ENSGT00940000156244.a.a	ENSGT00940000157724.b.b.a	ENSGT00940000154091.a.a.s.a.d	ENSGT00500000045469	ENSGT00940000155680.d.`b.a	ENSGT00940000159394.g	ENSGT00510000047171.z.c	ENSGT00390000014879.c.b.d.b	ENSGT00390000000113.A.a.a	ENSGT00940000166353	ENSGT00730000113053.b	ENSGT00940000177226	ENSGT00940000159371.n	ENSGT00940000157548.q.b #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c.c.b	ENSGT00890000139463.b.b.b.f.a	ENSGT00940000158449.e.a	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000163761.j	ENSGT00940000157298.m	ENSGT00530000064292
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	50	ENSGT00940000154091.a.a.s.a.d	ENSGT00500000045469	ENSGT00940000155680.d.`b.a	ENSGT00940000164201.c.b.a.a	ENSGT01100000263516.a.b.a.k.a.b	ENSGT00940000159394.g	ENSGT00510000047171.z.c	ENSGT00390000014879.c.b.d.b	ENSGT00390000000113.A.a.a	ENSGT00940000166353	ENSGT00730000113053.b	ENSGT00940000156901.B.b	ENSGT00940000159928.g.a	ENSGT00940000177226	ENSGT00940000159371.n	ENSGT00940000157548.q.b #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c.c.b	ENSGT00890000139463.b.b.b.f.a	ENSGT00940000158449.e.a	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000163761.j	ENSGT00940000157298.m	ENSGT01000000214878.f	ENSGT01060000248978.c	ENSGT00940000160018.m	ENSGT00940000153654.`f.a.b.b	ENSGT00990000207738.a	ENSGT00730000112019.b	ENSGT00900000141033.a.cb.a	ENSGT00940000161917.a.b
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000154091.a.a.s.a.d	ENSGT00940000155680.d.`b.a	ENSGT00940000164201.c.b.a.a	ENSGT01100000263516.a.b.a.k.a.b	ENSGT00940000159394.g	ENSGT00510000047171.z.c	ENSGT00390000014879.c.b.d.a.a	ENSGT00390000014879.c.b.d.a.b.b	ENSGT00390000000113.A.a.a	ENSGT00940000166353	ENSGT00730000113053.b	ENSGT00940000156901.B.b	ENSGT00940000159928.g.a	ENSGT00940000159928.g.b	ENSGT00940000159371.n	ENSGT00940000157548.q.b #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c.c.b	ENSGT00890000139463.b.b.b.f.a	ENSGT00940000158449.e.a	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000163761.j	ENSGT00940000157298.m	ENSGT01000000214878.f	ENSGT01060000248978.c.d	ENSGT00940000160018.m	ENSGT00940000153654.`f.a.b.b	ENSGT00990000207738.a	ENSGT00730000112019.b	ENSGT00900000141033.a.cb.a	ENSGT00940000159834.p
Rainbow trout	MODERN SPECIES	2	ENSOMYG00000066529	ENSOMYG00000033067	ENSOMYG00000033009	lipg (ENSOMYG00000032999)	ENSOMYG00000054104	ENSOMYG00000048670	ENSOMYG00000048074	ENSOMYG00000032963	ENSOMYG00000054608	ENSOMYG00000052792	ENSOMYG00000050373	ENSOMYG00000032835	ENSOMYG00000032861	ENSOMYG00000032880	ENSOMYG00000051957	bmp2k (ENSOMYG00000032910) #22	ENSOMYG00000056369	paqr3a (ENSOMYG00000052169) #23	ENSOMYG00000053534	ENSOMYG00000004525	ENSOMYG00000052096	ENSOMYG00000048165	antxr2a (ENSOMYG00000071928)	ENSOMYG00000053700	prdm8b (ENSOMYG00000077804)	fgf5 (ENSOMYG00000032809)	anxa3a (ENSOMYG00000069546) #21	fras1 (ENSOMYG00000053395)	cnot6l (ENSOMYG00000032771)	ENSOMYG00000032760	ENSOMYG00000060004
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	72	ENSGT00940000158223.j	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000181199	ENSGT00940000155816.b.g.b	ENSGT00980000198897.a.a	ENSGT00940000164201.c.b.a.a	ENSGT00940000159394.g	ENSGT00510000047171.z.c	ENSGT00390000014879.c.b.d.a.a	ENSGT00940000166353	ENSGT00730000113053.b	ENSGT00940000156901.B.b	ENSGT00940000159928.g.a	ENSGT00940000159928.g.b	ENSGT00940000159371.n	ENSGT00940000157548.q.b #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c.c.b	ENSGT00890000139463.b.b.b.f.a	ENSGT00940000158449.e.a	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000163761.j	ENSGT00940000157298.m	ENSGT01000000214878.f	ENSGT01060000248978.c.d	ENSGT00940000160018.m	ENSGT00940000153654.`f.a.b.b	ENSGT00990000207738.a	ENSGT00730000112019.b	ENSGT00900000141033.a.cb.a	ENSGT00940000159834.p
Coho salmon	MODERN SPECIES	28	ENSOKIG00005032430	ENSOKIG00005032438	lipg (ENSOKIG00005032446)	KCMF1 (ENSOKIG00005032478)	slc20a2 (ENSOKIG00005032509)	ENSOKIG00005032596	ENSOKIG00005032615	ENSOKIG00005032627	ENSOKIG00005032669	mthfd2l (ENSOKIG00005032689)	ENSOKIG00005032883	ENSOKIG00005032920	ENSOKIG00005032946	ENSOKIG00005032960	GPX8 (ENSOKIG00005032971)	bmp2k (ENSOKIG00005033001) #22	paqr3a (ENSOKIG00005033335) #23	FAU (ENSOKIG00005033354)	ENSOKIG00005033399	ENSOKIG00005033449	ENSOKIG00005033486	antxr2a (ENSOKIG00005033535)	prdm8b (ENSOKIG00005033615)	fgf5 (ENSOKIG00005033626)	anxa3a (ENSOKIG00005033664) #21	fras1 (ENSOKIG00005033916)	ENSOKIG00005035645	cnot6l (ENSOKIG00005035662)	ENSOKIG00005035740	ENSOKIG00005035815	sdf2l1 (ENSOKIG00005035919)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	3	ENSOTSG00005010600	naaladl1 (ENSOTSG00005010232)	ENSOTSG00005010228	FNDC5 (ENSOTSG00005010226)	ENSOTSG00005010225	ENSOTSG00005010223	ENSOTSG00005010216	ENSOTSG00005010213	ENSOTSG00005010210	ENSOTSG00005010208	ENSOTSG00005010204	cnot6l (ENSOTSG00005010036)	ENSOTSG00005010030	ENSOTSG00005010027	gpx8 (ENSOTSG00005010024)	bmp2k (ENSOTSG00005010019) #22	paqr3a (ENSOTSG00005010014) #23	ENSOTSG00005010012	ENSOTSG00005010011	ENSOTSG00005010008	slc20a2 (ENSOTSG00005010007)	KCMF1 (ENSOTSG00005010005)	ENSOTSG00005010003	lipg (ENSOTSG00005010002)	ENSOTSG00005010000	ENSOTSG00005009732	ENSOTSG00005009730	ENSOTSG00005009729	fsta (ENSOTSG00005009669)	ENSOTSG00005009668	ENSOTSG00005009667
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00390000015667	ENSGT00980000198897.a.a	ENSGT00940000155816.b.g.b	ENSGT00940000164201.c.b.a.a	ENSGT01100000263516.a.b.a.k.a.b	ENSGT00940000159394.g	ENSGT00510000047171.z.c	ENSGT00390000014879.c.b.d.b	ENSGT00390000000113.A.a.a	ENSGT00940000166353	ENSGT00730000113053.b	ENSGT00940000156901.B.b	ENSGT00940000159928.g.a	ENSGT00940000177226	ENSGT00940000159371.n	ENSGT00940000157548.q.b #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c.c.b	ENSGT00890000139463.b.b.b.f.a	ENSGT00940000158449.e.a	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000163761.j	ENSGT00940000162168.r	ENSGT00940000157298.m	ENSGT00530000064292	ENSGT01000000214878.f	ENSGT01060000248978.c	ENSGT01060000248978.d	ENSGT00990000214281	ENSGT00940000160018.m	ENSGT00990000207738.a
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	6	ENSSSAG00000117576	ENSSSAG00000074299	lipe (ENSSSAG00000074291)	ENSSSAG00000074288	ENSSSAG00000074282	ENSSSAG00000074274	ENSSSAG00000074211	epgn (ENSSSAG00000074217)	areg (ENSSSAG00000074219)	ENSSSAG00000074222	ENSSSAG00000074239	graa (ENSSSAG00000074271)	ENSSSAG00000074240	ENSSSAG00000121811	ENSSSAG00000118638	bmp2k (ENSSSAG00000074250) #22	paqr3a (ENSSSAG00000074263) #23	ENSSSAG00000114903	antxr2a (ENSSSAG00000053308)	prdm8b (ENSSSAG00000073783)	fgf5 (ENSSSAG00000109915)	anxa3a (ENSSSAG00000073808) #21	ENSSSAG00000090231	fras1 (ENSSSAG00000074181)	cxl13 (ENSSSAG00000073760)	cnot6l (ENSSSAG00000105794)	ENSSSAG00000073423	scyb7 (ENSSSAG00000106328)	ENSSSAG00000073402	ENSSSAG00000084028	ENSSSAG00000092486
River trout	MODERN SPECIES	39	ENSSTUG00000009432	tmem175 (ENSSTUG00000009388)	ENSSTUG00000009383	rasgef1ba (ENSSTUG00000009331)	ENSSTUG00000009310	ENSSTUG00000009243	lipg (ENSSTUG00000009210)	KCMF1 (ENSSTUG00000009202)	slc20a2 (ENSSTUG00000009081)	ENSSTUG00000009044	mthfd2l (ENSSTUG00000008999)	ENSSTUG00000008978	ENSSTUG00000008960	ENSSTUG00000008946	gpx8 (ENSSTUG00000008943)	bmp2k (ENSSTUG00000008925) #22	paqr3a (ENSSTUG00000008911) #23	antxr2a (ENSSTUG00000008854)	anxa3a (ENSSTUG00000008520) #21	ENSSTUG00000008503	fras1 (ENSSTUG00000008121)	ENSSTUG00000008093	mrpl1 (ENSSTUG00000008058)	cnot6l (ENSSTUG00000008011)	CXCL13 (ENSSTUG00000008000)	ENSSTUG00000007990	ENSSTUG00000007948	ENSSTUG00000007932	ENSSTUG00000007917	sdf2l1 (ENSSTUG00000007900)	ube2l3a (ENSSTUG00000007879)
Huchen	MODERN SPECIES	5353														gpx8 (ENSHHUG00000030709)	gpx8 (ENSHHUG00000030755)	ENSHHUG00000030795 #22
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000157548.r #22
Huchen	MODERN SPECIES	4056											ENSHHUG00000006331	ENSHHUG00000006327	ENSHHUG00000006320	ENSHHUG00000006319	mecp2 (ENSHHUG00000006317)	ENSHHUG00000006315 #22
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000157548.r #22
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00390000007848.b.d	ENSGT00390000015354.d.a.b.d	ENSGT00940000154717.pc.a.c	ENSGT00390000012719.b.a.d	ENSGT00940000164235.b.d	ENSGT00940000154601.h.a.d	ENSGT00940000155794.g.f	ENSGT00940000158555.a.b.b	ENSGT00900000143589	ENSGT01030000234574.B.c.b.b.n	ENSGT00940000157079.b.z.b	ENSGT00940000165511.b.d	ENSGT00940000164214.k.b.c	ENSGT00940000158663.d	ENSGT00940000156575.p	ENSGT00940000157548.r #22	ENSGT00940000156522.c.b.d	ENSGT01070000253744.b.a.a.b.b	ENSGT00940000157176.b.c	ENSGT00940000167013.j	ENSGT00970000197492	ENSGT00940000153664.A.b.a	ENSGT00390000017848.b	ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.a.b	ENSGT00940000164468.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000160554.a.d	ENSGT00940000164725.a.b.a.d	ENSGT00940000159553.a.d	ENSGT00940000155898.u.b	ENSGT00390000009004.c.f	ENSGT01060000248588.a.c.a.b.f
Oncorhynchus_a	DUPLICATION
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00390000007848.b.d	ENSGT00390000015354.d.a.b.d	ENSGT00940000154717.pc.a.c	ENSGT00390000012719.b.a.d	ENSGT00940000164235.b.d	ENSGT00940000154601.h.a.d	ENSGT00940000155794.g.f	ENSGT00940000158555.a.b.b	ENSGT00900000143589	ENSGT01030000234574.B.c.b.b.n	ENSGT00940000157079.b.z.b	ENSGT00940000165511.b.d	ENSGT00940000164214.k.b.c	ENSGT00940000158663.d	ENSGT00940000156575.p	ENSGT00940000157548.r.a #22	ENSGT00940000156522.c.b.d	ENSGT01070000253744.b.a.a.b.b	ENSGT00940000157176.b.c	ENSGT00940000167013.j	ENSGT00940000153664.A.b.a	ENSGT00390000017848.b	ENSGT00950000183116.b.a.a.b.a.a.b	ENSGT00940000164468.a.a.a.b.a.a	ENSGT00940000160554.a.d	ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a.a.b	ENSGT01090000260159	ENSGT00940000164173.b.b.b.a.e.b.a.a.a	ENSGT00940000164173.b.a.c.a	ENSGT00940000164725.a.b.a.d	ENSGT00940000159553.a.d
Chinook salmon	MODERN SPECIES	33	tmem120b (ENSOTSG00005040483)	orai1b (ENSOTSG00005040653)	KDM2B (ENSOTSG00005040686)	rnf34b (ENSOTSG00005040907)	lrrc75bb (ENSOTSG00005040909)	ENSOTSG00005040911	ENSOTSG00005040912	cabp1b (ENSOTSG00005040919)	ENSOTSG00005040920	gpat4 (ENSOTSG00005040922)	ENSOTSG00005040923	ENSOTSG00005040924	prlhr2b (ENSOTSG00005040925)	adrb3b (ENSOTSG00005040926)	anxa4 (ENSOTSG00005040938)	ENSOTSG00005041028 #22	ANTXR1 (ENSOTSG00005041033)	npffr1l1 (ENSOTSG00005041039)	bmp1b (ENSOTSG00005041073)	trim69 (ENSOTSG00005045440)	ENSOTSG00005045443	ENSOTSG00005045445	ENSOTSG00005045446	ENSOTSG00005045448	ENSOTSG00005045449	PCDHAC2 (ENSOTSG00005000946)	ENSOTSG00005000953	pcdh1a4 (ENSOTSG00005000960)	ENSOTSG00005001032	fgf18b (ENSOTSG00005001239)	ENSOTSG00005001252
Coho salmon	MODERN SPECIES	26	tmem120b (ENSOKIG00005002518)	KDM2B (ENSOKIG00005003275)	orai1b (ENSOKIG00005003703)	rnf34b (ENSOKIG00005003711)	lrrc75bb (ENSOKIG00005003719)	ENSOKIG00005003724	ENSOKIG00005003734	cabp1b (ENSOKIG00005003762)	gpat4 (ENSOKIG00005003781)	ENSOKIG00005003820	ENSOKIG00005003825	ENSOKIG00005003834	prlhr2b (ENSOKIG00005003848)	adrb3b (ENSOKIG00005003858)	anxa4 (ENSOKIG00005003876)	ENSOKIG00005003929 #22	ENSOKIG00005003964	ENSOKIG00005003982	ENSOKIG00005003984	bmp1b (ENSOKIG00005004687)	trim69 (ENSOKIG00005012340)	ENSOKIG00005012352	ENSOKIG00005012360	ENSOKIG00005012370	ENSOKIG00005012383	PCDHAC2 (ENSOKIG00005012405)	ENSOKIG00005012426	ENSOKIG00005012430	ENSOKIG00005012437	fgf18b (ENSOKIG00005012440)	ENSOKIG00005012479
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000157548.r.b #22
Chinook salmon	MODERN SPECIES	12	rhof (ENSOTSG00005036535)	tmem120b (ENSOTSG00005035503)	morn3 (ENSOTSG00005035502)	orai1b (ENSOTSG00005035501)	KDM2B (ENSOTSG00005034912)	rnf34b (ENSOTSG00005034908)	lrrc75bb (ENSOTSG00005034907)	ENSOTSG00005034895	GGT5 (ENSOTSG00005034635)	ENSOTSG00005034634	ENSOTSG00005034631	ENSOTSG00005034630	brf2 (ENSOTSG00005028522)	prlhr2b (ENSOTSG00005028517)	anxa4 (ENSOTSG00005028495)	ENSOTSG00005028483 #22	ANTXR1 (ENSOTSG00005028477)	npffr1l1 (ENSOTSG00005028475)	bmp1b (ENSOTSG00005028444)	trim69 (ENSOTSG00005028441)	pcna (ENSOTSG00005028438)	kcnip3b (ENSOTSG00005028415)	ENSOTSG00005028414	ENSOTSG00005028413	prnpb (ENSOTSG00005028412)	PPTC7 (ENSOTSG00005028411)	TBC1D10A (ENSOTSG00005028408)	ENSOTSG00005028404	aplnrb (ENSOTSG00005028403)	ENSOTSG00005028400	ENSOTSG00005027853
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000156085	ENSGT01070000253744.b.b.e	ENSGT00390000000113.B	ENSGT00940000156290.a	ENSGT01050000244898.b.b.e.a	ENSGT00940000158529	ENSGT00940000165677	ENSGT00940000156035	ENSGT01080000257489	ENSGT01030000234997	ENSGT01000000214878	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00500000045469	ENSGT00940000154091.a.a.s.a	ENSGT00940000157724.b	ENSGT00940000161247
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	448															ENSGT00530000064873.b	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b
Denticle herring	MODERN SPECIES	2	cdc45 (ENSDCDG00000027298)	ufd1l (ENSDCDG00000027329)	ENSDCDG00000027378	ENSDCDG00000027379	ENSDCDG00000027380	ENSDCDG00000027381	ENSDCDG00000002990	srrd (ENSDCDG00000003026)	ENSDCDG00000003047	ENSDCDG00000003177	ENSDCDG00000003542	ENSDCDG00000003544	plekha2 (ENSDCDG00000003558)	ENSDCDG00000003618	prnprs3 (ENSDCDG00000003619)	bmp2k (ENSDCDG00000003621) #22	paqr3a (ENSDCDG00000003625) #23	antxr2a (ENSDCDG00000003631)	prdm8b (ENSDCDG00000003639)	fgf5 (ENSDCDG00000003640)	cfap299 (ENSDCDG00000003642)	bmp3 (ENSDCDG00000003643)	prkg2 (ENSDCDG00000003650)	rasgef1ba (ENSDCDG00000003667)	hip1rb (ENSDCDG00000003747)	si:ch211-51h9.6 (ENSDCDG00000003875)	mrpl40 (ENSDCDG00000003876)	acaa2 (ENSDCDG00000003889)	rpl6 (ENSDCDG00000004161)	ENSDCDG00000004163	dynll1 (ENSDCDG00000004165)
Atlantic herring	MODERN SPECIES	23	ENSCHAG00000026688	ENSCHAG00000026691	ENSCHAG00000026694	ENSCHAG00000026696	srrd (ENSCHAG00000026698)	ENSCHAG00000026701	ctsk (ENSCHAG00000026705)	ctsk (ENSCHAG00000026706)	ENSCHAG00000026707	ENSCHAG00000000184	ENSCHAG00000000189	ENSCHAG00000000201	ENSCHAG00000000207	prnprs3 (ENSCHAG00000000228)	prnprs3 (ENSCHAG00000000238)	bmp2k (ENSCHAG00000000264) #22	paqr3a (ENSCHAG00000000357) #23	antxr2a (ENSCHAG00000000414)	prdm8b (ENSCHAG00000000468)	fgf5 (ENSCHAG00000000579)	cfap299 (ENSCHAG00000000633)	bmp3 (ENSCHAG00000000661)	prkg2 (ENSCHAG00000000891)	rasgef1ba (ENSCHAG00000001283)	ENSCHAG00000001450	ENSCHAG00000001527	ENSCHAG00000001551	ENSCHAG00000001565	ascc2 (ENSCHAG00000001620)	RNF215 (ENSCHAG00000001960)	sec14l8 (ENSCHAG00000001998)
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	78	ENSGT00940000156085	ENSGT01070000253744.b.b.e	ENSGT00390000000113.B	ENSGT00940000156290.a	ENSGT01050000244898.b.b.e.a	ENSGT00940000165677	ENSGT00940000156035	ENSGT01080000257489	ENSGT01030000234997	ENSGT00940000161751	ENSGT01000000214878	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00500000045469.a	ENSGT00940000154091.a.a.s.a	ENSGT00940000157724.b	ENSGT00940000161247
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	115								ENSGT00940000164220.b.a.b	ENSGT00940000164220.b.a.a	ENSGT00940000161751.c.b	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000159174.f #21	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b.c	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00500000045469.a	ENSGT00940000154091.a.a.s.a	ENSGT00940000157724.b	ENSGT00940000161247
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160229.g	ENSGT00940000160933.c	ENSGT00940000165048.b.b	ENSGT01030000234579.A.a.f.b	ENSGT00890000139453.a.f	ENSGT01030000234582.f.b.e	ENSGT00390000018426.e.b	ENSGT00940000164220.b.a.b.a	ENSGT00940000164220.b.a.a	ENSGT00940000161751.c.b	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298.h	ENSGT00940000162168.n	ENSGT00940000163761.c	ENSGT00940000159174.f.e #21	ENSGT00940000157548.s #22	ENSGT00940000155291.a.b #23	ENSGT00940000156320.c.a	ENSGT00890000139463.b.b.b.p.a	ENSGT00940000158449.tb.b	ENSGT00390000016547.b	ENSGT00940000159775.f	ENSGT00940000159393.a	ENSGT00940000155816.b.c.b	ENSGT00390000015667.e	ENSGT00940000158223.l	ENSGT00940000155680.d.m.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.a.b	ENSGT00940000157724.b.c	ENSGT00940000161247.b	ENSGT00940000156244.a.a.b
Goldfish	MODERN SPECIES	44	ENSCARG00000030456	gnb2 (ENSCARG00000030464)	mink1 (ENSCARG00000030564)	PLD2 (ENSCARG00000031293)	gltpd2b (ENSCARG00000033856)	atp1b2b (ENSCARG00000033862)	ENSCARG00000033912	mogat3b (ENSCARG00000033918)	znhit1 (ENSCARG00000033933)	ENSCARG00000033952	ENSCARG00000033978	ENSCARG00000034013	ENSCARG00000034052	ENSCARG00000034064	fras1 (ENSCARG00000034598)	bmp2k (ENSCARG00000039068) #22	antxr2a (ENSCARG00000039214)	prdm8b (ENSCARG00000039369)	fgf5 (ENSCARG00000039379)	cfap299 (ENSCARG00000039406)	bmp3 (ENSCARG00000039448)	prkg2 (ENSCARG00000039463)	rasgef1ba (ENSCARG00000039644)	tmem175 (ENSCARG00000040186)	ENSCARG00000040248	WDFY3 (ENSCARG00000041621)	snx18a (ENSCARG00000042176)	hspb3 (ENSCARG00000042227)	arl15a (ENSCARG00000042233)	ndufs4 (ENSCARG00000042254)	fsta (ENSCARG00000042302)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160933.c	ENSGT00940000165048.b.b	ENSGT01030000234579.A.a.f.b	ENSGT00890000139453.a.f	ENSGT01030000234582.f.b.e	ENSGT00940000164220.a.b.c	ENSGT00940000165297.k.b	ENSGT00940000164220.b.a.b.a.a	ENSGT00940000164220.b.a.a	ENSGT00940000161751.c.b	ENSGT00530000064292	ENSGT00940000157298.h	ENSGT00940000162168.n	ENSGT00940000163761.c	ENSGT00940000159174.f.e #21	ENSGT00940000157548.s #22	ENSGT00940000155291.a.b #23	ENSGT00940000156320.c.a	ENSGT00890000139463.b.b.b.p.a	ENSGT00940000158449.tb.b	ENSGT00390000016547.b	ENSGT00940000159775.f	ENSGT00940000159393.a	ENSGT00940000155816.b.c.b	ENSGT00390000015667.e	ENSGT00940000158223.l	ENSGT00940000155680.d.m.b	ENSGT00940000154091.a.a.s.a.b	ENSGT00940000157724.b.c	ENSGT00940000161247.b	ENSGT00940000156244.a.a.b
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	1158							si:dkey-58f10.7 (ENSSGRG00000021144)	ENSSGRG00000021146	ENSSGRG00000021147	ENSSGRG00000021457	cnot6l (ENSSGRG00000021150)	mrpl1 (ENSSGRG00000021468)	fras1 (ENSSGRG00000021483)	anxa3a (ENSSGRG00000021509) #21	anxa3a (ENSSGRG00000021511) #21	bmp2k (ENSSGRG00000021559) #22	paqr3a (ENSSGRG00000021563) #23
Common carp reference	MODERN SPECIES	7	mogat3b (ENSCCRG00000021156)	ENSCCRG00000079816	ENSCCRG00000066723	ENSCCRG00000014676	ENSCCRG00000074350	ENSCCRG00000055846	ENSCCRG00000065764	ENSCCRG00000020280	ENSCCRG00000021151	ENSCCRG00000020294	cxcl11.8 (ENSCCRG00000020297)	CXCL13 (ENSCCRG00000066883)	cnot6l (ENSCCRG00000010419)	mrpl1 (ENSCCRG00000013649)	fras1 (ENSCCRG00000022446)	bmp2k (ENSCCRG00000069122) #22	paqr3a (ENSCCRG00000049564) #23	ENSCCRG00000056952	antxr2a (ENSCCRG00000021124)	prdm8b (ENSCCRG00000040285)	fgf5 (ENSCCRG00000018389)	cfap299 (ENSCCRG00000078923)	bmp3 (ENSCCRG00000061905)	prkg2 (ENSCCRG00000001098)	rasgef1ba (ENSCCRG00000000937)	tmem175 (ENSCCRG00000000911)	ENSCCRG00000056651	ENSCCRG00000000518	si:dkey-193c22.1 (ENSCCRG00000057409)	snx18a (ENSCCRG00000082281)	arl15a (ENSCCRG00000064325)
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	53	ENSGT01100000263556.a.a.q.d.j.b	ENSGT01000000214413.b.b.h	ENSGT00950000183196.A.f	ENSGT00940000160229.h	ENSGT00940000160933.d	ENSGT00940000165048.b.a	ENSGT01030000234579.A.a.f.a	ENSGT00890000139453.a.e	ENSGT01030000234582.f.b.f	ENSGT00390000018426.e.a	ENSGT01000000214878.b	ENSGT00940000157298.g	ENSGT00940000162168.m	ENSGT00940000163761.d	ENSGT00940000159174.f.f #21	ENSGT00940000157548.t #22	ENSGT00940000155291.a.a #23	ENSGT00940000156320.c.b	ENSGT00890000139463.b.b.b.p.b	ENSGT00940000158449.tb.a	ENSGT00390000016547.a	ENSGT00940000159775.e	ENSGT00940000159393.b	ENSGT00940000155816.b.c.a	ENSGT00390000015667.f	ENSGT00940000158223.k	ENSGT00940000155680.d.m.a	ENSGT00940000154091.a.a.s.a.a	ENSGT00940000157724.b.d	ENSGT00940000161247.a	ENSGT00940000156244.a.a.a
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	233	ENSGT00940000159400.l	ENSGT01100000263556.a.a.q.d.j.b	ENSGT01000000214413.b.b.h	ENSGT00950000183196.A.f	ENSGT00940000160229.h	ENSGT00940000160933.d	ENSGT00940000165048.b.a	ENSGT01030000234579.A.a.f.a	ENSGT00890000139453.a.e	ENSGT01030000234582.f.b.f	ENSGT00390000018426.f	ENSGT00940000157298.g	ENSGT00940000162168.m	ENSGT00940000163761.d	ENSGT00940000159174.f.f #21	ENSGT00940000157548.t #22	ENSGT00940000155291.a.a #23	ENSGT00940000156320.c.b	ENSGT00890000139463.b.b.b.p.b	ENSGT00940000158449.tb.a	ENSGT00390000016547.a	ENSGT00940000159775.e	ENSGT00940000159393.b	ENSGT00940000155816.b.c.a	ENSGT00390000015667.f	ENSGT00940000158223.k	ENSGT00940000155680.d.m.a	ENSGT00940000155680.d.n	ENSGT00940000154091.a.a.s.a.a	ENSGT00940000157724.b.d	ENSGT00940000161247.a
Common carp reference	MODERN SPECIES	15	chrne (ENSCCRG00000028920)	gltpd2b (ENSCCRG00000029201)	atp1b2b (ENSCCRG00000046528)	ENSCCRG00000042803	mogat3b (ENSCCRG00000024727)	ENSCCRG00000060378	znhit1 (ENSCCRG00000066156)	ENSCCRG00000066043	ENSCCRG00000053878	ENSCCRG00000019016	cnot6l (ENSCCRG00000055928)	mrpl1 (ENSCCRG00000010885)	fras1 (ENSCCRG00000074242)	anxa3a (ENSCCRG00000056845) #21	anxa3a (ENSCCRG00000022066) #21	bmp2k (ENSCCRG00000049579) #22	paqr3a (ENSCCRG00000062167) #23	antxr2a (ENSCCRG00000066719)	prdm8b (ENSCCRG00000066172)	fgf5 (ENSCCRG00000066434)	cfap299 (ENSCCRG00000001036)	bmp3 (ENSCCRG00000075904)	prkg2 (ENSCCRG00000001018)	rasgef1ba (ENSCCRG00000064135)	tmem175 (ENSCCRG00000077547)	ENSCCRG00000000880	ENSCCRG00000000683	ENSCCRG00000063491	ENSCCRG00000053695	ENSCCRG00000036136	snx18a (ENSCCRG00000060082)
Goldfish	MODERN SPECIES	23	gnb2 (ENSCARG00000059334)	mink1 (ENSCARG00000059763)	PLD2 (ENSCARG00000066271)	chrne (ENSCARG00000066652)	gltpd2b (ENSCARG00000066676)	atp1b2b (ENSCARG00000066682)	ENSCARG00000066717	mogat3b (ENSCARG00000066723)	znhit1 (ENSCARG00000066744)	ENSCARG00000066759	ENSCARG00000066773	cnot6l (ENSCARG00000066787)	mrpl1 (ENSCARG00000066891)	fras1 (ENSCARG00000067096)	anxa3a (ENSCARG00000068280) #21	bmp2k (ENSCARG00000068489) #22	paqr3a (ENSCARG00000068548) #23	antxr2a (ENSCARG00000068565)	prdm8b (ENSCARG00000068590)	fgf5 (ENSCARG00000068598)	cfap299 (ENSCARG00000068606)	bmp3 (ENSCARG00000068613)	prkg2 (ENSCARG00000068640)	rasgef1ba (ENSCARG00000068759)	tmem175 (ENSCARG00000069156)	ENSCARG00000069195	WDFY3 (ENSCARG00000069213)	ENSCARG00000069241	snx18a (ENSCARG00000069246)	hspb3 (ENSCARG00000069252)	arl15a (ENSCARG00000069255)
Zebrafish	MODERN SPECIES	20	ENSDARG00000095532	ENSDARG00000092680	si:dkey-58f10.11 (ENSDARG00000094935)	si:dkey-58f10.10 (ENSDARG00000094284)	ENSDARG00000103480	ENSDARG00000093350	si:dkey-58f10.7 (ENSDARG00000091972)	ENSDARG00000110321	ENSDARG00000094489	cxcl11.8 (ENSDARG00000095747)	ENSDARG00000094820	cnot6l (ENSDARG00000054597)	mrpl1 (ENSDARG00000054606)	fras1 (ENSDARG00000054619)	anxa3a (ENSDARG00000009196) #21	bmp2k (ENSDARG00000020009) #22	paqr3a (ENSDARG00000017703) #23	antxr2a (ENSDARG00000104118)	prdm8b (ENSDARG00000054683)	fgf5 (ENSDARG00000035377)	cfap299 (ENSDARG00000088753)	bmp3 (ENSDARG00000060526)	prkg2 (ENSDARG00000054741)	rasgef1ba (ENSDARG00000033614)	ENSDARG00000095562	ENSDARG00000092697	tmem175 (ENSDARG00000076376)	CDS1 (ENSDARG00000019549)	WDFY3 (ENSDARG00000078890)	si:dkey-193c22.1 (ENSDARG00000093687)	ENSDARG00000076735
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT00940000154821.b	ENSGT00940000156085	ENSGT01070000253744.b.b.e	ENSGT00390000000113.B	ENSGT00940000156290.a	ENSGT01050000244898.b.b.e.a	ENSGT00940000165677	ENSGT00940000156035	ENSGT01080000257489	ENSGT01030000234997	ENSGT00940000161751	ENSGT01000000214878	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00500000045469.a	ENSGT00940000154091.a.a.s.a	ENSGT00940000157724.b	ENSGT00940000161247
Channel catfish	MODERN SPECIES	14	npffr2 (ENSIPUG00000010900)	gc (ENSIPUG00000010871)	SLC4A4 (ENSIPUG00000010635)	mob1ba (ENSIPUG00000010553)	grsf1 (ENSIPUG00000010533)	rufy3 (ENSIPUG00000010389)	CXCL11.3 (ENSIPUG00000010185)	ENSIPUG00000010048	CXCL11.2 (ENSIPUG00000009994)	CXCL20.2 (ENSIPUG00000009952)	cxcl11.1 (ENSIPUG00000009941)	cxcl13 (ENSIPUG00000009919)	cnot6l (ENSIPUG00000009879)	mrpl1 (ENSIPUG00000009866)	fras1 (ENSIPUG00000009502)	bmp2k (ENSIPUG00000009414) #22	paqr3 (ENSIPUG00000009375) #23	antxr2 (ENSIPUG00000009308)	prdm8 (ENSIPUG00000009279)	fgf5 (ENSIPUG00000009260)	cfap299 (ENSIPUG00000009180)	bmp3 (ENSIPUG00000009159)	prkg2 (ENSIPUG00000009083)	rasgef1ba (ENSIPUG00000009034)	tmem175 (ENSIPUG00000009006)	CDS1 (ENSIPUG00000008975)	ENSIPUG00000008959	WDFY3 (ENSIPUG00000008826)	ENSIPUG00000008798	Snx18 (ENSIPUG00000008781)	hspb3 (ENSIPUG00000008774)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000154821.b	ENSGT00940000156085	ENSGT01070000253744.b.b.e	ENSGT00390000000113.B	ENSGT00940000156290.a	ENSGT01050000244898.b.b.e.a	ENSGT00940000165677	ENSGT00940000156035	ENSGT01080000257489	ENSGT01030000234997	ENSGT00940000161751.a	ENSGT01000000214878	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00500000045469.a	ENSGT00940000154091.a.a.s.a	ENSGT00940000157724.b	ENSGT00940000161247
Electric eel	MODERN SPECIES	20	NPFFR2 (ENSEEEG00000002938)	gc (ENSEEEG00000002926)	slc4a4a (ENSEEEG00000001876)	mob1ba (ENSEEEG00000001798)	grsf1 (ENSEEEG00000001796)	rufy3 (ENSEEEG00000001085)	ENSEEEG00000001024	cxcl11.1 (ENSEEEG00000001022)	cxcl11.1 (ENSEEEG00000001020)	cxcl11.6 (ENSEEEG00000001017)	ENSEEEG00000001015	ENSEEEG00000001008	cnot6l (ENSEEEG00000000964)	mrpl1 (ENSEEEG00000000955)	fras1 (ENSEEEG00000000880)	bmp2k (ENSEEEG00000000791) #22	paqr3a (ENSEEEG00000000784) #23	antxr2a (ENSEEEG00000000764)	prdm8b (ENSEEEG00000000753)	fgf5 (ENSEEEG00000000748)	cfap299 (ENSEEEG00000000743)	bmp3 (ENSEEEG00000000722)	prkg2 (ENSEEEG00000000713)	rasgef1ba (ENSEEEG00000000535)	tmem175 (ENSEEEG00000000465)	CDS1 (ENSEEEG00000000401)	WDFY3 (ENSEEEG00000000283)	ENSEEEG00000000201	snx18a (ENSEEEG00000000186)	hspb3 (ENSEEEG00000000180)	arl15a (ENSEEEG00000000173)
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00940000156085	ENSGT01070000253744.b.b.e	ENSGT00390000000113.B	ENSGT00940000156290.a	ENSGT01050000244898.b.b.e.a	ENSGT00940000165677	ENSGT00940000156035	ENSGT01080000257489	ENSGT00940000161751.b	ENSGT01030000234997.c	ENSGT00940000161751.a	ENSGT01000000214878	ENSGT00940000157298	ENSGT00940000162168	ENSGT00940000163761	ENSGT00940000157548 #22	ENSGT00940000155291.a #23	ENSGT00940000156320.c	ENSGT00890000139463.b.b.b	ENSGT00940000158449	ENSGT00390000016547	ENSGT00940000159775	ENSGT00940000159393	ENSGT00940000155816.b	ENSGT00390000015667	ENSGT00940000158223	ENSGT00940000155680.d	ENSGT00500000045469.a	ENSGT00940000154091.a.a.s.a	ENSGT00940000157724.b	ENSGT00940000161247
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	107	rars1 (ENSPNAG00000018183)	ublcp1 (ENSPNAG00000018236)	ENSPNAG00000003516	ubtd2 (ENSPNAG00000018276)	adrb2b (ENSPNAG00000018285)	ABLIM3 (ENSPNAG00000018341)	cct6a (ENSPNAG00000018405)	NIPSNAP2 (ENSPNAG00000018459)	cxcl11.1 (ENSPNAG00000006645)	ENSPNAG00000018507	ENSPNAG00000006131	ENSPNAG00000018545	cnot6l (ENSPNAG00000003537)	mrpl1 (ENSPNAG00000018662)	fras1 (ENSPNAG00000019185)	bmp2k (ENSPNAG00000019284) #22	paqr3a (ENSPNAG00000019318) #23	antxr2a (ENSPNAG00000019395)	prdm8b (ENSPNAG00000019414)	fgf5 (ENSPNAG00000019426)	cfap299 (ENSPNAG00000019451)	bmp3 (ENSPNAG00000019467)	prkg2 (ENSPNAG00000019547)	rasgef1ba (ENSPNAG00000019607)	tmem175 (ENSPNAG00000019642)	CDS1 (ENSPNAG00000019719)	WDFY3 (ENSPNAG00000019894)	si:dkey-193c22.1 (ENSPNAG00000019920)	ENSPNAG00000019957	snx18a (ENSPNAG00000019975)	hspb3 (ENSPNAG00000019992)
Mexicana tetra	DUPLICATION
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	28	mob1ba (ENSAMXG00000013309)	grsf1 (ENSAMXG00000012270)	rufy3 (ENSAMXG00000012255)	ENSAMXG00000039760	ENSAMXG00000036399	cxcl11.1 (ENSAMXG00000038718)	ENSAMXG00000040166	ENSAMXG00000040357	cxcl11.1 (ENSAMXG00000042180)	cxcl11.1 (ENSAMXG00000008942)	ENSAMXG00000036528	ENSAMXG00000037467	cnot6l (ENSAMXG00000008943)	mrpl1 (ENSAMXG00000033077)	fras1 (ENSAMXG00000020167)	bmp2k (ENSAMXG00000030267) #22	paqr3a (ENSAMXG00000020133) #23	ENSAMXG00000039912	antxr2a (ENSAMXG00000020087)	prdm8b (ENSAMXG00000020060)	fgf5 (ENSAMXG00000041105)	ENSAMXG00000031754	cfap299 (ENSAMXG00000020037)	bmp3 (ENSAMXG00000033554)	prkg2 (ENSAMXG00000019972)	rasgef1ba (ENSAMXG00000019929)	tmem175 (ENSAMXG00000031606)	CDS1 (ENSAMXG00000041656)	WDFY3 (ENSAMXG00000019775)	si:dkey-193c22.1 (ENSAMXG00000019724)	ENSAMXG00000019699
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	21	SEMA6A (ENSAMXG00000012798)	sema6a (ENSAMXG00000040240)	COMMD10 (ENSAMXG00000033277)	AP3S1 (ENSAMXG00000012830)	cdo1 (ENSAMXG00000012844)	tmed7 (ENSAMXG00000038759)	ENSAMXG00000038515	fem1c (ENSAMXG00000012868)	CCDC112 (ENSAMXG00000012879)	pggt1b (ENSAMXG00000012896)	trim36 (ENSAMXG00000033345)	ENSAMXG00000012907	PHYHIP (ENSAMXG00000033441)	ENSAMXG00000003100	ENSAMXG00000029758	ENSAMXG00000003110 #22	nfu1 (ENSAMXG00000036614)	gfpt1 (ENSAMXG00000003160)	ANTXR1 (ENSAMXG00000003169)	ENSAMXG00000044044	ENSAMXG00000036177	ENSAMXG00000035468	kansl3 (ENSAMXG00000003175)	bmp1a (ENSAMXG00000003185)	DISP3 (ENSAMXG00000003222)	ENSAMXG00000007299	rab7b (ENSAMXG00000031957)	zgc:56596 (ENSAMXG00000040562)	ENSAMXG00000007283	ENSAMXG00000030283	ENSAMXG00000007279
Elephant shark	MODERN SPECIES	1535	FAM241A (ENSCMIG00000007507)	pitx2 (ENSCMIG00000007502)	enpep (ENSCMIG00000007462)	elovl6 (ENSCMIG00000007452)	egf (ENSCMIG00000007447)	lrit3b (ENSCMIG00000007444)	rrh (ENSCMIG00000007434)	gar1 (ENSCMIG00000007425)	ENSCMIG00000007417	cnot6l (ENSCMIG00000007404)	mrpl1 (ENSCMIG00000007401)	ENSCMIG00000007384	ENSCMIG00000007374	fras1 (ENSCMIG00000007343)	ANXA3 (ENSCMIG00000007326) #21	bmp2k (ENSCMIG00000007305) #22	paqr3b (ENSCMIG00000007299) #23	ENSCMIG00000007296	ENSCMIG00000007289	prdm8b (ENSCMIG00000007284)	fgf5 (ENSCMIG00000007279)	ENSCMIG00000007277	cfap299 (ENSCMIG00000007273)	bmp3 (ENSCMIG00000007269)	prkg2 (ENSCMIG00000007237)	rasgef1ba (ENSCMIG00000007211)	tmem175 (ENSCMIG00000007174)	CDS1 (ENSCMIG00000007022)	WDFY3 (ENSCMIG00000006939)	ARHGAP24 (ENSCMIG00000006879)	mapk10 (ENSCMIG00000006833)
Cyclostomata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000157548 #22
Lamprey	MODERN SPECIES	854												ENSPMAG00000006328	lztr1 (ENSPMAG00000006338)	gucd1 (ENSPMAG00000006388)	ENSPMAG00000006396	ENSPMAG00000006397 #22	hadh (ENSPMAG00000006400)
Hagfish	DUPLICATION
Hagfish	MODERN SPECIES	1340											slc25a16 (ENSEBUG00000014139)	ENSEBUG00000009078	ENSEBUG00000013228	ENSEBUG00000000813	paqr3a (ENSEBUG00000016892) #23	ENSEBUG00000015795 #22	ENSEBUG00000012772	ENSEBUG00000005659	ENSEBUG00000000342	ENSEBUG00000016369	unc119.1 (ENSEBUG00000016761)	drg1 (ENSEBUG00000008333)	ENSEBUG00000012499	ENSEBUG00000008836	ENSEBUG00000013537	VARS1 (ENSEBUG00000004637)	ENSEBUG00000010912	ENSEBUG00000010513	ENSEBUG00000015852
Hagfish	MODERN SPECIES	362												ENSEBUG00000004988	ENSEBUG00000002123	ENSEBUG00000012660	puraa (ENSEBUG00000003859)	ENSEBUG00000015541 #22	ENSEBUG00000012043	ENSEBUG00000007883	GDF10 (ENSEBUG00000009126)	ENSEBUG00000010375	ENSEBUG00000005182