Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 Spiny chromis MODERN SPECIES 816 tgfbr1b (ENSAPOG00000021903) lancl2 (ENSAPOG00000021872) ENSAPOG00000021840 ENSAPOG00000021823 #22 VOPP1 (ENSAPOG00000021803) Cichlidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 Midas cichlid MODERN SPECIES 603 ENSACIG00000012954 #22 ADGRB1 (ENSACIG00000012975) ENSACIG00000013012 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 Haplochromini_B DUPLICATION Haplochromini_B DUPLICATION Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h.c.a #22 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1108 CIT (ENSMZEG00005026898) MYL2 (ENSMZEG00005026901) ENSMZEG00005026902 ENSMZEG00005026904 rplp0 (ENSMZEG00005026905) golga7 (ENSMZEG00005026911) ENSMZEG00005026912 loxl2a (ENSMZEG00005026914) ENSMZEG00005026917 aggf1 (ENSMZEG00005026920) NSG1 (ENSMZEG00005026922) stx18 (ENSMZEG00005026924) msx1a (ENSMZEG00005026925) CYTL1 (ENSMZEG00005026927) EVC2 (ENSMZEG00005026928) ENSMZEG00005026934 #22 ENSMZEG00005026935 ENSMZEG00005026941 ENSMZEG00005026943 PLXNA1 (ENSMZEG00005026946) chchd6b (ENSMZEG00005026951) tpra1 (ENSMZEG00005026953) ENSMZEG00005026955 LPIN3 (ENSMZEG00005026956) ENSMZEG00005026958 ENSMZEG00005026959 ENSMZEG00005026960 DLGAP4 (ENSMZEG00005026962) quo (ENSMZEG00005026963) tgm2b (ENSMZEG00005026966) VSTM2L (ENSMZEG00005026968) Eastern happy MODERN SPECIES 4 ENSACLG00000000880 ENSACLG00000000874 ENSACLG00000000849 pdxkb (ENSACLG00000000813) ENSACLG00000000793 ENSACLG00000000625 ITSN1 (ENSACLG00000000144) cryzl1 (ENSACLG00000000127) setd4 (ENSACLG00000000121) cbr1 (ENSACLG00000000103) cbr1 (ENSACLG00000000042) cbr1 (ENSACLG00000000032) cbr1 (ENSACLG00000027796) ENSACLG00000027790 ENSACLG00000027780 ENSACLG00000027777 #22 ENSACLG00000027776 ENSACLG00000027774 ENSACLG00000027773 si:ch1073-126c3.2 (ENSACLG00000027771) ENSACLG00000027768 GFRA1 (ENSACLG00000027753) ENSACLG00000027711 PRKCE (ENSACLG00000027703) epas1b (ENSACLG00000027698) ENSACLG00000027697 ENSACLG00000027696 ENSACLG00000027695 ENSACLG00000027694 lhb (ENSACLG00000027434) KLHL10 (ENSACLG00000027412) Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h.c.b #22 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1099 atxn10 (ENSMZEG00005012204) ENSMZEG00005012232 ENSMZEG00005012279 ENSMZEG00005012907 ENSMZEG00005012927 KDM5A (ENSMZEG00005013002) SLC6A13 (ENSMZEG00005013090) USP15 (ENSMZEG00005015324) ENSMZEG00005015387 ENSMZEG00005015415 pim3 (ENSMZEG00005015428) creld2 (ENSMZEG00005015450) alg12 (ENSMZEG00005015460) zbed4 (ENSMZEG00005015468) BRD1 (ENSMZEG00005015483) ENSMZEG00005015499 #22 ENSMZEG00005015509 tafa5a (ENSMZEG00005015542) tbc1d22a (ENSMZEG00005015551) cerk (ENSMZEG00005015578) GRAMD4 (ENSMZEG00005015613) ENSMZEG00005015715 trmu (ENSMZEG00005015797) ENSMZEG00005015804 tprkb (ENSMZEG00005015816) alg10 (ENSMZEG00005015825) CPNE8 (ENSMZEG00005015833) ENSMZEG00005015858 ABCD2 (ENSMZEG00005015888) SLC2A13 (ENSMZEG00005015910) ENSMZEG00005015966 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h.d #22 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1092 vps26bl (ENSMZEG00005023702) jam3b (ENSMZEG00005023705) IGSF9B (ENSMZEG00005023711) ENSMZEG00005023716 fez1 (ENSMZEG00005023717) esama (ENSMZEG00005023721) esama (ENSMZEG00005023722) MSANTD2 (ENSMZEG00005023731) robo3 (ENSMZEG00005023734) ENSMZEG00005023739 tmem218 (ENSMZEG00005023743) pknox2 (ENSMZEG00005023746) PANX3 (ENSMZEG00005023749) ENSMZEG00005023751 opcml (ENSMZEG00005023755) ENSMZEG00005023757 #22 ENSMZEG00005023759 ENSMZEG00005023762 ENSMZEG00005023763 hspb1 (ENSMZEG00005023765) YWHAG (ENSMZEG00005023766) ENSMZEG00005023768 ENSMZEG00005023770 ENSMZEG00005023775 supt4h1 (ENSMZEG00005023783) ENSMZEG00005023785 RNF43 (ENSMZEG00005023788) hpda (ENSMZEG00005023791) MTMR4 (ENSMZEG00005023795) ca4a (ENSMZEG00005023800) GUSB (ENSMZEG00005023801) Eastern happy DUPLICATION Eastern happy MODERN SPECIES 5 p2rx8 (ENSACLG00000024226) ENSACLG00000024223 DHX40 (ENSACLG00000024213) akt2 (ENSACLG00000024211) ccnp (ENSACLG00000024209) ENSACLG00000024208 si:ch211-132b12.2 (ENSACLG00000024204) ENSACLG00000024200 ENSACLG00000024194 ENSACLG00000024012 ENSACLG00000023986 ENSACLG00000023984 ENSACLG00000023890 ENSACLG00000023858 kif2c (ENSACLG00000023755) ENSACLG00000023741 #22 ENSACLG00000023725 naalad2 (ENSACLG00000023683) ENSACLG00000023653 tyr (ENSACLG00000023639) ENSACLG00000023633 grm5b (ENSACLG00000023565) ctsc (ENSACLG00000023538) RAB38 (ENSACLG00000023535) fzd4 (ENSACLG00000023472) ENSACLG00000023462 ENSACLG00000023448 DYNC2H1 (ENSACLG00000023242) ENSACLG00000023072 ENSACLG00000023063 ENSACLG00000023056 Eastern happy MODERN SPECIES 16 tspan4b (ENSACLG00000002482) ENSACLG00000002505 nosip (ENSACLG00000002526) rcn3 (ENSACLG00000002546) abat (ENSACLG00000002554) pdxdc1 (ENSACLG00000002655) slc25a23b (ENSACLG00000002671) gps1 (ENSACLG00000002752) ENSACLG00000002801 ENSACLG00000002843 ENSACLG00000003070 ENSACLG00000003089 ENSACLG00000003164 ENSACLG00000003361 eve1 (ENSACLG00000003367) ENSACLG00000003399 #22 hoxb13a (ENSACLG00000003412) hoxb9a (ENSACLG00000003422) hoxb8a (ENSACLG00000003429) hoxb7a (ENSACLG00000003441) ENSACLG00000003444 HOXB5 (ENSACLG00000003462) hoxb4a (ENSACLG00000003470) hoxb3a (ENSACLG00000003477) hoxb2a (ENSACLG00000003504) hoxb1a (ENSACLG00000003508) ENSACLG00000003517 CBX1 (ENSACLG00000003536) nfe2l1a (ENSACLG00000003558) praf2 (ENSACLG00000003574) copz2 (ENSACLG00000003587) Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 Oryzias ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 16 ENSORLG00000025528 fezf1 (ENSORLG00000019987) AIG1 (ENSORLG00000018719) ENSORLG00000024692 adat2 (ENSORLG00000020141) pex3 (ENSORLG00000021852) atf3 (ENSORLG00000019980) ENSORLG00000026179 nsl1 (ENSORLG00000028145) ENSORLG00000023022 #22 flvcr1 (ENSORLG00000020505) ENSORLG00000020536 ENSORLG00000020535 RRM2 (ENSORLG00000030298) tmem242 (ENSORLG00000024573) ENSORLG00000022927 tmem251 (ENSORLG00000018200) ubr7 (ENSORLG00000018193) ENSORLG00000018186 PPP4R4 (ENSORLG00000018184) serpina10a (ENSORLG00000018182) xrcc3 (ENSORLG00000018178) ENSORLG00000018175 ENSORLG00000018171 btbd6b (ENSORLG00000018172) Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 Mummichog MODERN SPECIES 535 ENSFHEG00000007774 ENSFHEG00000007784 ##22 ENSFHEG00000007794 #22 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 Poecilia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 Guppy MODERN SPECIES 448 drap1 (ENSPREG00000021987) zgc:63470 (ENSPREG00000021977) rela (ENSPREG00000021967) PPP1CB (ENSPREG00000021947) SLC29A2 (ENSPREG00000021932) ENSPREG00000021925 ENSPREG00000021921 S100P (ENSPREG00000021912) kiaa0232 (ENSPREG00000021904) TBC1D14 (ENSPREG00000021882) ENSPREG00000021864 ENSPREG00000021859 ENSPREG00000021854 ENSPREG00000021842 ENSPREG00000021829 ENSPREG00000021823 #22 PAQR9 (ENSPREG00000021816) ACO1 (ENSPREG00000021791) AFAP1 (ENSPREG00000021768) ENSPREG00000021757 ABLIM2 (ENSPREG00000021724) zcchc4 (ENSPREG00000021704) ENSPREG00000021696 pde5ab (ENSPREG00000021683) mad2l1 (ENSPREG00000021671) ARSJ (ENSPREG00000021666) camk2d1 (ENSPREG00000021625) ENSPREG00000021607 ENSPREG00000021603 ENSPREG00000021590 ENSPREG00000021584 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 Fugu MODERN SPECIES 15 taf13 (ENSTRUG00000029448) ENSTRUG00000004255 dpm1 (ENSTRUG00000023748) adnpb (ENSTRUG00000024563) PARD6B (ENSTRUG00000029210) ENSTRUG00000032204 ARFGEF2 (ENSTRUG00000005014) bcl2l1 (ENSTRUG00000030575) ENSTRUG00000033463 ENSTRUG00000028128 ENSTRUG00000031810 ENSTRUG00000033304 tnnc2.2 (ENSTRUG00000004150) ENSTRUG00000026585 ENSTRUG00000022515 ENSTRUG00000031259 #22 ENSTRUG00000030546 ENSTRUG00000003111 ENSTRUG00000030204 ENSTRUG00000001372 ENSTRUG00000028687 ENSTRUG00000025189 ENSTRUG00000027500 ENSTRUG00000021765 ENSTRUG00000026256 ENSTRUG00000026008 ENSTRUG00000022139 ENSTRUG00000033209 ppdpfb (ENSTRUG00000030735) ENSTRUG00000027642 tpd52l2 (ENSTRUG00000026587) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 4439 ENSLBEG00000028737 #22 ENSLBEG00000028741 Ballan wrasse MODERN SPECIES 2734 ENSLBEG00000012926 ENSLBEG00000012909 ENSLBEG00000012891 #22 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 Gilthead seabream MODERN SPECIES 10 klhl40b (ENSSAUG00010015271) ZBTB47 (ENSSAUG00010015270) NKTR (ENSSAUG00010015262) SEC22C (ENSSAUG00010015252) vipr1b (ENSSAUG00010014777) ENSSAUG00010014755 ENSSAUG00010014749 NANOS2 (ENSSAUG00010014747) KPNA1 (ENSSAUG00010014617) fam162a (ENSSAUG00010014594) mix23 (ENSSAUG00010014592) ENSSAUG00010014590 ENSSAUG00010014586 ENSSAUG00010014585 ENSSAUG00010014583 ENSSAUG00010014582 #22 ENSSAUG00010014579 CSTA (ENSSAUG00010014574) cst14a.1 (ENSSAUG00010014569) ENSSAUG00010014565 drd3 (ENSSAUG00010014562) qtrt2 (ENSSAUG00010014560) ccdc191 (ENSSAUG00010014556) zdhhc23b (ENSSAUG00010014555) GRAMD1C (ENSSAUG00010014554) ATP6V1A (ENSSAUG00010014547) naa50 (ENSSAUG00010014538) USF3 (ENSSAUG00010014534) boc (ENSSAUG00010014528) spice1 (ENSSAUG00010014521) SHISA2 (ENSSAUG00010014518) Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 European seabass MODERN SPECIES 18 ENSDLAG00005032993 ENSDLAG00005010546 ENSDLAG00005019720 ENSDLAG00005019828 ENSDLAG00005019858 ENSDLAG00005028917 ENSDLAG00005030736 ENSDLAG00005033347 ENSDLAG00005020221 ENSDLAG00005020231 ENSDLAG00005005856 ENSDLAG00005026641 ENSDLAG00005031005 ENSDLAG00005020248 ENSDLAG00005030908 ENSDLAG00005029872 #22 fgf3 (ENSDLAG00005020264) ENSDLAG00005020271 fgf19 (ENSDLAG00005034144) ENSDLAG00005020284 ENSDLAG00005033490 ENSDLAG00005003097 ENSDLAG00005020443 ENSDLAG00005020302 ENSDLAG00005034986 ENSDLAG00005009183 ENSDLAG00005020465 ENSDLAG00005034006 ENSDLAG00005030971 ENSDLAG00005020478 ENSDLAG00005030331 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 10 APP (ENSBSLG00000001758) cyyr1 (ENSBSLG00000001324) ADAMTS1 (ENSBSLG00000001319) ADAMTS5 (ENSBSLG00000001313) ENSBSLG00000001255 ENSBSLG00000001214 ENSBSLG00000001194 ENSBSLG00000000989 ENSBSLG00000000799 FUNDC1 (ENSBSLG00000000632) cenpl (ENSBSLG00000000592) ENSBSLG00000000581 ENSBSLG00000000429 il1rapl1b (ENSBSLG00000000351) ENSBSLG00000000325 ENSBSLG00000000315 #22 ENSBSLG00000000295 ENSBSLG00000000259 MSL3 (ENSBSLG00000000198) ARHGAP6 (ENSBSLG00000000135) MID1 (ENSBSLG00000025089) SLITRK5 (ENSBSLG00000024997) slitrk6 (ENSBSLG00000024980) spry2 (ENSBSLG00000024912) ndfip2 (ENSBSLG00000024810) GABRB3 (ENSBSLG00000024665) ENSBSLG00000024345 GABRG3 (ENSBSLG00000024200) ENSBSLG00000024111 ENSBSLG00000023884 ENSBSLG00000023766 Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 Seriola ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183016.B.h #22 Greater amberjack MODERN SPECIES 174 ttc27 (ENSSDUG00000021996) ENSSDUG00000021989 BIRC6 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