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Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000004690.a.a.v #8	ENSGT00390000004450 #9	ENSGT00440000039055 #10	ENSGT00940000159874 #11	ENSGT00550000074820.h #12	ENSGT00940000159730 #13	ENSGT00390000004574 #14	ENSGT00940000158572 #15	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C #16	ENSGT00940000157982.b #17	ENSGT00940000156314 #18	ENSGT00940000160776 #19	ENSGT00390000012679 #20	ENSGT00940000155246 #21	ENSGT00550000074898 #22	ENSGT00940000153704.B #23	ENSGT00940000160397 #24	ENSGT00940000157439 #25	ENSGT00390000000603 #26	ENSGT00940000161315 #28	ENSGT00390000013474.b.a #27	ENSGT00940000161498 #29	ENSGT00940000159590 #30	ENSGT00390000011219 #31	ENSGT00940000154534.a #32	ENSGT00390000000713 #33	ENSGT00390000004405.b #34	ENSGT00950000182892.a.b.a.a #35	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b #36	ENSGT00940000160113 #37
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000154775.c.a #7	ENSGT00390000004690.a.a.v #8	ENSGT00390000004450 #9	ENSGT00440000039055 #10	ENSGT00940000159874 #11	ENSGT00550000074820.h #12	ENSGT00940000159730 #13	ENSGT00390000004574 #14	ENSGT00940000158572 #15	ENSGT00940000157961.C #16	ENSGT00940000157982.b #17	ENSGT00940000156314 #18	ENSGT00940000160776 #19	ENSGT00390000012679 #20	ENSGT00940000155246 #21	ENSGT00550000074898 #22	ENSGT00940000153704.B #23	ENSGT00940000160397 #24	ENSGT00940000157439 #25	ENSGT00390000000603 #26	ENSGT00940000161315 #28	ENSGT00390000013474.b.a #27	ENSGT00940000161498 #29	ENSGT00940000159590 #30	ENSGT00390000011219 #31	ENSGT00940000154534.a #32	ENSGT00390000000713 #33	ENSGT00390000004405.b #34	ENSGT00950000182892.a.b.a.a #35	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b #36	ENSGT00940000160113 #37
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	158	LASP1 (ENSCLAG00000015296) #7	RPL23 (ENSCLAG00000017095) #8	C17orf98 (ENSCLAG00000017144) #9	CWC25 (ENSCLAG00000017102) #10	PIP4K2B (ENSCLAG00000014591) #11	PSMB3 (ENSCLAG00000015553) #12	PCGF2 (ENSCLAG00000016096) #13	CISD3 (ENSCLAG00000014350) #14	MLLT6 (ENSCLAG00000013781) #15	SRCIN1 (ENSCLAG00000015589) #16	ARHGAP23 (ENSCLAG00000014290) #17	SOCS7 (ENSCLAG00000015232) #18	GPR179 (ENSCLAG00000014803) #19	MRPL45 (ENSCLAG00000015324) #20	NPEPPS (ENSCLAG00000016661) #21	KPNB1 (ENSCLAG00000017091) #22	ENSCLAG00000015338 #23	TBX21 (ENSCLAG00000015235) #24	OSBPL7 (ENSCLAG00000014839) #25	MRPL10 (ENSCLAG00000015400) #26	SCRN2 (ENSCLAG00000013965) #27	LRRC46 (ENSCLAG00000016713) #28	SP6 (ENSCLAG00000016276) #29	SP2 (ENSCLAG00000014115) #30	PNPO (ENSCLAG00000013871) #31	PRR15L (ENSCLAG00000017903) #32	CDK5RAP3 (ENSCLAG00000012292) #33	COPZ2 (ENSCLAG00000013544) #34	NFE2L1 (ENSCLAG00000014836) #35	CBX1 (ENSCLAG00000013587) #36	SNX11 (ENSCLAG00000015837) #37
Degu	MODERN SPECIES	97	ENSODEG00000020506	ENSODEG00000017558 #7	ENSODEG00000017564 ##8	C17orf98 (ENSODEG00000017432) #9	CWC25 (ENSODEG00000017487) #10	PIP4K2B (ENSODEG00000017411) #11	ENSODEG00000017437 #12	CISD3 (ENSODEG00000017593) #14	MLLT6 (ENSODEG00000017604) #15	SRCIN1 (ENSODEG00000017506) #16	ARHGAP23 (ENSODEG00000017612) #17	GPR179 (ENSODEG00000017327) #19	MRPL45 (ENSODEG00000017631) #20	SOCS7 (ENSODEG00000017559) #18	NPEPPS (ENSODEG00000017337) #21	KPNB1 (ENSODEG00000017287) #22	ENSODEG00000017455 #23	TBX21 (ENSODEG00000017610) #24	OSBPL7 (ENSODEG00000017364) #25	MRPL10 (ENSODEG00000017536) #26	LRRC46 (ENSODEG00000017367) #28	SCRN2 (ENSODEG00000017395) #27	SP6 (ENSODEG00000017625) #29	SP2 (ENSODEG00000017126) #30	PNPO (ENSODEG00000017424) #31	ENSODEG00000017229 #33	COPZ2 (ENSODEG00000017565) #34	ENSODEG00000020421	NFE2L1 (ENSODEG00000017348) #35	CBX1 (ENSODEG00000017272) #36	SNX11 (ENSODEG00000017458) #37
Guinea pig	MODERN SPECIES	53	RPL23 (ENSCPOG00000010002) #8	C17orf98 (ENSCPOG00000023335) #9	CWC25 (ENSCPOG00000015127) #10	PIP4K2B (ENSCPOG00000005470) #11	PSMB3 (ENSCPOG00000025974) #12	PCGF2 (ENSCPOG00000027284) #13	CISD3 (ENSCPOG00000036120) #14	MLLT6 (ENSCPOG00000006561) #15	EPOP (ENSCPOG00000026798)	SRCIN1 (ENSCPOG00000022478) #16	ARHGAP23 (ENSCPOG00000025821) #17	SOCS7 (ENSCPOG00000011473) #18	GPR179 (ENSCPOG00000027503) #19	MRPL45 (ENSCPOG00000001574) #20	NPEPPS (ENSCPOG00000006559) #21	KPNB1 (ENSCPOG00000006566) #22	TBKBP1 (ENSCPOG00000036345) #23	TBX21 (ENSCPOG00000026273) #24	OSBPL7 (ENSCPOG00000006914) #25	MRPL10 (ENSCPOG00000037104) #26	LRRC46 (ENSCPOG00000006925) #28	SCRN2 (ENSCPOG00000006929) #27	SP6 (ENSCPOG00000007638) #29	SP2 (ENSCPOG00000014943) #30	PNPO (ENSCPOG00000003187) #31	PRR15L (ENSCPOG00000035567) #32	CDK5RAP3 (ENSCPOG00000007275) #33	COPZ2 (ENSCPOG00000019500) #34	NFE2L1 (ENSCPOG00000030805) #35	CBX1 (ENSCPOG00000034435) #36	SNX11 (ENSCPOG00000020234) #37
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	12	CWC25 (ENSHGLG00000014785) #10	PIP4K2B (ENSHGLG00000050783) #11	ENSHGLG00000016190 #12	PCGF2 (ENSHGLG00000015321) #13	CISD3 (ENSHGLG00000009890) #14	MLLT6 (ENSHGLG00000012901) #15	EPOP (ENSHGLG00000047748)	ENSHGLG00000021180	SRCIN1 (ENSHGLG00000010912) #16	ARHGAP23 (ENSHGLG00000012944) #17	SOCS7 (ENSHGLG00000035093) #18	ENSHGLG00000041148 #19	ENSHGLG00000050482	ENSHGLG00000010863 #20	ENSHGLG00000012466 #21	KPNB1 (ENSHGLG00000014138) #22	TBKBP1 (ENSHGLG00000049817) #23	TBX21 (ENSHGLG00000012216) #24	OSBPL7 (ENSHGLG00000012525) #25	MRPL10 (ENSHGLG00000048399) #26	LRRC46 (ENSHGLG00000035931) #28	SCRN2 (ENSHGLG00000041375) #27	SP6 (ENSHGLG00000021113) #29	SP2 (ENSHGLG00000009902) #30	PNPO (ENSHGLG00000013159) #31	PRR15L (ENSHGLG00000014696) #32	CDK5RAP3 (ENSHGLG00000019464) #33	COPZ2 (ENSHGLG00000018543) #34	NFE2L1 (ENSHGLG00000012592) #35	CBX1 (ENSHGLG00000013574) #36	SNX11 (ENSHGLG00000016837) #37