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Guinea pig	MODERN SPECIES	72	C1QTNF4 (ENSCPOG00000023948) #7	NDUFS3 (ENSCPOG00000006141) #8	KBTBD4 (ENSCPOG00000019448) #9	PTPMT1 (ENSCPOG00000031147) #10	CELF1 (ENSCPOG00000036381) #11	RAPSN (ENSCPOG00000015456) #12	PSMC3 (ENSCPOG00000008176) #13	SLC39A13 (ENSCPOG00000008169) #14	SPI1 (ENSCPOG00000022138) #15	MYBPC3 (ENSCPOG00000013368) #16	MADD (ENSCPOG00000013364) #17	NR1H3 (ENSCPOG00000013362) #18	ACP2 (ENSCPOG00000013359) #19	DDB2 (ENSCPOG00000013358) #20	PACSIN3 (ENSCPOG00000013356) #21	ARFGAP2 (ENSCPOG00000013352) #22	CSTPP1 (ENSCPOG00000020334) #23	LRP4 (ENSCPOG00000007072) #24	CKAP5 (ENSCPOG00000007054) #25	F2 (ENSCPOG00000026682) #26	ARHGAP1 (ENSCPOG00000013046) #27	ATG13 (ENSCPOG00000013042) #28	HARBI1 (ENSCPOG00000037304) #29	AMBRA1 (ENSCPOG00000007341) #30	CHRM4 (ENSCPOG00000020788) #31	MDK (ENSCPOG00000007340) #32	DGKZ (ENSCPOG00000009636) #33	CREB3L1 (ENSCPOG00000010073) #34	PHF21A (ENSCPOG00000001299) #35	LARGE2 (ENSCPOG00000033339) #36	PEX16 (ENSCPOG00000027497) #37
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a #7	ENSGT00390000017480 #8	ENSGT00940000158775 #9	ENSGT00940000158970 #11	ENSGT00390000016785 #12	ENSGT01020000230346.E #13	ENSGT00940000157349 #14	ENSGT00940000159754 #15	ENSGT00940000157698.b #16	ENSGT00940000156718 #17	ENSGT00940000159068 #18	ENSGT00940000158446 #19	ENSGT00510000047881 #20	ENSGT00950000182973.b.a #21	ENSGT00940000155568 #22	ENSGT00390000012935 #23	ENSGT00940000158287 #24	ENSGT00390000014757 #25	ENSGT00940000154234.b #26	ENSGT00940000160630 #27	ENSGT00390000007055 #28	ENSGT00940000154348.c.b.a #29	ENSGT00390000016223 #30	ENSGT00940000160394.a #31	ENSGT00390000007640.b #32	ENSGT00940000156152 #33	ENSGT00860000136066	ENSGT00940000159848 #34	ENSGT00940000156124 #35	ENSGT00940000158758 #36
Degu	MODERN SPECIES	59	FNBP4 (ENSODEG00000016574)	AGBL2 (ENSODEG00000016111)	MTCH2 (ENSODEG00000015416)	NDUFS3 (ENSODEG00000015948) #8	KBTBD4 (ENSODEG00000015830) #9	CELF1 (ENSODEG00000015204) #11	RAPSN (ENSODEG00000015194) #12	ENSODEG00000016550 #13	SLC39A13 (ENSODEG00000015895) #14	SPI1 (ENSODEG00000015369) #15	MYBPC3 (ENSODEG00000016030) #16	MADD (ENSODEG00000017645) #17	NR1H3 (ENSODEG00000016180) #18	ACP2 (ENSODEG00000015528) #19	ENSODEG00000015965 #21	ENSODEG00000016456 #22	CSTPP1 (ENSODEG00000016656) #23	LRP4 (ENSODEG00000015720) #24	CKAP5 (ENSODEG00000016409) #25	F2 (ENSODEG00000016157) #26	ARHGAP1 (ENSODEG00000016156) #27	ATG13 (ENSODEG00000017294) #28	ENSODEG00000016339	AMBRA1 (ENSODEG00000016633) #30	CHRM4 (ENSODEG00000020352) #31	MDK (ENSODEG00000015931) #32	DGKZ (ENSODEG00000016309) #33	ENSODEG00000016420 #33	ENSODEG00000016039	CREB3L1 (ENSODEG00000016017) #34	ENSODEG00000016348
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	129	MTCH2 (ENSCLAG00000012026)	C1QTNF4 (ENSCLAG00000015186) #7	NDUFS3 (ENSCLAG00000014873) #8	KBTBD4 (ENSCLAG00000016255) #9	CELF1 (ENSCLAG00000011791) #11	RAPSN (ENSCLAG00000015497) #12	PSMC3 (ENSCLAG00000013916) #13	SLC39A13 (ENSCLAG00000014480) #14	SPI1 (ENSCLAG00000017201) #15	MYBPC3 (ENSCLAG00000015418) #16	MADD (ENSCLAG00000012503) #17	NR1H3 (ENSCLAG00000013563) #18	ACP2 (ENSCLAG00000014608) #19	DDB2 (ENSCLAG00000016473) #20	ENSCLAG00000012709 #21	ARFGAP2 (ENSCLAG00000016467) #22	CSTPP1 (ENSCLAG00000014110) #23	LRP4 (ENSCLAG00000016159) #24	CKAP5 (ENSCLAG00000015801) #25	F2 (ENSCLAG00000015618) #26	ARHGAP1 (ENSCLAG00000013542) #27	ATG13 (ENSCLAG00000015328) #28	HARBI1 (ENSCLAG00000013578) #29	AMBRA1 (ENSCLAG00000015156) #30	CHRM4 (ENSCLAG00000013251) #31	MDK (ENSCLAG00000014462) #32	DGKZ (ENSCLAG00000016057) #33	ENSCLAG00000014194	CREB3L1 (ENSCLAG00000013609) #34	PHF21A (ENSCLAG00000016632) #35	LARGE2 (ENSCLAG00000014846) #36