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Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158572 #7	ENSGT00940000157961.C #8	ENSGT00940000157982.b #9	ENSGT00940000156314 #10	ENSGT00940000160776 #11	ENSGT00390000012679 #12	ENSGT00940000155246 #13	ENSGT00550000074898 #14	ENSGT00940000153704.B #15	ENSGT00940000160397 #16	ENSGT00940000157439 #17	ENSGT00390000000603 #18	ENSGT00940000161315 #20	ENSGT00390000013474.b.a #19	ENSGT00940000161498 #21	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219 #23	ENSGT00940000154534.a #24	ENSGT00390000000713 #25	ENSGT00390000004405.b #26	ENSGT00950000182892.a.b.a.a #27	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b #28	ENSGT00940000160113 #29	ENSGT00390000017856.b #30	ENSGT00940000159503 #31	ENSGT00940000155029.c.b #32	ENSGT00940000159774 #33	ENSGT00940000162072 #34	ENSGT00940000158354 #35	ENSGT00940000161108 #36	ENSGT00940000161230 #37
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	158	MLLT6 (ENSCLAG00000013781) #7	SRCIN1 (ENSCLAG00000015589) #8	ARHGAP23 (ENSCLAG00000014290) #9	SOCS7 (ENSCLAG00000015232) #10	GPR179 (ENSCLAG00000014803) #11	MRPL45 (ENSCLAG00000015324) #12	NPEPPS (ENSCLAG00000016661) #13	KPNB1 (ENSCLAG00000017091) #14	ENSCLAG00000015338 #15	TBX21 (ENSCLAG00000015235) #16	OSBPL7 (ENSCLAG00000014839) #17	MRPL10 (ENSCLAG00000015400) #18	SCRN2 (ENSCLAG00000013965) #19	LRRC46 (ENSCLAG00000016713) #20	SP6 (ENSCLAG00000016276) #21	SP2 (ENSCLAG00000014115) #22	PNPO (ENSCLAG00000013871) #23	PRR15L (ENSCLAG00000017903) #24	CDK5RAP3 (ENSCLAG00000012292) #25	COPZ2 (ENSCLAG00000013544) #26	NFE2L1 (ENSCLAG00000014836) #27	CBX1 (ENSCLAG00000013587) #28	SNX11 (ENSCLAG00000015837) #29	SKAP1 (ENSCLAG00000015423) #30	HOXB1 (ENSCLAG00000013047) #31	HOXB2 (ENSCLAG00000015271) #32	HOXB3 (ENSCLAG00000015322) #33	HOXB4 (ENSCLAG00000014725) #34	HOXB5 (ENSCLAG00000014374) #35	HOXB6 (ENSCLAG00000015524) #36	HOXB7 (ENSCLAG00000014906) #37
Degu	MODERN SPECIES	97	MLLT6 (ENSODEG00000017604) #7	SRCIN1 (ENSODEG00000017506) #8	ARHGAP23 (ENSODEG00000017612) #9	GPR179 (ENSODEG00000017327) #11	MRPL45 (ENSODEG00000017631) #12	SOCS7 (ENSODEG00000017559) #10	NPEPPS (ENSODEG00000017337) #13	KPNB1 (ENSODEG00000017287) #14	ENSODEG00000017455 #15	TBX21 (ENSODEG00000017610) #16	OSBPL7 (ENSODEG00000017364) #17	MRPL10 (ENSODEG00000017536) #18	LRRC46 (ENSODEG00000017367) #20	SCRN2 (ENSODEG00000017395) #19	SP6 (ENSODEG00000017625) #21	SP2 (ENSODEG00000017126) #22	PNPO (ENSODEG00000017424) #23	ENSODEG00000017229 #25	COPZ2 (ENSODEG00000017565) #26	ENSODEG00000020421	NFE2L1 (ENSODEG00000017348) #27	CBX1 (ENSODEG00000017272) #28	SNX11 (ENSODEG00000017458) #29	SKAP1 (ENSODEG00000017533) #30	HOXB1 (ENSODEG00000017050) #31	HOXB2 (ENSODEG00000017153) #32	HOXB3 (ENSODEG00000017116) #33	HOXB4 (ENSODEG00000017038) #34	HOXB5 (ENSODEG00000017253) #35	HOXB6 (ENSODEG00000016988) #36	HOXB8 (ENSODEG00000017119)
Guinea pig	MODERN SPECIES	53	EPOP (ENSCPOG00000026798)	SRCIN1 (ENSCPOG00000022478) #8	ARHGAP23 (ENSCPOG00000025821) #9	SOCS7 (ENSCPOG00000011473) #10	GPR179 (ENSCPOG00000027503) #11	MRPL45 (ENSCPOG00000001574) #12	NPEPPS (ENSCPOG00000006559) #13	KPNB1 (ENSCPOG00000006566) #14	TBKBP1 (ENSCPOG00000036345) #15	TBX21 (ENSCPOG00000026273) #16	OSBPL7 (ENSCPOG00000006914) #17	MRPL10 (ENSCPOG00000037104) #18	LRRC46 (ENSCPOG00000006925) #20	SCRN2 (ENSCPOG00000006929) #19	SP6 (ENSCPOG00000007638) #21	SP2 (ENSCPOG00000014943) #22	PNPO (ENSCPOG00000003187) #23	PRR15L (ENSCPOG00000035567) #24	CDK5RAP3 (ENSCPOG00000007275) #25	COPZ2 (ENSCPOG00000019500) #26	NFE2L1 (ENSCPOG00000030805) #27	CBX1 (ENSCPOG00000034435) #28	SNX11 (ENSCPOG00000020234) #29	SKAP1 (ENSCPOG00000022118) #30	HOXB1 (ENSCPOG00000022183) #31	HOXB2 (ENSCPOG00000035468) #32	ENSCPOG00000010107 #33	ENSCPOG00000010105	HOXB5 (ENSCPOG00000030746) #35	HOXB6 (ENSCPOG00000040707) #36	HOXB9 (ENSCPOG00000037597)
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	12	SRCIN1 (ENSHGLG00000010912) #8	ARHGAP23 (ENSHGLG00000012944) #9	SOCS7 (ENSHGLG00000035093) #10	ENSHGLG00000041148 #11	ENSHGLG00000050482	ENSHGLG00000010863 #12	ENSHGLG00000012466 #13	KPNB1 (ENSHGLG00000014138) #14	TBKBP1 (ENSHGLG00000049817) #15	TBX21 (ENSHGLG00000012216) #16	OSBPL7 (ENSHGLG00000012525) #17	MRPL10 (ENSHGLG00000048399) #18	LRRC46 (ENSHGLG00000035931) #20	SCRN2 (ENSHGLG00000041375) #19	SP6 (ENSHGLG00000021113) #21	SP2 (ENSHGLG00000009902) #22	PNPO (ENSHGLG00000013159) #23	PRR15L (ENSHGLG00000014696) #24	CDK5RAP3 (ENSHGLG00000019464) #25	COPZ2 (ENSHGLG00000018543) #26	NFE2L1 (ENSHGLG00000012592) #27	CBX1 (ENSHGLG00000013574) #28	SNX11 (ENSHGLG00000016837) #29	SKAP1 (ENSHGLG00000014563) #30	HOXB1 (ENSHGLG00000009781) #31	HOXB2 (ENSHGLG00000010090) #32	HOXB3 (ENSHGLG00000010686) #33	HOXB4 (ENSHGLG00000034075) #34	HOXB5 (ENSHGLG00000039265) #35	HOXB6 (ENSHGLG00000012400) #36	HOXB7 (ENSHGLG00000045318) #37