Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155065	ENSGT00390000005949	ENSGT01100000263518.A.a.b	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00640000092844	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00640000092844	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00640000092844	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000172404	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354
Theria	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00640000092844	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000172404	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00950000185410	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00980000199681	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00950000185410	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00980000199681	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES	628																ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a
Common shrew	MODERN SPECIES	4826																SP2 (ENSSARG00000003559) #22	CDK5RAP3 (ENSSARG00000003586) #23
Hedgehog	MODERN SPECIES	6186																SP2 (ENSEEUG00000014248) #22	ENSEEUG00000014320	PRR15L (ENSEEUG00000014410)
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00930000153020	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000185410	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00980000199681	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00930000153020	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000185410	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00980000199681	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00930000153020	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000185410	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00980000199681	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00930000153020	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00950000185410	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00980000199681	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Narwhal	MODERN SPECIES	316	ENSMMNG00015017965	SRCIN1 (ENSMMNG00015017795)	ARHGAP23 (ENSMMNG00015017676)	SOCS7 (ENSMMNG00015017571)	GPR179 (ENSMMNG00015017480)	MRPL45 (ENSMMNG00015017435)	NPEPPS (ENSMMNG00015017277)	KPNB1 (ENSMMNG00015017215)	TBKBP1 (ENSMMNG00015017190)	TBX21 (ENSMMNG00015017166)	OSBPL7 (ENSMMNG00015017115)	MRPL10 (ENSMMNG00015017084)	LRRC46 (ENSMMNG00015017038)	SCRN2 (ENSMMNG00015016985)	SP6 (ENSMMNG00015016969)	SP2 (ENSMMNG00015016948) #22	PNPO (ENSMMNG00015016895)	PRR15L (ENSMMNG00015016868)	CDK5RAP3 (ENSMMNG00015016820) #23	COPZ2 (ENSMMNG00015016743)	NFE2L1 (ENSMMNG00015016634)	CBX1 (ENSMMNG00015016582)	SNX11 (ENSMMNG00015016452)	SKAP1 (ENSMMNG00015016386)	HOXB1 (ENSMMNG00015016356)	HOXB2 (ENSMMNG00015016324)	HOXB3 (ENSMMNG00015016287)	HOXB4 (ENSMMNG00015016252)	HOXB5 (ENSMMNG00015016235)	HOXB6 (ENSMMNG00015016215)	HOXB7 (ENSMMNG00015016197)
Beluga whale	MODERN SPECIES	26	SRCIN1 (ENSDLEG00000003944)	ENSDLEG00000003976	ARHGAP23 (ENSDLEG00000003989)	SOCS7 (ENSDLEG00000004014)	GPR179 (ENSDLEG00000004032)	MRPL45 (ENSDLEG00000004037)	NPEPPS (ENSDLEG00000004076)	KPNB1 (ENSDLEG00000004223)	TBKBP1 (ENSDLEG00000004240)	TBX21 (ENSDLEG00000004247)	OSBPL7 (ENSDLEG00000004366)	MRPL10 (ENSDLEG00000004678)	ENSDLEG00000004684	SCRN2 (ENSDLEG00000004688)	SP6 (ENSDLEG00000004694)	SP2 (ENSDLEG00000004697) #22	PNPO (ENSDLEG00000004701)	PRR15L (ENSDLEG00000004704)	CDK5RAP3 (ENSDLEG00000004709) #23	COPZ2 (ENSDLEG00000004721)	ENSDLEG00000004734	NFE2L1 (ENSDLEG00000004744)	CBX1 (ENSDLEG00000004754)	SNX11 (ENSDLEG00000004765)	SKAP1 (ENSDLEG00000004779)	HOXB1 (ENSDLEG00000004807)	HOXB2 (ENSDLEG00000004813)	HOXB3 (ENSDLEG00000004817)	HOXB4 (ENSDLEG00000004820)	HOXB5 (ENSDLEG00000004826)	HOXB6 (ENSDLEG00000004829)
Vaquita	MODERN SPECIES	12	ENSPSNG00000020092	SRCIN1 (ENSPSNG00000019720)	ARHGAP23 (ENSPSNG00000019589)	SOCS7 (ENSPSNG00000019467)	GPR179 (ENSPSNG00000019300)	MRPL45 (ENSPSNG00000019227)	NPEPPS (ENSPSNG00000019016)	KPNB1 (ENSPSNG00000018946)	TBKBP1 (ENSPSNG00000018911)	TBX21 (ENSPSNG00000018852)	OSBPL7 (ENSPSNG00000018799)	ENSPSNG00000018757	LRRC46 (ENSPSNG00000018676)	SCRN2 (ENSPSNG00000018588)	SP6 (ENSPSNG00000018568)	SP2 (ENSPSNG00000018528) #22	PNPO (ENSPSNG00000018423)	PRR15L (ENSPSNG00000018399)	CDK5RAP3 (ENSPSNG00000018321) #23	COPZ2 (ENSPSNG00000018262)	NFE2L1 (ENSPSNG00000018052)	ENSPSNG00000017984	SNX11 (ENSPSNG00000017889)	SKAP1 (ENSPSNG00000017760)	HOXB1 (ENSPSNG00000017728)	HOXB2 (ENSPSNG00000017708)	HOXB3 (ENSPSNG00000017636)	HOXB4 (ENSPSNG00000017604)	HOXB5 (ENSPSNG00000017559)	HOXB6 (ENSPSNG00000017525)	HOXB7 (ENSPSNG00000017482)
Dolphin	MODERN SPECIES	6789											OSBPL7 (ENSTTRG00000012411)	MRPL10 (ENSTTRG00000012452)	LRRC46 (ENSTTRG00000012463)	SCRN2 (ENSTTRG00000012472)	SP6 (ENSTTRG00000012481)	SP2 (ENSTTRG00000012483) #22	PNPO (ENSTTRG00000012493)
Sperm whale	MODERN SPECIES	5	ATP5MC1 (ENSPCTG00005004516)	CALCOCO2 (ENSPCTG00005004611)	TTLL6 (ENSPCTG00005004739)	HOXB13 (ENSPCTG00005004788)	HOXB9 (ENSPCTG00005004847)	HOXB8 (ENSPCTG00005004864)	HOXB7 (ENSPCTG00005004882)	HOXB6 (ENSPCTG00005004887)	HOXB5 (ENSPCTG00005004905)	HOXB4 (ENSPCTG00005004920)	HOXB3 (ENSPCTG00005004930)	HOXB2 (ENSPCTG00005004951)	HOXB1 (ENSPCTG00005004966)	SKAP1 (ENSPCTG00005004985)	CBX1 (ENSPCTG00005005034)	ENSPCTG00005005083 #22	TBX21 (ENSPCTG00005005105)	TBKBP1 (ENSPCTG00005005144)	KPNB1 (ENSPCTG00005005195)	NPEPPS (ENSPCTG00005005245)	GPR179 (ENSPCTG00005005545)	SOCS7 (ENSPCTG00005005634)	ARHGAP23 (ENSPCTG00005005753)	SRCIN1 (ENSPCTG00005005823)	ENSPCTG00005006189	PSMB3 (ENSPCTG00005006224)	PIP4K2B (ENSPCTG00005006258)	CWC25 (ENSPCTG00005006298)	C14H17orf98 (ENSPCTG00005006357)	LASP1 (ENSPCTG00005006383)	FBXO47 (ENSPCTG00005006420)
Blue whale	MODERN SPECIES	12	ENSBMSG00010019467	ENSBMSG00010019451	STXBP4 (ENSBMSG00010019312)	COX11 (ENSBMSG00010019249)	ENSBMSG00010019021	KIF2B (ENSBMSG00010018945)	ENSBMSG00010018906	CA10 (ENSBMSG00010018845)	ENSBMSG00010018791	ENSBMSG00010018759	ENSBMSG00010018708	ENSBMSG00010018688	ENSBMSG00010018673	ENSBMSG00010018650	SP6 (ENSBMSG00010018628)	SP2 (ENSBMSG00010018607) #22	PNPO (ENSBMSG00010018544)	PRR15L (ENSBMSG00010018513)	CDK5RAP3 (ENSBMSG00010018481) #23	COPZ2 (ENSBMSG00010018306)	NFE2L1 (ENSBMSG00010018163)	CBX1 (ENSBMSG00010018099)	SNX11 (ENSBMSG00010018006)	SKAP1 (ENSBMSG00010017921)	HOXB1 (ENSBMSG00010017892)	HOXB2 (ENSBMSG00010017860)	HOXB3 (ENSBMSG00010017838)	HOXB4 (ENSBMSG00010017814)	HOXB5 (ENSBMSG00010017772)	HOXB6 (ENSBMSG00010017746)	HOXB7 (ENSBMSG00010017724)
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00930000153020	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00950000185410	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00980000199681	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00930000153020	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00980000199681	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00930000153020	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000154688.b.j	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Rambouillet Sheep	DUPLICATION
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	2	ENSOARG00020018303	SRCIN1 (ENSOARG00020018349)	ARHGAP23 (ENSOARG00020019239)	SOCS7 (ENSOARG00020019553)	GPR179 (ENSOARG00020019685)	MRPL45 (ENSOARG00020019879)	NPEPPS (ENSOARG00020020009)	KPNB1 (ENSOARG00020020287)	TBKBP1 (ENSOARG00020020372)	TBX21 (ENSOARG00020020433)	OSBPL7 (ENSOARG00020020494)	MRPL10 (ENSOARG00020020614)	LRRC46 (ENSOARG00020020663)	SCRN2 (ENSOARG00020020770)	SP6 (ENSOARG00020020944)	SP2 (ENSOARG00020020972) #22	PNPO (ENSOARG00020021017)	PRR15L (ENSOARG00020021319)	CDK5RAP3 (ENSOARG00020021339) #23	COPZ2 (ENSOARG00020021377)	NFE2L1 (ENSOARG00020021460)	CBX1 (ENSOARG00020021741)	SNX11 (ENSOARG00020021783)	SKAP1 (ENSOARG00020021817)	HOXB1 (ENSOARG00020021886)	HOXB2 (ENSOARG00020021907)	HOXB3 (ENSOARG00020021943)	HOXB4 (ENSOARG00020021954)	HOXB5 (ENSOARG00020022004)	HOXB6 (ENSOARG00020022021)	HOXB7 (ENSOARG00020022042)
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	6	RNF214 (ENSOARG00020003821)	BACE1 (ENSOARG00020004145)	ENSOARG00020004547	DSCAML1 (ENSOARG00020006009)	FXYD2 (ENSOARG00020006659)	FXYD6 (ENSOARG00020006743)	TMPRSS13 (ENSOARG00020006885)	IL10RA (ENSOARG00020007104)	SMIM35 (ENSOARG00020007401)	TMPRSS4 (ENSOARG00020007492)	SCN4B (ENSOARG00020008129)	SCN2B (ENSOARG00020008245)	JAML (ENSOARG00020008303)	MPZL3 (ENSOARG00020008369)	MPZL2 (ENSOARG00020008415)	ENSOARG00020008464 #22	CD3E (ENSOARG00020008497)	CD3D (ENSOARG00020008660)	CD3G (ENSOARG00020008794)	UBE4A (ENSOARG00020008890)	ENSOARG00020008962	KMT2A (ENSOARG00020009065)	TTC36 (ENSOARG00020010334)	TMEM25 (ENSOARG00020010366)	IFT46 (ENSOARG00020010461)	ARCN1 (ENSOARG00020011031)	PHLDB1 (ENSOARG00020011300)	TREH (ENSOARG00020011898)	DDX6 (ENSOARG00020012273)	CXCR5 (ENSOARG00020012413)	BCL9L (ENSOARG00020012453)
Goat	MODERN SPECIES	10	ENSCHIG00000019374	SRCIN1 (ENSCHIG00000022297)	ARHGAP23 (ENSCHIG00000023996)	SOCS7 (ENSCHIG00000012449)	GPR179 (ENSCHIG00000026098)	MRPL45 (ENSCHIG00000014110)	NPEPPS (ENSCHIG00000022782)	KPNB1 (ENSCHIG00000014896)	TBKBP1 (ENSCHIG00000016860)	TBX21 (ENSCHIG00000021993)	OSBPL7 (ENSCHIG00000023060)	MRPL10 (ENSCHIG00000027033)	LRRC46 (ENSCHIG00000015497)	SCRN2 (ENSCHIG00000026802)	SP6 (ENSCHIG00000009897)	SP2 (ENSCHIG00000018648) #22	PNPO (ENSCHIG00000004606)	PRR15L (ENSCHIG00000008261)	CDK5RAP3 (ENSCHIG00000025420) #23	COPZ2 (ENSCHIG00000026544)	NFE2L1 (ENSCHIG00000015427)	CBX1 (ENSCHIG00000010985)	SNX11 (ENSCHIG00000017547)	ENSCHIG00000026878	ENSCHIG00000015920	ENSCHIG00000010180	HOXB1 (ENSCHIG00000017872)	HOXB2 (ENSCHIG00000025836)	HOXB3 (ENSCHIG00000013978)	HOXB4 (ENSCHIG00000025323)	HOXB5 (ENSCHIG00000023147)
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00930000153020	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00960000190232	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
American bison	MODERN SPECIES	3101	ENSBBBG00000022356	ENSBBBG00000005896	SOCS7 (ENSBBBG00000005889)	ENSBBBG00000005882	MRPL45 (ENSBBBG00000022294)	ENSBBBG00000022252	NPEPPS (ENSBBBG00000022236)	KPNB1 (ENSBBBG00000022131)	ENSBBBG00000022076	TBX21 (ENSBBBG00000005826)	OSBPL7 (ENSBBBG00000022056)	MRPL10 (ENSBBBG00000021983)	LRRC46 (ENSBBBG00000021972)	SCRN2 (ENSBBBG00000021958)	SP6 (ENSBBBG00000021924)	SP2 (ENSBBBG00000021914) #22	PNPO (ENSBBBG00000021862)	PRR15L (ENSBBBG00000021809)	CDK5RAP3 (ENSBBBG00000021808) #23	COPZ2 (ENSBBBG00000021782)	NFE2L1 (ENSBBBG00000021740)	ENSBBBG00000021675	SNX11 (ENSBBBG00000021652)	SKAP1 (ENSBBBG00000021634)	HOXB1 (ENSBBBG00000021601)	HOXB2 (ENSBBBG00000021598)	HOXB3 (ENSBBBG00000005740)	HOXB4 (ENSBBBG00000021585)	HOXB5 (ENSBBBG00000021577)	HOXB6 (ENSBBBG00000021567)	HOXB7 (ENSBBBG00000021565)
Bos	DUPLICATION
Bos	DUPLICATION
Bos	DUPLICATION
Bos	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159590.e.a.a #22
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159590.e.a.a #22
Hybrid Bos Indicus	DUPLICATION
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	27	TEX10 (ENSBIXG00005028410)	ENSBIXG00005007787	ENSBIXG00005004856	ENSBIXG00005004847	ENSBIXG00005028169	ENSBIXG00005028091	ENSBIXG00005028069	ENSBIXG00005004822	LPL (ENSBIXG00005028031)	ENSBIXG00005027982	SLC18A1 (ENSBIXG00005027964)	ATP6V1B2 (ENSBIXG00005027918)	LZTS1 (ENSBIXG00005027830)	ENSBIXG00005027774	ENSBIXG00005027763	ENSBIXG00005027749 #22	ENSBIXG00005027723	ENSBIXG00005004760	GFRA2 (ENSBIXG00005027647)	DOK2 (ENSBIXG00005004736)	XPO7 (ENSBIXG00005027512)	NPM2 (ENSBIXG00005027463)	FGF17 (ENSBIXG00005027428)	DMTN (ENSBIXG00005027387)	FHIP2B (ENSBIXG00005004662)	NUDT18 (ENSBIXG00005027121)	HR (ENSBIXG00005027087)	REEP4 (ENSBIXG00005027035)	LGI3 (ENSBIXG00005004632)	SFTPC (ENSBIXG00005004620)	BMP1 (ENSBIXG00005026935)
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	315	ENSBIXG00005023432	ENSBIXG00005023472	GPC4 (ENSBIXG00005004018)	ENSBIXG00005004032	ENSBIXG00005023613	GPC3 (ENSBIXG00005023687)	PHF6 (ENSBIXG00005023899)	ENSBIXG00005023941	PABIR2 (ENSBIXG00005007177)	MOSPD1 (ENSBIXG00005024236)	ENSBIXG00005024246	ENSBIXG00005006288	ENSBIXG00005024346	ENSBIXG00005024359	ENSBIXG00005024383	ENSBIXG00005024425 #22	ENSBIXG00005024448	ENSBIXG00005024564	ZNF449 (ENSBIXG00005024616)	ENSBIXG00005024630	ENSBIXG00005024668	ENSBIXG00005024681	INTS6L (ENSBIXG00005024755)	ENSBIXG00005024777	ENSBIXG00005024820	SLC9A6 (ENSBIXG00005024885)	ENSBIXG00005024891	FHL1 (ENSBIXG00005025100)	ENSBIXG00005025140	ENSBIXG00005025166	BRS3 (ENSBIXG00005025192)
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159590.e.a.a #22
Wild yak	MODERN SPECIES	319																SP2 (ENSBMUG00000001179) #22	PNPO (ENSBMUG00000001160)	ENSBMUG00000001125	CDK5RAP3 (ENSBMUG00000001110) #23	COPZ2 (ENSBMUG00000001081)	NFE2L1 (ENSBMUG00000001054)	CBX1 (ENSBMUG00000000974)	SNX11 (ENSBMUG00000000953)	SKAP1 (ENSBMUG00000000925)	ENSBMUG00000000901	HOXB1 (ENSBMUG00000000891)	HOXB2 (ENSBMUG00000000885)	HOXB3 (ENSBMUG00000000876)	HOXB4 (ENSBMUG00000000867)	HOXB5 (ENSBMUG00000000849)	HOXB6 (ENSBMUG00000000839)
Bos	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159590.e.a.b #22
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159590.e.a.b #22
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	10	SRCIN1 (ENSBIXG00005030456)	ARHGAP23 (ENSBIXG00005030331)	SOCS7 (ENSBIXG00005030269)	GPR179 (ENSBIXG00005030235)	ENSBIXG00005030228	MRPL45 (ENSBIXG00005030219)	NPEPPS (ENSBIXG00005030159)	KPNB1 (ENSBIXG00005030131)	TBKBP1 (ENSBIXG00005030097)	TBX21 (ENSBIXG00005030084)	OSBPL7 (ENSBIXG00005030039)	MRPL10 (ENSBIXG00005030023)	LRRC46 (ENSBIXG00005030008)	SCRN2 (ENSBIXG00005029976)	SP6 (ENSBIXG00005029948)	ENSBIXG00005029934 #22	PNPO (ENSBIXG00005029918)	PRR15L (ENSBIXG00005029905)	CDK5RAP3 (ENSBIXG00005029886) #23	COPZ2 (ENSBIXG00005029862)	NFE2L1 (ENSBIXG00005029748)	CBX1 (ENSBIXG00005029691)	SNX11 (ENSBIXG00005029679)	SKAP1 (ENSBIXG00005029657)	ENSBIXG00005029636	HOXB1 (ENSBIXG00005029618)	HOXB2 (ENSBIXG00005029607)	HOXB3 (ENSBIXG00005029591)	HOXB4 (ENSBIXG00005029577)	HOXB5 (ENSBIXG00005029559)	HOXB6 (ENSBIXG00005029554)
Bos	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00930000153020	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00960000190232	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590.e.b #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b.i	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000154688.b.k.a	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00960000190232	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590.e.b #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b.i	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000154688.b.k.a	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Cow	MODERN SPECIES	10	SRCIN1 (ENSBTAG00000013469)	ARHGAP23 (ENSBTAG00000016911)	SOCS7 (ENSBTAG00000008535)	GPR179 (ENSBTAG00000001804)	ENSBTAG00000049522	MRPL45 (ENSBTAG00000025001)	NPEPPS (ENSBTAG00000011435)	KPNB1 (ENSBTAG00000006586)	TBKBP1 (ENSBTAG00000011280)	TBX21 (ENSBTAG00000014199)	OSBPL7 (ENSBTAG00000013523)	MRPL10 (ENSBTAG00000001832)	LRRC46 (ENSBTAG00000001830)	SCRN2 (ENSBTAG00000001828)	SP6 (ENSBTAG00000001825)	SP2 (ENSBTAG00000013740) #22	PNPO (ENSBTAG00000012259)	PRR15L (ENSBTAG00000012249)	CDK5RAP3 (ENSBTAG00000014202) #23	COPZ2 (ENSBTAG00000039954)	NFE2L1 (ENSBTAG00000013653)	CBX1 (ENSBTAG00000002949)	SNX11 (ENSBTAG00000020321)	SKAP1 (ENSBTAG00000000641)	HOXB1 (ENSBTAG00000007603)	HOXB2 (ENSBTAG00000009979)	HOXB3 (ENSBTAG00000021427)	HOXB4 (ENSBTAG00000039599)	HOXB5 (ENSBTAG00000045835)	HOXB6 (ENSBTAG00000050006)	HOXB7 (ENSBTAG00000005546)
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00930000153020	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00960000190232	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590.e.b #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b.i	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000154688.b.k.a	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Domestic yak	MODERN SPECIES	10	ENSBGRG00000016987	ARHGAP23 (ENSBGRG00000017050)	SOCS7 (ENSBGRG00000017476)	ENSBGRG00000017816	MRPL45 (ENSBGRG00000017975)	ENSBGRG00000018222	NPEPPS (ENSBGRG00000018276)	KPNB1 (ENSBGRG00000018571)	TBKBP1 (ENSBGRG00000019067)	TBX21 (ENSBGRG00000019171)	OSBPL7 (ENSBGRG00000019260)	MRPL10 (ENSBGRG00000019422)	LRRC46 (ENSBGRG00000019490)	SCRN2 (ENSBGRG00000019672)	SP6 (ENSBGRG00000019744)	ENSBGRG00000019774 #22	PNPO (ENSBGRG00000019898)	ENSBGRG00000020194	CDK5RAP3 (ENSBGRG00000020283) #23	COPZ2 (ENSBGRG00000020574)	NFE2L1 (ENSBGRG00000020783)	CBX1 (ENSBGRG00000021062)	SNX11 (ENSBGRG00000021141)	SKAP1 (ENSBGRG00000021202)	HOXB1 (ENSBGRG00000021404)	HOXB2 (ENSBGRG00000021425)	HOXB3 (ENSBGRG00000021464)	HOXB4 (ENSBGRG00000021501)	HOXB5 (ENSBGRG00000021555)	HOXB6 (ENSBGRG00000021579)	HOXB8 (ENSBGRG00000021618)
Bos	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159590.f #22
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159590.f #22
Domestic yak	MODERN SPECIES	13	ALPK2 (ENSBGRG00000014330)	MALT1 (ENSBGRG00000014428)	ZNF532 (ENSBGRG00000014854)	ENSBGRG00000014978	SEC11C (ENSBGRG00000015083)	ENSBGRG00000015203	RAX (ENSBGRG00000015248)	CPLX4 (ENSBGRG00000015391)	LMAN1 (ENSBGRG00000015446)	CCBE1 (ENSBGRG00000015792)	ENSBGRG00000015958	PMAIP1 (ENSBGRG00000015982)	MC4R (ENSBGRG00000016023)	ENSBGRG00000016053	ENSBGRG00000016227	ENSBGRG00000016258 #22	ENSBGRG00000016321	ENSBGRG00000016372	ENSBGRG00000016450	CDH20 (ENSBGRG00000016472)	RNF152 (ENSBGRG00000016707)	PIGN (ENSBGRG00000016802)	RELCH (ENSBGRG00000017550)	TNFRSF11A (ENSBGRG00000018261)	ZCCHC2 (ENSBGRG00000018501)	BCL2 (ENSBGRG00000019339)	ENSBGRG00000019385	KDSR (ENSBGRG00000019413)	VPS4B (ENSBGRG00000019724)	SERPINB5 (ENSBGRG00000019802)	SERPINB12 (ENSBGRG00000019909)
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	1210	ARHGAP23 (ENSMMSG00000019156)	SOCS7 (ENSMMSG00000019056)	GPR179 (ENSMMSG00000018906)	MRPL45 (ENSMMSG00000018849)	ENSMMSG00000018805	NPEPPS (ENSMMSG00000018632)	KPNB1 (ENSMMSG00000018546)	TBKBP1 (ENSMMSG00000018512)	TBX21 (ENSMMSG00000018475)	ENSMMSG00000018451	OSBPL7 (ENSMMSG00000018422)	MRPL10 (ENSMMSG00000018396)	LRRC46 (ENSMMSG00000018351)	SCRN2 (ENSMMSG00000018238)	SP6 (ENSMMSG00000018224)	SP2 (ENSMMSG00000024551) #22	PNPO (ENSMMSG00000024550)	PRR15L (ENSMMSG00000024549)	CDK5RAP3 (ENSMMSG00000024548) #23	COPZ2 (ENSMMSG00000024546)	NFE2L1 (ENSMMSG00000024541)	CBX1 (ENSMMSG00000024540)	SNX11 (ENSMMSG00000024538)	SKAP1 (ENSMMSG00000024536)	ENSMMSG00000024535	HOXB1 (ENSMMSG00000024533)	HOXB2 (ENSMMSG00000024532)	HOXB3 (ENSMMSG00000024531)	ENSMMSG00000024530	HOXB4 (ENSMMSG00000024528)	HOXB5 (ENSMMSG00000024526)
Yarkand deer	MODERN SPECIES	28	ENSCHYG00000000749	ARHGAP23 (ENSCHYG00000000727)	SOCS7 (ENSCHYG00000000633)	GPR179 (ENSCHYG00000000586)	MRPL45 (ENSCHYG00000000557)	NPEPPS (ENSCHYG00000000456)	ENSCHYG00000000411	KPNB1 (ENSCHYG00000000360)	TBKBP1 (ENSCHYG00000000333)	TBX21 (ENSCHYG00000000318)	OSBPL7 (ENSCHYG00000000286)	MRPL10 (ENSCHYG00000000265)	LRRC46 (ENSCHYG00000000251)	SCRN2 (ENSCHYG00000000227)	SP6 (ENSCHYG00000000221)	SP2 (ENSCHYG00000000198) #22	PNPO (ENSCHYG00000000157)	PRR15L (ENSCHYG00000000125)	CDK5RAP3 (ENSCHYG00000000101) #23	ENSCHYG00000004851	COPZ2 (ENSCHYG00000004829)	NFE2L1 (ENSCHYG00000004781)	CBX1 (ENSCHYG00000004750)	SNX11 (ENSCHYG00000004737)	ENSCHYG00000004720	SKAP1 (ENSCHYG00000004692)	HOXB1 (ENSCHYG00000004684)	HOXB2 (ENSCHYG00000004674)	HOXB3 (ENSCHYG00000004670)	HOXB4 (ENSCHYG00000004668)	HOXB5 (ENSCHYG00000004658)
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	60	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000185410	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000154152.d.a.a	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Arabian camel	MODERN SPECIES	7	ENSCDRG00005019591	SRCIN1 (ENSCDRG00005019469)	ENSCDRG00005019433	SOCS7 (ENSCDRG00005019385)	GPR179 (ENSCDRG00005019342)	MRPL45 (ENSCDRG00005019287)	NPEPPS (ENSCDRG00005019119)	KPNB1 (ENSCDRG00005019017)	TBKBP1 (ENSCDRG00005018994)	TBX21 (ENSCDRG00005018980)	OSBPL7 (ENSCDRG00005018943)	MRPL10 (ENSCDRG00005018906)	LRRC46 (ENSCDRG00005018865)	SCRN2 (ENSCDRG00005018805)	SP6 (ENSCDRG00005018791)	SP2 (ENSCDRG00005018756) #22	PRR15L (ENSCDRG00005018636)	CDK5RAP3 (ENSCDRG00005018564) #23	COPZ2 (ENSCDRG00005018538)	ENSCDRG00005018515	NFE2L1 (ENSCDRG00005018357)	CBX1 (ENSCDRG00005018330)	SNX11 (ENSCDRG00005018232)	SKAP1 (ENSCDRG00005018166)	HOXB1 (ENSCDRG00005018147)	HOXB2 (ENSCDRG00005018121)	HOXB3 (ENSCDRG00005018104)	HOXB4 (ENSCDRG00005018079)	HOXB5 (ENSCDRG00005018055)	HOXB6 (ENSCDRG00005018029)	HOXB7 (ENSCDRG00005018007)
Alpaca	MODERN SPECIES	6028															MRPL10 (ENSVPAG00000004498)	SP2 (ENSVPAG00000004499) #22
Suina	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00860000135964	ENSGT00930000153020	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	145	EPOP (ENSCWAG00000001220)	SRCIN1 (ENSCWAG00000001149)	ARHGAP23 (ENSCWAG00000001049)	SOCS7 (ENSCWAG00000001002)	GPR179 (ENSCWAG00000000941)	MRPL45 (ENSCWAG00000000905)	NPEPPS (ENSCWAG00000000826)	KPNB1 (ENSCWAG00000000755)	TBKBP1 (ENSCWAG00000000726)	TBX21 (ENSCWAG00000000709)	OSBPL7 (ENSCWAG00000000623)	MRPL10 (ENSCWAG00000000589)	LRRC46 (ENSCWAG00000000570)	SCRN2 (ENSCWAG00000000520)	SP6 (ENSCWAG00000000502)	SP2 (ENSCWAG00000000474) #22	PNPO (ENSCWAG00000000427)	PRR15L (ENSCWAG00000000410)	CDK5RAP3 (ENSCWAG00000000377) #23	COPZ2 (ENSCWAG00000000341)	NFE2L1 (ENSCWAG00000000185)	CBX1 (ENSCWAG00000000121)	SNX11 (ENSCWAG00000000070)	SKAP1 (ENSCWAG00000000046)	HOXB1 (ENSCWAG00000022080)	HOXB2 (ENSCWAG00000022078)	HOXB3 (ENSCWAG00000022077)	HOXB4 (ENSCWAG00000022074)	HOXB5 (ENSCWAG00000022071)	HOXB6 (ENSCWAG00000022069)	HOXB7 (ENSCWAG00000022067)
Pig	MODERN SPECIES	3	ENSSSCG00000046446	ENSSSCG00000045701	ARHGAP23 (ENSSSCG00000018058)	SOCS7 (ENSSSCG00000018057)	GPR179 (ENSSSCG00000020884)	MRPL45 (ENSSSCG00000023263)	NPEPPS (ENSSSCG00000017513)	KPNB1 (ENSSSCG00000017514)	ENSSSCG00000057498	TBX21 (ENSSSCG00000017517)	OSBPL7 (ENSSSCG00000017518)	MRPL10 (ENSSSCG00000017519)	LRRC46 (ENSSSCG00000017520)	SCRN2 (ENSSSCG00000017521)	SP6 (ENSSSCG00000017522)	SP2 (ENSSSCG00000017516) #22	PNPO (ENSSSCG00000032782)	PRR15L (ENSSSCG00000054179)	CDK5RAP3 (ENSSSCG00000017524) #23	COPZ2 (ENSSSCG00000017526)	NFE2L1 (ENSSSCG00000017525)	CBX1 (ENSSSCG00000017529)	SNX11 (ENSSSCG00000017528)	SKAP1 (ENSSSCG00000017527)	HOXB1 (ENSSSCG00000017532)	HOXB2 (ENSSSCG00000017533)	HOXB3 (ENSSSCG00000017534)	HOXB4 (ENSSSCG00000017535)	HOXB5 (ENSSSCG00000017540)	HOXB6 (ENSSSCG00000017539)	HOXB7 (ENSSSCG00000017538)
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00930000153020	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000185410	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00980000199681	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00980000199681	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Equus	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Horse	MODERN SPECIES	2	MLLT6 (ENSECAG00000012082)	EPOP (ENSECAG00000036519)	SRCIN1 (ENSECAG00000014219)	ARHGAP23 (ENSECAG00000031942)	SOCS7 (ENSECAG00000021699)	GPR179 (ENSECAG00000021843)	MRPL45 (ENSECAG00000000590)	NPEPPS (ENSECAG00000007392)	KPNB1 (ENSECAG00000014560)	TBKBP1 (ENSECAG00000016107)	TBX21 (ENSECAG00000018160)	OSBPL7 (ENSECAG00000019067)	LRRC46 (ENSECAG00000007543)	SCRN2 (ENSECAG00000009826)	SP6 (ENSECAG00000012853)	SP2 (ENSECAG00000012859) #22	PNPO (ENSECAG00000014995)	PRR15L (ENSECAG00000002658)	CDK5RAP3 (ENSECAG00000018688) #23	COPZ2 (ENSECAG00000024471)	NFE2L1 (ENSECAG00000007777)	CBX1 (ENSECAG00000008048)	SNX11 (ENSECAG00000008117)	SKAP1 (ENSECAG00000010544)	HOXB1 (ENSECAG00000011628)	HOXB2 (ENSECAG00000012423)	HOXB3 (ENSECAG00000002707)	HOXB4 (ENSECAG00000028576)	HOXB5 (ENSECAG00000012439)	HOXB8 (ENSECAG00000034473)	HOXB9 (ENSECAG00000036001)
Donkey	MODERN SPECIES	4	EPOP (ENSEASG00005029689)	SRCIN1 (ENSEASG00005001556)	ARHGAP23 (ENSEASG00005001497)	SOCS7 (ENSEASG00005001492)	ENSEASG00005001474	ENSEASG00005001461	ENSEASG00005000896	KPNB1 (ENSEASG00005000805)	TBKBP1 (ENSEASG00005000756)	TBX21 (ENSEASG00005000739)	OSBPL7 (ENSEASG00005000733)	MRPL10 (ENSEASG00005027403)	LRRC46 (ENSEASG00005000676)	SCRN2 (ENSEASG00005000671)	SP6 (ENSEASG00005036407)	SP2 (ENSEASG00005000667) #22	PNPO (ENSEASG00005028794)	PRR15L (ENSEASG00005000660)	CDK5RAP3 (ENSEASG00005000658) #23	COPZ2 (ENSEASG00005000641)	NFE2L1 (ENSEASG00005000634)	CBX1 (ENSEASG00005000607)	SNX11 (ENSEASG00005000605)	SKAP1 (ENSEASG00005000601)	HOXB1 (ENSEASG00005000594)	HOXB2 (ENSEASG00005000585)	HOXB3 (ENSEASG00005000581)	HOXB6 (ENSEASG00005000560)	HOXB5 (ENSEASG00005000563)	HOXB7 (ENSEASG00005000556)	HOXB8 (ENSEASG00005024978)
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00980000199681	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Megabat	MODERN SPECIES	2332											OSBPL7 (ENSPVAG00000004250)	MRPL10 (ENSPVAG00000004251)	LRRC46 (ENSPVAG00000004252)	SCRN2 (ENSPVAG00000004253)	SP6 (ENSPVAG00000004254)	SP2 (ENSPVAG00000004255) #22	PNPO (ENSPVAG00000004256)	CDK5RAP3 (ENSPVAG00000004258) #23	COPZ2 (ENSPVAG00000004259)
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00980000199681	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Microbat	MODERN SPECIES	1191					SOCS7 (ENSMLUG00000002876)	GPR179 (ENSMLUG00000002866)	MRPL45 (ENSMLUG00000002863)	NPEPPS (ENSMLUG00000013342)	KPNB1 (ENSMLUG00000014522)	TBKBP1 (ENSMLUG00000014537)	TBX21 (ENSMLUG00000014542)	OSBPL7 (ENSMLUG00000006392)	MRPL10 (ENSMLUG00000006405)	LRRC46 (ENSMLUG00000006409)	SCRN2 (ENSMLUG00000006417)	SP2 (ENSMLUG00000005000) #22	PNPO (ENSMLUG00000005003)	PRR15L (ENSMLUG00000005012)	CDK5RAP3 (ENSMLUG00000005014) #23	NFE2L1 (ENSMLUG00000005024)	CBX1 (ENSMLUG00000005030)	SNX11 (ENSMLUG00000005033)	SKAP1 (ENSMLUG00000005037)	HOXB1 (ENSMLUG00000008429)	HOXB3 (ENSMLUG00000008445)	ENSMLUG00000027291	ENSMLUG00000014513	HOXB6 (ENSMLUG00000010649)	HOXB7 (ENSMLUG00000002609)	HOXB9 (ENSMLUG00000011677)	ENSMLUG00000029480
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	13	EPOP (ENSRFEG00010009672)	SRCIN1 (ENSRFEG00010009277)	ARHGAP23 (ENSRFEG00010009067)	SOCS7 (ENSRFEG00010008940)	GPR179 (ENSRFEG00010008688)	MRPL45 (ENSRFEG00010008623)	NPEPPS (ENSRFEG00010008553)	KPNB1 (ENSRFEG00010008460)	TBKBP1 (ENSRFEG00010008412)	TBX21 (ENSRFEG00010008382)	OSBPL7 (ENSRFEG00010008272)	MRPL10 (ENSRFEG00010008230)	LRRC46 (ENSRFEG00010008197)	SCRN2 (ENSRFEG00010021961)	SP6 (ENSRFEG00010021957)	SP2 (ENSRFEG00010021950) #22	PNPO (ENSRFEG00010021942)	PRR15L (ENSRFEG00010021936)	CDK5RAP3 (ENSRFEG00010021928) #23	COPZ2 (ENSRFEG00010021918)	NFE2L1 (ENSRFEG00010021900)	CBX1 (ENSRFEG00010021893)	SNX11 (ENSRFEG00010021879)	SKAP1 (ENSRFEG00010021866)	HOXB1 (ENSRFEG00010021864)	HOXB2 (ENSRFEG00010021859)	HOXB3 (ENSRFEG00010021853)	ENSRFEG00010021849	HOXB4 (ENSRFEG00010021844)	HOXB5 (ENSRFEG00010021836)	HOXB6 (ENSRFEG00010021831)
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00930000153020	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000185410	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00930000153020	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679.i	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000185410	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00390000013771.p	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354
Cat	MODERN SPECIES	245	ENSFCAG00000048827	SRCIN1 (ENSFCAG00000005817)	ARHGAP23 (ENSFCAG00000005816)	SOCS7 (ENSFCAG00000005815)	GPR179 (ENSFCAG00000005812)	MRPL45 (ENSFCAG00000005808)	NPEPPS (ENSFCAG00000027844)	KPNB1 (ENSFCAG00000023994)	TBKBP1 (ENSFCAG00000010605)	TBX21 (ENSFCAG00000010607)	OSBPL7 (ENSFCAG00000009359)	MRPL10 (ENSFCAG00000009360)	LRRC46 (ENSFCAG00000045119)	SCRN2 (ENSFCAG00000009362)	SP6 (ENSFCAG00000009363)	SP2 (ENSFCAG00000009365) #22	PNPO (ENSFCAG00000001300)	PRR15L (ENSFCAG00000009366)	CDK5RAP3 (ENSFCAG00000009367) #23	COPZ2 (ENSFCAG00000034233)	NFE2L1 (ENSFCAG00000009369)	CBX1 (ENSFCAG00000006056)	SNX11 (ENSFCAG00000009371)	SKAP1 (ENSFCAG00000004784)	ENSFCAG00000034133	HOXB1 (ENSFCAG00000028151)	HOXB2 (ENSFCAG00000045039)	HOXB3 (ENSFCAG00000006408)	HOXB4 (ENSFCAG00000051422)	HOXB5 (ENSFCAG00000039068)	HOXB6 (ENSFCAG00000034768)
Panthera	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00930000153020	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679.i.a.a	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000185410	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00390000013771.p	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354
Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00930000153020	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679.i.b	ENSGT00390000012679.i.a.a	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00390000013771.p	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
lion	MODERN SPECIES	14	EPOP (ENSPLOG00000006763)	SRCIN1 (ENSPLOG00000006464)	ARHGAP23 (ENSPLOG00000006163)	SOCS7 (ENSPLOG00000006096)	GPR179 (ENSPLOG00000006047)	MRPL45 (ENSPLOG00000006010)	NPEPPS (ENSPLOG00000005888)	KPNB1 (ENSPLOG00000005771)	TBKBP1 (ENSPLOG00000005658)	TBX21 (ENSPLOG00000005640)	OSBPL7 (ENSPLOG00000005563)	MRPL10 (ENSPLOG00000005459)	LRRC46 (ENSPLOG00000005433)	SCRN2 (ENSPLOG00000022130)	SP6 (ENSPLOG00000022115)	SP2 (ENSPLOG00000022101) #22	PRR15L (ENSPLOG00000022093)	CDK5RAP3 (ENSPLOG00000022033) #23	COPZ2 (ENSPLOG00000021972)	NFE2L1 (ENSPLOG00000021931)	CBX1 (ENSPLOG00000021907)	SNX11 (ENSPLOG00000021872)	SKAP1 (ENSPLOG00000021790)	ENSPLOG00000021761	HOXB1 (ENSPLOG00000021742)	HOXB2 (ENSPLOG00000021733)	HOXB3 (ENSPLOG00000021711)	HOXB4 (ENSPLOG00000021697)	HOXB5 (ENSPLOG00000021683)	HOXB6 (ENSPLOG00000021669)	HOXB7 (ENSPLOG00000021659)
leopard	MODERN SPECIES	67	SRCIN1 (ENSPPRG00000011073)	ENSPPRG00000011407	ARHGAP23 (ENSPPRG00000012371)	SOCS7 (ENSPPRG00000012918)	GPR179 (ENSPPRG00000013909)	ENSPPRG00000014693	NPEPPS (ENSPPRG00000020677)	KPNB1 (ENSPPRG00000022879)	TBKBP1 (ENSPPRG00000000101)	TBX21 (ENSPPRG00000000491)	ENSPPRG00000001011	MRPL10 (ENSPPRG00000001188)	LRRC46 (ENSPPRG00000001915)	SCRN2 (ENSPPRG00000002730)	SP6 (ENSPPRG00000016089)	SP2 (ENSPPRG00000003332) #22	PNPO (ENSPPRG00000005037)	CDK5RAP3 (ENSPPRG00000006376) #23	COPZ2 (ENSPPRG00000006801)	NFE2L1 (ENSPPRG00000009101)	CBX1 (ENSPPRG00000009475)	SNX11 (ENSPPRG00000012061)	SKAP1 (ENSPPRG00000015336)	ENSPPRG00000016613	ENSPPRG00000017115	HOXB1 (ENSPPRG00000017656)	HOXB2 (ENSPPRG00000020926)	HOXB3 (ENSPPRG00000022415)	HOXB4 (ENSPPRG00000000220)	HOXB5 (ENSPPRG00000000333)	HOXB6 (ENSPPRG00000000532)
Tiger	MODERN SPECIES	230	PCGF2 (ENSPTIG00000013278)	CISD3 (ENSPTIG00000012358)	MLLT6 (ENSPTIG00000007153)	SRCIN1 (ENSPTIG00000021759)	ARHGAP23 (ENSPTIG00000018889)	SOCS7 (ENSPTIG00000017283)	MRPL45 (ENSPTIG00000013013)	NPEPPS (ENSPTIG00000010447)	KPNB1 (ENSPTIG00000006870)	ENSPTIG00000005274	TBX21 (ENSPTIG00000001553)	ENSPTIG00000019388	MRPL10 (ENSPTIG00000018968)	LRRC46 (ENSPTIG00000018466)	SCRN2 (ENSPTIG00000016232)	SP2 (ENSPTIG00000014873) #22	PNPO (ENSPTIG00000012157)	CDK5RAP3 (ENSPTIG00000009086) #23	COPZ2 (ENSPTIG00000007508)	ENSPTIG00000007047	NFE2L1 (ENSPTIG00000021715)	CBX1 (ENSPTIG00000020896)	SNX11 (ENSPTIG00000018316)	SKAP1 (ENSPTIG00000016493)	HOXB1 (ENSPTIG00000015694)	HOXB2 (ENSPTIG00000015306)	HOXB4 (ENSPTIG00000014995)	HOXB5 (ENSPTIG00000014877)	HOXB7 (ENSPTIG00000014471)	ENSPTIG00000013326	TTLL6 (ENSPTIG00000010570)
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00860000135964	ENSGT00930000153020	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000185410	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Dingo	MODERN SPECIES	150	ENSCAFG00020023090	ARHGAP23 (ENSCAFG00020023111)	SOCS7 (ENSCAFG00020023179)	GPR179 (ENSCAFG00020023180)	MRPL45 (ENSCAFG00020023186)	ENSCAFG00020023199	NPEPPS (ENSCAFG00020023203)	KPNB1 (ENSCAFG00020023205)	TBKBP1 (ENSCAFG00020023210)	TBX21 (ENSCAFG00020023221)	OSBPL7 (ENSCAFG00020023225)	MRPL10 (ENSCAFG00020023232)	LRRC46 (ENSCAFG00020023236)	SCRN2 (ENSCAFG00020023238)	SP6 (ENSCAFG00020023243)	SP2 (ENSCAFG00020023246) #22	PNPO (ENSCAFG00020023249)	PRR15L (ENSCAFG00020023256)	CDK5RAP3 (ENSCAFG00020023258) #23	COPZ2 (ENSCAFG00020023263)	NFE2L1 (ENSCAFG00020023270)	CBX1 (ENSCAFG00020023275)	SNX11 (ENSCAFG00020023282)	SKAP1 (ENSCAFG00020023287)	HOXB1 (ENSCAFG00020023290)	HOXB2 (ENSCAFG00020023293)	HOXB3 (ENSCAFG00020023294)	HOXB4 (ENSCAFG00020023297)	HOXB5 (ENSCAFG00020023301)	HOXB6 (ENSCAFG00020023302)	ENSCAFG00020023303
Dog	MODERN SPECIES	37	EPOP (ENSCAFG00845014204)	SRCIN1 (ENSCAFG00845014295)	ARHGAP23 (ENSCAFG00845014513)	SOCS7 (ENSCAFG00845014686)	GPR179 (ENSCAFG00845014777)	ENSCAFG00845014840	NPEPPS (ENSCAFG00845014931)	KPNB1 (ENSCAFG00845015226)	TBKBP1 (ENSCAFG00845015281)	TBX21 (ENSCAFG00845015330)	OSBPL7 (ENSCAFG00845015415)	MRPL10 (ENSCAFG00845015539)	LRRC46 (ENSCAFG00845015603)	SCRN2 (ENSCAFG00845015686)	SP6 (ENSCAFG00845015746)	SP2 (ENSCAFG00845015786) #22	PNPO (ENSCAFG00845015876)	PRR15L (ENSCAFG00845015978)	ENSCAFG00845016000	CDK5RAP3 (ENSCAFG00845016051) #23	COPZ2 (ENSCAFG00845016156)	NFE2L1 (ENSCAFG00845016388)	CBX1 (ENSCAFG00845016596)	SNX11 (ENSCAFG00845016720)	SKAP1 (ENSCAFG00845016959)	HOXB1 (ENSCAFG00845017096)	HOXB2 (ENSCAFG00845017142)	HOXB3 (ENSCAFG00845017188)	HOXB4 (ENSCAFG00845017264)	HOXB5 (ENSCAFG00845009832)	HOXB6 (ENSCAFG00845009871)
Red fox	MODERN SPECIES	20	EPOP (ENSVVUG00000002338)	SRCIN1 (ENSVVUG00000002377)	ARHGAP23 (ENSVVUG00000002610)	SOCS7 (ENSVVUG00000002941)	GPR179 (ENSVVUG00000002981)	MRPL45 (ENSVVUG00000003030)	NPEPPS (ENSVVUG00000003061)	KPNB1 (ENSVVUG00000003085)	ENSVVUG00000003100	TBX21 (ENSVVUG00000003106)	ENSVVUG00000003127	MRPL10 (ENSVVUG00000003141)	LRRC46 (ENSVVUG00000003146)	SCRN2 (ENSVVUG00000003154)	SP6 (ENSVVUG00000003167)	SP2 (ENSVVUG00000003171) #22	PNPO (ENSVVUG00000003178)	PRR15L (ENSVVUG00000003218)	CDK5RAP3 (ENSVVUG00000003227) #23	COPZ2 (ENSVVUG00000003249)	NFE2L1 (ENSVVUG00000003262)	ENSVVUG00000003272	SNX11 (ENSVVUG00000003276)	SKAP1 (ENSVVUG00000003297)	HOXB1 (ENSVVUG00000003325)	HOXB2 (ENSVVUG00000003328)	HOXB3 (ENSVVUG00000003329)	ENSVVUG00000003340	HOXB5 (ENSVVUG00000003354)	HOXB6 (ENSVVUG00000003359)	HOXB7 (ENSVVUG00000003360)
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00860000135964	ENSGT00930000153020	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000185410	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00860000135964	ENSGT00930000153020	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000185410	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
American mink	MODERN SPECIES	92	ENSNVIG00000005132	ENSNVIG00000005143	ARHGAP23 (ENSNVIG00000005156)	SOCS7 (ENSNVIG00000005194)	GPR179 (ENSNVIG00000005217)	MRPL45 (ENSNVIG00000005287)	NPEPPS (ENSNVIG00000005313)	KPNB1 (ENSNVIG00000005359)	ENSNVIG00000005426	TBX21 (ENSNVIG00000005442)	OSBPL7 (ENSNVIG00000005460)	RM10 (ENSNVIG00000005608)	LRRC46 (ENSNVIG00000005619)	SCRN2 (ENSNVIG00000005641)	SP6 (ENSNVIG00000005667)	SP2 (ENSNVIG00000005673) #22	PNPO (ENSNVIG00000005692)	PR15L (ENSNVIG00000005731)	CDK5RAP3 (ENSNVIG00000005742) #23	COPZ2 (ENSNVIG00000005837)	ENSNVIG00000005842	NFE2L1 (ENSNVIG00000005857)	CBX1 (ENSNVIG00000005946)	SNX11 (ENSNVIG00000005959)	SKAP1 (ENSNVIG00000005974)	ENSNVIG00000006009	HOXB1 (ENSNVIG00000006017)	HOXB2 (ENSNVIG00000006024)	HOXB3 (ENSNVIG00000006032)	HOXB4 (ENSNVIG00000006040)	HOXB5 (ENSNVIG00000006049)
Ferret	MODERN SPECIES	270	ARHGAP23 (ENSMPUG00000015145)	SOCS7 (ENSMPUG00000015192)	GPR179 (ENSMPUG00000015211)	MRPL45 (ENSMPUG00000015218)	NPEPPS (ENSMPUG00000015219)	KPNB1 (ENSMPUG00000015220)	TBKBP1 (ENSMPUG00000015271)	TBX21 (ENSMPUG00000015272)	ENSMPUG00000015273	ENSMPUG00000015275	OSBPL7 (ENSMPUG00000015276)	MRPL10 (ENSMPUG00000015278)	LRRC46 (ENSMPUG00000015287)	SCRN2 (ENSMPUG00000015288)	SP6 (ENSMPUG00000020086)	SP2 (ENSMPUG00000015289) #22	PNPO (ENSMPUG00000015290)	PRR15L (ENSMPUG00000020087)	CDK5RAP3 (ENSMPUG00000015291) #23	COPZ2 (ENSMPUG00000015292)	NFE2L1 (ENSMPUG00000015301)	CBX1 (ENSMPUG00000015302)	SNX11 (ENSMPUG00000015303)	SKAP1 (ENSMPUG00000015305)	HOXB1 (ENSMPUG00000015307)	HOXB2 (ENSMPUG00000015309)	HOXB4 (ENSMPUG00000015310)	HOXB5 (ENSMPUG00000015316)	HOXB6 (ENSMPUG00000015322)	HOXB7 (ENSMPUG00000015328)	HOXB8 (ENSMPUG00000015329)
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000185410	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Giant Panda	MODERN SPECIES	4	MLLT6 (ENSAMEG00000004398)	ENSAMEG00000004480	SRCIN1 (ENSAMEG00000004436)	ARHGAP23 (ENSAMEG00000024032)	SOCS7 (ENSAMEG00000004494)	ENSAMEG00000029558	ENSAMEG00000004511	ENSAMEG00000004523	KPNB1 (ENSAMEG00000004613)	TBKBP1 (ENSAMEG00000004659)	TBX21 (ENSAMEG00000004661)	OSBPL7 (ENSAMEG00000004670)	MRPL10 (ENSAMEG00000004722)	LRRC46 (ENSAMEG00000004734)	SCRN2 (ENSAMEG00000004751)	SP2 (ENSAMEG00000004772) #22	PNPO (ENSAMEG00000004786)	PRR15L (ENSAMEG00000025744)	CDK5RAP3 (ENSAMEG00000004818) #23	ENSAMEG00000030152	COPZ2 (ENSAMEG00000004850)	NFE2L1 (ENSAMEG00000004881)	CBX1 (ENSAMEG00000004890)	SNX11 (ENSAMEG00000004898)	SKAP1 (ENSAMEG00000004919)	HOXB1 (ENSAMEG00000004935)	HOXB2 (ENSAMEG00000030987)	HOXB3 (ENSAMEG00000027375)	HOXB4 (ENSAMEG00000028329)	HOXB5 (ENSAMEG00000004967)	HOXB6 (ENSAMEG00000004971)
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	67		ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00390000005809.c.b	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000185410	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
American black bear	MODERN SPECIES	1414												MRPL10 (ENSUAMG00000017142)	LRRC46 (ENSUAMG00000017138)	SCRN2 (ENSUAMG00000017135)	SP6 (ENSUAMG00000017132)	SP2 (ENSUAMG00000017127) #22	PNPO (ENSUAMG00000017122)	PRR15L (ENSUAMG00000017119)	CDK5RAP3 (ENSUAMG00000017117) #23	COPZ2 (ENSUAMG00000017115)	ENSUAMG00000017113	NFE2L1 (ENSUAMG00000017111)	CBX1 (ENSUAMG00000017105)	SNX11 (ENSUAMG00000017102)
Polar bear	MODERN SPECIES	94			ARHGAP23 (ENSUMAG00000016886)	SOCS7 (ENSUMAG00000016879)	ENSUMAG00000016874	MRPL45 (ENSUMAG00000016869)	NPEPPS (ENSUMAG00000016765)	ENSUMAG00000016745	KPNB1 (ENSUMAG00000016471)	ENSUMAG00000016425	ENSUMAG00000016418	OSBPL7 (ENSUMAG00000016080)	MRPL10 (ENSUMAG00000016024)	LRRC46 (ENSUMAG00000016015)	SCRN2 (ENSUMAG00000016006)	SP2 (ENSUMAG00000015996) #22	PNPO (ENSUMAG00000015992)	PRR15L (ENSUMAG00000015982)	ENSUMAG00000015972 #23	ENSUMAG00000015965 #23	ENSUMAG00000015942	NFE2L1 (ENSUMAG00000015890)	CBX1 (ENSUMAG00000015878)	SNX11 (ENSUMAG00000015873)	SKAP1 (ENSUMAG00000015835)	HOXB1 (ENSUMAG00000015821)	HOXB5 (ENSUMAG00000015806)	HOXB7 (ENSUMAG00000015795)	ENSUMAG00000015785	TTLL6 (ENSUMAG00000015764)	CALCOCO2 (ENSUMAG00000015754)
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00950000185410	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00980000199681	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354
Primates	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00950000185410	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00980000199681	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354
Strepsirrhini	DUPLICATION
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159590.g #22
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159590.g #22
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159590.g #22
Greater bamboo lemur	DUPLICATION
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	2232																ENSPSMG00000003078 #22
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	107	ENSPSMG00000008308	SRCIN1 (ENSPSMG00000008297)	ARHGAP23 (ENSPSMG00000008194)	SOCS7 (ENSPSMG00000008100)	GPR179 (ENSPSMG00000008075)	MRPL45 (ENSPSMG00000008060)	NPEPPS (ENSPSMG00000007984)	KPNB1 (ENSPSMG00000007848)	TBKBP1 (ENSPSMG00000007810)	TBX21 (ENSPSMG00000007791)	OSBPL7 (ENSPSMG00000007730)	MRPL10 (ENSPSMG00000007514)	LRRC46 (ENSPSMG00000007500)	SCRN2 (ENSPSMG00000007491)	SP6 (ENSPSMG00000007463)	ENSPSMG00000007462 #22	SP2 (ENSPSMG00000007456) #22	PNPO (ENSPSMG00000007445)	PRR15L (ENSPSMG00000007406)	ENSPSMG00000007395 #23	ENSPSMG00000007342	ENSPSMG00000007339	NFE2L1 (ENSPSMG00000007285)
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590.h #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00950000185410	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590.h #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00950000185410	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Mouse lemur	MODERN SPECIES	7	MLLT6 (ENSMICG00000002976)	SRCIN1 (ENSMICG00000000639)	ARHGAP23 (ENSMICG00000000638)	SOCS7 (ENSMICG00000000636)	GPR179 (ENSMICG00000000628)	MRPL45 (ENSMICG00000000626)	NPEPPS (ENSMICG00000012034)	KPNB1 (ENSMICG00000012059)	TBKBP1 (ENSMICG00000012069)	TBX21 (ENSMICG00000035345)	OSBPL7 (ENSMICG00000004799)	MRPL10 (ENSMICG00000048091)	LRRC46 (ENSMICG00000004816)	SCRN2 (ENSMICG00000004823)	SP6 (ENSMICG00000047695)	SP2 (ENSMICG00000036051) #22	ENSMICG00000014065	CDK5RAP3 (ENSMICG00000014077) #23	COPZ2 (ENSMICG00000014097)	ENSMICG00000009510	NFE2L1 (ENSMICG00000014716)	SNX11 (ENSMICG00000014741)	ENSMICG00000029923	SKAP1 (ENSMICG00000047158)	HOXB1 (ENSMICG00000048152)	HOXB2 (ENSMICG00000038222)	HOXB3 (ENSMICG00000007522)	HOXB4 (ENSMICG00000043173)	HOXB5 (ENSMICG00000047139)	HOXB6 (ENSMICG00000042216)	HOXB7 (ENSMICG00000007539)
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590.h #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00950000185410	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	120	SRCIN1 (ENSPCOG00000008761)	ARHGAP23 (ENSPCOG00000013530)	SOCS7 (ENSPCOG00000023874)	GPR179 (ENSPCOG00000007958)	MRPL45 (ENSPCOG00000014660)	ENSPCOG00000027158	ENSPCOG00000014331	KPNB1 (ENSPCOG00000026259)	TBKBP1 (ENSPCOG00000026427)	TBX21 (ENSPCOG00000014387)	OSBPL7 (ENSPCOG00000019714)	MRPL10 (ENSPCOG00000025492)	LRRC46 (ENSPCOG00000015829)	SCRN2 (ENSPCOG00000014438)	SP6 (ENSPCOG00000008529)	SP2 (ENSPCOG00000017198) #22	PNPO (ENSPCOG00000017906)	CDK5RAP3 (ENSPCOG00000016598) #23	COPZ2 (ENSPCOG00000018359)	NFE2L1 (ENSPCOG00000021740)	ENSPCOG00000010902	SNX11 (ENSPCOG00000011015)	SKAP1 (ENSPCOG00000022221)	HOXB1 (ENSPCOG00000025930)	HOXB2 (ENSPCOG00000017380)	HOXB3 (ENSPCOG00000020113)	HOXB4 (ENSPCOG00000022963)	HOXB5 (ENSPCOG00000015692)	HOXB6 (ENSPCOG00000019931)	HOXB7 (ENSPCOG00000028248)	HOXB8 (ENSPCOG00000024853)
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	107	SRCIN1 (ENSPSMG00000008297)	ARHGAP23 (ENSPSMG00000008194)	SOCS7 (ENSPSMG00000008100)	GPR179 (ENSPSMG00000008075)	MRPL45 (ENSPSMG00000008060)	NPEPPS (ENSPSMG00000007984)	KPNB1 (ENSPSMG00000007848)	TBKBP1 (ENSPSMG00000007810)	TBX21 (ENSPSMG00000007791)	OSBPL7 (ENSPSMG00000007730)	MRPL10 (ENSPSMG00000007514)	LRRC46 (ENSPSMG00000007500)	SCRN2 (ENSPSMG00000007491)	SP6 (ENSPSMG00000007463)	ENSPSMG00000007462 #22	SP2 (ENSPSMG00000007456) #22	PNPO (ENSPSMG00000007445)	PRR15L (ENSPSMG00000007406)	ENSPSMG00000007395 #23	ENSPSMG00000007342	ENSPSMG00000007339	NFE2L1 (ENSPSMG00000007285)
Bushbaby	MODERN SPECIES	133	EPOP (ENSOGAG00000030366)	SRCIN1 (ENSOGAG00000009948)	ARHGAP23 (ENSOGAG00000030856)	SOCS7 (ENSOGAG00000012422)	GPR179 (ENSOGAG00000031431)	MRPL45 (ENSOGAG00000015816)	NPEPPS (ENSOGAG00000006365)	KPNB1 (ENSOGAG00000006153)	TBKBP1 (ENSOGAG00000032523)	TBX21 (ENSOGAG00000006160)	OSBPL7 (ENSOGAG00000006166)	MRPL10 (ENSOGAG00000006173)	LRRC46 (ENSOGAG00000006177)	SCRN2 (ENSOGAG00000006181)	SP6 (ENSOGAG00000030282)	SP2 (ENSOGAG00000030380) #22	PNPO (ENSOGAG00000006186)	PRR15L (ENSOGAG00000006187)	CDK5RAP3 (ENSOGAG00000004951) #23	COPZ2 (ENSOGAG00000004954)	NFE2L1 (ENSOGAG00000025191)	CBX1 (ENSOGAG00000005658)	SNX11 (ENSOGAG00000015854)	SKAP1 (ENSOGAG00000015855)	HOXB1 (ENSOGAG00000031645)	HOXB2 (ENSOGAG00000029280)	HOXB3 (ENSOGAG00000032090)	HOXB4 (ENSOGAG00000033709)	HOXB5 (ENSOGAG00000032432)	HOXB6 (ENSOGAG00000008661)	HOXB7 (ENSOGAG00000008667)
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00980000199681	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Tarsier	MODERN SPECIES	7208											OSBPL7 (ENSTSYG00000014378)	MRPL10 (ENSTSYG00000034759)	LRRC46 (ENSTSYG00000003710)	SCRN2 (ENSTSYG00000003730)	SP6 (ENSTSYG00000031192)	SP2 (ENSTSYG00000013766) #22	PNPO (ENSTSYG00000002012)	CDK5RAP3 (ENSTSYG00000010313) #23	COPZ2 (ENSTSYG00000030074)	NFE2L1 (ENSTSYG00000011468)	CBX1 (ENSTSYG00000034806)	SNX11 (ENSTSYG00000035487)	SKAP1 (ENSTSYG00000008218)
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898.b	ENSGT00550000074898.a	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898.b	ENSGT00550000074898.a	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000154172.gb.b.b.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898.b	ENSGT00550000074898.a	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000154172.gb.b.b.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Capuchin	MODERN SPECIES	228	ENSCCAG00000023743	SRCIN1 (ENSCCAG00000029783)	ARHGAP23 (ENSCCAG00000025162)	SOCS7 (ENSCCAG00000033044)	GPR179 (ENSCCAG00000037056)	MRPL45 (ENSCCAG00000034579)	NPEPPS (ENSCCAG00000035472)	ENSCCAG00000029263	TBKBP1 (ENSCCAG00000026129)	TBX21 (ENSCCAG00000026112)	OSBPL7 (ENSCCAG00000034097)	MRPL10 (ENSCCAG00000023150)	LRRC46 (ENSCCAG00000030568)	SCRN2 (ENSCCAG00000031435)	SP6 (ENSCCAG00000020330)	SP2 (ENSCCAG00000038047) #22	PNPO (ENSCCAG00000029175)	CDK5RAP3 (ENSCCAG00000038053) #23	COPZ2 (ENSCCAG00000021292)	NFE2L1 (ENSCCAG00000029090)	CBX1 (ENSCCAG00000025085)	SNX11 (ENSCCAG00000030167)	SKAP1 (ENSCCAG00000035663)	ENSCCAG00000019181	HOXB1 (ENSCCAG00000027667)	HOXB2 (ENSCCAG00000024035)	HOXB3 (ENSCCAG00000013598)	HOXB4 (ENSCCAG00000020311)	HOXB5 (ENSCCAG00000036867)	HOXB6 (ENSCCAG00000022842)	HOXB8 (ENSCCAG00000026051)
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	86	ENSSBOG00000020882	ARHGAP23 (ENSSBOG00000017157)	SOCS7 (ENSSBOG00000031544)	GPR179 (ENSSBOG00000022698)	MRPL45 (ENSSBOG00000028242)	NPEPPS (ENSSBOG00000032725)	KPNB1 (ENSSBOG00000030025)	ENSSBOG00000014766	ENSSBOG00000029189	TBX21 (ENSSBOG00000028744)	OSBPL7 (ENSSBOG00000033435)	MRPL10 (ENSSBOG00000004214)	LRRC46 (ENSSBOG00000026980)	SCRN2 (ENSSBOG00000027391)	SP6 (ENSSBOG00000014210)	SP2 (ENSSBOG00000029098) #22	PNPO (ENSSBOG00000021213)	PRR15L (ENSSBOG00000019240)	CDK5RAP3 (ENSSBOG00000033272) #23	COPZ2 (ENSSBOG00000033633)	NFE2L1 (ENSSBOG00000023867)	ENSSBOG00000031880	SNX11 (ENSSBOG00000026967)	SKAP1 (ENSSBOG00000029434)	ENSSBOG00000019520	HOXB1 (ENSSBOG00000034875)	HOXB2 (ENSSBOG00000025070)	HOXB3 (ENSSBOG00000030844)	HOXB4 (ENSSBOG00000024432)	HOXB5 (ENSSBOG00000018198)	HOXB6 (ENSSBOG00000031900)
Marmoset	MODERN SPECIES	17	ARHGAP23 (ENSCJAG00000008112)	ENSCJAG00000008111	SOCS7 (ENSCJAG00000008108)	GPR179 (ENSCJAG00000008100)	MRPL45 (ENSCJAG00000008080)	ENSCJAG00000048573	NPEPPS (ENSCJAG00000007985)	KPNB1 (ENSCJAG00000007834)	TBKBP1 (ENSCJAG00000045710)	TBX21 (ENSCJAG00000007796)	OSBPL7 (ENSCJAG00000007585)	MRPL10 (ENSCJAG00000007787)	LRRC46 (ENSCJAG00000007776)	SCRN2 (ENSCJAG00000047705)	SP6 (ENSCJAG00000043946)	SP2 (ENSCJAG00000007713) #22	PNPO (ENSCJAG00000007693)	PRR15L (ENSCJAG00000044487)	CDK5RAP3 (ENSCJAG00000007669) #23	COPZ2 (ENSCJAG00000007567)	ENSCJAG00000058197	NFE2L1 (ENSCJAG00000007542)	CBX1 (ENSCJAG00000042052)	SNX11 (ENSCJAG00000039549)	SKAP1 (ENSCJAG00000007504)	ENSCJAG00000038853	HOXB1 (ENSCJAG00000007496)	HOXB2 (ENSCJAG00000007494)	HOXB3 (ENSCJAG00000007487)	HOXB4 (ENSCJAG00000007480)	HOXB5 (ENSCJAG00000007472)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	481	ENSANAG00000022130	ARHGAP23 (ENSANAG00000026348)	SOCS7 (ENSANAG00000028278)	GPR179 (ENSANAG00000033667)	MRPL45 (ENSANAG00000028167)	NPEPPS (ENSANAG00000028371)	ENSANAG00000019395	ENSANAG00000024932	TBKBP1 (ENSANAG00000020710)	TBX21 (ENSANAG00000037999)	OSBPL7 (ENSANAG00000021406)	MRPL10 (ENSANAG00000022792)	LRRC46 (ENSANAG00000028496)	SCRN2 (ENSANAG00000021482)	SP6 (ENSANAG00000019338)	SP2 (ENSANAG00000032738) #22	PNPO (ENSANAG00000026080)	CDK5RAP3 (ENSANAG00000021880) #23	COPZ2 (ENSANAG00000023309)	NFE2L1 (ENSANAG00000027606)	ENSANAG00000036853	SNX11 (ENSANAG00000022588)	SKAP1 (ENSANAG00000026853)	ENSANAG00000023400	HOXB1 (ENSANAG00000032306)	HOXB2 (ENSANAG00000023626)	HOXB3 (ENSANAG00000032072)	HOXB4 (ENSANAG00000024005)	HOXB5 (ENSANAG00000024299)	HOXB6 (ENSANAG00000023964)	HOXB7 (ENSANAG00000025513)
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603.b	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246.j.b.b	ENSGT00940000155246.i	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603.b	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713.h.b #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246.j.b.b	ENSGT00940000155246.i	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603.b	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713.h.a #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00530000063282.t.h.a.b.d	ENSGT00940000155111.h	ENSGT00950000182950.C.a.a	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a	ENSGT01090000259987.b.b.a.a.b	ENSGT00390000004027	ENSGT00940000155246.j.b.a	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603.b	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713.h.a.a.b #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00530000063282.t.h.a.b.d	ENSGT00950000182950.C.a.a	ENSGT00950000182950.C.a.b.a	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a	ENSGT01090000259987.b.b.a.a.b	ENSGT00390000004027	ENSGT00940000155246.j.b.a	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603.b	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713.h.a.a.b #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Pan	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00530000063282.t.h.a.b.d	ENSGT00950000182950.C.a.a	ENSGT01030000234570.d.b.a.b.a	ENSGT01090000259987.b.b.a.a.b	ENSGT00390000004027	ENSGT00940000153464.A.b.b	ENSGT00940000155246.j.b.a	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603.b	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713.h.a.a.b #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Bonobo	MODERN SPECIES	8	CDC27 (ENSPPAG00000035989)	MYL4 (ENSPPAG00000032176)	ITGB3 (ENSPPAG00000030328)	ENSPPAG00000019537	ENSPPAG00000041328	ENSPPAG00000031240	ENSPPAG00000041383	KPNB1 (ENSPPAG00000028842)	ENSPPAG00000040088	TBX21 (ENSPPAG00000033988)	OSBPL7 (ENSPPAG00000027887)	MRPL10 (ENSPPAG00000034452)	LRRC46 (ENSPPAG00000038983)	SCRN2 (ENSPPAG00000028214)	SP6 (ENSPPAG00000026169)	SP2 (ENSPPAG00000027065) #22	PNPO (ENSPPAG00000038148)	PRR15L (ENSPPAG00000003316)	ENSPPAG00000029145 #23	COPZ2 (ENSPPAG00000043351)	NFE2L1 (ENSPPAG00000031737)	ENSPPAG00000030413	SNX11 (ENSPPAG00000033185)	SKAP1 (ENSPPAG00000039277)	HOXB1 (ENSPPAG00000039129)	HOXB2 (ENSPPAG00000027417)	HOXB3 (ENSPPAG00000032630)	HOXB4 (ENSPPAG00000040659)	HOXB5 (ENSPPAG00000039181)	HOXB6 (ENSPPAG00000032229)	HOXB7 (ENSPPAG00000010963)
Chimpanzee	MODERN SPECIES	8	ENSPTRG00000051416	CDC27 (ENSPTRG00000009326)	MYL4 (ENSPTRG00000024314)	EFCAB13 (ENSPTRG00000009329)	ENSPTRG00000045761	ENSPTRG00000048037	NPEPPS (ENSPTRG00000009330)	KPNB1 (ENSPTRG00000009333)	TBKBP1 (ENSPTRG00000009334)	TBX21 (ENSPTRG00000009335)	OSBPL7 (ENSPTRG00000009336)	MRPL10 (ENSPTRG00000009337)	LRRC46 (ENSPTRG00000009338)	SCRN2 (ENSPTRG00000009339)	SP6 (ENSPTRG00000009340)	SP2 (ENSPTRG00000009342) #22	PNPO (ENSPTRG00000009343)	PRR15L (ENSPTRG00000047216)	CDK5RAP3 (ENSPTRG00000009345) #23	COPZ2 (ENSPTRG00000009346)	NFE2L1 (ENSPTRG00000022631)	CBX1 (ENSPTRG00000052115)	SNX11 (ENSPTRG00000009349)	SKAP1 (ENSPTRG00000009350)	HOXB1 (ENSPTRG00000009351)	HOXB2 (ENSPTRG00000009352)	HOXB3 (ENSPTRG00000052423)	HOXB4 (ENSPTRG00000009354)	HOXB5 (ENSPTRG00000009355)	HOXB6 (ENSPTRG00000009356)	HOXB7 (ENSPTRG00000009357)
Human	MODERN SPECIES	8	GOSR2 (ENSG00000108433)	RPRML (ENSG00000179673)	CDC27 (ENSG00000004897)	MYL4 (ENSG00000198336)	ITGB3 (ENSG00000259207)	EFCAB13 (ENSG00000178852)	NPEPPS (ENSG00000141279)	KPNB1 (ENSG00000108424)	TBKBP1 (ENSG00000198933)	TBX21 (ENSG00000073861)	OSBPL7 (ENSG00000006025)	MRPL10 (ENSG00000159111)	LRRC46 (ENSG00000141294)	SCRN2 (ENSG00000141295)	SP6 (ENSG00000189120)	SP2 (ENSG00000167182) #22	PNPO (ENSG00000108439)	PRR15L (ENSG00000167183)	CDK5RAP3 (ENSG00000108465) #23	COPZ2 (ENSG00000005243)	NFE2L1 (ENSG00000082641)	CBX1 (ENSG00000108468)	SNX11 (ENSG00000002919)	SKAP1 (ENSG00000141293)	HOXB1 (ENSG00000120094)	HOXB2 (ENSG00000173917)	HOXB3 (ENSG00000120093)	HOXB4 (ENSG00000182742)	HOXB5 (ENSG00000120075)	HOXB6 (ENSG00000108511)	HOXB7 (ENSG00000260027)
Gorilla	MODERN SPECIES	18	ENSGGOG00000040439	CDC27 (ENSGGOG00000014729)	MYL4 (ENSGGOG00000009722)	ITGB3 (ENSGGOG00000007757)	ENSGGOG00000023488	EFCAB13 (ENSGGOG00000022715)	ENSGGOG00000022991	KPNB1 (ENSGGOG00000008089)	TBKBP1 (ENSGGOG00000002206)	TBX21 (ENSGGOG00000002208)	OSBPL7 (ENSGGOG00000015344)	MRPL10 (ENSGGOG00000015353)	LRRC46 (ENSGGOG00000012667)	SCRN2 (ENSGGOG00000004547)	SP6 (ENSGGOG00000036261)	SP2 (ENSGGOG00000005330) #22	PNPO (ENSGGOG00000003786)	PRR15L (ENSGGOG00000037816)	ENSGGOG00000022994 #23	COPZ2 (ENSGGOG00000002264)	NFE2L1 (ENSGGOG00000002268)	CBX1 (ENSGGOG00000024063)	ENSGGOG00000025896	SKAP1 (ENSGGOG00000012624)	HOXB1 (ENSGGOG00000009904)	HOXB2 (ENSGGOG00000009910)	HOXB3 (ENSGGOG00000012838)	HOXB5 (ENSGGOG00000023582)	HOXB6 (ENSGGOG00000002634)	HOXB7 (ENSGGOG00000002637)	HOXB8 (ENSGGOG00000039810)
Orangutan	MODERN SPECIES	8	SRCIN1 (ENSPPYG00000008871)	ARHGAP23 (ENSPPYG00000008872)	SOCS7 (ENSPPYG00000008873)	ENSPPYG00000039847	GPR179 (ENSPPYG00000008874)	MRPL45 (ENSPPYG00000008876)	NPEPPS (ENSPPYG00000008877)	KPNB1 (ENSPPYG00000025935)	TBKBP1 (ENSPPYG00000008878)	TBX21 (ENSPPYG00000008879)	OSBPL7 (ENSPPYG00000008880)	MRPL10 (ENSPPYG00000008881)	LRRC46 (ENSPPYG00000032761)	SCRN2 (ENSPPYG00000008883)	SP6 (ENSPPYG00000008884)	SP2 (ENSPPYG00000008885) #22	PNPO (ENSPPYG00000040967)	PRR15L (ENSPPYG00000008887)	CDK5RAP3 (ENSPPYG00000008888) #23	ENSPPYG00000008889	NFE2L1 (ENSPPYG00000036998)	ENSPPYG00000008891	SNX11 (ENSPPYG00000008892)	SKAP1 (ENSPPYG00000008893)	HOXB1 (ENSPPYG00000008894)	HOXB2 (ENSPPYG00000008895)	HOXB3 (ENSPPYG00000008896)	HOXB4 (ENSPPYG00000008897)	HOXB5 (ENSPPYG00000008898)	HOXB6 (ENSPPYG00000008899)	HOXB7 (ENSPPYG00000008901)
Gibbon	MODERN SPECIES	105								KPNB1 (ENSNLEG00000001446)	ENSNLEG00000032565	ENSNLEG00000001655	OSBPL7 (ENSNLEG00000001657)	MRPL10 (ENSNLEG00000001803)	LRRC46 (ENSNLEG00000001902)	SCRN2 (ENSNLEG00000001940)	SP6 (ENSNLEG00000002050)	ENSNLEG00000002058 #22	PNPO (ENSNLEG00000002062)	PRR15L (ENSNLEG00000002102)	ENSNLEG00000002109 #23	ENSNLEG00000002409	NFE2L1 (ENSNLEG00000002415)	ENSNLEG00000002435	SNX11 (ENSNLEG00000002479)	SKAP1 (ENSNLEG00000002519)	ENSNLEG00000018815	HOXB2 (ENSNLEG00000002566)	HOXB4 (ENSNLEG00000002570)	HOXB5 (ENSNLEG00000002574)	HOXB6 (ENSNLEG00000002585)	ENSNLEG00000029075	ENSNLEG00000036120
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679.n	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603.b	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679.m	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603.b	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1661												OCRL (ENSRBIG00000041702)	ENSRBIG00000040735	TXNDC2 (ENSRBIG00000040108)	ENSRBIG00000039530	SP2 (ENSRBIG00000032526) #22	PNPO (ENSRBIG00000042160)	PRR15L (ENSRBIG00000030176)	CDK5RAP3 (ENSRBIG00000039441) #23	COPZ2 (ENSRBIG00000038810)	NFE2L1 (ENSRBIG00000034817)	ENSRBIG00000027048	SNX11 (ENSRBIG00000030129)	SKAP1 (ENSRBIG00000042563)	HOXB1 (ENSRBIG00000041849)	HOXB2 (ENSRBIG00000029105)	HOXB3 (ENSRBIG00000036705)	HOXB4 (ENSRBIG00000036141)	HOXB5 (ENSRBIG00000015821)	HOXB6 (ENSRBIG00000029050)	HOXB7 (ENSRBIG00000039896)
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	585											OSBPL7 (ENSRROG00000017659)	MRPL10 (ENSRROG00000033938)	LRRC46 (ENSRROG00000039559)	SCRN2 (ENSRROG00000037252)	SP6 (ENSRROG00000008983)	SP2 (ENSRROG00000037481) #22	PNPO (ENSRROG00000044027)	PRR15L (ENSRROG00000009484)	CDK5RAP3 (ENSRROG00000044651) #23	COPZ2 (ENSRROG00000030969)	NFE2L1 (ENSRROG00000044774)	CBX1 (ENSRROG00000041227)	SNX11 (ENSRROG00000029464)	SKAP1 (ENSRROG00000031517)	HOXB1 (ENSRROG00000042747)	HOXB2 (ENSRROG00000044849)	HOXB3 (ENSRROG00000037630)	HOXB5 (ENSRROG00000030674)	HOXB6 (ENSRROG00000028093)	HOXB7 (ENSRROG00000035066)	HOXB8 (ENSRROG00000045349)
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679.n	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603.b	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	7	EPOP (ENSCSAG00000019040)	SRCIN1 (ENSCSAG00000002635)	ARHGAP23 (ENSCSAG00000002632)	SOCS7 (ENSCSAG00000002628)	GPR179 (ENSCSAG00000002621)	ENSCSAG00000002616	NPEPPS (ENSCSAG00000002610)	KPNB1 (ENSCSAG00000002605)	TBKBP1 (ENSCSAG00000002598)	TBX21 (ENSCSAG00000002587)	OSBPL7 (ENSCSAG00000002580)	MRPL10 (ENSCSAG00000002576)	LRRC46 (ENSCSAG00000002574)	SCRN2 (ENSCSAG00000002569)	SP6 (ENSCSAG00000019041)	SP2 (ENSCSAG00000002567) #22	PNPO (ENSCSAG00000002565)	PRR15L (ENSCSAG00000019042)	CDK5RAP3 (ENSCSAG00000002562) #23	COPZ2 (ENSCSAG00000002558)	NFE2L1 (ENSCSAG00000002550)	CBX1 (ENSCSAG00000002547)	SNX11 (ENSCSAG00000002545)	SKAP1 (ENSCSAG00000002542)	ENSCSAG00000019043	HOXB1 (ENSCSAG00000002538)	HOXB2 (ENSCSAG00000002536)	HOXB3 (ENSCSAG00000002533)	HOXB4 (ENSCSAG00000002530)	HOXB5 (ENSCSAG00000002529)	HOXB6 (ENSCSAG00000002526)
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679.n	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603.b	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679.n	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603.b	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Olive baboon	MODERN SPECIES	8	ENSPANG00000041026	SRCIN1 (ENSPANG00000022035)	ARHGAP23 (ENSPANG00000022030)	SOCS7 (ENSPANG00000022062)	GPR179 (ENSPANG00000022074)	MRPL45 (ENSPANG00000022083)	NPEPPS (ENSPANG00000022080)	KPNB1 (ENSPANG00000022099)	TBKBP1 (ENSPANG00000022108)	TBX21 (ENSPANG00000022107)	OSBPL7 (ENSPANG00000022928)	MRPL10 (ENSPANG00000022926)	LRRC46 (ENSPANG00000022918)	SCRN2 (ENSPANG00000022920)	SP6 (ENSPANG00000017158)	SP2 (ENSPANG00000022922) #22	PNPO (ENSPANG00000022924)	CDK5RAP3 (ENSPANG00000022902) #23	COPZ2 (ENSPANG00000022903)	NFE2L1 (ENSPANG00000022904)	CBX1 (ENSPANG00000022906)	SNX11 (ENSPANG00000022898)	ENSPANG00000026200	SKAP1 (ENSPANG00000022897)	HOXB1 (ENSPANG00000022886)	HOXB2 (ENSPANG00000034765)	ENSPANG00000045928	HOXB4 (ENSPANG00000022888)	HOXB5 (ENSPANG00000022889)	HOXB6 (ENSPANG00000022891)	HOXB7 (ENSPANG00000041701)
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679.n	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603.b	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Drill	MODERN SPECIES	1297											OSBPL7 (ENSMLEG00000040663)	MRPL10 (ENSMLEG00000042780)	LRRC46 (ENSMLEG00000031583)	SCRN2 (ENSMLEG00000041491)	SP6 (ENSMLEG00000027177)	SP2 (ENSMLEG00000032228) #22	PNPO (ENSMLEG00000040872)	PRR15L (ENSMLEG00000020212)	CDK5RAP3 (ENSMLEG00000033869) #23	COPZ2 (ENSMLEG00000039090)	NFE2L1 (ENSMLEG00000039330)	CBX1 (ENSMLEG00000038745)	SNX11 (ENSMLEG00000039008)	SKAP1 (ENSMLEG00000029308)	HOXB1 (ENSMLEG00000037557)	HOXB2 (ENSMLEG00000031955)	HOXB4 (ENSMLEG00000029897)	HOXB3 (ENSMLEG00000026268)	HOXB5 (ENSMLEG00000009970)	HOXB6 (ENSMLEG00000029580)	HOXB7 (ENSMLEG00000042331)
Sooty mangabey	DUPLICATION
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	40																ENSCATG00000029564 #22
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	564	ENSCATG00000032235	SRCIN1 (ENSCATG00000035063)	ARHGAP23 (ENSCATG00000031687)	SOCS7 (ENSCATG00000038123)	GPR179 (ENSCATG00000016000)	ENSCATG00000005112	NPEPPS (ENSCATG00000011160)	KPNB1 (ENSCATG00000037124)	TBKBP1 (ENSCATG00000040564)	TBX21 (ENSCATG00000010529)	OSBPL7 (ENSCATG00000033623)	MRPL10 (ENSCATG00000035686)	LRRC46 (ENSCATG00000031406)	SCRN2 (ENSCATG00000038846)	SP6 (ENSCATG00000020123)	ENSCATG00000003341 #22	PNPO (ENSCATG00000039934)	PRR15L (ENSCATG00000020186)	CDK5RAP3 (ENSCATG00000006699) #23	COPZ2 (ENSCATG00000042708)	NFE2L1 (ENSCATG00000040775)	ENSCATG00000034735	SNX11 (ENSCATG00000030351)	ENSCATG00000019817	SKAP1 (ENSCATG00000044458)	HOXB1 (ENSCATG00000035575)	HOXB2 (ENSCATG00000035238)	HOXB4 (ENSCATG00000040704)	HOXB3 (ENSCATG00000031126)	HOXB5 (ENSCATG00000027616)	HOXB6 (ENSCATG00000043342)
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679.n	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603.b	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	494	SRCIN1 (ENSMNEG00000015519)	ENSMNEG00000035424	ARHGAP23 (ENSMNEG00000037605)	SOCS7 (ENSMNEG00000032316)	GPR179 (ENSMNEG00000042928)	ENSMNEG00000044663	NPEPPS (ENSMNEG00000000757)	KPNB1 (ENSMNEG00000040927)	TBKBP1 (ENSMNEG00000039009)	TBX21 (ENSMNEG00000036627)	OSBPL7 (ENSMNEG00000042829)	MRPL10 (ENSMNEG00000030905)	LRRC46 (ENSMNEG00000037035)	SCRN2 (ENSMNEG00000031786)	SP6 (ENSMNEG00000023861)	SP2 (ENSMNEG00000029577) #22	PNPO (ENSMNEG00000037010)	PRR15L (ENSMNEG00000028174)	CDK5RAP3 (ENSMNEG00000029039) #23	COPZ2 (ENSMNEG00000038720)	NFE2L1 (ENSMNEG00000037921)	CBX1 (ENSMNEG00000039720)	SNX11 (ENSMNEG00000034920)	SKAP1 (ENSMNEG00000015541)	ENSMNEG00000033446	HOXB1 (ENSMNEG00000036848)	HOXB2 (ENSMNEG00000043416)	HOXB3 (ENSMNEG00000032425)	HOXB4 (ENSMNEG00000032435)	HOXB5 (ENSMNEG00000039003)	HOXB6 (ENSMNEG00000042554)
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000163244.d.b.a.b.b.b.b.b.b.b.b.a.b.a.a.b	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679.n	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT01100000263493.a.b.b.a.a.b.b.a.a.a.a.a.a.a.d.a.b.b	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00980000199681	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Rhesus	MODERN SPECIES	7	SRCIN1 (ENSMMUG00000005041)	ARHGAP23 (ENSMMUG00000020020)	SOCS7 (ENSMMUG00000020531)	ENSMMUG00000055904	GPR179 (ENSMMUG00000020528)	MRPL45 (ENSMMUG00000030213)	NPEPPS (ENSMMUG00000005869)	KPNB1 (ENSMMUG00000019760)	TBKBP1 (ENSMMUG00000019762)	TBX21 (ENSMMUG00000057231)	OSBPL7 (ENSMMUG00000019039)	LRRC46 (ENSMMUG00000061605)	MRPL10 (ENSMMUG00000021486)	SP6 (ENSMMUG00000061952)	ENSMMUG00000053935	SP2 (ENSMMUG00000004765) #22	PNPO (ENSMMUG00000003325)	PRR15L (ENSMMUG00000050551)	CDK5RAP3 (ENSMMUG00000004760) #23	COPZ2 (ENSMMUG00000021934)	NFE2L1 (ENSMMUG00000021935)	CBX1 (ENSMMUG00000019882)	SNX11 (ENSMMUG00000020658)	SKAP1 (ENSMMUG00000050742)	HOXB1 (ENSMMUG00000022212)	HOXB2 (ENSMMUG00000057001)	HOXB4 (ENSMMUG00000052130)	ENSMMUG00000045203	HOXB5 (ENSMMUG00000051420)	HOXB6 (ENSMMUG00000062283)	HOXB7 (ENSMMUG00000055324)
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	7	ENSMFAG00000049053	ENSMFAG00000062343	SOCS7 (ENSMFAG00000044702)	ENSMFAG00000064016	GPR179 (ENSMFAG00000002774)	MRPL45 (ENSMFAG00000043718)	NPEPPS (ENSMFAG00000003608)	KPNB1 (ENSMFAG00000030197)	TBKBP1 (ENSMFAG00000001252)	TBX21 (ENSMFAG00000042504)	OSBPL7 (ENSMFAG00000001330)	LRRC46 (ENSMFAG00000031915)	ENSMFAG00000030335	SP6 (ENSMFAG00000030247)	ENSMFAG00000052999	SP2 (ENSMFAG00000038712) #22	PNPO (ENSMFAG00000039285)	PRR15L (ENSMFAG00000030161)	CDK5RAP3 (ENSMFAG00000046364) #23	COPZ2 (ENSMFAG00000045896)	NFE2L1 (ENSMFAG00000035583)	CBX1 (ENSMFAG00000036790)	SNX11 (ENSMFAG00000001845)	ENSMFAG00000047205	ENSMFAG00000048147	SKAP1 (ENSMFAG00000038763)	HOXB1 (ENSMFAG00000052359)	HOXB2 (ENSMFAG00000034146)	ENSMFAG00000062776	HOXB4 (ENSMFAG00000041000)	HOXB5 (ENSMFAG00000042418)
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Tree shrew	MODERN SPECIES	8668																SP2 (ENSTBEG00000013463) #22
Glires	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b.dc	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b	ENSGT00940000154152.d.a.a	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b.dc.a.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Golden Hamster	MODERN SPECIES	674	Epop (ENSMAUG00000015662)	Srcin1 (ENSMAUG00000021175)	Arhgap23 (ENSMAUG00000018856)	Socs7 (ENSMAUG00000015461)	ENSMAUG00000015632	Mrpl45 (ENSMAUG00000021636)	Npepps (ENSMAUG00000017383)	Kpnb1 (ENSMAUG00000006211)	Tbkbp1 (ENSMAUG00000018604)	Tbx21 (ENSMAUG00000017507)	Osbpl7 (ENSMAUG00000013876)	Mrpl10 (ENSMAUG00000000820)	Lrrc46 (ENSMAUG00000019416)	Scrn2 (ENSMAUG00000010014)	Sp6 (ENSMAUG00000009667)	Sp2 (ENSMAUG00000019269) #22	Pnpo (ENSMAUG00000021706)	Cdk5rap3 (ENSMAUG00000007991) #23	Copz2 (ENSMAUG00000010560)	Nfe2l1 (ENSMAUG00000020456)	ENSMAUG00000003463	Snx11 (ENSMAUG00000021528)	Skap1 (ENSMAUG00000022191)	Hoxb1 (ENSMAUG00000013237)	Hoxb2 (ENSMAUG00000021979)	Hoxb3 (ENSMAUG00000011251)	Hoxb4 (ENSMAUG00000009367)	Hoxb5 (ENSMAUG00000021419)	Hoxb6 (ENSMAUG00000021423)	Hoxb7 (ENSMAUG00000021297)	Hoxb8 (ENSMAUG00000012636)
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	33	ENSCGRG00001002748	Srcin1 (ENSCGRG00001017021)	Arhgap23 (ENSCGRG00001018199)	Socs7 (ENSCGRG00001021949)	Gpr179 (ENSCGRG00001014708)	Mrpl45 (ENSCGRG00001000066)	Npepps (ENSCGRG00001005930)	Kpnb1 (ENSCGRG00001016042)	Tbkbp1 (ENSCGRG00001018526)	Tbx21 (ENSCGRG00001008276)	Osbpl7 (ENSCGRG00001013737)	Mrpl10 (ENSCGRG00001024199)	Lrrc46 (ENSCGRG00001019758)	Scrn2 (ENSCGRG00001022143)	Sp6 (ENSCGRG00001002797)	Sp2 (ENSCGRG00001010976) #22	Pnpo (ENSCGRG00001018189)	Prr15l (ENSCGRG00001008926)	Cdk5rap3 (ENSCGRG00001006966) #23	Copz2 (ENSCGRG00001014767)	Nfe2l1 (ENSCGRG00001015287)	Cbx1 (ENSCGRG00001014799)	Snx11 (ENSCGRG00001022221)	ENSCGRG00001020759	ENSCGRG00001023355	Hoxb1 (ENSCGRG00001024619)	Hoxb2 (ENSCGRG00001017587)	Hoxb3 (ENSCGRG00001016667)	Hoxb4 (ENSCGRG00001022431)	Hoxb5 (ENSCGRG00001016167)	Hoxb6 (ENSCGRG00001015674)
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Prairie vole	MODERN SPECIES	114	Epop (ENSMOCG00000020613)	Srcin1 (ENSMOCG00000017212)	Arhgap23 (ENSMOCG00000005846)	Socs7 (ENSMOCG00000015144)	ENSMOCG00000022822	Mrpl45 (ENSMOCG00000002139)	Npepps (ENSMOCG00000011600)	Kpnb1 (ENSMOCG00000003683)	Tbkbp1 (ENSMOCG00000017020)	Tbx21 (ENSMOCG00000004097)	Osbpl7 (ENSMOCG00000021054)	Mrpl10 (ENSMOCG00000019451)	Lrrc46 (ENSMOCG00000016707)	Scrn2 (ENSMOCG00000019511)	Sp6 (ENSMOCG00000007065)	Sp2 (ENSMOCG00000020935) #22	Pnpo (ENSMOCG00000011655)	Prr15l (ENSMOCG00000006695)	Cdk5rap3 (ENSMOCG00000019534) #23	Copz2 (ENSMOCG00000022427)	Nfe2l1 (ENSMOCG00000016002)	Cbx1 (ENSMOCG00000001520)	Snx11 (ENSMOCG00000019303)	Skap1 (ENSMOCG00000018431)	Hoxb1 (ENSMOCG00000002452)	Hoxb2 (ENSMOCG00000014846)	Hoxb3 (ENSMOCG00000020739)	Hoxb4 (ENSMOCG00000022964)	Hoxb5 (ENSMOCG00000014523)	Hoxb6 (ENSMOCG00000020355)	Hoxb7 (ENSMOCG00000020820)
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	21	Epop (ENSPEMG00000026437)	Srcin1 (ENSPEMG00000014663)	Arhgap23 (ENSPEMG00000004296)	Socs7 (ENSPEMG00000000521)	ENSPEMG00000027307	Mrpl45 (ENSPEMG00000005654)	Npepps (ENSPEMG00000012220)	Kpnb1 (ENSPEMG00000017783)	Tbkbp1 (ENSPEMG00000027762)	Tbx21 (ENSPEMG00000010056)	Osbpl7 (ENSPEMG00000001423)	Mrpl10 (ENSPEMG00000014613)	Lrrc46 (ENSPEMG00000020507)	Scrn2 (ENSPEMG00000020381)	Sp6 (ENSPEMG00000001231)	Sp2 (ENSPEMG00000017112) #22	Pnpo (ENSPEMG00000025094)	Prr15l (ENSPEMG00000024436)	ENSPEMG00000030963	Cdk5rap3 (ENSPEMG00000020712) #23	Copz2 (ENSPEMG00000011137)	Nfe2l1 (ENSPEMG00000010512)	Cbx1 (ENSPEMG00000020976)	Snx11 (ENSPEMG00000000381)	ENSPEMG00000020286	Skap1 (ENSPEMG00000000585)	Hoxb1 (ENSPEMG00000023977)	Hoxb2 (ENSPEMG00000029510)	Hoxb3 (ENSPEMG00000028692)	Hoxb4 (ENSPEMG00000029805)	Hoxb5 (ENSPEMG00000030101)
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Mus	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00800000125316	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000153593.c.b.k	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00800000125316	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000153593.c.b.k	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00800000125316	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000153593.c.b.k	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Mouse	MODERN SPECIES	2	Epop (ENSMUSG00000043439)	Srcin1 (ENSMUSG00000038453)	Arhgap23 (ENSMUSG00000049807)	Socs7 (ENSMUSG00000038485)	Gpr179 (ENSMUSG00000070337)	Mrpl45 (ENSMUSG00000018882)	Npepps (ENSMUSG00000001441)	Kpnb1 (ENSMUSG00000001440)	Tbkbp1 (ENSMUSG00000038517)	Tbx21 (ENSMUSG00000001444)	Osbpl7 (ENSMUSG00000038534)	Mrpl10 (ENSMUSG00000001445)	Lrrc46 (ENSMUSG00000020878)	Scrn2 (ENSMUSG00000020877)	Sp6 (ENSMUSG00000038560)	Sp2 (ENSMUSG00000018678) #22	Pnpo (ENSMUSG00000018659)	Prr15l (ENSMUSG00000047040)	Cdk5rap3 (ENSMUSG00000018669) #23	Copz2 (ENSMUSG00000018672)	Nfe2l1 (ENSMUSG00000038615)	Cbx1 (ENSMUSG00000018666)	Snx11 (ENSMUSG00000020876)	Skap1 (ENSMUSG00000057058)	Hoxb1 (ENSMUSG00000018973)	Hoxb2 (ENSMUSG00000075588)	Hoxb3 (ENSMUSG00000048763)	Hoxb4 (ENSMUSG00000038692)	Hoxb5 (ENSMUSG00000038700)	Hoxb6 (ENSMUSG00000000690)	Hoxb7 (ENSMUSG00000038721)
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00800000125316	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000153593.c.b.k	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
spretus	MODERN SPECIES	2	Srcin1 (MGP_SPRETEiJ_G0017903)	MGP_SPRETEiJ_G0017902	Arhgap23 (MGP_SPRETEiJ_G0017901)	Socs7 (MGP_SPRETEiJ_G0017900)	Gpr179 (MGP_SPRETEiJ_G0017899)	Mrpl45 (MGP_SPRETEiJ_G0017898)	Npepps (MGP_SPRETEiJ_G0017897)	Kpnb1 (MGP_SPRETEiJ_G0017896)	Tbkbp1 (MGP_SPRETEiJ_G0017895)	Tbx21 (MGP_SPRETEiJ_G0017894)	Osbpl7 (MGP_SPRETEiJ_G0017893)	Mrpl10 (MGP_SPRETEiJ_G0017892)	Lrrc46 (MGP_SPRETEiJ_G0017891)	Scrn2 (MGP_SPRETEiJ_G0017890)	Sp6 (MGP_SPRETEiJ_G0017889)	Sp2 (MGP_SPRETEiJ_G0017888) #22	Pnpo (MGP_SPRETEiJ_G0017887)	Prr15l (MGP_SPRETEiJ_G0017886)	Cdk5rap3 (MGP_SPRETEiJ_G0017885) #23	Copz2 (MGP_SPRETEiJ_G0017884)	Nfe2l1 (MGP_SPRETEiJ_G0017883)	MGP_SPRETEiJ_G0017882	Cbx1 (MGP_SPRETEiJ_G0017881)	Snx11 (MGP_SPRETEiJ_G0017880)	MGP_SPRETEiJ_G0017879	Hoxb1 (MGP_SPRETEiJ_G0017878)	Hoxb2 (MGP_SPRETEiJ_G0017877)	Hoxb3 (MGP_SPRETEiJ_G0017876)	Hoxb4 (MGP_SPRETEiJ_G0017875)	Hoxb5 (MGP_SPRETEiJ_G0017874)	Hoxb6 (MGP_SPRETEiJ_G0017873)
Steppe mouse	MODERN SPECIES	3291	Srcin1 (ENSMSIG00000017360)	Arhgap23 (ENSMSIG00000017701)	ENSMSIG00000017794	Socs7 (ENSMSIG00000017810)	Gpr179 (ENSMSIG00000017852)	Mrpl45 (ENSMSIG00000017873)	Npepps (ENSMSIG00000017886)	Kpnb1 (ENSMSIG00000017971)	Tbkbp1 (ENSMSIG00000018040)	Tbx21 (ENSMSIG00000018069)	Osbpl7 (ENSMSIG00000018093)	Mrpl10 (ENSMSIG00000018160)	Lrrc46 (ENSMSIG00000018171)	Scrn2 (ENSMSIG00000018202)	Sp6 (ENSMSIG00000018223)	Sp2 (ENSMSIG00000018237) #22	ENSMSIG00000018267	ENSMSIG00000018270	Cdk5rap3 (ENSMSIG00000018309) #23	Copz2 (ENSMSIG00000018337)	Nfe2l1 (ENSMSIG00000018374)	Cbx1 (ENSMSIG00000018447)	ENSMSIG00000018520	Snx11 (ENSMSIG00000018546)	Skap1 (ENSMSIG00000018601)	Hoxb1 (ENSMSIG00000018752)	Hoxb2 (ENSMSIG00000018769)	Hoxb3 (ENSMSIG00000018771)	ENSMSIG00000018776	Hoxb4 (ENSMSIG00000018777)	Hoxb5 (ENSMSIG00000018787)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	2	Srcin1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017057)	MGP_CAROLIEiJ_G0017056	Arhgap23 (MGP_CAROLIEiJ_G0017055)	Socs7 (MGP_CAROLIEiJ_G0017054)	Gpr179 (MGP_CAROLIEiJ_G0017053)	Mrpl45 (MGP_CAROLIEiJ_G0017052)	Npepps (MGP_CAROLIEiJ_G0017051)	Kpnb1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017050)	Tbkbp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017049)	Tbx21 (MGP_CAROLIEiJ_G0017048)	Osbpl7 (MGP_CAROLIEiJ_G0017047)	Mrpl10 (MGP_CAROLIEiJ_G0017046)	Lrrc46 (MGP_CAROLIEiJ_G0017045)	MGP_CAROLIEiJ_G0017044	Sp6 (MGP_CAROLIEiJ_G0017043)	Sp2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017042) #22	Pnpo (MGP_CAROLIEiJ_G0017041)	Prr15l (MGP_CAROLIEiJ_G0017040)	Cdk5rap3 (MGP_CAROLIEiJ_G0017039) #23	Copz2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017038)	Nfe2l1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017037)	MGP_CAROLIEiJ_G0017036	Cbx1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017035)	Snx11 (MGP_CAROLIEiJ_G0017034)	Skap1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017033)	Hoxb1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017032)	Hoxb2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017031)	Hoxb3 (MGP_CAROLIEiJ_G0017030)	Hoxb4 (MGP_CAROLIEiJ_G0017029)	Hoxb5 (MGP_CAROLIEiJ_G0017028)	Hoxb6 (MGP_CAROLIEiJ_G0017027)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	5	Epop (MGP_PahariEiJ_G0018187)	Srcin1 (MGP_PahariEiJ_G0018186)	MGP_PahariEiJ_G0018185	Arhgap23 (MGP_PahariEiJ_G0018184)	Socs7 (MGP_PahariEiJ_G0018183)	Gpr179 (MGP_PahariEiJ_G0018182)	MGP_PahariEiJ_G0018181	Npepps (MGP_PahariEiJ_G0018180)	Tbkbp1 (MGP_PahariEiJ_G0018179)	Tbx21 (MGP_PahariEiJ_G0018178)	Osbpl7 (MGP_PahariEiJ_G0018177)	Mrpl10 (MGP_PahariEiJ_G0018176)	Lrrc46 (MGP_PahariEiJ_G0018175)	Scrn2 (MGP_PahariEiJ_G0018174)	Sp6 (MGP_PahariEiJ_G0018173)	Sp2 (MGP_PahariEiJ_G0018172) #22	Pnpo (MGP_PahariEiJ_G0018171)	Prr15l (MGP_PahariEiJ_G0018170)	Cdk5rap3 (MGP_PahariEiJ_G0018169) #23	Copz2 (MGP_PahariEiJ_G0018168)	Nfe2l1 (MGP_PahariEiJ_G0018167)	MGP_PahariEiJ_G0018166	Cbx1 (MGP_PahariEiJ_G0018165)	Snx11 (MGP_PahariEiJ_G0018164)	Skap1 (MGP_PahariEiJ_G0018163)	Hoxb1 (MGP_PahariEiJ_G0018162)	Hoxb2 (MGP_PahariEiJ_G0018161)	Hoxb3 (MGP_PahariEiJ_G0018160)	Hoxb4 (MGP_PahariEiJ_G0018159)	Hoxb5 (MGP_PahariEiJ_G0018158)	Hoxb6 (MGP_PahariEiJ_G0018157)
Rat	MODERN SPECIES	1	Srcin1 (ENSRNOG00000011475)	Arhgap23 (ENSRNOG00000022771)	Socs7 (ENSRNOG00000059008)	Gpr179 (ENSRNOG00000029245)	Mrpl45 (ENSRNOG00000010540)	Npepps (ENSRNOG00000023095)	AABR07030425.1 (ENSRNOG00000056057)	Kpnb1 (ENSRNOG00000009275)	Tbkbp1 (ENSRNOG00000009370)	Tbx21 (ENSRNOG00000009427)	Osbpl7 (ENSRNOG00000009473)	Mrpl10 (ENSRNOG00000009567)	Lrrc46 (ENSRNOG00000009902)	Scrn2 (ENSRNOG00000010214)	Sp6 (ENSRNOG00000023551)	Sp2 (ENSRNOG00000010492) #22	Pnpo (ENSRNOG00000046493)	Prr15l (ENSRNOG00000049162)	Cdk5rap3 (ENSRNOG00000048747) #23	Copz2 (ENSRNOG00000009225)	Nfe2l1 (ENSRNOG00000008830)	Cbx1 (ENSRNOG00000008689)	Snx11 (ENSRNOG00000008642)	Skap1 (ENSRNOG00000023881)	Hoxb1 (ENSRNOG00000008506)	Hoxb2 (ENSRNOG00000008365)	Hoxb3 (ENSRNOG00000008313)	Hoxb4 (ENSRNOG00000008191)	Hoxb5 (ENSRNOG00000008010)	Hoxb6 (ENSRNOG00000007823)	Hoxb7 (ENSRNOG00000007611)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1028	Hexim1 (ENSNGAG00000004671)	Hexim2 (ENSNGAG00000008154)	Fmnl1 (ENSNGAG00000018866)	Efcab15 (ENSNGAG00000014012)	Map3k14 (ENSNGAG00000018057)	Arhgap27 (ENSNGAG00000021239)	Plekhm1 (ENSNGAG00000013194)	Kpnb1 (ENSNGAG00000017610)	Tbkbp1 (ENSNGAG00000021163)	Tbx21 (ENSNGAG00000002476)	Osbpl7 (ENSNGAG00000019382)	Mrpl10 (ENSNGAG00000022195)	Lrrc46 (ENSNGAG00000022557)	Scrn2 (ENSNGAG00000023806)	Sp6 (ENSNGAG00000015868)	Sp2 (ENSNGAG00000017612) #22	Pnpo (ENSNGAG00000020016)	Prr15l (ENSNGAG00000021432)	ENSNGAG00000022529	ENSNGAG00000000747 #23	Copz2 (ENSNGAG00000023713)	Nfe2l1 (ENSNGAG00000000736)	Cbx1 (ENSNGAG00000006760)	Snx11 (ENSNGAG00000010446)	Skap1 (ENSNGAG00000012571)	Hoxb1 (ENSNGAG00000018593)	Hoxb2 (ENSNGAG00000019089)	Hoxb3 (ENSNGAG00000020227)	Hoxb4 (ENSNGAG00000021768)	Hoxb5 (ENSNGAG00000023238)	Hoxb6 (ENSNGAG00000000973)
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	56	Epop (ENSJJAG00000023234)	Srcin1 (ENSJJAG00000000573)	ENSJJAG00000002946	Socs7 (ENSJJAG00000007563)	ENSJJAG00000002004	ENSJJAG00000009505	Npepps (ENSJJAG00000005423)	Kpnb1 (ENSJJAG00000010909)	ENSJJAG00000010141	Tbx21 (ENSJJAG00000000813)	Osbpl7 (ENSJJAG00000004477)	Mrpl10 (ENSJJAG00000004046)	Lrrc46 (ENSJJAG00000010412)	Scrn2 (ENSJJAG00000023635)	Sp6 (ENSJJAG00000006452)	Sp2 (ENSJJAG00000003061) #22	Pnpo (ENSJJAG00000023608)	Prr15l (ENSJJAG00000006478)	ENSJJAG00000002511 #23	Copz2 (ENSJJAG00000001025)	Nfe2l1 (ENSJJAG00000006432)	ENSJJAG00000007753	ENSJJAG00000005754	Skap1 (ENSJJAG00000003458)	Hoxb1 (ENSJJAG00000001073)	Hoxb2 (ENSJJAG00000009465)	Hoxb3 (ENSJJAG00000007804)	Hoxb4 (ENSJJAG00000002642)	Hoxb5 (ENSJJAG00000000763)	Hoxb6 (ENSJJAG00000000997)	Hoxb7 (ENSJJAG00000001284)
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	326	1700001P01Rik (ENSDORG00000013037)	Cwc25 (ENSDORG00000003061)	Pip4k2b (ENSDORG00000009810)	Psmb3 (ENSDORG00000009809)	Pcgf2 (ENSDORG00000016581)	Cisd3 (ENSDORG00000029439)	Mllt6 (ENSDORG00000016578)	Srcin1 (ENSDORG00000007714)	ENSDORG00000007713	Socs7 (ENSDORG00000028979)	Npepps (ENSDORG00000009627)	Tbx21 (ENSDORG00000013302)	Osbpl7 (ENSDORG00000002354)	Scrn2 (ENSDORG00000002361)	Sp6 (ENSDORG00000026201)	Sp2 (ENSDORG00000014109) #22	Pnpo (ENSDORG00000014110)	Prr15l (ENSDORG00000027427)	Copz2 (ENSDORG00000013441)	Nfe2l1 (ENSDORG00000000715)	Cbx1 (ENSDORG00000026399)	Snx11 (ENSDORG00000029078)	Hoxb1 (ENSDORG00000007896)	Hoxb2 (ENSDORG00000007897)	Hoxb3 (ENSDORG00000007898)	Hoxb4 (ENSDORG00000007899)	Hoxb5 (ENSDORG00000007900)	Hoxb6 (ENSDORG00000023877)	Hoxb7 (ENSDORG00000007905)	Hoxb8 (ENSDORG00000007906)	Hoxb9 (ENSDORG00000027423)
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158572	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	158	MLLT6 (ENSCLAG00000013781)	SRCIN1 (ENSCLAG00000015589)	ARHGAP23 (ENSCLAG00000014290)	SOCS7 (ENSCLAG00000015232)	GPR179 (ENSCLAG00000014803)	MRPL45 (ENSCLAG00000015324)	NPEPPS (ENSCLAG00000016661)	KPNB1 (ENSCLAG00000017091)	ENSCLAG00000015338	TBX21 (ENSCLAG00000015235)	OSBPL7 (ENSCLAG00000014839)	MRPL10 (ENSCLAG00000015400)	SCRN2 (ENSCLAG00000013965)	LRRC46 (ENSCLAG00000016713)	SP6 (ENSCLAG00000016276)	SP2 (ENSCLAG00000014115) #22	PNPO (ENSCLAG00000013871)	PRR15L (ENSCLAG00000017903)	CDK5RAP3 (ENSCLAG00000012292) #23	COPZ2 (ENSCLAG00000013544)	NFE2L1 (ENSCLAG00000014836)	CBX1 (ENSCLAG00000013587)	SNX11 (ENSCLAG00000015837)	SKAP1 (ENSCLAG00000015423)	HOXB1 (ENSCLAG00000013047)	HOXB2 (ENSCLAG00000015271)	HOXB3 (ENSCLAG00000015322)	HOXB4 (ENSCLAG00000014725)	HOXB5 (ENSCLAG00000014374)	HOXB6 (ENSCLAG00000015524)	HOXB7 (ENSCLAG00000014906)
Degu	MODERN SPECIES	97	MLLT6 (ENSODEG00000017604)	SRCIN1 (ENSODEG00000017506)	ARHGAP23 (ENSODEG00000017612)	GPR179 (ENSODEG00000017327)	MRPL45 (ENSODEG00000017631)	SOCS7 (ENSODEG00000017559)	NPEPPS (ENSODEG00000017337)	KPNB1 (ENSODEG00000017287)	ENSODEG00000017455	TBX21 (ENSODEG00000017610)	OSBPL7 (ENSODEG00000017364)	MRPL10 (ENSODEG00000017536)	LRRC46 (ENSODEG00000017367)	SCRN2 (ENSODEG00000017395)	SP6 (ENSODEG00000017625)	SP2 (ENSODEG00000017126) #22	PNPO (ENSODEG00000017424)	ENSODEG00000017229 #23	COPZ2 (ENSODEG00000017565)	ENSODEG00000020421	NFE2L1 (ENSODEG00000017348)	CBX1 (ENSODEG00000017272)	SNX11 (ENSODEG00000017458)	SKAP1 (ENSODEG00000017533)	HOXB1 (ENSODEG00000017050)	HOXB2 (ENSODEG00000017153)	HOXB3 (ENSODEG00000017116)	HOXB4 (ENSODEG00000017038)	HOXB5 (ENSODEG00000017253)	HOXB6 (ENSODEG00000016988)	HOXB8 (ENSODEG00000017119)
Guinea pig	MODERN SPECIES	53	EPOP (ENSCPOG00000026798)	SRCIN1 (ENSCPOG00000022478)	ARHGAP23 (ENSCPOG00000025821)	SOCS7 (ENSCPOG00000011473)	GPR179 (ENSCPOG00000027503)	MRPL45 (ENSCPOG00000001574)	NPEPPS (ENSCPOG00000006559)	KPNB1 (ENSCPOG00000006566)	TBKBP1 (ENSCPOG00000036345)	TBX21 (ENSCPOG00000026273)	OSBPL7 (ENSCPOG00000006914)	MRPL10 (ENSCPOG00000037104)	LRRC46 (ENSCPOG00000006925)	SCRN2 (ENSCPOG00000006929)	SP6 (ENSCPOG00000007638)	SP2 (ENSCPOG00000014943) #22	PNPO (ENSCPOG00000003187)	PRR15L (ENSCPOG00000035567)	CDK5RAP3 (ENSCPOG00000007275) #23	COPZ2 (ENSCPOG00000019500)	NFE2L1 (ENSCPOG00000030805)	CBX1 (ENSCPOG00000034435)	SNX11 (ENSCPOG00000020234)	SKAP1 (ENSCPOG00000022118)	HOXB1 (ENSCPOG00000022183)	HOXB2 (ENSCPOG00000035468)	ENSCPOG00000010107	ENSCPOG00000010105	HOXB5 (ENSCPOG00000030746)	HOXB6 (ENSCPOG00000040707)	HOXB9 (ENSCPOG00000037597)
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	12	SRCIN1 (ENSHGLG00000010912)	ARHGAP23 (ENSHGLG00000012944)	SOCS7 (ENSHGLG00000035093)	ENSHGLG00000041148	ENSHGLG00000050482	ENSHGLG00000010863	ENSHGLG00000012466	KPNB1 (ENSHGLG00000014138)	TBKBP1 (ENSHGLG00000049817)	TBX21 (ENSHGLG00000012216)	OSBPL7 (ENSHGLG00000012525)	MRPL10 (ENSHGLG00000048399)	LRRC46 (ENSHGLG00000035931)	SCRN2 (ENSHGLG00000041375)	SP6 (ENSHGLG00000021113)	SP2 (ENSHGLG00000009902) #22	PNPO (ENSHGLG00000013159)	PRR15L (ENSHGLG00000014696)	CDK5RAP3 (ENSHGLG00000019464) #23	COPZ2 (ENSHGLG00000018543)	NFE2L1 (ENSHGLG00000012592)	CBX1 (ENSHGLG00000013574)	SNX11 (ENSHGLG00000016837)	SKAP1 (ENSHGLG00000014563)	HOXB1 (ENSHGLG00000009781)	HOXB2 (ENSHGLG00000010090)	HOXB3 (ENSHGLG00000010686)	HOXB4 (ENSHGLG00000034075)	HOXB5 (ENSHGLG00000039265)	HOXB6 (ENSHGLG00000012400)	HOXB7 (ENSHGLG00000045318)
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00860000135964	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679.o	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679.o	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b.dc.b	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Squirrel	MODERN SPECIES	90	EPOP (ENSSTOG00000022964)	SRCIN1 (ENSSTOG00000028994)	ARHGAP23 (ENSSTOG00000029240)	SOCS7 (ENSSTOG00000000068)	GPR179 (ENSSTOG00000024299)	ENSSTOG00000000304	NPEPPS (ENSSTOG00000004901)	KPNB1 (ENSSTOG00000007896)	TBKBP1 (ENSSTOG00000023713)	TBX21 (ENSSTOG00000001626)	OSBPL7 (ENSSTOG00000001636)	MRPL10 (ENSSTOG00000024617)	LRRC46 (ENSSTOG00000002068)	SCRN2 (ENSSTOG00000027108)	SP6 (ENSSTOG00000001607)	SP2 (ENSSTOG00000015926) #22	PNPO (ENSSTOG00000006221)	PRR15L (ENSSTOG00000006235)	CDK5RAP3 (ENSSTOG00000006244) #23	ENSSTOG00000027550	NFE2L1 (ENSSTOG00000013664)	CBX1 (ENSSTOG00000023986)	SNX11 (ENSSTOG00000013684)	SKAP1 (ENSSTOG00000013692)	HOXB1 (ENSSTOG00000028630)	HOXB2 (ENSSTOG00000023586)	HOXB3 (ENSSTOG00000025093)	HOXB4 (ENSSTOG00000009734)	HOXB5 (ENSSTOG00000009740)	HOXB6 (ENSSTOG00000020303)	HOXB7 (ENSSTOG00000025657)
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	46	MLLT6 (ENSUPAG00010006969)	SRCIN1 (ENSUPAG00010006849)	ARHGAP23 (ENSUPAG00010006763)	SOCS7 (ENSUPAG00010006716)	GPR179 (ENSUPAG00010006698)	ENSUPAG00010006685	NPEPPS (ENSUPAG00010006649)	KPNB1 (ENSUPAG00010006624)	TBKBP1 (ENSUPAG00010006591)	TBX21 (ENSUPAG00010006582)	OSBPL7 (ENSUPAG00010006545)	MRPL10 (ENSUPAG00010006539)	LRRC46 (ENSUPAG00010006533)	SCRN2 (ENSUPAG00010006526)	SP6 (ENSUPAG00010006522)	SP2 (ENSUPAG00010006507) #22	PNPO (ENSUPAG00010006483)	PRR15L (ENSUPAG00010006473)	CDK5RAP3 (ENSUPAG00010006466) #23	COPZ2 (ENSUPAG00010006455)	NFE2L1 (ENSUPAG00010006396)	CBX1 (ENSUPAG00010006381)	SNX11 (ENSUPAG00010006370)	SKAP1 (ENSUPAG00010006345)	HOXB1 (ENSUPAG00010006340)	HOXB2 (ENSUPAG00010006336)	HOXB3 (ENSUPAG00010006328)	HOXB4 (ENSUPAG00010006325)	HOXB5 (ENSUPAG00010006320)	HOXB6 (ENSUPAG00010006317)	HOXB7 (ENSUPAG00010006312)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	126	ENSMMMG00000020172	ARHGAP23 (ENSMMMG00000020178)	SOCS7 (ENSMMMG00000020236)	GPR179 (ENSMMMG00000020262)	ENSMMMG00000020288	NPEPPS (ENSMMMG00000020297)	KPNB1 (ENSMMMG00000020318)	ENSMMMG00000020322	TBX21 (ENSMMMG00000020329)	ENSMMMG00000020333	OSBPL7 (ENSMMMG00000020336)	MRPL10 (ENSMMMG00000020352)	LRRC46 (ENSMMMG00000020356)	SCRN2 (ENSMMMG00000020372)	SP6 (ENSMMMG00000020386)	SP2 (ENSMMMG00000020394) #22	PNPO (ENSMMMG00000020407)	PRR15L (ENSMMMG00000020424)
Eurasian red squirrel	DUPLICATION
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	12	SRCIN1 (ENSSVLG00005016103)	ARHGAP23 (ENSSVLG00005016593)	SOCS7 (ENSSVLG00005016676)	GPR179 (ENSSVLG00005016761)	ENSSVLG00005017021	MRPL45 (ENSSVLG00005017084)	NPEPPS (ENSSVLG00005017198)	KPNB1 (ENSSVLG00005017557)	TBKBP1 (ENSSVLG00005017602)	TBX21 (ENSSVLG00005017653)	OSBPL7 (ENSSVLG00005017757)	MRPL10 (ENSSVLG00005017985)	LRRC46 (ENSSVLG00005018036)	SCRN2 (ENSSVLG00005018077)	SP6 (ENSSVLG00005018194)	ENSSVLG00005018218 #22	PNPO (ENSSVLG00005018295)	PRR15L (ENSSVLG00005018399)	CDK5RAP3 (ENSSVLG00005018459) #23	COPZ2 (ENSSVLG00005018641)	NFE2L1 (ENSSVLG00005018798)	CBX1 (ENSSVLG00005019034)	SNX11 (ENSSVLG00005019122)	SKAP1 (ENSSVLG00005019232)	HOXB1 (ENSSVLG00005019304)	HOXB2 (ENSSVLG00005019378)	HOXB3 (ENSSVLG00005019421)	HOXB4 (ENSSVLG00005019455)	HOXB5 (ENSSVLG00005019546)	HOXB6 (ENSSVLG00005019586)	HOXB7 (ENSSVLG00005019618)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	8	CABP5 (ENSSVLG00005015933)	ENSSVLG00005016000	ELSPBP1 (ENSSVLG00005016038)	BSPH1 (ENSSVLG00005016144)	ENSSVLG00005016193	PLA2G4C (ENSSVLG00005016365)	LIG1 (ENSSVLG00005016507)	ZSWIM9 (ENSSVLG00005016795)	ENSSVLG00005016818	ENSSVLG00005016867	ENSSVLG00005016918	ENSSVLG00005016954	ENSSVLG00005016972	ENSSVLG00005017037	ENSSVLG00005017076	ENSSVLG00005017091 #22	ENSSVLG00005017112	ENSSVLG00005017163	EMP3 (ENSSVLG00005017530)	TMEM143 (ENSSVLG00005017613)	SYNGR4 (ENSSVLG00005017908)	ENSSVLG00005017961	GRIN2D (ENSSVLG00005018033)	GRWD1 (ENSSVLG00005018183)	KCNJ14 (ENSSVLG00005018257)	CYTH2 (ENSSVLG00005018286)	LMTK3 (ENSSVLG00005018367)	SULT2B1 (ENSSVLG00005018677)	FAM83E (ENSSVLG00005018800)	SPACA4 (ENSSVLG00005018869)	ENSSVLG00005018906
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158572	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d.b.dc	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161529	ENSGT00940000161386
Rabbit	MODERN SPECIES	10	MLLT6 (ENSOCUG00000027604)	SRCIN1 (ENSOCUG00000005505)	ARHGAP23 (ENSOCUG00000011758)	SOCS7 (ENSOCUG00000015724)	GPR179 (ENSOCUG00000015704)	MRPL45 (ENSOCUG00000015690)	NPEPPS (ENSOCUG00000015748)	KPNB1 (ENSOCUG00000015425)	TBKBP1 (ENSOCUG00000014771)	TBX21 (ENSOCUG00000012907)	OSBPL7 (ENSOCUG00000009447)	MRPL10 (ENSOCUG00000009452)	LRRC46 (ENSOCUG00000009453)	SCRN2 (ENSOCUG00000009457)	SP6 (ENSOCUG00000023482)	SP2 (ENSOCUG00000027415) #22	PNPO (ENSOCUG00000017484)	PRR15L (ENSOCUG00000017489)	CDK5RAP3 (ENSOCUG00000012325) #23	COPZ2 (ENSOCUG00000001802)	NFE2L1 (ENSOCUG00000022298)	CBX1 (ENSOCUG00000008021)	SNX11 (ENSOCUG00000002309)	SKAP1 (ENSOCUG00000001717)	HOXB1 (ENSOCUG00000001720)	HOXB2 (ENSOCUG00000024951)	HOXB3 (ENSOCUG00000023337)	HOXB6 (ENSOCUG00000011560)	HOXB5 (ENSOCUG00000023093)	HOXB8 (ENSOCUG00000029186)	HOXB9 (ENSOCUG00000027316)
Pika	MODERN SPECIES	633							NPEPPS (ENSOPRG00000003735)	KPNB1 (ENSOPRG00000003795)	TBKBP1 (ENSOPRG00000003843)	TBX21 (ENSOPRG00000003888)	OSBPL7 (ENSOPRG00000003904)	MRPL10 (ENSOPRG00000003949)	LRRC46 (ENSOPRG00000003963)	SCRN2 (ENSOPRG00000003992)	SP6 (ENSOPRG00000004019)	SP2 (ENSOPRG00000004048) #22	PNPO (ENSOPRG00000004080)	CDK5RAP3 (ENSOPRG00000004107) #23
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES	258										ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b
Sloth	MODERN SPECIES	5533																SP2 (ENSCHOG00000008313) #22
Armadillo	MODERN SPECIES	825										ENSDNOG00000045438	OSBPL7 (ENSDNOG00000033308)	MRPL10 (ENSDNOG00000024176)	LRRC46 (ENSDNOG00000047964)	SCRN2 (ENSDNOG00000034719)	SP6 (ENSDNOG00000042665)	SP2 (ENSDNOG00000013944) #22	PNPO (ENSDNOG00000032160)	PRR15L (ENSDNOG00000008323)	CDK5RAP3 (ENSDNOG00000030779) #23	COPZ2 (ENSDNOG00000037475)	NFE2L1 (ENSDNOG00000047006)	CBX1 (ENSDNOG00000040249)	SNX11 (ENSDNOG00000032877)	SKAP1 (ENSDNOG00000039133)
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Tenrec	MODERN SPECIES	3741																SP2 (ENSETEG00000009168) #22
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Elephant	MODERN SPECIES	310	EPOP (ENSLAFG00000023127)	SRCIN1 (ENSLAFG00000012974)	ARHGAP23 (ENSLAFG00000028622)	SOCS7 (ENSLAFG00000015279)	ENSLAFG00000015267	MRPL45 (ENSLAFG00000014050)	NPEPPS (ENSLAFG00000001325)	KPNB1 (ENSLAFG00000001328)	TBKBP1 (ENSLAFG00000001330)	TBX21 (ENSLAFG00000028463)	OSBPL7 (ENSLAFG00000006819)	MRPL10 (ENSLAFG00000028127)	LRRC46 (ENSLAFG00000006826)	SCRN2 (ENSLAFG00000025964)	SP6 (ENSLAFG00000010701)	SP2 (ENSLAFG00000021817) #22	PNPO (ENSLAFG00000015550)	PRR15L (ENSLAFG00000015553)	CDK5RAP3 (ENSLAFG00000000339) #23	ENSLAFG00000030284	ENSLAFG00000015209	NFE2L1 (ENSLAFG00000018523)	CBX1 (ENSLAFG00000018526)	SNX11 (ENSLAFG00000018529)	SKAP1 (ENSLAFG00000018530)	ENSLAFG00000031610	HOXB2 (ENSLAFG00000030161)	ENSLAFG00000030505	HOXB3 (ENSLAFG00000030335)	HOXB4 (ENSLAFG00000013588)	HOXB5 (ENSLAFG00000013590)
Hyrax	MODERN SPECIES	4555												OSBPL7 (ENSPCAG00000001932)	ENSPCAG00000002027	LRRC46 (ENSPCAG00000002042)	SCRN2 (ENSPCAG00000002092)	SP2 (ENSPCAG00000002140) #22	PNPO (ENSPCAG00000002196)	PRR15L (ENSPCAG00000002248)	CDK5RAP3 (ENSPCAG00000002257) #23	COPZ2 (ENSPCAG00000002327)	CBX1 (ENSPCAG00000002381)
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397.b	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00640000092844	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Opossum	MODERN SPECIES	1	ENSMODG00000012582	SRCIN1 (ENSMODG00000012577)	ARHGAP23 (ENSMODG00000012570)	SOCS7 (ENSMODG00000012566)	GPR179 (ENSMODG00000012564)	MRPL45 (ENSMODG00000012560)	NPEPPS (ENSMODG00000012557)	KPNB1 (ENSMODG00000012505)	ENSMODG00000039000	ENSMODG00000012526	OSBPL7 (ENSMODG00000012518)	MRPL10 (ENSMODG00000038269)	LRRC46 (ENSMODG00000012473)	SCRN2 (ENSMODG00000012467)	SP6 (ENSMODG00000012454)	SP2 (ENSMODG00000012452) #22	ENSMODG00000050066	PNPO (ENSMODG00000012446)	PRR15L (ENSMODG00000024090)	CDK5RAP3 (ENSMODG00000012439) #23	COPZ2 (ENSMODG00000012424)	NFE2L1 (ENSMODG00000012375)	CBX1 (ENSMODG00000012368)	SNX11 (ENSMODG00000051179)	SKAP1 (ENSMODG00000012360)	HOXB1 (ENSMODG00000046816)	HOXB2 (ENSMODG00000012347)	HOXB3 (ENSMODG00000012344)	HOXB4 (ENSMODG00000042083)	HOXB5 (ENSMODG00000012338)	HOXB6 (ENSMODG00000012334)
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397.b	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00640000092844	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397.b	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00640000092844	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246.e	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397.b	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00640000092844	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Common wonbat	MODERN SPECIES	1037	EPOP (ENSVURG00010006761)	SRCIN1 (ENSVURG00010006777)	ARHGAP23 (ENSVURG00010006847)	SOCS7 (ENSVURG00010006912)	ENSVURG00010007072	MRPL45 (ENSVURG00010007098)	ENSVURG00010007112	KPNB1 (ENSVURG00010007118)	TBKBP1 (ENSVURG00010007134)	TBX21 (ENSVURG00010007151)	OSBPL7 (ENSVURG00010007175)	MRPL10 (ENSVURG00010007313)	LRRC46 (ENSVURG00010007320)	SCRN2 (ENSVURG00010007326)	SP6 (ENSVURG00010007336)	SP2 (ENSVURG00010007347) #22	ENSVURG00010007365	PNPO (ENSVURG00010007376)	PRR15L (ENSVURG00010007394)	CDK5RAP3 (ENSVURG00010007403) #23	COPZ2 (ENSVURG00010007430)	NFE2L1 (ENSVURG00010007465)	CBX1 (ENSVURG00010007537)	SNX11 (ENSVURG00010007541)	SKAP1 (ENSVURG00010007559)	HOXB1 (ENSVURG00010007572)	HOXB2 (ENSVURG00010007579)	HOXB3 (ENSVURG00010007587)	HOXB4 (ENSVURG00010007589)	HOXB5 (ENSVURG00010007599)	HOXB6 (ENSVURG00010007602)
koala	MODERN SPECIES	67	EPOP (ENSPCIG00000001334)	SRCIN1 (ENSPCIG00000001224)	ARHGAP23 (ENSPCIG00000001149)	SOCS7 (ENSPCIG00000001102)	ENSPCIG00000001092	MRPL45 (ENSPCIG00000001069)	NPEPPS (ENSPCIG00000009620)	KPNB1 (ENSPCIG00000001034)	TBKBP1 (ENSPCIG00000001017)	ENSPCIG00000000999	OSBPL7 (ENSPCIG00000000940)	MRPL10 (ENSPCIG00000031062)	LRRC46 (ENSPCIG00000000900)	SCRN2 (ENSPCIG00000000883)	SP6 (ENSPCIG00000000873)	SP2 (ENSPCIG00000000843) #22	ENSPCIG00000000834	PNPO (ENSPCIG00000000828)	PRR15L (ENSPCIG00000000814)	CDK5RAP3 (ENSPCIG00000000798) #23	COPZ2 (ENSPCIG00000000757)	NFE2L1 (ENSPCIG00000000720)	CBX1 (ENSPCIG00000000630)	SNX11 (ENSPCIG00000000612)	SKAP1 (ENSPCIG00000000339)	HOXB1 (ENSPCIG00000033449)	HOXB2 (ENSPCIG00000000295)	HOXB3 (ENSPCIG00000000217)	HOXB4 (ENSPCIG00000000195)	HOXB5 (ENSPCIG00000031080)	HOXB6 (ENSPCIG00000000076)
Wallaby	MODERN SPECIES	13659																SP2 (ENSMEUG00000015302) #22	PNPO (ENSMEUG00000015300)
Tasmanian devil	MODERN SPECIES	3	SRCIN1 (ENSSHAG00000017633)	ARHGAP23 (ENSSHAG00000017726)	SOCS7 (ENSSHAG00000031561)	ENSSHAG00000017950	ENSSHAG00000025003	ENSSHAG00000018038	ENSSHAG00000018214	TBKBP1 (ENSSHAG00000021573)	ENSSHAG00000018315	ENSSHAG00000028042	OSBPL7 (ENSSHAG00000003116)	MRPL10 (ENSSHAG00000030224)	LRRC46 (ENSSHAG00000003740)	SCRN2 (ENSSHAG00000003868)	SP6 (ENSSHAG00000030597)	SP2 (ENSSHAG00000005633) #22	ENSSHAG00000005930	PNPO (ENSSHAG00000023730)	PRR15L (ENSSHAG00000025985)	CDK5RAP3 (ENSSHAG00000006548) #23	COPZ2 (ENSSHAG00000023675)	NFE2L1 (ENSSHAG00000026195)	CBX1 (ENSSHAG00000023789)	SNX11 (ENSSHAG00000029423)	ENSSHAG00000029678	HOXB1 (ENSSHAG00000012150)	HOXB2 (ENSSHAG00000012232)	HOXB3 (ENSSHAG00000031207)	HOXB5 (ENSSHAG00000024100)	HOXB7 (ENSSHAG00000022783)	HOXB8 (ENSSHAG00000023021)
Platypus	MODERN SPECIES	2	CRYAB (ENSOANG00000006525)	HSPB2 (ENSOANG00000037146)	CFAP68 (ENSOANG00000048516)	ALG9 (ENSOANG00000003843)	PPP2R1B (ENSOANG00000014964)	ENSOANG00000037618	ENSOANG00000036757	ENSOANG00000036194	KPNB1 (ENSOANG00000005371)	TBKBP1 (ENSOANG00000030462)	ENSOANG00000012287	OSBPL7 (ENSOANG00000012288)	MRPL10 (ENSOANG00000006797)	ENSOANG00000001541	SCRN2 (ENSOANG00000001540)	SP2 (ENSOANG00000050083) #22	ENSOANG00000049621	PNPO (ENSOANG00000013451)	PRR15L (ENSOANG00000013452)	ENSOANG00000048116 #23	NFE2L1 (ENSOANG00000043783)	CBX1 (ENSOANG00000049057)	ENSOANG00000039817	SKAP1 (ENSOANG00000010840)	ENSOANG00000044458	HOXB1 (ENSOANG00000010307)	HOXB2 (ENSOANG00000041050)	HOXB3 (ENSOANG00000039840)	HOXB4 (ENSOANG00000042426)	HOXB5 (ENSOANG00000051056)	HOXB6 (ENSOANG00000050952)
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00640000092844	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00640000092844	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.c.a	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00640000092844	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.c.a	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00960000192469	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.c.a	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Elapidae	DUPLICATION
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159590.a #22
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159590.a #22
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000159590.a #22
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	498																ENSNSUG00000010523 #22	ENSNSUG00000010525
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	368																ENSPTXG00000016389 #22
Indian cobra	MODERN SPECIES	159																ENSNNAG00000009156 #22
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776.a	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898.e	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00960000192469	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590.b #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.c.a	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230.g
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776.a	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898.e	ENSGT00940000153704.B.f	ENSGT00940000153704.B.e	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439.c	ENSGT00390000000603	ENSGT00960000192469	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590.b #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.c.a	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230.g
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776.a	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898.e	ENSGT00940000153704.B.f	ENSGT00940000153704.B.e	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439.c	ENSGT00390000000603	ENSGT00960000192469	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590.b #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.c.a	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230.g
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	49	SRCIN1 (ENSPTXG00000013940)	ARHGAP23 (ENSPTXG00000013936)	SOCS7 (ENSPTXG00000013935)	ENSPTXG00000013934	MRPL45 (ENSPTXG00000013933)	NPEPPS (ENSPTXG00000013932)	ENSPTXG00000013931	ENSPTXG00000013930	ENSPTXG00000013929	TBX21 (ENSPTXG00000013928)	OSBPL7 (ENSPTXG00000013922)	MRPL10 (ENSPTXG00000013921)	ENSPTXG00000013920	SCRN2 (ENSPTXG00000013919)	SP6 (ENSPTXG00000013918)	ENSPTXG00000013917 #22	PNPO (ENSPTXG00000013916)	PRR15L (ENSPTXG00000013915)	CDK5RAP3 (ENSPTXG00000013914) #23	COPZ2 (ENSPTXG00000013913)	NFE2L1 (ENSPTXG00000013912)	ENSPTXG00000013911	SNX11 (ENSPTXG00000013909)	SKAP1 (ENSPTXG00000013908)	ENSPTXG00000013907	HOXB1 (ENSPTXG00000013906)	HOXB2 (ENSPTXG00000013905)	HOXB3 (ENSPTXG00000013904)	HOXB4 (ENSPTXG00000013902)	HOXB5 (ENSPTXG00000013900)	HOXB6 (ENSPTXG00000013898)
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	29	MLLT6 (ENSNSUG00000008711)	ENSNSUG00000008710	SRCIN1 (ENSNSUG00000008709)	SOCS7 (ENSNSUG00000008683)	ENSNSUG00000008682	MRPL45 (ENSNSUG00000008681)	NPEPPS (ENSNSUG00000008148)	ENSNSUG00000007596	TBKBP1 (ENSNSUG00000007595)	TBX21 (ENSNSUG00000007594)	OSBPL7 (ENSNSUG00000007592)	MRPL10 (ENSNSUG00000007520)	ENSNSUG00000007519	SCRN2 (ENSNSUG00000007517)	SP6 (ENSNSUG00000007513)	ENSNSUG00000007509 #22	PNPO (ENSNSUG00000007506)	PRR15L (ENSNSUG00000007504)	CDK5RAP3 (ENSNSUG00000007503) #23	COPZ2 (ENSNSUG00000007459)	NFE2L1 (ENSNSUG00000007456)	ENSNSUG00000007455	SNX11 (ENSNSUG00000007454)	SKAP1 (ENSNSUG00000007452)	HOXB1 (ENSNSUG00000007450)	HOXB2 (ENSNSUG00000007449)	HOXB3 (ENSNSUG00000007448)	HOXB4 (ENSNSUG00000007447)	HOXB5 (ENSNSUG00000007445)	HOXB6 (ENSNSUG00000007444)	ENSNSUG00000007443
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	3367																SP2 (ENSLLTG00000016876) #22	PNPO (ENSLLTG00000016879)	PRR15L (ENSLLTG00000016880)	CDK5RAP3 (ENSLLTG00000016881) #23
Indian cobra	MODERN SPECIES	337	SRCIN1 (ENSNNAG00000007080)	ENSNNAG00000007142	ARHGAP23 (ENSNNAG00000007152)	SOCS7 (ENSNNAG00000007201)	ENSNNAG00000007277	MRPL45 (ENSNNAG00000007294)	NPEPPS (ENSNNAG00000007364)	ENSNNAG00000007982	TBKBP1 (ENSNNAG00000008059)	TBX21 (ENSNNAG00000008104)	OSBPL7 (ENSNNAG00000008187)	MRPL10 (ENSNNAG00000008730)	ENSNNAG00000008753	SCRN2 (ENSNNAG00000008774)	SP6 (ENSNNAG00000008820)	ENSNNAG00000008826 #22	PNPO (ENSNNAG00000008837)	PRR15L (ENSNNAG00000008859)	CDK5RAP3 (ENSNNAG00000008878) #23	COPZ2 (ENSNNAG00000008924)	NFE2L1 (ENSNNAG00000009022)	ENSNNAG00000009045	SNX11 (ENSNNAG00000009074)	HOXB1 (ENSNNAG00000009145)	HOXB2 (ENSNNAG00000009232)	HOXB3 (ENSNNAG00000009256)	HOXB4 (ENSNNAG00000009277)	HOXB5 (ENSNNAG00000009308)	HOXB6 (ENSNNAG00000009328)	HOXB7 (ENSNNAG00000009344)	HOXB8 (ENSNNAG00000009361)
Lizard	MODERN SPECIES	5	ENSACAG00000017973	SRCIN1 (ENSACAG00000007498)	ARHGAP23 (ENSACAG00000007448)	SOCS7 (ENSACAG00000032737)	GPR179 (ENSACAG00000043732)	MRPL45 (ENSACAG00000007343)	NPEPPS (ENSACAG00000007242)	KPNB1 (ENSACAG00000007097)	TBKBP1 (ENSACAG00000007079)	TBX21 (ENSACAG00000007044)	OSBPL7 (ENSACAG00000006906)	MRPL10 (ENSACAG00000006889)	LRRC46 (ENSACAG00000006887)	SCRN2 (ENSACAG00000006837)	SP6 (ENSACAG00000006831)	SP2 (ENSACAG00000006793) #22	PNPO (ENSACAG00000006764)	PRR15L (ENSACAG00000006762)	CDK5RAP3 (ENSACAG00000006686) #23	COPZ2 (ENSACAG00000006651)	NFE2L1 (ENSACAG00000006615)	ENSACAG00000006594	SNX11 (ENSACAG00000006556)	SKAP1 (ENSACAG00000006534)	ENSACAG00000034966	ENSACAG00000041448	HOXB1 (ENSACAG00000035547)	HOXB2 (ENSACAG00000006521)	HOXB3 (ENSACAG00000006508)	HOXB4 (ENSACAG00000006499)	HOXB5 (ENSACAG00000042998)
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00640000092844	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.c.a	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Common wall lizard	MODERN SPECIES	4	ENSPMRG00000015948	ENSPMRG00000015937	SRCIN1 (ENSPMRG00000015906)	ARHGAP23 (ENSPMRG00000015886)	SOCS7 (ENSPMRG00000015866)	GPR179 (ENSPMRG00000013502)	MRPL45 (ENSPMRG00000013492)	NPEPPS (ENSPMRG00000013437)	KPNB1 (ENSPMRG00000013395)	TBKBP1 (ENSPMRG00000013381)	TBX21 (ENSPMRG00000013375)	OSBPL7 (ENSPMRG00000013357)	LRRC46 (ENSPMRG00000013345)	SCRN2 (ENSPMRG00000013336)	SP6 (ENSPMRG00000013329)	SP2 (ENSPMRG00000013320) #22	ENSPMRG00000013316	PNPO (ENSPMRG00000013310)	CDK5RAP3 (ENSPMRG00000013294) #23	COPZ2 (ENSPMRG00000013275)	ENSPMRG00000013258	NFE2L1 (ENSPMRG00000013246)	SNX11 (ENSPMRG00000013221)	CBX1 (ENSPMRG00000013202)	ENSPMRG00000013192	HOXB1 (ENSPMRG00000013189)	HOXB2 (ENSPMRG00000013183)	HOXB3 (ENSPMRG00000013178)	HOXB4 (ENSPMRG00000013173)	HOXB5 (ENSPMRG00000013170)	HOXB6 (ENSPMRG00000013165)
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	32	SRCIN1 (ENSSMRG00000000664)	ARHGAP23 (ENSSMRG00000000448)	ENSSMRG00000000409	SOCS7 (ENSSMRG00000000374)	GPR179 (ENSSMRG00000000359)	MRPL45 (ENSSMRG00000000340)	NPEPPS (ENSSMRG00000000307)	KPNB1 (ENSSMRG00000000247)	TBKBP1 (ENSSMRG00000000217)	TBX21 (ENSSMRG00000000195)	OSBPL7 (ENSSMRG00000000139)	MRPL10 (ENSSMRG00000000096)	LRRC46 (ENSSMRG00000000025)	SCRN2 (ENSSMRG00000021858)	SP6 (ENSSMRG00000021857)	SP2 (ENSSMRG00000021856) #22	ENSSMRG00000021855	PNPO (ENSSMRG00000021854)	PRR15L (ENSSMRG00000021853)	CDK5RAP3 (ENSSMRG00000021852) #23	COPZ2 (ENSSMRG00000021851)	NFE2L1 (ENSSMRG00000021850)	CBX1 (ENSSMRG00000021849)	SNX11 (ENSSMRG00000021848)	SKAP1 (ENSSMRG00000021847)	HOXB1 (ENSSMRG00000021845)	HOXB2 (ENSSMRG00000021844)	HOXB3 (ENSSMRG00000021842)	HOXB4 (ENSSMRG00000021841)	HOXB5 (ENSSMRG00000021839)	HOXB6 (ENSSMRG00000021838)
tuatara	MODERN SPECIES	1705	SRCIN1 (ENSSPUG00000017913)	ENSSPUG00000017899	ARHGAP23 (ENSSPUG00000017887)	SOCS7 (ENSSPUG00000017876)	ENSSPUG00000017870	MRPL45 (ENSSPUG00000017848)	NPEPPS (ENSSPUG00000017816)	KPNB1 (ENSSPUG00000017799)	TBKBP1 (ENSSPUG00000017792)	TBX21 (ENSSPUG00000017746)	OSBPL7 (ENSSPUG00000017709)	MRPL10 (ENSSPUG00000017695)	LRRC46 (ENSSPUG00000017689)	SCRN2 (ENSSPUG00000017669)	SP6 (ENSSPUG00000017659)	SP2 (ENSSPUG00000017648) #22	ENSSPUG00000017635	PRR15L (ENSSPUG00000017603)	CDK5RAP3 (ENSSPUG00000017587) #23	COPZ2 (ENSSPUG00000017576)	NFE2L1 (ENSSPUG00000017549)	CBX1 (ENSSPUG00000017523)	SNX11 (ENSSPUG00000017511)	SKAP1 (ENSSPUG00000017498)	ENSSPUG00000017491
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00640000092844	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00640000092844	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00640000092844	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00640000092844	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	91	SRCIN1 (ENSTMTG00000006192)	ARHGAP23 (ENSTMTG00000006551)	SOCS7 (ENSTMTG00000006649)	ENSTMTG00000006740	MRPL45 (ENSTMTG00000006838)	NPEPPS (ENSTMTG00000006865)	KPNB1 (ENSTMTG00000006930)	TBKBP1 (ENSTMTG00000006974)	TBX21 (ENSTMTG00000007000)	ENSTMTG00000007028	ENSTMTG00000007063	MRPL10 (ENSTMTG00000007114)	ENSTMTG00000007129	SCRN2 (ENSTMTG00000007144)	ENSTMTG00000007161	SP2 (ENSTMTG00000007171) #22	ENSTMTG00000007188	PNPO (ENSTMTG00000007206)	PRR15L (ENSTMTG00000007217)	CDK5RAP3 (ENSTMTG00000007229) #23	COPZ2 (ENSTMTG00000007271)	NFE2L1 (ENSTMTG00000007320)	CBX1 (ENSTMTG00000007333)	SNX11 (ENSTMTG00000007347)	SKAP1 (ENSTMTG00000007393)	HOXB1 (ENSTMTG00000007622)	HOXB2 (ENSTMTG00000007640)	HOXB3 (ENSTMTG00000007653)	HOXB4 (ENSTMTG00000007660)	HOXB5 (ENSTMTG00000007666)	HOXB6 (ENSTMTG00000007672)
painted turtle	MODERN SPECIES	2394	MLLT6 (ENSCPBG00000027478)	ENSCPBG00000027476	SRCIN1 (ENSCPBG00000027469)	ARHGAP23 (ENSCPBG00000027456)	ENSCPBG00000027434	MRPL45 (ENSCPBG00000027431)	NPEPPS (ENSCPBG00000027428)	KPNB1 (ENSCPBG00000027423)	ENSCPBG00000027421	TBX21 (ENSCPBG00000027414)	OSBPL7 (ENSCPBG00000027405)	MRPL10 (ENSCPBG00000027401)	LRRC46 (ENSCPBG00000027399)	SCRN2 (ENSCPBG00000027397)	SP6 (ENSCPBG00000027395)	SP2 (ENSCPBG00000027391) #22	ENSCPBG00000027388	PNPO (ENSCPBG00000027382)	PRR15L (ENSCPBG00000027380)	CDK5RAP3 (ENSCPBG00000027376) #23	COPZ2 (ENSCPBG00000027373)	NFE2L1 (ENSCPBG00000027369)	CBX1 (ENSCPBG00000027366)	SNX11 (ENSCPBG00000027362)	SKAP1 (ENSCPBG00000027357)	HOXB1 (ENSCPBG00000027354)	HOXB2 (ENSCPBG00000027352)	ENSCPBG00000027351	HOXB5 (ENSCPBG00000027349)	HOXB6 (ENSCPBG00000027348)	HOXB3 (ENSCPBG00000027344)
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00640000092844	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	1609	ENSCABG00000002620	SRCIN1 (ENSCABG00000002622)	ARHGAP23 (ENSCABG00000002627)	SOCS7 (ENSCABG00000002631)	ENSCABG00000002635	MRPL45 (ENSCABG00000002638)	NPEPPS (ENSCABG00000002641)	KPNB1 (ENSCABG00000002648)	TBKBP1 (ENSCABG00000002655)	TBX21 (ENSCABG00000002657)	OSBPL7 (ENSCABG00000002659)	MRPL10 (ENSCABG00000002666)	ENSCABG00000002668	SCRN2 (ENSCABG00000002671)	SP6 (ENSCABG00000002674)	SP2 (ENSCABG00000002675) #22	ENSCABG00000002677	PNPO (ENSCABG00000002678)	PRR15L (ENSCABG00000002679)	CDK5RAP3 (ENSCABG00000002680) #23	COPZ2 (ENSCABG00000002681)	NFE2L1 (ENSCABG00000002708)	CBX1 (ENSCABG00000002713)	SNX11 (ENSCABG00000002717)	SKAP1 (ENSCABG00000002721)	HOXB1 (ENSCABG00000002728)	HOXB2 (ENSCABG00000002731)	HOXB3 (ENSCABG00000002733)	HOXB4 (ENSCABG00000002736)	HOXB5 (ENSCABG00000002737)	HOXB6 (ENSCABG00000002738)
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	15	SRCIN1 (ENSGEVG00005016485)	ARHGAP23 (ENSGEVG00005016604)	ENSGEVG00005016677	SOCS7 (ENSGEVG00005016708)	ENSGEVG00005016842	MRPL45 (ENSGEVG00005017007)	NPEPPS (ENSGEVG00005017041)	KPNB1 (ENSGEVG00005017083)	TBKBP1 (ENSGEVG00005017137)	TBX21 (ENSGEVG00005017193)	ENSGEVG00005017280	ENSGEVG00005017409	MRPL10 (ENSGEVG00005017446)	LRRC46 (ENSGEVG00005017463)	SCRN2 (ENSGEVG00005017480)	SP2 (ENSGEVG00005017526) #22	ENSGEVG00005017553	PNPO (ENSGEVG00005017569)	PRR15L (ENSGEVG00005017586)	CDK5RAP3 (ENSGEVG00005017600) #23	COPZ2 (ENSGEVG00005017626)	NFE2L1 (ENSGEVG00005017658)	CBX1 (ENSGEVG00005017682)	SNX11 (ENSGEVG00005017693)	SKAP1 (ENSGEVG00005017712)	HOXB1 (ENSGEVG00005017735)	HOXB2 (ENSGEVG00005017753)	HOXB3 (ENSGEVG00005017763)	HOXB4 (ENSGEVG00005017783)	HOXB5 (ENSGEVG00005017800)	HOXB6 (ENSGEVG00005017822)
Chinese turtle	MODERN SPECIES	1167							SOCS7 (ENSPSIG00000005627)	GPR179 (ENSPSIG00000007458)	MRPL45 (ENSPSIG00000008346)	NPEPPS (ENSPSIG00000008746)	KPNB1 (ENSPSIG00000009775)	ENSPSIG00000013582	MRPL10 (ENSPSIG00000013604)	LRRC46 (ENSPSIG00000014002)	SCRN2 (ENSPSIG00000004892)	SP2 (ENSPSIG00000005275) #22	PNPO (ENSPSIG00000005322)	PRR15L (ENSPSIG00000005485)	ENSPSIG00000005647 #23
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00640000092844	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Aves	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00640000092844	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00640000092844	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439.i	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	70											ENSGT00940000157439.i	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	305											ENSABRG00000001168	MRPL10 (ENSABRG00000001154)	LRRC46 (ENSABRG00000001138)	SCRN2 (ENSABRG00000001107)	SP6 (ENSABRG00000001100)	SP2 (ENSABRG00000001034) #22	PNPO (ENSABRG00000000676)	CDK5RAP3 (ENSABRG00000000636) #23	ENSABRG00000000606	NFE2L1 (ENSABRG00000000594)	CBX1 (ENSABRG00000000584)	SNX11 (ENSABRG00000000576)	SKAP1 (ENSABRG00000000558)	HOXB1 (ENSABRG00000000522)	HOXB2 (ENSABRG00000000517)	HOXB3 (ENSABRG00000000506)	HOXB4 (ENSABRG00000000495)	HOXB5 (ENSABRG00000000485)	HOXB6 (ENSABRG00000000480)	HOXB7 (ENSABRG00000000473)	HOXB8 (ENSABRG00000000461)
Duck	MODERN SPECIES	2050																SP2 (ENSAPLG00000029557) #22
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439.i	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230	ENSGT00940000161529
Japanese quail	MODERN SPECIES	19	MLLT6 (ENSCJPG00005002307)	ENSCJPG00005002306	ENSCJPG00005002305	SRCIN1 (ENSCJPG00005002304)	ARHGAP23 (ENSCJPG00005001122)	SOCS7 (ENSCJPG00005001011)	ENSCJPG00005001001	MRPL45 (ENSCJPG00005000986)	NPEPPS (ENSCJPG00005000955)	KPNB1 (ENSCJPG00005000892)	TBX21 (ENSCJPG00005019401)	MRPL10 (ENSCJPG00005019391)	LRRC46 (ENSCJPG00005019390)	SCRN2 (ENSCJPG00005019389)	SP6 (ENSCJPG00005019388)	SP2 (ENSCJPG00005019387) #22	PRR15L (ENSCJPG00005019386)	CDK5RAP3 (ENSCJPG00005019379) #23	NFE2L1 (ENSCJPG00005019378)	CBX1 (ENSCJPG00005019377)	SNX11 (ENSCJPG00005019376)	SKAP1 (ENSCJPG00005019375)	HOXB1 (ENSCJPG00005019374)	HOXB2 (ENSCJPG00005019373)	HOXB3 (ENSCJPG00005019372)	HOXB4 (ENSCJPG00005019371)	HOXB5 (ENSCJPG00005019369)	HOXB6 (ENSCJPG00005019368)	HOXB7 (ENSCJPG00005019367)	HOXB8 (ENSCJPG00005019366)	HOXB9 (ENSCJPG00005019365)
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000158572	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246.c.b	ENSGT00940000155246.c.a	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439.i	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230	ENSGT00940000161529
Chicken	MODERN SPECIES	19	MLLT6 (ENSGALG00010022085)	SRCIN1 (ENSGALG00010024162)	SOCS7 (ENSGALG00010024122)	ENSGALG00010024047	MRPL45 (ENSGALG00010024039)	ENSGALG00010021150	ENSGALG00010024010	KPNB1 (ENSGALG00010023927)	TBKBP1 (ENSGALG00010023903)	TBX21 (ENSGALG00010023883)	OSBPL7 (ENSGALG00010023841)	MRPL10 (ENSGALG00010023807)	LRRC46 (ENSGALG00010023784)	SCRN2 (ENSGALG00010023770)	SP6 (ENSGALG00010023742)	SP2 (ENSGALG00010023730) #22	PNPO (ENSGALG00010023726)	PRR15L (ENSGALG00010023722)	CDK5RAP3 (ENSGALG00010023706) #23	NFE2L1 (ENSGALG00010021583)	CBX1 (ENSGALG00010021565)	SNX11 (ENSGALG00010021554)	SKAP1 (ENSGALG00010021479)	HOXB1 (ENSGALG00010023454)	HOXB2 (ENSGALG00010023438)	HOXB3 (ENSGALG00010023428)	HOXB4 (ENSGALG00010023415)	HOXB5 (ENSGALG00010023394)	HOXB6 (ENSGALG00010023383)	HOXB7 (ENSGALG00010023381)	HOXB8 (ENSGALG00010021446)
Turkey	MODERN SPECIES	951												OSBPL7 (ENSMGAG00000002368)	MRPL10 (ENSMGAG00000022761)	LRRC46 (ENSMGAG00000018266)	SCRN2 (ENSMGAG00000008023)	SP2 (ENSMGAG00000008043) #22	PNPO (ENSMGAG00000002670)	PRR15L (ENSMGAG00000016209)	CDK5RAP3 (ENSMGAG00000002616) #23
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00640000092844	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00640000092844	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Golden eagle	MODERN SPECIES	24	MLLT6 (ENSACCG00020004903)	ENSACCG00020004918	SRCIN1 (ENSACCG00020005053)	ARHGAP23 (ENSACCG00020005177)	SOCS7 (ENSACCG00020005201)	GPR179 (ENSACCG00020005244)	MRPL45 (ENSACCG00020005292)	NPEPPS (ENSACCG00020005314)	KPNB1 (ENSACCG00020005348)	TBKBP1 (ENSACCG00020005362)	TBX21 (ENSACCG00020005386)	OSBPL7 (ENSACCG00020005401)	MRPL10 (ENSACCG00020005421)	LRRC46 (ENSACCG00020005432)	SCRN2 (ENSACCG00020005452)	SP2 (ENSACCG00020005484) #22	ENSACCG00020005504	PNPO (ENSACCG00020005520)	PRR15L (ENSACCG00020005531)	CDK5RAP3 (ENSACCG00020005558) #23	ENSACCG00020005600	NFE2L1 (ENSACCG00020005624)	CBX1 (ENSACCG00020005635)	SNX11 (ENSACCG00020005654)	SKAP1 (ENSACCG00020005684)	ENSACCG00020005744	HOXB1 (ENSACCG00020005760)	HOXB2 (ENSACCG00020005767)	HOXB3 (ENSACCG00020005780)	HOXB4 (ENSACCG00020005789)	HOXB5 (ENSACCG00020005810)
Kakapo	MODERN SPECIES	12	SRCIN1 (ENSSHBG00005009216)	ARHGAP23 (ENSSHBG00005009300)	SOCS7 (ENSSHBG00005009381)	GPR179 (ENSSHBG00005009413)	MRPL45 (ENSSHBG00005009448)	NPEPPS (ENSSHBG00005009482)	KPNB1 (ENSSHBG00005009532)	ENSSHBG00005009552	ENSSHBG00005009566	TBX21 (ENSSHBG00005009578)	OSBPL7 (ENSSHBG00005009643)	MRPL10 (ENSSHBG00005009737)	ENSSHBG00005009744	SCRN2 (ENSSHBG00005009758)	SP6 (ENSSHBG00005009774)	SP2 (ENSSHBG00005009786) #22	PNPO (ENSSHBG00005009805)	PRR15L (ENSSHBG00005009820)	CDK5RAP3 (ENSSHBG00005009863) #23	ENSSHBG00005009936	ENSSHBG00005009950	ENSSHBG00005009969	ENSSHBG00005009990	ENSSHBG00005010020	DLX3 (ENSSHBG00005010048)	ENSSHBG00005010082	ENSSHBG00005010109	FTSJ3 (ENSSHBG00005010153)	PSMC5 (ENSSHBG00005010198)	SMARCD2 (ENSSHBG00005010280)	ASIC2 (ENSSHBG00005010612)
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000158572	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00940000172406	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000158988.a.b	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230	ENSGT00940000161529	ENSGT00940000161386
Great tit	MODERN SPECIES	304								TBKBP1 (ENSPMJG00000005810)	ENSPMJG00000005815	ENSPMJG00000005817	ENSPMJG00000005821	ENSPMJG00000005831	ENSPMJG00000005834	SCRN2 (ENSPMJG00000005843)	SP6 (ENSPMJG00000005847)	SP2 (ENSPMJG00000005848) #22
Passeriformes_d	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000158572	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b.c	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00940000172406	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000158988.a.b	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230	ENSGT00940000161529	ENSGT00940000161386
Flycatcher	MODERN SPECIES	236													ENSFALG00000002738	LRRC46 (ENSFALG00000023046)	SCRN2 (ENSFALG00000002734)	SP2 (ENSFALG00000002730) #22
Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES	50	ENSGT00940000165589	ENSGT00940000158572	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b.c	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00940000172406	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000158988.a.b	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230	ENSGT00940000161529	ENSGT00940000161386
Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	49	ENSGT00940000158572	ENSGT00940000153451.a.a.a	ENSGT00940000157961.C	ENSGT00940000157982.b.d	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00940000157439	ENSGT00940000172406	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00390000011219	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152.d	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000158988.a.b	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108	ENSGT00940000161230	ENSGT00940000161529	ENSGT00940000161386
Zebra finch	MODERN SPECIES	20	SRCIN1 (ENSTGUG00000017145)	ARHGAP23 (ENSTGUG00000023504)	ENSTGUG00000028017	SOCS7 (ENSTGUG00000003337)	GPR179 (ENSTGUG00000020188)	MRPL45 (ENSTGUG00000003330)	NPEPPS (ENSTGUG00000003339)	KPNB1 (ENSTGUG00000003387)	TBKBP1 (ENSTGUG00000026971)	ENSTGUG00000021058	ENSTGUG00000021758	ENSTGUG00000028791	ENSTGUG00000029748	SCRN2 (ENSTGUG00000021900)	SP6 (ENSTGUG00000027194)	SP2 (ENSTGUG00000024446) #22	PNPO (ENSTGUG00000027633)	CDK5RAP3 (ENSTGUG00000016909) #23	NFE2L1 (ENSTGUG00000014715)	ENSTGUG00000026594	SKAP1 (ENSTGUG00000029482)	HOXB1 (ENSTGUG00000025694)	HOXB2 (ENSTGUG00000022054)	ENSTGUG00000021689	HOXB5 (ENSTGUG00000003430)	HOXB6 (ENSTGUG00000003435)	ENSTGUG00000020107	HOXB8 (ENSTGUG00000003441)	HOXB9 (ENSTGUG00000003448)	ENSTGUG00000026217	ENSTGUG00000027404
African ostrich	MODERN SPECIES	625																SP2 (ENSSCUG00000008476) #22	PNPO (ENSSCUG00000008474)	PRR15L (ENSSCUG00000008473)	ENSSCUG00000008472 #23	ENSSCUG00000008471 #23	NFE2L1 (ENSSCUG00000008470)	CBX1 (ENSSCUG00000008469)	SNX11 (ENSSCUG00000008468)	SKAP1 (ENSSCUG00000008467)	HOXB1 (ENSSCUG00000008466)	HOXB2 (ENSSCUG00000008465)	HOXB3 (ENSSCUG00000008463)	HOXB4 (ENSSCUG00000008461)	HOXB5 (ENSSCUG00000008457)	HOXB7 (ENSSCUG00000008454)	HOXB8 (ENSSCUG00000008451)
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	60								KPNB1 (ENSCPRG00005006998)	TBKBP1 (ENSCPRG00005007027)	TBX21 (ENSCPRG00005007057)	OSBPL7 (ENSCPRG00005007117)	MRPL10 (ENSCPRG00005007129)	LRRC46 (ENSCPRG00005007132)	SCRN2 (ENSCPRG00005007138)	SP6 (ENSCPRG00005007147)	SP2 (ENSCPRG00005007150) #22	ENSCPRG00005007151	PNPO (ENSCPRG00005007155)	PRR15L (ENSCPRG00005007160)	CDK5RAP3 (ENSCPRG00005007163) #23	COPZ2 (ENSCPRG00005007172)	NFE2L1 (ENSCPRG00005007178)	CBX1 (ENSCPRG00005007181)	SNX11 (ENSCPRG00005007185)	SKAP1 (ENSCPRG00005007201)	HOXB1 (ENSCPRG00005007211)	HOXB2 (ENSCPRG00005007216)	HOXB3 (ENSCPRG00005007217)	HOXB4 (ENSCPRG00005007218)	HOXB5 (ENSCPRG00005007222)	HOXB6 (ENSCPRG00005007226)
Anura	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000156314	ENSGT00940000160776	ENSGT00390000012679	ENSGT00680000100037	ENSGT00940000155065.c	ENSGT00390000005949	ENSGT01100000263518.A.a.b	ENSGT00940000155246	ENSGT00550000074898	ENSGT00940000153704.B	ENSGT00940000160397	ENSGT00390000000603	ENSGT00940000161315	ENSGT00390000013474.b.a	ENSGT00940000161498	ENSGT00940000159590 #22	ENSGT00640000092844	ENSGT00390000011219	ENSGT00940000154534.a	ENSGT00390000000713 #23	ENSGT00390000004405.b	ENSGT00950000182892.a.b.a.a	ENSGT00940000154152	ENSGT00940000160113	ENSGT00390000017856.b	ENSGT00940000159503	ENSGT00940000155029.c.b	ENSGT00940000159774	ENSGT00940000162072	ENSGT00940000158354	ENSGT00940000161108
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	3	ENSLLEG00000023353	ENSLLEG00000023420	ENSLLEG00000023454	MRPL45 (ENSLLEG00000023547)	ENSLLEG00000023810	ENSLLEG00000023877	KPNB1 (ENSLLEG00000024335)	ENSLLEG00000024653	TBKBP1 (ENSLLEG00000024678)	ENSLLEG00000024817	TBX21 (ENSLLEG00000024840)	ENSLLEG00000024888	SCRN2 (ENSLLEG00000021262)	SP6 (ENSLLEG00000021323)	ENSLLEG00000021350	SP2 (ENSLLEG00000021414) #22	ENSLLEG00000021466	PNPO (ENSLLEG00000021591)	PRR15L (ENSLLEG00000022006)	CDK5RAP3 (ENSLLEG00000022067) #23	COPZ2 (ENSLLEG00000022282)	NFE2L1 (ENSLLEG00000022364)	CBX1 (ENSLLEG00000022470)	SNX11 (ENSLLEG00000022564)	SKAP1 (ENSLLEG00000022705)	HOXB1 (ENSLLEG00000023048)	HOXB2 (ENSLLEG00000023108)	HOXB3 (ENSLLEG00000023143)	ENSLLEG00000023190	HOXB5 (ENSLLEG00000023222)	HOXB6 (ENSLLEG00000023245)
Frog	MODERN SPECIES	1	gpr179 (ENSXETG00000033123)	socs7 (ENSXETG00000034343)	arhgap23 (ENSXETG00000014740)	ENSXETG00000047667	srcin1 (ENSXETG00000014743)	ENSXETG00000039202	mllt6 (ENSXETG00000014744)	pcgf2 (ENSXETG00000014746)	ENSXETG00000047787	mrpl10 (ENSXETG00000014749)	tbx21 (ENSXETG00000041059)	lrrc46 (ENSXETG00000045741)	scrn2 (ENSXETG00000021947)	sp6 (ENSXETG00000048156)	ENSXETG00000043506	sp2 (ENSXETG00000021952) #22	XB5788060 [provisional] (ENSXETG00000027360)	cdk5rap3 (ENSXETG00000027359) #23	prr15l (ENSXETG00000032726)	copz2 (ENSXETG00000021957)	nfe2l1 (ENSXETG00000021958)	cbx1 (ENSXETG00000021962)	snx11 (ENSXETG00000038807)	skap1 (ENSXETG00000027357)	hoxb1 (ENSXETG00000049208)	hoxb2 (ENSXETG00000027353)	hoxb3 (ENSXETG00000021967)	hoxb4 (ENSXETG00000021973)	hoxb5 (ENSXETG00000021978)	hoxb6 (ENSXETG00000021987)	hoxb8 (ENSXETG00000021993)