Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000007772.eb	ENSGT00390000006095	ENSGT00900000141083.d	ENSGT00940000160165	ENSGT00940000159675	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00950000183086.a.a.b	ENSGT00530000064220	ENSGT00940000154369.d.a	ENSGT01030000234629.C	ENSGT00910000144184.r	ENSGT00390000016324 #18	ENSGT00940000161449 #19	ENSGT00940000158201 #20	ENSGT00940000171658.a #21	ENSGT00940000155481 #22	ENSGT00940000160511 #23	ENSGT01030000234579.A.b.eb	ENSGT00910000147942.a #24	ENSGT00940000157909 #26	ENSGT01000000214434.A #27	ENSGT00670000098080 #28	ENSGT00940000155714 #29	ENSGT00950000183097.a.b #30	ENSGT01060000248594.f #31	ENSGT00940000157649 #32	ENSGT00940000153096.b.c.b.b.a.a.a.a.a.a.a #33	ENSGT00940000162334 #34	ENSGT00390000010687.a.a #35	ENSGT00940000161292 #36	ENSGT00940000160094 #37
Bos	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000007772.eb	ENSGT00390000006095	ENSGT00900000141083.d	ENSGT00940000160165	ENSGT00940000159675	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00950000183086.a.a.b	ENSGT00530000064220	ENSGT00940000154369.d.a	ENSGT01030000234629.C	ENSGT00910000144184.r	ENSGT00390000016324 #18	ENSGT00940000161449 #19	ENSGT00940000158201 #20	ENSGT00940000171658.a #21	ENSGT00940000155481 #22	ENSGT00940000160511 #23	ENSGT00910000147942.a #24	ENSGT00940000157909 #26	ENSGT01000000214434.A #27	ENSGT00670000098080 #28	ENSGT00940000155714 #29	ENSGT00950000183097.a.b #30	ENSGT01060000248594.f #31	ENSGT00940000157649 #32	ENSGT00940000153096.b.c.b.b.a.a.a.a.a.a.a #33	ENSGT00940000162334 #34	ENSGT00390000010687.a.a #35	ENSGT00940000161292 #36	ENSGT00940000160094 #37	ENSGT00520000055625.b
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000007772.eb	ENSGT00390000006095	ENSGT00900000141083.d.a	ENSGT00940000160165	ENSGT00940000159675	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00950000183086.a.a.b	ENSGT00530000064220	ENSGT00940000154369.c.a	ENSGT01030000234629.C	ENSGT00910000144184.r	ENSGT00390000016324 #18	ENSGT00940000161449 #19	ENSGT00940000158201 #20	ENSGT00940000171658.a #21	ENSGT00940000155481 #22	ENSGT00940000160511 #23	ENSGT01030000234579.A.b.eb	ENSGT00390000018318.u.b.a.b.a.a.b #25	ENSGT00940000157909 #26	ENSGT01000000214434.A #27	ENSGT00670000098080 #28	ENSGT00940000155714 #29	ENSGT00950000183097.a.b #30	ENSGT01060000248594.f #31	ENSGT00940000157649 #32	ENSGT00940000153096.b.c.b.b.a.a.a.a.a.a.a #33	ENSGT00940000162334 #34	ENSGT00390000010687.a.a #35	ENSGT00940000161292 #36	ENSGT00940000160094 #37
Wild yak	MODERN SPECIES	182												PXYLP1 (ENSBMUG00000020857) #18	ZBTB38 (ENSBMUG00000020833) #19	RASA2 (ENSBMUG00000020801) #20	ENSBMUG00000020763 #21	RNF7 (ENSBMUG00000020720) #22	GRK7 (ENSBMUG00000020702) #23	ENSBMUG00000020679 #24	ENSBMUG00000020675 #25	TFDP2 (ENSBMUG00000020653) #26	GK5 (ENSBMUG00000020565) #27	XRN1 (ENSBMUG00000020548) #28	ATR (ENSBMUG00000020470) #29	PLS1 (ENSBMUG00000020434) #30	TRPC1 (ENSBMUG00000020407) #31	PCOLCE2 (ENSBMUG00000020376) #32	ENSBMUG00000020362 #33	PAQR9 (ENSBMUG00000020355) #34	U2SURP (ENSBMUG00000020347) #35	CHST2 (ENSBMUG00000020326) #36	SLC9A9 (ENSBMUG00000020313) #37
Domestic yak	MODERN SPECIES		ENSBGRG00000001602	ENSBGRG00000001595	MRPS22 (ENSBGRG00000001541)	ENSBGRG00000001520	RBP2 (ENSBGRG00000001501)	NMNAT3 (ENSBGRG00000001428)	CLSTN2 (ENSBGRG00000001375)	TRIM42 (ENSBGRG00000001357)	ENSBGRG00000001349	SLC25A36 (ENSBGRG00000001317)	SPSB4 (ENSBGRG00000001297)	ENSBGRG00000001284	PXYLP1 (ENSBGRG00000001263) #18	ZBTB38 (ENSBGRG00000001246) #19	RASA2 (ENSBGRG00000001166) #20	RNF7 (ENSBGRG00000001134) #22	GRK7 (ENSBGRG00000001107) #23	ATP1B3 (ENSBGRG00000001064)	ENSBGRG00000001057 #25	TFDP2 (ENSBGRG00000001010) #26	GK5 (ENSBGRG00000000970) #27	XRN1 (ENSBGRG00000000705) #28	ATR (ENSBGRG00000000428) #29	PLS1 (ENSBGRG00000000350) #30	TRPC1 (ENSBGRG00000000286) #31	PCOLCE2 (ENSBGRG00000000254) #32	PAQR9 (ENSBGRG00000000229) #34	U2SURP (ENSBGRG00000000223) #35	CHST2 (ENSBGRG00000000218) #36	ENSBGRG00000000212	ENSBGRG00000000206
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000007772.db.d.h	ENSGT00390000007772.eb	ENSGT00390000006095	ENSGT00900000141083.d	ENSGT00940000160165	ENSGT00940000159675	ENSGT00950000183179.b.b	ENSGT00950000183086.a.a.b	ENSGT00530000064220	ENSGT00940000154369.d.a	ENSGT01030000234629.C	ENSGT00910000144184.r	ENSGT00390000016324 #18	ENSGT00940000161449 #19	ENSGT00940000158201 #20	ENSGT00940000155481 #22	ENSGT00940000160511 #23	ENSGT01030000234579.A.b.eb	ENSGT00390000018318.u.b.a.b.a.a.b #25	ENSGT00940000157909 #26	ENSGT01000000214434.A #27	ENSGT00670000098080 #28	ENSGT00940000155714 #29	ENSGT00950000183097.a.b #30	ENSGT01060000248594.f #31	ENSGT00940000157649 #32	ENSGT00940000153096.b.c.b.b.a.a.a.a.a.a.a #33	ENSGT00940000162334 #34	ENSGT00390000010687.a.a #35	ENSGT00940000161292 #36	ENSGT00940000160094 #37
Cow	MODERN SPECIES		ENSBTAG00000046040	MRPS22 (ENSBTAG00000047608)	COPB2 (ENSBTAG00000014843)	RBP2 (ENSBTAG00000015056)	RBP1 (ENSBTAG00000020028)	NMNAT3 (ENSBTAG00000051936)	CLSTN2 (ENSBTAG00000008714)	TRIM42 (ENSBTAG00000018346)	ENSBTAG00000052041	SLC25A36 (ENSBTAG00000015310)	SPSB4 (ENSBTAG00000009115)	ENSBTAG00000050470	PXYLP1 (ENSBTAG00000050763) #18	ZBTB38 (ENSBTAG00000040061) #19	RASA2 (ENSBTAG00000015413) #20	RNF7 (ENSBTAG00000002185) #22	GRK7 (ENSBTAG00000021886) #23	ATP1B3 (ENSBTAG00000014140)	ENSBTAG00000019007 #25	TFDP2 (ENSBTAG00000006222) #26	GK5 (ENSBTAG00000018138) #27	XRN1 (ENSBTAG00000011524) #28	ATR (ENSBTAG00000011529) #29	PLS1 (ENSBTAG00000023429) #30	TRPC1 (ENSBTAG00000002232) #31	PCOLCE2 (ENSBTAG00000016026) #32	ENSBTAG00000038111 #33	PAQR9 (ENSBTAG00000011116) #34	U2SURP (ENSBTAG00000009154) #35	CHST2 (ENSBTAG00000011584) #36	ENSBTAG00000054067
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES		ENSBIXG00005029080	ENSBIXG00005005148	ENSBIXG00005029095	MRPS22 (ENSBIXG00005005189)	COPB2 (ENSBIXG00005001816)	RBP2 (ENSBIXG00005001783)	ENSBIXG00005029214	CLSTN2 (ENSBIXG00005029240)	TRIM42 (ENSBIXG00005001565)	SLC25A36 (ENSBIXG00005001539)	SPSB4 (ENSBIXG00005001522)	ENSBIXG00005005286	PXYLP1 (ENSBIXG00005029247) #18	ZBTB38 (ENSBIXG00005005290) #19	RASA2 (ENSBIXG00005005293) #20	RNF7 (ENSBIXG00005005297) #22	GRK7 (ENSBIXG00005029666) #23	ATP1B3 (ENSBIXG00005029659)	ENSBIXG00005029647 #25	ENSBIXG00005029643	TFDP2 (ENSBIXG00005029603) #26	GK5 (ENSBIXG00005029572) #27	ENSBIXG00005029562	XRN1 (ENSBIXG00005029509) #28	ATR (ENSBIXG00005029438) #29	PLS1 (ENSBIXG00005029412) #30	TRPC1 (ENSBIXG00005029391) #31	PCOLCE2 (ENSBIXG00005029362) #32	ENSBIXG00005029331 #33	PAQR9 (ENSBIXG00005029326) #34	U2SURP (ENSBIXG00005029299) #35
American bison	MODERN SPECIES	3298	ENSBBBG00000016176	MRPS22 (ENSBBBG00000016196)	COPB2 (ENSBBBG00000016249)	RBP2 (ENSBBBG00000016260)	ENSBBBG00000016274	NMNAT3 (ENSBBBG00000016315)	CLSTN2 (ENSBBBG00000016341)	TRIM42 (ENSBBBG00000016347)	ENSBBBG00000016376	SPSB4 (ENSBBBG00000008334)	ENSBBBG00000004054	PXYLP1 (ENSBBBG00000016417) #18	ZBTB38 (ENSBBBG00000016426) #19	RASA2 (ENSBBBG00000016517) #20	ENSBBBG00000016540 #21	RNF7 (ENSBBBG00000004080) #22	GRK7 (ENSBBBG00000016561) #23	ATP1B3 (ENSBBBG00000016573)	ENSBBBG00000016579 #24	ENSBBBG00000004088 #25	TFDP2 (ENSBBBG00000016664) #26	GK5 (ENSBBBG00000016698) #27	XRN1 (ENSBBBG00000009064) #28	ATR (ENSBBBG00000008122) #29	PLS1 (ENSBBBG00000017029) #30	TRPC1 (ENSBBBG00000008340) #31	PCOLCE2 (ENSBBBG00000017158) #32	ENSBBBG00000017165 #33	PAQR9 (ENSBBBG00000004249) #34	U2SURP (ENSBBBG00000017226) #35	CHST2 (ENSBBBG00000017229) #36