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Primates	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000155689	ENSGT00940000159332	ENSGT00940000163099	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000163434	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000155272	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00730000111729	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000158787.nb	ENSGT00940000159442	ENSGT01090000260070.C	ENSGT00390000017974	ENSGT00950000183031.A.a.a
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000155689	ENSGT00940000159332	ENSGT00940000163099	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000163434	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000155272	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00730000111729	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00940000165766	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000158787.nb	ENSGT00940000159442	ENSGT01090000260070.C	ENSGT00390000017974
Tarsier	MODERN SPECIES	7096															MYCL (ENSTSYG00000009275) #21	TRIT1 (ENSTSYG00000004363) #22	HSPA8 (ENSTSYG00000036507) #23	CLMP (ENSTSYG00000002660) #24	GRAMD1B (ENSTSYG00000025695) #25	SCN3B (ENSTSYG00000000101) #26	ZNF202 (ENSTSYG00000036828) #27	ENSTSYG00000031930 #28	OR6M1 (ENSTSYG00000000862) #29	TMEM225 (ENSTSYG00000002218) #30	OR8D4 (ENSTSYG00000008358) #31
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000155689	ENSGT00940000159332	ENSGT00940000163099	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000163434	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000155272	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00730000111729	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000158787.nb	ENSGT00940000159442	ENSGT01090000260070.C	ENSGT00390000017974	ENSGT00950000183031.A.a.a
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000155689.c	ENSGT00940000159332	ENSGT00940000163099	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000163434	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c.s	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000155272	ENSGT00940000158790	ENSGT00390000004380.m.a.a.b	ENSGT00940000161166	ENSGT00910000147126	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00860000135787	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00730000111729	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000158787.nb	ENSGT00940000159442
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000155689.c	ENSGT00940000159332	ENSGT00940000163099	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000163434	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c.s.a	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000158790	ENSGT00390000004380.m.a.a.b	ENSGT00940000161166	ENSGT00910000147126	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00860000135787	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000155272	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00730000111729	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000158787.nb	ENSGT00940000159442
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000155689.c	ENSGT00940000159332	ENSGT00940000163099	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000163434	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c.s.a	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000158790	ENSGT00390000004380.m.a.a.b	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00860000135787	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000155272	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00730000111729	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000158787.nb	ENSGT00940000159442	ENSGT01090000260070.C
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000159332	ENSGT00940000163099	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000163434	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c.s.a	ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.a	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000155272.ec.a	ENSGT00940000158790	ENSGT00390000004380.m.a.a.b	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00860000135787	ENSGT00940000155272.dc	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000155272.ec.b	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00730000111729	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000158787.nb.a
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Pan	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000159332	ENSGT00940000163099	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000163434	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c.s.a	ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.a.a.b.b.a	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000155272.ec.a	ENSGT00940000158790	ENSGT00390000004380.m.a.a.b	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00860000135787	ENSGT00940000155272.dc	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000155272.ec.b	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00730000111729	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000158787.nb.a
Bonobo	MODERN SPECIES		KCNQ4 (ENSPPAG00000041138)	ENSPPAG00000032067	RIMS3 (ENSPPAG00000040113)	ZNF684 (ENSPPAG00000030066)	ZFP69 (ENSPPAG00000028849)	ZFP69B (ENSPPAG00000040903)	SMAP2 (ENSPPAG00000033555)	COL9A2 (ENSPPAG00000042613)	ZMPSTE24 (ENSPPAG00000034912)	TMCO2 (ENSPPAG00000028744)	RLF (ENSPPAG00000032318)	PPT1 (ENSPPAG00000040559)	CAP1 (ENSPPAG00000033903)	MFSD2A (ENSPPAG00000037970)	MYCL (ENSPPAG00000029651) #21	TRIT1 (ENSPPAG00000023930) #22	ENSPPAG00000008285	PPIE (ENSPPAG00000042403)	ENSPPAG00000018066	HPCAL4 (ENSPPAG00000030421)	NT5C1A (ENSPPAG00000042148)	HEYL (ENSPPAG00000029785)	PABPC4 (ENSPPAG00000043625)	ENSPPAG00000017922	ENSPPAG00000039451	ENSPPAG00000030685	ENSPPAG00000037863	MACF1 (ENSPPAG00000032133)	NDUFS5 (ENSPPAG00000030074)	AKIRIN1 (ENSPPAG00000033039)	RHBDL2 (ENSPPAG00000041735)
Chimpanzee	MODERN SPECIES		RIMS3 (ENSPTRG00000000594)	ZNF684 (ENSPTRG00000000593)	EXO5 (ENSPTRG00000000592)	ZFP69 (ENSPTRG00000000591)	ZFP69B (ENSPTRG00000000590)	SMAP2 (ENSPTRG00000000589)	COL9A2 (ENSPTRG00000044977)	ZMPSTE24 (ENSPTRG00000000587)	TMCO2 (ENSPTRG00000000586)	RLF (ENSPTRG00000000585)	PPT1 (ENSPTRG00000000584)	CAP1 (ENSPTRG00000000583)	ENSPTRG00000046517	MFSD2A (ENSPTRG00000000581)	MYCL (ENSPTRG00000000580) #21	TRIT1 (ENSPTRG00000000579) #22	BMP8B (ENSPTRG00000000578)	PPIE (ENSPTRG00000000577)	ENSPTRG00000044983	HPCAL4 (ENSPTRG00000000576)	NT5C1A (ENSPTRG00000000575)	HEYL (ENSPTRG00000047504)	PABPC4 (ENSPTRG00000000573)	ENSPTRG00000049535	ENSPTRG00000000572	MACF1 (ENSPTRG00000043118)	NDUFS5 (ENSPTRG00000000568)	ENSPTRG00000052337	RHBDL2 (ENSPTRG00000000566)	GJA9 (ENSPTRG00000034043)	MYCBP (ENSPTRG00000052820)
Human	MODERN SPECIES		NFYC (ENSG00000066136)	RIMS3 (ENSG00000117016)	ZNF684 (ENSG00000117010)	EXO5 (ENSG00000164002)	ZFP69 (ENSG00000187815)	ZFP69B (ENSG00000187801)	SMAP2 (ENSG00000084070)	COL9A2 (ENSG00000049089)	ZMPSTE24 (ENSG00000084073)	TMCO2 (ENSG00000188800)	RLF (ENSG00000117000)	PPT1 (ENSG00000131238)	CAP1 (ENSG00000131236)	MFSD2A (ENSG00000168389)	MYCL (ENSG00000116990) #21	TRIT1 (ENSG00000043514) #22	OXCT2 (ENSG00000198754)	BMP8B (ENSG00000116985)	PPIE (ENSG00000084072)	HPCAL4 (ENSG00000116983)	NT5C1A (ENSG00000116981)	HEYL (ENSG00000163909)	PABPC4 (ENSG00000090621)	BMP8A (ENSG00000183682)	MACF1 (ENSG00000127603)	NDUFS5 (ENSG00000168653)	AKIRIN1 (ENSG00000174574)	RHBDL2 (ENSG00000158315)	GJA9 (ENSG00000131233)	ENSG00000274944	MYCBP (ENSG00000214114)
Gorilla	MODERN SPECIES		RIMS3 (ENSGGOG00000009986)	ZNF684 (ENSGGOG00000022914)	EXO5 (ENSGGOG00000024174)	ZFP69 (ENSGGOG00000006972)	ZFP69B (ENSGGOG00000039613)	SMAP2 (ENSGGOG00000004018)	COL9A2 (ENSGGOG00000002596)	ZMPSTE24 (ENSGGOG00000002591)	TMCO2 (ENSGGOG00000015048)	RLF (ENSGGOG00000015221)	PPT1 (ENSGGOG00000025819)	CAP1 (ENSGGOG00000027527)	ENSGGOG00000023672	MFSD2A (ENSGGOG00000015275)	MYCL (ENSGGOG00000001693) #21	TRIT1 (ENSGGOG00000010070) #22	BMP8A (ENSGGOG00000015791)	PPIE (ENSGGOG00000015783)	ENSGGOG00000039917	NT5C1A (ENSGGOG00000008274)	HEYL (ENSGGOG00000008268)	PABPC4 (ENSGGOG00000004002)	ENSGGOG00000039231	ENSGGOG00000039286	MACF1 (ENSGGOG00000022652)	AKIRIN1 (ENSGGOG00000006053)	RHBDL2 (ENSGGOG00000009504)	GJA9 (ENSGGOG00000005807)	MYCBP (ENSGGOG00000005810)	RRAGC (ENSGGOG00000013382)	ENSGGOG00000027537
Orangutan	MODERN SPECIES		RIMS3 (ENSPPYG00000001485)	ZNF684 (ENSPPYG00000001486)	EXO5 (ENSPPYG00000001487)	ENSPPYG00000035572	ZFP69 (ENSPPYG00000001488)	ZFP69B (ENSPPYG00000001489)	SMAP2 (ENSPPYG00000001490)	COL9A2 (ENSPPYG00000001491)	ZMPSTE24 (ENSPPYG00000001492)	TMCO2 (ENSPPYG00000001493)	RLF (ENSPPYG00000001494)	PPT1 (ENSPPYG00000030814)	CAP1 (ENSPPYG00000001496)	ENSPPYG00000001497	MYCL (ENSPPYG00000032517) #21	TRIT1 (ENSPPYG00000001499) #22	ENSPPYG00000001500	PPIE (ENSPPYG00000001501)	HPCAL4 (ENSPPYG00000001503)	NT5C1A (ENSPPYG00000001504)	HEYL (ENSPPYG00000001505)	PABPC4 (ENSPPYG00000001506)	ENSPPYG00000037293	ENSPPYG00000033182	ENSPPYG00000001507	MACF1 (ENSPPYG00000001509)	NDUFS5 (ENSPPYG00000001511)	RHBDL2 (ENSPPYG00000001512)	GJA9 (ENSPPYG00000001514)	MYCBP (ENSPPYG00000001515)	RRAGC (ENSPPYG00000001516)
Gibbon	MODERN SPECIES	2	RIMS3 (ENSNLEG00000012190)	ZNF684 (ENSNLEG00000012187)	EXO5 (ENSNLEG00000028361)	ZFP69 (ENSNLEG00000012184)	ZFP69B (ENSNLEG00000034783)	SMAP2 (ENSNLEG00000032450)	COL9A2 (ENSNLEG00000012137)	ZMPSTE24 (ENSNLEG00000012132)	TMCO2 (ENSNLEG00000012130)	RLF (ENSNLEG00000012124)	PPT1 (ENSNLEG00000012121)	CAP1 (ENSNLEG00000012077)	ENSNLEG00000012076	ENSNLEG00000012066	MYCL (ENSNLEG00000012063) #21	TRIT1 (ENSNLEG00000012038) #22	OXCT2 (ENSNLEG00000012037)	ENSNLEG00000012019	PPIE (ENSNLEG00000011979)	ENSNLEG00000028202	ENSNLEG00000028855	NT5C1A (ENSNLEG00000011971)	HEYL (ENSNLEG00000011965)	PABPC4 (ENSNLEG00000011928)	MACF1 (ENSNLEG00000011857)	ENSNLEG00000034249	AKIRIN1 (ENSNLEG00000035139)	ENSNLEG00000011848	RHBDL2 (ENSNLEG00000011836)	GJA9 (ENSNLEG00000011831)	ENSNLEG00000035297
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000159332	ENSGT00550000074801.h.c.b.a.a	ENSGT00940000163099	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000163434	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c.s	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000155272.`c.a	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000158790	ENSGT00390000004380.m.a.a.b	ENSGT00940000161166	ENSGT00910000147126	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00860000135787	ENSGT00940000155272.ac	ENSGT00730000111729	ENSGT00940000155272.`c.b	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00940000165766
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000159332	ENSGT00550000074801.h.c.b.a.a	ENSGT00940000163099	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000163434	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c.s	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000155272.`c.a	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000158790	ENSGT00390000004380.m.a.a.b	ENSGT00940000161166	ENSGT00910000147126	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000155272.ac	ENSGT00860000135787	ENSGT00940000155272.`c.b	ENSGT00730000111729	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00390000002919.u
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	12	RIMS3 (ENSCSAG00000001151)	ZNF684 (ENSCSAG00000001150)	EXO5 (ENSCSAG00000000137)	ZFP69 (ENSCSAG00000001149)	ZFP69B (ENSCSAG00000001148)	SMAP2 (ENSCSAG00000001147)	COL9A2 (ENSCSAG00000001146)	ZMPSTE24 (ENSCSAG00000001145)	TMCO2 (ENSCSAG00000001144)	RLF (ENSCSAG00000001143)	ENSCSAG00000001142	PPT1 (ENSCSAG00000001141)	CAP1 (ENSCSAG00000001140)	MFSD2A (ENSCSAG00000001139)	MYCL (ENSCSAG00000001138) #21	TRIT1 (ENSCSAG00000001137) #22	ENSCSAG00000001136	PABPC4 (ENSCSAG00000001135)	HEYL (ENSCSAG00000001134)	NT5C1A (ENSCSAG00000001133)	HPCAL4 (ENSCSAG00000001132)	PPIE (ENSCSAG00000001131)	ENSCSAG00000001130	ENSCSAG00000001129	MACF1 (ENSCSAG00000001128)	AKIRIN1 (ENSCSAG00000001126)	RHBDL2 (ENSCSAG00000001125)	GJA9 (ENSCSAG00000000136)	MYCBP (ENSCSAG00000001124)	RRAGC (ENSCSAG00000001123)	POU3F1 (ENSCSAG00000000135)
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000159332	ENSGT00550000074801.h.c.b.a.a	ENSGT00940000163099	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000163434	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c.s	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000155272.`c.a	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000158790	ENSGT00390000004380.m.a.a.b	ENSGT00940000161166	ENSGT00910000147126	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000155272.ac	ENSGT00860000135787	ENSGT00940000155272.`c.b	ENSGT00730000111729	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00390000002919.u
Macaca	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000155689.c	ENSGT00940000159332	ENSGT00940000163099	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000163434	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c.s	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000155272.`c.a	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000158790	ENSGT00390000004380.m.a.a.b	ENSGT00940000161166	ENSGT00910000147126	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00860000135787	ENSGT00940000155272.`c.b	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00390000002919.u	ENSGT00390000002919.v.b.a.b	ENSGT00940000158787.nb
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	217	NFYC (ENSMNEG00000027645)	RIMS3 (ENSMNEG00000034822)	ZNF684 (ENSMNEG00000044680)	EXO5 (ENSMNEG00000008813)	ZFP69 (ENSMNEG00000036561)	ZFP69B (ENSMNEG00000017249)	SMAP2 (ENSMNEG00000032255)	COL9A2 (ENSMNEG00000043170)	ZMPSTE24 (ENSMNEG00000038045)	TMCO2 (ENSMNEG00000034686)	RLF (ENSMNEG00000043618)	PPT1 (ENSMNEG00000036176)	CAP1 (ENSMNEG00000036964)	MFSD2A (ENSMNEG00000028513)	MYCL (ENSMNEG00000032787) #21	TRIT1 (ENSMNEG00000023137) #22	ENSMNEG00000034094	PPIE (ENSMNEG00000031362)	ENSMNEG00000033191	HPCAL4 (ENSMNEG00000028502)	ENSMNEG00000002154	NT5C1A (ENSMNEG00000031973)	HEYL (ENSMNEG00000009070)	ENSMNEG00000043139	PABPC4 (ENSMNEG00000043054)	ENSMNEG00000043485	ENSMNEG00000038372	ENSMNEG00000035118	MACF1 (ENSMNEG00000033514)	NDUFS5 (ENSMNEG00000027516)	AKIRIN1 (ENSMNEG00000038763)
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000161627.a.a.a.a.b.a.a.a.b.c.a.b.b.a.a.d	ENSGT00940000163099	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c.s	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT01100000263493.a.a.a.b.b.b.b.a.a.a.a.a.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT01100000263493.a.a.a.b.a.a.a.a.a.a.b.a.a	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000155272.`c.a	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000155272.`c.b	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00390000002919.u	ENSGT00940000158787.nb	ENSGT00940000159442	ENSGT01090000260070.C	ENSGT00390000017974.db	ENSGT00950000183031.A.a.a
Rhesus	MODERN SPECIES		ZFP69B (ENSMMUG00000005836)	ENSMMUG00000057845	SMAP2 (ENSMMUG00000013839)	COL9A2 (ENSMMUG00000018664)	ZMPSTE24 (ENSMMUG00000005992)	TMCO2 (ENSMMUG00000052510)	RLF (ENSMMUG00000032180)	PPT1 (ENSMMUG00000009189)	CAP1 (ENSMMUG00000009188)	MFSD2A (ENSMMUG00000011264)	ENSMMUG00000053512	ENSMMUG00000060377	MYCL (ENSMMUG00000016223) #21	ENSMMUG00000054563	ENSMMUG00000051893	TRIT1 (ENSMMUG00000016220) #22	ENSMMUG00000063318	ENSMMUG00000058881	PPIE (ENSMMUG00000018869)	HPCAL4 (ENSMMUG00000044273)	NT5C1A (ENSMMUG00000056128)	HEYL (ENSMMUG00000050019)	PABPC4 (ENSMMUG00000007497)	ENSMMUG00000064543	MACF1 (ENSMMUG00000009562)	ENSMMUG00000057080	AKIRIN1 (ENSMMUG00000009373)	RHBDL2 (ENSMMUG00000032188)	MYCBP (ENSMMUG00000039765)	RRAGC (ENSMMUG00000023634)	POU3F1 (ENSMMUG00000044406)
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES		EXO5 (ENSMFAG00000008984)	ZFP69 (ENSMFAG00000038294)	SMAP2 (ENSMFAG00000044100)	COL9A2 (ENSMFAG00000028569)	ZMPSTE24 (ENSMFAG00000044167)	ENSMFAG00000053876	TMCO2 (ENSMFAG00000038683)	RLF (ENSMFAG00000001299)	PPT1 (ENSMFAG00000029038)	CAP1 (ENSMFAG00000036663)	MFSD2A (ENSMFAG00000003330)	ENSMFAG00000058771	ENSMFAG00000063746	MYCL (ENSMFAG00000029625) #21	ENSMFAG00000052885	TRIT1 (ENSMFAG00000001316) #22	ENSMFAG00000058462	ENSMFAG00000041908	ENSMFAG00000031586	PPIE (ENSMFAG00000002082)	HPCAL4 (ENSMFAG00000033968)	NT5C1A (ENSMFAG00000056414)	HEYL (ENSMFAG00000045585)	PABPC4 (ENSMFAG00000041481)	ENSMFAG00000002753	MACF1 (ENSMFAG00000036050)	NDUFS5 (ENSMFAG00000027526)	ENSMFAG00000057367	AKIRIN1 (ENSMFAG00000038417)	RHBDL2 (ENSMFAG00000033099)	GJA9 (ENSMFAG00000028859)
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000159332	ENSGT00550000074801.h.c.b.a.a	ENSGT00940000163099	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000163434	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c.s	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000155272.`c.a	ENSGT00940000158790	ENSGT00390000004380.m.a.a.b	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000155272.ac	ENSGT00730000111729	ENSGT00940000155272.`c.b	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00390000002919.u	ENSGT00390000002919.v.b.b	ENSGT00940000158787.nb	ENSGT00940000159442
Olive baboon	MODERN SPECIES		KCNQ4 (ENSPANG00000006225)	NFYC (ENSPANG00000026473)	RIMS3 (ENSPANG00000010023)	ZNF684 (ENSPANG00000018123)	EXO5 (ENSPANG00000032341)	ZFP69 (ENSPANG00000048994)	ZFP69B (ENSPANG00000018450)	COL9A2 (ENSPANG00000007011)	ZMPSTE24 (ENSPANG00000007506)	TMCO2 (ENSPANG00000006394)	RLF (ENSPANG00000018124)	PPT1 (ENSPANG00000017273)	CAP1 (ENSPANG00000006452)	MFSD2A (ENSPANG00000011715)	MYCL (ENSPANG00000042839) #21	TRIT1 (ENSPANG00000018125) #22	ENSPANG00000010056	PPIE (ENSPANG00000000575)	HPCAL4 (ENSPANG00000006453)	NT5C1A (ENSPANG00000025518)	HEYL (ENSPANG00000006227)	PABPC4 (ENSPANG00000009484)	ENSPANG00000006813	MACF1 (ENSPANG00000019093)	ENSPANG00000019099	AKIRIN1 (ENSPANG00000004583)	RHBDL2 (ENSPANG00000034798)	GJA9 (ENSPANG00000006763)	ENSPANG00000029466	RRAGC (ENSPANG00000017086)	POU3F1 (ENSPANG00000009765)
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000159332	ENSGT00550000074801.h.c.b.a.a	ENSGT00940000163099	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000163434	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c.s	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000155272.`c.a	ENSGT00940000158790	ENSGT00390000004380.m.a.a.b	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00910000147126	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000155272.ac	ENSGT00730000111729	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00390000002919.v.b.b	ENSGT00940000158787.nb	ENSGT00940000159442	ENSGT01090000260070.C
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	227	NFYC (ENSCATG00000032882)	RIMS3 (ENSCATG00000017445)	ZNF684 (ENSCATG00000032130)	EXO5 (ENSCATG00000003100)	ZFP69 (ENSCATG00000030938)	ZFP69B (ENSCATG00000032477)	SMAP2 (ENSCATG00000039372)	COL9A2 (ENSCATG00000032540)	ZMPSTE24 (ENSCATG00000043666)	TMCO2 (ENSCATG00000044427)	RLF (ENSCATG00000032206)	PPT1 (ENSCATG00000035844)	ENSCATG00000035987	MFSD2A (ENSCATG00000032272)	MYCL (ENSCATG00000033384) #21	TRIT1 (ENSCATG00000034344) #22	ENSCATG00000037613	PPIE (ENSCATG00000034495)	ENSCATG00000032456	HPCAL4 (ENSCATG00000032488)	NT5C1A (ENSCATG00000038875)	ENSCATG00000036036	HEYL (ENSCATG00000037907)	ENSCATG00000005536	ENSCATG00000002769	PABPC4 (ENSCATG00000042164)	ENSCATG00000033745	MACF1 (ENSCATG00000039558)	ENSCATG00000043856	NDUFS5 (ENSCATG00000034399)	AKIRIN1 (ENSCATG00000036878)
Drill	MODERN SPECIES	672	RIMS3 (ENSMLEG00000042796)	ENSMLEG00000041734	ZNF684 (ENSMLEG00000035552)	EXO5 (ENSMLEG00000001570)	ZFP69 (ENSMLEG00000042959)	ZFP69B (ENSMLEG00000014259)	SMAP2 (ENSMLEG00000032355)	COL9A2 (ENSMLEG00000035440)	ZMPSTE24 (ENSMLEG00000037696)	TMCO2 (ENSMLEG00000034301)	RLF (ENSMLEG00000040465)	ENSMLEG00000043746	CAP1 (ENSMLEG00000044449)	MFSD2A (ENSMLEG00000040826)	MYCL (ENSMLEG00000017162) #21	TRIT1 (ENSMLEG00000035296) #22	ENSMLEG00000044426	PPIE (ENSMLEG00000040735)	ENSMLEG00000040607	NT5C1A (ENSMLEG00000038970)	ENSMLEG00000032704	HEYL (ENSMLEG00000032705)	PABPC4 (ENSMLEG00000040716)	ENSMLEG00000006499	MACF1 (ENSMLEG00000044445)	ENSMLEG00000040128	ENSMLEG00000043083	AKIRIN1 (ENSMLEG00000044218)	RHBDL2 (ENSMLEG00000010184)	GJA9 (ENSMLEG00000004074)	ENSMLEG00000044124
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	76	ENSGT00550000074801.h.c.b.a.a	ENSGT00940000163099	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000163434	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c.s	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00550000076451.a.a.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000155272.`c.a	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000155272.ac	ENSGT00940000158790	ENSGT00390000004380.m.a.a.b	ENSGT00940000161166	ENSGT00910000147126	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00860000135787
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	2906	RIMS3 (ENSRROG00000044320)	ZNF684 (ENSRROG00000032375)	EXO5 (ENSRROG00000003374)	ZFP69 (ENSRROG00000001028)	ZFP69B (ENSRROG00000035064)	SMAP2 (ENSRROG00000044815)	COL9A2 (ENSRROG00000001908)	ZMPSTE24 (ENSRROG00000029334)	TMCO2 (ENSRROG00000041961)	RLF (ENSRROG00000028839)	PPT1 (ENSRROG00000019913)	CAP1 (ENSRROG00000037313)	MFSD2A (ENSRROG00000045774)	ENSRROG00000042951	MYCL (ENSRROG00000039181) #21	TRIT1 (ENSRROG00000042670) #22	ENSRROG00000036368	PPIE (ENSRROG00000044935)	HPCAL4 (ENSRROG00000039612)	ENSRROG00000044816	NT5C1A (ENSRROG00000029433)	HEYL (ENSRROG00000035732)	PABPC4 (ENSRROG00000033355)	ENSRROG00000036630	ENSRROG00000035560
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	443	RIMS3 (ENSRBIG00000031605)	ENSRBIG00000038649	ZNF684 (ENSRBIG00000040446)	ZFP69 (ENSRBIG00000031369)	ZFP69B (ENSRBIG00000033501)	SMAP2 (ENSRBIG00000031486)	COL9A2 (ENSRBIG00000030760)	ZMPSTE24 (ENSRBIG00000021858)	TMCO2 (ENSRBIG00000037974)	RLF (ENSRBIG00000036531)	PPT1 (ENSRBIG00000035690)	CAP1 (ENSRBIG00000028175)	MFSD2A (ENSRBIG00000027966)	ENSRBIG00000039892	MYCL (ENSRBIG00000043373) #21	TRIT1 (ENSRBIG00000043179) #22
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000155689	ENSGT00940000159332	ENSGT00940000163099.g	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000163434	ENSGT00940000158387.a	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c.q.a	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000155272.yb	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000155272.xb	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00730000111729	ENSGT00390000002919.q	ENSGT00940000158787.nb	ENSGT00940000159442	ENSGT01090000260070.C	ENSGT00940000165268	ENSGT00390000017974
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000155689	ENSGT00940000159332	ENSGT00940000163099.g	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000163434	ENSGT00940000158387.a	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c.q.a	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000155272.xb	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000155272.yb	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00730000111729	ENSGT00390000002919.q	ENSGT00940000158787.nb	ENSGT00940000159442	ENSGT01090000260070.C	ENSGT00940000165268	ENSGT00390000017974
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000155689	ENSGT00940000159332	ENSGT00940000163099.g	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000163434	ENSGT00940000158387.a	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c.q.a	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000155272.xb	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000155272.yb	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00730000111729	ENSGT00390000002919.q.c	ENSGT00940000158787.nb	ENSGT00940000159442	ENSGT00390000017974	ENSGT00950000183031.A.a.a	ENSGT00940000163458
Capuchin	MODERN SPECIES	385	YARS2 (ENSCCAG00000038073)	PKP2 (ENSCCAG00000019077)	ENSCCAG00000027686	ENSCCAG00000036754	ZFP69B (ENSCCAG00000033657)	SMAP2 (ENSCCAG00000037997)	COL9A2 (ENSCCAG00000035153)	ZMPSTE24 (ENSCCAG00000024055)	TMCO2 (ENSCCAG00000028511)	RLF (ENSCCAG00000029606)	ENSCCAG00000022725	PPT1 (ENSCCAG00000036658)	ENSCCAG00000027519	MFSD2A (ENSCCAG00000030199)	MYCL (ENSCCAG00000022829) #21	TRIT1 (ENSCCAG00000031271) #22	ENSCCAG00000035167	PPIE (ENSCCAG00000024434)	HPCAL4 (ENSCCAG00000019940)	NT5C1A (ENSCCAG00000020441)	HEYL (ENSCCAG00000024717)	PABPC4 (ENSCCAG00000037306)	ENSCCAG00000015253	ENSCCAG00000032988	MACF1 (ENSCCAG00000032251)	ENSCCAG00000035166	ENSCCAG00000023836	AKIRIN1 (ENSCCAG00000035175)	CMTM4 (ENSCCAG00000025172)	CMTM3 (ENSCCAG00000027209)	CMTM2 (ENSCCAG00000031809)
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	130	NFYC (ENSSBOG00000023269)	RIMS3 (ENSSBOG00000013055)	ENSSBOG00000036155	EXO5 (ENSSBOG00000009084)	ZFP69 (ENSSBOG00000021129)	ZFP69B (ENSSBOG00000029619)	SMAP2 (ENSSBOG00000002291)	ENSSBOG00000034698	ZMPSTE24 (ENSSBOG00000026426)	TMCO2 (ENSSBOG00000036191)	RLF (ENSSBOG00000004728)	PPT1 (ENSSBOG00000031697)	ENSSBOG00000023387	MFSD2A (ENSSBOG00000034208)	MYCL (ENSSBOG00000031434) #21	TRIT1 (ENSSBOG00000024417) #22	PPIE (ENSSBOG00000035061)	HPCAL4 (ENSSBOG00000028543)	NT5C1A (ENSSBOG00000034033)	HEYL (ENSSBOG00000035072)	PABPC4 (ENSSBOG00000026193)	ENSSBOG00000023286	MACF1 (ENSSBOG00000035552)	ENSSBOG00000026836	ENSSBOG00000031752	AKIRIN1 (ENSSBOG00000032907)	RHBDL2 (ENSSBOG00000026311)	MYCBP (ENSSBOG00000030077)	RRAGC (ENSSBOG00000031005)	ENSSBOG00000028225	FHL3 (ENSSBOG00000032864)
Marmoset	MODERN SPECIES	19	RIMS3 (ENSCJAG00000002973)	ZNF684 (ENSCJAG00000002965)	EXO5 (ENSCJAG00000002961)	ZFP69 (ENSCJAG00000062374)	ZFP69B (ENSCJAG00000002952)	SMAP2 (ENSCJAG00000002908)	COL9A2 (ENSCJAG00000002851)	ENSCJAG00000075493	ZMPSTE24 (ENSCJAG00000002833)	TMCO2 (ENSCJAG00000002830)	RLF (ENSCJAG00000042605)	PPT1 (ENSCJAG00000002798)	CAP1 (ENSCJAG00000002738)	MFSD2A (ENSCJAG00000002712)	MYCL (ENSCJAG00000002700) #21	TRIT1 (ENSCJAG00000002620) #22	PPIE (ENSCJAG00000002589)	HPCAL4 (ENSCJAG00000041542)	NT5C1A (ENSCJAG00000002566)	HEYL (ENSCJAG00000065395)	ENSCJAG00000002512	ENSCJAG00000002504	ENSCJAG00000083308	MACF1 (ENSCJAG00000002323)	ENSCJAG00000045917	ENSCJAG00000043919	ENSCJAG00000082857	RHBDL2 (ENSCJAG00000002293)	GJA9 (ENSCJAG00000002288)	ENSCJAG00000073854	RRAGC (ENSCJAG00000045612)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	604	KCNQ4 (ENSANAG00000021072)	NFYC (ENSANAG00000020951)	RIMS3 (ENSANAG00000029140)	ENSANAG00000020223	ZFP69 (ENSANAG00000027896)	ZFP69B (ENSANAG00000033029)	SMAP2 (ENSANAG00000035291)	COL9A2 (ENSANAG00000036329)	ZMPSTE24 (ENSANAG00000027026)	TMCO2 (ENSANAG00000033235)	RLF (ENSANAG00000031894)	PPT1 (ENSANAG00000026377)	ENSANAG00000036880	MFSD2A (ENSANAG00000034076)	MYCL (ENSANAG00000035601) #21	TRIT1 (ENSANAG00000030732) #22	ENSANAG00000026668	PPIE (ENSANAG00000033595)	HPCAL4 (ENSANAG00000025899)	NT5C1A (ENSANAG00000037589)	ENSANAG00000035822	HEYL (ENSANAG00000019401)	PABPC4 (ENSANAG00000025079)	ENSANAG00000034394	ENSANAG00000034250	MACF1 (ENSANAG00000033273)	ENSANAG00000006239	ENSANAG00000000718	ENSANAG00000030654	AKIRIN1 (ENSANAG00000024590)	ENSANAG00000021869
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000155689	ENSGT00940000159332	ENSGT00940000163099	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000163434	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000155272	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00730000111729	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000158787.nb	ENSGT00940000159442	ENSGT01090000260070.C	ENSGT00390000017974	ENSGT00950000183031.A.a.a	ENSGT00940000163458
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000155689	ENSGT00940000159332	ENSGT00940000163099	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000163434	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000155272	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00730000111729	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000158787.nb	ENSGT00940000159442	ENSGT01090000260070.C	ENSGT00390000017974	ENSGT00950000183031.A.a.a	ENSGT00940000163458
Mouse lemur	MODERN SPECIES	11	KCNQ4 (ENSMICG00000046630)	NFYC (ENSMICG00000004285)	RIMS3 (ENSMICG00000004270)	ZNF684 (ENSMICG00000044852)	ZFP69 (ENSMICG00000007201)	ZFP69B (ENSMICG00000042001)	SMAP2 (ENSMICG00000015504)	COL9A2 (ENSMICG00000009969)	ZMPSTE24 (ENSMICG00000000308)	TMCO2 (ENSMICG00000014156)	RLF (ENSMICG00000000307)	ENSMICG00000000250	CAP1 (ENSMICG00000000248)	MFSD2A (ENSMICG00000016306)	MYCL (ENSMICG00000030328) #21	TRIT1 (ENSMICG00000016294) #22	ENSMICG00000034577	ENSMICG00000016676	HPCAL4 (ENSMICG00000034680)	NT5C1A (ENSMICG00000016662)	HEYL (ENSMICG00000030376)	ENSMICG00000042198	PABPC4 (ENSMICG00000016633)	ENSMICG00000044077	ENSMICG00000043579	MACF1 (ENSMICG00000016523)	ENSMICG00000042874	NDUFS5 (ENSMICG00000016518)	AKIRIN1 (ENSMICG00000016510)	RHBDL2 (ENSMICG00000006246)	ENSMICG00000031944
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	72	ENSGT00940000155689	ENSGT00940000159332	ENSGT00940000163099	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000163434	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000161351	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161166	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000155272	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00730000111729	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000158787.nb	ENSGT00940000159442	ENSGT01090000260070.C	ENSGT00390000017974	ENSGT00950000183031.A.a.a
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	508													ENSPSMG00000011544	MFSD2A (ENSPSMG00000011402)	MYCL (ENSPSMG00000011381) #21	TRIT1 (ENSPSMG00000011292) #22
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	357	KCNQ4 (ENSPCOG00000021204)	NFYC (ENSPCOG00000021083)	RIMS3 (ENSPCOG00000028045)	ZNF684 (ENSPCOG00000026540)	ZFP69 (ENSPCOG00000028710)	ZFP69B (ENSPCOG00000017570)	SMAP2 (ENSPCOG00000026437)	COL9A2 (ENSPCOG00000022937)	ZMPSTE24 (ENSPCOG00000016460)	TMCO2 (ENSPCOG00000009437)	RLF (ENSPCOG00000027247)	PPT1 (ENSPCOG00000010059)	CAP1 (ENSPCOG00000009880)	MFSD2A (ENSPCOG00000013582)	MYCL (ENSPCOG00000021177) #21	TRIT1 (ENSPCOG00000014150) #22	PABPC4 (ENSPCOG00000023725)	HEYL (ENSPCOG00000000827)	NT5C1A (ENSPCOG00000015476)	HPCAL4 (ENSPCOG00000013420)	ENSPCOG00000014516	ENSPCOG00000024778	MACF1 (ENSPCOG00000027318)	ENSPCOG00000025754	NDUFS5 (ENSPCOG00000016682)	AKIRIN1 (ENSPCOG00000028364)	RHBDL2 (ENSPCOG00000018792)	MYCBP (ENSPCOG00000016054)	ENSPCOG00000007138	POU3F1 (ENSPCOG00000005829)	UTP11 (ENSPCOG00000019349)
Bushbaby	MODERN SPECIES	259	KCNQ4 (ENSOGAG00000012616)	NFYC (ENSOGAG00000012614)	RIMS3 (ENSOGAG00000006117)	ENSOGAG00000014249	ZFP69 (ENSOGAG00000009257)	ZFP69B (ENSOGAG00000009114)	SMAP2 (ENSOGAG00000009115)	COL9A2 (ENSOGAG00000010159)	ZMPSTE24 (ENSOGAG00000008841)	TMCO2 (ENSOGAG00000002767)	RLF (ENSOGAG00000002764)	PPT1 (ENSOGAG00000005495)	CAP1 (ENSOGAG00000005492)	MFSD2A (ENSOGAG00000005489)	MYCL (ENSOGAG00000015380) #21	TRIT1 (ENSOGAG00000009571) #22	ENSOGAG00000025082	PPIE (ENSOGAG00000003620)	HPCAL4 (ENSOGAG00000031345)	NT5C1A (ENSOGAG00000003617)	HEYL (ENSOGAG00000030877)	PABPC4 (ENSOGAG00000004067)	ENSOGAG00000029048	MACF1 (ENSOGAG00000000073)	AKIRIN1 (ENSOGAG00000007962)	RHBDL2 (ENSOGAG00000014547)	GJA9 (ENSOGAG00000014545)	MYCBP (ENSOGAG00000024435)	RRAGC (ENSOGAG00000014541)	POU3F1 (ENSOGAG00000029584)	UTP11 (ENSOGAG00000016492)
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000155689	ENSGT00940000159332	ENSGT00940000163099	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000163434	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000164770	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000155272	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00980000198642	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00730000111729	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000158787	ENSGT00940000159442	ENSGT01090000260070.C
Tree shrew	MODERN SPECIES	1168												PPT1 (ENSTBEG00000005886)	CAP1 (ENSTBEG00000005022)	MFSD2A (ENSTBEG00000003227)	MYCL (ENSTBEG00000002060) #21	TRIT1 (ENSTBEG00000001317) #22
Glires	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000155689	ENSGT00940000159332	ENSGT00940000163099	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000163434	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000164770	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000155272	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00980000198642	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00730000111729	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000158787	ENSGT00940000159442	ENSGT01090000260070.C
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000159209	ENSGT00940000155689	ENSGT00940000159332	ENSGT00940000163099	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000155272	ENSGT00940000154788	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351
Rabbit	MODERN SPECIES	4	KCNQ4 (ENSOCUG00000015852)	NFYC (ENSOCUG00000025540)	RIMS3 (ENSOCUG00000014068)	ENSOCUG00000030737	EXO5 (ENSOCUG00000016005)	ZFP69 (ENSOCUG00000016000)	SMAP2 (ENSOCUG00000015858)	COL9A2 (ENSOCUG00000015838)	ZMPSTE24 (ENSOCUG00000015825)	TMCO2 (ENSOCUG00000017275)	RLF (ENSOCUG00000017263)	PPT1 (ENSOCUG00000012796)	ENSOCUG00000012790	MFSD2A (ENSOCUG00000001028)	MYCL (ENSOCUG00000025113) #21	TRIT1 (ENSOCUG00000002054) #22	ENSOCUG00000007677	ENSOCUG00000031949	PPIE (ENSOCUG00000007665)	HPCAL4 (ENSOCUG00000022645)	NT5C1A (ENSOCUG00000004298)	HEYL (ENSOCUG00000000560)	PABPC4 (ENSOCUG00000000562)	ENSOCUG00000023797	ENSOCUG00000032823	MACF1 (ENSOCUG00000000677)	ENSOCUG00000022318	NDUFS5 (ENSOCUG00000024417)	ENSOCUG00000005500	RHBDL2 (ENSOCUG00000016197)	GJA9 (ENSOCUG00000016515)
Pika	MODERN SPECIES	701															ENSOPRG00000003229 #21	ENSOPRG00000003205 #22	ENSOPRG00000003172
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000155689	ENSGT00940000159332	ENSGT00940000163099	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000163434	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000164770	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000155272	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00980000198642	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00730000111729	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000158787	ENSGT00940000159442	ENSGT01090000260070.C
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000155689	ENSGT00940000159332	ENSGT00940000163099	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000163434	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000155272	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000164770	ENSGT00980000198642	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00730000111729	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000158787	ENSGT00940000159442	ENSGT01090000260070.C
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000155689	ENSGT00940000159332	ENSGT00940000163099	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000163434	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000155272	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00730000111729	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000158787	ENSGT00940000159442	ENSGT01090000260070.C	ENSGT00390000017974	ENSGT00950000183031.A.a.a
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000159332	ENSGT00940000163099	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000163434	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00960000186932	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000155272	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00390000002919.l	ENSGT00730000111729	ENSGT00390000002919.k.b	ENSGT00940000158787	ENSGT00940000159442	ENSGT01090000260070.C	ENSGT00390000017974	ENSGT00950000183031.A.a.a
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000155689	ENSGT00940000159332	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000163434	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00960000186932	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000155272	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00390000002919.l	ENSGT00730000111729	ENSGT00390000002919.k.a	ENSGT00940000158787	ENSGT00940000159442	ENSGT01090000260070.C	ENSGT00390000017974	ENSGT00950000183031.A.a.a
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	120									TMCO2 (ENSUPAG00010016423)	RLF (ENSUPAG00010016437)	ENSUPAG00010016456	CAP1 (ENSUPAG00010016461)	MFSD2A (ENSUPAG00010016486)	MYCL (ENSUPAG00010016508) #21	ENSUPAG00010016518	TRIT1 (ENSUPAG00010016523) #22	PPIE (ENSUPAG00010016536)	HPCAL4 (ENSUPAG00010016554)	NT5C1A (ENSUPAG00010016564)	HEYL (ENSUPAG00010016578)	ENSUPAG00010016593	ENSUPAG00010016600	MACF1 (ENSUPAG00010016632)	ENSUPAG00010016776	NDUFS5 (ENSUPAG00010016787)	ENSUPAG00010016799	RHBDL2 (ENSUPAG00010016814)	GJA9 (ENSUPAG00010016834)	MYCBP (ENSUPAG00010016841)	RRAGC (ENSUPAG00010016855)	POU3F1 (ENSUPAG00010016876)
Squirrel	MODERN SPECIES	74	RIMS3 (ENSSTOG00000001897)	EXO5 (ENSSTOG00000007049)	ZFP69 (ENSSTOG00000031462)	ZFP69B (ENSSTOG00000009229)	SMAP2 (ENSSTOG00000005913)	COL9A2 (ENSSTOG00000005862)	ZMPSTE24 (ENSSTOG00000020016)	TMCO2 (ENSSTOG00000004814)	ENSSTOG00000022071	ENSSTOG00000033898	PPT1 (ENSSTOG00000005065)	CAP1 (ENSSTOG00000022338)	MFSD2A (ENSSTOG00000005042)	MYCL (ENSSTOG00000005037) #21	ENSSTOG00000034207	TRIT1 (ENSSTOG00000006446) #22	ENSSTOG00000031537	PPIE (ENSSTOG00000010445)	HPCAL4 (ENSSTOG00000033957)	NT5C1A (ENSSTOG00000010430)	HEYL (ENSSTOG00000010427)	PABPC4 (ENSSTOG00000010416)	ENSSTOG00000029371	MACF1 (ENSSTOG00000028672)	NDUFS5 (ENSSTOG00000011059)	ENSSTOG00000030751	AKIRIN1 (ENSSTOG00000023219)	RHBDL2 (ENSSTOG00000027167)	GJA9 (ENSSTOG00000027990)	MYCBP (ENSSTOG00000021547)	RRAGC (ENSSTOG00000011043)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	15	NFYC (ENSMMMG00000002381)	RIMS3 (ENSMMMG00000002414)	ZNF684 (ENSMMMG00000002456)	EXO5 (ENSMMMG00000002472)	ZFP69 (ENSMMMG00000002478)	ZFP69B (ENSMMMG00000002528)	SMAP2 (ENSMMMG00000002536)	ENSMMMG00000002633	TMCO2 (ENSMMMG00000002664)	RLF (ENSMMMG00000002678)	PPT1 (ENSMMMG00000002699)	CAP1 (ENSMMMG00000002734)	MFSD2A (ENSMMMG00000002807)	MYCL (ENSMMMG00000002838) #21	ENSMMMG00000002850	TRIT1 (ENSMMMG00000002859) #22	PPIE (ENSMMMG00000002879)	HPCAL4 (ENSMMMG00000002894)	NT5C1A (ENSMMMG00000002912)	HEYL (ENSMMMG00000002927)	PABPC4 (ENSMMMG00000002940)	MACF1 (ENSMMMG00000003103)	ENSMMMG00000003276	ENSMMMG00000003287	ENSMMMG00000003299	ENSMMMG00000003320	RHBDL2 (ENSMMMG00000003332)	GJA9 (ENSMMMG00000003355)	ENSMMMG00000003363	RRAGC (ENSMMMG00000003368)	UTP11 (ENSMMMG00000003393)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES		RIMS3 (ENSSVLG00005009202)	ENSSVLG00005009174	ENSSVLG00005009149	EXO5 (ENSSVLG00005009138)	ZFP69 (ENSSVLG00005009085)	ZFP69B (ENSSVLG00005009014)	SMAP2 (ENSSVLG00005008838)	COL9A2 (ENSSVLG00005008637)	ZMPSTE24 (ENSSVLG00005008594)	TMCO2 (ENSSVLG00005007276)	RLF (ENSSVLG00005007220)	PPT1 (ENSSVLG00005007110)	ENSSVLG00005007032	MFSD2A (ENSSVLG00005006874)	MYCL (ENSSVLG00005006832) #21	TRIT1 (ENSSVLG00005006559) #22	ENSSVLG00005006472	PPIE (ENSSVLG00005006402)	HPCAL4 (ENSSVLG00005006346)	NT5C1A (ENSSVLG00005006307)	HEYL (ENSSVLG00005006277)	PABPC4 (ENSSVLG00005006197)	ENSSVLG00005006142	ENSSVLG00005006096	MACF1 (ENSSVLG00005004041)	NDUFS5 (ENSSVLG00005003321)	AKIRIN1 (ENSSVLG00005003301)	RHBDL2 (ENSSVLG00005003273)	GJA9 (ENSSVLG00005003263)	ENSSVLG00005003250	ENSSVLG00005003228
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000159209	ENSGT00940000155689	ENSGT00940000159332	ENSGT00940000163099	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000155272	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000164770	ENSGT00980000198642	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000158787	ENSGT00940000159442	ENSGT00390000017974.v	ENSGT00390000017974.u.b
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00530000063624.C	ENSGT00940000159209	ENSGT00940000155689	ENSGT00940000159332	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000155272	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000164770	ENSGT00980000198642	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000158787	ENSGT00940000159442	ENSGT00390000017974.u.b	ENSGT00860000135887
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	7										ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000155272	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00980000198642	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000158787	ENSGT00940000159442	ENSGT00390000017974.u.b	ENSGT00860000135887	ENSGT00950000183031.A.a.a	ENSGT00940000163458
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	159										TMCO2 (ENSCLAG00000013078)	RLF (ENSCLAG00000009565)	PPT1 (ENSCLAG00000009987)	CAP1 (ENSCLAG00000009526)	MFSD2A (ENSCLAG00000011973)	MYCL (ENSCLAG00000010158) #21	TRIT1 (ENSCLAG00000009828) #22	PPIE (ENSCLAG00000010288)	HPCAL4 (ENSCLAG00000009571)	NT5C1A (ENSCLAG00000011943)	ENSCLAG00000018068	HEYL (ENSCLAG00000012566)	PABPC4 (ENSCLAG00000011899)	MACF1 (ENSCLAG00000011083)	NDUFS5 (ENSCLAG00000009162)	AKIRIN1 (ENSCLAG00000014736)	RHBDL2 (ENSCLAG00000012649)	ENSCLAG00000010129	ENSCLAG00000009189	RRAGC (ENSCLAG00000014225)	UTP11 (ENSCLAG00000012521)	FHL3 (ENSCLAG00000010530)
Degu	MODERN SPECIES	171							ENSODEG00000007201	ENSODEG00000019277	TMCO2 (ENSODEG00000008442)	RLF (ENSODEG00000007661)	ENSODEG00000019420	PPT1 (ENSODEG00000006483)	ENSODEG00000006778	MFSD2A (ENSODEG00000008097)	MYCL (ENSODEG00000007752) #21	TRIT1 (ENSODEG00000006117) #22	ENSODEG00000007914	ENSODEG00000007670	HPCAL4 (ENSODEG00000007714)	NT5C1A (ENSODEG00000008226)	HEYL (ENSODEG00000006313)	ENSODEG00000019223	ENSODEG00000006592	ENSODEG00000006675	ENSODEG00000006963	ENSODEG00000006381	NDUFS5 (ENSODEG00000006145)	ENSODEG00000006600	RHBDL2 (ENSODEG00000007151)	ENSODEG00000019387	ENSODEG00000006834
Guinea pig	MODERN SPECIES	143						EXO5 (ENSCPOG00000039403)	ZFP69 (ENSCPOG00000039050)	SMAP2 (ENSCPOG00000011534)	ZMPSTE24 (ENSCPOG00000011521)	TMCO2 (ENSCPOG00000004615)	RLF (ENSCPOG00000013002)	PPT1 (ENSCPOG00000005754)	ENSCPOG00000005746	MFSD2A (ENSCPOG00000012982)	MYCL (ENSCPOG00000036849) #21	TRIT1 (ENSCPOG00000012820) #22	OXCT2 (ENSCPOG00000024317)	ENSCPOG00000019366	PPIE (ENSCPOG00000007365)	HPCAL4 (ENSCPOG00000038678)	NT5C1A (ENSCPOG00000039653)	HEYL (ENSCPOG00000038617)	PABPC4 (ENSCPOG00000009552)	ENSCPOG00000021540	MACF1 (ENSCPOG00000010588)	NDUFS5 (ENSCPOG00000033659)	AKIRIN1 (ENSCPOG00000031693)	RHBDL2 (ENSCPOG00000022360)	H2AZ1 (ENSCPOG00000003879)	MYCBP (ENSCPOG00000020447)	ENSCPOG00000033169
Naked mole-rat female	DUPLICATION
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	26	RIMS3 (ENSHGLG00000003243)	ZNF684 (ENSHGLG00000039044)	EXO5 (ENSHGLG00000016741)	SMAP2 (ENSHGLG00000044537)	COL9A2 (ENSHGLG00000014385)	ZMPSTE24 (ENSHGLG00000047091)	TMCO2 (ENSHGLG00000012956)	ENSHGLG00000017963	RLF (ENSHGLG00000012491)	ENSHGLG00000035541	PPT1 (ENSHGLG00000011635)	ENSHGLG00000011409	ENSHGLG00000049961	MFSD2A (ENSHGLG00000010975)	MYCL (ENSHGLG00000035021) #21	ENSHGLG00000010308 #22	ENSHGLG00000033839	PABPC4 (ENSHGLG00000011162)	NT5C1A (ENSHGLG00000040411)	HPCAL4 (ENSHGLG00000037547)	PPIE (ENSHGLG00000012598)	ENSHGLG00000013430	MACF1 (ENSHGLG00000012916)	NDUFS5 (ENSHGLG00000040333)	ENSHGLG00000010032	RHBDL2 (ENSHGLG00000035014)	MYCBP (ENSHGLG00000049839)	RRAGC (ENSHGLG00000016185)	POU3F1 (ENSHGLG00000034082)	UTP11L (ENSHGLG00000037948)	FHL3 (ENSHGLG00000014086)
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	1	ENSHGLG00000016312	ENSHGLG00000017220	ENSHGLG00000010206	FBXL14 (ENSHGLG00000018846)	WNT5B (ENSHGLG00000018867)	ADIPOR2 (ENSHGLG00000018584)	CACNA2D4 (ENSHGLG00000009530)	LRTM2 (ENSHGLG00000015685)	DCP1B (ENSHGLG00000019233)	ENSHGLG00000015597	ENSHGLG00000037716	ENSHGLG00000020936	ENSHGLG00000016169	ENSHGLG00000010684	ADA2 (ENSHGLG00000046267)	ENSHGLG00000009564 #22	CECR2 (ENSHGLG00000007263)	ENSHGLG00000004087	SLC25A18 (ENSHGLG00000033243)	ATP6V1E1 (ENSHGLG00000012473)	ENSHGLG00000045187	ENSHGLG00000004800	BID (ENSHGLG00000018877)	MICAL3 (ENSHGLG00000016545)	PEX26 (ENSHGLG00000016019)	TUBA8 (ENSHGLG00000015926)	ENSHGLG00000016303	ENSHGLG00000034178	ENSHGLG00000017583	ENSHGLG00000006817	ENSHGLG00000043872
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00530000063624.C	ENSGT00940000159209	ENSGT00940000155689	ENSGT00940000159332	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000155272	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000164770	ENSGT00980000198642	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00730000111729	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000158787	ENSGT00940000159442	ENSGT00390000017974
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00530000063624.C	ENSGT00940000159209	ENSGT00940000155689	ENSGT00940000159332	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000155272	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000164770	ENSGT00980000198642	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00730000111729	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000158787	ENSGT00940000159442	ENSGT00390000017974
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00530000063624.C	ENSGT00940000159209	ENSGT00940000155689	ENSGT00940000159332	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000155272	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000164770	ENSGT00980000198642	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00730000111729	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000158787	ENSGT00940000159442	ENSGT00390000017974
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00530000063624.C	ENSGT00940000159209	ENSGT00940000155689	ENSGT00940000159332	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000164770.b	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000155272	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000164770.a	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00730000111729	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000158787	ENSGT00940000159442	ENSGT00520000061577
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00530000063624.C	ENSGT00940000159209	ENSGT00940000155689	ENSGT00940000159332	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000164770.b	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000155272	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00980000198642	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00730000111729	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000158787	ENSGT00940000159442.h	ENSGT00520000061577
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00530000063624.C	ENSGT00940000159209	ENSGT00940000155689	ENSGT00940000159332	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000164770.b	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000155272	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000158787	ENSGT00940000159442.h	ENSGT00390000017974.t	ENSGT00860000135887	ENSGT00950000183031.A.a.a	ENSGT00940000163458
Golden Hamster	MODERN SPECIES	783												Ppt1 (ENSMAUG00000005418)	Cap1 (ENSMAUG00000014946)	Mfsd2a (ENSMAUG00000008783)	Mycl (ENSMAUG00000019673) #21	Trit1 (ENSMAUG00000000399) #22	Ppie (ENSMAUG00000020323)	Hpcal4 (ENSMAUG00000019694)	Heyl (ENSMAUG00000021921)	ENSMAUG00000019763	ENSMAUG00000016732	Macf1 (ENSMAUG00000019511)	Ndufs5 (ENSMAUG00000017342)	Akirin1 (ENSMAUG00000021503)	Rhbdl2 (ENSMAUG00000015665)	Mycbp (ENSMAUG00000013797)	Rragc (ENSMAUG00000012656)	ENSMAUG00000005081	Pou3f1 (ENSMAUG00000014508)	Utp11 (ENSMAUG00000008360)	Fhl3 (ENSMAUG00000013735)
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	111	Rims3 (ENSCGRG00001020274)	Exo5 (ENSCGRG00001006191)	Zfp69 (ENSCGRG00001020565)	Smap2 (ENSCGRG00001019982)	Col9a2 (ENSCGRG00001015354)	Zmpste24 (ENSCGRG00001013492)	Tmco2 (ENSCGRG00001013255)	Rlf (ENSCGRG00001007124)	ENSCGRG00001001757	ENSCGRG00001019636	ENSCGRG00001019698	Ppt1 (ENSCGRG00001017317)	Cap1 (ENSCGRG00001014999)	Mfsd2a (ENSCGRG00001012559)	Mycl (ENSCGRG00001012143) #21	Trit1 (ENSCGRG00001001894) #22	Bmp8b (ENSCGRG00001024934)	Ppie (ENSCGRG00001018491)	Hpcal4 (ENSCGRG00001017506)	Nt5c1a (ENSCGRG00001015879)	Heyl (ENSCGRG00001014507)	Pabpc4 (ENSCGRG00001018166)	ENSCGRG00001024169	Macf1 (ENSCGRG00001022689)	Ndufs5 (ENSCGRG00001010913)	Akirin1 (ENSCGRG00001019740)	Rhbdl2 (ENSCGRG00001019222)	ENSCGRG00001000948	ENSCGRG00001001548	Mycbp (ENSCGRG00001014579)	ENSCGRG00001004752
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00530000063624.C	ENSGT00940000159209	ENSGT00940000155689	ENSGT00940000159332	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000155272	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00730000111729	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000158787	ENSGT00940000159442.h	ENSGT00390000017974.s.b	ENSGT00950000183031.A.a.a	ENSGT00940000163458
Prairie vole	MODERN SPECIES	1	Kcnq4 (ENSMOCG00000010712)	Nfyc (ENSMOCG00000018240)	ENSMOCG00000010327	Rims3 (ENSMOCG00000002716)	Exo5 (ENSMOCG00000009071)	Zfp69 (ENSMOCG00000001233)	Smap2 (ENSMOCG00000003493)	Col9a2 (ENSMOCG00000016172)	Zmpste24 (ENSMOCG00000001622)	Tmco2 (ENSMOCG00000008800)	Rlf (ENSMOCG00000021851)	Ppt1 (ENSMOCG00000015437)	ENSMOCG00000005738	Mfsd2a (ENSMOCG00000020481)	Mycl (ENSMOCG00000021799) #21	Trit1 (ENSMOCG00000008173) #22	Bmp8b (ENSMOCG00000022145)	ENSMOCG00000018443	Hpcal4 (ENSMOCG00000017738)	Nt5c1a (ENSMOCG00000014202)	Heyl (ENSMOCG00000000498)	Pabpc4 (ENSMOCG00000006763)	ENSMOCG00000006289	ENSMOCG00000001459	ENSMOCG00000013336	ENSMOCG00000016501	Ndufs5 (ENSMOCG00000012730)	Akirin1 (ENSMOCG00000003567)	Rhbdl2 (ENSMOCG00000002795)	Mycbp (ENSMOCG00000015574)	Rragc (ENSMOCG00000014353)
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	11	Nfyc (ENSPEMG00000008178)	Rims3 (ENSPEMG00000029843)	Exo5 (ENSPEMG00000024028)	Zfp69 (ENSPEMG00000004280)	Smap2 (ENSPEMG00000022978)	Col9a2 (ENSPEMG00000018729)	Zmpste24 (ENSPEMG00000017887)	Tmco2 (ENSPEMG00000018032)	Rlf (ENSPEMG00000027824)	ENSPEMG00000009772	ENSPEMG00000030310	Ppt1 (ENSPEMG00000008449)	Cap1 (ENSPEMG00000021949)	Mfsd2a (ENSPEMG00000022479)	Mycl (ENSPEMG00000029362) #21	Trit1 (ENSPEMG00000022418) #22	ENSPEMG00000024171	Ppie (ENSPEMG00000013681)	Hpcal4 (ENSPEMG00000031286)	Nt5c1a (ENSPEMG00000021341)	Heyl (ENSPEMG00000028938)	ENSPEMG00000023569	ENSPEMG00000022339	ENSPEMG00000026409	Macf1 (ENSPEMG00000012737)	ENSPEMG00000025195	Ndufs5 (ENSPEMG00000008080)	Akirin1 (ENSPEMG00000030900)	ENSPEMG00000031249	Mycbp (ENSPEMG00000024417)	Rragc (ENSPEMG00000004170)
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00530000063624.C	ENSGT00940000159209	ENSGT00940000155689	ENSGT00940000159332	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000164770.b	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000155272	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000158787	ENSGT00940000159442	ENSGT00520000061577	ENSGT00390000017974	ENSGT00860000135887
Mus	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000155689	ENSGT00940000159332	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00390000000102.b	ENSGT00390000000102.a	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000164770.b	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788	ENSGT00940000155272	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000158787	ENSGT00940000159442	ENSGT00520000061577.a	ENSGT00390000017974	ENSGT00860000135887
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00530000063624.C	ENSGT00940000159209	ENSGT00940000155689	ENSGT00940000159332	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000164770.b	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788.s	ENSGT00940000155272	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000158787	ENSGT00940000159442	ENSGT00520000061577.a	ENSGT00390000017974	ENSGT00860000135887
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000159332	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00390000000102.b.b.b	ENSGT00390000000102.b.b.a	ENSGT00390000000102.a	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000164770.b	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788.s	ENSGT00940000155272	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000158787	ENSGT00940000159442	ENSGT00520000061577.a	ENSGT00390000017974	ENSGT00860000135887
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000159332	ENSGT00390000015205	ENSGT00940000162278	ENSGT00940000158387	ENSGT00940000161290	ENSGT00390000002053	ENSGT00390000001528	ENSGT00950000183034.B	ENSGT00390000000102.b.a	ENSGT00390000000102.b.b.a	ENSGT00390000000102.a	ENSGT00940000156790	ENSGT00390000017955.c	ENSGT00390000005318.b.b.b	ENSGT00940000158613 #21	ENSGT00390000015214 #22	ENSGT00940000164770.b	ENSGT00390000009130.a.b	ENSGT00940000158790	ENSGT00940000161166	ENSGT00390000017767.b.b	ENSGT00940000161351	ENSGT00940000154788.s	ENSGT00940000155272	ENSGT00940000155824.C	ENSGT00390000002919	ENSGT00940000158787	ENSGT00940000159442	ENSGT00520000061577.a	ENSGT00390000017974	ENSGT00860000135887
Steppe mouse	MODERN SPECIES	3362										ENSMSIG00000012831	Ppt1 (ENSMSIG00000012843)	Cap1 (ENSMSIG00000012888)	ENSMSIG00000012905	Mfsd2a (ENSMSIG00000012913)	Mycl (ENSMSIG00000012978) #21	Trit1 (ENSMSIG00000013008) #22	Bmp8b (ENSMSIG00000013040)	Ppie (ENSMSIG00000013106)	Hpcal4 (ENSMSIG00000013133)	Nt5c1a (ENSMSIG00000013149)	Heyl (ENSMSIG00000013161)	Pabpc4 (ENSMSIG00000013185)	ENSMSIG00000013542	Macf1 (ENSMSIG00000013599)	ENSMSIG00000014771	ENSMSIG00000014777	Akirin1 (ENSMSIG00000014798)	Rhbdl2 (ENSMSIG00000014815)	ENSMSIG00000014855	ENSMSIG00000014863	Mycbp (ENSMSIG00000014871)
spretus	MODERN SPECIES	13	Rims3 (MGP_SPRETEiJ_G0027393)	Exo5 (MGP_SPRETEiJ_G0027394)	Zfp69 (MGP_SPRETEiJ_G0027395)	Smap2 (MGP_SPRETEiJ_G0027396)	Col9a2 (MGP_SPRETEiJ_G0027397)	Zmpste24 (MGP_SPRETEiJ_G0027398)	Tmco2 (MGP_SPRETEiJ_G0027399)	Rlf (MGP_SPRETEiJ_G0027400)	MGP_SPRETEiJ_G0027401	MGP_SPRETEiJ_G0027402	MGP_SPRETEiJ_G0027403	Ppt1 (MGP_SPRETEiJ_G0027404)	Cap1 (MGP_SPRETEiJ_G0027405)	Mfsd2a (MGP_SPRETEiJ_G0027406)	MGP_SPRETEiJ_G0027407 #21	Trit1 (MGP_SPRETEiJ_G0027408) #22	Bmp8b (MGP_SPRETEiJ_G0027409)	MGP_SPRETEiJ_G0027410	Ppie (MGP_SPRETEiJ_G0027411)	Hpcal4 (MGP_SPRETEiJ_G0027412)	Nt5c1a (MGP_SPRETEiJ_G0027413)	Heyl (MGP_SPRETEiJ_G0027414)	Pabpc4 (MGP_SPRETEiJ_G0027415)	MGP_SPRETEiJ_G0027416	Macf1 (MGP_SPRETEiJ_G0027417)	MGP_SPRETEiJ_G0027418	Akirin1 (MGP_SPRETEiJ_G0027419)	Rhbdl2 (MGP_SPRETEiJ_G0027420)	MGP_SPRETEiJ_G0027421	Mycbp (MGP_SPRETEiJ_G0027422)	Rragc (MGP_SPRETEiJ_G0027423)
Mouse	MODERN SPECIES	13	Exo5 (ENSMUSG00000028629)	Zfp69 (ENSMUSG00000064141)	Smap2 (ENSMUSG00000032870)	Col9a2 (ENSMUSG00000028626)	Zmpste24 (ENSMUSG00000043207)	Tmco2 (ENSMUSG00000078577)	Rlf (ENSMUSG00000049878)	Gm12888 (ENSMUSG00000073764)	Gm12886 (ENSMUSG00000078576)	Gm12887 (ENSMUSG00000078575)	9530002B09Rik (ENSMUSG00000023263)	Ppt1 (ENSMUSG00000028657)	Cap1 (ENSMUSG00000028656)	Mfsd2a (ENSMUSG00000028655)	Mycl (ENSMUSG00000028654) #21	Trit1 (ENSMUSG00000028653) #22	Bmp8b (ENSMUSG00000002384)	Oxct2b (ENSMUSG00000076438)	Ppie (ENSMUSG00000028651)	Hpcal4 (ENSMUSG00000046093)	Nt5c1a (ENSMUSG00000054958)	Heyl (ENSMUSG00000032744)	Pabpc4 (ENSMUSG00000011257)	Bmp8a (ENSMUSG00000032726)	Oxct2a (ENSMUSG00000076436)	Macf1 (ENSMUSG00000028649)	Ndufs5 (ENSMUSG00000028648)	Akirin1 (ENSMUSG00000023075)	Rhbdl2 (ENSMUSG00000043333)	Mycbp (ENSMUSG00000028647)	Rragc (ENSMUSG00000028646)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	13	Cited4 (MGP_CAROLIEiJ_G0026413)	Kcnq4 (MGP_CAROLIEiJ_G0026414)	Nfyc (MGP_CAROLIEiJ_G0026415)	Rims3 (MGP_CAROLIEiJ_G0026416)	Exo5 (MGP_CAROLIEiJ_G0026417)	Zfp69 (MGP_CAROLIEiJ_G0026418)	Smap2 (MGP_CAROLIEiJ_G0026419)	Col9a2 (MGP_CAROLIEiJ_G0026420)	Zmpste24 (MGP_CAROLIEiJ_G0026421)	Tmco2 (MGP_CAROLIEiJ_G0026422)	Rlf (MGP_CAROLIEiJ_G0026423)	Ppt1 (MGP_CAROLIEiJ_G0026424)	Cap1 (MGP_CAROLIEiJ_G0026425)	Mfsd2a (MGP_CAROLIEiJ_G0026426)	Mycl (MGP_CAROLIEiJ_G0026427) #21	Trit1 (MGP_CAROLIEiJ_G0026428) #22	Bmp8b (MGP_CAROLIEiJ_G0026429)	MGP_CAROLIEiJ_G0026430	Ppie (MGP_CAROLIEiJ_G0026431)	Hpcal4 (MGP_CAROLIEiJ_G0026432)	Nt5c1a (MGP_CAROLIEiJ_G0026433)	Heyl (MGP_CAROLIEiJ_G0026434)	Pabpc4 (MGP_CAROLIEiJ_G0026435)	MGP_CAROLIEiJ_G0026436	Macf1 (MGP_CAROLIEiJ_G0026437)	Ndufs5 (MGP_CAROLIEiJ_G0026438)	Akirin1 (MGP_CAROLIEiJ_G0026439)	Rhbdl2 (MGP_CAROLIEiJ_G0026440)	MGP_CAROLIEiJ_G0026441	MGP_CAROLIEiJ_G0026442	Rragc (MGP_CAROLIEiJ_G0026443)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	19	Kcnq4 (MGP_PahariEiJ_G0028743)	Nfyc (MGP_PahariEiJ_G0028744)	Rims3 (MGP_PahariEiJ_G0028745)	Exo5 (MGP_PahariEiJ_G0028746)	MGP_PahariEiJ_G0028747	Smap2 (MGP_PahariEiJ_G0028748)	Col9a2 (MGP_PahariEiJ_G0028749)	Zmpste24 (MGP_PahariEiJ_G0028750)	Tmco2 (MGP_PahariEiJ_G0028751)	Rlf (MGP_PahariEiJ_G0028752)	MGP_PahariEiJ_G0028753	Ppt1 (MGP_PahariEiJ_G0028754)	Cap1 (MGP_PahariEiJ_G0028755)	Mfsd2a (MGP_PahariEiJ_G0028756)	Mycl (MGP_PahariEiJ_G0028757) #21	Trit1 (MGP_PahariEiJ_G0028758) #22	MGP_PahariEiJ_G0028759	MGP_PahariEiJ_G0028760	Ppie (MGP_PahariEiJ_G0028761)	Hpcal4 (MGP_PahariEiJ_G0028762)	Nt5c1a (MGP_PahariEiJ_G0028763)	Heyl (MGP_PahariEiJ_G0028764)	Pabpc4 (MGP_PahariEiJ_G0028765)	Bmp8a (MGP_PahariEiJ_G0028766)	Macf1 (MGP_PahariEiJ_G0028767)	MGP_PahariEiJ_G0028768	Ndufs5 (MGP_PahariEiJ_G0028769)	Akirin1 (MGP_PahariEiJ_G0028770)	Rhbdl2 (MGP_PahariEiJ_G0028771)	MGP_PahariEiJ_G0028772	Mycbp (MGP_PahariEiJ_G0028773)
Rat	MODERN SPECIES	15	Rims3 (ENSRNOG00000011171)	Exo5 (ENSRNOG00000037432)	Zfp69 (ENSRNOG00000028662)	Smap2 (ENSRNOG00000011421)	LOC680700 (ENSRNOG00000011484)	Col9a2 (ENSRNOG00000011502)	Zmpste24 (ENSRNOG00000012054)	Tmco2 (ENSRNOG00000012340)	Rlf (ENSRNOG00000027921)	AC124205.2 (ENSRNOG00000059975)	Twf1-ps1 (ENSRNOG00000012595)	Ppt1 (ENSRNOG00000012616)	Cap1 (ENSRNOG00000013492)	Mfsd2a (ENSRNOG00000014008)	Mycl (ENSRNOG00000014259) #21	Trit1 (ENSRNOG00000014274) #22	Bmp8b (ENSRNOG00000033209)	Ppie (ENSRNOG00000014762)	Hpcal4 (ENSRNOG00000050983)	Nt5c1a (ENSRNOG00000068555)	Heyl (ENSRNOG00000015318)	Pabpc4 (ENSRNOG00000015642)	Oxct2a (ENSRNOG00000070053)	Bmp8a (ENSRNOG00000030155)	Macf1 (ENSRNOG00000016047)	Ndufs5 (ENSRNOG00000026646)	Akirin1 (ENSRNOG00000026610)	Rhbdl2 (ENSRNOG00000026592)	ENSRNOG00000069690	Mycbp (ENSRNOG00000065724)	Rragc (ENSRNOG00000017426)
Lesser Egyptian jerboa	DUPLICATION
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	79	Ccdc32 (ENSJJAG00000017032)	Rpusd2 (ENSJJAG00000023160)	ENSJJAG00000012632	ENSJJAG00000000354	Rad51 (ENSJJAG00000019338)	Rmdn3 (ENSJJAG00000020742)	Gchfr (ENSJJAG00000005040)	Dnajc17 (ENSJJAG00000011274)	Zfyve19 (ENSJJAG00000022792)	ENSJJAG00000011645	Spint1 (ENSJJAG00000014215)	Rhov (ENSJJAG00000005067)	Vps18 (ENSJJAG00000015321)	Dll4 (ENSJJAG00000019587)	Ino80 (ENSJJAG00000016166)	ENSJJAG00000000316 #22	ENSJJAG00000005674	ENSJJAG00000018584	ENSJJAG00000004045	Traf6 (ENSJJAG00000019637)	ENSJJAG00000024040	ENSJJAG00000009576	Pamr1 (ENSJJAG00000002115)	ENSJJAG00000012579	ENSJJAG00000017687	ENSJJAG00000024031	Pdhx (ENSJJAG00000007859)	ENSJJAG00000011063	Ehf (ENSJJAG00000023839)	Elf5 (ENSJJAG00000003357)	Cat (ENSJJAG00000012897)
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	117					ENSJJAG00000022543	Smap2 (ENSJJAG00000024140)	Col9a2 (ENSJJAG00000000950)	Zmpste24 (ENSJJAG00000023367)	Tmco2 (ENSJJAG00000006506)	Rlf (ENSJJAG00000013083)	ENSJJAG00000021094	Ppt1 (ENSJJAG00000016991)	Cap1 (ENSJJAG00000021395)	Mfsd2a (ENSJJAG00000015941)	Mycl (ENSJJAG00000011159) #21	ENSJJAG00000000300 #22	ENSJJAG00000023596	Tinagl1 (ENSJJAG00000019903)	Hcrtr1 (ENSJJAG00000024301)	Pef1 (ENSJJAG00000018921)	ENSJJAG00000019371	Adgrb2 (ENSJJAG00000017327)	ENSJJAG00000023812	ENSJJAG00000022891	Khdrbs1 (ENSJJAG00000016809)	Tmem39b (ENSJJAG00000010538)	Kpna6 (ENSJJAG00000015362)	Txlna (ENSJJAG00000007353)	Ccdc28b (ENSJJAG00000017928)	ENSJJAG00000013086	Dcdc2b (ENSJJAG00000022479)
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	352	Cited4 (ENSDORG00000024161)	Kcnq4 (ENSDORG00000009865)	Nfyc (ENSDORG00000009863)	Rims3 (ENSDORG00000014652)	Exo5 (ENSDORG00000003571)	Zfp69 (ENSDORG00000024989)	Smap2 (ENSDORG00000016161)	Col9a2 (ENSDORG00000014027)	Zmpste24 (ENSDORG00000014026)	Tmco2 (ENSDORG00000024253)	Rlf (ENSDORG00000010416)	Ppt1 (ENSDORG00000027642)	ENSDORG00000003053	Mfsd2a (ENSDORG00000012839)	Mycl (ENSDORG00000026501) #21	Trit1 (ENSDORG00000012449) #22	ENSDORG00000025089	Ppie (ENSDORG00000005175)	Hpcal4 (ENSDORG00000005161)	Nt5c1a (ENSDORG00000028589)	Heyl (ENSDORG00000024912)	Pabpc4 (ENSDORG00000011581)	ENSDORG00000016166	ENSDORG00000023553	ENSDORG00000024495	Ndufs5 (ENSDORG00000014651)	Akirin1 (ENSDORG00000025387)	Rhbdl2 (ENSDORG00000010234)	ENSDORG00000028436	Mycbp (ENSDORG00000010232)	ENSDORG00000024713