Chordata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000001332 #22 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000001332 #22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000001332 #22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000161107 ENSGT00940000161610 ENSGT00940000159896 ENSGT00730000111119 ENSGT00390000017800 ENSGT00940000162043 ENSGT00940000161150 ENSGT00940000161442 ENSGT00390000006916.d ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000166431 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00950000183024.a.b.a Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000166431 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00950000183024.a.b.a Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000166431 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00950000183024.a.b.a Amniota ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000166431 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00940000166226 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000166431 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00940000166226 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Theria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000166431 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00940000166226 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000166431 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00940000166226 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158921 ENSGT01070000257281 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000166431 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00940000166226 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01070000257281 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000166431 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158921 ENSGT01070000257281 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000166431 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 Glires ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000158921 ENSGT01070000257281 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000166431 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158921 ENSGT01070000257281 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d.t ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00640000092775 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d.t ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00640000092775 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d.t ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00640000092775 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Muroidea ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d.t ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00640000092775 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 351 ENSNGAG00000005761 #21 Eapp (ENSNGAG00000015838) #22 Sptssa (ENSNGAG00000005131) #23 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00950000182987.c.a.a.o.a ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d.t ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00640000092775 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Murinae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00950000182987.c.a.a.o.a ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d.t ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00640000092775 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Mus ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00950000182987.c.a.a.o.a ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d.t ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00640000092775 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Mus_A ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00950000182987.c.a.a.o.a ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d.t ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00640000092775 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Mus_B ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00950000182987.c.a.a.o.a ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d.t ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a.d ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00640000092775 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Mus_C ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00950000182987.c.a.a.o.a ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d.t ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000012799 ENSGT00640000092775 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a spretus MODERN SPECIES 3 Brms1l (MGP_SPRETEiJ_G0018609) MGP_SPRETEiJ_G0018608 Insm2 (MGP_SPRETEiJ_G0018607) Aldoart2 (MGP_SPRETEiJ_G0018606) Nfkbia (MGP_SPRETEiJ_G0018605) Psma6 (MGP_SPRETEiJ_G0018604) MGP_SPRETEiJ_G0018603 Fam177a2 (MGP_SPRETEiJ_G0018602) Fam177a (MGP_SPRETEiJ_G0018601) MGP_SPRETEiJ_G0018600 MGP_SPRETEiJ_G0018599 MGP_SPRETEiJ_G0018598 Baz1a (MGP_SPRETEiJ_G0018597) Cfl2 (MGP_SPRETEiJ_G0018596) Snx6 (MGP_SPRETEiJ_G0018595) Eapp (MGP_SPRETEiJ_G0018594) #22 Sptssa (MGP_SPRETEiJ_G0018593) #23 Egln3 (MGP_SPRETEiJ_G0018592) Npas3 (MGP_SPRETEiJ_G0018591) Akap6 (MGP_SPRETEiJ_G0018590) Arhgap5 (MGP_SPRETEiJ_G0018589) Nubpl (MGP_SPRETEiJ_G0018588) Gpr33 (MGP_SPRETEiJ_G0018587) Dtd2 (MGP_SPRETEiJ_G0018586) #21 Heatr5a (MGP_SPRETEiJ_G0018585) Hectd1 (MGP_SPRETEiJ_G0018584) Ap4s1 (MGP_SPRETEiJ_G0018583) Strn3 (MGP_SPRETEiJ_G0018582) Coch (MGP_SPRETEiJ_G0018581) Scfd1 (MGP_SPRETEiJ_G0018580) G2e3 (MGP_SPRETEiJ_G0018579) Steppe mouse MODERN SPECIES 2243 Eapp (ENSMSIG00000008901) #22 Sptssa (ENSMSIG00000008968) #23 Mouse MODERN SPECIES 3 Insm2 (ENSMUSG00000045440) Aldoart2 (ENSMUSG00000063129) Nfkbia (ENSMUSG00000021025) Psma6 (ENSMUSG00000021024) Prorp (ENSMUSG00000021023) Ppp2r3c (ENSMUSG00000021022) Srp54c (ENSMUSG00000079108) Fam177a2 (ENSMUSG00000094103) Srp54b (ENSMUSG00000112449) Fam177a (ENSMUSG00000095595) Srp54a (ENSMUSG00000073079) 2700097O09Rik (ENSMUSG00000062198) Baz1a (ENSMUSG00000035021) Cfl2 (ENSMUSG00000062929) Snx6 (ENSMUSG00000005656) Eapp (ENSMUSG00000054302) #22 Sptssa (ENSMUSG00000044408) #23 Egln3 (ENSMUSG00000035105) Npas3 (ENSMUSG00000021010) Akap6 (ENSMUSG00000061603) Arhgap5 (ENSMUSG00000035133) Nubpl (ENSMUSG00000035142) Gpr33 (ENSMUSG00000035148) Dtd2 (ENSMUSG00000020956) #21 Heatr5a (ENSMUSG00000035181) Hectd1 (ENSMUSG00000035247) Ap4s1 (ENSMUSG00000020955) Strn3 (ENSMUSG00000020954) Coch (ENSMUSG00000020953) Scfd1 (ENSMUSG00000020952) G2e3 (ENSMUSG00000035293) Ryukyu mouse MODERN SPECIES 3 MGP_CAROLIEiJ_G0017763 Insm2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017762) Aldoart2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017761) Nfkbia (MGP_CAROLIEiJ_G0017760) Psma6 (MGP_CAROLIEiJ_G0017759) Prorp (MGP_CAROLIEiJ_G0017758) Ppp2r3c (MGP_CAROLIEiJ_G0017757) MGP_CAROLIEiJ_G0017756 MGP_CAROLIEiJ_G0017755 MGP_CAROLIEiJ_G0017754 2700097O09Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0017753) MGP_CAROLIEiJ_G0017752 Baz1a (MGP_CAROLIEiJ_G0017751) Cfl2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017750) Snx6 (MGP_CAROLIEiJ_G0017749) Eapp (MGP_CAROLIEiJ_G0017748) #22 Sptssa (MGP_CAROLIEiJ_G0017747) #23 Egln3 (MGP_CAROLIEiJ_G0017746) Npas3 (MGP_CAROLIEiJ_G0017745) Akap6 (MGP_CAROLIEiJ_G0017744) Arhgap5 (MGP_CAROLIEiJ_G0017743) Nubpl (MGP_CAROLIEiJ_G0017742) Gpr33 (MGP_CAROLIEiJ_G0017741) Dtd2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017740) #21 Heatr5a (MGP_CAROLIEiJ_G0017739) Hectd1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017738) Ap4s1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017737) Strn3 (MGP_CAROLIEiJ_G0017736) Coch (MGP_CAROLIEiJ_G0017735) Scfd1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017734) G2e3 (MGP_CAROLIEiJ_G0017733) Shrew mouse MODERN SPECIES 20 MGP_PahariEiJ_G0029519 Insm2 (MGP_PahariEiJ_G0029518) Aldoart2 (MGP_PahariEiJ_G0029517) Nfkbia (MGP_PahariEiJ_G0029516) Psma6 (MGP_PahariEiJ_G0029515) Prorp (MGP_PahariEiJ_G0029514) Ppp2r3c (MGP_PahariEiJ_G0029513) MGP_PahariEiJ_G0029512 MGP_PahariEiJ_G0029511 MGP_PahariEiJ_G0029510 2700097O09Rik (MGP_PahariEiJ_G0029509) MGP_PahariEiJ_G0029508 Baz1a (MGP_PahariEiJ_G0029507) Cfl2 (MGP_PahariEiJ_G0029506) Snx6 (MGP_PahariEiJ_G0029505) Eapp (MGP_PahariEiJ_G0029504) #22 Sptssa (MGP_PahariEiJ_G0029503) #23 Egln3 (MGP_PahariEiJ_G0029502) Npas3 (MGP_PahariEiJ_G0029501) Akap6 (MGP_PahariEiJ_G0029500) Arhgap5 (MGP_PahariEiJ_G0029499) Nubpl (MGP_PahariEiJ_G0029498) Gpr33 (MGP_PahariEiJ_G0029497) Dtd2 (MGP_PahariEiJ_G0029496) #21 Heatr5a (MGP_PahariEiJ_G0029495) Hectd1 (MGP_PahariEiJ_G0029494) Ap4s1 (MGP_PahariEiJ_G0029493) Strn3 (MGP_PahariEiJ_G0029492) Coch (MGP_PahariEiJ_G0029491) Scfd1 (MGP_PahariEiJ_G0029490) G2e3 (MGP_PahariEiJ_G0029489) Rat MODERN SPECIES 16 Mbip (ENSRNOG00000008610) Brms1l (ENSRNOG00000008249) LOC100359668 (ENSRNOG00000033776) Ralgapa1 (ENSRNOG00000046256) Aldoart2 (ENSRNOG00000030869) Nfkbia (ENSRNOG00000007390) Psma6 (ENSRNOG00000007114) Prorp (ENSRNOG00000007043) Ppp2r3c (ENSRNOG00000023591) Fam177a1 (ENSRNOG00000064975) Srp54a (ENSRNOG00000032776) RGD1304624 (ENSRNOG00000006986) Baz1a (ENSRNOG00000006828) Cfl2 (ENSRNOG00000045892) Snx6 (ENSRNOG00000005249) Eapp (ENSRNOG00000004509) #22 Sptssa (ENSRNOG00000004292) #23 Rps10 (ENSRNOG00000066637) Timm23b (ENSRNOG00000031285) Egln3 (ENSRNOG00000005053) ENSRNOG00000066295 Npas3 (ENSRNOG00000068162) Akap6 (ENSRNOG00000004841) Arhgap5 (ENSRNOG00000004696) ENSRNOG00000070950 Nubpl (ENSRNOG00000027444) Gpr33-ps1 (ENSRNOG00000038990) Dtd2 (ENSRNOG00000006727) #21 Heatr5a (ENSRNOG00000006483) Hectd1 (ENSRNOG00000006905) Ap4s1 (ENSRNOG00000005765) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00950000182987.c.a.a.o.a ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d.t ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00640000092775 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00900000143527 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00950000182987.c.a.a.o.a ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d.t ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00640000092775 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 2 ENSCGRG00001024105 Ralgapa1 (ENSCGRG00001024774) Insm2 (ENSCGRG00001024873) Aldoart2 (ENSCGRG00001002722) ENSCGRG00001024024 Psma6 (ENSCGRG00001001597) ENSCGRG00001003022 ENSCGRG00001006281 ENSCGRG00001007854 ENSCGRG00001009525 2700097O09Rik (ENSCGRG00001023053) ENSCGRG00001023351 Baz1a (ENSCGRG00001013418) Cfl2 (ENSCGRG00001014849) Snx6 (ENSCGRG00001015718) Eapp (ENSCGRG00001019760) #22 Sptssa (ENSCGRG00001009767) #23 Egln3 (ENSCGRG00001011120) Npas3 (ENSCGRG00001014006) Akap6 (ENSCGRG00001015059) ENSCGRG00001009818 Arhgap5 (ENSCGRG00001002196) Nubpl (ENSCGRG00001004006) ENSCGRG00001006641 Gpr33 (ENSCGRG00001011244) Dtd2 (ENSCGRG00001015902) #21 Heatr5a (ENSCGRG00001017067) ENSCGRG00001024436 Hectd1 (ENSCGRG00001024884) Ap4s1 (ENSCGRG00001023362) Strn3 (ENSCGRG00001000550) Golden Hamster MODERN SPECIES 716 Nkx2-1 (ENSMAUG00000019963) ENSMAUG00000012140 Brms1l (ENSMAUG00000020210) ENSMAUG00000009162 Ralgapa1 (ENSMAUG00000013201) Insm2 (ENSMAUG00000003017) Nfkbia (ENSMAUG00000006212) Psma6 (ENSMAUG00000019916) Prorp (ENSMAUG00000019281) Ppp2r3c (ENSMAUG00000016875) ENSMAUG00000010631 ENSMAUG00000014447 Baz1a (ENSMAUG00000012163) Cfl2 (ENSMAUG00000000736) ENSMAUG00000014794 Eapp (ENSMAUG00000011998) #22 Sptssa (ENSMAUG00000014218) #23 Egln3 (ENSMAUG00000012097) Npas3 (ENSMAUG00000001084) Akap6 (ENSMAUG00000014339) Arhgap5 (ENSMAUG00000008108) Lesser Egyptian jerboa DUPLICATION Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 86 ENSJJAG00000015801 #22 Sptssa (ENSJJAG00000014413) #23 ENSJJAG00000003660 Egln3 (ENSJJAG00000013045) Arhgap5 (ENSJJAG00000022832) ENSJJAG00000019398 ENSJJAG00000015737 #21 Heatr5a (ENSJJAG00000019420) Hectd1 (ENSJJAG00000001344) Ap4s1 (ENSJJAG00000022804) Strn3 (ENSJJAG00000019703) Coch (ENSJJAG00000019025) G2e3 (ENSJJAG00000014439) ENSJJAG00000001269 ENSJJAG00000001174 Nova1 (ENSJJAG00000012915) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 184 ENSJJAG00000019460 Rnase10 (ENSJJAG00000019054) ENSJJAG00000018453 Pip4p1 (ENSJJAG00000012864) ENSJJAG00000012067 Osgep (ENSJJAG00000010067) ENSJJAG00000007593 Klhl33 (ENSJJAG00000002330) Tep1 (ENSJJAG00000000067) Parp2 (ENSJJAG00000006912) ENSJJAG00000000726 ENSJJAG00000012265 Ttc5 (ENSJJAG00000000234) ENSJJAG00000020853 #22 ENSJJAG00000012244 Or4k1 (ENSJJAG00000012249) Or4m1 (ENSJJAG00000012228) ENSJJAG00000012234 ENSJJAG00000012206 ENSJJAG00000019743 Or4n5 (ENSJJAG00000023766) Slc30a4 (ENSJJAG00000022834) ENSJJAG00000022498 Sqor (ENSJJAG00000022157) ENSJJAG00000020506 ENSJJAG00000012383 ENSJJAG00000012377 ENSJJAG00000020214 Sema6d (ENSJJAG00000017228) Kangaroo rat MODERN SPECIES 335 Pax9 (ENSDORG00000028039) Nkx2-1 (ENSDORG00000023229) Mbip (ENSDORG00000000347) ENSDORG00000024326 ENSDORG00000027989 Brms1l (ENSDORG00000005811) Ralgapa1 (ENSDORG00000001812) ENSDORG00000012862 Psma6 (ENSDORG00000010060) ENSDORG00000010059 ENSDORG00000026400 ENSDORG00000005159 Baz1a (ENSDORG00000008833) Cfl2 (ENSDORG00000006039) Snx6 (ENSDORG00000007000) Eapp (ENSDORG00000010166) #22 Sptssa (ENSDORG00000030126) #23 Egln3 (ENSDORG00000014235) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158921 ENSGT01070000257281 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d.t.j ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00640000092775 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000158921 ENSGT01070000257281 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d.t.j ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00640000092775 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d.s.a ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d.t.j ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00640000092775 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 108 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d.t.j ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00640000092775 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Squirrel DUPLICATION Squirrel MODERN SPECIES 354 ZFAND2A (ENSSTOG00000003030) GPER1 (ENSSTOG00000034461) ENSSTOG00000031759 GPR146 (ENSSTOG00000030630) C7orf50 (ENSSTOG00000027588) CYP2W1 (ENSSTOG00000003002) COX19 (ENSSTOG00000032354) ADAP1 (ENSSTOG00000024349) GET4 (ENSSTOG00000003934) SUN1 (ENSSTOG00000003895) DNAAF5 (ENSSTOG00000003874) PRKAR1B (ENSSTOG00000003855) PDGFA (ENSSTOG00000003223) FAM20C (ENSSTOG00000019720) ENSSTOG00000034676 ENSSTOG00000024440 #22 Squirrel MODERN SPECIES 94 BRMS1L (ENSSTOG00000026072) RALGAPA1 (ENSSTOG00000001249) INSM2 (ENSSTOG00000026540) NFKBIA (ENSSTOG00000007587) ENSSTOG00000011774 ENSSTOG00000023566 ENSSTOG00000011766 PPP2R3C (ENSSTOG00000009212) FAM177A1 (ENSSTOG00000016027) SRP54 (ENSSTOG00000016023) ENSSTOG00000024975 ENSSTOG00000027145 BAZ1A (ENSSTOG00000012204) ENSSTOG00000001675 SNX6 (ENSSTOG00000030590) ENSSTOG00000005273 #22 SPTSSA (ENSSTOG00000025158) #23 EGLN3 (ENSSTOG00000027368) NPAS3 (ENSSTOG00000014736) AKAP6 (ENSSTOG00000024157) ARHGAP5 (ENSSTOG00000020291) NUBPL (ENSSTOG00000004688) GPR33 (ENSSTOG00000027164) ENSSTOG00000025562 #21 HEATR5A (ENSSTOG00000004620) HECTD1 (ENSSTOG00000023965) ENSSTOG00000010759 STRN3 (ENSSTOG00000010749) COCH (ENSSTOG00000000556) SCFD1 (ENSSTOG00000008939) G2E3 (ENSSTOG00000008924) Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 18 MBIP (ENSUPAG00010000502) ENSUPAG00010000520 RALGAPA1 (ENSUPAG00010000544) INSM2 (ENSUPAG00010001161) NFKBIA (ENSUPAG00010001173) PSMA6 (ENSUPAG00010001196) PRORP (ENSUPAG00010001241) ENSUPAG00010001286 PPP2R3C (ENSUPAG00010001303) FAM177A1 (ENSUPAG00010001644) SRP54 (ENSUPAG00010001653) ENSUPAG00010001684 BAZ1A (ENSUPAG00010001722) ENSUPAG00010001776 SNX6 (ENSUPAG00010001786) EAPP (ENSUPAG00010001833) #22 ENSUPAG00010001845 SPTSSA (ENSUPAG00010001850) #23 EGLN3 (ENSUPAG00010001862) NPAS3 (ENSUPAG00010001878) ENSUPAG00010001945 AKAP6 (ENSUPAG00010001952) ARHGAP5 (ENSUPAG00010001993) NUBPL (ENSUPAG00010002012) GPR33 (ENSUPAG00010002026) ENSUPAG00010002029 #21 HEATR5A (ENSUPAG00010002104) HECTD1 (ENSUPAG00010012181) AP4S1 (ENSUPAG00010012317) STRN3 (ENSUPAG00010012325) COCH (ENSUPAG00010012392) Alpin marmot MODERN SPECIES 1 ENSMMMG00000005857 BRMS1L (ENSMMMG00000005865) RALGAPA1 (ENSMMMG00000005888) INSM2 (ENSMMMG00000006417) ENSMMMG00000006428 PSMA6 (ENSMMMG00000006439) PRORP (ENSMMMG00000006469) ENSMMMG00000006558 FAM177A1 (ENSMMMG00000006572) SRP54 (ENSMMMG00000006580) ENSMMMG00000006634 BAZ1A (ENSMMMG00000006696) ENSMMMG00000006731 ENSMMMG00000006738 ENSMMMG00000006742 EAPP (ENSMMMG00000006761) #22 ENSMMMG00000006766 SPTSSA (ENSMMMG00000006776) #23 EGLN3 (ENSMMMG00000006788) ENSMMMG00000006799 ENSMMMG00000006834 ARHGAP5 (ENSMMMG00000006856) ENSMMMG00000006876 NUBPL (ENSMMMG00000006890) GPR33 (ENSMMMG00000006908) DTD2 (ENSMMMG00000006910) #21 HEATR5A (ENSMMMG00000006921) HECTD1 (ENSMMMG00000006978) AP4S1 (ENSMMMG00000007043) STRN3 (ENSMMMG00000007068) COCH (ENSMMMG00000009368) Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 11 RALGAPA1 (ENSSVLG00005001913) INSM2 (ENSSVLG00005002423) NFKBIA (ENSSVLG00005002436) PSMA6 (ENSSVLG00005002482) PRORP (ENSSVLG00005002581) PPP2R3C (ENSSVLG00005002629) FAM177A1 (ENSSVLG00005002647) ENSSVLG00005002666 ENSSVLG00005002677 SRP54 (ENSSVLG00005002707) ENSSVLG00005002806 BAZ1A (ENSSVLG00005002845) ENSSVLG00005002890 ENSSVLG00005002935 ENSSVLG00005003024 ENSSVLG00005003042 #22 ENSSVLG00005003053 #23 ENSSVLG00005003068 ENSSVLG00005003086 ENSSVLG00005003092 EGLN3 (ENSSVLG00005003108) NPAS3 (ENSSVLG00005003199) AKAP6 (ENSSVLG00005003395) ARHGAP5 (ENSSVLG00005003448) NUBPL (ENSSVLG00005003491) GPR33 (ENSSVLG00005003516) DTD2 (ENSSVLG00005003527) #21 HEATR5A (ENSSVLG00005003550) HECTD1 (ENSSVLG00005003644) AP4S1 (ENSSVLG00005003726) STRN3 (ENSSVLG00005003765) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 5 ENSSVLG00005021243 ENSSVLG00005021277 SLC1A4 (ENSSVLG00005021330) SERTAD2 (ENSSVLG00005021387) ENSSVLG00005021416 LGALSL (ENSSVLG00005021478) PELI1 (ENSSVLG00005021561) VPS54 (ENSSVLG00005021631) UGP2 (ENSSVLG00005021917) MDH1 (ENSSVLG00005022103) WDPCP (ENSSVLG00005022261) OTX1 (ENSSVLG00005022587) EHBP1 (ENSSVLG00005022645) TMEM17 (ENSSVLG00005022771) B3GNT2 (ENSSVLG00005022804) ENSSVLG00005022821 #22 ENSSVLG00005022859 CRIPT (ENSSVLG00005022896) CCT4 (ENSSVLG00005022942) FAM161A (ENSSVLG00005023008) ENSSVLG00005023092 ENSSVLG00005023117 ENSSVLG00005023491 XPO1 (ENSSVLG00005023207) USP34 (ENSSVLG00005023531) ENSSVLG00005023593 ENSSVLG00005023624 ENSSVLG00005023655 C2orf74 (ENSSVLG00005023693) ENSSVLG00005023730 SANBR (ENSSVLG00005023769) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d.t.j ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00640000092775 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00950000182957.a.a.b ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 11 ENSHGLG00000000299 ENSHGLG00000000511 RALGAPA1 (ENSHGLG00000001193) INSM2 (ENSHGLG00000049957) NFKBIA (ENSHGLG00000034266) ENSHGLG00000000520 PRORP (ENSHGLG00000001372) ENSHGLG00000002301 FAM177A1 (ENSHGLG00000045828) SRP54 (ENSHGLG00000002850) ENSHGLG00000000845 BAZ1A (ENSHGLG00000007236) ENSHGLG00000047884 CFL2 (ENSHGLG00000001467) SNX6 (ENSHGLG00000002236) EAPP (ENSHGLG00000035378) #22 ENSHGLG00000046910 ENSHGLG00000002049 ENSHGLG00000032861 ENSHGLG00000001381 ENSHGLG00000001684 ENSHGLG00000000723 ENSHGLG00000045174 ENSHGLG00000001019 ENSHGLG00000001333 ENSHGLG00000050257 ENSHGLG00000036198 ENSHGLG00000048569 ENSHGLG00000050973 ENSHGLG00000003356 ENSHGLG00000043700 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d.t.j ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00640000092775 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00950000182957.a.a.b ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 Guinea pig DUPLICATION Guinea pig MODERN SPECIES 23 MBIP (ENSCPOG00000004648) BRMS1L (ENSCPOG00000031299) RALGAPA1 (ENSCPOG00000013938) INSM2 (ENSCPOG00000013937) NFKBIA (ENSCPOG00000005455) PSMA6 (ENSCPOG00000003107) PRORP (ENSCPOG00000004789) PPP2R3C (ENSCPOG00000004781) FAM177A1 (ENSCPOG00000035599) SRP54 (ENSCPOG00000003691) ENSCPOG00000026661 ENSCPOG00000039496 BAZ1A (ENSCPOG00000011951) CFL2 (ENSCPOG00000033162) SNX6 (ENSCPOG00000006862) ENSCPOG00000003005 #22 SPTSSA (ENSCPOG00000038925) #23 EGLN3 (ENSCPOG00000013369) ENSCPOG00000014222 NPAS3 (ENSCPOG00000006976) AKAP6 (ENSCPOG00000007031) Guinea pig MODERN SPECIES 32 RNF32 (ENSCPOG00000012026) SHH (ENSCPOG00000023638) RBM33 (ENSCPOG00000011852) ENSCPOG00000009846 EN2 (ENSCPOG00000024572) INSIG1 (ENSCPOG00000014739) HTR5A (ENSCPOG00000007970) PAXIP1 (ENSCPOG00000001303) DPP6 (ENSCPOG00000003511) ENSCPOG00000003695 XRCC2 (ENSCPOG00000012263) CCT8L2 (ENSCPOG00000020546) KMT2C (ENSCPOG00000001857) GALNT11 (ENSCPOG00000005174) GALNTL5 (ENSCPOG00000005168) ENSCPOG00000022472 #22 PRKAG2 (ENSCPOG00000015691) RHEB (ENSCPOG00000031743) Crygn (ENSCPOG00000005218) WDR86 (ENSCPOG00000026626) NUB1 (ENSCPOG00000012070) SMARCD3 (ENSCPOG00000020971) CHPF2 (ENSCPOG00000033035) ABCF2 (ENSCPOG00000008379) IQCA1L (ENSCPOG00000006528) ASB10 (ENSCPOG00000007315) GBX1 (ENSCPOG00000011349) AGAP3 (ENSCPOG00000004084) TMUB1 (ENSCPOG00000032741) FASTK (ENSCPOG00000037276) SLC4A2 (ENSCPOG00000013226) Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d.t.j ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00950000182957.a.a.b ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 116 NKX2-1 (ENSCLAG00000011429) MBIP (ENSCLAG00000010075) BRMS1L (ENSCLAG00000009601) RALGAPA1 (ENSCLAG00000009050) INSM2 (ENSCLAG00000011235) NFKBIA (ENSCLAG00000011667) PSMA6 (ENSCLAG00000012840) PRORP (ENSCLAG00000012615) ENSCLAG00000014794 FAM177A1 (ENSCLAG00000015226) SRP54 (ENSCLAG00000015076) ENSCLAG00000012880 BAZ1A (ENSCLAG00000015173) ENSCLAG00000012876 SNX6 (ENSCLAG00000012353) EAPP (ENSCLAG00000013007) #22 ENSCLAG00000012005 EGLN3 (ENSCLAG00000010720) ENSCLAG00000011029 NPAS3 (ENSCLAG00000013939) AKAP6 (ENSCLAG00000013553) ARHGAP5 (ENSCLAG00000015975) NUBPL (ENSCLAG00000011929) GPR33 (ENSCLAG00000013344) DTD2 (ENSCLAG00000014737) #21 HEATR5A (ENSCLAG00000009555) HECTD1 (ENSCLAG00000011096) ENSCLAG00000009036 ENSCLAG00000011538 COCH (ENSCLAG00000011067) SCFD1 (ENSCLAG00000012279) Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 83 ENSODEG00000007841 ENSODEG00000009188 WNT8B (ENSODEG00000006011) ENSODEG00000005730 #22 NDUFB8 (ENSODEG00000006621) ENSODEG00000007007 PAX2 (ENSODEG00000006975) SLF2 (ENSODEG00000008647) SEMA4G (ENSODEG00000005984) ENSODEG00000006668 TWNK (ENSODEG00000006072) LZTS2 (ENSODEG00000006752) PDZD7 (ENSODEG00000006718) SFXN3 (ENSODEG00000007542) KAZALD1 (ENSODEG00000005804) ENSODEG00000006094 LBX1 (ENSODEG00000006684) BTRC (ENSODEG00000008464) POLL (ENSODEG00000007469) Degu MODERN SPECIES 108 ENSODEG00000010363 ENSODEG00000011399 PTPN5 (ENSODEG00000011115) TMEM86A (ENSODEG00000012064) ENSODEG00000019868 ENSODEG00000010606 ENSODEG00000009912 SPTY2D1 (ENSODEG00000011157) ENSODEG00000010073 #22 ENSODEG00000009385 TSG101 (ENSODEG00000011046) ENSODEG00000010760 ENSODEG00000010324 ENSODEG00000009666 ENSODEG00000019665 ENSODEG00000010218 ENSODEG00000009884 ENSODEG00000009628 ENSODEG00000009541 ENSODEG00000009128 SAAL1 (ENSODEG00000013515) TPH1 (ENSODEG00000009357) KCNC1 (ENSODEG00000009078) MYOD1 (ENSODEG00000009827) Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00940000167277 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Rabbit MODERN SPECIES 8 BRMS1L (ENSOCUG00000006825) ENSOCUG00000029888 RALGAPA1 (ENSOCUG00000006807) INSM2 (ENSOCUG00000006804) NFKBIA (ENSOCUG00000015642) PSMA6 (ENSOCUG00000015635) PRORP (ENSOCUG00000016663) PPP2R3C (ENSOCUG00000005768) FAM177A1 (ENSOCUG00000005763) SRP54 (ENSOCUG00000007838) ENSOCUG00000022589 BAZ1A (ENSOCUG00000012593) CFL2 (ENSOCUG00000009383) ENSOCUG00000027099 SNX6 (ENSOCUG00000029421) EAPP (ENSOCUG00000003226) #22 ENSOCUG00000024362 ENSOCUG00000008560 NPAS3 (ENSOCUG00000010632) AKAP6 (ENSOCUG00000014205) ENSOCUG00000025739 ARHGAP5 (ENSOCUG00000010548) NUBPL (ENSOCUG00000017713) GPR33 (ENSOCUG00000022411) DTD2 (ENSOCUG00000007778) #21 ENSOCUG00000027034 HEATR5A (ENSOCUG00000007228) ENSOCUG00000002021 HECTD1 (ENSOCUG00000003816) AP4S1 (ENSOCUG00000011430) STRN3 (ENSOCUG00000011418) Tree shrew MODERN SPECIES 5642 ENSTBEG00000001431 ENSTBEG00000001424 EAPP (ENSTBEG00000001306) #22 Primates ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00560000078697 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940.pb ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000161610 ENSGT00940000161107 ENSGT00560000078697 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940.pb ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00910000147374 ENSGT00940000154553.a.b.e ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00730000111119 ENSGT00940000159896 ENSGT00940000161610 ENSGT00940000161107 ENSGT00560000078697 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940.pb ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00910000147374 ENSGT00940000154553.a.b.e ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00390000012569.a.fb.a.a ENSGT00940000162733 ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a.a.a ENSGT00390000012569.a.fb.b.b.b.b ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940.pb ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00910000147374 ENSGT00940000154553.a.b.e ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B.x ENSGT00950000183095.a.a Vervet Monkey MODERN SPECIES 16 ENSCSAG00000015474 MBIP (ENSCSAG00000015484) BRMS1L (ENSCSAG00000015489) RALGAPA1 (ENSCSAG00000015500) INSM2 (ENSCSAG00000019401) ENSCSAG00000015517 NFKBIA (ENSCSAG00000015526) PSMA6 (ENSCSAG00000015552) PRORP (ENSCSAG00000015561) PPP2R3C (ENSCSAG00000015566) FAM177A1 (ENSCSAG00000015569) SRP54 (ENSCSAG00000015575) BAZ1A (ENSCSAG00000015625) ENSCSAG00000015638 SNX6 (ENSCSAG00000015642) EAPP (ENSCSAG00000015646) #22 SPTSSA (ENSCSAG00000015651) #23 EGLN3 (ENSCSAG00000015653) NPAS3 (ENSCSAG00000015658) ENSCSAG00000019400 AKAP6 (ENSCSAG00000015666) ARHGAP5 (ENSCSAG00000015675) ENSCSAG00000015689 NUBPL (ENSCSAG00000015694) GPR33 (ENSCSAG00000019399) DTD2 (ENSCSAG00000015699) #21 HEATR5A (ENSCSAG00000015711) HECTD1 (ENSCSAG00000015728) STRN3 (ENSCSAG00000015737) COCH (ENSCSAG00000015743) SCFD1 (ENSCSAG00000015756) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a.a.a ENSGT00390000012569.a.fb.b.b.b.b ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000002414.`b.a.a.f ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940.pb ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00910000147374 ENSGT00940000154553.a.b.e ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B.x ENSGT00950000183095.a.a Macaca ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00560000078697 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a.a.a ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940.pb ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00910000147374 ENSGT00940000154553.a.b.e ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B.x ENSGT00950000183095.a.a Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000161107 ENSGT00560000078697 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940.pb ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00940000164709.a.b.b.a.b.b.a.a.b.a.a.a.a.b.b.b ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b.e ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B.x ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Rhesus MODERN SPECIES 17 ENSMMUG00000041260 MBIP (ENSMMUG00000004856) BRMS1L (ENSMMUG00000010665) INSM2 (ENSMMUG00000016483) RALGAPA1 (ENSMMUG00000016487) NFKBIA (ENSMMUG00000020374) PSMA6 (ENSMMUG00000016544) PRORP (ENSMMUG00000019875) PPP2R3C (ENSMMUG00000003530) FAM177A1 (ENSMMUG00000060802) SRP54 (ENSMMUG00000015073) BAZ1A (ENSMMUG00000058073) CFL2 (ENSMMUG00000039560) SNX6 (ENSMMUG00000012576) ENSMMUG00000054661 EAPP (ENSMMUG00000056506) #22 ENSMMUG00000054885 ENSMMUG00000018813 SPTSSA (ENSMMUG00000049364) #23 ENSMMUG00000057166 ENSMMUG00000064654 EGLN3 (ENSMMUG00000000040) ENSMMUG00000054677 NPAS3 (ENSMMUG00000014839) ENSMMUG00000062990 AKAP6 (ENSMMUG00000015128) ARHGAP5 (ENSMMUG00000016346) ENSMMUG00000056320 ENSMMUG00000054094 NUBPL (ENSMMUG00000012726) GPR33 (ENSMMUG00000015703) Crab-eating macaque MODERN SPECIES 17 INSM2 (ENSMFAG00000009696) NFKBIA (ENSMFAG00000017605) PSMA6 (ENSMFAG00000043654) ENSMFAG00000058533 PRORP (ENSMFAG00000001453) PPP2R3C (ENSMFAG00000033038) FAM177A1 (ENSMFAG00000062033) SRP54 (ENSMFAG00000044371) ENSMFAG00000054611 BAZ1A (ENSMFAG00000043129) ENSMFAG00000049174 CFL2 (ENSMFAG00000001352) ENSMFAG00000062650 ENSMFAG00000053943 SNX6 (ENSMFAG00000040770) EAPP (ENSMFAG00000002843) #22 ENSMFAG00000062453 ENSMFAG00000060787 ENSMFAG00000030913 SPTSSA (ENSMFAG00000048755) #23 ENSMFAG00000058983 EGLN3 (ENSMFAG00000036942) ENSMFAG00000057891 NPAS3 (ENSMFAG00000043431) ENSMFAG00000000440 AKAP6 (ENSMFAG00000040818) ARHGAP5 (ENSMFAG00000000350) NUBPL (ENSMFAG00000038751) ENSMFAG00000054026 ENSMFAG00000062632 GPR33 (ENSMFAG00000038012) Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 548 ENSMNEG00000041330 BRMS1L (ENSMNEG00000043819) ENSMNEG00000044293 ENSMNEG00000000324 RALGAPA1 (ENSMNEG00000028557) ENSMNEG00000000902 NFKBIA (ENSMNEG00000039580) ENSMNEG00000036798 ENSMNEG00000010776 PRORP (ENSMNEG00000029194) PPP2R3C (ENSMNEG00000023978) SRP54 (ENSMNEG00000006947) BAZ1A (ENSMNEG00000043110) CFL2 (ENSMNEG00000039241) SNX6 (ENSMNEG00000044189) EAPP (ENSMNEG00000034819) #22 SPTSSA (ENSMNEG00000041970) #23 EGLN3 (ENSMNEG00000034405) ENSMNEG00000019306 NPAS3 (ENSMNEG00000034614) AKAP6 (ENSMNEG00000039858) ENSMNEG00000011661 ARHGAP5 (ENSMNEG00000044390) ENSMNEG00000027078 NUBPL (ENSMNEG00000031679) DTD2 (ENSMNEG00000045027) #21 HEATR5A (ENSMNEG00000034513) HECTD1 (ENSMNEG00000001350) ENSMNEG00000040344 STRN3 (ENSMNEG00000032023) COCH (ENSMNEG00000031522) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a.a.a ENSGT00390000012569.a.fb.b.b.b.b ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000002414.`b.a.a.f ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940.pb ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00910000147374 ENSGT00940000154553.a.b.e ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B.x.b ENSGT00950000183095.a.a Olive baboon MODERN SPECIES 17 MBIP (ENSPANG00000020627) ENSPANG00000039092 ENSPANG00000037543 BRMS1L (ENSPANG00000015154) RALGAPA1 (ENSPANG00000014246) INSM2 (ENSPANG00000021247) NFKBIA (ENSPANG00000021245) PSMA6 (ENSPANG00000029375) PRORP (ENSPANG00000025053) PPP2R3C (ENSPANG00000024268) FAM177A1 (ENSPANG00000038043) SRP54 (ENSPANG00000023853) BAZ1A (ENSPANG00000021332) CFL2 (ENSPANG00000021779) ENSPANG00000022563 EAPP (ENSPANG00000018424) #22 SPTSSA (ENSPANG00000044993) #23 ENSPANG00000039055 EGLN3 (ENSPANG00000047484) NPAS3 (ENSPANG00000021333) AKAP6 (ENSPANG00000022397) ENSPANG00000038010 ENSPANG00000038472 ARHGAP5 (ENSPANG00000024272) ENSPANG00000047627 NUBPL (ENSPANG00000021781) GPR33 (ENSPANG00000021666) DTD2 (ENSPANG00000021336) #21 HEATR5A (ENSPANG00000000801) HECTD1 (ENSPANG00000017149) ENSPANG00000017427 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 101 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00910000147374 ENSGT00940000154553.a.b.e ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B.x.b ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Drill MODERN SPECIES 1086 EAPP (ENSMLEG00000042797) #22 TACR3 (ENSMLEG00000044107) CENPE (ENSMLEG00000028666) BDH2 (ENSMLEG00000039239) SLC9B2 (ENSMLEG00000040747) SLC9B1 (ENSMLEG00000030173) CISD2 (ENSMLEG00000039455) ENSMLEG00000036393 ENSMLEG00000038269 ENSMLEG00000030905 MANBA (ENSMLEG00000036247) ENSMLEG00000042292 NFKB1 (ENSMLEG00000030561) SLC39A8 (ENSMLEG00000022871) Sooty mangabey MODERN SPECIES 186 EAPP (ENSCATG00000044341) #22 SPTSSA (ENSCATG00000029208) #23 ENSCATG00000030363 EGLN3 (ENSCATG00000040041) ENSCATG00000043412 NPAS3 (ENSCATG00000029945) AKAP6 (ENSCATG00000037210) ENSCATG00000018768 ARHGAP5 (ENSCATG00000035037) ENSCATG00000015897 NUBPL (ENSCATG00000033880) DTD2 (ENSCATG00000031883) #21 HEATR5A (ENSCATG00000032282) HECTD1 (ENSCATG00000032933) ENSCATG00000035780 STRN3 (ENSCATG00000022375) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 225 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b.e ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00930000150941.x.b.a Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1258 EAPP (ENSRBIG00000044230) #22 SPTSSA (ENSRBIG00000039846) #23 EGLN3 (ENSRBIG00000039961) ENSRBIG00000019858 NPAS3 (ENSRBIG00000032686) ENSRBIG00000032788 AKAP6 (ENSRBIG00000038045) ARHGAP5 (ENSRBIG00000016020) ENSRBIG00000038307 NUBPL (ENSRBIG00000033232) DTD2 (ENSRBIG00000031412) #21 HEATR5A (ENSRBIG00000035494) HECTD1 (ENSRBIG00000014027) ENSRBIG00000031706 STRN3 (ENSRBIG00000034106) COCH (ENSRBIG00000024567) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1658 EAPP (ENSRROG00000029693) #22 ENSRROG00000039005 SPTSSA (ENSRROG00000031858) #23 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00390000012569.a.fb.a.a ENSGT00940000162733 ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a.a.a ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940.pb ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00910000147374 ENSGT00940000154553.a.b.e ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B Hominidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00390000012569.a.fb.a.a ENSGT00940000162733 ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a.a.a ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940.pb ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00910000147374 ENSGT00940000154553.a.b.e ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00390000012569.a.fb.a.a ENSGT00940000162733 ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a.a.a ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00940000158135.i ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940.pb ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00910000147374 ENSGT00940000154553.a.b.e ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a Gorilla MODERN SPECIES 5 ENSGGOG00000037483 RALGAPA1 (ENSGGOG00000008354) INSM2 (ENSGGOG00000041074) ENSGGOG00000039181 NFKBIA (ENSGGOG00000009397) ENSGGOG00000036672 PSMA6 (ENSGGOG00000013201) PRORP (ENSGGOG00000012248) ENSGGOG00000012223 ENSGGOG00000041904 SRP54 (ENSGGOG00000002926) ENSGGOG00000028571 ENSGGOG00000008915 CFL2 (ENSGGOG00000038032) SNX6 (ENSGGOG00000007659) EAPP (ENSGGOG00000007784) #22 EGLN3 (ENSGGOG00000014900) ENSGGOG00000037716 ENSGGOG00000022941 ENSGGOG00000041161 AKAP6 (ENSGGOG00000025608) ENSGGOG00000042101 ARHGAP5 (ENSGGOG00000002593) NUBPL (ENSGGOG00000009764) GPR33 (ENSGGOG00000026905) DTD2 (ENSGGOG00000043676) #21 HEATR5A (ENSGGOG00000000655) HECTD1 (ENSGGOG00000026552) ENSGGOG00000003198 STRN3 (ENSGGOG00000006096) ENSGGOG00000042724 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00390000012569.a.fb.a.a ENSGT00940000162733 ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a.a.a ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00940000158135.i ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940.pb ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b.e ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Pan ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00390000012569.a.fb.a.a ENSGT00940000162733 ENSGT00390000017839.o.b.b.a.a.a.a ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00550000074824 ENSGT00940000158135.i ENSGT00390000006922.m.a ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940.pb ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b.e ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Chimpanzee MODERN SPECIES 5 MBIP (ENSPTRG00000006273) BRMS1L (ENSPTRG00000006272) RALGAPA1 (ENSPTRG00000006268) INSM2 (ENSPTRG00000006267) ENSPTRG00000041063 NFKBIA (ENSPTRG00000006265) ENSPTRG00000043789 PSMA6 (ENSPTRG00000006264) PRORP (ENSPTRG00000006263) PPP2R3C (ENSPTRG00000006261) FAM177A1 (ENSPTRG00000006259) BAZ1A (ENSPTRG00000006255) ENSPTRG00000051817 CFL2 (ENSPTRG00000006254) SNX6 (ENSPTRG00000006253) EAPP (ENSPTRG00000006252) #22 SPTSSA (ENSPTRG00000006251) #23 EGLN3 (ENSPTRG00000006250) ENSPTRG00000043856 NPAS3 (ENSPTRG00000006249) AKAP6 (ENSPTRG00000006247) ARHGAP5 (ENSPTRG00000006246) NUBPL (ENSPTRG00000006245) GPR33 (ENSPTRG00000032557) DTD2 (ENSPTRG00000006244) #21 HEATR5A (ENSPTRG00000006241) HECTD1 (ENSPTRG00000006240) AP4S1 (ENSPTRG00000006239) STRN3 (ENSPTRG00000006238) COCH (ENSPTRG00000006237) ENSPTRG00000047778 Bonobo MODERN SPECIES 5 BRMS1L (ENSPPAG00000029997) ENSPPAG00000027690 RALGAPA1 (ENSPPAG00000038560) ENSPPAG00000013978 ENSPPAG00000039340 ENSPPAG00000041784 ENSPPAG00000006620 ENSPPAG00000024947 PRORP (ENSPPAG00000040873) PPP2R3C (ENSPPAG00000030301) SRP54 (ENSPPAG00000017434) BAZ1A (ENSPPAG00000026030) ENSPPAG00000008100 CFL2 (ENSPPAG00000007558) SNX6 (ENSPPAG00000037141) EAPP (ENSPPAG00000030095) #22 EGLN3 (ENSPPAG00000018135) ENSPPAG00000004989 NPAS3 (ENSPPAG00000028096) AKAP6 (ENSPPAG00000036668) ARHGAP5 (ENSPPAG00000037127) ENSPPAG00000034553 ENSPPAG00000033459 GPR33 (ENSPPAG00000016765) DTD2 (ENSPPAG00000029393) #21 HEATR5A (ENSPPAG00000034508) HECTD1 (ENSPPAG00000036559) ENSPPAG00000041450 STRN3 (ENSPPAG00000028044) COCH (ENSPPAG00000042223) ENSPPAG00000038553 Human MODERN SPECIES 5 NKX2-8 (ENSG00000136327) NKX2-1 (ENSG00000136352) MBIP (ENSG00000151332) BRMS1L (ENSG00000100916) RALGAPA1 (ENSG00000174373) INSM2 (ENSG00000168348) NFKBIA (ENSG00000100906) PSMA6 (ENSG00000100902) PRORP (ENSG00000100890) PPP2R3C (ENSG00000092020) FAM177A1 (ENSG00000151327) SRP54 (ENSG00000100883) BAZ1A (ENSG00000198604) CFL2 (ENSG00000165410) SNX6 (ENSG00000129515) EAPP (ENSG00000129518) #22 SPTSSA (ENSG00000165389) #23 EGLN3 (ENSG00000129521) NPAS3 (ENSG00000151322) AKAP6 (ENSG00000151320) ARHGAP5 (ENSG00000100852) NUBPL (ENSG00000151413) GPR33 (ENSG00000214943) DTD2 (ENSG00000129480) #21 ENSG00000203546 HEATR5A (ENSG00000129493) HECTD1 (ENSG00000092148) AP4S1 (ENSG00000100478) STRN3 (ENSG00000196792) COCH (ENSG00000100473) SCFD1 (ENSG00000092108) Orangutan MODERN SPECIES 5 ENSPPYG00000041488 MBIP (ENSPPYG00000005748) BRMS1L (ENSPPYG00000005747) RALGAPA1 (ENSPPYG00000005746) INSM2 (ENSPPYG00000005745) ENSPPYG00000034833 ENSPPYG00000005743 PSMA6 (ENSPPYG00000029719) PRORP (ENSPPYG00000005742) PPP2R3C (ENSPPYG00000005741) FAM177A1 (ENSPPYG00000005740) SRP54 (ENSPPYG00000005739) BAZ1A (ENSPPYG00000005738) CFL2 (ENSPPYG00000005737) SNX6 (ENSPPYG00000005736) EAPP (ENSPPYG00000005735) #22 SPTSSA (ENSPPYG00000005733) #23 EGLN3 (ENSPPYG00000005732) NPAS3 (ENSPPYG00000005731) AKAP6 (ENSPPYG00000005730) ARHGAP5 (ENSPPYG00000005729) NUBPL (ENSPPYG00000005727) DTD2 (ENSPPYG00000036770) #21 HEATR5A (ENSPPYG00000005725) HECTD1 (ENSPPYG00000005724) ENSPPYG00000005723 STRN3 (ENSPPYG00000005722) COCH (ENSPPYG00000005721) SCFD1 (ENSPPYG00000005720) G2E3 (ENSPPYG00000005719) PRKD1 (ENSPPYG00000005718) Gibbon MODERN SPECIES 10 ENSNLEG00000003924 MBIP (ENSNLEG00000003876) BRMS1L (ENSNLEG00000032667) RALGAPA1 (ENSNLEG00000003739) INSM2 (ENSNLEG00000003723) NFKBIA (ENSNLEG00000003728) ENSNLEG00000003724 ENSNLEG00000028320 ENSNLEG00000032079 PRORP (ENSNLEG00000003691) PPP2R3C (ENSNLEG00000003591) SRP54 (ENSNLEG00000003496) BAZ1A (ENSNLEG00000003440) CFL2 (ENSNLEG00000003417) SNX6 (ENSNLEG00000003310) EAPP (ENSNLEG00000034702) #22 SPTSSA (ENSNLEG00000029839) #23 EGLN3 (ENSNLEG00000003247) ENSNLEG00000032145 ENSNLEG00000032055 AKAP6 (ENSNLEG00000003187) ENSNLEG00000003168 ENSNLEG00000028683 NUBPL (ENSNLEG00000003141) DTD2 (ENSNLEG00000034317) #21 ENSNLEG00000027838 RIOX1 (ENSNLEG00000003130) HEATR4 (ENSNLEG00000003060) NUMB (ENSNLEG00000002944) PAPLN (ENSNLEG00000002925) PSEN1 (ENSNLEG00000002855) Platyrrhini DUPLICATION Platyrrhini DUPLICATION Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000001332.k.a #22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000001332.k.a #22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161107 ENSGT00560000078697 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000154191.i.a.r.b ENSGT00940000158921.g ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940.pb ENSGT00390000001332.k.a #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT01030000234542.b.a.a.b.a.b.k.b ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 Capuchin MODERN SPECIES 496 BAZ1A (ENSCCAG00000028091) CFL2 (ENSCCAG00000037328) SNX6 (ENSCCAG00000033377) ENSCCAG00000020846 #22 SPESP1 (ENSCCAG00000035908) ENSCCAG00000030222 ENSCCAG00000018938 CORO2B (ENSCCAG00000009202) ITGA11 (ENSCCAG00000035460) FEM1B (ENSCCAG00000022866) CLN6 (ENSCCAG00000033490) ENSCCAG00000027951 CALML4 (ENSCCAG00000024372) PIAS1 (ENSCCAG00000025457) SKOR1 (ENSCCAG00000026202) Mas night monkey MODERN SPECIES 819 NKX2-8 (ENSANAG00000023511) NKX2-1 (ENSANAG00000028255) ENSANAG00000023382 MBIP (ENSANAG00000027296) BRMS1L (ENSANAG00000026406) RALGAPA1 (ENSANAG00000029085) NFKBIA (ENSANAG00000030609) ENSANAG00000020043 PRORP (ENSANAG00000029895) PPP2R3C (ENSANAG00000019227) SRP54 (ENSANAG00000022133) BAZ1A (ENSANAG00000009176) CFL2 (ENSANAG00000001737) SNX6 (ENSANAG00000019855) ENSANAG00000030653 ENSANAG00000021068 #22 ENSANAG00000024247 EGLN3 (ENSANAG00000037222) ENSANAG00000020399 NPAS3 (ENSANAG00000023028) ENSANAG00000020942 AKAP6 (ENSANAG00000034900) ARHGAP5 (ENSANAG00000037055) NUBPL (ENSANAG00000036864) DTD2 (ENSANAG00000036862) #21 ENSANAG00000033419 ENSANAG00000035920 HECTD1 (ENSANAG00000037367) AP4S1 (ENSANAG00000026444) STRN3 (ENSANAG00000026168) COCH (ENSANAG00000029746) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000156910 ENSGT00510000046843.b ENSGT00430000032851 ENSGT00410000029301 ENSGT00430000033088 ENSGT00950000182952.C ENSGT00940000158382 ENSGT00940000158177.b ENSGT00940000158968 ENSGT00940000157574 ENSGT00730000111529 ENSGT00940000158686 ENSGT00940000160413 ENSGT00940000158342.b ENSGT00390000018272 ENSGT00390000001332.k.b #22 ENSGT00940000157538 ENSGT00730000111039.C ENSGT00500000044938 ENSGT00920000149095.b ENSGT00940000155352 ENSGT00640000091574 ENSGT00950000182839.A.c ENSGT00940000158251 ENSGT00940000162858 ENSGT00940000163725 ENSGT00390000014620.j ENSGT00940000157277 ENSGT00940000156144 ENSGT00530000063745.b ENSGT00390000006546 Mas night monkey MODERN SPECIES 844 PLEKHG7 (ENSANAG00000037547) ENSANAG00000036770 ENSANAG00000020232 ENSANAG00000036734 BTG1 (ENSANAG00000037621) ENSANAG00000037565 DCN (ENSANAG00000022968) LUM (ENSANAG00000020478) KERA (ENSANAG00000037464) EPYC (ENSANAG00000037744) ENSANAG00000018323 ATP2B1 (ENSANAG00000027760) POC1B (ENSANAG00000023816) DUSP6 (ENSANAG00000037906) KITLG (ENSANAG00000001756) ENSANAG00000022268 #22 TMTC3 (ENSANAG00000021779) CEP290 (ENSANAG00000021204) C12orf29 (ENSANAG00000023232) Cebidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000003156.a.b.k.a.b ENSGT00940000156910 ENSGT00510000046843.b ENSGT00430000033088 ENSGT00410000029301 ENSGT00950000182952.C ENSGT00940000158382 ENSGT00940000158177.b ENSGT00940000158968 ENSGT00940000157574 ENSGT00730000111529 ENSGT00940000158686 ENSGT00940000160413 ENSGT00940000158342.b ENSGT00390000018272 ENSGT00390000001332.k.b #22 ENSGT00940000157538 ENSGT00730000111039.C ENSGT00500000044938 ENSGT00920000149095.b ENSGT00940000155352 ENSGT00640000091574 ENSGT00950000182839.A.c ENSGT00940000158251 ENSGT00940000162858 ENSGT00940000163725 ENSGT00390000014620.j ENSGT00940000157277 ENSGT00940000156144 ENSGT00530000063745.b ENSGT00390000006546 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000003156.a.b.k.a.b ENSGT00940000156910 ENSGT00510000046843.b ENSGT00430000033088 ENSGT00410000029301 ENSGT00950000182952.C ENSGT00940000158382 ENSGT00940000158177.b ENSGT00940000158968 ENSGT00940000157574 ENSGT00730000111529 ENSGT00940000158686 ENSGT00940000160413 ENSGT00940000158342.b ENSGT00390000018272 ENSGT00390000001332.k.b #22 ENSGT00940000157538 ENSGT00730000111039.C ENSGT00500000044938 ENSGT00920000149095.b ENSGT00940000155352 ENSGT00640000091574 ENSGT00950000182839.A.c ENSGT00940000158251 ENSGT00940000162858 ENSGT00940000163725 ENSGT00390000014620.j ENSGT00940000157277 ENSGT00390000008708.o.a ENSGT00940000156144 ENSGT00530000063745.b Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 67 PLEKHG7 (ENSSBOG00000035263) ENSSBOG00000027119 ENSSBOG00000029330 BTG1 (ENSSBOG00000031360) DCN (ENSSBOG00000032365) LUM (ENSSBOG00000030254) KERA (ENSSBOG00000020371) EPYC (ENSSBOG00000026508) CCER1 (ENSSBOG00000001585) ENSSBOG00000030149 ATP2B1 (ENSSBOG00000022877) POC1B (ENSSBOG00000023395) DUSP6 (ENSSBOG00000022133) ENSSBOG00000021475 KITLG (ENSSBOG00000026788) ENSSBOG00000025089 #22 TMTC3 (ENSSBOG00000027049) CEP290 (ENSSBOG00000024214) C12orf29 (ENSSBOG00000033321) C12orf50 (ENSSBOG00000016644) MGAT4C (ENSSBOG00000025097) NTS (ENSSBOG00000032612) RASSF9 (ENSSBOG00000030703) ALX1 (ENSSBOG00000028789) LRRIQ1 (ENSSBOG00000024808) TSPAN19 (ENSSBOG00000018936) SLC6A15 (ENSSBOG00000036273) ENSSBOG00000035574 ENSSBOG00000032046 TMTC2 (ENSSBOG00000024696) ENSSBOG00000025592 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161107 ENSGT00560000078697 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921.g ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940.pb ENSGT00390000001332.l #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT01030000234542.b.a.a.b.a.b.k.b ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000161610 ENSGT00940000161107 ENSGT00560000078697 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921.g ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940.pb ENSGT00390000001332.l #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT01030000234542.b.a.a.b.a.b.k.b ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Marmoset MODERN SPECIES 1 INSM2 (ENSCJAG00000006816) ENSCJAG00000081814 ENSCJAG00000078340 ENSCJAG00000006806 ENSCJAG00000073389 ENSCJAG00000071935 PSMA6 (ENSCJAG00000041141) PRORP (ENSCJAG00000006750) PPP2R3C (ENSCJAG00000041694) ENSCJAG00000062861 FAM177A1 (ENSCJAG00000069586) SRP54 (ENSCJAG00000006581) BAZ1A (ENSCJAG00000006421) CFL2 (ENSCJAG00000041665) SNX6 (ENSCJAG00000044761) EAPP (ENSCJAG00000042239) #22 ENSCJAG00000032302 SPTSSA (ENSCJAG00000086959) #23 EGLN3 (ENSCJAG00000005424) NPAS3 (ENSCJAG00000047425) AKAP6 (ENSCJAG00000005474) ARHGAP5 (ENSCJAG00000005538) NUBPL (ENSCJAG00000005582) GPR33 (ENSCJAG00000035428) DTD2 (ENSCJAG00000073851) #21 ENSCJAG00000075200 HEATR5A (ENSCJAG00000005593) ENSCJAG00000073672 HECTD1 (ENSCJAG00000005631) AP4S1 (ENSCJAG00000005786) ENSCJAG00000071091 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000001332.l #22 Capuchin MODERN SPECIES 132 PTGIS (ENSCCAG00000028852) KCNB1 (ENSCCAG00000022245) ZNFX1 (ENSCCAG00000027959) DDX27 (ENSCCAG00000029782) STAU1 (ENSCCAG00000034339) CSE1L (ENSCCAG00000014373) ARFGEF2 (ENSCCAG00000035477) PREX1 (ENSCCAG00000020464) ENSCCAG00000034261 SULF2 (ENSCCAG00000021288) NCOA3 (ENSCCAG00000018891) ENSCCAG00000031328 #22 ENSCCAG00000020080 ZMYND8 (ENSCCAG00000034996) EYA2 (ENSCCAG00000006439) SLC2A10 (ENSCCAG00000024883) TP53RK (ENSCCAG00000025781) ENSCCAG00000032665 SLC13A3 (ENSCCAG00000023479) OCSTAMP (ENSCCAG00000032955) ZNF334 (ENSCCAG00000037086) ELMO2 (ENSCCAG00000021611) SLC35C2 (ENSCCAG00000033921) CDH22 (ENSCCAG00000031781) CD40 (ENSCCAG00000031327) NCOA5 (ENSCCAG00000030312) SLC12A5 (ENSCCAG00000031231) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 50 BIRC2 (ENSSBOG00000034069) BIRC3 (ENSSBOG00000031187) YAP1 (ENSSBOG00000027497) ENSSBOG00000036077 CFAP300 (ENSSBOG00000033758) CEP126 (ENSSBOG00000028647) ANGPTL5 (ENSSBOG00000031015) ENSSBOG00000032893 TRPC6 (ENSSBOG00000019836) ENSSBOG00000021319 ENSSBOG00000023108 ENSSBOG00000023277 PGR (ENSSBOG00000013714) ARHGAP42 (ENSSBOG00000035822) CNTN5 (ENSSBOG00000023228) ENSSBOG00000018311 #22 CCDC82 (ENSSBOG00000027897) MAML2 (ENSSBOG00000031458) MTMR2 (ENSSBOG00000012973) CEP57 (ENSSBOG00000030610) FAM76B (ENSSBOG00000017588) Mas night monkey MODERN SPECIES 835 ENSANAG00000022457 #22 ENSANAG00000022652 IZUMO3 (ENSANAG00000021921) ELAVL2 (ENSANAG00000032553) ENSANAG00000029023 DMRTA1 (ENSANAG00000021248) CDKN2B (ENSANAG00000018770) CDKN2A (ENSANAG00000025540) ENSANAG00000019784 MTAP (ENSANAG00000029387) IFNE (ENSANAG00000027745) KLHL9 (ENSANAG00000033732) ENSANAG00000031381 HACD4 (ENSANAG00000027847) FOCAD (ENSANAG00000029314) MLLT3 (ENSANAG00000032095) Tarsier MODERN SPECIES 6381 EAPP (ENSTSYG00000006040) #22 ENSTSYG00000025976 ENSTSYG00000029878 ENSTSYG00000030381 EPB41L2 (ENSTSYG00000004773) SMLR1 (ENSTSYG00000029108) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Mouse lemur MODERN SPECIES 22 ENSMICG00000032621 ENSMICG00000026534 CGRRF1 (ENSMICG00000047854) SAMD4A (ENSMICG00000016212) GCH1 (ENSMICG00000016234) WDHD1 (ENSMICG00000016239) SOCS4 (ENSMICG00000047239) MAPK1IP1L (ENSMICG00000035738) LGALS3 (ENSMICG00000016283) DLGAP5 (ENSMICG00000016289) ENSMICG00000042184 ENSMICG00000041981 ATG14 (ENSMICG00000000939) TBPL2 (ENSMICG00000000943) KTN1 (ENSMICG00000032329) EAPP (ENSMICG00000044807) #22 SPTSSA (ENSMICG00000046623) #23 ENSMICG00000032213 ENSMICG00000047011 EGLN3 (ENSMICG00000000618) NPAS3 (ENSMICG00000031841) AKAP6 (ENSMICG00000027865) ARHGAP5 (ENSMICG00000007275) NUBPL (ENSMICG00000034340) ENSMICG00000027167 DTD2 (ENSMICG00000030584) #21 HEATR5A (ENSMICG00000007619) HECTD1 (ENSMICG00000034057) AP4S1 (ENSMICG00000003359) STRN3 (ENSMICG00000026845) COCH (ENSMICG00000003344) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 194 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Coquerels sifaka MODERN SPECIES 389 EAPP (ENSPCOG00000021389) #22 SPTSSA (ENSPCOG00000027257) #23 ENSPCOG00000015194 NPAS3 (ENSPCOG00000020941) AKAP6 (ENSPCOG00000013700) ARHGAP5 (ENSPCOG00000024862) ENSPCOG00000015979 NUBPL (ENSPCOG00000022890) DTD2 (ENSPCOG00000017568) #21 HEATR5A (ENSPCOG00000022777) HECTD1 (ENSPCOG00000020200) ENSPCOG00000028456 AP4S1 (ENSPCOG00000016646) STRN3 (ENSPCOG00000001434) COCH (ENSPCOG00000023301) ENSPCOG00000012773 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 1334 EAPP (ENSPSMG00000008618) #22 SPTSSA (ENSPSMG00000008591) #23 EGLN3 (ENSPSMG00000008578) Bushbaby MODERN SPECIES 167 NKX2-1 (ENSOGAG00000028624) MBIP (ENSOGAG00000013109) BRMS1L (ENSOGAG00000016974) RALGAPA1 (ENSOGAG00000014961) INSM2 (ENSOGAG00000024855) NFKBIA (ENSOGAG00000003716) PSMA6 (ENSOGAG00000008492) PRORP (ENSOGAG00000024550) PPP2R3C (ENSOGAG00000008489) FAM177A1 (ENSOGAG00000008488) SRP54 (ENSOGAG00000012188) ENSOGAG00000031729 BAZ1A (ENSOGAG00000002234) CFL2 (ENSOGAG00000032321) SNX6 (ENSOGAG00000008020) EAPP (ENSOGAG00000012492) #22 SPTSSA (ENSOGAG00000030285) #23 ENSOGAG00000001254 EGLN3 (ENSOGAG00000014893) NPAS3 (ENSOGAG00000014886) AKAP6 (ENSOGAG00000001808) ARHGAP5 (ENSOGAG00000029734) NUBPL (ENSOGAG00000011550) DTD2 (ENSOGAG00000013060) #21 HEATR5A (ENSOGAG00000013052) AP4S1 (ENSOGAG00000004703) STRN3 (ENSOGAG00000004698) COCH (ENSOGAG00000004695) SCFD1 (ENSOGAG00000017096) G2E3 (ENSOGAG00000017094) PRKD1 (ENSOGAG00000002966) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT01070000257281 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00940000166226 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000001332 #22 Hedgehog MODERN SPECIES 2707 EAPP (ENSEEUG00000011775) #22 Common shrew MODERN SPECIES 2011 EAPP (ENSSARG00000000229) #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT01070000257281 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00940000166226 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT01070000257281 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00940000166226 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00940000166226 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00940000167277 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Alpaca MODERN SPECIES 305 BAZ1A (ENSVPAG00000003274) CFL2 (ENSVPAG00000003273) SNX6 (ENSVPAG00000003272) EAPP (ENSVPAG00000003271) #22 Arabian camel MODERN SPECIES 32 NKX2-1 (ENSCDRG00005017830) MBIP (ENSCDRG00005017739) BRMS1L (ENSCDRG00005017695) RALGAPA1 (ENSCDRG00005017292) INSM2 (ENSCDRG00005017254) NFKBIA (ENSCDRG00005017198) PSMA6 (ENSCDRG00005017112) PRORP (ENSCDRG00005016960) PPP2R3C (ENSCDRG00005016852) FAM177A1 (ENSCDRG00005016804) SRP54 (ENSCDRG00005016645) ENSCDRG00005016608 BAZ1A (ENSCDRG00005016142) CFL2 (ENSCDRG00005016024) SNX6 (ENSCDRG00005015791) EAPP (ENSCDRG00005015710) #22 ENSCDRG00005015685 EGLN3 (ENSCDRG00005015624) ENSCDRG00005015572 AKAP6 (ENSCDRG00005015475) ARHGAP5 (ENSCDRG00005015272) NUBPL (ENSCDRG00005015152) GPR33 (ENSCDRG00005015130) DTD2 (ENSCDRG00005015091) #21 HEATR5A (ENSCDRG00005014747) ENSCDRG00005014715 HECTD1 (ENSCDRG00005014317) AP4S1 (ENSCDRG00005014200) STRN3 (ENSCDRG00005013738) COCH (ENSCDRG00005013624) SCFD1 (ENSCDRG00005013449) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00940000166226 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00940000166226 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00940000166226 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Odontoceti_a DUPLICATION Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332.m #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00390000015821.h ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00940000166226 ENSGT00810000125473.B.l ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00940000178928 ENSGT00390000001332.m #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00940000166226 ENSGT00810000125473.B.l ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00940000178928 ENSGT00390000001332.m #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00940000166226 ENSGT00810000125473.B.l ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Narwhal MODERN SPECIES 308 BRMS1L (ENSMMNG00015020339) ENSMMNG00015020326 RALGAPA1 (ENSMMNG00015020129) INSM2 (ENSMMNG00015020039) NFKBIA (ENSMMNG00015020016) PSMA6 (ENSMMNG00015019949) PRORP (ENSMMNG00015019841) PPP2R3C (ENSMMNG00015019785) FAM177A1 (ENSMMNG00015019748) SRP54 (ENSMMNG00015019691) ENSMMNG00015019653 BAZ1A (ENSMMNG00015019553) CFL2 (ENSMMNG00015019505) SNX6 (ENSMMNG00015019443) ENSMMNG00015019404 ENSMMNG00015019371 #22 SPTSSA (ENSMMNG00015019349) #23 EGLN3 (ENSMMNG00015019291) NPAS3 (ENSMMNG00015019078) AKAP6 (ENSMMNG00015018988) ARHGAP5 (ENSMMNG00015018917) ENSMMNG00015018891 NUBPL (ENSMMNG00015018841) GPR33 (ENSMMNG00015018815) DTD2 (ENSMMNG00015018797) #21 HEATR5A (ENSMMNG00015018679) HECTD1 (ENSMMNG00015018463) AP4S1 (ENSMMNG00015018404) STRN3 (ENSMMNG00015018258) COCH (ENSMMNG00015018104) ENSMMNG00015018060 Beluga whale MODERN SPECIES 44 NKX2-1 (ENSDLEG00000012182) MBIP (ENSDLEG00000012196) BRMS1L (ENSDLEG00000012215) RALGAPA1 (ENSDLEG00000012252) INSM2 (ENSDLEG00000012328) NFKBIA (ENSDLEG00000012342) PSMA6 (ENSDLEG00000012355) ENSDLEG00000012386 PPP2R3C (ENSDLEG00000012415) FAM177A1 (ENSDLEG00000012441) SRP54 (ENSDLEG00000012450) ENSDLEG00000012461 BAZ1A (ENSDLEG00000012480) CFL2 (ENSDLEG00000012575) SNX6 (ENSDLEG00000012585) ENSDLEG00000012618 #22 ENSDLEG00000012640 SPTSSA (ENSDLEG00000012661) #23 ENSDLEG00000012666 EGLN3 (ENSDLEG00000012687) NPAS3 (ENSDLEG00000012702) ENSDLEG00000012728 ENSDLEG00000012743 ENSDLEG00000012755 ARHGAP5 (ENSDLEG00000012779) ENSDLEG00000012791 NUBPL (ENSDLEG00000013432) GPR33 (ENSDLEG00000013450) DTD2 (ENSDLEG00000013452) #21 HEATR5A (ENSDLEG00000013600) HECTD1 (ENSDLEG00000015830) Vaquita MODERN SPECIES 11 MBIP (ENSPSNG00000008119) BRMS1L (ENSPSNG00000008049) RALGAPA1 (ENSPSNG00000007885) INSM2 (ENSPSNG00000019636) NFKBIA (ENSPSNG00000019593) PSMA6 (ENSPSNG00000019488) PRORP (ENSPSNG00000019340) PPP2R3C (ENSPSNG00000019237) FAM177A1 (ENSPSNG00000019175) SRP54 (ENSPSNG00000018994) ENSPSNG00000018927 BAZ1A (ENSPSNG00000018849) ENSPSNG00000018765 SNX6 (ENSPSNG00000018667) ENSPSNG00000018564 ENSPSNG00000018519 #22 ENSPSNG00000018496 SPTSSA (ENSPSNG00000018482) #23 ENSPSNG00000018446 EGLN3 (ENSPSNG00000018355) NPAS3 (ENSPSNG00000017739) AKAP6 (ENSPSNG00000017615) ARHGAP5 (ENSPSNG00000017472) ENSPSNG00000017433 NUBPL (ENSPSNG00000017395) DTD2 (ENSPSNG00000017275) #21 HEATR5A (ENSPSNG00000017090) HECTD1 (ENSPSNG00000016911) AP4S1 (ENSPSNG00000016811) STRN3 (ENSPSNG00000016653) COCH (ENSPSNG00000016321) Dolphin MODERN SPECIES 1591 EAPP (ENSTTRG00000011628) #22 SPTSSA (ENSTTRG00000011626) #23 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000001332.n #22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000008496.j.b.b.b ENSGT00940000160782 ENSGT00940000154443.b.a ENSGT00940000155375.c ENSGT00390000001021 ENSGT00390000006290 ENSGT00940000163590 ENSGT00390000008856 ENSGT00940000153737.b ENSGT00500000044890.a.a ENSGT00940000156153 ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b ENSGT00510000047417.j ENSGT00940000159616 ENSGT00940000160302 ENSGT00390000001332.n #22 ENSGT00940000158618 ENSGT00940000155009 ENSGT00940000160244 ENSGT00390000003231.b ENSGT00530000063186.a ENSGT00940000158538 ENSGT00940000159951.e.a.a ENSGT00940000154631.c.a ENSGT00940000162825 ENSGT00940000158854.i.b ENSGT00940000165165 ENSGT00950000183442 ENSGT00530000063484.b.b ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d.a.a ENSGT00940000164247 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000008496.j.b.b.b ENSGT00940000160782 ENSGT00940000154443.b.a ENSGT00940000155375.c ENSGT00390000001021 ENSGT00390000006290 ENSGT00940000163590 ENSGT00390000008856 ENSGT00940000153737.b ENSGT00500000044890.a.a ENSGT00940000156153 ENSGT00940000153096.b.c.a.a.b ENSGT00510000047417.j ENSGT00940000159616 ENSGT00940000160302 ENSGT00390000001332.n #22 ENSGT00940000158618 ENSGT00940000155009 ENSGT00940000160244 ENSGT00390000003231.b ENSGT00530000063186.a ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d.a.a.d ENSGT00940000158538 ENSGT00940000159951.e.a.a ENSGT00940000154631.c.a ENSGT00940000162825 ENSGT00390000009435.h.b ENSGT00940000158854.i.b ENSGT00940000165165 ENSGT00530000063484.b.b ENSGT00950000182841.b.a.a.a.d.a.a.c Narwhal MODERN SPECIES 309 NYX (ENSMMNG00015010048) ENSMMNG00015010041 DDX3X (ENSMMNG00015010005) USP9X (ENSMMNG00015009970) MED14 (ENSMMNG00015009892) CXorf38 (ENSMMNG00015009866) ENSMMNG00015009857 ATP6AP2 (ENSMMNG00015009785) BCOR (ENSMMNG00015009731) MID1IP1 (ENSMMNG00015009716) TSPAN7 (ENSMMNG00015009703) ENSMMNG00015009683 OTC (ENSMMNG00015009674) RPGR (ENSMMNG00015009649) SRPX (ENSMMNG00015009593) ENSMMNG00015009557 #22 SYTL5 (ENSMMNG00015009525) DYNLT3 (ENSMMNG00015009487) CYBB (ENSMMNG00015009458) XK (ENSMMNG00015009443) LANCL3 (ENSMMNG00015009431) ENSMMNG00015009412 PRRG1 (ENSMMNG00015009403) ENSMMNG00015009377 ENSMMNG00015009347 ENSMMNG00015009340 ENSMMNG00015009333 ENSMMNG00015014787 TMEM47 (ENSMMNG00015014773) ENSMMNG00015014766 ENSMMNG00015014749 Beluga whale MODERN SPECIES 58 CASK (ENSDLEG00000017934) NYX (ENSDLEG00000017648) DDX3X (ENSDLEG00000017612) ENSDLEG00000017591 USP9X (ENSDLEG00000014783) MED14 (ENSDLEG00000013718) CUNHXorf38 (ENSDLEG00000013605) ENSDLEG00000013589 ATP6AP2 (ENSDLEG00000013556) BCOR (ENSDLEG00000013499) MID1IP1 (ENSDLEG00000013488) TSPAN7 (ENSDLEG00000013478) OTC (ENSDLEG00000013458) RPGR (ENSDLEG00000013393) SRPX (ENSDLEG00000013368) ENSDLEG00000013338 #22 SYTL5 (ENSDLEG00000013025) DYNLT3 (ENSDLEG00000012975) XK (ENSDLEG00000012944) LANCL3 (ENSDLEG00000012905) ENSDLEG00000012893 ENSDLEG00000012888 ENSDLEG00000012878 ENSDLEG00000012845 ENSDLEG00000012838 PPP4R3C (ENSDLEG00000012820) ENSDLEG00000012808 Vaquita MODERN SPECIES 34 CASK (ENSPSNG00000015050) ENSPSNG00000014987 NYX (ENSPSNG00000014932) DDX3X (ENSPSNG00000014476) USP9X (ENSPSNG00000013676) ENSPSNG00000013458 CXorf38 (ENSPSNG00000013381) ENSPSNG00000021202 ATP6AP2 (ENSPSNG00000021047) BCOR (ENSPSNG00000020930) MID1IP1 (ENSPSNG00000020892) TSPAN7 (ENSPSNG00000020865) OTC (ENSPSNG00000020795) ENSPSNG00000020756 SRPX (ENSPSNG00000020642) ENSPSNG00000020588 #22 SYTL5 (ENSPSNG00000020543) ENSPSNG00000020516 DYNLT3 (ENSPSNG00000020495) CYBB (ENSPSNG00000020418) XK (ENSPSNG00000020390) LANCL3 (ENSPSNG00000020277) ENSPSNG00000020262 ENSPSNG00000020244 PRRG1 (ENSPSNG00000020215) ENSPSNG00000020178 ENSPSNG00000020168 ENSPSNG00000020148 ENSPSNG00000020119 ENSPSNG00000020097 ENSPSNG00000020035 Sperm whale MODERN SPECIES 2 MBIP (ENSPCTG00005010176) BRMS1L (ENSPCTG00005010126) ENSPCTG00005010040 RALGAPA1 (ENSPCTG00005009631) INSM2 (ENSPCTG00005009574) NFKBIA (ENSPCTG00005009454) PSMA6 (ENSPCTG00005009278) KIAA0391 (ENSPCTG00005009126) PPP2R3C (ENSPCTG00005008942) FAM177A1 (ENSPCTG00005008870) SRP54 (ENSPCTG00005008651) ENSPCTG00005008553 BAZ1A (ENSPCTG00005008484) CFL2 (ENSPCTG00005008413) SNX6 (ENSPCTG00005008297) EAPP (ENSPCTG00005008229) #22 ENSPCTG00005008216 SPTSSA (ENSPCTG00005008208) #23 EGLN3 (ENSPCTG00005008171) NPAS3 (ENSPCTG00005007723) AKAP6 (ENSPCTG00005007589) ARHGAP5 (ENSPCTG00005007494) ENSPCTG00005007465 NUBPL (ENSPCTG00005007415) ENSPCTG00005007388 ENSPCTG00005007379 GPR33 (ENSPCTG00005007371) DTD2 (ENSPCTG00005007351) #21 HEATR5A (ENSPCTG00005007185) ENSPCTG00005007130 HECTD1 (ENSPCTG00005007027) Blue whale DUPLICATION Blue whale MODERN SPECIES 11 INSM2 (ENSBMSG00010000547) NFKBIA (ENSBMSG00010000520) PSMA6 (ENSBMSG00010000487) PRORP (ENSBMSG00010000430) PPP2R3C (ENSBMSG00010000349) FAM177A1 (ENSBMSG00010000293) SRP54 (ENSBMSG00010000198) ENSBMSG00010000124 BAZ1A (ENSBMSG00010013408) ENSBMSG00010013382 SNX6 (ENSBMSG00010013359) ENSBMSG00010013323 ENSBMSG00010013306 #22 ENSBMSG00010013286 ENSBMSG00010013245 ENSBMSG00010013231 #22 ENSBMSG00010013221 EGLN3 (ENSBMSG00010013202) NPAS3 (ENSBMSG00010013089) AKAP6 (ENSBMSG00010013021) ARHGAP5 (ENSBMSG00010012978) NUBPL (ENSBMSG00010012964) GPR33 (ENSBMSG00010012958) DTD2 (ENSBMSG00010012949) #21 HEATR5A (ENSBMSG00010012932) HECTD1 (ENSBMSG00010012906) AP4S1 (ENSBMSG00010012875) STRN3 (ENSBMSG00010012838) COCH (ENSBMSG00010012783) SCFD1 (ENSBMSG00010012723) ENSBMSG00010012692 Blue whale MODERN SPECIES 11 STRN3 (ENSBMSG00010012838) AP4S1 (ENSBMSG00010012875) HECTD1 (ENSBMSG00010012906) HEATR5A (ENSBMSG00010012932) DTD2 (ENSBMSG00010012949) #21 GPR33 (ENSBMSG00010012958) NUBPL (ENSBMSG00010012964) ARHGAP5 (ENSBMSG00010012978) AKAP6 (ENSBMSG00010013021) NPAS3 (ENSBMSG00010013089) EGLN3 (ENSBMSG00010013202) ENSBMSG00010013221 ENSBMSG00010013231 #22 ENSBMSG00010013245 ENSBMSG00010013286 ENSBMSG00010013306 #22 ENSBMSG00010013323 SNX6 (ENSBMSG00010013359) ENSBMSG00010013382 BAZ1A (ENSBMSG00010013408) ENSBMSG00010000124 SRP54 (ENSBMSG00010000198) FAM177A1 (ENSBMSG00010000293) PPP2R3C (ENSBMSG00010000349) PRORP (ENSBMSG00010000430) PSMA6 (ENSBMSG00010000487) NFKBIA (ENSBMSG00010000520) INSM2 (ENSBMSG00010000547) ENSBMSG00010001500 BRMS1L (ENSBMSG00010001513) ENSBMSG00010001533 Pecora ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000161610 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000163541.g ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Yarkand deer MODERN SPECIES 4 NKX2-1 (ENSCHYG00000008971) MBIP (ENSCHYG00000008530) BRMS1L (ENSCHYG00000008475) RALGAPA1 (ENSCHYG00000007571) INSM2 (ENSCHYG00000007476) ENSCHYG00000007413 PRORP (ENSCHYG00000007053) PPP2R3C (ENSCHYG00000006920) FAM177A1 (ENSCHYG00000006869) SRP54 (ENSCHYG00000006731) ENSCHYG00000006663 BAZ1A (ENSCHYG00000006594) CFL2 (ENSCHYG00000006518) ENSCHYG00000006486 ENSCHYG00000006328 EAPP (ENSCHYG00000006243) #22 ENSCHYG00000006229 SPTSSA (ENSCHYG00000006204) #23 ENSCHYG00000006192 EGLN3 (ENSCHYG00000006118) NPAS3 (ENSCHYG00000005548) ENSCHYG00000005433 ENSCHYG00000005372 ENSCHYG00000005283 ENSCHYG00000005261 ENSCHYG00000005213 ENSCHYG00000005175 ENSCHYG00000005154 #21 ENSCHYG00000004859 ENSCHYG00000004808 ENSCHYG00000004784 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000163541.g ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000163541.g ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a.h ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a.l.b #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00940000154690.p.b Bos ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921.f ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a.h ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940.gb ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a.l.b #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT01100000263480.a.b.a.a.a.b.b.b.b.b.b.b.b.a.a.b.a.b.a.a.a ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921.f.b ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a.h ENSGT00950000183010.a.b.a.a.a.a.a.b.b.i.a.b.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940.gb ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a.l.b #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT01100000263480.a.b.a.a.a.b.b.b.b.b.b.b.b.a.a.b.a.b.a.a.a ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Cow MODERN SPECIES 13 BRMS1L (ENSBTAG00000018400) RALGAPA1 (ENSBTAG00000001282) INSM2 (ENSBTAG00000027013) NFKBIA (ENSBTAG00000016683) PSMA6 (ENSBTAG00000009683) ENSBTAG00000049349 PRORP (ENSBTAG00000009682) PPP2R3C (ENSBTAG00000009681) FAM177A1 (ENSBTAG00000009680) ENSBTAG00000000425 SRP54 (ENSBTAG00000019085) ENSBTAG00000037938 BAZ1A (ENSBTAG00000020164) CFL2 (ENSBTAG00000015053) SNX6 (ENSBTAG00000012873) EAPP (ENSBTAG00000003419) #22 SPTSSA (ENSBTAG00000013981) #23 EGLN3 (ENSBTAG00000008172) NPAS3 (ENSBTAG00000004462) AKAP6 (ENSBTAG00000017719) ARHGAP5 (ENSBTAG00000027024) ENSBTAG00000055201 NUBPL (ENSBTAG00000044121) GPR33 (ENSBTAG00000010536) ENSBTAG00000038020 #21 HEATR5A (ENSBTAG00000022847) HECTD1 (ENSBTAG00000032477) AP4S1 (ENSBTAG00000017201) STRN3 (ENSBTAG00000021845) COCH (ENSBTAG00000021844) SCFD1 (ENSBTAG00000017565) Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 13 MBIP (ENSBIXG00005026348) ENSBIXG00005026403 RALGAPA1 (ENSBIXG00005026523) INSM2 (ENSBIXG00005026558) NFKBIA (ENSBIXG00005026599) PSMA6 (ENSBIXG00005004554) PRORP (ENSBIXG00005026751) PPP2R3C (ENSBIXG00005026776) ENSBIXG00005026804 ENSBIXG00005004583 SRP54 (ENSBIXG00005004590) ENSBIXG00005004603 BAZ1A (ENSBIXG00005026976) CFL2 (ENSBIXG00005004635) SNX6 (ENSBIXG00005027072) EAPP (ENSBIXG00005027140) #22 ENSBIXG00005027146 SPTSSA (ENSBIXG00005027156) #23 EGLN3 (ENSBIXG00005004670) NPAS3 (ENSBIXG00005004743) ENSBIXG00005027635 AKAP6 (ENSBIXG00005004751) ARHGAP5 (ENSBIXG00005027783) ENSBIXG00005027817 ENSBIXG00005004787 NUBPL (ENSBIXG00005027931) GPR33 (ENSBIXG00005027980) ENSBIXG00005027995 #21 HEATR5A (ENSBIXG00005028101) ENSBIXG00005028130 HECTD1 (ENSBIXG00005028215) Bos_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921.f ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a.h ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940.gb ENSGT00940000154940.fb.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a.l.b #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT01100000263480.a.b.a.a.a.b.b.b.b.b.b.b.b.a.a.b.a.b.a.a.a ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00940000154690.p.b Wild yak MODERN SPECIES 2722 ENSBMUG00000004626 EAPP (ENSBMUG00000004570) #22 ENSBMUG00000004548 SPTSSA (ENSBMUG00000004541) #23 Domestic yak MODERN SPECIES 8 ENSBGRG00000013838 RALGAPA1 (ENSBGRG00000012142) INSM2 (ENSBGRG00000012041) ENSBGRG00000011907 PSMA6 (ENSBGRG00000011146) PRORP (ENSBGRG00000010633) PPP2R3C (ENSBGRG00000010465) ENSBGRG00000010370 FAM177A1 (ENSBGRG00000010282) SRP54 (ENSBGRG00000009974) ENSBGRG00000009920 BAZ1A (ENSBGRG00000009766) ENSBGRG00000009716 SNX6 (ENSBGRG00000009511) CFL2 (ENSBGRG00000009349) EAPP (ENSBGRG00000009269) #22 SPTSSA (ENSBGRG00000009176) #23 EGLN3 (ENSBGRG00000009029) ENSBGRG00000009008 NPAS3 (ENSBGRG00000008650) AKAP6 (ENSBGRG00000008525) ARHGAP5 (ENSBGRG00000008406) ENSBGRG00000008358 ENSBGRG00000008307 NUBPL (ENSBGRG00000008223) DTD2 (ENSBGRG00000008143) #21 HEATR5A (ENSBGRG00000007992) ENSBGRG00000007953 HECTD1 (ENSBGRG00000007751) AP4S1 (ENSBGRG00000007586) STRN3 (ENSBGRG00000007105) American bison MODERN SPECIES 2979 PAX9 (ENSBBBG00000009458) MBIP (ENSBBBG00000009469) BRMS1L (ENSBBBG00000001516) RALGAPA1 (ENSBBBG00000009495) INSM2 (ENSBBBG00000001523) NFKBIA (ENSBBBG00000009508) PSMA6 (ENSBBBG00000009515) PRORP (ENSBBBG00000009525) PPP2R3C (ENSBBBG00000009534) ENSBBBG00000009538 SRP54 (ENSBBBG00000009551) ENSBBBG00000007487 BAZ1A (ENSBBBG00000009578) CFL2 (ENSBBBG00000009594) SNX6 (ENSBBBG00000009605) EAPP (ENSBBBG00000009619) #22 EGLN3 (ENSBBBG00000009629) Caprinae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000163541.g ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00910000147163 ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Goat MODERN SPECIES 13 ENSCHIG00000008222 ENSCHIG00000011615 BRMS1L (ENSCHIG00000016496) RALGAPA1 (ENSCHIG00000021528) INSM2 (ENSCHIG00000019716) NFKBIA (ENSCHIG00000010157) PSMA6 (ENSCHIG00000020801) PRORP (ENSCHIG00000026248) PPP2R3C (ENSCHIG00000015062) FAM177A1 (ENSCHIG00000026400) SRP54 (ENSCHIG00000026345) ENSCHIG00000023755 BAZ1A (ENSCHIG00000019365) CFL2 (ENSCHIG00000015758) ENSCHIG00000017907 EAPP (ENSCHIG00000022171) #22 ENSCHIG00000016213 ENSCHIG00000008804 #23 ENSCHIG00000021678 EGLN3 (ENSCHIG00000016948) NPAS3 (ENSCHIG00000019397) AKAP6 (ENSCHIG00000024298) ARHGAP5 (ENSCHIG00000010874) NUBPL (ENSCHIG00000006710) GPR33 (ENSCHIG00000007857) ENSCHIG00000011637 #21 HEATR5A (ENSCHIG00000010796) HECTD1 (ENSCHIG00000018114) AP4S1 (ENSCHIG00000016142) STRN3 (ENSCHIG00000019005) COCH (ENSCHIG00000007305) Rambouillet Sheep DUPLICATION Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 9 CLEC14A (ENSOARG00020011752) SSTR1 (ENSOARG00020011703) ENSOARG00020011587 ENSOARG00020011571 FOXA1 (ENSOARG00020011508) MIPOL1 (ENSOARG00020011197) SLC25A21 (ENSOARG00020010778) PAX9 (ENSOARG00020010673) NKX2-8 (ENSOARG00020010624) NKX2-1 (ENSOARG00020010481) MBIP (ENSOARG00020010152) ENSOARG00020010080 BRMS1L (ENSOARG00020009991) RALGAPA1 (ENSOARG00020007640) INSM2 (ENSOARG00020007546) ENSOARG00020007449 #22 NFKBIA (ENSOARG00020007336) PSMA6 (ENSOARG00020006992) PPP2R3C (ENSOARG00020006825) FAM177A1 (ENSOARG00020006769) SRP54 (ENSOARG00020006524) ENSOARG00020006421 BAZ1A (ENSOARG00020006340) CFL2 (ENSOARG00020006245) SNX6 (ENSOARG00020005948) ENSOARG00020005839 #22 ENSOARG00020005825 #23 EGLN3 (ENSOARG00020005770) NPAS3 (ENSOARG00020005668) AKAP6 (ENSOARG00020005604) ARHGAP5 (ENSOARG00020005438) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 9 MBIP (ENSOARG00020010152) ENSOARG00020010080 BRMS1L (ENSOARG00020009991) RALGAPA1 (ENSOARG00020007640) INSM2 (ENSOARG00020007546) ENSOARG00020007449 #22 NFKBIA (ENSOARG00020007336) PSMA6 (ENSOARG00020006992) PPP2R3C (ENSOARG00020006825) FAM177A1 (ENSOARG00020006769) SRP54 (ENSOARG00020006524) ENSOARG00020006421 BAZ1A (ENSOARG00020006340) CFL2 (ENSOARG00020006245) SNX6 (ENSOARG00020005948) ENSOARG00020005839 #22 ENSOARG00020005825 #23 EGLN3 (ENSOARG00020005770) NPAS3 (ENSOARG00020005668) AKAP6 (ENSOARG00020005604) ARHGAP5 (ENSOARG00020005438) ENSOARG00020005406 NUBPL (ENSOARG00020005362) GPR33 (ENSOARG00020005349) DTD2 (ENSOARG00020005329) #21 HEATR5A (ENSOARG00020005213) HECTD1 (ENSOARG00020005016) AP4S1 (ENSOARG00020004957) STRN3 (ENSOARG00020004854) COCH (ENSOARG00020004770) SCFD1 (ENSOARG00020004656) Siberian musk deer DUPLICATION Siberian musk deer MODERN SPECIES 138 ENSMMSG00000019426 LMLN (ENSMMSG00000019182) OSBPL11 (ENSMMSG00000019129) ENSMMSG00000019084 SNX4 (ENSMMSG00000019042) ZNF148 (ENSMMSG00000018980) SLC12A8 (ENSMMSG00000018899) HEG1 (ENSMMSG00000018772) ENSMMSG00000018667 ITGB5 (ENSMMSG00000018600) UMPS (ENSMMSG00000018563) KALRN (ENSMMSG00000017294) ENSMMSG00000017181 ENSMMSG00000017146 CCDC14 (ENSMMSG00000017046) ENSMMSG00000017003 #22 MYLK (ENSMMSG00000016805) HACD2 (ENSMMSG00000016733) ADCY5 (ENSMMSG00000016606) SEC22A (ENSMMSG00000016529) PDIA5 (ENSMMSG00000016449) SEMA5B (ENSMMSG00000016391) SLC49A4 (ENSMMSG00000016322) HSPBAP1 (ENSMMSG00000016268) PARP14 (ENSMMSG00000016234) DTX3L (ENSMMSG00000016186) PARP9 (ENSMMSG00000016081) KPNA1 (ENSMMSG00000016044) WDR5B (ENSMMSG00000016033) ENSMMSG00000016018 FAM162A (ENSMMSG00000015960) Siberian musk deer MODERN SPECIES 392 BRMS1L (ENSMMSG00000015961) RALGAPA1 (ENSMMSG00000016068) INSM2 (ENSMMSG00000016329) ENSMMSG00000016348 PSMA6 (ENSMMSG00000016417) PRORP (ENSMMSG00000015820) PPP2R3C (ENSMMSG00000015971) FAM177A1 (ENSMMSG00000016070) ENSMMSG00000016102 SRP54 (ENSMMSG00000016134) ENSMMSG00000016259 BAZ1A (ENSMMSG00000016300) CFL2 (ENSMMSG00000016590) ENSMMSG00000016650 SNX6 (ENSMMSG00000016683) ENSMMSG00000016793 #22 SPTSSA (ENSMMSG00000016814) #23 ENSMMSG00000016824 EGLN3 (ENSMMSG00000016837) NPAS3 (ENSMMSG00000016904) AKAP6 (ENSMMSG00000017405) ARHGAP5 (ENSMMSG00000017499) NUBPL (ENSMMSG00000017580) Suina ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT01070000257281 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 Pig MODERN SPECIES 15 ENSSSCG00000044591 BRMS1L (ENSSSCG00000001947) RALGAPA1 (ENSSSCG00000032377) ENSSSCG00000047970 INSM2 (ENSSSCG00000001949) NFKBIA (ENSSSCG00000001952) PSMA6 (ENSSSCG00000054516) PRORP (ENSSSCG00000001950) PPP2R3C (ENSSSCG00000031498) FAM177A1 (ENSSSCG00000034753) SRP54 (ENSSSCG00000001955) ENSSSCG00000062223 BAZ1A (ENSSSCG00000001958) CFL2 (ENSSSCG00000001959) SNX6 (ENSSSCG00000040912) EAPP (ENSSSCG00000001960) #22 SPTSSA (ENSSSCG00000060304) #23 EGLN3 (ENSSSCG00000001963) ENSSSCG00000036652 NPAS3 (ENSSSCG00000001964) AKAP6 (ENSSSCG00000024517) ARHGAP5 (ENSSSCG00000001966) NUBPL (ENSSSCG00000001968) ENSSSCG00000044304 GPR33 (ENSSSCG00000025131) DTD2 (ENSSSCG00000026663) #21 ENSSSCG00000061987 ENSSSCG00000001970 HECTD1 (ENSSSCG00000001971) AP4S1 (ENSSSCG00000001972) STRN3 (ENSSSCG00000040657) Chacoan peccary MODERN SPECIES 883 NKX2-1 (ENSCWAG00000021794) MBIP (ENSCWAG00000021783) BRMS1L (ENSCWAG00000021744) RALGAPA1 (ENSCWAG00000021428) INSM2 (ENSCWAG00000021348) NFKBIA (ENSCWAG00000021339) PSMA6 (ENSCWAG00000021327) PRORP (ENSCWAG00000021308) PPP2R3C (ENSCWAG00000021289) FAM177A1 (ENSCWAG00000021278) SRP54 (ENSCWAG00000021240) ENSCWAG00000021220 BAZ1A (ENSCWAG00000021194) CFL2 (ENSCWAG00000021171) SNX6 (ENSCWAG00000021128) EAPP (ENSCWAG00000021095) #22 SPTSSA (ENSCWAG00000021089) #23 EGLN3 (ENSCWAG00000021081) NPAS3 (ENSCWAG00000020800) AKAP6 (ENSCWAG00000020720) ARHGAP5 (ENSCWAG00000020683) NUBPL (ENSCWAG00000020665) GPR33 (ENSCWAG00000020655) DTD2 (ENSCWAG00000020644) #21 HEATR5A (ENSCWAG00000020563) HECTD1 (ENSCWAG00000020463) AP4S1 (ENSCWAG00000020431) STRN3 (ENSCWAG00000020364) COCH (ENSCWAG00000020293) SCFD1 (ENSCWAG00000020229) G2E3 (ENSCWAG00000020142) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00940000166226 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00940000166226 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Caniformia ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00940000166226 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00940000166226 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00390000011943.a.a.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 Ursus ANCESTRAL SPECIES 202 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000016972.a.a.b.b.a ENSGT00390000006205.b ENSGT00390000011943.a.a.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 Polar bear MODERN SPECIES 413 EAPP (ENSUMAG00000010403) #22 EGLN3 (ENSUMAG00000010391) NPAS3 (ENSUMAG00000010286) AKAP6 (ENSUMAG00000010177) ENSUMAG00000010161 ARHGAP5 (ENSUMAG00000010158) NUBPL (ENSUMAG00000010133) GPR33 (ENSUMAG00000010119) ENSUMAG00000010115 #21 ENSUMAG00000010111 HEATR5A (ENSUMAG00000007915) ENSUMAG00000007548 HECTD1 (ENSUMAG00000007523) AP4S1 (ENSUMAG00000007515) STRN3 (ENSUMAG00000006765) COCH (ENSUMAG00000006665) Giant Panda MODERN SPECIES 12 NKX2-1 (ENSAMEG00000031459) MBIP (ENSAMEG00000013537) BRMS1L (ENSAMEG00000015738) RALGAPA1 (ENSAMEG00000015649) INSM2 (ENSAMEG00000019215) NFKBIA (ENSAMEG00000015629) PSMA6 (ENSAMEG00000015614) PRORP (ENSAMEG00000015610) PPP2R3C (ENSAMEG00000015586) FAM177A1 (ENSAMEG00000015581) SRP54 (ENSAMEG00000015544) ENSAMEG00000015534 BAZ1A (ENSAMEG00000015512) CFL2 (ENSAMEG00000015508) SNX6 (ENSAMEG00000015476) EAPP (ENSAMEG00000006454) #22 SPTSSA (ENSAMEG00000028071) #23 EGLN3 (ENSAMEG00000023682) NPAS3 (ENSAMEG00000029238) AKAP6 (ENSAMEG00000015685) ARHGAP5 (ENSAMEG00000015709) NUBPL (ENSAMEG00000015724) GPR33 (ENSAMEG00000019764) DTD2 (ENSAMEG00000024284) #21 HEATR5A (ENSAMEG00000015736) ENSAMEG00000028378 HECTD1 (ENSAMEG00000015770) AP4S1 (ENSAMEG00000015823) STRN3 (ENSAMEG00000015829) COCH (ENSAMEG00000015859) SCFD1 (ENSAMEG00000005072) Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00940000166226 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 Ferret DUPLICATION Ferret MODERN SPECIES 259 ENSMPUG00000018691 VSTM5 (ENSMPUG00000010671) MED17 (ENSMPUG00000010667) C11orf54 (ENSMPUG00000010663) TAF1D (ENSMPUG00000010659) CEP295 (ENSMPUG00000010628) ENSMPUG00000010626 ENSMPUG00000010589 SLC36A4 (ENSMPUG00000010579) ENSMPUG00000010574 ENSMPUG00000010572 FAT3 (ENSMPUG00000010556) ENSMPUG00000018690 #22 ENSMPUG00000018689 CHORDC1 (ENSMPUG00000010548) NAALAD2 (ENSMPUG00000010401) FOLH1 (ENSMPUG00000010390) NOX4 (ENSMPUG00000010385) TYR (ENSMPUG00000010381) GRM5 (ENSMPUG00000010375) CTSC (ENSMPUG00000010370) RAB38 (ENSMPUG00000010366) TMEM135 (ENSMPUG00000010358) ENSMPUG00000010356 FZD4 (ENSMPUG00000010353) PRSS23 (ENSMPUG00000018688) ME3 (ENSMPUG00000010166) ENSMPUG00000018687 Ferret MODERN SPECIES 384 ENSMPUG00000001029 #22 EGLN3 (ENSMPUG00000001043) NPAS3 (ENSMPUG00000001045) ENSMPUG00000001046 AKAP6 (ENSMPUG00000001051) ARHGAP5 (ENSMPUG00000001057) NUBPL (ENSMPUG00000001061) GPR33 (ENSMPUG00000019234) DTD2 (ENSMPUG00000001065) #21 HEATR5A (ENSMPUG00000001067) American mink MODERN SPECIES 84 RALGAPA1 (ENSNVIG00000001947) INSM2 (ENSNVIG00000002180) NFKBIA (ENSNVIG00000002189) PSMA6 (ENSNVIG00000002214) PRORP (ENSNVIG00000002327) PPP2R3C (ENSNVIG00000002372) FAM177A1 (ENSNVIG00000002414) ENSNVIG00000002439 SRP54 (ENSNVIG00000002461) ENSNVIG00000002515 BAZ1A (ENSNVIG00000002565) CFL2 (ENSNVIG00000002744) SNX6 (ENSNVIG00000002824) EAPP (ENSNVIG00000002902) #22 SPTSSA (ENSNVIG00000002933) #23 ENSNVIG00000002935 EGLN3 (ENSNVIG00000002975) NPAS3 (ENSNVIG00000002999) AKAP6 (ENSNVIG00000003054) ARHGAP5 (ENSNVIG00000003107) NUBPL (ENSNVIG00000003207) GPR33 (ENSNVIG00000003227) DTD2 (ENSNVIG00000003240) #21 F5H619 (ENSNVIG00000003257) ENSNVIG00000003418 HECTD1 (ENSNVIG00000003432) AP4S1 (ENSNVIG00000003530) STRN3 (ENSNVIG00000003579) COCH (ENSNVIG00000003618) Canidae DUPLICATION Canidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d.j ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332.w #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00940000165919 ENSGT00970000193421.B.h.a ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d.i.a.b ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332.w #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a.o #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00390000008918.a.a ENSGT00940000156572 ENSGT00940000165919 ENSGT00970000193421.B.h.a ENSGT00950000183095.a.a Dingo MODERN SPECIES 161 MBIP (ENSCAFG00020022316) BRMS1L (ENSCAFG00020022326) RALGAPA1 (ENSCAFG00020022394) INSM2 (ENSCAFG00020023381) ENSCAFG00020023383 ENSCAFG00020023389 PRORP (ENSCAFG00020023411) PPP2R3C (ENSCAFG00020023418) FAM177A1 (ENSCAFG00020023422) SRP54 (ENSCAFG00020023427) ENSCAFG00020023434 BAZ1A (ENSCAFG00020023452) CFL2 (ENSCAFG00020023554) ENSCAFG00020023557 ENSCAFG00020023570 EAPP (ENSCAFG00020023572) #22 SPTSSA (ENSCAFG00020023575) #23 EGLN3 (ENSCAFG00020023576) NPAS3 (ENSCAFG00020023578) AKAP6 (ENSCAFG00020023612) ARHGAP5 (ENSCAFG00020023643) ENSCAFG00020023647 ENSCAFG00020023650 ENSCAFG00020023655 ENSCAFG00020023659 GPR33 (ENSCAFG00020023662) ENSCAFG00020023663 #21 HEATR5A (ENSCAFG00020023674) ENSCAFG00020023694 HECTD1 (ENSCAFG00020023723) AP4S1 (ENSCAFG00020024081) Dog MODERN SPECIES 36 MBIP (ENSCAFG00845002536) BRMS1L (ENSCAFG00845002506) RALGAPA1 (ENSCAFG00845002236) INSM2 (ENSCAFG00845002072) NFKBIA (ENSCAFG00845002047) PSMA6 (ENSCAFG00845001929) PSMA6 (ENSCAFG00845001872) PPP2R3C (ENSCAFG00845001831) FAM177A1 (ENSCAFG00845001803) SRP54 (ENSCAFG00845001751) ENSCAFG00845001684 BAZ1A (ENSCAFG00845001639) CFL2 (ENSCAFG00845001611) ENSCAFG00845001579 ENSCAFG00845001517 EAPP (ENSCAFG00845001503) #22 ENSCAFG00845001492 #23 ENSCAFG00845001464 EGLN3 (ENSCAFG00845012583) NPAS3 (ENSCAFG00845012355) AKAP6 (ENSCAFG00845012171) ARHGAP5 (ENSCAFG00845012045) NUBPL (ENSCAFG00845011856) GPR33 (ENSCAFG00845011804) DTD2 (ENSCAFG00845011795) #21 ENSCAFG00845011772 HEATR5A (ENSCAFG00845011579) HECTD1 (ENSCAFG00845011087) ENSCAFG00845011023 AP4S1 (ENSCAFG00845010937) STRN3 (ENSCAFG00845010851) Red fox MODERN SPECIES 65 ENSVVUG00000029955 #22 ENSVVUG00000029949 NPAS3 (ENSVVUG00000029947) AKAP6 (ENSVVUG00000029932) ENSVVUG00000029926 ARHGAP5 (ENSVVUG00000029922) ENSVVUG00000029921 NUBPL (ENSVVUG00000029910) ENSVVUG00000029909 GPR33 (ENSVVUG00000029908) DTD2 (ENSVVUG00000029907) #21 HEATR5A (ENSVVUG00000029806) HECTD1 (ENSVVUG00000029612) ENSVVUG00000029588 ENSVVUG00000029587 STRN3 (ENSVVUG00000029456) Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000001332.x #22 Red fox MODERN SPECIES 16 NAGK (ENSVVUG00000007503) PAIP2B (ENSVVUG00000007493) ZNF638 (ENSVVUG00000007369) DYSF (ENSVVUG00000007163) CYP26B1 (ENSVVUG00000007121) EXOC6B (ENSVVUG00000006974) SPR (ENSVVUG00000006933) EMX1 (ENSVVUG00000006929) SFXN5 (ENSVVUG00000006892) RAB11FIP5 (ENSVVUG00000006886) SMYD5 (ENSVVUG00000006859) PRADC1 (ENSVVUG00000006845) ENSVVUG00000005352 FBXO41 (ENSVVUG00000005266) EGR4 (ENSVVUG00000005259) ENSVVUG00000005256 #22 ALMS1 (ENSVVUG00000004856) ENSVVUG00000004791 TPRKB (ENSVVUG00000004786) DUSP11 (ENSVVUG00000004768) CUNH2orf78 (ENSVVUG00000004761) STAMBP (ENSVVUG00000004755) ACTG2 (ENSVVUG00000004752) DGUOK (ENSVVUG00000004734) TET3 (ENSVVUG00000004693) BOLA3 (ENSVVUG00000004673) MOB1A (ENSVVUG00000004664) MTHFD2 (ENSVVUG00000004659) SLC4A5 (ENSVVUG00000004630) ENSVVUG00000004625 DCTN1 (ENSVVUG00000004552) Felidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a.d ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Panthera ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B.c.a ENSGT00950000183095.a.a.d ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Tiger MODERN SPECIES 578 EAPP (ENSPTIG00000018266) #22 EGLN3 (ENSPTIG00000017846) NPAS3 (ENSPTIG00000015688) AKAP6 (ENSPTIG00000012016) ARHGAP5 (ENSPTIG00000011092) NUBPL (ENSPTIG00000009627) DTD2 (ENSPTIG00000008518) #21 HEATR5A (ENSPTIG00000003357) ENSPTIG00000000922 HECTD1 (ENSPTIG00000020313) ENSPTIG00000019757 STRN3 (ENSPTIG00000018841) COCH (ENSPTIG00000017113) SCFD1 (ENSPTIG00000015762) G2E3 (ENSPTIG00000013202) PRKD1 (ENSPTIG00000011129) Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000165456 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B.c.a ENSGT00950000183095.a.a.c ENSGT00970000193421.B.d ENSGT00950000183095.a.a.d ENSGT00940000159386 leopard MODERN SPECIES 112 EAPP (ENSPPRG00000009599) #22 EGLN3 (ENSPPRG00000009618) NPAS3 (ENSPPRG00000010049) AKAP6 (ENSPPRG00000010405) ARHGAP5 (ENSPPRG00000010531) ENSPPRG00000010606 NUBPL (ENSPPRG00000010686) DTD2 (ENSPPRG00000010899) #21 HEATR5A (ENSPPRG00000010977) HECTD1 (ENSPPRG00000011166) ENSPPRG00000011288 ENSPPRG00000011315 ENSPPRG00000011448 COCH (ENSPPRG00000011542) ENSPPRG00000011631 SCFD1 (ENSPPRG00000011656) lion MODERN SPECIES 6 RALGAPA1 (ENSPLOG00000002123) INSM2 (ENSPLOG00000002008) ENSPLOG00000001985 ENSPLOG00000001964 ENSPLOG00000001956 NFKBIA (ENSPLOG00000001934) PSMA6 (ENSPLOG00000001875) PRORP (ENSPLOG00000001810) PPP2R3C (ENSPLOG00000001758) FAM177A1 (ENSPLOG00000001730) SRP54 (ENSPLOG00000001676) ENSPLOG00000001640 BAZ1A (ENSPLOG00000001606) ENSPLOG00000001550 ENSPLOG00000001525 EAPP (ENSPLOG00000001486) #22 SPTSSA (ENSPLOG00000001474) #23 ENSPLOG00000001468 EGLN3 (ENSPLOG00000001437) ENSPLOG00000001420 NPAS3 (ENSPLOG00000001299) AKAP6 (ENSPLOG00000001171) ARHGAP5 (ENSPLOG00000001022) NUBPL (ENSPLOG00000000974) GPR33 (ENSPLOG00000000949) DTD2 (ENSPLOG00000000933) #21 HEATR5A (ENSPLOG00000000896) HECTD1 (ENSPLOG00000000806) AP4S1 (ENSPLOG00000000730) STRN3 (ENSPLOG00000000594) COCH (ENSPLOG00000000512) Cat MODERN SPECIES 237 BRMS1L (ENSFCAG00000024948) RALGAPA1 (ENSFCAG00000012361) INSM2 (ENSFCAG00000025118) ENSFCAG00000035826 ENSFCAG00000050300 NFKBIA (ENSFCAG00000006671) PSMA6 (ENSFCAG00000026276) PRORP (ENSFCAG00000004383) PPP2R3C (ENSFCAG00000030690) FAM177A1 (ENSFCAG00000043712) SRP54 (ENSFCAG00000032033) ENSFCAG00000029463 BAZ1A (ENSFCAG00000024924) CFL2 (ENSFCAG00000008480) SNX6 (ENSFCAG00000018851) EAPP (ENSFCAG00000030251) #22 SPTSSA (ENSFCAG00000042893) #23 ENSFCAG00000023772 EGLN3 (ENSFCAG00000040826) NPAS3 (ENSFCAG00000041731) AKAP6 (ENSFCAG00000010934) ARHGAP5 (ENSFCAG00000024536) NUBPL (ENSFCAG00000024538) GPR33 (ENSFCAG00000030877) DTD2 (ENSFCAG00000031441) #21 HEATR5A (ENSFCAG00000014756) ENSFCAG00000038310 HECTD1 (ENSFCAG00000001734) AP4S1 (ENSFCAG00000005738) STRN3 (ENSFCAG00000013708) COCH (ENSFCAG00000011638) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Microbat MODERN SPECIES 959 ENSMLUG00000004184 BRMS1L (ENSMLUG00000008089) RALGAPA1 (ENSMLUG00000007979) ENSMLUG00000023852 INSM2 (ENSMLUG00000026985) ENSMLUG00000004519 PSMA6 (ENSMLUG00000010228) PRORP (ENSMLUG00000010205) PPP2R3C (ENSMLUG00000024559) FAM177A1 (ENSMLUG00000010187) SRP54 (ENSMLUG00000008958) ENSMLUG00000023750 BAZ1A (ENSMLUG00000006672) SNX6 (ENSMLUG00000007049) ENSMLUG00000030716 EAPP (ENSMLUG00000013814) #22 SPTSSA (ENSMLUG00000013821) #23 EGLN3 (ENSMLUG00000014716) NPAS3 (ENSMLUG00000016973) AKAP6 (ENSMLUG00000007138) ARHGAP5 (ENSMLUG00000026153) NUBPL (ENSMLUG00000004368) DTD2 (ENSMLUG00000005789) #21 HEATR5A (ENSMLUG00000005763) HECTD1 (ENSMLUG00000013003) AP4S1 (ENSMLUG00000011671) STRN3 (ENSMLUG00000011642) COCH (ENSMLUG00000011622) SCFD1 (ENSMLUG00000000542) G2E3 (ENSMLUG00000000531) ENSMLUG00000027139 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 24 BRMS1L (ENSRFEG00010003180) RALGAPA1 (ENSRFEG00010003084) INSM2 (ENSRFEG00010003015) ENSRFEG00010002998 NFKBIA (ENSRFEG00010002978) ENSRFEG00010002929 PRORP (ENSRFEG00010002863) PPP2R3C (ENSRFEG00010002782) FAM177A1 (ENSRFEG00010002737) SRP54 (ENSRFEG00010002671) ENSRFEG00010002630 BAZ1A (ENSRFEG00010002589) CFL2 (ENSRFEG00010002557) ENSRFEG00010002540 SNX6 (ENSRFEG00010002499) EAPP (ENSRFEG00010002434) #22 SPTSSA (ENSRFEG00010002421) #23 EGLN3 (ENSRFEG00010002399) NPAS3 (ENSRFEG00010002279) AKAP6 (ENSRFEG00010002160) ENSRFEG00010002109 ARHGAP5 (ENSRFEG00010002064) NUBPL (ENSRFEG00010002035) GPR33 (ENSRFEG00010002026) DTD2 (ENSRFEG00010002009) #21 HEATR5A (ENSRFEG00010001860) HECTD1 (ENSRFEG00010001711) AP4S1 (ENSRFEG00010001649) STRN3 (ENSRFEG00010001558) COCH (ENSRFEG00010001503) ENSRFEG00010001476 Megabat MODERN SPECIES 5313 EAPP (ENSPVAG00000010091) #22 Equus ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT01100000265618 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00440000034918.q.b.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 Donkey MODERN SPECIES 11 BRMS1L (ENSEASG00005007558) RALGAPA1 (ENSEASG00005002495) INSM2 (ENSEASG00005002073) NFKBIA (ENSEASG00005002070) PSMA6 (ENSEASG00005002068) PRORP (ENSEASG00005002065) PPP2R3C (ENSEASG00005002062) FAM177A1 (ENSEASG00005002060) SRP54 (ENSEASG00005002057) ENSEASG00005002053 ENSEASG00005002050 ENSEASG00005001804 CFL2 (ENSEASG00005001781) ENSEASG00005034847 ENSEASG00005009746 EAPP (ENSEASG00005026397) #22 SPTSSA (ENSEASG00005026736) #23 EGLN3 (ENSEASG00005028459) NPAS3 (ENSEASG00005005778) AKAP6 (ENSEASG00005005719) ARHGAP5 (ENSEASG00005005703) NUBPL (ENSEASG00005005696) GPR33 (ENSEASG00005005695) DTD2 (ENSEASG00005028650) #21 HEATR5A (ENSEASG00005003563) ENSEASG00005003251 HECTD1 (ENSEASG00005002686) AP4S1 (ENSEASG00005034840) STRN3 (ENSEASG00005001153) COCH (ENSEASG00005000969) SCFD1 (ENSEASG00005000580) Horse MODERN SPECIES MBIP (ENSECAG00000022491) BRMS1L (ENSECAG00000013452) RALGAPA1 (ENSECAG00000024960) INSM2 (ENSECAG00000034097) NFKBIA (ENSECAG00000023420) PSMA6 (ENSECAG00000022437) PRORP (ENSECAG00000019221) PPP2R3C (ENSECAG00000015352) FAM177A1 (ENSECAG00000012435) SRP54 (ENSECAG00000018042) ENSECAG00000015906 ENSECAG00000054257 BAZ1A (ENSECAG00000007751) CFL2 (ENSECAG00000000511) SNX6 (ENSECAG00000012176) EAPP (ENSECAG00000009667) #22 SPTSSA (ENSECAG00000034886) #23 EGLN3 (ENSECAG00000005086) NPAS3 (ENSECAG00000021888) ENSECAG00000044670 AKAP6 (ENSECAG00000019940) ENSECAG00000048271 ENSECAG00000046933 ARHGAP5 (ENSECAG00000017271) ENSECAG00000033699 ENSECAG00000058754 NUBPL (ENSECAG00000016526) GPR33 (ENSECAG00000039612) DTD2 (ENSECAG00000016348) #21 HEATR5A (ENSECAG00000015912) ENSECAG00000031422 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000162733 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT01020000230438.B.b.b.a ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Hyrax MODERN SPECIES 2117 EAPP (ENSPCAG00000002226) #22 Elephant MODERN SPECIES 602 NKX2-1 (ENSLAFG00000028846) MBIP (ENSLAFG00000013070) BRMS1L (ENSLAFG00000017810) RALGAPA1 (ENSLAFG00000008245) INSM2 (ENSLAFG00000008242) NFKBIA (ENSLAFG00000018611) PSMA6 (ENSLAFG00000017359) PRORP (ENSLAFG00000009871) ENSLAFG00000009868 FAM177A1 (ENSLAFG00000022331) SRP54 (ENSLAFG00000012007) ENSLAFG00000025618 BAZ1A (ENSLAFG00000010581) CFL2 (ENSLAFG00000010579) SNX6 (ENSLAFG00000010573) EAPP (ENSLAFG00000010570) #22 SPTSSA (ENSLAFG00000030948) #23 EGLN3 (ENSLAFG00000007342) NPAS3 (ENSLAFG00000007169) AKAP6 (ENSLAFG00000000717) ARHGAP5 (ENSLAFG00000012386) NUBPL (ENSLAFG00000004185) GPR33 (ENSLAFG00000031980) DTD2 (ENSLAFG00000018559) #21 HEATR5A (ENSLAFG00000001023) HECTD1 (ENSLAFG00000005491) AP4S1 (ENSLAFG00000005485) STRN3 (ENSLAFG00000012349) COCH (ENSLAFG00000012342) SCFD1 (ENSLAFG00000006117) G2E3 (ENSLAFG00000005684) Tenrec MODERN SPECIES 14274 EAPP (ENSETEG00000009023) #22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000001332 #22 Sloth MODERN SPECIES 2330 EAPP (ENSCHOG00000005412) #22 Armadillo MODERN SPECIES 2602 EAPP (ENSDNOG00000046713) #22 ENSDNOG00000018790 EGLN3 (ENSDNOG00000036494) NPAS3 (ENSDNOG00000048909) AKAP6 (ENSDNOG00000047853) ARHGAP5 (ENSDNOG00000011488) Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000164663 ENSGT01050000244936.d.a.a ENSGT01030000234536.b.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00940000161491.d ENSGT00940000162793 ENSGT00940000163076 ENSGT00940000161516 ENSGT00390000003866.a.b ENSGT00390000011474 ENSGT00940000162342 ENSGT00940000158683.b ENSGT01030000234573.B.c.a ENSGT00950000183209.b.b ENSGT00940000155720 ENSGT00390000010349.a.a ENSGT00940000160944 ENSGT00950000183136.a.b ENSGT00530000063867.a.b Opossum MODERN SPECIES PCBD2 (ENSMODG00000038053) PITX1 (ENSMODG00000048877) MACROH2A1 (ENSMODG00000014397) TIFAB (ENSMODG00000037601) CXCL14 (ENSMODG00000014463) SLC25A48 (ENSMODG00000014470) PTGER2 (ENSMODG00000014473) TXNDC16 (ENSMODG00000014477) GPR137C (ENSMODG00000014483) ENSMODG00000036920 PSMC6 (ENSMODG00000014500) STYX (ENSMODG00000029372) GNPNAT1 (ENSMODG00000014505) ENSMODG00000043319 SNX6 (ENSMODG00000014517) EAPP (ENSMODG00000014525) #22 ENSMODG00000014528 #23 ENSMODG00000045965 #23 ENSMODG00000023887 ENSMODG00000023886 ENSMODG00000038794 ENSMODG00000014551 ENSMODG00000023888 ENSMODG00000014576 ENSMODG00000014577 ENSMODG00000040125 ENSMODG00000014596 ENSMODG00000023889 ENSMODG00000014545 ENSMODG00000014580 ENSMODG00000046961 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007341.a ENSGT00510000048466 ENSGT00390000012435 ENSGT00940000157509 ENSGT00940000157150 ENSGT00390000018516 ENSGT00390000004717 ENSGT00950000182834.A.a.a ENSGT00390000008920.c.a ENSGT00660000095541.a.b ENSGT00940000156106 ENSGT00940000158704 ENSGT00940000158296 ENSGT00940000155369.A ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000001332 #22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000001332 #22 koala MODERN SPECIES 105 ENSPCIG00000024435 ENSPCIG00000033208 #23 ENSPCIG00000018357 EAPP (ENSPCIG00000018355) #22 ENSPCIG00000037042 #23 SNX6 (ENSPCIG00000009058) MDGA2 (ENSPCIG00000012334) LRFN5 (ENSPCIG00000012328) ATL1 (ENSPCIG00000012325) SAV1 (ENSPCIG00000012324) ENSPCIG00000012321 GMFB (ENSPCIG00000012315) ENSPCIG00000012314 ENSPCIG00000012313 NEMF (ENSPCIG00000015034) KLHDC2 (ENSPCIG00000012310) KLHDC1 (ENSPCIG00000012308) POLE2 (ENSPCIG00000011901) ENSPCIG00000011887 Wallaby MODERN SPECIES 3522 ENSMEUG00000008331 #22 Tasmanian devil MODERN SPECIES 1 ENSSHAG00000024428 ENSSHAG00000005447 PRORP (ENSSHAG00000004793) PPP2R3C (ENSSHAG00000004348) ENSSHAG00000023976 ENSSHAG00000000671 ENSSHAG00000001967 ENSSHAG00000025205 ENSSHAG00000000762 ENSSHAG00000002053 ENSSHAG00000003890 ENSSHAG00000024873 ENSSHAG00000003743 ENSSHAG00000003214 ENSSHAG00000028625 ENSSHAG00000030048 #22 ENSSHAG00000031274 ENSSHAG00000002490 ENSSHAG00000023080 ENSSHAG00000031263 ENSSHAG00000029628 ENSSHAG00000024941 ENSSHAG00000000466 ENSSHAG00000000457 ENSSHAG00000022138 ENSSHAG00000031448 ENSSHAG00000026221 ENSSHAG00000022305 ENSSHAG00000002300 ENSSHAG00000006262 ENSSHAG00000005558 Platypus MODERN SPECIES 5 SLC25A21 (ENSOANG00000014067) PAX9 (ENSOANG00000014065) NKX2-1 (ENSOANG00000043116) MBIP (ENSOANG00000014064) BRMS1L (ENSOANG00000014063) RALGAPA1 (ENSOANG00000014058) NFKBIA (ENSOANG00000043305) PSMA6 (ENSOANG00000014057) PRORP (ENSOANG00000049280) PPP2R3C (ENSOANG00000036349) FAM177A1 (ENSOANG00000014053) SRP54 (ENSOANG00000041370) ENSOANG00000014050 BAZ1A (ENSOANG00000014049) SNX6 (ENSOANG00000042198) EAPP (ENSOANG00000049496) #22 SPTSSA (ENSOANG00000043145) #23 EGLN3 (ENSOANG00000037294) ENSOANG00000049968 NPAS3 (ENSOANG00000014044) AKAP6 (ENSOANG00000014040) ARHGAP5 (ENSOANG00000014039) NUBPL (ENSOANG00000014034) DTD2 (ENSOANG00000014038) #21 HEATR5A (ENSOANG00000014036) HECTD1 (ENSOANG00000014033) AP4S1 (ENSOANG00000039192) STRN3 (ENSOANG00000014029) COCH (ENSOANG00000014025) SCFD1 (ENSOANG00000014020) G2E3 (ENSOANG00000014019) Sauria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00940000166226 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00940000166226 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00940000166226 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Aves ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00940000166226 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Neognathae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00940000166226 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 Great tit MODERN SPECIES 25 NKX2-8 (ENSPMJG00000016673) NKX2-1 (ENSPMJG00000016671) MBIP (ENSPMJG00000016669) BRMS1L (ENSPMJG00000016668) RALGAPA1 (ENSPMJG00000016667) ENSPMJG00000016665 PSMA6 (ENSPMJG00000016664) PRORP (ENSPMJG00000016663) PPP2R3C (ENSPMJG00000016662) FAM177A1 (ENSPMJG00000016661) SRP54 (ENSPMJG00000016660) ENSPMJG00000016659 BAZ1A (ENSPMJG00000016658) CFL2 (ENSPMJG00000016657) SNX6 (ENSPMJG00000016656) EAPP (ENSPMJG00000016655) #22 SPTSSA (ENSPMJG00000016654) #23 EGLN3 (ENSPMJG00000016652) NPAS3 (ENSPMJG00000016650) AKAP6 (ENSPMJG00000016649) ARHGAP5 (ENSPMJG00000016648) NUBPL (ENSPMJG00000016645) ENSPMJG00000016644 DTD2 (ENSPMJG00000016643) #21 HEATR5A (ENSPMJG00000016642) HECTD1 (ENSPMJG00000016624) AP4S1 (ENSPMJG00000016623) STRN3 (ENSPMJG00000016622) COCH (ENSPMJG00000016621) SCFD1 (ENSPMJG00000016620) G2E3 (ENSPMJG00000016619) Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940.p ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00940000167277 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940.p ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00940000167277 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940.p ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00940000167277 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Common canary MODERN SPECIES 3 NKX2-1 (ENSSCAG00000010416) MBIP (ENSSCAG00000010424) BRMS1L (ENSSCAG00000010429) RALGAPA1 (ENSSCAG00000010435) ENSSCAG00000010447 PSMA6 (ENSSCAG00000010454) PRORP (ENSSCAG00000010457) PPP2R3C (ENSSCAG00000010463) FAM177A1 (ENSSCAG00000010470) SRP54 (ENSSCAG00000010479) ENSSCAG00000010491 BAZ1A (ENSSCAG00000010530) CFL2 (ENSSCAG00000010641) ENSSCAG00000010645 ENSSCAG00000010652 EAPP (ENSSCAG00000010655) #22 ENSSCAG00000010660 EGLN3 (ENSSCAG00000010695) ENSSCAG00000010705 NPAS3 (ENSSCAG00000010750) AKAP6 (ENSSCAG00000010790) ARHGAP5 (ENSSCAG00000010952) NUBPL (ENSSCAG00000010959) DTD2 (ENSSCAG00000010966) #21 HEATR5A (ENSSCAG00000010970) HECTD1 (ENSSCAG00000011001) AP4S1 (ENSSCAG00000011172) STRN3 (ENSSCAG00000011190) COCH (ENSSCAG00000011326) SCFD1 (ENSSCAG00000011356) G2E3 (ENSSCAG00000011391) Zebra finch MODERN SPECIES 27 NKX2-1 (ENSTGUG00000012009) MBIP (ENSTGUG00000012006) BRMS1L (ENSTGUG00000012002) RALGAPA1 (ENSTGUG00000011986) INSM2 (ENSTGUG00000020314) ENSTGUG00000011983 PSMA6 (ENSTGUG00000011976) PRORP (ENSTGUG00000011968) PPP2R3C (ENSTGUG00000011965) FAM177A1 (ENSTGUG00000023877) SRP54 (ENSTGUG00000011945) ENSTGUG00000011942 BAZ1A (ENSTGUG00000011934) CFL2 (ENSTGUG00000011931) SNX6 (ENSTGUG00000011923) EAPP (ENSTGUG00000024220) #22 EGLN3 (ENSTGUG00000029575) ENSTGUG00000027432 NPAS3 (ENSTGUG00000011912) AKAP6 (ENSTGUG00000011906) ARHGAP5 (ENSTGUG00000011900) NUBPL (ENSTGUG00000011890) DTD2 (ENSTGUG00000011886) #21 HEATR5A (ENSTGUG00000011873) HECTD1 (ENSTGUG00000011864) AP4S1 (ENSTGUG00000011859) STRN3 (ENSTGUG00000011841) COCH (ENSTGUG00000011834) SCFD1 (ENSTGUG00000011823) G2E3 (ENSTGUG00000011816) PRKD1 (ENSTGUG00000011808) Medium ground finch MODERN SPECIES 4 PAX9 (ENSGFOG00000003595) NKX2-1 (ENSGFOG00000003614) MBIP (ENSGFOG00000003621) BRMS1L (ENSGFOG00000003639) RALGAPA1 (ENSGFOG00000003659) ENSGFOG00000003736 PSMA6 (ENSGFOG00000003747) PRORP (ENSGFOG00000003765) PPP2R3C (ENSGFOG00000003781) FAM177A1 (ENSGFOG00000002462) SRP54 (ENSGFOG00000002596) ENSGFOG00000002765 BAZ1A (ENSGFOG00000002793) CFL2 (ENSGFOG00000002878) SNX6 (ENSGFOG00000002910) EAPP (ENSGFOG00000002927) #22 EGLN3 (ENSGFOG00000002947) NPAS3 (ENSGFOG00000003313) AKAP6 (ENSGFOG00000003343) ARHGAP5 (ENSGFOG00000003373) NUBPL (ENSGFOG00000003402) DTD2 (ENSGFOG00000003419) #21 HEATR5A (ENSGFOG00000003447) HECTD1 (ENSGFOG00000003495) AP4S1 (ENSGFOG00000003601) STRN3 (ENSGFOG00000003655) COCH (ENSGFOG00000003866) SCFD1 (ENSGFOG00000003995) G2E3 (ENSGFOG00000004680) PRKD1 (ENSGFOG00000004710) ENSGFOG00000004765 Flycatcher MODERN SPECIES 24 PAX9 (ENSFALG00000006155) NKX2-1 (ENSFALG00000006148) MBIP (ENSFALG00000006136) BRMS1L (ENSFALG00000006120) RALGAPA1 (ENSFALG00000006075) ENSFALG00000006032 PSMA6 (ENSFALG00000006020) PRORP (ENSFALG00000006013) PPP2R3C (ENSFALG00000006010) FAM177A1 (ENSFALG00000024874) SRP54 (ENSFALG00000005995) ENSFALG00000005984 BAZ1A (ENSFALG00000005979) CFL2 (ENSFALG00000024812) SNX6 (ENSFALG00000005957) EAPP (ENSFALG00000028368) #22 EGLN3 (ENSFALG00000026324) NPAS3 (ENSFALG00000005925) AKAP6 (ENSFALG00000005900) ARHGAP5 (ENSFALG00000005883) ENSFALG00000025541 NUBPL (ENSFALG00000027668) DTD2 (ENSFALG00000028414) #21 ENSFALG00000027956 HECTD1 (ENSFALG00000005851) AP4S1 (ENSFALG00000023839) STRN3 (ENSFALG00000005833) COCH (ENSFALG00000005818) G2E3 (ENSFALG00000005783) PRKD1 (ENSFALG00000005728) FOXG1 (ENSFALG00000005708) Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00950000183024.a.b.a Kakapo MODERN SPECIES 21 NKX2-1 (ENSSHBG00005002766) MBIP (ENSSHBG00005002779) BRMS1L (ENSSHBG00005002804) RALGAPA1 (ENSSHBG00005003054) INSM2 (ENSSHBG00005003423) ENSSHBG00005003430 PSMA6 (ENSSHBG00005003440) PRORP (ENSSHBG00005003453) PPP2R3C (ENSSHBG00005003472) FAM177A1 (ENSSHBG00005003507) SRP54 (ENSSHBG00005003516) ENSSHBG00005003529 BAZ1A (ENSSHBG00005003560) CFL2 (ENSSHBG00005003606) SNX6 (ENSSHBG00005003622) EAPP (ENSSHBG00005003642) #22 SPTSSA (ENSSHBG00005003649) #23 EGLN3 (ENSSHBG00005003658) NPAS3 (ENSSHBG00005003672) AKAP6 (ENSSHBG00005003692) ARHGAP5 (ENSSHBG00005003726) NUBPL (ENSSHBG00005003744) DTD2 (ENSSHBG00005003767) #21 HEATR5A (ENSSHBG00005004034) HECTD1 (ENSSHBG00005004649) AP4S1 (ENSSHBG00005004700) STRN3 (ENSSHBG00005004714) COCH (ENSSHBG00005004736) SCFD1 (ENSSHBG00005000517) G2E3 (ENSSHBG00005000523) PRKD1 (ENSSHBG00005010583) Golden eagle MODERN SPECIES 11 NKX2-8 (ENSACCG00020003335) NKX2-1 (ENSACCG00020003352) MBIP (ENSACCG00020003368) BRMS1L (ENSACCG00020003386) RALGAPA1 (ENSACCG00020003463) ENSACCG00020003607 PSMA6 (ENSACCG00020003622) PRORP (ENSACCG00020003638) PPP2R3C (ENSACCG00020003689) FAM177A1 (ENSACCG00020003708) SRP54 (ENSACCG00020000288) ENSACCG00020000294 BAZ1A (ENSACCG00020000305) CFL2 (ENSACCG00020000332) SNX6 (ENSACCG00020000377) EAPP (ENSACCG00020000384) #22 SPTSSA (ENSACCG00020000395) #23 EGLN3 (ENSACCG00020000405) NPAS3 (ENSACCG00020000519) AKAP6 (ENSACCG00020000582) ARHGAP5 (ENSACCG00020000601) NUBPL (ENSACCG00020000650) DTD2 (ENSACCG00020000678) #21 HEATR5A (ENSACCG00020000762) HECTD1 (ENSACCG00020000924) AP4S1 (ENSACCG00020001142) STRN3 (ENSACCG00020001183) COCH (ENSACCG00020001226) SCFD1 (ENSACCG00020001288) PRKD1 (ENSACCG00020001378) FOXG1 (ENSACCG00020001418) Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00960000192415 ENSGT00940000158051 ENSGT00940000166226 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00960000192415 ENSGT00940000158051 ENSGT00940000166226 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Japanese quail MODERN SPECIES 23 NKX2-8 (ENSCJPG00005019076) NKX2-1 (ENSCJPG00005019074) MBIP (ENSCJPG00005019069) BRMS1L (ENSCJPG00005019065) RALGAPA1 (ENSCJPG00005017708) ENSCJPG00005017706 PSMA6 (ENSCJPG00005017705) PRORP (ENSCJPG00005017704) PPP2R3C (ENSCJPG00005017703) FAM177A1 (ENSCJPG00005017702) SRP54 (ENSCJPG00005017701) ENSCJPG00005017700 BAZ1A (ENSCJPG00005017586) CFL2 (ENSCJPG00005017583) SNX6 (ENSCJPG00005017581) EAPP (ENSCJPG00005017580) #22 SPTSSA (ENSCJPG00005017579) #23 EGLN3 (ENSCJPG00005017575) NPAS3 (ENSCJPG00005017573) FOXG1 (ENSCJPG00005017565) PRKD1 (ENSCJPG00005017560) G2E3 (ENSCJPG00005017559) SCFD1 (ENSCJPG00005017558) COCH (ENSCJPG00005017557) STRN3 (ENSCJPG00005017556) AP4S1 (ENSCJPG00005017555) HECTD1 (ENSCJPG00005017554) HEATR5A (ENSCJPG00005017553) DTD2 (ENSCJPG00005017552) #21 NUBPL (ENSCJPG00005017551) ARHGAP5 (ENSCJPG00005017550) Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00960000192415 ENSGT00940000158051 ENSGT00940000166226 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Chicken MODERN SPECIES 34 NKX2-1 (ENSGALG00010004654) MBIP (ENSGALG00010004623) BRMS1L (ENSGALG00010005909) RALGAPA1 (ENSGALG00010006052) INSM2 (ENSGALG00010006860) NFKBIA (ENSGALG00010005913) PSMA6 (ENSGALG00010006804) PRORP (ENSGALG00010007337) PPP2R3C (ENSGALG00010006761) FAM177A1 (ENSGALG00010006748) SRP54 (ENSGALG00010006720) ENSGALG00010006685 BAZ1A (ENSGALG00010006673) CFL2 (ENSGALG00010006653) SNX32 (ENSGALG00010005890) EAPP (ENSGALG00010005902) #22 SPTSSA (ENSGALG00010005900) #23 EGLN3 (ENSGALG00010005871) ENSGALG00010005864 NPAS3 (ENSGALG00010005829) AKAP6 (ENSGALG00010005763) ARHGAP5 (ENSGALG00010005714) NUBPL (ENSGALG00010005696) DTD2 (ENSGALG00010005617) #21 HEATR5A (ENSGALG00010005578) HECTD1 (ENSGALG00010005562) AP4S1 (ENSGALG00010005535) STRN3 (ENSGALG00010005526) COCH (ENSGALG00010005509) SCFD1 (ENSGALG00010005502) G2E3 (ENSGALG00010005489) Turkey MODERN SPECIES 25 MIPOL1 (ENSMGAG00000012539) SLC25A21 (ENSMGAG00000012532) NKX2-8 (ENSMGAG00000012528) MBIP (ENSMGAG00000012523) BRMS1L (ENSMGAG00000012520) RALGAPA1 (ENSMGAG00000012509) ENSMGAG00000012505 PSMA6 (ENSMGAG00000012499) PRORP (ENSMGAG00000012497) PPP2R3C (ENSMGAG00000012492) SRP54 (ENSMGAG00000012481) ENSMGAG00000012478 BAZ1A (ENSMGAG00000012463) CFL2 (ENSMGAG00000012456) SNX6 (ENSMGAG00000017417) EAPP (ENSMGAG00000012459) #22 EGLN3 (ENSMGAG00000012453) NPAS3 (ENSMGAG00000012451) ENSMGAG00000016559 AKAP6 (ENSMGAG00000017059) ARHGAP5 (ENSMGAG00000012438) NUBPL (ENSMGAG00000019955) ENSMGAG00000017755 DTD2 (ENSMGAG00000012433) #21 HEATR5A (ENSMGAG00000012421) HECTD1 (ENSMGAG00000012408) AP4S1 (ENSMGAG00000012406) STRN3 (ENSMGAG00000012362) COCH (ENSMGAG00000012391) SCFD1 (ENSMGAG00000012377) G2E3 (ENSMGAG00000012370) Anatidae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00390000007087 ENSGT00940000157760 ENSGT00440000033504.A ENSGT00940000160155 ENSGT00550000074828.a ENSGT00940000161780 ENSGT00940000161196 ENSGT00940000160931 ENSGT00940000161427 ENSGT00950000183205.b.b ENSGT00950000182839.B.b ENSGT00390000001545 ENSGT00940000155653.b ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00950000183024.a.b.a Pink-footed goose MODERN SPECIES 31 POLR2L (ENSABRG00000014187) CD151 (ENSABRG00000014181) ENSABRG00000014155 PNPLA2 (ENSABRG00000014141) RPLP2 (ENSABRG00000014125) PIDD1 (ENSABRG00000014118) SLC25A22 (ENSABRG00000014053) IRF7 (ENSABRG00000014045) ENSABRG00000014036 ENSABRG00000014030 RASSF7 (ENSABRG00000014022) LRRC56 (ENSABRG00000014013) HRAS (ENSABRG00000014008) CFL2 (ENSABRG00000013987) SNX6 (ENSABRG00000013972) EAPP (ENSABRG00000013967) #22 SPTSSA (ENSABRG00000013952) #23 EGLN3 (ENSABRG00000013942) NPAS3 (ENSABRG00000013913) AKAP6 (ENSABRG00000013882) ARHGAP5 (ENSABRG00000013863) NUBPL (ENSABRG00000013842) DTD2 (ENSABRG00000013834) #21 HEATR5A (ENSABRG00000013782) HECTD1 (ENSABRG00000013176) AP4S1 (ENSABRG00000013147) STRN3 (ENSABRG00000012535) COCH (ENSABRG00000012468) SCFD1 (ENSABRG00000012162) G2E3 (ENSABRG00000012051) PRKD1 (ENSABRG00000011989) Duck MODERN SPECIES 23 TSPAN4 (ENSAPLG00000003602) POLR2L (ENSAPLG00000023236) CD151 (ENSAPLG00000013662) ENSAPLG00000013528 ENSAPLG00000019646 PNPLA2 (ENSAPLG00000013222) RPLP2 (ENSAPLG00000013085) PIDD1 (ENSAPLG00000012991) SLC25A22 (ENSAPLG00000012816) IRF7 (ENSAPLG00000012752) ENSAPLG00000025316 ENSAPLG00000012427 HRAS (ENSAPLG00000012248) CFL2 (ENSAPLG00000025574) SNX6 (ENSAPLG00000011961) EAPP (ENSAPLG00000021600) #22 EGLN3 (ENSAPLG00000020625) NPAS3 (ENSAPLG00000015085) AKAP6 (ENSAPLG00000015214) ARHGAP5 (ENSAPLG00000015365) NUBPL (ENSAPLG00000015416) DTD2 (ENSAPLG00000003883) #21 HEATR5A (ENSAPLG00000003094) HECTD1 (ENSAPLG00000002424) AP4S1 (ENSAPLG00000001781) STRN3 (ENSAPLG00000016038) COCH (ENSAPLG00000015813) SCFD1 (ENSAPLG00000015536) G2E3 (ENSAPLG00000015236) PRKD1 (ENSAPLG00000014715) FOXG1 (ENSAPLG00000027732) African ostrich MODERN SPECIES 438 ENSSCUG00000010336 RBM41 (ENSSCUG00000010334) MORC4 (ENSSCUG00000010329) CLDN2 (ENSSCUG00000010326) RIPPLY1 (ENSSCUG00000010325) PRRG3 (ENSSCUG00000010324) ENSSCUG00000010322 CNGA2 (ENSSCUG00000010321) GABRE (ENSSCUG00000010314) GABRA3 (ENSSCUG00000010312) ENSSCUG00000010311 SOX3 (ENSSCUG00000010308) BAZ1A (ENSSCUG00000010301) CFL2 (ENSSCUG00000010299) SNX6 (ENSSCUG00000010298) EAPP (ENSSCUG00000010297) #22 EGLN3 (ENSSCUG00000010295) ENSSCUG00000010294 NPAS3 (ENSSCUG00000010293) AKAP6 (ENSSCUG00000010292) ARHGAP5 (ENSSCUG00000010290) NUBPL (ENSSCUG00000010286) HEATR5A (ENSSCUG00000010240) HECTD1 (ENSSCUG00000010193) AP4S1 (ENSSCUG00000010186) STRN3 (ENSSCUG00000010158) COCH (ENSSCUG00000010148) SCFD1 (ENSSCUG00000010147) G2E3 (ENSSCUG00000010146) PRKD1 (ENSSCUG00000010145) FOXG1 (ENSSCUG00000010141) Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 64 SLC25A21 (ENSCPRG00005003789) PAX9 (ENSCPRG00005003781) NKX2-1 (ENSCPRG00005003775) MBIP (ENSCPRG00005003762) BRMS1L (ENSCPRG00005003727) RALGAPA1 (ENSCPRG00005003702) ENSCPRG00005003675 PSMA6 (ENSCPRG00005003666) PPP2R3C (ENSCPRG00005003642) FAM177A1 (ENSCPRG00005003635) SRP54 (ENSCPRG00005003625) ENSCPRG00005003622 BAZ1A (ENSCPRG00005003577) CFL2 (ENSCPRG00005003558) SNX6 (ENSCPRG00005003417) EAPP (ENSCPRG00005003401) #22 SPTSSA (ENSCPRG00005003398) #23 EGLN3 (ENSCPRG00005003375) ENSCPRG00005003366 NPAS3 (ENSCPRG00005003280) AKAP6 (ENSCPRG00005003219) ARHGAP5 (ENSCPRG00005003188) NUBPL (ENSCPRG00005003181) DTD2 (ENSCPRG00005003165) #21 HEATR5A (ENSCPRG00005002056) HECTD1 (ENSCPRG00005001329) AP4S1 (ENSCPRG00005001250) STRN3 (ENSCPRG00005000658) COCH (ENSCPRG00005000540) SCFD1 (ENSCPRG00005000469) PRKD1 (ENSCPRG00005000356) Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00940000166226 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Emydidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT01020000230798 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Three-toed box turtle MODERN SPECIES 40 NKX2-1 (ENSTMTG00000010756) MBIP (ENSTMTG00000010736) BRMS1L (ENSTMTG00000010693) RALGAPA1 (ENSTMTG00000010494) INSM2 (ENSTMTG00000010472) ENSTMTG00000010447 PSMA6 (ENSTMTG00000010430) PRORP (ENSTMTG00000010405) PPP2R3C (ENSTMTG00000010366) FAM177A1 (ENSTMTG00000010346) SRP54 (ENSTMTG00000010325) ENSTMTG00000010311 BAZ1A (ENSTMTG00000010196) CFL2 (ENSTMTG00000010187) SNX6 (ENSTMTG00000010145) EAPP (ENSTMTG00000010091) #22 SPTSSA (ENSTMTG00000010079) #23 EGLN3 (ENSTMTG00000010061) ENSTMTG00000010048 NPAS3 (ENSTMTG00000009693) AKAP6 (ENSTMTG00000009566) ARHGAP5 (ENSTMTG00000009538) NUBPL (ENSTMTG00000009520) DTD2 (ENSTMTG00000009510) #21 HEATR5A (ENSTMTG00000009443) HECTD1 (ENSTMTG00000009351) AP4S1 (ENSTMTG00000009331) STRN3 (ENSTMTG00000009240) ENSTMTG00000009208 ENSTMTG00000009193 SCFD1 (ENSTMTG00000009144) painted turtle MODERN SPECIES 13 GEMIN2 (ENSCPBG00000026207) SEC23A (ENSCPBG00000026206) CLEC14A (ENSCPBG00000026203) SSTR1 (ENSCPBG00000026202) TTC6 (ENSCPBG00000026201) FOXA1 (ENSCPBG00000026200) PSMA6 (ENSCPBG00000026199) PRORP (ENSCPBG00000026198) PPP2R3C (ENSCPBG00000026197) FAM177A1 (ENSCPBG00000026196) SRP54 (ENSCPBG00000026195) ENSCPBG00000026194 BAZ1A (ENSCPBG00000026193) CFL2 (ENSCPBG00000026192) SNX6 (ENSCPBG00000026191) EAPP (ENSCPBG00000026190) #22 SPTSSA (ENSCPBG00000026189) #23 ENSCPBG00000026187 ENSCPBG00000026186 ENSCPBG00000026185 ENSCPBG00000026183 AKAP6 (ENSCPBG00000026181) ARHGAP5 (ENSCPBG00000026180) NUBPL (ENSCPBG00000026179) DTD2 (ENSCPBG00000026177) #21 HEATR5A (ENSCPBG00000026015) HECTD1 (ENSCPBG00000025954) AP4S1 (ENSCPBG00000025936) STRN3 (ENSCPBG00000025355) COCH (ENSCPBG00000025281) SCFD1 (ENSCPBG00000025264) Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000161610 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201.i ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00950000183024.a.b.a Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 2041 EAPP (ENSCABG00000020590) #22 SPTSSA (ENSCABG00000020591) #23 EGLN3 (ENSCABG00000020593) NPAS3 (ENSCABG00000020599) AKAP6 (ENSCABG00000020663) ENSCABG00000020665 Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 18 NKX2-8 (ENSGEVG00005003320) NKX2-1 (ENSGEVG00005003330) MBIP (ENSGEVG00005003348) BRMS1L (ENSGEVG00005003373) RALGAPA1 (ENSGEVG00005003399) ENSGEVG00005003452 PSMA6 (ENSGEVG00005003462) PRORP (ENSGEVG00005003474) PPP2R3C (ENSGEVG00005003486) FAM177A1 (ENSGEVG00005003513) SRP54 (ENSGEVG00005003538) ENSGEVG00005003559 BAZ1A (ENSGEVG00005003590) CFL2 (ENSGEVG00005003634) SNX6 (ENSGEVG00005003670) EAPP (ENSGEVG00005003705) #22 SPTSSA (ENSGEVG00005003714) #23 EGLN3 (ENSGEVG00005003725) NPAS3 (ENSGEVG00005003782) AKAP6 (ENSGEVG00005003920) ENSGEVG00005003955 ARHGAP5 (ENSGEVG00005000079) NUBPL (ENSGEVG00005000120) DTD2 (ENSGEVG00005000160) #21 HEATR5A (ENSGEVG00005001307) AP4S1 (ENSGEVG00005002860) STRN3 (ENSGEVG00005002888) ENSGEVG00005002940 ENSGEVG00005002963 SCFD1 (ENSGEVG00005003003) ENSGEVG00005003087 Chinese turtle MODERN SPECIES 666 NKX2-1 (ENSPSIG00000010273) MBIP (ENSPSIG00000009993) ENSPSIG00000000368 BRMS1L (ENSPSIG00000009452) ENSPSIG00000009399 PSMA6 (ENSPSIG00000008904) PRORP (ENSPSIG00000008820) PPP2R3C (ENSPSIG00000007705) FAM177A1 (ENSPSIG00000007459) SRP54 (ENSPSIG00000006476) ENSPSIG00000018036 BAZ1A (ENSPSIG00000017675) CFL2 (ENSPSIG00000017595) ENSPSIG00000000362 SNX6 (ENSPSIG00000017358) EAPP (ENSPSIG00000017258) #22 SPTSSA (ENSPSIG00000017252) #23 EGLN3 (ENSPSIG00000017197) NPAS3 (ENSPSIG00000017064) ENSPSIG00000017052 AKAP6 (ENSPSIG00000016513) ARHGAP5 (ENSPSIG00000016183) ENSPSIG00000016061 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Episquamata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT01100000263530.a ENSGT01100000263530.b ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 Laterata ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT01100000263530.a ENSGT01100000263530.b ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 Common wall lizard MODERN SPECIES BRMS1L (ENSPMRG00000008992) RALGAPA1 (ENSPMRG00000009034) INSM2 (ENSPMRG00000009128) ENSPMRG00000009136 ENSPMRG00000009142 ENSPMRG00000009146 ENSPMRG00000009151 ENSPMRG00000009160 PRORP (ENSPMRG00000009184) PPP2R3C (ENSPMRG00000009211) SRP54 (ENSPMRG00000009275) ENSPMRG00000009338 BAZ1A (ENSPMRG00000009387) CFL2 (ENSPMRG00000009760) SNX6 (ENSPMRG00000003888) EAPP (ENSPMRG00000004150) #22 SPTSSA (ENSPMRG00000004164) #23 EGLN3 (ENSPMRG00000004171) ENSPMRG00000004181 NPAS3 (ENSPMRG00000004200) ENSPMRG00000004269 ENSPMRG00000004271 ENSPMRG00000004277 ENSPMRG00000004283 AKAP6 (ENSPMRG00000004291) ENSPMRG00000004319 ENSPMRG00000004327 NUBPL (ENSPMRG00000004333) DTD2 (ENSPMRG00000004359) #21 HEATR5A (ENSPMRG00000004459) HECTD1 (ENSPMRG00000005579) Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 14 COCH (ENSSMRG00000014678) STRN3 (ENSSMRG00000014675) AP4S1 (ENSSMRG00000014674) HECTD1 (ENSSMRG00000012971) HEATR5A (ENSSMRG00000012967) ENSSMRG00000012966 #21 NUBPL (ENSSMRG00000012965) ARHGAP5 (ENSSMRG00000012963) AKAP6 (ENSSMRG00000012959) ENSSMRG00000012958 NPAS3 (ENSSMRG00000012956) EGLN3 (ENSSMRG00000012949) SPTSSA (ENSSMRG00000012947) #23 CFL2 (ENSSMRG00000012946) SNX6 (ENSSMRG00000012944) EAPP (ENSSMRG00000012943) #22 BAZ1A (ENSSMRG00000012801) ENSSMRG00000012800 SRP54 (ENSSMRG00000012796) FAM177A1 (ENSSMRG00000012795) PPP2R3C (ENSSMRG00000012786) PRORP (ENSSMRG00000012784) PSMA6 (ENSSMRG00000012783) ENSSMRG00000012781 RALGAPA1 (ENSSMRG00000012770) EEFSEC (ENSSMRG00000012767) BRMS1L (ENSSMRG00000012764) ENSSMRG00000012760 MBIP (ENSSMRG00000012759) NKX2-1 (ENSSMRG00000012757) ENSSMRG00000012756 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT01100000263530.a ENSGT01100000263530.b ENSGT01100000263481 ENSGT00940000162286.a.a ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B Elapidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824.c ENSGT00550000074824.d ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b.m ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a.g ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Indian cobra MODERN SPECIES PAX9 (ENSNNAG00000008668) NKX2-1 (ENSNNAG00000008530) MBIP (ENSNNAG00000008486) BRMS1L (ENSNNAG00000008437) RALGAPA1 (ENSNNAG00000007897) INSM2 (ENSNNAG00000007853) ENSNNAG00000007821 PSMA6 (ENSNNAG00000007786) PRORP (ENSNNAG00000007723) PPP2R3C (ENSNNAG00000007681) SRP54 (ENSNNAG00000007461) ENSNNAG00000007422 BAZ1A (ENSNNAG00000007312) CFL2 (ENSNNAG00000007288) SNX6 (ENSNNAG00000007261) EAPP (ENSNNAG00000007231) #22 SPTSSA (ENSNNAG00000007223) #23 ENSNNAG00000007211 NPAS3 (ENSNNAG00000006932) AKAP6 (ENSNNAG00000006787) ARHGAP5 (ENSNNAG00000006737) NUBPL (ENSNNAG00000006706) DTD2 (ENSNNAG00000013978) #21 HEATR5A (ENSNNAG00000013880) HECTD1 (ENSNNAG00000013803) AP4S1 (ENSNNAG00000013772) ENSNNAG00000012651 ENSNNAG00000012061 COCH (ENSNNAG00000011926) SCFD1 (ENSNNAG00000010584) G2E3 (ENSNNAG00000010420) Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824.c ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b.m ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a.g ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000161107 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000158921 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000162391 ENSGT00940000163080 ENSGT00550000074807.d ENSGT00390000002201 ENSGT00940000155583 ENSGT00390000016736.a ENSGT00550000074824.c ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000170035 ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b.m ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a.g ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Eastern brown snake MODERN SPECIES 1 NKX2-1 (ENSPTXG00000015939) MBIP (ENSPTXG00000015934) BRMS1L (ENSPTXG00000015929) RALGAPA1 (ENSPTXG00000003376) INSM2 (ENSPTXG00000003225) ENSPTXG00000003223 PSMA6 (ENSPTXG00000003220) PRORP (ENSPTXG00000003219) PPP2R3C (ENSPTXG00000003174) FAM177A1 (ENSPTXG00000003169) SRP54 (ENSPTXG00000003166) ENSPTXG00000003164 BAZ1A (ENSPTXG00000003134) CFL2 (ENSPTXG00000003130) SNX6 (ENSPTXG00000003129) EAPP (ENSPTXG00000003127) #22 SPTSSA (ENSPTXG00000003126) #23 EGLN3 (ENSPTXG00000003125) NPAS3 (ENSPTXG00000003122) AKAP6 (ENSPTXG00000003121) ARHGAP5 (ENSPTXG00000003120) NUBPL (ENSPTXG00000003118) ENSPTXG00000003117 DTD2 (ENSPTXG00000003115) #21 HEATR5A (ENSPTXG00000003041) HECTD1 (ENSPTXG00000003020) AP4S1 (ENSPTXG00000003015) STRN3 (ENSPTXG00000003009) COCH (ENSPTXG00000003006) SCFD1 (ENSPTXG00000003002) G2E3 (ENSPTXG00000002827) Mainland tiger snake MODERN SPECIES 8 NKX2-1 (ENSNSUG00000003422) MBIP (ENSNSUG00000003426) BRMS1L (ENSNSUG00000003433) RALGAPA1 (ENSNSUG00000003444) INSM2 (ENSNSUG00000003553) ENSNSUG00000003555 PSMA6 (ENSNSUG00000003565) PRORP (ENSNSUG00000003576) PPP2R3C (ENSNSUG00000003583) FAM177A1 (ENSNSUG00000003650) ENSNSUG00000003651 ENSNSUG00000003653 BAZ1A (ENSNSUG00000003669) CFL2 (ENSNSUG00000003720) SNX6 (ENSNSUG00000003722) EAPP (ENSNSUG00000003724) #22 SPTSSA (ENSNSUG00000003726) #23 EGLN3 (ENSNSUG00000003728) NPAS3 (ENSNSUG00000003732) AKAP6 (ENSNSUG00000003783) ARHGAP5 (ENSNSUG00000003836) NUBPL (ENSNSUG00000003840) ENSNSUG00000003841 DTD2 (ENSNSUG00000003844) #21 HEATR5A (ENSNSUG00000003845) HECTD1 (ENSNSUG00000003900) AP4S1 (ENSNSUG00000004769) ENSNSUG00000004774 ENSNSUG00000004776 COCH (ENSNSUG00000004777) SCFD1 (ENSNSUG00000004783) Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 8712 EAPP (ENSLLTG00000004293) #22 Lizard MODERN SPECIES 1 ENSACAG00000041498 KDM4C (ENSACAG00000004592) PTPRD (ENSACAG00000004644) ENSACAG00000040460 ENSACAG00000037270 ENSACAG00000001848 PRORP (ENSACAG00000001929) PPP2R3C (ENSACAG00000002011) FAM177A1 (ENSACAG00000024339) ENSACAG00000002103 ENSACAG00000002294 BAZ1A (ENSACAG00000002328) ENSACAG00000035722 CFL2 (ENSACAG00000002385) SNX6 (ENSACAG00000002409) EAPP (ENSACAG00000040323) #22 SPTSSA (ENSACAG00000044505) #23 EGLN3 (ENSACAG00000040138) NPAS3 (ENSACAG00000002620) ENSACAG00000036757 AKAP6 (ENSACAG00000002643) ENSACAG00000044565 ARHGAP5 (ENSACAG00000002726) ENSACAG00000029681 NUBPL (ENSACAG00000015286) DTD2 (ENSACAG00000015281) #21 HEATR5A (ENSACAG00000015177) HECTD1 (ENSACAG00000015118) AP4S1 (ENSACAG00000015092) STRN3 (ENSACAG00000014886) ENSACAG00000034657 tuatara DUPLICATION tuatara MODERN SPECIES 1090 BRMS1L (ENSSPUG00000012305) RALGAPA1 (ENSSPUG00000012506) ENSSPUG00000013022 ENSSPUG00000013027 PSMA6 (ENSSPUG00000013038) PRORP (ENSSPUG00000013053) PPP2R3C (ENSSPUG00000013069) FAM177A1 (ENSSPUG00000013088) SRP54 (ENSSPUG00000013101) ENSSPUG00000013118 BAZ1A (ENSSPUG00000013228) CFL2 (ENSSPUG00000013535) SNX6 (ENSSPUG00000013552) ENSSPUG00000013571 #22 ENSSPUG00000013578 #22 SPTSSA (ENSSPUG00000013585) #23 ENSSPUG00000013590 ENSSPUG00000013593 NPAS3 (ENSSPUG00000013629) tuatara MODERN SPECIES 1090 BRMS1L (ENSSPUG00000012305) RALGAPA1 (ENSSPUG00000012506) ENSSPUG00000013022 ENSSPUG00000013027 PSMA6 (ENSSPUG00000013038) PRORP (ENSSPUG00000013053) PPP2R3C (ENSSPUG00000013069) FAM177A1 (ENSSPUG00000013088) SRP54 (ENSSPUG00000013101) ENSSPUG00000013118 BAZ1A (ENSSPUG00000013228) CFL2 (ENSSPUG00000013535) SNX6 (ENSSPUG00000013552) ENSSPUG00000013571 #22 ENSSPUG00000013578 #22 SPTSSA (ENSSPUG00000013585) #23 ENSSPUG00000013590 ENSSPUG00000013593 NPAS3 (ENSSPUG00000013629) Anura ANCESTRAL SPECIES 231 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00940000162391 ENSGT00950000183139.B ENSGT00940000158921 ENSGT00510000047831 ENSGT00940000161107 ENSGT00940000161610 ENSGT00940000159896 ENSGT00730000111119 ENSGT00390000017800 ENSGT00940000161150 ENSGT00940000161442 ENSGT00940000156092 Frog MODERN SPECIES 8 smoc1 (ENSXETG00000030085) ENSXETG00000046063 srsf5 (ENSXETG00000002211) churc1 (ENSXETG00000039130) sptb (ENSXETG00000032471) eif2ak4 (ENSXETG00000002204) fntb (ENSXETG00000002203) slc10a1 (ENSXETG00000031082) rab15 (ENSXETG00000038460) chst9l.1 (ENSXETG00000038414) ENSXETG00000025857 chst9l.4 (ENSXETG00000040554) itpka (ENSXETG00000002921) znf106 (ENSXETG00000002920) ENSXETG00000041771 eapp (ENSXETG00000002919) #22 INSM2 (ENSXETG00000039004) ralgapa1 (ENSXETG00000025861) brms1l (ENSXETG00000002912) mbip (ENSXETG00000002911) nkx2-1 (ENSXETG00000034580) nkx2-8 (ENSXETG00000039398) pax9 (ENSXETG00000002907) slc25a21 (ENSXETG00000012316) mipol1 (ENSXETG00000035327) foxa1 (ENSXETG00000025867) ttc6 (ENSXETG00000031053) sstr1 (ENSXETG00000045347) ENSXETG00000039166 capn3 (ENSXETG00000012304) snx6 (ENSXETG00000012302) Leishan spiny toad MODERN SPECIES 4 IFT43 (ENSLLEG00000029165) SNAP23 (ENSLLEG00000029135) LRRC57 (ENSLLEG00000029111) HAUS2 (ENSLLEG00000029053) ENSLLEG00000028963 ENSLLEG00000028873 DNAL1 (ENSLLEG00000028794) MIDEAS (ENSLLEG00000028739) PTGR2 (ENSLLEG00000028577) TMEM62 (ENSLLEG00000028514) SRP54 (ENSLLEG00000028415) ENSLLEG00000028362 BAZ1A (ENSLLEG00000028193) CFL2 (ENSLLEG00000028145) SNX6 (ENSLLEG00000028033) EAPP (ENSLLEG00000027981) #22 INSM2 (ENSLLEG00000027899) RALGAPA1 (ENSLLEG00000027614) BRMS1L (ENSLLEG00000027170) MBIP (ENSLLEG00000027047) NKX2-1 (ENSLLEG00000026992) NKX2-8 (ENSLLEG00000026970) PAX9 (ENSLLEG00000026831) ENSLLEG00000026780 ENSLLEG00000026140 SLC25A21 (ENSLLEG00000025873) ENSLLEG00000025816 ENSLLEG00000025667 ENSLLEG00000025591 TTC6 (ENSLLEG00000024256) SSTR1 (ENSLLEG00000024125) Coelacanth MODERN SPECIES 259 NKX2-1 (ENSLACG00000016555) MBIP (ENSLACG00000016916) BRMS1L (ENSLACG00000017368) RALGAPA1 (ENSLACG00000017404) INSM2 (ENSLACG00000017606) nfkbiab (ENSLACG00000017693) PSMA6 (ENSLACG00000017724) PRORP (ENSLACG00000017748) PPP2R3C (ENSLACG00000017849) FAM177A1 (ENSLACG00000017875) SRP54 (ENSLACG00000017890) zgc:109986 (ENSLACG00000017921) BAZ1A (ENSLACG00000017935) CFL2 (ENSLACG00000018011) SNX6 (ENSLACG00000018041) EAPP (ENSLACG00000018078) #22 ENSLACG00000018110 EGLN3 (ENSLACG00000018190) NPAS3 (ENSLACG00000018285) Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 59 ENSGT00940000160102 ENSGT00940000156159 ENSGT00550000074912 ENSGT00390000017800 ENSGT00940000162043 ENSGT00950000185018 ENSGT00940000161150 ENSGT00940000161442 ENSGT00390000006916.d ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000166431 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00950000183024.a.b.a Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000160102 ENSGT00940000156159 ENSGT00550000074912 ENSGT00390000017800 ENSGT00940000162043 ENSGT00950000185018 ENSGT00940000161150 ENSGT00940000161442 ENSGT00390000006916.d ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000166431 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00950000183024.a.b.a Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00550000074912 ENSGT00390000017800 ENSGT00940000162043 ENSGT00950000185018 ENSGT00940000161150 ENSGT00940000161442 ENSGT01030000234987 ENSGT00390000006916.d ENSGT00940000166955 ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000166431 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000155704 ENSGT00940000167277 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT01100000263524.G.e Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000162043 ENSGT00950000185018 ENSGT00940000161150 ENSGT00940000161442 ENSGT01030000234987 ENSGT00390000006916.d.b ENSGT00940000166955 ENSGT00940000166602.A ENSGT00390000006916.d.a.b ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000166431 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT00940000153431.a.v.b #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT01100000263524.G.e ENSGT00550000074845 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT00390000017800 ENSGT00940000162043 ENSGT00940000161150 ENSGT00940000161442 ENSGT01030000234987 ENSGT00390000006916.d.b ENSGT00940000166955 ENSGT00940000166602.A ENSGT00390000006916.d.a.b ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000166431 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT01100000263524.G.e ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 117 ENSGT00940000158601 ENSGT00940000161549.a.a ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT00940000153431.a.v.b #21 ENSGT00970000193421.B ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT01060000249637 ENSGT00940000156572 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00940000158601 ENSGT00940000161549.a.a ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT00940000153431.a.v.b #21 ENSGT00970000193421.B ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT01060000249637 ENSGT00940000156572 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00940000156159 ENSGT00940000160102 ENSGT00940000162596 ENSGT00940000165313 ENSGT00390000012397 ENSGT00950000183181.B.a ENSGT00940000165169.b.a ENSGT00530000064222.b ENSGT00900000141196 ENSGT00940000159561.m ENSGT00390000011854 ENSGT00940000158601 ENSGT00940000161549.a.a ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT00940000153431.a.v.b #21 ENSGT00970000193421.B ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT01060000249637 ENSGT00940000156572 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000155599.i.b ENSGT00940000155599.i.a.b ENSGT00390000004056 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00940000178078 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00940000158601 ENSGT00940000161549.a.a ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT00940000153431.a.v.b #21 ENSGT00530000069038.a.b ENSGT00940000153168.A ENSGT00390000018691.c ENSGT00940000159673 ENSGT00530000063876.b ENSGT00940000177588 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000155599.i.b ENSGT00940000155599.i.a.b ENSGT00390000004056 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00940000178078 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00940000158601 ENSGT00940000161549.a.a ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT00940000153431.a.v.b #21 ENSGT00530000069038.a.b ENSGT00940000153168.A ENSGT00390000018691.c ENSGT00940000159673 ENSGT00530000063876.b ENSGT00940000177588 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT00940000153431.a.v.b #21 ENSGT00530000069038.a.b ENSGT00940000153168.A ENSGT00390000018691.c ENSGT00940000159673 ENSGT00530000063876.b ENSGT00940000158836.a.a ENSGT00390000006996 Oryzias ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01030000234620.a.b.a ENSGT00390000006996 ENSGT00940000158836.a.a ENSGT00530000063876.b ENSGT00940000159673 ENSGT00390000018691.c ENSGT00940000153168.A ENSGT00530000069038.a.b ENSGT00940000153431.a.v.b #21 ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000158051 ENSGT00940000158745 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00390000013159 ENSGT00910000144274 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00940000154713.B ENSGT00940000156627.b ENSGT00940000154340.A ENSGT00950000182998.A ENSGT00940000160193 ENSGT00390000016577.a ENSGT00940000156087.b ENSGT00530000063596.B ENSGT00940000159481 ENSGT00990000203829 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT01030000234620.a.b.a ENSGT00390000006996 ENSGT00940000158836.a.a ENSGT00530000063876.b ENSGT00940000159673 ENSGT00390000018691.c ENSGT00940000153168.A ENSGT00530000069038.a.b ENSGT00940000153431.a.v.b #21 ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000158051 ENSGT00940000158745 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00390000013159 ENSGT00910000144274 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00940000154713.B ENSGT00940000156627.b ENSGT00940000154340.A ENSGT00950000182998.A ENSGT00940000160193 ENSGT00390000016577.a ENSGT00940000156087.b ENSGT00530000063596.B ENSGT00940000159481 ENSGT00990000203829 Indian medaka MODERN SPECIES ENSOMEG00000005417 ARHGAP5 (ENSOMEG00000005441) AKAP6 (ENSOMEG00000005617) ENSOMEG00000005671 NPAS3 (ENSOMEG00000005794) egln3 (ENSOMEG00000005866) dtd2 (ENSOMEG00000005881) #21 ENSOMEG00000005901 #21 ENSOMEG00000005921 yipf6 (ENSOMEG00000005937) ENSOMEG00000005953 ENSOMEG00000005963 wdr89 (ENSOMEG00000005966) ppp2r5eb (ENSOMEG00000006045) KCNH5 (ENSOMEG00000000134) eapp (ENSOMEG00000006071) #22 sptssa (ENSOMEG00000006091) #23 lamtor3 (ENSOMEG00000006127) dapp1 (ENSOMEG00000006158) ENSOMEG00000006169 atp10d (ENSOMEG00000006250) commd8 (ENSOMEG00000006314) ENSOMEG00000006350 lrit3b (ENSOMEG00000006362) fam241a (ENSOMEG00000006378) GPR135 (ENSOMEG00000006391) GABRG1 (ENSOMEG00000006413) ENSOMEG00000006592 PALS1 (ENSOMEG00000006695) vps39 (ENSOMEG00000006826) ENSOMEG00000006891 Javanese ricefish MODERN SPECIES 14 ENSOJAG00000020201 ENSOJAG00000020191 snapc1b (ENSOJAG00000020184) yipf6 (ENSOJAG00000020169) ENSOJAG00000020161 ENSOJAG00000020113 ENSOJAG00000020058 ENSOJAG00000020032 #21 dtd2 (ENSOJAG00000020027) #21 nubpl (ENSOJAG00000019988) ARHGAP5 (ENSOJAG00000019983) ENSOJAG00000019876 ENSOJAG00000019813 NPAS3 (ENSOJAG00000019700) egln3 (ENSOJAG00000019674) eapp (ENSOJAG00000019661) #22 sptssa (ENSOJAG00000019647) #23 lamtor3 (ENSOJAG00000019614) dapp1 (ENSOJAG00000019582) atp10d (ENSOJAG00000019383) commd8 (ENSOJAG00000019363) ENSOJAG00000019233 lrit3b (ENSOJAG00000019210) ENSOJAG00000019202 ENSOJAG00000019191 ldah (ENSOJAG00000019164) ENSOJAG00000018556 GPR68 (ENSOJAG00000018523) capn3a (ENSOJAG00000015788) ENSOJAG00000015722 HHIPL1 (ENSOJAG00000015711) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000156540.a ENSGT01030000234620.a.b.a ENSGT00390000006996 ENSGT00940000158836.a.a ENSGT00940000159673 ENSGT00940000164439.f ENSGT00390000018691.c ENSGT00940000153168.A ENSGT00530000069038.a.b ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000158051 ENSGT00940000158745 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00390000013159 ENSGT00910000144274 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00940000154713.B ENSGT00940000156627.b ENSGT00940000154340.A ENSGT00950000182998.A ENSGT00940000160193 ENSGT00390000016577.a ENSGT00940000156087.b ENSGT00530000063596.B ENSGT00940000159481 ENSGT00990000203829 Chinese medaka MODERN SPECIES 1118 ARHGAP5 (ENSOSIG00000008432) ENSOSIG00000008430 AKAP6 (ENSOSIG00000008426) NPAS3 (ENSOSIG00000008417) egln3 (ENSOSIG00000008416) eapp (ENSOSIG00000008414) #22 sptssa (ENSOSIG00000008413) #23 lamtor3 (ENSOSIG00000008411) dapp1 (ENSOSIG00000008410) atp10d (ENSOSIG00000004512) commd8 (ENSOSIG00000004443) ENSOSIG00000003456 fam241a (ENSOSIG00000003434) GPR135 (ENSOSIG00000003428) GABRG1 (ENSOSIG00000003419) ENSOSIG00000002637 psma5 (ENSOSIG00000002553) vps39 (ENSOSIG00000002486) ENSOSIG00000002471 ENSOSIG00000002462 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 14 ENSORLG00000018049 ENSORLG00000018052 snapc1b (ENSORLG00000018054) yipf6 (ENSORLG00000018055) ENSORLG00000023403 dtd2 (ENSORLG00000022301) #21 nubpl (ENSORLG00000018060) ENSORLG00000028611 ENSORLG00000027714 ARHGAP5 (ENSORLG00000018062) AKAP6 (ENSORLG00000022749) ENSORLG00000025330 NPAS3 (ENSORLG00000018065) egln3 (ENSORLG00000018068) ENSORLG00000028972 eapp (ENSORLG00000018070) #22 sptssa (ENSORLG00000027483) #23 lamtor3 (ENSORLG00000018073) dapp1 (ENSORLG00000028356) atp10d (ENSORLG00000018077) ENSORLG00000029592 commd8 (ENSORLG00000018079) ENSORLG00000018082 ENSORLG00000018083 fam241a (ENSORLG00000023421) GPR135 (ENSORLG00000018086) GABRG1 (ENSORLG00000018089) ENSORLG00000027115 PALS1 (ENSORLG00000018093) vps39 (ENSORLG00000018103) ENSORLG00000018111 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 81 ENSGT00940000165169.b.a ENSGT00530000064222.b ENSGT00900000141196 ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 107 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00550000074912 ENSGT00940000156159 ENSGT00940000160102 ENSGT00390000012397 ENSGT00940000162596 ENSGT00950000183181.B.a ENSGT00940000165169.b.a ENSGT00530000064222.b ENSGT00900000141196 ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 277 PRKD1 (ENSKMAG00000007918) eapp (ENSKMAG00000007977) #22 sptssa (ENSKMAG00000008006) #23 egln3 (ENSKMAG00000008024) SZT2 (ENSKMAG00000008082) hyi (ENSKMAG00000008380) ptprfa (ENSKMAG00000008489) ENSKMAG00000008851 Turquoise killifish MODERN SPECIES 746 ENSNFUG00015010381 EAPP (ENSNFUG00015010386) #22 sptssa (ENSNFUG00015010398) #23 EGLN3 (ENSNFUG00015010411) Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00940000158135 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000156646.d ENSGT00940000158601 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00550000074845 ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00970000193421.B ENSGT00940000156572 ENSGT00390000004056 ENSGT00940000165169.b.a ENSGT00530000064222.b ENSGT00900000141196 ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000158135 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000156646.d ENSGT00940000158601 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00550000074845 ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00970000193421.B ENSGT00940000156572 ENSGT00390000004056 ENSGT00940000165169.b.a ENSGT00530000064222.b ENSGT00900000141196 ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00390000018691.c ENSGT01030000234620.a.b.a ENSGT00940000158836.a.a ENSGT00940000164854.a ENSGT00940000156116.A Poecilia ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00940000158135 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000156646.d ENSGT00940000158601 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00550000074845 ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00970000193421.B ENSGT00940000156572 ENSGT00390000004056 ENSGT00940000165169.b.a ENSGT00530000064222.b ENSGT00900000141196 ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00390000018691.c ENSGT01030000234620.a.b.a ENSGT00940000158836.a.a ENSGT00940000164854.a ENSGT00940000156116.A NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 163 ENSGT00940000158135 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000156646.d ENSGT00940000158601 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00550000074845 ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00970000193421.B ENSGT00940000156572 ENSGT00390000004056 ENSGT00940000165169.b.a ENSGT00530000064222.b ENSGT00900000141196 ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT01030000234620.a.b.a ENSGT00940000158836.a.a ENSGT00940000164854.a Amazon molly MODERN SPECIES 439 hikeshi (ENSPFOG00000019982) lgals3b (ENSPFOG00000011393) fbxo34 (ENSPFOG00000022150) jmjd7 (ENSPFOG00000011317) foxg1a (ENSPFOG00000011287) PRKD1 (ENSPFOG00000010961) eapp (ENSPFOG00000010918) #22 sptssa (ENSPFOG00000010915) #23 egln3 (ENSPFOG00000010877) NPAS3 (ENSPFOG00000010784) AKAP6 (ENSPFOG00000010644) ENSPFOG00000010556 ppp2r5eb (ENSPFOG00000010367) SGPP1 (ENSPFOG00000010284) ENSPFOG00000009141 Sailfin molly MODERN SPECIES 613 PRKD1 (ENSPLAG00000023768) eapp (ENSPLAG00000023820) #22 sptssa (ENSPLAG00000023835) #23 egln3 (ENSPLAG00000023868) NPAS3 (ENSPLAG00000023911) Guppy MODERN SPECIES 453 zgc:109986 (ENSPREG00000003548) slc3a2b (ENSPREG00000003533) ehd4 (ENSPREG00000003513) g2e3 (ENSPREG00000003497) ENSPREG00000003478 scfd1 (ENSPREG00000003386) strn3 (ENSPREG00000003359) ap4s1 (ENSPREG00000003331) hectd1 (ENSPREG00000003161) hikeshi (ENSPREG00000003130) ENSPREG00000003117 jmjd7 (ENSPREG00000003079) foxg1a (ENSPREG00000003063) ENSPREG00000003042 PRKD1 (ENSPREG00000003011) eapp (ENSPREG00000002981) #22 sptssa (ENSPREG00000002968) #23 egln3 (ENSPREG00000002945) NPAS3 (ENSPREG00000002851) AKAP6 (ENSPREG00000002776) snapc1b (ENSPREG00000002744) ppp2r5eb (ENSPREG00000002688) SGPP1 (ENSPREG00000002668) ENSPREG00000002659 ENSPREG00000002598 ENSPREG00000002544 ENSPREG00000002518 esr2b (ENSPREG00000002510) ENSPREG00000002485 MDGA2 (ENSPREG00000002460) tbpl2 (ENSPREG00000002441) Platyfish MODERN SPECIES 10 cfl2 (ENSXMAG00000028653) BAZ1A (ENSXMAG00000004820) zgc:109986 (ENSXMAG00000022689) slc3a2b (ENSXMAG00000004796) ehd4 (ENSXMAG00000021228) g2e3 (ENSXMAG00000021115) scfd1 (ENSXMAG00000029757) strn3 (ENSXMAG00000009308) ap4s1 (ENSXMAG00000024600) hectd1 (ENSXMAG00000009354) lgals3b (ENSXMAG00000014963) fbxo34 (ENSXMAG00000025098) jmjd7 (ENSXMAG00000014939) foxg1a (ENSXMAG00000024501) PRKD1 (ENSXMAG00000001499) eapp (ENSXMAG00000028528) #22 ENSXMAG00000021280 egln3 (ENSXMAG00000000068) NPAS3 (ENSXMAG00000000074) AKAP6 (ENSXMAG00000017748) snapc1b (ENSXMAG00000017760) ppp2r5eb (ENSXMAG00000021713) ENSXMAG00000004941 ENSXMAG00000000634 esr2b (ENSXMAG00000023811) ENSXMAG00000027569 ENSXMAG00000027211 ENSXMAG00000009045 slc2a2 (ENSXMAG00000009046) tnika (ENSXMAG00000009078) pld1a (ENSXMAG00000009132) NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 456 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 Mummichog MODERN SPECIES 967 eapp (ENSFHEG00000003315) #22 ENSFHEG00000000665 egln3 (ENSFHEG00000003355) Sheepshead minnow MODERN SPECIES 276 ENSCVAG00000017313 ENSCVAG00000000861 ENSCVAG00000017350 ENSCVAG00000017358 ENSCVAG00000017375 ENSCVAG00000017390 ENSCVAG00000017502 cldn15lb (ENSCVAG00000017523) PARL (ENSCVAG00000017535) ENSCVAG00000017545 ENSCVAG00000017557 fgf12b (ENSCVAG00000017575) ENSCVAG00000017586 ENSCVAG00000017609 eapp (ENSCVAG00000017637) #22 sptssa (ENSCVAG00000017652) #23 egln3 (ENSCVAG00000017730) NPAS3 (ENSCVAG00000017759) Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000155599.i.b ENSGT00940000155599.i.a.b ENSGT00390000004056 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00940000178078 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00940000158601 ENSGT00940000161549.a.a ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT00940000153431.a.v.b #21 ENSGT00530000069038.a.b ENSGT00940000153168.A ENSGT00390000018691.c ENSGT00940000159673 ENSGT00940000177588 ENSGT00940000158836.a.a Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000156646.d ENSGT00940000155369.A.d.a ENSGT00940000155599.i.b ENSGT00390000004056 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00940000158601 ENSGT00940000161549.a.a ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT00940000153431.a.v.b #21 ENSGT00530000069038.a.b ENSGT00940000153168.A ENSGT00390000018691.c ENSGT00940000159673 ENSGT00940000177588 ENSGT00940000158836.a.a Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000004056 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00940000158601 ENSGT00940000161549.a.a ENSGT00940000157038.a.b.u.b ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT00940000153431.a.v.b #21 ENSGT00530000069038.a.b.c ENSGT00940000153168.A ENSGT00390000018691.c ENSGT00940000159673 ENSGT00940000177588 ENSGT00940000158836.a.a Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000004056 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00940000158601 ENSGT00940000161549.a.a ENSGT00940000157038.a.b.u.b ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT00940000178522 ENSGT00940000153431.a.v.b #21 ENSGT00530000069038.a.b.c ENSGT00940000153168.A ENSGT00390000018691.c ENSGT00940000159673 ENSGT00940000177588 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00390000004056 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00940000158601 ENSGT00940000161549.a.a ENSGT00940000157038.a.b.u.b ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT00940000178522 ENSGT00940000153431.a.v.b #21 ENSGT00530000069038.a.b.c ENSGT00940000153168.A ENSGT00390000018691.c ENSGT00940000159673 ENSGT00940000177588 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 569 ENSHBUG00000016632 ap4s1 (ENSHBUG00000000489) strn3 (ENSHBUG00000000483) coch (ENSHBUG00000016503) scfd1 (ENSHBUG00000016430) g2e3 (ENSHBUG00000016168) ehd4 (ENSHBUG00000016153) ENSHBUG00000016091 ENSHBUG00000015705 foxg1a (ENSHBUG00000015682) PRKD1 (ENSHBUG00000015648) eapp (ENSHBUG00000015496) #22 sptssa (ENSHBUG00000015484) #23 egln3 (ENSHBUG00000015449) Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00390000004056 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00940000158601 ENSGT00940000161549.a.a ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT00940000178522 ENSGT00940000153431.a.v.b #21 ENSGT00530000069038.a.b.c ENSGT00940000153168.A ENSGT00390000018691.c ENSGT00940000159673 ENSGT00940000177588 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT00940000153431.a.v.b #21 ENSGT00530000069038.a.b.c ENSGT00940000153168.A ENSGT00390000018691.c ENSGT00940000159673 ENSGT00940000177588 ENSGT00940000158836.a.a Eastern happy MODERN SPECIES 10 ENSACLG00000007111 PRKD1 (ENSACLG00000007128) eapp (ENSACLG00000007278) #22 sptssa (ENSACLG00000007291) #23 egln3 (ENSACLG00000007509) NPAS3 (ENSACLG00000007993) ENSACLG00000008058 AKAP6 (ENSACLG00000008355) ENSACLG00000008373 ENSACLG00000008381 ARHGAP5 (ENSACLG00000008385) nubpl (ENSACLG00000008400) dtd2 (ENSACLG00000008425) #21 ENSACLG00000008433 #21 ENSACLG00000008480 ENSACLG00000008485 yipf6 (ENSACLG00000008486) snapc1b (ENSACLG00000008495) Zebra mbuna MODERN SPECIES 221 ENSMZEG00005009952 ENSMZEG00005009958 eapp (ENSMZEG00005009970) #22 sptssa (ENSMZEG00005009977) #23 egln3 (ENSMZEG00005009989) P. nyererei MODERN SPECIES 324 hikeshi (ENSPNYG00000013322) HEATR5A (ENSPNYG00000013359) hectd1 (ENSPNYG00000013578) ap4s1 (ENSPNYG00000013670) strn3 (ENSPNYG00000013710) coch (ENSPNYG00000013761) scfd1 (ENSPNYG00000013788) g2e3 (ENSPNYG00000013844) ehd4 (ENSPNYG00000013916) ENSPNYG00000013995 foxg1a (ENSPNYG00000014291) PRKD1 (ENSPNYG00000014311) eapp (ENSPNYG00000014361) #22 sptssa (ENSPNYG00000014367) #23 egln3 (ENSPNYG00000014374) NPAS3 (ENSPNYG00000014398) ENSPNYG00000014421 ENSPNYG00000014444 ENSPNYG00000014476 ARHGAP5 (ENSPNYG00000014497) nubpl (ENSPNYG00000014525) dtd2 (ENSPNYG00000014554) #21 ENSPNYG00000014580 DTD2 (ENSPNYG00000014598) #21 ENSPNYG00000014633 yipf6 (ENSPNYG00000014643) snapc1b (ENSPNYG00000014650) SYT16 (ENSPNYG00000014656) Lyretail cichlid MODERN SPECIES 299 galcb (ENSNBRG00000022375) hikeshi (ENSNBRG00000022423) HEATR5A (ENSNBRG00000022437) ENSNBRG00000022477 ap4s1 (ENSNBRG00000022483) strn3 (ENSNBRG00000022491) coch (ENSNBRG00000022518) scfd1 (ENSNBRG00000022555) ENSNBRG00000022568 g2e3 (ENSNBRG00000022590) ehd4 (ENSNBRG00000022623) ENSNBRG00000022636 ENSNBRG00000022651 foxg1a (ENSNBRG00000022682) PRKD1 (ENSNBRG00000022691) eapp (ENSNBRG00000022713) #22 sptssa (ENSNBRG00000022727) #23 egln3 (ENSNBRG00000022731) NPAS3 (ENSNBRG00000022746) ENSNBRG00000022764 ENSNBRG00000022821 ARHGAP5 (ENSNBRG00000022830) nubpl (ENSNBRG00000022842) dtd2 (ENSNBRG00000022855) #21 ENSNBRG00000022862 ENSNBRG00000022875 yipf6 (ENSNBRG00000022878) snapc1b (ENSNBRG00000022884) ENSNBRG00000022893 SGPP1 (ENSNBRG00000022898) wdr89 (ENSNBRG00000022904) Nile tilapia MODERN SPECIES 10 ENSONIG00000032516 slc3a2b (ENSONIG00000001729) hikeshi (ENSONIG00000020832) HEATR5A (ENSONIG00000001918) hectd1 (ENSONIG00000001899) ap4s1 (ENSONIG00000001896) strn3 (ENSONIG00000001884) coch (ENSONIG00000001879) scfd1 (ENSONIG00000001862) g2e3 (ENSONIG00000001857) ehd4 (ENSONIG00000038089) ENSONIG00000001828 ENSONIG00000038497 foxg1a (ENSONIG00000029950) PRKD1 (ENSONIG00000001814) eapp (ENSONIG00000001809) #22 sptssa (ENSONIG00000036220) #23 egln3 (ENSONIG00000035400) NPAS3 (ENSONIG00000037265) AKAP6 (ENSONIG00000001789) ARHGAP5 (ENSONIG00000001785) nubpl (ENSONIG00000001779) ENSONIG00000027478 dtd2 (ENSONIG00000042067) #21 ENSONIG00000041880 #21 ENSONIG00000001775 yipf6 (ENSONIG00000029806) snapc1b (ENSONIG00000001765) SYT16 (ENSONIG00000001764) ENSONIG00000034414 SGPP1 (ENSONIG00000043214) Midas cichlid MODERN SPECIES 1289 ehd4 (ENSACIG00000005591) ENSACIG00000005339 foxg1a (ENSACIG00000005304) PRKD1 (ENSACIG00000005253) ENSACIG00000005231 eapp (ENSACIG00000005205) #22 sptssa (ENSACIG00000005195) #23 egln3 (ENSACIG00000005177) NPAS3 (ENSACIG00000005148) ENSACIG00000005096 ENSACIG00000005080 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 78 ENSGT00940000155369.A.d.a ENSGT00940000155599.i.b ENSGT00940000155599.i.a.b ENSGT00390000004056 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00940000178078 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00940000158601 ENSGT00940000161549.a.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051.h Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 93 ENSGT00940000155599.i.b ENSGT00940000155599.i.a.b.b ENSGT00940000155599.i.a.b.a ENSGT00390000004056 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00940000178078 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00940000158601 ENSGT00940000161549.a.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 181 ENSGT00940000159386 ENSGT00940000178078 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00940000158601 ENSGT00940000161549.a.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745.p ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00970000193421.B ENSGT00940000156572 ENSGT00390000006205.b ENSGT00390000004056 ENSGT00940000155599.i.a.b.a ENSGT00940000155599.i.a.b.b ENSGT00940000155599.i.b ENSGT00940000155369.A.d.a ENSGT00940000156646.d ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b Orange clownfish DUPLICATION Orange clownfish MODERN SPECIES 9 ENSAPEG00000013707 PRKD1 (ENSAPEG00000013662) ENSAPEG00000013638 ENSAPEG00000013621 ENSAPEG00000013604 foxg1a (ENSAPEG00000013581) ENSAPEG00000013566 ENSAPEG00000013439 ENSAPEG00000013375 ENSAPEG00000013356 ehd4 (ENSAPEG00000013326) g2e3 (ENSAPEG00000013279) scfd1 (ENSAPEG00000013158) ENSAPEG00000013135 coch (ENSAPEG00000013099) eapp (ENSAPEG00000013072) #22 ENSAPEG00000013061 sptssa (ENSAPEG00000013049) #23 strn3 (ENSAPEG00000012987) ap4s1 (ENSAPEG00000012966) hectd1 (ENSAPEG00000012851) HEATR5A (ENSAPEG00000012740) hikeshi (ENSAPEG00000012684) DHRS13 (ENSAPEG00000012661) dhrs13a.1 (ENSAPEG00000012638) ENSAPEG00000012622 ENSAPEG00000012613 dhrs13a.2 (ENSAPEG00000012591) MDGA2 (ENSAPEG00000012549) ENSAPEG00000012525 ENSAPEG00000012506 Orange clownfish MODERN SPECIES 9 ENSAPEG00000013135 scfd1 (ENSAPEG00000013158) g2e3 (ENSAPEG00000013279) ehd4 (ENSAPEG00000013326) ENSAPEG00000013356 ENSAPEG00000013375 ENSAPEG00000013439 ENSAPEG00000013566 foxg1a (ENSAPEG00000013581) ENSAPEG00000013604 ENSAPEG00000013621 ENSAPEG00000013638 PRKD1 (ENSAPEG00000013662) ENSAPEG00000013707 ENSAPEG00000013738 eapp (ENSAPEG00000013780) #22 ENSAPEG00000013813 sptssa (ENSAPEG00000013841) #23 egln3 (ENSAPEG00000013864) nubpl (ENSAPEG00000013976) dtd2 (ENSAPEG00000013995) #21 ENSAPEG00000014004 ENSAPEG00000014019 ENSAPEG00000014069 yipf6 (ENSAPEG00000014086) TMEM187 (ENSAPEG00000014099) ARHGAP5 (ENSAPEG00000014117) ENSAPEG00000014137 ENSAPEG00000014159 ENSAPEG00000014213 ENSAPEG00000014227 Clown anemonefish MODERN SPECIES 648 eapp (ENSAOCG00000001759) #22 sptssa (ENSAOCG00000024030) #23 Spiny chromis MODERN SPECIES 744 eapp (ENSAPOG00000007818) #22 ENSAPOG00000007785 egln3 (ENSAPOG00000007757) TMEM187 (ENSAPOG00000007729) yipf6 (ENSAPOG00000007718) ENSAPOG00000007705 ENSAPOG00000007697 dtd2 (ENSAPOG00000007677) #21 nubpl (ENSAPOG00000007649) KCTD14 (ENSAPOG00000007614) ARHGAP5 (ENSAPOG00000007564) AKAP6 (ENSAPOG00000007530) ENSAPOG00000007510 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 614 ENSSPAG00000007261 eapp (ENSSPAG00000007225) #22 sptssa (ENSSPAG00000007216) #23 egln3 (ENSSPAG00000007191) NPAS3 (ENSSPAG00000007160) Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000155599.i.a.b ENSGT00390000004056 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00940000168627 ENSGT00940000159386 ENSGT00940000178078 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00940000158601 ENSGT00940000161549.a.a ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT00940000153431.a.v.b #21 ENSGT00530000069038.a.b ENSGT00940000153168.A ENSGT00390000018691.c ENSGT00940000159673 ENSGT00940000177588 ENSGT00940000158836.a.a Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000155599.i.a.b ENSGT00390000004056 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00940000168627 ENSGT00940000159386 ENSGT00940000178078 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00940000158601 ENSGT00940000161549.a.a ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT00940000153431.a.v.b #21 ENSGT00530000069038.a.b ENSGT00940000153168.A ENSGT00390000018691.c ENSGT00940000159673 ENSGT00940000177588 ENSGT00940000158836.a.a Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000159561.m ENSGT00390000011854 ENSGT00940000163520.A.a.a.a.a.a.a.g.b ENSGT00940000164564.e.a ENSGT00940000155599.i.b ENSGT00390000004056 ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00940000168627 ENSGT00550000074845 ENSGT00940000159386 ENSGT00940000158601 ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000158836.a.a ENSGT00940000159673 ENSGT00390000018691.c ENSGT00940000153168.A ENSGT00390000006996 ENSGT01030000234620.a.b.a ENSGT00940000156540.a ENSGT00730000111179.b ENSGT00940000154656.ob.a Fugu MODERN SPECIES 11 ENSTRUG00000028870 lrrc57 (ENSTRUG00000010341) ENSTRUG00000010421 haus2 (ENSTRUG00000023669) dhrs13a.2 (ENSTRUG00000010572) hikeshi (ENSTRUG00000025477) hectd1 (ENSTRUG00000011055) ap4s1 (ENSTRUG00000011227) strn3 (ENSTRUG00000011310) ENSTRUG00000011636 scfd1 (ENSTRUG00000011884) coch (ENSTRUG00000027600) ehd4 (ENSTRUG00000022398) foxg1a (ENSTRUG00000012582) PRKD1 (ENSTRUG00000002543) eapp (ENSTRUG00000031136) #22 sptssa (ENSTRUG00000027104) #23 egln3 (ENSTRUG00000024714) NPAS3 (ENSTRUG00000004071) AKAP6 (ENSTRUG00000023905) SGPP1 (ENSTRUG00000025016) SYT16 (ENSTRUG00000026371) snapc1b (ENSTRUG00000003344) yipf6 (ENSTRUG00000003721) ENSTRUG00000029938 ppp2r5eb (ENSTRUG00000003840) KCNH5 (ENSTRUG00000004743) gphb5 (ENSTRUG00000005808) ENSTRUG00000024118 ENSTRUG00000030125 esr2b (ENSTRUG00000006761) Tetraodon MODERN SPECIES 26 UBL3 (ENSTNIG00000009908) ENSTNIG00000002831 uqcc1 (ENSTNIG00000002832) fam83c (ENSTNIG00000002833) MMP24 (ENSTNIG00000002834) ENSTNIG00000002835 eif6 (ENSTNIG00000002836) map1lc3a (ENSTNIG00000002837) dynlrb1 (ENSTNIG00000002838) ENSTNIG00000002839 ENSTNIG00000002840 ENSTNIG00000002841 ENSTNIG00000002842 ENSTNIG00000002843 vps45 (ENSTNIG00000002844) eapp (ENSTNIG00000002845) #22 egln3 (ENSTNIG00000002846) ENSTNIG00000002847 ENSTNIG00000002848 sgms2b (ENSTNIG00000002849) SRPK3 (ENSTNIG00000002850) PLXNB3 (ENSTNIG00000002851) brinp2 (ENSTNIG00000002852) ENSTNIG00000002857 slc35a2 (ENSTNIG00000002858) otud5a (ENSTNIG00000002859) ENSTNIG00000001123 ENSTNIG00000002863 lsm8 (ENSTNIG00000002864) TYMP (ENSTNIG00000002865) SHANK3 (ENSTNIG00000002866) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000155599.i.a.b ENSGT00390000004056 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00940000168627 ENSGT00940000159386 ENSGT00940000178078 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00940000158601 ENSGT00940000161549.a.a ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00940000166226 ENSGT00810000125473.B ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT00940000153431.a.v.b #21 ENSGT00530000069038.a.b ENSGT00940000153168.A ENSGT00390000018691.c ENSGT00940000159673 ENSGT00940000177588 Ballan wrasse MODERN SPECIES 174 SHE (ENSLBEG00000005361) CHRNB2 (ENSLBEG00000005352) s100t (ENSLBEG00000005335) ENSLBEG00000005321 s100a11 (ENSLBEG00000005309) ENSLBEG00000005266 lenep (ENSLBEG00000005250) SHC1 (ENSLBEG00000005176) flad1 (ENSLBEG00000005108) ENSLBEG00000005068 ENSLBEG00000005027 ENSLBEG00000005004 foxg1a (ENSLBEG00000004975) ENSLBEG00000004964 PRKD1 (ENSLBEG00000004909) eapp (ENSLBEG00000004887) #22 sptssa (ENSLBEG00000004865) #23 ENSLBEG00000004850 egln3 (ENSLBEG00000004818) NPAS3 (ENSLBEG00000004799) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000155599.i.b ENSGT00940000155599.i.a.b ENSGT00390000004056 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00940000168627 ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00940000158601 ENSGT00940000161549.a.a ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00940000166226 ENSGT00810000125473.B ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT00940000153431.a.v.b #21 ENSGT00530000069038.a.b ENSGT00940000153168.A ENSGT00390000018691.c ENSGT00940000159673 ENSGT00940000177588 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000158601 ENSGT00940000161549.a.a ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00940000166226 ENSGT00810000125473.B ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT00940000153431.a.v.b #21 ENSGT01060000248778 ENSGT00940000180386 ENSGT00940000153168.A ENSGT00390000018691.c ENSGT00940000159673 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT00940000153431.a.v.b #21 ENSGT00940000153168.A ENSGT00390000018691.c ENSGT00940000159673 ENSGT00940000158836.a.a ENSGT00390000006996 ENSGT01030000234620.a.b.a ENSGT00940000156540.a ENSGT00730000111179.b ENSGT00940000154656.ob.a Lumpfish MODERN SPECIES 14 ENSCLMG00005020861 ENSCLMG00005020862 ENSCLMG00005020865 odf3l2a (ENSCLMG00005020867) crlf1a (ENSCLMG00005020870) keap1a (ENSCLMG00005020895) SSBP4 (ENSCLMG00005020898) ENSCLMG00005020900 ENSCLMG00005020901 ehd4 (ENSCLMG00005020902) KLHL10 (ENSCLMG00005020919) ENSCLMG00005020920 foxg1a (ENSCLMG00005020922) PRKD1 (ENSCLMG00005020924) ENSCLMG00005021006 eapp (ENSCLMG00005021007) #22 sptssa (ENSCLMG00005021008) #23 ENSCLMG00005021009 egln3 (ENSCLMG00005021010) ENSCLMG00005021012 ENSCLMG00005021022 ARHGAP5 (ENSCLMG00005021023) nubpl (ENSCLMG00005021024) dtd2 (ENSCLMG00005002797) #21 ENSCLMG00005002808 #21 ENSCLMG00005002824 yipf6 (ENSCLMG00005002850) snapc1b (ENSCLMG00005002968) ENSCLMG00005002979 SGPP1 (ENSCLMG00005002984) wdr89 (ENSCLMG00005002987) Stickleback MODERN SPECIES 316 eapp (ENSGACG00000015699) #22 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00940000155599.i.b ENSGT00940000155599.i.a.b ENSGT00390000004056 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00940000153804.B ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00550000074845 ENSGT00940000159386 ENSGT00940000158601 ENSGT00940000161549.a.a ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 Pike perch MODERN SPECIES 345 eapp (ENSSLUG00000007627) #22 sptssa (ENSSLUG00000007622) #23 egln3 (ENSSLUG00000007619) NPAS3 (ENSSLUG00000007607) Channel bull blenny MODERN SPECIES 14 MDGA2 (ENSCGOG00000020243) dhrs13a.2 (ENSCGOG00000020222) dhrs13a.1 (ENSCGOG00000020129) hikeshi (ENSCGOG00000020116) HEATR5A (ENSCGOG00000018946) hectd1 (ENSCGOG00000018233) ap4s1 (ENSCGOG00000018201) strn3 (ENSCGOG00000017733) ccdc65 (ENSCGOG00000017717) g2e3 (ENSCGOG00000017712) scfd1 (ENSCGOG00000016938) coch (ENSCGOG00000016770) ehd4 (ENSCGOG00000015288) ENSCGOG00000015193 PRKD1 (ENSCGOG00000013397) eapp (ENSCGOG00000013361) #22 sptssa (ENSCGOG00000013360) #23 egln3 (ENSCGOG00000013359) NPAS3 (ENSCGOG00000013332) pygl (ENSCGOG00000022761) ENSCGOG00000022727 atl1 (ENSCGOG00000022711) ENSCGOG00000022710 sos2 (ENSCGOG00000022451) cdkn3 (ENSCGOG00000022433) cnih1 (ENSCGOG00000022424) gmfb (ENSCGOG00000022384) lgals3a (ENSCGOG00000022382) synj2bp (ENSCGOG00000022380) ENSCGOG00000022379 srsf5a (ENSCGOG00000022377) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000156646.d ENSGT00940000155599.i.b ENSGT00940000155599.i.a.b ENSGT00390000004056 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00940000168627.e.b ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845.g ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00940000158601 ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT00940000153431.a.v.b #21 ENSGT00530000069038.a.b ENSGT00940000153168.A ENSGT00390000018691.c ENSGT00940000159673 ENSGT00940000177588 ENSGT00940000158836.a.a ENSGT00390000006996 Gilthead seabream MODERN SPECIES 7 dhrs13a.2 (ENSSAUG00010008688) ENSSAUG00010008692 ENSSAUG00010008693 ENSSAUG00010008694 coch (ENSSAUG00010008696) ENSSAUG00010008699 coch (ENSSAUG00010008704) ENSSAUG00010008708 scfd1 (ENSSAUG00010008727) g2e3 (ENSSAUG00010010170) ehd4 (ENSSAUG00010010174) foxg1a (ENSSAUG00010010180) PRKD1 (ENSSAUG00010010251) ENSSAUG00010013363 ENSSAUG00010013366 eapp (ENSSAUG00010013368) #22 sptssa (ENSSAUG00010013370) #23 ENSSAUG00010013388 ENSSAUG00010013394 ENSSAUG00010013395 ENSSAUG00010013396 egln3 (ENSSAUG00010013399) NPAS3 (ENSSAUG00010013408) ENSSAUG00010013449 ENSSAUG00010013451 ENSSAUG00010013453 ENSSAUG00010013458 ENSSAUG00010013460 ENSSAUG00010013462 ENSSAUG00010013464 ENSSAUG00010013466 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000156646.d ENSGT00940000155599.i.b ENSGT00940000155599.i.a.b ENSGT00390000004056 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00940000168627.e.b ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845.g ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00940000158601 ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.a.b.a ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT01060000248778 ENSGT00940000180386 ENSGT00530000069038.a.b ENSGT00940000153168.A ENSGT00390000018691.c ENSGT00940000159673 ENSGT00940000177588 Large yellow croaker MODERN SPECIES 477 ENSLCRG00005014264 ENSLCRG00005014260 ENSLCRG00005013904 GPR135 (ENSLCRG00005013893) jkamp (ENSLCRG00005013891) fam241a (ENSLCRG00005013890) lrit3b (ENSLCRG00005013888) enpep (ENSLCRG00005013775) rrh (ENSLCRG00005013770) ENSLCRG00005013769 dhrs13a.1 (ENSLCRG00005013768) g2e3 (ENSLCRG00005013765) ehd4 (ENSLCRG00005013724) foxg1a (ENSLCRG00005013720) PRKD1 (ENSLCRG00005010588) eapp (ENSLCRG00005010570) #22 sptssa (ENSLCRG00005010569) #23 egln3 (ENSLCRG00005010568) NPAS3 (ENSLCRG00005010444) ENSLCRG00005010431 AKAP6 (ENSLCRG00005010425) ARHGAP5 (ENSLCRG00005010422) nubpl (ENSLCRG00005010148) dhrs13a.2 (ENSLCRG00005010147) DNAL1 (ENSLCRG00005010121) ENSLCRG00005010119 SGPP1 (ENSLCRG00005010118) ENSLCRG00005010117 ENSLCRG00005010116 snapc1b (ENSLCRG00005010114) ccdc88c (ENSLCRG00005009354) European seabass MODERN SPECIES 20 eapp (ENSDLAG00005029016) #22 ENSDLAG00005029801 egln3 (ENSDLAG00005034789) NPAS3 (ENSDLAG00005026335) ENSDLAG00005027050 AKAP6 (ENSDLAG00005031789) ARHGAP5 (ENSDLAG00005020630) ENSDLAG00005002488 ENSDLAG00005015513 ENSDLAG00005013598 ENSDLAG00005003278 ENSDLAG00005018447 ENSDLAG00005033533 c3b.2 (ENSDLAG00005013047) yju2b (ENSDLAG00005034427) ENSDLAG00005012998 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000155599.i.b ENSGT00940000155599.i.a.b ENSGT00390000004056 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00940000168627 ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00940000158601 ENSGT00940000161549.a.a ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT00940000153431.a.v.b #21 ENSGT00530000069038.a.b ENSGT00940000153168.A ENSGT00390000018691.c ENSGT00940000159673 ENSGT00940000177588 ENSGT00940000158836.a.a ENSGT00390000006996 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000155599.i.a.b ENSGT00390000004056 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00940000153804.B ENSGT00940000168627 ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00940000158601 ENSGT00940000161549.a.a ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT01060000248778 ENSGT00530000069038.a.b ENSGT00940000153168.A ENSGT00390000018691.c ENSGT00940000159673 ENSGT00940000177588 ENSGT00940000158836.a.a ENSGT00390000006996 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000155599.i.b ENSGT00940000155599.i.a.b ENSGT00390000004056 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00940000153804.B ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00940000158601 ENSGT00940000161549.a.a ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT01030000234583.a.a.c.b.a.a.b.b ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT00530000069038.a.b ENSGT01060000248778 ENSGT00940000153168.A ENSGT00390000018691.c ENSGT00940000159673 ENSGT00940000158836.a.a ENSGT00390000006996 Climbing perch MODERN SPECIES 13 HEATR5A (ENSATEG00000014961) ENSATEG00000015068 hectd1 (ENSATEG00000015098) ap4s1 (ENSATEG00000015227) strn3 (ENSATEG00000015245) ENSATEG00000015368 coch (ENSATEG00000015389) scfd1 (ENSATEG00000015471) g2e3 (ENSATEG00000015553) ehd4 (ENSATEG00000015573) ENSATEG00000015643 foxg1a (ENSATEG00000016130) ENSATEG00000016142 ENSATEG00000027849 ENSATEG00000025189 eapp (ENSATEG00000016262) #22 sptssa (ENSATEG00000016285) #23 egln3 (ENSATEG00000016315) ENSATEG00000016407 ENSATEG00000016441 ENSATEG00000016454 ENSATEG00000016527 ARHGAP5 (ENSATEG00000016540) NUBPL (ENSATEG00000016572) dtd2 (ENSATEG00000016615) #21 ENSATEG00000016628 ENSATEG00000016643 ENSATEG00000027955 snapc1b (ENSATEG00000016673) ENSATEG00000016687 SGPP1 (ENSATEG00000029823) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 12 ENSBSLG00000011458 slc3a2b (ENSBSLG00000011462) dhrs13a.2 (ENSBSLG00000011472) DHRS13 (ENSBSLG00000011482) hikeshi (ENSBSLG00000011962) ENSBSLG00000012558 hectd1 (ENSBSLG00000012567) ap4s1 (ENSBSLG00000005279) strn3 (ENSBSLG00000005421) coch (ENSBSLG00000005967) scfd1 (ENSBSLG00000005976) g2e3 (ENSBSLG00000006025) ehd4 (ENSBSLG00000006613) foxg1a (ENSBSLG00000007331) ENSBSLG00000007349 eapp (ENSBSLG00000007589) #22 sptssa (ENSBSLG00000007592) #23 ENSBSLG00000007595 egln3 (ENSBSLG00000007597) NPAS3 (ENSBSLG00000007614) ENSBSLG00000007622 ENSBSLG00000007626 ENSBSLG00000007633 brf1a (ENSBSLG00000007640) BTBD6 (ENSBSLG00000007657) ENSBSLG00000007659 ENSBSLG00000007717 ENSBSLG00000007836 esr2b (ENSBSLG00000008098) ENSBSLG00000008389 gphb5 (ENSBSLG00000008453) Zig-zag eel MODERN SPECIES 14 ENSMAMG00000027189 ENSMAMG00000000010 ENSMAMG00000025908 ENSMAMG00000026657 ENSMAMG00000000015 hectd1 (ENSMAMG00000000016) ap4s1 (ENSMAMG00000000017) strn3 (ENSMAMG00000000018) g2e3 (ENSMAMG00000000019) ENSMAMG00000000021 coch (ENSMAMG00000000022) ENSMAMG00000028251 ehd4 (ENSMAMG00000000024) ENSMAMG00000000027 ENSMAMG00000000028 eapp (ENSMAMG00000000029) #22 sptssa (ENSMAMG00000000030) #23 egln3 (ENSMAMG00000000031) ENSMAMG00000026367 NPAS3 (ENSMAMG00000000032) ENSMAMG00000000033 ENSMAMG00000000034 ARHGAP5 (ENSMAMG00000000035) NUBPL (ENSMAMG00000000036) dtd2 (ENSMAMG00000000037) #21 ENSMAMG00000000038 ENSMAMG00000000039 ENSMAMG00000028066 snapc1b (ENSMAMG00000000041) ENSMAMG00000000042 ENSMAMG00000000043 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000155599.i.b ENSGT00940000155599.i.a.b ENSGT00390000004056 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00940000168627 ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00940000158601 ENSGT00940000161549.a.a ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT00940000153431.a.v.b #21 ENSGT00530000069038.a.b ENSGT00940000153168.A ENSGT00390000018691.c ENSGT00940000159673 ENSGT00940000177588 ENSGT00940000158836.a.a ENSGT00390000006996 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT00940000155599.i.b ENSGT00940000155599.i.a.b ENSGT00390000004056 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00940000158601 ENSGT00940000161549.a.a ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 Seriola ANCESTRAL SPECIES 102 ENSGT00940000155599.i.b ENSGT00940000155599.i.a.b ENSGT00390000004056 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00940000158601 ENSGT00940000161549.a.a ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000158051 ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT00390000017666 ENSGT00940000157417 ENSGT00940000154782.d ENSGT01030000234930 ENSGT00940000161442 ENSGT00940000162043 ENSGT00950000183701 ENSGT00390000014940 Greater amberjack MODERN SPECIES 163 HEATR5A (ENSSDUG00000011377) hectd1 (ENSSDUG00000011288) ap4s1 (ENSSDUG00000011269) strn3 (ENSSDUG00000011224) coch (ENSSDUG00000011195) scfd1 (ENSSDUG00000011167) ENSSDUG00000011152 g2e3 (ENSSDUG00000010993) ENSSDUG00000010967 ehd4 (ENSSDUG00000010947) ENSSDUG00000010913 ENSSDUG00000010788 foxg1a (ENSSDUG00000010776) PRKD1 (ENSSDUG00000010737) ENSSDUG00000010718 eapp (ENSSDUG00000010689) #22 sptssa (ENSSDUG00000010684) #23 egln3 (ENSSDUG00000010655) ENSSDUG00000010615 ENSSDUG00000010604 ENSSDUG00000010595 NPAS3 (ENSSDUG00000010568) ENSSDUG00000010558 ARHGAP5 (ENSSDUG00000010523) nubpl (ENSSDUG00000010495) dtd2 (ENSSDUG00000010466) #21 med6 (ENSSDUG00000010442) PCNX1 (ENSSDUG00000010332) lgmn (ENSSDUG00000010301) ENSSDUG00000010298 SSTR1 (ENSSDUG00000010290) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2625 eapp (ENSSLDG00000006745) #22 sptssa (ENSSLDG00000006726) #23 Barramundi perch MODERN SPECIES 43 smim7 (ENSLCAG00010005272) ENSLCAG00010005270 ENSLCAG00010005263 MED26 (ENSLCAG00010005259) slc35e1 (ENSLCAG00010005253) ENSLCAG00010005248 ENSLCAG00010005247 ENSLCAG00010005243 ENSLCAG00010005240 ENSLCAG00010005233 ENSLCAG00010005227 foxg1a (ENSLCAG00010005224) PRKD1 (ENSLCAG00010005162) ENSLCAG00010005141 ENSLCAG00010005136 eapp (ENSLCAG00010005134) #22 sptssa (ENSLCAG00010005131) #23 egln3 (ENSLCAG00010005126) ENSLCAG00010005121 ENSLCAG00010005118 ENSLCAG00010005098 ENSLCAG00010005088 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155369.A.d.a ENSGT00940000155599.i.b ENSGT00390000004056 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00940000168627 ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00940000158601 ENSGT00940000161549.a.a ENSGT00940000160678.a ENSGT00950000183024.a.b.a ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT01060000248778 ENSGT00940000153168.A ENSGT00390000018691.c ENSGT00940000159673 ENSGT00940000158836.a.a ENSGT00390000006996 ENSGT01030000234620.a.b.a ENSGT00940000156540.a Tongue sole MODERN SPECIES hikeshi (ENSCSEG00000011654) hikeshi (ENSCSEG00000011650) HEATR5A (ENSCSEG00000011564) hectd1 (ENSCSEG00000011469) ap4s1 (ENSCSEG00000011445) strn3 (ENSCSEG00000011317) g2e3 (ENSCSEG00000011272) scfd1 (ENSCSEG00000011230) coch (ENSCSEG00000011217) ehd4 (ENSCSEG00000011195) ENSCSEG00000011139 ENSCSEG00000011116 foxg1a (ENSCSEG00000011113) ENSCSEG00000011106 PRKD1 (ENSCSEG00000011076) eapp (ENSCSEG00000011062) #22 sptssa (ENSCSEG00000011058) #23 DCTN1 (ENSCSEG00000010866) ENSCSEG00000010747 ENSCSEG00000010730 ENSCSEG00000010722 SLC39A8 (ENSCSEG00000010711) manba (ENSCSEG00000010694) ube2d3 (ENSCSEG00000010225) ENSCSEG00000010183 CPXM1 (ENSCSEG00000010172) wdr32 (ENSCSEG00000010165) HHIPL2 (ENSCSEG00000010139) marc1 (ENSCSEG00000010115) ENSCSEG00000010110 ezra (ENSCSEG00000010091) Turbot MODERN SPECIES 8 timm9 (ENSSMAG00000035879) arid4a (ENSSMAG00000012268) psma3 (ENSSMAG00000012319) ENSSMAG00000030491 snx6 (ENSSMAG00000012367) cfl2 (ENSSMAG00000012418) BAZ1A (ENSSMAG00000012566) zgc:109986 (ENSSMAG00000012609) ENSSMAG00000002958 ehd4 (ENSSMAG00000002935) ENSSMAG00000026503 foxg1a (ENSSMAG00000022260) ENSSMAG00000030108 ENSSMAG00000035441 ENSSMAG00000026450 eapp (ENSSMAG00000002811) #22 SPTSSA (ENSSMAG00000002830) #23 egln3 (ENSSMAG00000002860) ENSSMAG00000002873 ENSSMAG00000034079 NPAS3 (ENSSMAG00000034084) ENSSMAG00000018689 ENSSMAG00000000960 ARHGAP5 (ENSSMAG00000000757) NUBPL (ENSSMAG00000000795) dtd2 (ENSSMAG00000000833) #21 ENSSMAG00000000840 ENSSMAG00000001071 ENSSMAG00000002079 ENSSMAG00000029463 ENSSMAG00000001974 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 43 hikeshi (ENSHCOG00000021190) hikeshi (ENSHCOG00000021191) ENSHCOG00000021193 ENSHCOG00000021195 ENSHCOG00000021196 ENSHCOG00000021198 ap4s1 (ENSHCOG00000021199) strn3 (ENSHCOG00000021201) ENSHCOG00000021203 coch (ENSHCOG00000021205) scfd1 (ENSHCOG00000021210) g2e3 (ENSHCOG00000021216) ehd4 (ENSHCOG00000021219) foxg1a (ENSHCOG00000021221) ENSHCOG00000021223 eapp (ENSHCOG00000021078) #22 sptssa (ENSHCOG00000021055) #23 NPAS3 (ENSHCOG00000021038) AKAP6 (ENSHCOG00000020979) ARHGAP5 (ENSHCOG00000020862) ENSHCOG00000020841 SYT16 (ENSHCOG00000020828) yipf6 (ENSHCOG00000020816) ENSHCOG00000020810 dtd2 (ENSHCOG00000020804) #21 nubpl (ENSHCOG00000000564) SGPP1 (ENSHCOG00000020754) wdr89 (ENSHCOG00000000560) ppp2r5eb (ENSHCOG00000020734) ENSHCOG00000020691 esr2b (ENSHCOG00000020638) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 14 ENSMMDG00005007598 ENSMMDG00005007596 ENSMMDG00005007592 ENSMMDG00005007591 ENSMMDG00005007588 ENSMMDG00005007586 coch (ENSMMDG00005013041) scfd1 (ENSMMDG00005011578) g2e3 (ENSMMDG00005011443) ENSMMDG00005011431 ENSMMDG00005011424 ehd4 (ENSMMDG00005011421) ENSMMDG00005011411 foxg1a (ENSMMDG00005011409) PRKD1 (ENSMMDG00005010830) eapp (ENSMMDG00005010804) #22 ENSMMDG00005010801 ENSMMDG00005010798 ENSMMDG00005010797 ENSMMDG00005010795 ENSMMDG00005010794 ENSMMDG00005010792 ENSMMDG00005010791 ENSMMDG00005010789 ENSMMDG00005010787 strn3 (ENSMMDG00005010641) hectd1 (ENSMMDG00005010633) HEATR5A (ENSMMDG00005010601) hikeshi (ENSMMDG00005010574) DHRS13 (ENSMMDG00005010194) slc3a2b (ENSMMDG00005010007) Cod MODERN SPECIES 18 ENSGMOG00000006518 ENSGMOG00000006507 ENSGMOG00000031559 ENSGMOG00000014294 ENSGMOG00000006936 ENSGMOG00000022996 HEATR5A (ENSGMOG00000033228) hectd1 (ENSGMOG00000006063) ap4s1 (ENSGMOG00000006133) strn3 (ENSGMOG00000006143) g2e3 (ENSGMOG00000006176) ENSGMOG00000006205 coch (ENSGMOG00000001380) ENSGMOG00000014910 ENSGMOG00000034342 ENSGMOG00000024480 #22 ENSGMOG00000023565 #23 ENSGMOG00000028819 ENSGMOG00000030535 ENSGMOG00000036276 ENSGMOG00000019814 ENSGMOG00000037191 ENSGMOG00000036545 ENSGMOG00000030538 ENSGMOG00000025584 ENSGMOG00000029142 ENSGMOG00000036234 ENSGMOG00000027819 ENSGMOG00000036081 ENSGMOG00000032123 ENSGMOG00000015246 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000160102.f ENSGT00940000156159 ENSGT00550000074912 ENSGT00390000017800 ENSGT00940000162043 ENSGT00940000161150 ENSGT00940000161442 ENSGT01030000234987 ENSGT00390000006916.d.b ENSGT00940000166955 ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B.a ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B.h ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT01100000263524.G.e ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 185 ENSGT00940000160102.f ENSGT00940000156159.k ENSGT00550000074912.ib ENSGT00390000017800 ENSGT00940000162043.c ENSGT00940000161150 ENSGT00940000161442.c ENSGT01030000234987.d ENSGT00390000006916.d.b.a ENSGT00940000166955 ENSGT00550000074824.t ENSGT00390000012799.j ENSGT00940000158135.c ENSGT00950000183000.c.b.i ENSGT00940000154940.k.b ENSGT00390000001332.bb #22 ENSGT00940000167277 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 64 ENSGT00940000160102.f ENSGT00940000156159.k ENSGT00550000074912.ib ENSGT00390000017800 ENSGT00940000162043.c ENSGT00940000161150 ENSGT00940000161442.c ENSGT01030000234987.d ENSGT00390000006916.d.b.a ENSGT00940000166955 ENSGT00550000074824.t ENSGT00390000012799.j ENSGT00940000158135.c ENSGT00950000183000.c.b.i ENSGT00940000154940.k.b ENSGT00390000001332.bb #22 ENSGT00940000167277 Salmo ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000012397 ENSGT00940000165313 ENSGT00940000156159.k ENSGT00550000074912.ib ENSGT00390000017800 ENSGT00940000162043.c ENSGT00940000161150 ENSGT00940000161442.c ENSGT01030000234987.d ENSGT00390000006916.d.b.a ENSGT00550000074824.t ENSGT00390000012799.j ENSGT00940000158135.c ENSGT00950000183000.c.b.i ENSGT00940000154940.k.b ENSGT00390000001332.bb #22 ENSGT00940000167277 ENSGT00940000158051.e ENSGT00810000125473.B.a.a ENSGT00940000154553.a.b.q ENSGT00950000183193.B.h.a ENSGT00940000153431.a.v.a.b #21 ENSGT00390000006205.b.u ENSGT00940000156572.e ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a.d ENSGT00940000159386 ENSGT01100000263524.G.e ENSGT00550000074845.c ENSGT00950000182865.b.a.a.a ENSGT00950000183024.a.b.a.i River trout MODERN SPECIES 26 si:ch211-185a18.2 (ENSSTUG00000050968) ENSSTUG00000050972 arid4a (ENSSTUG00000050977) psma3 (ENSSTUG00000050989) mipol1 (ENSSTUG00000050990) foxa1 (ENSSTUG00000050992) TTC6 (ENSSTUG00000050993) SSTR1 (ENSSTUG00000050996) clec14a (ENSSTUG00000050997) sec23a (ENSSTUG00000050999) srp54 (ENSSTUG00000051000) zgc:109986 (ENSSTUG00000051002) BAZ1A (ENSSTUG00000051004) cfl2 (ENSSTUG00000051005) snx6 (ENSSTUG00000051009) eapp (ENSSTUG00000051050) #22 ENSSTUG00000021292 egln3 (ENSSTUG00000021301) NPAS3 (ENSSTUG00000021327) ENSSTUG00000021899 AKAP6 (ENSSTUG00000021906) ARHGAP5 (ENSSTUG00000021943) nubpl (ENSSTUG00000021955) dtd2 (ENSSTUG00000022064) #21 HEATR5A (ENSSTUG00000022095) hectd1 (ENSSTUG00000022570) ap4s1 (ENSSTUG00000022727) strn3 (ENSSTUG00000022743) coch (ENSSTUG00000022865) opn6b (ENSSTUG00000022884) scfd1 (ENSSTUG00000022919) Atlantic salmon MODERN SPECIES arid4a (ENSSSAG00000036764) ENSSSAG00000095724 psma3 (ENSSSAG00000034990) mipol1 (ENSSSAG00000034734) foxa1 (ENSSSAG00000034634) TTC6 (ENSSSAG00000034160) sstr1 (ENSSSAG00000118561) clec14a (ENSSSAG00000114142) ENSSSAG00000077787 sec23a (ENSSSAG00000077707) ENSSSAG00000118940 SRP54 (ENSSSAG00000077694) BAZ1A (ENSSSAG00000077671) cfl2 (ENSSSAG00000119678) snx6 (ENSSSAG00000077003) eapp (ENSSSAG00000076989) #22 egln3 (ENSSSAG00000076988) NPAS3 (ENSSSAG00000076969) AKAP6 (ENSSSAG00000076953) arhgap5 (ENSSSAG00000076945) ENSSSAG00000120473 NUBPL (ENSSSAG00000076831) dtd2 (ENSSSAG00000076941) #21 HEATR5A (ENSSSAG00000072849) hectd1 (ENSSSAG00000072645) ap4s1 (ENSSSAG00000094718) strn3 (ENSSSAG00000071739) coch (ENSSSAG00000071720) opn6b (ENSSSAG00000071695) scfd1 (ENSSSAG00000071642) g2e3 (ENSSSAG00000071501) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000160102.f ENSGT00940000156159.k ENSGT00550000074912.ib.a ENSGT00390000017800 ENSGT00940000162043.c ENSGT00940000161150 ENSGT00940000161442.c ENSGT01030000234987.d ENSGT00390000006916.d.b.a ENSGT00940000166955 ENSGT00550000074824.t ENSGT00390000012799.j ENSGT00940000158135.c ENSGT00950000183000.c.b.i ENSGT00940000154940.k.b ENSGT00390000001332.bb #22 ENSGT00940000167277 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051.e ENSGT00810000125473.B.a.a ENSGT00940000154553.a.b.q ENSGT00950000183193.B.h ENSGT00940000153431.a.v.a.b #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572.e ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a.d ENSGT00940000159386 ENSGT01100000263524.G.e ENSGT00550000074845.c ENSGT00950000182865.b.a.a.a Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000160102.f ENSGT00940000156159.k ENSGT00550000074912.ib.a ENSGT00390000017800 ENSGT00940000162043.c ENSGT00940000161150 ENSGT00940000161442.c ENSGT01030000234987.d ENSGT00390000006916.d.b.a ENSGT00940000166955 ENSGT00550000074824.t ENSGT00390000012799.j ENSGT00940000158135.c ENSGT00950000183000.c.b.i ENSGT00940000154940.k.b ENSGT00390000001332.bb #22 ENSGT00940000167277 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051.e ENSGT00810000125473.B.a.a ENSGT00940000154553.a.b.q ENSGT00950000183193.B.h ENSGT00940000153431.a.v.a.b #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572.e ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a.d ENSGT00940000159386 ENSGT01100000263524.G.e ENSGT00550000074845.c ENSGT00950000182865.b.a.a.a Chinook salmon DUPLICATION Chinook salmon MODERN SPECIES 2 fbxo34 (ENSOTSG00005014231) ENSOTSG00005014232 dact1 (ENSOTSG00005014234) timm9 (ENSOTSG00005014235) arid4a (ENSOTSG00005014237) psma3 (ENSOTSG00005014241) foxa1 (ENSOTSG00005014260) TTC6 (ENSOTSG00005014261) SSTR1 (ENSOTSG00005014262) clec14a (ENSOTSG00005014263) sec23a (ENSOTSG00005014268) srp54 (ENSOTSG00005014533) BAZ1A (ENSOTSG00005014540) cfl2 (ENSOTSG00005014554) snx6 (ENSOTSG00005014574) eapp (ENSOTSG00005017943) #22 ENSOTSG00005017945 egln3 (ENSOTSG00005017947) NPAS3 (ENSOTSG00005017950) ENSOTSG00005017953 C14orf132 (ENSOTSG00005017956) BDKRB2 (ENSOTSG00005017959) ENSOTSG00005017961 ENSOTSG00005017962 kcnk10b (ENSOTSG00005017964) PTPN21 (ENSOTSG00005017977) zgc:100868 (ENSOTSG00005018003) fam98b (ENSOTSG00005018013) spred1 (ENSOTSG00005018014) ENSOTSG00005018016 cdin1 (ENSOTSG00005018418) Chinook salmon MODERN SPECIES 46 ENSOTSG00005034729 dact1 (ENSOTSG00005034730) si:ch211-185a18.2 (ENSOTSG00005034733) timm9 (ENSOTSG00005034734) arid4a (ENSOTSG00005034737) psma3 (ENSOTSG00005034746) foxa1 (ENSOTSG00005034751) TTC6 (ENSOTSG00005034752) SSTR1 (ENSOTSG00005034753) clec14a (ENSOTSG00005034754) sec23a (ENSOTSG00005034756) srp54 (ENSOTSG00005035151) BAZ1A (ENSOTSG00005035155) cfl2 (ENSOTSG00005035205) snx6 (ENSOTSG00005035207) eapp (ENSOTSG00005039068) #22 ENSOTSG00005039070 egln3 (ENSOTSG00005039071) NPAS3 (ENSOTSG00005039072) ENSOTSG00005039073 negr1 (ENSOTSG00005039076) vtg3 (ENSOTSG00005039078) ADGRL2 (ENSOTSG00005039110) ENSOTSG00005042779 ttll7 (ENSOTSG00005042783) ENSOTSG00005043367 ctbs (ENSOTSG00005043822) SPATA1 (ENSOTSG00005043823) ENSOTSG00005043828 SSX2IP (ENSOTSG00005043829) ENSOTSG00005033620 Coho salmon MODERN SPECIES 27 ENSOKIG00005007496 arid4a (ENSOKIG00005007553) mipol1 (ENSOKIG00005008028) PSMA3 (ENSOKIG00005008061) foxa1 (ENSOKIG00005008090) TTC6 (ENSOKIG00005008113) SSTR1 (ENSOKIG00005008212) clec14a (ENSOKIG00005008219) sec23a (ENSOKIG00005008259) ENSOKIG00005008512 srp54 (ENSOKIG00005008527) zgc:109986 (ENSOKIG00005008601) BAZ1A (ENSOKIG00005008685) cfl2 (ENSOKIG00005008698) snx6 (ENSOKIG00005008760) eapp (ENSOKIG00005009407) #22 ENSOKIG00005009419 egln3 (ENSOKIG00005009425) NPAS3 (ENSOKIG00005009455) ENSOKIG00005009846 ARHGAP5 (ENSOKIG00005009866) nubpl (ENSOKIG00005009896) dtd2 (ENSOKIG00005010002) #21 HEATR5A (ENSOKIG00005010129) hectd1 (ENSOKIG00005010612) ap4s1 (ENSOKIG00005010660) strn3 (ENSOKIG00005010765) coch (ENSOKIG00005012823) opn6b (ENSOKIG00005013084) scfd1 (ENSOKIG00005013130) g2e3 (ENSOKIG00005013265) Rainbow trout MODERN SPECIES 10 ENSOMYG00000036554 arid4a (ENSOMYG00000036662) psma3 (ENSOMYG00000036901) mipol1 (ENSOMYG00000036864) ENSOMYG00000066785 foxa1 (ENSOMYG00000036917) TTC6 (ENSOMYG00000036934) SSTR1 (ENSOMYG00000036963) clec14a (ENSOMYG00000036972) sec23a (ENSOMYG00000037008) ENSOMYG00000019205 SRP54 (ENSOMYG00000037073) ENSOMYG00000037104 cfl2 (ENSOMYG00000037113) snx6 (ENSOMYG00000037313) eapp (ENSOMYG00000038851) #22 ENSOMYG00000038878 egln3 (ENSOMYG00000038907) NPAS3 (ENSOMYG00000038938) AKAP6 (ENSOMYG00000038985) ARHGAP5 (ENSOMYG00000035067) NUBPL (ENSOMYG00000035080) dtd2 (ENSOMYG00000035093) #21 HEATR5A (ENSOMYG00000035291) hectd1 (ENSOMYG00000035713) ap4s1 (ENSOMYG00000035925) strn3 (ENSOMYG00000036019) coch (ENSOMYG00000036724) opn6b (ENSOMYG00000036731) scfd1 (ENSOMYG00000036822) ENSOMYG00000059713 Huchen MODERN SPECIES 195 ENSHHUG00000025207 gdf11 (ENSHHUG00000025209) ENSHHUG00000025274 ENSHHUG00000025279 ENSHHUG00000025282 TMBIM6 (ENSHHUG00000025286) avil (ENSHHUG00000025364) ENSHHUG00000025824 sec23a (ENSHHUG00000025893) srp54 (ENSHHUG00000025963) zgc:109986 (ENSHHUG00000025995) BAZ1A (ENSHHUG00000026005) cfl2 (ENSHHUG00000026014) snx6 (ENSHHUG00000026024) eapp (ENSHHUG00000026393) #22 ENSHHUG00000026406 egln3 (ENSHHUG00000026409) NPAS3 (ENSHHUG00000026414) ENSHHUG00000026444 ENSHHUG00000026450 ARHGAP5 (ENSHHUG00000026454) nubpl (ENSHHUG00000026460) dtd2 (ENSHHUG00000026549) #21 HEATR5A (ENSHHUG00000026563) hectd1 (ENSHHUG00000026608) ap4s1 (ENSHHUG00000026630) strn3 (ENSHHUG00000026639) opn6b (ENSHHUG00000026663) scfd1 (ENSHHUG00000026674) g2e3 (ENSHHUG00000026721) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 125 ENSGT00940000159561.k ENSGT00390000011854.b ENSGT00530000064222.b.j ENSGT00950000183181.B.a.c ENSGT00940000156159.l ENSGT00550000074912.hb ENSGT00940000162043.d ENSGT00940000161442.d ENSGT01030000234987.c ENSGT00390000006916.d.b.b ENSGT00550000074824.s ENSGT00390000012799.i ENSGT00940000158135.d ENSGT00950000183000.c.b.j ENSGT00940000154940.k.a ENSGT00390000001332.cb #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051.e ENSGT00810000125473.B.a.a ENSGT00940000154553.a.b.q ENSGT00950000183193.B.h ENSGT00940000153431.a.v.a.b #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572.e ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a.d ENSGT00940000159386 ENSGT01100000263524.G.e ENSGT00550000074845.c ENSGT00950000182865.b.a.a.a Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000165169.b.b.d.b ENSGT00950000183181.B.a.c ENSGT00940000162596 ENSGT00940000160102.e ENSGT00940000156159.l ENSGT00550000074912.hb ENSGT00940000162043.d ENSGT00940000161442.d ENSGT01030000234987.c ENSGT00390000006916.d.b.b ENSGT00550000074824.s ENSGT00390000012799.i ENSGT00940000158135.d ENSGT00950000183000.c.b.j ENSGT00940000154940.k.a ENSGT00390000001332.cb #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051.e ENSGT00810000125473.B.a.a ENSGT00940000154553.a.b.q ENSGT00950000183193.B.h ENSGT00940000153431.a.v.a.b #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572.e ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a.d ENSGT00940000159386 ENSGT01100000263524.G.e ENSGT00550000074845.c ENSGT00950000182865.b.a.a.a Salmo ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00530000064222.b.j ENSGT00940000165169.b.b.d.b ENSGT00950000183181.B.a.c ENSGT00940000160102.e ENSGT00940000156159.l ENSGT00550000074912.hb ENSGT00940000162043.d ENSGT00940000161442.d ENSGT01030000234987.c ENSGT00390000006916.d.b.b ENSGT00550000074824.s ENSGT00390000012799.i ENSGT00940000158135.d ENSGT00950000183000.c.b.j ENSGT00940000154940.k.a ENSGT00390000001332.cb #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051.f ENSGT00810000125473.B.a.b ENSGT00990000211844 ENSGT00940000154553.a.b.r ENSGT00950000183193.B.h.b ENSGT00940000153431.a.v.a.a #21 ENSGT00390000006205.b.v ENSGT00940000156572.f ENSGT01060000249637 ENSGT00950000183095.a.b.a.a.c ENSGT00550000074845.d ENSGT00950000182865.b.a.a.b ENSGT00950000183024.a.b.a.j River trout MODERN SPECIES 17 ENSSTUG00000030484 timm9 (ENSSTUG00000030497) arid4a (ENSSTUG00000030518) psma3 (ENSSTUG00000030918) foxa1 (ENSSTUG00000030937) SSTR1 (ENSSTUG00000030944) clec14a (ENSSTUG00000030946) sec23a (ENSSTUG00000030966) srp54 (ENSSTUG00000031042) zgc:109986 (ENSSTUG00000031062) BAZ1A (ENSSTUG00000031073) cfl2 (ENSSTUG00000003466) ENSSTUG00000003479 ENSSTUG00000003482 snx6 (ENSSTUG00000003540) eapp (ENSSTUG00000004768) #22 sptssa (ENSSTUG00000004789) #23 EGLN3 (ENSSTUG00000004808) NPAS3 (ENSSTUG00000004837) AKAP6 (ENSSTUG00000004966) ENSSTUG00000005016 ARHGAP5 (ENSSTUG00000005053) nubpl (ENSSTUG00000005061) dtd2 (ENSSTUG00000005093) #21 ENSSTUG00000005099 hectd1 (ENSSTUG00000005169) ENSSTUG00000006222 strn3 (ENSSTUG00000006262) scfd1 (ENSSTUG00000007165) g2e3 (ENSSTUG00000007558) ENSSTUG00000007590 Atlantic salmon MODERN SPECIES 28 atg14 (ENSSSAG00000114319) fbxo34 (ENSSSAG00000103562) ENSSSAG00000071455 DACT1 (ENSSSAG00000071445) arid4a (ENSSSAG00000071199) PSMA3 (ENSSSAG00000071166) ENSSSAG00000117079 foxa1 (ENSSSAG00000071160) SSTR1 (ENSSSAG00000101610) clec14a (ENSSSAG00000071151) sec23a (ENSSSAG00000071046) srp54 (ENSSSAG00000071013) BAZ1A (ENSSSAG00000070981) cfl2 (ENSSSAG00000070963) snx6 (ENSSSAG00000070077) eapp (ENSSSAG00000070043) #22 EGLN3 (ENSSSAG00000091105) NPAS3 (ENSSSAG00000069230) AKAP6 (ENSSSAG00000069193) ENSSSAG00000088484 ARHGAP5 (ENSSSAG00000069185) NUBPL (ENSSSAG00000069171) dtd2 (ENSSSAG00000069166) #21 ENSSSAG00000066854 ENSSSAG00000064401 scfd1 (ENSSSAG00000064292) ENSSSAG00000064280 PRKD1 (ENSSSAG00000062230) ENSSSAG00000095362 EHD4 (ENSSSAG00000061846) traf3 (ENSSSAG00000098239) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000157224.ab ENSGT00950000183181.B.a.c ENSGT00940000162596 ENSGT01000000222075 ENSGT00940000156159.l ENSGT00550000074912.hb ENSGT00940000162043.d ENSGT00940000161442.d ENSGT01030000234987.c ENSGT00390000006916.d.b.b ENSGT00550000074824.s ENSGT00390000012799.i ENSGT00940000158135.d ENSGT00950000183000.c.b.j ENSGT00940000154940.k.a ENSGT00390000001332.cb #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158051.f ENSGT00810000125473.B.a.b ENSGT00940000154553.a.b.r ENSGT00940000153431.a.v.a.a #21 ENSGT00940000156572.f ENSGT00990000212923 ENSGT00950000183095.a.b.a.a.c ENSGT00550000074845.d ENSGT00950000182865.b.a.a.b ENSGT00950000183024.a.b.a.j ENSGT00940000160678.a.mc ENSGT00940000158601.g ENSGT00940000163836.b.c ENSGT00940000155654.x Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00940000157224.ab ENSGT00950000183181.B.a.c ENSGT00940000162596 ENSGT01000000222075 ENSGT00940000156159.l ENSGT00550000074912.hb ENSGT00940000162043.d ENSGT00940000161442.d ENSGT01030000234987.c ENSGT00390000006916.d.b.b ENSGT00550000074824.s ENSGT00390000012799.i ENSGT00940000166431 ENSGT00950000183000.c.b.j ENSGT00940000154940.k.a ENSGT00390000001332.cb #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00810000125473.B.a.b ENSGT00940000154553.a.b.r ENSGT00940000153431.a.v.a.a #21 ENSGT00940000156572.f ENSGT00990000212923 ENSGT00950000183095.a.b.a.a.c ENSGT00550000074845.d ENSGT00950000182865.b.a.a.b ENSGT00950000183024.a.b.a.j ENSGT00940000160678.a.mc ENSGT00940000158601.g ENSGT00940000163836.b.c ENSGT00940000155654.x ENSGT00390000018116.d Chinook salmon MODERN SPECIES 32 LGALS3 (ENSOTSG00005001168) dact1 (ENSOTSG00005001161) irf2bpl (ENSOTSG00005001159) ENSOTSG00005001156 arid4a (ENSOTSG00005000933) psma3 (ENSOTSG00005000793) foxa1 (ENSOTSG00005012905) SSTR1 (ENSOTSG00005012904) clec14a (ENSOTSG00005012903) sec23a (ENSOTSG00005012901) srp54 (ENSOTSG00005012900) zgc:109986 (ENSOTSG00005012899) ENSOTSG00005012898 cfl2 (ENSOTSG00005012897) snx6 (ENSOTSG00005011088) eapp (ENSOTSG00005011075) #22 sptssa (ENSOTSG00005011072) #23 EGLN3 (ENSOTSG00005011070) crlf3 (ENSOTSG00005011033) ENSOTSG00005011020 AKAP6 (ENSOTSG00005011018) ARHGAP5 (ENSOTSG00005011013) dtd2 (ENSOTSG00005011010) #21 hectd1 (ENSOTSG00005010985) ENSOTSG00005010980 strn3 (ENSOTSG00005010801) scfd1 (ENSOTSG00005010394) g2e3 (ENSOTSG00005010384) PRKD1 (ENSOTSG00005009868) foxg1a (ENSOTSG00005009863) ehd4 (ENSOTSG00005009861) Coho salmon MODERN SPECIES 5 ENSOKIG00005050333 dact1 (ENSOKIG00005050336) irf2bpl (ENSOKIG00005050344) ENSOKIG00005050347 arid4a (ENSOKIG00005050352) psma3 (ENSOKIG00005050365) foxa1 (ENSOKIG00005050373) SSTR1 (ENSOKIG00005012773) clec14a (ENSOKIG00005012778) sec23a (ENSOKIG00005012806) srp54 (ENSOKIG00005012863) zgc:109986 (ENSOKIG00005012891) ENSOKIG00005012901 cfl2 (ENSOKIG00005012912) snx6 (ENSOKIG00005012994) eapp (ENSOKIG00005014524) #22 sptssa (ENSOKIG00005014576) #23 EGLN3 (ENSOKIG00005014584) NPAS3 (ENSOKIG00005014602) ENSOKIG00005014648 ENSOKIG00005014657 ENSOKIG00005014674 ENSOKIG00005014679 ARHGAP5 (ENSOKIG00005014684) DTD2 (ENSOKIG00005014696) #21 HECTD1 (ENSOKIG00005014742) ENSOKIG00005014878 ENSOKIG00005014995 scfd1 (ENSOKIG00005016995) g2e3 (ENSOKIG00005017163) PRKD1 (ENSOKIG00005017209) Rainbow trout MODERN SPECIES 17 ENSOMYG00000062140 irf2bpl (ENSOMYG00000019953) ENSOMYG00000019944 arid4a (ENSOMYG00000019447) psma3 (ENSOMYG00000019274) foxa1 (ENSOMYG00000019247) SSTR1 (ENSOMYG00000050236) clec14a (ENSOMYG00000019213) ENSOMYG00000071644 sec23a (ENSOMYG00000019011) srp54 (ENSOMYG00000018934) zgc:109986 (ENSOMYG00000018928) BAZ1A (ENSOMYG00000018919) cfl2 (ENSOMYG00000018883) snx6 (ENSOMYG00000018567) eapp (ENSOMYG00000018508) #22 sptssa (ENSOMYG00000018485) #23 EGLN3 (ENSOMYG00000018467) NPAS3 (ENSOMYG00000018350) AKAP6 (ENSOMYG00000018315) ENSOMYG00000018305 ARHGAP5 (ENSOMYG00000018282) ENSOMYG00000053457 ENSOMYG00000018274 ENSOMYG00000018257 ENSOMYG00000018080 ENSOMYG00000063478 ENSOMYG00000017695 ENSOMYG00000075078 scfd1 (ENSOMYG00000017079) g2e3 (ENSOMYG00000016900) Huchen MODERN SPECIES 1576 foxa1 (ENSHHUG00000050562) SSTR1 (ENSHHUG00000050565) clec14a (ENSHHUG00000050567) sec23a (ENSHHUG00000050571) srp54 (ENSHHUG00000050638) zgc:109986 (ENSHHUG00000050657) BAZ1A (ENSHHUG00000050667) cfl2 (ENSHHUG00000050672) snx6 (ENSHHUG00000050678) eapp (ENSHHUG00000050869) #22 sptssa (ENSHHUG00000050870) #23 EGLN3 (ENSHHUG00000050874) NPAS3 (ENSHHUG00000050875) Northern pike MODERN SPECIES 14 si:ch211-185a18.2 (ENSELUG00000003051) timm9 (ENSELUG00000003059) arid4a (ENSELUG00000003087) psma3 (ENSELUG00000003123) mipol1 (ENSELUG00000003145) foxa1 (ENSELUG00000003158) ENSELUG00000003227 SSTR1 (ENSELUG00000003269) clec14a (ENSELUG00000003274) sec23a (ENSELUG00000003344) srp54 (ENSELUG00000003395) zgc:109986 (ENSELUG00000003420) BAZ1A (ENSELUG00000003446) cfl2 (ENSELUG00000003457) snx6 (ENSELUG00000003469) eapp (ENSELUG00000003487) #22 sptssa (ENSELUG00000003498) #23 egln3 (ENSELUG00000003505) NPAS3 (ENSELUG00000003567) AKAP6 (ENSELUG00000003612) ENSELUG00000032036 ARHGAP5 (ENSELUG00000003636) nubpl (ENSELUG00000003661) dtd2 (ENSELUG00000032184) #21 HEATR5A (ENSELUG00000003720) hectd1 (ENSELUG00000003779) ap4s1 (ENSELUG00000003800) strn3 (ENSELUG00000003868) coch (ENSELUG00000003893) opn6b (ENSELUG00000003930) scfd1 (ENSELUG00000004003) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000017800 ENSGT00940000162043 ENSGT00950000185018 ENSGT00940000161150 ENSGT00940000161442 ENSGT01030000234987 ENSGT00390000006916.d.b ENSGT00940000166955 ENSGT00390000006916.d.a.b ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000166431 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00390000003866.a.a.f ENSGT00530000064271 ENSGT00940000157388.b.b ENSGT00940000155704 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT01060000249969 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000156269.a.a ENSGT00940000155879 ENSGT00390000017800 ENSGT00940000162043 ENSGT00940000161150 ENSGT00940000161442 ENSGT01030000234987 ENSGT00940000166602.A ENSGT00390000006916.d.b ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000166431 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00390000003866.a.a.f ENSGT00530000064271 ENSGT00940000157388.b.b ENSGT00940000155704 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000158045.b ENSGT01020000230346.C.q.b ENSGT00510000050935 ENSGT00940000160188 ENSGT00390000014797 ENSGT00940000175884 ENSGT00940000154430.c.b Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000155879 ENSGT00390000017800 ENSGT00940000162043 ENSGT00940000161150 ENSGT00940000161442 ENSGT01030000234987 ENSGT00940000166602.A ENSGT00390000006916.d.a.a ENSGT00390000006916.d.a.b ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000166431 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000170208 ENSGT00940000157388.b.b ENSGT00940000155704 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000158045.b ENSGT01020000230346.C.q.b ENSGT00510000050935.b ENSGT00510000050935.a ENSGT00940000160188 ENSGT00390000014797 ENSGT00940000175884 ENSGT00940000154430.c.b Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00550000074824.r ENSGT00390000012799.a ENSGT00940000166431.b ENSGT00950000183000.c.b.h.a ENSGT00940000154940.a ENSGT00390000017800.g ENSGT00940000162043.a ENSGT00940000161442.a ENSGT01030000234987.b ENSGT00390000006916.d.a.b.d ENSGT00550000074824.q ENSGT00390000012799.b ENSGT00940000166431.a ENSGT00950000183000.c.b.h.b ENSGT00940000154940.b ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745.k.a ENSGT00940000155704.jb ENSGT00940000158745.k.b ENSGT00940000158051.d ENSGT00810000125473.B.f ENSGT00940000158045.b.c ENSGT01000000220214 ENSGT00510000050935.a.b.a.b ENSGT00510000050935.a.a.b ENSGT00940000160188.f ENSGT00390000014797.l ENSGT00940000175884 ENSGT00940000171352.e ENSGT00390000004700.b.d Goldfish DUPLICATION Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 36 zgc:109986 (ENSCARG00000054794) ENSCARG00000054778 arid4a (ENSCARG00000054624) timm9 (ENSCARG00000054587) irf2bpl (ENSCARG00000054578) nfkbiab (ENSCARG00000054536) psma6a (ENSCARG00000054213) PRORP (ENSCARG00000054159) ppp2r3c (ENSCARG00000054097) ENSCARG00000054090 stx11a (ENSCARG00000054084) ENSCARG00000054060 ENSCARG00000053961 cfl2 (ENSCARG00000053893) snx6 (ENSCARG00000050955) eapp (ENSCARG00000050839) #22 sptssa (ENSCARG00000050830) #23 ENSCARG00000050809 NPAS3 (ENSCARG00000050748) khk (ENSCARG00000050736) ENSCARG00000050677 gpn1 (ENSCARG00000050537) foxa1 (ENSCARG00000050517) SSTR1 (ENSCARG00000050498) clec14a (ENSCARG00000050488) zranb1b (ENSCARG00000050435) nkl.2 (ENSCARG00000050424) ENSCARG00000050339 tonsl (ENSCARG00000049958) EDRF1 (ENSCARG00000048779) ctbp2a (ENSCARG00000047656) Goldfish MODERN SPECIES 36 ENSCARG00000054060 stx11a (ENSCARG00000054084) ENSCARG00000054090 ppp2r3c (ENSCARG00000054097) PRORP (ENSCARG00000054159) psma6a (ENSCARG00000054213) nfkbiab (ENSCARG00000054536) irf2bpl (ENSCARG00000054578) timm9 (ENSCARG00000054587) arid4a (ENSCARG00000054624) ENSCARG00000054778 zgc:109986 (ENSCARG00000054794) ENSCARG00000054846 cfl2 (ENSCARG00000055139) snx6 (ENSCARG00000055222) eapp (ENSCARG00000055860) #22 sptssa (ENSCARG00000055904) #23 egln3 (ENSCARG00000055921) pnn (ENSCARG00000055972) gemin2 (ENSCARG00000056217) cdc5l (ENSCARG00000056447) supt3h (ENSCARG00000056555) ENSCARG00000056656 Goldfish MODERN SPECIES 8 ENSCARG00000032988 mgaa (ENSCARG00000033014) tyro3 (ENSCARG00000033161) mipol1 (ENSCARG00000035445) foxa1 (ENSCARG00000035464) ENSCARG00000035470 clec14a (ENSCARG00000035522) SSTR1 (ENSCARG00000035529) sec23a (ENSCARG00000035551) ENSCARG00000035835 srp54 (ENSCARG00000035849) zgc:109986 (ENSCARG00000035883) ENSCARG00000035944 cfl2 (ENSCARG00000036186) snx6 (ENSCARG00000036262) eapp (ENSCARG00000038191) #22 egln3 (ENSCARG00000038218) NPAS3 (ENSCARG00000038321) AKAP6 (ENSCARG00000038897) zranb1b (ENSCARG00000038942) psmc1a (ENSCARG00000039024) ENSCARG00000039498 nkl.2 (ENSCARG00000039502) nkl.2 (ENSCARG00000039519) ENSCARG00000039524 ENSCARG00000039532 ENSCARG00000039539 ENSCARG00000039559 ENSCARG00000039568 EDRF1 (ENSCARG00000039593) ctbp2a (ENSCARG00000039685) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 108 ENSGT00940000164564.f.a.m ENSGT01030000234534.A.d.a ENSGT00940000156269.a.a.b ENSGT00940000155879.i ENSGT00390000017800.h ENSGT00940000162043.b ENSGT00940000161150 ENSGT00940000161442.b ENSGT01030000234987.a ENSGT00390000006916.d.a.b.c ENSGT00550000074824.r ENSGT00390000012799.a ENSGT00940000166431.b ENSGT00950000183000.c.b.h.a ENSGT00940000154940.b ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00940000158745.k.b ENSGT00940000158051.d ENSGT00810000125473.B.f ENSGT00940000158045.b.c ENSGT01020000230346.C.q.b.b ENSGT00510000050935.b.a.a.a ENSGT01000000220214 ENSGT00510000050935.a.b.a.b ENSGT00510000050935.a.a.b ENSGT00940000160188.f ENSGT00390000014797.l ENSGT00940000175884 ENSGT00940000171352.e ENSGT00390000004700.b.d ENSGT00940000156491.a.c.a.b Common carp reference MODERN SPECIES 30 ENSCCRG00000003163 ENSCCRG00000030069 mgaa (ENSCCRG00000030063) tyro3 (ENSCCRG00000013786) mipol1 (ENSCCRG00000082052) foxa1 (ENSCCRG00000061117) SSTR1 (ENSCCRG00000067950) clec14a (ENSCCRG00000013828) sec23a (ENSCCRG00000055148) ENSCCRG00000057404 srp54 (ENSCCRG00000022851) zgc:109986 (ENSCCRG00000022858) ENSCCRG00000022898 cfl2 (ENSCCRG00000078087) snx6 (ENSCCRG00000038863) eapp (ENSCCRG00000066018) #22 egln3 (ENSCCRG00000021591) NPAS3 (ENSCCRG00000023602) AKAP6 (ENSCCRG00000058966) zranb1b (ENSCCRG00000025422) psmc1a (ENSCCRG00000025380) nkl.2 (ENSCCRG00000075616) ENSCCRG00000036841 ENSCCRG00000069426 ENSCCRG00000074338 ENSCCRG00000035978 nkl.2 (ENSCCRG00000025414) ENSCCRG00000057207 ENSCCRG00000005827 tex36 (ENSCCRG00000039127) ENSCCRG00000063832 Golden-line barbel MODERN SPECIES 4895 eapp (ENSSGRG00000002820) #22 Zebrafish MODERN SPECIES 8 mgaa (ENSDARG00000078784) tyro3 (ENSDARG00000005356) mipol1 (ENSDARG00000104845) foxa1 (ENSDARG00000102138) TTC6 (ENSDARG00000104125) SSTR1 (ENSDARG00000104922) clec14a (ENSDARG00000103533) ENSDARG00000104695 sec23a (ENSDARG00000104230) srp54 (ENSDARG00000098367) zgc:109986 (ENSDARG00000102608) ENSDARG00000099745 ENSDARG00000063233 cfl2 (ENSDARG00000014106) snx6 (ENSDARG00000058444) eapp (ENSDARG00000017272) #22 sptssa (ENSDARG00000071203) #23 egln3 (ENSDARG00000032553) NPAS3 (ENSDARG00000109820) AKAP6 (ENSDARG00000077295) zranb1b (ENSDARG00000063190) psmc1a (ENSDARG00000030537) nkl.2 (ENSDARG00000058673) nkl.3 (ENSDARG00000089202) nkl.4 (ENSDARG00000044023) tonsl (ENSDARG00000071294) EDRF1 (ENSDARG00000019834) tex36 (ENSDARG00000097920) ctbp2a (ENSDARG00000044062) ENSDARG00000090072 ENSDARG00000103562 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01030000234534.A.d ENSGT00940000156269.a.a ENSGT00940000155879 ENSGT00390000017800 ENSGT00940000162043 ENSGT00940000161150 ENSGT00940000161442 ENSGT01030000234987 ENSGT00940000166602.A ENSGT00390000006916.d.b ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000158045.b ENSGT01020000230346.C.q.b ENSGT00510000050935.c ENSGT00940000160188 ENSGT00390000014797 ENSGT00940000175884 ENSGT00940000157135 ENSGT00940000156593.pc.a ENSGT00390000001610.d.h.a ENSGT00940000159075.C ENSGT00940000176979 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT01030000234534.A.d ENSGT00940000156269.a.a ENSGT00940000155879 ENSGT00390000017800 ENSGT00940000162043 ENSGT00940000161150 ENSGT00940000161442 ENSGT01030000234987 ENSGT00940000166602.A ENSGT00390000006916.d.b ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000158045.b ENSGT01020000230346.C.q.b ENSGT00510000050935.d ENSGT00510000050935.c.a ENSGT00940000160188 ENSGT00390000014797 ENSGT00940000175884 ENSGT00940000157135 ENSGT00940000156593.pc.a ENSGT00390000001610.d.h.a ENSGT00940000159075.C Characoidei ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT01030000234534.A.d ENSGT00940000156269.a.a ENSGT00940000155879 ENSGT00390000017800 ENSGT00940000162043 ENSGT00940000161150 ENSGT00940000161442 ENSGT01030000234987 ENSGT00940000166602.A ENSGT00390000006916.d.b ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000166431 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000158045.b ENSGT01020000230346.C.q.b ENSGT00510000050935.d ENSGT00510000050935.c.a ENSGT00940000160188 ENSGT00390000014797 ENSGT00940000175884 ENSGT00940000157135 ENSGT00940000156593.pc.a ENSGT00390000001610.d.h.a ENSGT00940000159075.C Red-bellied piranha MODERN SPECIES 64 ENSPNAG00000000884 mgaa (ENSPNAG00000000905) tyro3 (ENSPNAG00000008345) mipol1 (ENSPNAG00000000920) foxa1 (ENSPNAG00000008357) clec14a (ENSPNAG00000000929) SSTR1 (ENSPNAG00000008364) TTC6 (ENSPNAG00000001025) ENSPNAG00000001033 sec23a (ENSPNAG00000008514) srp54 (ENSPNAG00000008544) zgc:109986 (ENSPNAG00000008554) ENSPNAG00000005544 cfl2 (ENSPNAG00000005324) snx6 (ENSPNAG00000008607) eapp (ENSPNAG00000008614) #22 sptssa (ENSPNAG00000001126) #23 egln3 (ENSPNAG00000008631) NPAS3 (ENSPNAG00000008664) AKAP6 (ENSPNAG00000001159) zranb1b (ENSPNAG00000008717) psmc1a (ENSPNAG00000008732) ENSPNAG00000008747 ENSPNAG00000001179 ENSPNAG00000008758 ENSPNAG00000008764 tonsl (ENSPNAG00000008839) EDRF1 (ENSPNAG00000008907) tex36 (ENSPNAG00000008934) vcpkmt (ENSPNAG00000001259) arf6b (ENSPNAG00000008989) Mexicana tetra MODERN SPECIES 24 ENSAMXG00000000319 ENSAMXG00000034478 tyro3 (ENSAMXG00000000312) mipol1 (ENSAMXG00000034555) foxa1 (ENSAMXG00000040223) TTC6 (ENSAMXG00000000300) SSTR1 (ENSAMXG00000025379) clec14a (ENSAMXG00000029965) ENSAMXG00000029727 sec23a (ENSAMXG00000002897) srp54 (ENSAMXG00000032669) zgc:109986 (ENSAMXG00000002860) ENSAMXG00000002816 cfl2 (ENSAMXG00000038329) snx6 (ENSAMXG00000002762) eapp (ENSAMXG00000032957) #22 sptssa (ENSAMXG00000039032) #23 egln3 (ENSAMXG00000002702) NPAS3 (ENSAMXG00000007972) ENSAMXG00000007996 zranb1b (ENSAMXG00000008009) psmc1a (ENSAMXG00000008023) ENSAMXG00000008038 ENSAMXG00000042375 tonsl (ENSAMXG00000008066) ENSAMXG00000031618 tex36 (ENSAMXG00000038344) vcpkmt (ENSAMXG00000008118) arf6b (ENSAMXG00000025904) aspg (ENSAMXG00000008130) KIF26A (ENSAMXG00000008141) Electric eel MODERN SPECIES 198 ENSEEEG00000004303 mgaa (ENSEEEG00000004309) tyro3 (ENSEEEG00000004312) mipol1 (ENSEEEG00000004317) foxa1 (ENSEEEG00000004320) ENSEEEG00000004324 SSTR1 (ENSEEEG00000004331) clec14a (ENSEEEG00000004332) sec23a (ENSEEEG00000004336) ENSEEEG00000004366 srp54 (ENSEEEG00000004368) zgc:109986 (ENSEEEG00000004371) BAZ1A (ENSEEEG00000004373) cfl2 (ENSEEEG00000004375) snx6 (ENSEEEG00000004394) eapp (ENSEEEG00000004749) #22 ENSEEEG00000004751 sptssa (ENSEEEG00000004752) #23 ENSEEEG00000004756 NPAS3 (ENSEEEG00000004757) Channel catfish MODERN SPECIES 28 jmjd7 (ENSIPUG00000001797) ENSIPUG00000001765 mgaa (ENSIPUG00000001641) tyro3 (ENSIPUG00000001585) mipol1 (ENSIPUG00000001554) foxa1 (ENSIPUG00000001537) sstr1 (ENSIPUG00000001536) CLEC14A (ENSIPUG00000001526) ENSIPUG00000001512 sec23a (ENSIPUG00000001462) srp54 (ENSIPUG00000001420) zgc:109986 (ENSIPUG00000001412) baz1a (ENSIPUG00000001305) CFL2 (ENSIPUG00000001293) SNX6 (ENSIPUG00000001204) eapp (ENSIPUG00000001140) #22 sptssa (ENSIPUG00000001121) #23 egln3 (ENSIPUG00000001099) npas3 (ENSIPUG00000001060) AKAP6 (ENSIPUG00000001037) zranb1b (ENSIPUG00000000984) Psmc1 (ENSIPUG00000000956) ENSIPUG00000000939 ENSIPUG00000000937 ENSIPUG00000000924 ENSIPUG00000000912 tonsl (ENSIPUG00000000901) edrf1 (ENSIPUG00000000846) CKB (ENSIPUG00000000834) tex36 (ENSIPUG00000000825) VCPKMT (ENSIPUG00000000816) Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000156159 ENSGT00550000074912 ENSGT00390000017800 ENSGT00940000162043 ENSGT00950000185018 ENSGT00940000161150 ENSGT00940000161442 ENSGT01030000234987 ENSGT00390000006916.d.b ENSGT00940000166955 ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a.v.a #21 ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000156837 ENSGT00520000055955 ENSGT00940000155548 ENSGT00950000182900.A.b ENSGT00950000183209.b.b ENSGT00940000164884 ENSGT00940000164487 Denticle herring MODERN SPECIES arid4a (ENSDCDG00000001477) psma3 (ENSDCDG00000001830) mipol1 (ENSDCDG00000001835) foxa1 (ENSDCDG00000001840) ENSDCDG00000001843 ENSDCDG00000001859 SSTR1 (ENSDCDG00000001864) clec14a (ENSDCDG00000001866) sec23a (ENSDCDG00000001879) ENSDCDG00000001894 srp54 (ENSDCDG00000001899) zgc:109986 (ENSDCDG00000001926) BAZ1A (ENSDCDG00000001944) cfl2 (ENSDCDG00000001966) snx6 (ENSDCDG00000001980) eapp (ENSDCDG00000002103) #22 sptssa (ENSDCDG00000002122) #23 egln3 (ENSDCDG00000002127) NPAS3 (ENSDCDG00000002136) AKAP6 (ENSDCDG00000002153) ARHGAP5 (ENSDCDG00000002165) nubpl (ENSDCDG00000002174) dtd2 (ENSDCDG00000002212) #21 ENSDCDG00000002213 ENSDCDG00000002216 cox16 (ENSDCDG00000002217) actn1 (ENSDCDG00000002269) dcaf5 (ENSDCDG00000002709) pacs2 (ENSDCDG00000002720) srsf5a (ENSDCDG00000002743) ENSDCDG00000002746 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000160102 ENSGT00940000156159 ENSGT00550000074912 ENSGT00390000017800 ENSGT00940000162043 ENSGT00940000161150 ENSGT00940000161442 ENSGT01030000234987 ENSGT00390000006916.d ENSGT00940000166955 ENSGT00550000074824 ENSGT00390000012799 ENSGT00940000158135 ENSGT00950000183000.c.b ENSGT00940000154940 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000002766.b.b #23 ENSGT00940000158745 ENSGT00940000158051 ENSGT00810000125473.B ENSGT00940000154553.a.b ENSGT00950000183193.B ENSGT00940000153431.a #21 ENSGT00390000006205.b ENSGT00940000156572 ENSGT00970000193421.B ENSGT00950000183095.a.b.a.a ENSGT00940000159386 ENSGT00550000074845 ENSGT00950000182865.b.a.a ENSGT00950000183024.a.b.a Asian bonytongue MODERN SPECIES 18 ENSSFOG00015013578 ptgdsb.1 (ENSSFOG00015013652) cst14a.1 (ENSSFOG00015013664) ENSSFOG00015029480 ENSSFOG00015029601 ENSSFOG00015013695 pan3 (ENSSFOG00015013716) ENSSFOG00015013788 clec14a (ENSSFOG00015013793) sec23a (ENSSFOG00015013820) srp54 (ENSSFOG00015013920) zgc:109986 (ENSSFOG00015013998) BAZ1A (ENSSFOG00015014035) cfl2 (ENSSFOG00015030770) snx6 (ENSSFOG00015014115) eapp (ENSSFOG00015014177) #22 sptssa (ENSSFOG00015026974) #23 egln3 (ENSSFOG00015032021) NPAS3 (ENSSFOG00015032174) AKAP6 (ENSSFOG00015014266) ARHGAP5 (ENSSFOG00015014323) nubpl (ENSSFOG00015014340) dtd2 (ENSSFOG00015031243) #21 HEATR5A (ENSSFOG00015014376) hectd1 (ENSSFOG00015014489) ap4s1 (ENSSFOG00015014560) strn3 (ENSSFOG00015014593) coch (ENSSFOG00015014673) scfd1 (ENSSFOG00015014709) g2e3 (ENSSFOG00015014745) PRKD1 (ENSSFOG00015014764) P. kingsleyae MODERN SPECIES 284 ENSPKIG00000001832 sec23a (ENSPKIG00000001863) ENSPKIG00000001901 srp54 (ENSPKIG00000001953) zgc:109986 (ENSPKIG00000002034) BAZ1A (ENSPKIG00000002068) cfl2 (ENSPKIG00000002121) snx6 (ENSPKIG00000002157) eapp (ENSPKIG00000002266) #22 sptssa (ENSPKIG00000002293) #23 egln3 (ENSPKIG00000002331) NPAS3 (ENSPKIG00000002390) AKAP6 (ENSPKIG00000002444) ENSPKIG00000002494 ARHGAP5 (ENSPKIG00000002509) Spotted gar MODERN SPECIES 673 si:ch211-185a18.2 (ENSLOCG00000009320) timm9 (ENSLOCG00000009345) arid4a (ENSLOCG00000009355) psma3 (ENSLOCG00000009368) mipol1 (ENSLOCG00000009377) foxa1 (ENSLOCG00000009382) TTC6 (ENSLOCG00000009393) SSTR1 (ENSLOCG00000017701) ENSLOCG00000009400 sec23a (ENSLOCG00000009415) ENSLOCG00000009429 srp54 (ENSLOCG00000009440) BAZ1A (ENSLOCG00000009448) cfl2 (ENSLOCG00000009463) snx6 (ENSLOCG00000009469) eapp (ENSLOCG00000009484) #22 sptssa (ENSLOCG00000009497) #23 egln3 (ENSLOCG00000009500) NPAS3 (ENSLOCG00000009512) AKAP6 (ENSLOCG00000009529) ARHGAP5 (ENSLOCG00000009544) nubpl (ENSLOCG00000009552) dtd2 (ENSLOCG00000009563) #21 ENSLOCG00000009572 HEATR5A (ENSLOCG00000009580) hectd1 (ENSLOCG00000009590) ap4s1 (ENSLOCG00000009611) STRN3 (ENSLOCG00000009618) coch (ENSLOCG00000009643) opn6b (ENSLOCG00000009657) scfd1 (ENSLOCG00000009663) Reedfish MODERN SPECIES 7 dact1 (ENSECRG00000015766) si:ch211-185a18.2 (ENSECRG00000015790) irf2bpl (ENSECRG00000015852) timm9 (ENSECRG00000015902) arid4a (ENSECRG00000015920) psma3 (ENSECRG00000015974) mipol1 (ENSECRG00000016052) foxa1 (ENSECRG00000016084) ENSECRG00000016099 SSTR1 (ENSECRG00000016118) sec23a (ENSECRG00000016145) srp54 (ENSECRG00000016207) BAZ1A (ENSECRG00000016298) cfl2 (ENSECRG00000016375) snx6 (ENSECRG00000016414) eapp (ENSECRG00000016516) #22 sptssa (ENSECRG00000016533) #23 ENSECRG00000016548 ENSECRG00000016567 egln3 (ENSECRG00000016585) NPAS3 (ENSECRG00000016667) ssna1 (ENSECRG00000016832) ENSECRG00000016843 AKAP6 (ENSECRG00000016857) ARHGAP5 (ENSECRG00000016897) nubpl (ENSECRG00000016921) dtd2 (ENSECRG00000016948) #21 HEATR5A (ENSECRG00000016971) hectd1 (ENSECRG00000017052) ap4s1 (ENSECRG00000017237) STRN3 (ENSECRG00000017315) Elephant shark MODERN SPECIES 1491 EMILIN3 (ENSCMIG00000015772) rpn2 (ENSCMIG00000015623) ENSCMIG00000015562 manbal (ENSCMIG00000015559) NTSR1 (ENSCMIG00000015551) SLCO4A1 (ENSCMIG00000015549) gata5 (ENSCMIG00000015548) ENSCMIG00000015545 CABLES2 (ENSCMIG00000015542) rps21 (ENSCMIG00000015530) PLTP (ENSCMIG00000015525) ube2c (ENSCMIG00000015518) DNTTIP1 (ENSCMIG00000015514) pcif1 (ENSCMIG00000015497) bmp7a (ENSCMIG00000015490) eapp (ENSCMIG00000015488) #22 ENSCMIG00000015482 ENSCMIG00000015477 ENSCMIG00000015476 ENSCMIG00000015474 GPR42 (ENSCMIG00000015473) ENSCMIG00000015471 ENSCMIG00000015470 ENSCMIG00000015467 ENSCMIG00000015466 ENSCMIG00000015464 ttll9 (ENSCMIG00000015463) spo11 (ENSCMIG00000015456) rae1 (ENSCMIG00000015449) rbm24a (ENSCMIG00000015448) pck1 (ENSCMIG00000015446) Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000001332 #22 Lamprey MODERN SPECIES 4002 eapp (ENSPMAG00000005245) #22 Hagfish MODERN SPECIES 1398 ENSEBUG00000010052 ENSEBUG00000004491 ENSEBUG00000013970 ENSEBUG00000000471 ENSEBUG00000010720 eapp (ENSEBUG00000009097) #22 ENSEBUG00000015024 ENSEBUG00000009365 ENSEBUG00000007775 ENSEBUG00000001203 Ciona ANCESTRAL SPECIES 935 ENSGT00390000001332 #22 ENSGT00390000010922 Ciona intestinalis MODERN SPECIES 247 ENSCING00000000988 #22 ENSCING00000000992 Ciona savignyi MODERN SPECIES 223 ENSCSAVG00000005369 ENSCSAVG00000005366 ENSCSAVG00000005245 ENSCSAVG00000005019 ENSCSAVG00000004993 ENSCSAVG00000004904 ENSCSAVG00000004885 ENSCSAVG00000004854 ENSCSAVG00000004853 ENSCSAVG00000004794 ENSCSAVG00000004791 ENSCSAVG00000004789 ENSCSAVG00000004786 ENSCSAVG00000004782 ENSCSAVG00000004781 ENSCSAVG00000004776 #22 ENSCSAVG00000004773 ENSCSAVG00000004771 ENSCSAVG00000004648 ENSCSAVG00000004617 ENSCSAVG00000004613 ENSCSAVG00000004611 ENSCSAVG00000004447 ENSCSAVG00000004047 ENSCSAVG00000004044 ENSCSAVG00000004042 ENSCSAVG00000004041 ENSCSAVG00000004034 ENSCSAVG00000004028 ENSCSAVG00000004026 ENSCSAVG00000004023