Bilateria DUPLICATION Bilateria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182900.B #22 Chordata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182900.B #22 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182900.B #22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 191 ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000007879 #7 ENSGT00950000183056.A.a ENSGT00940000158412 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 321 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000154868.a.b ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00950000182802.B #8 ENSGT00390000007879 #7 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00940000156072 ENSGT00940000156529 ENSGT00940000158412 ENSGT00950000183056.A.a ENSGT00530000067301 ENSGT00940000159599 ENSGT00940000161879 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000154868.a.b ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000163923 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT00950000183168.B.a ENSGT00390000003312 ENSGT00940000157582 ENSGT00940000155543 ENSGT00940000157669 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000154798.b ENSGT00390000007879 #7 ENSGT00950000182802.B #8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00960000189819 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000154868.a.b ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00940000157531 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000163923 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT00950000183168.B.a ENSGT00390000003312 ENSGT00940000157582 ENSGT00940000155543 Amniota ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00390000007879 #7 ENSGT00950000182802.B #8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00390000017418 #19 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000154868.a.b ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000163923 ENSGT00940000160073 #31 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000007879 #7 ENSGT00950000182802.B #8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00390000017418 #19 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000163923 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045 #35 ENSGT00950000183182.a.a #36 Theria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000007879 #7 ENSGT00950000182802.B.a.a ##8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00390000017418 #19 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00940000163188 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045 #35 ENSGT00950000183182.a.a #36 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007879 #7 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a ##8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00390000017418 #19 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00940000163188 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000163178 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045 #35 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.b #8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00900000143263 ENSGT00390000017418 #19 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00940000163188 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000163178 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045 #35 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.i.b ##8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00900000143263 ENSGT00390000017418 #19 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00940000163188 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000163178 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045 #35 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.i.b ##8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00900000143263 ENSGT00390000017418 #19 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00940000163188 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045 #35 ENSGT00950000183182.a.a #36 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.i.b ##8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00900000143263 ENSGT00390000017418 #19 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00940000163188 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045 #35 ENSGT00950000183182.a.a #36 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.i.b ##8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00900000143263 ENSGT00390000017418 #19 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00940000163188 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045 #35 ENSGT00950000183182.a.a #36 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.i.b ##8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00900000143263 ENSGT00390000017418 #19 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00940000163188 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045 #35 ENSGT00950000183182.a.a #36 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.i.b ##8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00900000143263 ENSGT00390000017418 #19 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00940000163188 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045 #35 ENSGT00950000183182.a.a #36 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.i.b ##8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00900000143263 ENSGT00390000017418 #19 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045 #35 ENSGT00950000183182.a.a #36 ENSGT01090000260093.b #37 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.i.b ##8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00900000143263 ENSGT00390000017418 #19 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045 #35 ENSGT00950000183182.a.a #36 ENSGT01090000260093.b #37 Murinae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.i.b ##8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00900000143263 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00390000017418 #19 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045 #35 ENSGT00950000183182.a.a #36 ENSGT01090000260093.b #37 Mus ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.i.b ##8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00900000143263 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00390000017418 #19 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045 #35 ENSGT00950000183182.a.a #36 ENSGT01090000260093.b #37 Shrew mouse MODERN SPECIES 19 Dhdds (MGP_PahariEiJ_G0028935) #7 MGP_PahariEiJ_G0028934 #8 Rps6ka1 (MGP_PahariEiJ_G0028933) #9 Arid1a (MGP_PahariEiJ_G0028932) #10 Pigv (MGP_PahariEiJ_G0028931) #11 MGP_PahariEiJ_G0028930 #12 Sfn (MGP_PahariEiJ_G0028929) #13 Gpn2 (MGP_PahariEiJ_G0028928) #14 Gpatch3 (MGP_PahariEiJ_G0028927) #15 Nr0b2 (MGP_PahariEiJ_G0028926) #16 Nudc (MGP_PahariEiJ_G0028925) #17 Kdf1 (MGP_PahariEiJ_G0028924) #18 Trnp1 (MGP_PahariEiJ_G0028923) #19 Tent5b (MGP_PahariEiJ_G0028922) #20 Slc9a1 (MGP_PahariEiJ_G0028921) #21 Wdtc1 (MGP_PahariEiJ_G0028920) #22 Tmem222 (MGP_PahariEiJ_G0028919) #23 Sytl1 (MGP_PahariEiJ_G0028918) #24 Map3k6 (MGP_PahariEiJ_G0028917) #25 Cd164l2 (MGP_PahariEiJ_G0028916) #26 Gpr3 (MGP_PahariEiJ_G0028915) #27 Wasf2 (MGP_PahariEiJ_G0028914) #28 Ahdc1 (MGP_PahariEiJ_G0028913) #29 Fgr (MGP_PahariEiJ_G0028912) #30 Fam76a (MGP_PahariEiJ_G0028911) #31 MGP_PahariEiJ_G0028910 #32 Ppp1r8 (MGP_PahariEiJ_G0028909) #33 Themis2 (MGP_PahariEiJ_G0028908) #34 Rpa2 (MGP_PahariEiJ_G0028907) #35 Smpdl3b (MGP_PahariEiJ_G0028906) #36 Xkr8 (MGP_PahariEiJ_G0028905) #37 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.i.b ##8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 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ENSGT00900000143263 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00390000017418 #19 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045 #35 ENSGT00950000183182.a.a #36 ENSGT01090000260093.b #37 Mus_C ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.i.b ##8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00900000143263 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00390000017418 #19 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 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ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00390000017418 #19 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00940000163188 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000163178 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045 #35 Bushbaby MODERN SPECIES 271 DHDDS (ENSOGAG00000003973) #7 ENSOGAG00000032571 ##8 RPS6KA1 (ENSOGAG00000003977) #9 ARID1A (ENSOGAG00000002450) #10 PIGV (ENSOGAG00000029083) #11 ZDHHC18 (ENSOGAG00000007934) #12 SFN (ENSOGAG00000004791) #13 GPN2 (ENSOGAG00000033911) #14 GPATCH3 (ENSOGAG00000011647) #15 NR0B2 (ENSOGAG00000002078) #16 NUDC (ENSOGAG00000002080) #17 KDF1 (ENSOGAG00000002084) #18 TRNP1 (ENSOGAG00000029493) #19 TENT5B 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ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045.g.b.a #35 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000007879.a #7 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.h.a.a.a.a ##8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00390000017418 #19 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00940000163188 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000163178 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045.g.b.a #35 Marmoset MODERN SPECIES 19 ENSCJAG00000060928 ARID1A (ENSCJAG00000009833) #10 PIGV (ENSCJAG00000042636) #11 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ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045 #35 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 1535 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 Hedgehog MODERN SPECIES 3961 WDTC1 (ENSEEUG00000005340) #22 Common shrew MODERN SPECIES 3004 WDTC1 (ENSSARG00000011638) #22 TMEM222 (ENSSARG00000011684) #23 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.b #8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00900000143263 ENSGT00390000017418 #19 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00940000163188 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000163178 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045 #35 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.b #8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00900000143263 ENSGT00390000017418 #19 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00940000163188 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000163178 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045 #35 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.b #8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00900000143263 ENSGT00390000017418 #19 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00940000163188 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000163178 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045 #35 Equus ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000007879 #7 ENSGT00950000182802.B.a.b #8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00390000017418 #19 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00940000163188 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000163178 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045 #35 Donkey MODERN SPECIES 25 DHDDS (ENSEASG00005003944) #7 ENSEASG00005037497 ##8 RPS6KA1 (ENSEASG00005003928) #9 ARID1A (ENSEASG00005008616) #10 PIGV (ENSEASG00005008625) #11 ZDHHC18 (ENSEASG00005038436) #12 SFN (ENSEASG00005008630) #13 GPN2 (ENSEASG00005033906) #14 GPATCH3 (ENSEASG00005008636) #15 NR0B2 (ENSEASG00005008640) #16 NUDC (ENSEASG00005008644) #17 KDF1 (ENSEASG00005008678) #18 TRNP1 (ENSEASG00005008681) #19 TENT5B (ENSEASG00005030650) #20 SLC9A1 (ENSEASG00005008683) #21 WDTC1 (ENSEASG00005008688) #22 TMEM222 (ENSEASG00005027327) #23 SYTL1 (ENSEASG00005008710) #24 MAP3K6 (ENSEASG00005008765) #25 FCN3 (ENSEASG00005032502) CD164L2 (ENSEASG00005009485) #26 GPR3 (ENSEASG00005031706) #27 WASF2 (ENSEASG00005009488) #28 AHDC1 (ENSEASG00005009489) #29 FGR (ENSEASG00005009494) #30 FAM76A (ENSEASG00005009497) #31 IFI6 (ENSEASG00005025976) STX12 (ENSEASG00005009498) #32 PPP1R8 (ENSEASG00005009499) #33 THEMIS2 (ENSEASG00005009503) #34 ENSEASG00005009504 #35 Horse MODERN SPECIES 11 LIN28A (ENSECAG00000020267) ENSECAG00000037332 #8 DHDDS (ENSECAG00000016220) #7 RPS6KA1 (ENSECAG00000016238) #9 ARID1A (ENSECAG00000017991) #10 PIGV (ENSECAG00000017119) #11 ENSECAG00000045174 #12 GPN2 (ENSECAG00000041580) #14 GPATCH3 (ENSECAG00000007653) #15 NR0B2 (ENSECAG00000050372) #16 NUDC (ENSECAG00000021311) #17 KDF1 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ENSGT00940000163188 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000163178 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045 #35 Microbat MODERN SPECIES 1134 RPS6KA1 (ENSMLUG00000002474) #9 ENSMLUG00000026071 ARID1A (ENSMLUG00000002492) #10 PIGV (ENSMLUG00000002508) #11 ZDHHC18 (ENSMLUG00000010194) #12 ENSMLUG00000010207 #13 GPN2 (ENSMLUG00000004651) #14 GPATCH3 (ENSMLUG00000023528) #15 NR0B2 (ENSMLUG00000004658) #16 NUDC (ENSMLUG00000004662) #17 KDF1 (ENSMLUG00000004669) #18 TRNP1 (ENSMLUG00000004673) #19 TENT5B (ENSMLUG00000004676) #20 SLC9A1 (ENSMLUG00000004681) #21 WDTC1 (ENSMLUG00000004136) #22 TMEM222 (ENSMLUG00000004145) #23 SYTL1 (ENSMLUG00000001802) #24 MAP3K6 (ENSMLUG00000001811) #25 FCN3 (ENSMLUG00000001825) CD164L2 (ENSMLUG00000024507) #26 WASF2 (ENSMLUG00000001835) #28 FGR (ENSMLUG00000014580) #30 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ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045 #35 Felidae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000182802.B.a.b #8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00900000143263 ENSGT00390000017418 #19 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00940000163188 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000003248.a.b.a.a ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000163178 ENSGT00390000005534.b.b.c.a ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 Panthera ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000182802.B.a.b #8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00900000143263 ENSGT00390000017418 #19 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00940000163188 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000003248.a.b.a.a ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000161804.f ENSGT00940000163178 ENSGT00390000005534.b.b.c.a ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000182802.B.a.b #8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000016565 #18 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Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000007879 #7 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00900000143263 ENSGT00390000017418 #19 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000163178 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045 #35 ENSGT00950000183182.a.a #36 Dog MODERN SPECIES 11 LIN28A (ENSCAFG00845012312) HMGN2 (ENSCAFG00845012085) #7 RPS6KA1 (ENSCAFG00845011855) #9 ARID1A (ENSCAFG00845011619) #10 PIGV (ENSCAFG00845011546) #11 ZDHHC18 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ENSCAFG00020021638 #14 GPATCH3 (ENSCAFG00020021640) #15 NR0B2 (ENSCAFG00020021643) #16 NUDC (ENSCAFG00020021647) #17 KDF1 (ENSCAFG00020021675) #18 ENSCAFG00020021677 TRNP1 (ENSCAFG00020021680) #19 TENT5B (ENSCAFG00020021681) #20 SLC9A1 (ENSCAFG00020021719) #21 WDTC1 (ENSCAFG00020022295) #22 TMEM222 (ENSCAFG00020022297) #23 MAP3K6 (ENSCAFG00020022327) #25 CD164L2 (ENSCAFG00020022358) #26 GPR3 (ENSCAFG00020022364) #27 WASF2 (ENSCAFG00020022369) #28 AHDC1 (ENSCAFG00020022386) #29 FGR (ENSCAFG00020022400) #30 IFI6 (ENSCAFG00020023299) FAM76A (ENSCAFG00020023311) #31 STX12 (ENSCAFG00020023387) #32 PPP1R8 (ENSCAFG00020023390) #33 THEMIS2 (ENSCAFG00020023394) #34 RPA2 (ENSCAFG00020023397) #35 ENSCAFG00020023408 #36 XKR8 (ENSCAFG00020023415) #37 Red fox MODERN SPECIES 103 LIN28A (ENSVVUG00000011926) DHDDS (ENSVVUG00000011934) #7 RPS6KA1 (ENSVVUG00000011954) #9 ARID1A (ENSVVUG00000011964) #10 PIGV (ENSVVUG00000011980) #11 ZDHHC18 (ENSVVUG00000012001) #12 SFN (ENSVVUG00000012027) #13 GPN2 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ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00940000163188 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000163178 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045 #35 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182802.B.a.b #8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00900000143263 ENSGT00390000017418 #19 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00940000163188 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 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SPECIES 31 ENSCHYG00000001546 ENSCHYG00000001562 DHDDS (ENSCHYG00000001603) #7 RPS6KA1 (ENSCHYG00000001724) #9 ARID1A (ENSCHYG00000001939) #10 PIGV (ENSCHYG00000001986) #11 ZDHHC18 (ENSCHYG00000002005) #12 SFN (ENSCHYG00000002025) #13 GPN2 (ENSCHYG00000002038) #14 GPATCH3 (ENSCHYG00000002063) #15 NR0B2 (ENSCHYG00000002069) #16 NUDC (ENSCHYG00000002088) #17 KDF1 (ENSCHYG00000002127) #18 TENT5B (ENSCHYG00000002147) #20 SLC9A1 (ENSCHYG00000002158) #21 WDTC1 (ENSCHYG00000002182) #22 TMEM222 (ENSCHYG00000002225) #23 SYTL1 (ENSCHYG00000002263) #24 MAP3K6 (ENSCHYG00000002378) #25 CD164L2 (ENSCHYG00000002659) #26 GPR3 (ENSCHYG00000002685) #27 WASF2 (ENSCHYG00000002699) #28 ENSCHYG00000002732 AHDC1 (ENSCHYG00000002738) #29 ENSCHYG00000002750 #30 IFI6 (ENSCHYG00000002768) FAM76A (ENSCHYG00000002798) #31 STX12 (ENSCHYG00000002839) #32 PPP1R8 (ENSCHYG00000002883) #33 ENSCHYG00000002910 THEMIS2 (ENSCHYG00000002918) #34 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000182802.B.b ##8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00900000143263 ENSGT00390000017418 #19 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00940000163188 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000163178 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045 #35 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000182802.B.b ##8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00900000143263 ENSGT00390000017418 #19 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00940000163188 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000163178 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045.k #35 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000007879 #7 ENSGT00950000182802.B.b ##8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00390000017418 #19 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000163178 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045.k.b #35 ENSGT00950000183182.a.a #36 Bos ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000007879 #7 ENSGT00950000182802.B.b ##8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00390000017418 #19 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000163178 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045.k.b #35 ENSGT00950000183182.a.a #36 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000007879 #7 ENSGT00950000184988.a.a ENSGT00950000182802.B.b ##8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000163178 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045.k.b #35 ENSGT00950000183182.a.a #36 Wild yak MODERN SPECIES 762 ENSBMUG00000016448 DHDDS (ENSBMUG00000016476) #7 ENSBMUG00000016490 RPS6KA1 (ENSBMUG00000016615) #9 ARID1A (ENSBMUG00000016706) #10 PIGV (ENSBMUG00000016736) #11 ZDHHC18 (ENSBMUG00000016747) #12 SFN (ENSBMUG00000016763) #13 GPN2 (ENSBMUG00000016798) #14 GPATCH3 (ENSBMUG00000016826) #15 NR0B2 (ENSBMUG00000016841) #16 NUDC (ENSBMUG00000016856) #17 KDF1 (ENSBMUG00000016871) #18 TENT5B (ENSBMUG00000016880) #20 SLC9A1 (ENSBMUG00000016893) #21 WDTC1 (ENSBMUG00000016909) #22 TMEM222 (ENSBMUG00000016948) #23 SYTL1 (ENSBMUG00000017014) #24 MAP3K6 (ENSBMUG00000017097) #25 CD164L2 (ENSBMUG00000017125) #26 GPR3 (ENSBMUG00000017133) #27 WASF2 (ENSBMUG00000017163) #28 AHDC1 (ENSBMUG00000017189) #29 FGR (ENSBMUG00000017246) #30 IFI6 (ENSBMUG00000017279) FAM76A (ENSBMUG00000017312) #31 STX12 (ENSBMUG00000017327) #32 PPP1R8 (ENSBMUG00000017340) #33 THEMIS2 (ENSBMUG00000017367) #34 ENSBMUG00000017390 #35 SMPDL3B (ENSBMUG00000017413) #36 Domestic yak MODERN SPECIES 11 ENSBGRG00000006850 ENSBGRG00000006878 ##8 RPS6KA1 (ENSBGRG00000007015) #9 ENSBGRG00000008100 ARID1A (ENSBGRG00000008144) #10 PIGV (ENSBGRG00000008647) #11 ZDHHC18 (ENSBGRG00000008689) #12 GPN2 (ENSBGRG00000008777) #14 SFN (ENSBGRG00000008845) #13 GPATCH3 (ENSBGRG00000008880) #15 ENSBGRG00000008953 #16 NUDC (ENSBGRG00000008992) #17 KDF1 (ENSBGRG00000009082) #18 TENT5B (ENSBGRG00000009168) #20 SLC9A1 (ENSBGRG00000009191) #21 WDTC1 (ENSBGRG00000009375) #22 ENSBGRG00000009602 #23 SYTL1 (ENSBGRG00000009724) #24 MAP3K6 (ENSBGRG00000009866) #25 CD164L2 (ENSBGRG00000011089) #26 GPR3 (ENSBGRG00000011392) #27 WASF2 (ENSBGRG00000011448) #28 AHDC1 (ENSBGRG00000011636) #29 FGR (ENSBGRG00000011695) #30 IFI6 (ENSBGRG00000011996) FAM76A (ENSBGRG00000012076) #31 ENSBGRG00000012364 STX12 (ENSBGRG00000012395) #32 PPP1R8 (ENSBGRG00000012519) #33 ENSBGRG00000012570 THEMIS2 (ENSBGRG00000012596) #34 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000007879 #7 ENSGT00950000182802.B.b ##8 ENSGT00940000159314 #9 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ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045 #35 ENSGT00950000183182.a.a #36 Armadillo MODERN SPECIES 1291 WDTC1 (ENSDNOG00000001232) #22 TMEM222 (ENSDNOG00000043003) #23 SYTL1 (ENSDNOG00000009697) #24 MAP3K6 (ENSDNOG00000009722) #25 FCN3 (ENSDNOG00000031654) CD164L2 (ENSDNOG00000039635) #26 GPR3 (ENSDNOG00000024172) #27 WASF2 (ENSDNOG00000034536) #28 AHDC1 (ENSDNOG00000038844) #29 FGR (ENSDNOG00000014797) #30 ENSDNOG00000034433 FAM76A (ENSDNOG00000049213) #31 STX12 (ENSDNOG00000049359) #32 PPP1R8 (ENSDNOG00000033057) #33 THEMIS2 (ENSDNOG00000013968) #34 RPA2 (ENSDNOG00000023660) #35 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000007879 #7 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.b.a.a ##8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 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#24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00940000163188 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000163178 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045 #35 Elephant MODERN SPECIES 332 ZNF683 (ENSLAFG00000001781) LIN28A (ENSLAFG00000017525) DHDDS (ENSLAFG00000017527) #7 RPS6KA1 (ENSLAFG00000004940) #9 ARID1A (ENSLAFG00000017591) #10 PIGV (ENSLAFG00000016679) #11 ZDHHC18 (ENSLAFG00000016682) #12 SFN (ENSLAFG00000007721) #13 GPN2 (ENSLAFG00000021641) #14 GPATCH3 (ENSLAFG00000016691) #15 NR0B2 (ENSLAFG00000016698) #16 NUDC (ENSLAFG00000027857) #17 KDF1 (ENSLAFG00000016045) #18 TENT5B (ENSLAFG00000023075) #20 SLC9A1 (ENSLAFG00000011339) #21 WDTC1 (ENSLAFG00000006032) #22 TMEM222 (ENSLAFG00000006037) #23 SYTL1 (ENSLAFG00000006041) #24 MAP3K6 (ENSLAFG00000006042) #25 CD164L2 (ENSLAFG00000026681) #26 GPR3 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ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00940000163188 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 #30 ENSGT00940000160073 #31 ENSGT01000000214440.A.a.b.a #32 ENSGT00940000156115 #33 ENSGT00530000063770.c.a #34 ENSGT00390000010045 #35 ENSGT00950000183182.a.a #36 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000007879 #7 ENSGT00950000182802.B.a.a ##8 ENSGT00940000159314 #9 ENSGT00940000155194 #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585 #12 ENSGT01090000260040.b.b.b.a #13 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00390000015719.c #16 ENSGT00940000155361 #17 ENSGT00390000016565 #18 ENSGT00390000017418 #19 ENSGT00940000160747 #20 ENSGT00940000156338 #21 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371 #23 ENSGT00940000160932 #24 ENSGT00940000159398 #25 ENSGT00940000163188 ENSGT00530000063929.a.b #26 ENSGT01060000248564.b.a.a.a #27 ENSGT00950000182962.b.a #28 ENSGT00390000018883 #29 ENSGT00940000157554 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MODERN SPECIES 14 DHDDS (ENSPCIG00000012690) #7 RPS6KA1 (ENSPCIG00000012689) #9 ARID1A (ENSPCIG00000012686) #10 PIGV (ENSPCIG00000012685) #11 ZDHHC18 (ENSPCIG00000012684) #12 SFN (ENSPCIG00000012683) #13 GPN2 (ENSPCIG00000012682) #14 GPATCH3 (ENSPCIG00000012681) #15 ENSPCIG00000033728 NR0B2 (ENSPCIG00000012680) #16 NUDC (ENSPCIG00000012676) #17 KDF1 (ENSPCIG00000012674) #18 TRNP1 (ENSPCIG00000012669) #19 TENT5B (ENSPCIG00000031333) #20 SLC9A1 (ENSPCIG00000012661) #21 WDTC1 (ENSPCIG00000024839) #22 TMEM222 (ENSPCIG00000024842) #23 SYTL1 (ENSPCIG00000024846) #24 MAP3K6 (ENSPCIG00000024851) #25 ENSPCIG00000034177 CD164L2 (ENSPCIG00000024856) #26 GPR3 (ENSPCIG00000024859) #27 WASF2 (ENSPCIG00000034938) #28 AHDC1 (ENSPCIG00000009216) #29 FGR (ENSPCIG00000000551) #30 FAM76A (ENSPCIG00000022294) #31 STX12 (ENSPCIG00000022297) #32 PPP1R8 (ENSPCIG00000036471) #33 THEMIS2 (ENSPCIG00000022310) #34 RPA2 (ENSPCIG00000022320) #35 SMPDL3B (ENSPCIG00000022329) #36 Common wonbat MODERN SPECIES 1016 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ARID1A (ENSSHAG00000013363) #10 PIGV (ENSSHAG00000013863) #11 ZDHHC18 (ENSSHAG00000031107) #12 SFN (ENSSHAG00000024644) #13 GPN2 (ENSSHAG00000027495) #14 GPATCH3 (ENSSHAG00000026633) #15 NR0B2 (ENSSHAG00000014359) #16 NUDC (ENSSHAG00000003633) #17 ENSSHAG00000029984 KDF1 (ENSSHAG00000032177) #18 TRNP1 (ENSSHAG00000029647) #19 TENT5B (ENSSHAG00000026408) #20 SLC9A1 (ENSSHAG00000021244) #21 WDTC1 (ENSSHAG00000001544) #22 TMEM222 (ENSSHAG00000025224) #23 SYTL1 (ENSSHAG00000021748) #24 CD164L2 (ENSSHAG00000003127) #26 GPR3 (ENSSHAG00000032210) #27 WASF2 (ENSSHAG00000004886) #28 FGR (ENSSHAG00000001546) #30 FAM76A (ENSSHAG00000022341) #31 PPP1R8 (ENSSHAG00000024313) #33 THEMIS2 (ENSSHAG00000015133) #34 RPA2 (ENSSHAG00000015255) #35 SMPDL3B (ENSSHAG00000015331) #36 XKR8 (ENSSHAG00000026927) #37 EYA3 (ENSSHAG00000027000) ENSSHAG00000029212 PTAFR (ENSSHAG00000026787) Opossum MODERN SPECIES 3 DHDDS (ENSMODG00000014246) #7 ENSMODG00000041565 ##8 ENSMODG00000050678 RPS6KA1 (ENSMODG00000014283) #9 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ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00940000155194.v.b #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585.c.a #12 ENSGT00940000165028.a ENSGT00940000157034 ENSGT00940000157669.a.b ENSGT00940000155543 ENSGT00940000157582.g ENSGT00950000183053.A.a.b Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 109 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371.f #23 ENSGT00940000154868.a.b.b ENSGT00390000016565.g #18 ENSGT00390000015719.c.c #16 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00940000155194.v.b #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585.c.a #12 ENSGT00940000165028.a ENSGT00940000157034 ENSGT00940000157669.b ENSGT00940000155543 ENSGT00940000157582.g ENSGT00950000183053.A.a.b Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371.f #23 ENSGT00940000154868.a.b.b ENSGT00390000016565.g #18 ENSGT00390000015719.c.c #16 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00940000166269.h ENSGT00940000155194.v.b #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585.c.a #12 ENSGT00940000165028.a ENSGT00940000157034 ENSGT00940000157669.b ENSGT00940000155543 ENSGT00940000157582.g Atlantic herring MODERN SPECIES 2 NOD1 (ENSCHAG00000015908) cep162 (ENSCHAG00000015891) mrap2a (ENSCHAG00000015885) cyb5r4 (ENSCHAG00000015846) sim1a (ENSCHAG00000015763) ASCC3 (ENSCHAG00000015189) ENSCHAG00000015161 GRIK2 (ENSCHAG00000013969) HACE1 (ENSCHAG00000013710) LIN28B (ENSCHAG00000013701) bves (ENSCHAG00000013628) popdc3 (ENSCHAG00000013622) STX12 (ENSCHAG00000013613) #32 ENSCHAG00000013605 fut7 (ENSCHAG00000013598) wdtc1 (ENSCHAG00000013568) #22 tmem222a (ENSCHAG00000013528) #23 tpbgl (ENSCHAG00000013521) KDF1 (ENSCHAG00000013512) #18 nr0b2a (ENSCHAG00000013503) #16 gpatch3 (ENSCHAG00000013497) #15 gpn2 (ENSCHAG00000013470) #14 ENSCHAG00000013222 ARID1A (ENSCHAG00000011660) #10 pigv (ENSCHAG00000011617) #11 zdhhc18a (ENSCHAG00000011480) #12 tent5ba (ENSCHAG00000011459) tcea3 (ENSCHAG00000011394) oprd1b (ENSCHAG00000011370) rcc1 (ENSCHAG00000011153) phactr4b (ENSCHAG00000011111) Denticle herring MODERN SPECIES 15 ENSDCDG00000015962 ENSDCDG00000015963 pitpnc1b (ENSDCDG00000015976) GRIN2D (ENSDCDG00000015992) ENSDCDG00000016103 CACNG7 (ENSDCDG00000017307) CACNG8 (ENSDCDG00000017311) CACNG6 (ENSDCDG00000017315) u2af2a (ENSDCDG00000017320) zgc:92606 (ENSDCDG00000017386) si:dkey-26c10.5 (ENSDCDG00000017390) trpv6 (ENSDCDG00000017400) ENSDCDG00000017412 ENSDCDG00000017440 TRNAU1AP (ENSDCDG00000017920) wdtc1 (ENSDCDG00000017925) #22 tmem222a (ENSDCDG00000017994) #23 tpbgl (ENSDCDG00000017999) ENSDCDG00000018002 #18 nr0b2a (ENSDCDG00000018005) #16 gpatch3 (ENSDCDG00000018012) #15 gpn2 (ENSDCDG00000018019) #14 ENSDCDG00000018028 ARID1A (ENSDCDG00000018078) #10 pigv (ENSDCDG00000018090) #11 zdhhc18a (ENSDCDG00000018092) #12 tent5ba (ENSDCDG00000018094) tcea3 (ENSDCDG00000018104) oprd1b (ENSDCDG00000018122) rcc1 (ENSDCDG00000018128) phactr4b (ENSDCDG00000018248) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 105 ENSGT00940000168471 ENSGT00390000008744 ENSGT00440000034270.a.b ENSGT00940000156347.f ENSGT01060000248575.D.c.b.a.b.b.b.a ENSGT00650000094921 ENSGT00390000017671.a.b ENSGT00940000158741 ENSGT00530000063023.B ENSGT00940000157045.a ENSGT00940000158728.l ENSGT00940000166989 ENSGT00940000153704.A.q ENSGT00940000155141.w.b ENSGT00940000165015 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371.f #23 ENSGT00940000154868.a.b.b ENSGT00390000016565.g #18 ENSGT00390000015719.c.c #16 ENSGT00940000160311.a.a ENSGT00940000160803 ENSGT00940000159046.C ENSGT00940000155418.b ENSGT00940000155539.a.b ENSGT00390000004140.a ENSGT00940000173371 ENSGT01100000263573.a.a.a ENSGT00940000164984 ENSGT00940000157640 ENSGT00940000162584.j Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 157 ENSGT00940000158741 ENSGT00390000017671.a.b ENSGT00530000063023.B ENSGT00940000157045.a ENSGT00940000158728.l ENSGT00390000018696 ENSGT00940000153704.A.q ENSGT00940000155141.w.b ENSGT00940000165015 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371.f #23 ENSGT00940000154868.a.b.b ENSGT00390000016565.g #18 ENSGT00390000015719.c.c #16 ENSGT00940000160311.a.a ENSGT00940000160803 ENSGT00940000159046.C ENSGT00940000155418.b ENSGT00940000155539.a.b ENSGT00390000004140.a ENSGT00940000173371 ENSGT01100000263573.a.a.a ENSGT00940000164984 ENSGT00940000157640 ENSGT00940000162584.j Channel catfish MODERN SPECIES 59 Cndp1 (ENSIPUG00000006098) wdtc1 (ENSIPUG00000006026) #22 tmem222a (ENSIPUG00000006015) #23 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT00550000074792.b ENSGT00390000008744 ENSGT00440000034270.a.b ENSGT00940000156347.f ENSGT01060000248575.D.c.b.a.b.b.b.a ENSGT00650000094921 ENSGT00940000158741 ENSGT00390000017671.a.b ENSGT00530000063023.B ENSGT00940000157045.a ENSGT00940000158728.l ENSGT00390000018696 ENSGT00940000153704.A.q ENSGT00940000155141.w.b ENSGT00940000165015 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371.f #23 ENSGT00940000154868.a.b.b ENSGT00390000016565.g #18 ENSGT00390000015719.c.c #16 ENSGT00940000160311.a.a ENSGT00940000160803 ENSGT00940000159046.C ENSGT00940000155418.b ENSGT00940000155539.a.b ENSGT00390000004140.a ENSGT01100000263535.b.a.b.bb ENSGT00990000203527.a.a.b ENSGT00940000164984 ENSGT00940000157640 ENSGT00940000162584.j Characoidei ANCESTRAL SPECIES 160 ENSGT01060000248575.D.c.b.a.b.b.b.a ENSGT00650000094921 ENSGT00940000158741 ENSGT00390000017671.a.b ENSGT00530000063023.B ENSGT00950000183116.b.a.b.b ENSGT00940000157045.a ENSGT00940000158728.l ENSGT00390000018696 ENSGT00940000153704.A.q ENSGT00940000155141.w.b ENSGT00940000165015 ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371.f #23 ENSGT00940000154868.a.b.b ENSGT00390000016565.g #18 ENSGT00390000015719.c.c #16 ENSGT00940000160311.a.a ENSGT00940000160803 ENSGT00940000159046.C ENSGT00940000155418.b ENSGT00940000155539.a.b ENSGT00390000004140.a ENSGT01100000263535.b.a.b.bb ENSGT00990000203527.a.a.b ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.a.a.d.a ENSGT01100000263535.b.a.b.ab.a ENSGT00990000203527.a.a.a.e.a.c.a Red-bellied piranha MODERN SPECIES 96 ENSPNAG00000027536 ENSPNAG00000027551 pigm (ENSPNAG00000027562) ENSPNAG00000004243 ANKS6 (ENSPNAG00000027599) tbx20 (ENSPNAG00000027679) herpud2 (ENSPNAG00000027698) dpy19l1l (ENSPNAG00000006615) ENSPNAG00000027893 SLC4A7 (ENSPNAG00000028100) eomesb (ENSPNAG00000005104) cmc1 (ENSPNAG00000028155) azi2 (ENSPNAG00000006491) ENSPNAG00000028195 cndp1 (ENSPNAG00000028208) wdtc1 (ENSPNAG00000028259) #22 tmem222a (ENSPNAG00000028267) #23 tpbgl (ENSPNAG00000028286) KDF1 (ENSPNAG00000028323) #18 nr0b2a (ENSPNAG00000028338) #16 pabpc1a (ENSPNAG00000028408) ENSPNAG00000028424 ethe1 (ENSPNAG00000004361) ENSPNAG00000028465 drd2l (ENSPNAG00000006971) xrcc1 (ENSPNAG00000004392) ENSPNAG00000004408 ENSPNAG00000004847 ENSPNAG00000028720 ENSPNAG00000028723 ENSPNAG00000006566 Mexicana tetra MODERN SPECIES 760 ENSAMXG00000043406 ENSAMXG00000036799 ENSAMXG00000040422 ENSAMXG00000037971 ENSAMXG00000032859 eomesb (ENSAMXG00000036691) ENSAMXG00000040805 ENSAMXG00000020988 ENSAMXG00000043353 ENSAMXG00000039134 eomesb (ENSAMXG00000031106) CMC1 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Goldfish MODERN SPECIES 7 ENSCARG00000002245 DENND4B (ENSCARG00000002069) ENSCARG00000002012 ENSCARG00000001990 ENSCARG00000001982 ENSCARG00000020503 ENSCARG00000020450 ENSCARG00000020434 iqgap3 (ENSCARG00000009034) eomesb (ENSCARG00000008583) cmc1 (ENSCARG00000008570) ENSCARG00000008565 azi2 (ENSCARG00000008557) ENSCARG00000008547 cndp1 (ENSCARG00000006732) wdtc1 (ENSCARG00000006598) #22 tmem222a (ENSCARG00000006560) #23 tpbgl (ENSCARG00000006526) KDF1 (ENSCARG00000006515) #18 nr0b2a (ENSCARG00000006500) #16 pabpc1a (ENSCARG00000006050) ENSCARG00000006004 PHLDB3 (ENSCARG00000005986) ethe1 (ENSCARG00000005955) ENSCARG00000005940 xrcc1 (ENSCARG00000005893) ENSCARG00000005872 ENSCARG00000005868 ENSCARG00000005857 ENSCARG00000005838 cdk14 (ENSCARG00000005144) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182900.B.a.b #22 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182900.B.a.b #22 Golden-line barbel MODERN SPECIES 1811 ENSSGRG00000018738 wdtc1 (ENSSGRG00000018742) #22 tmem222a 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ENSGT01090000260029.a.b.b.b.a.a.b.b.b.b.b.b.a.a.b.a.a ENSGT00940000162584.j ENSGT00940000159017.a.a.c Common carp reference MODERN SPECIES 47 ENSCCRG00000080775 ENSCCRG00000063406 ENSCCRG00000003135 ENSCCRG00000075267 ENSCCRG00000021417 ENSCCRG00000069116 ENSCCRG00000065514 ENSCCRG00000055145 ENSCCRG00000077715 ENSCCRG00000070223 eomesb (ENSCCRG00000003431) cmc1 (ENSCCRG00000076867) azi2 (ENSCCRG00000050867) ENSCCRG00000059078 cndp1 (ENSCCRG00000012165) wdtc1 (ENSCCRG00000076999) #22 tmem222a (ENSCCRG00000033459) #23 tpbgl (ENSCCRG00000074889) ENSCCRG00000033476 #18 nr0b2a (ENSCCRG00000033486) #16 pabpc1a (ENSCCRG00000033428) ENSCCRG00000070879 PHLDB3 (ENSCCRG00000032388) ethe1 (ENSCCRG00000079750) ENSCCRG00000032408 xrcc1 (ENSCCRG00000058607) ENSCCRG00000076089 cdk14 (ENSCCRG00000056799) ENSCCRG00000079497 znrf2b (ENSCCRG00000058383) ggctb (ENSCCRG00000055804) Golden-line barbel MODERN SPECIES 1506 eomesb (ENSSGRG00000018160) cmc1 (ENSSGRG00000018158) azi2 (ENSSGRG00000018157) ENSSGRG00000018156 cndp1 (ENSSGRG00000018099) wdtc1 (ENSSGRG00000018063) #22 tmem222a (ENSSGRG00000018060) #23 tpbgl (ENSSGRG00000018059) ENSSGRG00000018058 #18 nr0b2a (ENSSGRG00000018047) #16 Zebrafish MODERN SPECIES 7 iqgap3 (ENSDARG00000098650) eomesb (ENSDARG00000104243) cmc1 (ENSDARG00000103670) azi2 (ENSDARG00000102419) ENSDARG00000077559 cndp1 (ENSDARG00000069583) wdtc1 (ENSDARG00000059760) #22 tmem222a (ENSDARG00000069589) #23 tpbgl (ENSDARG00000114338) ENSDARG00000079834 #18 nr0b2a (ENSDARG00000044685) #16 pabpc1a (ENSDARG00000017219) zbtb7b (ENSDARG00000021891) khdc4 (ENSDARG00000035023) malsu1 (ENSDARG00000091079) ENSDARG00000102438 ENSDARG00000102087 fbxo43 (ENSDARG00000104186) spag1b (ENSDARG00000069499) DENND4B (ENSDARG00000102914) fzd6 (ENSDARG00000104874) clk2b (ENSDARG00000059870) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 185 ENSGT00520000055567.b ENSGT00620000087993.a.b ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371.f #23 ENSGT00940000154868.a.b.b ENSGT00390000016565.g #18 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ENSGT00390000018110 ENSGT00390000017400 ENSGT00390000001515 ENSGT00940000153769.F.n ENSGT00520000055667 ENSGT00940000159019 ENSGT00390000015114 ENSGT00390000009719 ENSGT00390000010209.c.b ENSGT00950000183186.B.b.c ENSGT00390000017627.a.a.b ENSGT00520000055567.b ENSGT00620000087993.a.b ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371.f #23 ENSGT00940000154868.a.b.b ENSGT00390000016565.g #18 ENSGT00390000015719.c.c #16 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00940000155194.v.b #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585.c.a #12 ENSGT00940000165028.a ENSGT00940000157034 ENSGT00940000157669.a.b ENSGT00940000155543 ENSGT00940000157582.g ENSGT00950000183053.A.a.b Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000009988 ENSGT00940000157222.b ENSGT00390000018110 ENSGT00390000017400 ENSGT00390000001515 ENSGT00940000153769.F.n ENSGT00520000055667 ENSGT00940000159019 ENSGT00390000015114 ENSGT00390000009719 ENSGT00390000010209.c.b ENSGT00950000183186.B.b.c ENSGT00390000017627.a.a.b 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ENSGT00940000155194.v.b #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585.c.a #12 ENSGT00940000165028.a ENSGT00940000157034 ENSGT00940000157669.a.b ENSGT00940000155543 ENSGT00940000157582.g ENSGT00950000183053.A.a.b Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000157222.b ENSGT00390000018110 ENSGT00390000017400 ENSGT00390000001515 ENSGT00940000153769.F.n ENSGT00520000055667 ENSGT00940000159019 ENSGT00390000015114 ENSGT00390000009719 ENSGT00390000010209.c.b ENSGT00950000183186.B.b.c ENSGT00390000017627.a.a.b ENSGT00940000178119 ENSGT00520000055567.b ENSGT00620000087993.a.b ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371.f #23 ENSGT00940000154868.a.b.b ENSGT00390000016565.g #18 ENSGT00390000015719.c.c #16 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00940000155194.v.b #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585.c.a #12 ENSGT00940000165028.a ENSGT00940000157034 ENSGT00940000157669.a.b ENSGT00940000155543 ENSGT00940000157582.g ENSGT00950000183053.A.a.b Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157222.b ENSGT00390000018110 ENSGT00390000017400 ENSGT00390000001515 ENSGT00940000153769.F.n ENSGT00520000055667 ENSGT00940000159019 ENSGT00390000015114 ENSGT00390000009719 ENSGT00390000010209.c.b ENSGT00950000183186.B.b.c ENSGT00390000017627.a.a.b ENSGT00940000178119 ENSGT00520000055567.b ENSGT00620000087993.a.b ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371.f #23 ENSGT00940000154868.a.b.b ENSGT00390000016565.g #18 ENSGT00390000015719.c.c #16 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00940000155194.v.b #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585.c.a #12 ENSGT00940000165028.a ENSGT00940000157034 ENSGT00940000157669.a.b ENSGT00940000155543 ENSGT00940000157582.g ENSGT00950000183053.A.a.b Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157222.b ENSGT00390000018110 ENSGT00390000017400 ENSGT00390000001515 ENSGT00940000153769.F.n ENSGT00520000055667 ENSGT00940000159019 ENSGT00390000015114 ENSGT00390000009719 ENSGT00390000010209.c.b ENSGT00950000183186.B.b.c ENSGT00390000017627.a.a.b ENSGT00940000178119 ENSGT00520000055567.b ENSGT00620000087993.a.b ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371.f #23 ENSGT00940000154868.a.b.b ENSGT00390000016565.g #18 ENSGT00390000015719.c.c #16 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00940000155194.v.b #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585.c.a #12 ENSGT00940000165028.a ENSGT00940000157034 ENSGT00940000157669.a.b ENSGT00940000155543 ENSGT00940000157582.g ENSGT00950000183053.A.a.b Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 83 ENSGT00520000055667 ENSGT00940000159019 ENSGT00390000015114 ENSGT00390000009719 ENSGT00390000010209.c.b ENSGT00950000183186.B.b.c ENSGT00390000017627.a.a.b ENSGT00520000055567.b ENSGT00620000087993.a.b ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371.f #23 ENSGT00940000154868.a.b.b ENSGT00390000016565.g #18 ENSGT00390000015719.c.c #16 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00940000155194.v.b #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585.c.a #12 ENSGT00940000165028.a ENSGT00940000157034 ENSGT00940000157669.a.b ENSGT00940000155543 ENSGT00940000157582.g ENSGT00950000183053.A.a.b Mangrove rivulus MODERN SPECIES 402 deptor (ENSKMAG00000020928) LIMD1 (ENSKMAG00000020912) lars2 (ENSKMAG00000020875) TMEM158 (ENSKMAG00000020865) CLEC3B (ENSKMAG00000020857) ENSKMAG00000020849 ENSKMAG00000020836 CEP85 (ENSKMAG00000020811) wdtc1 (ENSKMAG00000020782) #22 tmem222a (ENSKMAG00000020767) #23 tpbgl (ENSKMAG00000020751) ENSKMAG00000020738 #18 nr0b2a (ENSKMAG00000020730) #16 gpatch3 (ENSKMAG00000020717) #15 gpn2 (ENSKMAG00000020696) #14 ARID1A (ENSKMAG00000020627) #10 pigv (ENSKMAG00000020611) #11 zdhhc18a (ENSKMAG00000020602) #12 ENSKMAG00000020593 Turquoise killifish MODERN SPECIES 29 COX20 (ENSNFUG00015014283) ENSNFUG00015014259 deptor (ENSNFUG00015014220) LIMD1 (ENSNFUG00015014106) LARS2 (ENSNFUG00015022107) TMEM158 (ENSNFUG00015022097) cdcp1a (ENSNFUG00015022084) CLEC3BA (ENSNFUG00015022077) ENSNFUG00015022074 ENSNFUG00015022071 CEP85 (ENSNFUG00015022060) wdtc1 (ENSNFUG00015021980) #22 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157222.b ENSGT00390000018110 ENSGT00390000017400 ENSGT00390000001515 ENSGT00940000153769.F.n ENSGT00520000055667 ENSGT00940000159019 ENSGT00390000015114 ENSGT00390000009719 ENSGT00390000010209.c.b ENSGT00950000183186.B.b.c ENSGT00390000017627.a.a.b ENSGT00940000178119 ENSGT00520000055567.b ENSGT00620000087993.a.b ENSGT00950000182900.B #22 ENSGT00390000007371.f #23 ENSGT00940000154868.a.b.b ENSGT00390000016565.g #18 ENSGT00390000015719.c.c #16 ENSGT00390000004191 #15 ENSGT00950000183172.B #14 ENSGT00940000155194.v.b #10 ENSGT00390000013174 #11 ENSGT00940000156585.c.a #12 ENSGT00940000165028.a ENSGT00940000157034 ENSGT00940000157669.a.b ENSGT00940000155543 ENSGT00940000157582.g ENSGT00950000183053.A.a.b Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000157222.b ENSGT00390000018110 ENSGT00390000017400 ENSGT00390000001515 ENSGT00940000153769.F.n ENSGT00520000055667.j 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gpn2 (ENSECRG00000018368) #14 tbxta (ENSECRG00000018388) ARID1A (ENSECRG00000018433) #10 pigv (ENSECRG00000018504) #11 zdhhc18b (ENSECRG00000018524) #12 tent5bb (ENSECRG00000018545) ENSECRG00000018553 #19 rps6ka1 (ENSECRG00000018755) #9 cnksr1 (ENSECRG00000020115) Elephant shark MODERN SPECIES 1521 yrdc (ENSCMIG00000019103) ENSCMIG00000019100 ENSCMIG00000019098 ENSCMIG00000019096 ENSCMIG00000019092 ENSCMIG00000019084 ENSCMIG00000019081 ENSCMIG00000019077 C1orf109 (ENSCMIG00000019075) GRIK3 (ENSCMIG00000018961) ZC3H12A (ENSCMIG00000018915) nt5c1aa (ENSCMIG00000018912) ENSCMIG00000018847 sytl1 (ENSCMIG00000018815) #24 slc9a1b (ENSCMIG00000018806) #21 wdtc1 (ENSCMIG00000018800) #22 ENSCMIG00000018798 ENSCMIG00000018797 #18 nudc (ENSCMIG00000018794) #17 nr0b2a (ENSCMIG00000018792) #16 gpatch3 (ENSCMIG00000018791) #15 gpn2 (ENSCMIG00000018789) #14 zdhhc18b (ENSCMIG00000018788) #12 pigv (ENSCMIG00000018785) #11 ARID1A (ENSCMIG00000018700) #10 ENSCMIG00000018657 ENSCMIG00000018656 dhdds (ENSCMIG00000018655) #7 ENSCMIG00000018653 pdik1l (ENSCMIG00000018650) paqr7b (ENSCMIG00000018648) Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182900.B #22 Hagfish MODERN SPECIES 1445 cul5a (ENSEBUG00000002025) wdtc1 (ENSEBUG00000011105) #22 ENSEBUG00000013839 ENSEBUG00000013487 ENSEBUG00000015299 ENSEBUG00000000307 MRPS9 (ENSEBUG00000009642) Ciona ANCESTRAL SPECIES 442 ENSGT00940000166784 ENSGT00940000165506.C ENSGT00950000182900.B #22 Ciona savignyi MODERN SPECIES 2 ENSCSAVG00000011086 ENSCSAVG00000011087 ENSCSAVG00000011118 ENSCSAVG00000011122 ENSCSAVG00000011124 ENSCSAVG00000011125 ENSCSAVG00000011127 ENSCSAVG00000011128 ENSCSAVG00000011129 ENSCSAVG00000011130 ENSCSAVG00000011131 ENSCSAVG00000011132 ENSCSAVG00000011133 ENSCSAVG00000011135 ENSCSAVG00000011147 ENSCSAVG00000011151 #22 ENSCSAVG00000011159 ENSCSAVG00000011160 ENSCSAVG00000011163 ENSCSAVG00000011169 ENSCSAVG00000011171 ENSCSAVG00000011172 ENSCSAVG00000011174 ENSCSAVG00000011186 ENSCSAVG00000011278 ENSCSAVG00000011318 ENSCSAVG00000011328 ENSCSAVG00000011331 ENSCSAVG00000011340 ENSCSAVG00000011341 ENSCSAVG00000011342 Ciona intestinalis MODERN SPECIES 7 ENSCING00000008991 ENSCING00000008990 ENSCING00000009858 zf(ring)-26 (ENSCING00000008989) ENSCING00000008988 ENSCING00000019877 ENSCING00000024685 ENSCING00000018311 ENSCING00000008984 ENSCING00000024962 ENSCING00000012455 ENSCING00000009017 ENSCING00000009016 ENSCING00000012460 ENSCING00000012461 ENSCING00000009015 #22 ENSCING00000009013 ENSCING00000022973 ENSCING00000019058 ENSCING00000023943 ENSCING00000023794 ENSCING00000009019 ENSCING00000012443 ENSCING00000018656 ENSCING00000009023 smad6/7 (ENSCING00000009022) ENSCING00000009021 ENSCING00000009859 ENSCING00000023609 ENSCING00000012449 ENSCING00000009020 Ecdysozoa ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182900.B #22 Caenorhabditis elegans MODERN SPECIES mrpl-15 (WBGene00022373) F37F2.2 (WBGene00018159) spe-15 (WBGene00004969) gst-25 (WBGene00001773) F47G6.3 (WBGene00018580) acs-16 (WBGene00018579) dyb-1 (WBGene00001115) Y92H12A.5 (WBGene00022361) ints-3 (WBGene00022360) Y92H12A.2 (WBGene00022358) src-1 (WBGene00005077) Y73E7A.3 (WBGene00022270) cpx-1 (WBGene00022271) aatf-1 (WBGene00022269) Y73E7A.6 (WBGene00022273) adpr-1 (WBGene00044440) #22 bre-4 (WBGene00000269) Y73E7A.1 (WBGene00022268) Y73E7A.8 (WBGene00022274) mab-20 (WBGene00003111) Y71G12B.18 (WBGene00022156) pqn-88 (WBGene00004168) Y71G12B.33 (WBGene00044358) Y71G12B.22 (WBGene00022157) Y71G12B.17 (WBGene00022155) Y71G12B.23 (WBGene00022158) Y71G12B.35 (WBGene00185098) drag-1 (WBGene00022154) Y71G12B.31 (WBGene00044348) ubc-3 (WBGene00006702) lsm-6 (WBGene00003080) Fruitfly MODERN SPECIES 17 CG10911 (FBgn0034295) CG10912 (FBgn0034296) CG34386 (FBgn0085415) CG5757 (FBgn0034299) CG5098 (FBgn0034300) CG5756 (FBgn0034301) CG34196 (FBgn0085225) stau (FBgn0003520) Spn55B (FBgn0028983) Dlip3 (FBgn0040465) Hsf (FBgn0001222) Pcl (FBgn0003044) pAbp (FBgn0265297) EMRE (FBgn0062440) CG5742 (FBgn0034304) adp (FBgn0000057) #22 lolal (FBgn0022238) CG10914 (FBgn0034307) Naus (FBgn0034308) Nup75 (FBgn0034310) CG42518 (FBgn0260392) MED9 (FBgn0260401) Dgp-1 (FBgn0027836) CG10916 (FBgn0034312) CG5726 (FBgn0034313) nopo (FBgn0034314) CG5721 (FBgn0034315) CG33958 (FBgn0053958) CG14499 (FBgn0034317) CG14500 (FBgn0034318) CG30114 (FBgn0050114) Bilateria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182900.C ##22 Chordata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182900.C ##22 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182900.C ##22 Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182900.C ##22 Hagfish DUPLICATION Hagfish MODERN SPECIES 1207 ENSEBUG00000008503 ENSEBUG00000013571 hgd (ENSEBUG00000011671) ENSEBUG00000010712 ENSEBUG00000010693 ENSEBUG00000006387 ##22 ENSEBUG00000016772 ##22 ENSEBUG00000013657 ENSEBUG00000015252 Hagfish MODERN SPECIES 1207 ENSEBUG00000008503 ENSEBUG00000013571 hgd (ENSEBUG00000011671) ENSEBUG00000010712 ENSEBUG00000010693 ENSEBUG00000006387 ##22 ENSEBUG00000016772 ##22 ENSEBUG00000013657 ENSEBUG00000015252 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00510000047120 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 ENSGT00390000010308 ENSGT00950000182827.A ENSGT00940000164470 ENSGT00520000055625.a ENSGT00940000155202 ENSGT00940000154517 ENSGT00530000063528.B ENSGT00940000166930 ENSGT00940000166107 ENSGT00990000203619.A.a ENSGT01030000234518.C.b ENSGT01060000248589.C Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT00390000017311 ENSGT00390000018244 ENSGT00390000009400 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C ENSGT00390000010760 ENSGT00510000047120 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 ENSGT00390000010308 ENSGT00950000182827.A ENSGT00940000164470 ENSGT00520000055625.a ENSGT00940000155202 ENSGT00940000154517 ENSGT00530000063528.B ENSGT00940000166930 ENSGT00940000166107 ENSGT00940000160782 ENSGT00940000154443 ENSGT00940000153244.B Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 229 ENSGT00940000159906 ENSGT00390000017311 ENSGT00390000018244 ENSGT00390000009400 ENSGT00940000158946 ENSGT01030000234579.C ENSGT00390000010760 ENSGT00510000047120 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 ENSGT00390000010308 ENSGT00940000164470 ENSGT00950000182827.A ENSGT00530000063528.B ENSGT00940000166930 ENSGT00940000166107 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 338 ENSGT00510000047120 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 Amniota ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a ENSGT00970000196888 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00390000006659 ENSGT00390000018525.a.b ENSGT00940000160000 ENSGT00390000010760 ENSGT01030000234579.C ENSGT00940000158946 ENSGT00390000009400 ENSGT00390000018244 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 ENSGT00390000010308 ENSGT00940000164470 ENSGT00950000182827.A ENSGT00940000161699 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000018059.b ENSGT00940000160836.d ENSGT00440000039028 ENSGT00390000011644 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a ENSGT00390000001322 ENSGT00510000047120 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00390000006659 ENSGT00390000018525.a.b ENSGT00940000160000 ENSGT00940000165676 ENSGT00390000010760 ENSGT01030000234579.C ENSGT00940000158946 ENSGT00390000009400 ENSGT00390000018244 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 ENSGT00940000161063 ENSGT00940000160168 ENSGT00390000000464 Theria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000160836.d ENSGT00940000162904 ENSGT00440000039028 ENSGT00390000011644 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00940000153997.b.a.b 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ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT00390000001322 ENSGT00510000047120 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00390000006659 ENSGT00390000018525.a.b ENSGT00940000160000 ENSGT01100000263557.A.b.b ENSGT00940000165676 ENSGT00390000010760 ENSGT01030000234579.C ENSGT00940000158946 ENSGT00390000009400 ENSGT00390000018244 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 ENSGT00940000161063.e.a ENSGT00940000161063.e.b Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000162904.a.a ENSGT00940000160836.d ENSGT00940000162904.b ENSGT00440000039028 ENSGT00390000011644 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT00390000001322 ENSGT00510000047120 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00390000006659 ENSGT00390000018525.a.b ENSGT00940000160000 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Caprinae ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00390000018059.b ENSGT00940000162904 ENSGT00440000039028 ENSGT00390000011644 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a ENSGT00390000001322 ENSGT00510000047120 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00390000001447.lb.b ENSGT00940000157829 ENSGT00390000006659 ENSGT00390000018525.a.b ENSGT00940000160000 ENSGT00940000163962 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES FAM78B (ENSOARG00020001972) ENSOARG00020001986 POGK (ENSOARG00020002000) TADA1 (ENSOARG00020002011) ILDR2 (ENSOARG00020002154) MAEL (ENSOARG00020002619) GPA33 (ENSOARG00020002684) STYXL2 (ENSOARG00020002699) POU2F1 (ENSOARG00020002732) CD247 (ENSOARG00020002799) CREG1 (ENSOARG00020002817) RCSD1 (ENSOARG00020002827) MPZL1 (ENSOARG00020002842) ADCY10 (ENSOARG00020002882) MPC2 (ENSOARG00020003003) DCAF6 (ENSOARG00020003205) ##22 GPR161 (ENSOARG00020005125) 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ENSGT00390000018525.a.b ENSGT00940000160000 ENSGT01100000263557.A.b.b ENSGT00390000010760 ENSGT01030000234579.C ENSGT00940000158946 ENSGT00390000009400 ENSGT00390000018244 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 ENSGT00940000161063 ENSGT00940000162076 ENSGT00940000160168 Pig MODERN SPECIES 12 ENSSSCG00000006320 ENSSSCG00000060092 POGK (ENSSSCG00000006319) TADA1 (ENSSSCG00000006318) ILDR2 (ENSSSCG00000035124) MAEL (ENSSSCG00000006316) GPA33 (ENSSSCG00000006312) STYXL2 (ENSSSCG00000006311) POU2F1 (ENSSSCG00000006310) CD247 (ENSSSCG00000006309) CREG1 (ENSSSCG00000006308) RCSD1 (ENSSSCG00000006307) MPZL1 (ENSSSCG00000006306) ADCY10 (ENSSSCG00000006305) MPC2 (ENSSSCG00000006304) DCAF6 (ENSSSCG00000006303) ##22 GPR161 (ENSSSCG00000006302) TIPRL (ENSSSCG00000006301) SFT2D2 (ENSSSCG00000031617) TBX19 (ENSSSCG00000006299) ENSSSCG00000044238 XCL1 (ENSSSCG00000006298) DPT (ENSSSCG00000035937) ATP1B1 (ENSSSCG00000006296) NME7 (ENSSSCG00000006294) BLZF1 (ENSSSCG00000022396) CCDC181 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ENSGT00390000018059.b ENSGT00940000160836.d ENSGT00440000039028 ENSGT00390000011644 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a ENSGT00390000001322 ENSGT00510000047120 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00390000006659 ENSGT00390000018525.a.b ENSGT00940000160000 ENSGT00940000165676 ENSGT01100000263557.A.b.b ENSGT00390000010760 ENSGT01030000234579.C ENSGT00940000158946 ENSGT00390000009400 ENSGT00390000018244 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 ENSGT00940000161063 ENSGT00940000162076 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000018059.b ENSGT00940000160836.d ENSGT00440000039028 ENSGT00390000011644 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a 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ENSGT00940000158556 ENSGT00940000161063 ENSGT00940000162076 ENSGT00940000160168 Felidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000154289.B ENSGT00440000039028 ENSGT00390000011644 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00950000185149 ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a.k ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a ENSGT00390000001322 ENSGT00510000047120 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00390000006659 ENSGT00390000018525.a.b ENSGT00940000160000 ENSGT01100000263557.A.b.b ENSGT00390000010760 ENSGT01030000234579.C ENSGT00940000158946 ENSGT00390000009400 ENSGT00390000018244 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 ENSGT00940000161063 ENSGT00940000162076 ENSGT00940000160168 Panthera ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000154289.B ENSGT00440000039028 ENSGT00390000011644 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00950000185149 ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 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ENSGT01030000234579.C ENSGT00940000158946 ENSGT00390000009400 ENSGT00390000018244 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 ENSGT00940000161063 ENSGT00940000162076 ENSGT00940000160168 leopard MODERN SPECIES 4 GREM2 (ENSPPRG00000018431) FMN2 (ENSPPRG00000007138) POGK (ENSPPRG00000005433) TADA1 (ENSPPRG00000004853) ILDR2 (ENSPPRG00000004118) MAEL (ENSPPRG00000003002) GPA33 (ENSPPRG00000000746) STYXL2 (ENSPPRG00000000420) POU2F1 (ENSPPRG00000000216) CD247 (ENSPPRG00000023277) CREG1 (ENSPPRG00000019626) RCSD1 (ENSPPRG00000017716) MPZL1 (ENSPPRG00000015560) ADCY10 (ENSPPRG00000013005) MPC2 (ENSPPRG00000009574) DCAF6 (ENSPPRG00000008789) ##22 GPR161 (ENSPPRG00000003308) TIPRL (ENSPPRG00000001883) SFT2D2 (ENSPPRG00000001530) TBX19 (ENSPPRG00000000719) ENSPPRG00000000315 DPT (ENSPPRG00000022606) ATP1B1 (ENSPPRG00000022684) NME7 (ENSPPRG00000023098) BLZF1 (ENSPPRG00000024249) CCDC181 (ENSPPRG00000022585) SLC19A2 (ENSPPRG00000016714) ENSPPRG00000013883 F5 (ENSPPRG00000013583) SELP 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ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161899 ENSGT00440000039028 ENSGT00390000011644 ENSGT00950000185149 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a.k ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a ENSGT00390000001322 ENSGT00510000047120 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00390000006659 ENSGT00390000018525.a.b ENSGT00940000160000 ENSGT01100000263557.A.b.b ENSGT00390000010760 ENSGT01030000234579.C ENSGT00940000158946 ENSGT00390000009400 ENSGT00390000018244 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 ENSGT00940000161063 ENSGT00940000162076 ENSGT00940000160168 Dingo MODERN SPECIES 271 FMN2 (ENSCAFG00020023044) POGK (ENSCAFG00020023039) TADA1 (ENSCAFG00020023038) ENSCAFG00020023036 ILDR2 (ENSCAFG00020022873) MAEL (ENSCAFG00020022822) GPA33 (ENSCAFG00020022816) STYXL2 (ENSCAFG00020022815) POU2F1 (ENSCAFG00020022783) ENSCAFG00020022762 CREG1 (ENSCAFG00020022760) RCSD1 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ENSGT01030000234556.a.b.a ENSGT00390000001322 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00390000006659 ENSGT00390000018525.a.b ENSGT00940000160000 ENSGT01100000263557.A.b.b ENSGT00390000010760 ENSGT01030000234579.C American mink MODERN SPECIES 417 ENSNVIG00000024519 RCSD1 (ENSNVIG00000024517) MPZL1 (ENSNVIG00000024514) ADCY10 (ENSNVIG00000024503) DCAF6 (ENSNVIG00000024499) ##22 GPR161 (ENSNVIG00000024498) TIPRL (ENSNVIG00000024494) SFT2D2 (ENSNVIG00000024491) TBX19 (ENSNVIG00000024489) XCL1 (ENSNVIG00000024486) DPT (ENSNVIG00000024484) Ferret MODERN SPECIES 460 RCSD1 (ENSMPUG00000000559) MPZL1 (ENSMPUG00000000550) ADCY10 (ENSMPUG00000000543) DCAF6 (ENSMPUG00000000538) ##22 GPR161 (ENSMPUG00000000536) TIPRL (ENSMPUG00000000533) SFT2D2 (ENSMPUG00000000531) TBX19 (ENSMPUG00000000522) ENSMPUG00000000519 ENSMPUG00000000517 ENSMPUG00000000514 ENSMPUG00000000513 ENSMPUG00000000511 DPT (ENSMPUG00000000509) ATP1B1 (ENSMPUG00000000508) Ursidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154209.a.b ENSGT00940000161899 ENSGT00440000039028 ENSGT00390000011644 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a.k ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a ENSGT00390000001322 ENSGT00510000047120.ab ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00390000006659 ENSGT00390000018525.a.b ENSGT00940000160000 ENSGT01100000263557.A.b.b ENSGT00390000010760.l ENSGT01030000234579.C.d ENSGT00940000158946 ENSGT00390000009400 ENSGT00390000018244 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556.j ENSGT00940000161063 ENSGT00940000162076 ENSGT00940000160168 Giant Panda MODERN SPECIES 18 RGS7 (ENSAMEG00000014028) GREM2 (ENSAMEG00000030827) ENSAMEG00000030686 ENSAMEG00000014071 ENSAMEG00000000017 MAEL (ENSAMEG00000000018) GPA33 (ENSAMEG00000000019) STYXL2 (ENSAMEG00000000020) POU2F1 (ENSAMEG00000000021) CD247 (ENSAMEG00000000022) CREG1 (ENSAMEG00000030316) RCSD1 (ENSAMEG00000006253) MPZL1 (ENSAMEG00000006264) ADCY10 (ENSAMEG00000025814) MPC2 (ENSAMEG00000006273) DCAF6 (ENSAMEG00000006284) ##22 GPR161 (ENSAMEG00000006340) TIPRL (ENSAMEG00000015479) TBX19 (ENSAMEG00000004326) ENSAMEG00000029912 DPT (ENSAMEG00000024315) ENSAMEG00000011522 NME7 (ENSAMEG00000011496) BLZF1 (ENSAMEG00000011473) CCDC181 (ENSAMEG00000011462) SLC19A2 (ENSAMEG00000011458) F5 (ENSAMEG00000011403) SELP (ENSAMEG00000011331) SELL (ENSAMEG00000011311) SELE (ENSAMEG00000011258) METTL18 (ENSAMEG00000019804) Ursus ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a.k ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a ENSGT00390000001322 ENSGT00510000047120.ab ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00390000006659 ENSGT00390000018525.a.b ENSGT00940000160000 ENSGT01100000263557.A.b.b ENSGT00390000010760.l ENSGT01030000234579.C.d ENSGT00940000158946 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bear MODERN SPECIES 2356 MPC2 (ENSUAMG00000007899) DCAF6 (ENSUAMG00000007905) ##22 GPR161 (ENSUAMG00000007976) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162904 ENSGT00440000039028 ENSGT00390000011644 ENSGT00950000185149 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a ENSGT00390000001322 ENSGT00510000047120 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00390000006659 ENSGT00390000018525.a.b ENSGT00940000160000 ENSGT01100000263557.A.b.b ENSGT00390000010760 ENSGT01030000234579.C ENSGT00940000158946 ENSGT00390000009400 ENSGT00390000018244 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 ENSGT00940000161063 ENSGT00940000162076 ENSGT00940000160168 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162904 ENSGT00440000039028 ENSGT00390000011644 ENSGT00950000185149 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 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ENSGT00940000160168 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 2 Gm4846 (ENSPEMG00000014518) Pogk (ENSPEMG00000016935) Tada1 (ENSPEMG00000001422) Ildr2 (ENSPEMG00000010455) Mael (ENSPEMG00000028769) Gpa33 (ENSPEMG00000021697) Dusp27 (ENSPEMG00000023293) Pou2f1 (ENSPEMG00000026471) Cd247 (ENSPEMG00000022519) Creg1 (ENSPEMG00000021993) Rcsd1 (ENSPEMG00000022454) Mpzl1 (ENSPEMG00000022310) ENSPEMG00000030485 Adcy10 (ENSPEMG00000009112) Mpc2 (ENSPEMG00000022372) Dcaf6 (ENSPEMG00000023920) ##22 Gpr161 (ENSPEMG00000025952) Tiprl (ENSPEMG00000023157) ENSPEMG00000023312 Sft2d2 (ENSPEMG00000015870) Tbx19 (ENSPEMG00000022626) Xcl1 (ENSPEMG00000019474) Dpt (ENSPEMG00000019351) Atp1b1 (ENSPEMG00000020031) ENSPEMG00000030544 Nme7 (ENSPEMG00000020011) Blzf1 (ENSPEMG00000019649) Ccdc181 (ENSPEMG00000019471) Slc19a2 (ENSPEMG00000019561) F5 (ENSPEMG00000019577) Selp (ENSPEMG00000020102) Prairie vole MODERN SPECIES 153 Gm4846 (ENSMOCG00000007775) ENSMOCG00000022763 Pogk (ENSMOCG00000005507) Tada1 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ENSGT00390000010760 ENSGT01030000234579.C ENSGT00940000158946 ENSGT00390000009400 ENSGT00390000018244 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 ENSGT00940000161063 ENSGT00940000162076 ENSGT00940000160168 Mouse MODERN SPECIES Gm4847 (ENSMUSG00000051081) Gm4846 (ENSMUSG00000086056) Pogk (ENSMUSG00000040596) Tada1 (ENSMUSG00000026563) Ildr2 (ENSMUSG00000040612) Mael (ENSMUSG00000040629) Gpa33 (ENSMUSG00000000544) Dusp27 (ENSMUSG00000026564) Pou2f1 (ENSMUSG00000026565) Cd247 (ENSMUSG00000005763) Creg1 (ENSMUSG00000040713) Rcsd1 (ENSMUSG00000040723) Mpzl1 (ENSMUSG00000026566) Adcy10 (ENSMUSG00000026567) Mpc2 (ENSMUSG00000026568) Dcaf6 (ENSMUSG00000026571) ##22 Gpr161 (ENSMUSG00000040836) Tiprl (ENSMUSG00000040843) Sft2d2 (ENSMUSG00000040848) Tbx19 (ENSMUSG00000026572) Xcl1 (ENSMUSG00000026573) Dpt (ENSMUSG00000026574) Atp1b1 (ENSMUSG00000026576) Nme7 (ENSMUSG00000026575) Blzf1 (ENSMUSG00000026577) Ccdc181 (ENSMUSG00000026578) Slc19a2 (ENSMUSG00000040918) F5 (ENSMUSG00000026579) Selp 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Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1874 Dcaf6 (ENSNGAG00000000565) ##22 Gpr161 (ENSNGAG00000015606) ENSNGAG00000012044 ENSNGAG00000011114 Sft2d2 (ENSNGAG00000011625) Tbx19 (ENSNGAG00000017170) ENSNGAG00000015040 Dpt (ENSNGAG00000011655) Atp1b1 (ENSNGAG00000008905) Nme7 (ENSNGAG00000013080) Blzf1 (ENSNGAG00000017469) Ccdc181 (ENSNGAG00000013174) Slc19a2 (ENSNGAG00000020534) F5 (ENSNGAG00000019816) Selp (ENSNGAG00000010565) Sell (ENSNGAG00000020396) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 68 Creg1 (ENSJJAG00000002260) Rcsd1 (ENSJJAG00000011303) ENSJJAG00000017172 ENSJJAG00000016985 Adcy10 (ENSJJAG00000010438) Mpc2 (ENSJJAG00000023856) Dcaf6 (ENSJJAG00000006446) ##22 ENSJJAG00000023724 Gpr161 (ENSJJAG00000020745) ENSJJAG00000011484 Sft2d2 (ENSJJAG00000018560) Tbx19 (ENSJJAG00000022328) ENSJJAG00000011688 Xcl1 (ENSJJAG00000014577) Dpt (ENSJJAG00000021367) Atp1b1 (ENSJJAG00000017903) Nme7 (ENSJJAG00000013080) Blzf1 (ENSJJAG00000012171) Ccdc181 (ENSJJAG00000002620) Slc19a2 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ENSGT00940000160168 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000160836.d ENSGT00940000162904 ENSGT00440000039028 ENSGT00390000011644 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a ENSGT00390000001322 ENSGT00510000047120 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00390000006659.q ENSGT00390000018525.a.b ENSGT00940000160000 ENSGT01100000263557.A.b.b ENSGT00390000010760 ENSGT01030000234579.C ENSGT00940000158946 ENSGT00390000009400 ENSGT00390000018244 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 ENSGT00940000161063 ENSGT00940000162076 ENSGT00940000160168 Alpin marmot MODERN SPECIES 29 ENSMMMG00000020622 ENSMMMG00000020613 POGK (ENSMMMG00000020598) TADA1 (ENSMMMG00000020592) ILDR2 (ENSMMMG00000020581) MAEL (ENSMMMG00000020549) GPA33 (ENSMMMG00000020543) ENSMMMG00000020541 POU2F1 (ENSMMMG00000020142) CD247 (ENSMMMG00000020139) 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ENSGT00940000160000 ENSGT01100000263557.A.b.b ENSGT00390000010760 ENSGT01030000234579.C ENSGT00940000158946 ENSGT00390000009400 ENSGT00390000018244 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 ENSGT00940000161063 ENSGT00940000162076 ENSGT00940000160168 Squirrel MODERN SPECIES 81 ENSSTOG00000001862 ENSSTOG00000025310 POGK (ENSSTOG00000025009) TADA1 (ENSSTOG00000006199) ILDR2 (ENSSTOG00000015430) MAEL (ENSSTOG00000015434) GPA33 (ENSSTOG00000010462) STYXL2 (ENSSTOG00000010472) POU2F1 (ENSSTOG00000005980) CD247 (ENSSTOG00000027006) ENSSTOG00000032814 RCSD1 (ENSSTOG00000027565) MPZL1 (ENSSTOG00000008875) ADCY10 (ENSSTOG00000003252) ENSSTOG00000034079 DCAF6 (ENSSTOG00000002913) ##22 GPR161 (ENSSTOG00000024601) ENSSTOG00000014921 SFT2D2 (ENSSTOG00000030565) TBX19 (ENSSTOG00000019913) ENSSTOG00000014588 DPT (ENSSTOG00000029188) ATP1B1 (ENSSTOG00000011473) NME7 (ENSSTOG00000011478) BLZF1 (ENSSTOG00000011491) CCDC181 (ENSSTOG00000023591) SLC19A2 (ENSSTOG00000008889) F5 (ENSSTOG00000008897) SELP (ENSSTOG00000008931) SELL (ENSSTOG00000008958) SELE (ENSSTOG00000008973) Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 314 DCAF6 (ENSUPAG00010011091) ##22 GPR161 (ENSUPAG00010011079) ENSUPAG00010011074 TIPRL (ENSUPAG00010011057) SFT2D2 (ENSUPAG00010011039) TBX19 (ENSUPAG00010011029) ENSUPAG00010011020 DPT (ENSUPAG00010011014) ATP1B1 (ENSUPAG00010010998) NME7 (ENSUPAG00010010951) BLZF1 (ENSUPAG00010010941) CCDC181 (ENSUPAG00010010935) SLC19A2 (ENSUPAG00010010910) F5 (ENSUPAG00010010738) SELP (ENSUPAG00010010702) ENSUPAG00010010678 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 3 ENSSVLG00005008667 ENSSVLG00005008356 ENSSVLG00005008109 POGK (ENSSVLG00005008055) TADA1 (ENSSVLG00005008032) ILDR2 (ENSSVLG00005007571) MAEL (ENSSVLG00005007267) GPA33 (ENSSVLG00005007183) STYXL2 (ENSSVLG00005007140) ENSSVLG00005006838 CD247 (ENSSVLG00005006678) CREG1 (ENSSVLG00005006640) RCSD1 (ENSSVLG00005006562) ADCY10 (ENSSVLG00005006248) MPC2 (ENSSVLG00005006196) DCAF6 (ENSSVLG00005005682) ##22 GPR161 (ENSSVLG00005005499) 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ENSGT00940000161063 ENSGT00940000162076 ENSGT00940000160168 Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 20 MAEL (ENSHGLG00000013438) GPA33 (ENSHGLG00000002446) STYXL2 (ENSHGLG00000050560) ENSHGLG00000002671 POU2F1 (ENSHGLG00000003955) CD247 (ENSHGLG00000044870) CREG1 (ENSHGLG00000003531) RCSD1 (ENSHGLG00000004154) ENSHGLG00000048142 MPZL1 (ENSHGLG00000050117) ENSHGLG00000042405 ENSHGLG00000004748 ENSHGLG00000050084 ENSHGLG00000034812 ENSHGLG00000020687 DCAF6 (ENSHGLG00000007535) ##22 GPR161 (ENSHGLG00000009958) TIPRL (ENSHGLG00000010990) ENSHGLG00000038783 TBX19 (ENSHGLG00000001534) ENSHGLG00000001604 ENSHGLG00000033916 DPT (ENSHGLG00000001646) ENSHGLG00000046760 ATP1B1 (ENSHGLG00000041771) NME7 (ENSHGLG00000002119) BLZF1 (ENSHGLG00000003011) ENSHGLG00000050690 ENSHGLG00000040907 SLC19A2 (ENSHGLG00000001890) F5 (ENSHGLG00000002250) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 22 ENSHGLG00000043622 ENSHGLG00000032785 ENSHGLG00000005496 ENSHGLG00000004699 ENSHGLG00000004553 ENSHGLG00000035939 ENSHGLG00000025302 GALNT5 (ENSHGLG00000040944) ERMN (ENSHGLG00000044020) CYTIP (ENSHGLG00000049755) ACVR1C (ENSHGLG00000007777) ACVR1 (ENSHGLG00000006379) UPP2 (ENSHGLG00000004451) CCDC148 (ENSHGLG00000004309) ENSHGLG00000007575 ENSHGLG00000004955 ##22 ENSHGLG00000009016 ENSHGLG00000048160 TANC1 (ENSHGLG00000014465) WDSUB1 (ENSHGLG00000014132) BAZ2B (ENSHGLG00000011355) MARCHF7 (ENSHGLG00000008628) CD302 (ENSHGLG00000007983) LY75 (ENSHGLG00000005575) PLA2R1 (ENSHGLG00000007846) ITGB6 (ENSHGLG00000006124) RBMS1 (ENSHGLG00000010387) ENSHGLG00000038629 ENSHGLG00000020395 ENSHGLG00000005114 ENSHGLG00000005063 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000162904.l ENSGT00940000162904.k ENSGT00440000039028 ENSGT00390000011644 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a ENSGT00390000001322 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ENSGT00940000158556 ENSGT00940000161063 ENSGT00940000162076 ENSGT00940000160168 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160836.d ENSGT00440000039028 ENSGT00390000011644 ENSGT00950000185149 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a ENSGT00390000001322 ENSGT00510000047120.i ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00390000006659 ENSGT00390000018525.a.b ENSGT00940000160000 ENSGT01100000263557.A.b.b ENSGT00390000010760 ENSGT01030000234579.C ENSGT00940000158946 ENSGT00390000009400 ENSGT00390000018244 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 ENSGT00940000161063 ENSGT00940000162076 ENSGT00940000160168 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000160836.d ENSGT00440000039028 ENSGT00390000011644 ENSGT00950000185149 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a ENSGT00390000001322 ENSGT00510000047120.i ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00390000006659 ENSGT00390000018525.a.b ENSGT00940000160000 ENSGT01100000263557.A.b.b ENSGT00390000010760 ENSGT01030000234579.C ENSGT00940000158946 ENSGT00390000009400 ENSGT00390000018244 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 ENSGT00940000161063 ENSGT00940000162076 ENSGT00940000160168 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 74 ENSGT00940000160836.d ENSGT00440000039028 ENSGT00390000011644 ENSGT00950000185149 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a ENSGT00390000001322 ENSGT00510000047120.i ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00390000006659 ENSGT00390000018525.a.b ENSGT00940000160000 ENSGT01100000263557.A.b.b ENSGT00390000010760 ENSGT01030000234579.C ENSGT00940000158946 ENSGT00390000009400 ENSGT00390000018244 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 ENSGT00940000161063 ENSGT00940000162076 ENSGT00940000160168 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 402 POGK (ENSPSMG00000010550) TADA1 (ENSPSMG00000010532) ENSPSMG00000010520 ILDR2 (ENSPSMG00000010338) ENSPSMG00000010195 MAEL (ENSPSMG00000010178) GPA33 (ENSPSMG00000010109) STYXL2 (ENSPSMG00000010097) POU2F1 (ENSPSMG00000010072) CD247 (ENSPSMG00000010011) CREG1 (ENSPSMG00000010004) RCSD1 (ENSPSMG00000010002) MPZL1 (ENSPSMG00000009994) ENSPSMG00000009893 ENSPSMG00000009886 DCAF6 (ENSPSMG00000009296) ##22 GPR161 (ENSPSMG00000008747) TIPRL (ENSPSMG00000008663) SFT2D2 (ENSPSMG00000008638) S1PR1 (ENSPSMG00000008592) Coquerels sifaka MODERN SPECIES 718 FAM78B (ENSPCOG00000025796) POGK (ENSPCOG00000022929) ENSPCOG00000020977 ILDR2 (ENSPCOG00000012242) MAEL (ENSPCOG00000007295) GPA33 (ENSPCOG00000017837) STYXL2 (ENSPCOG00000015602) POU2F1 (ENSPCOG00000000741) CD247 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ENSOGAG00000011103 DPT (ENSOGAG00000009625) ATP1B1 (ENSOGAG00000010046) NME7 (ENSOGAG00000010051) BLZF1 (ENSOGAG00000010058) CCDC181 (ENSOGAG00000029896) SLC19A2 (ENSOGAG00000010060) ENSOGAG00000010063 SELP (ENSOGAG00000010076) SELL (ENSOGAG00000010080) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000018059.b ENSGT00440000039028 ENSGT00390000011644 ENSGT00950000185149 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a ENSGT00390000001322 ENSGT00510000047120 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00390000006659 ENSGT00390000018525.a.b ENSGT00940000160000 ENSGT01100000263557.A.b.b ENSGT00390000010760 ENSGT01030000234579.C ENSGT00940000158946 ENSGT00390000009400 ENSGT00390000018244 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 ENSGT00940000161063 ENSGT00940000162076 ENSGT00940000160168 Tarsier MODERN SPECIES 6103 ENSTSYG00000010225 MPC2 (ENSTSYG00000010251) DCAF6 (ENSTSYG00000000017) ##22 ENSTSYG00000036206 GPR161 (ENSTSYG00000026789) TIPRL (ENSTSYG00000002121) SFT2D2 (ENSTSYG00000001382) TBX19 (ENSTSYG00000004961) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000018059.b ENSGT00440000039028 ENSGT00390000011644 ENSGT00950000185149 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a ENSGT00390000001322 ENSGT00510000047120 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00390000006659 ENSGT00390000018525.a.b ENSGT00940000160000 ENSGT01100000263557.A.b.b ENSGT00390000010760 ENSGT01030000234579.C ENSGT00940000158946 ENSGT00390000009400 ENSGT00390000018244 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 ENSGT00940000161063 ENSGT00940000162076 ENSGT00940000160168 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000018059.b ENSGT00440000039028 ENSGT00390000011644 ENSGT00950000185149 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a ENSGT00390000001322 ENSGT00510000047120 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00390000006659 ENSGT00390000018525.a.b ENSGT00940000160000 ENSGT00390000015360.i.b ENSGT01100000263557.A.b.b ENSGT00390000010760 ENSGT01030000234579.C ENSGT00940000158946 ENSGT00390000009400 ENSGT00390000018244 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 ENSGT00940000161063 ENSGT00940000162076 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000018059.b ENSGT00440000039028 ENSGT00390000011644 ENSGT00950000185149 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a ENSGT00390000001322 ENSGT00510000047120 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00390000006659 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squirrel monkey MODERN SPECIES 69 TMCO1 (ENSSBOG00000033156) FAM78B (ENSSBOG00000034137) POGK (ENSSBOG00000019300) TADA1 (ENSSBOG00000025874) ILDR2 (ENSSBOG00000028013) MAEL (ENSSBOG00000027193) GPA33 (ENSSBOG00000018974) STYXL2 (ENSSBOG00000035084) POU2F1 (ENSSBOG00000025169) CD247 (ENSSBOG00000026118) CREG1 (ENSSBOG00000030869) RCSD1 (ENSSBOG00000032056) MPZL1 (ENSSBOG00000032480) ADCY10 (ENSSBOG00000027766) ENSSBOG00000030589 DCAF6 (ENSSBOG00000034143) ##22 GPR161 (ENSSBOG00000030060) TIPRL (ENSSBOG00000030225) SFT2D2 (ENSSBOG00000031966) TBX19 (ENSSBOG00000029923) ENSSBOG00000035482 DPT (ENSSBOG00000024429) ATP1B1 (ENSSBOG00000032878) NME7 (ENSSBOG00000034004) BLZF1 (ENSSBOG00000033672) CCDC181 (ENSSBOG00000036053) SLC19A2 (ENSSBOG00000022009) F5 (ENSSBOG00000020664) IZUMO3 (ENSSBOG00000031342) ELAVL2 (ENSSBOG00000028114) DMRTA1 (ENSSBOG00000020210) Capuchin MODERN SPECIES 84 UCK2 (ENSCCAG00000017279) FAM78B (ENSCCAG00000029557) POGK (ENSCCAG00000021290) TADA1 (ENSCCAG00000033176) 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ENSGT00940000158556 ENSGT00940000161063 ENSGT00940000162076 ENSGT00940000160168 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000011644 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00910000146947 ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a ENSGT00910000147687 ENSGT00910000146993 ENSGT00390000001322 ENSGT00510000047120 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00390000006659 ENSGT00390000018525.a.b ENSGT00940000160000 ENSGT00390000015360.i.b ENSGT00550000074866.j ENSGT01100000263557.A.b.b ENSGT00390000010760 ENSGT01030000234579.C ENSGT00940000158946 ENSGT00390000009400 ENSGT00390000018244 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 ENSGT00940000161063 Gibbon MODERN SPECIES 2 POGK (ENSNLEG00000014756) TADA1 (ENSNLEG00000014761) ENSNLEG00000014769 MAEL (ENSNLEG00000014771) ENSNLEG00000028779 STYXL2 (ENSNLEG00000014783) POU2F1 (ENSNLEG00000014790) CD247 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ENSGT00390000006659 ENSGT00390000018525.a.b ENSGT00940000160000 ENSGT00390000015360.i.b ENSGT00550000074866.j ENSGT01100000263557.A.b.b ENSGT00390000010760 ENSGT01030000234579.C ENSGT00940000158946 ENSGT00390000009400 ENSGT00390000018244 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 ENSGT00940000161063 Orangutan MODERN SPECIES UCK2 (ENSPPYG00000000563) FAM78B (ENSPPYG00000000561) POGK (ENSPPYG00000037463) TADA1 (ENSPPYG00000000557) ILDR2 (ENSPPYG00000000556) MAEL (ENSPPYG00000000555) GPA33 (ENSPPYG00000000554) STYXL2 (ENSPPYG00000000553) POU2F1 (ENSPPYG00000000552) CD247 (ENSPPYG00000000551) CREG1 (ENSPPYG00000000550) RCSD1 (ENSPPYG00000000549) MPZL1 (ENSPPYG00000000548) ADCY10 (ENSPPYG00000000547) MPC2 (ENSPPYG00000000546) DCAF6 (ENSPPYG00000000545) ##22 GPR161 (ENSPPYG00000000544) TIPRL (ENSPPYG00000000543) SFT2D2 (ENSPPYG00000000541) TBX19 (ENSPPYG00000000540) ENSPPYG00000035525 ENSPPYG00000000539 ENSPPYG00000000538 DPT (ENSPPYG00000000537) ENSPPYG00000014387 ATP1B1 (ENSPPYG00000000536) NME7 (ENSPPYG00000000535) BLZF1 (ENSPPYG00000000534) CCDC181 (ENSPPYG00000000533) SLC19A2 (ENSPPYG00000000532) F5 (ENSPPYG00000000531) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000011644 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00910000146947 ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a ENSGT00910000147687 ENSGT00910000146993 ENSGT00390000001322 ENSGT00510000047120 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00390000006659 ENSGT00390000018525.a.b ENSGT00940000160000 ENSGT00390000015360.i.b ENSGT00550000074866.j ENSGT01100000263557.A.b.b.j ENSGT01100000263557.A.b.b.i ENSGT00390000010760 ENSGT01030000234579.C ENSGT00940000158946 ENSGT00390000009400 ENSGT00390000018244 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 Gorilla MODERN SPECIES ENSGGOG00000039149 TADA1 (ENSGGOG00000008168) ILDR2 (ENSGGOG00000008177) MAEL (ENSGGOG00000012560) GPA33 (ENSGGOG00000004520) STYXL2 (ENSGGOG00000004523) POU2F1 (ENSGGOG00000016243) CD247 (ENSGGOG00000007716) CREG1 (ENSGGOG00000002145) RCSD1 (ENSGGOG00000007100) MPZL1 (ENSGGOG00000040368) ENSGGOG00000040195 ENSGGOG00000044114 ADCY10 (ENSGGOG00000009856) MPC2 (ENSGGOG00000027565) DCAF6 (ENSGGOG00000028357) ##22 GPR161 (ENSGGOG00000012683) TIPRL (ENSGGOG00000012994) SFT2D2 (ENSGGOG00000023890) TBX19 (ENSGGOG00000001338) ENSGGOG00000036517 QRSL1 (ENSGGOG00000036326) ENSGGOG00000002598 ENSGGOG00000037002 DPT (ENSGGOG00000003563) ATP1B1 (ENSGGOG00000002499) NME7 (ENSGGOG00000002502) BLZF1 (ENSGGOG00000034839) CCDC181 (ENSGGOG00000026920) SLC19A2 (ENSGGOG00000025385) F5 (ENSGGOG00000010691) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000011644 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00910000146947 ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a ENSGT00910000147687 ENSGT00910000146993 ENSGT00390000001322 ENSGT00510000047120 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00390000006659 ENSGT00390000018525.a.b ENSGT00940000160000 ENSGT00390000015360.i.b ENSGT00550000074866.j ENSGT01100000263557.A.b.b.j ENSGT01100000263557.A.b.b.i ENSGT00390000010760 ENSGT01030000234579.C ENSGT00940000158946 ENSGT00390000009400 ENSGT00390000018244 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 Human MODERN SPECIES UCK2 (ENSG00000143179) FAM78B (ENSG00000188859) POGK (ENSG00000143157) TADA1 (ENSG00000152382) ILDR2 (ENSG00000143195) MAEL (ENSG00000143194) GPA33 (ENSG00000143167) STYXL2 (ENSG00000198842) POU2F1 (ENSG00000143190) CD247 (ENSG00000198821) CREG1 (ENSG00000143162) RCSD1 (ENSG00000198771) MPZL1 (ENSG00000197965) ADCY10 (ENSG00000143199) MPC2 (ENSG00000143158) DCAF6 (ENSG00000143164) ##22 GPR161 (ENSG00000143147) TIPRL (ENSG00000143155) SFT2D2 (ENSG00000213064) TBX19 (ENSG00000143178) XCL2 (ENSG00000143185) XCL1 (ENSG00000143184) DPT (ENSG00000143196) ATP1B1 (ENSG00000143153) NME7 (ENSG00000143156) BLZF1 (ENSG00000117475) CCDC181 (ENSG00000117477) SLC19A2 (ENSG00000117479) F5 (ENSG00000198734) SELP (ENSG00000174175) C1orf112 (ENSG00000000460) Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011644 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00910000146947 ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a.y ENSGT00910000147687 ENSGT00910000146993 ENSGT00390000001322 ENSGT00510000047120 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00390000006659 ENSGT00390000018525.a.b ENSGT00940000160000 ENSGT00390000015360.i.b ENSGT00550000074866.j ENSGT01100000263557.A.b.b.j ENSGT01100000263557.A.b.b.i ENSGT00390000010760 ENSGT01030000234579.C ENSGT00940000158946 ENSGT00390000009400 ENSGT00390000018244 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 Chimpanzee MODERN SPECIES ENSPTRG00000045175 POGK (ENSPTRG00000001626) TADA1 (ENSPTRG00000045809) ILDR2 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(ENSRBIG00000044232) ILDR2 (ENSRBIG00000042586) MAEL (ENSRBIG00000038763) GPA33 (ENSRBIG00000029206) STYXL2 (ENSRBIG00000038201) POU2F1 (ENSRBIG00000033382) CD247 (ENSRBIG00000004546) CREG1 (ENSRBIG00000034099) ENSRBIG00000039341 RCSD1 (ENSRBIG00000036271) MPZL1 (ENSRBIG00000035932) ENSRBIG00000040832 ADCY10 (ENSRBIG00000034959) MPC2 (ENSRBIG00000036007) DCAF6 (ENSRBIG00000037863) ##22 GPR161 (ENSRBIG00000032656) TIPRL (ENSRBIG00000037656) SFT2D2 (ENSRBIG00000040295) TBX19 (ENSRBIG00000033174) ENSRBIG00000037800 ENSRBIG00000025979 ENSRBIG00000032005 DPT (ENSRBIG00000032243) ENSRBIG00000017012 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 227 ENSRBIG00000042175 TJP1 (ENSRBIG00000036659) ENSRBIG00000000521 ##22 ENTREP2 (ENSRBIG00000029502) APBA2 (ENSRBIG00000028293) Golden snub-nosed monkey DUPLICATION Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1628 MAEL (ENSRROG00000039365) GPA33 (ENSRROG00000031341) STYXL2 (ENSRROG00000032684) POU2F1 (ENSRROG00000010244) CD247 (ENSRROG00000033647) CREG1 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ENSGT00940000160000 ENSGT00550000074866.j ENSGT01100000263557.A.b.b.e.a ENSGT01100000263557.A.b.b.e.b ENSGT00390000010760 ENSGT01030000234579.C ENSGT00940000158946 ENSGT00390000009400 ENSGT00390000018244 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 ENSGT00940000161063 Vervet Monkey MODERN SPECIES 17 ENSCSAG00000000234 FAM78B (ENSCSAG00000010776) POGK (ENSCSAG00000010784) TADA1 (ENSCSAG00000010789) ILDR2 (ENSCSAG00000010833) MAEL (ENSCSAG00000010893) GPA33 (ENSCSAG00000010901) STYXL2 (ENSCSAG00000010906) ENSCSAG00000010909 POU2F1 (ENSCSAG00000010919) CD247 (ENSCSAG00000010930) CREG1 (ENSCSAG00000010936) RCSD1 (ENSCSAG00000010941) MPZL1 (ENSCSAG00000010949) ADCY10 (ENSCSAG00000011020) DCAF6 (ENSCSAG00000011041) ##22 GPR161 (ENSCSAG00000011046) TIPRL (ENSCSAG00000011048) SFT2D2 (ENSCSAG00000011053) TBX19 (ENSCSAG00000011055) ENSCSAG00000011060 ENSCSAG00000011061 DPT (ENSCSAG00000011064) ATP1B1 (ENSCSAG00000011067) NME7 (ENSCSAG00000011071) BLZF1 (ENSCSAG00000011077) CCDC181 (ENSCSAG00000011089) SLC19A2 (ENSCSAG00000011125) F5 (ENSCSAG00000011149) SELP (ENSCSAG00000011257) SELL (ENSCSAG00000011287) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011644 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00910000146947 ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a.w ENSGT00910000147687 ENSGT00910000146993 ENSGT00390000001322 ENSGT00510000047120.c ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00390000006659 ENSGT00390000018525.a.b ENSGT00940000160000 ENSGT00550000074866.j ENSGT01100000263557.A.b.b.e.a ENSGT01100000263557.A.b.b.e.b ENSGT00390000010760 ENSGT01030000234579.C ENSGT00940000158946 ENSGT00390000009400 ENSGT00390000018244 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 ENSGT00940000161063 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000147137 ENSGT00390000011644 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00910000146947 ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a.w ENSGT00910000147687 ENSGT00390000001322 ENSGT00510000047120.c ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00390000006659.f ENSGT00390000018525.a.b ENSGT00940000160000 ENSGT01100000263557.A.b.b.e.a ENSGT00550000074866.j ENSGT01100000263557.A.b.b.f ENSGT01100000263557.A.b.b.e.b ENSGT00390000010760 ENSGT01030000234579.C ENSGT00940000158946 ENSGT00390000009400 ENSGT00390000018244 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 Pig-tailed macaque DUPLICATION Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 197 ENSMNEG00000034726 TADA1 (ENSMNEG00000011970) ILDR2 (ENSMNEG00000042117) MAEL (ENSMNEG00000042870) GPA33 (ENSMNEG00000040838) STYXL2 (ENSMNEG00000026724) POU2F1 (ENSMNEG00000032112) CD247 (ENSMNEG00000041300) CREG1 (ENSMNEG00000038518) RCSD1 (ENSMNEG00000041991) ENSMNEG00000035331 ENSMNEG00000041274 ENSMNEG00000035784 ADCY10 (ENSMNEG00000035818) MPC2 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ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT01100000263539.b.a.a.a.b.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a.w ENSGT00910000147687 ENSGT00390000001322 ENSGT00510000047120.c ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00390000006659.f ENSGT00390000018525.a.b ENSGT00940000160000 ENSGT01100000263557.A.b.b.e.a ENSGT01100000263557.A.b.b.e.b ENSGT00390000010760 ENSGT01030000234579.C ENSGT00940000158946 ENSGT00390000009400 ENSGT00390000018244 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 ENSGT00940000161063 ENSGT00980000202103.B.a.a.b Crab-eating macaque MODERN SPECIES FAM78B (ENSMFAG00000032771) POGK (ENSMFAG00000037391) TADA1 (ENSMFAG00000032577) ILDR2 (ENSMFAG00000002585) MAEL (ENSMFAG00000040593) GPA33 (ENSMFAG00000001951) STYXL2 (ENSMFAG00000005792) POU2F1 (ENSMFAG00000002865) CD247 (ENSMFAG00000000076) CREG1 (ENSMFAG00000045348) ENSMFAG00000047258 RCSD1 (ENSMFAG00000039084) MPZL1 (ENSMFAG00000045417) ADCY10 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(ENSMMUG00000060729) ENSMMUG00000013779 XCL1 (ENSMMUG00000060218) DPT (ENSMMUG00000002932) ATP1B1 (ENSMMUG00000021078) NME7 (ENSMMUG00000021079) BLZF1 (ENSMMUG00000021080) CCDC181 (ENSMMUG00000000065) SLC19A2 (ENSMMUG00000013039) F5 (ENSMMUG00000042510) SELP (ENSMMUG00000013044) ENSMMUG00000054881 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000011644 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00910000146947 ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a.w ENSGT00910000147687 ENSGT00910000146993 ENSGT00390000001322 ENSGT00510000047120.c ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00390000006659 ENSGT00390000018525.a.b ENSGT00940000160000 ENSGT00550000074866.j ENSGT01100000263557.A.b.b.e.a ENSGT01100000263557.A.b.b.e.b ENSGT00390000010760 ENSGT01030000234579.C ENSGT00940000158946 ENSGT00390000009400 ENSGT00390000018244 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 ENSGT00940000161063 Olive baboon MODERN SPECIES POGK (ENSPANG00000013790) TADA1 (ENSPANG00000010530) ILDR2 (ENSPANG00000002248) MAEL (ENSPANG00000000174) GPA33 (ENSPANG00000041543) STYXL2 (ENSPANG00000000175) ENSPANG00000040953 POU2F1 (ENSPANG00000006362) CD247 (ENSPANG00000015050) CREG1 (ENSPANG00000049146) ENSPANG00000044055 RCSD1 (ENSPANG00000022547) MPZL1 (ENSPANG00000018323) ADCY10 (ENSPANG00000010285) MPC2 (ENSPANG00000031639) DCAF6 (ENSPANG00000006546) ##22 GPR161 (ENSPANG00000015261) TIPRL (ENSPANG00000026389) SFT2D2 (ENSPANG00000008888) TBX19 (ENSPANG00000021432) ENSPANG00000040534 DPT (ENSPANG00000019710) ENSPANG00000043430 ENSPANG00000051371 ATP1B1 (ENSPANG00000005097) ENSPANG00000047492 NME7 (ENSPANG00000017310) BLZF1 (ENSPANG00000009151) CCDC181 (ENSPANG00000008887) SLC19A2 (ENSPANG00000006361) F5 (ENSPANG00000019750) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 112 ENSGT00390000011644 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00910000146947 ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a.w ENSGT00910000147687 ENSGT00910000146993 ENSGT00390000001322 ENSGT00510000047120.c ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00390000006659 ENSGT00390000018525.a.b ENSGT00940000160000 ENSGT00550000074866.j ENSGT01100000263557.A.b.b.e.a ENSGT01100000263557.A.b.b.e.b ENSGT00390000010760 ENSGT01030000234579.C ENSGT00940000158946 ENSGT00390000009400 ENSGT00390000018244 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000158556 ENSGT00940000161063 Sooty mangabey DUPLICATION Sooty mangabey MODERN SPECIES 317 MAEL (ENSCATG00000036493) GPA33 (ENSCATG00000037113) STYXL2 (ENSCATG00000033692) POU2F1 (ENSCATG00000019885) CD247 (ENSCATG00000045017) CREG1 (ENSCATG00000024098) ENSCATG00000037789 RCSD1 (ENSCATG00000039748) ENSCATG00000021821 ENSCATG00000030678 ADCY10 (ENSCATG00000038734) MPC2 (ENSCATG00000029934) DCAF6 (ENSCATG00000036975) ##22 GPR161 (ENSCATG00000020613) 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ENSGT00530000063970.d Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155177.b ENSGT00940000161722 ENSGT00940000158367 ENSGT01020000230623 ENSGT00530000068641 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a ENSGT00510000047120 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000159906 ENSGT00390000000083.b ENSGT00940000160816 ENSGT00940000156459 ENSGT00940000154490.b ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000156365 ENSGT01050000244948.c.a ENSGT00940000154035.b ENSGT00940000157088 ENSGT00390000000367 ENSGT00950000183034.A ENSGT00390000017898 ENSGT00390000017390 ENSGT00530000063970.d Episquamata ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155177.b ENSGT00940000161722 ENSGT00940000158367 ENSGT00530000068641 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a.t ENSGT01030000234556.a.b.a.s ENSGT00510000047120 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000159906 ENSGT00390000000083.b ENSGT00940000160816 ENSGT00940000156459 ENSGT00940000154490.b ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000156365 ENSGT01050000244948.c.a ENSGT00940000154035.b ENSGT00940000157088 ENSGT00390000000367 ENSGT00950000183034.A ENSGT00390000017898 ENSGT00390000017390 ENSGT00530000063970.d Laterata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063627.b ENSGT00940000155177.b ENSGT00940000161722 ENSGT00940000158367 ENSGT00530000068641 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000005914.a ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a.t ENSGT01030000234556.a.b.a.s ENSGT00510000047120 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000159906 ENSGT00390000000083.b ENSGT00940000160816 ENSGT00940000156459 ENSGT00940000154490.b ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000156365 ENSGT01050000244948.c.a ENSGT00940000154035.b ENSGT00940000157088 ENSGT00390000000367 ENSGT00950000183034.A ENSGT00390000017898 ENSGT00530000063970.d ENSGT00530000063970.c.b Common wall lizard MODERN SPECIES 12 ENSPMRG00000009746 ILDR2 (ENSPMRG00000009714) ENSPMRG00000009701 MAEL (ENSPMRG00000009695) GPA33 (ENSPMRG00000009689) STYXL2 (ENSPMRG00000009679) POU2F1 (ENSPMRG00000009659) CREG1 (ENSPMRG00000009644) RCSD1 (ENSPMRG00000009631) ENSPMRG00000009624 ENSPMRG00000009619 ENSPMRG00000009615 ENSPMRG00000009609 ENSPMRG00000009594 MPC2 (ENSPMRG00000009588) DCAF6 (ENSPMRG00000009566) ##22 GABRR3 (ENSPMRG00000009542) RIOX2 (ENSPMRG00000009525) CRYBG3 (ENSPMRG00000009398) ARL6 (ENSPMRG00000009377) EPHA6 (ENSPMRG00000009273) ENSPMRG00000009229 ENSPMRG00000009223 STX19 (ENSPMRG00000009220) ARL13B (ENSPMRG00000009174) PROS1 (ENSPMRG00000009155) EPHA3 (ENSPMRG00000009145) C3orf38 (ENSPMRG00000009139) ZNF654 (ENSPMRG00000009127) CGGBP1 (ENSPMRG00000009121) ENSPMRG00000009118 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES ENSSMRG00000002106 ADPRH (ENSSMRG00000002121) IGSF3 (ENSSMRG00000002150) CD101 (ENSSMRG00000002167) PTGFRN (ENSSMRG00000002184) ILDR2 (ENSSMRG00000002213) MAEL (ENSSMRG00000002222) GPA33 (ENSSMRG00000002230) STYXL2 (ENSSMRG00000002252) POU2F1 (ENSSMRG00000002261) CREG1 (ENSSMRG00000002341) RCSD1 (ENSSMRG00000002351) ENSSMRG00000002360 ENSSMRG00000002367 MPC2 (ENSSMRG00000002371) DCAF6 (ENSSMRG00000002468) ##22 GABRR3 (ENSSMRG00000002489) RIOX2 (ENSSMRG00000002491) ENSSMRG00000002531 ARL6 (ENSSMRG00000002700) ENSSMRG00000002703 ENSSMRG00000002893 NSUN3 (ENSSMRG00000002923) ARL13B (ENSSMRG00000002934) STX19 (ENSSMRG00000002939) PROS1 (ENSSMRG00000002940) EPHA3 (ENSSMRG00000002972) ENSSMRG00000003067 ZNF654 (ENSSMRG00000003078) CGGBP1 (ENSSMRG00000003090) CD200 (ENSSMRG00000003092) Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000155177.b ENSGT00940000155177.a ENSGT00940000158367 ENSGT00530000068641 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 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ENSGT00390000013817 ENSGT00960000189608 ENSGT00530000063627.b ENSGT00940000155177.b ENSGT00940000158367 ENSGT00990000211806 ENSGT00950000183058.A.a.h ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000005914.a ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a.s ENSGT00510000047120 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000159906 ENSGT00390000000083.b ENSGT00940000160816 ENSGT00940000156459 ENSGT00940000154490.b ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT00940000156365.n ENSGT01050000244948.c.a ENSGT00940000156365.m ENSGT00940000154035.b ENSGT00940000157088 ENSGT00390000000367 ENSGT00950000183034.A ENSGT00390000017898 ENSGT00530000063970.d Eastern brown snake MODERN SPECIES 14 ENSPTXG00000003622 ADPRH (ENSPTXG00000003627) IGSF3 (ENSPTXG00000003630) PTGFRN (ENSPTXG00000003633) ENSPTXG00000003635 ILDR2 (ENSPTXG00000003636) MAEL (ENSPTXG00000003887) GPA33 (ENSPTXG00000003889) STYXL2 (ENSPTXG00000003907) ENSPTXG00000003909 POU2F1 (ENSPTXG00000003911) CREG1 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ENSGT01050000244948.c.a ENSGT00940000156365 ENSGT00940000154035.b ENSGT00940000157088 ENSGT00390000000367 ENSGT00950000183034.A ENSGT00390000017898 ENSGT00390000017390 ENSGT00530000063970.d Three-toed box turtle MODERN SPECIES 272 CD101 (ENSTMTG00000003945) ENSTMTG00000003929 PTGFRN (ENSTMTG00000003910) ENSTMTG00000003879 ENSTMTG00000003867 ENSTMTG00000003856 ILDR2 (ENSTMTG00000003834) MAEL (ENSTMTG00000003805) GPA33 (ENSTMTG00000003787) STYXL2 (ENSTMTG00000003760) POU2F1 (ENSTMTG00000003578) CD247 (ENSTMTG00000003507) CREG1 (ENSTMTG00000003483) RCSD1 (ENSTMTG00000003343) MPC2 (ENSTMTG00000020612) DCAF6 (ENSTMTG00000020586) ##22 GABRR3 (ENSTMTG00000020573) RIOX2 (ENSTMTG00000020567) CRYBG3 (ENSTMTG00000020245) ARL6 (ENSTMTG00000020203) ENSTMTG00000020190 ENSTMTG00000020181 NSUN3 (ENSTMTG00000020177) STX19 (ENSTMTG00000020170) ARL13B (ENSTMTG00000020146) PROS1 (ENSTMTG00000020137) EPHA3 (ENSTMTG00000020062) C3orf38 (ENSTMTG00000020045) ZNF654 (ENSTMTG00000020035) CGGBP1 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ENSGT00950000183034.A ENSGT00390000017898 ENSGT00390000017390 ENSGT00530000063970.d Aves ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155177.a ENSGT00940000158367 ENSGT01020000230623 ENSGT00530000068641 ENSGT00940000154715.a.a.a.a.a ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a ENSGT00510000047120 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000159906 ENSGT00390000000083.b ENSGT00940000160816 ENSGT00940000156459 ENSGT00940000154490.b ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT01050000244948.c.a ENSGT00940000156365 ENSGT00940000154035.b ENSGT00940000157088 ENSGT00390000000367 ENSGT00950000183034.A ENSGT00390000017898 ENSGT00390000017390 ENSGT00530000063970.d Neognathae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155177.a ENSGT00940000158367 ENSGT01020000230623 ENSGT00530000068641 ENSGT00940000154488.A.a.a.h ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 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ENSGT00940000160816 ENSGT00940000156459 ENSGT00940000154490.b ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT01050000244948.c.a ENSGT00940000156365 ENSGT00940000154035.b ENSGT00940000157088 ENSGT00390000000367 ENSGT00950000183034.A ENSGT00390000017898 ENSGT00530000063970.d ENSGT00530000063970.c.a Japanese quail MODERN SPECIES PTGFRN (ENSCJPG00005003368) ENSCJPG00005003362 ENSCJPG00005003360 ENSCJPG00005003358 ENSCJPG00005003356 ILDR2 (ENSCJPG00005003355) MAEL (ENSCJPG00005003354) GPA33 (ENSCJPG00005003349) STYXL2 (ENSCJPG00005003348) POU2F1 (ENSCJPG00005001172) CD247 (ENSCJPG00005001117) CREG1 (ENSCJPG00005001115) RCSD1 (ENSCJPG00005001108) MPZL1 (ENSCJPG00005001102) MPC2 (ENSCJPG00005000937) DCAF6 (ENSCJPG00005000914) ##22 GABRR3 (ENSCJPG00005000869) RIOX2 (ENSCJPG00005000861) CRYBG3 (ENSCJPG00005000837) ARL6 (ENSCJPG00005000825) ENSCJPG00005000820 ENSCJPG00005000806 NSUN3 (ENSCJPG00005017697) STX19 (ENSCJPG00005017696) ARL13B (ENSCJPG00005017695) PROS1 (ENSCJPG00005017694) EPHA3 (ENSCJPG00005017690) ENSCJPG00005017686 C3orf38 (ENSCJPG00005017682) ZNF654 (ENSCJPG00005017681) CGGBP1 (ENSCJPG00005017680) Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155177.a.b ENSGT00940000158367 ENSGT01020000230623 ENSGT00530000068641 ENSGT00940000154715.a.a.a.a.a ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a ENSGT00510000047120 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000159906 ENSGT00390000000083.b ENSGT00940000160816 ENSGT00940000154490.b ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT01050000244948.c.a ENSGT00940000156365 ENSGT00940000154035.b ENSGT00940000157088 ENSGT00390000000367 ENSGT00950000183034.A ENSGT00390000017898 ENSGT00530000063970.d ENSGT00530000063970.c.a ENSGT00530000063970.c.b Chicken MODERN SPECIES ENSGALG00010008309 PTGFRN (ENSGALG00010008291) ENSGALG00010008268 ENSGALG00010008265 ZFP92 (ENSGALG00010008252) ILDR2 (ENSGALG00010008208) MAEL (ENSGALG00010008235) STYXL2 (ENSGALG00010008222) GPA33 (ENSGALG00010008216) POU2F1 (ENSGALG00010008180) CD247 (ENSGALG00010008142) CREG1 (ENSGALG00010008133) RCSD1 (ENSGALG00010008130) MPZL1 (ENSGALG00010008121) MPC2 (ENSGALG00010008067) DCAF6 (ENSGALG00010007889) ##22 GABRR3 (ENSGALG00010007865) MINA (ENSGALG00010007168) ARL6 (ENSGALG00010007110) EPHA6 (ENSGALG00010004445) NSUN3 (ENSGALG00010006346) STX19 (ENSGALG00010006330) ARL13B (ENSGALG00010006273) PROS1 (ENSGALG00010006254) EPHA3 (ENSGALG00010006244) C1H3ORF38 (ENSGALG00010006236) ZNF654 (ENSGALG00010006232) CGGBP1 (ENSGALG00010006205) CD200 (ENSGALG00010007321) CD200L (ENSGALG00010006180) ENSGALG00010004479 Turkey MODERN SPECIES ENSMGAG00000014460 ENSMGAG00000014459 ENSMGAG00000014461 ENSMGAG00000022257 ENSMGAG00000018411 ENSMGAG00000022304 #23 ENSMGAG00000014465 ENSMGAG00000014467 ENSMGAG00000022262 ENSMGAG00000013499 ENSMGAG00000014417 ENSMGAG00000017943 ENSMGAG00000016728 ENSMGAG00000014426 ENSMGAG00000014427 ENSMGAG00000014428 ##22 ENSMGAG00000014429 ENSMGAG00000014430 ENSMGAG00000014431 CREG1 (ENSMGAG00000014432) ENSMGAG00000014434 ENSMGAG00000014433 MAEL (ENSMGAG00000014437) ENSMGAG00000014436 STYXL2 (ENSMGAG00000014435) ENSMGAG00000014440 ENSMGAG00000014439 ENSMGAG00000014438 ENSMGAG00000014443 ENSMGAG00000013294 ENSMGAG00000013302 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155177.a ENSGT00940000158367 ENSGT01020000230623 ENSGT00530000068641 ENSGT00940000154488.A.a.a.h ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a ENSGT00510000047120 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000159906 ENSGT00390000000083.b ENSGT00940000160816 ENSGT00940000156459 ENSGT00940000154490.b ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT01050000244948.c.a ENSGT00940000156365 ENSGT00940000154035.b ENSGT00940000157088 ENSGT00390000000367 ENSGT00950000183034.A ENSGT00390000017898 ENSGT00530000063970.d ENSGT00530000063970.c.a Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000155177.b ENSGT00940000155177.a ENSGT00940000158367 ENSGT01020000230623 ENSGT00530000068641 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a ENSGT00510000047120 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000159906 ENSGT00390000000083.b ENSGT00940000160816 ENSGT00940000156459 ENSGT00940000154490.b ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT01050000244948.c.a ENSGT00940000156365 ENSGT00940000154035.b ENSGT00940000157088 ENSGT00390000000367 ENSGT00950000183034.A ENSGT00390000017898 ENSGT00390000013073 ENSGT00940000159090 Great tit MODERN SPECIES PTGFRN (ENSPMJG00000012244) ENSPMJG00000012245 ENSPMJG00000012246 ENSPMJG00000012247 ILDR2 (ENSPMJG00000012248) MAEL (ENSPMJG00000012249) STYXL2 (ENSPMJG00000012250) GPA33 (ENSPMJG00000012251) POU2F1 (ENSPMJG00000012253) CD247 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ENSGT00390000000083.b ENSGT00940000160816 ENSGT00940000156459 ENSGT00940000154490.b ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT01050000244948.c.a ENSGT00940000156365 ENSGT00940000154035.b ENSGT00940000157088 ENSGT00390000000367 ENSGT00950000183034.A ENSGT00390000017898 ENSGT00390000013073 ENSGT00940000159090 Flycatcher MODERN SPECIES ENSFALG00000001518 ENSFALG00000024381 ENSFALG00000001523 ENSFALG00000001526 ENSFALG00000001528 ILDR2 (ENSFALG00000027675) MAEL (ENSFALG00000001548) GPA33 (ENSFALG00000001556) STYXL2 (ENSFALG00000001558) POU2F1 (ENSFALG00000001560) CD247 (ENSFALG00000025584) CREG1 (ENSFALG00000024245) RCSD1 (ENSFALG00000001570) MPZL1 (ENSFALG00000001574) MPC2 (ENSFALG00000001579) DCAF6 (ENSFALG00000001587) ##22 GABRR3 (ENSFALG00000001597) RIOX2 (ENSFALG00000026105) ENSFALG00000001634 ARL6 (ENSFALG00000001644) EPHA6 (ENSFALG00000001647) NSUN3 (ENSFALG00000027575) ARL13B (ENSFALG00000001654) STX19 (ENSFALG00000014778) PROS1 (ENSFALG00000001657) EPHA3 (ENSFALG00000001675) ENSFALG00000028288 C3orf38 (ENSFALG00000001712) ZNF654 (ENSFALG00000001715) CGGBP1 (ENSFALG00000014795) N6AMT1 (ENSFALG00000026052) Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000155177.b ENSGT00940000155177.a ENSGT00940000158367 ENSGT01020000230623 ENSGT00530000068641 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a ENSGT00510000047120 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000159906 ENSGT00390000000083.b ENSGT00940000160816 ENSGT00940000156459 ENSGT00940000154490.b ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT01050000244948.c.a ENSGT00940000156365 ENSGT00940000154035.b ENSGT00940000157088 ENSGT00390000000367 ENSGT00950000183034.A ENSGT00390000017898 ENSGT00390000013073 ENSGT00940000159090 Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000155177.b ENSGT00940000155177.a ENSGT00940000158367 ENSGT01020000230623 ENSGT00530000068641 ENSGT00950000183058.A.a ENSGT00390000003645 ENSGT00940000160248 ENSGT00940000159723 ENSGT00940000157831 ENSGT00390000018208 ENSGT00390000005914.a ENSGT00940000153997.b.a.b ENSGT01030000234556.a.b.a ENSGT00510000047120 ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000159906 ENSGT00390000000083.b ENSGT00940000160816 ENSGT00940000156459 ENSGT00940000154490.b ENSGT00940000153665.b.a.a ENSGT01050000244948.c.a ENSGT00940000156365 ENSGT00940000154035.b ENSGT00940000157088 ENSGT00390000000367 ENSGT00950000183034.A ENSGT00390000017898 ENSGT00390000013073 ENSGT00940000159090 Common canary MODERN SPECIES 19 IGSF3 (ENSSCAG00000012224) ENSSCAG00000012247 PTGFRN (ENSSCAG00000012255) ENSSCAG00000012284 ENSSCAG00000012286 ILDR2 (ENSSCAG00000012289) MAEL (ENSSCAG00000012296) GPA33 (ENSSCAG00000012307) STYXL2 (ENSSCAG00000012315) POU2F1 (ENSSCAG00000012320) CD247 (ENSSCAG00000012334) CREG1 (ENSSCAG00000012342) RCSD1 (ENSSCAG00000012345) MPZL1 (ENSSCAG00000012355) MPC2 (ENSSCAG00000012360) DCAF6 (ENSSCAG00000012372) ##22 GABRR3 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(ENSSHBG00005007195) GPA33 (ENSSHBG00005006974) STYXL2 (ENSSHBG00005006886) POU2F1 (ENSSHBG00005006846) CD247 (ENSSHBG00005006751) CREG1 (ENSSHBG00005006728) RCSD1 (ENSSHBG00005006716) MPZL1 (ENSSHBG00005006695) ENSSHBG00005006672 DCAF6 (ENSSHBG00005006206) ##22 ENSSHBG00005006085 ENSSHBG00005005908 ROBO2 (ENSSHBG00005005717) ENSSHBG00005000898 ENSSHBG00005000889 ENSSHBG00005008960 ENSSHBG00005008947 Golden eagle MODERN SPECIES 23 ENSACCG00020006252 PTGFRN (ENSACCG00020006235) ENSACCG00020006225 ENSACCG00020006220 ENSACCG00020006210 ILDR2 (ENSACCG00020006190) MAEL (ENSACCG00020006160) GPA33 (ENSACCG00020006142) STYXL2 (ENSACCG00020006121) POU2F1 (ENSACCG00020006072) CD247 (ENSACCG00020006014) CREG1 (ENSACCG00020006000) RCSD1 (ENSACCG00020005984) MPZL1 (ENSACCG00020005967) MPC2 (ENSACCG00020005950) DCAF6 (ENSACCG00020005866) ##22 GABRR3 (ENSACCG00020005782) RIOX2 (ENSACCG00020005761) CRYBG3 (ENSACCG00020005696) ARL6 (ENSACCG00020005605) EPHA6 (ENSACCG00020005578) ENSACCG00020005560 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ENSLLEG00000001937 ENSLLEG00000001877 CNTN2 (ENSLLEG00000001673) DCAF6 (ENSLLEG00000001357) ##22 ZNHIT3 (ENSLLEG00000001287) MYO19 (ENSLLEG00000001213) PIGW (ENSLLEG00000001206) GGNBP2 (ENSLLEG00000001180) SLC41A1 (ENSLLEG00000001142) RAB29 (ENSLLEG00000001126) NUCKS1 (ENSLLEG00000001102) ENSLLEG00000001088 SLC45A3 (ENSLLEG00000001078) ENSLLEG00000001069 ENSLLEG00000001066 ELK4 (ENSLLEG00000001044) ENSLLEG00000001035 MFSD4A (ENSLLEG00000001009) CDK18 (ENSLLEG00000000794) Frog MODERN SPECIES 2 pm20d1 (ENSXETG00000005950) ENSXETG00000047513 slc41a1 (ENSXETG00000040543) nucks1 (ENSXETG00000035501) slc45a3 (ENSXETG00000000993) klf15.2 (ENSXETG00000000992) elk4 (ENSXETG00000000987) mfsd4a (ENSXETG00000000985) cdk18 (ENSXETG00000000980) ENSXETG00000041249 lemd1 (ENSXETG00000033482) klhdc8a (ENSXETG00000000976) nuak2 (ENSXETG00000000974) tmcc2 (ENSXETG00000000973) znhit3 (ENSXETG00000025713) dcaf6 (ENSXETG00000000972) ##22 mpc2 (ENSXETG00000025716) ENSXETG00000045272 ENSXETG00000042028 rnpep (ENSXETG00000000963) elf3 (ENSXETG00000031510) gpr37l1 (ENSXETG00000033722) rbbp5 (ENSXETG00000000933) ube2t (ENSXETG00000035755) arl8a (ENSXETG00000000910) dstyk (ENSXETG00000000902) myo19 (ENSXETG00000002040) pigw (ENSXETG00000002039) ggnbp2 (ENSXETG00000002038) ENSXETG00000049081 dhrs11 (ENSXETG00000002036) Coelacanth MODERN SPECIES 384 ENSLACG00000017293 ENSLACG00000016850 ccdc80 (ENSLACG00000016701) SLC35A5 (ENSLACG00000016660) ATG3 (ENSLACG00000016562) F5 (ENSLACG00000016237) GABRR3 (ENSLACG00000016035) CPOX (ENSLACG00000015896) CCDC181 (ENSLACG00000015731) BLZF1 (ENSLACG00000015633) NME7 (ENSLACG00000014441) ATP1B1 (ENSLACG00000014205) ENSLACG00000013853 DPT (ENSLACG00000013000) MPC2 (ENSLACG00000010937) DCAF6 (ENSLACG00000008499) ##22 GPR161 (ENSLACG00000008204) ENSLACG00000007489 INTS10 (ENSLACG00000006851) TIPRL (ENSLACG00000006272) RIOX2 (ENSLACG00000005774) ENSLACG00000004092 ARL6 (ENSLACG00000001976) ENSLACG00000000796 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 3 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ENSGT00940000155600.b ENSGT00990000203619.A.a ENSGT01030000234518.C.b Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 58 ENSGT00530000063252.a.b.a.b ENSGT00940000155799 ENSGT00940000165208.b ENSGT00940000166048.a.a ENSGT00940000156596.d ENSGT00940000154652.p ENSGT00940000157453.s ENSGT00940000154927.c.b ENSGT00950000182899.B.a.j ENSGT00940000157231.b ENSGT00950000183058.A.a.c ENSGT00950000183058.A.b.a ENSGT00950000183134.c.a.a ENSGT00950000182866.D.d.a.c.a ENSGT00510000047120.fb ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00940000158556 ENSGT00950000182827.A ENSGT00940000164470.a ENSGT00520000055625.a ENSGT00940000155202 ENSGT00940000154517.mb ENSGT00530000063528.B ENSGT00940000166292 ENSGT00940000166446 ENSGT00990000203619.A.a ENSGT01030000234518.C.b ENSGT01060000248589.C.g.a ENSGT00940000155600.b ENSGT00940000160782 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 93 ENSGT00940000155799 ENSGT00940000165208.b ENSGT00940000166048.a.a ENSGT00940000156596.d ENSGT00940000154652.p ENSGT00940000157453.s 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(ENSCHAG00000027234) gpr34b (ENSCHAG00000027230) caska (ENSCHAG00000026530) nyx (ENSCHAG00000026468) Denticle herring MODERN SPECIES 19 ENSDCDG00000035061 ugt1a2 (ENSDCDG00000035065) ENSDCDG00000035068 prmt2 (ENSDCDG00000035071) ENSDCDG00000035073 DIP2A (ENSDCDG00000035163) ENSDCDG00000035389 ndufb3 (ENSDCDG00000035390) gpa33a (ENSDCDG00000035391) ildr2 (ENSDCDG00000035392) ildr1b (ENSDCDG00000035395) me3 (ENSDCDG00000035407) nxpe3 (ENSDCDG00000035487) hnmt (ENSDCDG00000035489) mpc2b (ENSDCDG00000035493) dcaf6 (ENSDCDG00000035505) ##22 GPR161 (ENSDCDG00000035530) f5 (ENSDCDG00000035541) slc35a5 (ENSDCDG00000035579) ccdc80 (ENSDCDG00000014043) DIPK2B (ENSDCDG00000014055) KDM6A (ENSDCDG00000015322) fundc1 (ENSDCDG00000032900) efhc2 (ENSDCDG00000032907) ENSDCDG00000032914 mao (ENSDCDG00000032955) caska (ENSDCDG00000033445) GPR82 (ENSDCDG00000033472) ENSDCDG00000033473 gpr34b (ENSDCDG00000033475) nyx (ENSDCDG00000033476) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000154927.c.b 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ENSGT00940000156107.e.b.o ENSGT00950000183080.a.a.e.b.d.b.b ENSGT00940000159521.p ENSGT01000000218756 ENSGT00940000160614.q.a ENSGT00940000153931.b.b.a ENSGT00940000156862.u ENSGT00950000183071.a.a.a.e.b.g.b ENSGT00950000182900.C.x ##22 ENSGT00390000010308.a ENSGT00390000009940 ENSGT00940000164444.b.b ENSGT00950000182882.A.b.b.f.b ENSGT00950000183165.b.a.e.a ENSGT00950000183165.b.a.e.b.d.a.a.b.b ENSGT00940000161352.f.b.a.b ENSGT00940000163262.b ENSGT00940000156075.a.b.d ENSGT00940000154866.B.b.a ENSGT00940000153431.b.l ENSGT00390000006916.c.r.b ENSGT00940000157361.a.n.a ENSGT00940000156983.a.a.q.c ENSGT00940000155103.a.b.ld.d Goldfish MODERN SPECIES 24 myh9a (ENSCARG00000036561) slc25a38b (ENSCARG00000037394) ENSCARG00000037452 ttc26 (ENSCARG00000037540) ENSCARG00000038116 pa2g4a (ENSCARG00000040036) ERBB3 (ENSCARG00000040804) arf3b (ENSCARG00000044305) fkbp11 (ENSCARG00000044339) ENSCARG00000044386 sox21a (ENSCARG00000005829) abcc4 (ENSCARG00000005912) cldn10a (ENSCARG00000006817) dzip1 (ENSCARG00000006825) ENSCARG00000006859 ENSCARG00000006929 ##22 atg3 (ENSCARG00000008692) ihhb (ENSCARG00000008737) bin1b (ENSCARG00000008792) tuba8l4 (ENSCARG00000009345) map3k20a (ENSCARG00000009371) rapgef4b (ENSCARG00000009479) RIN2 (ENSCARG00000011249) dtd1 (ENSCARG00000011273) sec23b (ENSCARG00000011302) ccdc85al (ENSCARG00000011373) bcl11ab (ENSCARG00000011389) ENSCARG00000011397 ENSCARG00000011418 CCDC88A (ENSCARG00000011494) ENSCARG00000013442 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182900.C.x ##22 Golden-line barbel MODERN SPECIES 33 ubn2a (ENSSGRG00000048755) ENSSGRG00000048314 pa2g4a (ENSSGRG00000048017) ENSSGRG00000047981 arf3b (ENSSGRG00000047979) fkbp11 (ENSSGRG00000047978) ENSSGRG00000047977 sox21a (ENSSGRG00000047976) abcc4 (ENSSGRG00000047917) cldn10a (ENSSGRG00000047912) ENSSGRG00000047911 CLDN10 (ENSSGRG00000047908) dzip1 (ENSSGRG00000047907) CLDN10 (ENSSGRG00000047906) ENSSGRG00000047905 ENSSGRG00000047904 ##22 atg3 (ENSSGRG00000047856) ENSSGRG00000047851 ENSSGRG00000047849 nhej1 (ENSSGRG00000047848) ihhb (ENSSGRG00000047845) bin1b (ENSSGRG00000047843) si:ch211-114n24.6 (ENSSGRG00000047658) map3k20a (ENSSGRG00000047640) rapgef4b (ENSSGRG00000047468) ENSSGRG00000047455 dtd1 (ENSSGRG00000047451) dtd1 (ENSSGRG00000047450) ENSSGRG00000047447 ccdc85al (ENSSGRG00000047445) bcl11ab (ENSSGRG00000047440) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT00940000166048.a.a ENSGT00940000156596.d ENSGT00940000159927.d.b ENSGT00940000154652.p ENSGT00940000157453.s ENSGT00940000154927.c.b ENSGT00950000182899.B.a.j ENSGT00940000157231.b ENSGT00950000183058.A.a.c ENSGT00950000183058.A.b.a ENSGT00950000183134.c.a.a ENSGT00950000182866.D.d.a.c.a ENSGT00910000144283 ENSGT00950000183105.A ENSGT00510000047120.fb ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156596.d ENSGT00940000159927.d.b ENSGT00940000154652.p ENSGT00940000157453.s ENSGT00940000154927.c.b ENSGT00950000182899.B.a.j ENSGT00940000157831 ENSGT00940000160248.a ENSGT00950000183058.A.a.c ENSGT00950000183058.A.b.a ENSGT00950000183134.c.a.a ENSGT00950000182866.D.d.a.c.a.h ENSGT00910000144283 ENSGT00950000183105.A ENSGT00510000047120.fb ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00510000047417 ENSGT00940000159616 ENSGT00940000160302 ENSGT00940000158618 ENSGT00940000155009.a ENSGT00390000003231.b ENSGT00530000063186.a ENSGT01100000263512.b.b.a.j ENSGT00940000166315 ENSGT00390000014405 ENSGT01030000239885 ENSGT00530000063252.a.b.a.b ENSGT00940000155799 ENSGT00510000047027.c.b Cod DUPLICATION Cod MODERN SPECIES 12 tfdp1a (ENSGMOG00000027221) dcun1d2a (ENSGMOG00000005782) grtp1b (ENSGMOG00000031351) lamp1b (ENSGMOG00000027758) pou2f1b (ENSGMOG00000011587) ENSGMOG00000011606 ildr2 (ENSGMOG00000011612) ildr1b (ENSGMOG00000037170) me3 (ENSGMOG00000011631) nxpe3 (ENSGMOG00000029131) nxpe3 (ENSGMOG00000022197) ENSGMOG00000027391 ENSGMOG00000027269 RPL24 (ENSGMOG00000003627) mpc2b (ENSGMOG00000003638) ENSGMOG00000003651 ##22 gpr161b (ENSGMOG00000003731) OTC (ENSGMOG00000003743) ENSGMOG00000003765 srpx (ENSGMOG00000003854) SYTL5 (ENSGMOG00000003889) ENSGMOG00000013967 ENSGMOG00000013984 ENSGMOG00000012727 ENSGMOG00000012733 CHPF (ENSGMOG00000012737) asic4a (ENSGMOG00000012740) ENSGMOG00000012752 gmppaa (ENSGMOG00000012792) ENSGMOG00000019956 ENSGMOG00000001491 Cod MODERN SPECIES 20 ENSGMOG00000002942 ENSGMOG00000002928 ENSGMOG00000034066 ENSGMOG00000033235 ENSGMOG00000000146 ENSGMOG00000030009 ENSGMOG00000018993 ENSGMOG00000018946 ENSGMOG00000003146 ENSGMOG00000027949 ENSGMOG00000030541 ENSGMOG00000022325 ENSGMOG00000025130 ENSGMOG00000007206 mpc2a (ENSGMOG00000030387) ENSGMOG00000018726 ##22 ENSGMOG00000018766 ENSGMOG00000018780 ENSGMOG00000024581 ENSGMOG00000027432 ENSGMOG00000026743 ENSGMOG00000017494 ENSGMOG00000017514 pudp (ENSGMOG00000011328) ENSGMOG00000029703 nlgn4xa (ENSGMOG00000007687) ENSGMOG00000024168 PRKX (ENSGMOG00000003669) ENSGMOG00000032604 ENSGMOG00000035909 ENSGMOG00000028832 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000159927.d.b ENSGT00940000154652.p ENSGT00940000157453.s ENSGT00940000154927.c.b ENSGT00950000182899.B.a.j ENSGT00940000177034 ENSGT00940000157831 ENSGT00940000160248.a ENSGT00950000183058.A.a.c ENSGT00950000183058.A.b.a ENSGT00950000183134.c.a.a ENSGT00950000182866.D.d.a.c.a.h ENSGT00910000144283 ENSGT00950000183105.A ENSGT00510000047120.fb ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00510000047417 ENSGT00940000159616 ENSGT00940000160302 ENSGT00940000158618 ENSGT00940000155009.a ENSGT00390000003231.b ENSGT00530000063186.a ENSGT01100000263512.b.b.a.j ENSGT00940000166315 ENSGT00390000014405 ENSGT01030000239885 ENSGT00530000063252.a.b.a.b ENSGT00940000155799 ENSGT00510000047027.c.b Pinecone sodierfish DUPLICATION Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 13 tfdp1a (ENSMMDG00005017140) dcun1d2a (ENSMMDG00005017130) grtp1b (ENSMMDG00005017125) lamp1b (ENSMMDG00005017123) ENSMMDG00005017122 pou2f1b (ENSMMDG00005017116) ENSMMDG00005017107 ildr2 (ENSMMDG00005017097) ildr1b (ENSMMDG00005017095) me3 (ENSMMDG00005014802) nxpe3 (ENSMMDG00005014755) ENSMMDG00005014754 ENSMMDG00005014748 rpl24 (ENSMMDG00005014741) mpc2b (ENSMMDG00005014737) dcaf6 (ENSMMDG00005013680) ##22 gpr161b (ENSMMDG00005013662) OTC (ENSMMDG00005013652) ENSMMDG00005013644 srpx (ENSMMDG00005013583) SYTL5 (ENSMMDG00005013580) DYNLT3 (ENSMMDG00005013578) xk (ENSMMDG00005013576) LANCL3 (ENSMMDG00005013575) GRPR (ENSMMDG00005013573) asb11 (ENSMMDG00005013557) piga (ENSMMDG00005013551) appb (ENSMMDG00005009898) gabpa (ENSMMDG00005009838) u2af1 (ENSMMDG00005009813) ENSMMDG00005004733 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 11 ENSMMDG00005000928 ENSMMDG00005000929 dynlt2b (ENSMMDG00005000930) ENSMMDG00005000932 atp1b1b (ENSMMDG00005000936) ENSMMDG00005000937 atg13 (ENSMMDG00005000941) DGKZ (ENSMMDG00005000978) mdka (ENSMMDG00005002030) CHRM4 (ENSMMDG00005002055) ENSMMDG00005002061 ##22 SLC19A2 (ENSMMDG00005002065) atg3 (ENSMMDG00005002090) ENSMMDG00005002119 GJA1 (ENSMMDG00005002151) ENSMMDG00005002158 ENSMMDG00005002160 ENSMMDG00005002163 ENSMMDG00005002165 ENSMMDG00005002166 ENSMMDG00005002169 ENSMMDG00005002170 ENSMMDG00005002172 ENSMMDG00005002174 ankrd10a (ENSMMDG00005002179) ube2al (ENSMMDG00005002184) Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000159927.d.b ENSGT00940000154652.p ENSGT00940000157453.s ENSGT00940000154927.c.b ENSGT00950000182899.B.a.j ENSGT00940000177034 ENSGT00940000157831 ENSGT00940000160248.a ENSGT00950000183058.A.a.c ENSGT00950000183058.A.b.a ENSGT00950000183134.c.a.a ENSGT00950000182866.D.d.a.c.a.h ENSGT00910000144283 ENSGT00950000183105.A ENSGT00510000047120.fb ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00510000047417 ENSGT00940000159616 ENSGT00940000160302 ENSGT00940000158618 ENSGT00940000155009.a ENSGT00390000003231.b ENSGT00530000063186.a ENSGT01100000263512.b.b.a.j ENSGT00940000166315 ENSGT00390000014405 ENSGT01030000239885 ENSGT00530000063252.a.b.a.b ENSGT00940000155799 ENSGT00510000047027.d Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 440 dcun1d2a (ENSHCOG00000004132) lamp1b (ENSHCOG00000004146) pou2f1b (ENSHCOG00000004173) ENSHCOG00000004183 ildr2 (ENSHCOG00000004233) ildr1b (ENSHCOG00000004243) ENSHCOG00000004252 me3 (ENSHCOG00000004262) nxpe3 (ENSHCOG00000004270) nxpe3 (ENSHCOG00000004287) mpc2b (ENSHCOG00000004294) rpl24 (ENSHCOG00000004302) ENSHCOG00000004306 ENSHCOG00000004309 nxpe3 (ENSHCOG00000004332) dcaf6 (ENSHCOG00000004359) ##22 gpr161b (ENSHCOG00000004391) OTC (ENSHCOG00000004411) ENSHCOG00000004419 srpx (ENSHCOG00000004443) SYTL5 (ENSHCOG00000004466) ENSHCOG00000004476 DYNLT3 (ENSHCOG00000004485) xk (ENSHCOG00000004492) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000159927.d.b ENSGT00940000154652.p ENSGT00940000157453.s ENSGT00940000154927.c.b ENSGT00950000182899.B.a.j ENSGT00940000177034 ENSGT00940000157831 ENSGT00940000160248.a ENSGT00950000183058.A.a.c ENSGT00950000183058.A.b.a ENSGT00950000183134.c.a.a ENSGT00950000182866.D.d.a.c.a.h ENSGT00910000144283 ENSGT00950000183105.A ENSGT00510000047120.fb ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00510000047417 ENSGT00940000159616 ENSGT00940000160302 ENSGT00940000158618 ENSGT00940000155009.a ENSGT00390000003231.b ENSGT00530000063186.a ENSGT01100000263512.b.b.a.j ENSGT00940000166315 ENSGT00390000014405 ENSGT01030000237909 ENSGT00530000063252.a.b.a.b ENSGT00940000155799 ENSGT00510000047027.d Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000159927.d.b ENSGT00940000154652.p ENSGT00940000157453.s ENSGT00940000154927.c.b ENSGT00950000182899.B.a.j ENSGT00940000177034 ENSGT00940000157831 ENSGT00940000160248.a ENSGT00950000183058.A.a.c ENSGT00950000183058.A.b.a ENSGT00950000183134.c.a.a ENSGT00950000182866.D.d.a.c.a.h ENSGT00910000144283 ENSGT00950000183105.A ENSGT00510000047120.fb ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00510000047417 ENSGT00940000159616 ENSGT00940000160302 ENSGT00940000158618 ENSGT00940000155009.a ENSGT00390000003231.b ENSGT00530000063186.a ENSGT01100000263512.b.b.a.j ENSGT00940000166315 ENSGT00390000014405 ENSGT01030000237909 ENSGT00530000063252.a.b.a.b ENSGT00940000155799 ENSGT00510000047027.d Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000159927.d.b ENSGT00940000154652.p ENSGT00940000157453.s ENSGT00940000154927.c.b ENSGT00950000182899.B.a.j ENSGT00940000177034 ENSGT00940000157831 ENSGT00940000160248.a ENSGT00950000183058.A.a.c ENSGT00950000183058.A.b.a ENSGT00950000183134.c.a.a ENSGT00950000182866.D.d.a.c.a.h ENSGT00910000144283 ENSGT00950000183105.A ENSGT00510000047120.fb ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00510000047417 ENSGT00940000159616 ENSGT00940000160302 ENSGT00940000158618 ENSGT00940000155009.a ENSGT00390000003231.b ENSGT00530000063186.a ENSGT01100000263512.b.b.a.j ENSGT00940000166315 ENSGT00390000014405 ENSGT01030000237909 ENSGT00530000063252.a.b.a.b ENSGT00940000155799 ENSGT00510000047027.d Oryzias ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000182837.b.b.c.a ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.a.a.a ENSGT00970000193758 ENSGT00940000158977 ENSGT00940000154295 ENSGT00940000175639 ENSGT00440000033329.b.a.a ENSGT00940000155063.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b.c ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b.d ENSGT01090000259985.b.a.a.b ENSGT00940000178691 ENSGT01090000260082.d.a.b.o.b ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00510000047417 ENSGT00940000159616 ENSGT00940000160302 ENSGT00940000158618 ENSGT00940000155009.a ENSGT00390000003231.b ENSGT00530000063186.a ENSGT01100000263512.b.b.a.j ENSGT00940000166315 ENSGT00390000014405 ENSGT01030000239885 ENSGT00530000063252.a.b.a.b ENSGT00940000155799 ENSGT00510000047027.d Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000182837.b.b.c.a ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.a.a.a ENSGT00970000193758 ENSGT00940000158977 ENSGT00940000154295 ENSGT00940000175639 ENSGT00440000033329.b.a.a ENSGT00940000155063.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b.c ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b.d ENSGT01090000259985.b.a.a.b ENSGT00940000178691 ENSGT01090000260082.d.a.b.o.b ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00510000047417 ENSGT00940000159616 ENSGT00940000160302 ENSGT00940000158618 ENSGT00940000155009.a ENSGT00390000003231.b ENSGT00530000063186.a ENSGT01100000263512.b.b.a.j ENSGT00940000166315 ENSGT00390000014405 ENSGT01030000239885 ENSGT00530000063252.a.b.a.b ENSGT00940000155799 ENSGT00510000047027.d Indian medaka MODERN SPECIES 18 arl5a (ENSOMEG00000017228) NEB (ENSOMEG00000017518) ENSOMEG00000017591 TBC1D8 (ENSOMEG00000017709) PDCL3 (ENSOMEG00000017760) ENSOMEG00000017777 LONRF2 (ENSOMEG00000017796) MAP4K4 (ENSOMEG00000018134) ENSOMEG00000018288 ENSOMEG00000018317 ENSOMEG00000018459 ENSOMEG00000018561 ENSOMEG00000018595 ENSOMEG00000018642 RDX (ENSOMEG00000018770) dcaf6 (ENSOMEG00000018956) ##22 gpr161b (ENSOMEG00000019007) OTC (ENSOMEG00000000500) ENSOMEG00000019054 srpx (ENSOMEG00000019129) SYTL5 (ENSOMEG00000019206) DYNLT3 (ENSOMEG00000019242) xk (ENSOMEG00000019255) LANCL3 (ENSOMEG00000019267) GRPR (ENSOMEG00000019284) asb11 (ENSOMEG00000019308) piga (ENSOMEG00000019320) ENSOMEG00000019331 appb (ENSOMEG00000019469) gabpa (ENSOMEG00000019515) u2af1 (ENSOMEG00000019531) Javanese ricefish MODERN SPECIES 13 arl5a (ENSOJAG00000022605) ENSOJAG00000022657 TBC1D8 (ENSOJAG00000023120) ENSOJAG00000023138 PDCL3 (ENSOJAG00000023142) ENSOJAG00000023151 ENSOJAG00000023167 MAP4K4 (ENSOJAG00000023340) ENSOJAG00000023529 ENSOJAG00000023544 ENSOJAG00000023559 ENSOJAG00000023566 ENSOJAG00000023575 ENSOJAG00000023582 RDX (ENSOJAG00000023621) dcaf6 (ENSOJAG00000023706) ##22 gpr161b (ENSOJAG00000023754) OTC (ENSOJAG00000023758) gdf3 (ENSOJAG00000023760) OTC (ENSOJAG00000023763) ENSOJAG00000012654 srpx (ENSOJAG00000012703) SYTL5 (ENSOJAG00000013005) DYNLT3 (ENSOJAG00000013056) xk (ENSOJAG00000013064) LANCL3 (ENSOJAG00000013088) GRPR (ENSOJAG00000013096) asb11 (ENSOJAG00000013115) piga (ENSOJAG00000013154) appb (ENSOJAG00000013473) gabpa (ENSOJAG00000017283) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00950000182837.b.b.c.a ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.a.a.a ENSGT00970000193758 ENSGT00940000158977 ENSGT00940000154295 ENSGT00940000175639 ENSGT00440000033329.b.a.a ENSGT00940000155063.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b.c ENSGT01090000259985.b.b.b.a.b.d ENSGT01090000259985.b.a.a.b ENSGT00940000178691 ENSGT01090000260082.d.a.b.o.b ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00510000047417 ENSGT00940000159616 ENSGT00940000160302 ENSGT00940000158618 ENSGT00940000155009.a ENSGT00390000003231.b ENSGT00530000063186.a ENSGT01100000263512.b.b.a.j ENSGT00940000166315 ENSGT00390000014405 ENSGT00530000063252.a.b.a.b ENSGT00940000155799 ENSGT00940000154989 ENSGT00940000154311.a.b.db Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 13 ENSORLG00000025648 TBC1D8 (ENSORLG00000009369) ENSORLG00000022389 PDCL3 (ENSORLG00000009325) ENSORLG00000009303 ENSORLG00000023781 LONRF2 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(ENSOSIG00000020335) OTC (ENSOSIG00000020343) ENSOSIG00000020454 srpx (ENSOSIG00000020476) SYTL5 (ENSOSIG00000020479) Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000159927.d.b ENSGT00940000154652.p ENSGT00940000157453.s ENSGT00940000154927.c.b ENSGT00950000182899.B.a.j ENSGT00940000177034 ENSGT00940000157831 ENSGT00940000160248.a ENSGT00950000183058.A.a.c ENSGT00950000183058.A.b.a ENSGT00950000183134.c.a.a ENSGT00950000182866.D.d.a.c.a.h ENSGT00910000144283 ENSGT00950000183105.A ENSGT00510000047120.fb ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00510000047417 ENSGT00940000159616 ENSGT00940000160302 ENSGT00940000158618 ENSGT00940000155009.a ENSGT00390000003231.b ENSGT00530000063186.a ENSGT01100000263512.b.b.a.j ENSGT00940000166315 ENSGT00390000014405 ENSGT01030000237909 ENSGT00530000063252.a.b.a.b ENSGT00940000155799 ENSGT00950000183152.B.c.a Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000159927.d.b ENSGT00940000154652.p ENSGT00940000157453.s ENSGT00940000154927.c.b 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ENSGT00390000005548 ENSGT00940000159177 ENSGT00390000005914.b ENSGT00950000183134.c.a.a ENSGT00950000182866.D.d.a.c.a.h ENSGT00910000144283 ENSGT00950000183105.A ENSGT00510000047120.fb ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00510000047417.s ENSGT00510000047417.t ENSGT00940000159616 ENSGT00940000160302 ENSGT00940000158618 ENSGT00940000180067 ENSGT00940000155009.a ENSGT00390000003231.b ENSGT00530000063186.a ENSGT01100000263512.b.b.a.j ENSGT00940000166315 ENSGT00390000014405 ENSGT00530000063252.a.b.a.b ENSGT00940000155799 Eastern happy MODERN SPECIES 7 GPR45 (ENSACLG00000002273) ENSACLG00000002290 tmem182a (ENSACLG00000002301) MFSD9 (ENSACLG00000002313) slc9a2 (ENSACLG00000002320) inpp4aa (ENSACLG00000002378) si:ch211-229n2.6 (ENSACLG00000002456) si:dkey-4e7.3 (ENSACLG00000002473) coa5 (ENSACLG00000002488) MGAT4A (ENSACLG00000002518) creg2 (ENSACLG00000002559) ENSACLG00000002572 rpl24 (ENSACLG00000002583) ENSACLG00000002639 mpc2b (ENSACLG00000002669) dcaf6 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ENSGT01100000263512.b.b.a.j ENSGT00390000014405 ENSGT00530000063252.a.b.a.b ENSGT00940000155799 ENSGT00510000047027.d ENSGT00940000154989 ENSGT00940000156564.a Bicolor damselfish MODERN SPECIES 291 mettl21cb (ENSSPAG00000006612) grk1a (ENSSPAG00000006586) tfdp1a (ENSSPAG00000006545) dcun1d2a (ENSSPAG00000006498) grtp1b (ENSSPAG00000006445) lamp1b (ENSSPAG00000006429) ENSSPAG00000006409 pou2f1b (ENSSPAG00000006360) ildr2 (ENSSPAG00000006336) ildr1b (ENSSPAG00000006318) me3 (ENSSPAG00000006275) nxpe3 (ENSSPAG00000006266) cep97 (ENSSPAG00000006188) rpl24 (ENSSPAG00000006170) mpc2b (ENSSPAG00000006155) dcaf6 (ENSSPAG00000006077) ##22 gpr161b (ENSSPAG00000006038) OTC (ENSSPAG00000005999) ENSSPAG00000005972 srpx (ENSSPAG00000005947) SYTL5 (ENSSPAG00000005896) DYNLT3 (ENSSPAG00000005880) xk (ENSSPAG00000005870) LANCL3 (ENSSPAG00000005853) GRPR (ENSSPAG00000005818) piga (ENSSPAG00000005794) appb (ENSSPAG00000005769) gabpa (ENSSPAG00000005736) u2af1 (ENSSPAG00000005712) ENSSPAG00000005641 sik1 (ENSSPAG00000005598) Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000159927.d.b ENSGT00940000154652.p ENSGT00940000157453.s ENSGT00940000154927.c.b ENSGT00950000182899.B.a.j ENSGT00940000177034 ENSGT00940000157831 ENSGT00940000160248.a ENSGT00950000183058.A.a.c ENSGT00950000183058.A.b.a ENSGT00950000183134.c.a.a ENSGT00950000182866.D.d.a.c.a.h ENSGT00910000144283 ENSGT00950000183105.A ENSGT00510000047120.fb ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00510000047417 ENSGT00940000159616 ENSGT00940000160302 ENSGT00940000158618 Spiny chromis MODERN SPECIES 504 grk1a (ENSAPOG00000008583) tfdp1a (ENSAPOG00000008568) dcun1d2a (ENSAPOG00000008487) grtp1b (ENSAPOG00000001132) lamp1b (ENSAPOG00000008417) ENSAPOG00000008409 pou2f1b (ENSAPOG00000008392) ENSAPOG00000000220 ildr2 (ENSAPOG00000008336) ildr1b (ENSAPOG00000008303) me3 (ENSAPOG00000008289) nxpe3 (ENSAPOG00000008219) ENSAPOG00000008206 rpl24 (ENSAPOG00000008183) mpc2b (ENSAPOG00000008148) dcaf6 (ENSAPOG00000008108) ##22 gpr161b 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(ENSLBEG00000001038) SYTL5 (ENSLBEG00000001000) DYNLT3 (ENSLBEG00000000982) xk (ENSLBEG00000000964) LANCL3 (ENSLBEG00000000926) GRPR (ENSLBEG00000000852) asb11 (ENSLBEG00000000827) piga (ENSLBEG00000000785) appb (ENSLBEG00000000716) gabpa (ENSLBEG00000000680) u2af1 (ENSLBEG00000000652) sik1 (ENSLBEG00000000594) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000159927.d.b ENSGT00940000154652.p ENSGT00940000157453.s ENSGT00940000154927.c.b ENSGT00950000182899.B.a.j ENSGT00940000177034 ENSGT00940000157831 ENSGT00940000160248.a ENSGT00950000183058.A.a.c ENSGT00950000183058.A.b.a ENSGT00950000183134.c.a.a ENSGT00950000182866.D.d.a.c.a.h ENSGT00910000144283 ENSGT00950000183105.A ENSGT00510000047120.fb ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00510000047417 ENSGT00940000159616 ENSGT00940000160302 ENSGT00940000158618 ENSGT00940000155009.a ENSGT00390000003231.b ENSGT00530000063186.a ENSGT01100000263512.b.b.a.j ENSGT00940000166315 ENSGT00390000014405 ENSGT01030000237909 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ENSGT00940000177034 ENSGT00940000157831 ENSGT00940000160248.a ENSGT00950000183058.A.a.c ENSGT00950000183058.A.b.a ENSGT00950000183134.c.a.a ENSGT00950000182866.D.d.a.c.a.h ENSGT00910000144283 ENSGT00950000183105.A ENSGT00510000047120.fb ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00510000047417 ENSGT00940000159616.d ENSGT00940000160302 ENSGT00940000158618 ENSGT00940000155009.a ENSGT00390000003231.b ENSGT00530000063186.a ENSGT01100000263512.b.b.a.j ENSGT00940000166315 ENSGT00390000014405 ENSGT01030000237909 ENSGT00530000063252.a.b.a.b ENSGT00940000155799 ENSGT00950000183152.B.c.a.s.a European seabass MODERN SPECIES 5 ENSDLAG00005015944 tfdp1a (ENSDLAG00005035138) dcun1d2a (ENSDLAG00005015860) grtp1b (ENSDLAG00005028293) lamp1b (ENSDLAG00005015802) ENSDLAG00005015793 GPA33 (ENSDLAG00005022007) pou2f1b (ENSDLAG00005028998) ildr2 (ENSDLAG00005015280) ildr1b (ENSDLAG00005015273) me3 (ENSDLAG00005013570) nxpe3 (ENSDLAG00005013512) ENSDLAG00005013477 RPL24 (ENSDLAG00005013403) mpc2b 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(ENSSAUG00010012263) gabpa (ENSSAUG00010013667) u2af1 (ENSSAUG00010013669) sik1 (ENSSAUG00010013670) Perciformes ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000159927.d.b ENSGT00940000154652.p ENSGT00940000157453.s ENSGT00940000154927.c.b ENSGT00950000182899.B.a.j ENSGT00940000177034 ENSGT00940000157831 ENSGT00940000160248.a ENSGT00950000183058.A.a.c ENSGT00950000183058.A.b.a ENSGT00950000183134.c.a.a ENSGT00950000182866.D.d.a.c.a.h ENSGT00910000144283 ENSGT00950000183105.A ENSGT00510000047120.fb ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00510000047417 ENSGT00940000159616 ENSGT00940000160302 ENSGT00940000158618 ENSGT00940000155009.a ENSGT00390000003231.b ENSGT01100000263512.b.b.a.j ENSGT00940000166315 ENSGT00390000014405 ENSGT01030000237909 ENSGT00530000063252.a.b.a.b ENSGT00940000155799 ENSGT00950000183152.B.c.a.s.a ENSGT00510000047027.d Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000156596.d ENSGT00940000159927.d.b ENSGT00940000154652.p ENSGT00940000157453.s ENSGT00940000154927.c.b ENSGT00950000182899.B.a.j ENSGT00940000157831 ENSGT00940000160248.a ENSGT00950000183058.A.a.c ENSGT00950000183058.A.b.a ENSGT00950000183134.c.a.a ENSGT00950000182866.D.d.a.c.a.h ENSGT00910000144283 ENSGT00950000183105.A ENSGT00510000047120.fb ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00510000047417 ENSGT00940000159616 ENSGT00940000160302 ENSGT00940000158618 ENSGT00940000155009.a ENSGT00390000003231.b ENSGT01100000263512.b.b.a.j ENSGT00940000166315 ENSGT00390000014405 ENSGT01030000237909 ENSGT00530000063252.a.b.a.b ENSGT00940000155799 ENSGT00950000183152.B.c.a.s.a ENSGT00940000154989 Lumpfish MODERN SPECIES 13 st6gal2a (ENSCLMG00005020331) jam2b (ENSCLMG00005020332) grk1a (ENSCLMG00005020333) tfdp1a (ENSCLMG00005020335) dcun1d2a (ENSCLMG00005020344) grtp1b (ENSCLMG00005020345) lamp1b (ENSCLMG00005020346) pou2f1b (ENSCLMG00005020347) ENSCLMG00005020350 ildr2 (ENSCLMG00005020351) ildr1b (ENSCLMG00005002772) me3 (ENSCLMG00005002776) cep97 (ENSCLMG00005002782) rpl24 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ENSGACG00000003314 srpx (ENSGACG00000003318) SYTL5 (ENSGACG00000003344) DYNLT3 (ENSGACG00000003355) xk (ENSGACG00000003384) GRPR (ENSGACG00000003391) asb11 (ENSGACG00000003395) piga (ENSGACG00000003400) ENSGACG00000003420 appb (ENSGACG00000003424) gabpa (ENSGACG00000003430) u2af1 (ENSGACG00000003454) sik1 (ENSGACG00000003459) Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000159927.d.b ENSGT00940000154652.p ENSGT00940000157453.s ENSGT00940000154927.c.b ENSGT00950000182899.B.a.j ENSGT00940000177034 ENSGT00940000157831 ENSGT00940000160248.a ENSGT00950000183058.A.a.c ENSGT00950000183058.A.b.a ENSGT00950000183134.c.a.a ENSGT00950000182866.D.d.a.c.a.h ENSGT00910000144283 ENSGT00950000183105.A ENSGT00510000047120.fb ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00510000047417 ENSGT00940000159616 ENSGT00940000160302 ENSGT00940000158618 ENSGT00940000155009.a ENSGT00390000003231.b ENSGT01100000263512.b.b.a.j ENSGT00940000166315 ENSGT00390000014405 ENSGT00530000063252.a.b.a.b 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ENSMAMG00000015542 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000159927.d.b ENSGT00940000154652.p ENSGT00940000157453.s ENSGT00940000154927.c.b ENSGT00950000182899.B.a.j ENSGT00940000177034 ENSGT00940000157831 ENSGT00940000160248.a ENSGT00950000183058.A.a.c ENSGT00950000183058.A.b.a ENSGT00950000183134.c.a.a ENSGT00950000182866.D.d.a.c.a.h ENSGT00910000144283 ENSGT00950000183105.A ENSGT00510000047120.fb ENSGT00950000182900.C ##22 ENSGT00940000157829 ENSGT00510000047417 ENSGT00940000159616 ENSGT00940000160302 ENSGT00940000158618 ENSGT00940000155009.a ENSGT00390000003231.b ENSGT00530000063186.a ENSGT01100000263512.b.b.a.j ENSGT00940000166315 ENSGT00390000014405 ENSGT00530000063252.a.b.a.b ENSGT00940000155799 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00510000047027.d Siamese fighting fish MODERN SPECIES 11 grk1a (ENSBSLG00000013574) tfdp1a (ENSBSLG00000013519) dcun1d2a (ENSBSLG00000013626) grtp1b (ENSBSLG00000013729) lamp1b (ENSBSLG00000013740) ENSBSLG00000013747 pou2f1b (ENSBSLG00000013759) 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ENSGT00910000144283.c ENSGT00950000183105.A.g.a ENSGT00510000047120.fb ENSGT00950000182900.C.hb.a ##22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157453.s.b ENSGT00940000154927.c.b.c ENSGT00950000182899.B.a.j.e ENSGT00990000210160.a ENSGT00940000157831.k.b ENSGT00940000160215 ENSGT00940000166391 ENSGT00940000160248.a ENSGT00950000183058.A.a.c.c ENSGT00950000183058.A.b.a.c ENSGT00950000183134.c.a.a.ab ENSGT00950000182866.D.d.a.c.a.i.a.a ENSGT00910000144283.c ENSGT00950000183105.A.g.a ENSGT00510000047120.fb ENSGT00950000182900.C.hb.a ##22 ENSGT00390000001021.w.b ENSGT00940000155375.m.a ENSGT00940000153244.B.j ENSGT00940000154443.e.d.b ENSGT00940000160782 ENSGT00940000155600.a.b.b ENSGT01060000248589.C.g.a.e ENSGT00990000203619.A.a ENSGT00940000166446.h ENSGT00940000166292.a ENSGT00940000154517.mb.c ENSGT00940000155202.g.b ENSGT00940000164470.a.f ENSGT00390000011709.fb.a ENSGT00940000158106.t Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000157453.s.b ENSGT00940000154927.c.b.c 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##22 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000010308.h ENSGT00940000164470.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C ENSGT00940000154365.a.b.d ENSGT01070000255150 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 148 ENSGT00940000153514.b.m.b.g.d ENSGT00950000183014.f.a ENSGT00940000162403.c ENSGT00390000006826 ENSGT00940000165235.a.a.a ENSGT00940000156186.l.a.c ENSGT00940000155675.p.b ENSGT00950000183140.a.a.k.b ENSGT00940000156056.A.j.c ENSGT00950000182910.a.a.d ENSGT00390000003896.e ENSGT00390000014995.k ENSGT00940000161625.m.c ENSGT00940000155812.u.b ENSGT00510000047120.gb.f.a.b ENSGT00950000182900.C.ib ##22 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000010308.h ENSGT00940000164470.b ENSGT00390000007364.j Coho salmon DUPLICATION Coho salmon MODERN SPECIES 34 ENSOKIG00005050295 mlpha (ENSOKIG00005050274) trim63a (ENSOKIG00005050272) ACKR3 (ENSOKIG00005050269) ENSOKIG00005050267 iqca1 (ENSOKIG00005050260) ENSOKIG00005050257 ENSOKIG00005050254 gbx2 (ENSOKIG00005050252) AGAP1 (ENSOKIG00005050224) 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River trout MODERN SPECIES 32 ENSSTUG00000040103 ENSSTUG00000040098 ENSSTUG00000040095 ENSSTUG00000040050 ENSSTUG00000040037 arl6ip6 (ENSSTUG00000040033) eef1b2 (ENSSTUG00000039946) ndufs1 (ENSSTUG00000039871) ENSSTUG00000039539 vps16 (ENSSTUG00000038908) rgn (ENSSTUG00000038871) zgc:112023 (ENSSTUG00000038839) nabp1b (ENSSTUG00000038834) ENSSTUG00000038828 MPC2 (ENSSTUG00000044906) ENSSTUG00000044865 ##22 SLC19A2 (ENSSTUG00000044858) atg3 (ENSSTUG00000044814) ENSSTUG00000044801 faimb (ENSSTUG00000044778) AGAP1 (ENSSTUG00000042119) gbx2 (ENSSTUG00000042014) ENSSTUG00000042005 iqca1 (ENSSTUG00000041806) ACKR3 (ENSSTUG00000041780) trim63a (ENSSTUG00000041773) mlpha (ENSSTUG00000041743) ENSSTUG00000041724 ENSSTUG00000041713 ENSSTUG00000041681 SNX4 (ENSSTUG00000040732) River trout MODERN SPECIES 36 ndufs1 (ENSSTUG00000022318) eef1b2 (ENSSTUG00000022511) dytn (ENSSTUG00000022550) zswim2 (ENSSTUG00000022558) ENSSTUG00000022579 GULP1 (ENSSTUG00000023168) ENSSTUG00000023389 ENSSTUG00000023400 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