Theria ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000156646 #9 ENSGT00390000015119 #10 ENSGT01000000214440.C #11 ENSGT00390000007539 #12 ENSGT00390000012589 #13 ENSGT00510000048151 #14 ENSGT00640000091486.a #15 ENSGT00390000008975 #16 ENSGT00950000183059.a ENSGT00940000161486 #17 ENSGT00940000161805 #18 ENSGT00940000160376 #19 ENSGT01100000263497.B #20 ENSGT00390000011639 #21 ENSGT00940000162696 ENSGT00940000156457 #22 ENSGT00390000001930 #23 ENSGT00510000049875 #25 ENSGT00390000002615 ENSGT00390000008374 ENSGT00940000159139 ENSGT00940000156954 ENSGT00940000159921 ENSGT00940000159589 ENSGT01030000234573.B.c.b.b ENSGT00940000159914 ENSGT00390000007552 ENSGT00940000154902.bb.a ENSGT00940000154902.bb.b ENSGT00940000155073.b ENSGT00950000183045.A.a.a Eutheria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000162301 #8 ENSGT00940000156646 #9 ENSGT00390000015119 #10 ENSGT01000000214440.C #11 ENSGT00390000007539.i.a #12 ENSGT00390000012589 #13 ENSGT00510000048151 #14 ENSGT00640000091486.a #15 ENSGT00390000008975 #16 ENSGT00940000161486 #17 ENSGT00940000161805 #18 ENSGT00940000160376 #19 ENSGT01100000263497.B #20 ENSGT00390000011639 #21 ENSGT00940000162696 ENSGT00940000156457 #22 ENSGT00390000001930 #23 ENSGT00400000022873 #24 ENSGT00510000049875 #25 ENSGT00390000002615 ENSGT00390000008374 ENSGT00940000159139 ENSGT00940000156954 ENSGT00940000159921 ENSGT00940000159589 ENSGT01030000234573.B.c.b.b ENSGT00940000159914 ENSGT00390000007552 ENSGT00940000154902.bb.a ENSGT00940000154902.bb.b ENSGT00940000155073.b Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156646 #9 ENSGT00390000015119 #10 ENSGT00700000106100 ENSGT01000000214440.C #11 ENSGT00390000007539.i.a #12 ENSGT00390000012589 #13 ENSGT00510000048151 #14 ENSGT00640000091486.a #15 ENSGT00390000008975 #16 ENSGT00940000161486 #17 ENSGT00940000161805 #18 ENSGT00940000160376 #19 ENSGT01100000263497.B #20 ENSGT00390000011639 #21 ENSGT00940000162696 ENSGT00940000156457 #22 ENSGT00390000001930 #23 ENSGT00400000022873 #24 ENSGT00510000049875 #25 ENSGT00390000002615 ENSGT00390000008374 ENSGT00940000159139 ENSGT00940000156954 ENSGT00940000159921 ENSGT00940000159589 ENSGT01030000234573.B.c.b.b ENSGT00940000159914 ENSGT00390000007552.f ENSGT00940000154902.bb.a ENSGT00940000154902.bb.b ENSGT00940000155073.b Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156646 #9 ENSGT00390000015119 #10 ENSGT00700000106100 ENSGT01000000214440.C #11 ENSGT00390000007539.i.a #12 ENSGT00390000012589 #13 ENSGT00510000048151 #14 ENSGT00640000091486.a #15 ENSGT00390000008975 #16 ENSGT00940000161486 #17 ENSGT00940000161805 #18 ENSGT00940000160376 #19 ENSGT01100000263497.B #20 ENSGT00390000011639 #21 ENSGT00940000162696 ENSGT00940000156457 #22 ENSGT00390000001930 #23 ENSGT00510000049875 #25 ENSGT00400000022873 #24 ENSGT00390000002615 ENSGT00390000008374 ENSGT00940000159139 ENSGT00940000156954 ENSGT00940000159921 ENSGT00940000159589 ENSGT01030000234573.B.c.b.b ENSGT00940000159914 ENSGT00390000007552.f ENSGT00940000154902.bb.b ENSGT00940000154902.bb.a ENSGT00940000155073.b Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156646 #9 ENSGT00390000015119 #10 ENSGT00700000106100 ENSGT01000000214440.C #11 ENSGT00390000007539.i.a #12 ENSGT00390000012589 #13 ENSGT00510000048151 #14 ENSGT00640000091486.a #15 ENSGT00390000008975 #16 ENSGT00940000161486 #17 ENSGT00940000161805 #18 ENSGT00940000160376 #19 ENSGT01100000263497.B #20 ENSGT00390000011639 #21 ENSGT00940000162696 ENSGT00940000156457 #22 ENSGT00390000001930 #23 ENSGT00400000022873 #24 ENSGT00510000049875 #25 ENSGT00390000002615 ENSGT00390000008374 ENSGT00940000159139 ENSGT00940000156954 ENSGT00940000159921 ENSGT00940000159589 ENSGT01030000234573.B.c.b.b ENSGT00940000159914 ENSGT00390000007552.f ENSGT00940000154902.bb.b ENSGT00940000154902.bb.a ENSGT00940000155073.b Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156646 #9 ENSGT00390000015119 #10 ENSGT00700000106100 ENSGT01000000214440.C #11 ENSGT00390000007539.i.a #12 ENSGT00390000012589 #13 ENSGT00510000048151 #14 ENSGT00640000091486.a #15 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(ENSTSYG00000025677) #21 UBXN1 (ENSTSYG00000004434) #22 UQCC3 (ENSTSYG00000006832) #23 LBHD1 (ENSTSYG00000008520) #24 CSKMT (ENSTSYG00000008533) #25 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015119 #10 ENSGT00700000106100 ENSGT01000000214440.C #11 ENSGT00910000147729 ENSGT00390000007539.i.a #12 ENSGT00390000012589 #13 ENSGT00510000048151 #14 ENSGT00640000091486.a #15 ENSGT00390000008975 #16 ENSGT00940000161486 #17 ENSGT00940000161805 #18 ENSGT00940000160376 #19 ENSGT01100000263497.B #20 ENSGT00390000011639 #21 ENSGT00940000162696 ENSGT00940000156457 #22 ENSGT00390000001930 #23 ENSGT00400000022873 #24 ENSGT00510000049875 #25 ENSGT00390000002615 ENSGT00390000008374 ENSGT00940000159139 ENSGT00940000156954 ENSGT00940000159921 ENSGT00940000159589 ENSGT01030000234573.B.c.b.b ENSGT00940000159914 ENSGT00390000007552.f.x ENSGT00940000154902.bb.b ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000013802.v.a Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000015119 #10 ENSGT00700000106100 ENSGT01000000214440.C #11 ENSGT00910000147729 ENSGT00390000007539.i.a #12 ENSGT00390000012589 #13 ENSGT00510000048151 #14 ENSGT00640000091486.a #15 ENSGT00390000008975 #16 ENSGT00940000161486 #17 ENSGT00940000161805 #18 ENSGT00940000160376 #19 ENSGT01100000263497.B #20 ENSGT00390000011639 #21 ENSGT00940000162696 ENSGT00940000156457 #22 ENSGT00390000001930 #23 ENSGT00510000049875 #25 ENSGT00400000022873 #24 ENSGT00390000008374 ENSGT00940000159139 ENSGT00940000156954 ENSGT00940000159921 ENSGT00940000159589 ENSGT01030000234573.B.c.b.b ENSGT00940000159914 ENSGT00390000007552.f.x ENSGT00940000154902.bb.b ENSGT00940000154902.bb.a ENSGT00940000155073.b ENSGT00950000183045.A.a.a.i Mas night monkey MODERN SPECIES 336 ENSANAG00000020205 #7 CHRM1 (ENSANAG00000020194) #8 SLC3A2 (ENSANAG00000037370) #9 WDR74 (ENSANAG00000031747) #10 STX5 (ENSANAG00000028924) #11 NXF1 (ENSANAG00000024600) #12 TMEM223 (ENSANAG00000037673) #13 TMEM179B (ENSANAG00000036828) #14 TAF6L (ENSANAG00000037691) #15 POLR2G (ENSANAG00000037428) #16 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ENSGT01030000234573.B.c.b.b ENSGT00940000159914 ENSGT00390000007552.f.x ENSGT00940000154902.bb.a ENSGT00940000155073.b ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00940000153052.c.a.a.a Olive baboon MODERN SPECIES 3 CHRM1 (ENSPANG00000021843) #8 SLC3A2 (ENSPANG00000012315) #9 WDR74 (ENSPANG00000013148) #10 STX5 (ENSPANG00000019343) #11 NXF1 (ENSPANG00000012132) #12 TMEM223 (ENSPANG00000012314) #13 TMEM179B (ENSPANG00000021117) #14 TAF6L (ENSPANG00000013647) #15 POLR2G (ENSPANG00000037490) #16 ZBTB3 (ENSPANG00000008469) #17 TTC9C (ENSPANG00000039235) #18 HNRNPUL2 (ENSPANG00000023745) #19 GNG3 (ENSPANG00000042558) #20 BSCL2 (ENSPANG00000011406) #21 LRRN4CL (ENSPANG00000003479) UBXN1 (ENSPANG00000005453) #22 UQCC3 (ENSPANG00000035430) #23 CSKMT (ENSPANG00000046328) #25 C11orf98 (ENSPANG00000007575) ENSPANG00000040911 GANAB (ENSPANG00000010909) B3GAT3 (ENSPANG00000005376) ROM1 (ENSPANG00000015653) EML3 (ENSPANG00000012313) MTA2 (ENSPANG00000005452) TUT1 (ENSPANG00000010908) EEF1G (ENSPANG00000003106) 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ENSGT00390000008374 ENSGT00940000159139 ENSGT00940000156954 ENSGT00940000159921 ENSGT00940000159589 ENSGT01030000234573.B.c.b.b ENSGT00940000159914 ENSGT00390000007552.f.x ENSGT00940000154902.bb.b ENSGT00940000155073.b ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00530000063866.c.b Crab-eating macaque MODERN SPECIES 5 SLC3A2 (ENSMFAG00000032262) #9 ENSMFAG00000055662 WDR74 (ENSMFAG00000034162) #10 STX5 (ENSMFAG00000003488) #11 NXF1 (ENSMFAG00000045399) #12 TMEM223 (ENSMFAG00000030143) #13 TMEM179B (ENSMFAG00000037362) #14 TAF6L (ENSMFAG00000030912) #15 POLR2G (ENSMFAG00000033674) #16 ZBTB3 (ENSMFAG00000003520) #17 TTC9C (ENSMFAG00000036997) #18 HNRNPUL2 (ENSMFAG00000041014) #19 ENSMFAG00000039354 #20 BSCL2 (ENSMFAG00000031001) #21 LRRN4CL (ENSMFAG00000049892) UBXN1 (ENSMFAG00000045415) #22 ENSMFAG00000051023 ENSMFAG00000061333 CSKMT (ENSMFAG00000032323) #25 C11orf98 (ENSMFAG00000003562) INTS5 (ENSMFAG00000031212) GANAB (ENSMFAG00000045211) B3GAT3 (ENSMFAG00000037575) ROM1 (ENSMFAG00000002310) EML3 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Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000015119 #10 ENSGT00700000106100 ENSGT01000000214440.C #11 ENSGT00910000147729 ENSGT00390000007539.i.a #12 ENSGT00390000012589 #13 ENSGT00510000048151 #14 ENSGT00640000091486.a #15 ENSGT00390000008975 #16 ENSGT00940000161486 #17 ENSGT00940000161805 #18 ENSGT00940000160376 #19 ENSGT01100000263497.B #20 ENSGT00390000011639 #21 ENSGT00940000162696 ENSGT00940000156457 #22 ENSGT00390000001930 #23 ENSGT00510000049875 #25 ENSGT00400000022873 #24 ENSGT00390000008374 ENSGT00940000159139 ENSGT00940000156954.k.a ENSGT00940000159921 ENSGT00940000159589 ENSGT01030000234573.B.c.b.b ENSGT00940000159914 ENSGT00390000007552.f.x ENSGT00940000154902.bb.b ENSGT00940000155073.b ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00940000153052.c.a.a.c Gibbon MODERN SPECIES 19 SLC3A2 (ENSNLEG00000004298) #9 WDR74 (ENSNLEG00000004238) #10 STX5 (ENSNLEG00000004184) #11 ENSNLEG00000035784 ENSNLEG00000004123 #12 TMEM223 (ENSNLEG00000004119) #13 TMEM179B (ENSNLEG00000036102) #14 TAF6L 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#20 ENSGT00390000011639 #21 ENSGT00940000162696 ENSGT00940000156457 #22 ENSGT00390000001930 #23 ENSGT00510000049875 #25 ENSGT00400000022873 #24 ENSGT00390000008374 ENSGT00940000159139 ENSGT00940000156954.k.a ENSGT00940000159921 ENSGT00940000159589 ENSGT01030000234573.B.c.b.b ENSGT00940000159914 ENSGT00390000007552.f.x ENSGT00940000154902.bb.b ENSGT00940000155073.b ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00940000153052.c.a.a.c Orangutan MODERN SPECIES 2 SLC3A2 (ENSPPYG00000003140) #9 WDR74 (ENSPPYG00000003141) #10 TEX54 (ENSPPYG00000034365) STX5 (ENSPPYG00000003142) #11 NXF1 (ENSPPYG00000003143) #12 TMEM223 (ENSPPYG00000003144) #13 TMEM179B (ENSPPYG00000003145) #14 TAF6L (ENSPPYG00000003146) #15 ENSPPYG00000003147 #16 ZBTB3 (ENSPPYG00000003148) #17 TTC9C (ENSPPYG00000030629) #18 HNRNPUL2 (ENSPPYG00000029773) #19 GNG3 (ENSPPYG00000003150) #20 BSCL2 (ENSPPYG00000038932) #21 LRRN4CL (ENSPPYG00000003152) UBXN1 (ENSPPYG00000003153) #22 ENSPPYG00000003154 #23 LBHD1 (ENSPPYG00000003155) #24 CSKMT 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ENSGT00940000156457 #22 ENSGT00390000001930 #23 ENSGT00400000022873 #24 ENSGT00390000002615 ENSGT00390000008374 ENSGT00940000159139 ENSGT00940000156954 ENSGT00940000159921 ENSGT00940000159589 ENSGT01030000234573.B.c.b.b ENSGT00940000159914 ENSGT00390000007552.f ENSGT00940000154902.bb.b ENSGT00940000154902.bb.a ENSGT00940000155073.b ENSGT00950000183045.A.a.a Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES Slc3a2 (ENSRNOG00000018487) #9 LOC690251 (ENSRNOG00000029315) Wdr74 (ENSRNOG00000042878) #10 LOC120099984 (ENSRNOG00000063481) Stx5 (ENSRNOG00000018847) #11 Nxf1 (ENSRNOG00000019069) #12 Tmem223 (ENSRNOG00000019266) #13 Tmem179b (ENSRNOG00000019341) #14 Taf6l (ENSRNOG00000019419) #15 Zbtb3 (ENSRNOG00000019461) #17 Polr2g (ENSRNOG00000019439) #16 Ttc9c (ENSRNOG00000019464) #18 Hnrnpul2 (ENSRNOG00000019507) Gng3 (ENSRNOG00000019570) #20 Bscl2 (ENSRNOG00000052393) #21 Ubxn1 (ENSRNOG00000019666) #22 Uqcc3 (ENSRNOG00000045561) #23 Gm49403 (ENSRNOG00000064559) #24 C1h11orf98 (ENSRNOG00000019701) Ints5 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ENSGT01100000263497.B #20 ENSGT00390000011639 #21 ENSGT00940000162696 ENSGT00940000156457 #22 ENSGT00390000001930 #23 ENSGT00400000022873 #24 ENSGT00390000002615 ENSGT00390000008374 ENSGT00940000159139 ENSGT00940000156954 ENSGT00940000159921 ENSGT00940000159589 ENSGT01030000234573.B.c.b.b ENSGT00940000159914 ENSGT00390000007552.f ENSGT00940000154902.bb.b ENSGT00940000154902.bb.a ENSGT00940000155073.b ENSGT00950000183045.A.a.a Mouse MODERN SPECIES 10 Slc3a2 (ENSMUSG00000010095) #9 Wdr74 (ENSMUSG00000042729) #10 Tex54 (ENSMUSG00000090840) Stx5a (ENSMUSG00000010110) #11 Nxf1 (ENSMUSG00000010097) #12 Tmem223 (ENSMUSG00000117924) #13 Tmem179b (ENSMUSG00000118346) #14 Taf6l (ENSMUSG00000003680) #15 Polr2g (ENSMUSG00000071662) #16 Zbtb3 (ENSMUSG00000071661) #17 Ttc9c (ENSMUSG00000071660) #18 Hnrnpul2 (ENSMUSG00000071659) #19 Gng3 (ENSMUSG00000071658) #20 Bscl2 (ENSMUSG00000071657) #21 Lrrn4cl (ENSMUSG00000071656) Ubxn1 (ENSMUSG00000071655) #22 Uqcc3 (ENSMUSG00000071654) #23 Lbhd1 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ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000162301 #8 ENSGT00940000156646 #9 ENSGT00390000015119 #10 ENSGT01000000214440.C #11 ENSGT00390000007539.i.a #12 ENSGT00390000012589 #13 ENSGT00510000048151 #14 ENSGT00640000091486.a #15 ENSGT00390000008975 #16 ENSGT00940000161486 #17 ENSGT00940000161805 #18 ENSGT00940000160376 #19 ENSGT01100000263497.B #20 ENSGT00390000011639 #21 ENSGT00940000162696 ENSGT00940000156457 #22 ENSGT00390000001930 #23 ENSGT00510000049875 #25 ENSGT00390000002615 ENSGT00390000008374 ENSGT00940000159139 ENSGT00940000156954 ENSGT00940000159921 ENSGT00940000159589 ENSGT01030000234573.B.c.b.b ENSGT00940000159914 ENSGT00390000007552.f ENSGT00940000154902.bb.b ENSGT00940000155073.b ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00390000013802 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 2 CHRM1 (ENSRFEG00010011318) #8 SLC3A2 (ENSRFEG00010011338) #9 WDR74 (ENSRFEG00010011575) #10 STX5 (ENSRFEG00010011935) #11 NXF1 (ENSRFEG00010012033) #12 TMEM223 (ENSRFEG00010012090) #13 TMEM179B (ENSRFEG00010012153) #14 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INTS5 (ENSPVAG00000003463) GANAB (ENSPVAG00000003458) B3GAT3 (ENSPVAG00000003456) ROM1 (ENSPVAG00000003455) EML3 (ENSPVAG00000003451) MTA2 (ENSPVAG00000003447) TUT1 (ENSPVAG00000003444) EEF1G (ENSPVAG00000003440) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156646 #9 ENSGT00390000015119 #10 ENSGT00700000106100 ENSGT01000000214440.C #11 ENSGT00390000007539.i.a #12 ENSGT00390000012589 #13 ENSGT00510000048151 #14 ENSGT00640000091486.a #15 ENSGT00390000008975 #16 ENSGT00940000161486 #17 ENSGT00940000161805 #18 ENSGT00940000160376 #19 ENSGT01100000263497.B #20 ENSGT00390000011639 #21 ENSGT00940000162696 ENSGT00940000156457 #22 ENSGT00390000001930 #23 ENSGT00400000022873 #24 ENSGT00510000049875 #25 ENSGT00390000002615 ENSGT00390000008374 ENSGT00940000159139 ENSGT00940000156954 ENSGT00940000159921 ENSGT00940000159589 ENSGT01030000234573.B.c.b.b ENSGT00940000159914 ENSGT00390000007552.f ENSGT00940000154902.bb.a ENSGT00940000154902.bb.b ENSGT00940000155073.b Suina ANCESTRAL SPECIES 14 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(ENSCHYG00000015186) TUT1 (ENSCHYG00000015098) EEF1G (ENSCHYG00000014986) ENSCHYG00000014832 ENSCHYG00000014697 ENSCHYG00000014657 ASRGL1 (ENSCHYG00000014526) Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00390000008975 #16 ENSGT00940000161486 #17 ENSGT00940000165941 ENSGT00940000160376 #19 ENSGT01100000263497.B #20 ENSGT00940000156457 #22 ENSGT00390000001930 #23 Common shrew MODERN SPECIES 6771 ENSSARG00000008773 #16 ZBTB3 (ENSSARG00000008770) #17 ENSSARG00000008748 HNRNPUL2 (ENSSARG00000008713) #19 GNG3 (ENSSARG00000008694) #20 UBXN1 (ENSSARG00000008689) #22 UQCC3 (ENSSARG00000008687) #23 Hedgehog MODERN SPECIES 5393 UBXN1 (ENSEEUG00000006105) #22 UQCC3 (ENSEEUG00000006086) #23 ENSEEUG00000005991 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000162301 #8 ENSGT00940000156646 #9 ENSGT00390000015119 #10 ENSGT01000000214440.C #11 ENSGT00390000007539.i.a #12 ENSGT00390000012589.h #13 ENSGT00510000048151 #14 ENSGT00640000091486.a #15 ENSGT00390000008975 #16 ENSGT00940000161486 #17 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ENSGT00390000008374 ENSGT00940000159139 ENSGT00940000159921 ENSGT00940000156954 ENSGT00940000159589 ENSGT01030000234573.B.c.b.b ENSGT00940000159914 ENSGT00940000154902.bb.b ENSGT00950000183045.A.a.a Armadillo MODERN SPECIES 576 CHRM1 (ENSDNOG00000033696) #8 SLC3A2 (ENSDNOG00000035768) #9 WDR74 (ENSDNOG00000043582) #10 ENSDNOG00000005008 #11 NXF1 (ENSDNOG00000024303) #12 TMEM223 (ENSDNOG00000003066) #13 TMEM179B (ENSDNOG00000045983) #14 ENSDNOG00000031631 #15 POLR2G (ENSDNOG00000043426) #16 ENSDNOG00000012208 ENSDNOG00000043011 #17 TTC9C (ENSDNOG00000006523) #18 HNRNPUL2 (ENSDNOG00000006508) #19 GNG3 (ENSDNOG00000006502) #20 BSCL2 (ENSDNOG00000045976) #21 UBXN1 (ENSDNOG00000002776) #22 UQCC3 (ENSDNOG00000002774) #23 ENSDNOG00000002773 #24 CSKMT (ENSDNOG00000036002) #25 C11orf98 (ENSDNOG00000035199) INTS5 (ENSDNOG00000047221) GANAB (ENSDNOG00000016317) ROM1 (ENSDNOG00000034552) B3GAT3 (ENSDNOG00000046900) EML3 (ENSDNOG00000034127) MTA2 (ENSDNOG00000016309) TUT1 (ENSDNOG00000038908) AHNAK 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