Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT01060000252496	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00950000184268	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000154537
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT01060000252496	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00950000184268	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.a	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT01060000252496	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00950000184268	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00940000165487	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.a	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES	2497																ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00940000165487
Common shrew	MODERN SPECIES	1647																ANXA11 (ENSSARG00000000769) #22
Hedgehog	MODERN SPECIES	8021																ANXA11 (ENSEEUG00000009215) #22	ENSEEUG00000009201
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT01060000252496	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00950000184268	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.a	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.a	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172
Suina	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000157372	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172	ENSGT00940000155509
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	975	KAT6B (ENSCWAG00000021665)	DUSP29 (ENSCWAG00000021659)	DUSP13 (ENSCWAG00000021652)	SAMD8 (ENSCWAG00000021649)	VDAC2 (ENSCWAG00000021644)	COMTD1 (ENSCWAG00000021639)	ZNF503 (ENSCWAG00000021636)	LRMDA (ENSCWAG00000021618)	KCNMA1 (ENSCWAG00000018002)	DLG5 (ENSCWAG00000017488)	POLR3A (ENSCWAG00000017336)	ENSCWAG00000017213	ZMIZ1 (ENSCWAG00000017058)	PPIF (ENSCWAG00000017029)	ZCCHC24 (ENSCWAG00000017002)	ANXA11 (ENSCWAG00000016962) #22	PLAC9 (ENSCWAG00000016948)	TMEM254 (ENSCWAG00000016918)	ENSCWAG00000016901	SFTPD (ENSCWAG00000016854)	ENSCWAG00000016806	ENSCWAG00000016771	MAT1A (ENSCWAG00000016704)	DYDC1 (ENSCWAG00000016654)	DYDC2 (ENSCWAG00000016627)	PRXL2A (ENSCWAG00000016536)	TSPAN14 (ENSCWAG00000016283)	SH2D4B (ENSCWAG00000016213)	ENSCWAG00000016174	NRG3 (ENSCWAG00000015993)	GHITM (ENSCWAG00000015973)
Pig	MODERN SPECIES	5	ENSSSCG00000035105	VDAC2 (ENSSSCG00000010320)	COMTD1 (ENSSSCG00000037237)	ENSSSCG00000048472	ZNF503 (ENSSSCG00000010322)	LRMDA (ENSSSCG00000034308)	ENSSSCG00000043656	KCNMA1 (ENSSSCG00000010325)	ENSSSCG00000048875	DLG5 (ENSSSCG00000026268)	POLR3A (ENSSSCG00000010327)	ENSSSCG00000039544	ZMIZ1 (ENSSSCG00000010329)	PPIF (ENSSSCG00000010330)	ZCCHC24 (ENSSSCG00000033074)	ANXA11 (ENSSSCG00000010331) #22	PLAC9 (ENSSSCG00000010332)	TMEM254 (ENSSSCG00000024300)	MBL1 (ENSSSCG00000055445)	SFTPD (ENSSSCG00000010334)	SFTPA1 (ENSSSCG00000010336)	MAT1A (ENSSSCG00000010337)	DYDC1 (ENSSSCG00000061214)	ENSSSCG00000045226	DYDC2 (ENSSSCG00000010339)	PRXL2A (ENSSSCG00000010340)	TSPAN14 (ENSSSCG00000010341)	SH2D4B (ENSSSCG00000010342)	ENSSSCG00000010343	ENSSSCG00000051331	NRG3 (ENSSSCG00000010344)
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.a	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157372	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00950000182869.e.a.a.e.b	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.a	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172	ENSGT00940000155509
Arabian camel	MODERN SPECIES	2	ENSCDRG00005018186	SAMD8 (ENSCDRG00005018320)	ENSCDRG00005018348	ENSCDRG00005018370	ENSCDRG00005018385	COMTD1 (ENSCDRG00005018451)	ZNF503 (ENSCDRG00005018488)	LRMDA (ENSCDRG00005018525)	KCNMA1 (ENSCDRG00005019550)	DLG5 (ENSCDRG00005022253)	ENSCDRG00005022255	ENSCDRG00005022257	RPS24 (ENSCDRG00005022258)	PPIF (ENSCDRG00005006732)	ZCCHC24 (ENSCDRG00005006751)	ANXA11 (ENSCDRG00005006778) #22	ENSCDRG00005006822	TMEM254 (ENSCDRG00005006878)	SFTPD (ENSCDRG00005006926)	ENSCDRG00005006976	ENSCDRG00005007005	MAT1A (ENSCDRG00005007061)	DYDC1 (ENSCDRG00005007116)	ENSCDRG00005007182	ENSCDRG00005007240	ENSCDRG00005007349	SH2D4B (ENSCDRG00005007650)	ENSCDRG00005007698	ENSCDRG00005007739	ENSCDRG00005007794	ENSCDRG00005007837
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.a	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00950000182960.a.a.a.a.b.qb.a	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000153524.b.a.b	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172	ENSGT00940000155509
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00950000182960.a.a.a.a.b.qb.a	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000153524.b.a.b	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172	ENSGT00940000155509
Sperm whale	DUPLICATION
Sperm whale	MODERN SPECIES	12	CDHR1 (ENSPCTG00005006669)	GPR15LG (ENSPCTG00005006634)	GHITM (ENSPCTG00005006615)	NRG3 (ENSPCTG00005006486)	ENSPCTG00005006456	SH2D4B (ENSPCTG00005006438)	PRXL2A (ENSPCTG00005006403)	TSPAN14 (ENSPCTG00005006388)	DYDC2 (ENSPCTG00005006371)	DYDC1 (ENSPCTG00005006354)	MAT1A (ENSPCTG00005006306)	ENSPCTG00005006277	MBL2 (ENSPCTG00005006245)	SFTPD (ENSPCTG00005006186)	TMEM254 (ENSPCTG00005006162)	ENSPCTG00005006115 #22	ENSPCTG00005006100	ZMIZ1 (ENSPCTG00005006080)	RPS24 (ENSPCTG00005005966)	POLR3A (ENSPCTG00005005766)	ENSPCTG00005005355	KCNMA1 (ENSPCTG00005004698)	ENSPCTG00005004484	ENSPCTG00005004478	ENSPCTG00005004441	LRMDA (ENSPCTG00005004419)	ENSPCTG00005004390	ENSPCTG00005020849	COMTD1 (ENSPCTG00005020832)	VDAC2 (ENSPCTG00005020809)	SAMD8 (ENSPCTG00005020782)
Sperm whale	MODERN SPECIES	1110																ENSPCTG00005021164 #22	PLAC9 (ENSPCTG00005021178)
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000153524.b.a.b	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172	ENSGT00940000155509
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000000916.f	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000153524.b.a.b	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172	ENSGT00940000155509
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000000916.f	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000153524.b.a.b	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172	ENSGT00940000155509
Narwhal	MODERN SPECIES	311	SAMD8 (ENSMMNG00015011491)	VDAC2 (ENSMMNG00015011504)	COMTD1 (ENSMMNG00015011519)	ENSMMNG00015011553	ENSMMNG00015011565	ZNF503 (ENSMMNG00015011576)	LRMDA (ENSMMNG00015011597)	KCNMA1 (ENSMMNG00015011966)	DLG5 (ENSMMNG00015012641)	POLR3A (ENSMMNG00015012741)	ENSMMNG00015012806	ZMIZ1 (ENSMMNG00015012852)	PPIF (ENSMMNG00015012885)	ZCCHC24 (ENSMMNG00015012905)	ENSMMNG00015012913	ANXA11 (ENSMMNG00015012925) #22	ENSMMNG00015012941	PLAC9 (ENSMMNG00015012952)	TMEM254 (ENSMMNG00015012964)	SFTPD (ENSMMNG00015012972)	ENSMMNG00015012984	ENSMMNG00015012993	MAT1A (ENSMMNG00015013003)	DYDC1 (ENSMMNG00015013023)	DYDC2 (ENSMMNG00015013037)	PRXL2A (ENSMMNG00015013046)	TSPAN14 (ENSMMNG00015013074)	SH2D4B (ENSMMNG00015013109)	NRG3 (ENSMMNG00015013141)	GHITM (ENSMMNG00015013177)	GPR15LG (ENSMMNG00015013188)
Beluga whale	MODERN SPECIES	65	ENSDLEG00000009567	ZNF503 (ENSDLEG00000009559)	LRMDA (ENSDLEG00000009546)	ENSDLEG00000009527	ENSDLEG00000009522	KCNMA1 (ENSDLEG00000009375)	ENSDLEG00000009359	DLG5 (ENSDLEG00000009115)	POLR3A (ENSDLEG00000008899)	RPS24 (ENSDLEG00000008847)	ZMIZ1 (ENSDLEG00000008643)	PPIF (ENSDLEG00000008590)	ZCCHC24 (ENSDLEG00000008566)	ENSDLEG00000008547	ENSDLEG00000008507	ANXA11 (ENSDLEG00000008446) #22	ENSDLEG00000008405	TMEM254 (ENSDLEG00000008376)	SFTPD (ENSDLEG00000008308)	ENSDLEG00000008274	ENSDLEG00000008253	MAT1A (ENSDLEG00000008206)	DYDC1 (ENSDLEG00000008165)	DYDC2 (ENSDLEG00000008134)	FAM213A (ENSDLEG00000008086)	TSPAN14 (ENSDLEG00000008056)	SH2D4B (ENSDLEG00000008032)	ENSDLEG00000008022	GHITM (ENSDLEG00000007990)	CDHR1 (ENSDLEG00000007970)	LRIT2 (ENSDLEG00000007947)
Vaquita	MODERN SPECIES	7	SAMD8 (ENSPSNG00000018913)	VDAC2 (ENSPSNG00000018978)	COMTD1 (ENSPSNG00000019015)	ENSPSNG00000019024	ZNF503 (ENSPSNG00000019055)	LRMDA (ENSPSNG00000019120)	ENSPSNG00000019239	KCNMA1 (ENSPSNG00000021619)	DLG5 (ENSPSNG00000022596)	POLR3A (ENSPSNG00000022598)	ENSPSNG00000022599	ZMIZ1 (ENSPSNG00000022601)	PPIF (ENSPSNG00000022602)	ZCCHC24 (ENSPSNG00000022605)	ENSPSNG00000022606	ANXA11 (ENSPSNG00000022607) #22	PLAC9 (ENSPSNG00000022608)	TMEM254 (ENSPSNG00000022609)	SFTPD (ENSPSNG00000022610)	ENSPSNG00000022611	ENSPSNG00000022612	MAT1A (ENSPSNG00000022614)	ENSPSNG00000022615	PRXL2A (ENSPSNG00000022616)	TSPAN14 (ENSPSNG00000022619)	SH2D4B (ENSPSNG00000022622)	NRG3 (ENSPSNG00000022624)	GHITM (ENSPSNG00000022628)	GPR15LG (ENSPSNG00000022629)	CDHR1 (ENSPSNG00000022630)	LRIT2 (ENSPSNG00000022631)
Blue whale	MODERN SPECIES	7	DUSP13 (ENSBMSG00010012774)	SAMD8 (ENSBMSG00010012756)	VDAC2 (ENSBMSG00010012729)	COMTD1 (ENSBMSG00010012707)	ENSBMSG00010012699	ZNF503 (ENSBMSG00010012691)	LRMDA (ENSBMSG00010012642)	KCNMA1 (ENSBMSG00010022513)	DLG5 (ENSBMSG00010022512)	POLR3A (ENSBMSG00010022509)	ENSBMSG00010022505	ZMIZ1 (ENSBMSG00010022504)	PPIF (ENSBMSG00010022502)	ZCCHC24 (ENSBMSG00010022501)	ENSBMSG00010022499	ANXA11 (ENSBMSG00010022498) #22	PLAC9 (ENSBMSG00010022496)	TMEM254 (ENSBMSG00010022495)	SFTPD (ENSBMSG00010022493)	ENSBMSG00010022490	MAT1A (ENSBMSG00010022487)	DYDC1 (ENSBMSG00010022484)	DYDC2 (ENSBMSG00010022483)	PRXL2A (ENSBMSG00010022482)	TSPAN14 (ENSBMSG00010022479)	SH2D4B (ENSBMSG00010022475)	NRG3 (ENSBMSG00010022472)	ENSBMSG00010022469	ENSBMSG00010022468	ENSBMSG00010022467	CDHR1 (ENSBMSG00010022466)
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b.h.a	ENSGT00940000155748.b.g	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.a	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b
Yarkand deer	MODERN SPECIES	6	DUSP29 (ENSCHYG00000005048)	ENSCHYG00000005091	ENSCHYG00000005291	ENSCHYG00000005450	COMTD1 (ENSCHYG00000005474)	ZNF503 (ENSCHYG00000005491)	LRMDA (ENSCHYG00000005527)	ENSCHYG00000005620	KCNMA1 (ENSCHYG00000006117)	DLG5 (ENSCHYG00000012083)	POLR3A (ENSCHYG00000012420)	ENSCHYG00000012766	ZMIZ1 (ENSCHYG00000012931)	PPIF (ENSCHYG00000013395)	ZCCHC24 (ENSCHYG00000013440)	ANXA11 (ENSCHYG00000013542) #22	PLAC9 (ENSCHYG00000013866)	ENSCHYG00000014032	ENSCHYG00000014145	SH2D4B (ENSCHYG00000014276)	TSPAN14 (ENSCHYG00000014417)	PRXL2A (ENSCHYG00000014641)	DYDC2 (ENSCHYG00000014807)	DYDC1 (ENSCHYG00000014842)	MAT1A (ENSCHYG00000014940)	ENSCHYG00000015043	ENSCHYG00000015129	ENSCHYG00000015171	ENSCHYG00000015409	NRG3 (ENSCHYG00000015462)	ENSCHYG00000015888
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b.h.a	ENSGT00940000155748.b.g	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.a	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b.h.a.b	ENSGT00940000155748.b.g	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.a	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000005496.l	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b.h.a.b.a	ENSGT00940000155748.b.h.b	ENSGT00940000155748.b.h.a.b.b	ENSGT00940000155748.b.g	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b
Bos	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000005496.l	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b.h.a.b.a	ENSGT00940000155748.b.h.a.a.b	ENSGT00940000155748.b.h.b	ENSGT00940000155748.b.h.a.b.b	ENSGT00940000155748.b.g	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000005496.l	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b.h.a.b.a	ENSGT00940000155748.b.g	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172
Wild yak	MODERN SPECIES	1087													ZMIZ1 (ENSBMUG00000026122)	PPIF (ENSBMUG00000026118)	ZCCHC24 (ENSBMUG00000026115)	ANXA11 (ENSBMUG00000026109) #22	ENSBMUG00000026098
Domestic yak	MODERN SPECIES	19	ENSBGRG00000020597	VDAC2 (ENSBGRG00000020806)	COMTD1 (ENSBGRG00000020910)	ENSBGRG00000020979	ZNF503 (ENSBGRG00000021005)	LRMDA (ENSBGRG00000021084)	ENSBGRG00000021338	KCNMA1 (ENSBGRG00000021722)	ENSBGRG00000025755	DLG5 (ENSBGRG00000025765)	POLR3A (ENSBGRG00000025792)	ENSBGRG00000025877	ZMIZ1 (ENSBGRG00000025955)	PPIF (ENSBGRG00000026020)	ZCCHC24 (ENSBGRG00000026029)	ANXA11 (ENSBGRG00000026044) #22	ENSBGRG00000026065	ENSBGRG00000026078	ENSBGRG00000026101	ENSBGRG00000026148	ENSBGRG00000026156	MAT1A (ENSBGRG00000026171)	DYDC1 (ENSBGRG00000026188)	DYDC2 (ENSBGRG00000026194)	PRXL2A (ENSBGRG00000026197)	TSPAN14 (ENSBGRG00000026210)	SH2D4B (ENSBGRG00000026255)	NRG3 (ENSBGRG00000026267)	ENSBGRG00000026297	ENSBGRG00000026300	GHITM (ENSBGRG00000026306)
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000005496.l	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b.h.a.b.a	ENSGT00940000155748.b.h.a.a.b	ENSGT00940000155748.b.h.b	ENSGT00940000155748.b.h.a.b.b	ENSGT00940000155748.b.g	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	20	COMTD1 (ENSBIXG00005014344)	ENSBIXG00005014300	SAMD8 (ENSBIXG00005014231)	VDAC2 (ENSBIXG00005007495)	ENSBIXG00005014174	ZNF503 (ENSBIXG00005014154)	LRMDA (ENSBIXG00005014068)	ENSBIXG00005013973	KCNMA1 (ENSBIXG00005013099)	DLG5 (ENSBIXG00005030481)	POLR3A (ENSBIXG00005030530)	ENSBIXG00005030563	ZMIZ1 (ENSBIXG00005030635)	PPIF (ENSBIXG00005030643)	ZCCHC24 (ENSBIXG00005030657)	ANXA11 (ENSBIXG00005030671) #22	PLAC9 (ENSBIXG00005030679)	TMEM254 (ENSBIXG00005030687)	ENSBIXG00005030718	ENSBIXG00005030747	ENSBIXG00005030755	ENSBIXG00005030762	DYDC2 (ENSBIXG00005030775)	PRXL2A (ENSBIXG00005030789)	TSPAN14 (ENSBIXG00005030815)	SH2D4B (ENSBIXG00005030847)	NRG3 (ENSBIXG00005030869)	GHITM (ENSBIXG00005030889)	CDHR1 (ENSBIXG00005030897)	LRIT2 (ENSBIXG00005030907)	LRIT1 (ENSBIXG00005030911)
Cow	MODERN SPECIES	20	DUSP29 (ENSBTAG00000002924)	DUSP13 (ENSBTAG00000023039)	SAMD8 (ENSBTAG00000008619)	VDAC2 (ENSBTAG00000012975)	COMTD1 (ENSBTAG00000012977)	ENSBTAG00000013585	ZNF503 (ENSBTAG00000014506)	LRMDA (ENSBTAG00000052007)	KCNMA1 (ENSBTAG00000013300)	DLG5 (ENSBTAG00000013187)	POLR3A (ENSBTAG00000013259)	RPS24 (ENSBTAG00000013264)	ZMIZ1 (ENSBTAG00000019313)	PPIF (ENSBTAG00000016711)	ZCCHC24 (ENSBTAG00000003877)	ANXA11 (ENSBTAG00000020940) #22	PLAC9 (ENSBTAG00000020939)	TMEM254 (ENSBTAG00000001656)	CGN1 (ENSBTAG00000047317)	CL46 (ENSBTAG00000006536)	ENSBTAG00000052810	CL43 (ENSBTAG00000054756)	ENSBTAG00000048082	SFTPD (ENSBTAG00000046421)	MBL1 (ENSBTAG00000054761)	SFTPA1 (ENSBTAG00000023032)	MAT1A (ENSBTAG00000005963)	DYDC1 (ENSBTAG00000032858)	DYDC2 (ENSBTAG00000032862)	PRXL2A (ENSBTAG00000021416)	TSPAN14 (ENSBTAG00000003907)
American bison	MODERN SPECIES	2968									KCNMA1 (ENSBBBG00000015496)	DLG5 (ENSBBBG00000015723)	POLR3A (ENSBBBG00000015752)	RPS24 (ENSBBBG00000015864)	ZMIZ1 (ENSBBBG00000015897)	PPIF (ENSBBBG00000015913)	ZCCHC24 (ENSBBBG00000015927)	ANXA11 (ENSBBBG00000003980) #22	PLAC9 (ENSBBBG00000015987)	TMEM254 (ENSBBBG00000016012)	ENSBBBG00000002568	ENSBBBG00000016044	ENSBBBG00000016073	ENSBBBG00000003996	ENSBBBG00000016103	ENSBBBG00000016117	ENSBBBG00000016126	ENSBBBG00000016144	MAT1A (ENSBBBG00000016161)	DYDC1 (ENSBBBG00000004016)	DYDC2 (ENSBBBG00000004021)	PRXL2A (ENSBBBG00000016221)	TSPAN14 (ENSBBBG00000016354)
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b.h.a.b.d	ENSGT00940000155748.b.h.b	ENSGT00940000155748.b.h.a.b.c	ENSGT00940000155748.b.g	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.a
Goat	MODERN SPECIES	20	ENSCHIG00000023236	VDAC2 (ENSCHIG00000013328)	COMTD1 (ENSCHIG00000005405)	ZNF503 (ENSCHIG00000020542)	ENSCHIG00000016052	LRMDA (ENSCHIG00000011904)	KCNMA1 (ENSCHIG00000025127)	ENSCHIG00000016306	DLG5 (ENSCHIG00000000389)	POLR3A (ENSCHIG00000000352)	ENSCHIG00000000315	ZMIZ1 (ENSCHIG00000000282)	PPIF (ENSCHIG00000000241)	ZCCHC24 (ENSCHIG00000000203)	ENSCHIG00000000166	ANXA11 (ENSCHIG00000000134) #22	PLAC9 (ENSCHIG00000000102)	ENSCHIG00000000069	ENSCHIG00000008740	ENSCHIG00000024354	CGN (ENSCHIG00000020824)	ENSCHIG00000018462	ENSCHIG00000015787	ENSCHIG00000013431	MAT1A (ENSCHIG00000009411)	DYDC1 (ENSCHIG00000009877)	DYDC2 (ENSCHIG00000000451)	PRXL2A (ENSCHIG00000000416)	TSPAN14 (ENSCHIG00000000382)	SH2D4B (ENSCHIG00000000351)	ENSCHIG00000000316
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	17	KAT6B (ENSOARG00020006486)	DUSP29 (ENSOARG00020006531)	DUSP13 (ENSOARG00020006598)	SAMD8 (ENSOARG00020006740)	VDAC2 (ENSOARG00020006819)	COMTD1 (ENSOARG00020006868)	ZNF503 (ENSOARG00020006909)	LRMDA (ENSOARG00020006966)	KCNMA1 (ENSOARG00020008389)	DLG5 (ENSOARG00020026193)	POLR3A (ENSOARG00020026198)	ENSOARG00020026205	ZMIZ1 (ENSOARG00020026214)	PPIF (ENSOARG00020026220)	ZCCHC24 (ENSOARG00020026221)	ANXA11 (ENSOARG00020026223) #22	PLAC9 (ENSOARG00020026228)	TMEM254 (ENSOARG00020026230)	ENSOARG00020026232	ENSOARG00020026235	ENSOARG00020026239	ENSOARG00020026241	ENSOARG00020026243	ENSOARG00020026246	ENSOARG00020026250	MBLA (ENSOARG00020026253)	SFTPA1 (ENSOARG00020026254)	MAT1A (ENSOARG00020026255)	DYDC1 (ENSOARG00020026256)	DYDC2 (ENSOARG00020026258)	PRXL2A (ENSOARG00020026259)
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	1227	DUSP13 (ENSMMSG00000012590)	SAMD8 (ENSMMSG00000012740)	VDAC2 (ENSMMSG00000012764)	COMTD1 (ENSMMSG00000012778)	ZNF503 (ENSMMSG00000012799)	LRMDA (ENSMMSG00000012829)	KCNMA1 (ENSMMSG00000013398)	ENSMMSG00000022915	DLG5 (ENSMMSG00000022925)	POLR3A (ENSMMSG00000022968)	ENSMMSG00000023003	ZMIZ1 (ENSMMSG00000023032)	PPIF (ENSMMSG00000023077)	ENSMMSG00000023087	ZCCHC24 (ENSMMSG00000023092)	ANXA11 (ENSMMSG00000023104) #22	PLAC9 (ENSMMSG00000023126)	TMEM254 (ENSMMSG00000023136)	SFTPD (ENSMMSG00000023146)	ENSMMSG00000023158	ENSMMSG00000023163	MAT1A (ENSMMSG00000023169)	DYDC1 (ENSMMSG00000023180)	DYDC2 (ENSMMSG00000023192)	ENSMMSG00000023200	TSPAN14 (ENSMMSG00000023222)	ENSMMSG00000023269	SH2D4B (ENSMMSG00000023276)	ENSMMSG00000023292
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT01060000252496	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00950000184268	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172	ENSGT00940000155509
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT01060000252496	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00950000184268	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00520000058758	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT01060000252496	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00950000184268	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT00390000000153.l.b.c.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00520000058758	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00950000184268	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00520000058758	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT00390000000153.l.a.eb	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00520000058758	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172
American mink	MODERN SPECIES	11	DUSP29 (ENSNVIG00000008146)	DUSP13 (ENSNVIG00000008093)	SAMD8 (ENSNVIG00000008018)	VDAC2 (ENSNVIG00000007976)	COMTD1 (ENSNVIG00000007928)	ZNF503 (ENSNVIG00000007904)	LRMDA (ENSNVIG00000007862)	KCNMA1 (ENSNVIG00000003936)	DLG5 (ENSNVIG00000003623)	POLR3A (ENSNVIG00000003446)	ENSNVIG00000003309	ENSNVIG00000003270	ZMIZ1 (ENSNVIG00000003249)	PPIF (ENSNVIG00000003242)	ZCH24 (ENSNVIG00000003225)	ANXA11 (ENSNVIG00000003166) #22	ENSNVIG00000003151	TMEM254 (ENSNVIG00000003106)	ENSNVIG00000003096	SFTPD (ENSNVIG00000003080)	ENSNVIG00000003058	ENSNVIG00000003026	MAT1A (ENSNVIG00000003011)	DYDC1 (ENSNVIG00000002971)	DYDC2 (ENSNVIG00000002926)	PRXL2A (ENSNVIG00000002853)	TSPAN14 (ENSNVIG00000002720)	SH2D4B (ENSNVIG00000002706)	NRG3 (ENSNVIG00000002639)	ZNF641 (ENSNVIG00000002592)
Ferret	MODERN SPECIES	273	AQP3 (ENSMPUG00000004092)	NOL6 (ENSMPUG00000003922)	UBE2R2 (ENSMPUG00000003878)	UBAP2 (ENSMPUG00000003858)	ENSMPUG00000003855	LRMDA (ENSMPUG00000003848)	KCNMA1 (ENSMPUG00000003834)	DLG5 (ENSMPUG00000003812)	POLR3A (ENSMPUG00000003790)	ENSMPUG00000003778	ENSMPUG00000003772	ZMIZ1 (ENSMPUG00000003659)	PPIF (ENSMPUG00000003652)	ZCCHC24 (ENSMPUG00000003650)	ENSMPUG00000003646	ANXA11 (ENSMPUG00000003637) #22	PLAC9 (ENSMPUG00000003622)	TMEM254 (ENSMPUG00000003613)	ENSMPUG00000003600	SFTPD (ENSMPUG00000003586)	ENSMPUG00000003579	ENSMPUG00000003575	MAT1A (ENSMPUG00000003570)	DYDC1 (ENSMPUG00000003562)	DYDC2 (ENSMPUG00000003553)	PRXL2A (ENSMPUG00000003544)	TSPAN14 (ENSMPUG00000003537)	SH2D4B (ENSMPUG00000003514)	ENSMPUG00000018427	ENSMPUG00000003508	ENSMPUG00000018426
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00950000184268	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b.d	ENSGT00390000015172	ENSGT00940000155509
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT01100000265856	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00950000184268	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b.d	ENSGT00940000155509	ENSGT00940000159143
American black bear	MODERN SPECIES	7291																ANXA11 (ENSUAMG00000011451) #22
Polar bear	MODERN SPECIES	197	DUSP29 (ENSUMAG00000012691)	DUSP13 (ENSUMAG00000012700)	ENSUMAG00000012703	VDAC2 (ENSUMAG00000012709)	ENSUMAG00000012714	ENSUMAG00000012715	LRMDA (ENSUMAG00000012748)	ENSUMAG00000012754	KCNMA1 (ENSUMAG00000012880)	DLG5 (ENSUMAG00000013627)	POLR3A (ENSUMAG00000013913)	ENSUMAG00000013927	ZMIZ1 (ENSUMAG00000013958)	ENSUMAG00000014059	ZCCHC24 (ENSUMAG00000014060)	ANXA11 (ENSUMAG00000014068) #22	ENSUMAG00000014078	ENSUMAG00000014081	TMEM254 (ENSUMAG00000014083)	SFTPD (ENSUMAG00000014111)	ENSUMAG00000014120	ENSUMAG00000014124	MAT1A (ENSUMAG00000014130)	DYDC1 (ENSUMAG00000014159)	DYDC2 (ENSUMAG00000014162)	PRXL2A (ENSUMAG00000014166)	TSPAN14 (ENSUMAG00000014172)	SH2D4B (ENSUMAG00000014184)	ENSUMAG00000014191	GHITM (ENSUMAG00000014200)	CDHR1 (ENSUMAG00000014204)
Giant Panda	MODERN SPECIES	16	KAT6B (ENSAMEG00000001747)	ENSAMEG00000001742	DUSP13 (ENSAMEG00000001730)	SAMD8 (ENSAMEG00000001717)	VDAC2 (ENSAMEG00000001690)	COMTD1 (ENSAMEG00000001676)	ZNF503 (ENSAMEG00000001674)	LRMDA (ENSAMEG00000009397)	KCNMA1 (ENSAMEG00000017723)	DLG5 (ENSAMEG00000017787)	POLR3A (ENSAMEG00000017801)	RPS24 (ENSAMEG00000017818)	ZMIZ1 (ENSAMEG00000012891)	PPIF (ENSAMEG00000012922)	ENSAMEG00000012940	ENSAMEG00000012946 #22	PLAC9 (ENSAMEG00000012985)	TMEM254 (ENSAMEG00000012986)	ENSAMEG00000013003	ENSAMEG00000013016	ENSAMEG00000026411	ENSAMEG00000013025	ENSAMEG00000013050	DYDC2 (ENSAMEG00000013056)	PRXL2A (ENSAMEG00000013059)	TSPAN14 (ENSAMEG00000013070)	SH2D4B (ENSAMEG00000012951)	ENSAMEG00000027737	ENSAMEG00000030329	NRG3 (ENSAMEG00000002812)	GHITM (ENSAMEG00000009753)
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT01060000252496	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00950000184268	ENSGT00950000186316	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172	ENSGT00940000155509
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00950000186003	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00950000186316	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT00390000015224.c.b.b.a.b.b.a	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172
Dingo	MODERN SPECIES	324	ENSCAFG00020016208	COMTD1 (ENSCAFG00020016203)	ZNF503 (ENSCAFG00020016201)	ENSCAFG00020016194	LRMDA (ENSCAFG00020016191)	ENSCAFG00020016190	ENSCAFG00020016188	KCNMA1 (ENSCAFG00020014954)	DLG5 (ENSCAFG00020014784)	POLR3A (ENSCAFG00020014711)	RPS24 (ENSCAFG00020014698)	ZMIZ1 (ENSCAFG00020014475)	ENSCAFG00020014445	PPIF (ENSCAFG00020014441)	ZCCHC24 (ENSCAFG00020014439)	ANXA11 (ENSCAFG00020014434) #22	PLAC9 (ENSCAFG00020014433)	TMEM254 (ENSCAFG00020014432)	SFTPD (ENSCAFG00020014425)	ENSCAFG00020014422	ENSCAFG00020014421	MAT1A (ENSCAFG00020013955)	DYDC1 (ENSCAFG00020013931)	DYDC2 (ENSCAFG00020013930)	PRXL2A (ENSCAFG00020013929)	TSPAN14 (ENSCAFG00020013921)	SH2D4B (ENSCAFG00020013912)	ENSCAFG00020013887	ENSCAFG00020013873	ENSCAFG00020013858	GHITM (ENSCAFG00020013851)
Dog	MODERN SPECIES	32	DUSP13 (ENSCAFG00845010082)	SAMD8 (ENSCAFG00845010171)	VDAC2 (ENSCAFG00845010278)	COMTD1 (ENSCAFG00845010345)	LRMDA (ENSCAFG00845010464)	ZNF503 (ENSCAFG00845010719)	ENSCAFG00845010740	ENSCAFG00845010767	KCNMA1 (ENSCAFG00845011389)	DLG5 (ENSCAFG00845013364)	POLR3A (ENSCAFG00845013802)	RPS24 (ENSCAFG00845014074)	ZMIZ1 (ENSCAFG00845014304)	PPIF (ENSCAFG00845014432)	ZCCHC24 (ENSCAFG00845014540)	ENSCAFG00845014646 #22	ENSCAFG00845014704	TMEM254 (ENSCAFG00845014737)	SFTPD (ENSCAFG00845014766)	MBL1 (ENSCAFG00845014803)	ENSCAFG00845014850	MAT1A (ENSCAFG00845014891)	DYDC1 (ENSCAFG00845015050)	ENSCAFG00845015141	DYDC2 (ENSCAFG00845015159)	ENSCAFG00845015186	ENSCAFG00845015388	SH2D4B (ENSCAFG00845015623)	NRG3 (ENSCAFG00845015872)	ENSCAFG00845016035	ENSCAFG00845005888
Red fox	MODERN SPECIES	2	ENSVVUG00000023462	ENSVVUG00000023470	ZNF503 (ENSVVUG00000023475)	ENSVVUG00000023479	LRMDA (ENSVVUG00000023484)	ENSVVUG00000023498	ENSVVUG00000023502	KCNMA1 (ENSVVUG00000023686)	DLG5 (ENSVVUG00000025517)	POLR3A (ENSVVUG00000025523)	RPS24 (ENSVVUG00000025527)	ZMIZ1 (ENSVVUG00000025540)	PPIF (ENSVVUG00000025544)	ENSVVUG00000025546	ZCCHC24 (ENSVVUG00000025548)	ANXA11 (ENSVVUG00000025550) #22	ENSVVUG00000025553	SFTPD (ENSVVUG00000025558)	MBL2 (ENSVVUG00000025563)	ENSVVUG00000025565	MAT1A (ENSVVUG00000025567)	DYDC1 (ENSVVUG00000025572)	DYDC2 (ENSVVUG00000025574)	PRXL2A (ENSVVUG00000025576)	TSPAN14 (ENSVVUG00000025577)	SH2D4B (ENSVVUG00000025579)	ENSVVUG00000025602	GHITM (ENSVVUG00000025608)	ENSVVUG00000025609	CDHR1 (ENSVVUG00000025648)	LRIT2 (ENSVVUG00000025806)
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00950000186316	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00520000058758	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT00940000153299.c.a.b	ENSGT01050000244940.a.b
Panthera	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00950000186316	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b.i	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT00940000153299.c.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172
Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00950000186316	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b.i	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT00940000153299.c.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172
lion	MODERN SPECIES	11	DUSP13 (ENSPLOG00000014496)	SAMD8 (ENSPLOG00000014446)	VDAC2 (ENSPLOG00000014384)	COMTD1 (ENSPLOG00000014289)	ENSPLOG00000014258	ZNF503 (ENSPLOG00000014222)	ENSPLOG00000014117	LRMDA (ENSPLOG00000013997)	KCNMA1 (ENSPLOG00000010467)	DLG5 (ENSPLOG00000009697)	POLR3A (ENSPLOG00000009659)	ENSPLOG00000009559	ZMIZ1 (ENSPLOG00000009443)	PPIF (ENSPLOG00000009388)	ZCCHC24 (ENSPLOG00000009359)	ANXA11 (ENSPLOG00000009306) #22	ENSPLOG00000009261	TMEM254 (ENSPLOG00000009112)	SFTPD (ENSPLOG00000008966)	ENSPLOG00000008931	ENSPLOG00000008891	MAT1A (ENSPLOG00000008835)	DYDC1 (ENSPLOG00000008784)	DYDC2 (ENSPLOG00000008760)	PRXL2A (ENSPLOG00000008707)	TSPAN14 (ENSPLOG00000008575)	SH2D4B (ENSPLOG00000008503)	ENSPLOG00000008484	ENSPLOG00000008457	NRG3 (ENSPLOG00000008323)	ENSPLOG00000008300
leopard	MODERN SPECIES	11	DUSP13 (ENSPPRG00000010272)	ENSPPRG00000009738	SAMD8 (ENSPPRG00000009450)	VDAC2 (ENSPPRG00000008901)	COMTD1 (ENSPPRG00000007978)	ZNF503 (ENSPPRG00000007343)	LRMDA (ENSPPRG00000007251)	KCNMA1 (ENSPPRG00000006089)	ENSPPRG00000004090	DLG5 (ENSPPRG00000003524)	POLR3A (ENSPPRG00000002128)	ENSPPRG00000023004	ZMIZ1 (ENSPPRG00000023358)	PPIF (ENSPPRG00000023808)	ZCCHC24 (ENSPPRG00000023833)	ANXA11 (ENSPPRG00000024029) #22	PLAC9 (ENSPPRG00000024241)	TMEM254 (ENSPPRG00000024425)	SFTPD (ENSPPRG00000024511)	ENSPPRG00000024551	ENSPPRG00000024605	MAT1A (ENSPPRG00000024698)	DYDC1 (ENSPPRG00000024760)	DYDC2 (ENSPPRG00000024841)	PRXL2A (ENSPPRG00000024880)	TSPAN14 (ENSPPRG00000024937)	SH2D4B (ENSPPRG00000025005)	NRG3 (ENSPPRG00000020718)	ENSPPRG00000019021	ENSPPRG00000018110	ENSPPRG00000022253
Tiger	MODERN SPECIES	507	KAT6B (ENSPTIG00000020017)	DUSP29 (ENSPTIG00000019868)	DUSP13 (ENSPTIG00000018719)	ENSPTIG00000018284	SAMD8 (ENSPTIG00000017445)	VDAC2 (ENSPTIG00000016826)	COMTD1 (ENSPTIG00000016356)	LRMDA (ENSPTIG00000014508)	KCNMA1 (ENSPTIG00000012047)	DLG5 (ENSPTIG00000006163)	POLR3A (ENSPTIG00000020916)	ENSPTIG00000018226	ZMIZ1 (ENSPTIG00000014547)	PPIF (ENSPTIG00000013743)	ZCCHC24 (ENSPTIG00000013378)	ANXA11 (ENSPTIG00000012716) #22	ENSPTIG00000012313	TMEM254 (ENSPTIG00000010003)	SFTPD (ENSPTIG00000009408)	ENSPTIG00000008123	ENSPTIG00000006379	MAT1A (ENSPTIG00000005663)	DYDC1 (ENSPTIG00000002659)	DYDC2 (ENSPTIG00000021714)	PRXL2A (ENSPTIG00000021293)	TSPAN14 (ENSPTIG00000016757)	SH2D4B (ENSPTIG00000013351)
Cat	MODERN SPECIES	242	DUSP13 (ENSFCAG00000036709)	SAMD8 (ENSFCAG00000026865)	VDAC2 (ENSFCAG00000026943)	COMTD1 (ENSFCAG00000005086)	ENSFCAG00000026027	ZNF503 (ENSFCAG00000010035)	LRMDA (ENSFCAG00000041676)	ENSFCAG00000052289	KCNMA1 (ENSFCAG00000007701)	DLG5 (ENSFCAG00000002056)	POLR3A (ENSFCAG00000000843)	ENSFCAG00000000849	ZMIZ1 (ENSFCAG00000011569)	PPIF (ENSFCAG00000025543)	ZCCHC24 (ENSFCAG00000040394)	ANXA11 (ENSFCAG00000023518) #22	ENSFCAG00000040701	TMEM254 (ENSFCAG00000046502)	ENSFCAG00000048777	SFTPD (ENSFCAG00000029978)	MBL1 (ENSFCAG00000036170)	ENSFCAG00000040044	MAT1A (ENSFCAG00000011579)	DYDC1 (ENSFCAG00000022550)	DYDC2 (ENSFCAG00000040959)	PRXL2A (ENSFCAG00000024546)	TSPAN14 (ENSFCAG00000037107)	SH2D4B (ENSFCAG00000000713)	NRG3 (ENSFCAG00000014132)	ENSFCAG00000038749	GHITM (ENSFCAG00000001647)
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00950000184268	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT00390000000153.l.a.eb	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172	ENSGT00940000155509
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172	ENSGT00940000155509
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172	ENSGT00940000155509
Microbat	DUPLICATION
Microbat	MODERN SPECIES	1272															ENSMLUG00000023177	ENSMLUG00000007600 #22	PLAC9 (ENSMLUG00000007594)	TMEM254 (ENSMLUG00000007585)	ENSMLUG00000023584	ENSMLUG00000027766	ENSMLUG00000029822	ENSMLUG00000027676	ENSMLUG00000022499	ENSMLUG00000014573	MAT1A (ENSMLUG00000001273)	DYDC1 (ENSMLUG00000001277)	DYDC2 (ENSMLUG00000001282)	PRXL2A (ENSMLUG00000001289)	TSPAN14 (ENSMLUG00000006757)	SH2D4B (ENSMLUG00000006772)
Microbat	MODERN SPECIES	952	CLDN12 (ENSMLUG00000007413)	FZD1 (ENSMLUG00000002634)	MTERF1 (ENSMLUG00000011330)	AKAP9 (ENSMLUG00000017713)	CYP51A1 (ENSMLUG00000017714)	KRIT1 (ENSMLUG00000017177)	ANKIB1 (ENSMLUG00000011789)	ENSMLUG00000028584	GATAD1 (ENSMLUG00000011820)	PEX1 (ENSMLUG00000011828)	RBM48 (ENSMLUG00000011863)	ENSMLUG00000028906	FAM133B (ENSMLUG00000005933)	CDK6 (ENSMLUG00000011872)	ENSMLUG00000027335	ENSMLUG00000022770 #22	SAMD9L (ENSMLUG00000017034)	HEPACAM2 (ENSMLUG00000000672)	VPS50 (ENSMLUG00000010632)	CALCR (ENSMLUG00000006718)	ENSMLUG00000023902	TFPI2 (ENSMLUG00000017498)	ENSMLUG00000026472	ENSMLUG00000028366	COL1A2 (ENSMLUG00000015487)	CASD1 (ENSMLUG00000016713)	SGCE (ENSMLUG00000016724)	PPP1R9A (ENSMLUG00000014166)	PON1 (ENSMLUG00000014176)	PON3 (ENSMLUG00000006984)	PON2 (ENSMLUG00000006998)
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	7	KAT6B (ENSRFEG00010005507)	DUSP29 (ENSRFEG00010005542)	DUSP13 (ENSRFEG00010005601)	SAMD8 (ENSRFEG00010005728)	VDAC2 (ENSRFEG00010005777)	COMTD1 (ENSRFEG00010005853)	ZNF503 (ENSRFEG00010005883)	LRMDA (ENSRFEG00010006056)	KCNMA1 (ENSRFEG00010007791)	DLG5 (ENSRFEG00010018952)	POLR3A (ENSRFEG00010019028)	ENSRFEG00010019078	ZMIZ1 (ENSRFEG00010019186)	PPIF (ENSRFEG00010019256)	ZCCHC24 (ENSRFEG00010019281)	ANXA11 (ENSRFEG00010019316) #22	PLAC9 (ENSRFEG00010019355)	TMEM254 (ENSRFEG00010019393)	SFTPD (ENSRFEG00010019424)	ENSRFEG00010019463	ENSRFEG00010019477	MAT1A (ENSRFEG00010019524)	DYDC1 (ENSRFEG00010019560)	DYDC2 (ENSRFEG00010019583)	PRXL2A (ENSRFEG00010019602)	TSPAN14 (ENSRFEG00010019662)	SH2D4B (ENSRFEG00010019792)	ENSRFEG00010019836	NRG3 (ENSRFEG00010019871)	ENSRFEG00010020047	GHITM (ENSRFEG00010020061)
Megabat	MODERN SPECIES	4713																ANXA11 (ENSPVAG00000015612) #22
Equus	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00950000184268	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.a.eb	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00520000058758
Horse	MODERN SPECIES		VDAC2 (ENSECAG00000015321)	COMTD1 (ENSECAG00000012473)	ZNF503 (ENSECAG00000009470)	ENSECAG00000037270	ENSECAG00000010620	ENSECAG00000045937	KCNMA1 (ENSECAG00000010713)	ENSECAG00000048193	DLG5 (ENSECAG00000013283)	ENSECAG00000045030	POLR3A (ENSECAG00000019416)	RPS24 (ENSECAG00000016939)	ZMIZ1 (ENSECAG00000021528)	ZCCHC24 (ENSECAG00000017763)	PPIF (ENSECAG00000008796)	ANXA11 (ENSECAG00000019671) #22	ENSECAG00000045443	TMEM254 (ENSECAG00000013627)	AGT (ENSECAG00000015711)	COG2 (ENSECAG00000010075)	ENSECAG00000050926	ENSECAG00000027790	PGBD5 (ENSECAG00000006175)	GALNT2 (ENSECAG00000008653)	ENSECAG00000035867	ENSECAG00000045954	ENSECAG00000033308	URB2 (ENSECAG00000012338)	TAF5L (ENSECAG00000016369)	ABCB10 (ENSECAG00000017883)	NUP133 (ENSECAG00000020760)
Donkey	MODERN SPECIES	20	CCDC170 (ENSEASG00005018748)	ARMT1 (ENSEASG00005031339)	RMND1 (ENSEASG00005018744)	ZBTB2 (ENSEASG00005018742)	AKAP12 (ENSEASG00005018740)	MTHFD1L (ENSEASG00005017019)	ENSEASG00005016807	ENSEASG00005016792	ENSEASG00005023024	DLG5 (ENSEASG00005023049)	POLR3A (ENSEASG00005023053)	ENSEASG00005023056	ZMIZ1 (ENSEASG00005023063)	PPIF (ENSEASG00005032195)	ENSEASG00005023074	ENSEASG00005028916 #22	ENSEASG00005027669	ENSEASG00005027838	ENSEASG00005027781	ENSEASG00005032265	ENSEASG00005032238	ENSEASG00005036802	SEC61G (ENSEASG00005034207)	ENSEASG00005009322	EGFR (ENSEASG00005018099)	LANCL2 (ENSEASG00005018115)	ENSEASG00005030872	ENSEASG00005031911	ENSEASG00005019228	ENSEASG00005019225	ENSEASG00005033468
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.a	ENSGT00390000000153.l.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172	ENSGT00940000155509
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000154537	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172
Glires	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00940000165487	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172	ENSGT00940000155509	ENSGT00940000159143
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	385													ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22
Rabbit	MODERN SPECIES	569													ZMIZ1 (ENSOCUG00000003587)	PPIF (ENSOCUG00000012345)	ZCCHC24 (ENSOCUG00000006382)	ANXA11 (ENSOCUG00000004569) #22
Pika	MODERN SPECIES	705																ENSOPRG00000008969 #22
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00940000165487	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172	ENSGT00940000155509	ENSGT00940000159143
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00940000165487	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172	ENSGT00940000155509	ENSGT00940000159143
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00940000165487	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172	ENSGT00940000155509	ENSGT00940000159143
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	43	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00900000143356	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000154537
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00900000143356	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00520000058758	ENSGT00940000154537	ENSGT00940000157660	ENSGT00390000005529.a	ENSGT00940000156297	ENSGT00940000157205	ENSGT00940000154280	ENSGT00940000156550	ENSGT00940000156624	ENSGT00940000156780	ENSGT00940000156669.b	ENSGT00940000158385	ENSGT00530000063735.a
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00900000143356	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00520000058758	ENSGT00940000154537	ENSGT00940000157660	ENSGT00390000005529.a	ENSGT00940000156297	ENSGT00940000157205	ENSGT00940000154280	ENSGT00940000156550	ENSGT00940000156624	ENSGT00940000156780	ENSGT00940000156669.b	ENSGT00940000158385	ENSGT00530000063735.a
Mus	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000157372	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00520000058758	ENSGT00940000154537	ENSGT00940000157660	ENSGT00390000005529.a	ENSGT00940000156297	ENSGT00940000157205	ENSGT00940000154280	ENSGT00940000156550	ENSGT00940000156624	ENSGT00940000156780	ENSGT00940000156669.b	ENSGT00940000158385	ENSGT00530000063735.a
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b.j	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00860000136364	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00520000058758	ENSGT00940000154537	ENSGT00940000157660	ENSGT00390000008294.e.a.w.b	ENSGT00390000005529.a	ENSGT00940000156297	ENSGT00940000157205	ENSGT00940000154280	ENSGT00940000156550	ENSGT00940000156624	ENSGT00940000156780	ENSGT00940000156669.b	ENSGT00940000158385
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	5	Dusp13 (MGP_CAROLIEiJ_G0019007)	Samd8 (MGP_CAROLIEiJ_G0019008)	Vdac2 (MGP_CAROLIEiJ_G0019009)	Comtd1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019010)	Zfp503 (MGP_CAROLIEiJ_G0019011)	Lrmda (MGP_CAROLIEiJ_G0019012)	Kcnma1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019013)	Dlg5 (MGP_CAROLIEiJ_G0019014)	MGP_CAROLIEiJ_G0019015	Polr3a (MGP_CAROLIEiJ_G0019016)	Rps24 (MGP_CAROLIEiJ_G0019017)	Zmiz1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019018)	Ppif (MGP_CAROLIEiJ_G0019019)	Zcchc24 (MGP_CAROLIEiJ_G0019020)	MGP_CAROLIEiJ_G0019021	Anxa11 (MGP_CAROLIEiJ_G0019022) #22	MGP_CAROLIEiJ_G0019023	MGP_CAROLIEiJ_G0019024	MGP_CAROLIEiJ_G0019025	MGP_CAROLIEiJ_G0019026	MGP_CAROLIEiJ_G0019027	Slmap (MGP_CAROLIEiJ_G0019028)	MGP_CAROLIEiJ_G0019029	Dennd6a (MGP_CAROLIEiJ_G0019030)	Arf4 (MGP_CAROLIEiJ_G0019031)	Pde12 (MGP_CAROLIEiJ_G0019032)	MGP_CAROLIEiJ_G0019033	Asb14 (MGP_CAROLIEiJ_G0019034)	Appl1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019035)	Hesx1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019036)	Il17rd (MGP_CAROLIEiJ_G0019037)
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b.j	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00860000136364	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00520000058758	ENSGT00940000154537	ENSGT00940000157660	ENSGT00390000008294.e.a.w.b	ENSGT00390000005529.a	ENSGT00940000156297	ENSGT00940000157205	ENSGT00940000154280	ENSGT00940000156550	ENSGT00940000156624	ENSGT00940000156780	ENSGT00940000156669.b	ENSGT00940000158385
Mouse	MODERN SPECIES	5	Kat6b (ENSMUSG00000021767)	Dusp29 (ENSMUSG00000063821)	Dusp13 (ENSMUSG00000021768)	Samd8 (ENSMUSG00000021770)	Vdac2 (ENSMUSG00000021771)	Comtd1 (ENSMUSG00000021773)	Zfp503 (ENSMUSG00000039081)	Lrmda (ENSMUSG00000063458)	Kcnma1 (ENSMUSG00000063142)	Dlg5 (ENSMUSG00000021782)	Polr3a (ENSMUSG00000025280)	Rps24 (ENSMUSG00000025290)	Zmiz1 (ENSMUSG00000007817)	Ppif (ENSMUSG00000021868)	Zcchc24 (ENSMUSG00000055538)	Anxa11 (ENSMUSG00000021866) #22	Plac9 (ENSMUSG00000095304)	Tmem254 (ENSMUSG00000072676)	Cphx1 (ENSMUSG00000095975)	Duxbl1 (ENSMUSG00000048502)	Slmap (ENSMUSG00000021870)	Dennd6a (ENSMUSG00000040818)	Arf4 (ENSMUSG00000021877)	Pde12 (ENSMUSG00000043702)	Dnah12 (ENSMUSG00000021879)	Asb14 (ENSMUSG00000021898)	Appl1 (ENSMUSG00000040760)	Hesx1 (ENSMUSG00000040726)	Il17rd (ENSMUSG00000040717)	Arhgef3 (ENSMUSG00000021895)	Tasor (ENSMUSG00000040651)
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b.j	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00860000136364	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00520000058758	ENSGT00940000154537	ENSGT00940000157660	ENSGT00390000008294.e.a.w.b	ENSGT00390000005529.a	ENSGT00940000156297	ENSGT00940000157205	ENSGT00940000154280	ENSGT00940000156550	ENSGT00940000156624	ENSGT00940000156780	ENSGT00940000156669.b	ENSGT00950000182869.e.b.b
Steppe mouse	MODERN SPECIES	275																Anxa11 (ENSMSIG00000026525) #22	Plac9 (ENSMSIG00000026558)	Tmem254 (ENSMSIG00000026609)	Cphx1 (ENSMSIG00000026692)	Duxbl1 (ENSMSIG00000026714)	ENSMSIG00000026746	Slmap (ENSMSIG00000026772)	ENSMSIG00000027380	Dennd6a (ENSMSIG00000027390)	Arf4 (ENSMSIG00000027424)	Pde12 (ENSMSIG00000027439)	Dnah12 (ENSMSIG00000027454)	Asb14 (ENSMSIG00000027841)	Appl1 (ENSMSIG00000027855)	Hesx1 (ENSMSIG00000027875)	Il17rd (ENSMSIG00000027878)
spretus	MODERN SPECIES	5	Dusp29 (MGP_SPRETEiJ_G0019884)	Dusp13 (MGP_SPRETEiJ_G0019885)	Samd8 (MGP_SPRETEiJ_G0019886)	Vdac2 (MGP_SPRETEiJ_G0019887)	Comtd1 (MGP_SPRETEiJ_G0019888)	Zfp503 (MGP_SPRETEiJ_G0019889)	Lrmda (MGP_SPRETEiJ_G0019890)	Kcnma1 (MGP_SPRETEiJ_G0019891)	Dlg5 (MGP_SPRETEiJ_G0019892)	MGP_SPRETEiJ_G0019893	Polr3a (MGP_SPRETEiJ_G0019894)	MGP_SPRETEiJ_G0019895	Zmiz1 (MGP_SPRETEiJ_G0019896)	Ppif (MGP_SPRETEiJ_G0019897)	Zcchc24 (MGP_SPRETEiJ_G0019898)	Anxa11 (MGP_SPRETEiJ_G0019899) #22	MGP_SPRETEiJ_G0019900	MGP_SPRETEiJ_G0019901	MGP_SPRETEiJ_G0019902	MGP_SPRETEiJ_G0019903	MGP_SPRETEiJ_G0019904	MGP_SPRETEiJ_G0019905	MGP_SPRETEiJ_G0019906	MGP_SPRETEiJ_G0019907	MGP_SPRETEiJ_G0019908	MGP_SPRETEiJ_G0019910	MGP_SPRETEiJ_G0019909	Slmap (MGP_SPRETEiJ_G0019912)	MGP_SPRETEiJ_G0019913	Dennd6a (MGP_SPRETEiJ_G0019914)	Arf4 (MGP_SPRETEiJ_G0019915)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	21	MGP_PahariEiJ_G0030019	Dusp29 (MGP_PahariEiJ_G0030020)	Dusp13 (MGP_PahariEiJ_G0030021)	Samd8 (MGP_PahariEiJ_G0030022)	Vdac2 (MGP_PahariEiJ_G0030023)	Comtd1 (MGP_PahariEiJ_G0030024)	Zfp503 (MGP_PahariEiJ_G0030025)	Lrmda (MGP_PahariEiJ_G0030026)	Kcnma1 (MGP_PahariEiJ_G0030027)	Dlg5 (MGP_PahariEiJ_G0030028)	Polr3a (MGP_PahariEiJ_G0030029)	Rps24 (MGP_PahariEiJ_G0030030)	Zmiz1 (MGP_PahariEiJ_G0030031)	Ppif (MGP_PahariEiJ_G0030032)	Zcchc24 (MGP_PahariEiJ_G0030033)	Anxa11 (MGP_PahariEiJ_G0030034) #22	MGP_PahariEiJ_G0030035	MGP_PahariEiJ_G0030036	MGP_PahariEiJ_G0030037	MGP_PahariEiJ_G0030038	MGP_PahariEiJ_G0030039	MGP_PahariEiJ_G0030040	MGP_PahariEiJ_G0030041	MGP_PahariEiJ_G0030042	MGP_PahariEiJ_G0030043	MGP_PahariEiJ_G0030044	MGP_PahariEiJ_G0030045	Slmap (MGP_PahariEiJ_G0030046)	Dennd6a (MGP_PahariEiJ_G0030047)	Arf4 (MGP_PahariEiJ_G0030048)	Pde12 (MGP_PahariEiJ_G0030049)
Rat	MODERN SPECIES	7								Polr3a (ENSRNOG00000010008)	Rps24 (ENSRNOG00000010189)	ENSRNOG00000070644	Zmiz1 (ENSRNOG00000010488)	Ppif (ENSRNOG00000010558)	Zcchc24 (ENSRNOG00000040205)	LOC103693862 (ENSRNOG00000056629)	ENSRNOG00000064603	Anxa11 (ENSRNOG00000010984) #22	Plac9 (ENSRNOG00000011263)	Tmem254 (ENSRNOG00000011276)	Cphx1 (ENSRNOG00000025433)	Dux4 (ENSRNOG00000025408)	LOC100911661 (ENSRNOG00000067370)	Slmap (ENSRNOG00000011307)	Dennd6a (ENSRNOG00000011636)	Arf4 (ENSRNOG00000012623)	Pde12 (ENSRNOG00000059442)	Dnah12 (ENSRNOG00000059865)	Asb14 (ENSRNOG00000013346)	Appl1 (ENSRNOG00000013574)	Hesx1 (ENSRNOG00000014133)	Il17rd (ENSRNOG00000021966)	Arhgef3 (ENSRNOG00000014363)
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00900000143356	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028.bb.b	ENSGT00390000000153.l.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00520000058758	ENSGT00940000154537.z	ENSGT00940000157660	ENSGT00390000005529.a	ENSGT00940000156297	ENSGT00940000157205	ENSGT00940000154280	ENSGT00940000156550	ENSGT00940000156624	ENSGT00940000156780	ENSGT00940000156669.b	ENSGT00940000158385	ENSGT00530000063735.a
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00900000143356	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028.bb.b	ENSGT00390000000153.l.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00520000058758	ENSGT00940000154537.z	ENSGT00390000017724.a.a	ENSGT00940000156679	ENSGT00390000018500.b	ENSGT00940000155892	ENSGT00940000154791	ENSGT00940000156388	ENSGT00950000182865.a	ENSGT00940000157677	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000156494	ENSGT00940000157928
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	22	Dusp13 (ENSPEMG00000012475)	Samd8 (ENSPEMG00000020777)	Vdac2 (ENSPEMG00000020528)	Comtd1 (ENSPEMG00000015720)	Zfp503 (ENSPEMG00000011642)	Lrmda (ENSPEMG00000015468)	ENSPEMG00000027529	ENSPEMG00000030855	Kcnma1 (ENSPEMG00000021200)	Dlg5 (ENSPEMG00000000028)	ENSPEMG00000006768	Rps24 (ENSPEMG00000014749)	Zmiz1 (ENSPEMG00000018413)	Ppif (ENSPEMG00000022747)	Zcchc24 (ENSPEMG00000026551)	Anxa11 (ENSPEMG00000005803) #22	Plac9 (ENSPEMG00000023790)	Tmem254 (ENSPEMG00000008045)	ENSPEMG00000016400	Duxbl1 (ENSPEMG00000024340)	ENSPEMG00000030014	ENSPEMG00000025547	Eaf1 (ENSPEMG00000015934)	Mettl6 (ENSPEMG00000006627)	Sh3bp5 (ENSPEMG00000010547)	Capn7 (ENSPEMG00000015264)	Dnah1 (ENSPEMG00000009939)	Bap1 (ENSPEMG00000004441)	Phf7 (ENSPEMG00000018721)	Sema3g (ENSPEMG00000013600)	Tnnc1 (ENSPEMG00000012039)
Prairie vole	MODERN SPECIES	14	Appl1 (ENSMOCG00000020080)	Asb14 (ENSMOCG00000005229)	ENSMOCG00000021714	ENSMOCG00000005104	ENSMOCG00000010627	ENSMOCG00000013173	Pde12 (ENSMOCG00000020734)	ENSMOCG00000001505	Dennd6a (ENSMOCG00000007569)	Slmap (ENSMOCG00000022562)	Polr3a (ENSMOCG00000012185)	Rps24 (ENSMOCG00000018968)	Zmiz1 (ENSMOCG00000020382)	Ppif (ENSMOCG00000018006)	Zcchc24 (ENSMOCG00000022142)	Anxa11 (ENSMOCG00000022761) #22	Plac9 (ENSMOCG00000022874)	Tmem254 (ENSMOCG00000008162)	Duxbl1 (ENSMOCG00000009549)	Eaf1 (ENSMOCG00000016000)	Mettl6 (ENSMOCG00000017391)	Sh3bp5 (ENSMOCG00000019047)	Capn7 (ENSMOCG00000020566)	Dnah1 (ENSMOCG00000007684)	Bap1 (ENSMOCG00000013939)	Phf7 (ENSMOCG00000016623)	Sema3g (ENSMOCG00000005022)	Tnnc1 (ENSMOCG00000002938)	ENSMOCG00000017988	ENSMOCG00000012665	Stab1 (ENSMOCG00000019424)
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	47										ENSGT00940000161714.b	ENSGT00930000151028.bb.a	ENSGT00390000000153.l.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000154537.z	ENSGT00940000157660	ENSGT00390000005529.a	ENSGT00940000156297	ENSGT00940000157205	ENSGT00940000154280	ENSGT00940000156550	ENSGT00940000156624	ENSGT00940000156780	ENSGT00940000156669.b	ENSGT00940000158385	ENSGT00530000063735.a	ENSGT00390000012411
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	76											ENSCGRG00001015599	Rps24 (ENSCGRG00001012180)	Zmiz1 (ENSCGRG00001013752)	Ppif (ENSCGRG00001021457)	Zcchc24 (ENSCGRG00001021075)	Anxa11 (ENSCGRG00001008189) #22	Plac9 (ENSCGRG00001010798)	Tmem254 (ENSCGRG00001023811)	Duxbl1 (ENSCGRG00001017348)	Slmap (ENSCGRG00001024198)	Dennd6a (ENSCGRG00001021471)	Arf4 (ENSCGRG00001004744)	Pde12 (ENSCGRG00001021836)	ENSCGRG00001000070	ENSCGRG00001013441	Asb14 (ENSCGRG00001022870)	Appl1 (ENSCGRG00001015615)	Hesx1 (ENSCGRG00001024571)	Il17rd (ENSCGRG00001018167)	Arhgef3 (ENSCGRG00001006619)	Tasor (ENSCGRG00001023504)
Golden Hamster	MODERN SPECIES	803											Nlrp2 (ENSMAUG00000015789)	Polr3a (ENSMAUG00000016247)	ENSMAUG00000003646	Ppif (ENSMAUG00000019533)	Zcchc24 (ENSMAUG00000016450)	Anxa11 (ENSMAUG00000009705) #22	Plac9 (ENSMAUG00000001932)	Tmem254 (ENSMAUG00000010787)	ENSMAUG00000015071	ENSMAUG00000009139	ENSMAUG00000007867	Sh3bp5 (ENSMAUG00000010671)	Capn7 (ENSMAUG00000019335)	ENSMAUG00000013275	ENSMAUG00000016506	Bap1 (ENSMAUG00000013459)	Phf7 (ENSMAUG00000014188)	Sema3g (ENSMAUG00000000962)	Tnnc1 (ENSMAUG00000018023)	Nisch (ENSMAUG00000011330)	Stab1 (ENSMAUG00000001222)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1504	Sh2d4b (ENSNGAG00000013815)	Tspan14 (ENSNGAG00000014144)	Prxl2a (ENSNGAG00000014978)	Dydc2 (ENSNGAG00000015558)	Dydc1 (ENSNGAG00000016125)	Mat1a (ENSNGAG00000020715)	Sftpa1 (ENSNGAG00000021105)	Mbl1 (ENSNGAG00000021485)	Sftpd (ENSNGAG00000000804)	Polr3a (ENSNGAG00000015863)	Rps24 (ENSNGAG00000016361)	ENSNGAG00000002316	Zmiz1 (ENSNGAG00000014318)	Ppif (ENSNGAG00000010430)	Zcchc24 (ENSNGAG00000015277)	Anxa11 (ENSNGAG00000016721) #22	ENSNGAG00000020773	Tmem254 (ENSNGAG00000003387)	Duxbl1 (ENSNGAG00000007173)	ENSNGAG00000012930	Kcnma1 (ENSNGAG00000013295)	ENSNGAG00000004000	Lrmda (ENSNGAG00000011225)	Zfp503 (ENSNGAG00000017468)	Comtd1 (ENSNGAG00000018108)	ENSNGAG00000019006	Samd8 (ENSNGAG00000009450)	Dusp13 (ENSNGAG00000010931)	Dusp29 (ENSNGAG00000015948)	ENSNGAG00000000383	Adk (ENSNGAG00000008826)
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	64	Dusp29 (ENSJJAG00000012771)	Dusp13 (ENSJJAG00000021011)	Samd8 (ENSJJAG00000019200)	Vdac2 (ENSJJAG00000013813)	Comtd1 (ENSJJAG00000023380)	Zfp503 (ENSJJAG00000012451)	Lrmda (ENSJJAG00000010771)	Kcnma1 (ENSJJAG00000015287)	ENSJJAG00000019119	ENSJJAG00000006291	ENSJJAG00000016217	ENSJJAG00000007712	Zmiz1 (ENSJJAG00000016307)	Ppif (ENSJJAG00000011851)	Zcchc24 (ENSJJAG00000010391)	Anxa11 (ENSJJAG00000016249) #22	ENSJJAG00000013392	Tmem254 (ENSJJAG00000024320)	Duxbl1 (ENSJJAG00000021637)	Sftpd (ENSJJAG00000023114)	Mbl1 (ENSJJAG00000015405)	Sftpa1 (ENSJJAG00000018997)	Mat1a (ENSJJAG00000022624)	Dydc1 (ENSJJAG00000017106)	Dydc2 (ENSJJAG00000010678)	Prxl2a (ENSJJAG00000021962)	Tspan14 (ENSJJAG00000023639)	Sh2d4b (ENSJJAG00000001387)	Nrg3 (ENSJJAG00000010166)	ENSJJAG00000016988	Cdhr1 (ENSJJAG00000019113)
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	405	Adk (ENSDORG00000012651)	ENSDORG00000005364	Dusp29 (ENSDORG00000029726)	Dusp13 (ENSDORG00000012352)	Samd8 (ENSDORG00000012353)	Vdac2 (ENSDORG00000024659)	Comtd1 (ENSDORG00000009074)	Lrmda (ENSDORG00000002961)	Kcnma1 (ENSDORG00000015531)	ENSDORG00000026315	Polr3a (ENSDORG00000000184)	Rps24 (ENSDORG00000000189)	Zmiz1 (ENSDORG00000015513)	Ppif (ENSDORG00000010799)	Zcchc24 (ENSDORG00000024846)	Anxa11 (ENSDORG00000013204) #22	ENSDORG00000029292	Tmem254 (ENSDORG00000025850)
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00520000058758	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000157372	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172	ENSGT00940000155509
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00940000157372	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042
Alpin marmot	MODERN SPECIES	93	DUSP29 (ENSMMMG00000023348)	DUSP13 (ENSMMMG00000023340)	SAMD8 (ENSMMMG00000023335)	VDAC2 (ENSMMMG00000023331)	ENSMMMG00000023326	LRMDA (ENSMMMG00000023316)	KCNMA1 (ENSMMMG00000021609)	ENSMMMG00000021576	ENSMMMG00000021568	DLG5 (ENSMMMG00000021508)	POLR3A (ENSMMMG00000021484)	ENSMMMG00000021460	ZMIZ1 (ENSMMMG00000021427)	PPIF (ENSMMMG00000021422)	ZCCHC24 (ENSMMMG00000021417)	ANXA11 (ENSMMMG00000021405) #22	PLAC9 (ENSMMMG00000021381)	ENSMMMG00000021353
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	53	ENSGT00940000157372	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	75	DUSP29 (ENSUPAG00010009810)	ENSUPAG00010009693	SAMD8 (ENSUPAG00010009689)	ENSUPAG00010009651	COMTD1 (ENSUPAG00010009638)	ZNF503 (ENSUPAG00010009632)	LRMDA (ENSUPAG00010009618)	ENSUPAG00010009612	KCNMA1 (ENSUPAG00010002959)	DLG5 (ENSUPAG00010002814)	POLR3A (ENSUPAG00010002781)	ENSUPAG00010002719	ZMIZ1 (ENSUPAG00010002653)	PPIF (ENSUPAG00010002642)	ZCCHC24 (ENSUPAG00010002627)	ANXA11 (ENSUPAG00010002591) #22	PLAC9 (ENSUPAG00010002557)	TMEM254 (ENSUPAG00010002530)
Squirrel	MODERN SPECIES	121	KAT6B (ENSSTOG00000011169)	DUSP29 (ENSSTOG00000029009)	DUSP13 (ENSSTOG00000005514)	SAMD8 (ENSSTOG00000028532)	VDAC2 (ENSSTOG00000011353)	COMTD1 (ENSSTOG00000021669)	ZNF503 (ENSSTOG00000004349)	LRMDA (ENSSTOG00000010640)	KCNMA1 (ENSSTOG00000009391)	DLG5 (ENSSTOG00000022087)	POLR3A (ENSSTOG00000012983)	ENSSTOG00000013000	ZMIZ1 (ENSSTOG00000015815)	PPIF (ENSSTOG00000003021)	ZCCHC24 (ENSSTOG00000013873)	ANXA11 (ENSSTOG00000011180) #22	ENSSTOG00000011176	TMEM254 (ENSSTOG00000030373)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	13	ZNF503 (ENSSVLG00005010698)	LRMDA (ENSSVLG00005010576)	KCNMA1 (ENSSVLG00005007882)	ENSSVLG00005006853	ENSSVLG00005006820	ENSSVLG00005006809	ENSSVLG00005006795	DLG5 (ENSSVLG00005006751)	POLR3A (ENSSVLG00005006708)	ENSSVLG00005006601	ZMIZ1 (ENSSVLG00005006475)	ENSSVLG00005006423	ZCCHC24 (ENSSVLG00005006394)	ENSSVLG00005006356	ENSSVLG00005006337	ANXA11 (ENSSVLG00005006301) #22	PLAC9 (ENSSVLG00005006256)	TMEM254 (ENSSVLG00005006215)	ENSSVLG00005006190	ENSSVLG00005006135	ENSSVLG00005006106	ENSSVLG00005006085	ENSSVLG00005006056	ENSSVLG00005006036	ENSSVLG00005006012	ENSSVLG00005004436	SFTPD (ENSSVLG00005004412)	ENSSVLG00005004372	ENSSVLG00005004335	MAT1A (ENSSVLG00005004294)	DYDC1 (ENSSVLG00005004260)
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00520000058758	ENSGT00940000156827	ENSGT01100000263524.B.a	ENSGT00940000161797	ENSGT00940000162401	ENSGT00940000157566	ENSGT00940000156212	ENSGT00940000161228	ENSGT00940000154603.B	ENSGT00950000183111.a.a	ENSGT00610000086772	ENSGT00390000005233.b	ENSGT00940000159049
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000156827	ENSGT01100000263524.B.a	ENSGT00940000161797	ENSGT00940000162401	ENSGT00940000157566	ENSGT00940000156212	ENSGT00940000161228	ENSGT00940000154603.B	ENSGT00950000183111.a.a	ENSGT00610000086772	ENSGT00390000005233.b	ENSGT00940000159049	ENSGT00940000160098
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000156827	ENSGT01100000263524.B.a	ENSGT00940000157566	ENSGT00940000156212	ENSGT00940000161228	ENSGT00940000154603.B	ENSGT00950000183111.a.a	ENSGT00610000086772	ENSGT00390000005233.b	ENSGT00940000159049	ENSGT00940000160098	ENSGT00940000153141.A	ENSGT00940000159767
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	144	DUSP13 (ENSCLAG00000009900)	ENSCLAG00000009800	SAMD8 (ENSCLAG00000009370)	ENSCLAG00000012366	COMTD1 (ENSCLAG00000010142)	VDAC2 (ENSCLAG00000009384)	ZNF503 (ENSCLAG00000013608)	LRMDA (ENSCLAG00000010070)	KCNMA1 (ENSCLAG00000014554)	DLG5 (ENSCLAG00000014620)	POLR3A (ENSCLAG00000009629)	ENSCLAG00000013936	ZMIZ1 (ENSCLAG00000016557)	PPIF (ENSCLAG00000014222)	ZCCHC24 (ENSCLAG00000011227)	ANXA11 (ENSCLAG00000009076) #22	PLAC9 (ENSCLAG00000012966)	TMEM254 (ENSCLAG00000012491)	PTCHD4 (ENSCLAG00000011234)	OPN5 (ENSCLAG00000009879)	ADGRF4 (ENSCLAG00000009923)	ENSCLAG00000010147	ENSCLAG00000009308	CD2AP (ENSCLAG00000009331)	TNFRSF21 (ENSCLAG00000015128)	ADGRF1 (ENSCLAG00000016116)	ADGRF5 (ENSCLAG00000010731)	ENSCLAG00000013170	ANKRD66 (ENSCLAG00000013892)	PLA2G7 (ENSCLAG00000010984)	TDRD6 (ENSCLAG00000009187)
Degu	MODERN SPECIES	46	DUSP29 (ENSODEG00000014367)	DUSP13 (ENSODEG00000014816)	SAMD8 (ENSODEG00000015010)	VDAC2 (ENSODEG00000014433)	COMTD1 (ENSODEG00000015636)	ENSODEG00000014826	ZNF503 (ENSODEG00000015000)	LRMDA (ENSODEG00000015494)	KCNMA1 (ENSODEG00000016449)	DLG5 (ENSODEG00000015060)	POLR3A (ENSODEG00000015146)	RPS24 (ENSODEG00000015382)	ZMIZ1 (ENSODEG00000015504)	PPIF (ENSODEG00000015244)	ZCCHC24 (ENSODEG00000015281)	ANXA11 (ENSODEG00000014938) #22	ENSODEG00000014928	ENSODEG00000015033	OPN5 (ENSODEG00000015357)	CD2AP (ENSODEG00000015575)	ENSODEG00000020279	TNFRSF21 (ENSODEG00000014919)	ENSODEG00000020221	ADGRF1 (ENSODEG00000016021)	ADGRF5 (ENSODEG00000016148)	ENSODEG00000015890	ANKRD66 (ENSODEG00000015928)	PLA2G7 (ENSODEG00000015738)	TDRD6 (ENSODEG00000015639)	SLC25A27 (ENSODEG00000015240)	CYP39A1 (ENSODEG00000015974)
Guinea pig	MODERN SPECIES	15	KAT6B (ENSCPOG00000006544)	DUSP29 (ENSCPOG00000022980)	DUSP13 (ENSCPOG00000006560)	SAMD8 (ENSCPOG00000031357)	VDAC2 (ENSCPOG00000002752)	COMTD1 (ENSCPOG00000002758)	ZNF503 (ENSCPOG00000010319)	LRMDA (ENSCPOG00000008454)	KCNMA1 (ENSCPOG00000011100)	DLG5 (ENSCPOG00000005329)	POLR3A (ENSCPOG00000022387)	RPS24 (ENSCPOG00000020096)	ZMIZ1 (ENSCPOG00000002268)	PPIF (ENSCPOG00000013666)	ZCCHC24 (ENSCPOG00000026826)	ANXA11 (ENSCPOG00000023458) #22	ENSCPOG00000034945	ENSCPOG00000037289	TMEM254 (ENSCPOG00000030137)	PTCHD4 (ENSCPOG00000005747)	OPN5 (ENSCPOG00000005742)	ADGRF4 (ENSCPOG00000010768)	ENSCPOG00000010766	CD2AP (ENSCPOG00000010757)	TNFRSF21 (ENSCPOG00000010287)	ADGRF1 (ENSCPOG00000007461)	ENSCPOG00000020034	ENSCPOG00000011402	ANKRD66 (ENSCPOG00000037432)	PLA2G7 (ENSCPOG00000012786)	TDRD6 (ENSCPOG00000015698)
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	4	ENSHGLG00000038436	ENSHGLG00000017721	ENSHGLG00000012957	ENSHGLG00000043730	LRMDA (ENSHGLG00000037301)	ENSHGLG00000047836	ENSHGLG00000037377	KCNMA1 (ENSHGLG00000014096)	ENSHGLG00000044375	ENSHGLG00000017828	POLR3A (ENSHGLG00000017899)	RPS24 (ENSHGLG00000019372)	ZMIZ1 (ENSHGLG00000019319)	PPIF (ENSHGLG00000019197)	ENSHGLG00000042244	ENSHGLG00000017009 #22	ENSHGLG00000017020	ENSHGLG00000017035	ENSHGLG00000047182	ENSHGLG00000017041	ENSHGLG00000032722	ENSHGLG00000017403	ENSHGLG00000021041	ENSHGLG00000040541	ENSHGLG00000049756	ENSHGLG00000016523	ENSHGLG00000038333	OPN5 (ENSHGLG00000016532)	ADGRF4 (ENSHGLG00000016547)	ENSHGLG00000016560	ENSHGLG00000021025
Tree shrew	MODERN SPECIES	957																ANXA11 (ENSTBEG00000000125) #22
Primates	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172	ENSGT00940000155509
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172	ENSGT00940000155509
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00910000146898	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00910000147265	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172	ENSGT00940000155509
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00910000146898	ENSGT00910000147360	ENSGT00910000148289	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00910000147265	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00390000015405.t	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00910000146898	ENSGT00910000147360	ENSGT00910000148289	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00910000147265	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00390000015405.t	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172	ENSGT00940000155509
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00910000146898	ENSGT00910000147360	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00910000147265	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00390000015405.t	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172	ENSGT00940000155509
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00910000146898	ENSGT00910000147360	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00910000147265	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00390000015405.t	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000156653.i	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00390000010045.g.a.b	ENSGT00860000136117.a	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00910000146898	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00910000147265	ENSGT00390000008264	ENSGT00390000003738.a.a.b.y.b	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00390000015405.t	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000156653.i	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00390000010045.g.a.b	ENSGT00860000136117.a	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b
Human	MODERN SPECIES	1	GRID1 (ENSG00000182771)	CCSER2 (ENSG00000107771)	LRIT1 (ENSG00000148602)	RGR (ENSG00000148604)	LRIT2 (ENSG00000204033)	CDHR1 (ENSG00000148600)	GPR15LG (ENSG00000188373)	GHITM (ENSG00000165678)	NRG3 (ENSG00000185737)	SH2D4B (ENSG00000178217)	TSPAN14 (ENSG00000108219)	PRXL2A (ENSG00000122378)	DYDC2 (ENSG00000133665)	DYDC1 (ENSG00000170788)	MAT1A (ENSG00000151224)	ANXA11 (ENSG00000122359) #22	PLAC9 (ENSG00000189129)	TMEM254 (ENSG00000133678)	SFTPD (ENSG00000133661)	NUTM2E (ENSG00000228570)	NUTM2B (ENSG00000188199)	SFTPA1 (ENSG00000122852)	SFTPA2 (ENSG00000185303)	EIF5AL1 (ENSG00000253626)	ZCCHC24 (ENSG00000165424)	PPIF (ENSG00000108179)	ZMIZ1 (ENSG00000108175)	RPS24 (ENSG00000138326)	POLR3A (ENSG00000148606)	DLG5 (ENSG00000151208)	KCNMA1 (ENSG00000156113)
Pan	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00910000146898	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000154156.d.n.b.b.a	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.b.c.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00910000147265	ENSGT00390000008264	ENSGT00390000003738.a.a.b.y.b	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00390000015405.t	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000156653.i	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00390000010045.g.a.b	ENSGT00860000136117.a	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b
Bonobo	MODERN SPECIES	1	COMTD1 (ENSPPAG00000029541)	ZNF503 (ENSPPAG00000000057)	LRMDA (ENSPPAG00000032754)	KCNMA1 (ENSPPAG00000031977)	ENSPPAG00000034645	ENSPPAG00000034656	DLG5 (ENSPPAG00000041668)	ENSPPAG00000031986	ENSPPAG00000041726	ENSPPAG00000043469	ZMIZ1 (ENSPPAG00000037801)	PPIF (ENSPPAG00000032388)	ENSPPAG00000034843	ENSPPAG00000039528	ENSPPAG00000040556	ANXA11 (ENSPPAG00000035965) #22	PLAC9 (ENSPPAG00000022596)	TMEM254 (ENSPPAG00000037427)	ENSPPAG00000040091	SFTPD (ENSPPAG00000040170)	SFTPA2 (ENSPPAG00000037547)	MAT1A (ENSPPAG00000029317)	DYDC1 (ENSPPAG00000009095)	DYDC2 (ENSPPAG00000036598)	PRXL2A (ENSPPAG00000037245)	TSPAN14 (ENSPPAG00000030989)	ENSPPAG00000037034	ENSPPAG00000020127	ENSPPAG00000040005	NRG3 (ENSPPAG00000033661)	GHITM (ENSPPAG00000014417)
Chimpanzee	MODERN SPECIES	1	ENSPTRG00000050280	COMTD1 (ENSPTRG00000002658)	ZNF503 (ENSPTRG00000029870)	LRMDA (ENSPTRG00000002660)	KCNMA1 (ENSPTRG00000046743)	ENSPTRG00000045968	ENSPTRG00000048458	DLG5 (ENSPTRG00000002663)	POLR3A (ENSPTRG00000002664)	RPS24 (ENSPTRG00000002666)	ZMIZ1 (ENSPTRG00000002668)	PPIF (ENSPTRG00000002669)	ENSPTRG00000052838	ZCCHC24 (ENSPTRG00000002670)	ENSPTRG00000039342	ANXA11 (ENSPTRG00000002680) #22	PLAC9 (ENSPTRG00000029864)	TMEM254 (ENSPTRG00000002678)	SFTPD (ENSPTRG00000044965)	ENSPTRG00000021133	ENSPTRG00000046308	ENSPTRG00000049357	SFTPA1 (ENSPTRG00000002673)	SFTPA2 (ENSPTRG00000002671)	ENSPTRG00000042721	MAT1A (ENSPTRG00000002682)	DYDC1 (ENSPTRG00000002683)	DYDC2 (ENSPTRG00000002684)	PRXL2A (ENSPTRG00000002685)	TSPAN14 (ENSPTRG00000002686)	SH2D4B (ENSPTRG00000002687)
Gorilla	MODERN SPECIES	1	RGR (ENSGGOG00000012798)	LRIT1 (ENSGGOG00000012795)	LRIT2 (ENSGGOG00000012781)	CDHR1 (ENSGGOG00000012764)	C10orf99 (ENSGGOG00000012510)	GHITM (ENSGGOG00000011008)	NRG3 (ENSGGOG00000011517)	ENSGGOG00000036412	ENSGGOG00000024160	ENSGGOG00000006297	TSPAN14 (ENSGGOG00000005770)	PRXL2A (ENSGGOG00000013246)	DYDC2 (ENSGGOG00000003755)	DYDC1 (ENSGGOG00000002717)	MAT1A (ENSGGOG00000005862)	ANXA11 (ENSGGOG00000005851) #22	PLAC9 (ENSGGOG00000011111)	TMEM254 (ENSGGOG00000005287)	ENSGGOG00000025808	SFTPD (ENSGGOG00000008952)	ENSGGOG00000003464	SFTPA2 (ENSGGOG00000021975)	ENSGGOG00000022019	SFTPA1 (ENSGGOG00000022096)	ENSGGOG00000024380	ENSGGOG00000025726	RAB18 (ENSGGOG00000008086)	MKX (ENSGGOG00000016220)	ODAD2 (ENSGGOG00000014550)	MPP7 (ENSGGOG00000013306)	WAC (ENSGGOG00000005639)
Orangutan	MODERN SPECIES	1	CCSER2 (ENSPPYG00000002274)	RGR (ENSPPYG00000002275)	LRIT1 (ENSPPYG00000002276)	LRIT2 (ENSPPYG00000002277)	CDHR1 (ENSPPYG00000002278)	GPR15LG (ENSPPYG00000002279)	GHITM (ENSPPYG00000002280)	ENSPPYG00000002282	NRG3 (ENSPPYG00000032077)	SH2D4B (ENSPPYG00000002286)	TSPAN14 (ENSPPYG00000002287)	DYDC2 (ENSPPYG00000002288)	DYDC1 (ENSPPYG00000002289)	ENSPPYG00000002290	MAT1A (ENSPPYG00000002291)	ANXA11 (ENSPPYG00000002292) #22	PLAC9 (ENSPPYG00000038414)	TMEM254 (ENSPPYG00000002293)	ENSPPYG00000002294	ENSPPYG00000002295	ENSPPYG00000041507	ENSPPYG00000039923	ZCCHC24 (ENSPPYG00000035309)	PPIF (ENSPPYG00000002301)	ZMIZ1 (ENSPPYG00000002302)	RPS24 (ENSPPYG00000002304)	POLR3A (ENSPPYG00000002305)	DLG5 (ENSPPYG00000002306)	ENSPPYG00000002308	KCNMA1 (ENSPPYG00000002311)	LRMDA (ENSPPYG00000002312)
Gibbon	MODERN SPECIES	8	KCNMA1 (ENSNLEG00000016890)	ENSNLEG00000028468	ENSNLEG00000027618	ENSNLEG00000032892	ENSNLEG00000029842	ENSNLEG00000033530	DLG5 (ENSNLEG00000010435)	ENSNLEG00000032733	POLR3A (ENSNLEG00000010501)	ENSNLEG00000010524	ZMIZ1 (ENSNLEG00000010540)	PPIF (ENSNLEG00000028226)	ENSNLEG00000010615	ENSNLEG00000034878	ENSNLEG00000010624	ANXA11 (ENSNLEG00000010635) #22	ENSNLEG00000010646	TMEM254 (ENSNLEG00000028953)	SFTPD (ENSNLEG00000010686)	ENSNLEG00000010694	ENSNLEG00000035944	MAT1A (ENSNLEG00000010703)	DYDC1 (ENSNLEG00000010716)	DYDC2 (ENSNLEG00000035375)	ENSNLEG00000010726	TSPAN14 (ENSNLEG00000029109)	ENSNLEG00000010754	ENSNLEG00000032276	NRG3 (ENSNLEG00000010762)	ENSNLEG00000033654	ENSNLEG00000033385
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000153912.A	ENSGT00390000016470.d	ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b	ENSGT00940000156033	ENSGT00940000159143	ENSGT00940000155509	ENSGT00390000015172	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161631	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00390000015405.t	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00390000008264	ENSGT00910000147265	ENSGT00940000156008	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00390000000153.l.b.c.a	ENSGT00930000151028	ENSGT00940000155303	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000153289.a.a.a
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000153912.A	ENSGT00390000016470.d	ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b	ENSGT00940000156033	ENSGT00940000159143	ENSGT00940000155509	ENSGT00390000015172	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000161199.b.a	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161631	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00390000015405.t	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653.n	ENSGT00940000156653.o	ENSGT00390000008264	ENSGT00910000147265	ENSGT00940000156008	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00390000000153.l.b.c.a	ENSGT00930000151028	ENSGT00940000155303	ENSGT00940000154935
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000153912.A	ENSGT00390000016470.d	ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b	ENSGT00940000156033	ENSGT00940000159143	ENSGT00940000155509	ENSGT00390000015172	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000161199.b.a	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161631	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00390000015405.t	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000156653.n.b	ENSGT00940000156653.o	ENSGT00390000008264	ENSGT00910000147265	ENSGT00940000156008	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00390000000153.l.b.c.a	ENSGT00930000151028	ENSGT00940000155303	ENSGT00940000154935	ENSGT00910000147319
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000016470.d	ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b	ENSGT00940000156033	ENSGT00940000159143	ENSGT00940000155509	ENSGT00390000015172	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT00950000183120.e.a.b.k	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000161199.b.a	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161631	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00390000015405.t	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000156653.n.b	ENSGT00390000008264	ENSGT00910000147265	ENSGT00940000156008	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00390000014818.g.b.b	ENSGT00390000000153.l.b.c.a	ENSGT00930000151028	ENSGT00940000155303	ENSGT00940000154935	ENSGT00910000147319
Olive baboon	MODERN SPECIES	2	LRIT1 (ENSPANG00000022599)	LRIT2 (ENSPANG00000022600)	CDHR1 (ENSPANG00000022602)	GPR15LG (ENSPANG00000038684)	GHITM (ENSPANG00000022606)	ENSPANG00000037881	NRG3 (ENSPANG00000022613)	ENSPANG00000048493	SH2D4B (ENSPANG00000022612)	TSPAN14 (ENSPANG00000022582)	PRXL2A (ENSPANG00000022583)	ENSPANG00000024230	DYDC2 (ENSPANG00000022584)	DYDC1 (ENSPANG00000022585)	MAT1A (ENSPANG00000022586)	ANXA11 (ENSPANG00000022587) #22	ENSPANG00000039078	TMEM254 (ENSPANG00000022580)	ENSPANG00000044291	ENSPANG00000000501	SFTPD (ENSPANG00000022579)	ENSPANG00000022578	ENSPANG00000037998	ENSPANG00000031002	ENSPANG00000039699	ZCCHC24 (ENSPANG00000022503)	PPIF (ENSPANG00000022504)	ZMIZ1 (ENSPANG00000022505)	ENSPANG00000048295	ENSPANG00000047646	ENSPANG00000022507
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	214										ENSGT00940000159732	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000161199.b.a	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161631	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00940000165487	ENSGT00390000016042	ENSGT00390000015405.t	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000156653.n.b
Drill	MODERN SPECIES	78										SH2D4B (ENSMLEG00000035791)	TSPAN14 (ENSMLEG00000035796)	PRXL2A (ENSMLEG00000026958)	DYDC2 (ENSMLEG00000035512)	DYDC1 (ENSMLEG00000030490)	MAT1A (ENSMLEG00000028991)	ANXA11 (ENSMLEG00000027396) #22	ENSMLEG00000017189	TMEM254 (ENSMLEG00000036463)
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	379										SH2D4B (ENSCATG00000030474)	TSPAN14 (ENSCATG00000031568)	PRXL2A (ENSCATG00000006717)	DYDC2 (ENSCATG00000007951)	DYDC1 (ENSCATG00000002011)	MAT1A (ENSCATG00000000417)	ANXA11 (ENSCATG00000009045) #22	ENSCATG00000033421	TMEM254 (ENSCATG00000029182)	ENSCATG00000043348	SFTPD (ENSCATG00000036936)	ENSCATG00000005654	ENSCATG00000033717
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00550000076451.a.a.c	ENSGT00940000153912.A	ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b	ENSGT00940000156033	ENSGT00940000159143	ENSGT00940000155509	ENSGT00390000015172	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000161199.b.a	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161631	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00390000015405.t	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653.n.a.a	ENSGT00940000156653.o	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156008	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00390000000153.l.b.c.a	ENSGT00930000151028	ENSGT00940000155303	ENSGT00940000154935	ENSGT00910000147319
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	353							ENSMNEG00000020863	ENSMNEG00000027191	ENSMNEG00000038329	SH2D4B (ENSMNEG00000036278)	TSPAN14 (ENSMNEG00000032257)	ENSMNEG00000039158	DYDC2 (ENSMNEG00000029695)	DYDC1 (ENSMNEG00000002410)	MAT1A (ENSMNEG00000042654)	ANXA11 (ENSMNEG00000007272) #22	PLAC9 (ENSMNEG00000031716)	TMEM254 (ENSMNEG00000031740)	ENSMNEG00000020626	SFTPD (ENSMNEG00000033500)	ENSMNEG00000044696	ENSMNEG00000033190	ENSMNEG00000030862	ZCCHC24 (ENSMNEG00000042050)	PPIF (ENSMNEG00000028765)	ZMIZ1 (ENSMNEG00000041879)	ENSMNEG00000014810	POLR3A (ENSMNEG00000035163)	DLG5 (ENSMNEG00000026685)	ENSMNEG00000043575	KCNMA1 (ENSMNEG00000039864)
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000153912.A	ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b	ENSGT00940000156033	ENSGT00940000159143	ENSGT00940000155509	ENSGT00390000015172	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000161199.b.a	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161631	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT01100000263493.a.b.a.a.b.b.b.a.b.a.a.b	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00390000015405.t	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653.n.a.a	ENSGT00940000156653.o	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156008	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00390000000153.l.b.c.a	ENSGT00930000151028	ENSGT00940000155303	ENSGT00940000154935	ENSGT00910000147319
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	19	RGR (ENSMFAG00000043610)	LRIT1 (ENSMFAG00000000369)	LRIT2 (ENSMFAG00000000819)	CDHR1 (ENSMFAG00000001885)	GPR15LG (ENSMFAG00000043609)	GHITM (ENSMFAG00000043812)	ENSMFAG00000058668	NRG3 (ENSMFAG00000039411)	TSPAN14 (ENSMFAG00000045856)	SH2D4B (ENSMFAG00000003299)	PRXL2A (ENSMFAG00000043331)	DYDC2 (ENSMFAG00000031434)	DYDC1 (ENSMFAG00000036906)	MAT1A (ENSMFAG00000038544)	ENSMFAG00000063395	ANXA11 (ENSMFAG00000045443) #22	ENSMFAG00000026512	ENSMFAG00000033371	ENSMFAG00000034034	SFTPD (ENSMFAG00000045610)	ENSMFAG00000001265	ENSMFAG00000039235	ENSMFAG00000051159	ZCCHC24 (ENSMFAG00000063832)	ENSMFAG00000054056	PPIF (ENSMFAG00000041215)	ZMIZ1 (ENSMFAG00000043959)	ENSMFAG00000056846	ENSMFAG00000037643	POLR3A (ENSMFAG00000032218)	DLG5 (ENSMFAG00000032038)
Rhesus	MODERN SPECIES	19	CCSER2 (ENSMMUG00000019720)	RGR (ENSMMUG00000000661)	LRIT1 (ENSMMUG00000000660)	LRIT2 (ENSMMUG00000000659)	CDHR1 (ENSMMUG00000000658)	GHITM (ENSMMUG00000018572)	NRG3 (ENSMMUG00000017380)	ENSMMUG00000055918	ENSMMUG00000049411	TSPAN14 (ENSMMUG00000013895)	PRXL2A (ENSMMUG00000021773)	DYDC2 (ENSMMUG00000021774)	DYDC1 (ENSMMUG00000055336)	MAT1A (ENSMMUG00000018634)	ENSMMUG00000063666	ANXA11 (ENSMMUG00000019780) #22	PLAC9 (ENSMMUG00000003014)	TMEM254 (ENSMMUG00000003015)	ENSMMUG00000043184	SFTPD (ENSMMUG00000002787)	MBL1 (ENSMMUG00000002786)	ENSMMUG00000040590	SFTPA1 (ENSMMUG00000047229)	ENSMMUG00000057196	ZCCHC24 (ENSMMUG00000051972)	PPIF (ENSMMUG00000003189)	ZMIZ1 (ENSMMUG00000008790)	RPS24 (ENSMMUG00000030562)	POLR3A (ENSMMUG00000005514)	DLG5 (ENSMMUG00000009128)	KCNMA1 (ENSMMUG00000018390)
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	28	RGR (ENSCSAG00000009607)	LRIT1 (ENSCSAG00000009590)	LRIT2 (ENSCSAG00000009583)	CDHR1 (ENSCSAG00000009566)	GPR15LG (ENSCSAG00000009520)	GHITM (ENSCSAG00000009514)	ENSCSAG00000018425	NRG3 (ENSCSAG00000009497)	SH2D4B (ENSCSAG00000009481)	TSPAN14 (ENSCSAG00000009464)	ENSCSAG00000009424	DYDC2 (ENSCSAG00000009412)	ENSCSAG00000018426	DYDC1 (ENSCSAG00000009406)	MAT1A (ENSCSAG00000009396)	ANXA11 (ENSCSAG00000009384) #22	PLAC9 (ENSCSAG00000009370)	TMEM254 (ENSCSAG00000009360)	SFTPD (ENSCSAG00000009350)	ENSCSAG00000009340	ENSCSAG00000009335	ENSCSAG00000009329	ZCCHC24 (ENSCSAG00000009325)	PPIF (ENSCSAG00000009321)	ZMIZ1 (ENSCSAG00000009314)	ENSCSAG00000009299	POLR3A (ENSCSAG00000009292)	DLG5 (ENSCSAG00000009267)	KCNMA1 (ENSCSAG00000009242)	LRMDA (ENSCSAG00000009213)	ZNF503 (ENSCSAG00000009170)
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	204										ENSGT00940000159732	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161631	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00390000015405.t	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653.l	ENSGT00940000156653.m	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156008	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000163541	ENSGT00390000000153.l.b.c.a	ENSGT00930000151028	ENSGT00940000155303	ENSGT00940000154156.d.n.b.b.a.a
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1841										SH2D4B (ENSRBIG00000039902)	TSPAN14 (ENSRBIG00000033365)	PRXL2A (ENSRBIG00000031726)	DYDC2 (ENSRBIG00000034822)	DYDC1 (ENSRBIG00000025903)	MAT1A (ENSRBIG00000039833)	ANXA11 (ENSRBIG00000040122) #22	PLAC9 (ENSRBIG00000043290)	TMEM254 (ENSRBIG00000035777)	ENSRBIG00000026211	SFTPD (ENSRBIG00000041704)	ENSRBIG00000030139	ENSRBIG00000040102	ENSRBIG00000022591
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1067														MAT1A (ENSRROG00000029224)	ENSRROG00000041756	ANXA11 (ENSRROG00000019845) #22	PLAC9 (ENSRROG00000040785)	TMEM254 (ENSRROG00000038790)	ENSRROG00000005944	SFTPD (ENSRROG00000032074)	ENSRROG00000038797	ENSRROG00000005158	ENSRROG00000033783	ZCCHC24 (ENSRROG00000041812)	PPIF (ENSRROG00000036080)	ZMIZ1 (ENSRROG00000033232)	ENSRROG00000032510	POLR3A (ENSRROG00000025527)	DLG5 (ENSRROG00000029367)	ENSRROG00000035209	ENSRROG00000034151
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	14			ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b	ENSGT00940000156033	ENSGT00940000159143	ENSGT00940000155509	ENSGT00390000015172	ENSGT01050000244940.a.b.eb.a	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161631	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00390000008264	ENSGT00910000147265	ENSGT00940000156008	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00390000000153.l.a.cb.i	ENSGT00930000151028	ENSGT00940000155303	ENSGT00940000154935	ENSGT00910000146898	ENSGT00940000153289.a.a.a
Cebidae	DUPLICATION
Cebidae	DUPLICATION
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000156914.g.a #22
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000156914.g.a #22
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	160																ANXA11 (ENSSBOG00000027057) #22	TMEM254 (ENSSBOG00000025018)	SFTPD (ENSSBOG00000029000)	ENSSBOG00000030584	ENSSBOG00000034112	ZCCHC24 (ENSSBOG00000026206)	PPIF (ENSSBOG00000013749)	ZMIZ1 (ENSSBOG00000025984)	ENSSBOG00000027494	POLR3A (ENSSBOG00000022199)	DLG5 (ENSSBOG00000035473)	ENSSBOG00000022184	KCNMA1 (ENSSBOG00000035390)	ENSSBOG00000026360	LRMDA (ENSSBOG00000029367)	ZNF503 (ENSSBOG00000036119)
Marmoset	MODERN SPECIES	3	ENSCJAG00000085492	ENSCJAG00000086184	ENSCJAG00000075789	CCSER2 (ENSCJAG00000002054)	ENSCJAG00000053419	ENSCJAG00000042274	ENSCJAG00000079480	ENSCJAG00000081461	NRG3 (ENSCJAG00000043195)	SH2D4B (ENSCJAG00000003404)	TSPAN14 (ENSCJAG00000075943)	PRXL2A (ENSCJAG00000003657)	DYDC2 (ENSCJAG00000080313)	DYDC1 (ENSCJAG00000003641)	MAT1A (ENSCJAG00000003632)	ENSCJAG00000043070 #22	ENSCJAG00000075137	ENSCJAG00000005520	ENSCJAG00000077470	ENSCJAG00000071648	ENSCJAG00000077921	ENSCJAG00000075452	ENSCJAG00000081880	ENSCJAG00000086814	ENSCJAG00000018197	ENSCJAG00000038466	ENSCJAG00000086928	ZCCHC24 (ENSCJAG00000040780)	PPIF (ENSCJAG00000000973)	ZMIZ1 (ENSCJAG00000000976)	ENSCJAG00000012512
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000156914.g.b #22
Marmoset	MODERN SPECIES	3	ENSCJAG00000042274	ENSCJAG00000053419	CCSER2 (ENSCJAG00000002054)	ENSCJAG00000075789	ENSCJAG00000086184	ENSCJAG00000085492	ENSCJAG00000083216	ENSCJAG00000069667	ENSCJAG00000073308	GRID1 (ENSCJAG00000020533)	WAPL (ENSCJAG00000003491)	ENSCJAG00000076067	ENSCJAG00000085816	ENSCJAG00000001964	ENSCJAG00000044249	ENSCJAG00000055667 #22	ENSCJAG00000087144	ENSCJAG00000087361	ENSCJAG00000078491	ENSCJAG00000061688	GPRIN2 (ENSCJAG00000045811)	ENSCJAG00000011770	SHLD2 (ENSCJAG00000011757)	ENSCJAG00000011633	ENSCJAG00000011628	ADIRF (ENSCJAG00000073286)	SNCG (ENSCJAG00000065128)	ENSCJAG00000084420	MMRN2 (ENSCJAG00000011588)	BMPR1A (ENSCJAG00000011555)	LDB3 (ENSCJAG00000011521)
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	17			ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b	ENSGT00940000156033	ENSGT00940000159143	ENSGT00940000155509	ENSGT00390000015172	ENSGT01050000244940.a.b.eb.a	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161631	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000156914.h #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156008	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00390000000153.l.a.cb.i	ENSGT00930000151028	ENSGT00940000155303	ENSGT00940000154935	ENSGT00910000146898	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00390000014618.a
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	79			ENSGT01090000260051.b.a.a.b.b	ENSGT00940000156033	ENSGT00940000159143	ENSGT00940000155509	ENSGT00390000015172	ENSGT01050000244940.a.b.eb.a	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161631	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000156914.h #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156008	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00390000000153.l.b.c.a	ENSGT00930000151028	ENSGT00940000155303	ENSGT00940000155228.gb.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00910000146898	ENSGT00940000153289.a.a.a
Capuchin	MODERN SPECIES	11	ZUP1 (ENSCCAG00000025061)	KPNA5 (ENSCCAG00000022746)	FAM162B (ENSCCAG00000031118)	GPRC6A (ENSCCAG00000030003)	RFX6 (ENSCCAG00000019715)	VGLL2 (ENSCCAG00000028036)	ROS1 (ENSCCAG00000033956)	ENSCCAG00000027081	DCBLD1 (ENSCCAG00000025349)	ENSCCAG00000028924	ENSCCAG00000024292	NUS1 (ENSCCAG00000020694)	DYDC2 (ENSCCAG00000028493)	DYDC1 (ENSCCAG00000026278)	MAT1A (ENSCCAG00000021786)	ANXA11 (ENSCCAG00000037639) #22	PLAC9 (ENSCCAG00000026257)	TMEM254 (ENSCCAG00000021130)	ENSCCAG00000028226	ENSCCAG00000021547	SFTPD (ENSCCAG00000025815)	ENSCCAG00000003281	ZCCHC24 (ENSCCAG00000031702)	PPIF (ENSCCAG00000023235)	ZMIZ1 (ENSCCAG00000028934)	ENSCCAG00000033731	POLR3A (ENSCCAG00000032995)	DLG5 (ENSCCAG00000023904)	ENSCCAG00000022279	ENSCCAG00000021193	KCNMA1 (ENSCCAG00000036045)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	552																ANXA11 (ENSANAG00000031664) #22	ENSANAG00000034866
Tarsier	MODERN SPECIES	4083																ANXA11 (ENSTSYG00000012890) #22	ENSTSYG00000032087	TMEM254 (ENSTSYG00000006920)	SFTPD (ENSTSYG00000004171)	ENSTSYG00000000194
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.a.cb	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161199	ENSGT00940000159235	ENSGT00940000159732	ENSGT00940000156754.a.b	ENSGT01050000244940.a.b	ENSGT00390000015172	ENSGT00940000155509
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000157372	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.a.cb	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161044	ENSGT00390000013319	ENSGT00390000014309	ENSGT00390000014549	ENSGT00530000063727.A	ENSGT00390000015361	ENSGT00940000158879
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	48	ENSGT00940000157372	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a.f	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.a.cb	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00940000155748.b	ENSGT00940000154368.k	ENSGT00940000156653	ENSGT00950000183185.c.a.b	ENSGT00940000161631	ENSGT00940000162091	ENSGT00940000161044	ENSGT00390000013319	ENSGT00390000014309	ENSGT00390000014549	ENSGT00530000063727.A	ENSGT00390000015361	ENSGT00940000158879
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	136						LRMDA (ENSPSMG00000010147)	KCNMA1 (ENSPSMG00000011986)	DLG5 (ENSPSMG00000015386)	POLR3A (ENSPSMG00000015585)	ENSPSMG00000015678	ZMIZ1 (ENSPSMG00000015783)	PPIF (ENSPSMG00000015817)	ENSPSMG00000015824	ZCCHC24 (ENSPSMG00000015828)	ENSPSMG00000015841	ANXA11 (ENSPSMG00000015896) #22	PLAC9 (ENSPSMG00000015919)	TMEM254 (ENSPSMG00000015934)	SFTPD (ENSPSMG00000015948)	ENSPSMG00000015956	ENSPSMG00000015968	MAT1A (ENSPSMG00000016009)	DYDC1 (ENSPSMG00000016025)
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	928	KAT6B (ENSPCOG00000016023)	DUSP29 (ENSPCOG00000016837)	DUSP13 (ENSPCOG00000016616)	SAMD8 (ENSPCOG00000018979)	VDAC2 (ENSPCOG00000012191)	COMTD1 (ENSPCOG00000004040)	ZNF503 (ENSPCOG00000013174)	LRMDA (ENSPCOG00000022238)	KCNMA1 (ENSPCOG00000024611)	DLG5 (ENSPCOG00000000249)	POLR3A (ENSPCOG00000028311)	ENSPCOG00000004154	ZMIZ1 (ENSPCOG00000014810)	PPIF (ENSPCOG00000019223)	ZCCHC24 (ENSPCOG00000025341)	ANXA11 (ENSPCOG00000008738) #22	PLAC9 (ENSPCOG00000018708)	TMEM254 (ENSPCOG00000022717)	SFTPD (ENSPCOG00000020971)	ENSPCOG00000027954	MAT1A (ENSPCOG00000024259)	DYDC1 (ENSPCOG00000007484)	DYDC2 (ENSPCOG00000017581)	ENSPCOG00000027863	CFAP70 (ENSPCOG00000014993)	MRPS16 (ENSPCOG00000009898)	DNAJC9 (ENSPCOG00000021730)	FAM149B1 (ENSPCOG00000020320)	ECD (ENSPCOG00000020716)	ENSPCOG00000025022	NUDT13 (ENSPCOG00000019806)
Mouse lemur	MODERN SPECIES	6	ENSMICG00000035063	SAMD8 (ENSMICG00000037514)	VDAC2 (ENSMICG00000017815)	COMTD1 (ENSMICG00000046906)	ZNF503 (ENSMICG00000010900)	LRMDA (ENSMICG00000010906)	KCNMA1 (ENSMICG00000010913)	DLG5 (ENSMICG00000005916)	POLR3A (ENSMICG00000005937)	ENSMICG00000005951	ENSMICG00000027090	ZMIZ1 (ENSMICG00000038253)	ENSMICG00000042190	PPIF (ENSMICG00000007086)	ZCCHC24 (ENSMICG00000035887)	ANXA11 (ENSMICG00000038324) #22	PLAC9 (ENSMICG00000026495)	TMEM254 (ENSMICG00000007868)	SFTPD (ENSMICG00000030174)	ENSMICG00000030906	ENSMICG00000029014	MAT1A (ENSMICG00000007105)	DYDC1 (ENSMICG00000047425)	DYDC2 (ENSMICG00000035424)	ENSMICG00000007129	CFAP70 (ENSMICG00000013896)	MRPS16 (ENSMICG00000042573)	DNAJC9 (ENSMICG00000033859)	FAM149B1 (ENSMICG00000013882)	ECD (ENSMICG00000013871)	NUDT13 (ENSMICG00000013860)
Bushbaby	MODERN SPECIES	123	ENSOGAG00000029180	ENSOGAG00000031665	ZNF503 (ENSOGAG00000014304)	ENSOGAG00000026163	LRMDA (ENSOGAG00000015046)	KCNMA1 (ENSOGAG00000007370)	ENSOGAG00000027548	DLG5 (ENSOGAG00000016435)	ENSOGAG00000025837	POLR3A (ENSOGAG00000010995)	RPS24 (ENSOGAG00000011005)	ENSOGAG00000032884	ZMIZ1 (ENSOGAG00000005655)	PPIF (ENSOGAG00000003114)	ZCCHC24 (ENSOGAG00000001904)	ANXA11 (ENSOGAG00000003031) #22	PLAC9 (ENSOGAG00000003029)	ENSOGAG00000028898	ENSOGAG00000013675	ENSOGAG00000010834	ENSOGAG00000025282	SFTPD (ENSOGAG00000008476)	ENSOGAG00000004024	MAT1A (ENSOGAG00000004025)	DYDC1 (ENSOGAG00000004027)	DYDC2 (ENSOGAG00000004028)	PRXL2A (ENSOGAG00000013638)	TSPAN14 (ENSOGAG00000000957)	SH2D4B (ENSOGAG00000013668)	ENSOGAG00000033882	ENSOGAG00000026189
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	81	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.a	ENSGT00390000000153.l.b.c.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00520000058758
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000154628.B	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.a	ENSGT00390000000153.l.b.c.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000160190	ENSGT00940000162682.A.a.b	ENSGT00940000155540.b.b	ENSGT00950000182869.e.a.a	ENSGT00390000004409	ENSGT00390000014618.a	ENSGT00940000153289.a.a.a	ENSGT00940000154935	ENSGT00940000155303	ENSGT00930000151028	ENSGT00390000000153.l.a	ENSGT00390000000153.l.b.c.a	ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848
Elephant	MODERN SPECIES	3	DUSP29 (ENSLAFG00000021406)	ENSLAFG00000026669	SAMD8 (ENSLAFG00000013269)	VDAC2 (ENSLAFG00000009526)	COMTD1 (ENSLAFG00000009529)	ZNF503 (ENSLAFG00000031176)	LRMDA (ENSLAFG00000004894)	KCNMA1 (ENSLAFG00000003481)	ENSLAFG00000029514	DLG5 (ENSLAFG00000004091)	POLR3A (ENSLAFG00000016719)	RPS24 (ENSLAFG00000027878)	ZMIZ1 (ENSLAFG00000022250)	PPIF (ENSLAFG00000000379)	ZCCHC24 (ENSLAFG00000012854)	ANXA11 (ENSLAFG00000023249) #22	PLAC9 (ENSLAFG00000007184)	ENSLAFG00000026006	ENSLAFG00000029465	HNRNPF (ENSLAFG00000000424)	ENSLAFG00000006370	ZNF32 (ENSLAFG00000005025)	CXCL12 (ENSLAFG00000016167)	TMEM72 (ENSLAFG00000013102)	RASSF4 (ENSLAFG00000012041)	DEPP1 (ENSLAFG00000030292)	ZNF22 (ENSLAFG00000000878)	OR13A1 (ENSLAFG00000004785)	ALOX5 (ENSLAFG00000012188)	MARCHF8 (ENSLAFG00000010941)	ENSLAFG00000027002
Hyrax	MODERN SPECIES	6685																ANXA11 (ENSPCAG00000010823) #22	ENSPCAG00000010788
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES	773													ENSGT01030000234539.b.b.b	ENSGT00940000156008	ENSGT00390000008264	ENSGT00940000156914 #22	ENSGT00390000017848	ENSGT00390000016042	ENSGT00520000058758
Armadillo	DUPLICATION
Armadillo	MODERN SPECIES	4762													ZMIZ1 (ENSDNOG00000032247)	PPIF (ENSDNOG00000036607)	ZCCHC24 (ENSDNOG00000046513)	ENSDNOG00000031885 #22	PLAC9 (ENSDNOG00000044384)	TMEM254 (ENSDNOG00000044588)	ENSDNOG00000048270
Armadillo	MODERN SPECIES	4506		ENSDNOG00000013005	TEPP (ENSDNOG00000023995)	ZNF319 (ENSDNOG00000042239)	MMP15 (ENSDNOG00000049245)	CFAP20 (ENSDNOG00000007477)	CSNK2A2 (ENSDNOG00000040840)	CCDC113 (ENSDNOG00000047490)	PRSS54 (ENSDNOG00000015196)	GINS3 (ENSDNOG00000024402)	SETD6 (ENSDNOG00000013238)	CNOT1 (ENSDNOG00000013250)	ENSDNOG00000038963	SLC38A7 (ENSDNOG00000048905)	GOT2 (ENSDNOG00000004957)	ENSDNOG00000044937 #22	ENSDNOG00000019616	ENSDNOG00000040780	ENSDNOG00000034082	CDH8 (ENSDNOG00000010731)