Sauria	ANCESTRAL SPECIES	9		ENSGT00940000162486	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000163340	ENSGT00940000160680 #19	ENSGT00940000156768 #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00510000047718 #24	ENSGT00940000154360.A.b #25	ENSGT00940000156404 #26	ENSGT00390000018807 #29	ENSGT00940000159292 #30	ENSGT00390000001159 #31	ENSGT00940000155792 #32	ENSGT00470000042284 #33	ENSGT00940000160342	ENSGT00940000160749.b	ENSGT00940000158655	ENSGT00940000160898	ENSGT00510000047981.d	ENSGT00940000155297
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000162486	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000160680 #19	ENSGT00940000156768 #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00510000047718 #24	ENSGT00940000154360.A.b #25	ENSGT00940000156404 #26	ENSGT00390000018807 #29	ENSGT00940000159292 #30	ENSGT00390000001159 #31	ENSGT00940000155792 #32	ENSGT00470000042284 #33	ENSGT00940000160342	ENSGT00940000160749.b	ENSGT00940000158655	ENSGT00940000160898	ENSGT00510000047981.d	ENSGT00940000155297
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	60													ENSGT00940000160680 #19	ENSGT00940000156768 #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00510000047718 #24	ENSGT00940000154360.A.b #25	ENSGT00940000156404 #26	ENSGT00390000018807 #29	ENSGT00940000159292 #30	ENSGT00390000001159 #31	ENSGT00940000155792 #32	ENSGT00470000042284 #33	ENSGT00940000160342	ENSGT00940000160749.b	ENSGT00940000158655	ENSGT00940000160898	ENSGT00510000047981.d	ENSGT00940000155297
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	30													ETV5 (ENSCPRG00005005052) #19	DGKG (ENSCPRG00005005031) #20	ENSCPRG00005005020 #21	SUMO3 (ENSCPRG00005005013) #22	UBE2G2 (ENSCPRG00005005006) #23	TSPEAR (ENSCPRG00005004982) #24	LRRC3 (ENSCPRG00005004974) #25	ENSCPRG00005004955 #26	ENSCPRG00005004881 #27	ENSCPRG00005004842 #28	CFAP410 (ENSCPRG00005004834) #29	PFKL (ENSCPRG00005004812) #30	ENSCPRG00005004806 #31	DNAJB11 (ENSCPRG00005004800) #32	TBCCD1 (ENSCPRG00005004793) #33	CAB39 (ENSCPRG00005004789) #34	PER2 (ENSCPRG00005004773) #35	ENSCPRG00005004754 #36	PIK3CB (ENSCPRG00005004745) #37
Aves	ANCESTRAL SPECIES	49	ENSGT00940000153241.B	ENSGT01050000244976.b.b.b.a.a.b	ENSGT00940000160730	ENSGT00460000041648	ENSGT00940000159035	ENSGT00940000162473	ENSGT00940000158551.k.a	ENSGT00900000141059	ENSGT00940000155098	ENSGT00940000158642	ENSGT00940000153476.a	ENSGT01090000260100.B	ENSGT00940000160680 #19	ENSGT00940000156768 #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00510000047718 #24	ENSGT00940000154360.A.b #25	ENSGT00940000156404 #26	ENSGT00940000158447	ENSGT00990000204467	ENSGT00530000063000.a.b.b	ENSGT00940000154030.a.a	ENSGT00940000158159	ENSGT00550000075086	ENSGT00950000182923.B.a	ENSGT00950000182944.B.a	ENSGT01030000234590.A.a.a	ENSGT00390000018687	ENSGT00940000153680.a
African ostrich	DUPLICATION
African ostrich	MODERN SPECIES	313	RECQL5 (ENSSCUG00000002065)	ENSSCUG00000002055	ENSSCUG00000002042	LLGL2 (ENSSCUG00000002031)	ENSSCUG00000002025	ENSSCUG00000002022	ENSSCUG00000002020	ENSSCUG00000002019	TMEM94 (ENSSCUG00000002007)	GRB2 (ENSSCUG00000002002)	SLC25A19 (ENSSCUG00000001999)	MIF4GD (ENSSCUG00000001995)	MRPS7 (ENSSCUG00000001990)	GGA3 (ENSSCUG00000001983)	NUP85 (ENSSCUG00000001961)	ENSSCUG00000001956 #22	JPT1 (ENSSCUG00000001952)	NT5C (ENSSCUG00000001950)
African ostrich	MODERN SPECIES	280	AGXT (ENSSCUG00000006147)	MAB21L4 (ENSSCUG00000006165)	SNED1 (ENSSCUG00000006176)	PASK (ENSSCUG00000006194)	ENSSCUG00000006201	ANO7 (ENSSCUG00000006210)	HDLBP (ENSSCUG00000006230)	SEPTIN2 (ENSSCUG00000006244)	ENSSCUG00000006249	ENSSCUG00000006251	STK25 (ENSSCUG00000006258)	BOK (ENSSCUG00000006267)	ENSSCUG00000006269 #19	DGKG (ENSSCUG00000006276) #20	ENSSCUG00000006288 #21	ENSSCUG00000006292 #22	UBE2G2 (ENSSCUG00000006297) #23	TSPEAR (ENSSCUG00000006301) #24	LRRC3 (ENSSCUG00000006303) #25	TRPM2 (ENSSCUG00000006306) #26
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000153241.B	ENSGT01050000244976.b.b.b.a.a.b	ENSGT00940000160730	ENSGT00460000041648	ENSGT00940000159035	ENSGT00940000162473	ENSGT00940000158551.k.a	ENSGT00900000141059	ENSGT00940000155098	ENSGT00940000158642	ENSGT00940000153476.a	ENSGT01090000260100.B	ENSGT00940000160680 #19	ENSGT00940000156768 #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00510000047718 #24	ENSGT00940000154360.A.b #25	ENSGT00940000156404 #26	ENSGT00940000158447	ENSGT00990000204467	ENSGT00530000063000.a.b.b	ENSGT00940000154030.a.a	ENSGT00940000158159	ENSGT00550000075086	ENSGT00950000182923.B.a	ENSGT00950000182944.B.a	ENSGT01030000234590.A.a.a	ENSGT00390000018687	ENSGT00940000153680.a
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000156474	ENSGT00940000153241.B	ENSGT01050000244976.b.b.b.a.a.b	ENSGT00940000160730	ENSGT00460000041648	ENSGT00940000159035	ENSGT00940000162473	ENSGT00900000141059	ENSGT00940000155098	ENSGT00940000158642	ENSGT00940000153476.a	ENSGT01090000260100.B	ENSGT00940000160680 #19	ENSGT00940000156768 #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00510000047718 #24	ENSGT00940000154360.A.b #25	ENSGT00940000156404 #26	ENSGT00940000158447	ENSGT00990000204467	ENSGT00530000063000.a.b.b	ENSGT00940000154030.a.a	ENSGT00940000158159	ENSGT00550000075086	ENSGT00950000182923.B.a	ENSGT00950000182944.B.a	ENSGT01030000234590.A.a.a	ENSGT00390000018687	ENSGT00940000153680.a
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00930000151032.B	ENSGT00950000182906.a.a.b	ENSGT00390000004214	ENSGT00940000154272.B	ENSGT00940000158025.b	ENSGT00940000158256	ENSGT00390000016550	ENSGT00940000155738	ENSGT00550000074902	ENSGT00940000153432.A.a	ENSGT00390000014620	ENSGT00940000157333	ENSGT00390000000204	ENSGT00950000182895.a.a.a.b ##22	ENSGT00950000182895.a.a.b ##22	ENSGT00950000182895.a.b #22	ENSGT00940000162422	ENSGT00390000011596.b	ENSGT00940000164193	ENSGT00940000159666	ENSGT00940000158336	ENSGT00390000003582	ENSGT00940000163471	ENSGT00390000013268	ENSGT00390000018570.b	ENSGT00390000003070	ENSGT00940000160638	ENSGT00940000156691	ENSGT00390000017548.b	ENSGT00950000182990.b	ENSGT00390000013574
Passeriformes_d	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000170136	ENSGT00930000151032.B	ENSGT00950000182906.a.a.b	ENSGT00390000004214	ENSGT00940000154272.B	ENSGT00940000158256	ENSGT00390000016550	ENSGT00940000155738	ENSGT00550000074902	ENSGT00940000153432.A.a	ENSGT00390000014620	ENSGT00940000157333	ENSGT00390000000204	ENSGT00950000182895.a.a.a.b ##22	ENSGT00950000182895.a.a.b ##22	ENSGT00950000182895.a.b #22	ENSGT00940000162422	ENSGT00390000011596.b	ENSGT00940000164193	ENSGT00940000159666	ENSGT00940000158336	ENSGT00390000003582	ENSGT00940000163471	ENSGT00390000013268	ENSGT00390000018570.b	ENSGT00390000003070	ENSGT00940000160638	ENSGT00940000156691	ENSGT00390000017548.b	ENSGT00950000182990.b	ENSGT00390000013574
Flycatcher	MODERN SPECIES	8	SAP30BP (ENSFALG00000027577)	RECQL5 (ENSFALG00000001087)	ENSFALG00000001093	ENSFALG00000024516	LLGL2 (ENSFALG00000001115)	TSEN54 (ENSFALG00000001119)	ENSFALG00000015106	CASKIN2 (ENSFALG00000001125)	TMEM94 (ENSFALG00000001137)	GRB2 (ENSFALG00000023197)	SLC25A19 (ENSFALG00000023937)	MIF4GD (ENSFALG00000025719)	MRPS7 (ENSFALG00000001162)	GGA3 (ENSFALG00000001172)	NUP85 (ENSFALG00000001202)	ENSFALG00000028956 #22	JPT1 (ENSFALG00000001225)	NT5C (ENSFALG00000026242)	ENSFALG00000022944	SLC16A5 (ENSFALG00000001231)	KCTD2 (ENSFALG00000001233)	ATP5PD (ENSFALG00000001236)	ENSFALG00000001240	ENSFALG00000001244	CDR2L (ENSFALG00000001251)	HID1 (ENSFALG00000001252)	OTOP3 (ENSFALG00000001254)	OTOP2 (ENSFALG00000001257)	USH1G (ENSFALG00000001261)	FADS6 (ENSFALG00000001263)	ENSFALG00000001271
Great tit	MODERN SPECIES	8	SMIM5 (ENSPMJG00000001247)	RECQL5 (ENSPMJG00000001223)	ENSPMJG00000001212	ENSPMJG00000000845	LLGL2 (ENSPMJG00000000795)	TSEN54 (ENSPMJG00000000766)	MCHR1 (ENSPMJG00000000758)	ENSPMJG00000000725	TMEM94 (ENSPMJG00000000598)	GRB2 (ENSPMJG00000000573)	SLC25A19 (ENSPMJG00000000566)	MIF4GD (ENSPMJG00000000560)	MRPS7 (ENSPMJG00000000556)	GGA3 (ENSPMJG00000000519)	NUP85 (ENSPMJG00000000448)	ENSPMJG00000000437 #22	JPT1 (ENSPMJG00000000431)	NT5C (ENSPMJG00000000423)	SLC16A5 (ENSPMJG00000000412)	KCTD2 (ENSPMJG00000000404)	ATP5PD (ENSPMJG00000000391)	MRPL58 (ENSPMJG00000000387)	CDR2L (ENSPMJG00000000365)	HID1 (ENSPMJG00000000337)	OTOP3 (ENSPMJG00000000258)	OTOP2 (ENSPMJG00000000235)	USH1G (ENSPMJG00000000224)	FDXR (ENSPMJG00000000162)	GRIN2C (ENSPMJG00000000130)	TMEM104 (ENSPMJG00000000123)	NAT9 (ENSPMJG00000000107)
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000156474	ENSGT00940000153241.B	ENSGT01050000244976.b.b.b.a.a.b	ENSGT00940000160730	ENSGT00460000041648	ENSGT00940000159035	ENSGT00940000162473	ENSGT00900000141059	ENSGT00940000155098	ENSGT00940000158642	ENSGT00940000153476.a	ENSGT01090000260100.B	ENSGT00940000160680 #19	ENSGT00940000156768 #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00510000047718 #24	ENSGT00940000154360.A.b #25	ENSGT00940000156404 #26	ENSGT00940000158447	ENSGT00530000063000.a.b.b	ENSGT00940000154030.a.a	ENSGT00940000158159	ENSGT00550000075086	ENSGT00950000182923.B.a	ENSGT00950000182944.B.a	ENSGT01030000234590.A.a.a	ENSGT00390000018687	ENSGT00940000153680.a	ENSGT00390000011073
Kakapo	MODERN SPECIES	25	ILKAP (ENSSHBG00005018391)	KIF1A (ENSSHBG00005018396)	AGXT (ENSSHBG00005018413)	SNED1 (ENSSHBG00005018420)	MTERF4 (ENSSHBG00005018434)	PASK (ENSSHBG00005018439)	ENSSHBG00005018445	HDLBP (ENSSHBG00005018451)	SEPTIN2 (ENSSHBG00005018455)	FARP2 (ENSSHBG00005018492)	STK25 (ENSSHBG00005019215)	BOK (ENSSHBG00005019219)	ETV5 (ENSSHBG00005019229) #19	DGKG (ENSSHBG00005019268) #20	ENSSHBG00005019709 #21	SUMO3 (ENSSHBG00005019710) #22	UBE2G2 (ENSSHBG00005019713) #23	TSPEAR (ENSSHBG00005019721) #24	LRRC3 (ENSSHBG00005019730) #25	ENSSHBG00005019732 #26	TRPM2 (ENSSHBG00005019743) #26	THAP4 (ENSSHBG00005019750)	ATG4B (ENSSHBG00005019753)	DTYMK (ENSSHBG00005019758)	ING5 (ENSSHBG00005019761)	D2HGDH (ENSSHBG00005019764)	GAL3ST2 (ENSSHBG00005019768)	NEU4 (ENSSHBG00005019771)	TM4SF19 (ENSSHBG00005019776)	UBXN7 (ENSSHBG00005000533)	RNF168 (ENSSHBG00005000535)
Golden eagle	MODERN SPECIES	1	KIF1A (ENSACCG00020006922)	AGXT (ENSACCG00020006731)	MAB21L4 (ENSACCG00020006709)	SNED1 (ENSACCG00020006638)	MTERF4 (ENSACCG00020006578)	PASK (ENSACCG00020006533)	ENSACCG00020006487	HDLBP (ENSACCG00020006434)	SEPTIN2 (ENSACCG00020006400)	FARP2 (ENSACCG00020006362)	STK25 (ENSACCG00020006340)	BOK (ENSACCG00020006323)	ETV5 (ENSACCG00020006267) #19	DGKG (ENSACCG00020006205) #20	ENSACCG00020006180 #21	SUMO3 (ENSACCG00020006165) #22	UBE2G2 (ENSACCG00020006144) #23	TSPEAR (ENSACCG00020006103) #24	LRRC3 (ENSACCG00020006078) #25	TRPM2 (ENSACCG00020006040) #26	THAP4 (ENSACCG00020006021)	ATG4B (ENSACCG00020005995)	DTYMK (ENSACCG00020005969)	ING5 (ENSACCG00020005952)	D2HGDH (ENSACCG00020005925)	GAL3ST2 (ENSACCG00020005907)	NEU4 (ENSACCG00020005884)	TM4SF19 (ENSACCG00020005863)	UBXN7 (ENSACCG00020005823)	RNF168 (ENSACCG00020005790)	WDR53 (ENSACCG00020005777)
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000153241.B	ENSGT01050000244976.b.b.b.a.a.b	ENSGT00940000160730	ENSGT00460000041648	ENSGT00940000159035	ENSGT00940000162473	ENSGT00940000158551.k.a	ENSGT00900000141059	ENSGT00940000155098	ENSGT00940000158642	ENSGT00940000153476.a	ENSGT01090000260100.B	ENSGT00940000160680 #19	ENSGT00940000156768 #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00510000047718 #24	ENSGT00940000156404 #26
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000153241.B	ENSGT01050000244976.b.b.b.a.a.b	ENSGT00940000160730	ENSGT00460000041648	ENSGT00940000159035	ENSGT00940000162473	ENSGT00940000158551.k.a	ENSGT00900000141059	ENSGT00940000155098	ENSGT00940000158642	ENSGT00940000153476.a	ENSGT01090000260100.B	ENSGT00940000160680 #19	ENSGT00940000156768 #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00510000047718 #24	ENSGT00940000156404 #26	ENSGT00390000013989.a	ENSGT00390000005140.b.b	ENSGT00940000160622	ENSGT00530000063529.C	ENSGT01030000235073	ENSGT00940000154345.b	ENSGT00940000154345.a	ENSGT00940000156789	ENSGT00530000063947.B	ENSGT00390000013063	ENSGT00940000157650.z.b	ENSGT00940000157650.z.a
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	71	AGXT (ENSABRG00000019657)	MAB21L4 (ENSABRG00000019646)	SNED1 (ENSABRG00000019626)	MTERF4 (ENSABRG00000019613)	PASK (ENSABRG00000019573)	ENSABRG00000019504	ANO7 (ENSABRG00000019474)	HDLBP (ENSABRG00000018659)	SEPTIN2 (ENSABRG00000018574)	FARP2 (ENSABRG00000017878)	STK25 (ENSABRG00000017819)	BOK (ENSABRG00000017818)	ETV5 (ENSABRG00000017815) #19	DGKG (ENSABRG00000017599) #20	ENSABRG00000017558 #21	SUMO3 (ENSABRG00000017547) #22	UBE2G2 (ENSABRG00000017543) #23	TSPEAR (ENSABRG00000017518) #24	TRPM2 (ENSABRG00000017270) #26	PLEKHB2 (ENSABRG00000017241)	FAM168B (ENSABRG00000017240)	ENSABRG00000017217	AMER3 (ENSABRG00000017208)	ENSABRG00000017205	KLHL6 (ENSABRG00000017201)	KLHL24 (ENSABRG00000017197)	YEATS2 (ENSABRG00000017179)	MAP6D1 (ENSABRG00000017173)	PARL (ENSABRG00000017161)	ENSABRG00000017158	DUSP28 (ENSABRG00000017152)
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000156474	ENSGT00940000153241.B	ENSGT01050000244976.b.b.b.a.a.b	ENSGT00940000160730	ENSGT00460000041648	ENSGT00940000159035	ENSGT00940000162473	ENSGT00900000141059	ENSGT00940000155098	ENSGT00940000158642	ENSGT00940000153476.a	ENSGT01090000260100.B	ENSGT00940000160680 #19	ENSGT00940000156768 #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00510000047718 #24	ENSGT00940000156404 #26	ENSGT00950000185905	ENSGT00390000011600	ENSGT00390000000076	ENSGT00940000159828	ENSGT00940000157053.m	ENSGT01040000240444.A.b.a.b.fb.b	ENSGT01040000240444.A.b.a.b.fb.a	ENSGT01040000240444.A.b.a.a	ENSGT01040000240444.A.b.b	ENSGT00950000183115.a	ENSGT00390000004360.a.b.b #34	ENSGT00940000164578
Japanese quail	MODERN SPECIES	27	ENSCJPG00005001707	KIF1A (ENSCJPG00005001732)	AGXT (ENSCJPG00005002074)	MAB21L4 (ENSCJPG00005002089)	SNED1 (ENSCJPG00005002116)	PASK (ENSCJPG00005002204)	ENSCJPG00005002206	HDLBP (ENSCJPG00005002244)	SEPTIN2 (ENSCJPG00005004473)	FARP2 (ENSCJPG00005004476)	STK25 (ENSCJPG00005005276)	BOK (ENSCJPG00005005445)	ETV5 (ENSCJPG00005005451) #19	DGKG (ENSCJPG00005005455) #20	ENSCJPG00005005475 #21	SUMO3 (ENSCJPG00005005478) #22	UBE2G2 (ENSCJPG00005005480) #23	TSPEAR (ENSCJPG00005005484) #24	TRPM2 (ENSCJPG00005005486) #26	ENSCJPG00005005506	OTOS (ENSCJPG00005005513)	COPS9 (ENSCJPG00005005516)	ADIPOQ (ENSCJPG00005005522)	ST6GAL1 (ENSCJPG00005005531)	ENSCJPG00005005538	ENSCJPG00005005540	GPR55 (ENSCJPG00005005542)	ENSCJPG00005005545	ITM2C (ENSCJPG00005005549)	CAB39 (ENSCJPG00005005578) #34	ENSCJPG00005005581
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000156474	ENSGT00940000153241.B	ENSGT01050000244976.b.b.b.a.a.b	ENSGT00940000160730	ENSGT00460000041648	ENSGT00940000159035	ENSGT00940000158551.k.b	ENSGT00900000141059	ENSGT00940000155098	ENSGT00940000158642	ENSGT00940000153476.a	ENSGT01090000260100.B	ENSGT00940000160680 #19	ENSGT00940000156768 #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00510000047718 #24	ENSGT00940000156404 #26	ENSGT00950000185905	ENSGT00390000011600	ENSGT00390000000076	ENSGT00940000159828	ENSGT00940000157053.m	ENSGT01040000240444.A.b.a.b.fb.b	ENSGT01040000240444.A.b.a.b.fb.a	ENSGT01040000240444.A.b.a.a	ENSGT01040000240444.A.b.b	ENSGT00950000183115.a	ENSGT00390000004360.a.b.b #34	ENSGT00940000164578
Chicken	DUPLICATION
Chicken	MODERN SPECIES	9					LLGL2 (ENSGALG00010030108)	TSEN54 (ENSGALG00010029725)	MCHR1 (ENSGALG00010029714)	CASKIN2 (ENSGALG00010029711)	TMEM94 (ENSGALG00010029708)	GRB2 (ENSGALG00010029705)	SLC25A19 (ENSGALG00010029704)	MIF4GD (ENSGALG00010029703)	MRPS7 (ENSGALG00010029701)	GGA3 (ENSGALG00010029700)	NUP85 (ENSGALG00010029698)	SUMO2 (ENSGALG00010029696) #22	ARMC7 (ENSGALG00010029694)	HN1 (ENSGALG00010029693)	SLC16A5 (ENSGALG00010029687)	KCTD2 (ENSGALG00010029686)	ATP5H (ENSGALG00010029685)	ENSGALG00010029684	MRPL58 (ENSGALG00010029683)	CDR2L (ENSGALG00010029682)	OTOP3 (ENSGALG00010029680)	OTOP2 (ENSGALG00010029679)	USH1G (ENSGALG00010029678)	FADS6 (ENSGALG00010029676)	FDXR (ENSGALG00010029674)	GRIN2C (ENSGALG00010029671)	HID1 (ENSGALG00010029669)
Chicken	MODERN SPECIES	38	KIF1A (ENSGALG00010024946)	AGXT (ENSGALG00010024959)	MAB21L4 (ENSGALG00010024962)	SNED1 (ENSGALG00010025389)	MTERF4 (ENSGALG00010025403)	PASK (ENSGALG00010023299)	PPP1R7 (ENSGALG00010023332)	HDLBP (ENSGALG00010023338)	SEPTIN2 (ENSGALG00010023354)	FARP2 (ENSGALG00010023388)	STK25 (ENSGALG00010023442)	BOK (ENSGALG00010023473)	ETV5 (ENSGALG00010023489) #19	DGKG (ENSGALG00010023519) #20	ENSGALG00010025508 #21	SUMO3 (ENSGALG00010025522) #22	UBE2G2 (ENSGALG00010025553) #23	TSPEAR (ENSGALG00010025563) #24	TRPM2 (ENSGALG00010025575) #26	ENSGALG00010025581	OTOS (ENSGALG00010025591)	COPS9 (ENSGALG00010025599)	ADIPOQ (ENSGALG00010025618)	ST6GAL1 (ENSGALG00010025629)	ENSGALG00010025657	ENSGALG00010025648	GPR55 (ENSGALG00010025664)	ENSGALG00010025692	ITM2C (ENSGALG00010024964)	CAB39 (ENSGALG00010024970) #34	HES6 (ENSGALG00010024997)
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000162486	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000160680 #19	ENSGT00940000156768 #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00510000047718 #24	ENSGT00940000154360.A.b #25	ENSGT00940000156404 #26	ENSGT00390000018807 #29	ENSGT00940000159292 #30	ENSGT00390000001159 #31	ENSGT00940000155792 #32	ENSGT00470000042284 #33	ENSGT00940000160342	ENSGT00940000160749.b	ENSGT00940000158655	ENSGT00940000160898	ENSGT00510000047981.d	ENSGT00940000155297
Chinese turtle	MODERN SPECIES	1233														DGKG (ENSPSIG00000015834) #20	ENSPSIG00000015931 #21	SUMO3 (ENSPSIG00000016097) #22	UBE2G2 (ENSPSIG00000016313) #23	TSPEAR (ENSPSIG00000016342) #24	LRRC3 (ENSPSIG00000006502) #25
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000162486	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000160680 #19	ENSGT00940000156768 #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00510000047718 #24	ENSGT00940000154360.A.b #25	ENSGT00940000156404 #26	ENSGT00390000018807 #29	ENSGT00940000159292 #30	ENSGT00390000001159 #31	ENSGT00940000155792 #32	ENSGT00470000042284 #33	ENSGT00940000160342	ENSGT00940000160749.b	ENSGT00940000158655	ENSGT00940000160898	ENSGT00510000047981.d.d	ENSGT00510000047981.d.c
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000162486	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000160680 #19	ENSGT00940000156768 #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00510000047718 #24	ENSGT00940000154360.A.b #25	ENSGT00940000156404 #26	ENSGT00390000018807 #29	ENSGT00940000159292 #30	ENSGT00390000001159 #31	ENSGT00940000155792 #32	ENSGT00470000042284 #33	ENSGT00940000160342	ENSGT00940000160749.b	ENSGT00940000158655	ENSGT00940000160898	ENSGT00510000047981.d.c	ENSGT00940000155297.a
painted turtle	MODERN SPECIES	776																SUMO3 (ENSCPBG00000000990) #22	UBE2G2 (ENSCPBG00000000961) #23	TSPEAR (ENSCPBG00000000821) #24	LRRC3 (ENSCPBG00000000788) #25	TRPM2 (ENSCPBG00000000683) #26	CFAP410 (ENSCPBG00000000638) #29	PFKL (ENSCPBG00000000606) #30	ENSCPBG00000000582 #31	DNAJB11 (ENSCPBG00000000567) #32	TBCCD1 (ENSCPBG00000000555) #33	ENSCPBG00000000543	CRYGS (ENSCPBG00000000526)	RNF7 (ENSCPBG00000000507)	SOX14 (ENSCPBG00000000488)	CLDN18 (ENSCPBG00000000452)	DZIP1L (ENSCPBG00000000430)
Three-toed box turtle	DUPLICATION
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	384												ENSTMTG00000004920	ETV5 (ENSTMTG00000004932) #19	DGKG (ENSTMTG00000005057) #20	ENSTMTG00000005986 #21	ENSTMTG00000006007 #22	UBE2G2 (ENSTMTG00000006035) #23	TSPEAR (ENSTMTG00000006080) #24	LRRC3 (ENSTMTG00000006208) #25	TRPM2 (ENSTMTG00000006442) #26	CFAP410 (ENSTMTG00000009210) #29	PFKL (ENSTMTG00000009232) #30	PROCR (ENSTMTG00000009275) #31	DNAJB11 (ENSTMTG00000009281) #32	TBCCD1 (ENSTMTG00000009321) #33	CRYGS (ENSTMTG00000009357)	SOX14 (ENSTMTG00000009366)	CLDN18 (ENSTMTG00000009380)	ENSTMTG00000009397	ENSTMTG00000009413	ENSTMTG00000009424
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	90	SMIM5 (ENSTMTG00000015772)	RECQL5 (ENSTMTG00000015741)	ENSTMTG00000015710	ENSTMTG00000015653	LLGL2 (ENSTMTG00000015592)	TSEN54 (ENSTMTG00000015553)	ENSTMTG00000015541	ENSTMTG00000015533	TMEM94 (ENSTMTG00000015482)	GRB2 (ENSTMTG00000015461)	SLC25A19 (ENSTMTG00000015450)	MIF4GD (ENSTMTG00000015427)	MRPS7 (ENSTMTG00000015414)	GGA3 (ENSTMTG00000015393)	NUP85 (ENSTMTG00000015363)	ENSTMTG00000015348 #22	JPT1 (ENSTMTG00000015295)	NT5C (ENSTMTG00000015284)	ENSTMTG00000015278	SLC16A5 (ENSTMTG00000015267)	ENSTMTG00000015211	KCTD2 (ENSTMTG00000015200)	ATP5PD (ENSTMTG00000015190)	MRPL58 (ENSTMTG00000015181)	CDR2L (ENSTMTG00000015174)	HID1 (ENSTMTG00000015149)	OTOP3 (ENSTMTG00000015110)	OTOP2 (ENSTMTG00000015096)	USH1G (ENSTMTG00000015083)	FADS6 (ENSTMTG00000015037)	ENSTMTG00000015000
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00510000047481	ENSGT00390000003033	ENSGT00940000162486	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000160680 #19	ENSGT00940000156768 #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00510000047718 #24	ENSGT00940000154360.A.b #25	ENSGT00940000156404 #26	ENSGT00390000018807 #29	ENSGT00940000159292 #30	ENSGT00390000001159 #31	ENSGT00940000155792 #32	ENSGT00470000042284 #33	ENSGT00940000160342	ENSGT00940000160749.b	ENSGT00940000158655	ENSGT00940000160898	ENSGT00510000047981.d.d	ENSGT00510000047981.d.c
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	247												TRA2B (ENSCABG00000021776)	ETV5 (ENSCABG00000021753) #19	DGKG (ENSCABG00000021705) #20	ENSCABG00000021701 #21	SUMO3 (ENSCABG00000021700) #22	UBE2G2 (ENSCABG00000021699) #23	TSPEAR (ENSCABG00000021695) #24	LRRC3 (ENSCABG00000021692) #25	ENSCABG00000021687 #26	ENSCABG00000021624 #26	ENSCABG00000021610 #26	CFAP410 (ENSCABG00000021604) #29	PFKL (ENSCABG00000020197) #30	ENSCABG00000020025 #31	DNAJB11 (ENSCABG00000019987) #32	TBCCD1 (ENSCABG00000019974) #33	CRYGS (ENSCABG00000019935)	ENSCABG00000019930	SOX14 (ENSCABG00000019927)	CLDN18 (ENSCABG00000019924)
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	23	ENSGEVG00005017215	DBR1 (ENSGEVG00005017237)	ARMC8 (ENSGEVG00005017273)	VPS8 (ENSGEVG00005017396)	C3orf70 (ENSGEVG00005017547)	EHHADH (ENSGEVG00005017560)	MAP3K13 (ENSGEVG00005017580)	TMEM41A (ENSGEVG00005017612)	LIPH (ENSGEVG00005017629)	SENP2 (ENSGEVG00005017716)	IGF2BP2 (ENSGEVG00005017746)	TRA2B (ENSGEVG00005017784)	ETV5 (ENSGEVG00005017806) #19	DGKG (ENSGEVG00005018029) #20	ENSGEVG00005019001 #21	SUMO3 (ENSGEVG00005019014) #22	UBE2G2 (ENSGEVG00005019022) #23	TSPEAR (ENSGEVG00005019038) #24	LRRC3 (ENSGEVG00005019061) #25	TRPM2 (ENSGEVG00005019195) #26	CFAP410 (ENSGEVG00005019553) #29	PFKL (ENSGEVG00005019748) #30	PROCR (ENSGEVG00005020012) #31	DNAJB11 (ENSGEVG00005020016) #32	TBCCD1 (ENSGEVG00005020024) #33	CRYGS (ENSGEVG00005020032)	SOX14 (ENSGEVG00005020036)	CLDN18 (ENSGEVG00005020040)	ENSGEVG00005020044	ENSGEVG00005020053	ENSGEVG00005020057
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	48	ENSGT00940000162486	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000163412	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000156285	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000163340	ENSGT00940000160680 #19	ENSGT00940000156768 #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00510000047718 #24	ENSGT00940000154360.A.b #25	ENSGT00940000156404 #26	ENSGT00390000018807 #29	ENSGT00940000159292 #30	ENSGT00390000001159 #31	ENSGT00940000155792 #32	ENSGT00470000042284 #33	ENSGT00940000160342	ENSGT00940000160749.b	ENSGT00940000158655	ENSGT00940000160898	ENSGT00510000047981.d	ENSGT00940000155297
tuatara	DUPLICATION
tuatara	MODERN SPECIES	1429	RECQL5 (ENSSPUG00000008872)	ENSSPUG00000008902	ENSSPUG00000008907	ENSSPUG00000008914	ENSSPUG00000008936	LLGL2 (ENSSPUG00000008946)	TSEN54 (ENSSPUG00000008988)	ENSSPUG00000009000	ENSSPUG00000009007	GRB2 (ENSSPUG00000009161)	SLC25A19 (ENSSPUG00000009266)	MIF4GD (ENSSPUG00000009304)	MRPS7 (ENSSPUG00000009313)	GGA3 (ENSSPUG00000009334)	NUP85 (ENSSPUG00000009393)	ENSSPUG00000009419 #22	ENSSPUG00000009437	NT5C (ENSSPUG00000009455)	ENSSPUG00000009466	SLC16A5 (ENSSPUG00000009476)	ENSSPUG00000009502	ENSSPUG00000009537	ATP5PD (ENSSPUG00000009550)	MRPL58 (ENSSPUG00000009563)	CDR2L (ENSSPUG00000009573)	HID1 (ENSSPUG00000009600)	USH1G (ENSSPUG00000009717)	FADS6 (ENSSPUG00000009733)	ENSSPUG00000009776	GRIN2C (ENSSPUG00000009945)	TMEM104 (ENSSPUG00000009993)
tuatara	MODERN SPECIES	1136														ENSSPUG00000014259 #20	ENSSPUG00000014247 #21	ENSSPUG00000014238 #22	UBE2G2 (ENSSPUG00000014223) #23	TSPEAR (ENSSPUG00000014192) #24	LRRC3 (ENSSPUG00000014179) #25	ENSSPUG00000014147 #26	ENSSPUG00000014099 #26
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00950000182972.a.a.a.b	ENSGT00940000157741	ENSGT00940000153249.b.d	ENSGT00940000162486	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000163412	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000160680 #19	ENSGT00940000156768 #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00510000047718 #24	ENSGT00940000154360.A.b #25	ENSGT00940000156404 #26	ENSGT00390000018807 #29	ENSGT00940000159292 #30	ENSGT00390000001159 #31	ENSGT00940000155792 #32	ENSGT00470000042284 #33	ENSGT00940000160342	ENSGT00940000160749.b	ENSGT00940000158655	ENSGT00940000160898	ENSGT00510000047981.d	ENSGT00940000155297
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00950000182972.a.a.a.b	ENSGT00940000157741	ENSGT00940000153249.b.d	ENSGT00940000162486	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000163412	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000160680 #19	ENSGT00940000156768 #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00510000047718 #24	ENSGT00940000154360.A.b #25	ENSGT00940000156404 #26	ENSGT00390000018807 #29	ENSGT00940000159292 #30	ENSGT00390000001159 #31	ENSGT00940000155792 #32	ENSGT00470000042284 #33	ENSGT00940000160342	ENSGT00940000160749.b	ENSGT00940000158655	ENSGT00940000160898	ENSGT00510000047981.d	ENSGT00940000155297
Lizard	DUPLICATION
Lizard	MODERN SPECIES	1	ENSACAG00000039759	ENSACAG00000036517	ENSACAG00000006818	LLGL2 (ENSACAG00000006728)	TSEN54 (ENSACAG00000006714)	ENSACAG00000036665	CASKIN2 (ENSACAG00000006671)	TMEM94 (ENSACAG00000006582)	ENSACAG00000041425	GRB2 (ENSACAG00000006524)	SLC25A19 (ENSACAG00000006493)	MIF4GD (ENSACAG00000006463)	MRPS7 (ENSACAG00000006441)	GGA3 (ENSACAG00000006288)	NUP85 (ENSACAG00000006230)	ENSACAG00000006212 #22	JPT1 (ENSACAG00000006208)	NT5C (ENSACAG00000028622)	ENSACAG00000006197	SLC16A5 (ENSACAG00000006160)	ENSACAG00000006147	KCTD2 (ENSACAG00000006112)	ATP5PD (ENSACAG00000006092)	ENSACAG00000044373	ENSACAG00000039326	MRPL58 (ENSACAG00000006044)	CDR2L (ENSACAG00000005998)	HID1 (ENSACAG00000005900)	OTOP3 (ENSACAG00000005877)	ENSACAG00000038598	OTOP2 (ENSACAG00000005863)
Lizard	MODERN SPECIES	2	ENSACAG00000007593	ENSACAG00000007713	VPS8 (ENSACAG00000007715)	C3orf70 (ENSACAG00000034562)	ENSACAG00000043530	EHHADH (ENSACAG00000007778)	MAP3K13 (ENSACAG00000007817)	ENSACAG00000007904	SENP2 (ENSACAG00000007929)	IGF2BP2 (ENSACAG00000007995)	TRA2B (ENSACAG00000044734)	ETV5 (ENSACAG00000008128) #19	ENSACAG00000042474	DGKG (ENSACAG00000008171) #20	ENSACAG00000008261 #21	SUMO3 (ENSACAG00000008281) #22	UBE2G2 (ENSACAG00000040929) #23	ENSACAG00000008283 #23	TSPEAR (ENSACAG00000008325) #24	LRRC3 (ENSACAG00000008369) #25	TRPM2 (ENSACAG00000008372) #26	CFAP410 (ENSACAG00000008678) #29	PFKL (ENSACAG00000008680) #30	ENSACAG00000009038 #31	dnajb11 (ENSACAG00000036360) #32	ENSACAG00000009103 #33	CRYGS (ENSACAG00000009129)	SOX14 (ENSACAG00000009132)	CLDN18 (ENSACAG00000009163)	DZIP1L (ENSACAG00000009191)	A4GNT (ENSACAG00000009237)
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157741	ENSGT00940000153249.b.d	ENSGT00940000162486	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000163412	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000160680 #19	ENSGT00940000156768.s.b #20	ENSGT00940000156768.s.a #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00510000047718 #24	ENSGT00940000154360.A.b #25	ENSGT00940000156404 #26	ENSGT00390000018807 #29	ENSGT00940000159292 #30	ENSGT00390000001159 #31	ENSGT00940000155792 #32	ENSGT00470000042284 #33	ENSGT00940000160342	ENSGT00940000160749.b	ENSGT00940000158655	ENSGT00940000160898	ENSGT00510000047981.d	ENSGT00940000155297
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000182972.a.a.a.b	ENSGT00940000157741	ENSGT00940000153249.b.d	ENSGT00940000162486	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000163412	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000160680 #19	ENSGT00940000156768.s.a #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00510000047718.a #24	ENSGT00940000154360.A.b #25	ENSGT00940000156404 #26	ENSGT00390000018807 #29	ENSGT00940000159292 #30	ENSGT00390000001159 #31	ENSGT00940000155792 #32	ENSGT00470000042284 #33	ENSGT00940000160342	ENSGT00940000160749.b	ENSGT00940000158655	ENSGT00940000160898	ENSGT00510000047981.d	ENSGT00940000155297
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	422															ENSLLTG00000001032 #21	SUMO3 (ENSLLTG00000001044) #22	ENSLLTG00000001054	ENSLLTG00000001061
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00950000182972.a.a.a.b	ENSGT00940000157741	ENSGT00940000153249.b.d	ENSGT00940000162486	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000163412	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000160680 #19	ENSGT00940000156768.s.a #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00510000047718.a #24	ENSGT00940000154360.A.b #25	ENSGT00940000156404 #26	ENSGT00390000018807 #29	ENSGT00940000159292 #30	ENSGT00390000001159 #31	ENSGT00940000155792 #32	ENSGT00470000042284 #33	ENSGT00940000160342	ENSGT00940000160749.b	ENSGT00940000158655	ENSGT00940000160898	ENSGT00510000047981.d	ENSGT00940000155297
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES		MSL2 (ENSNSUG00000013037)	STAG1 (ENSNSUG00000013039)	PCCB (ENSNSUG00000013110)	SLC35G2 (ENSNSUG00000013156)	VPS8 (ENSNSUG00000013157)	C3orf70 (ENSNSUG00000013159)	EHHADH (ENSNSUG00000013160)	MAP3K13 (ENSNSUG00000013161)	ENSNSUG00000013177	SENP2 (ENSNSUG00000013178)	IGF2BP2 (ENSNSUG00000013179)	TRA2B (ENSNSUG00000013180)	ETV5 (ENSNSUG00000013185) #19	DGKG (ENSNSUG00000013210) #20	ENSNSUG00000013211 #21	SUMO3 (ENSNSUG00000013212) #22	UBE2G2 (ENSNSUG00000013213) #23	TSPEAR (ENSNSUG00000013214) #24	LRRC3 (ENSNSUG00000013215) #25	ENSNSUG00000013216 #26	ENSNSUG00000013217 #26	CFAP410 (ENSNSUG00000013218) #29	PFKL (ENSNSUG00000013221) #30	ENSNSUG00000013416 #31	DNAJB11 (ENSNSUG00000013417) #32	TBCCD1 (ENSNSUG00000013419) #33	CRYGS (ENSNSUG00000013420)	SOX14 (ENSNSUG00000013421)	CLDN18 (ENSNSUG00000013423)	ENSNSUG00000013425	A4GNT (ENSNSUG00000013427)
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	16	STAG1 (ENSPTXG00000018621)	PCCB (ENSPTXG00000018623)	SLC35G2 (ENSPTXG00000018625)	ENSPTXG00000018627	VPS8 (ENSPTXG00000018632)	C3orf70 (ENSPTXG00000018811)	EHHADH (ENSPTXG00000018812)	MAP3K13 (ENSPTXG00000018813)	ENSPTXG00000018814	SENP2 (ENSPTXG00000018815)	IGF2BP2 (ENSPTXG00000018816)	TRA2B (ENSPTXG00000018817)	ETV5 (ENSPTXG00000018818) #19	DGKG (ENSPTXG00000018819) #20	ENSPTXG00000018820 #21	SUMO3 (ENSPTXG00000018821) #22	UBE2G2 (ENSPTXG00000018822) #23	TSPEAR (ENSPTXG00000018823) #24	LRRC3 (ENSPTXG00000018824) #25	TRPM2 (ENSPTXG00000018825) #26	CFAP410 (ENSPTXG00000018826) #29	PFKL (ENSPTXG00000018827) #30	ENSPTXG00000018831 #31	DNAJB11 (ENSPTXG00000018833) #32	TBCCD1 (ENSPTXG00000018835) #33	CRYGS (ENSPTXG00000018837)	SOX14 (ENSPTXG00000018839)	CLDN18 (ENSPTXG00000018840)	ENSPTXG00000018842	A4GNT (ENSPTXG00000018844)	EPHB1 (ENSPTXG00000018847)
Laterata	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000157741	ENSGT00940000153249.b.d	ENSGT00940000162486	ENSGT00390000010672	ENSGT00390000006618	ENSGT00940000157516	ENSGT00940000158216	ENSGT00940000162528	ENSGT00940000163412	ENSGT00940000154951	ENSGT00940000154913	ENSGT00950000183009	ENSGT00940000160680 #19	ENSGT00940000156768 #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00510000047718 #24	ENSGT00940000154360.A.b #25	ENSGT00940000156404 #26	ENSGT00390000018807 #29	ENSGT00940000159292 #30	ENSGT00390000001159 #31	ENSGT00940000155792 #32	ENSGT00470000042284 #33	ENSGT00940000160342	ENSGT00940000160749.b	ENSGT00940000158655	ENSGT00940000160898	ENSGT00510000047981.d	ENSGT00940000155297
Common wall lizard	MODERN SPECIES	10	ITGB4 (ENSPMRG00000003570)	SAP30BP (ENSPMRG00000003194)	RECQL5 (ENSPMRG00000003180)	ENSPMRG00000003157	LLGL2 (ENSPMRG00000002877)	TSEN54 (ENSPMRG00000002771)	ENSPMRG00000002756	ENSPMRG00000002745	TMEM94 (ENSPMRG00000015187)	GRB2 (ENSPMRG00000015175)	SLC25A19 (ENSPMRG00000015170)	MIF4GD (ENSPMRG00000015162)	MRPS7 (ENSPMRG00000015158)	GGA3 (ENSPMRG00000014536)	NUP85 (ENSPMRG00000014342)	ENSPMRG00000014280 #22	NT5C (ENSPMRG00000014259)	ENSPMRG00000014252	SLC16A5 (ENSPMRG00000014242)	ENSPMRG00000014219	ENSPMRG00000014213	ATP5PD (ENSPMRG00000014204)	ENSPMRG00000014198	CDR2L (ENSPMRG00000014153)	HID1 (ENSPMRG00000014039)	OTOP3 (ENSPMRG00000013982)	OTOP2 (ENSPMRG00000013965)	USH1G (ENSPMRG00000013957)	FADS6 (ENSPMRG00000013951)	ENSPMRG00000013934	GRIN2C (ENSPMRG00000013920)
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	19	STAG1 (ENSSMRG00000022083)	PCCB (ENSSMRG00000022084)	SLC35G2 (ENSSMRG00000022085)	ENSSMRG00000022086	VPS8 (ENSSMRG00000022087)	C3orf70 (ENSSMRG00000022089)	EHHADH (ENSSMRG00000022090)	MAP3K13 (ENSSMRG00000022091)	TMEM41A (ENSSMRG00000022092)	SENP2 (ENSSMRG00000022093)	IGF2BP2 (ENSSMRG00000022094)	TRA2B (ENSSMRG00000022095)	ETV5 (ENSSMRG00000022097) #19	DGKG (ENSSMRG00000022098) #20	ENSSMRG00000022099 #21	SUMO3 (ENSSMRG00000022100) #22	UBE2G2 (ENSSMRG00000022101) #23	TSPEAR (ENSSMRG00000022102) #24	LRRC3 (ENSSMRG00000022103) #25	ENSSMRG00000022104 #26	ENSSMRG00000022105 #26	CFAP410 (ENSSMRG00000022119) #29	PFKL (ENSSMRG00000022120) #30	ENSSMRG00000022122 #31	DNAJB11 (ENSSMRG00000022123) #32	TBCCD1 (ENSSMRG00000022124) #33	CRYGS (ENSSMRG00000022126)	SOX14 (ENSSMRG00000022136)	CLDN18 (ENSSMRG00000022137)	DZIP1L (ENSSMRG00000022138)	A4GNT (ENSSMRG00000022139)