Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000183170.b.b ENSGT00940000156322 ENSGT00390000011570 ENSGT00520000055666.b ENSGT00390000005581.a ENSGT00940000155682 ENSGT00940000162889 ENSGT00940000162185 ENSGT00950000183022.b ENSGT00940000158212.B ENSGT00390000007989 ENSGT00940000155992 ENSGT00390000015709 ENSGT01090000259987.a.a.a ENSGT00390000004977 ENSGT00950000182895.a.b.j #22 ENSGT00940000158193 ENSGT00510000047718 ENSGT00940000163845 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000156404 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000159292 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161590 ENSGT00390000003706.a.a ENSGT00550000074981 ENSGT00390000003873 ENSGT00950000182836.b.b.b.a ENSGT01020000234487 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183170.b.b ENSGT00940000156322 ENSGT00390000011570 ENSGT00520000055666.b ENSGT00390000005581.a ENSGT00940000155682 ENSGT00940000162889 ENSGT00940000162185 ENSGT00950000183022.b ENSGT00940000158212.B ENSGT00390000007989 ENSGT00940000155992 ENSGT00390000015709 ENSGT01090000259987.a.a.a ENSGT00390000004977 ENSGT00950000182895.a.b.j #22 ENSGT00940000158193 ENSGT00510000047718 ENSGT00940000163845 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000156404 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000159292 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161590 ENSGT00390000003706.a.a ENSGT00550000074981 ENSGT00390000003873 ENSGT00950000182836.b.b.b.a ENSGT00390000011821.b Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183170.b.b ENSGT00940000156322 ENSGT00390000011570 ENSGT00520000055666.b ENSGT00390000005581.a ENSGT00940000155682 ENSGT00940000162889 ENSGT00940000162185 ENSGT00950000183022.b ENSGT00940000158212.B ENSGT00390000007989 ENSGT00940000155992 ENSGT00390000015709 ENSGT01090000259987.a.a.a ENSGT00390000004977 ENSGT00950000182895.a.b.j #22 ENSGT00940000158193 ENSGT00510000047718 ENSGT00940000163845 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000156404 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000159292 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161590 ENSGT00390000003706.a.a ENSGT00550000074981 ENSGT00390000003873 ENSGT00950000182836.b.b.b.a ENSGT00390000011821.b Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000156322 ENSGT00390000011570 ENSGT00520000055666.b ENSGT00390000005581.a ENSGT00940000155682 ENSGT00940000162889 ENSGT00940000162768.B ENSGT00960000191015 ENSGT00950000183022.b ENSGT00940000158212.B ENSGT00390000007989 ENSGT00940000155992 ENSGT00390000015709 ENSGT01090000259987.a.a.a ENSGT00390000004977 ENSGT00950000182895.a.b.j #22 ENSGT00940000158193 ENSGT00940000163441.f.a.a.b ENSGT00940000163441.f.b.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000156404 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000159292 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161590 ENSGT00390000003706.a.a ENSGT00550000074981 ENSGT00390000003873 ENSGT00950000182836.b.b.b.a Megabat MODERN SPECIES 2785 SUMO3 (ENSPVAG00000015248) #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000156322 ENSGT00390000011570 ENSGT00520000055666.b ENSGT00390000005581.a ENSGT00940000155682 ENSGT00940000162889 ENSGT00940000162768.B ENSGT00960000191015 ENSGT00950000183022.b ENSGT00940000158212.B ENSGT00390000007989 ENSGT00940000155992 ENSGT00390000015709 ENSGT01090000259987.a.a.a ENSGT00390000004977 ENSGT00950000182895.a.b.j #22 ENSGT00940000158193 ENSGT00940000163441.f.a.a.b ENSGT00940000163441.f.b.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000156404 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000159292 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161590 ENSGT00390000003706.a.a ENSGT00550000074981 ENSGT00390000003873 ENSGT00950000182836.b.b.b.a Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 11 ENSRFEG00010001831 COL6A2 (ENSRFEG00010001753) COL6A1 (ENSRFEG00010001707) ENSRFEG00010001629 ENSRFEG00010001580 ENSRFEG00010001565 SLC19A1 (ENSRFEG00010001553) ENSRFEG00010001539 ENSRFEG00010001505 ENSRFEG00010001475 ENSRFEG00010001456 ADARB1 (ENSRFEG00010001412) SLX9 (ENSRFEG00010001351) ITGB2 (ENSRFEG00010001275) PTTG1IP (ENSRFEG00010001246) SUMO3 (ENSRFEG00010001215) #22 UBE2G2 (ENSRFEG00010001187) ENSRFEG00010001158 ENSRFEG00010001114 ENSRFEG00010001026 TSPEAR (ENSRFEG00010000980) LRRC3 (ENSRFEG00010000940) TRPM2 (ENSRFEG00010000872) CFAP410 (ENSRFEG00010000827) PFKL (ENSRFEG00010000776) AIRE (ENSRFEG00010000735) DNMT3L (ENSRFEG00010000669) ICOSLG (ENSRFEG00010000645) GATD3 (ENSRFEG00010000628) PWP2 (ENSRFEG00010000602) TRAPPC10 (ENSRFEG00010000559) Microbat DUPLICATION Microbat MODERN SPECIES 1228 ENSMLUG00000013364 PCBP3 (ENSMLUG00000003074) SLC19A1 (ENSMLUG00000015818) COL18A1 (ENSMLUG00000015768) ENSMLUG00000025632 POFUT2 (ENSMLUG00000013242) ADARB1 (ENSMLUG00000011328) SLX9 (ENSMLUG00000017651) ITGB2 (ENSMLUG00000003153) PTTG1IP (ENSMLUG00000003464) ENSMLUG00000028601 #22 UBE2G2 (ENSMLUG00000011264) ENSMLUG00000011524 ENSMLUG00000010897 ENSMLUG00000017019 TSPEAR (ENSMLUG00000011225) LRRC3 (ENSMLUG00000011171) TRPM2 (ENSMLUG00000011096) CFAP410 (ENSMLUG00000011059) PFKL (ENSMLUG00000010992) ENSMLUG00000010968 DNMT3L (ENSMLUG00000013954) GATD3 (ENSMLUG00000004837) PWP2 (ENSMLUG00000004823) TRAPPC10 (ENSMLUG00000004810) AGPAT3 (ENSMLUG00000004785) Microbat MODERN SPECIES 1419 GALK1 (ENSMLUG00000015425) ITGB4 (ENSMLUG00000015402) SAP30BP (ENSMLUG00000015391) RECQL5 (ENSMLUG00000015374) ENSMLUG00000015365 LLGL2 (ENSMLUG00000015307) TSEN54 (ENSMLUG00000015298) CASKIN2 (ENSMLUG00000015284) TMEM94 (ENSMLUG00000015265) GRB2 (ENSMLUG00000015262) SLC25A19 (ENSMLUG00000015251) MIF4GD (ENSMLUG00000015242) MRPS7 (ENSMLUG00000015237) GGA3 (ENSMLUG00000015225) NUP85 (ENSMLUG00000015211) ENSMLUG00000025342 #22 JPT1 (ENSMLUG00000015205) NT5C (ENSMLUG00000015199) ARMC7 (ENSMLUG00000012851) SLC16A5 (ENSMLUG00000012847) ENSMLUG00000030452 KCTD2 (ENSMLUG00000012842) ATP5PD (ENSMLUG00000010620) MRPL58 (ENSMLUG00000006752) HID1 (ENSMLUG00000003519) Equus ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00950000182895.a.b.j #22 ENSGT00940000158193 ENSGT00510000047718 ENSGT00940000163845 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000156404 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000159292 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161590 ENSGT00390000003706.a.a ENSGT00550000074981 ENSGT00390000003873 ENSGT00950000182836.b.b.b.a ENSGT00390000011821.b Donkey MODERN SPECIES 9 SPATC1L (ENSEASG00005007013) FTCD (ENSEASG00005007018) COL6A2 (ENSEASG00005007037) COL6A1 (ENSEASG00005035660) PCBP3 (ENSEASG00005007068) SLC19A1 (ENSEASG00005007070) COL18A1 (ENSEASG00005038430) POFUT2 (ENSEASG00005007081) ADARB1 (ENSEASG00005007085) SLX9 (ENSEASG00005023956) ENSEASG00005032799 ENSEASG00005020183 ENSEASG00005018136 ENSEASG00005036911 PTTG1IP (ENSEASG00005034537) ENSEASG00005025870 #22 UBE2G2 (ENSEASG00005037598) ENSEASG00005000235 ENSEASG00005026028 ENSEASG00005026444 ENSEASG00005025990 ENSEASG00005032600 ENSEASG00005014722 ENSEASG00005037300 ENSEASG00005026527 ENSEASG00005033364 ENSEASG00005035707 TRPM2 (ENSEASG00005000375) CFAP410 (ENSEASG00005001598) PFKL (ENSEASG00005001615) AIRE (ENSEASG00005001620) Horse MODERN SPECIES 18 ENSECAG00000047281 LSS (ENSECAG00000008899) SPATC1L (ENSECAG00000006870) FTCD (ENSECAG00000011979) COL6A2 (ENSECAG00000019436) COL6A1 (ENSECAG00000022731) ENSECAG00000047101 PCBP3 (ENSECAG00000012413) SLC19A1 (ENSECAG00000002116) COL18A1 (ENSECAG00000016361) POFUT2 (ENSECAG00000004992) ADARB1 (ENSECAG00000019917) SLX9 (ENSECAG00000016590) ITGB2 (ENSECAG00000023061) PTTG1IP (ENSECAG00000022770) ENSECAG00000021271 #22 UBE2G2 (ENSECAG00000015327) ENSECAG00000049876 ENSECAG00000015092 ENSECAG00000047135 ENSECAG00000015117 ENSECAG00000051879 ENSECAG00000051909 ENSECAG00000029396 TSPEAR (ENSECAG00000051756) LRRC3 (ENSECAG00000005082) TSPEAR (ENSECAG00000008057) TRPM2 (ENSECAG00000023430) PFKL (ENSECAG00000017863) AIRE (ENSECAG00000012924) DNMT3L (ENSECAG00000009690) Carnivora ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000183170.b.b ENSGT00940000156322 ENSGT00390000011570 ENSGT00520000055666.b ENSGT00390000005581.a ENSGT00940000155682 ENSGT00940000162889 ENSGT00940000162185 ENSGT00950000183022.b ENSGT00940000158212.B ENSGT00390000007989 ENSGT00940000155992 ENSGT00390000015709 ENSGT01090000259987.a.a.a ENSGT00390000004977 ENSGT00950000182895.a.b.j #22 ENSGT00940000158193 ENSGT00940000155183 ENSGT00940000163441.f.b.a.a ENSGT00940000163441.f.a.a.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000156404 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000159292 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161590 ENSGT00390000003706.a.a ENSGT00550000074981 ENSGT00390000003873 Felidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000183170.b.b ENSGT00940000156322 ENSGT00390000011570 ENSGT00520000055666.b ENSGT00390000005581.a ENSGT00940000155682 ENSGT00940000162889 ENSGT00940000162185 ENSGT00950000183022.b ENSGT00940000158212.B ENSGT00390000007989 ENSGT00940000155992 ENSGT00390000015709 ENSGT01090000259987.a.a.a ENSGT00390000004977 ENSGT00950000182895.a.b.j #22 ENSGT00940000158193 ENSGT00940000163441.f.b.a.a.c ENSGT00510000047718 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000156404 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000159292 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161590 ENSGT00390000003706.a.a ENSGT00550000074981 ENSGT00390000003873 ENSGT00950000182836.b.b.b.a ENSGT00390000011821.b Panthera ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00950000183170.b.b ENSGT00940000156322 ENSGT00390000011570 ENSGT00520000055666.b ENSGT00390000005581.a ENSGT00940000155682 ENSGT00940000162889 ENSGT00940000162185 ENSGT00950000183022.b ENSGT00940000158212.B ENSGT00390000007989 ENSGT00940000155992 ENSGT00390000015709 ENSGT01090000259987.a.a.a ENSGT00390000004977 ENSGT00950000182895.a.b.j #22 ENSGT00940000158193 ENSGT00940000163441.f.b.a.a.c ENSGT00510000047718 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000156404 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000159292 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161590 ENSGT00390000003706.a.a ENSGT00550000074981 ENSGT00390000003873 ENSGT00950000182836.b.b.b.a ENSGT00390000011821.b Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00950000183170.b.b ENSGT00940000156322 ENSGT00390000011570 ENSGT00520000055666.b ENSGT00390000005581.a ENSGT00940000155682 ENSGT00940000162889 ENSGT00940000162185 ENSGT00950000183022.b ENSGT00940000158212.B ENSGT00390000007989 ENSGT00940000155992 ENSGT00390000015709 ENSGT01090000259987.a.a.a ENSGT00390000004977 ENSGT00950000182895.a.b.j #22 ENSGT00940000158193 ENSGT00940000163441.f.b.a.a.c leopard MODERN SPECIES 167 DIP2A (ENSPPRG00000023404) YBEY (ENSPPRG00000003325) MCM3AP (ENSPPRG00000006018) LSS (ENSPPRG00000008675) SPATC1L (ENSPPRG00000008783) FTCD (ENSPPRG00000011402) COL6A2 (ENSPPRG00000024558) COL6A1 (ENSPPRG00000000566) PCBP3 (ENSPPRG00000003933) SLC19A1 (ENSPPRG00000004605) POFUT2 (ENSPPRG00000010612) ADARB1 (ENSPPRG00000012281) SLX9 (ENSPPRG00000012813) ITGB2 (ENSPPRG00000001670) PTTG1IP (ENSPPRG00000001982) SUMO3 (ENSPPRG00000002862) #22 UBE2G2 (ENSPPRG00000003006) ENSPPRG00000003469 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183170.b.b ENSGT00940000156322 ENSGT00390000011570 ENSGT00520000055666.b ENSGT00390000005581.a ENSGT00940000155682 ENSGT00940000162889 ENSGT00940000162185 ENSGT00950000183022.b ENSGT00940000158212.B ENSGT00390000007989 ENSGT00940000155992 ENSGT00390000015709 ENSGT01090000259987.a.a.a ENSGT00390000004977 ENSGT00950000182895.a.b.j #22 ENSGT00940000158193 ENSGT00940000155183.a ENSGT00940000163441.f.b.a.a.a ENSGT00940000163441.f.b.a.a.b ENSGT00940000163441.f.a.a.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000156404 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000159292 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161590 ENSGT00390000003706.a.a ENSGT00550000074981 Canidae ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00950000183170.b.b ENSGT00940000156322 ENSGT00390000011570 ENSGT00520000055666.b ENSGT00390000005581.a ENSGT00940000155682 ENSGT00940000162889 ENSGT00940000162185 ENSGT00950000183022.b ENSGT00940000158212.B ENSGT00390000007989 ENSGT00940000155992 ENSGT00390000015709 ENSGT01090000259987.a.a.a.i ENSGT00390000004977 ENSGT00950000182895.a.b.j #22 ENSGT00940000158193 ENSGT00510000047718 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000156404 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000159292 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161590 ENSGT00390000003706.a.a ENSGT00550000074981 ENSGT00390000003873 ENSGT00950000182836.b.b.b.a ENSGT00390000011821.b ENSGT00940000154826 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00950000183170.b.b ENSGT00940000156322 ENSGT00390000011570 ENSGT00520000055666.b ENSGT00390000005581.a ENSGT00940000155682 ENSGT00940000162889 ENSGT00940000162185 ENSGT00950000183022.b ENSGT00940000158212.B ENSGT00390000007989 ENSGT00940000155992 ENSGT00390000015709 ENSGT01090000259987.a.a.a.i ENSGT00390000004977 ENSGT00950000182895.a.b.j #22 ENSGT00940000158193 ENSGT00940000163441.f.a.a.b.a ENSGT00940000161526.a.c ENSGT00940000161526.a.d ENSGT00510000047718 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000156404 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000159292 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161590 ENSGT00390000003706.a.a ENSGT00550000074981 ENSGT00390000003873 Dog MODERN SPECIES 24 ENSCAFG00845026433 MCM3AP (ENSCAFG00845025335) LSS (ENSCAFG00845024919) SPATC1L (ENSCAFG00845024849) FTCD (ENSCAFG00845024727) COL6A2 (ENSCAFG00845024255) COL6A1 (ENSCAFG00845024031) PCBP3 (ENSCAFG00845023560) ENSCAFG00845023388 COL18A1 (ENSCAFG00845022231) POFUT2 (ENSCAFG00845022063) ADARB1 (ENSCAFG00845021975) SLX9 (ENSCAFG00845021885) ITGB2 (ENSCAFG00845021592) PTTG1IP (ENSCAFG00845021456) ENSCAFG00845021390 #22 UBE2G2 (ENSCAFG00845021306) ENSCAFG00845021222 ENSCAFG00845021169 ENSCAFG00845021000 ENSCAFG00845020843 TSPEAR (ENSCAFG00845020761) TRPM2 (ENSCAFG00845020419) ICOSLG (ENSCAFG00845020326) PFKL (ENSCAFG00845020069) AIRE (ENSCAFG00845019838) DNMT3L (ENSCAFG00845019683) ICOSLG (ENSCAFG00845019541) GATD3 (ENSCAFG00845019382) PWP2 (ENSCAFG00845019135) TRAPPC10 (ENSCAFG00845018939) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183170.b.b ENSGT00940000156322 ENSGT00390000011570 ENSGT00520000055666.b ENSGT00390000005581.a ENSGT00940000155682 ENSGT00940000162889 ENSGT00940000162185 ENSGT00950000183022.b ENSGT00940000158212.B ENSGT00390000007989 ENSGT00940000155992 ENSGT00390000015709 ENSGT01090000259987.a.a.a ENSGT00390000004977 ENSGT00950000182895.a.b.j #22 ENSGT00940000158193 ENSGT00510000047718 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000156404 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000159292 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161590 ENSGT00390000003706.a.a ENSGT00550000074981 ENSGT00390000003873 ENSGT00950000182836.b.b.b.a ENSGT00390000011821.b ENSGT00940000154826 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 67 ENSGT00950000183170.b.b ENSGT00940000156322 ENSGT00390000011570 ENSGT00520000055666.b ENSGT00390000005581.a ENSGT00940000155682 ENSGT00940000162889 ENSGT00940000162185 ENSGT00950000183022.b ENSGT00940000158212.B ENSGT00390000007989 ENSGT00940000155992 ENSGT00390000015709 ENSGT01090000259987.a.a.a ENSGT00390000004977 ENSGT00950000182895.a.b.j #22 ENSGT00940000158193 ENSGT00510000047718 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000156404 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000159292 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161590 ENSGT00390000003706.a.a ENSGT00550000074981 ENSGT00390000003873 ENSGT00950000182836.b.b.b.a ENSGT00390000011821.b ENSGT00940000154826 American mink MODERN SPECIES 122 LSS (ENSNVIG00000008849) SPATC1L (ENSNVIG00000008811) FTCD (ENSNVIG00000008760) ENSNVIG00000008753 COL6A1 (ENSNVIG00000008572) PCBP3 (ENSNVIG00000008330) ENSNVIG00000008290 ENSNVIG00000008255 ENSNVIG00000008220 ENSNVIG00000008211 ENSNVIG00000008191 ADARB1 (ENSNVIG00000008112) SLX9 (ENSNVIG00000008023) ITGB2 (ENSNVIG00000007863) PTTG1IP (ENSNVIG00000007848) SUMO3 (ENSNVIG00000007817) #22 UBE2G2 (ENSNVIG00000007799) ENSNVIG00000007785 ENSNVIG00000007773 ENSNVIG00000007725 TSPEAR (ENSNVIG00000007674) LRRC3 (ENSNVIG00000007665) TRPM2 (ENSNVIG00000007475) ENSNVIG00000007455 PFKL (ENSNVIG00000007397) AIRE (ENSNVIG00000007211) ENSNVIG00000007199 ICOSLG (ENSNVIG00000007190) GATD3 (ENSNVIG00000007184) PWP2 (ENSNVIG00000007096) TRAPPC10 (ENSNVIG00000007089) Ferret DUPLICATION Ferret MODERN SPECIES 248 SLC19A1 (ENSMPUG00000010396) ENSMPUG00000010382 ENSMPUG00000019068 COL18A1 (ENSMPUG00000010362) ENSMPUG00000010360 ENSMPUG00000010357 POFUT2 (ENSMPUG00000010302) ADARB1 (ENSMPUG00000010296) ENSMPUG00000010290 SLX9 (ENSMPUG00000010279) ITGB2 (ENSMPUG00000010269) PTTG1IP (ENSMPUG00000010248) ENSMPUG00000010234 #22 UBE2G2 (ENSMPUG00000010187) ENSMPUG00000019067 TSPEAR (ENSMPUG00000010176) LRRC3 (ENSMPUG00000019066) TRPM2 (ENSMPUG00000010155) CFAP410 (ENSMPUG00000010108) PFKL (ENSMPUG00000010091) AIRE (ENSMPUG00000010031) ENSMPUG00000010029 DNMT3L (ENSMPUG00000010003) ICOSLG (ENSMPUG00000009996) GATD3 (ENSMPUG00000009943) PWP2 (ENSMPUG00000009936) TRAPPC10 (ENSMPUG00000009927) AGPAT3 (ENSMPUG00000009918) Ferret MODERN SPECIES 186 GALK1 (ENSMPUG00000013819) ITGB4 (ENSMPUG00000013821) SAP30BP (ENSMPUG00000013829) RECQL5 (ENSMPUG00000013833) ENSMPUG00000013837 LLGL2 (ENSMPUG00000013865) TSEN54 (ENSMPUG00000013870) CASKIN2 (ENSMPUG00000013874) TMEM94 (ENSMPUG00000013877) GRB2 (ENSMPUG00000013882) SLC25A19 (ENSMPUG00000013885) MIF4GD (ENSMPUG00000013909) MRPS7 (ENSMPUG00000013928) GGA3 (ENSMPUG00000013944) NUP85 (ENSMPUG00000013951) ENSMPUG00000013954 #22 JPT1 (ENSMPUG00000013971) NT5C (ENSMPUG00000013985) ARMC7 (ENSMPUG00000013987) SLC16A5 (ENSMPUG00000013991) ENSMPUG00000019916 ENSMPUG00000014018 KCTD2 (ENSMPUG00000014024) ENSMPUG00000014048 ENSMPUG00000014083 MRPL58 (ENSMPUG00000014086) CDR2L (ENSMPUG00000014096) HID1 (ENSMPUG00000014100) OTOP3 (ENSMPUG00000014106) ENSMPUG00000014110 ENSMPUG00000014114 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183170.b.b ENSGT00940000156322 ENSGT00390000011570 ENSGT00520000055666.b ENSGT00390000005581.a ENSGT00940000155682 ENSGT00940000162889 ENSGT00940000162185 ENSGT00950000183022.b ENSGT00940000158212.B ENSGT00390000007989 ENSGT00940000155992 ENSGT00390000015709 ENSGT01090000259987.a.a.a ENSGT00390000004977 ENSGT00950000182895.a.b.j #22 ENSGT00940000158193 ENSGT00940000161526.a.a ENSGT00940000163441.f.b.a.a.a.c ENSGT00940000163441.f.b.a.a.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000156404 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000159292 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161590 ENSGT00390000003706.a.a.cb ENSGT00550000074981 ENSGT00390000003873 Ursus ANCESTRAL SPECIES 94 ENSGT00950000182997.a.b.b.a.m ENSGT00730000110871.a.a.a.b ENSGT00950000183170.b.b ENSGT00940000156322 ENSGT00390000011570 ENSGT00520000055666.b ENSGT00390000005581.a ENSGT00940000155682 ENSGT00950000183546 ENSGT00940000162185 ENSGT00390000007989 ENSGT00940000155992 ENSGT00390000015709 ENSGT01090000259987.a.a.a ENSGT00390000004977 ENSGT00950000182895.a.b.j #22 ENSGT00940000158193 ENSGT00940000161526.a.a ENSGT00940000163441.f.a.a.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000156404 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000159292.a ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161590 ENSGT00390000003706.a.a.cb ENSGT00550000074981 ENSGT00390000003873 ENSGT00950000182836.b.b.b.a ENSGT00390000011821.b Polar bear DUPLICATION Polar bear MODERN SPECIES 185 ITGB4 (ENSUMAG00000009253) SAP30BP (ENSUMAG00000009122) ENSUMAG00000009118 RECQL5 (ENSUMAG00000009115) ENSUMAG00000009111 LLGL2 (ENSUMAG00000009023) TSEN54 (ENSUMAG00000008979) ENSUMAG00000008973 TMEM94 (ENSUMAG00000008703) GRB2 (ENSUMAG00000008668) SLC25A19 (ENSUMAG00000008660) MIF4GD (ENSUMAG00000008655) MRPS7 (ENSUMAG00000008652) GGA3 (ENSUMAG00000008648) NUP85 (ENSUMAG00000008643) ENSUMAG00000008640 #22 JPT1 (ENSUMAG00000008637) NT5C (ENSUMAG00000008633) ARMC7 (ENSUMAG00000008632) SLC16A5 (ENSUMAG00000008628) ENSUMAG00000008623 ENSUMAG00000008620 ENSUMAG00000008615 ATP5PD (ENSUMAG00000008611) MRPL58 (ENSUMAG00000008604) CDR2L (ENSUMAG00000008589) HID1 (ENSUMAG00000008253) OTOP3 (ENSUMAG00000008210) ENSUMAG00000008202 ENSUMAG00000008197 FADS6 (ENSUMAG00000008188) Polar bear MODERN SPECIES 394 DIP2A (ENSUMAG00000025037) PCNT (ENSUMAG00000025235) YBEY (ENSUMAG00000025236) MCM3AP (ENSUMAG00000025237) LSS (ENSUMAG00000025396) ENSUMAG00000025397 FTCD (ENSUMAG00000025398) COL6A2 (ENSUMAG00000025399) ENSUMAG00000025402 PCBP3 (ENSUMAG00000025403) POFUT2 (ENSUMAG00000025410) ADARB1 (ENSUMAG00000025411) SLX9 (ENSUMAG00000025416) ITGB2 (ENSUMAG00000025417) PTTG1IP (ENSUMAG00000025418) ENSUMAG00000025419 #22 UBE2G2 (ENSUMAG00000025420) ENSUMAG00000025421 ENSUMAG00000025422 ENSUMAG00000025423 ENSUMAG00000025425 TSPEAR (ENSUMAG00000025426) LRRC3 (ENSUMAG00000025427) TRPM2 (ENSUMAG00000025428) ENSUMAG00000025469 PFKL (ENSUMAG00000025470) ENSUMAG00000025471 ICOSLG (ENSUMAG00000025473) GATD3 (ENSUMAG00000025476) PWP2 (ENSUMAG00000025481) TRAPPC10 (ENSUMAG00000025503) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183170.b.b ENSGT00940000156322 ENSGT00390000011570 ENSGT00520000055666.b ENSGT00390000005581.a ENSGT00940000155682 ENSGT00940000162889 ENSGT00940000162185 ENSGT00950000183022.b ENSGT00940000158212.B ENSGT00390000007989 ENSGT00940000155992 ENSGT00390000015709 ENSGT01090000259987.a.a.a ENSGT00390000004977 ENSGT00950000182895.a.b.j #22 ENSGT00940000158193 ENSGT00510000047718 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000156404 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000159292 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161590 ENSGT00390000003706.a.a ENSGT00550000074981 ENSGT00390000003873 ENSGT00950000182836.b.b.b.a ENSGT01020000234487 ENSGT00390000011821.b Suina ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000162889 ENSGT00940000162185 ENSGT00950000183022.b ENSGT00940000158212.B ENSGT00390000007989 ENSGT00940000155992 ENSGT00390000015709 ENSGT01090000259987.a.a.a ENSGT00390000004977 ENSGT00950000182895.a.b.j #22 ENSGT00940000158193 ENSGT00940000163441.f.b.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000156404 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000159292 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161590 ENSGT00390000003706.a.a ENSGT00550000074981 ENSGT00390000003873 ENSGT00950000182836.b.b.b.a ENSGT01020000234487 Chacoan peccary MODERN SPECIES 916 POFUT2 (ENSCWAG00000021320) ADARB1 (ENSCWAG00000021307) SLX9 (ENSCWAG00000021290) ITGB2 (ENSCWAG00000021248) PTTG1IP (ENSCWAG00000021232) SUMO3 (ENSCWAG00000021223) #22 UBE2G2 (ENSCWAG00000021213) Pig MODERN SPECIES 4 COL6A1 (ENSSSCG00000022506) PCBP3 (ENSSSCG00000023041) ENSSSCG00000030696 COL18A1 (ENSSSCG00000038089) ENSSSCG00000012088 ADARB1 (ENSSSCG00000012089) SLX9 (ENSSSCG00000028571) ITGB2 (ENSSSCG00000025133) PTTG1IP (ENSSSCG00000031249) SUMO3 (ENSSSCG00000035795) #22 UBE2G2 (ENSSSCG00000027165) ENSSSCG00000025793 ENSSSCG00000029038 ENSSSCG00000037222 ENSSSCG00000039836 ENSSSCG00000047876 ENSSSCG00000046681 ENSSSCG00000047309 ENSSSCG00000048449 ENSSSCG00000028768 TSPEAR (ENSSSCG00000022988) LRRC3 (ENSSSCG00000053846) TRPM2 (ENSSSCG00000023762) CFAP410 (ENSSSCG00000024500) PFKL (ENSSSCG00000028197) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000183170.b.b ENSGT00940000156322 ENSGT00390000011570 ENSGT00520000055666.b ENSGT00390000005581.a ENSGT00940000155682 ENSGT00940000162889 ENSGT00940000162185 ENSGT00950000183022.b ENSGT00940000158212.B ENSGT00390000007989 ENSGT00940000155992 ENSGT00390000015709 ENSGT01090000259987.a.a.a ENSGT00390000004977 ENSGT00950000182895.a.b.j #22 ENSGT00940000158193 ENSGT00510000047718 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000156404 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000159292 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161590 ENSGT00390000003706.a.a ENSGT00550000074981 ENSGT00390000003873 ENSGT00950000182836.b.b.b.a ENSGT00390000011821.b ENSGT00940000154826 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00390000007870 ENSGT00940000157800 ENSGT00940000165228 ENSGT00520000062027 ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00390000004214 ENSGT00940000158256 ENSGT00390000016550 ENSGT00940000155738 ENSGT00550000074902 ENSGT00940000153432.A.a ENSGT00390000014620 ENSGT00940000157333 ENSGT00390000000204 ENSGT00950000182895.a.b.j #22 ENSGT00940000162422 ENSGT00390000011596.b ENSGT00940000162633 ENSGT00940000159666 ENSGT00940000162951 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(ENSCDRG00005008674) FDXR (ENSCDRG00005008777) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000183170.b.b ENSGT00940000156322 ENSGT00390000011570 ENSGT00520000055666.b ENSGT00390000005581.a ENSGT00940000155682 ENSGT00940000162889 ENSGT00940000162185 ENSGT00950000183022.b ENSGT00940000158212.B ENSGT00390000007989 ENSGT00940000155992 ENSGT00390000015709 ENSGT01090000259987.a.a.a ENSGT00390000004977 ENSGT00950000182895.a.b.j #22 ENSGT00940000158193 ENSGT00510000047718 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000156404 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000159292 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161590 ENSGT00390000003706.a.a ENSGT00550000074981 ENSGT00390000003873 ENSGT00950000182836.b.b.b.a ENSGT00390000011821.b ENSGT00940000154826 Pecora ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000183170.b.b ENSGT00940000156322 ENSGT00390000011570 ENSGT00520000055666.b ENSGT00390000005581.a ENSGT00940000155682 ENSGT00940000162889 ENSGT00940000162185 ENSGT00950000183022.b ENSGT00940000158212.B 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(ENSBTAG00000050520) OR10A3G (ENSBTAG00000053959) OR10A3I (ENSBTAG00000049963) Caprinae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000183170.b.b ENSGT00940000156322 ENSGT00390000011570 ENSGT00520000055666.b ENSGT00390000005581.a ENSGT00940000155682 ENSGT00940000163601 ENSGT00940000162185 ENSGT00950000183022.b ENSGT00940000158212.B ENSGT00390000007989 ENSGT00940000155992 ENSGT00390000015709 ENSGT01090000259987.a.a.a ENSGT00390000004977 ENSGT00950000182895.a.b.j #22 ENSGT00940000158193 ENSGT00940000163441.f.a.b.c.a.a.a ENSGT00940000161526.b.j.a.b ENSGT00940000163441.f.b.b.c.b ENSGT00940000163441.f.a.b.c.a.b.a.b.a.b.b ENSGT00940000163441.f.a.b.c.a.b.a.a.a.a ENSGT00510000047718 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000156404 ENSGT00510000047493.n ENSGT00390000018807 ENSGT00940000159292 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161590 Goat DUPLICATION Goat MODERN SPECIES 23 TFPI2 (ENSCHIG00000026816) CALCR (ENSCHIG00000012930) VPS50 (ENSCHIG00000012919) HEPACAM2 (ENSCHIG00000008983) 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(ENSCHIG00000008651) CDH17 (ENSCHIG00000012379) ENSCHIG00000001629 PDP1 (ENSCHIG00000021127) ENSCHIG00000011909 #22 TMEM67 (ENSCHIG00000015650) RBM12B (ENSCHIG00000006790) ENSCHIG00000023975 ENSCHIG00000015464 TRIQK (ENSCHIG00000008695) RUNX1T1 (ENSCHIG00000014084) SLC26A7 (ENSCHIG00000016301) LRRC69 (ENSCHIG00000016924) PIP4P2 (ENSCHIG00000015234) C8orf88 (ENSCHIG00000011393) TMEM64 (ENSCHIG00000015622) CALB1 (ENSCHIG00000021026) DECR1 (ENSCHIG00000013816) NBN (ENSCHIG00000011173) OSGIN2 (ENSCHIG00000026429) Goat MODERN SPECIES MCM3AP (ENSCHIG00000025098) LSS (ENSCHIG00000013212) SPATC1L (ENSCHIG00000023038) FTCD (ENSCHIG00000010407) COL6A2 (ENSCHIG00000018004) ENSCHIG00000004889 PCBP3 (ENSCHIG00000015841) SLC19A1 (ENSCHIG00000025066) ENSCHIG00000013263 ENSCHIG00000020589 POFUT2 (ENSCHIG00000000514) ADARB1 (ENSCHIG00000018259) SLX9 (ENSCHIG00000017685) ITGB2 (ENSCHIG00000014136) PTTG1IP (ENSCHIG00000021017) ENSCHIG00000015930 #22 UBE2G2 (ENSCHIG00000006556) ENSCHIG00000024813 ENSCHIG00000011506 ENSCHIG00000006780 ENSCHIG00000000533 ENSCHIG00000015017 ENSCHIG00000010601 ENSCHIG00000026079 ENSCHIG00000025434 ENSCHIG00000010344 ENSCHIG00000017373 ENSCHIG00000014533 ENSCHIG00000011548 TSPEAR (ENSCHIG00000017708) LRRC3 (ENSCHIG00000009418) Cetacea ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000183170.b.b ENSGT00940000156322 ENSGT00390000011570 ENSGT00520000055666.b ENSGT00390000005581.a ENSGT00940000155682 ENSGT00940000162889 ENSGT00940000162185 ENSGT00950000183022.b ENSGT00940000158212.B ENSGT00390000007989 ENSGT00940000155992 ENSGT00390000015709 ENSGT01090000259987.a.a.a ENSGT00390000004977 ENSGT00950000182895.a.b.j #22 ENSGT00940000158193 ENSGT00510000047718 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000156404 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000159292 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161590 ENSGT00390000003706.a.a ENSGT00550000074981 ENSGT00390000003873 ENSGT00950000182836.b.b.b.a ENSGT00390000011821.b ENSGT00940000154826 Blue whale MODERN SPECIES 15 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ENSGT00940000162185 ENSGT00950000183022.b ENSGT00940000158212.B ENSGT00390000007989 ENSGT00940000155992 ENSGT00390000015709 ENSGT01090000259987.a.a.a ENSGT00390000004977 ENSGT00950000182895.a.b.j #22 ENSGT00940000158193 ENSGT00510000047718 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000156404 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000159292 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161590 ENSGT00390000003706.a.a ENSGT00550000074981 ENSGT00390000003873 ENSGT00950000182836.b.b.b.a ENSGT00390000011821.b ENSGT00940000154826 Sperm whale MODERN SPECIES 19 PDE9A (ENSPCTG00005012834) HSF2BP (ENSPCTG00005014642) RRP1B (ENSPCTG00005014769) PDXK (ENSPCTG00005014904) CSTB (ENSPCTG00005015015) U2AF1 (ENSPCTG00005015178) CRYAA (ENSPCTG00005015249) AGPAT3 (ENSPCTG00005015313) TRAPPC10 (ENSPCTG00005015440) PWP2 (ENSPCTG00005015641) GATD3A (ENSPCTG00005015921) ICOSLG (ENSPCTG00005016088) DNMT3L (ENSPCTG00005016240) AIRE (ENSPCTG00005016581) PFKL (ENSPCTG00005017230) SUMO3 (ENSPCTG00005017367) #22 UBE2G2 (ENSPCTG00005017422) TSPEAR (ENSPCTG00005017485) ENSPCTG00005017543 ENSPCTG00005017608 LRRC3 (ENSPCTG00005017660) ENSPCTG00005017676 ENSPCTG00005017771 ITGB2 (ENSPCTG00005017857) ADARB1 (ENSPCTG00005017937) POFUT2 (ENSPCTG00005017994) SLC19A1 (ENSPCTG00005019281) PCBP3 (ENSPCTG00005019331) COL6A1 (ENSPCTG00005019551) COL6A2 (ENSPCTG00005020074) FTCD (ENSPCTG00005020224) Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000183170.b.b ENSGT00940000156322 ENSGT00390000011570 ENSGT00520000055666.b ENSGT00390000005581.a ENSGT00940000155682 ENSGT00940000162889 ENSGT00940000162768.B ENSGT00950000183022.b ENSGT00940000158212.B ENSGT00390000007989 ENSGT00940000155992 ENSGT00390000015709 ENSGT01090000259987.a.a.a ENSGT00390000004977 ENSGT00950000182895.a.b.j #22 ENSGT00940000158193 ENSGT00510000047718 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000156404 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000159292 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161590 ENSGT00390000003706.a.a ENSGT00550000074981 ENSGT00390000003873 ENSGT00950000182836.b.b.b.a ENSGT00390000011821.b ENSGT00940000154826 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000183170.b.b ENSGT00940000156322 ENSGT00390000011570 ENSGT00520000055666.b ENSGT00390000005581.a ENSGT00940000155682 ENSGT00940000162889 ENSGT00940000162768.B ENSGT00950000183022.b ENSGT00940000158212.B ENSGT00390000007989 ENSGT00940000155992 ENSGT00390000015709 ENSGT01090000259987.a.a.a ENSGT00390000004977 ENSGT00950000182895.a.b.j #22 ENSGT00940000158193 ENSGT00510000047718 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000156404 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000159292 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161590 ENSGT00390000003706.a.a ENSGT00550000074981 ENSGT00390000003873 ENSGT00950000182836.b.b.b.a ENSGT00390000011821.b ENSGT00940000154826 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156322 ENSGT00390000011570 ENSGT00520000055666.b ENSGT00390000005581.a ENSGT00940000155682 ENSGT00940000162768.B ENSGT00940000163601 ENSGT00940000162185 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