Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00950000183170.b.b	ENSGT00940000156322	ENSGT00390000011570	ENSGT00520000055666.b	ENSGT00390000005581.a	ENSGT00940000155682	ENSGT00940000162889	ENSGT00940000162185	ENSGT00950000183022.b	ENSGT00940000158212.B	ENSGT00390000007989 #17	ENSGT00940000155992 #18	ENSGT00390000015709 #19	ENSGT01090000259987.a.a.a #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b.j #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00510000047718	ENSGT00940000154360.A.b	ENSGT00940000156404	ENSGT00390000018807	ENSGT00940000159292	ENSGT00940000161104	ENSGT00940000162228	ENSGT00940000161590	ENSGT00390000003706.a.a	ENSGT00550000074981	ENSGT00390000003873	ENSGT00950000182836.b.b.b.a	ENSGT00390000011821.b	ENSGT00940000154826
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00950000183170.b.b	ENSGT00940000156322	ENSGT00390000011570	ENSGT00520000055666.b	ENSGT00390000005581.a	ENSGT00940000155682	ENSGT00940000162889	ENSGT00940000162185	ENSGT00950000183022.b	ENSGT00940000158212.B	ENSGT00390000007989 #17	ENSGT00940000155992 #18	ENSGT00390000015709 #19	ENSGT01090000259987.a.a.a #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b.j #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00510000047718	ENSGT00940000154360.A.b	ENSGT00940000156404	ENSGT00390000018807	ENSGT00940000159292	ENSGT01100000265026	ENSGT00940000161104	ENSGT00940000162228	ENSGT00940000161590	ENSGT00390000003706.a.a	ENSGT00550000074981	ENSGT00390000003873	ENSGT00950000182836.b.b.b.a	ENSGT00390000011821.b
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00950000183170.b.b	ENSGT00940000156322	ENSGT00390000011570	ENSGT00520000055666.b	ENSGT00390000005581.a	ENSGT00940000155682	ENSGT00940000162889	ENSGT00940000162185	ENSGT00950000183022.b	ENSGT00940000158212.B	ENSGT00390000007989 #17	ENSGT00940000155992 #18	ENSGT00390000015709 #19	ENSGT01090000259987.a.a.a #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b.j #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00510000047718	ENSGT00940000154360.A.b	ENSGT00940000156404	ENSGT00390000018807	ENSGT00940000159292	ENSGT01100000265026	ENSGT00940000161104	ENSGT00940000162228	ENSGT00940000161590	ENSGT00390000003706.a.a	ENSGT00550000074981	ENSGT00390000003873	ENSGT00950000182836.b.b.b.a	ENSGT00390000011821.b
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00950000183170.b.b	ENSGT00940000156322	ENSGT00390000011570	ENSGT00520000055666.b	ENSGT00390000005581.a	ENSGT00940000155682	ENSGT00940000162889	ENSGT00940000162185	ENSGT00950000183022.b	ENSGT00940000158212.B	ENSGT00390000007989 #17	ENSGT00940000155992 #18	ENSGT00390000015709 #19	ENSGT01090000259987.a.a.a #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b.j #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00510000047718	ENSGT00940000154360.A.b	ENSGT00940000156404	ENSGT00390000018807	ENSGT00940000159292	ENSGT01100000265026	ENSGT00940000161104	ENSGT00940000162228	ENSGT00940000161590	ENSGT00390000003706.a.a	ENSGT00550000074981	ENSGT00390000003873	ENSGT00950000182836.b.b.b.a	ENSGT00390000011821.b
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00950000183170.b.b	ENSGT00940000156322	ENSGT00390000011570	ENSGT00520000055666.b	ENSGT00390000005581.a	ENSGT00940000155682	ENSGT00940000162889	ENSGT00940000162185	ENSGT00950000183022.b	ENSGT00940000158212.B	ENSGT00390000007989 #17	ENSGT00940000155992 #18	ENSGT00390000015709 #19	ENSGT01090000259987.a.a.a #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b.j #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00510000047718	ENSGT00940000154360.A.b	ENSGT00940000156404	ENSGT00390000018807	ENSGT00940000159292	ENSGT01100000265026	ENSGT00940000161104	ENSGT00940000162228	ENSGT00940000161590	ENSGT00390000003706.a.a	ENSGT00550000074981	ENSGT00390000003873	ENSGT00950000182836.b.b.b.a	ENSGT00390000011821.b
Bos	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00950000183170.b.b	ENSGT00940000156322	ENSGT00390000011570	ENSGT00520000055666.b	ENSGT00390000005581.a	ENSGT00940000155682	ENSGT00940000162889	ENSGT00940000162185	ENSGT00950000183022.b	ENSGT00940000158212.B	ENSGT00390000007989 #17	ENSGT00940000155992 #18	ENSGT00390000015709 #19	ENSGT01090000259987.a.a.a #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b.j #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00940000163441.f.a.b.d	ENSGT00940000163441.f.a.b.c.a.b.a.b.a.b.a.b	ENSGT00510000047718	ENSGT00940000154360.A.b	ENSGT00940000156404	ENSGT00390000018807	ENSGT00940000159292	ENSGT01100000265026	ENSGT00940000161104	ENSGT00940000162228	ENSGT00940000161590	ENSGT00390000003706.a.a	ENSGT00550000074981	ENSGT00390000003873
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000011514	ENSGT00950000183170.b.b	ENSGT00940000156322	ENSGT00390000011570	ENSGT00520000055666.b	ENSGT00390000005581.a	ENSGT00940000155682	ENSGT00940000162889	ENSGT00940000162185	ENSGT00950000183022.b	ENSGT00390000007989 #17	ENSGT00940000155992 #18	ENSGT00390000015709 #19	ENSGT01090000259987.a.a.a #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b.j #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00940000163441.f.a.b.d	ENSGT00940000163441.f.a.b.c.a.b.a.a.a	ENSGT00960000187239.b	ENSGT00940000161526.b.i	ENSGT00940000161526.b.j.a	ENSGT00960000187239.a	ENSGT00940000163441.f.a.b.c.b	ENSGT00940000163441.f.a.b.c.a.b.a.b.a.b.a.b	ENSGT00510000047718	ENSGT00940000154360.A.b	ENSGT00940000156404	ENSGT00390000018807	ENSGT00940000159292	ENSGT01100000265026
Wild yak	MODERN SPECIES	1051											POFUT2 (ENSBMUG00000002792) #17	ADARB1 (ENSBMUG00000002765) #18	SLX9 (ENSBMUG00000002589) #19	ITGB2 (ENSBMUG00000001419) #20	PTTG1IP (ENSBMUG00000000206) #21	SUMO3 (ENSBMUG00000000140) #22	ENSBMUG00000000080 #23
Domestic yak	MODERN SPECIES	4	AMPD3 (ENSBGRG00000004237)	ADM (ENSBGRG00000004160)	ENSBGRG00000004139	SBF2 (ENSBGRG00000003871)	SWAP70 (ENSBGRG00000003749)	ENSBGRG00000003714	WEE1 (ENSBGRG00000003666)	ENSBGRG00000011132	ZNF143 (ENSBGRG00000010621)	IPO7 (ENSBGRG00000010346)	ENSBGRG00000010326	TMEM41B (ENSBGRG00000010234)	DENND5A (ENSBGRG00000009763)	SCUBE2 (ENSBGRG00000008891)	NRIP3 (ENSBGRG00000008609)	ENSBGRG00000008570 #22	ASCL3 (ENSBGRG00000008558)	C11orf16 (ENSBGRG00000008516)	ENSBGRG00000008233	DENND2B (ENSBGRG00000007364)	ENSBGRG00000007115	TRIM66 (ENSBGRG00000007026)	STK33 (ENSBGRG00000006761)	ENSBGRG00000006613	RIC3 (ENSBGRG00000006512)	TUB (ENSBGRG00000006223)	EIF3F (ENSBGRG00000006058)	ENSBGRG00000006022	ENSBGRG00000005999	ENSBGRG00000005965	ENSBGRG00000005955
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00950000183170.b.b	ENSGT00940000156322	ENSGT00390000011570	ENSGT00520000055666.b	ENSGT00390000005581.a	ENSGT00940000155682	ENSGT00940000163601	ENSGT00940000162185	ENSGT00950000183022.b	ENSGT00940000158212.B	ENSGT00390000007989 #17	ENSGT00940000155992 #18	ENSGT00390000015709 #19	ENSGT01090000259987.a.a.a #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b.j #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00940000163441.f.a.b.c.a.b.a.a.a	ENSGT00960000187239.b	ENSGT00940000161526.b.i	ENSGT00940000161526.b.j.a	ENSGT00940000163441.f.a.b.c.b	ENSGT00940000163441.f.b.b.c.b	ENSGT00940000163441.f.a.b.c.a.b.a.b.a.b.b	ENSGT00940000163441.f.b.b.c.a	ENSGT00510000047718	ENSGT00940000154360.A.b	ENSGT00940000156404	ENSGT00390000018807	ENSGT00940000159292	ENSGT01100000265026
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	6	ENSBIXG00005000080	SBF2 (ENSBIXG00005016555)	ENSBIXG00005016647	SWAP70 (ENSBIXG00005016714)	WEE1 (ENSBIXG00005016783)	ENSBIXG00005016814	ZNF143 (ENSBIXG00005002751)	IPO7 (ENSBIXG00005006019)	ENSBIXG00005017064	TMEM41B (ENSBIXG00005017095)	ENSBIXG00005017135	DENND5A (ENSBIXG00005002794)	SCUBE2 (ENSBIXG00005006584)	NRIP3 (ENSBIXG00005017604)	TMEM9B (ENSBIXG00005017678)	ENSBIXG00005017708 #22	ASCL3 (ENSBIXG00005017718)	C11orf16 (ENSBIXG00005017732)	AKIP1 (ENSBIXG00005007802)	DENND2B (ENSBIXG00005018004)	ENSBIXG00005018100	TRIM66 (ENSBIXG00005007053)	STK33 (ENSBIXG00005002945)	LMO1 (ENSBIXG00005018215)	RIC3 (ENSBIXG00005018251)	TUB (ENSBIXG00005018323)	ENSBIXG00005018389	ENSBIXG00005018402	ENSBIXG00005018421	ENSBIXG00005018435	ENSBIXG00005018449
Cow	DUPLICATION
Cow	MODERN SPECIES		MCM3AP (ENSBTAG00000003148)	LSS (ENSBTAG00000018936)	SPATC1L (ENSBTAG00000020409)	FTCD (ENSBTAG00000020404)	COL6A2 (ENSBTAG00000019269)	COL6A1 (ENSBTAG00000011802)	ENSBTAG00000048318	PCBP3 (ENSBTAG00000030775)	SLC19A1 (ENSBTAG00000024162)	COL18A1 (ENSBTAG00000023907)	POFUT2 (ENSBTAG00000007818) #17	ADARB1 (ENSBTAG00000017486) #18	SLX9 (ENSBTAG00000017010) #19	ITGB2 (ENSBTAG00000017060) #20	PTTG1IP (ENSBTAG00000021771) #21	SUMO3 (ENSBTAG00000017321) #22	UBE2G2 (ENSBTAG00000048090) #23	ENSBTAG00000050038	ENSBTAG00000051778	KRTAP12-2 (ENSBTAG00000018610)	ENSBTAG00000053056	KRTAP10-8 (ENSBTAG00000040291)	ENSBTAG00000052773	ENSBTAG00000037662	ENSBTAG00000051900	TSPEAR (ENSBTAG00000018607)	LRRC3 (ENSBTAG00000017882)	TRPM2 (ENSBTAG00000021901)	CFAP410 (ENSBTAG00000019589)	PFKL (ENSBTAG00000010658)	ENSBTAG00000051579
Cow	MODERN SPECIES	6	AMPD3 (ENSBTAG00000015821)	ENSBTAG00000051340	ADM (ENSBTAG00000021048)	SBF2 (ENSBTAG00000043981)	SWAP70 (ENSBTAG00000001987)	WEE1 (ENSBTAG00000005278)	ZNF143 (ENSBTAG00000016074)	ENSBTAG00000045658	IPO7 (ENSBTAG00000027722)	ENSBTAG00000027723	TMEM41B (ENSBTAG00000001607)	DENND5A (ENSBTAG00000006322)	SCUBE2 (ENSBTAG00000020573)	NRIP3 (ENSBTAG00000013366)	TMEM9B (ENSBTAG00000008310)	ENSBTAG00000004771 #22	ASCL3 (ENSBTAG00000032339)	C15H11orf16 (ENSBTAG00000001917)	AKIP1 (ENSBTAG00000001922)	DENND2B (ENSBTAG00000005356)	RPL27A (ENSBTAG00000005349)	TRIM66 (ENSBTAG00000020890)	STK33 (ENSBTAG00000011910)	LMO1 (ENSBTAG00000016320)	RIC3 (ENSBTAG00000004863)	TUB (ENSBTAG00000004862)	EIF3F (ENSBTAG00000004861)	OR10A3F (ENSBTAG00000055217)	OR10A3HP (ENSBTAG00000050520)	OR10A3G (ENSBTAG00000053959)	OR10A3I (ENSBTAG00000049963)
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00950000183170.b.b	ENSGT00940000156322	ENSGT00390000011570	ENSGT00520000055666.b	ENSGT00390000005581.a	ENSGT00940000155682	ENSGT00940000163601	ENSGT00940000162185	ENSGT00950000183022.b	ENSGT00940000158212.B	ENSGT00390000007989 #17	ENSGT00940000155992 #18	ENSGT00390000015709 #19	ENSGT01090000259987.a.a.a #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b.j #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00940000163441.f.a.b.c.a.a.a	ENSGT00940000161526.b.j.a.b	ENSGT00940000163441.f.b.b.c.b	ENSGT00940000163441.f.a.b.c.a.b.a.b.a.b.b	ENSGT00940000163441.f.a.b.c.a.b.a.a.a.a	ENSGT00510000047718	ENSGT00940000154360.A.b	ENSGT00940000156404	ENSGT00510000047493.n	ENSGT00390000018807	ENSGT00940000159292	ENSGT00940000161104	ENSGT00940000162228	ENSGT00940000161590
Goat	DUPLICATION
Goat	MODERN SPECIES	23	TFPI2 (ENSCHIG00000026816)	CALCR (ENSCHIG00000012930)	VPS50 (ENSCHIG00000012919)	HEPACAM2 (ENSCHIG00000008983)	ENSCHIG00000012415	SAMD9 (ENSCHIG00000007683)	CDK6 (ENSCHIG00000011604)	ENSCHIG00000025157	ENSCHIG00000021463	RBM48 (ENSCHIG00000015110)	PEX1 (ENSCHIG00000027266)	GATAD1 (ENSCHIG00000006633)	ENSCHIG00000021464	ANKIB1 (ENSCHIG00000026782)	KRIT1 (ENSCHIG00000023971)	ENSCHIG00000010640 #22	LRRD1 (ENSCHIG00000018885)	CYP51A1 (ENSCHIG00000009890)	AKAP9 (ENSCHIG00000015192)	MTERF1 (ENSCHIG00000013172)	FZD1 (ENSCHIG00000012408)	CDK14 (ENSCHIG00000004524)	CLDN12 (ENSCHIG00000000615)	ENSCHIG00000005960	SUN3 (ENSCHIG00000026852)	C7orf57 (ENSCHIG00000013490)	UPP1 (ENSCHIG00000014663)	ABCA13 (ENSCHIG00000020126)	ENSCHIG00000008014	VWC2 (ENSCHIG00000020940)	ZPBP (ENSCHIG00000008321)
Goat	MODERN SPECIES	5	PLEKHF2 (ENSCHIG00000009121)	ENSCHIG00000014016	TP53INP1 (ENSCHIG00000009037)	CCNE2 (ENSCHIG00000022720)	INTS8 (ENSCHIG00000014183)	ENSCHIG00000008889	DPY19L4 (ENSCHIG00000020474)	ESRP1 (ENSCHIG00000014128)	ENSCHIG00000019947	VIRMA (ENSCHIG00000015977)	RAD54B (ENSCHIG00000008230)	GEM (ENSCHIG00000008651)	CDH17 (ENSCHIG00000012379)	ENSCHIG00000001629	PDP1 (ENSCHIG00000021127)	ENSCHIG00000011909 #22	TMEM67 (ENSCHIG00000015650)	RBM12B (ENSCHIG00000006790)	ENSCHIG00000023975	ENSCHIG00000015464	TRIQK (ENSCHIG00000008695)	RUNX1T1 (ENSCHIG00000014084)	SLC26A7 (ENSCHIG00000016301)	LRRC69 (ENSCHIG00000016924)	PIP4P2 (ENSCHIG00000015234)	C8orf88 (ENSCHIG00000011393)	TMEM64 (ENSCHIG00000015622)	CALB1 (ENSCHIG00000021026)	DECR1 (ENSCHIG00000013816)	NBN (ENSCHIG00000011173)	OSGIN2 (ENSCHIG00000026429)
Goat	MODERN SPECIES		MCM3AP (ENSCHIG00000025098)	LSS (ENSCHIG00000013212)	SPATC1L (ENSCHIG00000023038)	FTCD (ENSCHIG00000010407)	COL6A2 (ENSCHIG00000018004)	ENSCHIG00000004889	PCBP3 (ENSCHIG00000015841)	SLC19A1 (ENSCHIG00000025066)	ENSCHIG00000013263	ENSCHIG00000020589	POFUT2 (ENSCHIG00000000514) #17	ADARB1 (ENSCHIG00000018259) #18	SLX9 (ENSCHIG00000017685) #19	ITGB2 (ENSCHIG00000014136) #20	PTTG1IP (ENSCHIG00000021017) #21	ENSCHIG00000015930 #22	UBE2G2 (ENSCHIG00000006556) #23	ENSCHIG00000024813	ENSCHIG00000011506	ENSCHIG00000006780	ENSCHIG00000000533	ENSCHIG00000015017	ENSCHIG00000010601	ENSCHIG00000026079	ENSCHIG00000025434	ENSCHIG00000010344	ENSCHIG00000017373	ENSCHIG00000014533	ENSCHIG00000011548	TSPEAR (ENSCHIG00000017708)	LRRC3 (ENSCHIG00000009418)
Yarkand deer	MODERN SPECIES	13	ENSCHYG00000006473	ENSCHYG00000006490	TP53INP1 (ENSCHYG00000006568)	ENSCHYG00000006609	CCNE2 (ENSCHYG00000006642)	INTS8 (ENSCHYG00000006742)	DPY19L4 (ENSCHYG00000006979)	ESRP1 (ENSCHYG00000007116)	VIRMA (ENSCHYG00000007760)	RAD54B (ENSCHYG00000008124)	GEM (ENSCHYG00000008382)	CDH17 (ENSCHYG00000008444)	ENSCHYG00000008519	ENSCHYG00000008529	PDP1 (ENSCHYG00000008541)	ENSCHYG00000008561 #22	TMEM67 (ENSCHYG00000008621)	ENSCHYG00000009165	RBM12B (ENSCHYG00000009201)	ENSCHYG00000009303	ENSCHYG00000009356	TRIQK (ENSCHYG00000009400)	RUNX1T1 (ENSCHYG00000009466)	ENSCHYG00000009900	LRRC69 (ENSCHYG00000009964)	ENSCHYG00000010134	PIP4P2 (ENSCHYG00000010301)	C8orf88 (ENSCHYG00000010352)	ENSCHYG00000010442	CALB1 (ENSCHYG00000010474)	DECR1 (ENSCHYG00000010587)
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00950000183170.b.b	ENSGT00940000156322	ENSGT00390000011570	ENSGT00520000055666.b	ENSGT00390000005581.a	ENSGT00940000155682	ENSGT00940000162889	ENSGT00940000162185	ENSGT00950000183022.b	ENSGT00940000158212.B	ENSGT00390000007989 #17	ENSGT00940000155992 #18	ENSGT00390000015709 #19	ENSGT01090000259987.a.a.a #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b.j #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00510000047718	ENSGT00940000154360.A.b	ENSGT00940000156404	ENSGT00390000018807	ENSGT00940000159292	ENSGT00940000161104	ENSGT00940000162228	ENSGT00940000161590	ENSGT00390000003706.a.a	ENSGT00550000074981	ENSGT00390000003873	ENSGT00950000182836.b.b.b.a	ENSGT00390000011821.b	ENSGT00940000154826
Blue whale	MODERN SPECIES	15	ENSBMSG00010004286	ENSBMSG00010004263	MCM3AP (ENSBMSG00010004232)	LSS (ENSBMSG00010004134)	FTCD (ENSBMSG00010004051)	COL6A2 (ENSBMSG00010004034)	COL6A1 (ENSBMSG00010004019)	PCBP3 (ENSBMSG00010003986)	SLC19A1 (ENSBMSG00010003963)	COL18A1 (ENSBMSG00010003836)	POFUT2 (ENSBMSG00010003795) #17	ADARB1 (ENSBMSG00010003764) #18	SLX9 (ENSBMSG00010007433) #19	ITGB2 (ENSBMSG00010007391) #20	PTTG1IP (ENSBMSG00010007362) #21	SUMO3 (ENSBMSG00010007354) #22	UBE2G2 (ENSBMSG00010007343) #23	ENSBMSG00010007332	ENSBMSG00010007310	ENSBMSG00010007295	TSPEAR (ENSBMSG00010007281)	LRRC3 (ENSBMSG00010007273)	TRPM2 (ENSBMSG00010007233)	CFAP410 (ENSBMSG00010007203)	PFKL (ENSBMSG00010007189)	AIRE (ENSBMSG00010007103)	DNMT3L (ENSBMSG00010007028)	ICOSLG (ENSBMSG00010006991)	GATD3 (ENSBMSG00010006949)	PWP2 (ENSBMSG00010006911)	TRAPPC10 (ENSBMSG00010006876)
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000011570	ENSGT00520000055666.b	ENSGT00390000005581.a	ENSGT00940000155682	ENSGT00940000162889	ENSGT00940000162768.B	ENSGT00940000163601	ENSGT00940000162185	ENSGT00950000183022.b	ENSGT00940000158212.B	ENSGT00390000007989 #17	ENSGT00940000155992 #18	ENSGT00390000015709 #19	ENSGT01090000259987.a.a.a #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b.j #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00510000047718	ENSGT00940000154360.A.b	ENSGT00940000156404	ENSGT00390000018807	ENSGT00940000159292	ENSGT00940000161104	ENSGT00940000162228	ENSGT00940000161590	ENSGT00390000003706.a.a	ENSGT00550000074981	ENSGT00390000003873	ENSGT00950000182836.b.b.b.a	ENSGT00390000011821.b	ENSGT00940000154826
Sperm whale	MODERN SPECIES	19	PDE9A (ENSPCTG00005012834)	HSF2BP (ENSPCTG00005014642)	RRP1B (ENSPCTG00005014769)	PDXK (ENSPCTG00005014904)	CSTB (ENSPCTG00005015015)	U2AF1 (ENSPCTG00005015178)	CRYAA (ENSPCTG00005015249)	AGPAT3 (ENSPCTG00005015313)	TRAPPC10 (ENSPCTG00005015440)	PWP2 (ENSPCTG00005015641)	GATD3A (ENSPCTG00005015921)	ICOSLG (ENSPCTG00005016088)	DNMT3L (ENSPCTG00005016240)	AIRE (ENSPCTG00005016581)	PFKL (ENSPCTG00005017230)	SUMO3 (ENSPCTG00005017367) #22	UBE2G2 (ENSPCTG00005017422) #23	TSPEAR (ENSPCTG00005017485)	ENSPCTG00005017543	ENSPCTG00005017608	LRRC3 (ENSPCTG00005017660)	ENSPCTG00005017676	ENSPCTG00005017771	ITGB2 (ENSPCTG00005017857) #20	ADARB1 (ENSPCTG00005017937) #18	POFUT2 (ENSPCTG00005017994) #17	SLC19A1 (ENSPCTG00005019281)	PCBP3 (ENSPCTG00005019331)	COL6A1 (ENSPCTG00005019551)	COL6A2 (ENSPCTG00005020074)	FTCD (ENSPCTG00005020224)
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00950000183170.b.b	ENSGT00940000156322	ENSGT00390000011570	ENSGT00520000055666.b	ENSGT00390000005581.a	ENSGT00940000155682	ENSGT00940000162889	ENSGT00940000162768.B	ENSGT00950000183022.b	ENSGT00940000158212.B	ENSGT00390000007989 #17	ENSGT00940000155992 #18	ENSGT00390000015709 #19	ENSGT01090000259987.a.a.a #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b.j #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00510000047718	ENSGT00940000154360.A.b	ENSGT00940000156404	ENSGT00390000018807	ENSGT00940000159292	ENSGT00940000161104	ENSGT00940000162228	ENSGT00940000161590	ENSGT00390000003706.a.a	ENSGT00550000074981	ENSGT00390000003873	ENSGT00950000182836.b.b.b.a	ENSGT00390000011821.b	ENSGT00940000154826
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00950000183170.b.b	ENSGT00940000156322	ENSGT00390000011570	ENSGT00520000055666.b	ENSGT00390000005581.a	ENSGT00940000155682	ENSGT00940000162889	ENSGT00940000162768.B	ENSGT00950000183022.b	ENSGT00940000158212.B	ENSGT00390000007989 #17	ENSGT00940000155992 #18	ENSGT00390000015709 #19	ENSGT01090000259987.a.a.a #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b.j #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00510000047718	ENSGT00940000154360.A.b	ENSGT00940000156404	ENSGT00390000018807	ENSGT00940000159292	ENSGT00940000161104	ENSGT00940000162228	ENSGT00940000161590	ENSGT00390000003706.a.a	ENSGT00550000074981	ENSGT00390000003873	ENSGT00950000182836.b.b.b.a	ENSGT00390000011821.b	ENSGT00940000154826
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000156322	ENSGT00390000011570	ENSGT00520000055666.b	ENSGT00390000005581.a	ENSGT00940000155682	ENSGT00940000162768.B	ENSGT00940000163601	ENSGT00940000162185	ENSGT00950000183022.b	ENSGT00940000158212.B	ENSGT00390000007989 #17	ENSGT00940000155992 #18	ENSGT00390000015709 #19	ENSGT01090000259987.a.a.a #20	ENSGT00390000004977 #21	ENSGT00950000182895.a.b.j #22	ENSGT00940000158193 #23	ENSGT00510000047718	ENSGT00940000154360.A.b	ENSGT00940000156404	ENSGT00390000018807	ENSGT00940000159292	ENSGT00940000161104	ENSGT00940000162228	ENSGT00940000161590	ENSGT00390000003706.a.a	ENSGT00550000074981	ENSGT00390000003873	ENSGT00950000182836.b.b.b.a	ENSGT00390000011821.b	ENSGT00940000154826
Narwhal	DUPLICATION
Narwhal	MODERN SPECIES	297	LSS (ENSMMNG00015000081)	SPATC1L (ENSMMNG00015000171)	FTCD (ENSMMNG00015000207)	COL6A2 (ENSMMNG00015000293)	ENSMMNG00015000354	ENSMMNG00015000368	ENSMMNG00015000412	PCBP3 (ENSMMNG00015000534)	SLC19A1 (ENSMMNG00015000587)	ENSMMNG00015000658	POFUT2 (ENSMMNG00015000876) #17	ADARB1 (ENSMMNG00015001009) #18	SLX9 (ENSMMNG00015001036) #19	ITGB2 (ENSMMNG00015001076) #20	PTTG1IP (ENSMMNG00015001159) #21	SUMO3 (ENSMMNG00015001196) #22	UBE2G2 (ENSMMNG00015001235) #23	TSPEAR (ENSMMNG00015001273)	TRPM2 (ENSMMNG00015001381)	CFAP410 (ENSMMNG00015001497)	PFKL (ENSMMNG00015001526)	AIRE (ENSMMNG00015001730)	DNMT3L (ENSMMNG00015001913)	ICOSLG (ENSMMNG00015001974)	ENSMMNG00015002030	PWP2 (ENSMMNG00015002118)	TRAPPC10 (ENSMMNG00015002229)	AGPAT3 (ENSMMNG00015002330)	RRP1 (ENSMMNG00015002366)	CSTB (ENSMMNG00015002400)	PDXK (ENSMMNG00015002424)
Narwhal	MODERN SPECIES	311	COL13A1 (ENSMMNG00015019392)	FAM241B (ENSMMNG00015018581)	NEUROG3 (ENSMMNG00015018559)	TSPAN15 (ENSMMNG00015018513)	TACR2 (ENSMMNG00015018482)	HK1 (ENSMMNG00015018338)	HKDC1 (ENSMMNG00015018235)	SUPV3L1 (ENSMMNG00015018179)	ENSMMNG00015018123	SRGN (ENSMMNG00015018086)	KIFBP (ENSMMNG00015018048)	DDX21 (ENSMMNG00015017919)	DDX50 (ENSMMNG00015017887)	ENSMMNG00015017869	STOX1 (ENSMMNG00015017814)	ENSMMNG00015017786 #22	CCAR1 (ENSMMNG00015017705)	ENSMMNG00015017672	TET1 (ENSMMNG00015017620)	SLC25A16 (ENSMMNG00015017583)	DNA2 (ENSMMNG00015017542)	RUFY2 (ENSMMNG00015017154)	HNRNPH3 (ENSMMNG00015017060)	PBLD (ENSMMNG00015017026)	MYPN (ENSMMNG00015016802)	HERC4 (ENSMMNG00015016513)	SIRT1 (ENSMMNG00015016378)	DNAJC12 (ENSMMNG00015016250)	LRRTM3 (ENSMMNG00015016206)	CTNNA3 (ENSMMNG00015016145)	ENSMMNG00015016066
Beluga whale	DUPLICATION
Beluga whale	MODERN SPECIES	26	SAP30BP (ENSDLEG00000006870)	RECQL5 (ENSDLEG00000006875)	SMIM5 (ENSDLEG00000006889)	ENSDLEG00000006899	ENSDLEG00000006941	LLGL2 (ENSDLEG00000006955)	TSEN54 (ENSDLEG00000007044)	CASKIN2 (ENSDLEG00000007101)	TMEM94 (ENSDLEG00000007244)	GRB2 (ENSDLEG00000007603)	ENSDLEG00000007607	MIF4GD (ENSDLEG00000007609)	MRPS7 (ENSDLEG00000007613)	GGA3 (ENSDLEG00000007697)	NUP85 (ENSDLEG00000009671)	ENSDLEG00000010267 #22	JPT1 (ENSDLEG00000010301)	NT5C (ENSDLEG00000010315)	ARMC7 (ENSDLEG00000010329)	SLC16A5 (ENSDLEG00000010349)	ENSDLEG00000010366	ATP5H (ENSDLEG00000010375)	MRPL58 (ENSDLEG00000010388)	CDR2L (ENSDLEG00000010398)	HID1 (ENSDLEG00000010418)	OTOP3 (ENSDLEG00000010598)	OTOP2 (ENSDLEG00000010663)	USH1G (ENSDLEG00000010675)	FADS6 (ENSDLEG00000010697)	FDXR (ENSDLEG00000010749)	GRIN2C (ENSDLEG00000010808)
Beluga whale	MODERN SPECIES	65	COL13A1 (ENSDLEG00000008033)	FAM241B (ENSDLEG00000008202)	NEUROG3 (ENSDLEG00000008229)	TSPAN15 (ENSDLEG00000008241)	TACR2 (ENSDLEG00000008300)	HK1 (ENSDLEG00000008408)	HKDC1 (ENSDLEG00000008490)	SUPV3L1 (ENSDLEG00000008552)	ENSDLEG00000008599	SRGN (ENSDLEG00000008630)	KIFBP (ENSDLEG00000008645)	DDX21 (ENSDLEG00000008677)	DDX50 (ENSDLEG00000008715)	ENSDLEG00000008782	STOX1 (ENSDLEG00000008804)	ENSDLEG00000008946 #22	CCAR1 (ENSDLEG00000008968)	TET1 (ENSDLEG00000009112)	ENSDLEG00000009139	SLC25A16 (ENSDLEG00000009240)	RUFY2 (ENSDLEG00000010171)	HNRNPH3 (ENSDLEG00000011376)	PBLD (ENSDLEG00000011403)	ATOH7 (ENSDLEG00000011420)	MYPN (ENSDLEG00000011459)	HERC4 (ENSDLEG00000011906)	SIRT1 (ENSDLEG00000011987)	ENSDLEG00000012197	ENSDLEG00000012205	ENSDLEG00000012216	ENSDLEG00000012231
Vaquita	DUPLICATION
Vaquita	MODERN SPECIES	15	MCM3AP (ENSPSNG00000015503)	LSS (ENSPSNG00000015377)	SPATC1L (ENSPSNG00000015232)	FTCD (ENSPSNG00000014870)	COL6A2 (ENSPSNG00000014738)	COL6A1 (ENSPSNG00000014616)	ENSPSNG00000014382	SLC19A1 (ENSPSNG00000014338)	COL18A1 (ENSPSNG00000013985)	POFUT2 (ENSPSNG00000013804) #17	ADARB1 (ENSPSNG00000013670) #18	SLX9 (ENSPSNG00000013591) #19	ENSPSNG00000013509	ENSPSNG00000013374 ##20	PTTG1IP (ENSPSNG00000013293) #21	SUMO3 (ENSPSNG00000013255) #22	UBE2G2 (ENSPSNG00000013185) #23	TSPEAR (ENSPSNG00000012864)	LRRC3 (ENSPSNG00000012828)	TRPM2 (ENSPSNG00000012233)	CFAP410 (ENSPSNG00000012160)	PFKL (ENSPSNG00000012080)	AIRE (ENSPSNG00000011555)	DNMT3L (ENSPSNG00000011244)	ICOSLG (ENSPSNG00000010983)	GATD3 (ENSPSNG00000010801)	PWP2 (ENSPSNG00000010734)	TRAPPC10 (ENSPSNG00000010640)	AGPAT3 (ENSPSNG00000010576)	RRP1 (ENSPSNG00000010522)	ENSPSNG00000010486
Vaquita	MODERN SPECIES	7	MACROH2A2 (ENSPSNG00000020131)	COL13A1 (ENSPSNG00000019849)	FAM241B (ENSPSNG00000019661)	NEUROG3 (ENSPSNG00000019648)	TSPAN15 (ENSPSNG00000019618)	TACR2 (ENSPSNG00000019582)	HK1 (ENSPSNG00000019292)	HKDC1 (ENSPSNG00000019172)	SUPV3L1 (ENSPSNG00000019123)	VPS26A (ENSPSNG00000019043)	SRGN (ENSPSNG00000019006)	KIFBP (ENSPSNG00000018956)	DDX21 (ENSPSNG00000018882)	DDX50 (ENSPSNG00000018841)	STOX1 (ENSPSNG00000018733)	ENSPSNG00000018685 #22	CCAR1 (ENSPSNG00000018574)	ENSPSNG00000018517	TET1 (ENSPSNG00000018401)	DNA2 (ENSPSNG00000018291)	RUFY2 (ENSPSNG00000018016)	HNRNPH3 (ENSPSNG00000017903)	PBLD (ENSPSNG00000017813)	ATOH7 (ENSPSNG00000017790)	MYPN (ENSPSNG00000017208)	HERC4 (ENSPSNG00000016699)	SIRT1 (ENSPSNG00000016409)	ENSPSNG00000016344	DNAJC12 (ENSPSNG00000016132)	LRRTM3 (ENSPSNG00000016050)	CTNNA3 (ENSPSNG00000015816)