Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000154003.B	ENSGT00390000002725 #7	ENSGT00940000156853.d #8	ENSGT00390000015892 #11	ENSGT00950000182933.A.a.a #12	ENSGT00950000183044.a.a.a.d #13	ENSGT00940000160070 #14	ENSGT00910000148243	ENSGT00940000159703 #15	ENSGT00550000075065 #16	ENSGT00940000158204.a #17	ENSGT00550000075186 #18	ENSGT00950000184814 #19	ENSGT00410000025615 #20	ENSGT00390000006233.c.b #21	ENSGT00940000157351 #22	ENSGT00940000159603 #23	ENSGT00940000161850 #24	ENSGT00940000157969 #25	ENSGT00940000156783 #26	ENSGT00390000000190 #27	ENSGT00940000158297	ENSGT00730000111327 #28	ENSGT00390000004169 #29	ENSGT00390000003596 #30	ENSGT00390000013260.B #31	ENSGT00940000160874 #32	ENSGT00390000018731 #33	ENSGT00390000016682 #34	ENSGT00950000183157.a.a.a #35	ENSGT00950000182960.a.a.a.b.db.a #36
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	12	CENPX (ENSSVLG00005016768) #7	ENSSVLG00005016908 #8	ENSSVLG00005016920 #9	ENSSVLG00005016958 #10	NOTUM (ENSSVLG00005016990) #11	MYADML2 (ENSSVLG00005017144) #12	PYCR1 (ENSSVLG00005017184) #13	MAFG (ENSSVLG00005017296) #14	SIRT7 (ENSSVLG00005017343) #15	PCYT2 (ENSSVLG00005017544) #16	NPB (ENSSVLG00005018182) #17	ANAPC11 (ENSSVLG00005018201) #18	ENSSVLG00005018234 #19	ALYREF (ENSSVLG00005018278) #20	ARHGDIA (ENSSVLG00005018349) #21	P4HB (ENSSVLG00005018406) #22	PPP1R27 (ENSSVLG00005018481) #23	MCRIP1 (ENSSVLG00005018541) #24	GCGR (ENSSVLG00005018678) #25	SLC25A10 (ENSSVLG00005018780) #26	MRPL12 (ENSSVLG00005018826) #27	ARL16 (ENSSVLG00005018922) #28	CCDC137 (ENSSVLG00005019032) #29	OXLD1 (ENSSVLG00005019115) #30	PDE6G (ENSSVLG00005019138) #31	TSPAN10 (ENSSVLG00005019196) #32	NPLOC4 (ENSSVLG00005019392) #33	FAAP100 (ENSSVLG00005019478) #34	FSCN2 (ENSSVLG00005019552) #35	ENSSVLG00005019596 #36	BAHCC1 (ENSSVLG00005019700) #37
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT00940000154003.B	ENSGT00390000002725 #7	ENSGT00940000156853.d #8	ENSGT00390000015892 #11	ENSGT00950000182933.A.a.a #12	ENSGT00950000183044.a.a.a.d #13	ENSGT00940000160070 #14	ENSGT00910000148243	ENSGT00940000159703 #15	ENSGT00550000075065 #16	ENSGT00940000158204.a #17	ENSGT00550000075186 #18	ENSGT00950000184814 #19	ENSGT00410000025615 #20	ENSGT00390000006233.c.b #21	ENSGT00940000157351 #22	ENSGT00940000159603 #23	ENSGT00940000161850 #24	ENSGT00940000157969 #25	ENSGT00940000156783 #26	ENSGT00390000000190 #27	ENSGT00940000158297	ENSGT00730000111327 #28	ENSGT00390000004169 #29	ENSGT00390000003596 #30	ENSGT00390000013260.B #31	ENSGT00940000160874 #32	ENSGT00390000018731 #33	ENSGT00390000016682 #34	ENSGT00950000183157.a.a.a #35	ENSGT00950000182960.a.a.a.b.db.a #36
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000154003.B	ENSGT00390000002725 #7	ENSGT00940000156853.d #8	ENSGT00390000015892 #11	ENSGT00950000182933.A.a.a #12	ENSGT00950000183044.a.a.a.d #13	ENSGT00910000148243	ENSGT00940000160070 #14	ENSGT00940000159703 #15	ENSGT00550000075065 #16	ENSGT00940000158204.a #17	ENSGT00550000075186 #18	ENSGT00950000184814 #19	ENSGT00410000025615 #20	ENSGT00390000006233.c.b #21	ENSGT00940000157351 #22	ENSGT00940000159603 #23	ENSGT00940000161850 #24	ENSGT00940000157969 #25	ENSGT00940000156783 #26	ENSGT00390000000190 #27	ENSGT00940000158297	ENSGT00730000111327 #28	ENSGT00390000004169 #29	ENSGT00390000003596 #30	ENSGT00390000013260.B #31	ENSGT00940000160874 #32	ENSGT00390000018731 #33	ENSGT00390000016682 #34	ENSGT00950000183157.a.a.a #35	ENSGT00950000182960.a.a.a.b.db.a #36
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	470	LRRC45 (ENSUPAG00010000745)	CENPX (ENSUPAG00010000729) #7	ASPSCR1 (ENSUPAG00010000586) #8	NOTUM (ENSUPAG00010000559) #11	MYADML2 (ENSUPAG00010000551) #12	PYCR1 (ENSUPAG00010000543) #13	ENSUPAG00010000535	MAFG (ENSUPAG00010000525) #14	SIRT7 (ENSUPAG00010000513) #15	NPB (ENSUPAG00010000504) #17	PCYT2 (ENSUPAG00010000437) #16	ANAPC11 (ENSUPAG00010000424) #18	ENSUPAG00010000411 #19	ALYREF (ENSUPAG00010000402) #20	ARHGDIA (ENSUPAG00010000396) #21	P4HB (ENSUPAG00010000365) #22	PPP1R27 (ENSUPAG00010000343) #23	MCRIP1 (ENSUPAG00010000327) #24	SLC25A10 (ENSUPAG00010000161) #26	MRPL12 (ENSUPAG00010000143) #27	HGS (ENSUPAG00010000083)	ARL16 (ENSUPAG00010000027) #28	CCDC137 (ENSUPAG00010019712) #29	OXLD1 (ENSUPAG00010019709) #30	PDE6G (ENSUPAG00010019703) #31	TSPAN10 (ENSUPAG00010019685) #32	NPLOC4 (ENSUPAG00010019627) #33	FAAP100 (ENSUPAG00010019610) #34	FSCN2 (ENSUPAG00010019602) #35	ENSUPAG00010019594 ##36	BAHCC1 (ENSUPAG00010019471) #37
Squirrel	MODERN SPECIES	194	DCXR (ENSSTOG00000028714)	RAC3 (ENSSTOG00000014015)	LRRC45 (ENSSTOG00000007315)	CENPX (ENSSTOG00000030309) #7	ASPSCR1 (ENSSTOG00000006300) #8	NOTUM (ENSSTOG00000006274) #11	ENSSTOG00000006267 #12	PYCR1 (ENSSTOG00000014080) #13	MAFG (ENSSTOG00000024966) #14	SIRT7 (ENSSTOG00000006241) #15	PCYT2 (ENSSTOG00000006219) #16	NPB (ENSSTOG00000025278) #17	ANAPC11 (ENSSTOG00000027337) #18	ENSSTOG00000016570	ARHGDIA (ENSSTOG00000015756) #21	P4HB (ENSSTOG00000026026) #22	PPP1R27 (ENSSTOG00000028022) #23	MCRIP1 (ENSSTOG00000025718) #24	GCGR (ENSSTOG00000027046) #25	SLC25A10 (ENSSTOG00000029677) #26	MRPL12 (ENSSTOG00000031761) #27	HGS (ENSSTOG00000000091)	ARL16 (ENSSTOG00000025354) #28	CCDC137 (ENSSTOG00000000089) #29	PDE6G (ENSSTOG00000000085) #31	TSPAN10 (ENSSTOG00000000083) #32	NPLOC4 (ENSSTOG00000000080) #33	FAAP100 (ENSSTOG00000000078) #34	FSCN2 (ENSSTOG00000028223) #35	ENSSTOG00000006868 #36	BAHCC1 (ENSSTOG00000021534) #37
Alpin marmot	MODERN SPECIES	90	DCXR (ENSMMMG00000004960)	RAC3 (ENSMMMG00000004991)	LRRC45 (ENSMMMG00000005027)	CENPX (ENSMMMG00000005068) #7	ASPSCR1 (ENSMMMG00000005107) #8	NOTUM (ENSMMMG00000005284) #11	MYADML2 (ENSMMMG00000005339) #12	PYCR1 (ENSMMMG00000005348) #13	MAFG (ENSMMMG00000005373) #14	ENSMMMG00000005384	ENSMMMG00000005394	ENSMMMG00000005400 #15	PCYT2 (ENSMMMG00000005412) #16	ANAPC11 (ENSMMMG00000005453) #18	ARHGDIA (ENSMMMG00000005480) #21	P4HB (ENSMMMG00000005494) #22	MCRIP1 (ENSMMMG00000005529) #24	SLC25A10 (ENSMMMG00000005551) #26	MRPL12 (ENSMMMG00000005577) #27	HGS (ENSMMMG00000005586)	ARL16 (ENSMMMG00000005609) #28	CCDC137 (ENSMMMG00000005620) #29	ENSMMMG00000005731 #30	TSPAN10 (ENSMMMG00000005734) #32	PDE6G (ENSMMMG00000005769) #31	NPLOC4 (ENSMMMG00000005787) #33	FAAP100 (ENSMMMG00000005853) #34	FSCN2 (ENSMMMG00000006216) #35	ACTG1 (ENSMMMG00000006224) #36	SLC38A10 (ENSMMMG00000006531)	TEPSIN (ENSMMMG00000006619)