Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000165226	ENSGT00940000153691.a.a	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00940000157553	ENSGT00390000013048	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000161531	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000010285.d	ENSGT00580000082227	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00940000162619	ENSGT00940000162251	ENSGT00940000172426	ENSGT00940000156519
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	59	ENSGT00940000165226	ENSGT00940000160587	ENSGT00940000153691.a.a	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000161531	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00940000166153	ENSGT00940000164357	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00530000063956.b.b	ENSGT00940000165226	ENSGT00940000160587	ENSGT00940000153691.a.a	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00940000166153	ENSGT00940000164357	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000012054.b	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000005410
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000165226	ENSGT00940000160587	ENSGT00940000153691.a.a	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00990000204256	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000012054.b	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000005410	ENSGT00940000166270	ENSGT00390000006293	ENSGT00940000156938
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT01100000263508.A.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00940000167952	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00990000204256	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000012054.b	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006293	ENSGT00940000156938	ENSGT00390000014299
Theria	ANCESTRAL SPECIES	62				ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00940000167952	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000012054.b	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	31		ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00940000167952	ENSGT00390000009268	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
Primates	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000165352	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000165352	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000165352	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.x.b #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00550000076258	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00520000058758.g	ENSGT00390000012976.c.b.a	ENSGT00940000157674	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.x.b #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00550000076258	ENSGT00620000089250	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000012976.c.b.a.a.a	ENSGT00940000157674	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00860000136182	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.x.b #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00620000089250	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293.fd	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	22												ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.x.b.i.b #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293.fd	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	901													CDYL2 (ENSRBIG00000033699) #19	CMC2 (ENSRBIG00000026007) #20	CENPN (ENSRBIG00000033117) #21	ATMIN (ENSRBIG00000044219) #22	C16orf46 (ENSRBIG00000039697) #23	ENSRBIG00000000931 #24	ENSRBIG00000044415 #25	BCO1 (ENSRBIG00000019930) #26	GAN (ENSRBIG00000041752) #27	CMIP (ENSRBIG00000043971) #28	PLCG2 (ENSRBIG00000030632) #29	ENSRBIG00000041712 #30
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1836											ENSRROG00000044738	DYNLRB2 (ENSRROG00000034202)	CDYL2 (ENSRROG00000040508) #19	CMC2 (ENSRROG00000034163) #20	CENPN (ENSRROG00000006914) #21	ATMIN (ENSRROG00000040180) #22	C16orf46 (ENSRROG00000044557) #23	ENSRROG00000034467 ##24	ENSRROG00000004213	ENSRROG00000038312 #25	BCO1 (ENSRROG00000042760) #26	GAN (ENSRROG00000000822) #27	CMIP (ENSRROG00000034726) #28	PLCG2 (ENSRROG00000045090) #29	SDR42E1 (ENSRROG00000032867) #30	HSD17B2 (ENSRROG00000040362)	MPHOSPH6 (ENSRROG00000033784)
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000012976.c.b.a.a.a	ENSGT00940000157674	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00860000136182	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.x.b #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00620000089250	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212.o.b	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293.fd	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000012976.c.b.a.a.a	ENSGT00940000157674	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00860000136182	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.x.b #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00620000089250	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212.p	ENSGT00390000009212.o.b	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293.fd	ENSGT00390000005410
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000012976.c.b.a.a.a	ENSGT00940000157674	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00860000136182	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.x.b #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212.o.b	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293.fd	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	178	CNTNAP4 (ENSMNEG00000029247)	MON1B (ENSMNEG00000037776)	SYCE1L (ENSMNEG00000033349)	ADAMTS18 (ENSMNEG00000031484)	NUDT7 (ENSMNEG00000038660)	VAT1L (ENSMNEG00000021232)	CLEC3A (ENSMNEG00000035656)	ENSMNEG00000037686	ENSMNEG00000035509	WWOX (ENSMNEG00000011321)	MAF (ENSMNEG00000037088)	DYNLRB2 (ENSMNEG00000041692)	CDYL2 (ENSMNEG00000010839) #19	CMC2 (ENSMNEG00000032151) #20	CENPN (ENSMNEG00000037652) #21	ATMIN (ENSMNEG00000040533) #22	C16orf46 (ENSMNEG00000040087) #23	ENSMNEG00000032644 #24	ENSMNEG00000036656 #25	BCO1 (ENSMNEG00000039611) #26	GAN (ENSMNEG00000042633) #27	ENSMNEG00000009056	ENSMNEG00000038255	ENSMNEG00000044434	CMIP (ENSMNEG00000036250) #28	PLCG2 (ENSMNEG00000014560) #29	SDR42E1 (ENSMNEG00000036201) #30	HSD17B2 (ENSMNEG00000037692)	MPHOSPH6 (ENSMNEG00000040998)	ENSMNEG00000038514
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000164262	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.x.b #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00620000089250	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212.o.b	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293.fd	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	12	SYCE1L (ENSMFAG00000031480)	ADAMTS18 (ENSMFAG00000003786)	NUDT7 (ENSMFAG00000000905)	VAT1L (ENSMFAG00000034237)	CLEC3A (ENSMFAG00000050540)	WWOX (ENSMFAG00000037127)	ENSMFAG00000054515	ENSMFAG00000055442	ENSMFAG00000061675	MAF (ENSMFAG00000064321)	ENSMFAG00000059854	DYNLRB2 (ENSMFAG00000029001)	CDYL2 (ENSMFAG00000039809) #19	CMC2 (ENSMFAG00000030783) #20	CENPN (ENSMFAG00000032373) #21	ATMIN (ENSMFAG00000035738) #22	C16orf46 (ENSMFAG00000041497) #23	ENSMFAG00000041821 #24	PKD1L2 (ENSMFAG00000044240) #25	ENSMFAG00000057739	BCO1 (ENSMFAG00000035655) #26	GAN (ENSMFAG00000033724) #27	CMIP (ENSMFAG00000035465) #28	ENSMFAG00000054241	ENSMFAG00000054000	PLCG2 (ENSMFAG00000042565) #29	SDR42E1 (ENSMFAG00000040108) #30	HSD17B2 (ENSMFAG00000002586)	MPHOSPH6 (ENSMFAG00000002729)	CDH13 (ENSMFAG00000003153)	HSBP1 (ENSMFAG00000000302)
Rhesus	MODERN SPECIES	12	CLEC3A (ENSMMUG00000051335)	WWOX (ENSMMUG00000010610)	ENSMMUG00000041596	ENSMMUG00000055251	ENSMMUG00000053231	ENSMMUG00000051334	MAF (ENSMMUG00000037756)	ENSMMUG00000002246	DYNLRB2 (ENSMMUG00000001907)	CDYL2 (ENSMMUG00000011847) #19	ENSMMUG00000064571	ENSMMUG00000065089	ENSMMUG00000052945	CENPN (ENSMMUG00000013082) #21	GCSH (ENSMMUG00000013088) ##24	ATMIN (ENSMMUG00000013086) #22	C20H16orf46 (ENSMMUG00000013087) #23	ENSMMUG00000003662 #25	BCO1 (ENSMMUG00000047071) #26	GAN (ENSMMUG00000015029) #27	CMIP (ENSMMUG00000041581) #28	ENSMMUG00000053124	PLCG2 (ENSMMUG00000005334) #29	ENSMMUG00000062047	SDR42E1 (ENSMMUG00000020372) #30	HSD17B2 (ENSMMUG00000037580)	MPHOSPH6 (ENSMMUG00000022575)	CDH13 (ENSMMUG00000020114)	HSBP1 (ENSMMUG00000020115)	OSGIN1 (ENSMMUG00000009849)	NECAB2 (ENSMMUG00000029071)
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000012976.c.b.a.a.a	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000162517.k.a	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.x.b #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00620000089250	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212.p	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293.fd.d	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
Olive baboon	MODERN SPECIES	9	CNTNAP4 (ENSPANG00000006309)	ENSPANG00000006203	MON1B (ENSPANG00000018516)	SYCE1L (ENSPANG00000018343)	ADAMTS18 (ENSPANG00000011329)	ENSPANG00000038009	NUDT7 (ENSPANG00000018935)	ENSPANG00000038343	VAT1L (ENSPANG00000018199)	CLEC3A (ENSPANG00000051229)	ENSPANG00000037613	WWOX (ENSPANG00000017326)	DYNLRB2 (ENSPANG00000021879)	CDYL2 (ENSPANG00000015585) #19	CMC2 (ENSPANG00000039177) #20	ATMIN (ENSPANG00000010334) #22	C16orf46 (ENSPANG00000012567) #23	ENSPANG00000001043 #24	ENSPANG00000007353 #25	BCO1 (ENSPANG00000018039) #26	GAN (ENSPANG00000008267) #27	CMIP (ENSPANG00000000893) #28	PLCG2 (ENSPANG00000021730) #29	SDR42E1 (ENSPANG00000044754) #30	HSD17B2 (ENSPANG00000024392)	MPHOSPH6 (ENSPANG00000019619)	CDH13 (ENSPANG00000016956)	ENSPANG00000029444	MLYCD (ENSPANG00000010882)	OSGIN1 (ENSPANG00000017404)	NECAB2 (ENSPANG00000015946)
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000012976.c.b.a.a.a	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000162517.k.a	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.x.b #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00620000089250	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212.p	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293.fd.d	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
Drill	MODERN SPECIES	1030	CPHXL (ENSMLEG00000028811)	ENSMLEG00000037780	CNTNAP4 (ENSMLEG00000029378)	ENSMLEG00000002295	MON1B (ENSMLEG00000033579)	SYCE1L (ENSMLEG00000043298)	ADAMTS18 (ENSMLEG00000040294)	NUDT7 (ENSMLEG00000044207)	VAT1L (ENSMLEG00000040020)	CLEC3A (ENSMLEG00000035474)	WWOX (ENSMLEG00000026450)	DYNLRB2 (ENSMLEG00000036024)	CDYL2 (ENSMLEG00000043686) #19	CMC2 (ENSMLEG00000043490) #20	CENPN (ENSMLEG00000043653) #21	ATMIN (ENSMLEG00000035981) #22	C16orf46 (ENSMLEG00000029776) #23	ENSMLEG00000026860 #25	BCO1 (ENSMLEG00000027065) #26	GAN (ENSMLEG00000037931) #27	ENSMLEG00000025440	ENSMLEG00000039722	CMIP (ENSMLEG00000041107) #28	PLCG2 (ENSMLEG00000036172) #29	SDR42E1 (ENSMLEG00000031944) #30	HSD17B2 (ENSMLEG00000033859)	MPHOSPH6 (ENSMLEG00000029763)	ENSMLEG00000033994
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	96	ENSCATG00000038738	CNTNAP4 (ENSCATG00000034579)	MON1B (ENSCATG00000017854)	SYCE1L (ENSCATG00000040347)	ADAMTS18 (ENSCATG00000030919)	NUDT7 (ENSCATG00000031071)	VAT1L (ENSCATG00000037460)	CLEC3A (ENSCATG00000037811)	ENSCATG00000031630	WWOX (ENSCATG00000038357)	MAF (ENSCATG00000041922)	DYNLRB2 (ENSCATG00000036839)	CDYL2 (ENSCATG00000043765) #19	CMC2 (ENSCATG00000036100) #20	CENPN (ENSCATG00000033167) #21	ATMIN (ENSCATG00000041468) #22	C16orf46 (ENSCATG00000036987) #23	ENSCATG00000029678 #24	ENSCATG00000040997 #25	BCO1 (ENSCATG00000044107) #26	GAN (ENSCATG00000037337) #27	ENSCATG00000033845	CMIP (ENSCATG00000015703) #28	PLCG2 (ENSCATG00000033923) #29	SDR42E1 (ENSCATG00000041320) #30	HSD17B2 (ENSCATG00000031945)	MPHOSPH6 (ENSCATG00000031117)	ENSCATG00000034788	CDH13 (ENSCATG00000033164)	HSBP1 (ENSCATG00000039295)	MLYCD (ENSCATG00000043712)
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	24	TERF2IP (ENSCSAG00000003658)	DUXB (ENSCSAG00000003647)	CNTNAP4 (ENSCSAG00000003642)	MON1B (ENSCSAG00000003631)	SYCE1L (ENSCSAG00000003626)	ADAMTS18 (ENSCSAG00000003611)	NUDT7 (ENSCSAG00000003596)	VAT1L (ENSCSAG00000003593)	CLEC3A (ENSCSAG00000003589)	WWOX (ENSCSAG00000003584)	ENSCSAG00000018475	DYNLRB2 (ENSCSAG00000003580)	CDYL2 (ENSCSAG00000003578) #19	CMC2 (ENSCSAG00000003575) #20	CENPN (ENSCSAG00000003572) #21	ATMIN (ENSCSAG00000003568) #22	C16orf46 (ENSCSAG00000003567) #23	GCSH (ENSCSAG00000003563) #24	PKD1L2 (ENSCSAG00000003536) #25	BCO1 (ENSCSAG00000003502) #26	GAN (ENSCSAG00000003492) #27	CMIP (ENSCSAG00000003464) #28	PLCG2 (ENSCSAG00000003427) #29	SDR42E1 (ENSCSAG00000003417) #30	HSD17B2 (ENSCSAG00000003413)	ENSCSAG00000003410	CDH13 (ENSCSAG00000003407)	MLYCD (ENSCSAG00000003401)	OSGIN1 (ENSCSAG00000003392)	NECAB2 (ENSCSAG00000003387)	SLC38A8 (ENSCSAG00000003381)
Hominoidea	DUPLICATION
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000012976.c.b.a	ENSGT00940000157674	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00860000136182	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091.o #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.x.b.l #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00620000089250	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000012976.c.b.a	ENSGT00940000157674	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00860000136182	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091.o #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.x.b.l #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00620000089250	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00390000012976.c.b.a	ENSGT00940000157674	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00860000136182	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091.o #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.x.b.l #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00620000089250	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00520000058758.g	ENSGT00390000012976.c.b.a	ENSGT00940000157674	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091.o #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.x.b.l #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00620000089250	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
Pan	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00390000012976.c.b.a	ENSGT00940000157674	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00860000136182	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091.o #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.x.b.l #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00620000089250	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
Chimpanzee	MODERN SPECIES	7	CNTNAP4 (ENSPTRG00000008367)	MON1B (ENSPTRG00000008370)	SYCE1L (ENSPTRG00000031140)	ADAMTS18 (ENSPTRG00000008372)	NUDT7 (ENSPTRG00000008373)	VAT1L (ENSPTRG00000008374)	CLEC3A (ENSPTRG00000008375)	WWOX (ENSPTRG00000008376)	ENSPTRG00000049801	ENSPTRG00000047655	MAF (ENSPTRG00000045874)	DYNLRB2 (ENSPTRG00000008379)	CDYL2 (ENSPTRG00000008380) #19	CMC2 (ENSPTRG00000008382) #20	CENPN (ENSPTRG00000008383) #21	ATMIN (ENSPTRG00000008384) #22	C16H16orf46 (ENSPTRG00000008385) #23	GCSH (ENSPTRG00000008386) #24	ENSPTRG00000043634 #25	BCO1 (ENSPTRG00000008389) #26	GAN (ENSPTRG00000008391) #27	CMIP (ENSPTRG00000008393) #28	ENSPTRG00000052311	ENSPTRG00000042898	PLCG2 (ENSPTRG00000008395) #29	SDR42E1 (ENSPTRG00000008396) #30	HSD17B2 (ENSPTRG00000008397)	MPHOSPH6 (ENSPTRG00000008398)	CDH13 (ENSPTRG00000008400)	HSBP1 (ENSPTRG00000008401)	MLYCD (ENSPTRG00000008403)
Bonobo	MODERN SPECIES	7	DUXB (ENSPPAG00000028561)	ENSPPAG00000037627	CNTNAP4 (ENSPPAG00000005772)	MON1B (ENSPPAG00000030166)	SYCE1L (ENSPPAG00000040039)	ADAMTS18 (ENSPPAG00000003071)	NUDT7 (ENSPPAG00000039743)	VAT1L (ENSPPAG00000027927)	CLEC3A (ENSPPAG00000022224)	WWOX (ENSPPAG00000038043)	ENSPPAG00000020043	ENSPPAG00000025636	CDYL2 (ENSPPAG00000033654) #19	ENSPPAG00000031935 #20	CENPN (ENSPPAG00000036057) #21	ENSPPAG00000017223 #22	C16orf46 (ENSPPAG00000040845) #23	ENSPPAG00000014722 ##24	ENSPPAG00000038301 #25	BCO1 (ENSPPAG00000013810) #26	GAN (ENSPPAG00000040205) #27	CMIP (ENSPPAG00000042404) #28	PLCG2 (ENSPPAG00000039636) #29	SDR42E1 (ENSPPAG00000033148) #30	HSD17B2 (ENSPPAG00000037971)	MPHOSPH6 (ENSPPAG00000040858)	CDH13 (ENSPPAG00000039487)	ENSPPAG00000040330	MLYCD (ENSPPAG00000040926)	OSGIN1 (ENSPPAG00000026986)	NECAB2 (ENSPPAG00000019159)
Human	MODERN SPECIES	7	CNTNAP4 (ENSG00000152910)	MON1B (ENSG00000103111)	SYCE1L (ENSG00000205078)	ADAMTS18 (ENSG00000140873)	NUDT7 (ENSG00000140876)	VAT1L (ENSG00000171724)	CLEC3A (ENSG00000166509)	WWOX (ENSG00000186153)	MAF (ENSG00000178573)	DYNLRB2 (ENSG00000168589)	CDYL2 (ENSG00000166446) #19	ENSG00000286221	CMC2 (ENSG00000103121) #20	CENPN (ENSG00000166451) #21	ENSG00000284512	ATMIN (ENSG00000166454) #22	C16orf46 (ENSG00000166455) #23	ENSG00000260643	GCSH (ENSG00000140905) #24	PKD1L2 (ENSG00000166473) #25	BCO1 (ENSG00000135697) #26	GAN (ENSG00000261609) #27	CMIP (ENSG00000153815) #28	PLCG2 (ENSG00000197943) #29	SDR42E1 (ENSG00000184860) #30	HSD17B2 (ENSG00000086696)	MPHOSPH6 (ENSG00000135698)	CDH13 (ENSG00000140945)	HSBP1 (ENSG00000230989)	MLYCD (ENSG00000103150)	OSGIN1 (ENSG00000140961)
Gorilla	MODERN SPECIES	7	ENSGGOG00000023451	CNTNAP4 (ENSGGOG00000009394)	MON1B (ENSGGOG00000016471)	SYCE1L (ENSGGOG00000043044)	ADAMTS18 (ENSGGOG00000034890)	NUDT7 (ENSGGOG00000017049)	VAT1L (ENSGGOG00000009496)	CLEC3A (ENSGGOG00000009506)	WWOX (ENSGGOG00000042973)	ENSGGOG00000028287	ENSGGOG00000011454	ENSGGOG00000008687	CDYL2 (ENSGGOG00000006084) #19	ENSGGOG00000006740 #20	CENPN (ENSGGOG00000002868) #21	ATMIN (ENSGGOG00000013004) #22	C16orf46 (ENSGGOG00000006688) #23	GCSH (ENSGGOG00000000232) #24	ENSGGOG00000000233 #25	BCO1 (ENSGGOG00000000237) #26	GAN (ENSGGOG00000014214) #27	CMIP (ENSGGOG00000000035) #28	ENSGGOG00000025361	PLCG2 (ENSGGOG00000017132) #29	SDR42E1 (ENSGGOG00000013178) #30	HSD17B2 (ENSGGOG00000016637)	MPHOSPH6 (ENSGGOG00000001405)	CDH13 (ENSGGOG00000012330)	ENSGGOG00000036564	MLYCD (ENSGGOG00000008007)	SLC38A8 (ENSGGOG00000003919)
Orangutan	MODERN SPECIES	7	ENSPPYG00000036122	CNTNAP4 (ENSPPYG00000007569)	MON1B (ENSPPYG00000007570)	SYCE1L (ENSPPYG00000007571)	ADAMTS18 (ENSPPYG00000007572)	NUDT7 (ENSPPYG00000007573)	VAT1L (ENSPPYG00000007574)	CLEC3A (ENSPPYG00000007575)	WWOX (ENSPPYG00000007576)	ENSPPYG00000007577	MAF (ENSPPYG00000041151)	ENSPPYG00000007579	CDYL2 (ENSPPYG00000007580) #19	ENSPPYG00000007581	CENPN (ENSPPYG00000007582) #21	ATMIN (ENSPPYG00000007583) #22	C16orf46 (ENSPPYG00000007584) #23	GCSH (ENSPPYG00000007585) #24	ENSPPYG00000007586 #25	BCO1 (ENSPPYG00000007587) #26	GAN (ENSPPYG00000007588) #27	CMIP (ENSPPYG00000007738) #28	PLCG2 (ENSPPYG00000007589) #29	SDR42E1 (ENSPPYG00000007590) #30	HSD17B2 (ENSPPYG00000007591)	MPHOSPH6 (ENSPPYG00000007592)	CDH13 (ENSPPYG00000007593)	HSBP1 (ENSPPYG00000041045)	MLYCD (ENSPPYG00000007594)	OSGIN1 (ENSPPYG00000007595)	NECAB2 (ENSPPYG00000007596)
Gibbon	MODERN SPECIES	11	CPHXL (ENSNLEG00000032281)	ENSNLEG00000033037	CNTNAP4 (ENSNLEG00000013100)	MON1B (ENSNLEG00000013161)	ADAMTS18 (ENSNLEG00000013176)	NUDT7 (ENSNLEG00000013280)	VAT1L (ENSNLEG00000013285)	CLEC3A (ENSNLEG00000030222)	WWOX (ENSNLEG00000013308)	ENSNLEG00000030521	MAF (ENSNLEG00000010420)	ENSNLEG00000010422	CDYL2 (ENSNLEG00000010424) #19	ENSNLEG00000010438 #20	CENPN (ENSNLEG00000010442) #21	ATMIN (ENSNLEG00000029083) #22	C16orf46 (ENSNLEG00000035295) #23	GCSH (ENSNLEG00000035315) #24	ENSNLEG00000010482 #25	BCO1 (ENSNLEG00000010612) #26	GAN (ENSNLEG00000010617) #27	ENSNLEG00000010677	CMIP (ENSNLEG00000010663) #28	PLCG2 (ENSNLEG00000010678) #29	SDR42E1 (ENSNLEG00000010695) #30	HSD17B2 (ENSNLEG00000010702)	MPHOSPH6 (ENSNLEG00000010725)	CDH13 (ENSNLEG00000010747)	HSBP1 (ENSNLEG00000035650)	MLYCD (ENSNLEG00000029910)	ENSNLEG00000010850
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	19										ENSGT00910000147621	ENSGT00950000182894.B	ENSGT00390000015513.a.a.b	ENSGT00390000015513.a.a.a	ENSGT00940000155211	ENSGT00390000016390	ENSGT00390000013091.p #22	ENSGT00940000159011	ENSGT00940000163752	ENSGT00490000044166	ENSGT00940000161328	ENSGT00940000160266	ENSGT00940000160237	ENSGT00670000098074	ENSGT00520000055591.b	ENSGT00940000155950.g.a	ENSGT00510000048363	ENSGT00950000183077.a.a.a.a.a.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000153505.a.b.b	ENSGT00940000163051	ENSGT00940000154367.a	ENSGT00940000163510.D
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000157161.b	ENSGT00530000063168.a.b	ENSGT00390000001747	ENSGT00530000063168.a.a.a	ENSGT00910000148179	ENSGT00940000158148	ENSGT00940000160218	ENSGT00390000004113	ENSGT00940000163169	ENSGT00410000025793.b.t	ENSGT00940000156081	ENSGT00390000015513.a.a.b	ENSGT00390000015513.a.a.a	ENSGT00940000155211	ENSGT00390000016390	ENSGT00390000013091.p #22	ENSGT00940000159011	ENSGT00940000161328	ENSGT00940000163752	ENSGT00940000160266	ENSGT00940000160237	ENSGT00670000098074	ENSGT00520000055591.b	ENSGT00940000155950.g.a	ENSGT00510000048363	ENSGT00950000183077.a.a.a.a.a.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000153505.a.b.b	ENSGT00940000163051	ENSGT00940000154367.a	ENSGT00940000163510.D	ENSGT00940000153246.a.a.b
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Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000158892.b	ENSGT00940000157161.b	ENSGT00530000063168.a.b	ENSGT00390000001747	ENSGT00530000063168.a.a.a	ENSGT00940000158148.n	ENSGT00940000160218	ENSGT00390000004113	ENSGT00940000163169	ENSGT00410000025793.b.t	ENSGT00940000156081	ENSGT00390000015513.a.a.b	ENSGT00390000015513.a.a.a	ENSGT00940000155211	ENSGT00390000016390	ENSGT00390000013091.p #22	ENSGT00940000159011	ENSGT00940000161328	ENSGT00940000153336.e.a.a.a.a.e	ENSGT00940000163752	ENSGT00940000160266	ENSGT00940000160237	ENSGT00670000098074	ENSGT00520000055591.b	ENSGT00940000155950.g.a	ENSGT00510000048363.g	ENSGT00950000183077.a.a.a.a.a.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000153505.a.b.b	ENSGT00940000163051	ENSGT00940000154367.a	ENSGT00940000163510.D
Pan	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000158892.b	ENSGT00940000157161.b	ENSGT00530000063168.a.b	ENSGT00390000001747	ENSGT00530000063168.a.a.a	ENSGT00940000158148.n	ENSGT00940000160218	ENSGT00390000004113	ENSGT00940000163169	ENSGT00410000025793.b.t	ENSGT00940000156081	ENSGT00390000015513.a.a.b	ENSGT00390000015513.a.a.a	ENSGT00940000155211	ENSGT00390000016390	ENSGT00390000013091.p #22	ENSGT00940000159011	ENSGT00940000161328	ENSGT00940000153336.e.a.a.a.a.e	ENSGT00940000160266	ENSGT00940000160237	ENSGT00670000098074	ENSGT00520000055591.b	ENSGT00940000155950.g.a	ENSGT00510000048363.g	ENSGT00940000155950.g.b.c	ENSGT00510000048363.h.a	ENSGT00950000183077.a.a.a.a.a.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000153505.a.b.b	ENSGT00940000163051	ENSGT00940000154367.a
Chimpanzee	MODERN SPECIES	22	NINJ1 (ENSPTRG00000021124)	WNK2 (ENSPTRG00000044172)	FAM120A2P (ENSPTRG00000029217)	FAM120AOS (ENSPTRG00000049688)	FAM120A (ENSPTRG00000021127)	PHF2 (ENSPTRG00000021128)	BARX1 (ENSPTRG00000021129)	PTPDC1 (ENSPTRG00000021130)	ZNF169 (ENSPTRG00000021131)	ENSPTRG00000041325	MFSD14B (ENSPTRG00000021134)	FBP2 (ENSPTRG00000021136)	FBP1 (ENSPTRG00000021138)	AOPEP (ENSPTRG00000021139)	FANCC (ENSPTRG00000021140)	ENSPTRG00000039664 #22	ENSPTRG00000049213	PTCH1 (ENSPTRG00000046951)	ERCC6L2 (ENSPTRG00000048689)	ENSPTRG00000043521	HSD17B3 (ENSPTRG00000021150)	SLC35D2 (ENSPTRG00000021151)	ZNF367 (ENSPTRG00000021153)	ENSPTRG00000046335	HABP4 (ENSPTRG00000021154)	CDC14B (ENSPTRG00000021155)	PRXL2C (ENSPTRG00000021156)	ENSPTRG00000044248	ZNF510 (ENSPTRG00000023307)	ZNF782 (ENSPTRG00000021157)	ENSPTRG00000021132
Bonobo	MODERN SPECIES	22	CARD19 (ENSPPAG00000033925)	NINJ1 (ENSPPAG00000036288)	WNK2 (ENSPPAG00000041184)	ENSPPAG00000040654	FAM120AOS (ENSPPAG00000036180)	FAM120A (ENSPPAG00000010221)	PHF2 (ENSPPAG00000038271)	ENSPPAG00000028799	PTPDC1 (ENSPPAG00000036709)	ZNF169 (ENSPPAG00000037304)	MFSD14B (ENSPPAG00000025011)	FBP2 (ENSPPAG00000034055)	FBP1 (ENSPPAG00000042827)	AOPEP (ENSPPAG00000028823)	FANCC (ENSPPAG00000037232)	ENSPPAG00000033158 #22	PTCH1 (ENSPPAG00000042033)	ENSPPAG00000035061	ENSPPAG00000042252	HSD17B3 (ENSPPAG00000040278)	ENSPPAG00000039175	ZNF367 (ENSPPAG00000035864)	HABP4 (ENSPPAG00000031320)	ENSPPAG00000039845	ENSPPAG00000038888	ENSPPAG00000033645	ZNF510 (ENSPPAG00000038934)	ZNF782 (ENSPPAG00000040069)	CTSV (ENSPPAG00000041013)	ENSPPAG00000033776	CCDC180 (ENSPPAG00000009246)
Gorilla	MODERN SPECIES	22	FAM120A (ENSGGOG00000003353)	ENSGGOG00000040022	PHF2 (ENSGGOG00000004414)	BARX1 (ENSGGOG00000010464)	ENSGGOG00000012440	ENSGGOG00000024707	ENSGGOG00000027871	ZNF169 (ENSGGOG00000025313)	ENSGGOG00000009983	ENSGGOG00000008048	MFSD14B (ENSGGOG00000008483)	FBP2 (ENSGGOG00000005665)	FBP1 (ENSGGOG00000005671)	AOPEP (ENSGGOG00000005975)	FANCC (ENSGGOG00000005983)	ENSGGOG00000040052 #22	PTCH1 (ENSGGOG00000008123)	ENSGGOG00000002705	ENSGGOG00000004382	HSD17B3 (ENSGGOG00000002825)	SLC35D2 (ENSGGOG00000007499)	ZNF367 (ENSGGOG00000012699)	HABP4 (ENSGGOG00000012317)	CDC14B (ENSGGOG00000008986)	ENSGGOG00000036718	ZNF510 (ENSGGOG00000002140)	ZNF782 (ENSGGOG00000013745)	CTSV (ENSGGOG00000024642)	ENSGGOG00000041208	ENSGGOG00000025728	CCDC180 (ENSGGOG00000012429)
Gibbon	MODERN SPECIES	10	ENSNLEG00000035210	PTPDC1 (ENSNLEG00000016629)	ENSNLEG00000036255	ZNF169 (ENSNLEG00000016651)	ENSNLEG00000030528	MFSD14B (ENSNLEG00000016654)	ENSNLEG00000035369	ENSNLEG00000016673	ENSNLEG00000034642	ENSNLEG00000032096	TEKT4 (ENSNLEG00000016708)	FBP2 (ENSNLEG00000016721)	FBP1 (ENSNLEG00000016727)	AOPEP (ENSNLEG00000016734)	FANCC (ENSNLEG00000016749)	ENSNLEG00000010465 #22	PTCH1 (ENSNLEG00000016755)	ENSNLEG00000032943	ENSNLEG00000016784	HSD17B3 (ENSNLEG00000032342)	SLC35D2 (ENSNLEG00000016807)	ENSNLEG00000016813	ENSNLEG00000029121	HABP4 (ENSNLEG00000016819)	CDC14B (ENSNLEG00000016822)	PRXL2C (ENSNLEG00000036194)	ENSNLEG00000027861	ZNF510 (ENSNLEG00000016838)	ZNF782 (ENSNLEG00000016845)	ENSNLEG00000018342	CTSV (ENSNLEG00000016847)
Platyrrhini	DUPLICATION
Platyrrhini	DUPLICATION
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000013091.q.a #22
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000013091.q.a #22
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000011725.d	ENSGT00940000153655.A.b	ENSGT00940000159812	ENSGT00940000162644	ENSGT00850000132319.a.a.a	ENSGT00940000155877.i.a.b	ENSGT00440000037505.a	ENSGT01060000248589.B	ENSGT01060000248592.D	ENSGT01060000248592.B	ENSGT01060000248592.E	ENSGT00940000158290	ENSGT00940000161405	ENSGT00940000155975	ENSGT01030000234621.A	ENSGT00390000013091.q.a #22	ENSGT00950000182897.B.a.a	ENSGT01030000234621.B	ENSGT00940000160283	ENSGT01030000234571.a.a	ENSGT00940000156903	ENSGT00390000003715	ENSGT00940000156745	ENSGT00940000166505	ENSGT00940000153773.a.a.b.c.a	ENSGT00940000157185	ENSGT00390000004493	ENSGT00940000154019.a	ENSGT00390000006591.d	ENSGT00940000156760	ENSGT00390000000970.b.n.a.b
Capuchin	MODERN SPECIES	25	SELENOT (ENSCCAG00000018531)	ENSCCAG00000018164	ERICH6 (ENSCCAG00000028850)	SIAH2 (ENSCCAG00000032110)	MINDY4B (ENSCCAG00000001023)	CLRN1 (ENSCCAG00000020009)	MED12L (ENSCCAG00000038021)	GPR171 (ENSCCAG00000004527)	GPR87 (ENSCCAG00000029287)	P2RY13 (ENSCCAG00000026652)	P2RY12 (ENSCCAG00000001489)	IGSF10 (ENSCCAG00000022669)	AADACL2 (ENSCCAG00000030862)	AADAC (ENSCCAG00000029588)	SUCNR1 (ENSCCAG00000036210)	ENSCCAG00000033295 #22	MBNL1 (ENSCCAG00000036732)	P2RY1 (ENSCCAG00000001488)	RAP2B (ENSCCAG00000019904)	ENSCCAG00000030504	ENSCCAG00000028759	ARHGEF26 (ENSCCAG00000025030)	DHX36 (ENSCCAG00000035199)	GPR149 (ENSCCAG00000037844)	MME (ENSCCAG00000033778)	STRIT1 (ENSCCAG00000034361)	ENSCCAG00000028512	PLCH1 (ENSCCAG00000027178)	C3orf33 (ENSCCAG00000020896)	SLC33A1 (ENSCCAG00000036825)	ENSCCAG00000031267
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	54	ERICH6 (ENSSBOG00000033438)	SIAH2 (ENSSBOG00000025717)	MINDY4B (ENSSBOG00000021253)	CLRN1 (ENSSBOG00000029016)	ENSSBOG00000035099	GPR171 (ENSSBOG00000009570)	GPR87 (ENSSBOG00000025278)	P2RY13 (ENSSBOG00000026950)	P2RY12 (ENSSBOG00000008981)	MED12L (ENSSBOG00000034783)	IGSF10 (ENSSBOG00000022507)	ENSSBOG00000024512	AADACL2 (ENSSBOG00000029261)	AADAC (ENSSBOG00000018433)	SUCNR1 (ENSSBOG00000035745)	ENSSBOG00000036049 #22	MBNL1 (ENSSBOG00000020980)	P2RY1 (ENSSBOG00000017142)	RAP2B (ENSSBOG00000010993)	ARHGEF26 (ENSSBOG00000019075)	DHX36 (ENSSBOG00000024666)	ENSSBOG00000014186	GPR149 (ENSSBOG00000019206)	MME (ENSSBOG00000016144)	ENSSBOG00000028023	STRIT1 (ENSSBOG00000010194)	ENSSBOG00000005590	PLCH1 (ENSSBOG00000035699)	C3orf33 (ENSSBOG00000022745)	SLC33A1 (ENSSBOG00000022127)	GMPS (ENSSBOG00000033046)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	401	SIAH2 (ENSANAG00000016748)	MINDY4B (ENSANAG00000038244)	CLRN1 (ENSANAG00000036741)	ENSANAG00000022057	ENSANAG00000031186	GPR171 (ENSANAG00000017383)	GPR87 (ENSANAG00000019565)	P2RY13 (ENSANAG00000038036)	P2RY12 (ENSANAG00000018631)	MED12L (ENSANAG00000029382)	IGSF10 (ENSANAG00000030658)	AADACL2 (ENSANAG00000027707)	AADAC (ENSANAG00000036921)	SUCNR1 (ENSANAG00000037486)	ENSANAG00000036831	ENSANAG00000015250 #22	MBNL1 (ENSANAG00000028111)	ENSANAG00000001399	P2RY1 (ENSANAG00000010368)	RAP2B (ENSANAG00000006728)	ENSANAG00000036489	ENSANAG00000026217	ENSANAG00000035507	DHX36 (ENSANAG00000020741)	GPR149 (ENSANAG00000037941)	ENSANAG00000030491	ENSANAG00000027891	MME (ENSANAG00000023570)
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	87																ENSGT00390000013091.q.b #22	ENSGT00390000005823	ENSGT00950000183008.a.b.d
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	82																ENSGT00390000013091.q.b #22	ENSGT00390000005823	ENSGT00950000183008.a.b.d
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	170																ENSGT00390000013091.q.b #22	ENSGT00390000005823	ENSGT00950000183008.a.b.d
Capuchin	MODERN SPECIES	56																ENSCCAG00000037877 #22	C3orf80 (ENSCCAG00000019682)	ENSCCAG00000038113	ENSCCAG00000027393	TRHR (ENSCCAG00000031514)	ENSCCAG00000024886	EIF3E (ENSCCAG00000026961)	RSPO2 (ENSCCAG00000018637)	ANGPT1 (ENSCCAG00000022543)	ABRA (ENSCCAG00000024449)	OXR1 (ENSCCAG00000028865)	ZFPM2 (ENSCCAG00000031529)	LRP12 (ENSCCAG00000022730)	DPYS (ENSCCAG00000031986)	DCSTAMP (ENSCCAG00000021560)	ENSCCAG00000034487
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	54	PTX3 (ENSSBOG00000030163)	VEPH1 (ENSSBOG00000027631)	ENSSBOG00000021272	SHOX2 (ENSSBOG00000035166)	RSRC1 (ENSSBOG00000027990)	MLF1 (ENSSBOG00000024403)	LXN (ENSSBOG00000034211)	GFM1 (ENSSBOG00000023252)	RARRES1 (ENSSBOG00000032081)	ENSSBOG00000026376	MFSD1 (ENSSBOG00000031153)	IQCJ (ENSSBOG00000013244)	ENSSBOG00000031233	ENSSBOG00000021868	IL12A (ENSSBOG00000034138)	ENSSBOG00000032637 #22	IFT80 (ENSSBOG00000032172)	ENSSBOG00000029510	ENSSBOG00000022707	KPNA4 (ENSSBOG00000033918)	OR2B3 (ENSSBOG00000020382)	PPM1L (ENSSBOG00000023959)	NMD3 (ENSSBOG00000024021)	SPTSSB (ENSSBOG00000019607)	ENSSBOG00000030988	OTOL1 (ENSSBOG00000028845)	SI (ENSSBOG00000025982)	SLITRK3 (ENSSBOG00000005267)	BCHE (ENSSBOG00000014953)	ZBBX (ENSSBOG00000035563)	SERPINI2 (ENSSBOG00000025243)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	400	ENSANAG00000036049	SHOX2 (ENSANAG00000013863)	ENSANAG00000029278	MLF1 (ENSANAG00000026540)	LXN (ENSANAG00000024771)	GFM1 (ENSANAG00000035983)	RARRES1 (ENSANAG00000027312)	MFSD1 (ENSANAG00000024294)	ENSANAG00000025825	ENSANAG00000021265	ENSANAG00000021216	ENSANAG00000018582	ENSANAG00000000056	IL12A (ENSANAG00000028740)	ENSANAG00000037662	ENSANAG00000029587 #22	C3orf80 (ENSANAG00000016866)	ENSANAG00000031841	IFT80 (ENSANAG00000027523)	ENSANAG00000034080	KPNA4 (ENSANAG00000027947)	PPM1L (ENSANAG00000035681)	NMD3 (ENSANAG00000026434)	SPTSSB (ENSANAG00000019578)	ENSANAG00000035210	OTOL1 (ENSANAG00000027787)	SI (ENSANAG00000031042)	SLITRK3 (ENSANAG00000018554)	BCHE (ENSANAG00000019984)
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00940000159769.b.d	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091.r #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.x.b #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00550000076258	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212.m.a	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00940000159769.b.d	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738.b #21	ENSGT00390000013091.r #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.x.b #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212.m.a	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	51			ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00940000159769.b.d	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738.b #21	ENSGT00390000013091.r #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.x.b #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212.m.a	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Bolivian squirrel monkey	DUPLICATION
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	137			MON1B (ENSSBOG00000035530)	SYCE1L (ENSSBOG00000020303)	ADAMTS18 (ENSSBOG00000017634)	NUDT7 (ENSSBOG00000031725)	VAT1L (ENSSBOG00000021201)	CLEC3A (ENSSBOG00000014185)	WWOX (ENSSBOG00000029958)	ENSSBOG00000033059	DYNLRB2 (ENSSBOG00000033490)	CDYL2 (ENSSBOG00000023679) #19	ENSSBOG00000020281	CMC2 (ENSSBOG00000026454) #20	ENSSBOG00000023971 #21	ENSSBOG00000020729 #22	C16orf46 (ENSSBOG00000029905) #23	ENSSBOG00000028280 ##24	ENSSBOG00000023334 #25	BCO1 (ENSSBOG00000014568) #26	GAN (ENSSBOG00000024113) #27	CMIP (ENSSBOG00000003467) #28	PLCG2 (ENSSBOG00000026469) #29	SDR42E1 (ENSSBOG00000034896) #30	HSD17B2 (ENSSBOG00000033511)	ENSSBOG00000031580	CDH13 (ENSSBOG00000019920)	HSBP1 (ENSSBOG00000027265)	ENSSBOG00000026816	MAP4K4 (ENSSBOG00000028082)	RFX8 (ENSSBOG00000019961)
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	46	PSMD14 (ENSSBOG00000023531)	TANK (ENSSBOG00000031963)	ENSSBOG00000028896	ENSSBOG00000034705	ITGB6 (ENSSBOG00000029531)	PLA2R1 (ENSSBOG00000009898)	LY75 (ENSSBOG00000033492)	CD302 (ENSSBOG00000027733)	MARCHF7 (ENSSBOG00000027159)	BAZ2B (ENSSBOG00000028235)	WDSUB1 (ENSSBOG00000022704)	TANC1 (ENSSBOG00000035294)	ENSSBOG00000020626	PKP4 (ENSSBOG00000035588)	CCDC148 (ENSSBOG00000028768)	ENSSBOG00000018918 #22	UPP2 (ENSSBOG00000025379)	ENSSBOG00000005244	ACVR1 (ENSSBOG00000025226)	ACVR1C (ENSSBOG00000030313)	ENSSBOG00000035700	CYTIP (ENSSBOG00000025520)	ENSSBOG00000028587	ERMN (ENSSBOG00000031955)	GALNT5 (ENSSBOG00000020422)	ENSSBOG00000023257	ENSSBOG00000027281	NR4A2 (ENSSBOG00000021402)	KCNJ3 (ENSSBOG00000023474)	ENSSBOG00000030750	GALNT13 (ENSSBOG00000024917)
Capuchin	MODERN SPECIES	137		MON1B (ENSCCAG00000022286)	SYCE1L (ENSCCAG00000027535)	ADAMTS18 (ENSCCAG00000020385)	NUDT7 (ENSCCAG00000016819)	VAT1L (ENSCCAG00000029888)	CLEC3A (ENSCCAG00000018795)	WWOX (ENSCCAG00000033057)	ENSCCAG00000020493	MAF (ENSCCAG00000033131)	ENSCCAG00000023113	DYNLRB2 (ENSCCAG00000023094)	CDYL2 (ENSCCAG00000029391) #19	CMC2 (ENSCCAG00000019738) #20	CENPN (ENSCCAG00000025012) #21	ENSCCAG00000001760 #22	C16orf46 (ENSCCAG00000023525) #23	ENSCCAG00000031393 #24	PKD1L2 (ENSCCAG00000037509) #25	BCO1 (ENSCCAG00000033122) #26	GAN (ENSCCAG00000016849) #27	CMIP (ENSCCAG00000024316) #28	PLCG2 (ENSCCAG00000020986) #29	SDR42E1 (ENSCCAG00000037533) #30	HSD17B2 (ENSCCAG00000015333)	ENSCCAG00000022557
Marmoset	MODERN SPECIES	12	ENSCJAG00000078953	MON1B (ENSCJAG00000014113)	SYCE1L (ENSCJAG00000014101)	ADAMTS18 (ENSCJAG00000014053)	NUDT7 (ENSCJAG00000043913)	VAT1L (ENSCJAG00000014046)	CLEC3A (ENSCJAG00000039841)	WWOX (ENSCJAG00000014032)	MAF (ENSCJAG00000041654)	ENSCJAG00000084007	ENSCJAG00000080145	DYNLRB2 (ENSCJAG00000016709)	CDYL2 (ENSCJAG00000016685) #19	CMC2 (ENSCJAG00000072359) #20	CENPN (ENSCJAG00000016673) #21	ATMIN (ENSCJAG00000016670) #22	C16orf46 (ENSCJAG00000016662) #23	ENSCJAG00000083289 #24	ENSCJAG00000016609 #25	BCO1 (ENSCJAG00000077714) #26	GAN (ENSCJAG00000016571) #27	CMIP (ENSCJAG00000016538) #28	ENSCJAG00000080065	PLCG2 (ENSCJAG00000016515) #29	SDR42E1 (ENSCJAG00000054745) #30	HSD17B2 (ENSCJAG00000016505)	MPHOSPH6 (ENSCJAG00000016498)	CDH13 (ENSCJAG00000008343)	HSBP1 (ENSCJAG00000047707)	MLYCD (ENSCJAG00000000633)	OSGIN1 (ENSCJAG00000083606)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	517											MAF (ENSANAG00000034156)	ENSANAG00000037239	DYNLRB2 (ENSANAG00000037742)	CDYL2 (ENSANAG00000021651) #19	CMC2 (ENSANAG00000023151) #20	ENSANAG00000032681 #22	C16orf46 (ENSANAG00000033425) #23	ENSANAG00000022292 ##24	ENSANAG00000025943 #25	BCO1 (ENSANAG00000031210) #26	GAN (ENSANAG00000033975) #27	ENSANAG00000033422	CMIP (ENSANAG00000021925) #28	PLCG2 (ENSANAG00000025033) #29	SDR42E1 (ENSANAG00000030613) #30	HSD17B2 (ENSANAG00000036673)	ENSANAG00000034555	CDH13 (ENSANAG00000028622)	HSBP1 (ENSANAG00000038047)	MLYCD (ENSANAG00000033161)	OSGIN1 (ENSANAG00000010277)
Tarsier	MODERN SPECIES	5652												DYNLRB2 (ENSTSYG00000007776)	CDYL2 (ENSTSYG00000011469) #19	CMC2 (ENSTSYG00000007059) #20	CENPN (ENSTSYG00000002871) #21	ATMIN (ENSTSYG00000036649) #22	C16orf46 (ENSTSYG00000035549) #23	ENSTSYG00000000248 #24	ENSTSYG00000026897 #25	BCO1 (ENSTSYG00000009405) #26	GAN (ENSTSYG00000036909) #27	CMIP (ENSTSYG00000028001) #28	PLCG2 (ENSTSYG00000014024) #29	SDR42E1 (ENSTSYG00000013803) #30	HSD17B2 (ENSTSYG00000013598)
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000165352	ENSGT00940000157674	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.`b.a #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00390000011666.`b.b #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	51												ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.`b.a #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00390000011666.`b.b #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293.yc	ENSGT00390000005410
Mouse lemur	DUPLICATION
Mouse lemur	MODERN SPECIES	12	TMEM231 (ENSMICG00000011968)	ENSMICG00000037996	GABARAPL2 (ENSMICG00000037412)	ADAT1 (ENSMICG00000011987)	KARS1 (ENSMICG00000011997)	TERF2IP (ENSMICG00000041861)	DUXB (ENSMICG00000042018)	CNTNAP4 (ENSMICG00000012242)	MON1B (ENSMICG00000009221)	SYCE1L (ENSMICG00000028524)	ADAMTS18 (ENSMICG00000009225)	DYNLRB2 (ENSMICG00000000631)	CDYL2 (ENSMICG00000000633) #19	CMC2 (ENSMICG00000011915) #20	CENPN (ENSMICG00000011918) #21	ENSMICG00000011930 #22	C16orf46 (ENSMICG00000045406) #23	ENSMICG00000045290 #24	ENSMICG00000011945 #25	BCO1 (ENSMICG00000014945) #26	GAN (ENSMICG00000014957) #27	MAF (ENSMICG00000043372)	WWOX (ENSMICG00000029194)	CLEC3A (ENSMICG00000047455)	VAT1L (ENSMICG00000009243)	ENSMICG00000041836	NUDT7 (ENSMICG00000031936)	ADGRG5 (ENSMICG00000031680)	CCDC102A (ENSMICG00000027073)	ENSMICG00000012449	ENSMICG00000041838
Mouse lemur	MODERN SPECIES	31	TTLL13 (ENSMICG00000012703)	NGRN (ENSMICG00000047039)	VPS33B (ENSMICG00000014841)	PRC1 (ENSMICG00000014826)	RCCD1 (ENSMICG00000008338)	UNC45A (ENSMICG00000008324)	HDDC3 (ENSMICG00000041559)	MAN2A2 (ENSMICG00000015397)	FES (ENSMICG00000015372)	FURIN (ENSMICG00000027223)	BLM (ENSMICG00000034442)	CRTC3 (ENSMICG00000006993)	IQGAP1 (ENSMICG00000006970)	ZNF774 (ENSMICG00000034148)	ZSCAN2 (ENSMICG00000038660)	ENSMICG00000030469 #22	WDR73 (ENSMICG00000015924)	NMB (ENSMICG00000015939)	SEC11A (ENSMICG00000015944)	ZNF592 (ENSMICG00000000763)	ALPK3 (ENSMICG00000033036)	ENSMICG00000000775	ENSMICG00000043870	PDE8A (ENSMICG00000000779)	ENSMICG00000035765	CPEB1 (ENSMICG00000026395)	AP3B2 (ENSMICG00000017195)	FSD2 (ENSMICG00000017199)	WHAMM (ENSMICG00000030573)	HOMER2 (ENSMICG00000017213)	ENSMICG00000046729
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	55											ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.`b.a #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00390000011666.`b.b #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293.yc	ENSGT00390000005410
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	399											MAF (ENSPCOG00000020508)	DYNLRB2 (ENSPCOG00000028370)	CDYL2 (ENSPCOG00000017731) #19	ENSPCOG00000020662	CENPN (ENSPCOG00000020111) #21	ATMIN (ENSPCOG00000019245) #22	C16orf46 (ENSPCOG00000021267) #23	ENSPCOG00000016082 #24	ENSPCOG00000018154 #25	BCO1 (ENSPCOG00000011909) #26	GAN (ENSPCOG00000016506) #27	CMIP (ENSPCOG00000026783) #28	PLCG2 (ENSPCOG00000017491) #29	SDR42E1 (ENSPCOG00000024993) #30	HSD17B2 (ENSPCOG00000015807)	ENSPCOG00000014174	CDH13 (ENSPCOG00000011394)	ENSPCOG00000013345	HSBP1 (ENSPCOG00000013114)	MLYCD (ENSPCOG00000014205)	OSGIN1 (ENSPCOG00000017513)
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	420												DYNLRB2 (ENSPSMG00000005504)	CDYL2 (ENSPSMG00000005531) #19	CMC2 (ENSPSMG00000005556) #20	CENPN (ENSPSMG00000005594) #21	ATMIN (ENSPSMG00000005678) #22	C16orf46 (ENSPSMG00000005682) #23	ENSPSMG00000005725 #24	ENSPSMG00000005766	ENSPSMG00000005782 #25	BCO1 (ENSPSMG00000005790) #26	GAN (ENSPSMG00000005802) #27	CMIP (ENSPSMG00000005904) #28	PLCG2 (ENSPSMG00000006135) #29	SDR42E1 (ENSPSMG00000006142) #30	HSD17B2 (ENSPSMG00000006150)	MPHOSPH6 (ENSPSMG00000006170)	CDH13 (ENSPSMG00000006218)	ENSPSMG00000006243	MLYCD (ENSPSMG00000006247)	OSGIN1 (ENSPSMG00000006253)
Bushbaby	DUPLICATION
Bushbaby	DUPLICATION
Bushbaby	MODERN SPECIES	162	KARS1 (ENSOGAG00000005903)	ENSOGAG00000005909	CNTNAP4 (ENSOGAG00000014485)	ENSOGAG00000024762	MON1B (ENSOGAG00000000955)	SYCE1L (ENSOGAG00000027541)	ADAMTS18 (ENSOGAG00000011951)	NUDT7 (ENSOGAG00000005648)	VAT1L (ENSOGAG00000005649)	CLEC3A (ENSOGAG00000005654)	ENSOGAG00000005657	ENSOGAG00000031340	DYNLRB2 (ENSOGAG00000000907)	CDYL2 (ENSOGAG00000000906) #19	CENPN (ENSOGAG00000006972) #21	ENSOGAG00000029620 #22	ENSOGAG00000029585	ENSOGAG00000007967 #24	ENSOGAG00000007970 #25	BCO1 (ENSOGAG00000016237) #26	GAN (ENSOGAG00000012484) #27	CMIP (ENSOGAG00000016409) #28	PLCG2 (ENSOGAG00000006986) #29	ENSOGAG00000006999 #30	HSD17B2 (ENSOGAG00000012529)	MPHOSPH6 (ENSOGAG00000012532)	CDH13 (ENSOGAG00000009291)	HSBP1 (ENSOGAG00000015437)	MLYCD (ENSOGAG00000009296)	OSGIN1 (ENSOGAG00000034472)	NECAB2 (ENSOGAG00000009297)
Bushbaby	MODERN SPECIES	506																ENSOGAG00000032597 #22	ENSOGAG00000024352
Bushbaby	MODERN SPECIES	221	SUCLA2 (ENSOGAG00000007452)	NUDT15 (ENSOGAG00000024482)	MED4 (ENSOGAG00000007456)	ITM2B (ENSOGAG00000007459)	ENSOGAG00000033501	RB1 (ENSOGAG00000007461)	LPAR6 (ENSOGAG00000007467)	RCBTB2 (ENSOGAG00000007469)	CRYL1 (ENSOGAG00000016250)	ENSOGAG00000030885	GJB6 (ENSOGAG00000005343)	GJB2 (ENSOGAG00000011675)	GJA3 (ENSOGAG00000015365)	ZMYM2 (ENSOGAG00000015350)	ENSOGAG00000034482	ENSOGAG00000024065 #22	ENSOGAG00000032663	PSPC1 (ENSOGAG00000012643)	MPHOSPH8 (ENSOGAG00000012635)	PARP4 (ENSOGAG00000016230)	CENPJ (ENSOGAG00000014821)	RNF17 (ENSOGAG00000014803)	ATP12A (ENSOGAG00000003804)	ENSOGAG00000031608	IFT88 (ENSOGAG00000006694)	IL17D (ENSOGAG00000001196)	EEF1AKMT1 (ENSOGAG00000033563)	XPO4 (ENSOGAG00000000048)	LATS2 (ENSOGAG00000005624)	SAP18 (ENSOGAG00000010062)	SKA3 (ENSOGAG00000003206)
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
Tree shrew	MODERN SPECIES	3582												DYNLRB2 (ENSTBEG00000000009)	CDYL2 (ENSTBEG00000000034) #19	CMC2 (ENSTBEG00000000038) #20	CENPN (ENSTBEG00000000039) #21	ATMIN (ENSTBEG00000000041) #22	C16orf46 (ENSTBEG00000000050) #23	GCSH (ENSTBEG00000000056) #24	PKD1L2 (ENSTBEG00000000066) #25	BCO1 (ENSTBEG00000000090) #26	ENSTBEG00000000096 #27
Glires	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00940000154420.B	ENSGT00940000167952	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212.j	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00940000154420.B	ENSGT00940000167952	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212.j	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00390000005351	ENSGT00940000157674	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212.j	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00390000005351	ENSGT00940000157674	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212.j	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT01030000234618.A	ENSGT00390000005351	ENSGT00940000157674	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212.j	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT01030000234618.A	ENSGT00390000005351	ENSGT00940000157674	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212.j	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT01030000234618.A	ENSGT00390000005351	ENSGT00940000157674	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212.j	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT01030000234618.A	ENSGT00390000005351	ENSGT00940000157674	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212.j	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	18	Terf2ip (ENSPEMG00000004753)	Cntnap4 (ENSPEMG00000012271)	Mon1b (ENSPEMG00000010449)	Syce1l (ENSPEMG00000007573)	Adamts18 (ENSPEMG00000017721)	Nudt7 (ENSPEMG00000015550)	Vat1l (ENSPEMG00000015665)	Clec3a (ENSPEMG00000031227)	Wwox (ENSPEMG00000016944)	ENSPEMG00000030824	Maf (ENSPEMG00000019355)	Dynlrb2 (ENSPEMG00000019948)	Cdyl2 (ENSPEMG00000019625) #19	ENSPEMG00000020157 #20	Cenpn (ENSPEMG00000002034) #21	Atmin (ENSPEMG00000019534) #22	ENSPEMG00000011494	1700030J22Rik (ENSPEMG00000014171) #23	Gcsh (ENSPEMG00000019328) #24	Pkd1l2 (ENSPEMG00000019583) #25	Bco1 (ENSPEMG00000020066) #26	Gan (ENSPEMG00000020147) #27	Cmip (ENSPEMG00000019741) #28	Plcg2 (ENSPEMG00000018570) #29	Sdr42e1 (ENSPEMG00000029375) #30	Hsd17b2 (ENSPEMG00000016574)	ENSPEMG00000031107	Mphosph6 (ENSPEMG00000019756)	Cdh13 (ENSPEMG00000019421)	ENSPEMG00000030115	Mlycd (ENSPEMG00000019846)
Prairie vole	MODERN SPECIES	12	Cntnap4 (ENSMOCG00000005286)	ENSMOCG00000010395	Mon1b (ENSMOCG00000003753)	Syce1l (ENSMOCG00000022883)	Adamts18 (ENSMOCG00000015505)	ENSMOCG00000010114	Nudt7 (ENSMOCG00000015530)	Vat1l (ENSMOCG00000018479)	Clec3a (ENSMOCG00000016149)	Wwox (ENSMOCG00000013122)	Maf (ENSMOCG00000017607)	Dynlrb2 (ENSMOCG00000016123)	Cdyl2 (ENSMOCG00000021578) #19	ENSMOCG00000007353 #20	Cenpn (ENSMOCG00000011952) #21	Atmin (ENSMOCG00000020741) #22	1700030J22Rik (ENSMOCG00000021044) #23	Gcsh (ENSMOCG00000000583) #24	Pkd1l2 (ENSMOCG00000017193) #25	Bco1 (ENSMOCG00000015152) #26	Gan (ENSMOCG00000022503) #27	Cmip (ENSMOCG00000009023) #28	Plcg2 (ENSMOCG00000014818) #29	Sdr42e1 (ENSMOCG00000021183) #30	Hsd17b2 (ENSMOCG00000021716)	ENSMOCG00000005132	Mphosph6 (ENSMOCG00000007125)	Cdh13 (ENSMOCG00000019245)	Hsbp1 (ENSMOCG00000017033)	Mlycd (ENSMOCG00000014323)	Osgin1 (ENSMOCG00000021893)
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT01030000234618.A	ENSGT00390000005351	ENSGT00940000157674	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212.j	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Chinese hamster chok1gshd	DUPLICATION
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	112	Adamts18 (ENSCGRG00001010706)	ENSCGRG00001011004	ENSCGRG00001010096	Nudt7 (ENSCGRG00001016438)	Vat1l (ENSCGRG00001022889)	Clec3a (ENSCGRG00001006598)	ENSCGRG00001019630	ENSCGRG00001011032	ENSCGRG00001011674	Wwox (ENSCGRG00001021234)	Maf (ENSCGRG00001007125)	Dynlrb2 (ENSCGRG00001000535)	Cdyl2 (ENSCGRG00001021515) #19	ENSCGRG00001019915 #20	Cenpn (ENSCGRG00001022755) #21	ENSCGRG00001013048 #22	1700030J22Rik (ENSCGRG00001020202) #23	ENSCGRG00001023751 #24	ENSCGRG00001024350	Pkd1l2 (ENSCGRG00001022012) #25	Bco1 (ENSCGRG00001021072) #26	Gan (ENSCGRG00001010582) #27	Cmip (ENSCGRG00001020795) #28	Plcg2 (ENSCGRG00001019941) #29	Sdr42e1 (ENSCGRG00001011865) #30	Hsd17b2 (ENSCGRG00001014890)	ENSCGRG00001019665	Cdh13 (ENSCGRG00001001385)	Hsbp1 (ENSCGRG00001016781)	Mlycd (ENSCGRG00001017150)	Osgin1 (ENSCGRG00001001559)
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	271							Ppp6c (ENSCGRG00001000312)	ENSCGRG00001005051	ENSCGRG00001000645	Zfp619 (ENSCGRG00001020374)	ENSCGRG00001022651	ENSCGRG00001011009	Vstm2b (ENSCGRG00001020469)	ENSCGRG00001017653	Pop4 (ENSCGRG00001017185)	ENSCGRG00001014372 #22	Zfp715 (ENSCGRG00001011966)	Siglecf (ENSCGRG00001009571)	Siglecg (ENSCGRG00001018242)	Gm38999 (ENSCGRG00001017564)	Lim2 (ENSCGRG00001014786)	Nkg7 (ENSCGRG00001014108)	Cldnd2 (ENSCGRG00001011312)	Etfb (ENSCGRG00001022229)	Vsig10l (ENSCGRG00001012455)	Iglon5 (ENSCGRG00001020985)	4931406B18Rik (ENSCGRG00001022577)	ENSCGRG00001020212	ENSCGRG00001018781	ENSCGRG00001017124	Siglece (ENSCGRG00001013597)
Golden Hamster	MODERN SPECIES	654	Gabarapl2 (ENSMAUG00000017141)	Adat1 (ENSMAUG00000009647)	Cntnap4 (ENSMAUG00000011098)	Mon1b (ENSMAUG00000000766)	Adamts18 (ENSMAUG00000022273)	ENSMAUG00000010341	ENSMAUG00000003225	Vat1l (ENSMAUG00000016275)	Clec3a (ENSMAUG00000014441)	Wwox (ENSMAUG00000007520)	Maf (ENSMAUG00000021039)	Dynlrb2 (ENSMAUG00000010167)	Cdyl2 (ENSMAUG00000015698) #19	ENSMAUG00000011255 #20	ENSMAUG00000017433 #21	Atmin (ENSMAUG00000015374) #22	1700030J22Rik (ENSMAUG00000012382) #23	ENSMAUG00000018099 #24	Pkd1l2 (ENSMAUG00000002511) #25	Bco1 (ENSMAUG00000008009) #26	ENSMAUG00000009114 #27	Cmip (ENSMAUG00000013194) #28	Plcg2 (ENSMAUG00000007620) #29	Sdr42e1 (ENSMAUG00000001530) #30	Hsd17b2 (ENSMAUG00000017677)	Mphosph6 (ENSMAUG00000011107)	Cdh13 (ENSMAUG00000006607)	Hsbp1 (ENSMAUG00000014829)	Mlycd (ENSMAUG00000016063)	Osgin1 (ENSMAUG00000006693)	Necab2 (ENSMAUG00000001187)
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT01030000234618.A	ENSGT00390000005351	ENSGT00940000157674	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212.j	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Mus	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT01030000234618.A	ENSGT00390000005351	ENSGT00940000157674	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212.j	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT01030000234618.A	ENSGT00390000005351	ENSGT00940000157674	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.cb #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212.j	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT01030000234618.A	ENSGT00390000005351	ENSGT00940000157674	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.cb #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212.j	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Mouse	MODERN SPECIES	17	Kars (ENSMUSG00000031948)	Terf2ip (ENSMUSG00000033430)	Cntnap4 (ENSMUSG00000031772)	Mon1b (ENSMUSG00000078908)	Syce1l (ENSMUSG00000033409)	Adamts18 (ENSMUSG00000053399)	Nudt7 (ENSMUSG00000031767)	Vat1l (ENSMUSG00000046844)	Clec3a (ENSMUSG00000008874)	Wwox (ENSMUSG00000004637)	Maf (ENSMUSG00000055435)	Dynlrb2 (ENSMUSG00000034467)	Cdyl2 (ENSMUSG00000031758) #19	Cmc2 (ENSMUSG00000014633)	Cenpn (ENSMUSG00000031756) #21	Atmin (ENSMUSG00000047388) #22	1700030J22Rik (ENSMUSG00000031847) #23	Gcsh (ENSMUSG00000034424) #24	Pkd1l2 (ENSMUSG00000034416) #25	Bco1 (ENSMUSG00000031845) #26	Gan (ENSMUSG00000052557) #27	Cmip (ENSMUSG00000034390) #28	Plcg2 (ENSMUSG00000034330) #29	Sdr42e1 (ENSMUSG00000034308) #30	Hsd17b2 (ENSMUSG00000031844)	Mphosph6 (ENSMUSG00000031843)	Cdh13 (ENSMUSG00000031841)	Hsbp1 (ENSMUSG00000031839)	Mlycd (ENSMUSG00000074064)	Osgin1 (ENSMUSG00000074063)	Necab2 (ENSMUSG00000031837)
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT01030000234618.A	ENSGT00390000005351	ENSGT00940000157674	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.cb #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212.j	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Steppe mouse	MODERN SPECIES	3379	Cntnap4 (ENSMSIG00000020072)	ENSMSIG00000020146	Mon1b (ENSMSIG00000020187)	Syce1l (ENSMSIG00000020198)	Adamts18 (ENSMSIG00000020295)	ENSMSIG00000020331	Nudt7 (ENSMSIG00000020337)	Vat1l (ENSMSIG00000020396)	Clec3a (ENSMSIG00000020422)	Wwox (ENSMSIG00000020449)	ENSMSIG00000020647	Dynlrb2 (ENSMSIG00000020660)	Cdyl2 (ENSMSIG00000020716) #19	ENSMSIG00000020729 #20	Cenpn (ENSMSIG00000020746) #21	Atmin (ENSMSIG00000020843) #22	1700030J22Rik (ENSMSIG00000020871) #23	ENSMSIG00000020877 #24	Pkd1l2 (ENSMSIG00000020891) #25	Bco1 (ENSMSIG00000021036) #26	Gan (ENSMSIG00000021114) #27	Cmip (ENSMSIG00000021151) #28	Plcg2 (ENSMSIG00000021222) #29	Sdr42e1 (ENSMSIG00000021283) #30	ENSMSIG00000021297
spretus	MODERN SPECIES	17	Kars (MGP_SPRETEiJ_G0032706)	Terf2ip (MGP_SPRETEiJ_G0032707)	Cntnap4 (MGP_SPRETEiJ_G0032708)	Mon1b (MGP_SPRETEiJ_G0032709)	Syce1l (MGP_SPRETEiJ_G0032710)	Adamts18 (MGP_SPRETEiJ_G0032711)	Nudt7 (MGP_SPRETEiJ_G0032712)	Vat1l (MGP_SPRETEiJ_G0032713)	Clec3a (MGP_SPRETEiJ_G0032714)	Wwox (MGP_SPRETEiJ_G0032715)	MGP_SPRETEiJ_G0032716	Dynlrb2 (MGP_SPRETEiJ_G0032717)	Cdyl2 (MGP_SPRETEiJ_G0032718) #19	Cmc2 (MGP_SPRETEiJ_G0032719)	Cenpn (MGP_SPRETEiJ_G0032720) #21	Atmin (MGP_SPRETEiJ_G0032721) #22	1700030J22Rik (MGP_SPRETEiJ_G0032722) #23	Gcsh (MGP_SPRETEiJ_G0032723) #24	Pkd1l2 (MGP_SPRETEiJ_G0032724) #25	Bco1 (MGP_SPRETEiJ_G0032725) #26	Gan (MGP_SPRETEiJ_G0032726) #27	Cmip (MGP_SPRETEiJ_G0032727) #28	Plcg2 (MGP_SPRETEiJ_G0032728) #29	Sdr42e1 (MGP_SPRETEiJ_G0032729) #30	Hsd17b2 (MGP_SPRETEiJ_G0032730)	Mphosph6 (MGP_SPRETEiJ_G0032731)	Cdh13 (MGP_SPRETEiJ_G0032732)	Hsbp1 (MGP_SPRETEiJ_G0032733)	Mlycd (MGP_SPRETEiJ_G0032734)	Osgin1 (MGP_SPRETEiJ_G0032735)	Necab2 (MGP_SPRETEiJ_G0032736)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	17	Kars (MGP_CAROLIEiJ_G0031588)	Terf2ip (MGP_CAROLIEiJ_G0031589)	Cntnap4 (MGP_CAROLIEiJ_G0031590)	Mon1b (MGP_CAROLIEiJ_G0031591)	Syce1l (MGP_CAROLIEiJ_G0031592)	Adamts18 (MGP_CAROLIEiJ_G0031593)	Nudt7 (MGP_CAROLIEiJ_G0031594)	Vat1l (MGP_CAROLIEiJ_G0031595)	Clec3a (MGP_CAROLIEiJ_G0031596)	Wwox (MGP_CAROLIEiJ_G0031597)	Maf (MGP_CAROLIEiJ_G0031598)	Dynlrb2 (MGP_CAROLIEiJ_G0031599)	Cdyl2 (MGP_CAROLIEiJ_G0031600) #19	Cmc2 (MGP_CAROLIEiJ_G0031601)	Cenpn (MGP_CAROLIEiJ_G0031602) #21	Atmin (MGP_CAROLIEiJ_G0031603) #22	1700030J22Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0031604) #23	Gcsh (MGP_CAROLIEiJ_G0031605) #24	Pkd1l2 (MGP_CAROLIEiJ_G0031606) #25	Bco1 (MGP_CAROLIEiJ_G0031607) #26	Gan (MGP_CAROLIEiJ_G0031608) #27	Cmip (MGP_CAROLIEiJ_G0031609) #28	Plcg2 (MGP_CAROLIEiJ_G0031610) #29	Sdr42e1 (MGP_CAROLIEiJ_G0031611) #30	Hsd17b2 (MGP_CAROLIEiJ_G0031612)	Mphosph6 (MGP_CAROLIEiJ_G0031613)	Cdh13 (MGP_CAROLIEiJ_G0031614)	Hsbp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0031615)	Mlycd (MGP_CAROLIEiJ_G0031616)	Osgin1 (MGP_CAROLIEiJ_G0031617)	Necab2 (MGP_CAROLIEiJ_G0031618)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	12	Kars (MGP_PahariEiJ_G0023186)	Terf2ip (MGP_PahariEiJ_G0023187)	Cntnap4 (MGP_PahariEiJ_G0023188)	Mon1b (MGP_PahariEiJ_G0023189)	Syce1l (MGP_PahariEiJ_G0023190)	Adamts18 (MGP_PahariEiJ_G0023191)	MGP_PahariEiJ_G0023192	Vat1l (MGP_PahariEiJ_G0023193)	Clec3a (MGP_PahariEiJ_G0023194)	Wwox (MGP_PahariEiJ_G0023195)	Maf (MGP_PahariEiJ_G0023196)	Dynlrb2 (MGP_PahariEiJ_G0023197)	Cdyl2 (MGP_PahariEiJ_G0023198) #19	Cmc2 (MGP_PahariEiJ_G0023199)	Cenpn (MGP_PahariEiJ_G0023200) #21	Atmin (MGP_PahariEiJ_G0023201) #22	1700030J22Rik (MGP_PahariEiJ_G0023202) #23	Gcsh (MGP_PahariEiJ_G0023203) #24	Pkd1l2 (MGP_PahariEiJ_G0023204) #25	Bco1 (MGP_PahariEiJ_G0023205) #26	Gan (MGP_PahariEiJ_G0023206) #27	Cmip (MGP_PahariEiJ_G0023207) #28	Plcg2 (MGP_PahariEiJ_G0023208) #29	Sdr42e1 (MGP_PahariEiJ_G0023209) #30	Hsd17b2 (MGP_PahariEiJ_G0023210)	Mphosph6 (MGP_PahariEiJ_G0023211)	Cdh13 (MGP_PahariEiJ_G0023212)	Hsbp1 (MGP_PahariEiJ_G0023213)	Mlycd (MGP_PahariEiJ_G0023214)	Osgin1 (MGP_PahariEiJ_G0023215)	Necab2 (MGP_PahariEiJ_G0023216)
Rat	MODERN SPECIES	10	AC126899.1 (ENSRNOG00000011065)	Cntnap4 (ENSRNOG00000011231)	Syce1l (ENSRNOG00000031097)	Mon1b (ENSRNOG00000011552)	Adamts18 (ENSRNOG00000011575)	ENSRNOG00000066574	Nudt7 (ENSRNOG00000011976)	Vat1l (ENSRNOG00000011989)	Clec3a (ENSRNOG00000070954)	Wwox (ENSRNOG00000012030)	Maf (ENSRNOG00000012428)	Dynlrb2 (ENSRNOG00000012450)	Cdyl2 (ENSRNOG00000042888) #19	Cmc2 (ENSRNOG00000068690)	Cenpn (ENSRNOG00000011296) #21	Atmin (ENSRNOG00000011422) #22	C19h16orf46 (ENSRNOG00000045541) #23	Gcsh (ENSRNOG00000011535) #24	Pkd1l2 (ENSRNOG00000045626) #25	Bco1 (ENSRNOG00000012027) #26	Gan (ENSRNOG00000012671) #27	Cmip (ENSRNOG00000013178) #28	Plcg2 (ENSRNOG00000051986) #29	Sdr42e1 (ENSRNOG00000051819) #30	Hsd17b2 (ENSRNOG00000013982)	Mphosph6 (ENSRNOG00000050087)	Cdh13 (ENSRNOG00000014371)	Hsbp1 (ENSRNOG00000014415)	Mlycd (ENSRNOG00000014522)	Osgin1 (ENSRNOG00000014948)	Necab2 (ENSRNOG00000015084)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1428														ENSNGAG00000015512 #20	Cenpn (ENSNGAG00000016612) #21	Atmin (ENSNGAG00000000027) #22	1700030J22Rik (ENSNGAG00000017698) #23	Gcsh (ENSNGAG00000000077) #24
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	337	Adat1 (ENSDORG00000004779)	Kars (ENSDORG00000004780)	Terf2ip (ENSDORG00000004783)	Cntnap4 (ENSDORG00000010466)	Mon1b (ENSDORG00000003584)	Adamts18 (ENSDORG00000003587)	Nudt7 (ENSDORG00000011038)	Vat1l (ENSDORG00000005299)	Clec3a (ENSDORG00000014965)	Wwox (ENSDORG00000014966)	Maf (ENSDORG00000028766)	Dynlrb2 (ENSDORG00000000891)	Cdyl2 (ENSDORG00000011301) #19	ENSDORG00000010432 #20	Cenpn (ENSDORG00000000402) #21	Atmin (ENSDORG00000029539) #22	1700030J22Rik (ENSDORG00000007829) #23	ENSDORG00000007831 #24	Bco1 (ENSDORG00000007838) #26	Gan (ENSDORG00000007841) #27	Cmip (ENSDORG00000007997) #28	Plcg2 (ENSDORG00000016026) #29	Sdr42e1 (ENSDORG00000007291) #30	Hsd17b2 (ENSDORG00000029871)	Mphosph6 (ENSDORG00000011060)	Cdh13 (ENSDORG00000015523)	ENSDORG00000009913	ENSDORG00000001345	Necab2 (ENSDORG00000001348)	Slc38a8 (ENSDORG00000016238)	Mbtps1 (ENSDORG00000016240)
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00940000154420.B	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212.j	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293.xc	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT01030000234618.A	ENSGT00390000005351.d	ENSGT00940000157674	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212.j	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293.xc	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT01030000234618.A	ENSGT00390000005351.d	ENSGT00940000157674	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT01030000234618.A	ENSGT00390000005351.d	ENSGT00940000157674	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	229					MON1B (ENSCLAG00000000195)	ENSCLAG00000000207	ADAMTS18 (ENSCLAG00000000225)	NUDT7 (ENSCLAG00000000398)	VAT1L (ENSCLAG00000000415)	CLEC3A (ENSCLAG00000000418)	WWOX (ENSCLAG00000000478)	DYNLRB2 (ENSCLAG00000000937)	CDYL2 (ENSCLAG00000000214) #19	CMC2 (ENSCLAG00000000295) #20	CENPN (ENSCLAG00000000300) #21	ATMIN (ENSCLAG00000000316) #22	ENSCLAG00000000329 #23	GCSH (ENSCLAG00000000355) #24	PKD1L2 (ENSCLAG00000000118) #25	BCO1 (ENSCLAG00000000277) #26	GAN (ENSCLAG00000000989) #27	CMIP (ENSCLAG00000000406) #28	PLCG2 (ENSCLAG00000000592) #29
Degu	MODERN SPECIES	52	TERF2IP (ENSODEG00000013617)	CNTNAP4 (ENSODEG00000014247)	MON1B (ENSODEG00000013202)	ENSODEG00000013470	ADAMTS18 (ENSODEG00000013530)	NUDT7 (ENSODEG00000012841)	VAT1L (ENSODEG00000013630)	CLEC3A (ENSODEG00000015370)	WWOX (ENSODEG00000014111)	MAF (ENSODEG00000014515)	DYNLRB2 (ENSODEG00000012819)	CDYL2 (ENSODEG00000012881) #19	ENSODEG00000019996	CMC2 (ENSODEG00000014155) #20	CENPN (ENSODEG00000012974) #21	ATMIN (ENSODEG00000012463) #22	GCSH (ENSODEG00000013012) #24	PKD1L2 (ENSODEG00000013047) #25	BCO1 (ENSODEG00000013835) #26	GAN (ENSODEG00000014419) #27	CMIP (ENSODEG00000013897) #28	PLCG2 (ENSODEG00000014144) #29	ENSODEG00000020092
Guinea pig	MODERN SPECIES	118					MON1B (ENSCPOG00000013894)	SYCE1L (ENSCPOG00000013897)	ADAMTS18 (ENSCPOG00000013899)	NUDT7 (ENSCPOG00000040012)	VAT1L (ENSCPOG00000007669)	CLEC3A (ENSCPOG00000033144)	WWOX (ENSCPOG00000001954)	DYNLRB2 (ENSCPOG00000021696)	CDYL2 (ENSCPOG00000008786) #19	CMC2 (ENSCPOG00000012364) #20	CENPN (ENSCPOG00000004015) #21	ATMIN (ENSCPOG00000020155) #22	ENSCPOG00000040141 #23	GCSH (ENSCPOG00000009983) #24
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	26	ENSHGLG00000037762	CNTNAP4 (ENSHGLG00000014557)	MON1B (ENSHGLG00000011826)	ENSHGLG00000042594	ADAMTS18 (ENSHGLG00000012658)	NUDT7 (ENSHGLG00000011902)	VAT1L (ENSHGLG00000010671)	CLEC3A (ENSHGLG00000042627)	WWOX (ENSHGLG00000013627)	MAF (ENSHGLG00000037503)	DYNLRB2 (ENSHGLG00000009690)	CDYL2 (ENSHGLG00000018737) #19	ENSHGLG00000019436	ENSHGLG00000039367	CENPN (ENSHGLG00000050859) #21	ATMIN (ENSHGLG00000014861) #22	C16orf46 (ENSHGLG00000034703) #23	GCSH (ENSHGLG00000044660) #24	ENSHGLG00000038072 #25	BCO1 (ENSHGLG00000017639) #26	GAN (ENSHGLG00000018670) #27	CMIP (ENSHGLG00000009888) #28	PLCG2 (ENSHGLG00000014242) #29	SDR42E1 (ENSHGLG00000010816) #30	ENSHGLG00000038316	MPHOSPH6 (ENSHGLG00000019140)	ENSHGLG00000045793	ENSHGLG00000018583	CIAO2B (ENSHGLG00000043672)	RRAD (ENSHGLG00000016885)	CDH16 (ENSHGLG00000019376)
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00940000154420.B	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212.i.a	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293.xc	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00940000154420.B	ENSGT00390000004738.c #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.ob.b #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212.i.a	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293.xc	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Alpin marmot	MODERN SPECIES	43	TERF2IP (ENSMMMG00000012629)	CNTNAP4 (ENSMMMG00000012584)	ENSMMMG00000012568	MON1B (ENSMMMG00000012559)	ADAMTS18 (ENSMMMG00000012500)	NUDT7 (ENSMMMG00000012478)	VAT1L (ENSMMMG00000012469)	CLEC3A (ENSMMMG00000012467)	WWOX (ENSMMMG00000012447)	ENSMMMG00000012440	DYNLRB2 (ENSMMMG00000012433)	CDYL2 (ENSMMMG00000012427) #19	CMC2 (ENSMMMG00000012416) #20	ENSMMMG00000012414	ENSMMMG00000012408 #21	ATMIN (ENSMMMG00000012386) #22	C16orf46 (ENSMMMG00000012372) #23	ENSMMMG00000012364 #24	PKD1L2 (ENSMMMG00000012278) #25	BCO1 (ENSMMMG00000012247) #26	GAN (ENSMMMG00000012233) #27	CMIP (ENSMMMG00000012172) #28	ENSMMMG00000012168	PLCG2 (ENSMMMG00000012131) #29	SDR42E1 (ENSMMMG00000012120) #30	HSD17B2 (ENSMMMG00000012113)	ENSMMMG00000012102	ENSMMMG00000012088	CDH13 (ENSMMMG00000012072)	MLYCD (ENSMMMG00000012063)	OSGIN1 (ENSMMMG00000012058)
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT01030000234618.A	ENSGT00390000005351	ENSGT00940000157674	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738.c #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.ob.b #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212.i.a.b
Squirrel	MODERN SPECIES	75	TERF2IP (ENSSTOG00000023669)	CNTNAP4 (ENSSTOG00000000938)	MON1B (ENSSTOG00000027070)	ENSSTOG00000026850	ADAMTS18 (ENSSTOG00000012392)	NUDT7 (ENSSTOG00000028240)	VAT1L (ENSSTOG00000005476)	CLEC3A (ENSSTOG00000005493)	WWOX (ENSSTOG00000028005)	DYNLRB2 (ENSSTOG00000023418)	CDYL2 (ENSSTOG00000013005) #19	CMC2 (ENSSTOG00000033130) #20	ENSSTOG00000030854 #21	ENSSTOG00000007345 #21	C16orf46 (ENSSTOG00000007385) #23	ATMIN (ENSSTOG00000007376) #22	GCSH (ENSSTOG00000016433) #24	PKD1L2 (ENSSTOG00000007401) #25	BCO1 (ENSSTOG00000007469) #26	GAN (ENSSTOG00000007492) #27	CMIP (ENSSTOG00000006702) #28	PLCG2 (ENSSTOG00000005756) #29	SDR42E1 (ENSSTOG00000027319) #30	HSD17B2 (ENSSTOG00000021305)	ENSSTOG00000019608
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	113				ENSUPAG00010009207	MON1B (ENSUPAG00010009187)	ADAMTS18 (ENSUPAG00010009111)	NUDT7 (ENSUPAG00010009093)	VAT1L (ENSUPAG00010009071)	CLEC3A (ENSUPAG00010009058)	WWOX (ENSUPAG00010009031)	MAF (ENSUPAG00010009006)	DYNLRB2 (ENSUPAG00010008995)	CDYL2 (ENSUPAG00010008980) #19	CMC2 (ENSUPAG00010008966) #20	ENSUPAG00010008959 #21	ATMIN (ENSUPAG00010008930) #22	C16orf46 (ENSUPAG00010008921) #23	ENSUPAG00010008909 #24	PKD1L2 (ENSUPAG00010008770) #25	BCO1 (ENSUPAG00010008730) #26	GAN (ENSUPAG00010008708) #27	CMIP (ENSUPAG00010008669) #28	ENSUPAG00010008662	PLCG2 (ENSUPAG00010008607) #29	SDR42E1 (ENSUPAG00010008582) #30	HSD17B2 (ENSUPAG00010008573)	ENSUPAG00010008571
Eurasian red squirrel	DUPLICATION
Eurasian red squirrel	DUPLICATION
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	8	CNTNAP4 (ENSSVLG00005016453)	MON1B (ENSSVLG00005016284)	SYCE1L (ENSSVLG00005016146)	ENSSVLG00005016092	ADAMTS18 (ENSSVLG00005015898)	NUDT7 (ENSSVLG00005015783)	VAT1L (ENSSVLG00005015671)	CLEC3A (ENSSVLG00005015615)	ENSSVLG00005015573	WWOX (ENSSVLG00005015526)	ENSSVLG00005015446	DYNLRB2 (ENSSVLG00005015349)	CDYL2 (ENSSVLG00005015278) #19	CMC2 (ENSSVLG00005015210) #20	CENPN (ENSSVLG00005015134) #21	ENSSVLG00005015037 #22	C16orf46 (ENSSVLG00005014992) #23	ENSSVLG00005025763	BCO1 (ENSSVLG00005025719) #26	GAN (ENSSVLG00005025710) #27	ENSSVLG00005025705	PLCG2 (ENSSVLG00005025677) #29	SDR42E1 (ENSSVLG00005025668) #30	ENSSVLG00005025661	HSD17B2 (ENSSVLG00005025655)	MPHOSPH6 (ENSSVLG00005025646)	CDH13 (ENSSVLG00005025632)	HSBP1 (ENSSVLG00005025608)	MLYCD (ENSSVLG00005025603)	OSGIN1 (ENSSVLG00005025591)	NECAB2 (ENSSVLG00005025579)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	16	ENSSVLG00005021418	ENSSVLG00005010938	ENSSVLG00005010970	ENSSVLG00005011101	ESR1 (ENSSVLG00005011518)	CCDC170 (ENSSVLG00005011680)	ARMT1 (ENSSVLG00005011814)	RMND1 (ENSSVLG00005011890)	ZBTB2 (ENSSVLG00005011964)	AKAP12 (ENSSVLG00005012004)	MTHFD1L (ENSSVLG00005012073)	PLEKHG1 (ENSSVLG00005012201)	IYD (ENSSVLG00005012284)	PPP1R14C (ENSSVLG00005012500)	ENSSVLG00005012559	ENSSVLG00005012613 #22	ENSSVLG00005012647	ENSSVLG00005012789	LRP11 (ENSSVLG00005012935)	ENSSVLG00005013084	PCMT1 (ENSSVLG00005013272)	NUP43 (ENSSVLG00005013493)	LATS1 (ENSSVLG00005013545)	KATNA1 (ENSSVLG00005013780)	ENSSVLG00005013892	PPIL4 (ENSSVLG00005013984)	ZC3H12D (ENSSVLG00005014060)	TAB2 (ENSSVLG00005014149)	ENSSVLG00005014219	UST (ENSSVLG00005014236)	SASH1 (ENSSVLG00005014292)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	92															ENSSVLG00005015223	ENSSVLG00005015103 #22
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00940000154420.B	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212.i.b	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b.b
Rabbit	MODERN SPECIES	16	CNTNAP4 (ENSOCUG00000002907)	ENSOCUG00000029408	MON1B (ENSOCUG00000024409)	ADAMTS18 (ENSOCUG00000014350)	NUDT7 (ENSOCUG00000001859)	VAT1L (ENSOCUG00000001863)	CLEC3A (ENSOCUG00000001866)	WWOX (ENSOCUG00000002504)	ENSOCUG00000035588	DYNLRB2 (ENSOCUG00000008578)	CDYL2 (ENSOCUG00000008581) #19	ENSOCUG00000035609	CMC2 (ENSOCUG00000013790) #20	ENSOCUG00000032694	CENPN (ENSOCUG00000000024) #21	ATMIN (ENSOCUG00000007807) #22	C16orf46 (ENSOCUG00000007811) #23	ENSOCUG00000011557 #24	ENSOCUG00000036494	ENSOCUG00000011939 #25	BCO1 (ENSOCUG00000001072) #26	GAN (ENSOCUG00000001073) #27	CMIP (ENSOCUG00000002120) #28	PLCG2 (ENSOCUG00000013105) #29	SDR42E1 (ENSOCUG00000016649) #30	HSD17B2 (ENSOCUG00000016655)	ENSOCUG00000024341	CDH13 (ENSOCUG00000025617)	HSBP1 (ENSOCUG00000001286)	ENSOCUG00000016223	ENSOCUG00000033324
Pika	MODERN SPECIES	3054													CDYL2 (ENSOPRG00000003180) #19	CMC2 (ENSOPRG00000003190) #20	CENPN (ENSOPRG00000003202) #21	ATMIN (ENSOPRG00000003220) #22	C16orf46 (ENSOPRG00000003260) #23	GCSH (ENSOPRG00000003281) #24	ENSOPRG00000003293 #25	BCO1 (ENSOPRG00000003425) #26	GAN (ENSOPRG00000003458) #27	CMIP (ENSOPRG00000003491) #28	PLCG2 (ENSOPRG00000003571) #29
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00940000167952	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000013091 #22
Common shrew	MODERN SPECIES	4757																ENSSARG00000011857 #22
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00940000167952	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
Suina	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00940000167952	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
Pig	DUPLICATION
Pig	MODERN SPECIES	14	ENSSSCG00000039747	MON1B (ENSSSCG00000002701)	ENSSSCG00000002700	ENSSSCG00000034356	ADAMTS18 (ENSSSCG00000038627)	NUDT7 (ENSSSCG00000002697)	VAT1L (ENSSSCG00000002696)	CLEC3A (ENSSSCG00000034604)	WWOX (ENSSSCG00000027415)	ENSSSCG00000058620	MAF (ENSSSCG00000040607)	DYNLRB2 (ENSSSCG00000031421)	CDYL2 (ENSSSCG00000038128) #19	ENSSSCG00000032060	CENPN (ENSSSCG00000039216) #21	ENSSSCG00000032216 #22	C16orf46 (ENSSSCG00000035388) #23	ENSSSCG00000040203 #24	PKD1L2 (ENSSSCG00000039200) #25	BCO1 (ENSSSCG00000036572) #26	GAN (ENSSSCG00000002690) #27	CMIP (ENSSSCG00000002689) #28	PLCG2 (ENSSSCG00000002688) #29	SDR42E1 (ENSSSCG00000035182) #30	HSD17B2 (ENSSSCG00000038221)	ENSSSCG00000034572	CDH13 (ENSSSCG00000002684)	HSBP1 (ENSSSCG00000057749)	MLYCD (ENSSSCG00000031450)	OSGIN1 (ENSSSCG00000032115)	SLC38A8 (ENSSSCG00000039218)
Pig	MODERN SPECIES	5	TLL2 (ENSSSCG00000010507)	OPALIN (ENSSSCG00000010506)	DNTT (ENSSSCG00000010505)	BLNK (ENSSSCG00000010504)	ZNF518A (ENSSSCG00000010503)	CCNJ (ENSSSCG00000010502)	CC2D2B (ENSSSCG00000046471)	ENTPD1 (ENSSSCG00000010497)	TCTN3 (ENSSSCG00000010496)	ALDH18A1 (ENSSSCG00000010495)	SORBS1 (ENSSSCG00000010494)	ENSSSCG00000055925	PDLIM1 (ENSSSCG00000010493)	ENSSSCG00000051054	CYP2C42 (ENSSSCG00000055326)	ENSSSCG00000010489 #22	ENSSSCG00000062451	ENSSSCG00000058563	CYP2C49 (ENSSSCG00000059716)	ENSSSCG00000035347	ENSSSCG00000055019	ENSSSCG00000032095	ENSSSCG00000061845	ENSSSCG00000057811	HELLS (ENSSSCG00000010486)	ENSSSCG00000022567	TBC1D12 (ENSSSCG00000010485)	NOC3L (ENSSSCG00000010484)	PLCE1 (ENSSSCG00000010483)	SLC35G1 (ENSSSCG00000027230)	LGI1 (ENSSSCG00000010481)
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	10	DUXB (ENSCWAG00000002591)	CNTNAP4 (ENSCWAG00000002643)	ENSCWAG00000002981	MON1B (ENSCWAG00000003007)	ADAMTS18 (ENSCWAG00000003043)	NUDT7 (ENSCWAG00000003085)	VAT1L (ENSCWAG00000003111)	CLEC3A (ENSCWAG00000003144)	WWOX (ENSCWAG00000003182)	MAF (ENSCWAG00000003304)	DYNLRB2 (ENSCWAG00000003320)	CDYL2 (ENSCWAG00000003341) #19	CMC2 (ENSCWAG00000003359) #20	ENSCWAG00000003362	CENPN (ENSCWAG00000003382) #21	ATMIN (ENSCWAG00000003427) #22	C16orf46 (ENSCWAG00000003437) #23	ENSCWAG00000003443 #24	ENSCWAG00000003448	ENSCWAG00000003458 #25	BCO1 (ENSCWAG00000003482) #26	GAN (ENSCWAG00000003493) #27	CMIP (ENSCWAG00000003539) #28	PLCG2 (ENSCWAG00000003695) #29	SDR42E1 (ENSCWAG00000003827) #30	HSD17B2 (ENSCWAG00000003852)	ENSCWAG00000003885	CDH13 (ENSCWAG00000003978)	ENSCWAG00000004352	MLYCD (ENSCWAG00000004385)	OSGIN1 (ENSCWAG00000004417)
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT01000000214745.b.a	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.f #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00940000159996.b	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000157674	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000004738.q.a #21	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738.r #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.f #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000157674	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000004738.q.a #21	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738.r #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.f #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT01050000244868.a.a.a.b.a.b.b	ENSGT00940000162711	ENSGT00940000159996.b	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157674	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00990000203553.c.b	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000004738.q.a #21	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.f #24	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00940000159996.b.a	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000157674	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00990000203553.c.b	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000004738.q.a #21	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.f #24	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000159996.b.a	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Narwhal	MODERN SPECIES	296	ENSMMNG00015000755	CNTNAP4 (ENSMMNG00015000561)	MON1B (ENSMMNG00015000449)	SYCE1L (ENSMMNG00015000389)	ADAMTS18 (ENSMMNG00015000332)	NUDT7 (ENSMMNG00015000278)	VAT1L (ENSMMNG00015000235)	CLEC3A (ENSMMNG00015000210)	WWOX (ENSMMNG00015000155)	ENSMMNG00015000027	MAF (ENSMMNG00015003720)	DYNLRB2 (ENSMMNG00015003694)	CDYL2 (ENSMMNG00015003666) #19	CENPN (ENSMMNG00015003599) #21	CMC2 (ENSMMNG00015003550) #20	ATMIN (ENSMMNG00015003532) #22	C16orf46 (ENSMMNG00015003505) #23	ENSMMNG00015003480	BCO1 (ENSMMNG00015003389) #26	ENSMMNG00015003355	GAN (ENSMMNG00015003328) #27	CMIP (ENSMMNG00015003203) #28	PLCG2 (ENSMMNG00015003113) #29	SDR42E1 (ENSMMNG00015003089) #30	HSD17B2 (ENSMMNG00015003068)	MPHOSPH6 (ENSMMNG00015003044)	CDH13 (ENSMMNG00015002972)	HSBP1 (ENSMMNG00015002935)	MLYCD (ENSMMNG00015002914)	OSGIN1 (ENSMMNG00015002851)	NECAB2 (ENSMMNG00015002809)
Beluga whale	MODERN SPECIES	12	ENSDLEG00000002292	CNTNAP4 (ENSDLEG00000002209)	MON1B (ENSDLEG00000002182)	ADAMTS18 (ENSDLEG00000002130)	NUDT7 (ENSDLEG00000002100)	VAT1L (ENSDLEG00000002079)	CLEC3A (ENSDLEG00000002066)	ENSDLEG00000002057	ENSDLEG00000002047	ENSDLEG00000002038	MAF (ENSDLEG00000002029)	DYNLRB2 (ENSDLEG00000002002)	CDYL2 (ENSDLEG00000001993) #19	CENPN (ENSDLEG00000001968) #21	ENSDLEG00000001954 #20	ATMIN (ENSDLEG00000001947) #22	CUNH16orf46 (ENSDLEG00000001938) #23	GCSH (ENSDLEG00000001922) #24	BCO1 (ENSDLEG00000001896) #26	ENSDLEG00000001893	GAN (ENSDLEG00000001871) #27	CMIP (ENSDLEG00000001842) #28	PLCG2 (ENSDLEG00000001817) #29	SDR42E1 (ENSDLEG00000001808) #30	HSD17B2 (ENSDLEG00000001788)	MPHOSPH6 (ENSDLEG00000001774)	CDH13 (ENSDLEG00000001760)	MLYCD (ENSDLEG00000001753)	OSGIN1 (ENSDLEG00000001743)	NECAB2 (ENSDLEG00000001725)	SLC38A8 (ENSDLEG00000001712)
Vaquita	MODERN SPECIES	10	ENSPSNG00000014400	CNTNAP4 (ENSPSNG00000014526)	MON1B (ENSPSNG00000016015)	SYCE1L (ENSPSNG00000016164)	ADAMTS18 (ENSPSNG00000016335)	NUDT7 (ENSPSNG00000016645)	VAT1L (ENSPSNG00000016714)	CLEC3A (ENSPSNG00000016763)	WWOX (ENSPSNG00000016826)	ENSPSNG00000016902	MAF (ENSPSNG00000016924)	DYNLRB2 (ENSPSNG00000016981)	CDYL2 (ENSPSNG00000017043) #19	ENSPSNG00000017109	CENPN (ENSPSNG00000017184) #21	ATMIN (ENSPSNG00000017296) #22	C16orf46 (ENSPSNG00000017374) #23	ENSPSNG00000017406 #24	BCO1 (ENSPSNG00000017682) #26	GAN (ENSPSNG00000017829) #27	ENSPSNG00000017863	CMIP (ENSPSNG00000017922) #28	PLCG2 (ENSPSNG00000018224) #29	SDR42E1 (ENSPSNG00000018307) #30	HSD17B2 (ENSPSNG00000018349)	MPHOSPH6 (ENSPSNG00000018456)	CDH13 (ENSPSNG00000018575)	HSBP1 (ENSPSNG00000018883)	MLYCD (ENSPSNG00000018921)	OSGIN1 (ENSPSNG00000018976)	NECAB2 (ENSPSNG00000019029)
Dolphin	MODERN SPECIES	3195														CMC2 (ENSTTRG00000007982) #20	CENPN (ENSTTRG00000007988) #21	ATMIN (ENSTTRG00000007989) #22	C16orf46 (ENSTTRG00000007991) #23	GCSH (ENSTTRG00000007992) #24	PKD1L2 (ENSTTRG00000007994) #25
Sperm whale	MODERN SPECIES	8	KARS (ENSPCTG00005014053)	TERF2IP (ENSPCTG00005014315)	ENSPCTG00005014372	CNTNAP4 (ENSPCTG00005014435)	MON1B (ENSPCTG00005015899)	SYCE1L (ENSPCTG00005016040)	ENSPCTG00005016194	NUDT7 (ENSPCTG00005016259)	VAT1L (ENSPCTG00005016341)	CLEC3A (ENSPCTG00005016505)	WWOX (ENSPCTG00005016572)	DYNLRB2 (ENSPCTG00005016690)	CDYL2 (ENSPCTG00005016738) #19	ENSPCTG00005016761	CENPN (ENSPCTG00005016837) #21	ATMIN (ENSPCTG00005016937) #22	C17H16orf46 (ENSPCTG00005016971) #23	ENSPCTG00005017009	ENSPCTG00005017044	ENSPCTG00005017248 #26	GAN (ENSPCTG00005017301) #27	ENSPCTG00005017350	PLCG2 (ENSPCTG00005017420) #29	SDR42E1 (ENSPCTG00005017582) #30	HSD17B2 (ENSPCTG00005017614)	MPHOSPH6 (ENSPCTG00005017703)	CDH13 (ENSPCTG00005017798)	HSBP1 (ENSPCTG00005018092)	ENSPCTG00005018157	OSGIN1 (ENSPCTG00005018585)	ENSPCTG00005018655
Blue whale	MODERN SPECIES	10	CNTNAP4 (ENSBMSG00010013511)	ENSBMSG00010013645	MON1B (ENSBMSG00010013661)	SYCE1L (ENSBMSG00010013688)	ADAMTS18 (ENSBMSG00010013750)	ENSBMSG00010013805	NUDT7 (ENSBMSG00010013822)	VAT1L (ENSBMSG00010013861)	CLEC3A (ENSBMSG00010013904)	WWOX (ENSBMSG00010013976)	MAF (ENSBMSG00010014160)	DYNLRB2 (ENSBMSG00010014210)	CDYL2 (ENSBMSG00010014282) #19	ENSBMSG00010014361	ENSBMSG00010014412 #21	ATMIN (ENSBMSG00010014471) #22	C16orf46 (ENSBMSG00010014516) #23	ENSBMSG00010014571 #24	BCO1 (ENSBMSG00010014729) #26	GAN (ENSBMSG00010014760) #27	ENSBMSG00010014813	CMIP (ENSBMSG00010014952) #28	PLCG2 (ENSBMSG00010015932) #29	SDR42E1 (ENSBMSG00010016016) #30	HSD17B2 (ENSBMSG00010016042)	ENSBMSG00010016071	CDH13 (ENSBMSG00010016147)	ENSBMSG00010016302	MLYCD (ENSBMSG00010016323)	ENSBMSG00010016347	NECAB2 (ENSBMSG00010016382)
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.h.a.a.b #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
Yarkand deer	MODERN SPECIES	27	ADAMTS18 (ENSCHYG00000000109)	ENSCHYG00000000127	ENSCHYG00000000143	NUDT7 (ENSCHYG00000000156)	VAT1L (ENSCHYG00000000176)	CLEC3A (ENSCHYG00000000192)	WWOX (ENSCHYG00000000219)	MAF (ENSCHYG00000000268)	DYNLRB2 (ENSCHYG00000000287)	CDYL2 (ENSCHYG00000000319) #19	ENSCHYG00000000338	ENSCHYG00000000345	ENSCHYG00000000359	ENSCHYG00000000384	ENSCHYG00000000403 #21	ATMIN (ENSCHYG00000000420) #22	C16orf46 (ENSCHYG00000000440) #23	ENSCHYG00000000480 #24	ENSCHYG00000000496	ENSCHYG00000000525 #25	BCO1 (ENSCHYG00000000591) #26	GAN (ENSCHYG00000000629) #27	CMIP (ENSCHYG00000000697) #28	PLCG2 (ENSCHYG00000000839) #29	SDR42E1 (ENSCHYG00000000977) #30	HSD17B2 (ENSCHYG00000000993)	ENSCHYG00000001028	CDH13 (ENSCHYG00000001073)	ENSCHYG00000001159	HSBP1 (ENSCHYG00000001187)	MLYCD (ENSCHYG00000001202)
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908.e #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.h.a.a.b #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
Siberian musk deer	DUPLICATION
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	1191	ENSMMSG00000005926	MON1B (ENSMMSG00000005961)	ADAMTS18 (ENSMMSG00000006104)	NUDT7 (ENSMMSG00000006153)	VAT1L (ENSMMSG00000006188)	ENSMMSG00000006218	CLEC3A (ENSMMSG00000006231)	WWOX (ENSMMSG00000006266)	ENSMMSG00000006308	MAF (ENSMMSG00000006317)	ENSMMSG00000006336	DYNLRB2 (ENSMMSG00000006363)	CDYL2 (ENSMMSG00000006390) #19	ENSMMSG00000006429 #20	CENPN (ENSMMSG00000006463) #21	ENSMMSG00000006535 #22	C16orf46 (ENSMMSG00000006560) #23	ENSMMSG00000006588 #24	ENSMMSG00000006620	ENSMMSG00000006646 #25	BCO1 (ENSMMSG00000006711) #26	GAN (ENSMMSG00000006796) #27	CMIP (ENSMMSG00000006942) #28	ENSMMSG00000007554	PLCG2 (ENSMMSG00000007574) #29	SDR42E1 (ENSMMSG00000007630) #30	HSD17B2 (ENSMMSG00000007653)	MPHOSPH6 (ENSMMSG00000007688)	CDH13 (ENSMMSG00000007802)	HSBP1 (ENSMMSG00000008024)	MLYCD (ENSMMSG00000008057)
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	1269	SLIT2 (ENSMMSG00000015533)	PACRGL (ENSMMSG00000015388)	KCNIP4 (ENSMMSG00000014468)	ENSMMSG00000014413	ADGRA3 (ENSMMSG00000014314)	GBA3 (ENSMMSG00000014264)	PPARGC1A (ENSMMSG00000014222)	DHX15 (ENSMMSG00000014182)	SOD3 (ENSMMSG00000014159)	CCDC149 (ENSMMSG00000014088)	LGI2 (ENSMMSG00000014063)	SEPSECS (ENSMMSG00000014034)	PI4K2B (ENSMMSG00000013983)	ENSMMSG00000013962	ANAPC4 (ENSMMSG00000013938)	ENSMMSG00000013917 #22	SLC34A2 (ENSMMSG00000013857)	SEL1L3 (ENSMMSG00000013767)	ENSMMSG00000013746	ENSMMSG00000013732	RBPJ (ENSMMSG00000013568)	CCKAR (ENSMMSG00000013523)	ENSMMSG00000013500	TBC1D19 (ENSMMSG00000013351)	STIM2 (ENSMMSG00000013185)	ENSMMSG00000013164	ENSMMSG00000013140	ENSMMSG00000013133	PCDH7 (ENSMMSG00000013089)	ENSMMSG00000013078	ENSMMSG00000013060
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908.e #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.h.a.a.b #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00530000064208.b.c.b	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908.e #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.h.a.a.b.a.a.a #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00910000146900	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410
Bos	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00530000064208.b.c.b	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908.e #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.h.a.a.b.a.a.a.b #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00960000192777	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00910000146900	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000005351	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908.e #20	ENSGT00390000004738.m #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.h.a.a.b.a.a.a.b #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00960000192777	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00910000146900	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293
Cow	MODERN SPECIES	9	TERF2IP (ENSBTAG00000015686)	CNTNAP4 (ENSBTAG00000026004)	ENSBTAG00000012131	MON1B (ENSBTAG00000052957)	ADAMTS18 (ENSBTAG00000001010)	NUDT7 (ENSBTAG00000007184)	VAT1L (ENSBTAG00000018146)	CLEC3A (ENSBTAG00000046772)	WWOX (ENSBTAG00000015894)	ENSBTAG00000050959	MAF (ENSBTAG00000044192)	DYNLRB2 (ENSBTAG00000017752)	CDYL2 (ENSBTAG00000017112) #19	CMC2 (ENSBTAG00000017009) #20	CENPN (ENSBTAG00000011635) #21	ATMIN (ENSBTAG00000008213) #22	C18H16orf46 (ENSBTAG00000023765) #23	GCSH (ENSBTAG00000006795) #24	PKD1L2 (ENSBTAG00000012693) #25	ENSBTAG00000051615	BCO1 (ENSBTAG00000001026) #26	GAN (ENSBTAG00000009428) #27	ENSBTAG00000050732	CMIP (ENSBTAG00000013524) #28	PLCG2 (ENSBTAG00000002103) #29	SDR42E1 (ENSBTAG00000018394) #30	HSD17B2 (ENSBTAG00000003234)	MPHOSPH6 (ENSBTAG00000009746)	ENSBTAG00000054821	CDH13 (ENSBTAG00000034373)	HSBP1 (ENSBTAG00000053436)
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	9		CNTNAP4 (ENSBIXG00005028712)	ENSBIXG00005028795	MON1B (ENSBIXG00005002293)	SYCE1L (ENSBIXG00005005033)	ADAMTS18 (ENSBIXG00005005070)	NUDT7 (ENSBIXG00005002142)	VAT1L (ENSBIXG00005002111)	CLEC3A (ENSBIXG00005005098)	WWOX (ENSBIXG00005002001)	MAF (ENSBIXG00005001960)	DYNLRB2 (ENSBIXG00005001913)	CDYL2 (ENSBIXG00005005167) #19	ENSBIXG00005005197	ENSBIXG00005005211 #21	ATMIN (ENSBIXG00005029184) #22	C16orf46 (ENSBIXG00005001704) #23	ENSBIXG00005001668 #24	ENSBIXG00005008306	ENSBIXG00005008337 #25	BCO1 (ENSBIXG00005008357) #26	GAN (ENSBIXG00005008371) #27	ENSBIXG00005008377	CMIP (ENSBIXG00005008441) #28	PLCG2 (ENSBIXG00005005354) #29	SDR42E1 (ENSBIXG00005008529) #30	HSD17B2 (ENSBIXG00005008546)	MPHOSPH6 (ENSBIXG00005000224)	CDH13 (ENSBIXG00005005903)	HSBP1 (ENSBIXG00005005940)	MLYCD (ENSBIXG00005006190)
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00530000064208.b.c.b	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908.e #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.h.a.a.b.a.a.a.b #24	ENSGT00390000011666.h.a.a.b.a.b #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00960000192777	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293
Domestic yak	MODERN SPECIES	12	CNTNAP4 (ENSBGRG00000024655)	ENSBGRG00000024592	MON1B (ENSBGRG00000024539)	SYCE1L (ENSBGRG00000024519)	ADAMTS18 (ENSBGRG00000024315)	ENSBGRG00000024244	VAT1L (ENSBGRG00000024156)	CLEC3A (ENSBGRG00000024115)	ENSBGRG00000024103	WWOX (ENSBGRG00000023828)	MAF (ENSBGRG00000023768)	DYNLRB2 (ENSBGRG00000023709)	CDYL2 (ENSBGRG00000023605) #19	CMC2 (ENSBGRG00000023563) #20	CENPN (ENSBGRG00000023413) #21	ATMIN (ENSBGRG00000023349) #22	C16orf46 (ENSBGRG00000023267) #23	ENSBGRG00000023192 #24	ENSBGRG00000023174	ENSBGRG00000023167	ENSBGRG00000022947 #25	BCO1 (ENSBGRG00000022755) #26	GAN (ENSBGRG00000022506) #27	ENSBGRG00000022460	CMIP (ENSBGRG00000020212) #28	PLCG2 (ENSBGRG00000019275) #29	SDR42E1 (ENSBGRG00000019208) #30	HSD17B2 (ENSBGRG00000019120)	MPHOSPH6 (ENSBGRG00000019000)	CDH13 (ENSBGRG00000018217)	HSBP1 (ENSBGRG00000018120)
Wild yak	MODERN SPECIES	2170										MAF (ENSBMUG00000006426)	ENSBMUG00000006431	DYNLRB2 (ENSBMUG00000006439)	CDYL2 (ENSBMUG00000006444) #19	CMC2 (ENSBMUG00000006462) #20	CENPN (ENSBMUG00000006510) #21	ATMIN (ENSBMUG00000006529) #22	C16orf46 (ENSBMUG00000006558) #23	ENSBMUG00000006574 #24	ENSBMUG00000006605	ENSBMUG00000006628 #25	BCMO1 (ENSBMUG00000006665) #26	GAN (ENSBMUG00000006681) #27	ENSBMUG00000006689	CMIP (ENSBMUG00000006723) #28
American bison	MODERN SPECIES	3209	CNTNAP4 (ENSBBBG00000019886)	ENSBBBG00000005336	MON1B (ENSBBBG00000019685)	ENSBBBG00000019668	ADAMTS18 (ENSBBBG00000005184)	NUDT7 (ENSBBBG00000019632)	VAT1L (ENSBBBG00000019613)	CLEC3A (ENSBBBG00000019590)	WWOX (ENSBBBG00000019578)	MAF (ENSBBBG00000005288)	ENSBBBG00000005280	DYNLRB2 (ENSBBBG00000019521)	CDYL2 (ENSBBBG00000019511) #19	ENSBBBG00000008949 #20	CENPN (ENSBBBG00000019457) #21	ATMIN (ENSBBBG00000019400) #22	C16orf46 (ENSBBBG00000005132) #23	ENSBBBG00000019376 #24	ENSBBBG00000005106	ENSBBBG00000007009 #25	BCO1 (ENSBBBG00000019337) #26	GAN (ENSBBBG00000008171) #27	CMIP (ENSBBBG00000009169) #28	PLCG2 (ENSBBBG00000004928) #29	SDR42E1 (ENSBBBG00000004897) #30	HSD17B2 (ENSBBBG00000019087)	MPHOSPH6 (ENSBBBG00000019077)	ENSBBBG00000019065	CDH13 (ENSBBBG00000019053)	ENSBBBG00000009154	HSBP1 (ENSBBBG00000008463)
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000005351	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908.e #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.h.a.a.b.c.a.a #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Rambouillet Sheep	DUPLICATION
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	5	ENSOARG00020021758	MON1B (ENSOARG00020021839)	ADAMTS18 (ENSOARG00020022075)	NUDT7 (ENSOARG00020022376)	VAT1L (ENSOARG00020022400)	ENSOARG00020022554	CLEC3A (ENSOARG00020022576)	WWOX (ENSOARG00020003215)	ENSOARG00020003259	MAF (ENSOARG00020003282)	DYNLRB2 (ENSOARG00020003305)	ENSOARG00020003382	CMC2 (ENSOARG00020003408) #20	CENPN (ENSOARG00020003427) #21	ENSOARG00020003451	ENSOARG00020003459 #22	ENSOARG00020003523 #24	ENSOARG00020003562	ENSOARG00020003601 #25	BCO1 (ENSOARG00020003735) #26	GAN (ENSOARG00020003869) #27	CMIP (ENSOARG00020004094) #28	PLCG2 (ENSOARG00020005201) #29	ENSOARG00020005853	ENSOARG00020005859	ENSOARG00020005864	SDR42E1 (ENSOARG00020005879) #30	HSD17B2 (ENSOARG00020005890)	MPHOSPH6 (ENSOARG00020005925)	CDH13 (ENSOARG00020005989)	ENSOARG00020006229
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	17	ENSOARG00020014283	MAP3K21 (ENSOARG00020014333)	ENSOARG00020014471	KCNK1 (ENSOARG00020014578)	SLC35F3 (ENSOARG00020014634)	ENSOARG00020014831	TARBP1 (ENSOARG00020014895)	ENSOARG00020015422	IRF2BP2 (ENSOARG00020015445)	TOMM20 (ENSOARG00020015523)	ENSOARG00020015590	ARID4B (ENSOARG00020015673)	GGPS1 (ENSOARG00020016218)	TBCE (ENSOARG00020016274)	B3GALNT2 (ENSOARG00020016542)	ENSOARG00020016607 #22	GNG4 (ENSOARG00020016634)	LYST (ENSOARG00020016708)	NID1 (ENSOARG00020017963)	GPR137B (ENSOARG00020018310)	ERO1B (ENSOARG00020018369)	EDARADD (ENSOARG00020018503)	LGALS8 (ENSOARG00020018619)	HEATR1 (ENSOARG00020018840)	ACTN2 (ENSOARG00020019247)	MTR (ENSOARG00020019401)	RYR2 (ENSOARG00020019907)	ENSOARG00020020560	ZP4 (ENSOARG00020020715)	CHRM3 (ENSOARG00020020814)	ZNF33B (ENSOARG00020020852)
Goat	MODERN SPECIES	9	MON1B (ENSCHIG00000020925)	ADAMTS18 (ENSCHIG00000011081)	NUDT7 (ENSCHIG00000014899)	VAT1L (ENSCHIG00000025649)	CLEC3A (ENSCHIG00000018485)	ENSCHIG00000021638	ENSCHIG00000018228	MAF (ENSCHIG00000022588)	ENSCHIG00000024635	POLR2C (ENSCHIG00000012072)	DOK4 (ENSCHIG00000024959)	DYNLRB2 (ENSCHIG00000011911)	CDYL2 (ENSCHIG00000012454) #19	CMC2 (ENSCHIG00000013555) #20	CENPN (ENSCHIG00000013032) #21	ATMIN (ENSCHIG00000022350) #22	C16orf46 (ENSCHIG00000023947) #23	ENSCHIG00000026231 #24	PKD1L2 (ENSCHIG00000004177) #25	BCO1 (ENSCHIG00000022901) #26	GAN (ENSCHIG00000025169) #27	CMIP (ENSCHIG00000006544) #28	PLCG2 (ENSCHIG00000017356) #29	SDR42E1 (ENSCHIG00000022692) #30	HSD17B2 (ENSCHIG00000002159)	ENSCHIG00000006189	MPHOSPH6 (ENSCHIG00000015522)	ENSCHIG00000013951	CDH13 (ENSCHIG00000011245)	HSBP1 (ENSCHIG00000019904)	MLYCD (ENSCHIG00000009133)
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000005351	ENSGT00940000154537	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00940000167952	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Arabian camel	MODERN SPECIES	35	TERF2IP (ENSCDRG00005015151)	CNTNAP4 (ENSCDRG00005015194)	ENSCDRG00005015417	MON1B (ENSCDRG00005015477)	ENSCDRG00005015563	ADAMTS18 (ENSCDRG00005015619)	NUDT7 (ENSCDRG00005015789)	VAT1L (ENSCDRG00005015834)	CLEC3A (ENSCDRG00005015888)	WWOX (ENSCDRG00005015930)	ENSCDRG00005015981	DYNLRB2 (ENSCDRG00005016530)	CDYL2 (ENSCDRG00005016623) #19	ENSCDRG00005016716	CENPN (ENSCDRG00005016773) #21	ATMIN (ENSCDRG00005016854) #22	C16orf46 (ENSCDRG00005000122) #23	ENSCDRG00005000130 #24	PKD1L2 (ENSCDRG00005000189) #25	BCO1 (ENSCDRG00005000320) #26	GAN (ENSCDRG00005000345) #27	CMIP (ENSCDRG00005000438) #28	PLCG2 (ENSCDRG00005001023) #29	SDR42E1 (ENSCDRG00005001117) #30	HSD17B2 (ENSCDRG00005001133)	MPHOSPH6 (ENSCDRG00005001161)	CDH13 (ENSCDRG00005001202)	HSBP1 (ENSCDRG00005001270)	MLYCD (ENSCDRG00005001279)	OSGIN1 (ENSCDRG00005001288)	NECAB2 (ENSCDRG00005001312)
Alpaca	MODERN SPECIES	4657																ATMIN (ENSVPAG00000003349) #22
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000154537	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000005351	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000005351	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908.c #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.o #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293.eb	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Ursus	DUPLICATION
Ursus	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000013091.k #22
Polar bear	MODERN SPECIES	162	KARS1 (ENSUMAG00000014559)	TERF2IP (ENSUMAG00000014570)	CNTNAP4 (ENSUMAG00000014610)	ENSUMAG00000014926	MON1B (ENSUMAG00000014940)	SYCE1L (ENSUMAG00000014944)	ADAMTS18 (ENSUMAG00000014963)	NUDT7 (ENSUMAG00000015025)	VAT1L (ENSUMAG00000015030)	CLEC3A (ENSUMAG00000015050)	WWOX (ENSUMAG00000015058)	DYNLRB2 (ENSUMAG00000015064)	CDYL2 (ENSUMAG00000015069) #19	ENSUMAG00000015088 #20	CENPN (ENSUMAG00000015095) #21	ATMIN (ENSUMAG00000015098) #22	C16orf46 (ENSUMAG00000015103) #23	ENSUMAG00000015107 #24	PKD1L2 (ENSUMAG00000015112) #25	ENSUMAG00000015144	BCO1 (ENSUMAG00000015159) #26	ENSUMAG00000015238	GAN (ENSUMAG00000015243) #27	CMIP (ENSUMAG00000015248) #28	PLCG2 (ENSUMAG00000015261) #29	SDR42E1 (ENSUMAG00000015268) #30	HSD17B2 (ENSUMAG00000015271)	MPHOSPH6 (ENSUMAG00000015279)	ENSUMAG00000015287	CDH13 (ENSUMAG00000015326)	HSBP1 (ENSUMAG00000015705)
American black bear	MODERN SPECIES	1207																ENSUAMG00000023936 #22
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	109	ENSGT01030000234618.A	ENSGT00390000005351	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908.c #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091.l #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.o #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00940000164458.d	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293.eb	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
American black bear	MODERN SPECIES	143														ENSUAMG00000006664	ENSUAMG00000006668 #21	ENSUAMG00000006675 #22	C16orf46 (ENSUAMG00000006678) #23	ENSUAMG00000006680 #24	PKD1L2 (ENSUAMG00000006681) #25	ENSUAMG00000006690	BCO1 (ENSUAMG00000006693) #26	GAN (ENSUAMG00000006697) #27	ENSUAMG00000006702	CMIP (ENSUAMG00000006703) #28	PLCG2 (ENSUAMG00000006714) #29
Giant Panda	MODERN SPECIES	3	MON1B (ENSAMEG00000014769)	SYCE1L (ENSAMEG00000014763)	ADAMTS18 (ENSAMEG00000009659)	NUDT7 (ENSAMEG00000023822)	VAT1L (ENSAMEG00000009628)	CLEC3A (ENSAMEG00000009612)	ENSAMEG00000009604	ENSAMEG00000018329	ENSAMEG00000018324	ENSAMEG00000008069	ENSAMEG00000029152	ENSAMEG00000010346	ENSAMEG00000016964	CDYL2 (ENSAMEG00000016966) #19	ENSAMEG00000013929 #20	ATMIN (ENSAMEG00000013952) #22	C16orf46 (ENSAMEG00000024452) #23	ENSAMEG00000013959 #24	PKD1L2 (ENSAMEG00000029920) #25	BCO1 (ENSAMEG00000013973) #26	GAN (ENSAMEG00000014009) #27	CMIP (ENSAMEG00000014029) #28	PLCG2 (ENSAMEG00000014051) #29	SDR42E1 (ENSAMEG00000023929) #30	HSD17B2 (ENSAMEG00000029860)	MPHOSPH6 (ENSAMEG00000014150)	CDH13 (ENSAMEG00000006487)	HSBP1 (ENSAMEG00000006485)	MLYCD (ENSAMEG00000027054)	NECAB2 (ENSAMEG00000006457)	SLC38A8 (ENSAMEG00000006433)
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000005351	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
American mink	MODERN SPECIES	120	CNTNAP4 (ENSNVIG00000019533)	ENSNVIG00000019706	ENSNVIG00000019715	ENSNVIG00000019718	MON1B (ENSNVIG00000019735)	SYCE1L (ENSNVIG00000019796)	ADAMTS18 (ENSNVIG00000019828)	NUDT7 (ENSNVIG00000019873)	VAT1L (ENSNVIG00000019899)	CLEC3A (ENSNVIG00000019924)	WWOX (ENSNVIG00000019953)	DLRB2 (ENSNVIG00000020012)	CDYL2 (ENSNVIG00000020046) #19	CMC2 (ENSNVIG00000020052) #20	CENPN (ENSNVIG00000020073) #21	ATMIN (ENSNVIG00000020134) #22	C16orf46 (ENSNVIG00000020149) #23	GCSH (ENSNVIG00000020159) #24	ENSNVIG00000020171	ENSNVIG00000020185 #25	BCDO1 (ENSNVIG00000020212) #26	GAN (ENSNVIG00000020231) #27	CMIP (ENSNVIG00000020244) #28	PLCG2 (ENSNVIG00000020392) #29	SDR42E1 (ENSNVIG00000020459) #30	DHB2 (ENSNVIG00000020464)	MPHOSPH6 (ENSNVIG00000020481)	CDH13 (ENSNVIG00000020494)	ENSNVIG00000020595	MLYCD (ENSNVIG00000020606)	OSGIN1 (ENSNVIG00000020614)
Ferret	MODERN SPECIES	203	TERF2IP (ENSMPUG00000009867)	CNTNAP4 (ENSMPUG00000009853)	ENSMPUG00000009849	MON1B (ENSMPUG00000009844)	SYCE1L (ENSMPUG00000009838)	ADAMTS18 (ENSMPUG00000009827)	NUDT7 (ENSMPUG00000009824)	VAT1L (ENSMPUG00000009815)	CLEC3A (ENSMPUG00000009809)	WWOX (ENSMPUG00000009803)	ENSMPUG00000009798	ENSMPUG00000009792	DYNLRB2 (ENSMPUG00000009785)	CDYL2 (ENSMPUG00000009741) #19	ENSMPUG00000009732 #20	ATMIN (ENSMPUG00000009728) #22	C16orf46 (ENSMPUG00000009721) #23	GCSH (ENSMPUG00000009677) #24	PKD1L2 (ENSMPUG00000009585) #25	CENPN (ENSMPUG00000009564) #21	GAN (ENSMPUG00000009551) #27	CMIP (ENSMPUG00000009536) #28	PLCG2 (ENSMPUG00000009243) #29	SDR42E1 (ENSMPUG00000009237) #30	HSD17B2 (ENSMPUG00000009231)	MPHOSPH6 (ENSMPUG00000009221)	ENSMPUG00000020013	CDH13 (ENSMPUG00000009207)	ENSMPUG00000009201	HSBP1 (ENSMPUG00000009190)	MLYCD (ENSMPUG00000009180)
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000154537	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908.a.b #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000157674	ENSGT00950000182901.a.a.a.b.a.a.a	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908.a.b #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Dingo	MODERN SPECIES	373	ENSCAFG00020002217	MON1B (ENSCAFG00020002232)	SYCE1L (ENSCAFG00020002241)	ENSCAFG00020002252	ENSCAFG00020002287	NUDT7 (ENSCAFG00020002293)	VAT1L (ENSCAFG00020002313)	CLEC3A (ENSCAFG00020002332)	WWOX (ENSCAFG00020002350)	MAF (ENSCAFG00020002357)	ENSCAFG00020002373	CDYL2 (ENSCAFG00020002393) #19	ENSCAFG00020002425 #20	ENSCAFG00020002429 #21	ENSCAFG00020002431 #21	ATMIN (ENSCAFG00020002436) #22	C16orf46 (ENSCAFG00020002439) #23	GCSH (ENSCAFG00020002440) #24	PKD1L2 (ENSCAFG00020002444) #25	BCO1 (ENSCAFG00020002476) #26	GAN (ENSCAFG00020002506) #27	ENSCAFG00020002531	CMIP (ENSCAFG00020002534) #28	PLCG2 (ENSCAFG00020002593) #29	SDR42E1 (ENSCAFG00020002962) #30	HSD17B2 (ENSCAFG00020002967)	ENSCAFG00020002991	ENSCAFG00020003011	CDH13 (ENSCAFG00020003045)	HSBP1 (ENSCAFG00020003283)	MLYCD (ENSCAFG00020003288)
Dog	MODERN SPECIES	33	CNTNAP4 (ENSCAFG00845023054)	ENSCAFG00845022974	ENSCAFG00845022925	MON1B (ENSCAFG00845022803)	ENSCAFG00845022616	ADAMTS18 (ENSCAFG00845022320)	NUDT7 (ENSCAFG00845022170)	VAT1L (ENSCAFG00845022047)	CLEC3A (ENSCAFG00845021995)	WWOX (ENSCAFG00845021522)	MAF (ENSCAFG00845021165)	DYNLRB2 (ENSCAFG00845021057)	CDYL2 (ENSCAFG00845020878) #19	ENSCAFG00845020815	CENPN (ENSCAFG00845020660) #21	ATMIN (ENSCAFG00845020541) #22	C16orf46 (ENSCAFG00845020475) #23	ENSCAFG00845020374 #24	ENSCAFG00845020020 #25	BCO1 (ENSCAFG00845019952) #26	ENSCAFG00845019918	GAN (ENSCAFG00845019691) #27	CMIP (ENSCAFG00845018752) #28	PLCG2 (ENSCAFG00845017949) #29	SDR42E1 (ENSCAFG00845017877) #30	HSD17B2 (ENSCAFG00845017721)	ENSCAFG00845017638	CDH13 (ENSCAFG00845017012)	HSBP1 (ENSCAFG00845016653)	MLYCD (ENSCAFG00845016601)	OSGIN1 (ENSCAFG00845016421)
Red fox	MODERN SPECIES	283														ENSVVUG00000027132	CENPN (ENSVVUG00000027131) #21	ATMIN (ENSVVUG00000027130) #22	CUNH16orf46 (ENSVVUG00000027129) #23	GCSH (ENSVVUG00000027128) #24	PKD1L2 (ENSVVUG00000027126) #25	BCO1 (ENSVVUG00000027117) #26	ENSVVUG00000027114	CMIP (ENSVVUG00000027109) #28	ENSVVUG00000026971 #29
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.l.a #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000017515.o.a	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b
Panthera	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.l.a #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000005351	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.l.a #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
lion	MODERN SPECIES	15	KARS1 (ENSPLOG00000017669)	TERF2IP (ENSPLOG00000017740)	CNTNAP4 (ENSPLOG00000017837)	ENSPLOG00000018704	MON1B (ENSPLOG00000018826)	SYCE1L (ENSPLOG00000018915)	ADAMTS18 (ENSPLOG00000018990)	NUDT7 (ENSPLOG00000019129)	VAT1L (ENSPLOG00000019173)	CLEC3A (ENSPLOG00000019239)	WWOX (ENSPLOG00000019311)	DYNLRB2 (ENSPLOG00000019543)	CDYL2 (ENSPLOG00000019594) #19	ENSPLOG00000019610 #20	ENSPLOG00000019648 #21	ATMIN (ENSPLOG00000019710) #22	C16orf46 (ENSPLOG00000019742) #23	ENSPLOG00000019766 #24	PKD1L2 (ENSPLOG00000019863) #25	BCO1 (ENSPLOG00000020093) #26	GAN (ENSPLOG00000020158) #27	ENSPLOG00000020187	CMIP (ENSPLOG00000020262) #28	PLCG2 (ENSPLOG00000020573) #29	SDR42E1 (ENSPLOG00000020620) #30	HSD17B2 (ENSPLOG00000020638)	MPHOSPH6 (ENSPLOG00000020668)	CDH13 (ENSPLOG00000020733)	HSBP1 (ENSPLOG00000020851)	MLYCD (ENSPLOG00000020875)	OSGIN1 (ENSPLOG00000020893)
leopard	MODERN SPECIES	60	CNTNAP4 (ENSPPRG00000009121)	ENSPPRG00000009426	MON1B (ENSPPRG00000009852)	SYCE1L (ENSPPRG00000010458)	ADAMTS18 (ENSPPRG00000010675)	NUDT7 (ENSPPRG00000011885)	VAT1L (ENSPPRG00000012251)	CLEC3A (ENSPPRG00000012420)	WWOX (ENSPPRG00000015480)	MAF (ENSPPRG00000016630)	DYNLRB2 (ENSPPRG00000017658)	CDYL2 (ENSPPRG00000020724) #19	ENSPPRG00000024339	CMC2 (ENSPPRG00000023624) #20	CENPN (ENSPPRG00000000055) #21	ATMIN (ENSPPRG00000000693) #22	C16orf46 (ENSPPRG00000000885) #23	ENSPPRG00000001521 #24	ENSPPRG00000003585 #25	BCO1 (ENSPPRG00000004167) #26	ENSPPRG00000019706 #27	ENSPPRG00000019730	GAN (ENSPPRG00000004887) #27	CMIP (ENSPPRG00000008468) #28	ENSPPRG00000008613	PLCG2 (ENSPPRG00000011326) #29	SDR42E1 (ENSPPRG00000011531) #30	HSD17B2 (ENSPPRG00000011942)	MPHOSPH6 (ENSPPRG00000012627)	ENSPPRG00000014633	CDH13 (ENSPPRG00000019564)
Tiger	MODERN SPECIES	176												DYNLRB2 (ENSPTIG00000013255)	CDYL2 (ENSPTIG00000009990) #19	CMC2 (ENSPTIG00000007511) #20	CENPN (ENSPTIG00000019596) #21	ATMIN (ENSPTIG00000018927) #22	C16orf46 (ENSPTIG00000018481) #23	ENSPTIG00000018330 #24	ENSPTIG00000015213 #25	BCO1 (ENSPTIG00000014390) #26	GAN (ENSPTIG00000012567) #27	CMIP (ENSPTIG00000011336) #28	PLCG2 (ENSPTIG00000006583) #29	SDR42E1 (ENSPTIG00000006116) #30	HSD17B2 (ENSPTIG00000005395)	MPHOSPH6 (ENSPTIG00000000518)	CDH13 (ENSPTIG00000019366)	HSBP1 (ENSPTIG00000018555)	MLYCD (ENSPTIG00000018312)	OSGIN1 (ENSPTIG00000016465)	NECAB2 (ENSPTIG00000015250)
Cat	MODERN SPECIES	246	CNTNAP4 (ENSFCAG00000013476)	ENSFCAG00000045934	MON1B (ENSFCAG00000004104)	SYCE1L (ENSFCAG00000018221)	ADAMTS18 (ENSFCAG00000010408)	NUDT7 (ENSFCAG00000022107)	VAT1L (ENSFCAG00000004729)	CLEC3A (ENSFCAG00000028303)	WWOX (ENSFCAG00000022130)	MAF (ENSFCAG00000042273)	DYNLRB2 (ENSFCAG00000004084)	CDYL2 (ENSFCAG00000014748) #19	ENSFCAG00000022025	CMC2 (ENSFCAG00000004977) #20	CENPN (ENSFCAG00000035603) #21	ATMIN (ENSFCAG00000004979) #22	C16orf46 (ENSFCAG00000040782) #23	ENSFCAG00000013038 #24	PKD1L2 (ENSFCAG00000004981) #25	BCO1 (ENSFCAG00000004984) #26	GAN (ENSFCAG00000028273) #27	ENSFCAG00000036536	CMIP (ENSFCAG00000004986) #28	PLCG2 (ENSFCAG00000004987) #29	SDR42E1 (ENSFCAG00000024343) #30	HSD17B2 (ENSFCAG00000004989)	MPHOSPH6 (ENSFCAG00000004990)	CDH13 (ENSFCAG00000004387)	ENSFCAG00000047154	HSBP1 (ENSFCAG00000034194)	MLYCD (ENSFCAG00000011551)
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000165352	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Equus	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000165352	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Horse	MODERN SPECIES	22	CNTNAP4 (ENSECAG00000011893)	ENSECAG00000059274	ENSECAG00000032946	ENSECAG00000030127	MON1B (ENSECAG00000015777)	ADAMTS18 (ENSECAG00000019006)	NUDT7 (ENSECAG00000009401)	VAT1L (ENSECAG00000009839)	CLEC3A (ENSECAG00000014778)	WWOX (ENSECAG00000016036)	MAF (ENSECAG00000033482)	DYNLRB2 (ENSECAG00000018830)	CDYL2 (ENSECAG00000019160) #19	CMC2 (ENSECAG00000000963) #20	CENPN (ENSECAG00000001041) #21	ATMIN (ENSECAG00000011923) #22	C3H16orf46 (ENSECAG00000015354) #23	GCSH (ENSECAG00000026862) #24	ENSECAG00000015980 #25	BCO1 (ENSECAG00000000280) #26	GAN (ENSECAG00000012155) #27	ENSECAG00000033092	CMIP (ENSECAG00000013542) #28	PLCG2 (ENSECAG00000000291) #29	SDR42E1 (ENSECAG00000011349) #30	HSD17B2 (ENSECAG00000012114)	CDH13 (ENSECAG00000021162)	MLYCD (ENSECAG00000022837)	OSGIN1 (ENSECAG00000023023)	NECAB2 (ENSECAG00000023746)	SLC38A8 (ENSECAG00000003354)
Donkey	MODERN SPECIES	20	CNTNAP4 (ENSEASG00005013505)	ENSEASG00005024465	ENSEASG00005030506	MON1B (ENSEASG00005013527)	SYCE1L (ENSEASG00005032860)	ADAMTS18 (ENSEASG00005013537)	NUDT7 (ENSEASG00005013555)	VAT1L (ENSEASG00005013560)	CLEC3A (ENSEASG00005037444)	WWOX (ENSEASG00005013576)	MAF (ENSEASG00005031499)	DYNLRB2 (ENSEASG00005013585)	CDYL2 (ENSEASG00005013589) #19	CMC2 (ENSEASG00005023757) #20	CENPN (ENSEASG00005032181) #21	ATMIN (ENSEASG00005013597) #22	C16orf46 (ENSEASG00005028489) #23	GCSH (ENSEASG00005035967) #24	PKD1L2 (ENSEASG00005013610) #25	BCO1 (ENSEASG00005013625) #26	GAN (ENSEASG00005013631) #27	CMIP (ENSEASG00005013643) #28	PLCG2 (ENSEASG00005013661) #29	SDR42E1 (ENSEASG00005030350) #30	HSD17B2 (ENSEASG00005013674)	MPHOSPH6 (ENSEASG00005027868)	CDH13 (ENSEASG00005013691)	HSBP1 (ENSEASG00005034692)	MLYCD (ENSEASG00005013697)	OSGIN1 (ENSEASG00005013700)	NECAB2 (ENSEASG00005013703)
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00390000005351	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000005351	ENSGT00940000157674	ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Microbat	DUPLICATION
Microbat	MODERN SPECIES	972	TERF2IP (ENSMLUG00000015124)	CNTNAP4 (ENSMLUG00000012921)	ENSMLUG00000022726	MON1B (ENSMLUG00000003775)	ENSMLUG00000026103	ADAMTS18 (ENSMLUG00000009268)	NUDT7 (ENSMLUG00000009335)	VAT1L (ENSMLUG00000009345)	CLEC3A (ENSMLUG00000009365)	WWOX (ENSMLUG00000009368)	ENSMLUG00000025894	DYNLRB2 (ENSMLUG00000001399)	CDYL2 (ENSMLUG00000001407) #19	CMC2 (ENSMLUG00000008494) #20	CENPN (ENSMLUG00000005884) #21	ENSMLUG00000005888 #22	C16orf46 (ENSMLUG00000005894) #23	GCSH (ENSMLUG00000005783) #24	ENSMLUG00000025067 #25	ENSMLUG00000028202	BCO1 (ENSMLUG00000014885) #26	GAN (ENSMLUG00000014891) #27	CMIP (ENSMLUG00000014899) #28	PLCG2 (ENSMLUG00000014908) #29	SDR42E1 (ENSMLUG00000015708) #30	HSD17B2 (ENSMLUG00000015714)	ENSMLUG00000000268	ENSMLUG00000007609	HSBP1 (ENSMLUG00000007636)	MLYCD (ENSMLUG00000002980)	OSGIN1 (ENSMLUG00000002987)
Microbat	MODERN SPECIES	960	SEMA6D (ENSMLUG00000007932)	ENSMLUG00000030579	SLC24A5 (ENSMLUG00000006760)	MYEF2 (ENSMLUG00000006781)	CTXN2 (ENSMLUG00000025495)	SLC12A1 (ENSMLUG00000006815)	DUT (ENSMLUG00000006842)	ENSMLUG00000026203	FBN1 (ENSMLUG00000006857)	CEP152 (ENSMLUG00000012896)	EID1 (ENSMLUG00000027610)	SHC4 (ENSMLUG00000012913)	ENSMLUG00000028542	SECISBP2L (ENSMLUG00000012918)	COPS2 (ENSMLUG00000013760)	ENSMLUG00000025580 #22	GALK2 (ENSMLUG00000013767)	FGF7 (ENSMLUG00000010428)	DTWD1 (ENSMLUG00000001784)	ATP8B4 (ENSMLUG00000008270)	SLC27A2 (ENSMLUG00000005760)	HDC (ENSMLUG00000005768)	GABPB1 (ENSMLUG00000005780)	USP8 (ENSMLUG00000000389)	USP50 (ENSMLUG00000006756)	ENSMLUG00000024658	TRPM7 (ENSMLUG00000000187)	SPPL2A (ENSMLUG00000016737)	AP4E1 (ENSMLUG00000009792)	TNFAIP8L3 (ENSMLUG00000009833)	CYP19A1 (ENSMLUG00000009854)
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	6	TERF2IP (ENSRFEG00010015304)	CNTNAP4 (ENSRFEG00010007251)	ENSRFEG00010007398	ENSRFEG00010007447	MON1B (ENSRFEG00010007521)	ADAMTS18 (ENSRFEG00010007780)	NUDT7 (ENSRFEG00010008000)	VAT1L (ENSRFEG00010008062)	CLEC3A (ENSRFEG00010008108)	WWOX (ENSRFEG00010008177)	MAF (ENSRFEG00010008255)	DYNLRB2 (ENSRFEG00010008310)	CDYL2 (ENSRFEG00010008362) #19	CMC2 (ENSRFEG00010008437) #20	ENSRFEG00010008493 #21	ATMIN (ENSRFEG00010008777) #22	C16orf46 (ENSRFEG00010008835) #23	GCSH (ENSRFEG00010008913) #24	BCO1 (ENSRFEG00010008967) #26	GAN (ENSRFEG00010009014) #27	CMIP (ENSRFEG00010009132) #28	PLCG2 (ENSRFEG00010009626) #29	SDR42E1 (ENSRFEG00010009698) #30	HSD17B2 (ENSRFEG00010009719)	MPHOSPH6 (ENSRFEG00010009737)	CDH13 (ENSRFEG00010009815)	ENSRFEG00010010056	MLYCD (ENSRFEG00010010090)	OSGIN1 (ENSRFEG00010010128)	NECAB2 (ENSRFEG00010010165)	SLC38A8 (ENSRFEG00010010227)
Megabat	MODERN SPECIES	2022															CENPN (ENSPVAG00000009951) #21	ATMIN (ENSPVAG00000009952) #22	C16orf46 (ENSPVAG00000009953) #23	GCSH (ENSPVAG00000009956) #24	PKD1L2 (ENSPVAG00000009961) #25
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	52		ENSGT00940000165693	ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	50			ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	94			ENSGT00390000006665.b	ENSGT00390000017352.d	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000006293	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006658.b	ENSGT00950000183131.b.b
Elephant	MODERN SPECIES	458			MON1B (ENSLAFG00000028110)	ENSLAFG00000029845	ADAMTS18 (ENSLAFG00000014632)	NUDT7 (ENSLAFG00000015102)	VAT1L (ENSLAFG00000002783)	CLEC3A (ENSLAFG00000021345)	ENSLAFG00000012515	ENSLAFG00000032762	MAF (ENSLAFG00000003211)	DYNLRB2 (ENSLAFG00000018336)	CDYL2 (ENSLAFG00000018183) #19	CMC2 (ENSLAFG00000004378) #20	CENPN (ENSLAFG00000004382) #21	ATMIN (ENSLAFG00000004383) #22	C16orf46 (ENSLAFG00000014008) #23	GCSH (ENSLAFG00000015586) #24	ENSLAFG00000013094 #25	BCO1 (ENSLAFG00000013100) #26	GAN (ENSLAFG00000013109) #27	CMIP (ENSLAFG00000013907) #28	PLCG2 (ENSLAFG00000001815) #29	SDR42E1 (ENSLAFG00000007085) #30	ENSLAFG00000001816	MPHOSPH6 (ENSLAFG00000004842)	CDH13 (ENSLAFG00000000367)	ENSLAFG00000014112	MLYCD (ENSLAFG00000008543)	OSGIN1 (ENSLAFG00000029645)	NECAB2 (ENSLAFG00000006053)
Hyrax	MODERN SPECIES	5012															CENPN (ENSPCAG00000015534) #21	ATMIN (ENSPCAG00000015604) #22
Tenrec	MODERN SPECIES	638																ATMIN (ENSETEG00000018568) #22
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES	593														ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27
Armadillo	DUPLICATION
Armadillo	DUPLICATION
Armadillo	MODERN SPECIES	2390											SLC15A2 (ENSDNOG00000015140)	ILDR1 (ENSDNOG00000003909)	ENSDNOG00000001920	CASR (ENSDNOG00000015243)	ENSDNOG00000033555	ENSDNOG00000047231 #22	MIX23 (ENSDNOG00000005535)	FAM162A (ENSDNOG00000048394)	WDR5B (ENSDNOG00000005558)	KPNA1 (ENSDNOG00000005561)	DTX3L (ENSDNOG00000008031)	PARP14 (ENSDNOG00000015400)	HSPBAP1 (ENSDNOG00000034751)	SLC49A4 (ENSDNOG00000015403)	ENSDNOG00000014815
Armadillo	MODERN SPECIES	3117																ENSDNOG00000040448 #22	STC2 (ENSDNOG00000035052)
Armadillo	MODERN SPECIES	603													DYNLRB2 (ENSDNOG00000041975)	CDYL2 (ENSDNOG00000000515) #19	ENSDNOG00000004354	ENSDNOG00000042547 #22	C16orf46 (ENSDNOG00000036955) #23	GCSH (ENSDNOG00000017870) #24	PKD1L2 (ENSDNOG00000002410) #25	BCO1 (ENSDNOG00000000413) #26	GAN (ENSDNOG00000000417) #27
Sloth	MODERN SPECIES	5449																ATMIN (ENSCHOG00000009648) #22	ENSCHOG00000009668 #23
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00900000143268	ENSGT00940000155823.B	ENSGT00940000158843	ENSGT00440000037341.a	ENSGT00940000160910	ENSGT00390000017627.a	ENSGT00940000159330	ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b	ENSGT00390000006205.a	ENSGT00440000039029	ENSGT00940000160736	ENSGT00940000159084	ENSGT00500000045333	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.wb #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000012054.b	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000005410	ENSGT01090000260024.A.a.b.a.b.a.a.a.b.b	ENSGT01090000260024.A.a.b.a.b.a.a.a.b.a.b
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00900000143268	ENSGT00940000155823.B	ENSGT00940000158843	ENSGT00440000037341.a	ENSGT00940000160910	ENSGT00390000017627.a	ENSGT00940000159330	ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b	ENSGT00390000006205.a	ENSGT00440000039029	ENSGT00940000160736	ENSGT00940000159084	ENSGT00500000045333	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.wb #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000012054.b	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000005410	ENSGT01090000260024.A.a.b.a.b.a.a.a.b.b	ENSGT01090000260024.A.a.b.a.b.a.a.a.b.a.b
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00900000143268	ENSGT00940000155823.B	ENSGT00940000158843	ENSGT00440000037341.a	ENSGT00940000160910	ENSGT00390000017627.a	ENSGT00940000159330	ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b	ENSGT00390000006205.a	ENSGT00440000039029	ENSGT00940000160736	ENSGT00940000159084	ENSGT00500000045333	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.vb.a #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000012054.b	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000005410	ENSGT01090000260024.A.a.b.a.b.a.a.a.b.b	ENSGT01090000260024.A.a.b.a.b.a.a.a.b.a.b
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00900000143268	ENSGT00940000155823.B	ENSGT00940000158843	ENSGT00440000037341.a	ENSGT00940000160910	ENSGT00390000017627.a	ENSGT00940000159330	ENSGT00950000183095.a.b.a.b.b	ENSGT00390000006205.a	ENSGT00440000039029	ENSGT00940000160736	ENSGT00940000159084	ENSGT00500000045333.b	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666.vb.a #24	ENSGT00940000165999	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000012054.b	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000005410	ENSGT00390000006293.y
Common wonbat	MODERN SPECIES	574	FAM98A (ENSVURG00010016822)	ENSVURG00010016813	ENSVURG00010016810	ENSVURG00010016805	CRIM1 (ENSVURG00010016792)	FEZ2 (ENSVURG00010016777)	VIT (ENSVURG00010016752)	STRN (ENSVURG00010016708)	HEATR5B (ENSVURG00010016661)	GPATCH11 (ENSVURG00010016627)	ENSVURG00010016594	SULT6B1 (ENSVURG00010016574)	ENSVURG00010016569	CMC2 (ENSVURG00010016565) #20	CENPN (ENSVURG00010016556) #21	ATMIN (ENSVURG00010016546) #22	ENSVURG00010016541 #23	ENSVURG00010016533	ENSVURG00010016487 #25	BCO1 (ENSVURG00010016469) #26	GAN (ENSVURG00010016455) #27	CMIP (ENSVURG00010016430) #28	ENSVURG00010016418	PLCG2 (ENSVURG00010016355) #29	SDR42E1 (ENSVURG00010016334) #30	HSD17B2 (ENSVURG00010016318)	MPHOSPH6 (ENSVURG00010016311)	CDH13 (ENSVURG00010016295)	ENSVURG00010016249	ENSVURG00010016238	ENSVURG00010016224
koala	MODERN SPECIES	47		ENSPCIG00000035478	ENSPCIG00000032366	CRIM1 (ENSPCIG00000010964)	FEZ2 (ENSPCIG00000010967)	ENSPCIG00000032789	ENSPCIG00000010969	STRN (ENSPCIG00000010971)	HEATR5B (ENSPCIG00000010975)	GPATCH11 (ENSPCIG00000010983)	ENSPCIG00000010984	SULT6B1 (ENSPCIG00000010986)	ENSPCIG00000010987	CMC2 (ENSPCIG00000032133) #20	CENPN (ENSPCIG00000010989) #21	ATMIN (ENSPCIG00000010990) #22	ENSPCIG00000010992 #23	ENSPCIG00000010994 #24	ENSPCIG00000010998 #25	BCO1 (ENSPCIG00000011002) #26	GAN (ENSPCIG00000011004) #27	CMIP (ENSPCIG00000015315) #28	PLCG2 (ENSPCIG00000015304) #29	SDR42E1 (ENSPCIG00000015298) #30	HSD17B2 (ENSPCIG00000010747)	ENSPCIG00000036337	MPHOSPH6 (ENSPCIG00000010743)	ENSPCIG00000010739	ENSPCIG00000016009	CDH13 (ENSPCIG00000011670)	MLYCD (ENSPCIG00000009581)
Wallaby	MODERN SPECIES	7375																ATMIN (ENSMEUG00000014128) #22
Tasmanian devil	MODERN SPECIES	1	ENSSHAG00000027521	ENSSHAG00000015127	ENSSHAG00000023321	ENSSHAG00000023790	ENSSHAG00000028955	ENSSHAG00000009712	ENSSHAG00000010867	VIT (ENSSHAG00000012061)	STRN (ENSSHAG00000012733)	HEATR5B (ENSSHAG00000013525)	GPATCH11 (ENSSHAG00000023702)	ENSSHAG00000001447	SULT6B1 (ENSSHAG00000004594)	ENSSHAG00000024600	ENSSHAG00000023635 #20	ENSSHAG00000020527 #22	ENSSHAG00000026628 #23	GCSH (ENSSHAG00000029630) #24	ENSSHAG00000005909 #25	BCO1 (ENSSHAG00000007696) #26	GAN (ENSSHAG00000008348) #27	ENSSHAG00000010454	PLCG2 (ENSSHAG00000011637) #29	SDR42E1 (ENSSHAG00000012555) #30	HSD17B2 (ENSSHAG00000031931)	ENSSHAG00000026367	MPHOSPH6 (ENSSHAG00000013630)	CDH13 (ENSSHAG00000008933)	ENSSHAG00000030969	ENSSHAG00000002202	ENSSHAG00000026391
Opossum	MODERN SPECIES		ENSMODG00000027462	ENSMODG00000029800	ENSMODG00000044237	ENSMODG00000049199	CRIM1 (ENSMODG00000015395)	FEZ2 (ENSMODG00000015390)	VIT (ENSMODG00000015382)	STRN (ENSMODG00000015376)	HEATR5B (ENSMODG00000015367)	GPATCH11 (ENSMODG00000015289)	ENSMODG00000015286	SULT6B1 (ENSMODG00000015278)	ENSMODG00000048395	CMC2 (ENSMODG00000025763) #20	CENPN (ENSMODG00000015271) #21	ATMIN (ENSMODG00000015266) #22	ENSMODG00000015261 #23	ENSMODG00000050374	GCSH (ENSMODG00000039999) #24	BCO1 (ENSMODG00000015217) #26	GAN (ENSMODG00000015214) #27	CMIP (ENSMODG00000015208) #28	PLCG2 (ENSMODG00000015196) #29	SDR42E1 (ENSMODG00000015169) #30	HSD17B2 (ENSMODG00000015163)	ENSMODG00000023205	MPHOSPH6 (ENSMODG00000015131)	ENSMODG00000042788	CDH13 (ENSMODG00000015029)	ENSMODG00000040958	MLYCD (ENSMODG00000014843)
Platypus	MODERN SPECIES	2	LRP6 (ENSOANG00000006877)	ENSOANG00000000732	BORCS5 (ENSOANG00000046805)	DUSP16 (ENSOANG00000000734)	CREBL2 (ENSOANG00000040260)	GPR19 (ENSOANG00000046830)	ENSOANG00000045776	ENSOANG00000045395	ETV6 (ENSOANG00000014578)	ENSOANG00000045152	LUC7L2 (ENSOANG00000002993)	FMC1 (ENSOANG00000037156)	TTC26 (ENSOANG00000005994)	ENSOANG00000039813 #20	CENPN (ENSOANG00000011086) #21	ATMIN (ENSOANG00000051099) #22	ENSOANG00000050825	ENSOANG00000011089 #24	SLC6A2 (ENSOANG00000011092)	LPCAT2 (ENSOANG00000011096)	MMP2 (ENSOANG00000011098)	ENSOANG00000029378	IRX5 (ENSOANG00000044475)	ENSOANG00000045495	ENSOANG00000050066	ENSOANG00000013407	RPGRIP1L (ENSOANG00000013406)	AKTIP (ENSOANG00000013405)	RBL2 (ENSOANG00000013404)	CHD9 (ENSOANG00000013401)	TOX3 (ENSOANG00000013400)
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000160587	ENSGT00940000153691.a.a.b	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT01060000249485	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00940000159432.C	ENSGT00940000154805.b.g	ENSGT00940000161867	ENSGT00950000183008.a.a.b	ENSGT00940000160959	ENSGT00940000154606	ENSGT00940000161906	ENSGT00950000182893.a.b	ENSGT00740000115581.e	ENSGT00940000158278	ENSGT00940000161681	ENSGT00390000007438	ENSGT00710000106790	ENSGT00940000159567
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000165226	ENSGT00940000160587	ENSGT00940000153691.a.a.b	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT01060000249485	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00940000164357	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000012054.b.ab.a	ENSGT00390000012054.b.ab.b	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000005410
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Aves	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000165226	ENSGT00940000160587	ENSGT00940000153691.a.a.b	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000165319	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000164357	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000012054.b.ab.a	ENSGT00390000012054.b.ab.b	ENSGT00390000012054.b.`b
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000165226	ENSGT00940000160587	ENSGT00940000153691.a.a.b	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000165319	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000012054.b.ab.a	ENSGT00390000012054.b.ab.b	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000165226	ENSGT00940000160587	ENSGT00940000153691.a.a.b	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000165319	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000012054.b.ab.a	ENSGT00390000012054.b.ab.b	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000165226	ENSGT00940000160587	ENSGT00940000153691.a.a.b	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000165319	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000012054.b.ab.a	ENSGT00390000012054.b.ab.b	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000005410
Japanese quail	MODERN SPECIES	2	CDH5 (ENSCJPG00005014650)	CDH11 (ENSCJPG00005014655)	CDH8 (ENSCJPG00005014665)	ADAMTS18 (ENSCJPG00005014678)	ENSCJPG00005014680	NUDT7 (ENSCJPG00005014681)	VAT1L (ENSCJPG00005014682)	CLEC3A (ENSCJPG00005014683)	WWOX (ENSCJPG00005014684)	ENSCJPG00005014685	MAF (ENSCJPG00005014686)	DYNLRB2 (ENSCJPG00005014691)	CDYL2 (ENSCJPG00005014692) #19	ENSCJPG00005014693 #20	CENPN (ENSCJPG00005014694) #21	ATMIN (ENSCJPG00005014695) #22	PPP1R3E (ENSCJPG00005014696)	ENSCJPG00005014697	PKD1L2 (ENSCJPG00005014698) #25	BCO1 (ENSCJPG00005014699) #26	GAN (ENSCJPG00005014700) #27	CMIP (ENSCJPG00005014701) #28	PLCG2 (ENSCJPG00005014704) #29	SDR42E1 (ENSCJPG00005014705) #30	HSD17B2 (ENSCJPG00005014706)	ENSCJPG00005014708	ENSCJPG00005014709	ENSCJPG00005014710	MPHOSPH6 (ENSCJPG00005014711)	CDH13 (ENSCJPG00005014715)	MLYCD (ENSCJPG00005014717)
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000165226	ENSGT00940000160587	ENSGT00940000153691.a.a.b	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000165319	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000012054.b.ab.a	ENSGT00390000012054.b.ab.b	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000005410
Turkey	MODERN SPECIES	4	ENSMGAG00000018466	ENSMGAG00000000917	ENSMGAG00000000918	TRADD (ENSMGAG00000018981)	ENSMGAG00000000909	ENSMGAG00000000886	ENSMGAG00000000906	HSDL1 (ENSMGAG00000000871)	ENSMGAG00000000862	ENSMGAG00000000801	MBTPS1 (ENSMGAG00000000805)	OSGIN1 (ENSMGAG00000000787)	GAN (ENSMGAG00000006826) #27	ENSMGAG00000006759 #25	ENSMGAG00000006799 #26	ATMIN (ENSMGAG00000006738) #22	ENSMGAG00000006868 #19	ENSMGAG00000006719 #20	ENSMGAG00000006725 #21	DYNLRB2 (ENSMGAG00000006708)	ENSMGAG00000018698	ENSMGAG00000006687	ENSMGAG00000019485	ENSMGAG00000006683	ENSMGAG00000006649	ENSMGAG00000019886	ENSMGAG00000006670	ENSMGAG00000020260	CMIP (ENSMGAG00000006844) #28	PLCG2 (ENSMGAG00000006882) #29	SDR42E1 (ENSMGAG00000006936) #30
Chicken	MODERN SPECIES	2	BEAN1 (ENSGALG00010007243)	CDH5 (ENSGALG00010007270)	CDH11 (ENSGALG00010007302)	CDH8 (ENSGALG00010007678)	ADAMTS18 (ENSGALG00010007698)	ENSGALG00010007735	NUDT7 (ENSGALG00010007765)	VAT1L (ENSGALG00010007767)	CLEC3A (ENSGALG00010007772)	WWOX (ENSGALG00010007789)	MAF (ENSGALG00010007800)	DYNLRB2 (ENSGALG00010007806)	CDYL2 (ENSGALG00010007817) #19	CMC2 (ENSGALG00010007847) #20	CENPN (ENSGALG00010007859) #21	ATMIN (ENSGALG00010007862) #22	PPP1R3E (ENSGALG00010009779)	GCSH (ENSGALG00010007869) #24	PKD1L2 (ENSGALG00010007876) #25	BCO1 (ENSGALG00010007880) #26	GAN (ENSGALG00010007324) #27	CMIP (ENSGALG00010007374) #28	PLCG2 (ENSGALG00010007393) #29	SDR42E1 (ENSGALG00010007403) #30	HSD17B2 (ENSGALG00010007439)	NAT (ENSGALG00010007432)	PNAT3 (ENSGALG00010007436)	PNAT10 (ENSGALG00010007465)	MPHOSPH6 (ENSGALG00010007500)	CDH13 (ENSGALG00010007529)	MLYCD (ENSGALG00010007544)
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000165226	ENSGT00940000160587	ENSGT00940000153691.a.a.b	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000165319	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00990000204256	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000012054.b.ab.a	ENSGT00390000012054.b.ab.b	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	28	ENSABRG00000010374	CDH5 (ENSABRG00000010423)	CDH11 (ENSABRG00000010473)	CDH8 (ENSABRG00000010544)	ADAMTS18 (ENSABRG00000010647)	ENSABRG00000010910	NUDT7 (ENSABRG00000010920)	VAT1L (ENSABRG00000010924)	CLEC3A (ENSABRG00000010932)	WWOX (ENSABRG00000010937)	MAF (ENSABRG00000010950)	DYNLRB2 (ENSABRG00000010978)	CDYL2 (ENSABRG00000011016) #19	CMC2 (ENSABRG00000011023) #20	CENPN (ENSABRG00000011037) #21	ATMIN (ENSABRG00000011044) #22	ENSABRG00000011053 #23	PPP1R3E (ENSABRG00000011069)	PKD1L2 (ENSABRG00000011097) #25	BCO1 (ENSABRG00000011129) #26	GAN (ENSABRG00000011136) #27
Duck	MODERN SPECIES	3	CDH11 (ENSAPLG00000015154)	ENSAPLG00000027372	CDH8 (ENSAPLG00000007743)	ADAMTS18 (ENSAPLG00000008153)	ENSAPLG00000008904	NUDT7 (ENSAPLG00000028392)	VAT1L (ENSAPLG00000009070)	CLEC3A (ENSAPLG00000022572)	WWOX (ENSAPLG00000009300)	ENSAPLG00000026540	MAF (ENSAPLG00000019538)	DYNLRB2 (ENSAPLG00000009314)	CDYL2 (ENSAPLG00000009316) #19	CMC2 (ENSAPLG00000009535) #20	CENPN (ENSAPLG00000009538) #21	ATMIN (ENSAPLG00000009633) #22	ENSAPLG00000027134	PPP1R3E (ENSAPLG00000020132)	GCSH (ENSAPLG00000021043) #24	ENSAPLG00000017829	ENSAPLG00000016688 #25	BCO1 (ENSAPLG00000010038) #26	GAN (ENSAPLG00000010354) #27	CMIP (ENSAPLG00000010524) #28	PLCG2 (ENSAPLG00000010652) #29	SDR42E1 (ENSAPLG00000001581) #30	HSD17B2 (ENSAPLG00000001835)	ENSAPLG00000002080	ENSAPLG00000002085	ENSAPLG00000002088	MPHOSPH6 (ENSAPLG00000018311)
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000165226	ENSGT00940000160587	ENSGT00940000153691.a.a.b	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000165319	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273.mb #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000012054.b.ab.a	ENSGT00390000012054.b.ab.b	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000005410
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000160432	ENSGT00940000160587	ENSGT00940000153691.a.a.b	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000165319	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273.mb.b #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000012054.b.ab.a	ENSGT00390000012054.b.ab.b	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000005410
Kakapo	DUPLICATION
Kakapo	MODERN SPECIES	4	ENSSHBG00005000297	ENSSHBG00005000298	ENSSHBG00005000301	ENSSHBG00005000303	ENSSHBG00005000305	ENSSHBG00005000308	ENSSHBG00005000309	ENSSHBG00005000312	ENSSHBG00005000314	ENSSHBG00005000317	ENSSHBG00005000320	ENSSHBG00005000322 #19	ENSSHBG00005000324	ENSSHBG00005000326	ENSSHBG00005000328	ENSSHBG00005000330 #22	ENSSHBG00005000334	ENSSHBG00005000339	ENSSHBG00005000343 #26	ENSSHBG00005000344	ENSSHBG00005000347 #27	ENSSHBG00005000360 #28	ENSSHBG00005000369	ENSSHBG00005000370	ENSSHBG00005000372	ENSSHBG00005000373	ENSSHBG00005000375	ENSSHBG00005000377	ENSSHBG00005000380	ENSSHBG00005000384	ENSSHBG00005000386
Kakapo	MODERN SPECIES	19	ENSSHBG00005010374	ENSSHBG00005010357	ENSSHBG00005010343	CDH8 (ENSSHBG00005010317)	ADAMTS18 (ENSSHBG00005010200)	ENSSHBG00005010159	NUDT7 (ENSSHBG00005010142)	VAT1L (ENSSHBG00005010126)	CLEC3A (ENSSHBG00005010105)	WWOX (ENSSHBG00005010085)	ENSSHBG00005009983	DYNLRB2 (ENSSHBG00005009960)	ENSSHBG00005009937 #19	CMC2 (ENSSHBG00005009923) #20	CENPN (ENSSHBG00005009907) #21	ENSSHBG00005009901 #22	ENSSHBG00005009897	GCSH (ENSSHBG00005000943) #24	PKD1L2 (ENSSHBG00005000921) #25	ENSSHBG00005000904 #26	ENSSHBG00005013352 #27	ENSSHBG00005013341 #28	PLCG2 (ENSSHBG00005012588) #29	SDR42E1 (ENSSHBG00005012498) #30	HSD17B2 (ENSSHBG00005012293)	ENSSHBG00005012234	ENSSHBG00005012218	ENSSHBG00005012207	MPHOSPH6 (ENSSHBG00005012198)	ENSSHBG00005012175	MLYCD (ENSSHBG00005012147)
Golden eagle	MODERN SPECIES	25	ENSACCG00020000478	CDH5 (ENSACCG00020000457)	CDH11 (ENSACCG00020000432)	CDH8 (ENSACCG00020004323)	ADAMTS18 (ENSACCG00020004303)	ENSACCG00020004275	NUDT7 (ENSACCG00020004265)	VAT1L (ENSACCG00020004257)	CLEC3A (ENSACCG00020004252)	WWOX (ENSACCG00020004239)	MAF (ENSACCG00020004213)	DYNLRB2 (ENSACCG00020004205)	CDYL2 (ENSACCG00020004193) #19	CMC2 (ENSACCG00020004182) #20	CENPN (ENSACCG00020004175) #21	ATMIN (ENSACCG00020004163) #22	ENSACCG00020004154	GCSH (ENSACCG00020004146) #24	PKD1L2 (ENSACCG00020004126) #25	ENSACCG00020004105 #27	ENSACCG00020004091 #27	CMIP (ENSACCG00020004071) #28	PLCG2 (ENSACCG00020003960) #29	SDR42E1 (ENSACCG00020003812) #30	HSD17B2 (ENSACCG00020003783)	ENSACCG00020003752	ENSACCG00020003741	ENSACCG00020003736	MPHOSPH6 (ENSACCG00020003725)	CDH13 (ENSACCG00020003709)	MLYCD (ENSACCG00020003692)
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000162283	ENSGT00940000160309	ENSGT00390000004596	ENSGT00940000156939	ENSGT00390000004554	ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a	ENSGT00390000001622	ENSGT00950000185219	ENSGT00950000182872.f.b.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00960000189518	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273.mb #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000012054.b.ab.a	ENSGT00390000012054.b.ab.b	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B	ENSGT00390000005410
Passeriformes_d	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000162283	ENSGT00940000160309	ENSGT00390000004596	ENSGT00940000156939	ENSGT00390000004554	ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a	ENSGT00390000001622	ENSGT00950000185219	ENSGT00950000182872.f.b.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00960000189518	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00940000165999	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273.mb #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000012054.b.ab.a	ENSGT00390000012054.b.ab.b	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B
Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000162283	ENSGT00940000160309	ENSGT00390000004596	ENSGT00940000156939	ENSGT00390000004554	ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a	ENSGT00390000001622	ENSGT00950000185219	ENSGT00950000182872.f.b.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00960000189518	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00940000165999	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273.mb #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000012054.b.ab.a	ENSGT00390000012054.b.ab.b	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B
Medium ground finch	MODERN SPECIES	46	KIFC3 (ENSGFOG00000012217)	ENSGFOG00000012230	ZNF319 (ENSGFOG00000012238)	USB1 (ENSGFOG00000012240)	MMP15 (ENSGFOG00000012247)	CFAP20 (ENSGFOG00000012251)	CSNK2A2 (ENSGFOG00000012255)	GINS3 (ENSGFOG00000012261)	NDRG4 (ENSGFOG00000012266)	WWOX (ENSGFOG00000012276)	ENSGFOG00000012277	ENSGFOG00000012284	CDYL2 (ENSGFOG00000012287) #19	CMC2 (ENSGFOG00000012291) #20	CENPN (ENSGFOG00000012298) #21	ATMIN (ENSGFOG00000012302) #22
Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000162283	ENSGT00940000160309	ENSGT00390000004596	ENSGT00940000156939	ENSGT00390000004554	ENSGT00390000004215.a.b.b.c.a	ENSGT00390000001622	ENSGT00950000185219	ENSGT00950000182872.f.b.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00960000189518	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00940000165999	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273.mb #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000012054.b.ab.a	ENSGT00390000012054.b.ab.b	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212	ENSGT00940000155218.B
Zebra finch	MODERN SPECIES	2	KIFC3 (ENSTGUG00000004843)	ENSTGUG00000004800	ZNF319 (ENSTGUG00000023895)	USB1 (ENSTGUG00000004792)	MMP15 (ENSTGUG00000004764)	CFAP20 (ENSTGUG00000004759)	CSNK2A2 (ENSTGUG00000004713)	GINS3 (ENSTGUG00000022921)	NDRG4 (ENSTGUG00000026031)	WWOX (ENSTGUG00000004614)	MAF (ENSTGUG00000004610)	ENSTGUG00000022634	CDYL2 (ENSTGUG00000004589) #19	CMC2 (ENSTGUG00000022858) #20	CENPN (ENSTGUG00000004579) #21	ATMIN (ENSTGUG00000004575) #22	PPP1R3E (ENSTGUG00000023284)	BCO1 (ENSTGUG00000004509) #26	GCSH (ENSTGUG00000004561) #24	PKD1L2 (ENSTGUG00000004529) #25	GAN (ENSTGUG00000004495) #27	CMIP (ENSTGUG00000004472) #28	PLCG2 (ENSTGUG00000004405) #29	SDR42E1 (ENSTGUG00000004400) #30	HSD17B2 (ENSTGUG00000004388)	nat4 (ENSTGUG00000004382)	nat2 (ENSTGUG00000004387)	ENSTGUG00000021722	MPHOSPH6 (ENSTGUG00000025891)	CDH13 (ENSTGUG00000004357)	MLYCD (ENSTGUG00000004352)
Common canary	MODERN SPECIES	14	USB1 (ENSSCAG00000006388)	MMP15 (ENSSCAG00000006393)	CFAP20 (ENSSCAG00000006401)	ENSSCAG00000006403	CSNK2A2 (ENSSCAG00000006420)	GINS3 (ENSSCAG00000006492)	ENSSCAG00000006496	NDRG4 (ENSSCAG00000006499)	WWOX (ENSSCAG00000006512)	ENSSCAG00000006519	MAF (ENSSCAG00000006531)	ENSSCAG00000006546	CDYL2 (ENSSCAG00000006552) #19	CMC2 (ENSSCAG00000006557) #20	CENPN (ENSSCAG00000006563) #21	ATMIN (ENSSCAG00000006567) #22	ENSSCAG00000006569	PKD1L2 (ENSSCAG00000006577) #25	BCO1 (ENSSCAG00000006597) #26	GAN (ENSSCAG00000006604) #27	CMIP (ENSSCAG00000006615) #28	PLCG2 (ENSSCAG00000006629) #29	SDR42E1 (ENSSCAG00000006634) #30	HSD17B2 (ENSSCAG00000006639)	ENSSCAG00000006652	ENSSCAG00000006658	ENSSCAG00000006660	MPHOSPH6 (ENSSCAG00000006662)	CDH13 (ENSSCAG00000006672)	MLYCD (ENSSCAG00000006674)	HSBP1 (ENSSCAG00000006677)
Flycatcher	MODERN SPECIES	2	KIFC3 (ENSFALG00000006898)	CNGB1 (ENSFALG00000006885)	ZNF319 (ENSFALG00000014292)	USB1 (ENSFALG00000006876)	MMP15 (ENSFALG00000023117)	CFAP20 (ENSFALG00000024771)	CSNK2A2 (ENSFALG00000006864)	ENSFALG00000006902	GINS3 (ENSFALG00000029037)	NDRG4 (ENSFALG00000006850)	ENSFALG00000006846	ENSFALG00000023580	MAF (ENSFALG00000006844)	ENSFALG00000006840 #19	CMC2 (ENSFALG00000026435) #20	ATMIN (ENSFALG00000006834) #22	CENPN (ENSFALG00000006835) #21	ENSFALG00000006829	PKD1L2 (ENSFALG00000006826) #25	BCO1 (ENSFALG00000006810) #26	GAN (ENSFALG00000006805) #27	CMIP (ENSFALG00000006794) #28	PLCG2 (ENSFALG00000006754) #29	SDR42E1 (ENSFALG00000023083) #30	HSD17B2 (ENSFALG00000006730)	ENSFALG00000014290	ENSFALG00000014286	ENSFALG00000014283	MPHOSPH6 (ENSFALG00000028959)	ENSFALG00000025591	CDH13 (ENSFALG00000006727)
Great tit	MODERN SPECIES	2	CNGB1 (ENSPMJG00000014045)	ZNF319 (ENSPMJG00000014044)	USB1 (ENSPMJG00000014043)	MMP15 (ENSPMJG00000014042)	CFAP20 (ENSPMJG00000014041)	CSNK2A2 (ENSPMJG00000014040)	GINS3 (ENSPMJG00000014038)	NDRG4 (ENSPMJG00000014035)	WWOX (ENSPMJG00000014034)	ENSPMJG00000014027	MAF (ENSPMJG00000014026)	ENSPMJG00000014018	CDYL2 (ENSPMJG00000014015) #19	CMC2 (ENSPMJG00000014012) #20	CENPN (ENSPMJG00000014005) #21	ATMIN (ENSPMJG00000014003) #22	PPP1R3E (ENSPMJG00000014002)	GCSH (ENSPMJG00000013998) #24	PKD1L2 (ENSPMJG00000013992) #25	BCO1 (ENSPMJG00000013991) #26	GAN (ENSPMJG00000013990) #27	CMIP (ENSPMJG00000013988) #28	PLCG2 (ENSPMJG00000013982) #29	SDR42E1 (ENSPMJG00000013981) #30	HSD17B2 (ENSPMJG00000013980)	ENSPMJG00000013978	ENSPMJG00000013977	ENSPMJG00000013976	MPHOSPH6 (ENSPMJG00000013975)	CDH13 (ENSPMJG00000013971)	MLYCD (ENSPMJG00000013963)
African ostrich	MODERN SPECIES	889												ENSSCUG00000012792	ENSSCUG00000012791	CDYL2 (ENSSCUG00000012787) #19	CENPN (ENSSCUG00000012783) #21	ATMIN (ENSSCUG00000012782) #22	ENSSCUG00000012781 #23	ENSSCUG00000012779	PKD1L2 (ENSSCUG00000012773) #25	BCO1 (ENSSCUG00000012767) #26	GAN (ENSSCUG00000012766) #27	CMIP (ENSSCUG00000012759) #28	PLCG2 (ENSSCUG00000012749) #29	SDR42E1 (ENSSCUG00000012746) #30	HSD17B2 (ENSSCUG00000012744)	ENSSCUG00000012742	ENSSCUG00000012740	ENSSCUG00000012738	MPHOSPH6 (ENSSCUG00000012736)	CDH13 (ENSSCUG00000012728)	MLYCD (ENSSCUG00000012723)
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	35	CDH5 (ENSCPRG00005005443)	CDH11 (ENSCPRG00005005508)	ENSCPRG00005005523	PPM1L (ENSCPRG00005005524)	CDH8 (ENSCPRG00005005540)	ADAMTS18 (ENSCPRG00005005562)	NUDT7 (ENSCPRG00005005600)	VAT1L (ENSCPRG00005005616)	CLEC3A (ENSCPRG00005005706)	WWOX (ENSCPRG00005005732)	ENSCPRG00005005777	MAF (ENSCPRG00005005799)	DYNLRB2 (ENSCPRG00005005821)	CDYL2 (ENSCPRG00005005831) #19	CMC2 (ENSCPRG00005005851) #20	ATMIN (ENSCPRG00005005860) #22	ENSCPRG00005005888 #23	ENSCPRG00005005903	PKD1L2 (ENSCPRG00005005912) #25	BCO1 (ENSCPRG00005005937) #26	GAN (ENSCPRG00005005955) #27	CMIP (ENSCPRG00005005977) #28	PLCG2 (ENSCPRG00005006038) #29	SDR42E1 (ENSCPRG00005006053) #30	HSD17B2 (ENSCPRG00005006082)	ENSCPRG00005006255	ENSCPRG00005006261	ENSCPRG00005006265	MPHOSPH6 (ENSCPRG00005006275)	CDH13 (ENSCPRG00005006294)	MLYCD (ENSCPRG00005006313)
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000165226	ENSGT00940000160587	ENSGT00940000153691.a.a.b	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT01060000249485	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00940000159432.C	ENSGT00940000167286	ENSGT00940000154805.b.g	ENSGT00950000183008.a.a.b	ENSGT00940000154606	ENSGT00940000161906	ENSGT00950000182893.a.b	ENSGT00740000115581.e	ENSGT00940000158278	ENSGT00940000161681	ENSGT00390000007438	ENSGT00710000106790	ENSGT00940000159567	ENSGT00940000162200
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000165226	ENSGT00940000160587	ENSGT00940000153691.a.a.b	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT01060000249485	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00940000167286	ENSGT00940000154805.b.g	ENSGT00950000183008.a.a.b	ENSGT00940000154606	ENSGT00940000161906	ENSGT00950000182893.a.b	ENSGT00740000115581.e	ENSGT00940000158278	ENSGT00940000161681	ENSGT00390000007438	ENSGT00710000106790.q	ENSGT00940000159567	ENSGT00940000162200	ENSGT00940000157841
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	47			ENSGT00940000153691.a.a.a.b	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT01060000249485	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00950000183008.a.a.b	ENSGT00940000154606	ENSGT00940000161906	ENSGT00950000182893.a.b	ENSGT00740000115581.e	ENSGT00940000158278	ENSGT00940000161681	ENSGT00390000007438	ENSGT00710000106790.q	ENSGT00940000159567	ENSGT00940000162200	ENSGT00940000157841	ENSGT00390000012708	ENSGT00390000014634
Three-toed box turtle	DUPLICATION
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	2267	ENSTMTG00000010395	ENSTMTG00000010448	ENSTMTG00000010694	ENSTMTG00000010788	ENSTMTG00000010804	ENSTMTG00000010854	ENSTMTG00000010880	ENSTMTG00000010888	ENSTMTG00000010903	ENSTMTG00000010911	ENSTMTG00000010922	ENSTMTG00000010934	ENSTMTG00000010946 #19	ENSTMTG00000010976 #20	ENSTMTG00000010997 #21	ENSTMTG00000011034 #22	ENSTMTG00000011045 #23	ENSTMTG00000011081	ENSTMTG00000011104	ENSTMTG00000011124 #26	ENSTMTG00000011150 #27	ENSTMTG00000011182 #28	ENSTMTG00000011289 #29	ENSTMTG00000012327 #30	ENSTMTG00000012335	ENSTMTG00000012349	ENSTMTG00000012366	ENSTMTG00000012392	ENSTMTG00000012415	ENSTMTG00000012475	ENSTMTG00000012535
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	2272				ENSTMTG00000012887	ENSTMTG00000012938	ENSTMTG00000013113	ENSTMTG00000013209	ENSTMTG00000013228	ENSTMTG00000013265	ENSTMTG00000013288	ENSTMTG00000013305	ENSTMTG00000013316	ENSTMTG00000013328 #19	ENSTMTG00000013345 #20	ENSTMTG00000013358 #21	ENSTMTG00000013372 #22	ENSTMTG00000013394 #23	ENSTMTG00000013402	ENSTMTG00000013410	ENSTMTG00000013421 #25	ENSTMTG00000013433	ENSTMTG00000013451 #26	ENSTMTG00000013501 #27	ENSTMTG00000013515 #27	ENSTMTG00000013546 #28	ENSTMTG00000013651 #29	ENSTMTG00000014269 #30	ENSTMTG00000014279	ENSTMTG00000014298	ENSTMTG00000014313	ENSTMTG00000014328
painted turtle	MODERN SPECIES	708												DYNLRB2 (ENSCPBG00000000123)	CDYL2 (ENSCPBG00000024003) #19	CMC2 (ENSCPBG00000023998) #20	CENPN (ENSCPBG00000023991) #21	ATMIN (ENSCPBG00000023988) #22	ENSCPBG00000023985 #23	ENSCPBG00000023980	ENSCPBG00000023978	PKD1L2 (ENSCPBG00000023969) #25	BCO1 (ENSCPBG00000023964) #26	GAN (ENSCPBG00000023962) #27	CMIP (ENSCPBG00000023954) #28	PLCG2 (ENSCPBG00000023944) #29	SDR42E1 (ENSCPBG00000023938) #30	HSD17B2 (ENSCPBG00000023906)	ENSCPBG00000023901	ENSCPBG00000023899	MPHOSPH6 (ENSCPBG00000023898)	CDH13 (ENSCPBG00000023893)	MLYCD (ENSCPBG00000023890)
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00530000063956.b.b	ENSGT00940000165226	ENSGT00940000160587	ENSGT00940000153691.a.a.b	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT01100000266524	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00940000167286	ENSGT00940000154805.b.g	ENSGT00950000183008.a.a.b	ENSGT00940000154606	ENSGT00940000161906	ENSGT00950000182893.a.b	ENSGT00740000115581.e	ENSGT00940000158278	ENSGT00940000161681	ENSGT00710000106790.q	ENSGT00940000159567	ENSGT00940000157841	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	2769												CDYL2 (ENSCABG00000021598) #19	ENSCABG00000021596	ENSCABG00000021594	CENPN (ENSCABG00000021591) #21	ATMIN (ENSCABG00000021588) #22	C16orf46 (ENSCABG00000021586) #23	ENSCABG00000021581	ENSCABG00000021578	PKD1L2 (ENSCABG00000021574) #25	BCO1 (ENSCABG00000021570) #26	GAN (ENSCABG00000021567) #27
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	3	ENSGEVG00005014732	CDH5 (ENSGEVG00005014779)	CDH11 (ENSGEVG00005015145)	CDH8 (ENSGEVG00005015245)	ADAMTS18 (ENSGEVG00005015477)	NUDT7 (ENSGEVG00005015659)	VAT1L (ENSGEVG00005015682)	CLEC3A (ENSGEVG00005015758)	WWOX (ENSGEVG00005015800)	ENSGEVG00005015858	MAF (ENSGEVG00005015870)	DYNLRB2 (ENSGEVG00005015907)	CDYL2 (ENSGEVG00005015928) #19	ENSGEVG00005015990	CENPN (ENSGEVG00005016003) #21	ATMIN (ENSGEVG00005016050) #22	C16orf46 (ENSGEVG00005016069) #23	PPP1R3E (ENSGEVG00005016079)	GCSH (ENSGEVG00005016103) #24	PKD1L2 (ENSGEVG00005016151) #25	BCO1 (ENSGEVG00005016447) #26	GAN (ENSGEVG00005016541) #27	CMIP (ENSGEVG00005016563) #28	ENSGEVG00005016596	PLCG2 (ENSGEVG00005016632) #29	SDR42E1 (ENSGEVG00005016717) #30	HSD17B2 (ENSGEVG00005016732)	ENSGEVG00005016762	ENSGEVG00005016789	ENSGEVG00005016819	MPHOSPH6 (ENSGEVG00005016869)
Chinese turtle	MODERN SPECIES	1051											DYNLRB2 (ENSPSIG00000003887)	ENSPSIG00000003882 #19	ENSPSIG00000003880 #19	CMC2 (ENSPSIG00000003876) #20	CENPN (ENSPSIG00000003873) #21	ATMIN (ENSPSIG00000003868) #22	C16orf46 (ENSPSIG00000003864) #23	ENSPSIG00000003859	PKD1L2 (ENSPSIG00000003740) #25	BCO1 (ENSPSIG00000003698) #26	GAN (ENSPSIG00000003693) #27	CMIP (ENSPSIG00000003580) #28	PLCG2 (ENSPSIG00000003341) #29	SDR42E1 (ENSPSIG00000003337) #30	HSD17B2 (ENSPSIG00000003303)	ENSPSIG00000001107	ENSPSIG00000003301	ENSPSIG00000001091	MPHOSPH6 (ENSPSIG00000018195)	CDH13 (ENSPSIG00000018164)
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000165226	ENSGT00940000160587	ENSGT00940000153691.a.a.b	ENSGT00940000153691.a.b.g	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00940000160959	ENSGT00940000154606	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000158070 #30	ENSGT00940000160204	ENSGT00390000012054.b.ab	ENSGT00390000012054.b.`b	ENSGT00390000009212
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000165226	ENSGT00940000160587	ENSGT00940000153691.a.a.b	ENSGT00940000153691.a.b.g	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00940000154606	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000157672	ENSGT01030000235333	ENSGT00940000160211	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.b	ENSGT00940000161738	ENSGT00550000075019
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000165226	ENSGT00940000160587	ENSGT00940000153691.a.a.b	ENSGT00940000153691.a.b.g	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00940000154606	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000157672	ENSGT01030000235333	ENSGT00940000160211	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.b	ENSGT00940000161738	ENSGT00550000075019
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000165226	ENSGT00940000160587	ENSGT00940000153691.a.a.b	ENSGT00940000153691.a.b.g	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00940000154606	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000157672	ENSGT01030000235333	ENSGT00940000160211	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.b	ENSGT00940000161738	ENSGT00550000075019	ENSGT00940000156131.a.b
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000165226	ENSGT00940000160587	ENSGT00940000153691.a.a.b	ENSGT00940000153691.a.b.g	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000165226	ENSGT00940000160587	ENSGT00940000153691.a.a.b	ENSGT00940000153691.a.b.g	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000157672	ENSGT01030000235333	ENSGT00940000160211	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.b	ENSGT00940000161738	ENSGT00550000075019	ENSGT00940000156131.a.b	ENSGT00940000157187	ENSGT00950000182966.B
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	41	ENSNSUG00000010288	CDH5 (ENSNSUG00000010302)	CDH11 (ENSNSUG00000010313)	CDH8 (ENSNSUG00000010380)	ADAMTS18 (ENSNSUG00000010393)	NUDT7 (ENSNSUG00000010397)	VAT1L (ENSNSUG00000010399)	CLEC3A (ENSNSUG00000010400)	ENSNSUG00000010402	WWOX (ENSNSUG00000010403)	MAF (ENSNSUG00000010404)	DYNLRB2 (ENSNSUG00000010408)	CDYL2 (ENSNSUG00000010409) #19	CMC2 (ENSNSUG00000010411) #20	CENPN (ENSNSUG00000010412) #21	ATMIN (ENSNSUG00000010415) #22	ENSNSUG00000010416	GCSH (ENSNSUG00000010417) #24	PKD1L2 (ENSNSUG00000010419) #25	GAN (ENSNSUG00000010426) #27	CMIP (ENSNSUG00000010432) #28	ENSNSUG00000010435	PLCG2 (ENSNSUG00000010437) #29	SLC12A4 (ENSNSUG00000010482)	ENSNSUG00000017961	ENSNSUG00000017962	DDX28 (ENSNSUG00000017963)	DUS2 (ENSNSUG00000017964)	NFATC3 (ENSNSUG00000017965)	ESRP2 (ENSNSUG00000017966)	ENSNSUG00000017970
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	67	CDH5 (ENSPTXG00000006123)	CDH11 (ENSPTXG00000006121)	CDH8 (ENSPTXG00000006118)	ADAMTS18 (ENSPTXG00000006117)	NUDT7 (ENSPTXG00000006116)	VAT1L (ENSPTXG00000006115)	CLEC3A (ENSPTXG00000006113)	ENSPTXG00000006112	WWOX (ENSPTXG00000006111)	MAF (ENSPTXG00000006110)	DYNLRB2 (ENSPTXG00000006109)	CDYL2 (ENSPTXG00000006108) #19	CMC2 (ENSPTXG00000006106) #20	ENSPTXG00000006105	CENPN (ENSPTXG00000006104) #21	ATMIN (ENSPTXG00000006103) #22	ENSPTXG00000006102	GCSH (ENSPTXG00000006100) #24	PKD1L2 (ENSPTXG00000006096) #25	GAN (ENSPTXG00000006094) #27	CMIP (ENSPTXG00000006092) #28	PLCG2 (ENSPTXG00000006091) #29	SLC12A4 (ENSPTXG00000006090)	ENSPTXG00000006089	DPEP2 (ENSPTXG00000006087)	ENSPTXG00000006086	DDX28 (ENSPTXG00000006085)	DUS2 (ENSPTXG00000006052)	NFATC3 (ENSPTXG00000006051)	ESRP2 (ENSPTXG00000006050)	ENSPTXG00000006049
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	4731													CDYL2 (ENSLLTG00000018030) #19	CMC2 (ENSLLTG00000018029) #20	CENPN (ENSLLTG00000018027) #21	ATMIN (ENSLLTG00000018026) #22	ENSLLTG00000018025
Indian cobra	MODERN SPECIES	12	ENSNNAG00000012924	CDH5 (ENSNNAG00000012804)	CDH11 (ENSNNAG00000012759)	ENSNNAG00000012750	ENSNNAG00000012734	ADAMTS18 (ENSNNAG00000012235)	NUDT7 (ENSNNAG00000012179)	VAT1L (ENSNNAG00000012058)	CLEC3A (ENSNNAG00000012008)	WWOX (ENSNNAG00000011982)	MAF (ENSNNAG00000011944)	DYNLRB2 (ENSNNAG00000011901)	CDYL2 (ENSNNAG00000011876) #19	CMC2 (ENSNNAG00000011857) #20	CENPN (ENSNNAG00000011786) #21	ATMIN (ENSNNAG00000011761) #22	ENSNNAG00000011753 #23	ENSNNAG00000011737	ENSNNAG00000011724	PKD1L2 (ENSNNAG00000011501) #25	GAN (ENSNNAG00000011360) #27	CMIP (ENSNNAG00000011311) #28	PLCG2 (ENSNNAG00000011138) #29	SLC12A4 (ENSNNAG00000011059)	DPEP2 (ENSNNAG00000010899)	ENSNNAG00000010849	DDX28 (ENSNNAG00000010315)	DUS2 (ENSNNAG00000010247)	NFATC3 (ENSNNAG00000010199)	ESRP2 (ENSNNAG00000010114)	ENSNNAG00000011995
Lizard	MODERN SPECIES	803	ENSACAG00000013263	ENSACAG00000044584	SHCBP1 (ENSACAG00000013221)	ENSACAG00000040332	ENSACAG00000036107	ENSACAG00000037601	ENSACAG00000043785	ENSACAG00000022476	ENSACAG00000044705	ENSACAG00000041576	ENSACAG00000038945	ENSACAG00000008780	ENSACAG00000008783 #19	CMC2 (ENSACAG00000008855) #20	CENPN (ENSACAG00000008859) #21	ATMIN (ENSACAG00000008885) #22	ENSACAG00000042178 #23	ENSACAG00000043658	ENSACAG00000008905	PKD1L2 (ENSACAG00000008955) #25	BCO1 (ENSACAG00000009055) #26	GAN (ENSACAG00000009119) #27	CMIP (ENSACAG00000009149) #28	PLCG2 (ENSACAG00000009200) #29	SLC12A4 (ENSACAG00000009446)	ENSACAG00000009652	ENSACAG00000009728	DDX28 (ENSACAG00000009755)	DUS2 (ENSACAG00000009757)	NFATC3 (ENSACAG00000009839)	ESRP2 (ENSACAG00000009900)
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00530000063956.b.b	ENSGT00940000165226	ENSGT00940000160587	ENSGT00940000153691.a.a.b	ENSGT00940000153691.a.b.g	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00390000017224 #23	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28	ENSGT00940000157517 #29	ENSGT00940000157672	ENSGT00940000160211.a	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.b	ENSGT00940000161738	ENSGT00550000075019	ENSGT00940000156131.a.b	ENSGT00940000157187	ENSGT00950000182966.B
Common wall lizard	MODERN SPECIES	16	ENSPMRG00000009600	ENSPMRG00000009595	ENSPMRG00000009586	ENSPMRG00000009583	ENSPMRG00000009580	ADAMTS18 (ENSPMRG00000009570)	NUDT7 (ENSPMRG00000009565)	VAT1L (ENSPMRG00000009558)	CLEC3A (ENSPMRG00000009550)	WWOX (ENSPMRG00000009541)	MAF (ENSPMRG00000009533)	ENSPMRG00000009527	CDYL2 (ENSPMRG00000009518) #19	ENSPMRG00000009511	CENPN (ENSPMRG00000009503) #21	ATMIN (ENSPMRG00000009498) #22	ENSPMRG00000009494 #23	ENSPMRG00000009488	ENSPMRG00000009483	GCSH (ENSPMRG00000009476) #24	PKD1L2 (ENSPMRG00000009431) #25	BCO1 (ENSPMRG00000009422) #26	GAN (ENSPMRG00000009402) #27	CMIP (ENSPMRG00000009390) #28	PLCG2 (ENSPMRG00000009303) #29	ENSPMRG00000009228	ENSPMRG00000009204	ENSPMRG00000009157	ENSPMRG00000009133	DDX28 (ENSPMRG00000009125)	DUS2 (ENSPMRG00000009109)
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	57	TK2 (ENSSMRG00000011139)	ENSSMRG00000011142	ENSSMRG00000011147	CDH5 (ENSSMRG00000011152)	CDH11 (ENSSMRG00000011205)	CDH8 (ENSSMRG00000011246)	ADAMTS18 (ENSSMRG00000011269)	VAT1L (ENSSMRG00000011492)	WWOX (ENSSMRG00000011502)	ENSSMRG00000011503	MAF (ENSSMRG00000011520)	DYNLRB2 (ENSSMRG00000011551)	CDYL2 (ENSSMRG00000011552) #19	CMC2 (ENSSMRG00000011555) #20	CENPN (ENSSMRG00000011557) #21	ATMIN (ENSSMRG00000011558) #22	ENSSMRG00000011559 #23	ENSSMRG00000011560	ENSSMRG00000011562	PKD1L2 (ENSSMRG00000011581) #25	BCO1 (ENSSMRG00000011589) #26	GAN (ENSSMRG00000011590) #27	CMIP (ENSSMRG00000011592) #28	PLCG2 (ENSSMRG00000011598) #29	SLC12A4 (ENSSMRG00000000008)	ENSSMRG00000000151	ENSSMRG00000000184	DDX28 (ENSSMRG00000000268)	DUS2 (ENSSMRG00000000287)	NFATC3 (ENSSMRG00000000337)	ESRP2 (ENSSMRG00000000355)
Anura	ANCESTRAL SPECIES	59	ENSGT00530000063956.b.b	ENSGT00940000165226	ENSGT00940000160587	ENSGT00940000153691.a.a	ENSGT00940000153691.a.b	ENSGT00940000157553	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000161531	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT01000000220627	ENSGT00390000011666 #24	ENSGT00940000161577 #25	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000155273 #27	ENSGT00390000018220 #28
Frog	MODERN SPECIES	4	cdh11 (ENSXETG00000020467)	ENSXETG00000041091	ENSXETG00000031154	cdh8 (ENSXETG00000021259)	ENSXETG00000044147	adamts18 (ENSXETG00000012701)	nudt7 (ENSXETG00000012700)	vat1l (ENSXETG00000012696)	clec3a (ENSXETG00000012694)	wwox (ENSXETG00000012689)	maf (ENSXETG00000000172)	dynlrb2 (ENSXETG00000024765)	cdyl2 (ENSXETG00000032985) #19	cmc2 (ENSXETG00000039714) #20	cenpn (ENSXETG00000000170) #21	atmin (ENSXETG00000000183) #22	ENSXETG00000036204	cdk10 (ENSXETG00000000185)	XB5887600 [provisional:cry1] (ENSXETG00000034974)	gcsh (ENSXETG00000047032) #24	pkd1l2 (ENSXETG00000032436) #25	bco1 (ENSXETG00000036664) #26	gan (ENSXETG00000018044) #27	ENSXETG00000046692	cmip (ENSXETG00000031832) #28	dnaaf1 (ENSXETG00000033921)	ENSXETG00000032337	ENSXETG00000040094	ENSXETG00000020037	hsf4 (ENSXETG00000030007)	fbxl8 (ENSXETG00000033251)
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	1	ENSLLEG00000009978	TERB1 (ENSLLEG00000010002)	NAE1 (ENSLLEG00000010124)	SNAI3 (ENSLLEG00000010336)	RNF166 (ENSLLEG00000010400)	ENSLLEG00000010511	CDT1 (ENSLLEG00000010745)	APRT (ENSLLEG00000010959)	GALNS (ENSLLEG00000011328)	TRAPPC2L (ENSLLEG00000012102)	PABPN1L (ENSLLEG00000012152)	CBFA2T3 (ENSLLEG00000012214)	ACSF3 (ENSLLEG00000012437)	CDH15 (ENSLLEG00000012694)	SLC22A31 (ENSLLEG00000012833)	ATMIN (ENSLLEG00000013064) #22	ENSLLEG00000013129	ENSLLEG00000013205	ENSLLEG00000013223	PKD1L2 (ENSLLEG00000013267) #25	BCO1 (ENSLLEG00000013530) #26	GAN (ENSLLEG00000013717) #27	CMIP (ENSLLEG00000014012) #28	ENSLLEG00000015284	ENSLLEG00000015328	HSDL1 (ENSLLEG00000015384)	ENSLLEG00000015567	ENSLLEG00000015888	ENSLLEG00000015974	ENSLLEG00000016045	ENSLLEG00000016065
Coelacanth	MODERN SPECIES	1315														CDYL2 (ENSLACG00000010341) #19	CENPN (ENSLACG00000022615) #21	ATMIN (ENSLACG00000008127) #22	ENSLACG00000007259	gcshb (ENSLACG00000005626)	PKD1L2 (ENSLACG00000002808) #25	BCO1 (ENSLACG00000000150) #26
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00950000182913.A.b.a ##26	ENSGT00950000182913.A.b.b #26	ENSGT00940000166064	ENSGT00390000013048	ENSGT00940000159631	ENSGT00940000159184	ENSGT00950000183186.B.a	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000161531.a.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00940000154593.b	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000010285.d	ENSGT00580000082227	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00940000153229.A.a.a	ENSGT00390000009477	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	25									ENSGT00940000161531.a.b	ENSGT00940000157389	ENSGT01060000249485	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000010285.d	ENSGT00580000082227	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00940000155200	ENSGT00940000153229.A.a.a.b	ENSGT00390000009477	ENSGT00390000018903
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	91	ENSGT00940000161285.b	ENSGT00940000156586	ENSGT00940000159068	ENSGT00940000156718	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000159754.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00390000015299.a.a.a	ENSGT00940000161531.a.b	ENSGT00940000157389	ENSGT01060000249485	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000010285.d	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00940000153229.A.a.a.b	ENSGT00390000009477	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000156734.b	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000010285.d	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00940000153229.A.a.a.b	ENSGT00390000009477	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	173							ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000010285.d	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000009477	ENSGT00390000018903.m	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT00940000159115
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	33					ENSGT00940000158330	ENSGT00730000111263	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000010285.d	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000009477	ENSGT00390000018903.m	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT00940000159115
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00390000017361	ENSGT00940000160434	ENSGT00950000183151.a.a.a	ENSGT00390000013180	ENSGT00940000158330	ENSGT00730000111263	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.b	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000010285.d.k	ENSGT00390000010285.d.l	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000009477	ENSGT00390000018903.m	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00410000025651.A	ENSGT00390000017361	ENSGT00940000160434	ENSGT00950000183151.a.a.a	ENSGT00390000013180	ENSGT00940000158330	ENSGT00730000111263	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00970000197690	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000010285.d.k	ENSGT00390000010285.d.l	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000009477	ENSGT00390000018903.m	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000160434	ENSGT00950000183151.a.a.a	ENSGT00390000013180	ENSGT00940000158330	ENSGT00730000111263	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00970000197690	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a.h	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000010285.d.k	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000009477	ENSGT00390000018903.m	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT00940000159115
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	485													CDYL2 (ENSPNAG00000008852) #19	ENSPNAG00000008824	cenpn (ENSPNAG00000008820) #21	ATMIN (ENSPNAG00000008812) #22	ENSPNAG00000008809	ENSPNAG00000008793	CDH24 (ENSPNAG00000001176)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	9	ENSAMXG00000042699	ENSAMXG00000010434	sh3bp4 (ENSAMXG00000010387)	arl4cb (ENSAMXG00000024926)	ENSAMXG00000041823	ENSAMXG00000040111	ENSAMXG00000003098	spon1a (ENSAMXG00000003147)	SYT9 (ENSAMXG00000033745)	ENSAMXG00000038354	ENSAMXG00000003198	MAF (ENSAMXG00000003234)	CDYL2 (ENSAMXG00000003261) #19	cmc2 (ENSAMXG00000031858) #20	cenpn (ENSAMXG00000037478) #21	ATMIN (ENSAMXG00000044124) #22	PPP1R3E (ENSAMXG00000025809)	CIBAR2 (ENSAMXG00000043090)	gse1b (ENSAMXG00000003358)	gins2 (ENSAMXG00000037657)	emc8 (ENSAMXG00000029836)	cox4i1 (ENSAMXG00000042641)	dusp22a (ENSAMXG00000003438)	irf8 (ENSAMXG00000003452)	foxf1 (ENSAMXG00000003465)	mthfsd (ENSAMXG00000003476)	DBNDD1 (ENSAMXG00000034317)	ENSAMXG00000003503	def8 (ENSAMXG00000038632)	ENSAMXG00000031816	tcf25 (ENSAMXG00000003532)
Electric eel	MODERN SPECIES	35	ENSEEEG00000001348	tspan4a (ENSEEEG00000001346)	ddb1 (ENSEEEG00000001345)	LRCH3 (ENSEEEG00000001339)	iqcg (ENSEEEG00000001336)	hipk3b (ENSEEEG00000000439)	ENSEEEG00000017344	ENSEEEG00000017343	spon1a (ENSEEEG00000017342)	SYT9 (ENSEEEG00000017341)	PPFIBP2 (ENSEEEG00000017180)	MAF (ENSEEEG00000017175)	CDYL2 (ENSEEEG00000017173) #19	cmc2 (ENSEEEG00000017172) #20	cenpn (ENSEEEG00000017169) #21	ATMIN (ENSEEEG00000017168) #22	ENSEEEG00000017166	CIBAR2 (ENSEEEG00000017165)	gse1b (ENSEEEG00000017163)	gins2 (ENSEEEG00000017159)	emc8 (ENSEEEG00000017157)	cox4i1 (ENSEEEG00000017154)	dusp22a (ENSEEEG00000017152)	irf8 (ENSEEEG00000017148)	foxf1 (ENSEEEG00000017147)	mthfsd (ENSEEEG00000017146)	gas8 (ENSEEEG00000017144)	DBNDD1 (ENSEEEG00000017143)	ENSEEEG00000017131	def8 (ENSEEEG00000017065)	TUBB3 (ENSEEEG00000017061)
Channel catfish	MODERN SPECIES	23	taldo1 (ENSIPUG00000005480)	tspan4 (ENSIPUG00000005571)	DDB1 (ENSIPUG00000005612)	luzp2 (ENSIPUG00000005750)	LRCH3 (ENSIPUG00000005779)	iqcg (ENSIPUG00000005890)	hipk3b (ENSIPUG00000005910)	ENSIPUG00000005971	SPON1 (ENSIPUG00000006012)	SYT9 (ENSIPUG00000006078)	PPFIBP2 (ENSIPUG00000006130)	maf (ENSIPUG00000006164)	cdyl2 (ENSIPUG00000006192) #19	ENSIPUG00000006213	cenpn (ENSIPUG00000006231) #21	ATMIN (ENSIPUG00000006337) #22	PPP1R3E (ENSIPUG00000006355)	ENSIPUG00000006380	CIBAR2 (ENSIPUG00000006386)	gse1 (ENSIPUG00000006415)	gins2 (ENSIPUG00000006459)	emc8 (ENSIPUG00000006484)	COX41 (ENSIPUG00000006497)	dusp22a (ENSIPUG00000006542)	IRF8 (ENSIPUG00000006571)	gas8 (ENSIPUG00000006643)	foxf1 (ENSIPUG00000006677)	mthfsd (ENSIPUG00000006695)	ENSIPUG00000006745	dbndd1 (ENSIPUG00000006763)	gas8 (ENSIPUG00000006773)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	162							ENSGT00730000111263	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.b.c.a.b	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000155648.A.a.a	ENSGT00730000111007.a.b	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	1037															ENSGT00390000004738.x #21	ENSGT00390000013091.bb #22	ENSGT00730000111007.a.b.j	ENSGT00700000104539.b.a.d
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	281	ENSGT01000000214413.a.v.l.b	ENSGT01050000244883.C.h.d	ENSGT01090000260029.a.b.b.b.a.a.a.a.b.a.a.b	ENSGT00940000155347.a.b.bb	ENSGT00940000157573.k	ENSGT00950000183103.c.i	ENSGT00730000111263	ENSGT00940000155960.b.e	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a.b	ENSGT00940000154910.b.b.n	ENSGT00940000155948.b.a.b	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b.d	ENSGT00940000161531.a.b.c.a.b.b	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738.x #21	ENSGT00390000013091.bb #22	ENSGT00730000111007.a.b.j	ENSGT00700000104539.b.a.d
Common carp reference	MODERN SPECIES	19	ENSCCRG00000016806	spon1a (ENSCCRG00000043503)	ENSCCRG00000026778	ENSCCRG00000081219	ENSCCRG00000026797	ENSCCRG00000070497	mafa (ENSCCRG00000065550)	ENSCCRG00000059270	ENSCCRG00000053077	ENSCCRG00000075013	ENSCCRG00000055732	ENSCCRG00000063184	ENSCCRG00000080785	cmc2 (ENSCCRG00000072874) #20	cenpn (ENSCCRG00000053713) #21	ATMIN (ENSCCRG00000048898) #22	ENSCCRG00000048899	ENSCCRG00000048903	ENSCCRG00000068597	gse1b (ENSCCRG00000012030)	ENSCCRG00000077711	ENSCCRG00000065259	ENSCCRG00000073518	ENSCCRG00000075628	ENSCCRG00000020593	ENSCCRG00000051551	ENSCCRG00000033905	ENSCCRG00000067325	mc1r (ENSCCRG00000039934)	ENSCCRG00000045164	ENSCCRG00000040071
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	993												PPFIBP2 (ENSSGRG00000032284)	mafa (ENSSGRG00000032277)	ENSSGRG00000032275	cenpn (ENSSGRG00000032274) #21	ATMIN (ENSSGRG00000032272) #22	ENSSGRG00000032270	gse1b (ENSSGRG00000032139)	cox4i1 (ENSSGRG00000032135)
Goldfish	MODERN SPECIES	1985												ENSCARG00000051540	ENSCARG00000051546	ENSCARG00000051554	cenpn (ENSCARG00000051559) #21	ENSCARG00000051624 #22	ENSCARG00000051633	ENSCARG00000051648
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	78	ENSGT00940000158280.n	ENSGT00940000154351.ub	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.b.a.g.a	ENSGT01000000214413.a.v.k	ENSGT00940000155347.a.b.cb	ENSGT00940000157573.l	ENSGT00950000183103.c.j	ENSGT00940000155960.b.f	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154910.b.b.m	ENSGT00940000155948.b.a.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b.c	ENSGT00940000161531.a.b.c.a.b.a	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738.w #21	ENSGT00390000013091.cb #22	ENSGT00940000155648.A.a.a	ENSGT00730000111007.a.b.i	ENSGT00700000104539.b.a.c	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d.gb
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	156	ENSGT00940000160054.i	ENSGT00940000158280.n	ENSGT00940000154351.ub	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.b.a.g.a	ENSGT01000000214413.a.v.k	ENSGT00940000155347.a.b.cb	ENSGT00940000157573.l	ENSGT00950000183103.c.j	ENSGT00940000155960.b.f	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a.a	ENSGT00940000154910.b.b.m	ENSGT00940000155948.b.a.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b.c	ENSGT00940000161531.a.b.c.a.b.a	ENSGT00390000004738.w #21	ENSGT00390000013091.cb #22	ENSGT00940000155648.A.a.a.a	ENSGT00730000111007.a.b.i	ENSGT00700000104539.b.a.c	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d.gb
Common carp reference	MODERN SPECIES	9	MYO5A (ENSCCRG00000019001)	atosa (ENSCCRG00000067812)	onecut1 (ENSCCRG00000077301)	hipk3b (ENSCCRG00000015496)	ENSCCRG00000063950	ENSCCRG00000060415	ENSCCRG00000077058	spon1a (ENSCCRG00000063218)	ENSCCRG00000064204	ENSCCRG00000073026	mafa (ENSCCRG00000079056)	ENSCCRG00000076139	ENSCCRG00000078389	CMC2 (ENSCCRG00000069947) #20	cenpn (ENSCCRG00000042150) #21	ATMIN (ENSCCRG00000063095) #22	ENSCCRG00000042161	ENSCCRG00000042166	gse1b (ENSCCRG00000008618)	gins2 (ENSCCRG00000008615)	ENSCCRG00000070859	MTHFSD (ENSCCRG00000009383)	ENSCCRG00000043592	ENSCCRG00000072803	ENSCCRG00000061228	ENSCCRG00000061588	ENSCCRG00000038231	ENSCCRG00000075116	ENSCCRG00000064198	ENSCCRG00000040531	IRF8 (ENSCCRG00000015195)
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	1139											ENSSGRG00000042548	ENSSGRG00000042549	ENSSGRG00000000256	ENSSGRG00000000300	cenpn (ENSSGRG00000000317) #21	ATMIN (ENSSGRG00000000332) #22	ENSSGRG00000000340	ENSSGRG00000000359
Goldfish	MODERN SPECIES	37	hipk3b (ENSCARG00000057590)	KIAA1549L (ENSCARG00000057148)	ENSCARG00000057134	ENSCARG00000057127	ENSCARG00000057125	spon1a (ENSCARG00000054059)	ENSCARG00000069749	SYT9 (ENSCARG00000069747)	ENSCARG00000069741	ENSCARG00000069736	PPFIBP2 (ENSCARG00000069730)	mafa (ENSCARG00000069724)	ENSCARG00000069720	cmc2 (ENSCARG00000069713) #20	cenpn (ENSCARG00000069709) #21	ATMIN (ENSCARG00000069707) #22	ENSCARG00000069706	ENSCARG00000069703	ENSCARG00000069696	gse1b (ENSCARG00000069665)	gins2 (ENSCARG00000069656)	emc8 (ENSCARG00000069655)	ENSCARG00000069652	cox4i1 (ENSCARG00000069651)	ENSCARG00000069650	ttc36 (ENSCARG00000069648)	cntn5 (ENSCARG00000069627)	NECTIN1 (ENSCARG00000069617)	ENSCARG00000069614	DDX6 (ENSCARG00000069595)	CXCR5 (ENSCARG00000069592)
Zebrafish	MODERN SPECIES	9	cd82b (ENSDARG00000026070)	ENSDARG00000111114	tspan18b (ENSDARG00000015015)	ENSDARG00000094425	iqcg (ENSDARG00000068678)	hipk3b (ENSDARG00000062082)	ENSDARG00000062086	spon1a (ENSDARG00000010029)	ENSDARG00000093015	SYT9 (ENSDARG00000003994)	ENSDARG00000061977	mafa (ENSDARG00000015890)	cmc2 (ENSDARG00000043635) #20	cenpn (ENSDARG00000043640) #21	mhc2dbb (ENSDARG00000056330)	ATMIN (ENSDARG00000068601) #22	si:ch73-103b9.2 (ENSDARG00000092489)	ENSDARG00000007976	ENSDARG00000093977	gse1b (ENSDARG00000062020)	gins2 (ENSDARG00000002304)	emc8 (ENSDARG00000017093)	cox4i1 (ENSDARG00000032970)	dusp22a (ENSDARG00000056396)	irf8 (ENSDARG00000056407)	foxf1 (ENSDARG00000015399)	mthfsd (ENSDARG00000062042)	cd151l (ENSDARG00000068629)	uraha (ENSDARG00000100719)	gas8 (ENSDARG00000101431)	mvda (ENSDARG00000099336)
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	60	ENSGT00940000159190	ENSGT00940000160212	ENSGT01050000244970.b.j.a	ENSGT00390000018333	ENSGT00940000157859.a.a	ENSGT00400000022240	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000010285.d	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000009477
Atlantic herring	MODERN SPECIES	22	ENSCHAG00000012536	slc9a5 (ENSCHAG00000013270)	FHOD1 (ENSCHAG00000013415)	RFX7 (ENSCHAG00000014090)	tex9 (ENSCHAG00000014106)	calml4a (ENSCHAG00000014156)	cln6a (ENSCHAG00000014165)	hipk3b (ENSCHAG00000014240)	spon1a (ENSCHAG00000015091)	SYT9 (ENSCHAG00000015613)	PPFIBP2 (ENSCHAG00000015678)	MAF (ENSCHAG00000017649)	CDYL2 (ENSCHAG00000017662) #19	ENSCHAG00000017671	cenpn (ENSCHAG00000017711) #21	ATMIN (ENSCHAG00000017773) #22	ENSCHAG00000017789	CIBAR2 (ENSCHAG00000017805)	gse1b (ENSCHAG00000017820)	gins2 (ENSCHAG00000017970)	emc8 (ENSCHAG00000017994)	cox4i1 (ENSCHAG00000018019)	dusp22a (ENSCHAG00000018053)	irf8 (ENSCHAG00000018062)	myo9aa (ENSCHAG00000018095)	ENSCHAG00000018171	znf609b (ENSCHAG00000018202)	trip4 (ENSCHAG00000018218)	ADAMTS7 (ENSCHAG00000018269)	ENSCHAG00000019101	ENSCHAG00000019130
Denticle herring	MODERN SPECIES	7	slc9a5 (ENSDCDG00000034270)	FHOD1 (ENSDCDG00000034298)	RFX7 (ENSDCDG00000034337)	tex9 (ENSDCDG00000034340)	calml4a (ENSDCDG00000034344)	cln6a (ENSDCDG00000034342)	hipk3b (ENSDCDG00000034369)	ENSDCDG00000034423	spon1a (ENSDCDG00000034435)	SYT9 (ENSDCDG00000034493)	PPFIBP2 (ENSDCDG00000034508)	MAF (ENSDCDG00000034525)	CDYL2 (ENSDCDG00000034527) #19	cmc2 (ENSDCDG00000034528) #20	cenpn (ENSDCDG00000034530) #21	ATMIN (ENSDCDG00000034534) #22	PPP1R3E (ENSDCDG00000034537)	CIBAR2 (ENSDCDG00000034540)	gse1b (ENSDCDG00000034546)	ENSDCDG00000034581	gins2 (ENSDCDG00000034583)	emc8 (ENSDCDG00000034584)	cox4i1 (ENSDCDG00000034586)	dusp22a (ENSDCDG00000034588)	irf8 (ENSDCDG00000034590)	foxf1 (ENSDCDG00000034594)	mthfsd (ENSDCDG00000034601)	gas8 (ENSDCDG00000034609)	DOK4 (ENSDCDG00000034614)	ccdc102a (ENSDCDG00000034617)	adgrg1 (ENSDCDG00000034619)
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	94	ENSGT00940000156734.b	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00530000067249	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000010285.d	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000009477	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.h	ENSGT00970000197915	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00530000067249	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000010285.d	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000009477	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000156734.b	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00530000067249	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000009477	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000156734.b	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00530000067249	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.h	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00530000067249	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.h	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000002290
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000156734.b	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000002290
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000156734.b	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000002290
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000156734.b	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000002290
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	5	wt1b (ENSKMAG00000011114)	eif3m (ENSKMAG00000011080)	prrg4 (ENSKMAG00000011059)	QSER1 (ENSKMAG00000011034)	depdc7a (ENSKMAG00000011001)	cstf3 (ENSKMAG00000010916)	hipk3b (ENSKMAG00000010769)	ENSKMAG00000010699	spon1a (ENSKMAG00000010630)	SYT9 (ENSKMAG00000010557)	PPFIBP2 (ENSKMAG00000010500)	MAF (ENSKMAG00000010484)	CDYL2 (ENSKMAG00000010456) #19	cmc2 (ENSKMAG00000010445) #20	cenpn (ENSKMAG00000010432) #21	ATMIN (ENSKMAG00000010415) #22	ENSKMAG00000010400	gse1b (ENSKMAG00000010204)	gins2 (ENSKMAG00000010131)	emc8 (ENSKMAG00000010107)	cox4i1 (ENSKMAG00000010092)	dusp22a (ENSKMAG00000010072)	irf8 (ENSKMAG00000010038)	foxf1 (ENSKMAG00000010016)	mthfsd (ENSKMAG00000009981)	DBNDD1 (ENSKMAG00000009962)	ENSKMAG00000009916	def8 (ENSKMAG00000009864)	mc1r (ENSKMAG00000009842)	tcf25 (ENSKMAG00000009818)	cyba (ENSKMAG00000009784)
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	515													CDYL2 (ENSNFUG00015019463) #19	cmc2 (ENSNFUG00015019461) #20	cenpn (ENSNFUG00015019457) #21	ATMIN (ENSNFUG00015019452) #22	ENSNFUG00015019448
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000156734.b	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000002290
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000156734.b	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000002290
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000156734.b	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000002290
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Guppy	MODERN SPECIES	455	eif3m (ENSPREG00000013722)	wt1b (ENSPREG00000013693)	prrg4 (ENSPREG00000013678)	QSER1 (ENSPREG00000013652)	depdc7a (ENSPREG00000013622)	cstf3 (ENSPREG00000013549)	hipk3b (ENSPREG00000013469)	ENSPREG00000013412	spon1a (ENSPREG00000013355)	SYT9 (ENSPREG00000013318)	PPFIBP2 (ENSPREG00000013251)	MAF (ENSPREG00000013215)	CDYL2 (ENSPREG00000013176) #19	cmc2 (ENSPREG00000013157) #20	cenpn (ENSPREG00000013147) #21	ATMIN (ENSPREG00000013131) #22	ENSPREG00000013110	gse1b (ENSPREG00000012934)	gins2 (ENSPREG00000012868)	emc8 (ENSPREG00000012849)	cox4i1 (ENSPREG00000012715)	dusp22a (ENSPREG00000012678)	irf8 (ENSPREG00000012647)	foxf1 (ENSPREG00000012626)	mthfsd (ENSPREG00000012611)	DBNDD1 (ENSPREG00000012597)	ENSPREG00000012576	zfand3 (ENSPREG00000012538)	SLC7A9 (ENSPREG00000012477)	RGS9BP (ENSPREG00000012431)	nudt19 (ENSPREG00000012419)
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Mummichog	MODERN SPECIES	692	wt1b (ENSFHEG00000020493)	eif3m (ENSFHEG00000020507)	prrg4 (ENSFHEG00000020524)	QSER1 (ENSFHEG00000020534)	depdc7a (ENSFHEG00000020541)	cstf3 (ENSFHEG00000020623)	hipk3b (ENSFHEG00000020712)	ENSFHEG00000020777	spon1a (ENSFHEG00000020876)	SYT9 (ENSFHEG00000020908)	PPFIBP2 (ENSFHEG00000020934)	MAF (ENSFHEG00000020937)	CDYL2 (ENSFHEG00000020976) #19	cmc2 (ENSFHEG00000020988) #20	cenpn (ENSFHEG00000020994) #21	ATMIN (ENSFHEG00000020997) #22	ENSFHEG00000021010	gse1b (ENSFHEG00000021165)	gins2 (ENSFHEG00000021191)	emc8 (ENSFHEG00000021214)	cox4i1 (ENSFHEG00000021228)	dusp22a (ENSFHEG00000021234)	irf8 (ENSFHEG00000021238)	foxf1 (ENSFHEG00000021248)	mthfsd (ENSFHEG00000021266)	DBNDD1 (ENSFHEG00000021281)	ENSFHEG00000000525	def8 (ENSFHEG00000021316)	mc1r (ENSFHEG00000021344)	tcf25 (ENSFHEG00000021356)	cyba (ENSFHEG00000021377)
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Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000156734.b	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000002290
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000156734.b	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000002290
Indian medaka	MODERN SPECIES	26	wt1b (ENSOMEG00000003946)	eif3m (ENSOMEG00000003931)	prrg4 (ENSOMEG00000003908)	QSER1 (ENSOMEG00000003899)	depdc7a (ENSOMEG00000003873)	cstf3 (ENSOMEG00000003848)	hipk3b (ENSOMEG00000003788)	ENSOMEG00000000080	spon1a (ENSOMEG00000003700)	ENSOMEG00000003636	PPFIBP2 (ENSOMEG00000003605)	MAF (ENSOMEG00000003546)	CDYL2 (ENSOMEG00000003527) #19	cmc2 (ENSOMEG00000003502) #20	cenpn (ENSOMEG00000003497) #21	ATMIN (ENSOMEG00000003483) #22	ENSOMEG00000003474	gse1b (ENSOMEG00000003436)	gins2 (ENSOMEG00000003295)	emc8 (ENSOMEG00000003284)	cox4i1 (ENSOMEG00000003270)	dusp22a (ENSOMEG00000003238)	irf8 (ENSOMEG00000003132)	foxf1 (ENSOMEG00000002898)	mthfsd (ENSOMEG00000002887)	DBNDD1 (ENSOMEG00000002872)	ENSOMEG00000002867	def8 (ENSOMEG00000002853)	mc1r (ENSOMEG00000002838)	tcf25 (ENSOMEG00000001008)	cyba (ENSOMEG00000002819)
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	17	pax6b (ENSOJAG00000012869)	RCN1 (ENSOJAG00000012811)	wt1b (ENSOJAG00000012762)	EIF3M (ENSOJAG00000012699)	prrg4 (ENSOJAG00000012680)	depdc7a (ENSOJAG00000012470)	cstf3 (ENSOJAG00000011914)	hipk3b (ENSOJAG00000011499)	spon1a (ENSOJAG00000011311)	ENSOJAG00000011291	PPFIBP2 (ENSOJAG00000011033)	MAF (ENSOJAG00000010995)	CDYL2 (ENSOJAG00000010983) #19	cmc2 (ENSOJAG00000010974) #20	cenpn (ENSOJAG00000010913) #21	ATMIN (ENSOJAG00000010900) #22	ENSOJAG00000010860	gse1b (ENSOJAG00000010277)	gins2 (ENSOJAG00000010199)	emc8 (ENSOJAG00000010160)	cox4i1 (ENSOJAG00000010137)	dusp22a (ENSOJAG00000010032)	irf8 (ENSOJAG00000010003)	foxf1 (ENSOJAG00000009974)	mthfsd (ENSOJAG00000009948)	DBNDD1 (ENSOJAG00000009915)	ENSOJAG00000009478	def8 (ENSOJAG00000009072)	mc1r (ENSOJAG00000009037)	tcf25 (ENSOJAG00000007652)	cyba (ENSOJAG00000007462)
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000156734.b	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000002290
Chinese medaka	MODERN SPECIES	888	ENSOSIG00000014473	wt1b (ENSOSIG00000014475)	eif3m (ENSOSIG00000014485)	prrg4 (ENSOSIG00000014489)	QSER1 (ENSOSIG00000014492)	depdc7a (ENSOSIG00000014494)	cstf3 (ENSOSIG00000014498)	hipk3b (ENSOSIG00000014734)	spon1a (ENSOSIG00000015176)	SYT9 (ENSOSIG00000016406)	ENSOSIG00000016407	MAF (ENSOSIG00000016409)	CDYL2 (ENSOSIG00000016419) #19	cmc2 (ENSOSIG00000016423) #20	ENSOSIG00000016427 #21	ATMIN (ENSOSIG00000016429) #22	ENSOSIG00000016431	gse1b (ENSOSIG00000016453)	gins2 (ENSOSIG00000016671)	emc8 (ENSOSIG00000016674)	cox4i1 (ENSOSIG00000016679)	dusp22a (ENSOSIG00000016683)	irf8 (ENSOSIG00000016738)	foxf1 (ENSOSIG00000016744)	mthfsd (ENSOSIG00000016746)	DBNDD1 (ENSOSIG00000016748)	ENSOSIG00000016805	def8 (ENSOSIG00000018393)	mc1r (ENSOSIG00000019258)	tcf25 (ENSOSIG00000019277)	cyba (ENSOSIG00000019280)
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	17	depdc7a (ENSORLG00000009791)	cstf3 (ENSORLG00000009762)	hipk3b (ENSORLG00000009737)	ENSORLG00000029752	ENSORLG00000030034	ENSORLG00000028061	spon1a (ENSORLG00000026461)	ENSORLG00000009678	ENSORLG00000009654	ENSORLG00000026289	MAF (ENSORLG00000009643)	ENSORLG00000023512	CDYL2 (ENSORLG00000009635) #19	ENSORLG00000028792	cenpn (ENSORLG00000009577) #21	ATMIN (ENSORLG00000009553) #22	ENSORLG00000009546	gse1b (ENSORLG00000009542)	gins2 (ENSORLG00000009515)	emc8 (ENSORLG00000009505)	cox4i1 (ENSORLG00000026675)	dusp22a (ENSORLG00000027595)	irf8 (ENSORLG00000018216)	foxf1 (ENSORLG00000009476)	mthfsd (ENSORLG00000025578)	DBNDD1 (ENSORLG00000026883)	ENSORLG00000009456	def8 (ENSORLG00000009448)	mc1r (ENSORLG00000009400)	tcf25 (ENSORLG00000009390)	cyba (ENSORLG00000025140)
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.h	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000002290
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.h	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000002290
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Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.h	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000002290
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000156734.b	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730.a.a	ENSGT00390000011730.b	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000156734.b	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730.b	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000002290
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000156734.b	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730.b	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000002290
Eastern happy	MODERN SPECIES		eif3m (ENSACLG00000007918)	prrg4 (ENSACLG00000007910)	QSER1 (ENSACLG00000007880)	depdc7a (ENSACLG00000007858)	cstf3 (ENSACLG00000007820)	hipk3b (ENSACLG00000007796)	ENSACLG00000007789	spon1a (ENSACLG00000007296)	SYT9 (ENSACLG00000007253)	PPFIBP2 (ENSACLG00000007184)	MAF (ENSACLG00000007176)	rpl30 (ENSACLG00000007160)	CDYL2 (ENSACLG00000007151) #19	cmc2 (ENSACLG00000006734) #20	cenpn (ENSACLG00000006724) #21	ATMIN (ENSACLG00000006720) #22	ENSACLG00000006716	gse1b (ENSACLG00000006689)	gins2 (ENSACLG00000006665)	emc8 (ENSACLG00000006655)	cox4i1 (ENSACLG00000006264)	dusp22a (ENSACLG00000006240)	irf8 (ENSACLG00000006208)	foxf1 (ENSACLG00000006199)	mthfsd (ENSACLG00000006177)	ENSACLG00000006174	DBNDD1 (ENSACLG00000006167)	ENSACLG00000006151	def8 (ENSACLG00000006040)	mc1r (ENSACLG00000006015)	tcf25 (ENSACLG00000005982)
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1091	eif3m (ENSMZEG00005011988)	prrg4 (ENSMZEG00005012014)	QSER1 (ENSMZEG00005012029)	depdc7a (ENSMZEG00005012062)	cstf3 (ENSMZEG00005012082)	hipk3b (ENSMZEG00005012127)	ENSMZEG00005012152	spon1a (ENSMZEG00005012177)	SYT9 (ENSMZEG00005012208)	PPFIBP2 (ENSMZEG00005012230)	MAF (ENSMZEG00005012264)	ENSMZEG00005012272	CDYL2 (ENSMZEG00005012284) #19	cmc2 (ENSMZEG00005012293) #20	cenpn (ENSMZEG00005012304) #21	ATMIN (ENSMZEG00005012313) #22	ENSMZEG00005012322	gse1b (ENSMZEG00005012345)	gins2 (ENSMZEG00005012396)	emc8 (ENSMZEG00005012413)	cox4i1 (ENSMZEG00005012428)	dusp22a (ENSMZEG00005012452)	irf8 (ENSMZEG00005012469)	foxf1 (ENSMZEG00005012491)	mthfsd (ENSMZEG00005012498)	DBNDD1 (ENSMZEG00005012511)	ENSMZEG00005012522	def8 (ENSMZEG00005012548)	mc1r (ENSMZEG00005012573)	tcf25 (ENSMZEG00005012587)	cyba (ENSMZEG00005012611)
P. nyererei	MODERN SPECIES	461	wt1b (ENSPNYG00000018035)	eif3m (ENSPNYG00000018073)	prrg4 (ENSPNYG00000018114)	QSER1 (ENSPNYG00000018141)	depdc7a (ENSPNYG00000018203)	cstf3 (ENSPNYG00000018259)	hipk3b (ENSPNYG00000018333)	ENSPNYG00000018405	spon1a (ENSPNYG00000018447)	SYT9 (ENSPNYG00000018498)	PPFIBP2 (ENSPNYG00000018525)	MAF (ENSPNYG00000018546)	CDYL2 (ENSPNYG00000018560) #19	cmc2 (ENSPNYG00000018581) #20	cenpn (ENSPNYG00000018596) #21	ATMIN (ENSPNYG00000018621) #22	ENSPNYG00000018633	gse1b (ENSPNYG00000018655)
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	278	wt1b (ENSHBUG00000016837)	eif3m (ENSHBUG00000016804)	prrg4 (ENSHBUG00000016765)	QSER1 (ENSHBUG00000016751)	depdc7a (ENSHBUG00000016687)	cstf3 (ENSHBUG00000016656)	hipk3b (ENSHBUG00000016572)	ENSHBUG00000016455	spon1a (ENSHBUG00000016418)	SYT9 (ENSHBUG00000016364)	PPFIBP2 (ENSHBUG00000016313)	MAF (ENSHBUG00000016288)	CDYL2 (ENSHBUG00000016282) #19	cmc2 (ENSHBUG00000016271) #20	cenpn (ENSHBUG00000016262) #21	ATMIN (ENSHBUG00000016255) #22	ENSHBUG00000016242	gse1b (ENSHBUG00000016230)	gins2 (ENSHBUG00000016136)	emc8 (ENSHBUG00000016112)	cox4i1 (ENSHBUG00000016090)	dusp22a (ENSHBUG00000016085)	irf8 (ENSHBUG00000016070)	foxf1 (ENSHBUG00000016014)	mthfsd (ENSHBUG00000016009)	ENSHBUG00000015999	DBNDD1 (ENSHBUG00000015989)	ENSHBUG00000015972	def8 (ENSHBUG00000015914)	mc1r (ENSHBUG00000015850)	tcf25 (ENSHBUG00000000898)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	290	prrg4 (ENSNBRG00000007240)	QSER1 (ENSNBRG00000007269)	depdc7a (ENSNBRG00000007303)	cstf3 (ENSNBRG00000007345)	ENSNBRG00000007388	hipk3b (ENSNBRG00000007420)	ENSNBRG00000007502	spon1a (ENSNBRG00000007540)	SYT9 (ENSNBRG00000007601)	ENSNBRG00000007625	ENSNBRG00000007652	MAF (ENSNBRG00000007685)	CDYL2 (ENSNBRG00000007702) #19	cmc2 (ENSNBRG00000007714) #20	cenpn (ENSNBRG00000007732) #21	ATMIN (ENSNBRG00000007768) #22	ENSNBRG00000007787	gse1b (ENSNBRG00000007827)	gins2 (ENSNBRG00000007893)	emc8 (ENSNBRG00000007960)	cox4i1 (ENSNBRG00000007985)	dusp22a (ENSNBRG00000008001)	irf8 (ENSNBRG00000008014)	foxf1 (ENSNBRG00000008052)	mthfsd (ENSNBRG00000008068)	DBNDD1 (ENSNBRG00000008116)	ENSNBRG00000008141	def8 (ENSNBRG00000008186)	mc1r (ENSNBRG00000008217)	tcf25 (ENSNBRG00000008266)	cyba (ENSNBRG00000008290)
Nile tilapia	MODERN SPECIES		wt1b (ENSONIG00000005545)	eif3m (ENSONIG00000005547)	prrg4 (ENSONIG00000005554)	QSER1 (ENSONIG00000005555)	depdc7a (ENSONIG00000005559)	cstf3 (ENSONIG00000005563)	hipk3b (ENSONIG00000005569)	KIAA1549L (ENSONIG00000005573)	spon1a (ENSONIG00000005578)	SYT9 (ENSONIG00000005585)	PPFIBP2 (ENSONIG00000005589)	MAF (ENSONIG00000005596)	CDYL2 (ENSONIG00000005598) #19	cmc2 (ENSONIG00000035642) #20	cenpn (ENSONIG00000005603) #21	atmin (ENSONIG00000032684) #22	ENSONIG00000021392	gse1b (ENSONIG00000005611)	gins2 (ENSONIG00000005614)	emc8 (ENSONIG00000005616)	cox4i1 (ENSONIG00000005620)	dusp22a (ENSONIG00000037181)	irf8 (ENSONIG00000005631)	foxf1 (ENSONIG00000005638)	mthfsd (ENSONIG00000005640)	DBNDD1 (ENSONIG00000005641)	ENSONIG00000005642	def8 (ENSONIG00000005645)	mc1r (ENSONIG00000021393)	ENSONIG00000037012	tcf25 (ENSONIG00000005649)
Midas cichlid	MODERN SPECIES	313	prrg4 (ENSACIG00000005633)	QSER1 (ENSACIG00000005596)	depdc7a (ENSACIG00000005574)	cstf3 (ENSACIG00000005539)	ENSACIG00000005527	hipk3b (ENSACIG00000005485)	ENSACIG00000005451	spon1a (ENSACIG00000005420)	SYT9 (ENSACIG00000005401)	ENSACIG00000005384	ENSACIG00000005349	MAF (ENSACIG00000005335)	CDYL2 (ENSACIG00000005321) #19	cmc2 (ENSACIG00000005313) #20	cenpn (ENSACIG00000005286) #21	ATMIN (ENSACIG00000005269) #22	ENSACIG00000005261	ENSACIG00000005254	gse1b (ENSACIG00000005165)	gins2 (ENSACIG00000005143)	emc8 (ENSACIG00000005128)	cox4i1 (ENSACIG00000005112)	dusp22a (ENSACIG00000005055)	irf8 (ENSACIG00000004583)	foxf1 (ENSACIG00000004559)	mthfsd (ENSACIG00000004537)	DBNDD1 (ENSACIG00000004528)	ENSACIG00000004481	def8 (ENSACIG00000004450)	mc1r (ENSACIG00000004441)	tcf25 (ENSACIG00000004382)
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	49	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.h	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000002290
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	47	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.h	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000002290
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.h	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	1294								spon1a (ENSAOCG00000016909)	SYT9 (ENSAOCG00000016837)	ENSAOCG00000016785	ENSAOCG00000016761	MAF (ENSAOCG00000016705)	CDYL2 (ENSAOCG00000016695) #19	cmc2 (ENSAOCG00000016661) #20	cenpn (ENSAOCG00000016641) #21	ATMIN (ENSAOCG00000016631) #22	ENSAOCG00000016618	gse1b (ENSAOCG00000016576)	gins2 (ENSAOCG00000016482)
Orange clownfish	MODERN SPECIES		eif3m (ENSAPEG00000007816)	prrg4 (ENSAPEG00000007850)	QSER1 (ENSAPEG00000007862)	depdc7a (ENSAPEG00000007876)	cstf3 (ENSAPEG00000007903)	hipk3b (ENSAPEG00000007989)	ENSAPEG00000008076	spon1a (ENSAPEG00000008111)	SYT9 (ENSAPEG00000008163)	ENSAPEG00000008193	ENSAPEG00000008213	MAF (ENSAPEG00000008264)	CDYL2 (ENSAPEG00000008292) #19	cmc2 (ENSAPEG00000008340) #20	cenpn (ENSAPEG00000008357) #21	ATMIN (ENSAPEG00000008400) #22	ENSAPEG00000008412	gse1b (ENSAPEG00000008461)	gins2 (ENSAPEG00000008523)	caprin1a (ENSAPEG00000008548)	nucb2a (ENSAPEG00000008562)	PLEKHA7 (ENSAPEG00000008627)	sox6 (ENSAPEG00000008721)	CALCB (ENSAPEG00000008768)	CYP2R1 (ENSAPEG00000008784)	PDE3B (ENSAPEG00000008800)	copb1 (ENSAPEG00000008894)	rras2 (ENSAPEG00000008980)	TUB (ENSAPEG00000009006)	ENSAPEG00000009056	lmo1 (ENSAPEG00000009063)
Spiny chromis	MODERN SPECIES	82									SYT9 (ENSAPOG00000013864)	ENSAPOG00000013824	ENSAPOG00000013792	MAF (ENSAPOG00000013747)	CDYL2 (ENSAPOG00000013735) #19	cmc2 (ENSAPOG00000013686) #20	cenpn (ENSAPOG00000013671) #21	ATMIN (ENSAPOG00000013667) #22	ENSAPOG00000013658	gse1b (ENSAPOG00000013631)	gins2 (ENSAPOG00000013518)	emc8 (ENSAPOG00000013492)	cox4i1 (ENSAPOG00000013449)	dusp22a (ENSAPOG00000013411)	irf8 (ENSAPOG00000013360)	foxf1 (ENSAPOG00000013244)	mthfsd (ENSAPOG00000000770)	DBNDD1 (ENSAPOG00000013203)	ENSAPOG00000013193	def8 (ENSAPOG00000013171)	mc1r (ENSAPOG00000013122)	tcf25 (ENSAPOG00000013074)	cyba (ENSAPOG00000013048)
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	1221													CDYL2 (ENSSPAG00000012862) #19	cmc2 (ENSSPAG00000012873) #20	cenpn (ENSSPAG00000012879) #21	ATMIN (ENSSPAG00000012891) #22	ENSSPAG00000012900	gse1b (ENSSPAG00000012931)
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.h	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00530000067249	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.h	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00530000067249	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000156734.b	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00530000067249	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000002290
Fugu	MODERN SPECIES	4	wt1b (ENSTRUG00000006559)	eif3m (ENSTRUG00000006300)	prrg4 (ENSTRUG00000006147)	QSER1 (ENSTRUG00000005934)	depdc7a (ENSTRUG00000005631)	cstf3 (ENSTRUG00000004959)	hipk3b (ENSTRUG00000004241)	KIAA1549L (ENSTRUG00000004096)	spon1a (ENSTRUG00000003204)	SYT9 (ENSTRUG00000008469)	PPFIBP2 (ENSTRUG00000018289)	MAF (ENSTRUG00000018285)	CDYL2 (ENSTRUG00000018265) #19	cmc2 (ENSTRUG00000018261) #20	cenpn (ENSTRUG00000025592) #21	ATMIN (ENSTRUG00000018258) #22	ENSTRUG00000025608	gse1b (ENSTRUG00000018255)	gins2 (ENSTRUG00000021790)	emc8 (ENSTRUG00000018249)	cox4i1 (ENSTRUG00000018241)	dusp22a (ENSTRUG00000018237)	irf8 (ENSTRUG00000018213)	foxf1 (ENSTRUG00000032426)	MTHFSD (ENSTRUG00000025457)	DBNDD1 (ENSTRUG00000018202)	def8 (ENSTRUG00000018196)	mc1r (ENSTRUG00000018192)	tcf25 (ENSTRUG00000018187)	p22phox (ENSTRUG00000018180)	mvda (ENSTRUG00000018170)
Tetraodon	MODERN SPECIES	20	wt1b (ENSTNIG00000013806)	eif3m (ENSTNIG00000013807)	prrg4 (ENSTNIG00000013808)	QSER1 (ENSTNIG00000013809)	depdc7a (ENSTNIG00000013810)	cstf3 (ENSTNIG00000013811)	hipk3b (ENSTNIG00000013812)	ENSTNIG00000013813	spon1a (ENSTNIG00000013814)	SYT9 (ENSTNIG00000013815)	ENSTNIG00000013816	MAF (ENSTNIG00000005526)	CDYL2 (ENSTNIG00000009276) #19	cmc2 (ENSTNIG00000000544) #20	cenpn (ENSTNIG00000000860) #21	ATMIN (ENSTNIG00000009277) #22	ENSTNIG00000000138	ENSTNIG00000009278	gse1b (ENSTNIG00000009279)	gins2 (ENSTNIG00000009280)	emc8 (ENSTNIG00000009281)	dusp22a (ENSTNIG00000009282)	irf8 (ENSTNIG00000009283)	foxf1 (ENSTNIG00000009284)	mthfsd (ENSTNIG00000009285)	DBNDD1 (ENSTNIG00000009286)	def8 (ENSTNIG00000009287)	mc1r (ENSTNIG00000009288)	tcf25 (ENSTNIG00000009289)	cyba (ENSTNIG00000009290)	mvda (ENSTNIG00000009291)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.h	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000002290
Ballan wrasse	MODERN SPECIES		wt1b (ENSLBEG00000002082)	eif3m (ENSLBEG00000002143)	prrg4 (ENSLBEG00000002213)	QSER1 (ENSLBEG00000002233)	depdc7a (ENSLBEG00000002276)	cstf3 (ENSLBEG00000002306)	hipk3b (ENSLBEG00000002394)	ENSLBEG00000002459	spon1a (ENSLBEG00000002479)	SYT9 (ENSLBEG00000002539)	ENSLBEG00000002602	MAF (ENSLBEG00000002648)	CDYL2 (ENSLBEG00000002675) #19	cmc2 (ENSLBEG00000002711) #20	cenpn (ENSLBEG00000002725) #21	ATMIN (ENSLBEG00000002751) #22	ENSLBEG00000002769	gse1b (ENSLBEG00000002802)	gins2 (ENSLBEG00000002858)	emc8 (ENSLBEG00000002877)	cox4i1 (ENSLBEG00000002888)	dusp22a (ENSLBEG00000002904)	irf8 (ENSLBEG00000002942)	ENSLBEG00000002953	pdcd2 (ENSLBEG00000002972)	tbp (ENSLBEG00000002992)	psmc3 (ENSLBEG00000003008)	psmb1 (ENSLBEG00000003033)	phf10 (ENSLBEG00000003061)	rab4a (ENSLBEG00000003101)	ccsapb (ENSLBEG00000003142)
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.h	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000002290
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000156734.b	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000002290
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	18	prrg4 (ENSSAUG00010011414)	QSER1 (ENSSAUG00010011413)	depdc7a (ENSSAUG00010011410)	cstf3 (ENSSAUG00010011355)	hipk3b (ENSSAUG00010009741)	KIAA1549L (ENSSAUG00010009724)	spon1a (ENSSAUG00010009633)	SYT9 (ENSSAUG00010009616)	PPFIBP2 (ENSSAUG00010008841)	ENSSAUG00010008829	MAF (ENSSAUG00010008824)	ENSSAUG00010008820	CDYL2 (ENSSAUG00010008818) #19	cmc2 (ENSSAUG00010008816) #20	cenpn (ENSSAUG00010008814) #21	ATMIN (ENSSAUG00010008811) #22	PPP1R3E (ENSSAUG00010008806)	gse1b (ENSSAUG00010008797)	gins2 (ENSSAUG00010008796)	emc8 (ENSSAUG00010008795)	Cox4a (ENSSAUG00010008794)	dusp22a (ENSSAUG00010008790)	irf8 (ENSSAUG00010008763)	foxf1 (ENSSAUG00010008759)	mthfsd (ENSSAUG00010008756)	DBNDD1 (ENSSAUG00010008754)	ENSSAUG00010008701	def8 (ENSSAUG00010008686)	mc1r (ENSSAUG00010008684)	tcf25 (ENSSAUG00010008308)	cyba (ENSSAUG00010008288)
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00940000167952	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000002290
European seabass	MODERN SPECIES	18	RCN1 (ENSDLAG00005014488)	wt1b (ENSDLAG00005032362)	eif3m (ENSDLAG00005014522)	prrg4 (ENSDLAG00005014553)	QSER1 (ENSDLAG00005014586)	depdc7a (ENSDLAG00005014596)	cstf3 (ENSDLAG00005014611)	hipk3b (ENSDLAG00005014821)	KIAA1549L (ENSDLAG00005015824)	spon1a (ENSDLAG00005015885)	ENSDLAG00005016407	ENSDLAG00005016453	ENSDLAG00005027773	ENSDLAG00005032416 #19	cmc2 (ENSDLAG00005030968) #20	ENSDLAG00005016805 #22	ENSDLAG00005016811	gse1b (ENSDLAG00005016826)	gins2 (ENSDLAG00005016928)	cox4i1 (ENSDLAG00005016960)	emc8 (ENSDLAG00005028986)	dusp22a (ENSDLAG00005030446)	irf8 (ENSDLAG00005016984)	foxf1 (ENSDLAG00005017030)	MTHFSD (ENSDLAG00005027729)	DBNDD1 (ENSDLAG00005017096)	ENSDLAG00005017110	DEF8 (ENSDLAG00005017148)	MC1R (ENSDLAG00005017519)	tcf25 (ENSDLAG00005017532)	ENSDLAG00005026379
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	480	RCN1 (ENSLCRG00005005748)	wt1b (ENSLCRG00005005746)	eif3m (ENSLCRG00005005744)	prrg4 (ENSLCRG00005005743)	QSER1 (ENSLCRG00005005740)	depdc7a (ENSLCRG00005005739)	cstf3 (ENSLCRG00005004821)	hipk3b (ENSLCRG00005004657)	spon1a (ENSLCRG00005003595)	SYT9 (ENSLCRG00005003571)	PPFIBP2 (ENSLCRG00005001376)	MAF (ENSLCRG00005001355)	CDYL2 (ENSLCRG00005001354) #19	ENSLCRG00005001353	cenpn (ENSLCRG00005001349) #21	ATMIN (ENSLCRG00005001346) #22	ENSLCRG00005001345	gse1b (ENSLCRG00005001326)	gins2 (ENSLCRG00005001311)	emc8 (ENSLCRG00005001305)	dusp22a (ENSLCRG00005001298)	irf8 (ENSLCRG00005001294)	foxf1 (ENSLCRG00005001293)	mthfsd (ENSLCRG00005001289)	DBNDD1 (ENSLCRG00005001281)	ENSLCRG00005000376	def8 (ENSLCRG00005000290)	mc1r (ENSLCRG00005000275)	tcf25 (ENSLCRG00005000183)	cyba (ENSLCRG00005019724)	mvda (ENSLCRG00005019722)
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.h	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000002290
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.h	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000002290	ENSGT00390000015359
Pike perch	MODERN SPECIES	29	eif3m (ENSSLUG00000012405)	prrg4 (ENSSLUG00000012393)	QSER1 (ENSSLUG00000012383)	depdc7a (ENSSLUG00000012360)	cstf3 (ENSSLUG00000012145)	hipk3b (ENSSLUG00000012086)	ENSSLUG00000012077	spon1a (ENSSLUG00000012035)	SYT9 (ENSSLUG00000011988)	ENSSLUG00000011977	PPFIBP2 (ENSSLUG00000011972)	MAF (ENSSLUG00000011971)	CDYL2 (ENSSLUG00000011968) #19	cmc2 (ENSSLUG00000011964) #20	cenpn (ENSSLUG00000011960) #21	ATMIN (ENSSLUG00000011952) #22	ENSSLUG00000011947	gins2 (ENSSLUG00000011901)	emc8 (ENSSLUG00000011898)	cox4i1 (ENSSLUG00000011890)	dusp22a (ENSSLUG00000011880)	irf8 (ENSSLUG00000011865)	foxf1 (ENSSLUG00000011858)	mthfsd (ENSSLUG00000011853)	DBNDD1 (ENSSLUG00000011846)	ENSSLUG00000011822	def8 (ENSSLUG00000011594)	mc1r (ENSSLUG00000011569)	tcf25 (ENSSLUG00000010670)	cyba (ENSSLUG00000010608)	mvda (ENSSLUG00000010582)
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	17	eif3m (ENSCGOG00000002728)	prrg4 (ENSCGOG00000002620)	depdc7a (ENSCGOG00000021464)	cstf3 (ENSCGOG00000021343)	hipk3b (ENSCGOG00000021259)	spon1a (ENSCGOG00000021031)	ENSCGOG00000021018	ENSCGOG00000021016	SYT9 (ENSCGOG00000021015)	PPFIBP2 (ENSCGOG00000020761)	MAF (ENSCGOG00000020750)	ENSCGOG00000020746	CDYL2 (ENSCGOG00000020740) #19	cmc2 (ENSCGOG00000020736) #20	cenpn (ENSCGOG00000020733) #21	ATMIN (ENSCGOG00000020732) #22	ENSCGOG00000020730	gins2 (ENSCGOG00000020713)	emc8 (ENSCGOG00000020712)	cox4i1 (ENSCGOG00000020707)	dusp22a (ENSCGOG00000020701)	irf8 (ENSCGOG00000020665)	foxf1 (ENSCGOG00000020663)	mthfsd (ENSCGOG00000020659)	DBNDD1 (ENSCGOG00000020656)	ENSCGOG00000020399	def8 (ENSCGOG00000020277)	mc1r (ENSCGOG00000020267)	tcf25 (ENSCGOG00000020200)	cyba (ENSCGOG00000020130)	mvda (ENSCGOG00000020043)
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000156734.b	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000002290
Stickleback	MODERN SPECIES	1	wt1b (ENSGACG00000016020)	eif3m (ENSGACG00000016009)	prrg4 (ENSGACG00000016006)	QSER1 (ENSGACG00000016002)	depdc7a (ENSGACG00000016001)	cstf3 (ENSGACG00000015997)	hipk3b (ENSGACG00000015995)	ENSGACG00000015992	spon1a (ENSGACG00000015990)	SYT9 (ENSGACG00000015987)	PPFIBP2 (ENSGACG00000015982)	MAF (ENSGACG00000015980)	CDYL2 (ENSGACG00000015978) #19	cmc2 (ENSGACG00000015977) #20	cenpn (ENSGACG00000015976) #21	ATMIN (ENSGACG00000015975) #22	ENSGACG00000015973	gse1b (ENSGACG00000015970)	gins2 (ENSGACG00000015967)	emc8 (ENSGACG00000015965)	cox4i1 (ENSGACG00000015963)	dusp22a (ENSGACG00000015961)	irf8 (ENSGACG00000015958)	foxf1 (ENSGACG00000015956)	mthfsd (ENSGACG00000015955)	DBNDD1 (ENSGACG00000015954)	def8 (ENSGACG00000015953)	mc1r (ENSGACG00000015952)	tcf25 (ENSGACG00000015948)	cyba (ENSGACG00000015943)	mvda (ENSGACG00000015940)
Lumpfish	MODERN SPECIES	18	wt1b (ENSCLMG00005002720)	eif3m (ENSCLMG00005002719)	prrg4 (ENSCLMG00005002716)	QSER1 (ENSCLMG00005002715)	depdc7a (ENSCLMG00005002714)	cstf3 (ENSCLMG00005002598)	hipk3b (ENSCLMG00005001874)	ENSCLMG00005001863	spon1a (ENSCLMG00005001862)	SYT9 (ENSCLMG00005001827)	PPFIBP2 (ENSCLMG00005000991)	MAF (ENSCLMG00005000983)	CDYL2 (ENSCLMG00005000980) #19	ENSCLMG00005000979	cenpn (ENSCLMG00005000973) #21	ATMIN (ENSCLMG00005000971) #22	ENSCLMG00005000968	gse1b (ENSCLMG00005000959)	gins2 (ENSCLMG00005000951)	emc8 (ENSCLMG00005000947)	cox4i1 (ENSCLMG00005000942)	dusp22a (ENSCLMG00005000939)	irf8 (ENSCLMG00005000936)	foxf1 (ENSCLMG00005000934)	mthfsd (ENSCLMG00005000933)	DBNDD1 (ENSCLMG00005000931)	ENSCLMG00005000268	def8 (ENSCLMG00005000142)	mc1r (ENSCLMG00005000107)	tcf25 (ENSCLMG00005000073)	tcf25 (ENSCLMG00005000046)
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.h	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000002290
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.h	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000002290
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.h	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000002290
Tongue sole	MODERN SPECIES	15	cyba (ENSCSEG00000007093)	tcf25 (ENSCSEG00000007012)	mc1r (ENSCSEG00000007004)	def8 (ENSCSEG00000014854)	DBNDD1 (ENSCSEG00000014840)	mthfsd (ENSCSEG00000014829)	foxf1 (ENSCSEG00000014822)	spon1a (ENSCSEG00000014787)	SYT9 (ENSCSEG00000014769)	ENSCSEG00000014751	ENSCSEG00000014739	MAF (ENSCSEG00000014730)	CDYL2 (ENSCSEG00000014709) #19	cmc2 (ENSCSEG00000014703) #20	cenpn (ENSCSEG00000014700) #21	ATMIN (ENSCSEG00000014693) #22	ENSCSEG00000014689	gse1b (ENSCSEG00000014621)	gins2 (ENSCSEG00000014601)	emc8 (ENSCSEG00000014587)	cox4i1 (ENSCSEG00000014570)	dusp22a (ENSCSEG00000014548)	irf8 (ENSCSEG00000014526)	immp1l (ENSCSEG00000014509)	elp4 (ENSCSEG00000014446)	pax6b (ENSCSEG00000014397)	RCN1 (ENSCSEG00000014384)	wt1b (ENSCSEG00000014378)	eif3m (ENSCSEG00000014358)	prrg4 (ENSCSEG00000014352)	QSER1 (ENSCSEG00000014329)
Turbot	MODERN SPECIES	17	wt1b (ENSSMAG00000002419)	EIF3M (ENSSMAG00000002377)	prrg4 (ENSSMAG00000002342)	QSER1 (ENSSMAG00000002320)	depdc7a (ENSSMAG00000002286)	cstf3 (ENSSMAG00000002197)	hipk3b (ENSSMAG00000002060)	KIAA1549L (ENSSMAG00000002034)	spon1a (ENSSMAG00000001982)	ENSSMAG00000001973	ENSSMAG00000001882	ENSSMAG00000001864	ENSSMAG00000001851 #19	ENSSMAG00000001837	cenpn (ENSSMAG00000001825) #21	ENSSMAG00000001821 #22	ENSSMAG00000001810	gse1b (ENSSMAG00000001629)	gins2 (ENSSMAG00000024847)	emc8 (ENSSMAG00000001580)	cox4i1 (ENSSMAG00000001565)	dusp22a (ENSSMAG00000001514)	IRF8 (ENSSMAG00000001479)	foxf1 (ENSSMAG00000001470)	MTHFSD (ENSSMAG00000001455)	DBNDD1 (ENSSMAG00000024394)	ENSSMAG00000001420	DEF8 (ENSSMAG00000001350)	MC1R (ENSSMAG00000001276)	tcf25 (ENSSMAG00000001248)	ENSSMAG00000001094
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000156734.b	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000002290
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000156734.b	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000002290
Greater amberjack	MODERN SPECIES	1	eif3m (ENSSDUG00000020604)	prrg4 (ENSSDUG00000020592)	QSER1 (ENSSDUG00000020555)	depdc7a (ENSSDUG00000020535)	depdc7a (ENSSDUG00000020479)	cstf3 (ENSSDUG00000020426)	hipk3b (ENSSDUG00000020362)	ENSSDUG00000020333	spon1a (ENSSDUG00000020296)	SYT9 (ENSSDUG00000020276)	PPFIBP2 (ENSSDUG00000020253)	MAF (ENSSDUG00000020239)	CDYL2 (ENSSDUG00000020205) #19	cmc2 (ENSSDUG00000020194) #20	cenpn (ENSSDUG00000020184) #21	ATMIN (ENSSDUG00000020177) #22	ENSSDUG00000020171	gse1b (ENSSDUG00000020065)	gins2 (ENSSDUG00000020039)	emc8 (ENSSDUG00000020029)	cox4i1 (ENSSDUG00000020018)	irf8 (ENSSDUG00000019993)	foxf1 (ENSSDUG00000019983)	mthfsd (ENSSDUG00000019966)	DBNDD1 (ENSSDUG00000019958)	ENSSDUG00000019936	def8 (ENSSDUG00000019902)	mc1r (ENSSDUG00000019897)	tcf25 (ENSSDUG00000019877)	cyba (ENSSDUG00000019861)	mvda (ENSSDUG00000019835)
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3255										SYT9 (ENSSLDG00000019722)	PPFIBP2 (ENSSLDG00000019671)	MAF (ENSSLDG00000019657)	CDYL2 (ENSSLDG00000019641) #19	cmc2 (ENSSLDG00000019629) #20	cenpn (ENSSLDG00000019621) #21	ATMIN (ENSSLDG00000019609) #22	ENSSLDG00000019599	gse1b (ENSSLDG00000019549)	gins2 (ENSSLDG00000019537)	emc8 (ENSSLDG00000019518)	cox4i1 (ENSSLDG00000019494)	dusp22a (ENSSLDG00000019478)	irf8 (ENSSLDG00000019463)	foxf1 (ENSSLDG00000019451)	mthfsd (ENSSLDG00000019413)	DBNDD1 (ENSSLDG00000019400)	ENSSLDG00000019377	def8 (ENSSLDG00000019353)	mc1r (ENSSLDG00000019348)	tcf25 (ENSSLDG00000019326)	cyba (ENSSLDG00000019308)
Barramundi perch	MODERN SPECIES	107	RCN1 (ENSLCAG00010004771)	wt1b (ENSLCAG00010004762)	eif3m (ENSLCAG00010004753)	prrg4 (ENSLCAG00010004747)	QSER1 (ENSLCAG00010004740)	depdc7a (ENSLCAG00010004732)	cstf3 (ENSLCAG00010004427)	hipk3b (ENSLCAG00010004305)	spon1a (ENSLCAG00010004082)	SYT9 (ENSLCAG00010004031)	PPFIBP2 (ENSLCAG00010003923)	MAF (ENSLCAG00010003892)	CDYL2 (ENSLCAG00010003889) #19	cmc2 (ENSLCAG00010003885) #20	cenpn (ENSLCAG00010003881) #21	ATMIN (ENSLCAG00010003877) #22	ENSLCAG00010003871	gse1b (ENSLCAG00010003839)	gins2 (ENSLCAG00010003821)	emc8 (ENSLCAG00010003815)	cox4i1 (ENSLCAG00010003814)	dusp22a (ENSLCAG00010003808)	irf8 (ENSLCAG00010003800)	foxf1 (ENSLCAG00010003793)	mthfsd (ENSLCAG00010003788)	DBNDD1 (ENSLCAG00010003784)	ENSLCAG00010003616	def8 (ENSLCAG00010003505)	mc1r (ENSLCAG00010003451)	tcf25 (ENSLCAG00010003246)	cyba (ENSLCAG00010003195)
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000156734.b	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000002290
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	17	prrg4 (ENSMAMG00000020402)	QSER1 (ENSMAMG00000020414)	depdc7a (ENSMAMG00000020418)	cstf3 (ENSMAMG00000020423)	hipk3b (ENSMAMG00000020443)	ENSMAMG00000026873	spon1a (ENSMAMG00000020500)	ENSMAMG00000025356	ENSMAMG00000026817	ENSMAMG00000020516	ENSMAMG00000020532	ENSMAMG00000020542	ENSMAMG00000020553 #19	cmc2 (ENSMAMG00000020557) #20	cenpn (ENSMAMG00000020559) #21	ATMIN (ENSMAMG00000020562) #22	ENSMAMG00000020567	gse1b (ENSMAMG00000020574)	gins2 (ENSMAMG00000020603)	emc8 (ENSMAMG00000027341)	cox4i1 (ENSMAMG00000020621)	dusp22a (ENSMAMG00000020627)	irf8 (ENSMAMG00000020632)	foxf1 (ENSMAMG00000020639)	MTHFSD (ENSMAMG00000020645)	DBNDD1 (ENSMAMG00000020653)	ENSMAMG00000020656	DEF8 (ENSMAMG00000020658)	MC1R (ENSMAMG00000020664)	tcf25 (ENSMAMG00000020668)	ENSMAMG00000025710
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000156734.b	ENSGT00390000004456	ENSGT00940000158268.a	ENSGT00440000037417.A	ENSGT00950000182976.a.b.d	ENSGT00390000006758.b.l	ENSGT00940000155960.b	ENSGT00530000063472.b.b.a.b.a.a	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182	ENSGT01030000234510.b	ENSGT00390000005563	ENSGT00390000002290
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	14	wt1b (ENSBSLG00000020925)	eif3m (ENSBSLG00000021132)	prrg4 (ENSBSLG00000021321)	QSER1 (ENSBSLG00000021331)	depdc7a (ENSBSLG00000021362)	cstf3 (ENSBSLG00000021420)	hipk3b (ENSBSLG00000021675)	KIAA1549L (ENSBSLG00000021777)	spon1a (ENSBSLG00000021854)	SYT9 (ENSBSLG00000022233)	PPFIBP2 (ENSBSLG00000022250)	MAF (ENSBSLG00000022278)	CDYL2 (ENSBSLG00000022316) #19	ENSBSLG00000022335	cenpn (ENSBSLG00000022361) #21	ATMIN (ENSBSLG00000022410) #22	ENSBSLG00000022423	gse1b (ENSBSLG00000022436)	gins2 (ENSBSLG00000022479)	emc8 (ENSBSLG00000022492)	cox4i1 (ENSBSLG00000022498)	dusp22a (ENSBSLG00000000388)	irf8 (ENSBSLG00000000402)	foxf1 (ENSBSLG00000000418)	mthfsd (ENSBSLG00000000430)	DBNDD1 (ENSBSLG00000000441)	ENSBSLG00000000464	def8 (ENSBSLG00000000615)	mc1r (ENSBSLG00000000703)	tcf25 (ENSBSLG00000000773)	cyba (ENSBSLG00000000899)
Climbing perch	MODERN SPECIES	16	pax6b (ENSATEG00000022478)	RCN1 (ENSATEG00000022490)	WT1 (ENSATEG00000022506)	ENSATEG00000022520	ENSATEG00000000029	DEPDC7 (ENSATEG00000000182)	cstf3 (ENSATEG00000000190)	hipk3b (ENSATEG00000000285)	spon1a (ENSATEG00000000456)	ENSATEG00000000520	ENSATEG00000028145	ENSATEG00000000651	ENSATEG00000000664 #19	cmc2 (ENSATEG00000000716) #20	cenpn (ENSATEG00000000720) #21	ATMIN (ENSATEG00000026624) #22	ENSATEG00000025166	gse1b (ENSATEG00000000761)	gins2 (ENSATEG00000000892)	emc8 (ENSATEG00000027409)	cox4i1 (ENSATEG00000000933)	dusp22a (ENSATEG00000029652)	irf8 (ENSATEG00000000971)	foxf1 (ENSATEG00000001013)	MTHFSD (ENSATEG00000001024)	DBNDD1 (ENSATEG00000027825)	ENSATEG00000001080	DEF8 (ENSATEG00000001092)	MC1R (ENSATEG00000001166)	tcf25 (ENSATEG00000001124)	ENSATEG00000001175
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	461	wt1b (ENSHCOG00000015039)	eif3m (ENSHCOG00000015089)	prrg4 (ENSHCOG00000015096)	QSER1 (ENSHCOG00000000582)	depdc7a (ENSHCOG00000015179)	cstf3 (ENSHCOG00000015218)	hipk3b (ENSHCOG00000015255)	ENSHCOG00000015268	spon1a (ENSHCOG00000015295)	SYT9 (ENSHCOG00000015317)	ENSHCOG00000015338	MAF (ENSHCOG00000015343)	CDYL2 (ENSHCOG00000015376) #19	cmc2 (ENSHCOG00000015383) #20	cenpn (ENSHCOG00000015408) #21	ATMIN (ENSHCOG00000015417) #22	ENSHCOG00000015429	gse1b (ENSHCOG00000000871)	gins2 (ENSHCOG00000015581)	emc8 (ENSHCOG00000015593)	cox4i1 (ENSHCOG00000000437)	dusp22a (ENSHCOG00000015624)	irf8 (ENSHCOG00000015649)	foxf1 (ENSHCOG00000015661)	mthfsd (ENSHCOG00000015682)	DBNDD1 (ENSHCOG00000015696)	ENSHCOG00000015723	def8 (ENSHCOG00000015726)	mc1r (ENSHCOG00000015736)	tcf25 (ENSHCOG00000015742)
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	17	prrg4 (ENSMMDG00005003425)	QSER1 (ENSMMDG00005003426)	depdc7a (ENSMMDG00005003431)	cstf3 (ENSMMDG00005003515)	hipk3b (ENSMMDG00005009570)	ENSMMDG00005009576	spon1a (ENSMMDG00005009581)	SYT9 (ENSMMDG00005009603)	ENSMMDG00005009719	ENSMMDG00005009723	ENSMMDG00005009724	MAF (ENSMMDG00005009726)	CDYL2 (ENSMMDG00005009728) #19	cmc2 (ENSMMDG00005009730) #20	cenpn (ENSMMDG00005009732) #21	ATMIN (ENSMMDG00005009733) #22	ENSMMDG00005009734	gse1b (ENSMMDG00005009736)	gins2 (ENSMMDG00005009737)	emc8 (ENSMMDG00005009739)	cox4i1 (ENSMMDG00005009744)	dusp22a (ENSMMDG00005009762)	irf8 (ENSMMDG00005009766)	foxf1 (ENSMMDG00005009774)	mthfsd (ENSMMDG00005009778)	gas8 (ENSMMDG00005009783)	gas8 (ENSMMDG00005009795)	DBNDD1 (ENSMMDG00005009848)	ENSMMDG00005009858	def8 (ENSMMDG00005010044)	mc1r (ENSMMDG00005010547)
Cod	MODERN SPECIES	5	ENSGMOG00000019508	ENSGMOG00000032306	ENSGMOG00000019526	ctrb.3 (ENSGMOG00000032693)	ctrb.3 (ENSGMOG00000034433)	ctrb.2 (ENSGMOG00000009502)	agrp (ENSGMOG00000019888)	atp6v0d1 (ENSGMOG00000009493)	ENSGMOG00000009491	ENSGMOG00000016695	ENSGMOG00000029580	ENSGMOG00000031928	ENSGMOG00000026846 #19	cmc2 (ENSGMOG00000010901) #20	cenpn (ENSGMOG00000010889) #21	ATMIN (ENSGMOG00000030655) #22	ENSGMOG00000033155	CIBAR2 (ENSGMOG00000035566)	gse1b (ENSGMOG00000004047)	gins2 (ENSGMOG00000004029)	emc8 (ENSGMOG00000022548)	cox4i1 (ENSGMOG00000003997)	dusp22a (ENSGMOG00000003973)	irf8 (ENSGMOG00000003945)	ENSGMOG00000033433	foxf1 (ENSGMOG00000003941)	MTHFSD (ENSGMOG00000003911)	GAS8 (ENSGMOG00000003802)	DBNDD1 (ENSGMOG00000003796)	DEF8 (ENSGMOG00000003774)	MC1R (ENSGMOG00000019737)
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000158805.a	ENSGT00940000156912.c.a	ENSGT01040000240607	ENSGT00940000156076.a.a.a.a.f	ENSGT00940000163235.A.a.b	ENSGT00940000156076.a.a.a.a.e	ENSGT00940000163235.A.a.a.b	ENSGT00390000013104	ENSGT00940000154910.b.b	ENSGT00940000155948.b.a	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b	ENSGT00940000161531.a.a.c	ENSGT00940000159646 #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00530000067249	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000010285.d	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000164598	ENSGT00940000158140	ENSGT00940000161035	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000009477	ENSGT00390000018903	ENSGT00940000160625.r.b	ENSGT00940000159182
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	70	ENSGT00940000156076.a.a.a.a.e	ENSGT00940000163235.A.a.b	ENSGT01040000240607.b	ENSGT00940000156076.a.a.a.a.f.b	ENSGT00940000177923	ENSGT00940000163235.A.a.a.b.c.b	ENSGT00940000162219.b	ENSGT00390000013104.e	ENSGT00940000154910.b.b.q	ENSGT00940000155948.b.a.c	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b.g	ENSGT00940000161531.a.a.c.a	ENSGT00940000159646.i.b #19	ENSGT00390000016908.n #20	ENSGT00390000004738.z #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00530000067249	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000010285.d.h
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	136	ENSGT01040000240607.a	ENSGT00940000156076.a.a.a.a.f.a.b	ENSGT00940000163235.A.a.b	ENSGT01040000240607.b	ENSGT00940000156076.a.a.a.a.f.b	ENSGT00940000177923	ENSGT00940000162219.b	ENSGT00390000013104.e	ENSGT00940000154910.b.b.q	ENSGT00940000155948.b.a.c	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b.g	ENSGT00940000161531.a.a.c.a	ENSGT00940000159646.i.b #19	ENSGT00390000016908.m #20	ENSGT00390000004738.z #21	ENSGT00390000013091 #22	ENSGT00530000067249	ENSGT00940000161906.c	ENSGT00390000010285.d.h	ENSGT00390000007838.c	ENSGT00390000006738.a.d
Salmo	DUPLICATION
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River trout	MODERN SPECIES	3	ENSSTUG00000023206	ENSSTUG00000023140	ENSSTUG00000023131	ENSSTUG00000023097	ENSSTUG00000023088	ENSSTUG00000022843	tollip (ENSSTUG00000022758)	spon1a (ENSSTUG00000021488)	SYT9 (ENSSTUG00000021450)	PPFIBP2 (ENSSTUG00000021181)	ENSSTUG00000021161	MAF (ENSSTUG00000021149)	CDYL2 (ENSSTUG00000021143) #19	cmc2 (ENSSTUG00000021141) #20	cenpn (ENSSTUG00000021132) #21	ATMIN (ENSSTUG00000021129) #22	ENSSTUG00000021123	CIBAR2 (ENSSTUG00000021116)	gins2 (ENSSTUG00000021108)	emc8 (ENSSTUG00000021078)	cox4i1 (ENSSTUG00000021068)	irf8 (ENSSTUG00000021023)	foxf1 (ENSSTUG00000021013)	mthfsd (ENSSTUG00000020999)	ENSSTUG00000020974	gas8 (ENSSTUG00000020922)	DBNDD1 (ENSSTUG00000020908)	ENSSTUG00000020783	def8 (ENSSTUG00000020516)	TUBB3 (ENSSTUG00000020507)	mc1r (ENSSTUG00000020496)
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000159515.c.b.c	ENSGT00940000158805.a.j.a	ENSGT00940000156912.c.a.b	ENSGT00950000182885.A.a.f.e.a	ENSGT00950000182838.A.a.b.m	ENSGT00940000156076.a.a.a.a.f.a.a	ENSGT00940000163235.A.a.a.b.d	ENSGT00390000013104.e	ENSGT00940000154910.b.b.q	ENSGT00940000155948.b.a.c	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b.g	ENSGT00940000161531.a.a.c.a	ENSGT00940000159646.i.b #19	ENSGT00390000016908.n #20	ENSGT00390000004738.z #21	ENSGT00390000013091.eb #22	ENSGT00530000067249	ENSGT00940000161906.c	ENSGT00390000010285.d.h.a	ENSGT00700000104539.b.a.e	ENSGT00390000006738.a.c	ENSGT00390000002407.d.jb	ENSGT00940000164598.a.a	ENSGT00940000158140.ib	ENSGT00940000161035.f.b	ENSGT00390000011730.c.b	ENSGT00390000009477.q	ENSGT00390000018903.i	ENSGT00940000160625.r.b.b	ENSGT00940000159182.g.b.a	ENSGT00940000159115.c.a
River trout	MODERN SPECIES	21	ENSSTUG00000011661	ENSSTUG00000011679	ENSSTUG00000011693	ENSSTUG00000011712	ENSSTUG00000011725	tollip (ENSSTUG00000011745)	spon1a (ENSSTUG00000011796)	SYT9 (ENSSTUG00000012465)	PPFIBP2 (ENSSTUG00000012510)	ENSSTUG00000013692	MAF (ENSSTUG00000013706)	ENSSTUG00000013709	CDYL2 (ENSSTUG00000013712) #19	cmc2 (ENSSTUG00000013722) #20	cenpn (ENSSTUG00000013730) #21	ATMIN (ENSSTUG00000013743) #22	ENSSTUG00000013748	ENSSTUG00000013755	CIBAR2 (ENSSTUG00000013765)	ENSSTUG00000013782	emc8 (ENSSTUG00000013791)	cox4i1 (ENSSTUG00000013801)	irf8 (ENSSTUG00000013817)	ENSSTUG00000013861	foxf1 (ENSSTUG00000013862)	MTHFSD (ENSSTUG00000013870)	gas8 (ENSSTUG00000013908)	ENSSTUG00000013964	DBNDD1 (ENSSTUG00000013969)	ENSSTUG00000014000	def8 (ENSSTUG00000014164)
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	18	ENSSSAG00000093916	ENSSSAG00000056947	ENSSSAG00000040384	ENSSSAG00000022087	ENSSSAG00000056775	ENSSSAG00000113269	ENSSSAG00000110236	ENSSSAG00000059113	ENSSSAG00000056681	spon1a (ENSSSAG00000052884)	ENSSSAG00000041695	ENSSSAG00000052684	ENSSSAG00000052644	cdyl2 (ENSSSAG00000052637) #19	cmc2 (ENSSSAG00000052629) #20	ENSSSAG00000052619 #22	ENSSSAG00000052586	ENSSSAG00000105747	CIBAR2 (ENSSSAG00000112039)	ENSSSAG00000084798	ENSSSAG00000121577	ENSSSAG00000114913	ENSSSAG00000116433	gse1b (ENSSSAG00000113104)	ENSSSAG00000091800	emc8 (ENSSSAG00000052526)	cox4i1 (ENSSSAG00000052502)	dusp22a (ENSSSAG00000052429)	irf8 (ENSSSAG00000083711)	foxf1 (ENSSSAG00000111023)	MTHFSD (ENSSSAG00000085072)
Oncorhynchus	DUPLICATION
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Coho salmon	MODERN SPECIES	28	ENSOKIG00005008991	ENSOKIG00005008498	ENSOKIG00005008434	ENSOKIG00005008329	ENSOKIG00005008288	ENSOKIG00005008093	TOLLIP (ENSOKIG00005007917)	spon1a (ENSOKIG00005005745)	SYT9 (ENSOKIG00005005582)	PPFIBP2 (ENSOKIG00005005533)	MAF (ENSOKIG00005005519)	ENSOKIG00005005502	CDYL2 (ENSOKIG00005005495) #19	cenpn (ENSOKIG00005005482) #21	cmc2 (ENSOKIG00005005479) #20	ATMIN (ENSOKIG00005005475) #22	ENSOKIG00005005466	ENSOKIG00005005462	ENSOKIG00005005459	gse1b (ENSOKIG00005005427)	gins2 (ENSOKIG00005005401)	emc8 (ENSOKIG00005005386)	cox4i1 (ENSOKIG00005005372)	irf8 (ENSOKIG00005005330)	foxf1 (ENSOKIG00005005314)	MTHFSD (ENSOKIG00005005302)	ENSOKIG00005005285	GAS8 (ENSOKIG00005005277)	DBNDD1 (ENSOKIG00005005262)	ENSOKIG00005005181	DEF8 (ENSOKIG00005004911)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	28	ENSOTSG00005003727	ENSOTSG00005003726	ENSOTSG00005003725	ENSOTSG00005003721	tollip (ENSOTSG00005003439)	spon1a (ENSOTSG00005002842)	CDYL2 (ENSOTSG00005002802) #19	cmc2 (ENSOTSG00005002794) #20	cenpn (ENSOTSG00005002785) #21	ATMIN (ENSOTSG00005002781) #22	ENSOTSG00005002779	ENSOTSG00005002776	ENSOTSG00005002770 #19	cmc2 (ENSOTSG00005002762) #20	cenpn (ENSOTSG00005002758) #21	ATMIN (ENSOTSG00005002755) #22	ENSOTSG00005019398	CIBAR2 (ENSOTSG00005019394)	foxf1 (ENSOTSG00005019392)	mthfsd (ENSOTSG00005019389)	gas8 (ENSOTSG00005019294)	ENSOTSG00005019293	DBNDD1 (ENSOTSG00005019292)	ENSOTSG00005019290	def8 (ENSOTSG00005019287)	TUBB3 (ENSOTSG00005019285)	mc1r (ENSOTSG00005019283)	tcf25 (ENSOTSG00005015447)	cyba (ENSOTSG00005015443)	mvda (ENSOTSG00005015440)	pdcd5 (ENSOTSG00005015438)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	18	ENSOMYG00000041817	ENSOMYG00000055755	TOLLIP (ENSOMYG00000041767)	spon1a (ENSOMYG00000041701)	ENSOMYG00000054357	ENSOMYG00000041680	ENSOMYG00000041670	ENSOMYG00000041654	ENSOMYG00000041642	ENSOMYG00000041639	ENSOMYG00000055174	ENSOMYG00000041626 #19	cmc2 (ENSOMYG00000041619) #20	ENSOMYG00000048666	cenpn (ENSOMYG00000063548) #21	ATMIN (ENSOMYG00000041607) #22	ENSOMYG00000041599	ENSOMYG00000055637	CIBAR2 (ENSOMYG00000041592)	ENSOMYG00000055252	ENSOMYG00000050931	ENSOMYG00000061944	gse1b (ENSOMYG00000067020)	gins2 (ENSOMYG00000041586)	emc8 (ENSOMYG00000041580)	ENSOMYG00000041579	cox4i1 (ENSOMYG00000041573)	dusp22a (ENSOMYG00000071017)	ENSOMYG00000055139	irf8 (ENSOMYG00000041511)	foxf1 (ENSOMYG00000041502)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000159515.c.b.c	ENSGT00940000158805.a.j	ENSGT00940000156912.c.a.b.a	ENSGT00950000182885.A.a.f.e.a	ENSGT00950000182838.A.a.b.m	ENSGT00940000162219.b	ENSGT00390000013104.e	ENSGT00940000154910.b.b.q	ENSGT00940000155948.b.a.c	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b.g	ENSGT01090000262925	ENSGT00940000161531.a.a.c.a	ENSGT00940000159646.i.b #19	ENSGT00390000016908.m #20	ENSGT00390000004738.z #21	ENSGT00390000013091.gb #22	ENSGT00940000161906.c	ENSGT00390000010285.d.h	ENSGT00700000104539.b.a.f	ENSGT00390000006738.a.c.a.a	ENSGT00390000002407.d.mb	ENSGT00940000164598.b	ENSGT00940000158140.ib.a	ENSGT00940000161035.e.b	ENSGT00390000011730.c.b	ENSGT00390000009477.q	ENSGT01010000224458.b	ENSGT00390000018903.i	ENSGT00940000160625.r.b.b	ENSGT00940000159182.g.b	ENSGT00940000159115.c.b
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000158805.a.j	ENSGT00940000156912.c.a.b.a	ENSGT00950000182885.A.a.f.e.a	ENSGT00950000182838.A.a.b.m	ENSGT00940000156076.a.a.a.a.e.d	ENSGT00390000013104.e	ENSGT00940000154910.b.b.q	ENSGT00940000154910.b.b.r.a.a	ENSGT00940000155948.b.a.c	ENSGT01050000244951.a.b.a.a.g.b.g	ENSGT01090000262925	ENSGT00940000161531.a.a.c.a	ENSGT00940000159646.i.b #19	ENSGT00390000016908.m #20	ENSGT00390000004738.z #21	ENSGT00390000013091.gb #22	ENSGT00940000161906.c	ENSGT00390000010285.d.h	ENSGT00700000104539.b.a.f	ENSGT00390000006738.a.c.a.a	ENSGT00390000002407.d.mb	ENSGT00940000164598.b	ENSGT00940000158140.ib.a	ENSGT00940000161035.e.b	ENSGT00390000011730.c.b	ENSGT00390000009477.q	ENSGT01010000224458.b	ENSGT00390000018903.i	ENSGT00940000160625.r.b.b	ENSGT00940000159182.g.b	ENSGT00940000159115.c.b
Chinook salmon	MODERN SPECIES	28	AP2A2 (ENSOTSG00005003748)	ENSOTSG00005003739	ENSOTSG00005003737	ENSOTSG00005003734	ENSOTSG00005003731	ENSOTSG00005003729	ENSOTSG00005003727	ENSOTSG00005003726	ENSOTSG00005003725	ENSOTSG00005003721	tollip (ENSOTSG00005003439)	spon1a (ENSOTSG00005002842)	CDYL2 (ENSOTSG00005002802) #19	cmc2 (ENSOTSG00005002794) #20	cenpn (ENSOTSG00005002785) #21	ATMIN (ENSOTSG00005002781) #22	ENSOTSG00005002779	ENSOTSG00005002776	ENSOTSG00005002770 #19	cmc2 (ENSOTSG00005002762) #20	cenpn (ENSOTSG00005002758) #21	ATMIN (ENSOTSG00005002755) #22	ENSOTSG00005019398	CIBAR2 (ENSOTSG00005019394)	foxf1 (ENSOTSG00005019392)	mthfsd (ENSOTSG00005019389)	gas8 (ENSOTSG00005019294)	ENSOTSG00005019293	DBNDD1 (ENSOTSG00005019292)	ENSOTSG00005019290	def8 (ENSOTSG00005019287)
Coho salmon	MODERN SPECIES	22	kcnc1a (ENSOKIG00005028628)	TPH1 (ENSOKIG00005027297)	AP2A2 (ENSOKIG00005026928)	ENSOKIG00005026898	ENSOKIG00005026476	tollip (ENSOKIG00005026290)	spon1a (ENSOKIG00005025781)	SYT9 (ENSOKIG00005025736)	ENSOKIG00005025729	PPFIBP2 (ENSOKIG00005025532)	MAF (ENSOKIG00005025485)	ENSOKIG00005025475	CDYL2 (ENSOKIG00005025351) #19	cmc2 (ENSOKIG00005025339) #20	cenpn (ENSOKIG00005025286) #21	ATMIN (ENSOKIG00005025254) #22	ENSOKIG00005025217	CIBAR2 (ENSOKIG00005025206)	ENSOKIG00005025199	gse1b (ENSOKIG00005025184)	emc8 (ENSOKIG00005025137)	cox4i1 (ENSOKIG00005025111)	dusp22a (ENSOKIG00005025086)	irf8 (ENSOKIG00005024997)	foxf1 (ENSOKIG00005024986)	MTHFSD (ENSOKIG00005024959)	ENSOKIG00005024930	gas8 (ENSOKIG00005024543)	ENSOKIG00005024512	DBNDD1 (ENSOKIG00005024491)	ENSOKIG00005024284
Rainbow trout	MODERN SPECIES	27	ENSOMYG00000065765	ENSOMYG00000061323	ENSOMYG00000015931	tollip (ENSOMYG00000015845)	spon1a (ENSOMYG00000015807)	ENSOMYG00000015788	ENSOMYG00000062892	ENSOMYG00000015713	ENSOMYG00000076323	ENSOMYG00000015686	ENSOMYG00000071956	ENSOMYG00000069689	ENSOMYG00000015682 #19	cmc2 (ENSOMYG00000015675) #20	cenpn (ENSOMYG00000041611) #21	ATMIN (ENSOMYG00000015647) #22	ENSOMYG00000015633	CIBAR2 (ENSOMYG00000015629)	ENSOMYG00000009138	ENSOMYG00000077595	ENSOMYG00000066690	gse1b (ENSOMYG00000015591)	ENSOMYG00000067011	gins2 (ENSOMYG00000015561)	emc8 (ENSOMYG00000027633)	COX41 (ENSOMYG00000027622)	dusp22a (ENSOMYG00000063021)	irf8 (ENSOMYG00000027543)	foxf1 (ENSOMYG00000027496)	MTHFSD (ENSOMYG00000027461)	ENSOMYG00000026931
Huchen	DUPLICATION
Huchen	MODERN SPECIES	1600													CDYL2 (ENSHHUG00000035448) #19	cmc2 (ENSHHUG00000035453) #20	cenpn (ENSHHUG00000035457) #21	ATMIN (ENSHHUG00000035468) #22	ENSHHUG00000035478	ENSHHUG00000035489
Huchen	MODERN SPECIES	3589													CDYL2 (ENSHHUG00000044990) #19	cmc2 (ENSHHUG00000044992) #20	cenpn (ENSHHUG00000044994) #21	ATMIN (ENSHHUG00000044998) #22	ENSHHUG00000045002	CIBAR2 (ENSHHUG00000045006)
Northern pike	MODERN SPECIES	1	mybpc3 (ENSELUG00000009830)	spi1b (ENSELUG00000009875)	slc39a13 (ENSELUG00000009899)	ENSELUG00000009916	tssc4 (ENSELUG00000009939)	PKP3 (ENSELUG00000009958)	cd81a (ENSELUG00000009978)	ENSELUG00000010053	ENSELUG00000028137	ENSELUG00000001489	tollip (ENSELUG00000010125)	MAF (ENSELUG00000010148)	CDYL2 (ENSELUG00000001080) #19	cmc2 (ENSELUG00000010206) #20	cenpn (ENSELUG00000010225) #21	ATMIN (ENSELUG00000010232) #22	ENSELUG00000010237	CIBAR2 (ENSELUG00000010263)	gse1b (ENSELUG00000010341)	gins2 (ENSELUG00000010371)	emc8 (ENSELUG00000010382)	cox4i1 (ENSELUG00000010435)	dusp22a (ENSELUG00000010452)	irf8 (ENSELUG00000010474)	foxf1 (ENSELUG00000010487)	mthfsd (ENSELUG00000010525)	gas8 (ENSELUG00000010570)	DBNDD1 (ENSELUG00000025369)	ENSELUG00000010644	def8 (ENSELUG00000010657)	TUBB3 (ENSELUG00000010664)
Osteoglossiformes	DUPLICATION
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00940000162248	ENSGT00940000161285.b	ENSGT00940000156586	ENSGT00940000159068.b	ENSGT00940000156718.d	ENSGT00940000157698.b.e	ENSGT00940000159754.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00390000015299.a.a.a.n	ENSGT00940000161531.a.a.b	ENSGT00940000157389	ENSGT00390000011067.B	ENSGT00940000159646.k #19	ENSGT00390000016908 #20	ENSGT00390000004738 #21	ENSGT00390000013091.jb #22	ENSGT00940000161906	ENSGT00390000010285.d	ENSGT00700000104539.b.a	ENSGT00390000007838	ENSGT00390000006738.a	ENSGT00390000002407.d	ENSGT00940000158140.db	ENSGT00940000161035.a	ENSGT00390000011730	ENSGT00390000009477	ENSGT00390000018903.g	ENSGT00940000160625.r.a	ENSGT00940000159182	ENSGT00940000159115.b	ENSGT01030000234510.b.c
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	122	ENSPKIG00000001005	ENSPKIG00000000982	nr1h3 (ENSPKIG00000000964)	MADD (ENSPKIG00000000930)	ENSPKIG00000000903	ENSPKIG00000000887	spi1b (ENSPKIG00000000872)	slc39a13 (ENSPKIG00000000830)	ENSPKIG00000000787	MAF (ENSPKIG00000000774)	wwox (ENSPKIG00000000751)	dynlrb2 (ENSPKIG00000000719)	CDYL2 (ENSPKIG00000000693) #19	cmc2 (ENSPKIG00000000667) #20	cenpn (ENSPKIG00000000636) #21	ATMIN (ENSPKIG00000000615) #22	ENSPKIG00000000595	ENSPKIG00000000579	CIBAR2 (ENSPKIG00000000561)	gse1b (ENSPKIG00000000453)	gins2 (ENSPKIG00000000343)	emc8 (ENSPKIG00000000324)	cox4i1 (ENSPKIG00000000311)	irf8 (ENSPKIG00000000299)
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	2	KCNA4 (ENSSFOG00015006985)	fshb (ENSSFOG00015007004)	arl14ep (ENSSFOG00015007017)	nr1h3 (ENSSFOG00015024439)	MADD (ENSSFOG00015007092)	spi1b (ENSSFOG00015007221)	slc39a13 (ENSSFOG00015007237)	ENSSFOG00015007247	MAF (ENSSFOG00015028613)	wwox (ENSSFOG00015007310)	ENSSFOG00015007368	dynlrb2 (ENSSFOG00015007380)	CDYL2 (ENSSFOG00015007388) #19	cmc2 (ENSSFOG00015007417) #20	cenpn (ENSSFOG00015007436) #21	ATMIN (ENSSFOG00015007483) #22	PPP1R3E (ENSSFOG00015025897)	CIBAR2 (ENSSFOG00015007491)	gse1b (ENSSFOG00015007500)	gins2 (ENSSFOG00015007537)	emc8 (ENSSFOG00015025012)	cox4i1 (ENSSFOG00015007633)	irf8 (ENSSFOG00015007654)	foxf1 (ENSSFOG00015007688)	mthfsd (ENSSFOG00015007696)	gas8 (ENSSFOG00015007723)	DBNDD1 (ENSSFOG00015032073)	ENSSFOG00015007771	def8 (ENSSFOG00015007809)	ENSSFOG00015026929	mc1r (ENSSFOG00015007906)
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00390000013091.kb #22
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	22	ENSSFOG00015019480	zfhx3b (ENSSFOG00015019511)	ENSSFOG00015019543	cyb5b (ENSSFOG00015019555)	CPNE7 (ENSSFOG00015019566)	rpl13 (ENSSFOG00015028948)	ENSSFOG00015019625	ENSSFOG00015019642	psmd7 (ENSSFOG00015019662)	bco1 (ENSSFOG00015019750) #26	ENSSFOG00015019776	ENSSFOG00015019788	mafa (ENSSFOG00015029551)	ENSSFOG00015019845	ENSSFOG00015019855 #19	ATMIN (ENSSFOG00015019871) #22	gse1b (ENSSFOG00015019928)	dusp22a (ENSSFOG00015020073)	irf8 (ENSSFOG00015020084)	foxf1 (ENSSFOG00015020091)	DBNDD1 (ENSSFOG00015020101)	ENSSFOG00015020116	ENSSFOG00015014131	mc1r (ENSSFOG00015020179)	ENSSFOG00015030264	ENSSFOG00015024905	WDR59 (ENSSFOG00015020229)	ENSSFOG00015000068	TMED6 (ENSSFOG00015000070)	ENSSFOG00015025056	zdhhc7 (ENSSFOG00015000116)
Spotted gar	MODERN SPECIES	662									MAF (ENSLOCG00000000440)	ENSLOCG00000017582	wwox (ENSLOCG00000000486)	dynlrb2 (ENSLOCG00000000574)	CDYL2 (ENSLOCG00000000608) #19	cmc2 (ENSLOCG00000000647) #20	cenpn (ENSLOCG00000000681) #21	ATMIN (ENSLOCG00000000709) #22	ENSLOCG00000017583	ENSLOCG00000000764	CIBAR2 (ENSLOCG00000000792)	ENSLOCG00000000856	gse1b (ENSLOCG00000000905)	gins2 (ENSLOCG00000000923)	emc8 (ENSLOCG00000000943)	cox4i1 (ENSLOCG00000000961)	dusp22a (ENSLOCG00000000986)	irf8 (ENSLOCG00000001013)	foxf1 (ENSLOCG00000001042)	mthfsd (ENSLOCG00000001066)	gas8 (ENSLOCG00000001086)	DBNDD1 (ENSLOCG00000001107)	ENSLOCG00000001134
Reedfish	MODERN SPECIES	17	ENSECRG00000016663	bco1l (ENSECRG00000016682) ##26	bco1 (ENSECRG00000016724) #26	hprt1l (ENSECRG00000016751)	bola3 (ENSECRG00000016779)	NUDT7 (ENSECRG00000016799)	vat1l (ENSECRG00000016815)	CLEC3A (ENSECRG00000016841)	MAF (ENSECRG00000016861)	WWOX (ENSECRG00000016879)	ENSECRG00000016916	dynlrb2 (ENSECRG00000016945)	CDYL2 (ENSECRG00000016973) #19	cmc2 (ENSECRG00000016991) #20	ENSECRG00000017010 #21	ATMIN (ENSECRG00000017039) #22	ENSECRG00000017049	CIBAR2 (ENSECRG00000017068)	gse1b (ENSECRG00000017097)	gins2 (ENSECRG00000017174)	emc8 (ENSECRG00000017199)	cox4i1 (ENSECRG00000017215)	dusp22a (ENSECRG00000017235)	irf8 (ENSECRG00000017260)	foxf1 (ENSECRG00000017289)	mthfsd (ENSECRG00000017307)	ENSECRG00000017329	gas8 (ENSECRG00000017357)	DBNDD1 (ENSECRG00000017380)	ENSECRG00000017393	def8 (ENSECRG00000017457)