Chordata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155370 #22 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155370 #22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000003836 ENSGT00940000161000 ENSGT00940000155240.B ENSGT00940000157476 ENSGT00940000156508 ENSGT00900000141099 ENSGT00940000156042 ENSGT00390000015971 ENSGT00940000156678 ENSGT00940000157711 ENSGT00940000153451.a.b ENSGT00940000156390 ENSGT00440000033408.a ENSGT00940000158809 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a ENSGT00390000015525 ENSGT00940000157171 ENSGT00530000062962.a.b ENSGT01030000234535.B ENSGT00940000156146 ENSGT00390000016416 ENSGT00940000155299.A ENSGT00940000158676 ENSGT00390000006960 ENSGT00940000170561 ENSGT00390000008042.A.a.b ENSGT00390000008042.A.a.a Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000161000 ENSGT00940000155240.B ENSGT00940000157476 ENSGT00940000156508 ENSGT00900000141099 ENSGT00940000156042 ENSGT00390000015971 ENSGT00940000156678 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1 ENSGT00940000161673 ENSGT00940000157476 ENSGT00940000156508 ENSGT00900000141099 ENSGT00940000156042 ENSGT00390000015971 ENSGT00940000156678 ENSGT00940000157711 ENSGT00940000153451.a.b ENSGT00940000156390 ENSGT00940000154775.c.b ENSGT00440000033408.a ENSGT00940000158809 ENSGT00940000165398 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b ENSGT00390000015525 ENSGT00940000157171 ENSGT00530000062962.a.b ENSGT01030000234535.B ENSGT00940000156146 ENSGT00390000016416 ENSGT00940000155299.A ENSGT00940000158676 ENSGT00940000161639 ENSGT00390000006960 ENSGT00940000155958 ENSGT00940000156737 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00900000141099 ENSGT00940000156042 ENSGT00390000015971 ENSGT00940000156678 ENSGT00940000157711 ENSGT00940000153451.a.b ENSGT00410000028443 ENSGT00940000172425 ENSGT00410000028701 ENSGT00940000156390 ENSGT00940000154775.c.b ENSGT00440000033408.a ENSGT00940000158809 ENSGT00940000165398 ENSGT00940000157567 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VAMP1 (ENSPPYG00000004187) #28 TAPBPL (ENSPPYG00000004186) #30 CD27 (ENSPPYG00000029486) #31 LTBR (ENSPPYG00000039662) #34 SCNN1A (ENSPPYG00000004184) #35 TNFRSF1A (ENSPPYG00000004183) #36 PLEKHG6 (ENSPPYG00000004182) #37 CD9 (ENSPPYG00000004181) VWF (ENSPPYG00000004180) ANO2 (ENSPPYG00000004179) NTF3 (ENSPPYG00000004178) Gibbon MODERN SPECIES 24 ARMC3 (ENSNLEG00000012885) PIP4K2A (ENSNLEG00000012884) SPAG6 (ENSNLEG00000012859) BMI1 (ENSNLEG00000012850) COMMD3 (ENSNLEG00000030814) DNAJC1 (ENSNLEG00000012820) MLLT10 (ENSNLEG00000012771) ENSNLEG00000012769 NEBL (ENSNLEG00000012730) ENSNLEG00000012768 ENSNLEG00000035400 PLXDC2 (ENSNLEG00000012709) MALRD1 (ENSNLEG00000012702) ENSNLEG00000028677 ARL5B (ENSNLEG00000027383) NSUN6 (ENSNLEG00000012680) #22 ENSNLEG00000012660 SLC39A12 (ENSNLEG00000012624) TMEM236 (ENSNLEG00000012620) STAM (ENSNLEG00000012603) HACD1 (ENSNLEG00000012594) ENSNLEG00000012592 ENSNLEG00000012578 ENSNLEG00000012568 TRDMT1 (ENSNLEG00000012525) CUBN (ENSNLEG00000012456) RSU1 (ENSNLEG00000029235) C1QL3 (ENSNLEG00000028261) PTER (ENSNLEG00000012435) MINDY3 (ENSNLEG00000012397) ITGA8 (ENSNLEG00000012372) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00490000044176.b.a.a ENSGT00940000156678 ENSGT00940000157711 ENSGT00940000153451.a.b ENSGT00410000028443 ENSGT00390000016470.c.h ENSGT00410000028701 ENSGT00910000147166 ENSGT00940000164579 ENSGT00940000153336.e.b.a.a.a ENSGT00940000156390 ENSGT00910000147567 ENSGT00440000033408.a ENSGT00940000158809 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b ENSGT00390000015525 ENSGT00940000157171 ENSGT00530000062962.a.b ENSGT01030000234535.B ENSGT00940000158017.f ENSGT00940000156146 ENSGT00390000016416 ENSGT00940000155299.A ENSGT00940000158676 ENSGT00940000161639 ENSGT00910000147477 ENSGT00390000006960 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00490000044176.b.a.a ENSGT00940000156678 ENSGT00940000157711 ENSGT00940000153451.a.b ENSGT00410000028443 ENSGT00390000016470.c.h ENSGT00410000028701 ENSGT00910000147166 ENSGT00940000164579 ENSGT00940000153336.e.b.a.a.a ENSGT00940000156390 ENSGT00910000147567 ENSGT00440000033408.a ENSGT00940000158809 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b ENSGT00390000015525 ENSGT00940000157171 ENSGT00530000062962.a.b ENSGT00390000002416.i.b ENSGT01030000234535.B ENSGT00940000158017.f ENSGT00940000156146 ENSGT00390000016416 ENSGT00940000155299.A ENSGT00940000158676 ENSGT00940000161639 ENSGT00910000147477 Vervet Monkey MODERN SPECIES 28 ENSCSAG00000012415 PTF1A (ENSCSAG00000012422) MSRB2 (ENSCSAG00000012427) ARMC3 (ENSCSAG00000012440) PIP4K2A (ENSCSAG00000012448) SPAG6 (ENSCSAG00000012459) BMI1 (ENSCSAG00000012472) DNAJC1 (ENSCSAG00000012486) MLLT10 (ENSCSAG00000012502) SKIDA1 (ENSCSAG00000019057) ENSCSAG00000012513 ENSCSAG00000012531 NEBL (ENSCSAG00000012544) PLXDC2 (ENSCSAG00000012558) ARL5B (ENSCSAG00000012564) NSUN6 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ENSGT00940000158017.f ENSGT00940000156146 ENSGT00390000016416 ENSGT00940000155299.A ENSGT00940000158676 ENSGT00940000161639 ENSGT00910000147477 Macaca ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000156042 ENSGT00390000015971 ENSGT00490000044176.b.a.a ENSGT00940000156678 ENSGT00940000157711 ENSGT00940000153451.a.b ENSGT00410000028443 ENSGT00390000016470.c.h ENSGT00410000028701 ENSGT00940000164579.i.b ENSGT00940000153336.e.b.a.a.a ENSGT00940000156390 ENSGT00440000033408.a ENSGT00940000158809 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b ENSGT00390000015525 ENSGT00940000157171 ENSGT00530000062962.a.b ENSGT00390000002416.i.b ENSGT01030000234535.B ENSGT00940000158017.f ENSGT00940000156146 ENSGT00390000016416 ENSGT00940000155299.A ENSGT00940000158676 ENSGT00940000161639 ENSGT00910000147477 Pig-tailed macaque DUPLICATION Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 144 COL22A1 (ENSMNEG00000042329) FAM135B (ENSMNEG00000030000) KHDRBS3 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night monkey MODERN SPECIES 274 GPR162 (ENSANAG00000035754) #10 CD4 (ENSANAG00000031728) #11 LAG3 (ENSANAG00000027143) #12 PTMS (ENSANAG00000025029) MLF2 (ENSANAG00000023951) #14 ENSANAG00000034921 ENSANAG00000036949 ENSANAG00000035023 ENSANAG00000032919 COPS7A (ENSANAG00000037741) #15 PIANP (ENSANAG00000026580) #16 ZNF384 (ENSANAG00000032088) #17 ING4 (ENSANAG00000018382) #18 ACRBP (ENSANAG00000032730) #19 CHD4 (ENSANAG00000035685) #21 ENSANAG00000026027 #22 IFFO1 (ENSANAG00000016258) #23 ENSANAG00000036575 ##24 NCAPD2 (ENSANAG00000036586) #25 ENSANAG00000021671 #26 ENSANAG00000018367 VAMP1 (ENSANAG00000037847) #28 TAPBPL (ENSANAG00000017857) #30 CD27 (ENSANAG00000036800) #31 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000161673 ENSGT00940000157476 ENSGT00940000156508 ENSGT00900000141099 ENSGT00940000156042.mb ENSGT00390000015971 ENSGT00940000156678 ENSGT00940000157711 ENSGT00940000153451.a.b ENSGT00410000028443 ENSGT00410000028701 ENSGT00940000156390 ENSGT00440000033408.a 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MODERN SPECIES 1852 Arl5b (ENSNGAG00000006384) Nsun6 (ENSNGAG00000004582) #22 Cacnb2 (ENSNGAG00000007965) Slc39a12 (ENSNGAG00000016149) Mrc1 (ENSNGAG00000017365) Tmem236 (ENSNGAG00000012733) Stam (ENSNGAG00000011450) Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000161000 ENSGT00940000161673 ENSGT00940000157476 ENSGT00940000156508 ENSGT00900000141099.d ENSGT00940000156042 ENSGT00390000015971 ENSGT00940000156678 ENSGT00940000157711 ENSGT00940000153451.a.b ENSGT00940000154775.c.b ENSGT00940000156390 ENSGT00440000033408.a ENSGT00940000158809 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b ENSGT00390000015525 ENSGT00940000157171 ENSGT00530000062962.a.b ENSGT01030000234535.B ENSGT00940000156146 ENSGT00390000016416 ENSGT00940000155299.A ENSGT00940000158676 ENSGT00940000161639 ENSGT00390000006960 ENSGT00940000155958 ENSGT00940000156737 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000161000 ENSGT00940000161673 ENSGT00940000157476 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ENSGT00940000156737 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000161673 ENSGT00940000157476 ENSGT00940000156508 ENSGT00900000141099.d ENSGT00940000156042 ENSGT00390000015971 ENSGT00940000156678 ENSGT00940000157711 ENSGT00940000153451.a.b ENSGT00940000162492.g.a ENSGT00860000136241 ENSGT00940000156390 ENSGT00440000033408.a ENSGT00940000158809 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b ENSGT00390000015525 ENSGT00940000157171 ENSGT00530000062962.a.b ENSGT01030000234535.B ENSGT00940000156146 ENSGT00390000016416 ENSGT00940000155299.A ENSGT00940000158676 ENSGT00940000161639 ENSGT00390000006960 ENSGT00940000155958 ENSGT00940000156737 Mouse MODERN SPECIES 11 Msrb2 (ENSMUSG00000023094) Armc3 (ENSMUSG00000037683) Pip4k2a (ENSMUSG00000026737) Carlr (ENSMUSG00000097638) Spag6 (ENSMUSG00000037708) Bmi1 (ENSMUSG00000026739) Commd3 (ENSMUSG00000051154) Dnajc1 (ENSMUSG00000026740) Mllt10 (ENSMUSG00000026743) Skida1 (ENSMUSG00000054074) 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ENSGT01050000244842.a.a.b ENSGT00390000015525 ENSGT00940000157171 ENSGT00530000062962.a.b ENSGT01030000234535.B ENSGT00940000156146 ENSGT00390000016416 ENSGT00940000155299.A ENSGT00940000158676 ENSGT00940000161639 ENSGT00390000006960 ENSGT00940000155958 ENSGT00940000156737 Steppe mouse MODERN SPECIES 2428 Arl5b (ENSMSIG00000031325) Nsun6 (ENSMSIG00000031323) #22 Cacnb2 (ENSMSIG00000031316) Ryukyu mouse MODERN SPECIES 11 Armc3 (MGP_CAROLIEiJ_G0023211) MGP_CAROLIEiJ_G0023210 Pip4k2a (MGP_CAROLIEiJ_G0023209) Spag6 (MGP_CAROLIEiJ_G0023208) Bmi1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023207) Commd3 (MGP_CAROLIEiJ_G0023206) Dnajc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023205) Mllt10 (MGP_CAROLIEiJ_G0023204) Skida1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023203) MGP_CAROLIEiJ_G0023202 H2al2a (MGP_CAROLIEiJ_G0023201) Nebl (MGP_CAROLIEiJ_G0023200) Plxdc2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023199) Malrd1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023198) Arl5b (MGP_CAROLIEiJ_G0023197) Nsun6 (MGP_CAROLIEiJ_G0023196) #22 MGP_CAROLIEiJ_G0023195 Cacnb2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023194) Slc39a12 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ENSGT00940000161673 ENSGT00940000157476 ENSGT00940000156508 ENSGT00900000141099 ENSGT00940000156042 ENSGT00390000015971 ENSGT00940000156678 ENSGT00940000157711 ENSGT00940000153451.a.b ENSGT00940000156390 ENSGT00440000033408.a ENSGT00940000158809 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b ENSGT00390000015525 ENSGT00940000157171 ENSGT00530000062962.a.b ENSGT01030000234535.B ENSGT00940000156146 ENSGT00390000016416 ENSGT00940000155299.A ENSGT00940000158676 ENSGT00940000161639 ENSGT00390000006960 ENSGT00940000155958 ENSGT00940000156737 Microbat MODERN SPECIES 1058 ENSMLUG00000001285 ENSMLUG00000024250 ENSMLUG00000024489 ENSMLUG00000028069 ARL5B (ENSMLUG00000001833) NSUN6 (ENSMLUG00000001824) #22 ENSMLUG00000022890 CACNB2 (ENSMLUG00000001818) SLC39A12 (ENSMLUG00000007079) MRC1 (ENSMLUG00000009142) TMEM236 (ENSMLUG00000026911) STAM (ENSMLUG00000017515) HACD1 (ENSMLUG00000026226) ST8SIA6 (ENSMLUG00000013878) VIM 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Megabat MODERN SPECIES 215 ARL5B (ENSPVAG00000006330) NSUN6 (ENSPVAG00000006329) #22 CACNB2 (ENSPVAG00000006328) SLC39A12 (ENSPVAG00000006327) MRC1 (ENSPVAG00000006324) Equus ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00390000003836 ENSGT00940000161000 ENSGT00940000161673 ENSGT00940000157476 ENSGT00940000156508 ENSGT00900000141099 ENSGT00940000156042 ENSGT00390000015971 ENSGT00940000156678 ENSGT00940000157711 ENSGT00940000153451.a.b ENSGT00940000156390 ENSGT00440000033408.a ENSGT00940000158809 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b ENSGT00390000015525 ENSGT00940000157171 ENSGT00530000062962.a.b ENSGT01030000234535.B ENSGT00940000156146 ENSGT00390000016416 ENSGT00940000155299.A ENSGT00940000158676 ENSGT00940000161639 ENSGT00390000006960 ENSGT00940000155958 ENSGT00940000156737 Horse MODERN SPECIES 21 MSRB2 (ENSECAG00000013072) ARMC3 (ENSECAG00000013576) PIP4K2A (ENSECAG00000007707) SPAG6 (ENSECAG00000012645) BMI1 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ENSGT00940000157171 ENSGT00530000062962.a.b ENSGT01030000234535.B ENSGT00940000156146 ENSGT00390000016416 ENSGT00940000155299.A ENSGT00940000158676 ENSGT00940000161639 ENSGT00910000147477 ENSGT00390000006960 ENSGT00940000155958 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000156227.f ENSGT00940000156625 ENSGT00940000156232.b.l ENSGT00440000037780.a ENSGT00940000154101.b ENSGT00940000159227 ENSGT00940000158806 ENSGT00940000158582 ENSGT00390000015348 ENSGT00940000154653 ENSGT00390000014526 ENSGT00950000183208.B ENSGT00950000182860.a.a.b ENSGT00940000154801 ENSGT00940000155003.e.a ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b ENSGT00390000015525 ENSGT00940000157171 ENSGT00530000062962.a.b ENSGT01030000234535.B ENSGT00940000156146 ENSGT00390000016416 ENSGT00940000155299.A ENSGT00940000158676 ENSGT00940000161639 ENSGT00910000147477 ENSGT00390000006960 ENSGT00940000155958 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000156227.f ENSGT00940000156625 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ENSGT00940000161639 ENSGT00910000147477 ENSGT00390000006960 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 4 ENSBIXG00005001753 ENSBIXG00005001784 MAP3K8 (ENSBIXG00005001797) MTPAP (ENSBIXG00005029152) JCAD (ENSBIXG00005029133) SVIL (ENSBIXG00005001956) ENSBIXG00005002318 ZNF438 (ENSBIXG00005028822) ENSBIXG00005028798 ENSBIXG00005028781 ZEB1 (ENSBIXG00005004971) ARHGAP12 (ENSBIXG00005028591) KIF5B (ENSBIXG00005028451) EPC1 (ENSBIXG00005028386) ENSBIXG00005028328 NSUN6 (ENSBIXG00005028312) #22 CACNB2 (ENSBIXG00005005335) ENSBIXG00005026875 ENSBIXG00005004587 SLC39A12 (ENSBIXG00005026797) MRC1 (ENSBIXG00005026627) STAM (ENSBIXG00005004538) HACD1 (ENSBIXG00005004526) ST8SIA6 (ENSBIXG00005004520) VIM (ENSBIXG00005026430) TRDMT1 (ENSBIXG00005026377) ENSBIXG00005004488 CUBN (ENSBIXG00005026292) RSU1 (ENSBIXG00005026245) C1QL3 (ENSBIXG00005026191) PTER (ENSBIXG00005026166) Cow MODERN SPECIES 4 ODAD2 (ENSBTAG00000000654) MPP7 (ENSBTAG00000017354) WAC (ENSBTAG00000018263) BAMBI (ENSBTAG00000003045) 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(ENSOARG00020004655) Goat MODERN SPECIES 4 ENSCHIG00000024362 ENSCHIG00000018589 WAC (ENSCHIG00000022497) BAMBI (ENSCHIG00000015150) ENSCHIG00000022034 MAP3K8 (ENSCHIG00000017886) MTPAP (ENSCHIG00000025725) JCAD (ENSCHIG00000013597) ENSCHIG00000023018 SVIL (ENSCHIG00000016403) ZNF438 (ENSCHIG00000013980) ZEB1 (ENSCHIG00000016385) ARHGAP12 (ENSCHIG00000024718) KIF5B (ENSCHIG00000019020) EPC1 (ENSCHIG00000005911) NSUN6 (ENSCHIG00000012618) #22 CACNB2 (ENSCHIG00000001734) SLC39A12 (ENSCHIG00000024612) MRC1 (ENSCHIG00000023775) TMEM236 (ENSCHIG00000002738) STAM (ENSCHIG00000004568) HACD1 (ENSCHIG00000026086) ST8SIA6 (ENSCHIG00000026819) VIM (ENSCHIG00000020459) TRDMT1 (ENSCHIG00000017788) CUBN (ENSCHIG00000019577) RSU1 (ENSCHIG00000015471) C1QL3 (ENSCHIG00000018119) PTER (ENSCHIG00000002557) MINDY3 (ENSCHIG00000011745) ITGA8 (ENSCHIG00000017512) Siberian musk deer MODERN SPECIES 1194 ENSMMSG00000021160 WAC (ENSMMSG00000021254) BAMBI (ENSMMSG00000021393) ENSMMSG00000021407 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(ENSCHYG00000013696) ZEB1 (ENSCHYG00000024350) ARHGAP12 (ENSCHYG00000023950) KIF5B (ENSCHYG00000023791) EPC1 (ENSCHYG00000023581) NSUN6 (ENSCHYG00000023455) #22 CACNB2 (ENSCHYG00000020467) SLC39A12 (ENSCHYG00000020036) ENSCHYG00000020009 MRC1 (ENSCHYG00000018709) STAM (ENSCHYG00000018548) HACD1 (ENSCHYG00000017477) ST8SIA6 (ENSCHYG00000017336) VIM (ENSCHYG00000017204) TRDMT1 (ENSCHYG00000017043) ENSCHYG00000016991 ENSCHYG00000016959 ENSCHYG00000016940 CUBN (ENSCHYG00000014261) RSU1 (ENSCHYG00000013881) C1QL3 (ENSCHYG00000013834) Camelidae ANCESTRAL SPECIES 152 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a Arabian camel MODERN SPECIES 28 ENSCDRG00005008514 GPR158 (ENSCDRG00005008574) ENSCDRG00005008599 ENSCDRG00005008660 MYO3A (ENSCDRG00005008724) ENSCDRG00005009230 ENSCDRG00005009271 GAD2 (ENSCDRG00005009327) APBB1IP (ENSCDRG00005009629) PDSS1 (ENSCDRG00005009781) ABI1 (ENSCDRG00005010036) ACBD5 (ENSCDRG00005011208) MASTL (ENSCDRG00005011932) YME1L1 (ENSCDRG00005012057) ENSCDRG00005012217 NSUN6 (ENSCDRG00005012397) #22 CACNB2 (ENSCDRG00005012541) ENSCDRG00005013694 ENSCDRG00005013717 ENSCDRG00005013781 THNSL1 (ENSCDRG00005013900) ENKUR (ENSCDRG00005013924) PRTFDC1 (ENSCDRG00005014044) ARHGAP21 (ENSCDRG00005014230) KIAA1217 (ENSCDRG00005014673) ENSCDRG00005017086 ENSCDRG00005017123 ENSCDRG00005017148 ENSCDRG00005017172 ENSCDRG00005017197 ENSCDRG00005017205 Alpaca MODERN SPECIES 1676 NSUN6 (ENSVPAG00000010144) #22 CACNB2 (ENSVPAG00000010142) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000161000 ENSGT00940000161673 ENSGT00940000157476 ENSGT00940000156508 ENSGT00900000141099 ENSGT00940000156042 ENSGT00390000015971 ENSGT00940000156678 ENSGT00940000157711 ENSGT00940000153451.a.b ENSGT00940000156390 ENSGT00440000033408.a ENSGT00940000158809.g.a.b ENSGT00940000165398 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b ENSGT00390000015525 ENSGT00940000157171 ENSGT00530000062962.a.b ENSGT01030000234535.B ENSGT00940000156146 ENSGT00390000016416 ENSGT00940000155299.A ENSGT00940000158676 ENSGT00940000161639 ENSGT00390000006960 ENSGT00940000155958 ENSGT00940000156737 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 1481 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a Sloth MODERN SPECIES 5373 ENSCHOG00000006503 #22 ENSCHOG00000006483 Armadillo MODERN SPECIES 2465 ARL5B (ENSDNOG00000010331) NSUN6 (ENSDNOG00000014162) #22 ENSDNOG00000045762 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000003836 ENSGT00940000161000 ENSGT00940000161673 ENSGT00940000157476 ENSGT00940000156508 ENSGT00900000141099 ENSGT00940000156042 ENSGT00390000015971 ENSGT00940000156678 ENSGT00940000157711 ENSGT00940000153451.a.b ENSGT00940000156390 ENSGT00440000033408.a ENSGT00940000165398 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b ENSGT00390000015525 ENSGT00940000157171 ENSGT00530000062962.a.b ENSGT01030000234535.B ENSGT00940000156146 ENSGT00390000016416 ENSGT00940000155299.A ENSGT00940000158676 ENSGT00940000161639 ENSGT00390000006960 ENSGT00940000155958 ENSGT00940000156737 Tenrec MODERN SPECIES 5853 NSUN6 (ENSETEG00000020201) #22 CACNB2 (ENSETEG00000020199) Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000003836 ENSGT00940000161000 ENSGT00940000161673 ENSGT00940000157476 ENSGT00940000156508 ENSGT00900000141099 ENSGT00940000156042 ENSGT00390000015971 ENSGT00940000156678 ENSGT00940000157711 ENSGT00940000153451.a.b ENSGT00940000156390 ENSGT00440000033408.a ENSGT00940000165398 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b ENSGT00390000015525 ENSGT00940000157171 ENSGT00530000062962.a.b ENSGT01030000234535.B ENSGT00940000156146 ENSGT00390000016416 ENSGT00940000155299.A ENSGT00940000158676 ENSGT00940000161639 ENSGT00390000006960 ENSGT00940000155958 ENSGT00940000156737 Elephant MODERN SPECIES 108 ENSLAFG00000009109 PTF1A 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ENSGT00940000155299.A ENSGT00940000158676 ENSGT00940000161639 ENSGT00390000006960 ENSGT00940000155958.d Tasmanian devil DUPLICATION Tasmanian devil MODERN SPECIES 4 PTF1A (ENSSHAG00000021518) ENSSHAG00000022275 ARMC3 (ENSSHAG00000007940) PIP4K2A (ENSSHAG00000024186) SPAG6 (ENSSHAG00000012425) BMI1 (ENSSHAG00000021675) COMMD3 (ENSSHAG00000027425) DNAJC1 (ENSSHAG00000014587) MLLT10 (ENSSHAG00000015106) SKIDA1 (ENSSHAG00000015799) NEBL (ENSSHAG00000017199) PLXDC2 (ENSSHAG00000020724) ENSSHAG00000024169 ENSSHAG00000032181 ARL5B (ENSSHAG00000027950) NSUN6 (ENSSHAG00000008315) #22 CACNB2 (ENSSHAG00000025230) SLC39A12 (ENSSHAG00000011792) MRC1 (ENSSHAG00000012471) STAM (ENSSHAG00000013302) HACD1 (ENSSHAG00000031104) ST8SIA6 (ENSSHAG00000026405) VIM (ENSSHAG00000022351) TRDMT1 (ENSSHAG00000030773) CUBN (ENSSHAG00000015092) RSU1 (ENSSHAG00000001959) C1QL3 (ENSSHAG00000029157) PTER (ENSSHAG00000007299) MINDY3 (ENSSHAG00000012259) ITGA8 (ENSSHAG00000012975) FAM171A1 (ENSSHAG00000014851) Tasmanian devil MODERN SPECIES 4 USP5 (ENSSHAG00000016035) GNB3 (ENSSHAG00000016006) #8 P3H3 (ENSSHAG00000015960) #9 GPR162 (ENSSHAG00000015934) #10 ENSSHAG00000015840 #11 ENSSHAG00000015690 #12 ENSSHAG00000024269 MLF2 (ENSSHAG00000028020) #14 COPS7A (ENSSHAG00000015469) #15 PIANP (ENSSHAG00000015440) #16 ZNF384 (ENSSHAG00000025785) #17 ING4 (ENSSHAG00000015278) #18 LPAR5 (ENSSHAG00000015208) #20 ENSSHAG00000015251 #19 ENSSHAG00000015079 #21 ENSSHAG00000031410 #22 IFFO1 (ENSSHAG00000027937) #23 ENSSHAG00000014953 ##24 NCAPD2 (ENSSHAG00000014814) #25 ENSSHAG00000029190 #26 ENSSHAG00000014740 #31 LTBR (ENSSHAG00000028116) #34 SCNN1A (ENSSHAG00000014354) #35 PLEKHG6 (ENSSHAG00000014065) #37 CD9 (ENSSHAG00000013749) VWF (ENSSHAG00000012094) ENSSHAG00000026710 ANO2 (ENSSHAG00000030277) NTF3 (ENSSHAG00000006721) KCNA5 (ENSSHAG00000011548) KCNA1 (ENSSHAG00000031762) Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000161000 ENSGT00940000161673 ENSGT00940000157476 ENSGT00940000156508 ENSGT00900000141099 ENSGT00940000156042 ENSGT00390000015971 ENSGT00940000156678 ENSGT00940000157711 ENSGT00940000153451.a.b ENSGT00940000154775.c.b ENSGT00940000156390 ENSGT00440000033408.a ENSGT00940000158809 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b ENSGT00390000015525 ENSGT00940000157171 ENSGT00530000062962.a.b ENSGT01030000234535.B ENSGT00940000156146 ENSGT00390000016416 ENSGT00910000145890 ENSGT00940000155299.A ENSGT00940000158676 ENSGT00940000161639 ENSGT00940000155958.d ENSGT00940000156737 Wallaby MODERN SPECIES 7286 NSUN6 (ENSMEUG00000005251) #22 CACNB2 (ENSMEUG00000005234) Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000161000 ENSGT00940000161673 ENSGT00940000157476 ENSGT00940000156508 ENSGT00900000141099 ENSGT00940000156042 ENSGT00390000015971 ENSGT00940000156678 ENSGT00940000157711 ENSGT00940000153451.a.b ENSGT00940000154775.c.b ENSGT00940000156390 ENSGT00440000033408.a ENSGT00940000158809 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b ENSGT00390000015525 ENSGT00940000157171 ENSGT00530000062962.a.b ENSGT01030000234535.B ENSGT00940000156146 ENSGT00390000016416 ENSGT00910000145890 ENSGT00940000155299.A ENSGT00940000158676 ENSGT00940000161639 ENSGT00940000155958.d ENSGT00940000156737 koala MODERN SPECIES 168 PIP4K2A (ENSPCIG00000025655) SPAG6 (ENSPCIG00000025652) BMI1 (ENSPCIG00000015159) COMMD3 (ENSPCIG00000015165) DNAJC1 (ENSPCIG00000025684) MLLT10 (ENSPCIG00000025692) SKIDA1 (ENSPCIG00000025701) ENSPCIG00000026966 NEBL (ENSPCIG00000008919) ENSPCIG00000008922 PLXDC2 (ENSPCIG00000008924) MALRD1 (ENSPCIG00000008927) ARL5B (ENSPCIG00000008947) NSUN6 (ENSPCIG00000008953) #22 CACNB2 (ENSPCIG00000008958) SLC39A12 (ENSPCIG00000021044) MRC1 (ENSPCIG00000021043) TMEM236 (ENSPCIG00000009698) STAM (ENSPCIG00000021041) ENSPCIG00000021038 ST8SIA6 (ENSPCIG00000021035) VIM (ENSPCIG00000021032) TRDMT1 (ENSPCIG00000021030) ENSPCIG00000021029 ENSPCIG00000021019 RSU1 (ENSPCIG00000021017) C1QL3 (ENSPCIG00000021016) Common wonbat MODERN SPECIES 329 PTF1A (ENSVURG00010023277) MSRB2 (ENSVURG00010023274) ARMC3 (ENSVURG00010023270) PIP4K2A (ENSVURG00010023266) SPAG6 (ENSVURG00010023262) BMI1 (ENSVURG00010023258) COMMD3 (ENSVURG00010023256) DNAJC1 (ENSVURG00010023254) MLLT10 (ENSVURG00010023240) SKIDA1 (ENSVURG00010023237) NEBL (ENSVURG00010023232) PLXDC2 (ENSVURG00010023231) ENSVURG00010023230 MALRD1 (ENSVURG00010023217) ARL5B (ENSVURG00010023212) NSUN6 (ENSVURG00010023209) #22 CACNB2 (ENSVURG00010023195) SLC39A12 (ENSVURG00010023181) MRC1 (ENSVURG00010023171) TMEM236 (ENSVURG00010023167) STAM (ENSVURG00010023162) HACD1 (ENSVURG00010023159) ST8SIA6 (ENSVURG00010023156) VIM (ENSVURG00010023151) TRDMT1 (ENSVURG00010023147) CUBN (ENSVURG00010023102) RSU1 (ENSVURG00010023079) C1QL3 (ENSVURG00010023075) MINDY3 (ENSVURG00010023070) ITGA8 (ENSVURG00010023059) FAM171A1 (ENSVURG00010023047) Platypus MODERN SPECIES 4 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Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000161000 ENSGT00940000161673 ENSGT00940000157476 ENSGT00940000156508 ENSGT00900000141099 ENSGT00940000156042 ENSGT00390000015971 ENSGT00940000156678 ENSGT00940000157711 ENSGT00940000153451.a.b ENSGT00940000154775.c.b ENSGT00940000156390 ENSGT00440000033408.a ENSGT00940000158809 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.a.a.a.a.b ENSGT01050000244842.a.a.a.a.a.b ENSGT01050000244842.a.a.a.a.a.a.a ENSGT01050000244842.a.a.a.a.b ENSGT01050000244842.a.a.a.b ENSGT00940000157171 ENSGT00530000062962.a.b ENSGT01030000234535.B ENSGT00940000156146 ENSGT00390000016416 ENSGT00940000155299.A ENSGT00940000158676 ENSGT00940000161639 Emydidae ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000161000 ENSGT00940000161673 ENSGT00940000157476 ENSGT00940000156508 ENSGT00900000141099 ENSGT00940000156042 ENSGT00390000015971 ENSGT00940000156678 ENSGT00940000157711 ENSGT00940000153451.a.b ENSGT00940000154775.c.b 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ENSGT00940000160483.k.b.c ENSGT00390000013315.a.b Goldfish MODERN SPECIES 47 PPARGC1A (ENSCARG00000063351) dhx15 (ENSCARG00000063047) sod3a (ENSCARG00000063009) ENSCARG00000062973 lgi2a (ENSCARG00000062932) ENSCARG00000062925 ppp1r15a (ENSCARG00000062920) ACER2 (ENSCARG00000062899) tyms (ENSCARG00000062865) adcyap1a (ENSCARG00000062847) SMCHD1 (ENSCARG00000060669) ENSCARG00000060513 MYOM1 (ENSCARG00000054786) myl12.1 (ENSCARG00000054533) ENSCARG00000054524 ENSCARG00000054374 #22 cacnb2a (ENSCARG00000047584) lrp4 (ENSCARG00000045769) psmd9 (ENSCARG00000045701) ywhae2 (ENSCARG00000045609) ENSCARG00000045529 RASGRP2 (ENSCARG00000044820) slc35c1 (ENSCARG00000044803) tollip (ENSCARG00000044691) ENSCARG00000044658 ENSCARG00000044646 ENSCARG00000044632 ENSCARG00000044608 ENSCARG00000044435 ENSCARG00000044376 HECTD4 (ENSCARG00000039804) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 141 ENSGT00940000165054.A.b ENSGT00940000157294.d.k.b ENSGT00390000007332.h ENSGT00940000165054.A.a.a ENSGT00940000157294.d.k.a 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ENSCCRG00000040510 MYOM1 (ENSCCRG00000044425) myl12.1 (ENSCCRG00000029974) ENSCCRG00000054700 #22 cacnb2a (ENSCCRG00000054723) lrp4 (ENSCCRG00000016152) psmd9 (ENSCCRG00000003936) ywhae2 (ENSCCRG00000061887) ENSCCRG00000003971 ENSCCRG00000040406 ENSCCRG00000075515 slc35c1 (ENSCCRG00000067739) tollip (ENSCCRG00000020513) ENSCCRG00000056257 ENSCCRG00000071859 ENSCCRG00000082617 ENSCCRG00000074248 ENSCCRG00000073285 mrpl21 (ENSCCRG00000000488) Golden-line barbel MODERN SPECIES 299 dhx15 (ENSSGRG00000029505) sod3a (ENSSGRG00000029821) sod3a (ENSSGRG00000029823) lgi2a (ENSSGRG00000029827) sepsecs (ENSSGRG00000029828) ACO1 (ENSSGRG00000029950) ENSSGRG00000030229 ppp1r15a (ENSSGRG00000030230) ENSSGRG00000030231 adcyap1a (ENSSGRG00000030233) adcyap1a (ENSSGRG00000030240) SMCHD1 (ENSSGRG00000030256) ENSSGRG00000030310 MYOM1 (ENSSGRG00000030320) myl12.1 (ENSSGRG00000030663) ENSSGRG00000030728 #22 ENSSGRG00000030733 ENSSGRG00000030735 lrp4 (ENSSGRG00000030740) ENSSGRG00000030900 SIPA1 (ENSSGRG00000030902) RASGRP2 (ENSSGRG00000031059) slc35c1 (ENSSGRG00000031067) tollip (ENSSGRG00000031069) ENSSGRG00000031072 ENSSGRG00000031074 ENSSGRG00000031076 ENSSGRG00000031079 ENSSGRG00000031082 Zebrafish MODERN SPECIES 22 ccdc149a (ENSDARG00000078829) ENSDARG00000087767 lgi2a (ENSDARG00000111069) sepsecs (ENSDARG00000033861) ACO1 (ENSDARG00000026376) ENSDARG00000101240 ppp1r15a (ENSDARG00000069135) ACER2 (ENSDARG00000077782) tyms (ENSDARG00000042894) adcyap1a (ENSDARG00000004015) METTL4 (ENSDARG00000088999) SMCHD1 (ENSDARG00000104374) ENSDARG00000102178 MYOM1 (ENSDARG00000104836) myl12.1 (ENSDARG00000099766) NSUN6 (ENSDARG00000103478) #22 cacnb2a (ENSDARG00000099045) ENSDARG00000116356 lrp4 (ENSDARG00000116353) psmd9 (ENSDARG00000006300) ywhae2 (ENSDARG00000017014) ENSDARG00000041086 SIPA1 (ENSDARG00000076697) RASGRP2 (ENSDARG00000099092) ENSDARG00000102247 slc35c1 (ENSDARG00000104669) tollip (ENSDARG00000098486) ENSDARG00000099470 ENSDARG00000104914 ENSDARG00000109688 ENSDARG00000105490 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 103 ENSGT00940000153725.a.b.b ENSGT00940000158957 ENSGT00940000153694.B ENSGT00530000063843.b ENSGT00530000063834.e.a ENSGT00940000155633.D ENSGT01050000244890.a.b.b.d ENSGT00630000089910 ENSGT01050000244857.B.a ENSGT00940000158945.u.a ENSGT00940000156325 ENSGT00440000033408.a.a ENSGT00940000165597 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a ENSGT00390000015525.a ENSGT00530000062962.a.b ENSGT00950000183074.A.a.a ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786 ENSGT00390000014290 ENSGT00940000154920.bb.a ENSGT00950000183154.b.a.b ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950 ENSGT01030000234633.B.a.c ENSGT00940000156313.c.a Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 64 ENSGT01060000248762 ENSGT00940000153725.a.b.b ENSGT00940000158957 ENSGT00940000153694.B ENSGT00530000063843.b ENSGT00530000063834.e.a ENSGT00940000155633.D ENSGT01050000244890.a.b.b.d ENSGT00630000089910 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(ENSPNAG00000008135) enosf1 (ENSPNAG00000008121) YES1 (ENSPNAG00000000667) Electric eel MODERN SPECIES 332 KIF9 (ENSEEEG00000024642) ENSEEEG00000024643 rgs9bp (ENSEEEG00000024644) zgc:165532 (ENSEEEG00000024645) dph2 (ENSEEEG00000024646) ncf2 (ENSEEEG00000024649) garem (ENSEEEG00000024650) PRKDC (ENSEEEG00000024659) CHPF2 (ENSEEEG00000024669) smarcd3b (ENSEEEG00000000561) NFX1 (ENSEEEG00000001529) plxdc2b (ENSEEEG00000001539) malrd1 (ENSEEEG00000001543) ENSEEEG00000001549 arl8 (ENSEEEG00000001552) NSUN6 (ENSEEEG00000001553) #22 cacnb2a (ENSEEEG00000001556) ENSEEEG00000001587 MRC1 (ENSEEEG00000001628) Channel catfish MODERN SPECIES 26 scrib (ENSIPUG00000004763) ENSIPUG00000005258 rgs9bp (ENSIPUG00000005293) zgc:165532 (ENSIPUG00000005301) dph2 (ENSIPUG00000005314) ncf2 (ENSIPUG00000005331) garem (ENSIPUG00000005369) PRKDC (ENSIPUG00000005438) Abcf2-1 (ENSIPUG00000005806) chpf2 (ENSIPUG00000005872) Smarcd3 (ENSIPUG00000005904) NFX1 (ENSIPUG00000005961) Plxdc2 (ENSIPUG00000006018) malrd1 (ENSIPUG00000006079) arl5b (ENSIPUG00000006168) nsun6 (ENSIPUG00000006281) #22 cacnb2 (ENSIPUG00000006349) ENSIPUG00000006447 mrc1 (ENSIPUG00000006475) TMEM236 (ENSIPUG00000006544) hacd1 (ENSIPUG00000006557) colec12 (ENSIPUG00000006596) tyms (ENSIPUG00000006627) enosf1 (ENSIPUG00000006647) adcyap1a (ENSIPUG00000006776) mettl4 (ENSIPUG00000006797) SMCHD1 (ENSIPUG00000006819) ENSIPUG00000006908 ENSIPUG00000006922 psmb5 (ENSIPUG00000006941) ENSIPUG00000006975 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 350 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a ENSGT00390000015525.a ENSGT00530000062962.a.b ENSGT00950000183074.A.a.a ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786 ENSGT00390000014290 ENSGT00950000183154.b.a.b ENSGT01060000248592.A.a ENSGT01030000234627.a.a.c ENSGT00390000014737 ENSGT00510000048685.g.a ENSGT00950000183191.a.b Denticle herring MODERN SPECIES 11 ENSDCDG00000018908 OAF (ENSDCDG00000018904) tlcd5a (ENSDCDG00000018902) alcamb (ENSDCDG00000018834) dyrk1ab (ENSDCDG00000018807) thap12b (ENSDCDG00000018803) zgc:112083 (ENSDCDG00000018779) gkup (ENSDCDG00000018774) ENSDCDG00000018767 ZPLD1 (ENSDCDG00000018760) picalmb (ENSDCDG00000018743) ENSDCDG00000018711 ENSDCDG00000018641 hspa8b (ENSDCDG00000017795) lim2.3 (ENSDCDG00000017773) NSUN6 (ENSDCDG00000017772) #22 cacnb2a (ENSDCDG00000017316) zgc:165518 (ENSDCDG00000015437) MRC1 (ENSDCDG00000014996) TMEM236 (ENSDCDG00000014944) hacd1 (ENSDCDG00000014942) COLEC12 (ENSDCDG00000014940) ENSDCDG00000014936 tyms (ENSDCDG00000014932) enosf1 (ENSDCDG00000014928) adcyap1a (ENSDCDG00000014925) ENSDCDG00000014922 bud23 (ENSDCDG00000014918) SH2B2 (ENSDCDG00000014916) ENSDCDG00000013318 endou (ENSDCDG00000013240) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00510000049635 ENSGT00940000156098.a ENSGT01100000263537.b.a.a.b.b ENSGT00940000156398 ENSGT00940000156177 ENSGT00940000160993 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a ENSGT00950000183138.a.a.b.u ENSGT00390000005489 ENSGT00730000111180 ENSGT00940000159257 ENSGT00940000162556.B ENSGT00440000033408.a.a ENSGT00940000165597 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a ENSGT00390000015525.a ENSGT00530000062962.a.b ENSGT00950000183074.A.a.a ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786 ENSGT00390000014290 ENSGT00940000154920.bb.b ENSGT00950000183154.b.a.a.a ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950 ENSGT01030000234633.B.a.c ENSGT00940000156313.c.a Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00940000156098.a ENSGT01100000263537.b.a.a.b.b ENSGT00940000156398.f ENSGT00940000156177 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a ENSGT00940000160993 ENSGT00940000164390.e ENSGT00950000183138.a.a.b.u ENSGT00390000005489 ENSGT00730000111180 ENSGT00940000159257 ENSGT00940000162556.B ENSGT00440000033408.a.a ENSGT00940000165597 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a ENSGT00390000015525.a ENSGT00530000062962.a.b ENSGT00950000183074.A.a.a ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786 ENSGT00390000014290 ENSGT00940000154920.bb.b ENSGT00950000183154.b.a.a.a ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950 ENSGT01030000234633.B.a.c ENSGT00940000156313.c.a Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 88 ENSGT00940000156098.a.i ENSGT01100000263537.b.a.a.b.b.a ENSGT00940000156398.f ENSGT00940000156177.e ENSGT01010000230021 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000164390.e ENSGT00950000183138.a.a.b.u.c.b.b ENSGT00390000005489.d ENSGT00730000111180 ENSGT00940000159257 ENSGT00940000162556.B.d ENSGT00440000033408.a.a.a ENSGT00940000165597 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370.c #22 ENSGT00950000182837.a.b.a.k ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a.d ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a.c ENSGT00390000015525.a.b ENSGT00530000062962.a.b.e ENSGT00950000183074.A.a.a.b ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786.c ENSGT00940000154920.bb.b.c ENSGT00950000183154.b.a.a.a.b ENSGT00940000167904.b ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950.i ENSGT01030000234633.B.a.c.b Huchen MODERN SPECIES 506 ENSHHUG00000012489 ENSHHUG00000012461 CSNK1E (ENSHHUG00000012417) tmem184ba (ENSHHUG00000012414) maff (ENSHHUG00000012405) tomm22 (ENSHHUG00000012398) dmc1 (ENSHHUG00000012217) gspt1 (ENSHHUG00000011817) rsl1d1 (ENSHHUG00000011788) SNX29 (ENSHHUG00000011769) shisa9a (ENSHHUG00000011762) ENSHHUG00000011755 malrd1 (ENSHHUG00000011741) ENSHHUG00000011734 arl8 (ENSHHUG00000011716) NSUN6 (ENSHHUG00000011686) #22 CACNB2 (ENSHHUG00000011384) ENSHHUG00000011358 MRC1 (ENSHHUG00000011331) MRC1 (ENSHHUG00000011291) TMEM236 (ENSHHUG00000011276) hacd1 (ENSHHUG00000011262) COLEC12 (ENSHHUG00000011244) CLUL1 (ENSHHUG00000011214) tyms (ENSHHUG00000011139) YES1 (ENSHHUG00000010621) ADCYAP1 (ENSHHUG00000010589) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 69 ENSGT01100000263537.b.a.a.b.b.a ENSGT00940000156398.f ENSGT00940000156177.e ENSGT01010000230021 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000164390.e ENSGT00950000183138.a.a.b.u.c.b.b ENSGT00390000005489.d ENSGT00730000111180 ENSGT00940000159257 ENSGT00940000162556.B.d ENSGT00440000033408.a.a.a ENSGT00940000165597 ENSGT00940000157567 ENSGT00950000182996.b.a.a.a.b ENSGT00940000155370.c #22 ENSGT00950000182837.a.b.a.k ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a.c ENSGT00390000015525.a.b ENSGT00530000062962.a.b.e ENSGT00950000183074.A.a.a.b ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786.c ENSGT00940000154920.bb.b.c ENSGT00950000183154.b.a.a.a.b ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950.i ENSGT01030000234633.B.a.c.b ENSGT00940000156313.c.a.b ENSGT00940000154982.c.a Salmo ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01100000263537.b.a.a.b.b.a ENSGT00940000156398.f ENSGT00940000156177.e ENSGT01010000230021 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000164390.e ENSGT00950000183138.a.a.b.u.c.b.b ENSGT00390000005489.d ENSGT00730000111180 ENSGT00940000159257 ENSGT00940000162556.B.d ENSGT00440000033408.a.a.a ENSGT00940000165597 ENSGT00940000157567 ENSGT00950000182996.b.a.a.a.b ENSGT00940000155370.c #22 ENSGT00950000182837.a.b.a.k ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a.c ENSGT00390000015525.a.b ENSGT00530000062962.a.b.e ENSGT00950000183074.A.a.a.b ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786.c ENSGT00940000154920.bb.b.c ENSGT00950000183154.b.a.a.a.b ENSGT00940000167904.b ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950.i ENSGT01030000234633.B.a.c.b ENSGT00940000156313.c.a.b River trout MODERN SPECIES 36 ENSSTUG00000005584 nphp3 (ENSSTUG00000005328) uba5 (ENSSTUG00000004994) ackr4b (ENSSTUG00000004981) ENSSTUG00000004963 myripb (ENSSTUG00000004935) ENSSTUG00000004930 zfand1 (ENSSTUG00000004890) chmp4c (ENSSTUG00000004876) ENSSTUG00000004860 plxdc2b (ENSSTUG00000004524) malrd1 (ENSSTUG00000003570) ENSSTUG00000003475 arl8 (ENSSTUG00000003450) ENSSTUG00000003428 NSUN6 (ENSSTUG00000003360) #22 CACNB2 (ENSSTUG00000003138) SLC39A12 (ENSSTUG00000003109) MRC1 (ENSSTUG00000000974) TMEM236 (ENSSTUG00000000804) hacd1 (ENSSTUG00000000800) COLEC12 (ENSSTUG00000000793) CLUL1 (ENSSTUG00000000375) tyms (ENSSTUG00000000198) YES1 (ENSSTUG00000042693) ADCYAP1 (ENSSTUG00000042588) ENSSTUG00000042579 ENSSTUG00000042565 METTL4 (ENSSTUG00000042549) SMCHD1 (ENSSTUG00000041432) EMILIN2 (ENSSTUG00000041395) Atlantic salmon MODERN SPECIES 21 ENSSSAG00000069243 nphp3 (ENSSSAG00000069282) ENSSSAG00000070074 uba5 (ENSSSAG00000099237) ENSSSAG00000099495 ENSSSAG00000070347 ackr4b (ENSSSAG00000119256) ENSSSAG00000070345 ENSSSAG00000070358 zfand1 (ENSSSAG00000070361) ENSSSAG00000070377 plxdc2b (ENSSSAG00000070397) malrd1 (ENSSSAG00000070649) arl8 (ENSSSAG00000108044) ENSSSAG00000070996 NSUN6 (ENSSSAG00000071007) #22 cacnb2a (ENSSSAG00000071149) SLC39A12 (ENSSSAG00000073552) mrc1 (ENSSSAG00000073565) TMEM236 (ENSSSAG00000112518) HACD1 (ENSSSAG00000073829) COLEC12 (ENSSSAG00000073837) clul1 (ENSSSAG00000073840) tyms (ENSSSAG00000073844) YES1 (ENSSSAG00000073876) ADCYAP1 (ENSSSAG00000074440) ENSSSAG00000074443 mettl4 (ENSSSAG00000074445) SMCHD1 (ENSSSAG00000074510) EMILIN2 (ENSSSAG00000087562) LPIN2 (ENSSSAG00000075262) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000156098.a.i ENSGT01100000263537.b.a.a.b.b.a ENSGT00940000156398.f ENSGT00940000156177.e ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000164390.e ENSGT00950000183138.a.a.b.u.c.b.b ENSGT00390000005489.d ENSGT00730000111180.m ENSGT00940000159257 ENSGT00940000162556.B.d ENSGT00440000033408.a.a.a ENSGT00940000165597 ENSGT00940000157567 ENSGT00950000182996.b.a.a.a.b ENSGT00940000155370.c #22 ENSGT00950000182837.a.b.a.k ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a.c ENSGT00390000015525.a.b ENSGT00530000062962.a.b.e ENSGT00950000183074.A.a.a.b ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786.c ENSGT00940000154920.bb.b.c ENSGT00950000183154.b.a.a.a.b ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950.i ENSGT01030000234633.B.a.c.b ENSGT00940000156313.c.a.b ENSGT00940000154982.c.a Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000156098.a.i ENSGT01100000263537.b.a.a.b.b.a ENSGT00940000156398.f ENSGT00940000156177.e ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000164390.e ENSGT00950000183138.a.a.b.u.c.b.b ENSGT00390000005489.d ENSGT00730000111180.m ENSGT00940000159257 ENSGT00940000162556.B.d ENSGT00440000033408.a.a.a ENSGT00940000165597 ENSGT00940000157567 ENSGT00950000182996.b.a.a.a.b ENSGT00940000155370.c #22 ENSGT00950000182837.a.b.a.k ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a.c ENSGT00390000015525.a.b ENSGT00530000062962.a.b.e ENSGT00950000183074.A.a.a.b ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00940000154920.bb.b.c ENSGT00950000183154.b.a.a.a.b ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950.i ENSGT01030000234633.B.a.c.b ENSGT00940000156313.c.a.b ENSGT00940000154982.c.a ENSGT00940000155458.k Coho salmon MODERN SPECIES 2 ENSOKIG00005032588 ENSOKIG00005032721 nphp3 (ENSOKIG00005032755) uba5 (ENSOKIG00005033004) ackr4b (ENSOKIG00005033132) ENSOKIG00005033143 myripb (ENSOKIG00005033214) ENSOKIG00005033234 zfand1 (ENSOKIG00005033245) chmp4c (ENSOKIG00005033290) ENSOKIG00005033315 plxdc2b (ENSOKIG00005033358) malrd1 (ENSOKIG00005034117) arl8 (ENSOKIG00005034717) ENSOKIG00005034735 NSUN6 (ENSOKIG00005034747) #22 CACNB2 (ENSOKIG00005035065) ENSOKIG00005038491 SLC39A12 (ENSOKIG00005038526) MRC1 (ENSOKIG00005038628) TMEM236 (ENSOKIG00005040363) HACD1 (ENSOKIG00005040374) COLEC12 (ENSOKIG00005040408) ENSOKIG00005040436 YES1 (ENSOKIG00005040587) ADCYAP1 (ENSOKIG00005043513) METTL4 (ENSOKIG00005043558) SMCHD1 (ENSOKIG00005043887) EMILIN2 (ENSOKIG00005045397) LPIN2 (ENSOKIG00005045445) MYOM1 (ENSOKIG00005045559) Chinook salmon MODERN SPECIES 21 ENSOTSG00005008917 ENSOTSG00005008910 nphp3 (ENSOTSG00005008108) uba5 (ENSOTSG00005007935) ackr4b (ENSOTSG00005007933) ugt2b5 (ENSOTSG00005007932) myripb (ENSOTSG00005007931) ENSOTSG00005007930 ENSOTSG00005007929 zfand1 (ENSOTSG00005007927) chmp4c (ENSOTSG00005007923) ENSOTSG00005007921 plxdc2b (ENSOTSG00005005120) malrd1 (ENSOTSG00005003154) arl8 (ENSOTSG00005002769) NSUN6 (ENSOTSG00005002715) #22 CACNB2 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(ENSOMYG00000018421) CLUL1 (ENSOMYG00000018391) tyms (ENSOMYG00000018372) YES1 (ENSOMYG00000017136) ADCYAP1 (ENSOMYG00000017026) METTL4 (ENSOMYG00000023827) SMCHD1 (ENSOMYG00000022813) EMILIN2 (ENSOMYG00000022516) LPIN2 (ENSOMYG00000022219) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 827 ENSGT00940000155370.d #22 ENSGT00950000182837.a.b.a.l ENSGT00390000015525.a.a ENSGT00530000062962.a.b.f ENSGT00950000183074.A.a.a.a ENSGT00390000014786.d ENSGT00390000014290 ENSGT00940000154920.bb.b.d ENSGT00950000183154.b.a.a.a.a Huchen MODERN SPECIES 1890 ENSHHUG00000024622 #22 CACNB2 (ENSHHUG00000023711) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00580000081600.c.a.c ENSGT01010000222287.B.a.b.a.l ENSGT00940000164547.b.a.h ENSGT00940000156220.k.a ENSGT00940000155230.e.a ENSGT00510000049635.d ENSGT00940000156098.a.j ENSGT01100000263537.b.a.a.b.b.b ENSGT00940000156177.f ENSGT00940000160993 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b.u.c.b.a ENSGT00390000005489.c ENSGT00940000162556.B.c ENSGT00440000033408.a.a.b ENSGT00940000155370.d #22 ENSGT00950000182837.a.b.a.l ENSGT00390000015525.a.a ENSGT00530000062962.a.b.f ENSGT00950000183074.A.a.a.a ENSGT00390000014786.d ENSGT00390000014290 ENSGT00940000154920.bb.b.d ENSGT00950000183154.b.a.a.a.a ENSGT00390000006950.j ENSGT01030000234633.B.a.c.a ENSGT00940000156313.c.a.a ENSGT00940000154982.c.b ENSGT00940000153607.a.b ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c.b Salmo ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01010000222287.B.a.b.a.l ENSGT00940000164547.b.a.h ENSGT00940000156220.k.a ENSGT00940000155230.e.a ENSGT00510000049635.d ENSGT00940000156098.a.j ENSGT01100000263537.b.a.a.b.b.b ENSGT00940000156177.f ENSGT00940000160993 ENSGT01030000234667.a.a.a.b.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b.u.c.a.a ENSGT00950000183138.a.a.b.u.c.b.a ENSGT00390000005489.c ENSGT00940000162556.B.c ENSGT00440000033408.a.a.b ENSGT00940000155370.d #22 ENSGT00950000182837.a.b.a.l ENSGT00390000015525.a.a ENSGT00530000062962.a.b.f ENSGT00950000183074.A.a.a.a ENSGT00970000193390.c.a.b.a.b ENSGT00390000014786.d ENSGT00390000014290 ENSGT00940000154920.bb.b.d ENSGT00950000183154.b.a.a.a.a ENSGT00390000006950.j ENSGT01030000234633.B.a.c.a ENSGT00940000156313.c.a.a ENSGT00940000154982.c.b ENSGT00940000153607.a.b ENSGT01030000234607.A.a.a.a.c.b Atlantic salmon MODERN SPECIES 10 ENSSSAG00000065775 HTR5A (ENSSSAG00000060915) ENSSSAG00000061192 ENSSSAG00000092337 tgif1 (ENSSSAG00000101993) ENSSSAG00000061254 ENSSSAG00000061293 ENSSSAG00000108151 ENSSSAG00000062871 ENSSSAG00000061717 ackr4b (ENSSSAG00000063130) ENSSSAG00000063147 ENSSSAG00000063161 ENSSSAG00000063280 PLXDC2 (ENSSSAG00000063291) ENSSSAG00000064158 #22 CACNB2 (ENSSSAG00000064266) ENSSSAG00000070669 ENSSSAG00000070671 ENSSSAG00000070680 ENSSSAG00000107938 ENSSSAG00000070701 TYMS (ENSSSAG00000070708) enosf1 (ENSSSAG00000070720) YES1 (ENSSSAG00000070866) ADCYAP1 (ENSSSAG00000074062) SMCHD1 (ENSSSAG00000115693) EMILIN2 (ENSSSAG00000074068) LPIN2 (ENSSSAG00000074165) ENSSSAG00000091327 MYOM1 (ENSSSAG00000076408) Northern pike MODERN SPECIES 20 ENSELUG00000009401 ENSELUG00000012602 ENSELUG00000009158 ENSELUG00000027258 ENSELUG00000009345 ENSELUG00000027846 ENSELUG00000022720 ENSELUG00000009421 ENSELUG00000022751 ENSELUG00000022764 ENSELUG00000022773 plxdc2b (ENSELUG00000022871) malrd1 (ENSELUG00000022907) arl8 (ENSELUG00000022956) ENSELUG00000032490 NSUN6 (ENSELUG00000021983) #22 CACNB2 (ENSELUG00000021961) SLC39A12 (ENSELUG00000021899) MRC1 (ENSELUG00000021836) ENSELUG00000032982 TMEM236 (ENSELUG00000008811) hacd1 (ENSELUG00000008798) ENSELUG00000001430 CLUL1 (ENSELUG00000008673) tyms (ENSELUG00000008633) enosf1 (ENSELUG00000008661) YES1 (ENSELUG00000008554) ADCYAP1 (ENSELUG00000008520) METTL4 (ENSELUG00000008466) SMCHD1 (ENSELUG00000008441) EMILIN2 (ENSELUG00000008396) Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000154095.b.a.a.b ENSGT00940000170921 ENSGT00940000154095.b.a.b ENSGT00490000043432 ENSGT00940000156086.d ENSGT00390000013743 ENSGT00940000163397 ENSGT01030000234531.B ENSGT00390000006896 ENSGT00730000111180 ENSGT00940000159257 ENSGT00940000162556.B ENSGT00440000033408.a.a ENSGT00940000165597 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a ENSGT00390000015525.a ENSGT00530000062962.a.b ENSGT00950000183074.A.a.a ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786 ENSGT00390000014290 ENSGT00940000154920.bb.b ENSGT00950000183154.b.a.a.a ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950 ENSGT01030000234633.B.a.c ENSGT00940000156313.c.a Cod MODERN SPECIES 15 ENSGMOG00000006751 plxdc2b (ENSGMOG00000004882) ENSGMOG00000027734 ENSGMOG00000002509 zfand1 (ENSGMOG00000002529) ENSGMOG00000024438 maf1b (ENSGMOG00000002546) ENSGMOG00000033195 ENSGMOG00000025033 ENSGMOG00000029194 ENSGMOG00000001664 ncapg2 (ENSGMOG00000011469) ENSGMOG00000028688 ENSGMOG00000009120 ENSGMOG00000032779 ENSGMOG00000011167 #22 ENSGMOG00000029912 ENSGMOG00000035225 ENSGMOG00000003838 ENSGMOG00000003862 ngdn (ENSGMOG00000003876) ENSGMOG00000030331 pabpn1 (ENSGMOG00000003922) ENSGMOG00000003942 thtpa (ENSGMOG00000003946) dcaf11 (ENSGMOG00000003969) ENSGMOG00000004006 psme1 (ENSGMOG00000004020) pck2 (ENSGMOG00000004056) ENSGMOG00000036219 ENSGMOG00000027436 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000154095.b.a.a.b ENSGT00940000170921 ENSGT00940000154095.b.a.b ENSGT00490000043432 ENSGT00940000156086.d ENSGT00390000013743 ENSGT00940000163397 ENSGT01030000234531.B ENSGT00390000006896 ENSGT00730000111180 ENSGT00940000159257 ENSGT00940000162556.B ENSGT00440000033408.a.a ENSGT00940000165597 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a ENSGT00390000015525.a ENSGT00530000062962.a.b ENSGT00950000183074.A.a.a ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786 ENSGT00390000014290 ENSGT00940000154920.bb.b ENSGT00950000183154.b.a.a.a ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950 ENSGT01030000234633.B.a.c ENSGT00940000156313.c.a Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 12 mnx1 (ENSMMDG00005010812) ube3c (ENSMMDG00005010784) dnajb6b (ENSMMDG00005010778) ptprn2 (ENSMMDG00005010768) ncapg2 (ENSMMDG00005010761) ESYT2 (ENSMMDG00005007951) DYNC2I1 (ENSMMDG00005007915) ENSMMDG00005007910 maf1b (ENSMMDG00005007908) zfand1 (ENSMMDG00005007906) chmp4c (ENSMMDG00005007903) ENSMMDG00005007902 plxdc2b (ENSMMDG00005007900) malrd1 (ENSMMDG00005007890) arl8 (ENSMMDG00005007886) NSUN6 (ENSMMDG00005007881) #22 cacnb2a (ENSMMDG00005007830) SLC39A12 (ENSMMDG00005007818) MRC1 (ENSMMDG00005007263) TMEM236 (ENSMMDG00005007237) hacd1 (ENSMMDG00005007235) COLEC12 (ENSMMDG00005007231) CLUL1 (ENSMMDG00005007227) tyms (ENSMMDG00005007223) enosf1 (ENSMMDG00005007166) YES1 (ENSMMDG00005003159) ADCYAP1 (ENSMMDG00005003017) METTL4 (ENSMMDG00005003006) SMCHD1 (ENSMMDG00005002853) EMILIN2 (ENSMMDG00005002780) LPIN2 (ENSMMDG00005002752) Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a ENSGT00390000015525.a ENSGT00530000062962.a.b ENSGT00950000183074.A.a.a ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786 ENSGT00390000014290 ENSGT00940000154920.bb.b ENSGT00950000183154.b.a.a.a ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950 ENSGT01030000234633.B.a.c ENSGT00940000156313.c.a Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 77 arl8 (ENSHCOG00000015779) NSUN6 (ENSHCOG00000015758) #22 cacnb2a (ENSHCOG00000015727) ENSHCOG00000015699 MRC1 (ENSHCOG00000015686) TMEM236 (ENSHCOG00000015675) hacd1 (ENSHCOG00000015665) cdv3 (ENSHCOG00000015632) scrib (ENSHCOG00000015612) puf60b (ENSHCOG00000015541) nrbp2b (ENSHCOG00000015532) ENSHCOG00000015499 ENSHCOG00000015493 slc4a2b (ENSHCOG00000015481) ENSHCOG00000015431 eif2s3 (ENSHCOG00000015356) klhl15 (ENSHCOG00000015329) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000154095.b.a.a.b ENSGT00940000170921 ENSGT00940000154095.b.a.b ENSGT00490000043432 ENSGT00940000156086.d ENSGT00390000013743 ENSGT00940000163397 ENSGT01030000234531.B ENSGT00940000165597 ENSGT00440000033408.a.a ENSGT00940000162556.B ENSGT00940000159257 ENSGT00730000111180 ENSGT00390000006896 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a ENSGT00390000015525.a ENSGT00530000062962.a.b ENSGT00950000183074.A.a.a ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786.f ENSGT00390000014290 ENSGT00940000154920.bb.b ENSGT00950000183154.b.a.a.a ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950 ENSGT01030000234633.B.a.c ENSGT00940000156313.c.a Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000156321 ENSGT00940000166388 ENSGT00940000154095.b.a.a.b ENSGT00490000043432 ENSGT00940000156086.d ENSGT00390000013743 ENSGT00940000163397 ENSGT01030000234531.B ENSGT00940000165597 ENSGT00440000033408.a.a ENSGT00940000162556.B ENSGT00940000159257 ENSGT00730000111180 ENSGT00390000006896 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a ENSGT00390000015525.a ENSGT00530000062962.a.b ENSGT00950000183074.A.a.a ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786.f ENSGT00390000014290 ENSGT00940000154920.bb.b ENSGT00950000183154.b.a.a.a ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950 ENSGT01030000234633.B.a.c ENSGT00940000156313.c.a Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000156321 ENSGT00940000166388 ENSGT00940000154095.b.a.a.b ENSGT00490000043432 ENSGT00940000156086.d ENSGT00390000013743 ENSGT00940000163397 ENSGT01030000234531.B ENSGT00940000165597 ENSGT00440000033408.a.a ENSGT00940000162556.B ENSGT00940000159257 ENSGT00730000111180 ENSGT00390000006896 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a ENSGT00390000015525.a ENSGT00530000062962.a.b ENSGT00950000183074.A.a.a ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786.f ENSGT00390000014290 ENSGT00940000154920.bb.b ENSGT00950000183154.b.a.a.a ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950 ENSGT01030000234633.B.a.c ENSGT00940000156313.c.a Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000160059.a.a ENSGT00940000156321 ENSGT00940000166388 ENSGT00940000154095.b.a.a.b ENSGT00490000043432 ENSGT00940000156086.d ENSGT00390000013743 ENSGT01030000234531.B ENSGT00940000165597 ENSGT00440000033408.a.a ENSGT00940000162556.B ENSGT00940000159257 ENSGT00730000111180 ENSGT00390000006896 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a ENSGT00390000015525.a ENSGT00530000062962.a.b ENSGT00950000183074.A.a.a ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786.f ENSGT00390000014290 ENSGT00940000154920.bb.b ENSGT00950000183154.b.a.a.a ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950 ENSGT01030000234633.B.a.c ENSGT00940000156313.c.a Midas cichlid MODERN SPECIES 718 ptprn2 (ENSACIG00000017077) ncapg2 (ENSACIG00000017009) ESYT2 (ENSACIG00000016960) ENSACIG00000016865 ENSACIG00000016849 malrd1 (ENSACIG00000016783) plxdc2b (ENSACIG00000016745) ENSACIG00000016728 ENSACIG00000016725 zfand1 (ENSACIG00000016700) zfand1 (ENSACIG00000016680) arl8 (ENSACIG00000016662) NSUN6 (ENSACIG00000016632) #22 cacnb2a (ENSACIG00000016610) ENSACIG00000016590 MRC1 (ENSACIG00000016518) MRC1 (ENSACIG00000016449) TMEM236 (ENSACIG00000016436) hacd1 (ENSACIG00000016413) COLEC12 (ENSACIG00000016362) ENSACIG00000016341 tyms (ENSACIG00000016229) enosf1 (ENSACIG00000016071) YES1 (ENSACIG00000016027) ADCYAP1 (ENSACIG00000016014) METTL4 (ENSACIG00000015975) Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000160059.a.a ENSGT00940000156321 ENSGT00940000166388 ENSGT00940000154095.b.a.a.b ENSGT00490000043432 ENSGT00940000156086.d ENSGT00390000013743 ENSGT01030000234531.B ENSGT00940000165597 ENSGT00440000033408.a.a ENSGT00940000162556.B ENSGT00940000159257 ENSGT00730000111180 ENSGT00390000006896 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a ENSGT00390000015525.a ENSGT00530000062962.a.b ENSGT00950000183074.A.a.a ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786.f ENSGT00390000014290 ENSGT00940000154920.bb.b ENSGT00950000183154.b.a.a.a ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950 ENSGT01030000234633.B.a.c ENSGT00940000156313.c.a Nile tilapia MODERN SPECIES 21 mnx1 (ENSONIG00000005962) ube3c (ENSONIG00000005968) dnajb6b (ENSONIG00000005984) ptprn2 (ENSONIG00000005989) ncapg2 (ENSONIG00000005990) ESYT2 (ENSONIG00000005994) DYNC2I1 (ENSONIG00000006004) ENSONIG00000028998 malrd1 (ENSONIG00000006012) plxdc2b (ENSONIG00000006016) ENSONIG00000006023 chmp4c (ENSONIG00000006024) zfand1 (ENSONIG00000006027) maf1b (ENSONIG00000006030) arl8 (ENSONIG00000006036) NSUN6 (ENSONIG00000006038) #22 cacnb2a (ENSONIG00000006040) SLC39A12 (ENSONIG00000006057) MRC1 (ENSONIG00000006060) TMEM236 (ENSONIG00000006071) hacd1 (ENSONIG00000006072) COLEC12 (ENSONIG00000006077) CLUL1 (ENSONIG00000006081) tyms (ENSONIG00000006083) ENSONIG00000041839 enosf1 (ENSONIG00000006085) YES1 (ENSONIG00000006089) ADCYAP1 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ENSGT00940000156086.d ENSGT00390000013743 ENSGT01030000234531.B ENSGT00940000165597 ENSGT00440000033408.a.a ENSGT00940000162556.B ENSGT00940000159257 ENSGT00730000111180 ENSGT00390000006896 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a ENSGT00390000015525.a ENSGT00530000062962.a.b ENSGT00950000183074.A.a.a ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786.f ENSGT00390000014290 ENSGT00940000154920.bb.b ENSGT00950000183154.b.a.a.a ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950 ENSGT01030000234633.B.a.c ENSGT00940000156313.c.a Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1029 ENSHBUG00000008859 ENSHBUG00000008869 ENSHBUG00000008901 plxdc2b (ENSHBUG00000008940) ENSHBUG00000008959 chmp4c (ENSHBUG00000008982) zfand1 (ENSHBUG00000000226) maf1b (ENSHBUG00000000770) arl8 (ENSHBUG00000009050) NSUN6 (ENSHBUG00000009093) #22 cacnb2a (ENSHBUG00000009170) SLC39A12 (ENSHBUG00000009207) Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000160059.a.a ENSGT00940000156321 ENSGT00940000166388 ENSGT00940000154095.b.a.a.b ENSGT00490000043432 ENSGT00940000156086.d ENSGT00390000013743 ENSGT01030000234531.B ENSGT00940000165597 ENSGT00440000033408.a.a ENSGT00940000162556.B ENSGT00940000159257 ENSGT00730000111180 ENSGT00390000006896 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a ENSGT00390000015525.a ENSGT00530000062962.a.b ENSGT00950000183074.A.a.a ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786.f ENSGT00390000014290 ENSGT00940000154920.bb.b ENSGT00950000183154.b.a.a.a ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950 ENSGT01030000234633.B.a.c ENSGT00940000156313.c.a P. nyererei MODERN SPECIES 382 ENSPNYG00000000499 malrd1 (ENSPNYG00000000517) plxdc2b (ENSPNYG00000000584) zfand1 (ENSPNYG00000000596) ENSPNYG00000000610 maf1b (ENSPNYG00000000616) arl8 (ENSPNYG00000000635) NSUN6 (ENSPNYG00000000646) #22 cacnb2a (ENSPNYG00000000672) SLC39A12 (ENSPNYG00000000733) MRC1 (ENSPNYG00000000778) TMEM236 (ENSPNYG00000000884) hacd1 (ENSPNYG00000000901) COLEC12 (ENSPNYG00000000937) CLUL1 (ENSPNYG00000000946) tyms (ENSPNYG00000000985) enosf1 (ENSPNYG00000001174) YES1 (ENSPNYG00000001250) ADCYAP1 (ENSPNYG00000001296) METTL4 (ENSPNYG00000001318) SMCHD1 (ENSPNYG00000001333) EMILIN2 (ENSPNYG00000001414) LPIN2 (ENSPNYG00000001433) Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000160059.a.a ENSGT00940000156321 ENSGT00940000166388 ENSGT00940000154095.b.a.a.b ENSGT00490000043432 ENSGT00940000156086.d ENSGT00390000013743 ENSGT01030000234531.B ENSGT00940000165597 ENSGT00440000033408.a.a ENSGT00940000162556.B ENSGT00940000159257 ENSGT00730000111180 ENSGT00390000006896 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a ENSGT00390000015525.a ENSGT00530000062962.a.b ENSGT00950000183074.A.a.a ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786.f ENSGT00390000014290 ENSGT00940000154920.bb.b ENSGT00950000183154.b.a.a.a ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950 ENSGT01030000234633.B.a.c ENSGT00940000156313.c.a Zebra mbuna MODERN SPECIES 1112 mnx1 (ENSMZEG00005000443) ube3c (ENSMZEG00005000448) dnajb6b (ENSMZEG00005000535) ptprn2 (ENSMZEG00005000547) ncapg2 (ENSMZEG00005000580) ESYT2 (ENSMZEG00005000604) DYNC2I1 (ENSMZEG00005000704) ENSMZEG00005000773 malrd1 (ENSMZEG00005000804) plxdc2b (ENSMZEG00005000890) ENSMZEG00005000909 chmp4c (ENSMZEG00005000932) zfand1 (ENSMZEG00005000943) maf1b (ENSMZEG00005000951) arl8 (ENSMZEG00005000976) NSUN6 (ENSMZEG00005000999) #22 cacnb2a (ENSMZEG00005001051) SLC39A12 (ENSMZEG00005001304) MRC1 (ENSMZEG00005001317) ENSMZEG00005001364 TMEM236 (ENSMZEG00005001371) hacd1 (ENSMZEG00005001380) COLEC12 (ENSMZEG00005001401) CLUL1 (ENSMZEG00005001408) tyms (ENSMZEG00005001459) enosf1 (ENSMZEG00005001419) YES1 (ENSMZEG00005001467) ADCYAP1 (ENSMZEG00005001484) METTL4 (ENSMZEG00005001519) SMCHD1 (ENSMZEG00005001548) EMILIN2 (ENSMZEG00005001644) Eastern happy DUPLICATION Eastern happy MODERN SPECIES 21 mnx1 (ENSACLG00000000070) ube3c (ENSACLG00000000077) dnajb6b (ENSACLG00000000170) ptprn2 (ENSACLG00000000190) ncapg2 (ENSACLG00000000242) ESYT2 (ENSACLG00000000296) DYNC2I1 (ENSACLG00000000421) ENSACLG00000000478 malrd1 (ENSACLG00000000510) plxdc2b (ENSACLG00000000698) ENSACLG00000000713 chmp4c (ENSACLG00000000727) zfand1 (ENSACLG00000000740) maf1b (ENSACLG00000000767) arl8 (ENSACLG00000000787) NSUN6 (ENSACLG00000000803) #22 cacnb2a (ENSACLG00000000867) SLC39A12 (ENSACLG00000001027) MRC1 (ENSACLG00000001041) TMEM236 (ENSACLG00000001069) hacd1 (ENSACLG00000001077) COLEC12 (ENSACLG00000001101) CLUL1 (ENSACLG00000001106) tyms (ENSACLG00000001127) enosf1 (ENSACLG00000001151) YES1 (ENSACLG00000001229) ADCYAP1 (ENSACLG00000001273) METTL4 (ENSACLG00000001329) SMCHD1 (ENSACLG00000001360) EMILIN2 (ENSACLG00000001450) LPIN2 (ENSACLG00000001467) Eastern happy MODERN SPECIES 2 si:dkey-26c10.5 (ENSACLG00000023015) m6pr (ENSACLG00000023222) zgc:92606 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ENSGT00390000006896 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a ENSGT00390000015525.a ENSGT00530000062962.a.b ENSGT00950000183074.A.a.a ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786.f ENSGT00390000014290 ENSGT00940000154920.bb.b ENSGT00950000183154.b.a.a.a ENSGT01090000260132.b.a.a ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950.c ENSGT01030000234633.B.a.c Spiny chromis MODERN SPECIES 1181 arl8 (ENSAPOG00000016146) NSUN6 (ENSAPOG00000016126) #22 cacnb2a (ENSAPOG00000016048) SLC39A12 (ENSAPOG00000015381) MRC1 (ENSAPOG00000015368) TMEM236 (ENSAPOG00000015351) hacd1 (ENSAPOG00000015328) COLEC12 (ENSAPOG00000015284) ENSAPOG00000015276 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000156321 ENSGT00940000166388 ENSGT00940000154095.b.a.a.b ENSGT00490000043432 ENSGT00940000156086.d ENSGT00390000013743 ENSGT00940000163397 ENSGT01030000234531.B ENSGT00940000165597 ENSGT00440000033408.a.a ENSGT00940000162556.B ENSGT00940000159257 ENSGT00730000111180 ENSGT00390000006896 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a ENSGT00390000015525.a ENSGT00530000062962.a.b ENSGT00950000183074.A.a.a ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786.f ENSGT00390000014290 ENSGT00940000154920.bb.b ENSGT00950000183154.b.a.a.a ENSGT01090000260132.b.a.a ENSGT00950000182912.b.a.a.b.b.b.a.l.a ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950.c Orange clownfish MODERN SPECIES 14 ube3c (ENSAPEG00000015902) dnajb6b (ENSAPEG00000015875) ptprn2 (ENSAPEG00000015791) ncapg2 (ENSAPEG00000015653) ESYT2 (ENSAPEG00000015582) DYNC2I1 (ENSAPEG00000015572) ENSAPEG00000015526 ENSAPEG00000015510 malrd1 (ENSAPEG00000015427) plxdc2b (ENSAPEG00000015389) ENSAPEG00000015371 chmp4c (ENSAPEG00000015349) zfand1 (ENSAPEG00000015340) maf1b (ENSAPEG00000015308) arl8 (ENSAPEG00000015271) NSUN6 (ENSAPEG00000015212) #22 cacnb2a (ENSAPEG00000015139) SLC39A12 (ENSAPEG00000015107) MRC1 (ENSAPEG00000015082) 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ENSGT00950000183074.A.a.a ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786.f ENSGT00390000014290 ENSGT00940000154920.bb.b ENSGT00950000183154.b.a.a.a ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950 ENSGT01030000234633.B.a.c ENSGT00940000156313.c.a Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000160059.a.a ENSGT00940000156321 ENSGT00940000166388 ENSGT00940000154095.b.a.a.b ENSGT00490000043432 ENSGT00940000156086.d ENSGT00390000013743 ENSGT01030000234531.B ENSGT00940000165597 ENSGT00440000033408.a.a ENSGT00940000162556.B ENSGT00940000159257 ENSGT00730000111180 ENSGT00390000006896 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a ENSGT00390000015525.a ENSGT00530000062962.a.b ENSGT00950000183074.A.a.a ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786.f ENSGT00390000014290 ENSGT00940000154920.bb.b ENSGT00950000183154.b.a.a.a ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950 ENSGT01030000234633.B.a.c ENSGT00940000156313.c.a Indian medaka MODERN SPECIES 14 ube3c (ENSOMEG00000004179) ptprn2 (ENSOMEG00000004127) dnajb6b (ENSOMEG00000004046) ncapg2 (ENSOMEG00000004008) ESYT2 (ENSOMEG00000003937) DYNC2I1 (ENSOMEG00000003842) ENSOMEG00000003794 malrd1 (ENSOMEG00000003783) ENSOMEG00000003755 plxdc2b (ENSOMEG00000000081) ENSOMEG00000003707 chmp4c (ENSOMEG00000000079) zfand1 (ENSOMEG00000003674) maf1b (ENSOMEG00000003656) arl8 (ENSOMEG00000003634) NSUN6 (ENSOMEG00000003613) #22 cacnb2a (ENSOMEG00000003573) SLC39A12 (ENSOMEG00000003515) MRC1 (ENSOMEG00000003488) TMEM236 (ENSOMEG00000003457) hacd1 (ENSOMEG00000003440) COLEC12 (ENSOMEG00000003417) CLUL1 (ENSOMEG00000003388) tyms (ENSOMEG00000003341) enosf1 (ENSOMEG00000003301) YES1 (ENSOMEG00000003245) ADCYAP1 (ENSOMEG00000003204) SMCHD1 (ENSOMEG00000002848) EMILIN2 (ENSOMEG00000002209) LPIN2 (ENSOMEG00000002192) MYOM1 (ENSOMEG00000002167) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000160059.a.a ENSGT00940000156321 ENSGT00940000166388 ENSGT00940000154095.b.a.a.b ENSGT00490000043432 ENSGT00940000156086.d ENSGT00390000013743 ENSGT01030000234531.B ENSGT00940000165597 ENSGT00440000033408.a.a ENSGT00940000162556.B ENSGT00940000159257 ENSGT00730000111180 ENSGT00390000006896 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a ENSGT00390000015525.a ENSGT00530000062962.a.b ENSGT00950000183074.A.a.a ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786.f ENSGT00940000154920.bb.b ENSGT00950000183154.b.a.a.a ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950 ENSGT01030000234633.B.a.c ENSGT00940000156313.c.a ENSGT00940000154982.c Chinese medaka MODERN SPECIES 71 mnx1 (ENSOSIG00000006051) ube3c (ENSOSIG00000006068) dnajb6b (ENSOSIG00000006112) ptprn2 (ENSOSIG00000006119) ncapg2 (ENSOSIG00000006755) ESYT2 (ENSOSIG00000006756) DYNC2I1 (ENSOSIG00000006761) ENSOSIG00000006769 malrd1 (ENSOSIG00000006773) plxdc2b (ENSOSIG00000006802) ENSOSIG00000007112 chmp4c (ENSOSIG00000007115) zfand1 (ENSOSIG00000007117) maf1b (ENSOSIG00000007119) arl8 (ENSOSIG00000007123) NSUN6 (ENSOSIG00000007125) #22 cacnb2a (ENSOSIG00000007150) ENSOSIG00000011681 MRC1 (ENSOSIG00000011690) TMEM236 (ENSOSIG00000012865) hacd1 (ENSOSIG00000012873) COLEC12 (ENSOSIG00000012878) ENSOSIG00000012887 tyms (ENSOSIG00000012893) YES1 (ENSOSIG00000012901) ADCYAP1 (ENSOSIG00000014531) METTL4 (ENSOSIG00000014533) EMILIN2 (ENSOSIG00000014541) LPIN2 (ENSOSIG00000014566) MYOM1 (ENSOSIG00000014774) ENSOSIG00000015113 Japanese Medaka HdrR DUPLICATION Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 12 ube3c (ENSORLG00000010581) dnajb6b (ENSORLG00000010614) ptprn2 (ENSORLG00000010629) ncapg2 (ENSORLG00000010666) ESYT2 (ENSORLG00000010719) DYNC2I1 (ENSORLG00000010740) ENSORLG00000027898 ENSORLG00000010754 malrd1 (ENSORLG00000023049) PLXDC2 (ENSORLG00000010779) ENSORLG00000010786 chmp4c (ENSORLG00000010806) zfand1 (ENSORLG00000010815) maf1b (ENSORLG00000010829) arl8 (ENSORLG00000010847) NSUN6 (ENSORLG00000010870) #22 cacnb2a (ENSORLG00000010896) SLC39A12 (ENSORLG00000010930) 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(ENSSDUG00000011807) ENSSDUG00000011894 ENSSDUG00000011920 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000160059.a.a ENSGT00940000156321 ENSGT00940000166388 ENSGT00940000154095.b.a.a.b ENSGT00490000043432 ENSGT00940000156086.d ENSGT00390000013743 ENSGT01030000234531.B ENSGT00940000165597 ENSGT00440000033408.a.a ENSGT00940000162556.B ENSGT00940000159257 ENSGT00730000111180 ENSGT00390000006896 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a ENSGT00390000015525.a ENSGT00530000062962.a.b ENSGT00950000183074.A.a.a ENSGT00390000014786.f ENSGT00390000014290 ENSGT00940000154920.bb.b ENSGT00950000183154.b.a.a.a ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950 ENSGT01030000234633.B.a.c ENSGT00940000156313.c.a ENSGT00940000154982.c Turbot MODERN SPECIES 13 ube3c (ENSSMAG00000011093) dnajb6b (ENSSMAG00000011142) ptprn2 (ENSSMAG00000011170) ncapg2 (ENSSMAG00000011184) ESYT2 (ENSSMAG00000011212) DYNC2I1 (ENSSMAG00000011379) 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(ENSCSEG00000000400) YES1 (ENSCSEG00000000393) ADCYAP1 (ENSCSEG00000000388) METTL4 (ENSCSEG00000000384) SMCHD1 (ENSCSEG00000000365) EMILIN2 (ENSCSEG00000000350) LPIN2 (ENSCSEG00000000331) MYOM1 (ENSCSEG00000000297) Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000154095.b.a.a.b ENSGT00940000170921 ENSGT00490000043432 ENSGT00940000156086.d ENSGT00390000013743 ENSGT00940000163397 ENSGT01030000234531.B ENSGT00990000210289 ENSGT00940000165597 ENSGT00440000033408.a.a ENSGT00940000162556.B ENSGT00940000159257 ENSGT00730000111180 ENSGT00390000006896 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a ENSGT00390000015525.a ENSGT00530000062962.a.b ENSGT00950000183074.A.a.a ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786.f ENSGT00390000014290 ENSGT00940000154920.bb.b ENSGT00950000183154.b.a.a.a ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950 ENSGT01030000234633.B.a.c ENSGT00940000156313.c.a Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000153458.A ENSGT00940000160059.a.a ENSGT00940000156321 ENSGT00940000166388 ENSGT00940000154095.b.a.a.b ENSGT00490000043432 ENSGT00940000156086.d ENSGT00390000013743 ENSGT00940000165597 ENSGT00440000033408.a.a ENSGT00940000162556.B ENSGT00940000159257 ENSGT00730000111180 ENSGT00390000006896 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a ENSGT00390000015525.a ENSGT00530000062962.a.b ENSGT00950000183074.A.a.a ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786.f ENSGT00390000014290 ENSGT00940000154920.bb.b ENSGT00950000183154.b.a.a.a ENSGT00390000016237 ENSGT01030000234633.B.a.c ENSGT00940000156313.c.a ENSGT00940000154982.c Tetraodon MODERN SPECIES 21 nom1 (ENSTNIG00000012783) mnx1 (ENSTNIG00000012784) ube3c (ENSTNIG00000012785) dnajb6b (ENSTNIG00000012786) ENSTNIG00000005842 ncapg2 (ENSTNIG00000005843) ESYT2 (ENSTNIG00000005844) DYNC2I1 (ENSTNIG00000005845) malrd1 (ENSTNIG00000005846) plxdc2b (ENSTNIG00000005847) ENSTNIG00000005848 chmp4c (ENSTNIG00000005849) zfand1 (ENSTNIG00000005850) maf1b (ENSTNIG00000005851) arl8 (ENSTNIG00000005852) NSUN6 (ENSTNIG00000017110) #22 cacnb2a (ENSTNIG00000017111) SLC39A12 (ENSTNIG00000017112) MRC1 (ENSTNIG00000017113) ENSTNIG00000017114 enosf1 (ENSTNIG00000017115) YES1 (ENSTNIG00000017116) ADCYAP1 (ENSTNIG00000017117) METTL4 (ENSTNIG00000017118) EMILIN2 (ENSTNIG00000017119) LPIN2 (ENSTNIG00000017120) MYOM1 (ENSTNIG00000017121) MYL12B (ENSTNIG00000017122) FASTKD3 (ENSTNIG00000017123) ENSTNIG00000017124 OPRK1 (ENSTNIG00000017125) Fugu MODERN SPECIES 1 shha (ENSTRUG00000025705) rnf32 (ENSTRUG00000010576) lmbr1 (ENSTRUG00000010286) nom1 (ENSTRUG00000010239) mnx1 (ENSTRUG00000010178) ube3c (ENSTRUG00000009905) dnajb6b (ENSTRUG00000009824) ptprn2 (ENSTRUG00000009798) ncapg2 (ENSTRUG00000021691) plxdc2b (ENSTRUG00000008838) ENSTRUG00000027708 chmp4c (ENSTRUG00000008663) zfand1 (ENSTRUG00000008606) maf1b (ENSTRUG00000025393) arl5b (ENSTRUG00000028160) NSUN6 (ENSTRUG00000008314) #22 cacnb2a (ENSTRUG00000007932) SLC39A12 (ENSTRUG00000007740) MRC1 (ENSTRUG00000007315) TMEM236 (ENSTRUG00000007274) hacd1 (ENSTRUG00000007061) COLEC12 (ENSTRUG00000006852) ENSTRUG00000027319 tyms (ENSTRUG00000002155) YES1 (ENSTRUG00000003054) EMILIN2 (ENSTRUG00000003983) LPIN2 (ENSTRUG00000004278) ENSTRUG00000011112 FASTKD3 (ENSTRUG00000006808) OPRK1 (ENSTRUG00000007104) ENSTRUG00000007273 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000154095.b.a.a.b ENSGT00940000170921 ENSGT00490000043432 ENSGT00940000156086.d ENSGT00390000013743 ENSGT00940000163397 ENSGT01030000234531.B ENSGT00990000210289 ENSGT00940000165597 ENSGT00440000033408.a.a ENSGT00940000162556.B ENSGT00940000159257 ENSGT00730000111180 ENSGT00390000006896 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a ENSGT00390000015525.a ENSGT00530000062962.a.b ENSGT00950000183074.A.a.a ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786.f ENSGT00390000014290.b ENSGT00940000154920.bb.b ENSGT00950000183154.b.a.a.a ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950 ENSGT01030000234633.B.a.c ENSGT00940000156313.c.a Ballan wrasse MODERN SPECIES 284 irf9 (ENSLBEG00000017676) RNF31 (ENSLBEG00000017626) CDH20 (ENSLBEG00000017588) ENSLBEG00000017567 RNF152 (ENSLBEG00000017554) ENSLBEG00000017541 ENSLBEG00000017497 kbtbd2 (ENSLBEG00000017461) avl9 (ENSLBEG00000017406) LSM5 (ENSLBEG00000017379) psme2 (ENSLBEG00000017320) chmp4c (ENSLBEG00000017281) zfand1 (ENSLBEG00000017229) maf1b (ENSLBEG00000017190) arl8 (ENSLBEG00000017173) NSUN6 (ENSLBEG00000017133) #22 cacnb2a (ENSLBEG00000017022) SLC39A12 (ENSLBEG00000016927) ENSLBEG00000016858 TMEM236 (ENSLBEG00000016829) hacd1 (ENSLBEG00000016812) COLEC12 (ENSLBEG00000016793) CLUL1 (ENSLBEG00000016753) tyms (ENSLBEG00000016708) enosf1 (ENSLBEG00000016626) YES1 (ENSLBEG00000016096) ADCYAP1 (ENSLBEG00000015916) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000154095.b.a.a.b ENSGT00940000170921 ENSGT00490000043432 ENSGT00940000156086.d ENSGT00390000013743 ENSGT00940000163397 ENSGT01030000234531.B ENSGT00990000210289 ENSGT00940000165597 ENSGT00440000033408.a.a ENSGT00940000162556.B ENSGT00940000159257 ENSGT00730000111180 ENSGT00390000006896 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a ENSGT00390000015525.a ENSGT00530000062962.a.b ENSGT00950000183074.A.a.a ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786.f ENSGT00390000014290.b ENSGT00940000154920.bb.b ENSGT00950000183154.b.a.a.a ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950 ENSGT01030000234633.B.a.c ENSGT00940000156313.c.a Perciformes ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000154095.b.a.a.b ENSGT00940000170921 ENSGT00490000043432 ENSGT00940000156086.d ENSGT00390000013743 ENSGT00940000163397 ENSGT01030000234531.B ENSGT00990000210289 ENSGT00940000165597 ENSGT00440000033408.a.a ENSGT00940000162556.B ENSGT00940000159257 ENSGT00730000111180 ENSGT00390000006896 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a ENSGT00390000015525.a ENSGT00530000062962.a.b ENSGT00950000183074.A.a.a ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786.f ENSGT00390000014290.b ENSGT00940000154920.bb.b ENSGT00950000183154.b.a.a.a ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950 ENSGT01030000234633.B.a.c ENSGT00940000156313.c.a Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000166388 ENSGT00940000154095.b.a.a.b ENSGT00940000170921 ENSGT00490000043432 ENSGT00940000156086.d ENSGT00390000013743 ENSGT01030000234531.B ENSGT00990000210289 ENSGT00940000165597 ENSGT00440000033408.a.a ENSGT00940000162556.B ENSGT00940000159257 ENSGT00730000111180 ENSGT00390000006896 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a ENSGT00390000015525.a ENSGT00530000062962.a.b ENSGT00950000183074.A.a.a ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786.f ENSGT00390000014290.b ENSGT00940000154920.bb.b ENSGT00950000183154.b.a.a.a ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950 ENSGT01030000234633.B.a.c ENSGT00940000156313.c.a Lumpfish MODERN SPECIES 12 ube3c (ENSCLMG00005022010) dnajb6b (ENSCLMG00005021990) ptprn2 (ENSCLMG00005021988) ncapg2 (ENSCLMG00005021987) ESYT2 (ENSCLMG00005021968) DYNC2I1 (ENSCLMG00005021964) ENSCLMG00005021962 ENSCLMG00005021960 malrd1 (ENSCLMG00005021959) PLXDC2 (ENSCLMG00005021956) ENSCLMG00005021955 chmp4c (ENSCLMG00005021954) zfand1 (ENSCLMG00005021950) maf1b (ENSCLMG00005021949) arl8 (ENSCLMG00005021946) NSUN6 (ENSCLMG00005021942) #22 cacnb2a (ENSCLMG00005021920) ENSCLMG00005021918 ENSCLMG00005021916 MRC1 (ENSCLMG00005021911) TMEM236 (ENSCLMG00005021907) hacd1 (ENSCLMG00005021902) ENSCLMG00005021901 COLEC12 (ENSCLMG00005021883) ENSCLMG00005021880 CLUL1 (ENSCLMG00005021879) tyms (ENSCLMG00005021878) enosf1 (ENSCLMG00005021863) YES1 (ENSCLMG00005020789) ADCYAP1 (ENSCLMG00005020762) METTL4 (ENSCLMG00005020755) Stickleback MODERN SPECIES 20 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ENSGT01030000234531.B ENSGT00940000165597 ENSGT00440000033408.a.a ENSGT00940000162556.B ENSGT00940000159257 ENSGT00730000111180 ENSGT00390000006896 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a ENSGT00390000015525.a ENSGT00530000062962.a.b ENSGT00950000183074.A.a.a ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786.f ENSGT00390000014290.b ENSGT00940000154920.bb.b ENSGT00950000183154.b.a.a.a ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950 ENSGT01030000234633.B.a.c ENSGT00940000156313.c.a Channel bull blenny MODERN SPECIES 12 ube3c (ENSCGOG00000002847) dnajb6b (ENSCGOG00000003496) ptprn2 (ENSCGOG00000003507) ncapg2 (ENSCGOG00000003619) ESYT2 (ENSCGOG00000003692) DYNC2I1 (ENSCGOG00000005261) ENSCGOG00000005267 ENSCGOG00000005270 malrd1 (ENSCGOG00000005273) plxdc2b (ENSCGOG00000005290) ENSCGOG00000005497 chmp4c (ENSCGOG00000005500) zfand1 (ENSCGOG00000005505) maf1b (ENSCGOG00000005509) arl8 (ENSCGOG00000005523) NSUN6 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hacd1 (ENSSLUG00000023899) COLEC12 (ENSSLUG00000023895) ENSSLUG00000023887 tyms (ENSSLUG00000023872) enosf1 (ENSSLUG00000023553) YES1 (ENSSLUG00000022296) ADCYAP1 (ENSSLUG00000022157) METTL4 (ENSSLUG00000022134) SMCHD1 (ENSSLUG00000021722) EMILIN2 (ENSSLUG00000021617) LPIN2 (ENSSLUG00000021324) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000156321 ENSGT00940000166388 ENSGT00940000154095.b.a.a.b ENSGT00490000043432 ENSGT00940000156086.d ENSGT00390000013743 ENSGT00940000163397 ENSGT01030000234531.B ENSGT00940000165597 ENSGT00440000033408.a.a ENSGT00940000162556.B ENSGT00940000159257 ENSGT00730000111180 ENSGT00390000006896 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a ENSGT00390000015525.a ENSGT00530000062962.a.b ENSGT00950000183074.A.a.a ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786.f ENSGT00390000014290.b ENSGT00940000154920.bb.b ENSGT00950000183154.b.a.a.a ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950 ENSGT01030000234633.B.a.c ENSGT00940000156313.c.a Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000156321 ENSGT00940000166388 ENSGT00940000154095.b.a.a.b ENSGT00490000043432 ENSGT00940000156086.d ENSGT00390000013743 ENSGT00940000163397 ENSGT01030000234531.B ENSGT00940000165597 ENSGT00440000033408.a.a ENSGT00940000162556.B ENSGT00940000159257 ENSGT00730000111180 ENSGT00390000006896 ENSGT00940000157567 ENSGT00940000155370 #22 ENSGT00950000182837.a.b.a ENSGT00940000157914 ENSGT01050000244842.a.a.b.b.a ENSGT00390000015525.a ENSGT00530000062962.a.b ENSGT00950000183074.A.a.a ENSGT00530000063668.A.d ENSGT00390000014786.f ENSGT00390000014290.b ENSGT00940000154920.bb.b ENSGT00950000183154.b.a.a.a ENSGT00390000016237 ENSGT00390000006950 ENSGT01030000234633.B.a.c ENSGT00940000156313.c.a Large yellow croaker MODERN SPECIES 494 mnx1 (ENSLCRG00005023041) ube3c (ENSLCRG00005023027) ptprn2 (ENSLCRG00005023019) ncapg2 (ENSLCRG00005023017) ESYT2 (ENSLCRG00005022854) DYNC2I1 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ENSDLAG00005013363 ENSDLAG00005030807 ZFAND1 (ENSDLAG00005033862) ARL5B (ENSDLAG00005013449) NSUN6 (ENSDLAG00005033054) #22 CACNB2 (ENSDLAG00005013589) ENSDLAG00005027760 ENSDLAG00005033852 SLC39A12 (ENSDLAG00005016066) MRC1 (ENSDLAG00005016127) TMEM236 (ENSDLAG00005030344) HACD1 (ENSDLAG00005018856) COLEC12 (ENSDLAG00005018862) CLUL1 (ENSDLAG00005018881) tyms (ENSDLAG00005018900) ENOSF1 (ENSDLAG00005018953) YES1 (ENSDLAG00005019225) ADCYAP1 (ENSDLAG00005019829) METTL4 (ENSDLAG00005019846) SMCHD1 (ENSDLAG00005019865) Gilthead seabream MODERN SPECIES 10 ptprn2 (ENSSAUG00010013215) ncapg2 (ENSSAUG00010013205) ESYT2 (ENSSAUG00010013124) DYNC2I1 (ENSSAUG00010013117) ENSSAUG00010013115 ENSSAUG00010013114 ENSSAUG00010013113 ENSSAUG00010013111 malrd1 (ENSSAUG00010013060) plxdc2b (ENSSAUG00010012582) ENSSAUG00010012572 zfand1 (ENSSAUG00010012570) chmp4c (ENSSAUG00010012566) maf1b (ENSSAUG00010012565) arl8 (ENSSAUG00010012560) NSUN6 (ENSSAUG00010012557) #22 cacnb2a (ENSSAUG00010012021) SLC39A12 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