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Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	49	ENSGT00940000159835 #7	ENSGT00390000014353 #8	ENSGT00390000011082 #9	ENSGT00390000000631 #10	ENSGT00390000016970 #11	ENSGT00390000005780.b #12	ENSGT00730000111360 #13	ENSGT00940000160255 #14	ENSGT00730000111286 #15	ENSGT00940000161421 #16	ENSGT00390000005596 #17	ENSGT00390000018596.A.a.a #18	ENSGT00940000161059 #19	ENSGT00940000154857 #20	ENSGT00390000016233 #21	ENSGT00390000008947 #22	ENSGT00940000156378.b #23	ENSGT00640000091554 #24	ENSGT00940000157794 #25	ENSGT00940000159659 #26	ENSGT00390000018852 #27	ENSGT00990000203541.a.b #28	ENSGT00940000157446 #29	ENSGT00530000063557.a #30	ENSGT00950000182824.a.b.a #31	ENSGT00390000011230 #32	ENSGT01050000244882.a.a.b #33	ENSGT00950000183006.B.f.b.b #34	ENSGT00440000038003 #35	ENSGT00940000158813 #36	ENSGT01030000234648.a.a.d
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	62	ENSGT00940000159835 #7	ENSGT00390000014353 #8	ENSGT00390000011082 #9	ENSGT00390000000631 #10	ENSGT00390000016970 #11	ENSGT00390000005780.b #12	ENSGT00730000111360 #13	ENSGT00940000160255 #14	ENSGT00730000111286 #15	ENSGT00940000161421 #16	ENSGT00390000005596 #17	ENSGT00390000018596.A.a.a #18	ENSGT00940000161059 #19	ENSGT00940000154857 #20	ENSGT00390000016233 #21	ENSGT00390000008947 #22	ENSGT00940000156378.b #23	ENSGT00640000091554 #24	ENSGT00940000157794 #25	ENSGT00940000159659 #26	ENSGT00390000018852 #27	ENSGT00990000203541.a.b #28	ENSGT00940000157446 #29	ENSGT00530000063557.a #30	ENSGT00950000182824.a.b.a #31	ENSGT00390000011230 #32	ENSGT01050000244882.a.a.b #33	ENSGT00950000183006.B.f.b.b #34	ENSGT00440000038003 #35	ENSGT00940000158813 #36	ENSGT01030000234648.a.a.d
Squirrel	MODERN SPECIES	202	IRAK2 (ENSSTOG00000013972) #7	ENSSTOG00000013959 #8	BRK1 (ENSSTOG00000013945) #9	FANCD2OS (ENSSTOG00000029094) #10	FANCD2 (ENSSTOG00000013919) #11	EMC3 (ENSSTOG00000023811) #12	PRRT3 (ENSSTOG00000019747) #13	CRELD1 (ENSSTOG00000023165) #14	IL17RC (ENSSTOG00000002163) #15	IL17RE (ENSSTOG00000002153) #16	JAGN1 (ENSSTOG00000031374) #17	CIDEC (ENSSTOG00000002137) #18	RPUSD3 (ENSSTOG00000002125) #19	TTLL3 (ENSSTOG00000024902) #20	ARPC4 (ENSSTOG00000024608) #21	TADA3 (ENSSTOG00000002107) #22	CAMK1 (ENSSTOG00000002094) #23	OGG1 (ENSSTOG00000002087) #24	BRPF1 (ENSSTOG00000002078) #25	CPNE9 (ENSSTOG00000002061) #26	MTMR14 (ENSSTOG00000002048) #27	LHFPL4 (ENSSTOG00000021198) #28	SETD5 (ENSSTOG00000002023) #29	THUMPD3 (ENSSTOG00000003973) #30	SRGAP3 (ENSSTOG00000004891) #31	RAD18 (ENSSTOG00000004870) #32	OXTR (ENSSTOG00000013332) #33	CAV3 (ENSSTOG00000013328) #34	SSUH2 (ENSSTOG00000013310) #35	LMCD1 (ENSSTOG00000013558) #36	ENSSTOG00000029032 #37
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	23	TATDN2 (ENSUPAG00010022994)	IRAK2 (ENSUPAG00010022988) #7	BRK1 (ENSUPAG00010022984) #9	FANCD2OS (ENSUPAG00010022983) #10	FANCD2 (ENSUPAG00010022972) #11	EMC3 (ENSUPAG00010022965) #12	PRRT3 (ENSUPAG00010022944) #13	CRELD1 (ENSUPAG00010022942) #14	IL17RC (ENSUPAG00010022941) #15	IL17RE (ENSUPAG00010022937) #16	JAGN1 (ENSUPAG00010022936) #17	CIDEC (ENSUPAG00010022934) #18	RPUSD3 (ENSUPAG00010022933) #19	ENSUPAG00010022932 #20	ARPC4 (ENSUPAG00010022930) #21	TADA3 (ENSUPAG00010022928) #22	CAMK1 (ENSUPAG00010022925) #23	BRPF1 (ENSUPAG00010022889) #25	CPNE9 (ENSUPAG00010022882) #26	MTMR14 (ENSUPAG00010022881) #27	LHFPL4 (ENSUPAG00010022879) #28	SETD5 (ENSUPAG00010022873) #29	THUMPD3 (ENSUPAG00010022869) #30	SRGAP3 (ENSUPAG00010022863) #31	RAD18 (ENSUPAG00010022854) #32	OXTR (ENSUPAG00010022853) #33	CAV3 (ENSUPAG00010022852) #34	SSUH2 (ENSUPAG00010022850) #35	LMCD1 (ENSUPAG00010022849) #36	ENSUPAG00010022848	GRM7 (ENSUPAG00010022847)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	40	BRK1 (ENSMMMG00000009396) #9	FANCD2OS (ENSMMMG00000009389) #10	FANCD2 (ENSMMMG00000009206) #11	EMC3 (ENSMMMG00000009189) #12	ENSMMMG00000009178 #13	CRELD1 (ENSMMMG00000009172) #14	IL17RC (ENSMMMG00000009153) #15	ENSMMMG00000009145 #16	ENSMMMG00000009135 #16	JAGN1 (ENSMMMG00000009124) #17	CIDEC (ENSMMMG00000009121) #18	RPUSD3 (ENSMMMG00000009104) #19	ENSMMMG00000009096 #20	ENSMMMG00000009087 #20	ARPC4 (ENSMMMG00000009043) #21	TADA3 (ENSMMMG00000009015) #22	CAMK1 (ENSMMMG00000008993) #23	OGG1 (ENSMMMG00000008989) #24	BRPF1 (ENSMMMG00000008752) #25	CPNE9 (ENSMMMG00000008660) #26	ENSMMMG00000008637 #27	LHFPL4 (ENSMMMG00000008628) #28	SETD5 (ENSMMMG00000008559) #29	THUMPD3 (ENSMMMG00000008539) #30	SRGAP3 (ENSMMMG00000008489) #31	RAD18 (ENSMMMG00000008426) #32	OXTR (ENSMMMG00000008417) #33	CAV3 (ENSMMMG00000008414) #34	SSUH2 (ENSMMMG00000008390) #35	LMCD1 (ENSMMMG00000008370) #36	GRM7 (ENSMMMG00000008319)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	10	IRAK2 (ENSSVLG00005024086) #7	ENSSVLG00005024111 #8	BRK1 (ENSSVLG00005024143) #9	FANCD2OS (ENSSVLG00005024166) #10	FANCD2 (ENSSVLG00005024206) #11	ENSSVLG00005024410 #12	PRRT3 (ENSSVLG00005024435) #13	CRELD1 (ENSSVLG00005024456) #14	IL17RC (ENSSVLG00005024518) #15	IL17RE (ENSSVLG00005024583) #16	JAGN1 (ENSSVLG00005024642) #17	CIDEC (ENSSVLG00005024691) #18	RPUSD3 (ENSSVLG00005024754) #19	ENSSVLG00005024852 #20	ENSSVLG00005024910 #21	TADA3 (ENSSVLG00005024948) #22	CAMK1 (ENSSVLG00005024976) #23	OGG1 (ENSSVLG00005025032) #24	BRPF1 (ENSSVLG00005025105) #25	CPNE9 (ENSSVLG00005025235) #26	MTMR14 (ENSSVLG00005025326) #27	LHFPL4 (ENSSVLG00005025392) #28	SETD5 (ENSSVLG00005025433) #29	THUMPD3 (ENSSVLG00005025481) #30	SRGAP3 (ENSSVLG00005025521) #31	RAD18 (ENSSVLG00005025578) #32	OXTR (ENSSVLG00005025596) #33	CAV3 (ENSSVLG00005025604) #34	SSUH2 (ENSSVLG00005025613) #35	LMCD1 (ENSSVLG00005025633) #36	GRM7 (ENSSVLG00005025662)
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000159835 #7	ENSGT00390000014353 #8	ENSGT00390000011082 #9	ENSGT00390000000631 #10	ENSGT00390000016970 #11	ENSGT00390000005780.b #12	ENSGT00730000111360 #13	ENSGT00940000160255 #14	ENSGT00730000111286 #15	ENSGT00940000161421 #16	ENSGT00390000005596 #17	ENSGT00390000018596.A.a.a #18	ENSGT00940000161059 #19	ENSGT00940000154857 #20	ENSGT00390000016233 #21	ENSGT00390000008947 #22	ENSGT00940000156378.b #23	ENSGT00640000091554 #24	ENSGT00940000157794 #25	ENSGT00940000159659 #26	ENSGT00390000018852 #27	ENSGT00990000203541.a.b #28	ENSGT00940000157446 #29	ENSGT00530000063557.a #30	ENSGT00950000182824.a.b.a #31	ENSGT00390000011230 #32	ENSGT01050000244882.a.a.b #33	ENSGT00950000183006.B.f.b.b #34	ENSGT00440000038003 #35	ENSGT00940000158813 #36	ENSGT00940000154607.b.a.m
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Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	268	IRAK2 (ENSCLAG00000001248) #7	VHL (ENSCLAG00000001214) #8	BRK1 (ENSCLAG00000001163) #9	FANCD2OS (ENSCLAG00000006926) #10	FANCD2 (ENSCLAG00000003572) #11	EMC3 (ENSCLAG00000002932) #12	PRRT3 (ENSCLAG00000002796) #13	CRELD1 (ENSCLAG00000001155) #14	IL17RC (ENSCLAG00000000976) #15	IL17RE (ENSCLAG00000000786) #16	JAGN1 (ENSCLAG00000000700) #17	ENSCLAG00000002188 #18	RPUSD3 (ENSCLAG00000003240) #19	ENSCLAG00000002997 #20	ARPC4 (ENSCLAG00000002816) #21	TADA3 (ENSCLAG00000001872) #22	CAMK1 (ENSCLAG00000001440) #23	OGG1 (ENSCLAG00000001426) #24	BRPF1 (ENSCLAG00000000910) #25	CPNE9 (ENSCLAG00000001159) #26	MTMR14 (ENSCLAG00000000926) #27	ENSCLAG00000001236	ENSCLAG00000001183	LHFPL4 (ENSCLAG00000001079) #28	SETD5 (ENSCLAG00000000809) #29	THUMPD3 (ENSCLAG00000000690) #30	SRGAP3 (ENSCLAG00000002146) #31	RAD18 (ENSCLAG00000003652) #32	OXTR (ENSCLAG00000003172) #33	CAV3 (ENSCLAG00000001721) #34	SSUH2 (ENSCLAG00000001410) #35
Degu	MODERN SPECIES	49	IRAK2 (ENSODEG00000018213) #7	VHL (ENSODEG00000018122) #8	BRK1 (ENSODEG00000018259) #9	FANCD2OS (ENSODEG00000020518) #10	FANCD2 (ENSODEG00000018239) #11	EMC3 (ENSODEG00000018222) #12	PRRT3 (ENSODEG00000018225) #13	CRELD1 (ENSODEG00000018113) #14	IL17RC (ENSODEG00000018144) #15	IL17RE (ENSODEG00000018313) #16	ENSODEG00000018255 #17	CIDEC (ENSODEG00000018117) #18	RPUSD3 (ENSODEG00000018137) #19	ENSODEG00000018188 #20	ARPC4 (ENSODEG00000018185) #21	TADA3 (ENSODEG00000018173) #22	CAMK1 (ENSODEG00000018146) #23	OGG1 (ENSODEG00000018217) #24	BRPF1 (ENSODEG00000018200) #25	CPNE9 (ENSODEG00000018383) #26	MTMR14 (ENSODEG00000018300) #27	ENSODEG00000018249	LHFPL4 (ENSODEG00000018130) #28	ENSODEG00000020522	SETD5 (ENSODEG00000018265) #29	THUMPD3 (ENSODEG00000018242) #30	SRGAP3 (ENSODEG00000018235) #31	RAD18 (ENSODEG00000018158) #32	ENSODEG00000018124	OXTR (ENSODEG00000018131) #33	CAV3 (ENSODEG00000018263) #34
Guinea pig	MODERN SPECIES	87	IRAK2 (ENSCPOG00000001184) #7	VHL (ENSCPOG00000023134) #8	BRK1 (ENSCPOG00000038719) #9	FANCD2OS (ENSCPOG00000005732) #10	FANCD2 (ENSCPOG00000005717) #11	EMC3 (ENSCPOG00000032790) #12	PRRT3 (ENSCPOG00000006915) #13	CRELD1 (ENSCPOG00000006705) #14	IL17RC (ENSCPOG00000006690) #15	ENSCPOG00000038397 #16	JAGN1 (ENSCPOG00000038327) #17	CIDEC (ENSCPOG00000033010) #18	RPUSD3 (ENSCPOG00000037956) #19	ENSCPOG00000034221 #20	ARPC4 (ENSCPOG00000023539) #21	TADA3 (ENSCPOG00000007692) #22	CAMK1 (ENSCPOG00000008785) #23	OGG1 (ENSCPOG00000008778) #24	BRPF1 (ENSCPOG00000008771) #25	CPNE9 (ENSCPOG00000008755) #26	MTMR14 (ENSCPOG00000010330) #27	LHFPL4 (ENSCPOG00000038955) #28	SETD5 (ENSCPOG00000006520) #29	THUMPD3 (ENSCPOG00000033287) #30	SRGAP3 (ENSCPOG00000001996) #31	RAD18 (ENSCPOG00000013890) #32	OXTR (ENSCPOG00000037653) #33	CAV3 (ENSCPOG00000033048) #34	SSUH2 (ENSCPOG00000002444) #35	LMCD1 (ENSCPOG00000032663) #36	ENSCPOG00000006454