Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000154885.C	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT00940000161022	ENSGT00940000160668	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00940000165402	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000164059	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT01030000234629.E.b	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00390000015299.a.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000164059	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000164059	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Theria	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000164059	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00910000148141	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00910000148141	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a
Primates	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00910000148141	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00910000148141	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Tarsier	MODERN SPECIES	4544														MADD (ENSTSYG00000001550) #20	NR1H3 (ENSTSYG00000001532) #21	ACP2 (ENSTSYG00000001510) #22	DDB2 (ENSTSYG00000001500) #23	PACSIN3 (ENSTSYG00000025849) #24	ARFGAP2 (ENSTSYG00000014155) #25	CUNH11orf49 (ENSTSYG00000014153) #26	ENSTSYG00000033400 #27
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E.s.b	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00910000148141	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E.s.b	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00910000148141	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E.s.b	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00910000148141	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E.s.b	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E.s.b	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E.s.b	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Pan	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E.s.b	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00390000003248.a.b.a.b	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Bonobo	MODERN SPECIES	2	AGBL2 (ENSPPAG00000006927)	MTCH2 (ENSPPAG00000042054)	ENSPPAG00000041168	FAM180B (ENSPPAG00000030975)	NDUFS3 (ENSPPAG00000031162)	KBTBD4 (ENSPPAG00000031866)	PTPMT1 (ENSPPAG00000040774)	CELF1 (ENSPPAG00000033870)	RAPSN (ENSPPAG00000042512)	PSMC3 (ENSPPAG00000042401)	SLC39A13 (ENSPPAG00000042717)	SPI1 (ENSPPAG00000036814)	MYBPC3 (ENSPPAG00000030985)	MADD (ENSPPAG00000043339) #20	NR1H3 (ENSPPAG00000039033) #21	ACP2 (ENSPPAG00000042373) #22	DDB2 (ENSPPAG00000000958) #23	ENSPPAG00000021284	PACSIN3 (ENSPPAG00000040614) #24	ARFGAP2 (ENSPPAG00000030940) #25	CSTPP1 (ENSPPAG00000040870) #26	LRP4 (ENSPPAG00000043379)	CKAP5 (ENSPPAG00000030676)	F2 (ENSPPAG00000041509)	ZNF408 (ENSPPAG00000034993)	ARHGAP1 (ENSPPAG00000027953)	ATG13 (ENSPPAG00000042268)	HARBI1 (ENSPPAG00000035636)	AMBRA1 (ENSPPAG00000034195)	CHRM4 (ENSPPAG00000025475)	MDK (ENSPPAG00000023561)
Chimpanzee	MODERN SPECIES	2	FNBP4 (ENSPTRG00000003575)	AGBL2 (ENSPTRG00000003574)	MTCH2 (ENSPTRG00000003573)	FAM180B (ENSPTRG00000023838)	NDUFS3 (ENSPTRG00000003571)	KBTBD4 (ENSPTRG00000003570)	PTPMT1 (ENSPTRG00000033944)	CELF1 (ENSPTRG00000052299)	RAPSN (ENSPTRG00000003567)	PSMC3 (ENSPTRG00000003565)	SLC39A13 (ENSPTRG00000003564)	SPI1 (ENSPTRG00000003563)	MYBPC3 (ENSPTRG00000003562)	MADD (ENSPTRG00000003561) #20	NR1H3 (ENSPTRG00000003560) #21	ACP2 (ENSPTRG00000003559) #22	DDB2 (ENSPTRG00000003558) #23	ENSPTRG00000045675	PACSIN3 (ENSPTRG00000003557) #24	ARFGAP2 (ENSPTRG00000003556) #25	CSTPP1 (ENSPTRG00000003555) #26	LRP4 (ENSPTRG00000003554)	CKAP5 (ENSPTRG00000003553)	F2 (ENSPTRG00000003552)	ZNF408 (ENSPTRG00000003551)	ARHGAP1 (ENSPTRG00000003550)	ATG13 (ENSPTRG00000003549)	HARBI1 (ENSPTRG00000003548)	ENSPTRG00000043648	AMBRA1 (ENSPTRG00000003546)	CHRM4 (ENSPTRG00000038696)
Human	MODERN SPECIES	2	AGBL2 (ENSG00000165923)	MTCH2 (ENSG00000109919)	C1QTNF4 (ENSG00000172247)	FAM180B (ENSG00000196666)	KBTBD4 (ENSG00000123444)	PTPMT1 (ENSG00000110536)	NDUFS3 (ENSG00000213619)	CELF1 (ENSG00000149187)	RAPSN (ENSG00000165917)	PSMC3 (ENSG00000165916)	SLC39A13 (ENSG00000165915)	SPI1 (ENSG00000066336)	MYBPC3 (ENSG00000134571)	MADD (ENSG00000110514) #20	NR1H3 (ENSG00000025434) #21	ACP2 (ENSG00000134575) #22	DDB2 (ENSG00000134574) #23	PACSIN3 (ENSG00000165912) #24	ARFGAP2 (ENSG00000149182) #25	CSTPP1 (ENSG00000149179) #26	LRP4 (ENSG00000134569)	CKAP5 (ENSG00000175216)	F2 (ENSG00000180210)	ZNF408 (ENSG00000175213)	ARHGAP1 (ENSG00000175220)	ATG13 (ENSG00000175224)	HARBI1 (ENSG00000180423)	AMBRA1 (ENSG00000110497)	CHRM4 (ENSG00000180720)	MDK (ENSG00000110492)	DGKZ (ENSG00000149091)
Gorilla	MODERN SPECIES	2	FNBP4 (ENSGGOG00000014374)	AGBL2 (ENSGGOG00000014354)	MTCH2 (ENSGGOG00000008281)	FAM180B (ENSGGOG00000014401)	NDUFS3 (ENSGGOG00000014393)	KBTBD4 (ENSGGOG00000013959)	PTPMT1 (ENSGGOG00000013954)	CELF1 (ENSGGOG00000004106)	RAPSN (ENSGGOG00000007325)	PSMC3 (ENSGGOG00000016530)	SLC39A13 (ENSGGOG00000016524)	SPI1 (ENSGGOG00000006485)	MYBPC3 (ENSGGOG00000006471)	MADD (ENSGGOG00000008588) #20	NR1H3 (ENSGGOG00000008583) #21	ACP2 (ENSGGOG00000008576) #22	DDB2 (ENSGGOG00000008569) #23	PACSIN3 (ENSGGOG00000008566) #24	ARFGAP2 (ENSGGOG00000008555) #25	CSTPP1 (ENSGGOG00000008547) #26	LRP4 (ENSGGOG00000001024)	CKAP5 (ENSGGOG00000006980)	F2 (ENSGGOG00000006967)	ZNF408 (ENSGGOG00000010152)	ARHGAP1 (ENSGGOG00000005697)	ATG13 (ENSGGOG00000005689)	HARBI1 (ENSGGOG00000004410)	AMBRA1 (ENSGGOG00000011880)	CHRM4 (ENSGGOG00000026871)	MDK (ENSGGOG00000011872)	DGKZ (ENSGGOG00000011849)
Orangutan	MODERN SPECIES	2	AGBL2 (ENSPPYG00000003295)	MTCH2 (ENSPPYG00000003296)	ENSPPYG00000038525	FAM180B (ENSPPYG00000040243)	NDUFS3 (ENSPPYG00000003299)	KBTBD4 (ENSPPYG00000003300)	PTPMT1 (ENSPPYG00000003301)	CELF1 (ENSPPYG00000003302)	RAPSN (ENSPPYG00000003303)	PSMC3 (ENSPPYG00000003304)	SLC39A13 (ENSPPYG00000003305)	SPI1 (ENSPPYG00000003306)	MYBPC3 (ENSPPYG00000003307)	MADD (ENSPPYG00000003308) #20	NR1H3 (ENSPPYG00000003309) #21	ACP2 (ENSPPYG00000003310) #22	DDB2 (ENSPPYG00000003311) #23	PACSIN3 (ENSPPYG00000003312) #24	ARFGAP2 (ENSPPYG00000003313) #25	CSTPP1 (ENSPPYG00000003314) #26	LRP4 (ENSPPYG00000003315)	CKAP5 (ENSPPYG00000003316)	F2 (ENSPPYG00000003317)	ZNF408 (ENSPPYG00000003318)	ARHGAP1 (ENSPPYG00000003319)	ATG13 (ENSPPYG00000003320)	HARBI1 (ENSPPYG00000003321)	AMBRA1 (ENSPPYG00000003322)	CHRM4 (ENSPPYG00000029365)	ENSPPYG00000038515	DGKZ (ENSPPYG00000003323)
Gibbon	MODERN SPECIES	5	AGBL2 (ENSNLEG00000014711)	MTCH2 (ENSNLEG00000034575)	ENSNLEG00000014694	NDUFS3 (ENSNLEG00000028559)	KBTBD4 (ENSNLEG00000014672)	PTPMT1 (ENSNLEG00000033815)	ENSNLEG00000033020	CELF1 (ENSNLEG00000014638)	RAPSN (ENSNLEG00000014627)	PSMC3 (ENSNLEG00000014572)	ENSNLEG00000014565	SPI1 (ENSNLEG00000014555)	ENSNLEG00000014525	MADD (ENSNLEG00000014491) #20	NR1H3 (ENSNLEG00000014458) #21	ACP2 (ENSNLEG00000014425) #22	DDB2 (ENSNLEG00000014385) #23	PACSIN3 (ENSNLEG00000014344) #24	ARFGAP2 (ENSNLEG00000014290) #25	CSTPP1 (ENSNLEG00000014283) #26	LRP4 (ENSNLEG00000014206)	CKAP5 (ENSNLEG00000014160)	F2 (ENSNLEG00000014150)	ZNF408 (ENSNLEG00000014132)	ARHGAP1 (ENSNLEG00000014095)	ATG13 (ENSNLEG00000014030)	HARBI1 (ENSNLEG00000014025)	ENSNLEG00000030310	AMBRA1 (ENSNLEG00000014020)	ENSNLEG00000014019	DGKZ (ENSNLEG00000014014)
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E.s.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00910000148141	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b.l
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E.s.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00910000148141	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b.l
Vervet Monkey	MODERN SPECIES		FNBP4 (ENSCSAG00000005833)	AGBL2 (ENSCSAG00000005812)	C1QTNF4 (ENSCSAG00000019208)	FAM180B (ENSCSAG00000005805)	NDUFS3 (ENSCSAG00000005802)	KBTBD4 (ENSCSAG00000005797)	PTPMT1 (ENSCSAG00000005789)	CELF1 (ENSCSAG00000005786)	RAPSN (ENSCSAG00000005780)	PSMC3 (ENSCSAG00000005779)	SLC39A13 (ENSCSAG00000005760)	SPI1 (ENSCSAG00000005757)	MYBPC3 (ENSCSAG00000005746)	MADD (ENSCSAG00000005705) #20	NR1H3 (ENSCSAG00000005699) #21	ACP2 (ENSCSAG00000005697) #22	DDB2 (ENSCSAG00000005694) #23	PACSIN3 (ENSCSAG00000005693) #24	ARFGAP2 (ENSCSAG00000005691) #25	CSTPP1 (ENSCSAG00000005689) #26	ENSCSAG00000019209	LRP4 (ENSCSAG00000005688)	CKAP5 (ENSCSAG00000005686)	F2 (ENSCSAG00000005684)	ZNF408 (ENSCSAG00000005681)	ARHGAP1 (ENSCSAG00000005680)	ATG13 (ENSCSAG00000005678)	HARBI1 (ENSCSAG00000005676)	AMBRA1 (ENSCSAG00000005675)	CHRM4 (ENSCSAG00000019210)	ENSCSAG00000005668
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E.s.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00910000148141	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b.l
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E.s.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b.l	ENSGT00940000156152
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	485	FNBP4 (ENSMNEG00000039382)	AGBL2 (ENSMNEG00000028554)	MTCH2 (ENSMNEG00000020815)	FAM180B (ENSMNEG00000033276)	NDUFS3 (ENSMNEG00000030290)	KBTBD4 (ENSMNEG00000036394)	PTPMT1 (ENSMNEG00000034588)	CELF1 (ENSMNEG00000022558)	RAPSN (ENSMNEG00000029367)	ENSMNEG00000044564	SLC39A13 (ENSMNEG00000040430)	SPI1 (ENSMNEG00000027877)	MYBPC3 (ENSMNEG00000029406)	MADD (ENSMNEG00000030300) #20	NR1H3 (ENSMNEG00000032200) #21	ACP2 (ENSMNEG00000031619) #22	DDB2 (ENSMNEG00000029423) #23	PACSIN3 (ENSMNEG00000041496) #24	ARFGAP2 (ENSMNEG00000042175) #25	CSTPP1 (ENSMNEG00000043208) #26	LRP4 (ENSMNEG00000039196)	CKAP5 (ENSMNEG00000045449)	F2 (ENSMNEG00000040864)	ZNF408 (ENSMNEG00000040215)	ARHGAP1 (ENSMNEG00000044079)	ATG13 (ENSMNEG00000028546)	HARBI1 (ENSMNEG00000039470)	AMBRA1 (ENSMNEG00000041218)	CHRM4 (ENSMNEG00000019466)	MDK (ENSMNEG00000006686)	DGKZ (ENSMNEG00000042881)
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E.s.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b.l	ENSGT00940000156152
Rhesus	DUPLICATION
Rhesus	MODERN SPECIES	5	MTCH2 (ENSMMUG00000043682)	C1QTNF4 (ENSMMUG00000004294)	FAM180B (ENSMMUG00000053860)	NDUFS3 (ENSMMUG00000045281)	PTPMT1 (ENSMMUG00000004286)	KBTBD4 (ENSMMUG00000004289)	CELF1 (ENSMMUG00000011657)	ENSMMUG00000064417	RAPSN (ENSMMUG00000009498)	PSMC3 (ENSMMUG00000015611)	SLC39A13 (ENSMMUG00000015607)	SPI1 (ENSMMUG00000015606)	MYBPC3 (ENSMMUG00000015604)	MADD (ENSMMUG00000015602) #20	NR1H3 (ENSMMUG00000015598) #21	ACP2 (ENSMMUG00000015597) #22	PACSIN3 (ENSMMUG00000006359) #24	ARFGAP2 (ENSMMUG00000006357) #25	CSTPP1 (ENSMMUG00000006355) #26	LRP4 (ENSMMUG00000013100)	CKAP5 (ENSMMUG00000003631)	F2 (ENSMMUG00000019674)	ZNF408 (ENSMMUG00000063711)	ARHGAP1 (ENSMMUG00000007831)	ATG13 (ENSMMUG00000019672)	HARBI1 (ENSMMUG00000059160)	AMBRA1 (ENSMMUG00000011526)	CHRM4 (ENSMMUG00000039412)	MDK (ENSMMUG00000038138)	DGKZ (ENSMMUG00000021446)	CREB3L1 (ENSMMUG00000018571)
Rhesus	MODERN SPECIES	54																ENSMMUG00000049949 #22
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	5	AGBL2 (ENSMFAG00000043435)	MTCH2 (ENSMFAG00000036915)	ENSMFAG00000049478	FAM180B (ENSMFAG00000043005)	NDUFS3 (ENSMFAG00000031067)	PTPMT1 (ENSMFAG00000042995)	KBTBD4 (ENSMFAG00000032928)	CELF1 (ENSMFAG00000003505)	RAPSN (ENSMFAG00000037957)	PSMC3 (ENSMFAG00000003854)	SLC39A13 (ENSMFAG00000003412)	ENSMFAG00000050805	MYBPC3 (ENSMFAG00000041621)	MADD (ENSMFAG00000039619) #20	NR1H3 (ENSMFAG00000002014) #21	ACP2 (ENSMFAG00000000393) #22	DDB2 (ENSMFAG00000031723) #23	ENSMFAG00000057633	PACSIN3 (ENSMFAG00000039377) #24	ARFGAP2 (ENSMFAG00000030043) #25	CSTPP1 (ENSMFAG00000038437) #26	LRP4 (ENSMFAG00000003482)	CKAP5 (ENSMFAG00000001378)	F2 (ENSMFAG00000031977)	ZNF408 (ENSMFAG00000036575)	ARHGAP1 (ENSMFAG00000036912)	ATG13 (ENSMFAG00000038288)	HARBI1 (ENSMFAG00000002487)	ENSMFAG00000002000	CHRM4 (ENSMFAG00000021204)	MDK (ENSMFAG00000000818)
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E.s.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718.m #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00910000148141	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b.l
Olive baboon	MODERN SPECIES	3	MDK (ENSPANG00000020889)	AMBRA1 (ENSPANG00000017260)	CKAP5 (ENSPANG00000013230)	F2 (ENSPANG00000016657)	ZNF408 (ENSPANG00000032617)	ARHGAP1 (ENSPANG00000012059)	ATG13 (ENSPANG00000006613)	HARBI1 (ENSPANG00000023007)	ENSPANG00000023598	ENSPANG00000030649	CSTPP1 (ENSPANG00000001891) #26	ARFGAP2 (ENSPANG00000016976) #25	PACSIN3 (ENSPANG00000007979) #24	ENSPANG00000018411 #20	NR1H3 (ENSPANG00000016658) #21	ACP2 (ENSPANG00000001892) #22	DDB2 (ENSPANG00000006542) #23	MYBPC3 (ENSPANG00000016552)	SPI1 (ENSPANG00000004468)	SLC39A13 (ENSPANG00000013478)	PSMC3 (ENSPANG00000017381)	RAPSN (ENSPANG00000004124)	CELF1 (ENSPANG00000021676)	ENSPANG00000007187	KBTBD4 (ENSPANG00000017205)	NDUFS3 (ENSPANG00000001634)	FAM180B (ENSPANG00000000112)	ENSPANG00000000111	MTCH2 (ENSPANG00000001893)	AGBL2 (ENSPANG00000005171)	FNBP4 (ENSPANG00000006036)
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	61	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E.s.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718.m #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00910000147892	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00910000148141	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	193	FNBP4 (ENSCATG00000038551)	AGBL2 (ENSCATG00000036090)	MTCH2 (ENSCATG00000004816)	FAM180B (ENSCATG00000042552)	NDUFS3 (ENSCATG00000029573)	KBTBD4 (ENSCATG00000032867)	PTPMT1 (ENSCATG00000033306)	CELF1 (ENSCATG00000040143)	RAPSN (ENSCATG00000043406)	ENSCATG00000020806	SLC39A13 (ENSCATG00000042480)	SPI1 (ENSCATG00000041395)	MYBPC3 (ENSCATG00000033529)	MADD (ENSCATG00000019656) #20	NR1H3 (ENSCATG00000031838) #21	ACP2 (ENSCATG00000039992) #22	DDB2 (ENSCATG00000037043) #23	PACSIN3 (ENSCATG00000044836) #24	ARFGAP2 (ENSCATG00000032091) #25	CSTPP1 (ENSCATG00000034976) #26	LRP4 (ENSCATG00000034844)	CKAP5 (ENSCATG00000037509)	F2 (ENSCATG00000038182)	ZNF408 (ENSCATG00000035814)	ENSCATG00000034262	ARHGAP1 (ENSCATG00000043789)	ATG13 (ENSCATG00000038547)	HARBI1 (ENSCATG00000043376)	AMBRA1 (ENSCATG00000037285)	CHRM4 (ENSCATG00000003262)	MDK (ENSCATG00000042264)
Drill	MODERN SPECIES	1384	AGBL2 (ENSMLEG00000032331)	MTCH2 (ENSMLEG00000005996)	ENSMLEG00000010056	FAM180B (ENSMLEG00000030769)	NDUFS3 (ENSMLEG00000042396)	KBTBD4 (ENSMLEG00000028879)	PTPMT1 (ENSMLEG00000020293)	CELF1 (ENSMLEG00000040834)	RAPSN (ENSMLEG00000037859)	ENSMLEG00000033056	SLC39A13 (ENSMLEG00000043749)	SPI1 (ENSMLEG00000004290)	MYBPC3 (ENSMLEG00000028682)	MADD (ENSMLEG00000032767) #20	NR1H3 (ENSMLEG00000044270) #21	ACP2 (ENSMLEG00000042774) #22	DDB2 (ENSMLEG00000032535) #23	PACSIN3 (ENSMLEG00000043145) #24	ARFGAP2 (ENSMLEG00000043821) #25	ENSMLEG00000028689	CSTPP1 (ENSMLEG00000040490) #26	LRP4 (ENSMLEG00000043395)	CKAP5 (ENSMLEG00000034738)	F2 (ENSMLEG00000043758)	ZNF408 (ENSMLEG00000044029)	ENSMLEG00000042128	ARHGAP1 (ENSMLEG00000031958)	ATG13 (ENSMLEG00000027900)	HARBI1 (ENSMLEG00000026358)	ENSMLEG00000027431	AMBRA1 (ENSMLEG00000040418)
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	64	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E.s.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223.b	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b.l	ENSGT00940000156152
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	2256													MYBPC3 (ENSRBIG00000040693)	MADD (ENSRBIG00000041171) #20	NR1H3 (ENSRBIG00000002426) #21	ACP2 (ENSRBIG00000003979) #22	DDB2 (ENSRBIG00000036127) #23	PACSIN3 (ENSRBIG00000027822) #24	ARFGAP2 (ENSRBIG00000041344) #25	CSTPP1 (ENSRBIG00000040070) #26	ENSRBIG00000043694	LRP4 (ENSRBIG00000024580)	CKAP5 (ENSRBIG00000044614)	F2 (ENSRBIG00000033898)	ZNF408 (ENSRBIG00000010662)	ARHGAP1 (ENSRBIG00000029818)	ENSRBIG00000044190	ATG13 (ENSRBIG00000044753)	HARBI1 (ENSRBIG00000010258)	ENSRBIG00000031731	RUBCNL (ENSRBIG00000034790)
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1568	AGBL2 (ENSRROG00000038333)	MTCH2 (ENSRROG00000044709)	ENSRROG00000045763	FAM180B (ENSRROG00000041406)	NDUFS3 (ENSRROG00000031411)	KBTBD4 (ENSRROG00000043819)	PTPMT1 (ENSRROG00000030092)	CELF1 (ENSRROG00000032588)	RAPSN (ENSRROG00000040174)	ENSRROG00000041915	SLC39A13 (ENSRROG00000038485)	SPI1 (ENSRROG00000045565)	MYBPC3 (ENSRROG00000043489)	MADD (ENSRROG00000041291) #20	NR1H3 (ENSRROG00000045605) #21	ACP2 (ENSRROG00000028745) #22	DDB2 (ENSRROG00000045383) #23	PACSIN3 (ENSRROG00000041480) #24	ARFGAP2 (ENSRROG00000030954) #25	CSTPP1 (ENSRROG00000045631) #26	LRP4 (ENSRROG00000039736)	CKAP5 (ENSRROG00000039765)	F2 (ENSRROG00000038131)	ZNF408 (ENSRROG00000033904)	ARHGAP1 (ENSRROG00000037876)	ATG13 (ENSRROG00000031087)	HARBI1 (ENSRROG00000031237)	AMBRA1 (ENSRROG00000034630)	CHRM4 (ENSRROG00000024047)	ENSRROG00000040007	DGKZ (ENSRROG00000044186)
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E.s.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568.s #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b.n.b	ENSGT00940000156152
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E.s.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568.s #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b.n.b	ENSGT00940000156152
Marmoset	MODERN SPECIES	2	FNBP4 (ENSCJAG00000020254)	AGBL2 (ENSCJAG00000020239)	MTCH2 (ENSCJAG00000020213)	ENSCJAG00000039852	FAM180B (ENSCJAG00000043701)	NDUFS3 (ENSCJAG00000020194)	KBTBD4 (ENSCJAG00000020173)	PTPMT1 (ENSCJAG00000020163)	CELF1 (ENSCJAG00000020133)	RAPSN (ENSCJAG00000020129)	ENSCJAG00000020108	SPI1 (ENSCJAG00000020100)	MYBPC3 (ENSCJAG00000020066)	MADD (ENSCJAG00000020045) #20	NR1H3 (ENSCJAG00000020019) #21	ACP2 (ENSCJAG00000020008) #22	SLC39A13 (ENSCJAG00000020101)	DDB2 (ENSCJAG00000020000) #23	PACSIN3 (ENSCJAG00000019993) #24	ENSCJAG00000019965 #25	CSTPP1 (ENSCJAG00000019962) #26	LRP4 (ENSCJAG00000019944)	CKAP5 (ENSCJAG00000019878)	F2 (ENSCJAG00000019864)	ZNF408 (ENSCJAG00000019859)	ARHGAP1 (ENSCJAG00000019849)	ATG13 (ENSCJAG00000019823)	HARBI1 (ENSCJAG00000046232)	AMBRA1 (ENSCJAG00000002155)	CHRM4 (ENSCJAG00000011861)	ENSCJAG00000011852
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E.s.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568.s.a #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b.n.b	ENSGT00940000156152
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	42	AGBL2 (ENSSBOG00000023063)	MTCH2 (ENSSBOG00000027552)	C1QTNF4 (ENSSBOG00000033834)	FAM180B (ENSSBOG00000029352)	ENSSBOG00000001386	KBTBD4 (ENSSBOG00000030700)	ENSSBOG00000025269	CELF1 (ENSSBOG00000021912)	RAPSN (ENSSBOG00000022262)	ENSSBOG00000006227	SLC39A13 (ENSSBOG00000010603)	SPI1 (ENSSBOG00000022091)	MYBPC3 (ENSSBOG00000030340)	MADD (ENSSBOG00000021915) #20	NR1H3 (ENSSBOG00000027982) #21	ACP2 (ENSSBOG00000033600) #22	DDB2 (ENSSBOG00000030867) #23	PACSIN3 (ENSSBOG00000033696) #24	ENSSBOG00000031368 #25	CSTPP1 (ENSSBOG00000033686) #26	LRP4 (ENSSBOG00000032261)	ENSSBOG00000032726	ENSSBOG00000028063	CKAP5 (ENSSBOG00000031735)	F2 (ENSSBOG00000020779)	ZNF408 (ENSSBOG00000033023)	ARHGAP1 (ENSSBOG00000032970)	ATG13 (ENSSBOG00000009657)	HARBI1 (ENSSBOG00000025915)	AMBRA1 (ENSSBOG00000021917)	CHRM4 (ENSSBOG00000015294)
Capuchin	MODERN SPECIES	58		AGBL2 (ENSCCAG00000026390)	MTCH2 (ENSCCAG00000035226)	FAM180B (ENSCCAG00000028252)	NDUFS3 (ENSCCAG00000031365)	KBTBD4 (ENSCCAG00000020004)	PTPMT1 (ENSCCAG00000034346)	CELF1 (ENSCCAG00000033487)	RAPSN (ENSCCAG00000022014)	PSMC3 (ENSCCAG00000025080)	SLC39A13 (ENSCCAG00000034535)	SPI1 (ENSCCAG00000022473)	MYBPC3 (ENSCCAG00000036859)	MADD (ENSCCAG00000036617) #20	NR1H3 (ENSCCAG00000024854) #21	ACP2 (ENSCCAG00000022333) #22	DDB2 (ENSCCAG00000031012) #23	PACSIN3 (ENSCCAG00000031265) #24	ENSCCAG00000036464 #25	C11orf49 (ENSCCAG00000028967) #26	LRP4 (ENSCCAG00000034888)	ENSCCAG00000033202	CKAP5 (ENSCCAG00000029859)	PGAM4 (ENSCCAG00000037081)	F2 (ENSCCAG00000028699)	ZNF408 (ENSCCAG00000029472)	ARHGAP1 (ENSCCAG00000005865)	ATG13 (ENSCCAG00000033415)	HARBI1 (ENSCCAG00000033538)	AMBRA1 (ENSCCAG00000036631)	CHRM4 (ENSCCAG00000016622)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	349	FNBP4 (ENSANAG00000027721)	AGBL2 (ENSANAG00000033268)	MTCH2 (ENSANAG00000022984)	FAM180B (ENSANAG00000021375)	NDUFS3 (ENSANAG00000030907)	KBTBD4 (ENSANAG00000029505)	ENSANAG00000033117	CELF1 (ENSANAG00000031770)	RAPSN (ENSANAG00000022248)	ENSANAG00000037076	SLC39A13 (ENSANAG00000027448)	SPI1 (ENSANAG00000029485)	MYBPC3 (ENSANAG00000023289)	MADD (ENSANAG00000024603) #20	NR1H3 (ENSANAG00000037990) #21	ACP2 (ENSANAG00000032696) #22	DDB2 (ENSANAG00000036510) #23	PACSIN3 (ENSANAG00000030038) #24	ARFGAP2 (ENSANAG00000031850) #25	ENSANAG00000026796	CSTPP1 (ENSANAG00000037882) #26	LRP4 (ENSANAG00000038492)	ENSANAG00000038320	CKAP5 (ENSANAG00000031236)	F2 (ENSANAG00000036904)	ZNF408 (ENSANAG00000036294)	ARHGAP1 (ENSANAG00000038289)	ATG13 (ENSANAG00000036615)	HARBI1 (ENSANAG00000038532)	AMBRA1 (ENSANAG00000037577)	CHRM4 (ENSANAG00000007361)
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000003450	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Mouse lemur	MODERN SPECIES	27	ENSMICG00000005314	MTCH2 (ENSMICG00000027810)	FAM180B (ENSMICG00000001091)	NDUFS3 (ENSMICG00000045989)	KBTBD4 (ENSMICG00000001087)	PTPMT1 (ENSMICG00000028273)	CELF1 (ENSMICG00000045113)	ENSMICG00000043341	RAPSN (ENSMICG00000007148)	PSMC3 (ENSMICG00000007138)	SLC39A13 (ENSMICG00000007125)	SPI1 (ENSMICG00000007120)	MYBPC3 (ENSMICG00000007096)	MADD (ENSMICG00000007074) #20	NR1H3 (ENSMICG00000007066) #21	ACP2 (ENSMICG00000007053) #22	DDB2 (ENSMICG00000007047) #23	PACSIN3 (ENSMICG00000007038) #24	ENSMICG00000007019 #25	CSTPP1 (ENSMICG00000007010) #26	LRP4 (ENSMICG00000006982)	CKAP5 (ENSMICG00000006951)	F2 (ENSMICG00000006934)	ZNF408 (ENSMICG00000045320)	ARHGAP1 (ENSMICG00000006918)	ATG13 (ENSMICG00000006905)	HARBI1 (ENSMICG00000029266)	AMBRA1 (ENSMICG00000006891)	CHRM4 (ENSMICG00000042428)	MDK (ENSMICG00000006889)	DGKZ (ENSMICG00000006865)
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	75	ENSGT00390000003450	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	1076	AGBL2 (ENSPSMG00000019802)	ENSPSMG00000019812	ENSPSMG00000019906	FAM180B (ENSPSMG00000019935)	NDUFS3 (ENSPSMG00000019959)	KBTBD4 (ENSPSMG00000019995)	PTPMT1 (ENSPSMG00000020020)	CELF1 (ENSPSMG00000020100)	RAPSN (ENSPSMG00000020171)	PSMC3 (ENSPSMG00000020244)	SLC39A13 (ENSPSMG00000020336)	SPI1 (ENSPSMG00000020380)	MYBPC3 (ENSPSMG00000020533)	MADD (ENSPSMG00000021740) #20	NR1H3 (ENSPSMG00000022646) #21	ACP2 (ENSPSMG00000022714) #22	DDB2 (ENSPSMG00000022768) #23	PACSIN3 (ENSPSMG00000022785) #24	ARFGAP2 (ENSPSMG00000022927) #25	CSTPP1 (ENSPSMG00000022997) #26
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	328	FNBP4 (ENSPCOG00000016107)	AGBL2 (ENSPCOG00000020344)	MTCH2 (ENSPCOG00000018416)	FAM180B (ENSPCOG00000014736)	NDUFS3 (ENSPCOG00000012926)	KBTBD4 (ENSPCOG00000017241)	PTPMT1 (ENSPCOG00000026725)	CELF1 (ENSPCOG00000021865)	RAPSN (ENSPCOG00000019055)	PSMC3 (ENSPCOG00000020878)	SLC39A13 (ENSPCOG00000020868)	SPI1 (ENSPCOG00000026208)	MYBPC3 (ENSPCOG00000018047)	MADD (ENSPCOG00000013832) #20	NR1H3 (ENSPCOG00000023831) #21	ACP2 (ENSPCOG00000027729) #22	DDB2 (ENSPCOG00000022207) #23	PACSIN3 (ENSPCOG00000020469) #24	ARFGAP2 (ENSPCOG00000028490) #25	CSTPP1 (ENSPCOG00000013763) #26	LRP4 (ENSPCOG00000028608)	CKAP5 (ENSPCOG00000017517)	F2 (ENSPCOG00000018345)	ZNF408 (ENSPCOG00000028698)	ARHGAP1 (ENSPCOG00000020308)	ATG13 (ENSPCOG00000023763)	HARBI1 (ENSPCOG00000027989)	AMBRA1 (ENSPCOG00000028231)	CHRM4 (ENSPCOG00000013773)	MDK (ENSPCOG00000017622)	DGKZ (ENSPCOG00000026865)
Bushbaby	MODERN SPECIES	116	MTCH2 (ENSOGAG00000011607)	C1QTNF4 (ENSOGAG00000025902)	FAM180B (ENSOGAG00000032394)	NDUFS3 (ENSOGAG00000011606)	ENSOGAG00000030764	KBTBD4 (ENSOGAG00000028799)	PTPMT1 (ENSOGAG00000031935)	CELF1 (ENSOGAG00000011600)	RAPSN (ENSOGAG00000027783)	ENSOGAG00000015289	SLC39A13 (ENSOGAG00000012440)	SPI1 (ENSOGAG00000012435)	MYBPC3 (ENSOGAG00000012425)	MADD (ENSOGAG00000012414) #20	NR1H3 (ENSOGAG00000012410) #21	ACP2 (ENSOGAG00000025562) #22	DDB2 (ENSOGAG00000012408) #23	PACSIN3 (ENSOGAG00000012403) #24	ARFGAP2 (ENSOGAG00000012399) #25	ENSOGAG00000026518	CSTPP1 (ENSOGAG00000012396) #26	LRP4 (ENSOGAG00000011979)	CKAP5 (ENSOGAG00000004560)	F2 (ENSOGAG00000004555)	ZNF408 (ENSOGAG00000034080)	ARHGAP1 (ENSOGAG00000014288)	ATG13 (ENSOGAG00000004547)	HARBI1 (ENSOGAG00000004554)	ENSOGAG00000033750	AMBRA1 (ENSOGAG00000002355)	CHRM4 (ENSOGAG00000033812)
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Tree shrew	MODERN SPECIES	1561												ENSTBEG00000001919	MYBPC3 (ENSTBEG00000000966)	MADD (ENSTBEG00000000554) #20	NR1H3 (ENSTBEG00000000492) #21	ACP2 (ENSTBEG00000000444) #22	DDB2 (ENSTBEG00000000275) #23
Glires	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000003450	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000164059	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00940000156152	ENSGT00940000159848
Rabbit	MODERN SPECIES		FNBP4 (ENSOCUG00000017534)	AGBL2 (ENSOCUG00000017524)	MTCH2 (ENSOCUG00000006368)	C1QTNF4 (ENSOCUG00000006365)	FAM180B (ENSOCUG00000006361)	NDUFS3 (ENSOCUG00000006359)	KBTBD4 (ENSOCUG00000006353)	PTPMT1 (ENSOCUG00000021229)	CELF1 (ENSOCUG00000001311)	RAPSN (ENSOCUG00000008892)	PSMC3 (ENSOCUG00000026980)	SLC39A13 (ENSOCUG00000005557)	MYBPC3 (ENSOCUG00000002112)	MADD (ENSOCUG00000002099) #20	NR1H3 (ENSOCUG00000002095) #21	ACP2 (ENSOCUG00000013342) #22	DDB2 (ENSOCUG00000002076) #23	PACSIN3 (ENSOCUG00000027715) #24	ENSOCUG00000002073 #25	CSTPP1 (ENSOCUG00000002066) #26	LRP4 (ENSOCUG00000002052)	CKAP5 (ENSOCUG00000016200)	ZNF408 (ENSOCUG00000010953)	ARHGAP1 (ENSOCUG00000016160)	ATG13 (ENSOCUG00000016144)	HARBI1 (ENSOCUG00000016137)	AMBRA1 (ENSOCUG00000016117)	CHRM4 (ENSOCUG00000021064)	ENSOCUG00000024752	CREB3L1 (ENSOCUG00000004418)	PHF21A (ENSOCUG00000001675)
Pika	MODERN SPECIES	3586													MYBPC3 (ENSOPRG00000009569)	MADD (ENSOPRG00000009509) #20	NR1H3 (ENSOPRG00000009497) #21	ACP2 (ENSOPRG00000009485) #22	DDB2 (ENSOPRG00000009468) #23	PACSIN3 (ENSOPRG00000009451) #24	ARFGAP2 (ENSOPRG00000009432) #25	CSTPP1 (ENSOPRG00000009417) #26	LRP4 (ENSOPRG00000009347)	CKAP5 (ENSOPRG00000009287)	ENSOPRG00000009249	ZNF408 (ENSOPRG00000009225)	ARHGAP1 (ENSOPRG00000009201)	ATG13 (ENSOPRG00000009172)
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000003450	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000003450	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000003450	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000003450	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000003450	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00390000003450	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	17	Nup160 (ENSPEMG00000018101)	Fnbp4 (ENSPEMG00000016688)	Agbl2 (ENSPEMG00000001437)	Mtch2 (ENSPEMG00000010063)	C1qtnf4 (ENSPEMG00000024602)	Ndufs3 (ENSPEMG00000007248)	Kbtbd4 (ENSPEMG00000001992)	Ptpmt1 (ENSPEMG00000030250)	Celf1 (ENSPEMG00000015644)	Rapsn (ENSPEMG00000016952)	Slc39a13 (ENSPEMG00000016290)	Spi1 (ENSPEMG00000009647)	Mybpc3 (ENSPEMG00000009479)	Madd (ENSPEMG00000001264) #20	Nr1h3 (ENSPEMG00000018824) #21	Acp2 (ENSPEMG00000011860) #22	Ddb2 (ENSPEMG00000012899) #23	Pacsin3 (ENSPEMG00000018424) #24	Arfgap2 (ENSPEMG00000009220) #25	Cstpp1 (ENSPEMG00000018931) #26	Lrp4 (ENSPEMG00000015598)	Ckap5 (ENSPEMG00000007231)	F2 (ENSPEMG00000018118)	Zfp408 (ENSPEMG00000016757)	Arhgap1 (ENSPEMG00000011370)	Atg13 (ENSPEMG00000017021)	Harbi1 (ENSPEMG00000013606)	ENSPEMG00000025318	Ambra1 (ENSPEMG00000005111)	Chrm4 (ENSPEMG00000028345)	Mdk (ENSPEMG00000014123)
Prairie vole	MODERN SPECIES	81	Agbl2 (ENSMOCG00000015547)	Mtch2 (ENSMOCG00000001577)	C1qtnf4 (ENSMOCG00000013500)	Ndufs3 (ENSMOCG00000009375)	Kbtbd4 (ENSMOCG00000021780)	Ptpmt1 (ENSMOCG00000018913)	Celf1 (ENSMOCG00000012633)	Rapsn (ENSMOCG00000012267)	Psmc3 (ENSMOCG00000001464)	ENSMOCG00000006097	ENSMOCG00000008195	Spi1 (ENSMOCG00000006114)	Mybpc3 (ENSMOCG00000008344)	Madd (ENSMOCG00000003278) #20	Nr1h3 (ENSMOCG00000010671) #21	Acp2 (ENSMOCG00000002882) #22	Ddb2 (ENSMOCG00000021291) #23	Pacsin3 (ENSMOCG00000022577) #24	Arfgap2 (ENSMOCG00000016700) #25	Cstpp1 (ENSMOCG00000006672) #26	Lrp4 (ENSMOCG00000005823)	Ckap5 (ENSMOCG00000022214)	F2 (ENSMOCG00000019585)	Arhgap1 (ENSMOCG00000008533)	Atg13 (ENSMOCG00000018209)	ENSMOCG00000007253	Ambra1 (ENSMOCG00000018792)	Chrm4 (ENSMOCG00000016103)	Mdk (ENSMOCG00000014474)	Dgkz (ENSMOCG00000000694)	Creb3l1 (ENSMOCG00000012802)
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000003450	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	188	Fnbp4 (ENSCGRG00001022832)	Agbl2 (ENSCGRG00001000549)	Mtch2 (ENSCGRG00001024807)	C1qtnf4 (ENSCGRG00001007540)	Ndufs3 (ENSCGRG00001024136)	Kbtbd4 (ENSCGRG00001023919)	Ptpmt1 (ENSCGRG00001012152)	Celf1 (ENSCGRG00001011274)	Rapsn (ENSCGRG00001009650)	Psmc3 (ENSCGRG00001005657)	Slc39a13 (ENSCGRG00001003447)	Spi1 (ENSCGRG00001009684)	Mybpc3 (ENSCGRG00001006702)	Madd (ENSCGRG00001024681) #20	Nr1h3 (ENSCGRG00001022656) #21	Acp2 (ENSCGRG00001022138) #22	Ddb2 (ENSCGRG00001012939) #23	Pacsin3 (ENSCGRG00001011840) #24	Arfgap2 (ENSCGRG00001010700) #25	Cstpp1 (ENSCGRG00001020042) #26	Lrp4 (ENSCGRG00001018783)	Ckap5 (ENSCGRG00001013368)	F2 (ENSCGRG00001023426)	Zfp408 (ENSCGRG00001023588)	Arhgap1 (ENSCGRG00001023260)	ENSCGRG00001022859	Atg13 (ENSCGRG00001022112)	Harbi1 (ENSCGRG00001021313)	Ambra1 (ENSCGRG00001020313)	Chrm4 (ENSCGRG00001012019)	Mdk (ENSCGRG00001022566)
Golden Hamster	MODERN SPECIES	618	Nup160 (ENSMAUG00000009877)	Agbl2 (ENSMAUG00000013242)	Mtch2 (ENSMAUG00000009619)	C1qtnf4 (ENSMAUG00000009128)	Ndufs3 (ENSMAUG00000010036)	Kbtbd4 (ENSMAUG00000009694)	Ptpmt1 (ENSMAUG00000010436)	Celf1 (ENSMAUG00000009468)	Rapsn (ENSMAUG00000008690)	Psmc3 (ENSMAUG00000007346)	ENSMAUG00000009110	Spi1 (ENSMAUG00000008854)	Mybpc3 (ENSMAUG00000008229)	Madd (ENSMAUG00000009156) #20	Nr1h3 (ENSMAUG00000008657) #21	Acp2 (ENSMAUG00000007767) #22	Ddb2 (ENSMAUG00000010179) #23	Pacsin3 (ENSMAUG00000009572) #24	Arfgap2 (ENSMAUG00000009218) #25	ENSMAUG00000008870	ENSMAUG00000008742	Cstpp1 (ENSMAUG00000008635) #26	Lrp4 (ENSMAUG00000016435)	Ckap5 (ENSMAUG00000012944)	F2 (ENSMAUG00000009414)	Arhgap1 (ENSMAUG00000012048)	Atg13 (ENSMAUG00000011052)	Harbi1 (ENSMAUG00000012193)	Ambra1 (ENSMAUG00000008821)	Chrm4 (ENSMAUG00000007510)	Mdk (ENSMAUG00000006759)
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000003450	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Mus	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000003450	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000003450	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b.g
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000003450	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b.g
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000003450	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b.g
spretus	MODERN SPECIES	11	Nup160 (MGP_SPRETEiJ_G0024852)	Fnbp4 (MGP_SPRETEiJ_G0024853)	Agbl2 (MGP_SPRETEiJ_G0024854)	Mtch2 (MGP_SPRETEiJ_G0024855)	C1qtnf4 (MGP_SPRETEiJ_G0024856)	Ndufs3 (MGP_SPRETEiJ_G0024857)	Kbtbd4 (MGP_SPRETEiJ_G0024858)	Celf1 (MGP_SPRETEiJ_G0024859)	Rapsn (MGP_SPRETEiJ_G0024860)	Psmc3 (MGP_SPRETEiJ_G0024861)	Slc39a13 (MGP_SPRETEiJ_G0024862)	Spi1 (MGP_SPRETEiJ_G0024863)	Mybpc3 (MGP_SPRETEiJ_G0024864)	Madd (MGP_SPRETEiJ_G0024865) #20	Nr1h3 (MGP_SPRETEiJ_G0024866) #21	Acp2 (MGP_SPRETEiJ_G0024867) #22	Ddb2 (MGP_SPRETEiJ_G0024868) #23	Pacsin3 (MGP_SPRETEiJ_G0024869) #24	Arfgap2 (MGP_SPRETEiJ_G0024870) #25	Cstpp1 (MGP_SPRETEiJ_G0024871) #26	Lrp4 (MGP_SPRETEiJ_G0024872)	Ckap5 (MGP_SPRETEiJ_G0024873)	F2 (MGP_SPRETEiJ_G0024874)	Zfp408 (MGP_SPRETEiJ_G0024875)	Arhgap1 (MGP_SPRETEiJ_G0024876)	Atg13 (MGP_SPRETEiJ_G0024877)	Harbi1 (MGP_SPRETEiJ_G0024878)	Ambra1 (MGP_SPRETEiJ_G0024879)	Chrm4 (MGP_SPRETEiJ_G0024880)	Mdk (MGP_SPRETEiJ_G0024881)	Dgkz (MGP_SPRETEiJ_G0024882)
Steppe mouse	MODERN SPECIES	36	Agbl2 (ENSMSIG00000027703)	ENSMSIG00000027642	C1qtnf4 (ENSMSIG00000027637)	Ndufs3 (ENSMSIG00000027630)	Kbtbd4 (ENSMSIG00000027623)	ENSMSIG00000027615	Celf1 (ENSMSIG00000027572)	ENSMSIG00000027554	Rapsn (ENSMSIG00000027530)	Psmc3 (ENSMSIG00000027459)	Slc39a13 (ENSMSIG00000027429)	Spi1 (ENSMSIG00000027421)	Mybpc3 (ENSMSIG00000027308)	Madd (ENSMSIG00000021063) #20	Nr1h3 (ENSMSIG00000020950) #21	Acp2 (ENSMSIG00000020936) #22	Ddb2 (ENSMSIG00000020921) #23	Pacsin3 (ENSMSIG00000020892) #24	Arfgap2 (ENSMSIG00000020760) #25	ENSMSIG00000020727 #26	ENSMSIG00000020721	Lrp4 (ENSMSIG00000020667)	ENSMSIG00000020658	Ckap5 (ENSMSIG00000020211)	F2 (ENSMSIG00000020083)	Zfp408 (ENSMSIG00000020068)	Arhgap1 (ENSMSIG00000020000)	Atg13 (ENSMSIG00000019915)	Harbi1 (ENSMSIG00000019911)	Ambra1 (ENSMSIG00000019820)	Chrm4 (ENSMSIG00000019816)
Mouse	MODERN SPECIES	11	Fnbp4 (ENSMUSG00000008200)	Agbl2 (ENSMUSG00000040812)	Mtch2 (ENSMUSG00000027282)	C1qtnf4 (ENSMUSG00000040794)	Ndufs3 (ENSMUSG00000005510)	Kbtbd4 (ENSMUSG00000005505)	Ptpmt1 (ENSMUSG00000063235)	Celf1 (ENSMUSG00000005506)	Rapsn (ENSMUSG00000002104)	Psmc3 (ENSMUSG00000002102)	Slc39a13 (ENSMUSG00000002105)	Spi1 (ENSMUSG00000002111)	Mybpc3 (ENSMUSG00000002100)	Madd (ENSMUSG00000040687) #20	Nr1h3 (ENSMUSG00000002108) #21	Acp2 (ENSMUSG00000002103) #22	Ddb2 (ENSMUSG00000002109) #23	Pacsin3 (ENSMUSG00000027257) #24	Arfgap2 (ENSMUSG00000027255) #25	Cstpp1 (ENSMUSG00000040591) #26	Lrp4 (ENSMUSG00000027253)	Ckap5 (ENSMUSG00000040549)	F2 (ENSMUSG00000027249)	Zfp408 (ENSMUSG00000075040)	Arhgap1 (ENSMUSG00000027247)	Atg13 (ENSMUSG00000027244)	Harbi1 (ENSMUSG00000027243)	Ambra1 (ENSMUSG00000040506)	Chrm4 (ENSMUSG00000040495)	Mdk (ENSMUSG00000027239)	Dgkz (ENSMUSG00000040479)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	11	Nup160 (MGP_CAROLIEiJ_G0023941)	Fnbp4 (MGP_CAROLIEiJ_G0023942)	Agbl2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023943)	Mtch2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023944)	Madd (MGP_CAROLIEiJ_G0023945) #20	C1qtnf4 (MGP_CAROLIEiJ_G0023946)	Ndufs3 (MGP_CAROLIEiJ_G0023947)	Kbtbd4 (MGP_CAROLIEiJ_G0023948)	Celf1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023949)	Rapsn (MGP_CAROLIEiJ_G0023950)	Psmc3 (MGP_CAROLIEiJ_G0023951)	Slc39a13 (MGP_CAROLIEiJ_G0023952)	Spi1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023953)	Mybpc3 (MGP_CAROLIEiJ_G0023954)	Nr1h3 (MGP_CAROLIEiJ_G0023955) #21	Acp2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023956) #22	Ddb2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023957) #23	Pacsin3 (MGP_CAROLIEiJ_G0023958) #24	Arfgap2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023959) #25	Cstpp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023960) #26	MGP_CAROLIEiJ_G0023961	Lrp4 (MGP_CAROLIEiJ_G0023962)	Ckap5 (MGP_CAROLIEiJ_G0023963)	F2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023964)	Zfp408 (MGP_CAROLIEiJ_G0023965)	Arhgap1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023966)	Atg13 (MGP_CAROLIEiJ_G0023967)	Harbi1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023968)	Ambra1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023969)	Chrm4 (MGP_CAROLIEiJ_G0023970)	Mdk (MGP_CAROLIEiJ_G0023971)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	16	Nup160 (MGP_PahariEiJ_G0025378)	Fnbp4 (MGP_PahariEiJ_G0025379)	Agbl2 (MGP_PahariEiJ_G0025380)	Mtch2 (MGP_PahariEiJ_G0025381)	C1qtnf4 (MGP_PahariEiJ_G0025382)	Ndufs3 (MGP_PahariEiJ_G0025383)	Kbtbd4 (MGP_PahariEiJ_G0025384)	Celf1 (MGP_PahariEiJ_G0025385)	Rapsn (MGP_PahariEiJ_G0025386)	Psmc3 (MGP_PahariEiJ_G0025387)	Slc39a13 (MGP_PahariEiJ_G0025388)	Spi1 (MGP_PahariEiJ_G0025389)	Mybpc3 (MGP_PahariEiJ_G0025390)	Madd (MGP_PahariEiJ_G0025391) #20	Nr1h3 (MGP_PahariEiJ_G0025392) #21	Acp2 (MGP_PahariEiJ_G0025393) #22	Ddb2 (MGP_PahariEiJ_G0025394) #23	Pacsin3 (MGP_PahariEiJ_G0025395) #24	Arfgap2 (MGP_PahariEiJ_G0025396) #25	Cstpp1 (MGP_PahariEiJ_G0025397) #26	MGP_PahariEiJ_G0025398	Lrp4 (MGP_PahariEiJ_G0025399)	Ckap5 (MGP_PahariEiJ_G0025400)	F2 (MGP_PahariEiJ_G0025401)	Zfp408 (MGP_PahariEiJ_G0025402)	Arhgap1 (MGP_PahariEiJ_G0025403)	Atg13 (MGP_PahariEiJ_G0025404)	Harbi1 (MGP_PahariEiJ_G0025405)	Ambra1 (MGP_PahariEiJ_G0025406)	Chrm4 (MGP_PahariEiJ_G0025407)	Mdk (MGP_PahariEiJ_G0025408)
Rat	MODERN SPECIES	13	Fnbp4 (ENSRNOG00000007241)	Agbl2 (ENSRNOG00000008467)	Mtch2 (ENSRNOG00000058658)	C1qtnf4 (ENSRNOG00000069579)	Ndufs3 (ENSRNOG00000009155)	Kbtbd4 (ENSRNOG00000009397)	Ptpmt1 (ENSRNOG00000009723)	Celf1 (ENSRNOG00000010379)	Rapsn (ENSRNOG00000011208)	Psmc3 (ENSRNOG00000011414)	Slc39a13 (ENSRNOG00000011981)	Spi1 (ENSRNOG00000012172)	Mybpc3 (ENSRNOG00000012307)	Madd (ENSRNOG00000012568) #20	Nr1h3 (ENSRNOG00000013172) #21	Acp2 (ENSRNOG00000013594) #22	Ddb2 (ENSRNOG00000014071) #23	Pacsin3 (ENSRNOG00000014204) #24	Arfgap2 (ENSRNOG00000014429) #25	Cstpp1 (ENSRNOG00000014798) #26	Lrp4 (ENSRNOG00000015285)	Ckap5 (ENSRNOG00000016067)	F2 (ENSRNOG00000016325)	ENSRNOG00000070459	Arhgap1 (ENSRNOG00000016610)	Atg13 (ENSRNOG00000016984)	Ambra1 (ENSRNOG00000017422)	Chrm4 (ENSRNOG00000017556)	Mdk (ENSRNOG00000017560)	Dgkz (ENSRNOG00000017737)	Creb3l1 (ENSRNOG00000005413)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1238	Agbl2 (ENSNGAG00000000234)	Mtch2 (ENSNGAG00000003094)	C1qtnf4 (ENSNGAG00000009680)	Ndufs3 (ENSNGAG00000012046)	Kbtbd4 (ENSNGAG00000000276)	Ptpmt1 (ENSNGAG00000017776)	ENSNGAG00000018260	Celf1 (ENSNGAG00000017390)	Rapsn (ENSNGAG00000007295)	Psmc3 (ENSNGAG00000017843)	Slc39a13 (ENSNGAG00000017536)	Spi1 (ENSNGAG00000010713)	Mybpc3 (ENSNGAG00000000260)	Madd (ENSNGAG00000017768) #20	Nr1h3 (ENSNGAG00000015402) #21	Acp2 (ENSNGAG00000007455) #22	Ddb2 (ENSNGAG00000017336) #23	Pacsin3 (ENSNGAG00000014205) #24	Arfgap2 (ENSNGAG00000009124) #25	Cstpp1 (ENSNGAG00000000171) #26	Lrp4 (ENSNGAG00000020436)	Ckap5 (ENSNGAG00000001579)	F2 (ENSNGAG00000010351)	Zfp408 (ENSNGAG00000000309)	Arhgap1 (ENSNGAG00000013969)	Atg13 (ENSNGAG00000015785)	ENSNGAG00000012504
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	62	Nup160 (ENSJJAG00000020091)	Fnbp4 (ENSJJAG00000009203)	Agbl2 (ENSJJAG00000022894)	Mtch2 (ENSJJAG00000011880)	C1qtnf4 (ENSJJAG00000023278)	Ndufs3 (ENSJJAG00000023557)	Kbtbd4 (ENSJJAG00000020543)	Celf1 (ENSJJAG00000020280)	Rapsn (ENSJJAG00000020297)	Psmc3 (ENSJJAG00000021354)	Slc39a13 (ENSJJAG00000007370)	Spi1 (ENSJJAG00000019221)	Mybpc3 (ENSJJAG00000018706)	Madd (ENSJJAG00000015606) #20	Nr1h3 (ENSJJAG00000020697) #21	Acp2 (ENSJJAG00000019515) #22	Ddb2 (ENSJJAG00000016552) #23	Pacsin3 (ENSJJAG00000023252) #24	Arfgap2 (ENSJJAG00000003129) #25	Cstpp1 (ENSJJAG00000008330) #26	Lrp4 (ENSJJAG00000014851)	Ckap5 (ENSJJAG00000023265)	F2 (ENSJJAG00000005619)	Zfp408 (ENSJJAG00000015381)	Arhgap1 (ENSJJAG00000022610)	Atg13 (ENSJJAG00000024173)	ENSJJAG00000015195	ENSJJAG00000016975	Ambra1 (ENSJJAG00000004138)	Chrm4 (ENSJJAG00000010466)	Mdk (ENSJJAG00000023305)
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	444	Nup160 (ENSDORG00000004246)	Fnbp4 (ENSDORG00000004245)	Agbl2 (ENSDORG00000025903)	Mtch2 (ENSDORG00000001511)	C1qtnf4 (ENSDORG00000015597)	Kbtbd4 (ENSDORG00000015593)	Ptpmt1 (ENSDORG00000015591)	Celf1 (ENSDORG00000013721)	Rapsn (ENSDORG00000000757)	Psmc3 (ENSDORG00000000756)	Slc39a13 (ENSDORG00000000753)	Spi1 (ENSDORG00000007758)	Mybpc3 (ENSDORG00000007751)	Madd (ENSDORG00000007749) #20	Nr1h3 (ENSDORG00000007747) #21	Acp2 (ENSDORG00000007743) #22	Ddb2 (ENSDORG00000007741) #23	ENSDORG00000013060 #24	Arfgap2 (ENSDORG00000013057) #25	Cstpp1 (ENSDORG00000013052) #26	Lrp4 (ENSDORG00000001785)	Ckap5 (ENSDORG00000011373)	F2 (ENSDORG00000029579)	Zfp408 (ENSDORG00000000387)	Arhgap1 (ENSDORG00000000385)	Atg13 (ENSDORG00000000382)	ENSDORG00000028941	Ambra1 (ENSDORG00000008382)	Chrm4 (ENSDORG00000024984)	Mdk (ENSDORG00000029447)	Dgkz (ENSDORG00000008377)
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b.e	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b.e	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	208	MTCH2 (ENSUPAG00010014096)	C1QTNF4 (ENSUPAG00010014090)	FAM180B (ENSUPAG00010014076)	NDUFS3 (ENSUPAG00010014067)	KBTBD4 (ENSUPAG00010014056)	ENSUPAG00010014045	CELF1 (ENSUPAG00010013973)	RAPSN (ENSUPAG00010013926)	PSMC3 (ENSUPAG00010013908)	SLC39A13 (ENSUPAG00010013855)	SPI1 (ENSUPAG00010013850)	ENSUPAG00010013841	MYBPC3 (ENSUPAG00010013812)	MADD (ENSUPAG00010011229) #20	NR1H3 (ENSUPAG00010011188) #21	ACP2 (ENSUPAG00010011162) #22	DDB2 (ENSUPAG00010011149) #23	PACSIN3 (ENSUPAG00010011141) #24	ARFGAP2 (ENSUPAG00010011117) #25	CSTPP1 (ENSUPAG00010011093) #26	LRP4 (ENSUPAG00010011049)	CKAP5 (ENSUPAG00010010730)	F2 (ENSUPAG00010010714)	ZNF408 (ENSUPAG00010010704)	ARHGAP1 (ENSUPAG00010010696)	ATG13 (ENSUPAG00010010621)	HARBI1 (ENSUPAG00010010611)	AMBRA1 (ENSUPAG00010010430)	CHRM4 (ENSUPAG00010010417)	MDK (ENSUPAG00010010379)	DGKZ (ENSUPAG00010010211)
Squirrel	MODERN SPECIES	162	AGBL2 (ENSSTOG00000003491)	ENSSTOG00000028441	C1QTNF4 (ENSSTOG00000024273)	FAM180B (ENSSTOG00000000628)	NDUFS3 (ENSSTOG00000000622)	KBTBD4 (ENSSTOG00000020864)	PTPMT1 (ENSSTOG00000019770)	CELF1 (ENSSTOG00000000613)	RAPSN (ENSSTOG00000011047)	PSMC3 (ENSSTOG00000011038)	SLC39A13 (ENSSTOG00000027722)	SPI1 (ENSSTOG00000022735)	MYBPC3 (ENSSTOG00000026473)	MADD (ENSSTOG00000007626) #20	NR1H3 (ENSSTOG00000007611) #21	ACP2 (ENSSTOG00000007586) #22	DDB2 (ENSSTOG00000007571) #23	PACSIN3 (ENSSTOG00000007547) #24	ARFGAP2 (ENSSTOG00000007524) #25	CSTPP1 (ENSSTOG00000007512) #26	LRP4 (ENSSTOG00000005236)	CKAP5 (ENSSTOG00000005158)	F2 (ENSSTOG00000005130)	ZNF408 (ENSSTOG00000005114)	ARHGAP1 (ENSSTOG00000026557)	ATG13 (ENSSTOG00000005077)	HARBI1 (ENSSTOG00000005072)	AMBRA1 (ENSSTOG00000019411)	CHRM4 (ENSSTOG00000022455)	MDK (ENSSTOG00000027636)	DGKZ (ENSSTOG00000012704)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	3	ENSMMMG00000015743	ENSMMMG00000015697	ENSMMMG00000015683	FAM180B (ENSMMMG00000015675)	NDUFS3 (ENSMMMG00000015667)	KBTBD4 (ENSMMMG00000015654)	ENSMMMG00000015652	CELF1 (ENSMMMG00000015346)	RAPSN (ENSMMMG00000015294)	PSMC3 (ENSMMMG00000015270)	SLC39A13 (ENSMMMG00000015224)	SPI1 (ENSMMMG00000015212)	MYBPC3 (ENSMMMG00000015189)	MADD (ENSMMMG00000014606) #20	NR1H3 (ENSMMMG00000014541) #21	ACP2 (ENSMMMG00000014527) #22	DDB2 (ENSMMMG00000014518) #23	PACSIN3 (ENSMMMG00000014498) #24	ARFGAP2 (ENSMMMG00000014424) #25	CSTPP1 (ENSMMMG00000014382) #26	LRP4 (ENSMMMG00000014335)	CKAP5 (ENSMMMG00000013993)	F2 (ENSMMMG00000013961)	ZNF408 (ENSMMMG00000013944)	ARHGAP1 (ENSMMMG00000013934)	ATG13 (ENSMMMG00000013875)	HARBI1 (ENSMMMG00000013860)	AMBRA1 (ENSMMMG00000013284)	CHRM4 (ENSMMMG00000013278)	MDK (ENSMMMG00000013259)	DGKZ (ENSMMMG00000013155)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	2	FAM180B (ENSSVLG00005009289)	NDUFS3 (ENSSVLG00005009316)	KBTBD4 (ENSSVLG00005009359)	PTPMT1 (ENSSVLG00005009417)	CELF1 (ENSSVLG00005009492)	RAPSN (ENSSVLG00005009920)	ENSSVLG00005009993	ENSSVLG00005010167	ENSSVLG00005010225	ENSSVLG00005010302	SPI1 (ENSSVLG00005010597)	MYBPC3 (ENSSVLG00005010729)	MADD (ENSSVLG00005011762) #20	ENSSVLG00005012055	NR1H3 (ENSSVLG00005012159) #21	ACP2 (ENSSVLG00005012397) #22	DDB2 (ENSSVLG00005012634) #23	PACSIN3 (ENSSVLG00005013010) #24	ARFGAP2 (ENSSVLG00005013354) #25	CSTPP1 (ENSSVLG00005013495) #26	LRP4 (ENSSVLG00005013702)	CKAP5 (ENSSVLG00005013939)	F2 (ENSSVLG00005014116)	ARHGAP1 (ENSSVLG00005014685)	ENSSVLG00005014869	HARBI1 (ENSSVLG00005015510)	AMBRA1 (ENSSVLG00005015569)	CHRM4 (ENSSVLG00005015740)	MDK (ENSSVLG00005015782)	DGKZ (ENSSVLG00005015887)	ENSSVLG00005015926
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00390000003450	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152	ENSGT00860000136066
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000003450	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152	ENSGT00860000136066
Guinea pig	MODERN SPECIES	72	FNBP4 (ENSCPOG00000000320)	AGBL2 (ENSCPOG00000003935)	MTCH2 (ENSCPOG00000006293)	C1QTNF4 (ENSCPOG00000023948)	NDUFS3 (ENSCPOG00000006141)	KBTBD4 (ENSCPOG00000019448)	PTPMT1 (ENSCPOG00000031147)	CELF1 (ENSCPOG00000036381)	RAPSN (ENSCPOG00000015456)	PSMC3 (ENSCPOG00000008176)	SLC39A13 (ENSCPOG00000008169)	SPI1 (ENSCPOG00000022138)	MYBPC3 (ENSCPOG00000013368)	MADD (ENSCPOG00000013364) #20	NR1H3 (ENSCPOG00000013362) #21	ACP2 (ENSCPOG00000013359) #22	DDB2 (ENSCPOG00000013358) #23	PACSIN3 (ENSCPOG00000013356) #24	ARFGAP2 (ENSCPOG00000013352) #25	CSTPP1 (ENSCPOG00000020334) #26	LRP4 (ENSCPOG00000007072)	CKAP5 (ENSCPOG00000007054)	F2 (ENSCPOG00000026682)	ARHGAP1 (ENSCPOG00000013046)	ATG13 (ENSCPOG00000013042)	HARBI1 (ENSCPOG00000037304)	AMBRA1 (ENSCPOG00000007341)	CHRM4 (ENSCPOG00000020788)	MDK (ENSCPOG00000007340)	DGKZ (ENSCPOG00000009636)	CREB3L1 (ENSCPOG00000010073)
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000000972	ENSGT00390000003450	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152	ENSGT00860000136066
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	129	PTPRJ (ENSCLAG00000015568)	NUP160 (ENSCLAG00000015457)	FNBP4 (ENSCLAG00000014534)	MTCH2 (ENSCLAG00000012026)	C1QTNF4 (ENSCLAG00000015186)	NDUFS3 (ENSCLAG00000014873)	KBTBD4 (ENSCLAG00000016255)	CELF1 (ENSCLAG00000011791)	RAPSN (ENSCLAG00000015497)	PSMC3 (ENSCLAG00000013916)	SLC39A13 (ENSCLAG00000014480)	SPI1 (ENSCLAG00000017201)	MYBPC3 (ENSCLAG00000015418)	MADD (ENSCLAG00000012503) #20	NR1H3 (ENSCLAG00000013563) #21	ACP2 (ENSCLAG00000014608) #22	DDB2 (ENSCLAG00000016473) #23	ENSCLAG00000012709 #24	ARFGAP2 (ENSCLAG00000016467) #25	CSTPP1 (ENSCLAG00000014110) #26	LRP4 (ENSCLAG00000016159)	CKAP5 (ENSCLAG00000015801)	F2 (ENSCLAG00000015618)	ARHGAP1 (ENSCLAG00000013542)	ATG13 (ENSCLAG00000015328)	HARBI1 (ENSCLAG00000013578)	AMBRA1 (ENSCLAG00000015156)	CHRM4 (ENSCLAG00000013251)	MDK (ENSCLAG00000014462)	DGKZ (ENSCLAG00000016057)	ENSCLAG00000014194
Degu	MODERN SPECIES	59	PTPRJ (ENSODEG00000016025)	NUP160 (ENSODEG00000015381)	FNBP4 (ENSODEG00000016574)	AGBL2 (ENSODEG00000016111)	MTCH2 (ENSODEG00000015416)	NDUFS3 (ENSODEG00000015948)	KBTBD4 (ENSODEG00000015830)	CELF1 (ENSODEG00000015204)	RAPSN (ENSODEG00000015194)	ENSODEG00000016550	SLC39A13 (ENSODEG00000015895)	SPI1 (ENSODEG00000015369)	MYBPC3 (ENSODEG00000016030)	MADD (ENSODEG00000017645) #20	NR1H3 (ENSODEG00000016180) #21	ACP2 (ENSODEG00000015528) #22	ENSODEG00000015965 #24	ENSODEG00000016456 #25	CSTPP1 (ENSODEG00000016656) #26	LRP4 (ENSODEG00000015720)	CKAP5 (ENSODEG00000016409)	F2 (ENSODEG00000016157)	ARHGAP1 (ENSODEG00000016156)	ATG13 (ENSODEG00000017294)	ENSODEG00000016339	AMBRA1 (ENSODEG00000016633)	CHRM4 (ENSODEG00000020352)	MDK (ENSODEG00000015931)	DGKZ (ENSODEG00000016309)	ENSODEG00000016420	ENSODEG00000016039
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	14	ENSHGLG00000039374	ENSHGLG00000008506	ENSHGLG00000043784	MTCH2 (ENSHGLG00000017536)	FAM180B (ENSHGLG00000038229)	NDUFS3 (ENSHGLG00000018368)	KBTBD4 (ENSHGLG00000047234)	ENSHGLG00000037048	ENSHGLG00000006909	RAPSN (ENSHGLG00000008521)	PSMC3 (ENSHGLG00000005713)	SLC39A13 (ENSHGLG00000041087)	ENSHGLG00000011456	ENSHGLG00000044290	NR1H3 (ENSHGLG00000014541) #21	ENSHGLG00000036516 #22	DDB2 (ENSHGLG00000018689) #23	ENSHGLG00000040462 #25	CSTPP1 (ENSHGLG00000018725) #26	ARHGAP1 (ENSHGLG00000017685)	ENSHGLG00000013428	ENSHGLG00000018447	AMBRA1 (ENSHGLG00000017564)	ENSHGLG00000034290	ENSHGLG00000042531	ENSHGLG00000032476	CREB3L1 (ENSHGLG00000048284)	ENSHGLG00000033741	ENSHGLG00000037709	ENSHGLG00000050302	ENSHGLG00000032419
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00910000148141	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES	133													ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23
Hedgehog	MODERN SPECIES	8779																ENSEEUG00000000750 #22
Common shrew	MODERN SPECIES	2331													ENSSARG00000002570	ENSSARG00000002437 #20	NR1H3 (ENSSARG00000002403) #21	ACP2 (ENSSARG00000002360) #22	DDB2 (ENSSARG00000002337) #23
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00910000148141	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Suina	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Pig	MODERN SPECIES	10	FNBP4 (ENSSSCG00000030610)	AGBL2 (ENSSSCG00000040838)	ENSSSCG00000013232	C1QTNF4 (ENSSSCG00000013231)	FAM180B (ENSSSCG00000013230)	NDUFS3 (ENSSSCG00000032081)	KBTBD4 (ENSSSCG00000013227)	PTPMT1 (ENSSSCG00000013226)	CELF1 (ENSSSCG00000013233)	PSMC3 (ENSSSCG00000013239)	SLC39A13 (ENSSSCG00000013238)	SPI1 (ENSSSCG00000013237)	MYBPC3 (ENSSSCG00000013236)	MADD (ENSSSCG00000013235) #20	NR1H3 (ENSSSCG00000013241) #21	ACP2 (ENSSSCG00000013242) #22	DDB2 (ENSSSCG00000013243) #23	PACSIN3 (ENSSSCG00000013244) #24	ARFGAP2 (ENSSSCG00000013245) #25	CSTPP1 (ENSSSCG00000013246) #26	LRP4 (ENSSSCG00000013248)	CKAP5 (ENSSSCG00000013249)	ENSSSCG00000048195	F2 (ENSSSCG00000013252)	ZNF408 (ENSSSCG00000023097)	ARHGAP1 (ENSSSCG00000013256)	ATG13 (ENSSSCG00000013257)	HARBI1 (ENSSSCG00000013258)	AMBRA1 (ENSSSCG00000013262)	CHRM4 (ENSSSCG00000013261)	MDK (ENSSSCG00000013260)
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	919	MTCH2 (ENSCWAG00000011837)	ENSCWAG00000011908	FAM180B (ENSCWAG00000011934)	NDUFS3 (ENSCWAG00000011975)	KBTBD4 (ENSCWAG00000012134)	PTPMT1 (ENSCWAG00000012300)	CELF1 (ENSCWAG00000012400)	RAPSN (ENSCWAG00000012571)	PSMC3 (ENSCWAG00000012918)	SLC39A13 (ENSCWAG00000013013)	ENSCWAG00000013126	SPI1 (ENSCWAG00000013165)	MYBPC3 (ENSCWAG00000013297)	MADD (ENSCWAG00000014593) #20	NR1H3 (ENSCWAG00000020217) #21	ACP2 (ENSCWAG00000020271) #22	DDB2 (ENSCWAG00000020312) #23	PACSIN3 (ENSCWAG00000020363) #24	ARFGAP2 (ENSCWAG00000020384) #25	CSTPP1 (ENSCWAG00000020423) #26	ENSCWAG00000020438	LRP4 (ENSCWAG00000020453)	CKAP5 (ENSCWAG00000020545)	F2 (ENSCWAG00000020586)	ZNF408 (ENSCWAG00000020629)	ARHGAP1 (ENSCWAG00000020638)	ATG13 (ENSCWAG00000020671)	HARBI1 (ENSCWAG00000020778)	AMBRA1 (ENSCWAG00000020799)	CHRM4 (ENSCWAG00000020869)	MDK (ENSCWAG00000020882)
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Alpaca	MODERN SPECIES	3542														ENSVPAG00000011844 #20	NR1H3 (ENSVPAG00000011840) #21	ENSVPAG00000011836 #22	DDB2 (ENSVPAG00000011835) #23	PACSIN3 (ENSVPAG00000011833) #24	ARFGAP2 (ENSVPAG00000011832) #25	ENSVPAG00000011831 #26	LRP4 (ENSVPAG00000011829)	CKAP5 (ENSVPAG00000011827)	ZNF408 (ENSVPAG00000011825)	ATG13 (ENSVPAG00000011823)	HARBI1 (ENSVPAG00000011821)	AMBRA1 (ENSVPAG00000011817)
Arabian camel	MODERN SPECIES	1	AGBL2 (ENSCDRG00005001568)	MTCH2 (ENSCDRG00005001631)	ENSCDRG00005001659	FAM180B (ENSCDRG00005001672)	NDUFS3 (ENSCDRG00005001699)	KBTBD4 (ENSCDRG00005001788)	PTPMT1 (ENSCDRG00005001832)	CELF1 (ENSCDRG00005001849)	RAPSN (ENSCDRG00005001888)	PSMC3 (ENSCDRG00005001939)	SLC39A13 (ENSCDRG00005001964)	SPI1 (ENSCDRG00005001988)	MYBPC3 (ENSCDRG00005002015)	MADD (ENSCDRG00005002594) #20	NR1H3 (ENSCDRG00005006795) #21	ACP2 (ENSCDRG00005006623) #22	DDB2 (ENSCDRG00005007029) #23	PACSIN3 (ENSCDRG00005007398) #24	ARFGAP2 (ENSCDRG00005007474) #25	CSTPP1 (ENSCDRG00005008190) #26	ENSCDRG00005008443	LRP4 (ENSCDRG00005008476)	CKAP5 (ENSCDRG00005008832)	F2 (ENSCDRG00005009091)	ZNF408 (ENSCDRG00005009244)	ARHGAP1 (ENSCDRG00005009320)	ATG13 (ENSCDRG00005009422)	HARBI1 (ENSCDRG00005009768)	AMBRA1 (ENSCDRG00005009861)	CHRM4 (ENSCDRG00005010302)	MDK (ENSCDRG00005010345)
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Dolphin	MODERN SPECIES	2041		MTCH2 (ENSTTRG00000014169)	C1QTNF4 (ENSTTRG00000014168)	FAM180B (ENSTTRG00000014167)	NDUFS3 (ENSTTRG00000014164)	KBTBD4 (ENSTTRG00000014159)	ENSTTRG00000014158	CELF1 (ENSTTRG00000014157)	RAPSN (ENSTTRG00000014156)	PSMC3 (ENSTTRG00000014155)	SLC39A13 (ENSTTRG00000014154)	SPI1 (ENSTTRG00000014153)	MYBPC3 (ENSTTRG00000014152)	MADD (ENSTTRG00000014150) #20	NR1H3 (ENSTTRG00000014149) #21	ACP2 (ENSTTRG00000014147) #22	DDB2 (ENSTTRG00000014146) #23	PACSIN3 (ENSTTRG00000014143) #24	ARFGAP2 (ENSTTRG00000014137) #25	CSTPP1 (ENSTTRG00000014133) #26	LRP4 (ENSTTRG00000014129)	CKAP5 (ENSTTRG00000014121)
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Vaquita	MODERN SPECIES	19	AGBL2 (ENSPSNG00000012052)	MTCH2 (ENSPSNG00000011989)	ENSPSNG00000011949	FAM180B (ENSPSNG00000011919)	NDUFS3 (ENSPSNG00000011780)	KBTBD4 (ENSPSNG00000011651)	PTPMT1 (ENSPSNG00000011591)	CELF1 (ENSPSNG00000011349)	RAPSN (ENSPSNG00000010989)	PSMC3 (ENSPSNG00000010889)	SLC39A13 (ENSPSNG00000010822)	SPI1 (ENSPSNG00000010691)	MYBPC3 (ENSPSNG00000009622)	MADD (ENSPSNG00000007281) #20	NR1H3 (ENSPSNG00000006534) #21	ACP2 (ENSPSNG00000006273) #22	DDB2 (ENSPSNG00000006057) #23	PACSIN3 (ENSPSNG00000006003) #24	ENSPSNG00000005975 #25	CSTPP1 (ENSPSNG00000005920) #26	LRP4 (ENSPSNG00000005781)	CKAP5 (ENSPSNG00000005667)	F2 (ENSPSNG00000005610)	ZNF408 (ENSPSNG00000005582)	ARHGAP1 (ENSPSNG00000005549)	ATG13 (ENSPSNG00000005490)	HARBI1 (ENSPSNG00000005453)	AMBRA1 (ENSPSNG00000005291)	CHRM4 (ENSPSNG00000005202)	MDK (ENSPSNG00000005164)	DGKZ (ENSPSNG00000004933)
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Beluga whale	MODERN SPECIES	7	ENSDLEG00000003961	MTCH2 (ENSDLEG00000003979)	ENSDLEG00000004045	FAM180B (ENSDLEG00000000116)	NDUFS3 (ENSDLEG00000000150)	KBTBD4 (ENSDLEG00000000205)	PTPMT1 (ENSDLEG00000000244)	CELF1 (ENSDLEG00000000264)	RAPSN (ENSDLEG00000000322)	PSMC3 (ENSDLEG00000000360)	SLC39A13 (ENSDLEG00000000405)	SPI1 (ENSDLEG00000000443)	MYBPC3 (ENSDLEG00000000811)	MADD (ENSDLEG00000003539) #20	NR1H3 (ENSDLEG00000013403) #21	ACP2 (ENSDLEG00000013563) #22	DDB2 (ENSDLEG00000014125) #23	PACSIN3 (ENSDLEG00000014213) #24	ARFGAP2 (ENSDLEG00000014461) #25	CSTPP1 (ENSDLEG00000016182) #26	LRP4 (ENSDLEG00000016355)	CKAP5 (ENSDLEG00000018239)	F2 (ENSDLEG00000018821)	ZNF408 (ENSDLEG00000018910)	ARHGAP1 (ENSDLEG00000018942)	ATG13 (ENSDLEG00000019150)	HARBI1 (ENSDLEG00000019555)	AMBRA1 (ENSDLEG00000019560)	CHRM4 (ENSDLEG00000019579)	MDK (ENSDLEG00000019582)	DGKZ (ENSDLEG00000019589)
Narwhal	MODERN SPECIES	314	AGBL2 (ENSMMNG00015021887)	MTCH2 (ENSMMNG00015021874)	ENSMMNG00015021868	FAM180B (ENSMMNG00015021863)	NDUFS3 (ENSMMNG00015021859)	KBTBD4 (ENSMMNG00015021852)	PTPMT1 (ENSMMNG00015021844)	CELF1 (ENSMMNG00015021830)	RAPSN (ENSMMNG00015021818)	PSMC3 (ENSMMNG00015021802)	SLC39A13 (ENSMMNG00015021773)	SPI1 (ENSMMNG00015021760)	MYBPC3 (ENSMMNG00015021686)	MADD (ENSMMNG00015021102) #20	NR1H3 (ENSMMNG00015020682) #21	ACP2 (ENSMMNG00015020547) #22	DDB2 (ENSMMNG00015020426) #23	PACSIN3 (ENSMMNG00015020360) #24	ARFGAP2 (ENSMMNG00015020303) #25	CSTPP1 (ENSMMNG00015020243) #26	LRP4 (ENSMMNG00015020152)	CKAP5 (ENSMMNG00015019798)	F2 (ENSMMNG00015019642)	ZNF408 (ENSMMNG00015019610)	ARHGAP1 (ENSMMNG00015019583)	ATG13 (ENSMMNG00015019491)	HARBI1 (ENSMMNG00015019436)	AMBRA1 (ENSMMNG00015019294)	CHRM4 (ENSMMNG00015019208)	MDK (ENSMMNG00015019173)	DGKZ (ENSMMNG00015018868)
Sperm whale	MODERN SPECIES	199																ACP2 (ENSPCTG00005021825) #22	DDB2 (ENSPCTG00005021776) #23	PACSIN3 (ENSPCTG00005021733) #24	ARFGAP2 (ENSPCTG00005021635) #25	CUNH11orf49 (ENSPCTG00005021607) #26
Blue whale	MODERN SPECIES	19	AGBL2 (ENSBMSG00010022008)	MTCH2 (ENSBMSG00010022003)	ENSBMSG00010022000	FAM180B (ENSBMSG00010021998)	NDUFS3 (ENSBMSG00010021996)	KBTBD4 (ENSBMSG00010021993)	PTPMT1 (ENSBMSG00010021990)	CELF1 (ENSBMSG00010021983)	RAPSN (ENSBMSG00010021975)	PSMC3 (ENSBMSG00010021968)	SLC39A13 (ENSBMSG00010021960)	SPI1 (ENSBMSG00010021953)	MYBPC3 (ENSBMSG00010021914)	MADD (ENSBMSG00010018497) #20	NR1H3 (ENSBMSG00010018229) #21	ACP2 (ENSBMSG00010018103) #22	DDB2 (ENSBMSG00010017897) #23	PACSIN3 (ENSBMSG00010017852) #24	ARFGAP2 (ENSBMSG00010017710) #25	CSTPP1 (ENSBMSG00010017644) #26	LRP4 (ENSBMSG00010017494)	CKAP5 (ENSBMSG00010017392)	F2 (ENSBMSG00010017325)	ZNF408 (ENSBMSG00010017299)	ENSBMSG00010017280	ARHGAP1 (ENSBMSG00010017220)	ATG13 (ENSBMSG00010017110)	HARBI1 (ENSBMSG00010017065)	AMBRA1 (ENSBMSG00010015727)	CHRM4 (ENSBMSG00010015622)	MDK (ENSBMSG00010015583)
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	6	AGBL2 (ENSOARG00020014911)	MTCH2 (ENSOARG00020014843)	ENSOARG00020014813	FAM180B (ENSOARG00020014767)	NDUFS3 (ENSOARG00020014698)	ENSOARG00020014554	ENSOARG00020014495	CELF1 (ENSOARG00020014203)	RAPSN (ENSOARG00020013803)	PSMC3 (ENSOARG00020013548)	SLC39A13 (ENSOARG00020013213)	SPI1 (ENSOARG00020013137)	MYBPC3 (ENSOARG00020012776)	MADD (ENSOARG00020011512) #20	NR1H3 (ENSOARG00020011361) #21	ACP2 (ENSOARG00020010726) #22	DDB2 (ENSOARG00020010497) #23	PACSIN3 (ENSOARG00020010393) #24	ARFGAP2 (ENSOARG00020010021) #25	CSTPP1 (ENSOARG00020023714) #26	LRP4 (ENSOARG00020023551)	CKAP5 (ENSOARG00020023388)	F2 (ENSOARG00020023298)	ZNF408 (ENSOARG00020023273)	ARHGAP1 (ENSOARG00020023238)	ATG13 (ENSOARG00020023093)	HARBI1 (ENSOARG00020023065)	AMBRA1 (ENSOARG00020022829)	CHRM4 (ENSOARG00020022796)	MDK (ENSOARG00020022725)	DGKZ (ENSOARG00020021820)
Goat	MODERN SPECIES	6	AGBL2 (ENSCHIG00000022131)	MTCH2 (ENSCHIG00000012614)	C1QTNF4 (ENSCHIG00000003743)	FAM180B (ENSCHIG00000011395)	NDUFS3 (ENSCHIG00000017760)	KBTBD4 (ENSCHIG00000016297)	PTPMT1 (ENSCHIG00000015788)	CELF1 (ENSCHIG00000024582)	RAPSN (ENSCHIG00000015950)	PSMC3 (ENSCHIG00000010249)	SLC39A13 (ENSCHIG00000018746)	SPI1 (ENSCHIG00000019747)	MYBPC3 (ENSCHIG00000021976)	MADD (ENSCHIG00000003140) #20	NR1H3 (ENSCHIG00000013751) #21	ACP2 (ENSCHIG00000017023) #22	DDB2 (ENSCHIG00000021645) #23	PACSIN3 (ENSCHIG00000007034) #24	ARFGAP2 (ENSCHIG00000003758) #25	CSTPP1 (ENSCHIG00000013768) #26	LRP4 (ENSCHIG00000024661)	CKAP5 (ENSCHIG00000018334)	ENSCHIG00000009743	F2 (ENSCHIG00000024270)	ZNF408 (ENSCHIG00000025346)	ARHGAP1 (ENSCHIG00000022137)	ATG13 (ENSCHIG00000014614)	HARBI1 (ENSCHIG00000014327)	AMBRA1 (ENSCHIG00000016854)	CHRM4 (ENSCHIG00000006372)	MDK (ENSCHIG00000020969)
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b.d.a	ENSGT00940000156152
Bos	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b.d.a	ENSGT00940000156152
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b.d.a	ENSGT00940000156152
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	6	FNBP4 (ENSBIXG00005020572)	AGBL2 (ENSBIXG00005020494)	MTCH2 (ENSBIXG00005003456)	ENSBIXG00005020389	FAM180B (ENSBIXG00005020374)	KBTBD4 (ENSBIXG00005020354)	PTPMT1 (ENSBIXG00005007208)	CELF1 (ENSBIXG00005020290)	RAPSN (ENSBIXG00005003352)	PSMC3 (ENSBIXG00005020171)	SLC39A13 (ENSBIXG00005003304)	SPI1 (ENSBIXG00005020034)	MYBPC3 (ENSBIXG00005002636)	MADD (ENSBIXG00005003241) #20	NR1H3 (ENSBIXG00005019630) #21	ACP2 (ENSBIXG00005019552) #22	DDB2 (ENSBIXG00005019438) #23	PACSIN3 (ENSBIXG00005019375) #24	ARFGAP2 (ENSBIXG00005019318) #25	CSTPP1 (ENSBIXG00005019202) #26	LRP4 (ENSBIXG00005019152)	CKAP5 (ENSBIXG00005018988)	F2 (ENSBIXG00005018882)	ZNF408 (ENSBIXG00005018816)	ARHGAP1 (ENSBIXG00005003058)	ATG13 (ENSBIXG00005003045)	HARBI1 (ENSBIXG00005018637)	AMBRA1 (ENSBIXG00005007656)	CHRM4 (ENSBIXG00005018467)	ENSBIXG00005018454	DGKZ (ENSBIXG00005018295)
Cow	MODERN SPECIES	6	FNBP4 (ENSBTAG00000020911)	AGBL2 (ENSBTAG00000051215)	MTCH2 (ENSBTAG00000018742)	FAM180B (ENSBTAG00000055123)	NDUFS3 (ENSBTAG00000018483)	KBTBD4 (ENSBTAG00000018482)	PTPMT1 (ENSBTAG00000018479)	CELF1 (ENSBTAG00000002520)	RAPSN (ENSBTAG00000021745)	PSMC3 (ENSBTAG00000021744)	SLC39A13 (ENSBTAG00000019436)	SPI1 (ENSBTAG00000021709)	MYBPC3 (ENSBTAG00000021707)	MADD (ENSBTAG00000021700) #20	NR1H3 (ENSBTAG00000010681) #21	ACP2 (ENSBTAG00000021002) #22	DDB2 (ENSBTAG00000020999) #23	PACSIN3 (ENSBTAG00000009576) #24	ARFGAP2 (ENSBTAG00000009574) #25	CSTPP1 (ENSBTAG00000009573) #26	LRP4 (ENSBTAG00000008429)	CKAP5 (ENSBTAG00000004448)	F2 (ENSBTAG00000007148)	ZNF408 (ENSBTAG00000027557)	ARHGAP1 (ENSBTAG00000016501)	ATG13 (ENSBTAG00000017325)	HARBI1 (ENSBTAG00000004639)	AMBRA1 (ENSBTAG00000004282)	CHRM4 (ENSBTAG00000033699)	MDK (ENSBTAG00000007740)	DGKZ (ENSBTAG00000013636)
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00940000155097.e.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b.d.a
Domestic yak	MODERN SPECIES	4	AGBL2 (ENSBGRG00000019908)	MTCH2 (ENSBGRG00000019732)	ENSBGRG00000019699	FAM180B (ENSBGRG00000019645)	NDUFS3 (ENSBGRG00000019602)	KBTBD4 (ENSBGRG00000019526)	ENSBGRG00000019424	CELF1 (ENSBGRG00000019052)	RAPSN (ENSBGRG00000018674)	PSMC3 (ENSBGRG00000018446)	SLC39A13 (ENSBGRG00000018326)	SPI1 (ENSBGRG00000018200)	MYBPC3 (ENSBGRG00000017872)	MADD (ENSBGRG00000017261) #20	NR1H3 (ENSBGRG00000016958) #21	ACP2 (ENSBGRG00000016478) #22	DDB2 (ENSBGRG00000016037) #23	PACSIN3 (ENSBGRG00000015878) #24	ARFGAP2 (ENSBGRG00000015155) #25	CSTPP1 (ENSBGRG00000014751) #26	LRP4 (ENSBGRG00000014275)	CKAP5 (ENSBGRG00000013953)	F2 (ENSBGRG00000013793)	ZNF408 (ENSBGRG00000013630)	ARHGAP1 (ENSBGRG00000013511)	ATG13 (ENSBGRG00000013263)	HARBI1 (ENSBGRG00000013222)	TAF9 (ENSBGRG00000013181)	AMBRA1 (ENSBGRG00000012979)	CHRM4 (ENSBGRG00000012936)	ENSBGRG00000012888
Wild yak	MODERN SPECIES	1047				ENSBMUG00000024672	NDUFS3 (ENSBMUG00000024660)	KBTBD4 (ENSBMUG00000024643)	ENSBMUG00000024626	CELF1 (ENSBMUG00000024594)	RAPSN (ENSBMUG00000024536)	PSMC3 (ENSBMUG00000024510)	SLC39A13 (ENSBMUG00000024475)	SPI1 (ENSBMUG00000024426)	MADD (ENSBMUG00000024292) #20	MYBPC3 (ENSBMUG00000023919)	NR1H3 (ENSBMUG00000023834) #21	ACP2 (ENSBMUG00000023770) #22	DDB2 (ENSBMUG00000023687) #23	PACSIN3 (ENSBMUG00000023616) #24	ARFGAP2 (ENSBMUG00000023585) #25	CSTPP1 (ENSBMUG00000023500) #26	LRP4 (ENSBMUG00000023473)	CKAP5 (ENSBMUG00000023430)	F2 (ENSBMUG00000023372)	ZNF408 (ENSBMUG00000023350)	ARHGAP1 (ENSBMUG00000023337)	ATG13 (ENSBMUG00000023285)	HARBI1 (ENSBMUG00000023163)	ENSBMUG00000023155	AMBRA1 (ENSBMUG00000023114)	CHRM4 (ENSBMUG00000022974)	ENSBMUG00000022959
American bison	MODERN SPECIES	3100	FNBP4 (ENSBBBG00000012233)	AGBL2 (ENSBBBG00000012259)	MTCH2 (ENSBBBG00000002309)	FAM180B (ENSBBBG00000002312)	NDUFS3 (ENSBBBG00000012284)	KBTBD4 (ENSBBBG00000012295)	PTPMT1 (ENSBBBG00000001931)	CELF1 (ENSBBBG00000012337)	RAPSN (ENSBBBG00000002335)	PSMC3 (ENSBBBG00000002347)	SLC39A13 (ENSBBBG00000002358)	ENSBBBG00000012398	MYBPC3 (ENSBBBG00000012763)	MADD (ENSBBBG00000013202) #20	NR1H3 (ENSBBBG00000013293) #21	ACP2 (ENSBBBG00000001605) #22	DDB2 (ENSBBBG00000007213) #23	PACSIN3 (ENSBBBG00000013420) #24	ARFGAP2 (ENSBBBG00000013487) #25	CSTPP1 (ENSBBBG00000013522) #26	LRP4 (ENSBBBG00000007215)	CKAP5 (ENSBBBG00000002889)	F2 (ENSBBBG00000002915)	ZNF408 (ENSBBBG00000013728)	ARHGAP1 (ENSBBBG00000013736)	ATG13 (ENSBBBG00000002985)	HARBI1 (ENSBBBG00000013882)	AMBRA1 (ENSBBBG00000014063)	CHRM4 (ENSBBBG00000014075)	ENSBBBG00000014102	ENSBBBG00000003163
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	118	MTCH2 (ENSMMSG00000002552)	ENSMMSG00000002578	FAM180B (ENSMMSG00000002588)	NDUFS3 (ENSMMSG00000002602)	KBTBD4 (ENSMMSG00000002638)	PTPMT1 (ENSMMSG00000002650)	CELF1 (ENSMMSG00000005936)	ENSMMSG00000006034	RAPSN (ENSMMSG00000006063)	PSMC3 (ENSMMSG00000006116)	SLC39A13 (ENSMMSG00000006163)	SPI1 (ENSMMSG00000006220)	MYBPC3 (ENSMMSG00000006254)	MADD (ENSMMSG00000006433) #20	NR1H3 (ENSMMSG00000006800) #21	ACP2 (ENSMMSG00000006877) #22	DDB2 (ENSMMSG00000007023) #23	ENSMMSG00000007128	PACSIN3 (ENSMMSG00000007142) #24	ARFGAP2 (ENSMMSG00000007196) #25	CSTPP1 (ENSMMSG00000007479) #26	LRP4 (ENSMMSG00000007545)	CKAP5 (ENSMMSG00000007823)	F2 (ENSMMSG00000008000)	ZNF408 (ENSMMSG00000008033)	ARHGAP1 (ENSMMSG00000008062)	ATG13 (ENSMMSG00000008155)	HARBI1 (ENSMMSG00000008321)	AMBRA1 (ENSMMSG00000008353)	CHRM4 (ENSMMSG00000008482)	MDK (ENSMMSG00000008497)
Yarkand deer	MODERN SPECIES		AGBL2 (ENSCHYG00000003509)	MTCH2 (ENSCHYG00000003437)	ENSCHYG00000003424	FAM180B (ENSCHYG00000003417)	NDUFS3 (ENSCHYG00000003399)	KBTBD4 (ENSCHYG00000003377)	PTPMT1 (ENSCHYG00000003361)	ENSCHYG00000003356	CELF1 (ENSCHYG00000003333)	RAPSN (ENSCHYG00000003218)	PSMC3 (ENSCHYG00000003185)	SLC39A13 (ENSCHYG00000003145)	SPI1 (ENSCHYG00000003123)	MADD (ENSCHYG00000002609) #20	NR1H3 (ENSCHYG00000002538) #21	ACP2 (ENSCHYG00000002437) #22	DDB2 (ENSCHYG00000002377) #23	PACSIN3 (ENSCHYG00000002328) #24	ARFGAP2 (ENSCHYG00000002254) #25	CSTPP1 (ENSCHYG00000002208) #26	LRP4 (ENSCHYG00000002074)	CKAP5 (ENSCHYG00000001967)	F2 (ENSCHYG00000001885)	ZNF408 (ENSCHYG00000001850)	ARHGAP1 (ENSCHYG00000001791)	ATG13 (ENSCHYG00000001705)	HARBI1 (ENSCHYG00000001684)	AMBRA1 (ENSCHYG00000001540)	CHRM4 (ENSCHYG00000001502)	MDK (ENSCHYG00000001474)	DGKZ (ENSCHYG00000001154)
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00910000148141	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00910000148141	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00910000148141	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00910000148141	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00910000148141	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	85	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00910000148141	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
American black bear	MODERN SPECIES	4876															NR1H3 (ENSUAMG00000002590) #21	ACP2 (ENSUAMG00000002864) #22	DDB2 (ENSUAMG00000003455) #23	PACSIN3 (ENSUAMG00000003457) #24	ARFGAP2 (ENSUAMG00000003461) #25	CSTPP1 (ENSUAMG00000003474) #26
Polar bear	MODERN SPECIES	229	FNBP4 (ENSUMAG00000009092)	AGBL2 (ENSUMAG00000009098)	MTCH2 (ENSUMAG00000009168)	FAM180B (ENSUMAG00000009202)	NDUFS3 (ENSUMAG00000009205)	KBTBD4 (ENSUMAG00000009210)	PTPMT1 (ENSUMAG00000009215)	CELF1 (ENSUMAG00000009218)	RAPSN (ENSUMAG00000009220)	PSMC3 (ENSUMAG00000009232)	SLC39A13 (ENSUMAG00000009241)	SPI1 (ENSUMAG00000009255)	MYBPC3 (ENSUMAG00000009303)	MADD (ENSUMAG00000009893) #20	NR1H3 (ENSUMAG00000014293) #21	ACP2 (ENSUMAG00000014297) #22	DDB2 (ENSUMAG00000014299) #23	PACSIN3 (ENSUMAG00000014303) #24	ARFGAP2 (ENSUMAG00000014307) #25	CSTPP1 (ENSUMAG00000014321) #26	LRP4 (ENSUMAG00000014330)	CKAP5 (ENSUMAG00000014345)	F2 (ENSUMAG00000014382)	ZNF408 (ENSUMAG00000014405)	ARHGAP1 (ENSUMAG00000014408)	ATG13 (ENSUMAG00000014415)	HARBI1 (ENSUMAG00000014427)	AMBRA1 (ENSUMAG00000014438)	MDK (ENSUMAG00000014474)	DGKZ (ENSUMAG00000014597)	CREB3L1 (ENSUMAG00000015322)
Giant Panda	MODERN SPECIES	7	AGBL2 (ENSAMEG00000007763)	MTCH2 (ENSAMEG00000007696)	ENSAMEG00000007688	FAM180B (ENSAMEG00000007683)	NDUFS3 (ENSAMEG00000007649)	KBTBD4 (ENSAMEG00000007634)	PTPMT1 (ENSAMEG00000007624)	CELF1 (ENSAMEG00000007596)	RAPSN (ENSAMEG00000007575)	PSMC3 (ENSAMEG00000007538)	SLC39A13 (ENSAMEG00000007505)	SPI1 (ENSAMEG00000030284)	MYBPC3 (ENSAMEG00000007362)	MADD (ENSAMEG00000007321) #20	NR1H3 (ENSAMEG00000007298) #21	ACP2 (ENSAMEG00000007273) #22	DDB2 (ENSAMEG00000007255) #23	PACSIN3 (ENSAMEG00000007225) #24	ARFGAP2 (ENSAMEG00000007175) #25	CSTPP1 (ENSAMEG00000007146) #26	LRP4 (ENSAMEG00000007069)	CKAP5 (ENSAMEG00000006979)	F2 (ENSAMEG00000006910)	ZNF408 (ENSAMEG00000006904)	ARHGAP1 (ENSAMEG00000006844)	ATG13 (ENSAMEG00000006798)	HARBI1 (ENSAMEG00000006795)	ENSAMEG00000023608	AMBRA1 (ENSAMEG00000006762)	CHRM4 (ENSAMEG00000020060)	MDK (ENSAMEG00000006752)
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	74	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
American mink	MODERN SPECIES	45	AGBL2 (ENSNVIG00000009947)	MTCH2 (ENSNVIG00000010063)	C1QTNF4 (ENSNVIG00000010108)	FAM180B (ENSNVIG00000010117)	NDUFS3 (ENSNVIG00000010127)	KBTB4 (ENSNVIG00000010139)	PTPMT1 (ENSNVIG00000010173)	CELF1 (ENSNVIG00000010227)	RAPSN (ENSNVIG00000010353)	PSMC3 (ENSNVIG00000010384)	SLC39A13 (ENSNVIG00000010448)	SPI1 (ENSNVIG00000010511)	MYBPC3 (ENSNVIG00000010535)	MADD (ENSNVIG00000010799) #20	NR1H3 (ENSNVIG00000011492) #21	ACP2 (ENSNVIG00000011563) #22	DDB2 (ENSNVIG00000011648) #23	PACSIN3 (ENSNVIG00000011680) #24	ARFGAP2 (ENSNVIG00000011708) #25	CK049 (ENSNVIG00000011836) #26	LRP4 (ENSNVIG00000011939)	CKAP5 (ENSNVIG00000012011)	F2 (ENSNVIG00000012216)	ZNF408 (ENSNVIG00000012294)	ATG13 (ENSNVIG00000012327)	HARB1 (ENSNVIG00000012442)	AMBRA1 (ENSNVIG00000012478)	CHRM4 (ENSNVIG00000012697)	ENSNVIG00000012699	DGKZ (ENSNVIG00000012726)	CREB3L1 (ENSNVIG00000012921)
Ferret	MODERN SPECIES	255	AGBL2 (ENSMPUG00000003840)	MTCH2 (ENSMPUG00000003852)	C1QTNF4 (ENSMPUG00000003861)	FAM180B (ENSMPUG00000003869)	NDUFS3 (ENSMPUG00000003880)	KBTBD4 (ENSMPUG00000003932)	PTPMT1 (ENSMPUG00000003938)	CELF1 (ENSMPUG00000003960)	RAPSN (ENSMPUG00000003974)	SLC39A13 (ENSMPUG00000003979)	PSMC3 (ENSMPUG00000003992)	SPI1 (ENSMPUG00000004125)	MYBPC3 (ENSMPUG00000004128)	MADD (ENSMPUG00000004775) #20	NR1H3 (ENSMPUG00000004787) #21	ACP2 (ENSMPUG00000004871) #22	DDB2 (ENSMPUG00000004880) #23	PACSIN3 (ENSMPUG00000004892) #24	ARFGAP2 (ENSMPUG00000005012) #25	CSTPP1 (ENSMPUG00000005029) #26	LRP4 (ENSMPUG00000005034)	CKAP5 (ENSMPUG00000005279)	F2 (ENSMPUG00000005310)	ZNF408 (ENSMPUG00000005490)	ARHGAP1 (ENSMPUG00000005499)	ATG13 (ENSMPUG00000005512)	HARBI1 (ENSMPUG00000005540)	AMBRA1 (ENSMPUG00000005552)	CHRM4 (ENSMPUG00000018440)	MDK (ENSMPUG00000005575)	DGKZ (ENSMPUG00000005616)
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480.h	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b.e.a	ENSGT00940000156152
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480.h	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E.u	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b.e.a	ENSGT00940000156152
Dingo	MODERN SPECIES	69	AGBL2 (ENSCAFG00020025573)	MTCH2 (ENSCAFG00020025567)	C1QTNF4 (ENSCAFG00020025565)	FAM180B (ENSCAFG00020025564)	ENSCAFG00020025563	KBTBD4 (ENSCAFG00020025561)	PTPMT1 (ENSCAFG00020025558)	CELF1 (ENSCAFG00020025487)	RAPSN (ENSCAFG00020025481)	ENSCAFG00020025479	SLC39A13 (ENSCAFG00020025475)	SPI1 (ENSCAFG00020025473)	MYBPC3 (ENSCAFG00020025458)	MADD (ENSCAFG00020022385) #20	NR1H3 (ENSCAFG00020022209) #21	ACP2 (ENSCAFG00020022205) #22	DDB2 (ENSCAFG00020022201) #23	PACSIN3 (ENSCAFG00020022195) #24	ARFGAP2 (ENSCAFG00020022191) #25	CSTPP1 (ENSCAFG00020022185) #26	LRP4 (ENSCAFG00020022152)	CKAP5 (ENSCAFG00020019305)	F2 (ENSCAFG00020019158)	ZNF408 (ENSCAFG00020019155)	ARHGAP1 (ENSCAFG00020019150)	ATG13 (ENSCAFG00020019142)	HARBI1 (ENSCAFG00020019139)	AMBRA1 (ENSCAFG00020019116)	CHRM4 (ENSCAFG00020019111)	ENSCAFG00020019107	DGKZ (ENSCAFG00020019055)
Dog	MODERN SPECIES	9	AGBL2 (ENSCAFG00845019987)	ENSCAFG00845020290	ENSCAFG00845020371	FAM180B (ENSCAFG00845020398)	ENSCAFG00845020432	KBTBD4 (ENSCAFG00845020495)	PTPMT1 (ENSCAFG00845020551)	CELF1 (ENSCAFG00845020631)	RAPSN (ENSCAFG00845020952)	ENSCAFG00845021252	SLC39A13 (ENSCAFG00845021469)	SPI1 (ENSCAFG00845021614)	MYBPC3 (ENSCAFG00845021902)	MADD (ENSCAFG00845023101) #20	NR1H3 (ENSCAFG00845024090) #21	ACP2 (ENSCAFG00845024517) #22	DDB2 (ENSCAFG00845024798) #23	PACSIN3 (ENSCAFG00845025012) #24	ARFGAP2 (ENSCAFG00845025262) #25	CSTPP1 (ENSCAFG00845025843) #26	LRP4 (ENSCAFG00845026118)	CKAP5 (ENSCAFG00845026513)	F2 (ENSCAFG00845026955)	ZNF408 (ENSCAFG00845027019)	ARHGAP1 (ENSCAFG00845027069)	ATG13 (ENSCAFG00845027292)	HARBI1 (ENSCAFG00845027517)	AMBRA1 (ENSCAFG00845027652)	ENSCAFG00845028115	CHRM4 (ENSCAFG00845028143)	ENSCAFG00845028187
Red fox	MODERN SPECIES	49	FNBP4 (ENSVVUG00000023114)	AGBL2 (ENSVVUG00000023154)	MTCH2 (ENSVVUG00000023181)	KBTBD4 (ENSVVUG00000023426)	ENSVVUG00000023430	NDUFS3 (ENSVVUG00000023433)	PTPMT1 (ENSVVUG00000023435)	CELF1 (ENSVVUG00000023439)	RAPSN (ENSVVUG00000023449)	PSMC3 (ENSVVUG00000023452)	SLC39A13 (ENSVVUG00000023457)	SPI1 (ENSVVUG00000023463)	MYBPC3 (ENSVVUG00000023562)	MADD (ENSVVUG00000025425) #20	NR1H3 (ENSVVUG00000026170) #21	ACP2 (ENSVVUG00000026189) #22	DDB2 (ENSVVUG00000026319) #23	PACSIN3 (ENSVVUG00000026352) #24	ARFGAP2 (ENSVVUG00000026397) #25	CSTPP1 (ENSVVUG00000026503) #26	LRP4 (ENSVVUG00000026554)	CKAP5 (ENSVVUG00000026762)	F2 (ENSVVUG00000026767)	ZNF408 (ENSVVUG00000026805)	ARHGAP1 (ENSVVUG00000026807)	ATG13 (ENSVVUG00000026821)	HARBI1 (ENSVVUG00000026967)	AMBRA1 (ENSVVUG00000026969)	CHRM4 (ENSVVUG00000026978)	MDK (ENSVVUG00000026979)	DGKZ (ENSVVUG00000026981)
Felidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00500000045038.m.a.a	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Panthera	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00500000045038.m.a.a	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00500000045038.m.a.a	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
leopard	MODERN SPECIES	58	AGBL2 (ENSPPRG00000024671)	MTCH2 (ENSPPRG00000024284)	ENSPPRG00000024156	FAM180B (ENSPPRG00000024070)	NDUFS3 (ENSPPRG00000023580)	KBTBD4 (ENSPPRG00000022635)	PTPMT1 (ENSPPRG00000000430)	CELF1 (ENSPPRG00000002376)	RAPSN (ENSPPRG00000004770)	PSMC3 (ENSPPRG00000006737)	SLC39A13 (ENSPPRG00000009592)	SPI1 (ENSPPRG00000010085)	MYBPC3 (ENSPPRG00000024064)	MADD (ENSPPRG00000000412) #20	NR1H3 (ENSPPRG00000002008) #21	ACP2 (ENSPPRG00000004019) #22	DDB2 (ENSPPRG00000005739) #23	PACSIN3 (ENSPPRG00000005994) #24	ARFGAP2 (ENSPPRG00000007483) #25	CSTPP1 (ENSPPRG00000008841) #26	LRP4 (ENSPPRG00000009649)	CKAP5 (ENSPPRG00000014495)	F2 (ENSPPRG00000015996)	ENSPPRG00000021564	ZNF408 (ENSPPRG00000016866)	ARHGAP1 (ENSPPRG00000017517)	ATG13 (ENSPPRG00000024435)	HARBI1 (ENSPPRG00000024315)	AMBRA1 (ENSPPRG00000000398)	CHRM4 (ENSPPRG00000021661)	MDK (ENSPPRG00000001591)
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Tiger	MODERN SPECIES	168	FNBP4 (ENSPTIG00000008430)	AGBL2 (ENSPTIG00000007694)	MTCH2 (ENSPTIG00000007190)	FAM180B (ENSPTIG00000007108)	NDUFS3 (ENSPTIG00000006928)	KBTBD4 (ENSPTIG00000006244)	PTPMT1 (ENSPTIG00000005838)	CELF1 (ENSPTIG00000003974)	RAPSN (ENSPTIG00000000869)	PSMC3 (ENSPTIG00000021263)	SLC39A13 (ENSPTIG00000021132)	SPI1 (ENSPTIG00000020982)	MYBPC3 (ENSPTIG00000020596)	MADD (ENSPTIG00000018995) #20	NR1H3 (ENSPTIG00000018538) #21	ACP2 (ENSPTIG00000018036) #22	DDB2 (ENSPTIG00000017739) #23	PACSIN3 (ENSPTIG00000017528) #24	ARFGAP2 (ENSPTIG00000017136) #25	CSTPP1 (ENSPTIG00000016931) #26	LRP4 (ENSPTIG00000016819)	CKAP5 (ENSPTIG00000015717)	F2 (ENSPTIG00000015545)	ZNF408 (ENSPTIG00000015467)	ARHGAP1 (ENSPTIG00000014598)	ATG13 (ENSPTIG00000014275)	HARBI1 (ENSPTIG00000014054)	AMBRA1 (ENSPTIG00000013363)	CHRM4 (ENSPTIG00000009949)	MDK (ENSPTIG00000012940)	DGKZ (ENSPTIG00000012708)
Cat	MODERN SPECIES	241	AGBL2 (ENSFCAG00000013803)	MTCH2 (ENSFCAG00000022906)	C1QTNF4 (ENSFCAG00000035523)	FAM180B (ENSFCAG00000009508)	NDUFS3 (ENSFCAG00000040734)	KBTBD4 (ENSFCAG00000009499)	ENSFCAG00000042609	CELF1 (ENSFCAG00000002535)	RAPSN (ENSFCAG00000002534)	PSMC3 (ENSFCAG00000002533)	SLC39A13 (ENSFCAG00000002532)	SPI1 (ENSFCAG00000002531)	MYBPC3 (ENSFCAG00000002530)	MADD (ENSFCAG00000002529) #20	NR1H3 (ENSFCAG00000002528) #21	ACP2 (ENSFCAG00000002527) #22	DDB2 (ENSFCAG00000025016) #23	PACSIN3 (ENSFCAG00000012631) #24	ARFGAP2 (ENSFCAG00000002525) #25	CSTPP1 (ENSFCAG00000002524) #26	LRP4 (ENSFCAG00000002523)	CKAP5 (ENSFCAG00000013640)	F2 (ENSFCAG00000029088)	ENSFCAG00000041074	ZNF408 (ENSFCAG00000029105)	ARHGAP1 (ENSFCAG00000013638)	ATG13 (ENSFCAG00000013637)	HARBI1 (ENSFCAG00000029910)	AMBRA1 (ENSFCAG00000013635)	CHRM4 (ENSFCAG00000024780)	MDK (ENSFCAG00000023547)
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065.f	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065.f	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	2	ENSRFEG00010011881	MTCH2 (ENSRFEG00010011915)	ENSRFEG00010011954	FAM180B (ENSRFEG00010011984)	NDUFS3 (ENSRFEG00010012038)	KBTBD4 (ENSRFEG00010012114)	PTPMT1 (ENSRFEG00010012248)	CELF1 (ENSRFEG00010012300)	RAPSN (ENSRFEG00010012492)	PSMC3 (ENSRFEG00010012635)	SLC39A13 (ENSRFEG00010012772)	SPI1 (ENSRFEG00010012946)	MYBPC3 (ENSRFEG00010013106)	MADD (ENSRFEG00010014628) #20	NR1H3 (ENSRFEG00010015025) #21	ACP2 (ENSRFEG00010015250) #22	DDB2 (ENSRFEG00010015496) #23	PACSIN3 (ENSRFEG00010000575) #24	ARFGAP2 (ENSRFEG00010000701) #25	CSTPP1 (ENSRFEG00010000992) #26	LRP4 (ENSRFEG00010001046)	CKAP5 (ENSRFEG00010001142)	F2 (ENSRFEG00010001400)	ZNF408 (ENSRFEG00010001453)	ARHGAP1 (ENSRFEG00010001486)	ATG13 (ENSRFEG00010001557)	HARBI1 (ENSRFEG00010001682)	AMBRA1 (ENSRFEG00010001788)	CHRM4 (ENSRFEG00010001975)	MDK (ENSRFEG00010001996)	DGKZ (ENSRFEG00010002446)
Microbat	MODERN SPECIES	1034	PTPRJ (ENSMLUG00000013225)	NUP160 (ENSMLUG00000014062)	FNBP4 (ENSMLUG00000011388)	MTCH2 (ENSMLUG00000016431)	FAM180B (ENSMLUG00000016658)	NDUFS3 (ENSMLUG00000016649)	KBTBD4 (ENSMLUG00000006745)	ENSMLUG00000024269	CELF1 (ENSMLUG00000016631)	ENSMLUG00000016626	PSMC3 (ENSMLUG00000016615)	SLC39A13 (ENSMLUG00000016608)	MYBPC3 (ENSMLUG00000017650)	MADD (ENSMLUG00000017647) #20	NR1H3 (ENSMLUG00000017646) #21	ACP2 (ENSMLUG00000017644) #22	DDB2 (ENSMLUG00000017642) #23	PACSIN3 (ENSMLUG00000017640) #24	ARFGAP2 (ENSMLUG00000017637) #25	CSTPP1 (ENSMLUG00000017636) #26	LRP4 (ENSMLUG00000017635)	CKAP5 (ENSMLUG00000017633)	F2 (ENSMLUG00000017631)	ZNF408 (ENSMLUG00000017629)	ARHGAP1 (ENSMLUG00000017628)	ATG13 (ENSMLUG00000017626)	HARBI1 (ENSMLUG00000011485)	AMBRA1 (ENSMLUG00000009880)	CHRM4 (ENSMLUG00000025622)	MDK (ENSMLUG00000022787)	DGKZ (ENSMLUG00000009836)
Megabat	MODERN SPECIES	646			MTCH2 (ENSPVAG00000007348)	FAM180B (ENSPVAG00000007346)	NDUFS3 (ENSPVAG00000007344)	KBTBD4 (ENSPVAG00000007342)	PTPMT1 (ENSPVAG00000007341)	CELF1 (ENSPVAG00000007340)	RAPSN (ENSPVAG00000007339)	PSMC3 (ENSPVAG00000007338)	SLC39A13 (ENSPVAG00000007337)	SPI1 (ENSPVAG00000007336)	MYBPC3 (ENSPVAG00000007332)	MADD (ENSPVAG00000007324) #20	NR1H3 (ENSPVAG00000007321) #21	ACP2 (ENSPVAG00000007314) #22	DDB2 (ENSPVAG00000007310) #23
Equus	ANCESTRAL SPECIES	56	ENSGT00390000003450	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000158775	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480.e	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Horse	MODERN SPECIES	3	NUP160 (ENSECAG00000021826)	FNBP4 (ENSECAG00000020072)	AGBL2 (ENSECAG00000018720)	MTCH2 (ENSECAG00000014198)	NDUFS3 (ENSECAG00000013454)	KBTBD4 (ENSECAG00000013258)	PTPMT1 (ENSECAG00000012816)	CELF1 (ENSECAG00000007741)	RAPSN (ENSECAG00000003289)	PSMC3 (ENSECAG00000024786)	SLC39A13 (ENSECAG00000024590)	SPI1 (ENSECAG00000024457)	MYBPC3 (ENSECAG00000024318)	MADD (ENSECAG00000016022) #20	NR1H3 (ENSECAG00000015726) #21	ACP2 (ENSECAG00000013128) #22	DDB2 (ENSECAG00000008711) #23	PACSIN3 (ENSECAG00000025103) #24	ARFGAP2 (ENSECAG00000024744) #25	ENSECAG00000051919	CSTPP1 (ENSECAG00000024739) #26	LRP4 (ENSECAG00000023663)	CKAP5 (ENSECAG00000015563)	F2 (ENSECAG00000011321)	ZNF408 (ENSECAG00000010878)	ARHGAP1 (ENSECAG00000009844)	ATG13 (ENSECAG00000024606)	HARBI1 (ENSECAG00000024452)	AMBRA1 (ENSECAG00000023789)	CHRM4 (ENSECAG00000023751)	ENSECAG00000029071
Donkey	MODERN SPECIES	8	FNBP4 (ENSEASG00005010995)	AGBL2 (ENSEASG00005010911)	MTCH2 (ENSEASG00005010837)	FAM180B (ENSEASG00005035695)	ENSEASG00005010834	KBTBD4 (ENSEASG00005031390)	PTPMT1 (ENSEASG00005037371)	CELF1 (ENSEASG00005010831)	RAPSN (ENSEASG00005010830)	PSMC3 (ENSEASG00005010810)	SLC39A13 (ENSEASG00005010790)	SPI1 (ENSEASG00005010780)	MYBPC3 (ENSEASG00005010750)	MADD (ENSEASG00005002251) #20	NR1H3 (ENSEASG00005001479) #21	ACP2 (ENSEASG00005001161) #22	DDB2 (ENSEASG00005001051) #23	PACSIN3 (ENSEASG00005000908) #24	ARFGAP2 (ENSEASG00005000180) #25	CSTPP1 (ENSEASG00005017823) #26	LRP4 (ENSEASG00005017791)	CKAP5 (ENSEASG00005015601)	F2 (ENSEASG00005015463)	ZNF408 (ENSEASG00005015461)	ARHGAP1 (ENSEASG00005015450)	ATG13 (ENSEASG00005015246)	HARBI1 (ENSEASG00005015208)	AMBRA1 (ENSEASG00005015004)	CHRM4 (ENSEASG00005029426)	MDK (ENSEASG00005029065)	DGKZ (ENSEASG00005014964)
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000003450	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Elephant	MODERN SPECIES	209	FNBP4 (ENSLAFG00000015244)	AGBL2 (ENSLAFG00000015233)	MTCH2 (ENSLAFG00000017949)	C1QTNF4 (ENSLAFG00000017947)	NDUFS3 (ENSLAFG00000017939)	KBTBD4 (ENSLAFG00000017937)	PTPMT1 (ENSLAFG00000020874)	CELF1 (ENSLAFG00000003484)	RAPSN (ENSLAFG00000016010)	PSMC3 (ENSLAFG00000032142)	SLC39A13 (ENSLAFG00000015999)	SPI1 (ENSLAFG00000004062)	MYBPC3 (ENSLAFG00000031033)	MADD (ENSLAFG00000009270) #20	NR1H3 (ENSLAFG00000009267) #21	ACP2 (ENSLAFG00000025658) #22	DDB2 (ENSLAFG00000009262) #23	PACSIN3 (ENSLAFG00000016193) #24	ARFGAP2 (ENSLAFG00000013742) #25	CSTPP1 (ENSLAFG00000013736) #26	LRP4 (ENSLAFG00000013726)	CKAP5 (ENSLAFG00000010386)	F2 (ENSLAFG00000010383)	ZNF408 (ENSLAFG00000027848)	ARHGAP1 (ENSLAFG00000015141)	ATG13 (ENSLAFG00000015138)	HARBI1 (ENSLAFG00000032359)	ENSLAFG00000015123	ENSLAFG00000030479	CHRM4 (ENSLAFG00000026552)	MDK (ENSLAFG00000015119)
Hyrax	MODERN SPECIES	3657												SPI1 (ENSPCAG00000016572)	MYBPC3 (ENSPCAG00000016433)	MADD (ENSPCAG00000016258) #20	NR1H3 (ENSPCAG00000016194) #21	ACP2 (ENSPCAG00000016140) #22	DDB2 (ENSPCAG00000016073) #23	PACSIN3 (ENSPCAG00000015992) #24	ARFGAP2 (ENSPCAG00000015888) #25	CSTPP1 (ENSPCAG00000015812) #26
Tenrec	MODERN SPECIES	5841												ENSETEG00000000432	MYBPC3 (ENSETEG00000000425)	MADD (ENSETEG00000000419) #20	NR1H3 (ENSETEG00000000415) #21	ACP2 (ENSETEG00000000413) #22	DDB2 (ENSETEG00000000408) #23
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00390000003450	ENSGT00940000160201	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000154234.b	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152	ENSGT00940000159848
Armadillo	MODERN SPECIES	1506	FNBP4 (ENSDNOG00000013302)	AGBL2 (ENSDNOG00000013277)	C1QTNF4 (ENSDNOG00000041468)	FAM180B (ENSDNOG00000009566)	NDUFS3 (ENSDNOG00000009548)	KBTBD4 (ENSDNOG00000009543)	ENSDNOG00000025849	CELF1 (ENSDNOG00000009523)	RAPSN (ENSDNOG00000040969)	PSMC3 (ENSDNOG00000033470)	SLC39A13 (ENSDNOG00000018463)	SPI1 (ENSDNOG00000041462)	MYBPC3 (ENSDNOG00000042129)	MADD (ENSDNOG00000011229) #20	NR1H3 (ENSDNOG00000011206) #21	ACP2 (ENSDNOG00000044310) #22	PACSIN3 (ENSDNOG00000030783) #24	ENSDNOG00000019820 #25	ENSDNOG00000038982	CSTPP1 (ENSDNOG00000019818) #26	LRP4 (ENSDNOG00000019816)	CKAP5 (ENSDNOG00000012007)	F2 (ENSDNOG00000012528)	ZNF408 (ENSDNOG00000047669)	ARHGAP1 (ENSDNOG00000017314)	ATG13 (ENSDNOG00000002084)	HARBI1 (ENSDNOG00000002083)	ENSDNOG00000049497	AMBRA1 (ENSDNOG00000049694)	CHRM4 (ENSDNOG00000043079)	ENSDNOG00000037925
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E.w.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000164059	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E.w.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000164059	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152	ENSGT00940000159848
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	46	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E.w.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000164059	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152	ENSGT00940000159848
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	46	ENSGT00940000160201	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E.w.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000164059	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152	ENSGT00940000159848
koala	MODERN SPECIES	139	AGBL2 (ENSPCIG00000016171)	MTCH2 (ENSPCIG00000016519)	ENSPCIG00000016521	ENSPCIG00000037012	NDUFS3 (ENSPCIG00000016526)	KBTBD4 (ENSPCIG00000016600)	ENSPCIG00000016602	CELF1 (ENSPCIG00000022947)	RAPSN (ENSPCIG00000022952)	PSMC3 (ENSPCIG00000007254)	SLC39A13 (ENSPCIG00000007257)	SPI1 (ENSPCIG00000007258)	MYBPC3 (ENSPCIG00000007264)	MADD (ENSPCIG00000007278) #20	NR1H3 (ENSPCIG00000007281) #21	ACP2 (ENSPCIG00000007284) #22	DDB2 (ENSPCIG00000007289) #23	PACSIN3 (ENSPCIG00000007325) #24	ARFGAP2 (ENSPCIG00000007326) #25	CSTPP1 (ENSPCIG00000007328) #26	LRP4 (ENSPCIG00000007330)	CKAP5 (ENSPCIG00000007436)	ENSPCIG00000020069	ARHGAP1 (ENSPCIG00000020071)	ATG13 (ENSPCIG00000020075)	HARBI1 (ENSPCIG00000020090)	AMBRA1 (ENSPCIG00000020093)	CHRM4 (ENSPCIG00000020098)	MDK (ENSPCIG00000020100)	DGKZ (ENSPCIG00000020101)	CREB3L1 (ENSPCIG00000020114)
Common wonbat	MODERN SPECIES	1058	AGBL2 (ENSVURG00010009724)	MTCH2 (ENSVURG00010009735)	ENSVURG00010009744	ENSVURG00010009751	NDUFS3 (ENSVURG00010009759)	KBTBD4 (ENSVURG00010009776)	ENSVURG00010009789	CELF1 (ENSVURG00010009795)	RAPSN (ENSVURG00010009821)	ENSVURG00010009856	SLC39A13 (ENSVURG00010009882)	SPI1 (ENSVURG00010009914)	MYBPC3 (ENSVURG00010009939)	MADD (ENSVURG00010010013) #20	NR1H3 (ENSVURG00010010094) #21	ACP2 (ENSVURG00010010120) #22	DDB2 (ENSVURG00010010162) #23	PACSIN3 (ENSVURG00010010192) #24	ARFGAP2 (ENSVURG00010010235) #25	CSTPP1 (ENSVURG00010010291) #26	LRP4 (ENSVURG00010010304)	CKAP5 (ENSVURG00010010351)	ARHGAP1 (ENSVURG00010010440)	ATG13 (ENSVURG00010010461)	HARBI1 (ENSVURG00010010503)	AMBRA1 (ENSVURG00010010523)	CHRM4 (ENSVURG00010010600)	MDK (ENSVURG00010010613)	DGKZ (ENSVURG00010010658)	CREB3L1 (ENSVURG00010010813)	PHF21A (ENSVURG00010010860)
Wallaby	MODERN SPECIES	7273																ACP2 (ENSMEUG00000009144) #22	ENSMEUG00000009131 #23	ENSMEUG00000009113 #24
Tasmanian devil	MODERN SPECIES	5	AGBL2 (ENSSHAG00000027609)	MTCH2 (ENSSHAG00000017622)	C1QTNF4 (ENSSHAG00000030434)	ENSSHAG00000026627	NDUFS3 (ENSSHAG00000025275)	KBTBD4 (ENSSHAG00000021528)	ENSSHAG00000024403	CELF1 (ENSSHAG00000017438)	RAPSN (ENSSHAG00000017408)	PSMC3 (ENSSHAG00000017393)	SLC39A13 (ENSSHAG00000017377)	SPI1 (ENSSHAG00000017291)	MYBPC3 (ENSSHAG00000017252)	NR1H3 (ENSSHAG00000017152) #21	MADD (ENSSHAG00000017189) #20	ACP2 (ENSSHAG00000017126) #22	DDB2 (ENSSHAG00000017108) #23	PACSIN3 (ENSSHAG00000017065) #24	ENSSHAG00000023512 #25	CSTPP1 (ENSSHAG00000032264) #26	LRP4 (ENSSHAG00000016580)	CKAP5 (ENSSHAG00000016386)	ENSSHAG00000016366	ARHGAP1 (ENSSHAG00000016324)	HARBI1 (ENSSHAG00000016218)	ATG13 (ENSSHAG00000016284)	AMBRA1 (ENSSHAG00000015742)	ENSSHAG00000030675	DGKZ (ENSSHAG00000026033)	CREB3L1 (ENSSHAG00000015230)	PHF21A (ENSSHAG00000014057)
Opossum	MODERN SPECIES	4	FNBP4 (ENSMODG00000019921)	AGBL2 (ENSMODG00000019920)	MTCH2 (ENSMODG00000019919)	ENSMODG00000024428	ENSMODG00000019916	KBTBD4 (ENSMODG00000019915)	ENSMODG00000019914	CELF1 (ENSMODG00000019913)	RAPSN (ENSMODG00000041760)	ENSMODG00000019911	SLC39A13 (ENSMODG00000019910)	SPI1 (ENSMODG00000019909)	MYBPC3 (ENSMODG00000019908)	MADD (ENSMODG00000019907) #20	NR1H3 (ENSMODG00000019906) #21	ACP2 (ENSMODG00000019905) #22	ENSMODG00000019904 #23	PACSIN3 (ENSMODG00000019903) #24	ARFGAP2 (ENSMODG00000019901) #25	CSTPP1 (ENSMODG00000019899) #26	ENSMODG00000019900	LRP4 (ENSMODG00000019898)	CKAP5 (ENSMODG00000019897)	ENSMODG00000019896	ZNF408 (ENSMODG00000019895)	ARHGAP1 (ENSMODG00000019894)	ATG13 (ENSMODG00000019893)	HARBI1 (ENSMODG00000019892)	AMBRA1 (ENSMODG00000019891)	CHRM4 (ENSMODG00000019889)	CREB3L1 (ENSMODG00000019888)
Platypus	MODERN SPECIES	14	FNBP4 (ENSOANG00000007909)	AGBL2 (ENSOANG00000007906)	MTCH2 (ENSOANG00000007903)	ENSOANG00000007902	NDUFS3 (ENSOANG00000007900)	KBTBD4 (ENSOANG00000007899)	ENSOANG00000050504	CELF1 (ENSOANG00000007896)	RAPSN (ENSOANG00000007894)	PSMC3 (ENSOANG00000040187)	SLC39A13 (ENSOANG00000007890)	SPI1 (ENSOANG00000050063)	MYBPC3 (ENSOANG00000007889)	MADD (ENSOANG00000007884) #20	NR1H3 (ENSOANG00000006250) #21	ACP2 (ENSOANG00000048933) #22	DDB2 (ENSOANG00000006247) #23	PACSIN3 (ENSOANG00000004082) #24	ARFGAP2 (ENSOANG00000004083) #25	CSTPP1 (ENSOANG00000031094) #26	LRP4 (ENSOANG00000001954)	CKAP5 (ENSOANG00000002765)	ENSOANG00000002767	ARHGAP1 (ENSOANG00000002770)	ATG13 (ENSOANG00000006550)	HARBI1 (ENSOANG00000004814)	AMBRA1 (ENSOANG00000014521)	CHRM4 (ENSOANG00000045540)	MDK (ENSOANG00000037361)	DGKZ (ENSOANG00000003635)	CREB3L1 (ENSOANG00000005356)
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00530000063737	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00390000015299.a.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT01030000235152.a	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757.g	ENSGT00940000164059	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00530000063737	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00390000015299.a.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000161474.b.b	ENSGT01030000235152.a	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757.g	ENSGT00940000164059	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00530000063737	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00390000015299.a.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000161474.b.b	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757.g	ENSGT00940000164059	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a
Aves	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00530000063737	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00390000015299.a.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757.g	ENSGT00940000164059	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00990000214181	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00390000015299.a.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757.g	ENSGT00940000164059	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00990000214181	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00390000015299.a.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757.g	ENSGT00940000164059	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00530000063737	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00390000015299.a.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757.g	ENSGT00940000164059	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Japanese quail	MODERN SPECIES	23	C1QTNF4 (ENSCJPG00005010836)	FAM180B (ENSCJPG00005010837)	NDUFS3 (ENSCJPG00005010838)	KBTBD4 (ENSCJPG00005010839)	PTPMT1 (ENSCJPG00005010840)	CELF1 (ENSCJPG00005010841)	RAPSN (ENSCJPG00005010842)	PSMC3 (ENSCJPG00005010843)	ENSCJPG00005010844	SLC39A13 (ENSCJPG00005010845)	SPI1 (ENSCJPG00005010846)	MYBPC3 (ENSCJPG00005010847)	ENSCJPG00005011665 #20	ENSCJPG00005011707 #20	NR1H3 (ENSCJPG00005012023) #21	ACP2 (ENSCJPG00005012024) #22	DDB2 (ENSCJPG00005012054) #23	PACSIN3 (ENSCJPG00005012055) #24	ARFGAP2 (ENSCJPG00005012077) #25	CSTPP1 (ENSCJPG00005012079) #26	ENSCJPG00005012080	LRP4 (ENSCJPG00005012083)	CKAP5 (ENSCJPG00005012374)	ENSCJPG00005013566	ARHGAP1 (ENSCJPG00005013573)	ATG13 (ENSCJPG00005013688)	HARBI1 (ENSCJPG00005013781)	AMBRA1 (ENSCJPG00005013782)	CHRM4 (ENSCJPG00005013889)	MDK (ENSCJPG00005013890)	DGKZ (ENSCJPG00005013891)
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00530000063737	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00390000015299.a.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757.g	ENSGT00940000164059	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152	ENSGT00940000159848
Chicken	MODERN SPECIES	34	FUT8 (ENSGALG00010021805)	C1QTNF4 (ENSGALG00010021945)	FAM180B (ENSGALG00010021988)	KBTBD4 (ENSGALG00010022032)	NDUFS3 (ENSGALG00010023836)	PTPMT1 (ENSGALG00010022073)	CELF1 (ENSGALG00010022161)	RAPSN (ENSGALG00010022229)	PSMC3 (ENSGALG00010022256)	ENSGALG00010022328	SLC39A13 (ENSGALG00010022353)	SPI1 (ENSGALG00010022386)	MYBPC3 (ENSGALG00010022468)	MADD (ENSGALG00010022619) #20	NR1H3 (ENSGALG00010022650) #21	ACP2 (ENSGALG00010022727) #22	DDB2 (ENSGALG00010022792) #23	PACSIN3 (ENSGALG00010022819) #24	ARFGAP2 (ENSGALG00010022838) #25	CSTPP1 (ENSGALG00010022864) #26	LRP4 (ENSGALG00010022929)	CKAP5 (ENSGALG00010022971)	F2 (ENSGALG00010022987)	ARHGAP1 (ENSGALG00010022997)	ATG13 (ENSGALG00010023064)	HARBI1 (ENSGALG00010023083)	AMBRA1 (ENSGALG00010023866)	CHRM4 (ENSGALG00010023120)	MDK (ENSGALG00010023136)	DGKZ (ENSGALG00010023196)	CREB3L1 (ENSGALG00010023217)
Turkey	MODERN SPECIES	25	ENSMGAG00000017332	ENSMGAG00000015803	MDK (ENSMGAG00000011008)	ENSMGAG00000010997	ENSMGAG00000010995	ENSMGAG00000010974	ENSMGAG00000010945	ENSMGAG00000020851	ENSMGAG00000010924	ENSMGAG00000010880	ENSMGAG00000010850	ENSMGAG00000022957	ENSMGAG00000019564	ENSMGAG00000010807 #25	ENSMGAG00000010789 #24	ENSMGAG00000010776 #22	ENSMGAG00000010763 #23	NR1H3 (ENSMGAG00000010751) #21	ENSMGAG00000021766 #20	ENSMGAG00000017760 #20	ENSMGAG00000010695	ENSMGAG00000010682	ENSMGAG00000010673	ENSMGAG00000010651	ENSMGAG00000010671	ENSMGAG00000010605	ENSMGAG00000021247	ENSMGAG00000010629	KBTBD4 (ENSMGAG00000010626)	ENSMGAG00000010627	NDUFS3 (ENSMGAG00000010620)
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	50	ENSGT00990000214181	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00390000015299.a.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00390000001738
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	39	FUT8 (ENSABRG00000017622)	C1QTNF4 (ENSABRG00000017618)	FAM180B (ENSABRG00000017617)	NDUFS3 (ENSABRG00000017605)	KBTBD4 (ENSABRG00000017600)	PTPMT1 (ENSABRG00000017594)	CELF1 (ENSABRG00000017589)	RAPSN (ENSABRG00000017555)	PSMC3 (ENSABRG00000017537)	ENSABRG00000017513	SLC39A13 (ENSABRG00000017506)	SPI1 (ENSABRG00000017499)	MYBPC3 (ENSABRG00000015621)	MADD (ENSABRG00000005509) #20	NR1H3 (ENSABRG00000004173) #21	ACP2 (ENSABRG00000002430) #22	VPS51 (ENSABRG00000002028)	ENSABRG00000001968	ENSABRG00000001880	LRRC55 (ENSABRG00000001850)	APLNR (ENSABRG00000001829)	ENSABRG00000001782	SSRP1 (ENSABRG00000001696)	P2RX3 (ENSABRG00000001629)
Duck	MODERN SPECIES	23	FUT8 (ENSAPLG00000009017)	ENSAPLG00000024392	C1QTNF4 (ENSAPLG00000000930)	FAM180B (ENSAPLG00000018391)	KBTBD4 (ENSAPLG00000008802)	NDUFS3 (ENSAPLG00000008862)	CELF1 (ENSAPLG00000020823)	RAPSN (ENSAPLG00000008323)	PSMC3 (ENSAPLG00000008009)	ENSAPLG00000002605	SLC39A13 (ENSAPLG00000002504)	SPI1 (ENSAPLG00000002423)	MYBPC3 (ENSAPLG00000016373)	MADD (ENSAPLG00000010515) #20	NR1H3 (ENSAPLG00000010925) #21	ACP2 (ENSAPLG00000011116) #22	VPS51 (ENSAPLG00000023418)	ZFP91 (ENSAPLG00000006822)	CNTF (ENSAPLG00000028898)	DTX4 (ENSAPLG00000019223)	MPEG1 (ENSAPLG00000007201)	BEST1 (ENSAPLG00000007353)	RAB3IL1 (ENSAPLG00000007457)	ENSAPLG00000007497	ENSAPLG00000008364	CSRP3 (ENSAPLG00000008804)	ENSAPLG00000007205	E2F8 (ENSAPLG00000009091)	NAV2 (ENSAPLG00000013035)	DBX1 (ENSAPLG00000028007)	PRMT3 (ENSAPLG00000006907)
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00990000214181	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00390000015299.a.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757.g	ENSGT00940000164059	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00990000214181	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00390000015299.a.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757.g	ENSGT00940000164059	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Golden eagle	MODERN SPECIES	11	FUT8 (ENSACCG00020004646)	C1QTNF4 (ENSACCG00020004637)	FAM180B (ENSACCG00020004632)	NDUFS3 (ENSACCG00020004622)	KBTBD4 (ENSACCG00020004612)	PTPMT1 (ENSACCG00020004607)	CELF1 (ENSACCG00020004593)	RAPSN (ENSACCG00020004581)	PSMC3 (ENSACCG00020004570)	ENSACCG00020004563	SLC39A13 (ENSACCG00020009305)	SPI1 (ENSACCG00020009293)	MYBPC3 (ENSACCG00020009268)	MADD (ENSACCG00020009078) #20	NR1H3 (ENSACCG00020008972) #21	ACP2 (ENSACCG00020008959) #22	DDB2 (ENSACCG00020008939) #23	PACSIN3 (ENSACCG00020008914) #24	ARFGAP2 (ENSACCG00020008855) #25	CSTPP1 (ENSACCG00020008796) #26	LRP4 (ENSACCG00020008390)	CKAP5 (ENSACCG00020007836)	ENSACCG00020007794	ZNF408 (ENSACCG00020007780)	ARHGAP1 (ENSACCG00020007772)	ATG13 (ENSACCG00020007724)	HARBI1 (ENSACCG00020007689)	AMBRA1 (ENSACCG00020007670)	CHRM4 (ENSACCG00020007659)	MDK (ENSACCG00020007651)	DGKZ (ENSACCG00020007561)
Kakapo	MODERN SPECIES	21	ENSSHBG00005002630	C1QTNF4 (ENSSHBG00005002642)	ENSSHBG00005002652	NDUFS3 (ENSSHBG00005002665)	KBTBD4 (ENSSHBG00005002689)	PTPMT1 (ENSSHBG00005002711)	CELF1 (ENSSHBG00005002788)	RAPSN (ENSSHBG00005002915)	PSMC3 (ENSSHBG00005002985)	ENSSHBG00005003006	SLC39A13 (ENSSHBG00005003021)	SPI1 (ENSSHBG00005003049)	MYBPC3 (ENSSHBG00005003084)	MADD (ENSSHBG00005003189) #20	NR1H3 (ENSSHBG00005003352) #21	ACP2 (ENSSHBG00005003371) #22	DDB2 (ENSSHBG00005003396) #23	PACSIN3 (ENSSHBG00005003435) #24	ARFGAP2 (ENSSHBG00005003460) #25	CSTPP1 (ENSSHBG00005003475) #26	LRP4 (ENSSHBG00005003580)	CKAP5 (ENSSHBG00005003723)	ENSSHBG00005003750	ARHGAP1 (ENSSHBG00005003766)	ATG13 (ENSSHBG00005003785)	HARBI1 (ENSSHBG00005003802)	AMBRA1 (ENSSHBG00005003842)	CHRM4 (ENSSHBG00005003882)	MDK (ENSSHBG00005003898)	DGKZ (ENSSHBG00005003935)	CREB3L1 (ENSSHBG00005003978)
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00530000063737	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00390000015299.a.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757.g	ENSGT00940000164059	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Great tit	MODERN SPECIES	25	SYT13 (ENSPMJG00000000628)	FUT8 (ENSPMJG00000000654)	C1QTNF4 (ENSPMJG00000000868)	ENSPMJG00000000873	NDUFS3 (ENSPMJG00000000879)	KBTBD4 (ENSPMJG00000000885)	PTPMT1 (ENSPMJG00000000896)	CELF1 (ENSPMJG00000000899)	PSMC3 (ENSPMJG00000000915)	ENSPMJG00000000920	SLC39A13 (ENSPMJG00000000932)	SPI1 (ENSPMJG00000000997)	MYBPC3 (ENSPMJG00000001019)	MADD (ENSPMJG00000004069) #20	NR1H3 (ENSPMJG00000012279) #21	ACP2 (ENSPMJG00000012280) #22	DDB2 (ENSPMJG00000012286) #23	PACSIN3 (ENSPMJG00000012291) #24	ARFGAP2 (ENSPMJG00000012299) #25	CSTPP1 (ENSPMJG00000012300) #26	ENSPMJG00000012301	LRP4 (ENSPMJG00000012302)	CKAP5 (ENSPMJG00000012334)	ENSPMJG00000013670	ARHGAP1 (ENSPMJG00000013679)	ATG13 (ENSPMJG00000013870)	HARBI1 (ENSPMJG00000013871)	AMBRA1 (ENSPMJG00000013872)	CHRM4 (ENSPMJG00000014372)	MDK (ENSPMJG00000014373)	DGKZ (ENSPMJG00000014374)
Passeriformes_d	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00530000063737	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00390000015299.a.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757.g	ENSGT00940000164059	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Flycatcher	MODERN SPECIES	24	C1QTNF4 (ENSFALG00000006415)	FAM180B (ENSFALG00000014206)	KBTBD4 (ENSFALG00000006408)	NDUFS3 (ENSFALG00000006411)	PTPMT1 (ENSFALG00000006406)	CELF1 (ENSFALG00000006402)	RAPSN (ENSFALG00000006401)	PSMC3 (ENSFALG00000006396)	ENSFALG00000028830	SLC39A13 (ENSFALG00000006394)	SPI1 (ENSFALG00000024717)	MYBPC3 (ENSFALG00000006369)	ENSFALG00000006333 #20	ENSFALG00000026717 #20	NR1H3 (ENSFALG00000006313) #21	ACP2 (ENSFALG00000026896) #22	DDB2 (ENSFALG00000025215) #23	PACSIN3 (ENSFALG00000006296) #24	ARFGAP2 (ENSFALG00000006292) #25	CSTPP1 (ENSFALG00000024272) #26	ENSFALG00000025106	LRP4 (ENSFALG00000006286)	CKAP5 (ENSFALG00000006282)	ENSFALG00000006272	ARHGAP1 (ENSFALG00000006265)	ATG13 (ENSFALG00000006261)	HARBI1 (ENSFALG00000028036)	AMBRA1 (ENSFALG00000006252)	CHRM4 (ENSFALG00000014204)	MDK (ENSFALG00000006248)	DGKZ (ENSFALG00000006244)
Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00530000063737	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000171188	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00390000015299.a.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757.g	ENSGT00940000164059	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152	ENSGT00940000159848
Medium ground finch	MODERN SPECIES	15	ENSGFOG00000006183	FUT8 (ENSGFOG00000006169)	C1QTNF4 (ENSGFOG00000006164)	ENSGFOG00000006160	NDUFS3 (ENSGFOG00000006152)	KBTBD4 (ENSGFOG00000006147)	CELF1 (ENSGFOG00000006114)	RAPSN (ENSGFOG00000006104)	PSMC3 (ENSGFOG00000006090)	ENSGFOG00000006082	SLC39A13 (ENSGFOG00000006071)	SPI1 (ENSGFOG00000006067)	MYBPC3 (ENSGFOG00000005710)	MADD (ENSGFOG00000005599) #20	NR1H3 (ENSGFOG00000005580) #21	ACP2 (ENSGFOG00000005529) #22	DDB2 (ENSGFOG00000005508) #23	PACSIN3 (ENSGFOG00000005468) #24	ARFGAP2 (ENSGFOG00000005441) #25	CSTPP1 (ENSGFOG00000005426) #26	LRP4 (ENSGFOG00000005261)	CKAP5 (ENSGFOG00000005139)	ENSGFOG00000005094	ARHGAP1 (ENSGFOG00000005074)	ATG13 (ENSGFOG00000005043)	HARBI1 (ENSGFOG00000005030)	AMBRA1 (ENSGFOG00000005019)	CHRM4 (ENSGFOG00000005010)	MDK (ENSGFOG00000005000)	DGKZ (ENSGFOG00000000238)	CREB3L1 (ENSGFOG00000000033)
Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00530000063737	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000171188	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00390000015299.a.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757.g	ENSGT00940000164059	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152	ENSGT00940000159848
Common canary	MODERN SPECIES	3	FUT8 (ENSSCAG00000003442)	C1QTNF4 (ENSSCAG00000003436)	ENSSCAG00000003433	NDUFS3 (ENSSCAG00000003420)	KBTBD4 (ENSSCAG00000003415)	PTPMT1 (ENSSCAG00000003409)	CELF1 (ENSSCAG00000003397)	RAPSN (ENSSCAG00000003388)	PSMC3 (ENSSCAG00000003373)	ENSSCAG00000003365	SLC39A13 (ENSSCAG00000003352)	SPI1 (ENSSCAG00000003345)	MYBPC3 (ENSSCAG00000003326)	MADD (ENSSCAG00000003307) #20	NR1H3 (ENSSCAG00000003301) #21	ACP2 (ENSSCAG00000003297) #22	DDB2 (ENSSCAG00000003292) #23	PACSIN3 (ENSSCAG00000003283) #24	ARFGAP2 (ENSSCAG00000003185) #25	CSTPP1 (ENSSCAG00000003159) #26	LRP4 (ENSSCAG00000003129)	CKAP5 (ENSSCAG00000003039)	ENSSCAG00000003007	ARHGAP1 (ENSSCAG00000002990)	ATG13 (ENSSCAG00000002981)	HARBI1 (ENSSCAG00000002978)	AMBRA1 (ENSSCAG00000002743)	CHRM4 (ENSSCAG00000002686)	MDK (ENSSCAG00000002680)	DGKZ (ENSSCAG00000002643)	CREB3L1 (ENSSCAG00000002634)
Zebra finch	MODERN SPECIES	27	SYT13 (ENSTGUG00000027086)	FUT8 (ENSTGUG00000010311)	C1QTNF4 (ENSTGUG00000010341)	ENSTGUG00000019362	NDUFS3 (ENSTGUG00000010343)	KBTBD4 (ENSTGUG00000010361)	PTPMT1 (ENSTGUG00000010369)	CELF1 (ENSTGUG00000010377)	RAPSN (ENSTGUG00000010400)	PSMC3 (ENSTGUG00000028944)	SLC39A13 (ENSTGUG00000010418)	SPI1 (ENSTGUG00000026691)	MYBPC3 (ENSTGUG00000010426)	MADD (ENSTGUG00000010454) #20	NR1H3 (ENSTGUG00000010475) #21	ACP2 (ENSTGUG00000010486) #22	DDB2 (ENSTGUG00000010493) #23	PACSIN3 (ENSTGUG00000010497) #24	ARFGAP2 (ENSTGUG00000010515) #25	CSTPP1 (ENSTGUG00000010527) #26	LRP4 (ENSTGUG00000010533)	CKAP5 (ENSTGUG00000023569)	ENSTGUG00000010580	ARHGAP1 (ENSTGUG00000010593)	ATG13 (ENSTGUG00000010603)	HARBI1 (ENSTGUG00000010627)	AMBRA1 (ENSTGUG00000010628)	CHRM4 (ENSTGUG00000010635)	MDK (ENSTGUG00000010641)	DGKZ (ENSTGUG00000010647)	CREB3L1 (ENSTGUG00000010669)
African ostrich	MODERN SPECIES	885	ENSSCUG00000017350	FUT8 (ENSSCUG00000017348)	C1QTNF4 (ENSSCUG00000017344)	FAM180B (ENSSCUG00000017343)	NDUFS3 (ENSSCUG00000017342)	KBTBD4 (ENSSCUG00000017340)	CELF1 (ENSSCUG00000017336)	RAPSN (ENSSCUG00000017332)	PSMC3 (ENSSCUG00000017315)	ENSSCUG00000017312	SLC39A13 (ENSSCUG00000017311)	SPI1 (ENSSCUG00000017309)	MYBPC3 (ENSSCUG00000017219)	MADD (ENSSCUG00000017005) #20	NR1H3 (ENSSCUG00000016935) #21	ACP2 (ENSSCUG00000016921) #22	DDB2 (ENSSCUG00000016918) #23	PACSIN3 (ENSSCUG00000016916) #24	ARFGAP2 (ENSSCUG00000016901) #25	CSTPP1 (ENSSCUG00000016889) #26	LRP4 (ENSSCUG00000016879)	CKAP5 (ENSSCUG00000016863)	ENSSCUG00000016848
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	64	ENSCPRG00005017457	FUT8 (ENSCPRG00005017454)	C1QTNF4 (ENSCPRG00005017446)	FAM180B (ENSCPRG00005017443)	NDUFS3 (ENSCPRG00005017439)	KBTBD4 (ENSCPRG00005017435)	PTPMT1 (ENSCPRG00005017408)	CELF1 (ENSCPRG00005017370)	PSMC3 (ENSCPRG00005017298)	ENSCPRG00005017284	SLC39A13 (ENSCPRG00005017281)	SPI1 (ENSCPRG00005017278)	MYBPC3 (ENSCPRG00005017258)	MADD (ENSCPRG00005015319) #20	NR1H3 (ENSCPRG00005014870) #21	ACP2 (ENSCPRG00005014864) #22	DDB2 (ENSCPRG00005014860) #23	PACSIN3 (ENSCPRG00005014853) #24	ENSCPRG00005014850	ARFGAP2 (ENSCPRG00005014830) #25	CSTPP1 (ENSCPRG00005014822) #26	LRP4 (ENSCPRG00005014807)	CKAP5 (ENSCPRG00005014039)	ENSCPRG00005013914	ZNF408 (ENSCPRG00005013908)	ARHGAP1 (ENSCPRG00005013849)	ATG13 (ENSCPRG00005013813)	HARBI1 (ENSCPRG00005013808)	AMBRA1 (ENSCPRG00005013805)	CHRM4 (ENSCPRG00005013799)	MDK (ENSCPRG00005013793)
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00530000063737	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00390000015299.a.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000161474.b.b	ENSGT01030000235152.a	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757.g	ENSGT00940000164059	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00530000063737	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00390000015299.a.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000161474.b.b	ENSGT01030000235152.a	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757.g	ENSGT00940000164059	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00530000063737	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00390000015299.a.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000161474.b.b	ENSGT01030000235152.a	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757.g	ENSGT00940000164059	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223
painted turtle	MODERN SPECIES	13	CIRBP (ENSCPBG00000022930)	MIDN (ENSCPBG00000022926)	ATP5F1D (ENSCPBG00000022922)	ENSCPBG00000022921	CBARP (ENSCPBG00000022920)	STK11 (ENSCPBG00000022919)	CELF1 (ENSCPBG00000022914)	RAPSN (ENSCPBG00000022911)	PSMC3 (ENSCPBG00000022907)	ENSCPBG00000022906	SLC39A13 (ENSCPBG00000022904)	SPI1 (ENSCPBG00000022901)	MYBPC3 (ENSCPBG00000022606)	MADD (ENSCPBG00000015642) #20	NR1H3 (ENSCPBG00000015508) #21	ACP2 (ENSCPBG00000015503) #22	DDB2 (ENSCPBG00000015494) #23	PACSIN3 (ENSCPBG00000015488) #24	ENSCPBG00000015485	ENSCPBG00000015483	ARFGAP2 (ENSCPBG00000015479) #25	CSTPP1 (ENSCPBG00000015473) #26	LRP4 (ENSCPBG00000015397)	CKAP5 (ENSCPBG00000012821)	ENSCPBG00000012688	ZNF408 (ENSCPBG00000012683)	ARHGAP1 (ENSCPBG00000012676)	ATG13 (ENSCPBG00000012673)	HARBI1 (ENSCPBG00000012670)	AMBRA1 (ENSCPBG00000012667)	CHRM4 (ENSCPBG00000012662)
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	40	FUT8 (ENSTMTG00000002222)	C1QTNF4 (ENSTMTG00000002213)	FAM180B (ENSTMTG00000002205)	NDUFS3 (ENSTMTG00000002201)	KBTBD4 (ENSTMTG00000002190)	PTPMT1 (ENSTMTG00000002180)	CELF1 (ENSTMTG00000002164)	RAPSN (ENSTMTG00000002125)	PSMC3 (ENSTMTG00000002110)	ENSTMTG00000002105	SLC39A13 (ENSTMTG00000002100)	SPI1 (ENSTMTG00000002089)	MYBPC3 (ENSTMTG00000002067)	MADD (ENSTMTG00000001980) #20	NR1H3 (ENSTMTG00000001955) #21	ACP2 (ENSTMTG00000001937) #22	DDB2 (ENSTMTG00000001919) #23	PACSIN3 (ENSTMTG00000001907) #24	ENSTMTG00000001899	ENSTMTG00000001884	ARFGAP2 (ENSTMTG00000001865) #25	CSTPP1 (ENSTMTG00000001857) #26	ENSTMTG00000001848	LRP4 (ENSTMTG00000001223)	CKAP5 (ENSTMTG00000000970)	ENSTMTG00000000941	ENSTMTG00000000932	ARHGAP1 (ENSTMTG00000000921)	ATG13 (ENSTMTG00000000864)	HARBI1 (ENSTMTG00000000846)	AMBRA1 (ENSTMTG00000000819)
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00530000063737	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000154479.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00390000015299.a.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000161474.b.b	ENSGT01030000235152.a	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757.g.c	ENSGT00940000164059	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	18	FUT8 (ENSGEVG00005018568)	C1QTNF4 (ENSGEVG00005018589)	FAM180B (ENSGEVG00005018619)	ENSGEVG00005018637	KBTBD4 (ENSGEVG00005018662)	PTPMT1 (ENSGEVG00005018678)	CELF1 (ENSGEVG00005008981)	RAPSN (ENSGEVG00005009044)	PSMC3 (ENSGEVG00005009237)	ENSGEVG00005009277	SLC39A13 (ENSGEVG00005009349)	SPI1 (ENSGEVG00005009450)	MYBPC3 (ENSGEVG00005009503)	MADD (ENSGEVG00005009759) #20	NR1H3 (ENSGEVG00005009930) #21	ACP2 (ENSGEVG00005009970) #22	DDB2 (ENSGEVG00005010017) #23	PACSIN3 (ENSGEVG00005010100) #24	ENSGEVG00005010139	ENSGEVG00005010166	ARFGAP2 (ENSGEVG00005010210) #25	CSTPP1 (ENSGEVG00005010346) #26	LRP4 (ENSGEVG00005010404)	CKAP5 (ENSGEVG00005010815)	ENSGEVG00005011016	ZNF408 (ENSGEVG00005011280)	ARHGAP1 (ENSGEVG00005011311)	ATG13 (ENSGEVG00005011349)	HARBI1 (ENSGEVG00005011393)	AMBRA1 (ENSGEVG00005011573)	CHRM4 (ENSGEVG00005011709)
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	852												SPI1 (ENSCABG00000010435)	MYBPC3 (ENSCABG00000010433)	MADD (ENSCABG00000001771) #20	NR1H3 (ENSCABG00000001529) #21	ACP2 (ENSCABG00000001524) #22	DDB2 (ENSCABG00000001519) #23	PACSIN3 (ENSCABG00000001512) #24	ENSCABG00000001508	ARFGAP2 (ENSCABG00000001499) #25	CSTPP1 (ENSCABG00000001380) #26
Chinese turtle	MODERN SPECIES	2040														MADD (ENSPSIG00000011191) #20	NR1H3 (ENSPSIG00000010360) #21	ACP2 (ENSPSIG00000009418) #22	DDB2 (ENSPSIG00000009124) #23	PACSIN3 (ENSPSIG00000008397) #24	ENSPSIG00000008989	ARFGAP2 (ENSPSIG00000008332) #25	CSTPP1 (ENSPSIG00000007995) #26	LRP4 (ENSPSIG00000017168)	ENSPSIG00000017079
Lepidosauria	DUPLICATION
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00530000063737	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000171188	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00390000015299.a.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446.bb #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT01030000235152.a	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757.g	ENSGT00940000164059	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00530000063737	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000171188	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00390000015299.a.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446.bb #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000161474.b	ENSGT01030000235152.a	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757.g	ENSGT00940000164059	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00530000063737	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000171188	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00390000015299.a.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446.bb #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000161474.b	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757.g	ENSGT00940000164059	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00530000063737	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000171188	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00390000015299.a.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446.bb #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757.g	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000164059	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Indian cobra	MODERN SPECIES		FUT8 (ENSNNAG00000007963)	ENSNNAG00000007935	ENSNNAG00000007916	NDUFS3 (ENSNNAG00000007881)	KBTBD4 (ENSNNAG00000007860)	PTPMT1 (ENSNNAG00000007839)	CELF1 (ENSNNAG00000007686)	RAPSN (ENSNNAG00000007663)	PSMC3 (ENSNNAG00000007548)	ENSNNAG00000007492	SLC39A13 (ENSNNAG00000007477)	SPI1 (ENSNNAG00000007464)	MYBPC3 (ENSNNAG00000007372)	MADD (ENSNNAG00000006994) #20	NR1H3 (ENSNNAG00000006918) #21	ACP2 (ENSNNAG00000006887) #22	DDB2 (ENSNNAG00000006863) #23	PACSIN3 (ENSNNAG00000006783) #24	ARFGAP2 (ENSNNAG00000006716) #25	CSTPP1 (ENSNNAG00000016196) #26	ENSNNAG00000016189	LRP4 (ENSNNAG00000016125)	CKAP5 (ENSNNAG00000012822)	ENSNNAG00000012596	ENSNNAG00000012433	ARHGAP1 (ENSNNAG00000012386)	ATG13 (ENSNNAG00000012104)	HARBI1 (ENSNNAG00000012072)	AMBRA1 (ENSNNAG00000011933)	CHRM4 (ENSNNAG00000011899)	MDK (ENSNNAG00000011865)
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00530000063737	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000171188	ENSGT00390000017480.a	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00390000015299.a.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446.bb #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757.g	ENSGT00940000164059	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00530000063737	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000171188	ENSGT00390000017480.a	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00390000015299.a.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446.bb #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00960000189374	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757.g	ENSGT00940000164059	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b	ENSGT00940000156152
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	36	FUT8 (ENSNSUG00000017707)	C1QTNF4 (ENSNSUG00000017708)	ENSNSUG00000017709	NDUFS3 (ENSNSUG00000017710)	KBTBD4 (ENSNSUG00000017712)	PTPMT1 (ENSNSUG00000017713)	CELF1 (ENSNSUG00000017714)	RAPSN (ENSNSUG00000017715)	PSMC3 (ENSNSUG00000017716)	ENSNSUG00000017717	SLC39A13 (ENSNSUG00000017718)	SPI1 (ENSNSUG00000017719)	MYBPC3 (ENSNSUG00000017720)	MADD (ENSNSUG00000017721) #20	NR1H3 (ENSNSUG00000017722) #21	ACP2 (ENSNSUG00000017723) #22	DDB2 (ENSNSUG00000017724) #23	PACSIN3 (ENSNSUG00000017725) #24	ARFGAP2 (ENSNSUG00000017726) #25	CSTPP1 (ENSNSUG00000017812) #26	ENSNSUG00000017813	LRP4 (ENSNSUG00000017814)	CKAP5 (ENSNSUG00000017815)	ENSNSUG00000017817	ARHGAP1 (ENSNSUG00000017818)	ATG13 (ENSNSUG00000017819)	HARBI1 (ENSNSUG00000017831)	AMBRA1 (ENSNSUG00000017836)	CHRM4 (ENSNSUG00000017843)	MDK (ENSNSUG00000017844)	DGKZ (ENSNSUG00000017845)
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	1	FUT8 (ENSPTXG00000012050)	C1QTNF4 (ENSPTXG00000012048)	ENSPTXG00000012047	ENSPTXG00000012045	KBTBD4 (ENSPTXG00000012043)	PTPMT1 (ENSPTXG00000012042)	CELF1 (ENSPTXG00000012038)	RAPSN (ENSPTXG00000012021)	PSMC3 (ENSPTXG00000012020)	ENSPTXG00000012019	SLC39A13 (ENSPTXG00000012018)	SPI1 (ENSPTXG00000012017)	MYBPC3 (ENSPTXG00000012012)	MADD (ENSPTXG00000011997) #20	NR1H3 (ENSPTXG00000011996) #21	ACP2 (ENSPTXG00000011995) #22	DDB2 (ENSPTXG00000011994) #23	PACSIN3 (ENSPTXG00000011992) #24	ARFGAP2 (ENSPTXG00000011989) #25	CSTPP1 (ENSPTXG00000011967) #26	LRP4 (ENSPTXG00000011966)	CKAP5 (ENSPTXG00000011950)	ENSPTXG00000011946	ARHGAP1 (ENSPTXG00000011944)	ATG13 (ENSPTXG00000011942)	HARBI1 (ENSPTXG00000011941)	AMBRA1 (ENSPTXG00000011938)	CHRM4 (ENSPTXG00000011936)	MDK (ENSPTXG00000011934)	DGKZ (ENSPTXG00000008729)	CREB3L1 (ENSPTXG00000008716)
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	974																ACP2 (ENSLLTG00000005805) #22	DDB2 (ENSLLTG00000005816) #23
Lizard	MODERN SPECIES		NDUFS3 (ENSACAG00000001966)	KBTBD4 (ENSACAG00000002052)	PTPMT1 (ENSACAG00000002085)	CELF1 (ENSACAG00000002114)	ENSACAG00000037762	RAPSN (ENSACAG00000002242)	PSMC3 (ENSACAG00000002289)	ENSACAG00000041621	SLC39A13 (ENSACAG00000002440)	SPI1 (ENSACAG00000035887)	MYBPC3 (ENSACAG00000002510)	ENSACAG00000043000	ENSACAG00000042190	MADD (ENSACAG00000002771) #20	NR1H3 (ENSACAG00000002940) #21	ACP2 (ENSACAG00000003028) #22	DDB2 (ENSACAG00000003132) #23	PACSIN3 (ENSACAG00000003162) #24	ENSACAG00000003234	ENSACAG00000040032 #25	ENSACAG00000003243 #25	CSTPP1 (ENSACAG00000003280) #26	LRP4 (ENSACAG00000003321)	CKAP5 (ENSACAG00000029651)	ENSACAG00000003853	ZNF408 (ENSACAG00000003860)	ARHGAP1 (ENSACAG00000003876)	ATG13 (ENSACAG00000003943)	HARBI1 (ENSACAG00000004077)	AMBRA1 (ENSACAG00000004085)	CHRM4 (ENSACAG00000004120)
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00530000063737	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00940000171188	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00390000015299.a.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000159068 #21	ENSGT00940000158446.bb #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT01030000235152.a	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757.g	ENSGT00940000164059	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a	ENSGT00390000007640.b
Common wall lizard	MODERN SPECIES		FUT8 (ENSPMRG00000003850)	C1QTNF4 (ENSPMRG00000003855)	ENSPMRG00000003859	NDUFS3 (ENSPMRG00000003864)	KBTBD4 (ENSPMRG00000003871)	PTPMT1 (ENSPMRG00000003875)	CELF1 (ENSPMRG00000003881)	PSMC3 (ENSPMRG00000003892)	ENSPMRG00000003975	ENSPMRG00000003979	SLC39A13 (ENSPMRG00000003994)	SPI1 (ENSPMRG00000004012)	MYBPC3 (ENSPMRG00000004475)	MADD (ENSPMRG00000008010) #20	NR1H3 (ENSPMRG00000011909) #21	ACP2 (ENSPMRG00000011917) #22	DDB2 (ENSPMRG00000011927) #23	PACSIN3 (ENSPMRG00000011938) #24	ENSPMRG00000011947	ARFGAP2 (ENSPMRG00000011954) #25	CSTPP1 (ENSPMRG00000011967) #26	LRP4 (ENSPMRG00000012004)	CKAP5 (ENSPMRG00000012212)	ENSPMRG00000012267	ZNF408 (ENSPMRG00000012272)	ARHGAP1 (ENSPMRG00000012280)	ATG13 (ENSPMRG00000012377)	HARBI1 (ENSPMRG00000012436)	AMBRA1 (ENSPMRG00000012441)	CHRM4 (ENSPMRG00000012456)	MDK (ENSPMRG00000012465)
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	3	FUT8 (ENSSMRG00000006374)	C1QTNF4 (ENSSMRG00000006349)	ENSSMRG00000006346	NDUFS3 (ENSSMRG00000006342)	KBTBD4 (ENSSMRG00000006338)	PTPMT1 (ENSSMRG00000006333)	CELF1 (ENSSMRG00000006315)	RAPSN (ENSSMRG00000006301)	PSMC3 (ENSSMRG00000006278)	ENSSMRG00000006277	SLC39A13 (ENSSMRG00000006274)	SPI1 (ENSSMRG00000006272)	MYBPC3 (ENSSMRG00000006219)	MADD (ENSSMRG00000006111) #20	NR1H3 (ENSSMRG00000006068) #21	ACP2 (ENSSMRG00000006020) #22	DDB2 (ENSSMRG00000006012) #23	PACSIN3 (ENSSMRG00000006009) #24	ARFGAP2 (ENSSMRG00000006004) #25	CSTPP1 (ENSSMRG00000006000) #26	LRP4 (ENSSMRG00000005929)	CKAP5 (ENSSMRG00000005833)	ENSSMRG00000005831	ZNF408 (ENSSMRG00000005829)	ARHGAP1 (ENSSMRG00000005826)	ATG13 (ENSSMRG00000005818)	HARBI1 (ENSSMRG00000005723)	AMBRA1 (ENSSMRG00000005709)	CHRM4 (ENSSMRG00000005613)	MDK (ENSSMRG00000005607)	DGKZ (ENSSMRG00000005548)
tuatara	MODERN SPECIES	1197				NDUFS3 (ENSSPUG00000004338)	KBTBD4 (ENSSPUG00000004313)	PTPMT1 (ENSSPUG00000004302)	CELF1 (ENSSPUG00000004228)	RAPSN (ENSSPUG00000004202)	PSMC3 (ENSSPUG00000004135)	ENSSPUG00000004090	SLC39A13 (ENSSPUG00000004075)	SPI1 (ENSSPUG00000004067)	MYBPC3 (ENSSPUG00000004024)	MADD (ENSSPUG00000003976) #20	NR1H3 (ENSSPUG00000003960) #21	ACP2 (ENSSPUG00000003932) #22	DDB2 (ENSSPUG00000003915) #23	PACSIN3 (ENSSPUG00000003902) #24	ENSSPUG00000003889	ARFGAP2 (ENSSPUG00000003827) #25	CSTPP1 (ENSSPUG00000003775) #26	LRP4 (ENSSPUG00000003709)	CKAP5 (ENSSPUG00000003628)	ENSSPUG00000003565	ZNF408 (ENSSPUG00000003559)	ARHGAP1 (ENSSPUG00000003553)	ATG13 (ENSSPUG00000003280)	HARBI1 (ENSSPUG00000003237)	AMBRA1 (ENSSPUG00000003231)	CHRM4 (ENSSPUG00000003226)	MDK (ENSSPUG00000003220)
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000158446.cb #22
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000158446.cb #22
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000158446.cb #22
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000158446.cb #22
Indian cobra	MODERN SPECIES	337	ENSNNAG00000007669	ENSNNAG00000016956	ENSNNAG00000016932	ENSNNAG00000016927	ENSNNAG00000016921	TOPBP1 (ENSNNAG00000016879)	CDV3 (ENSNNAG00000016865)	BFSP2 (ENSNNAG00000016830)	ENSNNAG00000016822	ENSNNAG00000016815	ENSNNAG00000016794	UBA5 (ENSNNAG00000016781)	ACAD11 (ENSNNAG00000016744)	DNAJC13 (ENSNNAG00000016521)	ENSNNAG00000015650	ENSNNAG00000015569 #22	ENSNNAG00000015562	ENSNNAG00000015550	ENSNNAG00000015515	ENSNNAG00000015501	MRPL3 (ENSNNAG00000015473)	ENSNNAG00000015466	ENSNNAG00000015445	ENSNNAG00000015427	ASTE1 (ENSNNAG00000015403)	ATP2C1 (ENSNNAG00000015308)	ENSNNAG00000015271	PIK3R4 (ENSNNAG00000015017)	ENSNNAG00000014893	ENSNNAG00000014847	ENSNNAG00000014744
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000158446.cb #22
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000158446.cb #22
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	160						COL6A6 (ENSNSUG00000010168)	PIK3R4 (ENSNSUG00000009975)	ATP2C1 (ENSNSUG00000008505)	ASTE1 (ENSNSUG00000008504)	NEK11 (ENSNSUG00000008503)	MRPL3 (ENSNSUG00000008502)	ENSNSUG00000008501	ENSNSUG00000008500	ENSNSUG00000008499	ENSNSUG00000008498	ENSNSUG00000008497 #22	ENSNSUG00000008490	DNAJC13 (ENSNSUG00000006950)	ENSNSUG00000006948	ACAD11 (ENSNSUG00000006946)	UBA5 (ENSNSUG00000006945)	NPHP3 (ENSNSUG00000006907)
Anura	ANCESTRAL SPECIES	75	ENSGT00940000154885.C	ENSGT00390000000020.b	ENSGT00940000161832.a	ENSGT00390000017480	ENSGT00940000158775	ENSGT00390000014065	ENSGT00940000158970	ENSGT00390000016785	ENSGT00940000161051.b.g	ENSGT01020000230346.E	ENSGT00390000015299.a.b.a	ENSGT00940000157349	ENSGT00940000159754	ENSGT00940000157698.b	ENSGT00940000156718 #20	ENSGT00940000158446 #22	ENSGT00510000047881 #23	ENSGT00950000182973.b.a #24	ENSGT00940000155568 #25	ENSGT00940000165402	ENSGT00390000012935 #26	ENSGT00940000158287	ENSGT00390000014757	ENSGT00940000164059	ENSGT00930000151062	ENSGT00940000160630	ENSGT01030000234629.E.b	ENSGT00390000007055	ENSGT00940000154348.c.b.a	ENSGT00390000016223	ENSGT00940000160394.a
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	1	C1QTNF4 (ENSLLEG00000024939)	NDUFS3 (ENSLLEG00000024831)	KBTBD4 (ENSLLEG00000024539)	PTPMT1 (ENSLLEG00000024438)	CELF1 (ENSLLEG00000023639)	RAPSN (ENSLLEG00000023499)	ENSLLEG00000023282	PSMC3 (ENSLLEG00000022403)	ENSLLEG00000022209	ENSLLEG00000022137	SLC39A13 (ENSLLEG00000022034)	ENSLLEG00000022001	SPI1 (ENSLLEG00000021892)	MYBPC3 (ENSLLEG00000015296)	MADD (ENSLLEG00000013247) #20	ACP2 (ENSLLEG00000013054) #22	DDB2 (ENSLLEG00000012938) #23	PACSIN3 (ENSLLEG00000012543) #24	ENSLLEG00000012474 #25	ENSLLEG00000012427	CSTPP1 (ENSLLEG00000012343) #26	LRP4 (ENSLLEG00000011330)	CKAP5 (ENSLLEG00000009276)	ENSLLEG00000008894	ZNF408 (ENSLLEG00000008856)	ARHGAP1 (ENSLLEG00000008726)	ENSLLEG00000025519	ATG13 (ENSLLEG00000025414)	HARBI1 (ENSLLEG00000025377)	ENSLLEG00000025363	AMBRA1 (ENSLLEG00000025123)
Frog	MODERN SPECIES	4	ndufs3 (ENSXETG00000019932)	ENSXETG00000049085	c1qtnf4 (ENSXETG00000019933)	agbl2 (ENSXETG00000019937)	fnbp4 (ENSXETG00000040583)	ENSXETG00000041614	nup160 (ENSXETG00000007917)	ENSXETG00000048500	psmc3 (ENSXETG00000007916)	tmem178.2 (ENSXETG00000007915)	slc39a13 (ENSXETG00000007914)	spi1 (ENSXETG00000041528)	mybpc3 (ENSXETG00000007912)	ENSXETG00000040104	madd (ENSXETG00000031749) #20	acp2 (ENSXETG00000003979) #22	ddb2 (ENSXETG00000003980) #23	cat.2 (ENSXETG00000003981)	ENSXETG00000038751	rdm1 (ENSXETG00000030141)	gh2 (ENSXETG00000003984)	lmo2 (ENSXETG00000042510)	caprin1 (ENSXETG00000003985)	nat10 (ENSXETG00000003782)	abtb2 (ENSXETG00000003783)	tfip11 (ENSXETG00000003784)	fbxo3 (ENSXETG00000003785)	ENSXETG00000044678	guca1bl (ENSXETG00000003788)	XB1001290 [provisional:golgb1] (ENSXETG00000037228)	ENSXETG00000041714