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Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	45	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833 #18	ENSGT00390000012355.B.a	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00940000156800	ENSGT00940000157220	ENSGT00940000158881	ENSGT01030000234638.b.b.c.a	ENSGT00940000159320	ENSGT00390000009453	ENSGT00940000165395	ENSGT00940000156813	ENSGT00390000011608	ENSGT00390000014472	ENSGT00940000161367	ENSGT00390000016718	ENSGT00940000158927	ENSGT00940000154870.D	ENSGT00390000012547.a
Theria	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833 #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00390000012355.B.a	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00940000156800	ENSGT00940000157220	ENSGT00940000158881	ENSGT01030000234638.b.b.c.a	ENSGT00940000159320	ENSGT00940000162149	ENSGT00390000009453	ENSGT00940000156813	ENSGT00390000011608	ENSGT00390000014472	ENSGT00940000161367	ENSGT00390000016718	ENSGT00940000158927	ENSGT00940000154870.D	ENSGT00390000012547.a
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Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327	ENSGT00940000175407	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00940000159270 #31
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327	ENSGT00940000175407	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00940000159270 #31
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Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00940000159270 #31	ENSGT00940000158487 #30
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Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00940000165862 #13	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00940000154652.e.b ##16	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00910000146897	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00390000009403	ENSGT00550000074827 #32
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00940000165862 #13	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00940000154652.e.b ##16	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327	ENSGT00950000182989.A.i	ENSGT00910000146897	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00390000009403	ENSGT00550000074827 #32
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00940000165862 #13	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00940000154652.e.b ##16	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00530000062932.c.a.a.b #26	ENSGT00940000158708.b #29	ENSGT00940000158487 #30	ENSGT00940000159270 #31	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000160380	ENSGT00910000146897	ENSGT00950000182989.A.i
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00940000165862 #13	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00940000154652.e.b ##16	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000158708.b #29	ENSGT00940000158487 #30	ENSGT00940000159270 #31	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000160380	ENSGT00910000146897	ENSGT00950000182989.A.i	ENSGT00940000157327
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00940000165862 #13	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00940000154652.e.b ##16	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819.b #25	ENSGT00530000062932.c.a.a.b.b.a #26	ENSGT00940000158708.b #29	ENSGT00940000158487 #30	ENSGT00940000159270 #31	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000160380	ENSGT00950000182989.A.i	ENSGT00940000157327
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01100000264184.a #11	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00940000165862 #13	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819.b #25	ENSGT00530000062932.c.a.a.b.b.a #26	ENSGT00530000062932.c.a.a.b.a #28	ENSGT00940000158708.b #29	ENSGT00940000158487 #30	ENSGT00940000159270 #31	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000160380	ENSGT00950000182989.A.i
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	17	ARNT2 (ENSMFAG00000001849) #7	ENSMFAG00000049004 #8	FAH (ENSMFAG00000034154) #9	ZFAND6 (ENSMFAG00000045344) #10	ENSMFAG00000064724 #11	BCL2A1 (ENSMFAG00000042767) #12	ENSMFAG00000038769 #13	MTHFS (ENSMFAG00000033383) #14	ENSMFAG00000053396 #15	ENSMFAG00000030790 #16	MINAR1 (ENSMFAG00000000425) #17	TMED3 (ENSMFAG00000037809) #18	ANKRD34C (ENSMFAG00000007725) #19	ENSMFAG00000063653 #20	RASGRF1 (ENSMFAG00000005368) #21	CTSH (ENSMFAG00000042803) #22	ENSMFAG00000007410 #23	ENSMFAG00000058149 #24	ADAMTS7 (ENSMFAG00000042737) #25	ENSMFAG00000053730 #26	ENSMFAG00000065589 #27	ENSMFAG00000041107 #28	CHRNB4 (ENSMFAG00000044105) #29	CHRNA3 (ENSMFAG00000002440) #30	CHRNA5 (ENSMFAG00000039718) #31	PSMA4 (ENSMFAG00000002125) #32	HYKK (ENSMFAG00000041819) #33	IREB2 (ENSMFAG00000039630) #34	CRABP1 (ENSMFAG00000060740) #35	SKIC8 (ENSMFAG00000036343) #36	DNAJA4 (ENSMFAG00000031045) #37
Rhesus	MODERN SPECIES	17	CFAP161 (ENSMMUG00000021143)	TLNRD1 (ENSMMUG00000052973)	MESD (ENSMMUG00000009409)	CEMIP (ENSMMUG00000002038)	ENSMMUG00000049824	ARNT2 (ENSMMUG00000011566) #7	FAH (ENSMMUG00000009361) #9	ZFAND6 (ENSMMUG00000056992) #10	ENSMMUG00000050525 #11	BCL2A1 (ENSMMUG00000003364) #12	MTHFS (ENSMMUG00000015224) #14	MINAR1 (ENSMMUG00000000534) #17	TMED3 (ENSMMUG00000016164) #18	ANKRD34C (ENSMMUG00000059439) #19	RASGRF1 (ENSMMUG00000064827) #21	CTSH (ENSMMUG00000010093) #22	MORF4L1 (ENSMMUG00000022926) #23	ADAMTS7 (ENSMMUG00000010716) #25	ENSMMUG00000008000 #27	ENSMMUG00000050284 ##26	CHRNB4 (ENSMMUG00000007541) #29	CHRNA3 (ENSMMUG00000023736) #30	CHRNA5 (ENSMMUG00000010743) #31	PSMA4 (ENSMMUG00000010740) #32	HYKK (ENSMMUG00000010738) #33	IREB2 (ENSMMUG00000045680) #34	CRABP1 (ENSMMUG00000009393) #35	SKIC8 (ENSMMUG00000014207) #36	DNAJA4 (ENSMMUG00000014204) #37	ACSBG1 (ENSMMUG00000011839)	IDH3A (ENSMMUG00000011838)
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	199	MESD (ENSMNEG00000032584)	CEMIP (ENSMNEG00000030930)	ABHD17C (ENSMNEG00000032949)	ARNT2 (ENSMNEG00000043775) #7	CTXND1 (ENSMNEG00000006598)	FAH (ENSMNEG00000039077) #9	ZFAND6 (ENSMNEG00000032885) #10	BCL2A1 (ENSMNEG00000042358) #12	ENSMNEG00000043940 #13	MTHFS (ENSMNEG00000034722) #14	ENSMNEG00000005742 ##16	MINAR1 (ENSMNEG00000028065) #17	TMED3 (ENSMNEG00000045387) #18	ANKRD34C (ENSMNEG00000023404) #19	RASGRF1 (ENSMNEG00000044392) #21	CTSH (ENSMNEG00000043848) #22	MORF4L1 (ENSMNEG00000036290) ##23	ADAMTS7 (ENSMNEG00000029214) #25	ENSMNEG00000014762 #26	ENSMNEG00000031097	CHRNB4 (ENSMNEG00000036684) #29	CHRNA3 (ENSMNEG00000033976) #30	CHRNA5 (ENSMNEG00000033511) #31	PSMA4 (ENSMNEG00000036436) #32	HYKK (ENSMNEG00000043268) #33	ENSMNEG00000026825	IREB2 (ENSMNEG00000039698) #34	CRABP1 (ENSMNEG00000042547) #35	SKIC8 (ENSMNEG00000021857) #36	DNAJA4 (ENSMNEG00000029933) #37	ACSBG1 (ENSMNEG00000039098)
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	52	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00940000165862 #13	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00940000154652.e.b ##16	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00530000062932.c.a.a.a.b.b.a.b.b ##26	ENSGT00940000158708.b #29	ENSGT00940000158487 #30	ENSGT00940000159270 #31	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000160380	ENSGT00910000146897	ENSGT00950000182989.A.i
Olive baboon	MODERN SPECIES	17	ENSPANG00000043381	ENSPANG00000050524	CTXND1 (ENSPANG00000036160)	FAH (ENSPANG00000015690) #9	ENSPANG00000047640	ZFAND6 (ENSPANG00000043027) #10	BCL2A1 (ENSPANG00000015707) #12	MTHFS (ENSPANG00000015706) #14	ENSPANG00000040026	ENSPANG00000051340	ENSPANG00000050254	MINAR1 (ENSPANG00000015731) #17	TMED3 (ENSPANG00000015730) #18	ANKRD34C (ENSPANG00000010307) #19	RASGRF1 (ENSPANG00000015770) #21	CTSH (ENSPANG00000015769) #22	MORF4L1 (ENSPANG00000015822) #23	ENSPANG00000015821 #25	ENSPANG00000041578	CHRNB4 (ENSPANG00000015819) #29	CHRNA3 (ENSPANG00000015818) #30	CHRNA5 (ENSPANG00000015817) #31	PSMA4 (ENSPANG00000015816) #32	HYKK (ENSPANG00000015814) #33	IREB2 (ENSPANG00000015813) #34	ENSPANG00000044330	CRABP1 (ENSPANG00000015829) #35	SKIC8 (ENSPANG00000015828) #36	DNAJA4 (ENSPANG00000015827) #37	ACSBG1 (ENSPANG00000015826)	ENSPANG00000015843
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	111	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00940000165862 #13	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00940000154652.e.b ##16	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00530000062932.c.a.a.a.b.b.a.b.b ##26	ENSGT00940000158708.b #29	ENSGT00940000158487 #30	ENSGT00940000159270 #31	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000160380	ENSGT00910000146897	ENSGT00950000182989.A.i
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	102	IL16 (ENSCATG00000031308)	CFAP161 (ENSCATG00000032251)	MESD (ENSCATG00000041343)	CEMIP (ENSCATG00000038083)	ABHD17C (ENSCATG00000014628)	ARNT2 (ENSCATG00000034335) #7	CTXND1 (ENSCATG00000020231)	FAH (ENSCATG00000040917) #9	BCL2A1 (ENSCATG00000000567) #12	MTHFS (ENSCATG00000032106) #14	ENSCATG00000035890 ##16	MINAR1 (ENSCATG00000037857) #17	TMED3 (ENSCATG00000040855) #18	ANKRD34C (ENSCATG00000020882) #19	RASGRF1 (ENSCATG00000041964) #21	CTSH (ENSCATG00000040994) #22	ENSCATG00000036990 #23	ADAMTS7 (ENSCATG00000032578) #25	ENSCATG00000040528 ##26	ENSCATG00000032237	ENSCATG00000033473 ##26	ENSCATG00000001339	ENSCATG00000006226 ##26	CHRNB4 (ENSCATG00000038045) #29	CHRNA5 (ENSCATG00000038985) #31	PSMA4 (ENSCATG00000041830) #32	HYKK (ENSCATG00000029082) #33	IREB2 (ENSCATG00000033462) #34	CRABP1 (ENSCATG00000040276) #35	SKIC8 (ENSCATG00000043772) #36	DNAJA4 (ENSCATG00000027950) #37
Drill	MODERN SPECIES	876	MESD (ENSMLEG00000038651)	CEMIP (ENSMLEG00000027906)	ENSMLEG00000034046	ARNT2 (ENSMLEG00000037187) #7	CTXND1 (ENSMLEG00000016324)	FAH (ENSMLEG00000039864) #9	ZFAND6 (ENSMLEG00000042827) #10	BCL2A1 (ENSMLEG00000043060) #12	ENSMLEG00000031849 #13	MTHFS (ENSMLEG00000040957) #14	ENSMLEG00000029753 ##16	MINAR1 (ENSMLEG00000031937) #17	TMED3 (ENSMLEG00000040574) #18	ANKRD34C (ENSMLEG00000041389) #19	RASGRF1 (ENSMLEG00000028210) #21	CTSH (ENSMLEG00000035029) #22	ENSMLEG00000041790 #23	ADAMTS7 (ENSMLEG00000043896) #25	ENSMLEG00000027717 ##26
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	18	MESD (ENSCSAG00000015109)	CEMIP (ENSCSAG00000015102)	ENSCSAG00000015092	ABHD17C (ENSCSAG00000015085)	ARNT2 (ENSCSAG00000015083) #7	ENSCSAG00000015077	FAH (ENSCSAG00000015069) #9	ZFAND6 (ENSCSAG00000015063) #10	BCL2A1 (ENSCSAG00000015060) #12	ENSCSAG00000015055	MTHFS (ENSCSAG00000015037) #14	MINAR1 (ENSCSAG00000015031) #17	TMED3 (ENSCSAG00000015025) #18	ANKRD34C (ENSCSAG00000019730) #19	RASGRF1 (ENSCSAG00000015020) #21	CTSH (ENSCSAG00000015006) #22	CHRNB4 (ENSCSAG00000014997) #29	CHRNA3 (ENSCSAG00000014992) #30	CHRNA5 (ENSCSAG00000014985) #31	PSMA4 (ENSCSAG00000014954) #32	HYKK (ENSCSAG00000014914) #33	IREB2 (ENSCSAG00000014904) #34	CRABP1 (ENSCSAG00000014895) #35	SKIC8 (ENSCSAG00000014890) #36	DNAJA4 (ENSCSAG00000014879) #37	ACSBG1 (ENSCSAG00000014872)	IDH3A (ENSCSAG00000014834)	CIB2 (ENSCSAG00000014761)	SH2D7 (ENSCSAG00000014754)	TBC1D2B (ENSCSAG00000014743)	LINGO1 (ENSCSAG00000019731)
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	238	ENSGT00390000018488	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00940000165862 #13	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000153402.c.a.a.b.c.b	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	2174															RASGRF1 (ENSRROG00000039891) #21	CTSH (ENSRROG00000027912) #22	ENSRROG00000036577 #23
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	841	IL16 (ENSRBIG00000043336)	CFAP161 (ENSRBIG00000032540)	MESD (ENSRBIG00000029784)	CEMIP (ENSRBIG00000024471)	ABHD17C (ENSRBIG00000044920)	ARNT2 (ENSRBIG00000021581) #7	CTXND1 (ENSRBIG00000000492)	FAH (ENSRBIG00000043713) #9	BCL2A1 (ENSRBIG00000037554) #12	MTHFS (ENSRBIG00000040188) #14	MINAR1 (ENSRBIG00000036639) #17	TMED3 (ENSRBIG00000025753) #18	ANKRD34C (ENSRBIG00000001964) #19	ENSRBIG00000034098	RASGRF1 (ENSRBIG00000028858) #21	CTSH (ENSRBIG00000041082) #22	ENSRBIG00000034479 #23
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00940000165862 #13	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00940000154652.e.b ##16	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000153402.c.a.a.a	ENSGT00390000018737	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h.u #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00910000146897	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00390000009403	ENSGT00550000074827 #32
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00940000165862 #13	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00940000154652.e.b ##16	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000153402.c.a.a.a	ENSGT00390000018737	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h.u #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00910000146897	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00390000009403	ENSGT00550000074827 #32
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00940000165862 #13	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00940000154652.e.b ##16	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000153402.c.a.a.a	ENSGT00390000018737	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h.u #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00910000146897.a.b	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00390000009403	ENSGT00550000074827 #32
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00940000165862 #13	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00940000154652.e.b ##16	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000153402.c.a.a.a	ENSGT00390000018737	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h.u #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00910000146897.a.b	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00390000009403	ENSGT00550000074827 #32
Pan	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00940000165862 #13	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00940000154652.e.b ##16	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000153402.c.a.a.a	ENSGT00390000018737	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h.u #23	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.g.b.a.b ##23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00910000146897.a.b	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00390000009403
Chimpanzee	MODERN SPECIES	6	CEMIP (ENSPTRG00000007365)	ABHD17C (ENSPTRG00000007364)	ARNT2 (ENSPTRG00000007363) #7	CTXND1 (ENSPTRG00000050540)	FAH (ENSPTRG00000007362) #9	BCL2A1 (ENSPTRG00000007359) #12	ST20 (ENSPTRG00000033922) #13	MTHFS (ENSPTRG00000007358) #14	ENSPTRG00000050800 ##16	MINAR1 (ENSPTRG00000007357) #17	TMED3 (ENSPTRG00000007356) #18	ANKRD34C (ENSPTRG00000044468) #19	ENSPTRG00000043469	ENSPTRG00000007354	RASGRF1 (ENSPTRG00000007353) #21	CTSH (ENSPTRG00000007352) #22	MORF4L1 (ENSPTRG00000007351) #23	ADAMTS7 (ENSPTRG00000007350) #25	ENSPTRG00000049009	CHRNB4 (ENSPTRG00000007348) #29	CHRNA3 (ENSPTRG00000007347) #30	CHRNA5 (ENSPTRG00000007346) #31	PSMA4 (ENSPTRG00000007345) #32	ENSPTRG00000048133	HYKK (ENSPTRG00000007343) #33	IREB2 (ENSPTRG00000007342) #34	CRABP1 (ENSPTRG00000007340) #35	SKIC8 (ENSPTRG00000007339) #36	DNAJA4 (ENSPTRG00000007338) #37	ACSBG1 (ENSPTRG00000007337)	ENSPTRG00000048362
Bonobo	MODERN SPECIES	6	ENSPPAG00000015510	MESD (ENSPPAG00000013103)	CEMIP (ENSPPAG00000039274)	ENSPPAG00000010874	ENSPPAG00000002668 #7	FAH (ENSPPAG00000043437) #9	BCL2A1 (ENSPPAG00000020907) #12	ENSPPAG00000035670 #13	ENSPPAG00000031138 #14	ENSPPAG00000042539 ##16	MINAR1 (ENSPPAG00000039983) #17	TMED3 (ENSPPAG00000039988) #18	ANKRD34C (ENSPPAG00000001950) #19	ENSPPAG00000041389	RASGRF1 (ENSPPAG00000025333) #21	CTSH (ENSPPAG00000041038) #22	ENSPPAG00000040597 ##23	ADAMTS7 (ENSPPAG00000040692) #25	ENSPPAG00000037344	ENSPPAG00000036795	ENSPPAG00000037146 #26	CHRNB4 (ENSPPAG00000029468) #29	CHRNA3 (ENSPPAG00000042093) #30	CHRNA5 (ENSPPAG00000034440) #31	PSMA4 (ENSPPAG00000026421) #32	HYKK (ENSPPAG00000043921) #33	IREB2 (ENSPPAG00000038956) #34	CRABP1 (ENSPPAG00000023226) #35	SKIC8 (ENSPPAG00000036539) #36	DNAJA4 (ENSPPAG00000035988) #37	ACSBG1 (ENSPPAG00000033283)
Human	MODERN SPECIES	6	TLNRD1 (ENSG00000140406)	MESD (ENSG00000117899)	CEMIP (ENSG00000103888)	ABHD17C (ENSG00000136379)	ARNT2 (ENSG00000172379) #7	CTXND1 (ENSG00000259417)	FAH (ENSG00000103876) #9	ZFAND6 (ENSG00000086666) #10	BCL2A1 (ENSG00000140379) #12	ST20-MTHFS (ENSG00000259332)	MTHFS (ENSG00000136371) #14	MINAR1 (ENSG00000169330) #17	TMED3 (ENSG00000166557) #18	ANKRD34C (ENSG00000235711) #19	RASGRF1 (ENSG00000058335) #21	CTSH (ENSG00000103811) #22	MORF4L1 (ENSG00000185787) #23	ADAMTS7 (ENSG00000136378) #25	CHRNB4 (ENSG00000117971) #29	CHRNA3 (ENSG00000080644) #30	CHRNA5 (ENSG00000169684) #31	PSMA4 (ENSG00000041357) #32	HYKK (ENSG00000188266) #33	IREB2 (ENSG00000136381) #34	CRABP1 (ENSG00000166426) #35	SKIC8 (ENSG00000140395) #36	DNAJA4 (ENSG00000140403) #37	ACSBG1 (ENSG00000103740)	IDH3A (ENSG00000166411)	CIB2 (ENSG00000136425)	SH2D7 (ENSG00000183476)
Gorilla	MODERN SPECIES	6	ABHD17C (ENSGGOG00000012949)	ENSGGOG00000012245 #7	CTXND1 (ENSGGOG00000040552)	FAH (ENSGGOG00000015621) #9	ENSGGOG00000042892	BCL2A1 (ENSGGOG00000006077) #12	ENSGGOG00000012196 #13	ENSGGOG00000012188 #14	ENSGGOG00000038692 ##16	MINAR1 (ENSGGOG00000012413) #17	TMED3 (ENSGGOG00000009973) #18	ANKRD34C (ENSGGOG00000039926) #19	ENSGGOG00000038170	ENSGGOG00000039411	RASGRF1 (ENSGGOG00000009950) #21	CTSH (ENSGGOG00000012275) #22	ENSGGOG00000040870	MORF4L1 (ENSGGOG00000016826) #23	ADAMTS7 (ENSGGOG00000011387) #25	ENSGGOG00000039841	CHRNB4 (ENSGGOG00000010462) #29	CHRNA3 (ENSGGOG00000010455) #30	CHRNA5 (ENSGGOG00000006540) #31	PSMA4 (ENSGGOG00000000191) #32	ENSGGOG00000041823	HYKK (ENSGGOG00000001263) #33	IREB2 (ENSGGOG00000015650) #34	CRABP1 (ENSGGOG00000010435) #35	SKIC8 (ENSGGOG00000011473) #36	DNAJA4 (ENSGGOG00000011469) #37	ACSBG1 (ENSGGOG00000002234)
Orangutan	MODERN SPECIES	6	MESD (ENSPPYG00000006717)	CEMIP (ENSPPYG00000006716)	ABHD17C (ENSPPYG00000029768)	ARNT2 (ENSPPYG00000006714) #7	CTXND1 (ENSPPYG00000040930)	FAH (ENSPPYG00000006713) #9	ZFAND6 (ENSPPYG00000006712) #10	ENSPPYG00000006711 #12	ENSPPYG00000035887 #13	ENSPPYG00000006710 #14	MINAR1 (ENSPPYG00000006709) #17	TMED3 (ENSPPYG00000006708) #18	ANKRD34C (ENSPPYG00000006707) #19	ENSPPYG00000041013	RASGRF1 (ENSPPYG00000006705) #21	CTSH (ENSPPYG00000006704) #22	MORF4L1 (ENSPPYG00000006703) #23	ADAMTS7 (ENSPPYG00000029573) #25	ENSPPYG00000035556	ENSPPYG00000036775 ##26	CHRNB4 (ENSPPYG00000006702) #29	CHRNA3 (ENSPPYG00000006701) #30	CHRNA5 (ENSPPYG00000006700) #31	PSMA4 (ENSPPYG00000006699) #32	ENSPPYG00000006698	HYKK (ENSPPYG00000006697) #33	IREB2 (ENSPPYG00000006696) #34	CRABP1 (ENSPPYG00000006694) #35	SKIC8 (ENSPPYG00000006693) #36	DNAJA4 (ENSPPYG00000006692) #37	ACSBG1 (ENSPPYG00000006691)
Gibbon	MODERN SPECIES	21	CEMIP (ENSNLEG00000009016)	ENSNLEG00000028272	ARNT2 (ENSNLEG00000008951) #7	CTXND1 (ENSNLEG00000030745)	FAH (ENSNLEG00000008888) #9	ENSNLEG00000035748	ENSNLEG00000029141 #12	ENSNLEG00000034840 #14	ENSNLEG00000030566 ##16	ENSNLEG00000033724 #17	TMED3 (ENSNLEG00000008832) #18	ANKRD34C (ENSNLEG00000028399) #19	ENSNLEG00000009500	ENSNLEG00000032326	RASGRF1 (ENSNLEG00000008805) #21	CTSH (ENSNLEG00000008753) #22	ENSNLEG00000008678 #23	ENSNLEG00000032339	CHRNB4 (ENSNLEG00000008668) #29	CHRNA3 (ENSNLEG00000008651) #30	CHRNA5 (ENSNLEG00000008645) #31	PSMA4 (ENSNLEG00000030373) #32	ENSNLEG00000018490	HYKK (ENSNLEG00000008639) #33	IREB2 (ENSNLEG00000008549) #34	CRABP1 (ENSNLEG00000008542) #35	SKIC8 (ENSNLEG00000029873) #36	DNAJA4 (ENSNLEG00000008494) #37	ACSBG1 (ENSNLEG00000008482)	IDH3A (ENSNLEG00000008435)	CIB2 (ENSNLEG00000031509)
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599.e #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25
Mas night monkey	MODERN SPECIES	789														TMED3 (ENSANAG00000022600) #18	RASGRF1 (ENSANAG00000025773) #21	CTSH (ENSANAG00000020973) #22	ENSANAG00000020181 #23	ADAMTS7 (ENSANAG00000022847) #25	ENSANAG00000035667
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599.e #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	66	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599.e #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23
Capuchin	MODERN SPECIES	957															ENSCCAG00000024496 #21	CTSH (ENSCCAG00000001925) #22	ENSCCAG00000024418 ##23
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	45	CFAP161 (ENSSBOG00000023404)	TLNRD1 (ENSSBOG00000016445)	MESD (ENSSBOG00000028574)	CEMIP (ENSSBOG00000031911)	ABHD17C (ENSSBOG00000029179)	ARNT2 (ENSSBOG00000025274) #7	CTXND1 (ENSSBOG00000018690)	FAH (ENSSBOG00000035677) #9	ZFAND6 (ENSSBOG00000022004) #10	BCL2A1 (ENSSBOG00000026843) #12	MTHFS (ENSSBOG00000020479) #14	MINAR1 (ENSSBOG00000031943) #17	TMED3 (ENSSBOG00000004100) #18	ANKRD34C (ENSSBOG00000018784) #19	RASGRF1 (ENSSBOG00000032821) #21	CTSH (ENSSBOG00000022797) #22	ENSSBOG00000024453 #23
Marmoset	MODERN SPECIES	18	ENSCJAG00000087135 #17	ENSCJAG00000081875	ENSCJAG00000079776 ##24	ENSCJAG00000008511	ENSCJAG00000076001	ENSCJAG00000043892	ENSCJAG00000086335	ENSCJAG00000078641	ENSCJAG00000087217 #17	ENSCJAG00000063236	ENSCJAG00000080331	TMED3 (ENSCJAG00000005277) #18	ANKRD34C (ENSCJAG00000005284) #19	RASGRF1 (ENSCJAG00000002316) #21	ENSCJAG00000085127	ENSCJAG00000002305 #22	MORF4L1 (ENSCJAG00000002214) #23	ADAMTS7 (ENSCJAG00000002181) #25	ENSCJAG00000052178	ENSCJAG00000057743	AKAP13 (ENSCJAG00000009388)	KLHL25 (ENSCJAG00000021976)	ENSCJAG00000059501	ENSCJAG00000065812	ENSCJAG00000064391	ENSCJAG00000085215	ENSCJAG00000076223	ENSCJAG00000056672	ENSCJAG00000076695	ENSCJAG00000052170 ##24	ENSCJAG00000004631
Tarsier	MODERN SPECIES	5418															ENSTSYG00000035305	CTSH (ENSTSYG00000006084) #22
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.g.a ##23	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00940000159270 #31
Bushbaby	MODERN SPECIES	126	TLNRD1 (ENSOGAG00000033271)	MESD (ENSOGAG00000012330)	CEMIP (ENSOGAG00000012324)	ABHD17C (ENSOGAG00000028018)	ENSOGAG00000011638	ARNT2 (ENSOGAG00000011634) #7	ENSOGAG00000015261	FAH (ENSOGAG00000014033) #9	ENSOGAG00000024159	BCL2A1 (ENSOGAG00000008713) #12	MTHFS (ENSOGAG00000011648) #14	MINAR1 (ENSOGAG00000006296) #17	TMED3 (ENSOGAG00000009289) #18	ANKRD34C (ENSOGAG00000006558) #19	RASGRF1 (ENSOGAG00000013664) #21	CTSH (ENSOGAG00000006050) #22	ENSOGAG00000006047 #23	ADAMTS7 (ENSOGAG00000013939) #25	TBC1D2B (ENSOGAG00000014091)	ENSOGAG00000033929	CIB2 (ENSOGAG00000014100)	IDH3A (ENSOGAG00000011120)	ACSBG1 (ENSOGAG00000011127)	ENSOGAG00000002390	ENSOGAG00000032026	DNAJA4 (ENSOGAG00000006752) #37	SKIC8 (ENSOGAG00000006755) #36	CRABP1 (ENSOGAG00000006757) #35	IREB2 (ENSOGAG00000010622) #34	HYKK (ENSOGAG00000010631) #33	PSMA4 (ENSOGAG00000010637) #32
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	43	ENSGT00940000156178.A	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.g.a ##23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327
Mouse lemur	MODERN SPECIES	31	MEX3B (ENSMICG00000043733)	TMC3 (ENSMICG00000047917)	STARD5 (ENSMICG00000037549)	IL16 (ENSMICG00000004948)	CFAP161 (ENSMICG00000045169)	TLNRD1 (ENSMICG00000002007)	MESD (ENSMICG00000048097)	CEMIP (ENSMICG00000017190)	ABHD17C (ENSMICG00000010941)	ARNT2 (ENSMICG00000015661) #7	CTXND1 (ENSMICG00000044717)	FAH (ENSMICG00000028610) #9	ZFAND6 (ENSMICG00000006343) #10	BCL2A1 (ENSMICG00000032100) #12	MTHFS (ENSMICG00000033263) #14	CTSH (ENSMICG00000037121) #22	ENSMICG00000027750 ##23	ADAMTS7 (ENSMICG00000035475) #25	TBC1D2B (ENSMICG00000009141)	SH2D7 (ENSMICG00000046037)	CIB2 (ENSMICG00000033416)	ENSMICG00000015401 ##18	ENSMICG00000030809 ##18	MINAR1 (ENSMICG00000041908) #17	RASGRF1 (ENSMICG00000036744) #21	POLG (ENSMICG00000001951)	ENSMICG00000043282	FANCI (ENSMICG00000001936)	RLBP1 (ENSMICG00000042518)	ABHD2 (ENSMICG00000001927)	MFGE8 (ENSMICG00000015488)
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	244													ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.g.a ##23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	790													MINAR1 (ENSPCOG00000017822) #17	TMED3 (ENSPCOG00000019787) #18	RASGRF1 (ENSPCOG00000012327) #21	CTSH (ENSPCOG00000004081) #22	MORF4L1 (ENSPCOG00000014226) ##23	ADAMTS7 (ENSPCOG00000016956) #25	TBC1D2B (ENSPCOG00000019898)	SH2D7 (ENSPCOG00000013233)	CIB2 (ENSPCOG00000015271)
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	369													MINAR1 (ENSPSMG00000007368) #17	TMED3 (ENSPSMG00000007383) #18	RASGRF1 (ENSPSMG00000007479) #21	CTSH (ENSPSMG00000007549) #22	MORF4L1 (ENSPSMG00000007778) ##23	ADAMTS7 (ENSPSMG00000007909) #25	TBC1D2B (ENSPSMG00000007927)	SH2D7 (ENSPSMG00000007934)
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327	ENSGT00940000175407	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00940000159270 #31
Glires	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327	ENSGT00940000175407	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00940000159270 #31
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327	ENSGT00940000175407	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00940000159270 #31
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327	ENSGT00940000175407	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00940000159270 #31
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000161538	ENSGT00940000155536	ENSGT00650000093438	ENSGT00390000009631	ENSGT00940000155566	ENSGT00530000063775	ENSGT00950000182856.a.b	ENSGT00940000153511.b	ENSGT00940000153505.a.a.c.b	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327	ENSGT00940000175407	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00940000159270 #31
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000161538	ENSGT00940000155536	ENSGT00650000093438	ENSGT00390000009631	ENSGT00940000155566	ENSGT00530000063775	ENSGT00950000182856.a.b	ENSGT00940000153511.b	ENSGT00940000153505.a.a.c.b	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327	ENSGT00940000175407	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00940000159270 #31
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000161538	ENSGT00940000155536	ENSGT00650000093438	ENSGT00390000009631	ENSGT00940000155566	ENSGT00530000063775	ENSGT00950000182856.a.b	ENSGT00940000153511.b	ENSGT00940000153505.a.a.c.b.a	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160269	ENSGT00940000154200.B	ENSGT00940000161728	ENSGT00940000154435.k.a	ENSGT00940000154435.k.b	ENSGT00940000154435.l	ENSGT00940000161947	ENSGT01030000234558.A.a.b	ENSGT00520000055625.b	ENSGT00940000160094	ENSGT00940000161292	ENSGT00390000010687.a.a
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000161538	ENSGT00940000155536	ENSGT00650000093438	ENSGT00390000009631	ENSGT00940000155566	ENSGT00530000063775	ENSGT00950000182856.a.b	ENSGT00940000153511.b	ENSGT00940000153505.a.a.c.b.a	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160269	ENSGT00940000154200.B	ENSGT00940000161728	ENSGT00940000154435.k.a	ENSGT00940000154435.k.b	ENSGT00940000154435.l	ENSGT00940000161947	ENSGT01030000234558.A.a.b	ENSGT00520000055625.b	ENSGT00940000160094	ENSGT00940000161292	ENSGT00390000010687.a.a
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000161538	ENSGT00940000155536	ENSGT00650000093438	ENSGT00390000009631	ENSGT00940000155566	ENSGT00530000063775	ENSGT00950000182856.a.b	ENSGT00940000153511.b	ENSGT00940000153505.a.a.c.b.a	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160269	ENSGT00940000154200.B	ENSGT00940000161728	ENSGT00940000154435.k.a	ENSGT00940000154435.k.b	ENSGT00940000154435.l	ENSGT00940000161947	ENSGT01030000234558.A.a.b	ENSGT00520000055625.b	ENSGT00940000160094	ENSGT00940000161292	ENSGT00390000010687.a.a
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	284	Ripply2 (ENSCGRG00001003480)	Cyb5r4 (ENSCGRG00001024358)	Mrap2 (ENSCGRG00001024554)	Cep162 (ENSCGRG00001021610)	Tbx18 (ENSCGRG00001020060)	Nt5e (ENSCGRG00001016518)	Snx14 (ENSCGRG00001014424)	Syncrip (ENSCGRG00001014564)	Zfp949 (ENSCGRG00001012754)	ENSCGRG00001009505 #12	ENSCGRG00001022191 #14	Minar1 (ENSCGRG00001007017) #17	Tmed3 (ENSCGRG00001025044) #18	Ankrd34c (ENSCGRG00001011814) #19	Rasgrf1 (ENSCGRG00001024142) #21	Ctsh (ENSCGRG00001017759) #22	Morf4l1 (ENSCGRG00001024458) #23	Adamts7 (ENSCGRG00001014261) #25	Tbc1d2b (ENSCGRG00001018935)	ENSCGRG00001012856	Zic1 (ENSCGRG00001015672)	Zic4 (ENSCGRG00001024222)	ENSCGRG00001020059	ENSCGRG00001017214	Plscr5 (ENSCGRG00001013925)	Plscr1 (ENSCGRG00001022988)	Plscr2 (ENSCGRG00001021981)	ENSCGRG00001018742	Plscr4 (ENSCGRG00001014929)	Plod2 (ENSCGRG00001022906)	ENSCGRG00001019093
Golden Hamster	MODERN SPECIES	719											Tmed3 (ENSMAUG00000012006) #18	Ankrd34c (ENSMAUG00000012130) #19	Rasgrf1 (ENSMAUG00000013291) #21	ENSMAUG00000014181	ENSMAUG00000015527	Ctsh (ENSMAUG00000016477) #22	ENSMAUG00000013401 #23	Adamts7 (ENSMAUG00000015892) #25	Tbc1d2b (ENSMAUG00000000447)	ENSMAUG00000000776	Zic1 (ENSMAUG00000000093)	Zic4 (ENSMAUG00000000134)	Plscr5 (ENSMAUG00000001158)	Plscr1 (ENSMAUG00000000569)	Plscr2 (ENSMAUG00000006078)	1700057G04Rik (ENSMAUG00000002609)	Plscr4 (ENSMAUG00000009045)	Plod2 (ENSMAUG00000003215)	Dipk2a (ENSMAUG00000007688)	Slc9a9 (ENSMAUG00000008995)	Chst2 (ENSMAUG00000006721)
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	23										ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160269	ENSGT00940000154200.B	ENSGT00940000161728	ENSGT00940000154435.k.a	ENSGT00940000154435.k.b	ENSGT00940000154435.l	ENSGT00940000161947	ENSGT01030000234558.A.a.b	ENSGT00520000055625.b	ENSGT00940000160094	ENSGT00940000161292	ENSGT00390000010687.a.a
Prairie vole	MODERN SPECIES	95											ENSMOCG00000016964 #14	Minar1 (ENSMOCG00000010871) #17	Tmed3 (ENSMOCG00000015691) #18	Ankrd34c (ENSMOCG00000017568) #19	Rasgrf1 (ENSMOCG00000011246) #21	Ctsh (ENSMOCG00000004510) #22	ENSMOCG00000002832 ##23	Adamts7 (ENSMOCG00000010540) #25	Tbc1d2b (ENSMOCG00000010939)	Zic1 (ENSMOCG00000015344)	ENSMOCG00000000978	Plscr5 (ENSMOCG00000012563)	Plscr1 (ENSMOCG00000006478)	Plscr2 (ENSMOCG00000000143)	1700057G04Rik (ENSMOCG00000000750)	Plscr4 (ENSMOCG00000006239)	Plod2 (ENSMOCG00000014848)	ENSMOCG00000022382	ENSMOCG00000015904	Slc9a9 (ENSMOCG00000007053)	Chst2 (ENSMOCG00000014642)
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	20	Cgas (ENSPEMG00000022880)	Ddx43 (ENSPEMG00000023986)	ENSPEMG00000029820	Dppa5a (ENSPEMG00000029152)	ENSPEMG00000028681	ENSPEMG00000023102	ENSPEMG00000030561	ENSPEMG00000025925	ENSPEMG00000023344	ENSPEMG00000019489 #12	ENSPEMG00000019623 #14	Minar1 (ENSPEMG00000019747) #17	Tmed3 (ENSPEMG00000019885) #18	Ankrd34c (ENSPEMG00000020141) #19	Rasgrf1 (ENSPEMG00000019313) #21	Ctsh (ENSPEMG00000019736) #22	Morf4l1 (ENSPEMG00000019429) #23	Adamts7 (ENSPEMG00000017976) #25	Tbc1d2b (ENSPEMG00000000960)	Zic1 (ENSPEMG00000019412)	Zic4 (ENSPEMG00000026607)	Plscr5 (ENSPEMG00000019462)	Plscr1 (ENSPEMG00000019486)	Plscr2 (ENSPEMG00000019567)	1700057G04Rik (ENSPEMG00000019593)	Plscr4 (ENSPEMG00000019619)	Plod2 (ENSPEMG00000023460)	ENSPEMG00000019304	Dipk2a (ENSPEMG00000019631)	Slc9a9 (ENSPEMG00000019907)	Chst2 (ENSPEMG00000019658)
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000161538	ENSGT00940000155536	ENSGT00650000093438	ENSGT00390000009631	ENSGT00940000155566	ENSGT00530000063775	ENSGT00950000182856.a.b	ENSGT00940000153511.b	ENSGT00900000143321	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160269	ENSGT00940000154200.B	ENSGT00940000161728	ENSGT00940000154435.k.a	ENSGT00940000154435.k.b	ENSGT00940000154435.l	ENSGT00940000161947	ENSGT01030000234558.A.a.b	ENSGT00520000055625.b	ENSGT00940000160094	ENSGT00940000161292	ENSGT00390000010687.a.a
Mus	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000155536	ENSGT00650000093438	ENSGT00390000009631	ENSGT00940000155566	ENSGT00530000063775	ENSGT00950000182856.a.b	ENSGT00940000153511.b	ENSGT00940000153505.a.a.c.b.a	ENSGT00940000160005.A.m	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160269	ENSGT00940000154200.B	ENSGT00940000161728	ENSGT00940000154435.k.a	ENSGT00940000154435.k.b	ENSGT00940000154435.l	ENSGT00940000161947	ENSGT01030000234558.A.a.b	ENSGT00520000055625.b	ENSGT00940000160094	ENSGT00940000161292	ENSGT00390000010687.a.a
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000155536	ENSGT00650000093438	ENSGT00390000009631	ENSGT00940000155566	ENSGT00530000063775	ENSGT00950000182856.a.b	ENSGT00940000153511.b	ENSGT00940000153505.a.a.c.b.a	ENSGT00940000160005.A.m	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160269	ENSGT00940000154200.B	ENSGT00940000161728	ENSGT00940000154435.k.a	ENSGT00940000154435.k.b	ENSGT00940000154435.l	ENSGT00940000161947	ENSGT01030000234558.A.a.b	ENSGT00520000055625.b	ENSGT00940000160094	ENSGT00940000161292	ENSGT00390000010687.a.a
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000155536	ENSGT00650000093438	ENSGT00390000009631	ENSGT00940000155566	ENSGT00530000063775	ENSGT00950000182856.a.b	ENSGT00940000153511.b	ENSGT00940000153505.a.a.c.b.a	ENSGT00940000160005.A.m	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a.c.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160269	ENSGT00940000154200.B	ENSGT00940000161728	ENSGT00940000154435.k.a	ENSGT00940000154435.k.b	ENSGT00940000154435.l	ENSGT00940000161947	ENSGT01030000234558.A.a.b	ENSGT00520000055625.b	ENSGT00940000160094	ENSGT00940000161292	ENSGT00390000010687.a.a
Mouse	MODERN SPECIES	18	Syncrip (ENSMUSG00000032423)	Zfp949 (ENSMUSG00000032425)	Trim43a (ENSMUSG00000090693)	Mthfsl (ENSMUSG00000079427) #14	Bcl2a1d (ENSMUSG00000099974) #12	Trim43c (ENSMUSG00000067399)	Bcl2a1a (ENSMUSG00000102037) #12	Trim43b (ENSMUSG00000079162)	Bcl2a1b (ENSMUSG00000089929) #12	Gm29094 (ENSMUSG00000100838)	Mthfs (ENSMUSG00000066442) #14	Minar1 (ENSMUSG00000039313) #17	Tmed3 (ENSMUSG00000032353) #18	Ankrd34c (ENSMUSG00000047606) #19	Rasgrf1 (ENSMUSG00000032356) #21	Ctsh (ENSMUSG00000032359) #22	Morf4l1 (ENSMUSG00000062270) #23	Adamts7 (ENSMUSG00000032363) #25	Tbc1d2b (ENSMUSG00000037410)	Zic1 (ENSMUSG00000032368)	Zic4 (ENSMUSG00000036972)	Plscr5 (ENSMUSG00000095654)	Plscr1 (ENSMUSG00000032369)	Plscr2 (ENSMUSG00000032372)	1700057G04Rik (ENSMUSG00000074139)	Plscr4 (ENSMUSG00000032377)	Plod2 (ENSMUSG00000032374)	Dipk2a (ENSMUSG00000045414)	Slc9a9 (ENSMUSG00000031129)	Chst2 (ENSMUSG00000033350)	U2surp (ENSMUSG00000032407)
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000000155.b	ENSGT00950000183068.b	ENSGT00940000161538	ENSGT00940000155536.o	ENSGT00650000093438	ENSGT00390000009631	ENSGT00940000155566	ENSGT00530000063775	ENSGT00950000182856.a.b	ENSGT00940000153511.b	ENSGT00940000153505.a.a.c.b.a	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737
Steppe mouse	MODERN SPECIES	2825											Minar1 (ENSMSIG00000026092) #17	Tmed3 (ENSMSIG00000026107) #18	Ankrd34c (ENSMSIG00000026116) #19	ENSMSIG00000026129	Rasgrf1 (ENSMSIG00000026132) #21	Ctsh (ENSMSIG00000026169) #22	ENSMSIG00000026191 #23	Adamts7 (ENSMSIG00000026293) #25	Tbc1d2b (ENSMSIG00000026428)
spretus	MODERN SPECIES	18	Ripply2 (MGP_SPRETEiJ_G0033640)	Cyb5r4 (MGP_SPRETEiJ_G0033641)	Mrap2 (MGP_SPRETEiJ_G0033642)	Cep162 (MGP_SPRETEiJ_G0033643)	Tbx18 (MGP_SPRETEiJ_G0033644)	Nt5e (MGP_SPRETEiJ_G0033645)	Snx14 (MGP_SPRETEiJ_G0033646)	MGP_SPRETEiJ_G0033647	Syncrip (MGP_SPRETEiJ_G0033648)	Zfp949 (MGP_SPRETEiJ_G0033649)	MGP_SPRETEiJ_G0033651 #14	Minar1 (MGP_SPRETEiJ_G0033652) #17	Tmed3 (MGP_SPRETEiJ_G0033653) #18	Ankrd34c (MGP_SPRETEiJ_G0033654) #19	Rasgrf1 (MGP_SPRETEiJ_G0033655) #21	Ctsh (MGP_SPRETEiJ_G0033656) #22	Morf4l1 (MGP_SPRETEiJ_G0033657) #23	Adamts7 (MGP_SPRETEiJ_G0033658) #25	Tbc1d2b (MGP_SPRETEiJ_G0033659)	Zic4 (MGP_SPRETEiJ_G0033660)	Zic1 (MGP_SPRETEiJ_G0033661)	MGP_SPRETEiJ_G0033662	Plscr5 (MGP_SPRETEiJ_G0033663)	Plscr1 (MGP_SPRETEiJ_G0033664)	MGP_SPRETEiJ_G0033665	1700057G04Rik (MGP_SPRETEiJ_G0033666)	Plscr4 (MGP_SPRETEiJ_G0033667)	Plod2 (MGP_SPRETEiJ_G0033668)	Dipk2a (MGP_SPRETEiJ_G0033669)	Slc9a9 (MGP_SPRETEiJ_G0033670)	Chst2 (MGP_SPRETEiJ_G0033671)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	1	Snap91 (MGP_PahariEiJ_G0015367)	MGP_PahariEiJ_G0015368	Cyb5r4 (MGP_PahariEiJ_G0015369)	Mrap2 (MGP_PahariEiJ_G0015370)	Cep162 (MGP_PahariEiJ_G0015371)	Tbx18 (MGP_PahariEiJ_G0015372)	Nt5e (MGP_PahariEiJ_G0015373)	Snx14 (MGP_PahariEiJ_G0015374)	MGP_PahariEiJ_G0015375	Syncrip (MGP_PahariEiJ_G0015376)	MGP_PahariEiJ_G0015377	Minar1 (MGP_PahariEiJ_G0015379) #17	Tmed3 (MGP_PahariEiJ_G0015380) #18	Ankrd34c (MGP_PahariEiJ_G0015381) #19	Rasgrf1 (MGP_PahariEiJ_G0015382) #21	Ctsh (MGP_PahariEiJ_G0015383) #22	Morf4l1 (MGP_PahariEiJ_G0015384) ##23	Adamts7 (MGP_PahariEiJ_G0015385) #25	MGP_PahariEiJ_G0015386	Zic1 (MGP_PahariEiJ_G0015387)	Zic4 (MGP_PahariEiJ_G0015388)	Plscr5 (MGP_PahariEiJ_G0015389)	Plscr1 (MGP_PahariEiJ_G0015390)	Plscr2 (MGP_PahariEiJ_G0015391)	1700057G04Rik (MGP_PahariEiJ_G0015392)	Plscr4 (MGP_PahariEiJ_G0015393)	Plod2 (MGP_PahariEiJ_G0015394)	Dipk2a (MGP_PahariEiJ_G0015395)	Slc9a9 (MGP_PahariEiJ_G0015396)	Chst2 (MGP_PahariEiJ_G0015397)	U2surp (MGP_PahariEiJ_G0015398)
Rat	MODERN SPECIES	18	Gabarapl2 (ENSRNOG00000051416)	Nt5e (ENSRNOG00000011071)	Snx14 (ENSRNOG00000011348)	Syncrip (ENSRNOG00000000204)	ENSRNOG00000069443	Zfp949 (ENSRNOG00000043223)	Trim43a (ENSRNOG00000010699)	RGD1560775 (ENSRNOG00000042726)	Bcl2a1 (ENSRNOG00000047606) #12	Mthfs (ENSRNOG00000013229) #14	ENSRNOG00000065366	Minar1 (ENSRNOG00000013399) #17	Tmed3 (ENSRNOG00000013889) #18	Ankrd34c (ENSRNOG00000013937) #19	Rasgrf1 (ENSRNOG00000014025) #21	Ctsh (ENSRNOG00000014064) #22	Morf4l1 (ENSRNOG00000058412) ##23	Adamts7 (ENSRNOG00000028036) #25	Tbc1d2b (ENSRNOG00000014543)	Zic1 (ENSRNOG00000014644)	Zic4 (ENSRNOG00000014871)	Plscr5 (ENSRNOG00000047917)	Plscr1 (ENSRNOG00000008048)	Plscr2 (ENSRNOG00000064984)	LOC102551265 (ENSRNOG00000030551)	Plscr4 (ENSRNOG00000008151)	Plod2 (ENSRNOG00000030183)	AABR07071101.1 (ENSRNOG00000008363)	Dipk2a (ENSRNOG00000008519)	Slc9a9 (ENSRNOG00000008554)	Chst2 (ENSRNOG00000047734)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1838									ENSNGAG00000013469 #12	ENSNGAG00000020068 #14	Minar1 (ENSNGAG00000020591) #17	Tmed3 (ENSNGAG00000011979) #18	Ankrd34c (ENSNGAG00000014730) #19	Rasgrf1 (ENSNGAG00000000095) #21	ENSNGAG00000000798	Ctsh (ENSNGAG00000012880) #22	ENSNGAG00000003161 #23	ENSNGAG00000002875 #25	Tbc1d2b (ENSNGAG00000011997)	ENSNGAG00000012237	Cib2 (ENSNGAG00000018891)	Idh3a (ENSNGAG00000000585)	Acsbg1 (ENSNGAG00000011166)	ENSNGAG00000007927 #37	ENSNGAG00000013635 #37	Skic8 (ENSNGAG00000017454) #36	Crabp1 (ENSNGAG00000016008) #35	Ireb2 (ENSNGAG00000017333) #34	Hykk (ENSNGAG00000012055) #33	Psma4 (ENSNGAG00000017002) #32	Chrna5 (ENSNGAG00000000528) #31
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	76	Cyb5r4 (ENSJJAG00000010025)	Mrap2 (ENSJJAG00000014346)	Cep162 (ENSJJAG00000013634)	Tbx18 (ENSJJAG00000021701)	ENSJJAG00000008538	Nt5e (ENSJJAG00000022214)	Snx14 (ENSJJAG00000010546)	Syncrip (ENSJJAG00000014190)	Zfp949 (ENSJJAG00000011037)	ENSJJAG00000020312 #12	ENSJJAG00000013247 #14	Minar1 (ENSJJAG00000023967) #17	Tmed3 (ENSJJAG00000022070) #18	ENSJJAG00000004605	Rasgrf1 (ENSJJAG00000020927) #21	Ctsh (ENSJJAG00000009132) #22	ENSJJAG00000023946 #23	Adamts7 (ENSJJAG00000009587) #25	ENSJJAG00000022301	Cib2 (ENSJJAG00000015817)	Idh3a (ENSJJAG00000017150)	Acsbg1 (ENSJJAG00000015467)	Dnaja4 (ENSJJAG00000016763) #37	ENSJJAG00000019990 #36	Crabp1 (ENSJJAG00000007260) #35	Ireb2 (ENSJJAG00000019768) #34	Hykk (ENSJJAG00000023025) #33	Psma4 (ENSJJAG00000015729) #32	Chrna5 (ENSJJAG00000022838) #31	Chrna3 (ENSJJAG00000023395) #30	Chrnb4 (ENSJJAG00000011309) #29
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	334								ENSDORG00000027000	Fah (ENSDORG00000014683) #9	Zfand6 (ENSDORG00000016648) #10	ENSDORG00000001404 #12	ENSDORG00000007108 #14	Minar1 (ENSDORG00000001377) #17	Tmed3 (ENSDORG00000013044) #18	Rasgrf1 (ENSDORG00000008781) #21	Ctsh (ENSDORG00000010282) #22	Morf4l1 (ENSDORG00000000895) #23	Adamts7 (ENSDORG00000028170) #25	Tbc1d2b (ENSDORG00000011070)	ENSDORG00000029269	Cib2 (ENSDORG00000011844)	ENSDORG00000027525	Acsbg1 (ENSDORG00000026740)	Dnaja4 (ENSDORG00000005972) #37	Skic8 (ENSDORG00000005973) #36	Crabp1 (ENSDORG00000029248) #35	Ireb2 (ENSDORG00000014339) #34	Hykk (ENSDORG00000026387) #33	Psma4 (ENSDORG00000001563) #32	Chrna5 (ENSDORG00000009955) #31	Chrna3 (ENSDORG00000008628) #30
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000154975	ENSGT00940000159067	ENSGT00940000155651	ENSGT00500000044831.a.b	ENSGT00940000155962	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00390000012355.B.a	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00940000159270 #31	ENSGT00940000158487 #30
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT01030000234550.b	ENSGT00940000154975	ENSGT00940000159067	ENSGT00940000155651	ENSGT00500000044831.a.b	ENSGT00940000155962	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00390000012355.B.a	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT01030000234550.b	ENSGT00940000154975	ENSGT00940000159067	ENSGT00940000155651	ENSGT00500000044831.a.b	ENSGT00940000155962	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00390000012355.B.a	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	110	ENSGT01030000234550.b	ENSGT00940000154975	ENSGT00940000159067	ENSGT00940000155651	ENSGT00500000044831.a.b	ENSGT00940000155962	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00390000012355.B.a	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	240	OCA2 (ENSCLAG00000002580)	HERC2 (ENSCLAG00000002190)	NIPA1 (ENSCLAG00000001173)	NIPA2 (ENSCLAG00000001028)	CYFIP1 (ENSCLAG00000000901)	TUBGCP5 (ENSCLAG00000001370)	CTXND1 (ENSCLAG00000017548)	FAH (ENSCLAG00000002458) #9	ZFAND6 (ENSCLAG00000002003) #10	BCL2A1 (ENSCLAG00000001913) #12	MTHFS (ENSCLAG00000003763) #14	MINAR1 (ENSCLAG00000003226) #17	TMED3 (ENSCLAG00000001708) #18	ENSCLAG00000001500	RASGRF1 (ENSCLAG00000001348) #21	CTSH (ENSCLAG00000000812) #22	ENSCLAG00000002413 #23
Degu	MODERN SPECIES	240	HERC2 (ENSODEG00000004618)	NIPA1 (ENSODEG00000005406)	ENSODEG00000005458	CYFIP1 (ENSODEG00000005616)	ENSODEG00000018957	TUBGCP5 (ENSODEG00000003406)	FAH (ENSODEG00000003764) #9	ENSODEG00000003846 #10	BCL2A1 (ENSODEG00000003896) #12	MTHFS (ENSODEG00000003916) #14	MINAR1 (ENSODEG00000003953) #17	TMED3 (ENSODEG00000003975) #18	ENSODEG00000004056	ENSODEG00000004063	RASGRF1 (ENSODEG00000002895) #21	CTSH (ENSODEG00000002992) #22	ENSODEG00000003094 #23
Guinea pig	MODERN SPECIES	188								CTXND1 (ENSCPOG00000032564)	FAH (ENSCPOG00000022356) #9	ZFAND6 (ENSCPOG00000007224) #10	BCL2A1 (ENSCPOG00000033645) #12	MTHFS (ENSCPOG00000030736) #14	MINAR1 (ENSCPOG00000006366) #17	TMED3 (ENSCPOG00000037672) #18	RASGRF1 (ENSCPOG00000005363) #21	CTSH (ENSCPOG00000002019) #22	ENSCPOG00000003778 ##23	ENSCPOG00000019315
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	6	ENSHGLG00000001178	ENSHGLG00000049828	ENSHGLG00000001156	CST7 (ENSHGLG00000001075)	APMAP (ENSHGLG00000045360)	ENSHGLG00000042834	ENSHGLG00000034236	ENSHGLG00000039362	ENTPD6 (ENSHGLG00000000193)	PYGB (ENSHGLG00000000176)	ABHD12 (ENSHGLG00000035916)	ENSHGLG00000035611	ENSHGLG00000040387 #18	ENSHGLG00000000136	RASGRF1 (ENSHGLG00000000128) #21	ENSHGLG00000000119 #22	ENSHGLG00000000106 #23	ENSHGLG00000041324	ENSHGLG00000000301	ENSHGLG00000036994 #17	ENSHGLG00000032666	MTHFS (ENSHGLG00000000152) #14	BCL2A1 (ENSHGLG00000000158) #12	ZFAND6 (ENSHGLG00000048326) #10	FAH (ENSHGLG00000000189) #9	ENSHGLG00000034019	ENSHGLG00000043737	ENSHGLG00000033992	ENSHGLG00000044792	FAM174B (ENSHGLG00000004472)	ST8SIA2 (ENSHGLG00000044069)
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000155607	ENSGT01030000234550.b	ENSGT00940000154975	ENSGT00940000159067	ENSGT00940000155651	ENSGT00500000044831.a.b	ENSGT00940000155962	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00940000159270 #31	ENSGT00940000158487 #30
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000155607	ENSGT01030000234550.b	ENSGT00940000154975	ENSGT00940000159067	ENSGT00940000155651.s.b	ENSGT00500000044831.a.b	ENSGT00940000155962	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00940000159270 #31	ENSGT00940000158487 #30
Alpin marmot	MODERN SPECIES	7	GABRG3 (ENSMMMG00000023125)	OCA2 (ENSMMMG00000023142)	HERC2 (ENSMMMG00000023161)	NIPA1 (ENSMMMG00000023282)	NIPA2 (ENSMMMG00000000083)	CYFIP1 (ENSMMMG00000000146)	TUBGCP5 (ENSMMMG00000000426)	FAH (ENSMMMG00000000552) #9	ZFAND6 (ENSMMMG00000000571) #10	BCL2A1 (ENSMMMG00000000627) #12	MTHFS (ENSMMMG00000000648) #14	MINAR1 (ENSMMMG00000000663) #17	TMED3 (ENSMMMG00000000674) #18	ANKRD34C (ENSMMMG00000000690) #19	RASGRF1 (ENSMMMG00000000703) #21	CTSH (ENSMMMG00000000767) #22	ENSMMMG00000000785 ##23	ADAMTS7 (ENSMMMG00000000900) #25	TBC1D2B (ENSMMMG00000000961)	ENSMMMG00000001004	CIB2 (ENSMMMG00000001021)	IDH3A (ENSMMMG00000001037)	ACSBG1 (ENSMMMG00000001070)	DNAJA4 (ENSMMMG00000001119) #37	SKIC8 (ENSMMMG00000001141) #36	CRABP1 (ENSMMMG00000001196) #35	IREB2 (ENSMMMG00000001216) #34	HYKK (ENSMMMG00000001270) #33	PSMA4 (ENSMMMG00000001281) #32	CHRNA5 (ENSMMMG00000001304) #31	CHRNA3 (ENSMMMG00000001358) #30
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000155607	ENSGT01030000234550.b	ENSGT00940000154975	ENSGT00940000159067	ENSGT00940000155651.s.b	ENSGT00500000044831.a.b	ENSGT00940000155962	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00940000159270 #31	ENSGT00940000158487 #30
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	230		OCA2 (ENSUPAG00010001057)	HERC2 (ENSUPAG00010000472)	NIPA1 (ENSUPAG00010000450)	NIPA2 (ENSUPAG00010000417)	CYFIP1 (ENSUPAG00010000024)	TUBGCP5 (ENSUPAG00010023638)	FAH (ENSUPAG00010023637) #9	ZFAND6 (ENSUPAG00010023632) #10	BCL2A1 (ENSUPAG00010023631) #12	MTHFS (ENSUPAG00010023629) #14	MINAR1 (ENSUPAG00010023628) #17	TMED3 (ENSUPAG00010023627) #18	ANKRD34C (ENSUPAG00010023626) #19	RASGRF1 (ENSUPAG00010023623) #21	CTSH (ENSUPAG00010023621) #22	ENSUPAG00010023620	MORF4L1 (ENSUPAG00010023618) #23	ADAMTS7 (ENSUPAG00010023617) #25	ENSUPAG00010023616	TBC1D2B (ENSUPAG00010023615)	ENSUPAG00010023614	CIB2 (ENSUPAG00010023613)	IDH3A (ENSUPAG00010023612)	ACSBG1 (ENSUPAG00010023611)	DNAJA4 (ENSUPAG00010023610) #37	SKIC8 (ENSUPAG00010023608) #36	CRABP1 (ENSUPAG00010023607) #35	ENSUPAG00010023606	ENSUPAG00010023605 #34	ENSUPAG00010023602
Squirrel	MODERN SPECIES	71	GABRG3 (ENSSTOG00000000919)	OCA2 (ENSSTOG00000006767)	HERC2 (ENSSTOG00000006805)	NIPA1 (ENSSTOG00000004008)	ENSSTOG00000004003	CYFIP1 (ENSSTOG00000022382)	TUBGCP5 (ENSSTOG00000000167)	FAH (ENSSTOG00000003980) #9	ZFAND6 (ENSSTOG00000025147) #10	BCL2A1 (ENSSTOG00000009135) #12	MTHFS (ENSSTOG00000009124) #14	MINAR1 (ENSSTOG00000004728) #17	TMED3 (ENSSTOG00000027548) #18	ANKRD34C (ENSSTOG00000002141) #19	RASGRF1 (ENSSTOG00000014265) #21	CTSH (ENSSTOG00000013302) #22	ENSSTOG00000013294 #23	ADAMTS7 (ENSSTOG00000023915) #25	TBC1D2B (ENSSTOG00000003679)	ENSSTOG00000019532	CIB2 (ENSSTOG00000023741)	IDH3A (ENSSTOG00000022510)	ACSBG1 (ENSSTOG00000007506)	DNAJA4 (ENSSTOG00000007771) #37	SKIC8 (ENSSTOG00000007784) #36	CRABP1 (ENSSTOG00000007805) #35	ENSSTOG00000027165	IREB2 (ENSSTOG00000009273) #34	HYKK (ENSSTOG00000010580) #33	PSMA4 (ENSSTOG00000010596) #32	CHRNA5 (ENSSTOG00000007639) #31
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	11	ENSSVLG00005008701	NIPA1 (ENSSVLG00005008682)	ENSSVLG00005008620	CYFIP1 (ENSSVLG00005008475)	TUBGCP5 (ENSSVLG00005008437)	FAH (ENSSVLG00005008412) #9	ZFAND6 (ENSSVLG00005008321) #10	ENSSVLG00005008292	BCL2A1 (ENSSVLG00005008264) #12	MTHFS (ENSSVLG00005008240) #14	MINAR1 (ENSSVLG00005008210) #17	TMED3 (ENSSVLG00005008188) #18	ANKRD34C (ENSSVLG00005008176) #19	ENSSVLG00005008153	RASGRF1 (ENSSVLG00005007962) #21	CTSH (ENSSVLG00005007841) #22	MORF4L1 (ENSSVLG00005007603) #23	ADAMTS7 (ENSSVLG00005007537) #25	TBC1D2B (ENSSVLG00005007497)	SH2D7 (ENSSVLG00005007466)	CIB2 (ENSSVLG00005007403)	ENSSVLG00005007289	ENSSVLG00005007245	ENSSVLG00005007234	ACSBG1 (ENSSVLG00005007166)	DNAJA4 (ENSSVLG00005007123) #37	SKIC8 (ENSSVLG00005007085) #36	CRABP1 (ENSSVLG00005007052) #35	IREB2 (ENSSVLG00005007016) #34	HYKK (ENSSVLG00005006951) #33	PSMA4 (ENSSVLG00005006789) #32
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	133													ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.g.b.a.b ##23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000157327	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00940000159270 #31	ENSGT00940000158487 #30	ENSGT00940000158708.b #29
Pika	MODERN SPECIES	5429																ENSOPRG00000012891 #22
Rabbit	MODERN SPECIES	479													TMED3 (ENSOCUG00000021808) #18	ANKRD34C (ENSOCUG00000008190) #19	RASGRF1 (ENSOCUG00000021019) #21	ENSOCUG00000006137 #22	ENSOCUG00000015117 ##23	ADAMTS7 (ENSOCUG00000026922) #25	TBC1D2B (ENSOCUG00000006503)	CIB2 (ENSOCUG00000016763)	IDH3A (ENSOCUG00000015765)	ACSBG1 (ENSOCUG00000024977)	DNAJA4 (ENSOCUG00000000228) #37	SKIC8 (ENSOCUG00000009040) #36	CRABP1 (ENSOCUG00000000431) #35	IREB2 (ENSOCUG00000009907) #34	HYKK (ENSOCUG00000021767) #33	PSMA4 (ENSOCUG00000013256) #32	CHRNA5 (ENSOCUG00000006114) #31	ENSOCUG00000031461	CHRNA3 (ENSOCUG00000005023) #30
Tree shrew	MODERN SPECIES	5																CTSH (ENSTBEG00000004697) #22
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00940000159270 #31	ENSGT00940000158487 #30
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000160227 #22
Common shrew	MODERN SPECIES	6802																CTSH (ENSSARG00000013028) #22
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00940000159270 #31	ENSGT00940000158487 #30
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Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156178.A	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000156900	ENSGT00390000018637	ENSGT00390000011359	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00940000158943	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00950000183206.b.c.a.b.b	ENSGT00950000182901.a.a.b.a.a	ENSGT00940000155164	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000158389	ENSGT01010000228784
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Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156178.A	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00910000146953	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000156900	ENSGT00390000018637	ENSGT00390000011359	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00940000158943	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00950000183206.b.c.a.b.b	ENSGT00940000155164	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000158389	ENSGT01010000228784
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00390000015537.u	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000156900	ENSGT00390000018637	ENSGT00390000011359	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00940000158943	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00950000183206.b.c.a.b.b	ENSGT00940000155164	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000158389	ENSGT01010000228784	ENSGT00940000159506
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Beluga whale	MODERN SPECIES	52	TLNRD1 (ENSDLEG00000006937)	MESD (ENSDLEG00000006934)	CEMIP (ENSDLEG00000006917)	ABHD17C (ENSDLEG00000006910)	ARNT2 (ENSDLEG00000006890) #7	ENSDLEG00000006886	ENSDLEG00000006880	FAH (ENSDLEG00000006867) #9	ZFAND6 (ENSDLEG00000006860) #10	ENSDLEG00000006855	BCL2A1 (ENSDLEG00000006834) #12	MINAR1 (ENSDLEG00000006816) #17	TMED3 (ENSDLEG00000006810) #18	ANKRD34C (ENSDLEG00000006807) #19	RASGRF1 (ENSDLEG00000020700) #21	CTSH (ENSDLEG00000020683) #22	ENSDLEG00000020674	MORF4L1 (ENSDLEG00000020654) #23	ENSDLEG00000020649	KLF13 (ENSDLEG00000020647)	TRPM1 (ENSDLEG00000020467)	MTMR10 (ENSDLEG00000020447)	FAN1 (ENSDLEG00000020439)	MPHOSPH10 (ENSDLEG00000020425)	MCEE (ENSDLEG00000020419)	ENSDLEG00000020415	APBA2 (ENSDLEG00000020399)	ENTREP2 (ENSDLEG00000020385)	ENSDLEG00000020376	TJP1 (ENSDLEG00000020324)	TARS3 (ENSDLEG00000019699)
Narwhal	MODERN SPECIES	308	CEMIP (ENSMMNG00015021076)	ABHD17C (ENSMMNG00015021050)	ARNT2 (ENSMMNG00015021003) #7	ENSMMNG00015020982	CTXND1 (ENSMMNG00015020971)	ENSMMNG00015020959	ENSMMNG00015020924 #9	ZFAND6 (ENSMMNG00015020898) #10	BCL2A1 (ENSMMNG00015020882) #12	MTHFS (ENSMMNG00015020873) #14	ENSMMNG00015020862	MINAR1 (ENSMMNG00015020856) #17	TMED3 (ENSMMNG00015020834) #18	ANKRD34C (ENSMMNG00015020810) #19	RASGRF1 (ENSMMNG00015020726) #21	CTSH (ENSMMNG00015020640) #22	ENSMMNG00015020628	MORF4L1 (ENSMMNG00015020596) #23	ENSMMNG00015020568	KLF13 (ENSMMNG00015020554)	TRPM1 (ENSMMNG00015020195)	MTMR10 (ENSMMNG00015019967)	FAN1 (ENSMMNG00015019931)	MPHOSPH10 (ENSMMNG00015019899)	MCEE (ENSMMNG00015019878)	ENSMMNG00015019869	APBA2 (ENSMMNG00015019801)	ENTREP2 (ENSMMNG00015019726)	ENSMMNG00015019699	TJP1 (ENSMMNG00015019601)	TARS3 (ENSMMNG00015019564)
Vaquita	MODERN SPECIES	11	CEMIP (ENSPSNG00000003196)	ABHD17C (ENSPSNG00000003170)	ARNT2 (ENSPSNG00000003138) #7	ENSPSNG00000003110	CTXND1 (ENSPSNG00000003105)	ENSPSNG00000003083	FAH (ENSPSNG00000003020) #9	ZFAND6 (ENSPSNG00000002967) #10	BCL2A1 (ENSPSNG00000002945) #12	MTHFS (ENSPSNG00000002937) #14	ENSPSNG00000002923	MINAR1 (ENSPSNG00000002913) #17	TMED3 (ENSPSNG00000002882) #18	ANKRD34C (ENSPSNG00000002859) #19	RASGRF1 (ENSPSNG00000002792) #21	CTSH (ENSPSNG00000002744) #22	ENSPSNG00000002702 #23	KLF13 (ENSPSNG00000002670)	TRPM1 (ENSPSNG00000002616)	MTMR10 (ENSPSNG00000002574)	FAN1 (ENSPSNG00000002540)	MPHOSPH10 (ENSPSNG00000002518)	MCEE (ENSPSNG00000002496)	APBA2 (ENSPSNG00000002459)	ENTREP2 (ENSPSNG00000002416)	ENSPSNG00000002398	TJP1 (ENSPSNG00000002312)	TARS3 (ENSPSNG00000002258)	TM2D3 (ENSPSNG00000002201)	ENSPSNG00000002174	PCSK6 (ENSPSNG00000002050)
Dolphin	MODERN SPECIES	1369													TMED3 (ENSTTRG00000016610) #18	ENSTTRG00000016609	RASGRF1 (ENSTTRG00000016608) #21	CTSH (ENSTTRG00000016607) #22	MORF4L1 (ENSTTRG00000016606) #23	FLYWCH2 (ENSTTRG00000016605)	FLYWCH1 (ENSTTRG00000016604)	KREMEN2 (ENSTTRG00000016603)	PAQR4 (ENSTTRG00000016602)	PKMYT1 (ENSTTRG00000016601)
Sperm whale	MODERN SPECIES	2	CEMIP (ENSPCTG00005021045)	ENSPCTG00005021009	ABHD17C (ENSPCTG00005020976)	ARNT2 (ENSPCTG00005020801) #7	ENSPCTG00005020763	ENSPCTG00005020719	CTXND1 (ENSPCTG00005020710)	ENSPCTG00005020692	FAH (ENSPCTG00005020652) #9	ZFAND6 (ENSPCTG00005020547) #10	BCL2A1 (ENSPCTG00005020519) #12	MTHFS (ENSPCTG00005020474) #14	MINAR1 (ENSPCTG00005020438) #17	TMED3 (ENSPCTG00005020394) #18	ANKRD34C (ENSPCTG00005020376) #19	CTSH (ENSPCTG00005020280) #22	ENSPCTG00005020071 #23	ENSPCTG00005020045	ENSPCTG00005019911	ENSPCTG00005019875	ENSPCTG00005019850	MTMR10 (ENSPCTG00005019736)	FAN1 (ENSPCTG00005019619)	MPHOSPH10 (ENSPCTG00005019581)	MCEE (ENSPCTG00005019555)	APBA2 (ENSPCTG00005019353)	ENTREP2 (ENSPCTG00005019223)	ENSPCTG00005019074	ENSPCTG00005019010	TJP1 (ENSPCTG00005018630)	TARS3 (ENSPCTG00005018147)
Blue whale	MODERN SPECIES	11	TLNRD1 (ENSBMSG00010000171)	MESD (ENSBMSG00010000141)	CEMIP (ENSBMSG00010000094)	ABHD17C (ENSBMSG00010000061)	ENSBMSG00010007902	CTXND1 (ENSBMSG00010007894)	ENSBMSG00010007887	FAH (ENSBMSG00010007879) #9	ZFAND6 (ENSBMSG00010007853) #10	BCL2A1 (ENSBMSG00010007836) #12	MTHFS (ENSBMSG00010007825) #14	MINAR1 (ENSBMSG00010007815) #17	TMED3 (ENSBMSG00010007796) #18	ANKRD34C (ENSBMSG00010007785) #19	RASGRF1 (ENSBMSG00010007726) #21	CTSH (ENSBMSG00010007698) #22	MORF4L1 (ENSBMSG00010007681) #23	ENSBMSG00010007665	TRPM1 (ENSBMSG00010007636)	MTMR10 (ENSBMSG00010007611)	FAN1 (ENSBMSG00010007593)	MPHOSPH10 (ENSBMSG00010007566)	ENSBMSG00010007557	MCEE (ENSBMSG00010007551)	APBA2 (ENSBMSG00010007516)	ENTREP2 (ENSBMSG00010007491)	ENSBMSG00010007483	ENSBMSG00010007474	TJP1 (ENSBMSG00010007327)	TARS3 (ENSBMSG00010007271)	TM2D3 (ENSBMSG00010007253)
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.g.a ##23	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b.f.b.b.a	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000158143	ENSGT00390000007252.d	ENSGT00940000171184	ENSGT00550000074806	ENSGT00940000160013	ENSGT00390000005052.r	ENSGT00390000012420.e	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000157324
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.g.a ##23	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b.f.a	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000158143	ENSGT00390000007252.d	ENSGT00940000171184	ENSGT00550000074806	ENSGT00940000160013	ENSGT00940000170401.c	ENSGT00390000012420.e	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000157324
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.g.a ##23	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b.f.a	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000158143	ENSGT00390000007252.d	ENSGT00550000074806	ENSGT00940000160013	ENSGT00940000170401.c	ENSGT00390000012420.e	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000157324	ENSGT00510000046704.b.b
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.g.a ##23	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b.f.a	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000158143	ENSGT00390000007252.d	ENSGT00550000074806	ENSGT00940000160013	ENSGT00390000005052.r	ENSGT00390000012420.e	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000157324	ENSGT00510000046704.b.b
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	9	CFAP161 (ENSOARG00020023620)	TLNRD1 (ENSOARG00020023596)	MESD (ENSOARG00020023575)	CEMIP (ENSOARG00020023508)	ABHD17C (ENSOARG00020023484)	ARNT2 (ENSOARG00020023147) #7	CTXND1 (ENSOARG00020023114)	FAH (ENSOARG00020023087) #9	FAH (ENSOARG00020022989) #10	BCL2A1 (ENSOARG00020022963) #12	MTHFS (ENSOARG00020022945) #14	MINAR1 (ENSOARG00020022930) #17	TMED3 (ENSOARG00020022894) #18	ANKRD34C (ENSOARG00020022885) #19	RASGRF1 (ENSOARG00020022608) #21	CTSH (ENSOARG00020022432) #22	MORF4L1 (ENSOARG00020022231) ##23	ENSOARG00020022206	PKIA (ENSOARG00020022185)	PKIA (ENSOARG00020022170)	ENSOARG00020022110	ENSOARG00020022086	MEX3B (ENSOARG00020022067)	EFL1 (ENSOARG00020021799)	SH3GL3 (ENSOARG00020021545)	BNC1 (ENSOARG00020021484)	HDGFL3 (ENSOARG00020021416)	TM6SF1 (ENSOARG00020021147)	BTBD1 (ENSOARG00020021086)	ENSOARG00020021019	C18H15orf40 (ENSOARG00020020903)
Goat	MODERN SPECIES	13	TLNRD1 (ENSCHIG00000004554)	MESD (ENSCHIG00000023206)	CEMIP (ENSCHIG00000021773)	ABHD17C (ENSCHIG00000027051)	ARNT2 (ENSCHIG00000022641) #7	FAH (ENSCHIG00000012774) #9	ENSCHIG00000022437 #10	BCL2A1 (ENSCHIG00000014131) #12	MTHFS (ENSCHIG00000016234) #14	ENSCHIG00000020351	ENSCHIG00000014011	MINAR1 (ENSCHIG00000025290) #17	TMED3 (ENSCHIG00000008576) #18	ANKRD34C (ENSCHIG00000009785) #19	RASGRF1 (ENSCHIG00000019842) #21	CTSH (ENSCHIG00000026002) #22	MORF4L1 (ENSCHIG00000008923) ##23	ENSCHIG00000005122	ENSCHIG00000015347	BTBD1 (ENSCHIG00000014631)	TM6SF1 (ENSCHIG00000021419)	HDGFL3 (ENSCHIG00000014453)	BNC1 (ENSCHIG00000019726)	SH3GL3 (ENSCHIG00000016013)	ADAMTSL3 (ENSCHIG00000016050)	SAXO2 (ENSCHIG00000007812)	EFL1 (ENSCHIG00000001883)	MEX3B (ENSCHIG00000019863)	ENSCHIG00000005722	ENSCHIG00000006667	ENSCHIG00000022311
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424.n.a	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791.m #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.g.a ##23	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b.f.b.b.a	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000158143	ENSGT00390000007252.d	ENSGT00550000074806	ENSGT00940000160013	ENSGT00940000170401.c	ENSGT00390000012420.e	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000157324	ENSGT00510000046704.b.b
Bos	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424.n.a	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791.m #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.g.a ##23	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b.f.b.b.a	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000158143	ENSGT00390000007252.d	ENSGT00550000074806	ENSGT00940000160013	ENSGT00940000170401.c	ENSGT00390000012420.e	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000157324	ENSGT00510000046704.b.b
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424.n.a	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791.m #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.g.a ##23	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b.f.b.b.a	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000158143.i	ENSGT00390000007252.d	ENSGT00550000074806	ENSGT00940000160013	ENSGT00940000170401.c	ENSGT00390000012420.e	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000157324	ENSGT00510000046704.b.b
Wild yak	MODERN SPECIES	266							CTXND1 (ENSBMUG00000026438)	FAH (ENSBMUG00000026439) #9	ZFAND6 (ENSBMUG00000026440) #10	BCL2A1 (ENSBMUG00000026441) #12	ENSBMUG00000026442 #14	MINAR1 (ENSBMUG00000026443) #17	TMED3 (ENSBMUG00000026444) #18	ANKRD34C (ENSBMUG00000026445) #19	RASGRF1 (ENSBMUG00000026447) #21	CTSH (ENSBMUG00000026448) #22	MORF4L1 (ENSBMUG00000026449) ##23	BTBD1 (ENSBMUG00000026450)	TM6SF1 (ENSBMUG00000026451)	HDGFL3 (ENSBMUG00000026452)	BNC1 (ENSBMUG00000026453)	SH3GL3 (ENSBMUG00000026455)	ENSBMUG00000026457
Domestic yak	MODERN SPECIES	8	ENSBGRG00000007919	ENSBGRG00000007874	CFAP161 (ENSBGRG00000007737)	TLNRD1 (ENSBGRG00000007673)	MESD (ENSBGRG00000023274)	CEMIP (ENSBGRG00000022978)	ARNT2 (ENSBGRG00000022496) #7	CTXND1 (ENSBGRG00000022437)	FAH (ENSBGRG00000022161) #9	ZFAND6 (ENSBGRG00000022045) #10	ENSBGRG00000021957 #14	MINAR1 (ENSBGRG00000021884) #17	TMED3 (ENSBGRG00000021794) #18	ANKRD34C (ENSBGRG00000021760) #19	RASGRF1 (ENSBGRG00000019063) #21	CTSH (ENSBGRG00000018563) #22	MORF4L1 (ENSBGRG00000017947) ##23	BTBD1 (ENSBGRG00000017551)	ENSBGRG00000017511	TM6SF1 (ENSBGRG00000017242)	HDGFL3 (ENSBGRG00000017033)	BNC1 (ENSBGRG00000016740)	SH3GL3 (ENSBGRG00000016514)	ADAMTSL3 (ENSBGRG00000015743)	SAXO2 (ENSBGRG00000015606)	EFL1 (ENSBGRG00000015240)	MEX3B (ENSBGRG00000015184)	ENSBGRG00000015162	ENSBGRG00000015094	HOMER2 (ENSBGRG00000014750)	WHAMM (ENSBGRG00000014627)
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000156178.A	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424.n.b	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791.m #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.g.a ##23	ENSGT00940000156756	ENSGT00390000012913.b	ENSGT00940000153942.b.f.b.b.a	ENSGT00390000005844.a.a	ENSGT00940000157398	ENSGT00940000158143	ENSGT00390000007252.d	ENSGT00550000074806	ENSGT00940000160013	ENSGT00940000170401.c	ENSGT00390000012420.e	ENSGT00390000011190	ENSGT00940000157324	ENSGT00510000046704.b.b
Cow	MODERN SPECIES	13	IL16 (ENSBTAG00000010963)	ENSBTAG00000049620	CFAP161 (ENSBTAG00000011861)	MESD (ENSBTAG00000001565)	CEMIP (ENSBTAG00000007431)	ABHD17C (ENSBTAG00000032951)	ARNT2 (ENSBTAG00000012351) #7	FAH (ENSBTAG00000012338) #9	ZFAND6 (ENSBTAG00000012321) #10	BCL2A1 (ENSBTAG00000000735) #12	MTHFS (ENSBTAG00000020023) #14	MINAR1 (ENSBTAG00000007094) #17	TMED3 (ENSBTAG00000000807) #18	ANKRD34C (ENSBTAG00000020195) #19	RASGRF1 (ENSBTAG00000019940) #21	CTSH (ENSBTAG00000010992) #22	MORF4L1 (ENSBTAG00000010988) ##23	BTBD1 (ENSBTAG00000021341)	TM6SF1 (ENSBTAG00000012926)	HDGFL3 (ENSBTAG00000018527)	BNC1 (ENSBTAG00000015462)	SH3GL3 (ENSBTAG00000018004)	ADAMTSL3 (ENSBTAG00000004645)	SAXO2 (ENSBTAG00000003414)	EFL1 (ENSBTAG00000003410)	MEX3B (ENSBTAG00000052904)	ENSBTAG00000050976	C21H15orf40 (ENSBTAG00000016522)	RAMAC (ENSBTAG00000027069)	HOMER2 (ENSBTAG00000017715)	WHAMM (ENSBTAG00000017711)
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	13	IL16 (ENSBIXG00005005585)	CFAP161 (ENSBIXG00005014844)	TLNRD1 (ENSBIXG00005014868)	MESD (ENSBIXG00005014897)	CEMIP (ENSBIXG00005014994)	ENSBIXG00005015074	ARNT2 (ENSBIXG00005015143) #7	FAH (ENSBIXG00005002239) #9	ZFAND6 (ENSBIXG00005015378) #10	ENSBIXG00005015408	ENSBIXG00005015440 #14	MINAR1 (ENSBIXG00005015462) #17	TMED3 (ENSBIXG00005015500) #18	ANKRD34C (ENSBIXG00005006234) #19	RASGRF1 (ENSBIXG00005015599) #21	CTSH (ENSBIXG00005015676) #22	MORF4L1 (ENSBIXG00005002498) ##23	ENSBIXG00005015915	ENSBIXG00005002514	BTBD1 (ENSBIXG00005002526)	TM6SF1 (ENSBIXG00005015984)	HDGFL3 (ENSBIXG00005015997)	BNC1 (ENSBIXG00005016055)	SH3GL3 (ENSBIXG00005016086)	ENSBIXG00005016108	ADAMTSL3 (ENSBIXG00005016225)	SAXO2 (ENSBIXG00005016300)	EFL1 (ENSBIXG00005016417)	MEX3B (ENSBIXG00005002623)	ENSBIXG00005016459	C15orf40 (ENSBIXG00005016526)
American bison	MODERN SPECIES	3102	IL16 (ENSBBBG00000011313)	CFAP161 (ENSBBBG00000011320)	MESD (ENSBBBG00000011332)	CEMIP (ENSBBBG00000002077)	ABHD17C (ENSBBBG00000002018)	ARNT2 (ENSBBBG00000011415) #7	CTXND1 (ENSBBBG00000011421)	FAH (ENSBBBG00000008900) #9	ZFAND6 (ENSBBBG00000011502) #10	BCL2A1 (ENSBBBG00000006836) #12	ENSBBBG00000011515 #14	MINAR1 (ENSBBBG00000011518) #17	TMED3 (ENSBBBG00000011522) #18	ANKRD34C (ENSBBBG00000011525) #19	RASGRF1 (ENSBBBG00000011556) #21	CTSH (ENSBBBG00000011584) #22	ENSBBBG00000011670 ##23
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	1277	CFAP161 (ENSMMSG00000021401)	TLNRD1 (ENSMMSG00000021441)	ENSMMSG00000021452	CEMIP (ENSMMSG00000021478)	ABHD17C (ENSMMSG00000021617)	ARNT2 (ENSMMSG00000021645) #7	CTXND1 (ENSMMSG00000021726)	FAH (ENSMMSG00000021738) #9	ZFAND6 (ENSMMSG00000021763) #10	BCL2A1 (ENSMMSG00000021784) #12	MTHFS (ENSMMSG00000021794) #14	MINAR1 (ENSMMSG00000021803) #17	TMED3 (ENSMMSG00000021823) #18	ANKRD34C (ENSMMSG00000021838) #19	RASGRF1 (ENSMMSG00000021865) #21	CTSH (ENSMMSG00000022021) #22	ENSMMSG00000022142 ##23	ENSMMSG00000022320	BTBD1 (ENSMMSG00000022328)	ENSMMSG00000022350	TM6SF1 (ENSMMSG00000022373)	HDGFL3 (ENSMMSG00000022420)	ENSMMSG00000022431	SH3GL3 (ENSMMSG00000022448)	ADAMTSL3 (ENSMMSG00000022467)	SAXO2 (ENSMMSG00000022484)	ENSMMSG00000022493	EFL1 (ENSMMSG00000022505)	ENSMMSG00000022552	MEX3B (ENSMMSG00000022560)	ENSMMSG00000022569
Yarkand deer	MODERN SPECIES	4	CFAP161 (ENSCHYG00000007549)	TLNRD1 (ENSCHYG00000007531)	MESD (ENSCHYG00000007487)	CEMIP (ENSCHYG00000007313)	ABHD17C (ENSCHYG00000007270)	ARNT2 (ENSCHYG00000007140) #7	CTXND1 (ENSCHYG00000007098)	FAH (ENSCHYG00000006889) #9	ENSCHYG00000006860	BCL2A1 (ENSCHYG00000006849) #12	ENSCHYG00000006822 #14	MINAR1 (ENSCHYG00000006790) #17	TMED3 (ENSCHYG00000006743) #18	ANKRD34C (ENSCHYG00000006722) #19	RASGRF1 (ENSCHYG00000006650) #21	CTSH (ENSCHYG00000006540) #22	ENSCHYG00000006422 ##23	BTBD1 (ENSCHYG00000006380)	ENSCHYG00000006355	TM6SF1 (ENSCHYG00000006216)	ENSCHYG00000006114	BNC1 (ENSCHYG00000006034)	SH3GL3 (ENSCHYG00000005917)	ADAMTSL3 (ENSCHYG00000005510)	SAXO2 (ENSCHYG00000005376)	EFL1 (ENSCHYG00000005221)	MEX3B (ENSCHYG00000005181)	ENSCHYG00000005151	C15orf40 (ENSCHYG00000005100)	ENSCHYG00000005070	HOMER2 (ENSCHYG00000005052)
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000156178.A	ENSGT00390000018488	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00940000159270 #31	ENSGT00940000158487 #30
Alpaca	MODERN SPECIES	2438																ENSVPAG00000008848 #22	MORF4L1 (ENSVPAG00000008847) #23
Arabian camel	MODERN SPECIES	19	IL16 (ENSCDRG00005017115)	CFAP161 (ENSCDRG00005017262)	ENSCDRG00005017468	CEMIP (ENSCDRG00005017507)	ABHD17C (ENSCDRG00005017629)	ARNT2 (ENSCDRG00005017654) #7	CTXND1 (ENSCDRG00005017773)	FAH (ENSCDRG00005017789) #9	ZFAND6 (ENSCDRG00005017871) #10	BCL2A1 (ENSCDRG00005017955) #12	MTHFS (ENSCDRG00005017981) #14	MINAR1 (ENSCDRG00005017997) #17	TMED3 (ENSCDRG00005018013) #18	ANKRD34C (ENSCDRG00005018037) #19	RASGRF1 (ENSCDRG00005018093) #21	CTSH (ENSCDRG00005018410) #22	MORF4L1 (ENSCDRG00005018463) #23	ENSCDRG00005018486	ADAMTS7 (ENSCDRG00005018509) #25	TBC1D2B (ENSCDRG00005018553)	SH2D7 (ENSCDRG00005018581)	CIB2 (ENSCDRG00005018630)	IDH3A (ENSCDRG00005018703)	ACSBG1 (ENSCDRG00005018776)	DNAJA4 (ENSCDRG00005018796) #37	SKIC8 (ENSCDRG00005018876) #36	CRABP1 (ENSCDRG00005018923) #35	IREB2 (ENSCDRG00005018986) #34	HYKK (ENSCDRG00005019103) #33	PSMA4 (ENSCDRG00005019152) #32	CHRNA5 (ENSCDRG00005019204) #31
Suina	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT01030000234518.B.b	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00940000159270 #31
Pig	MODERN SPECIES	15	TLNRD1 (ENSSSCG00000037209)	MESD (ENSSSCG00000021587)	CEMIP (ENSSSCG00000038929)	ABHD17C (ENSSSCG00000001782)	ARNT2 (ENSSSCG00000040288) #7	CTXND1 (ENSSSCG00000056088)	FAH (ENSSSCG00000001780) #9	ZFAND6 (ENSSSCG00000001779) #10	BCL2A1 (ENSSSCG00000040010) #12	MTHFS (ENSSSCG00000038708) #14	ENSSSCG00000001776	MINAR1 (ENSSSCG00000001775) #17	TMED3 (ENSSSCG00000001773) #18	ANKRD34C (ENSSSCG00000032430) #19	RASGRF1 (ENSSSCG00000001771) #21	CTSH (ENSSSCG00000001770) #22	MORF4L1 (ENSSSCG00000001769) #23	ENSSSCG00000041217	ADAMTS7 (ENSSSCG00000001765) #25	TBC1D2B (ENSSSCG00000027477)	SH2D7 (ENSSSCG00000001764)	CIB2 (ENSSSCG00000001762)	IDH3A (ENSSSCG00000032498)	ACSBG1 (ENSSSCG00000001760)	DNAJA4 (ENSSSCG00000037646) #37	SKIC8 (ENSSSCG00000001757) #36	CRABP1 (ENSSSCG00000021873) #35	IREB2 (ENSSSCG00000001756) #34	HYKK (ENSSSCG00000001755) #33	PSMA4 (ENSSSCG00000036924) #32	CHRNA5 (ENSSSCG00000001751) #31
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Horse	DUPLICATION
Horse	DUPLICATION
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Megabat	MODERN SPECIES	5471																CTSH (ENSPVAG00000006444) #22
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Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	20	ZFAND6 (ENSRFEG00010018236) #10	FAH (ENSRFEG00010018176) #9	CTXND1 (ENSRFEG00010018156)	ARNT2 (ENSRFEG00010018107) #7	ABHD17C (ENSRFEG00010017977)	CEMIP (ENSRFEG00010017906)	ENSRFEG00010017853	TLNRD1 (ENSRFEG00010017840)	CFAP161 (ENSRFEG00010017780)	IL16 (ENSRFEG00010017703)	BCL2A1 (ENSRFEG00010017664) #12	MTHFS (ENSRFEG00010017639) #14	MINAR1 (ENSRFEG00010017582) #17	TMED3 (ENSRFEG00010017536) #18	RASGRF1 (ENSRFEG00010017453) #21	CTSH (ENSRFEG00010017390) #22	ENSRFEG00010017300 #23	ADAMTS7 (ENSRFEG00010016946) #25	TBC1D2B (ENSRFEG00010016862)	SH2D7 (ENSRFEG00010016743)	CIB2 (ENSRFEG00010016653)	IDH3A (ENSRFEG00010016449)	ACSBG1 (ENSRFEG00010016378)	DNAJA4 (ENSRFEG00010016214) #37	SKIC8 (ENSRFEG00010016171) #36	CRABP1 (ENSRFEG00010016131) #35	IREB2 (ENSRFEG00010016054) #34	HYKK (ENSRFEG00010015947) #33	PSMA4 (ENSRFEG00010015777) #32	CHRNA5 (ENSRFEG00010015591) #31	CHRNA3 (ENSRFEG00010015516) #30
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00940000159270 #31	ENSGT00940000158487 #30
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833.o #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.g.a ##23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327.k	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707.jb.a #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00940000159270 #31	ENSGT00940000158487 #30
Panthera	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833.o #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.g.a ##23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327.k	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707.jb.a #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00940000159270 #31	ENSGT00940000158487 #30
Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833.o #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.g.a ##23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327.k	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707.jb.a #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00940000159270 #31	ENSGT00940000158487 #30
lion	MODERN SPECIES	6	IL16 (ENSPLOG00000012394)	CFAP161 (ENSPLOG00000012306)	TLNRD1 (ENSPLOG00000012286)	MESD (ENSPLOG00000012270)	CEMIP (ENSPLOG00000011977)	ABHD17C (ENSPLOG00000011910)	ARNT2 (ENSPLOG00000011499) #7	CTXND1 (ENSPLOG00000011470)	FAH (ENSPLOG00000011442) #9	ZFAND6 (ENSPLOG00000011396) #10	ENSPLOG00000011342 #14	MINAR1 (ENSPLOG00000011306) #17	TMED3 (ENSPLOG00000011268) #18	ANKRD34C (ENSPLOG00000011248) #19	RASGRF1 (ENSPLOG00000010838) #21	CTSH (ENSPLOG00000005364) #22	ENSPLOG00000005344 ##23
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Cat	MODERN SPECIES	237	CFAP161 (ENSFCAG00000013952)	TLNRD1 (ENSFCAG00000040775)	MESD (ENSFCAG00000013951)	CEMIP (ENSFCAG00000012937)	ABHD17C (ENSFCAG00000024683)	ARNT2 (ENSFCAG00000012936) #7	CTXND1 (ENSFCAG00000046738)	FAH (ENSFCAG00000012932) #9	ENSFCAG00000012931 #10	BCL2A1 (ENSFCAG00000012928) #12	ENSFCAG00000012202 #14	MINAR1 (ENSFCAG00000030462) #17	TMED3 (ENSFCAG00000010043) ##18	ANKRD34C (ENSFCAG00000030323) #19	RASGRF1 (ENSFCAG00000012199) #21	CTSH (ENSFCAG00000012198) #22	MORF4L1 (ENSFCAG00000012197) ##23	ADAMTS7 (ENSFCAG00000019139) #25	TBC1D2B (ENSFCAG00000010511)	SH2D7 (ENSFCAG00000010513)	ENSFCAG00000010514	IDH3A (ENSFCAG00000010515)	ACSBG1 (ENSFCAG00000005918)	DNAJA4 (ENSFCAG00000025623) #37	SKIC8 (ENSFCAG00000010517) #36	CRABP1 (ENSFCAG00000010519) #35	IREB2 (ENSFCAG00000001921) #34	HYKK (ENSFCAG00000044233) #33	PSMA4 (ENSFCAG00000039013) #32	CHRNA5 (ENSFCAG00000001930) #31	CHRNA3 (ENSFCAG00000001932) #30
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00940000159270 #31	ENSGT00940000158487 #30
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00940000159270 #31	ENSGT00940000158487 #30
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00940000159270 #31	ENSGT00940000158487 #30
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	66	ENSGT00940000156178.A	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25
American black bear	MODERN SPECIES	2890																CTSH (ENSUAMG00000020803) #22	MORF4L1 (ENSUAMG00000020802) #23	ENSUAMG00000020801 #25
Polar bear	MODERN SPECIES	145	ENSUMAG00000010330	ENSUMAG00000010340	CFAP161 (ENSUMAG00000010371)	ENSUMAG00000010389	CEMIP (ENSUMAG00000010401)	ENSUMAG00000010464	ARNT2 (ENSUMAG00000010483) #7	FAH (ENSUMAG00000010645) #9	ZFAND6 (ENSUMAG00000010928) #10	BCL2A1 (ENSUMAG00000010930) #12	MTHFS (ENSUMAG00000010932) #14	MINAR1 (ENSUMAG00000010933) #17	TMED3 (ENSUMAG00000010940) #18	ANKRD34C (ENSUMAG00000010945) #19	RASGRF1 (ENSUMAG00000010955) #21	CTSH (ENSUMAG00000010979) #22	MORF4L1 (ENSUMAG00000010988) #23
Giant Panda	MODERN SPECIES	19	IL16 (ENSAMEG00000006103)	CFAP161 (ENSAMEG00000006146)	MESD (ENSAMEG00000030718)	CEMIP (ENSAMEG00000006176)	ABHD17C (ENSAMEG00000028801)	ARNT2 (ENSAMEG00000006241) #7	CTXND1 (ENSAMEG00000026116)	FAH (ENSAMEG00000024294) #9	ZFAND6 (ENSAMEG00000006399) #10	BCL2A1 (ENSAMEG00000006414) #12	MTHFS (ENSAMEG00000004370) #14	MINAR1 (ENSAMEG00000012242) #17	TMED3 (ENSAMEG00000012246) #18	ANKRD34C (ENSAMEG00000018860) #19	RASGRF1 (ENSAMEG00000012257) #21	CTSH (ENSAMEG00000012293) #22	ENSAMEG00000012344 #23	ENSAMEG00000012369 #25	ENSAMEG00000012429	SH2D7 (ENSAMEG00000030256)	CIB2 (ENSAMEG00000012456)	IDH3A (ENSAMEG00000012473)	ACSBG1 (ENSAMEG00000012518)	DNAJA4 (ENSAMEG00000012576) #37	SKIC8 (ENSAMEG00000012599) #36	CRABP1 (ENSAMEG00000026314) #35	IREB2 (ENSAMEG00000012645) #34	HYKK (ENSAMEG00000012686) #33	ENSAMEG00000027057 #32	ENSAMEG00000027125 #29
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00940000157796 #34	ENSGT00390000011314 #33	ENSGT00550000074827 #32	ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.i.d.a.a	ENSGT00940000159270 #31
American mink	MODERN SPECIES	199	CFAP161 (ENSNVIG00000011977)	TLNRD1 (ENSNVIG00000011971)	MESD (ENSNVIG00000011951)	CEMIP (ENSNVIG00000011863)	ABHD17C (ENSNVIG00000011834)	ARNT2 (ENSNVIG00000011780) #7	CTXND1 (ENSNVIG00000011776)	FAH (ENSNVIG00000011658) #9	ZFAND6 (ENSNVIG00000011602) #10	B2LA1 (ENSNVIG00000011587) #12	MTHFS (ENSNVIG00000011583) #14	MINAR1 (ENSNVIG00000011577) #17	TMED3 (ENSNVIG00000011560) #18	ANKRD34C (ENSNVIG00000011550) #19	RASGRF1 (ENSNVIG00000011490) #21	CTSH (ENSNVIG00000011460) #22	MORF4L1 (ENSNVIG00000011337) #23	ADAMTS7 (ENSNVIG00000010159) #25	TBC1D2B (ENSNVIG00000010110)	SH2D7 (ENSNVIG00000010097)	CIB2 (ENSNVIG00000010089)	IDH3A (ENSNVIG00000010076)	ACSBG1 (ENSNVIG00000010039)	DNAJA4 (ENSNVIG00000010017) #37	ENSNVIG00000009961 #36	CRABP1 (ENSNVIG00000009940) #35	IREB2 (ENSNVIG00000009909) #34	HYKK (ENSNVIG00000009887) #33	PSMA4 (ENSNVIG00000009833) #32	ENSNVIG00000009818	CHRNA5 (ENSNVIG00000009811) #31
Ferret	MODERN SPECIES	260	CFAP161 (ENSMPUG00000015460)	TLNRD1 (ENSMPUG00000019757)	MESD (ENSMPUG00000015457)	ENSMPUG00000019756	CEMIP (ENSMPUG00000015452)	ABHD17C (ENSMPUG00000015449)	ENSMPUG00000015448	ARNT2 (ENSMPUG00000015447) #7	FAH (ENSMPUG00000015446) #9	BCL2A1 (ENSMPUG00000015444) #12	MTHFS (ENSMPUG00000015440) #14	MINAR1 (ENSMPUG00000015439) #17	TMED3 (ENSMPUG00000015437) #18	ANKRD34C (ENSMPUG00000019755) #19	RASGRF1 (ENSMPUG00000015435) #21	CTSH (ENSMPUG00000015432) #22	MORF4L1 (ENSMPUG00000015429) #23	ENSMPUG00000015428	ENSMPUG00000015426	ADAMTS7 (ENSMPUG00000015423) #25	ENSMPUG00000019754	TBC1D2B (ENSMPUG00000015422)	SH2D7 (ENSMPUG00000015421)	CIB2 (ENSMPUG00000015415)
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00390000006255.b.b.b	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a.m.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00950000182864.a.b.b.a.b.a.a.b	ENSGT01030000234638.b.a.b.n	ENSGT01030000234638.b.a.b.m	ENSGT00940000155541.C	ENSGT00940000155541.B
Red fox	MODERN SPECIES	1	ENSVVUG00000004877	TLNRD1 (ENSVVUG00000004865)	MESD (ENSVVUG00000004853)	CEMIP (ENSVVUG00000004803)	ABHD17C (ENSVVUG00000004789)	ARNT2 (ENSVVUG00000004741) #7	FAH (ENSVVUG00000004349) #9	ZFAND6 (ENSVVUG00000004314) #10	ENSVVUG00000004284 #12	MTHFS (ENSVVUG00000004279) #14	MINAR1 (ENSVVUG00000004246) #17	TMED3 (ENSVVUG00000004238) #18	ANKRD34C (ENSVVUG00000004236) #19	ENSVVUG00000004203	RASGRF1 (ENSVVUG00000004147) #21	CTSH (ENSVVUG00000004061) #22	MORF4L1 (ENSVVUG00000004035) #23	ADAMTS7 (ENSVVUG00000001832) #25	TBC1D2B (ENSVVUG00000001659)	SH2D7 (ENSVVUG00000001646)	CIB2 (ENSVVUG00000001627)	IDH3A (ENSVVUG00000001228)	ACSBG1 (ENSVVUG00000001165)	DNAJA4 (ENSVVUG00000001149) #37	ENSVVUG00000001135 #36	CRABP1 (ENSVVUG00000001115) #35	PPP2R2C (ENSVVUG00000001098)	ENSVVUG00000000613	ENSVVUG00000000562	ENSVVUG00000000501	ENSVVUG00000000473
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00390000006255.b.b.b	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833.b #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h #23	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157327	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000160380	ENSGT00940000155707 #37	ENSGT00940000153533.a.m.a #36	ENSGT00940000159422 #35	ENSGT00950000182864.a.b.b.a.b.a.a.b	ENSGT01030000234638.b.a.b.n	ENSGT01030000234638.b.a.b.m	ENSGT00940000155541.C	ENSGT00940000155541.B
Dog	MODERN SPECIES	22	TLNRD1 (ENSCAFG00845004822)	ENSCAFG00845004831	CEMIP (ENSCAFG00845004875)	ABHD17C (ENSCAFG00845004955)	ARNT2 (ENSCAFG00845004996) #7	FAH (ENSCAFG00845004974) #9	CTXND1 (ENSCAFG00845004997)	ZFAND6 (ENSCAFG00845005002) #10	ENSCAFG00845005018	ENSCAFG00845005023 #12	MTHFS (ENSCAFG00845005032) #14	MINAR1 (ENSCAFG00845005048) #17	TMED3 (ENSCAFG00845005060) #18	ANKRD34C (ENSCAFG00845005067) #19	RASGRF1 (ENSCAFG00845005087) #21	CTSH (ENSCAFG00845005115) #22	MORF4L1 (ENSCAFG00845005151) #23	ENSCAFG00845005528 #25	ENSCAFG00845006735	ENSCAFG00845006818	CIB2 (ENSCAFG00845006876)	IDH3A (ENSCAFG00845006975)	ACSBG1 (ENSCAFG00845007144)	DNAJA4 (ENSCAFG00845007373) #37	WDR61 (ENSCAFG00845007438) #36	ENSCAFG00845007506 #35	PPP2R2C (ENSCAFG00845007569)	ENSCAFG00845007645	ENSCAFG00845007718	MRFAP1 (ENSCAFG00845007784)	ENSCAFG00845007818
Dingo	MODERN SPECIES	138	CFAP161 (ENSCAFG00020015816)	ENSCAFG00020015815	TLNRD1 (ENSCAFG00020015813)	MESD (ENSCAFG00020015811)	CEMIP (ENSCAFG00020015762)	ABHD17C (ENSCAFG00020015759)	ARNT2 (ENSCAFG00020015755) #7	FAH (ENSCAFG00020015749) #9	ZFAND6 (ENSCAFG00020015747) #10	BCL2A1 (ENSCAFG00020015746) #12	MTHFS (ENSCAFG00020015745) #14	MINAR1 (ENSCAFG00020015743) #17	TMED3 (ENSCAFG00020015738) #18	ANKRD34C (ENSCAFG00020015737) #19	RASGRF1 (ENSCAFG00020015728) #21	ENSCAFG00020015721 #22	MORF4L1 (ENSCAFG00020015717) #23	ADAMTS7 (ENSCAFG00020015489) #25	TBC1D2B (ENSCAFG00020015461)	SH2D7 (ENSCAFG00020015457)	CIB2 (ENSCAFG00020015456)	IDH3A (ENSCAFG00020015452)	ACSBG1 (ENSCAFG00020015178)	DNAJA4 (ENSCAFG00020015153) #37	ENSCAFG00020015137 #36	CRABP1 (ENSCAFG00020015129) #35	PPP2R2C (ENSCAFG00020015119)	ENSCAFG00020015112	ENSCAFG00020015037	ENSCAFG00020015026	ENSCAFG00020015024
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Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993	ENSGT00940000153636.a	ENSGT00940000159424	ENSGT00940000158198 #7	ENSGT00960000186669	ENSGT00390000008646 #9	ENSGT00940000160833 #10	ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.a.a #12	ENSGT00390000017791 #14	ENSGT00530000063851.a #17	ENSGT00940000159833 #18	ENSGT00880000138051.b #19	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00940000156800	ENSGT00940000157220	ENSGT00940000158881	ENSGT01030000234638.b.b.c.a	ENSGT00390000009453.e.a	ENSGT00940000159320	ENSGT00940000162149	ENSGT00390000009453.f	ENSGT00940000156813	ENSGT00390000011608	ENSGT00390000014472	ENSGT00940000161367	ENSGT00390000016718	ENSGT00940000158927	ENSGT00940000154870.D
koala	MODERN SPECIES	6	STARD5 (ENSPCIG00000001709)	IL16 (ENSPCIG00000001651)	CFAP161 (ENSPCIG00000019416)	MESD (ENSPCIG00000019407)	CEMIP (ENSPCIG00000019389)	ABHD17C (ENSPCIG00000019365)	ARNT2 (ENSPCIG00000019354) #7	CTXND1 (ENSPCIG00000031248)	FAH (ENSPCIG00000019159) #9	ZFAND6 (ENSPCIG00000019156) #10	ENSPCIG00000027444 #14	MINAR1 (ENSPCIG00000014177) #17	TMED3 (ENSPCIG00000031723) #18	ANKRD34C (ENSPCIG00000010272) #19	RASGRF1 (ENSPCIG00000006622) #21	CTSH (ENSPCIG00000006615) #22	BLM (ENSPCIG00000006609)	FURIN (ENSPCIG00000006602)	FES (ENSPCIG00000006595)	MAN2A2 (ENSPCIG00000006586)	ENSPCIG00000006578	UNC45A (ENSPCIG00000006575)	RCCD1 (ENSPCIG00000006571)	ENSPCIG00000006566	VPS33B (ENSPCIG00000006563)	ENSPCIG00000006534	TTLL13 (ENSPCIG00000006528)	GDPGP1 (ENSPCIG00000006527)	CIB1 (ENSPCIG00000006525)	SEMA4B (ENSPCIG00000006519)	IDH2 (ENSPCIG00000006512)
Common wonbat	MODERN SPECIES	581	CFAP161 (ENSVURG00010004830)	TLNRD1 (ENSVURG00010004871)	MESD (ENSVURG00010004873)	CEMIP (ENSVURG00010004917)	ABHD17C (ENSVURG00010004942)	ARNT2 (ENSVURG00010005088) #7	CTXND1 (ENSVURG00010006115)	FAH (ENSVURG00010006131) #9	ZFAND6 (ENSVURG00010006166) #10	BCL2A1 (ENSVURG00010006227) #12	MTHFS (ENSVURG00010006230) #14	MINAR1 (ENSVURG00010006247) #17	TMED3 (ENSVURG00010006269) #18	ANKRD34C (ENSVURG00010006277) #19	RASGRF1 (ENSVURG00010006322) #21	CTSH (ENSVURG00010006513) #22	BLM (ENSVURG00010006529)	FURIN (ENSVURG00010006546)	FES (ENSVURG00010006572)	MAN2A2 (ENSVURG00010006740)	ENSVURG00010006788	UNC45A (ENSVURG00010006822)	RCCD1 (ENSVURG00010006842)	ENSVURG00010006860	VPS33B (ENSVURG00010006900)	ENSVURG00010006935	NGRN (ENSVURG00010006964)	TTLL13 (ENSVURG00010006972)	GDPGP1 (ENSVURG00010006996)	CIB1 (ENSVURG00010006999)	SEMA4B (ENSVURG00010007007)
Wallaby	MODERN SPECIES	1312																CTSH (ENSMEUG00000011093) #22
Tasmanian devil	MODERN SPECIES	1	CFAP161 (ENSSHAG00000029096)	TLNRD1 (ENSSHAG00000030878)	MESD (ENSSHAG00000027623)	CEMIP (ENSSHAG00000009812)	ENSSHAG00000027250	ENSSHAG00000011827	ARNT2 (ENSSHAG00000012937) #7	CTXND1 (ENSSHAG00000032031)	FAH (ENSSHAG00000014891) #9	ZFAND6 (ENSSHAG00000015112) #10	ENSSHAG00000015667 #14	MINAR1 (ENSSHAG00000001271) #17	TMED3 (ENSSHAG00000022806) #18	ENSSHAG00000024213	ENSSHAG00000000683 #21	ENSSHAG00000032156 #22	ENSSHAG00000007988	ENSSHAG00000030066	MAN2A2 (ENSSHAG00000009713)	ENSSHAG00000009935	UNC45A (ENSSHAG00000010200)	RCCD1 (ENSSHAG00000010570)	ENSSHAG00000010615	ENSSHAG00000032047	CIB1 (ENSSHAG00000011127)	SEMA4B (ENSSHAG00000011146)	IDH2 (ENSSHAG00000011631)	ZNF710 (ENSSHAG00000024570)	ENSSHAG00000031900	ENSSHAG00000028069	ANPEP (ENSSHAG00000013070)
Opossum	MODERN SPECIES		ENSMODG00000019397	CFAP161 (ENSMODG00000049991)	TLNRD1 (ENSMODG00000024731)	MESD (ENSMODG00000019402)	CEMIP (ENSMODG00000019403)	ABHD17C (ENSMODG00000019406)	ENSMODG00000019399	ARNT2 (ENSMODG00000019416) #7	FAH (ENSMODG00000037544) #9	ENSMODG00000019428 #10	BCL2A1 (ENSMODG00000019429) #12	ENSMODG00000019430 #14	MINAR1 (ENSMODG00000019431) #17	TMED3 (ENSMODG00000019434) #18	RASGRF1 (ENSMODG00000019438) #21	CTSH (ENSMODG00000019444) #22	BLM (ENSMODG00000019449)	FURIN (ENSMODG00000019452)	FES (ENSMODG00000019456)	MAN2A2 (ENSMODG00000019461)	ENSMODG00000019476	UNC45A (ENSMODG00000019488)	ENSMODG00000019495	VPS33B (ENSMODG00000019498)	TTLL13 (ENSMODG00000019503)	GDPGP1 (ENSMODG00000019506)	CIB1 (ENSMODG00000019510)	SEMA4B (ENSMODG00000019513)	IDH2 (ENSMODG00000019516)	ZNF710 (ENSMODG00000019518)	ARPIN (ENSMODG00000019519)
Platypus	MODERN SPECIES	84	UBA3 (ENSOANG00000000489)	ARL6IP5 (ENSOANG00000000488)	FRMD4B (ENSOANG00000000486)	MITF (ENSOANG00000012406)	MDFIC2 (ENSOANG00000051152)	FOXP1 (ENSOANG00000013093)	ENSOANG00000013094	GPR27 (ENSOANG00000005763)	ENSOANG00000050666	ENSOANG00000050965	ENSOANG00000037173	ENSOANG00000046070	ENSOANG00000041052	SPATA5L1 (ENSOANG00000006987)	RASGRF1 (ENSOANG00000042096) #21	CTSH (ENSOANG00000040239) #22	BLM (ENSOANG00000009316)	FURIN (ENSOANG00000047447)	FES (ENSOANG00000046391)	MAN2A2 (ENSOANG00000008973)	UNC45A (ENSOANG00000022352)	PRC1 (ENSOANG00000038100)	TTLL13 (ENSOANG00000006840)	ENSOANG00000039607	HDDC3 (ENSOANG00000043013)	VPS33B (ENSOANG00000040875)	GDPGP1 (ENSOANG00000036614)	CIB1 (ENSOANG00000050542)	SEMA4B (ENSOANG00000013510)	IDH2 (ENSOANG00000015236)	ZNF710 (ENSOANG00000046750)
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000011608	ENSGT00390000014472	ENSGT00940000161367	ENSGT00390000016718	ENSGT00940000158927	ENSGT00940000154870.D	ENSGT00390000012547.a	ENSGT00940000161170	ENSGT00530000064251	ENSGT00940000154876.b	ENSGT00530000063712.a.a	ENSGT00970000193421.C.b	ENSGT00940000159833 #18	ENSGT00390000012355.B.a	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00940000156800	ENSGT00510000048144	ENSGT00940000156346	ENSGT00530000063675.a	ENSGT01040000240503.A.a.a	ENSGT00390000018400	ENSGT00390000016791	ENSGT00390000017697.a	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00950000182965.a.b.b.b #23	ENSGT01030000234534.B.a.b	ENSGT00950000182965.a.b.b.a ##23	ENSGT00940000157475	ENSGT01030000234519.e.b	ENSGT00940000155837
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00390000009453	ENSGT00940000156813	ENSGT00390000011608	ENSGT00390000014472	ENSGT00940000161367	ENSGT00390000016718	ENSGT00940000158927	ENSGT00940000154870.D	ENSGT00390000012547.a	ENSGT00940000161170	ENSGT00530000064251	ENSGT00940000154876.b	ENSGT00530000063712.a.a	ENSGT00940000159833 #18	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00940000156800	ENSGT00510000048144	ENSGT00940000156346	ENSGT00530000063675.a	ENSGT01040000240503.A.a.a	ENSGT00390000018400	ENSGT00390000016791	ENSGT00390000017697.a	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00950000182965.a.b.b.a ##23	ENSGT00940000157475	ENSGT01030000234519.e.b	ENSGT00940000155837	ENSGT00940000158844	ENSGT00390000006043
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000164520	ENSGT00390000009453	ENSGT00940000156813	ENSGT00390000011608	ENSGT00390000014472	ENSGT00940000161367	ENSGT00390000016718	ENSGT00940000158927	ENSGT00940000154870.D	ENSGT00390000012547.a	ENSGT00940000161170	ENSGT00530000064251	ENSGT00940000154876.b	ENSGT00530000063712.a.a	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00940000156800	ENSGT00510000048144	ENSGT00940000156346	ENSGT00530000063675.a	ENSGT01040000240503.A.a.a	ENSGT00390000018400	ENSGT00390000016791	ENSGT00390000017697.a	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00950000182965.a.b.b.a ##23	ENSGT00940000157475	ENSGT01030000234519.e.b	ENSGT00940000155837	ENSGT00940000158844	ENSGT00390000006043
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	52	ENSGT00940000161367	ENSGT00390000016718	ENSGT00940000158927	ENSGT00940000154870.D	ENSGT00390000012547.a	ENSGT00940000161170	ENSGT00940000154876.b	ENSGT00950000183007.b.i.a.b	ENSGT00950000183007.a.a.b.eb	ENSGT00940000154757	ENSGT00940000158522	ENSGT01100000263845	ENSGT00390000012355.B.b	ENSGT01050000244841.A.a.b	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00940000156800	ENSGT00510000048144	ENSGT00940000156346	ENSGT00530000063675.a	ENSGT01040000240503.A.a.a	ENSGT00390000018400	ENSGT00390000016791	ENSGT00390000017697.a	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00950000182965.a.b.b.a ##23	ENSGT00940000157475	ENSGT01030000234519.e.b	ENSGT00940000155837
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT01030000234519.e.b	ENSGT00940000155837	ENSGT00940000164520	ENSGT00390000014472	ENSGT00940000161367	ENSGT00390000016718	ENSGT00940000158927	ENSGT00940000154870.D	ENSGT00390000012547.a	ENSGT00940000161170	ENSGT00940000154876.b	ENSGT01100000263845	ENSGT00390000012355.B.b	ENSGT01050000244841.A.a.b	ENSGT00940000157599.g #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00940000156800	ENSGT00510000048144	ENSGT00940000156346	ENSGT00530000063675.a	ENSGT01040000240503.A.a.a	ENSGT00390000018400	ENSGT00390000016791	ENSGT00390000017697.a	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00390000006043	ENSGT00940000162591	ENSGT00950000182907.a.b.b.b	ENSGT00940000158689	ENSGT00940000155465.c	ENSGT00940000164138
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT01030000234519.e.b	ENSGT00940000155837	ENSGT00940000164520	ENSGT00390000014472	ENSGT00940000161367	ENSGT00390000016718	ENSGT00940000158927	ENSGT00940000154870.D	ENSGT00390000012547.a	ENSGT00940000161170	ENSGT00940000154876.b	ENSGT01100000263845	ENSGT00390000012355.B.b	ENSGT01050000244841.A.a.b	ENSGT00940000157599.g #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00940000156800	ENSGT00510000048144	ENSGT00940000156346.h	ENSGT00940000156346.g	ENSGT00530000063675.a	ENSGT01040000240503.A.a.a	ENSGT00390000018400	ENSGT00390000016791	ENSGT00390000017697.a	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00390000006043	ENSGT00940000162591	ENSGT00950000182907.a.b.b.b	ENSGT00940000158689	ENSGT00940000155465.c
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	37	ENSGT00950000183076.a.b.b.a.a	ENSGT00950000182965.a.b.b.a ##23	ENSGT00940000157475	ENSGT01030000234519.e.b	ENSGT00940000155837	ENSGT00940000164520	ENSGT00390000014472	ENSGT00940000161367	ENSGT00390000016718	ENSGT00940000158927	ENSGT00940000154870.D	ENSGT00390000012547.a	ENSGT00940000161170	ENSGT00940000154876.b	ENSGT00940000157599.g #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00940000156800	ENSGT00510000048144	ENSGT00940000156346.h	ENSGT00940000156346.g	ENSGT00530000063675.a	ENSGT01040000240503.A.a.a	ENSGT00390000018400	ENSGT00390000016791	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00390000006043	ENSGT00940000162591	ENSGT00950000182907.a.b.b.b	ENSGT00940000158689	ENSGT00940000155465.c	ENSGT00940000164138
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	43	UACA (ENSPTXG00000015260)	TLE3 (ENSPTXG00000015273)	KIF23 (ENSPTXG00000015417)	ENSPTXG00000015425	ENSPTXG00000015426	TTLL13 (ENSPTXG00000015428)	GDPGP1 (ENSPTXG00000015430)	CIB1 (ENSPTXG00000015432)	SEMA4B (ENSPTXG00000015433)	IDH2 (ENSPTXG00000015434)	ZNF710 (ENSPTXG00000015435)	ANPEP (ENSPTXG00000015436)	ENSPTXG00000015441	ENSPTXG00000015471 #21	ENSPTXG00000015476 #21	CTSH (ENSPTXG00000015478) #22	BLM (ENSPTXG00000015481)	WDR76 (ENSPTXG00000015484)	ENSPTXG00000015486	ENSPTXG00000015487	CTDSPL2 (ENSPTXG00000015488)	EIF3J (ENSPTXG00000015491)	SPG11 (ENSPTXG00000015497)	ADAMTS7 (ENSPTXG00000015512) #25	GLCE (ENSPTXG00000015519)	NOX5 (ENSPTXG00000015521)	ENSPTXG00000015522	CORO2B (ENSPTXG00000015523)	ITGA11 (ENSPTXG00000015524)	ENSPTXG00000015525	CLN6 (ENSPTXG00000015526)
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	231	TUBGCP4 (ENSNSUG00000020233)	IQGAP1 (ENSNSUG00000020234)	MORF4L2 (ENSNSUG00000020250) ##23	UACA (ENSNSUG00000020251)	TLE3 (ENSNSUG00000020252)	KIF23 (ENSNSUG00000020253)	TTLL13 (ENSNSUG00000020255)	GDPGP1 (ENSNSUG00000020256)	CIB1 (ENSNSUG00000020257)	SEMA4B (ENSNSUG00000020258)	IDH2 (ENSNSUG00000020259)	ZNF710 (ENSNSUG00000020267)	ANPEP (ENSNSUG00000020268)	ENSNSUG00000020270	RASGRF1 (ENSNSUG00000020273) #21	CTSH (ENSNSUG00000020275) #22	ENSNSUG00000020276	WDR76 (ENSNSUG00000020277)	FRMD5 (ENSNSUG00000020278)	ENSNSUG00000020279	CTDSPL2 (ENSNSUG00000020281)	EIF3J (ENSNSUG00000020283)	CIAO2A (ENSNSUG00000020284)
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	4337															RASGRF1 (ENSLLTG00000016743) #21	CTSH (ENSLLTG00000016655) #22	BLM (ENSLLTG00000016647)	WDR76 (ENSLLTG00000016642)	ENSLLTG00000016637	SKOR1 (ENSLLTG00000016629)
Indian cobra	MODERN SPECIES	14	MORF4L2 (ENSNNAG00000017007) ##23	UACA (ENSNNAG00000016986)	TLE3 (ENSNNAG00000016943)	KIF23 (ENSNNAG00000016252)	ENSNNAG00000016169	ENSNNAG00000016158	TTLL13 (ENSNNAG00000016096)	GDPGP1 (ENSNNAG00000016088)	CIB1 (ENSNNAG00000016075)	SEMA4B (ENSNNAG00000016058)	IDH2 (ENSNNAG00000015195)	ZNF710 (ENSNNAG00000015127)	ANPEP (ENSNNAG00000015104)	ENSNNAG00000014995	RASGRF1 (ENSNNAG00000014651) #21	CTSH (ENSNNAG00000014614) #22	BLM (ENSNNAG00000014581)	WDR76 (ENSNNAG00000014501)	FRMD5 (ENSNNAG00000014437)	GOLM2 (ENSNNAG00000014360)	CTDSPL2 (ENSNNAG00000014328)	EIF3J (ENSNNAG00000014307)	SPG11 (ENSNNAG00000014243)	CIAO2A (ENSNNAG00000014216)	ADAMTS7 (ENSNNAG00000012990) #25	GLCE (ENSNNAG00000012927)	NOX5 (ENSNNAG00000012871)	ENSNNAG00000012830	CORO2B (ENSNNAG00000012805)	ITGA11 (ENSNNAG00000012334)	ENSNNAG00000012296
Lizard	MODERN SPECIES	1431															ENSACAG00000015585 #21	ENSACAG00000015663 #22	ENSACAG00000015720 #23	ENSACAG00000037589
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00940000156813	ENSGT00390000011608	ENSGT00390000014472	ENSGT00940000161367	ENSGT00390000016718	ENSGT00940000158927	ENSGT00940000154870.D	ENSGT00390000012547.a	ENSGT00940000161170	ENSGT00530000064251	ENSGT00940000154876.b	ENSGT00530000063712.a.a	ENSGT01050000244841.A.a.b	ENSGT00730000111185	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00940000156800	ENSGT00510000048144	ENSGT00940000156346	ENSGT00530000063675.a	ENSGT01040000240503.A.a.a	ENSGT00390000018400	ENSGT00390000016791	ENSGT00390000017697.a	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00950000182965.a.b.b.a ##23	ENSGT00940000157475	ENSGT01030000234519.e.b	ENSGT00940000155837	ENSGT00940000158844	ENSGT00390000006043
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	46	UNC45A (ENSSMRG00000020809)	ENSSMRG00000021149	PRC1 (ENSSMRG00000021158)	VPS33B (ENSSMRG00000021324)	HDDC3 (ENSSMRG00000021521)	TTLL13 (ENSSMRG00000021522)	GDPGP1 (ENSSMRG00000021523)	CIB1 (ENSSMRG00000021524)	SEMA4B (ENSSMRG00000021528)	IDH2 (ENSSMRG00000021530)	ZNF710 (ENSSMRG00000021531)	ANPEP (ENSSMRG00000021533)	ENSSMRG00000021534	ENSSMRG00000021535	RASGRF1 (ENSSMRG00000021536) #21	CTSH (ENSSMRG00000021537) #22	ENSSMRG00000021538	WDR76 (ENSSMRG00000021539)	FRMD5 (ENSSMRG00000021540)	GOLM2 (ENSSMRG00000021541)	CTDSPL2 (ENSSMRG00000021542)	EIF3J (ENSSMRG00000021543)	SPG11 (ENSSMRG00000021544)	CIAO2A (ENSSMRG00000021545)	ADAMTS7 (ENSSMRG00000021546) #25	MORF4L2 (ENSSMRG00000021547) ##23	UACA (ENSSMRG00000021548)	TLE3 (ENSSMRG00000021549)	KIF23 (ENSSMRG00000021553)	PAQR5 (ENSSMRG00000021554)	GLCE (ENSSMRG00000021556)
Common wall lizard	MODERN SPECIES	5	VPS33B (ENSPMRG00000022814)	HDDC3 (ENSPMRG00000022807)	NGRN (ENSPMRG00000022805)	TTLL13 (ENSPMRG00000022799)	ENSPMRG00000022796	CIB1 (ENSPMRG00000022792)	SEMA4B (ENSPMRG00000022778)	IDH2 (ENSPMRG00000022769)	ZNF710 (ENSPMRG00000022762)	ENSPMRG00000022761	ARPIN (ENSPMRG00000022756)	ANPEP (ENSPMRG00000022502)	ENSPMRG00000022444	ENSPMRG00000022441	RASGRF1 (ENSPMRG00000021640) #21	CTSH (ENSPMRG00000021435) #22	BLM (ENSPMRG00000021298)	WDR76 (ENSPMRG00000021251)	ENSPMRG00000021245	ENSPMRG00000021226	GOLM2 (ENSPMRG00000021201)	CTDSPL2 (ENSPMRG00000021187)	EIF3J (ENSPMRG00000021176)	SPG11 (ENSPMRG00000021112)	CIAO2A (ENSPMRG00000021096)	ADAMTS7 (ENSPMRG00000021081) #25	MORF4L2 (ENSPMRG00000021061) ##23	UACA (ENSPMRG00000021042)	TLE3 (ENSPMRG00000021022)	ENSPMRG00000020721	PAQR5 (ENSPMRG00000020585)
tuatara	MODERN SPECIES	344												ANPEP (ENSSPUG00000018033)	ENSSPUG00000018056	TMED3 (ENSSPUG00000018082) #18	RASGRF1 (ENSSPUG00000018172) #21	CTSH (ENSSPUG00000018319) #22	BLM (ENSSPUG00000000013)	WDR76 (ENSSPUG00000000120)	FRMD5 (ENSSPUG00000000250)	GOLM2 (ENSSPUG00000000350)	CTDSPL2 (ENSSPUG00000000380)	EIF3J (ENSSPUG00000000386)	SPG11 (ENSSPUG00000000393)	CIAO2A (ENSSPUG00000000403)	ADAMTS7 (ENSSPUG00000000406) #25	MORF4L2 (ENSSPUG00000000464) ##23	UACA (ENSSPUG00000000537)	ENSSPUG00000000607	TLE3 (ENSSPUG00000000655)
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000011608	ENSGT00390000014472	ENSGT00940000161367	ENSGT00390000016718	ENSGT00940000158927	ENSGT00940000154870.D	ENSGT00390000012547.a	ENSGT00940000161170	ENSGT00530000064251	ENSGT00940000154876.b	ENSGT00530000063712.a.a	ENSGT00970000193421.C.b	ENSGT00940000159833 #18	ENSGT00390000012355.B.a	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00940000156800	ENSGT00510000048144	ENSGT00940000156346	ENSGT00530000063675.a	ENSGT01040000240503.A.a.a	ENSGT00390000018400	ENSGT00390000016791	ENSGT00390000017697.a	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00950000182965.a.b.b.b #23	ENSGT01030000234534.B.a.b	ENSGT00950000182965.a.b.b.a ##23	ENSGT00940000157475	ENSGT01030000234519.e.b	ENSGT00940000155837
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	13			ENSGT00390000011608	ENSGT00390000014472	ENSGT00940000161367	ENSGT00390000016718	ENSGT00940000158927	ENSGT00940000154870.D	ENSGT00390000012547.a	ENSGT00940000161170	ENSGT00530000064251	ENSGT00940000154876.b	ENSGT00940000159833 #18	ENSGT00390000012355.B.a	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00940000156800	ENSGT00510000048144	ENSGT00940000156346	ENSGT00530000063675.a	ENSGT01040000240503.A.a.a	ENSGT00390000018400	ENSGT00390000016791	ENSGT00390000017697.a	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT01030000234534.B.a.b	ENSGT00950000182965.a.b.b.a ##23	ENSGT00940000157475	ENSGT01030000234519.e.b	ENSGT00940000155837	ENSGT00940000158844
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000156813.t	ENSGT00390000011608	ENSGT00390000014472	ENSGT00940000161367	ENSGT00390000016718	ENSGT00940000158927	ENSGT00940000154870.D	ENSGT00390000012547.a	ENSGT00940000161170	ENSGT00530000064251	ENSGT00940000154876.b	ENSGT00530000063712.a.a	ENSGT00940000159833 #18	ENSGT00390000012355.B.a	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00940000156800	ENSGT00510000048144	ENSGT00940000156346	ENSGT00530000063675.a	ENSGT01040000240503.A.a.a	ENSGT00390000018400	ENSGT00390000016791	ENSGT00390000017697.a	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT01030000234534.B.a.b	ENSGT00950000182965.a.b.b.a ##23	ENSGT00940000157475	ENSGT01030000234519.e.b	ENSGT00940000155837	ENSGT00940000158844
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000156813.t	ENSGT00390000011608	ENSGT00390000014472	ENSGT00940000161367	ENSGT00390000016718	ENSGT00940000158927	ENSGT00940000154870.D	ENSGT00390000012547.a	ENSGT00940000161170	ENSGT00530000064251	ENSGT00940000154876.b	ENSGT00530000063712.a.a.e	ENSGT00940000159833 #18	ENSGT00390000012355.B.a	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00940000156800	ENSGT00510000048144	ENSGT00940000156346	ENSGT00530000063675.a	ENSGT01040000240503.A.a.a	ENSGT00390000018400	ENSGT00390000016791	ENSGT00390000017697.a	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT01030000234534.B.a.b	ENSGT00950000182965.a.b.b.a ##23	ENSGT00940000157475	ENSGT01030000234519.e.b	ENSGT00940000155837	ENSGT00940000158844
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	1	ENSGEVG00005008729	PRC1 (ENSGEVG00005008866)	GDPGP1 (ENSGEVG00005008952)	CIB1 (ENSGEVG00005008971)	SEMA4B (ENSGEVG00005009000)	IDH2 (ENSGEVG00005009069)	ZNF710 (ENSGEVG00005009201)	ARPIN (ENSGEVG00005009224)	ANPEP (ENSGEVG00005009325)	ENSGEVG00005009382	ENSGEVG00005009462	TMED3 (ENSGEVG00005009691) #18	ENSGEVG00005009735	ENSGEVG00005009769 #21	ENSGEVG00005009916 #21	CTSH (ENSGEVG00005009965) #22	BLM (ENSGEVG00005010102)	WDR76 (ENSGEVG00005010927)	FRMD5 (ENSGEVG00005010982)	GOLM2 (ENSGEVG00005011188)	CTDSPL2 (ENSGEVG00005011247)	EIF3J (ENSGEVG00005011284)	SPG11 (ENSGEVG00005011322)	CIAO2A (ENSGEVG00005011373)	ADAMTS7 (ENSGEVG00005011410) #25	ENSGEVG00005011604	MORF4L2 (ENSGEVG00005011639) ##23	UACA (ENSGEVG00005011665)	TLE3 (ENSGEVG00005011815)	KIF23 (ENSGEVG00005011913)	PAQR5 (ENSGEVG00005012089)
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	1798	GDPGP1 (ENSCABG00000010133)	CIB1 (ENSCABG00000010147)	SEMA4B (ENSCABG00000010148)	ENSCABG00000010149	IDH2 (ENSCABG00000010150)	ZNF710 (ENSCABG00000010153)	ARPIN (ENSCABG00000010154)	ANPEP (ENSCABG00000010155)	ENSCABG00000010159	ENSCABG00000010160	ENSCABG00000010161	TMED3 (ENSCABG00000010171) #18	ENSCABG00000010175	ENSCABG00000010178	RASGRF1 (ENSCABG00000010185) #21	CTSH (ENSCABG00000010198) #22	GIMD1 (ENSCABG00000010363)	AIMP1 (ENSCABG00000010364)	TBCK (ENSCABG00000010394)	NPNT (ENSCABG00000011588)	GSTCD (ENSCABG00000011709)	INTS12 (ENSCABG00000011716)	ENSCABG00000011724	ENSCABG00000011735	ENSCABG00000011738	PPA2 (ENSCABG00000011741)	TET2 (ENSCABG00000011743)	TACR3 (ENSCABG00000011753)	RSPH4A (ENSCABG00000011758)	BDH2 (ENSCABG00000011765)	ENSCABG00000011771
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00390000009453	ENSGT00940000156813.t	ENSGT00390000011608	ENSGT00940000161367	ENSGT00390000016718	ENSGT00940000158927	ENSGT00940000154870.D	ENSGT00390000012547.a	ENSGT00940000161170	ENSGT00530000064251	ENSGT00940000154876.b	ENSGT00530000063712.a.a	ENSGT00940000159833 #18	ENSGT00390000012355.B.a	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00940000156800	ENSGT00510000048144	ENSGT00940000156346	ENSGT00530000063675.a	ENSGT01040000240503.A.a.a	ENSGT00390000018400	ENSGT00390000016791	ENSGT00390000017697.a	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT01030000234534.B.a.b	ENSGT00950000182965.a.b.b.a ##23	ENSGT00940000157475	ENSGT01030000234519.e.b	ENSGT00940000155837	ENSGT00940000158844
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	27	UNC45A (ENSTMTG00000001455)	ENSTMTG00000001393	PRC1 (ENSTMTG00000001377)	VPS33B (ENSTMTG00000001325)	TTLL13 (ENSTMTG00000001291)	CIB1 (ENSTMTG00000001269)	SEMA4B (ENSTMTG00000001259)	IDH2 (ENSTMTG00000000465)	ZNF710 (ENSTMTG00000000073)	ARPIN (ENSTMTG00000000048)	ANPEP (ENSTMTG00000010813)	TMED3 (ENSTMTG00000010644) #18	ENSTMTG00000010629	ENSTMTG00000010584 #21	ENSTMTG00000010510 #21	CTSH (ENSTMTG00000010493) #22	BLM (ENSTMTG00000010382)	WDR76 (ENSTMTG00000010297)	FRMD5 (ENSTMTG00000010115)	GOLM2 (ENSTMTG00000010056)	CTDSPL2 (ENSTMTG00000010013)	ENSTMTG00000010003	EIF3J (ENSTMTG00000009982)	SPG11 (ENSTMTG00000009532)	CIAO2A (ENSTMTG00000009493)	ADAMTS7 (ENSTMTG00000009395) #25	MORF4L2 (ENSTMTG00000009290) ##23	UACA (ENSTMTG00000009253)	TLE3 (ENSTMTG00000009181)	KIF23 (ENSTMTG00000009131)	PAQR5 (ENSTMTG00000009106)
painted turtle	MODERN SPECIES	742	VPS33B (ENSCPBG00000024473)	HDDC3 (ENSCPBG00000024474)	TTLL13 (ENSCPBG00000024475)	GDPGP1 (ENSCPBG00000024476)	CIB1 (ENSCPBG00000024477)	SEMA4B (ENSCPBG00000024478)	IDH2 (ENSCPBG00000024479)	ZNF710 (ENSCPBG00000024916)	ARPIN (ENSCPBG00000024924)	ANPEP (ENSCPBG00000024929)	ENSCPBG00000024935	ENSCPBG00000024942	TMED3 (ENSCPBG00000024949) #18	ENSCPBG00000024952	RASGRF1 (ENSCPBG00000024963) #21	CTSH (ENSCPBG00000024970) #22	BLM (ENSCPBG00000025000)	WDR76 (ENSCPBG00000025118)	FRMD5 (ENSCPBG00000025120)	GOLM2 (ENSCPBG00000025126)	CTDSPL2 (ENSCPBG00000025131)	EIF3J (ENSCPBG00000025162)	SPG11 (ENSCPBG00000025208)	CIAO2A (ENSCPBG00000025361)	ADAMTS7 (ENSCPBG00000025373) #25	ENSCPBG00000025408	MORF4L2 (ENSCPBG00000025409) ##23	UACA (ENSCPBG00000025503)	TLE3 (ENSCPBG00000025506)	ENSCPBG00000025510	ENSCPBG00000025512
Chinese turtle	MODERN SPECIES	1779															RASGRF1 (ENSPSIG00000011139) #21	CTSH (ENSPSIG00000010347) #22	BLM (ENSPSIG00000009792)	WDR76 (ENSPSIG00000009730)	ENSPSIG00000009606	FRMD5 (ENSPSIG00000008947)	GOLM2 (ENSPSIG00000008485)	CTDSPL2 (ENSPSIG00000008067)	EIF3J (ENSPSIG00000007786)	SPG11 (ENSPSIG00000007112)	CIAO2A (ENSPSIG00000006904)	ADAMTS7 (ENSPSIG00000006025) #25	MORF4L2 (ENSPSIG00000017080) ##23	UACA (ENSPSIG00000016716)	TLE3 (ENSPSIG00000016264)	ENSPSIG00000016179	KIF23 (ENSPSIG00000015679)
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000009453	ENSGT00940000156813	ENSGT00390000011608	ENSGT00940000161367	ENSGT00390000016718	ENSGT00940000158927	ENSGT00940000154870.D	ENSGT00390000012547.a	ENSGT00940000161170	ENSGT00940000154876.b	ENSGT00530000063712.a.a	ENSGT00970000193421.C.b	ENSGT00940000159833 #18	ENSGT00390000012355.B.a	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00940000156800	ENSGT00510000048144	ENSGT00940000156346	ENSGT00530000063675.a	ENSGT01040000240503.A.a.a	ENSGT00390000018400	ENSGT00390000016791	ENSGT00390000017697.a	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00950000182965.a.b.b.a ##23	ENSGT00940000157475	ENSGT01030000234519.e.b	ENSGT00940000155837	ENSGT00940000158844	ENSGT00390000006043
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	31								ENSCPRG00005004320	ENSCPRG00005004316	MRPS16 (ENSCPRG00005004312)	ENSCPRG00005002454	TUBGCP4 (ENSCPRG00005002219)	TP53BP1 (ENSCPRG00005002173)	MAP1A (ENSCPRG00005002156)	RASGRF1 (ENSCPRG00005002119) #21	CTSH (ENSCPRG00005002111) #22	BLM (ENSCPRG00005002099)	WDR76 (ENSCPRG00005002087)	FRMD5 (ENSCPRG00005002067)	GOLM2 (ENSCPRG00005001960)	CTDSPL2 (ENSCPRG00005001948)	EIF3J (ENSCPRG00005001932)	SPG11 (ENSCPRG00005001714)	CIAO2A (ENSCPRG00005001696)	ADAMTS7 (ENSCPRG00005001232) #25	ENSCPRG00005001186	ENSCPRG00005001169 ##23	UACA (ENSCPRG00005001122)	TLE3 (ENSCPRG00005001068)	ENSCPRG00005001006	ENSCPRG00005000997
Aves	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000009453	ENSGT00940000156813	ENSGT00390000011608	ENSGT00940000161367	ENSGT00390000016718	ENSGT00940000158927	ENSGT00940000154870.D	ENSGT00390000012547.a	ENSGT00940000161170	ENSGT00970000193421.C.b	ENSGT00940000154876.b	ENSGT00530000063712.a.a	ENSGT00940000159833 #18	ENSGT00390000012355.B.a	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00940000156800	ENSGT00510000048144	ENSGT00940000156346	ENSGT00530000063675.a	ENSGT01040000240503.A.a.a	ENSGT00390000018400	ENSGT00390000016791	ENSGT00390000017697.a	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00950000182965.a.b.b.a ##23	ENSGT00940000157475	ENSGT01030000234519.e.b	ENSGT00940000155837	ENSGT00940000158844	ENSGT00390000006043
African ostrich	DUPLICATION
African ostrich	MODERN SPECIES	1020								IDH2 (ENSSCUG00000013168)	ZNF710 (ENSSCUG00000013158)	AP3S2 (ENSSCUG00000013156)	ENSSCUG00000013155	TMED3 (ENSSCUG00000013152) #18	ENSSCUG00000013151	RASGRF1 (ENSSCUG00000013144) #21	ENSSCUG00000013142 #22	ENSSCUG00000013139 #22	BLM (ENSSCUG00000013117)	WDR76 (ENSSCUG00000013091)	FRMD5 (ENSSCUG00000013079)	GOLM2 (ENSSCUG00000013072)	CTDSPL2 (ENSSCUG00000013071)	EIF3J (ENSSCUG00000013070)	SPG11 (ENSSCUG00000013068)	CIAO2A (ENSSCUG00000013067)	ADAMTS7 (ENSSCUG00000013052) #25	MORF4L2 (ENSSCUG00000012999) ##23	UACA (ENSSCUG00000012971)	ENSSCUG00000012962	ENSSCUG00000012960	ENSSCUG00000012958
African ostrich	MODERN SPECIES	1020									IDH2 (ENSSCUG00000013168)	ZNF710 (ENSSCUG00000013158)	AP3S2 (ENSSCUG00000013156)	ENSSCUG00000013155	TMED3 (ENSSCUG00000013152) #18	ENSSCUG00000013151	RASGRF1 (ENSSCUG00000013144) #21	ENSSCUG00000013142 #22	ENSSCUG00000013139 #22	BLM (ENSSCUG00000013117)	WDR76 (ENSSCUG00000013091)	FRMD5 (ENSSCUG00000013079)	GOLM2 (ENSSCUG00000013072)	CTDSPL2 (ENSSCUG00000013071)	EIF3J (ENSSCUG00000013070)	SPG11 (ENSSCUG00000013068)	CIAO2A (ENSSCUG00000013067)	ADAMTS7 (ENSSCUG00000013052) #25	MORF4L2 (ENSSCUG00000012999) ##23	UACA (ENSSCUG00000012971)	ENSSCUG00000012962	ENSSCUG00000012960	ENSSCUG00000012958
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000156813	ENSGT00390000011608	ENSGT00940000161367	ENSGT00390000016718	ENSGT00940000158927	ENSGT00940000154870.D	ENSGT00390000012547.a	ENSGT00940000161170	ENSGT00970000193421.C.b	ENSGT00940000154876.b	ENSGT00530000063712.a.a.g	ENSGT00530000063712.a.a.h	ENSGT00940000159833 #18	ENSGT00390000012355.B.a	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00940000156800	ENSGT00510000048144	ENSGT00940000156346	ENSGT00530000063675.a	ENSGT01040000240503.A.a.a	ENSGT00390000018400	ENSGT00390000016791	ENSGT00390000017697.a	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00950000182965.a.b.b.a ##23	ENSGT00940000157475	ENSGT01030000234519.e.b	ENSGT00940000155837	ENSGT00940000158844	ENSGT00390000006043
Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000156813	ENSGT00390000011608	ENSGT00940000161367	ENSGT00390000016718	ENSGT00940000158927	ENSGT00940000154870.D	ENSGT00390000012547.a	ENSGT00940000161170	ENSGT00970000193421.C.b	ENSGT00940000154876.b	ENSGT00530000063712.a.a.g	ENSGT00530000063712.a.a.h	ENSGT00940000159833 #18	ENSGT00390000012355.B.a	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00940000156800	ENSGT00510000048144	ENSGT00940000156346	ENSGT00530000063675.a	ENSGT01040000240503.A.a.a	ENSGT00390000018400	ENSGT00390000016791	ENSGT00390000017697.a	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00950000182965.a.b.b.a ##23	ENSGT00940000157475	ENSGT01030000234519.e.b	ENSGT00940000155837	ENSGT00940000158844	ENSGT00390000006043
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000009453	ENSGT00940000156813	ENSGT00390000011608	ENSGT00940000161367	ENSGT00390000016718	ENSGT00940000158927	ENSGT00940000154870.D	ENSGT00390000012547.a	ENSGT00940000161170	ENSGT00970000193421.C.b	ENSGT00940000154876.b	ENSGT00530000063712.a.a.g	ENSGT00940000159833 #18	ENSGT00390000012355.B.a	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00940000156800	ENSGT00510000048144	ENSGT00940000156346	ENSGT00530000063675.a	ENSGT01040000240503.A.a.a	ENSGT00390000018400	ENSGT00390000016791	ENSGT00390000017697.a	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00950000182965.a.b.b.a ##23	ENSGT00940000157475	ENSGT01030000234519.e.b	ENSGT00940000155837	ENSGT00940000158844	ENSGT00390000006043
Kakapo	MODERN SPECIES	1	HDDC3 (ENSSHBG00005007632)	ENSSHBG00005007645	ENSSHBG00005007653	CIB1 (ENSSHBG00005007734)	SEMA4B (ENSSHBG00005007761)	IDH2 (ENSSHBG00005007782)	ZNF710 (ENSSHBG00005007803)	AP3S2 (ENSSHBG00005007818)	ANPEP (ENSSHBG00005007852)	ENSSHBG00005007919	ENSSHBG00005007929	ENSSHBG00005007935	TMED3 (ENSSHBG00005007939) #18	ENSSHBG00005007948	RASGRF1 (ENSSHBG00005007956) #21	CTSH (ENSSHBG00005007973) #22	BLM (ENSSHBG00005008005)	WDR76 (ENSSHBG00005008067)	FRMD5 (ENSSHBG00005008084)	GOLM2 (ENSSHBG00005008102)	CTDSPL2 (ENSSHBG00005008122)	EIF3J (ENSSHBG00005008136)	SPG11 (ENSSHBG00005008168)	CIAO2A (ENSSHBG00005008250)	ADAMTS7 (ENSSHBG00005008371) #25	MORF4L2 (ENSSHBG00005011335) ##23	UACA (ENSSHBG00005011394)	TLE3 (ENSSHBG00005011543)	KIF23 (ENSSHBG00005011580)	PAQR5 (ENSSHBG00005011637)	GLCE (ENSSHBG00005011650)
Golden eagle	MODERN SPECIES	21	HDDC3 (ENSACCG00020002786)	ENSACCG00020002759	GDPGP1 (ENSACCG00020002735)	ENSACCG00020002723	SEMA4B (ENSACCG00020002698)	IDH2 (ENSACCG00020002683)	ZNF710 (ENSACCG00020002669)	AP3S2 (ENSACCG00020002658)	ANPEP (ENSACCG00020002638)	ENSACCG00020002617	ENSACCG00020002606	ENSACCG00020002579	TMED3 (ENSACCG00020002558) #18	ENSACCG00020002547	RASGRF1 (ENSACCG00020002515) #21	CTSH (ENSACCG00020002474) #22	BLM (ENSACCG00020002368)	WDR76 (ENSACCG00020002221)	FRMD5 (ENSACCG00020002198)	GOLM2 (ENSACCG00020002151)	CTDSPL2 (ENSACCG00020002110)	EIF3J (ENSACCG00020002090)	SPG11 (ENSACCG00020002012)	CIAO2A (ENSACCG00020001958)	ADAMTS7 (ENSACCG00020001776) #25	MORF4L2 (ENSACCG00020001635) ##23	UACA (ENSACCG00020001551)	TLE3 (ENSACCG00020001470)	KIF23 (ENSACCG00020001359)	PAQR5 (ENSACCG00020001307)	GLCE (ENSACCG00020001293)
Passeriformes	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000156813	ENSGT00390000011608	ENSGT00940000161367	ENSGT00390000016718	ENSGT00940000158927	ENSGT00940000154870.D	ENSGT00390000012547.a	ENSGT00940000161170	ENSGT00970000193421.C.b	ENSGT00940000154876.b	ENSGT00530000063712.a.a.g	ENSGT01050000244841.A.a.b	ENSGT00940000159833 #18	ENSGT00390000012355.B.a	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00940000156800	ENSGT00510000048144	ENSGT00940000156346	ENSGT00530000063675.a	ENSGT01040000240503.A.a.a	ENSGT00390000018400	ENSGT00390000016791	ENSGT00390000017697.a	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00950000182965.a.b.b.a ##23	ENSGT00940000157475	ENSGT01030000234519.e.b	ENSGT00940000155837	ENSGT00940000158844	ENSGT00390000006043
Passeriformes_d	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000156813	ENSGT00390000011608	ENSGT00940000161367	ENSGT00390000016718	ENSGT00940000158927	ENSGT00940000154870.D	ENSGT00390000012547.a	ENSGT00940000161170	ENSGT00970000193421.C.b	ENSGT00940000154876.b	ENSGT00530000063712.a.a.g	ENSGT01050000244841.A.a.b	ENSGT00940000159833 #18	ENSGT00390000012355.B.a	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00940000156800	ENSGT00510000048144	ENSGT00940000156346	ENSGT00530000063675.a	ENSGT01040000240503.A.a.a	ENSGT00390000018400	ENSGT00390000016791	ENSGT00390000017697.a	ENSGT00940000159819.f #25	ENSGT00950000182965.a.b.b.a ##23	ENSGT00940000157475	ENSGT01030000234519.e.b	ENSGT00940000155837	ENSGT00940000158844	ENSGT00390000006043
Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000164520	ENSGT00390000009453	ENSGT00940000156813	ENSGT00940000161367	ENSGT00390000016718	ENSGT00940000158927	ENSGT00940000154870.D	ENSGT00390000012547.a	ENSGT00940000161170	ENSGT00970000193421.C.b	ENSGT00940000154876.b	ENSGT00530000063712.a.a.g	ENSGT01050000244841.A.a.b	ENSGT00940000159833 #18	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00940000156800	ENSGT00510000048144	ENSGT00940000156346	ENSGT00530000063675.a	ENSGT01040000240503.A.a.a	ENSGT00390000018400	ENSGT00390000016791	ENSGT00390000017697.a	ENSGT00940000159819.f #25	ENSGT00950000182965.a.b.b.a ##23	ENSGT00940000157475	ENSGT01030000234519.e.b	ENSGT00940000155837	ENSGT00940000158844	ENSGT00390000006043
Medium ground finch	MODERN SPECIES	69	FURIN (ENSGFOG00000013221)	FES (ENSGFOG00000013212)	MAN2A2 (ENSGFOG00000013198)	UNC45A (ENSGFOG00000013142)	PRC1 (ENSGFOG00000013124)	VPS33B (ENSGFOG00000013122)	TTLL13 (ENSGFOG00000013119)	ENSGFOG00000013116	SEMA4B (ENSGFOG00000013115)	IDH2 (ENSGFOG00000013114)	ENSGFOG00000013112	ENSGFOG00000013106	ANPEP (ENSGFOG00000013096)	TMED3 (ENSGFOG00000013090) #18	RASGRF1 (ENSGFOG00000012956) #21	CTSH (ENSGFOG00000012932) #22	BLM (ENSGFOG00000012602)	WDR76 (ENSGFOG00000012567)	FRMD5 (ENSGFOG00000012554)	GOLM2 (ENSGFOG00000012544)	CTDSPL2 (ENSGFOG00000012540)	EIF3J (ENSGFOG00000012537)	SPG11 (ENSGFOG00000012502)	CIAO2A (ENSGFOG00000012496)	ADAMTS7 (ENSGFOG00000012371) #25	MORF4L2 (ENSGFOG00000012359) ##23	UACA (ENSGFOG00000012349)	TLE3 (ENSGFOG00000012034)	KIF23 (ENSGFOG00000012017)	ENSGFOG00000012011	GLCE (ENSGFOG00000012008)
Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000164520	ENSGT00390000009453	ENSGT00940000156813	ENSGT00940000161367	ENSGT00390000016718	ENSGT00940000158927	ENSGT00940000154870.D	ENSGT00390000012547.a	ENSGT00940000161170	ENSGT00970000193421.C.b	ENSGT00940000154876.b	ENSGT00530000063712.a.a.g	ENSGT01050000244841.A.a.b	ENSGT00940000159833 #18	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00940000156800	ENSGT00510000048144	ENSGT00940000156346	ENSGT00530000063675.a	ENSGT01040000240503.A.a.a	ENSGT00390000018400	ENSGT00390000016791	ENSGT00390000017697.a	ENSGT00940000159819.f #25	ENSGT00950000182965.a.b.b.a ##23	ENSGT00940000157475	ENSGT01030000234519.e.b	ENSGT00940000155837	ENSGT00940000158844	ENSGT00390000006043.f
Zebra finch	MODERN SPECIES	1	CIB1 (ENSTGUG00000010028)	SEMA4B (ENSTGUG00000010009)	IDH2 (ENSTGUG00000022112)	ZNF710 (ENSTGUG00000026802)	ENSTGUG00000026005	ENSTGUG00000029649	AP3S2 (ENSTGUG00000014282)	ANPEP (ENSTGUG00000014295)	ENSTGUG00000020442	ENSTGUG00000014270	ENSTGUG00000021476 #18	ENSTGUG00000021398 #18	ENSTGUG00000028054	ENSTGUG00000024286	RASGRF1 (ENSTGUG00000009981) #21	CTSH (ENSTGUG00000009976) #22	BLM (ENSTGUG00000009959)	WDR76 (ENSTGUG00000009939)	FRMD5 (ENSTGUG00000009926)	GOLM2 (ENSTGUG00000009914)	CTDSPL2 (ENSTGUG00000009887)	EIF3J (ENSTGUG00000009878)	SPG11 (ENSTGUG00000009831)	CIAO2A (ENSTGUG00000009827)	ENSTGUG00000009778 #25	ENSTGUG00000021838 ##23	ENSTGUG00000020557	ENSTGUG00000024617	ENSTGUG00000026895	ENSTGUG00000023502	ENSTGUG00000022584
Common canary	MODERN SPECIES	12	MAN2A2 (ENSSCAG00000014295)	UNC45A (ENSSCAG00000014259)	PRC1 (ENSSCAG00000014249)	ENSSCAG00000014241	VPS33B (ENSSCAG00000014226)	TTLL13 (ENSSCAG00000014214)	CIB1 (ENSSCAG00000014212)	SEMA4B (ENSSCAG00000014205)	IDH2 (ENSSCAG00000014199)	ENSSCAG00000014195	AP3S2 (ENSSCAG00000014192)	ANPEP (ENSSCAG00000014187)	ENSSCAG00000014184	TMED3 (ENSSCAG00000014179) #18	RASGRF1 (ENSSCAG00000013440) #21	CTSH (ENSSCAG00000013083) #22	BLM (ENSSCAG00000012887)	WDR76 (ENSSCAG00000012854)	ENSSCAG00000012847	GOLM2 (ENSSCAG00000012840)	CTDSPL2 (ENSSCAG00000012831)	EIF3J (ENSSCAG00000012816)	SPG11 (ENSSCAG00000012635)	CIAO2A (ENSSCAG00000012588)	ADAMTS7 (ENSSCAG00000012368) #25	MORF4L2 (ENSSCAG00000012265) ##23	UACA (ENSSCAG00000012188)	ENSSCAG00000012151	TLE3 (ENSSCAG00000011497)	KIF23 (ENSSCAG00000010811)	PAQR5 (ENSSCAG00000010668)
Flycatcher	MODERN SPECIES	1	UNC45A (ENSFALG00000011163)	ENSFALG00000011157	VPS33B (ENSFALG00000011098)	ENSFALG00000026266	TTLL13 (ENSFALG00000011077)	CIB1 (ENSFALG00000011064)	SEMA4B (ENSFALG00000011052)	IDH2 (ENSFALG00000011043)	ZNF710 (ENSFALG00000011037)	AP3S2 (ENSFALG00000011031)	ANPEP (ENSFALG00000011026)	ENSFALG00000011022	ENSFALG00000011013	ENSFALG00000023639	ENSFALG00000011006 #21	ENSFALG00000011000 #22	ENSFALG00000010981	WDR76 (ENSFALG00000010962)	ENSFALG00000023463	ENSFALG00000025909	ENSFALG00000024257	GOLM2 (ENSFALG00000004951)	CTDSPL2 (ENSFALG00000004970)	EIF3J (ENSFALG00000004996)	ENSFALG00000023704	ENSFALG00000005020	ENSFALG00000025888	ENSFALG00000005079 #25	ENSFALG00000025019 #25	ENSFALG00000026728 ##23	UACA (ENSFALG00000005154)
Great tit	MODERN SPECIES	1	HDDC3 (ENSPMJG00000012013)	TTLL13 (ENSPMJG00000012011)	CIB1 (ENSPMJG00000012000)	GDPGP1 (ENSPMJG00000011999)	SEMA4B (ENSPMJG00000011998)	IDH2 (ENSPMJG00000011671)	ZNF710 (ENSPMJG00000011654)	AP3S2 (ENSPMJG00000011650)	ANPEP (ENSPMJG00000011645)	ENSPMJG00000011643	ENSPMJG00000011642	TMED3 (ENSPMJG00000011640) #18	ENSPMJG00000011639	ENSPMJG00000011636	RASGRF1 (ENSPMJG00000011635) #21	CTSH (ENSPMJG00000011634) #22	BLM (ENSPMJG00000011588)	WDR76 (ENSPMJG00000011587)	FRMD5 (ENSPMJG00000011586)	GOLM2 (ENSPMJG00000011585)	CTDSPL2 (ENSPMJG00000011584)	EIF3J (ENSPMJG00000011583)	SPG11 (ENSPMJG00000011303)	CIAO2A (ENSPMJG00000011301)	ADAMTS7 (ENSPMJG00000010272) #25	MORF4L2 (ENSPMJG00000010268) ##23	UACA (ENSPMJG00000010263)	ENSPMJG00000010262	ENSPMJG00000010244	TLE3 (ENSPMJG00000010074)	KIF23 (ENSPMJG00000010072)
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000011608	ENSGT00940000161367	ENSGT00390000016718	ENSGT00940000158927	ENSGT00940000154870.D	ENSGT00390000012547.a	ENSGT00940000161170	ENSGT00970000193421.C.b	ENSGT00940000154876.b	ENSGT00530000063712.a.a.g	ENSGT00530000063712.a.a.h	ENSGT01050000244841.A.a.b	ENSGT00940000159833 #18	ENSGT00390000012355.B.a	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00940000156800	ENSGT00510000048144	ENSGT00940000156346	ENSGT00530000063675.a	ENSGT01040000240503.A.a.a	ENSGT00390000018400	ENSGT00390000016791	ENSGT00390000017697.a	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00950000182965.a.b.b.a ##23	ENSGT00940000157475	ENSGT01030000234519.e.b	ENSGT00940000155837	ENSGT00940000158844	ENSGT00390000006043
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000009453	ENSGT00940000156813	ENSGT00390000011608	ENSGT00940000161367	ENSGT00390000016718	ENSGT00940000158927	ENSGT00940000154870.D	ENSGT00390000012547.a	ENSGT00940000161170.b	ENSGT00970000193421.C.b	ENSGT00940000154876.b	ENSGT00530000063712.a.a.g	ENSGT00530000063712.a.a.h	ENSGT01050000244841.A.a.b	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00940000156800	ENSGT00510000048144	ENSGT00940000156346	ENSGT00530000063675.a	ENSGT01040000240503.A.a.a	ENSGT00390000018400	ENSGT00390000016791	ENSGT00390000017697.a	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00950000182965.a.b.b.a ##23	ENSGT00940000157475	ENSGT01030000234519.e.b	ENSGT00940000155837	ENSGT00940000158844	ENSGT00390000006043
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000011608	ENSGT00940000161367	ENSGT00390000016718	ENSGT00940000158927	ENSGT00940000154870.D	ENSGT00390000012547.a	ENSGT00940000161170.b	ENSGT00970000193421.C.b	ENSGT00940000154876.b	ENSGT00530000063712.a.a.g	ENSGT00530000063712.a.a.h	ENSGT01050000244841.A.a.b	ENSGT00940000159833 #18	ENSGT00390000012355.B.a	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00940000156800	ENSGT00510000048144	ENSGT00940000156346	ENSGT00530000063675.a	ENSGT01040000240503.A.a.a	ENSGT00390000018400	ENSGT00390000016791	ENSGT00390000017697.a	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00950000182965.a.b.b.a ##23	ENSGT00940000157475	ENSGT01030000234519.e.b	ENSGT00940000155837	ENSGT00940000158844	ENSGT00390000006043
Turkey	MODERN SPECIES	3	ENSMGAG00000010721	ENSMGAG00000010652	ENSMGAG00000020677	ENSMGAG00000010525	SEMA4B (ENSMGAG00000010484)	ENSMGAG00000021657	ENSMGAG00000021568	ENSMGAG00000004597	ENSMGAG00000017294	ENSMGAG00000010489	ENSMGAG00000017180	ENSMGAG00000010510 #18	ENSMGAG00000010507	ENSMGAG00000010523	ENSMGAG00000012254 #21	ENSMGAG00000010582 #22	ENSMGAG00000010473	WDR76 (ENSMGAG00000010407)	ENSMGAG00000022869	FRMD5 (ENSMGAG00000016494)	CTDSPL2 (ENSMGAG00000010285)	EIF3J (ENSMGAG00000020198)	SPG11 (ENSMGAG00000010324)	ENSMGAG00000018525	ENSMGAG00000010348 #25	ENSMGAG00000010385 ##23	UACA (ENSMGAG00000010428)	TLE3 (ENSMGAG00000010249)	KIF23 (ENSMGAG00000010217)	PAQR5 (ENSMGAG00000010133)	GLCE (ENSMGAG00000010210)
Chicken	MODERN SPECIES	1	HDDC3 (ENSGALG00010000053)	TTLL13 (ENSGALG00010000052)	GDPGP1 (ENSGALG00010000051)	CIB1 (ENSGALG00010000050)	SEMA4B (ENSGALG00010020293)	IDH2 (ENSGALG00010020277)	ZNF710 (ENSGALG00010020257)	AP3S2 (ENSGALG00010015942)	ANPEP (ENSGALG00010015905)	ENSGALG00010015903	MESP1 (ENSGALG00010015956)	GNRHR (ENSGALG00010016446)	TMED3 (ENSGALG00010016433) #18	ENSGALG00010016421	RASGRF1 (ENSGALG00010016415) #21	CTSH (ENSGALG00010016411) #22	BLM (ENSGALG00010016393)	WDR76 (ENSGALG00010016378)	FRMD5 (ENSGALG00010016374)	CASC4 (ENSGALG00010016350)	CTDSPL2 (ENSGALG00010016317)	EIF3J (ENSGALG00010016304)	SPG11 (ENSGALG00010016262)	FAM96A (ENSGALG00010016245)	ADAMTS7 (ENSGALG00010016209) #25	MORF4L2 (ENSGALG00010020090) ##23	UACA (ENSGALG00010020056)	TLE3 (ENSGALG00010020011)	KIF23 (ENSGALG00010016498)	PAQR5 (ENSGALG00010016459)	GLCE (ENSGALG00010016452)
Japanese quail	MODERN SPECIES	1	HDDC3 (ENSCJPG00005021147)	TTLL13 (ENSCJPG00005021146)	GDPGP1 (ENSCJPG00005021145)	CIB1 (ENSCJPG00005021144)	SEMA4B (ENSCJPG00005021143)	IDH2 (ENSCJPG00005021141)	ZNF710 (ENSCJPG00005021140)	AP3S2 (ENSCJPG00005021138)	ENSCJPG00005021137	ENSCJPG00005021136	ENSCJPG00005021135	TMED3 (ENSCJPG00005021134) #18	ENSCJPG00005021133	ANPEP (ENSCJPG00005021131)	RASGRF1 (ENSCJPG00005021129) #21	CTSH (ENSCJPG00005021127) #22	BLM (ENSCJPG00005021125)	WDR76 (ENSCJPG00005021123)	FRMD5 (ENSCJPG00005021120)	GOLM2 (ENSCJPG00005021117)	CTDSPL2 (ENSCJPG00005021113)	EIF3J (ENSCJPG00005021111)	SPG11 (ENSCJPG00005021065)	CIAO2A (ENSCJPG00005021059)	ADAMTS7 (ENSCJPG00005021058) #25	MORF4L2 (ENSCJPG00005021057) ##23	UACA (ENSCJPG00005021056)	ENSCJPG00005021054	ENSCJPG00005021053	KIF23 (ENSCJPG00005021004)	PAQR5 (ENSCJPG00005021003)
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT00390000012547.a	ENSGT00940000161170	ENSGT00970000193421.C.b	ENSGT00940000154876.b	ENSGT00530000063712.a.a.g	ENSGT00530000063712.a.a.h	ENSGT01050000244841.A.a.b	ENSGT00730000111185	ENSGT00390000005869.a	ENSGT00390000014273.b	ENSGT00940000164422	ENSGT00940000158423	ENSGT00940000159833 #18	ENSGT00390000012355.B.a	ENSGT00940000157599 #21	ENSGT00940000160227 #22	ENSGT00940000156800	ENSGT00510000048144	ENSGT00940000156346	ENSGT00530000063675.a	ENSGT01040000240503.A.a.a	ENSGT00390000018400	ENSGT00390000016791	ENSGT00390000017697.a	ENSGT00940000159819 #25	ENSGT00950000182965.a.b.b.b #23	ENSGT00950000182965.a.b.b.a ##23	ENSGT00940000157475	ENSGT01030000234519.e.b	ENSGT00940000155837	ENSGT00940000158844
Duck	MODERN SPECIES	2	UNC45A (ENSAPLG00000004720)	MAN2A2 (ENSAPLG00000005234)	TTLL13 (ENSAPLG00000003844)	CIB1 (ENSAPLG00000010975)	SEMA4B (ENSAPLG00000010610)	VPS33B (ENSAPLG00000003869)	IDH2 (ENSAPLG00000027640)	ZNF710 (ENSAPLG00000026218)	AP3S2 (ENSAPLG00000005458)	ANPEP (ENSAPLG00000005574)	ENSAPLG00000017865	TMED3 (ENSAPLG00000006204) #18	ENSAPLG00000019685	ENSAPLG00000017978	RASGRF1 (ENSAPLG00000006206) #21	CTSH (ENSAPLG00000006722) #22	BLM (ENSAPLG00000006878)	WDR76 (ENSAPLG00000007086)	FRMD5 (ENSAPLG00000007330)	GOLM2 (ENSAPLG00000007781)	CTDSPL2 (ENSAPLG00000007949)	EIF3J (ENSAPLG00000008484)	SPG11 (ENSAPLG00000008622)	CIAO2A (ENSAPLG00000009207)	ADAMTS7 (ENSAPLG00000009285) #25	MORF4L2 (ENSAPLG00000004728) ##23	UACA (ENSAPLG00000004038)	ENSAPLG00000018292	TLE3 (ENSAPLG00000029482)	KIF23 (ENSAPLG00000012518)	ENSAPLG00000025612
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	52	VPS33B (ENSABRG00000004867)	TTLL13 (ENSABRG00000005796)	GDPGP1 (ENSABRG00000005831)	ENSABRG00000005836	SEMA4B (ENSABRG00000005843)	IDH2 (ENSABRG00000005863)	ZNF710 (ENSABRG00000005877)	AP3S2 (ENSABRG00000005881)	ANPEP (ENSABRG00000005895)	ENSABRG00000006916	ENSABRG00000006919	ENSABRG00000006921	TMED3 (ENSABRG00000006924) #18	ENSABRG00000006929	RASGRF1 (ENSABRG00000006932) #21	CTSH (ENSABRG00000006940) #22	BLM (ENSABRG00000006971)	WDR76 (ENSABRG00000007002)	FRMD5 (ENSABRG00000007028)	GOLM2 (ENSABRG00000007038)	CTDSPL2 (ENSABRG00000007046)	EIF3J (ENSABRG00000007056)	SPG11 (ENSABRG00000007060)	CIAO2A (ENSABRG00000007077)	ADAMTS7 (ENSABRG00000007081) #25	MORF4L1 (ENSABRG00000007094) #23	UACA (ENSABRG00000007097)	ENSABRG00000007124	KIF23 (ENSABRG00000007848)	PAQR5 (ENSABRG00000007901)	GLCE (ENSABRG00000007906)