Chordata DUPLICATION Chordata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182908.C #22 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES 143 ENSGT00940000157121 #13 ENSGT00390000004280 #18 ENSGT00950000182908.C #22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 239 ENSGT00940000154107 ENSGT00940000154995 ENSGT00940000156869 #10 ENSGT00940000157121 #13 ENSGT00940000155660.b #14 ENSGT00530000063480.b #16 ENSGT00530000063609.b #17 ENSGT00390000004280 #18 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.b ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 #7 ENSGT00530000063528.A.b #8 ENSGT00940000156869 #10 ENSGT00940000157121 #13 ENSGT00940000155660.b #14 ENSGT00530000063480.b #16 ENSGT00530000063609.b #17 ENSGT00390000004280 #18 ENSGT00390000009313 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.b ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 #7 ENSGT00530000063528.A.b #8 ENSGT00940000156869 #10 ENSGT00940000157121 #13 ENSGT00940000155660.b #14 ENSGT00530000063480.b #16 ENSGT00530000063609.b #17 ENSGT00390000004280 #18 ENSGT00390000009313 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00940000171365 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000154107.b ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 #7 ENSGT00530000063528.A.b #8 ENSGT00940000156869 #10 ENSGT00390000008096.D ##11 ENSGT00940000157121 #13 ENSGT00940000155660.b #14 ENSGT00530000063480.b #16 ENSGT00530000063609.b #17 ENSGT00390000004280 #18 ENSGT00390000009313 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT00940000154534.b.b ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a Amniota ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000155660.b #14 ENSGT00530000063480.b #16 ENSGT00530000063609.b #17 ENSGT00390000004280 #18 ENSGT00390000007225 #19 ENSGT00390000009313 ENSGT01030000234590.B.a.b ENSGT00390000000527 ENSGT00390000010184 ENSGT00950000182887.C.a.a.b ENSGT00730000111225 ENSGT00940000155191.b ENSGT00390000009664 ENSGT00390000014721 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT00940000154534.b.b ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00940000171365 ENSGT00390000003635 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 #7 ENSGT00530000063528.A.b #8 ENSGT00940000156869 #10 ENSGT00390000008096.D ##11 ENSGT00940000157121 #13 ENSGT00940000155660.b #14 ENSGT00530000063480.b #16 ENSGT00530000063609.b #17 ENSGT00390000004280 #18 ENSGT00390000007225 #19 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a #25 ENSGT00390000017724.b ##25 ENSGT00940000168676 ENSGT00940000156679 #26 ENSGT00900000143613 ENSGT00390000018500.b #27 ENSGT00940000155892 #28 ENSGT00940000163168 #29 ENSGT00940000155619 #31 ENSGT00390000016225 #32 ENSGT00940000156421 #33 ENSGT00390000010145.c.b #34 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 #7 ENSGT00530000063528.A.b #8 ENSGT00940000156869 #10 ENSGT00390000008096.D ##11 ENSGT00940000157121 #13 ENSGT00940000155660.b #14 ENSGT00530000063480.b #16 ENSGT00530000063609.b #17 ENSGT00390000004280 #18 ENSGT00390000007225 #19 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a #25 ENSGT00390000017724.b ##25 ENSGT00940000168676 ENSGT00940000156679 #26 ENSGT00900000143613 ENSGT00390000018500.b #27 ENSGT00940000155892 #28 ENSGT00940000163168 #29 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 #31 ENSGT00390000016225 #32 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 #7 ENSGT00530000063528.A.b #8 ENSGT00940000169676 ENSGT00940000156869 #10 ENSGT00390000008096.A #11 ENSGT00940000157121 #13 ENSGT00940000155660.b #14 ENSGT00530000063480.b #16 ENSGT00530000063609.b #17 ENSGT00390000004280 #18 ENSGT00390000007225 #19 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a #25 ENSGT00390000017724.b ##25 ENSGT00940000168676 ENSGT00940000156679 #26 ENSGT00900000143613 ENSGT00390000018500.b #27 ENSGT00940000155892 #28 ENSGT00940000163168 #29 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 #31 ENSGT00390000016225 #32 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 #7 ENSGT00530000063528.A.b #8 ENSGT00940000169676 ENSGT00940000156869 #10 ENSGT00390000008096.A #11 ENSGT00940000157121 #13 ENSGT00940000155660.b #14 ENSGT00530000063480.b #16 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b #17 ENSGT00390000004280 #18 ENSGT00390000007225 #19 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a #25 ENSGT00390000017724.b ##25 ENSGT00940000168676 ENSGT00940000156679 #26 ENSGT00900000143613 ENSGT00390000018500.b #27 ENSGT00940000155892 #28 ENSGT00940000163168 #29 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 #31 ENSGT00960000190088 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154337 #7 ENSGT00530000063528.A.b #8 ENSGT00940000169676 ENSGT00940000156869 #10 ENSGT00390000008096.A #11 ENSGT00940000157121 #13 ENSGT00940000155660.b #14 ENSGT00530000063480.b #16 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b #17 ENSGT00390000004280 #18 ENSGT00390000007225 #19 ENSGT00910000148216 ENSGT00940000167515 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00910000148052 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a #25 ENSGT00940000156679 #26 ENSGT00900000143613 ENSGT00390000018500.b #27 ENSGT00940000155892 #28 ENSGT00940000163168 #29 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 #31 ENSGT00960000190088 ENSGT00390000016225 #32 ENSGT00940000156421 #33 Primates ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 #7 ENSGT00530000063528.A.b #8 ENSGT00940000169676 ENSGT00940000156869 #10 ENSGT00390000008096.A #11 ENSGT00940000157121 #13 ENSGT00940000155660.b #14 ENSGT00530000063480.b #16 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b #17 ENSGT00390000004280 #18 ENSGT00390000007225 #19 ENSGT00910000148216 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00910000148052 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a #25 ENSGT00940000156679 #26 ENSGT00390000018500.b #27 ENSGT00940000155892 #28 ENSGT00940000163168 #29 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 #31 ENSGT00390000016225 #32 ENSGT00940000156421 #33 ENSGT00390000010145.c.b #34 ENSGT00940000160525 #36 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 #7 ENSGT00530000063528.A.b #8 ENSGT00940000169676 ENSGT00940000156869 #10 ENSGT00390000008096.A #11 ENSGT00940000157121 #13 ENSGT00940000155660.b #14 ENSGT00530000063480.b #16 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b #17 ENSGT00390000004280 #18 ENSGT00390000007225 #19 ENSGT00910000148216 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00910000148052 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a #25 ENSGT00940000156679 #26 ENSGT00390000018500.b #27 ENSGT00940000155892 #28 ENSGT00940000163168 #29 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 #31 ENSGT00390000016225 #32 ENSGT00940000156421 #33 ENSGT00390000010145.c.b #34 ENSGT00940000160525 #36 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 #7 ENSGT00530000063528.A.b #8 ENSGT00940000169676 ENSGT00940000156869 #10 ENSGT00390000008096.A #11 ENSGT00940000157121 #13 ENSGT00940000155660.b #14 ENSGT00530000063480.b #16 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b #17 ENSGT00390000004280 #18 ENSGT00390000007225 #19 ENSGT00910000148216 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00910000148052 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a #25 ENSGT00940000156679 #26 ENSGT00390000018500.b #27 ENSGT00940000155892 #28 ENSGT00940000163168 #29 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 #31 ENSGT00390000016225 #32 ENSGT00940000155351.cb ENSGT00940000156421 #33 ENSGT00390000010145.c.b #34 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 #7 ENSGT00530000063528.A.b #8 ENSGT00940000156869 #10 ENSGT00390000008096.A #11 ENSGT00940000154295.y.a.b ENSGT00390000017004.a.b.j.a ENSGT00940000157121 #13 ENSGT00940000155660.b #14 ENSGT00530000063480.b #16 ENSGT00530000063609.b 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ENSGT00940000156679 #26 ENSGT00390000018500.b #27 ENSGT00940000155892 #28 ENSGT00940000163168 #29 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 #31 ENSGT00390000016225 #32 ENSGT00940000155351.cb ENSGT00940000156421 #33 ENSGT00390000010145.c.b #34 ENSGT00390000008765.r.a.a #35 Marmoset MODERN SPECIES 8 RAB5A (ENSCJAG00000048394) #7 EFHB (ENSCJAG00000003700) #8 ENSCJAG00000069755 #9 KCNH8 (ENSCJAG00000003681) #10 SATB1 (ENSCJAG00000003645) #11 ENSCJAG00000078805 #12 TBC1D5 (ENSCJAG00000003617) #13 PLCL2 (ENSCJAG00000003599) #14 ENSCJAG00000070689 #15 DAZL (ENSCJAG00000039120) #16 RFTN1 (ENSCJAG00000003585) #17 OXNAD1 (ENSCJAG00000003582) #18 DPH3 (ENSCJAG00000072075) #19 ENSCJAG00000072992 #20 GALNT15 (ENSCJAG00000003566) #21 ANKRD28 (ENSCJAG00000003502) #22 BTD (ENSCJAG00000003498) #23 HACL1 (ENSCJAG00000003426) #24 EAF1 (ENSCJAG00000043266) #25 METTL6 (ENSCJAG00000003415) #26 SH3BP5 (ENSCJAG00000080725) #27 CAPN7 (ENSCJAG00000003376) #28 ENSCJAG00000060750 #29 COL6A5 (ENSCJAG00000003344) 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ENSGT00940000160525 #36 Capuchin MODERN SPECIES 24 ENSCCAG00000035359 EFHB (ENSCCAG00000026456) #8 KCNH8 (ENSCCAG00000025449) #10 SATB1 (ENSCCAG00000022150) #11 ENSCCAG00000024995 ENSCCAG00000026605 ENSCCAG00000027964 TBC1D5 (ENSCCAG00000035716) #13 PLCL2 (ENSCCAG00000033228) #14 ENSCCAG00000035747 #16 RFTN1 (ENSCCAG00000024706) #17 OXNAD1 (ENSCCAG00000024384) #18 DPH3 (ENSCCAG00000035148) #19 GALNT15 (ENSCCAG00000030762) #21 ENSCCAG00000035196 ANKRD28 (ENSCCAG00000000718) #22 BTD (ENSCCAG00000030979) #23 HACL1 (ENSCCAG00000026710) #24 COLQ (ENSCCAG00000037774) EAF1 (ENSCCAG00000037268) #25 METTL6 (ENSCCAG00000026438) #26 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 54 KAT2B (ENSSBOG00000028858) PP2D1 (ENSSBOG00000027219) RAB5A (ENSSBOG00000028989) #7 EFHB (ENSSBOG00000020861) #8 ENSSBOG00000023738 KCNH8 (ENSSBOG00000029678) #10 SATB1 (ENSSBOG00000019471) #11 ENSSBOG00000035188 TBC1D5 (ENSSBOG00000018924) #13 PLCL2 (ENSSBOG00000026576) #14 ENSSBOG00000033845 #16 RFTN1 (ENSSBOG00000022881) 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ENSGT00940000154337 #7 ENSGT00530000063528.A.b #8 ENSGT00940000156869 #10 ENSGT00390000008096.A #11 ENSGT00940000157121 #13 ENSGT00940000155660.b #14 ENSGT00530000063480.b.g #16 ENSGT00530000063609.b #17 ENSGT00390000004280 #18 ENSGT00390000007225 #19 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a #25 ENSGT00940000156679 #26 ENSGT00390000018500.b #27 ENSGT00940000155892 #28 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 #31 ENSGT00390000016225 #32 ENSGT00940000156421 #33 ENSGT00390000010145.c.b #34 ENSGT00940000160525 #36 ENSGT00390000016224.j.a.e.b ##37 ENSGT00390000011422 Rhesus MODERN SPECIES 11 SGO1 (ENSMMUG00000020341) KAT2B (ENSMMUG00000020342) PP2D1 (ENSMMUG00000006993) RAB5A (ENSMMUG00000062243) #7 EFHB (ENSMMUG00000018836) #8 KCNH8 (ENSMMUG00000005370) #10 ENSMMUG00000054204 SATB1 (ENSMMUG00000019009) #11 TBC1D5 (ENSMMUG00000023776) #13 PLCL2 (ENSMMUG00000023775) #14 DAZL 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Chat (ENSMOCG00000011050) Ercc6 (ENSMOCG00000018891) Drgx (ENSMOCG00000019746) 3425401B19Rik (ENSMOCG00000019101) Tmem273 (ENSMOCG00000018319) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000007225 #19 ENSGT00390000004280 #18 ENSGT00940000154371.b ENSGT00390000008403.u ENSGT00390000001094.j ENSGT00940000169181 ENSGT00390000003652.c ENSGT00950000183125.b.a.b ENSGT00390000002871 ENSGT01060000248556.A.b ENSGT00940000159449 ENSGT00940000158057 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 76 Uqcc5 (ENSCGRG00001014406) Nt5dc2 (ENSCGRG00001023862) Stab1 (ENSCGRG00001006175) Nisch (ENSCGRG00001023268) Tnnc1 (ENSCGRG00001012338) Sema3g (ENSCGRG00001018192) Phf7 (ENSCGRG00001022887) Bap1 (ENSCGRG00001000294) Dnah1 (ENSCGRG00001004021) Capn7 (ENSCGRG00001019135) #28 Sh3bp5 (ENSCGRG00001011458) #27 Mettl6 (ENSCGRG00001000127) #26 ENSCGRG00001019909 #25 Galnt15 (ENSCGRG00001018867) #21 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ENSGT00390000018500.b #27 ENSGT00940000155892 #28 ENSGT00940000163168 #29 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 #31 ENSGT00390000016225 #32 ENSGT00940000156421 #33 ENSGT00390000010145.c.b #34 ENSGT00940000160525 #36 ENSGT00390000016224.j.a #37 Donkey MODERN SPECIES 13 PP2D1 (ENSEASG00005005822) RAB5A (ENSEASG00005005818) #7 EFHB (ENSEASG00005005815) #8 ENSEASG00005005811 KCNH8 (ENSEASG00005005804) #10 SATB1 (ENSEASG00005005787) #11 TBC1D5 (ENSEASG00005005775) #13 PLCL2 (ENSEASG00005005767) #14 ENSEASG00005005756 #16 RFTN1 (ENSEASG00005005754) #17 OXNAD1 (ENSEASG00005005749) #18 ENSEASG00005025473 ENSEASG00005023827 GALNT15 (ENSEASG00005005743) #21 ENSEASG00005005740 ANKRD28 (ENSEASG00005005733) #22 BTD (ENSEASG00005005732) #23 HACL1 (ENSEASG00005005730) #24 COLQ (ENSEASG00005005725) EAF1 (ENSEASG00005005720) #25 METTL6 (ENSEASG00005005716) #26 ENSEASG00005005713 #27 ENSEASG00005005708 #28 ENSEASG00005005705 #29 ENSEASG00005005678 #30 COL6A6 (ENSEASG00005005653) #31 PIK3R4 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#8 ENSGT00940000156869 #10 ENSGT00390000008096.A #11 ENSGT00940000157121 #13 ENSGT00940000155660.b #14 ENSGT00530000063480.b #16 ENSGT00530000063609.b #17 ENSGT00390000004280 #18 ENSGT00940000169811 ENSGT00390000007225 #19 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a #25 ENSGT00390000018500.b #27 ENSGT00940000155892 #28 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 #31 ENSGT00390000016225 #32 ENSGT00940000156421 #33 ENSGT00390000010145.c.b #34 ENSGT00940000160525 #36 ENSGT00390000016224.j.a #37 ENSGT00390000011422 ENSGT00940000155519 Arabian camel MODERN SPECIES ENSCDRG00005003293 KAT2B (ENSCDRG00005002364) PP2D1 (ENSCDRG00005002250) RAB5A (ENSCDRG00005002235) #7 EFHB (ENSCDRG00005002193) #8 KCNH8 (ENSCDRG00005002155) #10 SATB1 (ENSCDRG00005002136) #11 ENSCDRG00005002109 TBC1D5 (ENSCDRG00005002049) #13 PLCL2 (ENSCDRG00005002032) #14 ENSCDRG00005002024 #16 RFTN1 (ENSCDRG00005002002) #17 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ENSGT00940000156421 #33 ENSGT00390000010145.c.b #34 ENSGT00940000160525 #36 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182908.C #22 Sloth MODERN SPECIES 7660 ANKRD28 (ENSCHOG00000012451) #22 Armadillo MODERN SPECIES 4626 ANKRD28 (ENSDNOG00000024373) #22 ENSDNOG00000041762 HACL1 (ENSDNOG00000033965) #24 ENSDNOG00000005444 #25 METTL6 (ENSDNOG00000038011) #26 SH3BP5 (ENSDNOG00000042790) #27 CAPN7 (ENSDNOG00000013353) #28 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 149 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a #25 ENSGT00940000156679 #26 ENSGT00390000018500.b #27 ENSGT00940000155892 #28 ENSGT00940000163168 #29 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 #31 ENSGT00390000016225 #32 ENSGT00940000156421 #33 ENSGT00390000010145.c.b #34 ENSGT00940000160525 #36 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 153 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 ENSGT00390000017724.a.a #25 ENSGT00940000156679 #26 ENSGT00390000018500.b #27 ENSGT00940000155892 #28 ENSGT00940000163168 #29 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 #31 ENSGT00390000016225 #32 ENSGT00940000156421 #33 ENSGT00390000010145.c.b #34 ENSGT00940000160525 #36 Elephant MODERN SPECIES 9 ANKRD28 (ENSLAFG00000012337) #22 BTD (ENSLAFG00000032188) #23 HACL1 (ENSLAFG00000017216) #24 COLQ (ENSLAFG00000006153) EAF1 (ENSLAFG00000006152) #25 METTL6 (ENSLAFG00000006149) #26 SH3BP5 (ENSLAFG00000014639) #27 CAPN7 (ENSLAFG00000010045) #28 ENSLAFG00000028757 #29 COL6A5 (ENSLAFG00000029126) #30 ENSLAFG00000014767 COL6A6 (ENSLAFG00000004730) #31 PIK3R4 (ENSLAFG00000009809) #32 ATP2C1 (ENSLAFG00000012428) #33 ASTE1 (ENSLAFG00000012435) #34 ENSLAFG00000012436 #36 Hyrax MODERN SPECIES 7212 ANKRD28 (ENSPCAG00000001459) #22 Tenrec MODERN SPECIES 8624 ANKRD28 (ENSETEG00000017760) #22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 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ENSGT00940000171365 ENSGT00390000003635 Archosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 #7 ENSGT00530000063528.A.b #8 ENSGT00940000156869 #10 ENSGT00390000008096.D ##11 ENSGT00940000157121 #13 ENSGT00940000155660.b #14 ENSGT00530000063480.b #16 ENSGT00530000063609.b #17 ENSGT00390000004280 #18 ENSGT00390000007225 #19 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a Aves ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 #7 ENSGT00530000063528.A.b #8 ENSGT00940000156869 #10 ENSGT00390000008096.D ##11 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#24 ENSGT00940000157248 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 Japanese quail MODERN SPECIES 11 ENSCJPG00005012593 SGO1 (ENSCJPG00005012590) KAT2B (ENSCJPG00005012589) PP2D1 (ENSCJPG00005012588) RAB5A (ENSCJPG00005012587) #7 EFHB (ENSCJPG00005012586) #8 KCNH8 (ENSCJPG00005012584) #10 ENSCJPG00005012578 ##11 TBC1D5 (ENSCJPG00005012576) #13 PLCL2 (ENSCJPG00005012574) #14 ENSCJPG00005012572 #16 RFTN1 (ENSCJPG00005012571) #17 OXNAD1 (ENSCJPG00005012570) #18 ENSCJPG00005012569 GALNT15 (ENSCJPG00005012568) #21 ANKRD28 (ENSCJPG00005012567) #22 BTD (ENSCJPG00005012566) #23 HACL1 (ENSCJPG00005012565) #24 COLQ (ENSCJPG00005012564) PLEKHA8 (ENSCJPG00005012563) FKBP14 (ENSCJPG00005012562) SCRN1 (ENSCJPG00005012561) WIPF3 (ENSCJPG00005012560) ENSCJPG00005012557 CHN2 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KAT2B (ENSGALG00010001778) PP2D1 (ENSGALG00010001770) RAB5A (ENSGALG00010001760) #7 EFHB (ENSGALG00010001750) #8 KCNH8 (ENSGALG00010001747) #10 SATB1 (ENSGALG00010001741) ##11 TBC1D5 (ENSGALG00010001521) #13 PLCL2 (ENSGALG00010001512) #14 DAZL (ENSGALG00010002294) #16 RFTN1 (ENSGALG00010002247) #17 OXNAD1 (ENSGALG00010002226) #18 DPH3P1 (ENSGALG00010002206) GALNT15 (ENSGALG00010002159) #21 ANKRD28 (ENSGALG00010002134) #22 BTD (ENSGALG00010002100) #23 HACL1 (ENSGALG00010002084) #24 COLQ (ENSGALG00010002005) PLEKHA8 (ENSGALG00010001969) FKBP14 (ENSGALG00010001386) SCRN1 (ENSGALG00010001380) WIPF3 (ENSGALG00010001368) ENSGALG00010002631 CHN2 (ENSGALG00010001585) CHN2 (ENSGALG00010002992) TRIL (ENSGALG00010001716) CREB5 (ENSGALG00010001711) JAZF1 (ENSGALG00010001458) TAX1BP1 (ENSGALG00010001453) HIBADH (ENSGALG00010001363) Turkey MODERN SPECIES 26 ENSMGAG00000010703 ENSMGAG00000010706 ENSMGAG00000019096 ENSMGAG00000010713 ENSMGAG00000020612 ENSMGAG00000017596 ENSMGAG00000010729 ENSMGAG00000010740 ENSMGAG00000019537 CHN2 (ENSMGAG00000010748) ENSMGAG00000010774 ENSMGAG00000010766 FKBP14 (ENSMGAG00000010782) ENSMGAG00000010801 ENSMGAG00000010790 ANKRD28 (ENSMGAG00000010846) #22 ENSMGAG00000010836 #23 HACL1 (ENSMGAG00000010817) #24 ENSMGAG00000019530 OXNAD1 (ENSMGAG00000010908) #18 ENSMGAG00000020455 #19 GALNT15 (ENSMGAG00000010891) #21 ENSMGAG00000021001 #17 ENSMGAG00000010878 #16 ENSMGAG00000010925 #14 ENSMGAG00000018979 ENSMGAG00000018008 #13 ENSMGAG00000010929 ##11 ENSMGAG00000022453 ##11 ENSMGAG00000019703 #10 ENSMGAG00000010970 #8 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 #7 ENSGT00530000063528.A.b #8 ENSGT00940000156869 #10 ENSGT00390000008096.D ##11 ENSGT00940000157121 #13 ENSGT00940000155660.b #14 ENSGT00530000063480.b #16 ENSGT00530000063609.b #17 ENSGT00390000004280 #18 ENSGT00390000007225 #19 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000160242 ENSGT01080000259642 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 #7 ENSGT00940000156869 #10 ENSGT00390000008096.D ##11 ENSGT00940000157121 #13 ENSGT00940000155660.b #14 ENSGT00530000063480.b #16 ENSGT00530000063609.b #17 ENSGT00390000004280 #18 ENSGT00390000007225 #19 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 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(ENSNNAG00000014691) TRIL (ENSNNAG00000014682) CREB5 (ENSNNAG00000014560) ENSNNAG00000014538 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000160242 ENSGT01080000259642 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 #7 ENSGT00940000156869 #10 ENSGT00390000008096.D ##11 ENSGT00940000157121 #13 ENSGT00940000155660.b #14 ENSGT00530000063480.b #16 ENSGT00530000063609.b #17 ENSGT00390000004280 #18 ENSGT00390000007225 #19 ENSGT00390000009313.h.b.b ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802.v #24 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000155985.bc.b ENSGT00940000160242 ENSGT01080000259642 ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 #7 ENSGT00940000156869 #10 ENSGT00390000008096.D ##11 ENSGT00940000157121 #13 ENSGT00940000155660.b #14 ENSGT00530000063480.b #16 ENSGT00530000063609.b #17 ENSGT00390000004280 #18 ENSGT00390000007225 #19 ENSGT00390000009313.h.b.b ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802.v #24 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 55 ZNF385D (ENSNSUG00000010394) ENSNSUG00000010439 ENSNSUG00000010440 PP2D1 (ENSNSUG00000010441) RAB5A (ENSNSUG00000010442) #7 KCNH8 (ENSNSUG00000010443) #10 ENSNSUG00000010445 ##11 ENSNSUG00000010446 ##11 TBC1D5 (ENSNSUG00000010455) #13 PLCL2 (ENSNSUG00000011589) #14 ENSNSUG00000011599 #16 RFTN1 (ENSNSUG00000011600) #17 OXNAD1 (ENSNSUG00000011609) #18 DPH3 (ENSNSUG00000011618) 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COLQ (ENSACAG00000002275) PLEKHA8 (ENSACAG00000000988) FKBP14 (ENSACAG00000000953) ENSACAG00000041098 SCRN1 (ENSACAG00000000877) WIPF3 (ENSACAG00000000853) ENSACAG00000003118 ENSACAG00000035653 ENSACAG00000003100 ENSACAG00000043597 ENSACAG00000003049 ENSACAG00000002991 GGCT (ENSACAG00000002984) Laterata DUPLICATION Laterata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182908.C.o #22 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 47 PTPN20 (ENSSMRG00000022381) MAPK8 (ENSSMRG00000022382) WDFY4 (ENSSMRG00000022383) ENSSMRG00000022384 #22 LRRC18 (ENSSMRG00000022385) ENSSMRG00000022386 VSTM4 (ENSSMRG00000000009) C10orf71 (ENSSMRG00000000095) DRGX (ENSSMRG00000000119) ENSSMRG00000000182 ERCC6 (ENSSMRG00000000194) CXCL12 (ENSSMRG00000000252) TMEM72 (ENSSMRG00000000306) PAOX (ENSSMRG00000000331) MTG1 (ENSSMRG00000000344) CHUK (ENSSMRG00000000367) ENSSMRG00000000410 COG3 (ENSSMRG00000000420) SORBS1 (ENSSMRG00000000518) Laterata ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 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ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858 ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000178886 ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a Osteoglossocephalai DUPLICATION Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00940000157827 ENSGT00940000162033.a.b ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163281.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000163281.b ENSGT00390000005553 ENSGT00940000161409 ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00940000154486.b.a.b ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858 ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a 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#22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT00940000164360.A ENSGT00940000164360.B ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000162818.c.b ENSGT00940000155137.a.b Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000179331 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000177895 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT00940000164360.A ENSGT00940000164360.B ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 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ENSAPOG00000011763 ENSAPOG00000011777 polr1f (ENSAPOG00000011796) ENSAPOG00000011814 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1268 VPS50 (ENSSPAG00000009087) hepacam2 (ENSSPAG00000009192) cdk6 (ENSSPAG00000009221) ENSSPAG00000009265 ENSSPAG00000009318 ENSSPAG00000009343 #22 btd (ENSSPAG00000009441) #23 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT00990000204445.a ENSGT00940000159917 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000177895 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT00940000164360.A ENSGT00940000164360.B ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000162818.c.b ENSGT00980000199528 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT00990000204445.a ENSGT00940000159917 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000177895 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT00940000164360.A ENSGT00940000164360.B ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000162818.c.b ENSGT00980000199528 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00940000158874 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b.d ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380.sd 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ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT00940000164360.A ENSGT00940000164360.B ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT01100000263568.b.a.c.a.m Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000158874 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT00940000159917 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a.ab.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT00940000164360.A ENSGT00940000164360.B ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000162818.c.b ENSGT00980000199528 European seabass MODERN SPECIES 22 asb4 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#22 ENSSAUG00010000645 #23 btd (ENSSAUG00010000641) #23 ENSSAUG00010000638 SNX13 (ENSSAUG00010000383) ENSSAUG00010000296 ENSSAUG00010000294 ENSSAUG00010000291 polr1f (ENSSAUG00010000288) ENSSAUG00010000282 fut9b.5 (ENSSAUG00010000280) ENSSAUG00010000276 ENSSAUG00010000270 ENSSAUG00010000267 ENSSAUG00010000264 ITGB8 (ENSSAUG00010000232) Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000158874 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT00940000164360.A ENSGT00940000164360.B ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 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ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000155137.a.b ENSGT00390000000878 ENSGT00390000014833 ENSGT00390000011295.b Climbing perch MODERN SPECIES 2 asb4 (ENSATEG00000028921) PPP1R9A (ENSATEG00000018826) sgce (ENSATEG00000018781) casd1 (ENSATEG00000018704) col1a2 (ENSATEG00000018607) bet1 (ENSATEG00000018582) zgc:85777 (ENSATEG00000018545) gngt1 (ENSATEG00000018505) tfpi2 (ENSATEG00000018500) CALCR (ENSATEG00000018440) VPS50 (ENSATEG00000018309) hepacam2 (ENSATEG00000018255) ENSATEG00000018232 ENSATEG00000025670 ENSATEG00000018204 ENSATEG00000018134 #22 ENSATEG00000018093 #23 ENSATEG00000025329 ENSATEG00000026971 #23 ENSATEG00000026657 ENSATEG00000025632 #23 ENSATEG00000027472 ENSATEG00000017997 ENSATEG00000017981 FERD3L (ENSATEG00000025236) ENSATEG00000027402 ENSATEG00000017939 ITGB8 (ENSATEG00000017924) ENSATEG00000017915 sp4 (ENSATEG00000017885) CDCA7L (ENSATEG00000017881) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 2 asb4 (ENSBSLG00000004720) PPP1R9A (ENSBSLG00000004725) sgce (ENSBSLG00000005066) casd1 (ENSBSLG00000005949) col1a2 (ENSBSLG00000005986) bet1 (ENSBSLG00000007713) zgc:85777 (ENSBSLG00000007815) gngt1 (ENSBSLG00000007952) tfpi2 (ENSBSLG00000007958) CALCR (ENSBSLG00000007989) VPS50 (ENSBSLG00000008430) hepacam2 (ENSBSLG00000010263) cdk6 (ENSBSLG00000010266) ENSBSLG00000010272 ENSBSLG00000010275 ENSBSLG00000010763 #22 ENSBSLG00000011198 btd (ENSBSLG00000011208) #23 ENSBSLG00000011222 SNX13 (ENSBSLG00000011258) ENSBSLG00000012496 FERD3L (ENSBSLG00000012501) polr1f (ENSBSLG00000013049) ENSBSLG00000013085 ITGB8 (ENSBSLG00000013126) ENSBSLG00000013158 sp4 (ENSBSLG00000013198) CDCA7L (ENSBSLG00000013239) RAPGEF5 (ENSBSLG00000013304) ENSBSLG00000013380 TOMM7 (ENSBSLG00000013389) Zig-zag eel MODERN SPECIES 2 asb4 (ENSMAMG00000008961) PPP1R9A (ENSMAMG00000009004) sgce (ENSMAMG00000009047) casd1 (ENSMAMG00000009075) col1a2 (ENSMAMG00000009132) bet1 (ENSMAMG00000009263) zgc:85777 (ENSMAMG00000009237) gngt1 (ENSMAMG00000025870) tfpi2 (ENSMAMG00000009282) CALCR (ENSMAMG00000009295) VPS50 (ENSMAMG00000009354) hepacam2 (ENSMAMG00000009531) CDK6 (ENSMAMG00000025835) ENSMAMG00000009579 ENSMAMG00000027656 ENSMAMG00000009614 #22 ENSMAMG00000009788 #23 ENSMAMG00000026141 ENSMAMG00000009831 ENSMAMG00000009910 ENSMAMG00000028648 ENSMAMG00000010095 ENSMAMG00000010099 ITGB8 (ENSMAMG00000010121) ENSMAMG00000026329 sp4 (ENSMAMG00000010162) CDCA7L (ENSMAMG00000010174) ENSMAMG00000010184 RAPGEF5 (ENSMAMG00000010204) ENSMAMG00000010281 TOMM7 (ENSMAMG00000010590) Carangaria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000158874 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT00940000164360.A ENSGT00940000164360.B ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000162818.c.b ENSGT01100000263568.b.a.c.a Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000158874 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a.p ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT00940000164360.B ENSGT00940000164360.A ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000162818.c.b ENSGT00940000155137.a.b Turbot MODERN SPECIES 14 asb4 (ENSSMAG00000013749) PPP1R9A (ENSSMAG00000013688) sgce (ENSSMAG00000013623) casd1 (ENSSMAG00000013550) col1a2 (ENSSMAG00000013511) bet1 (ENSSMAG00000013500) zgc:85777 (ENSSMAG00000013477) gngt1 (ENSSMAG00000013446) tfpi2 (ENSSMAG00000013402) CALCR (ENSSMAG00000013265) VPS50 (ENSSMAG00000013150) hepacam2 (ENSSMAG00000013127) cdk6 (ENSSMAG00000022076) ENSSMAG00000013092 ENSSMAG00000013075 ENSSMAG00000012923 #22 ENSSMAG00000012914 #23 ENSSMAG00000012904 ENSSMAG00000012807 ENSSMAG00000012801 ENSSMAG00000012799 POLR1F (ENSSMAG00000012792) ENSSMAG00000012774 ENSSMAG00000012770 ENSSMAG00000012764 ENSSMAG00000012707 ENSSMAG00000023368 ENSSMAG00000011362 sp8a (ENSSMAG00000011405) ITGB8 (ENSSMAG00000011367) SP4 (ENSSMAG00000011421) Tongue sole MODERN SPECIES 9 ENSCSEG00000012791 ENSCSEG00000012783 ENSCSEG00000012778 ENSCSEG00000012762 col1a2 (ENSCSEG00000012737) bet1 (ENSCSEG00000012731) zgc:85777 (ENSCSEG00000012715) gngt1 (ENSCSEG00000012711) tfpi2 (ENSCSEG00000012705) CALCR (ENSCSEG00000012673) VPS50 (ENSCSEG00000012607) hepacam2 (ENSCSEG00000012589) cdk6 (ENSCSEG00000012577) fam133b (ENSCSEG00000012571) ENSCSEG00000012570 ENSCSEG00000012525 #22 PPP1R9A (ENSCSEG00000012487) sgce (ENSCSEG00000012445) casd1 (ENSCSEG00000012412) asb4 (ENSCSEG00000012399) pdk4 (ENSCSEG00000012385) DYNC1I1 (ENSCSEG00000012327) ENSCSEG00000012316 dlx6a (ENSCSEG00000012309) dlx5a (ENSCSEG00000012302) ago2 (ENSCSEG00000012273) ENSCSEG00000012240 npy (ENSCSEG00000012223) fam221a (ENSCSEG00000012215) ccdc126 (ENSCSEG00000012212) tra2a (ENSCSEG00000012193) Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 16 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SPECIES 182 ENSHHUG00000005776 l3mbtl3 (ENSHHUG00000005798) tmem200a (ENSHHUG00000006045) ENSHHUG00000006048 EPB41L2 (ENSHHUG00000006063) AKAP7 (ENSHHUG00000006147) med23 (ENSHHUG00000006168) ENSHHUG00000006724 SLC35D3 (ENSHHUG00000006740) hey2 (ENSHHUG00000006755) hddc2 (ENSHHUG00000006770) tpd52l1 (ENSHHUG00000006781) rnf217 (ENSHHUG00000006830) nkain2 (ENSHHUG00000006840) ENSHHUG00000006866 ENSHHUG00000006910 #22 btd (ENSHHUG00000006972) #23 ENSHHUG00000007005 #27 Huchen MODERN SPECIES 3393 ENSHHUG00000001017 ENSHHUG00000000999 ENSHHUG00000000973 ENSHHUG00000000960 SNX13 (ENSHHUG00000000397) ENSHHUG00000000343 #22 Huchen MODERN SPECIES 7886 ENSHHUG00000021027 #22 ENSHHUG00000021021 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 224 ENSGT00390000014833 ENSGT00390000011295.b ENSGT00800000125328 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000157827 ENSGT00940000162033.a.b.a ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000163281.b ENSGT00390000005553 ENSGT00940000161409 ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 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(ENSCARG00000035583) ENSCARG00000035570 ENSCARG00000035557 #22 btd (ENSCARG00000035550) #23 SH3BP5 (ENSCARG00000035531) #27 mturn (ENSCARG00000035518) znrf2a (ENSCARG00000035502) ENSCARG00000035484 ggcta (ENSCARG00000035468) snrpd1 (ENSCARG00000035461) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 644 ENSGT00940000155137.b.c ENSGT00940000178859.a ENSGT00390000014833.s ENSGT00390000011295.b.i ENSGT00800000125328 ENSGT00940000159108.c ENSGT00940000157827.m.a ENSGT00940000162033.a.b.a.b ENSGT01090000259987.b.a.d ENSGT00940000163281.b.c ENSGT00390000005553.g ENSGT00940000163428.b.a.j.b ENSGT00940000166341.u.b ENSGT00950000182856.a.a.a.r ENSGT00950000182908.C.a.j.b #22 Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 3314 ENSCARG00000049416 #22 Goldfish MODERN SPECIES 38 nup42 (ENSCARG00000044818) cyp51 (ENSCARG00000043458) tmem79a (ENSCARG00000043395) ENSCARG00000043374 il6 (ENSCARG00000043341) TOMM7 (ENSCARG00000043304) hycc1 (ENSCARG00000043034) sp4 (ENSCARG00000042972) sp8a (ENSCARG00000042957) ENSCARG00000042914 ENSCARG00000042881 twist1a (ENSCARG00000042851) SNX13 (ENSCARG00000040999) ENSCARG00000040962 ENSCARG00000040954 ENSCARG00000040894 #22 ENSCARG00000040861 ENSCARG00000040841 ENSCARG00000040829 ST3GAL1 (ENSCARG00000040814) ENSCARG00000040805 eno2 (ENSCARG00000040759) tpi1a (ENSCARG00000040724) gnb3b (ENSCARG00000040701) ENSCARG00000040677 stx1b (ENSCARG00000040639) prf1.3 (ENSCARG00000040625) ENSCARG00000040590 si:dkeyp-113d7.1 (ENSCARG00000040581) ENSCARG00000040556 krtt1c19e (ENSCARG00000040524) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000178859.a ENSGT00390000014833.s ENSGT00390000011295.b.i ENSGT00800000125328 ENSGT00940000159108.c ENSGT00940000157827.n ENSGT00940000157827.m.a ENSGT00940000162033.a.b.a.b ENSGT01090000259987.b.a.d ENSGT00940000163281.b.c ENSGT00390000005553.g ENSGT00940000161409.d ENSGT00940000163428.b.a.j.b ENSGT00940000166341.u.b ENSGT00950000182856.a.a.a.r ENSGT00950000182908.C.a.j.b #22 ENSGT00950000182908.C.a.j.a.a #22 ENSGT00390000018500.b.b.b.a #27 ENSGT00500000045044.h ENSGT00940000159017.a.b.a.b ENSGT01100000263547.a.b.b.b.b.a.b.a.a.a.b.a.a.a.a.a ENSGT01090000260586 ENSGT00510000047245.nb ENSGT00530000063461.A.b.d ENSGT00550000074698.a.a ENSGT00550000074698.b ENSGT00940000155113.a.a.b.a.a ENSGT00940000155784.C.u.b.a ENSGT00940000155602 ENSGT00940000157780.rb.a ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b.c Golden-line barbel MODERN SPECIES 1756 SNX13 (ENSSGRG00000026617) ENSSGRG00000027438 #22 ENSSGRG00000027439 #22 ENSSGRG00000027440 #22 SH3BP5 (ENSSGRG00000027441) #27 mturn (ENSSGRG00000027536) znrf2a (ENSSGRG00000027538) ENSSGRG00000027541 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 172 ENSGT00390000000118 ENSGT00940000155602 ENSGT00940000155137.a.b ENSGT00390000014833 ENSGT00390000011295.b ENSGT00940000159108 ENSGT00940000157827 ENSGT00940000162033.a.b.a ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000163281.b ENSGT00390000005553 ENSGT00940000161409 ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00390000018500.b.b.b #27 ENSGT00500000045044 ENSGT00940000159017.a.b ENSGT00500000044921.a ENSGT00510000047245.mb ENSGT00730000111394 ENSGT00940000176166 ENSGT00940000154870.A.b ENSGT00400000025005 ENSGT00990000204388 ENSGT00940000158522.m ENSGT00950000182919.B.a.h ENSGT00940000159283.c.a Atlantic herring MODERN SPECIES 10 klhl7 (ENSCHAG00000000744) RAPGEF5 (ENSCHAG00000000509) ENSCHAG00000022506 TOMM7 (ENSCHAG00000022494) hycc1 (ENSCHAG00000022476) CDCA7L (ENSCHAG00000022456) sp4 (ENSCHAG00000022425) sp8a (ENSCHAG00000022415) ITGB8 (ENSCHAG00000022224) ENSCHAG00000022201 polr1f (ENSCHAG00000022198) FERD3L (ENSCHAG00000022187) twist1a (ENSCHAG00000022174) ENSCHAG00000022131 SNX13 (ENSCHAG00000021540) ANKRD28 (ENSCHAG00000017321) #22 btd (ENSCHAG00000017074) #23 SH3BP5 (ENSCHAG00000016955) #27 mturn (ENSCHAG00000016924) znrf2a (ENSCHAG00000016885) ggcta (ENSCHAG00000016657) snrpd1 (ENSCHAG00000016617) thap7 (ENSCHAG00000016585) ENSCHAG00000016559 s100v2 (ENSCHAG00000016552) ENSCHAG00000016441 ENSCHAG00000016423 ENSCHAG00000016417 ENSCHAG00000016413 ENSCHAG00000016394 polr3gla (ENSCHAG00000016381) Denticle herring MODERN SPECIES 12 CDCA7L (ENSDCDG00000027486) sp4 (ENSDCDG00000027489) ENSDCDG00000027491 ITGB8 (ENSDCDG00000027510) ENSDCDG00000028181 polr1f (ENSDCDG00000028182) TWIST1 (ENSDCDG00000028183) ENSDCDG00000028184 ENSDCDG00000028187 ENSDCDG00000028191 ENSDCDG00000028214 polr1f (ENSDCDG00000028215) TWIST1 (ENSDCDG00000028216) ENSDCDG00000028218 SNX13 (ENSDCDG00000028231) ANKRD28 (ENSDCDG00000028605) #22 btd (ENSDCDG00000032115) #23 SH3BP5 (ENSDCDG00000032120) #27 mturn (ENSDCDG00000032123) znrf2a (ENSDCDG00000032125) ggcta (ENSDCDG00000032126) snrpd1 (ENSDCDG00000032128) thap7 (ENSDCDG00000032131) si:ch211-195b13.1 (ENSDCDG00000032161) eya3 (ENSDCDG00000032708) ENSDCDG00000032799 ENSDCDG00000032801 xkr8.3 (ENSDCDG00000032803) ENSDCDG00000032804 ENSDCDG00000032806 ENSDCDG00000032807 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000011295.b ENSGT00390000014833 ENSGT01030000235040 ENSGT00940000155137.a.b ENSGT00940000159108.i ENSGT00940000157827.g ENSGT00940000162033.a.b ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00390000013151.a.b.f ENSGT00940000163281.b ENSGT00390000005553 ENSGT00940000161409 ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000157248.c.b Asian bonytongue MODERN SPECIES 15 hycc1 (ENSSFOG00015012478) TOMM7 (ENSSFOG00015032890) ENSSFOG00015012577 RAPGEF5 (ENSSFOG00015012593) CDCA7L (ENSSFOG00015012653) sp4 (ENSSFOG00015032600) sp8a (ENSSFOG00015028849) ITGB8 (ENSSFOG00015012748) macc1 (ENSSFOG00015012762) ENSSFOG00015012775 polr1f (ENSSFOG00015012788) FERD3L (ENSSFOG00015025160) twist1a (ENSSFOG00015012815) ENSSFOG00015032351 SNX13 (ENSSFOG00015012849) ANKRD28 (ENSSFOG00015012994) #22 btd (ENSSFOG00015013192) #23 COLQ (ENSSFOG00015013200) ENSSFOG00015013224 ENSSFOG00015013229 ENSSFOG00015013247 ENSSFOG00015013274 TRIL (ENSSFOG00015013322) CREB5 (ENSSFOG00015013343) JAZF1 (ENSSFOG00015021725) tax1bp1a (ENSSFOG00015013406) hibadhb (ENSSFOG00015030994) evx1 (ENSSFOG00015030473) hoxa13a (ENSSFOG00015013482) hoxa11a (ENSSFOG00015013545) hoxa10b (ENSSFOG00015013555) Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000157827 ENSGT00940000162033.a.b ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163281.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000163281.b ENSGT00390000005553 ENSGT00940000161409 ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00940000154486.b.a.b ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858 ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00390000011295.b ENSGT00390000014833 ENSGT00390000000878 ENSGT00940000155137.b ENSGT00940000155137.a.b ENSGT00940000159108 ENSGT00940000157827 ENSGT00940000162033.a.b ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000163281.b ENSGT00390000005553 ENSGT00940000161409 ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00940000154486.b.a.b ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00390000018500.b.b.b #27 ENSGT00500000045044 ENSGT00940000159017.a.b ENSGT00650000093438 ENSGT00390000009631 ENSGT00940000169325 ENSGT00940000157432.B ENSGT01000000214440.A.a.a ENSGT00940000164984 ENSGT00940000157640 ENSGT00940000162584.j ENSGT00940000159017.a.a Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 224 ENSGT00940000155602 ENSGT00940000155137.a.b ENSGT00390000014833 ENSGT00390000011295.b ENSGT00800000125328 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000157827 ENSGT00940000162033.a.b.a ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000163281.b ENSGT00390000005553 ENSGT00940000161409 ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00940000154486.b.a.b ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00390000018500.b.b.b #27 ENSGT00500000045044 ENSGT00940000159017.a.b ENSGT00500000044921.a ENSGT00510000047245 ENSGT00940000155579.a Otophysi ANCESTRAL SPECIES 170 ENSGT00940000155137.b.c ENSGT00940000178859 ENSGT00390000014833 ENSGT00390000011295.b ENSGT00800000125328 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000157827 ENSGT00940000162033.a.b.a ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000163281.b ENSGT00390000005553 ENSGT00940000161409 ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00940000154486.b.a.b ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000178869 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00390000018500.b.b.b #27 ENSGT00500000045044 ENSGT00940000159017.a.b ENSGT00500000044921.a ENSGT00510000047245 ENSGT00530000063461.A.b ENSGT00550000074698.b ENSGT00940000155113.a.a.b ENSGT00940000155784.C.u.b ENSGT00940000155602 ENSGT00940000157780 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000177026 ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650.e ENSGT00940000164650.f ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00940000155287 ENSGT00390000013151.a.b ENSGT01060000253044 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000178869 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT00760000119737.b ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.a Channel catfish MODERN SPECIES Slc6a19 (ENSIPUG00000001817) SLC6A18 (ENSIPUG00000001855) ENSIPUG00000001866 ENSIPUG00000001873 ENSIPUG00000001882 DNAH11 (ENSIPUG00000001945) sp8b (ENSIPUG00000002254) ENSIPUG00000002262 macc1 (ENSIPUG00000002290) ENSIPUG00000002297 hbb (ENSIPUG00000002316) hbae (ENSIPUG00000002404) twist1 (ENSIPUG00000002432) hdac9b (ENSIPUG00000002452) ahr (ENSIPUG00000002501) ankrd28 (ENSIPUG00000002544) #22 ENSIPUG00000002675 hacl1 (ENSIPUG00000002681) #24 colq (ENSIPUG00000002698) plekha8 (ENSIPUG00000002723) FKBP14 (ENSIPUG00000002766) ENSIPUG00000002780 chn2 (ENSIPUG00000002792) CPVL (ENSIPUG00000002845) creb5 (ENSIPUG00000002879) ENSIPUG00000002901 jazf1 (ENSIPUG00000002919) tax1bp1 (ENSIPUG00000002965) hibadh (ENSIPUG00000003016) hoxa13b (ENSIPUG00000003037) hoxa11 (ENSIPUG00000003074) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155137.b.d ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00940000155287 ENSGT00390000013151.a.b ENSGT01060000253044 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT00760000119737.b ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.a ENSGT00940000164628 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 329 ENSGT00940000162033.a.b.b ENSGT00940000166052 ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163281.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000166341 ENSGT00940000154486.b.a.b ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000178869 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 738 macc1 (ENSPNAG00000015846) ENSPNAG00000015854 ENSPNAG00000015873 hdac9b (ENSPNAG00000015973) ahr1a (ENSPNAG00000016149) ENSPNAG00000016222 #22 ENSPNAG00000003411 Mexicana tetra MODERN SPECIES 25 abcd4 (ENSAMXG00000004384) KLHL14 (ENSAMXG00000043692) ENSAMXG00000044115 dtna (ENSAMXG00000004333) mapre2 (ENSAMXG00000033250) SPIDR (ENSAMXG00000034318) cebpd (ENSAMXG00000037523) mcm4 (ENSAMXG00000004298) ube2v2 (ENSAMXG00000041649) snai2 (ENSAMXG00000038235) SNTG1 (ENSAMXG00000032073) pcmtd1 (ENSAMXG00000004269) ENSAMXG00000035774 ENSAMXG00000041785 RB1CC1 (ENSAMXG00000004228) ENSAMXG00000043688 #22 Electric eel MODERN SPECIES 39 rapgef5b (ENSEEEG00000013688) ENSEEEG00000013689 DNAH11 (ENSEEEG00000013712) sp8b (ENSEEEG00000013842) ENSEEEG00000013867 ENSEEEG00000014088 macc1 (ENSEEEG00000014089) ENSEEEG00000014091 twist1b (ENSEEEG00000014093) hdac9b (ENSEEEG00000014099) ANKRD28 (ENSEEEG00000014197) #22 hacl1 (ENSEEEG00000014667) #24 COLQ (ENSEEEG00000014684) plekha8 (ENSEEEG00000014685) fkbp14 (ENSEEEG00000014686) ENSEEEG00000014687 CHN2 (ENSEEEG00000014689) ENSEEEG00000014690 cpvl (ENSEEEG00000014691) CREB5 (ENSEEEG00000014694) JAZF1 (ENSEEEG00000014697) ENSEEEG00000014702 ENSEEEG00000014703 hibadhb (ENSEEEG00000014704) hoxa13b (ENSEEEG00000014718) hoxa11b (ENSEEEG00000014719) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000157527.b ENSGT00940000155137.a.b ENSGT00940000178859 ENSGT00390000014833 ENSGT00390000011295.b ENSGT00800000125328 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000157827 ENSGT00940000162033.a.b.a ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000163281.b ENSGT00390000005553 ENSGT00940000161409 ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000178869 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00390000018500.b.b.b #27 ENSGT00500000045044 ENSGT00940000159017.a.b.a ENSGT01100000263547.a.b.b.b.b.a.b.a.a.a.b.a.a ENSGT00500000044921.a ENSGT00510000047245 ENSGT00530000063461.A.b ENSGT00550000074698.b ENSGT00940000155113.a.a.b ENSGT00940000155784.C.u.b ENSGT00940000155602 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 184 ENSGT00940000177026.b ENSGT00390000008061.j.b.c.b.b ENSGT01000000216736 ENSGT00940000159208.B.b ENSGT00940000154807.a.a.eb ENSGT00940000154896.l.a.b ENSGT00940000164650.g.b ENSGT00940000155137.a.a.a.a ENSGT00940000162033.a.a.a ENSGT00940000166052 ENSGT00390000013151.a.b.j ENSGT00940000163281.a.b 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(ENSCARG00000037973) cpvl (ENSCARG00000037316) ENSCARG00000037247 CREB5 (ENSCARG00000037074) JAZF1 (ENSCARG00000037004) tax1bp1b (ENSCARG00000036964) hibadhb (ENSCARG00000036861) hoxa13b (ENSCARG00000036849) hoxa11b (ENSCARG00000036840) hoxa10b (ENSCARG00000036829) hoxa9b (ENSCARG00000036819) hoxa2b (ENSCARG00000036803) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000154807.a.a.eb ENSGT00940000154896.l.a.b ENSGT00940000164650.g.b ENSGT00940000155137.a.a.a.a ENSGT00940000164650.h ENSGT00940000155137.b.d ENSGT00940000155137.a.a.b ENSGT00940000158880.ob ENSGT00940000162033.a.a.a ENSGT00940000166052 ENSGT00390000013151.a.b.j ENSGT00940000163281.a.b ENSGT00940000163428.b.a.i.b ENSGT00940000166341.v.a ENSGT00940000154486.b.a.b.a ENSGT00950000182908.C.b.a #22 ENSGT00940000157248.c.a.b ENSGT00940000157288.m ENSGT00940000157858.i.a ENSGT01030000234635.a.b.a.a.b ENSGT00940000159498.b ENSGT00940000156420.a.a.h ENSGT00390000003635.h.d ENSGT00950000183025.b.a.`b.b ENSGT00940000155255.cb 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ENSGT00940000159498.a ENSGT00940000156420.a.a.g ENSGT00390000003635.h.c ENSGT00950000183025.b.a.`b.a ENSGT00940000155255.bb ENSGT00940000164071.b.a.a ENSGT00940000158311.b.b ENSGT00940000163268.d.a.a Golden-line barbel MODERN SPECIES 221 ENSSGRG00000015030 rxrbb (ENSSGRG00000015038) FHOD3 (ENSSGRG00000015130) slc6a19b (ENSSGRG00000015150) ENSSGRG00000015295 ENSSGRG00000015313 ENSSGRG00000015342 ENSSGRG00000015345 sp8b (ENSSGRG00000015346) ENSSGRG00000015364 macc1 (ENSSGRG00000017156) ENSSGRG00000017157 twist1b (ENSSGRG00000017158) hdac9b (ENSSGRG00000017162) ahr1a (ENSSGRG00000017174) ANKRD28 (ENSSGRG00000017910) #22 hacl1 (ENSSGRG00000020067) #24 plekha8 (ENSSGRG00000020120) fkbp14 (ENSSGRG00000020246) ENSSGRG00000020247 CHN2 (ENSSGRG00000020252) cpvl (ENSSGRG00000020303) CREB5 (ENSSGRG00000020355) JAZF1 (ENSSGRG00000020357) tax1bp1b (ENSSGRG00000020360) hibadhb (ENSSGRG00000020361) hoxa13b (ENSSGRG00000020364) hoxa11b (ENSSGRG00000020365) hoxa10b (ENSSGRG00000020366) hoxa9b (ENSSGRG00000020367) hoxa2b (ENSSGRG00000020369) Common carp reference MODERN SPECIES 47 ENSCCRG00000055645 ENSCCRG00000028906 rxrbb (ENSCCRG00000054882) ENSCCRG00000004830 slc6a19b (ENSCCRG00000050108) ENSCCRG00000029523 ENSCCRG00000034703 DNAH11 (ENSCCRG00000037634) sp8b (ENSCCRG00000060103) ENSCCRG00000058546 macc1 (ENSCCRG00000021557) ENSCCRG00000077612 hdac9b (ENSCCRG00000027316) twist1b (ENSCCRG00000056709) ahr1a (ENSCCRG00000021084) ANKRD28 (ENSCCRG00000018690) #22 ENSCCRG00000018651 hacl1 (ENSCCRG00000018645) #24 COLQ (ENSCCRG00000053136) plekha8 (ENSCCRG00000018609) fkbp14 (ENSCCRG00000073955) ENSCCRG00000018596 CHN2 (ENSCCRG00000053278) cpvl (ENSCCRG00000008840) CREB5 (ENSCCRG00000055556) JAZF1 (ENSCCRG00000064899) tax1bp1b (ENSCCRG00000073078) hibadhb (ENSCCRG00000063298) hoxa13b (ENSCCRG00000004452) hoxa11b (ENSCCRG00000004438) hoxa10b (ENSCCRG00000042776) Goldfish MODERN SPECIES 7 ENSCARG00000031553 ENSCARG00000031549 ENSCARG00000031541 rxrbb (ENSCARG00000031149) FHOD3 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ENSDCDG00000004949 ENSDCDG00000004950 #22 ENSDCDG00000004967 slc6a19b (ENSDCDG00000005047) ENSDCDG00000008381 rxrbb (ENSDCDG00000008486) ENSDCDG00000008610 ENSDCDG00000008636 ENSDCDG00000008656 PTP4A3 (ENSDCDG00000008668) ENSDCDG00000008754 ENSDCDG00000009194 DGAT1 (ENSDCDG00000009258) SLC45A4 (ENSDCDG00000009376) ENSDCDG00000009387 MRS2 (ENSDCDG00000010545) ENSDCDG00000010586 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT00940000155739 ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00940000166052 ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163281.a ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00940000154486.b.a.b ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858.i ENSGT00760000119737 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a 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killifish MODERN SPECIES 1614 KCNK5B (ENSNFUG00015002456) ENSNFUG00015002451 ENSNFUG00015002305 CK2B (ENSNFUG00015002253) AIF1 (ENSNFUG00015002243) ENSNFUG00015002227 RXRBB (ENSNFUG00015002175) FHOD3 (ENSNFUG00015001811) ENSNFUG00015001687 ENSNFUG00015001653 ENSNFUG00015001462 macc1 (ENSNFUG00015001453) TWIST1 (ENSNFUG00015001445) hdac9b (ENSNFUG00015001430) ENSNFUG00015001412 ANKRD28 (ENSNFUG00015001085) #22 ENSNFUG00015000965 hacl1 (ENSNFUG00015000945) #24 COLQ (ENSNFUG00015000936) PLEKHA8 (ENSNFUG00015000887) FKBP14 (ENSNFUG00015000869) CHN2 (ENSNFUG00015000744) ccdc12 (ENSNFUG00015000660) TMEM104 (ENSNFUG00015000650) ENSNFUG00015000641 GRIN2CA (ENSNFUG00015000576) ENSNFUG00015000521 ENSNFUG00015000516 ENSNFUG00015000512 ENSNFUG00015000507 RBFOX3L (ENSNFUG00015000470) Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT01030000235045 ENSGT00940000155739 ENSGT00950000183411 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a 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ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154807.b ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00940000156420.b ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01030000235045 ENSGT00940000155739.tb ENSGT00950000183411 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154807.b ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00940000156420.b ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01030000235045 ENSGT00940000155739.tb ENSGT00950000183411 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154807.b ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a 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ENSHBUG00000018814 rxrbb (ENSHBUG00000018792) FHOD3 (ENSHBUG00000018710) ENSHBUG00000018690 ENSHBUG00000018677 ENSHBUG00000018623 ENSHBUG00000018573 sp8b (ENSHBUG00000018357) macc1 (ENSHBUG00000018346) twist1b (ENSHBUG00000018336) hdac9b (ENSHBUG00000018280) ANKRD28 (ENSHBUG00000018150) #22 hacl1 (ENSHBUG00000018057) #24 COLQ (ENSHBUG00000017971) plekha8 (ENSHBUG00000017938) fkbp14 (ENSHBUG00000017848) CHN2 (ENSHBUG00000017824) cpvl (ENSHBUG00000017759) CREB5 (ENSHBUG00000001119) JAZF1 (ENSHBUG00000017624) tax1bp1b (ENSHBUG00000017598) hibadhb (ENSHBUG00000017577) hoxa13b (ENSHBUG00000017566) hoxa11b (ENSHBUG00000017560) ENSHBUG00000017556 hoxa9b (ENSHBUG00000017541) hoxa2b (ENSHBUG00000017536) Lyretail cichlid MODERN SPECIES 369 c4b (ENSNBRG00000017736) c4b (ENSNBRG00000017518) ENSNBRG00000017447 rxrbb (ENSNBRG00000017426) FHOD3 (ENSNBRG00000017399) ENSNBRG00000017385 ENSNBRG00000017379 ENSNBRG00000017349 ENSNBRG00000017320 ENSNBRG00000017281 DNAH11 (ENSNBRG00000017134) sp8b 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COLQ (ENSONIG00000002914) plekha8 (ENSONIG00000002916) fkbp14 (ENSONIG00000002921) CHN2 (ENSONIG00000002925) cpvl (ENSONIG00000002938) CREB5 (ENSONIG00000002945) JAZF1 (ENSONIG00000004607) tax1bp1b (ENSONIG00000002952) hibadhb (ENSONIG00000002955) hoxa13b (ENSONIG00000002962) hoxa11b (ENSONIG00000002963) ENSONIG00000002964 hoxa9b (ENSONIG00000002965) hoxa2b (ENSONIG00000002966) Midas cichlid MODERN SPECIES 303 ENSACIG00000017580 c4b (ENSACIG00000017508) c4b (ENSACIG00000017425) c4b (ENSACIG00000017277) rxrbb (ENSACIG00000017241) FHOD3 (ENSACIG00000017221) ENSACIG00000017212 ENSACIG00000017209 ENSACIG00000017178 RAPGEF5 (ENSACIG00000017155) DNAH11 (ENSACIG00000016892) sp8b (ENSACIG00000016834) macc1 (ENSACIG00000016818) twist1b (ENSACIG00000016767) hdac9b (ENSACIG00000016677) ANKRD28 (ENSACIG00000016624) #22 hacl1 (ENSACIG00000016585) #24 COLQ (ENSACIG00000016565) plekha8 (ENSACIG00000016533) fkbp14 (ENSACIG00000016522) CHN2 (ENSACIG00000016488) cpvl (ENSACIG00000016460) CREB5 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Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000003781.e.a ENSGT00390000013846.a.b ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 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ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Climbing perch MODERN SPECIES 7 ENSATEG00000008239 ENSATEG00000008144 ENSATEG00000008129 ENSATEG00000008074 ENSATEG00000008038 c4b (ENSATEG00000007852) rxrbb (ENSATEG00000007788) ENSATEG00000007774 ENSATEG00000007695 ENSATEG00000007586 DNAH11 (ENSATEG00000006948) sp8b (ENSATEG00000006843) macc1 (ENSATEG00000006829) twist1b (ENSATEG00000006779) hdac9b (ENSATEG00000006720) ANKRD28 (ENSATEG00000006576) #22 hacl1 (ENSATEG00000006565) #24 COLQ (ENSATEG00000025574) plekha8 (ENSATEG00000006488) fkbp14 (ENSATEG00000006455) CHN2 (ENSATEG00000006387) cpvl (ENSATEG00000006320) CREB5 (ENSATEG00000006306) JAZF1 (ENSATEG00000006282) tax1bp1b (ENSATEG00000006270) hibadhb (ENSATEG00000006226) hoxa13b (ENSATEG00000006127) hoxa11b (ENSATEG00000006040) ENSATEG00000006005 hoxa9b (ENSATEG00000005978) hoxa2b (ENSATEG00000005962) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 7 ENSBSLG00000025778 csnk2b (ENSBSLG00000025759) AIF1 (ENSBSLG00000025749) ENSBSLG00000025736 ENSBSLG00000025731 rxrbb (ENSBSLG00000025583) FHOD3 (ENSBSLG00000025484) SLC6A19 (ENSBSLG00000025442) ENSBSLG00000025413 ENSBSLG00000025395 DNAH11 (ENSBSLG00000024801) sp8b (ENSBSLG00000024778) macc1 (ENSBSLG00000024774) twist1b (ENSBSLG00000024765) hdac9b (ENSBSLG00000024733) ANKRD28 (ENSBSLG00000023994) #22 hacl1 (ENSBSLG00000023602) #24 COLQ (ENSBSLG00000023554) plekha8 (ENSBSLG00000023540) fkbp14 (ENSBSLG00000023475) CHN2 (ENSBSLG00000023238) cpvl (ENSBSLG00000023204) CREB5 (ENSBSLG00000023199) JAZF1 (ENSBSLG00000023176) tax1bp1b (ENSBSLG00000023142) hibadhb (ENSBSLG00000023113) hoxa13b (ENSBSLG00000023107) hoxa11b (ENSBSLG00000023103) ENSBSLG00000023098 hoxa9b (ENSBSLG00000023091) hoxa2b (ENSBSLG00000023087) Zig-zag eel MODERN SPECIES 7 ENSMAMG00000015069 ENSMAMG00000015044 ENSMAMG00000014967 ENSMAMG00000014882 c4b (ENSMAMG00000014759) rxrbb (ENSMAMG00000014664) ENSMAMG00000014726 ENSMAMG00000014586 ENSMAMG00000014575 ENSMAMG00000014490 DNAH11 (ENSMAMG00000014344) sp8b (ENSMAMG00000014328) macc1 (ENSMAMG00000014319) twist1b (ENSMAMG00000014267) hdac9b (ENSMAMG00000014205) ANKRD28 (ENSMAMG00000014112) #22 hacl1 (ENSMAMG00000014027) #24 COLQ (ENSMAMG00000013993) plekha8 (ENSMAMG00000013833) fkbp14 (ENSMAMG00000024896) CHN2 (ENSMAMG00000013775) cpvl (ENSMAMG00000013747) CREB5 (ENSMAMG00000013658) JAZF1 (ENSMAMG00000013626) tax1bp1b (ENSMAMG00000013585) hibadhb (ENSMAMG00000013563) hoxa13b (ENSMAMG00000013489) hoxa11b (ENSMAMG00000013483) ENSMAMG00000013470 hoxa9b (ENSMAMG00000013458) hoxa2b (ENSMAMG00000013414) Carangaria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 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ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Seriola ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802.q #24 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Greater amberjack MODERN SPECIES 250 ENSSDUG00000002470 ENSSDUG00000002351 c4b (ENSSDUG00000002239) ENSSDUG00000002219 rxrbb (ENSSDUG00000002150) FHOD3 (ENSSDUG00000002070) slc6a19b (ENSSDUG00000002036) SLC6A18 (ENSSDUG00000002006) ENSSDUG00000001992 RAPGEF5 (ENSSDUG00000001955) DNAH11 (ENSSDUG00000001754) sp8b (ENSSDUG00000001699) macc1 (ENSSDUG00000001682) twist1b (ENSSDUG00000001670) hdac9b (ENSSDUG00000001605) ANKRD28 (ENSSDUG00000001509) #22 hacl1 (ENSSDUG00000001427) #24 COLQ (ENSSDUG00000001385) plekha8 (ENSSDUG00000001363) fkbp14 (ENSSDUG00000001345) CHN2 (ENSSDUG00000001322) cpvl (ENSSDUG00000001270) CREB5 (ENSSDUG00000001228) JAZF1 (ENSSDUG00000001189) tax1bp1b (ENSSDUG00000001177) hibadhb (ENSSDUG00000001170) hoxa13b (ENSSDUG00000001137) hoxa11b (ENSSDUG00000001124) ENSSDUG00000001112 hoxa9b (ENSSDUG00000001099) hoxa2b (ENSSDUG00000001084) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 1911 ANKRD28 (ENSSLDG00000001382) #22 Barramundi perch MODERN SPECIES 17 ENSLCAG00010009007 ENSLCAG00010009011 ENSLCAG00010009012 rxrbb (ENSLCAG00010009026) FHOD3 (ENSLCAG00010009053) slc6a19b (ENSLCAG00010009062) SLC6A18 (ENSLCAG00010009083) ENSLCAG00010009103 ENSLCAG00010009105 RAPGEF5 (ENSLCAG00010009115) DNAH11 (ENSLCAG00010009391) sp8b (ENSLCAG00010010178) macc1 (ENSLCAG00010010184) twist1b (ENSLCAG00010010187) hdac9b (ENSLCAG00010010199) ANKRD28 (ENSLCAG00010010440) #22 hacl1 (ENSLCAG00010011623) #24 COLQ (ENSLCAG00010011685) plekha8 (ENSLCAG00010011690) fkbp14 (ENSLCAG00010011697) CHN2 (ENSLCAG00010011703) cpvl (ENSLCAG00010011717) CREB5 (ENSLCAG00010011737) JAZF1 (ENSLCAG00010011748) tax1bp1b (ENSLCAG00010011753) hibadhb (ENSLCAG00010011766) hoxa13b (ENSLCAG00010011777) hoxa11b (ENSLCAG00010011784) ENSLCAG00010011786 hoxa9b (ENSLCAG00010011789) hoxa2b (ENSLCAG00010011791) Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000013846.a.b ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Tongue sole MODERN SPECIES 4 MRS2 (ENSCSEG00000005059) ENSCSEG00000005055 CPQ (ENSCSEG00000005044) dscc1 (ENSCSEG00000005030) mrpl13 (ENSCSEG00000005024) FHOD3 (ENSCSEG00000005007) slc6a19b (ENSCSEG00000004999) ENSCSEG00000004998 ENSCSEG00000004997 ENSCSEG00000004986 ENSCSEG00000004949 sp8b (ENSCSEG00000004940) macc1 (ENSCSEG00000004928) twist1b (ENSCSEG00000004923) hdac9b (ENSCSEG00000004911) ANKRD28 (ENSCSEG00000004894) #22 hacl1 (ENSCSEG00000004885) #24 COLQ (ENSCSEG00000004880) plekha8 (ENSCSEG00000004876) fkbp14 (ENSCSEG00000004873) CHN2 (ENSCSEG00000004861) cpvl (ENSCSEG00000004857) CREB5 (ENSCSEG00000004842) JAZF1 (ENSCSEG00000004836) tax1bp1b (ENSCSEG00000004813) hibadhb (ENSCSEG00000004801) hoxa13b (ENSCSEG00000004792) hoxa11b (ENSCSEG00000004788) ENSCSEG00000004785 hoxa9b (ENSCSEG00000004783) hoxa2b (ENSCSEG00000004781) Turbot MODERN SPECIES ENSSMAG00000000325 ENSSMAG00000029108 c4b (ENSSMAG00000000287) ENSSMAG00000000281 rxrbb (ENSSMAG00000000277) ENSSMAG00000000234 ENSSMAG00000000224 ENSSMAG00000035029 ENSSMAG00000036567 ENSSMAG00000000208 DNAH11 (ENSSMAG00000000170) sp8b (ENSSMAG00000000167) macc1 (ENSSMAG00000000165) twist1b (ENSSMAG00000000162) hdac9b (ENSSMAG00000000130) ANKRD28 (ENSSMAG00000000101) #22 hacl1 (ENSSMAG00000000099) #24 COLQ (ENSSMAG00000000096) plekha8 (ENSSMAG00000000090) fkbp14 (ENSSMAG00000000089) CHN2 (ENSSMAG00000000085) cpvl (ENSSMAG00000000083) CREB5 (ENSSMAG00000000081) JAZF1 (ENSSMAG00000000079) tax1bp1b (ENSSMAG00000000076) hibadhb (ENSSMAG00000000075) hoxa13b (ENSSMAG00000000073) hoxa11b (ENSSMAG00000000072) ENSSMAG00000000071 hoxa9b (ENSSMAG00000000069) hoxa2b (ENSSMAG00000020316) Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154807.b ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000003781.e.a ENSGT00390000013846.a.b ENSGT00940000182043 ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739.fb ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Fugu MODERN SPECIES 19 csnk2b (ENSTRUG00000022619) aif1 (ENSTRUG00000016138) ENSTRUG00000029353 ENSTRUG00000026046 c4 (ENSTRUG00000015929) ENSTRUG00000022460 rxrbb (ENSTRUG00000015903) FHOD3 (ENSTRUG00000015843) ENSTRUG00000015834 RAPGEF5 (ENSTRUG00000015817) sp8b (ENSTRUG00000015810) macc1 (ENSTRUG00000015804) twist1 (ENSTRUG00000015797) ENSTRUG00000028716 hdac9b (ENSTRUG00000015773) ANKRD28 (ENSTRUG00000015695) #22 hacl1 (ENSTRUG00000015648) #24 COLQ (ENSTRUG00000015630) plekha8 (ENSTRUG00000015600) fkbp14 (ENSTRUG00000015596) CHN2 (ENSTRUG00000015557) cpvl (ENSTRUG00000015515) CREB5 (ENSTRUG00000015448) JAZF1 (ENSTRUG00000018220) tax1bp1b (ENSTRUG00000015394) hibadhb (ENSTRUG00000015370) ENSTRUG00000015364 hoxa11b (ENSTRUG00000029803) hoxa9b (ENSTRUG00000021837) hoxa2b (ENSTRUG00000015327) skap2 (ENSTRUG00000015267) Tetraodon MODERN SPECIES 23 csnk2b (ENSTNIG00000018452) AIF1 (ENSTNIG00000018451) ENSTNIG00000000031 ENSTNIG00000018450 ENSTNIG00000018449 ENSTNIG00000018448 ENSTNIG00000018447 rxrbb (ENSTNIG00000018446) FHOD3 (ENSTNIG00000018445) ENSTNIG00000018444 RAPGEF5 (ENSTNIG00000018443) sp8b (ENSTNIG00000018442) macc1 (ENSTNIG00000018441) twist1b (ENSTNIG00000018440) hdac9b (ENSTNIG00000018439) ANKRD28 (ENSTNIG00000018438) #22 hacl1 (ENSTNIG00000018437) #24 COLQ (ENSTNIG00000018436) plekha8 (ENSTNIG00000018435) fkbp14 (ENSTNIG00000018434) CHN2 (ENSTNIG00000018433) cpvl (ENSTNIG00000018432) CREB5 (ENSTNIG00000018431) JAZF1 (ENSTNIG00000018430) tax1bp1b (ENSTNIG00000018429) hibadhb (ENSTNIG00000018428) hoxa13b (ENSTNIG00000001781) hoxa11b (ENSTNIG00000000494) ENSTNIG00000001780 hoxa9b (ENSTNIG00000001769) hoxa2b (ENSTNIG00000001768) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154807.b ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Ballan wrasse MODERN SPECIES 101 ENSLBEG00000007076 c4b (ENSLBEG00000007249) ENSLBEG00000007578 rxrbb (ENSLBEG00000007629) FHOD3 (ENSLBEG00000007679) ENSLBEG00000007721 ENSLBEG00000007744 slc6a19b (ENSLBEG00000007772) ENSLBEG00000007896 RAPGEF5 (ENSLBEG00000008014) DNAH11 (ENSLBEG00000008100) sp8b (ENSLBEG00000008311) macc1 (ENSLBEG00000008327) twist1b (ENSLBEG00000008337) hdac9b (ENSLBEG00000008357) ANKRD28 (ENSLBEG00000008448) #22 hacl1 (ENSLBEG00000008593) #24 COLQ (ENSLBEG00000008704) plekha8 (ENSLBEG00000008747) fkbp14 (ENSLBEG00000008801) CHN2 (ENSLBEG00000008860) cpvl (ENSLBEG00000008956) CREB5 (ENSLBEG00000009016) JAZF1 (ENSLBEG00000009100) tax1bp1b (ENSLBEG00000009134) hibadhb (ENSLBEG00000009177) hoxa13b (ENSLBEG00000009213) hoxa11b (ENSLBEG00000009228) ENSLBEG00000009239 hoxa9b (ENSLBEG00000009261) hoxa2b (ENSLBEG00000009277) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Perciformes ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Lumpfish MODERN SPECIES 7 ENSCLMG00005004067 c4b (ENSCLMG00005004142) ENSCLMG00005004842 rxrbb (ENSCLMG00005004847) FHOD3 (ENSCLMG00005004940) ENSCLMG00005004945 slc6a19b (ENSCLMG00005004950) SLC6A18 (ENSCLMG00005004957) ENSCLMG00005004963 ENSCLMG00005004975 DNAH11 (ENSCLMG00005004983) sp8b (ENSCLMG00005005022) macc1 (ENSCLMG00005005023) twist1b (ENSCLMG00005005024) hdac9b (ENSCLMG00005005026) ANKRD28 (ENSCLMG00005005042) #22 hacl1 (ENSCLMG00005007962) #24 COLQ (ENSCLMG00005008200) plekha8 (ENSCLMG00005008203) fkbp14 (ENSCLMG00005008206) CHN2 (ENSCLMG00005008207) cpvl (ENSCLMG00005008209) CREB5 (ENSCLMG00005008226) JAZF1 (ENSCLMG00005008322) tax1bp1b (ENSCLMG00005008325) hibadhb (ENSCLMG00005008326) hoxa13b (ENSCLMG00005008335) hoxa11b (ENSCLMG00005008337) ENSCLMG00005008339 hoxa2b (ENSCLMG00005008340) skap2 (ENSCLMG00005008344) Stickleback MODERN SPECIES 19 ENSGACG00000007916 ENSGACG00000007921 c4b (ENSGACG00000007933) ENSGACG00000007971 rxrbb (ENSGACG00000007982) FHOD3 (ENSGACG00000007994) SLC6A18 (ENSGACG00000008011) ENSGACG00000008027 RAPGEF5 (ENSGACG00000008032) DNAH11 (ENSGACG00000008036) sp8b (ENSGACG00000008062) macc1 (ENSGACG00000008067) twist1b (ENSGACG00000008070) ENSGACG00000008075 hdac9b (ENSGACG00000008076) ANKRD28 (ENSGACG00000008084) #22 hacl1 (ENSGACG00000008098) #24 COLQ (ENSGACG00000008106) plekha8 (ENSGACG00000008123) fkbp14 (ENSGACG00000008133) CHN2 (ENSGACG00000008146) cpvl (ENSGACG00000008172) cpvl (ENSGACG00000008182) CREB5 (ENSGACG00000008212) JAZF1 (ENSGACG00000008216) tax1bp1b (ENSGACG00000008221) hibadhb (ENSGACG00000008229) hoxa13b (ENSGACG00000008296) hoxa11b (ENSGACG00000008297) ENSGACG00000008303 hoxa9b (ENSGACG00000008310) Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000154076.A ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Channel bull blenny MODERN SPECIES 7 ENSCGOG00000005713 rxrbb (ENSCGOG00000005542) FHOD3 (ENSCGOG00000005296) slc6a19b (ENSCGOG00000004964) ENSCGOG00000004937 RAPGEF5 (ENSCGOG00000004915) ENSCGOG00000004896 ENSCGOG00000004891 ENSCGOG00000004888 ENSCGOG00000004881 ENSCGOG00000004876 sp8b 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(ENSSLUG00000001647) #24 COLQ (ENSSLUG00000001725) plekha8 (ENSSLUG00000001749) fkbp14 (ENSSLUG00000001771) CHN2 (ENSSLUG00000001817) cpvl (ENSSLUG00000001939) CREB5 (ENSSLUG00000002018) JAZF1 (ENSSLUG00000002021) tax1bp1b (ENSSLUG00000002026) hibadhb (ENSSLUG00000002035) hoxa13b (ENSSLUG00000002053) hoxa11b (ENSSLUG00000002066) ENSSLUG00000002079 hoxa9b (ENSSLUG00000002087) hoxa2b (ENSSLUG00000002092) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e European seabass MODERN SPECIES 6 ENSDLAG00005011012 ENSDLAG00005010975 c4b (ENSDLAG00005009457) ENSDLAG00005009291 rxrbb (ENSDLAG00005009170) ENSDLAG00005007838 slc6a19b (ENSDLAG00005006402) ENSDLAG00005006119 ENSDLAG00005006103 ENSDLAG00005005661 DNAH11 (ENSDLAG00005004445) sp8b (ENSDLAG00005032957) macc1 (ENSDLAG00005019153) twist1b (ENSDLAG00005027630) hdac9b (ENSDLAG00005019085) ENSDLAG00005017437 #22 hacl1 (ENSDLAG00005017349) #24 plekha8 (ENSDLAG00005017284) fkbp14 (ENSDLAG00005027101) CHN2 (ENSDLAG00005016963) cpvl (ENSDLAG00005016207) CREB5 (ENSDLAG00005016181) JAZF1 (ENSDLAG00005016165) tax1bp1b (ENSDLAG00005016113) hibadhb (ENSDLAG00005016058) hoxa13b (ENSDLAG00005016052) hoxa11b (ENSDLAG00005034243) ENSDLAG00005016047 hoxa9b (ENSDLAG00005016040) skap2 (ENSDLAG00005016010) snx10b (ENSDLAG00005015985) Large yellow croaker MODERN SPECIES 484 csnk2b (ENSLCRG00005007761) AIF1 (ENSLCRG00005007760) ENSLCRG00005007756 c4b (ENSLCRG00005007562) ENSLCRG00005007556 rxrbb (ENSLCRG00005007535) FHOD3 (ENSLCRG00005007496) slc6a19b (ENSLCRG00005006846) ENSLCRG00005006825 RAPGEF5 (ENSLCRG00005006822) DNAH11 (ENSLCRG00005005753) sp8b (ENSLCRG00005005728) macc1 (ENSLCRG00005005727) twist1b (ENSLCRG00005005726) hdac9b (ENSLCRG00005005721) ANKRD28 (ENSLCRG00005004018) #22 hacl1 (ENSLCRG00005002619) #24 COLQ (ENSLCRG00005002579) plekha8 (ENSLCRG00005002558) fkbp14 (ENSLCRG00005002552) CHN2 (ENSLCRG00005001253) cpvl (ENSLCRG00005000690) CREB5 (ENSLCRG00005000631) JAZF1 (ENSLCRG00005009772) tax1bp1b (ENSLCRG00005009770) hibadhb (ENSLCRG00005009720) hoxa13b (ENSLCRG00005009719) hoxa11b (ENSLCRG00005009718) ENSLCRG00005009717 hoxa9b (ENSLCRG00005009716) hoxa2b (ENSLCRG00005009715) Gilthead seabream MODERN SPECIES 8 ENSSAUG00010004811 ENSSAUG00010004823 c4b (ENSSAUG00010004862) ENSSAUG00010005770 rxrbb (ENSSAUG00010005778) FHOD3 (ENSSAUG00010005799) slc6a19b (ENSSAUG00010005859) ENSSAUG00010006138 ENSSAUG00010006258 RAPGEF5 (ENSSAUG00010006261) DNAH11 (ENSSAUG00010006386) sp8b (ENSSAUG00010007105) macc1 (ENSSAUG00010007107) twist1b (ENSSAUG00010007108) hdac9b (ENSSAUG00010007109) ANKRD28 (ENSSAUG00010007114) #22 hacl1 (ENSSAUG00010007288) #24 COLQ (ENSSAUG00010007419) plekha8 (ENSSAUG00010007424) fkbp14 (ENSSAUG00010007466) CHN2 (ENSSAUG00010007468) cpvl (ENSSAUG00010007474) CREB5 (ENSSAUG00010007486) JAZF1 (ENSSAUG00010007488) tax1bp1b (ENSSAUG00010007490) hibadhb (ENSSAUG00010007493) hoxa13b (ENSSAUG00010007579) hoxa11b (ENSSAUG00010007580) ENSSAUG00010007581 hoxa9b (ENSSAUG00010007582) hoxa2b (ENSSAUG00010007584) Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 208 ENSHCOG00000012600 ENSHCOG00000012579 ENSHCOG00000012554 rxrbb (ENSHCOG00000012534) FHOD3 (ENSHCOG00000012494) ENSHCOG00000012463 ENSHCOG00000012447 slc6a19b (ENSHCOG00000012438) ENSHCOG00000012412 ENSHCOG00000012394 DNAH11 (ENSHCOG00000012354) sp8b (ENSHCOG00000012237) macc1 (ENSHCOG00000012219) twist1b (ENSHCOG00000012208) hdac9b (ENSHCOG00000012189) ANKRD28 (ENSHCOG00000012141) #22 ENSHCOG00000012084 CPQ (ENSHCOG00000012071) dscc1 (ENSHCOG00000012057) mrpl13 (ENSHCOG00000012037) COL14A1 (ENSHCOG00000012016) deptor (ENSHCOG00000011939) LIMD1 (ENSHCOG00000011905) lars2 (ENSHCOG00000011897) cdcp1a (ENSHCOG00000011848) CLEC3B (ENSHCOG00000011832) ENSHCOG00000011825 ENSHCOG00000011808 MRS2 (ENSHCOG00000011796) ENSHCOG00000011769 CLPTM1L (ENSHCOG00000000747) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 7 ENSMMDG00005010021 c4b (ENSMMDG00005010047) ENSMMDG00005011687 rxrbb (ENSMMDG00005011690) FHOD3 (ENSMMDG00005011754) ENSMMDG00005011756 ENSMMDG00005011757 ENSMMDG00005011770 ENSMMDG00005012023 RAPGEF5 (ENSMMDG00005012031) DNAH11 (ENSMMDG00005012062) sp8b (ENSMMDG00005012218) macc1 (ENSMMDG00005012219) twist1b (ENSMMDG00005012221) hdac9b (ENSMMDG00005012223) ANKRD28 (ENSMMDG00005012342) #22 hacl1 (ENSMMDG00005019372) #24 COLQ (ENSMMDG00005019402) plekha8 (ENSMMDG00005019413) fkbp14 (ENSMMDG00005019440) CHN2 (ENSMMDG00005019442) cpvl (ENSMMDG00005019447) CREB5 (ENSMMDG00005019865) JAZF1 (ENSMMDG00005019868) tax1bp1b (ENSMMDG00005019874) hibadhb (ENSMMDG00005019882) hoxa13b (ENSMMDG00005019936) hoxa11b (ENSMMDG00005019940) ENSMMDG00005019946 hoxa9b (ENSMMDG00005019947) hoxa2b (ENSMMDG00005019951) Cod MODERN SPECIES 2 ENSGMOG00000028331 ENSGMOG00000031400 ENSGMOG00000036632 ENSGMOG00000026370 CREB5 (ENSGMOG00000014131) cpvl (ENSGMOG00000014089) ENSGMOG00000027655 ENSGMOG00000026655 ENSGMOG00000030105 ENSGMOG00000004325 ENSGMOG00000004295 #24 ENSGMOG00000032740 ENSGMOG00000014145 ENSGMOG00000028624 ENSGMOG00000016215 ENSGMOG00000012039 #22 ENSGMOG00000023251 ENSGMOG00000034945 glipr2l (ENSGMOG00000016072) ENSGMOG00000031680 ENSGMOG00000016100 ENSGMOG00000008535 ENSGMOG00000008551 ENSGMOG00000033521 ENSGMOG00000025191 ENSGMOG00000023405 ENSGMOG00000037061 ENSGMOG00000026151 ITGA10 (ENSGMOG00000018921) polr3c (ENSGMOG00000018937) rnf115a (ENSGMOG00000018949) Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155565.a ENSGT01100000263473.a.b.h.b ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00940000166052 ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163281.a ENSGT00940000163428.b.a.a ENSGT00940000166341 ENSGT00940000154486.b.a.b ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858.i ENSGT00760000119737 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.g.d ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b Northern pike MODERN SPECIES 19 FHOD3 (ENSELUG00000006796) SLC6A18 (ENSELUG00000006864) ENSELUG00000006880 ENSELUG00000006893 ENSELUG00000006936 ENSELUG00000025177 ENSELUG00000034021 sp8b (ENSELUG00000006950) ENSELUG00000006975 macc1 (ENSELUG00000006998) ENSELUG00000007010 twist1a (ENSELUG00000007017) hdac9b (ENSELUG00000007075) ahr1a (ENSELUG00000007172) ENSELUG00000027964 ANKRD28 (ENSELUG00000007253) #22 hacl1 (ENSELUG00000007356) #24 COLQ (ENSELUG00000007408) plekha8 (ENSELUG00000007445) fkbp14 (ENSELUG00000033081) ENSELUG00000007457 CHN2 (ENSELUG00000000267) cpvl (ENSELUG00000007617) CREB5 (ENSELUG00000007691) jazf1a (ENSELUG00000000282) tax1bp1b (ENSELUG00000007759) hibadhb (ENSELUG00000007803) hoxa13b (ENSELUG00000007825) hoxa11b (ENSELUG00000007833) ENSELUG00000007844 hoxa2b (ENSELUG00000007865) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183411 ENSGT01100000263473.a.b.h.b.l ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l.y.a ENSGT00940000164650.l ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00940000166052 ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163281.a.c ENSGT00940000163428.b.a.a ENSGT00940000166341 ENSGT00940000154486.b.a.b ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a.c.b ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858.i ENSGT00760000119737 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.g.d ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b Huchen DUPLICATION Huchen MODERN SPECIES 9434 ENSHHUG00000039238 #22 Huchen DUPLICATION Huchen MODERN SPECIES 4145 ENSHHUG00000029765 lmo4b (ENSHHUG00000029776) ENSHHUG00000029778 #22 Huchen MODERN SPECIES 11463 ENSHHUG00000016243 #22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT01100000263473.a.b.h.b.l ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B.f.b ENSGT00940000159208.B.f.a.b ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l.y.a ENSGT00940000164650.l ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00940000166052 ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163281.a.c ENSGT00940000163428.b.a.a ENSGT00940000166341 ENSGT00940000154486.b.a.b ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a.c.b ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i.i ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858.i.j ENSGT00760000119737 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00940000156420.b ENSGT00390000003368 ENSGT00390000003635.g.d ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00940000155739.yb.b.a ENSGT01100000263473.a.b.h.b.l ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B.f.a.b ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l.y.a ENSGT00940000164650.l ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00940000166052 ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163281.a.c ENSGT00940000163428.b.a.a ENSGT00940000166341.f ENSGT00940000154486.b.a.b ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a.c.b ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858.i.i ENSGT00760000119737 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a.c ENSGT00390000003368 ENSGT00390000003635.g.d ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b Rainbow trout DUPLICATION Rainbow trout DUPLICATION Rainbow trout MODERN SPECIES 21 rxrbb (ENSOMYG00000010829) ENSOMYG00000001638 ENSOMYG00000067753 slc6a19b (ENSOMYG00000001677) ENSOMYG00000053985 ENSOMYG00000050040 ENSOMYG00000052698 sp8b (ENSOMYG00000010791) ENSOMYG00000064044 ENSOMYG00000004633 macc1 (ENSOMYG00000001168) ENSOMYG00000061693 ENSOMYG00000001144 hdac9b (ENSOMYG00000054264) ahr1a (ENSOMYG00000001067) ENSOMYG00000071501 #22 ENSOMYG00000068122 ENSOMYG00000069809 ENSOMYG00000062830 ENSOMYG00000071125 ENSOMYG00000074458 ENSOMYG00000064764 ENSOMYG00000064337 ENSOMYG00000048577 ENSOMYG00000058213 ENSOMYG00000059375 ENSOMYG00000061863 ENSOMYG00000057225 ENSOMYG00000060496 ENSOMYG00000055160 ENSOMYG00000055910 Rainbow trout MODERN SPECIES 317 ENSOMYG00000071462 #22 Rainbow trout MODERN SPECIES 11 ENSOMYG00000067648 ENSOMYG00000025106 rxrbb (ENSOMYG00000001564) ENSOMYG00000071819 slc6a19b (ENSOMYG00000028946) ENSOMYG00000056599 ENSOMYG00000063603 ENSOMYG00000072543 sp8b (ENSOMYG00000073802) ENSOMYG00000066537 macc1 (ENSOMYG00000064450) ENSOMYG00000060436 ENSOMYG00000056407 hdac9b (ENSOMYG00000077335) ahr1a (ENSOMYG00000036618) ENSOMYG00000054585 #22 ENSOMYG00000070229 ENSOMYG00000077428 ENSOMYG00000061937 ENSOMYG00000070369 ENSOMYG00000057446 ENSOMYG00000070573 ENSOMYG00000052871 ENSOMYG00000048461 hacl1 (ENSOMYG00000056364) #24 plekha8 (ENSOMYG00000001004) fkbp14 (ENSOMYG00000000983) ENSOMYG00000001041 CHN2 (ENSOMYG00000067588) cpvl (ENSOMYG00000000789) CREB5 (ENSOMYG00000076901) Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 112 ENSGT00940000166341.e ENSGT00940000154486.b.a.b ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a.c.b ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i.i ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858.i.j ENSGT00760000119737 ENSGT01030000234635.a.b.a.a.d ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a.c ENSGT00390000003368 ENSGT00390000003635.g.d ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a Coho salmon MODERN SPECIES 31 rxrbb (ENSOKIG00005046785) FHOD3 (ENSOKIG00005046855) slc6a19b (ENSOKIG00005046972) ENSOKIG00005047592 ENSOKIG00005047642 ENSOKIG00005047754 ENSOKIG00005047756 ENSOKIG00005047762 sp8b (ENSOKIG00005047774) ENSOKIG00005048046 macc1 (ENSOKIG00005049429) ENSOKIG00005049434 ENSOKIG00005049443 hdac9b (ENSOKIG00005049459) ahr1a (ENSOKIG00005049511) ANKRD28 (ENSOKIG00005049730) #22 hacl1 (ENSOKIG00005050053) #24 plekha8 (ENSOKIG00005050128) ENSOKIG00005050140 fkbp14 (ENSOKIG00005050143) ENSOKIG00005050149 ENSOKIG00005050152 CHN2 (ENSOKIG00005050170) cpvl (ENSOKIG00005050225) CREB5 (ENSOKIG00005050277) ENSOKIG00005050281 CREB5 (ENSOKIG00005050290) sycp1 (ENSOKIG00005050301) tax1bp1b (ENSOKIG00005050315) JAZF1 (ENSOKIG00005050330) hibadhb (ENSOKIG00005050338) Chinook salmon MODERN SPECIES 22 CCN3 (ENSOTSG00005015760) mal2 (ENSOTSG00005015758) COLEC10 (ENSOTSG00005015757) csnk2a1 (ENSOTSG00005015755) PON1 (ENSOTSG00005015753) kcnk5b 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ENSSSAG00000114748 ENSSSAG00000103025 plekha8 (ENSSSAG00000087781) ENSSSAG00000046042 ENSSSAG00000053505 ENSSSAG00000090755 cpvl (ENSSSAG00000059739) CREB5 (ENSSSAG00000040675) ENSSSAG00000097593 JAZF1 (ENSSSAG00000115280) tax1bp1b (ENSSSAG00000093981) Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.b ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000159108.j ENSGT00940000158880 ENSGT00940000157827.h ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00940000166052 ENSGT00940000155287 ENSGT00390000013151.a.b.e ENSGT00940000163281.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000154486.b.a.b.m ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a ENSGT00940000157288 ENSGT00940000160267 ENSGT00990000208316 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h.a ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255.db ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.a.f 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(ENSCMIG00000019371) Cyclostomata DUPLICATION Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182908.C.q #22 Lamprey MODERN SPECIES 2100 ENSPMAG00000007165 #22 Hagfish MODERN SPECIES 276 ENSEBUG00000011110 ENSEBUG00000009077 ENSEBUG00000012036 mcrs1 (ENSEBUG00000010094) ENSEBUG00000007218 ENSEBUG00000011202 ENSEBUG00000008643 satb2 (ENSEBUG00000002227) ##11 ENSEBUG00000001603 ENSEBUG00000008648 #17 cs (ENSEBUG00000007413) hspd1 (ENSEBUG00000015722) hspe1 (ENSEBUG00000009763) ENSEBUG00000008704 ##22 ENSEBUG00000004874 ENSEBUG00000012466 #22 ENSEBUG00000013321 ENSEBUG00000010091 ENSEBUG00000010924 Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182908.C.r #22 Lamprey MODERN SPECIES 4446 ENSPMAG00000003543 hacl1 (ENSPMAG00000003546) #24 ENSPMAG00000003580 anapc4 (ENSPMAG00000003587) ANKRD28 (ENSPMAG00000003623) #22 Hagfish MODERN SPECIES 950 ENSEBUG00000016962 ENSEBUG00000002473 ENSEBUG00000004353 ENSEBUG00000001996 ENSEBUG00000007500 ENSEBUG00000016550 ENSEBUG00000008127 ENSEBUG00000003466 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SLC39A10 (ENSCPBG00000021741) Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00960000192086 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a.r ##16 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.n ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000161744 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000160464.n ENSGT00940000160464.m ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 2251 ENSCABG00000006329 EPHA4 (ENSCABG00000006336) ENSCABG00000006347 PAX3 (ENSCABG00000006349) SGPP2 (ENSCABG00000006353) FARSB (ENSCABG00000006377) MOGAT1 (ENSCABG00000006987) ENSCABG00000006992 BOLL 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ENSPSIG00000001186 TMEFF2 (ENSPSIG00000012573) CAVIN2 (ENSPSIG00000012558) ENSPSIG00000001181 NABP1 (ENSPSIG00000012471) ENSPSIG00000001172 ENSPSIG00000001165 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.n ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000160464 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 66 KCTD18 (ENSCPRG00005009197) SPATS2L (ENSCPRG00005009201) TYW5 (ENSCPRG00005009213) 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##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.n ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000160464 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E African ostrich MODERN SPECIES 190 TYW5 (ENSSCUG00000001155) C2orf69 (ENSSCUG00000001156) SATB2 (ENSSCUG00000001157) ##11 PLCL1 (ENSSCUG00000001166) BOLL (ENSSCUG00000001167) ##16 RFTN2 (ENSSCUG00000001170) ##17 MOB4 (ENSSCUG00000001173) HSPE1 (ENSSCUG00000001176) HSPD1 (ENSSCUG00000001178) COQ10B (ENSSCUG00000001180) SF3B1 (ENSSCUG00000001181) ANKRD44 (ENSSCUG00000001187) ##22 PGAP1 (ENSSCUG00000001197) C2orf66 (ENSSCUG00000001199) GTF3C3 (ENSSCUG00000001201) CCDC150 (ENSSCUG00000001205) HECW2 (ENSSCUG00000001213) STK17B (ENSSCUG00000001218) DNAH7 (ENSSCUG00000001227) ENSSCUG00000001243 SLC39A10 (ENSSCUG00000001244) Neognathae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000154107.b.j.a ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.n ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000160464 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000154107.b.j.a ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B ##11 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ENSGT00940000155282 ENSGT00940000161744 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a.c ENSGT00940000155812 ENSGT00940000160464 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b ENSGT00390000006330.a.a Pink-footed goose MODERN SPECIES 18 ENSABRG00000008007 MAIP1 (ENSABRG00000008014) TYW5 (ENSABRG00000008024) C2orf69 (ENSABRG00000008031) SATB2 (ENSABRG00000008058) ##11 PLCL1 (ENSABRG00000008112) BOLL (ENSABRG00000008146) ##16 RFTN2 (ENSABRG00000008189) ##17 MOB4 (ENSABRG00000008210) ENSABRG00000008219 HSPE1 (ENSABRG00000008221) HSPD1 (ENSABRG00000008240) COQ10B (ENSABRG00000008578) SF3B1 (ENSABRG00000008654) ANKRD44 (ENSABRG00000009757) ##22 PGAP1 (ENSABRG00000012531) GTF3C3 (ENSABRG00000012719) HECW2 (ENSABRG00000012968) STK17B (ENSABRG00000013421) DNAH7 (ENSABRG00000013699) ENSABRG00000015369 ENSABRG00000015388 TMEFF2 (ENSABRG00000015426) CAVIN2 (ENSABRG00000015428) NABP1 (ENSABRG00000015430) TSSK6 (ENSABRG00000015431) MYO1B (ENSABRG00000015434) STAT1 (ENSABRG00000015630) GLS (ENSABRG00000017837) NAB1 (ENSABRG00000019061) Duck MODERN SPECIES 25 NIF3L1 (ENSAPLG00000015875) PPIL3 (ENSAPLG00000015961) CLK1 (ENSAPLG00000016010) BZW1 (ENSAPLG00000016194) AOX1 (ENSAPLG00000008708) SPATS2L (ENSAPLG00000008552) MAIP1 (ENSAPLG00000008514) TYW5 (ENSAPLG00000008413) C2orf69 (ENSAPLG00000000922) SATB2 (ENSAPLG00000008131) ##11 PLCL1 (ENSAPLG00000006530) BOLL (ENSAPLG00000006193) ##16 RFTN2 (ENSAPLG00000005755) ##17 MOB4 (ENSAPLG00000019077) SF3B1 (ENSAPLG00000003993) ANKRD44 (ENSAPLG00000002803) ##22 PGAP1 (ENSAPLG00000001884) GTF3C3 (ENSAPLG00000016020) ENSAPLG00000015999 HECW2 (ENSAPLG00000015383) STK17B (ENSAPLG00000015076) ENSAPLG00000022933 ENSAPLG00000026608 ENSAPLG00000015074 ENSAPLG00000013720 TMEFF2 (ENSAPLG00000014055) NABP1 (ENSAPLG00000024306) ENSAPLG00000028282 TSSK6 (ENSAPLG00000025422) MYO1B (ENSAPLG00000012334) STAT4 (ENSAPLG00000023296) Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154107.b.j.a ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.n ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000161744 ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000160464.q ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154107.b.j.a ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.n ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000161744 ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000160464.q ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E Chicken MODERN SPECIES 36 ENSGALG00010024213 KCTD18 (ENSGALG00010024207) SPATS2L (ENSGALG00010024075) MAIP1 (ENSGALG00010024020) TYW5 (ENSGALG00010023968) C2orf69 (ENSGALG00010023884) SATB2 (ENSGALG00010023831) ##11 PLCL1 (ENSGALG00010015218) BOLL (ENSGALG00010015152) ##16 RFTN2 (ENSGALG00010015133) ##17 MOB4 (ENSGALG00010015100) HSPE1 (ENSGALG00010015092) HSPD1 (ENSGALG00010015069) COQ10B (ENSGALG00010015043) SF3B1 (ENSGALG00010010748) ANKRD44 (ENSGALG00010010988) ##22 PGAP1 (ENSGALG00010010973) C7H2ORF66 (ENSGALG00010010961) GTF3C3 (ENSGALG00010010955) HECW2 (ENSGALG00010010928) STK17B (ENSGALG00010010908) ENSGALG00010010895 DNAH7 (ENSGALG00010010884) SLC39A10 (ENSGALG00010010868) TMEFF2 (ENSGALG00010010823) CAVIN2 (ENSGALG00010010796) NABP1 (ENSGALG00010010786) ENSGALG00010015242 MYO1B (ENSGALG00010014080) STAT4 (ENSGALG00010014000) STAT1 (ENSGALG00010013934) Turkey MODERN SPECIES 27 ENSMGAG00000007215 ENSMGAG00000021622 SPATS2L (ENSMGAG00000007229) MAIP1 (ENSMGAG00000007211) TYW5 (ENSMGAG00000007194) C2orf69 (ENSMGAG00000007191) SATB2 (ENSMGAG00000007173) ##11 ENSMGAG00000007167 BOLL (ENSMGAG00000020859) ##16 RFTN2 (ENSMGAG00000007142) ##17 MOB4 (ENSMGAG00000007119) HSPE1 (ENSMGAG00000007107) HSPD1 (ENSMGAG00000007073) COQ10B (ENSMGAG00000007063) SF3B1 (ENSMGAG00000007017) ANKRD44 (ENSMGAG00000006933) ##22 PGAP1 (ENSMGAG00000006871) C2orf66 (ENSMGAG00000006869) GTF3C3 (ENSMGAG00000006840) HECW2 (ENSMGAG00000006790) STK17B (ENSMGAG00000016466) ENSMGAG00000006729 DNAH7 (ENSMGAG00000006746) ENSMGAG00000006736 TMEFF2 (ENSMGAG00000006692) CAVIN2 (ENSMGAG00000022826) NABP1 (ENSMGAG00000021867) ENSMGAG00000016144 MYO1B (ENSMGAG00000006664) STAT1 (ENSMGAG00000006382) GLS (ENSMGAG00000006345) Japanese quail MODERN SPECIES 25 HSPE1 (ENSCJPG00005004256) HSPD1 (ENSCJPG00005004261) COQ10B (ENSCJPG00005004263) SF3B1 (ENSCJPG00005004274) ANKRD44 (ENSCJPG00005004523) ##22 PGAP1 (ENSCJPG00005006048) GTF3C3 (ENSCJPG00005006185) HECW2 (ENSCJPG00005006233) STK17B (ENSCJPG00005007025) DNAH7 (ENSCJPG00005007034) ENSCJPG00005008563 ENSCJPG00005008588 TMEFF2 (ENSCJPG00005008593) CAVIN2 (ENSCJPG00005008594) NABP1 (ENSCJPG00005008595) ENSCJPG00005008596 MYO1B (ENSCJPG00005008597) STAT4 (ENSCJPG00005008601) STAT1 (ENSCJPG00005009401) GLS (ENSCJPG00005009421) Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000154107.b.j.a ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.n ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000160464 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000154107.b.j.a ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.n ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000161744 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000160464 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b Great tit MODERN SPECIES 27 AOX1 (ENSPMJG00000004145) ENSPMJG00000004063 SPATS2L (ENSPMJG00000004053) MAIP1 (ENSPMJG00000004020) TYW5 (ENSPMJG00000004013) C2orf69 (ENSPMJG00000004011) SATB2 (ENSPMJG00000004001) ##11 PLCL1 (ENSPMJG00000003985) BOLL (ENSPMJG00000003966) ##16 RFTN2 (ENSPMJG00000003955) ##17 MOB4 (ENSPMJG00000003952) HSPE1 (ENSPMJG00000003948) HSPD1 (ENSPMJG00000003936) COQ10B (ENSPMJG00000003934) SF3B1 (ENSPMJG00000003918) ANKRD44 (ENSPMJG00000003248) ##22 PGAP1 (ENSPMJG00000003000) GTF3C3 (ENSPMJG00000000637) HECW2 (ENSPMJG00000000591) STK17B (ENSPMJG00000000570) ENSPMJG00000000562 SLC39A10 (ENSPMJG00000000557) TMEFF2 (ENSPMJG00000000457) CAVIN2 (ENSPMJG00000000447) NABP1 (ENSPMJG00000000436) TSSK6 (ENSPMJG00000000418) MYO1B (ENSPMJG00000000085) STAT4 (ENSPMJG00000008343) STAT1 (ENSPMJG00000008334) GLS (ENSPMJG00000008328) NAB1 (ENSPMJG00000008306) Passeriformes_d DUPLICATION Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154107.b.j.a ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.n ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D.c ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000161744 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000160464 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000154107.b.j.a ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.n ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D.c ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000161744 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000160464 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b Medium ground finch MODERN SPECIES 1 BZW1 (ENSGFOG00000000164) AOX1 (ENSGFOG00000000189) SPATS2L (ENSGFOG00000000276) MAIP1 (ENSGFOG00000000285) TYW5 (ENSGFOG00000000292) C2orf69 (ENSGFOG00000000297) SATB2 (ENSGFOG00000000304) ##11 PLCL1 (ENSGFOG00000000319) BOLL (ENSGFOG00000000330) ##16 RFTN2 (ENSGFOG00000000339) ##17 MOB4 (ENSGFOG00000000351) HSPE1 (ENSGFOG00000000358) HSPD1 (ENSGFOG00000000363) COQ10B (ENSGFOG00000000371) SF3B1 (ENSGFOG00000000377) ANKRD44 (ENSGFOG00000000465) ##22 PGAP1 (ENSGFOG00000001016) C2orf66 (ENSGFOG00000001182) GTF3C3 (ENSGFOG00000001187) HECW2 (ENSGFOG00000001246) STK17B (ENSGFOG00000001718) ENSGFOG00000001726 SLC39A10 (ENSGFOG00000001739) TMEFF2 (ENSGFOG00000001783) CAVIN2 (ENSGFOG00000001788) NABP1 (ENSGFOG00000001793) TSSK6 (ENSGFOG00000001804) MYO1B (ENSGFOG00000001817) STAT1 (ENSGFOG00000002040) GLS (ENSGFOG00000006696) NAB1 (ENSGFOG00000006923) Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154107.b.j.a ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.n ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D.c ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000161744 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000160464 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b Zebra finch MODERN SPECIES 29 ENSTGUG00000010459 ENSTGUG00000024909 SPATS2L (ENSTGUG00000010462) MAIP1 (ENSTGUG00000010466) TYW5 (ENSTGUG00000010474) C2orf69 (ENSTGUG00000028654) SATB2 (ENSTGUG00000010480) ##11 PLCL1 (ENSTGUG00000010492) BOLL (ENSTGUG00000010496) ##16 RFTN2 (ENSTGUG00000010512) ##17 MOB4 (ENSTGUG00000027293) HSPE1 (ENSTGUG00000020798) HSPD1 (ENSTGUG00000010538) COQ10B (ENSTGUG00000010549) SF3B1 (ENSTGUG00000010553) ANKRD44 (ENSTGUG00000010567) ##22 PGAP1 (ENSTGUG00000010613) C2orf66 (ENSTGUG00000010629) GTF3C3 (ENSTGUG00000010631) HECW2 (ENSTGUG00000010653) STK17B (ENSTGUG00000010679) SLC39A10 (ENSTGUG00000010699) ENSTGUG00000010697 TMEFF2 (ENSTGUG00000010716) CAVIN2 (ENSTGUG00000020992) NABP1 (ENSTGUG00000019307) ENSTGUG00000028555 MYO1B (ENSTGUG00000010724) ENSTGUG00000020203 STAT4 (ENSTGUG00000022880) STAT1 (ENSTGUG00000010768) Common canary MODERN SPECIES 8 AOX1 (ENSSCAG00000002748) ENSSCAG00000002760 SPATS2L (ENSSCAG00000002770) MAIP1 (ENSSCAG00000002783) TYW5 (ENSSCAG00000002800) C2orf69 (ENSSCAG00000002803) SATB2 (ENSSCAG00000002810) ##11 PLCL1 (ENSSCAG00000002820) BOLL (ENSSCAG00000002826) ##16 RFTN2 (ENSSCAG00000002834) ##17 MOB4 (ENSSCAG00000002843) HSPE1 (ENSSCAG00000002849) HSPD1 (ENSSCAG00000002857) COQ10B (ENSSCAG00000002862) SF3B1 (ENSSCAG00000002869) ANKRD44 (ENSSCAG00000002900) ##22 PGAP1 (ENSSCAG00000002970) GTF3C3 (ENSSCAG00000003067) HECW2 (ENSSCAG00000003082) STK17B (ENSSCAG00000003100) ENSSCAG00000003138 SLC39A10 (ENSSCAG00000003118) ENSSCAG00000003142 TMEFF2 (ENSSCAG00000003163) NABP1 (ENSSCAG00000003197) CAVIN2 (ENSSCAG00000003200) TSSK6 (ENSSCAG00000003202) MYO1B (ENSSCAG00000003213) STAT4 (ENSSCAG00000003278) STAT1 (ENSSCAG00000003470) GLS (ENSSCAG00000003559) Flycatcher MODERN SPECIES 26 KCTD18 (ENSFALG00000004224) SPATS2L (ENSFALG00000004226) MAIP1 (ENSFALG00000026216) TYW5 (ENSFALG00000026401) C2orf69 (ENSFALG00000028312) ENSFALG00000025773 SATB2 (ENSFALG00000004242) ##11 PLCL1 (ENSFALG00000004251) BOLL (ENSFALG00000004255) ##16 RFTN2 (ENSFALG00000004261) ##17 MOB4 (ENSFALG00000004266) HSPE1 (ENSFALG00000025157) HSPD1 (ENSFALG00000004272) COQ10B (ENSFALG00000004277) SF3B1 (ENSFALG00000004281) ENSFALG00000004286 ##22 PGAP1 (ENSFALG00000004291) C2orf66 (ENSFALG00000004295) GTF3C3 (ENSFALG00000004303) HECW2 (ENSFALG00000004319) STK17B (ENSFALG00000004323) ENSFALG00000004327 SLC39A10 (ENSFALG00000004330) ENSFALG00000024564 TMEFF2 (ENSFALG00000004336) CAVIN2 (ENSFALG00000004340) NABP1 (ENSFALG00000004342) ENSFALG00000015317 MYO1B (ENSFALG00000004345) STAT4 (ENSFALG00000023946) ENSFALG00000004349 Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182908.D.d ##22 Flycatcher MODERN SPECIES 559 ENSFALG00000000426 ENSFALG00000000427 ENSFALG00000025454 PTGES3 (ENSFALG00000000432) ATP5F1B (ENSFALG00000000436) BAZ2A (ENSFALG00000000445) ENSFALG00000000453 ENSFALG00000027295 ENSFALG00000000462 PAN2 (ENSFALG00000000464) CNPY2 (ENSFALG00000025790) CS (ENSFALG00000000485) COQ10A (ENSFALG00000000492) ENSFALG00000022864 ENSFALG00000025935 ##22 ENSFALG00000026686 ##22 ENSFALG00000023243 ENSFALG00000007001 ENSFALG00000010879 ENSFALG00000024789 ENSFALG00000028420 ENSFALG00000009282 PCBP2 (ENSFALG00000002980) MAP3K12 (ENSFALG00000027231) ENSFALG00000015328 ATF7 (ENSFALG00000028968) ENSFALG00000027248 ENSFALG00000025421 Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000183114.a.b.b.c.a ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.n ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812.kb ENSGT00940000160464 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b Kakapo MODERN SPECIES 22 ENSSHBG00005019636 KCTD18 (ENSSHBG00005019425) SPATS2L (ENSSHBG00005019422) MAIP1 (ENSSHBG00005019417) TYW5 (ENSSHBG00005019414) C2orf69 (ENSSHBG00005019413) SATB2 (ENSSHBG00005019410) ##11 PLCL1 (ENSSHBG00005019405) BOLL (ENSSHBG00005019392) ##16 RFTN2 (ENSSHBG00005019386) ##17 MOB4 (ENSSHBG00005019383) HSPE1 (ENSSHBG00005019379) HSPD1 (ENSSHBG00005019373) COQ10B (ENSSHBG00005019365) SF3B1 (ENSSHBG00005019352) ANKRD44 (ENSSHBG00005018394) ##22 PGAP1 (ENSSHBG00005018304) GTF3C3 (ENSSHBG00005018293) ENSSHBG00005018286 ENSSHBG00005018282 HECW2 (ENSSHBG00005018269) STK17B (ENSSHBG00005018259) ENSSHBG00005018255 DNAH7 (ENSSHBG00005013155) ENSSHBG00005011962 TMEFF2 (ENSSHBG00005011933) CAVIN2 (ENSSHBG00005011922) ENSSHBG00005011910 ENSSHBG00005011895 TSSK6 (ENSSHBG00005011889) MYO1B (ENSSHBG00005011868) Golden eagle MODERN SPECIES 22 ENSACCG00020002495 KCTD18 (ENSACCG00020002434) SPATS2L (ENSACCG00020002416) MAIP1 (ENSACCG00020002401) TYW5 (ENSACCG00020002393) C2orf69 (ENSACCG00020002380) SATB2 (ENSACCG00020002371) ##11 PLCL1 (ENSACCG00020002350) BOLL (ENSACCG00020002330) ##16 RFTN2 (ENSACCG00020002295) ##17 MOB4 (ENSACCG00020002267) HSPE1 (ENSACCG00020002252) HSPD1 (ENSACCG00020002238) COQ10B (ENSACCG00020002215) SF3B1 (ENSACCG00020002196) ANKRD44 (ENSACCG00020002129) ##22 PGAP1 (ENSACCG00020002045) GTF3C3 (ENSACCG00020001980) ENSACCG00020001942 HECW2 (ENSACCG00020001818) STK17B (ENSACCG00020001688) ENSACCG00020001679 ENSACCG00020001666 ENSACCG00020001648 SLC39A10 (ENSACCG00020001627) TMEFF2 (ENSACCG00020001604) CAVIN2 (ENSACCG00020001595) NABP1 (ENSACCG00020001579) TSSK6 (ENSACCG00020001568) MYO1B (ENSACCG00020001433) STAT4 (ENSACCG00020001332) Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.n ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000160464.l ENSGT00940000160464.k ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D tuatara MODERN SPECIES 1193 PLCL1 (ENSSPUG00000000630) ENSSPUG00000000626 ENSSPUG00000000618 ##16 RFTN2 (ENSSPUG00000000480) ##17 MOB4 (ENSSPUG00000000458) HSPE1 (ENSSPUG00000000441) HSPD1 (ENSSPUG00000000425) COQ10B (ENSSPUG00000000420) SF3B1 (ENSSPUG00000000410) ANKRD44 (ENSSPUG00000000341) ##22 PGAP1 (ENSSPUG00000000028) GTF3C3 (ENSSPUG00000019210) ENSSPUG00000019207 ENSSPUG00000019205 HECW2 (ENSSPUG00000019200) STK17B (ENSSPUG00000019195) ENSSPUG00000019192 ENSSPUG00000019190 DNAH7 (ENSSPUG00000019167) SLC39A10 (ENSSPUG00000019143) Episquamata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.n ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000160464.l ENSGT00940000160464.k ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D Laterata ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.n ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 12 MAIP1 (ENSSMRG00000020245) TYW5 (ENSSMRG00000020247) C2orf69 (ENSSMRG00000020249) FTCDNL1 (ENSSMRG00000020252) SATB2 (ENSSMRG00000020256) ##11 ENSSMRG00000020259 PLCL1 (ENSSMRG00000020260) ENSSMRG00000020262 ENSSMRG00000020263 ##16 RFTN2 (ENSSMRG00000020265) ##17 MOB4 (ENSSMRG00000020267) HSPE1 (ENSSMRG00000020269) HSPD1 (ENSSMRG00000020273) COQ10B (ENSSMRG00000020275) SF3B1 (ENSSMRG00000020276) ANKRD44 (ENSSMRG00000020279) ##22 PGAP1 (ENSSMRG00000020281) CFLAR (ENSSMRG00000020283) ENSSMRG00000020284 TRAK2 (ENSSMRG00000020286) MLNR (ENSSMRG00000020287) ENSSMRG00000020288 PTH2R (ENSSMRG00000020291) PIKFYVE (ENSSMRG00000020308) IDH1 (ENSSMRG00000020311) ENSSMRG00000020312 C2orf80 (ENSSMRG00000020315) PLEKHM3 (ENSSMRG00000020318) ENSSMRG00000020321 ENSSMRG00000020322 METTL21A (ENSSMRG00000020324) Common wall lizard MODERN SPECIES ENSPMRG00000005158 MAIP1 (ENSPMRG00000005161) TYW5 (ENSPMRG00000005165) C2orf69 (ENSPMRG00000005171) FTCDNL1 (ENSPMRG00000005176) SATB2 (ENSPMRG00000005180) ##11 ENSPMRG00000005184 PLCL1 (ENSPMRG00000005188) BOLL (ENSPMRG00000005191) ##16 RFTN2 (ENSPMRG00000005194) ##17 MOB4 (ENSPMRG00000005201) ENSPMRG00000005210 ENSPMRG00000005220 COQ10B (ENSPMRG00000005252) SF3B1 (ENSPMRG00000005261) ANKRD44 (ENSPMRG00000005384) ##22 PGAP1 (ENSPMRG00000006002) GTF3C3 (ENSPMRG00000006178) ENSPMRG00000006458 MPP4 (ENSPMRG00000006532) ALS2 (ENSPMRG00000006747) CDK15 (ENSPMRG00000006777) FZD7 (ENSPMRG00000006785) ENSPMRG00000006788 NOP58 (ENSPMRG00000006794) BMPR2 (ENSPMRG00000006815) ENSPMRG00000006832 ENSPMRG00000006842 WDR12 (ENSPMRG00000006856) ENSPMRG00000006909 CARF (ENSPMRG00000006921) Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 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ENSACAG00000045047 ENSACAG00000038919 ENSACAG00000044348 ENSACAG00000045055 ENSACAG00000035486 Elapidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183114.a.b.b.c.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.n ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000160464.l ENSGT00940000160464.k ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D Indian cobra MODERN SPECIES KCTD18 (ENSNNAG00000014023) SPATS2L (ENSNNAG00000014040) MAIP1 (ENSNNAG00000014058) TYW5 (ENSNNAG00000014077) C2orf69 (ENSNNAG00000006692) ENSNNAG00000006700 ##11 ENSNNAG00000006717 ##11 PLCL1 (ENSNNAG00000006743) BOLL (ENSNNAG00000006909) ##16 RFTN2 (ENSNNAG00000006926) ##17 MOB4 (ENSNNAG00000006969) HSPE1 (ENSNNAG00000006995) HSPD1 (ENSNNAG00000007012) COQ10B (ENSNNAG00000007040) SF3B1 (ENSNNAG00000007064) ANKRD44 (ENSNNAG00000007131) ##22 PGAP1 (ENSNNAG00000007275) GTF3C3 (ENSNNAG00000007525) CCDC150 (ENSNNAG00000007636) HECW2 (ENSNNAG00000007893) STK17B (ENSNNAG00000008143) ENSNNAG00000008194 ENSNNAG00000008235 ENSNNAG00000008270 ENSNNAG00000008331 SLC39A10 (ENSNNAG00000008425) TMEFF2 (ENSNNAG00000008498) CAVIN2 (ENSNNAG00000008538) NABP1 (ENSNNAG00000008554) ENSNNAG00000008583 ENSNNAG00000008614 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000183114.a.b.b.c.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.n ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 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7 KCTD18 (ENSPTXG00000004060) SPATS2L (ENSPTXG00000004073) MAIP1 (ENSPTXG00000004416) TYW5 (ENSPTXG00000004418) C2orf69 (ENSPTXG00000004419) ENSPTXG00000004420 ##11 ENSPTXG00000004422 PLCL1 (ENSPTXG00000004423) BOLL (ENSPTXG00000004425) ##16 RFTN2 (ENSPTXG00000004427) ##17 MOB4 (ENSPTXG00000004429) HSPE1 (ENSPTXG00000004431) HSPD1 (ENSPTXG00000004432) COQ10B (ENSPTXG00000004434) SF3B1 (ENSPTXG00000004437) ANKRD44 (ENSPTXG00000004451) ##22 PGAP1 (ENSPTXG00000006428) GTF3C3 (ENSPTXG00000006430) ENSPTXG00000006456 ENSPTXG00000006457 HECW2 (ENSPTXG00000006458) STK17B (ENSPTXG00000007586) DNAH7 (ENSPTXG00000007594) SLC39A10 (ENSPTXG00000008125) ENSPTXG00000008126 ENSPTXG00000008127 TMEFF2 (ENSPTXG00000008128) CAVIN2 (ENSPTXG00000008129) ENSPTXG00000008130 NABP1 (ENSPTXG00000008131) ENSPTXG00000008133 Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 5046 ENSLLTG00000004498 ##22 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 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ENSGT00940000153064.b ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.b ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00390000015052.j.b ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00790000123099 ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 Common wonbat MODERN SPECIES 1018 C2orf69 (ENSVURG00010016673) ENSVURG00010016695 SATB2 (ENSVURG00010016725) ##11 ENSVURG00010016787 ENSVURG00010016799 ENSVURG00010016811 PLCL1 (ENSVURG00010016821) BOLL (ENSVURG00010016845) ##16 MARS2 (ENSVURG00010016927) RFTN2 (ENSVURG00010016931) ##17 MOB4 (ENSVURG00010016938) ENSVURG00010016957 HSPD1 (ENSVURG00010016966) COQ10B (ENSVURG00010016979) SF3B1 (ENSVURG00010016994) ANKRD44 (ENSVURG00010017027) ##22 PGAP1 (ENSVURG00010017062) C2orf66 (ENSVURG00010017088) GTF3C3 (ENSVURG00010017104) ENSVURG00010017120 ENSVURG00010017139 HECW2 (ENSVURG00010017154) STK17B (ENSVURG00010017192) ENSVURG00010017203 ENSVURG00010017214 ENSVURG00010017232 ENSVURG00010017244 SLC39A10 (ENSVURG00010017250) ENSVURG00010017267 ENSVURG00010017277 ENSVURG00010017286 koala MODERN SPECIES 52 SATB2 (ENSPCIG00000011693) ##11 ENSPCIG00000014254 PLCL1 (ENSPCIG00000015570) ENSPCIG00000010605 ##16 MARS2 (ENSPCIG00000010610) RFTN2 (ENSPCIG00000010611) ##17 ENSPCIG00000010617 ENSPCIG00000010634 HSPD1 (ENSPCIG00000010636) COQ10B (ENSPCIG00000010639) ENSPCIG00000032633 SF3B1 (ENSPCIG00000010642) ANKRD44 (ENSPCIG00000010651) ##22 PGAP1 (ENSPCIG00000010659) GTF3C3 (ENSPCIG00000010674) ENSPCIG00000010684 ENSPCIG00000010690 ENSPCIG00000010694 HECW2 (ENSPCIG00000010702) STK17B (ENSPCIG00000010716) ENSPCIG00000010727 DNAH7 (ENSPCIG00000010721) SLC39A10 (ENSPCIG00000010730) ENSPCIG00000022189 ENSPCIG00000016054 ENSPCIG00000035831 TMEFF2 (ENSPCIG00000025114) CAVIN2 (ENSPCIG00000025115) Wallaby MODERN SPECIES 6502 ENSMEUG00000011022 ##22 Tasmanian devil MODERN SPECIES 2 SPATS2L (ENSSHAG00000016122) MAIP1 (ENSSHAG00000014443) TYW5 (ENSSHAG00000014351) C2orf69 (ENSSHAG00000014333) FTCDNL1 (ENSSHAG00000013838) SATB2 (ENSSHAG00000011077) ##11 PLCL1 (ENSSHAG00000018454) BOLL (ENSSHAG00000018057) ##16 RFTN2 (ENSSHAG00000017876) ##17 MARS2 (ENSSHAG00000017980) MOB4 (ENSSHAG00000017821) HSPE1 (ENSSHAG00000017770) HSPD1 (ENSSHAG00000017750) COQ10B (ENSSHAG00000017719) SF3B1 (ENSSHAG00000017564) 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(ENSMODG00000012121) DNAH7 (ENSMODG00000012112) SLC39A10 (ENSMODG00000012046) ENSMODG00000027636 ENSMODG00000024640 ENSMODG00000024642 ENSMODG00000029177 ENSMODG00000044100 ENSMODG00000029075 TMEFF2 (ENSMODG00000011908) Eutheria ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.c.b ENSGT00390000005727.a.b.a.b ENSGT00940000167249 ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.b ENSGT00390000005727.a.b.a.b ENSGT00940000167249 ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00950000185696 ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00950000185696 ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00950000185696 ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D Equus ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00390000005254.i.a.b ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00580000082664.a.a ENSGT00940000153298.n.q.g.a ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00950000185696 ENSGT00940000155812 Donkey MODERN SPECIES 24 TYW5 (ENSEASG00005026976) C2orf69 (ENSEASG00005031146) ENSEASG00005020080 ENSEASG00005029514 ##11 PLCL1 (ENSEASG00005020113) ENSEASG00005020114 BOLL (ENSEASG00005020122) ##16 MARS2 (ENSEASG00005020133) RFTN2 (ENSEASG00005020136) ##17 MOB4 (ENSEASG00005020142) HSPE1 (ENSEASG00005034821) ENSEASG00005020152 COQ10B (ENSEASG00005032559) SF3B1 (ENSEASG00005020159) ENSEASG00005020167 ANKRD44 (ENSEASG00005020169) ##22 PGAP1 (ENSEASG00005020202) C2orf66 (ENSEASG00005029887) GTF3C3 (ENSEASG00005020250) CCDC150 (ENSEASG00005020257) HECW2 (ENSEASG00005020398) STK17B (ENSEASG00005020775) DNAH7 (ENSEASG00005020795) SLC39A10 (ENSEASG00005020825) ENSEASG00005025902 ENSEASG00005029879 ENSEASG00005020854 CAVIN2 (ENSEASG00005027165) ENSEASG00005023585 NABP1 (ENSEASG00005020861) MYO1B (ENSEASG00005020872) Horse MODERN SPECIES 9 C18H2orf69 (ENSECAG00000014107) ENSECAG00000013663 SATB2 (ENSECAG00000010043) ##11 ENSECAG00000058569 BOLL (ENSECAG00000040654) ##16 PLCL1 (ENSECAG00000007274) MARS2 (ENSECAG00000004931) RFTN2 (ENSECAG00000021296) ##17 MOB4 (ENSECAG00000015560) ENSECAG00000055696 ENSECAG00000049872 HSPD1 (ENSECAG00000008968) COQ10B (ENSECAG00000006436) SF3B1 (ENSECAG00000021657) ENSECAG00000034847 ANKRD44 (ENSECAG00000008835) ##22 PGAP1 (ENSECAG00000019980) C2orf66 (ENSECAG00000058124) GTF3C3 (ENSECAG00000014763) CCDC150 (ENSECAG00000010941) ENSECAG00000047100 HECW2 (ENSECAG00000000544) STK17B (ENSECAG00000000520) DNAH7 (ENSECAG00000009699) SLC39A10 (ENSECAG00000006518) ENSECAG00000059223 ENSECAG00000053879 ENSECAG00000003944 ENSECAG00000049056 TMEFF2 (ENSECAG00000020863) CAVIN2 (ENSECAG00000055807) Chiroptera DUPLICATION Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182908.D.e ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182908.D.e ##22 Microbat MODERN SPECIES 718 ENSMLUG00000025527 ##22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.b ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367.r ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D.f ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b Megabat MODERN SPECIES 172 ANKRD44 (ENSPVAG00000004916) ##22 PGAP1 (ENSPVAG00000004908) C2orf66 (ENSPVAG00000004906) GTF3C3 (ENSPVAG00000004898) Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.d ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367.r ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D.f ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b ENSGT00390000006330.a.a Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 26 MAIP1 (ENSRFEG00010022032) TYW5 (ENSRFEG00010022036) C2orf69 (ENSRFEG00010022039) FTCDNL1 (ENSRFEG00010022040) SATB2 (ENSRFEG00010022046) ##11 PLCL1 (ENSRFEG00010022056) BOLL (ENSRFEG00010022065) ##16 MARS2 (ENSRFEG00010022069) RFTN2 (ENSRFEG00010022072) ##17 ENSRFEG00010022073 MOB4 (ENSRFEG00010022077) ENSRFEG00010022080 HSPD1 (ENSRFEG00010022083) ENSRFEG00010022086 SF3B1 (ENSRFEG00010022087) ANKRD44 (ENSRFEG00010022091) ##22 PGAP1 (ENSRFEG00010022103) GTF3C3 (ENSRFEG00010022114) CCDC150 (ENSRFEG00010022122) HECW2 (ENSRFEG00010022130) STK17B (ENSRFEG00010022132) ENSRFEG00010022133 ENSRFEG00010022135 ENSRFEG00010022136 ENSRFEG00010022138 SLC39A10 (ENSRFEG00010009668) ENSRFEG00010009699 TMEFF2 (ENSRFEG00010009756) CAVIN2 (ENSRFEG00010009836) ENSRFEG00010009876 NABP1 (ENSRFEG00010009903) Microbat MODERN SPECIES 940 MAIP1 (ENSMLUG00000015960) TYW5 (ENSMLUG00000015955) C2orf69 (ENSMLUG00000026751) ENSMLUG00000011411 SATB2 (ENSMLUG00000001554) ##11 PLCL1 (ENSMLUG00000002677) BOLL (ENSMLUG00000004999) ##16 RFTN2 (ENSMLUG00000004991) ##17 MOB4 (ENSMLUG00000004971) ENSMLUG00000000883 HSPE1 (ENSMLUG00000000878) ENSMLUG00000000871 COQ10B (ENSMLUG00000000865) SF3B1 (ENSMLUG00000000840) ENSMLUG00000005254 ANKRD44 (ENSMLUG00000010842) ##22 PGAP1 (ENSMLUG00000010784) GTF3C3 (ENSMLUG00000024692) CCDC150 (ENSMLUG00000001986) HECW2 (ENSMLUG00000007654) STK17B (ENSMLUG00000007648) DNAH7 (ENSMLUG00000007538) SLC39A10 (ENSMLUG00000007527) ENSMLUG00000028828 TMEFF2 (ENSMLUG00000007530) CAVIN2 (ENSMLUG00000015774) NABP1 (ENSMLUG00000012075) MYO1B (ENSMLUG00000000058) ENSMLUG00000000057 STAT1 (ENSMLUG00000010083) ENSMLUG00000010045 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b Caniformia ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00390000004856.w.b ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b Ursidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00390000004856.w.b ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393.p ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b Ursus ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00940000154276.kb.a.b ENSGT00390000004856.w.b ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393.p ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b ENSGT00390000006330.a.a Polar bear MODERN SPECIES 142 TYW5 (ENSUMAG00000021039) C2orf69 (ENSUMAG00000021037) FTCDNL1 (ENSUMAG00000021033) SATB2 (ENSUMAG00000021003) ##11 PLCL1 (ENSUMAG00000020984) ENSUMAG00000020978 ENSUMAG00000020976 BOLL (ENSUMAG00000020969) ##16 MARS2 (ENSUMAG00000020961) RFTN2 (ENSUMAG00000020958) ##17 MOB4 (ENSUMAG00000020955) HSPE1 (ENSUMAG00000020954) HSPD1 (ENSUMAG00000020952) COQ10B (ENSUMAG00000020949) SF3B1 (ENSUMAG00000020945) ANKRD44 (ENSUMAG00000020937) ##22 PGAP1 (ENSUMAG00000020815) GTF3C3 (ENSUMAG00000020787) CCDC150 (ENSUMAG00000020726) HECW2 (ENSUMAG00000020667) STK17B (ENSUMAG00000020656) DNAH7 (ENSUMAG00000020608) SLC39A10 (ENSUMAG00000020598) ENSUMAG00000020590 TMEFF2 (ENSUMAG00000020561) CAVIN2 (ENSUMAG00000020543) NABP1 (ENSUMAG00000020526) MYO1B (ENSUMAG00000020489) ENSUMAG00000020444 ENSUMAG00000020405 STAT1 (ENSUMAG00000019696) Giant Panda MODERN SPECIES 11 MAIP1 (ENSAMEG00000005390) TYW5 (ENSAMEG00000005386) C2orf69 (ENSAMEG00000005381) ENSAMEG00000023460 SATB2 (ENSAMEG00000005350) ##11 ENSAMEG00000019732 PLCL1 (ENSAMEG00000013707) BOLL (ENSAMEG00000013712) ##16 MARS2 (ENSAMEG00000019748) RFTN2 (ENSAMEG00000013737) ##17 MOB4 (ENSAMEG00000013751) ENSAMEG00000013769 HSPD1 (ENSAMEG00000013770) COQ10B (ENSAMEG00000013802) SF3B1 (ENSAMEG00000013809) ANKRD44 (ENSAMEG00000013836) ##22 PGAP1 (ENSAMEG00000013887) C2orf66 (ENSAMEG00000013924) GTF3C3 (ENSAMEG00000013925) CCDC150 (ENSAMEG00000013946) HECW2 (ENSAMEG00000004852) STK17B (ENSAMEG00000004835) DNAH7 (ENSAMEG00000004749) SLC39A10 (ENSAMEG00000004715) TMEFF2 (ENSAMEG00000014303) CAVIN2 (ENSAMEG00000026812) NABP1 (ENSAMEG00000014286) MYO1B (ENSAMEG00000014214) STAT1 (ENSAMEG00000014048) GLS (ENSAMEG00000014002) ENSAMEG00000013991 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b 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ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00950000185696 ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D Suina ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.b ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b Pig MODERN SPECIES 6 ENSSSCG00000016085 SATB2 (ENSSSCG00000021657) ##11 ENSSSCG00000041534 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##22 PGAP1 (ENSCWAG00000007386) C2orf66 (ENSCWAG00000007349) GTF3C3 (ENSCWAG00000007298) CCDC150 (ENSCWAG00000007141) HECW2 (ENSCWAG00000006914) STK17B (ENSCWAG00000006865) DNAH7 (ENSCWAG00000006496) SLC39A10 (ENSCWAG00000006425) ENSCWAG00000006400 TMEFF2 (ENSCWAG00000013139) CAVIN2 (ENSCWAG00000013094) NABP1 (ENSCWAG00000013016) MYO1B (ENSCWAG00000012353) STAT4 (ENSCWAG00000012106) STAT1 (ENSCWAG00000011618) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 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ENSPSNG00000019397 SATB2 (ENSPSNG00000019498) ##11 ENSPSNG00000019635 PLCL1 (ENSPSNG00000019688) ENSPSNG00000019773 BOLL (ENSPSNG00000019819) ##16 MARS2 (ENSPSNG00000020001) RFTN2 (ENSPSNG00000020023) ##17 MOB4 (ENSPSNG00000020101) HSPD1 (ENSPSNG00000020243) ENSPSNG00000020315 COQ10B (ENSPSNG00000020376) SF3B1 (ENSPSNG00000020453) ANKRD44 (ENSPSNG00000020570) ##22 PGAP1 (ENSPSNG00000020691) C2orf66 (ENSPSNG00000020837) GTF3C3 (ENSPSNG00000002123) ENSPSNG00000002154 ENSPSNG00000002190 HECW2 (ENSPSNG00000002242) STK17B (ENSPSNG00000002351) DNAH7 (ENSPSNG00000002449) SLC39A10 (ENSPSNG00000002609) TMEFF2 (ENSPSNG00000002652) CAVIN2 (ENSPSNG00000002672) NABP1 (ENSPSNG00000002707) MYO1B (ENSPSNG00000002795) ENSPSNG00000002855 STAT4 (ENSPSNG00000002881) Dolphin MODERN SPECIES 808 BOLL (ENSTTRG00000003422) ##16 MARS2 (ENSTTRG00000003421) RFTN2 (ENSTTRG00000003420) ##17 HSPE1 (ENSTTRG00000003419) ENSTTRG00000003418 HSPD1 (ENSTTRG00000003417) COQ10B (ENSTTRG00000003416) SF3B1 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ENSPCTG00005019707 Blue whale MODERN SPECIES 18 MAIP1 (ENSBMSG00010003193) TYW5 (ENSBMSG00010003179) C2orf69 (ENSBMSG00010003167) FTCDNL1 (ENSBMSG00010003148) SATB2 (ENSBMSG00010003076) ##11 PLCL1 (ENSBMSG00010002964) BOLL (ENSBMSG00010002886) ##16 MARS2 (ENSBMSG00010002857) RFTN2 (ENSBMSG00010002848) ##17 MOB4 (ENSBMSG00010002811) ENSBMSG00010002778 HSPD1 (ENSBMSG00010002754) COQ10B (ENSBMSG00010002718) SF3B1 (ENSBMSG00010002624) ENSBMSG00010002564 ANKRD44 (ENSBMSG00010002506) ##22 PGAP1 (ENSBMSG00010002370) C2orf66 (ENSBMSG00010002279) GTF3C3 (ENSBMSG00010002241) CCDC150 (ENSBMSG00010002134) HECW2 (ENSBMSG00010002072) STK17B (ENSBMSG00010002050) ENSBMSG00010002034 ENSBMSG00010002011 SLC39A10 (ENSBMSG00010001997) TMEFF2 (ENSBMSG00010001907) CAVIN2 (ENSBMSG00010001879) ENSBMSG00010001861 NABP1 (ENSBMSG00010001809) MYO1B (ENSBMSG00010001191) STAT4 (ENSBMSG00010000867) Pecora ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 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ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E Siberian musk deer MODERN SPECIES 349 MARS2 (ENSMMSG00000011601) RFTN2 (ENSMMSG00000011573) ##17 MOB4 (ENSMMSG00000011395) ENSMMSG00000011286 HSPD1 (ENSMMSG00000011233) COQ10B (ENSMMSG00000011136) SF3B1 (ENSMMSG00000011033) ANKRD44 (ENSMMSG00000010957) ##22 PGAP1 (ENSMMSG00000010803) C2orf66 (ENSMMSG00000010760) GTF3C3 (ENSMMSG00000010673) ENSMMSG00000010610 ENSMMSG00000010586 ENSMMSG00000010563 HECW2 (ENSMMSG00000010520) STK17B (ENSMMSG00000010475) ENSMMSG00000010454 DNAH7 (ENSMMSG00000010078) SLC39A10 (ENSMMSG00000010018) Bovidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367.t ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT01030000235049 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D Caprinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000158493.h ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.e ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367.s ENSGT00940000155367.t ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT01030000235049 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E Goat MODERN SPECIES 11 ENSCHIG00000017324 ENSCHIG00000011016 FTCDNL1 (ENSCHIG00000022126) SATB2 (ENSCHIG00000022376) ##11 PLCL1 (ENSCHIG00000013331) ENSCHIG00000011685 ENSCHIG00000021317 BOLL (ENSCHIG00000024995) ##16 MARS2 (ENSCHIG00000016548) RFTN2 (ENSCHIG00000012903) ##17 ENSCHIG00000026973 HSPE1 (ENSCHIG00000009467) HSPD1 (ENSCHIG00000004382) ENSCHIG00000020913 SF3B1 (ENSCHIG00000015226) ANKRD44 (ENSCHIG00000017665) ##22 ENSCHIG00000012550 PGAP1 (ENSCHIG00000018177) GTF3C3 (ENSCHIG00000016485) CCDC150 (ENSCHIG00000010518) HECW2 (ENSCHIG00000012868) STK17B (ENSCHIG00000013934) DNAH7 (ENSCHIG00000010331) SLC39A10 (ENSCHIG00000013836) ENSCHIG00000011156 ENSCHIG00000023149 ENSCHIG00000009122 TMEFF2 (ENSCHIG00000024847) CAVIN2 (ENSCHIG00000019774) NABP1 (ENSCHIG00000025573) MYO1B (ENSCHIG00000013498) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 11 SATB2 (ENSOARG00020013534) ##11 ENSOARG00020013422 ENSOARG00020013393 ENSOARG00020013380 ENSOARG00020013353 ENSOARG00020013326 ENSOARG00020013287 BOLL (ENSOARG00020012643) ##16 MARS2 (ENSOARG00020012596) RFTN2 (ENSOARG00020012524) ##17 ENSOARG00020012334 HSP10 (ENSOARG00020012227) ENSOARG00020012172 COQ10B (ENSOARG00020011999) SF3B1 (ENSOARG00020011806) ANKRD44 (ENSOARG00020010197) ##22 PGAP1 (ENSOARG00020009268) C2orf66 (ENSOARG00020009210) GTF3C3 (ENSOARG00020009036) ENSOARG00020008885 HECW2 (ENSOARG00020008825) STK17B (ENSOARG00020008783) ENSOARG00020008748 DNAH7 (ENSOARG00020008105) SLC39A10 (ENSOARG00020008005) ENSOARG00020007907 ENSOARG00020007893 TMEFF2 (ENSOARG00020007844) CAVIN2 (ENSOARG00020007809) ENSOARG00020007703 MYO1B (ENSOARG00020007023) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367.t ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00390000012078.b.v ENSGT01030000235049 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 American bison MODERN SPECIES 3330 MAIP1 (ENSBBBG00000001643) TYW5 (ENSBBBG00000013257) C2orf69 (ENSBBBG00000002681) FTCDNL1 (ENSBBBG00000008285) SATB2 (ENSBBBG00000013343) ##11 PLCL1 (ENSBBBG00000002738) BOLL (ENSBBBG00000013412) ##16 MARS2 (ENSBBBG00000013415) RFTN2 (ENSBBBG00000002765) ##17 MOB4 (ENSBBBG00000013501) ENSBBBG00000013516 HSPD1 (ENSBBBG00000013534) ENSBBBG00000007252 ENSBBBG00000013596 ENSBBBG00000013601 ANKRD44 (ENSBBBG00000013667) ##22 PGAP1 (ENSBBBG00000013723) C2orf66 (ENSBBBG00000013730) GTF3C3 (ENSBBBG00000002934) ENSBBBG00000013757 ENSBBBG00000013767 HECW2 (ENSBBBG00000013842) STK17B (ENSBBBG00000013858) DNAH7 (ENSBBBG00000013934) SLC39A10 (ENSBBBG00000013954) ENSBBBG00000013958 ENSBBBG00000013964 TMEFF2 (ENSBBBG00000003061) CAVIN2 (ENSBBBG00000013974) NABP1 (ENSBBBG00000003073) ENSBBBG00000003077 Bos ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.g ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367.t ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00390000012078.b.v ENSGT01030000235049 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01100000263480.a.b.a.b.a.a.b.a.a.a.a.a Bos_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.g ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367.t ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00390000012078.b.v ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01100000263480.a.b.a.b.a.a.b.a.a.a.a.a ENSGT01050000244905.D Domestic yak MODERN SPECIES 11 MAIP1 (ENSBGRG00000026693) TYW5 (ENSBGRG00000026697) C2orf69 (ENSBGRG00000026703) FTCDNL1 (ENSBGRG00000026708) SATB2 (ENSBGRG00000026716) ##11 ENSBGRG00000000192 PLCL1 (ENSBGRG00000000210) BOLL (ENSBGRG00000000262) ##16 MARS2 (ENSBGRG00000000375) RFTN2 (ENSBGRG00000000406) ##17 ENSBGRG00000000487 HSPE1 (ENSBGRG00000000521) HSPD1 (ENSBGRG00000000539) COQ10B (ENSBGRG00000000566) SF3B1 (ENSBGRG00000000604) ANKRD44 (ENSBGRG00000000733) ##22 PGAP1 (ENSBGRG00000000882) C2orf66 (ENSBGRG00000001016) GTF3C3 (ENSBGRG00000001029) ENSBGRG00000001058 CCDC150 (ENSBGRG00000001090) HECW2 (ENSBGRG00000001305) ENSBGRG00000001327 STK17B (ENSBGRG00000001329) DNAH7 (ENSBGRG00000001376) ENSBGRG00000001446 SLC39A10 (ENSBGRG00000001456) ENSBGRG00000001477 TMEFF2 (ENSBGRG00000001495) CAVIN2 (ENSBGRG00000001540) NABP1 (ENSBGRG00000001561) Wild yak MODERN SPECIES 666 ENSBMUG00000010105 BOLL (ENSBMUG00000010078) ##16 MARS2 (ENSBMUG00000010049) ENSBMUG00000010038 ##17 ENSBMUG00000010029 ##17 ENSBMUG00000010020 HSPE1 (ENSBMUG00000010011) HSPD1 (ENSBMUG00000009989) COQ10B (ENSBMUG00000009973) SF3B1 (ENSBMUG00000009914) ANKRD44 (ENSBMUG00000009842) ##22 PGAP1 (ENSBMUG00000009744) C2orf66 (ENSBMUG00000009657) GTF3C3 (ENSBMUG00000009649) Bos_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.g ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b.a ENSGT00940000155367.t ENSGT00390000018393 ENSGT00940000162534.b ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00390000012078.b.v ENSGT01030000235049 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01100000263480.a.b.a.b.a.a.b.a.a.a.a.a Cow MODERN SPECIES 11 MAIP1 (ENSBTAG00000019231) TYW5 (ENSBTAG00000019232) C2H2orf69 (ENSBTAG00000009952) ENSBTAG00000031595 SATB2 (ENSBTAG00000016334) ##11 PLCL1 (ENSBTAG00000007635) BOLL (ENSBTAG00000031614) ##16 MARS2 (ENSBTAG00000002056) RFTN2 (ENSBTAG00000007652) ##17 MOB4 (ENSBTAG00000019116) HSPE1 (ENSBTAG00000012589) HSPD1 (ENSBTAG00000012586) COQ10B (ENSBTAG00000004659) SF3B1 (ENSBTAG00000008915) ENSBTAG00000012171 ANKRD44 (ENSBTAG00000031696) ##22 PGAP1 (ENSBTAG00000020416) GTF3C3 (ENSBTAG00000007779) CCDC150 (ENSBTAG00000017695) HECW2 (ENSBTAG00000020696) STK17B (ENSBTAG00000013196) DNAH7 (ENSBTAG00000016784) SLC39A10 (ENSBTAG00000016782) ENSBTAG00000009976 ENSBTAG00000048361 ENSBTAG00000047783 TMEFF2 (ENSBTAG00000014832) CAVIN2 (ENSBTAG00000018497) NABP1 (ENSBTAG00000018653) MYO1B (ENSBTAG00000011256) STAT4 (ENSBTAG00000046699) Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 11 TYW5 (ENSBIXG00005008805) C2orf69 (ENSBIXG00005008818) FTCDNL1 (ENSBIXG00005008837) SATB2 (ENSBIXG00005008954) ##11 PLCL1 (ENSBIXG00005009092) ENSBIXG00005009140 BOLL (ENSBIXG00005009209) ##16 MARS2 (ENSBIXG00005009234) RFTN2 (ENSBIXG00005009241) ##17 MOB4 (ENSBIXG00005009278) ENSBIXG00005009301 ENSBIXG00005009345 COQ10B (ENSBIXG00005009394) SF3B1 (ENSBIXG00005000503) ENSBIXG00005009496 ANKRD44 (ENSBIXG00005009540) ##22 PGAP1 (ENSBIXG00005009684) C2orf66 (ENSBIXG00005009722) GTF3C3 (ENSBIXG00005005945) CCDC150 (ENSBIXG00005006499) HECW2 (ENSBIXG00005000763) STK17B (ENSBIXG00005010089) DNAH7 (ENSBIXG00005010123) SLC39A10 (ENSBIXG00005000815) ENSBIXG00005010274 ENSBIXG00005000832 ENSBIXG00005010317 ENSBIXG00005000844 TMEFF2 (ENSBIXG00005000872) ENSBIXG00005010536 MYO1B (ENSBIXG00005010764) Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182908.D ##22 Hedgehog MODERN SPECIES 5034 ANKRD44 (ENSEEUG00000014127) ##22 Common shrew MODERN SPECIES 3779 ANKRD44 (ENSSARG00000008810) ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.b.b ENSGT01050000244956.b.c.a ENSGT00390000006350.m.b ENSGT00940000167249 ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E Primates ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.c.a ENSGT00390000006350.m.b ENSGT00940000167249 ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.c.a ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b Tarsier MODERN SPECIES 952 ANKRD44 (ENSTSYG00000013629) ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.c.a ENSGT00390000006350.m.a.c.a.mb ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000000950.c.b.d.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.c.a.a ENSGT00390000006350.m.a.c.a.mb ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a ENSGT00940000155367.w ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00940000160312.f ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT00940000154958.lb.b Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000000950.c.b.d.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.c.a.a ENSGT00390000006350.m.a.c.a.mb.a.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.b.a ENSGT00390000006350.m.a.c.a.mb.b ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a ENSGT00940000155367.w ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00940000160312.f ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT00940000154958.lb.b Gibbon MODERN SPECIES 14 MAIP1 (ENSNLEG00000029234) TYW5 (ENSNLEG00000031551) C2orf69 (ENSNLEG00000031645) FTCDNL1 (ENSNLEG00000029410) SATB2 (ENSNLEG00000006893) ##11 PLCL1 (ENSNLEG00000006890) BOLL (ENSNLEG00000006885) ##16 MARS2 (ENSNLEG00000018752) RFTN2 (ENSNLEG00000006883) ##17 MOB4 (ENSNLEG00000006881) ENSNLEG00000030370 ENSNLEG00000006874 ENSNLEG00000029205 COQ10B (ENSNLEG00000006871) SF3B1 (ENSNLEG00000006861) ANKRD44 (ENSNLEG00000006855) ##22 PGAP1 (ENSNLEG00000006849) C2orf66 (ENSNLEG00000006848) GTF3C3 (ENSNLEG00000006837) ENSNLEG00000006833 HECW2 (ENSNLEG00000006821) STK17B (ENSNLEG00000006813) ENSNLEG00000033012 DNAH7 (ENSNLEG00000006803) SLC39A10 (ENSNLEG00000006791) ENSNLEG00000028697 ENSNLEG00000034807 ENSNLEG00000035441 ENSNLEG00000031318 TMEFF2 (ENSNLEG00000006778) ENSNLEG00000013541 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000000950.c.b.d.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.c.a.a ENSGT00390000006350.m.a.c.a.mb.a.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.b.a ENSGT00390000006350.m.a.c.a.mb.b ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a ENSGT00940000155367.w ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00940000160312.f ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT00940000154958.lb.b Orangutan MODERN SPECIES 15 MAIP1 (ENSPPYG00000035692) TYW5 (ENSPPYG00000033416) C2orf69 (ENSPPYG00000013054) FTCDNL1 (ENSPPYG00000033061) SATB2 (ENSPPYG00000013052) ##11 PLCL1 (ENSPPYG00000039108) BOLL (ENSPPYG00000037688) ##16 MARS2 (ENSPPYG00000013049) ENSPPYG00000041557 RFTN2 (ENSPPYG00000013048) ##17 MOB4 (ENSPPYG00000013047) HSPE1 (ENSPPYG00000025876) HSPD1 (ENSPPYG00000013046) COQ10B (ENSPPYG00000039065) SF3B1 (ENSPPYG00000013044) ANKRD44 (ENSPPYG00000013043) ##22 PGAP1 (ENSPPYG00000013042) C2orf66 (ENSPPYG00000037735) GTF3C3 (ENSPPYG00000013040) CCDC150 (ENSPPYG00000013039) HECW2 (ENSPPYG00000013038) STK17B (ENSPPYG00000013037) DNAH7 (ENSPPYG00000013036) SLC39A10 (ENSPPYG00000030265) TMEFF2 (ENSPPYG00000013032) CAVIN2 (ENSPPYG00000013031) NABP1 (ENSPPYG00000030949) MYO1B (ENSPPYG00000013029) STAT4 (ENSPPYG00000013028) STAT1 (ENSPPYG00000013027) GLS (ENSPPYG00000013026) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000000950.c.b.d.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.c.a.a ENSGT00390000006350.m.a.c.a.mb.a.a ENSGT00390000006350.m.a.c.a.mb.b ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a ENSGT00940000155367.w ENSGT00390000018393 ENSGT00940000157455.i.b ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00940000160312.f ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT00940000154958.lb.b Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000000950.c.b.d.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.c.a.a ENSGT00390000006350.m.a.c.a.mb.a.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a ENSGT00940000155367.w ENSGT00390000018393 ENSGT00940000157455.i.b ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00940000160312.f ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT00940000154958.lb.b Pan ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000000950.c.b.d.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.c.a.a ENSGT00390000006350.m.a.c.a.mb.a.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a ENSGT00940000155367.w ENSGT00390000018393 ENSGT00940000157455.i.b ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00940000160312.f ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT00940000154958.lb.b Bonobo MODERN SPECIES 15 C2orf69 (ENSPPAG00000035529) FTCDNL1 (ENSPPAG00000020283) ENSPPAG00000039843 SATB2 (ENSPPAG00000044026) ##11 PLCL1 (ENSPPAG00000042453) BOLL (ENSPPAG00000033757) ##16 MARS2 (ENSPPAG00000007220) RFTN2 (ENSPPAG00000026815) ##17 MOB4 (ENSPPAG00000044023) ENSPPAG00000023895 HSPD1 (ENSPPAG00000038858) COQ10B (ENSPPAG00000010452) SF3B1 (ENSPPAG00000035007) ENSPPAG00000043776 ENSPPAG00000042224 ANKRD44 (ENSPPAG00000033556) ##22 PGAP1 (ENSPPAG00000039254) C2orf66 (ENSPPAG00000029492) GTF3C3 (ENSPPAG00000002745) CCDC150 (ENSPPAG00000038945) HECW2 (ENSPPAG00000033901) STK17B (ENSPPAG00000023641) ENSPPAG00000040576 DNAH7 (ENSPPAG00000039511) SLC39A10 (ENSPPAG00000042493) ENSPPAG00000043506 TMEFF2 (ENSPPAG00000008977) ENSPPAG00000043388 CAVIN2 (ENSPPAG00000041899) NABP1 (ENSPPAG00000016940) MYO1B (ENSPPAG00000039631) Chimpanzee MODERN SPECIES 15 TYW5 (ENSPTRG00000012783) C2orf69 (ENSPTRG00000012782) FTCDNL1 (ENSPTRG00000047502) ENSPTRG00000050460 SATB2 (ENSPTRG00000012779) ##11 PLCL1 (ENSPTRG00000012778) BOLL (ENSPTRG00000012777) ##16 MARS2 (ENSPTRG00000047853) RFTN2 (ENSPTRG00000012776) ##17 MOB4 (ENSPTRG00000012775) HSPE1 (ENSPTRG00000012774) HSPD1 (ENSPTRG00000044665) COQ10B (ENSPTRG00000012772) SF3B1 (ENSPTRG00000012771) ENSPTRG00000049270 ANKRD44 (ENSPTRG00000012770) ##22 PGAP1 (ENSPTRG00000012769) C2BH2orf66 (ENSPTRG00000012768) GTF3C3 (ENSPTRG00000012767) CCDC150 (ENSPTRG00000012765) HECW2 (ENSPTRG00000012764) STK17B (ENSPTRG00000012763) ENSPTRG00000047674 DNAH7 (ENSPTRG00000012761) SLC39A10 (ENSPTRG00000012760) ENSPTRG00000048383 TMEFF2 (ENSPTRG00000012756) CAVIN2 (ENSPTRG00000012755) NABP1 (ENSPTRG00000012754) MYO1B (ENSPTRG00000023453) STAT4 (ENSPTRG00000047534) Human MODERN SPECIES 11 MAIP1 (ENSG00000162972) TYW5 (ENSG00000162971) C2orf69 (ENSG00000178074) FTCDNL1 (ENSG00000226124) SATB2 (ENSG00000119042) ##11 PLCL1 (ENSG00000115896) BOLL (ENSG00000152430) ##16 MARS2 (ENSG00000247626) RFTN2 (ENSG00000162944) ##17 MOB4 (ENSG00000115540) HSPE1-MOB4 (ENSG00000270757) HSPE1 (ENSG00000115541) HSPD1 (ENSG00000144381) COQ10B (ENSG00000115520) SF3B1 (ENSG00000115524) ANKRD44 (ENSG00000065413) ##22 PGAP1 (ENSG00000197121) C2orf66 (ENSG00000187944) GTF3C3 (ENSG00000119041) CCDC150 (ENSG00000144395) HECW2 (ENSG00000138411) STK17B (ENSG00000081320) DNAH7 (ENSG00000118997) SLC39A10 (ENSG00000196950) TMEFF2 (ENSG00000144339) CAVIN2 (ENSG00000168497) NABP1 (ENSG00000173559) MYO1B (ENSG00000128641) STAT4 (ENSG00000138378) STAT1 (ENSG00000115415) GLS (ENSG00000115419) Gorilla MODERN SPECIES 15 TYW5 (ENSGGOG00000041719) C2orf69 (ENSGGOG00000005649) FTCDNL1 (ENSGGOG00000040488) ENSGGOG00000044011 SATB2 (ENSGGOG00000014123) ##11 PLCL1 (ENSGGOG00000001959) BOLL (ENSGGOG00000013594) ##16 MARS2 (ENSGGOG00000034895) RFTN2 (ENSGGOG00000009318) ##17 MOB4 (ENSGGOG00000036779) HSPE1 (ENSGGOG00000027944) HSPD1 (ENSGGOG00000008267) COQ10B (ENSGGOG00000039158) SF3B1 (ENSGGOG00000009264) ENSGGOG00000038007 ANKRD44 (ENSGGOG00000014558) ##22 PGAP1 (ENSGGOG00000001785) C2orf66 (ENSGGOG00000038009) GTF3C3 (ENSGGOG00000011787) CCDC150 (ENSGGOG00000010004) HECW2 (ENSGGOG00000013295) STK17B (ENSGGOG00000016830) DNAH7 (ENSGGOG00000008893) ENSGGOG00000037015 SLC39A10 (ENSGGOG00000008154) ENSGGOG00000041675 TMEFF2 (ENSGGOG00000007989) ENSGGOG00000015813 CAVIN2 (ENSGGOG00000001639) NABP1 (ENSGGOG00000036855) MYO1B (ENSGGOG00000002321) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000000950.c.b.d.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00390000000854.c.b.k.a.a.b ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.c.a.a ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a.mb ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a ENSGT00940000155367.w ENSGT00390000018393 ENSGT00940000153941.a.a.h ENSGT00940000157455.i.b ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00940000160312.f ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT00940000154958.lb.b Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000000950.c.b.d.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00390000000854.c.b.k.a.a.b ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.c.a.a ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.b.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a ENSGT00940000155367.w ENSGT00390000018393 ENSGT00940000153941.a.a.h ENSGT00940000157455.i.b ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00940000160312.f ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT00940000154958.lb.b Vervet Monkey MODERN SPECIES 1 MAIP1 (ENSCSAG00000011334) TYW5 (ENSCSAG00000011351) C2orf69 (ENSCSAG00000011358) FTCDNL1 (ENSCSAG00000011372) SATB2 (ENSCSAG00000011380) ##11 PLCL1 (ENSCSAG00000011391) BOLL (ENSCSAG00000011399) ##16 MARS2 (ENSCSAG00000018765) RFTN2 (ENSCSAG00000011411) ##17 MOB4 (ENSCSAG00000011421) ENSCSAG00000011427 HSPD1 (ENSCSAG00000011463) COQ10B (ENSCSAG00000011483) SF3B1 (ENSCSAG00000011505) ENSCSAG00000011517 ANKRD44 (ENSCSAG00000011536) ##22 PGAP1 (ENSCSAG00000011561) C2orf66 (ENSCSAG00000011573) GTF3C3 (ENSCSAG00000011582) CCDC150 (ENSCSAG00000011637) HECW2 (ENSCSAG00000011673) STK17B (ENSCSAG00000011683) DNAH7 (ENSCSAG00000011927) SLC39A10 (ENSCSAG00000012006) ENSCSAG00000012018 TMEFF2 (ENSCSAG00000012029) CAVIN2 (ENSCSAG00000012033) NABP1 (ENSCSAG00000012038) MYO1B (ENSCSAG00000012057) STAT4 (ENSCSAG00000012146) STAT1 (ENSCSAG00000012191) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000000950.c.b.d.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00390000000854.c.b.k.a.a.b ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.c.a.a ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.b.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a ENSGT00940000155367.w ENSGT00390000018393 ENSGT00940000153941.a.a.h ENSGT00940000157455.i.b ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00390000014165.c.a.b.b.b.q.k ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00940000160312.f ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D Macaca ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000000950.c.b.d.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00390000000854.c.b.k.a.a.b ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.d ENSGT01050000244956.b.c.a.a ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.b.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a ENSGT00940000155367.w ENSGT00390000018393 ENSGT00940000153941.a.a.h ENSGT00940000157455.i.b ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00390000014165.c.a.b.b.b.q.k ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00940000160312.f ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00390000000854.c.b.k.a.a.b ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.d ENSGT01050000244956.b.c.a.a ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.b.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a.e ENSGT00940000155367.w ENSGT00390000018393 ENSGT00940000153941.a.a.h ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00390000000938.q ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT01100000263539.b.a.a.a.b.b.a.b.a.b.a.b.a ENSGT00940000156056.A ENSGT00940000160312.f ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 3 ENSMFAG00000038094 SATB2 (ENSMFAG00000035983) ##11 PLCL1 (ENSMFAG00000038838) BOLL (ENSMFAG00000030962) ##16 MARS2 (ENSMFAG00000012275) ENSMFAG00000003051 RFTN2 (ENSMFAG00000003082) ##17 ENSMFAG00000035530 ENSMFAG00000045023 ENSMFAG00000033000 COQ10B (ENSMFAG00000017910) ENSMFAG00000045829 SF3B1 (ENSMFAG00000036680) ENSMFAG00000057968 ENSMFAG00000057322 ANKRD44 (ENSMFAG00000032694) ##22 PGAP1 (ENSMFAG00000029122) C2orf66 (ENSMFAG00000035721) GTF3C3 (ENSMFAG00000030899) CCDC150 (ENSMFAG00000034579) HECW2 (ENSMFAG00000034346) ENSMFAG00000060880 STK17B (ENSMFAG00000031131) ENSMFAG00000050519 DNAH7 (ENSMFAG00000037848) SLC39A10 (ENSMFAG00000035991) ENSMFAG00000054433 TMEFF2 (ENSMFAG00000031535) ENSMFAG00000053515 CAVIN2 (ENSMFAG00000044151) NABP1 (ENSMFAG00000044164) Rhesus MODERN SPECIES 3 MAIP1 (ENSMMUG00000023168) TYW5 (ENSMMUG00000023167) C12H2orf69 (ENSMMUG00000041535) FTCDNL1 (ENSMMUG00000031310) SATB2 (ENSMMUG00000046254) ##11 ENSMMUG00000059853 PLCL1 (ENSMMUG00000012822) BOLL (ENSMMUG00000023811) ##16 MARS2 (ENSMMUG00000023810) RFTN2 (ENSMMUG00000023809) ##17 HSPE1 (ENSMMUG00000016547) HSPD1 (ENSMMUG00000010489) COQ10B (ENSMMUG00000056418) ENSMMUG00000058328 SF3B1 (ENSMMUG00000022430) ANKRD44 (ENSMMUG00000022425) ##22 PGAP1 (ENSMMUG00000043369) C2H2orf66 (ENSMMUG00000054516) GTF3C3 (ENSMMUG00000008643) CCDC150 (ENSMMUG00000015970) ENSMMUG00000057312 ##9 HECW2 (ENSMMUG00000005627) STK17B (ENSMMUG00000057432) ENSMMUG00000064727 DNAH7 (ENSMMUG00000005622) SLC39A10 (ENSMMUG00000005621) ENSMMUG00000063152 ENSMMUG00000050026 ENSMMUG00000064402 ENSMMUG00000056319 TMEFF2 (ENSMMUG00000001475) Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 409 C2orf69 (ENSMNEG00000035266) FTCDNL1 (ENSMNEG00000037918) ENSMNEG00000040066 SATB2 (ENSMNEG00000043012) ##11 PLCL1 (ENSMNEG00000019208) BOLL (ENSMNEG00000033015) ##16 MARS2 (ENSMNEG00000019593) RFTN2 (ENSMNEG00000033769) ##17 ENSMNEG00000033689 MOB4 (ENSMNEG00000033188) ENSMNEG00000039279 ENSMNEG00000043358 COQ10B (ENSMNEG00000032409) SF3B1 (ENSMNEG00000042333) ENSMNEG00000036998 ANKRD44 (ENSMNEG00000043273) ##22 ENSMNEG00000045145 PGAP1 (ENSMNEG00000033082) C2orf66 (ENSMNEG00000038376) GTF3C3 (ENSMNEG00000033000) CCDC150 (ENSMNEG00000045541) HECW2 (ENSMNEG00000040909) STK17B (ENSMNEG00000000208) DNAH7 (ENSMNEG00000023582) ENSMNEG00000036854 SLC39A10 (ENSMNEG00000034082) ENSMNEG00000044918 ENSMNEG00000033791 TMEFF2 (ENSMNEG00000041061) CAVIN2 (ENSMNEG00000016870) NABP1 (ENSMNEG00000041572) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000000950.c.b.d.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00390000000854.c.b.k.a.a.b ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.c.a.a ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.b.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a ENSGT00940000155367.w ENSGT00390000018393 ENSGT00940000153941.a.a.h ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000157455.i.b ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00390000014165.c.a.b.b.b.q.k ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00940000160312.f ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D Olive baboon MODERN SPECIES 1 PLCL1 (ENSPANG00000000848) BOLL (ENSPANG00000009570) ##16 ENSPANG00000042310 MARS2 (ENSPANG00000016544) RFTN2 (ENSPANG00000009899) ##17 MOB4 (ENSPANG00000016215) ENSPANG00000046137 ENSPANG00000029555 COQ10B (ENSPANG00000006879) ENSPANG00000037062 SF3B1 (ENSPANG00000013417) ENSPANG00000016748 ENSPANG00000037191 ENSPANG00000048684 ##12 ENSPANG00000041875 ##12 ANKRD44 (ENSPANG00000000736) ##22 PGAP1 (ENSPANG00000004620) C2orf66 (ENSPANG00000021308) GTF3C3 (ENSPANG00000004621) CCDC150 (ENSPANG00000012442) HECW2 (ENSPANG00000004283) STK17B (ENSPANG00000021873) ENSPANG00000051235 ENSPANG00000038928 DNAH7 (ENSPANG00000012148) SLC39A10 (ENSPANG00000024555) ENSPANG00000047944 ENSPANG00000023286 ENSPANG00000045945 ##12 TMEFF2 (ENSPANG00000017694) CAVIN2 (ENSPANG00000017693) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000000950.c.b.d.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00390000000854.c.b.k.a.a.b ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.c.a.a ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.b.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a ENSGT00940000155367.w ENSGT00390000018393 ENSGT00940000153941.a.a.h ENSGT00940000153052.c.b.a.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000157455.i.b ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 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ENSCATG00000040754 ENSCATG00000039142 ANKRD44 (ENSCATG00000034086) ##22 PGAP1 (ENSCATG00000041899) C2orf66 (ENSCATG00000040552) GTF3C3 (ENSCATG00000041160) CCDC150 (ENSCATG00000039440) HECW2 (ENSCATG00000042498) STK17B (ENSCATG00000041109) ENSCATG00000041947 ENSCATG00000005122 DNAH7 (ENSCATG00000044354) SLC39A10 (ENSCATG00000003457) ENSCATG00000038644 TMEFF2 (ENSCATG00000044161) ENSCATG00000041477 CAVIN2 (ENSCATG00000042767) NABP1 (ENSCATG00000038449) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 83 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000000950.c.b.d.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00390000000854.c.b.k.a.a.b ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.c.a.a ENSGT00390000006350.m.a.c.a.mb ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a ENSGT00940000155367.w ENSGT00390000018393 ENSGT00940000153941.a.a.h ENSGT00940000157455.i.b ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 285 ENSRBIG00000040901 IFT74 (ENSRBIG00000020357) PLAA (ENSRBIG00000032657) CAAP1 (ENSRBIG00000031931) BOLL (ENSRBIG00000042131) ##16 MARS2 (ENSRBIG00000018803) ENSRBIG00000026367 RFTN2 (ENSRBIG00000026987) ##17 ENSRBIG00000041973 ENSRBIG00000035189 ENSRBIG00000031908 COQ10B (ENSRBIG00000034451) ENSRBIG00000033148 SF3B1 (ENSRBIG00000026096) ENSRBIG00000031237 ANKRD44 (ENSRBIG00000044303) ##22 PGAP1 (ENSRBIG00000028600) C2orf66 (ENSRBIG00000038713) GTF3C3 (ENSRBIG00000010299) CCDC150 (ENSRBIG00000031913) HECW2 (ENSRBIG00000031978) STK17B (ENSRBIG00000042524) ENSRBIG00000027310 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2289 PLCL1 (ENSRROG00000033434) BOLL (ENSRROG00000016942) ##16 MARS2 (ENSRROG00000012594) GLUD2 (ENSRROG00000032728) RFTN2 (ENSRROG00000039985) ##17 ENSRROG00000045160 HSPE1 (ENSRROG00000043083) ENSRROG00000031493 COQ10B (ENSRROG00000041035) ENSRROG00000029755 SF3B1 (ENSRROG00000031308) ANKRD44 (ENSRROG00000042800) ##22 PGAP1 (ENSRROG00000030642) C2orf66 (ENSRROG00000033973) GTF3C3 (ENSRROG00000029073) ENSRROG00000028186 CCDC150 (ENSRROG00000030349) HECW2 (ENSRROG00000040750) STK17B (ENSRROG00000040256) ENSRROG00000042973 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.c.a ENSGT00390000006350.m.b.b ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00940000154958.lb.b Mas night monkey MODERN SPECIES 362 MARS2 (ENSANAG00000001001) RFTN2 (ENSANAG00000023119) ##17 ENSANAG00000023890 ENSANAG00000025956 HSPD1 (ENSANAG00000000200) COQ10B (ENSANAG00000029779) SF3B1 (ENSANAG00000021577) ANKRD44 (ENSANAG00000035561) ##22 ENSANAG00000021502 ENSANAG00000027386 PGAP1 (ENSANAG00000035641) C2orf66 (ENSANAG00000027973) GTF3C3 (ENSANAG00000000179) ENSANAG00000024825 ENSANAG00000035797 ENSANAG00000021324 ENSANAG00000035947 HECW2 (ENSANAG00000033510) STK17B (ENSANAG00000038231) ENSANAG00000025582 ENSANAG00000021882 ENSANAG00000026977 ENSANAG00000034842 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.c.a ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b.c.a.a ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 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(ENSSBOG00000023092) ENSSBOG00000024433 ENSSBOG00000027158 HSPD1 (ENSSBOG00000034003) COQ10B (ENSSBOG00000021591) ENSSBOG00000024424 SF3B1 (ENSSBOG00000020080) ANKRD44 (ENSSBOG00000020670) ##22 PGAP1 (ENSSBOG00000019868) C2orf66 (ENSSBOG00000021609) GTF3C3 (ENSSBOG00000028710) CCDC150 (ENSSBOG00000034993) ENSSBOG00000007486 ENSSBOG00000030473 HECW2 (ENSSBOG00000021143) STK17B (ENSSBOG00000028877) DNAH7 (ENSSBOG00000023702) SLC39A10 (ENSSBOG00000020695) Capuchin MODERN SPECIES 113 COQ10B (ENSCCAG00000036492) ENSCCAG00000014439 SF3B1 (ENSCCAG00000020506) ANKRD44 (ENSCCAG00000021887) ##22 PGAP1 (ENSCCAG00000007274) C2orf66 (ENSCCAG00000022882) GTF3C3 (ENSCCAG00000035358) CCDC150 (ENSCCAG00000027251) HECW2 (ENSCCAG00000034988) STK17B (ENSCCAG00000027737) DNAH7 (ENSCCAG00000024358) ENSCCAG00000008409 ENSCCAG00000024489 SLC39A10 (ENSCCAG00000026823) ENSCCAG00000017770 LUZP2 (ENSCCAG00000037659) MUC15 (ENSCCAG00000022698) ANO3 (ENSCCAG00000021124) SLC5A12 (ENSCCAG00000031218) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.c.a ENSGT00940000167249 ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00390000005727.a.b.a.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000165788 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E Bushbaby MODERN SPECIES 215 ENSOGAG00000027171 ENSOGAG00000030745 ZNF599 (ENSOGAG00000017121) ENSOGAG00000017120 WTIP (ENSOGAG00000011872) UBA2 (ENSOGAG00000008847) PDCD2L (ENSOGAG00000008843) GPI (ENSOGAG00000008835) GARRE1 (ENSOGAG00000008830) RFTN2 (ENSOGAG00000000275) ##17 MOB4 (ENSOGAG00000000272) ENSOGAG00000034434 ENSOGAG00000000269 COQ10B (ENSOGAG00000000268) ENSOGAG00000000267 ANKRD44 (ENSOGAG00000006314) ##22 PGAP1 (ENSOGAG00000006311) GTF3C3 (ENSOGAG00000000577) CCDC150 (ENSOGAG00000000573) HECW2 (ENSOGAG00000003101) STK17B (ENSOGAG00000003099) DNAH7 (ENSOGAG00000003080) SLC39A10 (ENSOGAG00000003077) ENSOGAG00000026264 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.c.b ENSGT00390000006350.m.a.c.b.a.b ENSGT01050000244956.b.c.a ENSGT00940000167249 ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000165788 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT00940000163656.d Mouse lemur MODERN SPECIES 30 SPATS2L (ENSMICG00000003956) MAIP1 (ENSMICG00000044985) TYW5 (ENSMICG00000046098) C2orf69 (ENSMICG00000035511) ENSMICG00000026608 ENSMICG00000037134 SATB2 (ENSMICG00000009378) ##11 PLCL1 (ENSMICG00000011854) BOLL (ENSMICG00000011845) ##16 RFTN2 (ENSMICG00000028117) ##17 ENSMICG00000037985 HSPD1 (ENSMICG00000028600) HSPE1 (ENSMICG00000046768) COQ10B (ENSMICG00000013910) SF3B1 (ENSMICG00000013879) ANKRD44 (ENSMICG00000013853) ##22 PGAP1 (ENSMICG00000013824) C2orf66 (ENSMICG00000043136) GTF3C3 (ENSMICG00000013800) CCDC150 (ENSMICG00000013761) HECW2 (ENSMICG00000013727) STK17B (ENSMICG00000013716) DNAH7 (ENSMICG00000012420) SLC39A10 (ENSMICG00000012402) ENSMICG00000044029 ENSMICG00000013462 ENSMICG00000043264 TMEFF2 (ENSMICG00000017769) CAVIN2 (ENSMICG00000034296) NABP1 (ENSMICG00000045078) MYO1B (ENSMICG00000003014) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 15 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(ENSPSMG00000025023) ##22 PGAP1 (ENSPSMG00000024985) GTF3C3 (ENSPSMG00000024937) CCDC150 (ENSPSMG00000024921) HECW2 (ENSPSMG00000024894) STK17B (ENSPSMG00000024880) ENSPSMG00000024870 DNAH7 (ENSPSMG00000024863) SLC39A10 (ENSPSMG00000024843) ENSPSMG00000024831 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 232 ENSPCOG00000015991 PLCL1 (ENSPCOG00000000157) BOLL (ENSPCOG00000002476) ##16 RFTN2 (ENSPCOG00000025477) ##17 ENSPCOG00000022966 ENSPCOG00000011151 ENSPCOG00000028555 HSPD1 (ENSPCOG00000013989) COQ10B (ENSPCOG00000009128) SF3B1 (ENSPCOG00000024074) ANKRD44 (ENSPCOG00000028108) ##22 PGAP1 (ENSPCOG00000022807) ENSPCOG00000021792 CCDC150 (ENSPCOG00000019512) HECW2 (ENSPCOG00000028576) STK17B (ENSPCOG00000015317) DNAH7 (ENSPCOG00000015047) SLC39A10 (ENSPCOG00000028345) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E Tree shrew MODERN SPECIES 4754 ANKRD44 (ENSTBEG00000007279) ##22 PGAP1 (ENSTBEG00000005639) ENSTBEG00000005444 Glires ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.a.b ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 Rabbit MODERN SPECIES 18 ENSOCUG00000035705 ENSOCUG00000016464 C2orf69 (ENSOCUG00000016473) SATB2 (ENSOCUG00000009700) ##11 PLCL1 (ENSOCUG00000013978) BOLL (ENSOCUG00000013979) ##16 MARS2 (ENSOCUG00000017798) RFTN2 (ENSOCUG00000003993) ##17 ENSOCUG00000005712 HSPE1 (ENSOCUG00000010360) HSPD1 (ENSOCUG00000012736) COQ10B (ENSOCUG00000012735) ENSOCUG00000000205 ENSOCUG00000029492 ENSOCUG00000012722 ANKRD44 (ENSOCUG00000009183) ##22 PGAP1 (ENSOCUG00000002192) C2orf66 (ENSOCUG00000028999) GTF3C3 (ENSOCUG00000000463) CCDC150 (ENSOCUG00000013579) ENSOCUG00000023862 HECW2 (ENSOCUG00000011694) STK17B (ENSOCUG00000011691) DNAH7 (ENSOCUG00000006747) SLC39A10 (ENSOCUG00000017936) ENSOCUG00000007304 ENSOCUG00000022437 ENSOCUG00000022890 ENSOCUG00000002599 ENSOCUG00000024927 TMEFF2 (ENSOCUG00000017725) Pika MODERN SPECIES 2067 ENSOPRG00000010943 ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00390000006350.m.a.c.b.b ENSGT00390000005727.a.b.a.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.b.b ENSGT00390000005727.a.b.a.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b Naked mole-rat female MODERN SPECIES 22 MAIP1 (ENSHGLG00000017548) TYW5 (ENSHGLG00000017557) C2orf69 (ENSHGLG00000040936) ENSHGLG00000020697 SATB2 (ENSHGLG00000015892) ##11 ENSHGLG00000043283 PLCL1 (ENSHGLG00000015970) BOLL (ENSHGLG00000017562) ##16 MARS2 (ENSHGLG00000049320) RFTN2 (ENSHGLG00000017636) ##17 MOB4 (ENSHGLG00000050196) ENSHGLG00000042669 HSPD1 (ENSHGLG00000007927) ENSHGLG00000038699 ENSHGLG00000008285 ANKRD44 (ENSHGLG00000008625) ##22 ENSHGLG00000049153 ENSHGLG00000040344 ENSHGLG00000008965 ENSHGLG00000042696 ENSHGLG00000002790 ENSHGLG00000003940 ENSHGLG00000034754 ENSHGLG00000004703 ENSHGLG00000004915 ENSHGLG00000037940 FLACC1 (ENSHGLG00000007412) ENSHGLG00000040561 ENSHGLG00000039700 ENSHGLG00000032663 ASDURF (ENSHGLG00000029891) Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.b.b ENSGT00390000005727.a.b.a.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b Guinea pig MODERN SPECIES 104 ENSCPOG00000012077 SPATS2L (ENSCPOG00000003190) MAIP1 (ENSCPOG00000003800) TYW5 (ENSCPOG00000035856) C2orf69 (ENSCPOG00000009934) SATB2 (ENSCPOG00000015198) ##11 PLCL1 (ENSCPOG00000011478) BOLL (ENSCPOG00000000390) ##16 MARS2 (ENSCPOG00000025973) RFTN2 (ENSCPOG00000010463) ##17 MOB4 (ENSCPOG00000012746) ENSCPOG00000027474 HSPD1 (ENSCPOG00000002588) COQ10B (ENSCPOG00000002673) SF3B1 (ENSCPOG00000009353) ANKRD44 (ENSCPOG00000026494) ##22 PGAP1 (ENSCPOG00000003177) GTF3C3 (ENSCPOG00000006643) CCDC150 (ENSCPOG00000031267) ENSCPOG00000040067 HECW2 (ENSCPOG00000008908) STK17B (ENSCPOG00000031678) DNAH7 (ENSCPOG00000001018) SLC39A10 (ENSCPOG00000030873) Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.b.b.a.b ENSGT00390000005727.a.b.a.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b ENSGT00390000006330.a.a ENSGT00390000002174.b Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 110 ENSCLAG00000014377 SPATS2L (ENSCLAG00000013167) MAIP1 (ENSCLAG00000011913) TYW5 (ENSCLAG00000012009) C2orf69 (ENSCLAG00000012813) SATB2 (ENSCLAG00000016994) ##11 PLCL1 (ENSCLAG00000016098) BOLL (ENSCLAG00000017375) ##16 MARS2 (ENSCLAG00000010386) RFTN2 (ENSCLAG00000009821) ##17 MOB4 (ENSCLAG00000010086) ENSCLAG00000010686 HSPD1 (ENSCLAG00000011541) COQ10B (ENSCLAG00000017377) SF3B1 (ENSCLAG00000014767) ANKRD44 (ENSCLAG00000015396) ##22 PGAP1 (ENSCLAG00000011838) GTF3C3 (ENSCLAG00000009827) CCDC150 (ENSCLAG00000012365) HECW2 (ENSCLAG00000011628) STK17B (ENSCLAG00000012520) DNAH7 (ENSCLAG00000014436) ENSCLAG00000010357 ENSCLAG00000010745 TMEFF2 (ENSCLAG00000012879) CAVIN2 (ENSCLAG00000009546) NABP1 (ENSCLAG00000010940) MYO1B (ENSCLAG00000012867) STAT4 (ENSCLAG00000011405) STAT1 (ENSCLAG00000011275) GLS (ENSCLAG00000010238) Degu MODERN SPECIES 66 SPATS2L (ENSODEG00000009851) MAIP1 (ENSODEG00000008914) TYW5 (ENSODEG00000009836) C2orf69 (ENSODEG00000008700) SATB2 (ENSODEG00000008383) ##11 PLCL1 (ENSODEG00000008918) BOLL (ENSODEG00000008471) ##16 RFTN2 (ENSODEG00000008704) ##17 MOB4 (ENSODEG00000009609) ENSODEG00000019874 ENSODEG00000011397 ENSODEG00000009026 COQ10B (ENSODEG00000008396) ENSODEG00000011153 ENSODEG00000019820 ENSODEG00000008898 ##22 ENSODEG00000008698 ENSODEG00000009525 PGAP1 (ENSODEG00000009932) ENSODEG00000009843 CCDC150 (ENSODEG00000009669) ENSODEG00000009135 STK17B (ENSODEG00000009479) ENSODEG00000010152 ENSODEG00000009266 ENSODEG00000009947 TMEFF2 (ENSODEG00000010187) CAVIN2 (ENSODEG00000008708) NABP1 (ENSODEG00000009583) ENSODEG00000010254 MYO1B (ENSODEG00000011414) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00390000005727.a.b.a.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 12 TYW5 (ENSSVLG00005003405) C2orf69 (ENSSVLG00005003387) FTCDNL1 (ENSSVLG00005003343) ENSSVLG00005003317 SATB2 (ENSSVLG00005003278) ##11 PLCL1 (ENSSVLG00005003227) ENSSVLG00005003207 BOLL (ENSSVLG00005003123) ##16 MARS2 (ENSSVLG00005003085) RFTN2 (ENSSVLG00005003057) ##17 MOB4 (ENSSVLG00005002989) HSPE1 (ENSSVLG00005002940) ENSSVLG00005002895 ENSSVLG00005002862 SF3B1 (ENSSVLG00005002801) ANKRD44 (ENSSVLG00005002705) ##22 PGAP1 (ENSSVLG00005002564) C2orf66 (ENSSVLG00005002524) ENSSVLG00005002519 GTF3C3 (ENSSVLG00005002487) CCDC150 (ENSSVLG00005002390) HECW2 (ENSSVLG00005002250) STK17B (ENSSVLG00005002206) DNAH7 (ENSSVLG00005002055) SLC39A10 (ENSSVLG00005001997) TMEFF2 (ENSSVLG00005001952) CAVIN2 (ENSSVLG00005001910) NABP1 (ENSSVLG00005001888) MYO1B (ENSSVLG00005001644) STAT4 (ENSSVLG00005001500) STAT1 (ENSSVLG00005001458) Marmotini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000012178.g.a.a ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a.v ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812.eb ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b Alpin marmot MODERN SPECIES 8 TYW5 (ENSMMMG00000011668) C2orf69 (ENSMMMG00000011660) FTCDNL1 (ENSMMMG00000011655) ENSMMMG00000011650 SATB2 (ENSMMMG00000011551) ##11 ENSMMMG00000011481 PLCL1 (ENSMMMG00000011429) BOLL (ENSMMMG00000011354) ##16 MARS2 (ENSMMMG00000011347) RFTN2 (ENSMMMG00000011220) ##17 ENSMMMG00000011174 ENSMMMG00000011161 ENSMMMG00000011138 ENSMMMG00000011101 SF3B1 (ENSMMMG00000011081) ANKRD44 (ENSMMMG00000010980) ##22 PGAP1 (ENSMMMG00000010912) GTF3C3 (ENSMMMG00000010874) ENSMMMG00000010858 ENSMMMG00000010842 HECW2 (ENSMMMG00000010763) STK17B (ENSMMMG00000010745) ENSMMMG00000010716 DNAH7 (ENSMMMG00000010354) SLC39A10 (ENSMMMG00000010329) ENSMMMG00000010316 TMEFF2 (ENSMMMG00000010276) CAVIN2 (ENSMMMG00000010261) ENSMMMG00000010190 MYO1B (ENSMMMG00000009951) STAT4 (ENSMMMG00000009824) Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 91 ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000012178.g.a.a ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a.v ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812.eb ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 398 ANKRD44 (ENSUPAG00010018649) ##22 PGAP1 (ENSUPAG00010018616) GTF3C3 (ENSUPAG00010018592) ENSUPAG00010018577 ENSUPAG00010018565 HECW2 (ENSUPAG00010018483) STK17B (ENSUPAG00010018468) DNAH7 (ENSUPAG00010018167) SLC39A10 (ENSUPAG00010018156) Squirrel MODERN SPECIES 106 SATB2 (ENSSTOG00000024964) ##11 PLCL1 (ENSSTOG00000026164) BOLL (ENSSTOG00000003536) ##16 MARS2 (ENSSTOG00000015451) RFTN2 (ENSSTOG00000015446) ##17 MOB4 (ENSSTOG00000021024) ENSSTOG00000031333 ENSSTOG00000028470 COQ10B (ENSSTOG00000011048) SF3B1 (ENSSTOG00000011034) ANKRD44 (ENSSTOG00000012130) ##22 PGAP1 (ENSSTOG00000010633) GTF3C3 (ENSSTOG00000011894) ENSSTOG00000014552 HECW2 (ENSSTOG00000015188) STK17B (ENSSTOG00000020599) DNAH7 (ENSSTOG00000024509) ENSSTOG00000026225 SLC39A10 (ENSSTOG00000027014) TMEFF2 (ENSSTOG00000012859) CAVIN2 (ENSSTOG00000025394) ENSSTOG00000013502 MYO1B (ENSSTOG00000008283) STAT4 (ENSSTOG00000027217) STAT1 (ENSSTOG00000008620) GLS (ENSSTOG00000028716) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b Kangaroo rat MODERN SPECIES 320 Aox1 (ENSDORG00000004358) Kctd18 (ENSDORG00000007817) Spats2l (ENSDORG00000007816) Maip1 (ENSDORG00000012569) Tyw5 (ENSDORG00000012567) Satb2 (ENSDORG00000001292) ##11 Plcl1 (ENSDORG00000000485) Boll (ENSDORG00000010791) ##16 Mars2 (ENSDORG00000010789) Rftn2 (ENSDORG00000008999) ##17 Mob4 (ENSDORG00000023241) ENSDORG00000011071 Hspd1 (ENSDORG00000011069) Coq10b (ENSDORG00000025804) Sf3b1 (ENSDORG00000002399) ENSDORG00000029693 ##22 ENSDORG00000024945 Pgap1 (ENSDORG00000000406) Gtf3c3 (ENSDORG00000000403) Hecw2 (ENSDORG00000014759) Stk17b (ENSDORG00000029601) ENSDORG00000024535 Slc39a10 (ENSDORG00000012466) ENSDORG00000023275 ENSDORG00000023474 Amer2 (ENSDORG00000027428) ENSDORG00000013283 ENSDORG00000029901 ENSDORG00000027809 C1qtnf9 (ENSDORG00000027816) Mipep (ENSDORG00000009787) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 52 Tyw5 (ENSJJAG00000019361) 1700066M21Rik (ENSJJAG00000019976) ENSJJAG00000023987 Satb2 (ENSJJAG00000019883) ##11 ENSJJAG00000012932 Plcl1 (ENSJJAG00000024297) Boll (ENSJJAG00000015508) ##16 Mars2 (ENSJJAG00000023940) Rftn2 (ENSJJAG00000002223) ##17 ENSJJAG00000009865 ENSJJAG00000012025 ENSJJAG00000016713 Coq10b (ENSJJAG00000020646) Sf3b1 (ENSJJAG00000010903) ENSJJAG00000018305 Ankrd44 (ENSJJAG00000016107) ##22 Pgap1 (ENSJJAG00000009924) Gtf3c3 (ENSJJAG00000004649) Hecw2 (ENSJJAG00000022806) ENSJJAG00000018698 ENSJJAG00000017586 ENSJJAG00000010520 ENSJJAG00000013506 ENSJJAG00000018649 ENSJJAG00000010776 Tnni3k (ENSJJAG00000021052) ENSJJAG00000009791 Cryz (ENSJJAG00000000662) ENSJJAG00000005103 Lhx8 (ENSJJAG00000018516) Slc44a5 (ENSJJAG00000003214) Muroidea ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 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ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b Murinae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000157452 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 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SPECIES 2644 Ankrd44 (ENSMSIG00000012777) ##22 ENSMSIG00000012366 ENSMSIG00000012306 Ccdc150 (ENSMSIG00000012196) Hecw2 (ENSMSIG00000012086) Stk17b (ENSMSIG00000012063) spretus MODERN SPECIES Kctd18 (MGP_SPRETEiJ_G0014962) Spats2l (MGP_SPRETEiJ_G0014961) Maip1 (MGP_SPRETEiJ_G0014960) Tyw5 (MGP_SPRETEiJ_G0014959) Satb2 (MGP_SPRETEiJ_G0014957) ##11 Hsfy2 (MGP_SPRETEiJ_G0014956) Plcl1 (MGP_SPRETEiJ_G0014955) MGP_SPRETEiJ_G0014954 ##16 Mars2 (MGP_SPRETEiJ_G0014953) Rftn2 (MGP_SPRETEiJ_G0014952) ##17 Mob4 (MGP_SPRETEiJ_G0014951) MGP_SPRETEiJ_G0014950 MGP_SPRETEiJ_G0014949 MGP_SPRETEiJ_G0014948 Sf3b1 (MGP_SPRETEiJ_G0014947) Ankrd44 (MGP_SPRETEiJ_G0014946) ##22 MGP_SPRETEiJ_G0014945 Gtf3c3 (MGP_SPRETEiJ_G0014944) Ccdc150 (MGP_SPRETEiJ_G0014943) Hecw2 (MGP_SPRETEiJ_G0014942) Stk17b (MGP_SPRETEiJ_G0014941) MGP_SPRETEiJ_G0014939 MGP_SPRETEiJ_G0014938 Osgepl1 (MGP_SPRETEiJ_G0014937) MGP_SPRETEiJ_G0014936 MGP_SPRETEiJ_G0014934 1700019A02Rik (MGP_SPRETEiJ_G0014933) Mstn (MGP_SPRETEiJ_G0014932) 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Ryukyu mouse MODERN SPECIES Kctd18 (MGP_CAROLIEiJ_G0014155) Spats2l (MGP_CAROLIEiJ_G0014154) Maip1 (MGP_CAROLIEiJ_G0014153) Tyw5 (MGP_CAROLIEiJ_G0014152) 1700066M21Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0014151) Satb2 (MGP_CAROLIEiJ_G0014150) ##11 Hsfy2 (MGP_CAROLIEiJ_G0014149) Plcl1 (MGP_CAROLIEiJ_G0014148) Mars2 (MGP_CAROLIEiJ_G0014147) Rftn2 (MGP_CAROLIEiJ_G0014146) ##17 Mob4 (MGP_CAROLIEiJ_G0014145) MGP_CAROLIEiJ_G0014144 Hspd1 (MGP_CAROLIEiJ_G0014143) Coq10b (MGP_CAROLIEiJ_G0014142) Sf3b1 (MGP_CAROLIEiJ_G0014141) Ankrd44 (MGP_CAROLIEiJ_G0014140) ##22 Pgap1 (MGP_CAROLIEiJ_G0014139) MGP_CAROLIEiJ_G0014138 Ccdc150 (MGP_CAROLIEiJ_G0014137) Hecw2 (MGP_CAROLIEiJ_G0014136) Stk17b (MGP_CAROLIEiJ_G0014135) MGP_CAROLIEiJ_G0014134 Tmeff2 (MGP_CAROLIEiJ_G0014133) Cavin2 (MGP_CAROLIEiJ_G0014132) Nabp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0014131) Myo1b (MGP_CAROLIEiJ_G0014130) Stat4 (MGP_CAROLIEiJ_G0014129) Stat1 (MGP_CAROLIEiJ_G0014128) Gls (MGP_CAROLIEiJ_G0014127) Nab1 (MGP_CAROLIEiJ_G0014126) Nemp2 (MGP_CAROLIEiJ_G0014125) Shrew mouse MODERN SPECIES 18 Kctd18 (MGP_PahariEiJ_G0027395) Spats2l (MGP_PahariEiJ_G0027394) Maip1 (MGP_PahariEiJ_G0027393) Tyw5 (MGP_PahariEiJ_G0027392) 1700066M21Rik (MGP_PahariEiJ_G0027391) Satb2 (MGP_PahariEiJ_G0027390) ##11 Hsfy2 (MGP_PahariEiJ_G0027389) Plcl1 (MGP_PahariEiJ_G0027388) Boll (MGP_PahariEiJ_G0027387) ##16 Mars2 (MGP_PahariEiJ_G0027386) Rftn2 (MGP_PahariEiJ_G0027385) ##17 MGP_PahariEiJ_G0027384 MGP_PahariEiJ_G0027383 MGP_PahariEiJ_G0027382 Coq10b (MGP_PahariEiJ_G0027381) Ankrd44 (MGP_PahariEiJ_G0027379) ##22 Pgap1 (MGP_PahariEiJ_G0027378) Gtf3c3 (MGP_PahariEiJ_G0027377) Ccdc150 (MGP_PahariEiJ_G0027376) Hecw2 (MGP_PahariEiJ_G0027375) Stk17b (MGP_PahariEiJ_G0027374) MGP_PahariEiJ_G0027373 MGP_PahariEiJ_G0027372 Osgepl1 (MGP_PahariEiJ_G0027371) MGP_PahariEiJ_G0027370 Pms1 (MGP_PahariEiJ_G0027369) Mstn (MGP_PahariEiJ_G0027368) 1700019D03Rik (MGP_PahariEiJ_G0027367) Hibch (MGP_PahariEiJ_G0027366) MGP_PahariEiJ_G0027365 Mfsd6 (MGP_PahariEiJ_G0027364) Rat MODERN SPECIES 19 Tyw5 (ENSRNOG00000010100) RGD1306941 (ENSRNOG00000010185) Satb2 (ENSRNOG00000010188) ##11 Hsfy2 (ENSRNOG00000038569) Plcl1 (ENSRNOG00000032659) Boll (ENSRNOG00000054379) ##16 Mars2 (ENSRNOG00000065339) AABR07067762.1 (ENSRNOG00000055383) Rftn2 (ENSRNOG00000015594) ##17 Mob4 (ENSRNOG00000014980) Hspe1 (ENSRNOG00000051624) Hspd1 (ENSRNOG00000014525) Coq10b (ENSRNOG00000014456) Sf3b1 (ENSRNOG00000013516) Tmem258b (ENSRNOG00000032740) Ankrd44 (ENSRNOG00000021384) ##22 Pgap1 (ENSRNOG00000013388) LOC686030 (ENSRNOG00000067303) Gtf3c3 (ENSRNOG00000002091) AABR07067749.1 (ENSRNOG00000032947) Ccdc150 (ENSRNOG00000013318) Hecw2 (ENSRNOG00000013257) Stk17b (ENSRNOG00000012502) Dnah7 (ENSRNOG00000060984) Slc39a10 (ENSRNOG00000011677) ENSRNOG00000068790 ENSRNOG00000069389 Tmeff2 (ENSRNOG00000016623) Cavin2 (ENSRNOG00000025895) Nabp1 (ENSRNOG00000015416) Myo1b (ENSRNOG00000048152) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000157452 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b.w.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b ENSGT00390000006330.a.a Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.b ENSGT00390000005727.a.b.b.w.a ENSGT00390000005727.a.b.b.w.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b ENSGT00390000006330.a.a Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 Tyw5 (ENSCGRG00001015297) 1700066M21Rik (ENSCGRG00001016585) Satb2 (ENSCGRG00001019669) ##11 Hsfy2 (ENSCGRG00001009926) ENSCGRG00001010393 Plcl1 (ENSCGRG00001015676) ENSCGRG00001009537 Boll (ENSCGRG00001020168) ##16 Mars2 (ENSCGRG00001010364) Rftn2 (ENSCGRG00001017788) ##17 Mob4 (ENSCGRG00001024203) ENSCGRG00001015345 HSPD1 (ENSCGRG00001021126) Coq10b (ENSCGRG00001015271) Sf3b1 (ENSCGRG00001016990) Ankrd44 (ENSCGRG00001018584) ##22 Pgap1 (ENSCGRG00001016707) Gtf3c3 (ENSCGRG00001014543) Ccdc150 (ENSCGRG00001015128) Hecw2 (ENSCGRG00001016301) Stk17b (ENSCGRG00001016645) ENSCGRG00001015915 Slc39a10 (ENSCGRG00001015325) ENSCGRG00001010525 Tmeff2 (ENSCGRG00001016368) Cavin2 (ENSCGRG00001019648) ENSCGRG00001018461 Myo1b (ENSCGRG00001018055) Stat4 (ENSCGRG00001014279) Stat1 (ENSCGRG00001015212) Gls (ENSCGRG00001014748) Golden Hamster MODERN SPECIES 723 ENSMAUG00000000248 Kctd18 (ENSMAUG00000019856) Spats2l (ENSMAUG00000016921) Maip1 (ENSMAUG00000007424) Tyw5 (ENSMAUG00000009449) 1700066M21Rik (ENSMAUG00000017438) Satb2 (ENSMAUG00000008545) ##11 Plcl1 (ENSMAUG00000003415) Boll (ENSMAUG00000008224) ##16 Mars2 (ENSMAUG00000017224) Rftn2 (ENSMAUG00000014348) ##17 ENSMAUG00000007042 ENSMAUG00000017789 Coq10b (ENSMAUG00000010644) Sf3b1 (ENSMAUG00000009071) Ankrd44 (ENSMAUG00000019633) ##22 Pgap1 (ENSMAUG00000018155) Gtf3c3 (ENSMAUG00000018770) Ccdc150 (ENSMAUG00000015624) Hecw2 (ENSMAUG00000011882) Stk17b (ENSMAUG00000018862) ENSMAUG00000020218 ENSMAUG00000018843 ENSMAUG00000017244 ENSMAUG00000000208 Tmeff2 (ENSMAUG00000013073) Cavin2 (ENSMAUG00000014461) ENSMAUG00000017899 ENSMAUG00000020938 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000157452 ENSGT00940000158407 ENSGT01030000235401 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT00390000006350.m.a.c.a.`b ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a.ab ENSGT00390000005727.a.b.b.w.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b ENSGT00390000006330.a.a Northern American deer mouse MODERN SPECIES 4 Tyw5 (ENSPEMG00000009506) 1700066M21Rik (ENSPEMG00000001657) Satb2 (ENSPEMG00000013811) ##11 Hsfy2 (ENSPEMG00000029057) Plcl1 (ENSPEMG00000001849) ENSPEMG00000024520 Boll (ENSPEMG00000018168) ##16 Mars2 (ENSPEMG00000008377) Rftn2 (ENSPEMG00000000048) ##17 Mob4 (ENSPEMG00000017361) ENSPEMG00000029712 ENSPEMG00000010504 Hspd1 (ENSPEMG00000015411) Coq10b (ENSPEMG00000005817) Sf3b1 (ENSPEMG00000010699) Ankrd44 (ENSPEMG00000016873) ##22 Pgap1 (ENSPEMG00000008939) ENSPEMG00000024521 Gtf3c3 (ENSPEMG00000011140) Ccdc150 (ENSPEMG00000003017) Hecw2 (ENSPEMG00000007291) Stk17b (ENSPEMG00000016251) ENSPEMG00000029814 Slc39a10 (ENSPEMG00000015631) Tmeff2 (ENSPEMG00000007899) Cavin2 (ENSPEMG00000030400) Nabp1 (ENSPEMG00000024779) Myo1b (ENSPEMG00000009657) Stat4 (ENSPEMG00000011276) Stat1 (ENSPEMG00000007933) Gls (ENSPEMG00000017208) Prairie vole MODERN SPECIES 91 Spats2l (ENSMOCG00000006136) Maip1 (ENSMOCG00000008182) Tyw5 (ENSMOCG00000018540) 1700066M21Rik (ENSMOCG00000018970) ENSMOCG00000005756 ##11 Hsfy2 (ENSMOCG00000013974) Plcl1 (ENSMOCG00000014862) Boll (ENSMOCG00000022824) ##16 Mars2 (ENSMOCG00000006676) Rftn2 (ENSMOCG00000020060) ##17 ENSMOCG00000000253 Mob4 (ENSMOCG00000020652) ENSMOCG00000002787 Coq10b (ENSMOCG00000012636) Sf3b1 (ENSMOCG00000000455) ENSMOCG00000021330 ##22 Pgap1 (ENSMOCG00000013936) Gtf3c3 (ENSMOCG00000019654) Ccdc150 (ENSMOCG00000001399) Hecw2 (ENSMOCG00000012140) Stk17b (ENSMOCG00000019876) ENSMOCG00000014843 Slc39a10 (ENSMOCG00000018909) Tmeff2 (ENSMOCG00000016412) ENSMOCG00000014360 Cavin2 (ENSMOCG00000019549) Nabp1 (ENSMOCG00000021580) Myo1b (ENSMOCG00000018855) Stat4 (ENSMOCG00000021247) ENSMOCG00000010644 Gls (ENSMOCG00000021786) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182908.D ##22 Sloth MODERN SPECIES 4734 ANKRD44 (ENSCHOG00000011389) ##22 Armadillo MODERN SPECIES 2552 PLCL1 (ENSDNOG00000030916) ENSDNOG00000000115 ENSDNOG00000035028 BOLL (ENSDNOG00000017076) ##16 MARS2 (ENSDNOG00000041522) RFTN2 (ENSDNOG00000001933) ##17 ENSDNOG00000041539 ENSDNOG00000008252 ENSDNOG00000013226 COQ10B (ENSDNOG00000031357) SF3B1 (ENSDNOG00000011754) ENSDNOG00000037521 ANKRD44 (ENSDNOG00000034608) ##22 ENSDNOG00000037436 ENSDNOG00000030871 PGAP1 (ENSDNOG00000018348) C2orf66 (ENSDNOG00000017813) GTF3C3 (ENSDNOG00000017811) CCDC150 (ENSDNOG00000017806) HECW2 (ENSDNOG00000011278) Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b Tenrec MODERN SPECIES 4690 ANKRD44 (ENSETEG00000007253) ##22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350.m.a.c.a ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 ENSGT00390000009468 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000155466 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000156056.A ENSGT00950000182910.a.a.a ENSGT00940000155812 ENSGT00940000155752 ENSGT01050000244905.D ENSGT01050000244905.E ENSGT00390000010463.a.b Elephant MODERN SPECIES 301 SPATS2L (ENSLAFG00000001437) MAIP1 (ENSLAFG00000011639) TYW5 (ENSLAFG00000018708) C2orf69 (ENSLAFG00000018707) ENSLAFG00000030925 SATB2 (ENSLAFG00000002924) ##11 PLCL1 (ENSLAFG00000016349) BOLL (ENSLAFG00000010956) ##16 MARS2 (ENSLAFG00000030667) RFTN2 (ENSLAFG00000000141) ##17 MOB4 (ENSLAFG00000008054) ENSLAFG00000000057 HSPD1 (ENSLAFG00000000053) COQ10B (ENSLAFG00000000052) SF3B1 (ENSLAFG00000001956) ANKRD44 (ENSLAFG00000002537) ##22 PGAP1 (ENSLAFG00000022372) GTF3C3 (ENSLAFG00000001792) CCDC150 (ENSLAFG00000008819) HECW2 (ENSLAFG00000011976) STK17B (ENSLAFG00000011972) DNAH7 (ENSLAFG00000011951) SLC39A10 (ENSLAFG00000011949) TMEFF2 (ENSLAFG00000022458) CAVIN2 (ENSLAFG00000029652) NABP1 (ENSLAFG00000016226) MYO1B (ENSLAFG00000016026) STAT4 (ENSLAFG00000012299) STAT1 (ENSLAFG00000001475) GLS (ENSLAFG00000010808) NAB1 (ENSLAFG00000028947) Hyrax MODERN SPECIES 4478 ANKRD44 (ENSPCAG00000001900) ##22 Anura ANCESTRAL SPECIES 239 ENSGT00940000156056.A ENSGT00940000165788 ENSGT00940000161155.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000154014.b.b ENSGT00940000155466 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350 ENSGT00390000005727.b ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00390000016484 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 10 SLC39A10 (ENSLLEG00000028414) ENSLLEG00000028392 ENSLLEG00000028352 DNAH7 (ENSLLEG00000027326) STK17B (ENSLLEG00000027115) ENSLLEG00000027075 HECW2 (ENSLLEG00000026793) ENSLLEG00000026748 RFTN2 (ENSLLEG00000026681) ##17 MOB4 (ENSLLEG00000026543) HSPE1 (ENSLLEG00000026495) HSPD1 (ENSLLEG00000026391) ENSLLEG00000026377 SF3B1 (ENSLLEG00000024911) ENSLLEG00000024805 ANKRD44 (ENSLLEG00000024410) ##22 PGAP1 (ENSLLEG00000024011) MFSD6 (ENSLLEG00000023824) INPP1 (ENSLLEG00000023750) ENSLLEG00000023734 ENSLLEG00000023683 HIBCH (ENSLLEG00000023192) ENSLLEG00000023125 ENSLLEG00000023084 ENSLLEG00000023045 ENSLLEG00000022955 ENSLLEG00000022879 ORMDL1 (ENSLLEG00000022808) OSGEPL1 (ENSLLEG00000022670) ANKAR (ENSLLEG00000022077) ENSLLEG00000021975 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 365 ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350 ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00510000047481 ENSGT00940000166096 ENSGT00940000162599 ENSGT00940000160342 ENSGT00470000042284 ENSGT00940000155792 ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350 ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00940000156307.b ENSGT00940000169129 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 157 ENSGT00510000047481 ENSGT00940000166096 ENSGT00940000162599 ENSGT00940000160342 ENSGT00470000042284 ENSGT00940000155792 ENSGT00390000008096.B ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350 ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00940000156307.b ENSGT00940000169129 ENSGT00940000164501 ENSGT00940000163322.a.b.a.a ENSGT00940000163148 ENSGT00940000163322.a.a ENSGT00940000163494.a.a.c.b.a Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 61 ENSGT00510000047481 ENSGT00940000166096 ENSGT00940000162599 ENSGT00940000160342 ENSGT00470000042284 ENSGT00940000155792 ENSGT00390000008096.B.e.a ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00940000177416 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350 ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00940000156307.b ENSGT00940000169129 ENSGT00940000177114 ENSGT00940000163322.b ENSGT00940000164501.b ENSGT00940000163494.a.b.b ENSGT00940000164501.a.a.b ENSGT00940000163322.a.b.a.b ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.a ENSGT00940000163149.b ENSGT00940000163322.a.b.a.a ENSGT00940000163148.a.b.a ENSGT00940000163494.a.a.c.b.b ENSGT00940000163322.a.a.b ENSGT00940000163148.a.a Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 105 ENSGT00940000162599 ENSGT00940000160342.e ENSGT00470000042284 ENSGT00940000155792 ENSGT00390000008096.B.e.a ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00940000177416 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.w.a ENSGT00940000167249 ENSGT00390000006350 ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00940000156307.b ENSGT00940000169129 ENSGT00940000177114 ENSGT00940000163322.b ENSGT00940000164501.b ENSGT00940000163494.a.b.b ENSGT00940000164501.a.a.b ENSGT00940000163322.a.b.a.b ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.a ENSGT00940000163149.b ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.b ENSGT00940000163494.a.a.c.b.a ENSGT00940000163494.a.a.c.a.a ENSGT00940000156768 ENSGT00940000165279.c Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 109 ENSGT00390000006350 ENSGT00390000005727.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00940000156307.b ENSGT00940000169129 ENSGT00940000177114 ENSGT00940000163322.b ENSGT00940000164501.b ENSGT00940000164501.a.b ENSGT00940000163322.a.b.a.b ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.a ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.a ENSGT00940000163149.a.a.p ENSGT00940000163148.a.b.b.b ENSGT00940000163322.a.a.a ENSGT00940000163494.a.a.c.a.a ENSGT00940000156768 ENSGT00940000165279.c Atlantic herring MODERN SPECIES 11 ENSCHAG00000021132 rab3gap1 (ENSCHAG00000020953) R3HDM1 (ENSCHAG00000020911) lcmt2 (ENSCHAG00000020653) crygs2 (ENSCHAG00000020631) tbccd1 (ENSCHAG00000020624) dnajb11 (ENSCHAG00000020348) mob4 (ENSCHAG00000020331) rftn2 (ENSCHAG00000020284) ##17 PLCL1 (ENSCHAG00000020263) satb2 (ENSCHAG00000020238) ##11 hspe1 (ENSCHAG00000020182) HSPD1 (ENSCHAG00000020147) coq10b (ENSCHAG00000020124) SF3B1 (ENSCHAG00000019458) ANKRD44 (ENSCHAG00000017049) ##22 pikfyve (ENSCHAG00000012619) ENSCHAG00000012479 ENSCHAG00000012458 crygm6 (ENSCHAG00000012399) si:dkey-57a22.15 (ENSCHAG00000012373) ENSCHAG00000012348 crygmxl1 (ENSCHAG00000012318) ENSCHAG00000012286 ENSCHAG00000012265 ENSCHAG00000012247 ENSCHAG00000012221 ENSCHAG00000012206 ENSCHAG00000012175 ENSCHAG00000012119 ENSCHAG00000012098 Denticle herring MODERN SPECIES 19 rftn2 (ENSDCDG00000011293) ##17 ccnt2a (ENSDCDG00000011117) rab3gap1 (ENSDCDG00000011005) ENSDCDG00000010961 ENSDCDG00000010947 lcmt2 (ENSDCDG00000010935) crygs2 (ENSDCDG00000010909) tbccd1 (ENSDCDG00000010891) dnajb11 (ENSDCDG00000010880) satb2 (ENSDCDG00000010873) ##11 PLCL1 (ENSDCDG00000010869) hspe1 (ENSDCDG00000010770) hspd1 (ENSDCDG00000010654) coq10b (ENSDCDG00000010623) SF3B1 (ENSDCDG00000010544) ANKRD44 (ENSDCDG00000003573) ##22 ENSDCDG00000003095 ENSDCDG00000003089 ENSDCDG00000003080 ENSDCDG00000003071 ENSDCDG00000003066 ENSDCDG00000003057 ENSDCDG00000003046 ENSDCDG00000003030 ENSDCDG00000003018 ENSDCDG00000003009 ENSDCDG00000002989 ENSDCDG00000026818 ENSDCDG00000026816 LACC1 (ENSDCDG00000026814) serp2 (ENSDCDG00000026812) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 130 ENSGT00940000161651 ENSGT00940000162722 ENSGT00390000011275 ENSGT00910000144271.C.db.a ENSGT00390000007467 ENSGT00940000155792 ENSGT00390000008096.B.e.a ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00940000177416 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.w.a ENSGT00390000006350 ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00940000156307.b ENSGT00940000164099.a.a ENSGT00940000156984.a.b ENSGT01100000263555.a.a.b.eb ENSGT00940000156023 ENSGT00940000155015.h ENSGT00940000158521 ENSGT00940000160645.o ENSGT00940000154200.A.a ENSGT00390000017163 ENSGT01030000234518.C.a.b.a.a ENSGT01030000234518.C.a.b.a.b.a ENSGT01100000263536.C ENSGT00390000001134.a.a ENSGT00940000156711.k.a Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000162722 ENSGT00390000011275 ENSGT00910000144271.C.db.a ENSGT01030000234551.i ENSGT00390000007467 ENSGT00940000155792.c ENSGT00390000008096.B.e.a ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00940000177416 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.w.a ENSGT00390000006350 ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00940000156307.b ENSGT00940000164099.a.a ENSGT00940000156984.b.c ENSGT01100000263555.a.a.b.eb ENSGT00940000156023 ENSGT00940000155015.h ENSGT00940000158521 ENSGT00940000160645.o ENSGT00940000154200.A.a ENSGT00390000017163 ENSGT01030000234518.C.a.b.a.a ENSGT00950000184597 ENSGT01030000234518.C.a.b.a.b.a ENSGT01100000263536.C ENSGT00390000001134.a.a Channel catfish MODERN SPECIES 25 olig1 (ENSIPUG00000012506) ercc1 (ENSIPUG00000012529) ENSIPUG00000012574 ENSIPUG00000012599 ENSIPUG00000012627 rabl3 (ENSIPUG00000012657) Dnajb11 (ENSIPUG00000012739) satb2 (ENSIPUG00000012822) ##11 plcl1 (ENSIPUG00000012928) RFTN2 (ENSIPUG00000012962) ##17 mob4 (ENSIPUG00000012994) hspe1 (ENSIPUG00000013031) HSPD1 (ENSIPUG00000013094) coq10b (ENSIPUG00000013141) sf3b1 (ENSIPUG00000013171) ANKRD44 (ENSIPUG00000013301) ##22 pikfyve (ENSIPUG00000013415) ENSIPUG00000013730 fgf14 (ENSIPUG00000013752) itgbl1 (ENSIPUG00000013787) nalcn (ENSIPUG00000013828) ENSIPUG00000013904 tmtc4 (ENSIPUG00000013937) zic2 (ENSIPUG00000014025) zic5 (ENSIPUG00000014029) clybl (ENSIPUG00000014045) si:ch211-184m13.4 (ENSIPUG00000014083) ENSIPUG00000014085 gpr183a (ENSIPUG00000014099) gpr18 (ENSIPUG00000014111) dachd (ENSIPUG00000014128) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00940000162722 ENSGT00390000011275 ENSGT00910000144271.C.db.b ENSGT00910000144271.C.db.a ENSGT00390000007467 ENSGT00940000155792.c ENSGT00390000008096.B.e.a ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00940000177416 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.w.a ENSGT00390000006350 ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00940000156307.b ENSGT00940000164099.a.a ENSGT00940000156984.b.c ENSGT01100000263555.a.a.b.eb ENSGT00940000156023 ENSGT00940000155015.h ENSGT00940000158521 ENSGT00940000160645.o ENSGT00940000154200.A.a ENSGT00390000017163 ENSGT01030000234518.C.a.b.a.a ENSGT00950000184597 ENSGT01030000234518.C.a.b.a.b.a ENSGT01100000263536.C ENSGT00390000001134.a.a Characoidei ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000161651 ENSGT00940000162722 ENSGT00390000011275 ENSGT00910000144271.C.db.b ENSGT00910000144271.C.db.a ENSGT00390000007467 ENSGT00940000155792.c ENSGT00390000008096.B.e.a ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.w.a ENSGT00390000006350 ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00940000156307.b ENSGT00940000164099.a.a ENSGT00940000156984.b.c ENSGT01100000263555.a.a.b.eb ENSGT00940000156023 ENSGT00940000155015.h ENSGT00940000158521 ENSGT00940000160645.o ENSGT00940000154200.A.a ENSGT00390000017163 ENSGT01030000234518.C.a.b.a.a ENSGT00950000184597 ENSGT01030000234518.C.a.b.a.b.a ENSGT01100000263536.C ENSGT00390000001134.a.a Mexicana tetra MODERN SPECIES 10 olig1 (ENSAMXG00000026067) ercc1 (ENSAMXG00000036571) ENSAMXG00000002169 gzm3 (ENSAMXG00000002176) rabl3 (ENSAMXG00000038716) dnajb11 (ENSAMXG00000042634) satb2 (ENSAMXG00000002186) ##11 PLCL1 (ENSAMXG00000002196) rftn2 (ENSAMXG00000002197) ##17 mob4 (ENSAMXG00000036359) hspe1 (ENSAMXG00000002204) hspd1 (ENSAMXG00000002207) coq10b (ENSAMXG00000002213) SF3B1 (ENSAMXG00000002219) ENSAMXG00000041633 ANKRD44 (ENSAMXG00000002232) ##22 pikfyve (ENSAMXG00000002267) ENSAMXG00000002269 FGF14 (ENSAMXG00000038135) itgbl1 (ENSAMXG00000002270) nalcn (ENSAMXG00000002279) ENSAMXG00000002297 tmtc4 (ENSAMXG00000002316) ZIC2 (ENSAMXG00000002320) zic5 (ENSAMXG00000002323) clybl (ENSAMXG00000042789) gpr183a (ENSAMXG00000026069) GPR18 (ENSAMXG00000026070) dachd (ENSAMXG00000042864) KLF5 (ENSAMXG00000002337) klf12b (ENSAMXG00000002340) Red-bellied piranha MODERN SPECIES 121 ercc1 (ENSPNAG00000007191) ENSPNAG00000008149 ENSPNAG00000008153 ENSPNAG00000008156 ENSPNAG00000000729 rabl3 (ENSPNAG00000000748) dnajb11 (ENSPNAG00000000766) satb2 (ENSPNAG00000004753) ##11 PLCL1 (ENSPNAG00000000792) rftn2 (ENSPNAG00000008235) ##17 mob4 (ENSPNAG00000008244) hspe1 (ENSPNAG00000008255) hspd1 (ENSPNAG00000000839) coq10b (ENSPNAG00000000841) SF3B1 (ENSPNAG00000008288) ANKRD44 (ENSPNAG00000008324) ##22 pikfyve (ENSPNAG00000008358) ENSPNAG00000000940 Electric eel MODERN SPECIES 50 ENSEEEG00000005580 ENSEEEG00000005577 ENSEEEG00000005575 il6 (ENSEEEG00000005573) TOMM7 (ENSEEEG00000005572) hycc1 (ENSEEEG00000005571) ENSEEEG00000005570 sp4 (ENSEEEG00000005546) ITGB8 (ENSEEEG00000005522) ENSEEEG00000005518 polr1f (ENSEEEG00000005516) FERD3L (ENSEEEG00000005515) twist1a (ENSEEEG00000005512) ENSEEEG00000005510 SNX13 (ENSEEEG00000005496) ENSEEEG00000003532 ##22 pikfyve (ENSEEEG00000002340) fgf14 (ENSEEEG00000002297) itgbl1 (ENSEEEG00000002288) ENSEEEG00000002286 ENSEEEG00000002278 tmtc4 (ENSEEEG00000002206) zic2a (ENSEEEG00000002197) zic5 (ENSEEEG00000002196) clybl (ENSEEEG00000002195) si:ch211-184m13.4 (ENSEEEG00000002194) ptpn1 (ENSEEEG00000002193) adipor1b (ENSEEEG00000002192) KLHL12 (ENSEEEG00000002191) tuba5 (ENSEEEG00000002190) kdm5bb (ENSEEEG00000002166) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 104 ENSGT00940000161651 ENSGT00940000162722 ENSGT00390000011275 ENSGT00910000144271.C.db.a.b ENSGT00910000144271.C.db.a.a ENSGT00390000007467 ENSGT00940000155792 ENSGT00390000008096.B.e.a ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b.w.a ENSGT00390000006350 ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00940000156307.b ENSGT00940000164099.a.a ENSGT00940000156984.a.b.a.b ENSGT01100000263555.a.a.b.eb ENSGT00940000156023.q.a ENSGT00940000155015.h ENSGT00940000156023.q.b ENSGT00940000158521 ENSGT00940000160645.o ENSGT00940000154200.A.a ENSGT00390000017163 ENSGT01030000234518.C.a.b.a.a ENSGT01030000234518.C.a.b.a.b.a ENSGT01100000263536.C ENSGT00390000001134.a.a Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000011275 ENSGT00910000144271.C.db.a.b.b ENSGT00910000144271.C.db.a.a.b.a ENSGT00910000144271.C.db.a.b.a ENSGT00910000144271.C.db.a.a.a ENSGT00390000007467.j ENSGT00940000155792.e ENSGT00390000008096.B.e.a.b ##11 ENSGT00940000158407.c ENSGT00530000063609.a.d ##17 ENSGT01050000244956.b.w.a.b ENSGT00390000006350.i ENSGT00390000005727.b.d ENSGT00940000155367.m ENSGT00390000018393.`b ENSGT00950000182908.D.g ##22 ENSGT00940000156307.b.b ENSGT00940000164099.a.a.a ENSGT00940000156984.a.b.a.b.b ENSGT01100000263555.a.a.b.eb.b ENSGT00940000156023.q.b ENSGT00940000155015.h ENSGT00940000158521.c ENSGT00940000160645.o.m.a ENSGT00940000154200.A.a.h ENSGT00390000017163.a ENSGT01100000263536.C.d ENSGT00390000001134.a.a.i ENSGT00940000156711.k.a.a ENSGT00940000158108.g.b ENSGT00940000158486.d Goldfish MODERN SPECIES 27 ENSCARG00000070214 ercc1 (ENSCARG00000070216) ENSCARG00000070217 gzm3.4 (ENSCARG00000070218) ENSCARG00000070219 rabl3 (ENSCARG00000070224) dnajb11 (ENSCARG00000070233) satb2 (ENSCARG00000070241) ##11 PLCL1 (ENSCARG00000070246) rftn2 (ENSCARG00000070249) ##17 mob4 (ENSCARG00000070252) hspe1 (ENSCARG00000023609) hspd1 (ENSCARG00000023635) coq10b (ENSCARG00000023675) SF3B1 (ENSCARG00000023698) ANKRD44 (ENSCARG00000023826) ##22 pikfyve (ENSCARG00000025700) ENSCARG00000030598 fgf14 (ENSCARG00000030599) itgbl1 (ENSCARG00000030640) NALCN (ENSCARG00000031166) ENSCARG00000031230 tmtc4 (ENSCARG00000031262) ENSCARG00000031489 zic2a (ENSCARG00000031495) zic5 (ENSCARG00000031506) clybl (ENSCARG00000031515) dachd (ENSCARG00000031546) ENSCARG00000031643 si:ch211-184m13.4 (ENSCARG00000031644) GPR18 (ENSCARG00000031650) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000162722.a ENSGT00390000011275 ENSGT00910000144271.C.db.a.b.a ENSGT00910000144271.C.db.a.a.a ENSGT00910000144271.C.db.a.a.b.a ENSGT00390000007467.j ENSGT00940000155792.e ENSGT00390000008096.B.e.a.b ##11 ENSGT00940000158407.c ENSGT00530000063609.a.d ##17 ENSGT01050000244956.b.w.a.b ENSGT00390000006350.i ENSGT00390000005727.b.d ENSGT00940000155367.m ENSGT00390000018393.`b ENSGT00950000182908.D.g ##22 ENSGT00940000156307.b.b ENSGT00940000164099.a.a.a ENSGT00940000156984.a.b.a.b.b ENSGT01100000263555.a.a.b.eb.b ENSGT00940000156023.q.b ENSGT00940000158521.c ENSGT00940000160645.o.m.a ENSGT00940000154200.A.a.h ENSGT00390000017163.a ENSGT01030000234518.C.a.b.a.a.d ENSGT01030000234518.C.a.b.a.b.a.f ENSGT01100000263536.C.d ENSGT00390000001134.a.a.i ENSGT00940000156711.k.a.a ENSGT00940000158108.g.b Common carp reference MODERN SPECIES 41 gatd3 (ENSCCRG00000069597) olig2 (ENSCCRG00000051550) olig1 (ENSCCRG00000080077) ercc1 (ENSCCRG00000059279) ENSCCRG00000003371 ENSCCRG00000003444 dnajb11 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ENSGT00390000008096.B.e.a.a ##11 ENSGT00940000158407.d ENSGT00530000063609.a.c ##17 ENSGT01050000244956.b.w.a.a ENSGT00390000006350.j ENSGT00390000005727.b.c ENSGT00940000155367.n ENSGT00390000018393.ab ENSGT00950000182908.D.h ##22 ENSGT00940000156307.b.a Common carp reference MODERN SPECIES 46 olig1 (ENSCCRG00000070193) ENSCCRG00000071698 ENSCCRG00000029032 ENSCCRG00000050423 ENSCCRG00000064107 rabl3 (ENSCCRG00000037485) dnajb11 (ENSCCRG00000057596) satb2 (ENSCCRG00000019510) ##11 PLCL1 (ENSCCRG00000008216) rftn2 (ENSCCRG00000053881) ##17 mob4 (ENSCCRG00000046024) hspe1 (ENSCCRG00000054775) hspd1 (ENSCCRG00000052785) coq10b (ENSCCRG00000052829) SF3B1 (ENSCCRG00000006506) ANKRD44 (ENSCCRG00000006626) ##22 pikfyve (ENSCCRG00000022396) ENSCCRG00000071879 FGF14 (ENSCCRG00000056849) ENSCCRG00000066702 itgbl1 (ENSCCRG00000078257) nalcn (ENSCCRG00000036987) ENSCCRG00000036949 tmtc4 (ENSCCRG00000055509) zic2a (ENSCCRG00000022279) zic5 (ENSCCRG00000022277) clybl (ENSCCRG00000014303) si:ch211-184m13.4 (ENSCCRG00000049475) gpr183a (ENSCCRG00000078361) GPR18 (ENSCCRG00000063260) dachd (ENSCCRG00000013984) Golden-line barbel MODERN SPECIES 27 olig2 (ENSSGRG00000052318) olig1 (ENSSGRG00000052317) ercc1 (ENSSGRG00000052315) ENSSGRG00000052308 ENSSGRG00000052307 rabl3 (ENSSGRG00000052306) dnajb11 (ENSSGRG00000052215) satb2 (ENSSGRG00000052210) ##11 PLCL1 (ENSSGRG00000052208) rftn2 (ENSSGRG00000052207) ##17 ENSSGRG00000052206 hspe1 (ENSSGRG00000052205) hspd1 (ENSSGRG00000052120) coq10b (ENSSGRG00000052114) SF3B1 (ENSSGRG00000052098) ANKRD44 (ENSSGRG00000051805) ##22 pikfyve (ENSSGRG00000051545) ENSSGRG00000051543 fgf14 (ENSSGRG00000051542) itgbl1 (ENSSGRG00000051540) nalcn (ENSSGRG00000051494) ENSSGRG00000051485 tmtc4 (ENSSGRG00000051475) zic2a (ENSSGRG00000051472) zic5 (ENSSGRG00000051471) clybl (ENSSGRG00000051470) si:ch211-184m13.4 (ENSSGRG00000051469) gpr183a (ENSSGRG00000051468) GPR18 (ENSSGRG00000051467) dachd (ENSSGRG00000051422) KLF5 (ENSSGRG00000051421) Zebrafish MODERN SPECIES 24 gzm3.4 (ENSDARG00000076814) gzm3.3 (ENSDARG00000093990) ENSDARG00000055986 gzm3 (ENSDARG00000078451) dnajb11 (ENSDARG00000015088) rabl3 (ENSDARG00000040959) satb2 (ENSDARG00000061885) ##11 PLCL1 (ENSDARG00000067676) rftn2 (ENSDARG00000056078) ##17 mob4 (ENSDARG00000056085) hspe1 (ENSDARG00000056167) hspd1 (ENSDARG00000056160) ENSDARG00000094145 coq10b (ENSDARG00000056141) SF3B1 (ENSDARG00000056138) ANKRD44 (ENSDARG00000026028) ##22 pikfyve (ENSDARG00000056112) ENSDARG00000093739 fgf14 (ENSDARG00000040982) ENSDARG00000079126 itgbl1 (ENSDARG00000040985) nalcn (ENSDARG00000001835) ENSDARG00000056191 tmtc4 (ENSDARG00000020447) zic2a (ENSDARG00000015554) zic5 (ENSDARG00000016022) si:ch211-184m13.4 (ENSDARG00000079522) gpr183a (ENSDARG00000010317) GPR18 (ENSDARG00000062009) clybl (ENSDARG00000029729) dachd (ENSDARG00000069440) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00510000047481 ENSGT00940000166096 ENSGT00940000162599 ENSGT00940000160342.g.b ENSGT00470000042284 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ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.b.b.a ENSGT00940000165279.c ENSGT00940000177452 ENSGT01090000259987.b.b.a.b ENSGT00940000157201 ENSGT00390000012204 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 13 rab5b (ENSMMDG00005025034) lcmt2 (ENSMMDG00005025035) CRYGS (ENSMMDG00005025036) tbccd1 (ENSMMDG00005025037) dnajb11 (ENSMMDG00005025038) satb2 (ENSMMDG00005025039) ##11 ENSMMDG00005025040 PLCL1 (ENSMMDG00005025041) ENSMMDG00005025042 rftn2 (ENSMMDG00005013675) ##17 MOB4 (ENSMMDG00005013679) hspe1 (ENSMMDG00005013681) hspd1 (ENSMMDG00005013697) coq10b (ENSMMDG00005013699) SF3B1 (ENSMMDG00005013701) ANKRD44 (ENSMMDG00005014236) ##22 crygm7 (ENSMMDG00005016201) ENSMMDG00005016203 crygm6 (ENSMMDG00005016207) zgc:153846 (ENSMMDG00005016209) ENSMMDG00005016213 ENSMMDG00005016239 ENSMMDG00005016245 crygm5 (ENSMMDG00005016266) crygm3 (ENSMMDG00005016267) crygs3 (ENSMMDG00005016271) ENSMMDG00005016299 etv5a (ENSMMDG00005016303) ENSMMDG00005016307 itgb5 (ENSMMDG00005016369) tnfaip6 (ENSMMDG00005019808) Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00510000047481 ENSGT00940000166096 ENSGT00940000162599 ENSGT00940000160342.g.b ENSGT00470000042284 ENSGT00940000155792 ENSGT00390000008096.B.e.a ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00940000177416 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350 ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00940000156307.b ENSGT00940000169129 ENSGT00940000177114 ENSGT00940000163322.b ENSGT00940000164501.b ENSGT00940000163494.a.b.b ENSGT00940000164501.a.a.b.b ENSGT00940000163322.a.b.a.b ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.a ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.b.b.a ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.a ENSGT00940000163149.a.a ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.b ENSGT00940000163322.a.a.a ENSGT00940000163494.a.a.c.b.a Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 258 ENSHCOG00000017601 slc35a5 (ENSHCOG00000017592) ccdc80 (ENSHCOG00000017571) KDM6A (ENSHCOG00000017561) ENSHCOG00000017503 fundc1 (ENSHCOG00000017489) efhc2 (ENSHCOG00000017465) ##8 ENSHCOG00000017376 mao (ENSHCOG00000017360) CASK (ENSHCOG00000017283) ENSHCOG00000017002 gpr34b (ENSHCOG00000016986) nyx (ENSHCOG00000016946) ddx3xa (ENSHCOG00000016890) SF3B1 (ENSHCOG00000016775) ENSHCOG00000016717 ##22 pikfyve (ENSHCOG00000000466) crygm7 (ENSHCOG00000016485) si:dkey-57a22.15 (ENSHCOG00000016478) ENSHCOG00000016460 ENSHCOG00000016443 ENSHCOG00000016246 ENSHCOG00000016225 ENSHCOG00000016145 crygs3 (ENSHCOG00000016073) DGKG (ENSHCOG00000016044) etv5a (ENSHCOG00000016003) itgb5 (ENSHCOG00000015991) tnfaip6 (ENSHCOG00000015958) rif1 (ENSHCOG00000015943) RAPH1 (ENSHCOG00000015930) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00510000047481 ENSGT00940000166096 ENSGT00940000162599 ENSGT00940000160342.g.b ENSGT00470000042284 ENSGT00940000155792 ENSGT00390000008096.B.e.a ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00940000177416 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350 ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00940000156307.b ENSGT00940000169129 ENSGT00940000177114 ENSGT00940000163322.b ENSGT00940000164501.b ENSGT00940000163494.a.b.b ENSGT00940000163322.a.b.a.b ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.a.d ENSGT00940000163149.a.a ENSGT00940000164501.a.a.a.a.a ENSGT00940000164501.a.a.a.a.b ENSGT00940000163494.a.b.a ENSGT00940000164501.a.a.b.a ENSGT00530000063480.a ##16 ENSGT00940000163148.a.b.a Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00510000047481 ENSGT00940000166096 ENSGT00940000162599 ENSGT00940000160342.g.b ENSGT00470000042284 ENSGT00940000155792 ENSGT00390000008096.B.e.a ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00940000177416 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350 ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00940000156307.b ENSGT00940000169129 ENSGT00390000004840 ENSGT00940000177631 ENSGT00940000177114 ENSGT00940000163322.b ENSGT00940000164501.b ENSGT00940000163494.a.b.b ENSGT00940000163322.a.b.a.a ENSGT00940000164501.a.a.b.b ENSGT00940000163322.a.b.a.b ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.a ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.b.b.a ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.b.b.b ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.a.c.b Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00510000047481 ENSGT00940000166096 ENSGT00940000162599 ENSGT00940000160342.g.b ENSGT00470000042284 ENSGT00940000155792 ENSGT00390000008096.B.e.a ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00940000177416 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350 ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00940000156307.b ENSGT00940000169129 ENSGT00390000004840 ENSGT00940000177631 ENSGT00940000177114 ENSGT00940000163322.b ENSGT00940000164501.b ENSGT00940000163322.a.b.a.a ENSGT00940000164501.a.a.b.b ENSGT00940000163322.a.b.a.b ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.a ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.b.b.a ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.b.b.b ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.a.c.b ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.a.c.a.b Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 108 ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.b ENSGT00940000163322.a.a.a ENSGT00940000163494.a.a.c.b.a ENSGT00940000163494.a.a.c.a.c ENSGT00940000156768 ENSGT00940000165279.c ENSGT01090000259987.b.b.a.b ENSGT00940000157201 ENSGT00390000012204 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350 ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367.h ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 100 ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.b ENSGT00940000163322.a.a.a ENSGT00940000163494.a.a.c.b.a ENSGT00940000163494.a.a.c.a.c ENSGT00940000156768 ENSGT00940000165279.c ENSGT01090000259987.b.b.a.b ENSGT00940000157201 ENSGT00390000012204 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350 ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367.h ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 120 ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.b ENSGT00940000163322.a.a.a ENSGT00940000163494.a.a.c.b.a ENSGT00940000163494.a.a.c.a.c ENSGT00940000156768 ENSGT00940000165279.c ENSGT01090000259987.b.b.a.b ENSGT00940000157201 ENSGT00390000012204 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350 ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367.h ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 Clown anemonefish MODERN SPECIES 2424 rftn2 (ENSAOCG00000004341) ##17 mob4 (ENSAOCG00000000157) hspe1 (ENSAOCG00000004377) hspd1 (ENSAOCG00000004404) coq10b (ENSAOCG00000004417) SF3B1 (ENSAOCG00000004478) ANKRD44 (ENSAOCG00000000172) ##22 Orange clownfish MODERN SPECIES 3 ENSAPEG00000013571 crygs4 (ENSAPEG00000013558) crygs3 (ENSAPEG00000013547) ENSAPEG00000013528 ENSAPEG00000013505 etv5a (ENSAPEG00000013446) itgb5 (ENSAPEG00000013373) tnfaip6 (ENSAPEG00000013313) rif1 (ENSAPEG00000013228) rftn2 (ENSAPEG00000013197) ##17 mob4 (ENSAPEG00000013120) hspe1 (ENSAPEG00000013089) hspd1 (ENSAPEG00000013053) coq10b (ENSAPEG00000013025) SF3B1 (ENSAPEG00000012937) ANKRD44 (ENSAPEG00000012834) ##22 ENSAPEG00000012816 lats2 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ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350 ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00940000156307.b ENSGT00940000169129 ENSGT00390000004840 ENSGT00940000177114 ENSGT00940000163322.b ENSGT00940000164501.b ENSGT00940000163322.a.b.a.a ENSGT00940000164501.a.a.b.b ENSGT00940000163322.a.b.a.b ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.a ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.b.b.a ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.b.b.b ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.a.c.b ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.a.c.a.b.j ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.a.c.a.b.i Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00510000047481 ENSGT00940000166096 ENSGT00940000162599 ENSGT00940000160342.g.b ENSGT00470000042284 ENSGT00940000155792.i ENSGT00390000008096.B.e.a ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00940000177416 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350 ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00940000156307.b ENSGT00940000169129 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(ENSMZEG00005021336) lcmt2 (ENSMZEG00005021330) crygs1 (ENSMZEG00005021328) tbccd1 (ENSMZEG00005021325) dnajb11 (ENSMZEG00005021318) satb2 (ENSMZEG00005021309) ##11 PLCL1 (ENSMZEG00005021302) rftn2 (ENSMZEG00005021297) ##17 mob4 (ENSMZEG00005021290) hspe1 (ENSMZEG00005021282) hspd1 (ENSMZEG00005021279) coq10b (ENSMZEG00005021274) SF3B1 (ENSMZEG00005021254) ANKRD44 (ENSMZEG00005021245) ##22 pikfyve (ENSMZEG00005021229) ENSMZEG00005021219 ENSMZEG00005021215 crygm7 (ENSMZEG00005021212) ENSMZEG00005021207 crygm6 (ENSMZEG00005021204) si:dkey-57a22.15 (ENSMZEG00005021200) zgc:153846 (ENSMZEG00005021196) ENSMZEG00005021192 ENSMZEG00005021189 ENSMZEG00005021186 ENSMZEG00005021180 ENSMZEG00005021176 ENSMZEG00005021171 ENSMZEG00005021116 Midas cichlid MODERN SPECIES 146 SF3B1 (ENSACIG00000020910) ANKRD44 (ENSACIG00000020861) ##22 pikfyve (ENSACIG00000020774) ENSACIG00000020750 ENSACIG00000020704 crygm7 (ENSACIG00000020681) ENSACIG00000020674 crygm6 (ENSACIG00000020633) si:dkey-57a22.15 (ENSACIG00000020594) zgc:153846 (ENSACIG00000020170) ENSACIG00000019808 ENSACIG00000019713 ENSACIG00000019435 ENSACIG00000018475 ENSACIG00000018298 ENSACIG00000018277 ENSACIG00000018100 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00510000047481 ENSGT00940000166096 ENSGT00940000162599 ENSGT00940000160342.g.b ENSGT00470000042284 ENSGT00940000155792 ENSGT00390000008096.B.e.a ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00940000177416 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350 ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00940000156307.b ENSGT00940000177631 ENSGT00940000169129 ENSGT00940000177114 ENSGT00940000163322.b ENSGT00940000164501.b ENSGT00940000163322.a.b.a.a ENSGT00940000164501.a.a.b.b ENSGT00940000163322.a.b.a.b ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.a ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.b.b.a ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.a.c.b ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.a.c.a.b ENSGT00940000163148.a.a.b ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.b Oryzias ANCESTRAL SPECIES 61 ENSGT00390000003033 ENSGT00510000047481.d ENSGT00940000166096 ENSGT00940000162599 ENSGT00940000160342.g.b ENSGT00470000042284 ENSGT00940000155792 ENSGT00390000008096.B.e.a ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350 ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00940000156307.b ENSGT00940000177114 ENSGT00940000163322.b ENSGT00940000164501.b ENSGT00940000163322.a.b.a.a ENSGT00940000164501.a.a.b.b ENSGT00940000163322.a.b.a.b ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.a ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.b.b.a ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.a.c.b ENSGT00940000163148.a.a.b ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.b ENSGT00940000156768 ENSGT00940000165279.c ENSGT01090000259987.b.b.a.b Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 107 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350 ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00940000156307.b ENSGT00940000177114 ENSGT00940000163149.a.b.d ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.a.c.b ENSGT00940000163148.a.a.b ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.b ENSGT00940000156768 ENSGT00940000165279.c ENSGT01090000259987.b.b.a.b ENSGT00390000012204 Chinese medaka MODERN SPECIES 4879 ENSOSIG00000004885 ##22 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 13 ENSORLG00000020885 ENSORLG00000023956 ENSORLG00000024448 rftn2 (ENSORLG00000020882) ##17 mob4 (ENSORLG00000020881) hspe1 (ENSORLG00000020879) hspd1 (ENSORLG00000020874) coq10b (ENSORLG00000020869) SF3B1 (ENSORLG00000020219) ENSORLG00000029045 ##22 ENSORLG00000028349 pikfyve (ENSORLG00000019828) ENSORLG00000026003 ENSORLG00000024162 ENSORLG00000024267 ENSORLG00000029063 ENSORLG00000026896 ENSORLG00000022769 ENSORLG00000023577 ENSORLG00000019359 crygm3 (ENSORLG00000019353) ENSORLG00000025010 ENSORLG00000024821 etv5a (ENSORLG00000020852) itgb5 (ENSORLG00000020862) Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 72 ENSGT00510000047481.d ENSGT00940000166096 ENSGT00940000162599 ENSGT00940000160342.g.b ENSGT00470000042284 ENSGT00940000155792 ENSGT00390000008096.B.e.a ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350 ENSGT00390000005727.b ENSGT00390000005727.a.a ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00940000156307.b ENSGT00940000177114 ENSGT00940000163322.b ENSGT00940000164501.b ENSGT00940000163322.a.b.a.a ENSGT00940000164501.a.a.b.b ENSGT00940000163322.a.b.a.b ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.a ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.b.b.a ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.a.c.b.c ENSGT00940000163149.a.b.d.a ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.a.c.a.b ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.a.c.b.d ENSGT00940000163149.a.b.d.b ENSGT00940000163148.a.a.b Indian medaka MODERN SPECIES 38 rab5b (ENSOMEG00000019618) lcmt2 (ENSOMEG00000019591) ENSOMEG00000019543 crygs1 (ENSOMEG00000019535) tbccd1 (ENSOMEG00000019509) dnajb11 (ENSOMEG00000019480) satb2 (ENSOMEG00000019458) ##11 ENSOMEG00000019415 PLCL1 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ENSGT01070000253816.a.a.b ENSGT00940000153313.B ENSGT00940000158106 ENSGT00390000006601 ENSGT00390000011709.gb ENSGT00940000158556 ENSGT00950000182827.A ENSGT00940000164470.a Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000177452 ENSGT01090000259987.b.b.a.b ENSGT00940000157201 ENSGT00390000012204 ENSGT00940000160342.g.b ENSGT00470000042284 ENSGT00940000155792 ENSGT00390000008096.B.e.a ##11 ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063609.a ##17 ENSGT01050000244956.b ENSGT00390000006350 ENSGT00390000005727.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ##22 ENSGT00940000162599 ENSGT00940000166096 ENSGT00510000047481 ENSGT00390000003033 ENSGT00940000165242.c ENSGT00390000012547.b ENSGT00390000013820 ENSGT01070000253816.a.a.b ENSGT00940000153313.B ENSGT00940000158106 ENSGT00390000006601 ENSGT00390000011709.gb ENSGT00940000158556 ENSGT00950000182827.A ENSGT00940000164470.a Poecilia ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000177452 ENSGT01090000259987.b.b.a.b ENSGT00940000157201 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ENSGT00510000047481.b ENSGT00390000003033 ENSGT00940000165242.c Amazon molly MODERN SPECIES 745 rftn2 (ENSPFOG00000000047) ##17 mob4 (ENSPFOG00000000049) hspe1 (ENSPFOG00000000051) hspd1 (ENSPFOG00000000054) coq10b (ENSPFOG00000000063) SF3B1 (ENSPFOG00000000073) ANKRD44 (ENSPFOG00000000110) ##22 lcmt2 (ENSPFOG00000000342) rab5b (ENSPFOG00000000391) dbr1 (ENSPFOG00000024172) dbr1 (ENSPFOG00000000447) armc8 (ENSPFOG00000000533) ENSPFOG00000000818 Sailfin molly MODERN SPECIES 407 crygs1 (ENSPLAG00000001977) tbccd1 (ENSPLAG00000001982) dnajb11 (ENSPLAG00000001992) satb2 (ENSPLAG00000002023) ##11 PLCL1 (ENSPLAG00000002036) rftn2 (ENSPLAG00000002045) ##17 mob4 (ENSPLAG00000002062) hspe1 (ENSPLAG00000002082) hspd1 (ENSPLAG00000002100) coq10b (ENSPLAG00000002109) SF3B1 (ENSPLAG00000002293) ANKRD44 (ENSPLAG00000002344) ##22 lcmt2 (ENSPLAG00000002366) rab5b (ENSPLAG00000002409) dbr1 (ENSPLAG00000002421) Guppy MODERN SPECIES 450 itgb5 (ENSPREG00000017730) tnfaip6 (ENSPREG00000017771) rif1 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ENSGT00940000163149.a.a.h.a ENSGT00940000163148.a.b.b.a.b.a.c.a.b ENSGT00940000163148.a.a.b Channel bull blenny MODERN SPECIES 13 ENSCGOG00000024697 armc8 (ENSCGOG00000024702) dbr1 (ENSCGOG00000024707) rab5b (ENSCGOG00000002590) lcmt2 (ENSCGOG00000002606) crygs1 (ENSCGOG00000002665) tbccd1 (ENSCGOG00000002892) dnajb11 (ENSCGOG00000002904) satb2 (ENSCGOG00000002962) ##11 ENSCGOG00000002975 rftn2 (ENSCGOG00000002980) ##17 mob4 (ENSCGOG00000003005) coq10b (ENSCGOG00000003077) hspd1 (ENSCGOG00000003123) SF3B1 (ENSCGOG00000003380) ANKRD44 (ENSCGOG00000003811) ##22 pikfyve (ENSCGOG00000005018) ENSCGOG00000006697 ENSCGOG00000006700 ENSCGOG00000006706 ENSCGOG00000006711 crygm6 (ENSCGOG00000006745) si:dkey-57a22.15 (ENSCGOG00000006753) zgc:153846 (ENSCGOG00000006772) ENSCGOG00000006778 ENSCGOG00000006782 ENSCGOG00000006784 ENSCGOG00000006792 ENSCGOG00000006801 ENSCGOG00000006806 ENSCGOG00000006810 Pike perch MODERN SPECIES 1 dbr1 (ENSSLUG00000017311) rab5b (ENSSLUG00000017321) lcmt2 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ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.a.j ENSGT00940000163494.a.b.a.b.b ENSGT00940000163148.a.a.a.a.a ENSGT00940000163148.a.b.b.b.c.a.a ENSGT00940000163322.a.b.a.a ENSGT00940000163148.a.b.b.b.d.a.a.b.a ENSGT00940000163148.a.b.b.b.c.a.b.b ENSGT00940000163148.a.b.b.b.d.a.a.b.b ENSGT00940000163148.a.b.b.b.c.a.b.a ENSGT00940000163148.a.a.b.p.a.b.a ENSGT00940000163148.a.b.a Atlantic salmon MODERN SPECIES 13 ENSSSAG00000052141 ENSSSAG00000116518 dnajb11 (ENSSSAG00000111994) satb2 (ENSSSAG00000053203) ##11 ENSSSAG00000053311 ENSSSAG00000088810 PLCL1 (ENSSSAG00000053340) ENSSSAG00000094048 rftn2 (ENSSSAG00000111108) ##17 MOB4 (ENSSSAG00000081444) hspe1 (ENSSSAG00000081441) hspd1 (ENSSSAG00000081432) coq10b (ENSSSAG00000081427) SF3B1 (ENSSSAG00000081423) ENSSSAG00000120274 ANKRD44 (ENSSSAG00000081383) ##22 pikfyve (ENSSSAG00000081108) ENSSSAG00000100402 crygm6 (ENSSSAG00000058473) ENSSSAG00000114573 ENSSSAG00000109366 ENSSSAG00000081059 ENSSSAG00000119690 ENSSSAG00000111348 ENSSSAG00000075489 ENSSSAG00000087867 ENSSSAG00000081047 ENSSSAG00000117052 crygs3 (ENSSSAG00000081044) ENSSSAG00000080856 etv5a (ENSSSAG00000080749) River trout MODERN SPECIES 12 ENSSTUG00000010236 armc8 (ENSSTUG00000010289) dbr1 (ENSSTUG00000011595) rab5b (ENSSTUG00000011617) ENSSTUG00000011626 tbccd1 (ENSSTUG00000011632) dnajb11 (ENSSTUG00000011647) satb2 (ENSSTUG00000011931) ##11 PLCL1 (ENSSTUG00000011969) rftn2 (ENSSTUG00000011987) ##17 MOB4 (ENSSTUG00000012002) hspe1 (ENSSTUG00000012021) hspd1 (ENSSTUG00000012049) coq10b (ENSSTUG00000012103) SF3B1 (ENSSTUG00000012136) ANKRD44 (ENSSTUG00000012286) ##22 pikfyve (ENSSTUG00000013007) crygm6 (ENSSTUG00000014959) si:dkey-57a22.15 (ENSSTUG00000014966) crygm1 (ENSSTUG00000014983) crygmxl1 (ENSSTUG00000014995) ENSSTUG00000015006 ENSSTUG00000034595 ENSSTUG00000034610 ENSSTUG00000034646 ENSSTUG00000034648 ENSSTUG00000034659 ENSSTUG00000034669 ENSSTUG00000034761 etv5a (ENSSTUG00000038029) itgb5 (ENSSTUG00000038146) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000165242.e.b.b ENSGT00390000003033.c ENSGT00510000047481.f.a ENSGT00940000166096.g ENSGT01000000220382 ENSGT00470000042284 ENSGT00940000155792.h ENSGT00390000008096.B.e.a.d ##11 ENSGT00940000158407.g ENSGT00530000063609.a.h ##17 ENSGT01050000244956.b.u.b ENSGT00390000006350.f ENSGT00390000005727.b.e ENSGT00940000155367.f ENSGT00390000018393.db ENSGT00950000182908.D.o ##22 ENSGT00940000156307.b.d ENSGT00940000164501.a.a.b.b.b ENSGT00940000163322.a.b.a.b.f ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.a.j ENSGT00940000163148.a.b.b.b.d.a.a.b ENSGT00940000163494.a.b.a.b.b ENSGT00940000163148.a.a.a.a ENSGT00940000163148.a.b.b.b.c.a.a ENSGT00940000163148.a.b.b.b.c.a.b.b ENSGT00940000164501.a.a.b.a.c.a ENSGT00940000163494.a.b.a.a ENSGT00940000163148.a.b.a ENSGT00940000163322.a.a.a.b ENSGT00940000163494.a.a.c.a.c.a ENSGT00940000156768.x.a.b Rainbow trout MODERN SPECIES 14 idh1 (ENSOMYG00000022000) ENSOMYG00000064355 armc8 (ENSOMYG00000019919) dbr1 (ENSOMYG00000019774) rab5b (ENSOMYG00000019771) ENSOMYG00000019765 ENSOMYG00000019760 dnajb11 (ENSOMYG00000019756) satb2 (ENSOMYG00000068548) ##11 ENSOMYG00000019746 rftn2 (ENSOMYG00000056375) ##17 mob3 (ENSOMYG00000019689) hspd1 (ENSOMYG00000019648) coq10b (ENSOMYG00000019601) SF3B1 (ENSOMYG00000019571) ANKRD44 (ENSOMYG00000019539) ##22 pikfyve (ENSOMYG00000019157) ENSOMYG00000056106 crygm6 (ENSOMYG00000018980) ENSOMYG00000018973 ENSOMYG00000018968 ENSOMYG00000024695 ENSOMYG00000018955 ENSOMYG00000018938 ENSOMYG00000018873 ENSOMYG00000018926 ENSOMYG00000018915 crygs3 (ENSOMYG00000018892) ENSOMYG00000075250 ENSOMYG00000018357 etv5a (ENSOMYG00000018303) Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000012547.b.x.a ENSGT00390000003033.c ENSGT00510000047481.f.a ENSGT00940000166096.g ENSGT01000000220382 ENSGT00470000042284 ENSGT00940000155792.h ENSGT00390000008096.B.e.a.d ##11 ENSGT00940000158407.g ENSGT00530000063609.a.h ##17 ENSGT01050000244956.b.u.b ENSGT00390000006350.f ENSGT00390000005727.b.e ENSGT00940000155367.f ENSGT00390000018393.db ENSGT00950000182908.D.o ##22 ENSGT00940000156307.b.d ENSGT00940000164501.a.a.b.b.b ENSGT00940000163322.a.b.a.b.f ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.a.j ENSGT00940000163148.a.b.b.b.d.a.a.b ENSGT00940000163494.a.b.a.b.b ENSGT00940000163148.a.a.a.a ENSGT00940000163148.a.b.b.b.c.a.a ENSGT00940000163148.a.b.b.b.c.a.b.b ENSGT00940000163148.a.a.b.p.a.a ENSGT00940000163322.a.a.a.b ENSGT00940000163494.a.a.c.a.c.a ENSGT00940000156768.x.a.b ENSGT00940000165279.c.d ENSGT01090000259987.b.b.a.b.n Coho salmon MODERN SPECIES 18 idh1 (ENSOKIG00005024323) armc8 (ENSOKIG00005021250) dbr1 (ENSOKIG00005021000) rab5b (ENSOKIG00005020965) ENSOKIG00005020949 tbccd1 (ENSOKIG00005020923) dnajb11 (ENSOKIG00005020809) satb2 (ENSOKIG00005020774) ##11 PLCL1 (ENSOKIG00005020711) rftn2 (ENSOKIG00005020694) ##17 MOB4 (ENSOKIG00005020680) hspe1 (ENSOKIG00005020651) hspd1 (ENSOKIG00005020599) coq10b (ENSOKIG00005020582) SF3B1 (ENSOKIG00005020547) ANKRD44 (ENSOKIG00005017701) ##22 pikfyve (ENSOKIG00005014938) ENSOKIG00005014547 crygmxl1 (ENSOKIG00005014540) ENSOKIG00005014508 ENSOKIG00005014491 ENSOKIG00005014477 ENSOKIG00005014475 ENSOKIG00005014446 ENSOKIG00005014426 crygs3 (ENSOKIG00005014406) ENSOKIG00005014398 ENSOKIG00005013720 etv5a (ENSOKIG00005013554) itgb5 (ENSOKIG00005012644) tnfaip6 (ENSOKIG00005012539) Chinook salmon MODERN SPECIES 18 ENSOTSG00005047371 creb1b (ENSOTSG00005047367) ccnyl1 (ENSOTSG00005047361) fzd5 (ENSOTSG00005047360) ENSOTSG00005047359 PLCL1 (ENSOTSG00005047357) ENSOTSG00005047356 ##11 ENSOTSG00005047355 ENSOTSG00005047354 rftn2 (ENSOTSG00005047352) ##17 MOB4 (ENSOTSG00005047351) hspe1 (ENSOTSG00005047349) hspd1 (ENSOTSG00005047345) coq10b (ENSOTSG00005047343) SF3B1 (ENSOTSG00005047341) ANKRD44 (ENSOTSG00005047338) ##22 pikfyve (ENSOTSG00005046954) crygm6 (ENSOTSG00005046934) si:dkey-57a22.15 (ENSOTSG00005046933) ENSOTSG00005046932 ENSOTSG00005046931 ENSOTSG00005046930 ENSOTSG00005046928 ENSOTSG00005046927 ENSOTSG00005046926 ENSOTSG00005046925 ENSOTSG00005046924 ENSOTSG00005046923 ENSOTSG00005046366 etv5a (ENSOTSG00005046302) itgb5 (ENSOTSG00005045772) Huchen MODERN SPECIES 1480 PLCL1 (ENSHHUG00000051538) rftn2 (ENSHHUG00000051539) ##17 MOB4 (ENSHHUG00000051544) hspd1 (ENSHHUG00000051567) coq10b (ENSHHUG00000051600) SF3B1 (ENSHHUG00000051604) ANKRD44 (ENSHHUG00000051638) ##22 pikfyve (ENSHHUG00000051735) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00510000047481.f.b ENSGT00940000166096.h ENSGT00940000162599 ENSGT00940000160342.g.b ENSGT00470000042284 ENSGT00940000155792.h ENSGT00390000008096.B.e.a.d ##11 ENSGT00940000155792.g ENSGT00390000008096.B.e.a.c ##11 ENSGT00940000158407.h ENSGT00530000063609.a.g ##17 ENSGT01050000244956.b.u.a ENSGT00390000005727.b.f ENSGT00940000155367.e ENSGT00390000018393.eb ENSGT00950000182908.D.p ##22 ENSGT00940000156307.b.c ENSGT00940000169129 ENSGT00940000177114 ENSGT00530000063186.b.b.p ENSGT00940000154695.d.b.b.b.b ENSGT00940000159224.b.a ENSGT00940000165586.b 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(ENSHHUG00000026274) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000165242.e.a ENSGT00390000003033.d ENSGT00510000047481.f.b ENSGT00940000166096.h ENSGT00940000162599 ENSGT00940000160342.g.b ENSGT00940000155792.g ENSGT00390000008096.B.e.a.c ##11 ENSGT00940000158407.h ENSGT00530000063609.a.g ##17 ENSGT01050000244956.b.u.a ENSGT00390000006350.e ENSGT00390000005727.b.f ENSGT00940000155367.e ENSGT00390000018393.eb ENSGT00950000182908.D.p ##22 ENSGT00940000156307.b.c ENSGT00940000169129 ENSGT00940000177114 ENSGT00940000156597.a.b.b.a.a.a.a ENSGT00940000157652.j.b ENSGT01030000234570.d.a.p.a ENSGT00530000063186.b.b.p ENSGT00940000154695.d.b.b.b.b ENSGT00940000159224.b.a ENSGT00940000165586.b ENSGT00940000155235.k.b.c ENSGT00940000155408.o.b ENSGT00940000157249.o ENSGT00940000154453.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000162639.b Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000165242.e.a ENSGT00390000003033.d ENSGT00510000047481.f.b ENSGT00940000166096.h ENSGT01060000253581 ENSGT00940000160342.g.b ENSGT00940000155792.g ENSGT00390000008096.B.e.a.c ##11 ENSGT00940000158407.h ENSGT00530000063609.a.g ##17 ENSGT01050000244956.b.u.a ENSGT00390000006350.e ENSGT00390000005727.b.f ENSGT00940000155367.e ENSGT00390000018393.eb ENSGT00950000182908.D.p ##22 ENSGT00940000156307.b.c ENSGT00940000169129 ENSGT00940000177114 ENSGT00940000163322.b ENSGT00940000164501.b ENSGT00940000163494.a.b.b ENSGT00940000164501.a.a.b.b.a ENSGT00940000163322.a.b.a.b.e ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.a.i ENSGT00940000163494.a.b.a.b.a ENSGT00940000163148.a.b.b.b.d.a.a.a.a.a ENSGT00940000163322.a.a.a.a ENSGT00940000163494.a.a.c.b.a ENSGT00940000163494.a.a.c.a.c.b ENSGT00940000156768.x.a.a Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000012547.b.x.b ENSGT00940000165242.e.a ENSGT00390000003033.d ENSGT00940000166096.h ENSGT01060000253581 ENSGT00940000160342.g.b ENSGT00940000155792.g ENSGT00390000008096.B.e.a.c ##11 ENSGT00940000158407.h ENSGT00530000063609.a.g ##17 ENSGT01050000244956.b.u.a ENSGT00390000006350.e ENSGT00390000005727.b.f ENSGT00940000155367.e ENSGT00390000018393.eb ENSGT00950000182908.D.p ##22 ENSGT00940000156307.b.c ENSGT00940000169129 ENSGT00940000177114 ENSGT00940000163322.b ENSGT00940000164501.b ENSGT00940000163494.a.b.b ENSGT00940000164501.a.a.b.b.a ENSGT00940000163322.a.b.a.b.e ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.a.i ENSGT00940000163494.a.b.a.b.a ENSGT00940000163148.a.b.b.b.d.a.a.a.a.a ENSGT00940000163322.a.a.a.a ENSGT00940000163494.a.a.c.b.a ENSGT00940000163494.a.a.c.a.c.b ENSGT00940000156768.x.a.a Coho salmon MODERN SPECIES 11 idh1 (ENSOKIG00005048897) ENSOKIG00005049075 armc8 (ENSOKIG00005049098) ENSOKIG00005049169 CRYGS (ENSOKIG00005049171) dnajb11 (ENSOKIG00005049174) satb2 (ENSOKIG00005049182) ##11 ENSOKIG00005049184 PLCL1 (ENSOKIG00005049189) rftn2 (ENSOKIG00005049193) ##17 MOB4 (ENSOKIG00005000137) hspe1 (ENSOKIG00005000118) hspd1 (ENSOKIG00005000168) coq10b (ENSOKIG00005000190) SF3B1 (ENSOKIG00005000295) ANKRD44 (ENSOKIG00005000788) ##22 pikfyve (ENSOKIG00005001656) 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ENSOTSG00005027136 crygmxl1 (ENSOTSG00005027137) ENSOTSG00005027140 ENSOTSG00005027141 crygs4 (ENSOTSG00005027142) crygs3 (ENSOTSG00005027143) ENSOTSG00005027152 etv5a (ENSOTSG00005027391) Rainbow trout MODERN SPECIES 21 ENSOMYG00000056558 armc8 (ENSOMYG00000016390) dbr1 (ENSOMYG00000016707) rab5b (ENSOMYG00000016734) ENSOMYG00000016754 ENSOMYG00000016813 dnajb11 (ENSOMYG00000016827) satb2 (ENSOMYG00000016906) ##11 ENSOMYG00000016971 rftn2 (ENSOMYG00000016981) ##17 MOB4 (ENSOMYG00000017003) hspd1 (ENSOMYG00000017062) ENSOMYG00000017102 coq10b (ENSOMYG00000017107) SF3B1 (ENSOMYG00000017172) ANKRD44 (ENSOMYG00000018186) ##22 pikfyve (ENSOMYG00000019478) ENSOMYG00000075666 ENSOMYG00000022842 ENSOMYG00000022852 ENSOMYG00000022863 crygm7 (ENSOMYG00000022914) ENSOMYG00000022892 crygm6 (ENSOMYG00000022885) si:dkey-57a22.15 (ENSOMYG00000061582) ENSOMYG00000022936 crygmxl1 (ENSOMYG00000022946) ENSOMYG00000023050 ENSOMYG00000060522 ENSOMYG00000023116 crygs3 (ENSOMYG00000023161) Salmo ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000012547.b.x.b ENSGT00940000165242.e.a ENSGT00390000003033.d ENSGT00940000166096.h ENSGT00940000162599.m ENSGT00940000160342.g.b ENSGT00940000155792.g ENSGT00390000008096.B.e.a.c ##11 ENSGT00940000158407.h ENSGT00530000063609.a.g ##17 ENSGT01050000244956.b.u.a ENSGT00390000006350.e ENSGT00390000005727.b.f ENSGT00940000155367.e ENSGT00390000018393.eb ENSGT00950000182908.D.p ##22 ENSGT00940000156307.b.c ENSGT00940000169129 ENSGT01050000244956.b.v.c ENSGT00940000163322.b.b ENSGT00940000164501.b ENSGT00940000163494.a.b.b ENSGT00940000164501.a.a.b.b.a ENSGT00940000163322.a.b.a.b.e ENSGT00940000163148.a.b.b.a.a.a.i ENSGT00940000163494.a.b.a.b.a ENSGT00940000163148.a.a.a.a.b ENSGT00940000163148.a.b.b.b.d.a.a.a.b ENSGT00940000163322.a.a.a.a ENSGT00940000163494.a.a.c.b.a ENSGT00940000163494.a.a.c.a.c.b River trout MODERN SPECIES 16 idh1 (ENSSTUG00000010572) ENSSTUG00000010728 armc8 (ENSSTUG00000010764) rab5b (ENSSTUG00000011218) lcmt2 (ENSSTUG00000011225) CRYGS 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