Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 239 ENSGT00940000154107 ENSGT00940000154995 ENSGT00940000156869 ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.b ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000009313 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.b ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000009313 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00940000171365 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000154107.b ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000009313 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT00940000154534.b.b ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a Amniota ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00390000009313 ENSGT01030000234590.B.a.b ENSGT00390000000527 ENSGT00390000010184 ENSGT00950000182887.C.a.a.b ENSGT00730000111225 ENSGT00940000155191.b ENSGT00390000009664 ENSGT00390000014721 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT00940000154534.b.b ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00940000171365 ENSGT00390000003635 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00390000017724.b ##26 ENSGT00940000168676 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00900000143613 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00390000017724.b ##26 ENSGT00940000168676 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00900000143613 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000169676 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00390000017724.b ##26 ENSGT00940000168676 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00900000143613 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000169676 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00390000017724.b ##26 ENSGT00940000168676 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00900000143613 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 ENSGT00960000190088 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000169676 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00910000148216 ENSGT00940000167515 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00910000148052 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00900000143613 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00960000190088 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 Primates ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000169676 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00910000148216 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00910000148052 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00390000008096.E.b ENSGT00390000008096.E.a ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 ENSGT00390000016224.j.a Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00390000008096.E.b ENSGT00390000008096.E.a ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 ENSGT00390000016224.j.a.g.b ENSGT00390000016224.j.a.h Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 ENSGT00390000016224.j.a.g.b ENSGT00390000016224.j.a.g.a Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 134 TBC1D5 (ENSPSMG00000008857) #15 PLCL2 (ENSPSMG00000008999) #16 ENSPSMG00000009049 #17 RFTN1 (ENSPSMG00000009111) #18 OXNAD1 (ENSPSMG00000009164) #19 DPH3 (ENSPSMG00000009196) #20 GALNT15 (ENSPSMG00000009213) #21 ANKRD28 (ENSPSMG00000009271) #22 BTD (ENSPSMG00000009312) #23 HACL1 (ENSPSMG00000009541) #24 COLQ (ENSPSMG00000009807) #25 EAF1 (ENSPSMG00000009851) #26 METTL6 (ENSPSMG00000009871) #27 SH3BP5 (ENSPSMG00000009896) #28 CAPN7 (ENSPSMG00000009974) #29 ENSPSMG00000009992 #30 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 123 SGO1 (ENSPCOG00000020116) ENSPCOG00000025661 PP2D1 (ENSPCOG00000022254) RAB5A (ENSPCOG00000013289) EFHB (ENSPCOG00000007351) KCNH8 (ENSPCOG00000017646) SATB1 (ENSPCOG00000019943) ENSPCOG00000017620 TBC1D5 (ENSPCOG00000020537) #15 PLCL2 (ENSPCOG00000015377) #16 ENSPCOG00000020704 RFTN1 (ENSPCOG00000028368) #18 OXNAD1 (ENSPCOG00000017016) #19 DPH3 (ENSPCOG00000020730) #20 GALNT15 (ENSPCOG00000019842) #21 ANKRD28 (ENSPCOG00000028450) #22 BTD (ENSPCOG00000018677) #23 HACL1 (ENSPCOG00000019398) #24 COLQ (ENSPCOG00000024494) #25 EAF1 (ENSPCOG00000028069) #26 METTL6 (ENSPCOG00000015487) #27 SH3BP5 (ENSPCOG00000027758) #28 CAPN7 (ENSPCOG00000013379) #29 COL6A5 (ENSPCOG00000002663) #30 COL6A6 (ENSPCOG00000023096) PIK3R4 (ENSPCOG00000023995) ATP2C1 (ENSPCOG00000016326) ASTE1 (ENSPCOG00000025768) NEK11 (ENSPCOG00000013103) ENSPCOG00000019848 ENSPCOG00000014497 Mouse lemur MODERN SPECIES ENSMICG00000049539 KCNH8 (ENSMICG00000049082) ENSMICG00000049466 ENSMICG00000049113 ENSMICG00000049072 TBC1D5 (ENSMICG00000049088) #15 PLCL2 (ENSMICG00000049502) #16 ENSMICG00000049389 #17 ENSMICG00000049245 RFTN1 (ENSMICG00000049449) #18 OXNAD1 (ENSMICG00000049273) #19 ENSMICG00000048866 DPH3 (ENSMICG00000049463) #20 GALNT15 (ENSMICG00000049267) #21 ENSMICG00000048918 ANKRD28 (ENSMICG00000048989) #22 BTD (ENSMICG00000049329) #23 HACL1 (ENSMICG00000049455) #24 ENSMICG00000048874 COLQ (ENSMICG00000049255) #25 EAF1 (ENSMICG00000048930) #26 ENSMICG00000048914 ENSMICG00000049001 #28 ENSMICG00000049043 COL6A6 (ENSMICG00000049371) PIK3R4 (ENSMICG00000049166) ENSMICG00000048885 ATP2C1 (ENSMICG00000049199) ENSMICG00000049451 NEK11 (ENSMICG00000048899) NUDT16 (ENSMICG00000049324) Bushbaby MODERN SPECIES 117 PP2D1 (ENSOGAG00000007917) RAB5A (ENSOGAG00000003948) EFHB (ENSOGAG00000003944) ENSOGAG00000027211 KCNH8 (ENSOGAG00000000804) SATB1 (ENSOGAG00000015441) ENSOGAG00000025343 ENSOGAG00000030351 TBC1D5 (ENSOGAG00000016352) #15 PLCL2 (ENSOGAG00000030914) #16 ENSOGAG00000006983 #17 RFTN1 (ENSOGAG00000014420) #18 OXNAD1 (ENSOGAG00000014419) #19 DPH3 (ENSOGAG00000034296) #20 GALNT15 (ENSOGAG00000014413) #21 ANKRD28 (ENSOGAG00000013981) #22 BTD (ENSOGAG00000013977) #23 HACL1 (ENSOGAG00000013969) #24 COLQ (ENSOGAG00000013967) #25 EAF1 (ENSOGAG00000013964) #26 METTL6 (ENSOGAG00000013962) #27 SH3BP5 (ENSOGAG00000013959) #28 CAPN7 (ENSOGAG00000013951) #29 ENSOGAG00000032781 COL6A5 (ENSOGAG00000028058) #30 COL6A6 (ENSOGAG00000007814) PIK3R4 (ENSOGAG00000007819) ENSOGAG00000027609 ATP2C1 (ENSOGAG00000016100) ASTE1 (ENSOGAG00000016111) NEK11 (ENSOGAG00000016116) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000169676 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00910000148216 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00910000148052 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000169676 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00910000148216 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00910000148052 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000155351.cb ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000154295.y.a.b ENSGT00390000017004.a.b.j.a ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000155351.cb ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000154295.y.a.b ENSGT00390000017004.a.b.j.a ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000155351.cb ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00390000008765.r.a.a Marmoset MODERN SPECIES 8 RAB5A (ENSCJAG00000048394) EFHB (ENSCJAG00000003700) ENSCJAG00000069755 KCNH8 (ENSCJAG00000003681) SATB1 (ENSCJAG00000003645) ENSCJAG00000078805 TBC1D5 (ENSCJAG00000003617) #15 PLCL2 (ENSCJAG00000003599) #16 ENSCJAG00000070689 DAZL (ENSCJAG00000039120) #17 RFTN1 (ENSCJAG00000003585) #18 OXNAD1 (ENSCJAG00000003582) #19 DPH3 (ENSCJAG00000072075) #20 ENSCJAG00000072992 GALNT15 (ENSCJAG00000003566) #21 ANKRD28 (ENSCJAG00000003502) #22 BTD (ENSCJAG00000003498) #23 HACL1 (ENSCJAG00000003426) #24 EAF1 (ENSCJAG00000043266) #26 METTL6 (ENSCJAG00000003415) #27 SH3BP5 (ENSCJAG00000080725) #28 CAPN7 (ENSCJAG00000003376) #29 ENSCJAG00000060750 COL6A5 (ENSCJAG00000003344) #30 COL6A6 (ENSCJAG00000003330) PIK3R4 (ENSCJAG00000003293) ATP2C1 (ENSCJAG00000003182) ASTE1 (ENSCJAG00000003181) ENSCJAG00000083191 NEK11 (ENSCJAG00000003164) NUDT16 (ENSCJAG00000003160) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000154295.y.a.b ENSGT00390000017004.a.b.j.a ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000155351.cb ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00390000008765.r.a.a ENSGT00940000160525 Capuchin MODERN SPECIES 24 ENSCCAG00000035359 EFHB (ENSCCAG00000026456) KCNH8 (ENSCCAG00000025449) SATB1 (ENSCCAG00000022150) ENSCCAG00000024995 ENSCCAG00000026605 ENSCCAG00000027964 TBC1D5 (ENSCCAG00000035716) #15 PLCL2 (ENSCCAG00000033228) #16 ENSCCAG00000035747 #17 RFTN1 (ENSCCAG00000024706) #18 OXNAD1 (ENSCCAG00000024384) #19 DPH3 (ENSCCAG00000035148) #20 GALNT15 (ENSCCAG00000030762) #21 ENSCCAG00000035196 ANKRD28 (ENSCCAG00000000718) #22 BTD (ENSCCAG00000030979) #23 HACL1 (ENSCCAG00000026710) #24 COLQ (ENSCCAG00000037774) #25 EAF1 (ENSCCAG00000037268) #26 METTL6 (ENSCCAG00000026438) #27 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 54 KAT2B (ENSSBOG00000028858) PP2D1 (ENSSBOG00000027219) RAB5A (ENSSBOG00000028989) EFHB (ENSSBOG00000020861) ENSSBOG00000023738 KCNH8 (ENSSBOG00000029678) SATB1 (ENSSBOG00000019471) ENSSBOG00000035188 TBC1D5 (ENSSBOG00000018924) #15 PLCL2 (ENSSBOG00000026576) #16 ENSSBOG00000033845 #17 RFTN1 (ENSSBOG00000022881) #18 OXNAD1 (ENSSBOG00000022408) #19 ENSSBOG00000026042 #20 GALNT15 (ENSSBOG00000033864) #21 ANKRD28 (ENSSBOG00000020685) #22 BTD (ENSSBOG00000010141) #23 HACL1 (ENSSBOG00000032071) #24 EAF1 (ENSSBOG00000029911) #26 METTL6 (ENSSBOG00000029385) #27 SH3BP5 (ENSSBOG00000022481) #28 CAPN7 (ENSSBOG00000025768) #29 EIF5A2 (ENSSBOG00000020577) ENSSBOG00000022346 CLDN11 (ENSSBOG00000033006) SLC7A14 (ENSSBOG00000021295) SKIL (ENSSBOG00000029173) PRKCI (ENSSBOG00000028708) ENSSBOG00000034894 ENSSBOG00000029918 PHC3 (ENSSBOG00000012175) Mas night monkey MODERN SPECIES 309 ENSANAG00000031028 PP2D1 (ENSANAG00000022659) ENSANAG00000025120 EFHB (ENSANAG00000014717) KCNH8 (ENSANAG00000033965) SATB1 (ENSANAG00000034492) ENSANAG00000023732 ENSANAG00000033391 TBC1D5 (ENSANAG00000032290) #15 PLCL2 (ENSANAG00000028813) #16 ENSANAG00000034405 #17 RFTN1 (ENSANAG00000019087) #18 OXNAD1 (ENSANAG00000033629) #19 DPH3 (ENSANAG00000031816) #20 GALNT15 (ENSANAG00000026907) #21 ANKRD28 (ENSANAG00000031839) #22 ENSANAG00000023863 #23 HACL1 (ENSANAG00000022352) #24 COLQ (ENSANAG00000028274) #25 EAF1 (ENSANAG00000025167) #26 ENSANAG00000024487 #27 SH3BP5 (ENSANAG00000037138) #28 CAPN7 (ENSANAG00000024102) #29 ENSANAG00000022047 COL6A5 (ENSANAG00000020296) #30 COL6A6 (ENSANAG00000026328) PIK3R4 (ENSANAG00000026825) ENSANAG00000032863 ATP2C1 (ENSANAG00000022472) ASTE1 (ENSANAG00000033319) NEK11 (ENSANAG00000029811) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000169676 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000012078.b.d ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000154295.y.a.b ENSGT00390000017004.a.b.m.b ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b.g #17 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00910000148216 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00910000148052 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000155351.cb ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000012078.b.d ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000154295.y.a.b ENSGT00390000017004.a.b.m.b ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b.g #17 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000155351.cb ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 ENSGT00390000016224.j.a.e.b Hominidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000012078.b.d ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000154295.y.a.b ENSGT00390000017004.a.b.m.b ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b.g #17 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.h.a.a.a.a ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000155351.cb ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000012078.b.d ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000154295.y.a.b ENSGT00390000017004.a.b.m.b ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b.g #17 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00950000182802.B.a.a.a.a.h.a.a.a.a ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00910000148131 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000012078.b.d ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000154295.y.a.b ENSGT00390000017004.a.b.m.b ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b.g #17 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00910000148131 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00910000146921 Pan ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000012078.b.d ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000154295.y.a.b ENSGT00390000017004.a.b.m.b ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b.g #17 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00390000007159 ENSGT00640000091558 ENSGT00940000158393 ENSGT00910000148131 ENSGT00940000157922 ENSGT00940000153655.B ENSGT00440000033958 ENSGT00910000146921 Bonobo MODERN SPECIES 16 PP2D1 (ENSPPAG00000037981) RAB5A (ENSPPAG00000041763) EFHB (ENSPPAG00000027704) KCNH8 (ENSPPAG00000043183) SATB1 (ENSPPAG00000024816) ENSPPAG00000036560 ENSPPAG00000038217 TBC1D5 (ENSPPAG00000033604) #15 PLCL2 (ENSPPAG00000013774) #16 DAZL (ENSPPAG00000037518) #17 ENSPPAG00000020664 RFTN1 (ENSPPAG00000043628) #18 OXNAD1 (ENSPPAG00000036281) #19 DPH3 (ENSPPAG00000032230) #20 GALNT15 (ENSPPAG00000039833) #21 ANKRD28 (ENSPPAG00000041736) #22 BTD (ENSPPAG00000035833) #23 HACL1 (ENSPPAG00000042783) #24 COLQ (ENSPPAG00000031635) #25 EAF1 (ENSPPAG00000039271) #26 METTL6 (ENSPPAG00000039377) #27 SH3BP5 (ENSPPAG00000038360) #28 CAPN7 (ENSPPAG00000032807) #29 RBSN (ENSPPAG00000038220) MRPS25 (ENSPPAG00000039324) NR2C2 (ENSPPAG00000023138) ENSPPAG00000042214 FGD5 (ENSPPAG00000025764) C3orf20 (ENSPPAG00000041311) CCDC174 (ENSPPAG00000038422) ENSPPAG00000033481 Chimpanzee MODERN SPECIES 16 RAB5A (ENSPTRG00000014682) EFHB (ENSPTRG00000014681) KCNH8 (ENSPTRG00000014679) ENSPTRG00000050714 SATB1 (ENSPTRG00000014677) ENSPTRG00000051757 ENSPTRG00000050687 TBC1D5 (ENSPTRG00000014676) #15 PLCL2 (ENSPTRG00000014675) #16 DAZL (ENSPTRG00000014674) #17 ENSPTRG00000048845 RFTN1 (ENSPTRG00000014673) #18 OXNAD1 (ENSPTRG00000014672) #19 DPH3 (ENSPTRG00000051794) #20 GALNT15 (ENSPTRG00000014670) #21 ANKRD28 (ENSPTRG00000030292) #22 BTD (ENSPTRG00000014668) #23 HACL1 (ENSPTRG00000014667) #24 COLQ (ENSPTRG00000030295) #25 EAF1 (ENSPTRG00000014665) #26 METTL6 (ENSPTRG00000030297) #27 ENSPTRG00000051176 SH3BP5 (ENSPTRG00000014662) #28 CAPN7 (ENSPTRG00000014661) #29 RBSN (ENSPTRG00000014659) MRPS25 (ENSPTRG00000014658) NR2C2 (ENSPTRG00000014657) FGD5 (ENSPTRG00000014656) C3H3orf20 (ENSPTRG00000014655) CCDC174 (ENSPTRG00000014654) ENSPTRG00000048798 Human MODERN SPECIES 15 ZNF385D (ENSG00000151789) SGO1 (ENSG00000129810) KAT2B (ENSG00000114166) PP2D1 (ENSG00000183977) RAB5A (ENSG00000144566) EFHB (ENSG00000163576) KCNH8 (ENSG00000183960) SATB1 (ENSG00000182568) TBC1D5 (ENSG00000131374) #15 PLCL2 (ENSG00000154822) #16 DAZL (ENSG00000092345) #17 RFTN1 (ENSG00000131378) #18 OXNAD1 (ENSG00000154814) #19 DPH3 (ENSG00000154813) #20 GALNT15 (ENSG00000131386) #21 ANKRD28 (ENSG00000206560) #22 BTD (ENSG00000169814) #23 HACL1 (ENSG00000131373) #24 COLQ (ENSG00000206561) #25 EAF1 (ENSG00000144597) #26 METTL6 (ENSG00000206562) #27 SH3BP5 (ENSG00000131370) #28 CAPN7 (ENSG00000131375) #29 RBSN (ENSG00000131381) MRPS25 (ENSG00000131368) NR2C2 (ENSG00000177463) FGD5 (ENSG00000154783) C3orf20 (ENSG00000131379) CCDC174 (ENSG00000154781) GRIP2 (ENSG00000144596) SLC6A6 (ENSG00000131389) Gorilla MODERN SPECIES 16 PP2D1 (ENSGGOG00000012034) RAB5A (ENSGGOG00000015981) EFHB (ENSGGOG00000013587) KCNH8 (ENSGGOG00000028470) SATB1 (ENSGGOG00000001779) ENSGGOG00000028241 ENSGGOG00000024653 TBC1D5 (ENSGGOG00000016312) #15 PLCL2 (ENSGGOG00000016029) #16 DAZL (ENSGGOG00000023632) #17 ENSGGOG00000040632 RFTN1 (ENSGGOG00000008885) #18 OXNAD1 (ENSGGOG00000006174) #19 DPH3 (ENSGGOG00000043523) #20 GALNT15 (ENSGGOG00000009285) #21 ANKRD28 (ENSGGOG00000009548) #22 BTD (ENSGGOG00000013932) #23 HACL1 (ENSGGOG00000010802) #24 COLQ (ENSGGOG00000004457) #25 EAF1 (ENSGGOG00000004453) #26 METTL6 (ENSGGOG00000024436) #27 ENSGGOG00000023889 SH3BP5 (ENSGGOG00000001667) #28 CAPN7 (ENSGGOG00000025671) #29 RBSN (ENSGGOG00000012784) MRPS25 (ENSGGOG00000011005) ENSGGOG00000044014 FGD5 (ENSGGOG00000001365) C3orf20 (ENSGGOG00000001361) CCDC174 (ENSGGOG00000001359) ENSGGOG00000038061 Orangutan MODERN SPECIES 16 ZNF385D (ENSPPYG00000014069) SGO1 (ENSPPYG00000014071) KAT2B (ENSPPYG00000014072) PP2D1 (ENSPPYG00000014073) RAB5A (ENSPPYG00000014074) EFHB (ENSPPYG00000014075) KCNH8 (ENSPPYG00000014076) SATB1 (ENSPPYG00000014077) TBC1D5 (ENSPPYG00000014078) #15 PLCL2 (ENSPPYG00000014079) #16 DAZL (ENSPPYG00000014080) #17 RFTN1 (ENSPPYG00000014081) #18 OXNAD1 (ENSPPYG00000014082) #19 DPH3 (ENSPPYG00000014083) #20 GALNT15 (ENSPPYG00000014084) #21 ANKRD28 (ENSPPYG00000014085) #22 BTD (ENSPPYG00000014086) #23 HACL1 (ENSPPYG00000014087) #24 EAF1 (ENSPPYG00000014089) #26 METTL6 (ENSPPYG00000034493) #27 ENSPPYG00000030473 SH3BP5 (ENSPPYG00000014091) #28 CAPN7 (ENSPPYG00000014092) #29 COL6A5 (ENSPPYG00000030510) #30 COL6A6 (ENSPPYG00000014094) PIK3R4 (ENSPPYG00000014096) ATP2C1 (ENSPPYG00000014097) ASTE1 (ENSPPYG00000014098) NEK11 (ENSPPYG00000014099) ENSPPYG00000014101 MRPL3 (ENSPPYG00000014102) Gibbon MODERN SPECIES 23 ATP6V1B2 (ENSNLEG00000000794) SLC18A1 (ENSNLEG00000000859) KCNH8 (ENSNLEG00000000890) ENSNLEG00000031311 SATB1 (ENSNLEG00000000912) ENSNLEG00000031530 ENSNLEG00000034876 TBC1D5 (ENSNLEG00000000935) #15 PLCL2 (ENSNLEG00000001015) #16 DAZL (ENSNLEG00000033788) #17 RFTN1 (ENSNLEG00000001069) #18 OXNAD1 (ENSNLEG00000001081) #19 DPH3 (ENSNLEG00000034066) #20 GALNT15 (ENSNLEG00000001100) #21 ENSNLEG00000033710 ANKRD28 (ENSNLEG00000001135) #22 BTD (ENSNLEG00000028699) #23 HACL1 (ENSNLEG00000001264) #24 COLQ (ENSNLEG00000028932) #25 EAF1 (ENSNLEG00000001566) #26 METTL6 (ENSNLEG00000001595) #27 ENSNLEG00000034796 SH3BP5 (ENSNLEG00000001617) #28 CAPN7 (ENSNLEG00000001691) #29 COL6A5 (ENSNLEG00000001778) #30 COL6A6 (ENSNLEG00000001904) PIK3R4 (ENSNLEG00000002001) ENSNLEG00000027309 ATP2C1 (ENSNLEG00000002211) ASTE1 (ENSNLEG00000002673) NEK11 (ENSNLEG00000002697) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000169676 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000012078.b.d ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000154295.y.a.b ENSGT00390000017004.a.b.m.b ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b.g #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00910000147226 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00910000148216 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00910000148052 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000155351.cb ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000169676 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000012078.b.d ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000154295.y.a.b ENSGT00390000017004.a.b.m.b ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b.g #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00910000147226 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00910000148216 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 ENSGT00390000016224.j.a.e.b Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000012078.b.d ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000154295.y.a.b ENSGT00390000017004.a.b.m.b ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b.g #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00910000147226 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00910000148216 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 ENSGT00390000016224.j.a.e.b Macaca ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00390000017004.a.b.m.b ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b.g #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00910000148216 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 ENSGT00390000016224.j.a.f Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b.g #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 ENSGT00390000016224.j.a.e.b ENSGT00390000011422 Rhesus MODERN SPECIES 11 SGO1 (ENSMMUG00000020341) KAT2B (ENSMMUG00000020342) PP2D1 (ENSMMUG00000006993) RAB5A (ENSMMUG00000062243) EFHB (ENSMMUG00000018836) KCNH8 (ENSMMUG00000005370) ENSMMUG00000054204 SATB1 (ENSMMUG00000019009) TBC1D5 (ENSMMUG00000023776) #15 PLCL2 (ENSMMUG00000023775) #16 DAZL (ENSMMUG00000011361) #17 RFTN1 (ENSMMUG00000022694) #18 OXNAD1 (ENSMMUG00000022693) #19 DPH3 (ENSMMUG00000022692) #20 GALNT15 (ENSMMUG00000022690) #21 ANKRD28 (ENSMMUG00000021288) #22 BTD (ENSMMUG00000020762) #23 HACL1 (ENSMMUG00000022519) #24 EAF1 (ENSMMUG00000020761) #26 METTL6 (ENSMMUG00000004933) #27 SH3BP5 (ENSMMUG00000006661) #28 CAPN7 (ENSMMUG00000006658) #29 ENSMMUG00000031489 ENSMMUG00000002827 ENSMMUG00000065285 COL6A5 (ENSMMUG00000020377) #30 COL6A6 (ENSMMUG00000040631) PIK3R4 (ENSMMUG00000020294) ATP2C1 (ENSMMUG00000005137) ASTE1 (ENSMMUG00000005142) ENSMMUG00000059947 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 11 EFHB (ENSMFAG00000027825) ENSMFAG00000046373 KCNH8 (ENSMFAG00000035903) SATB1 (ENSMFAG00000042093) TBC1D5 (ENSMFAG00000002555) #15 ENSMFAG00000049730 PLCL2 (ENSMFAG00000000647) #16 DAZL (ENSMFAG00000002406) #17 RFTN1 (ENSMFAG00000043580) #18 ENSMFAG00000050326 ENSMFAG00000049115 OXNAD1 (ENSMFAG00000043666) #19 DPH3 (ENSMFAG00000043479) #20 GALNT15 (ENSMFAG00000040291) #21 ENSMFAG00000048777 ANKRD28 (ENSMFAG00000045739) #22 BTD (ENSMFAG00000033539) #23 HACL1 (ENSMFAG00000034241) #24 COLQ (ENSMFAG00000053084) #25 EAF1 (ENSMFAG00000036590) #26 METTL6 (ENSMFAG00000000654) #27 ENSMFAG00000064261 SH3BP5 (ENSMFAG00000062882) #28 CAPN7 (ENSMFAG00000001867) #29 COL6A5 (ENSMFAG00000001186) #30 COL6A6 (ENSMFAG00000034470) PIK3R4 (ENSMFAG00000030574) ATP2C1 (ENSMFAG00000039173) ASTE1 (ENSMFAG00000043710) NEK11 (ENSMFAG00000041735) ENSMFAG00000049169 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 166 PLCL2 (ENSMNEG00000035618) #16 DAZL (ENSMNEG00000038455) #17 RFTN1 (ENSMNEG00000039491) #18 OXNAD1 (ENSMNEG00000035591) #19 ENSMNEG00000042037 DPH3 (ENSMNEG00000026870) #20 GALNT15 (ENSMNEG00000029389) #21 ANKRD28 (ENSMNEG00000041096) #22 BTD (ENSMNEG00000029578) #23 HACL1 (ENSMNEG00000039568) #24 COLQ (ENSMNEG00000040862) #25 EAF1 (ENSMNEG00000037473) #26 METTL6 (ENSMNEG00000035936) #27 SH3BP5 (ENSMNEG00000032860) #28 CAPN7 (ENSMNEG00000037304) #29 ENSMNEG00000039989 ENSMNEG00000031713 COL6A5 (ENSMNEG00000044376) #30 COL6A6 (ENSMNEG00000028497) PIK3R4 (ENSMNEG00000037454) ATP2C1 (ENSMNEG00000031332) ASTE1 (ENSMNEG00000026345) NEK11 (ENSMNEG00000028580) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000012078.b.d ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000154295.y.a.b ENSGT00390000017004.a.b.m.b ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b.g #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00910000147226 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00910000148216 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 ENSGT00390000016224.j.a.e.b ENSGT00390000016224.j.a.e.a Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000012078.b.d ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000154295.y.a.b ENSGT00390000017004.a.b.m.b ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b.g #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00910000147226 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00910000148216 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 ENSGT00390000016224.j.a.e.b ENSGT00390000016224.j.a.e.a Drill MODERN SPECIES 695 ENSMLEG00000042274 SATB1 (ENSMLEG00000036859) ENSMLEG00000014893 TBC1D5 (ENSMLEG00000042528) #15 PLCL2 (ENSMLEG00000000560) #16 DAZL (ENSMLEG00000038997) #17 RFTN1 (ENSMLEG00000034985) #18 ENSMLEG00000042876 OXNAD1 (ENSMLEG00000035297) #19 DPH3 (ENSMLEG00000031053) #20 ENSMLEG00000021537 GALNT15 (ENSMLEG00000038498) #21 ANKRD28 (ENSMLEG00000032794) #22 BTD (ENSMLEG00000013550) #23 HACL1 (ENSMLEG00000037023) #24 COLQ (ENSMLEG00000040921) #25 EAF1 (ENSMLEG00000027766) #26 METTL6 (ENSMLEG00000036079) #27 SH3BP5 (ENSMLEG00000032953) #28 CAPN7 (ENSMLEG00000022967) #29 ENSMLEG00000029398 COL6A6 (ENSMLEG00000028327) PIK3R4 (ENSMLEG00000042031) ATP2C1 (ENSMLEG00000005047) ASTE1 (ENSMLEG00000032479) NEK11 (ENSMLEG00000007109) ENSMLEG00000042536 NUDT16 (ENSMLEG00000035240) Sooty mangabey MODERN SPECIES 538 EFHB (ENSCATG00000034471) KCNH8 (ENSCATG00000031386) ENSCATG00000040272 SATB1 (ENSCATG00000040637) ENSCATG00000033401 ENSCATG00000033349 TBC1D5 (ENSCATG00000044866) #15 PLCL2 (ENSCATG00000028725) #16 DAZL (ENSCATG00000009078) #17 RFTN1 (ENSCATG00000040094) #18 ENSCATG00000022854 ENSCATG00000033560 DPH3 (ENSCATG00000024833) #20 ENSCATG00000031070 GALNT15 (ENSCATG00000037609) #21 ANKRD28 (ENSCATG00000031374) #22 BTD (ENSCATG00000035945) #23 HACL1 (ENSCATG00000039224) #24 COLQ (ENSCATG00000034663) #25 EAF1 (ENSCATG00000025927) #26 METTL6 (ENSCATG00000038487) #27 SH3BP5 (ENSCATG00000033553) #28 CAPN7 (ENSCATG00000040761) #29 ENSCATG00000035859 COL6A6 (ENSCATG00000041631) PIK3R4 (ENSCATG00000038352) ATP2C1 (ENSCATG00000033514) ASTE1 (ENSCATG00000033573) NEK11 (ENSCATG00000029127) Olive baboon MODERN SPECIES 11 RAB5A (ENSPANG00000001328) EFHB (ENSPANG00000002796) KCNH8 (ENSPANG00000010237) ENSPANG00000042126 SATB1 (ENSPANG00000004656) ENSPANG00000044764 TBC1D5 (ENSPANG00000008920) #15 PLCL2 (ENSPANG00000015928) #16 ENSPANG00000051128 ENSPANG00000045263 DAZL (ENSPANG00000015077) #17 RFTN1 (ENSPANG00000008251) #18 OXNAD1 (ENSPANG00000006447) #19 DPH3 (ENSPANG00000012596) #20 GALNT15 (ENSPANG00000011143) #21 ANKRD28 (ENSPANG00000018122) #22 BTD (ENSPANG00000017229) #23 HACL1 (ENSPANG00000012915) #24 COLQ (ENSPANG00000007739) #25 EAF1 (ENSPANG00000006663) #26 METTL6 (ENSPANG00000008253) #27 SH3BP5 (ENSPANG00000006393) #28 CAPN7 (ENSPANG00000007740) #29 COL6A5 (ENSPANG00000008320) #30 COL6A6 (ENSPANG00000016938) PIK3R4 (ENSPANG00000006762) ATP2C1 (ENSPANG00000000996) ASTE1 (ENSPANG00000000995) NEK11 (ENSPANG00000012073) ENSPANG00000034068 NUDT16 (ENSPANG00000016940) Vervet Monkey MODERN SPECIES 6 SGO1 (ENSCSAG00000009791) KAT2B (ENSCSAG00000009803) PP2D1 (ENSCSAG00000009816) RAB5A (ENSCSAG00000009831) EFHB (ENSCSAG00000009882) ENSCSAG00000009907 ENSCSAG00000009913 SATB1 (ENSCSAG00000009921) TBC1D5 (ENSCSAG00000009930) #15 PLCL2 (ENSCSAG00000009937) #16 DAZL (ENSCSAG00000009976) #17 RFTN1 (ENSCSAG00000010020) #18 OXNAD1 (ENSCSAG00000010052) #19 DPH3 (ENSCSAG00000010060) #20 GALNT15 (ENSCSAG00000010086) #21 ANKRD28 (ENSCSAG00000010110) #22 BTD (ENSCSAG00000010118) #23 HACL1 (ENSCSAG00000010130) #24 EAF1 (ENSCSAG00000010134) #26 METTL6 (ENSCSAG00000010155) #27 SH3BP5 (ENSCSAG00000010160) #28 CAPN7 (ENSCSAG00000010171) #29 ENSCSAG00000010190 COL6A5 (ENSCSAG00000010280) #30 COL6A6 (ENSCSAG00000010431) PIK3R4 (ENSCSAG00000010465) ATP2C1 (ENSCSAG00000010480) ASTE1 (ENSCSAG00000010488) NEK11 (ENSCSAG00000010499) NUDT16 (ENSCSAG00000010505) MRPL3 (ENSCSAG00000010510) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 272 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000154295.y.a.b ENSGT00390000017004.a.b.m.b ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b.g #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00910000147226 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00910000148052 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 21 DAZL (ENSRBIG00000039636) #17 RFTN1 (ENSRBIG00000031445) #18 OXNAD1 (ENSRBIG00000040950) #19 DPH3 (ENSRBIG00000039145) #20 GALNT15 (ENSRBIG00000041660) #21 ANKRD28 (ENSRBIG00000036586) #22 ENSRBIG00000040105 BTD (ENSRBIG00000044461) #23 HACL1 (ENSRBIG00000000662) #24 EAF1 (ENSRBIG00000039147) #26 METTL6 (ENSRBIG00000044482) #27 SH3BP5 (ENSRBIG00000004842) #28 CAPN7 (ENSRBIG00000031389) #29 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 3051 ENSRROG00000042562 ANKRD28 (ENSRROG00000033988) #22 BTD (ENSRROG00000032605) #23 HACL1 (ENSRROG00000032411) #24 COLQ (ENSRROG00000031844) #25 EAF1 (ENSRROG00000028669) #26 METTL6 (ENSRROG00000029409) #27 SH3BP5 (ENSRROG00000032039) #28 CAPN7 (ENSRROG00000032389) #29 ENSRROG00000031452 Tarsier MODERN SPECIES 1655 ANKRD28 (ENSTSYG00000000769) #22 HACL1 (ENSTSYG00000010202) #24 COLQ (ENSTSYG00000036685) #25 EAF1 (ENSTSYG00000032535) #26 METTL6 (ENSTSYG00000026099) #27 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00910000148216 ENSGT00940000167515 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00910000148052 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00900000143613 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 ENSGT00960000190088 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b Tree shrew MODERN SPECIES 1386 ANKRD28 (ENSTBEG00000012870) #22 HACL1 (ENSTBEG00000012665) #24 Glires ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00910000148216 ENSGT00940000167515 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00910000148052 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00900000143613 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 ENSGT00960000190088 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b Rodentia ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00910000148216 ENSGT00940000167515 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00910000148052 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00900000143613 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000154791 ENSGT00940000156388 ENSGT00950000182865.a ENSGT00940000157677 ENSGT00940000153541.B ENSGT00940000156494 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337.w ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00910000148216 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00910000148052 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000154791 ENSGT00940000156388 ENSGT00950000182865.a ENSGT00940000157677 ENSGT00940000153541.B ENSGT00940000156494 ENSGT00940000157928 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000154107.a.f.b ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337.w ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00910000148216 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a.c #23 ENSGT00950000182846.a.a.a.b ENSGT00390000003224.A ENSGT00940000156286.pb ENSGT00940000157660.f ENSGT00390000005529.a ENSGT00940000156297 ENSGT00940000157205 ENSGT00940000154280 ENSGT00940000156550 ENSGT00940000156624 ENSGT00940000156780 ENSGT00940000156669.b ENSGT00940000158385 ENSGT00530000063735.a Marmotini ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000154107.a.e ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337.w ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00910000148216 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a.c #23 ENSGT00950000182846.a.a.a.b ENSGT00390000003224.A ENSGT00940000156286.pb ENSGT00940000157660.f ENSGT00390000005529.a ENSGT00940000156297 ENSGT00940000157205 ENSGT00940000154280 ENSGT00940000156550 ENSGT00940000156624 ENSGT00940000156780 ENSGT00940000156669.b ENSGT00940000158385 ENSGT00530000063735.a Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a.e ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337.w ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225.hb #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a.c #23 ENSGT00950000182846.a.a.a.b ENSGT00390000003224.A ENSGT00940000156286.pb ENSGT00940000157660.f ENSGT00390000005529.a ENSGT00940000156297.v ENSGT00940000157205 ENSGT00940000154280 ENSGT00940000156550 ENSGT00940000156624 ENSGT00940000156780 ENSGT00940000156669.b ENSGT00940000158385 ENSGT00530000063735.a Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 60 TBC1D5 (ENSUPAG00010015063) #15 PLCL2 (ENSUPAG00010015041) #16 ENSUPAG00010014999 #17 RFTN1 (ENSUPAG00010014993) #18 OXNAD1 (ENSUPAG00010014977) #19 ENSUPAG00010014962 #20 GALNT15 (ENSUPAG00010014931) #21 ANKRD28 (ENSUPAG00010014697) #22 ENSUPAG00010014681 #23 DNASE1L3 (ENSUPAG00010014663) ENSUPAG00010014651 FLNB (ENSUPAG00010014602) SLMAP (ENSUPAG00010014147) DENND6A (ENSUPAG00010014063) ENSUPAG00010014058 PDE12 (ENSUPAG00010014057) DNAH12 (ENSUPAG00010013944) ASB14 (ENSUPAG00010013934) APPL1 (ENSUPAG00010013920) HESX1 (ENSUPAG00010013910) IL17RD (ENSUPAG00010013878) ARHGEF3 (ENSUPAG00010013835) TASOR (ENSUPAG00010013761) Squirrel MODERN SPECIES 73 ZNF385D (ENSSTOG00000005742) ENSSTOG00000031366 SGO1 (ENSSTOG00000003766) KAT2B (ENSSTOG00000002904) PP2D1 (ENSSTOG00000012388) RAB5A (ENSSTOG00000026229) KCNH8 (ENSSTOG00000023006) SATB1 (ENSSTOG00000010856) TBC1D5 (ENSSTOG00000028034) #15 PLCL2 (ENSSTOG00000000749) #16 ENSSTOG00000022122 #17 RFTN1 (ENSSTOG00000000072) #18 OXNAD1 (ENSSTOG00000000071) #19 ENSSTOG00000033525 #20 GALNT15 (ENSSTOG00000021175) #21 ANKRD28 (ENSSTOG00000003112) #22 DNASE1L3 (ENSSTOG00000010015) FLNB (ENSSTOG00000009959) SLMAP (ENSSTOG00000025675) DENND6A (ENSSTOG00000007895) ENSSTOG00000019470 PDE12 (ENSSTOG00000007861) ENSSTOG00000022072 ENSSTOG00000034503 ASB14 (ENSSTOG00000013391) APPL1 (ENSSTOG00000015203) HESX1 (ENSSTOG00000000375) IL17RD (ENSSTOG00000000369) ARHGEF3 (ENSSTOG00000000366) TASOR (ENSSTOG00000004802) CCDC66 (ENSSTOG00000004768) Alpin marmot MODERN SPECIES 38 EFHB (ENSMMMG00000008698) KCNH8 (ENSMMMG00000008724) SATB1 (ENSMMMG00000008761) TBC1D5 (ENSMMMG00000009048) #15 ENSMMMG00000009082 PLCL2 (ENSMMMG00000009088) #16 ENSMMMG00000009099 ENSMMMG00000009107 #17 ENSMMMG00000009137 #18 ENSMMMG00000009151 #18 OXNAD1 (ENSMMMG00000009156) #19 ENSMMMG00000009167 #20 ENSMMMG00000009182 GALNT15 (ENSMMMG00000009190) #21 ENSMMMG00000009230 ANKRD28 (ENSMMMG00000009244) #22 ENSMMMG00000009351 DNASE1L3 (ENSMMMG00000009356) FLNB (ENSMMMG00000009402) SLMAP (ENSMMMG00000009479) DENND6A (ENSMMMG00000009892) ARF4 (ENSMMMG00000009997) PDE12 (ENSMMMG00000010035) DNAH12 (ENSMMMG00000010064) ENSMMMG00000010201 ASB14 (ENSMMMG00000010218) APPL1 (ENSMMMG00000010253) HESX1 (ENSMMMG00000010298) IL17RD (ENSMMMG00000010318) ARHGEF3 (ENSMMMG00000010365) TASOR (ENSMMMG00000010441) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 7 KCNH8 (ENSSVLG00005024188) SATB1 (ENSSVLG00005024270) TBC1D5 (ENSSVLG00005008563) #15 PLCL2 (ENSSVLG00005008741) #16 ENSSVLG00005008794 #17 ENSSVLG00005008951 ENSSVLG00005008982 RFTN1 (ENSSVLG00005009013) #18 ENSSVLG00005009053 #19 ENSSVLG00005009153 #20 ENSSVLG00005009200 GALNT15 (ENSSVLG00005009222) #21 ENSSVLG00005009250 ENSSVLG00005009267 ENSSVLG00005009285 ANKRD28 (ENSSVLG00005009365) #22 ENSSVLG00005009644 ENSSVLG00005009695 ENSSVLG00005009728 DNASE1L3 (ENSSVLG00005009776) FLNB (ENSSVLG00005010013) ENSSVLG00005010131 ENSSVLG00005010152 SLMAP (ENSSVLG00005010258) ENSSVLG00005010744 DENND6A (ENSSVLG00005010816) ENSSVLG00005011013 PDE12 (ENSSVLG00005011192) DNAH12 (ENSSVLG00005011312) ENSSVLG00005012486 ASB14 (ENSSVLG00005012557) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337.w ENSGT00530000063528.A.b.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00910000148052 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00950000182846.a.a.a.b ENSGT00390000003224.A ENSGT00940000156286.pb ENSGT00940000157660 ENSGT00390000005529.a ENSGT00940000156297.y ENSGT00940000157205 ENSGT00940000154280.lb ENSGT00940000156550 ENSGT00940000156624 ENSGT00940000156780 ENSGT00940000156669.b ENSGT00940000158385 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337.w ENSGT00530000063528.A.b.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00950000182846.a.a.a.b ENSGT00390000003224.A ENSGT00940000156286.pb ENSGT00940000157660 ENSGT00390000005529.a ENSGT00940000156297.y ENSGT00940000157205 ENSGT00940000154280.lb ENSGT00940000156550 ENSGT00940000156624 ENSGT00940000156780 ENSGT00940000156669.b ENSGT00940000158385 ENSGT00530000063735.a Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337.w.f ENSGT00530000063528.A.b.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A.a ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00950000182846.a.a.a.b ENSGT00390000003224.A ENSGT00940000156286.pb ENSGT00940000157660 ENSGT00390000005529.a ENSGT00940000156297.y ENSGT00940000157205 ENSGT00940000154280.lb ENSGT00940000156550 ENSGT00940000156624 ENSGT00940000156780 ENSGT00940000156669.b ENSGT00940000158385 ENSGT00530000063735.a Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 137 ZNF385D (ENSCLAG00000004322) SGO1 (ENSCLAG00000007648) KAT2B (ENSCLAG00000006506) PP2D1 (ENSCLAG00000006309) ENSCLAG00000006053 EFHB (ENSCLAG00000005065) KCNH8 (ENSCLAG00000004698) ENSCLAG00000010743 TBC1D5 (ENSCLAG00000007497) #15 PLCL2 (ENSCLAG00000006737) #16 ENSCLAG00000006407 #17 RFTN1 (ENSCLAG00000010603) #18 OXNAD1 (ENSCLAG00000009252) #19 DPH3 (ENSCLAG00000010771) #20 GALNT15 (ENSCLAG00000009893) #21 ANKRD28 (ENSCLAG00000008300) #22 BTD (ENSCLAG00000007560) #23 DNASE1L3 (ENSCLAG00000007458) FLNB (ENSCLAG00000007353) SLMAP (ENSCLAG00000006086) ENSCLAG00000006196 DENND6A (ENSCLAG00000005592) ENSCLAG00000005094 PDE12 (ENSCLAG00000004864) ENSCLAG00000004164 ENSCLAG00000007058 ASB14 (ENSCLAG00000013726) APPL1 (ENSCLAG00000005192) HESX1 (ENSCLAG00000004680) IL17RD (ENSCLAG00000004131) ARHGEF3 (ENSCLAG00000016606) Degu MODERN SPECIES 84 KCNH8 (ENSODEG00000005720) SATB1 (ENSODEG00000006082) TBC1D5 (ENSODEG00000006516) #15 PLCL2 (ENSODEG00000005955) #16 ENSODEG00000019240 ENSODEG00000006167 #17 ENSODEG00000019190 RFTN1 (ENSODEG00000005477) #18 OXNAD1 (ENSODEG00000005968) #19 ENSODEG00000005288 #20 GALNT15 (ENSODEG00000005854) #21 ANKRD28 (ENSODEG00000007156) #22 ENSODEG00000019376 ENSODEG00000008690 ENSODEG00000019255 ENSODEG00000019220 BTD (ENSODEG00000006036) #23 DNASE1L3 (ENSODEG00000006359) ENSODEG00000006739 FLNB (ENSODEG00000008526) SLMAP (ENSODEG00000005798) ENSODEG00000006496 ENSODEG00000019341 DENND6A (ENSODEG00000005908) ENSODEG00000006837 PDE12 (ENSODEG00000006268) ENSODEG00000006477 Guinea pig MODERN SPECIES SGO1 (ENSCPOG00000008318) ENSCPOG00000032533 ENSCPOG00000008310 RAB5A (ENSCPOG00000005322) EFHB (ENSCPOG00000001936) KCNH8 (ENSCPOG00000033526) SATB1 (ENSCPOG00000007101) TBC1D5 (ENSCPOG00000011184) #15 PLCL2 (ENSCPOG00000008396) #16 ENSCPOG00000003836 ENSCPOG00000007628 #17 RFTN1 (ENSCPOG00000007616) #18 OXNAD1 (ENSCPOG00000026881) #19 DPH3 (ENSCPOG00000003477) #20 GALNT15 (ENSCPOG00000003476) #21 ANKRD28 (ENSCPOG00000015199) #22 BTD (ENSCPOG00000024569) #23 PLEKHO2 (ENSCPOG00000030376) PIF1 (ENSCPOG00000008211) RBPMS2 (ENSCPOG00000007695) OAZ2 (ENSCPOG00000001960) ZNF609 (ENSCPOG00000001956) TRIP4 (ENSCPOG00000006483) PCLAF (ENSCPOG00000033197) CSNK1G1 (ENSCPOG00000000256) PPIB (ENSCPOG00000034437) SNX22 (ENSCPOG00000000254) SNX1 (ENSCPOG00000000253) CIAO2A (ENSCPOG00000033175) DAPK2 (ENSCPOG00000000890) ENSCPOG00000030019 Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 28 ENSHGLG00000050199 ENSHGLG00000003608 SATB1 (ENSHGLG00000003343) ENSHGLG00000009740 TBC1D5 (ENSHGLG00000002692) #15 PLCL2 (ENSHGLG00000007251) #16 ENSHGLG00000013488 #17 ENSHGLG00000014287 RFTN1 (ENSHGLG00000012795) #18 ENSHGLG00000047215 OXNAD1 (ENSHGLG00000004913) #19 DPH3 (ENSHGLG00000045426) #20 ENSHGLG00000048611 GALNT15 (ENSHGLG00000036779) #21 ENSHGLG00000046432 ENSHGLG00000007756 #22 ENSHGLG00000049379 BTD (ENSHGLG00000006030) #23 ENSHGLG00000050502 ENSHGLG00000004869 FLNB (ENSHGLG00000004931) ENSHGLG00000040412 SLMAP (ENSHGLG00000004066) DENND6A (ENSHGLG00000010055) ENSHGLG00000037619 ENSHGLG00000040774 ENSHGLG00000005661 ENSHGLG00000003968 ENSHGLG00000046171 ENSHGLG00000033066 ENSHGLG00000033181 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 24 GYS2 (ENSHGLG00000016654) ENSHGLG00000034379 GOLT1B (ENSHGLG00000048680) RECQL (ENSHGLG00000009712) ENSHGLG00000010013 ENSHGLG00000048919 ENSHGLG00000017581 ENSHGLG00000011711 ENSHGLG00000013677 ENSHGLG00000005542 SLCO1C1 (ENSHGLG00000005494) PDE3A (ENSHGLG00000009119) AEBP2 (ENSHGLG00000017995) PLEKHA5 (ENSHGLG00000015699) ENSHGLG00000021020 ENSHGLG00000038994 #22 PLCZ1 (ENSHGLG00000007346) CAPZA3 (ENSHGLG00000020130) PIK3C2G (ENSHGLG00000006770) RERGL (ENSHGLG00000010746) LMO3 (ENSHGLG00000042625) MGST1 (ENSHGLG00000047521) SLC15A5 (ENSHGLG00000018627) DERA (ENSHGLG00000008563) ENSHGLG00000016785 ENSHGLG00000018779 EPS8 (ENSHGLG00000014063) PTPRO (ENSHGLG00000005809) RERG (ENSHGLG00000043638) PDE6H (ENSHGLG00000016447) ARHGDIB (ENSHGLG00000017937) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00900000143613 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000154791 ENSGT00940000156388 ENSGT00950000182865.a ENSGT00940000157677 ENSGT00940000153541.B ENSGT00940000156494 ENSGT00940000157928 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00900000143613 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000154791 ENSGT00940000156388 ENSGT00950000182865.a ENSGT00940000157677 ENSGT00940000153541.B ENSGT00940000156494 ENSGT00940000157928 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000154791 ENSGT00940000156388 ENSGT00950000182865.a ENSGT00940000157677 ENSGT00940000153541.B ENSGT00940000156494 ENSGT00940000157928 ENSGT00940000159940 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000159008 ENSGT00940000158057 ENSGT00940000159449 ENSGT01060000248556.A.b ENSGT00390000002871 ENSGT00950000183125.b.a.b ENSGT00390000003652.c ENSGT00390000001094.i.b ENSGT00940000169181 ENSGT00390000001094.j ENSGT00390000008403 ENSGT00940000154371.b ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000154791 ENSGT00940000156388 ENSGT00950000182865.a ENSGT00940000157677 ENSGT00940000153541.B ENSGT00940000156494 ENSGT00940000157928 ENSGT00940000159940 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00940000154371.b ENSGT00390000008403 ENSGT00390000001094.j ENSGT00940000169181 ENSGT00390000003652.c ENSGT00950000183125.b.a.b ENSGT00390000002871 ENSGT01060000248556.A.b ENSGT00940000159449 ENSGT00940000158057 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00940000154371.b ENSGT00390000008403 ENSGT00390000001094.j ENSGT00390000003652.c ENSGT00950000183125.b.a.b ENSGT00390000002871 ENSGT01060000248556.A.b ENSGT00940000159449 ENSGT00940000158057 ENSGT00940000159008 Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse MODERN SPECIES 22 Cfap20dc (ENSPEMG00000013755) Fam3d (ENSPEMG00000013914) Fam107a (ENSPEMG00000030495) Acox2 (ENSPEMG00000016996) Kctd6 (ENSPEMG00000026577) ENSPEMG00000017537 Pdhb (ENSPEMG00000010631) Pxk (ENSPEMG00000000865) Rpp14 (ENSPEMG00000006600) ENSPEMG00000029189 Abhd6 (ENSPEMG00000014877) Dnase1l3 (ENSPEMG00000010743) Flnb (ENSPEMG00000003413) ENSPEMG00000030669 #20 Galnt15 (ENSPEMG00000008935) #21 ENSPEMG00000014981 #22 ENSPEMG00000030131 #22 Btd (ENSPEMG00000014118) #23 Hacl1 (ENSPEMG00000024908) #24 Colq (ENSPEMG00000014122) #25 ENSPEMG00000025649 ENSPEMG00000026354 Slmap (ENSPEMG00000016271) Dennd6a (ENSPEMG00000023698) ENSPEMG00000028915 Arf4 (ENSPEMG00000012609) Pde12 (ENSPEMG00000007259) Dnah12 (ENSPEMG00000023606) Asb14 (ENSPEMG00000008349) Appl1 (ENSPEMG00000010024) Hesx1 (ENSPEMG00000025118) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 22 Fam3d (ENSPEMG00000013914) Fam107a (ENSPEMG00000030495) Acox2 (ENSPEMG00000016996) Kctd6 (ENSPEMG00000026577) ENSPEMG00000017537 Pdhb (ENSPEMG00000010631) Pxk (ENSPEMG00000000865) Rpp14 (ENSPEMG00000006600) ENSPEMG00000029189 Abhd6 (ENSPEMG00000014877) Dnase1l3 (ENSPEMG00000010743) Flnb (ENSPEMG00000003413) ENSPEMG00000030669 #20 Galnt15 (ENSPEMG00000008935) #21 ENSPEMG00000014981 #22 ENSPEMG00000030131 #22 Btd (ENSPEMG00000014118) #23 Hacl1 (ENSPEMG00000024908) #24 Colq (ENSPEMG00000014122) #25 ENSPEMG00000025649 ENSPEMG00000026354 Slmap (ENSPEMG00000016271) Dennd6a (ENSPEMG00000023698) ENSPEMG00000028915 Arf4 (ENSPEMG00000012609) Pde12 (ENSPEMG00000007259) Dnah12 (ENSPEMG00000023606) Asb14 (ENSPEMG00000008349) Appl1 (ENSPEMG00000010024) Hesx1 (ENSPEMG00000025118) Il17rd (ENSPEMG00000010551) Prairie vole MODERN SPECIES 14 ENSMOCG00000010627 ENSMOCG00000005104 ENSMOCG00000021714 Asb14 (ENSMOCG00000005229) Appl1 (ENSMOCG00000020080) ENSMOCG00000013571 Il17rd (ENSMOCG00000012945) ENSMOCG00000021783 Arhgef3 (ENSMOCG00000012890) Tasor (ENSMOCG00000008303) Ccdc66 (ENSMOCG00000021352) Erc2 (ENSMOCG00000022991) Wnt5a (ENSMOCG00000021601) Galnt15 (ENSMOCG00000006311) #21 ENSMOCG00000020826 Ankrd28 (ENSMOCG00000019440) #22 Btd (ENSMOCG00000007806) #23 Hacl1 (ENSMOCG00000013674) #24 Colq (ENSMOCG00000020980) #25 ENSMOCG00000001649 #20 Oxnad1 (ENSMOCG00000016694) #19 Msmb (ENSMOCG00000014809) Ncoa4 (ENSMOCG00000013373) Timm23 (ENSMOCG00000008485) Parg (ENSMOCG00000000881) 1700024G13Rik (ENSMOCG00000015892) Chat (ENSMOCG00000011050) Ercc6 (ENSMOCG00000018891) Drgx (ENSMOCG00000019746) 3425401B19Rik (ENSMOCG00000019101) Tmem273 (ENSMOCG00000018319) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00940000154371.b ENSGT00390000008403.u ENSGT00390000001094.j ENSGT00940000169181 ENSGT00390000003652.c ENSGT00950000183125.b.a.b ENSGT00390000002871 ENSGT01060000248556.A.b ENSGT00940000159449 ENSGT00940000158057 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 76 Uqcc5 (ENSCGRG00001014406) Nt5dc2 (ENSCGRG00001023862) Stab1 (ENSCGRG00001006175) Nisch (ENSCGRG00001023268) Tnnc1 (ENSCGRG00001012338) Sema3g (ENSCGRG00001018192) Phf7 (ENSCGRG00001022887) Bap1 (ENSCGRG00001000294) Dnah1 (ENSCGRG00001004021) Capn7 (ENSCGRG00001019135) #29 Sh3bp5 (ENSCGRG00001011458) #28 Mettl6 (ENSCGRG00001000127) #27 ENSCGRG00001019909 #26 Galnt15 (ENSCGRG00001018867) #21 ENSCGRG00001006788 Ankrd28 (ENSCGRG00001009527) #22 Btd (ENSCGRG00001020340) #23 Hacl1 (ENSCGRG00001023591) #24 Colq (ENSCGRG00001015328) #25 ENSCGRG00001015486 Dph3 (ENSCGRG00001012063) #20 Oxnad1 (ENSCGRG00001021866) #19 Msmb (ENSCGRG00001020896) ENSCGRG00001011568 Timm23 (ENSCGRG00001023683) Parg (ENSCGRG00001008414) Ogdhl (ENSCGRG00001016689) 1700024G13Rik (ENSCGRG00001010785) Chat (ENSCGRG00001018457) Slc18a3 (ENSCGRG00001008731) Ercc6 (ENSCGRG00001012126) Golden Hamster MODERN SPECIES 691 Tasor (ENSMAUG00000016270) Arhgef3 (ENSMAUG00000000450) Il17rd (ENSMAUG00000011014) Hesx1 (ENSMAUG00000000116) Appl1 (ENSMAUG00000019692) Asb14 (ENSMAUG00000004303) ENSMAUG00000012766 ENSMAUG00000013470 ENSMAUG00000017227 Pde12 (ENSMAUG00000000442) Arf4 (ENSMAUG00000017542) Dennd6a (ENSMAUG00000014357) Slmap (ENSMAUG00000012611) ENSMAUG00000010958 Galnt15 (ENSMAUG00000015426) #21 Ankrd28 (ENSMAUG00000000270) #22 Btd (ENSMAUG00000004166) #23 ENSMAUG00000006318 #24 Colq (ENSMAUG00000003606) #25 Dph3 (ENSMAUG00000006731) #20 Oxnad1 (ENSMAUG00000005564) #19 Msmb (ENSMAUG00000000398) ENSMAUG00000009207 ENSMAUG00000018189 ENSMAUG00000016794 Parg (ENSMAUG00000017464) Ogdhl (ENSMAUG00000000353) 1700024G13Rik (ENSMAUG00000014074) Chat (ENSMAUG00000016998) Slc18a3 (ENSMAUG00000016698) Ercc6 (ENSMAUG00000008335) Murinae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00390000000409 ENSGT00730000111333 ENSGT00940000159008 ENSGT00940000158057 ENSGT00940000159449 ENSGT01060000248556.A.b ENSGT00390000002871 ENSGT00950000183125.b.a.b ENSGT00390000003652.c ENSGT00390000001094.j ENSGT00390000008403 ENSGT00940000154371.b ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000154791 ENSGT00940000156388 ENSGT00950000182865.a ENSGT00940000157677 ENSGT00940000153541.B ENSGT00940000156494 ENSGT00940000157928 ENSGT00940000159940 Mus ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000000409 ENSGT00730000111333 ENSGT00940000159008 ENSGT00940000158057 ENSGT00940000159449 ENSGT01060000248556.A.b ENSGT00390000002871 ENSGT00950000183125.b.a.b ENSGT00390000003652.c ENSGT00390000001094.j ENSGT00390000008403 ENSGT00940000154371.b ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000154791 ENSGT00940000156388 ENSGT00950000182865.a ENSGT00940000157677 ENSGT00940000153541.B ENSGT00940000156494 ENSGT00940000157928 ENSGT00940000159940 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000000409 ENSGT00730000111333 ENSGT00940000159008 ENSGT00940000158057 ENSGT00940000159449 ENSGT01060000248556.A.b ENSGT00390000002871 ENSGT00950000183125.b.a.b ENSGT00390000003652.c ENSGT00390000001094.j ENSGT00390000008403 ENSGT00940000154371.b ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000154791 ENSGT00940000156388 ENSGT00950000182865.a ENSGT00940000157677 ENSGT00940000153541.B ENSGT00940000156494 ENSGT00940000157928 ENSGT00940000159940 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000000409 ENSGT00730000111333 ENSGT00940000159008 ENSGT00940000158057 ENSGT00940000159449 ENSGT01060000248556.A.b ENSGT00390000002871 ENSGT00950000183125.b.a.b ENSGT00390000003652.c ENSGT00390000001094.j ENSGT00390000008403 ENSGT00940000154371.b ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000154791 ENSGT00940000156388 ENSGT00950000182865.a ENSGT00940000157677 ENSGT00940000153541.B ENSGT00940000156494 ENSGT00940000157928 ENSGT00940000159940 Mouse MODERN SPECIES 5 Tmem273 (ENSMUSG00000041707) 3425401B19Rik (ENSMUSG00000071540) Drgx (ENSMUSG00000041730) Ercc6 (ENSMUSG00000054051) Slc18a3 (ENSMUSG00000100241) Chat (ENSMUSG00000021919) 1700024G13Rik (ENSMUSG00000072473) Ogdhl (ENSMUSG00000021913) Parg (ENSMUSG00000021911) Timm23 (ENSMUSG00000013701) Ncoa4 (ENSMUSG00000056234) Msmb (ENSMUSG00000021907) Oxnad1 (ENSMUSG00000021906) #19 Dph3 (ENSMUSG00000021905) #20 Galnt15 (ENSMUSG00000021903) #21 Ankrd28 (ENSMUSG00000014496) #22 Btd (ENSMUSG00000021900) #23 Hacl1 (ENSMUSG00000021884) #24 Colq (ENSMUSG00000057606) #25 Eaf1 (ENSMUSG00000021890) #26 Mettl6 (ENSMUSG00000021891) #27 Sh3bp5 (ENSMUSG00000021892) #28 Capn7 (ENSMUSG00000021893) #29 Dnah1 (ENSMUSG00000019027) Bap1 (ENSMUSG00000021901) Phf7 (ENSMUSG00000021902) Sema3g (ENSMUSG00000021904) Tnnc1 (ENSMUSG00000091898) Nisch (ENSMUSG00000021910) Stab1 (ENSMUSG00000042286) Nt5dc2 (ENSMUSG00000071547) Mus_C ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00390000000409 ENSGT00730000111333 ENSGT00940000159008 ENSGT00940000158057 ENSGT00940000159449 ENSGT01060000248556.A.b ENSGT00390000002871 ENSGT00950000183125.b.a.b ENSGT00390000003652.c ENSGT00390000001094.j ENSGT00390000008403 ENSGT00940000154371.b ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00900000143613 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000154791 ENSGT00940000156388 ENSGT00950000182865.a ENSGT00940000157677 ENSGT00940000153541.B ENSGT00940000156494 ENSGT00940000157928 Steppe mouse MODERN SPECIES 3258 Drgx (ENSMSIG00000012230) ENSMSIG00000012206 Ercc6 (ENSMSIG00000012140) Slc18a3 (ENSMSIG00000012122) Chat (ENSMSIG00000012100) ENSMSIG00000012074 Ogdhl (ENSMSIG00000011985) Parg (ENSMSIG00000011929) Timm23 (ENSMSIG00000011912) Ncoa4 (ENSMSIG00000011904) ENSMSIG00000011899 Msmb (ENSMSIG00000011891) Oxnad1 (ENSMSIG00000011885) #19 Dph3 (ENSMSIG00000011875) #20 Galnt15 (ENSMSIG00000011838) #21 Ankrd28 (ENSMSIG00000011569) #22 Btd (ENSMSIG00000011489) #23 Hacl1 (ENSMSIG00000011346) #24 Colq (ENSMSIG00000011244) #25 ENSMSIG00000011230 #26 Mettl6 (ENSMSIG00000011151) #27 ENSMSIG00000011135 spretus MODERN SPECIES 5 3425401B19Rik (MGP_SPRETEiJ_G0019981) Drgx (MGP_SPRETEiJ_G0019980) Ercc6 (MGP_SPRETEiJ_G0019979) Slc18a3 (MGP_SPRETEiJ_G0019978) Chat (MGP_SPRETEiJ_G0019977) 1700024G13Rik (MGP_SPRETEiJ_G0019976) Ogdhl (MGP_SPRETEiJ_G0019975) Parg (MGP_SPRETEiJ_G0019974) Timm23 (MGP_SPRETEiJ_G0019973) MGP_SPRETEiJ_G0019972 MGP_SPRETEiJ_G0019971 Msmb (MGP_SPRETEiJ_G0019970) Oxnad1 (MGP_SPRETEiJ_G0019969) #19 Dph3 (MGP_SPRETEiJ_G0019968) #20 Galnt15 (MGP_SPRETEiJ_G0019967) #21 Ankrd28 (MGP_SPRETEiJ_G0019966) #22 Btd (MGP_SPRETEiJ_G0019965) #23 Hacl1 (MGP_SPRETEiJ_G0019964) #24 Colq (MGP_SPRETEiJ_G0019963) #25 Eaf1 (MGP_SPRETEiJ_G0019962) #26 Mettl6 (MGP_SPRETEiJ_G0019961) #27 Sh3bp5 (MGP_SPRETEiJ_G0019960) #28 Capn7 (MGP_SPRETEiJ_G0019959) #29 Dnah1 (MGP_SPRETEiJ_G0019958) Bap1 (MGP_SPRETEiJ_G0019957) Phf7 (MGP_SPRETEiJ_G0019956) Sema3g (MGP_SPRETEiJ_G0019955) Tnnc1 (MGP_SPRETEiJ_G0019954) Nisch (MGP_SPRETEiJ_G0019953) Stab1 (MGP_SPRETEiJ_G0019952) Nt5dc2 (MGP_SPRETEiJ_G0019951) Ryukyu mouse MODERN SPECIES 5 Tmem273 (MGP_CAROLIEiJ_G0019096) 3425401B19Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0019095) Drgx (MGP_CAROLIEiJ_G0019094) Ercc6 (MGP_CAROLIEiJ_G0019093) Slc18a3 (MGP_CAROLIEiJ_G0019092) 1700024G13Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0019091) Ogdhl (MGP_CAROLIEiJ_G0019090) Parg (MGP_CAROLIEiJ_G0019089) MGP_CAROLIEiJ_G0019088 MGP_CAROLIEiJ_G0019087 MGP_CAROLIEiJ_G0019086 Msmb (MGP_CAROLIEiJ_G0019085) Oxnad1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019084) #19 Dph3 (MGP_CAROLIEiJ_G0019083) #20 Galnt15 (MGP_CAROLIEiJ_G0019082) #21 Ankrd28 (MGP_CAROLIEiJ_G0019081) #22 Btd (MGP_CAROLIEiJ_G0019080) #23 Hacl1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019079) #24 Colq (MGP_CAROLIEiJ_G0019078) #25 Eaf1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019077) #26 Mettl6 (MGP_CAROLIEiJ_G0019076) #27 Sh3bp5 (MGP_CAROLIEiJ_G0019075) #28 Capn7 (MGP_CAROLIEiJ_G0019074) #29 Dnah1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019073) Bap1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019072) Phf7 (MGP_CAROLIEiJ_G0019071) Sema3g (MGP_CAROLIEiJ_G0019070) Tnnc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019069) Nisch (MGP_CAROLIEiJ_G0019068) Stab1 (MGP_CAROLIEiJ_G0019067) Nt5dc2 (MGP_CAROLIEiJ_G0019066) Shrew mouse MODERN SPECIES 21 3425401B19Rik (MGP_PahariEiJ_G0030113) Drgx (MGP_PahariEiJ_G0030112) Ercc6 (MGP_PahariEiJ_G0030111) Slc18a3 (MGP_PahariEiJ_G0030110) Chat (MGP_PahariEiJ_G0030109) 1700024G13Rik (MGP_PahariEiJ_G0030108) Ogdhl (MGP_PahariEiJ_G0030107) Parg (MGP_PahariEiJ_G0030106) MGP_PahariEiJ_G0030105 MGP_PahariEiJ_G0030104 MGP_PahariEiJ_G0030103 Msmb (MGP_PahariEiJ_G0030102) Oxnad1 (MGP_PahariEiJ_G0030101) #19 Dph3 (MGP_PahariEiJ_G0030100) #20 Galnt15 (MGP_PahariEiJ_G0030099) #21 Ankrd28 (MGP_PahariEiJ_G0030098) #22 Btd (MGP_PahariEiJ_G0030097) #23 Hacl1 (MGP_PahariEiJ_G0030096) #24 Colq (MGP_PahariEiJ_G0030095) #25 Eaf1 (MGP_PahariEiJ_G0030094) #26 Mettl6 (MGP_PahariEiJ_G0030093) #27 Sh3bp5 (MGP_PahariEiJ_G0030092) #28 Capn7 (MGP_PahariEiJ_G0030091) #29 Dnah1 (MGP_PahariEiJ_G0030090) Bap1 (MGP_PahariEiJ_G0030089) Phf7 (MGP_PahariEiJ_G0030088) Sema3g (MGP_PahariEiJ_G0030087) Tnnc1 (MGP_PahariEiJ_G0030086) Nisch (MGP_PahariEiJ_G0030085) Stab1 (MGP_PahariEiJ_G0030084) MGP_PahariEiJ_G0030083 Rat MODERN SPECIES 7 Fam170b (ENSRNOG00000020077) Tmem273 (ENSRNOG00000042628) RGD1564899 (ENSRNOG00000049942) Drgx (ENSRNOG00000020045) Ercc6 (ENSRNOG00000030017) AC126482.2 (ENSRNOG00000061945) LOC680885 (ENSRNOG00000039749) Ogdhl (ENSRNOG00000019955) Parg (ENSRNOG00000019978) Timm23 (ENSRNOG00000019811) Ncoa4 (ENSRNOG00000063221) Ncoa4 (ENSRNOG00000019768) Msmb (ENSRNOG00000039786) Oxnad1 (ENSRNOG00000019760) #19 Galnt15 (ENSRNOG00000019718) #21 Ankrd28 (ENSRNOG00000019697) #22 Btd (ENSRNOG00000019656) #23 Hacl1 (ENSRNOG00000019630) #24 Colq (ENSRNOG00000019615) #25 Eaf1 (ENSRNOG00000019559) #26 Mettl6 (ENSRNOG00000052391) #28 Capn7 (ENSRNOG00000019273) #29 RGD1564325 (ENSRNOG00000046517) Dnah1 (ENSRNOG00000026914) Bap1 (ENSRNOG00000019097) Phf7 (ENSRNOG00000018996) Sema3g (ENSRNOG00000018952) Tnnc1 (ENSRNOG00000018943) ENSRNOG00000066386 Nisch (ENSRNOG00000018823) Stab1 (ENSRNOG00000018434) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1513 Kcnh8 (ENSNGAG00000013207) Satb1 (ENSNGAG00000020340) Tbc1d5 (ENSNGAG00000018813) #15 Plcl2 (ENSNGAG00000023127) #16 ENSNGAG00000020385 Dazl (ENSNGAG00000009472) #17 ENSNGAG00000014161 #18 ENSNGAG00000015104 #18 Oxnad1 (ENSNGAG00000019562) #19 ENSNGAG00000015855 Galnt15 (ENSNGAG00000017514) #21 Ankrd28 (ENSNGAG00000015942) #22 Btd (ENSNGAG00000013985) #23 Hacl1 (ENSNGAG00000014477) #24 Colq (ENSNGAG00000019455) #25 Eaf1 (ENSNGAG00000008079) #26 Mettl6 (ENSNGAG00000015822) #27 Sh3bp5 (ENSNGAG00000018171) #28 Capn7 (ENSNGAG00000000411) #29 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 82 ENSJJAG00000018004 ENSJJAG00000012104 ENSJJAG00000020894 Rab5a (ENSJJAG00000020190) Efhb (ENSJJAG00000023722) Kcnh8 (ENSJJAG00000011433) Satb1 (ENSJJAG00000011907) Tbc1d5 (ENSJJAG00000020820) #15 Plcl2 (ENSJJAG00000016157) #16 Dazl (ENSJJAG00000010767) #17 ENSJJAG00000010277 #18 ENSJJAG00000018830 #18 ENSJJAG00000017236 ENSJJAG00000013287 #20 Galnt15 (ENSJJAG00000019499) #21 Ankrd28 (ENSJJAG00000005228) #22 Btd (ENSJJAG00000020488) #23 Hacl1 (ENSJJAG00000018292) #24 Colq (ENSJJAG00000012436) #25 ENSJJAG00000014692 Eaf1 (ENSJJAG00000019409) #26 Mettl6 (ENSJJAG00000018567) #27 ENSJJAG00000014685 Sh3bp5 (ENSJJAG00000014182) #28 Capn7 (ENSJJAG00000019584) #29 ENSJJAG00000016845 Slmap (ENSJJAG00000022979) Dennd6a (ENSJJAG00000014183) Arf4 (ENSJJAG00000012294) Pde12 (ENSJJAG00000006038) ENSJJAG00000015636 Kangaroo rat MODERN SPECIES 379 Pp2d1 (ENSDORG00000024799) ENSDORG00000024958 Efhb (ENSDORG00000009402) ENSDORG00000023871 Kcnh8 (ENSDORG00000010205) Satb1 (ENSDORG00000005578) Tbc1d5 (ENSDORG00000001677) #15 Plcl2 (ENSDORG00000004496) #16 ENSDORG00000024181 Dazl (ENSDORG00000011497) #17 ENSDORG00000027840 #18 ENSDORG00000024452 #18 Oxnad1 (ENSDORG00000011643) #19 ENSDORG00000011642 #20 Galnt15 (ENSDORG00000011640) #21 Ankrd28 (ENSDORG00000002191) #22 Btd (ENSDORG00000008251) #23 Hacl1 (ENSDORG00000008247) #24 Colq (ENSDORG00000014117) #25 Eaf1 (ENSDORG00000027979) #26 Mettl6 (ENSDORG00000014113) #27 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 ENSGT00390000016224.j.a ENSGT00390000011422 Rabbit MODERN SPECIES 5 ENSOCUG00000032896 ENSOCUG00000000698 ENSOCUG00000025838 ENSOCUG00000027919 ENSOCUG00000034295 KCNH8 (ENSOCUG00000016348) SATB1 (ENSOCUG00000007174) TBC1D5 (ENSOCUG00000016596) #15 PLCL2 (ENSOCUG00000008317) #16 RFTN1 (ENSOCUG00000015875) #18 ENSOCUG00000026336 OXNAD1 (ENSOCUG00000015868) #19 DPH3 (ENSOCUG00000015862) #20 ENSOCUG00000039398 GALNT15 (ENSOCUG00000025111) #21 ANKRD28 (ENSOCUG00000008568) #22 BTD (ENSOCUG00000008562) #23 HACL1 (ENSOCUG00000000765) #24 COLQ (ENSOCUG00000016105) #25 EAF1 (ENSOCUG00000016089) #26 METTL6 (ENSOCUG00000016078) #27 SH3BP5 (ENSOCUG00000010501) #28 ENSOCUG00000037099 CAPN7 (ENSOCUG00000007287) #29 HMGB1 (ENSOCUG00000024061) COL6A5 (ENSOCUG00000024036) #30 COL6A6 (ENSOCUG00000002486) PIK3R4 (ENSOCUG00000002495) ATP2C1 (ENSOCUG00000021839) ASTE1 (ENSOCUG00000006842) NEK11 (ENSOCUG00000006846) Pika MODERN SPECIES 1098 ANKRD28 (ENSOPRG00000006498) #22 BTD (ENSOPRG00000006495) #23 HACL1 (ENSOPRG00000006470) #24 COLQ (ENSOPRG00000006457) #25 EAF1 (ENSOPRG00000006447) #26 METTL6 (ENSOPRG00000006445) #27 SH3BP5 (ENSOPRG00000006437) #28 CAPN7 (ENSOPRG00000006420) #29 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000154989 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00390000017724.b ##26 ENSGT00940000168676 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 95 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 Common shrew MODERN SPECIES 3149 ANKRD28 (ENSSARG00000014085) #22 BTD (ENSSARG00000014083) #23 HACL1 (ENSSARG00000014057) #24 COLQ (ENSSARG00000014027) #25 EAF1 (ENSSARG00000014007) #26 Hedgehog MODERN SPECIES 8688 ANKRD28 (ENSEEUG00000012640) #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00390000017724.b ##26 ENSGT00940000168676 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00390000017724.b ##26 ENSGT00940000168676 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00940000154772.g.b ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00390000017724.b ##26 ENSGT00940000168676 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00940000154772.g.b ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00390000017724.b ##26 ENSGT00940000168676 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00950000185006 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00940000154772.g.b ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00390000017724.b ##26 ENSGT00940000168676 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00950000185006 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00940000154772.g.b ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00390000017724.b ##26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00950000185006 ENSGT00940000156421.b Ursus ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00940000154772.g.b ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00390000017724.b ##26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421.b ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 American black bear DUPLICATION American black bear MODERN SPECIES 5771 ENSUAMG00000010896 #22 BTD (ENSUAMG00000010894) #23 HACL1 (ENSUAMG00000010891) #24 American black bear MODERN SPECIES 7225 ENSUAMG00000010201 #22 Polar bear MODERN SPECIES 112 SGO1 (ENSUMAG00000018474) KAT2B (ENSUMAG00000018349) PP2D1 (ENSUMAG00000018320) RAB5A (ENSUMAG00000018295) EFHB (ENSUMAG00000018281) KCNH8 (ENSUMAG00000018259) ENSUMAG00000018223 SATB1 (ENSUMAG00000018158) TBC1D5 (ENSUMAG00000018122) #15 PLCL2 (ENSUMAG00000018106) #16 ENSUMAG00000018079 #17 RFTN1 (ENSUMAG00000018067) #18 OXNAD1 (ENSUMAG00000018056) #19 DPH3 (ENSUMAG00000018052) #20 GALNT15 (ENSUMAG00000018040) #21 ANKRD28 (ENSUMAG00000017994) #22 BTD (ENSUMAG00000017973) #23 HACL1 (ENSUMAG00000017963) #24 COLQ (ENSUMAG00000017915) #25 EAF1 (ENSUMAG00000017898) #26 METTL6 (ENSUMAG00000017889) #27 SH3BP5 (ENSUMAG00000017855) #28 CAPN7 (ENSUMAG00000017845) #29 ENSUMAG00000017806 #30 ENSUMAG00000017796 COL6A6 (ENSUMAG00000017686) PIK3R4 (ENSUMAG00000017674) ENSUMAG00000017664 ATP2C1 (ENSUMAG00000017649) ASTE1 (ENSUMAG00000017642) ENSUMAG00000017640 Giant Panda MODERN SPECIES 16 KAT2B (ENSAMEG00000000922) PP2D1 (ENSAMEG00000000952) RAB5A (ENSAMEG00000000954) EFHB (ENSAMEG00000000973) KCNH8 (ENSAMEG00000007435) SATB1 (ENSAMEG00000009099) ENSAMEG00000024183 TBC1D5 (ENSAMEG00000009080) #15 PLCL2 (ENSAMEG00000009078) #16 ENSAMEG00000009059 #17 ENSAMEG00000027343 RFTN1 (ENSAMEG00000009041) #18 OXNAD1 (ENSAMEG00000009028) #19 DPH3 (ENSAMEG00000030700) #20 GALNT15 (ENSAMEG00000008995) #21 ANKRD28 (ENSAMEG00000008924) #22 BTD (ENSAMEG00000008918) #23 HACL1 (ENSAMEG00000008878) #24 COLQ (ENSAMEG00000008838) #25 EAF1 (ENSAMEG00000008829) #26 METTL6 (ENSAMEG00000008819) #27 ENSAMEG00000008803 #28 ENSAMEG00000008756 #29 ENSAMEG00000026185 ENSAMEG00000004820 #30 COL6A6 (ENSAMEG00000004780) PIK3R4 (ENSAMEG00000004733) ENSAMEG00000025080 ATP2C1 (ENSAMEG00000014314) ASTE1 (ENSAMEG00000014307) NEK11 (ENSAMEG00000031385) Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 153 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995.w ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00940000154772.g.b ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 Ferret MODERN SPECIES 345 KCNH8 (ENSMPUG00000001398) ENSMPUG00000001402 SATB1 (ENSMPUG00000001406) ENSMPUG00000001411 TBC1D5 (ENSMPUG00000001414) #15 PLCL2 (ENSMPUG00000001422) #16 ENSMPUG00000001426 #17 ENSMPUG00000001472 #18 ENSMPUG00000001478 #18 OXNAD1 (ENSMPUG00000001516) #19 DPH3 (ENSMPUG00000001521) #20 GALNT15 (ENSMPUG00000001528) #21 ANKRD28 (ENSMPUG00000001532) #22 BTD (ENSMPUG00000001545) #23 HACL1 (ENSMPUG00000001551) #24 COLQ (ENSMPUG00000001650) #25 EAF1 (ENSMPUG00000001699) #26 METTL6 (ENSMPUG00000001741) #27 SH3BP5 (ENSMPUG00000001747) #28 CAPN7 (ENSMPUG00000001751) #29 ENSMPUG00000001757 ENSMPUG00000001768 American mink MODERN SPECIES 136 SGO1 (ENSNVIG00000019530) KAT2B (ENSNVIG00000019496) PP2D1 (ENSNVIG00000019479) RAB5A (ENSNVIG00000019469) EFHB (ENSNVIG00000019456) KCNH8 (ENSNVIG00000019424) ENSNVIG00000019413 SATB1 (ENSNVIG00000019324) TBC1D5 (ENSNVIG00000019211) #15 PLCL2 (ENSNVIG00000019182) #16 ENSNVIG00000019152 #17 RFTN1 (ENSNVIG00000019134) #18 F5H620 (ENSNVIG00000019064) #19 DPH3 (ENSNVIG00000019043) #20 GALNT15 (ENSNVIG00000019006) #21 ANKRD28 (ENSNVIG00000017951) #22 BTD (ENSNVIG00000017840) #23 HACL1 (ENSNVIG00000017486) #24 COLQ (ENSNVIG00000017326) #25 ENSNVIG00000017316 Canidae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00940000154772.g.b ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679.e #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00950000185006 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00940000154772.g.b ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679.e #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 ENSGT00390000016224.j.a Dog MODERN SPECIES 15 KAT2B (ENSCAFG00845020587) PP2D1 (ENSCAFG00845021158) RAB5A (ENSCAFG00845021204) EFHB (ENSCAFG00845021296) KCNH8 (ENSCAFG00845021492) ENSCAFG00845021600 SATB1 (ENSCAFG00845021681) TBC1D5 (ENSCAFG00845021936) #15 ENSCAFG00845022287 PLCL2 (ENSCAFG00845022325) #16 DAZL (ENSCAFG00845022414) #17 RFTN1 (ENSCAFG00845022667) #18 OXNAD1 (ENSCAFG00845022998) #19 DPH3 (ENSCAFG00845023089) #20 GALNT15 (ENSCAFG00845023124) #21 ANKRD28 (ENSCAFG00845023341) #22 BTD (ENSCAFG00845024081) #23 ENSCAFG00845024606 #24 EAF1 (ENSCAFG00845026720) #26 SH3BP5 (ENSCAFG00845026935) #28 ENSCAFG00845027174 #29 ENSCAFG00845027371 ENSCAFG00845027616 COL6A5 (ENSCAFG00845027693) #30 COL6A6 (ENSCAFG00845027892) PIK3R4 (ENSCAFG00845028045) ATP2C1 (ENSCAFG00845028382) ASTE1 (ENSCAFG00845028741) NEK11 (ENSCAFG00845028794) NUDT16 (ENSCAFG00845028871) MRPL3 (ENSCAFG00845028932) Dingo MODERN SPECIES 80 ENSCAFG00020027282 ENSCAFG00020027283 PP2D1 (ENSCAFG00020027286) RAB5A (ENSCAFG00020027287) EFHB (ENSCAFG00020027289) KCNH8 (ENSCAFG00020027292) ENSCAFG00020027293 SATB1 (ENSCAFG00020027296) TBC1D5 (ENSCAFG00020027311) #15 PLCL2 (ENSCAFG00020027333) #16 ENSCAFG00020027335 #17 RFTN1 (ENSCAFG00020027339) #18 OXNAD1 (ENSCAFG00020027343) #19 DPH3 (ENSCAFG00020027350) #20 GALNT15 (ENSCAFG00020027352) #21 ANKRD28 (ENSCAFG00020027368) #22 BTD (ENSCAFG00020027376) #23 HACL1 (ENSCAFG00020027377) #24 ENSCAFG00020027379 #25 EAF1 (ENSCAFG00020027380) #26 ENSCAFG00020027381 #27 SH3BP5 (ENSCAFG00020027383) #28 CAPN7 (ENSCAFG00020027403) #29 ENSCAFG00020027431 ENSCAFG00020027435 ENSCAFG00020027436 PIK3R4 (ENSCAFG00020027438) ENSCAFG00020027439 ENSCAFG00020027440 ATP2C1 (ENSCAFG00020027442) ASTE1 (ENSCAFG00020027443) Red fox MODERN SPECIES 58 ENSVVUG00000000381 SGO1 (ENSVVUG00000000434) KAT2B (ENSVVUG00000000458) PP2D1 (ENSVVUG00000000482) RAB5A (ENSVVUG00000000489) EFHB (ENSVVUG00000000504) KCNH8 (ENSVVUG00000000541) SATB1 (ENSVVUG00000000582) TBC1D5 (ENSVVUG00000000609) #15 PLCL2 (ENSVVUG00000000654) #16 ENSVVUG00000000673 #17 RFTN1 (ENSVVUG00000000683) #18 OXNAD1 (ENSVVUG00000000718) #19 DPH3 (ENSVVUG00000000724) #20 GALNT15 (ENSVVUG00000000746) #21 ANKRD28 (ENSVVUG00000000775) #22 BTD (ENSVVUG00000000873) #23 HACL1 (ENSVVUG00000000910) #24 Felidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00940000154772.g.b.a.a ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT01000000220746 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 ENSGT00390000016224.j.a Panthera ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00940000154772.g.b.a.a ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT01000000220746 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 ENSGT00390000016224.j.a Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00940000154772.g.b.a.a ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT01000000220746 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 lion MODERN SPECIES 9 KAT2B (ENSPLOG00000007809) ENSPLOG00000008548 PP2D1 (ENSPLOG00000008568) RAB5A (ENSPLOG00000008606) EFHB (ENSPLOG00000008658) KCNH8 (ENSPLOG00000008800) SATB1 (ENSPLOG00000008905) TBC1D5 (ENSPLOG00000008965) #15 PLCL2 (ENSPLOG00000009144) #16 ENSPLOG00000009211 #17 RFTN1 (ENSPLOG00000009354) #18 OXNAD1 (ENSPLOG00000009387) #19 DPH3 (ENSPLOG00000009427) #20 ENSPLOG00000009456 GALNT15 (ENSPLOG00000009476) #21 ANKRD28 (ENSPLOG00000009621) #22 BTD (ENSPLOG00000009945) #23 HACL1 (ENSPLOG00000010310) #24 COLQ (ENSPLOG00000011130) #25 EAF1 (ENSPLOG00000011678) #26 SH3BP5 (ENSPLOG00000011742) #28 CAPN7 (ENSPLOG00000011881) #29 ENSPLOG00000011940 ENSPLOG00000012148 COL6A6 (ENSPLOG00000012227) PIK3R4 (ENSPLOG00000012541) ATP2C1 (ENSPLOG00000012688) ASTE1 (ENSPLOG00000012885) NEK11 (ENSPLOG00000012934) NUDT16 (ENSPLOG00000013001) MRPL3 (ENSPLOG00000013061) leopard MODERN SPECIES 5 ENSPPRG00000002641 PP2D1 (ENSPPRG00000002083) ENSPPRG00000001655 EFHB (ENSPPRG00000000503) KCNH8 (ENSPPRG00000023681) ENSPPRG00000020741 SATB1 (ENSPPRG00000019113) TBC1D5 (ENSPPRG00000015799) #15 ENSPPRG00000010158 PLCL2 (ENSPPRG00000009211) #16 ENSPPRG00000008794 #17 RFTN1 (ENSPPRG00000007488) #18 OXNAD1 (ENSPPRG00000007203) #19 DPH3 (ENSPPRG00000004843) #20 GALNT15 (ENSPPRG00000004449) #21 ANKRD28 (ENSPPRG00000004331) #22 ENSPPRG00000003237 BTD (ENSPPRG00000002804) #23 HACL1 (ENSPPRG00000001693) #24 COLQ (ENSPPRG00000023699) #25 EAF1 (ENSPPRG00000014826) #26 METTL6 (ENSPPRG00000014661) #27 SH3BP5 (ENSPPRG00000014017) #28 CAPN7 (ENSPPRG00000012968) #29 ENSPPRG00000012527 COL6A5 (ENSPPRG00000009495) #30 COL6A6 (ENSPPRG00000007548) PIK3R4 (ENSPPRG00000005985) ENSPPRG00000005137 ATP2C1 (ENSPPRG00000003594) ASTE1 (ENSPPRG00000001491) Tiger MODERN SPECIES 261 ENSPTIG00000012234 ENSPTIG00000012432 TBC1D5 (ENSPTIG00000012831) #15 PLCL2 (ENSPTIG00000019457) #16 ENSPTIG00000020895 #17 RFTN1 (ENSPTIG00000005860) #18 OXNAD1 (ENSPTIG00000007542) #19 DPH3 (ENSPTIG00000010209) #20 GALNT15 (ENSPTIG00000016217) #21 ANKRD28 (ENSPTIG00000017339) #22 BTD (ENSPTIG00000021790) #23 HACL1 (ENSPTIG00000022059) #24 COLQ (ENSPTIG00000008099) #25 EAF1 (ENSPTIG00000014507) #26 METTL6 (ENSPTIG00000015336) #27 SH3BP5 (ENSPTIG00000017234) #28 CAPN7 (ENSPTIG00000019564) #29 ENSPTIG00000002601 COL6A5 (ENSPTIG00000007444) #30 COL6A6 (ENSPTIG00000010831) PIK3R4 (ENSPTIG00000013702) ATP2C1 (ENSPTIG00000015983) ASTE1 (ENSPTIG00000021947) NEK11 (ENSPTIG00000001500) MRPL3 (ENSPTIG00000012251) Cat MODERN SPECIES 240 PP2D1 (ENSFCAG00000040097) RAB5A (ENSFCAG00000039795) EFHB (ENSFCAG00000004454) KCNH8 (ENSFCAG00000012306) ENSFCAG00000022406 SATB1 (ENSFCAG00000004295) ENSFCAG00000044938 TBC1D5 (ENSFCAG00000004653) #15 PLCL2 (ENSFCAG00000022152) #16 ENSFCAG00000023607 #17 RFTN1 (ENSFCAG00000022758) #18 OXNAD1 (ENSFCAG00000006357) #19 DPH3 (ENSFCAG00000035252) #20 ENSFCAG00000053298 GALNT15 (ENSFCAG00000006350) #21 ANKRD28 (ENSFCAG00000011307) #22 BTD (ENSFCAG00000011306) #23 HACL1 (ENSFCAG00000011305) #24 COLQ (ENSFCAG00000011304) #25 EAF1 (ENSFCAG00000011303) #26 METTL6 (ENSFCAG00000022284) #27 SH3BP5 (ENSFCAG00000013213) #28 CAPN7 (ENSFCAG00000030939) #29 COL6A5 (ENSFCAG00000044600) #30 COL6A6 (ENSFCAG00000013504) PIK3R4 (ENSFCAG00000013508) ATP2C1 (ENSFCAG00000030435) ASTE1 (ENSFCAG00000001170) NEK11 (ENSFCAG00000001171) NUDT16 (ENSFCAG00000033878) MRPL3 (ENSFCAG00000006335) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 ENSGT00390000016224.j.a Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 ENSGT00390000016224.j.a Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 ENSGT00390000016224.j.a Microbat MODERN SPECIES 945 SGO1 (ENSMLUG00000007432) KAT2B (ENSMLUG00000007403) PP2D1 (ENSMLUG00000011709) RAB5A (ENSMLUG00000011716) EFHB (ENSMLUG00000011722) KCNH8 (ENSMLUG00000001650) SATB1 (ENSMLUG00000001860) TBC1D5 (ENSMLUG00000013559) #15 PLCL2 (ENSMLUG00000013543) #16 ENSMLUG00000011337 #17 RFTN1 (ENSMLUG00000000975) #18 OXNAD1 (ENSMLUG00000000969) #19 DPH3 (ENSMLUG00000017660) #20 GALNT15 (ENSMLUG00000017659) #21 ENSMLUG00000022391 ANKRD28 (ENSMLUG00000002784) #22 BTD (ENSMLUG00000002778) #23 HACL1 (ENSMLUG00000002771) #24 COLQ (ENSMLUG00000002756) #25 EAF1 (ENSMLUG00000002747) #26 METTL6 (ENSMLUG00000002743) #27 SH3BP5 (ENSMLUG00000002737) #28 CAPN7 (ENSMLUG00000002720) #29 ENSMLUG00000005740 COL6A5 (ENSMLUG00000010691) #30 COL6A6 (ENSMLUG00000015376) PIK3R4 (ENSMLUG00000006103) ATP2C1 (ENSMLUG00000013867) ASTE1 (ENSMLUG00000013882) NEK11 (ENSMLUG00000013883) NUDT16 (ENSMLUG00000014825) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 8 SGO1 (ENSRFEG00010011604) KAT2B (ENSRFEG00010012070) PP2D1 (ENSRFEG00010012143) RAB5A (ENSRFEG00010012219) EFHB (ENSRFEG00010012369) KCNH8 (ENSRFEG00010012438) SATB1 (ENSRFEG00010012658) ENSRFEG00010012725 TBC1D5 (ENSRFEG00010012791) #15 PLCL2 (ENSRFEG00010012959) #16 ENSRFEG00010013048 #17 RFTN1 (ENSRFEG00010013368) #18 OXNAD1 (ENSRFEG00010013428) #19 DPH3 (ENSRFEG00010013628) #20 GALNT15 (ENSRFEG00010013714) #21 ANKRD28 (ENSRFEG00010013787) #22 BTD (ENSRFEG00010013954) #23 HACL1 (ENSRFEG00010014213) #24 COLQ (ENSRFEG00010014398) #25 EAF1 (ENSRFEG00010014564) #26 METTL6 (ENSRFEG00010014617) #27 SH3BP5 (ENSRFEG00010014768) #28 CAPN7 (ENSRFEG00010014864) #29 ENSRFEG00010014927 COL6A5 (ENSRFEG00010015260) #30 COL6A6 (ENSRFEG00010015736) PIK3R4 (ENSRFEG00010016092) ATP2C1 (ENSRFEG00010016158) ENSRFEG00010016381 ASTE1 (ENSRFEG00010016402) NEK11 (ENSRFEG00010016440) Megabat MODERN SPECIES 3310 ANKRD28 (ENSPVAG00000000741) #22 BTD (ENSPVAG00000000739) #23 HACL1 (ENSPVAG00000000738) #24 COLQ (ENSPVAG00000000737) #25 EAF1 (ENSPVAG00000000736) #26 METTL6 (ENSPVAG00000000735) #27 Equus ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT01030000238633 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00940000167515 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 ENSGT00390000016224.j.a Donkey MODERN SPECIES 13 PP2D1 (ENSEASG00005005822) RAB5A (ENSEASG00005005818) EFHB (ENSEASG00005005815) ENSEASG00005005811 KCNH8 (ENSEASG00005005804) SATB1 (ENSEASG00005005787) TBC1D5 (ENSEASG00005005775) #15 PLCL2 (ENSEASG00005005767) #16 ENSEASG00005005756 #17 RFTN1 (ENSEASG00005005754) #18 OXNAD1 (ENSEASG00005005749) #19 ENSEASG00005025473 ENSEASG00005023827 GALNT15 (ENSEASG00005005743) #21 ENSEASG00005005740 ANKRD28 (ENSEASG00005005733) #22 BTD (ENSEASG00005005732) #23 HACL1 (ENSEASG00005005730) #24 COLQ (ENSEASG00005005725) #25 EAF1 (ENSEASG00005005720) #26 METTL6 (ENSEASG00005005716) #27 ENSEASG00005005713 #28 ENSEASG00005005708 #29 ENSEASG00005005705 ENSEASG00005005678 #30 COL6A6 (ENSEASG00005005653) PIK3R4 (ENSEASG00005005636) ATP2C1 (ENSEASG00005005624) ASTE1 (ENSEASG00005005618) NEK11 (ENSEASG00005005611) NUDT16 (ENSEASG00005005606) Horse MODERN SPECIES 7 SGO1 (ENSECAG00000012475) PP2D1 (ENSECAG00000018679) RAB5A (ENSECAG00000019062) EFHB (ENSECAG00000019496) ENSECAG00000031635 KCNH8 (ENSECAG00000023098) SATB1 (ENSECAG00000023585) TBC1D5 (ENSECAG00000008017) #15 ENSECAG00000053253 PLCL2 (ENSECAG00000010068) #16 ENSECAG00000010923 #17 RFTN1 (ENSECAG00000013897) #18 OXNAD1 (ENSECAG00000014741) #19 ENSECAG00000042046 GALNT15 (ENSECAG00000016679) #21 ANKRD28 (ENSECAG00000019591) #22 BTD (ENSECAG00000003387) #23 ENSECAG00000056916 HACL1 (ENSECAG00000009309) #24 COLQ (ENSECAG00000019755) #25 EAF1 (ENSECAG00000024360) #26 METTL6 (ENSECAG00000055054) #27 SH3BP5 (ENSECAG00000024842) #28 CAPN7 (ENSECAG00000004932) #29 ENSECAG00000011581 COL6A5 (ENSECAG00000012733) #30 COL6A6 (ENSECAG00000016169) PIK3R4 (ENSECAG00000018119) ATP2C1 (ENSECAG00000023680) ASTE1 (ENSECAG00000014026) NEK11 (ENSECAG00000015688) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 Suina ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00910000147226 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 ENSGT01030000235108 Pig MODERN SPECIES 4 ENSSSCG00000059545 ENSSSCG00000053218 SATB1 (ENSSSCG00000011201) ENSSSCG00000058979 ENSSSCG00000061112 ENSSSCG00000061080 ENSSSCG00000049233 TBC1D5 (ENSSSCG00000011199) #15 PLCL2 (ENSSSCG00000029811) #16 ENSSSCG00000030671 #17 ENSSSCG00000050150 RFTN1 (ENSSSCG00000011198) #18 OXNAD1 (ENSSSCG00000011197) #19 DPH3 (ENSSSCG00000056217) #20 GALNT15 (ENSSSCG00000011195) #21 ANKRD28 (ENSSSCG00000011194) #22 BTD (ENSSSCG00000011193) #23 HACL1 (ENSSSCG00000011192) #24 COLQ (ENSSSCG00000028911) #25 EAF1 (ENSSSCG00000026622) #26 METTL6 (ENSSSCG00000011190) #27 SH3BP5 (ENSSSCG00000024938) #28 CAPN7 (ENSSSCG00000030697) #29 ENSSSCG00000054192 COL6A5 (ENSSSCG00000011186) #30 COL6A6 (ENSSSCG00000037430) PIK3R4 (ENSSSCG00000029094) ATP2C1 (ENSSSCG00000011183) ASTE1 (ENSSSCG00000011182) NEK11 (ENSSSCG00000011181) NUDT16 (ENSSSCG00000032424) Chacoan peccary MODERN SPECIES 950 ZNF385D (ENSCWAG00000014736) SGO1 (ENSCWAG00000014455) KAT2B (ENSCWAG00000014268) PP2D1 (ENSCWAG00000014209) RAB5A (ENSCWAG00000014144) EFHB (ENSCWAG00000013945) KCNH8 (ENSCWAG00000013749) SATB1 (ENSCWAG00000013549) TBC1D5 (ENSCWAG00000013341) #15 PLCL2 (ENSCWAG00000013243) #16 ENSCWAG00000013021 #17 RFTN1 (ENSCWAG00000012968) #18 OXNAD1 (ENSCWAG00000012470) #19 DPH3 (ENSCWAG00000012398) #20 GALNT15 (ENSCWAG00000012343) #21 ANKRD28 (ENSCWAG00000011879) #22 ENSCWAG00000020745 BTD (ENSCWAG00000020723) #23 HACL1 (ENSCWAG00000020631) #24 COLQ (ENSCWAG00000020535) #25 EAF1 (ENSCWAG00000020521) #26 METTL6 (ENSCWAG00000020511) #27 SH3BP5 (ENSCWAG00000020499) #28 CAPN7 (ENSCWAG00000020439) #29 ENSCWAG00000020406 COL6A5 (ENSCWAG00000020322) #30 COL6A6 (ENSCWAG00000020253) PIK3R4 (ENSCWAG00000020213) ATP2C1 (ENSCWAG00000020132) ASTE1 (ENSCWAG00000020109) ENSCWAG00000020102 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00900000141074.l ENSGT00390000008096.A ENSGT00390000007149.l ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225.h #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00950000182988.a.a.q ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 ENSGT01030000235108 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00990000211206 ENSGT00940000156869 ENSGT00940000160286.u.b ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000167974.d ENSGT00390000007149.l ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225.h #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00950000182988.a.a.q ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 ENSGT01030000235108 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00990000211206 ENSGT00940000156869 ENSGT00940000160286.u.b ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000167974.d ENSGT00390000007149.l ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225.h #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00950000182988.a.a.q ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 ENSGT01030000235108 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00990000211206 ENSGT00940000156869 ENSGT00940000160286.u.b ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000167974.d ENSGT00390000007149.l ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225.h #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00950000182988.a.a.q ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 ENSGT01030000235108 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00990000211206 ENSGT00940000156869 ENSGT00940000160286.u.b ENSGT00390000008096.A ENSGT00390000007149.l ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225.h #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00910000144184.r.a.b ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 ENSGT01030000235108 Beluga whale MODERN SPECIES 18 PLCL2 (ENSDLEG00000007213) #16 ENSDLEG00000007223 #17 RFTN1 (ENSDLEG00000007243) #18 OXNAD1 (ENSDLEG00000007252) #19 DPH3 (ENSDLEG00000007255) #20 GALNT15 (ENSDLEG00000007259) #21 ANKRD28 (ENSDLEG00000007274) #22 BTD (ENSDLEG00000007312) #23 HACL1 (ENSDLEG00000007320) #24 COLQ (ENSDLEG00000007339) #25 EAF1 (ENSDLEG00000007366) #26 METTL6 (ENSDLEG00000007375) #27 SH3BP5 (ENSDLEG00000007381) #28 CAPN7 (ENSDLEG00000007395) #29 ENSDLEG00000007406 ENSDLEG00000007410 ENSDLEG00000007417 #30 ENSDLEG00000007435 COL6A6 (ENSDLEG00000007505) PIK3R4 (ENSDLEG00000007745) ATP2C1 (ENSDLEG00000007762) ASTE1 (ENSDLEG00000007788) Narwhal MODERN SPECIES 297 EFHB (ENSMMNG00015010970) ENSMMNG00015010961 ENSMMNG00015010952 KCNH8 (ENSMMNG00015010929) ENSMMNG00015010903 SATB1 (ENSMMNG00015010870) ENSMMNG00015010848 TBC1D5 (ENSMMNG00015010791) #15 PLCL2 (ENSMMNG00015010765) #16 ENSMMNG00015010745 ENSMMNG00015010705 #17 RFTN1 (ENSMMNG00015010679) #18 OXNAD1 (ENSMMNG00015010649) #19 ENSMMNG00015010634 #20 GALNT15 (ENSMMNG00015010623) #21 ANKRD28 (ENSMMNG00015010516) #22 BTD (ENSMMNG00015010445) #23 HACL1 (ENSMMNG00015010128) #24 EAF1 (ENSMMNG00015009972) #26 METTL6 (ENSMMNG00015009949) #27 SH3BP5 (ENSMMNG00015009931) #28 CAPN7 (ENSMMNG00015009911) #29 ENSMMNG00015009902 ENSMMNG00015009901 COL6A5 (ENSMMNG00015009886) #30 COL6A6 (ENSMMNG00015009859) PIK3R4 (ENSMMNG00015009822) ATP2C1 (ENSMMNG00015009607) ASTE1 (ENSMMNG00015004788) ENSMMNG00015004772 NUDT16 (ENSMMNG00015004767) Vaquita MODERN SPECIES 15 PP2D1 (ENSPSNG00000004395) ENSPSNG00000004424 EFHB (ENSPSNG00000005780) ENSPSNG00000005865 KCNH8 (ENSPSNG00000005906) ENSPSNG00000005960 SATB1 (ENSPSNG00000005991) ENSPSNG00000006021 ENSPSNG00000006034 TBC1D5 (ENSPSNG00000006070) #15 PLCL2 (ENSPSNG00000006137) #16 ENSPSNG00000006191 #17 RFTN1 (ENSPSNG00000006302) #18 OXNAD1 (ENSPSNG00000006384) #19 GALNT15 (ENSPSNG00000006494) #21 ANKRD28 (ENSPSNG00000006571) #22 BTD (ENSPSNG00000006709) #23 HACL1 (ENSPSNG00000006877) #24 COLQ (ENSPSNG00000007053) #25 EAF1 (ENSPSNG00000007176) #26 METTL6 (ENSPSNG00000007214) #27 SH3BP5 (ENSPSNG00000007274) #28 CAPN7 (ENSPSNG00000007360) #29 ENSPSNG00000007439 COL6A5 (ENSPSNG00000007479) #30 COL6A6 (ENSPSNG00000007661) PIK3R4 (ENSPSNG00000007901) ATP2C1 (ENSPSNG00000008052) ASTE1 (ENSPSNG00000008211) ENSPSNG00000008479 NUDT16 (ENSPSNG00000008495) Dolphin MODERN SPECIES 2808 ANKRD28 (ENSTTRG00000009261) #22 Sperm whale MODERN SPECIES RAB5A (ENSPCTG00005002067) EFHB (ENSPCTG00005002045) ENSPCTG00005002029 KCNH8 (ENSPCTG00005002008) ENSPCTG00005001988 SATB1 (ENSPCTG00005001955) ENSPCTG00005001947 ENSPCTG00005001940 TBC1D5 (ENSPCTG00005001824) #15 PLCL2 (ENSPCTG00005001792) #16 ENSPCTG00005001768 #17 RFTN1 (ENSPCTG00005001747) #18 OXNAD1 (ENSPCTG00005001722) #19 DPH3 (ENSPCTG00005001706) #20 GALNT15 (ENSPCTG00005001677) #21 ANKRD28 (ENSPCTG00005001558) #22 BTD (ENSPCTG00005001503) #23 HACL1 (ENSPCTG00005001391) #24 EAF1 (ENSPCTG00005001335) #26 METTL6 (ENSPCTG00005001309) #27 SH3BP5 (ENSPCTG00005001266) #28 CAPN7 (ENSPCTG00005001222) #29 ENSPCTG00005001200 ENSPCTG00005001195 COL6A5 (ENSPCTG00005001123) #30 COL6A6 (ENSPCTG00005001039) PIK3R4 (ENSPCTG00005000977) ATP2C1 (ENSPCTG00005000766) ASTE1 (ENSPCTG00005000201) NEK11 (ENSPCTG00005000199) NUDT16 (ENSPCTG00005000198) Blue whale MODERN SPECIES 15 ENSBMSG00010001678 PP2D1 (ENSBMSG00010001686) RAB5A (ENSBMSG00010001697) EFHB (ENSBMSG00010001716) KCNH8 (ENSBMSG00010001759) ENSBMSG00010001776 SATB1 (ENSBMSG00010001793) ENSBMSG00010001810 TBC1D5 (ENSBMSG00010001844) #15 PLCL2 (ENSBMSG00010002116) #16 ENSBMSG00010002140 #17 RFTN1 (ENSBMSG00010002183) #18 OXNAD1 (ENSBMSG00010002208) #19 ENSBMSG00010002225 #20 GALNT15 (ENSBMSG00010002234) #21 ANKRD28 (ENSBMSG00010002267) #22 BTD (ENSBMSG00010002337) #23 HACL1 (ENSBMSG00010002421) #24 COLQ (ENSBMSG00010002575) #25 EAF1 (ENSBMSG00010002751) #26 METTL6 (ENSBMSG00010002767) #27 SH3BP5 (ENSBMSG00010002776) #28 ENSBMSG00010002789 CAPN7 (ENSBMSG00010002796) #29 ENSBMSG00010002810 COL6A5 (ENSBMSG00010002820) #30 COL6A6 (ENSBMSG00010002869) PIK3R4 (ENSBMSG00010002912) ATP2C1 (ENSBMSG00010003028) ASTE1 (ENSBMSG00010003984) ENSBMSG00010003991 Pecora ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154559.C ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000160202 ENSGT00940000160662 ENSGT00990000203615.b.a.a.a.b Percora_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000154559.C ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000160202 ENSGT00940000160662 ENSGT00990000203615.b.a.a.a.b Bovidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000154559.C ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000160202 ENSGT00940000160662 ENSGT00990000203615.b.a.a.a.b Bovinae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00960000190334 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT01050000248068 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000160202 ENSGT00940000160662 ENSGT00990000203615.b.a.a.a.b Bos DUPLICATION Bos DUPLICATION Bos ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b.l #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00960000190334 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C.e.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT01050000248068 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000160202 ENSGT00940000160662 ENSGT00990000203615.b.a.a.a.b Bos_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.E.b ENSGT00390000008096.E.a ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000154846.b.x.c ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b.l #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00960000190334 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C.f #22 ENSGT00950000182908.C.e.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000160202 ENSGT00940000160662 ENSGT00990000203615.b.a.a.a.b ENSGT01080000257365.b.a.b.a.a ENSGT00940000157408 Wild yak MODERN SPECIES 2697 ENSBMUG00000024601 #22 BTD (ENSBMUG00000024540) #23 HACL1 (ENSBMUG00000024471) #24 COLQ (ENSBMUG00000024312) #25 EAF1 (ENSBMUG00000024262) #26 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b.l #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT01100000263481.n.a.a.b.b.b.a.a.b.b.b ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C.e.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT01050000248068 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000160202 ENSGT00940000160662 ENSGT00990000203615.b.a.a.a.b Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES KAT2B (ENSBIXG00005013873) PP2D1 (ENSBIXG00005013941) RAB5A (ENSBIXG00005001761) EFHB (ENSBIXG00005001828) KCNH8 (ENSBIXG00005001852) SATB1 (ENSBIXG00005014252) TBC1D5 (ENSBIXG00005005933) #15 ENSBIXG00005001921 PLCL2 (ENSBIXG00005014406) #16 ENSBIXG00005014489 #17 RFTN1 (ENSBIXG00005001982) #18 OXNAD1 (ENSBIXG00005002032) #19 DPH3 (ENSBIXG00005002043) #20 ENSBIXG00005014630 GALNT15 (ENSBIXG00005014657) #21 ANKRD28 (ENSBIXG00005014993) #22 BTD (ENSBIXG00005015145) #23 HACL1 (ENSBIXG00005015316) #24 COLQ (ENSBIXG00005006233) #25 EAF1 (ENSBIXG00005002299) #26 METTL6 (ENSBIXG00005015538) #27 SH3BP5 (ENSBIXG00005015583) #28 CAPN7 (ENSBIXG00005015610) #29 ENSBIXG00005002441 COL6A5 (ENSBIXG00005015760) #30 COL6A6 (ENSBIXG00005002476) PIK3R4 (ENSBIXG00005015834) ETS2 (ENSBIXG00005015911) ERG (ENSBIXG00005016083) KCNJ15 (ENSBIXG00005002584) KCNJ6 (ENSBIXG00005016298) Cow MODERN SPECIES EFHB (ENSBTAG00000013806) ENSBTAG00000047978 KCNH8 (ENSBTAG00000012798) SATB1 (ENSBTAG00000021158) TBC1D5 (ENSBTAG00000030581) #15 ENSBTAG00000049193 PLCL2 (ENSBTAG00000009942) #16 DAZL (ENSBTAG00000000502) #17 ENSBTAG00000051752 #18 RFTN1 (ENSBTAG00000030593) #18 OXNAD1 (ENSBTAG00000004891) #19 ENSBTAG00000053091 DPH3 (ENSBTAG00000003916) #20 ENSBTAG00000051065 GALNT15 (ENSBTAG00000008240) #21 ANKRD28 (ENSBTAG00000024815) #22 BTD (ENSBTAG00000019129) #23 HACL1 (ENSBTAG00000003718) #24 COLQ (ENSBTAG00000040193) COLQ (ENSBTAG00000051541) #25 EAF1 (ENSBTAG00000019202) #26 METTL6 (ENSBTAG00000023375) #27 ENSBTAG00000030592 SH3BP5 (ENSBTAG00000023377) #28 CAPN7 (ENSBTAG00000006479) #29 COL6A5 (ENSBTAG00000049122) #30 COL6A6 (ENSBTAG00000012837) PIK3R4 (ENSBTAG00000020787) ETS2 (ENSBTAG00000009214) ERG (ENSBTAG00000011001) KCNJ15 (ENSBTAG00000000973) Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182908.C.e.b #22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182908.C.e.b #22 Wild yak MODERN SPECIES 2399 ENSBMUG00000011579 #22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182908.C.f #22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.E.b ENSGT00390000008096.E.a ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000154846.b.x.c ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b.l #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00960000190334 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C.f #22 ENSGT00950000182908.C.e.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000160202 ENSGT00940000160662 ENSGT00990000203615.b.a.a.a.b ENSGT01080000257365.b.a.b.a.a Domestic yak MODERN SPECIES ENSBGRG00000001755 KCNH8 (ENSBGRG00000001743) ENSBGRG00000001733 ENSBGRG00000001727 ENSBGRG00000001708 TBC1D5 (ENSBGRG00000000433) #15 ENSBGRG00000000231 ENSBGRG00000000227 PLCL2 (ENSBGRG00000000215) #16 ENSBGRG00000000174 #17 ENSBGRG00000005989 #18 RFTN1 (ENSBGRG00000005969) #18 OXNAD1 (ENSBGRG00000005867) #19 DPH3 (ENSBGRG00000005826) #20 GALNT15 (ENSBGRG00000005716) #21 ANKRD28 (ENSBGRG00000005474) #22 ENSBGRG00000005423 #23 HACL1 (ENSBGRG00000004645) #24 COLQ (ENSBGRG00000004392) #25 EAF1 (ENSBGRG00000004328) #26 METTL6 (ENSBGRG00000004234) #27 ENSBGRG00000004225 SH3BP5 (ENSBGRG00000004132) #28 CAPN7 (ENSBGRG00000004003) #29 COL6A5 (ENSBGRG00000003956) #30 COL6A6 (ENSBGRG00000003893) PIK3R4 (ENSBGRG00000003866) ETS2 (ENSBGRG00000003739) ERG (ENSBGRG00000003442) KCNJ15 (ENSBGRG00000003394) KCNJ6 (ENSBGRG00000003372) American bison MODERN SPECIES 3288 ENSBBBG00000010352 KCNH8 (ENSBBBG00000010348) ENSBBBG00000010337 ENSBBBG00000010335 ENSBBBG00000010332 SATB1 (ENSBBBG00000010327) TBC1D5 (ENSBBBG00000010308) #15 PLCL2 (ENSBBBG00000010278) #16 ENSBBBG00000007878 #17 ENSBBBG00000000039 #18 ENSBBBG00000000041 #18 OXNAD1 (ENSBBBG00000000045) #19 DPH3 (ENSBBBG00000000067) #20 ENSBBBG00000000073 GALNT15 (ENSBBBG00000000086) #21 ANKRD28 (ENSBBBG00000010251) #22 BTD (ENSBBBG00000010234) #23 HACL1 (ENSBBBG00000010217) #24 ENSBBBG00000010128 COLQ (ENSBBBG00000010123) #25 EAF1 (ENSBBBG00000010116) #26 METTL6 (ENSBBBG00000010111) #27 SH3BP5 (ENSBBBG00000010106) #28 CAPN7 (ENSBBBG00000010094) #29 COL6A5 (ENSBBBG00000010070) #30 COL6A6 (ENSBBBG00000010054) PIK3R4 (ENSBBBG00000010043) Caprinae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154559.C ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b.d #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225.d ENSGT00940000160202 ENSGT00940000160662 ENSGT00990000203615.b.a.a.a.b ENSGT01080000257365.b.a.b.a.a Goat MODERN SPECIES ZNF596 (ENSCHIG00000023889) SGO1 (ENSCHIG00000013739) KAT2B (ENSCHIG00000022776) PP2D1 (ENSCHIG00000017933) RAB5A (ENSCHIG00000025419) EFHB (ENSCHIG00000013082) KCNH8 (ENSCHIG00000018810) SATB1 (ENSCHIG00000023143) TBC1D5 (ENSCHIG00000022282) #15 PLCL2 (ENSCHIG00000010205) #16 DAZL (ENSCHIG00000017877) #17 RFTN1 (ENSCHIG00000013091) #18 OXNAD1 (ENSCHIG00000027046) #19 DPH3 (ENSCHIG00000016516) #20 GALNT15 (ENSCHIG00000012848) #21 ANKRD28 (ENSCHIG00000022112) #22 BTD (ENSCHIG00000014947) #23 HACL1 (ENSCHIG00000013034) #24 COLQ (ENSCHIG00000012168) #25 EAF1 (ENSCHIG00000024831) #26 METTL6 (ENSCHIG00000021242) #27 SH3BP5 (ENSCHIG00000007654) #28 CAPN7 (ENSCHIG00000022356) #29 COL6A5 (ENSCHIG00000010899) #30 ENSCHIG00000027271 COL6A6 (ENSCHIG00000018630) ENSCHIG00000025923 ETS2 (ENSCHIG00000015389) ERG (ENSCHIG00000011764) KCNJ15 (ENSCHIG00000019214) KCNJ6 (ENSCHIG00000023184) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES ENSOARG00020000700 ZNF596 (ENSOARG00020000680) ENSOARG00020000663 SGO1 (ENSOARG00020000404) KAT2B (ENSOARG00020000211) RAB5A (ENSOARG00020000129) EFHB (ENSOARG00020000122) SATB1 (ENSOARG00020022035) TBC1D5 (ENSOARG00020021801) #15 PLCL2 (ENSOARG00020021690) #16 ENSOARG00020021565 #17 RFTN1 (ENSOARG00020021528) #18 OXNAD1 (ENSOARG00020021467) #19 ENSOARG00020021433 ANKRD28 (ENSOARG00020020797) #22 ENSOARG00020020758 BTD (ENSOARG00020020641) #23 HACL1 (ENSOARG00020020063) #24 COLQ (ENSOARG00020019567) #25 EAF1 (ENSOARG00020019515) #26 METTL6 (ENSOARG00020019436) #27 SH3BP5 (ENSOARG00020019355) #28 CAPN7 (ENSOARG00020019235) #29 COL6A5 (ENSOARG00020019139) #30 COL6A6 (ENSOARG00020018833) PIK3R4 (ENSOARG00020018400) ETS2 (ENSOARG00020018270) ERG (ENSOARG00020017961) KCNJ15 (ENSOARG00020017911) KCNJ6 (ENSOARG00020017811) Siberian musk deer MODERN SPECIES 1179 KCNH8 (ENSMMSG00000021994) ENSMMSG00000021976 SATB1 (ENSMMSG00000021945) TBC1D5 (ENSMMSG00000021871) #15 PLCL2 (ENSMMSG00000021824) #16 ENSMMSG00000021788 #17 RFTN1 (ENSMMSG00000021767) #18 OXNAD1 (ENSMMSG00000021736) #19 DPH3 (ENSMMSG00000021713) #20 GALNT15 (ENSMMSG00000021671) #21 ANKRD28 (ENSMMSG00000021499) #22 BTD (ENSMMSG00000021460) #23 HACL1 (ENSMMSG00000021383) #24 COLQ (ENSMMSG00000020685) #25 EAF1 (ENSMMSG00000020617) #26 METTL6 (ENSMMSG00000020555) #27 SH3BP5 (ENSMMSG00000020492) #28 CAPN7 (ENSMMSG00000020429) #29 ENSMMSG00000020401 COL6A5 (ENSMMSG00000020230) #30 COL6A6 (ENSMMSG00000020084) PIK3R4 (ENSMMSG00000019999) ETS2 (ENSMMSG00000019912) ERG (ENSMMSG00000019738) KCNJ15 (ENSMMSG00000019718) Yarkand deer MODERN SPECIES 10 KAT2B (ENSCHYG00000018554) PP2D1 (ENSCHYG00000018405) RAB5A (ENSCHYG00000018319) EFHB (ENSCHYG00000017996) ENSCHYG00000017953 KCNH8 (ENSCHYG00000017889) ENSCHYG00000017861 SATB1 (ENSCHYG00000017752) TBC1D5 (ENSCHYG00000017550) #15 PLCL2 (ENSCHYG00000017252) #16 ENSCHYG00000017075 #17 RFTN1 (ENSCHYG00000016683) #18 OXNAD1 (ENSCHYG00000016543) #19 DPH3 (ENSCHYG00000016462) #20 GALNT15 (ENSCHYG00000016130) #21 ANKRD28 (ENSCHYG00000014677) #22 BTD (ENSCHYG00000014404) #23 ENSCHYG00000014376 HACL1 (ENSCHYG00000011632) #24 COLQ (ENSCHYG00000011149) #25 ENSCHYG00000011089 EAF1 (ENSCHYG00000011048) #26 METTL6 (ENSCHYG00000010912) #27 SH3BP5 (ENSCHYG00000010811) #28 CAPN7 (ENSCHYG00000010535) #29 ENSCHYG00000010481 COL6A5 (ENSCHYG00000009969) #30 COL6A6 (ENSCHYG00000009757) PIK3R4 (ENSCHYG00000009005) ENSCHYG00000008930 ETS2 (ENSCHYG00000008759) Camelidae ANCESTRAL SPECIES 92 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.A ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00940000169811 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 ENSGT00390000016224.j.a ENSGT00390000011422 ENSGT00940000155519 Arabian camel MODERN SPECIES ENSCDRG00005003293 KAT2B (ENSCDRG00005002364) PP2D1 (ENSCDRG00005002250) RAB5A (ENSCDRG00005002235) EFHB (ENSCDRG00005002193) KCNH8 (ENSCDRG00005002155) SATB1 (ENSCDRG00005002136) ENSCDRG00005002109 TBC1D5 (ENSCDRG00005002049) #15 PLCL2 (ENSCDRG00005002032) #16 ENSCDRG00005002024 #17 RFTN1 (ENSCDRG00005002002) #18 OXNAD1 (ENSCDRG00005001933) #19 DPH3 (ENSCDRG00005001905) #20 GALNT15 (ENSCDRG00005001875) #21 ANKRD28 (ENSCDRG00005001643) #22 BTD (ENSCDRG00005001581) #23 HACL1 (ENSCDRG00005001449) #24 COLQ (ENSCDRG00005001323) #25 EAF1 (ENSCDRG00005001289) #26 SH3BP5 (ENSCDRG00005001218) #28 CAPN7 (ENSCDRG00005001146) #29 COL6A5 (ENSCDRG00005000604) #30 COL6A6 (ENSCDRG00005000408) PIK3R4 (ENSCDRG00005000341) ATP2C1 (ENSCDRG00005000079) ASTE1 (ENSCDRG00005000027) NEK11 (ENSCDRG00005000023) NUDT16 (ENSCDRG00005000015) MRPL3 (ENSCDRG00005000012) CPNE4 (ENSCDRG00005000010) Alpaca MODERN SPECIES 2839 ANKRD28 (ENSVPAG00000007224) #22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 122 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182908.C #22 Sloth MODERN SPECIES 7660 ANKRD28 (ENSCHOG00000012451) #22 Armadillo MODERN SPECIES 4626 ANKRD28 (ENSDNOG00000024373) #22 ENSDNOG00000041762 HACL1 (ENSDNOG00000033965) #24 ENSDNOG00000005444 #26 METTL6 (ENSDNOG00000038011) #27 SH3BP5 (ENSDNOG00000042790) #28 CAPN7 (ENSDNOG00000013353) #29 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 149 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 153 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 Elephant MODERN SPECIES 9 ANKRD28 (ENSLAFG00000012337) #22 BTD (ENSLAFG00000032188) #23 HACL1 (ENSLAFG00000017216) #24 COLQ (ENSLAFG00000006153) #25 EAF1 (ENSLAFG00000006152) #26 METTL6 (ENSLAFG00000006149) #27 SH3BP5 (ENSLAFG00000014639) #28 CAPN7 (ENSLAFG00000010045) #29 ENSLAFG00000028757 COL6A5 (ENSLAFG00000029126) #30 ENSLAFG00000014767 COL6A6 (ENSLAFG00000004730) PIK3R4 (ENSLAFG00000009809) ATP2C1 (ENSLAFG00000012428) ASTE1 (ENSLAFG00000012435) ENSLAFG00000012436 Hyrax MODERN SPECIES 7212 ANKRD28 (ENSPCAG00000001459) #22 Tenrec MODERN SPECIES 8624 ANKRD28 (ENSETEG00000017760) #22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b.h #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00390000017724.a.a.b #26 ENSGT00390000017724.a.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b.h #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00390000017724.a.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 ENSGT00390000011422 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b.h #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00390000017724.a.a.a.a #26 ENSGT00940000156679 #27 ENSGT00390000018500.b #28 ENSGT00940000155892 #29 ENSGT00940000163168 ENSGT00940000162990 #30 ENSGT00940000164180 ENSGT00940000155619 ENSGT00390000016225 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 ENSGT00390000011422 koala MODERN SPECIES 28 KAT2B (ENSPCIG00000018318) ENSPCIG00000018319 RAB5A (ENSPCIG00000018321) EFHB (ENSPCIG00000018324) KCNH8 (ENSPCIG00000018327) ENSPCIG00000011063 TBC1D5 (ENSPCIG00000028315) #15 PLCL2 (ENSPCIG00000028319) #16 ENSPCIG00000033048 ENSPCIG00000028322 #17 RFTN1 (ENSPCIG00000034556) #18 ENSPCIG00000033229 OXNAD1 (ENSPCIG00000028177) #19 ENSPCIG00000028178 #20 GALNT15 (ENSPCIG00000028179) #21 ANKRD28 (ENSPCIG00000027832) #22 ENSPCIG00000032970 #23 HACL1 (ENSPCIG00000027834) #24 ENSPCIG00000027839 #26 METTL6 (ENSPCIG00000027841) #27 SH3BP5 (ENSPCIG00000027843) #28 CAPN7 (ENSPCIG00000027846) #29 ENSPCIG00000035105 ENSPCIG00000027854 #30 ENSPCIG00000027858 ENSPCIG00000034620 COL6A6 (ENSPCIG00000027869) PIK3R4 (ENSPCIG00000027899) ATP2C1 (ENSPCIG00000008799) ASTE1 (ENSPCIG00000008797) NEK11 (ENSPCIG00000008796) Common wonbat MODERN SPECIES 1036 ENSVURG00010022364 KAT2B (ENSVURG00010022260) ENSVURG00010022246 RAB5A (ENSVURG00010022243) EFHB (ENSVURG00010022239) KCNH8 (ENSVURG00010022228) ENSVURG00010022223 TBC1D5 (ENSVURG00010022214) #15 ENSVURG00010022210 PLCL2 (ENSVURG00010022207) #16 ENSVURG00010022194 #17 ENSVURG00010022189 #18 OXNAD1 (ENSVURG00010022184) #19 ENSVURG00010022180 GALNT15 (ENSVURG00010022172) #21 ANKRD28 (ENSVURG00010022148) #22 BTD (ENSVURG00010022127) #23 HACL1 (ENSVURG00010022114) #24 ENSVURG00010022112 #26 METTL6 (ENSVURG00010022110) #27 SH3BP5 (ENSVURG00010022104) #28 CAPN7 (ENSVURG00010022094) #29 ENSVURG00010022080 ENSVURG00010022059 #30 ENSVURG00010022053 COL6A6 (ENSVURG00010022049) PIK3R4 (ENSVURG00010022040) ATP2C1 (ENSVURG00010022007) ASTE1 (ENSVURG00010021996) NEK11 (ENSVURG00010021990) MRPL3 (ENSVURG00010021984) Wallaby MODERN SPECIES 10219 ANKRD28 (ENSMEUG00000016361) #22 Tasmanian devil MODERN SPECIES 4 ENSSHAG00000026012 ENSSHAG00000008910 KAT2B (ENSSHAG00000008162) ENSSHAG00000007207 RAB5A (ENSSHAG00000029470) ENSSHAG00000006023 KCNH8 (ENSSHAG00000008165) ENSSHAG00000015368 TBC1D5 (ENSSHAG00000011231) #15 PLCL2 (ENSSHAG00000007849) #16 ENSSHAG00000005944 #17 RFTN1 (ENSSHAG00000001247) #18 OXNAD1 (ENSSHAG00000031847) #19 ENSSHAG00000027017 GALNT15 (ENSSHAG00000020534) #21 ANKRD28 (ENSSHAG00000002238) #22 BTD (ENSSHAG00000031301) #23 HACL1 (ENSSHAG00000003429) #24 COLQ (ENSSHAG00000026105) #25 ENSSHAG00000006597 #26 METTL6 (ENSSHAG00000006443) #27 ENSSHAG00000028238 #28 ENSSHAG00000003266 #29 ENSSHAG00000000658 ENSSHAG00000022509 #30 COL6A6 (ENSSHAG00000008975) PIK3R4 (ENSSHAG00000008449) ATP2C1 (ENSSHAG00000006195) ASTE1 (ENSSHAG00000005869) NEK11 (ENSSHAG00000000350) MRPL3 (ENSSHAG00000026891) Opossum MODERN SPECIES 7 KAT2B (ENSMODG00000014806) ENSMODG00000014795 RAB5A (ENSMODG00000014793) ENSMODG00000014789 ENSMODG00000027853 KCNH8 (ENSMODG00000014786) ENSMODG00000014765 TBC1D5 (ENSMODG00000014750) #15 PLCL2 (ENSMODG00000014736) #16 ENSMODG00000014730 #17 RFTN1 (ENSMODG00000014607) #18 OXNAD1 (ENSMODG00000014601) #19 ENSMODG00000025472 #20 ENSMODG00000037052 #21 ENSMODG00000014591 ANKRD28 (ENSMODG00000014582) #22 BTD (ENSMODG00000014571) #23 ENSMODG00000014566 #24 COLQ (ENSMODG00000014557) #25 EAF1 (ENSMODG00000014543) #26 METTL6 (ENSMODG00000014536) #27 SH3BP5 (ENSMODG00000014532) #28 CAPN7 (ENSMODG00000014524) #29 ENSMODG00000029678 ENSMODG00000028047 ENSMODG00000013209 ENSMODG00000013205 PIK3R4 (ENSMODG00000012017) ATP2C1 (ENSMODG00000011991) ASTE1 (ENSMODG00000011917) ENSMODG00000029316 Platypus MODERN SPECIES 19 ZNF385D (ENSOANG00000004985) ENSOANG00000004986 KAT2B (ENSOANG00000004987) ENSOANG00000004988 RAB5A (ENSOANG00000004989) KCNH8 (ENSOANG00000004990) ENSOANG00000004992 TBC1D5 (ENSOANG00000004993) #15 PLCL2 (ENSOANG00000011166) #16 ENSOANG00000006742 #17 RFTN1 (ENSOANG00000006743) #18 ENSOANG00000006744 #19 DPH3 (ENSOANG00000036430) #20 ENSOANG00000006745 GALNT15 (ENSOANG00000006746) #21 ANKRD28 (ENSOANG00000006747) #22 ENSOANG00000048515 #23 HACL1 (ENSOANG00000006750) #24 COLQ (ENSOANG00000048600) #25 EAF1 (ENSOANG00000006754) #26 METTL6 (ENSOANG00000006755) #27 SH3BP5 (ENSOANG00000006756) #28 CAPN7 (ENSOANG00000006757) #29 ENSOANG00000006760 COL6A6 (ENSOANG00000006761) PIK3R4 (ENSOANG00000006762) ATP2C1 (ENSOANG00000006763) ASTE1 (ENSOANG00000006766) NEK11 (ENSOANG00000006767) MRPL3 (ENSOANG00000006770) CPNE4 (ENSOANG00000006772) Sauria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT00940000154534.b.b ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00940000171365 ENSGT00390000003635 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00390000009313.j ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00940000171365 ENSGT00390000003635 Archosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a Aves ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 Neognathae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 Galloanserae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 Anatidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00940000168259 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 Pink-footed goose MODERN SPECIES ZNF385D (ENSABRG00000006672) SGO1 (ENSABRG00000006726) KAT2B (ENSABRG00000006750) PP2D1 (ENSABRG00000006767) RAB5A (ENSABRG00000006776) ENSABRG00000006786 KCNH8 (ENSABRG00000006793) ENSABRG00000006820 TBC1D5 (ENSABRG00000006845) #15 PLCL2 (ENSABRG00000006870) #16 ENSABRG00000006879 #17 RFTN1 (ENSABRG00000006885) #18 OXNAD1 (ENSABRG00000006891) #19 DPH3 (ENSABRG00000006895) #20 GALNT15 (ENSABRG00000006903) #21 ANKRD28 (ENSABRG00000007037) #22 BTD (ENSABRG00000008195) #23 HACL1 (ENSABRG00000008288) #24 COLQ (ENSABRG00000009915) #25 PLEKHA8 (ENSABRG00000009927) FKBP14 (ENSABRG00000009950) SCRN1 (ENSABRG00000009959) WIPF3 (ENSABRG00000009966) ENSABRG00000009970 CHN2 (ENSABRG00000009976) TRIL (ENSABRG00000009999) CREB5 (ENSABRG00000010020) JAZF1 (ENSABRG00000010106) TAX1BP1 (ENSABRG00000010126) HIBADH (ENSABRG00000010163) EVX1 (ENSABRG00000010188) Duck MODERN SPECIES 10 ZNF385D (ENSAPLG00000011365) SGO1 (ENSAPLG00000012083) KAT2B (ENSAPLG00000012109) PP2D1 (ENSAPLG00000012677) RAB5A (ENSAPLG00000020042) ENSAPLG00000026271 KCNH8 (ENSAPLG00000013144) ENSAPLG00000009362 TBC1D5 (ENSAPLG00000015790) #15 PLCL2 (ENSAPLG00000015653) #16 ENSAPLG00000007738 #17 RFTN1 (ENSAPLG00000007977) #18 OXNAD1 (ENSAPLG00000008159) #19 DPH3 (ENSAPLG00000008234) #20 GALNT15 (ENSAPLG00000010884) #21 ANKRD28 (ENSAPLG00000002501) #22 BTD (ENSAPLG00000003612) #23 HACL1 (ENSAPLG00000003680) #24 COLQ (ENSAPLG00000004158) #25 PLEKHA8 (ENSAPLG00000004301) FKBP14 (ENSAPLG00000004374) SCRN1 (ENSAPLG00000004515) WIPF3 (ENSAPLG00000028949) ENSAPLG00000021266 CHN2 (ENSAPLG00000004770) TRIL (ENSAPLG00000027101) CREB5 (ENSAPLG00000004960) JAZF1 (ENSAPLG00000014482) TAX1BP1 (ENSAPLG00000010659) HIBADH (ENSAPLG00000010878) EVX1 (ENSAPLG00000020631) Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 Japanese quail MODERN SPECIES 11 ENSCJPG00005012593 SGO1 (ENSCJPG00005012590) KAT2B (ENSCJPG00005012589) PP2D1 (ENSCJPG00005012588) RAB5A (ENSCJPG00005012587) EFHB (ENSCJPG00005012586) KCNH8 (ENSCJPG00005012584) ENSCJPG00005012578 TBC1D5 (ENSCJPG00005012576) #15 PLCL2 (ENSCJPG00005012574) #16 ENSCJPG00005012572 #17 RFTN1 (ENSCJPG00005012571) #18 OXNAD1 (ENSCJPG00005012570) #19 ENSCJPG00005012569 GALNT15 (ENSCJPG00005012568) #21 ANKRD28 (ENSCJPG00005012567) #22 BTD (ENSCJPG00005012566) #23 HACL1 (ENSCJPG00005012565) #24 COLQ (ENSCJPG00005012564) #25 PLEKHA8 (ENSCJPG00005012563) FKBP14 (ENSCJPG00005012562) SCRN1 (ENSCJPG00005012561) WIPF3 (ENSCJPG00005012560) ENSCJPG00005012557 CHN2 (ENSCJPG00005012556) TRIL (ENSCJPG00005012555) CREB5 (ENSCJPG00005012554) ENSCJPG00005012552 JAZF1 (ENSCJPG00005012550) TAX1BP1 (ENSCJPG00005012549) HIBADH (ENSCJPG00005012548) Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 Chicken MODERN SPECIES 11 ZNF385D (ENSGALG00010001639) SGO1 (ENSGALG00010001783) KAT2B (ENSGALG00010001778) PP2D1 (ENSGALG00010001770) RAB5A (ENSGALG00010001760) EFHB (ENSGALG00010001750) KCNH8 (ENSGALG00010001747) SATB1 (ENSGALG00010001741) TBC1D5 (ENSGALG00010001521) #15 PLCL2 (ENSGALG00010001512) #16 DAZL (ENSGALG00010002294) #17 RFTN1 (ENSGALG00010002247) #18 OXNAD1 (ENSGALG00010002226) #19 DPH3P1 (ENSGALG00010002206) GALNT15 (ENSGALG00010002159) #21 ANKRD28 (ENSGALG00010002134) #22 BTD (ENSGALG00010002100) #23 HACL1 (ENSGALG00010002084) #24 COLQ (ENSGALG00010002005) #25 PLEKHA8 (ENSGALG00010001969) FKBP14 (ENSGALG00010001386) SCRN1 (ENSGALG00010001380) WIPF3 (ENSGALG00010001368) ENSGALG00010002631 CHN2 (ENSGALG00010001585) CHN2 (ENSGALG00010002992) TRIL (ENSGALG00010001716) CREB5 (ENSGALG00010001711) JAZF1 (ENSGALG00010001458) TAX1BP1 (ENSGALG00010001453) HIBADH (ENSGALG00010001363) Turkey MODERN SPECIES 26 ENSMGAG00000010703 ENSMGAG00000010706 ENSMGAG00000019096 ENSMGAG00000010713 ENSMGAG00000020612 ENSMGAG00000017596 ENSMGAG00000010729 ENSMGAG00000010740 ENSMGAG00000019537 CHN2 (ENSMGAG00000010748) ENSMGAG00000010774 ENSMGAG00000010766 FKBP14 (ENSMGAG00000010782) ENSMGAG00000010801 #25 ENSMGAG00000010790 ANKRD28 (ENSMGAG00000010846) #22 ENSMGAG00000010836 #23 HACL1 (ENSMGAG00000010817) #24 ENSMGAG00000019530 OXNAD1 (ENSMGAG00000010908) #19 ENSMGAG00000020455 #20 GALNT15 (ENSMGAG00000010891) #21 ENSMGAG00000021001 #18 ENSMGAG00000010878 #17 ENSMGAG00000010925 #16 ENSMGAG00000018979 ENSMGAG00000018008 #15 ENSMGAG00000010929 ENSMGAG00000022453 ENSMGAG00000019703 ENSMGAG00000010970 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000160242 ENSGT01080000259642 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 Golden eagle MODERN SPECIES 19 ZNF385D (ENSACCG00020012382) ENSACCG00020012400 KAT2B (ENSACCG00020012524) PP2D1 (ENSACCG00020012744) RAB5A (ENSACCG00020012757) ENSACCG00020012772 KCNH8 (ENSACCG00020012790) ENSACCG00020012827 TBC1D5 (ENSACCG00020012882) #15 PLCL2 (ENSACCG00020012951) #16 ENSACCG00020012975 #17 RFTN1 (ENSACCG00020013002) #18 OXNAD1 (ENSACCG00020013025) #19 DPH3 (ENSACCG00020013042) #20 GALNT15 (ENSACCG00020013056) #21 ANKRD28 (ENSACCG00020013115) #22 BTD (ENSACCG00020013145) #23 HACL1 (ENSACCG00020013198) #24 COLQ (ENSACCG00020013232) #25 PLEKHA8 (ENSACCG00020013248) FKBP14 (ENSACCG00020013297) SCRN1 (ENSACCG00020013307) WIPF3 (ENSACCG00020013321) ENSACCG00020013336 CHN2 (ENSACCG00020013356) ENSACCG00020013394 CREB5 (ENSACCG00020013419) JAZF1 (ENSACCG00020013461) TAX1BP1 (ENSACCG00020013544) HIBADH (ENSACCG00020013605) EVX1 (ENSACCG00020013622) Kakapo MODERN SPECIES UBE2E1 (ENSSHBG00005002683) ZNF385D (ENSSHBG00005002626) ENSSHBG00005002607 KAT2B (ENSSHBG00005002267) RAB5A (ENSSHBG00005002167) ENSSHBG00005002156 KCNH8 (ENSSHBG00005002135) ENSSHBG00005002053 TBC1D5 (ENSSHBG00005002014) #15 PLCL2 (ENSSHBG00005001968) #16 ENSSHBG00005001940 #17 RFTN1 (ENSSHBG00005001920) #18 OXNAD1 (ENSSHBG00005001891) #19 DPH3 (ENSSHBG00005001859) #20 GALNT15 (ENSSHBG00005001840) #21 ANKRD28 (ENSSHBG00005001812) #22 BTD (ENSSHBG00005001779) #23 HACL1 (ENSSHBG00005001594) #24 COLQ (ENSSHBG00005001473) #25 PLEKHA8 (ENSSHBG00005001444) FKBP14 (ENSSHBG00005001421) SCRN1 (ENSSHBG00005001403) WIPF3 (ENSSHBG00005001360) ENSSHBG00005001346 CHN2 (ENSSHBG00005001335) ENSSHBG00005001318 TRIL (ENSSHBG00005001311) CREB5 (ENSSHBG00005001299) JAZF1 (ENSSHBG00005001291) TAX1BP1 (ENSSHBG00005001265) HIBADH (ENSSHBG00005000011) Passeriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121.b #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121.b #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121.b #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 Common canary MODERN SPECIES 5 UBE2E2 (ENSSCAG00000015285) ZNF385D (ENSSCAG00000015281) SGO1 (ENSSCAG00000015278) KAT2B (ENSSCAG00000015226) RAB5A (ENSSCAG00000015213) ENSSCAG00000015212 KCNH8 (ENSSCAG00000015206) ENSSCAG00000015196 TBC1D5 (ENSSCAG00000015186) #15 PLCL2 (ENSSCAG00000015180) #16 ENSSCAG00000015174 #17 RFTN1 (ENSSCAG00000015166) #18 OXNAD1 (ENSSCAG00000015162) #19 DPH3 (ENSSCAG00000015155) #20 GALNT15 (ENSSCAG00000015152) #21 ANKRD28 (ENSSCAG00000015148) #22 BTD (ENSSCAG00000015144) #23 HACL1 (ENSSCAG00000015140) #24 PLEKHA8 (ENSSCAG00000015137) FKBP14 (ENSSCAG00000015135) SCRN1 (ENSSCAG00000015131) WIPF3 (ENSSCAG00000015128) ENSSCAG00000015122 CHN2 (ENSSCAG00000015120) ENSSCAG00000015114 CREB5 (ENSSCAG00000015109) JAZF1 (ENSSCAG00000015103) TAX1BP1 (ENSSCAG00000015090) HIBADH (ENSSCAG00000015082) EVX1 (ENSSCAG00000015076) HOXA13 (ENSSCAG00000015071) Zebra finch MODERN SPECIES 12 NKIRAS1 (ENSTGUG00000026551) UBE2E1 (ENSTGUG00000003303) ENSTGUG00000003279 SGO1 (ENSTGUG00000003277) KAT2B (ENSTGUG00000003246) RAB5A (ENSTGUG00000003236) EFHB (ENSTGUG00000003223) KCNH8 (ENSTGUG00000003211) ENSTGUG00000003198 TBC1D5 (ENSTGUG00000003159) #15 PLCL2 (ENSTGUG00000003154) #16 ENSTGUG00000003145 #17 RFTN1 (ENSTGUG00000003139) #18 OXNAD1 (ENSTGUG00000003132) #19 GALNT15 (ENSTGUG00000003115) #21 ANKRD28 (ENSTGUG00000003060) #22 BTD (ENSTGUG00000023167) #23 HACL1 (ENSTGUG00000003040) #24 COLQ (ENSTGUG00000003015) #25 PLEKHA8 (ENSTGUG00000002993) FKBP14 (ENSTGUG00000029292) SCRN1 (ENSTGUG00000002975) WIPF3 (ENSTGUG00000002969) ENSTGUG00000026485 CHN2 (ENSTGUG00000026687) TRIL (ENSTGUG00000025309) CREB5 (ENSTGUG00000002959) ENSTGUG00000002953 TAX1BP1 (ENSTGUG00000002932) HIBADH (ENSTGUG00000002930) EVX1 (ENSTGUG00000002928) Medium ground finch MODERN SPECIES 36 SGO1 (ENSGFOG00000006618) KAT2B (ENSGFOG00000006661) RAB5A (ENSGFOG00000007671) ENSGFOG00000007686 KCNH8 (ENSGFOG00000007725) ENSGFOG00000007747 TBC1D5 (ENSGFOG00000007796) #15 PLCL2 (ENSGFOG00000007823) #16 ENSGFOG00000007838 ENSGFOG00000007844 #17 RFTN1 (ENSGFOG00000007850) #18 OXNAD1 (ENSGFOG00000007863) #19 DPH3 (ENSGFOG00000007882) #20 GALNT15 (ENSGFOG00000007892) #21 ANKRD28 (ENSGFOG00000007988) #22 BTD (ENSGFOG00000009184) #23 HACL1 (ENSGFOG00000009191) #24 PLEKHA8 (ENSGFOG00000009202) FKBP14 (ENSGFOG00000009209) SCRN1 (ENSGFOG00000009219) CHN2 (ENSGFOG00000009230) ENSGFOG00000009247 CREB5 (ENSGFOG00000009281) JAZF1 (ENSGFOG00000009394) TAX1BP1 (ENSGFOG00000009405) HIBADH (ENSGFOG00000009445) ENSGFOG00000009454 EVX1 (ENSGFOG00000009462) HOXA11 (ENSGFOG00000009470) ENSGFOG00000009475 Flycatcher MODERN SPECIES 11 THRB (ENSFALG00000009204) NR1D2 (ENSFALG00000009205) RPL15 (ENSFALG00000028769) NKIRAS1 (ENSFALG00000028782) UBE2E1 (ENSFALG00000009215) ZNF385D (ENSFALG00000009217) SGO1 (ENSFALG00000009218) KAT2B (ENSFALG00000009224) RAB5A (ENSFALG00000009239) ENSFALG00000009245 KCNH8 (ENSFALG00000009249) ENSFALG00000009258 ENSFALG00000009266 #15 DPH3 (ENSFALG00000009270) #20 GALNT15 (ENSFALG00000009272) #21 ANKRD28 (ENSFALG00000009274) #22 BTD (ENSFALG00000009277) #23 HACL1 (ENSFALG00000009284) #24 COLQ (ENSFALG00000009294) #25 PLEKHA8 (ENSFALG00000009310) FKBP14 (ENSFALG00000009320) SCRN1 (ENSFALG00000009333) ENSFALG00000023338 CHN2 (ENSFALG00000009343) ENSFALG00000027482 ENSFALG00000026141 CREB5 (ENSFALG00000009349) JAZF1 (ENSFALG00000026296) TAX1BP1 (ENSFALG00000009370) HIBADH (ENSFALG00000009376) EVX1 (ENSFALG00000009382) Great tit MODERN SPECIES 11 ENSPMJG00000003694 ENSPMJG00000003683 SGO1 (ENSPMJG00000003626) KAT2B (ENSPMJG00000003620) RAB5A (ENSPMJG00000003611) ENSPMJG00000003560 KCNH8 (ENSPMJG00000003557) ENSPMJG00000003421 TBC1D5 (ENSPMJG00000003296) #15 PLCL2 (ENSPMJG00000002992) #16 ENSPMJG00000002924 #17 RFTN1 (ENSPMJG00000002904) #18 OXNAD1 (ENSPMJG00000002891) #19 DPH3 (ENSPMJG00000002879) #20 GALNT15 (ENSPMJG00000002873) #21 ANKRD28 (ENSPMJG00000002681) #22 BTD (ENSPMJG00000002679) #23 HACL1 (ENSPMJG00000002663) #24 COLQ (ENSPMJG00000002497) #25 PLEKHA8 (ENSPMJG00000002463) FKBP14 (ENSPMJG00000002458) SCRN1 (ENSPMJG00000002451) WIPF3 (ENSPMJG00000002436) ENSPMJG00000002419 ENSPMJG00000002395 CHN2 (ENSPMJG00000002367) TRIL (ENSPMJG00000002329) CREB5 (ENSPMJG00000002248) JAZF1 (ENSPMJG00000002239) TAX1BP1 (ENSPMJG00000001572) HIBADH (ENSPMJG00000001562) African ostrich MODERN SPECIES 661 ZNF385D (ENSSCUG00000011007) SGO1 (ENSSCUG00000011016) KAT2B (ENSSCUG00000011021) PP2D1 (ENSSCUG00000011031) RAB5A (ENSSCUG00000011033) EFHB (ENSSCUG00000011035) KCNH8 (ENSSCUG00000011037) ENSSCUG00000011041 TBC1D5 (ENSSCUG00000011046) #15 PLCL2 (ENSSCUG00000011057) #16 ENSSCUG00000011060 #17 RFTN1 (ENSSCUG00000011064) #18 OXNAD1 (ENSSCUG00000011070) #19 GALNT15 (ENSSCUG00000011075) #21 ANKRD28 (ENSSCUG00000006834) #22 BTD (ENSSCUG00000006840) #23 HACL1 (ENSSCUG00000006843) #24 COLQ (ENSSCUG00000006850) #25 PLEKHA8 (ENSSCUG00000006858) ENSSCUG00000006864 FKBP14 (ENSSCUG00000006867) ENSSCUG00000006869 SCRN1 (ENSSCUG00000006872) WIPF3 (ENSSCUG00000006876) CHN2 (ENSSCUG00000006879) ENSSCUG00000006886 CREB5 (ENSSCUG00000006888) JAZF1 (ENSSCUG00000006893) TAX1BP1 (ENSSCUG00000006898) HIBADH (ENSSCUG00000006903) Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES SGO1 (ENSCPRG00005001911) KAT2B (ENSCPRG00005001888) PP2D1 (ENSCPRG00005001820) RAB5A (ENSCPRG00005001816) EFHB (ENSCPRG00005001810) KCNH8 (ENSCPRG00005001753) ENSCPRG00005001584 TBC1D5 (ENSCPRG00005001492) #15 PLCL2 (ENSCPRG00005001400) #16 ENSCPRG00005001314 #17 RFTN1 (ENSCPRG00005001258) #18 OXNAD1 (ENSCPRG00005001257) #19 ENSCPRG00005001251 ENSCPRG00005001181 GALNT15 (ENSCPRG00005001164) #21 ANKRD28 (ENSCPRG00005001048) #22 BTD (ENSCPRG00005001046) #23 HACL1 (ENSCPRG00005001008) #24 COLQ (ENSCPRG00005000945) #25 PLEKHA8 (ENSCPRG00005000855) FKBP14 (ENSCPRG00005000846) SCRN1 (ENSCPRG00005000841) ENSCPRG00005000834 ENSCPRG00005000780 CHN2 (ENSCPRG00005000773) CPVL (ENSCPRG00005000643) ENSCPRG00005000637 ENSCPRG00005000571 CREB5 (ENSCPRG00005000565) JAZF1 (ENSCPRG00005000395) TAX1BP1 (ENSCPRG00005000237) Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00940000168259 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00390000009313.j ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00940000171365 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00940000168259 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00390000009313.j ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00940000157288.i ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00940000171365 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00940000168259 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00390000009313.j ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00940000157288.i ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00940000171365 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 2166 ENSCABG00000019247 #17 ENSCABG00000019248 #18 ENSCABG00000019249 #18 OXNAD1 (ENSCABG00000019252) #19 ENSCABG00000019254 DPH3 (ENSCABG00000019256) #20 ENSCABG00000019257 GALNT15 (ENSCABG00000019258) #21 ANKRD28 (ENSCABG00000019265) #22 BTD (ENSCABG00000000062) #23 ENSCABG00000000089 #24 COLQ (ENSCABG00000000097) #25 ENSCABG00000000115 Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 11 KAT2B (ENSGEVG00005008098) PP2D1 (ENSGEVG00005007987) RAB5A (ENSGEVG00005007969) ENSGEVG00005007928 KCNH8 (ENSGEVG00005007860) ENSGEVG00005007813 ENSGEVG00005007789 TBC1D5 (ENSGEVG00005007756) #15 PLCL2 (ENSGEVG00005007731) #16 ENSGEVG00005007633 #17 RFTN1 (ENSGEVG00005007575) #18 OXNAD1 (ENSGEVG00005007535) #19 DPH3 (ENSGEVG00005007515) #20 ENSGEVG00005007483 GALNT15 (ENSGEVG00005007399) #21 ANKRD28 (ENSGEVG00005007323) #22 BTD (ENSGEVG00005007298) #23 HACL1 (ENSGEVG00005007204) #24 COLQ (ENSGEVG00005007145) #25 PLEKHA8 (ENSGEVG00005007118) FKBP14 (ENSGEVG00005007097) SCRN1 (ENSGEVG00005007049) WIPF3 (ENSGEVG00005007035) ENSGEVG00005007021 CHN2 (ENSGEVG00005006883) ENSGEVG00005006833 ENSGEVG00005006804 CPVL (ENSGEVG00005006761) TRIL (ENSGEVG00005006732) ENSGEVG00005006725 CREB5 (ENSGEVG00005019423) Emydidae ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00390000009313.j ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00940000157288.i ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00940000171365 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a Three-toed box turtle MODERN SPECIES 30 ENSTMTG00000002650 KAT2B (ENSTMTG00000002662) PP2D1 (ENSTMTG00000002725) RAB5A (ENSTMTG00000002731) ENSTMTG00000002737 KCNH8 (ENSTMTG00000002744) ENSTMTG00000002760 TBC1D5 (ENSTMTG00000002777) #15 PLCL2 (ENSTMTG00000002794) #16 ENSTMTG00000002809 #17 RFTN1 (ENSTMTG00000002816) #18 OXNAD1 (ENSTMTG00000002822) #19 ENSTMTG00000002827 ENSTMTG00000002829 GALNT15 (ENSTMTG00000002833) #21 ANKRD28 (ENSTMTG00000002849) #22 BTD (ENSTMTG00000002858) #23 HACL1 (ENSTMTG00000002864) #24 COLQ (ENSTMTG00000002877) #25 PLEKHA8 (ENSTMTG00000002884) FKBP14 (ENSTMTG00000002892) SCRN1 (ENSTMTG00000002898) WIPF3 (ENSTMTG00000002904) ENSTMTG00000002909 CHN2 (ENSTMTG00000002915) CPVL (ENSTMTG00000002952) TRIL (ENSTMTG00000002957) CREB5 (ENSTMTG00000002964) ENSTMTG00000003001 JAZF1 (ENSTMTG00000003004) TAX1BP1 (ENSTMTG00000003013) painted turtle MODERN SPECIES 7 ENSCPBG00000022566 KAT2B (ENSCPBG00000022564) PP2D1 (ENSCPBG00000022561) RAB5A (ENSCPBG00000022559) ENSCPBG00000022555 KCNH8 (ENSCPBG00000022553) ENSCPBG00000022551 TBC1D5 (ENSCPBG00000022549) #15 PLCL2 (ENSCPBG00000022548) #16 ENSCPBG00000022547 #17 RFTN1 (ENSCPBG00000022546) #18 OXNAD1 (ENSCPBG00000022544) #19 DPH3 (ENSCPBG00000022542) #20 ENSCPBG00000022539 GALNT15 (ENSCPBG00000022536) #21 ANKRD28 (ENSCPBG00000022533) #22 BTD (ENSCPBG00000022532) #23 HACL1 (ENSCPBG00000022531) #24 COLQ (ENSCPBG00000022529) #25 FKBP14 (ENSCPBG00000022528) PLEKHA8 (ENSCPBG00000022526) SCRN1 (ENSCPBG00000022525) WIPF3 (ENSCPBG00000022524) ENSCPBG00000022523 CHN2 (ENSCPBG00000022522) CPVL (ENSCPBG00000022520) TRIL (ENSCPBG00000022519) CREB5 (ENSCPBG00000022518) JAZF1 (ENSCPBG00000022514) TAX1BP1 (ENSCPBG00000022513) HIBADH (ENSCPBG00000022512) Chinese turtle MODERN SPECIES 1869 SLC35G1 (ENSPSIG00000013667) LGI1 (ENSPSIG00000012944) FRA10AC1 (ENSPSIG00000012938) ENSPSIG00000012927 TBC1D5 (ENSPSIG00000011227) #15 ENSPSIG00000011207 PLCL2 (ENSPSIG00000010239) #16 ENSPSIG00000009803 #17 ENSPSIG00000000358 RFTN1 (ENSPSIG00000009596) #18 OXNAD1 (ENSPSIG00000009446) #19 DPH3 (ENSPSIG00000009436) #20 ENSPSIG00000009434 GALNT15 (ENSPSIG00000007294) #21 ANKRD28 (ENSPSIG00000007250) #22 BTD (ENSPSIG00000006873) #23 HACL1 (ENSPSIG00000006662) #24 COLQ (ENSPSIG00000017995) #25 PLEKHA8 (ENSPSIG00000017798) FKBP14 (ENSPSIG00000017755) SCRN1 (ENSPSIG00000017453) WIPF3 (ENSPSIG00000017225) CHN2 (ENSPSIG00000016284) CPVL (ENSPSIG00000015548) TRIL (ENSPSIG00000015545) CREB5 (ENSPSIG00000014715) JAZF1 (ENSPSIG00000014335) TAX1BP1 (ENSPSIG00000014263) HIBADH (ENSPSIG00000013677) ENSPSIG00000013655 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT00940000154534.b.b ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00940000171365 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a tuatara MODERN SPECIES 7 ENSSPUG00000001686 TBC1D5 (ENSSPUG00000001755) #15 PLCL2 (ENSSPUG00000001790) #16 ENSSPUG00000001799 #17 RFTN1 (ENSSPUG00000001829) #18 OXNAD1 (ENSSPUG00000001833) #19 DPH3 (ENSSPUG00000001843) #20 GALNT15 (ENSSPUG00000001851) #21 ANKRD28 (ENSSPUG00000001937) #22 BTD (ENSSPUG00000002404) #23 ENSSPUG00000002484 #24 ENSSPUG00000002495 #24 COLQ (ENSSPUG00000002500) #25 PLEKHA8 (ENSSPUG00000002533) ENSSPUG00000002554 SCRN1 (ENSSPUG00000002570) WIPF3 (ENSSPUG00000002603) PRR15 (ENSSPUG00000002614) CHN2 (ENSSPUG00000002626) CPVL (ENSSPUG00000002678) TRIL (ENSSPUG00000002723) CREB5 (ENSSPUG00000002731) ENSSPUG00000002800 ENSSPUG00000002816 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00390000009313.h.b ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 Elapidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01080000259642 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00390000009313.h.b.b ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802.v #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 Indian cobra DUPLICATION Indian cobra MODERN SPECIES 337 EFHB (ENSNNAG00000015590) ENSNNAG00000015574 KCNH8 (ENSNNAG00000015540) ENSNNAG00000015529 ENSNNAG00000015522 ENSNNAG00000015494 ENSNNAG00000015482 TBC1D5 (ENSNNAG00000015447) #15 PLCL2 (ENSNNAG00000015430) #16 ENSNNAG00000015397 #17 ENSNNAG00000015382 #18 ENSNNAG00000015354 #18 OXNAD1 (ENSNNAG00000015333) #19 ENSNNAG00000015323 ENSNNAG00000015275 #22 ENSNNAG00000015267 #22 BTD (ENSNNAG00000015172) #23 HACL1 (ENSNNAG00000014939) #24 COLQ (ENSNNAG00000014887) #25 PLEKHA8 (ENSNNAG00000014846) FKBP14 (ENSNNAG00000014798) SCRN1 (ENSNNAG00000014772) WIPF3 (ENSNNAG00000014763) ENSNNAG00000014741 ENSNNAG00000014734 ENSNNAG00000014715 CPVL (ENSNNAG00000014691) TRIL (ENSNNAG00000014682) CREB5 (ENSNNAG00000014560) ENSNNAG00000014538 TAX1BP1 (ENSNNAG00000014466) Indian cobra MODERN SPECIES 337 RAB5A (ENSNNAG00000015651) EFHB (ENSNNAG00000015590) ENSNNAG00000015574 KCNH8 (ENSNNAG00000015540) ENSNNAG00000015529 ENSNNAG00000015522 ENSNNAG00000015494 ENSNNAG00000015482 TBC1D5 (ENSNNAG00000015447) #15 PLCL2 (ENSNNAG00000015430) #16 ENSNNAG00000015397 #17 ENSNNAG00000015382 #18 ENSNNAG00000015354 #18 OXNAD1 (ENSNNAG00000015333) #19 ENSNNAG00000015323 ENSNNAG00000015275 #22 ENSNNAG00000015267 #22 BTD (ENSNNAG00000015172) #23 HACL1 (ENSNNAG00000014939) #24 COLQ (ENSNNAG00000014887) #25 PLEKHA8 (ENSNNAG00000014846) FKBP14 (ENSNNAG00000014798) SCRN1 (ENSNNAG00000014772) WIPF3 (ENSNNAG00000014763) ENSNNAG00000014741 ENSNNAG00000014734 ENSNNAG00000014715 CPVL (ENSNNAG00000014691) TRIL (ENSNNAG00000014682) CREB5 (ENSNNAG00000014560) ENSNNAG00000014538 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000160242 ENSGT01080000259642 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00390000009313.h.b.b ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802.v #24 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000155985.bc.b ENSGT00940000160242 ENSGT01080000259642 ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00390000009313.h.b.b ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802.v #24 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000164071 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 55 ZNF385D (ENSNSUG00000010394) ENSNSUG00000010439 ENSNSUG00000010440 PP2D1 (ENSNSUG00000010441) RAB5A (ENSNSUG00000010442) KCNH8 (ENSNSUG00000010443) ENSNSUG00000010445 ENSNSUG00000010446 TBC1D5 (ENSNSUG00000010455) #15 PLCL2 (ENSNSUG00000011589) #16 ENSNSUG00000011599 #17 RFTN1 (ENSNSUG00000011600) #18 OXNAD1 (ENSNSUG00000011609) #19 DPH3 (ENSNSUG00000011618) #20 ENSNSUG00000011620 ANKRD28 (ENSNSUG00000011629) #22 BTD (ENSNSUG00000011653) #23 HACL1 (ENSNSUG00000011654) #24 PLEKHA8 (ENSNSUG00000011655) FKBP14 (ENSNSUG00000011656) SCRN1 (ENSNSUG00000011662) WIPF3 (ENSNSUG00000011665) CHN2 (ENSNSUG00000011669) ENSNSUG00000011671 CPVL (ENSNSUG00000011672) TRIL (ENSNSUG00000011812) CREB5 (ENSNSUG00000011813) ENSNSUG00000011815 ENSNSUG00000011816 ENSNSUG00000011817 HIBADH (ENSNSUG00000011818) Eastern brown snake MODERN SPECIES 38 ENSPTXG00000015926 PP2D1 (ENSPTXG00000015930) RAB5A (ENSPTXG00000015932) ENSPTXG00000015936 KCNH8 (ENSPTXG00000015941) ENSPTXG00000015948 TBC1D5 (ENSPTXG00000015950) #15 PLCL2 (ENSPTXG00000015954) #16 ENSPTXG00000015957 ENSPTXG00000015959 #17 ENSPTXG00000015960 #18 ENSPTXG00000015962 #18 OXNAD1 (ENSPTXG00000015965) #19 DPH3 (ENSPTXG00000015967) #20 ENSPTXG00000015969 ANKRD28 (ENSPTXG00000015971) #22 BTD (ENSPTXG00000015972) #23 HACL1 (ENSPTXG00000015973) #24 PLEKHA8 (ENSPTXG00000015974) FKBP14 (ENSPTXG00000015975) SCRN1 (ENSPTXG00000015976) WIPF3 (ENSPTXG00000004460) CHN2 (ENSPTXG00000004466) CPVL (ENSPTXG00000004473) TRIL (ENSPTXG00000004476) CREB5 (ENSPTXG00000004478) JAZF1 (ENSPTXG00000004479) TAX1BP1 (ENSPTXG00000004481) HIBADH (ENSPTXG00000004483) EVX1 (ENSPTXG00000004485) ENSPTXG00000004487 Blue-lipped sea krait DUPLICATION Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 4327 ENSLLTG00000016410 #22 BTD (ENSLLTG00000016416) #23 Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 1235 ENSLLTG00000000889 #22 Lizard MODERN SPECIES 5 ENSACAG00000000018 KCNH8 (ENSACAG00000000019) ENSACAG00000007941 ENSACAG00000012672 ENSACAG00000040617 TBC1D5 (ENSACAG00000007864) #15 ENSACAG00000037902 ENSACAG00000039364 PLCL2 (ENSACAG00000007836) #16 ENSACAG00000007822 #17 RFTN1 (ENSACAG00000007784) #18 OXNAD1 (ENSACAG00000007757) #19 DPH3 (ENSACAG00000007752) #20 ENSACAG00000007746 GALNT15 (ENSACAG00000007710) #21 ANKRD28 (ENSACAG00000002496) #22 BTD (ENSACAG00000002449) #23 HACL1 (ENSACAG00000002368) #24 COLQ (ENSACAG00000002275) #25 PLEKHA8 (ENSACAG00000000988) FKBP14 (ENSACAG00000000953) ENSACAG00000041098 SCRN1 (ENSACAG00000000877) WIPF3 (ENSACAG00000000853) ENSACAG00000003118 ENSACAG00000035653 ENSACAG00000003100 ENSACAG00000043597 ENSACAG00000003049 ENSACAG00000002991 GGCT (ENSACAG00000002984) Laterata DUPLICATION Laterata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182908.C.o #22 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 47 PTPN20 (ENSSMRG00000022381) MAPK8 (ENSSMRG00000022382) WDFY4 (ENSSMRG00000022383) ENSSMRG00000022384 #22 LRRC18 (ENSSMRG00000022385) ENSSMRG00000022386 VSTM4 (ENSSMRG00000000009) C10orf71 (ENSSMRG00000000095) DRGX (ENSSMRG00000000119) ENSSMRG00000000182 ERCC6 (ENSSMRG00000000194) CXCL12 (ENSSMRG00000000252) TMEM72 (ENSSMRG00000000306) PAOX (ENSSMRG00000000331) MTG1 (ENSSMRG00000000344) CHUK (ENSSMRG00000000367) ENSSMRG00000000410 COG3 (ENSSMRG00000000420) SORBS1 (ENSSMRG00000000518) Laterata ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.a ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000007225 #20 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C.p #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT01030000235471 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 Common wall lizard MODERN SPECIES 3 ENSPMRG00000020429 RAB5A (ENSPMRG00000020406) EFHB (ENSPMRG00000020396) KCNH8 (ENSPMRG00000020383) ENSPMRG00000020377 ENSPMRG00000020366 ENSPMRG00000020361 TBC1D5 (ENSPMRG00000020314) #15 ENSPMRG00000020304 PLCL2 (ENSPMRG00000020299) #16 ENSPMRG00000020289 #17 RFTN1 (ENSPMRG00000020274) #18 OXNAD1 (ENSPMRG00000020264) #19 DPH3 (ENSPMRG00000020256) #20 GALNT15 (ENSPMRG00000020244) #21 ANKRD28 (ENSPMRG00000020179) #22 BTD (ENSPMRG00000020167) #23 ENSPMRG00000020164 HACL1 (ENSPMRG00000020129) #24 COLQ (ENSPMRG00000020111) #25 PLEKHA8 (ENSPMRG00000020103) FKBP14 (ENSPMRG00000020096) SCRN1 (ENSPMRG00000020090) WIPF3 (ENSPMRG00000020080) ENSPMRG00000020074 CHN2 (ENSPMRG00000017735) CPVL (ENSPMRG00000017701) TRIL (ENSPMRG00000017695) CREB5 (ENSPMRG00000017685) JAZF1 (ENSPMRG00000017671) TAX1BP1 (ENSPMRG00000017652) Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 5 KAT2B (ENSSMRG00000011638) PP2D1 (ENSSMRG00000011639) RAB5A (ENSSMRG00000011640) EFHB (ENSSMRG00000011641) ENSSMRG00000011642 KCNH8 (ENSSMRG00000011744) ENSSMRG00000011745 ENSSMRG00000011767 TBC1D5 (ENSSMRG00000011861) #15 PLCL2 (ENSSMRG00000000014) #16 ENSSMRG00000000066 #17 RFTN1 (ENSSMRG00000000291) #18 OXNAD1 (ENSSMRG00000000328) #19 DPH3 (ENSSMRG00000000343) #20 ENSSMRG00000000373 ANKRD28 (ENSSMRG00000000389) #22 BTD (ENSSMRG00000002412) #23 HACL1 (ENSSMRG00000002413) #24 COLQ (ENSSMRG00000002517) #25 PLEKHA8 (ENSSMRG00000002525) FKBP14 (ENSSMRG00000002542) SCRN1 (ENSSMRG00000002549) WIPF3 (ENSSMRG00000002554) ENSSMRG00000002559 CHN2 (ENSSMRG00000002579) ENSSMRG00000002597 CPVL (ENSSMRG00000002600) TRIL (ENSSMRG00000002616) CREB5 (ENSSMRG00000002892) JAZF1 (ENSSMRG00000002932) TAX1BP1 (ENSSMRG00000002937) Anura ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000155985 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.b ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.D ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT00940000154534.b.b ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a ENSGT00940000155255 Frog MODERN SPECIES 6 sgo1 (ENSXETG00000014009) kat2b (ENSXETG00000014008) pp2d1 (ENSXETG00000038157) rab5a (ENSXETG00000002305) efhb (ENSXETG00000033308) kcnh8 (ENSXETG00000014005) ENSXETG00000044139 ENSXETG00000036698 satb1 (ENSXETG00000009045) tbc1d5 (ENSXETG00000009047) #15 ENSXETG00000046622 plcl2 (ENSXETG00000009051) #16 rftn1 (ENSXETG00000033082) #18 oxnad1 (ENSXETG00000025778) #19 galnt15 (ENSXETG00000008988) #21 ankrd28 (ENSXETG00000008989) #22 btd (ENSXETG00000035930) #23 colq (ENSXETG00000008992) #24 plekha8 (ENSXETG00000008997) fkbp14 (ENSXETG00000008998) scrn1 (ENSXETG00000012057) prr15 (ENSXETG00000047208) wipf3 (ENSXETG00000012051) chn2 (ENSXETG00000012047) cpvl (ENSXETG00000012046) ENSXETG00000042712 tril (ENSXETG00000040671) creb5 (ENSXETG00000012041) ENSXETG00000046618 ENSXETG00000037596 vill (ENSXETG00000000754) Leishan spiny toad MODERN SPECIES 8 RAB5A (ENSLLEG00000014688) ENSLLEG00000014251 KCNH8 (ENSLLEG00000013837) ENSLLEG00000013792 ENSLLEG00000013631 ENSLLEG00000013583 ENSLLEG00000013533 TBC1D5 (ENSLLEG00000013413) #15 PLCL2 (ENSLLEG00000013245) #16 ENSLLEG00000013104 #17 RFTN1 (ENSLLEG00000013002) #18 ENSLLEG00000012981 OXNAD1 (ENSLLEG00000012884) #19 GALNT15 (ENSLLEG00000012781) #21 ENSLLEG00000012662 ANKRD28 (ENSLLEG00000012335) #22 BTD (ENSLLEG00000012283) #23 ENSLLEG00000012262 HACL1 (ENSLLEG00000011774) #24 COLQ (ENSLLEG00000011444) #25 PLEKHA8 (ENSLLEG00000011242) FKBP14 (ENSLLEG00000011179) SCRN1 (ENSLLEG00000011017) WIPF3 (ENSLLEG00000010864) PRR15 (ENSLLEG00000010846) CHN2 (ENSLLEG00000010376) ENSLLEG00000010320 CPVL (ENSLLEG00000009838) TRIL (ENSLLEG00000009710) CREB5 (ENSLLEG00000009663) ENSLLEG00000009644 Coelacanth MODERN SPECIES 1051 ENSLACG00000002895 #17 ENSLACG00000006795 OXNAD1 (ENSLACG00000008261) #19 ENSLACG00000009282 GALNT15 (ENSLACG00000009544) #21 ANKRD28 (ENSLACG00000012544) #22 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160242 ENSGT00940000154107.b ENSGT00940000154995 ENSGT00390000017863 ENSGT00940000154337 ENSGT00530000063528.A.b ENSGT00940000156869 ENSGT00390000008096.C ENSGT00940000157121 #15 ENSGT00940000155660.b #16 ENSGT00530000063480.b #17 ENSGT00530000063609.b #18 ENSGT00390000004280 #19 ENSGT00390000009313 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00940000171365 ENSGT00940000158311 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000009313 ENSGT00940000160808 #21 ENSGT00950000182908.C #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248 #25 ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858 ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000178886 ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a Osteoglossocephalai DUPLICATION Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00940000157827 ENSGT00940000162033.a.b ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163281.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000163281.b ENSGT00390000005553 ENSGT00940000161409 ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00940000154486.b.a.b ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858 ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000163268.d.b Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00390000000878 ENSGT00940000155137.b ENSGT00940000155137.a.b ENSGT00940000159108 ENSGT00940000157827 ENSGT00940000162033.a.b ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000163281.b ENSGT00390000005553 ENSGT00940000161409 ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00940000154486.b.a.b ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00390000018500.b.b.b #28 ENSGT00500000045044 ENSGT00940000159017.a.b ENSGT00650000093438 ENSGT00390000009631 ENSGT00940000169325 ENSGT00940000157432.B ENSGT01000000214440.A.a.a ENSGT00940000164984 ENSGT00940000157640 ENSGT00940000162584.j ENSGT00940000159017.a.a ENSGT00940000157845 ENSGT00500000044921.a Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 58 ENSGT00390000014833 ENSGT00390000000878 ENSGT00940000155137.b ENSGT01030000235040 ENSGT00940000155137.a.b ENSGT00940000159108 ENSGT00940000157827 ENSGT00940000162033.a.b ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000163281.b ENSGT00940000163002 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00390000018500.b.b.b #28 ENSGT00500000045044 ENSGT00940000159017.a.b ENSGT00940000162584.j ENSGT00940000159017.a.a ENSGT00940000157845 ENSGT00500000044921.a ENSGT00500000044921.b ENSGT00940000155873 ENSGT00940000155579.a ENSGT00940000159019 ENSGT00390000015114 ENSGT00390000009719 ENSGT00390000010209.c.b Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163002 ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000168253 ENSGT00940000163281.b ENSGT00940000176107 ENSGT00940000164360.B ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000179331 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000177895 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00940000177506 ENSGT00940000177254 ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT00940000164360.A ENSGT00940000164360.B ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000162818.c.b ENSGT00940000155137.a.b Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000179331 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000177895 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT00940000164360.A ENSGT00940000164360.B ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000162818.c.b ENSGT00940000155137.a.b Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000179331 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000177895 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT00940000164360.A ENSGT00940000164360.B ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000162818.c.b ENSGT00940000174731 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000179331 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT00940000176107 ENSGT00940000164360.B ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000162818.c.b ENSGT00940000174731 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000179331 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT01100000263568.b.a.c.a.k ENSGT00940000162818.c.b ENSGT00940000155137.a.b ENSGT00390000000878 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a.a ENSGT00470000042293.a.a.b ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT01100000263568.b.a.c.a.k.c.b ENSGT00940000162818.c.b.e.a.b.b ENSGT01100000263568.b.a.c.a.k.d ENSGT00940000162818.c.b.f Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a.a ENSGT00470000042293.a.a.b ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT01100000263568.b.a.c.a.k.c.a ENSGT00940000162818.c.b.e.a.a ENSGT00940000162818.c.b.e.a.b.b ENSGT00940000155137.a.b ENSGT01030000235040 Mangrove rivulus MODERN SPECIES 2 pdk4 (ENSKMAG00000020123) PPP1R9A (ENSKMAG00000000136) sgce (ENSKMAG00000000351) casd1 (ENSKMAG00000000407) col1a2 (ENSKMAG00000000507) bet1 (ENSKMAG00000000756) zgc:85777 (ENSKMAG00000000710) gngt1 (ENSKMAG00000000785) tfpi2 (ENSKMAG00000000793) CALCR (ENSKMAG00000000807) VPS50 (ENSKMAG00000000934) hepacam2 (ENSKMAG00000001105) cdk6 (ENSKMAG00000001123) ENSKMAG00000001165 ENSKMAG00000001179 ENSKMAG00000001209 #22 btd (ENSKMAG00000001377) #23 ENSKMAG00000001403 ENSKMAG00000001416 #23 SNX13 (ENSKMAG00000001443) ENSKMAG00000001528 polr1f (ENSKMAG00000001591) ENSKMAG00000001602 ITGB8 (ENSKMAG00000001626) ENSKMAG00000001670 sp4 (ENSKMAG00000001680) CDCA7L (ENSKMAG00000001697) ENSKMAG00000001716 ENSKMAG00000001737 ENSKMAG00000001774 RAPGEF5 (ENSKMAG00000001805) Turquoise killifish MODERN SPECIES 1618 bet1 (ENSNFUG00015024255) OLA.3715 (ENSNFUG00015024258) gngt1 (ENSNFUG00015024262) TFPI2 (ENSNFUG00015024269) CABZ01081490.1 (ENSNFUG00015024273) CALCR (ENSNFUG00015024313) ENSNFUG00015024741 ENSNFUG00015024743 VPS50 (ENSNFUG00015024746) hepacam2 (ENSNFUG00015024755) cdk6 (ENSNFUG00015024758) ENSNFUG00015024759 ENSNFUG00015024760 ENSNFUG00015024761 ENSNFUG00015024762 ANKRD28 (ENSNFUG00015024851) #22 BTD (ENSNFUG00015025204) #23 C11H1ORF50 (ENSNFUG00015025205) ENSNFUG00015025207 ENSNFUG00015025208 SNX13 (ENSNFUG00015025209) TWIST1A (ENSNFUG00015025231) TWISTNB (ENSNFUG00015025232) ENSNFUG00015025234 ITGB8 (ENSNFUG00015025236) ENSNFUG00015025239 sp4 (ENSNFUG00015025240) CDCA7L (ENSNFUG00015025243) HEYL (ENSNFUG00015025244) ENSNFUG00015025245 ENSNFUG00015005098 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a.a ENSGT00470000042293.a.a.b ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT01100000263568.b.a.c.a.k.c.b ENSGT00940000162818.c.b.e.a.b.b ENSGT00940000174731 ENSGT00940000162818.c.b.f NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 149 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a.a ENSGT00470000042293.a.a.b ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT01100000263568.b.a.c.a.k.c.b ENSGT00940000162818.c.b.e.a.b.b ENSGT01100000263568.b.a.c.a.k.d ENSGT00940000162818.c.b.f.b.b Mummichog MODERN SPECIES 265 ENSFHEG00000012513 zgc:85777 (ENSFHEG00000012560) gngt1 (ENSFHEG00000012590) tfpi2 (ENSFHEG00000012600) CALCR (ENSFHEG00000012667) VPS50 (ENSFHEG00000012916) hepacam2 (ENSFHEG00000000852) cdk6 (ENSFHEG00000012969) FAM133B (ENSFHEG00000012981) ENSFHEG00000013049 ENSFHEG00000013056 ENSFHEG00000013061 ENSFHEG00000013119 #22 btd (ENSFHEG00000013127) #23 btd (ENSFHEG00000013140) #23 ENSFHEG00000013148 SNX13 (ENSFHEG00000013231) ENSFHEG00000013304 polr1f (ENSFHEG00000013318) ENSFHEG00000013340 ITGB8 (ENSFHEG00000013355) ENSFHEG00000013375 sp4 (ENSFHEG00000013383) ENSFHEG00000013390 ENSFHEG00000013441 ENSFHEG00000013457 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 247 sgce (ENSCVAG00000015254) casd1 (ENSCVAG00000015158) col1a2 (ENSCVAG00000015066) bet1 (ENSCVAG00000014948) zgc:85777 (ENSCVAG00000000930) gngt1 (ENSCVAG00000014892) ENSCVAG00000014886 tfpi2 (ENSCVAG00000014871) CALCR (ENSCVAG00000014852) VPS50 (ENSCVAG00000014679) hepacam2 (ENSCVAG00000014602) cdk6 (ENSCVAG00000014594) fam133b (ENSCVAG00000014580) ENSCVAG00000014570 ENSCVAG00000014535 ENSCVAG00000014492 #22 btd (ENSCVAG00000014447) #23 ENSCVAG00000014440 SNX13 (ENSCVAG00000014434) ENSCVAG00000014337 FERD3L (ENSCVAG00000014330) polr1f (ENSCVAG00000014324) ENSCVAG00000014314 ITGB8 (ENSCVAG00000014278) ENSCVAG00000014262 sp4 (ENSCVAG00000014242) CDCA7L (ENSCVAG00000014238) ENSCVAG00000014230 ENSCVAG00000014203 ENSCVAG00000014170 ENSCVAG00000014159 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a.a ENSGT00470000042293.a.a.b ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a.r #23 ENSGT00390000013823.a.q #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00940000168253 ENSGT00940000163281.b ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000162818.c.b.e.b.a.b ENSGT01100000263568.b.a.c.a.k.d ENSGT00940000162818.c.b.e.a.b.b Poecilia ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a.a ENSGT00470000042293.a.a.b ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a.r.a #23 ENSGT00390000013823.a.q #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00940000168253 ENSGT00940000163281.b ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000162818.c.b.e.b.a.b ENSGT01100000263568.b.a.c.a.k.d ENSGT00940000162818.c.b.e.b.a.a Guppy MODERN SPECIES 441 asb4 (ENSPREG00000002290) PPP1R9A (ENSPREG00000002304) sgce (ENSPREG00000002358) casd1 (ENSPREG00000002427) col1a2 (ENSPREG00000002508) bet1 (ENSPREG00000002633) zgc:85777 (ENSPREG00000002646) gngt1 (ENSPREG00000002684) tfpi2 (ENSPREG00000002710) CALCR (ENSPREG00000002720) VPS50 (ENSPREG00000002804) hepacam2 (ENSPREG00000002947) cdk6 (ENSPREG00000002969) fam133b (ENSPREG00000002995) ENSPREG00000003018 ENSPREG00000003055 #22 btd (ENSPREG00000003210) #23 btd (ENSPREG00000003256) #23 ENSPREG00000003286 SNX13 (ENSPREG00000003316) ENSPREG00000003413 FERD3L (ENSPREG00000003422) ENSPREG00000003434 ENSPREG00000003443 ENSPREG00000003469 sp8a (ENSPREG00000003484) sp4 (ENSPREG00000003495) CDCA7L (ENSPREG00000003506) ENSPREG00000003516 ENSPREG00000003527 ENSPREG00000003565 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a.a ENSGT00470000042293.a.a.b ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a.r.a #23 ENSGT00390000013823.a.q #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00940000168253 ENSGT00940000163281.b ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000162818.c.b.e.b.a.b ENSGT01100000263568.b.a.c.a.k.d ENSGT00940000162818.c.b.e.b.a.a.b.a.a Sailfin molly MODERN SPECIES 606 ENSPLAG00000001090 VPS50 (ENSPLAG00000001086) hepacam2 (ENSPLAG00000001078) cdk6 (ENSPLAG00000001075) ENSPLAG00000001073 ENSPLAG00000001071 ENSPLAG00000001068 ENSPLAG00000001064 #22 Amazon molly MODERN SPECIES 273 ENSPFOG00000000438 hepacam2 (ENSPFOG00000000465) cdk6 (ENSPFOG00000000521) ENSPFOG00000000616 fam133b (ENSPFOG00000000621) ENSPFOG00000024742 ENSPFOG00000000636 ENSPFOG00000000742 #22 btd (ENSPFOG00000000998) #23 ENSPFOG00000021700 #23 SNX13 (ENSPFOG00000022376) ENSPFOG00000020053 ENSPFOG00000022793 ENSPFOG00000020055 ENSPFOG00000001131 ENSPFOG00000001178 ITGB8 (ENSPFOG00000001324) sp8a (ENSPFOG00000001566) sp4 (ENSPFOG00000001626) CDCA7L (ENSPFOG00000001712) ENSPFOG00000023552 ENSPFOG00000023503 ENSPFOG00000001765 Platyfish MODERN SPECIES 4 ENSXMAG00000022870 sgce (ENSXMAG00000000709) casd1 (ENSXMAG00000000704) col1a2 (ENSXMAG00000000698) zgc:85777 (ENSXMAG00000023712) bet1 (ENSXMAG00000000695) gngt1 (ENSXMAG00000024374) tfpi2 (ENSXMAG00000000682) CALCR (ENSXMAG00000000680) VPS50 (ENSXMAG00000000669) hepacam2 (ENSXMAG00000000667) cdk6 (ENSXMAG00000026356) fam133b (ENSXMAG00000026042) ENSXMAG00000023072 ENSXMAG00000000658 ENSXMAG00000000641 #22 btd (ENSXMAG00000023856) #23 ENSXMAG00000024324 #23 ENSXMAG00000023361 SNX13 (ENSXMAG00000000631) ENSXMAG00000020142 FERD3L (ENSXMAG00000020141) ENSXMAG00000023876 ENSXMAG00000000629 ITGB8 (ENSXMAG00000000593) sp8a (ENSXMAG00000023039) sp4 (ENSXMAG00000000588) CDCA7L (ENSXMAG00000000584) ENSXMAG00000024544 ENSXMAG00000023006 ENSXMAG00000028701 Oryzias ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000179331 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a.u #23 ENSGT00390000013823.a.v #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT01100000263568.b.a.c.a.k.a ENSGT00980000199528 ENSGT01100000263568.b.a.c.a.k.b Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000179331 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a.u #23 ENSGT00390000013823.a.v #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT01100000263568.b.a.c.a.k.a ENSGT01100000263568.b.a.c.a.k.b ENSGT00940000155137.a.b Indian medaka MODERN SPECIES 3 sgce (ENSOMEG00000017350) casd1 (ENSOMEG00000017161) col1a2 (ENSOMEG00000000803) ENSOMEG00000016940 bet1 (ENSOMEG00000016907) zgc:85777 (ENSOMEG00000016933) gngt1 (ENSOMEG00000016876) tfpi2 (ENSOMEG00000016854) CALCR (ENSOMEG00000016788) VPS50 (ENSOMEG00000016711) hepacam2 (ENSOMEG00000016663) cdk6 (ENSOMEG00000016622) ENSOMEG00000016560 ENSOMEG00000016341 ENSOMEG00000016260 ENSOMEG00000016192 #22 btd (ENSOMEG00000015955) #23 ENSOMEG00000015928 #23 ENSOMEG00000015821 SNX13 (ENSOMEG00000000399) ENSOMEG00000015805 ENSOMEG00000015768 ENSOMEG00000015759 ENSOMEG00000015748 ENSOMEG00000015733 sp8a (ENSOMEG00000015692) sp4 (ENSOMEG00000015685) CDCA7L (ENSOMEG00000000397) ENSOMEG00000015632 ENSOMEG00000015617 ENSOMEG00000015606 Javanese ricefish MODERN SPECIES 2 PPP1R9A (ENSOJAG00000008048) sgce (ENSOJAG00000009046) casd1 (ENSOJAG00000009202) col1a2 (ENSOJAG00000009445) ENSOJAG00000011446 bet1 (ENSOJAG00000011458) zgc:85777 (ENSOJAG00000011468) gngt1 (ENSOJAG00000011527) tfpi2 (ENSOJAG00000011544) CALCR (ENSOJAG00000011651) VPS50 (ENSOJAG00000013370) hepacam2 (ENSOJAG00000013705) cdk6 (ENSOJAG00000013777) FAM133B (ENSOJAG00000013790) ENSOJAG00000013796 ENSOJAG00000013810 #22 SNX13 (ENSOJAG00000014047) ENSOJAG00000014891 ENSOJAG00000014918 FERD3L (ENSOJAG00000014925) polr1f (ENSOJAG00000014951) ENSOJAG00000014960 ITGB8 (ENSOJAG00000014971) ENSOJAG00000014995 sp4 (ENSOJAG00000015031) CDCA7L (ENSOJAG00000015035) ENSOJAG00000015071 ENSOJAG00000015108 RAPGEF5 (ENSOJAG00000015125) ENSOJAG00000015140 TOMM7 (ENSOJAG00000015169) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000179331 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a.u #23 ENSGT00390000013823.a.v #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000162818.c.b.b ENSGT00980000199528 ENSGT01100000263568.b.a.c.a.k.b Chinese medaka MODERN SPECIES 1110 asb4 (ENSOSIG00000020407) ENSOSIG00000020409 ENSOSIG00000020413 casd1 (ENSOSIG00000020418) col1a2 (ENSOSIG00000020542) ENSOSIG00000022043 bet1 (ENSOSIG00000022046) zgc:85777 (ENSOSIG00000022062) gngt1 (ENSOSIG00000022064) tfpi2 (ENSOSIG00000022067) CALCR (ENSOSIG00000022084) VPS50 (ENSOSIG00000022212) hepacam2 (ENSOSIG00000022587) cdk6 (ENSOSIG00000022590) ENSOSIG00000022596 ENSOSIG00000022606 #22 btd (ENSOSIG00000022618) #23 ENSOSIG00000022619 ENSOSIG00000022635 FERD3L (ENSOSIG00000022641) polr1f (ENSOSIG00000022649) ENSOSIG00000022654 ITGB8 (ENSOSIG00000022656) ENSOSIG00000022657 sp4 (ENSOSIG00000022665) CDCA7L (ENSOSIG00000022673) ENSOSIG00000022674 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 2 sgce (ENSORLG00000004392) casd1 (ENSORLG00000004357) ENSORLG00000029271 col1a2 (ENSORLG00000004319) bet1 (ENSORLG00000018402) zgc:85777 (ENSORLG00000029640) gngt1 (ENSORLG00000004180) tfpi2 (ENSORLG00000004168) CALCR (ENSORLG00000004156) VPS50 (ENSORLG00000004143) hepacam2 (ENSORLG00000004092) ENSORLG00000022936 cdk6 (ENSORLG00000004090) ENSORLG00000004062 ENSORLG00000004055 ENSORLG00000004052 #22 btd (ENSORLG00000004039) #23 ENSORLG00000030568 #23 ENSORLG00000023146 SNX13 (ENSORLG00000004022) ENSORLG00000004012 FERD3L (ENSORLG00000004008) polr1f (ENSORLG00000004005) ENSORLG00000003995 ITGB8 (ENSORLG00000003989) ENSORLG00000003978 sp4 (ENSORLG00000003968) ENSORLG00000026948 ENSORLG00000023827 ENSORLG00000022373 ENSORLG00000026380 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000158874 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT00940000164360.B ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT01100000263568.b.a.c.a.k ENSGT00940000162818.c.b ENSGT00940000174731 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158874 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a.x.a #23 ENSGT00390000013823.a.x.b #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000162818.c.b.j ENSGT01100000263568.b.a.c.a.k ENSGT00940000162818.c.b.i.a Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a.c.a.b ENSGT00470000042293.a.a.c.a.a ENSGT00470000042293.a.a.c.b ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a.x.a #23 ENSGT00390000013823.a.x.b.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000162818.c.b.i.a.a.b ENSGT00940000174731 ENSGT01100000263568.b.a.c.a.l.c.b Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia DUPLICATION Nile tilapia MODERN SPECIES 5 ENSONIG00000005727 yap1 (ENSONIG00000005729) ENSONIG00000035687 trpc6a (ENSONIG00000005731) pgr (ENSONIG00000041442) ARHGAP42 (ENSONIG00000005735) cntn5 (ENSONIG00000005737) FBXO40 (ENSONIG00000005748) ttc36 (ENSONIG00000005749) NECTIN1 (ENSONIG00000005751) TREH (ENSONIG00000005752) DDX6 (ENSONIG00000005756) CXCR5 (ENSONIG00000021409) bcl9l (ENSONIG00000005760) cdon (ENSONIG00000005762) ENSONIG00000030752 #22 ENSONIG00000033950 ENSONIG00000034522 prdm10 (ENSONIG00000004091) aplp2 (ENSONIG00000004078) ENSONIG00000004071 dhx34 (ENSONIG00000004067) ENSONIG00000030402 spred3 (ENSONIG00000041122) ENSONIG00000004063 psmd8 (ENSONIG00000004059) nup88 (ENSONIG00000021321) EHD2 (ENSONIG00000004051) ENSONIG00000004046 napab (ENSONIG00000004037) B3GNT8 (ENSONIG00000004036) Nile tilapia MODERN SPECIES 387 ENSONIG00000030617 #23 ENSONIG00000033473 #22 ENSONIG00000037614 #23 ENSONIG00000037860 #23 Nile tilapia MODERN SPECIES 13 col1a2 (ENSONIG00000010792) bet1 (ENSONIG00000040156) zgc:85777 (ENSONIG00000010806) gngt1 (ENSONIG00000010811) tfpi2 (ENSONIG00000037672) CALCR (ENSONIG00000010814) ENSONIG00000027698 VPS50 (ENSONIG00000010824) hepacam2 (ENSONIG00000010833) cdk6 (ENSONIG00000038572) ENSONIG00000029312 ENSONIG00000034756 ENSONIG00000033687 granulin (ENSONIG00000010845) ENSONIG00000036488 ENSONIG00000010847 #22 btd (ENSONIG00000010851) #23 ENSONIG00000031063 SNX13 (ENSONIG00000010852) ENSONIG00000020502 ENSONIG00000037482 ENSONIG00000043203 ENSONIG00000010859 ITGB8 (ENSONIG00000010860) sp8a (ENSONIG00000010871) sp4 (ENSONIG00000010872) CDCA7L (ENSONIG00000010874) ENSONIG00000040873 ENSONIG00000028328 ENSONIG00000039052 ENSONIG00000027465 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00940000177506 ENSGT00940000177254 ENSGT00470000042293.a.a.c.a.b ENSGT00470000042293.a.a.c.a.a ENSGT00470000042293.a.a.c.b ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a.x.a #23 ENSGT00390000013823.a.x.b.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000162818.c.b.i.a.b.a ENSGT00940000155137.a.b ENSGT00940000155137.b Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00940000177506 ENSGT00940000177254 ENSGT00470000042293.a.a.c.a.b ENSGT00470000042293.a.a.c.a.a.a ENSGT00470000042293.a.a.c.a.a.b ENSGT00470000042293.a.a.c.b ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a.x.a #23 ENSGT00390000013823.a.x.b.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000162818.c.b.i.a.a.b ENSGT00940000174731 ENSGT01100000263568.b.a.c.a.l.c.b Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 367 col1a2 (ENSHBUG00000019130) bet1 (ENSHBUG00000019157) zgc:85777 (ENSHBUG00000019198) gngt1 (ENSHBUG00000019212) tfpi2 (ENSHBUG00000019217) CALCR (ENSHBUG00000019323) VPS50 (ENSHBUG00000019524) hepacam2 (ENSHBUG00000019548) cdk6 (ENSHBUG00000019574) ENSHBUG00000019592 ENSHBUG00000019607 ENSHBUG00000019625 ENSHBUG00000019629 ENSHBUG00000019636 ENSHBUG00000019682 ENSHBUG00000019850 #22 btd (ENSHBUG00000019887) #23 btd (ENSHBUG00000019913) #23 ENSHBUG00000019929 SNX13 (ENSHBUG00000020063) ENSHBUG00000020141 FERD3L (ENSHBUG00000000605) polr1f (ENSHBUG00000020155) ENSHBUG00000020171 ITGB8 (ENSHBUG00000020181) ENSHBUG00000020190 sp4 (ENSHBUG00000020205) ENSHBUG00000020213 ENSHBUG00000020232 ENSHBUG00000020239 ENSHBUG00000020266 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00940000177506 ENSGT00940000177254 ENSGT00470000042293.a.a.c.a.b ENSGT00470000042293.a.a.c.a.a.a ENSGT00470000042293.a.a.c.a.a.b ENSGT00470000042293.a.a.c.b ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a.x.a #23 ENSGT00390000013823.a.x.b.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT01100000263568.b.a.c.a.k.e.a.b.a ENSGT00940000162818.c.b.i.a.a.a.a.a ENSGT01100000263568.b.a.c.a.k.e.b P. nyererei MODERN SPECIES 705 ENSPNYG00000002203 ENSPNYG00000002241 #22 btd (ENSPNYG00000002355) #23 btd (ENSPNYG00000002370) #23 ENSPNYG00000002397 SNX13 (ENSPNYG00000002436) ENSPNYG00000002588 FERD3L (ENSPNYG00000002657) polr1f (ENSPNYG00000002674) ITGB8 (ENSPNYG00000002690) sp8a (ENSPNYG00000002750) sp4 (ENSPNYG00000002761) ENSPNYG00000002780 ENSPNYG00000002815 ENSPNYG00000002852 ENSPNYG00000002867 ENSPNYG00000002884 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00940000177506 ENSGT00940000177254 ENSGT00470000042293.a.a.c.a.b ENSGT00470000042293.a.a.c.a.a.a ENSGT00470000042293.a.a.c.a.a.b ENSGT00470000042293.a.a.c.b ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a.x.a #23 ENSGT00390000013823.a.x.b.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT01100000263568.b.a.c.a.k.e.a.b.a ENSGT00940000162818.c.b.i.a.a.a.a.a ENSGT01100000263568.b.a.c.a.k.e.b Eastern happy DUPLICATION Eastern happy MODERN SPECIES 13 col1a2 (ENSACLG00000023609) bet1 (ENSACLG00000023540) zgc:85777 (ENSACLG00000023519) gngt1 (ENSACLG00000023512) tfpi2 (ENSACLG00000023375) CALCR (ENSACLG00000023307) ENSACLG00000023298 VPS50 (ENSACLG00000023159) hepacam2 (ENSACLG00000023139) cdk6 (ENSACLG00000022998) ENSACLG00000022977 ENSACLG00000022968 ENSACLG00000022947 ENSACLG00000022917 ENSACLG00000022864 ENSACLG00000022634 #22 btd (ENSACLG00000022837) #23 btd (ENSACLG00000022600) #23 ENSACLG00000022593 SNX13 (ENSACLG00000022373) ENSACLG00000022307 FERD3L (ENSACLG00000022298) polr1f (ENSACLG00000022280) ENSACLG00000022269 ITGB8 (ENSACLG00000022235) ENSACLG00000022223 sp4 (ENSACLG00000022218) CDCA7L (ENSACLG00000022200) ENSACLG00000022169 ENSACLG00000022142 ENSACLG00000022128 Eastern happy MODERN SPECIES 16 CBX1 (ENSACLG00000003536) ENSACLG00000003517 hoxb1a (ENSACLG00000003508) hoxb2a (ENSACLG00000003504) hoxb3a (ENSACLG00000003477) hoxb4a (ENSACLG00000003470) HOXB5 (ENSACLG00000003462) ENSACLG00000003444 hoxb7a (ENSACLG00000003441) hoxb8a (ENSACLG00000003429) hoxb9a (ENSACLG00000003422) hoxb13a (ENSACLG00000003412) ENSACLG00000003399 eve1 (ENSACLG00000003367) ENSACLG00000003361 ENSACLG00000003164 #22 ENSACLG00000003089 #23 ENSACLG00000003070 #23 ENSACLG00000002843 ENSACLG00000002801 gps1 (ENSACLG00000002752) slc25a23b (ENSACLG00000002671) pdxdc1 (ENSACLG00000002655) abat (ENSACLG00000002554) rcn3 (ENSACLG00000002546) nosip (ENSACLG00000002526) ENSACLG00000002505 tspan4b (ENSACLG00000002482) tspan35 (ENSACLG00000002465) ZNF653 (ENSACLG00000002459) swsap1 (ENSACLG00000002450) Zebra mbuna MODERN SPECIES 1104 zgc:85777 (ENSMZEG00005008100) gngt1 (ENSMZEG00005008086) tfpi2 (ENSMZEG00005008078) CALCR (ENSMZEG00005008028) VPS50 (ENSMZEG00005007945) hepacam2 (ENSMZEG00005007924) cdk6 (ENSMZEG00005007908) ENSMZEG00005007899 ENSMZEG00005007890 ENSMZEG00005007875 ENSMZEG00005007859 ENSMZEG00005007827 ENSMZEG00005007820 ENSMZEG00005007808 ENSMZEG00005007795 ENSMZEG00005007714 #22 btd (ENSMZEG00005007695) #23 btd (ENSMZEG00005007688) #23 ENSMZEG00005007684 SNX13 (ENSMZEG00005007619) ENSMZEG00005007575 FERD3L (ENSMZEG00005007568) polr1f (ENSMZEG00005007561) ENSMZEG00005007545 ITGB8 (ENSMZEG00005007532) ENSMZEG00005007523 sp4 (ENSMZEG00005007488) ENSMZEG00005007471 ENSMZEG00005007461 ENSMZEG00005007446 ENSMZEG00005007427 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 302 bet1 (ENSNBRG00000007672) zgc:85777 (ENSNBRG00000007692) gngt1 (ENSNBRG00000007723) tfpi2 (ENSNBRG00000007736) CALCR (ENSNBRG00000007771) VPS50 (ENSNBRG00000007857) hepacam2 (ENSNBRG00000007958) cdk6 (ENSNBRG00000008020) FAM133B (ENSNBRG00000008059) ENSNBRG00000008067 ENSNBRG00000008074 ENSNBRG00000008180 ENSNBRG00000008232 ENSNBRG00000008281 ENSNBRG00000008297 ENSNBRG00000008337 #22 btd (ENSNBRG00000008433) #23 ENSNBRG00000008456 #23 ENSNBRG00000008470 #23 ENSNBRG00000008487 SNX13 (ENSNBRG00000008502) ENSNBRG00000008580 FERD3L (ENSNBRG00000008645) polr1f (ENSNBRG00000008652) ENSNBRG00000008666 ITGB8 (ENSNBRG00000008722) ENSNBRG00000008840 sp4 (ENSNBRG00000008869) CDCA7L (ENSNBRG00000008937) ENSNBRG00000008955 ENSNBRG00000008977 Midas cichlid MODERN SPECIES 563 casd1 (ENSACIG00000000834) col1a2 (ENSACIG00000000453) bet1 (ENSACIG00000000413) zgc:85777 (ENSACIG00000000376) gngt1 (ENSACIG00000000345) tfpi2 (ENSACIG00000000272) CALCR (ENSACIG00000000196) VPS50 (ENSACIG00000020723) hepacam2 (ENSACIG00000020688) cdk6 (ENSACIG00000020669) ENSACIG00000020659 ENSACIG00000020623 ENSACIG00000020601 ENSACIG00000020564 ENSACIG00000020560 ENSACIG00000020524 #22 btd (ENSACIG00000020507) #23 btd (ENSACIG00000020494) #23 btd (ENSACIG00000020483) #23 ENSACIG00000020475 SNX13 (ENSACIG00000020453) ENSACIG00000020423 polr1f (ENSACIG00000020400) ITGB8 (ENSACIG00000020344) sp8a (ENSACIG00000020326) sp4 (ENSACIG00000020289) ENSACIG00000020274 ENSACIG00000020271 ENSACIG00000020242 ENSACIG00000020230 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158874 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT00940000164360.B ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000162818.c.b.g.a ENSGT00940000174731 ENSGT00940000162818.c.b.g.b Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000158874 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000162818.c.b.g.a.b ENSGT00940000162818.c.b.g.a.a ENSGT00940000155137.a.b ENSGT00390000000878 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158874 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000162818.c.b.g.a.b ENSGT00940000162818.c.b.g.a.a ENSGT00940000155137.a.b ENSGT00390000000878 Orange clownfish MODERN SPECIES 8 asb4 (ENSAPEG00000018078) PPP1R9A (ENSAPEG00000018009) sgce (ENSAPEG00000017897) casd1 (ENSAPEG00000017804) col1a2 (ENSAPEG00000017655) bet1 (ENSAPEG00000017588) zgc:85777 (ENSAPEG00000017555) gngt1 (ENSAPEG00000017540) tfpi2 (ENSAPEG00000017506) CALCR (ENSAPEG00000017469) VPS50 (ENSAPEG00000017309) hepacam2 (ENSAPEG00000017198) cdk6 (ENSAPEG00000017168) ENSAPEG00000017145 ENSAPEG00000017131 ENSAPEG00000017058 #22 btd (ENSAPEG00000017026) #23 ENSAPEG00000017008 SNX13 (ENSAPEG00000016852) ENSAPEG00000016762 FERD3L (ENSAPEG00000016755) polr1f (ENSAPEG00000016750) ENSAPEG00000016729 ENSAPEG00000016708 ITGB8 (ENSAPEG00000016631) ENSAPEG00000016616 sp4 (ENSAPEG00000016605) ENSAPEG00000016592 ENSAPEG00000016572 ENSAPEG00000016536 ENSAPEG00000016529 Clown anemonefish MODERN SPECIES 1356 col1a2 (ENSAOCG00000015957) bet1 (ENSAOCG00000015782) zgc:85777 (ENSAOCG00000001094) ENSAOCG00000001090 gngt1 (ENSAOCG00000015711) tfpi2 (ENSAOCG00000015674) CALCR (ENSAOCG00000015628) VPS50 (ENSAOCG00000015557) hepacam2 (ENSAOCG00000015393) cdk6 (ENSAOCG00000015359) ENSAOCG00000015316 ENSAOCG00000015278 ENSAOCG00000001061 #22 btd (ENSAOCG00000015181) #23 dhx37 (ENSAOCG00000015168) ENSAOCG00000015083 septin5a (ENSAOCG00000015062) zgc:63587 (ENSAOCG00000015026) cldn5a (ENSAOCG00000014985) cdc45 (ENSAOCG00000014960) plpp5 (ENSAOCG00000014915) NSD3 (ENSAOCG00000001018) LETM2 (ENSAOCG00000014776) Spiny chromis MODERN SPECIES 452 psma4 (ENSAPOG00000011080) OAZ2 (ENSAPOG00000011113) ppib (ENSAPOG00000011121) adpgk (ENSAPOG00000011148) snx22 (ENSAPOG00000011169) ENSAPOG00000011184 VPS50 (ENSAPOG00000011306) hepacam2 (ENSAPOG00000011325) cdk6 (ENSAPOG00000011370) ENSAPOG00000011393 ENSAPOG00000011429 ENSAPOG00000011440 ENSAPOG00000011500 #22 btd (ENSAPOG00000011535) #23 ENSAPOG00000011554 SNX13 (ENSAPOG00000011698) ENSAPOG00000011763 ENSAPOG00000011777 polr1f (ENSAPOG00000011796) ENSAPOG00000011814 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1268 VPS50 (ENSSPAG00000009087) hepacam2 (ENSSPAG00000009192) cdk6 (ENSSPAG00000009221) ENSSPAG00000009265 ENSSPAG00000009318 ENSSPAG00000009343 #22 btd (ENSSPAG00000009441) #23 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT00990000204445.a ENSGT00940000159917 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000177895 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT00940000164360.A ENSGT00940000164360.B ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000162818.c.b ENSGT00980000199528 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT00990000204445.a ENSGT00940000159917 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000177895 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT00940000164360.A ENSGT00940000164360.B ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000162818.c.b ENSGT00980000199528 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00940000158874 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b.d ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380.sd ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b Fugu MODERN SPECIES 3 asb4 (ENSTRUG00000015951) PPP1R9A (ENSTRUG00000015914) sgce (ENSTRUG00000015890) casd1 (ENSTRUG00000015861) col1a2 (ENSTRUG00000015407) bet1 (ENSTRUG00000015403) zgc:85777 (ENSTRUG00000015393) gngt1 (ENSTRUG00000022037) tfpi2 (ENSTRUG00000015369) CALCR (ENSTRUG00000015319) VPS50 (ENSTRUG00000015181) hepacam2 (ENSTRUG00000015175) cdk6 (ENSTRUG00000015133) ENSTRUG00000015110 ENSTRUG00000015106 ENSTRUG00000014907 #22 btd (ENSTRUG00000014869) #23 ENSTRUG00000020939 SNX13 (ENSTRUG00000014752) ENSTRUG00000026755 ENSTRUG00000025781 polr1f (ENSTRUG00000019854) ENSTRUG00000014705 ENSTRUG00000014693 fabp4a (ENSTRUG00000014661) mrpl53 (ENSTRUG00000014652) znf704 (ENSTRUG00000014603) tpd52 (ENSTRUG00000028115) zbtb10 (ENSTRUG00000028937) hey1 (ENSTRUG00000030760) stmn2b (ENSTRUG00000014525) Tetraodon MODERN SPECIES 16 ago2 (ENSTNIG00000017760) dlx5a (ENSTNIG00000017761) dlx6a (ENSTNIG00000017762) sem1 (ENSTNIG00000017763) DYNC1I1 (ENSTNIG00000017764) col1a2 (ENSTNIG00000017765) bet1 (ENSTNIG00000017766) zgc:85777 (ENSTNIG00000017767) CALCR (ENSTNIG00000017768) VPS50 (ENSTNIG00000017769) hepacam2 (ENSTNIG00000017770) ENSTNIG00000001616 cdk6 (ENSTNIG00000017771) ENSTNIG00000017772 ENSTNIG00000017773 ENSTNIG00000017774 #22 btd (ENSTNIG00000017775) #23 SNX13 (ENSTNIG00000017776) ENSTNIG00000001678 FERD3L (ENSTNIG00000017777) polr1f (ENSTNIG00000017778) ENSTNIG00000017779 ENSTNIG00000017780 fabp4a (ENSTNIG00000017781) znf704 (ENSTNIG00000017782) tpd52 (ENSTNIG00000017783) zbtb10 (ENSTNIG00000017784) hey1 (ENSTNIG00000017785) stmn2b (ENSTNIG00000017786) si:dkeyp-120h9.1 (ENSTNIG00000017787) ripor2 (ENSTNIG00000017788) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT00990000204445.a ENSGT00940000159917 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000177895 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a.`b #23 ENSGT00390000013823.a.ab.b #23 ENSGT00390000013823.a.ab.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT00940000164360.A ENSGT00940000164360.B ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 Ballan wrasse MODERN SPECIES 42 PPP1R9A (ENSLBEG00000023211) sgce (ENSLBEG00000023250) casd1 (ENSLBEG00000023286) col1a2 (ENSLBEG00000023364) ENSLBEG00000023428 bet1 (ENSLBEG00000023445) zgc:85777 (ENSLBEG00000023468) gngt1 (ENSLBEG00000023483) tfpi2 (ENSLBEG00000023496) CALCR (ENSLBEG00000023537) VPS50 (ENSLBEG00000023655) hepacam2 (ENSLBEG00000023787) cdk6 (ENSLBEG00000023839) ENSLBEG00000023871 ENSLBEG00000023909 ENSLBEG00000023981 #22 btd (ENSLBEG00000024063) #23 ENSLBEG00000024081 #23 ENSLBEG00000024090 SNX13 (ENSLBEG00000024144) ENSLBEG00000024215 POLR1F (ENSLBEG00000024225) ENSLBEG00000024240 ENSLBEG00000024319 ITGB8 (ENSLBEG00000024512) ENSLBEG00000024532 sp4 (ENSLBEG00000024544) ENSLBEG00000024554 ENSLBEG00000024571 ENSLBEG00000024588 ENSLBEG00000024611 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT00990000204445.a ENSGT00940000159917 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000177895 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a.ab.a #23 ENSGT00390000013823.a.ab.b #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT00940000164360.A ENSGT00940000164360.B ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000162818.c.b Perciformes ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000177895 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a.`b #23 ENSGT00390000013823.a.ab.b #23 ENSGT00390000013823.a.ab.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT00940000164360.A ENSGT00940000164360.B ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT00990000204445.a ENSGT00940000159917 ENSGT00940000177895 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a.ab.b #23 ENSGT00390000013823.a.ab.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT00940000164360.A ENSGT00940000164360.B ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000162818.c.b Channel bull blenny MODERN SPECIES 2 asb4 (ENSCGOG00000014646) PPP1R9A (ENSCGOG00000014658) sgce (ENSCGOG00000014807) casd1 (ENSCGOG00000014817) col1a2 (ENSCGOG00000014901) zgc:85777 (ENSCGOG00000015297) bet1 (ENSCGOG00000015319) ENSCGOG00000015334 tfpi2 (ENSCGOG00000015337) CALCR (ENSCGOG00000015345) VPS50 (ENSCGOG00000015375) hepacam2 (ENSCGOG00000015498) cdk6 (ENSCGOG00000015501) fam133b (ENSCGOG00000015634) ENSCGOG00000015639 ENSCGOG00000015757 #22 btd (ENSCGOG00000018674) #23 ENSCGOG00000018675 #23 ENSCGOG00000018677 SNX13 (ENSCGOG00000018690) ENSCGOG00000018794 ENSCGOG00000018795 polr1f (ENSCGOG00000018796) ENSCGOG00000018797 fut9b.2 (ENSCGOG00000018798) ENSCGOG00000018800 ITGB8 (ENSCGOG00000018804) ENSCGOG00000018808 sp4 (ENSCGOG00000001262) ENSCGOG00000001276 ENSCGOG00000001286 Pike perch MODERN SPECIES 41 casd1 (ENSSLUG00000014624) col1a2 (ENSSLUG00000014735) bet1 (ENSSLUG00000016859) zgc:85777 (ENSSLUG00000016870) tfpi2 (ENSSLUG00000016912) ENSSLUG00000016919 ENSSLUG00000016926 ENSSLUG00000016928 ENSSLUG00000016933 CALCR (ENSSLUG00000016940) VPS50 (ENSSLUG00000017082) hepacam2 (ENSSLUG00000019272) cdk6 (ENSSLUG00000019273) fam133b (ENSSLUG00000019276) ENSSLUG00000019280 ENSSLUG00000019297 #22 ENSSLUG00000019325 #23 btd (ENSSLUG00000019317) #23 ENSSLUG00000019326 #23 ENSSLUG00000019328 SNX13 (ENSSLUG00000019350) ENSSLUG00000019509 ENSSLUG00000019511 polr1f (ENSSLUG00000019513) ENSSLUG00000019515 fut9b.5 (ENSSLUG00000019520) ENSSLUG00000019524 ITGB8 (ENSSLUG00000019534) ENSSLUG00000019625 sp4 (ENSSLUG00000019631) CDCA7L (ENSSLUG00000019637) Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158874 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a.`b #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT00940000164360.A ENSGT00940000164360.B ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000162818.c.b ENSGT00940000155137.a.b Lumpfish MODERN SPECIES 2 casd1 (ENSCLMG00005014589) col1a2 (ENSCLMG00005014056) bet1 (ENSCLMG00005014041) zgc:85777 (ENSCLMG00005013965) ENSCLMG00005013963 tfpi2 (ENSCLMG00005013962) ENSCLMG00005013960 ENSCLMG00005013959 ENSCLMG00005013958 CALCR (ENSCLMG00005013957) VPS50 (ENSCLMG00005012106) hepacam2 (ENSCLMG00005012097) cdk6 (ENSCLMG00005012095) ENSCLMG00005012094 ENSCLMG00005012093 ENSCLMG00005007788 #22 btd (ENSCLMG00005007755) #23 ENSCLMG00005007753 #23 ENSCLMG00005007752 SNX13 (ENSCLMG00005004809) ENSCLMG00005004639 ENSCLMG00005004625 polr1f (ENSCLMG00005004608) ENSCLMG00005004597 ENSCLMG00005004577 ENSCLMG00005004562 ENSCLMG00005004541 ENSCLMG00005004529 ENSCLMG00005004514 ITGB8 (ENSCLMG00005004369) ENSCLMG00005004311 Stickleback MODERN SPECIES 9 klhl7 (ENSGACG00000006062) hycc1 (ENSGACG00000006077) ENSGACG00000006102 RAPGEF5 (ENSGACG00000006108) ENSGACG00000006123 zgc:85777 (ENSGACG00000006126) bet1 (ENSGACG00000006253) gngt1 (ENSGACG00000006256) tfpi2 (ENSGACG00000006264) CALCR (ENSGACG00000006273) VPS50 (ENSGACG00000006302) hepacam2 (ENSGACG00000006322) cdk6 (ENSGACG00000006323) ENSGACG00000006347 ENSGACG00000006358 ENSGACG00000006364 #22 btd (ENSGACG00000006390) #23 SNX13 (ENSGACG00000006404) ENSGACG00000006420 ENSGACG00000006421 polr1f (ENSGACG00000006425) ENSGACG00000006429 fut9b.1 (ENSGACG00000006430) ENSGACG00000006431 ENSGACG00000006432 ENSGACG00000006436 ITGB8 (ENSGACG00000006439) ENSGACG00000006479 sp4 (ENSGACG00000006481) ENSGACG00000006495 ENSGACG00000006505 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000158874 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT00940000159917 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a.ab.a #23 ENSGT00390000013823.a.ab.b #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT00940000164360.A ENSGT00940000164360.B ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT01100000263568.b.a.c.a.m Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000158874 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT00940000159917 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a.ab.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT00940000164360.A ENSGT00940000164360.B ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000162818.c.b ENSGT00980000199528 European seabass MODERN SPECIES 22 asb4 (ENSDLAG00005014867) PPP1R9A (ENSDLAG00005014873) sgce (ENSDLAG00005014947) casd1 (ENSDLAG00005015184) col1a2 (ENSDLAG00005015255) bet1 (ENSDLAG00005016856) zgc:85777 (ENSDLAG00005016872) tfpi2 (ENSDLAG00005016947) gngt1 (ENSDLAG00005031025) CALCR (ENSDLAG00005016993) VPS50 (ENSDLAG00005017767) hepacam2 (ENSDLAG00005018462) CDK6 (ENSDLAG00005018467) ENSDLAG00005027749 ENSDLAG00005018481 ENSDLAG00005018515 #22 ENSDLAG00005018988 #23 ENSDLAG00005029430 ENSDLAG00005019021 ENSDLAG00005019261 ENSDLAG00005027728 ENSDLAG00005019271 ENSDLAG00005034882 ENSDLAG00005019286 ENSDLAG00005003402 ITGB8 (ENSDLAG00005019323) ENSDLAG00005034261 sp4 (ENSDLAG00005019328) CDCA7L (ENSDLAG00005019332) ENSDLAG00005031555 ENSDLAG00005007128 Large yellow croaker MODERN SPECIES 484 asb4 (ENSLCRG00005020658) PPP1R9A (ENSLCRG00005020668) sgce (ENSLCRG00005020859) casd1 (ENSLCRG00005021241) col1a2 (ENSLCRG00005021256) bet1 (ENSLCRG00005021336) zgc:85777 (ENSLCRG00005021338) gngt1 (ENSLCRG00005021340) tfpi2 (ENSLCRG00005021342) CALCR (ENSLCRG00005021352) VPS50 (ENSLCRG00005022074) hepacam2 (ENSLCRG00005022118) cdk6 (ENSLCRG00005022121) fam133b (ENSLCRG00005022126) ENSLCRG00005022128 ENSLCRG00005022140 #22 btd (ENSLCRG00005022157) #23 ENSLCRG00005022160 #23 ENSLCRG00005022162 SNX13 (ENSLCRG00005022166) ENSLCRG00005022195 ENSLCRG00005022196 ENSLCRG00005022197 polr1f (ENSLCRG00005022198) ENSLCRG00005022200 fut9b.5 (ENSLCRG00005022202) ENSLCRG00005022204 ITGB8 (ENSLCRG00005022206) ENSLCRG00005022208 sp4 (ENSLCRG00005003018) ENSLCRG00005003025 Gilthead seabream MODERN SPECIES 17 pdk4 (ENSSAUG00010004262) asb4 (ENSSAUG00010004189) PPP1R9A (ENSSAUG00010004046) sgce (ENSSAUG00010002284) casd1 (ENSSAUG00010002217) col1a2 (ENSSAUG00010001273) bet1 (ENSSAUG00010001231) zgc:85777 (ENSSAUG00010001229) gngt1 (ENSSAUG00010001227) tfpi2 (ENSSAUG00010001226) CALCR (ENSSAUG00010001175) VPS50 (ENSSAUG00010001127) cdk6 (ENSSAUG00010001111) FAM133B (ENSSAUG00010001106) ENSSAUG00010001104 ENSSAUG00010000682 #22 ENSSAUG00010000645 #23 btd (ENSSAUG00010000641) #23 ENSSAUG00010000638 SNX13 (ENSSAUG00010000383) ENSSAUG00010000296 ENSSAUG00010000294 ENSSAUG00010000291 polr1f (ENSSAUG00010000288) ENSSAUG00010000282 fut9b.5 (ENSSAUG00010000280) ENSSAUG00010000276 ENSSAUG00010000270 ENSSAUG00010000267 ENSSAUG00010000264 ITGB8 (ENSSAUG00010000232) Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000158874 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT00940000164360.A ENSGT00940000164360.B ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000162818.c.b ENSGT01100000263568.b.a.c.a Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158874 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00940000168253 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT01100000263568.b.a.c.a ENSGT00940000162818.c.b ENSGT00940000155137.a.b Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000158874 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000155137.a.b ENSGT00390000000878 ENSGT00390000014833 ENSGT00390000011295.b Climbing perch MODERN SPECIES 2 asb4 (ENSATEG00000028921) PPP1R9A (ENSATEG00000018826) sgce (ENSATEG00000018781) casd1 (ENSATEG00000018704) col1a2 (ENSATEG00000018607) bet1 (ENSATEG00000018582) zgc:85777 (ENSATEG00000018545) gngt1 (ENSATEG00000018505) tfpi2 (ENSATEG00000018500) CALCR (ENSATEG00000018440) VPS50 (ENSATEG00000018309) hepacam2 (ENSATEG00000018255) ENSATEG00000018232 ENSATEG00000025670 ENSATEG00000018204 ENSATEG00000018134 #22 ENSATEG00000018093 #23 ENSATEG00000025329 ENSATEG00000026971 #23 ENSATEG00000026657 ENSATEG00000025632 #23 ENSATEG00000027472 ENSATEG00000017997 ENSATEG00000017981 FERD3L (ENSATEG00000025236) ENSATEG00000027402 ENSATEG00000017939 ITGB8 (ENSATEG00000017924) ENSATEG00000017915 sp4 (ENSATEG00000017885) CDCA7L (ENSATEG00000017881) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 2 asb4 (ENSBSLG00000004720) PPP1R9A (ENSBSLG00000004725) sgce (ENSBSLG00000005066) casd1 (ENSBSLG00000005949) col1a2 (ENSBSLG00000005986) bet1 (ENSBSLG00000007713) zgc:85777 (ENSBSLG00000007815) gngt1 (ENSBSLG00000007952) tfpi2 (ENSBSLG00000007958) CALCR (ENSBSLG00000007989) VPS50 (ENSBSLG00000008430) hepacam2 (ENSBSLG00000010263) cdk6 (ENSBSLG00000010266) ENSBSLG00000010272 ENSBSLG00000010275 ENSBSLG00000010763 #22 ENSBSLG00000011198 btd (ENSBSLG00000011208) #23 ENSBSLG00000011222 SNX13 (ENSBSLG00000011258) ENSBSLG00000012496 FERD3L (ENSBSLG00000012501) polr1f (ENSBSLG00000013049) ENSBSLG00000013085 ITGB8 (ENSBSLG00000013126) ENSBSLG00000013158 sp4 (ENSBSLG00000013198) CDCA7L (ENSBSLG00000013239) RAPGEF5 (ENSBSLG00000013304) ENSBSLG00000013380 TOMM7 (ENSBSLG00000013389) Zig-zag eel MODERN SPECIES 2 asb4 (ENSMAMG00000008961) PPP1R9A (ENSMAMG00000009004) sgce (ENSMAMG00000009047) casd1 (ENSMAMG00000009075) col1a2 (ENSMAMG00000009132) bet1 (ENSMAMG00000009263) zgc:85777 (ENSMAMG00000009237) gngt1 (ENSMAMG00000025870) tfpi2 (ENSMAMG00000009282) CALCR (ENSMAMG00000009295) VPS50 (ENSMAMG00000009354) hepacam2 (ENSMAMG00000009531) CDK6 (ENSMAMG00000025835) ENSMAMG00000009579 ENSMAMG00000027656 ENSMAMG00000009614 #22 ENSMAMG00000009788 #23 ENSMAMG00000026141 ENSMAMG00000009831 ENSMAMG00000009910 ENSMAMG00000028648 ENSMAMG00000010095 ENSMAMG00000010099 ITGB8 (ENSMAMG00000010121) ENSMAMG00000026329 sp4 (ENSMAMG00000010162) CDCA7L (ENSMAMG00000010174) ENSMAMG00000010184 RAPGEF5 (ENSMAMG00000010204) ENSMAMG00000010281 TOMM7 (ENSMAMG00000010590) Carangaria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000158874 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT00940000164360.A ENSGT00940000164360.B ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000162818.c.b ENSGT01100000263568.b.a.c.a Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000158874 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a.p ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT00940000164360.B ENSGT00940000164360.A ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000162818.c.b ENSGT00940000155137.a.b Turbot MODERN SPECIES 14 asb4 (ENSSMAG00000013749) PPP1R9A (ENSSMAG00000013688) sgce (ENSSMAG00000013623) casd1 (ENSSMAG00000013550) col1a2 (ENSSMAG00000013511) bet1 (ENSSMAG00000013500) zgc:85777 (ENSSMAG00000013477) gngt1 (ENSSMAG00000013446) tfpi2 (ENSSMAG00000013402) CALCR (ENSSMAG00000013265) VPS50 (ENSSMAG00000013150) hepacam2 (ENSSMAG00000013127) cdk6 (ENSSMAG00000022076) ENSSMAG00000013092 ENSSMAG00000013075 ENSSMAG00000012923 #22 ENSSMAG00000012914 #23 ENSSMAG00000012904 ENSSMAG00000012807 ENSSMAG00000012801 ENSSMAG00000012799 POLR1F (ENSSMAG00000012792) ENSSMAG00000012774 ENSSMAG00000012770 ENSSMAG00000012764 ENSSMAG00000012707 ENSSMAG00000023368 ENSSMAG00000011362 sp8a (ENSSMAG00000011405) ITGB8 (ENSSMAG00000011367) SP4 (ENSSMAG00000011421) Tongue sole MODERN SPECIES 9 ENSCSEG00000012791 ENSCSEG00000012783 ENSCSEG00000012778 ENSCSEG00000012762 col1a2 (ENSCSEG00000012737) bet1 (ENSCSEG00000012731) zgc:85777 (ENSCSEG00000012715) gngt1 (ENSCSEG00000012711) tfpi2 (ENSCSEG00000012705) CALCR (ENSCSEG00000012673) VPS50 (ENSCSEG00000012607) hepacam2 (ENSCSEG00000012589) cdk6 (ENSCSEG00000012577) fam133b (ENSCSEG00000012571) ENSCSEG00000012570 ENSCSEG00000012525 #22 PPP1R9A (ENSCSEG00000012487) sgce (ENSCSEG00000012445) casd1 (ENSCSEG00000012412) asb4 (ENSCSEG00000012399) pdk4 (ENSCSEG00000012385) DYNC1I1 (ENSCSEG00000012327) ENSCSEG00000012316 dlx6a (ENSCSEG00000012309) dlx5a (ENSCSEG00000012302) ago2 (ENSCSEG00000012273) ENSCSEG00000012240 npy (ENSCSEG00000012223) fam221a (ENSCSEG00000012215) ccdc126 (ENSCSEG00000012212) tra2a (ENSCSEG00000012193) Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158874 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00940000168253 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT00940000164360.A ENSGT00940000164360.B ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000162818.c.b Barramundi perch MODERN SPECIES 3 pdk4 (ENSLCAG00010018420) asb4 (ENSLCAG00010018516) PPP1R9A (ENSLCAG00010018532) sgce (ENSLCAG00010018580) casd1 (ENSLCAG00010018639) col1a2 (ENSLCAG00010018745) bet1 (ENSLCAG00010019016) zgc:85777 (ENSLCAG00010019027) gngt1 (ENSLCAG00010019039) tfpi2 (ENSLCAG00010019046) CALCR (ENSLCAG00010019141) VPS50 (ENSLCAG00010019407) hepacam2 (ENSLCAG00010019615) cdk6 (ENSLCAG00010019619) ENSLCAG00010019626 ENSLCAG00010019678 #22 btd (ENSLCAG00010019803) #23 ENSLCAG00010019822 #23 ENSLCAG00010019827 #23 ENSLCAG00010019830 SNX13 (ENSLCAG00010019840) ENSLCAG00010019863 ENSLCAG00010019865 ENSLCAG00010019870 ENSLCAG00010019880 fut9b.2 (ENSLCAG00010019881) ENSLCAG00010019882 ITGB8 (ENSLCAG00010019908) ENSLCAG00010019988 sp4 (ENSLCAG00010019997) ENSLCAG00010020009 Seriola ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000158874 ENSGT00940000155538 ENSGT00390000005672.a.b ENSGT00390000004037 ENSGT00940000155639 ENSGT00940000163414 ENSGT00940000164410 ENSGT01100000263525.b.b ENSGT00940000159917 ENSGT00940000155380 ENSGT00390000003442 ENSGT01100000263551.b.b.b ENSGT00940000157957 ENSGT00730000111097 ENSGT00470000042293.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000174023 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00940000168253 ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163281.b ENSGT00940000164360.A ENSGT00940000164360.B ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000162033.a.b ENSGT00940000157827 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000162818.c.b.o.a Greater amberjack MODERN SPECIES 48 asb4 (ENSSDUG00000006034) PPP1R9A (ENSSDUG00000006052) sgce (ENSSDUG00000006087) casd1 (ENSSDUG00000006140) col1a2 (ENSSDUG00000006239) bet1 (ENSSDUG00000006388) zgc:85777 (ENSSDUG00000006406) gngt1 (ENSSDUG00000006460) tfpi2 (ENSSDUG00000006475) CALCR (ENSSDUG00000006509) VPS50 (ENSSDUG00000006570) hepacam2 (ENSSDUG00000006685) cdk6 (ENSSDUG00000006735) fam133b (ENSSDUG00000006753) ENSSDUG00000006769 ENSSDUG00000006803 #22 btd (ENSSDUG00000006882) #23 ENSSDUG00000006911 SNX13 (ENSSDUG00000006938) ENSSDUG00000007028 FERD3L (ENSSDUG00000007035) polr1f (ENSSDUG00000007038) ENSSDUG00000007047 fut9b.5 (ENSSDUG00000007064) ENSSDUG00000007104 ITGB8 (ENSSDUG00000007115) ENSSDUG00000007136 sp4 (ENSSDUG00000007150) CDCA7L (ENSSDUG00000007164) ENSSDUG00000007185 ENSSDUG00000007194 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2800 asb4 (ENSSLDG00000012381) PPP1R9A (ENSSLDG00000012389) sgce (ENSSLDG00000012439) casd1 (ENSSLDG00000012516) col1a2 (ENSSLDG00000012616) bet1 (ENSSLDG00000012707) zgc:85777 (ENSSLDG00000012725) gngt1 (ENSSLDG00000012756) tfpi2 (ENSSLDG00000012768) CALCR (ENSSLDG00000012800) VPS50 (ENSSLDG00000012930) hepacam2 (ENSSLDG00000012992) cdk6 (ENSSLDG00000013030) fam133b (ENSSLDG00000013059) ENSSLDG00000013078 ENSSLDG00000013117 #22 btd (ENSSLDG00000013222) #23 ENSSLDG00000013243 SNX13 (ENSSLDG00000013259) ENSSLDG00000013293 ENSSLDG00000013303 ENSSLDG00000013316 ENSSLDG00000013326 fut9b.2 (ENSSLDG00000013337) ENSSLDG00000013347 ENSSLDG00000013359 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 390 casd1 (ENSHCOG00000009695) col1a2 (ENSHCOG00000009651) bet1 (ENSHCOG00000000297) zgc:85777 (ENSHCOG00000009552) gngt1 (ENSHCOG00000009519) tfpi2 (ENSHCOG00000009486) ENSHCOG00000009479 CALCR (ENSHCOG00000009457) VPS50 (ENSHCOG00000009401) hepacam2 (ENSHCOG00000009343) cdk6 (ENSHCOG00000009338) fam133b (ENSHCOG00000009306) ENSHCOG00000009282 ENSHCOG00000009261 #22 btd (ENSHCOG00000009233) #23 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 2 sgce (ENSMMDG00005013596) casd1 (ENSMMDG00005013566) col1a2 (ENSMMDG00005013559) bet1 (ENSMMDG00005013556) zgc:85777 (ENSMMDG00005013540) gngt1 (ENSMMDG00005013537) tfpi2 (ENSMMDG00005013536) ENSMMDG00005013534 CALCR (ENSMMDG00005013532) VPS50 (ENSMMDG00005012204) hepacam2 (ENSMMDG00005012156) cdk6 (ENSMMDG00005012151) fam133b (ENSMMDG00005012150) ENSMMDG00005012146 ENSMMDG00005012137 ENSMMDG00005011935 #22 btd (ENSMMDG00005011919) #23 ENSMMDG00005011918 SNX13 (ENSMMDG00005010915) ENSMMDG00005010904 ENSMMDG00005010903 polr1f (ENSMMDG00005010902) ENSMMDG00005010900 fut9b.1 (ENSMMDG00005010898) ENSMMDG00005010897 ITGB8 (ENSMMDG00005010894) ENSMMDG00005010890 sp4 (ENSMMDG00005010888) CDCA7L (ENSMMDG00005010886) ENSMMDG00005010885 RAPGEF5 (ENSMMDG00005010884) Cod MODERN SPECIES 14 cibar1 (ENSGMOG00000004412) ENSGMOG00000029694 ENSGMOG00000036896 lratd2a (ENSGMOG00000004433) fam91a1 (ENSGMOG00000004452) ENSGMOG00000022404 klhl38a (ENSGMOG00000015458) spire1a (ENSGMOG00000015465) ENSGMOG00000023527 ENSGMOG00000015516 azin1b (ENSGMOG00000015534) ENSGMOG00000024288 ENSGMOG00000015594 ENSGMOG00000015607 ENSGMOG00000015616 ENSGMOG00000015442 #22 ENSGMOG00000025451 ENSGMOG00000015507 #23 ENSGMOG00000024473 ENSGMOG00000015525 ENSGMOG00000002790 ENSGMOG00000029136 ENSGMOG00000024576 ENSGMOG00000002779 ENSGMOG00000022355 ENSGMOG00000019840 ITGB8 (ENSGMOG00000017668) ENSGMOG00000024898 sp8a (ENSGMOG00000028532) sp4 (ENSGMOG00000017737) CDCA7L (ENSGMOG00000017758) Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155602 ENSGT00390000011295.b ENSGT00390000014833 ENSGT01030000235040 ENSGT00940000155137.b.e ENSGT00390000000878 ENSGT00940000155137.a.b.r ENSGT00940000159108 ENSGT00940000157827 ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000163281.b ENSGT00390000005553 ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000161409 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00390000018500.b.b.b #28 ENSGT00500000045044 ENSGT00940000159017.a.b.d ENSGT00500000044921.a ENSGT00510000047245 ENSGT00940000165758 ENSGT00940000164175.b ENSGT00940000159342.a ENSGT00940000157125 ENSGT00940000153814.a ENSGT00990000210357 ENSGT00390000009163 ENSGT00940000153845.a.b ENSGT00940000155574.C Northern pike MODERN SPECIES 9 klhl7 (ENSELUG00000003349) hycc1 (ENSELUG00000003311) TOMM7 (ENSELUG00000003290) ENSELUG00000003273 ENSELUG00000003214 ENSELUG00000025644 ENSELUG00000003252 CDCA7L (ENSELUG00000003203) sp4 (ENSELUG00000003176) ENSELUG00000003113 ENSELUG00000003091 POLR1F (ENSELUG00000000098) ENSELUG00000000097 ENSELUG00000025732 SNX13 (ENSELUG00000003060) ENSELUG00000003011 #22 btd (ENSELUG00000002927) #23 SH3BP5 (ENSELUG00000002905) #28 mturn (ENSELUG00000002897) znrf2a (ENSELUG00000002889) ggcta (ENSELUG00000002878) snrpd1 (ENSELUG00000026849) ankib1a (ENSELUG00000000082) rtp3 (ENSELUG00000002818) fam83hb (ENSELUG00000001087) fkbp9 (ENSELUG00000002808) crtap (ENSELUG00000002788) ENSELUG00000002771 fbxl2 (ENSELUG00000002746) clasp2 (ENSELUG00000002667) ubp1 (ENSELUG00000002570) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 158 ENSGT00440000034270.a.a ENSGT00940000156347.k ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000155602 ENSGT00390000011295.b.o ENSGT00390000014833.u ENSGT01030000235040.b ENSGT00940000155137.b.e ENSGT00390000000878 ENSGT00940000155137.a.b.r ENSGT00940000159108.h ENSGT00940000157827.j ENSGT01090000259987.b.a.e ENSGT00940000163281.b.b ENSGT00950000182856.a.a.a.m ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a.n.a #23 ENSGT00390000018500.b.b.b.c #28 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000155602 ENSGT00390000011295.b.o ENSGT00390000014833.u ENSGT01030000235040.b ENSGT00940000155137.a.b.r.a ENSGT00940000155137.b.e ENSGT00940000155137.a.b.r.b.b.b ENSGT00390000000878 ENSGT00940000155137.a.b.r.b.a ENSGT00940000159108.h ENSGT00940000157827.j ENSGT01090000259987.b.a.e ENSGT00940000163281.b.b ENSGT00940000161409.b ENSGT00950000182856.a.a.a.m ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a.n.a #23 ENSGT00390000018500.b.b.b.c #28 ENSGT00500000045044.e ENSGT00940000159017.a.b.d.b ENSGT00500000044921.a ENSGT00510000047245.qb ENSGT00940000165758 ENSGT00940000164175.b.c ENSGT00940000159342.a.f ENSGT00940000157125.f ENSGT00940000153814.a.f ENSGT00390000009163.i.a ENSGT00990000210357 ENSGT00390000009163.j.b.a ENSGT00940000153845.a.b.a Salmo ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156347.k ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000155602 ENSGT00390000011295.b.o ENSGT00390000014833.u ENSGT01030000235040.b ENSGT00940000155137.a.b.r.a ENSGT00940000155137.b.e ENSGT00940000155137.a.b.r.b.b.b ENSGT00940000159108.h ENSGT00940000157827.j ENSGT01090000259987.b.a.e ENSGT00940000163281.b.b ENSGT00940000161409.b ENSGT00950000182856.a.a.a.m ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a.n.a #23 ENSGT00390000018500.b.b.b.c #28 ENSGT00500000045044.e ENSGT00940000159017.a.b.d.b ENSGT00500000044921.a ENSGT00510000047245.pb.a.a ENSGT01090000260586.b ENSGT00510000047245.qb ENSGT00940000165758 ENSGT00940000164175.b.c ENSGT00940000159342.a.f ENSGT01100000265001.a ENSGT00940000157125.f ENSGT00940000153814.a.f ENSGT00390000009163.i.a River trout MODERN SPECIES 27 ENSSTUG00000041924 ENSSTUG00000041850 klhl7 (ENSSTUG00000041403) hycc1 (ENSSTUG00000040467) TOMM7 (ENSSTUG00000040435) ENSSTUG00000040418 ENSSTUG00000040397 ENSSTUG00000040366 CDCA7L (ENSSTUG00000040349) sp4 (ENSSTUG00000040292) ENSSTUG00000040244 ENSSTUG00000040231 ENSSTUG00000040210 ENSSTUG00000040205 SNX13 (ENSSTUG00000038634) ENSSTUG00000036618 #22 btd (ENSSTUG00000036496) #23 ENSSTUG00000036426 #28 mturn (ENSSTUG00000036409) znrf2a (ENSSTUG00000036390) ggcta (ENSSTUG00000036371) ENSSTUG00000036362 snrpd1 (ENSSTUG00000036351) ankib1a (ENSSTUG00000036280) ENSSTUG00000036260 fam83hb (ENSSTUG00000036246) ENSSTUG00000036210 fkbp9 (ENSSTUG00000035685) crtap (ENSSTUG00000035653) ENSSTUG00000035646 fbxl2 (ENSSTUG00000035110) Atlantic salmon MODERN SPECIES 19 ENSSSAG00000044259 ENSSSAG00000044162 klhl7 (ENSSSAG00000044146) HYCC1 (ENSSSAG00000044016) ENSSSAG00000083913 TOM7 (ENSSSAG00000043996) IL6B (ENSSSAG00000043950) RAPGEF5 (ENSSSAG00000117178) CDCA7L (ENSSSAG00000043736) ENSSSAG00000043717 ENSSSAG00000109279 ENSSSAG00000082645 ENSSSAG00000043644 ENSSSAG00000111748 ENSSSAG00000041896 ENSSSAG00000019439 #22 ENSSSAG00000100450 #23 ENSSSAG00000122168 #23 ENSSSAG00000016971 #28 mturn (ENSSSAG00000086197) znrf2a (ENSSSAG00000109583) ggcta (ENSSSAG00000111773) snrpd1 (ENSSSAG00000054572) ENSSSAG00000009861 ENSSSAG00000009797 ENSSSAG00000094794 ENSSSAG00000102829 ENSSSAG00000009768 fkbp9 (ENSSSAG00000108237) crtap (ENSSSAG00000114864) ENSSSAG00000081030 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00390000011422 ENSGT00440000034270.a.a ENSGT00940000156347.k.a ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000155602 ENSGT00390000011295.b.o ENSGT00390000014833.u ENSGT00390000000878 ENSGT00940000155137.a.b.r.b.a ENSGT00940000159108.h ENSGT00940000157827.j ENSGT01090000259987.b.a.e ENSGT00940000163281.b.b ENSGT00940000161409.b ENSGT00950000182856.a.a.a.m ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a.n.a #23 ENSGT00390000018500.b.b.b.c #28 ENSGT00500000045044.e ENSGT00940000159017.a.b.d.b ENSGT00500000044921.a ENSGT00510000047245.qb ENSGT00940000165758 ENSGT00940000164175.b.c ENSGT00940000159342.a.f ENSGT00940000157125.f ENSGT00940000153814.a.f ENSGT00390000009163.i.a ENSGT00940000153845.a.b.a ENSGT00940000155574.C.m.a ENSGT00940000156148.c.a Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00390000011422 ENSGT00440000034270.a.a ENSGT00940000156347.k.a ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000155602 ENSGT00390000011295.b.o ENSGT00390000014833.u ENSGT00390000000878 ENSGT00940000155137.a.b.r.b.a ENSGT00940000159108.h ENSGT00940000157827.j ENSGT01090000259987.b.a.e ENSGT00940000163281.b.b ENSGT00940000161409.b ENSGT00950000182856.a.a.a.m ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a.n.a.b #23 ENSGT00390000013823.a.n.a.a #23 ENSGT00390000018500.b.b.b.c #28 ENSGT00500000045044.e ENSGT00940000159017.a.b.d.b ENSGT00500000044921.a ENSGT00510000047245.qb ENSGT00940000165758 ENSGT00940000164175.b.c ENSGT00940000159342.a.f ENSGT00940000157125.f ENSGT00940000153814.a.f ENSGT00390000009163.i.a ENSGT00940000153845.a.b.a ENSGT00940000155574.C.m.a Coho salmon MODERN SPECIES 8 mrpl3 (ENSOKIG00005005363) ENSOKIG00005005415 ENSOKIG00005005429 klhl7 (ENSOKIG00005005578) ENSOKIG00005006129 HYCC1 (ENSOKIG00005006209) TOMM7 (ENSOKIG00005006650) ENSOKIG00005006667 ENSOKIG00005006705 ENSOKIG00005006769 sp4 (ENSOKIG00005006787) ENSOKIG00005006810 ENSOKIG00005006825 ENSOKIG00005006829 SNX13 (ENSOKIG00005007001) ENSOKIG00005009739 #22 btd (ENSOKIG00005010029) #23 btd (ENSOKIG00005010045) #23 SH3BP5 (ENSOKIG00005010101) #28 mturn (ENSOKIG00005010124) znrf2a (ENSOKIG00005010137) ggcta (ENSOKIG00005010165) snrpd1 (ENSOKIG00005010171) ENSOKIG00005010191 ENSOKIG00005010245 ENSOKIG00005010260 ENSOKIG00005010292 fkbp9 (ENSOKIG00005010298) crtap (ENSOKIG00005010314) ENSOKIG00005010340 fbxl2 (ENSOKIG00005010388) Rainbow trout MODERN SPECIES 9 ENSOMYG00000044619 KLHL7 (ENSOMYG00000044594) HYCC1 (ENSOMYG00000044542) TOMM7 (ENSOMYG00000044524) ENSOMYG00000044513 RAPGEF5 (ENSOMYG00000044499) CDCA7L (ENSOMYG00000044487) ENSOMYG00000044464 ENSOMYG00000053243 ENSOMYG00000044455 ENSOMYG00000050378 ENSOMYG00000044453 ENSOMYG00000044450 ENSOMYG00000044420 ENSOMYG00000077015 ENSOMYG00000043379 #22 btd (ENSOMYG00000077854) #23 ENSOMYG00000054938 btd (ENSOMYG00000043171) #23 ENSOMYG00000051760 #28 mturn (ENSOMYG00000043164) znrf2a (ENSOMYG00000043160) ggcta (ENSOMYG00000043155) snrpd1 (ENSOMYG00000043154) ENSOMYG00000051541 ENSOMYG00000043146 ENSOMYG00000043140 ENSOMYG00000043136 ENSOMYG00000052526 fkbp9 (ENSOMYG00000043116) crtap (ENSOMYG00000043111) Huchen DUPLICATION Huchen DUPLICATION Huchen MODERN SPECIES 182 ENSHHUG00000005776 l3mbtl3 (ENSHHUG00000005798) tmem200a (ENSHHUG00000006045) ENSHHUG00000006048 EPB41L2 (ENSHHUG00000006063) AKAP7 (ENSHHUG00000006147) med23 (ENSHHUG00000006168) ENSHHUG00000006724 SLC35D3 (ENSHHUG00000006740) hey2 (ENSHHUG00000006755) hddc2 (ENSHHUG00000006770) tpd52l1 (ENSHHUG00000006781) rnf217 (ENSHHUG00000006830) nkain2 (ENSHHUG00000006840) ENSHHUG00000006866 ENSHHUG00000006910 #22 btd (ENSHHUG00000006972) #23 ENSHHUG00000007005 #28 Huchen MODERN SPECIES 3393 ENSHHUG00000001017 ENSHHUG00000000999 ENSHHUG00000000973 ENSHHUG00000000960 SNX13 (ENSHHUG00000000397) ENSHHUG00000000343 #22 Huchen MODERN SPECIES 7886 ENSHHUG00000021027 #22 ENSHHUG00000021021 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 224 ENSGT00390000014833 ENSGT00390000011295.b ENSGT00800000125328 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000157827 ENSGT00940000162033.a.b.a ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000163281.b ENSGT00390000005553 ENSGT00940000161409 ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00940000154486.b.a.b ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00390000018500.b.b.b #28 ENSGT00500000045044 ENSGT00940000159017.a.b ENSGT00500000044921.a ENSGT00510000047245 ENSGT00940000155579.a Otophysi ANCESTRAL SPECIES 170 ENSGT00390000011295.b ENSGT00800000125328 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000157827 ENSGT00940000162033.a.b.a ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000163281.b ENSGT00390000005553 ENSGT00940000161409 ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00940000154486.b.a.b ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000178869 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00390000018500.b.b.b #28 ENSGT00500000045044 ENSGT00940000159017.a.b ENSGT00500000044921.a ENSGT00510000047245 ENSGT00530000063461.A.b ENSGT00550000074698.b ENSGT00940000155113.a.a.b ENSGT00940000155784.C.u.b ENSGT00940000155602 ENSGT00940000157780 ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b ENSGT01040000240444.B.a ENSGT00940000166193 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000178859 ENSGT00390000014833 ENSGT00390000011295.b ENSGT00800000125328 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000157827 ENSGT00940000162033.a.b.a ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000163281.b ENSGT00390000005553 ENSGT00940000161409 ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00940000154486.b.a.b ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00390000018500.b.b.b #28 ENSGT00500000045044 ENSGT00940000159017.a.b ENSGT00500000044921.a ENSGT00510000047245 ENSGT00530000063461.A.b ENSGT00550000074698.b ENSGT00940000155113.a.a.b ENSGT00940000164832.e.b ENSGT00940000155784.C.u.b ENSGT00940000155602 ENSGT00940000157780 ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b ENSGT01040000240444.B.a Channel catfish MODERN SPECIES 16 ENSIPUG00000004444 RAPGEF5 (ENSIPUG00000004364) il6 (ENSIPUG00000004332) TOMM7 (ENSIPUG00000004316) hycc1 (ENSIPUG00000004242) cdca7l (ENSIPUG00000004181) sp4 (ENSIPUG00000004173) sp8b (ENSIPUG00000004164) itgb8 (ENSIPUG00000004139) tmem196 (ENSIPUG00000004133) twistnb (ENSIPUG00000004117) FERD3L (ENSIPUG00000004109) twist1a (ENSIPUG00000004071) ENSIPUG00000004050 Snx13 (ENSIPUG00000003913) ANKRD28 (ENSIPUG00000003678) #22 btd (ENSIPUG00000003644) #23 SH3BP5 (ENSIPUG00000003633) #28 mturn (ENSIPUG00000003620) znrf2 (ENSIPUG00000003600) ggcta (ENSIPUG00000003587) snrpd1 (ENSIPUG00000003576) clptm1l (ENSIPUG00000003529) rplp1 (ENSIPUG00000003514) ptk2 (ENSIPUG00000003268) ENSIPUG00000003235 ggcta (ENSIPUG00000003221) ENSIPUG00000003213 slc45a4 (ENSIPUG00000003180) lrrc3b (ENSIPUG00000003166) klhl7 (ENSIPUG00000003141) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000178859 ENSGT00390000014833 ENSGT00390000011295.b ENSGT00800000125328 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000157827 ENSGT00940000162033.a.b.a ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000163281.b ENSGT00390000005553 ENSGT00940000161409 ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00940000154486.b.a.b ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00390000018500.b.b.b #28 ENSGT00500000045044 ENSGT00940000159017.a.b ENSGT00500000044921.a ENSGT00510000047245 ENSGT00530000063461.A.b ENSGT00550000074698.b ENSGT00940000155113.a.a.b ENSGT00940000164832.e.b ENSGT00940000155784.C.u.b ENSGT00940000155602 ENSGT00940000157780 ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b ENSGT01040000240444.B.a Characoidei ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00650000093633.a.b.a ENSGT00940000155137.a.b ENSGT00940000178859 ENSGT00390000014833 ENSGT00390000011295.b ENSGT00800000125328 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000157827 ENSGT00940000162033.a.b.a ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000163281.b ENSGT00390000005553 ENSGT00940000161409 ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00390000018500.b.b.b #28 ENSGT00500000045044 ENSGT00940000159017.a.b ENSGT00500000044921.a ENSGT00510000047245 ENSGT00530000063461.A.b ENSGT00550000074698.b ENSGT00940000155113.a.a.b ENSGT00940000164832.e.b ENSGT00940000155784.C.u.b ENSGT00940000155602 ENSGT00940000157780 ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b ENSGT01040000240444.B.a Red-bellied piranha MODERN SPECIES 404 sp8a (ENSPNAG00000012006) ITGB8 (ENSPNAG00000002043) ENSPNAG00000002030 polr1f (ENSPNAG00000011956) FERD3L (ENSPNAG00000002011) twist1a (ENSPNAG00000011916) ENSPNAG00000002002 SNX13 (ENSPNAG00000001981) ANKRD28 (ENSPNAG00000001923) #22 btd (ENSPNAG00000011712) #23 SH3BP5 (ENSPNAG00000001875) #28 ENSPNAG00000011645 ENSPNAG00000011591 Mexicana tetra MODERN SPECIES 144 SNX13 (ENSAMXG00000004675) ANKRD28 (ENSAMXG00000004638) #22 btd (ENSAMXG00000039474) #23 SH3BP5 (ENSAMXG00000039958) #28 mturn (ENSAMXG00000032980) znrf2a (ENSAMXG00000035513) ggcta (ENSAMXG00000038966) snrpd1 (ENSAMXG00000004589) clptm1l (ENSAMXG00000004561) rplp1 (ENSAMXG00000029436) PTK2 (ENSAMXG00000004491) ENSAMXG00000031714 DENND3 (ENSAMXG00000004469) klhl7 (ENSAMXG00000004443) lrrc3b (ENSAMXG00000025609) SLC45A4 (ENSAMXG00000004424) GPR20 (ENSAMXG00000025141) Electric eel DUPLICATION Electric eel MODERN SPECIES 605 ENSEEEG00000015870 ENSEEEG00000015868 C5AR1 (ENSEEEG00000015867) ENSEEEG00000015866 ENSEEEG00000015863 veph1 (ENSEEEG00000015853) ENSEEEG00000015847 #22 ccnl1a (ENSEEEG00000015731) ENSEEEG00000015729 ENSEEEG00000015728 tiparp (ENSEEEG00000015727) Electric eel MODERN SPECIES 868 ENSEEEG00000013560 #22 btd (ENSEEEG00000013555) #23 SH3BP5 (ENSEEEG00000013553) #28 mturn (ENSEEEG00000013552) znrf2a (ENSEEEG00000013551) ggcta (ENSEEEG00000013550) snrpd1 (ENSEEEG00000013549) clptm1l (ENSEEEG00000013365) rplp1 (ENSEEEG00000013353) PTK2 (ENSEEEG00000013275) ENSEEEG00000013260 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00390000014833 ENSGT00390000011295.b ENSGT00800000125328 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000157827 ENSGT00940000162033.a.b.a ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000163281.b ENSGT00390000005553 ENSGT00940000161409 ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000178869 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00390000018500.b.b.b #28 ENSGT00500000045044 ENSGT00940000159017.a.b.a ENSGT01100000263547.a.b.b.b.b.a.b.a.a.a.b.a.a ENSGT00500000044921.a ENSGT00510000047245 ENSGT00530000063461.A.b ENSGT00550000074698.b ENSGT00940000155113.a.a.b ENSGT00940000155784.C.u.b ENSGT00940000155602 ENSGT00940000157780 ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b ENSGT01040000240444.B.a Zebrafish MODERN SPECIES 10 ENSDARG00000075271 il6 (ENSDARG00000102318) tomm7 (ENSDARG00000067717) ENSDARG00000078912 hycc1 (ENSDARG00000026762) ENSDARG00000101218 ENSDARG00000076659 ENSDARG00000114159 polr1f (ENSDARG00000024416) sp4 (ENSDARG00000005186) sp8a (ENSDARG00000011870) ENSDARG00000028222 FERD3L (ENSDARG00000092160) twist1a (ENSDARG00000030402) SNX13 (ENSDARG00000013828) ENSDARG00000086326 #22 btd (ENSDARG00000099596) #23 SH3BP5 (ENSDARG00000100529) #28 mturn (ENSDARG00000074505) znrf2a (ENSDARG00000077855) ENSDARG00000079456 ggcta (ENSDARG00000076406) snrpd1 (ENSDARG00000011648) clptm1l (ENSDARG00000021048) rplp1 (ENSDARG00000021864) PTK2 (ENSDARG00000100456) DENND3 (ENSDARG00000078797) klhl7 (ENSDARG00000101445) lrrc3b (ENSDARG00000063215) SLC45A4 (ENSDARG00000104981) ENSDARG00000099438 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182908.C.a.i #22 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182908.C.a.i #22 Golden-line barbel MODERN SPECIES 1756 SNX13 (ENSSGRG00000026617) ENSSGRG00000027438 #22 ENSSGRG00000027439 #22 ENSSGRG00000027440 #22 SH3BP5 (ENSSGRG00000027441) #28 mturn (ENSSGRG00000027536) znrf2a (ENSSGRG00000027538) ENSSGRG00000027541 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 825 ENSGT00950000182908.C.a.j.a.a #22 ENSGT00390000018500.b.b.b.a #28 ENSGT00500000045044.h ENSGT00940000159017.a.b.a.b ENSGT01100000263547.a.b.b.b.b.a.b.a.a.a.b.a.a.a.a.a ENSGT01090000260586 ENSGT00510000047245.nb ENSGT00530000063461.A.b.d Goldfish MODERN SPECIES 10 JUP (ENSCARG00000042945) eif1 (ENSCARG00000042807) ENSCARG00000042724 ENSCARG00000042659 ENSCARG00000067727 FLOT1 (ENSCARG00000067669) ENSCARG00000067664 znf384a (ENSCARG00000067661) ENSCARG00000067635 zbtb22b (ENSCARG00000067623) daxx (ENSCARG00000067608) ENSCARG00000067445 tert (ENSCARG00000067362) DENND3 (ENSCARG00000067335) ENSCARG00000067326 ENSCARG00000066288 #22 SH3BP5 (ENSCARG00000066204) #28 mturn (ENSCARG00000066197) znrf2a (ENSCARG00000066189) PTK2 (ENSCARG00000066085) znrf2a (ENSCARG00000066061) mturn (ENSCARG00000066047) ENSCARG00000066038 ENSCARG00000066032 ENSCARG00000066016 snrpd1 (ENSCARG00000065987) clptm1l (ENSCARG00000065626) ENSCARG00000065552 ENSCARG00000065541 ENSCARG00000065538 ENSCARG00000065533 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00390000014833.s ENSGT00390000011295.b.i ENSGT00800000125328 ENSGT00940000159108.c ENSGT00940000157827.n ENSGT00940000157827.m.a ENSGT00940000162033.a.b.a.b ENSGT01090000259987.b.a.d ENSGT00940000163281.b.c ENSGT00390000005553.g ENSGT00940000161409.d ENSGT00940000163428.b.a.j.b ENSGT00940000166341.u.b ENSGT00950000182856.a.a.a.r ENSGT00950000182908.C.a.j.b #22 ENSGT00950000182908.C.a.j.a.a #22 ENSGT00390000018500.b.b.b.a #28 ENSGT00500000045044.h ENSGT00940000159017.a.b.a.b ENSGT01100000263547.a.b.b.b.b.a.b.a.a.a.b.a.a.a.a.a ENSGT01090000260586 ENSGT00510000047245.nb ENSGT00530000063461.A.b.d ENSGT00550000074698.a.a ENSGT00550000074698.b ENSGT00940000155113.a.a.b.a.a ENSGT00940000155784.C.u.b.a ENSGT00940000155602 ENSGT00940000157780.rb.a ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b.c ENSGT00940000166193.a Common carp reference MODERN SPECIES 12 il6 (ENSCCRG00000034667) hycc1 (ENSCCRG00000028330) ENSCCRG00000058991 ENSCCRG00000007676 sp4 (ENSCCRG00000007702) ENSCCRG00000043472 ITGB8 (ENSCCRG00000055609) ENSCCRG00000035496 POLR1F (ENSCCRG00000041390) FERD3L (ENSCCRG00000047398) twist1a (ENSCCRG00000066617) ENSCCRG00000038881 SNX13 (ENSCCRG00000070657) ENSCCRG00000016456 ENSCCRG00000063008 ENSCCRG00000078961 #22 ENSCCRG00000016428 #28 znrf2a (ENSCCRG00000016439) ENSCCRG00000079799 ENSCCRG00000004108 ENSCCRG00000060398 ENSCCRG00000076891 ENSCCRG00000066922 snrpd1 (ENSCCRG00000064087) clptm1l (ENSCCRG00000016498) rplp1 (ENSCCRG00000027873) ENSCCRG00000000513 ENSCCRG00000004661 klhl7 (ENSCCRG00000028109) lrrc3b (ENSCCRG00000060096) ENSCCRG00000007227 Golden-line barbel MODERN SPECIES 1756 SNX13 (ENSSGRG00000026617) ENSSGRG00000027438 #22 ENSSGRG00000027439 #22 ENSSGRG00000027440 #22 SH3BP5 (ENSSGRG00000027441) #28 mturn (ENSSGRG00000027536) znrf2a (ENSSGRG00000027538) ENSSGRG00000027541 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00940000178859.b ENSGT00390000014833.t ENSGT00390000011295.b.j ENSGT00940000159108.d ENSGT00940000157827.m.b ENSGT00940000162033.a.b.a.a ENSGT01090000259987.b.a.c ENSGT00940000163281.b.d ENSGT00390000005553.h ENSGT00940000161409 ENSGT00940000163428.b.a.j.a ENSGT00940000166341.u.a ENSGT00950000182856.a.a.a.q ENSGT01030000234592.A.a.b.c.a.b.a.b.a ENSGT01030000234592.A.a.b.c.a.b.b ENSGT00950000182908.C.a.j.a.b #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00390000018500.b.b.b.b #28 ENSGT00500000045044.g ENSGT00940000159017.a.b.a.a ENSGT01100000263547.a.b.b.b.b.a.b.a.a.a.b.a.a.a.b ENSGT00500000044921.a ENSGT00510000047245.ob.a ENSGT00530000063461.A.b.c ENSGT00550000074698.b ENSGT00940000155113.a.a.b.a.b ENSGT00940000155784.C.u.b.b ENSGT00550000074698.a.a ENSGT00940000155113.a.a.b.a.a ENSGT00940000155784.C.u.b.a ENSGT00940000155602 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 80 ENSGT00940000178859.b ENSGT00390000014833.t ENSGT00390000011295.b.j ENSGT00940000159108.d ENSGT00940000157827.m.b ENSGT00940000162033.a.b.a.a ENSGT01090000259987.b.a.c ENSGT00940000163281.b.d ENSGT00390000005553.h ENSGT00940000161409.c ENSGT00940000163428.b.a.j.a ENSGT00940000166341.u.a ENSGT00950000182856.a.a.a.q ENSGT01030000234592.A.a.b.c.a.b.a.b.a ENSGT01030000234592.A.a.b.c.a.b.b ENSGT00950000182908.C.a.j.a.b #22 ENSGT00390000013823.a.i #23 ENSGT00390000018500.b.b.b.b #28 ENSGT00500000045044.g ENSGT00940000159017.a.b.a.a ENSGT01100000263547.a.b.b.b.b.a.b.a.a.a.b.a.a.a.b ENSGT00500000044921.a ENSGT00510000047245.ob.a ENSGT00530000063461.A.b.c ENSGT00550000074698.a.b ENSGT00940000155113.a.a.b.a.b ENSGT00940000155784.C.u.b.b ENSGT00940000157780.rb.b ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b.d ENSGT01040000240444.B.a ENSGT00940000166193.b Common carp reference MODERN SPECIES 31 RAPGEF5 (ENSCCRG00000003744) il6 (ENSCCRG00000017495) ENSCCRG00000021977 hycc1 (ENSCCRG00000021947) ENSCCRG00000068985 sp4 (ENSCCRG00000007691) sp8a (ENSCCRG00000057624) ITGB8 (ENSCCRG00000043485) polr1f (ENSCCRG00000002502) FERD3L (ENSCCRG00000030181) twist1a (ENSCCRG00000030178) ENSCCRG00000030173 SNX13 (ENSCCRG00000064645) ENSCCRG00000082489 ENSCCRG00000014651 ENSCCRG00000014678 #22 btd (ENSCCRG00000041725) #23 znrf2a (ENSCCRG00000058021) ENSCCRG00000061212 #28 ENSCCRG00000073978 ggcta (ENSCCRG00000067420) clptm1l (ENSCCRG00000005615) snrpd1 (ENSCCRG00000027883) ENSCCRG00000060945 ENSCCRG00000027891 ENSCCRG00000058615 lrrc3b (ENSCCRG00000072455) SLC45A4 (ENSCCRG00000001335) ENSCCRG00000001527 ENSCCRG00000001552 ENSCCRG00000058852 Golden-line barbel MODERN SPECIES 695 ENSSGRG00000011007 ANKRD28 (ENSSGRG00000010912) #22 btd (ENSSGRG00000010910) #23 ENSSGRG00000010909 SH3BP5 (ENSSGRG00000010887) #28 mturn (ENSSGRG00000010886) ENSSGRG00000010885 znrf2a (ENSSGRG00000010884) ENSSGRG00000010882 snrpd1 (ENSSGRG00000010881) clptm1l (ENSSGRG00000010877) rplp1 (ENSSGRG00000010876) ENSSGRG00000010665 ENSSGRG00000010651 ENSSGRG00000010650 klhl7 (ENSSGRG00000010647) lrrc3b (ENSSGRG00000010642) Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 38 ENSCARG00000040444 scrt1a (ENSCARG00000040420) SNX13 (ENSCARG00000038509) ENSCARG00000038368 twist1a (ENSCARG00000038336) FERD3L (ENSCARG00000038327) ENSCARG00000038304 ENSCARG00000035939 #22 btd (ENSCARG00000035804) #23 ENSCARG00000035782 ENSCARG00000035763 ENSCARG00000035738 ENSCARG00000035715 TGFBR2 (ENSCARG00000035583) ENSCARG00000035570 ENSCARG00000035557 #22 btd (ENSCARG00000035550) #23 SH3BP5 (ENSCARG00000035531) #28 mturn (ENSCARG00000035518) znrf2a (ENSCARG00000035502) ENSCARG00000035484 ggcta (ENSCARG00000035468) snrpd1 (ENSCARG00000035461) clptm1l (ENSCARG00000035341) rplp1 (ENSCARG00000035331) PTK2 (ENSCARG00000032795) DENND3 (ENSCARG00000032651) lrrc3b (ENSCARG00000032644) ENSCARG00000032637 ENSCARG00000032632 TGFBR2 (ENSCARG00000032564) Goldfish MODERN SPECIES 38 ENSCARG00000040749 ENSCARG00000040742 ENSCARG00000040707 ENSCARG00000040690 OXSM (ENSCARG00000040679) cfap20 (ENSCARG00000040661) dgat1a (ENSCARG00000040513) zgc:63863 (ENSCARG00000040459) ENSCARG00000040444 scrt1a (ENSCARG00000040420) SNX13 (ENSCARG00000038509) ENSCARG00000038368 twist1a (ENSCARG00000038336) FERD3L (ENSCARG00000038327) ENSCARG00000038304 ENSCARG00000035939 #22 btd (ENSCARG00000035804) #23 ENSCARG00000035782 ENSCARG00000035763 ENSCARG00000035738 ENSCARG00000035715 TGFBR2 (ENSCARG00000035583) ENSCARG00000035570 ENSCARG00000035557 #22 btd (ENSCARG00000035550) #23 SH3BP5 (ENSCARG00000035531) #28 mturn (ENSCARG00000035518) znrf2a (ENSCARG00000035502) ENSCARG00000035484 ggcta (ENSCARG00000035468) snrpd1 (ENSCARG00000035461) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 644 ENSGT00940000155137.b.c ENSGT00940000178859.a ENSGT00390000014833.s ENSGT00390000011295.b.i ENSGT00800000125328 ENSGT00940000159108.c ENSGT00940000157827.m.a ENSGT00940000162033.a.b.a.b ENSGT01090000259987.b.a.d ENSGT00940000163281.b.c ENSGT00390000005553.g ENSGT00940000163428.b.a.j.b ENSGT00940000166341.u.b ENSGT00950000182856.a.a.a.r ENSGT00950000182908.C.a.j.b #22 Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 3314 ENSCARG00000049416 #22 Goldfish MODERN SPECIES 38 nup42 (ENSCARG00000044818) cyp51 (ENSCARG00000043458) tmem79a (ENSCARG00000043395) ENSCARG00000043374 il6 (ENSCARG00000043341) TOMM7 (ENSCARG00000043304) hycc1 (ENSCARG00000043034) sp4 (ENSCARG00000042972) sp8a (ENSCARG00000042957) ENSCARG00000042914 ENSCARG00000042881 twist1a (ENSCARG00000042851) SNX13 (ENSCARG00000040999) ENSCARG00000040962 ENSCARG00000040954 ENSCARG00000040894 #22 ENSCARG00000040861 ENSCARG00000040841 ENSCARG00000040829 ST3GAL1 (ENSCARG00000040814) ENSCARG00000040805 eno2 (ENSCARG00000040759) tpi1a (ENSCARG00000040724) gnb3b (ENSCARG00000040701) ENSCARG00000040677 stx1b (ENSCARG00000040639) prf1.3 (ENSCARG00000040625) ENSCARG00000040590 si:dkeyp-113d7.1 (ENSCARG00000040581) ENSCARG00000040556 krtt1c19e (ENSCARG00000040524) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000178859.a ENSGT00390000014833.s ENSGT00390000011295.b.i ENSGT00800000125328 ENSGT00940000159108.c ENSGT00940000157827.n ENSGT00940000157827.m.a ENSGT00940000162033.a.b.a.b ENSGT01090000259987.b.a.d ENSGT00940000163281.b.c ENSGT00390000005553.g ENSGT00940000161409.d ENSGT00940000163428.b.a.j.b ENSGT00940000166341.u.b ENSGT00950000182856.a.a.a.r ENSGT00950000182908.C.a.j.b #22 ENSGT00950000182908.C.a.j.a.a #22 ENSGT00390000018500.b.b.b.a #28 ENSGT00500000045044.h ENSGT00940000159017.a.b.a.b ENSGT01100000263547.a.b.b.b.b.a.b.a.a.a.b.a.a.a.a.a ENSGT01090000260586 ENSGT00510000047245.nb ENSGT00530000063461.A.b.d ENSGT00550000074698.a.a ENSGT00550000074698.b ENSGT00940000155113.a.a.b.a.a ENSGT00940000155784.C.u.b.a ENSGT00940000155602 ENSGT00940000157780.rb.a ENSGT00950000182914.a.a.a.c.b.c Golden-line barbel MODERN SPECIES 1756 SNX13 (ENSSGRG00000026617) ENSSGRG00000027438 #22 ENSSGRG00000027439 #22 ENSSGRG00000027440 #22 SH3BP5 (ENSSGRG00000027441) #28 mturn (ENSSGRG00000027536) znrf2a (ENSSGRG00000027538) ENSSGRG00000027541 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 172 ENSGT00390000000118 ENSGT00940000155602 ENSGT00940000155137.a.b ENSGT00390000014833 ENSGT00390000011295.b ENSGT00940000159108 ENSGT00940000157827 ENSGT00940000162033.a.b.a ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000163281.b ENSGT00390000005553 ENSGT00940000161409 ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00390000018500.b.b.b #28 ENSGT00500000045044 ENSGT00940000159017.a.b ENSGT00500000044921.a ENSGT00510000047245.mb ENSGT00730000111394 ENSGT00940000176166 ENSGT00940000154870.A.b ENSGT00400000025005 ENSGT00990000204388 ENSGT00940000158522.m ENSGT00950000182919.B.a.h ENSGT00940000159283.c.a Atlantic herring MODERN SPECIES 10 klhl7 (ENSCHAG00000000744) RAPGEF5 (ENSCHAG00000000509) ENSCHAG00000022506 TOMM7 (ENSCHAG00000022494) hycc1 (ENSCHAG00000022476) CDCA7L (ENSCHAG00000022456) sp4 (ENSCHAG00000022425) sp8a (ENSCHAG00000022415) ITGB8 (ENSCHAG00000022224) ENSCHAG00000022201 polr1f (ENSCHAG00000022198) FERD3L (ENSCHAG00000022187) twist1a (ENSCHAG00000022174) ENSCHAG00000022131 SNX13 (ENSCHAG00000021540) ANKRD28 (ENSCHAG00000017321) #22 btd (ENSCHAG00000017074) #23 SH3BP5 (ENSCHAG00000016955) #28 mturn (ENSCHAG00000016924) znrf2a (ENSCHAG00000016885) ggcta (ENSCHAG00000016657) snrpd1 (ENSCHAG00000016617) thap7 (ENSCHAG00000016585) ENSCHAG00000016559 s100v2 (ENSCHAG00000016552) ENSCHAG00000016441 ENSCHAG00000016423 ENSCHAG00000016417 ENSCHAG00000016413 ENSCHAG00000016394 polr3gla (ENSCHAG00000016381) Denticle herring MODERN SPECIES 12 CDCA7L (ENSDCDG00000027486) sp4 (ENSDCDG00000027489) ENSDCDG00000027491 ITGB8 (ENSDCDG00000027510) ENSDCDG00000028181 polr1f (ENSDCDG00000028182) TWIST1 (ENSDCDG00000028183) ENSDCDG00000028184 ENSDCDG00000028187 ENSDCDG00000028191 ENSDCDG00000028214 polr1f (ENSDCDG00000028215) TWIST1 (ENSDCDG00000028216) ENSDCDG00000028218 SNX13 (ENSDCDG00000028231) ANKRD28 (ENSDCDG00000028605) #22 btd (ENSDCDG00000032115) #23 SH3BP5 (ENSDCDG00000032120) #28 mturn (ENSDCDG00000032123) znrf2a (ENSDCDG00000032125) ggcta (ENSDCDG00000032126) snrpd1 (ENSDCDG00000032128) thap7 (ENSDCDG00000032131) si:ch211-195b13.1 (ENSDCDG00000032161) eya3 (ENSDCDG00000032708) ENSDCDG00000032799 ENSDCDG00000032801 xkr8.3 (ENSDCDG00000032803) ENSDCDG00000032804 ENSDCDG00000032806 ENSDCDG00000032807 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000011295.b ENSGT00390000014833 ENSGT01030000235040 ENSGT00940000155137.a.b ENSGT00940000159108.i ENSGT00940000157827.g ENSGT00940000162033.a.b ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00390000013151.a.b.f ENSGT00940000163281.b ENSGT00390000005553 ENSGT00940000161409 ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00940000157248.c.b #25 Asian bonytongue MODERN SPECIES 15 hycc1 (ENSSFOG00015012478) TOMM7 (ENSSFOG00015032890) ENSSFOG00015012577 RAPGEF5 (ENSSFOG00015012593) CDCA7L (ENSSFOG00015012653) sp4 (ENSSFOG00015032600) sp8a (ENSSFOG00015028849) ITGB8 (ENSSFOG00015012748) macc1 (ENSSFOG00015012762) ENSSFOG00015012775 polr1f (ENSSFOG00015012788) FERD3L (ENSSFOG00015025160) twist1a (ENSSFOG00015012815) ENSSFOG00015032351 SNX13 (ENSSFOG00015012849) ANKRD28 (ENSSFOG00015012994) #22 btd (ENSSFOG00015013192) #23 COLQ (ENSSFOG00015013200) #25 ENSSFOG00015013224 ENSSFOG00015013229 ENSSFOG00015013247 ENSSFOG00015013274 TRIL (ENSSFOG00015013322) CREB5 (ENSSFOG00015013343) JAZF1 (ENSSFOG00015021725) tax1bp1a (ENSSFOG00015013406) hibadhb (ENSSFOG00015030994) evx1 (ENSSFOG00015030473) hoxa13a (ENSSFOG00015013482) hoxa11a (ENSSFOG00015013545) hoxa10b (ENSSFOG00015013555) Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000157827 ENSGT00940000162033.a.b ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163281.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000163281.b ENSGT00390000005553 ENSGT00940000161409 ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00940000154486.b.a.b ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858 ENSGT00940000160267 ENSGT00760000119737 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00390000011295.b ENSGT00390000014833 ENSGT00390000000878 ENSGT00940000155137.b ENSGT00940000155137.a.b ENSGT00940000159108 ENSGT00940000157827 ENSGT00940000162033.a.b ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000163281.b ENSGT00390000005553 ENSGT00940000161409 ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00940000154486.b.a.b ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00390000018500.b.b.b #28 ENSGT00500000045044 ENSGT00940000159017.a.b ENSGT00650000093438 ENSGT00390000009631 ENSGT00940000169325 ENSGT00940000157432.B ENSGT01000000214440.A.a.a ENSGT00940000164984 ENSGT00940000157640 ENSGT00940000162584.j ENSGT00940000159017.a.a Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 224 ENSGT00940000155602 ENSGT00940000155137.a.b ENSGT00390000014833 ENSGT00390000011295.b ENSGT00800000125328 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000157827 ENSGT00940000162033.a.b.a ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000163281.b ENSGT00390000005553 ENSGT00940000161409 ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00940000154486.b.a.b ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00390000018500.b.b.b #28 ENSGT00500000045044 ENSGT00940000159017.a.b ENSGT00500000044921.a ENSGT00510000047245 ENSGT00940000155579.a Otophysi ANCESTRAL SPECIES 170 ENSGT00940000155137.b.c ENSGT00940000178859 ENSGT00390000014833 ENSGT00390000011295.b ENSGT00800000125328 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000157827 ENSGT00940000162033.a.b.a ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000163281.b ENSGT00390000005553 ENSGT00940000161409 ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00940000154486.b.a.b ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000178869 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00390000018500.b.b.b #28 ENSGT00500000045044 ENSGT00940000159017.a.b ENSGT00500000044921.a ENSGT00510000047245 ENSGT00530000063461.A.b ENSGT00550000074698.b ENSGT00940000155113.a.a.b ENSGT00940000155784.C.u.b ENSGT00940000155602 ENSGT00940000157780 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000177026 ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650.e ENSGT00940000164650.f ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00940000155287 ENSGT00390000013151.a.b ENSGT01060000253044 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000178869 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT00760000119737.b ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.a Channel catfish MODERN SPECIES Slc6a19 (ENSIPUG00000001817) SLC6A18 (ENSIPUG00000001855) ENSIPUG00000001866 ENSIPUG00000001873 ENSIPUG00000001882 DNAH11 (ENSIPUG00000001945) sp8b (ENSIPUG00000002254) ENSIPUG00000002262 macc1 (ENSIPUG00000002290) ENSIPUG00000002297 hbb (ENSIPUG00000002316) hbae (ENSIPUG00000002404) twist1 (ENSIPUG00000002432) hdac9b (ENSIPUG00000002452) ahr (ENSIPUG00000002501) ankrd28 (ENSIPUG00000002544) #22 ENSIPUG00000002675 hacl1 (ENSIPUG00000002681) #24 colq (ENSIPUG00000002698) #25 plekha8 (ENSIPUG00000002723) FKBP14 (ENSIPUG00000002766) ENSIPUG00000002780 chn2 (ENSIPUG00000002792) CPVL (ENSIPUG00000002845) creb5 (ENSIPUG00000002879) ENSIPUG00000002901 jazf1 (ENSIPUG00000002919) tax1bp1 (ENSIPUG00000002965) hibadh (ENSIPUG00000003016) hoxa13b (ENSIPUG00000003037) hoxa11 (ENSIPUG00000003074) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155137.b.d ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00940000155287 ENSGT00390000013151.a.b ENSGT01060000253044 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT00760000119737.b ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.a ENSGT00940000164628 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 329 ENSGT00940000162033.a.b.b ENSGT00940000166052 ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163281.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000166341 ENSGT00940000154486.b.a.b ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000178869 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 738 macc1 (ENSPNAG00000015846) ENSPNAG00000015854 ENSPNAG00000015873 hdac9b (ENSPNAG00000015973) ahr1a (ENSPNAG00000016149) ENSPNAG00000016222 #22 ENSPNAG00000003411 Mexicana tetra MODERN SPECIES 25 abcd4 (ENSAMXG00000004384) KLHL14 (ENSAMXG00000043692) ENSAMXG00000044115 dtna (ENSAMXG00000004333) mapre2 (ENSAMXG00000033250) SPIDR (ENSAMXG00000034318) cebpd (ENSAMXG00000037523) mcm4 (ENSAMXG00000004298) ube2v2 (ENSAMXG00000041649) snai2 (ENSAMXG00000038235) SNTG1 (ENSAMXG00000032073) pcmtd1 (ENSAMXG00000004269) ENSAMXG00000035774 ENSAMXG00000041785 RB1CC1 (ENSAMXG00000004228) ENSAMXG00000043688 #22 Electric eel MODERN SPECIES 39 rapgef5b (ENSEEEG00000013688) ENSEEEG00000013689 DNAH11 (ENSEEEG00000013712) sp8b (ENSEEEG00000013842) ENSEEEG00000013867 ENSEEEG00000014088 macc1 (ENSEEEG00000014089) ENSEEEG00000014091 twist1b (ENSEEEG00000014093) hdac9b (ENSEEEG00000014099) ANKRD28 (ENSEEEG00000014197) #22 hacl1 (ENSEEEG00000014667) #24 COLQ (ENSEEEG00000014684) #25 plekha8 (ENSEEEG00000014685) fkbp14 (ENSEEEG00000014686) ENSEEEG00000014687 CHN2 (ENSEEEG00000014689) ENSEEEG00000014690 cpvl (ENSEEEG00000014691) CREB5 (ENSEEEG00000014694) JAZF1 (ENSEEEG00000014697) ENSEEEG00000014702 ENSEEEG00000014703 hibadhb (ENSEEEG00000014704) hoxa13b (ENSEEEG00000014718) hoxa11b (ENSEEEG00000014719) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000157527.b ENSGT00940000155137.a.b ENSGT00940000178859 ENSGT00390000014833 ENSGT00390000011295.b ENSGT00800000125328 ENSGT00940000159108 ENSGT00940000157827 ENSGT00940000162033.a.b.a ENSGT01090000259987.b.a ENSGT00940000163281.b ENSGT00390000005553 ENSGT00940000161409 ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000178869 ENSGT00950000182856.a.a.a ENSGT00950000182908.C.a #22 ENSGT00390000013823.a #23 ENSGT00390000018500.b.b.b #28 ENSGT00500000045044 ENSGT00940000159017.a.b.a ENSGT01100000263547.a.b.b.b.b.a.b.a.a.a.b.a.a ENSGT00500000044921.a ENSGT00510000047245 ENSGT00530000063461.A.b ENSGT00550000074698.b ENSGT00940000155113.a.a.b ENSGT00940000155784.C.u.b ENSGT00940000155602 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 184 ENSGT00940000177026.b ENSGT00390000008061.j.b.c.b.b ENSGT01000000216736 ENSGT00940000159208.B.b ENSGT00940000154807.a.a.eb ENSGT00940000154896.l.a.b ENSGT00940000164650.g.b ENSGT00940000155137.a.a.a.a ENSGT00940000162033.a.a.a ENSGT00940000166052 ENSGT00390000013151.a.b.j ENSGT00940000163281.a.b ENSGT00940000163428.b.a.i.b ENSGT00940000166341.v.a ENSGT00940000154486.b.a.b.a ENSGT00950000182908.C.b.a #22 ENSGT00940000157248.c.a.b #25 ENSGT00940000157288.m ENSGT00940000157858.i.a ENSGT00760000119737.b.a.b ENSGT01030000234635.a.b.a.a.b ENSGT00940000159498.b ENSGT00940000156420.a.a.h ENSGT00390000003635.h.d ENSGT00950000183025.b.a.`b.b ENSGT00940000155255.cb ENSGT00940000164071.b.a.b ENSGT00940000158311.b.a ENSGT00940000163268.d.a.b ENSGT00940000164628.t ENSGT00940000155029.c.a.e.a.b Goldfish MODERN SPECIES 35 ENSCARG00000052211 ENSCARG00000052197 rxrbb (ENSCARG00000051979) FHOD3 (ENSCARG00000051396) slc6a19b (ENSCARG00000050684) ENSCARG00000050385 rapgef5b (ENSCARG00000050346) sox4b (ENSCARG00000050335) ENSCARG00000050327 ENSCARG00000050256 sp8b (ENSCARG00000050203) ENSCARG00000048354 macc1 (ENSCARG00000048210) twist1b (ENSCARG00000048182) hdac9b (ENSCARG00000048101) ANKRD28 (ENSCARG00000039700) #22 plekha8 (ENSCARG00000039034) fkbp14 (ENSCARG00000039016) ENSCARG00000039008 CHN2 (ENSCARG00000037973) cpvl (ENSCARG00000037316) ENSCARG00000037247 CREB5 (ENSCARG00000037074) JAZF1 (ENSCARG00000037004) tax1bp1b (ENSCARG00000036964) hibadhb (ENSCARG00000036861) hoxa13b (ENSCARG00000036849) hoxa11b (ENSCARG00000036840) hoxa10b (ENSCARG00000036829) hoxa9b (ENSCARG00000036819) hoxa2b (ENSCARG00000036803) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000154807.a.a.eb ENSGT00940000154896.l.a.b ENSGT00940000164650.g.b ENSGT00940000155137.a.a.a.a ENSGT00940000164650.h ENSGT00940000155137.b.d ENSGT00940000155137.a.a.b ENSGT00940000158880.ob ENSGT00940000162033.a.a.a ENSGT00940000166052 ENSGT00390000013151.a.b.j ENSGT00940000163281.a.b ENSGT00940000163428.b.a.i.b ENSGT00940000166341.v.a ENSGT00940000154486.b.a.b.a ENSGT00950000182908.C.b.a #22 ENSGT00940000157248.c.a.b #25 ENSGT00940000157288.m ENSGT00940000157858.i.a ENSGT01030000234635.a.b.a.a.b ENSGT00940000159498.b ENSGT00940000156420.a.a.h ENSGT00390000003635.h.d ENSGT00950000183025.b.a.`b.b ENSGT00940000155255.cb ENSGT00940000164071.b.a.b ENSGT00940000158311.b.a ENSGT00940000163268.d.a.b ENSGT00940000164628.t ENSGT00940000155029.c.a.e.a.a ENSGT00390000017856.a.k Common carp reference MODERN SPECIES 2 ENSCCRG00000051668 rxrbb (ENSCCRG00000028908) ENSCCRG00000050237 slc6a19b (ENSCCRG00000029545) ENSCCRG00000029527 ENSCCRG00000063722 ENSCCRG00000080234 ENSCCRG00000082667 sp8b (ENSCCRG00000021559) ENSCCRG00000070247 macc1 (ENSCCRG00000043252) ENSCCRG00000043247 twist1b (ENSCCRG00000073937) hdac9b (ENSCCRG00000021353) ahr1a (ENSCCRG00000041947) ENSCCRG00000019294 #22 ENSCCRG00000030998 ENSCCRG00000018624 #25 plekha8 (ENSCCRG00000066528) fkbp14 (ENSCCRG00000073005) CHN2 (ENSCCRG00000057495) cpvl (ENSCCRG00000008246) CREB5 (ENSCCRG00000054780) JAZF1 (ENSCCRG00000080168) tax1bp1b (ENSCCRG00000056000) hibadhb (ENSCCRG00000012416) hoxa13b (ENSCCRG00000012410) hoxa11b (ENSCCRG00000066087) hoxa10b (ENSCCRG00000007094) hoxa9b (ENSCCRG00000007096) hoxa2b (ENSCCRG00000047655) Golden-line barbel MODERN SPECIES 407 macc1 (ENSSGRG00000055107) ENSSGRG00000055106 twist1b (ENSSGRG00000055105) hdac9b (ENSSGRG00000055104) ENSSGRG00000055103 ENSSGRG00000055062 #22 ENSSGRG00000055039 #24 plekha8 (ENSSGRG00000055038) fkbp14 (ENSSGRG00000055037) CHN2 (ENSSGRG00000055032) cpvl (ENSSGRG00000055031) CREB5 (ENSSGRG00000055030) ENSSGRG00000055028 JAZF1 (ENSSGRG00000055027) tax1bp1b (ENSSGRG00000055025) hibadhb (ENSSGRG00000055023) hoxa13b (ENSSGRG00000055021) hoxa11b (ENSSGRG00000055020) hoxa10b (ENSSGRG00000055018) hoxa9b (ENSSGRG00000055017) hoxa2b (ENSSGRG00000055016) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 106 ENSGT00940000155565.a.a ENSGT01100000263473.b.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000159208.B.a ENSGT00940000154807.a.a.db ENSGT00940000154896.l.a.a ENSGT00940000164650.g.a ENSGT00940000155137.a.a.a.b ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a.b ENSGT00940000155287 ENSGT00390000013151.a.b.i ENSGT00940000163281.a.a ENSGT00940000163428.b.a.i.a ENSGT00940000166341.v.b ENSGT00940000154486.b.a.b.b ENSGT00950000182908.C.b.b #22 ENSGT00940000178869 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a.a #25 ENSGT00940000157288.n ENSGT00940000157858.i.b ENSGT00760000119737.b.a.a ENSGT01030000234635.a.b.a.a.a ENSGT00940000159498.a ENSGT00940000156420.a.a.g ENSGT00390000003635.h.c ENSGT00950000183025.b.a.`b.a ENSGT00940000155255.bb ENSGT00940000164071.b.a.a ENSGT00940000158311.b.b ENSGT00940000163268.d.a.a Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000155565.a.a ENSGT01100000263473.b.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000159208.B.a ENSGT00940000154807.a.a.db ENSGT00940000154896.l.a.a ENSGT00940000164650.g.a ENSGT00940000155137.a.a.a.b ENSGT00940000158880.nb ENSGT00940000162033.a.a.b ENSGT00940000155287 ENSGT00390000013151.a.b.i ENSGT00940000163281.a.a ENSGT00940000163428.b.a.i.a ENSGT00940000166341.v.b ENSGT00940000154486.b.a.b.b ENSGT00950000182908.C.b.b #22 ENSGT00940000178869 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a.a #25 ENSGT00940000157288.n ENSGT00940000157858.i.b ENSGT00760000119737.b.a.a ENSGT01030000234635.a.b.a.a.a ENSGT00940000159498.a ENSGT00940000156420.a.a.g ENSGT00390000003635.h.c ENSGT00950000183025.b.a.`b.a ENSGT00940000155255.bb ENSGT00940000164071.b.a.a ENSGT00940000158311.b.b ENSGT00940000163268.d.a.a Golden-line barbel MODERN SPECIES 221 ENSSGRG00000015030 rxrbb (ENSSGRG00000015038) FHOD3 (ENSSGRG00000015130) slc6a19b (ENSSGRG00000015150) ENSSGRG00000015295 ENSSGRG00000015313 ENSSGRG00000015342 ENSSGRG00000015345 sp8b (ENSSGRG00000015346) ENSSGRG00000015364 macc1 (ENSSGRG00000017156) ENSSGRG00000017157 twist1b (ENSSGRG00000017158) hdac9b (ENSSGRG00000017162) ahr1a (ENSSGRG00000017174) ANKRD28 (ENSSGRG00000017910) #22 hacl1 (ENSSGRG00000020067) #24 plekha8 (ENSSGRG00000020120) fkbp14 (ENSSGRG00000020246) ENSSGRG00000020247 CHN2 (ENSSGRG00000020252) cpvl (ENSSGRG00000020303) CREB5 (ENSSGRG00000020355) JAZF1 (ENSSGRG00000020357) tax1bp1b (ENSSGRG00000020360) hibadhb (ENSSGRG00000020361) hoxa13b (ENSSGRG00000020364) hoxa11b (ENSSGRG00000020365) hoxa10b (ENSSGRG00000020366) hoxa9b (ENSSGRG00000020367) hoxa2b (ENSSGRG00000020369) Common carp reference MODERN SPECIES 47 ENSCCRG00000055645 ENSCCRG00000028906 rxrbb (ENSCCRG00000054882) ENSCCRG00000004830 slc6a19b (ENSCCRG00000050108) ENSCCRG00000029523 ENSCCRG00000034703 DNAH11 (ENSCCRG00000037634) sp8b (ENSCCRG00000060103) ENSCCRG00000058546 macc1 (ENSCCRG00000021557) ENSCCRG00000077612 hdac9b (ENSCCRG00000027316) twist1b (ENSCCRG00000056709) ahr1a (ENSCCRG00000021084) ANKRD28 (ENSCCRG00000018690) #22 ENSCCRG00000018651 hacl1 (ENSCCRG00000018645) #24 COLQ (ENSCCRG00000053136) #25 plekha8 (ENSCCRG00000018609) fkbp14 (ENSCCRG00000073955) ENSCCRG00000018596 CHN2 (ENSCCRG00000053278) cpvl (ENSCCRG00000008840) CREB5 (ENSCCRG00000055556) JAZF1 (ENSCCRG00000064899) tax1bp1b (ENSCCRG00000073078) hibadhb (ENSCCRG00000063298) hoxa13b (ENSCCRG00000004452) hoxa11b (ENSCCRG00000004438) hoxa10b (ENSCCRG00000042776) Goldfish MODERN SPECIES 7 ENSCARG00000031553 ENSCARG00000031549 ENSCARG00000031541 rxrbb (ENSCARG00000031149) FHOD3 (ENSCARG00000030737) slc6a19b (ENSCARG00000030516) ENSCARG00000030271 ENSCARG00000030240 sp8b (ENSCARG00000028485) ENSCARG00000016909 macc1 (ENSCARG00000016586) ENSCARG00000016578 twist1b (ENSCARG00000016569) hdac9b (ENSCARG00000016508) ahr1a (ENSCARG00000015717) ANKRD28 (ENSCARG00000009382) #22 hacl1 (ENSCARG00000008333) #24 COLQ (ENSCARG00000008262) #25 plekha8 (ENSCARG00000008198) fkbp14 (ENSCARG00000008170) ENSCARG00000008165 CHN2 (ENSCARG00000008078) cpvl (ENSCARG00000007941) CREB5 (ENSCARG00000007899) JAZF1 (ENSCARG00000007879) tax1bp1b (ENSCARG00000007852) hibadhb (ENSCARG00000007813) hoxa13b (ENSCARG00000007807) hoxa11b (ENSCARG00000007800) hoxa10b (ENSCARG00000007790) hoxa9b (ENSCARG00000007788) Zebrafish MODERN SPECIES 7 rxrbb (ENSDARG00000002006) FHOD3 (ENSDARG00000061904) slc6a19b (ENSDARG00000056719) ENSDARG00000056750 ENSDARG00000094999 rapgef5b (ENSDARG00000074307) DNAH11 (ENSDARG00000094282) ENSDARG00000077384 sp8b (ENSDARG00000056666) ENSDARG00000021787 macc1 (ENSDARG00000040717) ENSDARG00000090140 twist1b (ENSDARG00000076010) hdac9b (ENSDARG00000056642) ahr1a (ENSDARG00000020046) ANKRD28 (ENSDARG00000009023) #22 c16h2orf66 (ENSDARG00000116758) hacl1 (ENSDARG00000020529) #24 COLQ (ENSDARG00000019692) #25 plekha8 (ENSDARG00000040698) fkbp14 (ENSDARG00000040695) ENSDARG00000095615 CHN2 (ENSDARG00000011845) cpvl (ENSDARG00000056480) CREB5 (ENSDARG00000070536) JAZF1 (ENSDARG00000056793) tax1bp1b (ENSDARG00000056856) hibadhb (ENSDARG00000007959) hoxa13b (ENSDARG00000036254) hoxa11b (ENSDARG00000007009) hoxa10b (ENSDARG00000031337) Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182908.C.b #22 Denticle herring MODERN SPECIES 15 marchf7 (ENSDCDG00000004004) LY75 (ENSDCDG00000004011) PLA2R1 (ENSDCDG00000004042) ITGB6 (ENSDCDG00000004139) ENSDCDG00000004756 ENSDCDG00000004814 wdsub1 (ENSDCDG00000004834) ENSDCDG00000004847 ENSDCDG00000004854 ENSDCDG00000004864 ENSDCDG00000004873 ENSDCDG00000004878 ENSDCDG00000004894 macc1 (ENSDCDG00000004948) ENSDCDG00000004949 ENSDCDG00000004950 #22 ENSDCDG00000004967 slc6a19b (ENSDCDG00000005047) ENSDCDG00000008381 rxrbb (ENSDCDG00000008486) ENSDCDG00000008610 ENSDCDG00000008636 ENSDCDG00000008656 PTP4A3 (ENSDCDG00000008668) ENSDCDG00000008754 ENSDCDG00000009194 DGAT1 (ENSDCDG00000009258) SLC45A4 (ENSDCDG00000009376) ENSDCDG00000009387 MRS2 (ENSDCDG00000010545) ENSDCDG00000010586 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT00940000155739 ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00940000166052 ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163281.a ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00940000154486.b.a.b ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858.i ENSGT00760000119737 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00940000171365 ENSGT00940000156420.b ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00390000013846.a.b ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00940000171365 ENSGT00940000156420.b ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.k.a ENSGT00940000154896.k.b ENSGT00940000158906.j ENSGT00940000154807.b ENSGT00940000160212 ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00940000171365 ENSGT00940000156420.b ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00940000171365 ENSGT00940000156420.b ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00940000171365 ENSGT00940000156420.b ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01030000235045 ENSGT00940000155739 ENSGT00950000183411 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00940000171365 ENSGT00940000156420.b ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT01030000235045 ENSGT00940000155739 ENSGT00950000183411 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT01030000235045 ENSGT00940000155739 ENSGT00950000183411 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000013846.a.b ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a.c ENSGT00940000155565.a.d ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Mangrove rivulus MODERN SPECIES 92 c4b (ENSKMAG00000016664) c4b (ENSKMAG00000016480) ENSKMAG00000016410 rxrbb (ENSKMAG00000016360) FHOD3 (ENSKMAG00000016169) ENSKMAG00000016123 ENSKMAG00000016115 RAPGEF5 (ENSKMAG00000016078) DNAH11 (ENSKMAG00000015924) ENSKMAG00000015867 sp8b (ENSKMAG00000015834) macc1 (ENSKMAG00000015806) ENSKMAG00000015779 twist1b (ENSKMAG00000015768) hdac9b (ENSKMAG00000015707) ANKRD28 (ENSKMAG00000015591) #22 hacl1 (ENSKMAG00000015483) #24 COLQ (ENSKMAG00000015426) #25 plekha8 (ENSKMAG00000015362) fkbp14 (ENSKMAG00000015321) CHN2 (ENSKMAG00000015268) cpvl (ENSKMAG00000015213) CREB5 (ENSKMAG00000015158) JAZF1 (ENSKMAG00000015126) tax1bp1b (ENSKMAG00000015099) hibadhb (ENSKMAG00000015068) hoxa13b (ENSKMAG00000015035) hoxa11b (ENSKMAG00000015024) ENSKMAG00000015007 hoxa9b (ENSKMAG00000014986) hoxa2b (ENSKMAG00000014967) Turquoise killifish MODERN SPECIES 1614 KCNK5B (ENSNFUG00015002456) ENSNFUG00015002451 ENSNFUG00015002305 CK2B (ENSNFUG00015002253) AIF1 (ENSNFUG00015002243) ENSNFUG00015002227 RXRBB (ENSNFUG00015002175) FHOD3 (ENSNFUG00015001811) ENSNFUG00015001687 ENSNFUG00015001653 ENSNFUG00015001462 macc1 (ENSNFUG00015001453) TWIST1 (ENSNFUG00015001445) hdac9b (ENSNFUG00015001430) ENSNFUG00015001412 ANKRD28 (ENSNFUG00015001085) #22 ENSNFUG00015000965 hacl1 (ENSNFUG00015000945) #24 COLQ (ENSNFUG00015000936) #25 PLEKHA8 (ENSNFUG00015000887) FKBP14 (ENSNFUG00015000869) CHN2 (ENSNFUG00015000744) ccdc12 (ENSNFUG00015000660) TMEM104 (ENSNFUG00015000650) ENSNFUG00015000641 GRIN2CA (ENSNFUG00015000576) ENSNFUG00015000521 ENSNFUG00015000516 ENSNFUG00015000512 ENSNFUG00015000507 RBFOX3L (ENSNFUG00015000470) Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT01030000235045 ENSGT00940000155739 ENSGT00950000183411 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000013846.a.b ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT00950000183411 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Sheepshead minnow MODERN SPECIES 114 phf14 (ENSCVAG00000013092) ENSCVAG00000013043 ENSCVAG00000013033 ENSCVAG00000012964 ENSCVAG00000012868 ENSCVAG00000012735 ENSCVAG00000012710 ENSCVAG00000000330 sp8b (ENSCVAG00000012665) macc1 (ENSCVAG00000012657) twist1b (ENSCVAG00000012651) hdac9b (ENSCVAG00000012568) ANKRD28 (ENSCVAG00000012490) #22 hacl1 (ENSCVAG00000012437) #24 COLQ (ENSCVAG00000012396) #25 plekha8 (ENSCVAG00000012388) fkbp14 (ENSCVAG00000012339) CHN2 (ENSCVAG00000012319) cpvl (ENSCVAG00000012267) CREB5 (ENSCVAG00000012236) JAZF1 (ENSCVAG00000012204) tax1bp1b (ENSCVAG00000012188) hibadhb (ENSCVAG00000012164) hoxa13b (ENSCVAG00000012158) hoxa11b (ENSCVAG00000012150) ENSCVAG00000012147 hoxa9b (ENSCVAG00000012142) hoxa2b (ENSCVAG00000012133) Mummichog MODERN SPECIES 2197 ENSFHEG00000013958 c4b (ENSFHEG00000014065) c4b (ENSFHEG00000014157) ENSFHEG00000014165 ENSFHEG00000014179 rxrbb (ENSFHEG00000014238) FHOD3 (ENSFHEG00000014267) ENSFHEG00000014284 RAPGEF5 (ENSFHEG00000014322) DNAH11 (ENSFHEG00000014485) ENSFHEG00000014634 sp8b (ENSFHEG00000014695) macc1 (ENSFHEG00000014702) twist1b (ENSFHEG00000014722) hdac9b (ENSFHEG00000014754) ANKRD28 (ENSFHEG00000014860) #22 hacl1 (ENSFHEG00000014867) #24 COLQ (ENSFHEG00000000612) #25 plekha8 (ENSFHEG00000014916) fkbp14 (ENSFHEG00000014927) CHN2 (ENSFHEG00000014974) cpvl (ENSFHEG00000015030) CREB5 (ENSFHEG00000015078) JAZF1 (ENSFHEG00000015101) tax1bp1b (ENSFHEG00000015152) hibadhb (ENSFHEG00000015184) hoxa13b (ENSFHEG00000000840) hoxa11b (ENSFHEG00000015193) ENSFHEG00000015202 hoxa9b (ENSFHEG00000015199) hoxa2b (ENSFHEG00000015214) Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000013846.a.b ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT01030000235045 ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a.e ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Poecilia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000013846.a.b ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT01030000235045 ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a.e ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e NAME_6 DUPLICATION NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00390000013846.a.b ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT01030000235045 ENSGT01100000265641 ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b.d #22 ENSGT00950000182908.C.b.c #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a.e ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Sailfin molly DUPLICATION Sailfin molly MODERN SPECIES 3765 ENSPLAG00000006419 #22 hacl1 (ENSPLAG00000006467) #24 Sailfin molly MODERN SPECIES 714 ENSPLAG00000002073 ENSPLAG00000002120 sp8b (ENSPLAG00000002158) macc1 (ENSPLAG00000002169) twist1b (ENSPLAG00000002183) hdac9b (ENSPLAG00000002207) ANKRD28 (ENSPLAG00000002231) #22 ANKRD28 (ENSPLAG00000002245) #22 hacl1 (ENSPLAG00000002269) #24 Amazon molly MODERN SPECIES 503 ENSPFOG00000010771 ENSPFOG00000010703 c4b (ENSPFOG00000010249) ENSPFOG00000010232 rxrbb (ENSPFOG00000010127) FHOD3 (ENSPFOG00000009943) ENSPFOG00000009892 ENSPFOG00000009714 DNAH11 (ENSPFOG00000008061) sp8b (ENSPFOG00000007998) macc1 (ENSPFOG00000007954) twist1b (ENSPFOG00000019887) hdac9b (ENSPFOG00000007880) ANKRD28 (ENSPFOG00000006560) #22 hacl1 (ENSPFOG00000006084) #24 COLQ (ENSPFOG00000022473) #25 ANKRD28 (ENSPFOG00000005715) #22 hacl1 (ENSPFOG00000005527) #24 plekha8 (ENSPFOG00000005412) fkbp14 (ENSPFOG00000005032) CHN2 (ENSPFOG00000005070) cpvl (ENSPFOG00000004633) CREB5 (ENSPFOG00000004378) JAZF1 (ENSPFOG00000004320) tax1bp1b (ENSPFOG00000003952) hibadhb (ENSPFOG00000003856) hoxa13b (ENSPFOG00000003827) hoxa11b (ENSPFOG00000003803) hoxa9b (ENSPFOG00000003793) NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00390000003781.e.a ENSGT00390000013846.a.b ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT01030000235045 ENSGT01100000265641 ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b.d #22 ENSGT00950000182908.C.b.c #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a.e ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 Amazon molly MODERN SPECIES 503 ENSPFOG00000010703 c4b (ENSPFOG00000010249) ENSPFOG00000010232 rxrbb (ENSPFOG00000010127) FHOD3 (ENSPFOG00000009943) ENSPFOG00000009892 ENSPFOG00000009714 DNAH11 (ENSPFOG00000008061) sp8b (ENSPFOG00000007998) macc1 (ENSPFOG00000007954) twist1b (ENSPFOG00000019887) hdac9b (ENSPFOG00000007880) ANKRD28 (ENSPFOG00000006560) #22 hacl1 (ENSPFOG00000006084) #24 COLQ (ENSPFOG00000022473) #25 ANKRD28 (ENSPFOG00000005715) #22 hacl1 (ENSPFOG00000005527) #24 plekha8 (ENSPFOG00000005412) fkbp14 (ENSPFOG00000005032) CHN2 (ENSPFOG00000005070) cpvl (ENSPFOG00000004633) CREB5 (ENSPFOG00000004378) JAZF1 (ENSPFOG00000004320) tax1bp1b (ENSPFOG00000003952) hibadhb (ENSPFOG00000003856) hoxa13b (ENSPFOG00000003827) hoxa11b (ENSPFOG00000003803) hoxa9b (ENSPFOG00000003793) hoxa2b (ENSPFOG00000003770) skap2 (ENSPFOG00000003684) snx10b (ENSPFOG00000003631) Sailfin molly MODERN SPECIES 714 ENSPLAG00000002073 ENSPLAG00000002120 sp8b (ENSPLAG00000002158) macc1 (ENSPLAG00000002169) twist1b (ENSPLAG00000002183) hdac9b (ENSPLAG00000002207) ANKRD28 (ENSPLAG00000002231) #22 ANKRD28 (ENSPLAG00000002245) #22 hacl1 (ENSPLAG00000002269) #24 Guppy MODERN SPECIES 446 ENSPREG00000002596 ENSPREG00000002578 c4b (ENSPREG00000002552) ENSPREG00000002533 ENSPREG00000002522 rxrbb (ENSPREG00000002487) FHOD3 (ENSPREG00000002448) ENSPREG00000002406 ENSPREG00000002369 DNAH11 (ENSPREG00000002163) ENSPREG00000002101 sp8b (ENSPREG00000002075) macc1 (ENSPREG00000002060) twist1b (ENSPREG00000001986) hdac9b (ENSPREG00000001897) ANKRD28 (ENSPREG00000001859) #22 hacl1 (ENSPREG00000001764) #24 COLQ (ENSPREG00000001751) #25 plekha8 (ENSPREG00000001692) fkbp14 (ENSPREG00000001666) CHN2 (ENSPREG00000001605) cpvl (ENSPREG00000001566) CREB5 (ENSPREG00000001516) JAZF1 (ENSPREG00000001479) tax1bp1b (ENSPREG00000001460) hibadhb (ENSPREG00000001412) hoxa13b (ENSPREG00000001397) hoxa11b (ENSPREG00000001364) ENSPREG00000001340 hoxa9b (ENSPREG00000001346) hoxa2b (ENSPREG00000001334) Platyfish MODERN SPECIES 17 AIF1 (ENSXMAG00000010299) ENSXMAG00000015016 ENSXMAG00000015072 c4b (ENSXMAG00000015081) ENSXMAG00000015119 rxrbb (ENSXMAG00000015121) FHOD3 (ENSXMAG00000015156) ENSXMAG00000015166 RAPGEF5 (ENSXMAG00000015176) ENSXMAG00000021144 ENSXMAG00000015189 sp8b (ENSXMAG00000023631) macc1 (ENSXMAG00000010861) twist1b (ENSXMAG00000019787) hdac9b (ENSXMAG00000013839) ANKRD28 (ENSXMAG00000013843) #22 hacl1 (ENSXMAG00000013857) #24 COLQ (ENSXMAG00000013868) #25 plekha8 (ENSXMAG00000013874) fkbp14 (ENSXMAG00000013879) CHN2 (ENSXMAG00000013882) cpvl (ENSXMAG00000013886) CREB5 (ENSXMAG00000013891) JAZF1 (ENSXMAG00000013895) tax1bp1b (ENSXMAG00000013896) hibadhb (ENSXMAG00000013899) hoxa13b (ENSXMAG00000026913) hoxa11b (ENSXMAG00000013903) ENSXMAG00000028422 hoxa9b (ENSXMAG00000013906) hoxa2b (ENSXMAG00000023698) Oryzias ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000003781.e.a ENSGT00390000013846.a.b ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000003781.e.a ENSGT00390000013846.a.b ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Indian medaka MODERN SPECIES 5 c4b (ENSOMEG00000019873) ENSOMEG00000019898 rxrbb (ENSOMEG00000019956) ENSOMEG00000020098 ENSOMEG00000020123 ENSOMEG00000020136 ENSOMEG00000020189 ENSOMEG00000020223 ENSOMEG00000020238 ENSOMEG00000020255 ENSOMEG00000020267 sp8b (ENSOMEG00000020278) macc1 (ENSOMEG00000020293) twist1b (ENSOMEG00000020301) hdac9b (ENSOMEG00000020371) ANKRD28 (ENSOMEG00000020476) #22 hacl1 (ENSOMEG00000020529) #24 COLQ (ENSOMEG00000020557) #25 plekha8 (ENSOMEG00000020599) fkbp14 (ENSOMEG00000020616) CHN2 (ENSOMEG00000020636) cpvl (ENSOMEG00000020677) CREB5 (ENSOMEG00000020734) JAZF1 (ENSOMEG00000020759) tax1bp1b (ENSOMEG00000020843) hibadhb (ENSOMEG00000020876) hoxa13b (ENSOMEG00000020887) hoxa11b (ENSOMEG00000020907) ENSOMEG00000020917 hoxa9b (ENSOMEG00000020924) hoxa2b (ENSOMEG00000020935) Javanese ricefish MODERN SPECIES 7 csnk2a1 (ENSOJAG00000010047) ENSOJAG00000010595 pon1 (ENSOJAG00000010606) kcnk5b (ENSOJAG00000010697) ENSOJAG00000010742 csnk2b (ENSOJAG00000010906) ENSOJAG00000010996 ENSOJAG00000012246 rxrbb (ENSOJAG00000012317) ENSOJAG00000012399 ENSOJAG00000012981 sp8b (ENSOJAG00000017342) macc1 (ENSOJAG00000001958) twist1b (ENSOJAG00000001984) hdac9b (ENSOJAG00000002010) ANKRD28 (ENSOJAG00000002474) #22 hacl1 (ENSOJAG00000004335) #24 COLQ (ENSOJAG00000004426) #25 plekha8 (ENSOJAG00000004450) fkbp14 (ENSOJAG00000004525) CHN2 (ENSOJAG00000004542) cpvl (ENSOJAG00000004653) CREB5 (ENSOJAG00000004901) JAZF1 (ENSOJAG00000004919) tax1bp1b (ENSOJAG00000004952) hibadhb (ENSOJAG00000004992) hoxa13b (ENSOJAG00000005031) hoxa11b (ENSOJAG00000005039) ENSOJAG00000005045 hoxa9b (ENSOJAG00000005049) hoxa2b (ENSOJAG00000005061) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000013846.a.b ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739.pb ENSGT00940000155739.qb ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Chinese medaka MODERN SPECIES 493 ENSOSIG00000020682 rxrbb (ENSOSIG00000020687) ENSOSIG00000020699 ENSOSIG00000020778 RAPGEF5 (ENSOSIG00000020793) sp8b (ENSOSIG00000020966) macc1 (ENSOSIG00000020967) twist1b (ENSOSIG00000020969) hdac9b (ENSOSIG00000020970) ANKRD28 (ENSOSIG00000021208) #22 hacl1 (ENSOSIG00000023206) #24 COLQ (ENSOSIG00000023271) #25 plekha8 (ENSOSIG00000023282) fkbp14 (ENSOSIG00000023284) CHN2 (ENSOSIG00000023311) cpvl (ENSOSIG00000023352) CREB5 (ENSOSIG00000023360) JAZF1 (ENSOSIG00000023362) tax1bp1b (ENSOSIG00000023368) hibadhb (ENSOSIG00000023371) hoxa13b (ENSOSIG00000023372) hoxa11b (ENSOSIG00000023374) ENSOSIG00000003721 hoxa9b (ENSOSIG00000003729) hoxa2b (ENSOSIG00000003738) Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 7 ENSORLG00000006987 rxrbb (ENSORLG00000007020) FHOD3 (ENSORLG00000007046) ENSORLG00000026013 ENSORLG00000027813 ENSORLG00000021856 ENSORLG00000007067 RAPGEF5 (ENSORLG00000007079) ENSORLG00000029580 ENSORLG00000007223 ENSORLG00000021870 sp8b (ENSORLG00000007242) macc1 (ENSORLG00000007248) twist1b (ENSORLG00000007251) hdac9b (ENSORLG00000007268) ANKRD28 (ENSORLG00000007319) #22 ENSORLG00000007334 hacl1 (ENSORLG00000007343) #24 COLQ (ENSORLG00000007381) #25 plekha8 (ENSORLG00000007400) fkbp14 (ENSORLG00000007415) CHN2 (ENSORLG00000007444) cpvl (ENSORLG00000007488) CREB5 (ENSORLG00000007509) JAZF1 (ENSORLG00000007516) tax1bp1b (ENSORLG00000007562) hibadhb (ENSORLG00000007586) hoxa13b (ENSORLG00000007597) hoxa11b (ENSORLG00000007608) ENSORLG00000007617 hoxa9b (ENSORLG00000007620) Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155739 ENSGT00950000183411 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154807.b ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00940000156420.b ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a.g ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00940000156420.b ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a.g ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00940000156420.b ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a.g ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00940000156420.b ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 Clown anemonefish MODERN SPECIES 3404 ENSAOCG00000004668 rxrbb (ENSAOCG00000004653) FHOD3 (ENSAOCG00000004613) ENSAOCG00000004595 ENSAOCG00000004580 slc6a19b (ENSAOCG00000004568) SLC6A18 (ENSAOCG00000004542) ENSAOCG00000004519 RAPGEF5 (ENSAOCG00000004433) ENSAOCG00000004405 ENSAOCG00000004325 sp8b (ENSAOCG00000004279) macc1 (ENSAOCG00000004274) twist1b (ENSAOCG00000004272) hdac9b (ENSAOCG00000004258) ANKRD28 (ENSAOCG00000004231) #22 hacl1 (ENSAOCG00000004167) #24 plekha8 (ENSAOCG00000004124) fkbp14 (ENSAOCG00000004089) CHN2 (ENSAOCG00000004058) cpvl (ENSAOCG00000003999) CREB5 (ENSAOCG00000003987) JAZF1 (ENSAOCG00000003982) tax1bp1b (ENSAOCG00000003970) hibadhb (ENSAOCG00000003953) hoxa13b (ENSAOCG00000003928) ENSAOCG00000003913 hoxa9b (ENSAOCG00000003903) hoxa2b (ENSAOCG00000003899) skap2 (ENSAOCG00000003894) snx10b (ENSAOCG00000003877) Orange clownfish MODERN SPECIES 21 ENSAPEG00000013093 ENSAPEG00000013087 slc6a19b (ENSAPEG00000012823) slc6a19b (ENSAPEG00000012767) slc6a19b (ENSAPEG00000012514) SLC6A18 (ENSAPEG00000012483) ENSAPEG00000012384 RAPGEF5 (ENSAPEG00000012323) ENSAPEG00000012294 ENSAPEG00000011992 ENSAPEG00000011854 sp8b (ENSAPEG00000011780) macc1 (ENSAPEG00000011766) twist1b (ENSAPEG00000011695) hdac9b (ENSAPEG00000011621) ANKRD28 (ENSAPEG00000011524) #22 hacl1 (ENSAPEG00000011431) #24 COLQ (ENSAPEG00000011370) #25 plekha8 (ENSAPEG00000011298) fkbp14 (ENSAPEG00000011268) CHN2 (ENSAPEG00000011217) cpvl (ENSAPEG00000011142) CREB5 (ENSAPEG00000010990) ENSAPEG00000010975 JAZF1 (ENSAPEG00000010953) tax1bp1b (ENSAPEG00000010863) hibadhb (ENSAPEG00000010821) hoxa13b (ENSAPEG00000010694) hoxa11b (ENSAPEG00000010686) ENSAPEG00000010652 hoxa2b (ENSAPEG00000010631) Spiny chromis MODERN SPECIES 194 RAPGEF5 (ENSAPOG00000016598) DNAH11 (ENSAPOG00000016847) ENSAPOG00000016913 sp8b (ENSAPOG00000016930) macc1 (ENSAPOG00000016938) twist1b (ENSAPOG00000016998) hdac9b (ENSAPOG00000017075) ANKRD28 (ENSAPOG00000017221) #22 hacl1 (ENSAPOG00000017232) #24 COLQ (ENSAPOG00000017255) #25 plekha8 (ENSAPOG00000017273) fkbp14 (ENSAPOG00000017291) CHN2 (ENSAPOG00000017355) cpvl (ENSAPOG00000017366) cpvl (ENSAPOG00000000472) CREB5 (ENSAPOG00000017445) JAZF1 (ENSAPOG00000017474) tax1bp1b (ENSAPOG00000017500) hibadhb (ENSAPOG00000017541) hoxa13b (ENSAPOG00000017602) hoxa11b (ENSAPOG00000017683) ENSAPOG00000017706 hoxa9b (ENSAPOG00000017744) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 2339 ANKRD28 (ENSSPAG00000012941) #22 hacl1 (ENSSPAG00000012877) #24 COLQ (ENSSPAG00000012851) #25 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT01030000235045 ENSGT00940000155739 ENSGT00950000183411 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154807.b ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00940000156420.b ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01030000235045 ENSGT00940000155739.tb ENSGT00950000183411 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154807.b ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00940000156420.b ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01030000235045 ENSGT00940000155739.tb ENSGT00950000183411 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154807.b ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00940000156420.b ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000155739.ub ENSGT01030000235045.i ENSGT00940000155739.tb ENSGT00950000183411 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000155739.ub ENSGT01030000235045.i ENSGT00940000155739.tb ENSGT00950000183411 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739.ub ENSGT00940000155739.tb ENSGT00950000183411 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Eastern happy MODERN SPECIES 2 ENSACLG00000001736 c4b (ENSACLG00000001868) c4b (ENSACLG00000001995) ENSACLG00000002085 ENSACLG00000002092 rxrbb (ENSACLG00000002108) FHOD3 (ENSACLG00000002229) ENSACLG00000002283 ENSACLG00000002413 RAPGEF5 (ENSACLG00000002424) DNAH11 (ENSACLG00000002481) sp8b (ENSACLG00000002726) macc1 (ENSACLG00000002730) twist1b (ENSACLG00000002756) hdac9b (ENSACLG00000002835) ANKRD28 (ENSACLG00000002928) #22 hacl1 (ENSACLG00000003050) #24 COLQ (ENSACLG00000003113) #25 plekha8 (ENSACLG00000003143) fkbp14 (ENSACLG00000003212) CHN2 (ENSACLG00000003258) cpvl (ENSACLG00000003328) CREB5 (ENSACLG00000003365) JAZF1 (ENSACLG00000003411) tax1bp1b (ENSACLG00000003435) hibadhb (ENSACLG00000003518) hoxa13b (ENSACLG00000003533) hoxa11b (ENSACLG00000003540) ENSACLG00000003545 hoxa9b (ENSACLG00000003565) hoxa2b (ENSACLG00000003578) Zebra mbuna MODERN SPECIES 1093 ENSMZEG00005013402 ENSMZEG00005013412 c4b (ENSMZEG00005013428) c4b (ENSMZEG00005013461) rxrbb (ENSMZEG00005013516) FHOD3 (ENSMZEG00005013566) SLC6A18 (ENSMZEG00005013664) ENSMZEG00005013694 ENSMZEG00005013707 ENSMZEG00005013729 sp8b (ENSMZEG00005013768) macc1 (ENSMZEG00005013770) twist1b (ENSMZEG00005013777) hdac9b (ENSMZEG00005013800) ENSMZEG00005013825 ANKRD28 (ENSMZEG00005013857) #22 hacl1 (ENSMZEG00005013889) #24 COLQ (ENSMZEG00005013922) #25 plekha8 (ENSMZEG00005013943) fkbp14 (ENSMZEG00005013971) CHN2 (ENSMZEG00005013985) cpvl (ENSMZEG00005014001) CREB5 (ENSMZEG00005014013) JAZF1 (ENSMZEG00005014024) tax1bp1b (ENSMZEG00005014031) hibadhb (ENSMZEG00005014049) hoxa13b (ENSMZEG00005014057) hoxa11b (ENSMZEG00005014064) ENSMZEG00005014069 hoxa9b (ENSMZEG00005014077) ENSMZEG00005014086 P. nyererei MODERN SPECIES 379 AIF1 (ENSPNYG00000013551) ENSPNYG00000013586 ENSPNYG00000013677 c4b (ENSPNYG00000013713) ENSPNYG00000013813 rxrbb (ENSPNYG00000013852) FHOD3 (ENSPNYG00000013926) ENSPNYG00000013996 ENSPNYG00000014080 ENSPNYG00000014109 ENSPNYG00000014167 sp8b (ENSPNYG00000014313) macc1 (ENSPNYG00000014344) twist1b (ENSPNYG00000014358) hdac9b (ENSPNYG00000014404) ANKRD28 (ENSPNYG00000014481) #22 hacl1 (ENSPNYG00000014606) #24 COLQ (ENSPNYG00000014683) #25 plekha8 (ENSPNYG00000014782) fkbp14 (ENSPNYG00000014830) CHN2 (ENSPNYG00000014857) cpvl (ENSPNYG00000014875) CREB5 (ENSPNYG00000014903) JAZF1 (ENSPNYG00000014932) tax1bp1b (ENSPNYG00000014959) hibadhb (ENSPNYG00000015054) hoxa13b (ENSPNYG00000015087) hoxa11b (ENSPNYG00000015136) ENSPNYG00000015144 hoxa9b (ENSPNYG00000015171) hoxa2b (ENSPNYG00000015186) Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 444 ENSHBUG00000018814 rxrbb (ENSHBUG00000018792) FHOD3 (ENSHBUG00000018710) ENSHBUG00000018690 ENSHBUG00000018677 ENSHBUG00000018623 ENSHBUG00000018573 sp8b (ENSHBUG00000018357) macc1 (ENSHBUG00000018346) twist1b (ENSHBUG00000018336) hdac9b (ENSHBUG00000018280) ANKRD28 (ENSHBUG00000018150) #22 hacl1 (ENSHBUG00000018057) #24 COLQ (ENSHBUG00000017971) #25 plekha8 (ENSHBUG00000017938) fkbp14 (ENSHBUG00000017848) CHN2 (ENSHBUG00000017824) cpvl (ENSHBUG00000017759) CREB5 (ENSHBUG00000001119) JAZF1 (ENSHBUG00000017624) tax1bp1b (ENSHBUG00000017598) hibadhb (ENSHBUG00000017577) hoxa13b (ENSHBUG00000017566) hoxa11b (ENSHBUG00000017560) ENSHBUG00000017556 hoxa9b (ENSHBUG00000017541) hoxa2b (ENSHBUG00000017536) Lyretail cichlid MODERN SPECIES 369 c4b (ENSNBRG00000017736) c4b (ENSNBRG00000017518) ENSNBRG00000017447 rxrbb (ENSNBRG00000017426) FHOD3 (ENSNBRG00000017399) ENSNBRG00000017385 ENSNBRG00000017379 ENSNBRG00000017349 ENSNBRG00000017320 ENSNBRG00000017281 DNAH11 (ENSNBRG00000017134) sp8b (ENSNBRG00000017082) macc1 (ENSNBRG00000017063) twist1b (ENSNBRG00000017011) hdac9b (ENSNBRG00000016972) ANKRD28 (ENSNBRG00000016903) #22 hacl1 (ENSNBRG00000016787) #24 COLQ (ENSNBRG00000016728) #25 plekha8 (ENSNBRG00000016692) fkbp14 (ENSNBRG00000016680) CHN2 (ENSNBRG00000016649) cpvl (ENSNBRG00000016620) CREB5 (ENSNBRG00000016593) ENSNBRG00000016575 JAZF1 (ENSNBRG00000016562) tax1bp1b (ENSNBRG00000016538) hibadhb (ENSNBRG00000016497) hoxa13b (ENSNBRG00000016416) hoxa11b (ENSNBRG00000016387) ENSNBRG00000016382 hoxa9b (ENSNBRG00000016323) Nile tilapia MODERN SPECIES 2 c4b (ENSONIG00000002827) ENSONIG00000028828 c4b (ENSONIG00000002863) ENSONIG00000028059 ENSONIG00000041654 rxrbb (ENSONIG00000002873) FHOD3 (ENSONIG00000002877) ENSONIG00000002879 ENSONIG00000002882 RAPGEF5 (ENSONIG00000002883) DNAH11 (ENSONIG00000002886) sp8b (ENSONIG00000002896) macc1 (ENSONIG00000002898) twist1b (ENSONIG00000020610) hdac9b (ENSONIG00000002902) ANKRD28 (ENSONIG00000002905) #22 hacl1 (ENSONIG00000002911) #24 COLQ (ENSONIG00000002914) #25 plekha8 (ENSONIG00000002916) fkbp14 (ENSONIG00000002921) CHN2 (ENSONIG00000002925) cpvl (ENSONIG00000002938) CREB5 (ENSONIG00000002945) JAZF1 (ENSONIG00000004607) tax1bp1b (ENSONIG00000002952) hibadhb (ENSONIG00000002955) hoxa13b (ENSONIG00000002962) hoxa11b (ENSONIG00000002963) ENSONIG00000002964 hoxa9b (ENSONIG00000002965) hoxa2b (ENSONIG00000002966) Midas cichlid MODERN SPECIES 303 ENSACIG00000017580 c4b (ENSACIG00000017508) c4b (ENSACIG00000017425) c4b (ENSACIG00000017277) rxrbb (ENSACIG00000017241) FHOD3 (ENSACIG00000017221) ENSACIG00000017212 ENSACIG00000017209 ENSACIG00000017178 RAPGEF5 (ENSACIG00000017155) DNAH11 (ENSACIG00000016892) sp8b (ENSACIG00000016834) macc1 (ENSACIG00000016818) twist1b (ENSACIG00000016767) hdac9b (ENSACIG00000016677) ANKRD28 (ENSACIG00000016624) #22 hacl1 (ENSACIG00000016585) #24 COLQ (ENSACIG00000016565) #25 plekha8 (ENSACIG00000016533) fkbp14 (ENSACIG00000016522) CHN2 (ENSACIG00000016488) cpvl (ENSACIG00000016460) CREB5 (ENSACIG00000016442) JAZF1 (ENSACIG00000016428) tax1bp1b (ENSACIG00000016387) hibadhb (ENSACIG00000016255) hoxa13b (ENSACIG00000016195) hoxa11b (ENSACIG00000016183) ENSACIG00000016169 hoxa9b (ENSACIG00000016147) hoxa2b (ENSACIG00000016137) Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154807.b ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000003781.e.a ENSGT00390000013846.a.b ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000157833.h.b ENSGT00390000003781.e.a ENSGT00390000013846.a.b ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Climbing perch MODERN SPECIES 7 ENSATEG00000008239 ENSATEG00000008144 ENSATEG00000008129 ENSATEG00000008074 ENSATEG00000008038 c4b (ENSATEG00000007852) rxrbb (ENSATEG00000007788) ENSATEG00000007774 ENSATEG00000007695 ENSATEG00000007586 DNAH11 (ENSATEG00000006948) sp8b (ENSATEG00000006843) macc1 (ENSATEG00000006829) twist1b (ENSATEG00000006779) hdac9b (ENSATEG00000006720) ANKRD28 (ENSATEG00000006576) #22 hacl1 (ENSATEG00000006565) #24 COLQ (ENSATEG00000025574) #25 plekha8 (ENSATEG00000006488) fkbp14 (ENSATEG00000006455) CHN2 (ENSATEG00000006387) cpvl (ENSATEG00000006320) CREB5 (ENSATEG00000006306) JAZF1 (ENSATEG00000006282) tax1bp1b (ENSATEG00000006270) hibadhb (ENSATEG00000006226) hoxa13b (ENSATEG00000006127) hoxa11b (ENSATEG00000006040) ENSATEG00000006005 hoxa9b (ENSATEG00000005978) hoxa2b (ENSATEG00000005962) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 7 ENSBSLG00000025778 csnk2b (ENSBSLG00000025759) AIF1 (ENSBSLG00000025749) ENSBSLG00000025736 ENSBSLG00000025731 rxrbb (ENSBSLG00000025583) FHOD3 (ENSBSLG00000025484) SLC6A19 (ENSBSLG00000025442) ENSBSLG00000025413 ENSBSLG00000025395 DNAH11 (ENSBSLG00000024801) sp8b (ENSBSLG00000024778) macc1 (ENSBSLG00000024774) twist1b (ENSBSLG00000024765) hdac9b (ENSBSLG00000024733) ANKRD28 (ENSBSLG00000023994) #22 hacl1 (ENSBSLG00000023602) #24 COLQ (ENSBSLG00000023554) #25 plekha8 (ENSBSLG00000023540) fkbp14 (ENSBSLG00000023475) CHN2 (ENSBSLG00000023238) cpvl (ENSBSLG00000023204) CREB5 (ENSBSLG00000023199) JAZF1 (ENSBSLG00000023176) tax1bp1b (ENSBSLG00000023142) hibadhb (ENSBSLG00000023113) hoxa13b (ENSBSLG00000023107) hoxa11b (ENSBSLG00000023103) ENSBSLG00000023098 hoxa9b (ENSBSLG00000023091) hoxa2b (ENSBSLG00000023087) Zig-zag eel MODERN SPECIES 7 ENSMAMG00000015069 ENSMAMG00000015044 ENSMAMG00000014967 ENSMAMG00000014882 c4b (ENSMAMG00000014759) rxrbb (ENSMAMG00000014664) ENSMAMG00000014726 ENSMAMG00000014586 ENSMAMG00000014575 ENSMAMG00000014490 DNAH11 (ENSMAMG00000014344) sp8b (ENSMAMG00000014328) macc1 (ENSMAMG00000014319) twist1b (ENSMAMG00000014267) hdac9b (ENSMAMG00000014205) ANKRD28 (ENSMAMG00000014112) #22 hacl1 (ENSMAMG00000014027) #24 COLQ (ENSMAMG00000013993) #25 plekha8 (ENSMAMG00000013833) fkbp14 (ENSMAMG00000024896) CHN2 (ENSMAMG00000013775) cpvl (ENSMAMG00000013747) CREB5 (ENSMAMG00000013658) JAZF1 (ENSMAMG00000013626) tax1bp1b (ENSMAMG00000013585) hibadhb (ENSMAMG00000013563) hoxa13b (ENSMAMG00000013489) hoxa11b (ENSMAMG00000013483) ENSMAMG00000013470 hoxa9b (ENSMAMG00000013458) hoxa2b (ENSMAMG00000013414) Carangaria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802.q #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Seriola ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802.q #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Greater amberjack MODERN SPECIES 250 ENSSDUG00000002470 ENSSDUG00000002351 c4b (ENSSDUG00000002239) ENSSDUG00000002219 rxrbb (ENSSDUG00000002150) FHOD3 (ENSSDUG00000002070) slc6a19b (ENSSDUG00000002036) SLC6A18 (ENSSDUG00000002006) ENSSDUG00000001992 RAPGEF5 (ENSSDUG00000001955) DNAH11 (ENSSDUG00000001754) sp8b (ENSSDUG00000001699) macc1 (ENSSDUG00000001682) twist1b (ENSSDUG00000001670) hdac9b (ENSSDUG00000001605) ANKRD28 (ENSSDUG00000001509) #22 hacl1 (ENSSDUG00000001427) #24 COLQ (ENSSDUG00000001385) #25 plekha8 (ENSSDUG00000001363) fkbp14 (ENSSDUG00000001345) CHN2 (ENSSDUG00000001322) cpvl (ENSSDUG00000001270) CREB5 (ENSSDUG00000001228) JAZF1 (ENSSDUG00000001189) tax1bp1b (ENSSDUG00000001177) hibadhb (ENSSDUG00000001170) hoxa13b (ENSSDUG00000001137) hoxa11b (ENSSDUG00000001124) ENSSDUG00000001112 hoxa9b (ENSSDUG00000001099) hoxa2b (ENSSDUG00000001084) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 1911 ANKRD28 (ENSSLDG00000001382) #22 Barramundi perch MODERN SPECIES 17 ENSLCAG00010009007 ENSLCAG00010009011 ENSLCAG00010009012 rxrbb (ENSLCAG00010009026) FHOD3 (ENSLCAG00010009053) slc6a19b (ENSLCAG00010009062) SLC6A18 (ENSLCAG00010009083) ENSLCAG00010009103 ENSLCAG00010009105 RAPGEF5 (ENSLCAG00010009115) DNAH11 (ENSLCAG00010009391) sp8b (ENSLCAG00010010178) macc1 (ENSLCAG00010010184) twist1b (ENSLCAG00010010187) hdac9b (ENSLCAG00010010199) ANKRD28 (ENSLCAG00010010440) #22 hacl1 (ENSLCAG00010011623) #24 COLQ (ENSLCAG00010011685) #25 plekha8 (ENSLCAG00010011690) fkbp14 (ENSLCAG00010011697) CHN2 (ENSLCAG00010011703) cpvl (ENSLCAG00010011717) CREB5 (ENSLCAG00010011737) JAZF1 (ENSLCAG00010011748) tax1bp1b (ENSLCAG00010011753) hibadhb (ENSLCAG00010011766) hoxa13b (ENSLCAG00010011777) hoxa11b (ENSLCAG00010011784) ENSLCAG00010011786 hoxa9b (ENSLCAG00010011789) hoxa2b (ENSLCAG00010011791) Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000013846.a.b ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Tongue sole MODERN SPECIES 4 MRS2 (ENSCSEG00000005059) ENSCSEG00000005055 CPQ (ENSCSEG00000005044) dscc1 (ENSCSEG00000005030) mrpl13 (ENSCSEG00000005024) FHOD3 (ENSCSEG00000005007) slc6a19b (ENSCSEG00000004999) ENSCSEG00000004998 ENSCSEG00000004997 ENSCSEG00000004986 ENSCSEG00000004949 sp8b (ENSCSEG00000004940) macc1 (ENSCSEG00000004928) twist1b (ENSCSEG00000004923) hdac9b (ENSCSEG00000004911) ANKRD28 (ENSCSEG00000004894) #22 hacl1 (ENSCSEG00000004885) #24 COLQ (ENSCSEG00000004880) #25 plekha8 (ENSCSEG00000004876) fkbp14 (ENSCSEG00000004873) CHN2 (ENSCSEG00000004861) cpvl (ENSCSEG00000004857) CREB5 (ENSCSEG00000004842) JAZF1 (ENSCSEG00000004836) tax1bp1b (ENSCSEG00000004813) hibadhb (ENSCSEG00000004801) hoxa13b (ENSCSEG00000004792) hoxa11b (ENSCSEG00000004788) ENSCSEG00000004785 hoxa9b (ENSCSEG00000004783) hoxa2b (ENSCSEG00000004781) Turbot MODERN SPECIES ENSSMAG00000000325 ENSSMAG00000029108 c4b (ENSSMAG00000000287) ENSSMAG00000000281 rxrbb (ENSSMAG00000000277) ENSSMAG00000000234 ENSSMAG00000000224 ENSSMAG00000035029 ENSSMAG00000036567 ENSSMAG00000000208 DNAH11 (ENSSMAG00000000170) sp8b (ENSSMAG00000000167) macc1 (ENSSMAG00000000165) twist1b (ENSSMAG00000000162) hdac9b (ENSSMAG00000000130) ANKRD28 (ENSSMAG00000000101) #22 hacl1 (ENSSMAG00000000099) #24 COLQ (ENSSMAG00000000096) #25 plekha8 (ENSSMAG00000000090) fkbp14 (ENSSMAG00000000089) CHN2 (ENSSMAG00000000085) cpvl (ENSSMAG00000000083) CREB5 (ENSSMAG00000000081) JAZF1 (ENSSMAG00000000079) tax1bp1b (ENSSMAG00000000076) hibadhb (ENSSMAG00000000075) hoxa13b (ENSSMAG00000000073) hoxa11b (ENSSMAG00000000072) ENSSMAG00000000071 hoxa9b (ENSSMAG00000000069) hoxa2b (ENSSMAG00000020316) Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154807.b ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000003781.e.a ENSGT00390000013846.a.b ENSGT00940000182043 ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739.fb ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Fugu MODERN SPECIES 19 csnk2b (ENSTRUG00000022619) aif1 (ENSTRUG00000016138) ENSTRUG00000029353 ENSTRUG00000026046 c4 (ENSTRUG00000015929) ENSTRUG00000022460 rxrbb (ENSTRUG00000015903) FHOD3 (ENSTRUG00000015843) ENSTRUG00000015834 RAPGEF5 (ENSTRUG00000015817) sp8b (ENSTRUG00000015810) macc1 (ENSTRUG00000015804) twist1 (ENSTRUG00000015797) ENSTRUG00000028716 hdac9b (ENSTRUG00000015773) ANKRD28 (ENSTRUG00000015695) #22 hacl1 (ENSTRUG00000015648) #24 COLQ (ENSTRUG00000015630) #25 plekha8 (ENSTRUG00000015600) fkbp14 (ENSTRUG00000015596) CHN2 (ENSTRUG00000015557) cpvl (ENSTRUG00000015515) CREB5 (ENSTRUG00000015448) JAZF1 (ENSTRUG00000018220) tax1bp1b (ENSTRUG00000015394) hibadhb (ENSTRUG00000015370) ENSTRUG00000015364 hoxa11b (ENSTRUG00000029803) hoxa9b (ENSTRUG00000021837) hoxa2b (ENSTRUG00000015327) skap2 (ENSTRUG00000015267) Tetraodon MODERN SPECIES 23 csnk2b (ENSTNIG00000018452) AIF1 (ENSTNIG00000018451) ENSTNIG00000000031 ENSTNIG00000018450 ENSTNIG00000018449 ENSTNIG00000018448 ENSTNIG00000018447 rxrbb (ENSTNIG00000018446) FHOD3 (ENSTNIG00000018445) ENSTNIG00000018444 RAPGEF5 (ENSTNIG00000018443) sp8b (ENSTNIG00000018442) macc1 (ENSTNIG00000018441) twist1b (ENSTNIG00000018440) hdac9b (ENSTNIG00000018439) ANKRD28 (ENSTNIG00000018438) #22 hacl1 (ENSTNIG00000018437) #24 COLQ (ENSTNIG00000018436) #25 plekha8 (ENSTNIG00000018435) fkbp14 (ENSTNIG00000018434) CHN2 (ENSTNIG00000018433) cpvl (ENSTNIG00000018432) CREB5 (ENSTNIG00000018431) JAZF1 (ENSTNIG00000018430) tax1bp1b (ENSTNIG00000018429) hibadhb (ENSTNIG00000018428) hoxa13b (ENSTNIG00000001781) hoxa11b (ENSTNIG00000000494) ENSTNIG00000001780 hoxa9b (ENSTNIG00000001769) hoxa2b (ENSTNIG00000001768) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154807.b ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Ballan wrasse MODERN SPECIES 101 ENSLBEG00000007076 c4b (ENSLBEG00000007249) ENSLBEG00000007578 rxrbb (ENSLBEG00000007629) FHOD3 (ENSLBEG00000007679) ENSLBEG00000007721 ENSLBEG00000007744 slc6a19b (ENSLBEG00000007772) ENSLBEG00000007896 RAPGEF5 (ENSLBEG00000008014) DNAH11 (ENSLBEG00000008100) sp8b (ENSLBEG00000008311) macc1 (ENSLBEG00000008327) twist1b (ENSLBEG00000008337) hdac9b (ENSLBEG00000008357) ANKRD28 (ENSLBEG00000008448) #22 hacl1 (ENSLBEG00000008593) #24 COLQ (ENSLBEG00000008704) #25 plekha8 (ENSLBEG00000008747) fkbp14 (ENSLBEG00000008801) CHN2 (ENSLBEG00000008860) cpvl (ENSLBEG00000008956) CREB5 (ENSLBEG00000009016) JAZF1 (ENSLBEG00000009100) tax1bp1b (ENSLBEG00000009134) hibadhb (ENSLBEG00000009177) hoxa13b (ENSLBEG00000009213) hoxa11b (ENSLBEG00000009228) ENSLBEG00000009239 hoxa9b (ENSLBEG00000009261) hoxa2b (ENSLBEG00000009277) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Perciformes ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Lumpfish MODERN SPECIES 7 ENSCLMG00005004067 c4b (ENSCLMG00005004142) ENSCLMG00005004842 rxrbb (ENSCLMG00005004847) FHOD3 (ENSCLMG00005004940) ENSCLMG00005004945 slc6a19b (ENSCLMG00005004950) SLC6A18 (ENSCLMG00005004957) ENSCLMG00005004963 ENSCLMG00005004975 DNAH11 (ENSCLMG00005004983) sp8b (ENSCLMG00005005022) macc1 (ENSCLMG00005005023) twist1b (ENSCLMG00005005024) hdac9b (ENSCLMG00005005026) ANKRD28 (ENSCLMG00005005042) #22 hacl1 (ENSCLMG00005007962) #24 COLQ (ENSCLMG00005008200) #25 plekha8 (ENSCLMG00005008203) fkbp14 (ENSCLMG00005008206) CHN2 (ENSCLMG00005008207) cpvl (ENSCLMG00005008209) CREB5 (ENSCLMG00005008226) JAZF1 (ENSCLMG00005008322) tax1bp1b (ENSCLMG00005008325) hibadhb (ENSCLMG00005008326) hoxa13b (ENSCLMG00005008335) hoxa11b (ENSCLMG00005008337) ENSCLMG00005008339 hoxa2b (ENSCLMG00005008340) skap2 (ENSCLMG00005008344) Stickleback MODERN SPECIES 19 ENSGACG00000007916 ENSGACG00000007921 c4b (ENSGACG00000007933) ENSGACG00000007971 rxrbb (ENSGACG00000007982) FHOD3 (ENSGACG00000007994) SLC6A18 (ENSGACG00000008011) ENSGACG00000008027 RAPGEF5 (ENSGACG00000008032) DNAH11 (ENSGACG00000008036) sp8b (ENSGACG00000008062) macc1 (ENSGACG00000008067) twist1b (ENSGACG00000008070) ENSGACG00000008075 hdac9b (ENSGACG00000008076) ANKRD28 (ENSGACG00000008084) #22 hacl1 (ENSGACG00000008098) #24 COLQ (ENSGACG00000008106) #25 plekha8 (ENSGACG00000008123) fkbp14 (ENSGACG00000008133) CHN2 (ENSGACG00000008146) cpvl (ENSGACG00000008172) cpvl (ENSGACG00000008182) CREB5 (ENSGACG00000008212) JAZF1 (ENSGACG00000008216) tax1bp1b (ENSGACG00000008221) hibadhb (ENSGACG00000008229) hoxa13b (ENSGACG00000008296) hoxa11b (ENSGACG00000008297) ENSGACG00000008303 hoxa9b (ENSGACG00000008310) Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000154076.A ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Channel bull blenny MODERN SPECIES 7 ENSCGOG00000005713 rxrbb (ENSCGOG00000005542) FHOD3 (ENSCGOG00000005296) slc6a19b (ENSCGOG00000004964) ENSCGOG00000004937 RAPGEF5 (ENSCGOG00000004915) ENSCGOG00000004896 ENSCGOG00000004891 ENSCGOG00000004888 ENSCGOG00000004881 ENSCGOG00000004876 sp8b (ENSCGOG00000004874) macc1 (ENSCGOG00000004860) twist1b (ENSCGOG00000004852) hdac9b (ENSCGOG00000004836) ANKRD28 (ENSCGOG00000002342) #22 hacl1 (ENSCGOG00000002111) #24 COLQ (ENSCGOG00000002085) #25 plekha8 (ENSCGOG00000002029) fkbp14 (ENSCGOG00000002025) ENSCGOG00000002023 CHN2 (ENSCGOG00000001775) cpvl (ENSCGOG00000001746) CREB5 (ENSCGOG00000001700) JAZF1 (ENSCGOG00000001692) tax1bp1b (ENSCGOG00000001686) hibadhb (ENSCGOG00000001639) hoxa13b (ENSCGOG00000001628) hoxa11b (ENSCGOG00000001607) ENSCGOG00000001598 hoxa9b (ENSCGOG00000024270) Pike perch MODERN SPECIES 15 ENSSLUG00000000458 c4b (ENSSLUG00000000530) rxrbb (ENSSLUG00000000716) FHOD3 (ENSSLUG00000000736) slc6a19b (ENSSLUG00000000764) SLC6A18 (ENSSLUG00000000785) ENSSLUG00000000796 RAPGEF5 (ENSSLUG00000000802) ENSSLUG00000000810 ENSSLUG00000000813 ENSSLUG00000000817 sp8b (ENSSLUG00000000819) macc1 (ENSSLUG00000000822) twist1b (ENSSLUG00000000839) hdac9b (ENSSLUG00000000844) ANKRD28 (ENSSLUG00000001010) #22 hacl1 (ENSSLUG00000001647) #24 COLQ (ENSSLUG00000001725) #25 plekha8 (ENSSLUG00000001749) fkbp14 (ENSSLUG00000001771) CHN2 (ENSSLUG00000001817) cpvl (ENSSLUG00000001939) CREB5 (ENSSLUG00000002018) JAZF1 (ENSSLUG00000002021) tax1bp1b (ENSSLUG00000002026) hibadhb (ENSSLUG00000002035) hoxa13b (ENSSLUG00000002053) hoxa11b (ENSSLUG00000002066) ENSSLUG00000002079 hoxa9b (ENSSLUG00000002087) hoxa2b (ENSSLUG00000002092) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158338 ENSGT00940000155565.a ENSGT00940000155739 ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000158880 ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163428.b.a ENSGT00940000166341 ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b ENSGT00940000164628 ENSGT00940000155029.c.a.e European seabass MODERN SPECIES 6 ENSDLAG00005011012 ENSDLAG00005010975 c4b (ENSDLAG00005009457) ENSDLAG00005009291 rxrbb (ENSDLAG00005009170) ENSDLAG00005007838 slc6a19b (ENSDLAG00005006402) ENSDLAG00005006119 ENSDLAG00005006103 ENSDLAG00005005661 DNAH11 (ENSDLAG00005004445) sp8b (ENSDLAG00005032957) macc1 (ENSDLAG00005019153) twist1b (ENSDLAG00005027630) hdac9b (ENSDLAG00005019085) ENSDLAG00005017437 #22 hacl1 (ENSDLAG00005017349) #24 plekha8 (ENSDLAG00005017284) fkbp14 (ENSDLAG00005027101) CHN2 (ENSDLAG00005016963) cpvl (ENSDLAG00005016207) CREB5 (ENSDLAG00005016181) JAZF1 (ENSDLAG00005016165) tax1bp1b (ENSDLAG00005016113) hibadhb (ENSDLAG00005016058) hoxa13b (ENSDLAG00005016052) hoxa11b (ENSDLAG00005034243) ENSDLAG00005016047 hoxa9b (ENSDLAG00005016040) skap2 (ENSDLAG00005016010) snx10b (ENSDLAG00005015985) Large yellow croaker MODERN SPECIES 484 csnk2b (ENSLCRG00005007761) AIF1 (ENSLCRG00005007760) ENSLCRG00005007756 c4b (ENSLCRG00005007562) ENSLCRG00005007556 rxrbb (ENSLCRG00005007535) FHOD3 (ENSLCRG00005007496) slc6a19b (ENSLCRG00005006846) ENSLCRG00005006825 RAPGEF5 (ENSLCRG00005006822) DNAH11 (ENSLCRG00005005753) sp8b (ENSLCRG00005005728) macc1 (ENSLCRG00005005727) twist1b (ENSLCRG00005005726) hdac9b (ENSLCRG00005005721) ANKRD28 (ENSLCRG00005004018) #22 hacl1 (ENSLCRG00005002619) #24 COLQ (ENSLCRG00005002579) #25 plekha8 (ENSLCRG00005002558) fkbp14 (ENSLCRG00005002552) CHN2 (ENSLCRG00005001253) cpvl (ENSLCRG00005000690) CREB5 (ENSLCRG00005000631) JAZF1 (ENSLCRG00005009772) tax1bp1b (ENSLCRG00005009770) hibadhb (ENSLCRG00005009720) hoxa13b (ENSLCRG00005009719) hoxa11b (ENSLCRG00005009718) ENSLCRG00005009717 hoxa9b (ENSLCRG00005009716) hoxa2b (ENSLCRG00005009715) Gilthead seabream MODERN SPECIES 8 ENSSAUG00010004811 ENSSAUG00010004823 c4b (ENSSAUG00010004862) ENSSAUG00010005770 rxrbb (ENSSAUG00010005778) FHOD3 (ENSSAUG00010005799) slc6a19b (ENSSAUG00010005859) ENSSAUG00010006138 ENSSAUG00010006258 RAPGEF5 (ENSSAUG00010006261) DNAH11 (ENSSAUG00010006386) sp8b (ENSSAUG00010007105) macc1 (ENSSAUG00010007107) twist1b (ENSSAUG00010007108) hdac9b (ENSSAUG00010007109) ANKRD28 (ENSSAUG00010007114) #22 hacl1 (ENSSAUG00010007288) #24 COLQ (ENSSAUG00010007419) #25 plekha8 (ENSSAUG00010007424) fkbp14 (ENSSAUG00010007466) CHN2 (ENSSAUG00010007468) cpvl (ENSSAUG00010007474) CREB5 (ENSSAUG00010007486) JAZF1 (ENSSAUG00010007488) tax1bp1b (ENSSAUG00010007490) hibadhb (ENSSAUG00010007493) hoxa13b (ENSSAUG00010007579) hoxa11b (ENSSAUG00010007580) ENSSAUG00010007581 hoxa9b (ENSSAUG00010007582) hoxa2b (ENSSAUG00010007584) Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 208 ENSHCOG00000012600 ENSHCOG00000012579 ENSHCOG00000012554 rxrbb (ENSHCOG00000012534) FHOD3 (ENSHCOG00000012494) ENSHCOG00000012463 ENSHCOG00000012447 slc6a19b (ENSHCOG00000012438) ENSHCOG00000012412 ENSHCOG00000012394 DNAH11 (ENSHCOG00000012354) sp8b (ENSHCOG00000012237) macc1 (ENSHCOG00000012219) twist1b (ENSHCOG00000012208) hdac9b (ENSHCOG00000012189) ANKRD28 (ENSHCOG00000012141) #22 ENSHCOG00000012084 CPQ (ENSHCOG00000012071) dscc1 (ENSHCOG00000012057) mrpl13 (ENSHCOG00000012037) COL14A1 (ENSHCOG00000012016) deptor (ENSHCOG00000011939) LIMD1 (ENSHCOG00000011905) lars2 (ENSHCOG00000011897) cdcp1a (ENSHCOG00000011848) CLEC3B (ENSHCOG00000011832) ENSHCOG00000011825 ENSHCOG00000011808 MRS2 (ENSHCOG00000011796) ENSHCOG00000011769 CLPTM1L (ENSHCOG00000000747) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 7 ENSMMDG00005010021 c4b (ENSMMDG00005010047) ENSMMDG00005011687 rxrbb (ENSMMDG00005011690) FHOD3 (ENSMMDG00005011754) ENSMMDG00005011756 ENSMMDG00005011757 ENSMMDG00005011770 ENSMMDG00005012023 RAPGEF5 (ENSMMDG00005012031) DNAH11 (ENSMMDG00005012062) sp8b (ENSMMDG00005012218) macc1 (ENSMMDG00005012219) twist1b (ENSMMDG00005012221) hdac9b (ENSMMDG00005012223) ANKRD28 (ENSMMDG00005012342) #22 hacl1 (ENSMMDG00005019372) #24 COLQ (ENSMMDG00005019402) #25 plekha8 (ENSMMDG00005019413) fkbp14 (ENSMMDG00005019440) CHN2 (ENSMMDG00005019442) cpvl (ENSMMDG00005019447) CREB5 (ENSMMDG00005019865) JAZF1 (ENSMMDG00005019868) tax1bp1b (ENSMMDG00005019874) hibadhb (ENSMMDG00005019882) hoxa13b (ENSMMDG00005019936) hoxa11b (ENSMMDG00005019940) ENSMMDG00005019946 hoxa9b (ENSMMDG00005019947) hoxa2b (ENSMMDG00005019951) Cod MODERN SPECIES 2 ENSGMOG00000028331 ENSGMOG00000031400 ENSGMOG00000036632 ENSGMOG00000026370 CREB5 (ENSGMOG00000014131) cpvl (ENSGMOG00000014089) ENSGMOG00000027655 ENSGMOG00000026655 ENSGMOG00000030105 ENSGMOG00000004325 #25 ENSGMOG00000004295 #24 ENSGMOG00000032740 ENSGMOG00000014145 ENSGMOG00000028624 ENSGMOG00000016215 ENSGMOG00000012039 #22 ENSGMOG00000023251 ENSGMOG00000034945 glipr2l (ENSGMOG00000016072) ENSGMOG00000031680 ENSGMOG00000016100 ENSGMOG00000008535 ENSGMOG00000008551 ENSGMOG00000033521 ENSGMOG00000025191 ENSGMOG00000023405 ENSGMOG00000037061 ENSGMOG00000026151 ITGA10 (ENSGMOG00000018921) polr3c (ENSGMOG00000018937) rnf115a (ENSGMOG00000018949) Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155565.a ENSGT01100000263473.a.b.h.b ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00940000166052 ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163281.a ENSGT00940000163428.b.a.a ENSGT00940000166341 ENSGT00940000154486.b.a.b ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858.i ENSGT00760000119737 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.g.d ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b Northern pike MODERN SPECIES 19 FHOD3 (ENSELUG00000006796) SLC6A18 (ENSELUG00000006864) ENSELUG00000006880 ENSELUG00000006893 ENSELUG00000006936 ENSELUG00000025177 ENSELUG00000034021 sp8b (ENSELUG00000006950) ENSELUG00000006975 macc1 (ENSELUG00000006998) ENSELUG00000007010 twist1a (ENSELUG00000007017) hdac9b (ENSELUG00000007075) ahr1a (ENSELUG00000007172) ENSELUG00000027964 ANKRD28 (ENSELUG00000007253) #22 hacl1 (ENSELUG00000007356) #24 COLQ (ENSELUG00000007408) #25 plekha8 (ENSELUG00000007445) fkbp14 (ENSELUG00000033081) ENSELUG00000007457 CHN2 (ENSELUG00000000267) cpvl (ENSELUG00000007617) CREB5 (ENSELUG00000007691) jazf1a (ENSELUG00000000282) tax1bp1b (ENSELUG00000007759) hibadhb (ENSELUG00000007803) hoxa13b (ENSELUG00000007825) hoxa11b (ENSELUG00000007833) ENSELUG00000007844 hoxa2b (ENSELUG00000007865) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183411 ENSGT01100000263473.a.b.h.b.l ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l.y.a ENSGT00940000164650.l ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00940000166052 ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163281.a.c ENSGT00940000163428.b.a.a ENSGT00940000166341 ENSGT00940000154486.b.a.b ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a.c.b #25 ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858.i ENSGT00760000119737 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.g.d ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.b Huchen DUPLICATION Huchen MODERN SPECIES 9434 ENSHHUG00000039238 #22 Huchen DUPLICATION Huchen MODERN SPECIES 4145 ENSHHUG00000029765 lmo4b (ENSHHUG00000029776) ENSHHUG00000029778 #22 Huchen MODERN SPECIES 11463 ENSHHUG00000016243 #22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT01100000263473.a.b.h.b.l ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B.f.b ENSGT00940000159208.B.f.a.b ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l.y.a ENSGT00940000164650.l ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00940000166052 ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163281.a.c ENSGT00940000163428.b.a.a ENSGT00940000166341 ENSGT00940000154486.b.a.b ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a.c.b #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i.i ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858.i.j ENSGT00760000119737 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00940000156420.b ENSGT00390000003368 ENSGT00390000003635.g.d ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00940000155739.yb.b.a ENSGT01100000263473.a.b.h.b.l ENSGT01100000263473.b.a.a.a ENSGT00940000159208.B.f.a.b ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l.y.a ENSGT00940000164650.l ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00940000166052 ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163281.a.c ENSGT00940000163428.b.a.a ENSGT00940000166341.f ENSGT00940000154486.b.a.b ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a.c.b #25 ENSGT00940000157288 ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858.i.i ENSGT00760000119737 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a.c ENSGT00390000003368 ENSGT00390000003635.g.d ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b Rainbow trout DUPLICATION Rainbow trout DUPLICATION Rainbow trout MODERN SPECIES 21 rxrbb (ENSOMYG00000010829) ENSOMYG00000001638 ENSOMYG00000067753 slc6a19b (ENSOMYG00000001677) ENSOMYG00000053985 ENSOMYG00000050040 ENSOMYG00000052698 sp8b (ENSOMYG00000010791) ENSOMYG00000064044 ENSOMYG00000004633 macc1 (ENSOMYG00000001168) ENSOMYG00000061693 ENSOMYG00000001144 hdac9b (ENSOMYG00000054264) ahr1a (ENSOMYG00000001067) ENSOMYG00000071501 #22 ENSOMYG00000068122 ENSOMYG00000069809 ENSOMYG00000062830 ENSOMYG00000071125 ENSOMYG00000074458 ENSOMYG00000064764 ENSOMYG00000064337 ENSOMYG00000048577 ENSOMYG00000058213 ENSOMYG00000059375 ENSOMYG00000061863 ENSOMYG00000057225 ENSOMYG00000060496 ENSOMYG00000055160 ENSOMYG00000055910 Rainbow trout MODERN SPECIES 317 ENSOMYG00000071462 #22 Rainbow trout MODERN SPECIES 11 ENSOMYG00000067648 ENSOMYG00000025106 rxrbb (ENSOMYG00000001564) ENSOMYG00000071819 slc6a19b (ENSOMYG00000028946) ENSOMYG00000056599 ENSOMYG00000063603 ENSOMYG00000072543 sp8b (ENSOMYG00000073802) ENSOMYG00000066537 macc1 (ENSOMYG00000064450) ENSOMYG00000060436 ENSOMYG00000056407 hdac9b (ENSOMYG00000077335) ahr1a (ENSOMYG00000036618) ENSOMYG00000054585 #22 ENSOMYG00000070229 ENSOMYG00000077428 ENSOMYG00000061937 ENSOMYG00000070369 ENSOMYG00000057446 ENSOMYG00000070573 ENSOMYG00000052871 ENSOMYG00000048461 hacl1 (ENSOMYG00000056364) #24 plekha8 (ENSOMYG00000001004) fkbp14 (ENSOMYG00000000983) ENSOMYG00000001041 CHN2 (ENSOMYG00000067588) cpvl (ENSOMYG00000000789) CREB5 (ENSOMYG00000076901) Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 112 ENSGT00940000166341.e ENSGT00940000154486.b.a.b ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a.c.b #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000157858.i.i ENSGT01000000221212 ENSGT00940000157858.i.j ENSGT00760000119737 ENSGT01030000234635.a.b.a.a.d ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a.c ENSGT00390000003368 ENSGT00390000003635.g.d ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255 ENSGT00940000164071.b.a Coho salmon MODERN SPECIES 31 rxrbb (ENSOKIG00005046785) FHOD3 (ENSOKIG00005046855) slc6a19b (ENSOKIG00005046972) ENSOKIG00005047592 ENSOKIG00005047642 ENSOKIG00005047754 ENSOKIG00005047756 ENSOKIG00005047762 sp8b (ENSOKIG00005047774) ENSOKIG00005048046 macc1 (ENSOKIG00005049429) ENSOKIG00005049434 ENSOKIG00005049443 hdac9b (ENSOKIG00005049459) ahr1a (ENSOKIG00005049511) ANKRD28 (ENSOKIG00005049730) #22 hacl1 (ENSOKIG00005050053) #24 plekha8 (ENSOKIG00005050128) ENSOKIG00005050140 fkbp14 (ENSOKIG00005050143) ENSOKIG00005050149 ENSOKIG00005050152 CHN2 (ENSOKIG00005050170) cpvl (ENSOKIG00005050225) CREB5 (ENSOKIG00005050277) ENSOKIG00005050281 CREB5 (ENSOKIG00005050290) sycp1 (ENSOKIG00005050301) tax1bp1b (ENSOKIG00005050315) JAZF1 (ENSOKIG00005050330) hibadhb (ENSOKIG00005050338) Chinook salmon MODERN SPECIES 22 CCN3 (ENSOTSG00005015760) mal2 (ENSOTSG00005015758) COLEC10 (ENSOTSG00005015757) csnk2a1 (ENSOTSG00005015755) PON1 (ENSOTSG00005015753) kcnk5b (ENSOTSG00005015752) csnk2b (ENSOTSG00005015748) ENSOTSG00005015746 ENSOTSG00005015745 ENSOTSG00005015743 sp8b (ENSOTSG00005015742) ENSOTSG00005000461 macc1 (ENSOTSG00005000374) ENSOTSG00005000369 twist1a (ENSOTSG00005000366) ANKRD28 (ENSOTSG00005000358) #22 ENSOTSG00005000354 ENSOTSG00005000352 ENSOTSG00005000350 ENSOTSG00005000349 ENSOTSG00005000346 hacl1 (ENSOTSG00005000344) #24 COLQ (ENSOTSG00005000342) #25 plekha8 (ENSOTSG00005000337) fkbp14 (ENSOTSG00005000331) ENSOTSG00005000327 ENSOTSG00005000326 CHN2 (ENSOTSG00005000314) cpvl (ENSOTSG00005000262) ENSOTSG00005000221 ENSOTSG00005005333 Salmo ANCESTRAL SPECIES 87 ENSGT00940000159208.B.f.b ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000154896.l.y.a ENSGT00940000154896.l.y.b.b.a.b ENSGT00940000164650.k.a.a ENSGT00940000155137.a.a.h ENSGT00940000162033.a.a.d ENSGT00940000161340 ENSGT00940000162033.a.a.c ENSGT00940000166052 ENSGT00390000013151.a.b ENSGT00940000163281.a.d ENSGT00940000163428.b.a.a ENSGT00940000166341 ENSGT00940000154486.b.a.b ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a.d #25 ENSGT00940000157288.t ENSGT00940000157858.i.j ENSGT00760000119737 ENSGT00940000157288.s ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a.f ENSGT00940000156420.b ENSGT00390000003368 ENSGT00390000003635.g.d ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255.y.a ENSGT00940000164071.b.a River trout DUPLICATION River trout MODERN SPECIES 22 ENSSTUG00000009958 ENSSTUG00000010015 c4b (ENSSTUG00000010060) ENSSTUG00000011317 ENSSTUG00000011321 rxrbb (ENSSTUG00000011327) FHOD3 (ENSSTUG00000011478) slc6a19b (ENSSTUG00000012068) sp8b (ENSSTUG00000012537) ENSSTUG00000012855 macc1 (ENSSTUG00000027819) ENSSTUG00000027827 ENSSTUG00000027834 hdac9b (ENSSTUG00000027839) ahr1a (ENSSTUG00000027876) ENSSTUG00000027938 #22 ENSSTUG00000028516 ENSSTUG00000028529 ENSSTUG00000028999 flad1 (ENSSTUG00000029011) SHC1 (ENSSTUG00000029117) lenep (ENSSTUG00000029443) ENSSTUG00000029448 ENSSTUG00000029468 s100a11 (ENSSTUG00000029505) ENSSTUG00000029509 ENSSTUG00000029525 ENSSTUG00000029541 tuft1a (ENSSTUG00000029570) C1orf43 (ENSSTUG00000029584) ENSSTUG00000029601 River trout MODERN SPECIES 147 ENSSTUG00000031308 sp8b (ENSSTUG00000031298) ENSSTUG00000029364 macc1 (ENSSTUG00000029313) ENSSTUG00000029294 ENSSTUG00000029288 ENSSTUG00000029277 hdac9b (ENSSTUG00000029262) ENSSTUG00000029251 ahr1a (ENSSTUG00000029214) ANKRD28 (ENSSTUG00000024939) #22 ENSSTUG00000024811 ENSSTUG00000024788 ENSSTUG00000024782 Atlantic salmon MODERN SPECIES 24 ENSSSAG00000088583 ENSSSAG00000118052 slc6a19b (ENSSSAG00000065673) slc6a19b (ENSSSAG00000104230) ENSSSAG00000082267 ENSSSAG00000094949 ENSSSAG00000106143 sp8b (ENSSSAG00000106905) ENSSSAG00000043709 macc1 (ENSSSAG00000094887) ENSSSAG00000115967 twst2 (ENSSSAG00000005235) ENSSSAG00000086502 hdac9b (ENSSSAG00000096709) ahr1a (ENSSSAG00000084403) ENSSSAG00000100848 #22 ENSSSAG00000120064 ENSSSAG00000093744 ENSSSAG00000082393 hacl1 (ENSSSAG00000058006) #24 ENSSSAG00000114748 ENSSSAG00000103025 #25 plekha8 (ENSSSAG00000087781) ENSSSAG00000046042 ENSSSAG00000053505 ENSSSAG00000090755 cpvl (ENSSSAG00000059739) CREB5 (ENSSSAG00000040675) ENSSSAG00000097593 JAZF1 (ENSSSAG00000115280) tax1bp1b (ENSSSAG00000093981) Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154807.a.a ENSGT00940000158906.i ENSGT00940000164650 ENSGT00940000155137.b ENSGT00940000155137.a.a ENSGT00940000159108.j ENSGT00940000158880 ENSGT00940000157827.h ENSGT00940000162033.a.a ENSGT00940000166052 ENSGT00940000155287 ENSGT00390000013151.a.b.e ENSGT00940000163281.a ENSGT00940000163428.b.b ENSGT00940000154486.b.a.b.m ENSGT00950000182908.C.b #22 ENSGT00940000156802 #24 ENSGT00940000157248.c.a #25 ENSGT00940000157288 ENSGT00940000160267 ENSGT00990000208316 ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000156420.a.a ENSGT00390000003635.h.a ENSGT00950000183025.b.a.`b ENSGT00940000155255.db ENSGT00940000164071.b.a ENSGT00940000158311.b ENSGT00940000163268.d.a.f ENSGT00940000164628 P. kingsleyae DUPLICATION P. kingsleyae MODERN SPECIES 161 TOMM7 (ENSPKIG00000022505) ENSPKIG00000022527 ENSPKIG00000022553 ENSPKIG00000022576 CDCA7L (ENSPKIG00000022621) sp4 (ENSPKIG00000022661) sp8a (ENSPKIG00000022680) ITGB8 (ENSPKIG00000022705) macc1 (ENSPKIG00000022743) ENSPKIG00000025637 polr1f (ENSPKIG00000025635) FERD3L (ENSPKIG00000025633) twist1a (ENSPKIG00000025630) ENSPKIG00000025662 SNX13 (ENSPKIG00000025692) ANKRD28 (ENSPKIG00000025678) #22 btd (ENSPKIG00000025675) #23 COLQ (ENSPKIG00000000019) #25 ENSPKIG00000000042 ENSPKIG00000000045 ENSPKIG00000000055 ENSPKIG00000000065 TRIL (ENSPKIG00000000080) CREB5 (ENSPKIG00000000103) JAZF1 (ENSPKIG00000000128) tax1bp1a (ENSPKIG00000000144) hibadhb (ENSPKIG00000000157) evx1 (ENSPKIG00000000173) hoxa13a (ENSPKIG00000000189) hoxa11a (ENSPKIG00000000203) hoxa10b (ENSPKIG00000000211) P. kingsleyae MODERN SPECIES 69 sp8b (ENSPKIG00000007088) ENSPKIG00000007436 ENSPKIG00000008113 ENSPKIG00000008135 ENSPKIG00000008153 ENSPKIG00000008168 ENSPKIG00000008186 ABCB5 (ENSPKIG00000008234) macc1 (ENSPKIG00000008306) twist1b (ENSPKIG00000008335) hdac9b (ENSPKIG00000008372) ahr1a (ENSPKIG00000008425) ANKRD28 (ENSPKIG00000008471) #22 hacl1 (ENSPKIG00000008678) #24 COLQ (ENSPKIG00000008863) #25 plekha8 (ENSPKIG00000008918) fkbp14 (ENSPKIG00000008955) ENSPKIG00000008975 CHN2 (ENSPKIG00000008999) cpvl (ENSPKIG00000009045) CREB5 (ENSPKIG00000009122) JAZF1 (ENSPKIG00000009182) tax1bp1b (ENSPKIG00000009206) hibadhb (ENSPKIG00000009313) hoxa13b (ENSPKIG00000009334) hoxa11b (ENSPKIG00000009343) hoxa10b (ENSPKIG00000009352) hoxa9b (ENSPKIG00000009363) Spotted gar MODERN SPECIES 649 myo1g (ENSLOCG00000005748) si:dkeyp-92c9.2 (ENSLOCG00000018329) cyhr1 (ENSLOCG00000005765) tonsl (ENSLOCG00000005779) tdp2b (ENSLOCG00000005817) KIAA0319 (ENSLOCG00000005830) aldh5a1 (ENSLOCG00000005880) KDM1B (ENSLOCG00000005898) dek (ENSLOCG00000005923) KCNV1 (ENSLOCG00000005940) gbp (ENSLOCG00000018330) DPY19L4 (ENSLOCG00000005956) ENSLOCG00000005972 ENSLOCG00000006002 GALNT15 (ENSLOCG00000006018) #21 ANKRD28 (ENSLOCG00000006030) #22 btd (ENSLOCG00000006069) #23 hacl1 (ENSLOCG00000006085) #24 COLQ (ENSLOCG00000006099) #25 plekha8 (ENSLOCG00000006111) fkbp14 (ENSLOCG00000006139) WIPF3 (ENSLOCG00000006162) ENSLOCG00000018331 CHN2 (ENSLOCG00000006208) rbm24b (ENSLOCG00000006244) ENSLOCG00000006274 ENSLOCG00000006294 ENSLOCG00000006314 ENSLOCG00000006333 nagpa (ENSLOCG00000006341) tp53inp1 (ENSLOCG00000006359) Reedfish MODERN SPECIES 4 kat2b (ENSECRG00000018781) ddx21 (ENSECRG00000019058) PP2D1 (ENSECRG00000020433) rab5ab (ENSECRG00000020444) ENSECRG00000020467 KCNH8 (ENSECRG00000020514) satb1a (ENSECRG00000020534) tbc1d5 (ENSECRG00000020562) #15 PLCL2 (ENSECRG00000020617) #16 dazl (ENSECRG00000020678) #17 RFTN1 (ENSECRG00000020704) #18 oxnad1 (ENSECRG00000020731) #19 ENSECRG00000020745 GALNT15 (ENSECRG00000020760) #21 ENSECRG00000020785 ANKRD28 (ENSECRG00000020828) #22 btd (ENSECRG00000020919) #23 hacl1 (ENSECRG00000020942) #24 COLQ (ENSECRG00000020973) #25 plekha8 (ENSECRG00000021010) fkbp14 (ENSECRG00000021041) SCRN1 (ENSECRG00000021054) WIPF3 (ENSECRG00000021065) ENSECRG00000021076 ENSECRG00000021118 CHN2 (ENSECRG00000021158) cpvl (ENSECRG00000021266) ENSECRG00000021534 TRIL (ENSECRG00000021548) CREB5 (ENSECRG00000021562) jazf1a (ENSECRG00000021586) Elephant shark MODERN SPECIES 1541 ENSCMIG00000018967 ENSCMIG00000018968 ENSCMIG00000018971 ENSCMIG00000018977 ENSCMIG00000018978 KCNH8 (ENSCMIG00000018981) ENSCMIG00000018984 ENSCMIG00000018985 tbc1d5 (ENSCMIG00000019001) #15 PLCL2 (ENSCMIG00000019043) #16 dazl (ENSCMIG00000019050) #17 ENSCMIG00000019054 #18 oxnad1 (ENSCMIG00000019055) #19 ENSCMIG00000019059 #21 ENSCMIG00000019061 #21 ANKRD28 (ENSCMIG00000019083) #22 btd (ENSCMIG00000019124) #23 hacl1 (ENSCMIG00000019180) #24 hecw1b (ENSCMIG00000019265) stk17a (ENSCMIG00000019286) ENSCMIG00000019287 blvra (ENSCMIG00000019288) ENSCMIG00000019291 lancl2 (ENSCMIG00000019297) egfra (ENSCMIG00000019371)