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Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00950000183192.a.a	ENSGT00940000158191	ENSGT00940000161505	ENSGT00920000149143 #8	ENSGT00940000160169 #9	ENSGT00940000155076.a #12	ENSGT00940000155548 #13	ENSGT00950000182900.A.b #14	ENSGT00390000014318 #15	ENSGT00940000158846 #16	ENSGT00390000003316.d.g.a.a ##17	ENSGT00390000010094.a #18	ENSGT00950000183017.a #19	ENSGT00740000115643 #20	ENSGT00940000157120 #21	ENSGT00940000158275 #22	ENSGT00950000182808.a.a.b.a #23	ENSGT00390000018436.a.a #24	ENSGT00940000157547 #25	ENSGT00830000128402 #26	ENSGT00520000055955 #27	ENSGT00940000161933.e	ENSGT00940000162712 #28	ENSGT00940000161067 #29	ENSGT00390000017666 #31	ENSGT00940000161472 #32	ENSGT00940000158243 #33	ENSGT00940000157417 #34	ENSGT00940000155944 #35	ENSGT00940000157159 #36	ENSGT00940000159153 #37
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00950000183192.a.a	ENSGT00940000158191	ENSGT00940000161505	ENSGT00920000149143 #8	ENSGT00940000160169 #9	ENSGT00940000155076.a #12	ENSGT00940000155548 #13	ENSGT00950000182900.A.b #14	ENSGT00390000014318 #15	ENSGT00940000158846 #16	ENSGT00390000003316.d.g.a.a ##17	ENSGT00390000010094.a #18	ENSGT00950000183017.a #19	ENSGT00740000115643 #20	ENSGT00940000157120 #21	ENSGT00940000158275 #22	ENSGT00950000182808.a.a.b.a #23	ENSGT00390000018436.a.a #24	ENSGT00940000157547 #25	ENSGT00830000128402 #26	ENSGT00520000055955 #27	ENSGT00940000161933.e	ENSGT00940000162712 #28	ENSGT00390000017666 #31	ENSGT00940000161472 #32	ENSGT00940000158243 #33	ENSGT00940000157417 #34	ENSGT00940000155944 #35	ENSGT00940000157159 #36	ENSGT00940000159153 #37	ENSGT00390000009546
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Goat	MODERN SPECIES	1	ENSCHIG00000019006 #7	ZFYVE26 (ENSCHIG00000020708) #8	RAD51B (ENSCHIG00000014545) #9	ENSCHIG00000012926 #10	ENSCHIG00000011216 #11	ZFP36L1 (ENSCHIG00000022716) #12	ACTN1 (ENSCHIG00000015756) #13	DCAF5 (ENSCHIG00000021848) #14	EXD2 (ENSCHIG00000021919) #15	GALNT16 (ENSCHIG00000024703) #16	ENSCHIG00000015872 #17	SLC39A9 (ENSCHIG00000017815) #18	PLEKHD1 (ENSCHIG00000014956) #19	CCDC177 (ENSCHIG00000011458) #20	SUSD6 (ENSCHIG00000021146) #21	SRSF5 (ENSCHIG00000016794) #22	SLC10A1 (ENSCHIG00000019542) #23	SMOC1 (ENSCHIG00000011592) #24	SLC8A3 (ENSCHIG00000011087) #25	ENSCHIG00000022232 #26	COX16 (ENSCHIG00000016082) #27	ADAM21 (ENSCHIG00000009441) #28	ADAM20 (ENSCHIG00000026951) #29	ENSCHIG00000011291 #30	MED6 (ENSCHIG00000024218) #31	TTC9 (ENSCHIG00000023182) #32	MAP3K9 (ENSCHIG00000016673) #33	PCNX1 (ENSCHIG00000026327) #34	SIPA1L1 (ENSCHIG00000020272) #35	RGS6 (ENSCHIG00000000519) #36	DPF3 (ENSCHIG00000024523) #37
Rambouillet Sheep	DUPLICATION
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Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000158191	ENSGT00940000161505	ENSGT00920000149143 #8	ENSGT00940000160169 #9	ENSGT00940000155076.a #12	ENSGT00940000155548 #13	ENSGT00950000182900.A.b #14	ENSGT00390000014318 #15	ENSGT00940000158846 #16	ENSGT00390000003316.d.g.a.a.b ##17	ENSGT00390000010094.a #18	ENSGT00950000183017.a #19	ENSGT00740000115643 #20	ENSGT00940000157120 #21	ENSGT00390000003248.a.a.a.b.t.a.a	ENSGT00940000158275 #22	ENSGT00950000182808.a.a.b.a #23	ENSGT00390000018436.a.a #24	ENSGT00940000157547 #25	ENSGT00830000128402 #26	ENSGT00520000055955 #27	ENSGT00940000161933.f	ENSGT00940000161933.e	ENSGT00940000162712 #28	ENSGT00940000161067 #29	ENSGT00390000017666 #31	ENSGT00940000161472 #32	ENSGT00940000158243 #33	ENSGT00940000157417 #34	ENSGT00940000155944 #35	ENSGT00940000157159 #36
Cow	MODERN SPECIES	1	RDH11 (ENSBTAG00000001950)	RDH12 (ENSBTAG00000012838)	ZFYVE26 (ENSBTAG00000014334) #8	RAD51B (ENSBTAG00000018971) #9	ZFP36L1 (ENSBTAG00000025434) #12	ACTN1 (ENSBTAG00000018255) #13	DCAF5 (ENSBTAG00000048519) #14	EXD2 (ENSBTAG00000010052) #15	GALNT16 (ENSBTAG00000009998) #16	ERH (ENSBTAG00000017798) ##17	SLC39A9 (ENSBTAG00000017811) #18	PLEKHD1 (ENSBTAG00000008576) #19	CCDC177 (ENSBTAG00000047101) #20	SUSD6 (ENSBTAG00000003857) #21	ENSBTAG00000050645	SRSF5 (ENSBTAG00000011596) #22	SLC10A1 (ENSBTAG00000001881) #23	SMOC1 (ENSBTAG00000030599) #24	SLC8A3 (ENSBTAG00000027080) #25	SYNJ2BP (ENSBTAG00000007586) #26	COX16 (ENSBTAG00000030595) #27	ENSBTAG00000054288	ENSBTAG00000037932	ADAM21 (ENSBTAG00000003715) #28	MED6 (ENSBTAG00000006786) #31	ADAM20 (ENSBTAG00000038377) #29	ENSBTAG00000052827 #30	TTC9 (ENSBTAG00000045604) #32	MAP3K9 (ENSBTAG00000005700) #33	PCNX1 (ENSBTAG00000012565) #34	ENSBTAG00000048690
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	1	RDH12 (ENSBIXG00005029526)	ZFYVE26 (ENSBIXG00005029551) #8	RAD51B (ENSBIXG00005029614) #9	ENSBIXG00005029630	ZFP36L1 (ENSBIXG00005029639) #12	ACTN1 (ENSBIXG00005029682) #13	DCAF5 (ENSBIXG00005029780) #14	EXD2 (ENSBIXG00005029803) #15	GALNT16 (ENSBIXG00005029858) #16	ENSBIXG00005029870 ##17	SLC39A9 (ENSBIXG00005029879) #18	PLEKHD1 (ENSBIXG00005001643) #19	CCDC177 (ENSBIXG00005001674) #20	SUSD6 (ENSBIXG00005001703) #21	ENSBIXG00005001752	SRSF5 (ENSBIXG00005001782) #22	SLC10A1 (ENSBIXG00005005187) #23	SMOC1 (ENSBIXG00005001873) #24	SLC8A3 (ENSBIXG00005029096) #25	SYNJ2BP (ENSBIXG00005029040) #26	COX16 (ENSBIXG00005005118) #27	ENSBIXG00005002066	ENSBIXG00005028980	ADAM21 (ENSBIXG00005028972) #28	MED6 (ENSBIXG00005005085) #31	ENSBIXG00005028916 #30	TTC9 (ENSBIXG00005028903) #32	MAP3K9 (ENSBIXG00005005038) #33	PCNX1 (ENSBIXG00005002329) #34	SIPA1L1 (ENSBIXG00005028352) #35	ENSBIXG00005028293
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000158191	ENSGT00940000161505	ENSGT00920000149143 #8	ENSGT00940000160169 #9	ENSGT00940000155076.a #12	ENSGT00940000155548 #13	ENSGT00950000182900.A.b #14	ENSGT00390000014318 #15	ENSGT00940000158846 #16	ENSGT00390000003316.d.g.a.a ##17	ENSGT00390000010094.a #18	ENSGT00950000183017.a #19	ENSGT00740000115643 #20	ENSGT00940000157120 #21	ENSGT00390000003248.a.a.a.b.t.a.a	ENSGT00940000158275 #22	ENSGT00950000182808.a.a.b.a #23	ENSGT00390000018436.a.a #24	ENSGT00940000157547 #25	ENSGT00830000128402 #26	ENSGT00520000055955 #27	ENSGT00940000161933.f	ENSGT00940000161933.e	ENSGT00940000162712 #28	ENSGT00940000161067 #29	ENSGT00390000017666 #31	ENSGT00940000161472 #32	ENSGT00940000158243 #33	ENSGT00940000157417 #34	ENSGT00950000182878.b.a.c.a.a.b.p.b.b.b	ENSGT00940000155944 #35
Wild yak	MODERN SPECIES	1824	VTI1B (ENSBMUG00000012578)	RDH11 (ENSBMUG00000012607)	RDH12 (ENSBMUG00000012624)	ZFYVE26 (ENSBMUG00000012670) #8	RAD51B (ENSBMUG00000012736) #9	ZFP36L1 (ENSBMUG00000012776) #12	ACTN1 (ENSBMUG00000012867) #13	DCAF5 (ENSBMUG00000012948) #14	EXD2 (ENSBMUG00000012988) #15	GALNT16 (ENSBMUG00000013012) #16	ENSBMUG00000013028 ##17	SLC39A9 (ENSBMUG00000013111) #18	PLEKHD1 (ENSBMUG00000013136) #19	SUSD6 (ENSBMUG00000013166) #21	ENSBMUG00000013177	SRSF5 (ENSBMUG00000013243) #22	SLC10A1 (ENSBMUG00000013283) #23	SMOC1 (ENSBMUG00000013315) #24	SLC8A3 (ENSBMUG00000013444) #25	SYNJ2BP (ENSBMUG00000013494) #26	COX16 (ENSBMUG00000013530) #27	ENSBMUG00000013584
Domestic yak	MODERN SPECIES	2	RDH11 (ENSBGRG00000005960)	RDH12 (ENSBGRG00000006048)	ZFYVE26 (ENSBGRG00000006154) #8	RAD51B (ENSBGRG00000006291) #9	ZFP36L1 (ENSBGRG00000006544) #12	ACTN1 (ENSBGRG00000006595) #13	DCAF5 (ENSBGRG00000007044) #14	EXD2 (ENSBGRG00000007112) #15	GALNT16 (ENSBGRG00000007271) #16	ENSBGRG00000007387 ##17	SLC39A9 (ENSBGRG00000007464) #18	PLEKHD1 (ENSBGRG00000007631) #19	CCDC177 (ENSBGRG00000007718) #20	SUSD6 (ENSBGRG00000007738) #21	ENSBGRG00000007840	SRSF5 (ENSBGRG00000007863) #22	SLC10A1 (ENSBGRG00000007947) #23	SMOC1 (ENSBGRG00000007997) #24	SLC8A3 (ENSBGRG00000008321) #25	SYNJ2BP (ENSBGRG00000008751) #26	COX16 (ENSBGRG00000008784) #27	ENSBGRG00000008867	ENSBGRG00000008921	ADAM21 (ENSBGRG00000008955) #28	MED6 (ENSBGRG00000008994) #31	TTC9 (ENSBGRG00000009323) #32	MAP3K9 (ENSBGRG00000009390) #33	PCNX1 (ENSBGRG00000009684) #34	ENSBGRG00000010436	SIPA1L1 (ENSBGRG00000010469) #35	RGS6 (ENSBGRG00000010823) #36
American bison	MODERN SPECIES	3156	ARG2 (ENSBBBG00000023706)	VTI1B (ENSBBBG00000006185)	RDH11 (ENSBBBG00000023755)	RDH12 (ENSBBBG00000006192)	ZFYVE26 (ENSBBBG00000008688) #8	RAD51B (ENSBBBG00000006221) #9	ACTN1 (ENSBBBG00000008979) #13	DCAF5 (ENSBBBG00000024180) #14	EXD2 (ENSBBBG00000024244) #15	GALNT16 (ENSBBBG00000024287) #16	ENSBBBG00000024305 ##17	SLC39A9 (ENSBBBG00000009006) #18	PLEKHD1 (ENSBBBG00000024457) #19	ENSBBBG00000024477	SUSD6 (ENSBBBG00000008034) #21	SRSF5 (ENSBBBG00000024564) #22	SLC10A1 (ENSBBBG00000009026) #23	SMOC1 (ENSBBBG00000006424) #24	SLC8A3 (ENSBBBG00000024696) #25	SYNJ2BP (ENSBBBG00000024709) #26	COX16 (ENSBBBG00000006522) #27	ENSBBBG00000008045	ENSBBBG00000006817	ADAM21 (ENSBBBG00000024843) #28	ADAM20 (ENSBBBG00000024877) #29	ENSBBBG00000024889 #30	MED6 (ENSBBBG00000007826) #31	ENSBBBG00000024958	TTC9 (ENSBBBG00000024964) #32	MAP3K9 (ENSBBBG00000006680) #33	PCNX1 (ENSBBBG00000006739) #34
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	260	RDH11 (ENSMMSG00000014690)	RDH12 (ENSMMSG00000014738)	ZFYVE26 (ENSMMSG00000014767) #8	RAD51B (ENSMMSG00000014830) #9	ZFP36L1 (ENSMMSG00000014866) #12	ACTN1 (ENSMMSG00000014903) #13	DCAF5 (ENSMMSG00000015125) #14	EXD2 (ENSMMSG00000015181) #15	GALNT16 (ENSMMSG00000015223) #16	ENSMMSG00000015260 #17	SLC39A9 (ENSMMSG00000015291) #18	PLEKHD1 (ENSMMSG00000015392) #19	CCDC177 (ENSMMSG00000015408) #20	SUSD6 (ENSMMSG00000015417) #21	ENSMMSG00000015442	SRSF5 (ENSMMSG00000015483) #22	SLC10A1 (ENSMMSG00000015540) #23	SMOC1 (ENSMMSG00000015568) #24	SLC8A3 (ENSMMSG00000015641) #25	ENSMMSG00000016377	SYNJ2BP (ENSMMSG00000016389) #26	COX16 (ENSMMSG00000016413) #27	ENSMMSG00000016438	ENSMMSG00000016460	ENSMMSG00000016479	ENSMMSG00000016499	ADAM21 (ENSMMSG00000016525) #28	ENSMMSG00000016564 #29	ENSMMSG00000016669 #29	MED6 (ENSMMSG00000016803) #31	ENSMMSG00000017035 #30
Yarkand deer	MODERN SPECIES	3	RDH11 (ENSCHYG00000012859)	RDH12 (ENSCHYG00000012949)	ZFYVE26 (ENSCHYG00000012995) #8	RAD51B (ENSCHYG00000013227) #9	ENSCHYG00000013374	ZFP36L1 (ENSCHYG00000013388) #12	ACTN1 (ENSCHYG00000013444) #13	DCAF5 (ENSCHYG00000014119) #14	EXD2 (ENSCHYG00000014357) #15	GALNT16 (ENSCHYG00000014437) #16	ENSCHYG00000014664 ##17	SLC39A9 (ENSCHYG00000014753) #18	PLEKHD1 (ENSCHYG00000015074) #19	CCDC177 (ENSCHYG00000015183) #20	SUSD6 (ENSCHYG00000015242) #21	SRSF5 (ENSCHYG00000015389) #22	SLC10A1 (ENSCHYG00000015547) #23	SMOC1 (ENSCHYG00000015652) #24	SLC8A3 (ENSCHYG00000016091) #25	ENSCHYG00000016416 #26	COX16 (ENSCHYG00000016477) #27	ENSCHYG00000016536	ADAM21 (ENSCHYG00000016571) #28	ADAM20 (ENSCHYG00000016594) #29	MED6 (ENSCHYG00000016619) #31	ENSCHYG00000016850 #30	TTC9 (ENSCHYG00000016904) #32	MAP3K9 (ENSCHYG00000016964) #33	PCNX1 (ENSCHYG00000017125) #34	SIPA1L1 (ENSCHYG00000017418) #35	ENSCHYG00000017850