Bilateria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000010125 #22 Ecdysozoa ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000010125 #22 Caenorhabditis elegans MODERN SPECIES 5 F11D11.21 (WBGene00206492) #7 F11D11.12 (WBGene00045362) #8 clec-252 (WBGene00008702) #9 clec-251 (WBGene00008703) #10 clec-250 (WBGene00045364) #11 scl-20 (WBGene00013972) #12 scl-19 (WBGene00013971) #13 asp-18 (WBGene00013973) #14 asp-19 (WBGene00077655) #15 Y17D7C.2 (WBGene00012456) #16 Y17D7C.6 (WBGene00194680) #17 Y17D7C.1 (WBGene00012455) #18 Y69H2.9 (WBGene00013484) #19 nhr-241 (WBGene00013483) #20 Y69H2.7 (WBGene00013482) #21 ubc-19 (WBGene00006714) #22 Y69H2.17 (WBGene00077455) #23 Y69H2.10 (WBGene00013485) #24 Y69H2.3 (WBGene00013481) #25 egas-2 (WBGene00013487) #26 egas-1 (WBGene00013486) #27 col-42 (WBGene00013489) #28 egas-3 (WBGene00013480) #29 Y69H2.15 (WBGene00050884) #30 Y69H2.1 (WBGene00013479) #31 nhr-70 (WBGene00003660) #32 grdn-1 (WBGene00013082) #33 txt-14 (WBGene00013081) #34 Y51A2D.13 (WBGene00013080) #35 Y51A2D.21 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ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT01040000241257 ENSGT00940000155706 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00530000064134.a.a Amniota ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00550000075019 ENSGT00940000161738 ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.b ENSGT00940000160211 ENSGT01030000235333 ENSGT00940000157672 ENSGT00940000158960 ENSGT00940000166682 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT01040000241257 ENSGT00940000155706 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 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#22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155706 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00530000064134.a.a ENSGT00940000158492 ENSGT00940000163703.b Episquamata ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000155218.B ENSGT00390000009212 ENSGT00390000012054.b.`b ENSGT00390000012054.b.ab ENSGT00940000160204 ENSGT00940000158070 ENSGT00940000158960 ENSGT00940000166682 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155706 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00530000064134.a.a ENSGT00940000158492 ENSGT00950000186190 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000005410 ENSGT00940000155218.B ENSGT00390000009212 ENSGT00390000012054.b.`b ENSGT00390000012054.b.ab ENSGT00940000160204 ENSGT00940000158070 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155706 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00530000064134.a.a ENSGT00940000158492 ENSGT00950000186190 Elapidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000012054.b.ab ENSGT00940000160204 ENSGT00940000158070 ENSGT00940000158960 ENSGT00640000091563.b ENSGT00950000182843.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000155478 ENSGT00940000156844.a ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 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ENSGT00940000155706 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00940000158492 ENSGT00940000159811 Aves ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000161738 ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.b ENSGT00940000160211 ENSGT01030000235333 ENSGT00940000157672 ENSGT00940000158960 ENSGT00940000166682 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000155478 ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT01040000241257 ENSGT00940000155706 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00940000158492 ENSGT00940000159811 Neognathae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000161738 ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.b ENSGT00940000160211 ENSGT01030000235333 ENSGT00940000157672 ENSGT00940000158960 ENSGT00940000166682 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000155478 ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT01040000241257 ENSGT00940000155706 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00940000158492 ENSGT00940000159811 Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00550000075019 ENSGT00940000161738 ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.b ENSGT00940000160211 ENSGT01030000235333 ENSGT00940000157672 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000166682 ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155706 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00940000158492 ENSGT00940000159811 ENSGT00940000158682 Anatidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00550000075019 ENSGT00940000161738 ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.b ENSGT00940000160211 ENSGT01030000235333 ENSGT00940000157672 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000166682 ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155706 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00940000158492 ENSGT00940000159811 ENSGT00940000158682 Pink-footed goose MODERN SPECIES 15 ESRP2 (ENSABRG00000022757) NFATC3 (ENSABRG00000022750) DUS2 (ENSABRG00000022711) DDX28 (ENSABRG00000022669) ENSABRG00000022667 ENSABRG00000022665 SLC12A4 (ENSABRG00000022298) SLC6A2 (ENSABRG00000022187) LPCAT2 (ENSABRG00000022184) MMP2 (ENSABRG00000022132) IRX6 (ENSABRG00000022116) IRX5 (ENSABRG00000022092) IRX3 (ENSABRG00000022069) FTO (ENSABRG00000022047) RPGRIP1L (ENSABRG00000022027) AKTIP (ENSABRG00000021982) #22 RBL2 (ENSABRG00000021843) CHD9 (ENSABRG00000020362) TOX3 (ENSABRG00000020053) SALL1 (ENSABRG00000020030) Duck MODERN SPECIES 3 ESRP2 (ENSAPLG00000004479) NFATC3 (ENSAPLG00000004470) ENSAPLG00000022119 DDX28 (ENSAPLG00000024535) ENSAPLG00000004353 DPEP2 (ENSAPLG00000004307) ENSAPLG00000022247 SLC12A4 (ENSAPLG00000004021) ENSAPLG00000003879 LPCAT2 (ENSAPLG00000003809) CAPNS2 (ENSAPLG00000023985) MMP2 (ENSAPLG00000003788) IRX3 (ENSAPLG00000019607) FTO (ENSAPLG00000016324) RPGRIP1L (ENSAPLG00000016340) AKTIP (ENSAPLG00000016399) #22 RBL2 (ENSAPLG00000001177) CHD9 (ENSAPLG00000002826) TOX3 (ENSAPLG00000003299) SALL1 (ENSAPLG00000003356) CYLD (ENSAPLG00000012780) SNX20 (ENSAPLG00000013062) NKD1 (ENSAPLG00000013087) ENSAPLG00000027872 BRD7 (ENSAPLG00000013363) ADCY7 (ENSAPLG00000013887) TENT4B (ENSAPLG00000014941) CNEP1R1 (ENSAPLG00000025705) ENSAPLG00000026611 HEATR3 (ENSAPLG00000009802) ZNF423 (ENSAPLG00000009508) Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000156131.a.b ENSGT00550000075019 ENSGT00940000161738 ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.b ENSGT00940000160211 ENSGT00940000157672 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000166682 ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155706.x ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00940000158492 ENSGT00940000159811 ENSGT00940000158682 Japanese quail MODERN SPECIES 2 NFATC3 (ENSCJPG00005012386) DUS2 (ENSCJPG00005012387) DDX28 (ENSCJPG00005012388) ENSCJPG00005012389 DPEP2 (ENSCJPG00005012390) SLC12A4 (ENSCJPG00005012391) SLC6A2 (ENSCJPG00005012392) LPCAT2 (ENSCJPG00005012393) CAPNS2 (ENSCJPG00005012394) MMP2 (ENSCJPG00005012395) IRX6 (ENSCJPG00005012397) IRX5 (ENSCJPG00005012400) IRX3 (ENSCJPG00005012408) FTO (ENSCJPG00005012412) RPGRIP1L (ENSCJPG00005012413) AKTIP (ENSCJPG00005012414) #22 RBL2 (ENSCJPG00005012415) CHD9 (ENSCJPG00005012416) TOX3 (ENSCJPG00005014332) SALL1 (ENSCJPG00005014342) CYLD (ENSCJPG00005014348) SNX20 (ENSCJPG00005014349) NKD1 (ENSCJPG00005014352) BRD7 (ENSCJPG00005014353) ADCY7 (ENSCJPG00005014354) TENT4B (ENSCJPG00005014355) HEATR3 (ENSCJPG00005014356) CNEP1R1 (ENSCJPG00005014357) ZNF423 (ENSCJPG00005014360) CBLN1 (ENSCJPG00005014363) N4BP1 (ENSCJPG00005014367) Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000183131.b.b ENSGT00940000157187 ENSGT00940000156131.a.b ENSGT00550000075019 ENSGT00940000161738 ENSGT00940000160211 ENSGT00940000157672 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155706.x ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301.c ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00940000158492 ENSGT00940000159811 ENSGT00940000158682 Chicken MODERN SPECIES 2 NFATC3 (ENSGALG00010021335) DUS2 (ENSGALG00010025291) DDX28 (ENSGALG00010025304) GALR1L (ENSGALG00010025309) DPEP2 (ENSGALG00010025325) SLC12A4 (ENSGALG00010025353) ENSGALG00010025372 SLC6A2 (ENSGALG00010025392) LPCAT2 (ENSGALG00010025257) MMP2 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ENSMGAG00000017825 ENSMGAG00000022119 ENSMGAG00000004311 ENSMGAG00000018372 ENSMGAG00000004090 ENSMGAG00000021306 ENSMGAG00000004072 ENSMGAG00000004069 ENSMGAG00000004063 ENSMGAG00000004019 ENSMGAG00000003992 ENSMGAG00000019303 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00550000075019 ENSGT00940000161738 ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.b ENSGT00940000160211 ENSGT00940000157672 ENSGT00940000158960 ENSGT00940000166682 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000155478 ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483.d.a ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B.f ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT01040000241257 ENSGT00940000155706 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00960000190127 ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00940000158492 Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000157187 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MODERN SPECIES 25 ESRP2 (ENSACCG00020001045) NFATC3 (ENSACCG00020001024) DUS2 (ENSACCG00020000994) DDX28 (ENSACCG00020000925) ENSACCG00020000798 ENSACCG00020000779 SLC12A4 (ENSACCG00020000700) SLC6A2 (ENSACCG00020000586) LPCAT2 (ENSACCG00020000417) MMP2 (ENSACCG00020000389) ENSACCG00020003392 IRX5 (ENSACCG00020003380) IRX3 (ENSACCG00020003366) FTO (ENSACCG00020003336) RPGRIP1L (ENSACCG00020003265) AKTIP (ENSACCG00020003199) #22 RBL2 (ENSACCG00020003164) CHD9 (ENSACCG00020003121) TOX3 (ENSACCG00020003095) SALL1 (ENSACCG00020003074) CYLD (ENSACCG00020003038) SNX20 (ENSACCG00020003015) NKD1 (ENSACCG00020002998) BRD7 (ENSACCG00020002949) ADCY7 (ENSACCG00020002875) TENT4B (ENSACCG00020002781) HEATR3 (ENSACCG00020002623) CNEP1R1 (ENSACCG00020002590) ZNF423 (ENSACCG00020002554) CBLN1 (ENSACCG00020002538) N4BP1 (ENSACCG00020002525) Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00550000075019 ENSGT00940000161738 ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.b ENSGT00940000160211 ENSGT00940000157672 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(ENSOANG00000000584) Theria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000002349 ENSGT00390000015814 ENSGT00940000156482 ENSGT00940000155883.a.b ENSGT00940000155883.a.a ENSGT00940000154623 ENSGT00940000158960 ENSGT00940000166682 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155706 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00530000064134.a.a ENSGT00940000158492 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000015814 ENSGT00940000156482 ENSGT00940000155883.a.b ENSGT00940000155883.a.a ENSGT00940000154623.o.b ENSGT00940000154623.o.a.a ENSGT00940000158960 ENSGT00940000166682 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155706 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00530000064134.a.a ENSGT00940000158492 Opossum MODERN SPECIES NUDT21 (ENSMODG00000013371) AMFR (ENSMODG00000013364) GNAO1 (ENSMODG00000013359) ENSMODG00000023448 ENSMODG00000013345 ENSMODG00000025750 SLC6A2 (ENSMODG00000013227) MMP2 (ENSMODG00000013214) IRX6 (ENSMODG00000013210) IRX5 (ENSMODG00000013202) ENSMODG00000013200 ENSMODG00000047345 IRX3 (ENSMODG00000013192) FTO (ENSMODG00000009684) RPGRIP1L (ENSMODG00000013180) AKTIP (ENSMODG00000025788) #22 RBL2 (ENSMODG00000013167) ENSMODG00000028845 CHD9 (ENSMODG00000013142) ENSMODG00000023478 TOX3 (ENSMODG00000043801) ENSMODG00000048280 ENSMODG00000046352 ENSMODG00000043097 SALL1 (ENSMODG00000013114) CYLD (ENSMODG00000013111) NOD2 (ENSMODG00000013087) SNX20 (ENSMODG00000013071) NKD1 (ENSMODG00000013068) ENSMODG00000013057 ADCY7 (ENSMODG00000013047) Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155883.a.b ENSGT00940000154623.o.a.a.b ENSGT00940000155883.a.a ENSGT00940000154623.o.b.a ENSGT00940000154623.o.a.b ENSGT00940000154623.o.a.a.a ENSGT00940000158960 ENSGT00940000166682 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155706 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00530000064134.a.a ENSGT00940000158492 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000156482 ENSGT00940000155883.a.b ENSGT00940000154623.o.a.a.b ENSGT00940000154623.o.b.a ENSGT00940000154623.o.a.b ENSGT00940000154623.o.a.a.a ENSGT00940000158960 ENSGT00940000166682 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155706 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00530000064134.a.a ENSGT00940000158492 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156482 ENSGT00940000155883.a.b ENSGT00940000154623.o.a.a.b ENSGT00940000154623.o.b.a ENSGT00940000154623.o.a.b ENSGT00940000154623.o.a.a.a ENSGT00940000158960 ENSGT00940000166682 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155706 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00530000064134.a.a ENSGT00940000158492 koala MODERN SPECIES 19 ENSPCIG00000018611 ENSPCIG00000003782 ENSPCIG00000003130 ENSPCIG00000033949 ENSPCIG00000016283 SLC6A2 (ENSPCIG00000003091) ENSPCIG00000033526 LPCAT2 (ENSPCIG00000003075) MMP2 (ENSPCIG00000003051) IRX6 (ENSPCIG00000022974) IRX5 (ENSPCIG00000013874) FTO (ENSPCIG00000024376) RPGRIP1L (ENSPCIG00000024349) ENSPCIG00000024347 AKTIP (ENSPCIG00000024346) #22 RBL2 (ENSPCIG00000024344) CHD9 (ENSPCIG00000017215) TOX3 (ENSPCIG00000027529) SALL1 (ENSPCIG00000017840) ENSPCIG00000032216 CYLD (ENSPCIG00000017853) NOD2 (ENSPCIG00000017861) SNX20 (ENSPCIG00000017863) NKD1 (ENSPCIG00000017864) BRD7 (ENSPCIG00000017871) ADCY7 (ENSPCIG00000016804) TENT4B (ENSPCIG00000018132) HEATR3 (ENSPCIG00000012841) CNEP1R1 (ENSPCIG00000003801) ENSPCIG00000002963 Common wonbat MODERN SPECIES 1030 GNAO1 (ENSVURG00010017913) ENSVURG00010017976 ENSVURG00010019197 ENSVURG00010019441 ENSVURG00010019766 ENSVURG00010019780 SLC6A2 (ENSVURG00010019792) LPCAT2 (ENSVURG00010019819) MMP2 (ENSVURG00010019856) IRX6 (ENSVURG00010019873) IRX5 (ENSVURG00010019880) IRX3 (ENSVURG00010019907) FTO (ENSVURG00010019930) RPGRIP1L (ENSVURG00010019968) ENSVURG00010020006 AKTIP (ENSVURG00010020011) #22 RBL2 (ENSVURG00010020023) CHD9 (ENSVURG00010020044) TOX3 (ENSVURG00010020069) ENSVURG00010020073 SALL1 (ENSVURG00010020083) CYLD (ENSVURG00010020092) NOD2 (ENSVURG00010020098) SNX20 (ENSVURG00010020106) NKD1 (ENSVURG00010020108) ENSVURG00010020128 ADCY7 (ENSVURG00010020149) TENT4B (ENSVURG00010020181) HEATR3 (ENSVURG00010020193) CNEP1R1 (ENSVURG00010020204) ENSVURG00010020211 Wallaby MODERN SPECIES 209 ENSMEUG00000010981 #22 Tasmanian devil MODERN SPECIES 1 ENSSHAG00000023373 ENSSHAG00000002116 ENSSHAG00000002765 ENSSHAG00000000745 ENSSHAG00000005170 SLC6A2 (ENSSHAG00000002816) CAPNS2 (ENSSHAG00000028677) LPCAT2 (ENSSHAG00000012383) MMP2 (ENSSHAG00000012197) IRX6 (ENSSHAG00000011163) IRX5 (ENSSHAG00000006589) ENSSHAG00000027911 IRX3 (ENSSHAG00000012619) FTO (ENSSHAG00000009174) RPGRIP1L (ENSSHAG00000008212) AKTIP (ENSSHAG00000024810) #22 RBL2 (ENSSHAG00000006471) CHD9 (ENSSHAG00000002719) TOX3 (ENSSHAG00000022477) SALL1 (ENSSHAG00000009477) CYLD (ENSSHAG00000003079) NOD2 (ENSSHAG00000029900) SNX20 (ENSSHAG00000018921) NKD1 (ENSSHAG00000028041) BRD7 (ENSSHAG00000018810) ADCY7 (ENSSHAG00000018774) TENT4B (ENSSHAG00000018746) HEATR3 (ENSSHAG00000014261) CNEP1R1 (ENSSHAG00000018694) ENSSHAG00000018669 ZNF423 (ENSSHAG00000018342) Eutheria ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000015814 ENSGT00940000156482 ENSGT00940000155883.a.b ENSGT00940000155883.a.a ENSGT00940000154623 ENSGT00940000158564 ENSGT00940000158960 ENSGT00940000166682 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ENSGT00940000155706 Hedgehog MODERN SPECIES 715 AKTIP (ENSEEUG00000008703) #22 RBL2 (ENSEEUG00000008401) Common shrew MODERN SPECIES 5575 AKTIP (ENSSARG00000010826) #22 RBL2 (ENSSARG00000010759) ENSSARG00000010749 CHD9 (ENSSARG00000010632) Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156482 ENSGT00940000155883.a.b ENSGT00940000155883.a.a ENSGT00940000161596 ENSGT00940000154623 ENSGT00940000158564 ENSGT00940000158960 ENSGT00940000166682 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155706 ENSGT00980000198839 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00960000190798 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000015814 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ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155706 ENSGT00980000198839 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938.j ENSGT00940000155938.i ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00960000190798 ENSGT00390000012529 Caniformia ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000002349 ENSGT00390000015814 ENSGT00940000156482 ENSGT00940000155883.a.b ENSGT00940000155883.a.a ENSGT00940000161596 ENSGT00940000158564 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155706 ENSGT00980000198839 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938.j ENSGT00940000155938.i ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 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ENSGT00390000008576 ENSGT00940000158492 Alpaca MODERN SPECIES 2175 AKTIP (ENSVPAG00000001377) #22 RBL2 (ENSVPAG00000001376) CHD9 (ENSVPAG00000001374) Arabian camel MODERN SPECIES 35 BBS2 (ENSCDRG00005002500) OGFOD1 (ENSCDRG00005002463) NUDT21 (ENSCDRG00005002425) AMFR (ENSCDRG00005002229) GNAO1 (ENSCDRG00005002147) CES5A (ENSCDRG00005002042) ENSCDRG00005001870 SLC6A2 (ENSCDRG00005001765) LPCAT2 (ENSCDRG00005001714) MMP2 (ENSCDRG00005001638) IRX6 (ENSCDRG00005001597) IRX5 (ENSCDRG00005001574) IRX3 (ENSCDRG00005001552) FTO (ENSCDRG00005001486) RPGRIP1L (ENSCDRG00005001382) AKTIP (ENSCDRG00005001331) #22 RBL2 (ENSCDRG00005001292) CHD9 (ENSCDRG00005001229) CHD9NB (ENSCDRG00005001186) ENSCDRG00005001171 TOX3 (ENSCDRG00005001153) SALL1 (ENSCDRG00005001107) CYLD (ENSCDRG00005001037) NOD2 (ENSCDRG00005000930) SNX20 (ENSCDRG00005000889) NKD1 (ENSCDRG00005000863) BRD7 (ENSCDRG00005000831) ADCY7 (ENSCDRG00005000750) TENT4B (ENSCDRG00005000655) HEATR3 (ENSCDRG00005000603) CNEP1R1 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MODERN SPECIES 1192 MT1A (ENSMMSG00000012273) ENSMMSG00000012266 ENSMMSG00000012241 ENSMMSG00000012234 ENSMMSG00000012209 ENSMMSG00000012191 ENSMMSG00000012156 SLC6A2 (ENSMMSG00000011050) LPCAT2 (ENSMMSG00000010940) MMP2 (ENSMMSG00000010869) IRX6 (ENSMMSG00000010817) IRX5 (ENSMMSG00000010766) IRX3 (ENSMMSG00000010728) FTO (ENSMMSG00000010603) RPGRIP1L (ENSMMSG00000010119) AKTIP (ENSMMSG00000010049) #22 RBL2 (ENSMMSG00000009982) CHD9 (ENSMMSG00000009559) ENSMMSG00000009494 TOX3 (ENSMMSG00000009435) SALL1 (ENSMMSG00000009393) CYLD (ENSMMSG00000009139) NOD2 (ENSMMSG00000009067) SNX20 (ENSMMSG00000008973) NKD1 (ENSMMSG00000008933) BRD7 (ENSMMSG00000008887) ADCY7 (ENSMMSG00000008792) TENT4B (ENSMMSG00000008637) HEATR3 (ENSMMSG00000008588) CNEP1R1 (ENSMMSG00000008491) ZNF423 (ENSMMSG00000008456) Bovidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000017113 ENSGT00950000182967.b ENSGT00950000182967.a.b ENSGT00950000182967.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000154623.k.a.a ENSGT00940000158564.e ENSGT00940000154623.k.a.b 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ENSOARG00020006477 BRD7 (ENSOARG00020006275) ADCY7 (ENSOARG00020006198) TENT4B (ENSOARG00020006032) Goat MODERN SPECIES 9 MT1B (ENSCHIG00000017153) ENSCHIG00000026788 ENSCHIG00000026692 ENSCHIG00000020804 ENSCHIG00000016650 ENSCHIG00000021089 SLC6A2 (ENSCHIG00000023734) LPCAT2 (ENSCHIG00000021714) MMP2 (ENSCHIG00000016293) IRX6 (ENSCHIG00000020999) IRX5 (ENSCHIG00000012181) IRX3 (ENSCHIG00000014903) FTO (ENSCHIG00000009126) RPGRIP1L (ENSCHIG00000016525) ENSCHIG00000009850 AKTIP (ENSCHIG00000011100) #22 RBL2 (ENSCHIG00000024944) CHD9 (ENSCHIG00000021000) ENSCHIG00000019505 SHCBP1 (ENSCHIG00000022997) VPS35 (ENSCHIG00000025912) ORC6 (ENSCHIG00000022439) MYLK3 (ENSCHIG00000019555) C16orf87 (ENSCHIG00000024479) GPT2 (ENSCHIG00000027095) ENSCHIG00000023464 ENSCHIG00000000692 NETO2 (ENSCHIG00000014739) ITFG1 (ENSCHIG00000020564) ENSCHIG00000010050 PHKB (ENSCHIG00000015267) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182967.a.a.a.a.a.a.n.c ENSGT00950000182967.a.a.a.a.a.a.n.d.a ENSGT00950000182967.a.a.a.a.a.b.a ENSGT00950000182967.a.a.a.a.a.a.n.d.b.a.a ENSGT00950000182967.a.a.a.a.a.a.n.d.b.b ENSGT00940000154623.k.a.a ENSGT00940000154623.k.a.b ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155706 ENSGT00910000148543 ENSGT01040000240503.B.cb.b ENSGT00940000158043 ENSGT00960000189733 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 Bos ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000182967.b ENSGT00950000182967.a.b ENSGT00950000182967.a.a.a.a.a.b.a ENSGT00950000182967.a.a.a.a.a.a.n.d.b.a.a ENSGT00950000182967.a.a.a.a.a.a.n.d.b.b ENSGT00940000154623.k.a.a ENSGT00940000154623.k.a.b ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155706 ENSGT00980000198839 ENSGT00910000148543 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00950000182967.a.a.a.a.a.b.a ENSGT00950000182967.a.a.a.a.a.a.n.c ENSGT00950000182967.a.a.a.a.a.a.n.d.a ENSGT00950000182967.a.a.a.a.a.a.n.d.b.b ENSGT00940000154623.k.a.a ENSGT00390000007818.e.b.a ENSGT00940000154623.k.a.b ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155706 ENSGT00980000198839 ENSGT00910000148543 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00390000003561.m.c.a ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 Wild yak MODERN SPECIES 355 ENSBMUG00000009918 ENSBMUG00000009928 SLC6A2 (ENSBMUG00000010092) LPCAT2 (ENSBMUG00000010132) MMP2 (ENSBMUG00000010148) IRX6 (ENSBMUG00000010165) IRX5 (ENSBMUG00000010181) IRX3 (ENSBMUG00000010223) FTO (ENSBMUG00000010305) ENSBMUG00000010323 RPGRIP1L (ENSBMUG00000010431) ENSBMUG00000010496 AKTIP (ENSBMUG00000010517) #22 RBL2 (ENSBMUG00000010579) CHD9 (ENSBMUG00000010701) CHD9NB (ENSBMUG00000010713) Domestic yak MODERN SPECIES 12 MT2A (ENSBGRG00000022584) ENSBGRG00000022635 ENSBGRG00000022662 ENSBGRG00000022677 ENSBGRG00000022766 ENSBGRG00000022847 SLC6A2 (ENSBGRG00000022943) LPCAT2 (ENSBGRG00000023829) MMP2 (ENSBGRG00000023889) IRX6 (ENSBGRG00000024080) IRX5 (ENSBGRG00000024137) IRX3 (ENSBGRG00000024169) FTO (ENSBGRG00000024270) 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ENSGT00390000018141.i.a.b.b.b.a.b.b.a.b.b ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 Cow MODERN SPECIES 9 MT3 (ENSBTAG00000016886) MT2A (ENSBTAG00000023659) MT1E (ENSBTAG00000001595) MT1E (ENSBTAG00000038706) MT1A (ENSBTAG00000054808) ENSBTAG00000001851 CES1 (ENSBTAG00000011021) SLC6A2 (ENSBTAG00000003353) LPCAT2 (ENSBTAG00000019272) MMP2 (ENSBTAG00000019267) IRX6 (ENSBTAG00000016407) IRX5 (ENSBTAG00000004838) IRX3 (ENSBTAG00000012083) FTO (ENSBTAG00000012501) RPGRIP1L (ENSBTAG00000012499) AKTIP (ENSBTAG00000016250) #22 RBL2 (ENSBTAG00000016243) CHD9 (ENSBTAG00000002287) ENSBTAG00000049705 TOX3 (ENSBTAG00000000418) ENSBTAG00000051871 SALL1 (ENSBTAG00000008544) CYLD (ENSBTAG00000006291) NOD2 (ENSBTAG00000020936) SNX20 (ENSBTAG00000003961) NKD1 (ENSBTAG00000012295) BRD7 (ENSBTAG00000021575) ADCY7 (ENSBTAG00000006208) TENT4B 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TOX3 (ENSDLEG00000004483) SALL1 (ENSDLEG00000004477) CYLD (ENSDLEG00000004470) NOD2 (ENSDLEG00000004464) SNX20 (ENSDLEG00000004455) NKD1 (ENSDLEG00000004447) BRD7 (ENSDLEG00000004432) ADCY7 (ENSDLEG00000004403) TENT4B (ENSDLEG00000004389) HEATR3 (ENSDLEG00000004380) CNEP1R1 (ENSDLEG00000004375) ZNF423 (ENSDLEG00000004357) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156482 ENSGT00940000155883.a.b ENSGT00940000155883.a.a ENSGT00940000161596 ENSGT00940000154623 ENSGT00940000158564 ENSGT00940000158960 ENSGT00940000166682 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00390000008759 ENSGT00940000155706 ENSGT00980000198839 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00960000190798 ENSGT00390000012529 Primates ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000002349 ENSGT00390000015814 ENSGT00940000156482 ENSGT00940000155883.a.a ENSGT00940000161596 ENSGT00940000154623 ENSGT00940000158960 ENSGT00940000166682 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155706 ENSGT00980000198839 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00940000158492 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000002349 ENSGT00390000015814 ENSGT00940000156482 ENSGT00940000155883.a.a ENSGT00940000161596 ENSGT00940000154623 ENSGT00940000158564 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155706 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00940000158492 ENSGT00390000014556 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 69 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155706 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00940000158492 ENSGT00390000014556 Mouse lemur DUPLICATION Mouse lemur DUPLICATION Mouse lemur MODERN SPECIES 27 ROBO4 (ENSMICG00000001710) HEPACAM (ENSMICG00000032042) CCDC15 (ENSMICG00000032597) SLC37A2 (ENSMICG00000002974) PKNOX2 (ENSMICG00000002993) ENSMICG00000028529 ENSMICG00000009663 PATE1 (ENSMICG00000001520) PATE2 (ENSMICG00000002420) PATE3 (ENSMICG00000041728) FEZ1 (ENSMICG00000003008) ENSMICG00000003023 STT3A (ENSMICG00000003036) ENSMICG00000016169 ACRV1 (ENSMICG00000003070) ENSMICG00000047901 #22 ENSMICG00000012248 ENSMICG00000006152 ENSMICG00000028929 ENSMICG00000034284 ENSMICG00000029616 ENSMICG00000005889 ENSMICG00000003817 TMEM45B (ENSMICG00000013858) NFRKB (ENSMICG00000013865) PRDM10 (ENSMICG00000013888) APLP2 (ENSMICG00000008471) ST14 (ENSMICG00000008486) ZBTB44 (ENSMICG00000008503) ADAMTS8 (ENSMICG00000008506) ENSMICG00000042926 Mouse lemur MODERN SPECIES 3 ENSMICG00000045935 ENSMICG00000042755 DTWD2 (ENSMICG00000033817) ENSMICG00000033829 ENSMICG00000032618 ZNF131 (ENSMICG00000042242) NIM1K (ENSMICG00000009901) HMGCS1 (ENSMICG00000001372) CCL28 (ENSMICG00000045487) ENSMICG00000032970 SEMA6A (ENSMICG00000001450) ENSMICG00000006173 ARL14EPL (ENSMICG00000033608) LVRN (ENSMICG00000006167) ENSMICG00000043714 ENSMICG00000033754 #22 AP3S1 (ENSMICG00000032412) ATG12 (ENSMICG00000009010) CDO1 (ENSMICG00000047296) ENSMICG00000009536 TMED7 (ENSMICG00000028228) ENSMICG00000045147 ENSMICG00000043716 ENSMICG00000044216 ENSMICG00000046287 FEM1C (ENSMICG00000046595) CCDC112 (ENSMICG00000010180) PGGT1B (ENSMICG00000010176) TRIM36 (ENSMICG00000015099) KCNN2 (ENSMICG00000002012) YTHDC2 (ENSMICG00000004030) Mouse lemur MODERN SPECIES 12 ENSMICG00000003822 SLC6A2 (ENSMICG00000003810) LPCAT2 (ENSMICG00000003798) MMP2 (ENSMICG00000003792) IRX6 (ENSMICG00000003780) IRX5 (ENSMICG00000027848) IRX3 (ENSMICG00000016860) FTO (ENSMICG00000016837) ENSMICG00000038175 RPGRIP1L (ENSMICG00000016808) ENSMICG00000010810 #22 RBL2 (ENSMICG00000016772) ENSMICG00000009260 CHD9 (ENSMICG00000016679) TOX3 (ENSMICG00000014881) SALL1 (ENSMICG00000036486) CYLD (ENSMICG00000008179) NOD2 (ENSMICG00000008172) SNX20 (ENSMICG00000044589) VPS35 (ENSMICG00000011393) ORC6 (ENSMICG00000028393) MYLK3 (ENSMICG00000046381) C16orf87 (ENSMICG00000005922) GPT2 (ENSMICG00000013187) ENSMICG00000043798 DNAJA2 (ENSMICG00000017777) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 236 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b Coquerels sifaka MODERN SPECIES 539 LPCAT2 (ENSPCOG00000019670) MMP2 (ENSPCOG00000015249) IRX6 (ENSPCOG00000019362) IRX5 (ENSPCOG00000023958) IRX3 (ENSPCOG00000020702) FTO (ENSPCOG00000021567) RPGRIP1L (ENSPCOG00000015539) AKTIP (ENSPCOG00000018375) #22 RBL2 (ENSPCOG00000019869) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 420 IRX5 (ENSPSMG00000006925) IRX3 (ENSPSMG00000006920) FTO (ENSPSMG00000006897) RPGRIP1L (ENSPSMG00000006681) AKTIP (ENSPSMG00000006498) #22 RBL2 (ENSPSMG00000006447) ADAD2 (ENSPSMG00000006339) ENSPSMG00000006334 ENSPSMG00000006326 ENSPSMG00000006316 HSDL1 (ENSPSMG00000006312) MBTPS1 (ENSPSMG00000006295) SLC38A8 (ENSPSMG00000006263) NECAB2 (ENSPSMG00000006259) OSGIN1 (ENSPSMG00000006253) MLYCD (ENSPSMG00000006247) ENSPSMG00000006243 CDH13 (ENSPSMG00000006218) MPHOSPH6 (ENSPSMG00000006170) HSD17B2 (ENSPSMG00000006150) Bushbaby MODERN SPECIES 173 NUDT21 (ENSOGAG00000014888) AMFR (ENSOGAG00000014884) ENSOGAG00000027139 ENSOGAG00000030943 CES5A (ENSOGAG00000012524) ENSOGAG00000014900 ENSOGAG00000012518 SLC6A2 (ENSOGAG00000004224) LPCAT2 (ENSOGAG00000004221) MMP2 (ENSOGAG00000030370) IRX6 (ENSOGAG00000026649) IRX5 (ENSOGAG00000004133) IRX3 (ENSOGAG00000029236) FTO (ENSOGAG00000005135) RPGRIP1L (ENSOGAG00000005128) AKTIP (ENSOGAG00000014495) #22 RBL2 (ENSOGAG00000014491) CHD9 (ENSOGAG00000002110) TOX3 (ENSOGAG00000009531) SALL1 (ENSOGAG00000027316) CYLD (ENSOGAG00000014666) NOD2 (ENSOGAG00000014655) SNX20 (ENSOGAG00000014652) NKD1 (ENSOGAG00000024948) BRD7 (ENSOGAG00000011289) ADCY7 (ENSOGAG00000011284) TENT4B (ENSOGAG00000011282) HEATR3 (ENSOGAG00000011658) CNEP1R1 (ENSOGAG00000015665) ZNF423 (ENSOGAG00000029813) C16orf78 (ENSOGAG00000012618) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000002349 ENSGT00390000015814 ENSGT00940000156482 ENSGT00940000155883.a.a ENSGT00940000161596 ENSGT00940000154623 ENSGT00940000158960 ENSGT00940000166682 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155706 ENSGT00980000198839 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00940000158492 Tarsier MODERN SPECIES 6126 FTO (ENSTSYG00000008905) RPGRIP1L (ENSTSYG00000009351) ENSTSYG00000029604 AKTIP (ENSTSYG00000000983) #22 RBL2 (ENSTSYG00000000967) CHD9 (ENSTSYG00000007693) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000015814 ENSGT00940000156482 ENSGT00940000155883.a.a ENSGT00940000161596 ENSGT00940000154623 ENSGT00940000158960 ENSGT00940000166682 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00910000146868 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155706 ENSGT00980000198839 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576.g.a ENSGT00940000158492 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000015814 ENSGT00940000156482 ENSGT00940000155883.a.b ENSGT00940000161596 ENSGT00940000154623.e ENSGT00940000154623.f ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158511 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Vervet Monkey MODERN SPECIES 24 GNAO1 (ENSCSAG00000005143) CES5A (ENSCSAG00000005154) ENSCSAG00000005164 ENSCSAG00000005170 ENSCSAG00000005241 SLC6A2 (ENSCSAG00000005269) LPCAT2 (ENSCSAG00000005278) MMP2 (ENSCSAG00000005282) IRX6 (ENSCSAG00000005285) IRX5 (ENSCSAG00000005287) ENSCSAG00000005289 IRX3 (ENSCSAG00000005290) ENSCSAG00000005293 FTO (ENSCSAG00000005296) RPGRIP1L (ENSCSAG00000005297) AKTIP (ENSCSAG00000005299) #22 RBL2 (ENSCSAG00000005301) ENSCSAG00000018863 ENSCSAG00000005305 CHD9 (ENSCSAG00000005311) TOX3 (ENSCSAG00000005317) SALL1 (ENSCSAG00000005319) CYLD (ENSCSAG00000005324) NOD2 (ENSCSAG00000005331) SNX20 (ENSCSAG00000005339) NKD1 (ENSCSAG00000005349) BRD7 (ENSCSAG00000005361) ADCY7 (ENSCSAG00000005371) TENT4B (ENSCSAG00000005390) HEATR3 (ENSCSAG00000005398) CNEP1R1 (ENSCSAG00000005400) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000155883.a.b ENSGT00910000147186 ENSGT00940000155883.a.a ENSGT00940000161596.f ENSGT00940000154623.c ENSGT00940000154623.d 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Crab-eating macaque MODERN SPECIES 12 ENSMFAG00000058142 ENSMFAG00000057214 ENSMFAG00000003402 ENSMFAG00000032808 CES1 (ENSMFAG00000031843) ENSMFAG00000043869 SLC6A2 (ENSMFAG00000002998) LPCAT2 (ENSMFAG00000032289) MMP2 (ENSMFAG00000037156) IRX6 (ENSMFAG00000046096) IRX5 (ENSMFAG00000002928) IRX3 (ENSMFAG00000032048) ENSMFAG00000065181 FTO (ENSMFAG00000033026) RPGRIP1L (ENSMFAG00000043106) AKTIP (ENSMFAG00000044514) #22 ENSMFAG00000059726 RBL2 (ENSMFAG00000039132) CHD9 (ENSMFAG00000041354) ENSMFAG00000060755 ENSMFAG00000056521 TOX3 (ENSMFAG00000032933) SALL1 (ENSMFAG00000003298) CYLD (ENSMFAG00000043501) NOD2 (ENSMFAG00000037753) ENSMFAG00000033996 NKD1 (ENSMFAG00000044696) BRD7 (ENSMFAG00000035566) ADCY7 (ENSMFAG00000037814) ENSMFAG00000002315 HEATR3 (ENSMFAG00000002184) Rhesus MODERN SPECIES 12 BBS2 (ENSMMUG00000013268) OGFOD1 (ENSMMUG00000029125) NUDT21 (ENSMMUG00000038955) AMFR (ENSMMUG00000019902) GNAO1 (ENSMMUG00000019900) CES5A (ENSMMUG00000051854) CES1 (ENSMMUG00000009454) 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(ENSPANG00000015100) ENSPANG00000008680 ENSPANG00000030695 SLC6A2 (ENSPANG00000018478) LPCAT2 (ENSPANG00000006269) MMP2 (ENSPANG00000006408) IRX6 (ENSPANG00000024570) IRX5 (ENSPANG00000007155) IRX3 (ENSPANG00000041905) ENSPANG00000017095 FTO (ENSPANG00000016386) RPGRIP1L (ENSPANG00000015743) AKTIP (ENSPANG00000018701) #22 RBL2 (ENSPANG00000021504) CHD9 (ENSPANG00000019307) CHD9NB (ENSPANG00000047104) ENSPANG00000034612 TOX3 (ENSPANG00000016176) SALL1 (ENSPANG00000024176) CYLD (ENSPANG00000019153) NOD2 (ENSPANG00000019150) SNX20 (ENSPANG00000000812) NKD1 (ENSPANG00000009782) BRD7 (ENSPANG00000024571) ADCY7 (ENSPANG00000011498) TENT4B (ENSPANG00000006934) HEATR3 (ENSPANG00000024573) CNEP1R1 (ENSPANG00000016962) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000015814 ENSGT00940000156482 ENSGT00940000155883.a.a ENSGT00940000161596.f ENSGT00940000154623.c ENSGT00940000154623.d ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00910000146868 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000163338.b.b.b ENSGT00940000155706 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576.g.a ENSGT00940000158492 Sooty mangabey MODERN SPECIES 96 ENSCATG00000028998 ENSCATG00000039943 ENSCATG00000044607 CES1 (ENSCATG00000014882) ENSCATG00000020328 ENSCATG00000017887 SLC6A2 (ENSCATG00000031249) LPCAT2 (ENSCATG00000044509) MMP2 (ENSCATG00000014549) IRX6 (ENSCATG00000035256) IRX5 (ENSCATG00000044712) ENSCATG00000021759 IRX3 (ENSCATG00000035868) FTO (ENSCATG00000030692) RPGRIP1L (ENSCATG00000037264) AKTIP (ENSCATG00000033583) #22 RBL2 (ENSCATG00000009941) ENSCATG00000009432 CHD9 (ENSCATG00000036753) ENSCATG00000030774 TOX3 (ENSCATG00000008040) SALL1 (ENSCATG00000004982) CYLD (ENSCATG00000025694) NOD2 (ENSCATG00000032818) SNX20 (ENSCATG00000031155) NKD1 (ENSCATG00000033443) BRD7 (ENSCATG00000027818) ENSCATG00000003671 ADCY7 (ENSCATG00000022081) TENT4B (ENSCATG00000031641) HEATR3 (ENSCATG00000021656) Drill MODERN SPECIES 984 AKTIP (ENSMLEG00000035100) #22 RBL2 (ENSMLEG00000038469) ENSMLEG00000036960 CHD9 (ENSMLEG00000043219) ENSMLEG00000039258 TOX3 (ENSMLEG00000009471) SALL1 (ENSMLEG00000036406) CYLD (ENSMLEG00000005317) NOD2 (ENSMLEG00000036716) SNX20 (ENSMLEG00000036378) NKD1 (ENSMLEG00000032515) BRD7 (ENSMLEG00000041253) ADCY7 (ENSMLEG00000015089) TENT4B (ENSMLEG00000034283) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 332 ENSGT00940000154623.c.a ENSGT00940000154623.d ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00910000146868 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00940000161598.e.a.a.a.b ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000163338.b.b ENSGT00940000155706.c Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 817 FTO (ENSRROG00000039169) RPGRIP1L (ENSRROG00000042972) ENSRROG00000036325 AKTIP (ENSRROG00000038050) #22 RBL2 (ENSRROG00000044868) ENSRROG00000034341 ENSRROG00000033278 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 487 LPCAT2 (ENSRBIG00000041129) MMP2 (ENSRBIG00000034271) IRX6 (ENSRBIG00000036640) IRX5 (ENSRBIG00000037396) ENSRBIG00000028078 IRX3 (ENSRBIG00000023657) ENSRBIG00000037512 ENSRBIG00000027550 RPGRIP1L (ENSRBIG00000031305) ENSRBIG00000038506 AKTIP (ENSRBIG00000034898) #22 RBL2 (ENSRBIG00000011461) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000156482 ENSGT00940000155883.a.b ENSGT00940000155883.a.a ENSGT00940000161596 ENSGT00940000154623 ENSGT00940000158564 ENSGT00940000158960 ENSGT00940000166682 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00390000008759 ENSGT00940000155706 ENSGT00980000198839 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00960000190798 ENSGT00390000012529 Tree shrew MODERN SPECIES 4125 AKTIP (ENSTBEG00000017105) #22 ENSTBEG00000016709 ENSTBEG00000016705 ENSTBEG00000016052 Glires ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000155883.a.b ENSGT00940000155883.a.a ENSGT00940000161596 ENSGT00940000158564.c.a ENSGT00940000154623 ENSGT00940000158564.c.b ENSGT00940000158960 ENSGT00940000166682 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155706 ENSGT00980000198839 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00960000190798 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000155883.a.a ENSGT00940000161596 ENSGT00940000158564.d ENSGT00940000154623 ENSGT00940000158564.c.a ENSGT00940000158564.c.b ENSGT00940000158960 ENSGT00940000166682 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155706 ENSGT00980000198839 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00960000190798 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000155883.a.a ENSGT00940000161596 ENSGT00940000158564.c.a.f ENSGT00940000154623 ENSGT00940000158564.c.a.e ENSGT00940000158564.c.b ENSGT00940000158960 ENSGT00940000166682 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ENSGT00940000160934 ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00940000158492 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000154623.h ENSGT00940000154623.g.b ENSGT00940000158564.c.a.f ENSGT00940000154623.g.a ENSGT00940000158564.c.a.e.a ENSGT00940000158564.c.b ENSGT00940000158960 ENSGT00940000166682 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155706 ENSGT00980000198839 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00940000158492 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000154623.g.b ENSGT00940000158564.c.a.f.a 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Timm10 (ENSCGRG00001024727) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 230 Adgrg2 (ENSCGRG00001022355) ENSCGRG00001020861 Pdha1 (ENSCGRG00001020742) Map3k15 (ENSCGRG00001017037) Sh3kbp1 (ENSCGRG00001012962) Bclaf3 (ENSCGRG00001017632) Map7d2 (ENSCGRG00001005576) ENSCGRG00001022852 Rps6ka3 (ENSCGRG00001007518) Cnksr2 (ENSCGRG00001022169) Klhl34 (ENSCGRG00001014357) Smpx (ENSCGRG00001020401) MBTPS2 (ENSCGRG00001018020) ENSCGRG00001000646 Phex (ENSCGRG00001019759) ENSCGRG00001015986 #22 ENSCGRG00001015828 Ptchd1 (ENSCGRG00001010854) Prdx4 (ENSCGRG00001009299) ENSCGRG00001000350 SAT1 (ENSCGRG00001022103) ENSCGRG00001013998 Cldn34d (ENSCGRG00001014236) ENSCGRG00001013899 ENSCGRG00001017212 ENSCGRG00001013770 Tbl1x (ENSCGRG00001016098) Prkx (ENSCGRG00001011584) Pbsn (ENSCGRG00001011020) ENSCGRG00001000213 ENSCGRG00001019539 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 112 Ces1e (ENSCGRG00001019039) Ces1d (ENSCGRG00001025029) ENSCGRG00001017957 ENSCGRG00001013949 Ces1a (ENSCGRG00001017007) Slc6a2 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ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00940000158492 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000158564.c.a.f.a ENSGT00940000158564.c.a.f.b ENSGT00940000154623.g.a.a ENSGT00940000154623.g.a.b.b ENSGT00940000154623.g.a.b.a ENSGT00940000158564.c.b ENSGT00940000158960 ENSGT00940000166682 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00900000143414 ENSGT00940000155706 ENSGT00980000198839 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000158564.c.a.f.a ENSGT00940000158564.c.a.f.b ENSGT00940000154623.g.a.a ENSGT00940000154623.g.a.b.b ENSGT00940000154623.g.a.b.a ENSGT00940000158564.c.b ENSGT00940000158960 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(ENSODEG00000008958) CHD9 (ENSODEG00000004466) ENSODEG00000004332 TLX3 (ENSODEG00000004462) ENSODEG00000004521 ENSODEG00000004642 GABRP (ENSODEG00000004715) KCNIP1 (ENSODEG00000005120) KCNMB1 (ENSODEG00000004061) LCP2 (ENSODEG00000004197) FOXI1 (ENSODEG00000005115) DOCK2 (ENSODEG00000004282) INSYN2B (ENSODEG00000006097) ENSODEG00000006240 SLIT3 (ENSODEG00000005145) Degu MODERN SPECIES 89 DRD1 (ENSODEG00000020062) ENSODEG00000019679 ENSODEG00000008973 S100A8 (ENSODEG00000010509) S100A9 (ENSODEG00000009731) PGLYRP4 (ENSODEG00000010627) PGLYRP3 (ENSODEG00000009237) ENSODEG00000008993 ENSODEG00000019689 ENSODEG00000019719 ENSODEG00000012331 ENSODEG00000019776 KPRP (ENSODEG00000009720) ENSODEG00000019631 C1orf68 (ENSODEG00000009558) ENSODEG00000019920 #22 ENSODEG00000010353 ENSODEG00000009304 ENSODEG00000009112 ENSODEG00000019709 ENSODEG00000009608 ENSODEG00000009939 THEM4 (ENSODEG00000010154) THEM5 (ENSODEG00000009312) C2CD4D (ENSODEG00000010767) ENSODEG00000009680 RORC (ENSODEG00000010665) LINGO4 (ENSODEG00000009935) ENSODEG00000009532 OAZ3 (ENSODEG00000010337) MRPL9 (ENSODEG00000010962) Degu MODERN SPECIES 102 MEI4 (ENSODEG00000004184) ENSODEG00000004202 IRAK1BP1 (ENSODEG00000004218) ENSODEG00000004247 ENSODEG00000004261 LCA5 (ENSODEG00000004406) ENSODEG00000019022 ENSODEG00000004441 ENSODEG00000004582 ELOVL4 (ENSODEG00000004597) ENSODEG00000004627 ENSODEG00000019046 ENSODEG00000004648 KCNQ5 (ENSODEG00000004476) ENSODEG00000004685 ENSODEG00000004801 #22 ENSODEG00000019070 ENSODEG00000004821 B3GAT2 (ENSODEG00000004838) SMAP1 (ENSODEG00000004883) SDHAF4 (ENSODEG00000004921) FAM135A (ENSODEG00000004939) ENSODEG00000005617 COL19A1 (ENSODEG00000005899) ENSODEG00000004181 LMBRD1 (ENSODEG00000004262) ENSODEG00000004325 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 140 OGFOD1 (ENSCLAG00000006400) NUDT21 (ENSCLAG00000005751) AMFR (ENSCLAG00000007397) GNAO1 (ENSCLAG00000006257) CES5A (ENSCLAG00000004557) CES1 (ENSCLAG00000005623) ENSCLAG00000006039 SLC6A2 (ENSCLAG00000005787) LPCAT2 (ENSCLAG00000004725) MMP2 (ENSCLAG00000004390) IRX6 (ENSCLAG00000008231) IRX5 (ENSCLAG00000009884) IRX3 (ENSCLAG00000013650) FTO (ENSCLAG00000013952) RPGRIP1L (ENSCLAG00000004568) AKTIP (ENSCLAG00000006949) #22 RBL2 (ENSCLAG00000005451) ENSCLAG00000005008 CHD9 (ENSCLAG00000007137) TOX3 (ENSCLAG00000006478) SALL1 (ENSCLAG00000006380) CYLD (ENSCLAG00000010166) NOD2 (ENSCLAG00000009024) SNX20 (ENSCLAG00000008955) NKD1 (ENSCLAG00000008184) BRD7 (ENSCLAG00000007993) ADCY7 (ENSCLAG00000006365) TENT4B (ENSCLAG00000004921) HEATR3 (ENSCLAG00000004335) ENSCLAG00000003975 ZNF423 (ENSCLAG00000007342) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 26 ENSHGLG00000049685 ENSHGLG00000010650 ENSHGLG00000011693 ENSHGLG00000004035 ENSHGLG00000004357 ENSHGLG00000005501 SLC6A2 (ENSHGLG00000006203) LPCAT2 (ENSHGLG00000006950) MMP2 (ENSHGLG00000003708) IRX6 (ENSHGLG00000003805) IRX5 (ENSHGLG00000004006) IRX3 (ENSHGLG00000004630) FTO (ENSHGLG00000005386) ENSHGLG00000050695 RPGRIP1L (ENSHGLG00000008154) AKTIP (ENSHGLG00000008426) #22 RBL2 (ENSHGLG00000012893) ENSHGLG00000014938 ENSHGLG00000003452 ENSHGLG00000003522 ENSHGLG00000003699 ENSHGLG00000046400 ENSHGLG00000004288 ENSHGLG00000005762 NOD2 (ENSHGLG00000003967) SNX20 (ENSHGLG00000004254) NKD1 (ENSHGLG00000041852) BRD7 (ENSHGLG00000005800) ADCY7 (ENSHGLG00000006152) TENT4B (ENSHGLG00000004206) HEATR3 (ENSHGLG00000004488) Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00950000182967.b ENSGT00390000017113 ENSGT00390000002349 ENSGT00390000015814 ENSGT00940000156482 ENSGT00940000155883.a.a ENSGT00940000161596 ENSGT00940000158564.d ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155706 ENSGT00940000158043 Rabbit MODERN SPECIES 16 ENSOCUG00000017224 AMFR (ENSOCUG00000017212) ENSOCUG00000017203 ENSOCUG00000034838 CES5A (ENSOCUG00000006744) ENSOCUG00000022830 ENSOCUG00000006737 ENSOCUG00000038633 SLC6A2 (ENSOCUG00000017310) LPCAT2 (ENSOCUG00000006719) MMP2 (ENSOCUG00000006714) IRX6 (ENSOCUG00000004079) IRX5 (ENSOCUG00000003240) FTO (ENSOCUG00000001741) RPGRIP1L (ENSOCUG00000001738) AKTIP (ENSOCUG00000002885) #22 RBL2 (ENSOCUG00000006354) ENSOCUG00000001016 ENSOCUG00000038351 ENSOCUG00000031625 TOX3 (ENSOCUG00000001546) ENSOCUG00000024882 ENSOCUG00000023470 ENSOCUG00000004364 UBA2 (ENSOCUG00000001464) GPI (ENSOCUG00000001455) GARRE1 (ENSOCUG00000002236) FKBP2 (ENSOCUG00000025678) ENSOCUG00000011872 KCTD15 (ENSOCUG00000010531) PEPD (ENSOCUG00000017042) Pika MODERN SPECIES 3661 AKTIP (ENSOPRG00000011251) #22 RBL2 (ENSOPRG00000011228) CHD9 (ENSOPRG00000011168) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000015814 ENSGT00940000156482 ENSGT00940000155883.a.b ENSGT00940000161596 ENSGT00940000158564 ENSGT00940000154623 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000166682 ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 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RBL2 (ENSDNOG00000004897) CHD9 (ENSDNOG00000006045) Sloth MODERN SPECIES 539 AKTIP (ENSCHOG00000013690) #22 RBL2 (ENSCHOG00000013655) Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00940000156482 ENSGT00940000155883.a.a ENSGT00940000155883.a.b ENSGT00940000161596 ENSGT00940000158564 ENSGT00940000154623 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000166682 ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155706 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00530000063759.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00940000158492 ENSGT00940000159811 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000156482 ENSGT00940000155883.a.a ENSGT00940000155883.a.b ENSGT00940000161596 ENSGT00940000158564 ENSGT00940000154623.n 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ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00940000162646 ENSGT00940000166016 ENSGT00940000159578 ENSGT00390000012054.b Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000153216.a.a.c.b ENSGT00940000154258.b ENSGT00390000002200.a.a ENSGT00940000159716 ENSGT00940000159191 ENSGT00940000153875.d.b ENSGT00940000160211 ENSGT00940000157672 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483.a.b ENSGT00940000161299.f ENSGT00390000017730 ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00940000178947 ENSGT00940000155706 ENSGT00940000162556.C ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938.b.a ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00940000162646 ENSGT00940000166016 ENSGT00940000159578 Channel catfish MODERN SPECIES 19 ENSIPUG00000017334 AGRP (ENSIPUG00000017322) atp6v0d1 (ENSIPUG00000017280) Hsd11b2 (ENSIPUG00000017251) Zdhhc1 (ENSIPUG00000017230) tppp3 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(ENSCCRG00000002413) gpatch1 (ENSCCRG00000002361) Golden-line barbel MODERN SPECIES 393 irx3a (ENSSGRG00000040151) FTO (ENSSGRG00000040153) aktip (ENSSGRG00000040157) #22 CHD9 (ENSSGRG00000040172) ENSSGRG00000040263 TOX3 (ENSSGRG00000040269) sall1a (ENSSGRG00000040272) CYLD (ENSSGRG00000040281) nod2 (ENSSGRG00000040397) nkd1 (ENSSGRG00000040495) ENSSGRG00000040497 ENSSGRG00000040498 ENSSGRG00000040499 ENSSGRG00000040500 zgc:158343 (ENSSGRG00000040523) tor4ab (ENSSGRG00000040524) ENSSGRG00000040525 slc2a11b (ENSSGRG00000040528) Zebrafish MODERN SPECIES 22 atp6v0d1 (ENSDARG00000069090) hsd11b2 (ENSDARG00000001975) zdhhc1 (ENSDARG00000077546) tppp3 (ENSDARG00000030463) AMFR (ENSDARG00000105578) ENSDARG00000079216 SLC12A4 (ENSDARG00000014378) SLC6A2 (ENSDARG00000016141) lpcat2 (ENSDARG00000053010) mmp2 (ENSDARG00000017676) irx6a (ENSDARG00000034420) irx5a (ENSDARG00000034043) irx3a (ENSDARG00000101076) ENSDARG00000109891 FTO (ENSDARG00000044216) aktip (ENSDARG00000026862) #22 CHD9 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ENSGT00940000156205.h ENSGT00940000156291.e ENSGT01010000222360.D.b ENSGT00940000155391.a.b.b ENSGT00390000001443 Atlantic herring MODERN SPECIES 22 ctrb.2 (ENSCHAG00000011919) ctrb.3 (ENSCHAG00000011887) galr1b (ENSCHAG00000011883) ddx28 (ENSCHAG00000011873) NFATC3 (ENSCHAG00000011772) ENSCHAG00000011762 SLC12A4 (ENSCHAG00000008398) SLC6A2 (ENSCHAG00000004045) lpcat2 (ENSCHAG00000002835) mmp2 (ENSCHAG00000001051) irx6a (ENSCHAG00000000320) irx5a (ENSCHAG00000000301) irx3a (ENSCHAG00000020547) FTO (ENSCHAG00000020531) rpl23a (ENSCHAG00000020512) aktip (ENSCHAG00000020457) #22 CHD9 (ENSCHAG00000014665) TOX3 (ENSCHAG00000014380) sall1a (ENSCHAG00000014333) CYLD (ENSCHAG00000014127) nod2 (ENSCHAG00000014031) nkd1 (ENSCHAG00000014022) brd7 (ENSCHAG00000013986) adcy7 (ENSCHAG00000013738) tent4b (ENSCHAG00000013423) LRRC28 (ENSCHAG00000013392) ENSCHAG00000013316 MCTP2 (ENSCHAG00000013087) RCN1 (ENSCHAG00000013051) pax6b (ENSCHAG00000011631) elp4 (ENSCHAG00000011336) Denticle herring MODERN SPECIES 7 ddx28 (ENSDCDG00000034038) NFATC3 (ENSDCDG00000034032) esrp2 (ENSDCDG00000034019) ENSDCDG00000034011 AMFR (ENSDCDG00000033995) ENSDCDG00000033960 SLC12A4 (ENSDCDG00000032025) SLC6A2 (ENSDCDG00000031681) lpcat2 (ENSDCDG00000031473) mmp2 (ENSDCDG00000031411) ENSDCDG00000031396 irx6a (ENSDCDG00000031393) irx5a (ENSDCDG00000031390) IRX3 (ENSDCDG00000031386) FTO (ENSDCDG00000031381) aktip (ENSDCDG00000031379) #22 CHD9 (ENSDCDG00000024568) TOX3 (ENSDCDG00000024124) sall1a (ENSDCDG00000024120) CYLD (ENSDCDG00000024116) nod2 (ENSDCDG00000024103) nkd1 (ENSDCDG00000024098) brd7 (ENSDCDG00000024096) adcy7 (ENSDCDG00000020745) tent4b (ENSDCDG00000020649) LRRC28 (ENSDCDG00000020645) ENSDCDG00000020644 MCTP2 (ENSDCDG00000020302) ENSDCDG00000020295 RCN1 (ENSDCDG00000035906) pax6b (ENSDCDG00000035904) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000161738 ENSGT00940000156131.a.b ENSGT00940000157187 ENSGT00950000182966.B.b ENSGT00950000182966.B.a ENSGT00940000156482.d ENSGT00940000160211 ENSGT00940000157672 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483.a.b ENSGT00940000161299.f ENSGT00390000017730 ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00940000178947 ENSGT00940000155706 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938.b.a ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000012054.b ENSGT00940000158070 ENSGT00940000160924 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 64 ENSGT00390000007946.j ENSGT00390000007946.i.b ENSGT00390000008859.b.d.q ENSGT00950000183129.b.b.a.a ENSGT00940000154201.a.b.t ENSGT00390000002564.b.c ENSGT00940000160211 ENSGT00940000157672 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483.a.b ENSGT00940000161299.f ENSGT00390000017730 ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00940000155706 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155938.b.b ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938.b.a ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000012054.b ENSGT00940000158070 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00390000007946.j ENSGT00390000007946.i.b ENSGT00390000008859.b.d.q ENSGT00950000183129.b.b.a.a ENSGT00940000154201.a.b.t ENSGT00390000002564.b.c ENSGT00940000160211 ENSGT00940000157672 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483.a.b ENSGT00940000161299.f ENSGT00390000017730 ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00940000155706 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155938.b.b ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938.b.a ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000012054.b ENSGT00940000158070 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00390000007946.i.b ENSGT00390000008859.b.d.q ENSGT00950000183129.b.b.a.a ENSGT00940000154201.a.b.t ENSGT00390000002564.b.c ENSGT00940000160211 ENSGT00940000157672 ENSGT01030000235333 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483.a.b ENSGT00940000161299.f ENSGT00390000017730 ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00940000155706 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155938.b.b ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938.b.a ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000012054.b ENSGT00940000158070 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00950000183129.b.b.a.a ENSGT00940000154201.a.b.t ENSGT00940000181466 ENSGT00390000002564.b.c ENSGT00940000160211 ENSGT00940000157672 ENSGT01030000235333 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483.a.b ENSGT00940000177581 ENSGT00940000161299.f ENSGT00390000017730 ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00940000155706 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155938.b.b ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938.b.a ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000012054.b ENSGT00940000158070 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000183129.b.b.a.a ENSGT00940000154201.a.b.t ENSGT00940000181466 ENSGT00390000002564.b.c ENSGT00940000160211 ENSGT00940000157672 ENSGT01030000235333 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483.a.b ENSGT00940000177581 ENSGT00940000161299.f ENSGT00390000017730 ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00940000155706 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155938.b.b ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938.b.a ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000012054.b ENSGT00940000158070 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000007946.i.b ENSGT00390000008859.b.d.q ENSGT00950000183129.b.b.a.a ENSGT00940000154201.a.b.t ENSGT00390000002564.b.c ENSGT00940000160211 ENSGT00940000157672 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483.a.b ENSGT00940000177581 ENSGT00940000161299.f ENSGT00390000017730 ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00940000155706 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155938.b.b ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938.b.a ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000012054.b ENSGT00940000158070 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000007946.j ENSGT00390000007946.i.b ENSGT00390000008859.b.d.q ENSGT00950000183129.b.b.a.a ENSGT00940000154201.a.b.t ENSGT00390000002564.b.c ENSGT00940000160211 ENSGT00940000157672 ENSGT00940000158960.i ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483.a.b ENSGT00940000161299.f ENSGT00390000017730 ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00940000155706 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938.b.a ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000008576 Tetraodon MODERN SPECIES 20 dhdh.2 (ENSTNIG00000001960) dhdh.2 (ENSTNIG00000006351) pkma (ENSTNIG00000006352) PARP6 (ENSTNIG00000006353) ENSTNIG00000005459 SLC12A4 (ENSTNIG00000019795) ENSTNIG00000019698 ENSTNIG00000006607 lpcat2 (ENSTNIG00000006606) mmp2 (ENSTNIG00000006605) ENSTNIG00000006604 irx6a (ENSTNIG00000013614) irx5a (ENSTNIG00000013613) FTO (ENSTNIG00000013612) ndufv1 (ENSTNIG00000013611) aktip (ENSTNIG00000013610) #22 CHD9 (ENSTNIG00000003825) ENSTNIG00000005030 Fugu MODERN SPECIES 4 dhdh.1 (ENSTRUG00000013036) dhdh.2 (ENSTRUG00000012946) pkm (ENSTRUG00000012678) PARP6 (ENSTRUG00000012505) ENSTRUG00000012391 rpp25b (ENSTRUG00000024908) ENSTRUG00000012222 SLC12A4 (ENSTRUG00000011258) SLC6A2 (ENSTRUG00000010868) lpcat2 (ENSTRUG00000010732) mmp2 (ENSTRUG00000010165) irx6a (ENSTRUG00000010131) irx5a (ENSTRUG00000010063) irx3a (ENSTRUG00000019772) FTO (ENSTRUG00000020259) aktip (ENSTRUG00000009719) #22 CHD9 (ENSTRUG00000009125) TOX3 (ENSTRUG00000024558) sall1a (ENSTRUG00000008950) CYLD (ENSTRUG00000008733) nod2 (ENSTRUG00000008459) nkd1 (ENSTRUG00000008266) brd7 (ENSTRUG00000008098) adcy7 (ENSTRUG00000007114) tent4b (ENSTRUG00000006962) cnep1r1 (ENSTRUG00000033421) ENSTRUG00000023296 KIF26B (ENSTRUG00000005556) ENSTRUG00000032036 ENSTRUG00000005280 ENSTRUG00000004994 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000007946.i.b ENSGT00390000008859.b.d.q ENSGT00950000183129.b.b.a.a ENSGT00940000154201.a.b.t ENSGT00390000002564.b.c ENSGT00940000160211 ENSGT00940000157672 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483.a.b ENSGT00940000177581 ENSGT00940000161299.f ENSGT00390000017730 ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00940000155706 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155938.b.b ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938.b.a ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000012054.b.d.a ENSGT00390000012054.b.c Ballan wrasse MODERN SPECIES dhdh.2 (ENSLBEG00000010689) pkma (ENSLBEG00000010965) PARP6 (ENSLBEG00000011115) CELF6 (ENSLBEG00000011338) rpp25b (ENSLBEG00000011461) ENSLBEG00000011494 SLC12A4 (ENSLBEG00000011557) SLC6A2 (ENSLBEG00000011667) lpcat2 (ENSLBEG00000011739) mmp2 (ENSLBEG00000011830) irx6a (ENSLBEG00000011872) irx5a (ENSLBEG00000011915) ENSLBEG00000011938 irx3a (ENSLBEG00000011952) FTO (ENSLBEG00000011970) aktip (ENSLBEG00000011993) #22 CHD9 (ENSLBEG00000012077) TOX3 (ENSLBEG00000012177) sall1a (ENSLBEG00000012207) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000007946.j ENSGT00390000007946.i.b ENSGT00390000008859.b.d.q ENSGT00950000183129.b.b.a.a ENSGT00940000154201.a.b.t ENSGT00390000002564.b.c ENSGT00940000160211 ENSGT00940000157672 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483.a.b ENSGT00940000161299.f ENSGT00390000017730 ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00940000155706 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155938.b.b ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938.b.a ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000012054.b.d.a ENSGT00390000012054.b.c Perciformes ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000007946.j ENSGT00390000007946.i.b ENSGT00390000008859.b.d.q ENSGT00950000183129.b.b.a.a ENSGT00940000154201.a.b.t ENSGT00390000002564.b.c ENSGT00940000160211 ENSGT00940000157672 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483.a.b ENSGT00940000161299.f ENSGT00390000017730 ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00940000155706 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938.b.a ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000012054.b.c ENSGT00940000158070 ENSGT00940000160924 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000007946.j ENSGT00390000007946.i.b ENSGT00390000008859.b.d.q ENSGT00950000183129.b.b.a.a ENSGT00940000154201.a.b.t ENSGT00390000002564.b.c ENSGT00940000160211 ENSGT00940000157672 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483.a.b ENSGT00940000161299.f ENSGT00390000017730 ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00940000155706 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938.b.a ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000012054.b.c ENSGT00940000158070 ENSGT00940000160924 ENSGT00390000000707.y.b Channel bull blenny MODERN SPECIES 17 dhdh.2 (ENSCGOG00000015063) pkma (ENSCGOG00000015181) PARP6 (ENSCGOG00000017165) ENSCGOG00000017235 ENSCGOG00000017239 rpp25b (ENSCGOG00000017241) ENSCGOG00000017243 SLC12A4 (ENSCGOG00000017365) SLC6A2 (ENSCGOG00000021954) lpcat2 (ENSCGOG00000022516) mmp2 (ENSCGOG00000022573) irx6a (ENSCGOG00000022830) irx5a (ENSCGOG00000022831) irx3a (ENSCGOG00000022832) FTO (ENSCGOG00000022836) aktip (ENSCGOG00000022843) #22 CHD9 (ENSCGOG00000022957) ENSCGOG00000023809 sall1a (ENSCGOG00000023814) CYLD (ENSCGOG00000023831) nod2 (ENSCGOG00000023937) nkd1 (ENSCGOG00000023948) brd7 (ENSCGOG00000023953) adcy7 (ENSCGOG00000023963) tent4b (ENSCGOG00000024003) heatr3 (ENSCGOG00000024017) cnep1r1 (ENSCGOG00000024091) sdr42e1 (ENSCGOG00000024095) wtip (ENSCGOG00000024096) gpib (ENSCGOG00000024133) GARRE1 (ENSCGOG00000000516) Pike perch MODERN SPECIES 56 dhdh.1 (ENSSLUG00000008196) dhdh.2 (ENSSLUG00000008186) pkma (ENSSLUG00000006949) PARP6 (ENSSLUG00000006480) ENSSLUG00000006446 rpp25b (ENSSLUG00000006440) ENSSLUG00000006434 SLC12A4 (ENSSLUG00000002058) SLC6A2 (ENSSLUG00000021814) lpcat2 (ENSSLUG00000021779) mmp2 (ENSSLUG00000021732) irx6a (ENSSLUG00000021709) irx5a (ENSSLUG00000021702) irx3a (ENSSLUG00000021695) FTO (ENSSLUG00000021688) aktip (ENSSLUG00000021556) #22 CHD9 (ENSSLUG00000020025) TOX3 (ENSSLUG00000019880) sall1a (ENSSLUG00000019875) CYLD (ENSSLUG00000019846) nod2 (ENSSLUG00000019680) nkd1 (ENSSLUG00000019666) brd7 (ENSSLUG00000019658) adcy7 (ENSSLUG00000017706) tent4b (ENSSLUG00000017587) heatr3 (ENSSLUG00000017500) cnep1r1 (ENSSLUG00000017474) zgc:101040 (ENSSLUG00000017466) sdr42e1 (ENSSLUG00000017458) wtip (ENSSLUG00000017397) gpib (ENSSLUG00000016442) Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000007946.j ENSGT00390000007946.i.b ENSGT00390000008859.b.d.q ENSGT00950000183129.b.b.a.a ENSGT00940000154201.a.b.t ENSGT00390000002564.b.c ENSGT00940000160211 ENSGT00940000157672 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483.a.b ENSGT00940000161299.f ENSGT00390000017730 ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00940000155706 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938.b.a ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000003488.a.a ENSGT00840000129915.b ENSGT00940000158020.d Stickleback MODERN SPECIES 1 ENSGACG00000016590 dhdh.2 (ENSGACG00000016594) pkma (ENSGACG00000016600) PARP6 (ENSGACG00000016620) CELF6 (ENSGACG00000016626) rpp25b (ENSGACG00000016627) ENSGACG00000016629 SLC12A4 (ENSGACG00000016630) SLC6A2 (ENSGACG00000016637) lpcat2 (ENSGACG00000016648) mmp2 (ENSGACG00000016670) irx6a (ENSGACG00000016678) irx5a (ENSGACG00000016681) irx3a (ENSGACG00000016682) FTO (ENSGACG00000016684) aktip (ENSGACG00000016685) #22 CHD9 (ENSGACG00000016694) ENSGACG00000016698 ENSGACG00000016699 TOX3 (ENSGACG00000016700) sall1a (ENSGACG00000016702) CYLD (ENSGACG00000016705) nod2 (ENSGACG00000016710) nkd1 (ENSGACG00000016716) brd7 (ENSGACG00000016718) adcy7 (ENSGACG00000016722) tent4b (ENSGACG00000016727) heatr3 (ENSGACG00000016729) cnep1r1 (ENSGACG00000016737) tnfaip8l3 (ENSGACG00000016741) cyp19a1a (ENSGACG00000016742) Lumpfish MODERN SPECIES 18 dhdh.2 (ENSCLMG00005020654) pkma (ENSCLMG00005020656) PARP6 (ENSCLMG00005020667) ENSCLMG00005020668 ENSCLMG00005002831 rpp25b (ENSCLMG00005002876) ENSCLMG00005002913 SLC12A4 (ENSCLMG00005003055) SLC6A2 (ENSCLMG00005003693) lpcat2 (ENSCLMG00005008693) mmp2 (ENSCLMG00005008734) irx6a (ENSCLMG00005008788) irx5a (ENSCLMG00005008791) irx3a (ENSCLMG00005008792) FTO (ENSCLMG00005008793) aktip (ENSCLMG00005008796) #22 CHD9 (ENSCLMG00005008933) TOX3 (ENSCLMG00005018564) sall1a (ENSCLMG00005018565) CYLD (ENSCLMG00005018569) nod2 (ENSCLMG00005018590) nkd1 (ENSCLMG00005018592) brd7 (ENSCLMG00005018593) adcy7 (ENSCLMG00005018599) tent4b (ENSCLMG00005019258) heatr3 (ENSCLMG00005019436) cnep1r1 (ENSCLMG00005019444) tnfaip8l3 (ENSCLMG00005019446) cyp19a1a (ENSCLMG00005019447) gldn (ENSCLMG00005019455) dmxl2 (ENSCLMG00005019473) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000007946.j ENSGT00390000007946.i.b ENSGT00390000008859.b.d.q ENSGT00950000183129.b.b.a.a ENSGT00940000154201.a.b.t ENSGT00390000002564.b.c ENSGT00940000160211 ENSGT00940000157672 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483.a.b ENSGT00940000161299.f ENSGT00390000017730 ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00940000155706 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938.b.a ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000012054.b.d.a ENSGT00940000158070 ENSGT00940000160924 ENSGT00390000000707.y.b Gilthead seabream MODERN SPECIES 18 dhdh.2 (ENSSAUG00010011792) pkma (ENSSAUG00010011808) PARP6 (ENSSAUG00010011980) ENSSAUG00010012857 rpp25b (ENSSAUG00010012892) ENSSAUG00010012893 SLC12A4 (ENSSAUG00010012895) ENSSAUG00010012917 SLC6A2 (ENSSAUG00010012930) lpcat2 (ENSSAUG00010014247) mmp2 (ENSSAUG00010014278) irx6a (ENSSAUG00010014399) irx5a (ENSSAUG00010014405) irx3a (ENSSAUG00010014407) FTO (ENSSAUG00010014412) aktip (ENSSAUG00010014424) #22 CHD9 (ENSSAUG00010014817) TOX3 (ENSSAUG00010016494) sall1a (ENSSAUG00010016498) CYLD (ENSSAUG00010016500) nod2 (ENSSAUG00010016509) nkd1 (ENSSAUG00010016522) brd7 (ENSSAUG00010016523) adcy7 (ENSSAUG00010016558) tent4b (ENSSAUG00010018910) heatr3 (ENSSAUG00010018924) cnep1r1 (ENSSAUG00010019661) zgc:101040 (ENSSAUG00010019675) C19orf12 (ENSSAUG00010019677) C19orf12 (ENSSAUG00010019680) sdr42e1 (ENSSAUG00010019681) Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000007946.j ENSGT00390000007946.i.b ENSGT00390000008859.b.d.q ENSGT00950000183129.b.b.a.a ENSGT00940000154201.a.b.t ENSGT00390000002564.b.c ENSGT00940000160211 ENSGT00940000157672 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483.a.b ENSGT00940000161299.f ENSGT00390000017730 ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00940000155706 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938.b.a ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000012054.b.d.a ENSGT00940000158070 ENSGT00940000160924 ENSGT00390000000707.y.b Large yellow croaker MODERN SPECIES 480 dhdh.2 (ENSLCRG00005022931) pkma (ENSLCRG00005022939) PARP6 (ENSLCRG00005023053) ENSLCRG00005023062 ENSLCRG00005023063 rpp25b (ENSLCRG00005023064) ENSLCRG00005023066 SLC12A4 (ENSLCRG00005023077) SLC6A2 (ENSLCRG00005023232) lpcat2 (ENSLCRG00005023349) mmp2 (ENSLCRG00005023354) irx6a (ENSLCRG00005023389) irx5a (ENSLCRG00005023390) irx3a (ENSLCRG00005023391) FTO (ENSLCRG00005023393) aktip (ENSLCRG00005023397) #22 CHD9 (ENSLCRG00005023425) TOX3 (ENSLCRG00005023714) sall1a (ENSLCRG00005023715) CYLD (ENSLCRG00005023716) NOD2 (ENSLCRG00005002376) nkd1 (ENSLCRG00005002547) brd7 (ENSLCRG00005002572) adcy7 (ENSLCRG00005003141) tent4b (ENSLCRG00005003591) heatr3 (ENSLCRG00005004088) cnep1r1 (ENSLCRG00005004229) ENSLCRG00005004230 ENSLCRG00005004232 sdr42e1 (ENSLCRG00005004234) wtip (ENSLCRG00005004236) European seabass MODERN SPECIES 18 ENSDLAG00005010337 dhdh.1 (ENSDLAG00005010326) dhdh.2 (ENSDLAG00005029199) pkma (ENSDLAG00005009008) ENSDLAG00005008853 ENSDLAG00005029281 ENSDLAG00005008826 ENSDLAG00005002933 SLC6A2 (ENSDLAG00005002040) lpcat2 (ENSDLAG00005001985) mmp2 (ENSDLAG00005001814) irx6a (ENSDLAG00005001796) irx5a (ENSDLAG00005029194) irx3a (ENSDLAG00005001776) FTO (ENSDLAG00005027892) aktip (ENSDLAG00005028186) #22 ENSDLAG00005025130 TOX3 (ENSDLAG00005025035) sall1a (ENSDLAG00005025026) CYLD (ENSDLAG00005025000) nod2 (ENSDLAG00005024955) nkd1 (ENSDLAG00005032053) brd7 (ENSDLAG00005024941) adcy7 (ENSDLAG00005024782) tent4b (ENSDLAG00005024732) heatr3 (ENSDLAG00005030804) sdr42e1 (ENSDLAG00005026879) wtip (ENSDLAG00005024678) gpib (ENSDLAG00005024556) ENSDLAG00005024531 ss18l2 (ENSDLAG00005024522) Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000183129.b.b.a.a ENSGT00940000154201.a.b.t ENSGT00940000181466 ENSGT00390000002564.b.c ENSGT00940000160211 ENSGT00940000157672 ENSGT01030000235333 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483.a.b ENSGT00940000177581 ENSGT00940000161299.f ENSGT00390000017730 ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00940000155706 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938.b.a ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000012054.b ENSGT00940000158070 ENSGT00940000160924 ENSGT00390000000707.y.b Carangaria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000183129.b.b.a.a ENSGT00940000154201.a.b.t ENSGT00940000181466 ENSGT00390000002564.b.c ENSGT00940000160211 ENSGT00940000157672 ENSGT01030000235333 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483.a.b ENSGT00940000177581 ENSGT00940000161299.f ENSGT00390000017730 ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00940000155706 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938.b.a ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000012054.b ENSGT00940000158070 ENSGT00940000160924 ENSGT00390000000707.y.b Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000007946.j ENSGT00390000007946.i.b ENSGT00390000008859.b.d.q ENSGT00950000183129.b.b.a.a ENSGT00940000154201.a.b.t ENSGT00390000002564.b.c ENSGT00940000160211 ENSGT00940000157672 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483.a.b ENSGT00940000161299.f ENSGT00390000017730 ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00940000155706 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938.b.a ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00940000158070 ENSGT00940000160924 ENSGT00390000000707.y.b ENSGT00390000003210 Tongue sole MODERN SPECIES 15 celf1 (ENSCSEG00000008675) tollip (ENSCSEG00000008694) ENSCSEG00000008707 ENSCSEG00000008715 ENSCSEG00000008723 snrpa1 (ENSCSEG00000008758) selenos (ENSCSEG00000008771) chsy1 (ENSCSEG00000008810) ENSCSEG00000008836 aldh1a3 (ENSCSEG00000008999) asb7 (ENSCSEG00000009020) cd81a (ENSCSEG00000009033) ENSCSEG00000009066 irx3a (ENSCSEG00000009128) FTO (ENSCSEG00000009135) aktip (ENSCSEG00000009168) #22 CHD9 (ENSCSEG00000009209) TOX3 (ENSCSEG00000009338) sall1a (ENSCSEG00000009349) kif23 (ENSCSEG00000009382) SCML2 (ENSCSEG00000009536) cdkl5 (ENSCSEG00000009558) ENSCSEG00000009585 ppef1 (ENSCSEG00000009602) PHKA2 (ENSCSEG00000009624) ap1s2 (ENSCSEG00000009663) ZRSR2 (ENSCSEG00000009682) TM6SF1 (ENSCSEG00000009726) BTBD1 (ENSCSEG00000009763) ENSCSEG00000009786 RAMAC (ENSCSEG00000009800) Turbot MODERN SPECIES 17 dhdh.1 (ENSSMAG00000008426) dhdh.2 (ENSSMAG00000008435) pkma (ENSSMAG00000008462) ENSSMAG00000008513 ENSSMAG00000008575 rpp25b (ENSSMAG00000008643) ENSSMAG00000008666 ENSSMAG00000008682 SLC6A2 (ENSSMAG00000008717) lpcat2 (ENSSMAG00000008763) mmp2 (ENSSMAG00000008836) irx6a (ENSSMAG00000008880) irx5a (ENSSMAG00000008914) irx3a (ENSSMAG00000031233) FTO (ENSSMAG00000008928) aktip (ENSSMAG00000008936) #22 ENSSMAG00000008953 TOX3 (ENSSMAG00000009123) sall1a (ENSSMAG00000009160) ENSSMAG00000031343 CYLD (ENSSMAG00000009173) nod2 (ENSSMAG00000009305) nkd1 (ENSSMAG00000009368) brd7 (ENSSMAG00000009397) adcy7 (ENSSMAG00000009414) tent4b (ENSSMAG00000009474) heatr3 (ENSSMAG00000038075) CNEP1R1 (ENSSMAG00000032497) sdr42e1 (ENSSMAG00000035062) wtip (ENSSMAG00000009606) gpib (ENSSMAG00000009643) Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00950000183129.b.b.a.a ENSGT00940000154201.a.b.t ENSGT00940000181466 ENSGT00390000002564.b.c ENSGT00940000160211 ENSGT00940000157672 ENSGT01030000235333 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483.a.b ENSGT00940000177581 ENSGT00940000161299.f ENSGT00390000017730 ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00940000155706 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938.b.a ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000012054.b ENSGT00940000158070 ENSGT00940000160924 ENSGT00390000000707.y.b Seriola ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000183129.b.b.a.a ENSGT00940000154201.a.b.t ENSGT00940000181466 ENSGT00390000002564.b.c ENSGT00940000160211 ENSGT00940000157672 ENSGT01030000235333 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483.a.b ENSGT00940000177581 ENSGT00940000161299.f ENSGT00390000017730 ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00940000155706 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938.b.a ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000012054.b.j ENSGT00390000012054.b.i ENSGT00940000158070 ENSGT00940000160924 Greater amberjack MODERN SPECIES 1 PARP6 (ENSSDUG00000005563) ENSSDUG00000005607 ENSSDUG00000005635 rpp25b (ENSSDUG00000005645) ENSSDUG00000005658 SLC12A4 (ENSSDUG00000005688) ENSSDUG00000005744 SLC6A2 (ENSSDUG00000005755) lpcat2 (ENSSDUG00000005797) mmp2 (ENSSDUG00000005944) irx6a (ENSSDUG00000005998) irx5a (ENSSDUG00000006018) ENSSDUG00000006031 irx3a (ENSSDUG00000006055) FTO (ENSSDUG00000006070) aktip (ENSSDUG00000006082) #22 CHD9 (ENSSDUG00000006139) TOX3 (ENSSDUG00000006450) ENSSDUG00000006485 sall1a (ENSSDUG00000006507) CYLD (ENSSDUG00000006536) nod2 (ENSSDUG00000006648) nkd1 (ENSSDUG00000006672) brd7 (ENSSDUG00000006703) adcy7 (ENSSDUG00000006797) tent4b (ENSSDUG00000006848) heatr3 (ENSSDUG00000006889) cnep1r1 (ENSSDUG00000006917) ENSSDUG00000006928 sdr42e1 (ENSSDUG00000006949) ENSSDUG00000006958 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3186 irx5a (ENSSLDG00000018200) ENSSLDG00000018183 irx3a (ENSSLDG00000018173) FTO (ENSSLDG00000018141) aktip (ENSSLDG00000018106) #22 CHD9 (ENSSLDG00000017818) TOX3 (ENSSLDG00000017732) sall1a (ENSSLDG00000017721) CYLD (ENSSLDG00000017572) nod2 (ENSSLDG00000017497) nkd1 (ENSSLDG00000017484) brd7 (ENSSLDG00000017420) adcy7 (ENSSLDG00000017343) tent4b (ENSSLDG00000017282) heatr3 (ENSSLDG00000017258) cnep1r1 (ENSSLDG00000017238) ENSSLDG00000017221 ENSSLDG00000017202 sdr42e1 (ENSSLDG00000017190) wtip (ENSSLDG00000017162) Barramundi perch MODERN SPECIES 98 dhdh.1 (ENSLCAG00010018716) dhdh.2 (ENSLCAG00010018710) pkma (ENSLCAG00010018222) PARP6 (ENSLCAG00010018140) ENSLCAG00010018131 rpp25b (ENSLCAG00010018130) ENSLCAG00010018128 SLC12A4 (ENSLCAG00010017027) SLC6A2 (ENSLCAG00010016861) lpcat2 (ENSLCAG00010016834) mmp2 (ENSLCAG00010016793) irx6a (ENSLCAG00010016783) irx5a (ENSLCAG00010016777) irx3a (ENSLCAG00010016776) FTO (ENSLCAG00010016765) aktip (ENSLCAG00010016754) #22 CHD9 (ENSLCAG00010016386) TOX3 (ENSLCAG00010016271) sall1a (ENSLCAG00010016267) CYLD (ENSLCAG00010016261) nod2 (ENSLCAG00010016222) nkd1 (ENSLCAG00010016201) brd7 (ENSLCAG00010016194) adcy7 (ENSLCAG00010016137) tent4b (ENSLCAG00010016119) heatr3 (ENSLCAG00010016105) cnep1r1 (ENSLCAG00010016091) zgc:101040 (ENSLCAG00010016085) sdr42e1 (ENSLCAG00010016081) wtip (ENSLCAG00010016077) gpib (ENSLCAG00010015967) Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000154743.B.o.a ENSGT00390000007946.i.b 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ENSGT00390000017730 ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00940000155706 ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938.b.a ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000012054.b ENSGT00940000158070 ENSGT00940000160924 ENSGT00390000000707.y.b Climbing perch MODERN SPECIES 16 ENSATEG00000002053 dhdh.2 (ENSATEG00000027782) pkma (ENSATEG00000002134) ENSATEG00000002188 ENSATEG00000002283 rpp25b (ENSATEG00000027420) ENSATEG00000026278 ENSATEG00000002376 SLC6A2 (ENSATEG00000002473) lpcat2 (ENSATEG00000002566) mmp2 (ENSATEG00000002575) irx6a (ENSATEG00000002637) irx5a (ENSATEG00000002662) irx3a (ENSATEG00000002688) FTO (ENSATEG00000002699) aktip (ENSATEG00000002703) #22 ENSATEG00000002748 ENSATEG00000002947 sall1a (ENSATEG00000003006) CYLD (ENSATEG00000003025) nod2 (ENSATEG00000003122) nkd1 (ENSATEG00000003139) brd7 (ENSATEG00000003146) adcy7 (ENSATEG00000003161) tent4b (ENSATEG00000003179) heatr3 (ENSATEG00000026766) CNEP1R1 (ENSATEG00000027563) ENSATEG00000027001 ENSATEG00000029184 ENSATEG00000026266 sdr42e1 (ENSATEG00000003407) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 14 PARP6 (ENSBSLG00000020567) ENSBSLG00000020620 ENSBSLG00000021266 ENSBSLG00000021677 ENSBSLG00000021682 rpp25b (ENSBSLG00000021684) ENSBSLG00000021686 SLC12A4 (ENSBSLG00000022056) SLC6A2 (ENSBSLG00000024700) lpcat2 (ENSBSLG00000024976) mmp2 (ENSBSLG00000025064) irx6a (ENSBSLG00000025143) irx5a (ENSBSLG00000005290) irx3a (ENSBSLG00000005404) FTO (ENSBSLG00000005434) aktip (ENSBSLG00000005524) #22 CHD9 (ENSBSLG00000005883) TOX3 (ENSBSLG00000009724) sall1a (ENSBSLG00000009855) CYLD (ENSBSLG00000009895) nod2 (ENSBSLG00000010171) nkd1 (ENSBSLG00000010211) brd7 (ENSBSLG00000010239) adcy7 (ENSBSLG00000010726) tent4b (ENSBSLG00000011102) heatr3 (ENSBSLG00000011243) ENSBSLG00000011295 ENSBSLG00000011299 ENSBSLG00000011302 sdr42e1 (ENSBSLG00000011637) wtip (ENSBSLG00000011701) Zig-zag eel MODERN SPECIES 17 ENSMAMG00000003104 dhdh.2 (ENSMAMG00000003171) pkma (ENSMAMG00000003203) ENSMAMG00000003253 ENSMAMG00000003343 rpp25b (ENSMAMG00000028359) ENSMAMG00000003377 ENSMAMG00000003392 SLC6A2 (ENSMAMG00000003500) lpcat2 (ENSMAMG00000003595) mmp2 (ENSMAMG00000003664) irx6a (ENSMAMG00000003743) irx5a (ENSMAMG00000003779) irx3a (ENSMAMG00000025354) FTO (ENSMAMG00000003830) aktip (ENSMAMG00000003852) #22 ENSMAMG00000003909 TOX3 (ENSMAMG00000004125) sall1a (ENSMAMG00000004164) CYLD (ENSMAMG00000004219) nod2 (ENSMAMG00000004330) nkd1 (ENSMAMG00000004411) brd7 (ENSMAMG00000004453) adcy7 (ENSMAMG00000004499) tent4b (ENSMAMG00000004618) heatr3 (ENSMAMG00000004653) CNEP1R1 (ENSMAMG00000025311) ENSMAMG00000004754 sdr42e1 (ENSMAMG00000028360) wtip (ENSMAMG00000004782) gpib (ENSMAMG00000004828) Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00950000183129.b.b.a.a ENSGT00940000154201.a.b.t ENSGT00940000181466 ENSGT00390000002564.b.c ENSGT00940000160211 ENSGT00940000157672 ENSGT01030000235333 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483.a.b ENSGT00940000177581 ENSGT00940000161299.f ENSGT00390000017730 ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00940000155706 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938.b.a ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000012054.b.a.a ENSGT00940000158070 ENSGT00940000160924 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000007946.i.b ENSGT00390000008859.b.d.q ENSGT00950000183129.b.b.a.a ENSGT00940000154201.a.b.t ENSGT00390000002564.b.c ENSGT00940000160211 ENSGT00940000157672 ENSGT01030000235333 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483.a.b ENSGT00940000161299.f ENSGT00390000017730 ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00940000155706 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938.b.a ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000012054.b.a.a ENSGT00940000158070 ENSGT00940000160924 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000007946.i.b ENSGT00390000008859.b.d.q ENSGT00950000183129.b.b.a.a ENSGT00940000154201.a.b.t ENSGT00390000002564.b.c ENSGT00940000160211 ENSGT00940000157672 ENSGT01030000235333 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483.a.b ENSGT00940000161299.f ENSGT00390000017730 ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00940000155706 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938.b.a ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000012054.b.a.a ENSGT00940000158070 ENSGT00940000160924 Aplocheiloidei 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ENSNFUG00015000989 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000007946.i.b.c ENSGT00390000008859.b.d.q ENSGT00950000183129.b.b.a.a ENSGT00940000154201.a.b.t ENSGT00390000002564.b.c ENSGT00940000160211 ENSGT00940000157672 ENSGT01030000235333 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483.a.b ENSGT00940000161299.f ENSGT00390000017730 ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00940000155706 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938.b.a ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000012054.b.a.a.b ENSGT00390000012054.b.a.a.a ENSGT00940000158070 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 428 ENSGT00940000159483.a.b ENSGT00940000161299.f ENSGT00390000017730 ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00940000155706 Mummichog MODERN SPECIES 2483 irx5a (ENSFHEG00000006187) irx3a (ENSFHEG00000006148) FTO (ENSFHEG00000006142) aktip (ENSFHEG00000006134) #22 CHD9 (ENSFHEG00000006068) Sheepshead minnow MODERN SPECIES 375 irx5a (ENSCVAG00000016010) irx3a (ENSCVAG00000016019) FTO (ENSCVAG00000016051) aktip (ENSCVAG00000016083) #22 CHD9 (ENSCVAG00000016195) Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT01090000260005.a.b.b ENSGT00950000183129.b.b.a.a ENSGT00940000154201.a.b.t ENSGT00390000002564.b.c ENSGT00940000160211 ENSGT00940000157672 ENSGT01030000235333 ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000178766 ENSGT00940000159483.a.b ENSGT00940000161299.f ENSGT00390000017730 ENSGT00390000010125 #22 ENSGT00940000155706 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000158043 ENSGT00940000155938.b.a ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000160934 ENSGT00440000033589.c ENSGT00950000183170.a ENSGT00940000159096 ENSGT00940000158301 ENSGT00390000012529 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000012054.b.a.a.b ENSGT00390000012054.b.a.a.a ENSGT00940000158070 Poecilia ANCESTRAL 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(ENSHBUG00000021651) tent4b (ENSHBUG00000021610) heatr3 (ENSHBUG00000021602) cnep1r1 (ENSHBUG00000021590) ENSHBUG00000021556 ENSHBUG00000021546 sdr42e1 (ENSHBUG00000021502) Lyretail cichlid MODERN SPECIES 290 pkma (ENSNBRG00000010179) PARP6 (ENSNBRG00000010136) ENSNBRG00000010123 ENSNBRG00000010105 rpp25b (ENSNBRG00000010094) ENSNBRG00000010037 SLC12A4 (ENSNBRG00000009962) SLC6A2 (ENSNBRG00000009926) lpcat2 (ENSNBRG00000009888) mmp2 (ENSNBRG00000009858) irx6a (ENSNBRG00000009831) irx5a (ENSNBRG00000009810) ENSNBRG00000009792 irx3a (ENSNBRG00000009776) FTO (ENSNBRG00000009670) aktip (ENSNBRG00000009622) #22 CHD9 (ENSNBRG00000009423) TOX3 (ENSNBRG00000009332) sall1a (ENSNBRG00000009307) CYLD (ENSNBRG00000009254) nod2 (ENSNBRG00000009217) ENSNBRG00000009203 nkd1 (ENSNBRG00000009143) brd7 (ENSNBRG00000009096) adcy7 (ENSNBRG00000008995) tent4b (ENSNBRG00000008931) heatr3 (ENSNBRG00000008875) cnep1r1 (ENSNBRG00000008843) ENSNBRG00000008815 ENSNBRG00000008797 ENSNBRG00000008776 Nile tilapia MODERN SPECIES dhdh.1 (ENSONIG00000039429) pkma (ENSONIG00000002725) PARP6 (ENSONIG00000002740) ENSONIG00000002755 rpp25b (ENSONIG00000041375) ENSONIG00000002760 SLC12A4 (ENSONIG00000002766) SLC6A2 (ENSONIG00000002785) lpcat2 (ENSONIG00000002790) mmp2 (ENSONIG00000002793) ENSONIG00000033403 irx6a (ENSONIG00000030514) irx5a (ENSONIG00000002806) irx3a (ENSONIG00000002808) FTO (ENSONIG00000034371) aktip (ENSONIG00000002813) #22 CHD9 (ENSONIG00000002816) TOX3 (ENSONIG00000002828) sall1a (ENSONIG00000002831) CYLD (ENSONIG00000002832) nod2 (ENSONIG00000002837) nkd1 (ENSONIG00000029445) brd7 (ENSONIG00000002844) adcy7 (ENSONIG00000002854) tent4b (ENSONIG00000002860) heatr3 (ENSONIG00000002862) cnep1r1 (ENSONIG00000002867) ENSONIG00000029863 ENSONIG00000020603 ENSONIG00000002868 sdr42e1 (ENSONIG00000002869) Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT00950000183129.b.b.a.a ENSGT00940000154201.a.b.s.a ENSGT00940000154201.a.b.t ENSGT00390000002564.b.c ENSGT00940000160211 ENSGT00940000157672 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