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Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000157678	ENSGT00940000157234	ENSGT00940000161024	ENSGT00390000000917	ENSGT00390000006347.b	ENSGT00940000155401.g	ENSGT00940000156564	ENSGT00940000155360.B	ENSGT00940000157872 #15	ENSGT00940000157849 #16	ENSGT00940000157874 #17	ENSGT00940000154474.A #18	ENSGT00940000157694 #19	ENSGT00390000001101 #20	ENSGT00940000156905 #21	ENSGT00950000182899.B.a #22	ENSGT00940000154927 #23	ENSGT00530000063627.a	ENSGT00940000157453	ENSGT00390000001394	ENSGT00940000154652	ENSGT01030000234579.B.b	ENSGT00940000159927	ENSGT00940000160889	ENSGT00940000161271	ENSGT00390000016480	ENSGT00940000157953	ENSGT00950000182950.B	ENSGT00390000017146.b	ENSGT00730000111351
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00940000157678	ENSGT00940000157234	ENSGT00940000161024	ENSGT00390000000917	ENSGT00390000006347.b	ENSGT00940000155401.g	ENSGT00940000156564	ENSGT00940000155360.B	ENSGT00940000157872 #15	ENSGT00940000157849 #16	ENSGT00940000157874 #17	ENSGT00940000154474.A #18	ENSGT00940000157694 #19	ENSGT00390000001101 #20	ENSGT00940000156905 #21	ENSGT00950000182899.B.a #22	ENSGT00940000154927 #23	ENSGT00530000063627.a	ENSGT00940000157453	ENSGT00390000001394	ENSGT00940000154652	ENSGT01030000234579.B.b	ENSGT00940000159927	ENSGT00940000160889	ENSGT00940000161271
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	649								ENSUPAG00010011925 #14	TUBGCP3 (ENSUPAG00010011868) #15	ATP11A (ENSUPAG00010011811) #16	MCF2L (ENSUPAG00010011660) #17	F7 (ENSUPAG00010011625) #18	F10 (ENSUPAG00010011613) #19	PCID2 (ENSUPAG00010011560) #20	CUL4A (ENSUPAG00010011517) #21	LAMP1 (ENSUPAG00010011509) #22	GRTP1 (ENSUPAG00010011479) #23
Squirrel	MODERN SPECIES	72	COL4A1 (ENSSTOG00000004254)	COL4A2 (ENSSTOG00000026757)	RAB20 (ENSSTOG00000008251)	NAXD (ENSSTOG00000012153)	CARS2 (ENSSTOG00000012158)	ENSSTOG00000026920	ANKRD10 (ENSSTOG00000023244)	ARHGEF7 (ENSSTOG00000014578)	TUBGCP3 (ENSSTOG00000000803) #15	ATP11A (ENSSTOG00000000270) #16	MCF2L (ENSSTOG00000003498) #17	F7 (ENSSTOG00000025843) #18	F10 (ENSSTOG00000020166) #19	PCID2 (ENSSTOG00000003919) #20	CUL4A (ENSSTOG00000003940) #21	LAMP1 (ENSSTOG00000003961) #22	GRTP1 (ENSSTOG00000003972) #23	ENSSTOG00000007972	DCUN1D2 (ENSSTOG00000007978)	TMCO3 (ENSSTOG00000023226)	TFDP1 (ENSSTOG00000002592)	ATP4B (ENSSTOG00000013113)	GRK1 (ENSSTOG00000027210)	TMEM255B (ENSSTOG00000026508)	GAS6 (ENSSTOG00000020442)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	13	RAB20 (ENSMMMG00000020082)	NAXD (ENSMMMG00000020065)	CARS2 (ENSMMMG00000019885)	ENSMMMG00000019878	ENSMMMG00000019874	ENSMMMG00000019872	ARHGEF7 (ENSMMMG00000019817)	ENSMMMG00000019809	TUBGCP3 (ENSMMMG00000019793) #15	ATP11A (ENSMMMG00000019764) #16	MCF2L (ENSMMMG00000019681) #17	F7 (ENSMMMG00000019651) #18	F10 (ENSMMMG00000019639) #19	PCID2 (ENSMMMG00000019625) #20	CUL4A (ENSMMMG00000014686) #21	LAMP1 (ENSMMMG00000014633) #22	GRTP1 (ENSMMMG00000014534) #23	ENSMMMG00000014528	ENSMMMG00000014431	TMCO3 (ENSMMMG00000014404)	TFDP1 (ENSMMMG00000014381)	ATP4B (ENSMMMG00000014370)	GRK1 (ENSMMMG00000014330)	TMEM255B (ENSMMMG00000014307)	GAS6 (ENSMMMG00000014286)	C13orf46 (ENSMMMG00000014275)	RASA3 (ENSMMMG00000014242)	CDC16 (ENSMMMG00000014221)	UPF3A (ENSMMMG00000014171)	CHAMP1 (ENSMMMG00000014156)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	13	ING1 (ENSSVLG00005000309)	ENSSVLG00005000341	ARHGEF7 (ENSSVLG00005000486)	SOX1 (ENSSVLG00005000621)	ENSSVLG00005000637	ENSSVLG00005000688 #15	ENSSVLG00005000771	ATP11A (ENSSVLG00005000814) #16	MCF2L (ENSSVLG00005001241) #17	ENSSVLG00005001682	F7 (ENSSVLG00005001724) #18	F10 (ENSSVLG00005001796) #19	PCID2 (ENSSVLG00005001897) #20	ENSSVLG00005001960 #21	ENSSVLG00005002003	LAMP1 (ENSSVLG00005002018) #22	GRTP1 (ENSSVLG00005002053) #23	ENSSVLG00005002088	ENSSVLG00005002123	TMCO3 (ENSSVLG00005002150)	ATP4B (ENSSVLG00005002190)	GRK1 (ENSSVLG00005002225)	TMEM255B (ENSSVLG00005002264)	GAS6 (ENSSVLG00005002307)	ENSSVLG00005002351	RASA3 (ENSSVLG00005002398)	CFAP97D2 (ENSSVLG00005002430)	ENSSVLG00005002469	ENSSVLG00005002544	ENSSVLG00005002676	CHAMP1 (ENSSVLG00005002688)
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00390000000917	ENSGT00390000006347.b	ENSGT00940000155401.h	ENSGT00940000156564	ENSGT00940000168071	ENSGT00940000155360.B	ENSGT00940000162479	ENSGT00940000157872 #15	ENSGT00940000157849 #16	ENSGT00940000157874 #17	ENSGT00940000154474.A #18	ENSGT00940000157694 #19	ENSGT00940000154505.A	ENSGT00390000001101.r #20	ENSGT00940000156905 #21	ENSGT00950000182899.B.a #22	ENSGT00940000154927 #23	ENSGT00530000063627.a	ENSGT00940000157453	ENSGT00390000001394	ENSGT00940000154652	ENSGT01030000234579.B.b	ENSGT00940000159927	ENSGT00940000160889	ENSGT00940000161271	ENSGT00390000016480	ENSGT00940000157953	ENSGT01000000214655	ENSGT00950000182950.B	ENSGT00390000017146.b.h	ENSGT00730000111351
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Guinea pig	MODERN SPECIES	5	COL4A2 (ENSCPOG00000010611)	RAB20 (ENSCPOG00000034193)	NAXD (ENSCPOG00000019974)	CARS2 (ENSCPOG00000024839)	ING1 (ENSCPOG00000035111)	ANKRD10 (ENSCPOG00000032064)	ARHGEF7 (ENSCPOG00000010585)	TUBGCP3 (ENSCPOG00000027201) #15	ATP11A (ENSCPOG00000010539) #16	MCF2L (ENSCPOG00000025369) #17	F7 (ENSCPOG00000005296) #18	F10 (ENSCPOG00000005297) #19	PROZ (ENSCPOG00000014204)	PCID2 (ENSCPOG00000014206) #20	CUL4A (ENSCPOG00000007488) #21	LAMP1 (ENSCPOG00000021441) #22	GRTP1 (ENSCPOG00000013842) #23	ENSCPOG00000014361	DCUN1D2 (ENSCPOG00000014364)	TMCO3 (ENSCPOG00000006999)	TFDP1 (ENSCPOG00000013486)	ATP4B (ENSCPOG00000013488)	GRK1 (ENSCPOG00000013493)	TMEM255B (ENSCPOG00000001504)	GAS6 (ENSCPOG00000007335)	C13orf46 (ENSCPOG00000022842)	RASA3 (ENSCPOG00000007813)	ENSCPOG00000030796	CDC16 (ENSCPOG00000005324)	UPF3A (ENSCPOG00000006824)	ENSCPOG00000032917
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00390000000917	ENSGT00390000006347.b	ENSGT00940000155401.h	ENSGT00940000156564	ENSGT00940000168071	ENSGT00940000155360.B	ENSGT00510000049560	ENSGT00940000157872 #15	ENSGT00940000157849 #16	ENSGT00940000157874 #17	ENSGT00940000154474.A #18	ENSGT00940000157694 #19	ENSGT00940000154505.A	ENSGT00390000001101.r #20	ENSGT00940000156905 #21	ENSGT00950000182899.B.a #22	ENSGT00940000154927 #23	ENSGT00530000063627.a	ENSGT00940000157453	ENSGT00390000001394	ENSGT00940000154652	ENSGT01030000234579.B.b	ENSGT00940000159927	ENSGT00940000160889	ENSGT00940000161271	ENSGT00390000016480	ENSGT00940000157953	ENSGT00950000182950.B	ENSGT00390000017146.b.h	ENSGT00730000111351
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	111	NAXD (ENSCLAG00000008979)	ING1 (ENSCLAG00000017685)	CARS2 (ENSCLAG00000010030)	ANKRD10 (ENSCLAG00000009950)	ENSCLAG00000015201	ARHGEF7 (ENSCLAG00000002159)	ENSCLAG00000001914	TUBGCP3 (ENSCLAG00000001848) #15	ATP11A (ENSCLAG00000006784) #16	MCF2L (ENSCLAG00000002098) #17	F7 (ENSCLAG00000004276) #18	F10 (ENSCLAG00000004028) #19	PROZ (ENSCLAG00000002909)	PCID2 (ENSCLAG00000002752) #20	CUL4A (ENSCLAG00000002629) #21	LAMP1 (ENSCLAG00000003876) #22	GRTP1 (ENSCLAG00000003539) #23	ENSCLAG00000002749	DCUN1D2 (ENSCLAG00000003327)	TMCO3 (ENSCLAG00000003648)	TFDP1 (ENSCLAG00000003535)	ATP4B (ENSCLAG00000003301)	GRK1 (ENSCLAG00000003146)	TMEM255B (ENSCLAG00000002978)	GAS6 (ENSCLAG00000002827)	ENSCLAG00000002436	RASA3 (ENSCLAG00000006342)	CDC16 (ENSCLAG00000006234)	CHAMP1 (ENSCLAG00000017633)
Degu	MODERN SPECIES	80	NAXD (ENSODEG00000008623)	CARS2 (ENSODEG00000008933)	ING1 (ENSODEG00000008422)	ENSODEG00000008348	ARHGEF7 (ENSODEG00000009477)	ENSODEG00000009444	ENSODEG00000019619	TUBGCP3 (ENSODEG00000008609) #15	ENSODEG00000008533	ATP11A (ENSODEG00000008675) #16	MCF2L (ENSODEG00000009412) #17	F10 (ENSODEG00000008696) #19	PROZ (ENSODEG00000009284)	PCID2 (ENSODEG00000007738) #20	CUL4A (ENSODEG00000007751) #21	LAMP1 (ENSODEG00000009126) #22	GRTP1 (ENSODEG00000007871) #23	ENSODEG00000008619	ENSODEG00000007633	DCUN1D2 (ENSODEG00000008899)	TMCO3 (ENSODEG00000009661)	ENSODEG00000009187	ATP4B (ENSODEG00000007695)	GRK1 (ENSODEG00000007663)	TMEM255B (ENSODEG00000007605)	GAS6 (ENSODEG00000012335)	C13orf46 (ENSODEG00000007606)	RASA3 (ENSODEG00000008030)	ENSODEG00000008845	ENSODEG00000019558	CDC16 (ENSODEG00000008438)
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	30	ENSHGLG00000001367	NSDHL (ENSHGLG00000034743)	CETN2 (ENSHGLG00000000679)	ENSHGLG00000034611	ENSHGLG00000041325	GABRQ (ENSHGLG00000000255)	ENSHGLG00000000811	ENSHGLG00000042494	ENSHGLG00000033171	ENSHGLG00000002103 #17	ENSHGLG00000046767 #18	F10 (ENSHGLG00000039136) #19	PROZ (ENSHGLG00000037291)	PCID2 (ENSHGLG00000003349) #20	CUL4A (ENSHGLG00000002538) #21	LAMP1 (ENSHGLG00000002376) #22	ENSHGLG00000002306 #23	ENSHGLG00000036527	DCUN1D2 (ENSHGLG00000004905)	TMCO3 (ENSHGLG00000003925)	TFDP1 (ENSHGLG00000003633)	ATP4B (ENSHGLG00000003223)	GRK1 (ENSHGLG00000002895)	TMEM255B (ENSHGLG00000002627)	GAS6 (ENSHGLG00000002481)	ENSHGLG00000038427	ENSHGLG00000002286	RASA3 (ENSHGLG00000002110)	CFAP97D2 (ENSHGLG00000049782)	CDC16 (ENSHGLG00000001834)	ENSHGLG00000034132