Mammalia ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000161883 ENSGT00940000157861 #12 ENSGT00770000120611.A #13 ENSGT00940000157905 #14 ENSGT00640000091617 #15 ENSGT00940000156985 #16 ENSGT00940000154371.a #18 ENSGT00390000006136 #17 ENSGT00390000010998 #19 ENSGT00940000160343 #20 ENSGT00940000157006 #21 ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 ENSGT00940000161646 #23 ENSGT00440000033863 #24 ENSGT00390000003668 #27 ENSGT00940000157807 #28 ENSGT00940000154822.b #29 ENSGT00900000141033.a #30 ENSGT00900000141033.b.a ##30 ENSGT00940000161917 #31 ENSGT00940000154929.A #32 ENSGT00940000154929.C ##32 ENSGT00940000159834 #34 ENSGT01030000234614.A #35 ENSGT00910000144278 #36 ENSGT00390000007195 #37 ENSGT00900000141071 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 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ENSGT00390000016476 #26 ENSGT00390000003668 #27 ENSGT00940000157807 #28 ENSGT00940000154822.b #29 ENSGT00900000141033.a #30 ENSGT00940000161917 #31 ENSGT00940000154929.A #32 ENSGT00940000159834 #34 ENSGT01030000234614.A #35 ENSGT00910000144278 #36 ENSGT00390000007195 #37 ENSGT00900000141071.f Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 111 Or13c7d (ENSCGRG00001004670) #7 Spaar (ENSCGRG00001003061) #8 Hrct1 (ENSCGRG00001004997) #9 Or13j1 (ENSCGRG00001004497) #10 Or13e8 (ENSCGRG00001003201) #11 Tmem8b (ENSCGRG00001015077) #12 Fam221b (ENSCGRG00001021843) #13 Hint2 (ENSCGRG00001022361) #14 ENSCGRG00001023642 #15 Npr2 (ENSCGRG00001002437) #16 Rgp1 (ENSCGRG00001013071) #17 Msmp (ENSCGRG00001018637) #18 Gba2 (ENSCGRG00001019184) #19 ENSCGRG00001019579 #20 Tln1 (ENSCGRG00001022418) #21 Tpm2 (ENSCGRG00001005345) #22 Car9 (ENSCGRG00001021639) #23 Arhgef39 (ENSCGRG00001021996) #24 Ccdc107 (ENSCGRG00001022872) #25 Sit1 (ENSCGRG00001002139) #26 Cd72 (ENSCGRG00001008526) #27 Tesk1 (ENSCGRG00001014228) 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Fam166b (ENSMAUG00000012187) #29 Rusc2 (ENSMAUG00000013885) #30 Atp8b5 (ENSMAUG00000017194) #31 ENSMAUG00000015941 #32 Atosb (ENSMAUG00000022204) #34 Stoml2 (ENSMAUG00000001356) #35 Pigo (ENSMAUG00000018188) #36 Fancg (ENSMAUG00000013616) #37 Vcp (ENSMAUG00000001185) Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Rat MODERN SPECIES 11 Chmp4c (ENSRNOG00000010238) Slc10a5 (ENSRNOG00000067758) Zfand1 (ENSRNOG00000010342) Impa1 (ENSRNOG00000010482) Fabp12 (ENSRNOG00000038825) Fabp4 (ENSRNOG00000010805) Fabp9 (ENSRNOG00000011082) Pmp2 (ENSRNOG00000022707) Fabp5 (ENSRNOG00000049075) Pag1 (ENSRNOG00000061328) Zfp704 (ENSRNOG00000054426) Zbtb10 (ENSRNOG00000061862) Tpd52 (ENSRNOG00000011441) Mrps28 (ENSRNOG00000032630) ENSRNOG00000033449 ENSRNOG00000066004 #22 Hey1 (ENSRNOG00000062882) Stmn2 (ENSRNOG00000011705) LOC100360846 (ENSRNOG00000011827) Il7 (ENSRNOG00000011973) Zc2hc1a (ENSRNOG00000022356) Pkia (ENSRNOG00000012095) ENSRNOG00000066927 ENSRNOG00000062390 Senp5-ps1 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ENSGT00850000133592 #8 ENSGT00510000049544 #9 ENSGT01040000240406.A.a #10 ENSGT00940000164268 #11 ENSGT00940000157861 #12 ENSGT00770000120611.A #13 ENSGT00940000157905 #14 ENSGT00640000091617 #15 ENSGT00940000156985 #16 ENSGT01100000267037 ENSGT00940000154371.a #18 ENSGT00390000006136 #17 ENSGT00390000010998 #19 ENSGT00940000160343 #20 ENSGT00940000157006 #21 ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234542.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000161646 #23 ENSGT00440000033863 #24 ENSGT00390000018608 #25 ENSGT00390000016476 #26 ENSGT00390000003668 #27 ENSGT00940000157807 #28 ENSGT00940000154822.b #29 ENSGT00900000141033.a #30 ENSGT00940000161917 #31 ENSGT00940000154929.A #32 ENSGT00940000159834 #34 ENSGT01030000234614.A #35 ENSGT00910000144278 #36 ENSGT00390000007195 #37 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 spretus MODERN SPECIES 13 Hrct1 (MGP_SPRETEiJ_G0026914) #9 Or13j1 (MGP_SPRETEiJ_G0026913) #10 Or13e8 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(MGP_CAROLIEiJ_G0025926) #37 Vcp (MGP_CAROLIEiJ_G0025925) Shrew mouse MODERN SPECIES 14 Or13c7b (MGP_PahariEiJ_G0024100) ##10 Or13c7d (MGP_PahariEiJ_G0024099) #7 Hrct1 (MGP_PahariEiJ_G0024098) #9 Or13j1 (MGP_PahariEiJ_G0024097) #10 Or13e8 (MGP_PahariEiJ_G0024096) #11 Tmem8b (MGP_PahariEiJ_G0024095) #12 Fam221b (MGP_PahariEiJ_G0024094) #13 Hint2 (MGP_PahariEiJ_G0024093) #14 MGP_PahariEiJ_G0024092 #15 Npr2 (MGP_PahariEiJ_G0024091) #16 Msmp (MGP_PahariEiJ_G0024090) #18 Rgp1 (MGP_PahariEiJ_G0024089) #17 Gba2 (MGP_PahariEiJ_G0024088) #19 Creb3 (MGP_PahariEiJ_G0024087) #20 Tln1 (MGP_PahariEiJ_G0024086) #21 Tpm2 (MGP_PahariEiJ_G0024085) #22 Car9 (MGP_PahariEiJ_G0024084) #23 Arhgef39 (MGP_PahariEiJ_G0024083) #24 Ccdc107 (MGP_PahariEiJ_G0024082) #25 Sit1 (MGP_PahariEiJ_G0024081) #26 MGP_PahariEiJ_G0024080 #27 Tesk1 (MGP_PahariEiJ_G0024079) #28 MGP_PahariEiJ_G0024078 #29 Rusc2 (MGP_PahariEiJ_G0024077) #30 Atp8b5 (MGP_PahariEiJ_G0024076) #31 MGP_PahariEiJ_G0024075 #32 Atosb (MGP_PahariEiJ_G0024074) #34 Stoml2 (MGP_PahariEiJ_G0024073) #35 Pigo (MGP_PahariEiJ_G0024072) #36 Fancg (MGP_PahariEiJ_G0024071) #37 Vcp (MGP_PahariEiJ_G0024070) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1193 Hrct1 (ENSNGAG00000018817) #9 Or13j1 (ENSNGAG00000020703) #10 Or13e8 (ENSNGAG00000021114) #11 ENSNGAG00000001233 #12 Hint2 (ENSNGAG00000003065) #14 Spag8 (ENSNGAG00000009517) #15 Npr2 (ENSNGAG00000012144) #16 Msmp (ENSNGAG00000000253) #18 Rgp1 (ENSNGAG00000001512) #17 Gba2 (ENSNGAG00000015334) #19 Creb3 (ENSNGAG00000020484) #20 Tln1 (ENSNGAG00000004118) #21 Tpm2 (ENSNGAG00000009787) #22 Car9 (ENSNGAG00000010790) #23 Arhgef39 (ENSNGAG00000012924) #24 Ccdc107 (ENSNGAG00000017156) #25 Sit1 (ENSNGAG00000020498) #26 Cd72 (ENSNGAG00000000679) #27 Tesk1 (ENSNGAG00000017508) #28 ENSNGAG00000010058 #29 Rusc2 (ENSNGAG00000012485) #30 ENSNGAG00000008794 #32 Atosb (ENSNGAG00000020349) #34 Stoml2 (ENSNGAG00000021085) #35 Pigo (ENSNGAG00000000757) #36 Fancg (ENSNGAG00000000885) #37 Vcp (ENSNGAG00000012998) 1700022I11Rik (ENSNGAG00000005829) Kangaroo rat MODERN SPECIES 414 Ccin (ENSDORG00000012835) ENSDORG00000012831 Reck (ENSDORG00000012827) Or13c7c (ENSDORG00000026683) ##10 ENSDORG00000015734 #7 Hrct1 (ENSDORG00000029256) #9 Or13j1 (ENSDORG00000006274) #10 ENSDORG00000006271 #12 Hint2 (ENSDORG00000006268) #14 Npr2 (ENSDORG00000006262) #16 Msmp (ENSDORG00000025071) #18 Rgp1 (ENSDORG00000006258) #17 Gba2 (ENSDORG00000006257) #19 Creb3 (ENSDORG00000029821) #20 Tln1 (ENSDORG00000006249) #21 Tpm2 (ENSDORG00000006246) #22 Car9 (ENSDORG00000014587) #23 Arhgef39 (ENSDORG00000014585) #24 Ccdc107 (ENSDORG00000014582) #25 Sit1 (ENSDORG00000029675) #26 ENSDORG00000014579 #27 Tesk1 (ENSDORG00000014578) #28 ENSDORG00000014577 #29 Rusc2 (ENSDORG00000014573) #30 Atp8b5 (ENSDORG00000027358) #31 ENSDORG00000016518 #32 Atosb (ENSDORG00000010303) #34 Stoml2 (ENSDORG00000010302) #35 Pigo (ENSDORG00000010301) #36 Fancg (ENSDORG00000019859) #37 Vcp (ENSDORG00000010299) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00850000133592 #8 ENSGT00510000049544 #9 ENSGT00960000190987 ENSGT01040000240406.A.a #10 ENSGT00940000164268 #11 ENSGT00940000157861 #12 ENSGT00770000120611.A #13 ENSGT00940000157905 #14 ENSGT00640000091617 #15 ENSGT00940000156985 #16 ENSGT00940000154371.a #18 ENSGT00390000006136 #17 ENSGT00390000010998 #19 ENSGT00940000160343 #20 ENSGT00940000157006 #21 ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 ENSGT01030000234542.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000161646 #23 ENSGT00440000033863 #24 ENSGT00390000018608 #25 ENSGT00390000016476 #26 ENSGT00390000003668 #27 ENSGT00940000157807 #28 ENSGT00940000154822.b #29 ENSGT00900000141033.a #30 ENSGT00940000161917 #31 ENSGT00940000154929.A #32 ENSGT00940000159834 #34 ENSGT01030000234614.A #35 ENSGT00910000144278 #36 ENSGT00390000007195 #37 Squirrel MODERN SPECIES 124 ENSSTOG00000027055 ##10 ENSSTOG00000022728 ##10 HRCT1 (ENSSTOG00000029426) #9 OR13J1 (ENSSTOG00000019968) #10 ENSSTOG00000007067 #11 TMEM8B (ENSSTOG00000007004) #12 FAM221B (ENSSTOG00000026697) #13 HINT2 (ENSSTOG00000006975) #14 SPAG8 (ENSSTOG00000031721) #15 NPR2 (ENSSTOG00000006885) #16 MSMP (ENSSTOG00000019953) #18 RGP1 (ENSSTOG00000005260) #17 GBA2 (ENSSTOG00000005223) #19 CREB3 (ENSSTOG00000005203) #20 TLN1 (ENSSTOG00000005092) #21 ENSSTOG00000005060 #22 CA9 (ENSSTOG00000005040) #23 ARHGEF39 (ENSSTOG00000005023) #24 CCDC107 (ENSSTOG00000005005) #25 SIT1 (ENSSTOG00000021283) #26 CD72 (ENSSTOG00000028460) #27 TESK1 (ENSSTOG00000022193) #28 FAM166B (ENSSTOG00000028838) #29 RUSC2 (ENSSTOG00000005996) #30 ENSSTOG00000019584 #31 ENSSTOG00000001641 #32 ATOSB (ENSSTOG00000015239) #34 STOML2 (ENSSTOG00000015225) #35 PIGO (ENSSTOG00000015210) #36 FANCG (ENSSTOG00000015194) #37 VCP (ENSSTOG00000015181) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 3 ENSHGLG00000040072 ENSHGLG00000001113 ENSHGLG00000021263 #10 TMEM8B (ENSHGLG00000019082) #12 FAM221B (ENSHGLG00000050266) #13 HINT2 (ENSHGLG00000047552) #14 ENSHGLG00000018211 #15 NPR2 (ENSHGLG00000018381) #16 ENSHGLG00000021386 MSMP (ENSHGLG00000033552) #18 RGP1 (ENSHGLG00000003062) #17 GBA2 (ENSHGLG00000005313) #19 CREB3 (ENSHGLG00000018724) #20 TLN1 (ENSHGLG00000018401) #21 ENSHGLG00000020017 ENSHGLG00000005363 #22 CA9 (ENSHGLG00000044546) #23 ARHGEF39 (ENSHGLG00000019101) #24 SIT1 (ENSHGLG00000041192) #26 CD72 (ENSHGLG00000003067) #27 TESK1 (ENSHGLG00000004902) #28 ENSHGLG00000036182 RUSC2 (ENSHGLG00000000643) #30 ENSHGLG00000001499 #31 ENSHGLG00000036725 ENSHGLG00000003611 #32 ENSHGLG00000036099 ATOSB (ENSHGLG00000002143) #34 STOML2 (ENSHGLG00000002045) #35 PIGO (ENSHGLG00000000517) #36 FANCG (ENSHGLG00000011031) #37 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Degu MODERN SPECIES 134 ENSODEG00000014331 HRAS (ENSODEG00000015703) RNH1 (ENSODEG00000014320) PTDSS2 (ENSODEG00000014250) ANO9 (ENSODEG00000014087) SIGIRR (ENSODEG00000014794) PKP3 (ENSODEG00000014948) B4GALNT4 (ENSODEG00000015497) ENSODEG00000014892 ENSODEG00000014441 IFITM5 (ENSODEG00000014917) PGGHG (ENSODEG00000015256) NLRP6 (ENSODEG00000014679) ENSODEG00000013804 PSMD13 (ENSODEG00000015037) ENSODEG00000014097 #22 SIRT3 (ENSODEG00000014136) RIC8A (ENSODEG00000015235) BET1L (ENSODEG00000013826) ODF3 (ENSODEG00000015176) ENSODEG00000014059 ENSODEG00000020278 PTCHD3 (ENSODEG00000014626) OR9K2 (ENSODEG00000014841) ENSODEG00000013814 ENSODEG00000015024 NEUROD4 (ENSODEG00000020179) TESPA1 (ENSODEG00000014898) ENSODEG00000013533 PPP1R1A (ENSODEG00000013950) PDE1B (ENSODEG00000013509) Guinea pig MODERN SPECIES 27 ENSCPOG00000031231 ##10 ENSCPOG00000030507 #7 ENSCPOG00000015207 #7 OR13J1 (ENSCPOG00000006373) #10 ENSCPOG00000022117 #11 TMEM8B (ENSCPOG00000024197) #12 FAM221B (ENSCPOG00000022477) #13 HINT2 (ENSCPOG00000040327) #14 ENSCPOG00000034450 #15 NPR2 (ENSCPOG00000000414) #16 MSMP (ENSCPOG00000030922) #18 RGP1 (ENSCPOG00000000412) #17 GBA2 (ENSCPOG00000000410) #19 CREB3 (ENSCPOG00000000409) #20 TLN1 (ENSCPOG00000000403) #21 ENSCPOG00000000401 #22 CA9 (ENSCPOG00000000400) #23 ARHGEF39 (ENSCPOG00000000398) #24 CCDC107 (ENSCPOG00000000396) #25 SIT1 (ENSCPOG00000031973) #26 CD72 (ENSCPOG00000033224) #27 TESK1 (ENSCPOG00000001230) #28 ENSCPOG00000008741 #30 ENSCPOG00000033272 ##30 ENSCPOG00000006017 #31 ENSCPOG00000012048 #32 ATOSB (ENSCPOG00000012040) #34 STOML2 (ENSCPOG00000012035) #35 PIGO (ENSCPOG00000012015) #36 FANCG (ENSCPOG00000012007) #37 VCP (ENSCPOG00000011991) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Mouse lemur MODERN SPECIES 22 ENSMICG00000038351 ENSMICG00000043092 SPESP1 (ENSMICG00000045479) GLCE (ENSMICG00000044587) PAQR5 (ENSMICG00000012222) KIF23 (ENSMICG00000012227) RPLP1 (ENSMICG00000036579) TLE3 (ENSMICG00000002321) UACA (ENSMICG00000034701) LARP6 (ENSMICG00000011234) LRRC49 (ENSMICG00000011247) THAP10 (ENSMICG00000030210) THSD4 (ENSMICG00000033528) NR2E3 (ENSMICG00000038667) MYO9A (ENSMICG00000000971) ENSMICG00000030629 #22 GRAMD2A (ENSMICG00000041898) PKM (ENSMICG00000013532) PARP6 (ENSMICG00000013544) CELF6 (ENSMICG00000027918) ENSMICG00000036904 HEXA (ENSMICG00000013561) ENSMICG00000027129 ARIH1 (ENSMICG00000012070) ENSMICG00000038537 BBS4 (ENSMICG00000032120) ENSMICG00000030696 ADPGK (ENSMICG00000015028) NEO1 (ENSMICG00000012371) HCN4 (ENSMICG00000007449) REC114 (ENSMICG00000014616) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Gibbon MODERN SPECIES 11 ENSNLEG00000018628 ENSNLEG00000005166 LCP2 (ENSNLEG00000005113) ENSNLEG00000005110 ENSNLEG00000032677 FOXI1 (ENSNLEG00000005109) DOCK2 (ENSNLEG00000004980) INSYN2B (ENSNLEG00000005107) SPDL1 (ENSNLEG00000004947) SLIT3 (ENSNLEG00000004908) PANK3 (ENSNLEG00000004896) FBLL1 (ENSNLEG00000031565) RARS1 (ENSNLEG00000004848) WWC1 (ENSNLEG00000026584) TENM2 (ENSNLEG00000004813) ENSNLEG00000035676 #22 MAT2B (ENSNLEG00000004785) HMMR (ENSNLEG00000004676) ENSNLEG00000004674 CCNG1 (ENSNLEG00000004641) GABRG2 (ENSNLEG00000004597) GABRA1 (ENSNLEG00000004541) GABRA6 (ENSNLEG00000004518) GABRB2 (ENSNLEG00000004479) ATP10B (ENSNLEG00000004434) PTTG1 (ENSNLEG00000004396) SLU7 (ENSNLEG00000004355) FAM200C (ENSNLEG00000018765) C1QTNF2 (ENSNLEG00000031564) ENSNLEG00000032973 CCNJL (ENSNLEG00000004343) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Vervet Monkey MODERN SPECIES 3 ENSCSAG00000000454 ##10 ENSCSAG00000000453 ##10 OR2S2 (ENSCSAG00000000452) ##10 HRCT1 (ENSCSAG00000000451) #9 OR13J1 (ENSCSAG00000000450) #10 TMEM8B (ENSCSAG00000010650) #12 FAM221B (ENSCSAG00000010633) #13 HINT2 (ENSCSAG00000010622) #14 SPAG8 (ENSCSAG00000010595) #15 NPR2 (ENSCSAG00000010612) #16 MSMP (ENSCSAG00000010584) #18 RGP1 (ENSCSAG00000010580) #17 GBA2 (ENSCSAG00000010566) #19 CREB3 (ENSCSAG00000010554) #20 TLN1 (ENSCSAG00000010542) #21 ENSCSAG00000010498 #22 CA9 (ENSCSAG00000010447) #23 ARHGEF39 (ENSCSAG00000010393) #24 CCDC107 (ENSCSAG00000010389) #25 SIT1 (ENSCSAG00000010386) #26 CD72 (ENSCSAG00000010375) #27 TESK1 (ENSCSAG00000010363) #28 RUSC2 (ENSCSAG00000010356) #30 FAM166B (ENSCSAG00000010348) #29 ENSCSAG00000010330 #32 ENSCSAG00000010310 ATOSB (ENSCSAG00000010301) #34 STOML2 (ENSCSAG00000010292) #35 PIGO (ENSCSAG00000010287) #36 FANCG (ENSCSAG00000010273) #37 VCP (ENSCSAG00000010257) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 566 C5orf58 (ENSMNEG00000045509) FOXI1 (ENSMNEG00000019116) INSYN2B (ENSMNEG00000038181) DOCK2 (ENSMNEG00000028317) SPDL1 (ENSMNEG00000040206) SLIT3 (ENSMNEG00000036017) PANK3 (ENSMNEG00000040137) RARS1 (ENSMNEG00000044708) ENSMNEG00000038297 WWC1 (ENSMNEG00000027736) TENM2 (ENSMNEG00000030074) ENSMNEG00000016038 ENSMNEG00000029204 ENSMNEG00000001722 ENSMNEG00000030988 ENSMNEG00000031403 #22 ENSMNEG00000031639 HMMR (ENSMNEG00000033353) NUDCD2 (ENSMNEG00000030247) CCNG1 (ENSMNEG00000036722) ENSMNEG00000041169 GABRG2 (ENSMNEG00000028600) GABRA1 (ENSMNEG00000039407) GABRA6 (ENSMNEG00000043018) GABRB2 (ENSMNEG00000029340) ENSMNEG00000024049 ENSMNEG00000012988 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Rhesus MODERN SPECIES 6 RECK (ENSMMUG00000022613) OR2S2 (ENSMMUG00000050498) ##10 SPAAR (ENSMMUG00000051938) #8 HRCT1 (ENSMMUG00000016342) #9 OR13J1 (ENSMMUG00000062401) #10 TMEM8B (ENSMMUG00000031865) #12 FAM221B (ENSMMUG00000031861) #13 HINT2 (ENSMMUG00000016337) #14 SPAG8 (ENSMMUG00000016336) #15 NPR2 (ENSMMUG00000016334) #16 MSMP (ENSMMUG00000056937) #18 RGP1 (ENSMMUG00000059406) #17 GBA2 (ENSMMUG00000016331) #19 CREB3 (ENSMMUG00000016328) #20 TLN1 (ENSMMUG00000031856) #21 TPM2 (ENSMMUG00000016321) #22 CA9 (ENSMMUG00000050822) #23 ARHGEF39 (ENSMMUG00000016323) #24 CCDC107 (ENSMMUG00000016327) #25 SIT1 (ENSMMUG00000063329) #26 CD72 (ENSMMUG00000016318) #27 TESK1 (ENSMMUG00000016316) #28 ENSMMUG00000049863 FAM166B (ENSMMUG00000016314) #29 RUSC2 (ENSMMUG00000016313) #30 UNC13B (ENSMMUG00000016308) #32 ATOSB (ENSMMUG00000011862) #34 STOML2 (ENSMMUG00000059191) #35 PIGO (ENSMMUG00000011866) #36 VCP (ENSMMUG00000020190) ENSMMUG00000061896 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Chacoan peccary MODERN SPECIES 887 ENSCWAG00000003829 ##10 OR2S2 (ENSCWAG00000003839) ##10 SPAAR (ENSCWAG00000003846) #8 HRCT1 (ENSCWAG00000003864) #9 ENSCWAG00000003872 #10 TMEM8B (ENSCWAG00000003887) #12 FAM221B (ENSCWAG00000003953) #13 HINT2 (ENSCWAG00000003988) #14 SPAG8 (ENSCWAG00000004016) #15 NPR2 (ENSCWAG00000004081) #16 MSMP (ENSCWAG00000004164) #18 RGP1 (ENSCWAG00000004191) #17 GBA2 (ENSCWAG00000004224) #19 CREB3 (ENSCWAG00000004257) #20 TLN1 (ENSCWAG00000004325) #21 ENSCWAG00000004599 #22 CA9 (ENSCWAG00000004676) #23 ARHGEF39 (ENSCWAG00000004746) #24 CCDC107 (ENSCWAG00000004786) #25 SIT1 (ENSCWAG00000004829) #26 CD72 (ENSCWAG00000004876) #27 TESK1 (ENSCWAG00000005115) #28 FAM166B (ENSCWAG00000005165) #29 RUSC2 (ENSCWAG00000005202) #30 ENSCWAG00000005344 #31 UNC13B (ENSCWAG00000006440) #32 ATOSB (ENSCWAG00000010237) #34 STOML2 (ENSCWAG00000010297) #35 PIGO (ENSCWAG00000010488) #36 FANCG (ENSCWAG00000010604) #37 VCP (ENSCWAG00000010708) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Blue whale MODERN SPECIES 11 ENSBMSG00010008236 ATP10A (ENSBMSG00010008266) UBE3A (ENSBMSG00010008323) SNRPN (ENSBMSG00010008520) NDN (ENSBMSG00010008546) MAGEL2 (ENSBMSG00010008554) ENSBMSG00010008562 CHRNA7 (ENSBMSG00010008603) ENSBMSG00010008876 ENSBMSG00010008883 OTUD7A (ENSBMSG00010013492) TBC1D2B (ENSBMSG00010013515) SH2D7 (ENSBMSG00010013535) CIB2 (ENSBMSG00010013559) IDH3A (ENSBMSG00010013586) ENSBMSG00010013604 #22 ACSBG1 (ENSBMSG00010013627) DNAJA4 (ENSBMSG00010013663) SKIC8 (ENSBMSG00010013689) CRABP1 (ENSBMSG00010013720) ENSBMSG00010013743 ENSBMSG00010013727 HYKK (ENSBMSG00010013756) PSMA4 (ENSBMSG00010013787) CHRNA5 (ENSBMSG00010013809) CHRNA3 (ENSBMSG00010013851) CHRNB4 (ENSBMSG00010013876) ENSBMSG00010013899 ENSBMSG00010013916 UBE2Q2 (ENSBMSG00010013962) ENSBMSG00010014136 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Narwhal MODERN SPECIES 312 ENSMMNG00015012421 ##10 ENSMMNG00015012407 ##10 OR2S2 (ENSMMNG00015012394) ##10 HRCT1 (ENSMMNG00015012373) #9 ENSMMNG00015012329 #11 TMEM8B (ENSMMNG00015012291) #12 FAM221B (ENSMMNG00015012262) #13 ENSMMNG00015012242 #14 SPAG8 (ENSMMNG00015012211) #15 NPR2 (ENSMMNG00015012171) #16 MSMP (ENSMMNG00015012146) #18 RGP1 (ENSMMNG00015012131) #17 GBA2 (ENSMMNG00015012088) #19 CREB3 (ENSMMNG00015018570) #20 TLN1 (ENSMMNG00015018382) #21 ENSMMNG00015018288 #22 CA9 (ENSMMNG00015018245) #23 ARHGEF39 (ENSMMNG00015018204) #24 CCDC107 (ENSMMNG00015018152) #25 SIT1 (ENSMMNG00015018130) #26 CD72 (ENSMMNG00015018062) #27 TESK1 (ENSMMNG00015018015) #28 FAM166B (ENSMMNG00015017991) #29 RUSC2 (ENSMMNG00015017947) #30 ENSMMNG00015017888 #31 UNC13B (ENSMMNG00015017219) #32 ATOSB (ENSMMNG00015016981) #34 STOML2 (ENSMMNG00015016899) #35 PIGO (ENSMMNG00015016828) #36 FANCG (ENSMMNG00015016755) #37 VCP (ENSMMNG00015016650) Beluga whale MODERN SPECIES 20 CHRNA7 (ENSDLEG00000001573) ENSDLEG00000001570 OTUD7A (ENSDLEG00000001539) ADAMTS7 (ENSDLEG00000000889) TBC1D2B (ENSDLEG00000000680) SH2D7 (ENSDLEG00000000658) CIB2 (ENSDLEG00000000640) ENSDLEG00000000623 #22 IDH3A (ENSDLEG00000000589) ACSBG1 (ENSDLEG00000000531) DNAJA4 (ENSDLEG00000000487) WDR61 (ENSDLEG00000000464) CRABP1 (ENSDLEG00000000441) IREB2 (ENSDLEG00000000397) HYKK (ENSDLEG00000000362) PSMA4 (ENSDLEG00000000329) CHRNA5 (ENSDLEG00000000246) CHRNA3 (ENSDLEG00000000140) CHRNB4 (ENSDLEG00000004654) UBE2Q2 (ENSDLEG00000004624) FBXO22 (ENSDLEG00000004615) NRG4 (ENSDLEG00000004607) TMEM266 (ENSDLEG00000004600) Pecora DUPLICATION Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b.g #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b.g #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b.g #22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b.g #22 Goat MODERN SPECIES 4 BANF2 (ENSCHIG00000008802) SNX5 (ENSCHIG00000017948) MGME1 (ENSCHIG00000008100) OVOL2 (ENSCHIG00000019495) PET117 (ENSCHIG00000008463) KAT14 (ENSCHIG00000023963) ENSCHIG00000015086 DZANK1 (ENSCHIG00000023950) POLR3F (ENSCHIG00000014743) RBBP9 (ENSCHIG00000024182) SEC23B (ENSCHIG00000016382) ENSCHIG00000024743 SCP2D1 (ENSCHIG00000007792) SLC24A3 (ENSCHIG00000010684) ENSCHIG00000008840 ENSCHIG00000020114 #22 RIN2 (ENSCHIG00000009997) NAA20 (ENSCHIG00000021922) CRNKL1 (ENSCHIG00000013171) CFAP61 (ENSCHIG00000022048) INSM1 (ENSCHIG00000002944) RALGAPA2 (ENSCHIG00000023081) ENSCHIG00000005268 ENSCHIG00000001410 KIZ (ENSCHIG00000020496) XRN2 (ENSCHIG00000006921) ENSCHIG00000009213 NKX2-4 (ENSCHIG00000017092) NKX2-2 (ENSCHIG00000025252) PAX1 (ENSCHIG00000025250) FOXA2 (ENSCHIG00000013879) Pecora DUPLICATION Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b.h.a #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b.h.a #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b.h.a #22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b.h.a #22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b.h.a #22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b.h.a #22 Cow MODERN SPECIES 27 OR13J1 (ENSBTAG00000053868) #10 OR13J1F (ENSBTAG00000048744) #10 OR13J1C (ENSBTAG00000052220) #10 OR13E10 (ENSBTAG00000052564) #11 OR13E1 (ENSBTAG00000053732) #11 TMEM8B (ENSBTAG00000011445) #12 FAM221B (ENSBTAG00000005222) #13 HINT2 (ENSBTAG00000011444) #14 SPAG8 (ENSBTAG00000011442) #15 NPR2 (ENSBTAG00000011434) #16 MSMP (ENSBTAG00000038777) #18 RGP1 (ENSBTAG00000011433) #17 GBA2 (ENSBTAG00000011431) #19 CREB3 (ENSBTAG00000011429) #20 TLN1 (ENSBTAG00000025868) #21 TPM2 (ENSBTAG00000011424) #22 CA9 (ENSBTAG00000011420) #23 ARHGEF39 (ENSBTAG00000011416) #24 CCDC107 (ENSBTAG00000011413) #25 SIT1 (ENSBTAG00000011411) #26 CD72 (ENSBTAG00000011409) #27 TESK1 (ENSBTAG00000011406) #28 FAM166B (ENSBTAG00000032509) #29 RUSC2 (ENSBTAG00000011403) #30 ENSBTAG00000011402 #31 UNC13B (ENSBTAG00000011397) #32 ATOSB (ENSBTAG00000011394) #34 STOML2 (ENSBTAG00000011388) #35 PIGO (ENSBTAG00000044135) #36 FANCG (ENSBTAG00000015005) #37 VCP (ENSBTAG00000015000) Siberian musk deer MODERN SPECIES 29 ENSMMSG00000015011 ##10 ENSMMSG00000015017 ##10 OR2S2 (ENSMMSG00000015024) ##10 HRCT1 (ENSMMSG00000015040) #9 OR13J1 (ENSMMSG00000015046) #10 TMEM8B (ENSMMSG00000015059) #12 FAM221B (ENSMMSG00000015107) #13 HINT2 (ENSMMSG00000015132) #14 ENSMMSG00000015165 #15 NPR2 (ENSMMSG00000015203) #16 MSMP (ENSMMSG00000015255) #18 RGP1 (ENSMMSG00000015277) #17 GBA2 (ENSMMSG00000015315) #19 CREB3 (ENSMMSG00000015379) #20 TLN1 (ENSMMSG00000015440) #21 ENSMMSG00000015633 #22 CA9 (ENSMMSG00000015710) #23 ARHGEF39 (ENSMMSG00000015773) #24 CCDC107 (ENSMMSG00000015845) #25 SIT1 (ENSMMSG00000015901) #26 ENSMMSG00000015921 #27 TESK1 (ENSMMSG00000015939) #28 FAM166B (ENSMMSG00000016004) #29 RUSC2 (ENSMMSG00000016099) #30 ENSMMSG00000016245 #31 UNC13B (ENSMMSG00000017606) #32 ATOSB (ENSMMSG00000021058) #34 STOML2 (ENSMMSG00000013696) #35 PIGO (ENSMMSG00000013774) #36 ENSMMSG00000013864 #37 VCP (ENSMMSG00000013911) Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b.h.b #22 Yarkand deer MODERN SPECIES 21 ENSCHYG00000021475 ##10 ENSCHYG00000021448 ##10 ENSCHYG00000021426 ##10 OR2S2 (ENSCHYG00000021412) ##10 HRCT1 (ENSCHYG00000021366) #9 TMEM8B (ENSCHYG00000021241) #12 FAM221B (ENSCHYG00000021157) #13 HINT2 (ENSCHYG00000021062) #14 SPAG8 (ENSCHYG00000020945) #15 NPR2 (ENSCHYG00000020493) #16 MSMP (ENSCHYG00000020407) #18 RGP1 (ENSCHYG00000020238) #17 GBA2 (ENSCHYG00000020190) #19 CREB3 (ENSCHYG00000020022) #20 TLN1 (ENSCHYG00000018771) #21 ENSCHYG00000018251 #22 CA9 (ENSCHYG00000018143) #23 ARHGEF39 (ENSCHYG00000017913) #24 CCDC107 (ENSCHYG00000017525) #25 ENSCHYG00000017430 #26 CD72 (ENSCHYG00000017324) #27 TESK1 (ENSCHYG00000017230) #28 ENSCHYG00000017158 RUSC2 (ENSCHYG00000017110) #30 ENSCHYG00000016777 #31 UNC13B (ENSCHYG00000014450) #32 ENSCHYG00000026628 #34 STOML2 (ENSCHYG00000026604) #35 PIGO (ENSCHYG00000026575) #36 FANCG (ENSCHYG00000026529) #37 VCP (ENSCHYG00000026503) Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b.h.b #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b.h.b #22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b.h.b #22 Goat MODERN SPECIES 27 ENSCHIG00000002364 ##10 OR2S2 (ENSCHIG00000005494) ##10 SPAAR (ENSCHIG00000023998) #8 OR13J1 (ENSCHIG00000012438) #10 ENSCHIG00000013865 #11 ENSCHIG00000013918 #12 FAM221B (ENSCHIG00000025372) #13 HINT2 (ENSCHIG00000010130) #14 ENSCHIG00000007164 #15 NPR2 (ENSCHIG00000008754) #16 MSMP (ENSCHIG00000017876) #18 RGP1 (ENSCHIG00000020979) #17 GBA2 (ENSCHIG00000025213) #19 CREB3 (ENSCHIG00000010117) #20 TLN1 (ENSCHIG00000006075) #21 ENSCHIG00000014590 #22 CA9 (ENSCHIG00000019915) #23 ARHGEF39 (ENSCHIG00000025444) #24 CCDC107 (ENSCHIG00000015321) #25 SIT1 (ENSCHIG00000021361) #26 CD72 (ENSCHIG00000026462) #27 TESK1 (ENSCHIG00000013203) #28 FAM166B (ENSCHIG00000015961) #29 RUSC2 (ENSCHIG00000021467) #30 ENSCHIG00000027178 ENSCHIG00000026189 #31 ENSCHIG00000012743 #32 ATOSB (ENSCHIG00000018514) #34 STOML2 (ENSCHIG00000025806) #35 PIGO (ENSCHIG00000013960) #36 FANCG (ENSCHIG00000021663) #37 Siberian musk deer MODERN SPECIES 1266 PAICS (ENSMMSG00000024303) PPAT (ENSMMSG00000024306) ENSMMSG00000024308 ENSMMSG00000024310 AASDH (ENSMMSG00000024311) ENSMMSG00000024316 ENSMMSG00000024317 CEP135 (ENSMMSG00000024320) EXOC1 (ENSMMSG00000024323) EXOC1L (ENSMMSG00000024327) NMU (ENSMMSG00000024331) PDCL2 (ENSMMSG00000024349) CLOCK (ENSMMSG00000020910) TMEM165 (ENSMMSG00000021016) SRD5A3 (ENSMMSG00000021061) ENSMMSG00000021085 #22 KDR (ENSMMSG00000021120) KIT (ENSMMSG00000021225) PDGFRA (ENSMMSG00000021277) ENSMMSG00000021324 ##22 GSX2 (ENSMMSG00000021348) CHIC2 (ENSMMSG00000021379) ENSMMSG00000021416 LNX1 (ENSMMSG00000021431) ENSMMSG00000021486 SCFD2 (ENSMMSG00000021640) RASL11B (ENSMMSG00000021670) USP46 (ENSMMSG00000021696) SPATA18 (ENSMMSG00000021782) SGCB (ENSMMSG00000021920) LRRC66 (ENSMMSG00000021932) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Dog MODERN SPECIES 3 PGK2 (ENSCAFG00845006942) ENSCAFG00845006978 DEFB114 (ENSCAFG00845007058) DEFB113 (ENSCAFG00845007099) DEFB110 (ENSCAFG00845007134) DEFB112 (ENSCAFG00845007163) TFAP2D (ENSCAFG00845007225) TFAP2B (ENSCAFG00845007336) PKHD1 (ENSCAFG00845007749) ENSCAFG00845008776 ENSCAFG00845008815 MCM3 (ENSCAFG00845008858) PAQR8 (ENSCAFG00845008976) EFHC1 (ENSCAFG00845009042) TRAM2 (ENSCAFG00845009321) ENSCAFG00845009462 #22 ENSCAFG00845009512 ENSCAFG00845009595 ENSCAFG00845009638 ENSCAFG00845009716 GSTA4 (ENSCAFG00845009775) CILK1 (ENSCAFG00845009901) FBXO9 (ENSCAFG00845010007) ENSCAFG00845010095 GCM1 (ENSCAFG00845010149) ELOVL5 (ENSCAFG00845010176) ENSCAFG00845010216 ENSCAFG00845010249 GCLC (ENSCAFG00845010300) ENSCAFG00845010386 KLHL31 (ENSCAFG00845010535) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Ursus ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 Polar bear MODERN SPECIES 191 ENSUMAG00000007469 ##10 ENSUMAG00000007466 OR13J1 (ENSUMAG00000007463) #10 ENSUMAG00000007462 #11 FAM221B (ENSUMAG00000007458) #13 ENSUMAG00000007454 #12 HINT2 (ENSUMAG00000007451) #14 SPAG8 (ENSUMAG00000007448) #15 NPR2 (ENSUMAG00000007437) #16 MSMP (ENSUMAG00000007433) #18 RGP1 (ENSUMAG00000007428) #17 GBA2 (ENSUMAG00000007217) #19 CREB3 (ENSUMAG00000007116) #20 ENSUMAG00000006769 #22 CA9 (ENSUMAG00000006763) #23 ARHGEF39 (ENSUMAG00000006759) #24 CCDC107 (ENSUMAG00000006757) #25 SIT1 (ENSUMAG00000006752) #26 ENSUMAG00000006750 #27 ENSUMAG00000006747 #27 TESK1 (ENSUMAG00000006745) #28 FAM166B (ENSUMAG00000006741) #29 RUSC2 (ENSUMAG00000006736) #30 ENSUMAG00000006640 #31 UNC13B (ENSUMAG00000006521) #32 ENSUMAG00000006433 ##32 ENSUMAG00000006421 ATOSB (ENSUMAG00000006412) #34 PIGO (ENSUMAG00000006408) #36 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234542.b.b.a.a.b #22 American mink MODERN SPECIES 494 ENSNVIG00000017068 ##10 ENSNVIG00000017059 ##10 SPAAR (ENSNVIG00000017044) #8 HRCT1 (ENSNVIG00000017033) #9 OR13J1 (ENSNVIG00000017028) #10 TMEM8B (ENSNVIG00000016974) #12 FAM221B (ENSNVIG00000016953) #13 HINT2 (ENSNVIG00000016936) #14 SPAG8 (ENSNVIG00000016925) #15 NPR2 (ENSNVIG00000016877) #16 MSMP (ENSNVIG00000016864) #18 RGP1 (ENSNVIG00000016849) #17 GBA2 (ENSNVIG00000016722) #19 CREB3 (ENSNVIG00000016702) #20 TLN1 (ENSNVIG00000016623) #21 ENSNVIG00000016587 #22 CA9 (ENSNVIG00000016550) #23 ARHGEF39 (ENSNVIG00000016533) #24 CCDC107 (ENSNVIG00000016507) #25 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