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Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000153972.C #7	ENSGT00940000160150.b #8	ENSGT00390000015442 #9	ENSGT00940000162265 #10	ENSGT00940000153394.c.b #11	ENSGT00940000160071 #12	ENSGT00950000183090.B #13	ENSGT00940000161365 #14	ENSGT00940000157236 #15	ENSGT00940000165505 #16	ENSGT00940000160682.b #17	ENSGT00940000159840 #18	ENSGT00940000156976 #20	ENSGT00940000168034	ENSGT00390000010968 #21	ENSGT00940000159839 #22	ENSGT00390000014323 #23	ENSGT00940000154189.B #24	ENSGT00390000002669 #25	ENSGT00940000162080 #26	ENSGT00390000007925 #27	ENSGT00940000157097 #28	ENSGT00940000158861.A #29	ENSGT00390000010377 #30	ENSGT00940000156642 #31	ENSGT00390000010825.b #32	ENSGT00940000157633 #33	ENSGT00390000010215.A #34	ENSGT00940000153392.b.a #35	ENSGT00390000004190 #36	ENSGT00440000035348 #37
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000009067	ENSGT00940000153972.C #7	ENSGT00940000160150.b #8	ENSGT00390000015442 #9	ENSGT00940000162265 #10	ENSGT00940000153394.c.b #11	ENSGT00940000160071 #12	ENSGT00950000183090.B #13	ENSGT00940000161365 #14	ENSGT00940000157236 #15	ENSGT00940000165505 #16	ENSGT00940000160682.b #17	ENSGT00940000159840 #18	ENSGT00940000156976 #20	ENSGT00390000010968 #21	ENSGT00940000159839 #22	ENSGT00390000014323 #23	ENSGT00940000154189.B #24	ENSGT00390000002669 #25	ENSGT00940000162080 #26	ENSGT00390000007925 #27	ENSGT00940000157097 #28	ENSGT00940000158861.A #29	ENSGT00390000010377 #30	ENSGT00940000156642 #31	ENSGT00390000010825.b #32	ENSGT00940000157633 #33	ENSGT00390000010215.A #34	ENSGT00940000153392.b.a #35	ENSGT00390000004190 #36	ENSGT00440000035348 #37
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	60	ENSGT00390000009067	ENSGT00940000153972.C #7	ENSGT00940000160150.b #8	ENSGT00390000015442 #9	ENSGT00940000162265 #10	ENSGT00940000153394.c.b #11	ENSGT00940000160071 #12	ENSGT00950000183090.B #13	ENSGT00940000161365 #14	ENSGT00940000157236 #15	ENSGT00940000165505 #16	ENSGT00940000160682.b #17	ENSGT00940000159840 #18	ENSGT00940000156976 #20	ENSGT00390000010968 #21	ENSGT00940000159839 #22	ENSGT00390000014323 #23	ENSGT00940000154189.B #24	ENSGT00390000002669 #25	ENSGT00940000162080 #26	ENSGT00390000007925 #27	ENSGT00940000157097 #28	ENSGT00940000158861.A #29	ENSGT00390000010377 #30	ENSGT00940000156642 #31	ENSGT00390000010825.b #32	ENSGT00940000157633 #33	ENSGT00390000010215.A #34	ENSGT00940000153392.b.a #35	ENSGT00390000004190 #36	ENSGT00440000035348 #37
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Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	136												TBC1D22A (ENSUPAG00010000801) #18	ENSUPAG00010000822	CERK (ENSUPAG00010000837) #20	GRAMD4 (ENSUPAG00010000878) #21	CELSR1 (ENSUPAG00010000911) #22	TRMU (ENSUPAG00010000993) #23	GTSE1 (ENSUPAG00010001015) #24	TTC38 (ENSUPAG00010001135) #25	PKDREJ (ENSUPAG00010001142) #26	ENSUPAG00010001152 #27	PPARA (ENSUPAG00010001194) #28	WNT7B (ENSUPAG00010001236) #29	ATXN10 (ENSUPAG00010001308) #30	ENSUPAG00010001323	FBLN1 (ENSUPAG00010001341) #31	RIBC2 (ENSUPAG00010001366) #32	SMC1B (ENSUPAG00010001387) #33	FAM118A (ENSUPAG00010001448) #34	UPK3A (ENSUPAG00010001467) #35	KIAA0930 (ENSUPAG00010001482) #36
Alpin marmot	MODERN SPECIES	76											ENSMMMG00000022752	TAFA5 (ENSMMMG00000022767) #17	TBC1D22A (ENSMMMG00000022775) #18	CERK (ENSMMMG00000022787) #20	GRAMD4 (ENSMMMG00000022791) #21	CELSR1 (ENSMMMG00000022800) #22	TRMU (ENSMMMG00000022837) #23	GTSE1 (ENSMMMG00000022842) #24	TTC38 (ENSMMMG00000022854) #25	PKDREJ (ENSMMMG00000022862) #26	CDPF1 (ENSMMMG00000022867) #27	PPARA (ENSMMMG00000022880) #28	ENSMMMG00000022892	WNT7B (ENSMMMG00000022894) #29	ATXN10 (ENSMMMG00000022899) #30	ENSMMMG00000022900	FBLN1 (ENSMMMG00000022901) #31	RIBC2 (ENSMMMG00000022915) #32	SMC1B (ENSMMMG00000022923) #33	FAM118A (ENSMMMG00000022934) #34	UPK3A (ENSMMMG00000022940) #35
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	14	ENSSVLG00005008197 ##8	MLC1 (ENSSVLG00005008063) #9	TTLL8 (ENSSVLG00005007883) #10	PIM3 (ENSSVLG00005007815) #11	CRELD2 (ENSSVLG00005007771) #12	ALG12 (ENSSVLG00005007721) #13	ZBED4 (ENSSVLG00005007699) #14	BRD1 (ENSSVLG00005007645) #15	ENSSVLG00005007598	ENSSVLG00005007576	TAFA5 (ENSSVLG00005007520) #17	TBC1D22A (ENSSVLG00005007405) #18	CERK (ENSSVLG00005007251) #20	ENSSVLG00005007199	ENSSVLG00005007139 #21	CELSR1 (ENSSVLG00005007014) #22	TRMU (ENSSVLG00005006961) #23	GTSE1 (ENSSVLG00005006916) #24	TTC38 (ENSSVLG00005006858) #25	PKDREJ (ENSSVLG00005006816) #26	CDPF1 (ENSSVLG00005006772) #27	PPARA (ENSSVLG00005006748) #28	WNT7B (ENSSVLG00005006679) #29	ATXN10 (ENSSVLG00005006578) #30	FBLN1 (ENSSVLG00005006308) #31	RIBC2 (ENSSVLG00005006192) #32	SMC1B (ENSSVLG00005005919) #33	ENSSVLG00005005861 #34	ENSSVLG00005005796 #35	ENSSVLG00005005734 #35	KIAA0930 (ENSSVLG00005005653) #36
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Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000005508.a	ENSGT00390000009067	ENSGT00940000153972.C #7	ENSGT00940000160150 #8	ENSGT00390000015442 #9	ENSGT00940000162265 #10	ENSGT00940000153394.c.b.d #11	ENSGT00940000160071 #12	ENSGT00950000183090.B #13	ENSGT00940000161365 #14	ENSGT00940000157236 #15	ENSGT00940000160682.b #17	ENSGT00940000159840.f #18	ENSGT00940000156976 #20	ENSGT00390000010968 #21	ENSGT00940000159839 #22	ENSGT00390000014323 #23	ENSGT00940000154189.B #24	ENSGT00390000002669 #25	ENSGT00940000162080 #26	ENSGT00390000007925 #27	ENSGT00940000157097 #28	ENSGT00940000158861.A #29	ENSGT00390000010377 #30	ENSGT00940000156642 #31	ENSGT00390000010825.b #32	ENSGT00940000157633 #33	ENSGT00390000010215.A #34	ENSGT00940000153392.b.a #35	ENSGT00390000004190 #36	ENSGT00440000035348 #37
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	120	SELENOO (ENSCLAG00000016415)	TRABD (ENSCLAG00000017256)	PANX2 (ENSCLAG00000017242) #7	MOV10L1 (ENSCLAG00000017288) #8	MLC1 (ENSCLAG00000017013) #9	TTLL8 (ENSCLAG00000015999) #10	PIM3 (ENSCLAG00000016870) #11	CRELD2 (ENSCLAG00000017304) #12	ALG12 (ENSCLAG00000016932) #13	ZBED4 (ENSCLAG00000017234) #14	BRD1 (ENSCLAG00000017112) #15	TAFA5 (ENSCLAG00000017180) #17	TBC1D22A (ENSCLAG00000015959) #18	CERK (ENSCLAG00000016678) #20	GRAMD4 (ENSCLAG00000017096) #21	CELSR1 (ENSCLAG00000016719) #22	TRMU (ENSCLAG00000017269) #23	GTSE1 (ENSCLAG00000017237) #24	TTC38 (ENSCLAG00000017023) #25	PKDREJ (ENSCLAG00000017056) #26	CDPF1 (ENSCLAG00000017222) #27	PPARA (ENSCLAG00000017301) #28	WNT7B (ENSCLAG00000017076) #29	ATXN10 (ENSCLAG00000016859) #30	FBLN1 (ENSCLAG00000016951) #31	RIBC2 (ENSCLAG00000017045) #32	SMC1B (ENSCLAG00000016971) #33	FAM118A (ENSCLAG00000016872) #34	UPK3A (ENSCLAG00000016597) #35	KIAA0930 (ENSCLAG00000016457) #36	ENSCLAG00000017084 #37
Degu	MODERN SPECIES	194	TUBGCP6 (ENSODEG00000015845)	SELENOO (ENSODEG00000016393)	TRABD (ENSODEG00000015551)	PANX2 (ENSODEG00000015716) #7	MOV10L1 (ENSODEG00000015326) #8	MLC1 (ENSODEG00000015862) #9	PIM3 (ENSODEG00000015238) #11	CRELD2 (ENSODEG00000015949) #12	ALG12 (ENSODEG00000015815) #13	ZBED4 (ENSODEG00000020394) #14	BRD1 (ENSODEG00000015579) #15	TAFA5 (ENSODEG00000015536) #17	TBC1D22A (ENSODEG00000015390) #18	CERK (ENSODEG00000016133) #20	GRAMD4 (ENSODEG00000014781) #21	CELSR1 (ENSODEG00000015461) #22	TRMU (ENSODEG00000014745) #23	ENSODEG00000015837 #24	TTC38 (ENSODEG00000014912) #25	PKDREJ (ENSODEG00000015429) #26	CDPF1 (ENSODEG00000016735) #27	PPARA (ENSODEG00000014591) #28	WNT7B (ENSODEG00000016370) #29	ATXN10 (ENSODEG00000014678) #30	FBLN1 (ENSODEG00000014780) #31	RIBC2 (ENSODEG00000016095) #32	SMC1B (ENSODEG00000014594) #33	FAM118A (ENSODEG00000015410) #34	UPK3A (ENSODEG00000014940) #35	KIAA0930 (ENSODEG00000015023) #36	NUP50 (ENSODEG00000014719) #37
Guinea pig	MODERN SPECIES	160												TAFA5 (ENSCPOG00000032237) #17	TBC1D22A (ENSCPOG00000006220) #18	CERK (ENSCPOG00000025691) #20	GRAMD4 (ENSCPOG00000012881) #21	CELSR1 (ENSCPOG00000013977) #22	TRMU (ENSCPOG00000020780) #23	GTSE1 (ENSCPOG00000006055) #24	TTC38 (ENSCPOG00000006041) #25	PKDREJ (ENSCPOG00000022266) #26	CDPF1 (ENSCPOG00000026736) #27	PPARA (ENSCPOG00000001483) #28	WNT7B (ENSCPOG00000026817) #29
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	24									ENSHGLG00000035438	ENSHGLG00000017848	ENSHGLG00000042716	ENSHGLG00000044258 #17	ENSHGLG00000050709 #18	ENSHGLG00000041713 #18	CERK (ENSHGLG00000014012) #20	ENSHGLG00000041173 #22	TRMU (ENSHGLG00000009278) #23	TTC38 (ENSHGLG00000047462) #25	CDPF1 (ENSHGLG00000049236) #27	PPARA (ENSHGLG00000011724) #28	WNT7B (ENSHGLG00000048718) #29	ATXN10 (ENSHGLG00000017700) #30	RIBC2 (ENSHGLG00000037390) #32	SMC1B (ENSHGLG00000004900) #33	FAM118A (ENSHGLG00000006413) #34	UPK3A (ENSHGLG00000041654) #35	KIAA0930 (ENSHGLG00000010540) #36	NUP50 (ENSHGLG00000009303) #37	PHF21B (ENSHGLG00000011301)	ARHGAP8 (ENSHGLG00000015769)	PRR5 (ENSHGLG00000040192)