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Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00950000182892.a.a.b #22
Common shrew	MODERN SPECIES	12665																NFE2L2 (ENSSARG00000010915) #22
Hedgehog	MODERN SPECIES	11801																NFE2L2 (ENSEEUG00000011243) #22
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT01100000263532.A.a.a.b.b.a.b	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.b	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.a	ENSGT00900000143154	ENSGT01100000263532.C.c.b	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010116	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT00390000001859	ENSGT00940000154298.a.a	ENSGT00940000156582
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT01100000263532.A.a.a.b.b.a.b	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.b	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.a	ENSGT00900000143154	ENSGT01100000263532.C.c.b	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010116	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT00390000001859	ENSGT00940000154298.a.a	ENSGT00940000156582
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.b	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.a	ENSGT00900000143154	ENSGT01100000263532.C.c.b	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010116.fc.b	ENSGT00390000010116.fc.a	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT00390000001859	ENSGT00940000154298.a.a	ENSGT00940000156582
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.b	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.a	ENSGT00900000143154	ENSGT01100000263532.C.c.b	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010116.fc.b	ENSGT00390000010116.fc.a	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT00390000001859	ENSGT00940000154298.a.a	ENSGT00940000156582
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT01100000263532.A.a.a.b.b.a.a	ENSGT01100000263532.A.a.a.b.b.a.b	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.b	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.a	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010116.fc.b	ENSGT00390000010116.fc.a	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a.hb.a	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT00390000001859	ENSGT00940000154298.a.a	ENSGT00940000156582
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT01100000263523.A	ENSGT01100000263532.A.a.a.b.b.a.a	ENSGT01100000263532.A.a.a.b.b.a.b	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.a	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010116.fc.b	ENSGT00390000010116.fc.a	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a.hb.b	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a.hb.a	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT00390000001859	ENSGT00940000154298.a.a
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT01100000263523.A	ENSGT01100000263532.A.a.a.b.b.a.a	ENSGT01100000263532.A.a.a.b.b.a.b	ENSGT01100000263523.L	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010116.fc.b	ENSGT00390000010116.fc.a	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a.hb.b	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a.hb.a	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT00390000001859	ENSGT00940000154298.a.a
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT01100000263523.A	ENSGT01100000263532.A.a.a.b.b.a.a	ENSGT01100000263532.A.a.a.b.b.a.b	ENSGT01100000263523.L	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010116.fc.b	ENSGT00390000010116.fc.a	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a.hb.a	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT00390000001859	ENSGT00390000008142.t	ENSGT00940000154298.a.a
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT01100000263532.A.a.a.b.b.a.a	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.a	ENSGT00900000143154	ENSGT01100000263523.A	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010116.fc.b	ENSGT00390000010116.fc.a	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a.hb.b	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT00390000001859	ENSGT00950000182834.A.a.a.t	ENSGT00390000008142.t
Narwhal	MODERN SPECIES	302	ENSMMNG00015008454	TTN (ENSMMNG00015009913)	PLEKHA3 (ENSMMNG00015013955)	ENSMMNG00015013983	FKBP7 (ENSMMNG00015013990)	PJVK (ENSMMNG00015014003)	PRKRA (ENSMMNG00015014019)	OSBPL6 (ENSMMNG00015014111)	RBM45 (ENSMMNG00015014220)	ENSMMNG00015014238	PDE11A (ENSMMNG00015014260)	ENSMMNG00015014296	ENSMMNG00015007201	ENSMMNG00015007232	AGPS (ENSMMNG00015007255)	NFE2L2 (ENSMMNG00015007306) #22	ENSMMNG00015007339	MTX2 (ENSMMNG00015007394)	HOXD1 (ENSMMNG00015007440)	HOXD3 (ENSMMNG00015007460)	HOXD4 (ENSMMNG00015007477)	HOXD8 (ENSMMNG00015007526)	HOXD9 (ENSMMNG00015007556)	HOXD10 (ENSMMNG00015007571)	ENSMMNG00015007589	HOXD12 (ENSMMNG00015007598)	HOXD13 (ENSMMNG00015007609)	EVX2 (ENSMMNG00015007622)	LNPK (ENSMMNG00015007647)	ENSMMNG00015007684	ENSMMNG00015007699
Beluga whale	MODERN SPECIES	84	ENSDLEG00000009909	ENSDLEG00000009890	ENSDLEG00000009862	ENSDLEG00000009851	PLEKHA3 (ENSDLEG00000009842)	FKBP7 (ENSDLEG00000009831)	PJVK (ENSDLEG00000009801)	PRKRA (ENSDLEG00000009768)	OSBPL6 (ENSDLEG00000009570)	RBM45 (ENSDLEG00000009507)	ENSDLEG00000009493	ENSDLEG00000009481	ENSDLEG00000009469	ENSDLEG00000009463	AGPS (ENSDLEG00000009335)	NFE2L2 (ENSDLEG00000009266) #22	ENSDLEG00000009227	MTX2 (ENSDLEG00000009199)	HOXD1 (ENSDLEG00000009181)	HOXD3 (ENSDLEG00000009171)	HOXD4 (ENSDLEG00000009166)	HOXD8 (ENSDLEG00000009104)	HOXD9 (ENSDLEG00000009091)	HOXD10 (ENSDLEG00000009076)	ENSDLEG00000009052	HOXD12 (ENSDLEG00000009038)	HOXD13 (ENSDLEG00000009014)	EVX2 (ENSDLEG00000008943)	LNPK (ENSDLEG00000008885)	ENSDLEG00000008854	ENSDLEG00000008837
Vaquita	MODERN SPECIES	18	ENSPSNG00000006659	ENSPSNG00000006702	ENSPSNG00000006762	PLEKHA3 (ENSPSNG00000006784)	ENSPSNG00000006805	FKBP7 (ENSPSNG00000006918)	PJVK (ENSPSNG00000006966)	PRKRA (ENSPSNG00000007030)	OSBPL6 (ENSPSNG00000007225)	RBM45 (ENSPSNG00000007527)	ENSPSNG00000007564	PDE11A (ENSPSNG00000007618)	ENSPSNG00000007902	ENSPSNG00000005284	AGPS (ENSPSNG00000005315)	NFE2L2 (ENSPSNG00000005384) #22	ENSPSNG00000005439	MTX2 (ENSPSNG00000005488)	HOXD1 (ENSPSNG00000005524)	HOXD3 (ENSPSNG00000005539)	HOXD4 (ENSPSNG00000005556)	HOXD8 (ENSPSNG00000005602)	HOXD9 (ENSPSNG00000005639)	HOXD10 (ENSPSNG00000005654)	HOXD11 (ENSPSNG00000005666)	HOXD12 (ENSPSNG00000005695)	HOXD13 (ENSPSNG00000005715)	EVX2 (ENSPSNG00000005734)	LNPK (ENSPSNG00000005786)	ENSPSNG00000005846	ENSPSNG00000005869
Dolphin	MODERN SPECIES	4341																NFE2L2 (ENSTTRG00000014247) #22	ENSTTRG00000014225
Sperm whale	MODERN SPECIES	11	ENSPCTG00005009719	ENSPCTG00005009648	ENSPCTG00005009577	TTN (ENSPCTG00005004468)	PLEKHA3 (ENSPCTG00005003988)	FKBP7 (ENSPCTG00005003977)	PRKRA (ENSPCTG00005003951)	PJVK (ENSPCTG00005003934)	OSBPL6 (ENSPCTG00005003757)	RBM45 (ENSPCTG00005003694)	ENSPCTG00005003686	PDE11A (ENSPCTG00005003616)	ENSPCTG00005003599	ENSPCTG00005003590	AGPS (ENSPCTG00005003530)	NFE2L2 (ENSPCTG00005003486) #22	ENSPCTG00005003466	MTX2 (ENSPCTG00005007528)	HOXD1 (ENSPCTG00005007516)	HOXD3 (ENSPCTG00005007508)	HOXD4 (ENSPCTG00005007493)	HOXD8 (ENSPCTG00005007418)	HOXD9 (ENSPCTG00005007399)	HOXD10 (ENSPCTG00005007393)	ENSPCTG00005007381	HOXD12 (ENSPCTG00005007367)	HOXD13 (ENSPCTG00005007354)	EVX2 (ENSPCTG00005007330)	LNPK (ENSPCTG00005007293)	ATP5MC3 (ENSPCTG00005007202)	ATF2 (ENSPCTG00005007004)
Blue whale	MODERN SPECIES	18	ENSBMSG00010006553	ENSBMSG00010006534	ENSBMSG00010006522	ENSBMSG00010006506	FKBP7 (ENSBMSG00010006490)	PJVK (ENSBMSG00010006471)	PRKRA (ENSBMSG00010006442)	OSBPL6 (ENSBMSG00010006347)	RBM45 (ENSBMSG00010006279)	ENSBMSG00010006266	ENSBMSG00010006255	PDE11A (ENSBMSG00010006216)	ENSBMSG00010006199	ENSBMSG00010006193	AGPS (ENSBMSG00010006175)	NFE2L2 (ENSBMSG00010006157) #22	ENSBMSG00010006149	MTX2 (ENSBMSG00010006100)	HOXD1 (ENSBMSG00010006055)	HOXD3 (ENSBMSG00010006046)	HOXD4 (ENSBMSG00010006036)	HOXD8 (ENSBMSG00010006022)	HOXD9 (ENSBMSG00010006014)	HOXD10 (ENSBMSG00010006002)	HOXD11 (ENSBMSG00010005993)	HOXD12 (ENSBMSG00010005987)	HOXD13 (ENSBMSG00010005980)	EVX2 (ENSBMSG00010005974)	LNPK (ENSBMSG00010005955)	ATP5MC3 (ENSBMSG00010005937)	ATF2 (ENSBMSG00010005883)
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.b	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.a	ENSGT00900000143154	ENSGT01100000263532.C.c.b	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010116.fc.b	ENSGT00390000010116.fc.a	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT00390000001859	ENSGT00940000154298.a.a	ENSGT00940000156582
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.b	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.a	ENSGT00900000143154	ENSGT01100000263532.C.c.b	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010116.fc.b	ENSGT00390000010116.fc.a	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT00390000001859	ENSGT00940000154298.a.a	ENSGT00940000156582
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.b	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.a	ENSGT00900000143154	ENSGT01100000263532.C.c.b	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010116.fc.b	ENSGT00390000010116.fc.a	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT00390000001859	ENSGT00940000154298.a.a	ENSGT00940000156582
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.a	ENSGT00900000143154	ENSGT01100000263532.C.c.b	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00940000162151	ENSGT01100000263474.a.b.b.f.g.a.b	ENSGT00390000010116.fc.b	ENSGT00390000010116.fc.a	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b.tb.a	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT00390000001859	ENSGT00940000153299.c.a.b.u.a	ENSGT00940000154298.a.a
Bos	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00900000143154	ENSGT01100000263532.C.c.b	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00940000162151	ENSGT01100000263474.a.b.b.f.g.a.b	ENSGT00390000010116.fc.b	ENSGT01100000263480.a.a.a.b.a.a.a.a.b.a	ENSGT00390000010116.fc.a	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b.tb.b	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b.tb.a	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT00390000001859	ENSGT00940000153299.c.a.b.u.a
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.a	ENSGT00900000143154	ENSGT01100000263532.C.c.b	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010116.fc.b	ENSGT01100000263480.a.a.a.b.a.a.a.a.b.a	ENSGT00390000010116.fc.a	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b.tb.a	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT00390000001859	ENSGT00940000153299.c.a.b.u.a	ENSGT00940000154298.a.a
Wild yak	MODERN SPECIES	1208								OSBPL6 (ENSBMUG00000024336)	ENSBMUG00000024374	RBM45 (ENSBMUG00000024394)	PDE11A (ENSBMUG00000024453)	ENSBMUG00000024477	ENSBMUG00000024480	ENSBMUG00000024488	AGPS (ENSBMUG00000024509)	NFE2L2 (ENSBMUG00000024519) #22	ENSBMUG00000024527
Domestic yak	MODERN SPECIES	11	PLEKHA3 (ENSBGRG00000000848)	FKBP7 (ENSBGRG00000000806)	PJVK (ENSBGRG00000000796)	PRKRA (ENSBGRG00000000775)	OSBPL6 (ENSBGRG00000000437)	ENSBGRG00000000374	RBM45 (ENSBGRG00000000341)	ENSBGRG00000000328	ENSBGRG00000000319	ENSBGRG00000000317	PDE11A (ENSBGRG00000000288)	ENSBGRG00000000270	ENSBGRG00000000264	ENSBGRG00000000256	AGPS (ENSBGRG00000000237)	NFE2L2 (ENSBGRG00000000213) #22	ENSBGRG00000000202	MTX2 (ENSBGRG00000017363)	HOXD1 (ENSBGRG00000017303)	HOXD3 (ENSBGRG00000017255)	ENSBGRG00000017167	HOXD8 (ENSBGRG00000017045)	HOXD9 (ENSBGRG00000017014)	HOXD10 (ENSBGRG00000016979)	HOXD11 (ENSBGRG00000016923)	HOXD12 (ENSBGRG00000016890)	HOXD13 (ENSBGRG00000016836)	EVX2 (ENSBGRG00000016780)	LNPK (ENSBGRG00000016182)	ENSBGRG00000016132	ATP5MC3 (ENSBGRG00000016024)
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00900000143154	ENSGT01100000263532.C.c.b	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00940000162151	ENSGT01100000263474.a.b.b.f.g.a.b	ENSGT00390000010116.fc.b	ENSGT01100000263480.a.a.a.b.a.a.a.a.b.a	ENSGT00390000010116.fc.a	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b.tb.b	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT01030000234916.g.b	ENSGT00390000001859	ENSGT00940000154298.a.a
Cow	MODERN SPECIES	11	ENSBTAG00000053974	ENSBTAG00000052348	ENSBTAG00000052709	PLEKHA3 (ENSBTAG00000001098)	FKBP7 (ENSBTAG00000001097)	PJVK (ENSBTAG00000033254)	PRKRA (ENSBTAG00000001096)	OSBPL6 (ENSBTAG00000014405)	RBM45 (ENSBTAG00000006168)	CYCT (ENSBTAG00000039522)	PDE11A (ENSBTAG00000016396)	ENSBTAG00000049860	TTC30A (ENSBTAG00000027694)	TTC30B (ENSBTAG00000027696)	AGPS (ENSBTAG00000009897)	NFE2L2 (ENSBTAG00000019255) #22	HNRNPA3 (ENSBTAG00000021580)	MTX2 (ENSBTAG00000006693)	HOXD1 (ENSBTAG00000015840)	HOXD3 (ENSBTAG00000004835)	HOXD4 (ENSBTAG00000039581)	HOXD8 (ENSBTAG00000049845)	HOXD9 (ENSBTAG00000016033)	HOXD10 (ENSBTAG00000016030)	HOXD11 (ENSBTAG00000033330)	HOXD12 (ENSBTAG00000004314)	HOXD13 (ENSBTAG00000004313)	EVX2 (ENSBTAG00000049537)	ENSBTAG00000002009	ENSBTAG00000050237	LNPK (ENSBTAG00000018061)
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	11	ENSBIXG00005029567	ENSBIXG00005029587	ENSBIXG00005029747	PLEKHA3 (ENSBIXG00005029758)	FKBP7 (ENSBIXG00005029776)	PJVK (ENSBIXG00005029785)	PRKRA (ENSBIXG00005029821)	OSBPL6 (ENSBIXG00005029906)	RBM45 (ENSBIXG00005030103)	ENSBIXG00005030117	PDE11A (ENSBIXG00005030175)	ENSBIXG00005030242	ENSBIXG00005030245	ENSBIXG00005030257	AGPS (ENSBIXG00005030278)	NFE2L2 (ENSBIXG00005030317) #22	HNRNPA3 (ENSBIXG00005030333)	ENSBIXG00005030352	ENSBIXG00005030356	MTX2 (ENSBIXG00005030400)	HOXD1 (ENSBIXG00005030413)	HOXD3 (ENSBIXG00005030419)	HOXD8 (ENSBIXG00005030431)	HOXD9 (ENSBIXG00005030437)	HOXD10 (ENSBIXG00005005289)	HOXD11 (ENSBIXG00005001515)	HOXD12 (ENSBIXG00005001517)	HOXD13 (ENSBIXG00005001519)	EVX2 (ENSBIXG00005005288)	ENSBIXG00005029246	ENSBIXG00005029245
American bison	MODERN SPECIES	3320	ENSBBBG00000018488	ENSBBBG00000018480	ENSBBBG00000018475	PLEKHA3 (ENSBBBG00000004536)	FKBP7 (ENSBBBG00000018464)	PJVK (ENSBBBG00000004525)	PRKRA (ENSBBBG00000018426)	OSBPL6 (ENSBBBG00000018398)	RBM45 (ENSBBBG00000004406)	ENSBBBG00000017912	PDE11A (ENSBBBG00000017894)	ENSBBBG00000017839	ENSBBBG00000017832	ENSBBBG00000007701	AGPS (ENSBBBG00000017817)	NFE2L2 (ENSBBBG00000017780) #22	ENSBBBG00000007269	MTX2 (ENSBBBG00000017733)	ENSBBBG00000017700	ENSBBBG00000004376	HOXD1 (ENSBBBG00000017690)	HOXD3 (ENSBBBG00000017682)	HOXD4 (ENSBBBG00000017669)	HOXD8 (ENSBBBG00000017657)	HOXD9 (ENSBBBG00000017650)	HOXD10 (ENSBBBG00000006962)	HOXD12 (ENSBBBG00000017645)	HOXD13 (ENSBBBG00000017641)	ENSBBBG00000017638	ENSBBBG00000017634	LNPK (ENSBBBG00000017627)
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT01100000263523.A	ENSGT01100000263532.A.a.a.b.b.a.a	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.a	ENSGT01100000263532.C.c.b	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010116.fc.b	ENSGT00390000010116.fc.a	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT00390000001859	ENSGT00940000154298.a.a	ENSGT00940000156582
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	11	ENSOARG00020020356	ENSOARG00020020425	ENSOARG00020020485	ENSOARG00020020514	PLEKHA3 (ENSOARG00020020544)	FKBP7 (ENSOARG00020020704)	PJVK (ENSOARG00020020753)	PRKRA (ENSOARG00020020855)	OSBPL6 (ENSOARG00020020986)	RBM45 (ENSOARG00020022028)	ENSOARG00020022078	PDE11A (ENSOARG00020022115)	ENSOARG00020022364	ENSOARG00020022373	AGPS (ENSOARG00020022410)	NFE2L2 (ENSOARG00020022726) #22	HNRNPA3 (ENSOARG00020000123)	MTX2 (ENSOARG00020000188)	HOXD1 (ENSOARG00020000237)	HOXD3 (ENSOARG00020000257)	HOXD4 (ENSOARG00020000275)	HOXD8 (ENSOARG00020000297)	HOXD9 (ENSOARG00020000321)	HOXD10 (ENSOARG00020000330)	hoxd11 (ENSOARG00020000346)	HOXD12 (ENSOARG00020000357)	HOXD13 (ENSOARG00020000373)	EVX2 (ENSOARG00020000381)	ENSOARG00020000394	LNPK (ENSOARG00020000416)	ATP5MC3 (ENSOARG00020000538)
Goat	MODERN SPECIES	11	ENSCHIG00000016308	ENSCHIG00000027063	ENSCHIG00000018472	PLEKHA3 (ENSCHIG00000019515)	FKBP7 (ENSCHIG00000017480)	PJVK (ENSCHIG00000013011)	PRKRA (ENSCHIG00000015333)	OSBPL6 (ENSCHIG00000008898)	ENSCHIG00000017164	RBM45 (ENSCHIG00000010687)	ENSCHIG00000026156	PDE11A (ENSCHIG00000016852)	ENSCHIG00000011716	ENSCHIG00000011750	AGPS (ENSCHIG00000015256)	NFE2L2 (ENSCHIG00000026055) #22	ENSCHIG00000015430	MTX2 (ENSCHIG00000008892)	HOXD1 (ENSCHIG00000017515)	HOXD3 (ENSCHIG00000011624)	HOXD4 (ENSCHIG00000019702)	HOXD8 (ENSCHIG00000013371)	HOXD9 (ENSCHIG00000023245)	HOXD10 (ENSCHIG00000011771)	HOXD11 (ENSCHIG00000026087)	HOXD12 (ENSCHIG00000014734)	HOXD13 (ENSCHIG00000009994)	EVX2 (ENSCHIG00000026644)	ENSCHIG00000004992	ENSCHIG00000025787	LNPK (ENSCHIG00000012313)
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	342								OSBPL6 (ENSMMSG00000006219)	RBM45 (ENSMMSG00000006596)	ENSMMSG00000006624	PDE11A (ENSMMSG00000006654)	ENSMMSG00000006819	ENSMMSG00000006854	AGPS (ENSMMSG00000006894)	ENSMMSG00000006963	NFE2L2 (ENSMMSG00000006992) #22	ENSMMSG00000007068	MTX2 (ENSMMSG00000007226)	HOXD1 (ENSMMSG00000007322)	HOXD3 (ENSMMSG00000007343)	HOXD4 (ENSMMSG00000007365)	HOXD8 (ENSMMSG00000007407)	HOXD9 (ENSMMSG00000007480)	HOXD10 (ENSMMSG00000007495)	HOXD11 (ENSMMSG00000007513)	HOXD12 (ENSMMSG00000007530)	HOXD13 (ENSMMSG00000007541)	EVX2 (ENSMMSG00000007555)	LNPK (ENSMMSG00000007582)	ENSMMSG00000007642	ATF2 (ENSMMSG00000007713)
Yarkand deer	MODERN SPECIES	26	ENSCHYG00000023401	ENSCHYG00000023464	ENSCHYG00000023539	PLEKHA3 (ENSCHYG00000023579)	FKBP7 (ENSCHYG00000023614)	PJVK (ENSCHYG00000023643)	PRKRA (ENSCHYG00000023726)	OSBPL6 (ENSCHYG00000023926)	RBM45 (ENSCHYG00000024364)	ENSCHYG00000024431	ENSCHYG00000024445	PDE11A (ENSCHYG00000024466)	ENSCHYG00000024550	ENSCHYG00000024559	AGPS (ENSCHYG00000024578)	NFE2L2 (ENSCHYG00000024719) #22	ENSCHYG00000015038	ENSCHYG00000015305	MTX2 (ENSCHYG00000015392)	HOXD1 (ENSCHYG00000015562)	HOXD3 (ENSCHYG00000015650)	HOXD4 (ENSCHYG00000015683)	HOXD8 (ENSCHYG00000015741)	HOXD9 (ENSCHYG00000015808)	HOXD10 (ENSCHYG00000015831)	ENSCHYG00000015846	HOXD12 (ENSCHYG00000015954)	HOXD13 (ENSCHYG00000015985)	LNPK (ENSCHYG00000016125)	ENSCHYG00000016391	ENSCHYG00000016417
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00730000111148	ENSGT00440000038972	ENSGT01100000263523.A	ENSGT01100000263532.A.a.a.b.b.a.a	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.b	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.a	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010116.fc.b	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT00390000001859	ENSGT00940000154298.a.a	ENSGT00940000156582	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.a
Alpaca	MODERN SPECIES	3699												PDE11A (ENSVPAG00000005129)	ENSVPAG00000005128	ENSVPAG00000005127	AGPS (ENSVPAG00000005122)	NFE2L2 (ENSVPAG00000005117) #22
Arabian camel	MODERN SPECIES	31	ENSCDRG00005005297	ENSCDRG00005005276	ENSCDRG00005005255	TTN (ENSCDRG00005003286)	PLEKHA3 (ENSCDRG00005003046)	FKBP7 (ENSCDRG00005003026)	PJVK (ENSCDRG00005003020)	PRKRA (ENSCDRG00005002991)	ENSCDRG00005002982	OSBPL6 (ENSCDRG00005002764)	RBM45 (ENSCDRG00005002693)	PDE11A (ENSCDRG00005002676)	ENSCDRG00005002663	ENSCDRG00005002654	AGPS (ENSCDRG00005002612)	NFE2L2 (ENSCDRG00005002588) #22	HNRNPA3 (ENSCDRG00005002567)	MTX2 (ENSCDRG00005002532)	HOXD3 (ENSCDRG00005002512)	HOXD4 (ENSCDRG00005002497)	HOXD8 (ENSCDRG00005002477)	HOXD9 (ENSCDRG00005002467)	HOXD10 (ENSCDRG00005002456)	HOXD11 (ENSCDRG00005002440)	HOXD12 (ENSCDRG00005002432)	HOXD13 (ENSCDRG00005002411)	EVX2 (ENSCDRG00005002358)	LNPK (ENSCDRG00005002325)	ATP5MC3 (ENSCDRG00005002307)	ATF2 (ENSCDRG00005002159)	CHN1 (ENSCDRG00005002091)
Suina	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00440000038972	ENSGT01100000263523.A	ENSGT01100000263532.A.a.a.b.b.a.a	ENSGT01100000263532.A.a.a.b.b.a.b	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.b	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.a	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT00390000010491.kb.a	ENSGT00390000001859	ENSGT00940000154298.a.a
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	88	SESTD1 (ENSCWAG00000004249)	ENSCWAG00000004196	ENSCWAG00000004147	ENSCWAG00000004104	ENSCWAG00000004059	TTN (ENSCWAG00000002022)	PLEKHA3 (ENSCWAG00000001517)	FKBP7 (ENSCWAG00000001502)	PJVK (ENSCWAG00000001480)	PRKRA (ENSCWAG00000001459)	OSBPL6 (ENSCWAG00000001227)	RBM45 (ENSCWAG00000001104)	ENSCWAG00000001084	PDE11A (ENSCWAG00000001000)	AGPS (ENSCWAG00000000957)	NFE2L2 (ENSCWAG00000000916) #22	HNRNPA3 (ENSCWAG00000000880)	MTX2 (ENSCWAG00000000848)	HOXD1 (ENSCWAG00000000831)	HOXD3 (ENSCWAG00000000815)	HOXD4 (ENSCWAG00000000799)	HOXD8 (ENSCWAG00000000766)	HOXD9 (ENSCWAG00000000750)	HOXD10 (ENSCWAG00000000737)	HOXD11 (ENSCWAG00000000728)	HOXD12 (ENSCWAG00000000716)	HOXD13 (ENSCWAG00000000704)	EVX2 (ENSCWAG00000000686)	ENSCWAG00000000677	LNPK (ENSCWAG00000000637)	ENSCWAG00000000620
Pig	MODERN SPECIES	6	ENSSSCG00000061723	ENSSSCG00000042430	ENSSSCG00000053021	ENSSSCG00000034677	ENSSSCG00000038561	ENSSSCG00000036052	PLEKHA3 (ENSSSCG00000049025)	FKBP7 (ENSSSCG00000015999)	PJVK (ENSSSCG00000015998)	PRKRA (ENSSSCG00000038254)	OSBPL6 (ENSSSCG00000023133)	RBM45 (ENSSSCG00000015996)	ENSSSCG00000047774	PDE11A (ENSSSCG00000038903)	AGPS (ENSSSCG00000023983)	NFE2L2 (ENSSSCG00000015987) #22	ENSSSCG00000015988	MTX2 (ENSSSCG00000022222)	HOXD1 (ENSSSCG00000015986)	HOXD3 (ENSSSCG00000015985)	HOXD4 (ENSSSCG00000015984)	HOXD8 (ENSSSCG00000040349)	HOXD9 (ENSSSCG00000015982)	HOXD10 (ENSSSCG00000015981)	HOXD11 (ENSSSCG00000034741)	HOXD12 (ENSSSCG00000015980)	HOXD13 (ENSSSCG00000057890)	EVX2 (ENSSSCG00000023146)	ENSSSCG00000053760	ENSSSCG00000039002	LNPK (ENSSSCG00000015976)
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT01100000263532.A.a.a.b.b.a.b	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.b	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.a	ENSGT00900000143154	ENSGT01100000263532.C.c.b	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010116	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT00390000001859	ENSGT00940000154298.a.a	ENSGT00940000156582
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000153458.B	ENSGT00940000155611.s	ENSGT00730000111148	ENSGT00440000038972	ENSGT01100000263523.A	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010116	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT00390000001859	ENSGT00940000154298.a.a	ENSGT00940000156582
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000153458.B	ENSGT00940000155611.s	ENSGT00730000111148	ENSGT00440000038972	ENSGT01100000263523.A	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010116	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT00390000001859	ENSGT00940000154298.a.a	ENSGT00940000156582
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00730000111148	ENSGT00440000038972	ENSGT01100000263523.A	ENSGT01100000263532.A.a.a.b.b.b	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.b	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010116	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.a	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT00390000001859	ENSGT00940000154298.a.a	ENSGT00940000156582
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	26	ZNF385B (ENSRFEG00010018087)	SESTD1 (ENSRFEG00010018265)	CCDC141 (ENSRFEG00010018317)	ENSRFEG00010020094	PLEKHA3 (ENSRFEG00010022147)	FKBP7 (ENSRFEG00010022148)	DFNB59 (ENSRFEG00010022149)	PRKRA (ENSRFEG00010022150)	OSBPL6 (ENSRFEG00010022151)	RBM45 (ENSRFEG00010022152)	ENSRFEG00010022153	PDE11A (ENSRFEG00010022154)	ENSRFEG00010022156	ENSRFEG00010022157	ENSRFEG00010022158	NFE2L2 (ENSRFEG00010022160) #22	ENSRFEG00010022161	MTX2 (ENSRFEG00010022163)	HOXD1 (ENSRFEG00010022164)	HOXD3 (ENSRFEG00010022165)	HOXD4 (ENSRFEG00010022166)	HOXD8 (ENSRFEG00010022168)	HOXD9 (ENSRFEG00010022169)	HOXD10 (ENSRFEG00010022170)	HOXD11 (ENSRFEG00010022171)	HOXD12 (ENSRFEG00010022172)	HOXD13 (ENSRFEG00010022173)	EVX2 (ENSRFEG00010000230)	LNPK (ENSRFEG00010000270)	ENSRFEG00010000353	ATF2 (ENSRFEG00010000479)
Microbat	MODERN SPECIES	942	TTN (ENSMLUG00000005832)	ENSMLUG00000024664	PLEKHA3 (ENSMLUG00000005823)	FKBP7 (ENSMLUG00000005816)	PJVK (ENSMLUG00000005814)	ENSMLUG00000005810	ENSMLUG00000022423	OSBPL6 (ENSMLUG00000005787)	RBM45 (ENSMLUG00000005782)	PDE11A (ENSMLUG00000005135)	ENSMLUG00000028755	ENSMLUG00000005133	ENSMLUG00000005126	AGPS (ENSMLUG00000005113)	ENSMLUG00000025480	NFE2L2 (ENSMLUG00000003909) #22	ENSMLUG00000003906	MTX2 (ENSMLUG00000015966)	ENSMLUG00000029447	HOXD3 (ENSMLUG00000012510)	HOXD4 (ENSMLUG00000012508)	HOXD8 (ENSMLUG00000028864)	HOXD10 (ENSMLUG00000007048)	HOXD11 (ENSMLUG00000007030)	HOXD12 (ENSMLUG00000007009)	HOXD13 (ENSMLUG00000006997)	EVX2 (ENSMLUG00000006989)	ENSMLUG00000022478	LNPK (ENSMLUG00000006972)	ENSMLUG00000012822	ATF2 (ENSMLUG00000015718)
Megabat	MODERN SPECIES	2191											RBM45 (ENSPVAG00000010390)	PDE11A (ENSPVAG00000010389)	ENSPVAG00000010388	ENSPVAG00000010387	AGPS (ENSPVAG00000010384)	NFE2L2 (ENSPVAG00000010382) #22	ENSPVAG00000010380
Equus	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000153458.B	ENSGT00940000155611.s	ENSGT00730000111148	ENSGT00440000038972	ENSGT01100000263523.A	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010116	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT00390000005569.x.a.a.b	ENSGT00390000001859	ENSGT00940000154298.a.a
Donkey	MODERN SPECIES	24	CCDC141 (ENSEASG00005022349)	TTN (ENSEASG00005024097)	ENSEASG00005036015	ENSEASG00005024821	PLEKHA3 (ENSEASG00005022419)	FKBP7 (ENSEASG00005022426)	PJVK (ENSEASG00005022430)	PRKRA (ENSEASG00005022436)	OSBPL6 (ENSEASG00005022455)	RBM45 (ENSEASG00005022475)	ENSEASG00005026887	PDE11A (ENSEASG00005022489)	ENSEASG00005028303	AGPS (ENSEASG00005022514)	ENSEASG00005026944	NFE2L2 (ENSEASG00005028739) #22	HNRNPA3 (ENSEASG00005022530)	MTX2 (ENSEASG00005022537)	HOXD1 (ENSEASG00005030887)	HOXD3 (ENSEASG00005022544)	HOXD4 (ENSEASG00005024806)	HOXD8 (ENSEASG00005033905)	HOXD9 (ENSEASG00005023994)	HOXD10 (ENSEASG00005022552)	HOXD11 (ENSEASG00005030904)	HOXD12 (ENSEASG00005022555)	HOXD13 (ENSEASG00005029242)	EVX2 (ENSEASG00005022562)	ENSEASG00005022564	LNPK (ENSEASG00005022567)	ATP5MC3 (ENSEASG00005022573)
Horse	MODERN SPECIES	9	SESTD1 (ENSECAG00000011753)	CCDC141 (ENSECAG00000007805)	TTN (ENSECAG00000042020)	PLEKHA3 (ENSECAG00000010715)	FKBP7 (ENSECAG00000008092)	PJVK (ENSECAG00000007310)	PRKRA (ENSECAG00000024263)	OSBPL6 (ENSECAG00000020078)	RBM45 (ENSECAG00000017129)	CYCT (ENSECAG00000016170)	ENSECAG00000057854	PDE11A (ENSECAG00000004445)	ENSECAG00000000927	ENSECAG00000051775	AGPS (ENSECAG00000008695)	NFE2L2 (ENSECAG00000005675) #22	HNRNPA3 (ENSECAG00000059976)	MTX2 (ENSECAG00000022464)	HOXD1 (ENSECAG00000035437)	HOXD3 (ENSECAG00000022129)	HOXD4 (ENSECAG00000038429)	HOXD8 (ENSECAG00000021980)	HOXD9 (ENSECAG00000021845)	HOXD10 (ENSECAG00000020599)	HOXD11 (ENSECAG00000003045)	HOXD13 (ENSECAG00000020388)	EVX2 (ENSECAG00000019796)	ENSECAG00000043913	LNPK (ENSECAG00000008534)	ATP5MC3 (ENSECAG00000008514)	ATF2 (ENSECAG00000018723)
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT01100000263532.A.a.a.b.b.a.b	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.b	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.a	ENSGT00900000143154	ENSGT01100000263532.C.c.b	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010116	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT00390000001859	ENSGT00940000154298.a.a	ENSGT00940000156582
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Panthera	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00730000111148	ENSGT00440000038972	ENSGT01100000263523.A	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.a	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010116.wb	ENSGT00390000010116.vb	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT00390000001859	ENSGT00940000154298.a.a	ENSGT00940000156582
Tiger	MODERN SPECIES	43																NFE2L2 (ENSPTIG00000007874) #22	HNRNPA3 (ENSPTIG00000008598)	MTX2 (ENSPTIG00000011503)	ENSPTIG00000013485	HOXD4 (ENSPTIG00000015199)	ENSPTIG00000015581	ENSPTIG00000006835	HOXD10 (ENSPTIG00000015771)	HOXD13 (ENSPTIG00000016212)	LNPK (ENSPTIG00000016532)	ATP5MC3 (ENSPTIG00000016881)	ATF2 (ENSPTIG00000017517)	CHN1 (ENSPTIG00000006887)	CHRNA1 (ENSPTIG00000012090)	WIPF1 (ENSPTIG00000016801)	GPR155 (ENSPTIG00000018965)
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lion	MODERN SPECIES	8	CWC22 (ENSPLOG00000004688)	ZNF385B (ENSPLOG00000004710)	SESTD1 (ENSPLOG00000004731)	CCDC141 (ENSPLOG00000004750)	ENSPLOG00000007181	PLEKHA3 (ENSPLOG00000021313)	FKBP7 (ENSPLOG00000021347)	PJVK (ENSPLOG00000021374)	PRKRA (ENSPLOG00000021458)	OSBPL6 (ENSPLOG00000021601)	RBM45 (ENSPLOG00000021986)	PDE11A (ENSPLOG00000022012)	ENSPLOG00000022045	ENSPLOG00000022046	AGPS (ENSPLOG00000022055)	NFE2L2 (ENSPLOG00000022123) #22	ENSPLOG00000022134	MTX2 (ENSPLOG00000022148)	HOXD1 (ENSPLOG00000022171)	HOXD3 (ENSPLOG00000022176)	HOXD4 (ENSPLOG00000022180)	HOXD8 (ENSPLOG00000022192)	HOXD9 (ENSPLOG00000022195)	HOXD10 (ENSPLOG00000022198)	HOXD11 (ENSPLOG00000022202)	HOXD12 (ENSPLOG00000022207)	HOXD13 (ENSPLOG00000022213)	EVX2 (ENSPLOG00000022219)	LNPK (ENSPLOG00000022229)	ATP5MC3 (ENSPLOG00000022249)	ATF2 (ENSPLOG00000022276)
leopard	MODERN SPECIES	1	SESTD1 (ENSPPRG00000001855)	CCDC141 (ENSPPRG00000002134)	ENSPPRG00000003860	TTN (ENSPPRG00000010584)	PLEKHA3 (ENSPPRG00000011583)	FKBP7 (ENSPPRG00000011718)	PJVK (ENSPPRG00000011834)	ENSPPRG00000011982	OSBPL6 (ENSPPRG00000015447)	RBM45 (ENSPPRG00000017073)	ENSPPRG00000017216	PDE11A (ENSPPRG00000019135)	ENSPPRG00000021101	ENSPPRG00000021116	AGPS (ENSPPRG00000020328)	NFE2L2 (ENSPPRG00000020872) #22	ENSPPRG00000022322	MTX2 (ENSPPRG00000022475)	HOXD1 (ENSPPRG00000023009)	HOXD3 (ENSPPRG00000022847)	HOXD4 (ENSPPRG00000022845)	HOXD8 (ENSPPRG00000022672)	HOXD9 (ENSPPRG00000000084)	HOXD10 (ENSPPRG00000000139)	HOXD11 (ENSPPRG00000000168)	HOXD12 (ENSPPRG00000000300)	HOXD13 (ENSPPRG00000000349)	EVX2 (ENSPPRG00000000389)	LNPK (ENSPPRG00000000436)	ATP5MC3 (ENSPPRG00000000490)	ATF2 (ENSPPRG00000001271)
Cat	MODERN SPECIES	239	ENSFCAG00000049768	ENSFCAG00000046893	ENSFCAG00000050241	ENSFCAG00000032293	TTN (ENSFCAG00000046559)	PLEKHA3 (ENSFCAG00000025945)	FKBP7 (ENSFCAG00000012540)	PJVK (ENSFCAG00000018124)	PRKRA (ENSFCAG00000031042)	OSBPL6 (ENSFCAG00000012535)	RBM45 (ENSFCAG00000018793)	PDE11A (ENSFCAG00000022207)	ENSFCAG00000049217	ENSFCAG00000048732	AGPS (ENSFCAG00000022316)	NFE2L2 (ENSFCAG00000012147) #22	HNRNPA3 (ENSFCAG00000012146)	MTX2 (ENSFCAG00000030099)	HOXD1 (ENSFCAG00000042171)	HOXD3 (ENSFCAG00000022371)	HOXD4 (ENSFCAG00000045772)	HOXD8 (ENSFCAG00000034788)	HOXD9 (ENSFCAG00000035038)	HOXD10 (ENSFCAG00000006264)	HOXD11 (ENSFCAG00000030594)	HOXD12 (ENSFCAG00000044671)	HOXD13 (ENSFCAG00000030694)	EVX2 (ENSFCAG00000023892)	LNPK (ENSFCAG00000033171)	ATP5MC3 (ENSFCAG00000012719)	ATF2 (ENSFCAG00000027595)
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT01100000263532.A.a.a.b.b.a.b	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.b	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.a	ENSGT00900000143154	ENSGT01100000263532.C.c.b	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010116	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT00390000001859	ENSGT00940000154298.a.a	ENSGT00940000156582
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	45	ENSGT01100000263532.A.a.a.b.b.a.b	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.a	ENSGT01100000263523.B	ENSGT01100000263523.L	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010116.ub	ENSGT00390000010116.tb	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT00390000001859	ENSGT00940000154298.a.a.i	ENSGT00940000156582
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT01100000263532.A.a.a.b.b.a.a	ENSGT01100000263532.A.a.a.b.b.a.b	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.a	ENSGT01100000263523.L	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010116.ub	ENSGT00390000010116.tb	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT00390000001859	ENSGT00940000154298.a.a.i	ENSGT00940000156582
Dingo	MODERN SPECIES	339	ENSCAFG00020007149	ENSCAFG00020007141	ENSCAFG00020007129	ENSCAFG00020007118	ENSCAFG00020007110	PLEKHA3 (ENSCAFG00020007100)	FKBP7 (ENSCAFG00020007095)	PJVK (ENSCAFG00020007088)	ENSCAFG00020007071	OSBPL6 (ENSCAFG00020007025)	RBM45 (ENSCAFG00020007013)	PDE11A (ENSCAFG00020006966)	ENSCAFG00020006963	ENSCAFG00020006961	AGPS (ENSCAFG00020006351)	NFE2L2 (ENSCAFG00020006313) #22	ENSCAFG00020006299	MTX2 (ENSCAFG00020006273)	HOXD1 (ENSCAFG00020006270)	HOXD3 (ENSCAFG00020006263)	HOXD4 (ENSCAFG00020006256)	HOXD8 (ENSCAFG00020006244)	HOXD10 (ENSCAFG00020006239)	HOXD11 (ENSCAFG00020006229)	HOXD9 (ENSCAFG00020006227)	HOXD12 (ENSCAFG00020006216)	HOXD13 (ENSCAFG00020006212)	EVX2 (ENSCAFG00020006206)	LNPK (ENSCAFG00020006192)	ENSCAFG00020006176	ENSCAFG00020006151
Dog	MODERN SPECIES	29	CCDC141 (ENSCAFG00845025967)	ENSCAFG00845025823	ENSCAFG00845025741	ENSCAFG00845025563	TTN (ENSCAFG00845023220)	PLEKHA3 (ENSCAFG00845022559)	FKBP7 (ENSCAFG00845022485)	ENSCAFG00845022360	PJVK (ENSCAFG00845022256)	OSBPL6 (ENSCAFG00845021295)	RBM45 (ENSCAFG00845020808)	ENSCAFG00845020768	PDE11A (ENSCAFG00845020545)	TTC30A (ENSCAFG00845020493)	AGPS (ENSCAFG00845020190)	NFE2L2 (ENSCAFG00845020022) #22	HNRNPA3 (ENSCAFG00845019864)	MTX2 (ENSCAFG00845019381)	HOXD1 (ENSCAFG00845019313)	HOXD3 (ENSCAFG00845019275)	HOXD4 (ENSCAFG00845019072)	HOXD10 (ENSCAFG00845019028)	HOXD9 (ENSCAFG00845018856)	ENSCAFG00845018802	HOXD12 (ENSCAFG00845018775)	HOXD13 (ENSCAFG00845018741)	EVX2 (ENSCAFG00845018704)	LNPK (ENSCAFG00845018510)	ENSCAFG00845018368	ATP5MC3 (ENSCAFG00845018248)	ATF2 (ENSCAFG00845017708)
Red fox	MODERN SPECIES	15	ENSVVUG00000009921	ENSVVUG00000009932	ENSVVUG00000009947	ENSVVUG00000010016	PLEKHA3 (ENSVVUG00000010019)	FKBP7 (ENSVVUG00000010027)	PJVK (ENSVVUG00000010029)	PRKRA (ENSVVUG00000010032)	OSBPL6 (ENSVVUG00000010039)	RBM45 (ENSVVUG00000010078)	PDE11A (ENSVVUG00000010094)	ENSVVUG00000010109	AGPS (ENSVVUG00000010164)	ENSVVUG00000012634	ENSVVUG00000012637	NFE2L2 (ENSVVUG00000012641) #22	ENSVVUG00000012651	ENSVVUG00000012682	ENSVVUG00000012694	HOXD3 (ENSVVUG00000012700)	HOXD8 (ENSVVUG00000012714)	ENSVVUG00000012717	HOXD10 (ENSVVUG00000012722)	ENSVVUG00000012726	HOXD12 (ENSVVUG00000012731)	HOXD13 (ENSVVUG00000012734)	EVX2 (ENSVVUG00000012735)	LNPK (ENSVVUG00000012737)	ATP5MC3 (ENSVVUG00000012759)	ATF2 (ENSVVUG00000012774)	CHN1 (ENSVVUG00000012819)
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT01100000263523.A	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.b	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.a	ENSGT00900000143154	ENSGT01100000263532.C.c.b	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010116	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT00390000001859	ENSGT00940000154298.a.a	ENSGT00940000156582
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT01100000263523.A	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.b	ENSGT01100000263532.A.a.a.a.b.c.a	ENSGT00900000143154	ENSGT01100000263532.C.c.b	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010116	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.b	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT00390000001859	ENSGT00940000154298.a.a.m.b
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000005421	ENSGT00940000155611.s	ENSGT00730000111148	ENSGT00440000038972	ENSGT01100000263523.A	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010116	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.b	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT00390000001859	ENSGT00940000154298.a.a.m.b	ENSGT00940000156582
Polar bear	MODERN SPECIES	142	SESTD1 (ENSUMAG00000016664)	CCDC141 (ENSUMAG00000016645)	ENSUMAG00000016620	ENSUMAG00000016607	ENSUMAG00000016602	ENSUMAG00000016583	PLEKHA3 (ENSUMAG00000016580)	FKBP7 (ENSUMAG00000016577)	PJVK (ENSUMAG00000016572)	PRKRA (ENSUMAG00000016566)	OSBPL6 (ENSUMAG00000016519)	RBM45 (ENSUMAG00000016503)	PDE11A (ENSUMAG00000016414)	ENSUMAG00000016390	AGPS (ENSUMAG00000015781)	NFE2L2 (ENSUMAG00000015689) #22	ENSUMAG00000015686	MTX2 (ENSUMAG00000015662)	HOXD4 (ENSUMAG00000015658)	ENSUMAG00000015653	HOXD10 (ENSUMAG00000015650)	ENSUMAG00000015649	LNPK (ENSUMAG00000015613)	ATP5MC3 (ENSUMAG00000015579)	ATF2 (ENSUMAG00000015564)	CHN1 (ENSUMAG00000015511)	CHRNA1 (ENSUMAG00000015480)	ENSUMAG00000015473	ENSUMAG00000015461	GPR155 (ENSUMAG00000015425)	SCRN3 (ENSUMAG00000015422)
American black bear	MODERN SPECIES	390																NFE2L2 (ENSUAMG00000007100) #22
Giant Panda	MODERN SPECIES	11	ENSAMEG00000029059	ENSAMEG00000029868	ENSAMEG00000028448	ENSAMEG00000026332	ENSAMEG00000029399	ENSAMEG00000030666	PLEKHA3 (ENSAMEG00000000774)	FKBP7 (ENSAMEG00000027885)	PJVK (ENSAMEG00000000801)	PRKRA (ENSAMEG00000000803)	OSBPL6 (ENSAMEG00000000825)	RBM45 (ENSAMEG00000000896)	ENSAMEG00000023664	PDE11A (ENSAMEG00000000902)	AGPS (ENSAMEG00000011950)	NFE2L2 (ENSAMEG00000011937) #22	HNRNPA3 (ENSAMEG00000011920)	ENSAMEG00000019906	MTX2 (ENSAMEG00000001799)	HOXD1 (ENSAMEG00000028345)	HOXD3 (ENSAMEG00000026957)	HOXD4 (ENSAMEG00000025663)	HOXD8 (ENSAMEG00000023565)	HOXD9 (ENSAMEG00000029987)	HOXD10 (ENSAMEG00000001849)	ENSAMEG00000025193	HOXD12 (ENSAMEG00000023609)	HOXD13 (ENSAMEG00000001865)	EVX2 (ENSAMEG00000001868)	LNPK (ENSAMEG00000001869)	ATP5MC3 (ENSAMEG00000012367)
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000153458.B	ENSGT00940000155611.s	ENSGT00730000111148	ENSGT00440000038972	ENSGT01100000263523.A	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000159964	ENSGT00950000183140.a.b	ENSGT00940000157618	ENSGT00940000156791	ENSGT00680000100059	ENSGT00940000157883.a.b.e.a	ENSGT00940000162151	ENSGT00390000010116	ENSGT00940000156112	ENSGT00950000182892.a.a.b #22	ENSGT00940000153147.m.a.a.a.b.a.b	ENSGT00950000182919.C	ENSGT00940000161892	ENSGT00940000160027	ENSGT00940000157270	ENSGT00940000161653	ENSGT00940000161503	ENSGT00940000158266	ENSGT00940000161308	ENSGT00940000159938	ENSGT00940000161457	ENSGT00940000161025	ENSGT00390000001859	ENSGT00940000154298.a.a	ENSGT00940000156582
American mink	MODERN SPECIES	222	ENSNVIG00000006216	ENSNVIG00000006230	ENSNVIG00000006244	ENSNVIG00000006252	ENSNVIG00000006264	PLEKHA3 (ENSNVIG00000006265)	FKBP7 (ENSNVIG00000006271)	PJVK (ENSNVIG00000006274)	PRKRA (ENSNVIG00000006320)	OSBPL6 (ENSNVIG00000006388)	RBM45 (ENSNVIG00000006823)	ENSNVIG00000006839	PDE11A (ENSNVIG00000006854)	ENSNVIG00000006929	AGPS (ENSNVIG00000006950)	NFE2L2 (ENSNVIG00000006995) #22	HNRNPA3 (ENSNVIG00000007022)	MTX2 (ENSNVIG00000007075)	HOXD1 (ENSNVIG00000007113)	HOXD3 (ENSNVIG00000007128)	HOXD4 (ENSNVIG00000007138)	ENSNVIG00000007149	HOXD9 (ENSNVIG00000007158)	HOXD10 (ENSNVIG00000007162)	ENSNVIG00000007170	HOXD12 (ENSNVIG00000007175)	HOXD13 (ENSNVIG00000007186)	EVX2 (ENSNVIG00000007198)	LNPK (ENSNVIG00000007208)
Ferret	MODERN SPECIES	359														AGPS (ENSMPUG00000014173)	ENSMPUG00000014172	ENSMPUG00000014168 #22	ENSMPUG00000014103	ENSMPUG00000014101	MTX2 (ENSMPUG00000014094)	ENSMPUG00000014088	HOXD1 (ENSMPUG00000014084)	ENSMPUG00000014080	HOXD3 (ENSMPUG00000014072)	HOXD4 (ENSMPUG00000014070)	ENSMPUG00000014067	ENSMPUG00000014060	HOXD9 (ENSMPUG00000014053)	HOXD10 (ENSMPUG00000014049)	HOXD11 (ENSMPUG00000014029)	HOXD12 (ENSMPUG00000014025)	HOXD13 (ENSMPUG00000014022)