Vertebrata ANCESTRAL SPECIES 320 ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 171 ENSGT00940000161996 ENSGT00940000157440 ENSGT00390000016151 ENSGT00940000154486.b.a.a.b ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000158974 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00940000166277 ENSGT00940000171532 ENSGT00940000156462.B ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00950000185272 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00940000166277 ENSGT00940000171532 ENSGT00940000156462.B ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b ENSGT00940000165690 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349 ENSGT00940000163794 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 199 ENSGT00940000171532.a ENSGT00940000156462.A ENSGT00940000156462.C ENSGT00940000156462.B ENSGT00950000183138.a.b 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ENSGT00940000160314 ENSGT00940000160138 ENSGT00910000146979 ENSGT00940000157702 ENSGT00390000009002 ENSGT00390000011962 ENSGT00940000154079.a ENSGT00940000155091 ENSGT00950000182951.B ENSGT00950000182888.a.a.b ENSGT00940000153838.b ENSGT00950000183081.a.a.a ENSGT00390000005554 ENSGT01030000234614.B.b ENSGT00940000154793.C.ab.n #22 ENSGT00940000159902 ENSGT00940000159228 ENSGT00390000012166.o ENSGT00390000012166.p ENSGT00940000155130 ENSGT00940000159504 ENSGT00940000157906 ENSGT00940000157458 ENSGT00950000182869.e.a.b.sb.b.a.b.a ENSGT00500000044895 ENSGT00390000013003 ENSGT00940000157639 ENSGT01100000263517.b.d.m.b.b ENSGT00900000141021.a ENSGT00940000155601 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003140.A ENSGT00940000160314 ENSGT00940000160138 ENSGT00910000146979 ENSGT00940000157702 ENSGT00390000009002 ENSGT00390000011962 ENSGT00940000154079.a ENSGT00940000155091 ENSGT00950000182951.B ENSGT00950000182888.a.a.b ENSGT00940000153838.b ENSGT00950000183081.a.a.a ENSGT00390000005554 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#24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977 ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b.e.a ENSGT00390000016508 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349.m.a.d ENSGT00940000157773 ENSGT00940000156970 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1152 SPP2 (ENSRROG00000028127) ARL4C (ENSRROG00000029871) SH3BP4 (ENSRROG00000031461) ENSRROG00000034551 AGAP1 (ENSRROG00000036190) #22 GBX2 (ENSRROG00000035138) ASB18 (ENSRROG00000011244) #23 IQCA1 (ENSRROG00000039851) #24 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1007 ENSRBIG00000027870 ENSRBIG00000038698 UGT1A5 (ENSRBIG00000044273) MROH2A (ENSRBIG00000041109) HJURP (ENSRBIG00000037337) ENSRBIG00000038620 TRPM8 (ENSRBIG00000038917) SPP2 (ENSRBIG00000044900) SH3BP4 (ENSRBIG00000042776) ENSRBIG00000033516 AGAP1 (ENSRBIG00000029245) #22 GBX2 (ENSRBIG00000033693) ASB18 (ENSRBIG00000025110) #23 IQCA1 (ENSRBIG00000030471) #24 ACKR3 (ENSRBIG00000029465) COPS8 (ENSRBIG00000042564) COL6A3 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(ENSCSAG00000006363) SAG (ENSCSAG00000006351) DGKD (ENSCSAG00000006335) USP40 (ENSCSAG00000006323) ENSCSAG00000006311 UGT1A5 (ENSCSAG00000006310) ENSCSAG00000006305 MROH2A (ENSCSAG00000006299) HJURP (ENSCSAG00000006286) ENSCSAG00000018793 TRPM8 (ENSCSAG00000006269) SPP2 (ENSCSAG00000006237) ARL4C (ENSCSAG00000018795) SH3BP4 (ENSCSAG00000006235) AGAP1 (ENSCSAG00000006230) #22 ENSCSAG00000006225 GBX2 (ENSCSAG00000006222) ASB18 (ENSCSAG00000006216) #23 IQCA1 (ENSCSAG00000006204) #24 ACKR3 (ENSCSAG00000018797) ENSCSAG00000006174 COL6A3 (ENSCSAG00000006162) ENSCSAG00000018799 MLPH (ENSCSAG00000006137) PRLH (ENSCSAG00000006132) RAB17 (ENSCSAG00000006115) LRRFIP1 (ENSCSAG00000006108) RBM44 (ENSCSAG00000006098) RAMP1 (ENSCSAG00000006090) SCLY (ENSCSAG00000006088) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000156202.a ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a ENSGT00940000159041 ENSGT00940000157267 ENSGT00940000162757.e.a ENSGT00940000159677.d ENSGT00940000161309 ENSGT00390000005575 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ENSGT00910000147210 ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b.e.a ENSGT00390000016508 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349.m.a.c ENSGT00940000157773 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 525 NEU2 (ENSMNEG00000028399) INPP5D (ENSMNEG00000028451) ATG16L1 (ENSMNEG00000030017) SAG (ENSMNEG00000041266) DGKD (ENSMNEG00000044349) USP40 (ENSMNEG00000005725) ENSMNEG00000040610 UGT1A1 (ENSMNEG00000029757) MROH2A (ENSMNEG00000007484) HJURP (ENSMNEG00000040615) TRPM8 (ENSMNEG00000035109) SPP2 (ENSMNEG00000034902) ARL4C (ENSMNEG00000031224) SH3BP4 (ENSMNEG00000039881) ENSMNEG00000037145 AGAP1 (ENSMNEG00000028819) #22 GBX2 (ENSMNEG00000036580) ENSMNEG00000044531 ASB18 (ENSMNEG00000029927) #23 IQCA1 (ENSMNEG00000039533) #24 ACKR3 (ENSMNEG00000008100) COPS8 (ENSMNEG00000044205) ENSMNEG00000019117 COL6A3 (ENSMNEG00000036597) MLPH (ENSMNEG00000032948) PRLH (ENSMNEG00000028766) RAB17 (ENSMNEG00000030785) ENSMNEG00000034659 RBM44 (ENSMNEG00000042905) RAMP1 (ENSMNEG00000045433) UBE2F (ENSMNEG00000034534) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000166673.d.a.a.a.a.b ENSGT00940000162757.f ENSGT00940000159677.d ENSGT00940000161309 ENSGT00390000005575 ENSGT00950000182965.b.eb.a ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000161627.a.a.a.b.b.b.a.a.b.c.a.b ENSGT01080000257484.C ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00940000167556.b.b.a.b.a.a.a.b.b.b.a.a.b.a.a.a.a ENSGT01100000263539.b.a.a.a.a.a.a.a.b.b.b.a.b.a.a.a ENSGT00940000154793.C.`b.a ##22 ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977 ENSGT00910000147210 ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b.e.a ENSGT00390000016508 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349.m.a.c ENSGT00940000157773 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 3 UGT1A8 (ENSMFAG00000042349) ENSMFAG00000056186 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(ENSMMUG00000011516) SH3BP4 (ENSMMUG00000013808) ENSMMUG00000064161 ENSMMUG00000050921 AGAP1 (ENSMMUG00000009346) #22 GBX2 (ENSMMUG00000005911) IQCA1 (ENSMMUG00000017404) #24 ACKR3 (ENSMMUG00000060487) COPS8 (ENSMMUG00000021605) COL6A3 (ENSMMUG00000014049) MLPH (ENSMMUG00000012089) PRLH (ENSMMUG00000050714) RAB17 (ENSMMUG00000012094) LRRFIP1 (ENSMMUG00000003386) RBM44 (ENSMMUG00000008908) ENSMMUG00000063771 RAMP1 (ENSMMUG00000052071) UBE2F (ENSMMUG00000018482) SCLY (ENSMMUG00000018483) ESPNL (ENSMMUG00000018486) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000182944.B.b ENSGT00940000156202.a ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a ENSGT00940000159041 ENSGT00940000162757.e.b.b ENSGT00940000159677.d ENSGT00940000161309 ENSGT00390000005575 ENSGT00950000182965.b.eb.a ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00910000147209 ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977 ENSGT00910000147210 ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b.e.a ENSGT00390000016508 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349.m.a.c ENSGT00940000157773 Olive baboon MODERN SPECIES 1 ATG16L1 (ENSPANG00000024161) SAG (ENSPANG00000008753) DGKD (ENSPANG00000017057) ENSPANG00000025666 ENSPANG00000040648 UGT1A4 (ENSPANG00000018059) ENSPANG00000032206 ENSPANG00000030852 MROH2A (ENSPANG00000018452) HJURP (ENSPANG00000015124) TRPM8 (ENSPANG00000024755) SPP2 (ENSPANG00000019534) ARL4C (ENSPANG00000047505) SH3BP4 (ENSPANG00000005413) ENSPANG00000047269 AGAP1 (ENSPANG00000011986) #22 GBX2 (ENSPANG00000017536) ASB18 (ENSPANG00000005054) #23 IQCA1 (ENSPANG00000014732) #24 ACKR3 (ENSPANG00000007800) COPS8 (ENSPANG00000011780) COL6A3 (ENSPANG00000006369) MLPH (ENSPANG00000018132) PRLH (ENSPANG00000005973) ENSPANG00000041795 RAB17 (ENSPANG00000037034) ENSPANG00000017841 RBM44 (ENSPANG00000010319) RAMP1 (ENSPANG00000051374) UBE2F (ENSPANG00000005411) SCLY (ENSPANG00000000673) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182887.C.b.a ENSGT00940000159041 ENSGT00940000157267 ENSGT00940000162757.e.a ENSGT00940000162757.e.b.b ENSGT00940000159677.d ENSGT00940000162976 ENSGT00940000161309 ENSGT00390000005575 ENSGT00950000182965.b.eb.a ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00910000147209 ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977 ENSGT00910000147210 ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b.e.a ENSGT00390000016508 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349.m.a.c ENSGT00940000157773 Sooty mangabey MODERN SPECIES 107 ENSCATG00000042377 ENSCATG00000042272 UGT1A1 (ENSCATG00000000047) MROH2A (ENSCATG00000029168) HJURP (ENSCATG00000033953) TRPM8 (ENSCATG00000032320) SPP2 (ENSCATG00000024118) ARL4C (ENSCATG00000041801) SH3BP4 (ENSCATG00000036213) ENSCATG00000035957 AGAP1 (ENSCATG00000029896) #22 GBX2 (ENSCATG00000034521) ENSCATG00000040015 ASB18 (ENSCATG00000033942) #23 IQCA1 (ENSCATG00000008806) #24 ACKR3 (ENSCATG00000021636) COPS8 (ENSCATG00000033600) ENSCATG00000020622 COL6A3 (ENSCATG00000036982) MLPH (ENSCATG00000044238) PRLH (ENSCATG00000034916) RAB17 (ENSCATG00000030578) ENSCATG00000040003 RBM44 (ENSCATG00000020323) RAMP1 (ENSCATG00000038364) ENSCATG00000028463 Drill MODERN SPECIES 784 ATG16L1 (ENSMLEG00000028574) SAG (ENSMLEG00000037213) DGKD (ENSMLEG00000043481) USP40 (ENSMLEG00000033899) UGT1A5 (ENSMLEG00000033333) ENSMLEG00000029773 ENSMLEG00000038711 MROH2A (ENSMLEG00000043616) HJURP (ENSMLEG00000040399) ENSMLEG00000036363 TRPM8 (ENSMLEG00000021173) SPP2 (ENSMLEG00000037361) ARL4C (ENSMLEG00000027620) SH3BP4 (ENSMLEG00000037429) ENSMLEG00000036559 AGAP1 (ENSMLEG00000034856) #22 ASB18 (ENSMLEG00000037239) #23 ENSMLEG00000036860 IQCA1 (ENSMLEG00000036394) #24 ACKR3 (ENSMLEG00000000234) COPS8 (ENSMLEG00000036293) ENSMLEG00000017370 COL6A3 (ENSMLEG00000030027) MLPH (ENSMLEG00000034413) PRLH (ENSMLEG00000040440) RAB17 (ENSMLEG00000041001) ENSMLEG00000038517 RBM44 (ENSMLEG00000007850) RAMP1 (ENSMLEG00000029626) ENSMLEG00000033263 SCLY (ENSMLEG00000037681) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000182944.B.b ENSGT00940000156202.a ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a ENSGT00940000159041 ENSGT00940000157267 ENSGT00940000162757 ENSGT00940000162976 ENSGT00940000161309 ENSGT00390000005575 ENSGT00950000182965.b.eb.a ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a.d ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977 ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b ENSGT00390000016508 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349.m.b.a ENSGT00940000157773 ENSGT00940000156970 Mas night monkey MODERN SPECIES 940 NGEF (ENSANAG00000024538) NEU2 (ENSANAG00000037129) INPP5D (ENSANAG00000036916) ATG16L1 (ENSANAG00000035256) SAG (ENSANAG00000026665) DGKD (ENSANAG00000033065) USP40 (ENSANAG00000036897) ENSANAG00000035564 HJURP (ENSANAG00000026897) ENSANAG00000026908 TRPM8 (ENSANAG00000026214) SPP2 (ENSANAG00000037484) ARL4C (ENSANAG00000038361) ENSANAG00000036206 ENSANAG00000019899 AGAP1 (ENSANAG00000033262) #22 GBX2 (ENSANAG00000028606) ASB18 (ENSANAG00000038140) #23 IQCA1 (ENSANAG00000014576) #24 ACKR3 (ENSANAG00000008341) COPS8 (ENSANAG00000036385) COL6A3 (ENSANAG00000020236) MLPH (ENSANAG00000037808) PRLH (ENSANAG00000030046) ENSANAG00000037953 ENSANAG00000021311 RBM44 (ENSANAG00000037356) RAMP1 (ENSANAG00000036130) Cebidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000182944.B.b ENSGT00940000156202.a ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a ENSGT00940000159041 ENSGT00940000157267 ENSGT00940000162757 ENSGT00940000162976 ENSGT00940000161309 ENSGT00390000005575 ENSGT00950000182965.b.eb.a ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a.d ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977 ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b ENSGT00390000016508 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349.m.b.a ENSGT00940000157773 ENSGT00940000156970 Marmoset MODERN SPECIES 18 USP40 (ENSCJAG00000014074) UGT1A1 (ENSCJAG00000014130) ENSCJAG00000075786 HJURP (ENSCJAG00000014161) ENSCJAG00000063077 TRPM8 (ENSCJAG00000014167) SPP2 (ENSCJAG00000071680) ENSCJAG00000079474 ARL4C (ENSCJAG00000042179) ENSCJAG00000072928 SH3BP4 (ENSCJAG00000014272) ENSCJAG00000079787 ENSCJAG00000086812 ENSCJAG00000063144 ENSCJAG00000075736 AGAP1 (ENSCJAG00000004382) #22 GBX2 (ENSCJAG00000004419) ASB18 (ENSCJAG00000004432) #23 IQCA1 (ENSCJAG00000004446) #24 ACKR3 (ENSCJAG00000022033) COPS8 (ENSCJAG00000040503) COL6A3 (ENSCJAG00000002226) MLPH (ENSCJAG00000076633) PRLH (ENSCJAG00000002208) ENSCJAG00000076425 ENSCJAG00000000491 RBM44 (ENSCJAG00000000484) RAMP1 (ENSCJAG00000086220) ENSCJAG00000000476 SCLY (ENSCJAG00000000471) ESPNL (ENSCJAG00000077549) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000182944.B.b ENSGT00940000156202.a ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a ENSGT00940000159041 ENSGT00940000157267 ENSGT00940000162757 ENSGT00940000162976 ENSGT00940000161309 ENSGT00390000005575 ENSGT00950000182965.b.eb.a ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a.d ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977 ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b ENSGT00390000016508 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349.m.b.a.b ENSGT00940000157773 ENSGT00940000156970 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 128 INPP5D (ENSSBOG00000028279) ATG16L1 (ENSSBOG00000024084) ENSSBOG00000021489 SAG (ENSSBOG00000030092) DGKD (ENSSBOG00000032101) USP40 (ENSSBOG00000034189) ENSSBOG00000030178 ENSSBOG00000031447 MROH2A (ENSSBOG00000018561) HJURP (ENSSBOG00000019880) ENSSBOG00000025162 TRPM8 (ENSSBOG00000027957) SPP2 (ENSSBOG00000032899) ARL4C (ENSSBOG00000033162) SH3BP4 (ENSSBOG00000034258) AGAP1 (ENSSBOG00000033198) #22 ASB18 (ENSSBOG00000029537) #23 IQCA1 (ENSSBOG00000029838) #24 ACKR3 (ENSSBOG00000024133) COPS8 (ENSSBOG00000031570) COL6A3 (ENSSBOG00000029543) MLPH (ENSSBOG00000031086) PRLH (ENSSBOG00000032702) RAB17 (ENSSBOG00000002460) ENSSBOG00000021844 RBM44 (ENSSBOG00000020250) RAMP1 (ENSSBOG00000034673) ENSSBOG00000020844 SCLY (ENSSBOG00000033368) ESPNL (ENSSBOG00000028721) ENSSBOG00000028703 Capuchin MODERN SPECIES 106 NEU2 (ENSCCAG00000032487) INPP5D (ENSCCAG00000019399) ATG16L1 (ENSCCAG00000007793) SAG (ENSCCAG00000019531) DGKD (ENSCCAG00000031333) USP40 (ENSCCAG00000026284) ENSCCAG00000024565 ENSCCAG00000033013 MROH2A (ENSCCAG00000027970) HJURP (ENSCCAG00000036106) ENSCCAG00000026708 TRPM8 (ENSCCAG00000022541) SPP2 (ENSCCAG00000024513) ARL4C (ENSCCAG00000024558) SH3BP4 (ENSCCAG00000020741) AGAP1 (ENSCCAG00000036651) #22 GBX2 (ENSCCAG00000031985) ASB18 (ENSCCAG00000024264) #23 IQCA1 (ENSCCAG00000034378) #24 ACKR3 (ENSCCAG00000013268) COPS8 (ENSCCAG00000036165) COL6A3 (ENSCCAG00000037000) MLPH (ENSCCAG00000024406) PRLH (ENSCCAG00000022877) RAB17 (ENSCCAG00000024584) ENSCCAG00000003358 RBM44 (ENSCCAG00000032705) RAMP1 (ENSCCAG00000032734) ENSCCAG00000004088 SCLY (ENSCCAG00000024192) ESPNL (ENSCCAG00000030132) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a ENSGT00940000159041 ENSGT00940000157267 ENSGT00940000163976 ENSGT00940000163820 ENSGT00940000162976 ENSGT00940000162757 ENSGT00940000159677.d ENSGT00940000161309 ENSGT00390000005575 ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977 ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b ENSGT00390000016508 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349 ENSGT00940000157773 ENSGT00940000156970 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000182944.B.b ENSGT00940000156202.a ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a ENSGT00940000159041 ENSGT00940000157267 ENSGT00940000162757 ENSGT00940000162976 ENSGT00940000159677.d ENSGT00940000161309 ENSGT00390000005575 ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977 ENSGT00940000156462.C 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ENSGT00940000163820 ENSGT00940000162976 ENSGT00940000162757 ENSGT00940000159677.d ENSGT00940000161309 ENSGT00390000005575 ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977 ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b ENSGT00390000016508 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349 ENSGT00940000157773 ENSGT00940000156970 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a ENSGT00940000159041 ENSGT00940000157267 ENSGT00940000163976 ENSGT00940000163820 ENSGT00940000162976 ENSGT00940000162757 ENSGT00940000159677.d ENSGT00940000161309 ENSGT00390000005575 ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977 ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b ENSGT00390000016508 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349 ENSGT00940000157773 ENSGT00940000156970 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a ENSGT00940000159041 ENSGT00940000157267 ENSGT00940000163976 ENSGT00940000163820 ENSGT00940000162976 ENSGT00940000162757 ENSGT00940000159677.d ENSGT00940000161309 ENSGT00390000005575 ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977 ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b ENSGT00390000016508 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349 ENSGT00940000157773 ENSGT00940000156970 Kangaroo rat DUPLICATION Kangaroo rat MODERN SPECIES 320 ENSDORG00000026631 Neu2 (ENSDORG00000025920) Inpp5d (ENSDORG00000015370) Atg16l1 (ENSDORG00000000191) Sag (ENSDORG00000000192) Dgkd (ENSDORG00000013135) ENSDORG00000026319 ENSDORG00000007480 ENSDORG00000024133 ENSDORG00000029743 Mroh2a (ENSDORG00000007483) Trpm8 (ENSDORG00000001000) Spp2 (ENSDORG00000025268) Arl4c (ENSDORG00000028955) Sh3bp4 (ENSDORG00000008492) ENSDORG00000028590 #22 ENSDORG00000005374 #22 Gbx2 (ENSDORG00000026040) Iqca (ENSDORG00000014321) #24 Ackr3 (ENSDORG00000007573) ENSDORG00000013459 Col6a3 (ENSDORG00000016705) Mlph (ENSDORG00000011783) Prlh (ENSDORG00000015671) Rab17 (ENSDORG00000028745) ENSDORG00000013588 Ramp1 (ENSDORG00000024593) Ube2f (ENSDORG00000009774) Scly (ENSDORG00000013372) Espnl (ENSDORG00000013375) Klhl30 (ENSDORG00000013380) Kangaroo rat MODERN SPECIES 320 Neu2 (ENSDORG00000025920) Inpp5d (ENSDORG00000015370) Atg16l1 (ENSDORG00000000191) Sag (ENSDORG00000000192) Dgkd (ENSDORG00000013135) 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MODERN SPECIES 13 NGEF (ENSCPOG00000013080) NEU2 (ENSCPOG00000009389) INPP5D (ENSCPOG00000011364) ATG16L1 (ENSCPOG00000011372) SAG (ENSCPOG00000013680) DGKD (ENSCPOG00000009544) USP40 (ENSCPOG00000003324) ENSCPOG00000035407 UGT1A6 (ENSCPOG00000038016) MROH2A (ENSCPOG00000006472) ENSCPOG00000004994 Trpm8 (ENSCPOG00000005510) SPP2 (ENSCPOG00000014773) ENSCPOG00000038150 SH3BP4 (ENSCPOG00000023889) AGAP1 (ENSCPOG00000021863) #22 GBX2 (ENSCPOG00000020471) ASB18 (ENSCPOG00000008264) #23 IQCA1 (ENSCPOG00000015228) #24 ACKR3 (ENSCPOG00000014142) COPS8 (ENSCPOG00000031921) COL6A3 (ENSCPOG00000011331) ENSCPOG00000031355 MLPH (ENSCPOG00000026459) PRLH (ENSCPOG00000020075) ENSCPOG00000032081 RAB17 (ENSCPOG00000015131) LRRFIP1 (ENSCPOG00000006777) RBM44 (ENSCPOG00000023598) RAMP1 (ENSCPOG00000026974) UBE2F (ENSCPOG00000006368) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 17 ATG16L1 (ENSHGLG00000019537) SAG (ENSHGLG00000007228) USP40 (ENSHGLG00000009619) ENSHGLG00000047617 ENSHGLG00000047348 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ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a ENSGT00940000159041 ENSGT00940000167884 ENSGT00940000162757 ENSGT00940000159677.d ENSGT00940000161309 ENSGT00390000005575 ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977 ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b ENSGT00390000016508 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349 ENSGT00940000157773 ENSGT00940000156970 leopard MODERN SPECIES 12 NEU2 (ENSPPRG00000009351) INPP5D (ENSPPRG00000011130) ATG16L1 (ENSPPRG00000013858) SAG (ENSPPRG00000016263) DGKD (ENSPPRG00000022746) ENSPPRG00000001460 ENSPPRG00000016397 ENSPPRG00000002019 MROH2A (ENSPPRG00000005126) ENSPPRG00000005246 ENSPPRG00000006139 ENSPPRG00000007515 SPP2 (ENSPPRG00000008027) ARL4C (ENSPPRG00000016572) SH3BP4 (ENSPPRG00000008510) AGAP1 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(ENSPTIG00000000304) ENSPTIG00000007166 ENSPTIG00000009514 ENSPTIG00000010578 ENSPTIG00000011473 MROH2A (ENSPTIG00000012321) ENSPTIG00000018950 TRPM8 (ENSPTIG00000005408) ENSPTIG00000010461 ARL4C (ENSPTIG00000011404) SH3BP4 (ENSPTIG00000012088) ENSPTIG00000013268 #22 ENSPTIG00000014757 #22 IQCA1 (ENSPTIG00000015897) #24 ACKR3 (ENSPTIG00000006941) COPS8 (ENSPTIG00000019830) COL6A3 (ENSPTIG00000005288) MLPH (ENSPTIG00000011594) RAB17 (ENSPTIG00000014452) Caniformia ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000156202.a ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a ENSGT00940000159041 ENSGT00940000157267 ENSGT00940000163976 ENSGT00940000162976 ENSGT00940000162757 ENSGT00940000159677.d ENSGT00940000161309 ENSGT00390000005575 ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977 ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b ENSGT00390000016508 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349 ENSGT00940000157773 ENSGT00940000156970 Canidae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00950000182944.B.b ENSGT00940000156202.a ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a ENSGT00940000159041 ENSGT00940000157267 ENSGT00940000162976 ENSGT00940000162757 ENSGT00940000159677.d ENSGT00940000161309 ENSGT00390000005575 ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977 ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b ENSGT00390000016508 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349 ENSGT00940000157773 ENSGT00940000156970 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT01030000234571.b.b.a.a.a ENSGT00950000182944.B.b ENSGT00940000156202.a ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a ENSGT00940000159041 ENSGT00940000157267 ENSGT00940000162757 ENSGT00940000159677.d ENSGT00940000161309 ENSGT00390000005575 ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977 ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b ENSGT00390000016508 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349 ENSGT00940000157773 ENSGT00940000156970 Dingo MODERN SPECIES 304 NEU2 (ENSCAFG00020023768) ENSCAFG00020023771 ENSCAFG00020023772 ATG16L1 (ENSCAFG00020023778) SAG (ENSCAFG00020023788) DGKD (ENSCAFG00020023838) USP40 (ENSCAFG00020024278) ENSCAFG00020024284 UGT1A1 (ENSCAFG00020024287) MROH2A (ENSCAFG00020024299) ENSCAFG00020024315 TRPM8 (ENSCAFG00020024320) SPP2 (ENSCAFG00020024397) ARL4C (ENSCAFG00020024408) SH3BP4 (ENSCAFG00020024420) AGAP1 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ENSGT00390000005575 ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977 ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b ENSGT00390000016508 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349 ENSGT00940000157773 ENSGT00940000156970.n Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT01030000234571.b.b.a.a.a ENSGT00950000182944.B.b ENSGT00940000156202.a ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a ENSGT00940000159041 ENSGT00940000157267 ENSGT00940000162757 ENSGT00940000159677.d ENSGT00940000161309.f.a ENSGT00390000005575 ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b American mink MODERN SPECIES 15 NEU2 (ENSNVIG00000004399) INPP5D (ENSNVIG00000004409) ATG16L1 (ENSNVIG00000004487) SAG (ENSNVIG00000004830) DGKD (ENSNVIG00000005206) USP40 (ENSNVIG00000005270) UGT1A1 (ENSNVIG00000005431) ENSNVIG00000005494 MROH2A (ENSNVIG00000005505) ENSNVIG00000005631 TRPM8 (ENSNVIG00000005660) SPP2 (ENSNVIG00000005759) ARL4C (ENSNVIG00000005778) SH3B4 (ENSNVIG00000005798) ENSNVIG00000005887 AGAP1 (ENSNVIG00000005895) #22 GBX2 (ENSNVIG00000005973) ASB18 (ENSNVIG00000005978) #23 IQCA1 (ENSNVIG00000005994) #24 ACKR3 (ENSNVIG00000006074) ENSNVIG00000006094 Ferret MODERN SPECIES 412 ENSMPUG00000002236 ENSMPUG00000002240 TRPM8 (ENSMPUG00000002248) SPP2 (ENSMPUG00000002325) ARL4C (ENSMPUG00000019267) SH3BP4 (ENSMPUG00000002332) AGAP1 (ENSMPUG00000002334) #22 GBX2 (ENSMPUG00000002403) ENSMPUG00000002417 #23 IQCA1 (ENSMPUG00000002421) #24 ACKR3 (ENSMPUG00000002423) Ursidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000182944.B.b ENSGT00940000156202.a ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a ENSGT00940000159041 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(ENSAMEG00000031021) IQCA1 (ENSAMEG00000001738) #24 ACKR3 (ENSAMEG00000019789) ENSAMEG00000012089 COL6A3 (ENSAMEG00000008251) MLPH (ENSAMEG00000008402) PRLH (ENSAMEG00000008444) RAB17 (ENSAMEG00000025339) ENSAMEG00000008474 RBM44 (ENSAMEG00000008500) RAMP1 (ENSAMEG00000030941) UBE2F (ENSAMEG00000008551) SCLY (ENSAMEG00000008515) ESPNL (ENSAMEG00000014973) KLHL30 (ENSAMEG00000014960) Ursus ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00950000182944.B.b ENSGT00940000156202.a ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a ENSGT00940000159041 ENSGT00940000157267 ENSGT00940000162757 ENSGT00940000159677.d ENSGT00940000161309 ENSGT00390000005575 ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00950000185374 ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977 ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00950000185133 ENSGT00530000063564.b ENSGT00390000016508 ENSGT00940000154349 ENSGT00940000157773 ENSGT00940000156970.n ENSGT00940000158597 American black bear MODERN SPECIES 955 AGAP1 (ENSUAMG00000024333) #22 GBX2 (ENSUAMG00000024599) Polar bear MODERN SPECIES 169 INPP5D (ENSUMAG00000014489) ATG16L1 (ENSUMAG00000014422) SAG (ENSUMAG00000014417) DGKD (ENSUMAG00000013632) USP40 (ENSUMAG00000013473) ENSUMAG00000013463 UGT1A1 (ENSUMAG00000013403) MROH2A (ENSUMAG00000013376) ENSUMAG00000013374 ENSUMAG00000013341 ENSUMAG00000013318 SPP2 (ENSUMAG00000013313) ARL4C (ENSUMAG00000013306) SH3BP4 (ENSUMAG00000013298) ENSUMAG00000013297 AGAP1 (ENSUMAG00000012743) #22 IQCA1 (ENSUMAG00000012664) #24 ACKR3 (ENSUMAG00000012658) COPS8 (ENSUMAG00000012651) COL6A3 (ENSUMAG00000012021) MLPH (ENSUMAG00000011968) PRLH (ENSUMAG00000011965) ENSUMAG00000011963 ENSUMAG00000011956 RBM44 (ENSUMAG00000011930) UBE2F (ENSUMAG00000011895) SCLY (ENSUMAG00000011882) ILKAP (ENSUMAG00000011877) PER2 (ENSUMAG00000011574) TRAF3IP1 (ENSUMAG00000011513) ASB1 (ENSUMAG00000011505) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a ENSGT00940000159041 ENSGT00940000157267 ENSGT00940000163976 ENSGT00940000163820 ENSGT00940000162757 ENSGT00940000159677.d ENSGT00940000162976 ENSGT00940000161309 ENSGT00390000005575 ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977 ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b ENSGT00390000016508 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349 ENSGT00940000157773 ENSGT00940000156970 Equus ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00950000182944.B.b ENSGT00940000156202.a ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a ENSGT00940000159041 ENSGT00940000167884 ENSGT00940000163820 ENSGT00940000162757 ENSGT00940000162976 ENSGT00940000161309 ENSGT00390000005575 ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977 ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b ENSGT00390000016508 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349 ENSGT00940000157773 ENSGT00940000156970 Horse MODERN SPECIES 27 DGKD (ENSECAG00000016916) USP40 (ENSECAG00000013493) ENSECAG00000023519 ENSECAG00000058487 ENSECAG00000048565 ENSECAG00000047984 ENSECAG00000030264 MROH2A (ENSECAG00000009998) HJURP (ENSECAG00000010053) ENSECAG00000050711 TRPM8 (ENSECAG00000011427) SPP2 (ENSECAG00000007372) ARL4C (ENSECAG00000000887) SH3BP4 (ENSECAG00000009382) ENSECAG00000044884 AGAP1 (ENSECAG00000014269) #22 GBX2 (ENSECAG00000007324) ASB18 (ENSECAG00000009378) #23 IQCA1 (ENSECAG00000009419) #24 ACKR3 (ENSECAG00000000942) COPS8 (ENSECAG00000013601) COL6A3 (ENSECAG00000020887) MLPH (ENSECAG00000024624) RAB17 (ENSECAG00000010528) PRLH (ENSECAG00000016201) LRRFIP1 (ENSECAG00000016447) RBM44 (ENSECAG00000004979) RAMP1 (ENSECAG00000009250) UBE2F (ENSECAG00000011687) SCLY (ENSECAG00000012094) ESPNL (ENSECAG00000022908) Donkey MODERN SPECIES 10 INPP5D (ENSEASG00005019862) ATG16L1 (ENSEASG00005019888) SAG (ENSEASG00005019896) DGKD (ENSEASG00005019899) ENSEASG00005027116 ENSEASG00005031382 ENSEASG00005032202 UGT1A6 (ENSEASG00005019912) MROH2A (ENSEASG00005019918) HJURP (ENSEASG00005019935) ENSEASG00005019946 ENSEASG00005019972 SPP2 (ENSEASG00005019988) ARL4C (ENSEASG00005025684) SH3BP4 (ENSEASG00005019991) AGAP1 (ENSEASG00005020004) #22 GBX2 (ENSEASG00005020029) ASB18 (ENSEASG00005020036) #23 IQCA1 (ENSEASG00005027257) #24 ACKR3 (ENSEASG00005029174) COPS8 (ENSEASG00005007121) COL6A3 (ENSEASG00005007197) MLPH (ENSEASG00005007335) PRLH (ENSEASG00005007336) RAB17 (ENSEASG00005007339) LRRFIP1 (ENSEASG00005007354) RBM44 (ENSEASG00005007379) ENSEASG00005026664 UBE2F (ENSEASG00005007386) SCLY (ENSEASG00005007391) ESPNL (ENSEASG00005007394) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156202.a ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a ENSGT00940000159041 ENSGT00940000157267 ENSGT00940000163976 ENSGT00940000163820 ENSGT00940000162757 ENSGT00940000159677.d ENSGT00940000161309 ENSGT00390000005575 ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977 ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b ENSGT00390000016508 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349 ENSGT00940000157773 ENSGT00940000156970 Megabat MODERN SPECIES 1605 AGAP1 (ENSPVAG00000008641) #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156202.a ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a ENSGT00940000159041 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ENSGT00950000182944.B.b ENSGT00940000156202.a ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a ENSGT00940000159041 ENSGT00940000157267 ENSGT00940000162757 ENSGT00940000162976 ENSGT00940000161309 ENSGT00390000005575 ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977 ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b ENSGT00390000016508 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349.db ENSGT00940000157773 ENSGT00940000156970 Pig MODERN SPECIES 6 NEU2 (ENSSSCG00000016297) INPP5D (ENSSSCG00000016298) ATG16L1 (ENSSSCG00000016300) SAG (ENSSSCG00000016301) DGKD (ENSSSCG00000009432) USP40 (ENSSSCG00000016306) ENSSSCG00000036274 ENSSSCG00000028217 MROH2A (ENSSSCG00000016305) HJURP (ENSSSCG00000016313) TRPM8 (ENSSSCG00000016314) SPP2 (ENSSSCG00000016315) ARL4C (ENSSSCG00000034293) ENSSSCG00000054647 SH3BP4 (ENSSSCG00000034692) AGAP1 (ENSSSCG00000016317) #22 GBX2 (ENSSSCG00000016319) ASB18 (ENSSSCG00000016318) #23 IQCA1 (ENSSSCG00000016321) #24 ACKR3 (ENSSSCG00000016322) COPS8 (ENSSSCG00000016323) COL6A3 (ENSSSCG00000027331) MLPH (ENSSSCG00000032849) ENSSSCG00000036981 RAB17 (ENSSSCG00000016328) ENSSSCG00000016330 RBM44 (ENSSSCG00000016332) RAMP1 (ENSSSCG00000016331) ENSSSCG00000027723 SCLY (ENSSSCG00000016334) ESPNL (ENSSSCG00000016335) Chacoan peccary MODERN SPECIES 810 NGEF (ENSCWAG00000021480) NEU2 (ENSCWAG00000021469) INPP5D (ENSCWAG00000021461) ATG16L1 (ENSCWAG00000021418) SAG (ENSCWAG00000021393) DGKD (ENSCWAG00000021380) USP40 (ENSCWAG00000021340) ENSCWAG00000021325 ENSCWAG00000021256 MROH2A (ENSCWAG00000021138) ENSCWAG00000021072 TRPM8 (ENSCWAG00000021012) SPP2 (ENSCWAG00000020992) ARL4C (ENSCWAG00000020977) SH3BP4 (ENSCWAG00000020969) AGAP1 (ENSCWAG00000020809) #22 GBX2 (ENSCWAG00000020784) ASB18 (ENSCWAG00000020774) #23 IQCA1 (ENSCWAG00000020641) #24 ACKR3 (ENSCWAG00000020621) COPS8 (ENSCWAG00000020602) ENSCWAG00000020585 ENSCWAG00000020458 ENSCWAG00000020424 PRLH (ENSCWAG00000020415) RAB17 (ENSCWAG00000020392) ENSCWAG00000020311 RBM44 (ENSCWAG00000020263) RAMP1 (ENSCWAG00000020241) UBE2F (ENSCWAG00000020129) SCLY (ENSCWAG00000020097) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156202.a ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a ENSGT00940000159041 ENSGT00940000157267 ENSGT00960000189764 ENSGT00940000162757 ENSGT00940000162976 ENSGT00940000159677.d ENSGT00940000161309 ENSGT00390000005575 ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977 ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b ENSGT00390000016508 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349 ENSGT00940000157773 ENSGT00940000156970 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 106 ENSGT00950000182944.B.b ENSGT00940000156202.a ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a ENSGT00940000159041 ENSGT00940000157267 ENSGT00940000162757 ENSGT00940000159677.d ENSGT00940000161309 ENSGT00390000005575 ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT01030000236316 ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 Arabian camel MODERN SPECIES 31 NEU2 (ENSCDRG00005009286) INPP5D (ENSCDRG00005009359) ATG16L1 (ENSCDRG00005009769) SAG (ENSCDRG00005010393) DGKD (ENSCDRG00005010577) USP40 (ENSCDRG00005010949) UGT1A1 (ENSCDRG00005011851) ENSCDRG00005011972 MROH2A (ENSCDRG00005012005) ENSCDRG00005012337 TRPM8 (ENSCDRG00005012445) SPP2 (ENSCDRG00005013014) ARL4C (ENSCDRG00005013071) SH3BP4 (ENSCDRG00005013122) ENSCDRG00005013165 AGAP1 (ENSCDRG00005013275) #22 GBX2 (ENSCDRG00005014059) ENSCDRG00005014127 #23 IQCA1 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ENSGT00940000162757 ENSGT00940000162976 ENSGT00940000161309 ENSGT00390000005575 ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977 ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b ENSGT00390000016508 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349 ENSGT00940000157773 ENSGT00940000156970 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000182944.B.b ENSGT00940000156202.a ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a ENSGT00940000159041 ENSGT00940000157267 ENSGT00960000189764 ENSGT00940000162757 ENSGT00940000162976 ENSGT00940000161309 ENSGT00390000005575 ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977 ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b ENSGT00390000016508 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349.fb.a ENSGT00940000157773 ENSGT00940000156970 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01030000234571.b.b.a.a.a ENSGT00950000182944.B.b ENSGT00940000156202.a ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a ENSGT00940000159041 ENSGT00940000157267 ENSGT00940000162757 ENSGT00940000162976 ENSGT00940000161309 ENSGT00390000005575 ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977 ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b ENSGT00390000016508 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349.fb.a ENSGT00940000157773 ENSGT00940000156970 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234571.b.b.a.a.a 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ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977.y.a ENSGT00940000156462.C ENSGT00390000013067.a.b ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b ENSGT00390000016508 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349.fb.a ENSGT00940000157773 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 22 NGEF (ENSBIXG00005025372) NEU2 (ENSBIXG00005025290) INPP5D (ENSBIXG00005025252) ATG16L1 (ENSBIXG00005025125) SAG (ENSBIXG00005004262) DGKD (ENSBIXG00005024925) USP40 (ENSBIXG00005006293) ENSBIXG00005007237 ENSBIXG00005024358 MROH2A (ENSBIXG00005024302) HJURP (ENSBIXG00005006477) TRPM8 (ENSBIXG00005023717) ENSBIXG00005023563 ARL4C (ENSBIXG00005023514) SH3BP4 (ENSBIXG00005006169) AGAP1 (ENSBIXG00005023299) #22 GBX2 (ENSBIXG00005022446) ASB18 (ENSBIXG00005022433) #23 IQCA1 (ENSBIXG00005022384) #24 ACKR3 (ENSBIXG00005003805) ENSBIXG00005022302 ENSBIXG00005022233 ENSBIXG00005022201 ENSBIXG00005006159 MLPH (ENSBIXG00005022128) PRLH (ENSBIXG00005022051) RAB17 (ENSBIXG00005022036) ENSBIXG00005021969 RBM44 (ENSBIXG00005021762) RAMP1 (ENSBIXG00005007162) UBE2F (ENSBIXG00005021630) Cow MODERN SPECIES 22 SNORC (ENSBTAG00000018058) NGEF (ENSBTAG00000008942) NEU2 (ENSBTAG00000020672) INPP5D (ENSBTAG00000020173) ATG16L1 (ENSBTAG00000003928) ENSBTAG00000054491 SAG (ENSBTAG00000021480) DGKD (ENSBTAG00000020616) USP40 (ENSBTAG00000000149) UGT1A6 (ENSBTAG00000026181) MROH2A (ENSBTAG00000017434) HJURP (ENSBTAG00000024726) TRPM8 (ENSBTAG00000014652) SPP2 (ENSBTAG00000002030) SH3BP4 (ENSBTAG00000013869) AGAP1 (ENSBTAG00000016504) #22 GBX2 (ENSBTAG00000008898) ASB18 (ENSBTAG00000002024) #23 IQCA1 (ENSBTAG00000013505) #24 ACKR3 (ENSBTAG00000018424) COPS8 (ENSBTAG00000005854) COL6A3 (ENSBTAG00000030190) ENSBTAG00000001538 MLPH (ENSBTAG00000000634) PRLH (ENSBTAG00000017615) RAB17 (ENSBTAG00000017624) LRRFIP1 (ENSBTAG00000005354) RBM44 (ENSBTAG00000010676) RAMP1 (ENSBTAG00000011534) UBE2F (ENSBTAG00000026114) SCLY (ENSBTAG00000017826) Bos_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01030000234571.b.b.a.a.a ENSGT00950000182944.B.b ENSGT00940000156202.a ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a ENSGT00940000159041 ENSGT00940000157267 ENSGT00940000162757 ENSGT00940000162976 ENSGT00940000161309 ENSGT00390000005575 ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977.y.a ENSGT00940000156462.C ENSGT00390000013067.a.b ENSGT00940000162093 ENSGT00940000162360 ENSGT00390000007540 ENSGT00390000001474 ENSGT00940000159702 ENSGT00390000008920.c.b ENSGT00390000003897.s.b.a.a.b.b ENSGT00940000160922 Domestic yak MODERN SPECIES 22 NEU2 (ENSBGRG00000010344) INPP5D (ENSBGRG00000010422) ATG16L1 (ENSBGRG00000010889) SAG (ENSBGRG00000011471) DGKD (ENSBGRG00000011771) USP40 (ENSBGRG00000012788) 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ENSGT00940000154349.fb.a ENSGT00940000157773 ENSGT00940000156970 Goat MODERN SPECIES 22 NEU2 (ENSCHIG00000024666) INPP5D (ENSCHIG00000018691) ATG16L1 (ENSCHIG00000026473) SAG (ENSCHIG00000002782) DGKD (ENSCHIG00000025662) USP40 (ENSCHIG00000023695) ENSCHIG00000012439 ENSCHIG00000022816 MROH2A (ENSCHIG00000016141) HJURP (ENSCHIG00000020706) TRPM8 (ENSCHIG00000026726) SPP2 (ENSCHIG00000021100) ARL4C (ENSCHIG00000008457) SH3BP4 (ENSCHIG00000013947) ENSCHIG00000002736 AGAP1 (ENSCHIG00000015729) #22 GBX2 (ENSCHIG00000017047) ASB18 (ENSCHIG00000024789) #23 IQCA1 (ENSCHIG00000005472) #24 ACKR3 (ENSCHIG00000002856) ENSCHIG00000004774 COPS8 (ENSCHIG00000026994) COL6A3 (ENSCHIG00000018312) MLPH (ENSCHIG00000013604) PRLH (ENSCHIG00000003316) RAB17 (ENSCHIG00000016171) LRRFIP1 (ENSCHIG00000006587) RBM44 (ENSCHIG00000004353) RAMP1 (ENSCHIG00000016318) ENSCHIG00000024862 SCLY (ENSCHIG00000014872) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES ATG16L1 (ENSOARG00020008250) SAG (ENSOARG00020008029) 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(ENSCHYG00000015812) RAB17 (ENSCHYG00000015919) ENSCHYG00000016146 RBM44 (ENSCHYG00000016388) RAMP1 (ENSCHYG00000016650) UBE2F (ENSCHYG00000016770) ENSCHYG00000017305 SCLY (ENSCHYG00000017354) Cetacea ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000182944.B.b ENSGT00940000156202.a ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a ENSGT00940000159041 ENSGT00940000157267 ENSGT00940000162757 ENSGT00940000162976 ENSGT00940000159677.d ENSGT00940000161309 ENSGT00390000005575 ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977.u ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b ENSGT00390000016508 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349 ENSGT00940000157773 ENSGT00940000156970 Blue whale MODERN SPECIES 18 NEU2 (ENSBMSG00010001399) INPP5D (ENSBMSG00010001433) ENSBMSG00010001490 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ENSPCTG00005019529 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 74 ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a ENSGT00940000159041 ENSGT00940000157267 ENSGT00940000163976 ENSGT00940000163820 ENSGT00940000162976 ENSGT00940000162757 ENSGT00940000159677.d ENSGT00940000161309 ENSGT00390000005575 ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977 ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b ENSGT00390000016508 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349 ENSGT00940000157773 ENSGT00940000156970 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 697 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977 Sloth MODERN SPECIES 4621 AGAP1 (ENSCHOG00000010057) #22 Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 1759 ENSDNOG00000042359 #22 GBX2 (ENSDNOG00000016724) ENSDNOG00000037746 ASB18 (ENSDNOG00000043632) #23 IQCA1 (ENSDNOG00000008579) #24 ENSDNOG00000031759 ACKR3 (ENSDNOG00000011040) ENSDNOG00000035628 Armadillo MODERN SPECIES 1793 SH3BP4 (ENSDNOG00000048631) ENSDNOG00000044828 #22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 80 ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a ENSGT00940000159041 ENSGT00940000157267 ENSGT00940000163976 ENSGT00940000163820 ENSGT00940000162976 ENSGT00940000162757 ENSGT00940000159677.d ENSGT00940000161309 ENSGT00390000005575 ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977 ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b ENSGT00390000016508 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349 ENSGT00940000157773 ENSGT00940000156970 ENSGT00940000158597 Tenrec MODERN SPECIES 4986 ENSETEG00000019907 #22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 79 ENSGT00940000153936.a ENSGT00950000182887.C.b.a ENSGT00940000159041 ENSGT00940000157267 ENSGT00940000163976 ENSGT00940000163820 ENSGT00940000162976 ENSGT00940000162757 ENSGT00940000159677.d ENSGT00940000161309 ENSGT00390000005575 ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977 ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b ENSGT00390000016508 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349 ENSGT00940000157773 ENSGT00940000156970 ENSGT00940000158597 Elephant DUPLICATION Elephant MODERN SPECIES 450 ENSLAFG00000029526 ENSLAFG00000031114 ENSLAFG00000030587 ENSLAFG00000026824 ENSLAFG00000028960 ENSLAFG00000031343 UGT1A1 (ENSLAFG00000031174) ENSLAFG00000027571 ENSLAFG00000022466 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Chicken MODERN SPECIES 36 COL18A1 (ENSGALG00010014162) AHR1B (ENSGALG00010014105) AHR2 (ENSGALG00010013824) NDUFA10 (ENSGALG00010013783) HDAC4 (ENSGALG00010013697) TWIST2 (ENSGALG00010013612) ENSGALG00010015254 ASB1 (ENSGALG00010013494) TRAF3IP1 (ENSGALG00010015025) USP40 (ENSGALG00010011106) UGT1A1 (ENSGALG00010011085) SH3BP4 (ENSGALG00010010719) ARL4C (ENSGALG00010012744) SPP2 (ENSGALG00010012708) TRPM8 (ENSGALG00010012680) AGAP1 (ENSGALG00010012571) #22 GBX2 (ENSGALG00010012489) ASB18 (ENSGALG00010012474) #23 IQCA1 (ENSGALG00010012454) #24 CXCR7 (ENSGALG00010012429) COPS8 (ENSGALG00010012447) COL6A3 (ENSGALG00010012362) MLPH (ENSGALG00010012325) PRLH (ENSGALG00010012236) RAB17 (ENSGALG00010012215) LRRFIP1 (ENSGALG00010012194) ENSGALG00010012120 UBE2F (ENSGALG00010012100) IFNL3 (ENSGALG00010012050) ENSGALG00010012045 IFNL3A (ENSGALG00010012030) Turkey MODERN SPECIES 27 SLC19A1 (ENSMGAG00000001945) ENSMGAG00000002118 ENSMGAG00000002128 NDUFA10 (ENSMGAG00000002122) HDAC4 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ENSGT00940000154793.C.`b.a ##22 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154793.C.`b.a ##22 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154793.C.`b.a ##22 Testudinidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154793.C.`b.a ##22 Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 594 ENSCABG00000002350 ##22 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154793.C.`b.a ##22 tuatara MODERN SPECIES 1003 ENSSPUG00000015810 ##22 ENSSPUG00000015820 #22 Mammalia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154793.C.`b.a ##22 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154793.C.`b.a ##22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154793.C.`b.a ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154793.C.`b.a ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154793.C.`b.a ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154793.C.`b.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154793.C.`b.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154793.C.`b.a ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154793.C.`b.a ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154793.C.`b.a ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154793.C.`b.a ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154793.C.`b.a ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154793.C.`b.a ##22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000157267 ENSGT00940000166673.d.a.a.a.a.b ENSGT00940000162757.f ENSGT00940000159677.d ENSGT00940000161309 ENSGT00390000005575 ENSGT00950000182965.b.eb.a ENSGT00940000160270 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000161627.a.a.a.b.b.b.a.a.b.c.a.b ENSGT01080000257484.C ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00940000167556.b.b.a.b.a.a.a.b.b.b.a.a.b.a.a.a.a ENSGT01100000263539.b.a.a.a.a.a.a.a.b.b.b.a.b.a.a.a ENSGT00940000154793.C.`b.a ##22 ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00390000000977 ENSGT00910000147210 ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b.e.a ENSGT00390000016508 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349.m.a.c Crab-eating macaque MODERN SPECIES 3 USP40 (ENSMFAG00000036495) UGT1A8 (ENSMFAG00000042349) ENSMFAG00000056186 ENSMFAG00000039060 MROH2A (ENSMFAG00000045490) HJURP (ENSMFAG00000000886) ENSMFAG00000050196 TRPM8 (ENSMFAG00000043208) SPP2 (ENSMFAG00000044433) ENSMFAG00000062028 ENSMFAG00000049398 ENSMFAG00000045232 SH3BP4 (ENSMFAG00000038422) ENSMFAG00000062617 ENSMFAG00000056989 ENSMFAG00000050981 ##22 ENSMFAG00000038629 #22 GBX2 (ENSMFAG00000031863) ASB18 (ENSMFAG00000042948) #23 IQCA1 (ENSMFAG00000046217) #24 ACKR3 (ENSMFAG00000029542) COPS8 (ENSMFAG00000043944) ENSMFAG00000030220 COL6A3 (ENSMFAG00000043048) MLPH (ENSMFAG00000040090) PRLH (ENSMFAG00000043339) RAB17 (ENSMFAG00000036950) ENSMFAG00000035972 RBM44 (ENSMFAG00000002416) RAMP1 (ENSMFAG00000032812) ENSMFAG00000035899 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000161997.a ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160270 ENSGT00940000159677.d ENSGT00940000163820 ENSGT00940000163976 ENSGT00940000157267 ENSGT00390000016151 ENSGT00940000157440 ENSGT00940000161996 ENSGT00940000153969.b ENSGT00720000108822 ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00940000156322.g ENSGT00940000154793.C.`b.a ##22 ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT01100000263477.A.b.a.a.a.a.a.b.b ENSGT01100000263477.A.b.a.a.a.a.b ENSGT01100000263477.A.b.a.a.a.a.a.a ENSGT00390000000977 ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b ENSGT00390000016508 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160270 ENSGT00940000159677.d ENSGT00940000163820 ENSGT00940000163976 ENSGT00940000157267 ENSGT00390000016151 ENSGT00940000157440 ENSGT00940000161996 ENSGT00940000153969.b ENSGT00720000108822 ENSGT00940000154486.b.a.a.b ENSGT00940000154486.b.b ENSGT00940000160639 ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00940000156322.g ENSGT00940000154793.C.`b.a ##22 ENSGT00940000154793.C.ab #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000162056 #23 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT01100000263477.A.b.a.a.a.a.a.b.b ENSGT01100000263477.A.b.a.a.a.a.b ENSGT01100000263477.A.b.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00390000000977.b ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b.a ENSGT00390000005489 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b ENSGT00390000016508 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154793.C.`b.a ##22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154793.C.`b.a ##22 Common wonbat MODERN SPECIES 787 TWIST2 (ENSVURG00010010490) ASB1 (ENSVURG00010010493) ENSVURG00010010502 ENSVURG00010010534 ENSVURG00010010536 ENSVURG00010010549 ENSVURG00010010564 ARL4C (ENSVURG00010010587) SH3BP4 (ENSVURG00010010594) ENSVURG00010010609 ##22 ENSVURG00010010616 #22 GBX2 (ENSVURG00010010623) ASB18 (ENSVURG00010010631) #23 IQCA1 (ENSVURG00010010657) #24 ENSVURG00010010702 ACKR3 (ENSVURG00010010709) ENSVURG00010010721 Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154793.C.`b.b ##22 Sauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154793.C.`b.b ##22 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154793.C.`b.b ##22 tuatara MODERN SPECIES 1357 ENSSPUG00000014394 ##22 Anura ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000182997.a.b.b.a ENSGT00940000160683 ENSGT00390000016151 ENSGT00940000157440 ENSGT00940000165503 ENSGT00940000153969.b ENSGT00720000108822 ENSGT00530000063273.b.b ENSGT00940000159677.c.a ENSGT00940000159677.c.b.a.f ENSGT00940000159677.c.b.a.e.a ENSGT00390000013151.a.a ENSGT00940000160639 ENSGT00390000009001 ENSGT00940000160270 ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00940000166277 ENSGT00940000171532.a ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00950000185272 ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b ENSGT00940000177452 ENSGT00940000159224 ENSGT00940000154349 ENSGT00940000163794.y ENSGT00940000166348 Frog MODERN SPECIES 9 ENSXETG00000045433 bard1 (ENSXETG00000014241) abca12 (ENSXETG00000014244) ENSXETG00000038463 atic (ENSXETG00000025087) fn1 (ENSXETG00000010898) mreg (ENSXETG00000010902) XB5811292 [provisional] (ENSXETG00000031863) ube2f (ENSXETG00000010905) ramp1 (ENSXETG00000010906) ugt1a6 (ENSXETG00000004890) sh3bp4 (ENSXETG00000010910) arl4c (ENSXETG00000043177) trpm8b (ENSXETG00000003271) trpm8 (ENSXETG00000026873) agap1 (ENSXETG00000003280) #22 gbx2.1 (ENSXETG00000003290) gbx2.2 (ENSXETG00000003293) asb18 (ENSXETG00000029996) iqca1 (ENSXETG00000032973) #24 ackr3 (ENSXETG00000039232) ENSXETG00000035869 col6a3 (ENSXETG00000031229) mlph (ENSXETG00000032232) ENSXETG00000037922 lrrfip1 (ENSXETG00000032269) ENSXETG00000041199 usp40 (ENSXETG00000004875) ENSXETG00000042977 ENSXETG00000047014 traf3ip1 (ENSXETG00000004877) Leishan spiny toad MODERN SPECIES 10 ASB1 (ENSLLEG00000016008) TRAF3IP1 (ENSLLEG00000015779) ENSLLEG00000019265 ENSLLEG00000019208 ENSLLEG00000019128 ENSLLEG00000019102 ENSLLEG00000019051 ENSLLEG00000018963 SH3BP4 (ENSLLEG00000018882) ARL4C (ENSLLEG00000018830) ENSLLEG00000018774 ENSLLEG00000018671 ENSLLEG00000018652 TRPM8 (ENSLLEG00000017415) ENSLLEG00000017294 AGAP1 (ENSLLEG00000015852) #22 GBX2 (ENSLLEG00000015780) ENSLLEG00000015687 ENSLLEG00000015634 IQCA1 (ENSLLEG00000015314) #24 ACKR3 (ENSLLEG00000015274) ENSLLEG00000015073 ENSLLEG00000015044 ENSLLEG00000015010 ENSLLEG00000014921 ENSLLEG00000014817 ENSLLEG00000014750 ENSLLEG00000014690 MLPH (ENSLLEG00000013914) ENSLLEG00000013829 ENSLLEG00000013714 Coelacanth DUPLICATION Coelacanth MODERN SPECIES 730 ARL4C (ENSLACG00000015350) ENSLACG00000022501 TRPM8 (ENSLACG00000014130) ENSLACG00000013782 ENSLACG00000011900 ENSLACG00000010100 #22 ENSLACG00000006421 #22 GBX2 (ENSLACG00000005440) ASB18 (ENSLACG00000004254) #23 IQCA1 (ENSLACG00000000391) #24 Coelacanth MODERN SPECIES 730 ARL4C (ENSLACG00000015350) ENSLACG00000022501 TRPM8 (ENSLACG00000014130) ENSLACG00000013782 ENSLACG00000011900 ENSLACG00000010100 #22 ENSLACG00000006421 #22 GBX2 (ENSLACG00000005440) ASB18 (ENSLACG00000004254) #23 IQCA1 (ENSLACG00000000391) #24 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 142 ENSGT00390000007989 ENSGT00940000155752 ENSGT00940000157295 ENSGT00940000156532 ENSGT00720000108792.B ENSGT00940000157137 ENSGT00940000154695 ENSGT00940000157192 ENSGT00530000063186.b.b ENSGT01030000234570.d.a ENSGT00940000157652 ENSGT00530000063688.a ENSGT00940000156597.b ENSGT00640000091496 ENSGT00390000001447 ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b Reedfish MODERN SPECIES 16 sec22a (ENSECRG00000017158) adcy5 (ENSECRG00000017181) hacd2 (ENSECRG00000017217) stam2 (ENSECRG00000017249) cacnb4a (ENSECRG00000017312) arl5a (ENSECRG00000017434) NEB (ENSECRG00000017571) rif1 (ENSECRG00000017982) tnfaip6 (ENSECRG00000018046) lancl1 (ENSECRG00000018081) mylz3 (ENSECRG00000018120) acadl (ENSECRG00000018174) ENSECRG00000018217 UNC80 (ENSECRG00000018287) rpe (ENSECRG00000018435) AGAP1 (ENSECRG00000018490) #22 gbx2 (ENSECRG00000018677) ASB18 (ENSECRG00000018700) #23 iqca1 (ENSECRG00000018772) #24 ackr3b (ENSECRG00000018909) trim63a (ENSECRG00000018917) cops8 (ENSECRG00000018930) ENSECRG00000018944 ENSECRG00000018994 MLPH (ENSECRG00000019106) ENSECRG00000019167 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00390000007989 ENSGT00940000155752 ENSGT00940000157295 ENSGT00940000156532 ENSGT00720000108792.B ENSGT00940000157137 ENSGT00940000154695 ENSGT00940000157192 ENSGT00530000063186.b.b ENSGT01030000234570.d.a ENSGT00940000157652 ENSGT00530000063688.a ENSGT00940000156597.b ENSGT00640000091496 ENSGT00390000001447 ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00940000166042 ENSGT00940000166277 ENSGT00940000156462.B.d ENSGT00940000156462.B.c.a ENSGT00940000156462.B.c.b ENSGT00940000156462.C ENSGT00950000183138.a.b ENSGT00940000161839 ENSGT00530000063564.b ENSGT00940000155282 ENSGT00940000160335 ENSGT00940000165788 Spotted gar MODERN SPECIES 650 pofut2 (ENSLOCG00000004410) MYO1B (ENSLOCG00000004425) ABCA12 (ENSLOCG00000004451) BARD1 (ENSLOCG00000004470) vwc2l (ENSLOCG00000004485) IKZF2 (ENSLOCG00000004501) erbb4a (ENSLOCG00000004529) CPS1 (ENSLOCG00000004580) lancl1 (ENSLOCG00000004634) mylz3 (ENSLOCG00000004651) acadl (ENSLOCG00000004680) KANSL1L (ENSLOCG00000004691) MAP2 (ENSLOCG00000004706) UNC80 (ENSLOCG00000004735) rpe (ENSLOCG00000004757) AGAP1 (ENSLOCG00000004775) #22 gbx2 (ENSLOCG00000004803) ENSLOCG00000004813 iqca1 (ENSLOCG00000004845) #24 ackr3b (ENSLOCG00000004865) cops8 (ENSLOCG00000004879) COL6A3 (ENSLOCG00000004896) mlpha (ENSLOCG00000004912) prlh (ENSLOCG00000004947) RAB17 (ENSLOCG00000004961) LRRFIP1 (ENSLOCG00000004973) DNAH7 (ENSLOCG00000005048) slc39a10 (ENSLOCG00000005081) tmeff2a (ENSLOCG00000005097) cavin2b (ENSLOCG00000005117) nabp1a (ENSLOCG00000005133) Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 196 ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b ENSGT00940000166042 ENSGT00940000166277 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(ENSPKIG00000012067) ftcdnl1 (ENSPKIG00000012083) nabp1a (ENSPKIG00000012112) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 315 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000010308 ENSGT00940000164470.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT01090000260051.b.b.dc.a ENSGT00940000168428.b.a ENSGT00940000177273 ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b.ec ENSGT00940000166042.a ENSGT00950000183138.a.b.r.a ENSGT00530000063564.b.a.a ENSGT00940000158714.c ENSGT01100000263502.A.a.a.a.b.a.b Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 253 ENSGT00940000157829.m.a ENSGT00390000010308 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000164470.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b.ec ENSGT00940000166042.a ENSGT00950000183138.a.b.r.a ENSGT00530000063564.b.a.a ENSGT00940000158714.c ENSGT01100000263502.A.a.a.a.b.a.b ENSGT00390000000145.e ENSGT00970000193621 ENSGT00940000157728.a.a ENSGT00390000007225 ENSGT00950000183028.a.a.a.g.b.g.b ENSGT00530000063596.A.i ENSGT00950000183001.a.b.b.l Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 123 ENSGT00940000156862 ENSGT00940000155232.t.a.b.b ENSGT00940000166422 ENSGT00940000157829.m.a ENSGT00390000010308 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000164470.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b.ec ENSGT00940000166042.a ENSGT00950000183138.a.b.r.a ENSGT00530000063564.b.a.a ENSGT00940000158714.c ENSGT01100000263502.A.a.a.a.b.a.b ENSGT00390000000145.f ENSGT00940000157728.a.b ENSGT00970000193621 ENSGT00940000157728.a.a ENSGT00390000007225 ENSGT00950000183028.a.a.a.g.b.g.b ENSGT00530000063596.A.i Denticle herring MODERN SPECIES 6 ENSDCDG00000035727 ECRG4 (ENSDCDG00000035725) ENSDCDG00000035724 st6gal2b (ENSDCDG00000035722) dzip1 (ENSDCDG00000035721) ENSDCDG00000035719 ENSDCDG00000035716 ENSDCDG00000035712 ENSDCDG00000035706 ENSDCDG00000035705 GPR161 (ENSDCDG00000035703) atg3 (ENSDCDG00000035698) SLC19A2 (ENSDCDG00000035685) ENSDCDG00000035681 faimb (ENSDCDG00000035680) AGAP1 (ENSDCDG00000035651) #22 gbx2 (ENSDCDG00000035616) iqca1 (ENSDCDG00000035604) #24 ackr3b (ENSDCDG00000035596) trim63a (ENSDCDG00000035595) mlpha (ENSDCDG00000035594) LRRFIP1 (ENSDCDG00000035587) cldn10a (ENSDCDG00000035586) abcc4 (ENSDCDG00000035439) SOX21 (ENSDCDG00000035420) GPR180 (ENSDCDG00000035418) TGDS (ENSDCDG00000035416) GPR34 (ENSDCDG00000035415) caskb (ENSDCDG00000035398) ENSDCDG00000035230 ddx3xb (ENSDCDG00000034724) Atlantic herring MODERN SPECIES 13 pcid2 (ENSCHAG00000003797) ENSCHAG00000003937 CARS2 (ENSCHAG00000003992) adprhl1 (ENSCHAG00000004396) TMCO3 (ENSCHAG00000004442) ENSCHAG00000004802 ATP4B (ENSCHAG00000005391) grk1a (ENSCHAG00000005421) gas6 (ENSCHAG00000005468) pros1 (ENSCHAG00000005634) RASA3 (ENSCHAG00000005887) mettl21e (ENSCHAG00000007037) ENSCHAG00000007050 ENSCHAG00000007088 abcc4 (ENSCHAG00000007230) AGAP1 (ENSCHAG00000012400) #22 gbx2 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ENSGT01100000263502.A.a.a.a.b.a.b ENSGT00390000000145.e ENSGT00970000193621 ENSGT00940000157728.a.a ENSGT00390000007225 ENSGT00950000183028.a.a.a.g.b.g.b ENSGT00530000063596.A.i Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00390000005935 ENSGT00940000177589 ENSGT00940000163418.D ENSGT00940000156702.a.b.b ENSGT00940000165423.a.b ENSGT00950000183022.b ENSGT00940000162768.B.b ENSGT00940000154360.A.b.b ENSGT00390000000089 ENSGT00640000091496.e ENSGT00640000091774.a.d ENSGT00550000074820 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000164470.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b.ec ENSGT00940000166042.a ENSGT00950000183138.a.b.r.a ENSGT00530000063564.b.a.a ENSGT00940000158714.c ENSGT01100000263502.A.a.a.a.b.a.b ENSGT00390000000145.e ENSGT00970000193621 ENSGT00940000157728.a.a ENSGT00390000007225 ENSGT00950000183028.a.a.a.g.b.g.b ENSGT00530000063596.A.i ENSGT00950000183001.a.b.b.l Channel catfish MODERN SPECIES 3 ENSIPUG00000010937 TBB6 (ENSIPUG00000010950) gnas (ENSIPUG00000010975) stx16 (ENSIPUG00000011032) dzip1 (ENSIPUG00000011056) CLDN10 (ENSIPUG00000011176) cldn10e (ENSIPUG00000011196) cldn10a (ENSIPUG00000011223) NOMO1 (ENSIPUG00000011249) UNC80 (ENSIPUG00000011371) ENSIPUG00000011467 psmb3 (ENSIPUG00000011479) slc19a2 (ENSIPUG00000011571) ENSIPUG00000011585 faimb (ENSIPUG00000011598) AGAP1 (ENSIPUG00000011638) #22 gbx2 (ENSIPUG00000011813) iqca1 (ENSIPUG00000011834) #24 ACKR3 (ENSIPUG00000011903) trim63a (ENSIPUG00000011920) mlph (ENSIPUG00000011958) LRRFIP1 (ENSIPUG00000012031) st6gal2b (ENSIPUG00000012156) ecrg4b (ENSIPUG00000012174) ENSIPUG00000012185 nck2b (ENSIPUG00000012201) dph3 (ENSIPUG00000012211) Fhl2 (ENSIPUG00000012229) tgfbrap1 (ENSIPUG00000012271) GPR45 (ENSIPUG00000012376) MRPS9 (ENSIPUG00000012385) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00390000005935 ENSGT00940000177589 ENSGT00940000163418.D ENSGT00940000156702.a.b.b ENSGT00940000158212.B ENSGT00950000183022.b ENSGT00940000162768.B.b ENSGT00940000154360.A.b.b ENSGT00390000000089 ENSGT00640000091496.e ENSGT00640000091774.a.d ENSGT00550000074820 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000164470.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b.ec ENSGT00940000166042.a ENSGT00950000183138.a.b.r.a ENSGT00530000063564.b.a.a ENSGT00940000158714.c ENSGT01100000263502.A.a.a.a.b.a.b ENSGT00390000000145.e ENSGT00970000193621 ENSGT00940000157728.a.a ENSGT00950000183028.a.a.a.g.b.h ENSGT00530000063596.A.i ENSGT00950000183001.a.b.b.l ENSGT00390000011204 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00390000005935 ENSGT00940000177589 ENSGT00940000163418.D ENSGT00940000156702.a.b.b ENSGT00940000158212.B ENSGT00950000183022.b ENSGT00940000162768.B.b ENSGT00940000154360.A.b.b ENSGT00390000000089 ENSGT00640000091496.e ENSGT00640000091774.a.d ENSGT00550000074820 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00940000164470.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000154067.c #24 ENSGT01090000260051.b.b.ec ENSGT00940000166042.a ENSGT00950000183138.a.b.r.a ENSGT00530000063564.b.a.a ENSGT00940000158714.c ENSGT01100000263502.A.a.a.a.b.a.b ENSGT00390000000145.e ENSGT00970000193621 ENSGT00940000157728.a.a ENSGT00950000183028.a.a.a.g.b.g.b ENSGT00530000063596.A.i ENSGT00950000183001.a.b.b.l ENSGT00390000011204 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 241 zgc:109982 (ENSPNAG00000001107) dr1 (ENSPNAG00000004694) GNG12 (ENSPNAG00000001124) gadd45ab (ENSPNAG00000001129) ENSPNAG00000001135 ENSPNAG00000008668 ENSPNAG00000001150 ENSPNAG00000008700 glulb (ENSPNAG00000001163) UNC80 (ENSPNAG00000008782) ENSPNAG00000001198 psmb3 (ENSPNAG00000008881) SLC19A2 (ENSPNAG00000008918) ENSPNAG00000008963 faimb (ENSPNAG00000001275) AGAP1 (ENSPNAG00000009031) #22 gbx2 (ENSPNAG00000009051) iqca1 (ENSPNAG00000009075) #24 ackr3b (ENSPNAG00000009081) trim63a (ENSPNAG00000009090) mlpha (ENSPNAG00000009109) LRRFIP1 (ENSPNAG00000009198) st6gal2b 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(ENSEEEG00000017476) si:dkey-260j18.2 (ENSEEEG00000017518) slc5a2 (ENSEEEG00000017561) fbxo46 (ENSEEEG00000018228) coq8b (ENSEEEG00000018241) NUMBL (ENSEEEG00000018291) UNC80 (ENSEEEG00000018295) psmb3 (ENSEEEG00000018300) SLC19A2 (ENSEEEG00000018301) ENSEEEG00000018303 faimb (ENSEEEG00000018304) AGAP1 (ENSEEEG00000018312) #22 gbx2 (ENSEEEG00000018425) iqca1 (ENSEEEG00000018427) #24 ackr3b (ENSEEEG00000018437) trim63a (ENSEEEG00000018440) mlpha (ENSEEEG00000018443) ENSEEEG00000018451 st6gal2b (ENSEEEG00000018454) ENSEEEG00000018458 ENSEEEG00000018462 nck2b (ENSEEEG00000018465) ENSEEEG00000018467 FHL2 (ENSEEEG00000018469) tgfbrap1 (ENSEEEG00000018481) GPR45 (ENSEEEG00000018482) mrps9 (ENSEEEG00000018498) Cyprinoidei DUPLICATION Cyprinoidei DUPLICATION Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00390000005935 ENSGT01090000260005.a.a.a.b.a.b.a ENSGT00940000158471 ENSGT00940000158542.a ENSGT00940000155890.a.b ENSGT00950000183022.b ENSGT00940000162768.B.b ENSGT00390000000089 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ENSGT00940000166042.a.a.a ENSGT00950000183138.a.b.r.a.a ENSGT00530000063564.b.a.a.a ENSGT00940000158714.c.d ENSGT01100000263502.A.a.a.a.b.b.a Goldfish MODERN SPECIES 46 tardbpb (ENSCARG00000055360) PTPRG (ENSCARG00000055791) ENSCARG00000055837 ENSCARG00000055892 ENSCARG00000056492 ENSCARG00000056510 ENSCARG00000056578 SLC19A1 (ENSCARG00000000192) ENSCARG00000000243 ENSCARG00000000426 UNC80 (ENSCARG00000000636) psmb3 (ENSCARG00000000927) ENSCARG00000000936 ENSCARG00000000952 faimb (ENSCARG00000000956) AGAP1 (ENSCARG00000001050) #22 gbx2 (ENSCARG00000001380) iqca1 (ENSCARG00000001386) #24 ackr3b (ENSCARG00000001402) trim63a (ENSCARG00000001405) mlpha (ENSCARG00000001411) ENSCARG00000001421 st6gal2b (ENSCARG00000001439) tmtops2a (ENSCARG00000001444) ENSCARG00000001449 ENSCARG00000001450 CAMK1 (ENSCARG00000001523) pbrm1l (ENSCARG00000002473) stau1 (ENSCARG00000002703) ENSCARG00000002752 ENSCARG00000002766 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 206 ENSGT00940000158471.i ENSGT00940000158542.a.a ENSGT00940000155890.a.b.a ENSGT00940000155400.A.g ENSGT00940000167200 ENSGT00940000158212.B ENSGT00950000183022.b.c ENSGT00940000162768.B.b.a ENSGT00390000000089.a ENSGT00640000091496.e ENSGT00640000091774.a.d ENSGT00550000074820.b ENSGT00950000183022.a.b.l ENSGT00940000164470.b ENSGT00390000007364.j.i ENSGT00940000154793.C.e.a.a #22 ENSGT00940000154365.a.b.g ENSGT00940000154067.c.eb.b.b #24 ENSGT01090000260051.b.b.ec.d.b ENSGT00940000166042.a.a.a ENSGT00950000183138.a.b.r.a.a ENSGT00530000063564.b.a.a.a ENSGT00940000158714.c.d ENSGT01100000263502.A.a.a.a.b.b.a ENSGT00390000000145.e.b ENSGT00970000193621.c.a ENSGT00940000157728.a.a.c.a ENSGT00390000007225.bc ENSGT00950000183028.a.a.a.g.b.g.b.a ENSGT00530000063596.A.i.b ENSGT00390000011204.c Common carp reference MODERN SPECIES 10 igfbp2a (ENSCCRG00000012457) igfbp5a (ENSCCRG00000058484) ENSCCRG00000030755 ENSCCRG00000061242 ENSCCRG00000065024 ENSCCRG00000031546 ENSCCRG00000031566 ENSCCRG00000031686 ENSCCRG00000070937 ENSCCRG00000053023 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pou3f3b (ENSSGRG00000046299) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154793.C.e.a.b #22 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154793.C.e.a.b #22 Golden-line barbel MODERN SPECIES 79 obsl1a (ENSSGRG00000018563) inha (ENSSGRG00000018555) ENSSGRG00000018553 stk11ip (ENSSGRG00000018549) igfbp2a (ENSSGRG00000018546) igfbp5a (ENSSGRG00000018545) ENSSGRG00000018542 ENSSGRG00000018536 SLC19A1 (ENSSGRG00000018510) ENSSGRG00000018498 ENSSGRG00000018124 UNC80 (ENSSGRG00000018121) psmb3 (ENSSGRG00000018119) SLC19A2 (ENSSGRG00000018118) ENSSGRG00000018117 AGAP1 (ENSSGRG00000015910) #22 gbx2 (ENSSGRG00000015884) iqca1 (ENSSGRG00000015878) #24 ackr3b (ENSSGRG00000015876) trim63a (ENSSGRG00000015875) trim63a (ENSSGRG00000015874) mlpha (ENSSGRG00000015872) ENSSGRG00000015867 Zebrafish MODERN SPECIES 21 ENSDARG00000097037 ENSDARG00000091845 ENSDARG00000116830 ENSDARG00000115519 ENSDARG00000097837 ENSDARG00000110832 ENSDARG00000111070 NOMO1 (ENSDARG00000078592) UNC80 (ENSDARG00000098290) ENSDARG00000076865 psmb3 (ENSDARG00000013938) zgc:161969 (ENSDARG00000041359) SLC19A2 (ENSDARG00000059712) ENSDARG00000030975 faimb (ENSDARG00000020814) AGAP1 (ENSDARG00000062123) #22 gbx2 (ENSDARG00000002933) ENSDARG00000115435 iqca1 (ENSDARG00000057276) #24 ackr3b (ENSDARG00000058179) trim63a (ENSDARG00000028027) mlpha (ENSDARG00000070991) ENSDARG00000095170 st6gal2b (ENSDARG00000088515) tmtops2a (ENSDARG00000061515) ENSDARG00000112756 ecrg4b (ENSDARG00000088717) ENSDARG00000096905 nck2b (ENSDARG00000043361) dph3 (ENSDARG00000043360) fhl2b (ENSDARG00000003991) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154793.C.e.b #22 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 298 ENSGT00940000158471.j ENSGT00940000158542.a.b ENSGT00940000155890.a.b.b ENSGT00940000155400.A.h ENSGT00940000162768.B.b.b ENSGT00390000000089.b ENSGT00640000091496.f ENSGT00550000074820.a ENSGT00950000183022.a.b.k ENSGT00390000007364.j.j ENSGT00940000154793.C.e.b #22 ENSGT00940000154365.a.b.h ENSGT01090000260051.b.b.ec.d.a 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(ENSCCRG00000040189) ENSCCRG00000060811 Goldfish MODERN SPECIES 24 ENSCARG00000038650 igfbp2a (ENSCARG00000038663) ENSCARG00000038678 igfbp5a (ENSCARG00000038690) ENSCARG00000038705 ENSCARG00000038710 ENSCARG00000038717 ENSCARG00000005882 ENSCARG00000006258 ENSCARG00000006688 ENSCARG00000008450 psmb3 (ENSCARG00000008453) SLC19A2 (ENSCARG00000008464) ENSCARG00000008477 faimb (ENSCARG00000008488) AGAP1 (ENSCARG00000008585) #22 gbx2 (ENSCARG00000010270) ackr3b (ENSCARG00000010278) ENSCARG00000010285 trim63a (ENSCARG00000010292) mlpha (ENSCARG00000010304) ENSCARG00000010329 st6gal2b (ENSCARG00000010343) tmtops2a (ENSCARG00000010354) ecrg4b (ENSCARG00000010369) ENSCARG00000010371 NCK2 (ENSCARG00000010374) dph3 (ENSCARG00000010384) fhl2b (ENSCARG00000010389) tgfbrap1 (ENSCARG00000010408) mrps9 (ENSCARG00000010475) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154793.C.f #22 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154793.C.f #22 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154793.C.f #22 Golden-line barbel MODERN SPECIES 811 ENSSGRG00000041732 ENSSGRG00000041735 SLC19A1 (ENSSGRG00000041736) ENSSGRG00000041741 ENSSGRG00000041795 ENSSGRG00000041980 psmb3 (ENSSGRG00000041997) faimb (ENSSGRG00000042020) ENSSGRG00000042021 #22 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 272 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000010308 ENSGT00940000164470.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000157652 ENSGT01030000234570.d.a.p ENSGT00530000063186.b.b ENSGT00940000154695.d.b.b ENSGT00940000159224.b ENSGT00940000165586.b ENSGT00940000155235.k.b ENSGT00940000155408.o.b ENSGT00940000157249 ENSGT00940000154453.a.b.a.a.b Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 112 ENSGT00940000158265 ENSGT00940000165301.b ENSGT00940000154817.b.b.b.p ENSGT00940000159213.q.b ENSGT00940000159862.b ENSGT00940000155984.i.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT01090000260051.b.b.dc.a ENSGT00940000166042.a ENSGT00950000183138.a.b.r.a 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Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000176171 ENSGT00500000044939 ENSGT00390000005159.j ENSGT00940000156444.c ENSGT00940000155861.C.e ENSGT00940000159606 ENSGT00940000158239.b ENSGT00940000164897.a.b ENSGT00940000158265 ENSGT00940000165301.b ENSGT00940000154817.b.b.b.p ENSGT00940000159213.q.b ENSGT00940000159862.b ENSGT00940000155984.i.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT01090000260051.b.b.dc.a ENSGT00940000166042.a ENSGT00950000183138.a.b.r.a ENSGT00530000063564.b.b.a ENSGT00530000063564.b.a.a ENSGT00940000158714.c ENSGT01100000263502.A.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000157728.a.a ENSGT00390000007225 ENSGT00950000183028.a.a.a.g.b ENSGT00390000014376.c.b ENSGT00940000178373 ENSGT01030000235131 ENSGT00940000155773.a Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 11 tmem237b (ENSMMDG00005019232) MPP4 (ENSMMDG00005019240) ALS2 (ENSMMDG00005019353) cdk15 (ENSMMDG00005019730) fzd7a (ENSMMDG00005019732) ENSMMDG00005019733 ENSMMDG00005019738 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ENSGT00940000156634.b ENSGT00940000158614 ENSGT00940000168817 ENSGT00730000111912.A.b ENSGT00940000175362 ENSGT00940000158265 ENSGT00940000165301.b ENSGT00940000154817.b.b.b.p ENSGT00940000159213.q.b ENSGT00940000159862.b ENSGT00940000155984.i.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00390000016811.g.h ENSGT00390000002143.b.b ENSGT00390000002188 ENSGT00940000155248.vb.g.b ENSGT00940000155248.vb.g.a ENSGT00950000182913.A.b.a ENSGT00940000163243 ENSGT00940000179865 ENSGT00390000008846 ENSGT00940000160303.a.b ENSGT00940000154607.a ENSGT00510000048137 ENSGT00940000159969.b.a.b ENSGT00940000175756 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000159213.q.b ENSGT00940000159862.b ENSGT00940000155984.i.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00390000016811.g.g.a ENSGT00390000002143.b.b ENSGT00390000002188 ENSGT00940000155248.vb.g.b ENSGT00940000155248.vb.g.a ENSGT00950000182913.A.b.a ENSGT00940000163243 ENSGT00940000179865 ENSGT00390000008846 ENSGT00940000160303.a.b ENSGT00940000154607.a ENSGT00510000048137 ENSGT00940000159969.b.a.b ENSGT00940000175756 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 222 ENSGT00940000177199 ENSGT00940000154817.b.b.b.p ENSGT00940000159213.q.b ENSGT00940000159862.b ENSGT00940000155984.i.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b Bicolor damselfish MODERN SPECIES 2301 ENSSPAG00000007844 #22 gbx2 (ENSSPAG00000007837) Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 258 ENSGT00940000159213.q.b ENSGT00940000159862.b ENSGT00940000155984.i.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b Spiny chromis MODERN SPECIES 1429 AGAP1 (ENSAPOG00000013964) #22 gbx2 (ENSAPOG00000013994) Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 280 ENSGT00390000002188 ENSGT00390000002143.b.b ENSGT00390000016811.g.g.a ENSGT00940000159213.q.b ENSGT00940000159862.b ENSGT00940000155984.i.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b Orange clownfish MODERN SPECIES 16 cd59 (ENSAPEG00000007881) SNX9 (ENSAPEG00000007655) ENSAPEG00000007555 mlpha (ENSAPEG00000007517) trim63a (ENSAPEG00000007491) ST6GAL2 (ENSAPEG00000007468) ECRG4 (ENSAPEG00000007434) ENSAPEG00000007414 EFR3B (ENSAPEG00000007392) pomca (ENSAPEG00000007378) GLI2 (ENSAPEG00000007312) ENSAPEG00000007292 INHBB (ENSAPEG00000007274) ENSAPEG00000007259 faimb (ENSAPEG00000007243) AGAP1 (ENSAPEG00000007151) #22 gbx2 (ENSAPEG00000007090) ENSAPEG00000006851 ENSAPEG00000006802 f10 (ENSAPEG00000006789) ENSAPEG00000006773 ENSAPEG00000006763 CLASP1 (ENSAPEG00000006647) ENSAPEG00000006625 ENSAPEG00000006561 ENSAPEG00000006528 GPR180 (ENSAPEG00000006487) ENSAPEG00000006410 ENSAPEG00000005976 SLC5A3 (ENSAPEG00000005887) ENSAPEG00000005865 Clown anemonefish DUPLICATION Clown anemonefish MODERN SPECIES 3211 ENSAOCG00000018825 #22 Clown anemonefish MODERN SPECIES 2578 ENSAOCG00000011635 FAIM (ENSAOCG00000011608) ENSAOCG00000011547 #22 ENSAOCG00000011506 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00940000159213.q.b ENSGT00940000159862.b ENSGT00940000155984.i.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00390000016811.g.g.a ENSGT00390000002143.b.b ENSGT00390000002188 ENSGT00940000155248.vb.g.b ENSGT00940000155248.vb.g.a ENSGT00950000182913.A.b.a ENSGT00940000163243 ENSGT00940000179865 ENSGT00390000008846 ENSGT00940000160303.a.b ENSGT00940000154607.a ENSGT00510000048137 ENSGT00940000159969.b.a.b ENSGT00940000175756 Midas cichlid MODERN SPECIES 528 ENSACIG00000007770 GLI2 (ENSACIG00000007662) INHBB (ENSACIG00000007640) ralbb (ENSACIG00000007537) faimb (ENSACIG00000007524) AGAP1 (ENSACIG00000007484) #22 gbx2 (ENSACIG00000007467) ENSACIG00000007457 ENSACIG00000007342 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000154851.A.o ENSGT00940000159723 ENSGT00940000158687.a.b ENSGT00940000156634.b ENSGT00940000158614 ENSGT00940000168817.p.b ENSGT00940000154817.b.b.b.p ENSGT00940000158265 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b.k.a.a.a.a.b.a.a.a ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b.k.a.a.a.a.b.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b.k.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000159213.q.b ENSGT00940000159862.b ENSGT00940000155984.i.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b.k.a.a.a.b ENSGT00390000016811.g.g.a ENSGT00390000002143.b.b ENSGT00390000002188 ENSGT00940000155248.vb.g.b ENSGT00940000155248.vb.g.a ENSGT00950000182913.A.b.a ENSGT00940000163243 ENSGT00940000179865 ENSGT00390000008846 ENSGT00940000160303.a.b ENSGT00940000154607.a ENSGT00510000048137 ENSGT00940000159969.b.a.b Nile tilapia MODERN SPECIES 14 ENSONIG00000030316 ENSONIG00000028044 ENSONIG00000034140 ENSONIG00000033365 ENSONIG00000041932 ENSONIG00000038974 ENSONIG00000033425 ENSONIG00000042604 ENSONIG00000027424 ENSONIG00000029213 ENSONIG00000020644 gli2b (ENSONIG00000003608) INHBB (ENSONIG00000032287) ralbb (ENSONIG00000003604) faimb (ENSONIG00000003601) AGAP1 (ENSONIG00000003589) #22 gbx2 (ENSONIG00000039796) ENSONIG00000003583 ENSONIG00000038577 ENSONIG00000038485 ENSONIG00000036642 ENSONIG00000038930 ENSONIG00000038516 ENSONIG00000038421 ENSONIG00000038677 ENSONIG00000035529 ENSONIG00000039704 ENSONIG00000003976 ENSONIG00000039544 ENSONIG00000039119 mid1ip1b (ENSONIG00000009043) Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158687.a.b ENSGT00940000156634.b ENSGT00940000158614 ENSGT00940000168817.p.b ENSGT00940000168817.p.a.a.a ENSGT00940000154851.A.p ENSGT00940000154817.b.b.b.p ENSGT00940000158265 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b.k.a.a.a.a.b.a.a.a ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b.k.a.a.a.a.b.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b.k.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000159213.q.b ENSGT00940000159862.b ENSGT00940000155984.i.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT01100000263513.a.a.b.b.b.b.b.a.b.a.a.a ENSGT00940000162312.h.e.b.b.a.b ENSGT00390000016811.g.g.a ENSGT00390000002143.b.b ENSGT00390000002188 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ENSPNYG00000009542 ENSPNYG00000009517 ENSPNYG00000009453 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 70 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b.k.a.a.a.a.b.b.b ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b.k.a.a.a.a.a.a.a.a.b.b.a ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b.k.a.a.a.a.a.a.a.a.b.a.a ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b.k.a.a.a.a.b.b.a ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b.k.a.a.a.a.a.a.a.a.a ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b.k.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000159213.q.b ENSGT00940000159862.b ENSGT00940000155984.i.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000166049.pb.b ENSGT01100000263513.a.a.b.b.b.b.b.a.b.a.a.a ENSGT01040000240400.c.a.b.a.b.a.a.b.a.b.b.k.a.a.a.b ENSGT00390000016811.g.g.a ENSGT00390000002143.b.b ENSGT00390000002188 ENSGT00940000153866.A.k.b.a.a.a.a ENSGT00940000155533.d ENSGT00940000154766.b ENSGT00940000166969.b ENSGT00940000155248.vb.g.b ENSGT00940000155248.vb.g.a ENSGT00950000182913.A.b.a ENSGT00940000163243 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ENSOJAG00000001172 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00940000158209 ENSGT00940000154474.A ENSGT00940000154474.B.a ENSGT00940000157694 ENSGT00940000154505.A.c ENSGT00390000001101 ENSGT00940000160000 ENSGT00390000018525.a.b.f ENSGT00940000165332.C ENSGT00940000164059 ENSGT00940000154817.b.b.b.p ENSGT00940000159213.q.b ENSGT00940000159862.b ENSGT00940000155984.i.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00390000016811.g.h ENSGT00390000002143.b.b ENSGT00390000002188 ENSGT00940000155248.vb.g.b ENSGT00940000155248.vb.g.a ENSGT00950000182913.A.b.a ENSGT00940000163243 ENSGT00390000008846 ENSGT00940000160303.a.b ENSGT00390000004585 ENSGT00940000154607.a ENSGT00510000048137 ENSGT00940000159969.b.a.b ENSGT00940000175756 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 11 f7 (ENSORLG00000001180) f10 (ENSORLG00000025207) ENSORLG00000001211 pcid2 (ENSORLG00000001231) ENSORLG00000001239 ENSORLG00000025319 ENSORLG00000023332 f2 (ENSORLG00000019844) ENSORLG00000000197 ENSORLG00000001248 CLASP1 (ENSORLG00000001312) gli2b (ENSORLG00000001328) INHBB (ENSORLG00000001340) ENSORLG00000001355 faimb (ENSORLG00000026394) AGAP1 (ENSORLG00000001374) #22 gbx2 (ENSORLG00000028146) pomca (ENSORLG00000025908) ENSORLG00000001436 ENSORLG00000001455 ENSORLG00000001484 ENSORLG00000024973 bco1l (ENSORLG00000001512) ENSORLG00000001525 lipt1 (ENSORLG00000001533) ENSORLG00000022258 ENSORLG00000030505 ENSORLG00000027295 SH3YL1 (ENSORLG00000001545) ENSORLG00000023474 ENSORLG00000027424 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 83 ENSGT00940000158265 ENSGT00940000154817.b.b.b.p ENSGT00940000159213.q.b ENSGT00940000159862.b ENSGT00940000155984.i.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00390000016811.g.h Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 104 ENSGT00940000158265 ENSGT00940000154817.b.b.b.p ENSGT00940000159213.q.b ENSGT00940000159862.b ENSGT00940000155984.i.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00390000016811.g.h Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000159169 ENSGT00390000005581.a ENSGT01100000263489.a.a.b.a.a.b.b.b.b.a.a ENSGT00940000153737.b.g.a ENSGT00500000044890.a.a.f ENSGT00940000156153.y.b ENSGT00950000183114.a.a ENSGT00940000166718 ENSGT00940000157133 ENSGT00940000158265 ENSGT00940000154817.b.b.b.p ENSGT00940000159213.q.b ENSGT00940000159862.b ENSGT00940000155984.i.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00390000016811.g.h ENSGT00390000007225 ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.b ENSGT00390000016940.c.b.b ENSGT00940000155522.g.b ENSGT00390000003164 ENSGT00940000154095.b.b.a.a ENSGT00950000183165.b.a.e.b.d.b ENSGT00950000182882.A.b.b.f ENSGT00940000164444.b ENSGT00390000009940 ENSGT00390000014242.k.c ENSGT00940000155009.b ENSGT00940000166110 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000159169 ENSGT00390000005581.a ENSGT01100000263489.a.a.b.a.a.b.b.b.b.a.a ENSGT00940000153737.b.g.a ENSGT00500000044890.a.a.f ENSGT00940000156153.y.b ENSGT00950000183114.a.a ENSGT00940000166718 ENSGT00940000157133 ENSGT00940000158265 ENSGT00940000154817.b.b.b.p ENSGT00940000159213.q.b ENSGT00940000159862.b ENSGT00940000155984.i.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00390000016811.g.h ENSGT00390000007225 ENSGT00950000182905.a.a.a.a.a.b ENSGT00390000016940.c.b.b ENSGT00940000155522.g.b ENSGT00390000003164 ENSGT00940000154095.b.b.a.a ENSGT00950000183165.b.a.e.b.d.b ENSGT00950000182882.A.b.b.f ENSGT00940000164444.b ENSGT00390000009940 ENSGT00390000014242.k.c ENSGT00940000155009.b ENSGT00940000166110 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 324 ENSGT00500000044890.a.a.f ENSGT00940000156153.y.b ENSGT00950000183114.a.a ENSGT00940000166718 ENSGT00940000157133 ENSGT00940000158265 ENSGT00940000154817.b.b.b.p ENSGT00940000159862.b ENSGT00940000155984.i.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00390000016811.g.h ENSGT00390000007225 Sailfin molly MODERN SPECIES 396 mid1ip1b (ENSPLAG00000008599) tspan7b (ENSPLAG00000008677) XDH (ENSPLAG00000008793) ENSPLAG00000008821 dnajc27 (ENSPLAG00000008845) ENSPLAG00000008856 clcn4 (ENSPLAG00000000184) ENSPLAG00000008890 ENSPLAG00000008947 ENSPLAG00000008979 INHBB (ENSPLAG00000008988) ENSPLAG00000008996 faimb (ENSPLAG00000009030) AGAP1 (ENSPLAG00000009106) #22 gbx2 (ENSPLAG00000009111) pomca (ENSPLAG00000009124) dph3 (ENSPLAG00000009140) Amazon molly MODERN SPECIES 516 mid1ip1b (ENSPFOG00000020004) tspan7b (ENSPFOG00000007487) XDH (ENSPFOG00000006876) ENSPFOG00000006456 dnajc27 (ENSPFOG00000006335) ENSPFOG00000006324 ENSPFOG00000006222 ENSPFOG00000006206 clcn4 (ENSPFOG00000006075) CLASP1 (ENSPFOG00000005373) ENSPFOG00000005116 INHBB (ENSPFOG00000005088) ENSPFOG00000005056 faimb (ENSPFOG00000004988) AGAP1 (ENSPFOG00000004340) #22 gbx2 (ENSPFOG00000004268) pomca (ENSPFOG00000004254) dph3 (ENSPFOG00000004226) ENSPFOG00000024498 Guppy MODERN SPECIES 450 ENSPREG00000012337 ENSPREG00000012351 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MLPH (ENSNFUG00015011558) SNX9 (ENSNFUG00015011387) BX957297.2 (ENSNFUG00015011364) ENSNFUG00015011343 EEF1B2 (ENSNFUG00015011306) arl11 (ENSNFUG00015011283) ebpl (ENSNFUG00015011262) ENSNFUG00015011253 SLC19A2 (ENSNFUG00015011244) ENSNFUG00015011234 ENSNFUG00015011228 ENSNFUG00015011220 Mangrove rivulus DUPLICATION Mangrove rivulus MODERN SPECIES 761 AGAP1 (ENSKMAG00000014359) #22 gbx2 (ENSKMAG00000014348) Mangrove rivulus MODERN SPECIES 1442 ENSKMAG00000001610 #22 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000166110 ENSGT00940000154851.A ENSGT00940000159723 ENSGT00940000178221 ENSGT00940000158687.a.b ENSGT00940000156634.b ENSGT00940000158614 ENSGT00940000168817 ENSGT00940000158265 ENSGT00940000165301.b ENSGT00940000154817.b.b.b.p ENSGT00940000159213.q.b ENSGT00940000159862.b ENSGT00940000155984.i.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00390000016811.g.g.a ENSGT00390000002143.b.b ENSGT00390000002188 ENSGT00940000155248.vb.g.b 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SPECIES 36 ENSGT00940000158265 ENSGT00940000165301.b ENSGT00940000154817.b.b.b.p ENSGT00940000159213.q.b ENSGT00940000159862.b ENSGT00940000155984.i.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00390000016811.g.g.a ENSGT00390000002143.b.b ENSGT00390000002188 ENSGT00940000155248.vb.g.b ENSGT00940000155248.vb.g.a ENSGT00950000182913.A.b.a ENSGT00940000163243 ENSGT00390000008846 ENSGT00940000160303.a.b ENSGT00940000154607.a ENSGT00510000048137 ENSGT00940000159969.b.a.b ENSGT00940000175756 ENSGT00940000153571.b Zig-zag eel MODERN SPECIES 11 ENSMAMG00000022514 ahr1b (ENSMAMG00000022515) ENSMAMG00000022516 mfsd6a (ENSMAMG00000022518) nab1a (ENSMAMG00000022520) glsa (ENSMAMG00000022523) ENSMAMG00000022525 ENSMAMG00000022527 ENSMAMG00000022531 ENSMAMG00000022534 CLASP1 (ENSMAMG00000022535) ENSMAMG00000022543 INHBB (ENSMAMG00000027863) ENSMAMG00000022548 faimb (ENSMAMG00000022549) ENSMAMG00000022551 #22 ENSMAMG00000022554 gbx2 (ENSMAMG00000022558) ENSMAMG00000022559 ENSMAMG00000022560 ENSMAMG00000026849 ENSMAMG00000022563 ENSMAMG00000024349 ENSMAMG00000022565 ENSMAMG00000026531 ENSMAMG00000022568 ENSMAMG00000022570 ENSMAMG00000022576 ENSMAMG00000022581 ENSMAMG00000022585 ENSMAMG00000022607 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000177277 ENSGT00940000167649 ENSGT01050000244905.A.a ENSGT00390000010463.a.b.c.a ENSGT00390000006330.a.a.b ENSGT00530000063599.B ENSGT00940000155311.B ENSGT00940000154486.b.b.a.a ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.b ENSGT00940000158265 ENSGT00940000154817.b.b.b.p ENSGT00940000159213.q.b ENSGT00940000159862.b ENSGT00940000155984.i.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00390000016811.g.g.a ENSGT00390000002143.b.b ENSGT00390000002188 ENSGT00940000155248.vb.g.a ENSGT00950000182913.A.b.a ENSGT00940000163243 ENSGT00390000008846 ENSGT00940000160303.a.b ENSGT00940000154607.a ENSGT00510000048137 ENSGT00940000175756 ENSGT00940000172021 ENSGT00940000153571.b ENSGT00940000158614 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 10 s100b (ENSBSLG00000010525) mstna (ENSBSLG00000010533) stat1a (ENSBSLG00000010548) glsa (ENSBSLG00000011120) nab1a (ENSBSLG00000011389) mfsd6a (ENSBSLG00000011394) ENSBSLG00000011399 ENSBSLG00000011400 clcn4 (ENSBSLG00000011430) CLASP1 (ENSBSLG00000013719) ENSBSLG00000019701 GLI2 (ENSBSLG00000019708) ENSBSLG00000019723 INHBB (ENSBSLG00000019726) ENSBSLG00000019728 AGAP1 (ENSBSLG00000019882) #22 gbx2 (ENSBSLG00000020418) mylz3 (ENSBSLG00000020425) lancl1 (ENSBSLG00000020438) erbb4a (ENSBSLG00000020537) RAMP1 (ENSBSLG00000022196) klf7a (ENSBSLG00000022198) CREB1 (ENSBSLG00000022332) mettl21a (ENSBSLG00000022369) ENSBSLG00000022388 ENSBSLG00000022466 ENSBSLG00000022605 igfbp5a (ENSBSLG00000022607) igfbp2a (ENSBSLG00000022803) stk11ip (ENSBSLG00000022845) ENSBSLG00000022921 Climbing perch MODERN SPECIES 11 glsa (ENSATEG00000012895) nab1a (ENSATEG00000012852) ENSATEG00000029503 mfsd6a (ENSATEG00000012822) ENSATEG00000012809 ahr1b (ENSATEG00000012788) ENSATEG00000012774 ENSATEG00000012721 ENSATEG00000012706 ENSATEG00000012700 CLASP1 (ENSATEG00000012593) ENSATEG00000012337 INHBB (ENSATEG00000012307) ENSATEG00000012302 faimb (ENSATEG00000012276) ENSATEG00000012222 #22 gbx2 (ENSATEG00000012203) ENSATEG00000011969 ENSATEG00000011744 ENSATEG00000011727 ENSATEG00000011617 ENSATEG00000011507 ENSATEG00000011451 ENSATEG00000011345 ENSATEG00000011259 ENSATEG00000006757 ENSATEG00000006751 ENSATEG00000029705 ENSATEG00000011172 ENSATEG00000011166 ENSATEG00000026564 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000157694 ENSGT00940000154505.A.c ENSGT00390000001101 ENSGT00940000160000 ENSGT00390000018525.a.b.f ENSGT00940000165332.C ENSGT00940000164059 ENSGT00940000168817 ENSGT00940000158265 ENSGT00940000165301.b ENSGT00940000154817.b.b.b.p ENSGT00940000159213.q.b ENSGT00940000159862.b ENSGT00940000155984.i.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000153571.b ENSGT00940000172021 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ENSGT00390000002188 Seriola ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00940000154474.B.a ENSGT00940000154474.B.b ENSGT00940000157694 ENSGT00940000154505.A.c ENSGT00390000001101 ENSGT00940000160000 ENSGT00390000018525.a.b.f ENSGT00940000165332.C ENSGT00940000164059 ENSGT00940000177199.a.b ENSGT00940000154817.b.b.b.p ENSGT00940000159213.q.b ENSGT00940000159862.b ENSGT00940000155984.i.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00940000153571.b ENSGT00940000172021 ENSGT00940000175756 ENSGT00940000159969.b.a.b ENSGT00510000048137 ENSGT00940000154607.a ENSGT00390000004585 ENSGT00390000008846 ENSGT00940000163243 ENSGT00950000182913.A.b.a ENSGT00940000155248.vb.g.a ENSGT00940000155248.vb.g.b ENSGT00390000002188 ENSGT00390000002143.b.b Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3263 f7 (ENSSLDG00000014996) f7i (ENSSLDG00000014979) f10 (ENSSLDG00000014961) prozb (ENSSLDG00000014942) pcid2 (ENSSLDG00000014914) ENSSLDG00000014716 ENSSLDG00000014653 ENSSLDG00000014615 f2 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MODERN SPECIES 404 gli2b (ENSLCAG00010002691) INHBB (ENSLCAG00010002699) ENSLCAG00010002707 faimb (ENSLCAG00010002716) AGAP1 (ENSLCAG00010002735) #22 ENSLCAG00010002775 gbx2 (ENSLCAG00010002779) lipt1 (ENSLCAG00010002784) ENSLCAG00010002832 bco1l (ENSLCAG00010003099) ENSLCAG00010003382 EFR3B (ENSLCAG00010003396) pomca (ENSLCAG00010003429) Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 124 ENSGT00940000159213.q.b ENSGT00940000159862.b ENSGT00940000155984.i.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b Tongue sole MODERN SPECIES 5 ENSCSEG00000008956 abi3bpb (ENSCSEG00000008989) ftcd (ENSCSEG00000009019) ENSCSEG00000009053 ENSCSEG00000009060 ENSCSEG00000009064 mlpha (ENSCSEG00000009091) ENSCSEG00000009127 ENSCSEG00000009143 eef1b2 (ENSCSEG00000009151) arl11 (ENSCSEG00000009161) ebpl (ENSCSEG00000009172) ENSCSEG00000009207 INHBB (ENSCSEG00000009232) ENSCSEG00000009239 AGAP1 (ENSCSEG00000009268) #22 gbx2 (ENSCSEG00000009352) SCAI (ENSCSEG00000009360) derl2 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ENSGT00940000159213.q.b ENSGT00940000159862.b ENSGT00940000155984.i.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000166110 ENSGT00940000154851.A ENSGT00940000159723 ENSGT00940000178221 ENSGT00940000158687.a.b ENSGT00940000156634.b ENSGT00940000158614 ENSGT00940000168817 ENSGT00940000158265 ENSGT00940000165301.b ENSGT00940000154817.b.b.b.p ENSGT00940000159213.q.b ENSGT00940000159862.b ENSGT00940000155984.i.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00940000155009.b ENSGT00940000166110 ENSGT00940000154851.A ENSGT00940000159723 ENSGT00940000158687.a.b ENSGT00940000156634.b ENSGT00940000158614 ENSGT00940000168817 ENSGT00940000158265 ENSGT00940000165301.b ENSGT00940000154817.b.b.b.p ENSGT00940000159213.q.b ENSGT00940000159862.b ENSGT00940000155984.i.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b Eupercaria_incertae_sedis 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ENSSAUG00010026259 ENSSAUG00010026252 ENSSAUG00010026249 ENSSAUG00010026247 ENSSAUG00010026227 ENSSAUG00010026218 ENSSAUG00010026217 clcn4 (ENSSAUG00010026096) ENSSAUG00010026074 CLASP1 (ENSSAUG00010019591) gli2b (ENSSAUG00010019244) ENSSAUG00010019233 INHBB (ENSSAUG00010019229) ENSSAUG00010019227 faimb (ENSSAUG00010019225) AGAP1 (ENSSAUG00010017889) #22 gbx2 (ENSSAUG00010017866) ENSSAUG00010027283 ENSSAUG00010027281 ephx2 (ENSSAUG00010027279) plaat1l (ENSSAUG00010027276) ZNF513 (ENSSAUG00010027275) dusp27 (ENSSAUG00010027272) ENSSAUG00010027271 ENSSAUG00010027269 cybb (ENSSAUG00010027164) dynlt3 (ENSSAUG00010027157) rpgrb (ENSSAUG00010027153) tdp2b (ENSSAUG00010027152) nhej1 (ENSSAUG00010027151) ihhb (ENSSAUG00010027150) Perciformes ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000155009.b ENSGT00940000166110 ENSGT00940000154851.A ENSGT00940000159723 ENSGT00940000178221 ENSGT00940000158687.a.b ENSGT00940000156634.b ENSGT00940000158614 ENSGT00940000158265 ENSGT00940000165301.b 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stat1a (ENSCGOG00000008365) glsa (ENSCGOG00000006267) Pike perch MODERN SPECIES 9 ENSSLUG00000026099 dynlt3 (ENSSLUG00000026103) cybb (ENSSLUG00000026104) ENSSLUG00000026105 dusp27 (ENSSLUG00000026106) ENSSLUG00000000117 ENSSLUG00000000123 plaat1l (ENSSLUG00000000128) clcn4 (ENSSLUG00000000339) ENSSLUG00000000892 CLASP1 (ENSSLUG00000000970) gli2b (ENSSLUG00000001131) INHBB (ENSSLUG00000001146) ENSSLUG00000001151 faimb (ENSSLUG00000001156) AGAP1 (ENSSLUG00000001214) #22 ENSSLUG00000001374 gbx2 (ENSSLUG00000001377) ENSSLUG00000001381 EFR3B (ENSSLUG00000001408) pomca (ENSSLUG00000001596) mlpha (ENSSLUG00000001612) ENSSLUG00000001629 st6gal2b (ENSSLUG00000001670) ENSSLUG00000001732 ENSSLUG00000001783 ENSSLUG00000001810 Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 1908 ENSLBEG00000005094 #22 gbx2 (ENSLBEG00000005114) Ballan wrasse MODERN SPECIES 301 rpgrb (ENSLBEG00000012095) dynlt3 (ENSLBEG00000012144) cybb (ENSLBEG00000012180) ENSLBEG00000012231 ENSLBEG00000012320 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(ENSTRUG00000023005) ENSTRUG00000011454 ENSTRUG00000011217 CLASP1 (ENSTRUG00000029577) gli2b (ENSTRUG00000010444) INHBB (ENSTRUG00000030143) ENSTRUG00000025204 faimb (ENSTRUG00000010234) AGAP1 (ENSTRUG00000009878) #22 gbx2 (ENSTRUG00000009833) pomc (ENSTRUG00000009747) EFR3B (ENSTRUG00000029981) ENSTRUG00000009218 bco1l (ENSTRUG00000007927) ENSTRUG00000007772 ENSTRUG00000022217 lipt1 (ENSTRUG00000007709) ENSTRUG00000028768 ENSTRUG00000024183 ENSTRUG00000007559 ENSTRUG00000021198 ENSTRUG00000027566 ENSTRUG00000030671 ENSTRUG00000033245 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 125 ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000010308 ENSGT00940000164470.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b ENSGT00930000151029.i.b ENSGT00640000091496 ENSGT00940000156597.a.b.b.a ENSGT00940000157652 ENSGT01030000234570.d.a.p ENSGT00530000063186.b.b ENSGT00940000154695.d.b.b ENSGT00940000159224.b ENSGT00940000165586.b ENSGT00940000155235.k.b ENSGT00940000155408.o.b ENSGT00940000157249 ENSGT00940000154453.a.b.a.a.b ENSGT00940000162639.b Northern pike MODERN SPECIES 21 ENSELUG00000026342 ENSELUG00000028550 cavin2b (ENSELUG00000003306) vps16 (ENSELUG00000003287) rgn (ENSELUG00000003236) zgc:112023 (ENSELUG00000001412) ENSELUG00000024817 nabp1b (ENSELUG00000003192) ENSELUG00000003175 ENSELUG00000003147 ENSELUG00000003136 SLC19A2 (ENSELUG00000003124) atg3 (ENSELUG00000003117) ENSELUG00000003103 faimb (ENSELUG00000003092) AGAP1 (ENSELUG00000003061) #22 ENSELUG00000032508 gbx2 (ENSELUG00000002965) iqca1 (ENSELUG00000002950) #24 ENSELUG00000026109 ACKR3 (ENSELUG00000002929) mlpha (ENSELUG00000002904) ENSELUG00000002824 SNX4 (ENSELUG00000002675) UNC80 (ENSELUG00000032668) ENSELUG00000002609 acadl (ENSELUG00000002558) mylz3 (ENSELUG00000033756) lancl1 (ENSELUG00000002523) erbb4a (ENSELUG00000002509) RAMP1 (ENSELUG00000002486) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 473 ENSGT00390000010308.g.a ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00950000182900.C.ib ENSGT00510000047120.gb.f 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ENSGT00940000156186.l.a.c ENSGT00940000155675.p.b ENSGT00950000183140.a.a.k.b ENSGT00940000156056.A.j.c ENSGT00950000182910.a.a.d ENSGT00390000003896.e ENSGT00390000014995.k ENSGT00940000161625.m.c ENSGT00940000155812.u.b ENSGT00510000047120.gb.f.a.b ENSGT00950000182900.C.ib ENSGT00950000183022.a.b ENSGT00390000010308.h ENSGT00940000164470.b ENSGT00390000007364.j ENSGT00940000154793.C #22 ENSGT00940000154365.a.b.d ENSGT01070000255150 Rainbow trout DUPLICATION Rainbow trout MODERN SPECIES 9 ENSOMYG00000066202 ENSOMYG00000008833 vps16 (ENSOMYG00000008747) ENSOMYG00000069912 zgc:112023 (ENSOMYG00000008315) ENSOMYG00000008669 ENSOMYG00000055339 ENSOMYG00000008005 ENSOMYG00000007705 ENSOMYG00000007211 ENSOMYG00000007143 ENSOMYG00000006806 faimb (ENSOMYG00000006656) ENSOMYG00000062407 ENSOMYG00000070608 AGAP1 (ENSOMYG00000064555) #22 gbx2 (ENSOMYG00000070878) iqca1 (ENSOMYG00000076046) #24 ENSOMYG00000073042 ACKR3 (ENSOMYG00000062182) mlpha (ENSOMYG00000052308) ENSOMYG00000006329 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#22 PRIM1 (ENSPMAG00000008970) ENSPMAG00000010206 ENSPMAG00000008982 Lamprey MODERN SPECIES 1923 ENSPMAG00000001670 #22 ENSPMAG00000001664 ENSPMAG00000001661 USP15 (ENSPMAG00000001614) Hagfish DUPLICATION Hagfish MODERN SPECIES 912 ENSEBUG00000005992 ENSEBUG00000009385 ENSEBUG00000016104 ENSEBUG00000000933 ENSEBUG00000011835 ENSEBUG00000008291 ENSEBUG00000002755 ENSEBUG00000009715 #22 ENSEBUG00000008379 ENSEBUG00000014561 ENSEBUG00000000589 ENSEBUG00000011650 ENSEBUG00000016399 ENSEBUG00000010391 ENSEBUG00000011440 ENSEBUG00000005459 ENSEBUG00000006515 ENSEBUG00000010470 chsy1 (ENSEBUG00000015487) ENSEBUG00000010797 ENSEBUG00000004082 ENSEBUG00000006880 UBE2Q1 (ENSEBUG00000013056) Hagfish MODERN SPECIES 361 ENSEBUG00000003937 lrrn1 (ENSEBUG00000004804) ENSEBUG00000002679 ENSEBUG00000002242 ENSEBUG00000012895 ENSEBUG00000007000 ENSEBUG00000012507 ENSEBUG00000006336 #22