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Guinea pig	MODERN SPECIES	9	AMDHD1 (ENSCPOG00000001031) #7	HAL (ENSCPOG00000013043) #8	LTA4H (ENSCPOG00000013048) #9	ELK3 (ENSCPOG00000005065) #10	CDK17 (ENSCPOG00000005070) #11	CFAP54 (ENSCPOG00000009624) #12	NEDD1 (ENSCPOG00000009631) #13	ENSCPOG00000004978 #14	TMPO (ENSCPOG00000011604) #15	SLC25A3 (ENSCPOG00000011606) #16	IKBIP (ENSCPOG00000040634) #17	APAF1 (ENSCPOG00000015196) #18	ANKS1B (ENSCPOG00000015197) #19	BLTP3B (ENSCPOG00000009379) #20	ACTR6 (ENSCPOG00000024022) #21	SCYL2 (ENSCPOG00000015459) #22	SLC17A8 (ENSCPOG00000009083) #23	NR1H4 (ENSCPOG00000002168) #24	GAS2L3 (ENSCPOG00000036868) #25	ANO4 (ENSCPOG00000008963) #26	SLC5A8 (ENSCPOG00000010055) #27	UTP20 (ENSCPOG00000003129) #28	ARL1 (ENSCPOG00000026014) #29	SPIC (ENSCPOG00000007301) #30	MYBPC1 (ENSCPOG00000011180) #31	CHPT1 (ENSCPOG00000001199) #32	SYCP3 (ENSCPOG00000001202) #33	GNPTAB (ENSCPOG00000022501) #34	ENSCPOG00000034099 #35	WASHC3 (ENSCPOG00000036997) #36	NUP37 (ENSCPOG00000011895) #37
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000153110.B	ENSGT00390000008645 #7	ENSGT00390000009047.b #8	ENSGT00940000156375 #9	ENSGT00940000157129 #10	ENSGT00940000155834 #11	ENSGT00940000162446 #12	ENSGT00390000001561 #13	ENSGT00940000154098.a.d ##15	ENSGT00390000008708 #16	ENSGT00500000045001 #17	ENSGT00940000157710 #18	ENSGT00940000154572.`c #19	ENSGT00600000084428.b #20	ENSGT00720000108833 #21	ENSGT00880000138031 #22	ENSGT00940000158187 #23	ENSGT00940000158037 #24	ENSGT00940000159389 #25	ENSGT00940000158600 #26	ENSGT00940000155166.A #27	ENSGT00390000016813 #28	ENSGT00940000155118.y.a #29	ENSGT00940000155067.a #30	ENSGT00940000158254 #31	ENSGT00950000183117.a.a #32	ENSGT00390000000062.x.a #33	ENSGT00390000006747 #34	ENSGT01030000234578.B.a #35	ENSGT00390000014084 #36	ENSGT00390000010777 #37
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	112	HAL (ENSCLAG00000009969) #8	Lta4h (ENSCLAG00000011828) #9	ELK3 (ENSCLAG00000014957) #10	CDK17 (ENSCLAG00000012821) #11	CFAP54 (ENSCLAG00000008151) #12	NEDD1 (ENSCLAG00000013064) #13	ENSCLAG00000007083	TMPO (ENSCLAG00000007244) #15	SLC25A3 (ENSCLAG00000007243) #16	IKBIP (ENSCLAG00000008628) #17	APAF1 (ENSCLAG00000009227) #18	ANKS1B (ENSCLAG00000009661) #19	ENSCLAG00000009179	BLTP3B (ENSCLAG00000012501) #20	ACTR6 (ENSCLAG00000007878) #21	SCYL2 (ENSCLAG00000010496) #22	SLC17A8 (ENSCLAG00000011320) #23	ENSCLAG00000015655	NR1H4 (ENSCLAG00000012775) #24	GAS2L3 (ENSCLAG00000007654) #25	ANO4 (ENSCLAG00000014090) #26	SLC5A8 (ENSCLAG00000009574) #27	UTP20 (ENSCLAG00000011569) #28	ARL1 (ENSCLAG00000008180) #29	SPIC (ENSCLAG00000016048) #30	MYBPC1 (ENSCLAG00000006936) #31	ENSCLAG00000012024 #32	SYCP3 (ENSCLAG00000006962) #33	GNPTAB (ENSCLAG00000007404) #34	DRAM1 (ENSCLAG00000008068) #35	WASHC3 (ENSCLAG00000008749) #36
Degu	MODERN SPECIES	45	ENSODEG00000010263	ENSODEG00000019742	ENSODEG00000019648	ENSODEG00000013377 ##15	SLC25A3 (ENSODEG00000009995) #16	ENSODEG00000010948 #17	APAF1 (ENSODEG00000010122) #18	ENSODEG00000019813	ENSODEG00000010313 #19	ENSODEG00000010573	ENSODEG00000010991	ENSODEG00000010669 #19	ENSODEG00000011572	BLTP3B (ENSODEG00000010196) #20	ENSODEG00000010649 #21	ENSODEG00000011114 #22	SLC17A8 (ENSODEG00000010869) #23	NR1H4 (ENSODEG00000012027) #24	ENSODEG00000010407 #25	ENSODEG00000009780	ANO4 (ENSODEG00000011009) #26	ENSODEG00000010202	SLC5A8 (ENSODEG00000010696) #27	UTP20 (ENSODEG00000013411) #28	ENSODEG00000010531 #29	SPIC (ENSODEG00000010078) #30	ENSODEG00000010424	MYBPC1 (ENSODEG00000012077) #31	CHPT1 (ENSODEG00000011230) #32	SYCP3 (ENSODEG00000011961) #33	GNPTAB (ENSODEG00000012289) #34