Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000155016.w.a	ENSGT00390000003290 #7	ENSGT00940000156334 #8	ENSGT00940000158165 #9	ENSGT00390000005848 #10	ENSGT00940000157275 #11	ENSGT00940000154003.A #12	ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.a.b.a.b #13	ENSGT00390000014448 #15	ENSGT00940000157983 #16	ENSGT00390000010491.lb #17	ENSGT00540000070023.c.b.b #18	ENSGT00940000155210.a.b #19	ENSGT00940000156910 #20	ENSGT00510000046843.b #21	ENSGT00950000182952.C #22	ENSGT00940000158382 #24	ENSGT00940000158177.b #25	ENSGT00940000158968 #26	ENSGT00940000157574 #27	ENSGT00730000111529 #28	ENSGT00940000158686 #30	ENSGT00940000160413 #31	ENSGT00940000163607	ENSGT00940000158342.b #32	ENSGT00390000018272 #34	ENSGT00940000157538 #35	ENSGT00730000111039.C #36	ENSGT00500000044938 #37	ENSGT00920000149095.b	ENSGT00940000155352
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	19	VEZT (ENSOARG00020014442) #7	FGD6 (ENSOARG00020014249) #8	NR2C1 (ENSOARG00020014046) #9	NDUFA12 (ENSOARG00020013894) #10	TMCC3 (ENSOARG00020013827) #11	CEP83 (ENSOARG00020013661) #12	PLXNC1 (ENSOARG00020012556) #13	ENSOARG00020012474 #14	CRADD (ENSOARG00020012437) #15	SOCS2 (ENSOARG00020012403) #16	MRPL42 (ENSOARG00020012331) #17	UBE2N (ENSOARG00020012230) #18	ENSOARG00020012168 #19	EEA1 (ENSOARG00020010609) #20	PLEKHG7 (ENSOARG00020010208) #21	BTG1 (ENSOARG00020010138) #22	ENSOARG00020010084 #23	DCN (ENSOARG00020009720) #24	LUM (ENSOARG00020009658) #25	KERA (ENSOARG00020009608) #26	EPYC (ENSOARG00020009542) #27	CCER1 (ENSOARG00020009520) #28	ENSOARG00020009475 #29	ATP2B1 (ENSOARG00020008845) #30	POC1B (ENSOARG00020008549) #31	DUSP6 (ENSOARG00020008467) #32	ENSOARG00020008432 #33	KITLG (ENSOARG00020008140) #34	TMTC3 (ENSOARG00020008061) #35	ENSOARG00020008023 #36	C3H12orf29 (ENSOARG00020007796) #37
Goat	MODERN SPECIES	24	FGD6 (ENSCHIG00000020399) #8	NR2C1 (ENSCHIG00000014160) #9	NDUFA12 (ENSCHIG00000018443) #10	TMCC3 (ENSCHIG00000020232) #11	CEP83 (ENSCHIG00000013917) #12	PLXNC1 (ENSCHIG00000011272) #13	ENSCHIG00000001717 #14	CRADD (ENSCHIG00000023376) #15	SOCS2 (ENSCHIG00000027066) #16	MRPL42 (ENSCHIG00000014921) #17	ENSCHIG00000021426	ENSCHIG00000025703 ##18	ENSCHIG00000022798 #19	EEA1 (ENSCHIG00000021418) #20	PLEKHG7 (ENSCHIG00000026476) #21	BTG1 (ENSCHIG00000012095) #22	DCN (ENSCHIG00000018030) #24	LUM (ENSCHIG00000023831) #25	KERA (ENSCHIG00000003728) #26	EPYC (ENSCHIG00000000730) #27	CCER1 (ENSCHIG00000003024) #28	ATP2B1 (ENSCHIG00000024254) #30	POC1B (ENSCHIG00000026402) #31	DUSP6 (ENSCHIG00000011320) #32	KITLG (ENSCHIG00000025211) #34	TMTC3 (ENSCHIG00000007192) #35	CEP290 (ENSCHIG00000010170) #36	C12orf29 (ENSCHIG00000011970) #37	C12orf50 (ENSCHIG00000016372)	MGAT4C (ENSCHIG00000026547)	NTS (ENSCHIG00000015085)
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	24	CRADD (ENSBIXG00005011535) #15	ENSBIXG00005011494 ##14	SOCS2 (ENSBIXG00005011463) #16	MRPL42 (ENSBIXG00005001077) #17	UBE2N (ENSBIXG00005001062) #18	ENSBIXG00005011234	ENSBIXG00005001049 #19	ENSBIXG00005011214	ENSBIXG00005011210	ENSBIXG00005011205	ENSBIXG00005011197	ENSBIXG00005011181	EEA1 (ENSBIXG00005001022) #20	PLEKHG7 (ENSBIXG00005000562) #21	ENSBIXG00005010925	ENSBIXG00005000962 #22	DCN (ENSBIXG00005010822) #24	LUM (ENSBIXG00005000930) #25	KERA (ENSBIXG00005010696) #26	EPYC (ENSBIXG00005000920) #27	CCER1 (ENSBIXG00005010660) #28	ATP2B1 (ENSBIXG00005000696) #30	POC1B (ENSBIXG00005010375) #31	DUSP6 (ENSBIXG00005010324) #32	ENSBIXG00005010310	KITLG (ENSBIXG00005010279) #34	TMTC3 (ENSBIXG00005000813) #35	CEP290 (ENSBIXG00005010227) #36	C12orf29 (ENSBIXG00005010182) #37	C12orf50 (ENSBIXG00005006418)	ENSBIXG00005000773
Cow	MODERN SPECIES	24	NR2C1 (ENSBTAG00000017729) #9	NDUFA12 (ENSBTAG00000014669) #10	TMCC3 (ENSBTAG00000014375) #11	CEP83 (ENSBTAG00000004484) #12	ENSBTAG00000052916	PLXNC1 (ENSBTAG00000011245) #13	ENSBTAG00000053589 ##14	CRADD (ENSBTAG00000051267) #15	SOCS2 (ENSBTAG00000012007) #16	MRPL42 (ENSBTAG00000002708) #17	UBE2N (ENSBTAG00000021767) ##18	NUDT4 (ENSBTAG00000007447) #19	EEA1 (ENSBTAG00000000421) #20	PLEKHG7 (ENSBTAG00000000818) #21	ENSBTAG00000033600	BTG1 (ENSBTAG00000020330) #22	DCN (ENSBTAG00000003505) #24	LUM (ENSBTAG00000001745) #25	KERA (ENSBTAG00000014340) #26	EPYC (ENSBTAG00000007990) #27	CCER1 (ENSBTAG00000007035) #28	ATP2B1 (ENSBTAG00000009552) #30	POC1B (ENSBTAG00000000687) #31	DUSP6 (ENSBTAG00000004587) #32	KITLG (ENSBTAG00000017549) #34	TMTC3 (ENSBTAG00000009023) #35	ENSBTAG00000051348 #36	ENSBTAG00000052837	CEP290 (ENSBTAG00000018745) #36	C5H12orf29 (ENSBTAG00000018743) #37	C5H12orf50 (ENSBTAG00000018180)
Domestic yak	MODERN SPECIES	24	FGD6 (ENSBGRG00000000973) #8	NR2C1 (ENSBGRG00000001106) #9	NDUFA12 (ENSBGRG00000001191) #10	TMCC3 (ENSBGRG00000001238) #11	CEP83 (ENSBGRG00000001277) #12	PLXNC1 (ENSBGRG00000001355) #13	ENSBGRG00000001744 #15	SOCS2 (ENSBGRG00000001760) #16	MRPL42 (ENSBGRG00000001775) #17	ENSBGRG00000001804	UBE2N (ENSBGRG00000001816) #18	ENSBGRG00000001842 #19	ENSBGRG00000001871	EEA1 (ENSBGRG00000001904) #20	PLEKHG7 (ENSBGRG00000002088) #21	ENSBGRG00000002139 #22	ENSBGRG00000002152	DCN (ENSBGRG00000002168) #24	LUM (ENSBGRG00000002309) #25	KERA (ENSBGRG00000002328) #26	EPYC (ENSBGRG00000002339) #27	CCER1 (ENSBGRG00000002370) #28	ATP2B1 (ENSBGRG00000002414) #30	POC1B (ENSBGRG00000002622) #31	GALNT4 (ENSBGRG00000002682)	DUSP6 (ENSBGRG00000002711) #32	ENSBGRG00000002741 #33	KITLG (ENSBGRG00000002777) #34	TMTC3 (ENSBGRG00000002830) #35	CEP290 (ENSBGRG00000002844) #36	ENSBGRG00000002890
Wild yak	MODERN SPECIES	2801																BTG1 (ENSBMUG00000022564) #22
American bison	MODERN SPECIES	3057						CEP83 (ENSBBBG00000005097) #12	PLXNC1 (ENSBBBG00000020000) #13	ENSBBBG00000019943 #15	SOCS2 (ENSBBBG00000019936) #16	ENSBBBG00000019921 #17	ENSBBBG00000019905 ##18	ENSBBBG00000019880 #19	EEA1 (ENSBBBG00000019856) #20	ENSBBBG00000019819 #21	ENSBBBG00000019784	BTG1 (ENSBBBG00000007234) #22
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	149															ENSMMSG00000013084	BTG1 (ENSMMSG00000013074) #22	DCN (ENSMMSG00000012969) #24	LUM (ENSMMSG00000012950) #25	KERA (ENSMMSG00000012932) #26	EPYC (ENSMMSG00000012903) #27	CCER1 (ENSMMSG00000012892) #28