Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000158165 #9	ENSGT00390000005848 #10	ENSGT00940000157275 #11	ENSGT00940000154003.A #12	ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.a.b.a.b #13	ENSGT00900000143786	ENSGT00390000014448	ENSGT00940000157983 #14	ENSGT00390000010491.lb #16	ENSGT00540000070023.c.b.b ##17	ENSGT00940000155210.a.b #18	ENSGT00940000156910 #21	ENSGT00510000046843.b #19	ENSGT00430000032851 #20	ENSGT00410000029301	ENSGT00950000182952.C #22	ENSGT00940000158382 #23	ENSGT00940000158177.b #24	ENSGT00940000158968 #25	ENSGT00940000157574 #26	ENSGT00730000111529 #27	ENSGT00940000158686 #31	ENSGT00940000163607 #32	ENSGT00940000160413	ENSGT00540000073882 #33	ENSGT00940000158342.b #34	ENSGT00390000018272 #36	ENSGT00940000157538 #37	ENSGT00730000111039.C	ENSGT00500000044938	ENSGT00920000149095.b
Horse	MODERN SPECIES	20	VEZT (ENSECAG00000002783) #7	FGD6 (ENSECAG00000021075) #8	NR2C1 (ENSECAG00000000645) #9	NDUFA12 (ENSECAG00000015836) #10	TMCC3 (ENSECAG00000011697) #11	CEP83 (ENSECAG00000008428) #12	PLXNC1 (ENSECAG00000022971) #13	SOCS2 (ENSECAG00000006833) #14	ENSECAG00000053683 #15	MRPL42 (ENSECAG00000026888) #16	ENSECAG00000019597 #17	NUDT4 (ENSECAG00000019319) #18	PLEKHG7 (ENSECAG00000000374) #19	ENSECAG00000056644 #20	EEA1 (ENSECAG00000007262) #21	BTG1 (ENSECAG00000031980) #22	DCN (ENSECAG00000020413) #23	LUM (ENSECAG00000018248) #24	KERA (ENSECAG00000017668) #25	EPYC (ENSECAG00000015607) #26	CCER1 (ENSECAG00000015541) #27	ENSECAG00000058662 #28	ENSECAG00000045962 #29	ENSECAG00000049161 #30	ATP2B1 (ENSECAG00000008450) #31	POC1B (ENSECAG00000013326) #32	ENSECAG00000046638 #33	DUSP6 (ENSECAG00000037937) #34	UBE2N (ENSECAG00000009937) #35	KITLG (ENSECAG00000000152) #36	TMTC3 (ENSECAG00000020616) #37
Donkey	MODERN SPECIES	11	ENSEASG00005019402 #7	ENSEASG00005028645 #7	FGD6 (ENSEASG00005019390) #8	NR2C1 (ENSEASG00005019381) #9	NDUFA12 (ENSEASG00005019380) #10	ENSEASG00005006922 #11	ENSEASG00005019376 #12	PLXNC1 (ENSEASG00005019375) #13	SOCS2 (ENSEASG00005019365) #14	MRPL42 (ENSEASG00005019361) #16	ENSEASG00005019358 #35	ENSEASG00005033697 #18	ENSEASG00005019352	EEA1 (ENSEASG00005019347) #21	PLEKHG7 (ENSEASG00005019344) #19	BTG1 (ENSEASG00005038206) #22	DCN (ENSEASG00005019334) #23	LUM (ENSEASG00005019333) #24	KERA (ENSEASG00005019332) #25	EPYC (ENSEASG00005019329) #26	CCER1 (ENSEASG00005019328) #27	ATP2B1 (ENSEASG00005019323) #31	GALNT4 (ENSEASG00005032213) #32	POC1B (ENSEASG00005019319)	ENSEASG00005029510 #33	DUSP6 (ENSEASG00005019316) #34	ENSEASG00005027464	ENSEASG00005026650 ##17	KITLG (ENSEASG00005019312) #36	TMTC3 (ENSEASG00005019307) #37	CEP290 (ENSEASG00005019245)
Megabat	MODERN SPECIES	7201																BTG1 (ENSPVAG00000005437) #22
Microbat	MODERN SPECIES	946					ENSMLUG00000000436	ENSMLUG00000016455	SOCS2 (ENSMLUG00000015422) #14	ENSMLUG00000027351	ENSMLUG00000009982 #17	ENSMLUG00000002767 #18	ENSMLUG00000022858	EEA1 (ENSMLUG00000003482) #21	ENSMLUG00000001417 #19	ENSMLUG00000023018 #20	ENSMLUG00000026108	BTG1 (ENSMLUG00000017492) #22	ENSMLUG00000028663	ENSMLUG00000027841	DCN (ENSMLUG00000000100) #23	LUM (ENSMLUG00000007704) #24	KERA (ENSMLUG00000007698) #25	EPYC (ENSMLUG00000007680) #26	ATP2B1 (ENSMLUG00000017233) #31	ENSMLUG00000009601	POC1B (ENSMLUG00000002893)	DUSP6 (ENSMLUG00000002881) #34	ENSMLUG00000029765	KITLG (ENSMLUG00000001777) #36	ENSMLUG00000003683	TMTC3 (ENSMLUG00000014827) #37	CEP290 (ENSMLUG00000011675)
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	1	RAD51AP1 (ENSRFEG00010019230)	DYRK4 (ENSRFEG00010019022)	AKAP3 (ENSRFEG00010018980)	NDUFA9 (ENSRFEG00010018944)	GALNT8 (ENSRFEG00010018902)	TMCC3 (ENSRFEG00010018851) #11	CEP83 (ENSRFEG00010018746) #12	PLXNC1 (ENSRFEG00010018545) #13	ENSRFEG00010018443 #14	ENSRFEG00010018385 #16	ENSRFEG00010018325 #35	ENSRFEG00010018237 #18	ENSRFEG00010018024	EEA1 (ENSRFEG00010017989) #21	PLEKHG7 (ENSRFEG00010017717) #19	BTG1 (ENSRFEG00010017678) #22	DCN (ENSRFEG00010017493) #23	LUM (ENSRFEG00010017456) #24	KERA (ENSRFEG00010017413) #25	EPYC (ENSRFEG00010017332) #26	CCER1 (ENSRFEG00010017318) #27	ATP2B1 (ENSRFEG00010017003) #31	POC1B (ENSRFEG00010016669)	KITLG (ENSRFEG00010016551) #36	TMTC3 (ENSRFEG00010016505) #37	CEP290 (ENSRFEG00010016392)	C12orf29 (ENSRFEG00010016353)	C12orf50 (ENSRFEG00010016011)	MGAT4C (ENSRFEG00010015934)	NTS (ENSRFEG00010015856)	RASSF9 (ENSRFEG00010015800)
lion	MODERN SPECIES	7	METAP2 (ENSPLOG00000011232)	VEZT (ENSPLOG00000011105) #7	FGD6 (ENSPLOG00000010832) #8	NR2C1 (ENSPLOG00000010742) #9	NDUFA12 (ENSPLOG00000005399) #10	TMCC3 (ENSPLOG00000005312) #11	CEP83 (ENSPLOG00000005293) #12	PLXNC1 (ENSPLOG00000005206) #13	CRADD (ENSPLOG00000005166)	SOCS2 (ENSPLOG00000005147) #14	ENSPLOG00000005119	ENSPLOG00000005096 #16	UBE2N (ENSPLOG00000005059) ##17	ENSPLOG00000005018 #18	EEA1 (ENSPLOG00000004979) #21	BTG1 (ENSPLOG00000004929) #22	DCN (ENSPLOG00000004902) #23	LUM (ENSPLOG00000004883) #24	KERA (ENSPLOG00000004874) #25	EPYC (ENSPLOG00000004861) #26	CCER1 (ENSPLOG00000004853) #27	ATP2B1 (ENSPLOG00000004810) #31	POC1B (ENSPLOG00000004776)	DUSP6 (ENSPLOG00000004748) #34	KITLG (ENSPLOG00000004722) #36	TMTC3 (ENSPLOG00000004704) #37	CEP290 (ENSPLOG00000004652)	C12orf29 (ENSPLOG00000004634)	C12orf50 (ENSPLOG00000004616)	ENSPLOG00000004594	MGAT4C (ENSPLOG00000004588)
leopard	MODERN SPECIES	13	NR2C1 (ENSPPRG00000000725) #9	ENSPPRG00000001562 #10	TMCC3 (ENSPPRG00000002306) #11	ENSPPRG00000002956	CEP83 (ENSPPRG00000005368) #12	PLXNC1 (ENSPPRG00000008196) #13	ENSPPRG00000009352	CRADD (ENSPPRG00000009591)	SOCS2 (ENSPPRG00000010190) #14	ENSPPRG00000012745	ENSPPRG00000013218 #16	ENSPPRG00000015222 ##17	ENSPPRG00000016358 #18	EEA1 (ENSPPRG00000017365) #21	ENSPPRG00000021645 #19	BTG1 (ENSPPRG00000023181) #22	DCN (ENSPPRG00000001125) #23	LUM (ENSPPRG00000001526) #24	KERA (ENSPPRG00000001587) #25	EPYC (ENSPPRG00000001902) #26	CCER1 (ENSPPRG00000018868) #27	ATP2B1 (ENSPPRG00000005222) #31	POC1B (ENSPPRG00000006168)	DUSP6 (ENSPPRG00000006553) #34	KITLG (ENSPPRG00000007405) #36	TMTC3 (ENSPPRG00000008299) #37	CEP290 (ENSPPRG00000018162)	C12orf29 (ENSPPRG00000020648)	C12orf50 (ENSPPRG00000022434)
Tiger	MODERN SPECIES	229	VEZT (ENSPTIG00000019201) #7	FGD6 (ENSPTIG00000017264) #8	NR2C1 (ENSPTIG00000014243) #9	ENSPTIG00000013446 #10	TMCC3 (ENSPTIG00000012501) #11	CEP83 (ENSPTIG00000008825) #12	ENSPTIG00000005416 #13	CRADD (ENSPTIG00000000280)	SOCS2 (ENSPTIG00000020683) #14	ENSPTIG00000020342	ENSPTIG00000019099 #16	ENSPTIG00000018236 #17	ENSPTIG00000016745 #18	EEA1 (ENSPTIG00000013727) #21	ENSPTIG00000012108 #19	BTG1 (ENSPTIG00000003723) #22	DCN (ENSPTIG00000010183) #23	LUM (ENSPTIG00000009273) #24	KERA (ENSPTIG00000009124) #25	EPYC (ENSPTIG00000008648) #26	ATP2B1 (ENSPTIG00000005250) #31	POC1B (ENSPTIG00000019536)	DUSP6 (ENSPTIG00000017946) #34	ENSPTIG00000014354	TMTC3 (ENSPTIG00000013419) #37	CEP290 (ENSPTIG00000022025)	C12orf29 (ENSPTIG00000021960)	C12orf50 (ENSPTIG00000021703)	MGAT4C (ENSPTIG00000021224)	NTS (ENSPTIG00000020009)	RASSF9 (ENSPTIG00000019594)
Cat	MODERN SPECIES	238	ENSFCAG00000045925	VEZT (ENSFCAG00000008353) #7	FGD6 (ENSFCAG00000008351) #8	NR2C1 (ENSFCAG00000026108) #9	ENSFCAG00000023050 #10	TMCC3 (ENSFCAG00000009894) #11	CEP83 (ENSFCAG00000027845) #12	PLXNC1 (ENSFCAG00000036479) #13	ENSFCAG00000051463	SOCS2 (ENSFCAG00000029868) #14	ENSFCAG00000022343	ENSFCAG00000037907 #16	UBE2N (ENSFCAG00000004260) ##17	ENSFCAG00000025933 #18	EEA1 (ENSFCAG00000022916) #21	BTG1 (ENSFCAG00000043871) #22	DCN (ENSFCAG00000022438) #23	LUM (ENSFCAG00000003764) #24	KERA (ENSFCAG00000041006) #25	EPYC (ENSFCAG00000027187) #26	CCER1 (ENSFCAG00000026894) #27	ATP2B1 (ENSFCAG00000007626) #31	POC1B (ENSFCAG00000007623)	DUSP6 (ENSFCAG00000029747) #34	KITLG (ENSFCAG00000028734) #36	ENSFCAG00000050203	TMTC3 (ENSFCAG00000025680) #37	CEP290 (ENSFCAG00000028019)	CB4H12orf29 (ENSFCAG00000000699)	CB4H12orf50 (ENSFCAG00000022045)	ENSFCAG00000051429
Dog	MODERN SPECIES	6	METAP2 (ENSCAFG00845023414)	VEZT (ENSCAFG00845023106) #7	FGD6 (ENSCAFG00845022871) #8	NR2C1 (ENSCAFG00845022744) #9	NDUFA12 (ENSCAFG00845022634) #10	TMCC3 (ENSCAFG00845022396) #11	CEP83 (ENSCAFG00845022275) #12	PLXNC1 (ENSCAFG00845021595) #13	ENSCAFG00845021424	CRADD (ENSCAFG00845021328)	ENSCAFG00845021192 #14	MRPL42 (ENSCAFG00845021094) #16	UBE2N (ENSCAFG00845021013) ##17	NUDT4 (ENSCAFG00845020960) #18	EEA1 (ENSCAFG00845020208) #21	BTG1 (ENSCAFG00845020084) #22	ENSCAFG00845020040	DCN (ENSCAFG00845019761) #23	LUM (ENSCAFG00845019701) #24	KERA (ENSCAFG00845019646) #25	EPYC (ENSCAFG00845019572) #26	CCER1 (ENSCAFG00845019552) #27	ATP2B1 (ENSCAFG00845019043) #31	POC1B (ENSCAFG00845018770)	DUSP6 (ENSCAFG00845018644) #34	KITLG (ENSCAFG00845018506) #36	TMTC3 (ENSCAFG00845018327) #37	CEP290 (ENSCAFG00845017266)	C15H12orf29 (ENSCAFG00845016711)	C15H12orf50 (ENSCAFG00845016524)	ENSCAFG00845016472
Dingo	MODERN SPECIES	277	ENSCAFG00020023187	FGD6 (ENSCAFG00020023183) #8	NR2C1 (ENSCAFG00020023077) #9	NDUFA12 (ENSCAFG00020023057) #10	TMCC3 (ENSCAFG00020023056) #11	CEP83 (ENSCAFG00020023051) #12	PLXNC1 (ENSCAFG00020023009) #13	ENSCAFG00020022981	ENSCAFG00020022976	SOCS2 (ENSCAFG00020022971) #14	MRPL42 (ENSCAFG00020022967) #16	ENSCAFG00020022966 #17	ENSCAFG00020022964 #18	ENSCAFG00020022963	EEA1 (ENSCAFG00020022666) #21	BTG1 (ENSCAFG00020022634) #22	DCN (ENSCAFG00020022624) #23	LUM (ENSCAFG00020022621) #24	KERA (ENSCAFG00020022620) #25	EPYC (ENSCAFG00020022615) #26	CCER1 (ENSCAFG00020022614) #27	ATP2B1 (ENSCAFG00020016571) #31	POC1B (ENSCAFG00020016403)	DUSP6 (ENSCAFG00020016400) #34	ENSCAFG00020016396 #36	ENSCAFG00020016394 #36	TMTC3 (ENSCAFG00020016371) #37	CEP290 (ENSCAFG00020016258)	C12orf29 (ENSCAFG00020016248)	C12orf50 (ENSCAFG00020016242)	ENSCAFG00020016235
Red fox	MODERN SPECIES	9					TMCC3 (ENSVVUG00000012324) #11	CEP83 (ENSVVUG00000012315) #12	PLXNC1 (ENSVVUG00000011903) #13	ENSVVUG00000011872	CRADD (ENSVVUG00000011866)	ENSVVUG00000011846 #14	MRPL42 (ENSVVUG00000011842) #16	ENSVVUG00000011840 ##17	NUDT4 (ENSVVUG00000011834) #18	EEA1 (ENSVVUG00000011772) #21	ENSVVUG00000011745	BTG1 (ENSVVUG00000011741) #22	DCN (ENSVVUG00000011722) #23	LUM (ENSVVUG00000011715) #24	KERA (ENSVVUG00000011712) #25	EPYC (ENSVVUG00000011701) #26	CCER1 (ENSVVUG00000011693) #27	ATP2B1 (ENSVVUG00000011650) #31	ENSVVUG00000011636	ENSVVUG00000011627	DUSP6 (ENSVVUG00000011620) #34	KITLG (ENSVVUG00000011565) #36	TMTC3 (ENSVVUG00000011546) #37	CEP290 (ENSVVUG00000011505)	C12orf29 (ENSVVUG00000011487)	C12orf50 (ENSVVUG00000011456)	ENSVVUG00000011423
Ferret	MODERN SPECIES	185	VEZT (ENSMPUG00000007304) #7	FGD6 (ENSMPUG00000007314) #8	NR2C1 (ENSMPUG00000007335) #9	NDUFA12 (ENSMPUG00000007354) #10	TMCC3 (ENSMPUG00000007383) #11	CEP83 (ENSMPUG00000007387) #12	ENSMPUG00000007401 #13	ENSMPUG00000007413 #13	ENSMPUG00000007427	CRADD (ENSMPUG00000007433)	ENSMPUG00000018718	SOCS2 (ENSMPUG00000007443) #14	ENSMPUG00000007452 #17	ENSMPUG00000007490 #18	EEA1 (ENSMPUG00000007498) #21	BTG1 (ENSMPUG00000007519) #22	DCN (ENSMPUG00000007528) #23	LUM (ENSMPUG00000007539) #24	KERA (ENSMPUG00000007541) #25	EPYC (ENSMPUG00000007552) #26	CCER1 (ENSMPUG00000018720) #27	ATP2B1 (ENSMPUG00000007566) #31	POC1B (ENSMPUG00000007581)	ENSMPUG00000007590	DUSP6 (ENSMPUG00000007599) #34	KITLG (ENSMPUG00000007604) #36	TMTC3 (ENSMPUG00000007613) #37	CEP290 (ENSMPUG00000007620)	C12orf29 (ENSMPUG00000007654)	C12orf50 (ENSMPUG00000007661)	ENSMPUG00000007691
American mink	MODERN SPECIES	22										SOCS2 (ENSNVIG00000023891) #14	ENSNVIG00000023894 #16	ENSNVIG00000023897	ENSNVIG00000023900 ##17	ENSNVIG00000023902 #18	EEA1 (ENSNVIG00000023904) #21	BTG1 (ENSNVIG00000023913) #22	DCN (ENSNVIG00000023917) #23	LUM (ENSNVIG00000023923) #24	KERA (ENSNVIG00000023924) #25	EPYC (ENSNVIG00000023926) #26	CCER1 (ENSNVIG00000023927) #27	ENSNVIG00000023933	ATP2B1 (ENSNVIG00000000007) #31	POC1B (ENSNVIG00000000231)	DUSP6 (ENSNVIG00000000281) #34	ENSNVIG00000000305 #36	TMTC3 (ENSNVIG00000000330) #37	CEP290 (ENSNVIG00000000345)	C12orf29 (ENSNVIG00000000481)	C12orf50 (ENSNVIG00000000495)	ENSNVIG00000000519
Polar bear	MODERN SPECIES	144	VEZT (ENSUMAG00000003464) #7	FGD6 (ENSUMAG00000003327) #8	NR2C1 (ENSUMAG00000003306) #9	NDUFA12 (ENSUMAG00000003277) #10	ENSUMAG00000003265	TMCC3 (ENSUMAG00000003259) #11	ENSUMAG00000003254	CEP83 (ENSUMAG00000003241) #12	PLXNC1 (ENSUMAG00000003163) #13	CRADD (ENSUMAG00000003126)	SOCS2 (ENSUMAG00000003118) #14	MRPL42 (ENSUMAG00000003107) #16	ENSUMAG00000003099 #17	ENSUMAG00000003093 #18	EEA1 (ENSUMAG00000002622) #21	BTG1 (ENSUMAG00000002516) #22	DCN (ENSUMAG00000002501) #23	LUM (ENSUMAG00000002496) #24	KERA (ENSUMAG00000002489) #25	EPYC (ENSUMAG00000002470) #26	ATP2B1 (ENSUMAG00000002449) #31	POC1B (ENSUMAG00000002434)	DUSP6 (ENSUMAG00000002421) #34	KITLG (ENSUMAG00000002410) #36	TMTC3 (ENSUMAG00000002232) #37	CEP290 (ENSUMAG00000001925)	C12orf29 (ENSUMAG00000001897)	C12orf50 (ENSUMAG00000001827)	ENSUMAG00000001817	MGAT4C (ENSUMAG00000001797)	NTS (ENSUMAG00000001768)
American black bear	MODERN SPECIES	7575																BTG1 (ENSUAMG00000011500) #22
Giant Panda	DUPLICATION
Giant Panda	MODERN SPECIES	6	METAP2 (ENSAMEG00000002192)	ENSAMEG00000028699	VEZT (ENSAMEG00000002219) #7	FGD6 (ENSAMEG00000002237) #8	NR2C1 (ENSAMEG00000002266) #9	NDUFA12 (ENSAMEG00000026868) #10	TMCC3 (ENSAMEG00000002299) #11	CEP83 (ENSAMEG00000009750) #12	PLXNC1 (ENSAMEG00000009772) #13	ENSAMEG00000009818 #14	MRPL42 (ENSAMEG00000009832) #16	UBE2N (ENSAMEG00000009833) ##17	ENSAMEG00000009844 #18	EEA1 (ENSAMEG00000006621) #21	ENSAMEG00000024259 #20	BTG1 (ENSAMEG00000018895) #22	DCN (ENSAMEG00000004377) #23	LUM (ENSAMEG00000014674) #24	KERA (ENSAMEG00000014670) #25	EPYC (ENSAMEG00000014653) #26	ATP2B1 (ENSAMEG00000016182) #31	POC1B (ENSAMEG00000001812)	DUSP6 (ENSAMEG00000001852) #34	KITLG (ENSAMEG00000002326) #36	TMTC3 (ENSAMEG00000002347) #37	CEP290 (ENSAMEG00000002356)	C12orf29 (ENSAMEG00000002394)	C12orf50 (ENSAMEG00000002419)	MGAT4C (ENSAMEG00000006123)	NTS (ENSAMEG00000006112)	RASSF9 (ENSAMEG00000006110)
Giant Panda	DUPLICATION
Giant Panda	MODERN SPECIES	703																ENSAMEG00000029781 #22
Giant Panda	MODERN SPECIES	671																ENSAMEG00000030857 #22
Alpaca	MODERN SPECIES	2657													EEA1 (ENSVPAG00000011188) #21	ENSVPAG00000011187 #19	ENSVPAG00000011186	BTG1 (ENSVPAG00000011185) #22	DCN (ENSVPAG00000011184) #23	LUM (ENSVPAG00000011183) #24	KERA (ENSVPAG00000011182) #25	EPYC (ENSVPAG00000011181) #26	CCER1 (ENSVPAG00000011180) #27
Arabian camel	DUPLICATION
Arabian camel	MODERN SPECIES	3	ENSCDRG00005020169	FGD6 (ENSCDRG00005020179) #8	NR2C1 (ENSCDRG00005020214) #9	ENSCDRG00005020236 #10	TMCC3 (ENSCDRG00005020264) #11	CEP83 (ENSCDRG00005020280) #12	ENSCDRG00005020305	PLXNC1 (ENSCDRG00005020326) #13	CRADD (ENSCDRG00005020435)	SOCS2 (ENSCDRG00005020456) #14	ENSCDRG00005020466 #16	UBE2N (ENSCDRG00005020486) ##17	ENSCDRG00005020498 #18	ENSCDRG00005020504	EEA1 (ENSCDRG00005020578) #21	ENSCDRG00005021459 #22	DCN (ENSCDRG00005021468) #23	LUM (ENSCDRG00005021485) #24	KERA (ENSCDRG00005021487) #25	EPYC (ENSCDRG00005021491) #26	CCER1 (ENSCDRG00005021493) #27	ATP2B1 (ENSCDRG00005021499) #31	POC1B (ENSCDRG00005021510)	DUSP6 (ENSCDRG00005021513) #34	KITLG (ENSCDRG00005021518) #36	TMTC3 (ENSCDRG00005021523) #37	CEP290 (ENSCDRG00005021536)	C12orf29 (ENSCDRG00005021555)	C12orf50 (ENSCDRG00005021566)	MGAT4C (ENSCDRG00005005093)	NTS (ENSCDRG00005005109)
Arabian camel	MODERN SPECIES	11	PPP3CA (ENSCDRG00005017194)	ENSCDRG00005017624	EMCN (ENSCDRG00005017637)	DDIT4L (ENSCDRG00005017713)	ENSCDRG00005017732	ENSCDRG00005017764	DNAJB14 (ENSCDRG00005017876)	LAMTOR3 (ENSCDRG00005017934)	DAPP1 (ENSCDRG00005017979)	C4orf54 (ENSCDRG00005018047)	MTTP (ENSCDRG00005018066)	TRMT10A (ENSCDRG00005018130)	C4orf17 (ENSCDRG00005018162)	ENSCDRG00005018187	ENSCDRG00005018280	ENSCDRG00005018374 #22	ADH6 (ENSCDRG00005006293)	ADH4 (ENSCDRG00005006348)	ADH5 (ENSCDRG00005006442)	METAP1 (ENSCDRG00005006507)	ENSCDRG00005006550	TSPAN5 (ENSCDRG00005006719)	RAP1GDS1 (ENSCDRG00005006817)	STPG2 (ENSCDRG00005008261)	ENSCDRG00005008544	PDHA2 (ENSCDRG00005008550)	UNC5C (ENSCDRG00005008588)	ENSCDRG00005008779	BMPR1B (ENSCDRG00005008805)	PDLIM5 (ENSCDRG00005008970)	HPGDS (ENSCDRG00005009472)
Yarkand deer	MODERN SPECIES	22	VEZT (ENSCHYG00000001339) #7	FGD6 (ENSCHYG00000001259) #8	NR2C1 (ENSCHYG00000001219) #9	NDUFA12 (ENSCHYG00000001181) #10	TMCC3 (ENSCHYG00000001134) #11	CEP83 (ENSCHYG00000001094) #12	PLXNC1 (ENSCHYG00000000862) #13	CRADD (ENSCHYG00000000817)	ENSCHYG00000000799 #14	ENSCHYG00000000783	ENSCHYG00000000768 #16	UBE2N (ENSCHYG00000000745) ##17	ENSCHYG00000000720 #18	EEA1 (ENSCHYG00000000516) #21	PLEKHG7 (ENSCHYG00000000447) #19	BTG1 (ENSCHYG00000000427) #22	DCN (ENSCHYG00000000364) #23	LUM (ENSCHYG00000000293) #24	KERA (ENSCHYG00000000274) #25	EPYC (ENSCHYG00000000260) #26	CCER1 (ENSCHYG00000000252) #27	ATP2B1 (ENSCHYG00000000182) #31	POC1B (ENSCHYG00000000134)	DUSP6 (ENSCHYG00000000104) #34	ENSCHYG00000000077	KITLG (ENSCHYG00000000054) #36	TMTC3 (ENSCHYG00000023107) #37	CEP290 (ENSCHYG00000022974)	C12orf29 (ENSCHYG00000022924)	C12orf50 (ENSCHYG00000022875)	MGAT4C (ENSCHYG00000022826)
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	19	VEZT (ENSOARG00020014442) #7	FGD6 (ENSOARG00020014249) #8	NR2C1 (ENSOARG00020014046) #9	NDUFA12 (ENSOARG00020013894) #10	TMCC3 (ENSOARG00020013827) #11	CEP83 (ENSOARG00020013661) #12	PLXNC1 (ENSOARG00020012556) #13	ENSOARG00020012474	CRADD (ENSOARG00020012437)	SOCS2 (ENSOARG00020012403) #14	MRPL42 (ENSOARG00020012331) #16	UBE2N (ENSOARG00020012230) ##17	ENSOARG00020012168 #18	EEA1 (ENSOARG00020010609) #21	PLEKHG7 (ENSOARG00020010208) #19	BTG1 (ENSOARG00020010138) #22	ENSOARG00020010084	DCN (ENSOARG00020009720) #23	LUM (ENSOARG00020009658) #24	KERA (ENSOARG00020009608) #25	EPYC (ENSOARG00020009542) #26	CCER1 (ENSOARG00020009520) #27	ENSOARG00020009475	ATP2B1 (ENSOARG00020008845) #31	POC1B (ENSOARG00020008549)	DUSP6 (ENSOARG00020008467) #34	ENSOARG00020008432	KITLG (ENSOARG00020008140) #36	TMTC3 (ENSOARG00020008061) #37	ENSOARG00020008023	C3H12orf29 (ENSOARG00020007796)
Goat	MODERN SPECIES	24	FGD6 (ENSCHIG00000020399) #8	NR2C1 (ENSCHIG00000014160) #9	NDUFA12 (ENSCHIG00000018443) #10	TMCC3 (ENSCHIG00000020232) #11	CEP83 (ENSCHIG00000013917) #12	PLXNC1 (ENSCHIG00000011272) #13	ENSCHIG00000001717	CRADD (ENSCHIG00000023376)	SOCS2 (ENSCHIG00000027066) #14	MRPL42 (ENSCHIG00000014921) #16	ENSCHIG00000021426	ENSCHIG00000025703 #17	ENSCHIG00000022798 #18	EEA1 (ENSCHIG00000021418) #21	PLEKHG7 (ENSCHIG00000026476) #19	BTG1 (ENSCHIG00000012095) #22	DCN (ENSCHIG00000018030) #23	LUM (ENSCHIG00000023831) #24	KERA (ENSCHIG00000003728) #25	EPYC (ENSCHIG00000000730) #26	CCER1 (ENSCHIG00000003024) #27	ATP2B1 (ENSCHIG00000024254) #31	POC1B (ENSCHIG00000026402)	DUSP6 (ENSCHIG00000011320) #34	KITLG (ENSCHIG00000025211) #36	TMTC3 (ENSCHIG00000007192) #37	CEP290 (ENSCHIG00000010170)	C12orf29 (ENSCHIG00000011970)	C12orf50 (ENSCHIG00000016372)	MGAT4C (ENSCHIG00000026547)	NTS (ENSCHIG00000015085)
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	24	CRADD (ENSBIXG00005011535)	ENSBIXG00005011494	SOCS2 (ENSBIXG00005011463) #14	MRPL42 (ENSBIXG00005001077) #16	UBE2N (ENSBIXG00005001062) ##17	ENSBIXG00005011234	ENSBIXG00005001049 #18	ENSBIXG00005011214	ENSBIXG00005011210	ENSBIXG00005011205	ENSBIXG00005011197	ENSBIXG00005011181	EEA1 (ENSBIXG00005001022) #21	PLEKHG7 (ENSBIXG00005000562) #19	ENSBIXG00005010925	ENSBIXG00005000962 #22	DCN (ENSBIXG00005010822) #23	LUM (ENSBIXG00005000930) #24	KERA (ENSBIXG00005010696) #25	EPYC (ENSBIXG00005000920) #26	CCER1 (ENSBIXG00005010660) #27	ATP2B1 (ENSBIXG00005000696) #31	POC1B (ENSBIXG00005010375)	DUSP6 (ENSBIXG00005010324) #34	ENSBIXG00005010310	KITLG (ENSBIXG00005010279) #36	TMTC3 (ENSBIXG00005000813) #37	CEP290 (ENSBIXG00005010227)	C12orf29 (ENSBIXG00005010182)	C12orf50 (ENSBIXG00005006418)	ENSBIXG00005000773
Cow	MODERN SPECIES	24	NR2C1 (ENSBTAG00000017729) #9	NDUFA12 (ENSBTAG00000014669) #10	TMCC3 (ENSBTAG00000014375) #11	CEP83 (ENSBTAG00000004484) #12	ENSBTAG00000052916	PLXNC1 (ENSBTAG00000011245) #13	ENSBTAG00000053589	CRADD (ENSBTAG00000051267)	SOCS2 (ENSBTAG00000012007) #14	MRPL42 (ENSBTAG00000002708) #16	UBE2N (ENSBTAG00000021767) #17	NUDT4 (ENSBTAG00000007447) #18	EEA1 (ENSBTAG00000000421) #21	PLEKHG7 (ENSBTAG00000000818) #19	ENSBTAG00000033600	BTG1 (ENSBTAG00000020330) #22	DCN (ENSBTAG00000003505) #23	LUM (ENSBTAG00000001745) #24	KERA (ENSBTAG00000014340) #25	EPYC (ENSBTAG00000007990) #26	CCER1 (ENSBTAG00000007035) #27	ATP2B1 (ENSBTAG00000009552) #31	POC1B (ENSBTAG00000000687)	DUSP6 (ENSBTAG00000004587) #34	KITLG (ENSBTAG00000017549) #36	TMTC3 (ENSBTAG00000009023) #37	ENSBTAG00000051348	ENSBTAG00000052837	CEP290 (ENSBTAG00000018745)	C5H12orf29 (ENSBTAG00000018743)	C5H12orf50 (ENSBTAG00000018180)
Domestic yak	MODERN SPECIES	24	FGD6 (ENSBGRG00000000973) #8	NR2C1 (ENSBGRG00000001106) #9	NDUFA12 (ENSBGRG00000001191) #10	TMCC3 (ENSBGRG00000001238) #11	CEP83 (ENSBGRG00000001277) #12	PLXNC1 (ENSBGRG00000001355) #13	ENSBGRG00000001744	SOCS2 (ENSBGRG00000001760) #14	MRPL42 (ENSBGRG00000001775) #16	ENSBGRG00000001804	UBE2N (ENSBGRG00000001816) ##17	ENSBGRG00000001842 #18	ENSBGRG00000001871	EEA1 (ENSBGRG00000001904) #21	PLEKHG7 (ENSBGRG00000002088) #19	ENSBGRG00000002139 #22	ENSBGRG00000002152	DCN (ENSBGRG00000002168) #23	LUM (ENSBGRG00000002309) #24	KERA (ENSBGRG00000002328) #25	EPYC (ENSBGRG00000002339) #26	CCER1 (ENSBGRG00000002370) #27	ATP2B1 (ENSBGRG00000002414) #31	POC1B (ENSBGRG00000002622)	GALNT4 (ENSBGRG00000002682) #32	DUSP6 (ENSBGRG00000002711) #34	ENSBGRG00000002741	KITLG (ENSBGRG00000002777) #36	TMTC3 (ENSBGRG00000002830) #37	CEP290 (ENSBGRG00000002844)	ENSBGRG00000002890
Wild yak	MODERN SPECIES	2801																BTG1 (ENSBMUG00000022564) #22
American bison	MODERN SPECIES	3057						CEP83 (ENSBBBG00000005097) #12	PLXNC1 (ENSBBBG00000020000) #13	ENSBBBG00000019943	SOCS2 (ENSBBBG00000019936) #14	ENSBBBG00000019921 #16	ENSBBBG00000019905 ##17	ENSBBBG00000019880 #18	EEA1 (ENSBBBG00000019856) #21	ENSBBBG00000019819 #19	ENSBBBG00000019784	BTG1 (ENSBBBG00000007234) #22
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	149															ENSMMSG00000013084 #20	BTG1 (ENSMMSG00000013074) #22	DCN (ENSMMSG00000012969) #23	LUM (ENSMMSG00000012950) #24	KERA (ENSMMSG00000012932) #25	EPYC (ENSMMSG00000012903) #26	CCER1 (ENSMMSG00000012892) #27
Blue whale	MODERN SPECIES	1	VEZT (ENSBMSG00010009384) #7	FGD6 (ENSBMSG00010009375) #8	NR2C1 (ENSBMSG00010009358) #9	ENSBMSG00010009348 #10	ENSBMSG00010009334	TMCC3 (ENSBMSG00010009320) #11	CEP83 (ENSBMSG00010009304) #12	PLXNC1 (ENSBMSG00010009279) #13	ENSBMSG00010009257	SOCS2 (ENSBMSG00010009251) #14	MRPL42 (ENSBMSG00010009238) #16	ENSBMSG00010009224 ##17	ENSBMSG00010009214 #18	EEA1 (ENSBMSG00010009204) #21	PLEKHG7 (ENSBMSG00010009181) #19	ENSBMSG00010009169 #22	ENSBMSG00010009163	DCN (ENSBMSG00010009144) #23	LUM (ENSBMSG00010009137) #24	KERA (ENSBMSG00010009128) #25	EPYC (ENSBMSG00010009120) #26	CCER1 (ENSBMSG00010009109) #27	ATP2B1 (ENSBMSG00010009037) #31	POC1B (ENSBMSG00010009000)	DUSP6 (ENSBMSG00010008987) #34	ENSBMSG00010008979	ENSBMSG00010008968	KITLG (ENSBMSG00010008954) #36	TMTC3 (ENSBMSG00010008926) #37	ENSBMSG00010008884	C12orf29 (ENSBMSG00010008863)
Dolphin	MODERN SPECIES	6746																BTG1 (ENSTTRG00000014118) #22
Vaquita	MODERN SPECIES	1	VEZT (ENSPSNG00000013799) #7	FGD6 (ENSPSNG00000014016) #8	NR2C1 (ENSPSNG00000014173) #9	ENSPSNG00000014297 #10	ENSPSNG00000014399	TMCC3 (ENSPSNG00000014446) #11	CEP83 (ENSPSNG00000014569) #12	PLXNC1 (ENSPSNG00000014704) #13	CRADD (ENSPSNG00000015305)	SOCS2 (ENSPSNG00000015360) #14	MRPL42 (ENSPSNG00000015405) #16	UBE2N (ENSPSNG00000015507) ##17	ENSPSNG00000015623 #18	EEA1 (ENSPSNG00000015763) #21	ENSPSNG00000015919 #19	BTG1 (ENSPSNG00000004224) #22	DCN (ENSPSNG00000004313) #23	LUM (ENSPSNG00000004371) #24	KERA (ENSPSNG00000004384) #25	EPYC (ENSPSNG00000004398) #26	CCER1 (ENSPSNG00000004420) #27	ATP2B1 (ENSPSNG00000004461) #31	POC1B (ENSPSNG00000004557)	DUSP6 (ENSPSNG00000004604) #34	KITLG (ENSPSNG00000004647) #36	TMTC3 (ENSPSNG00000004690) #37	CEP290 (ENSPSNG00000004767)	C12orf29 (ENSPSNG00000004829)	C12orf50 (ENSPSNG00000004876)	MGAT4C (ENSPSNG00000004935)	NTS (ENSPSNG00000004962)
Beluga whale	MODERN SPECIES	38								ENSDLEG00000004792	SOCS2 (ENSDLEG00000004798) #14	ENSDLEG00000004812 #16	ENSDLEG00000004828 #35	NUDT4 (ENSDLEG00000004835) #18	EEA1 (ENSDLEG00000004852) #21	ENSDLEG00000004902 #19	ENSDLEG00000004917 #20	BTG1 (ENSDLEG00000004924) #22	DCN (ENSDLEG00000004937) #23	LUM (ENSDLEG00000004945) #24	KERA (ENSDLEG00000004953) #25	EPYC (ENSDLEG00000004960) #26	CCER1 (ENSDLEG00000004965) #27	ATP2B1 (ENSDLEG00000004979) #31	POC1B (ENSDLEG00000005012)	DUSP6 (ENSDLEG00000005047) #34	ENSDLEG00000005056	KITLG (ENSDLEG00000005063) #36	TMTC3 (ENSDLEG00000005092) #37	CEP290 (ENSDLEG00000005127)	CUNH12orf29 (ENSDLEG00000005151)	C12orf50 (ENSDLEG00000005169)	MGAT4C (ENSDLEG00000005205)
Narwhal	DUPLICATION
Narwhal	MODERN SPECIES	307	BMPR1B (ENSMMNG00015011501)	PDLIM5 (ENSMMNG00015011438)	ENSMMNG00015011412	HPGDS (ENSMMNG00015011400)	SMARCAD1 (ENSMMNG00015011369)	ATOH1 (ENSMMNG00015011356)	ENSMMNG00015011351	GRID2 (ENSMMNG00015011268)	CCSER1 (ENSMMNG00015011215)	ENSMMNG00015011167	MMRN1 (ENSMMNG00015011136)	SNCA (ENSMMNG00015011091)	ENSMMNG00015011065	GPRIN3 (ENSMMNG00015011061)	TIGD2 (ENSMMNG00015011054)	ENSMMNG00015011038 #22	FAM13A (ENSMMNG00015010904)	NAP1L5 (ENSMMNG00015010819)	HERC3 (ENSMMNG00015010732)	ENSMMNG00015010704	HERC5 (ENSMMNG00015010595)	PPM1K (ENSMMNG00015010529)	ENSMMNG00015010427	PKD2 (ENSMMNG00015010375)	SPP1 (ENSMMNG00015010339)	MEPE (ENSMMNG00015010312)	IBSP (ENSMMNG00015010295)	DMP1 (ENSMMNG00015010277)	ENSMMNG00015010260	SPARCL1 (ENSMMNG00015010232)	NUDT9 (ENSMMNG00015010205)
Narwhal	MODERN SPECIES	313	VEZT (ENSMMNG00015021810) #7	FGD6 (ENSMMNG00015021789) #8	NR2C1 (ENSMMNG00015021774) #9	ENSMMNG00015021766 #10	TMCC3 (ENSMMNG00015021750) #11	ENSMMNG00015021743	CEP83 (ENSMMNG00015021737) #12	PLXNC1 (ENSMMNG00015021714) #13	CRADD (ENSMMNG00015021699)	SOCS2 (ENSMMNG00015021693) #14	ENSMMNG00015021684 #16	ENSMMNG00015021674 #35	ENSMMNG00015021656 #18	EEA1 (ENSMMNG00015021607) #21	ENSMMNG00015021573 #19	ENSMMNG00015021548 #22	ENSMMNG00015021543	DCN (ENSMMNG00015021512) #23	LUM (ENSMMNG00015021485) #24	KERA (ENSMMNG00015021476) #25	EPYC (ENSMMNG00015021465) #26	CCER1 (ENSMMNG00015021459) #27	ATP2B1 (ENSMMNG00015021401) #31	POC1B (ENSMMNG00015021321)	DUSP6 (ENSMMNG00015021301) #34	ENSMMNG00015021288	KITLG (ENSMMNG00015021271) #36	TMTC3 (ENSMMNG00015021249) #37	CEP290 (ENSMMNG00015021183)	C12orf29 (ENSMMNG00015021146)	C12orf50 (ENSMMNG00015021109)
Sperm whale	DUPLICATION
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